View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5079-Insertion-3 (Length: 772)

Name: NF5079-Insertion-3
Description: NF5079
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5079-Insertion-3
NF5079-Insertion-3
[»] chr1 (121 HSPs)
chr1 (295-772)||(26520103-26520580)
chr1 (435-772)||(8347255-8347593)
chr1 (427-772)||(42922184-42922529)
chr1 (270-757)||(17324635-17325118)
chr1 (427-770)||(18800557-18800900)
chr1 (420-772)||(13125440-13125794)
chr1 (270-669)||(21948281-21948674)
chr1 (270-669)||(31735614-31736006)
chr1 (270-669)||(47906065-47906458)
chr1 (270-669)||(15294927-15295330)
chr1 (427-772)||(15669375-15669722)
chr1 (428-772)||(8349034-8349379)
chr1 (427-758)||(14183588-14183917)
chr1 (270-669)||(24325456-24325851)
chr1 (270-670)||(48664961-48665367)
chr1 (270-669)||(39931871-39932261)
chr1 (286-669)||(2510418-2510798)
chr1 (295-668)||(28998347-28998710)
chr1 (295-668)||(29004063-29004426)
chr1 (270-669)||(9459509-9459904)
chr1 (270-669)||(9463336-9463731)
chr1 (270-669)||(27339223-27339617)
chr1 (427-729)||(13215031-13215341)
chr1 (270-757)||(27336939-27337423)
chr1 (427-757)||(25251273-25251606)
chr1 (422-669)||(2617461-2617704)
chr1 (426-669)||(10399921-10400160)
chr1 (427-670)||(16428603-16428842)
chr1 (427-670)||(38925570-38925809)
chr1 (270-668)||(2949325-2949706)
chr1 (427-729)||(50078846-50079152)
chr1 (428-757)||(17186126-17186458)
chr1 (427-670)||(11457567-11457806)
chr1 (427-757)||(9241084-9241417)
chr1 (427-759)||(27916447-27916782)
chr1 (401-670)||(39462443-39462708)
chr1 (273-669)||(46431800-46432207)
chr1 (427-669)||(51749989-51750227)
chr1 (396-668)||(6995794-6996063)
chr1 (428-669)||(20302410-20302647)
chr1 (427-670)||(49495303-49495530)
chr1 (427-670)||(18307059-18307298)
chr1 (427-670)||(41646870-41647109)
chr1 (427-670)||(50076764-50077003)
chr1 (382-772)||(16561373-16561766)
chr1 (427-669)||(20291407-20291645)
chr1 (427-772)||(26613222-26613571)
chr1 (433-669)||(6823840-6824080)
chr1 (427-757)||(12302504-12302841)
chr1 (427-757)||(18839537-18839870)
chr1 (427-772)||(30790384-30790725)
chr1 (427-669)||(16226117-16226356)
chr1 (427-670)||(6756477-6756715)
chr1 (427-668)||(31422967-31423205)
chr1 (427-668)||(50307640-50307878)
chr1 (427-757)||(13761787-13762118)
chr1 (427-670)||(15823496-15823735)
chr1 (427-772)||(30738610-30738957)
chr1 (427-757)||(28840628-28840961)
chr1 (427-669)||(28842443-28842683)
chr1 (427-668)||(50248666-50248903)
chr1 (433-669)||(6822971-6823202)
chr1 (401-670)||(14098062-14098327)
chr1 (427-670)||(17318843-17319076)
chr1 (428-670)||(17324016-17324252)
chr1 (427-669)||(47179659-47179902)
chr1 (415-601)||(13127787-13127971)
chr1 (485-772)||(28279277-28279567)
chr1 (427-670)||(31489865-31490102)
chr1 (430-670)||(3579708-3579946)
chr1 (421-602)||(26332715-26332891)
chr1 (442-670)||(31425107-31425335)
chr1 (427-669)||(47177308-47177551)
chr1 (420-670)||(25127808-25128061)
chr1 (427-669)||(51752315-51752552)
chr1 (447-729)||(4131401-4131692)
chr1 (427-598)||(28207223-28207397)
chr1 (300-757)||(6115101-6115541)
chr1 (427-729)||(40133885-40134200)
chr1 (427-546)||(47451598-47451718)
chr1 (556-662)||(155788-155888)
chr1 (559-729)||(16429042-16429213)
chr1 (270-346)||(6115532-6115608)
chr1 (686-772)||(15916603-15916689)
chr1 (553-669)||(16231642-16231752)
chr1 (426-515)||(25248757-25248846)
chr1 (553-757)||(25248550-25248754)
chr1 (270-349)||(4131694-4131772)
chr1 (606-669)||(23785966-23786028)
chr1 (270-349)||(45693836-45693915)
chr1 (671-772)||(13127670-13127771)
chr1 (427-515)||(16231551-16231639)
chr1 (560-670)||(43104245-43104350)
chr1 (571-661)||(4144782-4144865)
chr1 (574-757)||(21353345-21353525)
chr1 (381-435)||(14352878-14352932)
chr1 (553-670)||(16432473-16432583)
chr1 (574-768)||(9526469-9526662)
chr1 (270-327)||(11693580-11693637)
chr1 (270-327)||(13785662-13785719)
chr1 (270-327)||(14352785-14352842)
chr1 (566-662)||(51757623-51757712)
chr1 (571-666)||(2232597-2232685)
chr1 (574-661)||(2401320-2401400)
chr1 (574-661)||(25134074-25134154)
chr1 (622-670)||(46783189-46783237)
chr1 (313-360)||(6996175-6996222)
chr1 (556-668)||(14353047-14353153)
chr1 (382-428)||(10115695-10115741)
chr1 (556-602)||(26332642-26332688)
chr1 (611-663)||(13785368-13785421)
chr1 (621-669)||(23816027-23816074)
chr1 (379-439)||(32260948-32261008)
chr1 (609-660)||(14997072-14997122)
chr1 (741-772)||(43104454-43104485)
chr1 (476-545)||(32261036-32261103)
chr1 (427-461)||(43104109-43104143)
chr1 (611-663)||(8213624-8213677)
chr1 (604-657)||(9521742-9521794)
chr1 (427-472)||(16431051-16431096)
chr1 (556-600)||(49959129-49959174)
[»] chr4 (129 HSPs)
chr4 (270-757)||(19322549-19323031)
chr4 (427-772)||(8756232-8756579)
chr4 (427-772)||(18537455-18537800)
chr4 (429-772)||(18534813-18535156)
chr4 (270-668)||(56030298-56030685)
chr4 (270-669)||(44599928-44600319)
chr4 (414-772)||(9863699-9864064)
chr4 (270-668)||(14787523-14787912)
chr4 (499-772)||(38890206-38890480)
chr4 (379-768)||(10112825-10113218)
chr4 (270-669)||(24348067-24348460)
chr4 (270-669)||(22132482-22132878)
chr4 (427-757)||(36378296-36378629)
chr4 (270-669)||(17662336-17662717)
chr4 (427-772)||(28453691-28454035)
chr4 (427-772)||(12102094-12102440)
chr4 (427-772)||(16185816-16186166)
chr4 (427-670)||(40999040-40999276)
chr4 (427-729)||(22802758-22803063)
chr4 (427-668)||(48486323-48486560)
chr4 (427-757)||(19095886-19096219)
chr4 (270-527)||(5100852-5101101)
chr4 (427-757)||(24888800-24889132)
chr4 (427-721)||(37313097-37313395)
chr4 (427-768)||(15032532-15032865)
chr4 (422-669)||(40637073-40637316)
chr4 (427-669)||(5198424-5198662)
chr4 (422-669)||(14633319-14633560)
chr4 (427-670)||(12395935-12396174)
chr4 (427-670)||(24878993-24879232)
chr4 (431-670)||(33415578-33415812)
chr4 (427-668)||(38928269-38928507)
chr4 (427-669)||(51015250-51015488)
chr4 (270-669)||(22134707-22135110)
chr4 (427-757)||(22800859-22801191)
chr4 (381-669)||(18709254-18709547)
chr4 (427-670)||(12400897-12401136)
chr4 (427-670)||(24880455-24880694)
chr4 (427-670)||(40091505-40091744)
chr4 (427-669)||(18847157-18847396)
chr4 (420-772)||(47150874-47151227)
chr4 (422-669)||(8631510-8631757)
chr4 (427-669)||(11434959-11435197)
chr4 (427-669)||(22044481-22044719)
chr4 (427-669)||(22046776-22047014)
chr4 (270-639)||(30136424-30136762)
chr4 (427-669)||(38409203-38409447)
chr4 (422-669)||(2484963-2485207)
chr4 (427-663)||(41997496-41997728)
chr4 (427-670)||(619537-619776)
chr4 (427-670)||(47274731-47274969)
chr4 (427-757)||(9148255-9148588)
chr4 (427-670)||(13543958-13544202)
chr4 (427-669)||(5637556-5637798)
chr4 (427-729)||(16453313-16453619)
chr4 (422-669)||(6764838-6765086)
chr4 (427-757)||(37089369-37089703)
chr4 (427-669)||(9174236-9174475)
chr4 (427-669)||(16934233-16934472)
chr4 (427-670)||(36919674-36919916)
chr4 (422-669)||(47868400-47868643)
chr4 (429-670)||(36921583-36921822)
chr4 (379-727)||(9022263-9022613)
chr4 (427-669)||(9176564-9176803)
chr4 (427-639)||(6132877-6133085)
chr4 (461-669)||(11006327-11006532)
chr4 (461-669)||(11008656-11008861)
chr4 (442-669)||(31849689-31849913)
chr4 (427-655)||(3937314-3937537)
chr4 (292-603)||(53405001-53405312)
chr4 (427-669)||(16931879-16932118)
chr4 (555-768)||(31983513-31983727)
chr4 (496-667)||(26086069-26086236)
chr4 (427-772)||(25357641-25357995)
chr4 (427-669)||(3824661-3824902)
chr4 (427-669)||(7941323-7941565)
chr4 (381-669)||(47210843-47211122)
chr4 (461-669)||(22782828-22783033)
chr4 (427-581)||(38270158-38270315)
chr4 (401-603)||(52942596-52942802)
chr4 (503-757)||(36380429-36380686)
chr4 (427-763)||(18409338-18409675)
chr4 (461-669)||(22780463-22780668)
chr4 (427-581)||(24446756-24446908)
chr4 (270-407)||(38890478-38890610)
chr4 (554-670)||(16455375-16455484)
chr4 (559-772)||(3982156-3982374)
chr4 (503-602)||(10114412-10114509)
chr4 (427-527)||(2891320-2891421)
chr4 (562-670)||(2891433-2891534)
chr4 (671-772)||(22295416-22295517)
chr4 (506-662)||(27499128-27499280)
chr4 (568-670)||(13547302-13547397)
chr4 (602-660)||(5336882-5336939)
chr4 (528-601)||(38208836-38208910)
chr4 (574-661)||(16489352-16489432)
chr4 (602-661)||(4570119-4570177)
chr4 (571-661)||(7050356-7050439)
chr4 (606-757)||(4215486-4215642)
chr4 (686-772)||(10114583-10114669)
chr4 (574-659)||(25699752-25699830)
chr4 (383-449)||(54928982-54929048)
chr4 (387-515)||(29609684-29609814)
chr4 (574-661)||(4556158-4556238)
chr4 (574-661)||(4558314-4558394)
chr4 (571-666)||(11853549-11853637)
chr4 (574-661)||(15316961-15317041)
chr4 (574-661)||(31300427-31300507)
chr4 (687-758)||(26557852-26557923)
chr4 (476-570)||(52043567-52043659)
chr4 (620-669)||(11437557-11437605)
chr4 (602-663)||(16638852-16638912)
chr4 (556-670)||(54906722-54906832)
chr4 (671-763)||(3578662-3578753)
chr4 (686-770)||(4884988-4885071)
chr4 (621-669)||(5635567-5635614)
chr4 (574-657)||(8529270-8529346)
chr4 (574-661)||(16689039-16689119)
chr4 (686-757)||(8529381-8529452)
chr4 (427-466)||(36380378-36380417)
chr4 (622-668)||(2880972-2881018)
chr4 (686-768)||(15831255-15831337)
chr4 (686-756)||(16631297-16631367)
chr4 (393-451)||(38208986-38209044)
chr4 (624-670)||(52942549-52942594)
chr4 (624-661)||(13072080-13072117)
chr4 (688-757)||(40637342-40637410)
chr4 (270-311)||(47211158-47211199)
chr4 (270-327)||(54929094-54929151)
[»] chr5 (105 HSPs)
chr5 (383-770)||(6661168-6661555)
chr5 (270-670)||(18511302-18511693)
chr5 (303-757)||(40221349-40221805)
chr5 (270-729)||(18596446-18596901)
chr5 (270-669)||(18466482-18466872)
chr5 (270-670)||(18509408-18509798)
chr5 (270-669)||(18468807-18469199)
chr5 (270-669)||(25803816-25804213)
chr5 (270-669)||(27912328-27912724)
chr5 (270-669)||(27910244-27910638)
chr5 (270-670)||(26097530-26097921)
chr5 (427-729)||(31472636-31472942)
chr5 (270-603)||(26098401-26098732)
chr5 (270-669)||(15552034-15552434)
chr5 (476-738)||(17413181-17413443)
chr5 (430-670)||(34530756-34530992)
chr5 (427-757)||(36208530-36208858)
chr5 (422-670)||(39854429-39854672)
chr5 (422-669)||(10529190-10529433)
chr5 (427-670)||(25904053-25904292)
chr5 (427-670)||(37705870-37706109)
chr5 (461-757)||(34477050-34477349)
chr5 (427-670)||(39398083-39398321)
chr5 (427-757)||(17072833-17073166)
chr5 (427-666)||(31179464-31179700)
chr5 (427-757)||(2174869-2175200)
chr5 (427-639)||(20044960-20045169)
chr5 (427-669)||(31545030-31545269)
chr5 (427-669)||(38882055-38882294)
chr5 (427-669)||(25921564-25921802)
chr5 (427-757)||(21947977-21948308)
chr5 (270-669)||(10586638-10587020)
chr5 (427-669)||(31542685-31542923)
chr5 (427-669)||(4236579-4236817)
chr5 (461-757)||(34479415-34479714)
chr5 (427-757)||(9020172-9020502)
chr5 (427-757)||(24126806-24127138)
chr5 (427-638)||(20043000-20043208)
chr5 (427-638)||(42770724-42770924)
chr5 (427-757)||(1189604-1189943)
chr5 (427-597)||(12556079-12556252)
chr5 (427-670)||(10474413-10474652)
chr5 (431-662)||(16776112-16776339)
chr5 (427-668)||(2818427-2818665)
chr5 (461-668)||(16092292-16092495)
chr5 (270-465)||(3373332-3373521)
chr5 (496-669)||(6745088-6745256)
chr5 (556-772)||(15143547-15143765)
chr5 (464-757)||(20053834-20054119)
chr5 (422-669)||(6747249-6747493)
chr5 (402-661)||(6756419-6756674)
chr5 (427-670)||(36402418-36402657)
chr5 (428-670)||(17818580-17818817)
chr5 (427-757)||(695839-696160)
chr5 (427-670)||(31466069-31466307)
chr5 (272-483)||(15143293-15143496)
chr5 (477-662)||(2144661-2144841)
chr5 (571-772)||(15445248-15445453)
chr5 (461-669)||(21684542-21684746)
chr5 (477-662)||(4754158-4754335)
chr5 (553-670)||(20505931-20506041)
chr5 (553-669)||(39798126-39798235)
chr5 (503-670)||(658443-658606)
chr5 (429-670)||(2954368-2954606)
chr5 (553-669)||(4410102-4410211)
chr5 (476-661)||(29748350-29748529)
chr5 (602-767)||(4897850-4898023)
chr5 (381-493)||(41585970-41586082)
chr5 (427-544)||(20507673-20507791)
chr5 (428-729)||(21288715-21289016)
chr5 (606-669)||(3373227-3373289)
chr5 (606-669)||(10749827-10749889)
chr5 (286-344)||(21288655-21288713)
chr5 (553-670)||(41585834-41585944)
chr5 (609-669)||(10757306-10757365)
chr5 (485-663)||(31782554-31782731)
chr5 (476-662)||(15224866-15225049)
chr5 (528-663)||(34033665-34033796)
chr5 (427-471)||(2723917-2723961)
chr5 (604-670)||(42770934-42770999)
chr5 (422-515)||(4410002-4410099)
chr5 (602-663)||(10627389-10627449)
chr5 (571-666)||(1170811-1170899)
chr5 (571-666)||(35385546-35385634)
chr5 (606-669)||(15354665-15354726)
chr5 (606-669)||(15356941-15357002)
chr5 (606-669)||(23665171-23665232)
chr5 (606-669)||(23793355-23793416)
chr5 (556-660)||(35430259-35430359)
chr5 (557-603)||(2723985-2724031)
chr5 (574-658)||(25452498-25452575)
chr5 (605-661)||(1240456-1240511)
chr5 (602-658)||(25445521-25445576)
chr5 (688-759)||(3373132-3373202)
chr5 (602-661)||(11962532-11962590)
chr5 (621-668)||(13295880-13295927)
chr5 (602-661)||(17841348-17841406)
chr5 (610-669)||(23741949-23742006)
chr5 (686-757)||(42238374-42238445)
chr5 (686-768)||(1170924-1171006)
chr5 (602-660)||(26406573-26406630)
chr5 (621-663)||(32520579-32520621)
chr5 (686-768)||(35385438-35385520)
chr5 (477-546)||(35430171-35430238)
chr5 (688-757)||(27910664-27910732)
[»] chr3 (152 HSPs)
chr3 (427-772)||(31151277-31151623)
chr3 (270-757)||(1313191-1313671)
chr3 (270-757)||(53917659-53918141)
chr3 (270-757)||(53915491-53915973)
chr3 (381-670)||(6561694-6561979)
chr3 (270-669)||(458059-458453)
chr3 (270-669)||(455682-456076)
chr3 (270-669)||(746531-746926)
chr3 (270-669)||(25533216-25533610)
chr3 (420-772)||(36871280-36871631)
chr3 (270-669)||(4103984-4104374)
chr3 (427-771)||(53597171-53597514)
chr3 (428-601)||(24177210-24177383)
chr3 (270-668)||(51943151-51943537)
chr3 (428-670)||(23636958-23637192)
chr3 (270-669)||(10621618-10622018)
chr3 (427-663)||(23633390-23633616)
chr3 (270-546)||(27635834-27636103)
chr3 (478-772)||(561754-562049)
chr3 (427-757)||(28761422-28761755)
chr3 (422-669)||(4308370-4308613)
chr3 (427-670)||(1626771-1627010)
chr3 (270-598)||(42992062-42992390)
chr3 (427-670)||(43423551-43423790)
chr3 (427-670)||(28102090-28102329)
chr3 (270-669)||(42990061-42990472)
chr3 (427-757)||(3314614-3314947)
chr3 (422-669)||(43228216-43228459)
chr3 (427-670)||(43421503-43421742)
chr3 (427-670)||(45882869-45883108)
chr3 (401-661)||(24979611-24979867)
chr3 (422-669)||(51727096-51727338)
chr3 (504-770)||(25635391-25635657)
chr3 (427-666)||(35777351-35777587)
chr3 (270-586)||(41848913-41849244)
chr3 (427-666)||(5926856-5927091)
chr3 (427-670)||(39715400-39715638)
chr3 (427-669)||(3859458-3859696)
chr3 (427-669)||(10956116-10956354)
chr3 (427-669)||(11170334-11170572)
chr3 (432-669)||(18099259-18099493)
chr3 (427-670)||(880539-880779)
chr3 (427-669)||(6065884-6066124)
chr3 (427-772)||(1673905-1674242)
chr3 (422-669)||(43226011-43226253)
chr3 (427-669)||(5191583-5191821)
chr3 (427-669)||(10958412-10958650)
chr3 (427-669)||(22114394-22114632)
chr3 (427-670)||(18162594-18162832)
chr3 (427-656)||(28100143-28100368)
chr3 (461-669)||(38890004-38890208)
chr3 (427-669)||(18096989-18097228)
chr3 (422-670)||(27101269-27101517)
chr3 (427-670)||(36011757-36011996)
chr3 (541-771)||(1620441-1620672)
chr3 (427-669)||(6063534-6063775)
chr3 (427-639)||(28180954-28181161)
chr3 (504-751)||(13420186-13420432)
chr3 (427-728)||(32264060-32264370)
chr3 (427-661)||(12268061-12268293)
chr3 (422-669)||(50493924-50494168)
chr3 (427-670)||(53468544-53468782)
chr3 (427-668)||(48361761-48361997)
chr3 (427-670)||(47148983-47149227)
chr3 (427-598)||(54691727-54691900)
chr3 (427-670)||(889861-890098)
chr3 (427-669)||(10084478-10084720)
chr3 (496-669)||(28413120-28413290)
chr3 (478-603)||(13419865-13419988)
chr3 (461-669)||(30005805-30006009)
chr3 (603-772)||(24181483-24181659)
chr3 (422-669)||(35918032-35918281)
chr3 (427-670)||(15780790-15781040)
chr3 (461-669)||(38210334-38210539)
chr3 (461-669)||(9604696-9604899)
chr3 (427-669)||(5522715-5522942)
chr3 (427-669)||(26720478-26720715)
chr3 (503-669)||(1321485-1321647)
chr3 (504-670)||(17795269-17795427)
chr3 (504-670)||(19103709-19103867)
chr3 (476-772)||(7768552-7768849)
chr3 (496-759)||(25388905-25389169)
chr3 (504-602)||(25633930-25634028)
chr3 (461-669)||(29956650-29956854)
chr3 (427-546)||(6231379-6231499)
chr3 (427-527)||(47701822-47701922)
chr3 (553-757)||(6484419-6484622)
chr3 (429-546)||(11163082-11163200)
chr3 (553-670)||(25688249-25688359)
chr3 (427-639)||(28137424-28137622)
chr3 (553-669)||(7606676-7606785)
chr3 (427-663)||(10191405-10191640)
chr3 (526-670)||(14634530-14634667)
chr3 (427-670)||(51674854-51675082)
chr3 (428-670)||(32219026-32219253)
chr3 (553-670)||(6231860-6231969)
chr3 (487-772)||(27420644-27420929)
chr3 (555-669)||(5886261-5886367)
chr3 (427-527)||(3306729-3306829)
chr3 (427-670)||(53591125-53591353)
chr3 (555-669)||(5899734-5899840)
chr3 (558-757)||(11168165-11168363)
chr3 (485-601)||(31021295-31021410)
chr3 (382-542)||(11072830-11072983)
chr3 (427-479)||(6484315-6484367)
chr3 (427-594)||(1618819-1618985)
chr3 (556-660)||(11066652-11066751)
chr3 (427-493)||(1321371-1321436)
chr3 (553-670)||(4666573-4666685)
chr3 (602-758)||(23941864-23942028)
chr3 (574-661)||(27762085-27762165)
chr3 (571-661)||(47882981-47883064)
chr3 (429-598)||(54884089-54884259)
chr3 (571-661)||(5858546-5858627)
chr3 (602-663)||(13893487-13893547)
chr3 (571-666)||(10094168-10094256)
chr3 (571-666)||(10201048-10201136)
chr3 (574-661)||(29914052-29914132)
chr3 (574-661)||(47878270-47878350)
chr3 (574-661)||(54193229-54193309)
chr3 (553-639)||(4560402-4560482)
chr3 (602-661)||(10897030-10897088)
chr3 (571-657)||(16462203-16462282)
chr3 (602-661)||(54188534-54188592)
chr3 (602-660)||(3329918-3329975)
chr3 (686-772)||(10612761-10612846)
chr3 (422-479)||(4560540-4560597)
chr3 (602-659)||(7418089-7418145)
chr3 (688-757)||(10958318-10958386)
chr3 (688-757)||(35919110-35919178)
chr3 (422-475)||(53896475-53896528)
chr3 (602-666)||(10208094-10208157)
chr3 (602-642)||(11007630-11007670)
chr3 (606-661)||(4535643-4535697)
chr3 (427-458)||(4663849-4663880)
chr3 (602-661)||(10612877-10612935)
chr3 (476-546)||(13893362-13893429)
chr3 (686-757)||(16996991-16997062)
chr3 (602-661)||(38002894-38002952)
chr3 (619-670)||(42297752-42297803)
chr3 (619-662)||(46966746-46966789)
chr3 (686-757)||(47878168-47878239)
chr3 (686-768)||(6303423-6303505)
chr3 (553-583)||(7606828-7606858)
chr3 (602-656)||(16996900-16996953)
chr3 (485-559)||(23941737-23941811)
chr3 (686-768)||(54193340-54193422)
chr3 (382-435)||(11066474-11066527)
chr3 (688-729)||(11170598-11170639)
chr3 (688-757)||(30006035-30006103)
chr3 (688-729)||(47701693-47701734)
chr3 (406-439)||(53973903-53973936)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (304-772)||(1623-2080)
[»] chr7 (115 HSPs)
chr7 (270-757)||(42330994-42331484)
chr7 (270-757)||(13099471-13099956)
chr7 (270-670)||(24258267-24258662)
chr7 (427-770)||(7188503-7188846)
chr7 (270-669)||(3035524-3035922)
chr7 (270-757)||(20299264-20299752)
chr7 (270-669)||(31156001-31156391)
chr7 (277-670)||(37412217-37412600)
chr7 (270-669)||(11757034-11757428)
chr7 (270-669)||(7470113-7470512)
chr7 (270-669)||(20625843-20626236)
chr7 (270-669)||(20629734-20630127)
chr7 (270-669)||(20642153-20642546)
chr7 (270-669)||(20297168-20297560)
chr7 (428-768)||(24817338-24817677)
chr7 (270-669)||(38393792-38394184)
chr7 (270-670)||(21989960-21990349)
chr7 (270-669)||(7351742-7352137)
chr7 (490-772)||(24813479-24813761)
chr7 (270-669)||(7472071-7472465)
chr7 (270-669)||(18345346-18345739)
chr7 (381-670)||(443508-443794)
chr7 (427-670)||(20091635-20091870)
chr7 (270-669)||(7349363-7349758)
chr7 (270-669)||(28485370-28485764)
chr7 (274-669)||(28487362-28487751)
chr7 (427-757)||(20137106-20137438)
chr7 (427-668)||(4296026-4296265)
chr7 (270-669)||(43253608-43254006)
chr7 (427-757)||(44724539-44724871)
chr7 (270-669)||(1849774-1850179)
chr7 (427-670)||(11355218-11355457)
chr7 (428-729)||(24748555-24748860)
chr7 (427-670)||(39146077-39146316)
chr7 (427-729)||(31435070-31435376)
chr7 (427-772)||(27306213-27306558)
chr7 (427-670)||(21678026-21678265)
chr7 (427-670)||(21679987-21680226)
chr7 (427-669)||(44524-44762)
chr7 (427-772)||(6332186-6332529)
chr7 (471-772)||(11081515-11081818)
chr7 (427-670)||(25276101-25276340)
chr7 (427-669)||(35589-35827)
chr7 (427-669)||(1049386-1049624)
chr7 (427-670)||(24465508-24465736)
chr7 (270-472)||(3677087-3677285)
chr7 (270-464)||(7092471-7092659)
chr7 (427-603)||(22392433-22392600)
chr7 (427-670)||(9679014-9679258)
chr7 (427-669)||(40836833-40837071)
chr7 (422-757)||(48457604-48457945)
chr7 (381-772)||(40281364-40281752)
chr7 (270-469)||(1606280-1606472)
chr7 (476-772)||(6048883-6049181)
chr7 (270-493)||(7094686-7094906)
chr7 (439-668)||(21592235-21592460)
chr7 (427-670)||(9680774-9681019)
chr7 (432-669)||(3878540-3878775)
chr7 (427-670)||(22828723-22828962)
chr7 (443-729)||(27832656-27832947)
chr7 (461-669)||(1047015-1047219)
chr7 (420-561)||(6348771-6348913)
chr7 (270-450)||(38396095-38396269)
chr7 (427-669)||(25542491-25542727)
chr7 (427-639)||(42223116-42223327)
chr7 (427-664)||(26804533-26804765)
chr7 (270-359)||(47865437-47865526)
chr7 (427-582)||(18567573-18567731)
chr7 (519-772)||(13290455-13290710)
chr7 (556-772)||(16297002-16297222)
chr7 (553-669)||(7092303-7092412)
chr7 (270-359)||(21470685-21470774)
chr7 (466-669)||(40946327-40946526)
chr7 (427-670)||(22251640-22251871)
chr7 (553-669)||(7094551-7094660)
chr7 (428-758)||(26210507-26210837)
chr7 (602-738)||(6046625-6046768)
chr7 (496-642)||(11084409-11084547)
chr7 (427-543)||(30906264-30906379)
chr7 (553-669)||(38396724-38396833)
chr7 (624-757)||(22393876-22394015)
chr7 (606-669)||(2935405-2935467)
chr7 (555-661)||(2120881-2120982)
chr7 (602-670)||(6348914-6348981)
chr7 (606-669)||(1606517-1606578)
chr7 (571-661)||(25351353-25351436)
chr7 (571-661)||(25357047-25357130)
chr7 (571-661)||(25410130-25410213)
chr7 (571-772)||(3320033-3320232)
chr7 (571-772)||(3324781-3324980)
chr7 (534-603)||(12310166-12310236)
chr7 (485-661)||(30246879-30247053)
chr7 (571-666)||(7069780-7069868)
chr7 (571-666)||(7074787-7074875)
chr7 (602-768)||(8378490-8378661)
chr7 (571-666)||(25405393-25405481)
chr7 (574-661)||(44512624-44512704)
chr7 (606-669)||(9027284-9027345)
chr7 (606-669)||(22137215-22137276)
chr7 (609-757)||(26295586-26295740)
chr7 (606-669)||(40552242-40552303)
chr7 (571-661)||(42006663-42006746)
chr7 (602-660)||(6067300-6067357)
chr7 (381-435)||(10691029-10691083)
chr7 (574-661)||(44143965-44144045)
chr7 (686-757)||(6067195-6067266)
chr7 (606-669)||(22108204-22108265)
chr7 (686-757)||(25410244-25410315)
chr7 (686-757)||(30247084-30247155)
chr7 (686-757)||(34546877-34546948)
chr7 (606-669)||(40549964-40550025)
chr7 (685-755)||(2990627-2990697)
chr7 (686-768)||(25405506-25405588)
chr7 (270-327)||(12310442-12310499)
chr7 (689-754)||(49091665-49091729)
[»] chr6 (97 HSPs)
chr6 (270-670)||(17011885-17012264)
chr6 (270-669)||(19704659-19705056)
chr6 (427-772)||(3027833-3028179)
chr6 (270-669)||(12195605-12195995)
chr6 (270-669)||(2628976-2629370)
chr6 (270-669)||(30034694-30035087)
chr6 (270-669)||(30967032-30967424)
chr6 (427-768)||(16455410-16455753)
chr6 (430-670)||(25477262-25477498)
chr6 (427-670)||(13057179-13057418)
chr6 (270-772)||(22857934-22858427)
chr6 (427-670)||(3629954-3630193)
chr6 (427-670)||(3632028-3632267)
chr6 (453-772)||(15719665-15719976)
chr6 (270-669)||(26932652-26933049)
chr6 (427-772)||(19696426-19696774)
chr6 (427-757)||(3390364-3390697)
chr6 (427-772)||(26945133-26945478)
chr6 (427-669)||(11983120-11983358)
chr6 (427-669)||(14507266-14507504)
chr6 (427-670)||(9019911-9020150)
chr6 (427-670)||(15541230-15541469)
chr6 (422-669)||(28241412-28241655)
chr6 (270-527)||(17852375-17852627)
chr6 (428-669)||(14458858-14459093)
chr6 (401-670)||(15532771-15533036)
chr6 (427-729)||(13039739-13040045)
chr6 (427-757)||(30728821-30729157)
chr6 (427-729)||(32279982-32280287)
chr6 (427-662)||(15530220-15530451)
chr6 (427-670)||(24338537-24338777)
chr6 (422-669)||(1230340-1230583)
chr6 (270-464)||(18317860-18318048)
chr6 (427-668)||(3233822-3234059)
chr6 (427-757)||(12186068-12186398)
chr6 (461-669)||(4816322-4816526)
chr6 (427-584)||(15346376-15346524)
chr6 (461-669)||(20915446-20915651)
chr6 (427-546)||(32447525-32447645)
chr6 (427-639)||(19227528-19227737)
chr6 (270-359)||(5275730-5275819)
chr6 (430-670)||(12161647-12161880)
chr6 (429-670)||(22490626-22490864)
chr6 (429-772)||(25078539-25078879)
chr6 (461-668)||(26065005-26065205)
chr6 (461-668)||(26084974-26085174)
chr6 (427-772)||(15367021-15367364)
chr6 (519-662)||(20526885-20527022)
chr6 (553-669)||(5273306-5273416)
chr6 (427-546)||(1072086-1072206)
chr6 (559-670)||(1069809-1069913)
chr6 (476-746)||(30445553-30445832)
chr6 (614-768)||(12911431-12911592)
chr6 (428-545)||(13870632-13870749)
chr6 (427-527)||(8995464-8995564)
chr6 (606-669)||(26068485-26068547)
chr6 (603-768)||(12937179-12937350)
chr6 (643-772)||(25465572-25465708)
chr6 (488-668)||(6843178-6843355)
chr6 (557-757)||(28037722-28037927)
chr6 (686-758)||(7294042-7294114)
chr6 (556-662)||(11138423-11138524)
chr6 (606-669)||(26066214-26066276)
chr6 (706-772)||(11262726-11262792)
chr6 (602-663)||(5165912-5165972)
chr6 (383-432)||(20526751-20526800)
chr6 (556-670)||(7542472-7542581)
chr6 (688-772)||(15346596-15346679)
chr6 (556-670)||(14466440-14466547)
chr6 (606-669)||(33309019-33309080)
chr6 (606-669)||(33311288-33311349)
chr6 (427-471)||(10584111-10584155)
chr6 (571-666)||(13878727-13878815)
chr6 (571-666)||(16785919-16786007)
chr6 (574-661)||(17694950-17695030)
chr6 (485-564)||(17904553-17904630)
chr6 (571-666)||(26887318-26887406)
chr6 (571-666)||(31248808-31248896)
chr6 (571-666)||(35201420-35201508)
chr6 (571-657)||(13883475-13883554)
chr6 (606-669)||(29754799-29754861)
chr6 (602-660)||(12166246-12166303)
chr6 (686-772)||(35201309-35201395)
chr6 (433-515)||(12937437-12937519)
chr6 (686-758)||(30443535-30443607)
chr6 (602-661)||(22342900-22342958)
chr6 (686-757)||(25941783-25941854)
chr6 (725-772)||(26455139-26455186)
chr6 (688-759)||(26932557-26932627)
chr6 (686-768)||(13878840-13878922)
chr6 (686-768)||(13883588-13883670)
chr6 (686-768)||(16786032-16786114)
chr6 (686-768)||(17038348-17038430)
chr6 (427-493)||(25466434-25466499)
chr6 (604-661)||(25465998-25466054)
chr6 (477-603)||(30443336-30443459)
chr6 (270-327)||(30445347-30445404)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (270-757)||(78992-79476)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (270-669)||(11564-11952)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (427-772)||(15802-16147)
[»] chr2 (98 HSPs)
chr2 (270-669)||(42452558-42452945)
chr2 (427-772)||(11578089-11578433)
chr2 (270-669)||(23452328-23452720)
chr2 (427-772)||(20146589-20146936)
chr2 (427-772)||(17897227-17897571)
chr2 (270-670)||(42923599-42923985)
chr2 (270-669)||(35215676-35216075)
chr2 (427-757)||(18800310-18800631)
chr2 (427-670)||(15539565-15539804)
chr2 (427-662)||(35107226-35107452)
chr2 (427-670)||(40032148-40032387)
chr2 (270-669)||(35218053-35218456)
chr2 (554-772)||(40699429-40699649)
chr2 (427-669)||(13910135-13910373)
chr2 (427-770)||(31732761-31733094)
chr2 (422-757)||(45279981-45280319)
chr2 (427-669)||(19504437-19504674)
chr2 (427-670)||(28196563-28196802)
chr2 (427-772)||(22874068-22874405)
chr2 (427-669)||(27104725-27104962)
chr2 (427-670)||(19007566-19007805)
chr2 (427-669)||(42064441-42064679)
chr2 (427-666)||(3022089-3022324)
chr2 (427-670)||(17849043-17849282)
chr2 (427-669)||(19502102-19502340)
chr2 (511-670)||(27136215-27136368)
chr2 (429-666)||(34979673-34979906)
chr2 (427-757)||(6264145-6264474)
chr2 (427-717)||(6258852-6259144)
chr2 (427-598)||(24162367-24162541)
chr2 (427-757)||(11739556-11739889)
chr2 (427-757)||(44289064-44289397)
chr2 (372-603)||(27583489-27583710)
chr2 (430-597)||(14837202-14837372)
chr2 (427-670)||(21520783-21521024)
chr2 (473-662)||(43139351-43139532)
chr2 (427-670)||(22287426-22287665)
chr2 (427-592)||(22163109-22163276)
chr2 (427-670)||(43623670-43623897)
chr2 (461-729)||(45239001-45239271)
chr2 (427-603)||(17848371-17848549)
chr2 (553-757)||(5375343-5375545)
chr2 (602-670)||(20589788-20589856)
chr2 (427-506)||(12342660-12342739)
chr2 (427-770)||(37962925-37963256)
chr2 (427-662)||(35028505-35028732)
chr2 (461-598)||(38020162-38020302)
chr2 (602-768)||(13828327-13828501)
chr2 (427-571)||(22407591-22407738)
chr2 (511-670)||(28459280-28459435)
chr2 (571-663)||(28458925-28459011)
chr2 (602-772)||(33604019-33604196)
chr2 (606-669)||(36558954-36559016)
chr2 (606-669)||(36561231-36561293)
chr2 (554-639)||(38414201-38414279)
chr2 (555-667)||(26345661-26345768)
chr2 (427-515)||(20146988-20147077)
chr2 (270-327)||(28568584-28568641)
chr2 (555-662)||(15693958-15694061)
chr2 (372-437)||(15693788-15693853)
chr2 (556-668)||(30720703-30720811)
chr2 (427-515)||(38020069-38020157)
chr2 (571-661)||(20054864-20054947)
chr2 (606-669)||(45332271-45332333)
chr2 (392-552)||(39287110-39287260)
chr2 (686-772)||(39680158-39680244)
chr2 (571-768)||(39686983-39687178)
chr2 (381-435)||(41304705-41304759)
chr2 (422-546)||(5377638-5377767)
chr2 (707-772)||(8173539-8173604)
chr2 (556-772)||(17921754-17921971)
chr2 (556-662)||(34575207-34575308)
chr2 (571-666)||(2736205-2736293)
chr2 (571-666)||(2740941-2741029)
chr2 (574-661)||(17932637-17932717)
chr2 (574-661)||(17943540-17943620)
chr2 (708-772)||(20592288-20592352)
chr2 (574-661)||(27517738-27517818)
chr2 (571-666)||(45567409-45567497)
chr2 (571-657)||(17462436-17462515)
chr2 (571-657)||(22712619-22712698)
chr2 (571-657)||(22717328-22717407)
chr2 (618-669)||(24162313-24162363)
chr2 (270-327)||(15693698-15693755)
chr2 (617-670)||(22407544-22407596)
chr2 (604-657)||(30479021-30479073)
chr2 (602-662)||(41303130-41303191)
chr2 (379-435)||(41303357-41303413)
chr2 (570-663)||(10942608-10942696)
chr2 (570-663)||(10948477-10948565)
chr2 (686-768)||(2736318-2736400)
chr2 (686-768)||(17462549-17462631)
chr2 (620-670)||(30261861-30261911)
chr2 (427-469)||(40699236-40699278)
chr2 (686-768)||(45679836-45679918)
chr2 (689-754)||(17865207-17865271)
chr2 (689-754)||(20522224-20522288)
chr2 (270-327)||(34575556-34575613)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (428-772)||(16631-16975)
[»] chr8 (85 HSPs)
chr8 (427-770)||(31162219-31162564)
chr8 (270-669)||(15809071-15809462)
chr8 (270-669)||(28283310-28283704)
chr8 (270-669)||(608579-608978)
chr8 (429-670)||(27911023-27911259)
chr8 (429-670)||(27957442-27957678)
chr8 (270-668)||(41384602-41384987)
chr8 (270-669)||(3873859-3874254)
chr8 (427-670)||(27106987-27107226)
chr8 (452-757)||(3005627-3005931)
chr8 (427-757)||(36865543-36865875)
chr8 (427-757)||(13858481-13858813)
chr8 (427-757)||(14419187-14419520)
chr8 (381-670)||(32339264-32339554)
chr8 (511-757)||(15956051-15956296)
chr8 (427-669)||(14807757-14807995)
chr8 (427-772)||(21482328-21482664)
chr8 (427-670)||(14477282-14477521)
chr8 (427-668)||(1225172-1225409)
chr8 (270-546)||(41382528-41382799)
chr8 (427-670)||(30480593-30480832)
chr8 (540-772)||(31035239-31035474)
chr8 (427-590)||(31035073-31035238)
chr8 (449-772)||(21480542-21480856)
chr8 (469-660)||(31573826-31574009)
chr8 (427-669)||(27829303-27829541)
chr8 (427-639)||(33541508-33541717)
chr8 (427-669)||(18810714-18810952)
chr8 (427-669)||(27826992-27827230)
chr8 (427-669)||(28251658-28251896)
chr8 (381-669)||(24873271-24873563)
chr8 (427-670)||(15072716-15072956)
chr8 (531-772)||(31578258-31578501)
chr8 (270-669)||(43529980-43530359)
chr8 (427-669)||(4424024-4424262)
chr8 (427-670)||(5372268-5372506)
chr8 (427-757)||(15067987-15068319)
chr8 (427-727)||(25952527-25952830)
chr8 (427-669)||(44720849-44721088)
chr8 (496-669)||(43079677-43079847)
chr8 (312-515)||(181434-181631)
chr8 (461-757)||(22684650-22684951)
chr8 (461-669)||(43082013-43082218)
chr8 (427-581)||(35872555-35872707)
chr8 (427-592)||(5622899-5623067)
chr8 (427-592)||(26775207-26775375)
chr8 (427-598)||(2468261-2468427)
chr8 (427-669)||(18812899-18813126)
chr8 (427-592)||(15185871-15186039)
chr8 (604-772)||(17847705-17847874)
chr8 (554-670)||(181635-181747)
chr8 (427-521)||(3886153-3886247)
chr8 (610-772)||(6376174-6376343)
chr8 (556-772)||(33838902-33839120)
chr8 (519-770)||(3895920-3896175)
chr8 (643-772)||(2468111-2468247)
chr8 (625-772)||(16833749-16833903)
chr8 (571-666)||(4812581-4812669)
chr8 (427-527)||(12517253-12517355)
chr8 (571-661)||(9021206-9021289)
chr8 (571-663)||(13985176-13985262)
chr8 (427-469)||(14419784-14419826)
chr8 (571-768)||(28327908-28328103)
chr8 (485-660)||(30423120-30423295)
chr8 (270-319)||(32339203-32339252)
chr8 (571-666)||(16752616-16752704)
chr8 (571-666)||(16757361-16757449)
chr8 (571-658)||(28895502-28895582)
chr8 (574-661)||(33032657-33032737)
chr8 (713-772)||(31566539-31566598)
chr8 (606-668)||(41382844-41382905)
chr8 (574-666)||(590797-590882)
chr8 (610-663)||(2267120-2267172)
chr8 (477-565)||(13986013-13986099)
chr8 (574-661)||(3276347-3276427)
chr8 (602-666)||(25684668-25684731)
chr8 (602-660)||(15949559-15949617)
chr8 (619-670)||(33020993-33021044)
chr8 (686-772)||(4812470-4812556)
chr8 (427-488)||(6375995-6376054)
chr8 (686-768)||(16757254-16757336)
chr8 (686-768)||(25684756-25684838)
chr8 (686-768)||(28332744-28332826)
chr8 (686-768)||(28890879-28890961)
chr8 (452-493)||(37214474-37214514)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (270-668)||(51818-52207)
scaffold0005 (422-669)||(183732-183973)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (372-670)||(4718-5008)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (270-666)||(1844-2235)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (427-669)||(6158-6397)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (422-669)||(41574-41817)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (427-670)||(14978-15217)
scaffold0131 (461-772)||(14365-14677)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (429-669)||(69382-69622)
scaffold0025 (427-569)||(73207-73356)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (427-669)||(2839-3077)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (427-670)||(3956-4194)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (427-668)||(79818-80055)
scaffold0004 (571-661)||(188341-188424)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (427-729)||(85190-85495)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (461-669)||(34-239)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (461-669)||(29164-29368)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (553-669)||(1543-1652)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (427-639)||(35599-35807)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (422-527)||(1060-1165)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (609-772)||(57409-57581)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (571-666)||(224819-224907)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (606-639)||(22252-22285)
scaffold0140 (606-639)||(24527-24560)
[»] scaffold0256 (2 HSPs)
scaffold0256 (574-657)||(16328-16404)
scaffold0256 (686-768)||(16439-16521)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (686-768)||(3056-3138)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 386; Significance: 0; HSPs: 121)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 295 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 26520580 - 26520103
Alignment:
Q  295 atttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnnncaaaagagatgtatcttcagtgtg 394  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||        ||||||| ||||||||||||||||    
T  26520580 atttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcaccgaagaagaaaaaaa-caaaagaaatgtatcttcagtgtg 26520482  T
Q  395 atattcgttccaaatttataagttatatttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagaggggg-ctgaaaacaacggtttagaa 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26520481 atattcgttccaaatttataagttatatttctctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaacggtttagaa 26520382  T
Q  494 gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  26520381 gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattgaggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctc 26520282  T
Q  594 ttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatagtaaagttgcttataattatagt 693  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26520281 ttggtcacagtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgatagtaaagttgcttataattatagt 26520182  T
Q  694 ggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26520181 ggaacggagggttgctctttcccccaaattaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaatatcgtgtgttctctct 26520103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 435 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 8347593 - 8347255
Alignment:
Q  435 atagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttg 533  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  8347593 atagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggttgaaa-caagggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagattgctcttg 8347495  T
Q  534 gcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtaga 633  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||      | |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  8347494 gcaacaaacaccaaggttagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctctt------gatcacgggaagagattgagactttgagtaga 8347401  T
Q  634 attaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattag 725  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  8347400 attagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtggaacggagggatgctctttcccctagactag 8347302  T
Q  726 gtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    |||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  8347301 gtcagttttggaccgaacaagggaaacaaatttcgtgtgttctctct 8347255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 427 - 772
Target Start/End: Original strand, 42922184 - 42922529
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42922184 ctataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaat-aagggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagttt 42922282  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
    |||| | ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  42922283 gctcctagcaacaaacactagggttgaggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctctt------ggtcacgggaagagattgggacttt 42922376  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttccccc 718  Q
    |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||| || || |||| |||||||||||||  |||||| | ||||    
T  42922377 gggtagaattagg-cgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccc 42922475  T
Q  719 agattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
     || ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  42922476 cgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttatctct 42922529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 270 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 17325118 - 17324635
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  17325118 atatttttgtaccgtatgaaaaacgatttgatgcaaatatattttgcaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagaa----- 17325024  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||| |    
T  17325023 --aaaaaaaacgtatcttcagggtgatattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaaccagagtaaacctgaagataca 17324926  T
Q  469 gggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcac 564  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||  | ||||||||||| | || |  |||||||||||    
T  17324925 gggggct-aaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtatagagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 17324827  T
Q  565 cttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccca 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||    
T  17324826 cttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaactca 17324734  T
Q  665 ttgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaat 756  Q
    ||||||        |||| ||| || || | ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  17324733 ttgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 17324636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 427 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 18800900 - 18800557
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18800900 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatacaaggggctgaaa-caaaggtttagaagtcaacaagaaaactacggtttgtatagagttt 18800802  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
    ||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||      ||  ||||||||| ||||||| | |||||    
T  18800801 gctcttggccacaaatactagggttggggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtc------tctaggtcacgggtagagatttgaacttt 18800708  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttccccc 718  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||        |||||||| || || ||||||||| | |||||   |||||| ||||||    
T  18800707 gggtagaattagg-cgggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaagcggagaactgctctctccccc 18800609  T
Q  719 agattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctct 770  Q
    | | ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18800608 aaactaggttagttttggaccaaacagggtaaacaaatttcgtgtgttctct 18800557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 420 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 13125794 - 13125440
Alignment:
Q  420 tatttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttc-ta 518  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||  ||    
T  13125794 tatttctctataaatagaaaccttgtatcagagtaaaacttgagagaaagggggctgaaa-caagggttaagaagccaacaaggaaactagggtttggta 13125696  T
Q  519 tagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagatt 618  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || ||      ||||| |||||||||||    
T  13125695 tagagtttgctcttggcgacaaacactagggttgaggttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctctt------ggtcaagggaagagatt 13125602  T
Q  619 gggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctc 710  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||        |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||    
T  13125601 gggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagttgctc 13125502  T
Q  711 tttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    |  |||||  | ||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  13125501 tcccccccttactaggtcagtataggaccgaactaggtaaacaaatttcatgtgttctctct 13125440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 21948674 - 21948281
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||           
T  21948674 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcacagaaggaggaa---- 21948579  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatat-ttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt----gaga 464  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||    ||||    
T  21948578 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagaga 21948481  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgat 560  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||   ||||||||    
T  21948480 tagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgat 21948382  T
Q  561 tcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  21948381 tcacctt-ggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagacgctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 21948290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 31736006 - 31735614
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  31736006 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaga------ 31735913  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacct----tgaga 464  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||  ||||| |    |||||    
T  31735912 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaatgaga 31735815  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgat 560  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||   ||||||||    
T  31735814 tagagggggct-aaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 31735716  T
Q  561 tcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  31735715 tcaccttgggaaacactattaaggttgagtctctt------ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 31735623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 47906065 - 47906458
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||           
T  47906065 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggag------- 47906157  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt------ga 462  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||      ||    
T  47906158 --aaaaaaaaagtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 47906255  T
Q  463 gatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttg 558  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||   ||||||    
T  47906256 gatagagggggctg-aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttg 47906354  T
Q  559 attcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgt 658  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  47906355 attcaccttgagaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 47906447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 15295330 - 15294927
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  15295330 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagcgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaa----- 15295236  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatat-ttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt-------- 460  Q
      |||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||            
T  15295235 --aaaaaaaatgtatcttcagtgtggtattcgttcctaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagaga 15295138  T
Q  461 ------gagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt- 551  Q
          ||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||     
T  15295137 gagagagagatagagagggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggtttt 15295039  T
Q  552 -ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagactt 650  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  15295038 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattagg-tgggagattt 15294946  T
Q  651 attcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15294945 attcttgtaacccattgat 15294927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 427 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 15669722 - 15669375
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||| | || || ||  |||| |||||||| |||| ||||    
T  15669722 ctataaatacagaccttgtagcagatgtaaacattgggatagagggggctgaaaactagggtttgggaggcagcac-aaaagtagggtttgtataaagtt 15669624  T
Q  526 tgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactt 625  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||| |||||    
T  15669623 tgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggtcacgggaagagattgagactt 15669530  T
Q  626 tgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccc 717  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||        |||||| | || || |||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  15669529 tgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccc 15669431  T
Q  718 cagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcg-tgtgttctctct 772  Q
     ||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  15669430 gagactaggtcagttttagactgaactgtgtaaacaaattttgttgtgttctctct 15669375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 428 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 8349379 - 8349034
Alignment:
Q  428 tataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  8349379 tataaatatagatcttgtattagatgcaaaccttgagatagagagggctgaaa-caagggtttagaagtcaacaagaaaattaaggtttgtatagagttt 8349281  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||   | ||||||||||||||||| |||||||    
T  8349280 gctcttggcaacaaacactagggttggggtttattcaccttgggaaacactattaggattgag---tttg---atggtcacgggaagagattaggacttt 8349187  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttccccc 718  Q
     ||||||||||||   || |||||||||||||||| ||||| ||        || ||||| || || ||||||||||||  |||||||| ||| |||||     
T  8349186 aggtagaattagg-cgggtgacttattcttgtaactcattggtatctcttttgttaagttactcatcattatagtggaatagagggttgttctctcccca 8349088  T
Q  719 agattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||| || ||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8349087 agactatgtcagttttagaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctct 8349034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 427 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 14183917 - 14183588
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  |||||   |||||||||||| ||||||| ||    
T  14183917 ctataaatatagaccatgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctgaaa-caagggtttagaatgcaacac--aaactagggtttgtatagaggtt 14183821  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||      ||| ||||||||||||| | | |||    
T  14183820 gctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctctt------ggttacgggaagagattagaatttt 14183727  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttccccc 718  Q
    |||||||||||||   | ||||||||||||| ||||||||||||        |||||||| || || |||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  14183726 gggtagaattagg-cggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccccc 14183628  T
Q  719 agattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaattt 758  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  14183627 agactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaattt 14183588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 24325456 - 24325851
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  24325456 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagtgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaga------ 24325549  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt-------- 460  Q
      |||| | ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||            
T  24325550 --aaaaaaaatgtatctttagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagaga 24325647  T
Q  461 gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggtt 557  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||   ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||   |||||    
T  24325648 gagatagagggggctg-aaacaagggttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 24325746  T
Q  558 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttg 657  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  24325747 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttg 24325839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 270 - 670
Target Start/End: Original strand, 48664961 - 48665367
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaa--gnnnnn 367  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||            
T  48664961 atatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcacatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaagaaagaaaaaa 48665060  T
Q  368 nnncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagata 466  Q
        |||| | | |||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  48665061 aaaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtagtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagata 48665160  T
Q  467 gag-----ggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggtt 557  Q
    |||     |||| |  |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||   |||||    
T  48665161 gagggggagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 48665260  T
Q  558 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttg 657  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||     |||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  48665261 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttac-----cgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttg 48665354  T
Q  658 taacccattgata 670  Q
    |||||||||||||    
T  48665355 taacccattgata 48665367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 39931871 - 39932261
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | | ||||| ||           
T  39931871 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatacttttgatgcaaatattcttttattgaaggaga------ 39931964  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga--ta 466  Q
      |||| | | |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||  |||| ||||||  ||    
T  39931965 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatgagacaaaactttgagagata 39932062  T
Q  467 gagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattc 562  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||     
T  39932063 gagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgatta 39932161  T
Q  563 accttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||      ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  39932162 accttgggaaacactattaggattgaatctctt------ggttacgggaagagactgagactttgggtagaattagg-cgggagactaattcttgtaacc 39932254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 286 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 2510798 - 2510418
Alignment:
Q  286 tgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnnncaaaagagatgtatc 385  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||         |||| | | ||||     
T  2510798 tgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagggaaag---aaaaaaaacgtatt 2510702  T
Q  386 ttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga----tagagggggctgaaaa 480  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||    |||||||||||||||     
T  2510701 ttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaa- 2510603  T
Q  481 caacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacac 576  Q
    ||| |||||| || | |||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||||||||| ||||||||    
T  2510602 caagggtttataaaggcaaccacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacac 2510503  T
Q  577 tattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||||      ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2510502 tattaggattgagtctttt------ggttacgggaagagatttggactttgggtagaattagg--cagagacttattcttgtaacccattgat 2510418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 295 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 28998710 - 28998347
Alignment:
Q  295 atttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnnncaaaagagatgtatcttcagtgtg 394  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||         |||| |   |||| || ||||||    
T  28998710 atttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaa-------aaaaaaaccgtatatttagtgtg 28998618  T
Q  395 atattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa 493  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  28998617 gtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctg-aaacaagggtttagaa 28998519  T
Q  494 -gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 589  Q
     | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||  || |||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998518 tgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 28998419  T
Q  590 tcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga 668  Q
    ||| ||      ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||    
T  28998418 tctctt------ggttacaggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaactcattga 28998347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 295 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 29004426 - 29004063
Alignment:
Q  295 atttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnnncaaaagagatgtatcttcagtgtg 394  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||         |||| |   |||| || ||||||    
T  29004426 atttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaa-------aaaaaaaccgtatatttagtgtg 29004334  T
Q  395 atattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa 493  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  29004333 gtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctg-aaacaagggtttagaa 29004235  T
Q  494 -gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 589  Q
     | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||  || |||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004234 tgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 29004135  T
Q  590 tcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga 668  Q
    ||| ||      ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||    
T  29004134 tctctt------ggttacaggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaactcattga 29004063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 9459904 - 9459509
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    |||||||| || ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||           
T  9459904 atatttttataccgtatgaagaacaatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggaga------ 9459811  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt------ga 462  Q
      |||| | | ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||      ||    
T  9459810 --aaaaaaaacgtatcttcattgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 9459713  T
Q  463 gatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttg 558  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |  |||||||| | ||   ||||||    
T  9459712 gatagagggggctg-aaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttg 9459614  T
Q  559 attcaccttgggaaacactattaggattg-agtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttg 657  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||      ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  9459613 attcaccttgggaaacactattaggattgaagtctctt------ggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttatccttg 9459521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 9463731 - 9463336
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    |||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||           
T  9463731 atatttttatatcgtatgaagaacaatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggaga------ 9463638  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt------ga 462  Q
      |||| | | ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||      ||    
T  9463637 --aaaaaaaacgtatcttcattgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 9463540  T
Q  463 gatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttg 558  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |  |||||||| | ||   ||||||    
T  9463539 gatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttg 9463441  T
Q  559 attcaccttgggaaacactattaggattg-agtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttg 657  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||      ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  9463440 attcaccttgggaaacactattaggattgaagtctctt------ggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttatccttg 9463348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 27339617 - 27339223
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |            
T  27339617 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaaaaaa--- 27339521  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt----gaga 464  Q
      |||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||    ||||    
T  27339520 --aaaaga-acgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagaga 27339424  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgat 560  Q
    |||||||||||| |||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||   ||||||||    
T  27339423 tagagggggctg-aaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgat 27339325  T
Q  561 tcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||       || ||||||||||  || |||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  27339324 tcaccttgggaaatactattacgattgagtctctt------agttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggcgacttattcttgtaa 27339232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 427 - 729
Target Start/End: Original strand, 13215031 - 13215341
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13215031 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 13215129  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||      ||| |||||||||||||||||    
T  13215130 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctctt------ggttacgggaagagattggga 13215223  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata------------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctc 710  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||            ||||| || || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  13215224 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactcatcattatagtggaacggagggctgctc 13215322  T
Q  711 tttcccccagattaggtca 729  Q
    | ||||||||| |||||||    
T  13215323 tctcccccagactaggtca 13215341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 270 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 27337423 - 27336939
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |            
T  27337423 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttaactgaaggaaa------ 27337330  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt----gaga 464  Q
      |||| | | ||||||||  |||| |||| |||||||||||||  |||||| || | |||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||    ||||    
T  27337329 --aaaaaaaacgtatcttcgatgtggtatttgttccaaatttatgcgttatacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagaga 27337232  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgatt 561  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||  ||||| | ||||||||||| | ||   |||||||||    
T  27337231 tagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttatagatttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgatt 27337133  T
Q  562 caccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||      ||| ||||||||||  || ||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  27337132 caccttgggaaacactattaggattgggtctctt------ggttacgggaagaggctgtgactttgggtaaaattagg-cgggagacttattcttgtaac 27337040  T
Q  662 ccattga-------tagtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaa 754  Q
    |||||||       | |||| ||| || || | ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||||  |||||||| |||||    
T  27337039 ccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaa 27336942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 25251606 - 25251273
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||  |||    
T  25251606 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataacgtt 25251508  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      || |||| |||||||||||||||||    
T  25251507 tgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtc------tctcggttacgggaagagattggga 25251414  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    |||||||||||||||||   | | ||||||||||||||||||||||||        |||| ||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  25251413 ctttgggtagaattagg-cggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctc 25251315  T
Q  715 ccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||| | | |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  25251314 cccaatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 25251273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 422 - 669
Target Start/End: Original strand, 2617461 - 2617704
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctata 520  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||    
T  2617461 tttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggaggctgaaa-caagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 2617559  T
Q  521 gagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagat 617  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||      
T  2617560 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggc 2617653  T
Q  618 tgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2617654 tgggactttgggtagaattagg-atggagacttattcttgtaacccattgat 2617704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 426 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 10400160 - 10399921
Alignment:
Q  426 tctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagt 524  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  10400160 tctataaatatagaccttgtatcagagcaaactgggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagt 10400062  T
Q  525 ttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||||||||    
T  10400061 ttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattggg 10399968  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  10399967 actttcggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 10399921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 16428603 - 16428842
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||   || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16428603 ctataaatataggttttatatcagagcaaaccattagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 16428701  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || |||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||||||    
T  16428702 tgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattggga 16428795  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16428796 ctttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaacccattgata 16428842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 38925809 - 38925570
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| || ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  38925809 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctg-aaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 38925711  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||| ||    
T  38925710 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgaga 38925617  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38925616 ctttgggtagaattagg-ctggagacttattcttgtaacccattgata 38925570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 270 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 2949706 - 2949325
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    |||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||             
T  2949706 atatttttgtattgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatacaaatattctttcactgaaga--------g 2949615  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | |||||||      | |||||||||||||||||| ||||||| || | | ||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  2949614 aaaaaaaaaacgtatctt------ggtattcgttccaaatttatgagttatacttttacaataaatatagatattgaatccgagaaaaccttgagataga 2949521  T
Q  469 gggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcac 564  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  | |  |||||||||||    
T  2949520 gggggctg-aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcac 2949422  T
Q  565 cttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccca 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||      | | ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||    
T  2949421 cttgggaaacactattaggattgagtctctt------gtttacgagaatagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaactca 2949329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 427 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 50079152 - 50078846
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| || ||| |||||||||||||  ||||||||    
T  50079152 ctataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcatagagtt 50079054  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||      ||| ||||||||||||| |||    
T  50079053 tgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctt------ggttacgggaagagatttgga 50078960  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||  | || ||||||||||||| || || |||||| ||    
T  50078959 ctttgggtagaattagg-agggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctctctc 50078861  T
Q  715 ccccagattaggtca 729  Q
    ||||||| |||||||    
T  50078860 ccccagactaggtca 50078846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 428 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 17186458 - 17186126
Alignment:
Q  428 tataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  17186458 tataaatatagattttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctg-aaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 17186360  T
Q  527 g-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggac 623  Q
    | ||||| ||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||      ||| ||||||||||||| | ||    
T  17186359 gtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctctt------ggttacgggaagagatttgaac 17186266  T
Q  624 tttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcc 715  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||| |||        |||||||| || || |||||| |||||||||| | |||||| |||    
T  17186265 tttgggtagaatta-gaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctctcc 17186167  T
Q  716 cccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    |||||| |||||||  |||||||  || ||||||||||||||    
T  17186166 cccagactaggtca-atttggaccgaattgggtaaacaaatt 17186126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 11457806 - 11457567
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11457806 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 11457708  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    ||  ||||||||||||  |||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||      ||| ||| ||||||||||||     
T  11457707 tgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctctt------ggttacgcgaagagattgggg 11457614  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
     ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11457613 gtttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 11457567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 9241417 - 9241084
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag-ggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagt 524  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9241417 ctataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggggctg-aaacaa-ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 9241320  T
Q  525 ttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||      ||| ||| ||||||||||||    
T  9241319 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggattgagtctctt------ggttacgagaagagattggg 9241226  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctcttt 713  Q
     ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  9241225 gctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct 9241127  T
Q  714 cccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    |||||| | |||||||  |||||||  ||||||| |||||||||    
T  9241126 cccccatactaggtca-atttggaccgaactggggaaacaaatt 9241084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 427 - 759
Target Start/End: Original strand, 27916447 - 27916782
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggggct-gaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagt 524  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||| | || | ||  |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||    
T  27916447 ctataaatatagacattgtatcaaatgtaaactgtgagaaacagagagccagaaaacaagggtttagaagccagcaagaaaactagggtttgta--gagt 27916544  T
Q  525 ttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggact 624  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||      ||||||  |||||||||| ||||    
T  27916545 ttgctcttggcaacaaacactagggttggaattgattcaccttggaaaacactattagaattgagtctctt------ggtcacatgaagagattgtgact 27916638  T
Q  625 ttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc--cattgata-------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcc 715  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||  | ||||||       |||||||| || ||  |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27916639 ttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctctttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagggctgctctctcc 27916738  T
Q  716 cccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttc 759  Q
    |||||| ||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||    
T  27916739 cccagactaggtcagtattggaccgaattgggtaaacaaatttc 27916782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 401 - 670
Target Start/End: Original strand, 39462443 - 39462708
Alignment:
Q  401 gttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagt-caa 498  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| | |||    
T  39462443 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagaaggctgaaa-caaaggtttagaaatgcaa 39462540  T
Q  499 caagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattg--gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctttt 595  Q
     || ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39462541 aaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 39462640  T
Q  596 ggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  39462641 ------ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagaattattcttgtaaccctttgata 39462708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 273 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 46432207 - 46431800
Alignment:
Q  273 tttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnnnca 372  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||         |    
T  46432207 tttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaa-------a 46432115  T
Q  373 aaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga--- 468  Q
    ||| | | ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| |||       
T  46432114 aaaaaaacgtatcttcactgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagag 46432015  T
Q  469 ------------------gggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaag 548  Q
                      |||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| |    
T  46432014 agagagagagagagagatgggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagg 46431916  T
Q  549 att--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggag 646  Q
     ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||    
T  46431915 gtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattagg-cgggag 46431823  T
Q  647 acttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  46431822 acttattcttgtaacccattgat 46431800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 51749989 - 51750227
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  51749989 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 51750087  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  |||||    
T  51750088 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctggga 51750181  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  51750182 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 51750227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 396 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 6996063 - 6995794
Alignment:
Q  396 tattcgttccaaatttataagttatatttctct-ataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa- 493  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || | | |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||     
T  6996063 tattcgttccaaatttatgagttatacttttattataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggggccgaaa-caacggtttagaaa 6995965  T
Q  494 gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattg--gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 590  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6995964 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagt 6995865  T
Q  591 cttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga 668  Q
    || ||      ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||| ||||||    
T  6995864 ctctt------ggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggatactttttcttgtaactcattga 6995794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 428 - 669
Target Start/End: Original strand, 20302410 - 20302647
Alignment:
Q  428 tataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20302410 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 20302508  T
Q  527 g-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggac 623  Q
    | ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| | ||||||||| | ||||    
T  20302509 gtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttatgggaagagactaggac 20302602  T
Q  624 tttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  20302603 tttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 20302647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 49495530 - 49495303
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||       ||||||||||  ||| |||||    
T  49495530 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttataaatcaa-------actagggtttgcatatagttt 49495439  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||      ||||||||||| ||||    
T  49495438 gctcttggcaacaaacactatggttgag-ttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtcacggt------aagagattggggcttt 49495346  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49495345 gggtagaattagg-cgggagactcattcttgtaacccattgata 49495303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 18307059 - 18307298
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  18307059 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataaagtt 18307157  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||||||||     
T  18307158 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgggg 18307251  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||||| || ||||||||    
T  18307252 ctttgggtagaattagg-cgagagacttattcttgtgacgcattgata 18307298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 41646870 - 41647109
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  41646870 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctg-aaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 41646968  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaag--attggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||  |   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||      ||| |||||||||||||| ||    
T  41646969 tgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcactt------ggttacgggaagagattgcga 41647062  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41647063 ctttgggtagaattagg-ctggagacttattcttgtaactcattgata 41647109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 50077003 - 50076764
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||| | |||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  50077003 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaagggctgaaa-caaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataaagtt 50076905  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||| ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||||||    
T  50076904 tgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattggga 50076811  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
     ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  50076810 atttgggtagaattagg-cgggaaacttattcttgtaatccattgata 50076764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 382 - 772
Target Start/End: Original strand, 16561373 - 16561766
Alignment:
Q  382 tatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag-----ggggctg 476  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||  ||||||||||| ||||     | |||||    
T  16561373 tatcttcagcgtgatatccgtttcaaatttatgagttatatttctctataaatataaaccttatatcagatgaaaccttgagagagaggtagagaggctg 16561472  T
Q  477 aaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacac 576  Q
    ||||||| || ||||||   |||||  |||||||||||  ||||||| || ||||  ||   | || ||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  16561473 aaaacaagggattagaaacaaacaa-caaactagggtt--tatagaggtttctctaagcgggagactctagggtt-gggttgattcaccttgggaaacac 16561568  T
Q  577 tattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata------ 670  Q
    |||||||||| ||||| ||      || ||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||          
T  16561569 tattaggattaagtctctt------ggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctctt 16561662  T
Q  671 --gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
      |||||||| || || |||| ||||||||  ||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16561663 ttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaaacaaatttcgtgtgttct 16561762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 20291407 - 20291645
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||  ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20291407 ctataaatatagaccttgtattagagcaaattttgagatagagggagatgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 20291505  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||| | |||    
T  20291506 tgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggtcacgggaagagactagga 20291599  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  20291600 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 20291645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 427 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 26613571 - 26613222
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga--tagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaa--aactagggtttctataga 522  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||  || || ||  || ||||||||  | |||    
T  26613571 ctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagagatagagggggctgaaaacaagggtttagaagaaaaaaaaaacaaattagggttt--agaga 26613474  T
Q  523 gtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    | || ||||  ||   | |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |      |||||||||| |     
T  26613473 gatttctctaagcgggagacactagggttgggattgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacag------gaagagattgagg 26613380  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||        | |||||| || || ||||||||||||| ||| | | |||| ||    
T  26613379 ctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctc 26613280  T
Q  715 ccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26613279 ccccagattaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctct 26613222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 433 - 669
Target Start/End: Original strand, 6823840 - 6824080
Alignment:
Q  433 atatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagaggggg-ctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ct 529  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  6823840 atatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 6823938  T
Q  530 cttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcac-ggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
