View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF5079-Insertion-2 (Length: 825)
Name: NF5079-Insertion-2
Description: NF5079
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF5079-Insertion-2 |
 |  |
|
| [»] chr1 (46 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr2 (37 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr7 (26 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr3 (36 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr5 (34 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0057 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0116 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0494 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0219 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0201 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0513 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0794 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0169 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0011 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0199 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0293 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 514; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 514; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 730
Target Start/End: Original strand, 51641713 - 51642423
Alignment:
| Q |
8 |
gaatactacaggaaggaaccacacaaaaaataaaggatagagaattaattaatcaaattggaattgacatagggaagagtggataaggatgtgaatttaa |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51641713 |
gaatactacaggaaggaaccacgcaaaaaataaaggatagagaattaattaatcaaattggaatagacatagggaagagtggataaggatgtgaatttaa |
51641812 |
T |
 |
| Q |
108 |
aaaacgcaagtgatgaaaaggccggtagctgtgattgatcaatggagaaaagttgttttgtgaaaacaacagcaaaaccacgacgggaaaagttggcagt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51641813 |
aaaacgcaagtgatgaaaaggccggtagctgtgattgatcaatggagaaaagttgttttgtgaaaacaacagcaaaaccacgacgggaaaagttggcagt |
51641912 |
T |
 |
| Q |
208 |
aatcataatgaatcttttccagaaacactgccatatgactaattaaaattccaattcaaattaccgtaccttccaaatatttttgaaaatttgttgtaga |
307 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
51641913 |
aatcataatgaatcttttccagaaacactgccatatgactaattcaaatttcaattcaaattaccgtacctaccaaatatttttgaaaatttgct-tagg |
51642011 |
T |
 |
| Q |
308 |
cacgttgcataaggttgtttcacacgagtaaaatacgnnnnnnnnnnnncggcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca |
407 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
51642012 |
cacattgcataaggatgtatcacacgagtaaaatacgtttttgctttctcgacagttaaatgttaaggaaaacctcagta----------gagg--aaca |
51642099 |
T |
 |
| Q |
408 |
attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagtttttaaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatac |
506 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51642100 |
attatgcagatagtgggttctgcataattttaaagcattttcaaaccatttttcggtcagtttttaaccagagcattttcaaaggcaatataaatcatac |
51642199 |
T |
 |
| Q |
507 |
aatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttg |
606 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51642200 |
aatattgaaactcgatcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaaagtttg |
51642299 |
T |
 |
| Q |
607 |
aaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgc |
706 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
51642300 |
aaattcatcaaaacgttacaaattgtccataattaaacaacacattacaactcattacatatcattaagttaaatcccaacttacattcatcacaattac |
51642399 |
T |
 |
| Q |
707 |
atatagaacgaacatacatatata |
730 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51642400 |
atatagaacgaacatacatatata |
51642423 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 359 - 822
Target Start/End: Original strand, 38460459 - 38460924
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaattatgcaa-cagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattt |
457 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
38460459 |
gcagttaactgtcgaggaaaacctcggtaattaactgccgaggaaaacaattatgcagtcagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagccattt |
38460558 |
T |
 |
| Q |
458 |
ttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatc |
546 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
38460559 |
ttcggtcagtttttacctgtaattaaaccagagcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatataatatc |
38460658 |
T |
 |
| Q |
547 |
ttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacag |
646 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
38460659 |
ttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttgattcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaatgttacaaagtgtccataattaa---- |
38460754 |
T |
 |
| Q |
647 |
cacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcac |
746 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
38460755 |
------acaactcattacacatgattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcatatgcaacaaacatacatatataatatattattttccac |
38460848 |
T |
 |
| Q |
747 |
catattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcg |
822 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
38460849 |
catattctgaaacataaatccaacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcg |
38460924 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 373 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 44051118 - 44050651
Alignment:
| Q |
373 |
aggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaattatgcaa-cagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttt |
471 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
44051118 |
aggaaatcctcggtagttaactgccgaggaaaacaattatgcaaacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagccatttttcggccagttttt |
44051019 |
T |
 |
| Q |
472 |
a-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtcc |
560 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44051018 |
acttgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtcc |
44050919 |
T |
 |
| Q |
561 |
ataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacag |
656 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || | ||| |
|
|
| T |
44050918 |
ataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaa |
44050819 |
T |
 |
| Q |
657 |
ctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccga |
756 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
44050818 |
ctcattacacatcattaaattaaatccctacttgcattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccga |
44050719 |
T |
 |
| Q |
757 |
aacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
44050718 |
aacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaa-acatatagcttgttgttttccatgcgtat |
44050651 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 387 - 825
Target Start/End: Original strand, 18578684 - 18579134
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------ac |
474 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
18578684 |
agttatctgccgagaaaaacatttatgcagacagtggattctgcataattgttaagcatttccaagccatttttcggctagtttttacttgtaattcaac |
18578783 |
T |
 |
| Q |
475 |
cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
574 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||||||| | |||||| ||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18578784 |
cagagtatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcactcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
18578883 |
T |
 |
| Q |
575 |
ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaa |
674 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
18578884 |
ccgacatttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaatgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaa |
18578983 |
T |
 |
| Q |
675 |
gttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcg |
774 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
18578984 |
attaaatcacttcttacattcaacgcaattgcatatagaactaacatacatatataatatattatcttctaccatattccgaaacataaattcgacgtcg |
18579083 |
T |
 |
| Q |
775 |
ctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18579084 |
ctatcgtcttcaattagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
18579134 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 373 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 10423432 - 10422979
Alignment:
| Q |
373 |
aggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttt |
471 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
10423432 |
aggaaatcctaggtagttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtgggttttgcataaatctaaagcaattccaagccatttttcggccagttttt |
10423333 |
T |
 |
| Q |
472 |
a-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtcc |
560 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10423332 |
acctgtaattaaaccagagcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaataca-tatcttttacaattgtcc |
10423234 |
T |
 |
| Q |
561 |
ataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctca |
660 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
10423233 |
ataattaaattaaaccgacattaggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaatgtgtccataattaa----------acaactca |
10423144 |
T |
 |
| Q |
661 |
ttacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaaca |
760 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10423143 |
ttacatatcattagattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaaca |
10423044 |
T |
 |
| Q |
761 |
taaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
10423043 |
taaatccgacgtcgcaatcgccgcgaataagccaagacatatagcttgtcgttttccatgtgtat |
10422979 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 386 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 4774626 - 4774175
Alignment:
| Q |
386 |
tagttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------a |
473 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
4774626 |
tagttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttccaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaa |
4774527 |
T |
 |
| Q |
474 |
ccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaa |
573 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||||||| | |||||| ||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4774526 |
ccagagcatttccaaagccaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaa |
4774427 |
T |
 |
| Q |
574 |
accgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcatta |
673 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | | ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
4774426 |
atcgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcatta |
4774327 |
T |
 |
| Q |
674 |
agttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtc |
773 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4774326 |
aattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtc |
4774227 |
T |
 |
| Q |
774 |
gctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
4774226 |
gctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccatgcgtat |
4774175 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 547 - 825
Target Start/End: Original strand, 24415392 - 24415672
Alignment:
| Q |
547 |
ttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacag |
646 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
24415392 |
ttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaa |
24415491 |
T |
 |
| Q |
647 |
cacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcac |
746 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
24415492 |
cacattacaactcattacatatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccat |
24415591 |
T |
 |
| Q |
747 |
catattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggc--atatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
24415592 |
catattccgaaacataaatgcaacgtcgctatcgtcttcaataagtcaaggcatatatagcttgtcgttttccatgtgtat |
24415672 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 387 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 37395229 - 37394774
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttttta----------- |
472 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
37395229 |
agttaattgccgaggaaaactgattatgcagacagtgggttctgcataattctaaa-cattttcaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaa |
37395131 |
T |
 |
| Q |
473 |
accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca |
572 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
37395130 |
accagagcatttccaaaggaaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatta |
37395031 |
T |
 |
| Q |
573 |
aaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacatat |
668 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || | ||| ||||||||| || |
|
|
| T |
37395030 |
aaccgacatttgattcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacat |
37394931 |
T |
 |
| Q |
669 |
cattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccg |
768 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
37394930 |
cattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctg |
37394831 |
T |
 |
| Q |
769 |
acgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
37394830 |
acgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatacaacttgccgttttccatgcgtat |
37394774 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 357 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 3408282 - 3407810
Alignment:
| Q |
357 |
cggcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaacca |
454 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | |||||||||||| |||| | ||| ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
3408282 |
cggcagttaactgccgaggaaaacctcggtagtaacttgccgaggaaaactgattatgtagacagtgggttctgcataattctaaa-catttccaagcca |
3408184 |
T |
 |
| Q |
455 |
ttttt-cggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaa |
542 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
3408183 |
ttttttcggccagtttttacttgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaa |
3408084 |
T |
 |
| Q |
543 |
tatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttt-gttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataatta |
641 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3408083 |
tatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacattttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataatta |
3407984 |
T |
 |
| Q |
642 |
aacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattattt |
741 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
3407983 |
aac-------ta---ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatct |
3407894 |
T |
 |
| Q |
742 |
ttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
3407893 |
tccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtat |
3407810 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 514 - 825
Target Start/End: Original strand, 10374240 - 10374541
Alignment:
| Q |
514 |
aaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattca |
613 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10374240 |
aaactcggtcataaccaagaaaaatacaataccttttacagttgtccataattaaatgaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattca |
10374339 |
T |
 |
| Q |
614 |
tcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatataga |
713 |
Q |
| |
|
||||||| ||| || |||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |
|
|
| T |
10374340 |
tcaaaacattacaaggtgtccataattaaacaac----------tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatgga |
10374429 |
T |
 |
| Q |
714 |
acgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtt |
813 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
10374430 |
acgaacatacatatataatatattatcttccaccatatttcgaaacataaatctgatgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgtt |
10374529 |
T |
 |
| Q |
814 |
tcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |
|
|
| T |
10374530 |
ttccatgcgtat |
10374541 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 387 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 50905172 - 50904820
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------ac |
474 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||| || |
|
|
| T |
50905172 |
agttaactgccgaggaaaacaatta--cagacagtgagttctgcataattctaatgcatttccaagccatttttcggccaatttttacctgtaattaaac |
50905075 |
T |
 |
| Q |
475 |
cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
574 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50905074 |
cagagcatttctaaatgcaatataaatcatacaacattgaaactcgaacataaacaagaaaaatatgaaatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
50904975 |
T |
 |
| Q |
575 |
ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaa |
674 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| || ||||| || |||||||| |
|
|
| T |
50904974 |
ccgacattttgttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgatacaaagtgttcataattaaaca----at------tcatttcacatcattaa |
50904885 |
T |
 |
| Q |
675 |
gttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattat |
739 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
50904884 |
attaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacaaacatacaaatataatatattat |
50904820 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 472 - 825
Target Start/End: Original strand, 49563999 - 49564344
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatac--aatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaa |
569 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
49563999 |
aaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatattttacaattgttcataattaaa |
49564098 |
T |
 |
| Q |
570 |
tcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatc |
669 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
49564099 |
ttaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatc |
49564188 |
T |
 |
| Q |
670 |
attaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccga |
769 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49564189 |
attaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccga |
49564288 |
T |
 |
| Q |
770 |
cgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
49564289 |
cgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
49564344 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 359 - 825
Target Start/End: Original strand, 19069220 - 19069702
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatt |
456 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||| |||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19069220 |
gcagttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaaactgattatgcagacagtgggt-ctgcataattgtaaa-catttccaagccatt |
19069317 |
T |
 |
| Q |
457 |
ttt-cggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaata |
544 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||| | || |||| |
|
|
| T |
19069318 |
ttttcgaccagtttttacttgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtaaaata |
19069417 |
T |
 |
| Q |
545 |
tcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaa--------------acgttataaatt |
630 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||| | |
|
|
| T |
19069418 |
tcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaattaaactactcaaaacattacaaagt |
19069517 |
T |
 |
| Q |
631 |
gtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatata |
730 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
19069518 |
gtccataattaaac-------tac---tcattgcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatgtata |
19069607 |
T |
 |
| Q |
731 |
atatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19069608 |
atatattatcttccaccatattccgaaacataaacccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
19069702 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 524 - 805
Target Start/End: Original strand, 6186859 - 6187140
Alignment:
| Q |
524 |
ataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgtt |
623 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
6186859 |
ataaacaagaaaaatacattatcttttatagtagtcaataattaaatcaatccgacatttcgttaaaattacacgtatgtttgaaattcatcaaaacatt |
6186958 |
T |
 |
| Q |
624 |
ataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatac |
723 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| | || |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6186959 |
aaagggtgtccataattaaacaacacattacaacatattacatatcattaaattaaatctctactgacattctacgcatttgcatatggaacgaacatac |
6187058 |
T |
 |
| Q |
724 |
atatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagc |
805 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
6187059 |
atatataatatattatcttccaccatattgctaaacataaatccaatgtcgctatcgtcgtgaataagccaagacacatagc |
6187140 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 659 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 11506831 - 11506665
Alignment:
| Q |
659 |
cattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaa |
758 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |
|
|
| T |
11506831 |
cattacacatcattatattaaatccatacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatatttcaaaa |
11506732 |
T |
 |
| Q |
759 |
cataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11506731 |
cataaatccgacgtcgctattgtctttaataagtcaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
11506665 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 472 - 616
Target Start/End: Original strand, 51492230 - 51492374
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51492230 |
aaccagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattaaaactcgaacataaacaagataagtacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
51492329 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatca |
616 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
51492330 |
aaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca |
51492374 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 359 - 618
Target Start/End: Original strand, 15995755 - 15996026
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatt |
456 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15995755 |
gcagttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaaactgattatgcagacagtgggt-ctgcataattctaaa-catttccaagccatt |
15995852 |
T |
 |
| Q |
457 |
ttt-cggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaata |
544 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| ||||| |||| | ||||||| |
|
|
| T |
15995853 |
ttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaagtcggacataatgaagataagtacaata |
15995952 |
T |
 |
| Q |
545 |
tcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaa |
618 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15995953 |
tcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaa |
15996026 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 475 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 50278734 - 50278588
Alignment:
| Q |
475 |
cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
574 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
50278734 |
cagagcatttcgaaaggcaaaataatctatacaacattgaaactcggacataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattattcataattaaatcaaa |
50278635 |
T |
 |
| Q |
575 |
ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
50278634 |
ccgacatttggttgaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg |
50278588 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 475 - 616
Target Start/End: Original strand, 44674299 - 44674440
Alignment:
| Q |
475 |
cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
574 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44674299 |
cagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataagtacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
44674398 |
T |
 |
| Q |
575 |
ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatca |
616 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
44674399 |
ccgacatttggttcaaattacacaaacatttaaaattcatca |
44674440 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 472 - 621
Target Start/End: Original strand, 37016057 - 37016206
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37016057 |
aaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacatcattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
37016156 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37016157 |
aaactgacgtttgattcaaattacagaaacgtttgaaattcatcataacg |
37016206 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 472 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 30043346 - 30043022
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||| | || ||||| ||| | ||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
30043346 |
aaccagagcatttcaagaggcaatactattcgtacaacatttatactaagtcataaacaagaaaaatgtattatcttttacaattatccataattaaatc |
30043247 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat |
671 |
Q |
| |
|
|| ||||| | ||| ||||||||| | |||||||||| |||||||| ||| | | || ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||| | |
|
|
| T |
30043246 |
aatccgacgtagagttaaaattacacggatgtttgaaatttatcaaaacattaaagagtg-ccataattaaacaacacactacaacacattacatatcgt |
30043148 |
T |
 |
| Q |
672 |
taagttaaatccctacttacattc-atcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgac |
770 |
Q |
| |
|
||| | ||||| || | |||||| || | | ||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
30043147 |
taaatgaaatctctggtgacattctatga-agttgcaaatggaacgaaaatacaaatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgac |
30043049 |
T |
 |
| Q |
771 |
gtcgctatcgtctttaataagccaagg |
797 |
Q |
| |
|
||| ||||| | | |||||||||||| |
|
|
| T |
30043048 |
gtcattatcgccctgaataagccaagg |
30043022 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 376 - 472
Target Start/End: Original strand, 24414885 - 24414982
Alignment:
| Q |
376 |
aaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta |
472 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
24414885 |
aaaacctcggtagttaacggttggggaaaacaattatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagccatttatcggacagttttta |
24414982 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 1089626 - 1089579
Alignment:
| Q |
357 |
cggcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaa |
404 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
1089626 |
cggcagttaaatgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaa |
1089579 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 521 - 620
Target Start/End: Original strand, 31598700 - 31598798
Alignment:
| Q |
521 |
gtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaac |
620 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| || ||| |||||||| || |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
31598700 |
gtcataaacaagaacaatacataatctttcacaattgatcaaaattaaatcaattcgaca-ttcgttaaaattacatgaatgtttgaaattcaacaaaac |
31598798 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 359 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 16984201 - 16984155
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaa |
405 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16984201 |
gcagttaactgccgaggaaaacctcgatagttaactgccgaggaaaa |
16984155 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 357 - 402
Target Start/End: Original strand, 6175908 - 6175953
Alignment:
| Q |
357 |
cggcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgagga |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6175908 |
cggcagttaagtgccaaggaaaacctcggtagttaactgccgagga |
6175953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 357 - 406
Target Start/End: Original strand, 28234447 - 28234496
Alignment:
| Q |
357 |
cggcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaac |
406 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
28234447 |
cggcagttaaatgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgagaaaaac |
28234496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 357 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 37563322 - 37563273
Alignment:
| Q |
357 |
cggcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaac |
406 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
37563322 |
cggcagttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaaac |
37563273 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 357 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 54634057 - 54634008
Alignment:
| Q |
357 |
cggcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaac |
406 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
54634057 |
cggcagttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaaac |
54634008 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 46)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 387 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 51666677 - 51666237
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------ac |
474 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||| || |
|
|
| T |
51666677 |
agttaactgctgaggaaaacaattatgcacacagtgggttctgcataattctaaagcattctcaagccatttttcggccaatttttacctgtaattaaac |
51666578 |
T |
 |
| Q |
475 |
cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
574 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51666577 |
caaagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatattttacaattgtccataattaaatcaaa |
51666478 |
T |
 |
| Q |
575 |
ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaa |
674 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
51666477 |
ccgacatttggttcaaattacataaaagtttgaaattcatcaaaaagttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcattat |
51666388 |
T |
 |
| Q |
675 |
gttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcg |
774 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
51666387 |
attaaatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaattcgacgtcg |
51666288 |
T |
 |
| Q |
775 |
ctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |
|
|
| T |
51666287 |
ctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtgttccatgtgtat |
51666237 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 387 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 4518427 - 4517965
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------ac |
474 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
4518427 |
agttaactgccgaggaaaacaattatggagacagtaggttctgcataattctaaagcattttcaagccatttttcggccagtttttacctgtaattaaac |
4518328 |
T |
 |
| Q |
475 |
cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
574 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4518327 |
caaagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
4518228 |
T |
 |
| Q |
575 |
ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa--------------acagcacattacagctca |
660 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
4518227 |
ccgacatttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcagaacgttacaaaatgtccataattaagtgtccataattaaacaacacattacaactca |
4518128 |
T |
 |
| Q |
661 |
ttacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaaca |
760 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4518127 |
ttacacatcattatat--aatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaaca |
4518030 |
T |
 |
| Q |
761 |
taaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |
|
|
| T |
4518029 |
taaatccgacgttgctatagtctttaataagccaaggcatatagcttgccattttccatgcgtat |
4517965 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 359 - 825
Target Start/End: Original strand, 36072402 - 36072874
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattt |
457 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
36072402 |
gcagttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaaaaaactgattatgcagacagtggattctgcataattctaaagcattttcaaatcattt |
36072501 |
T |
 |
| Q |
458 |
ttcggtcagttttta-----accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttac |
552 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||| | | |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36072502 |
ttcgaaatttttttacctgtaccagaacatttccaaaggcaatataacttatacaacagttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttac |
36072601 |
T |
 |
| Q |
553 |
aattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacatt |
652 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||||| || ||| |
|
|
| T |
36072602 |
aattgttcataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacattagatagtgtccatgattaaacaacatatt |
36072701 |
T |
 |
| Q |
653 |
acagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatatt |
752 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
36072702 |
acaactcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatatt |
36072801 |
T |
 |
| Q |
753 |
ccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
36072802 |
ccgaaacataaatccgacgtcgctatcatcttcaattagccaaggcatatagcttgttgttttccatgcgtat |
36072874 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 387 - 825
Target Start/End: Original strand, 8459019 - 8459459
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------ac |
474 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
8459019 |
agttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcatttctaagccatttttcgaccagtttttacctgtaattaaac |
8459118 |
T |
 |
| Q |
475 |
cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
574 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8459119 |
catagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaacttggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
8459218 |
T |
 |
| Q |
575 |
ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaa |
674 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
8459219 |
ccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttaaaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatgattaa |
8459308 |
T |
 |
| Q |
675 |
gttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcg |
774 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8459309 |
attaaatccctacttacattcaacgcaattacatatagaacgaacatacatgtataatatattatcttctaccatattttgaaacataaatccgacgtcg |
8459408 |
T |
 |
| Q |
775 |
ctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8459409 |
ctatcgtcgcgaataagccaagacatatagcttgtcgttttccatgcgtat |
8459459 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 387 - 814
Target Start/End: Original strand, 19495101 - 19495543
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------ac |
474 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
19495101 |
agttaactgccgagaaaaactattatgcagacagtgggttctgcataattgttaagcatttccaagctatttttcggccagtttttacctgtaattaaac |
19495200 |
T |
 |
| Q |
475 |
cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
574 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19495201 |
cagagcatttccaaaggtaatataattcatacaacatttaaactcagtcataaataagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
19495300 |
T |
 |
| Q |
575 |
ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaac---gttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat |
671 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
19495301 |
ccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaacgcgtgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaagtcattacacatcat |
19495400 |
T |
 |
| Q |
672 |
taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacg |
771 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
19495401 |
taaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccaacg |
19495500 |
T |
 |
| Q |
772 |
tcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgttt |
814 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19495501 |
tcgctatcgtctcgaataagccaaggcatatagcttgccgttt |
19495543 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 373 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 13178158 - 13177697
Alignment:
| Q |
373 |
aggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaattatgcaacagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta |
472 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
13178158 |
aggaaaacctcgagagttaactgccgagaaaaacatttatgcaacagtgggttctgcataattataaagcacttccaagccattttttgaccagttttta |
13178059 |
T |
 |
| Q |
473 |
-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtcca |
561 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13178058 |
cctgtaatttaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatat--tatttaaactcagtcataaacaagtaaaatataatatcttttacaattgtcca |
13177961 |
T |
 |
| Q |
562 |
taattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcat |
661 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13177960 |
taattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccatagttaaacaacacattacaactcat |
13177861 |
T |
 |
| Q |
662 |
tacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacat |
761 |
Q |
| |
|
|||| || ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13177860 |
tacacattattaaattaaatccctacttactttcaatgcaattgcatatggaatgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacat |
13177761 |
T |
 |
| Q |
762 |
aaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13177760 |
aaatccgacgtcgctatcgttgcgattaagccaagccatatagcttgccgttttccatgcgtat |
13177697 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 424 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 46979231 - 46978805
Alignment:
| Q |
424 |
ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt |
512 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
46979231 |
ttctgcataattctaaaacattttcaagctatttttcggtcagtttttacttgtaattaaatcagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacatt |
46979132 |
T |
 |
| Q |
513 |
gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc |
612 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46979131 |
gaaactcggtcataaacaagaaaaatagaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacagacatttgattcaaattacacaaaagtttgaaattc |
46979032 |
T |
 |
| Q |
613 |
atcaaaacgttataaattgtccataattaa--------------acagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatc |
698 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46979031 |
atcaaaacattacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaacacattacaattcattacacatcattatattaaatccctacttacattcatc |
46978932 |
T |
 |
| Q |
699 |
acaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggc |
798 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46978931 |
acaattgcattaggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatatttcgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggc |
46978832 |
T |
 |
| Q |
799 |
atatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
46978831 |
atatagcttgtcgttttccatgtgtat |
46978805 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 359 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 1656129 - 1655651
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattt |
457 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
1656129 |
gcagttaactgtcgagaaaaacctcggtagttaactgccgaggaaaacatttatgcagacagtgggttctgcataattgttaagcactttcaagccattt |
1656030 |
T |
 |
| Q |
458 |
ttcggtcagtttttaac-----------cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatc |
546 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||| ||| | |||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
1656029 |
ttcggccagtttttacctgtaatttaatcagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaatttagtcataaacaagtaaaatacaatatc |
1655930 |
T |
 |
| Q |
547 |
ttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacag |
646 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | | ||||| |||||| |
|
|
| T |
1655929 |
ttttacaattgtccataattaaatcaaacggacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaatcgttacatagtatccatgcataaacaa |
1655830 |
T |
 |
| Q |
647 |
cacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcac |
746 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
1655829 |
cacattacaactcattacacatcattaaattaaatcattacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccac |
1655730 |
T |
 |
| Q |
747 |
catattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1655729 |
catattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaagacatatagcttgccgttttccatgcgtat |
1655651 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 386 - 825
Target Start/End: Original strand, 7966043 - 7966490
Alignment:
| Q |
386 |
tagttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------a |
473 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
7966043 |
tagttaactgctgagaaaattgattatgcagacagtgagttctgcataattctaaagcacttccaagccatttttcggccagtttttacctgtaatttaa |
7966142 |
T |
 |
| Q |
474 |
ccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatctttt-acaattgtccataattaaatca |
572 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7966143 |
ccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatctttttacaattgtccataattaaatca |
7966242 |
T |
 |
| Q |
573 |
aaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcatt |
672 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
7966243 |
aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattaca----tttacacatcatt |
7966338 |
T |
 |
| Q |
673 |
aagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgt |
772 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7966339 |
aaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatgtaatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgt |
7966438 |
T |
 |
| Q |
773 |
cgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
7966439 |
cgctatcgtcgcgaataag-caaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
7966490 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 359 - 825
Target Start/End: Original strand, 9710611 - 9711079
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaac-aattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatt |
456 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9710611 |
gcagttaactgccgaggaaaacttcgggagttaactgccgaggaaaacgaattatgcagacagtgggttctgcataattctaaa-catttccaagccatt |
9710709 |
T |
 |
| Q |
457 |
tttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatat |
545 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| || |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
9710710 |
tttcggtcagtttttacctgtaattaaacaagagtatttccaaaggtaaaataattcatacaacattgaaactaggacataaacaagataaatacaatat |
9710809 |
T |
 |
| Q |
546 |
cttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaaca |
645 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
9710810 |
cttttacaattgtccataattaaatcaaactgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaatgttacaaagtgtccataattaaaca |
9710909 |
T |
 |
| Q |
646 |
gcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttca |
745 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9710910 |
ac----------tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaaagaacatacatatataatatattatctttca |
9710999 |
T |
 |
| Q |
746 |
ccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
9711000 |
ccatattccgaaacataaatccgacgtcgctgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgtttttcatgcgtat |
9711079 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 359 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 44470051 - 44469582
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatt |
456 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
44470051 |
gcagttaactgccgaggaaaacctcgggagttaactgccgaggaaaactgattatgcagacagtggattctgcataattctaaa-catttccaagccatt |
44469953 |
T |
 |
| Q |
457 |
ttt-cggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaata |
544 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | ||||||| |
|
|
| T |
44469952 |
ttttcggtcagtttttacctgtaattgaaccagagcattttcaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatcaagataagtacaata |
44469853 |
T |
 |
| Q |
545 |
tcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaac |
644 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
44469852 |
tcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac |
44469753 |
T |
 |
| Q |
645 |
agcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttc |
744 |
Q |
| |
|
| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
44469752 |
aac----------tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttcc |
44469663 |
T |
 |
| Q |
745 |
accatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
44469662 |
accatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
44469582 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 516 - 825
Target Start/End: Original strand, 33168106 - 33168415
Alignment:
| Q |
516 |
actcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatc |
615 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
33168106 |
actcagtcataaacaaggaaaatatattatcttttacagttgtccataattaaatcaaaccgacatttagttcaaagtacacgaaagtttgaaaatcatc |
33168205 |
T |
 |
| Q |
616 |
aaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaac |
715 |
Q |
| |
|
||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
33168206 |
aaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacatatcattaaattaaatccctacttacactcaacgcaattacatatggaac |
33168305 |
T |
 |
| Q |
716 |
gaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttc |
815 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
33168306 |
gaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtctaaaataagtcaaggcatatagcttgttgtttt |
33168405 |
T |
 |
| Q |
816 |
ccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
33168406 |
ccatgcgtat |
33168415 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 521 - 825
Target Start/End: Original strand, 38690117 - 38690410
Alignment:
| Q |
521 |
gtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaac |
620 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38690117 |
gtcataaataagaaaaatacaatatcttttacaattgtccatagttaaatcaaaccgacatttgattcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaac |
38690216 |
T |
 |
| Q |
621 |
gttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaaca |
720 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
38690217 |
gttacaaagtgtccataattaaacaacacattacacatcattatat----------taaatcc-tacttacattcatcacaattgcatatggaacaaaca |
38690305 |
T |
 |
| Q |
721 |
tacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatg |
820 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
38690306 |
tacatatataatatattattttccaccatattttgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatg |
38690405 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 373 - 825
Target Start/End: Original strand, 50113354 - 50113823
Alignment:
| Q |
373 |
aggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttt |
469 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
50113354 |
aggaaaatctcggtagttaactgccgagaaaaactgattatgcagacagtgggttctgcataattctaaa-cattttcaatccattttttcggctagttt |
50113452 |
T |
 |
| Q |
470 |
ttaac-----------cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgt |
558 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50113453 |
ttaactgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacgttgaaactcagacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgt |
50113552 |
T |
 |
| Q |
559 |
ccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacatta----- |
653 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||| | ||| | |
|
|
| T |
50113553 |
ccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataac-aaagtgtccataattaaa |
50113651 |
T |
 |
| Q |
654 |
cagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattc |
753 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
50113652 |
caactcattacacattattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattc |
50113751 |
T |
 |
| Q |
754 |
cgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
50113752 |
cgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
50113823 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 472 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 37019310 - 37018967
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||| || |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37019310 |
aaccagagtattttcaaaggtaaaataattcatacaacattgaaactcggatataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatt |
37019211 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat |
671 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||| |
|
|
| T |
37019210 |
aaaccaacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaatgttacaaagtgtccataattaaacaac----------tcattacacatcat |
37019121 |
T |
 |
| Q |
672 |
taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacg |
771 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
37019120 |
taaattaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatcctatg |
37019021 |
T |
 |
| Q |
772 |
tcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
37019020 |
tcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
37018967 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 360 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 25040115 - 25039652
Alignment:
| Q |
360 |
cagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttt |
458 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
25040115 |
cagttaattgtcgaggaaaaccttggtagttaactgttgaggaaaacatttatgcagacagtgggttctgcataattgttaagcatttcc----catttt |
25040020 |
T |
 |
| Q |
459 |
tcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatct |
547 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||| | ||||| ||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
25040019 |
tcggccagtttttacctgtaatttaaccagaacatttccaaagacaatataacttgtacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatct |
25039920 |
T |
 |
| Q |
548 |
tttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagc |
647 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | | ||||||| |||||| | |
|
|
| T |
25039919 |
tttacaattgtccataattaaatcaaactgatatttggttcaaaatacacaaaagtttaaaattcatcaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaac |
25039820 |
T |
 |
| Q |
648 |
acattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcacc |
747 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
25039819 |
acattacac----------atcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgtatatggaacgaacatacacatataatatattatcttccacc |
25039730 |
T |
 |
| Q |
748 |
atattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25039729 |
atattccgaaacataaatccgacgtcgttatcgacgcgaataagccaaggcgtatagcttgccgttttccatgcgtat |
25039652 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 387 - 825
Target Start/End: Original strand, 29352294 - 29352735
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttttta----------- |
472 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||| |
|
|
| T |
29352294 |
agttaactgccgaggaaaactgattatgcagacagtggattctacataattctaaa-catttccaaaccattttttcggccaatttttacttgtaattaa |
29352392 |
T |
 |
| Q |
473 |
accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca |
572 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
29352393 |
accagagcatttgcaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaatta |
29352492 |
T |
 |
| Q |
573 |
aaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcatt |
672 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
29352493 |
aaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatcatt |
29352582 |
T |
 |
| Q |
673 |
aagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgt |
772 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29352583 |
aaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt |
29352682 |
T |
 |
| Q |
773 |
cgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
29352683 |
cgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
29352735 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 472 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 20353849 - 20353506
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20353849 |
aaccagagcatttccaaaggtaatataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagacaaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatt |
20353750 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat |
671 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| || ||||||| | ||||| |
|
|
| T |
20353749 |
aaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattatacatcat |
20353660 |
T |
 |
| Q |
672 |
taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacg |
771 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20353659 |
taaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacg |
20353560 |
T |
 |
| Q |
772 |
tcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20353559 |
tcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
20353506 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 472 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 30909943 - 30909600
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
30909943 |
aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaacataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaatt |
30909844 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat |
671 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
30909843 |
aaaccgacgtttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaag-------tac---tcattacacatcat |
30909754 |
T |
 |
| Q |
672 |
taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacg |
771 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30909753 |
taaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatgaaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacg |
30909654 |
T |
 |
| Q |
772 |
tcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
30909653 |
tcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgctgttttccatgcgtat |
30909600 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 472 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 13633787 - 13633443
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
13633787 |
aaccagacaatttccaaaggctaaataattcatacaatattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatt |
13633688 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaa-attacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatca |
670 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
13633687 |
taaccgacattttggttaacattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatca |
13633598 |
T |
 |
| Q |
671 |
ttaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgac |
770 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13633597 |
ataaattaaatccctacttacattcaacgcaattacatatggaacaaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgac |
13633498 |
T |
 |
| Q |
771 |
gtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13633497 |
gtcgccgtcatcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
13633443 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 472 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 5082280 - 5081935
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcg--gtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaa |
569 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| | ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
5082280 |
aaccagagcattttcaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactctcagacataataaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaa |
5082181 |
T |
 |
| Q |
570 |
tcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatc |
669 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||| || ||||| ||| |
|
|
| T |
5082180 |
ttaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaag-------tac---tccttacacatc |
5082091 |
T |
 |
| Q |
670 |
attaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccga |
769 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5082090 |
attaaattaaatccatatttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccga |
5081991 |
T |
 |
| Q |
770 |
cgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
5081990 |
cgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatataccttgtcgttttccatgcgtat |
5081935 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 474 - 825
Target Start/End: Original strand, 12643369 - 12643707
Alignment:
| Q |
474 |
ccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaa |
573 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
12643369 |
ccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcagacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaa |
12643468 |
T |
 |
| Q |
574 |
accgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattca---tcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatca |
670 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||| ||||| |||| |||| | || | | || || |||||||||||||||| | |||||||| |||| |
|
|
| T |
12643469 |
accgacatttggttaaaattaaacaaacgttt--aattaagtgtctata----attaagtgtccataattaaacaac----------tcattacacatca |
12643552 |
T |
 |
| Q |
671 |
ttaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgac |
770 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12643553 |
ttaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattctgaaacataaatccgac |
12643652 |
T |
 |
| Q |
771 |
gtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12643653 |
gtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
12643707 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 510 - 825
Target Start/End: Original strand, 3944172 - 3944477
Alignment:
| Q |
510 |
attgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaa |
609 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
3944172 |
attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa |
3944271 |
T |
 |
| Q |
610 |
ttcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcata |
709 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
3944272 |
ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata |
3944361 |
T |
 |
| Q |
710 |
tagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgt |
809 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
3944362 |
tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc |
3944461 |
T |
 |
| Q |
810 |
cgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |
|
|
| T |
3944462 |
cgttttccatgcgtat |
3944477 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 473 - 825
Target Start/End: Original strand, 6558047 - 6558403
Alignment:
| Q |
473 |
accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca |
572 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
6558047 |
accagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaatta |
6558146 |
T |
 |
| Q |
573 |
aaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaa--------------acgttataaattgtccataattaaacagcacattacagct |
658 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
6558147 |
aaccgacatttggttaaaattaaacaaatgtttgaaattcatcaaattaaaccactcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---t |
6558236 |
T |
 |
| Q |
659 |
cattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaa |
758 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |
|
|
| T |
6558237 |
cattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaa |
6558336 |
T |
 |
| Q |
759 |
cataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6558337 |
cataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
6558403 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 472 - 825
Target Start/End: Original strand, 38771788 - 38772133
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatac--aatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaa |
569 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
38771788 |
aaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcctttacaattgttcataattaaa |
38771887 |
T |
 |
| Q |
570 |
tcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatc |
669 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
38771888 |
ttaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatc |
38771977 |
T |
 |
| Q |
670 |
attaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccga |
769 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38771978 |
attaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccga |
38772077 |
T |
 |
| Q |
770 |
cgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||| | ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
38772078 |
cgtcaccgtcgtcgcggataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
38772133 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 510 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 3993718 - 3993413
Alignment:
| Q |
510 |
attgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaa |
609 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
3993718 |
attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa |
3993619 |
T |
 |
| Q |
610 |
ttcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcata |
709 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
3993618 |
ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata |
3993529 |
T |
 |
| Q |
710 |
tagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgt |
809 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
3993528 |
tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc |
3993429 |
T |
 |
| Q |
810 |
cgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |
|
|
| T |
3993428 |
cgttttccatgcgtat |
3993413 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 475 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 5141780 - 5141441
Alignment:
| Q |
475 |
cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
574 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| | |||| | |||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5141780 |
cagaacatttccaaaggcaatataactcatacaacatttatactcaggcataaacaagaaaattaca-tatcttttacagttgtccataattaaatcaaa |
5141682 |
T |
 |
| Q |
575 |
ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaa |
674 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||| | || ||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||||||||| ||||||| | |||| |||| |
|
|
| T |
5141681 |
ccgacaaggggttcgaattactcgaatgtttgaaattcattaaaacgttaaatagtgtcaataattaaacaacacattata----------tatcgttaa |
5141592 |
T |
 |
| Q |
675 |
gttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcg |
774 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
5141591 |
attaaatctctactgacattctacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatattccgaaacatacatctgacgtcg |
5141492 |
T |
 |
| Q |
775 |
ctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
5141491 |
ctatcgtcgcgaataagccaacgcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
5141441 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 387 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 22346055 - 22345818
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagtttttaac----------- |
474 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
22346055 |
agttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtgggttctgcataattctaatgcatttccaagccatttttcgaccagtttttacctgtaattaagc |
22345956 |
T |
 |
| Q |
475 |
cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
574 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22345955 |
cagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggac-----caagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataagtaaatcaaa |
22345861 |
T |
 |
| Q |
575 |
ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaa |
617 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22345860 |
ccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaa |
22345818 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 381 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 46886406 - 46886137
Alignment:
| Q |
381 |
ctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttttta----- |
472 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
46886406 |
ctcggtagttaactgccgaggaaaactgattatgcagacagtgggttctgcataattctaaa-catttccaagccattttttcggctagtttttacctgt |
46886308 |
T |
 |
| Q |
473 |
------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataatt |
566 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46886307 |
aattaaaccagagcctttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataatt |
46886208 |
T |
 |
| Q |
567 |
aaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccata |
637 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
46886207 |
aaattaaaccgacatttggttaaaattacacaaacgtttgaaattcatcgaaacattacaaagtgtccata |
46886137 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 357 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 15051390 - 15051090
Alignment:
| Q |
357 |
cggcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaacca |
454 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| | |||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
15051390 |
cggcagttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccggcgaaatctgattatgcagacagtgagttctgcataattctaaa-catttccaagcca |
15051292 |
T |
 |
| Q |
455 |
ttttt-cggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaa |
542 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||| | ||||| |
|
|
| T |
15051291 |
ttttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaa |
15051192 |
T |
 |
| Q |
543 |
tatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa |
642 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15051191 |
tatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa |
15051092 |
T |
 |
| Q |
643 |
ac |
644 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
15051091 |
ac |
15051090 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 475 - 621
Target Start/End: Original strand, 94559 - 94705
Alignment:
| Q |
475 |
cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
574 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
94559 |
cagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
94658 |
T |
 |
| Q |
575 |
ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
94659 |
ccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg |
94705 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 386 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 52805572 - 52805325
Alignment:
| Q |
386 |
tagttaactgctgaggaaaacaa-ttatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta----------- |
472 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
52805572 |
tagttaattgccgaggaaaacaaattatgcagacagtgggctctgcatgattctaaa-catttccaagccatttttcggtcagcttttacctgtaattaa |
52805474 |
T |
 |
| Q |
473 |
accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca |
572 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
52805473 |
accagagtatttccaaaggcaaaataattcatataacattgaaactctgacataaataagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatta |
52805374 |
T |
 |
| Q |
573 |
aaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
52805373 |
aaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg |
52805325 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 434 - 621
Target Start/End: Original strand, 16281807 - 16282004
Alignment:
| Q |
434 |
ttctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtc |
523 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| | |
|
|
| T |
16281807 |
ttctaaaacatttccaaactatttttcggtcagtttttactgtaattaaagcagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattaaaactcggac |
16281906 |
T |
 |
| Q |
524 |
ataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
16281907 |
ataaacaagaaaaatacaatattttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg |
16282004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 472 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 22527609 - 22527460
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22527609 |
aaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatgttttacaattgtccataattaaatc |
22527510 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
22527509 |
aaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcatcataacg |
22527460 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 474 - 621
Target Start/End: Original strand, 31780128 - 31780275
Alignment:
| Q |
474 |
ccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaa |
573 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| | || |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31780128 |
ccagagcatttcgaatggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaa |
31780227 |
T |
 |
| Q |
574 |
accgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
31780228 |
accgacattaggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg |
31780275 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 475 - 617
Target Start/End: Original strand, 19521758 - 19521900
Alignment:
| Q |
475 |
cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
574 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19521758 |
cagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacagcattgaaactcggacataaacaagaaaaatactatatcttttacaattgtctataattaaatcaaa |
19521857 |
T |
 |
| Q |
575 |
ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaa |
617 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19521858 |
tcgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaa |
19521900 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 475 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 21144542 - 21144396
Alignment:
| Q |
475 |
cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
574 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21144542 |
cagagaatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcgaacataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtctataattaaatcaaa |
21144443 |
T |
 |
| Q |
575 |
ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
21144442 |
tcgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcgtcataacg |
21144396 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 472 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 470984 - 470835
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
470984 |
aaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataagtacaatatcttttaccattgttcataatttaatc |
470885 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
470884 |
aaaccgacatttggttcaaattatacaaacgtttgaaattcatcataacg |
470835 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 359 - 472
Target Start/End: Original strand, 38689964 - 38690078
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattt |
457 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
38689964 |
gcagttaactgccaaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctacataattctaaagcatttccaagccattt |
38690063 |
T |
 |
| Q |
458 |
ttcggtcagttttta |
472 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |
|
|
| T |
38690064 |
ttcggccagttttta |
38690078 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 487 - 613
Target Start/End: Original strand, 50617376 - 50617503
Alignment:
| Q |
487 |
aaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataat-acaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttg |
585 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||||||||| | ||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
50617376 |
aaaggcaaaataattcatacaacattgaaactctgacataaacaaaaaaaaacacaatattttttacaattgtccatatttaaattaaaccgacatttgg |
50617475 |
T |
 |
| Q |
586 |
ttcaaattacacaaaagtttgaaattca |
613 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
50617476 |
ttcaaattacacaaacgtttgaaattca |
50617503 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 578 - 722
Target Start/End: Original strand, 1179878 - 1180022
Alignment:
| Q |
578 |
acattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagtt |
677 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| | | |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||| || |
|
|
| T |
1179878 |
acatttcgttaaaattacacgaatgtttgaaattcatcaaaacattaaagagtgtccacaattaaacaacacattacaacacattaaatattgttaaatt |
1179977 |
T |
 |
| Q |
678 |
aaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacata |
722 |
Q |
| |
|
|||| | || |||||| | || ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1179978 |
aaatatttgctgacattctacgcagttgcagatagaacgaacata |
1180022 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 472 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 47715001 - 47714877
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | | |||||| | || ||||| ||| | |||| ||||||||||| || |||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
47715001 |
aaccagagcatttccagaaacaatattagtcgtacaacatttatactcagtcataaacaacaaaaatacattatcttttatagctgtccataattgaatc |
47714902 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattaca |
596 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
47714901 |
aatccgacatttcattaaaattaca |
47714877 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 408
Target Start/End: Original strand, 50617238 - 50617287
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaa |
408 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
50617238 |
gcagttaactgtcaaggaaaacctcgggagttaactgccgaggaaaacaa |
50617287 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 472 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 23359263 - 23359217
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaact |
518 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23359263 |
aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaact |
23359217 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 522 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 10165703 - 10165606
Alignment:
| Q |
522 |
tcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaa |
619 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||| || |||||| || |||| | | ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10165703 |
tcataagcaagaacaatgcataatctttcaccattgacaaaaattaaatcaattcaacattttgttaaaattacacgaatgtttgaaattcaacaaaa |
10165606 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 388 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 47715089 - 47715044
Alignment:
| Q |
388 |
gttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcata |
432 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
47715089 |
gttaactgctgaggaaagcaattatgcagacagtgggttctgcata |
47715044 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 389 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 18610242 - 18609808
Alignment:
| Q |
389 |
ttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------acca |
476 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
18610242 |
ttaactgccgaggaaaacaactatgcagatagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagccatttttcggtcagtttttacatgtaattaaacca |
18610143 |
T |
 |
| Q |
477 |
gagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacc |
576 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18610142 |
gagcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacc |
18610043 |
T |
 |
| Q |
577 |
gacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagt |
676 |
Q |
| |
|
||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| || |||| | |
|
|
| T |
18610042 |
gacatctggttcgaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatgattatat |
18609953 |
T |
 |
| Q |
677 |
taaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgct |
776 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18609952 |
taaatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatataattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgct |
18609853 |
T |
 |
| Q |
777 |
atcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgc |
821 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18609852 |
atcgtctttaataagccaaggcatataacttgtcgttttccatgc |
18609808 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 387 - 814
Target Start/End: Original strand, 29286264 - 29286693
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------ac |
474 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
29286264 |
agttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtaggttctgcataattctaaagcatttccaagccatttttcggccagtttttacttgtaattaaac |
29286363 |
T |
 |
| Q |
475 |
cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
574 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29286364 |
cagagcattttcaaaggcaatataaatcatacaacgttgaaactcggtcttaaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
29286463 |
T |
 |
| Q |
575 |
ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaa |
674 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
29286464 |
ccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcattaa |
29286553 |
T |
 |
| Q |
675 |
gttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcg |
774 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29286554 |
attaaacctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcg |
29286653 |
T |
 |
| Q |
775 |
ctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgttt |
814 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
29286654 |
ctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagtttgccgttt |
29286693 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 359 - 825
Target Start/End: Original strand, 23958923 - 23959392
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaa-ttatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatt |
456 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23958923 |
gcagttaaatgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgagaaaaactggttatgcagacagtggattctgcataattctaaagcatttccaagccatt |
23959022 |
T |
 |
| Q |
457 |
tttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatat |
545 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
23959023 |
tttcgaccagattttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatat |
23959122 |
T |
 |
| Q |
546 |
cttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaaca |
645 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
23959123 |
tttttacaattgttcataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaatgttacatagtgtccataattaaaca |
23959222 |
T |
 |
| Q |
646 |
gcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttca |
745 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
23959223 |
acacattacac----------atcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatcttaca |
23959312 |
T |
 |
| Q |
746 |
ccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23959313 |
ccatattccgaaacataaatccaacgtcgctatcgtcgtgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
23959392 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 404 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 29667827 - 29667394
Alignment:
| Q |
404 |
aacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaagg |
491 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||| || |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29667827 |
aacatttatgcagacagtgggttttgcataattccaaagcacttccaagccatttttcggccagtttttatctgtaatttaaccagagcattttcaaagg |
29667728 |
T |
 |
| Q |
492 |
caatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaa |
591 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||| || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
29667727 |
caatataacttatacaacttttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaa |
29667628 |
T |
 |
| Q |
592 |
ttacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttac |
691 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
29667627 |
atacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacacagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttac |
29667528 |
T |
 |
| Q |
692 |
attcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataag |
791 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
29667527 |
attcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattaacttccaccatattccgaaacataaatctgacatcgctatcgtcacgaataag |
29667428 |
T |
 |
| Q |
792 |
ccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
29667427 |
ccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
29667394 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 387 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 25141117 - 25140676
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------ac |
474 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| || |
|
|
| T |
25141117 |
agttaactgccgaggaaaacaattatggagacagtgggttctgcataattctaaagcattttcaagccatttttcggccaagttttacctgtaattaaac |
25141018 |
T |
 |
| Q |
475 |
cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
574 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25141017 |
cagaacatttccaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggccataaacaagaaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaa |
25140918 |
T |
 |
| Q |
575 |
ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaa |
674 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
25140917 |
ccgacatttggttcaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaacacgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcattaa |
25140828 |
T |
 |
| Q |
675 |
gttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacataca-tatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtc |
773 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25140827 |
attaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacattatataatatattatctttcaccatattccgaaacataaatgcgacgtc |
25140728 |
T |
 |
| Q |
774 |
gctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
25140727 |
gctatcgtcacgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtat |
25140676 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 390 - 825
Target Start/End: Original strand, 7537250 - 7537702
Alignment:
| Q |
390 |
taactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------acca |
476 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
7537250 |
taactgccgaggaaaactgattatgcagacagtgaattctgcataattctaaagcatttccaagccatttttcggccagtttttacctgtaattaaacca |
7537349 |
T |
 |
| Q |
477 |
gagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacc |
576 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7537350 |
gagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacc |
7537449 |
T |
 |
| Q |
577 |
gacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacatatcatt |
672 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||| || | ||| ||||| || |||||| |
|
|
| T |
7537450 |
gacatttggttaaaattacacaaacgtttgaaattcatctaaacattacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaaatcattgcacatcatt |
7537549 |
T |
 |
| Q |
673 |
aagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgt |
772 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7537550 |
aaattaaatccctacttacattcaacgcaaatgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt |
7537649 |
T |
 |
| Q |
773 |
cgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
7537650 |
cgctatcgtcgcgaataagccaaggcatataacttgctgttttccatgcgtat |
7537702 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 359 - 825
Target Start/End: Original strand, 2051061 - 2051543
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattt |
457 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
2051061 |
gcagttaactgccgaggaaaacctcggtagttatctgcagaggaaaacaattatgcagacagtgggttatgcataattctaatgcattttcaagcaattt |
2051160 |
T |
 |
| Q |
458 |
ttcggtcagtttttaac-----------cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatc |
546 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
2051161 |
ttcggccagtttttatctgtaattaaaacagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcgatcataaccaagaaaaatacaatatc |
2051260 |
T |
 |
| Q |
547 |
ttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa---- |
642 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
2051261 |
ttttacagttgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgataaaaagtgttaataattaagtgt |
2051360 |
T |
 |
| Q |
643 |
acagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttt |
742 |
Q |
| |
|
|| | ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
2051361 |
tcataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatctt |
2051460 |
T |
 |
| Q |
743 |
tcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
2051461 |
ccaccatatttcgaaacataaatccgacgtcgccatcgtcgcgaataagccaagacatataacttgccgttttccatgcgtat |
2051543 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 359 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 28362771 - 28362292
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca--attatgcaa-cagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccat |
455 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
28362771 |
gcagttaactgccgaggaaaacctcgatagttaactgcagaggaaatctggattatgcaggcagtgtgttctgcataattctaaa-catttccaagccat |
28362673 |
T |
 |
| Q |
456 |
ttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaata |
544 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
28362672 |
ttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataaatcatataacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaata |
28362573 |
T |
 |
| Q |
545 |
tcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaa- |
643 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
28362572 |
tcttttacagttgtctaaaattaaattaaaccgacatttggttcaaattacacaaccgattgaaattcaacaaaacgttacaaagtgttcataattaaat |
28362473 |
T |
 |
| Q |
644 |
---cagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatt |
740 |
Q |
| |
|
|| || ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28362472 |
gtccatcattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacatacattctacacaattgcatatcgatcgaacatacatatataatatattatc |
28362373 |
T |
 |
| Q |
741 |
tttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgc |
821 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |
|
|
| T |
28362372 |
ttccaccatattctgaaacataaattcgacgtcgctatcatcgcaaataagccaaggcatatagcttgccattttccatgc |
28362292 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 387 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 31151076 - 31150636
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaacaa-ttatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagtttttaac---------- |
474 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
31151076 |
agttaactgccaaggaaaacaaattatgcagactgtgggttctgcataattctaaat-atttccaagccatttttcgcccagtttttacctataattaat |
31150978 |
T |
 |
| Q |
475 |
-cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaa |
573 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31150977 |
ccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaaggtaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaa |
31150878 |
T |
 |
| Q |
574 |
accgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcatta |
673 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
31150877 |
accgacatttggttccaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcatta |
31150788 |
T |
 |
| Q |
674 |
agttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtc |
773 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31150787 |
aattaaatccctacatacattcaacgcaattgcatatcgatcaaacatacatatataatatattatcttccaccatattctaaaacataaatccgacgtc |
31150688 |
T |
 |
| Q |
774 |
gctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
31150687 |
gctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccaagcgtat |
31150636 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 357 - 825
Target Start/End: Original strand, 13382660 - 13383143
Alignment:
| Q |
357 |
cggcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaacca |
454 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||| |||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
13382660 |
cggcagttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaaactgattatgcagacagtgggt-ctgcataattgtaaa-catttccaagcca |
13382757 |
T |
 |
| Q |
455 |
tttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaat |
543 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| | |||||| |
|
|
| T |
13382758 |
tttttcgaccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagtttgaaactcggacataataaagataactacaat |
13382857 |
T |
 |
| Q |
544 |
atcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaa--------------acgttataaat |
629 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||| |
|
|
| T |
13382858 |
atcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaattaaactactcaaaacattacaaag |
13382957 |
T |
 |
| Q |
630 |
tgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatat |
729 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13382958 |
tgtccataattaaac-------tac---tcattgcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatat |
13383047 |
T |
 |
| Q |
730 |
aatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13383048 |
aatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatataacttgacgttttccatgcgtat |
13383143 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 472 - 825
Target Start/End: Original strand, 1608451 - 1608796
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatac--aatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaa |
569 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| | ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1608451 |
aaccagagcatttccaaaagtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaa |
1608550 |
T |
 |
| Q |
570 |
tcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatc |
669 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
1608551 |
ttaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatc |
1608640 |
T |
 |
| Q |
670 |
attaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccga |
769 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1608641 |
attaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccga |
1608740 |
T |
 |
| Q |
770 |
cgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1608741 |
cgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
1608796 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 376 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 26702721 - 26702448
Alignment:
| Q |
376 |
aaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagca---tttccaaaccatttttcggtcagttttt |
471 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | | |||||| | || || |
|
|
| T |
26702721 |
aaaacctcgatagttaactg---aggaaaacaattatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcccatttttcgaccaatttttacat--gtaatt |
26702627 |
T |
 |
| Q |
472 |
aac-cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaat |
570 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26702626 |
aaatcagagcatttccaaaggcagtataaatcatacaacatagaaattcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaat |
26702527 |
T |
 |
| Q |
571 |
caaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcaca |
650 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
26702526 |
-aaaccgacatttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaacaca |
26702448 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 359 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 11840290 - 11840022
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgcaa-cagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatt |
456 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
11840290 |
gcagttaactgtcgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaatctgattatgcaggcagtgagctctgcataattctaaaacatttccaagccatt |
11840191 |
T |
 |
| Q |
457 |
tttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatat |
545 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11840190 |
tttcggccagtttttacctgtaattaaaccagaacatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcgaacataaacaagataaatacaatat |
11840091 |
T |
 |
| Q |
546 |
cttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcat |
614 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
11840090 |
cttttacaattgttcataattaaatcaaaccgacatttgattcaaattacacaaacgtttgaaattcat |
11840022 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 566 - 825
Target Start/End: Original strand, 2259338 - 2259586
Alignment:
| Q |
566 |
taaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattaca |
665 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||| || |||| | |
|
|
| T |
2259338 |
taaatgaaaccgacatttggttcaaaatgcacaaaatgttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaacttattaaa |
2259437 |
T |
 |
| Q |
666 |
tatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaat |
765 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||||| | | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
2259438 |
t----------taaatccttacttacattcaacgta-ttgcatatggaacaaacatgcatatataatatattattttccaccatatttcgaaacataaat |
2259526 |
T |
 |
| Q |
766 |
ccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
2259527 |
ctgacgtcgctttcgtctttaataagccaatgcatatagcttgtcgttttctatgcgtat |
2259586 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 358 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 18351684 - 18351385
Alignment:
| Q |
358 |
ggcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccat |
455 |
Q |
| |
|
||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| || |||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||| |
|
|
| T |
18351684 |
ggcagttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaagaaatctgattatgcagacagtgggttctgcataattctaaa-catttccgagccat |
18351586 |
T |
 |
| Q |
456 |
tttt-cggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaat |
543 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||| | |||||| |
|
|
| T |
18351585 |
tttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcattttcaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaat |
18351486 |
T |
 |
| Q |
544 |
atcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaa |
643 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18351485 |
atcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaa |
18351386 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 516 - 799
Target Start/End: Original strand, 34230682 - 34230956
Alignment:
| Q |
516 |
actcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaag-tttgaaattcat |
614 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| || || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || | |||||||||||| |
|
|
| T |
34230682 |
actcagtcataaagaataaaaatacattatcttttacaattgtctataattaaatcaaaccgacatttcgttaaaattacatgaatgctttgaaattcat |
34230781 |
T |
 |
| Q |
615 |
caaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaa |
714 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | | |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||| |||| ||||| || ||| |
|
|
| T |
34230782 |
caaaacattaaagagtgtccataattaaacaaca----------cattacacatcgttaaattaaatctctactaacattctacacagttgcagatggaa |
34230871 |
T |
 |
| Q |
715 |
cgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggca |
799 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
34230872 |
cgaacatacatatataatatattatcttctaccatattctaaaacataaatcggacgtcactatcctcttgaataagccaaggca |
34230956 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 473 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 3502577 - 3502429
Alignment:
| Q |
473 |
accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca |
572 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3502577 |
accagagcatttcaaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaacttggccataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca |
3502478 |
T |
 |
| Q |
573 |
aaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
3502477 |
aaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg |
3502429 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 480 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 31771646 - 31771505
Alignment:
| Q |
480 |
catttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgac |
579 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31771646 |
catttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagaaaaatacaatattttttacaattgttcataattaaattaaaccgac |
31771547 |
T |
 |
| Q |
580 |
attttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
31771546 |
atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg |
31771505 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 472 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 20448701 - 20448506
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20448701 |
aaccagagcatttacagaggcaatataactcatacaccatttatacttagtcataaacaagaagaatacattatcttttacagttgtccataattaaatc |
20448602 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacata |
667 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||| |||||| | || ||||||||||||| ||||| ||| | | |||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
20448601 |
aatccgacatttcgttaaaattagaggaatgtttgaaattcataaaaacattaaagagtgtccataattaaacaacacatttcatatcattacata |
20448506 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 402 - 568
Target Start/End: Original strand, 2258362 - 2258540
Alignment:
| Q |
402 |
aaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaa |
489 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
2258362 |
aaaacaattatgcagacagtgaattctgcataattctaaagaattttcaagtcatttttcagtcagattttacttgtaattaaaccagagcattttcaaa |
2258461 |
T |
 |
| Q |
490 |
ggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaa |
568 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2258462 |
ggcaatataactcatacaacatttaaactcagtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaa |
2258540 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 472 - 591
Target Start/End: Original strand, 8304596 - 8304715
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8304596 |
aaccagagcatttccaaagccaatatacctcatacaacatttgcactcagtcataaacaagaaaaatacattatcttttacaattgtccataattaaatc |
8304695 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaa |
591 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8304696 |
aaaccgacatttggttcaaa |
8304715 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 472 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 20439919 - 20439753
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||| || ||||||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20439919 |
aaccagagcatttccagaggcaatacaactcatacaccatttatacttagtcataaacaagaggaatacattatcttttacagttgtccataattaaatc |
20439820 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataa |
638 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||| |
|
|
| T |
20439819 |
aatccgacattttgttaaaattacaggaatgtttgaaattcatgaaaacattaaagagtgtccataa |
20439753 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 472 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 20436211 - 20436063
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || |||| || ||||||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
20436211 |
aaccagagcatttccagagaaaatacaattcatacaccatttatacttagtcataaacaagaggaatacattatcttttacagttgtccatgattaaatc |
20436112 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaac |
620 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20436111 |
aatccgacattttattaaaattacatgaatgtttgaaattcatgaaaac |
20436063 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 516 - 620
Target Start/End: Original strand, 19129180 - 19129281
Alignment:
| Q |
516 |
actcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatc |
615 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
19129180 |
actcagtcataaacaagaatg---cattatcttttacagttgtccataattaaatcaatctgacatttcgttgaaattacacgaatgtttgaaattcatc |
19129276 |
T |
 |
| Q |
616 |
aaaac |
620 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
19129277 |
aaaac |
19129281 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 359 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 13388748 - 13388702
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaa |
405 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
13388748 |
gcagttaactgtcgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaaa |
