View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5078_low_1 (Length: 532)

Name: NF5078_low_1
Description: NF5078
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5078_low_1
NF5078_low_1
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (14-360)||(51008-51354)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (14-340)||(41840-42166)
[»] chr3 (120 HSPs)
chr3 (14-340)||(12029970-12030299)
chr3 (14-340)||(2049921-2050249)
chr3 (14-340)||(13839005-13839329)
chr3 (60-340)||(14842433-14842713)
chr3 (14-440)||(19260647-19261076)
chr3 (178-340)||(51158008-51158170)
chr3 (14-334)||(17912296-17912628)
chr3 (151-356)||(15858986-15859192)
chr3 (114-320)||(16744041-16744247)
chr3 (69-340)||(15614945-15615214)
chr3 (194-334)||(15936633-15936773)
chr3 (194-334)||(15938475-15938615)
chr3 (66-334)||(45860923-45861202)
chr3 (14-146)||(38168237-38168372)
chr3 (14-146)||(33342204-33342333)
chr3 (69-320)||(2449107-2449370)
chr3 (66-334)||(13954756-13955035)
chr3 (188-334)||(13975722-13975867)
chr3 (114-253)||(19231979-19232121)
chr3 (318-441)||(50112166-50112289)
chr3 (318-441)||(35123705-35123828)
chr3 (14-146)||(54685104-54685233)
chr3 (200-334)||(55316337-55316471)
chr3 (318-441)||(12349845-12349967)
chr3 (318-441)||(14298430-14298553)
chr3 (318-441)||(14304057-14304180)
chr3 (200-334)||(41270193-41270327)
chr3 (318-441)||(14295447-14295571)
chr3 (205-441)||(17139517-17139754)
chr3 (318-437)||(17523004-17523124)
chr3 (66-146)||(53771365-53771445)
chr3 (219-334)||(16821257-16821372)
chr3 (318-441)||(54424021-54424144)
chr3 (323-441)||(11329081-11329199)
chr3 (60-334)||(54651574-54651850)
chr3 (66-146)||(16261777-16261857)
chr3 (318-438)||(16996174-16996294)
chr3 (318-438)||(19570803-19570923)
chr3 (318-441)||(22144387-22144510)
chr3 (318-441)||(53898570-53898693)
chr3 (60-146)||(11986026-11986112)
chr3 (318-424)||(12349654-12349760)
chr3 (318-440)||(17100663-17100785)
chr3 (318-440)||(17101348-17101470)
chr3 (17-146)||(30153265-30153396)
chr3 (312-440)||(38167924-38168052)
chr3 (318-440)||(6154446-6154567)
chr3 (318-430)||(317623-317735)
chr3 (312-440)||(3992560-3992688)
chr3 (329-441)||(14059339-14059451)
chr3 (318-441)||(14301074-14301198)
chr3 (318-441)||(14528126-14528250)
chr3 (323-441)||(12488846-12488964)
chr3 (318-438)||(13817527-13817644)
chr3 (73-146)||(28558494-28558567)
chr3 (312-441)||(33341890-33342019)
chr3 (312-441)||(54685418-54685547)
chr3 (312-440)||(2844201-2844329)
chr3 (14-117)||(5240527-5240632)
chr3 (312-440)||(16261463-16261591)
chr3 (318-441)||(6146861-6146983)
chr3 (328-439)||(8631801-8631912)
chr3 (323-438)||(16182065-16182180)
chr3 (312-441)||(30152951-30153080)
chr3 (318-441)||(16880132-16880256)
chr3 (312-440)||(53771051-53771179)
chr3 (329-441)||(55440975-55441087)
chr3 (318-441)||(17938583-17938706)
chr3 (72-146)||(14285289-14285363)
chr3 (14-146)||(51960932-51961063)
chr3 (312-441)||(7853991-7854120)
chr3 (329-441)||(12560362-12560474)
chr3 (312-440)||(23492383-23492511)
chr3 (312-440)||(45581641-45581769)
chr3 (320-441)||(17956109-17956230)
chr3 (372-441)||(19946707-19946776)
chr3 (69-146)||(23492696-23492773)
chr3 (60-313)||(25058876-25059132)
chr3 (312-440)||(54038241-54038369)
chr3 (72-146)||(19947026-19947100)
chr3 (191-284)||(11986169-11986262)
chr3 (73-307)||(12264668-12264905)
chr3 (72-313)||(18911130-18911374)
chr3 (72-146)||(11477053-11477127)
chr3 (323-441)||(17191550-17191668)
chr3 (69-146)||(8268605-8268682)
chr3 (69-146)||(8275705-8275782)
chr3 (318-441)||(11061120-11061244)
chr3 (72-313)||(12901965-12902209)
chr3 (365-441)||(38811170-38811246)
chr3 (329-408)||(3578131-3578209)
chr3 (345-423)||(15876095-15876173)
chr3 (72-146)||(16933827-16933901)
chr3 (204-441)||(14080518-14080756)
chr3 (264-390)||(14814826-14814952)
chr3 (323-420)||(39656556-39656653)
chr3 (194-313)||(49232573-49232694)
chr3 (24-145)||(8632111-8632231)
chr3 (318-373)||(34439458-34439513)
chr3 (60-146)||(18896907-18896993)
chr3 (329-427)||(34559922-34560020)
chr3 (204-424)||(6228625-6228846)
chr3 (114-146)||(17955884-17955916)
chr3 (222-441)||(3576456-3576676)
chr3 (195-307)||(5228456-5228570)
chr3 (114-149)||(15857163-15857198)
chr3 (60-146)||(5228619-5228705)
chr3 (60-146)||(15468203-15468289)
chr3 (194-284)||(15468338-15468428)
chr3 (194-284)||(22275377-22275467)
chr3 (24-146)||(40939446-40939570)
chr3 (204-312)||(4145814-4145923)
chr3 (403-440)||(28558216-28558253)
chr3 (222-427)||(41661588-41661794)
chr3 (72-145)||(44229293-44229366)
chr3 (114-146)||(2844514-2844546)
chr3 (114-146)||(3992873-3992905)
chr3 (205-288)||(47784767-47784851)
chr3 (114-146)||(54038024-54038056)
chr3 (114-146)||(55513193-55513225)
[»] chr4 (78 HSPs)
chr4 (14-340)||(122000-122328)
chr4 (14-340)||(13246541-13246866)
chr4 (33-380)||(15674927-15675281)
chr4 (33-390)||(10104088-10104452)
chr4 (114-340)||(54118168-54118396)
chr4 (43-260)||(33240891-33241114)
chr4 (318-441)||(16732178-16732301)
chr4 (215-380)||(31115700-31115865)
chr4 (318-441)||(34395266-34395389)
chr4 (188-334)||(13048221-13048367)
chr4 (188-320)||(26680331-26680463)
chr4 (69-320)||(16327795-16328058)
chr4 (188-320)||(10488693-10488825)
chr4 (318-440)||(21959578-21959700)
chr4 (33-222)||(31132543-31132739)
chr4 (219-334)||(10644337-10644452)
chr4 (320-441)||(23270051-23270172)
chr4 (66-146)||(15135859-15135939)
chr4 (66-146)||(15272163-15272243)
chr4 (321-441)||(45458973-45459093)
chr4 (60-334)||(47357772-47358043)
chr4 (14-145)||(55376397-55376525)
chr4 (318-441)||(44055924-44056047)
chr4 (318-441)||(820031-820150)
chr4 (320-441)||(55376714-55376835)
chr4 (205-441)||(13809511-13809748)
chr4 (318-438)||(53704848-53704968)
chr4 (204-390)||(40885570-40885756)
chr4 (264-424)||(30457929-30458089)
chr4 (205-424)||(15044854-15045074)
chr4 (318-441)||(12837315-12837438)
chr4 (205-424)||(15109350-15109570)
chr4 (24-146)||(40885368-40885491)
chr4 (318-440)||(30232611-30232733)
chr4 (69-146)||(16608968-16609045)
chr4 (69-146)||(26680517-26680594)
chr4 (72-146)||(32460561-32460635)
chr4 (322-438)||(53907818-53907931)
chr4 (312-441)||(14951771-14951900)
chr4 (312-440)||(15272429-15272557)
chr4 (318-424)||(8872586-8872695)
chr4 (312-440)||(25119324-25119452)
chr4 (345-437)||(27960984-27961076)
chr4 (318-438)||(44346839-44346959)
chr4 (76-146)||(14500074-14500144)
chr4 (316-441)||(18494440-18494566)
chr4 (69-146)||(10488879-10488956)
chr4 (72-313)||(7131940-7132184)
chr4 (72-313)||(22738406-22738650)
chr4 (71-146)||(14952085-14952160)
chr4 (72-146)||(8045272-8045346)
chr4 (69-139)||(13048090-13048160)
chr4 (323-441)||(52265628-52265746)
chr4 (203-424)||(15013282-15013503)
chr4 (60-334)||(17145520-17145796)
chr4 (69-146)||(20001030-20001107)
chr4 (211-424)||(41165953-41166167)
chr4 (69-145)||(26339327-26339403)
chr4 (192-361)||(7850089-7850259)
chr4 (222-424)||(18238175-18238378)
chr4 (312-441)||(5682644-5682773)
chr4 (194-313)||(18169107-18169228)
chr4 (72-144)||(18248527-18248599)
chr4 (71-146)||(15287119-15287194)
chr4 (71-146)||(15294228-15294303)
chr4 (367-441)||(19821940-19822014)
chr4 (71-145)||(22351938-22352012)
chr4 (222-427)||(7964730-7964935)
chr4 (194-313)||(19020623-19020744)
chr4 (264-424)||(38764735-38764895)
chr4 (238-334)||(8374625-8374722)
chr4 (72-146)||(8378493-8378567)
chr4 (72-146)||(14996445-14996519)
chr4 (76-146)||(16523146-16523216)
chr4 (72-146)||(19697236-19697310)
chr4 (72-146)||(19707821-19707895)
chr4 (23-95)||(23269737-23269809)
chr4 (24-146)||(52265312-52265435)
[»] chr2 (67 HSPs)
chr2 (67-340)||(462849-463122)
chr2 (14-356)||(36982267-36982609)
chr2 (56-340)||(8891353-8891639)
chr2 (33-380)||(24341227-24341581)
chr2 (114-334)||(20627238-20627459)
chr2 (114-356)||(19794629-19794872)
chr2 (114-334)||(43642881-43643103)
chr2 (60-433)||(25265249-25265635)
chr2 (14-209)||(22863170-22863364)
chr2 (66-334)||(17396519-17396798)
chr2 (69-320)||(23820202-23820465)
chr2 (69-320)||(14906309-14906572)
chr2 (69-320)||(19689270-19689533)
chr2 (14-146)||(9652699-9652828)
chr2 (318-441)||(25602033-25602156)
chr2 (318-441)||(28974058-28974181)
chr2 (318-441)||(271179-271302)
chr2 (71-320)||(20015142-20015403)
chr2 (192-334)||(7507848-7507990)
chr2 (321-441)||(4448251-4448371)
chr2 (318-441)||(32465867-32465990)
chr2 (357-441)||(27261815-27261899)
chr2 (318-438)||(36890800-36890920)
chr2 (200-334)||(19886661-19886795)
chr2 (66-146)||(21273901-21273980)
chr2 (307-438)||(23836809-23836940)
chr2 (318-441)||(22579976-22580097)
chr2 (39-145)||(32466177-32466281)
chr2 (318-438)||(25876034-25876154)
chr2 (69-313)||(12728529-12728776)
chr2 (69-313)||(34824612-34824859)
chr2 (72-146)||(33128372-33128446)
chr2 (205-441)||(68001-68238)
chr2 (69-313)||(8943983-8944230)
chr2 (69-313)||(12635740-12635987)
chr2 (318-419)||(24571406-24571508)
chr2 (72-146)||(28031092-28031166)
chr2 (69-146)||(12641514-12641591)
chr2 (320-440)||(9653021-9653141)
chr2 (60-313)||(16935730-16935986)
chr2 (60-313)||(17006390-17006646)
chr2 (320-424)||(21274174-21274278)
chr2 (320-429)||(6879458-6879567)
chr2 (312-441)||(22274732-22274860)
chr2 (69-145)||(23774444-23774520)
chr2 (72-146)||(17204659-17204733)
chr2 (69-146)||(3798475-3798552)
chr2 (204-441)||(19666537-19666775)
chr2 (204-441)||(19669109-19669347)
chr2 (72-145)||(21142203-21142276)
chr2 (312-441)||(22283965-22284093)
chr2 (365-441)||(3403-3479)
chr2 (365-441)||(24294685-24294761)
chr2 (211-393)||(24884743-24884926)
chr2 (323-421)||(31146301-31146398)
chr2 (323-441)||(43645902-43646020)
chr2 (72-145)||(5888505-5888578)
chr2 (194-313)||(23778043-23778164)
chr2 (222-390)||(9636805-9636974)
chr2 (114-146)||(22284278-22284310)
chr2 (115-146)||(25213372-25213403)
chr2 (323-441)||(19433452-19433570)
chr2 (102-313)||(42177874-42178088)
chr2 (238-313)||(3798645-3798722)
chr2 (113-146)||(7507756-7507789)
chr2 (365-441)||(722404-722480)
chr2 (114-146)||(22275045-22275077)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (14-389)||(89281-89655)
scaffold0028 (14-239)||(107611-107835)
scaffold0028 (115-146)||(130880-130911)
[»] chr7 (84 HSPs)
chr7 (14-340)||(16211877-16212205)
chr7 (34-340)||(13036858-13037166)
chr7 (14-340)||(11580564-11580891)
chr7 (14-340)||(36052775-36053105)
chr7 (115-334)||(3060083-3060302)
chr7 (72-356)||(47480902-47481199)
chr7 (194-340)||(18253841-18253987)
chr7 (60-432)||(13321033-13321420)
chr7 (69-320)||(11516358-11516621)
chr7 (69-320)||(15441433-15441696)
chr7 (69-320)||(30261998-30262261)
chr7 (218-334)||(16478980-16479096)
chr7 (69-334)||(25292207-25292484)
chr7 (14-146)||(3049905-3050040)
chr7 (69-320)||(7293147-7293410)
chr7 (318-441)||(11287426-11287549)
chr7 (14-146)||(2029244-2029373)
chr7 (318-441)||(7284175-7284298)
chr7 (219-334)||(13572794-13572909)
chr7 (318-441)||(15822546-15822669)
chr7 (200-334)||(10989527-10989661)
chr7 (220-334)||(13911044-13911158)
chr7 (194-334)||(2437575-2437715)
chr7 (66-146)||(42056140-42056220)
chr7 (318-441)||(26070379-26070502)
chr7 (318-441)||(26094166-26094289)
chr7 (14-146)||(25124450-25124584)
chr7 (312-440)||(3049593-3049721)
chr7 (33-202)||(15709407-15709583)
chr7 (43-220)||(36024372-36024556)
chr7 (318-437)||(12759000-12759119)
chr7 (318-440)||(3895035-3895157)
chr7 (335-441)||(45452298-45452404)
chr7 (318-441)||(13274796-13274920)
chr7 (318-441)||(16570120-16570244)
chr7 (318-441)||(16595418-16595542)
chr7 (318-441)||(49047788-49047912)
chr7 (72-316)||(295849-296094)
chr7 (320-438)||(39046740-39046858)
chr7 (66-146)||(2190037-2190117)
chr7 (318-441)||(47289791-47289913)
chr7 (318-441)||(12248235-12248359)
chr7 (14-117)||(17817258-17817363)
chr7 (14-117)||(19049638-19049743)
chr7 (312-439)||(111386-111513)
chr7 (312-441)||(126424-126553)
chr7 (318-441)||(143655-143771)
chr7 (312-440)||(2190303-2190431)
chr7 (205-424)||(13377555-13377775)
chr7 (69-146)||(14113858-14113935)
chr7 (312-440)||(2028931-2029059)
chr7 (312-440)||(32494163-32494291)
chr7 (318-441)||(12369955-12370078)
chr7 (313-440)||(42056407-42056534)
chr7 (71-313)||(18979895-18980140)
chr7 (69-146)||(14423509-14423585)
chr7 (204-424)||(16914928-16915149)
chr7 (318-438)||(35094829-35094948)
chr7 (318-441)||(44865237-44865362)
chr7 (69-313)||(13758507-13758754)
chr7 (73-313)||(15950667-15950910)
chr7 (323-441)||(17224058-17224176)
chr7 (194-288)||(48622664-48622758)
chr7 (72-145)||(10000245-10000318)
chr7 (71-313)||(15927705-15927950)
chr7 (60-313)||(15759977-15760233)
chr7 (72-146)||(371417-371491)
chr7 (204-424)||(9838905-9839126)
chr7 (14-146)||(15516659-15516793)
chr7 (72-145)||(48622541-48622614)
chr7 (318-424)||(13863044-13863151)
chr7 (188-231)||(14113989-14114032)
chr7 (188-231)||(14423639-14423682)
chr7 (222-424)||(48356670-48356873)
chr7 (222-360)||(28722200-28722339)
chr7 (267-441)||(31501182-31501356)
chr7 (204-424)||(9611333-9611555)
chr7 (71-146)||(13572981-13573056)
chr7 (244-424)||(20583595-20583775)
chr7 (244-390)||(13448868-13449014)
chr7 (72-145)||(16418805-16418878)
chr7 (114-146)||(126738-126770)
chr7 (323-411)||(16919598-16919686)
chr7 (114-146)||(32493946-32493978)
[»] chr1 (50 HSPs)
chr1 (14-380)||(20445750-20446116)
chr1 (14-334)||(20913147-20913469)
chr1 (15-340)||(37844275-37844603)
chr1 (14-380)||(20531515-20531880)
chr1 (14-340)||(20931456-20931784)
chr1 (14-340)||(20893454-20893778)
chr1 (114-340)||(41394333-41394559)
chr1 (69-340)||(45051534-45051803)
chr1 (69-340)||(2116366-2116635)
chr1 (318-441)||(21718237-21718360)
chr1 (69-320)||(51452623-51452886)
chr1 (318-441)||(35522434-35522557)
chr1 (200-334)||(18601118-18601252)
chr1 (60-340)||(22227920-22228201)
chr1 (200-334)||(5072388-5072522)
chr1 (194-340)||(22232617-22232763)
chr1 (318-441)||(49967659-49967782)
chr1 (318-441)||(22403225-22403347)
chr1 (318-440)||(35054766-35054888)
chr1 (345-441)||(9784242-9784338)
chr1 (318-440)||(27329870-27329992)
chr1 (321-441)||(51627781-51627902)
chr1 (318-438)||(41212081-41212204)
chr1 (312-440)||(21860021-21860149)
chr1 (312-441)||(22367028-22367156)
chr1 (312-440)||(44035088-44035215)
chr1 (312-441)||(15861543-15861670)
chr1 (204-441)||(22143361-22143599)
chr1 (205-424)||(20177201-20177421)
chr1 (69-145)||(7640806-7640882)
chr1 (318-390)||(9784179-9784248)
chr1 (27-146)||(51627472-51627590)
chr1 (24-145)||(9783870-9783990)
chr1 (69-145)||(22035755-22035831)
chr1 (366-441)||(13377003-13377078)
chr1 (329-424)||(37233986-37234081)
chr1 (73-146)||(15861285-15861358)
chr1 (69-146)||(46523695-46523772)
chr1 (205-288)||(17609090-17609174)
chr1 (204-424)||(21195040-21195261)
chr1 (366-441)||(41229102-41229177)
chr1 (331-380)||(16645982-16646031)
chr1 (238-313)||(17148704-17148781)
chr1 (194-313)||(18059756-18059877)
chr1 (331-379)||(16656709-16656757)
chr1 (71-131)||(18598849-18598908)
chr1 (114-146)||(21860334-21860366)
chr1 (365-441)||(27674805-27674881)
chr1 (365-441)||(36356455-36356531)
chr1 (114-146)||(44034871-44034903)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (14-340)||(1235-1564)
scaffold0266 (14-340)||(3406-3734)
[»] chr5 (81 HSPs)
chr5 (14-340)||(27182374-27182699)
chr5 (69-340)||(23507076-23507347)
chr5 (33-380)||(18530906-18531259)
chr5 (33-380)||(22053671-22054025)
chr5 (200-340)||(29188284-29188424)
chr5 (69-320)||(20623100-20623363)
chr5 (69-320)||(21233397-21233660)
chr5 (274-441)||(1168275-1168442)
chr5 (188-340)||(34939388-34939540)
chr5 (14-146)||(21651018-21651147)
chr5 (69-320)||(16536328-16536591)
chr5 (318-441)||(11337301-11337424)
chr5 (190-320)||(25900408-25900538)
chr5 (188-320)||(37052875-37053007)
chr5 (321-441)||(21906729-21906846)
chr5 (219-334)||(27009959-27010074)
chr5 (219-334)||(43443414-43443529)
chr5 (318-440)||(20712086-20712208)
chr5 (200-334)||(22366481-22366615)
chr5 (14-151)||(23981307-23981442)
chr5 (14-146)||(21205249-21205382)
chr5 (318-441)||(21397098-21397224)
chr5 (14-144)||(2032135-2032263)
chr5 (219-334)||(18778011-18778126)
chr5 (220-334)||(4200005-4200119)
chr5 (200-334)||(19500017-19500151)
chr5 (200-334)||(25426746-25426880)
chr5 (312-441)||(2031819-2031948)
chr5 (66-146)||(108680-108760)
chr5 (329-441)||(19405546-19405658)
chr5 (200-334)||(12492-12626)
chr5 (200-334)||(21073595-21073729)
chr5 (318-441)||(24183247-24183367)
chr5 (350-441)||(23466466-23466557)
chr5 (43-146)||(25005137-25005240)
chr5 (323-441)||(7728429-7728547)
chr5 (69-146)||(37053061-37053138)
chr5 (329-441)||(23493928-23494040)
chr5 (318-438)||(28261533-28261653)
chr5 (205-424)||(5450844-5451064)
chr5 (323-424)||(3673888-3673989)
chr5 (318-438)||(4865274-4865395)
chr5 (321-430)||(21646857-21646966)
chr5 (69-146)||(25900275-25900352)
chr5 (312-440)||(21650705-21650833)
chr5 (60-313)||(23514698-23514954)
chr5 (69-313)||(1219392-1219639)
chr5 (75-146)||(7529228-7529299)
chr5 (318-438)||(24475595-24475710)
chr5 (312-441)||(11342693-11342823)
chr5 (60-142)||(32951016-32951098)
chr5 (312-440)||(21204936-21205064)
chr5 (204-424)||(23981516-23981737)
chr5 (60-307)||(35790961-35791211)
chr5 (318-441)||(11584059-11584186)
chr5 (191-284)||(32950862-32950955)
chr5 (204-441)||(19862218-19862456)
chr5 (69-145)||(23328865-23328941)
chr5 (69-145)||(24616469-24616545)
chr5 (69-145)||(24712845-24712921)
chr5 (69-145)||(24745863-24745939)
chr5 (72-146)||(9730236-9730310)
chr5 (72-146)||(17909823-17909897)
chr5 (71-313)||(7425461-7425706)
chr5 (194-313)||(10777968-10778089)
chr5 (73-146)||(16105967-16106040)
chr5 (73-284)||(11211941-11212153)
chr5 (331-427)||(21222736-21222832)
chr5 (73-146)||(11343008-11343081)
chr5 (24-146)||(19405859-19405982)
chr5 (204-288)||(21310709-21310794)
chr5 (345-441)||(21617025-21617121)
chr5 (264-424)||(24084103-24084263)
chr5 (71-146)||(27010146-27010221)
chr5 (204-286)||(29918129-29918212)
chr5 (194-284)||(17471586-17471676)
chr5 (72-146)||(34939595-34939669)
chr5 (263-441)||(6456633-6456811)
chr5 (194-313)||(36989768-36989889)
chr5 (331-379)||(28902262-28902310)
chr5 (331-379)||(28938657-28938705)
[»] scaffold0162 (4 HSPs)
scaffold0162 (14-340)||(26243-26567)
scaffold0162 (14-349)||(7993-8341)
scaffold0162 (60-146)||(12063-12149)
scaffold0162 (353-441)||(7175-7263)
[»] chr8 (74 HSPs)
chr8 (14-334)||(24928614-24928937)
chr8 (14-334)||(16193541-16193862)
chr8 (14-340)||(43373290-43373620)
chr8 (114-340)||(16404900-16405127)
chr8 (200-340)||(6774258-6774398)
chr8 (200-340)||(24549093-24549233)
chr8 (69-320)||(5238218-5238481)
chr8 (69-320)||(22907083-22907346)
chr8 (69-320)||(24661117-24661380)
chr8 (69-320)||(43685677-43685940)
chr8 (60-340)||(17345680-17345973)
chr8 (318-441)||(20654020-20654143)
chr8 (323-441)||(20647949-20648067)
chr8 (14-146)||(24385550-24385684)
chr8 (318-441)||(20573307-20573430)
chr8 (219-334)||(21844591-21844706)
chr8 (219-334)||(21851984-21852099)
chr8 (318-441)||(41246667-41246790)
chr8 (200-334)||(30120840-30120974)
chr8 (318-440)||(20481615-20481737)
chr8 (200-334)||(16674392-16674526)
chr8 (14-146)||(41506611-41506741)
chr8 (312-441)||(41506926-41507055)
chr8 (318-441)||(37611678-37611800)
chr8 (14-145)||(7000422-7000551)
chr8 (318-438)||(22234918-22235038)
chr8 (329-437)||(39446892-39447000)
chr8 (318-438)||(19993169-19993289)
chr8 (318-441)||(21681011-21681135)
chr8 (329-441)||(38533658-38533770)
chr8 (72-146)||(21494314-21494388)
chr8 (312-440)||(274453-274581)
chr8 (312-440)||(641268-641396)
chr8 (312-440)||(827074-827202)
chr8 (312-440)||(16038998-16039126)
chr8 (312-440)||(39115285-39115413)
chr8 (263-334)||(222754-222825)
chr8 (263-334)||(736377-736448)
chr8 (263-334)||(860272-860343)
chr8 (374-441)||(20567329-20567396)
chr8 (374-441)||(20573522-20573589)
chr8 (72-146)||(22886654-22886728)
chr8 (323-380)||(20561751-20561808)
chr8 (312-440)||(24716979-24717107)
chr8 (323-441)||(23837207-23837325)
chr8 (392-441)||(20567188-20567237)
chr8 (204-424)||(26011520-26011741)
chr8 (72-313)||(13720803-13721047)
chr8 (60-313)||(22006121-22006377)
chr8 (263-321)||(691909-691967)
chr8 (72-146)||(3431134-3431208)
chr8 (323-441)||(22735958-22736076)
chr8 (69-313)||(16872923-16873170)
chr8 (72-146)||(2545265-2545339)
chr8 (222-424)||(15933324-15933527)
chr8 (72-313)||(13662140-13662384)
chr8 (204-441)||(21198152-21198390)
chr8 (368-441)||(25122546-25122618)
chr8 (336-424)||(5854640-5854728)
chr8 (222-389)||(33172289-33172457)
chr8 (264-424)||(45558998-45559158)
chr8 (114-146)||(24716762-24716794)
chr8 (194-307)||(16195374-16195489)
chr8 (264-424)||(18261532-18261692)
chr8 (72-146)||(16038744-16038818)
chr8 (24-145)||(21259301-21259422)
chr8 (211-441)||(23226083-23226314)
chr8 (323-417)||(29306450-29306544)
chr8 (323-372)||(22981351-22981400)
chr8 (114-146)||(274766-274798)
chr8 (114-146)||(641051-641083)
chr8 (114-146)||(826857-826889)
chr8 (205-288)||(17285366-17285450)
chr8 (385-441)||(23149790-23149846)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (14-340)||(172016-172344)
scaffold0001 (14-340)||(177719-178047)
scaffold0001 (323-441)||(60815-60933)
scaffold0001 (318-441)||(70737-70860)
scaffold0001 (72-146)||(164829-164903)
[»] chr6 (73 HSPs)
chr6 (40-340)||(23153558-23153860)
chr6 (115-340)||(14626045-14626270)
chr6 (14-433)||(35009253-35009684)
chr6 (69-340)||(1649976-1650245)
chr6 (34-183)||(23148266-23148415)
chr6 (188-340)||(1657748-1657900)
chr6 (60-340)||(15862582-15862875)
chr6 (60-380)||(29665944-29666267)
chr6 (38-273)||(27751603-27751850)
chr6 (318-441)||(31628277-31628400)
chr6 (66-146)||(23995247-23995327)
chr6 (318-437)||(18432656-18432775)
chr6 (318-441)||(32898799-32898922)
chr6 (200-334)||(25175681-25175815)
chr6 (200-334)||(27653983-27654117)
chr6 (318-441)||(22440944-22441066)
chr6 (200-330)||(16825752-16825884)
chr6 (318-441)||(16086026-16086149)
chr6 (321-440)||(18777156-18777275)
chr6 (323-441)||(18398947-18399065)
chr6 (318-440)||(18570289-18570411)
chr6 (312-441)||(35015274-35015403)
chr6 (312-440)||(26089745-26089873)
chr6 (321-438)||(25744331-25744448)
chr6 (318-438)||(13014824-13014943)
chr6 (72-144)||(15742078-15742150)
chr6 (312-440)||(23994933-23995061)
chr6 (59-146)||(26090059-26090146)
chr6 (72-146)||(32276617-32276691)
chr6 (318-419)||(16106547-16106648)
chr6 (312-440)||(18002613-18002741)
chr6 (316-433)||(28195205-28195324)
chr6 (323-441)||(25367357-25367475)
chr6 (71-313)||(16232029-16232274)
chr6 (372-441)||(18823565-18823634)
chr6 (372-441)||(18839420-18839489)
chr6 (60-313)||(1556142-1556398)
chr6 (222-441)||(18381701-18381921)
chr6 (72-134)||(16299844-16299906)
chr6 (72-146)||(18002353-18002427)
chr6 (312-390)||(18583377-18583455)
chr6 (204-441)||(16887792-16888030)
chr6 (222-441)||(22361783-22362003)
chr6 (42-93)||(14128502-14128552)
chr6 (318-440)||(15742343-15742468)
chr6 (72-146)||(18823241-18823315)
chr6 (72-146)||(18839096-18839170)
chr6 (204-441)||(35136013-35136250)
chr6 (318-441)||(19983414-19983537)
chr6 (69-313)||(23977906-23978153)
chr6 (204-427)||(33538370-33538593)
chr6 (60-146)||(1657607-1657693)
chr6 (399-441)||(18583342-18583384)
chr6 (60-146)||(19610325-19610411)
chr6 (269-380)||(27740909-27741021)
chr6 (71-313)||(18086697-18086942)
chr6 (72-313)||(13620669-13620913)
chr6 (204-433)||(29605467-29605696)
chr6 (222-390)||(17083216-17083384)
chr6 (329-424)||(25651263-25651358)
chr6 (203-420)||(15079709-15079925)
chr6 (204-288)||(18629608-18629693)
chr6 (204-441)||(33324702-33324939)
chr6 (205-441)||(21623177-21623414)
chr6 (115-146)||(4991396-4991427)
chr6 (367-441)||(25919622-25919696)
chr6 (71-145)||(29869650-29869724)
chr6 (194-313)||(16556137-16556258)
chr6 (194-313)||(16632693-16632814)
chr6 (194-313)||(22225736-22225857)
chr6 (24-95)||(18570649-18570720)
chr6 (114-146)||(19983192-19983224)
chr6 (114-146)||(35015057-35015089)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (14-334)||(8995-9317)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (14-340)||(48709-49037)
scaffold0023 (221-334)||(36211-36324)
scaffold0023 (60-313)||(153870-154126)
scaffold0023 (113-146)||(61121-61154)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (14-340)||(36732-37065)
scaffold0077 (318-440)||(15586-15711)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (14-334)||(127993-128315)
scaffold0008 (318-441)||(22700-22823)
scaffold0008 (221-334)||(31696-31809)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (14-340)||(122990-123316)
scaffold0011 (318-441)||(254929-255052)
scaffold0011 (318-441)||(261535-261658)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (14-340)||(247268-247594)
scaffold0012 (318-441)||(253104-253227)
scaffold0012 (60-312)||(34021-34276)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (14-334)||(12230-12553)
[»] scaffold0025 (6 HSPs)
scaffold0025 (14-440)||(146611-147040)
scaffold0025 (33-380)||(8920-9274)
scaffold0025 (162-340)||(148832-149012)
scaffold0025 (14-88)||(149014-149091)
scaffold0025 (331-424)||(53372-53465)
scaffold0025 (205-288)||(53508-53592)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (14-340)||(272136-272464)
scaffold0009 (329-424)||(69483-69578)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (64-340)||(5940-6216)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (60-340)||(828-1108)
scaffold0175 (14-105)||(15238-15326)
scaffold0175 (312-440)||(14959-15087)
[»] scaffold0195 (3 HSPs)
scaffold0195 (117-356)||(19301-19543)
scaffold0195 (188-356)||(21385-21553)
scaffold0195 (318-441)||(633-756)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (124-334)||(4996-5207)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (14-433)||(13524-13955)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (72-433)||(41666-42039)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (191-334)||(48304-48447)
scaffold0049 (72-146)||(48504-48578)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (188-340)||(534-686)
[»] scaffold0026 (5 HSPs)
scaffold0026 (194-334)||(107864-108004)
scaffold0026 (245-334)||(64573-64662)
scaffold0026 (203-254)||(89863-89915)
scaffold0026 (71-146)||(64395-64470)
scaffold0026 (24-144)||(89669-89790)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (192-334)||(5646-5788)
scaffold0772 (69-146)||(5846-5923)
[»] scaffold0597 (2 HSPs)
scaffold0597 (14-146)||(781-910)
scaffold0597 (312-440)||(1095-1223)
[»] scaffold0465 (2 HSPs)
scaffold0465 (14-146)||(9785-9914)
scaffold0465 (323-440)||(10094-10211)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (188-370)||(34460-34642)
scaffold0075 (318-424)||(4967-5073)
[»] scaffold0215 (4 HSPs)
scaffold0215 (219-340)||(9368-9489)
scaffold0215 (219-340)||(16266-16387)
scaffold0215 (72-146)||(9223-9297)
scaffold0215 (72-146)||(16121-16195)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (194-370)||(3044-3220)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (220-340)||(13345-13465)
[»] scaffold0160 (3 HSPs)
scaffold0160 (318-440)||(31-153)
scaffold0160 (40-145)||(339-444)
scaffold0160 (384-440)||(3529-3585)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (69-320)||(1451-1714)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (14-146)||(17207-17336)
scaffold0234 (312-440)||(17521-17649)
[»] scaffold0141 (3 HSPs)
scaffold0141 (69-320)||(22671-22934)
scaffold0141 (188-320)||(26926-27058)
scaffold0141 (69-146)||(27112-27189)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (318-441)||(153-276)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (318-441)||(691-814)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (318-441)||(21521-21644)
scaffold0120 (318-441)||(31220-31343)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (318-441)||(132365-132488)
scaffold0021 (318-441)||(11696-11820)
scaffold0021 (321-436)||(88289-88404)
scaffold0021 (24-146)||(12009-12132)
[»] scaffold0014 (3 HSPs)
scaffold0014 (318-441)||(85341-85464)
scaffold0014 (312-441)||(159311-159438)
scaffold0014 (24-146)||(159619-159742)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (323-441)||(109582-109700)
scaffold0035 (321-441)||(118081-118201)
[»] scaffold0032 (4 HSPs)
scaffold0032 (14-146)||(55904-56033)
scaffold0032 (60-146)||(108021-108107)
scaffold0032 (312-440)||(55591-55719)
scaffold0032 (204-441)||(104623-104860)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (14-146)||(193295-193429)
scaffold0004 (312-440)||(186643-186770)
scaffold0004 (312-440)||(193605-193732)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (188-320)||(37066-37198)
scaffold0078 (69-146)||(36935-37012)
scaffold0078 (312-440)||(41319-41447)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (318-441)||(11823-11946)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (318-441)||(9946-10069)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (238-339)||(5254-5355)
scaffold0022 (318-441)||(112660-112780)
scaffold0022 (323-441)||(109599-109717)
scaffold0022 (329-441)||(103048-103160)
[»] scaffold0706 (2 HSPs)
scaffold0706 (16-146)||(6343-6475)
scaffold0706 (312-440)||(6660-6788)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (318-441)||(1326-1449)
scaffold0359 (318-424)||(11769-11872)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (318-441)||(8996-9119)
[»] scaffold0116 (3 HSPs)
scaffold0116 (219-334)||(153-268)
scaffold0116 (345-441)||(30100-30196)
scaffold0116 (60-146)||(338-424)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (200-334)||(1304-1438)
[»] scaffold0039 (3 HSPs)
scaffold0039 (14-146)||(12316-12450)
scaffold0039 (312-440)||(12637-12765)
scaffold0039 (345-440)||(19051-19146)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (345-441)||(3308-3404)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (318-441)||(1390-1513)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (318-441)||(937-1060)
scaffold0673 (318-438)||(6960-7083)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (318-441)||(5361-5484)
scaffold0480 (318-441)||(8996-9120)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (219-334)||(14080-14195)
scaffold0139 (194-334)||(21110-21250)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (223-334)||(43115-43226)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (60-340)||(3833-4115)
[»] scaffold0251 (3 HSPs)
scaffold0251 (66-146)||(13237-13317)
scaffold0251 (312-440)||(13503-13631)
scaffold0251 (312-440)||(21477-21605)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (318-438)||(7581-7701)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (60-313)||(10202-10458)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (68-334)||(45147-45416)
scaffold0066 (68-334)||(54533-54802)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (66-146)||(57344-57424)
scaffold0058 (204-441)||(70307-70544)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (318-441)||(229-352)
scaffold0310 (318-407)||(6523-6612)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (318-441)||(11683-11806)
[»] scaffold0158 (3 HSPs)
scaffold0158 (318-441)||(24968-25090)
scaffold0158 (318-441)||(25221-25343)
scaffold0158 (38-145)||(25532-25638)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (318-441)||(38307-38430)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (318-441)||(1925-2048)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (329-437)||(33854-33962)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (318-433)||(32220-32335)
scaffold0091 (318-433)||(41968-42083)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (318-441)||(48157-48279)
scaffold0068 (318-441)||(61605-61727)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (318-438)||(14889-15006)
scaffold0083 (395-438)||(14229-14272)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (318-440)||(24843-24965)
scaffold0037 (312-440)||(94985-95113)
scaffold0037 (72-146)||(95298-95372)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (60-353)||(55959-56265)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (318-438)||(164227-164347)
scaffold0016 (312-441)||(162295-162425)
scaffold0016 (312-441)||(166381-166503)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (323-422)||(33690-33789)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (72-146)||(34266-34340)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (72-157)||(18015-18100)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (204-441)||(8019-8257)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (312-440)||(31397-31525)
[»] scaffold0092 (2 HSPs)
scaffold0092 (318-441)||(3328-3452)
scaffold0092 (24-146)||(3639-3762)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (318-441)||(46174-46297)
scaffold0034 (312-440)||(79874-80002)
scaffold0034 (318-441)||(40667-40790)
scaffold0034 (114-146)||(80187-80219)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (188-340)||(3300-3453)
scaffold0361 (72-146)||(3505-3578)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (312-441)||(6200-6329)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (312-440)||(9624-9752)
scaffold0574 (72-146)||(9370-9444)
[»] scaffold0303 (2 HSPs)
scaffold0303 (312-440)||(145-273)
scaffold0303 (72-146)||(4304-4378)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (318-427)||(5963-6073)
scaffold0342 (312-437)||(568-693)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (72-146)||(5434-5508)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (72-146)||(5549-5623)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (72-146)||(49710-49784)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (384-441)||(24378-24435)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (205-424)||(2317-2537)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (345-441)||(31053-31149)
scaffold0031 (329-409)||(70654-70734)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (204-441)||(76847-77085)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (60-313)||(1438-1694)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (318-424)||(4589-4696)
scaffold0447 (318-424)||(9203-9310)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (371-441)||(7843-7913)
[»] scaffold0740 (1 HSPs)
scaffold0740 (321-378)||(4357-4414)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (204-420)||(2555-2772)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (72-145)||(12002-12075)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (194-334)||(53992-54132)
scaffold0017 (72-145)||(54182-54255)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (204-360)||(22429-22586)
[»] scaffold0892 (2 HSPs)
scaffold0892 (240-334)||(3531-3625)
scaffold0892 (72-128)||(3743-3799)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (205-427)||(31043-31266)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (72-146)||(6068-6142)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (71-145)||(6905-6979)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (323-441)||(35487-35605)
scaffold0013 (71-131)||(154305-154365)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (323-424)||(335-436)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (204-303)||(1348-1449)
scaffold0409 (204-303)||(9603-9704)
[»] scaffold0383 (2 HSPs)
scaffold0383 (73-146)||(2700-2773)
scaffold0383 (318-424)||(7197-7305)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (72-313)||(1389-1633)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (264-424)||(7736-7896)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (222-441)||(28545-28765)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (345-420)||(197395-197470)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (222-360)||(3341-3480)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (72-146)||(7053-7127)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (112-146)||(17207-17241)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (204-300)||(22422-22520)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (367-424)||(2481-2538)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (194-313)||(39783-39904)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (72-145)||(7517-7590)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (367-423)||(11121-11177)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (204-424)||(29990-30211)


Alignment Details
Target: scaffold0018 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 51008 - 51354
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51008 agagaagaacaagggttagagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 51107  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcatgc 213  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51108 ttaggtaaggagattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 51207  T
Q  214 tccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51208 tccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaa 51307  T
Q  314 attgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgat 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  51308 attgtgctcaattggtgaattatgttatgtggttgatgaattgtgat 51354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 42166 - 41840
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  42166 agagaagaacaagggttagagagaaggagaacttgaagaactaaggattggactgagcttaggaggtaaattgaagtctaagttgggattaatatttatc 42067  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcatgc 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42066 taaggtaagggggttggtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 41967  T
Q  214 tccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41966 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaa 41867  T
Q  314 attgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  41866 attgtgctcaattggtgaattttgcta 41840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 120)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 12029970 - 12030299
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12029970 agagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 12030069  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattca 210  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12030070 atctaaggtaagggggttaatcattatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgacttttgcttatggataattgttgctaaattcg 12030169  T
Q  211 tgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 310  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12030170 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtg 12030269  T
Q  311 aaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  12030270 aaagttgtgctcaattggtgaattttgcta 12030299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 2050249 - 2049921
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2050249 agagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagtttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 2050151  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2050150 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatcaattttgcttatggataattgttgctaaattcg 2050051  T
Q  211 tgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 310  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  2050050 tgctccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtg 2049951  T
Q  311 aaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2049950 aaaattgtgctcaattggtgaattttgcta 2049921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13839329 - 13839005
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  13839329 agagaagaaaaagggttagagagaag---aacttgaagaattgaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtagggattactcttcatc 13839233  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  13839232 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatgaataattgttgctaaattcgtg 13839133  T
Q  213 ctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  13839132 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 13839033  T
Q  313 aattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  13839032 aattgtgctcaattggtgaattttgcta 13839005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 60 - 340
Target Start/End: Original strand, 14842433 - 14842713
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaa 159  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  14842433 attggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttgcaa 14842532  T
Q  160 attttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgt 259  Q
    ||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  14842533 attctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgt 14842632  T
Q  260 aagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14842633 atgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattttgcta 14842713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 440
Target Start/End: Original strand, 19260647 - 19261076
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19260647 agagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagattaagagctaaattgaagtctaagttgggattaatcttt 19260745  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  19260746 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaagttttcaaatgttgtatgaattttttttatggataattgttgctaaattcg 19260845  T
Q  211 tgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgat-gataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttg 308  Q
    ||||| || | ||||||||| |||  ||| ||||| | || |||||||| |   ||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||  | || ||      
T  19260846 tgctctaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtgt 19260945  T
Q  309 tgaaaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgat 408  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||  | ||||| |  ||    
T  19260946 tgaaaa-tatgctcaattggtgaattatactaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaaatgatgttatgaat 19261044  T
Q  409 gataattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  19261045 gttaattcatggcttgggtatgcatgattcat 19261076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 178 - 340
Target Start/End: Original strand, 51158008 - 51158170
Alignment:
Q  178 aattttgcttatggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaatt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51158008 aattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 51158107  T
Q  278 acatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51158108 acatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgcta 51158170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 334
Target Start/End: Original strand, 17912296 - 17912628
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    |||||||||||||||||  |||||||   |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17912296 agagaagaacaagggttaaagagaagagggagagcttgaagaatcaagg-ttggagtgagcttaggagctaaattgaagcctgaggtgggattaatcttt 17912394  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattt-tgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgctta----------tggataattgt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |   ||||||||    ||| ||||| |  | | |          |||||||||||    
T  17912395 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcatttattgcaattttcattatttgtatgaaatgggttgaaatgaatgaatggataattgt 17912494  T
Q  200 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 299  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17912495 tgctaaattcgtgctccaact-tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 17912593  T
Q  300 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||    
T  17912594 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatt 17912628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 151 - 356
Target Start/End: Original strand, 15858986 - 15859192
Alignment:
Q  151 attttgtaaattttcaaatgttgcatgaatttt-gctta-tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattg 248  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15858986 attttgtaaattt-caattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattg 15859084  T
Q  249 atgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttg 348  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  15859085 atgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttg 15859184  T
Q  349 atgaattg 356  Q
     |||||||    
T  15859185 ttgaattg 15859192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 114 - 320
Target Start/End: Original strand, 16744041 - 16744247
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcatgc 213  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  16744041 taaggtaacgaggttagtctttaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgttaaattcgtgc 16744140  T
Q  214 tccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16744141 tccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 16744240  T
Q  314 attgtgc 320  Q
    |||||||    
T  16744241 attgtgc 16744247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 69 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15615214 - 15614945
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaa 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  |    
T  15615214 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-taattttgca--ttttctca 15615118  T
Q  169 tgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 267  Q
    ||||| |||||  | | || ||| | ||||  ||||| |||  |||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15615117 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgtgctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgt 15615018  T
Q  268 tggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  15615017 tggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaatatggtgctcaattggtgaattttgcta 15614945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Original strand, 15936633 - 15936773
Alignment:
Q  194 aattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 293  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15936633 aattgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgt 15936732  T
Q  294 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15936733 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 15936773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Original strand, 15938475 - 15938615
Alignment:
Q  194 aattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 293  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15938475 aattgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgt 15938574  T
Q  294 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15938575 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 15938615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 66 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 45861202 - 45860923
Alignment:
Q  66 gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatt--ttgtaaattt 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  ||| || |||    
T  45861202 gtgagcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttaccataatcatattcattctttgcaatttt 45861103  T
Q  164 tcaaatgttgcatgaattttgctta----------tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgat 253  Q
    |||    ||| ||||| |  | | |          ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  45861102 tcatgaattgtatgaaatgggttgaaaggaatgaatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgat 45861004  T
Q  254 aattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
     |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  45861003 gattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatt 45860923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 38168372 - 38168237
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38168372 agagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttc 38168273  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168272 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 38168237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 33342333 - 33342204
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33342333 agagaagaacaagggttagagagaag---aacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatc 33342237  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33342236 taaggtaagagggttagtctttatcataatcat 33342204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Original strand, 2449107 - 2449370
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatt--ttgtaaattttca 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| || ||||||    
T  2449107 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttca 2449206  T
Q  167 aatgttgcatgaattttgctta----------tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataat 256  Q
        ||| ||||| |  | | |          ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  2449207 tgatttggatgaaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataat 2449306  T
Q  257 tgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2449307 tgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 2449370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 66 - 334
Target Start/End: Original strand, 13954756 - 13955035
Alignment:
Q  66 gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatt--ttgtaaattt 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  ||| || |||    
T  13954756 gtgagcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttaccataatcatgttcattctttgcaatttt 13954855  T
Q  164 tcaaatgttgcatgaattttgctta----------tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgat 253  Q
    |||    ||| ||||| |  | | |          ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  13954856 tcatgaattgtatgaaatgggttgaaaggaatgaatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgat 13954954  T
Q  254 aattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
     |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  13954955 gattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatt 13955035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 188 - 334
Target Start/End: Original strand, 13975722 - 13975867
Alignment:
Q  188 atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13975722 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13975820  T
Q  288 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  13975821 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatt 13975867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19232121 - 19231979
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgcatgaatttt-gctta-tggataattgttgctaaattca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  19232121 taaggtaagggggttagtctttatcttaatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 19232022  T
Q  211 tgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgat 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  19232021 tgctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgatgat 19231979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 50112166 - 50112289
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  50112166 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattca 50112265  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  50112266 tggcttgagtttgcatgattcatg 50112289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 35123828 - 35123705
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35123828 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttattgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattca 35123729  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||    
T  35123728 tggtttgggtttgcatgattcatg 35123705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Original strand, 54685104 - 54685233
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  54685104 agagaagaacaagggttagagagaag---aacttgaagaattaaggattggagtgaaattaggagctaaattgaagtctaagttgggattaatcttcatc 54685200  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  54685201 caaggtaagtgggttagtctttatgataatcat 54685233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 200 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 55316471 - 55316337
Alignment:
Q  200 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 299  Q
    |||||||||| |||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  55316471 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 55316372  T
Q  300 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  55316371 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatt 55316337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 12349845 - 12349967
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12349845 tgctcaattggtgaattatgcatcgtagttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattca 12349944  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| | ||||||||||||||    
T  12349945 tggcttg-ggttgcatgattcatg 12349967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 14298553 - 14298430
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  14298553 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtcatgttgttgatgataattca 14298454  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  14298453 tggcttgggtttgcatgattcatg 14298430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 14304180 - 14304057
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  14304180 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtcatgttgttgatgataattca 14304081  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  14304080 tggcttgggtttgcatgattcatg 14304057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 200 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 41270327 - 41270193
Alignment:
Q  200 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 299  Q
    |||||||||| |||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  41270327 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaat 41270228  T
Q  300 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  41270227 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatt 41270193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 14295571 - 14295447
Alignment:
Q  318 tgctcaattggt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattc 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  14295571 tgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgataattc 14295472  T
Q  417 atggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  14295471 atggcttgggtttgcatgattcatg 14295447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 205 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 17139754 - 17139517
Alignment:
Q  205 aattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgat 302  Q
    ||||| |||||||| | |||||| || |||| ||||||||| ||| || |||||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||| |    
T  17139754 aattcgtgctccaattatgatgacatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaactatgagaaaatggt 17139655  T
Q  303 aagttgtgaaaattgtgctcaattggt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgt 401  Q
    |  |  |||||  | |||||||||||| |||| |||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||    
T  17139654 atatgttgaaa--tatgctcaattggttgaatcatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgt 17139557  T
Q  402 tgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  17139556 tgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatg 17139517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 318 - 437
Target Start/End: Original strand, 17523004 - 17523124
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtc-atgttgttgatgataattc 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  17523004 tgctcaattggtgaattatgctatgttattgatgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgctaagtcaattttgttgatgataattc 17523103  T
Q  417 atggcttgagtttgcatgatt 437  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  17523104 atggcttgggtttgcatgatt 17523124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 53771445 - 53771365
Alignment:
Q  66 gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771445 gtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 53771365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 219 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16821372 - 16821257
Alignment:
Q  219 ctgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 318  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||  |||||    
T  16821372 ctgtgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgt 16821273  T
Q  319 gctcaattggtgaatt 334  Q
    ||| ||||||||||||    
T  16821272 gctaaattggtgaatt 16821257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 54424144 - 54424021
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| || | ||||| |||||| |||||    
T  54424144 tgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattgctaagtgacgttgtggatgattattca 54424045  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  54424044 tggcttgggtatgcatgattcatg 54424021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 323 - 441
Target Start/End: Original strand, 11329081 - 11329199
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 422  Q
    ||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  11329081 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggct 11329180  T
Q  423 tgagtttgcatgattcatg 441  Q
    || || |||||||||||||    
T  11329181 tgggtatgcatgattcatg 11329199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 54651850 - 54651574
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaa 159  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |      
T  54651850 attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgc 54651751  T
Q  160 attttcaaatgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattg 258  Q
    | ||||  |||||| |||||  | | || ||| |||||||||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  54651750 aatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattg 54651651  T
Q  259 taagattgttggtgaaattacatgtt-caaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    || ||||||  |||||||| |||||| |||| |||||| ||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  54651650 tatgattgtgagtgaaattgcatgttgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtgaatt 54651574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16261857 - 16261777