    ||| | ||||||||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| || ||| |||||||||||||||| ||||    
T  6823939 cttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgattgaatctcttggttacgggttacgggaagagattggggcttt 6824038  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||    
T  6824039 gggtagaattagg-cggcagacttattcttgtaacccattgat 6824080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 12302841 - 12302504
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgaga----tagagggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctata 520  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||    
T  12302841 ctataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 12302743  T
Q  521 gagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagat 617  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||||    
T  12302742 gagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagat 12302649  T
Q  618 tgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga--------tagtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgct 709  Q
    ||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||| ||||||        | |||| ||| || || | ||||||| ||||||||| ||||    
T  12302648 tgggactttaggtagaattagg-cgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgct 12302551  T
Q  710 ctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  12302550 ctctcccccagattaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 12302504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Original strand, 18839537 - 18839870
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttaga-agtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18839537 ctataaatatagacattgtattattgtaaaccatgagatagagggggctg-aaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 18839635  T
Q  526 t-gctcttggcaacaaacactaag--attggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    |  ||||| | |||||||| || |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||| ||||||| || ||    
T  18839636 tatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgagaagagaatgaga 18839729  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||        |||| ||| || || ||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  18839730 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttc 18839828  T
Q  715 ccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||| | |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  18839829 ccccatactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 18839870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 427 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 30790725 - 30790384
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||   |||||  ||||||||||||   ||||| ||    
T  30790725 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaacaaacaa-taaactagggttt---tagagatt 30790630  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
     ||||  |    | |||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||      ||| ||| |||||||| | ||||||    
T  30790629 tctctaagagggagacactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtctttt------ggttacgcgaagagatggagacttt 30790537  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttccccc 718  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| || || |||||||||||| ||| |  |||||| |  |||    
T  30790536 gtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tccc 30790438  T
Q  719 agattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  30790437 agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaaattcgtgtgtgctctct 30790384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 16226117 - 16226356
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||   |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16226117 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggtct-aaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 16226215  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||      ||| ||||||||||||||||    
T  16226216 tgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt------ggttacgggaagagattggg 16226309  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  16226310 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 16226356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 6756477 - 6756715
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| || |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  6756477 ctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaaatagaggggactgaaa-caagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 6756575  T
Q  526 tg-ctctt-ggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    || ||||| |||||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | | ||| ||||||||||||    
T  6756576 tgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctt--------gattacgagaagagattggg 6756667  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||    
T  6756668 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacctattgata 6756715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 427 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 31423205 - 31422967
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31423205 ctataaatataagcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtt 31423107  T
Q  526 tg-ctc-ttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    || ||| ||||||  |||||||| | || |   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||      ||| |||||||||||||| |    
T  31423106 tgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctctt------ggttacgggaagagattgag 31423013  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga 668  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  31423012 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattga 31422967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 427 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 50307878 - 50307640
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||| | ||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  50307878 ctataaatataagctttgtatcaaagtaaaccttgagatatatggggctgaaaa-aagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtt 50307780  T
Q  526 tg-ctctt-ggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    || ||||| |||||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||||||||    
T  50307779 tgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattggg 50307686  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga 668  Q
     |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  50307685 gctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaactcattga 50307640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Original strand, 13761787 - 13762118
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  13761787 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacataactagggtttgtatagagtt 13761885  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  || ||    
T  13761886 tgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagtctgtga 13761979  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga-------tagtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcc 715  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||       | |||| ||| || || | ||||||||| ||||||| | |||| |||    
T  13761980 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggaccggagggcttctctctcc 13762077  T
Q  716 cccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    |||||| |||||||  |||||||| |||||||| ||||||||    
T  13762078 cccagactaggtca-atttggactgaactgggtcaacaaatt 13762118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 15823496 - 15823735
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15823496 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttagagataaagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 15823594  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||      ||| ||||||||||  || ||    
T  15823595 tgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgaga 15823688  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15823689 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 15823735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 427 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 30738957 - 30738610
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||   || ||  ||||||||||||  | |||| ||    
T  30738957 ctataaacatagtccttgtatcagatgaaaccttgagatacaggtgactgaaaacaagggtttagaaacaaaaaaacaaactagggttt--agagagatt 30738860  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
     ||||  ||   | |||||| | ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |      ||||||||||||| |||    
T  30738859 tctctaagcgggagacactagggttgagattgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatag------gaagagattgggatttt 30738766  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataat--tatagtggaacggagggttgctctttccc 716  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||         |||||||| || || ||  ||||||| ||||||||| |||||| || |    
T  30738765 gggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctctctcac 30738666  T
Q  717 ccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||| | ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30738665 ccatactaggtcagtattggaccaaacttggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 30738610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Original strand, 28840628 - 28840961
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga--tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagag 523  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  || |||||| ||||| ||| ||||||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28840628 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatacagggggatgaaa-caagggtttagaaaggaaacaacaaaactagggtttgtatagag 28840726  T
Q  524 tttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgg 620  Q
    |||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  |||    
T  28840727 tttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgg 28840820  T
Q  621 gactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga-------tagtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctcttt 713  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||       | |||| ||| || || | ||||||||| ||||||| |||||| |    
T  28840821 gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 28840918  T
Q  714 cccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    |||||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  28840919 cccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 28840961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 28842443 - 28842683
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga--tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagag 523  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28842443 ctataaatataaaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 28842541  T
Q  524 tttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgg 620  Q
    |||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||     
T  28842542 tttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctatt------ggttacgggaagaggctga 28842635  T
Q  621 gactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  28842636 gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 28842683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 427 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 50248903 - 50248666
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggttt-agaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | ||| |||||| ||||||| | ||| |||||||||    
T  50248903 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctg-aaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatatagagtt 50248805  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| || ||||||||| | ||    
T  50248804 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacaggaagagatcgaga 50248711  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga 668  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  50248710 ctttgggtagaattagg-cgagagacttattcttgtaacccattga 50248666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 433 - 669
Target Start/End: Original strand, 6822971 - 6823202
Alignment:
Q  433 atatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctc 530  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  6822971 atatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc 6823069  T
Q  531 ttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgg 628  Q
    || | |||||| |||| | ||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||      ||| | |||||||||||||| ||||||    
T  6823070 ttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctctt------ggttatgggaagagattggggctttgg 6823162  T
Q  629 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||    
T  6823163 gtagaattagg-cgggagacttattcttgtaactcattgat 6823202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 401 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 14098327 - 14098062
Alignment:
Q  401 gttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaa 498  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||| || | |||    
T  14098327 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcaaactaaactttgagatagaggggactgaaa-caatggtttaaaaaggcaa 14098230  T
Q  499 caagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacacta-agattg-gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctttt 595  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  14098229 ctacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt 14098130  T
Q  596 ggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
          ||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14098129 ------ggttacgggaagagattagagctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaacccattgata 14098062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 17318843 - 17319076
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  17318843 ctataaatataggttttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttagagtt 17318941  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||      |||||||||||| ||      ||| ||||||| |||||||||    
T  17318942 tgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaac------aggattgagtctctt------ggttacgggaacagattggga 17319029  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||  |||||||    
T  17319030 ctttgggtagaattagg-cggaagacttattcttgtaacttattgata 17319076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 428 - 670
Target Start/End: Original strand, 17324016 - 17324252
Alignment:
Q  428 tataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| | | |||| ||||||  | ||| ||||||||||    
T  17324016 tataaatatagactttgtattagagtaaaccttgagatagagagggct-aaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttatagagttt 17324112  T
Q  527 g-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggac 623  Q
    | ||||||||||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      |   | ||||||||||||| ||    
T  17324113 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------gaatatgggaagagattggaac 17324206  T
Q  624 tttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324207 tttgggtaaaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 17324252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 47179659 - 47179902
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga----tagagggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctatag 521  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||||| ||||||||||||| |||||    
T  47179659 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 47179757  T
Q  522 agtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtcttttggtcacggtcacgggaagagat 617  Q
    |||||| ||||| | | ||| ||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||      ||||||||    
T  47179758 agtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgg------gaagagat 47179851  T
Q  618 tgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  47179852 tgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 47179902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 415 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 13127971 - 13127787
Alignment:
Q  415 agttatatttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtt 514  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| |||||||  |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13127971 agttttatttctctataaatataaaccttgtatcggagtaaacctttagagagagggg--ttgaaacaagggtttagaagccaacaagaaaagtagggtt 13127874  T
Q  515 tctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcac 601  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | || | ||| ||||| ||||||||    
T  13127873 tatatagagtttccttttggcaacaaacactagggttgggatagattcaccttgggaaacattgttggaattaagtctcttggtcac 13127787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 485 - 772
Target Start/End: Original strand, 28279277 - 28279567
Alignment:
Q  485 ggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgg-gaaacactattagg 583  Q
    |||||||||| ||| || |||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  28279277 ggtttagaagccaataacaaaattagggtttgta--gagtttgctcttgacaacaaacactagggttgggattgattccccttggagaaacactattagg 28279374  T
Q  584 attgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattg--------atagtaaa 675  Q
    ||||||  | ||||||      ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||         | |||||    
T  28279375 attgagcttcttggtc------acgggaagagattgggacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaa 28279468  T
Q  676 gttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttccccc-agattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaa-tttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||| || || ||||||||||||  ||| |||| |||||||||| ||| ||||||||| || ||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  28279469 gttactcatcattatagtggaattgagagttgttctttccccctagactaggtcagtattagatcgaactgggtaaacaaatttttgtgtgttctctct 28279567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 31489865 - 31490102
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||  ||||| ||||||||||||| |||  ||||    
T  31489865 ctataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggttg-aaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtat--agtt 31489961  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||      ||| |||||||||||||| ||    
T  31489962 tgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttctt------ggttacgggaagagattgaga 31490055  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31490056 ctttggatagaattagg-cggaagacttattcttgtaactcattgata 31490102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 430 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 3579946 - 3579708
Alignment:
Q  430 taaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagaggggg--ctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| | || ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3579946 taaatatagaccttgtatcagcgtaaaatttgagatagagggggggctgaaa-caagggttcagaaaggcagcaacaaaactagggtttgtatagagttt 3579848  T
Q  527 g-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggac 623  Q
    | ||||||||||||||||||| | || |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||      | | |||| ||||||||||| |    
T  3579847 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtctctt------gattacggaaagagattggggc 3579754  T
Q  624 tttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3579753 tttgggtaaaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 3579708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 421 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 26332891 - 26332715
Alignment:
Q  421 atttctctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctat 519  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    | ||||||| |||||||||| |||||  |||| |||||||| ||     
T  26332891 atttctctataaatacagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagagga---taaaaacaagggtttagaagccaacacaaaaa-tagggtttgta- 26332797  T
Q  520 agagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacg 602  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26332796 -gagtttgctcttggcaacaaacactaggtttgggtttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacg 26332715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 442 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 31425335 - 31425107
Alignment:
Q  442 ttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgc-tctt-ggcaac 538  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||    
T  31425335 ttgtatcaatgtaaaccttgagataaagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaac 31425237  T
Q  539 aaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaatt 636  Q
    |||||||| | || |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31425236 aaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgat---ctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaatt 31425140  T
Q  637 aggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||   |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31425139 agg-cgggaggcttattcttgtaactcattgata 31425107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 47177308 - 47177551
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga----tagagggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctatag 521  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||||| ||||||||||||| |||||    
T  47177308 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 47177406  T
Q  522 agtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtcttttggtcacggtcacgggaagagat 617  Q
    |||||| ||||| | | ||| ||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||      ||||||||    
T  47177407 agtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatgggagtctcttggttacgg------gaagagat 47177500  T
Q  618 tgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  47177501 tgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgat 47177551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 420 - 670
Target Start/End: Original strand, 25127808 - 25128061
Alignment:
Q  420 tatttctctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgaga------tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagg 511  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||      |||||||| |||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||    
T  25127808 tatttctctataaatataaaccttgtattagatgtaaaccttgagagagagatagaggggcctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 25127906  T
Q  512 gtttctatagagtttgc-tcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacg 608  Q
    |||| |||||||||||  |||||| ||||||||||| | || |  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||      ||| |||    
T  25127907 gtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactatttggattgagtctctt------ggttacg 25128000  T
Q  609 ggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25128001 ggaagagattgagacttttggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaattcattgata 25128061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 51752315 - 51752552
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||  |||||| |||  ||||| |||| ||||| || |||||||||    
T  51752315 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctg-aaacaagagtttagaaaggtaacaacaaaattagggcttgtatagagtt 51752413  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||      ||| ||||||||||  || ||    
T  51752414 tgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactatta-gattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgaga 51752506  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  51752507 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 51752552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 447 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 4131692 - 4131401
Alignment:
Q  447 tcagagtaaaccttgaga--tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaac 542  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||    
T  4131692 tcagagtaaaccttgagagatagagggggctgaaa-caaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 4131594  T
Q  543 actaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggt 640  Q
    |||| | || |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| || |||||||  | ||||||||||||||||||||     
T  4131593 actagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattagg- 4131502  T
Q  641 ttggagacttattcttgtaacccattgata------------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtc 728  Q
       || ||||||||||||||||||||||||            |||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  4131501 cgagaaacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtc 4131402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 427 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 28207397 - 28207223
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| | || ||||    
T  28207397 ctataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtaaagtt 28207299  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggt 598  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28207298 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggt 28207223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 300 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 6115541 - 6115101
Alignment:
Q  300 atgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnnncaaaagagatgtatc---ttcagtgtgat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||         |||| | | |||||    | ||||||||    
T  6115541 atgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggagaa-------aaaaaaaacgtatcactattagtgtgat 6115449  T
Q  397 attcgttccaaatttataa--gttatatttctctataaatatagacattgtatc------agagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtt 488  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||          |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  6115448 attcgttccaaatttatgagcgttatatttctctataaatatagaccttgtatcttgtatcctctaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtt 6115350  T
Q  489 tagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 588  Q
    ||||| ||       ||| |||||||| ||||||||||||||||| | |             |  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6115349 tagaaatc-------aaattagggtttgtatagagtttgctcttgtcta-------------ttaggttgattcaccttgaaaaacactattaggattga 6115270  T
Q  589 gtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgc 680  Q
    |||| ||      ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||        ||||| || |    
T  6115269 gtctctt------ggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggggacttattcttgtaaccaattgatatctcttttgtaaaattac 6115177  T
Q  681 ttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    | || ||||||||| ||||||  | |||||| ||||||||| |||||||  |||||||  |||||||||||||||||    
T  6115176 tcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtaaacaaatt 6115101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 427 - 729
Target Start/End: Original strand, 40133885 - 40134200
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaa---------acaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttc 516  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||         |||| ||||||||| | |||||| ||||| | |||||     
T  40133885 ctataaatataggctttgtatcagagtaaatcttgagatatagggg-ctgaaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacgaaggtttg 40133983  T
Q  517 tatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaag 613  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| | || |  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||      ||||||||||||    
T  40133984 tatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactactaggattgagtctctt------ggtcacgggaag 40134077  T
Q  614 agattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggt 705  Q
    |||||| |  |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||| || || ||||||||| |||||| ||     
T  40134078 agattgaggttttgggtaaaattagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggc 40134176  T
Q  706 tgctctttcccccagattaggtca 729  Q
    |||||| ||||||| | |||||||    
T  40134177 tgctctctcccccaaactaggtca 40134200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 427 - 546
Target Start/End: Original strand, 47451598 - 47451718
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  47451598 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggct-taaacaagggtttggaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 47451696  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacacta 546  Q
    || ||||||| |||||||||||    
T  47451697 tgtctcttgggaacaaacacta 47451718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 556 - 662
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155888
Alignment:
Q  556 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattct 655  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtc------acgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattct 155881  T
Q  656 tgtaacc 662  Q
    |||||||    
T  155882 tgtaacc 155888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 559 - 729
Target Start/End: Original strand, 16429042 - 16429213
Alignment:
Q  559 attcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgt 658  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      ||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  16429042 attcaacttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgg------gaagagattgggaatttgggtagaattagg-cggaagacttattcttgt 16429134  T
Q  659 aacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtca 729  Q
    ||||||||||||        |||| ||| || || ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  16429135 aacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 16429213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6115608 - 6115532
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatat 346  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  6115608 atatttttgtatcgtatgaatgacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatat 6115532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 686 - 772
Target Start/End: Original strand, 15916603 - 15916689
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15916603 attatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgcgttctctct 15916689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 553 - 669
Target Start/End: Original strand, 16231642 - 16231752
Alignment:
Q  553 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagactta 651  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||      |||||||||| | |||||||||||||||||   |||||||||    
T  16231642 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgg------gaagagattgagcctttgggtagaattaggcg-ggagactta 16231734  T
Q  652 ttcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16231735 ttcttgtaacccattgat 16231752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 426 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 25248846 - 25248757
Alignment:
Q  426 tctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggttt 515  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  25248846 tctagaaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 25248757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 553 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 25248754 - 25248550
Alignment:
Q  553 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttat 652  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |      |||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||||||    
T  25248754 gggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctct------cggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcg-ggagacttat 25248662  T
Q  653 tcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaact 744  Q
    ||||||||||||||||||        |||| ||| || |||||||||||| ||||||||  |||||  ||||| ||| |||||||  |||||||  ||||    
T  25248661 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtca-atttggaccgaact 25248563  T
Q  745 gggtaaacaaatt 757  Q
    |||| ||||||||    
T  25248562 gggtcaacaaatt 25248550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 270 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 4131772 - 4131694
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattct 349  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4131772 atatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattata-ttttgatgcaaatattct 4131694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 606 - 669
Target Start/End: Original strand, 23785966 - 23786028
Alignment:
Q  606 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  23785966 acgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 23786028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 270 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 45693915 - 45693836
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattct 349  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  45693915 atatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaataatatattttttatgcaaatattct 45693836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 671 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 13127771 - 13127670
Alignment:
Q  671 gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctct 770  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| | |||||| ||| ||||| ||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13127771 gtaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcctccagactaggttagtattggaccgaaccgggtaaacaaatttcatgtgttctct 13127672  T
Q  771 ct 772  Q
    ||    
T  13127671 ct 13127670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 427 - 515
Target Start/End: Original strand, 16231551 - 16231639
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggttt 515  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  16231551 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtctagaaaagcaacaagaaaactagggttt 16231639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 560 - 670
Target Start/End: Original strand, 43104245 - 43104350
Alignment:
Q  560 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggaga-cttattcttgt 658  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||      |||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||  || |||||||    
T  43104245 ttcaccttggaaaacactattagaattgagtctttt------ggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattaggtttgaagatttttttcttgt 43104338  T
Q  659 aacccattgata 670  Q
    ||||| ||||||    
T  43104339 aaccctttgata 43104350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 571 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144782
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  4144865 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagagactgggactt-gggtagaattaggtttgaagattgattcttgtaac 4144782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 574 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 21353525 - 21353345
Alignment:
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccca----ttgat 669  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||     |  |    
T  21353525 cactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactcaatatctctt 21353433  T
Q  670 agtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
     ||||||   || || ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||  ||| |||  |||||||||||||||||    
T  21353432 tgtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatctttagaccgaactgggtaaacaaatt 21353345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 381 - 435
Target Start/End: Original strand, 14352878 - 14352932
Alignment:
Q  381 gtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctctataaata 435  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14352878 gtatcttcagcgtgatatttgttccaaatttacgagttatatttctctataaata 14352932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 553 - 670
Target Start/End: Original strand, 16432473 - 16432583
Alignment:
Q  553 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttat 652  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||      ||| | ||||||||||||  |||||||||||||||| |   ||| | ||||    
T  16432473 gggttgattcaccttgggaaacattattaggattgaatctctt------ggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatg-cgggacaattat 16432565  T
Q  653 tcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16432566 tcttgtaacccattgata 16432583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 574 - 768
Target Start/End: Original strand, 9526469 - 9526662
Alignment:
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga----t 669  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || |      |    
T  9526469 cactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcaatatctctt 9526561  T
Q  670 agtaaagttgcttata--attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttc 767  Q
     ||||||   ||||||  ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||| || |||||||    
T  9526562 tgtaaagaaacttatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttc 9526661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11693637 - 11693580
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatatt 327  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11693637 atatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagggaatatt 11693580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13785719 - 13785662
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatatt 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  13785719 atatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaaaggaatatt 13785662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 327
Target Start/End: Original strand, 14352785 - 14352842
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatatt 327  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14352785 atatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagggaatatt 14352842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 566 - 662
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757712
Alignment:
Q  566 ttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 662  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc 51757712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 666
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232685
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  2232597 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt 2232685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 574 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 2401400 - 2401320
Alignment:
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2401400 cactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 2401320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 574 - 661
Target Start/End: Original strand, 25134074 - 25134154
Alignment:
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25134074 cactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 25134154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 622 - 670
Target Start/End: Original strand, 46783189 - 46783237
Alignment:
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  46783189 actttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgata 46783237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 313 - 360
Target Start/End: Original strand, 6996175 - 6996222
Alignment:
Q  313 ttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaaga 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  6996175 ttgaaagggaatattatatttttgttgcaaatattctttcactgaaga 6996222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353153
Alignment:
Q  556 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggtttggagacttatt 653  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||      |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctctt------ggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattaggttt-gaaac-tatt 14353138  T
Q  654 cttgtaacccattga 668  Q
    |||||||||| ||||    
T  14353139 cttgtaaccctttga 14353153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 428
Target Start/End: Original strand, 10115695 - 10115741
Alignment:
Q  382 tatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctct 428  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10115695 tatcttcagcgtgatatccgttccaaatttatgagttatatttctct 10115741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 556 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332642
Alignment:
Q  556 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacg 602  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacg 26332642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 611 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 13785421 - 13785368
Alignment:
Q  611 aagagatt-gggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 663  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  13785421 aagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaagactgattcttataaccc 13785368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 621 - 669
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816074
Alignment:
Q  621 gactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  23816027 gactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgat 23816074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 439
Target Start/End: Original strand, 32260948 - 32261008
Alignment:
Q  379 atgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctctataaatataga 439  Q
    |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32260948 atgtatattcaatgtgacatccgtttcaaatttacgagttatatttctctataaatataga 32261008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 609 - 660
Target Start/End: Original strand, 14997072 - 14997122
Alignment:
Q  609 ggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14997072 ggaagagattgagactt-gggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 14997122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 741 - 772
Target Start/End: Original strand, 43104454 - 43104485
Alignment:
Q  741 aactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43104454 aactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 43104485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 476 - 545
Target Start/End: Original strand, 32261036 - 32261103
Alignment:
Q  476 gaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacact 545  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||  |||||| |||||| |||||||||||    
T  32261036 gaaaacaagggtttagaagccaacaacaaaactaaggtttgta--gagttttctcttgacaacaaacact 32261103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 427 - 461
Target Start/End: Original strand, 43104109 - 43104143
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttg 461  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43104109 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttg 43104143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 611 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 8213677 - 8213624
Alignment:
Q  611 aagagatt-gggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 663  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  8213677 aagagattcgggactttggatagaattaggtttgaagactaattcatgtaaccc 8213624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 604 - 657
Target Start/End: Original strand, 9521742 - 9521794
Alignment:
Q  604 tcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttg 657  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  9521742 tcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttg 9521794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 427 - 472
Target Start/End: Original strand, 16431051 - 16431096
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggg 472  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16431051 ctataaatataggttttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg 16431096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 556 - 600
Target Start/End: Original strand, 49959129 - 49959174
Alignment:
Q  556 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtcttttggtca 600  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  49959129 ttgattcaccttggagaaacactattaggaatgagtctcttggtca 49959174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 129)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 270 - 757
Target Start/End: Original strand, 19322549 - 19323031
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  19322549 atatttttgtactgtataaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaa--- 19322645  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag 469  Q
      |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19322646 --aaaagaaatgtatcttcaatgtgatattcattccaaatttatgagttatattcatctataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagag 19322743  T
Q  470 ggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgg 569  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  19322744 ggggatgaaa-caagggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggtttgggttgattcaccttgg 19322842  T
Q  570 gaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19322843 gaaacactattaggattgagtctctt------ggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgat 19322935  T
Q  670 a--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    |        |||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  19322936 atctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaatt 19323031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 427 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 8756579 - 8756232
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  8756579 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaagtcaacaagaaaattaggatttgtatagagttt 8756480  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||      |||||||||||||||||| ||||||    
T  8756479 gctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctt-----tggtcacgggaagagattgagacttt 8756385  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttccccc 718  Q
    | ||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  8756384 gagtagaatta-gacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattatagtggaacggatggttgctctctcctcc 8756286  T
Q  719 agattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8756285 agactaggtcggttttggagcgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctct 8756232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 427 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 18537800 - 18537455
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  18537800 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaacaaacaacaaa-ctagggtttgtatagagttt 18537702  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||| ||||||    
T  18537701 gctcttggcaacaaccactagggttggggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctt------ggtcacgggaagagattgagacttt 18537608  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttccccc 718  Q
     ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  18537607 tggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccccc 18537509  T
Q  719 agattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    | | ||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18537508 ataataggtcattttttgaccgaactgggtaaacaaattttgtgcgttctctct 18537455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 429 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 18535156 - 18534813
Alignment:
Q  429 ataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgc 528  Q
    |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||   |||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  18535156 ataaatatagacctcgattcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagtgtttaaaaacaaacaa-caaactagggtttgtatagagtttgc 18535058  T
Q  529 tcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgg 628  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||      ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18535057 tcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctctt------ggtcacgagaagagattgagactttgg 18534964  T
Q  629 gtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccag 720  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||        |||||  | || |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  18534963 gtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacggaggggtgctctcccccccag 18534865  T
Q  721 attaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    | ||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18534864 actaggtaagttttggaccgaacagggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 18534813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 270 - 668
Target Start/End: Original strand, 56030298 - 56030685
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||           
T  56030298 atatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttggtgcaaatattctttcactgaaggaga------ 56030391  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  56030392 --aaaaaaaaagtatcttcggtgtggtattctttccaaatttatgagttatatttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagataga 56030489  T
Q  469 gggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcac 564  Q
     ||||||| |||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||||||    
T  56030490 aggggctg-aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 56030588  T
Q  565 cttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccca 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||      ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||    
T  56030589 cttgggaaacactattaggattgagtttctt------ggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaactca 56030681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 44600319 - 44599928
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  44600319 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttaaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaggaa---- 44600224  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | | |||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| |||||| | || |||| ||||||||||    
T  44600223 --aaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgtttcaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtattaaagcaaactttgagataga 44600126  T
Q  469 gggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcac 564  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||||||    
T  44600125 gggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 44600027  T
Q  565 cttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 663  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |    
T  44600026 cttgggaaacactattaggattggagtctctt------ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaactc 44599934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 414 - 772
Target Start/End: Original strand, 9863699 - 9864064
Alignment:
Q  414 aagttatatttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatag-agggggctgaaaa-caacggtttagaagtcaacaagaaaa-ctag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| || | |||||||| ||| |||||||||| ||| || |||| ||||    
T  9863699 aagttatatttctctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagatagtagagagctgaaaaacaagggtttagaagccaaaaacaaaaactag 9863798  T
Q  511 ggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacggg 610  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      |||||||||    
T  9863799 ggtttgta--gagtttgttcttggcaacaaacactaaggttgggtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtctttt------ggtcacggg 9863890  T
Q  611 aagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata-------gtaaagttgc---ttataattatagtggaacgg 700  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||       |||||||| |   | || |||||||||||||||    
T  9863891 aagagattgagactttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctctttgtaaagttactcatcatcattatagtggaacgg 9863990  T
Q  701 agggttgctcttt--cccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    || | |||||| |  |||||||| || |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9863991 agagctgctctctcccccccagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 9864064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 270 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 14787912 - 14787523
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||| ||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  14787912 atatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaga------ 14787819  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt--gagata 466  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||  ||||||    
T  14787818 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagata 14787721  T
Q  467 gagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattc 562  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||| | ||   || |||||||    
T  14787720 gagggggctg-aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattc 14787622  T
Q  563 accttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||     
T  14787621 accttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgtgactttggatagaattagg-tgggagactttttcttgtaact 14787529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 499 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 38890480 - 38890206
Alignment:
Q  499 caagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggt 598  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||       
T  38890480 caagaaaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacattagggttggggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctctt--- 38890384  T
Q  599 cacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattat 690  Q
       | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| || || |||||    
T  38890383 ---gatcacgggaagagattgagactttgggtagaatta-gaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 38890288  T
Q  691 agtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890287 agtggaacagagggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 38890206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 379 - 768
Target Start/End: Original strand, 10112825 - 10113218
Alignment:
Q  379 atgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctct--ataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggggct 475  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | |    
T  10112825 atgtatcttcagcgtgaaatccgttccaaatttatgagttatatttttttttataaatatagacattgtatcagatgtaaacctcgagagagagggagtt 10112924  T
Q  476 gaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaaca 575  Q
    |||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| |||||||    
T  10112925 gaaaacaagggtttagaagccaacacaaaaactagggtttgta--gagtttgctcttggcaacaaacactagggttgagattgattcaccttaggaaaca 10113022  T
Q  576 ctattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc-cattgata---- 670  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||     ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||   ||||||        
T  10113023 ctattatgattgagtctcttggtcacg-----gggaagagattaggactttgggtagaattagatttgaagactaattcttgtaacctttttgatatctc 10113117  T
Q  671 ---gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttc 767  Q
       |||| ||| || || |||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  10113118 tttgtaatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctctctccccaagactaggttagtattggaccgaactgggtaaaaaaaattcatgtgttc 10113217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 24348067 - 24348460
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  24348067 atatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaa----- 24348161  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt----gaga 464  Q
      |||| | | ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||   ||||| ||    ||||    
T  24348162 --aaaaaaaaagtatcttcaatgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagagaga 24348259  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgat 560  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||   ||||||||    
T  24348260 tagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgat 24348358  T
Q  561 tcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  24348359 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaa 24348451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 22132878 - 22132482
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  22132878 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaga------ 22132785  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| |||    
T  22132784 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 22132687  T
Q  469 g---------ggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--gggg 555  Q
    |         ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||   |||    
T  22132686 gagagatagaggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtggg 22132589  T
Q  556 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattct 655  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  22132588 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattct 22132496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Original strand, 36378296 - 36378629
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  36378296 ctataaatatagactttgtatcagaataaaccttgagatagacggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 36378394  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||||||||||||||| | || |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||       || |||||||||||||||||    
T  36378395 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctt------agttacgggaagagattggga 36378488  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||        || ||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  36378489 ctttgggtagaattaag-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgtgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc 36378587  T
Q  715 ccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||| |||||||  |||||||  |||||||||||||||||    
T  36378588 ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtaaacaaatt 36378629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 17662717 - 17662336
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||| |||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  17662717 atatttttgtaccgtacgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaga------ 17662624  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt----gaga 464  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||    ||||    
T  17662623 --aaaaaaaaagtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagaga 17662526  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgatt 561  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |          ||||| | ||||||||||| | ||   |||||||||    
T  17662525 tagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt----------ctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgatt 17662437  T
Q  562 caccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  17662436 caccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacaggaagagactgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 17662344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 427 - 772
Target Start/End: Original strand, 28453691 - 28454035
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||  |  |||||    
T  28453691 ctataaatatagaccttgtatcagatgtgaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagaagccaacactaaaactagggtttgca--gagtt 28453787  T
Q  526 tgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactt 625  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||      ||| ||||||||||||| |||| |    
T  28453788 tgctcttggcaagaaacactagggttgggattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctt------ggttacgggaagagatttggacct 28453881  T
Q  626 tgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccc 717  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |  ||||||        |||||||| || || |||||||||||||||||   | |||| |||||    
T  28453882 tgggtagaattagg-ttgaagactaattcttgtaaacttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctcccc 28453980  T
Q  718 cagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    |||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28453981 cagactaggttagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 28454035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 427 - 772
Target Start/End: Original strand, 12102094 - 12102440
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagaggggg-ctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||   ||||| ||| ||||||||| || |||| |    
T  12102094 ctataaatatagatcttgtatcagataaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaagggtttagaaacaaacaacaaa-ctagggttt-tagagagat 12102191  T
Q  526 tgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactt 625  Q
    | ||||  ||   | | |||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||      ||| ||||||| ||||    
T  12102192 ttctctaagcgggagaaactagggttgttgttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgg------gaaaagattggaactt 12102285  T
Q  626 tgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccc 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        |||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12102286 tgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccc 12102385  T
Q  718 cagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    || | ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  12102386 catactaggtcagttttggaccgaactaggtaaacaaatttcgtatgctctctct 12102440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 427 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 16186166 - 16185816
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||| |||||||||  | |||| ||    
T  16186166 ctataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagagagagggggctaaaaacaagggtttagaaacaaacaacaaa-ctagggttt--agagagatt 16186070  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttg-----attcaccttggg--aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattg 619  Q
     ||||  ||   | |||||||| ||||| |||     ||||||||||    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||    
T  16186069 tctctaagcgggagacactaaggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgg------gaagagattg 16185976  T
Q  620 ggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata-------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctt 712  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||       |||||||| || || ||||||||||||| ||||| ||||||     
T  16185975 gaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatctttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctc 16185876  T
Q  713 tcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16185875 tcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 16185816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 40999276 - 40999040
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  40999276 ctataaatataaaccttatatcagagtaaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagacgtcaacaagaaaactaggggttgtatagagttt 40999178  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||      |||||||||||||||| | ||||||    
T  40999177 gctcttgacaacaaacactaggattgagattgattcacctaggaaaacattattaggattgagtctctt------ggtcacgggaagagatcgagacttt 40999084  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  40999083 gggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaaccctttgata 40999040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 427 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 22803063 - 22802758
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22803063 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 22802965  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | |||||||| || | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  |||||    
T  22802964 tgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctggga 22802871  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||        |||| ||| || || | ||||||||||||||||||| |||| ||    
T  22802870 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatca-tatagtggaacggagggtttctctctc 22802773  T
Q  715 ccccagattaggtca 729  Q
    ||||||| |||||||    
T  22802772 ccccagactaggtca 22802758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 427 - 668
Target Start/End: Original strand, 48486323 - 48486560
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  48486323 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 48486421  T
Q  526 t-gctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    |  ||||| | ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||||||    
T  48486422 tatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattggga 48486515  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga 668  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  48486516 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacacattga 48486560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Original strand, 19095886 - 19096219
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  19095886 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtt 19095984  T
Q  526 tg-ctc-ttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    || ||| |||||||||||||||| | ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||||| |     
T  19095985 tgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattaga 19096078  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctcttt 713  Q
     |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||        |||| ||| ||||| | ||||||| ||||||| | |||||| |    
T  19096079 gctttgggtagaattagg-cgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatca-tatagtgaaacggagagctgctctct 19096176  T
Q  714 cccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    |||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19096177 cccccagactaggtca-atttggaccaaactgggtcaacaaatt 19096219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 270 - 527
Target Start/End: Original strand, 5100852 - 5101101
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  5100852 atatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag------- 5100944  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | ||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5100945 --aaaaaaaacgtatcttcaatctggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagggtaaaccttgagataga 5101042  T
Q  469 gggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg 527  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  5101043 ggggactg-aaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 5101101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Original strand, 24888800 - 24889132
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||| || |||||||||    
T  24888800 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggattgtatagagtt 24888898  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||| | |||    
T  24888899 tgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagactagga 24888992  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||        |||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  24888993 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatca-tatagtggaacggagggctgctctctc 24889090  T
Q  715 ccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  24889091 ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 24889132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 427 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 37313395 - 37313097
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  37313395 ctataaatataggttttgtatcaaagtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtt 37313297  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||||||||||||||| | ||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||| ||||||||||||    
T  37313296 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctctt------ggttacggaaagagattggga 37313203  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
     ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||        |||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37313202 ttttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttc 37313104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 427 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 15032865 - 15032532
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15032865 ctataaatatagacttggtaccagagtaaaccttgagataaagggggctgaaa-caagggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagttt 15032767  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
    |||||| ||||||||         || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||      || |||| ||| ||||| |||||||    
T  15032766 gctctttgcaacaaa---------tgaggttgattcatatttggaaacactattaggattgagtctctt------ggacacgagaaaagatttggacttt 15032682  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttccccc 718  Q
     ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||        |||||||| || || |||| ||||||||| || | |||||| ||||||    
T  15032681 tggtagaattagg-cgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacgaagagctgctctctccccc 15032583  T
Q  719 agattaggtcagttttggactaaact-gggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
    | | ||||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15032582 aaactaggtcagtattggaccgaactagggtatacaaatttcgtgtgttct 15032532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 422 - 669
Target Start/End: Original strand, 40637073 - 40637316
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctata 520  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||    
T  40637073 tttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 40637171  T
Q  521 gagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagat 617  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||      ||| ||||||||||||    
T  40637172 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctctt------ggttacgggaagagat 40637265  T
Q  618 tgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    || |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  40637266 tgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 40637316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 5198424 - 5198662
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  5198424 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtt 5198522  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      ||| ||||||||||||||||     
T  5198523 tgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctttt------ggttacgggaagagattgggg 5198616  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  5198617 ctttgtgtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 5198662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 422 - 669
Target Start/End: Original strand, 14633319 - 14633560
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctata 520  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||| ||||    
T  14633319 tttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaa-caaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 14633416  T
Q  521 gagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagat 617  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||||    
T  14633417 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-------ggaagagat 14633509  T
Q  618 tgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  14633510 tgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 14633560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 12396174 - 12395935
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  12396174 ctataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaa-caaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 12396076  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || |||| | |||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||| ||    
T  12396075 tgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgtga 12395982  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12395981 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattgttgtaacccattgata 12395935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 24878993 - 24879232
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24878993 ctataaatatagaccttgtatccgagtaaacttggagatagagggggctg-aaactagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 24879091  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||| | | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||| ||    
T  24879092 tgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgaga 24879185  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879186 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 24879232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 431 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 33415812 - 33415578
Alignment:
Q  431 aaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-c 528  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  33415812 aaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 33415714  T
Q  529 tcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
    |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||      ||| |||||||||||||| | ||||    
T  33415713 tcttgg-aacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctctt------ggttacgggaagagattgaggcttt 33415621  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33415620 gggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 33415578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 427 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 38928507 - 38928269
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  38928507 ctataaatataggctttgtattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 38928409  T
Q  526 tg-ctctt-ggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    || ||||| |||||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||| ||||||||    
T  38928408 tgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaaaagattggg 38928315  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga 668  Q
     |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  38928314 gctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaactcattga 38928269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 51015250 - 51015488
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  51015250 ctataaatatagactttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtt 51015348  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  |||||    
T  51015349 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctggga 51015442  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  51015443 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 51015488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 22135110 - 22134707
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||           
T  22135110 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgattcaaatattctttcactgaaggagaa----- 22135016  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||| |||    
T  22135015 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagagaga 22134918  T
Q  469 g---------------ggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt 551  Q
    |               ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||| | ||    
T  22134917 gagagagagagatagaggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt-caaacaaacactagggtt 22134820  T
Q  552 --ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagact 649  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| | ||||| ||  |||||| |||||||||||||||   |||||||    
T  22134819 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattagg-cgggagact 22134727  T
Q  650 tattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22134726 tattcttgtaacccattgat 22134707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 22801191 - 22800859
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22801191 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtt 22801093  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||      | | ||||||||||  || ||    
T  22801092 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt------gattacgggaagaggctgaga 22800999  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||        |||| ||| || || | ||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  22800998 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctctc 22800901  T
Q  715 ccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  22800900 ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 22800859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 381 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 18709547 - 18709254
Alignment:
Q  381 gtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga--------tagaggg 471  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||        |||||||    
T  18709547 gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagagagatagaggg 18709448  T
Q  472 ggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgggg--ttgattcacctt 567  Q
    |||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || | |  ||||||||||||    
T  18709447 ggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagttgattcacctt 18709349  T
Q  568 gggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattg 667  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||      |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  18709348 gggaaacactattagggttgagtctcttggttacgg------gaagagattgcgactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaacccattg 18709256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 12401136 - 12400897
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  12401136 ctataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaa-caaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 12401038  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || |||| | |||||||||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||      ||| |||||||||||||| ||    
T  12401037 tgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctctt------ggttacgggaagagattgtga 12400944  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12400943 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattgttgtaacccattgata 12400897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 24880455 - 24880694
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||| | |||| | ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24880455 ctataaatatagaccttgtatcggagtaaacttggagatagagggggc-gtaaactagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 24880553  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||| ||    
T  24880554 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgaga 24880647  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880648 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 24880694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 40091744 - 40091505
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||| || | |||||||    
T  40091744 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtttagagtt 40091646  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||      ||| ||||||||||  |||||    
T  40091645 tgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctctt------ggttacgggaagaggctggga 40091552  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40091551 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 40091505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 18847157 - 18847396
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18847157 ctataaatatagaccttgtatcaaaacaaactttgagatagagggggttgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 18847255  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacacta-agattg-gggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    || ||||| | ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||      ||| ||||||||||||||||    
T  18847256 tgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattggagtctctt------ggttacgggaagagattggg 18847349  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  18847350 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 18847396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 420 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 47151227 - 47150874
Alignment:
Q  420 tatttctctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatag-agggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttct 517  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |  || | ||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||| |||||      
T  47151227 tatttctccataaatataaacattctatcagatgtaaaccttgagagattagagagctgaaaacaagggtttagaagccaacac-aaaactaaggttt-- 47151131  T
Q  518 atagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagat 617  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||      ||||||  ||||||||    
T  47151130 atagagtttgctcttggtaaccaacactagggttgaaattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctt------ggtcacatgaagagat 47151037  T
Q  618 tgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgct 709  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||         |||||||||| || ||||||||||||| ||  | || |    
T  47151036 tgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttgctcatcattatagtggaacagatagatgtt 47150937  T
Q  710 ctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
     | ||||| ||| ||||||| | ||||||  || ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  47150936 atctcccctagactaggtcaatattggaccgaattgggtaaactaatttcttgtgttctctct 47150874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 422 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 8631757 - 8631510
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga----tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttc 516  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||     
T  8631757 tttcactataaatatagactttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 8631659  T
Q  517 tatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaag 613  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||    
T  8631658 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaag 8631565  T
Q  614 agattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  8631564 aggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 8631510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 11434959 - 11435197
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11434959 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 11435057  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||  ||| || |||||||  | |||    
T  11435058 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc------tcctggttaccggaagagtctagga 11435151  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  11435152 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 11435197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 22044719 - 22044481