13388702 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26702793 - 26702747
Alignment:
| Q |
298 |
ttgttgtagacacgttgcataaggttgtttcacacgagtaaaatacg |
344 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26702793 |
ttgttgttgacacattgcataaggctgtgtcacacgagtaaaatacg |
26702747 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 717 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 20448466 - 20448386
Alignment:
| Q |
717 |
aacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggc |
798 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
20448466 |
aacacacatatataatatattatctt-caacatatacctaaacataaatgaaacgtcgctatcgtcacgaataagccaaggc |
20448386 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 357 - 406
Target Start/End: Original strand, 26712079 - 26712128
Alignment:
| Q |
357 |
cggcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaac |
406 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
26712079 |
cggcagttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaaac |
26712128 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 357 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 27641760 - 27641715
Alignment:
| Q |
357 |
cggcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgagga |
402 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27641760 |
cggcagttcagtgtcgaggaaaacctcggtagttaactgctgagga |
27641715 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 37)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 376 - 825
Target Start/End: Original strand, 41004578 - 41005038
Alignment:
| Q |
376 |
aaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-- |
472 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
41004578 |
aaaacttcggtagttaactgccgaggaaaaatattatgcagacagtggattctgcataattctaaagcatttcaaagccatttt-cggtcagtttttacc |
41004676 |
T |
 |
| Q |
473 |
---------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccata |
563 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
41004677 |
tgtaattaaaccgaagcatttccaaagacaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatataatatcttttacaattgtctata |
41004776 |
T |
 |
| Q |
564 |
attaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcatta |
663 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
41004777 |
attaaatcaaaccaacatttggtttaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaacacattacaactcatta |
41004876 |
T |
 |
| Q |
664 |
catatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataa |
763 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
41004877 |
cacatcattatattaaatcactacttacattcatcacaattgcatatggaatgaacatacatatataatatataatttttcaacatattctgaaacataa |
41004976 |
T |
 |
| Q |
764 |
atccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41004977 |
atctgacgtcccaatcgtctttaataagccagggcatgtagcttgtcgttttccatgcgtat |
41005038 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 359 - 825
Target Start/End: Original strand, 43943722 - 43944203
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaa-caattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatt |
456 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| | | ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43943722 |
gcagttaactgtcgaggaaaaactcggtagttaactgccgaggaaaaacaattatgcagagaatgggttatgcataattctaaagcatttccaagccatt |
43943821 |
T |
 |
| Q |
457 |
tttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaa--tataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaat |
543 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
43943822 |
tttcggtcagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaatataaatcatacaacattaaaactcggtcataaacaagaaaaatacaat |
43943921 |
T |
 |
| Q |
544 |
atcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaa |
643 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
43943922 |
atcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacaaaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccatgcataaa |
43944021 |
T |
 |
| Q |
644 |
cagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattattttt |
743 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
43944022 |
caacacattacaattcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatatattatattatcttc |
43944121 |
T |
 |
| Q |
744 |
caccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
43944122 |
caccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcatcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
43944203 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 424 - 825
Target Start/End: Original strand, 12905622 - 12906031
Alignment:
| Q |
424 |
ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta--------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaa |
515 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| || |
|
|
| T |
12905622 |
ttctgcataattctaaagcatttccaagccatttttcgaccagtttttactaatttaaccagagcatttccaaaggcaatataactcatacaacatttaa |
12905721 |
T |
 |
| Q |
516 |
actcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatc |
615 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12905722 |
actcagtcataaacaagtaaaatacaatatattttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatc |
12905821 |
T |
 |
| Q |
616 |
aaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaac |
715 |
Q |
| |
|
||||||||| | | |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12905822 |
aaaacgttacatagtgtcaataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatccgtacttacattcaacgcaattgcatatggaac |
12905921 |
T |
 |
| Q |
716 |
gaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttc |
815 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12905922 |
aaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgttgtttt |
12906021 |
T |
 |
| Q |
816 |
ccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
12906022 |
ccatgcgtat |
12906031 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 386 - 814
Target Start/End: Original strand, 28342583 - 28343014
Alignment:
| Q |
386 |
tagttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------a |
473 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
28342583 |
tagttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtgggttctgcataattctaaagaatttccaaactatttttcggccagtttttatctgtaattaaa |
28342682 |
T |
 |
| Q |
474 |
ccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaa |
573 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28342683 |
ccagaacatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaa |
28342782 |
T |
 |
| Q |
574 |
accgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcatta |
673 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
28342783 |
accgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgttcataattaaaca----at------tcattacacatcatta |
28342872 |
T |
 |
| Q |
674 |
agttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccg-aaacataaatccgacgt |
772 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28342873 |
aattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaaacataaatccgacgt |
28342972 |
T |
 |
| Q |
773 |
cgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgttt |
814 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28342973 |
cgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttt |
28343014 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 359 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 82302 - 81821
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattt |
457 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
82302 |
gcagttaactgtcgaggaaaacctccgtagttaactgctgaggaaaacaattatgcagacaatgagttctgcataattctaaagcattttcaaaccattt |
82203 |
T |
 |
| Q |
458 |
ttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatc |
546 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
82202 |
ttcggtcagtttttacctgtaattaaaccagagcatttctaaaggcagtataaatcatccaacatcaaaacttggtcataaacaagaaaaatacaatatc |
82103 |
T |
 |
| Q |
547 |
ttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa-aca |
645 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
82102 |
ttttacaattgtccat-attaaatcaaaccgacatttgattcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgt |
82004 |
T |
 |
| Q |
646 |
gcacatt---acagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttt |
742 |
Q |
| |
|
||| | | ||| ||||||||| || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
82003 |
gcataattaaacaactcattacacatgattatattaaatgcatacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatttt |
81904 |
T |
 |
| Q |
743 |
tcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
81903 |
caaccatattccgaaacataaatccgacgtcgttatcgtctttaataagtcaagggatatagcttgccgttttccatgcgtat |
81821 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 389 - 825
Target Start/End: Original strand, 41181474 - 41181912
Alignment:
| Q |
389 |
ttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------acca |
476 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| |
|
|
| T |
41181474 |
ttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtgggttatgcataattctaatgcatttccaagccattttttgggcagtttttacctgtaattaaacca |
41181573 |
T |
 |
| Q |
477 |
gagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacc |
576 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41181574 |
gagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataactaagaaaaatacaatatcttttacagttgtccataattaaatcaaacc |
41181673 |
T |
 |
| Q |
577 |
gacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagt |
676 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
41181674 |
gacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcattaaat |
41181763 |
T |
 |
| Q |
677 |
taaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgct |
776 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41181764 |
taaatccctacttacattcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgct |
41181863 |
T |
 |
| Q |
777 |
atcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41181864 |
atcgtcgcgtataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
41181912 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 427 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 439792 - 439381
Alignment:
| Q |
427 |
tgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaa |
515 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
439792 |
tgcataattctaaagcatttccaagccatttttcggtcagtttttacctgtaattaaaccagcgcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaa |
439693 |
T |
 |
| Q |
516 |
actcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatc |
615 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
439692 |
actcggtcataaacaagaa--atacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatc |
439595 |
T |
 |
| Q |
616 |
aaaacgttataaattgtccataattaaa----cagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatata |
711 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||| | ||||||||||| || | ||| ||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
439594 |
aaagcgttacaaagtatccataattaagtgttcataattaaacaactcattacacatgattatattaaatccctccttacattcatcacaattgcatatg |
439495 |
T |
 |
| Q |
712 |
gaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcg |
811 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
439494 |
gaacgaacatacatatataatatattactttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccagggcatatagcttgccg |
439395 |
T |
 |
| Q |
812 |
tttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |
|
|
| T |
439394 |
ttttccatgcgtat |
439381 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 373 - 825
Target Start/End: Original strand, 24601686 - 24602153
Alignment:
| Q |
373 |
aggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagtttt |
470 |
Q |
| |
|
|||||| | ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24601686 |
aggaaatcttcggtagttaactgccgaggaaaactgattatgcagacagtggattctacataattcaaaagcatttccaagccatttttcggtcagtttt |
24601785 |
T |
 |
| Q |
471 |
ta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtc |
559 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24601786 |
tacttgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtc |
24601885 |
T |
 |
| Q |
560 |
cataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattaca |
655 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || | ||| |
|
|
| T |
24601886 |
cataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacagacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaaca |
24601985 |
T |
 |
| Q |
656 |
gctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccg |
755 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
24601986 |
actcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacat--atatataatatattatcttccaccatattccg |
24602083 |
T |
 |
| Q |
756 |
aaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
24602084 |
aaaaataaatccgacgttgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatccgtat |
24602153 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 373 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 24612428 - 24611961
Alignment:
| Q |
373 |
aggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagtttt |
470 |
Q |
| |
|
|||||| | ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24612428 |
aggaaatcttcggtagttaactgccgaggaaaactgattatgcagacagtggattctacataattcaaaagcatttccaagccatttttcggtcagtttt |
24612329 |
T |
 |
| Q |
471 |
ta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtc |
559 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24612328 |
tacttgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtc |
24612229 |
T |
 |
| Q |
560 |
cataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattaca |
655 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || | ||| |
|
|
| T |
24612228 |
cataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacagacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaaca |
24612129 |
T |
 |
| Q |
656 |
gctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccg |
755 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
24612128 |
actcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacat--atatataatatattatcttccaccatattccg |
24612031 |
T |
 |
| Q |
756 |
aaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
24612030 |
aaaaataaatccgacgttgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatccgtat |
24611961 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 373 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 9660081 - 9659611
Alignment:
| Q |
373 |
aggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttt |
471 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
9660081 |
aggaaaaccttggtagttaattgccgaggaaaacaattatgcagacagtgggttatgcataattctaaaacatttccaagccatttttcggccagttttt |
9659982 |
T |
 |
| Q |
472 |
a-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtcc |
560 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9659981 |
acctttaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtcc |
9659882 |
T |
 |
| Q |
561 |
ataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacag |
656 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| || | ||| |
|
|
| T |
9659881 |
ataattaaatcaaaacgacatttggttaaaattacacaaacgcttgaaattcatcaaaacgttacacagtgtccataattaagtgtccataattaaacaa |
9659782 |
T |
 |
| Q |
657 |
ctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatac--atatataatatattatttttcaccatattcc |
754 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
9659781 |
ctcattacacatcattaaattaaatacctacttacattcaacgcaattgcatattgaacgaacatacaaatataaaatatattatcttccaccatattcc |
9659682 |
T |
 |
| Q |
755 |
gaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
9659681 |
gaaacataaactcgacgtcgctatcgtcacgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
9659611 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 387 - 825
Target Start/End: Original strand, 41052683 - 41053135
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------ac |
474 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
41052683 |
agttaattgccgaggaaaataattatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagccatttttcggccagtttttacctgtaattaaac |
41052782 |
T |
 |
| Q |
475 |
cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
574 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41052783 |
cagagtatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
41052882 |
T |
 |
| Q |
575 |
ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacatatca |
670 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || | ||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
41052883 |
ccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaattcattacacatca |
41052982 |
T |
 |
| Q |
671 |
ttaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatata--gaacgaacatacatatat-aatatattatttttcaccatattccgaaacataaatcc |
767 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41052983 |
-----ttaaattcctacttacattcaatgcaattgcatatatggaacgaacacacatatataaatatattatcttccaccatattccgaaacataaatcc |
41053077 |
T |
 |
| Q |
768 |
gacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |
|
|
| T |
41053078 |
gacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttggcgttttcaatgcgtat |
41053135 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 408 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 45479811 - 45479392
Alignment:
| Q |
408 |
attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaat |
495 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
45479811 |
attatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcattttcaagctatttttcggccagtttttacttgtaatttaaccagagcatttccaaaggcaat |
45479712 |
T |
 |
| Q |
496 |
ataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattac |
595 |
Q |
| |
|
|||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
45479711 |
ataactaatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatac |
45479612 |
T |
 |
| Q |
596 |
acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattc |
695 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45479611 |
aaaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaaca----------cattacacatcattaaattaaatccctacttacattc |
45479522 |
T |
 |
| Q |
696 |
atcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaa |
795 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
45479521 |
aacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgccgatatcgtcgcgaataagccaa |
45479422 |
T |
 |
| Q |
796 |
ggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
45479421 |
ggcatatagcttgccgttttccatgtgtat |
45479392 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 387 - 825
Target Start/End: Original strand, 1096630 - 1097085
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttttta----------- |
472 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
1096630 |
agttaactgccgaggaaaactgattatgaagacagtgggttatgcataattctaaa-catttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaa |
1096728 |
T |
 |
| Q |
473 |
accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca |
572 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
1096729 |
accagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattaaaactcggacataaacaagataaatacagtatcttttacaattgtccataattaaatta |
1096828 |
T |
 |
| Q |
573 |
aaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacatat |
668 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || | ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1096829 |
aaccgacatttggttcaaactacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgttcataattaaacaactcattacatat |
1096928 |
T |
 |
| Q |
669 |
cattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccg |
768 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
1096929 |
cattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaattcg |
1097028 |
T |
 |
| Q |
769 |
acgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1097029 |
acgtcgctatcgtcgcaaataagcccaagcatataacttgccgttttccatgcgtat |
1097085 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 357 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 7267486 - 7267015
Alignment:
| Q |
357 |
cggcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaacca |
454 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
7267486 |
cggcagttaactgccaaggaaaatctcggtagttaactgccgaggaaatctgattatgcagacagtgggt-ctgcataattgtaaagcatttccaagcca |
7267388 |
T |
 |
| Q |
455 |
ttttt-cggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaa |
542 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| | |||||| |||||||||||| ||||| |||| | ||||| |
|
|
| T |
7267387 |
ttttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataatttatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaa |
7267288 |
T |
 |
| Q |
543 |
tatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa |
642 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7267287 |
tatcttttacaattgttcataattaaattaaacctacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa |
7267188 |
T |
 |
| Q |
643 |
acagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttt |
742 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
7267187 |
ac-------tac---tcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatctt |
7267098 |
T |
 |
| Q |
743 |
tcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
7267097 |
ccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggtatatagcttgtcgttttccatgcgtat |
7267015 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 472 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 24753938 - 24753595
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
24753938 |
aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactgggacataaacaagataaatacaatatcttttacaatttttcataattaaatt |
24753839 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat |
671 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24753838 |
aaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcat |
24753749 |
T |
 |
| Q |
672 |
taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacg |
771 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
24753748 |
taaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacaaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatacgatg |
24753649 |
T |
 |
| Q |
772 |
tcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
24753648 |
tcgccgtcgtcgcgaataagcaaaagcatatagcttgccgttttccatacgtat |
24753595 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 387 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 39798451 - 39798011
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttttta----------- |
472 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
39798451 |
agttaactgccgaggaaaactgattatgcagacagtgggttctgcataattctaga-catttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaa |
39798353 |
T |
 |
| Q |
473 |
accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca |
572 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
39798352 |
accagacaatttccaaaggttaaataattcatacaatattgaaactcggtcataatcaagataaatgcaatatcttttacaattgttcataattaaatta |
39798253 |
T |
 |
| Q |
573 |
aaccgacattttgttcaa-attacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat |
671 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
39798252 |
aaccgacattttggttaacattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaa--gtccataattaaac-------tac---tcattacacatcat |
39798165 |
T |
 |
| Q |
672 |
taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacg |
771 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39798164 |
taaattaaatctctacttacattcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacg |
39798065 |
T |
 |
| Q |
772 |
tcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
39798064 |
tcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
39798011 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 472 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 41564406 - 41564061
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatac--aatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaa |
569 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41564406 |
aaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaa |
41564307 |
T |
 |
| Q |
570 |
tcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatc |
669 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
41564306 |
ttaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatc |
41564217 |
T |
 |
| Q |
670 |
attaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccga |
769 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41564216 |
attaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccga |
41564117 |
T |
 |
| Q |
770 |
cgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41564116 |
cgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
41564061 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 359 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 25184870 - 25184606
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaattatgcaa-cagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattt |
457 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
25184870 |
gcagttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaaacaattatgtaaacagtgggttctgtataattctaaaacatttccaagccattt |
25184771 |
T |
 |
| Q |
458 |
ttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatc |
546 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25184770 |
ttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagtattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatc |
25184671 |
T |
 |
| Q |
547 |
ttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaatt |
611 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25184670 |
ttttacaattgtccataattaaatcaaaccgatatttggttcaaattacacaaacgtttgaaatt |
25184606 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 359 - 825
Target Start/End: Original strand, 3795370 - 3795852
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatt |
456 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3795370 |
gcagttaactgccgaggaaaaccttggaagttaactgccgaggaaaactgattatgcagacagtgggt-ctgcataattctaaa-catttccaagccatt |
3795467 |
T |
 |
| Q |
457 |
tttc-ggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaata |
544 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||| | ||||||| |
|
|
| T |
3795468 |
tttttggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaata |
3795567 |
T |
 |
| Q |
545 |
tcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaa--------------acgttataaatt |
630 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||| | |
|
|
| T |
3795568 |
tcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaattaaactactcaaaacattacaaagt |
3795667 |
T |
 |
| Q |
631 |
gtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatata |
730 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3795668 |
gtccataattaaac-------tac---tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatata |
3795757 |
T |
 |
| Q |
731 |
atatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
3795758 |
atatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcacgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
3795852 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 510 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 5351607 - 5351302
Alignment:
| Q |
510 |
attgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaa |
609 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
5351607 |
attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa |
5351508 |
T |
 |
| Q |
610 |
ttcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcata |
709 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
5351507 |
ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata |
5351418 |
T |
 |
| Q |
710 |
tagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgt |
809 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
5351417 |
tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc |
5351318 |
T |
 |
| Q |
810 |
cgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |
|
|
| T |
5351317 |
cgttttccatgcgtat |
5351302 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 510 - 825
Target Start/End: Original strand, 10620171 - 10620476
Alignment:
| Q |
510 |
attgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaa |
609 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
10620171 |
attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa |
10620270 |
T |
 |
| Q |
610 |
ttcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcata |
709 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
10620271 |
ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata |
10620360 |
T |
 |
| Q |
710 |
tagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgt |
809 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10620361 |
tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc |
10620460 |
T |
 |
| Q |
810 |
cgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |
|
|
| T |
10620461 |
cgttttccatgcgtat |
10620476 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 510 - 825
Target Start/End: Original strand, 209182 - 209487
Alignment:
| Q |
510 |
attgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaa |
609 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
209182 |
attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa |
209281 |
T |
 |
| Q |
610 |
ttcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcata |
709 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
209282 |
ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacata |
209371 |
T |
 |
| Q |
710 |
tagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgt |
809 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
209372 |
tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc |
209471 |
T |
 |
| Q |
810 |
cgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |
|
|
| T |
209472 |
cgttttccatgcgtat |
209487 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 472 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 38950480 - 38950232
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
38950480 |
aaccagagcatttccaaaggtaatataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatt |
38950381 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat |
671 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38950380 |
aaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcat |
38950291 |
T |
 |
| Q |
672 |
taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatata |
730 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38950290 |
taaattaaatccctacttacattcaacacaattacatatggaacgaacatacatatata |
38950232 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 472 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 39951085 - 39950936
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39951085 |
aaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
39950986 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
39950985 |
aaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcatcataacg |
39950936 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 472 - 621
Target Start/End: Original strand, 10825377 - 10825526
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10825377 |
aaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcagacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
10825476 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
10825477 |
aaacagacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg |
10825526 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 475 - 621
Target Start/End: Original strand, 32952892 - 32953038
Alignment:
| Q |
475 |
cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
574 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| | ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
32952892 |
cagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcagacatcaacaagaaaaatacaatattttttacaattgtccataattaaattaaa |
32952991 |
T |
 |
| Q |
575 |
ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
32952992 |
ccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg |
32953038 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 475 - 621
Target Start/End: Original strand, 29398071 - 29398213
Alignment:
| Q |
475 |
cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
574 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
29398071 |
cagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataa----gaaaaatacaatattttttacaattgtccataattaaattaaa |
29398166 |
T |
 |
| Q |
575 |
ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
29398167 |
ccgacatttagttcaaattacacaaatgtttgaaattcatcataacg |
29398213 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 658 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 1150769 - 1150602
Alignment:
| Q |
658 |
tcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaa |
757 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||| || |
|
|
| T |
1150769 |
tcattacacatcattaaattaaatcactacttacattcaatgaaattgcatatggaacgaacatacatatataatatagtatcttccatcatattccaaa |
1150670 |
T |
 |
| Q |
758 |
acataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1150669 |
acataaatccgacgtcgctatcgtcacaaataaaccaaggcgtatagtttgccgttttccatgcgtat |