Alignment:
Q  66 gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261857 gtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttggaattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16261777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 318 - 438
Target Start/End: Original strand, 16996174 - 16996294
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  16996174 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattca 16996273  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattc 438  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  16996274 tggcttgagtttgcataattc 16996294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 318 - 438
Target Start/End: Original strand, 19570803 - 19570923
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  19570803 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattca 19570902  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattc 438  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  19570903 tggcttgagtttgcataattc 19570923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 22144387 - 22144510
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| || | |||||||||||||||||| ||    
T  22144387 tgctcaattggtgaagtatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagccatgttgttgatgataataca 22144486  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  22144487 tggcttgggtttgcatgattcatg 22144510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 53898570 - 53898693
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||| || ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  53898570 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgcattgtgataagtttcatgatcaattaatgttgttgttgatatgtcatgttgttggtgataattca 53898669  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||    
T  53898670 tggcttgggtttgcaagattcatg 53898693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 146
Target Start/End: Original strand, 11986026 - 11986112
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11986026 attggggtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 11986112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 318 - 424
Target Start/End: Original strand, 12349654 - 12349760
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||    
T  12349654 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgtagatgataaatca 12349753  T
Q  418 tggcttg 424  Q
    |||||||    
T  12349754 tggcttg 12349760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 318 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 17100785 - 17100663
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| || || ||||| | |||| |||||||    
T  17100785 tgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgttatggatgttaattca 17100686  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||| || ||||||||||||    
T  17100685 tggcttgggtatgcatgattcat 17100663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 318 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 17101470 - 17101348
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| || || ||||| | |||| |||||||    
T  17101470 tgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgttatggatgttaattca 17101371  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||| || ||||||||||||    
T  17101370 tggcttgggtatgcatgattcat 17101348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 30153396 - 30153265
Alignment:
Q  17 gaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  30153396 gaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggggtgagcttaggagctaaagagaagtctaagttgggattaatcttcatc 30153298  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30153297 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 30153265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 38168052 - 38167924
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| | |||| |    
T  38168052 aaattatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtaataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgtt 38167953  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  38167952 aattcatggcttgggtatgcatgattcat 38167924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 318 - 440
Target Start/End: Original strand, 6154446 - 6154567
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  6154446 tgctcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttattgttaagtcatgttgttgatgataattca 6154545  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||| | |||||||||||||    
T  6154546 tggcttg-ggttgcatgattcat 6154567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 318 - 430
Target Start/End: Original strand, 317623 - 317735
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||| ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  317623 tgctaaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattca 317722  T
Q  418 tggcttgagtttg 430  Q
    |||||||||||||    
T  317723 tggcttgagtttg 317735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 3992688 - 3992560
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| | |||| |    
T  3992688 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgct 3992589  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3992588 aattcatggcttgggtatgcatgattcat 3992560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 329 - 441
Target Start/End: Original strand, 14059339 - 14059451
Alignment:
Q  329 tgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtt 428  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14059339 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgatgttattgttgctatgtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 14059438  T
Q  429 tgcatgattcatg 441  Q
    ||||| |||||||    
T  14059439 tgcataattcatg 14059451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 14301198 - 14301074
Alignment:
Q  318 tgctcaattggt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattc 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||| || |||||||||||||| ||||    
T  14301198 tgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgattattc 14301099  T
Q  417 atggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||    
T  14301098 atgtctttggtttgcatgattcatg 14301074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 14528126 - 14528250
Alignment:
Q  318 tgctcaattggt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattc 416  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  14528126 tgctcaattggttgaatcatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatggtaattc 14528225  T
Q  417 atggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||||| || || ||||||||||    
T  14528226 atggcttgggtatgaatgattcatg 14528250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 323 - 441
Target Start/End: Original strand, 12488846 - 12488964
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 422  Q
    ||||| ||||||||| || || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12488846 aattgatgaattatgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggct 12488945  T
Q  423 tgagtttgcatgattcatg 441  Q
    || || | ||| |||||||    
T  12488946 tgggtgttcataattcatg 12488964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 318 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 13817644 - 13817527
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  13817644 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattg---ttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattca 13817548  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattc 438  Q
    ||||||| |||||||| ||||    
T  13817547 tggcttgggtttgcataattc 13817527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 28558567 - 28558494
Alignment:
Q  73 taggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28558567 taggagcaaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagagggttagtttttatcataatcat 28558494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 312 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 33342019 - 33341890
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | | ||||||| |  ||||| | |||||||||    
T  33342019 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattatgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgat 33341920  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33341919 aattcatggcttgggtttgcatgattcatg 33341890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 312 - 441
Target Start/End: Original strand, 54685418 - 54685547
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||| |  ||||| | |||||||||    
T  54685418 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgat 54685517  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  54685518 aattcatggcttggatttgcatgattcatg 54685547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 2844329 - 2844201
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| | |||| |    
T  2844329 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgct 2844230  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  2844229 aattcatggcttgggtatgcatgattcat 2844201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Original strand, 5240527 - 5240632
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5240527 agagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttacgagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttc 5240625  T
Q  111 atctaag 117  Q
    |||||||    
T  5240626 atctaag 5240632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16261591 - 16261463
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| | |||| |    
T  16261591 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgct 16261492  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16261491 aattcatggcttgggtatgcatgattcat 16261463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 6146861 - 6146983
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||| ||||   || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  6146861 tgctcaattggtgaatcatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatggtcaattgttgctgttgttgttaagtcatgttgttgataataattca 6146960  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| |||| |||||||||||    
T  6146961 tggcttgggttt-catgattcatg 6146983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 328 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 8631912 - 8631801
Alignment:
Q  328 gtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagt 427  Q
    ||||||||||||  || |||| || ||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  8631912 gtgaattatgctttgttgttgttggattgtgataagtttcataacaaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggt 8631813  T
Q  428 ttgcatgattca 439  Q
    ||||||||||||    
T  8631812 ttgcatgattca 8631801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 323 - 438
Target Start/End: Original strand, 16182065 - 16182180
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 422  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16182065 aattggtgaattatgcattgtcgttgatgaattgtgataagtttaatgatcaattgttgttgttgttttttagtcatgttgttgatgataattcatggct 16182164  T
Q  423 tgagtttgcatgattc 438  Q
    || |||||||| ||||    
T  16182165 tgggtttgcataattc 16182180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 312 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 30153080 - 30152951
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  30153080 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 30152981  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
     ||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  30152980 gatatatggcttgggtttgcatgattcatg 30152951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 16880256 - 16880132
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaa-ttatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattc 416  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |  ||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  16880256 tgctcaatttgtgaaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttattgttgctaagtgatgttgtggatgataattc 16880157  T
Q  417 atggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||||| || ||||| |||||||    
T  16880156 atggcttgggtgtgcataattcatg 16880132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 53771179 - 53771051
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| |  ||| |    
T  53771179 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgct 53771080  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  53771079 aattcatggcttgggtatgcatgattcat 53771051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 329 - 441
Target Start/End: Original strand, 55440975 - 55441087
Alignment:
Q  329 tgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtt 428  Q
    |||||||| ||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  55440975 tgaattatactatgttgtggttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgatgctaagtgatgttgttgatgataattcatgacttgggta 55441074  T
Q  429 tgcatgattcatg 441  Q
    ||||| |||||||    
T  55441075 tgcataattcatg 55441087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 17938706 - 17938583
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||| ||||| |||||||||||  || |||| || |||||| | | ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  17938706 tgcttaattgatgaattatgctttgttgttgttggattgtggttattttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgataatcattca 17938607  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| |||| |||||||||||    
T  17938606 tggcttgggtttacatgattcatg 17938583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 14285363 - 14285289
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14285363 ttaggagctaaagtgaagcttaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 14285289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Original strand, 51960932 - 51961063
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaa-cttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttat 112  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||  ||| ||| | ||||   |||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  51960932 agagaggaacaagggtt--agagaaggagaaacttgaagaatcaagaattagggtgaatctaggaggtaaagtgaagtctaagtttggattaatcattat 51961029  T
Q  113 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51961030 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 51961063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 7854120 - 7853991
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||| |  ||||| | |||||||||    
T  7854120 aaattatgttcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgat 7854021  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  7854020 aattcatggcttgggtttgcatgaatcatg 7853991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 329 - 441
Target Start/End: Original strand, 12560362 - 12560474
Alignment:
Q  329 tgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtt 428  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||| | |||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||||||| ||     
T  12560362 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatatgattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgttaattcctggcttgggta 12560461  T
Q  429 tgcatgattcatg 441  Q
    |||||||||||||    
T  12560462 tgcatgattcatg 12560474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 23492511 - 23492383
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| | |||| |    
T  23492511 aaattatgctcaaatggtgaattatggatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgct 23492412  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23492411 aattcatggcttgggtatgcatgattcat 23492383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 45581769 - 45581641
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | | | ||||||| |  ||||| | |||||||||    
T  45581769 aaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgat 45581670  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  45581669 aattcatggcttgggtatgcatgattcat 45581641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 320 - 441
Target Start/End: Original strand, 17956109 - 17956230
Alignment:
Q  320 ctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatg 419  Q
    ||||||||||| |||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||| |  ||||| ||||||||||| || ||||    
T  17956109 ctcaattggtgtattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatg 17956208  T
Q  420 gcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  17956209 acttgggtttgcatgattcatg 17956230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 372 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 19946776 - 19946707
Alignment:
Q  372 tcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  19946776 tcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggcttgggtttgcatgattcatg 19946707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23492773 - 23492696
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| |||||||||   |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492773 agcttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23492696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25059132 - 25058876
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaa 159  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||  || || || ||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |      
T  25059132 attggggtaagcttaggagctgaattgaagcaaaaattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgcacaatttttgc 25059033  T
Q  160 attttcaaatgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattg 258  Q
    ||||||  |||||| |||||  | | || ||| | |||||||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |    
T  25059032 attttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgg 25058933  T
Q  259 taagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    || | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  25058932 tatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 25058876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Original strand, 54038241 - 54038369
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||   || ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| | | | ||||||| |  ||||| | |||||||||    
T  54038241 aaattatgctaaattggtgaattatgcatggttgttgatgaaatgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatagttgatgat 54038340  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  54038341 aattcatggcttgggtatgcatgattcat 54038369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19947100 - 19947026
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19947100 ttaggagttaaagtgaagcctaagtttggattaatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 19947026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 284
Target Start/End: Original strand, 11986169 - 11986262
Alignment:
Q  191 gataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 284  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| || || ||||||| || |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  11986169 gataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 11986262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 12264668 - 12264905
Alignment:
Q  73 taggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgtt 172  Q
    |||||||| |||||||||  | ||||||||||||| |  || |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  |||||    
T  12264668 taggagctgaattgaagcaaaggttgggattaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 12264767  T
Q  173 gcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggt 271  Q
    | |||||  | | || ||| | |||||||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||    
T  12264768 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 12264867  T
Q  272 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagtt 307  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  12264868 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtt 12264905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18911374 - 18911130
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgt 171  Q
    ||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||    
T  18911374 ttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgt 18911275  T
Q  172 tgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttgg 270  Q
    || |||||  | | || ||| | |||||||||||||||| |||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||    
T  18911274 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggg 18911175  T
Q  271 tgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  18911174 tgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 18911130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 11477053 - 11477127
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11477053 ttaggagttaaagtgaagcctaagtttgaattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttcttcataatcat 11477127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 323 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 17191668 - 17191550
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 422  Q
    ||||| ||||||||| || || |||| ||||||||||||||  ||||| | ||||||| | | |||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||    
T  17191668 aattgatgaattatgttatgttgttgctgaattgtgataagaatcatgtttaattgatgttgctgttgctaagtaatgttgttgttgatgattcatggct 17191569  T
Q  423 tgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||| | ||| |||||||    
T  17191568 tgagtgttcataattcatg 17191550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 146
Target Start/End: Original strand, 8268605 - 8268682
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8268605 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 8268682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 146
Target Start/End: Original strand, 8275705 - 8275782
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8275705 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 8275782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 11061120 - 11061244
Alignment:
Q  318 tgctcaattggt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattc 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||   ||||| ||||||||| | |||| ||||| || || |||||| |||| ||||    
T  11061120 tgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatagtcatgttcaattgatgttgttggtgctaagtgatattgttgttgatgattc 11061219  T
Q  417 atggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||||| || | ||| |||||||    
T  11061220 atggcttgggtgttcataattcatg 11061244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 313
Target Start/End: Original strand, 12901965 - 12902209
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgt 171  Q
    ||||||| |||| ||||||  ||||| | ||| ||| | | |||||||||||||||||||  | |||||||||||  ||| ||| |  ||||||  ||||    
T  12901965 ttaggagttaaagtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgt 12902064  T
Q  172 tgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttgg 270  Q
    || |||||  | | || ||| |||||| ||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||    
T  12902065 tgtatgaaaatgggttgatgaataatttttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggg 12902164  T
Q  271 tgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  12902165 tgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 12902209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 365 - 441
Target Start/End: Original strand, 38811170 - 38811246
Alignment:
Q  365 ttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||    
T  38811170 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgtgcataattcatg 38811246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 3578209 - 3578131
Alignment:
Q  329 tgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgat 408  Q
    ||||||| |||| || || | ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  3578209 tgaattacgctatgttgtggttgaattgcgataagtttcatgatcaattgat-ttgttgttgctaagtcatgttgttgat 3578131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 15876173 - 15876095
Alignment:
Q  345 gttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggctt 423  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  15876173 gttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttggtaagtgatgttgttaatgatgattcatggctt 15876095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 16933827 - 16933901
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933827 ttaggagctaaagtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16933901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080518
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 301  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |   | ||| ||||| || |||||||||| |||||| || ||     
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgtggttagtgaatttgcatgttcaaagtatgtataagtgc 14080657  T
Q  302 taagttgtgaaaattgtgctcaatt-ggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatg 400  Q
    ||| || ||  |||| ||||||||| |||||||| |||||  | |||| |||||| |||| ||   |||| ||||||||| | ||| |||| | || |||    
T  14080656 taacttatg--aattatgctcaattgggtgaattgtgctatattgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttattgcgaagtaatg 14080559  T
Q  401 ttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||| |||| ||| | |||||| || | ||| |||||||    
T  14080558 ttgttgttgatgatttacggcttgggtattcataattcatg 14080518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 390
Target Start/End: Original strand, 14814826 - 14814952
Alignment:
Q  264 ttgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgata 361  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||||  |||||||||| ||| |||||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  14814826 ttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa--ttgtgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgata 14814923  T
Q  362 agtttcatgatcaattgatatcgttgttg 390  Q
    ||  ||||| | ||||||| | |||||||    
T  14814924 agaatcatgtttaattgatgttgttgttg 14814952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 323 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 39656653 - 39656556
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatgg 420  Q
    ||||| |||||||||||| || |||| ||||||||  |||| |||||| ||||||||| | |||||||||| || || |||||| |||| ||||||||    
T  39656653 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgttgtaagattcatgttcaattgatgtggttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatgg 39656556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 49232694 - 49232573
Alignment:
Q  194 aattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 291  Q
    |||||||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  49232694 aattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 49232595  T
Q  292 gtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  49232594 gtataaatgttaagttatgaaa 49232573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8632231 - 8632111
Alignment:
Q  24 aagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattgga-gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtt-gggattaatctttatctaaggtaa 121  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||  |||||||||||    
T  8632231 aagggttagagagaagaggaacttgaagaatcaaggattgggtgagagct-aggagcaaaattgaagcctaagctagggattactct--atctaaggtaa 8632135  T
Q  122 gggggttagtctttatcataatca 145  Q
    |||||||||  || ||||||||||    
T  8632134 gggggttaggattcatcataatca 8632111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 373
Target Start/End: Original strand, 34439458 - 34439513
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatc 373  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34439458 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattatgataagtttcatgatc 34439513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 146
Target Start/End: Original strand, 18896907 - 18896993
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18896907 attggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttccaaggtaagggggttagttattatcataatcat 18896993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 34560020 - 34559922
Alignment:
Q  329 tgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagt 427  Q
    ||||||||| || || |||| |||||| |||| || |||||| || |||||| | |||||||||| || || |||||| |||| |||||||||||||||    
T  34560020 tgaattatgttatgtagttgttgaattatgatgagattcatgttcgattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagt 34559922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 424
Target Start/End: Original strand, 6228625 - 6228846
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatga 301  Q
    |||||| ||||| || | || |||||| |||| || |||||| ||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  6228625 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatgtgaaaatga 6228724  T
Q  302 taagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatg 400  Q
    ||  |||||  |||||||||| || || |||||| ||||| || ||||  ||||| ||||  |  ||||| | ||||||| | |||||||||| |  ||     
T  6228725 tatattgtg--aattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgtcgaattatgatgtggatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagaaata 6228822  T
Q  401 ttgttgatgataattcatggcttg 424  Q
    |||||| |||| ||||||||||||    
T  6228823 ttgttgttgatgattcatggcttg 6228846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 146
Target Start/End: Original strand, 17955884 - 17955916
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955884 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17955916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 441
Target Start/End: Original strand, 3576456 - 3576676
Alignment:
Q  222 tgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 319  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||  ||||  ||| |||||  |  ||||  || ||    
T  3576456 tgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaatgtatgagaaagtgatatatattgaa--ttatg 3576553  T
Q  320 ctcaa-ttggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcat 418  Q
    ||||| ||| || ||||||||| || |||| ||||||||||||||  ||||| |  |||||| | |||||||||| || || |||| | |||| ||||||    
T  3576554 ctcaaattgatggattatgctatgttgttgttgaattgtgataagagtcatgtttgattgatgttgttgttgctaagtaatattgtggttgatgattcat 3576653  T
Q  419 ggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||| || | ||| |||||||    
T  3576654 ggcttgggtgttcataattcatg 3576676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 5228570 - 5228456
Alignment:
Q  195 attgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt--caaatatg 292  Q
    ||||||||||||||| |||||   |||||||| ||| |   | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||    
T  5228570 attgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatttccttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaaatatg 5228471  T
Q  293 taaaaatgataagtt 307  Q
    || ||||| ||||||    
T  5228470 tataaatgttaagtt 5228456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 149
Target Start/End: Original strand, 15857163 - 15857198
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcat 149  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15857163 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcat 15857198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 5228705 - 5228619
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||| |   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  5228705 attggggtaagcttaggagctgaattgaaacaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcat 5228619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 146
Target Start/End: Original strand, 15468203 - 15468289
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||   | || || ||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15468203 attggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 15468289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 284
Target Start/End: Original strand, 15468338 - 15468428
Alignment:
Q  194 aattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 284  Q
    |||||||||||||||| |||||   || ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  15468338 aattgttgctaaattcgtgctcttgctatgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15468428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22275467 - 22275377
Alignment:
Q  194 aattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 284  Q
    |||||||||||||||| |||||   ||||||||  || ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  22275467 aattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgccattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 22275377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 40939570 - 40939446
Alignment:
Q  24 aagggtttgagagaagg-agaacttgaagaactaaggattgg-agtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtt---gggattaatctttatctaagg 118  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| |   | ||||||  | || ||||||    
T  40939570 aagggttagagagaagggagaacttgaagaatcaaggattgggagagagct-aggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaa--tataactaagg 40939474  T
Q  119 taagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||    
T  40939473 taagggggttagaattcatcataatcat 40939446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 312
Target Start/End: Original strand, 4145814 - 4145923
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgat 302  Q
    |||||| | |||||| | || |||||| |||| || ||||||||| ||||||||| |   |||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  4145814 aaattcgtactccaattatggtgatatgtttgaatacatgaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattacatgttcatagtatgtgaaaatgat 4145913  T
Q  303 aagttgtgaa 312  Q
    |  |||||||    
T  4145914 atattgtgaa 4145923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 28558253 - 28558216
Alignment:
Q  403 gttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  28558253 gttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcat 28558216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 41661794 - 41661588
Alignment:
Q  222 tgatgatatatttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 319  Q
    ||||||||| |||| || |||| || |||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||  |||||||    
T  41661794 tgatgatatgtttgaatacatggaaatgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattgtg 41661697  T
Q  320 ctc-aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcat 418  Q
    ||| || || |||||| ||||| ||  ||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||| | ||||||| |  |  || |||||| |||| ||||||    
T  41661696 ctctaaatgttgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttgagagatattgttgttgatgattcat 41661597  T
Q  419 ggcttgagt 427  Q
     ||||||||    
T  41661596 agcttgagt 41661588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 44229366 - 44229293
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 145  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||  |||||| | | |||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  44229366 ttaggagataaagtgaaacctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatca 44229293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2844546 - 2844514
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2844546 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 2844514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 3992905 - 3992873
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3992905 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3992873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 205 - 288
Target Start/End: Original strand, 47784767 - 47784851
Alignment:
Q  205 aattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 288  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  47784767 aattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 47784851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 146
Target Start/End: Original strand, 54038024 - 54038056
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54038024 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 54038056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 55513225 - 55513193
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55513225 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 55513193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 78)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 122328 - 122000
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  122328 agagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaagagctaaattgaagtctaagttgggattaatcttt 122230  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  122229 atctaaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaatttg 122130  T
Q  211 tgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 310  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  122129 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 122030  T
Q  311 aaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  122029 aaaattgtgctcaattggtgaattttgcta 122000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13246866 - 13246541
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    ||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246866 agagaagaaaaagggtt---gagaaggagaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 13246770  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaa-ttttgc-ttatggataattgttgctaaattcat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  13246769 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgt 13246670  T
Q  212 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 311  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  13246669 gctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13246570  T
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13246569 aaattgtgctcaattggtgaattttgcta 13246541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 33 - 380
Target Start/End: Original strand, 15674927 - 15675281
Alignment:
Q  33 agagaaggagaa-cttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagt 131  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15674927 agagaaggagaaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagt 15675026  T
Q  132 ctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgctta--tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgat 225  Q
    ||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| | ||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15675027 cttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgat 15675126  T
Q  226 gatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaat 325  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15675127 gatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaat 15675226  T
Q  326 tggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgat 380  Q
    ||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||    
T  15675227 tggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgat 15675281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 33 - 390
Target Start/End: Original strand, 10104088 - 10104452
Alignment:
Q  33 agagaaggagaa-cttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagt 131  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  10104088 agagaaggagaaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaagtaaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagt 10104187  T
Q  132 ctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgctta--tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgat 225  Q
    ||| |||||||||||||||||    |||  || ||||||||||| | ||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  10104188 cttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaatccgtgctccaactgtgat 10104287  T
Q  226 gatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaat 325  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10104288 gatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaat 10104387  T
Q  326 tggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttg 390  Q
    ||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | |||||| ||||||||| | |||||||    
T  10104388 tggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttgttg 10104452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 114 - 340
Target Start/End: Original strand, 54118168 - 54118396
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaatttt-gctta-tggataattgttgctaaattcat 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |    
T  54118168 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 54118267  T
Q  212 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 311  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||    
T  54118268 gctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtga 54118367  T
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54118368 aaattgtgctcaattggtgaattttgcta 54118396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33241114 - 33240891
Alignment:
Q  43 aacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataa 142  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33241114 aacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagttaaagcgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagtcttcatcataa 33241015  T
Q  143 tcatcatca----ttttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgctta--tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgt 236  Q
    |||||||||    ||||| || ||||||||||| | ||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  33241014 tcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgt 33240915  T
Q  237 atgcatgaattgatgataattgta 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  33240914 atgcatgaattgatgatgattgta 33240891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 16732301 - 16732178
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16732301 tgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattca 16732202  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  16732201 tggcttgggtttgcatgattcatg 16732178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 215 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115700
Alignment:
Q  215 ccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  315 ttgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgat 380  Q
    || ||||||||||||||||| | ||| || |||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||    
T  31115765 ttatgctcaattggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgat 31115700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 34395389 - 34395266
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34395389 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 34395290  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34395289 tggcttgagtttgcatgattcatg 34395266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 188 - 334
Target Start/End: Original strand, 13048221 - 13048367
Alignment:
Q  188 atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  13048221 atggataattgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 13048320  T
Q  288 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  13048321 atatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattgatgaatt 13048367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 188 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26680463 - 26680331
Alignment:
Q  188 atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  26680463 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 26680364  T
Q  288 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26680363 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 26680331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Original strand, 16327795 - 16328058
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatt--ttgtaaattttca 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| || ||||||    
T  16327795 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggcctaatcttcatataaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttca 16327894  T
Q  167 aatgttgcatgaattttgctta----------tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataat 256  Q
        ||| ||||| |  | | |          ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16327895 tgatttggatgaaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataat 16327994  T
Q  257 tgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16327995 tgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 16328058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 188 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 10488825 - 10488693
Alignment:
Q  188 atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |    
T  10488825 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 10488726  T
Q  288 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10488725 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 10488693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 318 - 440
Target Start/End: Original strand, 21959578 - 21959700
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  21959578 tgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattca 21959677  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||| | |||||||||||||    
T  21959678 tggcttgggcttgcatgattcat 21959700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31132739 - 31132543
Alignment:
Q  33 agagaaggagaa-cttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagt 131  Q
    |||||||||||| |||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  31132739 agagaaggagaaacttgtagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaagtggagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagt 31132640  T
Q  132 ctttatcataatcatcatca----ttttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgctta--tggataattgttgctaaattcatgctccaactgt 222  Q
    ||| |||||||| |||||||    ||||| || ||||||||||| | ||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31132639 cttcatcataattatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccaactgt 31132543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 219 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10644452 - 10644337
Alignment:
Q  219 ctgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 318  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||    
T  10644452 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 10644353  T
Q  319 gctcaattggtgaatt 334  Q
    ||| ||||||||||||    
T  10644352 gctaaattggtgaatt 10644337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 320 - 441
Target Start/End: Original strand, 23270051 - 23270172
Alignment:
Q  320 ctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatg 419  Q
    |||||||| ||||||||||   || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23270051 ctcaattgatgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtatcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 23270150  T
Q  420 gcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  23270151 gcttgggtttgcatgattcatg 23270172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Original strand, 15135859 - 15135939
Alignment:
Q  66 gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135859 gtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15135939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Original strand, 15272163 - 15272243
Alignment:
Q  66 gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272163 gtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15272243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 321 - 441
Target Start/End: Original strand, 45458973 - 45459093
Alignment:
Q  321 tcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatgg 420  Q
    |||||||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  45458973 tcaattggtgaattatgctttgctgttgttgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgaagataatccatgg 45459072  T
Q  421 cttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  45459073 cttgggtttgcatgattcatg 45459093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 47358043 - 47357772
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaa 159  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  | |||||| |     
T  47358043 attggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagttggg-ttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg-taattttgca- 47357947  T
Q  160 attttcaaatgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattg 258  Q
     ||| |  |||||| |||||  | | || ||| | ||||  |||||||||| |||||   |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||    
T  47357946 -tttcctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttg 47357848  T
Q  259 taagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  47357847 tataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatt 47357772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 145
Target Start/End: Original strand, 55376397 - 55376525
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    ||||||||| |||||||  |||  ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||    
T  55376397 agagaagaaaaagggtt--agaagaggagaacttgaagaaccaagaattgg-gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttgggttgatccttatc 55376493  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatca 145  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55376494 taaggtaagggggttagtcttcatcataatca 55376525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 44056047 - 44055924
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |  | |||||||||||||||||||||    
T  44056047 tgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtggtttagccatgttgttgatgataattca 44055948  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  44055947 tggcttgggtttgcatgattcatg 44055924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 820031 - 820150
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  820031 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattg---ttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattca 820127  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| | ||||||||||||||    
T  820128 tggcttg-ggttgcatgattcatg 820150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 320 - 441
Target Start/End: Original strand, 55376714 - 55376835
Alignment:
Q  320 ctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatg 419  Q
    ||||||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  55376714 ctcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaaattatgttgttgatgataattcatg 55376813  T
Q  420 gcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  55376814 gcttgggtttgcatgattcatg 55376835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 205 - 441
Target Start/End: Original strand, 13809511 - 13809748
Alignment:
Q  205 aattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgat 302  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||| || |||||| |   |||||||||| ||| |||||||||| ||||  |||||| |    
T  13809511 aattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgagatttcatgttcaaagtatgagaaaatggt 13809610  T
Q  303 aagttgtgaaaattgtgctcaattggt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgt 401  Q
    |  |  |||||  | ||||||||| || ||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||  | ||||    
T  13809611 atatgttgaaa--tatgctcaattagttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaattgatgt 13809708  T
Q  402 tgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  13809709 tgttgatgataattcatggcttggatatgcatgattcatg 13809748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 318 - 438
Target Start/End: Original strand, 53704848 - 53704968
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  53704848 tgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattca 53704947  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattc 438  Q
    ||||||| |||||||| ||||    
T  53704948 tggcttgggtttgcataattc 53704968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 204 - 390
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885756
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgat 302  Q
    |||||| | ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||      
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtc 40885669  T
Q  303 aagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttg 390  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||  ||| ||||||| |||| | |||||| ||||||||| | |||||||    
T  40885670 aagttatg-aaattatgctcaattggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttgttg 40885756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 264 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 30458089 - 30457929
Alignment:
Q  264 ttgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataa 362  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||  | || ||  |||||||  |||||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||    
T  30458089 ttgttggttgaattacatgttcaaagtatgtaaaatgggtatgtgttgaaaata-tgctcaattggtgaattacgcattgttgttgatgaattgtgataa 30457991  T
Q  363 gtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttg 424  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30457990 gtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgtggttgatgataattcatggcttg 30457929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 205 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 15045074 - 15044854
Alignment:
Q  205 aattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgat 302  Q
    ||||| |||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||    
T  15045074 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgat 15044975  T
Q  303 aagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgt 401  Q
    |  |  ||||  || ||||||| ||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||| || ||||    
T  15044974 atatgttgaa--ttatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgt 15044877  T
Q  402 tgttgatgataattcatggcttg 424  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  15044876 tgttgatgatgattcatggcttg 15044854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 12837315 - 12837438
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| || || ||||| | |||| |||||||    
T  12837315 tgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatggtcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattca 12837414  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  12837415 tggcttgggtatgcatgattcatg 12837438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 205 - 424
Target Start/End: Original strand, 15109350 - 15109570
Alignment:
Q  205 aattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgat 302  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||    
T  15109350 aattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgat 15109449  T
Q  303 aagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgt 401  Q
    |  |  ||||  || | ||||| ||| | |||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||| || ||||    
T  15109450 atatgttgaa--ttatactcaaattgataaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgt 15109547  T
Q  402 tgttgatgataattcatggcttg 424  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  15109548 tgttgatgatgattcatggcttg 15109570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 146
Target Start/End: Original strand, 40885368 - 40885491
Alignment:
Q  24 aagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggatt-ggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaag 122  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  40885368 aagggttagagagaagaggaacttgaagaatcaaggatttggagtgaatctaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaag 40885467  T
Q  123 ggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||  || |||||||||||    
T  40885468 ggggttagaattcatcataatcat 40885491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 318 - 440
Target Start/End: Original strand, 30232611 - 30232733
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| | |||| |||||||    
T  30232611 tgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattca 30232710  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||| || ||||| ||||||    
T  30232711 tggcttgggtatgcattattcat 30232733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 69 - 146
Target Start/End: Original strand, 16608968 - 16609045
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16608968 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16609045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 69 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 26680594 - 26680517
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680594 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26680517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 32460561 - 32460635
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  32460561 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcttcataatcat 32460635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 322 - 438
Target Start/End: Original strand, 53907818 - 53907931
Alignment:
Q  322 caattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggc 421  Q
    |||||||||||||||||   || ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |   ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  53907818 caattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaatgtttcatgatcaattgtt---gttgttgattagtcatgttgttgatgataattcatggc 53907914  T
Q  422 ttgagtttgcatgattc 438  Q
    ||| |||||||| ||||    
T  53907915 ttgggtttgcataattc 53907931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 14951900 - 14951771
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||  |  ||||| |||||||||||    
T  14951900 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttatttagtcatattgttgatgat 14951801  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