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22044719 ctataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 22044621  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  |||||    
T  22044620 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctggga 22044527  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22044526 ctttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgat 22044481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 22047014 - 22046776
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22047014 ctataaatataggccttgtatcggagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 22046916  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || || || | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  |||||    
T  22046915 tgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctggga 22046822  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  22046821 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 22046776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 270 - 639
Target Start/End: Original strand, 30136424 - 30136762
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    |||||||||||  || ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| ||           
T  30136424 atatttttgtactgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttaaaagagaatattatatttttgattcaaatattctttcattgaaggagaa----- 30136518  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||| | ||||| |||||||||||    
T  30136519 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtgatattcgttctaaatttattagttatatttctctataaatatatacctagtatcaaatgtaaatcttgagataga 30136616  T
Q  469 gggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttg 568  Q
    |        |||||| ||||| | || ||||           ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  30136617 g--------aaacaaaggtttgggaggcaac-----------ggtttgtatagagtttactcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttg 30136697  T
Q  569 ggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 639  Q
    |||||||||| || ||||| |||| ||      ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  30136698 ggaaacactactatgattgggtctctt------ggtcacgagaagaaattgtgactttgggtagaattagg 30136762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 38409203 - 38409447
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga------tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctat 519  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||      ||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| |||    
T  38409203 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagggagatagagggggctgaaa-caatggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 38409301  T
Q  520 agagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagaga 616  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||     
T  38409302 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagg 38409395  T
Q  617 ttgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
     ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409396 ctgggactttgggtagaattagg-ctggagacttattcttgtaacccattgat 38409447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 422 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 2485207 - 2484963
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga-gggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctat 519  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||    
T  2485207 tttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagctagaagggggct-aaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 2485109  T
Q  520 agagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattg--gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagaga 616  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||     
T  2485108 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagg 2485015  T
Q  617 ttgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
     ||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  2485014 ctgggactttgggtagagatagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 2484963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 427 - 663
Target Start/End: Original strand, 41997496 - 41997728
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| |||| |  ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  41997496 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaa-caagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagtt 41997594  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||||||||||||||| | || |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||       || ||||||| |||||| ||    
T  41997595 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt------agttacgggaaaagattgaga 41997688  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 663  Q
     |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  41997689 ttttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaaccc 41997728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 619776 - 619537
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggttta-gaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  619776 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggtttgcatagagtt 619678  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||||||||||||||| | ||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |      |||  ||| | ||||||||||||||     
T  619677 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgact------gtcttggttaagggaagagattgggt 619584  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   ||| | |||||||| |||||||||||||    
T  619583 ctttgggtagaattagg-cgggaaaattattcttataacccattgata 619537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 47274731 - 47274969
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  47274731 ctataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtt 47274828  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||| ||||||| | ||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||   |||||    
T  47274829 tgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaagctggga 47274922  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47274923 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 47274969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Original strand, 9148255 - 9148588
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga--tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagag 523  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||  ||| ||||||||| | |||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  9148255 ctataaatataggccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaag-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagag 9148353  T
Q  524 tttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgg 620  Q
    |||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  |||    
T  9148354 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgg 9148447  T
Q  621 gactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga-------tagtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctcttt 713  Q
    |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||       | |||| ||| || || | ||||||||||||||||| |||||| |    
T  9148448 gactttaggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctct 9148545  T
Q  714 cccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||  |||||||| ||||||||    
T  9148546 cccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 9148588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 13543958 - 13544202
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgaga----tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctata 520  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||    ||||||||||||||| ||| | | ||||| | |||||| ||||||||||||| ||||    
T  13543958 ctataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaa-caaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttgtata 13544056  T
Q  521 gagtttg-ctctt-ggcaacaaacactaagattgggg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagat 617  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||| ||||||||    
T  13544057 gagtttgtctctttggcaacaaacactaggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgtgaagagat 13544150  T
Q  618 tgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544151 tgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 13544202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 5637798 - 5637556
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga----tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatag 521  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||    ||||||||||||||| |||  |||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||    
T  5637798 ctataaatatagaccttgtataagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaa-caagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 5637700  T
Q  522 agtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagatt 618  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  |    
T  5637699 agtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggct 5637606  T
Q  619 gggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  5637605 gggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgat 5637556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 427 - 729
Target Start/End: Original strand, 16453313 - 16453619
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||| |||||||| |||| || | ||||    
T  16453313 ctataaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagatagagggggctgaaa-caagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtacaaagtt 16453411  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||| |||||||||||||    
T  16453412 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgagaagagattggga 16453505  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||        |||| ||| || || ||||||||| ||| || ||||||||| ||    
T  16453506 ctttgggtagtattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctc 16453604  T
Q  715 ccccagattaggtca 729  Q
    ||||||| |||||||    
T  16453605 ccccagactaggtca 16453619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 422 - 669
Target Start/End: Original strand, 6764838 - 6765086
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctata 520  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  6764838 tttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 6764936  T
Q  521 gagtttg-ctc-----ttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaa 612  Q
    ||||||| |||     || | ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||      ||| | |||||    
T  6764937 gagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctt------ggttatgggaa 6765030  T
Q  613 gagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6765031 gaggctgggactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaacccattgat 6765086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 37089703 - 37089369
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaacct---tgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctataga 522  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||| |    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37089703 ctataaatatagaccttgtatcaggctaaacttgagagagatagagggggctg-aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtataga 37089605  T
Q  523 gtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattg 619  Q
    ||||| |||||   ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      | | ||||||||||  ||    
T  37089604 gtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------gattacgggaagaggctg 37089511  T
Q  620 ggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga-------tagtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctt 712  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||       | |||| ||| || || | ||||||||||||||||| ||||||     
T  37089510 ggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctc 37089413  T
Q  713 tcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  37089412 tcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 37089369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 9174475 - 9174236
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  9174475 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 9174377  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    || ||||| | | ||||||||| | ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||      ||| |||||||||||||| |    
T  9174376 tgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctctt------ggttacgggaagagattgag 9174283  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  9174282 actttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaactcattgat 9174236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 16934472 - 16934233
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16934472 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-atacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 16934374  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    || ||||| | | ||||||||| | ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||      ||| |||||||||||||| |    
T  16934373 tgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctctt------ggttacgggaagagattgag 16934280  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  16934279 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 16934233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 36919916 - 36919674
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttga--gatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagag 523  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||  ||| ||    
T  36919916 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgatagatatagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggataaag 36919818  T
Q  524 tttg-ctctt-ggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattg 619  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||    
T  36919817 tttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctg 36919724  T
Q  620 ggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  36919723 ggacttttggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaatccattgata 36919674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 422 - 669
Target Start/End: Original strand, 47868400 - 47868643
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctata 520  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||  || ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||    
T  47868400 tttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaag-aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 47868498  T
Q  521 gagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagat 617  Q
    ||||||| ||| | | ||||||||||| | || |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||      
T  47868499 gagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggc 47868592  T
Q  618 tgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    || |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  47868593 tgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 47868643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 429 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 36921822 - 36921583
Alignment:
Q  429 ataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga--tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||| || |||||| | |||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  36921822 ataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagagatagaggggg-tgaaa-caagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtt 36921725  T
Q  526 tg-ctctt-ggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    || ||||| |||||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||    
T  36921724 tgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctggg 36921631  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  36921630 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaatccattgata 36921583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 379 - 727
Target Start/End: Original strand, 9022263 - 9022613
Alignment:
Q  379 atgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga---tagagggggct 475  Q
    |||||||||||  ||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||    |||||   ||||| |  |     
T  9022263 atgtatcttcaacgtgatatccattccaaatttatgtgttatatttctctataaatataaaccttgtatcagatgaaga--tgagagtgtagagagt-ca 9022359  T
Q  476 gaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgg-gaaac 574  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||    
T  9022360 gaaaacaagggtttagaagtcaacatcaaaactagggtttgtagagaatt--ctcttggcaacaaacactatggttgggattgattcaccttggagaaac 9022457  T
Q  575 actattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac--ccattgata-- 670  Q
    | ||||||||| || | | ||      |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||      
T  9022458 agtattaggatagaatttctt------ggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaagactaattcttgtaacctctattgatatc 9022551  T
Q  671 -----gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggt 727  Q
         |||||||| || || |||||||||||||  |||| |||||| ||||||| |||||||    
T  9022552 tctttgtaaagttactcatcattatagtggaacaaagggctgctctctcccccatattaggt 9022613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 9176803 - 9176564
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||   |||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  9176803 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtt 9176705  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    || ||||| | | ||| ||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||      |||||||||| |    
T  9176704 tgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgg------gaagagattgag 9176611  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  9176610 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 9176564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 427 - 639
Target Start/End: Original strand, 6132877 - 6133085
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||  ||||| |||| || ||| |||||| |||||||||| || |||||||||    
T  6132877 ctataaatatagacattgtatcggtgtaaacattgagatagaggaggctg--aacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtt 6132974  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || || |||||||||||||||| | ||   ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||| ||    
T  6132975 tgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgaga 6133068  T
Q  623 ctttgggtagaattagg 639  Q
    |||||||||||||||||    
T  6133069 ctttgggtagaattagg 6133085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 461 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 11006532 - 11006327
Alignment:
Q  461 gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggt 556  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||    
T  11006532 gagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 11006434  T
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattct 655  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||      ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  11006433 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt------ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattct 11006341  T
Q  656 tgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||    
T  11006340 tgtaacccattgat 11006327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 461 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 11008861 - 11008656
Alignment:
Q  461 gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggt 556  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||    
T  11008861 gagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 11008763  T
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattct 655  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||      ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  11008762 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt------ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattct 11008670  T
Q  656 tgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||    
T  11008669 tgtaacccattgat 11008656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 442 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 31849913 - 31849689
Alignment:
Q  442 ttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaaca 539  Q
    ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||    
T  31849913 ttgtatcagagcaaactaggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaca 31849815  T
Q  540 aacactaagattg---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaatt 636  Q
    ||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      | | ||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  31849814 aacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------gcttacgggaagaggctgagactttgggtagaatt 31849721  T
Q  637 aggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    | |   |||||||||||||||||||||||||||    
T  31849720 aag-cgggagacttattcttgtaacccattgat 31849689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 427 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 3937537 - 3937314
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  3937537 ctataaatatagacttt-tatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtatagagtt 3937440  T
Q  526 tgct-cttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || | ||||| ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||      ||| || ||||||||||| |     
T  3937439 tgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctctt------ggttacaggaagagattgagg 3937346  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattct 655  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  3937345 ctttgggtagaattagg-tgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 292 - 603
Target Start/End: Original strand, 53405001 - 53405312
Alignment:
Q  292 acgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnnncaaaagagatgtatcttcagt 391  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||         |||| | | |||| ||||||    
T  53405001 acgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaaaattatatttttgatgcaaatattctttcactaaaggagaaa------aaaaaaaacgtattttcagt 53405094  T
Q  392 gtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga---gggggctgaaaacaacggt 487  Q
    ||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| |||    ||||||| |||||| |||    
T  53405095 gtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctg-aaacaagggt 53405193  T
Q  488 ttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattagg 583  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||   |||||| |||| | ||   |||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  53405194 ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaag 53405292  T
Q  584 attgagtcttttggtcacgg 603  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  53405293 attgagtctcttggttacgg 53405312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 16932118 - 16931879
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  16932118 ctataaatataaaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-atacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtc 16932020  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    || ||||| | | ||||||||| | ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||      ||| |||||||||||||| |    
T  16932019 tgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctctt------ggttacgggaagagattgag 16931926  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  16931925 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 16931879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 555 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983513
Alignment:
Q  555 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattc 654  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgg------gaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttattt 31983634  T
Q  655 ttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgg 746  Q
    ||||||||| ||||||        ||||| || || || ||||||||||||||||||| |||||| | ||| | | ||||| ||| || ||| |||||||    
T  31983633 ttgtaaccctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctct-cccaatactaggtaagtattagaccaaactgg 31983535  T
Q  747 gtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  31983534 gtaaacaaatttcgtgtgttct 31983513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 496 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 26086236 - 26086069
Alignment:
Q  496 caacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 592  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26086236 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 26086137  T
Q  593 tttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattg 667  Q
     ||      ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  26086136 ctt------ggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattg 26086069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 427 - 772
Target Start/End: Original strand, 25357641 - 25357995
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag-----ggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatag 521  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||     |||||||||||||| |||||||||   ||||| ||| |||||||||  | ||    
T  25357641 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgagagagagtgagaggggctgaaaacaagggtttagaaacaaacaacaaa-ctagggttt--agag 25357737  T
Q  522 agtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    || || ||||  |    | |||||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||      ||||||||||||    
T  25357738 agatttctctaagtgggagacactagggttgtgattgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggtcatgg------gaagagattggg 25357831  T
Q  622 actttgggta----gaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgct 709  Q
    ||||||| ||    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||        |||||||| || || |||||||| |||||||  | ||||    
T  25357832 actttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatagctgct 25357931  T
Q  710 ctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaa-tttcgtgtgttctctct 772  Q
    || ||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  25357932 ctctcccctagactaggtcagtattggacctaactgggtaaacaaatttttgtgtgttctctct 25357995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 3824902 - 3824661
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt-----gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctata 520  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||   |||     ||||||||||||||||||| ||  |||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||    
T  3824902 ctataaatatagaccttgtatcagagtatttctttgagagagatagagggggctgaaa-ca--ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 3824806  T
Q  521 gagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagat 617  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||      
T  3824805 gagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctatt------ggttacgggaagaggc 3824712  T
Q  618 tgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  3824711 tgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 3824661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 7941323 - 7941565
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaacc--ttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagag 523  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7941323 ctataaatatagacgttgtatcagagcaaaccgggagagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 7941421  T
Q  524 tttg-ctcttggcaacaaa--cactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagatt 618  Q
    |||| |||||   | ||||  ||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| || |||||||  |    
T  7941422 tttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacaggaagaggct 7941515  T
Q  619 gggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  7941516 gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 7941565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 381 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 47211122 - 47210843
Alignment:
Q  381 gtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt------gagatagaggggg 473  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||      |||||||||||||    
T  47211122 gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagggagatagaggggg 47211023  T
Q  474 ctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttggga 571  Q
    ||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || | |          ||||||    
T  47211022 ctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg----------ttggga 47210934  T
Q  572 aacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||| ||       || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  47210933 aacactattaggattgagtctctt------agttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 47210843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 461 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 22783033 - 22782828
Alignment:
Q  461 gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggt 556  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||| | || |  |||    
T  22783033 gagatagagggggctgaaa-caggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggt 22782935  T
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattct 655  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  22782934 tgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgg------gaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattct 22782842  T
Q  656 tgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||    
T  22782841 tgtaacccattgat 22782828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 427 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 38270315 - 38270158
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  38270315 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaagaggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtt 38270217  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactatta 581  Q
    || || |||||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38270216 tgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 401 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 52942802 - 52942596
Alignment:
Q  401 gttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtat--cagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtc 496  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| | |    
T  52942802 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatatcagactaaactttgagatagagggg-ctgaaa-caagggtttagaaaggc 52942706  T
Q  497 aacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctt 593  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52942705 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 52942606  T
Q  594 ttggtcacgg 603  Q
    ||||| ||||    
T  52942605 ttggttacgg 52942596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 503 - 757
Target Start/End: Original strand, 36380429 - 36380686
Alignment:
Q  503 aaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtc 599  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || || || | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||        
T  36380429 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatctt---- 36380524  T
Q  600 acggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattata 691  Q
      ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||| || || ||||||    
T  36380525 --ggttaccggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattata 36380621  T
Q  692 gtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||||  ||||||   |||||||||||||||||    
T  36380622 gtggaactgagtgctgctctctcccccagactaggtca-atttggagcgaactgggtaaacaaatt 36380686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 427 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 18409675 - 18409338
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18409675 ctataaatatagaatttgtatcagtgtaaacaatgagatagagagg-ctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 18409578  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || | ||||||||||||||||| | || |  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||       || |  ||||||||||| ||    
T  18409577 tgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctctt------agttataggaagagattgaga 18409484  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    |||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||        || ||||| |  || ||||||||| ||| ||| |||||||| ||    
T  18409483 cttttggtagaattagg-cgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgt-aagttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctctc 18409386  T
Q  715 ccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgt 763  Q
    || |||| |||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18409385 cctcagactaggtca-atttggattgaactgggtaaacaaatttcgtgt 18409338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 461 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 22780668 - 22780463
Alignment:
Q  461 gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggt 556  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||| | || |  |||    
T  22780668 gagatagagggggctgaaa-caggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggt 22780570  T
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattct 655  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||      ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  22780569 tgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctctt------ggttacgggaagagattgggacttttggtagaattagg-cgggagacttattct 22780477  T
Q  656 tgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||    
T  22780476 tgtaacccattgat 22780463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 427 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 24446908 - 24446756
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||     ||||||||||| |||||||||    
T  24446908 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaac-----aactagggtttgtatagagtt 24446815  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactatta 581  Q
    || ||||||| ||| ||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446814 tgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 270 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 38890610 - 38890478
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaaggg-aatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnn 368  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||          
T  38890610 atatttttgtattgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaaatattatatttttgatgcaaatattctttcactaaaggagaaa--- 38890514  T
Q  369 nncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaa 407  Q
       |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38890513 ---aaaagaaatgtatcttcaatgtgatattcgttccaa 38890478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 554 - 670
Target Start/End: Original strand, 16455375 - 16455484
Alignment:
Q  554 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttatt 653  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  16455375 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttatt 16455467  T
Q  654 cttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||| ||||||||    
T  16455468 cttgtaactcattgata 16455484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 559 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 3982374 - 3982156
Alignment:
Q  559 attcaccttgg-gaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggtttggagacttattctt 656  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||      ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  3982374 attcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgg------gaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattctt 3982281  T
Q  657 gtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggt 748  Q
    ||||| | ||||||        |||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||| || | ||||||| | ||||||  |||  |||    
T  3982280 gtaacactttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcatactaggtcactattggaccgaacaaggt 3982181  T
Q  749 aaacaa-atttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||    
T  3982180 aaacaatttttcatgtgttctctct 3982156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 503 - 602
Target Start/End: Original strand, 10114412 - 10114509
Alignment:
Q  503 aaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacg 602  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10114412 aaaactagggtttgta--gagtctgctcttggcaacaaacactagggttgggattgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 10114509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 427 - 527
Target Start/End: Original strand, 2891320 - 2891421
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgta-tcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagt 524  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2891320 ctataaatatagacattgtaatcagtgtaaaccttaagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 2891418  T
Q  525 ttg 527  Q
    |||    
T  2891419 ttg 2891421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 562 - 670
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891534
Alignment:
Q  562 caccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||      |||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg------gaagagattgagactttgggtagaattagg-caggagacttgttcttgtaac 2891525  T
Q  662 ccattgata 670  Q
    |||||||||    
T  2891526 ccattgata 2891534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 671 - 772
Target Start/End: Original strand, 22295416 - 22295517
Alignment:
Q  671 gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctct 770  Q
    |||||||| || || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| | |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22295416 gtaaagttactcatcattatagtggaatggagaattgctctctcccccacactagggcagtattggactgaactgggtaaacaaatttcatgtgttctct 22295515  T
Q  771 ct 772  Q
    ||    
T  22295516 ct 22295517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 662
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499280
Alignment:
Q  506 actagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacg 602  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |  |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacg 27499227  T
Q  603 gtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 662  Q
     |      ||||||||| | ||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||||    
T  27499228 at------aagagattgaggctttgggtataattagg-cgggagacttatttttgtaacc 27499280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 568 - 670
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547397
Alignment:
Q  568 gggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattg 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||      |||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||    
T  13547302 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg------gaagagattgagactttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaactcattg 13547394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 602 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 5336939 - 5336882
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5336939 ggtcacgggaagagattgggactt-gggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 5336882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 528 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 38208910 - 38208836
Alignment:
Q  528 ctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtcttttggtcac 601  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38208910 ctcttggcaacaaacactagggttgagattgattcatcttggagaaacactattaagattgagtcttttggtcac 38208836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 574 - 661
Target Start/End: Original strand, 16489352 - 16489432
Alignment:
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16489352 cactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagagactgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 16489432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 661
Target Start/End: Original strand, 4570119 - 4570177
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4570119 ggtcacgggaagaggttgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 4570177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 571 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050356
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7050439 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 7050356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 606 - 757
Target Start/End: Original strand, 4215486 - 4215642
Alignment:
Q  606 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaa 697  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||        |||| ||| || || | ||||||||||    
T  4215486 acgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaa 4215583  T
Q  698 cggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    |||| || |||||| ||||||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  4215584 cggatggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 4215642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 686 - 772
Target Start/End: Original strand, 10114583 - 10114669
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    |||||||| ||||| || | |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||  || | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  10114583 attatagttgaacgaagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattaggtaaacaaatttcatgtgttctctct 10114669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 574 - 659
Target Start/End: Original strand, 25699752 - 25699830
Alignment:
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgta 659  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  25699752 cactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagagactgggactttgg-tagaattaggtttgaagactgattcttgta 25699830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 383 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 54929048 - 54928982
Alignment:
Q  383 atcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctctataaatatagacattgtatca 449  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  54929048 atcttcagcgtgatattcgtttcaaatttacgagttatatttctctataactataaaccttgtatca 54928982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 387 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 29609814 - 29609684
Alignment:
Q  387 tcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctctataaa----tatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggggctgaaaac 481  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    ||||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||| |||  |||||    
T  29609814 tcagcgtgatattcgttccaaatttatgagt--tatttctctataaatatttatagaccttgtataagatttaaaccttgagagagaggtggc-aaaaac 29609718  T
Q  482 aacggtttagaagtcaacaagaaaactagggttt 515  Q
    || |||||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  29609717 aagggtttataagccaacactaaaactagggttt 29609684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 574 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556158
Alignment:
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4556238 cactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactttgg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 4556158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 574 - 661
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558394
Alignment:
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4558314 cactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 4558394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 666
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853637
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  11853549 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt 11853637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 574 - 661
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317041
Alignment:
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15316961 cactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 15317041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 574 - 661
Target Start/End: Original strand, 31300427 - 31300507
Alignment:
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31300427 cactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 31300507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 687 - 758
Target Start/End: Original strand, 26557852 - 26557923
Alignment:
Q  687 ttatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaattt 758  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||| || |||||| ||||||  |||| |||||||||||||    
T  26557852 ttatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaagtcagtattggaccgaactaggtaaacaaattt 26557923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 476 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 52043659 - 52043567
Alignment:
Q  476 gaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttggg 570  Q
    |||||||| |||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||  |||||| |||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  52043659 gaaaacaagggtttagaagccaacatcaaaactaaggtttgta--gagttttctcttgtcagcaaacactagggttgggattgattcaccttggg 52043567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 620 - 669
Target Start/End: Original strand, 11437557 - 11437605
Alignment:
Q  620 ggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  11437557 ggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgat 11437605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 663
Target Start/End: Original strand, 16638852 - 16638912
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 663  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16638852 ggtcacaggaagagattgagactt-gggtagaatgaggtttgaagactgattcttgtaaccc 16638912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 556 - 670
Target Start/End: Original strand, 54906722 - 54906832
Alignment:
Q  556 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgg-gactttgggtagaattaggtttggagacttatt 653  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |      |||||||||   |||||| |||||||||||||||| ||||| |||    
T  54906722 ttgattcaccatggagaaacactattagaattgagtctcttggtcactg------gaagagattcaagactttaggtagaattaggtttgaagactgatt 54906815  T
Q  654 cttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||| | ||||||    
T  54906816 cttgtaactctttgata 54906832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 671 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 3578753 - 3578662
Alignment:
Q  671 gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgt 763  Q
    |||||||| || || |||||||||||| |||| | || ||| ||||||||| |||| |||| || |||  |||||||||||||||||||||||    
T  3578753 gtaaagttactcatcattatagtggaatggagagctg-tctctcccccagactaggccagtattagaccgaactgggtaaacaaatttcgtgt 3578662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 686 - 770
Target Start/End: Original strand, 4884988 - 4885071
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctct 770  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4884988 attatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa-ttcttgtgttctct 4885071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 621 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635567
Alignment:
Q  621 gactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  5635614 gactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgat 5635567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 574 - 657
Target Start/End: Original strand, 8529270 - 8529346
Alignment:
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttg 657  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8529270 cactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttg 8529346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 574 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 16689119 - 16689039
Alignment:
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16689119 cactattaggattgagtctcttggtcacag------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 16689039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 686 - 757
Target Start/End: Original strand, 8529381 - 8529452
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||||    
T  8529381 attatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 8529452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 427 - 466
Target Start/End: Original strand, 36380378 - 36380417
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagata 466  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36380378 ctataaatatggactttgtatcagagtaaaccttgagata 36380417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 622 - 668
Target Start/End: Original strand, 2880972 - 2881018
Alignment:
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga 668  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  2880972 actttcggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaaccctttga 2881018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 686 - 768
Target Start/End: Original strand, 15831255 - 15831337
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||| ||||||||| || ||||||||    
T  15831255 attatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaatatcttgtgttct 15831337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 686 - 756
Target Start/End: Original strand, 16631297 - 16631367
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaat 756  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| ||||||||| |||||||   || ||||||||||||||| |||||    
T  16631297 attatagtggaacggagagctactctctcccccagagtaggtcataattagactaaactgggtaatcaaat 16631367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 38209044 - 38208986
Alignment:
Q  393 tgatattcgttccaaatttataagttatatttctctataaatatagacattgtatcaga 451  Q
    |||||| | ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  38209044 tgatatccattccagatttatgagttatatttctttataaatataaactttgtatcaga 38208986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 624 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 52942594 - 52942549
Alignment:
Q  624 tttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942594 tttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgata 52942549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 624 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 13072117 - 13072080
Alignment:
Q  624 tttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13072117 tttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 13072080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 688 - 757
Target Start/End: Original strand, 40637342 - 40637410
Alignment:
Q  688 tatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  40637342 tatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 40637410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 47211199 - 47211158
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatat 311  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  47211199 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatat 47211158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 54929151 - 54929094
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatatt 327  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  54929151 atatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaataggaatatt 54929094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 105)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 383 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 6661555 - 6661168
Alignment:
Q  383 atcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaaca 482  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  6661555 atcttcagtgttatatccgtttcaaatttatgagttatatttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggttgaaa-ca 6661457  T
Q  483 acggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattag 582  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6661456 agggtttagaagtcaacaagaaaattagggtatgtatagagtttgttcttggcaacaaacactagagttggggttgattcaccatgggaaacactattag 6661357  T
Q  583 gattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaa 674  Q
    |||||||||| ||      ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||        ||||    
T  6661356 gattgagtctctt------ggtcacgggaagaaattgagattttgggtacaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 6661264  T
Q  675 agttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctct 770  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| |||| |||| |||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6661263 agttgctcataattatagtggaacggatgactgctctctccctcagactaggtcagatttggaccgaactggataaacaaatttcgtgtgttctct 6661168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 270 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 18511693 - 18511302
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  18511693 atatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaga------ 18511600  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctc-tataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga--ta 466  Q
      |||| | | ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||  ||    
T  18511599 --aaaaaaaacgtatctttagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttaatataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagata 18511502  T
Q  467 gagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattc 562  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || |  |||||||||    
T  18511501 gagggggctgaaa-caagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattc 18511403  T
Q  563 accttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  18511402 accttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgggactttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc 18511310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 303 - 757
Target Start/End: Original strand, 40221349 - 40221805
Alignment:
Q  303 caaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnnncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgt 402  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||         | || | | |||||||||||||||||| |||    
T  40221349 caaatatattttgaaaaggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgcaggagaaggaaaaaacaaaaaacgtatcttcagtgtgatatccgt 40221448  T
Q  403 tccaaatttataagttatatttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaa 501  Q
    || |||||||| |||||  |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||    
T  40221449 tctaaatttatgagttactttta-ctataaatatagacattgactcagagtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaatggcaacaa 40221546  T
Q  502 gaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggt 598  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||       
T  40221547 caaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt--- 40221643  T
Q  599 cacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattat 690  Q
       ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||        |||||||| || || |||||    
T  40221644 ---ggttacaggaagagattgggacttttggtagaattagg-cggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 40221739  T
Q  691 agtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  40221740 agtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 40221805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 270 - 729
Target Start/End: Original strand, 18596446 - 18596901
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||| ||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||           
T  18596446 atatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatacaaatattctatcactgaaggagaa----- 18596540  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18596541 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgggataga 18596638  T
Q  469 gggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcacc 565  Q
    |||||||| |||||| ||| || ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| || | ||   |||||||||||||    
T  18596639 gggggctg-aaacaagggtata-aagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcacc 18596736  T
Q  566 ttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccat 665  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||||| |||    
T  18596737 ttggaaaacactgttaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttatttttgtaactcat 18596829  T
Q  666 tgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtca 729  Q
    |||||        |||||||| || || |||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| |||||||    
T  18596830 tgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcctccagactaggtca 18596901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 18466482 - 18466872
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||           
T  18466482 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactaaaggag------- 18466574  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga---- 464  Q
       ||| | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||        
T  18466575 ---aaaaaaaagtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatatttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 18466671  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgat 560  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||    
T  18466672 tagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgat 18466770  T
Q  561 tcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  18466771 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacggaaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 18466863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 270 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 18509798 - 18509408
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  18509798 atatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaga------ 18509705  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | |||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | |    
T  18509704 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcatcccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagata 18509607  T
Q  469 g-ggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattca 563  Q
    | |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || |  ||||||||||    
T  18509606 gaggggctgaaa-caagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattca 18509508  T
Q  564 ccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| |    
T  18509507 ccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagaatgggactttgggtagaattaag-cgggagacttattcttgtaactc 18509415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 18468807 - 18469199
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  18468807 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaga------ 18468900  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt----gaga 464  Q
      |||  | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||   ||||| ||    ||||    
T  18468901 --aaataaaaagtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatgataaactttgagagaga 18468998  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgat 560  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||   ||||||||    
T  18468999 tagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgat 18469097  T
Q  561 tcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  18469098 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaa 18469190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 25803816 - 25804213
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  25803816 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaga------ 25803909  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacct--------- 459  Q
      |||| | | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||  ||||  |             
T  25803910 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtaatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaatttgagagagag 25804007  T
Q  460 tgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--gggg 555  Q
     |||||||||||||||  |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||   |||    
T  25804008 agagatagagggggct-caaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggg 25804106  T
Q  556 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattct 655  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  25804107 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattct 25804199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 27912328 - 27912724
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  27912328 atatttttgtatcgtatgaaaaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa---- 27912423  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt------ga 462  Q
      |||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||      ||    
T  27912424 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 27912521  T
Q  463 gatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttg 558  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| | || | ||   ||||||    
T  27912522 gatagagggtgctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttg 27912620  T
Q  559 attcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgt 658  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||| ||||||  || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  27912621 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 27912713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 27910244 - 27910638
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  27910244 atatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaa----- 27910338  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt------ga 462  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||      ||    
T  27910339 --aaaaaaaaagtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggttaaactttgagagaga 27910436  T
Q  463 gatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttga 559  Q
    ||||| |||||||| |||||| | || | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||   |||||||    
T  27910437 gatagcgggggctg-aaacaaggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttga 27910535  T
Q  560 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgta 659  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||      ||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  27910536 ttcaccttgggaaacactattaggattgaatctctt------ggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 27910628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 270 - 670
Target Start/End: Original strand, 26097530 - 26097921
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaa--agggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnn 367  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||         
T  26097530 atatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaagaaggaaatgttatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagga--- 26097626  T
Q  368 nnncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagata 466  Q
        |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  26097627 ----aaaaaaaatgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaactttgagata 26097722  T
Q  467 gagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattc 562  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||   ||||||||||    
T  26097723 gagggggctg-aaataaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattc 26097821  T
Q  563 accttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 662  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||      ||| ||||||| |   ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||     
T  26097822 acctt-ggaaacactattaggaatgagtctctt------ggttacgggaaaatgctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaact 26097913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 427 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 31472942 - 31472636
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31472942 ctataaatatggacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggct-aaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 31472844  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||| ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||    
T  31472843 tgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggtcacgggaagagattggga 31472750  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    |||| ||||||||||||   |||  | | ||||| |||||||||||||        |||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  31472749 cttttggtagaattagg-cgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctc 31472651  T
Q  715 ccccagattaggtca 729  Q
    ||||| | |||||||    
T  31472650 ccccatactaggtca 31472636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 270 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 26098732 - 26098401
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||| ||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||| ||||| ||           
T  26098732 atatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatacaaaaattctttcattgaaggagaaat--- 26098636  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
       ||| | | ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||| || | |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26098635 ---aaaaaaacgtatcttcaatgtggtattcgttccaattttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagataga 26098539  T
Q  469 gggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcac 564  Q
    |||||||| ||| || ||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||||||    
T  26098538 gggggctg-aaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 26098440  T
Q  565 cttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacgg 603  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  26098439 cttgacaaacactattatgattgagtctcttggttacgg 26098401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 15552034 - 15552434
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  15552034 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatgacatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaa----- 15552128  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt-------- 460  Q
      |||| | | |||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||            
T  15552129 --aaaaaaaacgtatcttcagcgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 15552226  T
Q  461 --gagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt-gctcttggcaacaaacactaagatt--ggg 554  Q
      |||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||| | | ||||||||| | ||   ||    
T  15552227 gagagatagaggggactg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgg 15552325  T
Q  555 gttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttatt 653  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||      | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  15552326 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt------gattacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatt 15552418  T
Q  654 cttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||    
T  15552419 cttgtaacccattgat 15552434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 476 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 17413443 - 17413181
Alignment:
Q  476 gaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaaca 575  Q
    |||||||| |||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17413443 gaaaacaagggtttagaaggcagcactaaaactatggtttgta--gagtttgctcttggcaacaaacactagggttgggattgattcaccttgggaaaca 17413346  T
Q  576 ctattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata----- 670  Q
    ||||||||||||||||| ||      ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||         
T  17413345 ctattaggattgagtctctt------ggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctct 17413252  T
Q  671 ---gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggac 738  Q
       |||||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||||||    
T  17413251 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctctcccccagagttggtcagtgttggac 17413181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 430 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 34530992 - 34530756
Alignment:
Q  430 taaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctatagagtttg- 527  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  34530992 taaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 34530894  T
Q  528 ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactt 625  Q
    ||||||||||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||  ||||||||||||| ||||||    
T  34530893 ctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggctacgggaagagattaggactt 34530800  T
Q  626 tgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    || |||||||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34530799 tgagtagaattagg-cgggagatttattcttgtaactcattgata 34530756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Original strand, 36208530 - 36208858
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||  |||||||||||| || |||| ||    
T  36208530 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaacaaacaa-caaactagggttt-tagagagatt 36208627  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
     ||||  ||   | | |||| | |||  ||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||      ||| |||||||||||||| ||||||    
T  36208628 tctctaagcgggagaaactagggttgttgttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctctt------ggtaacgggaagagattgagacttt 36208721  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttccccc 718  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        |||||||| || || ||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||    
T  36208722 gggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctcttt-cccc 36208820  T
Q  719 agattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    | | |||||||  |||||||  |||||||||||||||||    
T  36208821 atactaggtca-atttggaccgaactgggtaaacaaatt 36208858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 422 - 670
Target Start/End: Original strand, 39854429 - 39854672
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctata 520  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||    
T  39854429 tttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39854526  T
Q  521 gagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagat 617  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||| ||| |||||||||||     
T  39854527 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc------tcatggttacgggaagagac 39854620  T
Q  618 tgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854621 tggaactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 39854672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 422 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 10529433 - 10529190
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctata 520  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||| ||| ||||    
T  10529433 tttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagtgggttgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttttata 10529335  T
Q  521 gagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagat 617  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||||    
T  10529334 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagat 10529241  T
Q  618 tgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  10529240 tggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 10529190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 25904053 - 25904292
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||    
T  25904053 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtatagagtt 25904151  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||||| ||     
T  25904152 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattaggg 25904245  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25904246 ctttgagtataattagg-cgggagacttattcttgtaacacattgata 25904292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 37706109 - 37705870
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||| |||| | ||| ||||||||| |||||| ||    
T  37706109 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaataaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgtatagactt 37706011  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||||||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||| ||||||||| ||     
T  37706010 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgtgaagagattaggg 37705917  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
     ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37705916 ttttggatagaattagg-tgggagacttattcttgtaacccattgata 37705870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 461 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 34477349 - 34477050
Alignment:
Q  461 gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggt 556  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||    
T  34477349 gagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 34477251  T
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattct 655  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477250 tgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgg------gaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattct 34477157  T
Q  656 tgtaacccattga-------tagtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggt 748  Q
    |||||||||||||       | |||| ||| || || | ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||||  ||||||||    
T  34477156 tgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggt 34477059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 39398321 - 39398083
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  39398321 ctataaatataaacattgtaccggtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 39398224  T
Q  526 tg-ctctt-ggcaacaaacactaagattg-gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||| |||||||||| |    
T  39398223 tgtctctttggcaacaaacactaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacggaaagagattggaa 39398130  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||    
T  39398129 ctttgggtagaattagg-cagtagacttattcttgtaacccattgata 39398083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Original strand, 17072833 - 17073166
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17072833 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 17072931  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||      ||| | ||||||||||||||     
T  17072932 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctctt------ggttaggggaagagattgggg 17073025  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    |||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||        |||| ||| || || ||||||||  ||||||||| |||||| ||    
T  17073026 ctttcgatagaattagg-cggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctc 17073124  T
Q  715 ccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||| | |||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  17073125 ccccagactcggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 17073166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 427 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 31179700 - 31179464
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31179700 ctataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggagctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 31179602  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    || ||||| | | ||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||      ||| ||||||||||||||||    
T  31179601 tgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt------ggttacgggaagagattggg 31179508  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  31179507 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccatt 31179464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Original strand, 2174869 - 2175200
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||| || | ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2174869 ctataaatacaggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 2174967  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||      ||| ||||||||||  |||||    
T  2174968 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctctt------ggttacgggaagaggctggga 2175061  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga-------tagtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcc 715  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||       | |||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  2175062 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttacttatca-tatagtggatcggagggctgctctctcc 2175159  T
Q  716 cccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    |||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  2175160 cccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 2175200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 427 - 639
Target Start/End: Original strand, 20044960 - 20045169
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20044960 ctataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagacagagggggctgaaa-caagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 20045058  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||||||||||||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     || ||||||||||||||||    
T  20045059 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggt-----tc-cgggaagagattggga 20045152  T
Q  623 ctttgggtagaattagg 639  Q
    |||||||||||||||||    
T  20045153 ctttgggtagaattagg 20045169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 31545030 - 31545269
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31545030 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataaagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 31545128  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||      ||| ||||||||| ||||||    
T  31545129 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattagagtctctt------ggttacgggaagaaattggg 31545222  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  31545223 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 31545269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 38882055 - 38882294
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagaggggg-ctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagt 524  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  38882055 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaggggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 38882153  T
Q  525 ttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||    
T  38882154 ttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctggg 38882247  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  38882248 actttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgat 38882294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 25921802 - 25921564
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  25921802 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 25921704  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  |||||    
T  25921703 tgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctggga 25921610  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    || ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||    
T  25921609 ctctgggtagaattagg-cggaagacttattcttgtaacccattgat 25921564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Original strand, 21947977 - 21948308
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21947977 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggg-ctgaaa-caagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 21948074  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| | ||||||||  |||||    
T  21948075 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttatgggaagaggctggga 21948168  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||        |||| ||| || || | ||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  21948169 ctttgggtggaattagg-cgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 21948266  T
Q  715 ccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| |||||||| ||||||||    
T  21948267 ccccagactaggtca-atttggactgaactgggtcaacaaatt 21948308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 10586638 - 10587020
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  10586638 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaa----- 10586732  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| |||    
T  10586733 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 10586830  T
Q  469 ---gggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattc 562  Q
        ||||||| |||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||| | |        || |||| |||||||  || | ||   ||||||||||    
T  10586831 tagaggggctg-aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtct--------ct-ttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattc 10586920  T
Q  563 accttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 662  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||      | | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  10586921 accttgggaaacactattaggattcagtctctt------gcttacggaaagagattgagactttgggtagaattagg-caggagacttattcttttaacc 10587013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 31542685 - 31542923
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31542685 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 31542783  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||      ||| ||||||||||||||||    
T  31542784 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt------ggttacgggaagagattggg 31542877  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||| | |||||||||||    
T  31542878 actttgggtagaattagg-cgggagacttattctcg-aacccattgat 31542923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 4236579 - 4236817
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||| |||  |||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4236579 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaa-caagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 4236677  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  |||||    
T  4236678 tgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctggga 4236771  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  4236772 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 4236817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 461 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 34479714 - 34479415
Alignment:
Q  461 gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggt 556  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||    
T  34479714 gagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 34479616  T