1150602 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 522 - 652
Target Start/End: Original strand, 3206956 - 3207086
Alignment:
| Q |
522 |
tcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3206956 |
tcataaacaagaaagatacattatcttttacaattgtctataattaaatcaaaccgacatttagttcaaagtatacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
3207055 |
T |
 |
| Q |
622 |
ttataaattgtccataattaaacagcacatt |
652 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
3207056 |
ttgcatggtgtccataattaaaaatcacatt |
3207086 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 510 - 696
Target Start/End: Original strand, 18000430 - 18000606
Alignment:
| Q |
510 |
attgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaa |
609 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
18000430 |
attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa |
18000529 |
T |
 |
| Q |
610 |
ttcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattca |
696 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18000530 |
ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------ta---ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattca |
18000606 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 727 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 38949855 - 38949757
Alignment:
| Q |
727 |
tataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
38949855 |
tataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatataacttgccgttttccatgcgtat |
38949757 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 489 - 619
Target Start/End: Original strand, 25613379 - 25613508
Alignment:
| Q |
489 |
aggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttc |
588 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||| ||| ||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| | | ||||||||| |
|
|
| T |
25613379 |
aggcaatacaactcatacatcatttaaaatcagtcataaacaagaa-aatacataatcttttacaattgaccaaaattaaatcaatcaggcattttgttt |
25613477 |
T |
 |
| Q |
589 |
aaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaa |
619 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25613478 |
aaattacaagaatgtttgaaattcatcaaaa |
25613508 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 704 - 806
Target Start/End: Original strand, 25613583 - 25613685
Alignment:
| Q |
704 |
tgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatata |
803 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||| | | |||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
25613583 |
tgcagatggaacgaacacaaagatataatatattatctttaattatattcataaacataaatcctacgtcgctatcgtcacgaataagtcaaggcacata |
25613682 |
T |
 |
| Q |
804 |
gct |
806 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
25613683 |
gct |
25613685 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 82395 - 82349
Alignment:
| Q |
298 |
ttgttgtagacacgttgcataaggttgtttcacacgagtaaaatacg |
344 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
82395 |
ttgttgttgacacattgcataaggttatgtcacacgagtaaaatacg |
82349 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 359 - 405
Target Start/End: Original strand, 23346813 - 23346859
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaa |
405 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23346813 |
gcagttaactgccaaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaaa |
23346859 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 712 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 27732993 - 27732940
Alignment:
| Q |
712 |
gaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaat |
765 |
Q |
| |
|
||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
27732993 |
gaacgaacacaaagatataatatattatttttaaccatattcctatacataaat |
27732940 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 521 - 606
Target Start/End: Original strand, 43668329 - 43668414
Alignment:
| Q |
521 |
gtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttg |
606 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||| |||| || ||| ||||||||||| | || |||| || |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43668329 |
gtcataaacaagaacaatacataatctttcacaactgaccaaaattaaatcaatctgatatttcattaaaattacacaaatgtttg |
43668414 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 492 - 825
Target Start/End: Original strand, 12111394 - 12111725
Alignment:
| Q |
492 |
caatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaa |
591 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12111394 |
caatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttataattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaa |
12111493 |
T |
 |
| Q |
592 |
ttacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttac |
691 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12111494 |
ttacaccaaagtttaaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacaatacattacaactcattacatatcattaaattaaatccctacttac |
12111593 |
T |
 |
| Q |
692 |
attcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataag |
791 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12111594 |
attcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatata--atattattttccaccatattccgaaatataaatccgacgtcgctatcatctttaataaa |
12111691 |
T |
 |
| Q |
792 |
ccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
12111692 |
ccaaggcatatagcttgtcgttttccatgtgtat |
12111725 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 359 - 825
Target Start/End: Original strand, 34622532 - 34623000
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattt |
457 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
34622532 |
gcagttaactgtcgaggaaatcctcggtagttaacagccaaggaaaacaattatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagccattt |
34622631 |
T |
 |
| Q |
458 |
ttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatc |
546 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
34622632 |
ttcggtcagtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaataagaaaaatacaatata |
34622731 |
T |
 |
| Q |
547 |
ttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacag |
646 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
34622732 |
ttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaa---- |
34622827 |
T |
 |
| Q |
647 |
cacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcac |
746 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
34622828 |
------acaactcattacacatcattaaattaaacttctacttacattcaacgcaattgcatatgaaacgaacatacatatataatatattatcttccat |
34622921 |
T |
 |
| Q |
747 |
catattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
34622922 |
catattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
34623000 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 387 - 825
Target Start/End: Original strand, 10705309 - 10705759
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------ac |
474 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
10705309 |
agttaactgccgagaaaactgattatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcacttccaagtcatttttcggtcaatttttacatgtaatttaac |
10705408 |
T |
 |
| Q |
475 |
cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
574 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10705409 |
caaagcatttctaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
10705508 |
T |
 |
| Q |
575 |
ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaa |
674 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
10705509 |
ccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttaaaattcatcaaaatgttacatagtgtccataattaaacaatacattacaactcattacacatcaataa |
10705608 |
T |
 |
| Q |
675 |
gttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcg |
774 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10705609 |
attaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatcatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcg |
10705708 |
T |
 |
| Q |
775 |
ctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
10705709 |
ctatcgtcttcaattagccaaggcatatagcttgtcgttttccatgcgtat |
10705759 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 359 - 821
Target Start/End: Original strand, 19044326 - 19044804
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattt |
457 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19044326 |
gcagttaattgccgaggaaaacttcggtagttaactgccgaggaaaacaattatgcagatagtgggttttgcataattctaatgcatttccaagccattt |
19044425 |
T |
 |
| Q |
458 |
ttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatc |
546 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
19044426 |
ttcggctagtttttacctgtaattaaaccagagaatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaattgggtcataaccaagaaaaatacaatatc |
19044525 |
T |
 |
| Q |
547 |
ttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa---- |
642 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19044526 |
ttttacagttgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaagtgt |
19044625 |
T |
 |
| Q |
643 |
acagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttt |
742 |
Q |
| |
|
|| | ||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
19044626 |
ccataattaaacaaatcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatctt |
19044725 |
T |
 |
| Q |
743 |
tcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgc |
821 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
19044726 |
ccaccatatttcgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatataacttgccgttttccatgc |
19044804 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 359 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 20710310 - 20709832
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattt |
457 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20710310 |
gcagttaattgccgaggaaaacttcggtagttaactgccgaggaaaacaattatgcagatagtgggttttgcataattctaatgcatttccaagccattt |
20710211 |
T |
 |
| Q |
458 |
ttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatc |
546 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20710210 |
ttcggctagtttttacctgtaattaaaccagagaatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaattgggtcataaccaagaaaaatacaatatc |
20710111 |
T |
 |
| Q |
547 |
ttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa---- |
642 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
20710110 |
ttttacagttgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaagtgt |
20710011 |
T |
 |
| Q |
643 |
acagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttt |
742 |
Q |
| |
|
|| | ||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
20710010 |
ccataattaaacaaatcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatctt |
20709911 |
T |
 |
| Q |
743 |
tcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgc |
821 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
20709910 |
ccaccatatttcgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatataacttgccgttttccatgc |
20709832 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 387 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 47743001 - 47742560
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttc-ggtcagttttta----------- |
472 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
47743001 |
agttaactgtcgaggaaaactgattatgcagacagtgggttctgcataattctaaa-catttccaagccatttttttggccagtttttacctgtaattaa |
47742903 |
T |
 |
| Q |
473 |
accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca |
572 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
47742902 |
accagagcattttcaaaggcaaaataattcatacaacattgaaacatggacaaaaacaagataaatgcaatatcttttacaattgtccataattaaatta |
47742803 |
T |
 |
| Q |
573 |
aaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcatt |
672 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||| |
|
|
| T |
47742802 |
aaccaacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaac----------tcattacacatcatt |
47742713 |
T |
 |
| Q |
673 |
aagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgt |
772 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47742712 |
aaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt |
47742613 |
T |
 |
| Q |
773 |
cgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
47742612 |
cgccatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgtcgttttccatgcgtat |
47742560 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 416 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 18109775 - 18109364
Alignment:
| Q |
416 |
acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatca |
503 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
18109775 |
acagtgggttctgcataattctaaa-catttccaaaccattttttcggccagtttttatctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattca |
18109677 |
T |
 |
| Q |
504 |
tacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttg-ttcaaattacacaaaag |
602 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||| | |
|
|
| T |
18109676 |
tacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacattttggttaaaattaaacaaacg |
18109577 |
T |
 |
| Q |
603 |
tttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaa |
702 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
18109576 |
tttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaa |
18109487 |
T |
 |
| Q |
703 |
ttgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatat |
802 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18109486 |
ttgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatat |
18109387 |
T |
 |
| Q |
803 |
agcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18109386 |
agcttgccgttttccatgcgtat |
18109364 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 387 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 15070363 - 15069921
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttttta----------- |
472 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
15070363 |
agttaactgcngaggaaaactgattatgcagacagtgggttctgcataattctaga-catttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaaataa |
15070265 |
T |
 |
| Q |
473 |
accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca |
572 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
15070264 |
accagagcatttccaaaggctaaataattcatacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatta |
15070165 |
T |
 |
| Q |
573 |
aaccgacattttg-ttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat |
671 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
15070164 |
aaccgacattttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatcat |
15070075 |
T |
 |
| Q |
672 |
taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacg |
771 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15070074 |
taaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacg |
15069975 |
T |
 |
| Q |
772 |
tcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15069974 |
tcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
15069921 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 472 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 42503753 - 42503409
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||| | |||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
42503753 |
aaccagagcatctccaaaggctaaataattcatgcaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttataattgttcatgattaaatt |
42503654 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttg-ttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatca |
670 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
42503653 |
aaaccaacattttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatca |
42503564 |
T |
 |
| Q |
671 |
ttaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgac |
770 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42503563 |
ttaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgac |
42503464 |
T |
 |
| Q |
771 |
gtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
42503463 |
gtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatgtagcttgccgttttccatgcgtat |
42503409 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 357 - 825
Target Start/End: Original strand, 603810 - 604281
Alignment:
| Q |
357 |
cggcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaacca |
454 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | |||||||||| | |||| |||||| |||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| |
|
|
| T |
603810 |
cggcagttaactgccgaggaaaaccttggtagtaaactgccaaggaaatctgattatgcagacagtgggttctgcataattctaa-gtatttccaagcca |
603908 |
T |
 |
| Q |
455 |
ttttt-cggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaa |
542 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| || |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
603909 |
ttttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagaacatttccaaaggtaaaataattcatacaagattgaaactcgaacataatgaagataaatacaa |
604008 |
T |
 |
| Q |
543 |
tatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa |
642 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
604009 |
tatcttttacaattgttcataattaaattaaatcgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa |
604108 |
T |
 |
| Q |
643 |
acagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttt |
742 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
604109 |
ac-------tac---tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattacatatggaacaaacatacatatataatatattatctt |
604198 |
T |
 |
| Q |
743 |
tcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
604199 |
ccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
604281 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 546 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 47065148 - 47064865
Alignment:
| Q |
546 |
cttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaa-- |
643 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
47065148 |
cttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttgatttaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaatgttacaaagtatccataattaaatg |
47065049 |
T |
 |
| Q |
644 |
--cagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattattt |
741 |
Q |
| |
|
|| | ||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47065048 |
tccataattaaacaactcattacacatgattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattt |
47064949 |
T |
 |
| Q |
742 |
ttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
47064948 |
tccaccatatttcgaaacataaatttgacgtcgctatcatctttaataaaccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
47064865 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 472 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 30790922 - 30790577
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatac--aatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaa |
569 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
30790922 |
aaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatagaatatcttttacaattgttcataattaaa |
30790823 |
T |
 |
| Q |
570 |
tcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatc |
669 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
30790822 |
ttaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatc |
30790733 |
T |
 |
| Q |
670 |
attaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccga |
769 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30790732 |
attaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccga |
30790633 |
T |
 |
| Q |
770 |
cgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
30790632 |
cgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgctgttttccatgcgtat |
30790577 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 510 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 45767736 - 45767431
Alignment:
| Q |
510 |
attgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaa |
609 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
45767736 |
attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa |
45767637 |
T |
 |
| Q |
610 |
ttcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcata |
709 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
45767636 |
ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata |
45767547 |
T |
 |
| Q |
710 |
tagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgt |
809 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
45767546 |
tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc |
45767447 |
T |
 |
| Q |
810 |
cgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |
|
|
| T |
45767446 |
cgttttccatgcgtat |
45767431 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 510 - 825
Target Start/End: Original strand, 43619877 - 43620182
Alignment:
| Q |
510 |
attgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaa |
609 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
43619877 |
attgaaactcagacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa |
43619976 |
T |
 |
| Q |
610 |
ttcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcata |
709 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
43619977 |
ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata |
43620066 |
T |
 |
| Q |
710 |
tagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgt |
809 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
43620067 |
tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc |
43620166 |
T |
 |
| Q |
810 |
cgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |
|
|
| T |
43620167 |
cgttttccatgcgtat |
43620182 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 359 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 34742435 - 34742168
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaa-ttatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatt |
456 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
34742435 |
gcagttaactgccgaggaaaacctcggaagttaactgtcgaggaaaacaaattatgcagacagtgaactctgcatgattctaaaacatttccaagccatt |
34742336 |
T |
 |
| Q |
457 |
tttcggtcagtttttaacc-----------agagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatat |
545 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
34742335 |
tttcggtcagtttttacctgtaattaaagtagagcatttcgaaaggcaaaa-aattcatacaacattgaaactcggacataaacaagaaaaatacaatat |
34742237 |
T |
 |
| Q |
546 |
cttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcat |
614 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
34742236 |
cttttacaattgtccataattaaatcaaatcgacatttgattcaaattacacaaacgtttgaaattcat |
34742168 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 387 - 621
Target Start/End: Original strand, 5537907 - 5538152
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaacaa-ttatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta---------acc |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
5537907 |
agttaactgccgaggaaaacaaattatgtagacagtgagctctgcatgattctaaaacattttcaagccatttttcggtcagtttttacgtaattaaagc |
5538006 |
T |
 |
| Q |
476 |
agagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaac |
575 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5538007 |
agagcatttcgaaagggaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagaaaaataaaatatcttatacaattgtccataattaaatcaaac |
5538106 |
T |
 |
| Q |
576 |
cgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
5538107 |
cgacatttggttcaaattatacaaacgtttgaaattcatcataacg |
5538152 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 472 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 17838549 - 17838400
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17838549 |
aaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
17838450 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
17838449 |
aaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcatcataacg |
17838400 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 660 - 825
Target Start/End: Original strand, 29592839 - 29593004
Alignment:
| Q |
660 |
attacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaac |
759 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
29592839 |
attacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatgtattatcttccaccatattccgaaac |
29592938 |
T |
 |
| Q |
760 |
ataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
29592939 |
ataaatctgacgtcgctatcgttgcgaataagccaaggcatataacttgccgttttccatgcgtat |
29593004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 387 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 40928965 - 40928719
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttttta----------- |
472 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
40928965 |
agttaactgccgaggaaaactgattatgcagacagtgagttctgcataattctaaa-catttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaa |
40928867 |
T |
 |
| Q |
473 |
accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca |
572 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
40928866 |
accagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatta |
40928767 |
T |
 |
| Q |
573 |
aaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaac |
620 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40928766 |
aaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaac |
40928719 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 375 - 611
Target Start/End: Original strand, 29592592 - 29592841
Alignment:
| Q |
375 |
gaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttttt |
471 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
29592592 |
gaaaacttcggtagttaactgtcgaagaaaactgattatgcagacagtggattctgcataattttaaa-catttccaaaccattttttcggccagttttt |
29592690 |
T |
 |
| Q |
472 |
a-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtcc |
560 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
29592691 |
acctgtaattaaaccagagcatttccaaaggaaaaataattcatacaagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatattttttacaattgtcc |
29592790 |
T |
 |
| Q |
561 |
ataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaatt |
611 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
29592791 |
ataattaaattaaaccgacatttggttcaaattacacaaacttttgaaatt |
29592841 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 373 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 13323741 - 13323480
Alignment:
| Q |
373 |
aggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaa-ttatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagtttt |
470 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| | | || ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13323741 |
aggaaaacctcgggagttaactgctgagcaaaacaaattatgcagataatgagctcttcataattctaaaacatttccaagccatttttcgggcagtttt |
13323642 |
T |
 |
| Q |
471 |
taac-----------cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtc |
559 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
13323641 |
tacctgtaattaaagcagagcatttcgaaaggtaaaataattcatacaacgttgaaactgagacattaacaagaaaaatacaatattttttacaattttc |
13323542 |
T |
 |
| Q |
560 |
cataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13323541 |
cataattaaattaaaccggcatttcgttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg |
13323480 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 536 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 10522365 - 10522280
Alignment:
| Q |
536 |
aatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
10522365 |
aatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcatcataacg |
10522280 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 387 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 36186511 - 36186425
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta |
472 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36186511 |
agttaactgccgaggaaaacaattatacatacagtgagttctgcataattctaaagcattttcaagccatttttcggtcagttttta |
36186425 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 472 - 511
Target Start/End: Original strand, 12111360 - 12111399
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatat |
511 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12111360 |
aaccagagcattttcaaaggcaatataaatcatacaatat |
12111399 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 36186606 - 36186560
Alignment:
| Q |
298 |
ttgttgtagacacgttgcataaggttgtttcacacgagtaaaatacg |
344 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36186606 |
ttgttgttgacacattgcataaggctgtgtcacacgagtaaaatacg |
36186560 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 404
Target Start/End: Original strand, 34738397 - 34738442
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaa |
404 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
34738397 |
gcagttaaatgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaa |
34738442 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 359 - 823
Target Start/End: Original strand, 43679430 - 43679896
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattt |
457 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43679430 |
gcagttaattgttaaggaaaacctcggtagttaactgccgaagaaaataattatacagacagtgggttttgcataattctaaagcatttccaaatcattt |
43679529 |
T |
 |
| Q |
458 |
ttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatc |
546 |
Q |
| |
|
|| || | |||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
43679530 |
tttggctaatttttacatgtaattaaaccaaaatatttccaaaggcaatataaatcatacaaaattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatc |
43679629 |
T |
 |
| Q |
547 |
ttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacag |
646 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
43679630 |
ttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaaagtttaaaattcatcaaaacgttacaaagtgttcataattaa---- |
43679725 |
T |
 |
| Q |
647 |
cacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcac |
746 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
43679726 |
------acaactcattacacatcattatattaaatccctgcttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccac |
43679819 |
T |
 |
| Q |
747 |
catattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgt |
823 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
43679820 |
catattccgaaacataaatctgacgtctctatcgtctttaataagtcaaggcatataacttgtcgttttccatgcgt |
43679896 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 389 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 43377302 - 43376850
Alignment:
| Q |
389 |
ttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------acca |
476 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
43377302 |
ttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtgggttctacataattctaaagcatttccaagccatttttcggccagtttttacctgtaattaaacca |
43377203 |
T |
 |
| Q |
477 |
gagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacc |
576 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43377202 |
gagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatgaaacc |
43377103 |
T |
 |
| Q |
577 |
gacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacatatcatt |
672 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || | ||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
43377102 |
gaaatttggttcaagttacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccttaattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcatt |
43377003 |
T |
 |
| Q |
673 |
aagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgt |
772 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43377002 |
aaattaaattcctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgt |
43376903 |
T |
 |
| Q |
773 |
cgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
43376902 |
cactatcgtcgcgaataaaccaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
43376850 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 398 - 825
Target Start/End: Original strand, 2124250 - 2124696
Alignment:
| Q |
398 |
gaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta--------------accagagcat |
482 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
2124250 |
gaggaaaacaattatgcagacagtgggttctgcataattctaatgcatttccaagccatttttcggccactttttacctggaatatttaaaccagagcat |
2124349 |
T |
 |
| Q |
483 |
ttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatt |
582 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2124350 |
ttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccatagttaaatcaaaccgacatt |
2124449 |
T |
 |
| Q |
583 |
ttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacagctcattacatatcattaagtta |
678 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || | ||| ||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
2124450 |
tggttcaaattacacaaacatttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaatta |
2124549 |
T |
 |
| Q |
679 |
aatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctat |
778 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
2124550 |
agtccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaaaatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccaaagtcgctat |
2124649 |
T |
 |
| Q |
779 |
cgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
2124650 |
tgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
2124696 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 398 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 4867803 - 4867385
Alignment:
| Q |
398 |
gaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttc |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
4867803 |