     ||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  14951800 gatatatggcttgggtttgcatgattcatg 14951771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Original strand, 15272429 - 15272557
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| |  ||| |    
T  15272429 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttccatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgct 15272528  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15272529 aattcatggcttgggtatgcatgattcat 15272557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 318 - 424
Target Start/End: Original strand, 8872586 - 8872695
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataat 414  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||| | |   |||||||||||||||||||     
T  8872586 tgctcaattggtgaattatgcgttgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataac 8872685  T
Q  415 tcatggcttg 424  Q
    ||||||||||    
T  8872686 tcatggcttg 8872695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Original strand, 25119324 - 25119452
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||| |  ||||| |||||||| ||    
T  25119324 aaattatgatcaattggtgaattatgcatggtttttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgataat 25119423  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
     || ||||||||| |||||||||||||||    
T  25119424 gatacatggcttgggtttgcatgattcat 25119452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 345 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 27961076 - 27960984
Alignment:
Q  345 gttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgatt 437  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  27961076 gttgttgaattgttataagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgatgataattcatggtttgggtatgcatgatt 27960984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 318 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 44346959 - 44346839
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||| |   || ||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||| |  || |||| |||||||||||||||    
T  44346959 tgctcaattggtgaattatacattgttgttcatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtgatgtcgttgatgataattca 44346860  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattc 438  Q
    ||||||| |||||||| ||||    
T  44346859 tggcttgggtttgcataattc 44346839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 146
Target Start/End: Original strand, 14500074 - 14500144
Alignment:
Q  76 gagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14500074 gagctaaagtgaagcttaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttaggcttcatcataatcat 14500144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 441
Target Start/End: Original strand, 18494440 - 18494566
Alignment:
Q  316 tgtgctcaattggt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataat 414  Q
    |||||||||||||| | || |||||| || |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |   ||||||| || || |||||||||||| |||     
T  18494440 tgtgctcaattggttggatgatgctatgttgttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgttgctgttgttgttaagtgatgttgttgatggtaac 18494539  T
Q  415 tcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||||||| || |||||||||||||    
T  18494540 tcatggcttgggtatgcatgattcatg 18494566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 10488956 - 10488879
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  10488956 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaaggtggttggtctttatcttaatcat 10488879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 313
Target Start/End: Original strand, 7131940 - 7132184
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgt 171  Q
    ||||||||| |||||||||   |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||    
T  7131940 ttaggagctgaattgaagcaagagtttggattaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgt 7132039  T
Q  172 tgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttgg 270  Q
    |  |||||  | | || ||| | |||||||||||||||| |||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||    
T  7132040 tatatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggg 7132139  T
Q  271 tgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  7132140 tgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 7132184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22738650 - 22738406
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgt 171  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||| | | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   ||| ||| |  ||||||  ||||    
T  22738650 ttaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcaatttcaatttttgcattttctcatgt 22738551  T
Q  172 tgcatg-aattttgcttatggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttgg 270  Q
    || ||| || |  ||| | | | ||||| || ||||||| || ||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||    
T  22738550 tgtatgaaaatgggctgaggaacaattgatgttaaattcgtgttcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggg 22738451  T
Q  271 tgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  22738450 tgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtgaaa 22738406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 14952160 - 14952085
Alignment:
Q  71 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952160 cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14952085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8045346 - 8045272
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8045346 ttaggagctaaagtgaagtctaagtttgaattaatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 8045272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 139
Target Start/End: Original strand, 13048090 - 13048160
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatca 139  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13048090 agcttaggagttaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagttaagggggttagtctttatca 13048160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 323 - 441
Target Start/End: Original strand, 52265628 - 52265746
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 422  Q
    ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||| || || ||| || |||| ||||||||||    
T  52265628 aattgttgaattatgcaatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgatgttgatgattcatggct 52265727  T
Q  423 tgagtttgcatgattcatg 441  Q
    || || | ||| |||||||    
T  52265728 tgggtgttcataattcatg 52265746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 424
Target Start/End: Original strand, 15013282 - 15013503
Alignment:
Q  203 taaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatg 300  Q
    ||||||| ||||| || | ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||    
T  15013282 taaattcgtgctctaattatgatgatatgtt-gaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatg 15013380  T
Q  301 ataagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcat 399  Q
    | |  |||||||  || ||||||| ||| |||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||||| ||||||| || |  ||    
T  15013381 acatattgtgaa--ttatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatattgttgttgttaagagat 15013478  T
Q  400 gttgttgatgataattcatggcttg 424  Q
     |||||| |||| ||||||||||||    
T  15013479 attgttgttgatgattcatggcttg 15013503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 334
Target Start/End: Original strand, 17145520 - 17145796
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaa 159  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||    |||| |  ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||| |      
T  17145520 attggggtaagcttaggagctgaattgaagtaagagtttgtgttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgc 17145619  T
Q  160 attttcaaatgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattg 258  Q
    ||||||  |||||| |||||  |   || ||| | ||||| || ||||||| |||||  ||||||||| ||| ||  | | |||||||||||||| || |    
T  17145620 attttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttactgtgatgctattttcttgtacatgaattgatgattatgg 17145719  T
Q  259 taagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    || | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||||    
T  17145720 tatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtg-aaattatactcaattagtgaatt 17145796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 20001107 - 20001030
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20001107 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 20001030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 424
Target Start/End: Original strand, 41165953 - 41166167
Alignment:
Q  211 tgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttg 308  Q
    |||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   ||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||  |      
T  41165953 tgctccaattatgataatatatttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgt 41166052  T
Q  309 tgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttga 407  Q
    ||||  || ||||||| ||| |||||||||||| || |||| |||||||||  |||  ||||| ||||||||| | |||||||||| || |||||||||     
T  41166053 tgaa--ttatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggcaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgt 41166150  T
Q  408 tgataattcatggcttg 424  Q
    |||| | ||||||||||    
T  41166151 tgatgaatcatggcttg 41166167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 26339403 - 26339327
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 145  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26339403 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatca 26339327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 7850259 - 7850089
Alignment:
Q  192 ataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatat 291  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||  | |||| ||| |||| ||| ||| |||||||| || |||  ||||||||||| ||||  |||| ||| |||    
T  7850259 ataattgctgttaaattcgtgctccaatggagatgttatgtttgaatgaatgtattgatgaaaactgtgtgattgttggtggaattgtatgtccaattat 7850160  T
Q  292 gtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtg-aattatgctacgtggttgatgaattgtgata 361  Q
    || ||||||  ||||| |||||||||||||||| || || |||| ||||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  7850159 gtgaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaagtgatgaaattttgctaagtgattgttgaattgagata 7850089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 424
Target Start/End: Original strand, 18238175 - 18238378
Alignment:
Q  222 tgatgatatatttgtatgcatga-attgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 319  Q
    ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||||  |||||    
T  18238175 tgatgatatgtttgaatacatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa--ttgtg 18238272  T
Q  320 ctc-aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcat 418  Q
    ||| ||||| |||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||| | ||||||| || |  || |||||| |||| ||||||    
T  18238273 ctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcat 18238372  T
Q  419 ggcttg 424  Q
     |||||    
T  18238373 agcttg 18238378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 441
Target Start/End: Original strand, 5682644 - 5682773
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||| | | | | | ||||||  |   |||| |||||||||||    
T  5682644 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattattggttgttgttgttttttattcatattgttgatgat 5682743  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
     ||  ||| |||| ||||||||||||||||    
T  5682744 gatatatgtcttgggtttgcatgattcatg 5682773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18169228 - 18169107
Alignment:
Q  194 aattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 291  Q
    |||||||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  18169228 aattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 18169129  T
Q  292 gtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  18169128 gtataaatgttaagttatgaaa 18169107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18248599 - 18248527
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 144  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18248599 ttaggagttaaagtgaagcttaagttaagattaatcatcatctaaggtaagggggttagttattatcataatc 18248527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 146
Target Start/End: Original strand, 15287119 - 15287194
Alignment:
Q  71 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15287119 cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 15287194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 146
Target Start/End: Original strand, 15294228 - 15294303
Alignment:
Q  71 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15294228 cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 15294303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 441
Target Start/End: Original strand, 19821940 - 19822014
Alignment:
Q  367 catgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||    
T  19821940 catgttcaattgatgttgttgttgctatgtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatg 19822014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 145
Target Start/End: Original strand, 22351938 - 22352012
Alignment:
Q  71 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 145  Q
    |||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22351938 cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatca 22352012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 427
Target Start/End: Original strand, 7964730 - 7964935
Alignment:
Q  222 tgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatg--ataagttgtgaaaattgt 318  Q
    ||||||||| |||| || |||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||  ||| ||||    |||| |    
T  7964730 tgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaagtatgtgaaagtgttatatgttg----aattat 7964825  T
Q  319 gctc-aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||| || || |||||| ||||| || |||| |||||| |||| ||  ||||| | ||||||| | |||||||||| || || |||||| |||| |||||    
T  7964826 gctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgattttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattca 7964925  T
Q  418 tggcttgagt 427  Q
    ||||||||||    
T  7964926 tggcttgagt 7964935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19020744 - 19020623
Alignment:
Q  194 aattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 291  Q
    |||| ||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  19020744 aattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 19020645  T
Q  292 gtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  19020644 gtataaatgttaagttatgaaa 19020623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 38764895 - 38764735
Alignment:
Q  264 ttgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgata 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||  |||||  |||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| | |||| ||||     
T  38764895 ttgttggtgaaattacatgttcatagtatgtgaaaatgttatattgtg--aattgtgctcaaattgttgaattatgcgatgttgttgttcaattatgatg 38764798  T
Q  362 agtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttg 424  Q
    ||  ||||| | ||||||| | ||||||| || |  || |||||| |||| ||||||||||||    
T  38764797 agaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaaggaatattgttgttgatgattcatggcttg 38764735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8374722 - 8374625
Alignment:
Q  238 tgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||| | ||||||| |||||||    
T  8374722 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgcttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattagtgaatt 8374625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8378567 - 8378493
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||  |||||| | | ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  8378567 ttaggagttaaagtgaagcttaagttaagattaaacatcatctaaggtaaggggattagttattatcataatcat 8378493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 14996519 - 14996445
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14996519 ttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttttaaggtaagggggttagttattatcataatcat 14996445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16523216 - 16523146
Alignment:
Q  76 gagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||| ||||||  ||||| | ||| ||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16523216 gagctaaagtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 16523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 19697236 - 19697310
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | ||||||| | | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  19697236 ttaggaggtaaagtgaagcctaagtgtgaattaatcataacctaaggtaagggggttagtgttcttcataatcat 19697310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 19707821 - 19707895
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | ||||||| | | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  19707821 ttaggaggtaaagtgaagcctaagtgtgaattaatcataacctaaggtaagggggttagtgttcttcataatcat 19707895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 95
Target Start/End: Original strand, 23269737 - 23269809
Alignment:
Q  23 caagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggag-tgagcttaggagctaaattgaagcctaag 95  Q
    |||||||  ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23269737 caagggtcagagagaagaggaacttgaagaatcaaggattggagttgagc-taggagcaaaattgaagcctaag 23269809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 146
Target Start/End: Original strand, 52265312 - 52265435
Alignment:
Q  24 aagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattgga-gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtt---gggattaatctttatctaaggt 119  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||  || ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |   | ||||||||  |  |||||||    
T  52265312 aagggttagagagaagaggaacttgaagaatcaaagattggaagagagct-aggagctaaattgaagcctaagctagggagattaatc--tgactaaggt 52265408  T
Q  120 aagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||  || |||||||||||    
T  52265409 aagggggttagaattcatcataatcat 52265435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 67)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 67 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 463122 - 462849
Alignment:
Q  67 tgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttca 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  463122 tgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttca 463023  T
Q  167 aatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattg 266  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  463022 aatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattg 462923  T
Q  267 ttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  462922 ttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgcta 462849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 14 - 356
Target Start/End: Original strand, 36982267 - 36982609
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    ||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  36982267 agagaagaaaaagggtt---gagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagctgaggagctaaattgaagcctaagttggtattagtctttatc 36982363  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgcatgaatttt-gctta-tggataattgttgctaaattca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  36982364 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 36982463  T
Q  211 tgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36982464 tgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 36982563  T
Q  311 aaaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattg 356  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | || |||| |||||||    
T  36982564 aaaattgtgctcaattggtgaattttgccaagttgttgttgaattg 36982609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 56 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8891639 - 8891353
Alignment:
Q  56 aaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt 155  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8891639 aaggattggagtgagcttaggaactaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaaaggggttagtctttatcataatcatcatcatttt 8891540  T
Q  156 gtaaattttcaaatgttgcatgaatttt-gctta-tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgat 253  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  8891539 gtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgat 8891440  T
Q  254 aattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8891439 aattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgcta 8891353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 33 - 380
Target Start/End: Original strand, 24341227 - 24341581
Alignment:
Q  33 agagaaggagaa-cttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagt 131  Q
    |||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24341227 agagaaggagaaacttgaagcatcaagaattggagtgagcttaggagctaaaatgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagt 24341326  T
Q  132 ctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgctta--tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgat 225  Q
    ||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| | ||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24341327 cttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaattcatgcttcaactgtgat 24341426  T
Q  226 gatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaat 325  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24341427 gatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaat 24341526  T
Q  326 tggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgat 380  Q
    ||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||    
T  24341527 tggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgat 24341581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 114 - 334
Target Start/End: Original strand, 20627238 - 20627459
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaa-ttttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcatg 212  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20627238 taaggtaacggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaaattttcaaatattgtatgaattatgattatggataattgttgttaaattcgtg 20627337  T
Q  213 ctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20627338 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaa 20627437  T
Q  313 aattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20627438 aattgtgctcaattggtgaatt 20627459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 114 - 356
Target Start/End: Original strand, 19794629 - 19794872
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaatttt-gctta-tggataattgttgctaaattcat 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| | ||||||| |    
T  19794629 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtaaattt-caaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtcgttaaattcgt 19794727  T
Q  212 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  19794728 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 19794827  T
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattg 356  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  19794828 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattg 19794872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 114 - 334
Target Start/End: Original strand, 43642881 - 43643103
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaatttt-gctta-tggataattgttgctaaattcat 211  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |    
T  43642881 taagggaaggaggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcatagtggataattgttgctaaatttgt 43642980  T
Q  212 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 311  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  43642981 gctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtga 43643080  T
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  43643081 aaattgtgctcaattggtgaatt 43643103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 60 - 433
Target Start/End: Original strand, 25265249 - 25265635
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattt--tgt 157  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||  ||     
T  25265249 attggggtaagcttaggagctaaagtgaagcctaggtttggattaatcattatctaatgtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgc 25265348  T
Q  158 aaattttcaaatgttgcatgaattttgctt-----------atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaat 246  Q
    || || |||  ||||| |||||| | | ||           |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  25265349 aatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaat 25265448  T
Q  247 tgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggt 346  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  25265449 tgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgt 25265548  T
Q  347 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcat 433  Q
    || |||||| |||| ||   |||| ||||||||| | ||||||| ||  | ||||||||| | || | |||||||||| || |||||    
T  25265549 tgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcat 25265635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22863364 - 22863170
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    ||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22863364 agagaagaaaaagggtt---gagaaggagaacttgaagaatcaaggattggggtgagcttaggagctaaattgcagcctaagttgggattaatctttatc 22863268  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaa-ttttgc-ttatggataattgttgctaaattc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22863267 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattc 22863170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 66 - 334
Target Start/End: Original strand, 17396519 - 17396798
Alignment:
Q  66 gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatt--ttgtaaattt 163  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  ||| || |||    
T  17396519 gtgagcttaggagctaaattaaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttaccataatcatgttcattctttgcaatttt 17396618  T
Q  164 tcaaatgttgcatgaatt---ttg-ctt------atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgat 253  Q
    |||    ||| ||||| |   ||| | |      |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  17396619 tcatgatttgtatgaaatgggttgacatgaatgaatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgat 17396717  T
Q  254 aattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  17396718 gattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatt 17396798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23820465 - 23820202
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatt--ttgtaaattttca 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| || ||||||    
T  23820465 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttca 23820366  T
Q  167 aatgttgcatgaattttgctta----------tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataat 256  Q
        ||| ||||| |  | | |          ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  23820365 tgatttggatgaaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataat 23820266  T
Q  257 tgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23820265 tgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 23820202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Original strand, 14906309 - 14906572
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatt--ttgtaaattttca 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| || ||||||    
T  14906309 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttca 14906408  T
Q  167 aatgttgcatgaattttgctta----------tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataat 256  Q
        ||| ||||| |  | | |          ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  14906409 tgatttggatgaaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataat 14906508  T
Q  257 tgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14906509 tgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 14906572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Original strand, 19689270 - 19689533
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatt--ttgtaaattttca 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| || ||||||    
T  19689270 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttca 19689369  T
Q  167 aatgttgcatgaattttgctta----------tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataat 256  Q
        ||| ||||| |  | | |          ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19689370 tgatttgtatgaaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataat 19689469  T
Q  257 tgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19689470 tgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 19689533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Original strand, 9652699 - 9652828
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  9652699 agagaagaataagggttagagagaag---aacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaaacctaagttgggattaatcttcatc 9652795  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652796 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9652828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 25602156 - 25602033
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  25602156 tgctcaattggtgagttatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgtttatgataaatca 25602057  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||  ||||||||||||||||    
T  25602056 tggcttaggtttgcatgattcatg 25602033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 28974181 - 28974058
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28974181 tgctcatttggcgaattatgctatgttgttgatgaattgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattca 28974082  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  28974081 tggcttgggtttgcatgattcatg 28974058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 271302 - 271179
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  271302 tgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattca 271203  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    | ||||| ||||||||||||||||    
T  271202 tagcttgggtttgcatgattcatg 271179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 71 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20015403 - 20015142
Alignment:
Q  71 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatt--ttgtaaattttcaaa 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  ||| || ||||||      
T  20015403 cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcatgatcatgttcattctttgcaatttttcatg 20015304  T
Q  169 tgttgcatgaattttgctta----------tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattg 258  Q
      ||  ||||| || | | |          ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  20015303 atttagatgaaattggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattg 20015204  T
Q  259 taagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20015203 tgtgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 20015142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 334
Target Start/End: Original strand, 7507848 - 7507990
Alignment:
Q  192 ataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatat 291  Q
    |||||| ||||||||||| |||||    ||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7507848 ataattattgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatat 7507947  T
Q  292 gtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7507948 gtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaatt 7507990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 321 - 441
Target Start/End: Original strand, 4448251 - 4448371
Alignment:
Q  321 tcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatgg 420  Q
    ||||||||||||| |||||  || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4448251 tcaattggtgaatgatgctttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgg 4448350  T
Q  421 cttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  4448351 cttgggtttgcatgattcatg 4448371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 32465990 - 32465867
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  32465990 tgctcaattggtgaattatgcattgttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattca 32465891  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  32465890 tggcttgggtttgcatgattcatg 32465867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 357 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 27261899 - 27261815
Alignment:
Q  357 tgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27261899 tgataagtttcatgatcaattgatattgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 27261815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 318 - 438
Target Start/End: Original strand, 36890800 - 36890920
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| || ||||||| |||||| |||||    
T  36890800 tgcttaattggtgaattatgctatgttgttgataaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattca 36890899  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattc 438  Q
    ||||||| || ||||||||||    
T  36890900 tggcttgggtatgcatgattc 36890920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 200 - 334
Target Start/End: Original strand, 19886661 - 19886795
Alignment:
Q  200 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 299  Q
    |||||||||| |||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  19886661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 19886760  T
Q  300 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||    
T  19886761 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 19886795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Original strand, 21273901 - 21273980
Alignment:
Q  66 gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21273901 gtgagcttatgagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaa-ggggttagtctttatcataatcat 21273980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 307 - 438
Target Start/End: Original strand, 23836809 - 23836940
Alignment:
Q  307 tgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttg 406  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||| |  ||||| ||||||    
T  23836809 tgtgaaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcattttgttg 23836908  T
Q  407 atgataattcatggcttgagtttgcatgattc 438  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  23836909 atgataattcatgacttgggtttgcataattc 23836940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 22579976 - 22580097
Alignment:
Q  318 tgctcaattggt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattc 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  22579976 tgctcaattggttgaattatgct---ttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgctgctgatatgtgatgttgttgatgataattc 22580072  T
Q  417 atggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||||| || |||||||||||||    
T  22580073 atggcttgggtatgcatgattcatg 22580097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 32466281 - 32466177
Alignment:
Q  39 ggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatc 138  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  32466281 ggagaacttgaagaaccaagaattgg-gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttgggttgatccttatctaaggtaa-ggggttagtcttcatc 32466184  T
Q  139 ataatca 145  Q
    |||||||    
T  32466183 ataatca 32466177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 318 - 438
Target Start/End: Original strand, 25876034 - 25876154
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| | ||||||||||| || | | ||| ||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  25876034 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgcttcatgatcaaatgttgttgttattgtttagtcatgttgttgatgataattca 25876133  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattc 438  Q
    ||||||| |||||||| ||||    
T  25876134 tggcttgggtttgcataattc 25876154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12728776 - 12728529
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaa 168  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  |    
T  12728776 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctca 12728677  T
Q  169 tgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 267  Q
    ||||| |||||  | | || ||| | |||||||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  12728676 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgt 12728577  T
Q  268 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  12728576 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 12728529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 34824859 - 34824612
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaa 168  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  |    
T  34824859 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctca 34824760  T
Q  169 tgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 267  Q
    ||||| |||||  | | || ||| | |||||||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  34824759 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgt 34824660  T
Q  268 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  34824659 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 34824612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 33128446 - 33128372
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33128446 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 33128372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 68238 - 68001
Alignment:
Q  205 aattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgat 302  Q
    ||||| |||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||    
T  68238 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgat 68139  T
Q  303 aagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgt 401  Q
    |  |  |||||  | ||||||| ||| |||||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||| | |||||||||| || || |    
T  68138 atatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatat 68041  T
Q  402 tgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||| || | |||||||||||| || | ||| |||||||    
T  68040 tgttgttggtgattcatggcttgcgtgttcataattcatg 68001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 8944230 - 8943983
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaa 168  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  |    
T  8944230 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctca 8944131  T
Q  169 tgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 267  Q
    ||||| |||||  | | || ||| | |||||||||||||||| |||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   ||||    
T  8944130 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatatttgt 8944031  T
Q  268 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  8944030 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 8943983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 313
Target Start/End: Original strand, 12635740 - 12635987
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaa 168  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  |||| |  |    
T  12635740 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcatttcctca 12635839  T
Q  169 tgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 267  Q
    ||||| |||||  | | || ||| | |||||||||||||||| |||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  12635840 tgttgtatgaaaataggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgt 12635939  T
Q  268 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  12635940 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 12635987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 318 - 419
Target Start/End: Original strand, 24571406 - 24571508
Alignment:
Q  318 tgctcaattggt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattc 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||| || || |||||||||||||||| ||    
T  24571406 tgctcaattggttgaattatgctatgtttttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgatgataactc 24571505  T
Q  417 atg 419  Q
    |||    
T  24571506 atg 24571508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 28031092 - 28031166
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28031092 ttaggagttaaagtgaagcctaagtttgaattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 28031166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 146
Target Start/End: Original strand, 12641514 - 12641591
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12641514 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcatctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 12641591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 440
Target Start/End: Original strand, 9653021 - 9653141
Alignment:
Q  320 ctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatg 419  Q
    |||||||||||||||||||   || |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||| | | ||||| || || ||||| | |||| |||||||||    
T  9653021 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgcgatatttttcatgatcaatagatgttgatgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatg 9653120  T
Q  420 gcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||| || ||||||||||||    
T  9653121 gcttgggtatgcatgattcat 9653141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16935986 - 16935730
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaa 159  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||    |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |      
T  16935986 attggggtaagcttaggagctgaattgaagaaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgc 16935887  T
Q  160 attttcaaatgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattg 258  Q
    ||||||  |||||| |||||  | | || ||| | |||||||| |||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |    
T  16935886 attttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgg 16935787  T
Q  259 taagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    || | ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  16935786 tatgtttgtgcgtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 16935730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17006646 - 17006390
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaa 159  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||    |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |      
T  17006646 attggggtaagcttaggagctgaattgaagaaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgc 17006547  T
Q  160 attttcaaatgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattg 258  Q
    ||||||  |||||| |||||  | | || ||| | |||||||| |||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |    
T  17006546 attttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgg 17006447  T
Q  259 taagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    || | ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  17006446 tatgtttgtgcgtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 17006390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 424
Target Start/End: Original strand, 21274174 - 21274278
Alignment:
Q  320 ctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatg 419  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| | |||| |||||||||    
T  21274174 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtaatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatg 21274273  T
Q  420 gcttg 424  Q
    |||||    
T  21274274 gcttg 21274278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 6879567 - 6879458
Alignment:
Q  320 ctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatg 419  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||| | | ||||||  |  |||||||||||||||||||| ||||    
T  6879567 ctcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgatatgtttaatgatcaattgttgttgttgttatttagtcatgttgttgatgataatacatg 6879468  T
Q  420 gcttgagttt 429  Q
     |||| ||||    
T  6879467 tcttgggttt 6879458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 22274860 - 22274732
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||  |||||||||||||| | | | |||| || |  ||||| |||||||||||    
T  22274860 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatgat 22274761  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
     ||  |||||||| | ||||||||||||||    
T  22274760 gatagatggcttg-ggttgcatgattcatg 22274732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23774520 - 23774444
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 145  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23774520 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatca 23774444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 17204733 - 17204659
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| | | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17204733 ttaggagttaaagtgaagtctaagtttggattaatcataacctaaagtaagggggttagtcttcatcataatcat 17204659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 146
Target Start/End: Original strand, 3798475 - 3798552
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||| |||||||||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3798475 agcttatgagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 3798552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 19666775 - 19666537
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 301  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| |   || |||||||| || |||||||||| |||||| || ||     
T  19666775 aaattcatgctctaactataatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgtttttggtgaatttgcatgttcaaagtatgtataagtgt 19666676  T
Q  302 taagttgtgaaaattgtgctcaattggt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatg 400  Q
    ||| || ||||  || ||||||| |||| ||||||||||| || |||  |||||| |||| ||   |||| ||||||||| | |||||||||| || ||     
T  19666675 taacttatgaa--ttatgctcaaatggttgaattatgctatgttgttattgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 19666578  T
Q  401 ttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||| | |||| |||||||||||| || | ||| |||||||    
T  19666577 ttgtcgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatg 19666537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 441
Target Start/End: Original strand, 19669109 - 19669347
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc-aaatatgtaaaaatga 301  Q
    |||| ||||||| |||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||| ||||||| || |||||  || ||     
T  19669109 aaatccatgctctaactatggtgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttgttggtgaaattgcatgttctaagtatgtgtaagtgt 19669208  T
Q  302 taagttgtgaaaattgtgctcaattgg-tgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatg 400  Q
    ||| |||||  |||  |||| |||||| ||||||||| || || |||| |||||| ||||  |   |||| ||||||||| | |||||||||| || |||    
T  19669209 taacttgtg--aatcatgcttaattggttgaattatgatatgttgttgttgaattatgatgtgaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatg 19669306  T
Q  401 ttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    || ||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||    
T  19669307 ttattgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatg 19669347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 21142276 - 21142203
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||| | | |||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  21142276 ttaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatca 21142203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 22284093 - 22283965
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||  |||||||||||||| | | |  ||| || |  ||| | |||||||||||    
T  22284093 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatcgttgtttttgatgtttagtcttattgttgatgat 22283994  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
     || ||||||||| | ||||||||||||||    
T  22283993 gatacatggcttg-ggttgcatgattcatg 22283965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 441
Target Start/End: Original strand, 3403 - 3479
Alignment:
Q  365 ttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| || | ||| |||||||    
T  3403 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattcatg 3479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 441
Target Start/End: Original strand, 24294685 - 24294761
Alignment:
Q  365 ttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  24294685 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgttgatgatgattcatggcttgagtattcataattcatg 24294761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 24884926 - 24884743
Alignment:
Q  211 tgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttg 308  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||  |||    
T  24884926 tgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatggaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgatatattg 24884827  T
Q  309 tgaaaattgtgctc-aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgcta 393  Q
    ||  | || ||||| || || |||||| ||||| ||  ||| ||||||||||| || |||||| | ||||||| | ||||||||||    
T  24884826 tg--agttatgctctaaatgttgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgcta 24884743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 421
Target Start/End: Original strand, 31146301 - 31146398
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggc 421  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||| || ||||||||| |   |||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  31146301 aattgttgaattatgctatgtg-ttgttgaattgtaataagattcctgttcaattgatgttactgttgctaagtgatgttgttgatgataaatcatggc 31146398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 43646020 - 43645902
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 422  Q
    ||||| |||||||||||| || |||| |||| |||| ||||  ||||| ||||||||| | |||||||||| || |||||||||  ||| ||||||| ||    
T  43646020 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaactgtggtaagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgtcgatgattcatgact 43645921  T
Q  423 tgagtttgcatgattcatg 441  Q
    || || | ||| |||||||    
T  43645920 tgggtgttcataattcatg 43645902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 145
Target Start/End: Original strand, 5888505 - 5888578
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 145  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  |||||| | | |||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  5888505 ttaggagctaaagtgaagcttaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatca 5888578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Original strand, 23778043 - 23778164
Alignment:
Q  194 aattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 291  Q
    |||| ||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| || ||| | |||| | |||||||||||| |||||| |||    
T  23778043 aattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtat 23778142  T
Q  292 gtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  23778143 gtataaatgttaagttatgaaa 23778164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 9636974 - 9636805
Alignment:
Q  222 tgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 319  Q
    ||||||||| |||| || |||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||||  || ||    
T  9636974 tgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa--ttatg 9636877  T
Q  320 ctc-aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttg 390  Q
    ||| ||||| |||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||| | |||||||    
T  9636876 ctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 9636805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 22284310 - 22284278
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284310 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22284278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 25213403 - 25213372
Alignment:
Q  115 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213403 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25213372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 441
Target Start/End: Original strand, 19433452 - 19433570
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 422  Q
    ||||| |||||||||||| || |||  ||||||||  ||||  ||||| ||||||||| | |||||||||| |  || |||||| |||| ||||||||||    
T  19433452 aattgttgaattatgctatgttgttattgaattgttgtaagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggct 19433551  T
Q  423 tgagtttgcatgattcatg 441  Q
    || || | ||| |||||||    
T  19433552 tgggtgttcataattcatg 19433570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 313
Target Start/End: Original strand, 42177874 - 42178088
Alignment:
Q  102 ttaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgctt-atggataattgtt 200  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  |||||| |||||  | | || ||| | |||||||    
T  42177874 ttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtt 42177973  T
Q  201 gctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaa 298  Q
    ||||||||| |||||    ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | || | |||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  42177974 gctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaa 42178073  T
Q  299 tgataagttgtgaaa 313  Q
    || |||||| |||||    
T  42178074 tgttaagttatgaaa 42178088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 313
Target Start/End: Original strand, 3798645 - 3798722
Alignment:
Q  238 tgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  3798645 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 3798722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 146
Target Start/End: Original strand, 7507756 - 7507789
Alignment:
Q  113 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7507756 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 7507789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 365 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 722480 - 722404
Alignment:
Q  365 ttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||| ||||||||  | |||| ||||| || ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  722480 ttcatgttcaattgaagtagttgctgctaagtgatgttgttattgataattcatggcttgggtgtgcataattcatg 722404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 22275077 - 22275045
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22275077 taaggtaagggggttagcctttatcataatcat 22275045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 14 - 389
Target Start/End: Original strand, 89281 - 89655
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  89281 agagaagaacaagggtt---gagaaggagaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagttaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 89377  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaatttt-gctta-tggataattgttgctaaattcat 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |    
T  89378 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttctatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 89477  T
Q  212 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||    
T  89478 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtga 89577  T
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgtt 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || |||| | |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  89578 aaattgtgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttaaattgtgataagtttcatgaacaattgatgttgttgtt 89655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 107611 - 107835
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107611 agagaagaacaagtgtt---gagaaggagaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagttaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 107707  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaa-ttttgc-ttatggataattgttgctaaattcat 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||| |    
T  107708 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataatttttgctaaattcgt 107807  T
Q  212 gctccaactgtgatgatatatttgtatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  107808 gctccaactgtgatgatatatttgtatg 107835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 130911 - 130880
Alignment:
Q  115 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130911 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 130880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 84)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16212205 - 16211877
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   ||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16212205 agagaagaacaagggttagagagaagagggagagtttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttc 16212107  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  16212106 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggacaattgttgctaaattcg 16212007  T
Q  211 tgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16212006 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 16211907  T
Q  311 aaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16211906 aaaattgtgctcaattggtgaattttgcta 16211877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 34 - 340
Target Start/End: Original strand, 13036858 - 13037166
Alignment:
Q  34 gagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtct 133  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13036858 gagaaggagaacttgaagaatcaaggattggagtaagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtct 13036957  T
Q  134 ttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaa-ttttgc-ttatggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatata 231  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  13036958 tcaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatg 13037057  T