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattct 655  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479615 tgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacag------gaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattct 34479522  T
Q  656 tgtaacccattga-------tagtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggt 748  Q
    |||||||||||||       | |||| ||| || || | ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||||  ||||||||    
T  34479521 tgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggt 34479424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Original strand, 9020172 - 9020502
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||| | || |||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||| | || |||||  |||| |||||||| |||||||||    
T  9020172 ctataaatacataccttgtatcagatgtaaaccttgtgctagagggagctgaaaacaagggtttgggaggcaacac-aaaagtagggtttgtatagagtt 9020270  T
Q  526 tgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactt 625  Q
     |||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||      |||||||||||||||||||  |||    
T  9020271 -gctcttggcaacaaacactagggttgaagttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttctt------ggtcacgggaagagattggagctt 9020363  T
Q  626 tgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccc 717  Q
    ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||        ||||| || || || ||||||||||| |||| || |||||| ||| |    
T  9020364 tgggtagaattagg-cggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggatcggatggctgctctctcctc 9020462  T
Q  718 cagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    || |||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||    
T  9020463 caaattaggtctgttttggaccgaactggataaaccaatt 9020502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Original strand, 24126806 - 24127138
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24126806 ctataaatatagacattatatcagtgtaaaccttgagatagatggggctg-aaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 24126904  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || |||||| ||||||| |||| | || |  | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||      ||| |||||||||||||||||    
T  24126905 tgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctctt------ggttacgggaagagattggga 24126998  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    |||||||||||||||||     ||||||||||||||||| ||||||||        |||| ||| || || | ||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  24126999 ctttgggtagaattagg-cgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 24127096  T
Q  715 ccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  24127097 ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 24127138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 427 - 638
Target Start/End: Original strand, 20043000 - 20043208
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20043000 ctataaatataggctttgtatcatagcaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 20043098  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||| ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||| ||    
T  20043099 tgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgaga 20043192  T
Q  623 ctttgggtagaattag 638  Q
    |||||| |||||||||    
T  20043193 ctttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 427 - 638
Target Start/End: Original strand, 42770724 - 42770924
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||  |||| |||| ||| |||||| |||    
T  42770724 ctataaatataaactttgtatc-gagtaaaccttgagatagaggggactgaaaacaagggtttggaaggcaacac-aaaattagg-tttatatagaattt 42770820  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||| ||      |||||||||||||||||| ||||||    
T  42770821 gctcttggcaacaaacactaaggttggggttcattcaccatgggaa--actattaggactgagtctctt------ggtcacgggaagagattgagacttt 42770912  T
Q  627 gggtagaattag 638  Q
    ||||||||||||    
T  42770913 gggtagaattag 42770924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 1189943 - 1189604
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgaga----tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctata 520  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||| |||  |||||||| | |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  1189943 ctataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaa-caagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggtttgtata 1189845  T
Q  521 gagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagat 617  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||      ||| || |||||||||    
T  1189844 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctctt------ggttacaggaagagat 1189751  T
Q  618 tgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgct 709  Q
    || |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||        |||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1189750 tgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagggatgct 1189652  T
Q  710 ctttcc-cccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    || ||| |||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  1189651 ctctcctcccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 1189604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 427 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 12556252 - 12556079
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||| | |||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  12556252 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctg-aaataagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtt 12556154  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttgg 597  Q
    || ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12556153 tgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttgg 12556079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 10474652 - 10474413
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||| ||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  10474652 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgaaatagagggggctg-aaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 10474554  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||  | ||   |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||      ||| || ||||||||||||||    
T  10474553 tgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctctt------ggttacaggaagagattggga 10474460  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10474459 ctttgagtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgata 10474413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 431 - 662
Target Start/End: Original strand, 16776112 - 16776339
Alignment:
Q  431 aaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-c 528  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  16776112 aaatatagaccttgtatctgagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttacaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 16776210  T
Q  529 tcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
    |||| | || |||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  |||||||||    
T  16776211 tctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgggacttt 16776304  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 662  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  16776305 gggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc 16776339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 427 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 2818665 - 2818427
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  2818665 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactatggtttgtatagagtt 2818567  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt---ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||      ||| ||||||| ||  ||||    
T  2818566 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgattgagtctctt------ggttacgggaaaaggctggg 2818473  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga 668  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||    
T  2818472 actttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaactcattga 2818427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 461 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 16092495 - 16092292
Alignment:
Q  461 gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggt 556  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| | || |  |||    
T  16092495 gagatagagggggttgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggt 16092397  T
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattctt 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  16092396 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattctt 16092304  T
Q  657 gtaacccattga 668  Q
    ||||||||||||    
T  16092303 gtaacccattga 16092292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 270 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 3373521 - 3373332
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||           
T  3373521 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaaggagaa----- 3373427  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagat 465  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||    
T  3373426 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 3373332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 496 - 669
Target Start/End: Original strand, 6745088 - 6745256
Alignment:
Q  496 caacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattg-gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctt 593  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6745088 caacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 6745187  T
Q  594 ttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||      ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  6745188 tt------ggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 6745256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 556 - 772
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143765
Alignment:
Q  556 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattct 655  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||      ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtc------acgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattct 15143640  T
Q  656 tgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactggg 747  Q
    |||||||| ||||||        |||||||| || || ||||||||||||||| | | |||| | ||||| ||| ||||||||| || |||  || ||||    
T  15143641 tgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtcagtatttgaccgaaatggg 15143740  T
Q  748 taaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15143741 taaacaaatttcgtgtgttctctct 15143765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 464 - 757
Target Start/End: Original strand, 20053834 - 20054119
Alignment:
Q  464 atagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattca 563  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||  |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  20053834 atagagggcgctgaaa-caagggtttagaaggcaacacaaaaactagagtttatataaagtttgctcttggcaacaaacactagggttgaggttgattca 20053932  T
Q  564 ccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||              ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20053933 ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt-----------ttggagattgggactttaagtagaattagg-tgggagacttattcttgtaaccc 20054020  T
Q  664 -----attgatagtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
          |   | |||||||| || || |||||||| ||||||| || |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  20054021 gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggaccgaactgcgtaaacaaatt 20054119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 422 - 669
Target Start/End: Original strand, 6747249 - 6747493
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt--gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttcta 518  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||      ||||||||||||||||||| ||| |||||||||   |||||| |||||||| |||| ||    
T  6747249 tttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaagagaaagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttgta 6747347  T
Q  519 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattg-gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagaga 616  Q
    || | |||| ||||| | ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||    
T  6747348 taaaatttgtctctttgaaacaaacactaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaga 6747441  T
Q  617 ttgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
     ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||    
T  6747442 ctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaactcattgat 6747493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 402 - 661
Target Start/End: Original strand, 6756419 - 6756674
Alignment:
Q  402 ttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaac 499  Q
    |||||||||| ||||||||| || | |||| ||||||||  |||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||||    
T  6756419 ttccaaattt-taagttatacttttactattaatatagatcttgtatcatattaaactttgagatagagggagctgaaa-caatggtttagaaaggcaac 6756516  T
Q  500 aagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttg 596  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  6756517 aacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactattaggattgagtatctt- 6756615  T
Q  597 gtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
         ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  6756616 -----ggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 6756674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 36402657 - 36402418
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||  |  |||||||||||| |||||||||    
T  36402657 ctataaatatagaccttatatcagagtaaacgttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaatgacaatcacgaaactagggtttgtatagagtt 36402559  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||      ||| |||||| |||||||| |    
T  36402558 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaatctctt------ggttacgggaggagattggaa 36402465  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  36402464 ctttgggtaaaattagg-ctggagacttattattgtaatccattgata 36402418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 428 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 17818817 - 17818580
Alignment:
Q  428 tataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||| ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||     
T  17818817 tataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagaaaga-ggggctg-aaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttc 17818720  T
Q  527 g-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggac 623  Q
    | ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||      ||| |||||||||||||| | |    
T  17818719 gtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagactgagtctctt------ggttacgggaagagattgaggc 17818626  T
Q  624 tttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17818625 tttgggtagaattatg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 17818580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Original strand, 695839 - 696160
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||          
T  695839 ctatgaatatagacattgtatgagtgtaaaccttgagataaagggggatgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat------ 695931  T
Q  526 tgctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggac 623  Q
        ||| | ||||||||||| | || |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||      |||||||||| |||    
T  695932 ----ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgg------gaagagattgagac 696020  T
Q  624 tttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcc 715  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||  | || ||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  696021 tttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcc 696119  T
Q  716 cccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||  ||||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  696120 cccagacaaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 696160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 31466307 - 31466069
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa--gtcaacaagaaaactagggtttctatagagt 524  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||| ||| |||||| ||  || ||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  31466307 ctataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataaaaggggctgaaa-caaaggtttaaaaaagt-aacgacaaaactagggtttgtatagagt 31466210  T
Q  525 ttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    ||| ||||||| ||||||||| | | || |  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||      ||||||||| ||    
T  31466209 ttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttggttacgg------gaagagatttgg 31466116  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||    
T  31466115 actttgggtagaattagg-cgggagac-tattcttgtaacccattgata 31466069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 272 - 483
Target Start/End: Original strand, 15143293 - 15143496
Alignment:
Q  272 atttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnnnc 371  Q
    ||||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||||| ||||||||||||             
T  15143293 atttttgtaccatatgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt-------tgatgcaaatattctttcactgaagaaggggaa---- 15143381  T
Q  372 aaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatag--a 468  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  |    
T  15143382 aaaagaaacgtatcttcagcgtgatatccgttacaaatttatgagttatatttctctataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagata 15143481  T
Q  469 gggggctgaaaacaa 483  Q
    || ||||||||||||    
T  15143482 ggaggctgaaaacaa 15143496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 477 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 2144841 - 2144661
Alignment:
Q  477 aaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaa-acactaagattggggttgattcaccttgg-gaaac 574  Q
    ||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||    
T  2144841 aaaacaagggtttagaagccaacactaaaactagggtt--tgtagagtttgctcttggcaacaacacactagggttgggattgattcaccttggagaaac 2144744  T
Q  575 actattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 662  Q
    ||||||||||| |||||| ||      |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2144743 actattaggatggagtctctt------ggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgtaacc 2144661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 571 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 15445453 - 15445248
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||   ||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||    
T  15445453 aaacactgttaggattgagtctcttgg---cggccacatgaagagattgagactttgagtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccctttgata 15445357  T
Q  671 --------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtg 762  Q
            |||||||| || || |||||||||||||| |||| |||||| | ||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15445356 tctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctcttccc-agactaggtcagtattggactgaactgggtaaacaaatttcgtg 15445258  T
Q  763 tgttctctct 772  Q
    |||| |||||    
T  15445257 tgttttctct 15445248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 461 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 21684746 - 21684542
Alignment:
Q  461 gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattg--gggt 556  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||   ||||    
T  21684746 gagatagagggggctgaaa-caagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggt 21684648  T
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattctt 656  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||||    
T  21684647 tgattcgccttgggatacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattagg-caggagacttattctt 21684555  T
Q  657 gtaacccattgat 669  Q
    ||||| |||||||    
T  21684554 gtaactcattgat 21684542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 477 - 662
Target Start/End: Original strand, 4754158 - 4754335
Alignment:
Q  477 aaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacac 576  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||  || |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||  ||||||    
T  4754158 aaaacaagggtttaaaagccaacacaaacactagggtttgta--gagtttgctcttggcaacaaacactagggttgagattgattcaccttgaaaaacac 4754255  T
Q  577 tattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 662  Q
    |||||| |||||| || ||      |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  4754256 tattagaattgagcctctt------ggtcactggaagagattgtgactttggatagaattaggtttgaaggctaattcttgtaacc 4754335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 553 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 20506041 - 20505931
Alignment:
Q  553 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttat 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  20506041 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttat 20505949  T
Q  653 tcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  20505948 tcttgtaacacattgata 20505931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 553 - 669
Target Start/End: Original strand, 39798126 - 39798235
Alignment:
Q  553 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttat 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  39798126 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattagg-cgggagacttat 39798218  T
Q  653 tcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||    
T  39798219 tcttgtaacccattgat 39798235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 503 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 658606 - 658443
Alignment:
Q  503 aaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtc 599  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||     
T  658606 aaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctcttggtt 658507  T
Q  600 acggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||      ||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  658506 acgg------gaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgata 658443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 429 - 670
Target Start/End: Original strand, 2954368 - 2954606
Alignment:
Q  429 ataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg 527  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||| | || ||| ||||||||||||| | || | ||||    
T  2954368 ataaatataggctttgtatcagtgtaaactttgagatagaggagtatgaaa-caagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttg 2954466  T
Q  528 -ctctt-ggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggac 623  Q
     ||||| |||||||||||||| | || |  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||       || ||| |||||||||| |||    
T  2954467 tctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctctt------agttacgagaagagattgagac 2954560  T
Q  624 tttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2954561 tttgggtagaattagg-cgggagacgtattcttgtaacccattgata 2954606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 553 - 669
Target Start/End: Original strand, 4410102 - 4410211
Alignment:
Q  553 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttat 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  4410102 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttat 4410194  T
Q  653 tcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||| ||||||    
T  4410195 tcttgtaacctattgat 4410211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 476 - 661
Target Start/End: Original strand, 29748350 - 29748529
Alignment:
Q  476 gaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgg-gaaac 574  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||||| || | || || |||||||  ||||| |||||    
T  29748350 gaaaacaagggtttagaagccaacaagaaaactagggtttgtagagaatt--ctcttggcaacaaacagtagggttaggattgattcgtcttggagaaac 29748447  T
Q  575 actattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    |||| ||||||||||||| ||      ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  29748448 actaataggattgagtctctt------ggtcacgggaatagattcgggactttgggtagaactaaatttgaagactaattcttgtaac 29748529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 602 - 767
Target Start/End: Original strand, 4897850 - 4898023
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagt 693  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  ||||||        |||||||| || || |||||||     
T  4897850 ggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattgtaaagttactcatcattatagc 4897949  T
Q  694 ggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttc 767  Q
    ||||| | ||| |||| | ||||||| | ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  4897950 ggaacagtgggctgctttctcccccatactaggtcagtattcgactgaactgggtaaacaaattttttgtgttc 4898023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 381 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 41586082 - 41585970
Alignment:
Q  381 gtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaa 479  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||| || | ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  41586082 gtatcttcagtctggtattcgttccaaatctatgagttatacttttactataaatataggttttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctg-aa 41585984  T
Q  480 acaacggtttagaa 493  Q
    |||| |||||||||    
T  41585983 acaagggtttagaa 41585970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 427 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 20507791 - 20507673
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||||    
T  20507791 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtttgtatagagtt 20507693  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacac 544  Q
    || ||||| | |||||||||    
T  20507692 tgtctctttggaacaaacac 20507673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 428 - 729
Target Start/End: Original strand, 21288715 - 21289016
Alignment:
Q  428 tataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||   |||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  21288715 tataaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggttg-aaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagttt 21288813  T
Q  527 g-ctcttggcaacaaacactaagatt--------ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagat 617  Q
    | ||||| | ||||||||||| | ||         ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||      ||| ||||||||||||    
T  21288814 gtctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcacctt-gaaaacactattaggattgagtatctt------ggttacgggaagagat 21288906  T
Q  618 tgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatagtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccc 717  Q
    | ||||||||| |||||||| |   ||||| || |||||||||| |||   | |||| ||| || ||  |||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  21288907 taggactttggatagaattaag-cgggagattttttcttgtaactcatcttttgtaacgttactcat-cttatagtgaaacggagggctgctctctcccc 21289004  T
Q  718 cagattaggtca 729  Q
    |||| |||||||    
T  21289005 cagactaggtca 21289016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 606 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 3373289 - 3373227
Alignment:
Q  606 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  3373289 acgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 3373227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 606 - 669
Target Start/End: Original strand, 10749827 - 10749889
Alignment:
Q  606 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  10749827 acgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 10749889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 286 - 344
Target Start/End: Original strand, 21288655 - 21288713
Alignment:
Q  286 tgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaat 344  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21288655 tgaagaacgattttatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaat 21288713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 553 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 41585944 - 41585834
Alignment:
Q  553 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttat 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||      ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  41585944 gggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctctt------ggctacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-caggagacttat 41585852  T
Q  653 tcttgtaacccattgata 670  Q
    | ||||||  ||||||||    
T  41585851 ttttgtaagtcattgata 41585834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 609 - 669
Target Start/End: Original strand, 10757306 - 10757365
Alignment:
Q  609 ggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  10757306 ggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 10757365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 31782731 - 31782554
Alignment:
Q  485 ggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttg-----attcaccttggg--aaacact 577  Q
    |||||||||| |||||   |||||||||||| || | | ||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||     ||||||||||    |||||||    
T  31782731 ggtttagaagccaacatacaaactagggtttatagataattt-ctcttggcaacaaacactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacact 31782633  T
Q  578 attaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 663  Q
     |||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31782632 gttaggattgagtctcttggtcacgg------gaagagattgggaatt-gggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccc 31782554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 476 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 15225049 - 15224866
Alignment:
Q  476 gaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttcta-tagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgg-gaaa 573  Q
    |||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||  ||  |||||    ||||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||  ||||    
T  15225049 gaaaacaagggtttagaagccaacatcaaaactagggtggcttgtagagaactctcttggcaacaaacactagggttatgattgattcaccttgaagaaa 15224950  T
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 662  Q
    ||||||||||||  |||||||||      |||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  15224949 cactattaggataaagtcttttg------gtcatgggaagagattcgagactttgggtaaaattaggtttgaagactaatttttgtaacc 15224866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 528 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 34033796 - 34033665
Alignment:
Q  528 ctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagatt-gggactt 625  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||      |||| ||||||||||||  ||| ||    
T  34033796 ctcttggcaacaaacactagcgttgggattgatttaccttggagaaacactattaggattgagtctctt------ggtcgcgggaagagattcaggattt 34033703  T
Q  626 tgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 663  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| || | |||||||    
T  34033702 tgggtagaattaagtttgaagacttgttatggtaaccc 34033665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 427 - 471
Target Start/End: Original strand, 2723917 - 2723961
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagaggg 471  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2723917 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 2723961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 670
Target Start/End: Original strand, 42770934 - 42770999
Alignment:
Q  604 tcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  42770934 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgagagacttattcttgtaacctattgata 42770999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 422 - 515
Target Start/End: Original strand, 4410002 - 4410099
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt----gagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggttt 515  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  4410002 tttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 4410099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 602 - 663
Target Start/End: Original strand, 10627389 - 10627449
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 663  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  10627389 ggtcacgggaagagattgagacta-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaaccc 10627449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 666
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1170899
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  1170811 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt 1170899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385546
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  35385634 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactttgg-tagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt 35385546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 606 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 15354726 - 15354665
Alignment:
Q  606 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||||||||    
T  15354726 acgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cggaagac-tattcttgtaacccattgat 15354665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 606 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 15357002 - 15356941
Alignment:
Q  606 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||||||||    
T  15357002 acgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cggaagac-tattcttgtaacccattgat 15356941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 606 - 669
Target Start/End: Original strand, 23665171 - 23665232
Alignment:
Q  606 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||||||||    
T  23665171 acgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cggaagac-tattcttgtaacccattgat 23665232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 606 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 23793416 - 23793355
Alignment:
Q  606 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||||||||    
T  23793416 acgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cggaagac-tattcttgtaacccattgat 23793355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 556 - 660
Target Start/End: Original strand, 35430259 - 35430359
Alignment:
Q  556 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggtttggagacttatt 653  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||  ||      ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  35430259 ttgattcaccttggagaaacactattacaattgagtctcttggtctagg------gaagagattcgggtctttgggtagaattaggtttgaagactgatt 35430352  T
Q  654 cttgtaa 660  Q
    |||||||    
T  35430353 cttgtaa 35430359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 557 - 603
Target Start/End: Original strand, 2723985 - 2724031
Alignment:
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacgg 603  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2723985 tgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgg 2724031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 574 - 658
Target Start/End: Original strand, 25452498 - 25452575
Alignment:
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgt 658  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25452498 cactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgt 25452575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 605 - 661
Target Start/End: Original strand, 1240456 - 1240511
Alignment:
Q  605 cacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1240456 cacgggaagaggctggga-tttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 1240511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 602 - 658
Target Start/End: Original strand, 25445521 - 25445576
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgt 658  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25445521 ggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgt 25445576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 688 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 3373202 - 3373132
Alignment:
Q  688 tatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttc 759  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||  |||||||| ||||||||||    
T  3373202 tatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 3373132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 11962590 - 11962532
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11962590 ggtcacgggaagaggctgagactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 11962532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 621 - 668
Target Start/End: Original strand, 13295880 - 13295927
Alignment:
Q  621 gactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga 668  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  13295880 gactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaaccctttga 13295927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 17841406 - 17841348
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17841406 ggtcacgggaagaggctggaactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 17841348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 610 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 23742006 - 23741949
Alignment:
Q  610 gaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||||||||    
T  23742006 gaagagattgggactttgggtagaattagg-cggaagac-tattcttgtaacccattgat 23741949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 686 - 757
Target Start/End: Original strand, 42238374 - 42238445
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||||    
T  42238374 attatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 42238445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 686 - 768
Target Start/End: Original strand, 1170924 - 1171006
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  1170924 attatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttct 1171006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 602 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 26406630 - 26406573
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26406630 ggtcacaggaagagattgagactt-gagtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 26406573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 621 - 663
Target Start/End: Original strand, 32520579 - 32520621
Alignment:
Q  621 gactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 663  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  32520579 gactttgggtagaattaggtttgaaaactgattcttgtaaccc 32520621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 686 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 35385520 - 35385438
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  35385520 attatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttct 35385438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 477 - 546
Target Start/End: Original strand, 35430171 - 35430238
Alignment:
Q  477 aaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacacta 546  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  | || ||||| |||||||||| ||||||||    
T  35430171 aaaacaagggtttagaagtcaacatcaaaactagggtt--tgtacagttttctcttggcaataaacacta 35430238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 688 - 757
Target Start/End: Original strand, 27910664 - 27910732
Alignment:
Q  688 tatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    |||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  27910664 tataatggaacggagagctgctctctcccccagattaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 27910732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 177; Significance: 5e-95; HSPs: 152)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 427 - 772
Target Start/End: Original strand, 31151277 - 31151623
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31151277 ctataaatatagactttgtatcagatgtaaacctcgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaatcaacaagaaaactagggtttgtatagagtt 31151376  T
Q  526 tgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactt 625  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||| ||||||||||||    
T  31151377 tgctcttggcaacaaacaccagggttggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggtcacgggaaaagattgggactt 31151470  T
Q  626 tgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccc 717  Q
    ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||  |||||        |||||||| || ||  |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31151471 tgggtagaattagg-cgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggagggctgctctctcccc 31151567  T
Q  718 cagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt-tcgtgtgttctctct 772  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  31151568 cagactaggtcagttttgggctgaactgggtaaacaaattctcatgtgttctctct 31151623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 270 - 757
Target Start/End: Original strand, 1313191 - 1313671
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    |||||| |||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  1313191 atatttctgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag------- 1313283  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1313284 --aaaaaaaaagtatctttagtgtgatattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagataga 1313381  T
Q  469 gggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcac 564  Q
    |||||||| |||||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||||||    
T  1313382 gggggctg-aaacaa-ggtttacaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 1313479  T
Q  565 cttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccca 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||    
T  1313480 cttgggaaacactattaggattgagtctctt------agttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaatcca 1313572  T
Q  665 ttgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaat 756  Q
    ||||||        |||| ||| || || | ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  1313573 ttgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 1313670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 270 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 53918141 - 53917659
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    |||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||           
T  53918141 atatttttttaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggaga------ 53918048  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  53918047 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgtttcaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagattaaaccttgagatgga 53917950  T
Q  469 gggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcac 564  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || |  |||||||||||    
T  53917949 gggggctgaaa-caatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 53917851  T
Q  565 cttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccca 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  53917850 cttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccca 53917758  T
Q  665 ttgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaat 756  Q
    ||||||        |||||||| || || | ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  ||||||  |||||||| |||||||    
T  53917757 ttgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaat 53917660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 270 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 53915973 - 53915491
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  53915973 atatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaga------ 53915880  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  53915879 --aaaaaaaacgtatcttgagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagataga 53915782  T
Q  469 gggggctgaaaacaacggttta-gaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcac 564  Q
    |||||||| |||||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||| | || |  |||||||| ||    
T  53915781 gggggctg-aaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttac 53915683  T
Q  565 cttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccca 664  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  53915682 cttgtgaaacattattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccca 53915590  T
Q  665 ttgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaat 756  Q
    ||||||        |||| ||| || || ||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||| |||||||    
T  53915589 ttgatatctcttttgtaatgttactcatcatt-tagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttt-gactgaactgggtcaacaaat 53915492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 381 - 670
Target Start/End: Original strand, 6561694 - 6561979
Alignment:
Q  381 gtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6561694 gtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatgagttatatttctctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctg-aaa 6561792  T
Q  481 caacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacac 576  Q
    ||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||  | ||   ||||||||||||||||||||||||    
T  6561793 caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacac 6561892  T
Q  577 tattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  6561893 tattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaatccattgata 6561979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 458059 - 458453
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  458059 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaa----- 458153  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga---- 464  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||        
T  458154 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagaga 458251  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgat 560  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||| | || |  |||||||    
T  458252 tagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgat 458350  T
Q  561 tcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgta 659  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  458351 tcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt------ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 458443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 455682 - 456076
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  455682 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaa----- 455776  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga---- 464  Q
      |||| | | |||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||        
T  455777 --aaaaaaaacgtatcttcagtgcggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagaga 455874  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgat 560  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||| | || |  |||||||    
T  455875 tagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgat 455973  T
Q  561 tcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgta 659  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  455974 tcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt------ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 456066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 746531 - 746926
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  746531 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaga------ 746624  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt------ga 462  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||      ||    
T  746625 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 746722  T
Q  463 gatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttg 558  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||| | ||   ||||||    
T  746723 gatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttg 746821  T
Q  559 attcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttg 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  746822 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt------ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttg 746914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 25533216 - 25533610
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  25533216 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag------- 25533308  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga---- 464  Q
       ||| | | ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| || | |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||        
T  25533309 ---aaaaaaacgtatcttcagtgtgatatttgttctaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 25533405  T
Q  465 ----tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggt 556  Q
        ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||    
T  25533406 gagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggt 25533504  T
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattctt 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  25533505 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctttt------ggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattctt 25533597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 420 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 36871631 - 36871280
Alignment:
Q  420 tatttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctat 519  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||| | |  || ||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||| || |||    
T  36871631 tattactctataaatataaaccttgtatcatagtaaacctagggggag-gggggctgaaa-caagggtttacaagccaacaagaaaactagggcttgtat 36871534  T
Q  520 agagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattg 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | || || |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||      |||||||| |||||||||    
T  36871533 agagtttgctcttggcaacaaacaccagggttaggattgattcaccttggaaaacactgttaagattgagtctctt------ggtcacggaaagagattg 36871440  T
Q  620 ggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata-------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctt 712  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||       ||||||||  | || ||||||||||||||||||| ||||||     
T  36871439 ggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttatctctttgtaaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctc 36871340  T
Q  713 tcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36871339 tcccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatttcgtgtgttctctct 36871280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 4104374 - 4103984
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  4104374 atatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagaa----- 4104280  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga---- 464  Q
      |||| | | |||||   |||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||        
T  4104279 --aaaaaaaacgtatc---agtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 4104185  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgat 560  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||    
T  4104184 tagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 4104086  T
Q  561 tcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  4104085 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 4103993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 427 - 771
Target Start/End: Original strand, 53597171 - 53597514
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  53597171 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggga-tgaaa-caagggtttataagtcaacaagaaaactaggggttgtatagagttt 53597268  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
     ||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||| | ||| |||||| || |||    
T  53597269 tctcttggcaacaaacactagggttgaagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggtcatgagaatagattgagatttt 53597362  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttccccc 718  Q
    | |||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||        |||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  53597363 gagtagaattagg-caagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagggttgctctctcccac 53597461  T
Q  719 agattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctc 771  Q
    | | ||||||||| ||||||  || ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  53597462 aaactaggtcagtattggaccgaattgggtaagctaatttcgtgtgttctctc 53597514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 428 - 601
Target Start/End: Original strand, 24177210 - 24177383
Alignment:
Q  428 tataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg 527  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24177210 tataaatatagaccttgtatcatagtaaacattgagctagagggggctgaaaacaagagtttagatgtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg 24177309  T
Q  528 ctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcac 601  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24177310 ctcttggcaacaaacactaaggttggggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcac 24177383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 270 - 668
Target Start/End: Original strand, 51943151 - 51943537
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||           
T  51943151 atatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgtaaatattctttcattgaaggaga------ 51943244  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      || | | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  51943245 --aagaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgatttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagataga 51943342  T
Q  469 gggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcac 564  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||| | || |  |||||||||||    
T  51943343 gggtgctgaaa-caaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcac 51943441  T
Q  565 cttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccca 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||    
T  51943442 cttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-cgggagactt-ttcttgtaactca 51943533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 428 - 670
Target Start/End: Original strand, 23636958 - 23637192
Alignment:
Q  428 tataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg 527  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  23636958 tataaatatatactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggct-aaaacaagggtttagaagccaacaagaaaactagggtttgtatagagtctg 23637056  T
Q  528 ctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttg 627  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||      | ||| ||||||| ||| ||||||||    
T  23637057 ctcttggcaacaaacactagggtttgggttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtctctt------gttcatgggaagatattaggactttg 23637150  T
Q  628 ggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23637151 ggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 23637192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 10622018 - 10621618
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  10622018 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag------- 10621926  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt-------- 460  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||            
T  10621925 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 10621828  T
Q  461 ----gagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--g 552  Q
        ||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||| | ||       
T  10621827 gagagagatagagggtgctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgt 10621729  T
Q  553 gggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagactta 651  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  10621728 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt------ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagactta 10621636  T
Q  652 ttcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10621635 ttcttgtaacccattgat 10621618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 427 - 663
Target Start/End: Original strand, 23633390 - 23633616
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23633390 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggct-aaaacaaggatttagaagccaacaagaaaactagggtttgtatagtgttt 23633488  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||| ||||||    
T  23633489 gctcttggcaacaaacactagggttggggttgatttacc--gggaaacactattaggattgagtctctt------ggtcacgggaagagattgagacttt 23633580  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 663  Q
    |||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  23633581 gggtagaattagg-cggaagacttattcttgtaaccc 23633616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 270 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 27636103 - 27635834
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  27636103 atatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag------- 27636011  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct--ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatag 467  Q
       ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  27636010 ---aaaaaaatgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatattttttactacaaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatag 27635914  T
Q  468 agggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacacta 546  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27635913 agggggctg-aaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacacta 27635834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 478 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 562049 - 561754
Alignment:
Q  478 aaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacact 577  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  562049 aaacaagggtttagaagtcaacatgaaa-ctagggtttgtatagagttttctcttggcaacaaacactagggttcaggttgattcacattgggaaacact 561951  T
Q  578 attaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata------- 670  Q
    ||||||||| ||||| ||      ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||           
T  561950 attaggatttagtctctt------ggtcacgtgaagagattgagactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaagtcattgatatcttttt 561858  T
Q  671 -gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttccc-ccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||||||    
T  561857 tgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctctccctccagactaggtcagttttggaccgaaccgggtaaacaaatttcacgtgttct 561758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 28761755 - 28761422
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  28761755 ctataaatatagactttgcatcagagtaaaccttgagatagagggggttg-aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatatagtt 28761657  T
Q  526 tgctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggac 623  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||   | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||      ||| || |||||| |||| |||    
T  28761656 tgctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt------ggttacaggaagatattgagac 28761563  T
Q  624 tttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcc 715  Q
    ||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||| || || ||||||||| ||||||||  |||||| |||    
T  28761562 tttaggtagaattagg-cgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggactgctctctcc 28761464  T
Q  716 cccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    |||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  28761463 cccagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaacaaatt 28761422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 422 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 4308613 - 4308370
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctata 520  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||    
T  4308613 tttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 4308515  T
Q  521 gagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagat 617  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||| |    
T  4308514 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggt 4308421  T
Q  618 tgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  4308420 tgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 4308370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 1627010 - 1626771
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1627010 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 1626912  T
Q  526 t-gctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    |  ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||| |||||||||||    
T  1626911 tatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt------ggttacggggagagattggga 1626818  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1626817 ctttgggtagaattaag-cgggagacttattcttgtaacccattgata 1626771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 270 - 598
Target Start/End: Original strand, 42992062 - 42992390
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  42992062 atatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaga------ 42992155  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt----gaga 464  Q
      |||| | | ||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| || ||||||||   ||||| ||    ||||    
T  42992156 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtaatattaattccaaatttatgagttatacttttactataaatatataccttgtatcatgctaaactttaagagaga 42992253  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggttt-agaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgat 560  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||   ||||||||    
T  42992254 tagagggggctg-aaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgat 42992352  T
Q  561 tcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggt 598  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42992353 tcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggt 42992390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 43423790 - 43423551
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  43423790 ctataaatatagacattgtatcactgtaaaccttgagaaagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 43423692  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||| ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||||||||     
T  43423691 tgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgggg 43423598  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  43423597 ctttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaactcattgata 43423551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 28102329 - 28102090
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28102329 ctataaatataagcgttgtattagagtaacccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 28102231  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||| ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||||||||     
T  28102230 tgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgggg 28102137  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28102136 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 28102090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 42990061 - 42990472
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  42990061 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaa----- 42990155  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga---- 464  Q
      |||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||        
T  42990156 --aaaaaaaatgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatgctaaactttgagagaga 42990253  T
Q  465 ------------------tagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacac 544  Q
                      |||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||     
T  42990254 gagactttgagagagagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacat 42990352  T
Q  545 taagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggttt 642  Q
    || | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||       
T  42990353 taggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cg 42990445  T
Q  643 ggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  42990446 ggagacttattcttgtaactcattgat 42990472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Original strand, 3314614 - 3314947
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||  ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  3314614 ctataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaataagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 3314712  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| || |||||||||||||     
T  3314713 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacaggaagagattgggg 3314806  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    ||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||  | || ||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  3314807 ctttgggtaaaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctc 3314905  T
Q  715 ccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||| | |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  3314906 ccccaaactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 3314947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 422 - 669
Target Start/End: Original strand, 43228216 - 43228459
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctata 520  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||  |||||||| | |||||| |||||||| |||| ||||    
T  43228216 tttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgtata 43228314  T
Q  521 gagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagat 617  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||      
T  43228315 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggc 43228408  T
Q  618 tgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  43228409 tgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgat 43228459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 43421742 - 43421503
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  43421742 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaggggttg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtt 43421644  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||||||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||      ||| ||||||| ||||||||     
T  43421643 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctctt------ggttacgggaaaagattgggg 43421550  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
     |||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43421549 atttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaacccattgata 43421503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 45882869 - 45883108
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  45882869 ctataaatatagaccttgtatcatagtaaactatgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattt 45882967  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | |||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||| ||||||    
T  45882968 tgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggttggga 45883061  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45883062 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaactcattgata 45883108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 401 - 661
Target Start/End: Original strand, 24979611 - 24979867
Alignment:
Q  401 gttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaa 498  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||    
T  24979611 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatataccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaagacaa 24979708  T
Q  499 caagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctttt 595  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  24979709 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctctt 24979808  T
Q  596 ggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
          ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  24979809 ------ggttacggaaagagattgagactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaac 24979867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 422 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 51727338 - 51727096
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctata 520  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||| | ||||    
T  51727338 tttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgtata 51727240  T
Q  521 gagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattg-gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagatt 618  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||      |||||  |    
T  51727239 gagtttgtctctttggaacaaacactgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggt------aagaggct 51727146  T
Q  619 gggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  51727145 gagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 51727096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 504 - 770
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635657
Alignment:
Q  504 aaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacgg 603  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||      ||    
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttgctcttggcaacaaacactagggttgggattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctctt------gg 25635484  T
Q  604 tcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtgg 695  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||        |||||||| || || ||||| |||     
T  25635485 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcattatggtga 25635583  T
Q  696 aacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctct 770  Q
    ||| |||||||||||| |||||  |  |||| ||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25635584 aacagagggttgctctctcccctcggctaggcca-atttggaccaaactgcgtaaacaaatttcgtgtgttctct 25635657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 427 - 666
Target Start/End: Original strand, 35777351 - 35777587
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  35777351 ctataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 35777449  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||      ||| ||||||||||||||||    
T  35777450 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt------ggttacgggaagagattggg 35777543  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  35777544 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 270 - 586
Target Start/End: Original strand, 41848913 - 41849244
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactg-aagaagnnnnnn 368  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||            
T  41848913 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaaggaatattatatttttgatgcaaatattctttaactgaaagagaaaaaaa 41849012  T
Q  369 nncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttg------ 461  Q
       |||| | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||          
T  41849013 aaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagacattgtatcaggctaaactttgagagag 41849112  T
Q  462 ----agatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--gg 553  Q
        ||||||||||||||| |||||| |||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||   |    
T  41849113 agatagatagagggggctg-aaacaagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgag 41849211  T
Q  554 ggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 586  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41849212 ggttgattcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 427 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 5927091 - 5926856
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  5927091 ctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagagggctg-aaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtatagagtt 5926993  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || || || | ||||||||||| | ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||||||    
T  5926992 tgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattggga 5926899  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    |||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  5926898 cttttggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccatt 5926856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 39715400 - 39715638
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttaga-agtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  39715400 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataga-ggggctg-aaataagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgtatagagtt 39715497  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || || || | ||||||||||| | ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||||||    
T  39715498 tgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattggga 39715591  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39715592 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgcaacccattgata 39715638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 3859458 - 3859696
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  3859458 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 3859556  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  || ||    
T  3859557 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgaga 3859650  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||    
T  3859651 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacacattgat 3859696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 10956354 - 10956116
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10956354 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaacatgaagatagagggggctgaaa-caagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 10956256  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||| ||||||||||| | || |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  || ||    
T  10956255 tgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgaga 10956162  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10956161 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaactcattgat 10956116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 11170334 - 11170572
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11170334 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 11170432  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  ||| ||||||||||  |||||    
T  11170433 tgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagt------gtcttggttacgggaagaggctggga 11170526  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  11170527 ctttaggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 11170572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 432 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 18099493 - 18099259
Alignment:
Q  432 aatatagacattgtatcagagtaaacctt-gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-c 528  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18099493 aatatagaccttgtatcagagtaaacttgagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 18099395  T
Q  529 tcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
    |||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  |||||||||    
T  18099394 tctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgggacttt 18099301  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  18099300 gggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 18099259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 880779 - 880539
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  880779 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggtctg-aaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 880681  T
Q  526 tg-ctc-ttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
     | ||| |||||||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||      ||| |||| |||||||||||    
T  880680 cgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctctt------ggttacggaaagagattggg 880587  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
     ||||||||||||||| |   ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  880586 gctttgggtagaatta-gacgggagagttattcttgtaacccattgata 880539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 6066124 - 6065884
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagaggggg-ctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagt 524  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  6066124 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagatt 6066026  T
Q  525 ttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgg 620  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||      ||| |||||||||||||||    
T  6066025 ttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt------ggttacgggaagagattgg 6065932  T
Q  621 gactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  6065931 gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 6065884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 427 - 772
Target Start/End: Original strand, 1673905 - 1674242
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||  ||||| |  ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  1673905 ctataaatatagaacttgtatcaaaagtaaaccttgatgtagagagt-ctgaaaataagggtttagaagttaacaagaaaactagtgtttgtatatagtt 1674003  T
Q  526 tgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactt 625  Q
    ||||||||||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||      ||||||||||||||||    
T  1674004 tgctcttggcaacaaacactagggttaggattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgg------gaagagattgggactt 1674097  T
Q  626 tgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatagtaaagttgcttataatta-tagtggaacggagggttgctctttcccccagatta 724  Q
    ||||||||| |||    |||||||||||| |||||||| ||||||      |||  || | ||| |  ||||||||| || |||||| ||| ||||| ||    
T  1674098 tgggtagaaatagacg-ggagacttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttg--taaagttacttttggaacggatggctgctctctccaccagacta 1674194  T
Q  725 ggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||||||| || |||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  1674195 ggtcagtattagaccgaactgggtaaacaaattttgtgtattctctct 1674242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 422 - 669
Target Start/End: Original strand, 43226011 - 43226253
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctata 520  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||| | ||| ||||    
T  43226011 tttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactacg-tttgtata 43226108  T
Q  521 gagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagat 617  Q
    ||||||| ||| | | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||      
T  43226109 gagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggc 43226202  T
Q  618 tgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  43226203 tgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 43226253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 5191583 - 5191821
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||  || |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5191583 ctataaatatagaccttgtatctaagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 5191681  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  |||||    
T  5191682 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctggga 5191775  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||    
T  5191776 ctttgggtagaattagg-cgggagactcattcttgtaacccattgat 5191821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 10958650 - 10958412
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10958650 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaacataaagatagagggggctgaaa-caagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 10958552  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||| ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| | ||||||||  ||  |    
T  10958551 tgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttatgggaagaggctgaca 10958458  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10958457 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaactcattgat 10958412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 22114632 - 22114394
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | ||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  22114632 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaaggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtt 22114534  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  |||||    
T  22114533 tgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctggga 22114440  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
     ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  22114439 ttttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 22114394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 18162594 - 18162832
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatca-gagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagt 524  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||   ||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18162594 ctataaatatagaccttgtatcatgagtaaacttggagatagaggga--tgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 18162690  T
Q  525 ttg-ctcttggcaacaaacactaagattgggg--ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    ||| |||||   ||||||||||| | || | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||      ||||||||||||    
T  18162691 ttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg------gaagagattggg 18162784  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162785 actttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaacccattgata 18162832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 427 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 28100368 - 28100143
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28100368 ctataaatataagcgttgtatcagagtaacccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 28100270  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||| ||||||||||| | || |  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||      ||| ||||||||||||||||     
T  28100269 tgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtctttt------ggttacgggaagagattgggg 28100176  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattctt 656  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  28100175 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 461 - 669
Target Start/End: Original strand, 38890004 - 38890208
Alignment:
Q  461 gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggt 556  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||    