gaggaaaacaactatgcagacagtgggttttgcataattctaaagcatttccaagccattttttggccagtttttacttgtaattaaactagagcatttc |
4867704 |
T |
 |
| Q |
486 |
taaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttg |
585 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4867703 |
caaaggcaatataactcatacaacatttaaactcagtcataaacaagaaaaatacaatatctttcaccattgtccataattaaatcaaaccaacatttga |
4867604 |
T |
 |
| Q |
586 |
ttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccct |
685 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
4867603 |
tttaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacattacatagtctccataattaaacaacagattacaactcattacttatcattaaattaaatccct |
4867504 |
T |
 |
| Q |
686 |
acttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcttt |
785 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
4867503 |
acttacattcaacgcaattggatatggaacgaacatacgtatataatatattattttccaccataatccgaaacataaatccgacgtcgttatcatctcg |
4867404 |
T |
 |
| Q |
786 |
aataagccaaggcatatag |
804 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
4867403 |
aataagccaatgcacatag |
4867385 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 536 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 7172177 - 7171888
Alignment:
| Q |
536 |
aatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtcca |
635 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| |
|
|
| T |
7172177 |
aatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacccacattttgttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatgaaaacgttacatagtgtcca |
7172078 |
T |
 |
| Q |
636 |
taattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatata |
735 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7172077 |
taattaaacaacacattacaactcagtacacatcattaaattaaatctctacttacattcaatgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatata |
7171978 |
T |
 |
| Q |
736 |
ttatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |
|
|
| T |
7171977 |
ttattttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccattttccatgcgtat |
7171888 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 360 - 825
Target Start/End: Original strand, 35962341 - 35962809
Alignment:
| Q |
360 |
cagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgcaa-cagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattt |
457 |
Q |
| |
|
||||||| || | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
35962341 |
cagttaactgccgaggaaaacctcgggagttaactgccgaggaaaactgattatgcaggcagtgggttctgcataattctaaa-cattttcaagccattt |
35962439 |
T |
 |
| Q |
458 |
tt-cggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatat |
545 |
Q |
| |
|
|| ||| || |||||| ||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
35962440 |
tttcggccaatttttacgtgtaattataccagagtattacaaaaggcaaaataattcatacaacattaaaactcggatataaacaagataaatacaatat |
35962539 |
T |
 |
| Q |
546 |
cttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaaca |
645 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
35962540 |
cttttacaattgtccataattaaattaaaccgaaatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtgcataattaaaca |
35962639 |
T |
 |
| Q |
646 |
gcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttca |
745 |
Q |
| |
|
| ||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
35962640 |
ac----------tcattgcacatcattaaattaaattcctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacgtatataatatattatcttcca |
35962729 |
T |
 |
| Q |
746 |
ccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
35962730 |
ccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgtcgttttccatgcgtat |
35962809 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 512 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 22588316 - 22588013
Alignment:
| Q |
512 |
tgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaatt |
611 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22588316 |
tgaaactcgatcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattatccataattaaatcaaaccgacattaggttcaaattacacaaacgtttgaaatt |
22588217 |
T |
 |
| Q |
612 |
catcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatata |
711 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
22588216 |
gatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaac----------tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatata |
22588127 |
T |
 |
| Q |
712 |
gaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcg |
811 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
22588126 |
gaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatatttcaaaacataaatccgacgtcgctatcgtcttcaattagccaagacatatagcttgccg |
22588027 |
T |
 |
| Q |
812 |
tttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |
|
|
| T |
22588026 |
ttttccatgcgtat |
22588013 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 392 - 825
Target Start/End: Original strand, 23924032 - 23924467
Alignment:
| Q |
392 |
actgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accaga |
478 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
23924032 |
actgccgaggaaaactgattatgcagacaatggattatgcataattctaaa-cattttcaagccatttttcggtcagtttttacctgtaattaaactaga |
23924130 |
T |
 |
| Q |
479 |
gcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccga |
578 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
23924131 |
gcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataaaaaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccga |
23924230 |
T |
 |
| Q |
579 |
cattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagtta |
678 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
23924231 |
catttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaac----------tcattacacatcattaaatta |
23924320 |
T |
 |
| Q |
679 |
aatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctat |
778 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
23924321 |
aatccctacttacattcaacgcaactgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgt |
23924420 |
T |
 |
| Q |
779 |
cgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23924421 |
cgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
23924467 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 387 - 825
Target Start/End: Original strand, 39518 - 39959
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttttta----------- |
472 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| || |||||| |
|
|
| T |
39518 |
agttaactgccgaggaaaactgattatgcagacagtgagttctgcataattctaaa-catttccaagccattttttcggccaatttttacctgtaattaa |
39616 |
T |
 |
| Q |
473 |
accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca |
572 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
39617 |
accagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaacctcagacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatta |
39716 |
T |
 |
| Q |
573 |
aaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcatt |
672 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||| |
|
|
| T |
39717 |
aaccgacatttggttaaaattaaacaaacatttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaac----------tcattacacatcatt |
39806 |
T |
 |
| Q |
673 |
aagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgt |
772 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
39807 |
aaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatccgacat |
39906 |
T |
 |
| Q |
773 |
cgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
39907 |
cgccgtcgttgcgaataagcaaagacatatagcttgtcgttttccatgcgtat |
39959 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 472 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 31959975 - 31959618
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
31959975 |
aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatataagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgttcatgattaaatt |
31959876 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaa----cagcacattacagctcattacata |
667 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || | ||| ||||||||| | |
|
|
| T |
31959875 |
aaacccacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaattgtccataattaaacaactcattacaca |
31959776 |
T |
 |
| Q |
668 |
tcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatcc |
767 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
31959775 |
tcattaaattaaatccatacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccaaaacataaatcc |
31959676 |
T |
 |
| Q |
768 |
gacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
31959675 |
gacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
31959618 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 399 - 736
Target Start/End: Original strand, 39751134 - 39751473
Alignment:
| Q |
399 |
aggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagtttttaac-----------cagagcatttct |
486 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
39751134 |
aggaaaacagttatgcagacagtggattctgcatatttataatgcatttccaagctattttttggccagtttttaactataattaaaccagagcatttcc |
39751233 |
T |
 |
| Q |
487 |
aaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgt |
586 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
39751234 |
aaagacaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatacaatatcttttacagttgtccgtaattaaatcaaactgacatttggt |
39751333 |
T |
 |
| Q |
587 |
tcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatcccta |
686 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
39751334 |
tcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcattaaattaaatcccta |
39751423 |
T |
 |
| Q |
687 |
cttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatat |
736 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39751424 |
cttacattcaacgtaattgcatatggaacgaacatacatatataatatat |
39751473 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 472 - 825
Target Start/End: Original strand, 30301292 - 30301637
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatac--aatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaa |
569 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
30301292 |
aaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaa |
30301391 |
T |
 |
| Q |
570 |
tcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatc |
669 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
30301392 |
ttaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatc |
30301481 |
T |
 |
| Q |
670 |
attaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccga |
769 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30301482 |
attaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccga |
30301581 |
T |
 |
| Q |
770 |
cgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
30301582 |
cgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
30301637 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 357 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 7344599 - 7344127
Alignment:
| Q |
357 |
cggcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaacca |
454 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||| | |||||||| ||| |
|
|
| T |
7344599 |
cggcagttaactgccgaggaaaacctcgggagttaactgccgaggaaatttgattatgcagacagcaggttctgcataattctaa-gtatttccaagcca |
7344501 |
T |
 |
| Q |
455 |
tttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatac--aatattgaaactcggtcataaacaagaataataca |
541 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
7344500 |
tttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaataca |
7344401 |
T |
 |
| Q |
542 |
atatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataatta |
641 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | | | ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
7344400 |
atatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaatagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataatta |
7344301 |
T |
 |
| Q |
642 |
aacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattattt |
741 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
7344300 |
aac-------tac---tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtct |
7344211 |
T |
 |
| Q |
742 |
ttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
7344210 |
tccaccatattccgaaacataaatccgacgttgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
7344127 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 510 - 825
Target Start/End: Original strand, 32375849 - 32376154
Alignment:
| Q |
510 |
attgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaa |
609 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
32375849 |
attgaaactcgaacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaatcgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa |
32375948 |
T |
 |
| Q |
610 |
ttcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcata |
709 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
32375949 |
ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata |
32376038 |
T |
 |
| Q |
710 |
tagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgt |
809 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
32376039 |
tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccatcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc |
32376138 |
T |
 |
| Q |
810 |
cgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
32376139 |
cgtttcccatgcgtat |
32376154 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 510 - 825
Target Start/End: Original strand, 8419602 - 8419907
Alignment:
| Q |
510 |
attgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaa |
609 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
8419602 |
attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa |
8419701 |
T |
 |
| Q |
610 |
ttcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcata |
709 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
8419702 |
ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata |
8419791 |
T |
 |
| Q |
710 |
tagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgt |
809 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
8419792 |
tggaacgaacgtacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc |
8419891 |
T |
 |
| Q |
810 |
cgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8419892 |
cgttttccatgcgtat |
8419907 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 476 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 22661484 - 22661149
Alignment:
| Q |
476 |
agagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaac |
575 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||| | | ||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22661484 |
agagcatttccaaaggcattattagttgtacaacatttatactcagtcataaacaagaaaaatacattatcttttacggttgtccataattaaatcaaac |
22661385 |
T |
 |
| Q |
576 |
cgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaag |
675 |
Q |
| |
|
||| |||| ||| ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
22661384 |
cgatatttcgttaaaattacacgaatgtttgagattcatcaaaacattaaagagtgtccataattaaacaacacattaca----------tatcgttaaa |
22661295 |
T |
 |
| Q |
676 |
ttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgc |
775 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
22661294 |
ttaaatctctactgacattctgcgcagttgcatatggaacgaacatacatatataatatatcatcttccaccatattccgaaacatagacccgacgtcgc |
22661195 |
T |
 |
| Q |
776 |
tatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgc |
821 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
22661194 |
tatcgtcgtgaataagccaaggcatatggcttgccgttttccatgc |
22661149 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 373 - 583
Target Start/End: Original strand, 23578482 - 23578704
Alignment:
| Q |
373 |
aggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttt |
471 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
23578482 |
aggaaaaccttggcagttaactaccgaggaaaaaaattatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcagccagttttt |
23578581 |
T |
 |
| Q |
472 |
a-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtcc |
560 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
23578582 |
acctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaattatacaacattgaaactctgtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgttc |
23578681 |
T |
 |
| Q |
561 |
ataattaaatcaaaccgacattt |
583 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23578682 |
ataattaaatcaaaccgacattt |
23578704 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 472 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 20549173 - 20548938
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20549173 |
aaccagagcatttccaaagacaaaataattcatacaagattgaaactcggatataaacaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatt |
20549074 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat |
671 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20549073 |
aaaccgaaatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcat |
20548984 |
T |
 |
| Q |
672 |
taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacga |
717 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20548983 |
taaattaaatccttacttacattcaacgcaattgcatatggaacga |
20548938 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 373 - 616
Target Start/End: Original strand, 34366958 - 34367214
Alignment:
| Q |
373 |
aggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgcaa-cagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagtttt |
470 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| || |||| | |||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
34366958 |
aggaaaacctcggtagttaactgccgatgaaatctgattatgcaggcagtgagctctgcatcattctaaaacatttccaagccttttttcggccagtttt |
34367057 |
T |
 |
| Q |
471 |
ta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtc |
559 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34367058 |
tacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacagcattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtc |
34367157 |
T |
 |
| Q |
560 |
cataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatca |
616 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
34367158 |
cataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca |
34367214 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 660 - 825
Target Start/End: Original strand, 41744160 - 41744325
Alignment:
| Q |
660 |
attacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaac |
759 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
41744160 |
attacacatcattaaattaagtccctacttacattcaacgcaattgcatatggagcgaatatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaat |
41744259 |
T |
 |
| Q |
760 |
ataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41744260 |
ataaatccgacgtcgctatcgtcatgaataagccaaggcatataacttgtcgttttccatgcgtat |
41744325 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 475 - 615
Target Start/End: Original strand, 41239010 - 41239150
Alignment:
| Q |
475 |
cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
574 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||| |||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
41239010 |
cagagcatttcgaaatgcaaaataattcatacaacattgaatctcggacataaacaagacaaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatcaaa |
41239109 |
T |
 |
| Q |
575 |
ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatc |
615 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
41239110 |
ccgacatttgattcaaattacacaaacgtttgaaattcatc |
41239150 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 387 - 611
Target Start/End: Original strand, 41743925 - 41744162
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaac-aattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttttta----------- |
472 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
41743925 |
agttaactgccgaagaaaactaattatgcagacagtgggttctgcataattttaaa-catttccaagccattttttcggccagtttttacatgtaattaa |
41744023 |
T |
 |
| Q |
473 |
accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca |
572 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
41744024 |
accagagcatttccaaaggcaaaataatttatacaagattgaaactcgaacataaacaagataaatacaatattttttacaattgtccatgattaaatta |
41744123 |
T |
 |
| Q |
573 |
aaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaatt |
611 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41744124 |
aaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaatt |
41744162 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 489 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 30972771 - 30972593
Alignment:
| Q |
489 |
aggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttc |
588 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||| ||| |
|
|
| T |
30972771 |
aggcaatacaactcatacatcatttatactcagtcataaacaagaaaaatacattatcttttacggttgtcgataattaaatcaattcaacatttcgtta |
30972672 |
T |
 |
| Q |
589 |
aaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacata |
667 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| | | | | |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
30972671 |
aaattacacgaatgtttgaaattcatcaaaacattacagagtatacataattaaacaacacattacacatcattacata |
30972593 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 728 - 825
Target Start/End: Original strand, 39751659 - 39751756
Alignment:
| Q |
728 |
ataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
39751659 |
ataatatattatcttctaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaagacatatagtttgccgttttccatgcgtat |
39751756 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 472 - 619
Target Start/End: Original strand, 31280969 - 31281118
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || ||||| || ||||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
31280969 |
aaccagagcatttccagagacaatacaactcatacaccatttataatcggtcataaacaagaacaatacataatcttttacaattgactgtaattaaatc |
31281068 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaa--ttacacaaaagtttgaaattcatcaaaa |
619 |
Q |
| |
|
|| | ||||||| ||| ||| |||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31281069 |
aatctgacatttcgttaaaattttacacgaatgtttgaaattcatcaaaa |
31281118 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 405 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 22588392 - 22588324
Alignment:
| Q |
405 |
acaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta |
472 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22588392 |
acaattatgcagacagtgggttctgtataattctaaagcattttcaatcaatttttcggtcagttttta |
22588324 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 472 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 29807152 - 29807044
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| | |||||||| || ||||||| |||| | | | |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
29807152 |
aaccatagcatttccagaggcaatacaactcatacactatttataataagtcataaacaagaacattacatgatcttttacaattgttcataattaaatc |
29807053 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgaca |
580 |
Q |
| |
|
| |||||| |
|
|
| T |
29807052 |
tatccgaca |
29807044 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 408 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 7172603 - 7172550
Alignment:
| Q |
408 |
attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttc |
460 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
7172603 |
attatgcagacagtggcttctgcataattctaaagcatttccaagccgtttttc |
7172550 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 704 - 773
Target Start/End: Original strand, 31281193 - 31281262
Alignment:
| Q |
704 |
tgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtc |
773 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
31281193 |
tgcagatggaacgaacataaagatataatatattatcttcaaccatattctgaaacataaatcctacgtc |
31281262 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 357 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 184594 - 184545
Alignment:
| Q |
357 |
cggcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaac |
406 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
184594 |
cggcagttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaaac |
184545 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 36)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 359 - 825
Target Start/End: Original strand, 6489362 - 6489845
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattt |
457 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
6489362 |
gcagttaactgccgaggaaatcctcggtagttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagccattt |
6489461 |
T |
 |
| Q |
458 |
ttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatc |
546 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
6489462 |
ttcggccagtttttaccgctaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacattatc |
6489561 |
T |
 |
| Q |
547 |
ttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgtta-taaattgtccataattaa--- |
642 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
6489562 |
ttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcattgaaacgttacaaaagtgtccatacttaagtg |
6489661 |
T |
 |
| Q |
643 |
-acagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattattt |
741 |
Q |
| |
|
|| | ||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
6489662 |
tccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatct |
6489761 |
T |
 |
| Q |
742 |
ttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6489762 |
tccaccatattccgaaatataaatccgacgacgctatcgtcacgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
6489845 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 408 - 825
Target Start/End: Original strand, 66956 - 67385
Alignment:
| Q |
408 |
attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaat |
495 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||| ||||| |
|
|
| T |
66956 |
attatgcagacagtgggttctgcataattgttaagcatttccaagccatttttcggtcagtttttacctgtaattaaaccagagcaatcccaaatgcaat |
67055 |
T |
 |
| Q |
496 |
ataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattac |
595 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||| |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
67056 |
ataattcatacaacatttaaactcacttataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaactac |
67155 |
T |
 |
| Q |
596 |
acaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattc |
695 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
67156 |
acaaaagtttgaaattcatcaaaacggtacatagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaatgaaatccctacttacattc |
67255 |
T |
 |
| Q |
696 |
atcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaa |
795 |
Q |
| |
|
| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
67256 |
aacgcaatcacatatggaacgaacatacatatataatgtattattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctattgtctttaataagccaa |
67355 |
T |
 |
| Q |
796 |
ggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
67356 |
gacatatagcttgccgtttttcatgcgtat |
67385 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 359 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 4002545 - 4002062
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatt |
456 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4002545 |
gcagttaactgccgaggaaaacctcgggagttaactgccgaggaaaactgattatgcagacagcaagttctgcataattctaaa-catttccaagccatt |
4002447 |
T |
 |
| Q |
457 |
ttt-cggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaata |
544 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4002446 |
ttttcggcaagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataaacaagataaatacaata |
4002347 |
T |
 |
| Q |
545 |
tcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaa- |
643 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| ||| |
|
|
| T |
4002346 |
tcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtctataactaagt |
4002247 |
T |
 |
| Q |
644 |
---cagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatt |
740 |
Q |
| |
|
|| | | | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4002246 |
gtccataattaaataactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatt |
4002147 |
T |
 |
| Q |
741 |
tttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
4002146 |
ttccaccattttccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgtcgttttccatgcgtat |
4002062 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 392 - 825
Target Start/End: Original strand, 21951866 - 21952301
Alignment:
| Q |
392 |
actgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------accagag |
479 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
21951866 |
actgccgaggaaaacaattatgcagacagcaggttctgcagaattctaaaacaattccaagccatttttcggccagttttgacttgtaattaaaccagag |
21951965 |
T |
 |
| Q |
480 |
catttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgac |
579 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21951966 |
catttccaaatgcaatataaatcatacaacattgaaactcgaacataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgac |
21952065 |
T |
 |
| Q |
580 |
attttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaa |
679 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
21952066 |
atttgattaaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaatgtgtccatgattaa----------acaactcattacacgtcattaaattaa |
21952155 |
T |
 |
| Q |
680 |
atccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatc |
779 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21952156 |
atccctagttacattcaatgcaattgcatatggaacgaacatacaaatataatatatcatcttccaccatattccgaaacctaaatccgacgtcgctatc |
21952255 |
T |
 |
| Q |
780 |
gtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
21952256 |
atcgcgaataagccaaggcacatagcttgccgttttccatgcgtat |
21952301 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 487 - 825
Target Start/End: Original strand, 46989686 - 46990028
Alignment:
| Q |
487 |
aaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgt |
586 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
46989686 |
aaaggcaaaataattcatacaaatgtgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggt |
46989785 |
T |
 |
| Q |
587 |
tcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaa----cagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatc |
682 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || | ||| ||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
46989786 |
tcaaattacacaaacatttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatc |
46989885 |
T |
 |
| Q |
683 |
cctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtc |
782 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
46989886 |
cctacttacattcaacacaattgcatgtggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccaaaacataaatccgacgtcgtcatcgtc |
46989985 |
T |
 |
| Q |
783 |
tttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
46989986 |
gcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
46990028 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 425 - 825
Target Start/End: Original strand, 9426705 - 9427107
Alignment:
| Q |
425 |
tctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt |
512 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
9426705 |
tctgcataattataaagcatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagatt |
9426804 |
T |
 |
| Q |
513 |
gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc |
612 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9426805 |
gaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattc |
9426904 |
T |
 |
| Q |
613 |
atcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatag |
712 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| | |
|
|
| T |
9426905 |
atcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattacatatgg |
9426994 |
T |
 |
| Q |
713 |
aacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgt |
812 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
9426995 |
aacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagtttgccgt |
9427094 |
T |
 |
| Q |
813 |
ttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |
|
|
| T |
9427095 |
tttccatgcgtat |
9427107 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 359 - 825
Target Start/End: Original strand, 48246445 - 48246913
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaatt-atgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatt |
456 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
48246445 |
gcagttaactgtcgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaaactgtttatgcagacagtgtgtg-tgcataattctaaa-cattttcaagccatt |
48246542 |
T |
 |
| Q |
457 |
tttc-ggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaata |
544 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||| | ||||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
48246543 |
tttccggtcagtttttacctgtaattaaaccagagcattttcaaaggcaaaataattcataaaacattgaaactcagacataagcaatataaatacaata |
48246642 |
T |
 |
| Q |
545 |
tcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaac |
644 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
48246643 |
tcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttaaaattacacaaacttttgaaattcatcaaaaaattacaaagtgtccataattaaac |
48246742 |
T |
 |
| Q |
645 |
agcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttc |
744 |
Q |
| |
|
| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
48246743 |
aac----------tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcagttgcatatggaacaaacatacatatataatatattatcttcc |