Q  232 tttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13037058 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 13037157  T
Q  332 attatgcta 340  Q
    ||| |||||    
T  13037158 attttgcta 13037166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 11580564 - 11580891
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    ||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11580564 agagaagaaaaagggtt---gagaaggagaacttgaagaatcaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttaatc 11580660  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgcatgaatttt--gctta-tggataattgttgctaaattc 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  || || ||||||||| |||||||||||    
T  11580661 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttttgcataatggataattattgctaaattc 11580760  T
Q  210 atgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgt 309  Q
     ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  11580761 gtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgt 11580860  T
Q  310 gaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11580861 gaaaattgtgctcaattggtgaattttgcta 11580891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36053105 - 36052775
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||   |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36053105 agagaagaacaatggttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttt 36053007  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgctt--atggataattgttgctaaatt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||  |   |||||||||||||||||||||    
T  36053006 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattgttgctaaatt 36052907  T
Q  209 catgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttg 308  Q
     || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36052906 tatactccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttg 36052807  T
Q  309 tgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36052806 tgaaaattgtgctcaattggtgaattttgcta 36052775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 115 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3060302 - 3060083
Alignment:
Q  115 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcatgct 214  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3060302 aaggtaagggggtaagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttatatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgct 3060203  T
Q  215 ccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 314  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3060202 ccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaa 3060103  T
Q  315 ttgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    || ||||||| |||||||||    
T  3060102 ttatgctcaaatggtgaatt 3060083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 72 - 356
Target Start/End: Original strand, 47480902 - 47481199
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattt--tgtaaattttcaaat 169  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||  || || || |||  |    
T  47480902 ttaggaggtaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatattcatttattgcaatttctcattt 47481001  T
Q  170 gttgcatgaattttgctt-----------atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattg 258  Q
    |||| |||||| | | ||           |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47481002 gttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 47481101  T
Q  259 taagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattg 356  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  47481102 tatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattg 47481199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 194 - 340
Target Start/End: Original strand, 18253841 - 18253987
Alignment:
Q  194 aattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 293  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18253841 aattgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgt 18253940  T
Q  294 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18253941 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgcta 18253987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13321420 - 13321033
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattt--tgt 157  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||  ||     
T  13321420 attggggtaagcttaggagctaaagtgaagcctaggtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgc 13321321  T
Q  158 aaattttcaaatgttgcatgaattttgctta-----------tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaat 246  Q
    || || |||  ||||| |||||| | | ||            ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13321320 aatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataagtggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 13321221  T
Q  247 tgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgctacg-t 343  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  13321220 tgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatg-aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt 13321122  T
Q  344 ggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgca 432  Q
    | ||| ||||||| |||| | |||||| ||||||||| |  |||||| ||  | ||||||||| |||| | ||||| |||| |||||||    
T  13321121 gattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgca 13321033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 11516621 - 11516358
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatt--ttgtaaattttca 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| || ||||||    
T  11516621 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttca 11516522  T
Q  167 aatgttgcatgaattttgctta----------tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataat 256  Q
        ||| ||||| |  | | |          ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  11516521 tgatttggatgaaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataat 11516422  T
Q  257 tgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11516421 tgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 11516358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Original strand, 15441433 - 15441696
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatt--ttgtaaattttca 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| || ||||||    
T  15441433 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttca 15441532  T
Q  167 aatgttgcatgaattttgctta----------tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataat 256  Q
        ||| ||||| |  | | |          ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15441533 tgatttggatgaaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataat 15441632  T
Q  257 tgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15441633 tgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 15441696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Original strand, 30261998 - 30262261
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatt--ttgtaaattttca 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| || ||||||    
T  30261998 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttca 30262097  T
Q  167 aatgttgcatgaattttgctta----------tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataat 256  Q
        ||| ||||| |  | | |          ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  30262098 tgatttgtatgaaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataat 30262197  T
Q  257 tgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30262198 tgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 30262261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 218 - 334
Target Start/End: Original strand, 16478980 - 16479096
Alignment:
Q  218 actgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattg 317  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16478980 actgcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattg 16479079  T
Q  318 tgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||||||||||||    
T  16479080 tgctcaattggtgaatt 16479096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 69 - 334
Target Start/End: Original strand, 25292207 - 25292484
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatt--ttgtaaattttca 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||  ||| || ||||||    
T  25292207 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagataagggggttagtctttatcataatcaagttcattctttgcaatttttca 25292306  T
Q  167 aatgttgcatgaattttgctta----------tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataat 256  Q
    |   ||| ||||| |  | | |          ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||    
T  25292307 agatttgtatgaaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgat 25292406  T
Q  257 tgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  25292407 tgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgctcaattggtgaatt 25292484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 3050040 - 3049905
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3050040 agagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaattaaggattggagtgaacttaagagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 3049941  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3049940 atctaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3049905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 7293410 - 7293147
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatt--ttgtaaattttca 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| || ||||||    
T  7293410 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttca 7293311  T
Q  167 aatgttgcatgaattttgctta----------tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataat 256  Q
        ||| ||||| |  | | |          ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  7293310 tgatttgtatgaaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataat 7293211  T
Q  257 tgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7293210 tgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 7293147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 11287549 - 11287426
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11287549 tgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattca 11287450  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  11287449 tggcttgggtttgcatgattcatg 11287426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2029373 - 2029244
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2029373 agagaagagcaagggttagagagaag---aacttgaagaattaaaaattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttggaattaatctttatc 2029277  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029276 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2029244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 7284175 - 7284298
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||| |||||||||||||| ||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7284175 tgcttaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgataataattca 7284274  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  7284275 tggcttgagtttgcatgattcatg 7284298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 219 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13572909 - 13572794
Alignment:
Q  219 ctgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 318  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13572909 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgt 13572810  T
Q  319 gctcaattggtgaatt 334  Q
    ||||||||||||||||    
T  13572809 gctcaattggtgaatt 13572794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 15822546 - 15822669
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  15822546 tgctcaaatggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattca 15822645  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  15822646 tggcttgggtttgcatgattcatg 15822669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 200 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10989661 - 10989527
Alignment:
Q  200 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 299  Q
    |||||||||| |||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10989661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 10989562  T
Q  300 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  10989561 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatt 10989527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 334
Target Start/End: Original strand, 13911044 - 13911158
Alignment:
Q  220 tgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 319  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||    
T  13911044 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatg 13911143  T
Q  320 ctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||||||||||    
T  13911144 ctcaattggtgaatt 13911158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2437715 - 2437575
Alignment:
Q  194 aattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 293  Q
    |||| ||||||||||| |||||    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  2437715 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgc 2437616  T
Q  294 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  2437615 aaaaatgataagttatgaagattgtgttcaattggtgaatt 2437575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Original strand, 42056140 - 42056220
Alignment:
Q  66 gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056140 gtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 42056220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 26070379 - 26070502
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||| |||||| |||||    
T  26070379 tgcttaattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattca 26070478  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  26070479 tggcttgggtatgcatgattcatg 26070502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 26094166 - 26094289
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||| |||||| |||||    
T  26094166 tgcttaattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattca 26094265  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  26094266 tggcttgggtatgcatgattcatg 26094289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 25124584 - 25124450
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    |||||||||||||| || ||||||||   |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||    
T  25124584 agagaagaacaaggattagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagtttagattaatcatt 25124486  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25124485 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 25124450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 3049721 - 3049593
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| | |||| |    
T  3049721 aaattatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgtt 3049622  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3049621 aattcatggcttgggtatgcatgattcat 3049593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15709583 - 15709407
Alignment:
Q  33 agagaaggagaa-cttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagt 131  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| | |||||||||||| || |||||    
T  15709583 agagaaggagaaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagaggattagt 15709484  T
Q  132 ctttatcataatcatcatc----attttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgctta--tggataattgttgc 202  Q
    ||| |||||||||||||||    |||||| || ||||||||||| | ||||||||| | ||  ||||||||||||||    
T  15709483 cttcatcataatcatcatcatcaattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgc 15709407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 36024556 - 36024372
Alignment:
Q  43 aacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaaggggg-ttagtctttatcata 141  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  36024556 aacttgaagaatcaagaattggagtgagcttatgagctaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaaggggggttagtcttcatcata 36024457  T
Q  142 atcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgctta--tggataattgttgctaaattcatgctccaact 220  Q
    |||||||||||    |||  || ||||||||||| | ||||||||| | ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  36024456 atcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgtttctaaattcgtgctccaact 36024372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 318 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 12759119 - 12759000
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  12759119 tgctcaattggtgaattatgctatgttgttggtgaattatgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttggtgataattca 12759020  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgatt 437  Q
    ||||||| ||||||| ||||    
T  12759019 tggcttgggtttgcaggatt 12759000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 318 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 3895157 - 3895035
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| | |||| |||||||    
T  3895157 tgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattca 3895058  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||| || ||||||||||||    
T  3895057 tggcttgggtatgcatgattcat 3895035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 335 - 441
Target Start/End: Original strand, 45452298 - 45452404
Alignment:
Q  335 atgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatg 434  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  45452298 atgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgtcgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggttggcatg 45452397  T
Q  435 attcatg 441  Q
    |||||||    
T  45452398 attcatg 45452404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 13274920 - 13274796
Alignment:
Q  318 tgctcaattggt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattc 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  13274920 tgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattc 13274821  T
Q  417 atggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||||  || |||||||||||||    
T  13274820 atggctttggtatgcatgattcatg 13274796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 16570120 - 16570244
Alignment:
Q  318 tgctcaattggt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattc 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||| || |||||||||||    
T  16570120 tgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtcgtggatgataattc 16570219  T
Q  417 atggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||||| || |||||||||||||    
T  16570220 atggcttgggtatgcatgattcatg 16570244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 16595542 - 16595418
Alignment:
Q  318 tgctcaattggt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattc 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||| || |||||||||||    
T  16595542 tgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtcgtggatgataattc 16595443  T
Q  417 atggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||||| || |||||||||||||    
T  16595442 atggcttgggtatgcatgattcatg 16595418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 49047788 - 49047912
Alignment:
Q  318 tgctcaattggt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattc 416  Q
    |||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  49047788 tgctcaattggttgaattatgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgctgataattc 49047887  T
Q  417 atggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||||| || |||||||||||||    
T  49047888 atggcttgggtatgcatgattcatg 49047912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 316
Target Start/End: Original strand, 295849 - 296094
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatcta-aggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 170  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||||||| |  |||||||||      
T  295849 ttaggagctaaattgaagtacaagttgggattaatctttg-ctagaggtaagggggtttgtcttcaacataattctcatcatttt-tgcattttcaaact 295946  T
Q  171 ttgcatgaa-ttttgctta-tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtt 268  Q
    ||| ||||| |||||| || || |||||||||||||||||| || || || || | || ||| ||||| ||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  295947 ttgtatgaaattttgcataatgaataattgttgctaaattcgtgttctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgtt 296046  T
Q  269 ggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatt 316  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  296047 ggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttataaaaatt 296094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Original strand, 39046740 - 39046858
Alignment:
Q  320 ctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatg 419  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  39046740 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 39046839  T
Q  420 gcttgagtttgcatgattc 438  Q
    ||||| |||||||| ||||    
T  39046840 gcttgggtttgcataattc 39046858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Original strand, 2190037 - 2190117
Alignment:
Q  66 gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  2190037 gtgagcttaggagttaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaaggcggttagtttttatcataatcat 2190117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 47289913 - 47289791
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |   |||| || || ||||||||| |||||||||||||    
T  47289913 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgctgttgctgttaagtcatgttgatgatgataattca 47289814  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| | ||||||||||||||    
T  47289813 tggcttgtg-ttgcatgattcatg 47289791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 12248235 - 12248359
Alignment:
Q  318 tgctcaattggt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattc 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  12248235 tgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgataatgc 12248334  T
Q  417 atggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||| |||| || |||||||||||||    
T  12248335 atgacttgggtatgcatgattcatg 12248359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Original strand, 17817258 - 17817363
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17817258 agagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttacgagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttc 17817356  T
Q  111 atctaag 117  Q
    |||||||    
T  17817357 atctaag 17817363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 19049743 - 19049638
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19049743 agagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttacgagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttc 19049645  T
Q  111 atctaag 117  Q
    |||||||    
T  19049644 atctaag 19049638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 312 - 439
Target Start/End: Original strand, 111386 - 111513
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||| |  ||||| | |||||||||    
T  111386 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgat 111485  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattca 439  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||    
T  111486 aattcatggcttgggtatgcatgattca 111513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 312 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 126553 - 126424
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||| |  |||||  ||||||||||    
T  126553 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatactgttgatgat 126454  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  126453 gatacatggcttgggtttgcatgattcatg 126424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 143771 - 143655
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||      ||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  143771 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaatt------gttgttgttaagtcatgttgttaatgataattca 143678  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| | |||||| |||||||    
T  143677 tggcttg-ggttgcataattcatg 143655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Original strand, 2190303 - 2190431
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||| || || ||||| | |||| |    
T  2190303 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgatgttgttaagtgatgttatggatgct 2190402  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  2190403 aattcatggcttgggtatgcatgattcat 2190431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 13377775 - 13377555
Alignment:
Q  205 aattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgat 302  Q
    ||||| |||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||    
T  13377775 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgat 13377676  T
Q  303 aagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgt 401  Q
    |  |  ||||  || | ||||| ||| | |||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||| || ||||    
T  13377675 atatgttgaa--ttatactcaaattgattaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgt 13377578  T
Q  402 tgttgatgataattcatggcttg 424  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  13377577 tgttgatgatgattcatggcttg 13377555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 146
Target Start/End: Original strand, 14113858 - 14113935
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113858 agcttagaagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14113935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 2029059 - 2028931
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||| || || ||||| | |||| |    
T  2029059 aaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtcgttgttaagtgatgttatggatgct 2028960  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||    
T  2028959 aattcatgacttgggtatgcatgattcat 2028931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Original strand, 32494163 - 32494291
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | | | ||||||| |  ||||| |  ||||||||    
T  32494163 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatgattgatgat 32494262  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  32494263 aattcatggcttgtgtatgcatgattcat 32494291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 12369955 - 12370078
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||| || |||||||  || || |||||    
T  12369955 tgctcaattggtgaattatgccttgttgttgttgaattgtgataactttcatgattaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtgcataattattca 12370054  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||  || |||||||||||||    
T  12370055 tggcttaggtatgcatgattcatg 12370078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 313 - 440
Target Start/End: Original strand, 42056407 - 42056534
Alignment:
Q  313 aattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgata 412  Q
    |||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| || || || || |  ||| ||    
T  42056407 aattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatattatgaatgcta 42056506  T
Q  413 attcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||    
T  42056507 attcatggcttgggtatgcatgattcat 42056534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 313
Target Start/End: Original strand, 18979895 - 18980140
Alignment:
Q  71 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 170  Q
    |||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  |||    
T  18979895 cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 18979994  T
Q  171 ttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttg 269  Q
    ||| |||||  | | || ||| | |||||||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |    
T  18979995 ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgg 18980094  T
Q  270 gtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  18980095 gtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 18980140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 146
Target Start/End: Original strand, 14423509 - 14423585
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14423509 agcttagaagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtc-ttatcataatcat 14423585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 424
Target Start/End: Original strand, 16914928 - 16915149
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatg- 300  Q
    |||||| ||||| || | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||     
T  16914928 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgt 16915027  T
Q  301 -ataagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtca 398  Q
     ||| ||||    |||| ||||| ||  | |||||| ||||| || |||| |||||| |||| || |||||| ||||||||| | |||||||||| ||||    
T  16915028 tatatgttg----aattatgctctaaacgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtca 16915123  T
Q  399 tgttgttgatgataattcatggcttg 424  Q
    | |||||| |||| ||||||||||||    
T  16915124 tattgttgttgatgattcatggcttg 16915149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 318 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 35094948 - 35094829
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| | | |||||||||||||| | |   ||||||| |  ||||||||||||||||||| |||    
T  35094948 tgctcaattggtgaattatgcactgttgttgatgaattgttaaatgtttcatgatcaat-gttgctgttgttgtttagtcatgttgttgatgataaatca 35094850  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattc 438  Q
    ||||||| |||||||| ||||    
T  35094849 tggcttgggtttgcataattc 35094829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 44865362 - 44865237
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaa---ttgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataat 414  Q
    |||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| | | ||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  44865362 tgctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaattgttgttgttgttgttgttaagtcatgtagtttatgataat 44865263  T
Q  415 tcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||    
T  44865262 tcatggcttg-ggttgcataattcatg 44865237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13758754 - 13758507
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaa 168  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  |    
T  13758754 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctca 13758655  T
Q  169 tgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 267  Q
    ||||| |||||  | | || ||| | |||||| ||||||||| |||||    ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  13758654 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgt 13758555  T
Q  268 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  13758554 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 13758507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 313
Target Start/End: Original strand, 15950667 - 15950910
Alignment:
Q  73 taggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgtt 172  Q
    |||||||| |||||||||   |||| || ||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  |||||    
T  15950667 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 15950766  T
Q  173 gcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggt 271  Q
    | |||||  | | || ||| | |||||||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||    
T  15950767 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 15950866  T
Q  272 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  15950867 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 15950910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 323 - 441
Target Start/End: Original strand, 17224058 - 17224176
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 422  Q
    ||||| |||||||||||| || |||| ||||||||  ||||  ||||| ||||||||| | |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  17224058 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgttgtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttaatgatgattcatggct 17224157  T
Q  423 tgagtttgcatgattcatg 441  Q
    || || | ||| |||||||    
T  17224158 tgggtattcataattcatg 17224176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 288
Target Start/End: Original strand, 48622664 - 48622758
Alignment:
Q  194 aattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 288  Q
    ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  48622664 aattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttcaaa 48622758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 145
Target Start/End: Original strand, 10000245 - 10000318
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||| | | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10000245 ttaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatca 10000318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15927950 - 15927705
Alignment:
Q  71 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 170  Q
    |||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  |||    
T  15927950 cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 15927851  T
Q  171 ttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttg 269  Q
    ||| |||||  | | || |||   |||||||||||||||| |||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |    
T  15927850 ttgtatgaaaatggattgatgatcaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgcttgtgg 15927751  T
Q  270 gtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  15927750 gtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 15927705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 313
Target Start/End: Original strand, 15759977 - 15760233
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaa 159  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||   |||| |  ||||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||||||||  ||| ||| |      
T  15759977 attggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgtgttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgc 15760076  T
Q  160 attttcaaatgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattg 258  Q
    ||||||  |||||| |||||  | | || ||| | |||| ||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| ||      
T  15760077 attttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatga 15760176  T
Q  259 taagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    || | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  15760177 tatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 15760233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 371491 - 371417
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| | ||| ||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  371491 ttaggagctaaagtgaagcccaagtttgaattgatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 371417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 9839126 - 9838905
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatg- 300  Q
    |||||| ||||| || | ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||     
T  9839126 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgt 9839027  T
Q  301 -ataagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtca 398  Q
     ||| ||||    |||| ||||| || || |||||| ||||| || |||| |||||| |||| || |||||| ||||||||| | |||||||||| || |    
T  9839026 tatatgttg----aattatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtga 9838931  T
Q  399 tgttgttgatgataattcatggcttg 424  Q
    | |||||| |||| ||||||| ||||    
T  9838930 tattgttgttgatgattcatgacttg 9838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Original strand, 15516659 - 15516793
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||  ||| ||||| || ||  |||||||| |||||||||   |||| || |||||| |     
T  15516659 agagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggggtaagtctaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatc 15516757  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
     || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516758 ttcaaatgtaagggggttagtctttatcataatcat 15516793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 145
Target Start/End: Original strand, 48622541 - 48622614
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||| | | |||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  48622541 ttaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatca 48622614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 424
Target Start/End: Original strand, 13863044 - 13863151
Alignment:
Q  318 tgctcaattggt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattc 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||  |||||| ||||||| | | |||||||||| || || |||||| | || || |    
T  13863044 tgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgttgttgttgttgctaagtgatattgttgttaatgatgc 13863143  T
Q  417 atggcttg 424  Q
    ||||||||    
T  13863144 atggcttg 13863151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Original strand, 14113989 - 14114032
Alignment:
Q  188 atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatata 231  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14113989 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatata 14114032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Original strand, 14423639 - 14423682
Alignment:
Q  188 atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatata 231  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14423639 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatata 14423682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 48356873 - 48356670
Alignment:
Q  222 tgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatg--ataagttgtgaaaattg 317  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||  ||| ||||    ||||     
T  48356873 tgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttatatgttg----aatta 48356778  T
Q  318 tgctc-aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattc 416  Q
    ||||| || || |||||| || || || |||| |||||| |||| || |||||| ||||||||| | |||||||||| || || |||||| |||| ||||    
T  48356777 tgctctaaatgttgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattc 48356678  T
Q  417 atggcttg 424  Q
    ||||||||    
T  48356677 atggcttg 48356670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28722339 - 28722200
Alignment:
Q  222 tgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 319  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||  |||| ||    
T  28722339 tgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattatg 28722242  T
Q  320 ctc-aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgat 360  Q
    ||| ||||| |||||| ||||| || |||| |||||||||||    
T  28722241 ctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgat 28722200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 267 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 31501356 - 31501182
Alignment:
Q  267 ttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagt 364  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  ||||||| | ||  ||||| ||| |||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||     
T  31501356 ttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaataatg--ctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgaga 31501259  T
Q  365 ttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
     ||||| | ||||||| | ||||||| ||||  || |||||| |||| |||||||||||| || | ||||| |||||    
T  31501258 atcatgtttaattgatgttgttgttgttatgagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcatgagtcatg 31501182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 9611555 - 9611333
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatg- 300  Q
    |||||| ||||| || | ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||     
T  9611555 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgt 9611456  T
Q  301 -ataagttgtgaaaattgtgct--caattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtc 397  Q
     ||| ||||    |||| ||||   || || |||||| ||||| || |||| |||||| |||| || |||||| ||||||||| | |||||||||| ||     
T  9611455 tatatgttg----aattatgcttctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtg 9611360  T
Q  398 atgttgttgatgataattcatggcttg 424  Q
    || |||||| |||| ||||||| ||||    
T  9611359 atattgttgttgatgattcatgacttg 9611333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 13573056 - 13572981
Alignment:
Q  71 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  13573056 cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcat 13572981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 424
Target Start/End: Original strand, 20583595 - 20583775
Alignment:
Q  244 aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattatgctac 341  Q
    ||||| ||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||||  || ||||||| ||| |||||| |||||     
T  20583595 aattggtgataattgaattattgttgatgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa--ttatgctcaaattgttgaattgtgctat 20583692  T
Q  342 gtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttg 424  Q
    || |||| |||||| |||| ||  ||||| | ||||||| | ||||||| || |  || |||||| |||| ||||||||||||    
T  20583693 gttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagggatattgttgttgatgattcatggcttg 20583775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 390
Target Start/End: Original strand, 13448868 - 13449014
Alignment:
Q  244 aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattatgctac 341  Q
    ||||| ||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||  |||||||||| || || |||||| |||||     
T  13448868 aattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattgtgctctaaatgttgaattgtgctat 13448965  T
Q  342 gtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttg 390  Q
    ||  ||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||| | |||||||    
T  13448966 gttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 13449014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16418878 - 16418805
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 145  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||  |||||| | | |||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  16418878 ttaggagctaaagtgaagctttagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatca 16418805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 126770 - 126738
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  126770 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 126738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 323 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16919686 - 16919598
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||  || || | ||||||| | |||||||||| || || |||||| ||||    
T  16919686 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcgtgtttaattgatgttgttgttgctaagtaatattgttgttgat 16919598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 146
Target Start/End: Original strand, 32493946 - 32493978
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32493946 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 32493978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 50)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 14 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 20446116 - 20445750
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    ||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20446116 agagaagaaaaagggtt---gagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagttaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 20446020  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgcatgaatttt-gctta-tggataattgttgctaaattca 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  20446019 taaggtaagggagttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 20445920  T
Q  211 tgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 310  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||    
T  20445919 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtg 20445820  T
Q  311 aaaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgat 380  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  20445819 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgat 20445750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20913469 - 20913147
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20913469 agagaagaacaagggttagagagaagagggagaaattgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttt 20913371  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  20913370 atctaaggtaagggggttagtctttatcgtaatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaattttgcttacggataattgttgctaaattcg 20913271  T
Q  211 tgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20913270 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatg 20913171  T
Q  311 aaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20913170 aaaattgtgctcaattggtgaatt 20913147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 15 - 340
Target Start/End: Original strand, 37844275 - 37844603
Alignment:
Q  15 gagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatct 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37844275 gagaagaataagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatttttatct 37844374  T
Q  115 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaa-ttttgc-ttatggataattgttgctaaattcatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  37844375 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcatg 37844474  T
Q  213 ctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgat-aagttgtga 311  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| || | ||||    
T  37844475 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtga 37844574  T
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||    
T  37844575 aaattgtgctcaattaatgaattttgcta 37844603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 14 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 20531880 - 20531515
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    ||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20531880 agagaagaaaaagggtt---gagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagataaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 20531784  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaa-ttttgc-ttatggataattgttgctaaattcat 211  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  20531783 taaggtaaggaaattagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 20531684  T
Q  212 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 311  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||    
T  20531683 gctccaaatgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtga 20531584  T
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgat 380  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  20531583 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgat 20531515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20931784 - 20931456
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||| ||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20931784 agagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaataatcaag-attggagtgagcttagcagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttt 20931686  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattca 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  20931685 atctaaggtaagggggttagcctttatcataatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaagtttgcttatggataattgttgctaaattcg 20931586  T
Q  211 tgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20931585 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatg 20931486  T
Q  311 aaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  20931485 aaaattgtgctaaattggtgaattttgcta 20931456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 20893454 - 20893778
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    ||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20893454 agagaagaaaaagggtt---gagaaggagaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttacc 20893550  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaatttt-gctta-tggataattgttgctaaattcat 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |    
T  20893551 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaa-ttttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattctt 20893649  T
Q  212 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  20893650 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 20893749  T
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20893750 aaattgtgctcaattggtgaattttgcta 20893778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 114 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 41394559 - 41394333
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcatgc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  41394559 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 41394460  T
Q  214 tccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394459 tccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 41394360  T
Q  314 attgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  41394359 attgtgctcaattggtgaattttgcta 41394333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 69 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 45051803 - 45051534
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaa 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  |    
T  45051803 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-tgattttgca--ttttctca 45051707  T
Q  169 tgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 267  Q
    ||||| |||||  | | || ||| | ||||  ||||| |||| || ||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45051706 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgttcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgt 45051607  T
Q  268 tggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45051606 tggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgcta 45051534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 69 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 2116635 - 2116366
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaa 168  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| || |||||||| |||||||||  |||||||||||||  | |||||| |  |||||  |    
T  2116635 agcttatgagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatttaaggtaaaggggttagtgattatcataatcatg-taattttgca--ttttctca 2116539  T
Q  169 tgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 267  Q
    ||||| || ||  | | || ||| | ||||  ||||| |||| ||||   ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2116538 tgttgtataaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgcttttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgt 2116439  T
Q  268 tggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  2116438 tggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgcta 2116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21718360 - 21718237
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21718360 tgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattca 21718261  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  21718260 tggcttgggtttgcatgattcatg 21718237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 51452886 - 51452623
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatt--ttgtaaattttca 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  ||| || ||||||    
T  51452886 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcttaatcatgttcattctttgcaatttttca 51452787  T
Q  167 aatgttgcatgaattttgctta----------tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataat 256  Q
        ||| ||||| |  | | |          ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  51452786 tgatttgtatgaaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataat 51452687  T
Q  257 tgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  51452686 tgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 51452623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 35522434 - 35522557
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  35522434 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatacgtcatgttgttgatgataattca 35522533  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  35522534 tggcttgggtttgcatgattcatg 35522557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 200 - 334
Target Start/End: Original strand, 18601118 - 18601252
Alignment:
Q  200 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 299  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  18601118 tgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 18601217  T
Q  300 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18601218 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatt 18601252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22228201 - 22227920
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaa 159  Q
    ||||| || |||||| ||||| |||||||||   |||| || |||||| |  || |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |      
T  22228201 attggggtaagcttaagagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgc 22228102  T
Q  160 attttcaaatgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattg 258  Q
    ||||||  |||||| |||||  | | || ||| | |||| ||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  22228101 attttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattg 22228002  T
Q  259 taagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||| |||||    
T  22228001 tatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttgcta 22227920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 200 - 334
Target Start/End: Original strand, 5072388 - 5072522
Alignment:
Q  200 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 299  Q
    |||||||||| |||||   |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5072388 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 5072487  T
Q  300 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  5072488 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatt 5072522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 194 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22232763 - 22232617
Alignment:
Q  194 aattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 293  Q
    |||| ||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22232763 aattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgt 22232664  T
Q  294 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||| |||||    
T  22232663 aaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttgcta 22232617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 49967782 - 49967659
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  49967782 tgctcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgatacgtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattca 49967683  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    | ||||  ||||||||||||||||    
T  49967682 ttgcttcggtttgcatgattcatg 49967659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 22403225 - 22403347
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||| || || | | ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22403225 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaactgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattca 22403324  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| |||| |||||||||||    
T  22403325 tggcttgggttt-catgattcatg 22403347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 318 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 35054888 - 35054766
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| | |||| |||||||    
T  35054888 tgctcaattggtgaattatgctatgtagttgatgaactgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattca 35054789  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||| || ||||||||||||    
T  35054788 tggcttgggtatgcatgattcat 35054766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 345 - 441
Target Start/End: Original strand, 9784242 - 9784338
Alignment:
Q  345 gttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  9784242 gttgttgaattgtgataagtttcaagatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggcttgcatgattcatg 9784338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 318 - 440
Target Start/End: Original strand, 27329870 - 27329992
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| | |||| |||||||    
T  27329870 tgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattca 27329969  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||| || ||||||||||||    
T  27329970 tggcttgggtatgcatgattcat 27329992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 321 - 441
Target Start/End: Original strand, 51627781 - 51627902
Alignment:
Q  321 tcaattggt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatg 419  Q
    ||||||||| |||||||| || |  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  51627781 tcaattggttgaattatgatatggtgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgttgatgataattcatg 51627880  T
Q  420 gcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||| || |||||||||||||    
T  51627881 gcttgggtatgcatgattcatg 51627902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 318 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 41212204 - 41212081
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataat 414  Q
    ||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||| | |   ||||||||||||||||||||    
T  41212204 tgctcaattagtgaattatgcactgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataat 41212105  T
Q  415 tcatggcttgagtttgcatgattc 438  Q
    |||||||||| |||||||| ||||    
T  41212104 tcatggcttgggtttgcataattc 41212081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21860149 - 21860021
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | | | ||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  21860149 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 21860050  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