T  38890004 gagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 38890102  T
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattctt 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  38890103 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattctt 38890195  T
Q  657 gtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||    
T  38890196 gtaacccattgat 38890208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 18097228 - 18096989
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt-gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagt 524  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18097228 ctataaatatagaccttgtatcatagtaaacttgagagatagagggggctcaaa-caagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 18097130  T
Q  525 ttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||    
T  18097129 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctggg 18097036  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18097035 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacctattgat 18096989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 422 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 27101517 - 27101269
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacc----ttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttc 516  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||      | |||||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||     
T  27101517 tttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaattgagatagagatagaggaggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 27101419  T
Q  517 tatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaag 613  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| || |||||    
T  27101418 tatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacaggaag 27101325  T
Q  614 agattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101324 agaatgggactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaacccattgata 27101269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 36011757 - 36011996
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||| ||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  36011757 ctataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagataaagggggctg-aaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtatagagtt 36011855  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || |||||   ||||||||||| | ||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||      ||| |||||||||||||| ||    
T  36011856 tgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatatctt------ggttacgggaagagattgtga 36011949  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36011950 ctttgggtagaatta-gttgggagacttattcttgtaacccattgata 36011996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 541 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 1620672 - 1620441
Alignment:
Q  541 acactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggt 640  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1620672 acactagggttgggattgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgg------gaagagattgggactttgggtagaattaggt 1620579  T
Q  641 ttggagacttattcttgtaacccattgata-------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttt 733  Q
    ||| || ||  |||||||||||| ||||||       ||||| || || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| |    
T  1620578 ttgaaggctagttcttgtaaccctttgatatctctttgtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcagtat 1620479  T
Q  734 tggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctc 771  Q
    ||||| ||||| ||| |||||| || ||||||||||||    
T  1620478 tggaccaaactaggtgaacaaactttgtgtgttctctc 1620441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 6063775 - 6063534
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga--tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagag 523  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6063775 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 6063677  T
Q  524 tttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtcttttggtcacggtcacgggaagagattg 619  Q
    |||| || || | | ||||||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||      ||||||||||    
T  6063676 tttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgg------gaagagattg 6063583  T
Q  620 ggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  6063582 ggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 6063534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 427 - 639
Target Start/End: Original strand, 28180954 - 28181161
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28180954 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaata---ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 28181050  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||  |||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||||||    
T  28181051 tgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctatt------ggttacgggaagagattggga 28181144  T
Q  623 ctttgggtagaattagg 639  Q
    |||||| ||||||||||    
T  28181145 ctttggatagaattagg 28181161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 504 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 13420432 - 13420186
Alignment:
Q  504 aaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacgg 603  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||    
T  13420432 aaactagggtttgtatagagttttctctaggcaacaaacactagggttgag-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------gg 13420340  T
Q  604 tcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtgg 695  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||| || || |||||| |||    
T  13420339 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatgg 13420241  T
Q  696 aacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaa 751  Q
    ||||||| | |||||| | | ||||| ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  13420240 aacggagagctgctctct-caccagactaggtcagttttggaccgaaatgggtaaa 13420186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 427 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 32264370 - 32264060
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaa----ccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatag 521  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||  |||| |||||    
T  32264370 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaattaactttgagatagagggggctcaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatag 32264272  T
Q  522 agtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagatt 618  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| | ||||||||  |    
T  32264271 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttatgggaagaggct 32264178  T
Q  619 gggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata---------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgct 709  Q
    || |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||    
T  32264177 ggaactttgggtagaattatg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgct 32264079  T
Q  710 ctttcccccagattaggtc 728  Q
    || ||||||||| ||||||    
T  32264078 ctctcccccagactaggtc 32264060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 427 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 12268293 - 12268061
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaa-ctagggtttctatagagt 524  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  12268293 ctataaatatagaacttgtatcagagtaaactttgagatagagggagctgaaa-caagagtttagaaagacaacaacaaaaactagggtttgtatagagt 12268195  T
Q  525 ttg-ctctt-ggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgg 620  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| | || |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||||    
T  12268194 ttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgg 12268101  T
Q  621 gactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    | |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  12268100 ggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 12268061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 422 - 669
Target Start/End: Original strand, 50493924 - 50494168
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctata 520  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||| |||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||    
T  50493924 tttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactgagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 50494022  T
Q  521 gagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagaga 616  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||      ||| |||||||| ||    
T  50494023 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt------ggttacgggaaggga 50494116  T
Q  617 ttgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||    
T  50494117 ttgggactttgggtagaattagg-cggaagacttattcttgtaacccattgat 50494168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 53468782 - 53468544
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||| | ||||| |||||||||    
T  53468782 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaacctttagataaagggggctg-aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaacca-ggtttgtatagagtt 53468685  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgggg--ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | || |||||||| | || | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||      ||| ||||| |||||||||||    
T  53468684 tgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctctt------ggttacggggagagattggga 53468591  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53468590 ctttgggtaaaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 53468544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 427 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 48361997 - 48361761
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  48361997 ctataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatacagggggctg-aaacaa-ggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 48361900  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||| |||||| |||| | ||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||||||||||||||     
T  48361899 tgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctctt------agttacgggaagagattgggg 48361806  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga 668  Q
    |||| ||||||||||||   | |||||| |||||||||| ||||||    
T  48361805 cttttggtagaattagg-cggaagactttttcttgtaactcattga 48361761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 47149227 - 47148983
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgag----atagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctata 520  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||    |||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||    
T  47149227 ctataaatatagaccttgtatcagatgtaggccttgagggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 47149129  T
Q  521 gagtttg-ctc-ttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagaga 616  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||  |||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||      ||| |||||||||||    
T  47149128 gagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcacctt-ggaaacactattatgattgagtctctt------ggttacgggaagaga 47149036  T
Q  617 ttgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149035 ttgggtctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 47148983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 427 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 54691900 - 54691727
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||| | ||||||| | | |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  54691900 ctataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggt--aaaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtatagagtt 54691803  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggt 598  Q
    || ||||||||||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  54691802 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggt 54691727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 890098 - 889861
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||| | |||||  ||| ||||||||| |||||||||    
T  890098 ctataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggaagctg-aaacaagggtttagaatggcaaca--aaacctagggtttgtatagagtt 890002  T
Q  526 tg-ct-cttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    || ||  |||||||||||||||  | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||| |||||    
T  890001 tgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagag-ttggg 889909  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
     |||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  889908 gctttgggtagaattagg-caggagagttattcttgtaacccactgata 889861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 10084720 - 10084478
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga----tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatag 521  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||    |||||||||||| || ||| ||||||||| | ||| || ||||||||||||| |||||    
T  10084720 ctataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagatagagggggctggaa-caagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatag 10084622  T
Q  522 agtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagatt 618  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||      ||| ||||||||||  |    
T  10084621 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctctt------ggttacgggaagaggct 10084528  T
Q  619 gggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||    
T  10084527 gggactttgggtagaattagg-agggagacttattcttgtaacccgttgat 10084478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 496 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 28413290 - 28413120
Alignment:
Q  496 caacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtc 591  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28413290 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtc 28413191  T
Q  592 ttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    | ||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  28413190 tctt------ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 28413120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 478 - 603
Target Start/End: Original strand, 13419865 - 13419988
Alignment:
Q  478 aaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacact 577  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13419865 aaacaaaggtttaaaagccaacaagaaaactagggtttgta--gagtttgctcttggcaacaaacactagggttgggattgattcaccttgggaaacact 13419962  T
Q  578 attaggattgagtcttttggtcacgg 603  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||    
T  13419963 attaggatcaagtctcttggtcacgg 13419988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 461 - 669
Target Start/End: Original strand, 30005805 - 30006009
Alignment:
Q  461 gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggt 556  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||    
T  30005805 gagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 30005903  T
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattctt 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||      ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  30005904 tgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctctt------ggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattctt 30005996  T
Q  657 gtaacccattgat 669  Q
    ||||| |||||||    
T  30005997 gtaactcattgat 30006009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 603 - 772
Target Start/End: Original strand, 24181483 - 24181659
Alignment:
Q  603 gtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtg 694  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| || || |||||||||    
T  24181483 gtcacgggaaaagattgggactttgggtagaattagacg-ggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtg 24181581  T
Q  695 gaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||||||| |  |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24181582 gaacggatgactgctctctcctccaaactaggtcagttttggaccgaattgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 24181659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 422 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 35918281 - 35918032
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctata 520  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  35918281 tttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaattttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 35918183  T
Q  521 gagtttg-ctcttggcaacaaacacta-------agattg-gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacggga 611  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||| |       || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||      ||| ||| ||    
T  35918182 gagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctctt------ggttacgaga 35918089  T
Q  612 agagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  35918088 agagactgggaatttgggtagaaatagg-agggagacttattcttgtaacccattgat 35918032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 15780790 - 15781040
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15780790 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaacttggagatagagggggctg-aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 15780888  T
Q  526 tg------------ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacggga 611  Q
    ||            ||||| | ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||      ||| ||||||    
T  15780889 tgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattacgattgagtctctt------ggttacggga 15780982  T
Q  612 agagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15780983 agaggctgagactttcggtagaattagg-cggaagacttattcttgtaacccattgata 15781040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 461 - 669
Target Start/End: Original strand, 38210334 - 38210539
Alignment:
Q  461 gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggt 556  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||| | || |  |||    
T  38210334 gagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggt 38210432  T
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattct 655  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||      ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  38210433 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt------ggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattct 38210525  T
Q  656 tgtaacccattgat 669  Q
    |||||| |||||||    
T  38210526 tgtaactcattgat 38210539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 461 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 9604899 - 9604696
Alignment:
Q  461 gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggt 556  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | || |||||||| | || |  |||    
T  9604899 gagatagagggggctgaaa-caa-ggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggt 9604802  T
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattctt 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  9604801 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattctt 9604709  T
Q  657 gtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||    
T  9604708 gtaacccattgat 9604696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 5522942 - 5522715
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |            
T  5522942 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt-------- 5522852  T
Q  526 tgctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggac 623  Q
      ||||| | ||||||||||  | ||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||||    
T  5522851 --ctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgggac 5522760  T
Q  624 tttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  5522759 tttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 5522715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 26720478 - 26720715
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||| || ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  26720478 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctg-aaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 26720576  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || || || | ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| | ||      ||| ||||||||||  |||||    
T  26720577 tgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggattgagtttctt------ggttacgggaagaggctggga 26720669  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |||||    
T  26720670 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttttaaccctttgat 26720715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 503 - 669
Target Start/End: Original strand, 1321485 - 1321647
Alignment:
Q  503 aaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtc 599  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||        
T  1321485 aaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt---- 1321580  T
Q  600 acggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
      ||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  1321581 --ggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 1321647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 504 - 670
Target Start/End: Original strand, 17795269 - 17795427
Alignment:
Q  504 aaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacgg 603  Q
    ||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||      ||    
T  17795269 aaactagagtctgtatagagtttgcttttggcaacaaacactagggttggg-ttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctctt------gg 17795361  T
Q  604 tcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17795362 tcacggaaagagattgaggctttgggtagaattagg-cggaagacttattcttgtaacccattgata 17795427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 504 - 670
Target Start/End: Original strand, 19103709 - 19103867
Alignment:
Q  504 aaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacgg 603  Q
    ||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||      ||    
T  19103709 aaactagagtctgtatagagtttgcttttggcaacaaacactagggttggg-ttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctctt------gg 19103801  T
Q  604 tcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19103802 tcacggaaagagattgaggctttgggtagaattagg-cggaagacttattcttgtaacccattgata 19103867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 476 - 772
Target Start/End: Original strand, 7768552 - 7768849
Alignment:
Q  476 gaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaaca--ctaagattggggttgattcaccttgggaaa 573  Q
    |||||||| |||||||||| |||||  ||||||| ||||| || ||| ||  ||||||||||||||||  ||||| ||| | |||||||||||||| |||    
T  7768552 gaaaacaagggtttagaagccaacatcaaaactaaggtttgtagagaatt--ctcttggcaacaaacaaactaaggttgagattgattcaccttggaaaa 7768649  T
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--- 670  Q
    ||||||||||||||||||| ||      | |||||||   | ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  || |||       
T  7768650 cactattaggattgagtctctt------gctcacgggctaaaattggaactttgagtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttaatatac 7768743  T
Q  671 ----gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgtt 766  Q
        |||||||| || || |||||||||||||| |||||| |||  ||||||| | ||||||||| |||||   || |||||||| ||| ||||||| ||    
T  7768744 ctttgtaaagttactcattattatagtggaacgaagggttactccctcccccatactaggtcagtattggatcgaattgggtaaaaaaaattcgtgtctt 7768843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 496 - 759
Target Start/End: Original strand, 25388905 - 25389169
Alignment:
Q  496 caacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtc 591  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25388905 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaacactattaggattggagtc 25389003  T
Q  592 ttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga-------tagtaaagttgcttat 684  Q
    | ||||| ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||       | |||| ||| || ||    
T  25389004 tcttggttacgg------gaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacatattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcat 25389096  T
Q  685 aattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttc 759  Q
     | ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||    
T  25389097 ca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatttc 25389169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 504 - 602
Target Start/End: Original strand, 25633930 - 25634028
Alignment:
Q  504 aaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacg 602  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  25633930 aaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggctgggattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggtcacg 25634028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 461 - 669
Target Start/End: Original strand, 29956650 - 29956854
Alignment:
Q  461 gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggt 556  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| || | ||   ||||    
T  29956650 gagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggt 29956748  T
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattctt 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||      ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  29956749 tgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctctt------ggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattctt 29956841  T
Q  657 gtaacccattgat 669  Q
    ||||| |||||||    
T  29956842 gtaactcattgat 29956854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 427 - 546
Target Start/End: Original strand, 6231379 - 6231499
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| | ||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  6231379 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagcgggctg-aaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 6231477  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacacta 546  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  6231478 tgtctcttggcaacaaacacta 6231499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 427 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 47701922 - 47701822
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  47701922 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataaagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 47701824  T
Q  526 tg 527  Q
    ||    
T  47701823 tg 47701822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 553 - 757
Target Start/End: Original strand, 6484419 - 6484622
Alignment:
Q  553 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttat 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||      ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||| ||||||    
T  6484419 gggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctctt------ggttacgggaagagattggggttttgggtagaattagg-cgggaaacttat 6484511  T
Q  653 tcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaact 744  Q
    ||||||||||||||||||        |||||||| || || | ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||||  ||||    
T  6484512 tcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaact 6484609  T
Q  745 gggtaaacaaatt 757  Q
    |||| ||||||||    
T  6484610 gggtcaacaaatt 6484622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 429 - 546
Target Start/End: Original strand, 11163082 - 11163200
Alignment:
Q  429 ataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg 527  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  11163082 ataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 11163180  T
Q  528 -ctcttggcaacaaacacta 546  Q
     ||||| | |||||||||||    
T  11163181 tctctttggaacaaacacta 11163200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 553 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 25688359 - 25688249
Alignment:
Q  553 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttat 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  25688359 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttat 25688267  T
Q  653 tcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25688266 tcttgtaacccattgata 25688249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 427 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 28137622 - 28137424
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| |||| |            
T  28137622 ctataaatatatgcgttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgt-------- 28137532  T
Q  526 tgctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggac 623  Q
      ||||||| ||||||||||| | ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||      ||| |||||||||||||||| |    
T  28137531 --ctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctctt------ggttacgggaagagattggggc 28137440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 553 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 7606785 - 7606676
Alignment:
Q  553 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttat 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  7606785 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttat 7606693  T
Q  653 tcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||| |||||||    
T  7606692 tcttgtaacacattgat 7606676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 427 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 10191640 - 10191405
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga----gggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatag 521  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||    |||||||| || ||| ||||||||| | ||| || ||||||||||||| |||||    
T  10191640 ctataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagataaagggggctggaa-caagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttttatag 10191542  T
Q  522 agtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagatt 618  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||      ||| || |||||||  |    
T  10191541 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctctt------ggttacaggaagaggct 10191448  T
Q  619 gggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 663  Q
     ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  10191447 -ggactttgggtagaattagg-agggagacttattcttgtaaccc 10191405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 526 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 14634667 - 14634530
Alignment:
Q  526 tgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactt 625  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||       |||||| |||||||||| |||||    
T  14634667 tgctcttggcaacaaacactggg-ttgagattgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctctt------agtcacgagaagagattgagactt 14634575  T
Q  626 tgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||    
T  14634574 tgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaaacctttgata 14634530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 51675082 - 51674854
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| |            
T  51675082 ctataaatatagacgttgtatcaatgtaaacgttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgt-------- 51674992  T
Q  526 tgctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggac 623  Q
      | ||| | ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||      ||| ||| |||||||||||||     
T  51674991 --ccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgagaagagattgggat 51674900  T
Q  624 tttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  51674899 tttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaatccattgata 51674854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 428 - 670
Target Start/End: Original strand, 32219026 - 32219253
Alignment:
Q  428 tataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| || ||| |||||| |||||||| |||| |             
T  32219026 tataaatatagaccttgtatctgactaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagagtttgt--------- 32219115  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggact 624  Q
     ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||      |||  ||||||||||||||||||    
T  32219116 -ctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctctt------ggttgcgggaagagattgggact 32219208  T
Q  625 ttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||| |||||||||   | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32219209 ttgggcagaattagg-cggaagacttatttttgtaacccattgata 32219253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 553 - 670
Target Start/End: Original strand, 6231860 - 6231969
Alignment:
Q  553 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttat 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||      ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||    
T  6231860 gggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgg------gaagagattggga-tttgggtagaattaggcg-ggagacttat 6231951  T
Q  653 tcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6231952 tcttgtaacccattgata 6231969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 487 - 772
Target Start/End: Original strand, 27420644 - 27420929
Alignment:
Q  487 tttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgg-gaaacactattaggat 585  Q
    |||||||| || ||| |||| |||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  ||| |||| |||||||| |     
T  27420644 tttagaagccagcaacaaaattagggtttgtagagaattt--tcttggcaacaaacactatggttgggattgattcacgctggagaaatactattagaac 27420741  T
Q  586 tgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgg-gactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata------gtaaagtt 678  Q
    | ||||| ||||||||||      ||||||||| | |  ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||  |      ||||||||    
T  27420742 tcagtctcttggtcacgg------gaagagattcgaggttttcggtataattaggtttgaagactgattcttgtaaccctttggaatcttttgtaaagtt 27420835  T
Q  679 gcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
     || || |||||| ||||||  || |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  27420836 actcatcattataatggaacatagagttgctctctcccccatagtaggtcagttttggaccgaactaggtaaacaaattccatgtgttctctct 27420929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 555 - 669
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886367
Alignment:
Q  555 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattc 654  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||      |||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgg------gaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattc 5886352  T
Q  655 ttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||    
T  5886353 ttgtaacccattgat 5886367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 427 - 527
Target Start/End: Original strand, 3306729 - 3306829
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| |||  ||||||||    
T  3306729 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaacctagagatatagggggctg-aaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatagagtt 3306827  T
Q  526 tg 527  Q
    ||    
T  3306828 tg 3306829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 53591125 - 53591353
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||||||| |            
T  53591125 ctataaatatagacattgtataagtgtaaaccttgagatagaggaggctg-aaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt-------- 53591215  T
Q  526 tgctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggac 623  Q
      |||||   ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||      ||| ||| ||| ||||| |||     
T  53591216 --ctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctctt------ggttacgagaatagatttggat 53591307  T
Q  624 tttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  53591308 tttgggtagaattagg-cgggagacttattcttctaatccattgata 53591353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 555 - 669
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899840
Alignment:
Q  555 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattc 654  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||      |||| ||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgg------gaagtgattggggctttgggtagaattaggcg-ggagacttattc 5899825  T
Q  655 ttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||    
T  5899826 ttgtaacccattgat 5899840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 558 - 757
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168363
Alignment:
Q  558 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttg 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagt------gtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattagg-cgagagacttattcttg 11168257  T
Q  658 taacccattga--------tagtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggta 749  Q
    |||||||||||        | |||| ||| ||||| | |||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||||| |||     
T  11168258 taacccattgatttctcttttgtaacgttacttatca-tatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccaaacttggtc 11168355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 485 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 31021410 - 31021295
Alignment:
Q  485 ggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgg-gaaacactattagg 583  Q
    |||||||||| ||||   ||||||||||||| ||  |||||||| || | |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31021410 ggtttagaagccaaccctaaaactagggtttgta--gagtttgccctagtcaacaaacactagggttgggattgattcaccttggagaaacactattagg 31021313  T
Q  584 attgagtcttttggtcac 601  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  31021312 attgagtctcttgatcac 31021295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 382 - 542
Target Start/End: Original strand, 11072830 - 11072983
Alignment:
Q  382 tatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaac 481  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||  | |||| ||  |      |||||    
T  11072830 tatcttcagcgtgatatccgttccaaatttgtgagttatatttctctataaataaagatcttgtatcagaggaaatatggagagagtag-----aaaaac 11072924  T
Q  482 aacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaac 542  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||| |||  |  ||||||| |||||||||||||||    
T  11072925 aagggtttagaagtcaacaacaaaactagagtt--tggagagttttctcttggcaacaaac 11072983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 427 - 479
Target Start/End: Original strand, 6484315 - 6484367
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaa 479  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6484315 ctataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa 6484367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 427 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 1618985 - 1618819
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt--gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagt 524  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||   |||||  |||||||||||  |||||||     
T  1618985 ctataaatatagaccttgtaccatagtaaaccttgagagacagagggggctgaaaacaagggtttagaaacaaacaa-caaactagggtt--tatagaga 1618889  T
Q  525 ttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttt 594  Q
    || ||||   |   | |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  1618888 tttctctaaacgggagacactagggttgggattgattcaccttggaaaacactattatgattgagacttt 1618819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 556 - 660
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066751
Alignment:
Q  556 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggtttggagacttatt 653  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||      ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaatcttttgatcacgg------gaagagattcgggactttgggtagaattaggttt-gaaactgatt 11066744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 427 - 493
Target Start/End: Original strand, 1321371 - 1321436
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa 493  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  1321371 ctataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaa 1321436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 553 - 670
Target Start/End: Original strand, 4666573 - 4666685
Alignment:
Q  553 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggaga--ctt 650  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||      ||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||  |||    
T  4666573 gggttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtc------tctaggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagatcctt 4666665  T
Q  651 attcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  4666666 attcttgtaatccattgata 4666685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 758
Target Start/End: Original strand, 23941864 - 23942028
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattg------atagtaaagttgct-tataattatagt 693  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||       | |||||||| ||  | |||||||||    
T  23941864 ggtcacgggaaaagattcgggaatttgggtagaattaggtttgaatacttattcttgtaaccgtttggaatcttttgtaaagttactcaaaaattatagt 23941963  T
Q  694 ggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaattt 758  Q
    ||| || || |||||||| ||| ||| | ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  23941964 ggagcgaagagttgctctctcctccatagtaggtcagtattggaccaaactgggtaaataaattt 23942028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 574 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27762085
Alignment:
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||      |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27762165 cactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggttgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 27762085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 571 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47882981
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  47883064 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 47882981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 598
Target Start/End: Original strand, 54884089 - 54884259
Alignment:
Q  429 ataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg 527  Q
    ||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||||||| | |||||| ||||||||  ||| ||  |||||||    
T  54884089 ataaatataaacattggatcattgtaaaccttgagatagagggagctcgaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttgta--gagtttg 54884185  T
Q  528 ct-cttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggt 598  Q
     | ||| | ||||||||||| | || |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  54884186 tttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 54884259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 571 - 661
Target Start/End: Original strand, 5858546 - 5858627
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5858546 aaacactattaggattgagtctt--------ggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 5858627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 602 - 663
Target Start/End: Original strand, 13893487 - 13893547
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 663  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13893487 ggtcacgggaagagattgagactt-gggtaaaattaggtttgaagactgattcttgtaaccc 13893547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094168
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  10094256 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt 10094168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10201048
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  10201136 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt 10201048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 574 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 29914132 - 29914052
Alignment:
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29914132 cactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 29914052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 574 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 47878350 - 47878270
Alignment:
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  47878350 cactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 47878270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 574 - 661
Target Start/End: Original strand, 54193229 - 54193309
Alignment:
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  54193229 cactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 54193309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 553 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 4560482 - 4560402
Alignment:
Q  553 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 639  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||      ||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4560482 gggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgtt------ggttaccggaagagattggagctttgggtagaattagg 4560402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 602 - 661
Target Start/End: Original strand, 10897030 - 10897088
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  10897030 ggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 10897088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 571 - 657
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462282
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttg 657  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16462203 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactaattcttg 16462282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 602 - 661
Target Start/End: Original strand, 54188534 - 54188592
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  54188534 ggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 54188592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 660
Target Start/End: Original strand, 3329918 - 3329975
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3329918 ggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaa 3329975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 686 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 10612846 - 10612761
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10612846 attatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa-ttcttgtgttctctct 10612761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 4560597 - 4560540
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaa 479  Q
    |||| |||||| |||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4560597 tttcactataagtatagactatgtatcatagtaaacattgagatagagggggctgaaa 4560540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 659
Target Start/End: Original strand, 7418089 - 7418145
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgta 659  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  7418089 ggtcacgggaagagattgggac-ttggctagagttaggtttgaagactgattcttgta 7418145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 688 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 10958386 - 10958318
Alignment:
Q  688 tatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  10958386 tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 10958318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 688 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 35919178 - 35919110
Alignment:
Q  688 tatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  35919178 tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 35919110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 53896528 - 53896475
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggct 475  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  53896528 tttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct 53896475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 602 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 10208157 - 10208094
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  10208157 ggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt 10208094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 602 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 11007670 - 11007630
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggttt 642  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11007670 ggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattaggttt 11007630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 606 - 661
Target Start/End: Original strand, 4535643 - 4535697
Alignment:
Q  606 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4535643 acgggaagaggttgggaatt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 4535697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 427 - 458
Target Start/End: Original strand, 4663849 - 4663880
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaacc 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4663849 ctataaatatagacattgtatcagagtaaacc 4663880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 10612935 - 10612877
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  10612935 ggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttataac 10612877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 546
Target Start/End: Original strand, 13893362 - 13893429
Alignment:
Q  476 gaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacacta 546  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  13893362 gaaaacaa-ggtttagaagtcaacataaaaactagggtt--tatagagaattctcttggcaacaaacacta 13893429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 686 - 757
Target Start/End: Original strand, 16996991 - 16997062
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    |||||||||||||||||   |||||  ||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  16996991 attatagtggaacggagaactgctcactcccccagactaggtaagtatgggactgaactgggtaaacaaatt 16997062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 661
Target Start/End: Original strand, 38002894 - 38002952
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  38002894 ggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaac 38002952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 619 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 42297803 - 42297752
Alignment:
Q  619 gggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  42297803 gggattttgtgtagaattaggtttgaagactgattcttgtaaccctttgata 42297752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 619 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 46966789 - 46966746
Alignment:
Q  619 gggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 662  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  46966789 gggactttgggtagaattaggtttgaagactaattattgtaacc 46966746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 686 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 47878239 - 47878168
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||| ||||||| | || |||  |||||||||||||||||    
T  47878239 attatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaatt 47878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 686 - 768
Target Start/End: Original strand, 6303423 - 6303505
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||   ||  || ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6303423 attatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattaaaccaaactgggtaaacaaatatcttgtgttct 6303505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 553 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 7606858 - 7606828
Alignment:
Q  553 gggttgattcaccttgggaaacactattagg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606858 gggttgattcaccttgggaaacactattagg 7606828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 602 - 656
Target Start/End: Original strand, 16996900 - 16996953
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattctt 656  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16996900 ggtcacggaaagaaattggga-tttgggtagaattaggtttgaagactaattctt 16996953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 485 - 559
Target Start/End: Original strand, 23941737 - 23941811
Alignment:
Q  485 ggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttga 559  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||  ||| |||||| ||| |||||||||| ||||| ||||    
T  23941737 ggtttagaagccaacaacaaaactagggtttgtagagttttttctcttgacaataaacactaaggttgggattga 23941811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 686 - 768
Target Start/End: Original strand, 54193340 - 54193422
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  54193340 attatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttct 54193422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Original strand, 11066474 - 11066527
Alignment:
Q  382 tatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctctataaata 435  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||||||    
T  11066474 tatcttcagcgtgatatccgttccaaatttgtgagttctctttctctataaata 11066527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 688 - 729
Target Start/End: Original strand, 11170598 - 11170639
Alignment:
Q  688 tatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtca 729  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  11170598 tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 11170639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 688 - 757
Target Start/End: Original strand, 30006035 - 30006103
Alignment:
Q  688 tatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  30006035 tatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 30006103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 688 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 47701734 - 47701693
Alignment:
Q  688 tatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtca 729  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  47701734 tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagattaggtca 47701693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 406 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 53973936 - 53973903
Alignment:
Q  406 aaatttataagttatatttctctataaatataga 439  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53973936 aaatttatgagttatatttctctataaatataga 53973903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 304 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 2080 - 1623
Alignment:
Q  304 aaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnnncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgtt 403  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||         ||| || |  ||||||||| ||||||| | ||    
T  2080 aaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaa--aaaggaaacctatcttcagcgtgatatccatt 1983  T
Q  404 ccaaatttataagttatatttctctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaag 502  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  1982 ccaaatttacgagttacatttctcta--aatatagaccttgtatcagatgtaaacctagagatagaggtggctgaaa-caagggtttagaagtcaacaag 1886  T
Q  503 aaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacg 602  Q
    ||||||||||||| ||||||||||        |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||      |    
T  1885 aaaactagggtttgtatagagttt--------caacaaacactagggttgtggttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttctt------g 1800  T
Q  603 gtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtg 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||        |||||||| || || |||||||||    
T  1799 gtcacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg 1701  T
Q  695 gaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1700 gaacgtagggctgctctctcccccatactaggtcagtttttgaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 1623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 172; Significance: 5e-92; HSPs: 115)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 270 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 42331484 - 42330994
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||           
T  42331484 atatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggagaaagaaa 42331385  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  42331384 --aaaaaaaacgtatctttagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagataga 42331287  T
Q  469 gggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcac 564  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||||||    
T  42331286 gggggctgaaa-caagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 42331188  T
Q  565 cttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccca 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  42331187 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta----cacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccca 42331093  T
Q  665 ttgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaat 756  Q
    ||||||        |||||||| || || | ||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  42331092 ttgatatctcttttgtaaagttactcatta-tatagtgaaacggagggctattctctcccccagattaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 42330995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 270 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 13099956 - 13099471
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||| ||| ||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  13099956 atattttcgtaccgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaa----- 13099862  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  13099861 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaccttgagataga 13099764  T
Q  469 gggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacacta-agattg-gggttgattcac 564  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  13099763 gggggttgaaa-caagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcac 13099665  T
Q  565 cttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccca 664  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||      ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||    
T  13099664 cttgggaaacactattaagattgagtctctt------ggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagatttattcttgtaaccca 13099572  T
Q  665 ttgata---------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaa 755  Q
    ||||||         |||||||| || || ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||||||    
T  13099571 ttgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 13099473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 270 - 670
Target Start/End: Original strand, 24258267 - 24258662
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    |||||||||||  || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  24258267 atatttttgtacagtatgaaggacgattga-tgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgtaaatattctttcactgaaggagaaaaaaa 24258365  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgt--gatattcgttccaaatttataagttatatttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatag 467  Q
       ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||    
T  24258366 t--aaagaaatgtatcttcagtgtgtgatattcgttccaaatttatgagttatatttctctataaatataggttttgtatcagagtaaacattgagatag 24258463  T
Q  468 agggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattca 563  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||   |||||||||||    
T  24258464 agggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattca 24258562  T
Q  564 ccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 663  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||   | | |||||||||||||||||    
T  24258563 ccttggaaaacactattaggattgagtctctt------ggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattagg-cggaaaacttattcttgtaaccc 24258655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 427 - 770
Target Start/End: Original strand, 7188503 - 7188846
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||    
T  7188503 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaagtcaacaataaaaatagggtttgtatagggttt 7188601  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||| |||||| ||||||    
T  7188602 gctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt------ggtcacgggaatagattgagacttt 7188695  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttccccc 718  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||||||        ||||||||  | || |||||||||||||||| || |||||| | ||||    
T  7188696 gggtagaattaag-cgggagacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacggaaggctgctctcttcccc 7188794  T
Q  719 agattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctct 770  Q
    ||  || |||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  7188795 agtctatgtcagttttggactgaactaggtaaacaaattttgcgtgttctct 7188846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 3035524 - 3035922
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  3035524 atatttttgtatcgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaag--- 3035620  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga---- 464  Q
      |||| | | ||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||        
T  3035621 --aaaaaaaacgtatcttcagtatggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 3035718  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgat 560  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||    
T  3035719 tagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 3035817  T
Q  561 tcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |   ||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3035818 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa---gaagaggctgggactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaa 3035913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 270 - 757
Target Start/End: Original strand, 20299264 - 20299752
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  20299264 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaga------ 20299357  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt----gaga 464  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||    ||||    
T  20299358 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccatatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 20299455  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt---ggggttga 559  Q
    |||||||||||||||  |  ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||    |||||||    
T  20299456 tagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttga 20299555  T
Q  560 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgta 659  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  20299556 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 20299648  T
Q  660 acccattga--------tagtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaa 751  Q
    |||||||||        | |||| ||| || || | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||    
T  20299649 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggttgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 20299746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 31156391 - 31156001
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  31156391 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaa----- 31156297  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | | |||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||| || | |||||||||||||  ||||||||  | |||| ||||||||||    
T  31156296 --aaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagctatacttttactataaatatagagcttgtatcaaggcaaactttgagataga 31156199  T
Q  469 gggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcac 564  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||| |||| |  |||||||||||    
T  31156198 gggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcac 31156100  T
Q  565 cttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 663  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  31156099 cttgggaaacactattaggattggagtctcttg-----ggt-acgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc 31156007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 277 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 37412600 - 37412217
Alignment:
Q  277 tgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnnncaaaag 376  Q
    |||| ||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||         ||||     
T  37412600 tgtaacgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattcttccactgaaggaga--------aaaaa 37412509  T
Q  377 agatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggct 475  Q
    | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  37412508 aaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatttatgagttatatttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatatagggggct 37412409  T
Q  476 gaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttg-gcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttggg 570  Q
    |||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||| | || |  |||||||||||||||||    
T  37412408 gaaa-caagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg 37412310  T
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||||||| ||      ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37412309 aaacactattaggattgagtctctt------ggttacaggaagagactgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaactcattgata 37412217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 11757034 - 11757428
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  11757034 atatttttgtatcgtatgaagaactatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaga------ 11757127  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt----gaga 464  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||    ||||    
T  11757128 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 11757225  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt---ggggttga 559  Q
    |||||||||||||||  |  ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||    |||||||    
T  11757226 tagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttga 11757325  T
Q  560 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgta 659  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  11757326 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 11757418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 7470512 - 7470113
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||           
T  7470512 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggagaaaagaa 7470413  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga---- 464  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||        
T  7470412 aaaaaaaa-acgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagaga 7470314  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgat 560  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||    
T  7470313 tagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgat 7470215  T
Q  561 tcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  7470214 tcaccttgtgaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 7470122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 20625843 - 20626236
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||           
T  20625843 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaaggagca----- 20625937  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctct-ataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga---- 464  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | | | |||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||        
T  20625938 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagaga 20626035  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgat 560  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||| | || |  |||||||    
T  20626036 tagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgat 20626134  T
Q  561 tcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20626135 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-atggagacttattcttgtaa 20626227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 20629734 - 20630127
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||           
T  20629734 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaaggagca----- 20629828  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctct-ataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga---- 464  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | | | |||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||        
T  20629829 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagaga 20629926  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgat 560  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||| | || |  |||||||    
T  20629927 tagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgat 20630025  T
Q  561 tcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20630026 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-atggagacttattcttgtaa 20630118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 20642153 - 20642546
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||           
T  20642153 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaaggagca----- 20642247  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctct-ataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga---- 464  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | | | |||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||        
T  20642248 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagaga 20642345  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgat 560  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||| | || |  |||||||    
T  20642346 tagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgat 20642444  T
Q  561 tcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20642445 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-atggagacttattcttgtaa 20642537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 20297168 - 20297560
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||           
T  20297168 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcaccgaaggaga------ 20297261  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt----gaga 464  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||| |||  ||| |||||| ||| |||||||||  ||||| ||    ||||    
T  20297262 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttacgagttatacttttactaaaaatatggaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 20297359  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgat 560  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| || | ||   ||||||||    
T  20297360 tagagggggctg-aaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgat 20297458  T
Q  561 tcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  20297459 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattggggctttgggtagaaatagg-tgggagacttattcttgtaa 20297551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 428 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 24817677 - 24817338
Alignment:
Q  428 tataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24817677 tataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaa-caagggtttagaagtcaacaagagaactagggtttgtatagagttt 24817580  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
    |||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||| ||||||    
T  24817579 gctctttgcaacaaacactagggtt-gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattgagtctctt------ggtcacgggaagagattgagacttt 24817487  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga--------tagtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttccccc 718  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||        | |||||||| || || |||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  24817486 gggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccccc 24817388  T
Q  719 agattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
    | | ||||||||||||||||  |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  24817387 atactaggtcagttttggaccgaacttggtaaacgagtttcgtgtgttct 24817338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 38393792 - 38394184
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |           
T  38393792 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatgttatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggtgaa----- 38393886  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga---- 464  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||        
T  38393887 --aaaata-acgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 38393983  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgat 560  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||    
T  38393984 tagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgat 38394082  T
Q  561 tcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  38394083 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 38394175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 270 - 670
Target Start/End: Original strand, 21989960 - 21990349
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  21989960 atatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagga----- 21990054  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21990055 --aaaaaaaacgtatcttctgtgtggtattcgttccaaatttatgagttataattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagataga 21990152  T
Q  469 gggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcac 564  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||| | ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||||||    
T  21990153 gggg-ctgaaa-caagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 21990250  T
Q  565 cttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccca 664  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||      ||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||   |||||||| |||||||||| ||    
T  21990251 cttgagaaacactattagaattgagtctctt------ggttacgggaagagattgaggctttgagtagaattagg-cgggagactttttcttgtaactca 21990343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 7352137 - 7351742
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||           
T  7352137 atatttttgtatcgcatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgaggcaaatattctttcactgaatgaga------ 7352044  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt------ga 462  Q
      |||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| || |||||||||  ||||| ||      ||    
T  7352043 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatataaaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 7351946  T
Q  463 gatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttg 558  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||| | ||   ||||||    
T  7351945 gatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttg 7351847  T
Q  559 attcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttg 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  7351846 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt------ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttg 7351754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 490 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 24813761 - 24813479
Alignment:
Q  490 agaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24813761 agaagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaagaaacactagggtt-gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgag 24813663  T
Q  590 tcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgct 681  Q
    ||| ||      ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||        |||||||| ||    
T  24813662 tctctt------ggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttact 24813570  T
Q  682 tataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
     || ||||||||||| |||| || |||| | ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24813569 catcattatagtggagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctct 24813479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 7472465 - 7472071
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||           
T  7472465 atattattgtatcatatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggagaaa---- 7472370  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga---- 464  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||        
T  7472369 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagaga 7472272  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgat 560  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||    
T  7472271 tagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgat 7472173  T
Q  561 tcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||    
T  7472172 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattagg-cgggacacttattcttgtaa 7472080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 18345346 - 18345739
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  18345346 atatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaatggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaa----- 18345440  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgag----a 464  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| |||||||||  | ||| |||||    |    
T  18345441 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctgaactttgagggaga 18345538  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgat 560  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| | || |  |||||||    
T  18345539 tagagggggttgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgat 18345637  T
Q  561 tcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||| ||||||  || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  18345638 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 18345730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 381 - 670
Target Start/End: Original strand, 443508 - 443794
Alignment:
Q  381 gtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaa 479  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  443508 gtatcttcagtgtggaattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggagct-aaa 443606  T
Q  480 acaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaaca 575  Q
    |||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||    
T  443607 acaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca 443706  T
Q  576 ctattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||||||||| ||      | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  443707 ctattaggattgagtctctt------gattacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgagagacttattcttgtaatccattgata 443794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 20091870 - 20091635
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  20091870 ctataaatatagactttttatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttcggaggcaacac-aaaactagggtttgtatagagttt 20091772  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
    ||| ||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||      |||||||||||||||||| ||||||    
T  20091771 gctattggcaacaaagattagggttggggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctctt------ggtcacgggaagagattgagacttt 20091678  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20091677 gggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 20091635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 7349758 - 7349363
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||           
T  7349758 atatttttgtatcgcatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgaggcaaatattctttcactgaatgaga------ 7349665  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt------ga 462  Q
      |||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||      ||    
T  7349664 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 7349567  T
Q  463 gatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttg 558  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||| | ||   ||||||    
T  7349566 gatagagggggctg-aaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttg 7349468  T
Q  559 attcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttg 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||      ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  7349467 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt------ggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttg 7349375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 28485370 - 28485764
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||           
T  28485370 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcaccgaaggaggaa---- 28485465  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga---- 464  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||        
T  28485466 --aaaaaacacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 28485563  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgat 560  Q
    |||| |||| ||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||    
T  28485564 tagaaggggttgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgat 28485662  T
Q  561 tcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||   ||||| ||||||||||||    
T  28485663 tcacctttggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgagaagagattggggctttgagtataattagg-cgggagatttattcttgtaa 28485755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 274 - 669
Target Start/End: Original strand, 28487362 - 28487751
Alignment:
Q  274 ttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnnncaa 373  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||         ||    
T  28487362 ttttgtatcgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaa-------aa 28487454  T
Q  374 aagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctc-tataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga----taga 468  Q
    || | | |||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||| || || |||||||||||||  ||||||||  ||||| ||||||    ||||    
T  28487455 aaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttctaaatttatgagttatacttttcctataaatatagaccatgtatcaggctaaactttgagagagataga 28487554  T
Q  469 gggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcac 564  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||| | || |  |||||||||||    
T  28487555 gggggctgaaa-caagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcac 28487653  T
Q  565 cttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccca 664  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||      ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  28487654 ctttggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacaggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccca 28487746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 20137438 - 20137106
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  20137438 ctataaatattggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtt 20137340  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||      | | |||||||||||||||||    