48246832 |
T |
 |
| Q |
745 |
accatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
48246833 |
accatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagccaaagcatatagcttgtcgttttccatgcgtat |
48246913 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 387 - 825
Target Start/End: Original strand, 13743328 - 13743768
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttttta----------- |
472 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
13743328 |
agttaactgccgaggaaaactgattatgtagacagtgggttctgcataattctaaa-catttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaa |
13743426 |
T |
 |
| Q |
473 |
accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca |
572 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
13743427 |
actagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatcaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaatta |
13743526 |
T |
 |
| Q |
573 |
aaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcatt |
672 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
13743527 |
aaccgacatttggtt-aaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatcatt |
13743615 |
T |
 |
| Q |
673 |
aagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgt |
772 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13743616 |
aaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt |
13743715 |
T |
 |
| Q |
773 |
cgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13743716 |
cgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
13743768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 357 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 6745368 - 6744897
Alignment:
| Q |
357 |
cggcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaacca |
454 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||| | |||||||| ||| |
|
|
| T |
6745368 |
cggcagttaactgccaaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaatttgattatgcagacagcaggttctgcataattctaa-gtatttccaagcca |
6745270 |
T |
 |
| Q |
455 |
ttttt-cggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaa |
542 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
6745269 |
ttttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataaatacaa |
6745170 |
T |
 |
| Q |
543 |
tatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa |
642 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6745169 |
tatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa |
6745070 |
T |
 |
| Q |
643 |
acagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttt |
742 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
6745069 |
ac-------ta---ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtctt |
6744980 |
T |
 |
| Q |
743 |
tcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6744979 |
ccaccatattccgaaacataaatccgacgttgccgtcgtcgcgaataagcaaagacatatagcttgccgttttccatgcgtat |
6744897 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 425 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 2857955 - 2857553
Alignment:
| Q |
425 |
tctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt |
512 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
2857955 |
tctgcataattgtaaagcatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagatt |
2857856 |
T |
 |
| Q |
513 |
gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc |
612 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
2857855 |
gaaacttggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattc |
2857756 |
T |
 |
| Q |
613 |
atcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatag |
712 |
Q |
| |
|
||| ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| | |
|
|
| T |
2857755 |
atcttaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattacatatgg |
2857666 |
T |
 |
| Q |
713 |
aacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgt |
812 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
2857665 |
aatgaacatacatatataatatattattttccaccattttccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgt |
2857566 |
T |
 |
| Q |
813 |
ttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |
|
|
| T |
2857565 |
tttccatgcgtat |
2857553 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 373 - 814
Target Start/End: Original strand, 36812884 - 36813342
Alignment:
| Q |
373 |
aggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttt |
469 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
36812884 |
aggaaaacctcggtagtaaactgccgaggaaaactgattgtgcagacagcaaattctgcataattctaaa-catttccaagccattttttcggccagttt |
36812982 |
T |
 |
| Q |
470 |
tta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgt |
558 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
36812983 |
ttacctgtagttaaaccagagcatttccaaaggcaaaataatccatacaagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttatacaattgt |
36813082 |
T |
 |
| Q |
559 |
ccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaa----cagcacattac |
654 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||| || | || |
|
|
| T |
36813083 |
tcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcattaaaacattacaaagtttccataattaattgtccataattaaac |
36813182 |
T |
 |
| Q |
655 |
agctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattcc |
754 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
36813183 |
aactcattacacatcattaaattatatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatattccaccatattcc |
36813282 |
T |
 |
| Q |
755 |
gaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgttt |
814 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
36813283 |
gaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaagacatatagcttgccgttt |
36813342 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 357 - 825
Target Start/End: Original strand, 30943220 - 30943693
Alignment:
| Q |
357 |
cggcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaacca |
454 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||| | |||||||| ||| |
|
|
| T |
30943220 |
cggcagttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaatttgattatgcagacagcaggttctgcataattctaa-gtatttccaagcca |
30943318 |
T |
 |
| Q |
455 |
ttttt-cggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatac--aatattgaaactcggtcataaacaagaataatac |
540 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
30943319 |
ttttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaagtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatac |
30943418 |
T |
 |
| Q |
541 |
aatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataatt |
640 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
30943419 |
aatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataatt |
30943518 |
T |
 |
| Q |
641 |
aaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatt |
740 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
30943519 |
aaac-------tac---tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtc |
30943608 |
T |
 |
| Q |
741 |
tttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
30943609 |
ttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
30943693 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 357 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 3953257 - 3952785
Alignment:
| Q |
357 |
cggcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaacca |
454 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||| | |||||||| ||| |
|
|
| T |
3953257 |
cggcagttaactgccgaggaaaacctcgggagttaactgccgaggaaatttgattatgcagacagcaggttctgcataattctaa-gtatttccaagcca |
3953159 |
T |
 |
| Q |
455 |
tttttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatac--aatattgaaactcggtcataaacaagaataataca |
541 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
3953158 |
tttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaataca |
3953059 |
T |
 |
| Q |
542 |
atatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataatta |
641 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | | | ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3953058 |
atatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaatagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataatta |
3952959 |
T |
 |
| Q |
642 |
aacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattattt |
741 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
3952958 |
aac-------tac---tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtct |
3952869 |
T |
 |
| Q |
742 |
ttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
3952868 |
tccaccatattccgaaacataaatccgacgttgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
3952785 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 510 - 825
Target Start/End: Original strand, 8156706 - 8157011
Alignment:
| Q |
510 |
attgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaa |
609 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
8156706 |
attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa |
8156805 |
T |
 |
| Q |
610 |
ttcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcata |
709 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
8156806 |
ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata |
8156895 |
T |
 |
| Q |
710 |
tagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgt |
809 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
8156896 |
tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc |
8156995 |
T |
 |
| Q |
810 |
cgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8156996 |
cgttttccatgcgtat |
8157011 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 475 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 50957604 - 50957250
Alignment:
| Q |
475 |
cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
574 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
50957604 |
cagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaa |
50957505 |
T |
 |
| Q |
575 |
ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaa--------------aacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctca |
660 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
50957504 |
cagacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaattaaactactcaaaacattccaaagtgtccataattaaac-------tac---tca |
50957415 |
T |
 |
| Q |
661 |
ttacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaaca |
760 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50957414 |
ttacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaaca |
50957315 |
T |
 |
| Q |
761 |
taaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
50957314 |
aaaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaagacatatagcttgccgttttccatgcgtat |
50957250 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 359 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 600584 - 600309
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgcaa-cagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatt |
456 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
600584 |
gcagttaactgtcgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaatctgatcatgcaggcagtgagctctgcatgattctaaaacatttccaagccatt |
600485 |
T |
 |
| Q |
457 |
tttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatat |
545 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
600484 |
tttcggccaatttttacctgtaattaaaccagagcatttttaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagaaaaatacaatat |
600385 |
T |
 |
| Q |
546 |
cttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
600384 |
cttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg |
600309 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 657 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 14402744 - 14402576
Alignment:
| Q |
657 |
ctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccga |
756 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14402744 |
ctcattacacgtcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccga |
14402645 |
T |
 |
| Q |
757 |
aacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14402644 |
aacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
14402576 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 475 - 621
Target Start/End: Original strand, 50213619 - 50213765
Alignment:
| Q |
475 |
cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
574 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50213619 |
cagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagaaaaatgcaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
50213718 |
T |
 |
| Q |
575 |
ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
50213719 |
ccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg |
50213765 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 472 - 645
Target Start/End: Original strand, 7841254 - 7841427
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7841254 |
aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcagacataaacaagataaatacagtatcttttacaattgtccataagtaaatt |
7841353 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaaca |
645 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
7841354 |
aaaccgacatttggttaaaattacacaaacgtttaaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaaca |
7841427 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 657 - 825
Target Start/End: Original strand, 2743789 - 2743957
Alignment:
| Q |
657 |
ctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccga |
756 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
2743789 |
ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacgtatataatatattatcttccaccatattccga |
2743888 |
T |
 |
| Q |
757 |
aacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
2743889 |
aacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
2743957 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 475 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 36134194 - 36134048
Alignment:
| Q |
475 |
cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
574 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36134194 |
cagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
36134095 |
T |
 |
| Q |
575 |
ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
36134094 |
ccgacatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcatcataacg |
36134048 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 472 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 42166326 - 42166177
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42166326 |
aaccagagcattttgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
42166227 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
42166226 |
aaaccgacatttggttcaaattacactaatgtttgaaatttatcataacg |
42166177 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 472 - 621
Target Start/End: Original strand, 47070627 - 47070776
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47070627 |
aaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcgaacataaacaagataaatacaatatcttttccaattgtccataattaaatc |
47070726 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
47070727 |
aaaccgacgtttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg |
47070776 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 472 - 611
Target Start/End: Original strand, 52387958 - 52388097
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
52387958 |
aaccagagcatttcgaaaggcaaaccaattcatacaacattgaaactcggacataaacaatataaatacaatatcttttacaattgaccataattaaatc |
52388057 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaatt |
611 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
52388058 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaacgtttgaaatt |
52388097 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 472 - 621
Target Start/End: Original strand, 2271513 - 2271663
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaaga-ataatacaatatcttttacaattgtccataattaaat |
570 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2271513 |
aaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaacttggacataaacaagataaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaat |
2271612 |
T |
 |
| Q |
571 |
caaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
2271613 |
caaaccgacatttggttcaaattagacaaacgtttaaaattcatcataacg |
2271663 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 386 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 14403009 - 14402808
Alignment:
| Q |
386 |
tagttaactgctgaggaaaaca-attatgcaacagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttttta----------- |
472 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
14403009 |
tagttaactgccgaggaaaactgattatgcaacagtgagttctgcataattctaaa-catttccaaaccattttttcggccagtttttacctgtaattaa |
14402911 |
T |
 |
| Q |
473 |
accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca |
572 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
14402910 |
accagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatta |
14402811 |
T |
 |
| Q |
573 |
aac |
575 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
14402810 |
aac |
14402808 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 472 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 9473863 - 9473721
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9473863 |
aaccagatcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaatataaatacaatatctattacaattatccataattaaatc |
9473764 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcat |
614 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9473763 |
aaaccgacatttggttcaagttacacaaacgtttgaaattcat |
9473721 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 472 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 16647087 - 16646939
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||| | |||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16647087 |
aaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcagacataaa-aagataaatataatatcttttacgattgtccataattaaatc |
16646989 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
16646988 |
aaaccgacatttggtttaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg |
16646939 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 550 - 618
Target Start/End: Original strand, 2743678 - 2743746
Alignment:
| Q |
550 |
tacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaa |
618 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2743678 |
tacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaa |
2743746 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 522 - 620
Target Start/End: Original strand, 7314585 - 7314683
Alignment:
| Q |
522 |
tcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaac |
620 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
7314585 |
tcataaataagaacaatacataatctttcacaattgaccaaaattaaatcaattcgacattttgttaaaattatacgaatgtttgaaattcaacaaaac |
7314683 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 472 - 527
Target Start/End: Original strand, 2743556 - 2743611
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataa |
527 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2743556 |
aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataa |
2743611 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 406
Target Start/End: Original strand, 8475857 - 8475906
Alignment:
| Q |
357 |
cggcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaac |
406 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8475857 |
cggcagttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgctgaggaaaac |
8475906 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 472 - 527
Target Start/End: Original strand, 4005003 - 4005058
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataa |
527 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4005003 |
aaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataa |
4005058 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 359 - 405
Target Start/End: Original strand, 34691658 - 34691704
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaa |
405 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
34691658 |
gcagttaactgtcgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaaa |
34691704 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 30256043 - 30256002
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgag |
400 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30256043 |
gcagttaactgccgaggaaaacctcgatagttaactgctgag |
30256002 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 357 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 41844406 - 41844357
Alignment:
| Q |
357 |
cggcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaac |
406 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
41844406 |
cggcagttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaaac |
41844357 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 387 - 825
Target Start/End: Original strand, 24053215 - 24053665
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------ac |
474 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
24053215 |
agttaactgccgagaaaaacacttatgcagacagtgagttctgcataattgtcaagcattttcaagccatttttcggccagtttttacctgtaatttaac |
24053314 |
T |
 |
| Q |
475 |
cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
574 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24053315 |
cagagcattttcaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattacatcaaa |
24053414 |
T |
 |
| Q |
575 |
ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaa |
674 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
24053415 |
ccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacatattacaactcattacacatcattaa |
24053514 |
T |
 |
| Q |
675 |
gttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcg |
774 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24053515 |
attatatccctaattacattcaacgcaattgcatatagaaagaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcg |
24053614 |
T |
 |
| Q |
775 |
ctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
24053615 |
ctatcgtcttcaattcgccaaggcatatagcttgtcgttttccatgcgtat |
24053665 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 472 - 825
Target Start/End: Original strand, 7796736 - 7797079
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7796736 |
aaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggttataaacaagaaaaatacaatatcttttataattgtccataattaaatc |
7796835 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat |
671 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7796836 |
aaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcat |
7796925 |
T |
 |
| Q |
672 |
taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacg |
771 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7796926 |
taaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacg |
7797025 |
T |
 |
| Q |
772 |
tcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
7797026 |
tcgctatcgtcgcgaataagccaaagcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
7797079 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 424 - 825
Target Start/End: Original strand, 24050126 - 24050540
Alignment:
| Q |
424 |
ttctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagtttt-----------taaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatatt |
512 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| | |||||| ||| |
|
|
| T |
24050126 |
ttctgcataattgttaagcatttccaagccatttttcggccagttttcacatgtaatttaaccagagcattaccaaaggaaatataacttatacaacatt |
24050225 |
T |
 |
| Q |
513 |
gaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattc |
612 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24050226 |
taaattcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattc |
24050325 |
T |
 |
| Q |
613 |
atcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatag |
712 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | | | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
24050326 |
atcaaaacgttacatagtatccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaattatatccctacttacattcaacgcaattgcatatag |
24050425 |
T |
 |
| Q |
713 |
aacgaacatacatatata--atatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtc |
810 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
24050426 |
aacgaacatacatatataatatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcttcaattcgccaaggcatatagcttgcc |
24050525 |
T |
 |
| Q |
811 |
gtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |
|
|
| T |
24050526 |
gttttccatgcgtat |
24050540 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 373 - 791
Target Start/End: Original strand, 25877668 - 25878098
Alignment:
| Q |
373 |
aggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttt |
471 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
25877668 |
aggaaaacttcggtagttaactgccgaggaaaacatttatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagccatttttcggccagttttt |
25877767 |
T |
 |
| Q |
472 |
a-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtcc |
560 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25877768 |
acctgtaattaaaccagagcattttcaaaagcaatataaatcatacaacattgaaacttggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtcc |
25877867 |
T |
 |
| Q |
561 |
ataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa----acagcacattacag |
656 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || | ||| |
|
|
| T |
25877868 |
ataattaaat--aaccgacatttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaa |
25877965 |
T |
 |
| Q |
657 |
ctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccga |
756 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25877966 |
ctcattacacgtgattatattaaatccctacttaca--catcacaattgcatatggaacaaacatacatatataatatattattttccaccatattccga |
25878063 |
T |
 |
| Q |
757 |
aacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataag |
791 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25878064 |
aacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataag |
25878098 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 373 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 33995174 - 33994720
Alignment:
| Q |
373 |
aggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttt |
471 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
33995174 |
aggaaaacctcgggagttaactgccgaggaaaacatttatgcagacagtgggttatgcataattgttaagcatttccaagccatttttcggccagttttt |
33995075 |
T |
 |
| Q |
472 |
a-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtcc |
560 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33995074 |
acatgtaatttaaccagaacatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtcc |
33994975 |
T |
 |
| Q |
561 |
ataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctca |
660 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | | ||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
33994974 |
ataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacaaaaaagtttgaaattcttcaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacac---- |
33994879 |
T |
 |
| Q |
661 |
ttacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaaca |
760 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
33994878 |
------atcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattaagaaaca |
33994785 |
T |
 |
| Q |
761 |
taaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
33994784 |
taaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagtttgccgttgtccatgcgtat |
33994720 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 402 - 814
Target Start/End: Original strand, 30352504 - 30352921
Alignment:
| Q |
402 |
aaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagtttttaac-----------cagagcatttctaaa |
489 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
30352504 |
aaaacaattatgcagacagtgaattttgcataattgttaagcattttcaagccatttttcgatcagtttttatctgtaaataaatcagagcatttccaaa |
30352603 |
T |
 |
| Q |
490 |
ggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttca |
589 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
30352604 |
tgcaatataagccatacaacatttaaactcagtcataaa--agaaaaatacaatatctttt-----tgtccataattaaatcaaaccagcatttggttca |
30352696 |
T |
 |
| Q |
590 |
aattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctactt |
689 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
30352697 |
aaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacacagtgtccataattaaacagcacattacaactcattacatatcaataaattaaatctttactt |
30352796 |
T |
 |
| Q |
690 |
acattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaata |
789 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
30352797 |
acattcaatgcaattgcatatggaaaaaacatacatatataatatattattttccacaatattccgaaacataaatacgacgtcgctatcgtctttaaca |
30352896 |
T |
 |
| Q |
790 |
agccaaggcatatagcttgtcgttt |
814 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
30352897 |
agccaaggcatataacttgccgttt |
30352921 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 472 - 825
Target Start/End: Original strand, 13563800 - 13564143
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
13563800 |
aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaatt |
13563899 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat |
671 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||| |
|
|
| T |
13563900 |
aaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcattaaaacattacaaagtgtccataattaaacaac----------tcattacacatcat |
13563989 |
T |
 |
| Q |
672 |
taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacg |
771 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13563990 |
taaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggatcgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacg |
13564089 |
T |
 |
| Q |
772 |
tcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13564090 |
tcgctatcatcgcaaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
13564143 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 387 - 825
Target Start/End: Original strand, 38855776 - 38856217
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------a |
473 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
38855776 |
agttaactgccgaggaaaactgattatgcagacagtgggttctgcataattctaga-catttccaagccatttttcggtcagtttttacctgtaattaaa |
38855874 |
T |
 |
| Q |
474 |
ccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaa |
573 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |
|
|
| T |
38855875 |
ccagacaatttccaaaggctaaataattcatacaatattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcgtaattaaattaa |
38855974 |
T |
 |
| Q |
574 |
accgacattttgttcaa-attacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcatt |
672 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | || |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
38855975 |
accgacattttggttaacattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatcatt |
38856064 |
T |
 |
| Q |
673 |
aagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgt |
772 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38856065 |
aaattcaatccctacttacattcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt |
38856164 |
T |
 |
| Q |
773 |
cgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
38856165 |
cgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
38856217 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 359 - 825
Target Start/End: Original strand, 34122557 - 34123040
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatt |
456 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |
|
|
| T |
34122557 |
gcagttaactgccgaggaaaagctcggtagttaactgccgaggaaaactgattatgcagacagtggattctgcataattctaaat-attttcaagccatt |
34122655 |
T |
 |
| Q |
457 |
ttt-cggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaata |
544 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
34122656 |
ttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcattttcaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaata |
34122755 |
T |
 |
| Q |
545 |
tcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa-- |
642 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
34122756 |
tcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaaggttacaaggtgttcataattaagt |
34122855 |
T |
 |
| Q |
643 |
--acagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatt |
740 |
Q |
| |
|
|| | ||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
34122856 |
gtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaattcatacttacattcaatgcaattgcatatggaacgaacatatatatataatatattatc |
34122955 |
T |
 |
| Q |
741 |
tttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
34122956 |
ttccaccatattctgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatataacttaccgttttccatgcgtat |
34123040 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 357 - 825
Target Start/End: Original strand, 37814613 - 37815084
Alignment:
| Q |
357 |
cggcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaacca |
454 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | |||||||||| | ||||||||||| || |||| | || ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
37814613 |
cggcagttaactgccgaggaaaaccttggtagttaactgccgaagaaatctgataatgcagacagtgggttctgcatagttctaaa-catttccaagcca |
37814711 |
T |
 |
| Q |
455 |
tttttc-ggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaa |
542 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||| | ||||| |
|
|
| T |
37814712 |
tttttccggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaa |
37814811 |
T |
 |
| Q |
543 |
tatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa |
642 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37814812 |
tatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa |
37814911 |
T |
 |
| Q |
643 |
acagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttt |
742 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
37814912 |
ac-------tac---tcattacacatcattaaattaaatccctacttactttcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatctt |
37815001 |
T |
 |
| Q |
743 |
tcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
37815002 |
ccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgtgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
37815084 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 387 - 825
Target Start/End: Original strand, 27863464 - 27863905
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttttta----------- |
472 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
27863464 |
agttaactgccgaggaaaactgattatgcagatagtgggttctgcataattctaaa-cattttcaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaa |
27863562 |
T |
 |
| Q |
473 |
accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca |
572 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
27863563 |
accagaacatttccaaaggcaaaataattcacacaagattgaaactcggacataatcaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaatta |
27863662 |
T |
 |
| Q |
573 |
aaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcatt |
672 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||| |
|
|
| T |
27863663 |
aaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaac----------tcattacacatcatt |
27863752 |
T |
 |
| Q |
673 |
aagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgt |
772 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27863753 |
aaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcaaatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccaaaacataaatccgacgt |
27863852 |
T |
 |
| Q |
773 |
cgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27863853 |
cgctgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgtttttcatgcgtat |
27863905 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 472 - 825
Target Start/End: Original strand, 25890153 - 25890496
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25890153 |
aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttatacaattgttcataattaaatt |
25890252 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat |
671 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25890253 |
aaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgttcataattaa----------acaactcattacacatcat |
25890342 |
T |
 |
| Q |
672 |
taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacg |
771 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25890343 |
taaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattctgaaacataaatccgacg |
25890442 |
T |
 |
| Q |
772 |
tcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| |||||| |
|
|
| T |
25890443 |
tcgacgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatcgcttgctgttttccacgcgtat |
25890496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 472 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 1039719 - 1039363
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1039719 |
aaccagagcattttcaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataaacacgataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatt |
1039620 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagca--catt--acagctcattacata |
667 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| || ||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1039619 |
aaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtctataattaagtgtcaataatttaacaactcattacata |
1039520 |
T |
 |
| Q |
668 |
tcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatcc |
767 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1039519 |
tcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaactgcatatggtacgaacatacatatataacatattattttccaccatattcc-aaacataaatcc |
1039421 |
T |
 |
| Q |
768 |
gacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1039420 |
gatgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
1039363 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 502 - 825
Target Start/End: Original strand, 28882177 - 28882490
Alignment:
| Q |
502 |
catacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaa |
601 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
28882177 |
catacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttcgttaaaattaaacaaac |
28882276 |
T |
 |
| Q |
602 |
gtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcaca |
701 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| | || |
|
|
| T |
28882277 |
gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatcattaaattaaatccccacttacattcaacgca |
28882366 |
T |
 |
| Q |
702 |
attgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcata |
801 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| |
|
|
| T |
28882367 |
attgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcaaataagcaaatgcata |
28882466 |
T |
 |
| Q |
802 |
tagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
28882467 |
tagcttgccgttttccatgcgtat |
28882490 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 387 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 34080143 - 34079753
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttttta----------- |
472 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
34080143 |
agttaactgcagaggaaaactgattatgcagacagtgggttctgcataattctaaa-catttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaa |
34080045 |
T |
 |
| Q |
473 |
accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca |
572 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
34080044 |
accagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatcaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaatta |
34079945 |
T |
 |
| Q |
573 |
aaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcatt |
672 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
34079944 |
aaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcatt |
34079855 |
T |
 |
| Q |
673 |
aagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgt |
772 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
34079854 |
aaattaaatccttacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgccgt |
34079755 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 387 - 825
Target Start/End: Original strand, 11029069 - 11029509
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttttta----------- |
472 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
11029069 |
agttaactgccgaggaaaactgattatgcagacagtgggttctgcataattctaga-catttccaagccattttttcgaccagtttttacctgtaattaa |
11029167 |
T |
 |
| Q |
473 |
accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca |
572 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
11029168 |
accagacaatttccaaaggctaaataattcatacaatattgaaactcggtcataatcaagataaatgcaatatcttttacaattgttcataattaaatta |
11029267 |
T |
 |
| Q |
573 |
aaccgacattttgttcaa-attacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat |
671 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |
|
|
| T |
11029268 |
aaccgacattttggttaacattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaa--gtccataattaaac-------tac---tcatcacacatcat |
11029355 |
T |
 |
| Q |
672 |
taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacg |
771 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11029356 |
taaattaaatccctacttacattcaacgcaattacatatgaaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacg |
11029455 |
T |
 |
| Q |
772 |
tcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11029456 |
tcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
11029509 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 359 - 753
Target Start/End: Original strand, 7017545 - 7017941
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatt |
456 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
7017545 |
gcagttaactctcaaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaaactgattatgcagacagtgggt-ctgcataattctaaa-cattttcaagccatt |
7017642 |
T |
 |
| Q |
457 |
ttt-cggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaata |
544 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||| | ||||||| |
|
|
| T |
7017643 |
ttttcggccagtttttatctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaata |
7017742 |
T |
 |
| Q |
545 |
tcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaac |
644 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
7017743 |
tcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac |
7017842 |
T |
 |
| Q |
645 |
agcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttc |
744 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
7017843 |
-------ta---ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttcc |
7017932 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 589 - 821
Target Start/End: Original strand, 4196792 - 4197012
Alignment:
| Q |
589 |
aaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctact |
688 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
4196792 |
aaattacacaaacgtttggtattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaac----------tcattacatatgattatattaaatccctact |
4196881 |
T |
 |
| Q |
689 |
tacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaat |
788 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4196882 |
tacattcatcacaattgcatatggaacgaa--tacatatataatatattattttcgaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtctttaat |
4196979 |
T |
 |
| Q |
789 |
aagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgc |
821 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4196980 |
aagccaaggcatgtagcttgtcgttttccatgc |
4197012 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 602 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 14280762 - 14280549
Alignment:
| Q |
602 |
gtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcaca |
701 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
14280762 |
gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgca |
14280673 |
T |
 |
| Q |
702 |
attgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcata |
801 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14280672 |
attacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcata |
14280573 |
T |
 |
| Q |
802 |
tagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14280572 |
tagcttgccgttttccatgcgtat |
14280549 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 475 - 621
Target Start/End: Original strand, 38407308 - 38407454
Alignment:
| Q |
475 |
cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
574 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38407308 |
cagaacatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcagacataaacaagaaaaatacaatatcttttagaattgtccataattaaatcaaa |
38407407 |
T |
 |
| Q |
575 |
ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
38407408 |
ccggcatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg |
38407454 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 359 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 28388559 - 28388307
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatt |
456 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28388559 |
gcagttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaagaaaactgattatgcagacagtgggttctgcataattttaaa-catttccaagccatt |
28388461 |
T |
 |
| Q |
457 |
ttt-cggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaata |
544 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
28388460 |
ttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaattcggacataaacaaaataaatacaata |
28388361 |
T |
 |
| Q |
545 |
tcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacaca |
598 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28388360 |
ttttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttcaaattacaca |
28388307 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 472 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 7762157 - 7762008
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7762157 |
aaccaaagcattttgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcgaacataaacaagatagatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
7762058 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7762057 |
aaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg |
7762008 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 676 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 28387975 - 28387827
Alignment:
| Q |
676 |
ttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgc |
775 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
28387975 |
ttaaatccctacttacaatcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgc |
28387876 |
T |
 |
| Q |
776 |
tatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
28387875 |
tatcgtcgtgaataa-caaaggcatataacttgtcgttttccatgtgtat |
28387827 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 389 - 548
Target Start/End: Original strand, 4196618 - 4196790
Alignment:
| Q |
389 |
ttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------acca |
476 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
4196618 |
ttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagctatttttcggtcaatttttacctgtaattaaacca |
4196717 |
T |
 |
| Q |
477 |
gagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaag-aataatacaatatctt |
548 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
4196718 |
gagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaaatacaatatctt |
4196790 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 475 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 41799679 - 41799534
Alignment:
| Q |
475 |
cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
574 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
41799679 |
cagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaacttggacataaacaagaaaaatacaattt-ttttacaattgtccataattaaattaaa |
41799581 |
T |
 |
| Q |
575 |
ccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
41799580 |
ccgacatttgattcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg |
41799534 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 474 - 782
Target Start/End: Original strand, 6267635 - 6267932
Alignment:
| Q |
474 |
ccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaa |
573 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| | || ||||| ||| | ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
6267635 |
ccagagcatttccaaaggcaatactagtcgtacaacatttatcctcagtcataaacaagaaaaatacattatcttttaccgttatccataattaaatcaa |
6267734 |
T |
 |
| Q |
574 |
accgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcatta |
673 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||| ||| | | |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
6267735 |
tccgacatttcattaaaattgcaagaatgtttgaaattcatcataacattaaagagtgtccataattaaacaaca----------cattacatatcatta |
6267824 |
T |
 |
| Q |
674 |
agttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtc |
773 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||| |||||| | || ||||| || |||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6267825 |
aattaaatctctactgacattctacgcagttgcagatggaacaaaaatacatatataatatattatcttccatcatattccg-aacataaattcgacgtc |
6267923 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 472 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 43179814 - 43179605
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| | || ||||| ||| | ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
43179814 |
aaccagagcattttcaaaggcaatactagtcgtacaacatttatactcggtcaaaaacaagaaaaatatattatcttttacacttgtccataattaatac |
43179715 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat |
671 |
Q |
| |
|
|| || |||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| | |
|
|
| T |
43179714 |
aatccaacatttcgttaaaattacacgaatgtttgaaattcatcaaaacgttaaagagtgtccataattaaacaacacattacaacacattatatattgt |
43179615 |
T |
 |
| Q |
672 |
taagttaaat |
681 |
Q |
| |
|
||| |||||| |
|
|
| T |
43179614 |
taaattaaat |
43179605 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 702 - 823
Target Start/End: Complemental strand, 43179559 - 43179438
Alignment:
| Q |
702 |
attgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcata |
801 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
43179559 |
attgcagatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatcaaacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcata |
43179460 |
T |
 |
| Q |
802 |
tagcttgtcgtttcccatgcgt |
823 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
43179459 |
tagcttaccgttttccatgcgt |
43179438 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 487 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 16440315 - 16440192
Alignment:
| Q |
487 |
aaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgt |
586 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||| ||| | | || |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| || |
|
|
| T |
16440315 |
aaaggcaatacaactcatacaccatttataatcagtcataaacaagaacaatacataatattttagaattgaccataattaaatcaatccgatatttcgt |
16440216 |
T |
 |
| Q |
587 |
tcaaattacacaaaagtttgaaat |
610 |
Q |
| |
|
| ||||||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
16440215 |
taaaattacacgaatgtttaaaat |
16440192 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 440
Target Start/End: Original strand, 31094597 - 31094651
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaa |
440 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31094597 |
agttaactgccgaagaaaacaattatgcagacagtggattctgcataattctaaa |
31094651 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 344
Target Start/End: Original strand, 25877561 - 25877607
Alignment:
| Q |
298 |
ttgttgtagacacgttgcataaggttgtttcacacgagtaaaatacg |
344 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25877561 |
ttgttgttgacacattgcataaggttgtgtcacacgagtaaaatacg |
25877607 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 357 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 14280942 - 14280825
Alignment:
| Q |
357 |
cggcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaa-acaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaacca |
454 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | |||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
14280942 |
cggcagttaactgccgaggaaaacctcggtagttaacggccgaggaaatttaattatgcagacagcaggttctgcataattct-aagtatttccaagcca |
14280844 |
T |
 |
| Q |
455 |
-tttttcggtcagttttta |
472 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14280843 |
ttttttcggccagttttta |
14280825 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 529 - 619
Target Start/End: Original strand, 30292292 - 30292382
Alignment:
| Q |
529 |
caagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaa |
619 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| || || |||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| || ||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
30292292 |
caagaacaatacataattttgtacaattgaccaaaattaaatcaattcgacatttcgttaaaattacacgaatgttcgaaattcaacaaaa |
30292382 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 357 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 30708915 - 30708866
Alignment:
| Q |
357 |
cggcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaac |
406 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30708915 |
cggcagttaactgccgaagaaaacctcgatagttaactgccgaggaaaac |
30708866 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0057 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:
Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 472 - 825
Target Start/End: Original strand, 21808 - 22140
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21808 |
aaccagagcatttccaaaagcaatataaatcatacaatattgaaactcg------------aaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
21895 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat |
671 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21896 |
aaaccgacatttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttaaaaagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcat |
21995 |
T |
 |
| Q |
672 |
taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacg |
771 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21996 |
tatattaaatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatat---------ttttccaccatattccaaaacataaattcgacg |
22086 |
T |
 |
| Q |
772 |
tcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
22087 |
tcgctattgtctttaataagccaagacatataacttgtcattttccatgcgtat |
22140 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:
Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 359 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 15995 - 15526
Alignment:
| Q |
359 |
gcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatt |
456 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||| |
|
|
| T |
15995 |
gcagttaactgccgaggaaaacctcggtagttaacttccgaggaaaactgattatgcagacagtgagttctgcataattctaaa-catttctaagccatt |
15897 |
T |
 |
| Q |
457 |
t-ttcggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaata |
544 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15896 |
tgttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataaacaagataaatacaata |
15797 |
T |
 |
| Q |
545 |
tcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaac |
644 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15796 |
tcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttagttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa-- |
15699 |
T |
 |
| Q |
645 |
agcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttc |
744 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
15698 |
--------acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttcc |
15607 |
T |
 |
| Q |
745 |
accatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
15606 |
accatattccgaaacataaatctgacgtccccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatacgtat |
15526 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0494 (Bit Score: 184; Significance: 4e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:
Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 387 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 5339 - 4897
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttttta----------- |
472 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
5339 |
agttaactgccgaggaaaactgattatgcagacagtgggttctgcataattctaga-catttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaa |
5241 |
T |
 |
| Q |
473 |
accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca |
572 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
5240 |
accagagcatttccaaaggctaaataattcatacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatta |
5141 |
T |
 |
| Q |
573 |
aaccgacattttg-ttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctcattacatatcat |
671 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
5140 |
aaccgacattttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatgaaaacattacaaagtgtccataattaaac-------tac---tcattacacatcat |
5051 |
T |
 |
| Q |
672 |
taagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacg |
771 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5050 |
taaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacg |
4951 |
T |
 |
| Q |
772 |
tcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
4950 |
tcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
4897 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0219 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0219
Description:
Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 360 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 20151 - 19743
Alignment:
| Q |
360 |
cagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattt |
457 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
20151 |
cagttaactgtcgaggaaatcctcggtagtttactgccgaggaaaactgattatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagcttttt |
20052 |
T |
 |
| Q |
458 |
tt-cggtcagttttta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatat |
545 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20051 |
tttcggtcagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatat |
19952 |
T |
 |
| Q |
546 |
cttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaa--- |
642 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| || || ||||||| |
|
|
| T |
19951 |
cttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcatcaaaacgttacaaagtggccgtaattaagtg |
19852 |
T |
 |
| Q |
643 |
-acagcacattacagctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattattt |
741 |
Q |
| |
|
|| | ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
19851 |
ttcataattaaacaactcattgcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgagcatacatatataatatattatct |
19752 |
T |
 |
| Q |
742 |
ttcaccata |
750 |
Q |
| |
|
| ||||||| |
|
|
| T |
19751 |
tccaccata |
19743 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0219; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 748 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 19582 - 19505
Alignment:
| Q |
748 |
atattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19582 |
atattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaagcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
19505 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0201 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:
Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 373 - 825
Target Start/End: Original strand, 22450 - 22916
Alignment:
| Q |
373 |
aggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgcaacagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagtttt |
470 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| || |||| |
|
|
| T |
22450 |
aggaaaatctcggtagttaactgccgaggaaaactgattatgca-cagtgagttctgcataattctaaa-catttccaagccattttttcggccaatttt |
22547 |
T |
 |
| Q |
471 |
ta-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtc |
559 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22548 |
tacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatcaagataaatacaatatcttttacaattgtc |
22647 |
T |
 |
| Q |
560 |
cataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaa----cagcacattaca |
655 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||| || | ||| |
|
|
| T |
22648 |
cataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtt-gaaattcatcaaaacattacaaagtgttcataattaagtgtccataattaaaca |
22746 |
T |
 |
| Q |
656 |
gctcattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccg |
755 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
22747 |
actcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcaaatggaacgaacatacatatataatataatattttccaccatattctg |
22846 |
T |
 |
| Q |
756 |
aaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22847 |
aaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcaaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
22916 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0513 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:
Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 375 - 726
Target Start/End: Original strand, 8248 - 8602
Alignment:
| Q |
375 |
gaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaaca-attatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccattttt-cggtcagttttt |
471 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
8248 |
gaaaacctcggtagttaactgccaaggaaaactgattatgcagacagtgggttctgcataattctaaa-catttccaagccattttttcggccagttttt |
8346 |
T |
 |
| Q |
472 |
a-----------accagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtcc |
560 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
8347 |
acctgtaattaaaccaaagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcgggcataatcaagataagtacaatatcttttacaattgttc |
8446 |
T |
 |
| Q |
561 |
ataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacagcacattacagctca |
660 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
8447 |
ataattaaattaaaccaacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa----------acaactca |
8536 |
T |
 |
| Q |
661 |
ttacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacata |
726 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
8537 |
ttacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacata |
8602 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0794 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0794
Description:
Target: scaffold0794; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 659 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 1488 - 1322
Alignment:
| Q |
659 |
cattacatatcattaagttaaatccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaa |
758 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |
|
|
| T |
1488 |
cattacacatcattatattaaatccatacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatatttcaaaa |
1389 |
T |
 |
| Q |
759 |
cataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1388 |
cataaatccgacgtcgctattgtctttaataagtcaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtat |
1322 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0169 (Bit Score: 105; Significance: 5e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0169
Description:
Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 387 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 1695 - 1517
Alignment:
| Q |
387 |
agttaactgctgaggaaaacaattatgca-acagtggattctgcataattctaaagcatttccaaaccatttttcggtcagttttta-----------ac |
474 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
1695 |
agttaactgctgaggaaaacaattatgcagacagtgggttctgcataattctatagcatttccaagccatttttcggccagtttttacctgtaattaaac |
1596 |
T |
 |
| Q |
475 |
cagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttaca |
553 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1595 |
cagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttaca |
1517 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0169; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 682 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 10978 - 10835
Alignment:
| Q |
682 |
ccctacttacattcatcacaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgt |
781 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10978 |
ccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacaaatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatctgacgtcgctatcgt |
10879 |
T |
 |
| Q |
782 |
ctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtttcccatgcgtat |
825 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
10878 |
cacgaataagccaaggcatatagcttgctgttttccatgcgtat |
10835 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 472 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 236150 - 236001
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
236150 |
aaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaatattgaaactcagacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
236051 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacg |
621 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
236050 |
aaatcgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg |
236001 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 373 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 236286 - 236253
Alignment:
| Q |
373 |
aggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaac |
406 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
236286 |
aggaaaacctcgatagttaactgcagaggaaaac |
236253 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0199 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:
Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 472 - 616
Target Start/End: Original strand, 12562 - 12706
Alignment:
| Q |
472 |
aaccagagcatttctaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggtcataaacaagaataatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||| | || |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12562 |
aaccagagcatttcgaaaagcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
12661 |
T |
 |
| Q |
572 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaaagtttgaaattcatca |
616 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
12662 |
aaaccgacattttgtttaaattacacaaacgtttaaaattcatca |
12706 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0293 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:
Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 357 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 764 - 715
Alignment:
| Q |
357 |
cggcagttaaatgtcaaggaaaacctcgatagttaactgctgaggaaaac |
406 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
764 |
cggcagttaactgcccaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaaac |
715 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
© Oklahoma State University