     || ||||||| | |||||||||||||||    
T  21860049 gatacatggctcgggtttgcatgattcat 21860021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 22367156 - 22367028
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  22367156 aaattatgctcaattggtgaat-atgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 22367058  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
     || |||| |||| ||||||||||||||||    
T  22367057 gatacatgacttgggtttgcatgattcatg 22367028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Original strand, 44035088 - 44035215
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||| |  ||||| | |||||||||    
T  44035088 aaattatgctcatttggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatagttgatgat 44035187  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||    
T  44035188 ga-taatggcttgagtttgcatgattcat 44035215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 312 - 441
Target Start/End: Original strand, 15861543 - 15861670
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||  ||| |  ||||| |||||||||||    
T  15861543 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgt--ttgtttagtcatattgttgatgat 15861640  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
     || |||| |||| ||||||||||||||||    
T  15861641 gatgcatgacttgggtttgcatgattcatg 15861670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 441
Target Start/End: Original strand, 22143361 - 22143599
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 301  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||| | |||||||||||||| ||  ||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||     
T  22143361 aaattcgtgctctaactatgatgatgtgtttgtatgcatgaaatttgtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatgtataaatgt 22143460  T
Q  302 taagttgtgaaaattgtgctcaattggt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatg 400  Q
    ||| || ||||  || ||||||| |||| ||||||||||| || |||| |||||| |||| ||   |||| ||||||||| | |||| ||||| || ||     
T  22143461 taacttatgaa--ttatgctcaaatggttgaattatgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgctcaattgatgttgttgctgctaagtgata 22143558  T
Q  401 ttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||    
T  22143559 ttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatg 22143599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 20177421 - 20177201
Alignment:
Q  205 aattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgat 302  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| |||  ||||| ||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||    
T  20177421 aattcgtgctccaattatgatgatatgttttaatgcacgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgat 20177322  T
Q  303 aagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgt 401  Q
    |  |  ||||  || ||||||| ||| |||||||||||| || |||| ||||||||| |||   ||| | ||||||||| | |||||||||| || ||||    
T  20177321 atatgttgaa--ttatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaaaagtcaagttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgt 20177224  T
Q  402 tgttgatgataattcatggcttg 424  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  20177223 tgttgatgatgattcatggcttg 20177201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 145
Target Start/End: Original strand, 7640806 - 7640882
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 145  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7640806 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatca 7640882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 318 - 390
Target Start/End: Original strand, 9784179 - 9784248
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttg 390  Q
    |||| |||||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  9784179 tgcttaattggtgaattatgct---ttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 9784248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 146
Target Start/End: Original strand, 51627472 - 51627590
Alignment:
Q  27 ggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaag-ttggga-ttaatctttatctaaggtaaggg 124  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||  || ||||||||||||    
T  51627472 ggttagagagaaggggaacttgaagattcaaggattggagggagc-taggagctaaattgaagcttaagctagggagttaatc--taactaaggtaaggg 51627568  T
Q  125 ggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||  || |||||||||||    
T  51627569 ggttagaattcatcataatcat 51627590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 145
Target Start/End: Original strand, 9783870 - 9783990
Alignment:
Q  24 aagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattgga-gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtt-gggattaatctttatctaaggtaa 121  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||  |||||||||||    
T  9783870 aagggttagagagaagaggaacttgaagaatcaaggattgggtgagagct-aggagcaaaattgaagcctaagctagggattactct--atctaaggtaa 9783966  T
Q  122 gggggttagtctttatcataatca 145  Q
    |||||||||  || ||||||||||    
T  9783967 gggggttagaattcatcataatca 9783990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22035831 - 22035755
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 145  Q
    |||||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22035831 agcttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatca 22035755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 366 - 441
Target Start/End: Original strand, 13377003 - 13377078
Alignment:
Q  366 tcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  13377003 tcatgctcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgttgattcatggcttgagtattcataattcatg 13377078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 424
Target Start/End: Original strand, 37233986 - 37234081
Alignment:
Q  329 tgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttg 424  Q
    |||||||||||| || || | ||||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||||| || || |||||| |||| ||||||| ||||    
T  37233986 tgaattatgctatgttgtggttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatgacttg 37234081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 146
Target Start/End: Original strand, 15861285 - 15861358
Alignment:
Q  73 taggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||| |||||||||   |||| || |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861285 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15861358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 46523772 - 46523695
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||| |||||| ||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  46523772 agcttaggagataaattaaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 46523695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 17609174 - 17609090
Alignment:
Q  205 aattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 288  Q
    ||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  17609174 aattcgtgctctaattatgatgatatatttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 17609090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 21195261 - 21195040
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 301  Q
    |||||| ||||| || | || |||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| |   ||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||    
T  21195261 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaatga 21195162  T
Q  302 taagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatg 400  Q
    ||  |||||||  || ||||||| ||| |||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||  ||||| | |||| || | ||||||| || |  ||     
T  21195161 tatattgtgaa--ttatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattaatgttgttgttgttaagagata 21195064  T
Q  401 ttgttgatgataattcatggcttg 424  Q
    |||||| |||| ||||||||||||    
T  21195063 ttgttgttgatgattcatggcttg 21195040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 441
Target Start/End: Original strand, 41229102 - 41229177
Alignment:
Q  366 tcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  41229102 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttaatgattcatggcttgagtgttcataattcatg 41229177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 16646031 - 16645982
Alignment:
Q  331 aattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgat 380  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16646031 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgat 16645982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17148781 - 17148704
Alignment:
Q  238 tgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  17148781 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 17148704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Original strand, 18059756 - 18059877
Alignment:
Q  194 aattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | || | |||||||||||||| |||||| |||    
T  18059756 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 18059855  T
Q  292 gtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  18059856 gtataaatgttaagttatgaaa 18059877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 331 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16656757 - 16656709
Alignment:
Q  331 aattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattga 379  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16656757 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattga 16656709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 131
Target Start/End: Original strand, 18598849 - 18598908
Alignment:
Q  71 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagt 131  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18598849 cttaggagctgaattgaagcaagagttggg-ttaatcttcttctaaggtaagggggttagt 18598908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 21860366 - 21860334
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21860366 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 21860334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 365 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 27674881 - 27674805
Alignment:
Q  365 ttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||| ||||||| | | ||||||| || || ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  27674881 ttcatgttcaattggtgtagttgttgttaagtgatgttgttattgataattcatggcttgggtgtgcataattcatg 27674805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 365 - 441
Target Start/End: Original strand, 36356455 - 36356531
Alignment:
Q  365 ttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||| ||||||||| | |||||| ||| || |||||||||||||| ||| |||||||| || | ||| |||||||    
T  36356455 ttcatgttcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgatgatttatggcttgggtgttcataattcatg 36356531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 146
Target Start/End: Original strand, 44034871 - 44034903
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44034871 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 44034903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1564 - 1235
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  1564 agagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgtgattaatcttt 1466  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1465 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttcttatggataattgttgctaaattc 1366  T
Q  210 atgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgt 309  Q
     |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1365 gtgctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgt 1266  T
Q  310 gaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1265 gaaaattgtgctcaattggtgaattttgcta 1235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 3406 - 3734
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||   |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3406 agagaaaaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttt 3504  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||     
T  3505 atctaaggtaagggggttagtctttgtcataatcatcttcattttgtaaattttcaaaagttgtatgaattttgattatagataattgttgctaaattcg 3604  T
Q  211 tgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3605 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 3704  T
Q  311 aaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  3705 aaaattgtgctcaattggtaaattttgcta 3734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 81)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 27182374 - 27182699
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    ||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27182374 agagaagaaaaagggtt---gagaaggagaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttacc 27182470  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaa-ttttgc-ttatggataattgttgctaaattcat 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27182471 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 27182570  T
Q  212 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 311  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  27182571 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 27182670  T
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27182671 aaattgtgctcaattggtgaattttgcta 27182699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 69 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23507347 - 23507076
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaa 168  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||    
T  23507347 agcttaggagttaaagtgaagcataagttggaattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatctccattttgtaagatttcaaa 23507248  T
Q  169 tgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtt 268  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23507247 tgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgtt 23507148  T
Q  269 ggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23507147 ggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgcta 23507076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 33 - 380
Target Start/End: Original strand, 18530906 - 18531259
Alignment:
Q  33 agagaaggagaa-cttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagt 131  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18530906 agagaaggagaaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagt 18531005  T
Q  132 ctttatcataatc---atcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgctta--tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatg 226  Q
    ||| |||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| | |||||| || | ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18531006 cttcatcataatcgtcatcatcattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatgtttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatg 18531105  T
Q  227 atatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaatt 326  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  18531106 atatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaatt 18531205  T
Q  327 ggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgat 380  Q
    |||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||    
T  18531206 ggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgat 18531259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 33 - 380
Target Start/End: Original strand, 22053671 - 22054025
Alignment:
Q  33 agagaaggagaa-cttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagt 131  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22053671 agagaaggagaaacttgaagaatcaagaattgaagtgagcttaggagctaaagtgaagtctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagt 22053770  T
Q  132 ctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgctta--tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgat 225  Q
    ||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| | ||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22053771 cttcatcataatcatcatcatcatttttgaaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgat 22053870  T
Q  226 gatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaat 325  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22053871 gatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaat 22053970  T
Q  326 tggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgat 380  Q
    ||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||    
T  22053971 tggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgat 22054025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 200 - 340
Target Start/End: Original strand, 29188284 - 29188424
Alignment:
Q  200 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 299  Q
    ||||| |||| |||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29188284 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 29188383  T
Q  300 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  29188384 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgcta 29188424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20623363 - 20623100
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatt--ttgtaaattttca 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| || ||||||    
T  20623363 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttca 20623264  T
Q  167 aatgttgcatgaattttgctta----------tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataat 256  Q
        ||| ||||| |  | | |          ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  20623263 tgatttggatgaaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataat 20623164  T
Q  257 tgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20623163 tgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 20623100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Original strand, 21233397 - 21233660
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatt--ttgtaaattttca 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| || ||||||    
T  21233397 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttca 21233496  T
Q  167 aatgttgcatgaattttgctta----------tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataat 256  Q
        ||| ||||| |  | | |          ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  21233497 tgatttggatgaaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataat 21233596  T
Q  257 tgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21233597 tgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 21233660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 274 - 441
Target Start/End: Original strand, 1168275 - 1168442
Alignment:
Q  274 aattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgat 372  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||  |  |||||||  ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168275 aattacatgttcaaagtatgagaaaatgatatatgttgaaaata-tgctcaattggtgaattatgcaatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgat 1168373  T
Q  373 caattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1168374 caattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 1168442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 188 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 34939540 - 34939388
Alignment:
Q  188 atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 287  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  34939540 atggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 34939441  T
Q  288 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  34939440 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgcta 34939388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 21651147 - 21651018
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  21651147 agagaagaacaagggttagagagaag---aacttgaagaattaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagtctaagttgggattaatcttcatc 21651051  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21651050 taaggtaagggggttaatatttatcataatcat 21651018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16536591 - 16536328
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatt--ttgtaaattttca 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| || ||||||    
T  16536591 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagataagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttca 16536492  T
Q  167 aatgttgcatgaattttgctta----------tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataat 256  Q
        ||| ||||| |  | | |          ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  16536491 tgatttggatgaaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataat 16536392  T
Q  257 tgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16536391 tgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 16536328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 11337301 - 11337424
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11337301 tgctcatttggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgtcgttgatgataattca 11337400  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  11337401 tggcttgagtttacatgattcatg 11337424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 190 - 320
Target Start/End: Original strand, 25900408 - 25900538
Alignment:
Q  190 ggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaat 289  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  |||    
T  25900408 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaat 25900507  T
Q  290 atgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25900508 atgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 25900538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 188 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 37053007 - 37052875
Alignment:
Q  188 atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |    
T  37053007 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37052908  T
Q  288 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  37052907 atatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 37052875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 321 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21906846 - 21906729
Alignment:
Q  321 tcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatgg 420  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21906846 tcaattgatgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgat---gttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatgg 21906750  T
Q  421 cttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  21906749 cttgggtttgcatgattcatg 21906729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 219 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27010074 - 27009959
Alignment:
Q  219 ctgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 318  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  27010074 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgt 27009975  T
Q  319 gctcaattggtgaatt 334  Q
     |||||||||||||||    
T  27009974 actcaattggtgaatt 27009959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 219 - 334
Target Start/End: Original strand, 43443414 - 43443529
Alignment:
Q  219 ctgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 318  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  43443414 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgt 43443513  T
Q  319 gctcaattggtgaatt 334  Q
    ||||||||||||||||    
T  43443514 gctcaattggtgaatt 43443529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 318 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20712208 - 20712086
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  20712208 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgttaattca 20712109  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||| || ||||||||||||    
T  20712108 tggcttgggtatgcatgattcat 20712086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 200 - 334
Target Start/End: Original strand, 22366481 - 22366615
Alignment:
Q  200 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 299  Q
    |||||||||| |||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22366481 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 22366580  T
Q  300 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  22366581 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatt 22366615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 151
Target Start/End: Original strand, 23981307 - 23981442
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    |||||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  23981307 agagaagaacaagggtt--agaagaggagatcttgaagaatcaagaattggggtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttggattaatcttcatc 23981404  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatca 151  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  23981405 ttaggtaagggggttagtcttcatcaaaatcataatca 23981442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 21205382 - 21205249
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  21205382 agagaagaacaagggttagagagaagtgggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttggaattaatcttc 21205284  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21205283 atctaagataa-gggattagtctttatcataatcat 21205249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21397224 - 21397098
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcg---ttgttgctatgtcatgttgttgatgataat 414  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |   |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21397224 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttattgttgttaagtcatgttgttgatgataat 21397125  T
Q  415 tcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21397124 tcatggcttgggtttgcatgattcatg 21397098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 2032263 - 2032135
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    ||||||||| |||||||  |||  ||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  2032263 agagaagaaaaagggtt--agaagaggagaacttgaagaatcaagaattggggtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttgggttaatccttatc 2032166  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatc 144  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  2032165 taaggtaagggggttagttttcatcataatc 2032135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 219 - 334
Target Start/End: Original strand, 18778011 - 18778126
Alignment:
Q  219 ctgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 318  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  18778011 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 18778110  T
Q  319 gctcaattggtgaatt 334  Q
    ||| ||||||||||||    
T  18778111 gctaaattggtgaatt 18778126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 334
Target Start/End: Original strand, 4200005 - 4200119
Alignment:
Q  220 tgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 319  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||    
T  4200005 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatg 4200104  T
Q  320 ctcaattggtgaatt 334  Q
    || ||||||||||||    
T  4200105 ctaaattggtgaatt 4200119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 200 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19500151 - 19500017
Alignment:
Q  200 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 299  Q
    |||||||||| |||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19500151 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 19500052  T
Q  300 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||    
T  19500051 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 19500017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 200 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25426880 - 25426746
Alignment:
Q  200 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 299  Q
    |||||||||| |||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25426880 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25426781  T
Q  300 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||    
T  25426780 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 25426746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 312 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 2031948 - 2031819
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  2031948 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 2031849  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2031848 aattcatggcttgggtttgcatgattcatg 2031819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Original strand, 108680 - 108760
Alignment:
Q  66 gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  108680 gtgagcttaggaggtaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 108760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 329 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 19405658 - 19405546
Alignment:
Q  329 tgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtt 428  Q
    ||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  19405658 tgaattatgattcgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatattgttactggtatgtgatgttgttgatgataattcatggcttgggta 19405559  T
Q  429 tgcatgattcatg 441  Q
    |||||||||||||    
T  19405558 tgcatgattcatg 19405546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 200 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12492
Alignment:
Q  200 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 299  Q
    |||||||||| |||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  12626 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 12527  T
Q  300 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||    
T  12526 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 12492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 200 - 334
Target Start/End: Original strand, 21073595 - 21073729
Alignment:
Q  200 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 299  Q
    |||||||||| |||||   |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21073595 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 21073694  T
Q  300 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||||    
T  21073695 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatt 21073729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 24183247 - 24183367
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||   |||||||||||||| |    
T  24183247 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatgagtttcatgatcaattgatggtgttgttgatatgtca---tgttgatgataattaa 24183343  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  24183344 tggcttgggtttgcatgattcatg 24183367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 350 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 23466557 - 23466466
Alignment:
Q  350 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  23466557 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgttgatgatagttcatggcttgggtatgcatgattcatg 23466466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 25005240 - 25005137
Alignment:
Q  43 aacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataa 142  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25005240 aacttgaagaatcaagaattggagtgaatctaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaagtaagggggttagtcttcatcataa 25005141  T
Q  143 tcat 146  Q
    ||||    
T  25005140 tcat 25005137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 323 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 7728547 - 7728429
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 422  Q
    ||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| || |||    
T  7728547 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataatttatcgct 7728448  T
Q  423 tgagtttgcatgattcatg 441  Q
    || || ||||| |||||||    
T  7728447 tgggtgtgcataattcatg 7728429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 69 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 37053138 - 37053061
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37053138 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37053061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 329 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 23494040 - 23493928
Alignment:
Q  329 tgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtt 428  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  23494040 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtg 23493941  T
Q  429 tgcatgattcatg 441  Q
    | ||| |||||||    
T  23493940 ttcataattcatg 23493928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 318 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 28261653 - 28261533
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | | ||||||| |  ||||||||| |||||||||||||    
T  28261653 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattgtgatatgttttatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgctgatgataattca 28261554  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattc 438  Q
    ||||||| |||||||| ||||    
T  28261553 tggcttgggtttgcataattc 28261533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 424
Target Start/End: Original strand, 5450844 - 5451064
Alignment:
Q  205 aattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgat 302  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||    
T  5450844 aattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgat 5450943  T
Q  303 aagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgt 401  Q
    |  |  ||||  || ||||||| ||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||  |||||| |||| |||| | |||||||||| || ||||    
T  5450944 atatgttgaa--ttatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataaaattcatgttcaactgatgttgttgttgctaagtgatgt 5451041  T
Q  402 tgttgatgataattcatggcttg 424  Q
    |||||||||| |||| |||||||    
T  5451042 tgttgatgatgattcttggcttg 5451064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 323 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 3673989 - 3673888
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 422  Q
    ||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  | || ||||||||| ||||||||||    
T  3673989 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagcgaggtggttgatgatgattcatggct 3673890  T
Q  423 tg 424  Q
    ||    
T  3673889 tg 3673888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 4865395 - 4865274
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataa-ttc 416  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |  | |||| |   |||||||||||||||||| |||    
T  4865395 tgctcaattggtgaattatgcattgtggttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttatggttgtttattcatgttgttgatgataatttc 4865296  T
Q  417 atggcttgagtttgcatgattc 438  Q
    |||||||| |||||||| ||||    
T  4865295 atggcttgggtttgcataattc 4865274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 321 - 430
Target Start/End: Original strand, 21646857 - 21646966
Alignment:
Q  321 tcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatgg 420  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||    
T  21646857 tcaattggtgaattatgtatcgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgctgttgttgtttagtcatgatgttgatgataattcatgg 21646956  T
Q  421 cttgagtttg 430  Q
    |||| |||||    
T  21646957 cttgggtttg 21646966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 146
Target Start/End: Original strand, 25900275 - 25900352
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25900275 agcttaggagctaaattaaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25900352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21650833 - 21650705
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| |  ||| |    
T  21650833 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgct 21650734  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  21650733 aattcatggtttgggtatgcatgattcat 21650705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23514954 - 23514698
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaa 159  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||||||||  ||| ||| |      
T  23514954 attggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgc 23514855  T
Q  160 attttcaaatgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattg 258  Q
    ||||||  |||||| |||||  | | || ||| | |||||||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |    
T  23514854 attttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgg 23514755  T
Q  259 taagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    || | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  23514754 tatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 23514698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 313
Target Start/End: Original strand, 1219392 - 1219639
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaa 168  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  |    
T  1219392 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctca 1219491  T
Q  169 tgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 267  Q
    ||||| |||||  | | || ||| | |||||||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | ||||| |||||||||| || ||| | ||||    
T  1219492 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgt 1219591  T
Q  268 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  1219592 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 1219639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 7529299 - 7529228
Alignment:
Q  75 ggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7529299 ggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcttcataatcat 7529228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 318 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 24475710 - 24475595
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |   ||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  24475710 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgttat--gtttcatgatcaattgtt---gttgttgtttagtcatgttgttgatgataattca 24475616  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattc 438  Q
    ||||||| |||||||| ||||    
T  24475615 tggcttgggtttgcataattc 24475595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 11342823 - 11342693
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttg-ttgctatgtcatgttgttgatga 410  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | |||| ||| |  ||||| ||||||||||    
T  11342823 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtttgtttagtcatattgttgatga 11342724  T
Q  411 taattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    | ||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  11342723 tgatatatggcttgggtttgcatgattcatg 11342693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 32951098 - 32951016
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataa 142  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32951098 attggggtaagcttaggagctaaattgaagtctaagtttgaattaatcattatttaaggtaagggggttagtcttcatcataa 32951016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21205064 - 21204936
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||   | | ||||||| || || ||||| || ||  |    
T  21205064 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatatttgttgttgttgttaagtgatgttatttattct 21204965  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21204964 aattcatggcttgggtatgcatgattcat 21204936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 204 - 424
Target Start/End: Original strand, 23981516 - 23981737
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 301  Q
    |||||| ||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||     
T  23981516 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgtatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatgtataaatgt 23981615  T
Q  302 taagttgtgaaaattgtgctcaattggt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatg 400  Q
    ||| || ||||  || ||||||| |||| |||||||| || || |||| |||||| |||| ||   |||| ||||||||| | |||||||||| || ||     
T  23981616 taacttatgaa--ttatgctcaaatggttgaattatgatatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 23981713  T
Q  401 ttgttgatgataattcatggcttg 424  Q
    |||||| |||| ||||||||||||    
T  23981714 ttgttgttgatgattcatggcttg 23981737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 307
Target Start/End: Original strand, 35790961 - 35791211
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaa 159  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |      
T  35790961 attggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgc 35791060  T
Q  160 attttcaaatgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattg 258  Q
    ||||||  |||||| |||||  | | || ||| | |||||||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |    
T  35791061 attttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatgg 35791160  T
Q  259 taagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagtt 307  Q
    || | ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  35791161 tatgtttgtgagtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtt 35791211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 11584186 - 11584059
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgct---acgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataat 414  Q
    ||||||||||||||||||||||     || |||| |||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||| |  ||||| | ||||||||||||    
T  11584186 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgttgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataat 11584087  T
Q  415 tcatggcttgag-tttgcatgattcatg 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||    
T  11584086 tcatggcttgggttttgcatgattcatg 11584059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 32950955 - 32950862
Alignment:
Q  191 gataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 284  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| || || || |||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  32950955 gataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 32950862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 19862456 - 19862218
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 301  Q
    |||||| ||||| || | ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||    
T  19862456 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 19862357  T
Q  302 taagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatg 400  Q
    ||  |  ||||  || ||||||| ||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||||||| || ||     
T  19862356 tatatgttgaa--ttatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtgcaattgatgttgttgttgctaagtgata 19862259  T
Q  401 ttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    || ||| |||| ||||||| |||| || | ||| |||||||    
T  19862258 ttattgttgatgattcatgacttgggtgttcataattcatg 19862218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23328941 - 23328865
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 145  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23328941 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatca 23328865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24616545 - 24616469
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 145  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24616545 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatca 24616469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24712921 - 24712845
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 145  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24712921 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatca 24712845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24745939 - 24745863
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 145  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24745939 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatca 24745863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 9730236 - 9730310
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| | ||| ||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9730236 ttaggagctaaagtgaagcccaagtttgaattgatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 9730310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 17909897 - 17909823
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  17909897 ttaggagttaaagtgaagcctaagtttggattaatcataacctaaggtaagggggttagtgttcttcataatcat 17909823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7425706 - 7425461
Alignment:
Q  71 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 170  Q
    |||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  |||    
T  7425706 cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 7425607  T
Q  171 ttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttg 269  Q
    ||| |||||  | | || ||| | |||| ||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| | || ||| | |||| |    
T  7425606 ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgg 7425507  T
Q  270 gtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  7425506 gtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 7425461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Original strand, 10777968 - 10778089
Alignment:
Q  194 aattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 291  Q
    |||||||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  10777968 aattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 10778067  T
Q  292 gtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  10778068 gtataaatgttaagttatgaaa 10778089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16106040 - 16105967
Alignment:
Q  73 taggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||| |||||||||   ||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16106040 taggagctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16105967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 284
Target Start/End: Original strand, 11211941 - 11212153
Alignment:
Q  73 taggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgtt 172  Q
    |||||||| |||||||||   |||| || |||||| |  || |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||| |  ||||||  |||||    
T  11211941 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtt 11212040  T
Q  173 gcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggt 271  Q
    | |||||  | | || ||| | |||| ||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||    
T  11212041 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 11212140  T
Q  272 gaaattacatgtt 284  Q
    |||||||||||||    
T  11212141 gaaattacatgtt 11212153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 427
Target Start/End: Original strand, 21222736 - 21222832
Alignment:
Q  331 aattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagt 427  Q
    |||| ||||| || |||| |||||||||||||| |||||| |||||| || | |||||||||| || || |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  21222736 aattgtgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattaatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggattgagt 21222832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 11343081 - 11343008
Alignment:
Q  73 taggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||| |||||||||  | ||| || ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11343081 taggagctgaattgaagcagaggttagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 11343008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19405982 - 19405859
Alignment:
Q  24 aagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagt-gagcttaggagctaaattgaagcctaagtt---gggattaatctttatctaaggt 119  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| |   | ||||||||  || |||||||    
T  19405982 aagggttagagagaagaggaacttgaagaatcaaggattgggggagagct-aggagctaaattgaagcctaagctagggagattaatc--taactaaggt 19405886  T
Q  120 aagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||  || |||||||||||    
T  19405885 aagggggttagaattcatcataatcat 19405859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 288
Target Start/End: Original strand, 21310709 - 21310794
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 288  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  21310709 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 21310794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21617121 - 21617025
Alignment:
Q  345 gttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||| ||||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||||| || || |||||| || | |||||||||||| || | ||| |||||||    
T  21617121 gttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgttgattcatggcttgggtgttcataattcatg 21617025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 24084263 - 24084103
Alignment:
Q  264 ttgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgata 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||  |||||||| || || |||||| ||||| || |||| |||||||||||     
T  24084263 ttgttggtaaaattacatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa--ttgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatg 24084166  T
Q  362 agtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttg 424  Q
     |  ||||| | ||||||| | |||||||||| |  || |||||| |||  ||||||||||||    
T  24084165 tgaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagaaatattgttgttgaagattcatggcttg 24084103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 27010221 - 27010146
Alignment:
Q  71 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  27010221 cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcat 27010146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 29918212 - 29918129
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca 286  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||    
T  29918212 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 29918129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 284
Target Start/End: Original strand, 17471586 - 17471676
Alignment:
Q  194 aattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 284  Q
    |||||||| ||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  17471586 aattgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 17471676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 34939669 - 34939595
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||  | ||||||| | | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  34939669 ttaggagctaaagtgaagtctaagtgtgaattaatcataacctaaggtaagggggttagtgttcttcataatcat 34939595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 6456811 - 6456633
Alignment:
Q  263 attgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgat 360  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||  |||| ||||| ||||| |||||| || || || |||| |||||||||||    
T  6456811 attgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattatgctcaaattgttgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgat 6456714  T
Q  361 aagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
     ||  ||||| | ||||||| | ||||||| || |  || | |||| |||| |||||||||||| || | ||||| |||||    
T  6456713 gagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatcgttgttgatgattcatggcttgggtgttcatgaatcatg 6456633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Original strand, 36989768 - 36989889
Alignment:
Q  194 aattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 291  Q
    |||||||| ||||||| ||||| | |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||| | || | |||||||||||||| |||||| |||    
T  36989768 aattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 36989867  T
Q  292 gtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  36989868 gtataaatgttaagttatgaaa 36989889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 331 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 28902310 - 28902262
Alignment:
Q  331 aattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattga 379  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  28902310 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattga 28902262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 331 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 28938705 - 28938657
Alignment:
Q  331 aattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattga 379  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  28938705 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattga 28938657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 4)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 26243 - 26567
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  26243 agagaagaaaaagggttagagagaag---aacttgaagaattaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagatgggattaatcttcatc 26339  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgc-ttatggataattgttgctaaattcatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||| |||||||||||||||||| ||    
T  26340 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatgatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatgtataattgttgctaaattcgtg 26439  T
Q  213 ctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 312  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26440 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 26539  T
Q  313 aattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26540 aattgttctcaattggtgaattttgcta 26567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 349
Target Start/End: Original strand, 7993 - 8341
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaa-cttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttat 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||  ||| ||||  ||||   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7993 agagaagaacaagggttggaga--aggagaaacttgaagaatcaagaattgaggtgaatctaggagctaaaatgaagcctaagtttggattaatcattat 8090  T
Q  113 ctaaggtaaggggg-ttagtctttatcataatcatcatcattt--tgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgctt-----------atggataattg 198  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||  || || || |||  ||||| |||||| | | ||           |||||||||||    
T  8091 ctaaggtaaggggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattg 8190  T
Q  199 ttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 298  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8191 ttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaattatgtaaaaa 8290  T
Q  299 tgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttga 349  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  8291 tgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttga 8341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 12149 - 12063
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12149 attggggtaagcttaggagctaaattgaagccaaagtttggattaatcattatctaagataagggggttagtcttcatcataatcat 12063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 353 - 441
Target Start/End: Original strand, 7175 - 7263
Alignment:
Q  353 attgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||| | |||| ||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  7175 attgtgataagaatcatgttcaattgatgttgttgctgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataattcatg 7263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 74)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 334
Target Start/End: Original strand, 24928614 - 24928937
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24928614 agagaagaacaagggttagagagaagagggagatcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaattgaagtctaagttgggattaatcttt 24928712  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattc 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24928713 atctaaggtaatggggttagtctttatcataatcatcgtcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggataattgttgctaaattc 24928812  T
Q  210 atgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgt 309  Q
     ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  24928813 gtgctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgt 24928912  T
Q  310 gaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24928913 gaaaattgtgctcaattggtgaatt 24928937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 334
Target Start/End: Original strand, 16193541 - 16193862
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||   |||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16193541 agagaagaactagggttagagagaagagggagagcttaaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattcatcttt 16193639  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  16193640 atctaaggtaagggg-ttagtctttatcataatcatcatcatttggtaaattttcaaatattgtatgaattttgcttatggatgattgttgctaaattcg 16193738  T
Q  211 tgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 310  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193739 tgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 16193838  T
Q  311 aaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16193839 aaaattgtgctcaattggtgaatt 16193862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 43373290 - 43373620
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    |||||||||||||||||  |||||||   |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43373290 agagaagaacaagggttaaagagaagaaggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttt 43373388  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgctt--atggataattgttgctaaatt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||  |   ||||||||||  |||||||||    
T  43373389 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattaatgctaaatt 43373488  T
Q  209 catgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttg 308  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43373489 cgtgctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttg 43373588  T
Q  309 tgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43373589 tgaaaattgtgctcaattggtgaattttgcta 43373620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 114 - 340
Target Start/End: Original strand, 16404900 - 16405127
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaatttt-gctt-atggataattgttgctaaattcat 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||| ||||||||||| |    