T  20137339 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctctt------gattacgggaagagattggga 20137246  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| || || ||||||||| ||||||||| |||||| |     
T  20137245 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctct- 20137148  T
Q  715 ccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  20137147 ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 20137106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 427 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 4296265 - 4296026
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacatt-gtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagt 524  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4296265 ctataaatatagacatttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagt 4296167  T
Q  525 ttg-ctctt-ggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgg 620  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||||    
T  4296166 ttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgg 4296073  T
Q  621 gactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga 668  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4296072 gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaactcattga 4296026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 43254006 - 43253608
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  43254006 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaa-- 43253909  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatag- 467  Q
      | |||| | |||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||     
T  43253908 --ataaga-aagtatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 43253812  T
Q  468 -------agggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattg-gggtt 557  Q
           || |||||| |||||| | ||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||| |||||    
T  43253811 gagagaaagagggctg-aaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttgagggtt 43253713  T
Q  558 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttg 657  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      | | |||| |||||  || |||||||| ||||||||||   |||||||||||||||    
T  43253712 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------gattacggaaagaggctgagactttggatagaattagg-cgggagacttattcttg 43253620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Original strand, 44724539 - 44724871
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  44724539 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaacctggagatatagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 44724637  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||| ||||||  |||||    
T  44724638 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgagaagaggctggga 44724731  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||        |||| ||| || || | ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  44724732 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctc 44724829  T
Q  715 ccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  44724830 ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 44724871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 1849774 - 1850179
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||           
T  1849774 atatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcagatattctttcactgaaggagaa----- 1849868  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt-------- 460  Q
      |||| | | | |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||| ||| || |||| ||            
T  1849869 --aaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagaga 1849966  T
Q  461 --------gagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagat 550  Q
            |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |    
T  1849967 gagagagagagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 1850065  T
Q  551 t--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagac 648  Q
    |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||      | | ||||||||||  |||||||||| |||||||||||   ||||||    
T  1850066 ttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtttctt------gcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattagg-cgggagac 1850158  T
Q  649 ttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1850159 ttattcttgtaacccattgat 1850179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 11355218 - 11355457
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11355218 ctataaatataggctttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 11355316  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || |||||||||| |||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| || ||||||||||| ||    
T  11355317 tgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacaggaagagattgaga 11355410  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11355411 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaactcattgata 11355457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 428 - 729
Target Start/End: Original strand, 24748555 - 24748860
Alignment:
Q  428 tataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24748555 tataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgacttagagggggctg-aaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagttt 24748653  T
Q  527 g-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggac 623  Q
    | ||||| | ||||||||||| | ||   ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||     || |||||||||||||||||    
T  24748654 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggt-----tc-cgggaagagattgggac 24748747  T
Q  624 tttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcc 715  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||        |||| ||| || || ||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  24748748 tttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcc 24748846  T
Q  716 cccagattaggtca 729  Q
     |||||||||||||    
T  24748847 tccagattaggtca 24748860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 39146316 - 39146077
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttaga-agtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  39146316 ctataaatatagacactgtatcagtgtaaaccttgagatggagggggctg-aaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 39146218  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||||||||||||||| | || |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||      ||| ||||||||||||||| |    
T  39146217 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctctt------ggttacgggaagagattggaa 39146124  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39146123 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacacattgata 39146077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 427 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 31435376 - 31435070
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31435376 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 31435278  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||| ||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||| |    
T  31435277 tgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctggaa 31435184  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||        |||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  31435183 ctttgggtagaattagg-tggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc 31435085  T
Q  715 ccccagattaggtca 729  Q
    ||||| | |||||||    
T  31435084 ccccaaactaggtca 31435070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 427 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 27306558 - 27306213
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27306558 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-tatagagtt 27306461  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | |||||| |||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  |||||    
T  27306460 tgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctggga 27306367  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    ||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||        |||| ||| || || | ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  27306366 ctttgggtaaaattagg-cgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctc 27306269  T
Q  715 ccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  27306268 ccctagactaggtca-atttggaccaaactgggtcaacaaa-ttcttgtgttctctct 27306213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 21678026 - 21678265
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  21678026 ctataaatatagatattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtatagagtt 21678124  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||||||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||| ||||| |||||||    
T  21678125 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgagaagatattggga 21678218  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21678219 ctttgggtagcattagg-cgggagacgtattcttgtaacccattgata 21678265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 21679987 - 21680226
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21679987 ctataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 21680085  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| || ||||||||||||||    
T  21680086 tgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttaccggaagagattggga 21680179  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||||||| |   ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  21680180 ctttgggtagaatta-gacgggagatttattcttgtaacccaatgata 21680226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 44524 - 44762
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  44524 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtt 44622  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||      ||| |||||||||| ||||||    
T  44623 tgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctttt------ggttacgggaagaggttggga 44716  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  44717 ctttgggtagaattatg-tgggagacttattcttgtaacccattgat 44762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 427 - 772
Target Start/End: Original strand, 6332186 - 6332529
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||    |||| | | |||||||||  |||||||||    
T  6332186 ctataaatataaaacttgtatcagagtaa-ccttgagagagagggggctggaaacaagggtttataaacatacaacaga-ctagggttt--atagagttt 6332281  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||        |||||||||| ||||||    
T  6332282 actcttggcaacaaacactaggattgagattgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaa------gaagagattgagacttt 6332375  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttccccc 718  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||        |||||||| || || |||||||||||||||| |  || ||| |||||     
T  6332376 aggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttctctcccct 6332475  T
Q  719 agattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6332476 agactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 6332529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 471 - 772
Target Start/End: Original strand, 11081515 - 11081818
Alignment:
Q  471 gggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttggg 570  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||| ||  ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||| |||||    
T  11081515 gggctgaaaacaagggtttagaagccaacaacaaaactagggtttgtagagaatt--ctcttggcaacaaacactagggttgagattgattcactttggg 11081612  T
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc--attga 668  Q
    |||||||||||||||||||||| ||      | ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||   ||||    
T  11081613 aaacactattaggattgagtctctt------gatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttga 11081706  T
Q  669 ta--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcg 760  Q
    ||        |||||||| || ||  ||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |    
T  11081707 tatctcttgtgtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaactgggtaaacaaattttg 11081806  T
Q  761 tgtgttctctct 772  Q
    ||||||||||||    
T  11081807 tgtgttctctct 11081818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 25276101 - 25276340
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  25276101 ctataaatatatgctttgtatcagagcaaactttgagatagagggggct-aaaacaataatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 25276199  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||||||||||||||| | || |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||| ||    
T  25276200 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgaga 25276293  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  25276294 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgata 25276340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 35589 - 35827
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||| || ||| |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  35589 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggttcagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtagagtt 35687  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||      ||| ||||||||||  |||||    
T  35688 tgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctctt------ggttacgggaagaggctggga 35781  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  35782 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 35827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 1049624 - 1049386
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1049624 ctataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 1049526  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | || |||||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||      ||| ||||||||||  |||||    
T  1049525 tgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctggga 1049432  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  1049431 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 1049386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 24465508 - 24465736
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||       |||||||||| ||||| |||    
T  24465508 ctatagatatagactttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaatcaa-------actagggtttgtatagcgtt 24465599  T
Q  526 tgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactt 625  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||      ||||| ||||||||||||||||||    
T  24465600 tgctcttggcaacaaacactagggttgaa-ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctctt------ggtcatgggaagagattgggactt 24465692  T
Q  626 tgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24465693 tgggtagaattagg-tgggagatttattcttttaactcattgata 24465736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 270 - 472
Target Start/End: Original strand, 3677087 - 3677285
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  3677087 atatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagagaa--- 3677183  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||||||    
T  3677184 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatgagttatgtttttactataaatatagatcttgaatcagagtaaacttggagataga 3677281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 270 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 7092659 - 7092471
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  7092659 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagga----- 7092565  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatat-ttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga 464  Q
      |||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  7092564 --aaaaaaattgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgaga 7092471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 427 - 603
Target Start/End: Original strand, 22392433 - 22392600
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||       |||||||||| |||||| |||    
T  22392433 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttataaatcaa-------actagggtttgtatagaattt 22392524  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacgg 603  Q
    ||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22392525 gctattggcaacaaacactagggttggg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgg 22392600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 9679014 - 9679258
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgaga----tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctata 520  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||    ||||||||||||||| ||| | | ||||| | |||||| ||||||||||||| ||||    
T  9679014 ctataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaa-caaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttgtata 9679112  T
Q  521 gagtttg-ctctt-ggcaacaaacactaagattgggg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagat 617  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||| ||||||||    
T  9679113 gagtttgtctctttggcaacaaacactaggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgtgaagagat 9679206  T
Q  618 tgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9679207 tgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 9679258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 40837071 - 40836833
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||  | ||||| |||||||||||||  || ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  40837071 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaatttggagattgagggggctgaaag-aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 40836973  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  || ||    
T  40836972 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgaga 40836879  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  40836878 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 40836833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 422 - 757
Target Start/End: Original strand, 48457604 - 48457945
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga----tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttc 516  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||    ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||     
T  48457604 tttcactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 48457702  T
Q  517 tatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaag 613  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||    
T  48457703 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaag 48457796  T
Q  614 agattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga--------tagtaaagttgcttataattatagtggaacggagggt 705  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||        | |||| ||| || || | |||||||||||||||||     
T  48457797 aggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggc 48457894  T
Q  706 tgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    |||||| ||||||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  48457895 tgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 48457945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 381 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 40281752 - 40281364
Alignment:
Q  381 gtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatag--ag-ggggctga 477  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||| || ||  ||||||||||| ||  || | | || |    
T  40281752 gtatcttcagcgtgatatctgttccaaatttatgagttatatttctttataaatataaaccttgtctcggatgaaaccttgagagaggtagagagtctaa 40281653  T
Q  478 aaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacact 577  Q
    |||| | | |||||||   |||||  ||||||||||||  | |||  || ||||  ||   | |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||     
T  40281652 aaaccaggatttagaaacaaacaa-caaactagggtttagagagatatttctctaagcgggagacactagggttgggattaattcaccttgggaaacacc 40281554  T
Q  578 attaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga-tagtaaag 676  Q
     |||||||||||||| ||      |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  40281553 gttaggattgagtctgtt------ggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatttgtaaag 40281460  T
Q  677 ttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    || || ||  || | |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  40281459 ttactcatcgttgttgtggaacgaagggatgctctctcccccagactagttcagtattggacagaactgtgtaaacaaattttgtgtgttctctct 40281364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 270 - 469
Target Start/End: Original strand, 1606280 - 1606472
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  1606280 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaga------ 1606373  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | | |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||    
T  1606374 --aaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga 1606471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 476 - 772
Target Start/End: Original strand, 6048883 - 6049181
Alignment:
Q  476 gaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttg-ggaaac 574  Q
    |||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| || ||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||  |||||    
T  6048883 gaaaacaagggtttagaagccaacatcaaaactagggtttgtaaagaatt--ctcttggcaacaaacactaggtttgggattgattcaccttgaagaaac 6048980  T
Q  575 actattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata---- 670  Q
    |||||||||||||| ||| ||      ||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||        
T  6048981 actattaggattgaatctctt------ggtcacgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaagacgtattcttataaccctttgatatccc 6049074  T
Q  671 ---gtaaagttgcttataat--tatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgt 765  Q
       |||||||| || || ||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||| |||||  |||||  |||| |||| ||||||| |||||||    
T  6049075 tttgtaaagttactcatcattatatagtggaacggagagttgctcttccccccatactagctcagtaatggaccgaactaggtagacaaattccgtgtgt 6049174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 270 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 7094906 - 7094686
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  7094906 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagga----- 7094812  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatat-ttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt----gaga 464  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||    ||||    
T  7094811 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagaga 7094714  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggtttagaa 493  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  7094713 tagagggggctg-aaacaagggtttagaa 7094686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 439 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 21592460 - 21592235
Alignment:
Q  439 acattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggca 536  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| |||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | |    
T  21592460 acattgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctg-aaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttgga 21592362  T
Q  537 acaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaa 634  Q
    |||||||||| | ||   ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||      ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21592361 acaaacactagggtttgagggttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctctt------ggttacgcgaagagattgggactttgggtagaa 21592268  T
Q  635 ttaggtttggagacttattcttgtaacccattga 668  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21592267 ttagg-tgggagacttattcttgtaactcattga 21592235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 9680774 - 9681019
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgaga----tagagggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctata 520  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  9680774 ctataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggttgaaa-caagggtttagaagggcaacaacaaaactatggtttgtata 9680872  T
Q  521 gagtttg-ctctt-ggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagaga 616  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| | || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||    
T  9680873 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaga 9680966  T
Q  617 ttgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9680967 ttgagactttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaactcattgata 9681019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 432 - 669
Target Start/End: Original strand, 3878540 - 3878775
Alignment:
Q  432 aatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga--tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg- 527  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  3878540 aatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 3878638  T
Q  528 ctcttggcaacaaacacta-agattg-gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactt 625  Q
    ||||| | ||||||| |||  | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  || |||||    
T  3878639 ctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgagactt 3878732  T
Q  626 tgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  3878733 tgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 3878775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 22828962 - 22828723
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  22828962 ctataaatataggctttgtatccgagtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtt 22828864  T
Q  526 t-gctcttggcaacaaacacta-agattg-gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    |  ||||||  ||||||||||| || |||  ||||||||||  || | |||||||||||||||||||||| ||      ||| | |||||||||||| ||    
T  22828863 tatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggattgagtctctt------ggttatgggaagagattgaga 22828770  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22828769 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 22828723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 443 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 27832947 - 27832656
Alignment:
Q  443 tgtatcagagtaaaccttgagatagagggg-gctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaaca 539  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||| || | |||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27832947 tgtatcagagcaaaccttgtgatagagtggagctgaaa-caagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtatagagtttgtctcttggcaaca 27832849  T
Q  540 aacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaatta 637  Q
     |||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27832848 tacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgagactttgggtaaaatta 27832755  T
Q  638 ggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtca 729  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| || || ||||||||| || |||||| | |||| ||||||||| |||||||    
T  27832754 gg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctcccccagactaggtca 27832656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 461 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 1047219 - 1047015
Alignment:
Q  461 gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggt 556  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||    
T  1047219 gagatagagggggctgaaa-caggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 1047121  T
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattctt 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  1047120 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattctt 1047028  T
Q  657 gtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||    
T  1047027 gtaacccattgat 1047015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 420 - 561
Target Start/End: Original strand, 6348771 - 6348913
Alignment:
Q  420 tatttctctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttcta 518  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  6348771 tatttctctataaatataaaccttgtatcagatgtaaacattgagatagagaggactgaaaacaagggtttagaagtaaaaaagaaaactagggtttgta 6348870  T
Q  519 tagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgatt 561  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||    
T  6348871 tcgagtttgctcttggcaacaaacattagggttgaggttgatt 6348913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 270 - 450
Target Start/End: Original strand, 38396095 - 38396269
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  38396095 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaa----- 38396189  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcag 450  Q
      |||| | | |||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||    
T  38396190 --aaaaaaaacgtatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag 38396269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 25542491 - 25542727
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||  ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  25542491 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataga-ggggctg-aaacaaaggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 25542588  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | || |||||||| | ||   ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||      ||| || |||||||| |||||    
T  25542589 tgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-ggaaagactattaggattgagtctctt------ggttacaggaagagactggga 25542681  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||    
T  25542682 ctttgggtagaattatg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 25542727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 427 - 639
Target Start/End: Original strand, 42223116 - 42223327
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagg-gggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagt 524  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  42223116 ctataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagatgtgggatgaaa-caagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 42223214  T
Q  525 ttg-ctctt-ggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgg 620  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| | || |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||||    
T  42223215 ttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgg 42223308  T
Q  621 gactttgggtagaattagg 639  Q
      |||||| ||||||||||    
T  42223309 agctttggatagaattagg 42223327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 427 - 664
Target Start/End: Original strand, 26804533 - 26804765
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  26804533 ctataaatatagaccttgt----gagtaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 26804627  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacacta----agattg-gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattg 619  Q
    || ||||| | |||||||||||     | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||      ||| ||||||||||  ||    
T  26804628 tgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctctt------ggttacgggaagaggctg 26804721  T
Q  620 ggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccca 664  Q
     |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  26804722 agactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccca 26804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 270 - 359
Target Start/End: Original strand, 47865437 - 47865526
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaag 359  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  47865437 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 47865526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 427 - 582
Target Start/End: Original strand, 18567573 - 18567731
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18567573 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 18567671  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattag 582  Q
    || ||||| | ||||||| ||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567672 tgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 519 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 13290710 - 13290455
Alignment:
Q  519 tagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagat 617  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||      |||||| |||||| ||    
T  13290710 tagagttttctcttggcaacaaacactaggcttgggagtgattcaccttcgagaaacactattagaatttagtctctt------ggtcacaggaagatat 13290617  T
Q  618 tgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata-------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctc 710  Q
    | | ||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||       |||||||| || || ||||||| ||||| ||| | | | |    
T  13290616 tagaactctgggtagaattaggtttgaagaataattcttgtaaccttttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagcggaacagagagctacac 13290517  T
Q  711 tttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    | |||| |||| | ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13290516 tctccctcagacttggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 13290455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 556 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297002
Alignment:
Q  556 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattct 655  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||      |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| | |||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattct 16297129  T
Q  656 tgtaacccattga---------tagtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgg 746  Q
    |||||||| || |         | | |||||| || || |||||||| |||||||| | |||||| ||||| ||| || |||||| ||||||  |||||     
T  16297128 tgtaacccttttaatatctcttttgcaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcccctagactatgtcagtattggaccgaactgt 16297029  T
Q  747 gtaaacaaattt-cgtgtgttctctct 772  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16297028 gtaaacaaatttccgtgtgttctctct 16297002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 553 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 7092412 - 7092303
Alignment:
Q  553 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttat 652  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||      |||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  7092412 gggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgg------gaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttat 7092320  T
Q  653 tcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||    
T  7092319 tcttgtaacccattgat 7092303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 270 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21470774 - 21470685
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaag 359  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  21470774 atatttttatatcgtatgaagaacgatttgatgcgaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 21470685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 466 - 669
Target Start/End: Original strand, 40946327 - 40946526
Alignment:
Q  466 agagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgatt 561  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||    
T  40946327 agagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatt 40946425  T
Q  562 caccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
     || |||| |||||||||||||||||||||| ||       || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  40946426 tactttggaaaacactattaggattgagtctctt------agttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 40946518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 22251871 - 22251640
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||| ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22251871 ctataaatataaaccttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctg-aaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtt 22251773  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || || || | ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||        ||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||| |     
T  22251772 tgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgagg 22251687  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251686 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 22251640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 553 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 7094660 - 7094551
Alignment:
Q  553 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttat 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||      |||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  7094660 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgg------gaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttat 7094568  T
Q  653 tcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||    
T  7094567 tcttgtaacccattgat 7094551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 428 - 758
Target Start/End: Original strand, 26210507 - 26210837
Alignment:
Q  428 tataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    ||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||  |||||||  | |||||| | |||||||  ||||   ||||||||||||| || ||| ||     
T  26210507 tataaatatagaacttgtatcaaatgtaaaccttgaga--gaggggggaggaaacaaggttttagaatccaacctcaaaactagggtttgtagagaatt- 26210603  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagatt-gggact 624  Q
     ||||||||||||| ||||| | ||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||      ||| |||| |||||||| ||||||    
T  26210604 -ctcttggcaacaa-cactagggttgtgattgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctctt------ggtaacggaaagagattcgggact 26210695  T
Q  625 ttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc-attgata-------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttccc 716  Q
    || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||       | |||||| || || |||||| | |||||||| | | |||| ||||    
T  26210696 ttcggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaacccttttgatacatgtttggaaagttactcatcattataatagaacggagagcttctctctccc 26210795  T
Q  717 ccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaattt 758  Q
    |  || ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26210796 ctggagtaggttagtattggactgaactgggtaaacaaattt 26210837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 602 - 738
Target Start/End: Original strand, 6046625 - 6046768
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata-------gtaaagttgcttataattatagtg 694  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||       |||||||| || || |||||||||    
T  6046625 ggtcacgagaaaagaatgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtg 6046724  T
Q  695 gaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggac 738  Q
    ||| | || | |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  6046725 gaatgaagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggac 6046768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 496 - 642
Target Start/End: Original strand, 11084409 - 11084547
Alignment:
Q  496 caacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctttt 595  Q
    |||||||||||||||||||| || | | ||  |||||||||||||||| || | ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11084409 caacaagaaaactagggtttgtagaaaatt--ctcttggcaacaaacaatagggttgagattgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 11084506  T
Q  596 ggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggttt 642  Q
          ||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  11084507 ------ggtcacgagaagagattcgaactttgggtaaaattaggttt 11084547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 427 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 30906379 - 30906264
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||  |  ||||||| |||| ||||||||||    
T  30906379 ctataaatatagaccttgtataagagtaaatcttgagatagagggggctgaaaacaagaatttagaa-acaaataacaaactagagtttgtatagagttt 30906281  T
Q  527 gctcttggcaacaaaca 543  Q
    |||||| ||||||||||    
T  30906280 gctcttagcaacaaaca 30906264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 553 - 669
Target Start/End: Original strand, 38396724 - 38396833
Alignment:
Q  553 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttat 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||      ||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  38396724 gggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgg------gaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttat 38396816  T
Q  653 tcttgtaacccattgat 669  Q
    | |||||||||||||||    
T  38396817 ttttgtaacccattgat 38396833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 624 - 757
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22394015
Alignment:
Q  624 tttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcc 715  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| || || ||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  22393876 tttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctcc 22393974  T
Q  716 cccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    || ||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22393975 cctagactaggtca-atttggaccaaactgggtaaacaaatt 22394015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 606 - 669
Target Start/End: Original strand, 2935405 - 2935467
Alignment:
Q  606 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  2935405 acgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 2935467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 555 - 661
Target Start/End: Original strand, 2120881 - 2120982
Alignment:
Q  555 gttgattcaccttggg--aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttat 652  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  2120881 gttgattcaccttggacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgat 2120973  T
Q  653 tcttgtaac 661  Q
    |||||||||    
T  2120974 tcttgtaac 2120982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 602 - 670
Target Start/End: Original strand, 6348914 - 6348981
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6348914 ggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattattgtaacccattgata 6348981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 606 - 669
Target Start/End: Original strand, 1606517 - 1606578
Alignment:
Q  606 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1606517 acgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagac-tattcttgtaacccattgat 1606578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 571 - 661
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351436
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25351353 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 25351436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 571 - 661
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357130
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25357047 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 25357130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 571 - 661
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410213
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25410130 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 25410213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 571 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320033
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga-- 668  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||        
T  3320232 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcattatct 3320140  T
Q  669 --tagtaaagttgcttata-attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgt 765  Q
      | ||||||   || ||  ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||| || |||||    
T  3320139 ctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgt 3320040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 571 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324781
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga-- 668  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||        
T  3324980 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcattatct 3324888  T
Q  669 --tagtaaagttgcttata-attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgt 765  Q
      | ||||||   || ||  ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||| || |||||    
T  3324887 ctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgt 3324788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 534 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 12310236 - 12310166
Alignment:
Q  534 gcaacaaacactaagattggggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtcttttggtcacgg 603  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12310236 gcaacaaacactagggttgggattgattcaccttgaacaaacactattaggattgagtctcttggtcacgg 12310166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 485 - 661
Target Start/End: Original strand, 30246879 - 30247053
Alignment:
Q  485 ggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttg-----attcaccttgggaaa--cact 577  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| ||||| | ||||| |||     ||||||||||   ||  ||||    
T  30246879 ggtttagaagccaacaacaaaactagggtttatagagaattt-ctcttggcaacaa-cactacggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcact 30246976  T
Q  578 attaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  30246977 attaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagaccgattcttgtaac 30247053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 666
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069868
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  7069780 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt 7069868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 666
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074875
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  7074787 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt 7074875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 8378661 - 8378490
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga----tagtaaagttgcttata--attatagtgg 695  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||      | ||||||   || |||  ||||||||||    
T  8378661 ggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcattatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtgg 8378563  T
Q  696 aacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  8378562 atcggagagttgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttct 8378490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 666
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405481
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  25405393 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt 25405481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 574 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 44512704 - 44512624
Alignment:
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  44512704 cactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 44512624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 606 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 9027345 - 9027284
Alignment:
Q  606 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9027345 acgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagac-tattcttgtaacccattgat 9027284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 606 - 669
Target Start/End: Original strand, 22137215 - 22137276
Alignment:
Q  606 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||||||||    
T  22137215 acgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cggaagac-tattcttgtaacccattgat 22137276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 609 - 757
Target Start/End: Original strand, 26295586 - 26295740
Alignment:
Q  609 ggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacgg 700  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||| || || ||||||||| ||| |    
T  26295586 ggaagcgattgtgactttgggtagaattagg-cgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacag 26295684  T
Q  701 agggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    | |  |||||| ||| ||||| |||||||  |||||||| |||||| ||||||||||    
T  26295685 atgactgctctctcctccagactaggtca-atttggactgaactggataaacaaatt 26295740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 606 - 669
Target Start/End: Original strand, 40552242 - 40552303
Alignment:
Q  606 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||||||||    
T  40552242 acgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cggaagac-tattcttgtaacccattgat 40552303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 571 - 661
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006746
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  42006663 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgatttttgtaac 42006746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 6067357 - 6067300
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6067357 ggtcacgggaagagattgagactttga-tagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 6067300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 435
Target Start/End: Original strand, 10691029 - 10691083
Alignment:
Q  381 gtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctctataaata 435  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  10691029 gtatcttcggtgtgatatctgttccaaattcatgagttatatttctctataaata 10691083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 574 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 44144045 - 44143965
Alignment:
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  44144045 cactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactttggc-agaattaggtttgaagactgattcttgtaac 44143965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 686 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 6067266 - 6067195
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| | ||||||||| ||||||   ||||||||||||||||    
T  6067266 attatagtgaaacggagagctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccggactgggtaaacaaatt 6067195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 606 - 669
Target Start/End: Original strand, 22108204 - 22108265
Alignment:
Q  606 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||||||||    
T  22108204 acgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cggaagac-tattcttgtaacccattgat 22108265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 686 - 757
Target Start/End: Original strand, 25410244 - 25410315
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||||    
T  25410244 attatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 25410315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 686 - 757
Target Start/End: Original strand, 30247084 - 30247155
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||| |||||||   || ||| ||||||||||||||||||    
T  30247084 attatagtggaacggagagctgctatctcccccagactaggtcatcattagaccaaactgggtaaacaaatt 30247155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 686 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 34546948 - 34546877
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||||    
T  34546948 attatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 34546877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 606 - 669
Target Start/End: Original strand, 40549964 - 40550025
Alignment:
Q  606 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||||||||    
T  40549964 acgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cggaagac-tattcttgtaacccattgat 40550025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 685 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 2990697 - 2990627
Alignment:
Q  685 aattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaa 755  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||  ||||||||| |||||| || ||||||  |||||||||||||||    
T  2990697 aattagagtagaacggagagttgctccctcccccagagtaggtcggtattggaccgaactgggtaaacaaa 2990627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 686 - 768
Target Start/End: Original strand, 25405506 - 25405588
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  25405506 attatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttct 25405588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12310499 - 12310442
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatatt 327  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  12310499 atatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgtaaatatatttttaaaaggaatatt 12310442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 689 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 49091729 - 49091665
Alignment:
Q  689 atagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaa 754  Q
    ||||||||  |||| |||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  49091729 atagtggattggagagttgctctcttccccagattaggtca-tattggactaaactgggtcaacaa 49091665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 170; Significance: 8e-91; HSPs: 97)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 270 - 670
Target Start/End: Original strand, 17011885 - 17012264
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||               
T  17011885 atatttttgtaccgtatgatggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaa----------- 17011973  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag 469  Q
      |||| | | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17011974 --aaaaaaaacgtatcttcagagtgatgttcgttccaaatttatgagttatatttctctataaatatagaccttgtatcggagtaaaccttgagatagag 17012071  T
Q  470 ggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgg 569  Q
    ||| ||||| | || ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||      
T  17012072 gggtctgaataaaagggtttagaagtaaacaa-caaactagggtttgtataaagtttgctcttggcaacaaacactagggttgaggttgattcaccttct 17012170  T
Q  570 gaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||      ||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||    
T  17012171 gaaacaatattaggattgagtctctt------ggtcacgagaagagattgatgcttttggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaactcattgat 17012263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 19705056 - 19704659
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  19705056 atatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagaaaa--- 19704960  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt------gag 463  Q
      |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||      |||    
T  19704959 --aaaagaaacgtatcttaagtgtgatattcgttccaaatttatgagttatatttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagag 19704862  T
Q  464 atagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacacta-agattg-gggttga 559  Q
    || |||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||| || ||| |||||||    
T  19704861 atggagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttga 19704763  T
Q  560 ttcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgt 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  19704762 ttcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt------ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 19704670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 427 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 3028179 - 3027833
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  3028179 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccatgagataaaaggggctgaaaacaagggtttggaaggcaacac-aaaactagggtttgtatagagttt 3028081  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||| |||||||||| ||||||    
T  3028080 gctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggtcacgtgaagagattgagacttt 3027987  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctcttt-cccc 717  Q
    | |||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||        |||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  3027986 gagtagaattagg-ctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttccccc 3027888  T
Q  718 cagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    |||| |||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3027887 cagactaggtcagtttttgaccgaactggataaacaaatttcgtgtgttctctct 3027833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 12195995 - 12195605
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  12195995 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaa----- 12195901  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | | |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||    
T  12195900 --aaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga 12195803  T
Q  469 gggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcac 564  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||| | ||   ||||||||||||    
T  12195802 gggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcac 12195704  T
Q  565 cttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 663  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||      ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  12195703 cttgggaaacactattaggattggagtctctt------ggttacgggaagagattgggactttgagtagaatta-atcgggagacttattcttgtaaccc 12195611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 2629370 - 2628976
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  2629370 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagga----- 2629276  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | |||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||| |||    
T  2629275 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtagtatttgttccaaatttattagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatgttaaactttgagagaga 2629178  T
Q  469 g-----ggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttga 559  Q
    |     ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||   |||||||    
T  2629177 gatagaggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttga 2629079  T
Q  560 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggag-acttattcttgt 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||    
T  2629078 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg--cggagaatttattcttgt 2628987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 30035087 - 30034694
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||           
T  30035087 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcagatattctttcactgaaggagaa----- 30034993  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt----gaga 464  Q
      || | | | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||    ||||    
T  30034992 --aataaaaacgtatcttcaatgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttaagagaga 30034895  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgat 560  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||| |||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||    
T  30034894 tagagggagct-aaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 30034796  T
Q  561 tcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||      ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  30034795 tcaccttgggaaacactattaggattgagtcaatt------ggttaagggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 30034703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 30967032 - 30967424
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  30967032 atatttttgtattgtatgaagaacgatttaatgcaaatatattttgaaagcgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaa----- 30967126  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt----gaga 464  Q
      |||| | | | |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||    ||||    
T  30967127 --aaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtat-aggctaaactttgagagaga 30967223  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgat 560  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||   ||||||||    
T  30967224 tagagggggctg-aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgat 30967322  T
Q  561 tcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  30967323 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaa 30967415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 427 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 16455753 - 16455410
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga--tagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagt 524  Q
    ||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||  ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  16455753 ctataaatatataccttgtatcggtgtaaaccttgagaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtacagagt 16455655  T
Q  525 ttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggact 624  Q
    || ||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||      | |||||| ||||||||||||||    
T  16455654 tttctcttggcaacgaacactagggttgtggttgattcaccttgggaaacactgttaggattaagtctctt------gctcacggaaagagattgggact 16455561  T
Q  625 ttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttccc 716  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||        ||||| || || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16455560 ttgggtagaattagg-cgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 16455462  T
Q  717 ccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
    ||| | ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16455461 ccatactaggtcagtattggaccgaactgagtaaacaaatttcgtgtgttct 16455410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 430 - 670
Target Start/End: Original strand, 25477262 - 25477498
Alignment:
Q  430 taaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg- 527  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  25477262 taaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgt 25477360  T
Q  528 ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactt 625  Q
    ||||||| ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      |||||||| ||||||||||| |||    
T  25477361 ctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggtcacggaaagagattggggctt 25477454  T
Q  626 tgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25477455 tgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 25477498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 13057179 - 13057418
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  13057179 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtatagagtt 13057277  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||      ||| |||||||||||||||||    
T  13057278 tgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctctt------ggttacgggaagagattggga 13057371  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13057372 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 13057418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 270 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 22858427 - 22857934
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||| ||| |||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||| ||| ||||| ||           
T  22858427 atatttttgtaccgtatgaaagaagattagatgcaaatatattttgaaagggaat--------tttgatgcaaatattctttcattgaaggagaaa---- 22858340  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag 469  Q
      |||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||    ||||| |||     
T  22858339 --aaaagaaacgtatcttcaacgtgatatacgttccaaatttatgagttatatttctctataaatataaaccttgtatcagatgaatttgtgagagagat 22858242  T
Q  470 gggg-----ctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcac 564  Q
     | |     | |||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||| ||  || ||| ||||||| ||||||||||| | ||| | |||||||||    
T  22858241 agagagaaccagaaaacaagggtttagaagctaacacaaaaactagggtttgta--gaattttctcttggtaacaaacactagggttgagattgattcac 22858144  T
Q  565 cttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccca 664  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||        |||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  22858143 cttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacaa------gaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaagactaattcttgtaaccct 22858050  T
Q  665 tt-gata-------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaat 756  Q
    || ||||       |||||||| || || |||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  22858049 tttgatatatctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaaacaaat 22857950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 3630193 - 3629954
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  3630193 ctataaatatagacattgtatcaatgtaaaacttgagatagagggggctg-aaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 3630095  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| ||||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||      ||| ||||||||||||||||     
T  3630094 tgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctctt------ggttacgggaagagattgggg 3630001  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3630000 ctttgggtagaattagg-agggagacttattcttgtaacccattgata 3629954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 3632267 - 3632028
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  3632267 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagttg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 3632169  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||||||||||||||| | ||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||       || |||| ||||||||||||    
T  3632168 tgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctt------tgttacggaaagagattggga 3632075  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3632074 ctttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgata 3632028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 453 - 772
Target Start/End: Original strand, 15719665 - 15719976
Alignment:
Q  453 taaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattg 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||       |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  15719665 taaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaatcaa-------actagggtttgtatagagtttgcttttggcaacaaacactagggttg 15719756  T
Q  553 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttat 652  Q
     | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  15719757 ag-ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt------ggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttat 15719848  T
Q  653 tcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctcttt-cccccagattaggtcagttttggactaaac 743  Q
    ||||||||||||||||||        |||||||| || || ||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||  |||||||  |||    
T  15719849 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagagttgctctttccccccatactaggtca-atttggaccgaac 15719947  T
Q  744 tgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15719948 ttggtaaacaaatttcatgtgttctctct 15719976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 26933049 - 26932652
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  26933049 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaga------ 26932956  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt-------- 460  Q
      |||| | | | |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| || |||| ||            
T  26932955 --aaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgggttatactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagaga 26932858  T
Q  461 gagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggt 556  Q
    ||||||||||||| || |||||| || |||| ||  ||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||| | ||   ||||    
T  26932857 gagatagagggggttg-aaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggt 26932759  T
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattct 655  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||      ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  26932758 tgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctctt------ggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattct 26932666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 427 - 772
Target Start/End: Original strand, 19696426 - 19696774
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagaggg--ggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagt 524  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||  ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||   ||||| |||  |||||||| ||||||||    
T  19696426 ctataaatatagaccttgtatatgatgaaaccttgagagagagggagggctgaaaacaagggtttagaaacaaacaacaaat-tagggtttgtatagagt 19696524  T
Q  525 ttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggact 624  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||       ||||| | ||||||||| ||||    
T  19696525 ttgctcttggcaacaatcactagggttcaaattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctt------tgtcactgaaagagattgagact 19696618  T
Q  625 ttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttccc 716  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||        ||||||||  | || ||||||||||||| ||  | |||||| || |    
T  19696619 ttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatagctgctctctctc 19696718  T
Q  717 ccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19696719 ccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 19696774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Original strand, 3390364 - 3390697
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  3390364 ctataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagacggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 3390462  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    |  ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| || | |||||||||||     
T  3390463 tttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacagaaagagattgggg 3390556  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| || || |||| |||| ||||||||| |||||| ||    
T  3390557 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgctctctc 3390655  T
Q  715 ccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||| | |||||||  ||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  3390656 ccccatactaggtca-atttggaccaaattgggtcaacaaatt 3390697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 427 - 772
Target Start/End: Original strand, 26945133 - 26945478
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagag-taaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||   ||||| ||| ||||| |||  | |||| |    
T  26945133 ctataaatataaaccttgtatcaggtataaaccttgagatatagggggccgaaaacaagggtttagaaacaaacaacaaa-ctaggtttt--agagagat 26945229  T
Q  526 tgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactt 625  Q
    | ||||  ||   | |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||      ||||||||||||||||||||    
T  26945230 ttctctaagcggaagacactaaggttgtggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtc------acgggaagagattgggactt 26945323  T
Q  626 tgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccc 717  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||        |||||||| || || |||||||| ||||| ||||  |||||  ||||    
T  26945324 tgggtagaattaggtttgtagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccc 26945423  T
Q  718 cagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26945424 cagattatgtcaggtttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtcttctctct 26945478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 11983358 - 11983120
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| || |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11983358 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caaaggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 11983260  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  |||||    
T  11983259 tgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctggga 11983166  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  11983165 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 11983120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 14507504 - 14507266
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14507504 ctataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggct-aaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 14507406  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  |||||    
T  14507405 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctggga 14507312  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||    
T  14507311 ctttgggtagaattagg-cggaagacttattcttgtaacccattgat 14507266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 9019911 - 9020150
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  9019911 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggct-aaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 9020009  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||| ||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |  ||||||||||||||    
T  9020010 tgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttataggaagagattggga 9020103  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9020104 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 9020150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 15541469 - 15541230
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  15541469 ctataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtt 15541371  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | || |||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||      ||||||| |||||||||||||    
T  15541370 tgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctctt------ggtcacgagaagagattggga 15541277  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15541276 ctttgggtaggattagg-cgggagacgtattcttgtaacccattgata 15541230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 422 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 28241655 - 28241412
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctata 520  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||    
T  28241655 tttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28241557  T
Q  521 gagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagat 617  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||      
T  28241556 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggc 28241463  T
Q  618 tgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||| |||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||    
T  28241462 tgggactttcggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaacccattgat 28241412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 270 - 527
Target Start/End: Original strand, 17852375 - 17852627
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||| | | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  ||           
T  17852375 atatttttgtaccttatgaagaactatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattatttcactgaaagagaaga--- 17852471  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17852472 --aaaaaaaaagtatcttc-gtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagataga 17852568  T
Q  469 gggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg 527  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  17852569 gggggctg-aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttg 17852627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 428 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 14459093 - 14458858
Alignment:
Q  428 tataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14459093 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctg-aaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 14458995  T
Q  527 g-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggac 623  Q
    | ||||||| ||||||||||| | ||   ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||||    
T  14458994 gtctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgatt--ccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgggac 14458903  T
Q  624 tttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  14458902 tttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 14458858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 401 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 15533036 - 15532771
Alignment:
Q  401 gttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaa 498  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||    
T  15533036 gttccaaattt-taagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggtaa 15532939  T
Q  499 caagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctttt 595  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||||||  |||| | |||||||| || | ||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  15532938 caacaaaactagggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt 15532839  T
Q  596 ggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
          ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  15532838 ------ggtcatgggaagagattgggacttttggtagaattagg-cgagagacttattcttgtaacccattgata 15532771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 427 - 729
Target Start/End: Original strand, 13039739 - 13040045
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||| ||| ||| || |||||| |||||| |||||||||    
T  13039739 ctataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatataggaggctg-aaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtatagagtt 13039837  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||      ||| |||||||||||||| ||    
T  13039838 tgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctt------ggttacgggaagagattgaga 13039931  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    ||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||        |||| ||| || || ||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  13039932 ctttgcgtagaattagg-cggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctc 13040030  T
Q  715 ccccagattaggtca 729  Q
    ||| ||| |||||||    
T  13040031 ccctagactaggtca 13040045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 30729157 - 30728821
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||| |||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  30729157 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtatcgaaagacaacaacaaaacttgggtttgtatagagtt 30729059  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||      ||| ||||||||||  ||||     
T  30729058 tgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctctt------ggttacgggaagaggctgggg 30728965  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata------------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctc 710  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||||            |||||||| || || |||||||||||||||| || |||||    
T  30728964 ctttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcat-attatagtggaacggaaggctgctc 30728867  T
Q  711 tttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    | |||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  30728866 tctcccgcagactaggtca-atttggaccaaactgggtcaacaaatt 30728821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 427 - 729
Target Start/End: Original strand, 32279982 - 32280287
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggttt-agaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  32279982 ctatatatatagaccttgtatcatagtaaacttggagataga-ggggctg-aaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 32280079  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||||||||||||||  | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||||||    
T  32280080 tgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattggga 32280173  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    |||  ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| || ||  |||||||  ||||||||| |||||| ||    
T  32280174 cttcaggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtaaaacggagggctgctctctc 32280272  T
Q  715 ccccagattaggtca 729  Q
    ||||||| |||||||    
T  32280273 ccccagactaggtca 32280287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 427 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 15530451 - 15530220
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||| || |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15530451 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagagggggctgaag-caagggcttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 15530353  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||| ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||| |     
T  15530352 tgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgagg 15530259  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 662  Q
    |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  15530258 ctttgggttgaattagg-cgggagacttattcttgtaacc 15530220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 24338777 - 24338537
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||  ||| ||||    
T  24338777 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcataaagtt 24338679  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacacta--agattg-gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    ||  |||| |||||||||||||   | ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||      ||| | || ||||||||  |    
T  24338678 tgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagattgagtctttt------ggttatggaaagagattaag 24338585  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  24338584 actttgggtagaatta-gtcagaagacttattcttgtaacccattgata 24338537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 422 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 1230583 - 1230340
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctata 520  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||    
T  1230583 tttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaactttgagatagagagggttgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 1230485  T
Q  521 gagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagat 617  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||      ||| |  |||||||      
T  1230484 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctctt------ggttattggaagaggc 1230391  T
Q  618 tgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  1230390 tgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 1230340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 270 - 464
Target Start/End: Original strand, 18317860 - 18318048
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  18317860 atatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagaa----- 18317954  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga 464  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| || |||| ||||||    
T  18317955 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgaga 18318048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 427 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 3234059 - 3233822
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||| | |||||| ||||||| ||||| |||| ||||    
T  3234059 ctataaatatagac-ttgtatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaa-caaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtatatagtt 3233962  T
Q  526 tg-ctctt-ggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    || ||||| || ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||| |    
T  3233961 tgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgag 3233868  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga 668  Q
     ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  3233867 gctttgggtagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattga 3233822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 12186398 - 12186068
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    |||| ||| | ||| |||  | |||| |    
T  12186398 ctataaatataaaccttgtatcacatgtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaaacagacaacaaaccaaggtttt--agagagat 12186301  T
Q  526 tgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactt 625  Q
    | ||||  ||   | | |||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||      |||||||||| |||||    
T  12186300 ttctctaagcgggagaaactagggttgttgttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgg------gaagagattgagactt 12186207  T
Q  626 tgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccc 717  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| | ||     
T  12186206 tgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcct 12186107  T
Q  718 cagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    | || |||||||  |||| ||  |||||||||||||||||    
T  12186106 cggactaggtca-atttgaaccgaactgggtaaacaaatt 12186068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 461 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 4816526 - 4816322
Alignment:
Q  461 gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggt 556  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||    
T  4816526 gagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 4816428  T
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattctt 656  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  4816427 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattctt 4816335  T
Q  657 gtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||    
T  4816334 gtaacccattgat 4816322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 427 - 584
Target Start/End: Original strand, 15346376 - 15346524
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||       |||||||||| |||| | |||    
T  15346376 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaac-caagggtttagaattcaa-------actagggtttgtataaaattt 15346467  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattagga 584  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15346468 gctcttggcaacaaacactagggtt-gggttgattcaccttgggaaacactcttagga 15346524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 461 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 20915651 - 20915446
Alignment:
Q  461 gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggt 556  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||    
T  20915651 gagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 20915553  T
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattct 655  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||      ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||    
T  20915552 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt------ggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattagg-cgggagacttattct 20915460  T
Q  656 tgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||    
T  20915459 tgtaacccattgat 20915446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 427 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 32447645 - 32447525
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  32447645 ctataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 32447547  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacacta 546  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  32447546 tgtctcttggcaacaaacacta 32447525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 427 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 19227737 - 19227528
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19227737 ctataaatatagatcttgtatcagagcaaactttgagataaagggggct-caaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 19227639  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || || || | | ||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  || ||    
T  19227638 tgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgaga 19227545  T
Q  623 ctttgggtagaattagg 639  Q
    |||||||||||||||||    
T  19227544 ctttgggtagaattagg 19227528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 270 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5275819 - 5275730
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaag 359  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5275819 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 5275730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 430 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 12161880 - 12161647
Alignment:
Q  430 taaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctatagagtttgc 528  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  12161880 taaatatagacattgtatcattgtaaaccttgagata-aaggggctg-aaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg- 12161784  T
Q  529 tcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
    |||  | ||||||||||| | ||   |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||      ||| |||||||||||||| ||||||    
T  12161783 tctctggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaagatcgagtctatt------ggttacgggaagagattgagacttt 12161690  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
     |||| ||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12161689 aggtataattaag-tgggagatttattcttgtaacccattgata 12161647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 429 - 670
Target Start/End: Original strand, 22490626 - 22490864
Alignment:
Q  429 ataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag--aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  22490626 ataaatatagacattgaattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagttt 22490724  T
Q  527 g-ctcttggcaacaaacactaagattggggttg--attcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggac 623  Q
    | ||||| | ||||||||||| | || | |  |  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||| |||||||||||||    
T  22490725 gcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattgagtctctt------ggttacggaaagagattgggac 22490818  T
Q  624 tttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||    
T  22490819 tttgggtagaattatg-cgagagacttattcttgtaacccattgata 22490864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 429 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 25078879 - 25078539
Alignment:
Q  429 ataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag-ggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg 527  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||    |||| ||  ||||||||| ||  ||||||     
T  25078879 ataaatatagac-ttgtatcagaataaaccttgagagagagaggggccgaaaacaaaggtttagaaacatacaacaat-ctagggtttgta--gagttta 25078784  T
Q  528 ctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttg 627  Q
    |||||||||||||||| || | |||   |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| ||||||||||       ||||||||| || |||     
T  25078783 ctcttggcaacaaacattagggttgaaattgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacgga------aagagattgaga-ttta 25078691  T
Q  628 ggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttccccca 719  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||        |||||||| ||  | |||| |||||||||||||  |||| ||   ||||    
T  25078690 agtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcattacagtggaacggaggactgct-ttcttccca 25078592  T
Q  720 gattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    |  ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25078591 gtctaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctct 25078539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 461 - 668
Target Start/End: Original strand, 26065005 - 26065205
Alignment:
Q  461 gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggt 556  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||| | ||   |||||| | || |  |||    
T  26065005 gagatagagggggctgaaa-caagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggt 26065100  T
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattctt 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  26065101 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattctt 26065193  T
Q  657 gtaacccattga 668  Q
    ||||||||||||    
T  26065194 gtaacccattga 26065205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 461 - 668
Target Start/End: Original strand, 26084974 - 26085174
Alignment:
Q  461 gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggt 556  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||| | ||   |||||| | || |  |||    
T  26084974 gagatagagggggctgaaa-caagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggt 26085069  T
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattctt 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  26085070 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattctt 26085162  T
Q  657 gtaacccattga 668  Q
    ||||||||||||    
T  26085163 gtaacccattga 26085174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 427 - 772
Target Start/End: Original strand, 15367021 - 15367364
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcaga-------gtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctat 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||| || ||||       | ||||| || |||    
T  15367021 ctataaatatagacattgtatcagacatcggtgtaaaccttgagatagagggggctgaac-caagggcttataattcaa-------attaggggttgtat 15367112  T
Q  520 agagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattg 619  Q
     | |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||       ||| |||||||||||||    
T  15367113 tgtgtttgctcttggcaacaaacactagggttggg-ttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctctt------cgtcgcgggaagagattg 15367205  T
Q  620 ggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctct 711  Q
      |||||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||||| |||        ||||||||  | || | ||||||| |||||| || ||||||    
T  15367206 aaactttgggtaaaatta-atcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatca-tatagtgaaacggaaggctgctct 15367303  T
Q  712 ttc-ccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
     || ||||||| |||||||  |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15367304 ctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctct 15367364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 519 - 662
Target Start/End: Original strand, 20526885 - 20527022
Alignment:
Q  519 tagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagatt 618  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||      ||||||  |||||||||    
T  20526885 tagagtttgctcttgacaacaaacactagggttgagattgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt------ggtcacaagaagagatt 20526978  T
Q  619 gggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 662  Q
      |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20526979 aagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaacc 20527022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 553 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 5273416 - 5273306
Alignment:
Q  553 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagactta 651  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  5273416 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgg------gaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagactta 5273324  T
Q  652 ttcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5273323 ttcttgtaacccattgat 5273306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 427 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 1072206 - 1072086
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  1072206 ctataaatatagacattgtatcagagtaaactttgagatagaaggagctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtt 1072108  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacacta 546  Q
    || ||||| | |||||||||||    
T  1072107 tgtctctttggaacaaacacta 1072086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 559 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069809
Alignment:
Q  559 attcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgt 658  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |      |||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacag------gaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 1069821  T
Q  659 aacccattgata 670  Q
    ||||||||||||    
T  1069820 aacccattgata 1069809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 476 - 746
Target Start/End: Original strand, 30445553 - 30445832
Alignment:
Q  476 gaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgg-gaaac 574  Q
    |||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| || | | ||  ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||| |||||    
T  30445553 gaaaacaatggtttagaagccaacattaaaactagggtttgtagataatt--ctcttggcaacaaacactacggttgagattgattcaccttggagaaac 30445650  T
Q  575 actattaggattgagtct-tttggtcacggtcacgggaagagat-tgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata-- 670  Q
    |||||||||||    ||| ||   ||  ||||| | ||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||      
T  30445651 actattaggatattctctattctctcttggtcatgtgaagagatccaagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatc 30445750  T
Q  671 ------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgg 746  Q
          |||||||| || || |||||||||||||||||   |||||| ||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||||    
T  30445751 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctccaccatactaggtcagtattggactgaactgg 30445832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 614 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 12911592 - 12911431
Alignment:
Q  614 agattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata-------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggtt 706  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||||| || || ||||||||||||  || |||       |||||||| || || ||||||||||||||||||| |    
T  12911592 agattgagacttttggtagagttaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggct 12911493  T
Q  707 gctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12911492 gctctctcccccagactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaattttgtgtgttct 12911431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 428 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 13870749 - 13870632
Alignment:
Q  428 tataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  13870749 tataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagataga-ggggctg-aaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagttt 13870652  T
Q  527 g-ctcttggcaacaaacact 545  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  13870651 gtctcttggcaacaaacact 13870632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 427 - 527
Target Start/End: Original strand, 8995464 - 8995564
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  8995464 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggct-aaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 8995562  T
Q  526 tg 527  Q
    ||    
T  8995563 tg 8995564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 606 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 26068547 - 26068485
Alignment:
Q  606 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  26068547 acgggaagagattgggactttaggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaacccattgat 26068485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 603 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 12937350 - 12937179
Alignment:
Q  603 gtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata-------gtaaagttgcttataattatagtgg 695  Q
    |||||| ||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||  || |||       |||||||| || || ||||||||||    
T  12937350 gtcacgagaatagattgaaacttttggtagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctctttgtaaagttactcatcattatagtgg 12937251  T
Q  696 aacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||| |||||| ||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12937250 aacggagggctgctctct-ccccagactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaattttgtgtgttct 12937179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 643 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 25465708 - 25465572
Alignment:
Q  643 ggagacttattcttgtaacccattgata-------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttg 735  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||       |||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||| || |||| | || |||||| |||    
T  25465708 ggagacttattcttgtacccctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagtattg 25465609  T
Q  736 gactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25465608 gaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttctctct 25465572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 488 - 668
Target Start/End: Original strand, 6843178 - 6843355
Alignment:
Q  488 ttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaa-acactattaggatt 586  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||| || ||| |||  |||||||||||||||||| | || || |||| ||||||||   | |||| |||||||||    
T  6843178 ttagaagccaacaataaaactatggtttgtagagaattt--tcttggcaacaaacactagggttaggattgaatcaccttgaacacacaccattaggatt 6843275  T
Q  587 gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgg-gactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga 668  Q
    |||||| |||||||| |   | |||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||| ||||    
T  6843276 gagtctcttggtcacag---caggaagagattcgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaaccctttga 6843355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 557 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037722
Alignment:
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattctt 656  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||       || |||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacgga------aatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattctt 28037834  T
Q  657 gtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtgga---acggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactg 745  Q
    ||||||| ||||||        |||||||| || || || ||||||||   ||| | || |||||| ||||||||  ||||||||||||||||  | |||    
T  28037833 gtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggacggacgaaaggctgctctctcccccagtctaggtcagttttggaccgagctg 28037734  T
Q  746 ggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||||||||    
T  28037733 ggtaaacaaatt 28037722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 686 - 758
Target Start/End: Original strand, 7294042 - 7294114
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaattt 758  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  7294042 attatagtggaacagagagttgctctctcccccagagtaggtcagtattggaccaaactggataaacaaattt 7294114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 556 - 662
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138524
Alignment:
Q  556 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattc 654  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||      |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||     
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtc------acgggaagagatggggactttaggtagaattatgtttgaagactaatta 11138516  T
Q  655 ttgtaacc 662  Q
    ||||||||    
T  11138517 ttgtaacc 11138524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 606 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 26066276 - 26066214
Alignment:
Q  606 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  26066276 acgggaagagattgggactttaggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 26066214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 706 - 772
Target Start/End: Original strand, 11262726 - 11262792
Alignment:
Q  706 tgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11262726 tgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaacggggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 11262792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 5165972 - 5165912
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 663  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  5165972 ggtcacgggaagagattgggactt-gggtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccc 5165912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 432
Target Start/End: Original strand, 20526751 - 20526800
Alignment:
Q  383 atcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctctataa 432  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20526751 atcttcaatgtgatattcgttccaaatttacaagttatatttctctataa 20526800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 556 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 7542581 - 7542472
Alignment:
Q  556 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggtttggagacttattc 654  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||      ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||     
T  7542581 ttgattcacttggagaaacactattatgattgagtctcttggtcacgg------gaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaattt 7542488  T
Q  655 ttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||| ||||||    
T  7542487 ttgtaaccctttgata 7542472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 688 - 772
Target Start/End: Original strand, 15346596 - 15346679
Alignment:
Q  688 tatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||||||| ||||||  | |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15346596 tatagtgaaacggaaagctgctctctcccccagactaggtcaattt-ggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 15346679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 556 - 670
Target Start/End: Original strand, 14466440 - 14466547
Alignment:
Q  556 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattct 655  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||    ||||| ||||||    
T  14466440 ttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacggaaagagattgggagtttgagtagaattagg-cgagagacatattct 14466532  T
Q  656 tgtaacccattgata 670  Q
    |||||| ||||||||    
T  14466533 tgtaactcattgata 14466547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 606 - 669
Target Start/End: Original strand, 33309019 - 33309080
Alignment:
Q  606 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||    
T  33309019 acgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagac-tattcttgtaacccattgat 33309080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 606 - 669
Target Start/End: Original strand, 33311288 - 33311349
Alignment:
Q  606 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||    
T  33311288 acgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagac-tattcttgtaacccattgat 33311349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 427 - 471
Target Start/End: Original strand, 10584111 - 10584155
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagaggg 471  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10584111 ctataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 10584155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 666
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878815
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  13878727 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt 13878815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 666
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16786007
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  16785919 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt 16786007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 574 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 17695030 - 17694950
Alignment:
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17695030 cactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 17694950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 485 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 17904630 - 17904553
Alignment:
Q  485 ggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcac 564  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  17904630 ggtttagaagccaacaacaaaactagggtttgta--gagttttctctttgcaacaaacactaaggttgggattgaatcac 17904553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887318
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  26887406 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt 26887318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248808
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  31248896 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt 31248808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201420
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  35201508 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt 35201420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 571 - 657
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883554
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttg 657  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13883475 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttg 13883554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 606 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 29754861 - 29754799
Alignment:
Q  606 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||    
T  29754861 acggaaagagattgggactttaggtagaattagg-cggaagacttattcttgtaacccattgat 29754799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 12166303 - 12166246
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12166303 ggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaa 12166246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 686 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 35201395 - 35201309
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| ||||| ||| ||||||| | || |||  |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  35201395 attatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctctct 35201309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 433 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 12937519 - 12937437
Alignment:
Q  433 atatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagag-ggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggttt 515  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  12937519 atatagacattgtatcagatgtaaaccttgagatacagaggggctgaaaac-agggtttagaaacaaacaa-aaaactagggttt 12937437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 686 - 758
Target Start/End: Original strand, 30443535 - 30443607
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaattt 758  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  30443535 attatagtgtaacggagagctgctctctccccgagactaggtaagtattggaccgaactgggtaaacaaattt 30443607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 22342958 - 22342900
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22342958 ggtcacgggaagaggctggga-tttgggtagtattaggtttgaagactgattcttgtaac 22342900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 686 - 757
Target Start/End: Original strand, 25941783 - 25941854
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||||    
T  25941783 attatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 25941854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 725 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 26455186 - 26455139
Alignment:
Q  725 ggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26455186 ggtcagtattggactgaactggataaacaaatttcatgtgttctctct 26455139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 688 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 26932627 - 26932557
Alignment:
Q  688 tatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttc 759  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||  |||||||| ||||||||||    
T  26932627 tatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatttc 26932557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 686 - 768
Target Start/End: Original strand, 13878840 - 13878922
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  13878840 attatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttct 13878922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 686 - 768
Target Start/End: Original strand, 13883588 - 13883670
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  13883588 attatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttct 13883670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 686 - 768
Target Start/End: Original strand, 16786032 - 16786114
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  16786032 attatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttct 16786114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 686 - 768
Target Start/End: Original strand, 17038348 - 17038430
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| | |||||   || |||  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  17038348 attatagtggaacggagagctgctctctcccccagacttggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttct 17038430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 427 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 25466499 - 25466434
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa 493  Q
    |||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||    
T  25466499 ctataaatatagatcttttgtcagagtaaaccttgaggtaga-gaggctgaaaacaagggtttagaa 25466434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 604 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 25466054 - 25465998
Alignment:
Q  604 tcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    |||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25466054 tcacggaaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 25465998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 477 - 603
Target Start/End: Original strand, 30443336 - 30443459
Alignment:
Q  477 aaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttg-ggaaaca 575  Q
    ||||||| |||||||||| |||||  ||||||| | ||| || ||| ||  || |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||  ||||||    
T  30443336 aaaacaagggtttagaagccaacatcaaaactatgatttgtagagaatt--ctgttggcaacaaacactagggttgatattgattcaccttgaagaaaca 30443433  T
Q  576 ctattaggattgagtcttttggtcacgg 603  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||    
T  30443434 ctattaggat--agtcttctggtcacgg 30443459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 327
Target Start/End: Original strand, 30445347 - 30445404
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatatt 327  Q
    ||||||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  30445347 atatttttgtaccatatgaaggaagatttgatgcaaatatattttaaaaaggaatatt 30445404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 166; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 270 - 757
Target Start/End: Original strand, 78992 - 79476
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    |||||||||||  || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  78992 atatttttgtactgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaggaa---- 79087  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  | | |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  79088 --aaaaaaaatgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacctttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaacttgagataga 79185  T
Q  469 gggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattg--gggttgattcac 564  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||   ||||||||||||    
T  79186 gggggct-aaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcac 79284  T
Q  565 cttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccca 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  || || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  79285 cttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgagaatttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccca 79377  T
Q  665 ttga--------tagtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaat 756  Q
    ||||        | |||| ||| || || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||    
T  79378 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccaaactgggtcaacaaat 79475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 155; Significance: 7e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 11952 - 11564
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  11952 atatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaga------ 11859  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11858 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagataga 11761  T
Q  469 gggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcac 564  Q
    |||||||| |||||  | ||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||| | ||   |||||||||  |    
T  11760 gggggctg-aaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttc 11662  T
Q  565 cttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccca 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  11661 cttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggatacttattcttgtaaccca 11569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 154; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 427 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 16147 - 15802
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16147 ctataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaat-aagggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagttt 16049  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
    |||| | ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||    
T  16048 gctcctagcaacaaacactagggttgaggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctctt------ggtcacgggaagagattgggacttt 15955  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttccccc 718  Q
    |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||| || || |||| |||||||||||||  |||||| | ||||    
T  15954 gggtagaattagg-cgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccc 15856  T
Q  719 agattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
     || ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15855 cgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttatctct 15802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 98)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 42452558 - 42452945
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  42452558 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaa----- 42452652  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctct-ataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || | | |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  42452653 --aaaaaaaatgtatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttattataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagataga 42452750  T
Q  469 gggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacacta-agattg-gggttgattcacc 565  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||| |||| |||||| |||  | ||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  42452751 gggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtataaagtttg-tctctgtaacaaacactagagtttgtgggttgattcacc 42452848  T
Q  566 ttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccat 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  42452849 ttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccat 42452941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 427 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 11578433 - 11578089
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  11578433 ctataaatatagaccttatatcagggtaaatcttgagatagagtgggctgaaa-caagggtttagaagtcaacaaaaaaactagggtttgtatagaattt 11578335  T
Q  527 g-ctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactt 625  Q
      |||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||    
T  11578334 ttctcttggcaacaaac--tagggttggggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctctt------ggtcacgggaagagattgggactt 11578243  T
Q  626 tgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccc 717  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||        |||| ||| || || |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  11578242 tgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgctctttcccc 11578144  T
Q  718 cagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    |||| ||| |||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11578143 cagactagatcagttttagaccgaactaggtaaacaaatttcgtgtgttttctct 11578089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 23452720 - 23452328
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  23452720 atatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaga------ 23452627  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | ||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| |||    
T  23452626 --aaaaaaaaagtaccttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 23452529  T
Q  469 ----gggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgat 560  Q
        ||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||    
T  23452528 cagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgat 23452430  T
Q  561 tcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  23452429 tcaccttgagaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgggactttggatagaattagg-tgggagacttattcttgtaa 23452337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 427 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 20146936 - 20146589
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga--tagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagt 524  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||  ||||| |   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20146936 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttaagaggtagagagtt-tgaaaacaagggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagt 20146838  T
Q  525 ttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggact 624  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||      ||||||||||| |||||| || |    
T  20146837 ttgcccttggcaacaaacactatggttgggattgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtctctt------ggtcacgggaaaagattgagatt 20146744  T
Q  625 ttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttccc 716  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||| | ||||||        |||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20146743 ttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 20146645  T
Q  717 ccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
     |||| || |||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20146644 tcagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatttcgtgtgatctctct 20146589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 427 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 17897571 - 17897227
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| |  |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17897571 ctataaatatagaccttgtatcagatgtaaaacttgaggtagagagt-ctgagaacaagggtttagaagtcaacaataaaactagggtttgtatagagtt 17897473  T
Q  526 tgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactt 625  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||| | ||| |||||| || ||    
T  17897472 tgctcttcgcaacaaacact-aggttgagattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggtcatgagaaaagattgagattt 17897380  T
Q  626 tgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccc 717  Q
    || |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||        |||||||| || || |||||||| ||||||| || |||||| | |||    
T  17897379 tgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatggctgctctct-ccc 17897282  T
Q  718 cagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    |||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17897281 cagactaggtcagtattggtccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 17897227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 270 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 42923985 - 42923599
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  42923985 atatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaagaaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag------- 42923893  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga--ta 466  Q
      || | | | |||||||||| |||   |||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||    
T  42923892 --aacaaataagtatcttcag-gtg---ttcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcatagtaaaccttgagagata 42923799  T
Q  467 gagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattc 562  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || |  |||||||||    
T  42923798 gaggaggctgaaa-caagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattc 42923700  T
Q  563 accttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 662  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||      ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |    
T  42923699 accttggaaaacactattaggattgagtctctt------ggttatgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaatc 42923607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 35216075 - 35215676
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||           
T  35216075 atatttttgtatcgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcagatattctttcactgaaggaga------ 35215982  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt-------- 460  Q
      |||| | ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||            
T  35215981 --aaaaaaaatgaatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 35215884  T
Q  461 --gagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggg 554  Q
      |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||| | ||   ||    
T  35215883 gagagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgg 35215785  T
Q  555 gttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttatt 653  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||      ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35215784 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt------ggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattagg-tgggagacttatt 35215692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 18800631 - 18800310
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||        ||||||||| ||||||| ||    
T  18800631 ctataaatatagaccttgtatcagggtaaacatggagatatagggggctgaaa-caagggtttagaaatcaag-------ctagggtttgtatagaggtt 18800540  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      |||||| ||||||||||||| ||||    
T  18800539 gctcttggcaacaaacactagggttggg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggtcacaggaagagattggggcttt 18800447  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttccccc 718  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| ||  | ||||||||| ||||||||| | |||| | ||||    
T  18800446 gggtagaattagg-agggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcattatagtgaaacggagggctactctct-cccc 18800349  T
Q  719 agattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18800348 agaccaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaatt 18800310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 15539804 - 15539565
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  15539804 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatatagggggttg-aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtt 15539706  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||||||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||      ||| |||||||||||||| ||    
T  15539705 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctctt------ggttacgggaagagattgaga 15539612  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539611 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 15539565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 427 - 662
Target Start/End: Original strand, 35107226 - 35107452
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  || ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35107226 ctataaatatagacattgtatcatagtaaaccttgaggtagagagt-ctaaaaccaagagtttagaagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagttt 35107324  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
    |||||||||||||||||    | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||| ||||||    
T  35107325 gctcttggcaacaaacag---ggttgggattgattcaccttgagaaacattattaggattgagtctctt------ggtcacgggaagagattgtgacttt 35107415  T
Q  627 gggtagaattag-gtttggagacttattcttgtaacc 662  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  35107416 gggtagaattagattttgaagacttattcttgtaacc 35107452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 40032387 - 40032148
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  40032387 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 40032289  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| || ||||||| || |||    
T  40032288 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacaggaagaggttagga 40032195  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  40032194 ctttgggtagaattaggcgt-gagacttattcttgtaacccattgata 40032148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 35218456 - 35218053
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  35218456 atatttttgtatcgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaga------ 35218363  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt-------- 460  Q
      |||| | | | |||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||            
T  35218362 --aaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgctccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtataaggctaaactttgagagaga 35218265  T
Q  461 ------gagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt- 551  Q
          |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||| | ||     
T  35218264 gagagagagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttt 35218166  T
Q  552 -ggggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagact 649  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  35218165 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt------ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-tgggagact 35218073  T
Q  650 tattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  35218072 tattcttgtaacccgttgat 35218053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 554 - 772
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699649
Alignment:
Q  554 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttatt 653  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacga------gaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatt 40699522  T
Q  654 cttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactg 745  Q
     |||||| || ||||||        |||||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||  ||||     
T  40699523 tttgtaatcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaacta 40699622  T
Q  746 ggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  40699623 ggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 40699649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 13910373 - 13910135
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13910373 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 13910275  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattg--gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||| ||| |    
T  13910274 tgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagactggaa 13910181  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  13910180 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 13910135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 427 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 31733094 - 31732761
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  31733094 ctataaatatagactttgtaacagagtaaacattgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtt 31732996  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||                  ||||||    
T  31732995 tgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttggt------------------ttggga 31732914  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| || || ||||| ||| ||||||||  |||||| ||    
T  31732913 ctttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctctctc 31732815  T
Q  715 ccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctct 770  Q
    ||||||| |||||||  |||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31732814 ccccagactaggtca-atttggaccgagctgggtaaacaaa-ttcgtgtgttctct 31732761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 422 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 45280319 - 45279981
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagt--caacaagaaaactagggtttctat 519  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    |||||| ||||||||||||| |||    
T  45280319 tttcactataaatatataccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 45280221  T
Q  520 agagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagaga 616  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||     
T  45280220 agagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagg 45280127  T
Q  617 ttgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga--------tagtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgc 708  Q
     ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||        | |||| ||| || || | ||||||||| ||||||| |||    
T  45280126 ctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 45280029  T
Q  709 tctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  45280028 tctctcccccagactaggtca-atttggaccaaactgggtcaacaaatt 45279981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 19504674 - 19504437
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19504674 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 19504576  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||| | | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||  |||||    
T  19504575 tgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-------ggaagaggctggga 19504483  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  19504482 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 19504437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 28196563 - 28196802
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28196563 ctataaatatatgctttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctg-aaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 28196661  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || |||||||||||||||| || | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| | |||||||||||| |     
T  28196662 tgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttatgggaagagattgagg 28196755  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  28196756 ctttgggtagaattagg-cggaagatttattcttgtaacccattgata 28196802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 427 - 772
Target Start/End: Original strand, 22874068 - 22874405
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    ||||||||| || | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||       |||||||||| ||||||||||    
T  22874068 ctataaatacaggctttgtatcagagcaaacctggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaatcaa-------actagggtttgtatagagttt 22874159  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||| | ||||    
T  22874160 gctcttggcaacaaacactatggtt-gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctctt------agtcacgggaagagattgaggcttt 22874252  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttccccc 718  Q
     |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||| || || ||||||||| ||| ||| | |||||| |||| |    
T  22874253 cggtagaattagg-tgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaactgagagctgctctctccctc 22874351  T
Q  719 agattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt-tcgtgtgttctctct 772  Q
    | | |||||||  |||||||  || |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22874352 atactaggtca-atttggaccgaattgggtaaacaaattctcttgtgttctctct 22874405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 27104725 - 27104962
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||| || ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27104725 ctataaatatagaccttgtatcagagaaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 27104823  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | |||||| |||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  |||||    
T  27104824 tgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctggga 27104916  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  27104917 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 27104962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 19007566 - 19007805
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||||    
T  19007566 ctataaatataggctttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtatagagtt 19007664  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||      ||| | ||||||||||||||     
T  19007665 tgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttctt------ggttatgggaagagattgggg 19007758  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19007759 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 19007805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 42064441 - 42064679
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  42064441 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggagctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 42064539  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  || ||    
T  42064540 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgaga 42064633  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  42064634 ctttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 42064679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 427 - 666
Target Start/End: Original strand, 3022089 - 3022324
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggttta-gaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||  ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  3022089 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatataggaggctg-aaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtt 3022187  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||||||||||||||| | ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      ||| || ||||||||||| |     
T  3022188 tgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctt------ggttaccggaagagattgagg 3022281  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
     ||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  3022282 ttttaggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccatt 3022324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 17849043 - 17849282
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||| |||||||| |||  |||||||||    
T  17849043 ctataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtatagagtt 17849141  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | || |||||||| | ||   |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||      ||||||||| ||    
T  17849142 tgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggt------aagagattgaga 17849235  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17849236 ctttgggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgata 17849282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 19502340 - 19502102
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||| |||  |||||||| | |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  19502340 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaa-caagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtt 19502242  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  || ||    
T  19502241 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgaga 19502148  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  19502147 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 19502102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 511 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 27136368 - 27136215
Alignment:
Q  511 ggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacggg 610  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||      ||||||||     
T  27136368 ggtttatatagagcttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctctt------ggtcacgga 27136275  T
Q  611 aagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27136274 aagaaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgata 27136215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 429 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 34979906 - 34979673
Alignment:
Q  429 ataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg 527  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  34979906 ataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttg 34979808  T
Q  528 -ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggact 624  Q
     ||||| | ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||      ||| ||||||||||||| |||||    
T  34979807 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctctt------ggttacgggaagagattcggact 34979714  T
Q  625 ttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    || ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||    
T  34979713 ttcggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaatccatt 34979673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 6264474 - 6264145
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||    |||||| |||||||||    
T  6264474 ctataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaa-caaaggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtt 6264380  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| |  |||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |      || ||||||||     
T  6264379 tgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgat------aaaagattgggg 6264286  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    |||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| || || ||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  6264285 ctttggatagaatta-gacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctc 6264187  T
Q  715 ccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  6264186 ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 6264145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 427 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 6259144 - 6258852
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||| || ||||| |||  |||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  6259144 ctataaatatagaccttgtattagactaaactttgagatagaggaggatgaaa-caagagtttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtt 6259046  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || || || | || |||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||  ||||||||     
T  6259045 tgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacggga--agattgggg 6258954  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| || || ||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  6258953 ctttgggtagaattagg-tgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtgaaacggagggctgctctctc 6258855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 427 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 24162541 - 24162367
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24162541 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 24162443  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggt 598  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24162442 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggt 24162367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 11739889 - 11739556
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||| ||| |||||    
T  11739889 ctataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctg-gaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatggagtt 11739791  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||| ||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||      ||| |  ||||||||||||||    
T  11739790 tgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctctt------ggttataggaagagattggga 11739697  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    |||||||||||||||||   ||||| ||||||||| || |||||||||        | || ||| || || |||||||||||||||| |  |||||| ||    
T  11739696 ctttgggtagaattagg-cgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctc 11739598  T
Q  715 ccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  11739597 ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 11739556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 44289397 - 44289064
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||   |||||||| || ||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  44289397 ctataaatataggttttgtatcatagcaaaccttgatatagaggggact-aaaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtc 44289299  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||||||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||      ||| |||||||||||||||||    
T  44289298 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcactt------ggttacgggaagagattggga 44289205  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    ||| ||||||||||| | | | | ||||||||||||||||| ||||||        ||||  || || || ||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  44289204 cttagggtagaattaag-tggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctttc 44289106  T
Q  715 ccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||| | |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  44289105 ccccaaactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 44289064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 372 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 27583710 - 27583489
Alignment:
Q  372 aaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagg 470  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||| || |||||     
T  27583710 aaaagaaatgtatcttcagcgtgatatccgttccaaatttatgagttatatttctctataaatatagatcttgtatcagatgtaaatctttaggtagaga 27583611  T
Q  471 gggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttggg 570  Q
    |  |||||||||| ||||| |||       |  |||||| | ||    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||     
T  27583610 gt-ctgaaaacaagggtttggaa-------aataaactacgtttg---tagagttttctcttggcaacgaacactaaggttgggagtgattcaccttgga 27583522  T
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacgg 603  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27583521 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg 27583489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 430 - 597
Target Start/End: Original strand, 14837202 - 14837372
Alignment:
Q  430 taaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtt-tagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg- 527  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  | ||| |||||| ||||||||||||| || | ||||||     
T  14837202 taaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctg-aaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtacatagtttgt 14837300  T
Q  528 ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttgg 597  Q
    ||||| | ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14837301 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 14837372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 21521024 - 21520783
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga--tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagag 523  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||  |||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||| || |||||||    
T  21521024 ctataaatataaaccttgtatcagactaaactttgagagatagatggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagag 21520926  T
Q  524 tttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgg 620  Q
    |||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      ||| || |||||||  | |    
T  21520925 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacaggaagaggctag 21520832  T
Q  621 gactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21520831 gactttgggtagaattagg-cgggagactaattcttgtaacccattgata 21520783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 473 - 662
Target Start/End: Original strand, 43139351 - 43139532
Alignment:
Q  473 gctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaa 572  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||| ||||||||    
T  43139351 gctgaaaacaagggtttagaagccaacacaaaaacttgggtttgta--gagtttgctcttggcaacaaacactagggttgagattgattcatcttgggaa 43139448  T
Q  573 acactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 662  Q
    ||| |||||||||||||||| ||      ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||    
T  43139449 acattattaggattgagtctctt------ggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaacc 43139532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 22287665 - 22287426
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  22287665 ctataaatatagaccttgtattaaagtaaactttgagatatagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtc 22287567  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | |||||||| || | ||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||       || ||||||||||||||  |    
T  22287566 tgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctctt------agttacgggaagagattgaca 22287473  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22287472 cttcgggtagaatt-gggcgggagacttattcttgtaacccgttgata 22287426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 427 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 22163276 - 22163109
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||| |||||| || |||||||||| |||||||||    
T  22163276 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctg-aaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtatagagtt 22163178  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 592  Q
    || |||||   ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22163177 tgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg-ttgagtct 22163109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 43623897 - 43623670
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| || |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  43623897 ctataaaaatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagaggggggtg-aaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 43623799  T
Q  526 tgctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggac 623  Q
    || |||          ||||| | ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||||    
T  43623798 tg-tct----------cactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgggac 43623716  T
Q  624 tttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623715 tttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 43623670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 461 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 45239271 - 45239001
Alignment:
Q  461 gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctctt-ggcaacaaacactaagattgg--ggt 556  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||| | || |  |||    
T  45239271 gagatagagggggctgaaa-caatgatttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagacttt-ctctttggcaacaaacactagggtttgagggt 45239174  T
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattctt 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| |   ||| ||||||||||    
T  45239173 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaag-cgggatacttattctt 45239081  T
Q  657 gtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtca 729  Q
    ||||||||||||||        |||||||| || || | ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  45239080 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 45239001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 427 - 603
Target Start/End: Original strand, 17848371 - 17848549
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17848371 ctataaatataggctttgtatcag--taatccttgagatagagggggctcaaa-cgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 17848467  T
Q  526 tg-ctc-ttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacgg 603  Q
    || ||| |||||||||||||||  | ||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17848468 tgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg 17848549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 553 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 5375545 - 5375343
Alignment:
Q  553 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttat 652  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||      ||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  5375545 gggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg------gaagaggctgggactttgggtagaattaggc--ggagacttat 5375454  T
Q  653 tcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaact 744  Q
    ||||||||||||||||||        ||||  || || || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||||  ||||    
T  5375453 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaact 5375356  T
Q  745 gggtaaacaaatt 757  Q
    |||| ||||||||    
T  5375355 gggtcaacaaatt 5375343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 602 - 670
Target Start/End: Original strand, 20589788 - 20589856
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20589788 ggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgata 20589856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 427 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 12342739 - 12342660
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaa 506  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  12342739 ctataaatatacacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaagggtttagaagtcaacaaaaaaa 12342660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 427 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 37963256 - 37962925
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||       |||||||||||| | || |||||    
T  37963256 ctataaatatagactttgtataagagtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaatc-------aaactagggtttgtgtatagttt 37963165  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
    ||||||| |||||||||| | | || | |||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||| ||      ||||||  |||||||||| | ||||    
T  37963164 gctcttgacaacaaacaccatggtt-gtgttgattccccttagaaaacattattgagattgagtctctt------ggtcacctgaagagattgaggcttt 37963072  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga-----tagtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccaga 721  Q
    ||||||||||| |    ||||||||||||||||| |||||||     | ||||||||  | || ||||||||| ||| | ||  || ||| || |||| |    
T  37963071 gggtagaatta-gacgagagacttattcttgtaatccattgatttttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacagtggactgatctctctcccaca 37962973  T
Q  722 ttaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctct 770  Q
     ||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37962972 ctaggtta-atttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctct 37962925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 427 - 662
Target Start/End: Original strand, 35028505 - 35028732
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |  | |||||  | |||||||||  |||||| |||| | |||||| ||  |||||    
T  35028505 ctataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttgaattagagagc-cggaaaaacagggtttagaatccaacaataaaatttgggtttgta--gagtt 35028601  T
Q  526 tgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactt 625  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| ||      | ||||| ||||||||||  ||||    
T  35028602 tgctcttggtaacaaacactagggttgagattgattcgcattggaaaacactattatgattgagtctctt------gatcacgagaagagattgacactt 35028695  T
Q  626 tgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 662  Q
    |||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  35028696 tgggtagaattatgtttgaatactaattcttgtaacc 35028732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 461 - 598
Target Start/End: Original strand, 38020162 - 38020302
Alignment:
Q  461 gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggt 556  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||| | || |  |||    
T  38020162 gagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggt 38020260  T
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggt 598  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  38020261 tgattcaccatggtaaacactattaggattgagtctcttggt 38020302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 602 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 13828501 - 13828327
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagt 693  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||        ||||| || || |||||||||||    
T  13828501 ggtcacgggaagagattcagactttgggtagaattatgtttgaagacttattcttgtagccctttgatatctcttttgtaaaattactcataattatagt 13828402  T
Q  694 ggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
    ||||| |   | | |||| ||||| ||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13828401 ggaacagttagctactctctcccctagactaggtcagttctggaccgaactggataaacaaatttcgtgtgttct 13828327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 427 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 22407738 - 22407591
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22407738 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactgtgagatatagggtgctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 22407640  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttggga 571  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||    
T  22407639 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 22407591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 511 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459280
Alignment:
Q  511 ggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcac 607  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| |  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||      ||| ||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctctt------ggttac 28459342  T
Q  608 gggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||| ||||| |||  |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28459341 gggaagagtttggggcttcaggtataattagg-tgggagacttattcttgtaacccattgata 28459280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 571 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458925
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 663  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28459011 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgga------aagatattgggactttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaaccc 28458925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 602 - 772
Target Start/End: Original strand, 33604019 - 33604196
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata-------gtaaagttgcttataattatagtg 694  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||||||||| ||||| |||||| |||||  ||||||       |||||||| || || |||||||||    
T  33604019 ggtcatgggaagtgattgagactttaggaagaattaggtttgaagactaattcttctaaccttttgatatatctttgtaaagttactcatcattatagtg 33604118  T
Q  695 gaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||||||| |  |||||| |||||||   ||| || || |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33604119 gaacggatgactgctctctcccccaagatagatcggtattggaacaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttatctct 33604196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 606 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 36559016 - 36558954
Alignment:
Q  606 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  36559016 acgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 36558954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 606 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 36561293 - 36561231
Alignment:
Q  606 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  36561293 acgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 36561231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 554 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 38414279 - 38414201
Alignment:
Q  554 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 639  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  38414279 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcac-------ggaaaagattgggacttttggtagaattagg 38414201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 555 - 667
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345768
Alignment:
Q  555 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggtttggagacttatt 653  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||      |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctctt------ggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattaagtttgaagactgatt 26345754  T
Q  654 cttgtaacccattg 667  Q
    |||| |||||||||    
T  26345755 cttgaaacccattg 26345768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 427 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 20147077 - 20146988
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggct-gaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggttt 515  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | || | | | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20147077 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgagagatagagagtttgaaaacaagggttaagaagtcaacaagaaaactagggttt 20146988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 270 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28568641 - 28568584
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatatt 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28568641 atatttttgtatcgtgtgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 28568584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 555 - 662
Target Start/End: Original strand, 15693958 - 15694061
Alignment:
Q  555 gttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggtttggagacttat 652  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15693958 gttgattcaccgtggagaaacactattaggataaagtctcttggtcacag------gaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaat 15694051  T
Q  653 tcttgtaacc 662  Q
    ||||||||||    
T  15694052 tcttgtaacc 15694061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 437
Target Start/End: Original strand, 15693788 - 15693853
Alignment:
Q  372 aaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctctataaatata 437  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15693788 aaaagaaacgtatcttcagcgtgatatccgttctaaatttatgagttatatttctctataaatata 15693853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 30720811 - 30720703
Alignment:
Q  556 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtct-tttggtcacggtcacgggaagagattgg-gactttgggtagaattaggtttggagacttat 652  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||       |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  30720811 ttgattcatcttggagaaacactattaggattgagtctctttgg-------cacgagaagagattcgtgactttgggtagaattaggtttgaagactaat 30720719  T
Q  653 tcttgtaacccattga 668  Q
    ||||||||||| ||||    
T  30720718 tcttgtaaccctttga 30720703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 427 - 515
Target Start/End: Original strand, 38020069 - 38020157
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggttt 515  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  38020069 ctataaatatagacattgtatcggtgtaaacctggagatagagggggttg-gaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 571 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054864
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20054947 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 20054864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 606 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 45332333 - 45332271
Alignment:
Q  606 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||    
T  45332333 acgggaagagattaggactttgggtagaattagg-cgggagacttattattgtaacccattgat 45332271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 552
Target Start/End: Original strand, 39287110 - 39287260
Alignment:
Q  392 gtgatattcgttccaaatttataagttatatttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag 491  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |  ||||||||||  ||| ||||||| ||||  |    ||||||| |||||||    
T  39287110 gtgatatccgttccaaatttatgagttat--ttctcta--aatataaatcttgtatcagatgaaaacttgagagagagtag----aaaacaagggtttag 39287201  T
Q  492 aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattg 552  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||    
T  39287202 aagccaacaagaaaactagggtttgtagagaatt--ctcttagcaacaaacactaggattg 39287260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 686 - 772
Target Start/End: Original strand, 39680158 - 39680244
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  39680158 attatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctctct 39680244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 571 - 768
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687178
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga-- 668  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||        
T  39686983 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcattatct 39687075  T
Q  669 --tagtaaagttgcttata-attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgt 765  Q
      | ||||||   || ||  ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||| || |||||    
T  39687076 ctttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgt 39687175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 381 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 41304759 - 41304705
Alignment:
Q  381 gtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctctataaata 435  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41304759 gtatcttcagcgtgatatccattccaaatttatgagttatatttctctataaata 41304705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 422 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 5377767 - 5377638
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt----gagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttc 516  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||| |||| ||    |||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| |||||     