T  16404900 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattt-gtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcatgatggataattattgctaaattcgt 16404998  T
Q  212 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  16404999 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtga 16405098  T
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16405099 aaattgtgctcaattggtgaattttgcta 16405127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 200 - 340
Target Start/End: Original strand, 6774258 - 6774398
Alignment:
Q  200 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 299  Q
    ||||| |||| |||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6774258 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6774357  T
Q  300 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6774358 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgcta 6774398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 200 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24549233 - 24549093
Alignment:
Q  200 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 299  Q
    ||||| |||| |||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24549233 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 24549134  T
Q  300 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  24549133 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgcta 24549093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 5238481 - 5238218
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatt--ttgtaaattttca 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| || ||||||    
T  5238481 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttca 5238382  T
Q  167 aatgttgcatgaattttgctta----------tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataat 256  Q
        ||| ||||| |  | | |          ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  5238381 tgatttggatgaaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataat 5238282  T
Q  257 tgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5238281 tgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 5238218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Original strand, 22907083 - 22907346
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatt--ttgtaaattttca 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| || ||||||    
T  22907083 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttca 22907182  T
Q  167 aatgttgcatgaattttgctta----------tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataat 256  Q
        ||| ||||| |  | | |          ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22907183 tgatttgtatgaaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataat 22907282  T
Q  257 tgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22907283 tgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 22907346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Original strand, 24661117 - 24661380
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatt--ttgtaaattttca 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| || ||||||    
T  24661117 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttca 24661216  T
Q  167 aatgttgcatgaattttgctta----------tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataat 256  Q
        ||| ||||| |  | | |          ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24661217 tgatttggatgaaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataat 24661316  T
Q  257 tgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24661317 tgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 24661380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 43685940 - 43685677
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatt--ttgtaaattttca 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| || ||||||    
T  43685940 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttca 43685841  T
Q  167 aatgttgcatgaattttgctta----------tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataat 256  Q
        ||| ||||| |  | | |          ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  43685840 tgatttggatgaaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataat 43685741  T
Q  257 tgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  43685740 tgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 43685677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17345973 - 17345680
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatt--ttgt 157  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||  |||     
T  17345973 attggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttcttaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgc 17345874  T
Q  158 aaattttcaaatgttgcatgaattttgctt-----------atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaat 246  Q
    || || |||  ||||| |||||| | | ||           ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  17345873 aatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaat 17345774  T
Q  247 tgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  17345773 tgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgcta 17345680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 20654020 - 20654143
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20654020 tgcttaattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgttgatgttaattca 20654119  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    | ||||| ||||||||||||||||    
T  20654120 ttgcttgggtttgcatgattcatg 20654143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 323 - 441
Target Start/End: Original strand, 20647949 - 20648067
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 422  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20647949 aattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgttgatgttaatccatggct 20648048  T
Q  423 tgagtttgcatgattcatg 441  Q
    || ||||||||||||||||    
T  20648049 tgggtttgcatgattcatg 20648067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Original strand, 24385550 - 24385684
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  24385550 agagaagaacaagggttggagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttc 24385648  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385649 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24385684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 20573307 - 20573430
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20573307 tgctcaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattca 20573406  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  20573407 tggcttgggtttgcatgattcatg 20573430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 219 - 334
Target Start/End: Original strand, 21844591 - 21844706
Alignment:
Q  219 ctgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 318  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21844591 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgt 21844690  T
Q  319 gctcaattggtgaatt 334  Q
    ||||||||||||||||    
T  21844691 gctcaattggtgaatt 21844706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 219 - 334
Target Start/End: Original strand, 21851984 - 21852099
Alignment:
Q  219 ctgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 318  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21851984 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgt 21852083  T
Q  319 gctcaattggtgaatt 334  Q
    ||||||||||||||||    
T  21852084 gctcaattggtgaatt 21852099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 41246790 - 41246667
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||| ||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  41246790 tgcttaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattca 41246691  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  41246690 tggcttgggtttgcatgattcatg 41246667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 200 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30120974 - 30120840
Alignment:
Q  200 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 299  Q
    |||||||||| |||||   |||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  30120974 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 30120875  T
Q  300 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  30120874 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatt 30120840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 318 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20481737 - 20481615
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  20481737 tgctcaattggtgaattatactttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgttaattca 20481638  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||| || ||||||||||||    
T  20481637 tggcttgggtatgcatgattcat 20481615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 200 - 334
Target Start/End: Original strand, 16674392 - 16674526
Alignment:
Q  200 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 299  Q
    |||||||||| |||||   |||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16674392 tgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 16674491  T
Q  300 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  16674492 gataagttatgaatattgtgcttaattggtgaatt 16674526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Original strand, 41506611 - 41506741
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    ||||||||| |||||||  |||  ||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  41506611 agagaagaaaaagggtt--agaagaggagaacttgaagaatcaagaattggggtgagcttaagagctaaattgaagcctaagtttgggttaatccttatc 41506708  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  41506709 taaggtaagggggttagttttcatcataatcat 41506741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 312 - 441
Target Start/End: Original strand, 41506926 - 41507055
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  41506926 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 41507025  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41507026 aattcatggcttgggtttgcatgattcatg 41507055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 37611800 - 37611678
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  37611800 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgtggttgatgataattca 37611701  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| | |||||| |||||||    
T  37611700 tggcttg-ggttgcataattcatg 37611678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 145
Target Start/End: Original strand, 7000422 - 7000551
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    ||||||||| |||||||  |||  ||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  7000422 agagaagaaaaagggtt--agaagaggagaacttgtagaatcaagaattggggtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttgggttaatccttatc 7000519  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatca 145  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  7000520 taaagtaagggggttagttttcatcataatca 7000551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 318 - 438
Target Start/End: Original strand, 22234918 - 22235038
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  22234918 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattca 22235017  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattc 438  Q
    ||| ||| |||||||| ||||    
T  22235018 tggattgggtttgcataattc 22235038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 329 - 437
Target Start/End: Original strand, 39446892 - 39447000
Alignment:
Q  329 tgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtt 428  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  39446892 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataattcatggcttgggta 39446991  T
Q  429 tgcatgatt 437  Q
    |||||||||    
T  39446992 tgcatgatt 39447000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 318 - 438
Target Start/End: Original strand, 19993169 - 19993289
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| |||||| |||||||| | | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  19993169 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataaatttcatcatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattca 19993268  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattc 438  Q
    ||||| | |||||||| ||||    
T  19993269 tggctagggtttgcataattc 19993289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21681135 - 21681011
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaa-ttatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattc 416  Q
    |||||||||||| || |||||||  || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  || ||||| |||||||||||||||||||    
T  21681135 tgctcaattggttaaattatgctttgttgttgttgaattgtgattagtttcatgatcaattgatgttgttactggtatgtgatgttgttgatgataattc 21681036  T
Q  417 atggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||||| || |||||||||||||    
T  21681035 atggcttgggtatgcatgattcatg 21681011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 329 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 38533770 - 38533658
Alignment:
Q  329 tgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtt 428  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  38533770 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaggtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtg 38533671  T
Q  429 tgcatgattcatg 441  Q
    ||||| |||||||    
T  38533670 tgcataattcatg 38533658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 21494314 - 21494388
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21494314 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcttcataatcat 21494388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 274581 - 274453
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| || || ||||| | |||| |    
T  274581 aaattatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgct 274482  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  274481 aattcatggcttgggtatgcatgaatcat 274453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Original strand, 641268 - 641396
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| || || ||||| | |||| |    
T  641268 aaattatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgct 641367  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  641368 aattcatggcttgggtatgcatgaatcat 641396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Original strand, 827074 - 827202
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| || || ||||| | |||| |    
T  827074 aaattatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgct 827173  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  827174 aattcatggcttgggtatgcatgaatcat 827202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Original strand, 16038998 - 16039126
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| | |||| |    
T  16038998 aaattatgctcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgct 16039097  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    |||| ||||||||  | ||||||||||||    
T  16039098 aatttatggcttggatatgcatgattcat 16039126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 39115413 - 39115285
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||||| |||||| |||||||||||||| | | | ||||||| |  ||||| | |||||||||    
T  39115413 aaattatgctcaattggtgaattatgcatagttgttgatgaatcgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgat 39115314  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||    
T  39115313 aattcatgacttgtgtatgcatgattcat 39115285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 263 - 334
Target Start/End: Original strand, 222754 - 222825
Alignment:
Q  263 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  222754 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatt 222825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 263 - 334
Target Start/End: Original strand, 736377 - 736448
Alignment:
Q  263 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  736377 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatt 736448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 263 - 334
Target Start/End: Original strand, 860272 - 860343
Alignment:
Q  263 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  860272 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatt 860343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 374 - 441
Target Start/End: Original strand, 20567329 - 20567396
Alignment:
Q  374 aattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20567329 aattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 20567396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 374 - 441
Target Start/End: Original strand, 20573522 - 20573589
Alignment:
Q  374 aattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20573522 aattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 20573589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 22886728 - 22886654
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22886728 ttaggagctaaagtgaagcttaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttaatcataatcat 22886654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 323 - 380
Target Start/End: Original strand, 20561751 - 20561808
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgat 380  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20561751 aattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgat 20561808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Original strand, 24716979 - 24717107
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||  |||||||| ||||| | | | |||| || |  ||||| |||||||||||    
T  24716979 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatttgtttcatgttcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatgat 24717078  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
     || ||||||||| |||||||||||||||    
T  24717079 gatacatggcttgggtttgcatgattcat 24717107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 323 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 23837325 - 23837207
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 422  Q
    ||||| |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||||| | |||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||    
T  23837325 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggct 23837226  T
Q  423 tgagtttgcatgattcatg 441  Q
    || || | ||| |||||||    
T  23837225 tgggtattcataattcatg 23837207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 392 - 441
Target Start/End: Original strand, 20567188 - 20567237
Alignment:
Q  392 tatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20567188 tatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 20567237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 26011741 - 26011520
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatg- 300  Q
    |||||| ||||| || | ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||     
T  26011741 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtgaaagtgt 26011642  T
Q  301 -ataagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtca 398  Q
     ||| ||||    |||| ||||| || || |||||| ||||| || |||| ||||||||||| || |||||| | ||||||| | |||||||||| || |    
T  26011641 tatatgttg----aattatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttgaattgatgttgttgttgctaagtga 26011546  T
Q  399 tgttgttgatgataattcatggcttg 424  Q
    | |||||| |||| ||||||||||||    
T  26011545 tattgttgttgatgattcatggcttg 26011520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 313
Target Start/End: Original strand, 13720803 - 13721047
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgt 171  Q
    ||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||    
T  13720803 ttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgt 13720902  T
Q  172 tgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttgg 270  Q
    || |||||  | | || ||| | |||||||||||||||| |||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||    
T  13720903 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggg 13721002  T
Q  271 tgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  13721003 tgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 13721047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 313
Target Start/End: Original strand, 22006121 - 22006377
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaa 159  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||   |||| |  ||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |      
T  22006121 attggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgagttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgc 22006220  T
Q  160 attttcaaatgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattg 258  Q
    ||||||  |||||| |||||  | | || ||| | |||||||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |    
T  22006221 attttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgg 22006320  T
Q  259 taagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    || | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  22006321 tatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 22006377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 321
Target Start/End: Original strand, 691909 - 691967
Alignment:
Q  263 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  691909 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 691967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 3431134 - 3431208
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3431134 ttaggagctaaagtgaagcccaagtttggattgatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 3431208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 323 - 441
Target Start/End: Original strand, 22735958 - 22736076
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 422  Q
    ||||| |||||||| ||| || |||| || ||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||  | ||||||||| || ||||||||||||    
T  22735958 aattgatgaattatactatgttgttgttggattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttcttgctaactgatgttgttgttgttaattcatggct 22736057  T
Q  423 tgagtttgcatgattcatg 441  Q
    || || ||||| |||||||    
T  22736058 tgggtgtgcataattcatg 22736076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 313
Target Start/End: Original strand, 16872923 - 16873170
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaa 168  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| |  ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  |    
T  16872923 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgagttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctca 16873022  T
Q  169 tgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 267  Q
    ||||| |||||  | | || ||| | |||||| ||||||||| |||||    ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  16873023 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgt 16873122  T
Q  268 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  16873123 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 16873170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2545339 - 2545265
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || | ||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2545339 ttaggagctaaagtgaagcttaaatttgaattaatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 2545265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 15933527 - 15933324
Alignment:
Q  222 tgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 319  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| || ||| |  ||||  || ||    
T  15933527 tgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttaaatgttgaa--ttatg 15933430  T
Q  320 ctc-aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcat 418  Q
    ||| || || |||||| || || || |||| |||||| |||| || |||||| ||||||||| | |||||||||| || || |||||| |||| ||||||    
T  15933429 ctctaaatgttgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcat 15933330  T
Q  419 ggcttg 424  Q
    ||||||    
T  15933329 ggcttg 15933324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 313
Target Start/End: Original strand, 13662140 - 13662384
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgt 171  Q
    ||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||    
T  13662140 ttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgt 13662239  T
Q  172 tgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttgg 270  Q
    || |||||  | | || ||  | |||||||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||  ||||| || ||| | |||| ||    
T  13662240 tgtatgaaaatgggttgataaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtggg 13662339  T
Q  271 tgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  13662340 tgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 13662384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 441
Target Start/End: Original strand, 21198152 - 21198390
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 301  Q
    |||||| ||||| || | ||||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||    
T  21198152 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgtagataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 21198251  T
Q  302 taagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatg 400  Q
    ||  |  ||||  || ||||||| ||| ||||||||| || || |||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||||| | |||||||||| || |||    
T  21198252 tatatgttgaa--ttatgctcaaattgttgaattatgttatgttgttgttgaattgtggtaagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatg 21198349  T
Q  401 ttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||| || | || |||||||||||| || | ||| |||||||    
T  21198350 ttgctgttaatgattcatggcttgggtgttcataattcatg 21198390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 25122618 - 25122546
Alignment:
Q  368 atgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||||| ||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25122618 atgatcaatagatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttg-ggttgcatgattcatg 25122546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 5854728 - 5854640
Alignment:
Q  336 tgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttg 424  Q
    ||||| || |||| ||||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||    
T  5854728 tgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttg 5854640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 33172457 - 33172289
Alignment:
Q  222 tgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 319  Q
    ||||||||| |||| || |||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||||  |||||    
T  33172457 tgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa--ttgtg 33172360  T
Q  320 ctc-aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgtt 389  Q
    ||| ||||| |||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||| | ||||||    
T  33172359 ctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgtt 33172289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 424
Target Start/End: Original strand, 45558998 - 45559158
Alignment:
Q  264 ttgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgata 361  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||||  |||||||| ||||| |||||| ||||| || |||| |||||||||||     
T  45558998 ttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa--ttgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatg 45559095  T
Q  362 agtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttg 424  Q
    ||  ||||| | ||||||| | ||||||| || |  || |||||| |||| |||||| |||||    
T  45559096 agaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagggatattgttgttgatgattcatagcttg 45559158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 146
Target Start/End: Original strand, 24716762 - 24716794
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716762 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24716794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16195489 - 16195374
Alignment:
Q  194 aattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 291  Q
    |||||||||||||||| | |||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  16195489 aattgttgctaaattcgttctcgtgctgtgatgctatgttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 16195390  T
Q  292 gtaaaaatgataagtt 307  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  16195389 gtataaatgttaagtt 16195374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 424
Target Start/End: Original strand, 18261532 - 18261692
Alignment:
Q  264 ttgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgata 361  Q
    |||||||||||||| ||| |||| | ||||| |||||||||  |||||||  |||||||| ||||| |||||| ||||| || |||| |||||||||||     
T  18261532 ttgttggtgaaattgcatcttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa--ttgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatg 18261629  T
Q  362 agtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttg 424  Q
    ||  ||||| | ||||||| | ||||||| || |  || |||||| |||| |||||| |||||    
T  18261630 agaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttg 18261692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 16038744 - 16038818
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||| | ||| ||| | | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16038744 ttaggagctaaagtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 16038818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 145
Target Start/End: Original strand, 21259301 - 21259422
Alignment:
Q  24 aagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattgga-gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttggg--attaatctttatctaaggta 120  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||   |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| | ||  ||||||||  | ||||||||    
T  21259301 aagggttagagagaagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagct-aggagctaaattgaagcttaagctagggaattaatct--aactaaggta 21259397  T
Q  121 agggggttagtctttatcataatca 145  Q
    ||||||||||  || ||||||||||    
T  21259398 agggggttagaattcatcataatca 21259422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 441
Target Start/End: Original strand, 23226083 - 23226314
Alignment:
Q  211 tgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttg 308  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||| || |||||  ||| |||||| || || ||| ||     
T  23226083 tgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttgttggtgaatttgcatgtcaaaagtatgtataagtgttaactta 23226182  T
Q  309 tgaaaattgtgctcaattg-gtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttga 407  Q
    ||  |||| ||||||| ||  ||||||||| || || |||| |||||| |||| ||   |||| ||||||||| | ||||||| || || || ||||||     
T  23226183 tg--aattatgctcaaatgattgaattatgttatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaagtgatattgttgt 23226280  T
Q  408 tgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||| |||||||||||| || | ||| |||||||    
T  23226281 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatg 23226314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 29306544 - 29306450
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||| |||||| ||||| || |||| ||||||||||| || |||||| | ||||||| | |||||||||| || || |||||| |||| |||||    
T  29306544 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattca 29306450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22981400 - 22981351
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgat 372  Q
    ||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22981400 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgat 22981351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 274798 - 274766
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  274798 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 274766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 146
Target Start/End: Original strand, 641051 - 641083
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  641051 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 641083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 146
Target Start/End: Original strand, 826857 - 826889
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  826857 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 826889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 205 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 17285450 - 17285366
Alignment:
Q  205 aattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 288  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| |||  ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  17285450 aattcgtgctccaattatgatgatatgtttaaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 17285366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 23149846 - 23149790
Alignment:
Q  385 ttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  23149846 ttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgagtattcataattcatg 23149790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 172344 - 172016
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaa---ggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  172344 agagaagaacaagggttagagagaaaagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttt 172246  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  172245 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacg 172146  T
Q  211 tgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 310  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  172145 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 172046  T
Q  311 aaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  172045 aaaattgtgctaaattggtgaattttgcta 172016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 178047 - 177719
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaa---ggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  178047 agagaagaacaagggttagagagaaaagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttt 177949  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  177948 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacg 177849  T
Q  211 tgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 310  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  177848 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 177749  T
Q  311 aaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  177748 aaaattgtgctaaattggtgaattttgcta 177719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 323 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 60933 - 60815
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 422  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  60933 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgact 60834  T
Q  423 tgagtttgcatgattcatg 441  Q
    || ||||||||||||||||    
T  60833 tgggtttgcatgattcatg 60815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 70737 - 70860
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  70737 tgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcattggatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattca 70836  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    || |||| ||||||||||||||||    
T  70837 tgacttgggtttgcatgattcatg 70860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 164829 - 164903
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || | ||||||| | | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  164829 ttaggagctaaagtgaagcttaaatttgaattaatcataacctaaggtaagggggttagtgttcttcataatcat 164903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 73)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 40 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23153860 - 23153558
Alignment:
Q  40 gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatca 139  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  23153860 gagaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttacctaaggtaagggggttagtcttcatca 23153761  T
Q  140 taatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaa-ttttgc-ttatggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgta 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23153760 taatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtttctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgta 23153661  T
Q  238 tgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23153660 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttg 23153561  T
Q  338 cta 340  Q
    |||    
T  23153560 cta 23153558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 115 - 340
Target Start/End: Original strand, 14626045 - 14626270
Alignment:
Q  115 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcatgct 214  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||  |||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14626045 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtttgaattgtgattatggataattattgctaaattcgtgct 14626144  T
Q  215 ccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 314  Q
    |   |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14626145 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaa 14626244  T
Q  315 ttgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    |||||  |||||||||||||||||||    
T  14626245 ttgtgtgcaattggtgaattatgcta 14626270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 433
Target Start/End: Original strand, 35009253 - 35009684
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaa-cttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttat 112  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||  ||| ||||| ||||   || |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  35009253 agagaggaacaagggtt--agagaaggagaaacttgaagaatcaagaattggggtgaatctaagagctaaagtgaagccaaagtttggattaatcattat 35009350  T
Q  113 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattt--tgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgctt-----------atggataattgt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||  || || || |||  ||||| |||||| | | ||           ||||||||||||    
T  35009351 ctaaagtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaagaaatggataattgt 35009450  T
Q  200 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 299  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35009451 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 35009550  T
Q  300 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcat 399  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||| |||| ||   |||| ||||||||| | ||||||| ||  | ||    
T  35009551 gtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgat 35009650  T
Q  400 gttgttgatgataattcatggcttgagtttgcat 433  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||| || |||||    
T  35009651 gttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcat 35009684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 69 - 340
Target Start/End: Original strand, 1649976 - 1650245
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaa 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  |    
T  1649976 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-taattttgca--ttttctca 1650072  T
Q  169 tgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 267  Q
    ||||| |||||  | | || ||| | ||||  ||||| |||| |||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1650073 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgt 1650172  T
Q  268 tggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1650173 tggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgcta 1650245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 23148415 - 23148266
Alignment:
Q  34 gagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtct 133  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23148415 gagaaagagaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttacctaaggtaagggggttagtct 23148316  T
Q  134 ttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaatttt 183  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23148315 tcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 23148266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 188 - 340
Target Start/End: Original strand, 1657748 - 1657900
Alignment:
Q  188 atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1657748 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 1657847  T
Q  288 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  1657848 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgcta 1657900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15862875 - 15862582
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatt--ttgt 157  Q
    ||||| || |||||||||| | |||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||  |||     
T  15862875 attggggtaagcttaggaggtgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgc 15862776  T
Q  158 aaattttcaaatgttgcatgaattttgctt-----------atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaat 246  Q
    || || |||  ||||| |||||| | | ||           ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15862775 aatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 15862676  T
Q  247 tgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  15862675 tgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgcta 15862582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 60 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 29666267 - 29665944
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattt--tgt 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||  ||| ||  ||     
T  29666267 attggggtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttggattaatcattatctaacataagtgggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgc 29666168  T
Q  158 aaattttcaaatgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataat 256  Q
    || || |||  ||||| |||||  | |  | |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  29666167 aatttctcat-tgttgtatgaaaatggggtgatggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataat 29666069  T
Q  257 tgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaat 354  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||| | |||||  ||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||| ||||     
T  29666068 tgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgcataaatgtcaagttatg-aaattgtactcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaaa 29665970  T
Q  355 tgtgataagtttcatgatcaattgat 380  Q
    || |||| | |||||| |||||||||    
T  29665969 tgagatatgattcatgttcaattgat 29665944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27751850 - 27751603
Alignment:
Q  38 aggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttat 137  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27751850 aggagaacttgaagaatcaagaattggggtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttggattaatctttatctaaggtaagggggttagtcttcat 27751751  T
Q  138 cataatcatcatcatt--ttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgctt-----------atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtga 224  Q
    |||||||||  |||||  ||| || || |||  || || |||||| | | ||           |||||||| ||| ||||||||| ||||| || |||||    
T  27751750 cataatcatgttcatttattgcaatttctcatttg-tgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtga 27751652  T
Q  225 tgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtga 273  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27751651 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 31628400 - 31628277
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||| |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31628400 tgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattca 31628301  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  31628300 tggcttgggtttgcatgattcatg 31628277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23995327 - 23995247
Alignment:
Q  66 gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995327 gtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23995247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 318 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 18432775 - 18432656
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||| |||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18432775 tgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgatgttgttgatatgttatgttgttgatgataattca 18432676  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgatt 437  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  18432675 tggcttgggtttgcatgatt 18432656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 32898922 - 32898799
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |  ||||||||||||||||||||| |    
T  32898922 tgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgaagttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattaa 32898823  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  32898822 tggcttgggtttgcatgattcatg 32898799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 200 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25175815 - 25175681
Alignment:
Q  200 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 299  Q
    |||||||||| |||||   ||||| || ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25175815 tgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25175716  T
Q  300 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  25175715 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatt 25175681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 200 - 334
Target Start/End: Original strand, 27653983 - 27654117
Alignment:
Q  200 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 299  Q
    |||||||||| |||||   |||||||| |||  ||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27653983 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 27654082  T
Q  300 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  27654083 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatt 27654117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 22441066 - 22440944
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22441066 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttcatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattca 22440967  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| | ||||||||||||||    
T  22440966 tggcttg-ggttgcatgattcatg 22440944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 200 - 330
Target Start/End: Original strand, 16825752 - 16825884
Alignment:
Q  200 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaag--attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaa 297  Q
    |||||||||| |||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16825752 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 16825851  T
Q  298 atgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtg 330  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  16825852 atgataagttatgaagattgtgctaaattggtg 16825884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 16086149 - 16086026
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||| |||||||||||||| |   || |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16086149 tgcttaattggtgaattataccttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcatttgatgttgttgttgatatgtcatgttgttaatgataattca 16086050  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    || |||| ||||||||||||||||    
T  16086049 tgacttgggtttgcatgattcatg 16086026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 321 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18777275 - 18777156
Alignment:
Q  321 tcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatgg 420  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||| || || ||||| | |||| ||||||||||    
T  18777275 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatgaatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatgg 18777176  T
Q  421 cttgagtttgcatgattcat 440  Q
    |||| || ||||||||||||    
T  18777175 cttgggtatgcatgattcat 18777156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 323 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 18399065 - 18398947
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 422  Q
    ||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18399065 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggct 18398966  T
Q  423 tgagtttgcatgattcatg 441  Q
    || || ||||| |||||||    
T  18398965 tgggtgtgcataattcatg 18398947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 318 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18570411 - 18570289
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||| || || ||||| | |||| |||||||    
T  18570411 tgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagaagtagttgttgttaagtgatgttatggatgctaattca 18570312  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    |||| || || ||||||||||||    
T  18570311 tggcctgggtatgcatgattcat 18570289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 312 - 441
Target Start/End: Original strand, 35015274 - 35015403
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  35015274 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 35015373  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  35015374 gatacatggcttgggtttgcatgattcatg 35015403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 26089873 - 26089745
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| | |||| |    
T  26089873 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgct 26089774  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  26089773 aattcatggtttgggtatgcatgattcat 26089745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 321 - 438
Target Start/End: Original strand, 25744331 - 25744448
Alignment:
Q  321 tcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatgg 420  Q
    |||| |||||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25744331 tcaagtggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatgg 25744430  T
Q  421 cttgagtttgcatgattc 438  Q
    |||| |||||||| ||||    
T  25744431 cttgggtttgcataattc 25744448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 318 - 438
Target Start/End: Original strand, 13014824 - 13014943
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | | || || || ||||||||||||||||||||||     
T  13014824 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcaagatcaattgttgttgctgatgttaagtcatgttgttgatgataattcg 13014923  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattc 438  Q
    ||||||| | |||||||||||    
T  13014924 tggcttg-ggttgcatgattc 13014943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 144
Target Start/End: Original strand, 15742078 - 15742150
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742078 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 15742150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 23995061 - 23994933
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| |  ||| |    
T  23995061 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgct 23994962  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23994961 aattcatggcttgggtatgcatgattcat 23994933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 59 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 26090146 - 26090059
Alignment:
Q  59 gattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090146 gattggagtgaggttaggagctaaagtgaagcctaagtttagattgagcattacctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26090059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 32276617 - 32276691
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32276617 ttaggagctaaagtgaagcttaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 32276691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 16106648 - 16106547
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||| |||||||||||||| |   || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16106648 tgcttaattggtgaattataccttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcatttgatgttgttgttgatatgtcatgttgttaatgataattca 16106549  T
Q  418 tg 419  Q
    ||    
T  16106548 tg 16106547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Original strand, 18002613 - 18002741
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| || || | ||| | |||| |    
T  18002613 aaattatgctcaattgatgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgacgttatggatgct 18002712  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18002713 aattcatggcttgggtatgcatgattcat 18002741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 316 - 433
Target Start/End: Original strand, 28195205 - 28195324
Alignment:
Q  316 tgtgctcaattggt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataag-tttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataa 413  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |  |||| ||||||||||| || ||| ||||||||||| | | |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28195205 tgtgctcaattagttgaattatgccatgatgttgttgaattgtgatgagattttatgatcaattgttgtggttgttgctaagtgatgttgttgatgataa 28195304  T
Q  414 ttcatggcttgagtttgcat 433  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28195305 ttcatggcttgagtttgcat 28195324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 323 - 441
Target Start/End: Original strand, 25367357 - 25367475
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 422  Q
    ||||| |||||| || || || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||    
T  25367357 aattgttgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttatcgataattcatggct 25367456  T
Q  423 tgagtttgcatgattcatg 441  Q
    || || |||||||||||||    
T  25367457 tgggtgtgcatgattcatg 25367475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16232274 - 16232029
Alignment:
Q  71 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 170  Q
    |||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  |||    
T  16232274 cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 16232175  T
Q  171 ttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttg 269  Q
    ||| |||||  | | || ||| | |||||||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |    
T  16232174 ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgg 16232075  T
Q  270 gtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  16232074 gtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 16232029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 372 - 441
Target Start/End: Original strand, 18823565 - 18823634
Alignment:
Q  372 tcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18823565 tcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggcttgggtttgcatgattcatg 18823634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 372 - 441
Target Start/End: Original strand, 18839420 - 18839489
Alignment:
Q  372 tcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18839420 tcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggcttgggtttgcatgattcatg 18839489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1556398 - 1556142
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaa 159  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||   |||| |  ||||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||||||||  ||| ||| |      
T  1556398 attggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgtgttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgc 1556299  T
Q  160 attttcaaatgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattg 258  Q
    ||||||  |||||| |||||  | | || ||| | |||||||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |    
T  1556298 attttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgg 1556199  T
Q  259 taagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    || | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  1556198 tatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 1556142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 222 - 441
Target Start/End: Original strand, 18381701 - 18381921
Alignment:
Q  222 tgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 319  Q
    ||||||||| |||| || |||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||  |  ||||  || ||    
T  18381701 tgatgatatttttgaatacatgaagttgttgataattgaatggttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaa--ttatg 18381798  T
Q  320 ctcaa-ttggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcat 418  Q
    || || ||| |||||||||||  || |||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||| | |||||||||| || ||||||||| |||| ||||||    
T  18381799 cttaaattgttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcat 18381898  T
Q  419 ggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||| || | ||| |||||||    
T  18381899 ggcttgggtattcataattcatg 18381921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 134
Target Start/End: Original strand, 16299844 - 16299906
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctt 134  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16299844 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtctt 16299906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 18002353 - 18002427
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002353 ttaggagctaaagtgaaggctaagtttagattaatcataacctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 18002427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 312 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18583455 - 18583377
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttg 390  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  18583455 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttgttg 18583377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 441
Target Start/End: Original strand, 16887792 - 16888030
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 301  Q
    |||||| ||||| |||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||| | |||| || ||     
T  16887792 aaattcgtgctctaactatgataatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaactgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtgtgtataagtgc 16887891  T
Q  302 taagttgtgaaaattgtgctcaattgg-tgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatg 400  Q
    ||| |||||||  || ||||||||||| ||||||||| || || |||| |||||| |||| ||   |||| ||||||||| | |||||  |||||| |||    
T  16887892 taacttgtgaa--ttatgctcaattgggtgaattatgttatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgattttgttgtcactatgtgatg 16887989  T
Q  401 ttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    || ||| | || |||||||||||| || | ||| |||||||    
T  16887990 ttattgttaatgattcatggcttgggtatacataattcatg 16888030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 441
Target Start/End: Original strand, 22361783 - 22362003
Alignment:
Q  222 tgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga--taagttgtgaaaattg 317  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||| ||||||| |||||||||| ||||  ||| |||  |||||||    ||||     
T  22361783 tgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttgctgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgacataagttg----aatta 22361878  T
Q  318 tgctcaa-ttggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattc 416  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| || |||| ||||||||||| |  |||||| ||||||||| | |||||||||| || || |||||| |||| ||||    
T  22361879 tgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgaaattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattc 22361978  T
Q  417 atggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||||| || | ||| |||||||    
T  22361979 atggcttgggtgttcataattcatg 22362003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 93
Target Start/End: Original strand, 14128502 - 14128552
Alignment:
Q  42 gaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagccta 93  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14128502 gaacttgaagaactaaggattgg-gtgagcttaggagctaaattgaagccta 14128552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 318 - 440
Target Start/End: Original strand, 15742343 - 15742468
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat---tgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataat 414  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||   || | | ||||||| || || ||||| |  ||| ||||    
T  15742343 tgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaat 15742442  T
Q  415 tcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  15742443 tcatggcttgggtatgcatgattcat 15742468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 18823241 - 18823315
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18823241 ttaggagctaaagtgaagtttaagtttggattaatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18823315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 18839096 - 18839170
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18839096 ttagaagctaaagtgaagcttaagtttggattaatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18839170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 441
Target Start/End: Original strand, 35136013 - 35136250
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 301  Q
    |||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||| ||||| || |||||||||| | |||| || ||     
T  35136013 aaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgtt-gtgaatttgcatgttcaaagtgtgtataagtgc 35136111  T
Q  302 taagttgtgaaaattgtgctcaattgg-tgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatg 400  Q
    ||| |||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||  | || | |||||| |||| ||   |||| ||||||||| | ||| |||||| || |||    
T  35136112 taacttgtg--aattatgctcaattggatgaattatgctatattgtggttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttattgctaagtgatg 35136209  T
Q  401 ttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||    
T  35136210 ttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatg 35136250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 19983414 - 19983537
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||| |||||||| | | | | | | ||||||| |  ||||| ||||||||||| || ||    
T  19983414 tgctcaattagtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatggttagtggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgataca 19983513  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  19983514 tggcttgggtttgcatgattcatg 19983537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23978153 - 23977906
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaa 168  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  |    
T  23978153 agcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggcgttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctca 23978054  T
Q  169 tgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgt 267  Q
    ||||| |||||  | | || ||| | |||||| ||||||||| |||||    ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | ||||    
T  23978053 tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgt 23977954  T
Q  268 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  23977953 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 23977906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 427
Target Start/End: Original strand, 33538370 - 33538593
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 301  Q
    |||||| ||||| |||| || ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||    
T  33538370 aaattcgtgctctaactatggtgatatatttgaatgcatgaaattggtga-aattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtga 33538468  T
Q  302 taagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatg 400  Q
    || ||||||  |||| ||||| ||  | |||||| ||||| ||  ||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||| | ||| |||||| || ||     
T  33538469 tatgttgtg--aattatgctctaaaggttgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttattgctaagtgata 33538566  T
Q  401 ttgttgatgataattcatggcttgagt 427  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||    
T  33538567 ttgttgttgatgattcatggcttgagt 33538593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 146
Target Start/End: Original strand, 1657607 - 1657693
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||| |   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1657607 attggggtaagcttaggagctgaattgaaacaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 1657693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 399 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 18583384 - 18583342
Alignment:
Q  399 tgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18583384 tgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 18583342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19610411 - 19610325
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19610411 attggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 19610325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 269 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 27741021 - 27740909
Alignment:
Q  269 ggtgaaattacatgttc--aaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagttt 366  Q
    ||||||||||||||||   || |||||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | ||    
T  27741021 ggtgaaattacatgtttcgaagtatgtataaatgtcaagttatgaaa-ttgtgctcaattggtgaattttgctaagtcgttgttgaattgagatatgatt 27740923  T
Q  367 catgatcaattgat 380  Q
    |||| |||||||||    
T  27740922 catgttcaattgat 27740909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 313
Target Start/End: Original strand, 18086697 - 18086942
Alignment:
Q  71 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 170  Q
    |||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||   || ||| |  ||||||  |||    
T  18086697 cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattagtataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 18086796  T
Q  171 ttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttg 269  Q
    ||| |||||  | | || ||| | |||||||||||||||| |||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |    
T  18086797 ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgg 18086896  T
Q  270 gtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  18086897 gtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 18086942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 313
Target Start/End: Original strand, 13620669 - 13620913
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgt 171  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||    
T  13620669 ttaggagctaaagtgaagcctgagtttgaattgatcataacctaaggtaagggggttagtcttcttcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgt 13620768  T
Q  172 tgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttgg 270  Q
    || |||||  | | || ||| | |||||||||||||||| |||||    ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||    
T  13620769 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggg 13620868  T
Q  271 tgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  13620869 tgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 13620913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 29605696 - 29605467
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgat 302  Q
    |||||| ||||| || | || |||||| |||| |||||||||||  ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||     
T  29605696 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatgtgaaaatgaa 29605597  T
Q  303 aagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgt 401  Q
    |  |||||  |||||||||| || || |||||| ||||| || |||| |||||| ||||  |  ||||| | ||||||| | |||||||||| |  || |    
T  29605596 atattgtg--aattgtgctcaaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgtgaatcatgcttaattgatgttgttgttgctaagaaatat 29605499  T
Q  402 tgttgatgataattcatggcttgagtttgcat 433  Q
    ||||| |||| |||||||| ||| || |||||    
T  29605498 tgttgttgatgattcatggtttgggtgtgcat 29605467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 390
Target Start/End: Original strand, 17083216 - 17083384
Alignment:
Q  222 tgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||  |  ||  ||||||||    
T  17083216 tgatgatatgtttgaatgcatgaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaatgatatatgttg--aattgtgc 17083313  T
Q  321 tc-aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttg 390  Q
    || || || |||||| ||||| || |||| ||||||||||| || |||||| | ||||||| | |||||||    
T  17083314 tctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttg 17083384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 25651358 - 25651263
Alignment:
Q  329 tgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttg 424  Q
    |||||| ||||| || |||| |||||| |||| || |||||| ||||||||| | |||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||    
T  25651358 tgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttg 25651263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 203 - 420
Target Start/End: Original strand, 15079709 - 15079925
Alignment:
Q  203 taaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatg 300  Q
    ||||||| ||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| |   |||||| ||||||| |||||||||| | ||||  | ||    
T  15079709 taaattcgtgctctaactaggatgatatgtt-gtatgcatgaagttgaggataattgaattgttgttg-tgaaattgcatgttcaaagtgtgtatgagtg 15079806  T
Q  301 ataagttgtgaaaattgtgctcaattgg-tgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcat 399  Q
     ||| |||||||  || ||||||||||| ||||||||||||  | |||| |||||| |||| ||   |||| ||||||||||| ||| |||||| || ||    
T  15079807 ctaacttgtgaa--ttatgctcaattgggtgaattatgctatattgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatattgttattgctaagtgat 15079904  T
Q  400 gttgttgatgataattcatgg 420  Q
    ||||||| |||| ||||||||    
T  15079905 gttgttgttgatgattcatgg 15079925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 288
Target Start/End: Original strand, 18629608 - 18629693
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 288  Q
    |||||| ||||| || | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  18629608 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 18629693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 33324939 - 33324702
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 301  Q
    |||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |   |||||| |||| || |||||||||| | |||| || ||     
T  33324939 aaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttg-tgaatttgcatgttcaaagtgtgtataagtgc 33324841  T
Q  302 taagttgtgaaaattgtgctcaattgg-tgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatg 400  Q
    ||| || ||||  || ||||||||||| ||||||||||||  | || | |||||| |||| ||   |||| ||||||||| | ||| |||||| || |||    
T  33324840 taacttatgaa--ttatgctcaattggatgaattatgctatattgtggttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttattgctaagtgatg 33324743  T
Q  401 ttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||    
T  33324742 ttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatg 33324702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21623414 - 21623177
Alignment:
Q  205 aattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgat 302  Q
    ||||| |||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||| ||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||    
T  21623414 aattcgtgctccaattatgatggtatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttgctgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgat 21623315  T
Q  303 aagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgt 401  Q
    |  |  ||||  || ||||||| ||| |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||  ||||| || |||||| | |||||||||| || ||||    
T  21623314 atatgttgaa--ttatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagaatcatgttctattgatgttgttgttgctaagtgatgt 21623217  T
Q  402 tgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    || || | || | |||||||||| || | ||| |||||||    
T  21623216 tgatgttaatgagtcatggcttgggtattcataattcatg 21623177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 4991427 - 4991396
Alignment:
Q  115 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991427 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 4991396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 367 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 25919696 - 25919622
Alignment:
Q  367 catgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||    
T  25919696 catgttcaattgatgttgttgttgctatatgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatg 25919622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 145
Target Start/End: Original strand, 29869650 - 29869724
Alignment:
Q  71 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 145  Q
    |||||||||| |||||||||   |||| || || |||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29869650 cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttgatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatca 29869724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Original strand, 16556137 - 16556258
Alignment:
Q  194 aattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 291  Q
    |||||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||| | || | |||||||||||||| |||||| |||    
T  16556137 aattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 16556236  T
Q  292 gtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  16556237 gtataaatgttaagttatgaaa 16556258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Original strand, 16632693 - 16632814
Alignment:
Q  194 aattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 291  Q
    |||||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||| | || | |||||||||||||| |||||| |||    
T  16632693 aattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 16632792  T
Q  292 gtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  16632793 gtataaatgttaagttatgaaa 16632814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Original strand, 22225736 - 22225857
Alignment:
Q  194 aattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 291  Q
    |||||||| ||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | || | |||||||||||||| |||||| |||    
T  22225736 aattgttgttaaattcgtgctctttctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtat 22225835  T
Q  292 gtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  22225836 gtataaatgttaagttatgaaa 22225857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 18570720 - 18570649
Alignment:
Q  24 aagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggag-tgagcttaggagctaaattgaagcctaag 95  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18570720 aagggttagagagaagaggaacttgaagaatcaaggattggggttgagc-taggagcaaaattgaagcctaag 18570649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 146
Target Start/End: Original strand, 19983192 - 19983224
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19983192 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 19983224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 146
Target Start/End: Original strand, 35015057 - 35015089
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35015057 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 35015089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9317 - 8995
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaa---ggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9317 agagaagaacaagggttagagagaatagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttt 9219  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  9218 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtacgaattttgcttatggaaaattgttgctaaattcg 9119  T
Q  211 tgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 310  Q
    |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  9118 tgctccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtg 9019  T
Q  311 aaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  9018 aaaattgtgctcaattggtgaatt 8995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 49037 - 48709
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   ||||  ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||| | | ||    
T  49037 agagaagaacaagggttagagagaagagggagagattgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagtaaagcctaagtttagattgagcatt 48939  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattca 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48938 acctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcg 48839  T
Q  211 tgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  48838 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtg 48739  T
Q  311 aaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  48738 aaaattgtgctcagttggtgaattttgcta 48709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 36324 - 36211
Alignment:
Q  221 gtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  36324 gtgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 36225  T
Q  321 tcaattggtgaatt 334  Q
    | ||||||||||||    
T  36224 taaattggtgaatt 36211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 313
Target Start/End: Original strand, 153870 - 154126
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaa 159  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||   |||| |  ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |      
T  153870 attggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgagttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgc 153969  T
Q  160 attttcaaatgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattg 258  Q
    ||||||  |||||| |||||  | | || ||| | |||||||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |    
T  153970 attttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgg 154069  T
Q  259 taagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    || | |||| |||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  154070 tatgtttgtgggtgaagttacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 154126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 146
Target Start/End: Original strand, 61121 - 61154
Alignment:
Q  113 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  61121 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 61154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 36732 - 37065
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaat---tgaagcctaagttgggattaatc 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  36732 agagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaagaagtgaagcctaagttgggattaatc 36830  T
Q  108 tttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaatttt-gctta-tggataattgttgctaa 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| |||    
T  36831 tttatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaa 36930  T
Q  206 attcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataag 305  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36931 attcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataag 37030  T
Q  306 ttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  37031 ttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattttgcta 37065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 318 - 440
Target Start/End: Original strand, 15586 - 15711
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataat 414  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||| | |   |||||||| | |||| ||||    
T  15586 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttatagatgctaat 15685  T
Q  415 tcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  15686 tcatggcttgggtatgcatgattcat 15711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 334
Target Start/End: Original strand, 127993 - 128315
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||   |||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  127993 agagaagaacaacagttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagattaggagataaaatgaagcctaagttgggattaatcttt 128091  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  128092 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcg 128191  T
Q  211 tgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 310  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||    
T  128192 tgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtg 128291  T
Q  311 aaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  128292 aaaattgtgctcaattggcgaatt 128315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 22823 - 22700
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22823 tgctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttttgtcatgttgttgatgataattca 22724  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  22723 tggcttgggtttgcatgattcatg 22700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 334
Target Start/End: Original strand, 31696 - 31809
Alignment:
Q  221 gtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||    
T  31696 gtgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 31795  T
Q  321 tcaattggtgaatt 334  Q
    ||||||||||||||    
T  31796 tcaattggtgaatt 31809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 122990 - 123316
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    ||||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  122990 agagaagaaaaagggtt---gagaagaagaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttacc 123086  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgcatgaatttt-gctta-tggataattgttgctaaattca 210  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  123087 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcataatttttgtaaatttgcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 123186  T
Q  211 tgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 310  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  123187 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 123286  T
Q  311 aaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  123287 aaaattgtgctcaattggtgaattttgcta 123316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 254929 - 255052
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  254929 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattca 255028  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  255029 tggcttgagtttgcatgattcatg 255052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 261535 - 261658
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  261535 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattca 261634  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  261635 tggcttgagtttgcatgattcatg 261658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 247268 - 247594
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattg--gagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttta 111  Q
    ||||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||  |||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  247268 agagaagaaaaagggtt---gaggaggagaacttgaagaatcaagggttgaggag-gagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttta 247363  T
Q  112 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaa-ttttgc-ttatggataattgttgctaaattc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  247364 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattc 247463  T
Q  210 atgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgt 309  Q
     |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  247464 gtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgt 247563  T
Q  310 gaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  247564 gaaaattgtgctcaattggtaaattttgcta 247594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 253104 - 253227
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||| |||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  253104 tgctcaattggtgaatcatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtttttgttaagtcatgttgttgatgataattca 253203  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
     |||||| ||||||||||||||||    
T  253204 aggcttgggtttgcatgattcatg 253227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 312
Target Start/End: Original strand, 34021 - 34276
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaa 159  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||   |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| |      
T  34021 attggcgtaagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaatttttgc 34120  T
Q  160 attttc-aaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattg 258  Q
    ||||||  | ||||| ||||| |  | | ||| | |||||||||||||||| |||||   |||||| | ||| ||  | |||||||||||||||| || |    
T  34121 attttctcattgttgtatgaaatgggttgatgaaaaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttgtgcatgaattgatgattatgg 34220  T
Q  259 taagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaa 312  Q
    || | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  34221 tatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 34276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12553 - 12230
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  12553 agagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaatcaaaaattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttaggattaatctct 12454  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaa-ttttgcttatggataattgttgctaaattc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12453 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttaattttgtaacttt-caaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattc 12355  T
Q  210 atgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgt 309  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  12354 gtgctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgt 12255  T
Q  310 gaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  12254 gaaaattgtgctaaattggtgaatt 12230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 6)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 147040 - 146611
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  147040 agagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 146942  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  146941 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttcctaaattca 146842  T
Q  211 tgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatg-ataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttg 308  Q
    ||||  || | |||||| || |||  ||| ||||| | ||| ||||||| |   ||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||  | || ||      
T  146841 tgctttaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgtataattgaactgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatgggtatgtgt 146742  T
Q  309 tgaaaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgat 408  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| |  ||    
T  146741 tgaaaa-tatgctcaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgcat 146643  T
Q  409 gataattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  146642 gttaattcatggcttgggtatgcatgattcat 146611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 33 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 9274 - 8920
Alignment:
Q  33 agagaaggagaa-cttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagt 131  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| | |||||||||||| | ||||||    
T  9274 agagaaggagaaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagtgtgttagt 9175  T
Q  132 ctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgctta--tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgat 225  Q
    ||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| | ||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  9174 cttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgtatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccatctgtgat 9075  T
Q  226 gatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaat 325  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9074 gatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaat 8975  T
Q  326 tggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgat 380  Q
    ||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | || ||| |||||||||    
T  8974 tggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgat 8920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 162 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 149012 - 148832
Alignment:
Q  162 tttcaaatgttgcatgaatttt-gctta-tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgt 259  Q
    |||||||||||| ||||||||| || || | ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  149012 tttcaaatgttgtatgaatttttgcataattgataattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 148913  T
Q  260 aagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  148912 aagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgcta 148832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 149091 - 149014
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaa 88  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  149091 agagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaactaaagattggagtgagcttaggagctaaagtgaa 149014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 53465 - 53372
Alignment:
Q  331 aattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttg 424  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| | |||||||||| || |  |||||| | || ||||||||||||    
T  53465 aattatgctattttgttgatgaattgtgatgagattcatgttcaatggatgttgttgttgctaagtgacattgttgttaatgattcatggcttg 53372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 205 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 53592 - 53508
Alignment:
Q  205 aattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatga-attgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 288  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  53592 aattcatgctctaataatgatgatatgtttgaatgcatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 53508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 272464 - 272136
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||| ||| |||||  ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  272464 agagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttaaagaatcaag-attggagtgagctcaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttt 272366  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||| | ||||||||| |     
T  272365 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatattgtataaattttgattatggataaatattgctaaatacg 272266  T
Q  211 tgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 310  Q
    | |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  272265 tactccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 272166  T
Q  311 aaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  272165 aaaattgtgctaaattggtgaattttgcta 272136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 69578 - 69483
Alignment:
Q  329 tgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttg 424  Q
    |||||| ||||| || |||| ||||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||    
T  69578 tgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttg 69483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 64 - 340
Target Start/End: Original strand, 5940 - 6216
Alignment:
Q  64 gagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattt 163  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||     
T  5940 gagtaagcttaggagctgaattgaagcaagagttaggattaatctctatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcattttcactttgcaaattc 6039  T
Q  164 tcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaaga 263  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6040 tcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatga 6139  T
Q  264 ttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  6140 ttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaaattgtgctgaattggtgaattttgcta 6216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 60 - 340
Target Start/End: Original strand, 828 - 1108
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaa 159  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||| |   ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||    
T  828 attggggtaagcttaggagctgaattgaatcaagagttggggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttacaa 927  T
Q  160 attttcaaatgttgcatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgt 259  Q
    ||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  928 attctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 1027  T
Q  260 aagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1028 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgcta 1108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 15326 - 15238
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaa 105  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326 agagaagaacaaaggttagagagaag---aacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaa 15238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15087 - 14959
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| | |||| |    
T  15087 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgct 14988  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  14987 aattcatggcttgggtatgcatgattcat 14959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 117 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19543 - 19301
Alignment:
Q  117 ggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgcatgaatttt-gctta-tggataattgttgctaaattcatgc 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||    
T  19543 ggtaagggggttagtcttcatcataatcatcataatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgc 19444  T
Q  214 tccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19443 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 19344  T
Q  314 attgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattg 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  19343 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattg 19301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 188 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21553 - 21385
Alignment:
Q  188 atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21553 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 21454  T
Q  288 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattg 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  21453 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattg 21385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 633 - 756
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  633 tgctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttactaagtcatgttgttgatgataattca 732  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||    
T  733 tggcttgggttggcatgattcatg 756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 124 - 334
Target Start/End: Original strand, 4996 - 5207
Alignment:
Q  124 gggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgctta-tggataattgttgctaaattcatgctccaactgt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4996 gggttagtctttatcataatcattatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatggataattgttgctaaattcgtactccaactgt 5095  T
Q  223 gatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 322  Q
    || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5096 gacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 5195  T
Q  323 aattggtgaatt 334  Q
    ||||||||||||    
T  5196 aattggtgaatt 5207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 13955 - 13524
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaa-cttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttat 112  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||   ||| || |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13955 agagaggaacaagggtt--agagaagcagaaacttgaagaattaagaattggggtgaatctagaagataaagtgaagcctaagtttggattaatcattat 13858  T
Q  113 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattt--tgtaaattttcaaatgttgcatgaattttgctt-----------atggataattgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||  || || || |||  ||||| |||||| | | ||           ||||||||||||    
T  13857 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgtttatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgt 13758  T
Q  200 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 299  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13757 tgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 13658  T
Q  300 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcat 399  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||| |||||| |||| ||   |||| ||||||||| | ||||||| ||  | ||    
T  13657 gtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgat 13558  T
Q  400 gttgttgatgataattcatggcttgagtttgcat 433  Q
    ||||||| |||| | ||||| |||| || |||||    
T  13557 gttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcat 13524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 42039 - 41666
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattt-tgtaaattttcaaatg 170  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| | | |||||   | ||    
T  42039 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttatttcaatttctcattg 41940  T
Q  171 ttgcatgaattttgctt-----------atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgt 259  Q
    ||| |||||| | | ||           |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41939 ttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 41840  T
Q  260 aagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtga 359  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||| |||    
T  41839 atgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatga 41740  T
Q  360 taagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcat 433  Q
    | ||   |||| ||||||||| | ||||||| ||  | ||||||||| |||| | |||| ||||| || |||||    
T  41739 tgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcat 41666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 191 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 48447 - 48304
Alignment:
Q  191 gataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaata 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  48447 gataattgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatg 48348  T
Q  291 tgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48347 tgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 48304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 48578 - 48504
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| ||||||| || || | ||||||| | | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  48578 ttaggagctaaagtgaagcccaaatttgaattaatcataacctaatgtaagggggttagtcttcttcataatcat 48504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 188 - 340
Target Start/End: Original strand, 534 - 686
Alignment:
Q  188 atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  534 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 633  T
Q  288 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    ||| | | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  634 ataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattttgcta 686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 5)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 108004 - 107864
Alignment:
Q  194 aattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 293  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  108004 aattgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgc 107905  T
Q  294 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  107904 aaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaatt 107864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 245 - 334
Target Start/End: Original strand, 64573 - 64662
Alignment:
Q  245 attgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  64573 attgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatt 64662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 254
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89915
Alignment:
Q  203 taaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatg-aattgatgata 254  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgata 89915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 146
Target Start/End: Original strand, 64395 - 64470
Alignment:
Q  71 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  64395 cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcat 64470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 144
Target Start/End: Original strand, 89669 - 89790
Alignment:
Q  24 aagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattgga-gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtt---gggattaatctttatctaaggt 119  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||| |   | ||||||||  || |||||||    
T  89669 aagggttagagagaagtggaacttgaagaatcaaggattgaaagagagct-aggagctaaattgaagcctaagctagggagattaatc--taactaaggt 89765  T
Q  120 aagggggttagtctttatcataatc 144  Q
    |||||||||||  || |||||||||    
T  89766 aagggggttagaattcatcataatc 89790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 192 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5788 - 5646
Alignment:
Q  192 ataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatat 291  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5788 ataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatat 5689  T
Q  292 gtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  5688 gtaaaaatgataagtcatgaatattgtgctcaattggtgaatt 5646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 5923 - 5846
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5923 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 5846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Original strand, 781 - 910
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  781 agagaagaacaagggttagagagaag---aacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatc 877  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  878 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Original strand, 1095 - 1223
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| |  ||| |    
T  1095 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgct 1194  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1195 aattcatggcttgggtatgcatgattcat 1223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Original strand, 9785 - 9914
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9785 agagaagaacaagggttagagagaag---aacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatc 9881  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 323 - 440
Target Start/End: Original strand, 10094 - 10211
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 422  Q
    |||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| | |||| ||||||||||||    
T  10094 aattggcgaattatgcttggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggct 10193  T
Q  423 tgagtttgcatgattcat 440  Q
    || || ||||||||||||    
T  10194 tgggtatgcatgattcat 10211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 188 - 370
Target Start/End: Original strand, 34460 - 34642
Alignment:
Q  188 atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 287  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34460 atggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 34559  T
Q  288 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatg 370  Q
     | |||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | ||||||    
T  34560 ttgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatg 34642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 318 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 5073 - 4967
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||| ||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5073 tgcttaattggtgaattatgatttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattca 4974  T
Q  418 tggcttg 424  Q
    |||||||    
T  4973 tggcttg 4967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 219 - 340
Target Start/End: Original strand, 9368 - 9489
Alignment:
Q  219 ctgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 318  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9368 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggt 9467  T
Q  319 gctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  9468 gctcaattggtgaattttgcta 9489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 219 - 340
Target Start/End: Original strand, 16266 - 16387
Alignment:
Q  219 ctgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 318  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16266 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggt 16365  T
Q  319 gctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  16366 gctcaattggtgaattttgcta 16387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 9223 - 9297
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  9223 ttaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggttagttattatcacaatcat 9297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 16121 - 16195
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  16121 ttaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggttagttattatcacaatcat 16195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 101; Significance: 8e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 194 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 3220 - 3044
Alignment:
Q  194 aattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 293  Q
    |||| ||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3220 aattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgt 3121  T
Q  294 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatg 370  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | ||||||    
T  3120 aaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatg 3044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 101; Significance: 8e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 220 - 340
Target Start/End: Original strand, 13345 - 13465
Alignment:
Q  220 tgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 319  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13345 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtg 13444  T
Q  320 ctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  13445 ctcaattggtgaattttgcta 13465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 318 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 153 - 31
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  153 tgctcaattcgtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatcttgttgatgataattca 54  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  53 tggcttgggtttgcatgtttcat 31  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 444 - 339
Alignment:
Q  40 gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatca 139  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  444 gagaacttgaagaatcaagaattggggtggtcttaggagctaaattgaagcctaagtttggattaatccttatctaaggtaagggggttagtcttcatca 345  T
Q  140 taatca 145  Q
    ||||||    
T  344 taatca 339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 384 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 3585 - 3529
Alignment:
Q  384 gttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3585 gttgttgctatgtcatcttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgtttcat 3529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Original strand, 1451 - 1714
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatt--ttgtaaattttca 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| || ||||||    
T  1451 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttca 1550  T
Q  167 aatgttgcatgaattttgctta----------tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataat 256  Q
        ||| ||||| |  | | |          ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  1551 tgatttggatgaaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataat 1650  T
Q  257 tgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1651 tgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 1714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Original strand, 17207 - 17336
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  17207 agagaagaacaagggttagagagaag---aacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctccatc 17303  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17304 taaggtaagcgggttagtctttatcataatcat 17336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Original strand, 17521 - 17649
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| | |||| |    
T  17521 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgct 17620  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17621 aattcatggcttgggtatgcatgattcat 17649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22934 - 22671
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatt--ttgtaaattttca 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| || ||||||    
T  22934 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttca 22835  T
Q  167 aatgttgcatgaattttgctta----------tggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataat 256  Q
        ||| ||||| |  | | |          || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22834 tgatttggatgaaatgggttgaaatgaatgaatgaataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataat 22735  T
Q  257 tgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22734 tgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 22671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 188 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 27058 - 26926
Alignment:
Q  188 atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |    
T  27058 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 26959  T
Q  288 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26958 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 26926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 69 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 27189 - 27112
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27189 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 27112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 276 - 153
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  276 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattca 177  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  176 tggcttgggtttgcatgattcatg 153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 691 - 814
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  691 tgctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattca 790  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||    
T  791 tggcttgggttggcatgattcatg 814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21644 - 21521
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21644 tgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattatttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattca 21545  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  21544 tggcttgggtttgcatgattcatg 21521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 31343 - 31220
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31343 tgctcaattggtaaattatactatgttgttgatgaattgtgataagtttcattatcaattgatgtttttgttgctaagtcatgttgttgatgataattca 31244  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  31243 tggcttgggtttgcatgattcatg 31220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 132365 - 132488
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  132365 tgctcaattggtgaattatgcatcgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattca 132464  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  132465 tggcttgggtttgcatgattcatg 132488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 11820 - 11696
Alignment:
Q  318 tgctcaattggt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattc 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  11820 tgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtagaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgacgttgttgatgataattc 11721  T
Q  417 atggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||||  | |||||||||||||    
T  11720 atggcttggttatgcatgattcatg 11696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 321 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 88404 - 88289
Alignment:
Q  321 tcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatgg 420  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||| || || ||||| | |||| |||||| |||    
T  88404 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgctgttgttaagtgatgttatggatgctaattcttgg 88305  T
Q  421 cttgagtttgcatgat 436  Q
    |||| || ||||||||    
T  88304 cttgggtatgcatgat 88289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 12132 - 12009
Alignment:
Q  24 aagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggag-tgagcttaggagctaaattgaagcctaagtt---gggattaatctttatctaaggt 119  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||| |   | ||||||||  || |||||||    
T  12132 aagggttagagagaagaggaacttgaagaatcaaggattggagaagagc-taggagttaaattgaagcctaagctagggagattaatc--taactaaggt 12036  T
Q  120 aagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||| ||||||  || |||||||||||    
T  12035 aaggtggttagaattcatcataatcat 12009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 85464 - 85341
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  85464 tgcttaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattca 85365  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||    
T  85364 tggtttgggtttgcatgattcatg 85341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 159438 - 159311
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatga 410  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |   || |||||||||    
T  159438 aaattatgctcaattggttgaattatgctatgttgatgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaag---tgatgttgatga 159342  T
Q  411 taattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||  ||||||| || |||||||||||||    
T  159341 taatttttggcttgggtatgcatgattcatg 159311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 159742 - 159619
Alignment:
Q  24 aagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattgg-agtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtt---gggattaatctttatctaaggt 119  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| || |||||| ||||| ||||||||||||||| |   | ||||||||  || |||||||    
T  159742 aagggttagagagaaggggaacttgaagaatcaaggagtggaagagagctt-ggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatc--taactaaggt 159646  T
Q  120 aagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||  || |||||||||||    
T  159645 aagggggttagaattcatcataatcat 159619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 323 - 441
Target Start/End: Original strand, 109582 - 109700
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 422  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  109582 aattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggct 109681  T
Q  423 tgagtttgcatgattcatg 441  Q
    || | ||||||||||||||    
T  109682 tgggattgcatgattcatg 109700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 321 - 441
Target Start/End: Original strand, 118081 - 118201
Alignment:
Q  321 tcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatgg 420  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  118081 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatgg 118180  T
Q  421 cttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||| | ||||||||||||||    
T  118181 cttggggttgcatgattcatg 118201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 56033 - 55904
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatc 113  Q
    ||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  56033 agagaagaaaaagggtt---gagaaggaaaacttgaagaatcaagaattggagagagcttaggagctaaattgaagcctaaattgggattaatctttatc 55937  T
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55936 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 55904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 146
Target Start/End: Original strand, 108021 - 108107
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108021 attggggtaagcttaggagctgaattgaagcctaagttggaattaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 108107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 55719 - 55591
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| | |||| |    
T  55719 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgct 55620  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  55619 aattcatggcttgggtatgcatgattcat 55591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 441
Target Start/End: Original strand, 104623 - 104860
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgca-tgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 301  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |   ||||||||||| || || ||||||| |||||| |||||     
T  104623 aaattcatgctctaactatgatgatatgtttgtatgcattaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcaggttcaaagtatgtataaatgc 104722  T
Q  302 taagttgtgaaaattgtgctcaattgg-tgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatg 400  Q
    ||| || ||  |||| ||||||| ||| ||||||||| || || |||| |||||| |||| |    |||| | ||||||| | |||||||||| || ||     
T  104723 taacttatg--aattatgctcaaatggttgaattatgttatgttgttgttgaattatgatgataaccatg-ttaattgatgttgttgttgctaagtgata 104819  T
Q  401 ttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||    
T  104820 ttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatg 104860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Original strand, 193295 - 193429
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  193295 agagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaattaag-attggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttc 193393  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193394 atttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 193429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Original strand, 186643 - 186770
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| | |||| |    
T  186643 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatta-ttgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgct 186741  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  186742 aattcatggcttgggtatgcatgattcat 186770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Original strand, 193605 - 193732
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| | |||| |    
T  193605 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatta-ttgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgct 193703  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  193704 aattcatggcttgggtatgcatgattcat 193732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 188 - 320
Target Start/End: Original strand, 37066 - 37198
Alignment:
Q  188 atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |    
T  37066 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37165  T
Q  288 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 320  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  37166 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 37198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 69 - 146
Target Start/End: Original strand, 36935 - 37012
Alignment:
Q  69 agcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36935 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 41447 - 41319
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  41447 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 41348  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
     || ||||||||  |||||||||||||||    
T  41347 gatacatggcttaggtttgcatgattcat 41319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 11823 - 11946
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11823 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattca 11922  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  11923 tggcttgagtttgcatggttcatg 11946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 10069 - 9946
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  10069 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgattattca 9970  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  9969 tggcttgggtttgcatgattcatg 9946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 238 - 339
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5355
Alignment:
Q  238 tgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattttg 5353  T
Q  338 ct 339  Q
    ||    
T  5354 ct 5355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 112660 - 112780
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| || ||||||||||   ||||||||||    
T  112660 tgctcaattagtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatttatgttgttgttgttaagtcatgttgt---tgataattca 112756  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  112757 tggcttgggtttgcatgattcatg 112780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 323 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 109717 - 109599
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 422  Q
    ||||| |||||| ||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  109717 aattgttgaattttgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggct 109618  T
Q  423 tgagtttgcatgattcatg 441  Q
    || || |||| ||||||||    
T  109617 tgggtatgcacgattcatg 109599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 329 - 441
Target Start/End: Original strand, 103048 - 103160
Alignment:
Q  329 tgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtt 428  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| |  ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  103048 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataacattcatgttcaattgatgttattgtttctaagtgatgttgttgatgataattcatggtttgggtg 103147  T
Q  429 tgcatgattcatg 441  Q
    ||||| |||||||    
T  103148 tgcataattcatg 103160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Original strand, 6343 - 6475
Alignment:
Q  16 agaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttat 112  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||   |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  6343 agaagaacaagagttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattattccttat 6441  T
Q  113 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6442 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 6475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Original strand, 6660 - 6788
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| | |||| |    
T  6660 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttgatgatcaatagatcttgttgttgttaagtgatgttatggatgct 6759  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  6760 aattcatggcttgggtatgcatgattcat 6788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 1449 - 1326
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||| |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1449 tgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattca 1350  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  1349 tggcttgggtttgcatgattcatg 1326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 318 - 424
Target Start/End: Original strand, 11769 - 11872
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   | ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  11769 tgctcaattagtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattg---ttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattca 11865  T
Q  418 tggcttg 424  Q
    |||||||    
T  11866 tggcttg 11872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 9119 - 8996
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9119 tgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcaagatcacttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattca 9020  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| |||||| |||||||||    
T  9019 tggcttgggtttgcttgattcatg 8996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 219 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 153
Alignment:
Q  219 ctgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 318  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  268 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatattgt 169  T
Q  319 gctcaattggtgaatt 334  Q
    ||||||||||||||||    
T  168 gctcaattggtgaatt 153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 345 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 30196 - 30100
Alignment:
Q  345 gttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30196 gttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 30100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 424 - 338
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||   |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  424 attggggtaagcttaggagctgaattgaagcgagagtttggattaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcaaaatcat 338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 200 - 334
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1438
Alignment:
Q  200 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 299  Q
    |||||||||| |||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1304 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 1403  T
Q  300 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  1404 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatt 1438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Original strand, 12316 - 12450
Alignment:
Q  14 agagaagaacaagggtttgagagaag---gagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  12316 agagaagaacaagggttagagagaagagggagagcttgaagaatcaag-attggattgagcttaggagctaaattgaagtctaagttgggatgaatcttt 12414  T
Q  111 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12415 atctaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Original strand, 12637 - 12765
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | | | ||||||| |  ||||| | |||||||||    
T  12637 aaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgat 12736  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  12737 aattcatggcttgggtatgcatgattcat 12765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 440
Target Start/End: Original strand, 19051 - 19146
Alignment:
Q  345 gttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | | | ||||||| |  ||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  19051 gttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcat 19146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 345 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 3404 - 3308
Alignment:
Q  345 gttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3404 gttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 3308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 1513 - 1390
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1513 tgctcaattgttgaattatgttatgtgattgatgaattgtgataagtttcatgatcaataaatgttgctgttgctatgtcatgttgttgatgataaatca 1414  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  1413 tggcttgggtttgcatgattcatg 1390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 937 - 1060
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||   ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  937 tgctcaattggtgaattatgcattgttattgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattca 1036  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  1037 tggcttgggtttgcatgattcatg 1060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 318 - 438
Target Start/End: Original strand, 6960 - 7083
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataat 414  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| | |   ||||||||||||||||||||    
T  6960 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataat 7059  T
Q  415 tcatggcttgagtttgcatgattc 438  Q
    |||||||||| |||||||| ||||    
T  7060 tcatggcttgggtttgcataattc 7083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 5361 - 5484
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5361 tgctcaattggtgaattaggcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattca 5460  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||    
T  5461 tggtttgggtttgcatgattcatg 5484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 8996 - 9120
Alignment:
Q  318 tgctcaattggt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattc 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8996 tgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattc 9095  T
Q  417 atggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||||  || |||||||||||||    
T  9096 atggcttaggtatgcatgattcatg 9120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 219 - 334
Target Start/End: Original strand, 14080 - 14195
Alignment:
Q  219 ctgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 318  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  14080 ctgtgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgt 14179  T
Q  319 gctcaattggtgaatt 334  Q
    ||||||||||||||||    
T  14180 gctcaattggtgaatt 14195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Original strand, 21110 - 21250
Alignment:
Q  194 aattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 293  Q
    |||| ||||||||||| |||||    ||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21110 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgt 21209  T
Q  294 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  21210 aaaaatgataagttatgaagattgagctcaattggtgaatt 21250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 223 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 43226 - 43115
Alignment:
Q  223 gatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 322  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||     
T  43226 gatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgcta 43127  T
Q  323 aattggtgaatt 334  Q
    ||||||||||||    
T  43126 aattggtgaatt 43115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4115 - 3833
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaa 159  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||   |||| || |||||| |  |||||||||||||| |||||  |||||||||||||   || ||| |      
T  4115 attggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttctaaggtaaggggtttagttattatcataatcatgtacaatttttgc 4016  T
Q  160 attttcaaatgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattg 258  Q
    ||||||  |||||| |||||  | | || ||| | |||| ||||||||||| |||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  4015 attttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattg 3916  T
Q  259 taagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgta-aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  3915 tatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaattttgcta 3833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Original strand, 13237 - 13317
Alignment:
Q  66 gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13237 gtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 13317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Original strand, 13503 - 13631
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| | |||| |    
T  13503 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgct 13602  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13603 aattcatggcttgggtatgcatgattcat 13631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Original strand, 21477 - 21605
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| |  ||| |    
T  21477 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgct 21576  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21577 aattcatggcttgggtatgcatgattcat 21605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 318 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 7701 - 7581
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  7701 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattca 7602  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattc 438  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  7601 tggcttgggtttgcatgattc 7581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 313
Target Start/End: Original strand, 10202 - 10458
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaa 159  Q
    ||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||| ||| |      
T  10202 attggggtaagcttatgagctaaagtgaagcctaagttggggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcttcataatcatgttcaatttttgc 10301  T
Q  160 attttcaaatgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattg 258  Q
    ||||||  |||||| |||||  | | || ||| |||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| ||  | |||||||||||||||| || |    
T  10302 attttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatgg 10401  T
Q  259 taagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    || | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  10402 tatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgctaagttatgaaa 10458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 45416 - 45147
Alignment:
Q  68 gagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatca--ttttgtaaattttc 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||  | ||| || || ||    
T  45416 gagcttaggagcttaattgaagcctaagtttggattaaccattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctc 45317  T
Q  166 aaatgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagat 264  Q
     | ||||| |||||  | | || ||| |||||||||| ||||||| ||| |    ||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  45316 -attgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtgcccttgttgtgatgctattttgatgtgcatgaattgatgataattgtatgat 45218  T
Q  265 tgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||  ||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  45217 tgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttttg-aaattgtactcaattggtgaatt 45147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 54802 - 54533
Alignment:
Q  68 gagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatca--ttttgtaaattttc 165  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||  | ||| || || ||    
T  54802 gagcttaggagcttaattgaagcttaagtttggattaaccattatctaaggtaaggtggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctc 54703  T
Q  166 aaatgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagat 264  Q
     | ||||| |||||  | | || ||| |||||||||| ||||||| ||  |   |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  54702 -attgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtgtccttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgat 54604  T
Q  265 tgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    ||| ||||||||| |||| |||||| |||||| |||||  ||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  54603 tgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatg-aaattgtactcaattggtgaatt 54533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Original strand, 57344 - 57424
Alignment:
Q  66 gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57344 gtgagcttagtagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 441
Target Start/End: Original strand, 70307 - 70544
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 301  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |  |||||| ||||| || |||||||||| | ||||  | ||     
T  70307 aaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattcaattattgtt-gtgaatttgcatgttcaaagtgtgtatgagtgc 70405  T
Q  302 taagttgtgaaaattgtgctcaatt-ggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatg 400  Q
    ||| |||||  |||| ||||||||| ||||||||||| ||  | |||| |||||| |||| ||   |||| ||||||||| | ||| |||||| || |||    
T  70406 taacttgtg--aattatgctcaattgggtgaattatgttatattgttgttgaattatgatgaggaccatgttcaattgatgttgttattgctaagtgatg 70503  T
Q  401 ttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||| |||| |||| ||||||| || | ||| |||||||    
T  70504 ttgttgttgatgattcttggcttgggtattcataattcatg 70544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 229 - 352
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||| |||| |||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  229 tgcttaattcgtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttaatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattca 328  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    | ||||| ||||||||||||||||    
T  329 tagcttgggtttgcatgattcatg 352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 407
Target Start/End: Original strand, 6523 - 6612
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttga 407  Q
    |||| |||| |||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||| |||||| |||||||||    
T  6523 tgcttaattcgtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttaatgatcaattgatgttgttattgatatgtcttgttgttga 6612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Original strand, 11683 - 11806
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||| |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11683 tgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatcagtttcatgatcaatttatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattca 11782  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    || |||| |||||||| |||||||    
T  11783 tgacttgggtttgcataattcatg 11806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 25090 - 24968
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  25090 tgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgatatggcatgttgttgatgataattca 24991  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| | ||||||||||||||    
T  24990 tggcttg-ggttgcatgattcatg 24968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 25343 - 25221
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  25343 tgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgatatggcatgttgttgatgataattca 25244  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| | ||||||||||||||    
T  25243 tggcttg-ggttgcatgattcatg 25221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 25638 - 25532
Alignment:
Q  38 aggagaacttgaagaactaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttat 137  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25638 aggagaacttgaagaatcaagaattag-gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttgggttaatccttatctaaggtaagggggttagtcttcat 25540  T
Q  138 cataatca 145  Q
    ||||||||    
T  25539 cataatca 25532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 38430 - 38307
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||| |||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  38430 tgctcaattggcgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgacgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattca 38331  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |  |||| ||||||||||||||||    
T  38330 taacttgggtttgcatgattcatg 38307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 2048 - 1925
Alignment:
Q  318 tgctcaattggt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattc 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2048 tgctcaattggttgaattatgctatgtg-ttgttgatttgttataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgatgatgataattc 1950  T
Q  417 atggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
     |||||||||| |||||||||||||    
T  1949 ttggcttgagtatgcatgattcatg 1925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 329 - 437
Target Start/End: Original strand, 33854 - 33962
Alignment:
Q  329 tgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtt 428  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  33854 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataattcatggcttgggta 33953  T
Q  429 tgcatgatt 437  Q
    |||||||||    
T  33954 tgcatgatt 33962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 318 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 32335 - 32220
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  32335 tgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattca 32236  T
Q  418 tggcttgagtttgcat 433  Q
    ||||||| ||||||||    
T  32235 tggcttgggtttgcat 32220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 318 - 433
Target Start/End: Original strand, 41968 - 42083
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  41968 tgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattca 42067  T
Q  418 tggcttgagtttgcat 433  Q
    ||||||| ||||||||    
T  42068 tggcttgggtttgcat 42083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 48279 - 48157
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  48279 tgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttattattgttgttaagccatgttgttgatgataattca 48180  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| | |||||| |||||||    
T  48179 tggcttg-ggttgcataattcatg 48157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 61727 - 61605
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  61727 tgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttattattgttgttaagccatgttgttgatgataattca 61628  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| | |||||| |||||||    
T  61627 tggcttg-ggttgcataattcatg 61605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 318 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 15006 - 14889
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  15006 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattg---ttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattca 14910  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattc 438  Q
    ||||||| |||||||| ||||    
T  14909 tggcttgggtttgcataattc 14889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 395 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14272 - 14229
Alignment:
Q  395 gtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattc 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14272 gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattc 14229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 318 - 440
Target Start/End: Original strand, 24843 - 24965
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| | |||| ||||||     
T  24843 tgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattct 24942  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||| || | ||||||||||    
T  24943 tggcttgggtattcatgattcat 24965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 95113 - 94985
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || || ||||| | |||| |    
T  95113 aaattatgctcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgataagtgatgttatggatgct 95014  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  95013 aattcatggtttgggtatgcatgattcat 94985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 95372 - 95298
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  95372 ttaggagctaaagtgaagcctaggtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttcttcataatcat 95298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 353
Target Start/End: Original strand, 55959 - 56265
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattt--tgt 157  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| ||  ||     
T  55959 attggggtgaacttaggagataaattaaagcctaagtttggattaatcattatctacggtcagggggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgc 56058  T
Q  158 aaattttcaaatgttgcatgaattt---tgctt-------atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaatt 247  Q
    || || ||   ||||| ||||| ||   || ||       || ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| || || ||||||| ||    
T  56059 aacttctcccttgttgtatgaaattggttgattggaatgaatagataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgattt 56158  T
Q  248 gatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg--ttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtgg 345  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||  || || |||||| |||||  ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| || |    
T  56159 gatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatgtataaatgtcaagttatg-aaattgtgctcaaatggtgaattttgctaagttg 56257  T
Q  346 ttgatgaa 353  Q
    ||| ||||    
T  56258 ttgttgaa 56265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 318 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 164347 - 164227
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  164347 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatggtaattca 164248  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattc 438  Q
    ||||||| |||||||| ||||    
T  164247 tggcttgggtttgcataattc 164227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 312 - 441
Target Start/End: Original strand, 162295 - 162425
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttg-ttgctatgtcatgttgttgatga 410  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | |||| ||| |  ||||| ||||||||||    
T  162295 aaattatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtttgtttagtcatattgttgatga 162394  T
Q  411 taattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    | ||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  162395 tgatatatggcttgggtttgcatgattcatg 162425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 441
Target Start/End: Original strand, 166381 - 166503
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |   | ||||||| ||    || |||||||||||    
T  166381 aaattatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatgg---ttgttgttgtta----atattgttgatgat 166473  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  166474 gatacatggcttgggtttgcatgattcatg 166503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 323 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 33789 - 33690
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 422  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||    
T  33789 aattggtgaattatgctatgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 33690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 34266 - 34340
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34266 ttaggagctaaaatgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 34340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18100 - 18015
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt 157  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  18100 ttaggagttaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcataattattttgt 18015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 204 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8019
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 301  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||| |||||| || ||     
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatgtataagtgc 8158  T
Q  302 taagttgtgaaaattgtgctcaatt-ggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatg 400  Q
    ||| || ||  | || ||||||||| |||||||||||||| || ||||  ||||| |||| ||   |||| ||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  8157 taacttatg--atttatgctcaattgggtgaattatgctatgttgttgtggaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctatgtgatg 8060  T
Q  401 ttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| || | ||| |||||||    
T  8059 ttgttgttgatgattcatagcttgggtattcataattcatg 8019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Original strand, 31397 - 31525
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  31397 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgat 31496  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
     || ||||||||  |||||||||||||||    
T  31497 gatacatggcttaggtttgcatgattcat 31525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 3452 - 3328
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtg-aattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattc 416  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || || | |||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||| || ||||||| |||| ||||||    
T  3452 tgctcaattggtccaattatgctatgttgtagttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgatgttgctaagtgatgttgtggatgttaattc 3353  T
Q  417 atggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||||| || |||||||||||||    
T  3352 atggcttgggtatgcatgattcatg 3328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 3762 - 3639
Alignment:
Q  24 aagggtttgagagaaggagaacttgaagaactaaggattgga-gtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtt---gggattaatctttatctaaggt 119  Q
    ||||||| | ||||||  |||||||||||   |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| |   |||||||||||  | |||||||    
T  3762 aagggttagtgagaagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagct-aggagctaaattgaagcttaagatagggggattaatct--aactaaggt 3666  T
Q  120 aagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||  || |||||||||||    
T  3665 aagggggttagaattcatcataatcat 3639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 46297 - 46174
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| || || |||||| |||| |||||    
T  46297 tgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgtttctaagtgatattgttgttgatgattca 46198  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| || | ||| |||||||    
T  46197 tggcttgggtgttcataattcatg 46174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 80002 - 79874
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | | | ||||||| |  ||||| | |||||||||    
T  80002 aaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgat 79903  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  79902 aattcatggcttgggtatgcatgattcat 79874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 318 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 40790 - 40667
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattca 417  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| || || |||||| |||| |||||    
T  40790 tgctcaattggtgaattatgctatattgttgttacattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattca 40691  T
Q  418 tggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    ||||||| || | ||| |||||||    
T  40690 tggcttgggtgttcataattcatg 40667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 80219 - 80187
Alignment:
Q  114 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80219 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 80187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3300
Alignment:
Q  188 atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacat-gttca 286  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  3453 atggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacatatttca 3354  T
Q  287 aa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgcta 340  Q
    || |||||| ||||   ||||| || ||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  3353 aagtatgtataaatatcaagttatg-aaattgtactcaaatggtgaattttgcta 3300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 3578 - 3505
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||    
T  3578 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttgaattaatcatcatctaaggtaa-ggggttattcttcctcataatcat 3505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 441
Target Start/End: Original strand, 6200 - 6329
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||| |  || || |||||||||||    
T  6200 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtaatattgttgatgat 6299  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
     || |||| |||| ||||||||||||||||    
T  6300 gatacatgacttgggtttgcatgattcatg 6329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Original strand, 9624 - 9752
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || || | ||| | |||| |    
T  9624 aaattatgctcaattagtgacttatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgacgttatggatgct 9723  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  9724 aattcatggcttgggtatgcatgattcat 9752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 9370 - 9444
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9370 ttaggagctaaagtgaagcccaagtttgaattgatcataacctaaggtaagggggttagtcttcttcataatcat 9444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Original strand, 145 - 273
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||  || | ||||||| || || ||||| | |||| |    
T  145 aaattatgctcaattggtgaattatgcataataattgatgaattatgataagtttcatgatcaataaatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgct 244  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgattcat 440  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  245 aattcatggcttgagtatgcatgattcat 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 4304 - 4378
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4304 ttaggagctaaagtgaagcaaaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagactttatcataatcat 4378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 318 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 6073 - 5963
Alignment:
Q  318 tgctcaattggtgaa-ttatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattc 416  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| | |||||||||| || || |||||| |||| ||||    
T  6073 tgctcaattggttaaattatgctatgtggttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattc 5974  T
Q  417 atggcttgagt 427  Q
    |||||||||||    
T  5973 atggcttgagt 5963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 312 - 437
Target Start/End: Original strand, 568 - 693
Alignment:
Q  312 aaattgtgctcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | |||| |  |   |||| |||||||||||    
T  568 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgatatttactcatattgttgatgat 667  T
Q  412 aattcatggcttgagtttgcatgatt 437  Q
     || ||||||||| ||||||||||||    
T  668 gatacatggcttgggtttgcatgatt 693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 5434 - 5508
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5434 ttaggagctaaagtgaagcctaagattggattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 5508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 5623 - 5549
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5623 ttaggagctaaaatgaagcccaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 5549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 49710 - 49784
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  49710 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttcttcataatcat 49784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 384 - 441
Target Start/End: Original strand, 24378 - 24435
Alignment:
Q  384 gttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24378 gttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatgtcttgggtttgcatgattcatg 24435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 424
Target Start/End: Original strand, 2317 - 2537
Alignment:
Q  205 aattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga- 301  Q
    ||||| |||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||     
T  2317 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgac 2416  T
Q  302 -taagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcat 399  Q
     || ||||    |||| ||||||| ||| |||||||||||| || |||| |||||| |||||||  ||||| ||||||||| | |||||| ||| || ||    
T  2417 atatgttg----aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattatgataagactcatgttcaattgatgttgttgttcctaagtgat 2512  T
Q  400 gttgttgatgataattcatggcttg 424  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  2513 gttgttgatgatgattcatggcttg 2537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 345 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 31149 - 31053
Alignment:
Q  345 gttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||| | ||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  31149 gttgttgaattgtgataagtttcatgattaattgatgttgttgctgatatgtgaggtttttgatgataatttatggcttgggtatgcatgattcatg 31053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 70734 - 70654
Alignment:
Q  329 tgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatg 409  Q
    |||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| | ||||||||||||    
T  70734 tgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctgatatatgatgttgttgatg 70654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 441
Target Start/End: Original strand, 76847 - 77085
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 301  Q
    |||||||||||| || | ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||    
T  76847 aaattcatgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 76946  T
Q  302 taagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatg 400  Q
    ||  |  ||||  || || |||| ||| |||||||||||| || |||| ||||||||| | || |||||| ||||||||| | |||||||||| || ||     
T  76947 tatatgttgaa--ttatgttcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 77044  T
Q  401 ttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||  |||| |||||||||||| || | ||| |||||||    
T  77045 ttgttattgatgattcatggcttgggtattcataattcatg 77085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 313
Target Start/End: Original strand, 1438 - 1694
Alignment:
Q  60 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaa 159  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||    ||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||| |      
T  1438 attggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagggtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgc 1537  T
Q  160 attttcaaatgttgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattg 258  Q
    ||||||  |||||| |||||  | | || ||| | ||||||||||||| || ||| |   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |    
T  1538 attttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaaatcgtgcacttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgg 1637  T
Q  259 taagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    || | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  1638 tatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 1694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 4696 - 4589
Alignment:
Q  318 tgctcaattggt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattc 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||| | |||||||||||  |||||  ||||||||| | |||||||||| || || |||||| |||| ||||    
T  4696 tgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtttaattgtgataatattcattttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattc 4597  T
Q  417 atggcttg 424  Q
    ||||||||    
T  4596 atggcttg 4589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 9310 - 9203
Alignment:
Q  318 tgctcaattggt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattc 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||| | |||||||||||  |||||  ||||||||| | |||||||||| || || |||||| |||| ||||    
T  9310 tgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtttaattgtgataatattcattttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattc 9211  T
Q  417 atggcttg 424  Q
    ||||||||    
T  9210 atggcttg 9203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 371 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 7913 - 7843
Alignment:
Q  371 atcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||||||| | |||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  7913 atcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcatg 7843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4414 - 4357
Alignment:
Q  321 tcaattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattg 378  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4414 tcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagttttatgatcaattg 4357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 2772 - 2555
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatg- 300  Q
    |||||| ||||| || | ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| ||     
T  2772 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttggatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatatgaaagtgt 2673  T
Q  301 -ataagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtca 398  Q
     ||| ||||    |||| ||||| || || |||||||||||| || |||| |||||| |||| || |||||| ||||||||| | |||||||||| || |    
T  2672 tatatgttg----aattatgctctaaatgttgaattatgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtga 2577  T
Q  399 tgttgttgatgataattcatgg 420  Q
    | |||||| |||| ||||||||    
T  2576 tattgttgttgatgattcatgg 2555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 145
Target Start/End: Original strand, 12002 - 12075
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   ||||| | | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12002 ttaggagctaaagtgaagcctaagttaaaattaaacatcatctaaggtaagggggttagttattatcataatca 12075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 54132 - 53992
Alignment:
Q  194 aattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatg 292  Q
    ||||| |||||||||| |||||  ||||||||| | | ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  54132 aattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgctgttttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttcaaagcatg 54033  T
Q  293 taaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    || || || ||||||||| ||||| | | |||||||||||||    
T  54032 tataattgttaagttgtg-aaattatacccaattggtgaatt 53992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 54255 - 54182
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 145  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||||| | | |||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  54255 ttaggagctatagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatca 54182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 360
Target Start/End: Original strand, 22429 - 22586
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 301  Q
    |||||| ||||| ||||  ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||| | |||| || ||     
T  22429 aaattcgtgctctaactaggataatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtgtgtataagtgt 22528  T
Q  302 taagttgtgaaaattgtgctcaatt-ggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgat 360  Q
    ||| |||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||    
T  22529 taacttgtg--aattatgctcaattgggtgaattatgctaagttgttgttgaattatgat 22586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3625 - 3531
Alignment:
Q  240 catgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 334  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||| ||||| | | |||||||||||||    
T  3625 catgaattgatgattatggtatgattgtgggtgaaattacatgttcaaagcatgtataattgttaagttgtg-aaattatacccaattggtgaatt 3531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 3799 - 3743
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggtt 128  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||| | | ||||||||||| ||||||    
T  3799 ttaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaatggggtt 3743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 31266 - 31043
Alignment:
Q  205 aattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatg-- 300  Q
    ||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||      
T  31266 aattcgtgctctaattatgatgatatatttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaagtgtt 31167  T
Q  301 ataagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcat 399  Q
    ||| ||||    |||| ||||  || || |||||| ||||| ||  ||| ||||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||||| || ||    
T  31166 atatgttg----aattatgctttaaatgttgaattgtgctatgttcttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 31071  T
Q  400 gttgttgatgataattcatggcttgagt 427  Q
      ||||| |||| |||||||||||||||    
T  31070 actgttgttgatgattcatggcttgagt 31043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 6068 - 6142
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| | ||| ||| | | |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6068 ttaggagctaaagtgaagcccaagtttgaattgatcataacctaaggtaagggggttagtcttaaacataatcat 6142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 6979 - 6905
Alignment:
Q  71 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 145  Q
    |||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6979 cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatca 6905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 35605 - 35487
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 422  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||| |||| |||| ||||  ||||| ||||||||| |  ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||    
T  35605 aattgttgatttatgctatgttgttgttgaaatgtggtaagagtcatgttcaattgatgtttttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggct 35506  T
Q  423 tgagtttgcatgattcatg 441  Q
    || || | ||| |||||||    
T  35505 tgggtattcataattcatg 35487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 131
Target Start/End: Original strand, 154305 - 154365
Alignment:
Q  71 cttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagt 131  Q
    |||||||||| |||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  154305 cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagt 154365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 323 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 436 - 335
Alignment:
Q  323 aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggct 422  Q
    ||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||||| | |||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||| ||    
T  436 aattgttgaattatgctatgttattgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtttttgttgattattcatgcct 337  T
Q  423 tg 424  Q
    ||    
T  336 tg 335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 303
Target Start/End: Original strand, 1348 - 1449
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcat-gaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 301  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||    
T  1348 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatgtgaaaatga 1447  T
Q  302 ta 303  Q
    ||    
T  1448 ta 1449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 303
Target Start/End: Original strand, 9603 - 9704
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcat-gaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 301  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||    
T  9603 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatgtgaaaatga 9702  T
Q  302 ta 303  Q
    ||    
T  9703 ta 9704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2773 - 2700
Alignment:
Q  73 taggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||| |||||||||   |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2773 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 2700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 7305 - 7197
Alignment:
Q  318 tgctcaattggt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattg-atatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 415  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||| | |||||||||||  |||||  ||||||| || | |||||||||| || || |||||| |||| |||    
T  7305 tgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtttaattgtgataatattcattttcaattggatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgatt 7206  T
Q  416 catggcttg 424  Q
    |||||||||    
T  7205 catggcttg 7197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 313
Target Start/End: Original strand, 1389 - 1633
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgt 171  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||    
T  1389 ttaggagctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgt 1488  T
Q  172 tgcatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttgg 270  Q
    || |||||  | | || ||| | |||||||||||||||| |||||    ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | || | ||    
T  1489 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatggg 1588  T
Q  271 tgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  1589 tgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 1633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 424
Target Start/End: Original strand, 7736 - 7896
Alignment:
Q  264 ttgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgata 361  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||| || |||| ||| |||||||     
T  7736 ttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatg 7833  T
Q  362 agtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttg 424  Q
    ||  ||||| | ||||||| | ||||||| || |  || |||||| |||| |||||| |||||    
T  7834 agaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttg 7896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 28765 - 28545
Alignment:
Q  222 tgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 319  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |   ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||  |  ||||  || ||    
T  28765 tgatgatatgtttgaatgcatgaacttgttgataactgaattgttgttggtgaaattatatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaa--ttatg 28668  T
Q  320 ctcaa-ttggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcat 418  Q
    ||||| ||| ||||||||| || || |||| ||||||||  ||||  | ||| ||||||||| | |||||||||| || ||||||||| | || ||||||    
T  28667 ctcaaattgttgaattatggtatgttgttgttgaattgtagtaagaattatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttaatgattcat 28568  T
Q  419 ggcttgagtttgcatgattcatg 441  Q
    |||||| || | ||| |||||||    
T  28567 ggcttgggtgttcataattcatg 28545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 420
Target Start/End: Original strand, 197395 - 197470
Alignment:
Q  345 gttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatgg 420  Q
    |||| ||||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||||| || || |||||| |||| ||||||||    
T  197395 gttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatgg 197470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 3480 - 3341
Alignment:
Q  222 tgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 319  Q
    ||||||||| |||| || |||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||  ||||| |    
T  3480 tgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattggg 3383  T
Q  320 ctc-aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgat 360  Q
    ||| ||||| |||||| ||||| || |||| |||||||||||    
T  3382 ctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgat 3341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 7053 - 7127
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || | ||||||| | | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  7053 ttaggagctaaagtgaagcttaaatttgaattaatcataacctaaggtaagggggttagtgttcttcataatcat 7127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 146
Target Start/End: Original strand, 17207 - 17241
Alignment:
Q  112 tctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17207 tctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 17241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 300
Target Start/End: Original strand, 22422 - 22520
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc-aaatatgtaaaaatg 300  Q
    |||||| ||||| || | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |   ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||    
T  22422 aaattcgtgctctaaatatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataatttaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaaatatgtataaatg 22520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 2538 - 2481
Alignment:
Q  367 catgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttg 424  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2538 catgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttg 2481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 39904 - 39783
Alignment:
Q  194 aattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 291  Q
    |||||||||||||||| |||||   |||||||  ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  39904 aattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgattctattttcctgtgcatgaattgatgattatggtatttttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 39805  T
Q  292 gtaaaaatgataagttgtgaaa 313  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  39804 gtataaatgttaagttatgaaa 39783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 7590 - 7517
Alignment:
Q  72 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatca 145  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||  |||||| | | |||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  7590 ttaggagctaaagtgaagctttagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatca 7517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 11177 - 11121
Alignment:
Q  367 catgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggctt 423  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||    
T  11177 catgttcaattgatgttgttgttgctatgtgatgttgttgtttatgattcatggctt 11121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 30211 - 29990
Alignment:
Q  204 aaattcatgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 301  Q
    |||||| |||||  ||| ||||||||| |||| || |||||| ||| ||||||||| |   |||| ||||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  30211 aaattcgtgctcttactatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgtaggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 30112  T
Q  302 taagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatatcgttgttgctatgtcatg 400  Q
    ||  |||||||  || ||||| ||||| |||||| ||||| ||  ||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||| | ||||||| || |  ||     
T  30111 tatattgtgaa--ttttgctctaattgttgaattgtgctatgtttttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagcgata 30014  T
Q  401 ttgttgatgataattcatggcttg 424  Q
    |||||| |||| |||||| |||||    
T  30013 ttgttgttgatgattcatagcttg 29990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University