T  5377767 tttcactataaatatagaccttgtttcagagcaaactttgagagagatagaggggactg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttg 5377669  T
Q  517 tatagagtttg-ctcttggcaacaaacacta 546  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  5377668 tatagagtttgtctctttggaacaaacacta 5377638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 707 - 772
Target Start/End: Original strand, 8173539 - 8173604
Alignment:
Q  707 gctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8173539 gctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttcactct 8173604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 556 - 772
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921971
Alignment:
Q  556 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggtttggagacttatt 653  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || |      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||| |||    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggttacag------gaagagattcgggactttgggtagaattaggttttaaaactgatt 17921847  T
Q  654 cttgtaacccattga-----tagtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggt 748  Q
    |||| ||||| ||||     |  |||||||  | || ||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||| || |||  || |  ||    
T  17921848 cttgcaaccctttgattctttcataaagttagtcatcattatagtggaacggagggctgctctct-acccagactaggtcagtatttgaccgaattaagt 17921946  T
Q  749 aaacaaa-tttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||    
T  17921947 aaacaaattttcgtatgttctctct 17921971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 556 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 34575308 - 34575207
Alignment:
Q  556 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggtttggagacttatt 653  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||      ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  34575308 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtctcgg------gaa-agattcgggactttgggtagaattaggtttgaagactaatt 34575216  T
Q  654 cttgtaacc 662  Q
    ||| |||||    
T  34575215 cttataacc 34575207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 666
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736293
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  2736205 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactttgg-tagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt 2736293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 666
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741029
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      |||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||| ||||    
T  2740941 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggttgggactt-gggtagaattaggtttaaagactgattcttgaaactcatt 2741029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 574 - 661
Target Start/End: Original strand, 17932637 - 17932717
Alignment:
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17932637 cactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 17932717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 574 - 661
Target Start/End: Original strand, 17943540 - 17943620
Alignment:
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17943540 cactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 17943620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 708 - 772
Target Start/End: Original strand, 20592288 - 20592352
Alignment:
Q  708 ctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20592288 ctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattggataaacaaatttcgtgtgttctctct 20592352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 574 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 27517818 - 27517738
Alignment:
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27517818 cactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 27517738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 666
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567497
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  45567409 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt 45567497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 571 - 657
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462515
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttg 657  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17462436 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttg 17462515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 571 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712619
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttg 657  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22712698 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactaattcttg 22712619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 571 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717328
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttg 657  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22717407 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactaattcttg 22717328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 618 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 24162363 - 24162313
Alignment:
Q  618 tgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  24162363 tgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgat 24162313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 327
Target Start/End: Original strand, 15693698 - 15693755
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatatt 327  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  15693698 atatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaaggggatatt 15693755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 617 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 22407596 - 22407544
Alignment:
Q  617 ttgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407596 ttgggacttttggtagaattagggg-ggagacttattcttgtaacccattgata 22407544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 657
Target Start/End: Original strand, 30479021 - 30479073
Alignment:
Q  604 tcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttg 657  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30479021 tcacgggaagagactgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttg 30479073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 41303191 - 41303130
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 662  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  41303191 ggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattatgtttgaagactgattcatgtaacc 41303130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 41303413 - 41303357
Alignment:
Q  379 atgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctctataaata 435  Q
    ||||||| |||| ||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41303413 atgtatcatcagcgtgatatccattccaaatttacgagttatatttctctataaata 41303357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 570 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 10942696 - 10942608
Alignment:
Q  570 gaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 663  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||      ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||  || | |||||||||||||    
T  10942696 gaaacactattaggattgagtctctttgtcacgg------gaagaaattcgggactttgggtagaattatgtttgaggattgattcttgtaaccc 10942608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 570 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 10948565 - 10948477
Alignment:
Q  570 gaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 663  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||      ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||  || | |||||||||||||    
T  10948565 gaaacactattaggattgagtctctttgtcacgg------gaagaaattcgggactttgggtagaattatgtttgaggattgattcttgtaaccc 10948477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 686 - 768
Target Start/End: Original strand, 2736318 - 2736400
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  2736318 attatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttct 2736400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 686 - 768
Target Start/End: Original strand, 17462549 - 17462631
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  17462549 attatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttct 17462631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 620 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 30261911 - 30261861
Alignment:
Q  620 ggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  30261911 ggactttgggtagaattaggtttcaagactaattcttgtaactctttgata 30261861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 427 - 469
Target Start/End: Original strand, 40699236 - 40699278
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag 469  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40699236 ctataaatatagaccttgcatcagagtaaaccttgagagagag 40699278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 686 - 768
Target Start/End: Original strand, 45679836 - 45679918
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  45679836 attatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttct 45679918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 689 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 17865271 - 17865207
Alignment:
Q  689 atagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaa 754  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||| |||||||| |||||    
T  17865271 atagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtca-tattcgactgaactgggtcaacaa 17865207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 689 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 20522288 - 20522224
Alignment:
Q  689 atagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaa 754  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||| |||||    
T  20522288 atagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtca-tattggaccgaactgggtcaacaa 20522224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 34575613 - 34575556
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatatt 327  Q
    ||||||||||| | | | |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34575613 atatttttgtaccatataaaggaaaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 34575556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 145; Significance: 7e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 428 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 16975 - 16631
Alignment:
Q  428 tataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg 527  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  16975 tataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctgaaaacaagggtttgaaagacaacac-aaaactagggtttgtatagagtttg 16877  T
Q  528 ctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttg 627  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||      ||| |||||||||||||| |||||||    
T  16876 ctcttggcaacaaacactagggttgggattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcactt------ggtgacgggaagagattgagactttg 16783  T
Q  628 ggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttccccca 719  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||| || || |||||||||| ||  ||||||  ||| |||||||    
T  16782 ggtagaattagg-ccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgggacaaagggtttatctctccccca 16684  T
Q  720 gattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16683 gaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgttttctct 16631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 143; Significance: 1e-74; HSPs: 85)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 427 - 770
Target Start/End: Original strand, 31162219 - 31162564
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||   | ||| |||  ||| |||| |||| |||||    
T  31162219 ctataaatatagaccttgtatcatagtaaaccttgagaaagagggggctaaaaacaaaggtttagaaacaagcaacaaat-tagtgtttgtataaagttt 31162317  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      |||||| ||||||||||||||||||    
T  31162318 gctcttggcaacaaacactaacgttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggtcaccggaagagattgggacttt 31162411  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctcttt--ccc 716  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||        ||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||||| |  |||    
T  31162412 gggtagaattagg-tggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacagagggctgctctctccccc 31162510  T
Q  717 ccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctct 770  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31162511 ccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctct 31162564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 15809071 - 15809462
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  15809071 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaga------ 15809164  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| |||    
T  15809165 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 15809262  T
Q  469 ----gggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgat 560  Q
        ||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| | || |  |||||||    
T  15809263 taaagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgat 15809360  T
Q  561 tcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  15809361 tcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaaactaggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 15809453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 28283704 - 28283310
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  28283704 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagtgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaga------ 28283611  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt------ga 462  Q
      |||| | | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||      ||    
T  28283610 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtaatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 28283513  T
Q  463 gatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttg 558  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||   ||||||    
T  28283512 gatagagggggctg-aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttg 28283414  T
Q  559 attcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgt 658  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||      ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||     
T  28283413 attcacattgggaaacactattaggattgaatctctt------ggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-tggtagacttattcttgc 28283321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 608579 - 608978
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  608579 atatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatattttatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaa- 608677  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt--------g 461  Q
      |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || |||| ||        |    
T  608678 --aaaaga-acgtatcttcggtgtgatatttgttccaaatttatgagttatatttcactgtaaatatagaccttatatcatagcaaactttgagagagag 608774  T
Q  462 agatagagggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggtt 557  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||   |||||    
T  608775 agatagagggggctg-aaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 608873  T
Q  558 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttg 657  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  608874 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctt------ggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttg 608966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 429 - 670
Target Start/End: Original strand, 27911023 - 27911259
Alignment:
Q  429 ataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg- 527  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  27911023 ataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 27911121  T
Q  528 ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactt 625  Q
    ||||||||||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||||||||||||    
T  27911122 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgggactt 27911215  T
Q  626 tgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27911216 tgggtagaattagg-cgggagagttattcttgtaactcattgata 27911259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 429 - 670
Target Start/End: Original strand, 27957442 - 27957678
Alignment:
Q  429 ataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg- 527  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  27957442 ataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 27957540  T
Q  528 ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactt 625  Q
    ||||||||||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||||||||||||    
T  27957541 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgggactt 27957634  T
Q  626 tgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27957635 tgggtagaattagg-cgggagagttattcttgtaactcattgata 27957678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 270 - 668
Target Start/End: Original strand, 41384602 - 41384987
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||| |            
T  41384602 atatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt-atgcaaatattctttcattgaaggaaa------ 41384694  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| ||| |||| ||||||  ||||||||||    
T  41384695 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaaattgagataga 41384792  T
Q  469 gggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcac 564  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || |  |||||||||||    
T  41384793 gggg-ctgaaa-caagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcac 41384890  T
Q  565 cttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccca 664  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||    
T  41384891 cttgggaaacaccattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattggagctttaggtagaattagg-tgggagaatttttcttgtaactca 41384983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 3873859 - 3874254
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaagga-cgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnn 368  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||          
T  3873859 atatttttgtatcgtatgaagaaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa--- 3873955  T
Q  369 nncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatag 467  Q
       |||| | |  ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||    
T  3873956 ---aaaaaaaacatatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgtatcaggctaaactttgagagag 3874052  T
Q  468 a----gggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttga 559  Q
    |    ||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||  |||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||    
T  3874053 atagcgggggctgaaa-caagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttga 3874151  T
Q  560 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgta 659  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||      ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  3874152 ttcaccttgggaaacactattaggatttagtctctt------ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 3874244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 27107226 - 27106987
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27107226 ctataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 27107128  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacacta-agattg-gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||| ||    
T  27107127 tgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgtga 27107034  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27107033 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccatagata 27106987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 452 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 3005931 - 3005627
Alignment:
Q  452 gtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagatt 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||  |  ||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| || | ||    
T  3005931 gtaaaccttgagatagagggggctggaaacaagggtttagaa-acaaataacaaactagagtttgtatagagtttgctcttaacaacaaacaatagggtt 3005833  T
Q  552 ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagactta 651  Q
     || ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  3005832 -ggattgattcactttggaaaacactattagcattgagtctctt------ggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagactta 3005741  T
Q  652 ttcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaac 743  Q
    ||||||||| |||||||||        ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||  |||    
T  3005740 ttcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaac 3005641  T
Q  744 tgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||||||||||    
T  3005640 tgggtaaacaaatt 3005627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Original strand, 36865543 - 36865875
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagt 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  36865543 ctataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttaagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 36865641  T
Q  525 ttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    ||| |||||||||||||||| || | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||     
T  36865642 ttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct---------tcacgggaagagattgga 36865732  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctcttt 713  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||        |||||||| || || ||||||||| ||||||  | |||||| |    
T  36865733 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctct 36865831  T
Q  714 ccccc-agattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||| ||| |||||||  |||||||  |||||||||||||||||    
T  36865832 cccccaagactaggtca-atttggaccgaactgggtaaacaaatt 36865875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 13858813 - 13858481
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13858813 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 13858715  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || |||||| |||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      ||| ||||||||||||||||     
T  13858714 tgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttctt------ggttacgggaagagattgggg 13858621  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    ||||||||||||||| |   ||||||||||||||| | |||||| |||        |||||||| || || ||||||||| ||| ||||| |||||| ||    
T  13858620 ctttgggtagaattaag-cgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctc 13858523  T
Q  715 ccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||| |||||||  |||||||  |||||||||||||||||    
T  13858522 ccccagactaggtca-atttggacagaactgggtaaacaaatt 13858481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 14419520 - 14419187
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14419520 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtt 14419422  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||| | |||||| |  | ||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||      ||| |||||||||||||||||    
T  14419421 tgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctctt------ggttacgggaagagattggga 14419328  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||        |||| ||| || || ||||||||| ||| || || |||||| ||    
T  14419327 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgctctctc 14419229  T
Q  715 ccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  14419228 ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 14419187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 381 - 670
Target Start/End: Original strand, 32339264 - 32339554
Alignment:
Q  381 gtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga----tagagggggct 475  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||    |||||||||||    
T  32339264 gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggct 32339363  T
Q  476 gaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttggga 571  Q
    |||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||||||||||| |    
T  32339364 gaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggta 32339462  T
Q  572 aacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339463 aacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 32339554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 511 - 757
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956296
Alignment:
Q  511 ggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacggg 610  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||      |||||||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggttggg-ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatctttt------ggtcacggg 15956143  T
Q  611 aagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggag 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| || || ||||||||| |||||||    
T  15956144 aagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggag 15956242  T
Q  703 ggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||    
T  15956243 ggtttctctctccctcagattaggtca-atttggactgaactgggtcaacaaatt 15956296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 14807757 - 14807995
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14807757 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 14807855  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  |||||    
T  14807856 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctggga 14807949  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  14807950 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 14807995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 427 - 772
Target Start/End: Original strand, 21482328 - 21482664
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagttt 526  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||||       |||||||||| |||| |||||    
T  21482328 ctataaatatagaatttgtatcagagtaaactttgagatagagtggactgaaa-caagggtttagaaatcaa-------actagggtttgtataaagttt 21482419  T
Q  527 gctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggacttt 626  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||      ||| | |||||||||||||| ||||    
T  21482420 gctcttggcaacaaacactagggtt-gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctctt------ggttatgggaagagattggggcttt 21482512  T
Q  627 gggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttccccc 718  Q
    |||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||        |||||||| || || ||||||  | ||||||||| |||||| ||||||    
T  21482513 gggtagaattagg-cgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggagggctgctctctccccc 21482611  T
Q  719 agattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    | | |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21482612 aaactaggtca-atttggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 21482664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 14477282 - 14477521
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  14477282 ctataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggttgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataaagtt 14477380  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||||||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||| ||    
T  14477381 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgaga 14477474  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  14477475 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaatccattgata 14477521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 427 - 668
Target Start/End: Original strand, 1225172 - 1225409
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  1225172 ctataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtt 1225270  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||||||||     
T  1225271 tgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgggg 1225364  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga 668  Q
    ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1225365 ctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaactcattga 1225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 270 - 546
Target Start/End: Original strand, 41382528 - 41382799
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||  ||           
T  41382528 atatttttgtaccgtatgaacaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaatgagaa----- 41382622  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 468  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  41382623 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagataga 41382720  T
Q  469 gggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacacta 546  Q
     |||||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  41382721 tggggct-aaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagaatttgtctcttgggaacaaacacta 41382799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 30480832 - 30480593
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  30480832 ctataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtt 30480734  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||| |     
T  30480733 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggtcacgggaagagattgagg 30480640  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30480639 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 30480593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 540 - 772
Target Start/End: Original strand, 31035239 - 31035474
Alignment:
Q  540 aacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 639  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| |      |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  31035239 aacactatggttggggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacag------gaagagattgagactttaggtagaattagg 31035332  T
Q  640 tttggagacttattcttgtaacccattgata-------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagatta--ggtcag 730  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||       |||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||  ||||||    
T  31035333 tttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcag 31035432  T
Q  731 ttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31035433 tattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 31035474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 427 - 590
Target Start/End: Original strand, 31035073 - 31035238
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcaga-gtaaaccttgaga--tagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagag 523  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31035073 ctataaatatagaccttgtatcagatgtaaactttgagaggtagagagt-ctgaaaacaatggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttgtatagag 31035171  T
Q  524 tttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 590  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31035172 tttgctcttggcaacaaacactagggttgggattgattcaccttgggaaacaccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 449 - 772
Target Start/End: Original strand, 21480542 - 21480856
Alignment:
Q  449 agagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaag 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||       |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  21480542 agagtaaaccttgagatagatggggctgaaa-caagggtttagaaatcaa-------actagggtttgtatggagtttgctcttggcaacaaacactagg 21480633  T
Q  549 attggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagac 648  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||      ||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||   || |||    
T  21480634 tttggg-ttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctctt------ggttacgggaagatattggggtttttggtagaattagg-cgggtgac 21480725  T
Q  649 ttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggacta 740  Q
    ||||||||||||||||||||||        |||||||| || || ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||  ||||||       
T  21480726 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtca-atttggaacg 21480824  T
Q  741 aactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21480825 aactgggtaaaaaaaattcgtgtgttctctct 21480856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 469 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 31574009 - 31573826
Alignment:
Q  469 gggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttg 568  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  31574009 ggggactgaaaacaaaggtttagaagccaacacgaaaactaggatttgta--gagttttctcttggcaacaaacactatggttgggattgattcaccttg 31573912  T
Q  569 ggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31573911 ggaaacactgttaggattgagtctctt------ggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 31573826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 27829303 - 27829541
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27829303 ctataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 27829401  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  |||||    
T  27829402 tgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctggga 27829495  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  27829496 ccttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 27829541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 427 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 33541717 - 33541508
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33541717 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaacattgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 33541619  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||      ||| |||||||||||||||||    
T  33541618 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatctt------ggttacgggaagagattggga 33541525  T
Q  623 ctttgggtagaattagg 639  Q
    |||| ||||||||||||    
T  33541524 cttttggtagaattagg 33541508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 18810714 - 18810952
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18810714 ctataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 18810812  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||| ||  |||||    
T  18810813 tgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaataggctggga 18810906  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  18810907 ctttaggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 18810952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 27826992 - 27827230
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27826992 ctataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 27827090  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| || |||||||  |||||    
T  27827091 tgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacaggaagaggctggga 27827184  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  27827185 ccttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 27827230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 28251896 - 28251658
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28251896 ctataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatagagtgggttgaaa-caagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 28251798  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  |||||    
T  28251797 tgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctggga 28251704  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28251703 ctttgggtaaaattagg-cgggagacttattcttataacccattgat 28251658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 381 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 24873563 - 24873271
Alignment:
Q  381 gtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga------tagaggggg 473  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||      |||||||||    
T  24873563 gtatcttcagtgttgtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagaggggg 24873464  T
Q  474 ctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgg 569  Q
    |||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| | || |  |||||||||||||| |    
T  24873463 ctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttg 24873365  T
Q  570 gaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga 668  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||      ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||    
T  24873364 gaaacactattaggattggagtctctt------ggttacggaaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccgattga 24873272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 15072716 - 15072956
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  15072716 ctataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtt 15072814  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaag--attggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaaga-gattggg 621  Q
    || ||||| | ||||||||||| |   || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||      ||| ||| ||||| | |||||    
T  15072815 tgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgagaagagggttggg 15072908  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15072909 actttgggtagaattagg-cgggagatttattcttgtaacccattgata 15072956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 531 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 31578501 - 31578258
Alignment:
Q  531 ttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggt 630  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||      |||||||||||||||||||||    
T  31578501 ttggtaacaaacactaaggttgagattgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgg------gaagagattgggactttgggt 31578408  T
Q  631 agaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagat 722  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||        |||||||| || || |||||||||||||||||   |||||| ||||| |||     
T  31578407 agaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagac 31578308  T
Q  723 taggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||||||||| | ||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  31578307 taggtcagtataggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgctctctct 31578258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 270 - 669
Target Start/End: Original strand, 43529980 - 43530359
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||| ||           
T  43529980 atatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgctaatattctttcactgaaggaga------ 43530073  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt----gaga 464  Q
      |||| | | |||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||    ||||    
T  43530074 --aaaaaaaaagtatcttcagtgtggtatttattccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagaga 43530171  T
Q  465 tagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgatt 561  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||      |||  ||| | |     | ||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||    
T  43530172 tagagggggctg-aaacaagggtttagaa------aag-caacaacg-----tgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgatt 43530258  T
Q  562 caccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||      || |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||    
T  43530259 caccttgggaaacactattaggattgagtc------tctcggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcctgtaac 43530351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 4424024 - 4424262
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4424024 ctataaatacagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 4424122  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || | ||| | ||||||||||| | || |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||||      
T  4424123 tgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattggag 4424216  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  4424217 ctttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 4424262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 5372506 - 5372268
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  5372506 ctataattatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagggg-ctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatatagagtt 5372409  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||| ||||||||||| | || |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| | |||||||||||||||    
T  5372408 tgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttatgggaagagattggga 5372315  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||| ||| |||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5372314 ctttgagtataattagg-cggcagacttattcttgtaactcattgata 5372268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 427 - 757
Target Start/End: Original strand, 15067987 - 15068319
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||| || ||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  15067987 ctataaatataaaccttgtatcaacctaaactttgagatagaaggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaaccagggtttgtatagagtt 15068085  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      ||| |||| ||||| ||| ||    
T  15068086 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggattgagtctttt------ggttacggaaagaggttgaga 15068179  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||        |||| ||| || || | |||| |||||||||||| |||||| ||    
T  15068180 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tataatggaacggagggctgctctctc 15068277  T
Q  715 ccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatt 757  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| |||||||  ||||||||    
T  15068278 ccccagactaggtca-atttggactgaactgggccaacaaatt 15068319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 427 - 727
Target Start/End: Original strand, 25952527 - 25952830
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  25952527 ctataaatataagctttgtatcagaggaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattaggg-ttgtatatagtt 25952624  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||||||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||      ||| ||| ||||| |||| ||    
T  25952625 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctctt------ggttacgagaagaaattgaga 25952718  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    | |||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||        ||||| || || || ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  25952719 cattgggtagaattagg-cagaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc 25952817  T
Q  715 ccccagattaggt 727  Q
    ||||||| |||||    
T  25952818 ccccagactaggt 25952830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 44720849 - 44721088
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| | ||| ||||||||     
T  44720849 ctataaatatagaccttatatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatgttttgtatagagtc 44720947  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||    
T  44720948 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctggg 44721041  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  44721042 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 44721088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 496 - 669
Target Start/End: Original strand, 43079677 - 43079847
Alignment:
Q  496 caacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtc 591  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43079677 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 43079776  T
Q  592 ttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    | ||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  43079777 tctt------ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 43079847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 312 - 515
Target Start/End: Original strand, 181434 - 181631
Alignment:
Q  312 tttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnnncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaattt 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||          ||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  181434 tttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactaaaggagaag-------aaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaattt 181526  T
Q  412 ataagttatatttct-ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaacta 509  Q
    || ||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||| | |||||| |||||||    
T  181527 atgagttatacttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggcttagaatggcaacaataaaacta 181625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 461 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 22684951 - 22684650
Alignment:
Q  461 gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggt 556  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||| | || |  |||    
T  22684951 gagatagaggaggctgaaa-caagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggt 22684853  T
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattctt 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  22684852 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattctt 22684760  T
Q  657 gtaaccc---attg--------atagtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactg 745  Q
    |||||||   ||||        || |||| ||| || || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||  |||||    
T  22684759 gtaacccaatattgatttctctattgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagattaggtca-atttggaccgaactg 22684662  T
Q  746 ggtaaacaaatt 757  Q
    ||| ||||||||    
T  22684661 ggtcaacaaatt 22684650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 461 - 669
Target Start/End: Original strand, 43082013 - 43082218
Alignment:
Q  461 gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggt 556  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||   |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||    
T  43082013 gagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 43082111  T
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattct 655  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||    
T  43082112 tgattcaccttgggaaacactatcaggattggagtctctt------ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cggaagacttattct 43082204  T
Q  656 tgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||    
T  43082205 tgtaacccattgat 43082218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 427 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 35872707 - 35872555
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||     ||||||||||| |||||||||    
T  35872707 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaac-----aactagggtttgtatagagtt 35872614  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactatta 581  Q
    || ||||||| ||| ||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35872613 tgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 427 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 5623067 - 5622899
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5623067 ctataaatataggttttgtatcagaataaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 5622969  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 592  Q
    || || |||| ||||||||||| | ||   ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  5622968 tgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaaacattatttggattgagtct 5622899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 427 - 592
Target Start/End: Original strand, 26775207 - 26775375
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| || |||||||||| |||| ||||    
T  26775207 ctataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaatactagggtttgtatatagtt 26775305  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 592  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26775306 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacactattagaattgagtct 26775375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 427 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 2468427 - 2468261
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctata----ga 522  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||       |||| ||||| ||||    ||    
T  2468427 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggagctgaaa-caaggatttagaaatcaa-------actacggtttgtatatataga 2468336  T
Q  523 gtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggt 598  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2468335 gtttgctcttggcaacaaatactagggttggg-ttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 18812899 - 18813126
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||| |            
T  18812899 ctataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagaggaggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgt-------- 18812989  T
Q  526 tgctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggac 623  Q
      ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     ||| ||||||||||  || |||    
T  18812990 --ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg-----ggt-acgggaagaggctgtgac 18813081  T
Q  624 tttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  18813082 tttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 18813126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 427 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 15186039 - 15185871
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||| |||  || || ||||||| ||||| |||| ||||    
T  15186039 ctataaatataaactttgtatcagagtaaaccttgagataaaggtgactg-aaacaagggtttagaaagaaaataacaaaactatggtttatataaagtt 15185941  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 592  Q
    || ||||||||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  15185940 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattgagtct 15185871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 604 - 772
Target Start/End: Original strand, 17847705 - 17847874
Alignment:
Q  604 tcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatagtaaagttg-cttataattatagtggaacggag 702  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||      |||    || |||||||||||| ||||    
T  17847705 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa-cctttgatatctcttttgtaaaatcattatagtggaatggag 17847803  T
Q  703 ggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaac-aaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  17847804 ggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccaaactgggaaaactaattttcatgtgttctctct 17847874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 554 - 670
Target Start/End: Original strand, 181635 - 181747
Alignment:
Q  554 ggttgattcaccttgggaaacactatt-aggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttat 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || || |||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||    
T  181635 ggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacg----cgggaagagaatgggactttgggtagaattagg-cggaagacttat 181729  T
Q  653 tcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||||||||||    
T  181730 tcttgtaacccattgata 181747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 427 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 3886247 - 3886153
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatag 521  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  3886247 ctataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 610 - 772
Target Start/End: Original strand, 6376174 - 6376343
Alignment:
Q  610 gaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata-------gtaaagttgcttataattatagtggaacggag 702  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||       |||||||| || || ||||||||||||| ||     
T  6376174 gaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgttaccttttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacagaa 6376273  T
Q  703 ggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    || |||||| |||| |||| ||||||||| ||||||  ||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  6376274 ggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaacttagtaaacaaattttgtgtgttctctct 6376343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 556 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 33839120 - 33838902
Alignment:
Q  556 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgg-gactttgggtagaattaggtttggagacttatt 653  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||        ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  33839120 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggtca--------ggaagagattcaagactttgggtagaattaggtttgaagactaatt 33839029  T
Q  654 cttgtaacccattg------atagtaaagttgcttataa-ttatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgg 746  Q
    |||||||||| |||       | |||||||| |||| || ||||||||||||||||   |||||| ||||||| | || |||||| || |||  || |||    
T  33839028 cttgtaaccctttggaatcttttgtaaagttacttaaaagttatagtggaacggagaactgctctctcccccataatatgtcagtattcgaccgaattgg 33838929  T
Q  747 gtaaacaaa-tttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  33838928 gtaaacaaattttcgtgtgttctctct 33838902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 519 - 770
Target Start/End: Original strand, 3895920 - 3896175
Alignment:
Q  519 tagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagat 617  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||       |||||||||||| ||    
T  3895920 tagagtttgcttttggcaacaaacaatagggttgggattgattcactttggagaaacactattgcgattgagtctctt------cgtcacgggaagaaat 3896013  T
Q  618 tgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccat-tgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgc 708  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| | | | ||||||||||| | | |||||        |||||||| || || |||| ||| ||||||| || |||    
T  3896014 tgggactttgagtataattaggtttgaaaattaattcttgtaactcttatgatatctcttttgtaaagttactcatcattaaagtagaacggatggctgc 3896113  T
Q  709 tctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctct 770  Q
    ||| ||||||| | ||| ||||| |||||   || || ||||||||||||||||||||||||    
T  3896114 tctctcccccatagtagatcagtattggatcgaattgagtaaacaaatttcgtgtgttctct 3896175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 643 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 2468247 - 2468111
Alignment:
Q  643 ggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagtttt 734  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||        |||||||| || || ||||||||| ||  ||||| |||||| || |||||||||||||| |||     
T  2468247 ggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagattaggtcaattt- 2468149  T
Q  735 ggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2468148 ggacagaactaggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 2468111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 625 - 772
Target Start/End: Original strand, 16833749 - 16833903
Alignment:
Q  625 ttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttccc 716  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||        |||||||| || |  |||||||||||||| | || |||||| ||||    
T  16833749 ttgggtagaattaggtttgaagacttactcttgtaatcatttgatatctcttttgtaaagttactcaacattatagtggaacgaaaggctgctctctccc 16833848  T
Q  717 ccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
     |||| || |||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16833849 acagactaagtcacttttggacgaa-ctgggtaaacaaaattcgtgtgttctctct 16833903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 571 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 4812669 - 4812581
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  4812669 aaacactattaggattgagtcttttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt 4812581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 427 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 12517355 - 12517253
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga--tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagag 523  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  12517355 ctatatatatataccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 12517257  T
Q  524 tttg 527  Q
    ||||    
T  12517256 tttg 12517253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 571 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021206
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9021289 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 9021206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 571 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 13985262 - 13985176
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 663  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |      ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  13985262 aaacactattaggattgagtctcttggtcacag------gaagagattcgggactttgggtagaattaggttt-gaaactgattcttgtaaccc 13985176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 427 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 14419826 - 14419784
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag 469  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14419826 ctataaatatagacattgtatcagggtaaaccttgagatagag 14419784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 571 - 768
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28328103
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga-- 668  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||        
T  28327908 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcattatct 28328000  T
Q  669 --tagtaaagttgcttata-attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgt 765  Q
      | ||||||   || ||  ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||| || |||||    
T  28328001 ctttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgt 28328100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 660
Target Start/End: Original strand, 30423120 - 30423295
Alignment:
Q  485 ggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacacta------agattggggttgattcaccttggg--aaacac 576  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||      ||||||   |||||||||||||    ||||||    
T  30423120 ggtttagaagccaacaaacaaactagggtttatagagaattt-ctcttggcaacaaacactagggctgagattgtt-ttgattcaccttgaacaaaacac 30423217  T
Q  577 tattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    | |||||||||||||| |||||| |||      ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  30423218 ttttaggattgagtctcttggtcgcgg------gaagagattggaactttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaa 30423295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 319
Target Start/End: Original strand, 32339203 - 32339252
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaag 319  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32339203 atatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaag 32339252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752616
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  16752704 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt 16752616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757361
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  16757449 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt 16757361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 658
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895582
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgt 658  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28895502 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgt 28895582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 574 - 661
Target Start/End: Original strand, 33032657 - 33032737
Alignment:
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33032657 cactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 33032737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 713 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 31566598 - 31566539
Alignment:
Q  713 tcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31566598 tcccccatactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttcgtgagttctctct 31566539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 606 - 668
Target Start/End: Original strand, 41382844 - 41382905
Alignment:
Q  606 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga 668  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||    
T  41382844 acgggaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaactcattga 41382905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 574 - 666
Target Start/End: Original strand, 590797 - 590882
Alignment:
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  590797 cactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt 590882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 2267172 - 2267120
Alignment:
Q  610 gaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaaccc 663  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2267172 gaagagattaggactt-gggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccc 2267120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 477 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 13986099 - 13986013
Alignment:
Q  477 aaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcacc 565  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||  | |||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||| |||||    
T  13986099 aaaacaagggtttagaagtcaacaacaaaactagaatt--tgtagagttttctcttggaaacaaacattaggattgggattgaatcacc 13986013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 574 - 661
Target Start/End: Original strand, 3276347 - 3276427
Alignment:
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3276347 cactattaggattgagtctcttggtcatgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 3276427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 602 - 666
Target Start/End: Original strand, 25684668 - 25684731
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  25684668 ggtcacgggaagagacagggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt 25684731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 660
Target Start/End: Original strand, 15949559 - 15949617
Alignment:
Q  602 ggtcacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 660  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15949559 ggtcacgggaagagattcgggac-ttgggtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaa 15949617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 619 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 33021044 - 33020993
Alignment:
Q  619 gggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  33021044 gggattttgtgtagaattaggtttgaagactgattcttgtaaccctttgata 33020993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 686 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 4812556 - 4812470
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| ||||| ||| |||||||   || |||  |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  4812556 attatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcataattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttctctct 4812470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 427 - 488
Target Start/End: Original strand, 6375995 - 6376054
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtt 488  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||| ||||    
T  6375995 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaacattgag--aaagggggttgaaaacaagggtt 6376054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 686 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 16757336 - 16757254
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  16757336 attatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttct 16757254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 686 - 768
Target Start/End: Original strand, 25684756 - 25684838
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  25684756 attatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttct 25684838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 686 - 768
Target Start/End: Original strand, 28332744 - 28332826
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  28332744 attatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttct 28332826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 686 - 768
Target Start/End: Original strand, 28890879 - 28890961
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  28890879 attatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttct 28890961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 452 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 37214514 - 37214474
Alignment:
Q  452 gtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  37214514 gtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaa 37214474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 141; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 270 - 668
Target Start/End: Original strand, 51818 - 52207
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||| ||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  51818 atatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaga------ 51911  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaacctt--gagata 466  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||  ||||||    
T  51912 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagata 52009  T
Q  467 gagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattc 562  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||| | ||   || |||||||    
T  52010 gagggggctg-aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattc 52108  T
Q  563 accttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||     
T  52109 accttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagagattgtgactttggatagaattagg-tgggagactttttcttgtaact 52201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 422 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 183973 - 183732
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctata 520  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||| ||||    
T  183973 tttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaa-caaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 183876  T
Q  521 gagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagat 617  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||||    
T  183875 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-------ggaagagat 183783  T
Q  618 tgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  183782 tgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 183732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 372 - 670
Target Start/End: Original strand, 4718 - 5008
Alignment:
Q  372 aaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttatatttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagaggg 471  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4718 aaaagaaacgtatcttcagtgtgatattcgtttcaaatttatgagttatatttctctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggg 4817  T
Q  472 ggctgaaaacaacggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattggggttgattcaccttggga 571  Q
    | ||||||| || | ||||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||| ||||  |||||||||||||   ||| | ||||||||  ||||||    
T  4818 gtctgaaaaaaaggatttagaagtaagcaa-caaactagggtttatatagcgttttctctcagcaacaaacactagagttgagtttgattcatgttggga 4916  T
Q  572 aacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||||||||||||| ||      ||||| | ||||||||||   |||| ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4917 aacactattaggattgagtctctt------ggtcatgagaagagattgaagcttttggtagaattagg-cgggagacttatttttgtaacccattgata 5008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 123; Significance: 9e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 270 - 666
Target Start/End: Original strand, 1844 - 2235
Alignment:
Q  270 atatttttgtatcgtttgaaggacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgaaaatattctatcactgaagaagnnnnnnn 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||           
T  1844 atatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagaa----- 1938  T
Q  370 ncaaaagagatgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttg------a 462  Q
      |||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| || |||| |||      |    
T  1939 --aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttataagttatactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagaaa 2036  T
Q  463 gatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttg 558  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| | || ||| |||| | ||   ||||||    
T  2037 gatatagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttg 2134  T
Q  559 attcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgt 658  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  2135 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattagg-cgggaaacttattcttgt 2227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 98; Significance: 7e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 6158 - 6397
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  6158 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaataaaactagggtttgtatagagtt 6256  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||      ||| ||||||||||||||||    
T  6257 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctctt------ggttacgggaagagattggg 6350  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6351 actttgggtagaattagg-cgggagatttattcttgtaacccattgat 6397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 98; Significance: 7e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 422 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 41817 - 41574
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctata 520  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||    
T  41817 tttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 41719  T
Q  521 gagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagat 617  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||      
T  41718 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggc 41625  T
Q  618 tgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||| |||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||    
T  41624 tgggactttcggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaacccattgat 41574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 14978 - 15217
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| | |||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  14978 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caatgatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataaagtt 15076  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacacta-agattg-gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||| ||||||||  ||    
T  15077 tgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacggaaagagattcaga 15170  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15171 ctttgggtagaattatg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 15217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 461 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 14677 - 14365
Alignment:
Q  461 gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggt 556  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||    
T  14677 gagatagagggggatgaaa-caatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgagggt 14579  T
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattctt 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||      ||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  14578 tgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctctt------ggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattctt 14486  T
Q  657 gtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggt 748  Q
    ||||||||||||||        |||| ||| || || | ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||  |||||||  ||||||||    
T  14485 gtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggt 14388  T
Q  749 aaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
     |||||| ||| ||||||||||||    
T  14387 caacaaa-ttcttgtgttctctct 14365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 429 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 69622 - 69382
Alignment:
Q  429 ataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga----tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagag 523  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  69622 ataaatatagaccttatatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 69524  T
Q  524 tttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgg 620  Q
    |||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||| ||||    
T  69523 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggttgg 69430  T
Q  621 gactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  69429 gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 69382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 427 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 73356 - 73207
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgaga----tagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatag 521  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || |||| ||||||    ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |||||    
T  73356 ctataaatatagaccgtgtatcaaaggaaactttgagagagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatag 73258  T
Q  522 agtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgg 569  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||    
T  73257 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 73207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 93; Significance: 7e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 427 - 669
Target Start/End: Original strand, 2839 - 3077
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2839 ctataaatatagaacttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 2937  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | || |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||      ||| | ||||||||  | |||    
T  2938 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt------ggttatgggaagaggcttgga 3031  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  3032 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 3077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 427 - 670
Target Start/End: Original strand, 3956 - 4194
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  3956 ctataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtt 4053  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||| ||||||| | ||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||   |||||    
T  4054 tgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaagctggga 4147  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata 670  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4148 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 4194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 427 - 668
Target Start/End: Original strand, 79818 - 80055
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  79818 ctataaatatagtttttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtt 79916  T
Q  526 tg-ctc-ttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggg 621  Q
    || ||| ||||||||||| | || | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||      ||| ||||||||||||||||    
T  79917 tgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctctt------ggttacgggaagagattggg 80010  T
Q  622 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattga 668  Q
     |||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||| ||||||    
T  80011 gctttgggtag-attagg-caggagacttattcctgtaactcattga 80055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 571 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188341
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  188424 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 188341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 427 - 729
Target Start/End: Original strand, 85190 - 85495
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| | ||    |||||| | |||| || | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  85190 ctataaatataggctttgtatcaaagtaaaccttgagatagaagaggag--aaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 85287  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaa-gattg-gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||      ||| ||| |||||||||| ||    
T  85288 tgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtctttt------ggttacgagaagagattgtga 85381  T
Q  623 ctttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctttc 714  Q
    ||||| ||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| || || |||||||||||||||| |  |||||| ||    
T  85382 ctttgagtagaatca-gacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttcgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctc 85480  T
Q  715 ccccagattaggtca 729  Q
    ||||||| |||||||    
T  85481 ccccagactaggtca 85495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 461 - 669
Target Start/End: Original strand, 34 - 239
Alignment:
Q  461 gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattgg--ggt 556  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  |||    
T  34 gagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggt 132  T
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattct 655  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||      ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||   ||| |||||||||    
T  133 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt------ggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggaaacttattct 225  T
Q  656 tgtaacccattgat 669  Q
    ||||||||||||||    
T  226 tgtaacccattgat 239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 461 - 669
Target Start/End: Original strand, 29164 - 29368
Alignment:
Q  461 gagatagagggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattg--gggt 556  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||   ||||    
T  29164 gagatagagggggctgaaa-caagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggt 29262  T
Q  557 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattctt 656  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||||    
T  29263 tgattcgccttgggatacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattagg-caggagacttattctt 29355  T
Q  657 gtaacccattgat 669  Q
    ||||| |||||||    
T  29356 gtaactcattgat 29368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 553 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 1652 - 1543
Alignment:
Q  553 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttat 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  1652 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttat 1560  T
Q  653 tcttgtaacccattgat 669  Q
    |||||||||||||||||    
T  1559 tcttgtaacccattgat 1543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 427 - 639
Target Start/End: Original strand, 35599 - 35807
Alignment:
Q  427 ctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||  | |||||| || |||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  35599 ctataaatatagacattgtatcagtacaaaccgggtgataga-ggcgctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 35696  T
Q  526 tg-ctcttggcaacaaacactaagatt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattggga 622  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||   ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||      ||| ||||||||||  |||||    
T  35697 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaacactattaggattaagtctctt------ggttacgggaagaggctggga 35790  T
Q  623 ctttgggtagaattagg 639  Q
    |||||||||||||||||    
T  35791 ctttgggtagaattagg 35807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 422 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 1165 - 1060
Alignment:
Q  422 tttctctataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctata 520  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  1165 tttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 1067  T
Q  521 gagtttg 527  Q
    |||||||    
T  1066 gagtttg 1060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 57581 - 57409
Alignment:
Q  609 ggaagagatt-gggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacg 699  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||        |||||||| || || | |||| ||||||     
T  57581 ggaagagattcgggactttgggtggaattaggtttgaagatctattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcattaatataatggaaca 57482  T
Q  700 gagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttctctct 772  Q
    ||| | |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| | |  |||||||||||||||    
T  57481 gagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggacggaactaggtaaaaacaaatcgtgtgttctctct 57409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 666
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224907
Alignment:
Q  571 aaacactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccatt 666  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  224819 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt 224907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 606 - 639
Target Start/End: Original strand, 22252 - 22285
Alignment:
Q  606 acgggaagagattgggactttgggtagaattagg 639  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22252 acgggaagagattgggactttgggtagaattagg 22285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 606 - 639
Target Start/End: Original strand, 24527 - 24560
Alignment:
Q  606 acgggaagagattgggactttgggtagaattagg 639  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24527 acgggaagagattgggactttgggtagaattagg 24560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 574 - 657
Target Start/End: Original strand, 16328 - 16404
Alignment:
Q  574 cactattaggattgagtcttttggtcacggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttg 657  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16328 cactattaggattgagtctcttggtcacgg------gaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactaattcttg 16404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 686 - 768
Target Start/End: Original strand, 16439 - 16521
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  16439 attatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttct 16521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 686 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 3138 - 3056
Alignment:
Q  686 attatagtggaacggagggttgctctttcccccagattaggtcagttttggactaaactgggtaaacaaatttcgtgtgttct 768  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||   || |||  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  3138 attatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttct 3056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University