View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5084-Insertion-3 (Length: 834)

Name: NF5084-Insertion-3
Description: NF5084
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5084-Insertion-3
NF5084-Insertion-3
[»] chr3 (100 HSPs)
chr3 (6-834)||(55301581-55302403)
chr3 (183-834)||(54593435-54594086)
chr3 (183-815)||(49199254-49199890)
chr3 (182-834)||(6095389-6096037)
chr3 (233-815)||(46860220-46860804)
chr3 (182-834)||(43401586-43402228)
chr3 (183-815)||(43403530-43404152)
chr3 (231-834)||(30235855-30236458)
chr3 (233-834)||(41819363-41819959)
chr3 (233-834)||(36018581-36019178)
chr3 (397-834)||(34490943-34491379)
chr3 (317-834)||(4569681-4570202)
chr3 (225-834)||(47303982-47304591)
chr3 (231-618)||(46173311-46173688)
chr3 (416-831)||(5433901-5434313)
chr3 (556-834)||(40913068-40913350)
chr3 (397-619)||(44700480-44700703)
chr3 (397-619)||(40734442-40734665)
chr3 (397-619)||(44331489-44331712)
chr3 (397-619)||(19683889-19684113)
chr3 (397-619)||(29196387-29196612)
chr3 (402-608)||(40735337-40735545)
chr3 (397-608)||(7762220-7762433)
chr3 (397-619)||(5236458-5236680)
chr3 (397-619)||(9581227-9581450)
chr3 (397-619)||(45095109-45095331)
chr3 (404-619)||(22835010-22835226)
chr3 (464-651)||(31340268-31340457)
chr3 (397-619)||(37408403-37408626)
chr3 (386-617)||(32891049-32891282)
chr3 (397-608)||(51398768-51398981)
chr3 (421-619)||(760791-760991)
chr3 (397-619)||(29682303-29682526)
chr3 (421-619)||(29810812-29811012)
chr3 (386-608)||(53921493-53921717)
chr3 (397-608)||(7764422-7764632)
chr3 (397-619)||(5258144-5258368)
chr3 (397-608)||(16498984-16499196)
chr3 (354-703)||(26323027-26323383)
chr3 (397-608)||(29813017-29813230)
chr3 (405-619)||(31314389-31314604)
chr3 (397-619)||(39153362-39153585)
chr3 (385-780)||(35138694-35139091)
chr3 (397-619)||(23200138-23200360)
chr3 (397-620)||(9666467-9666693)
chr3 (397-619)||(5260323-5260547)
chr3 (397-619)||(23197939-23198161)
chr3 (397-608)||(9636126-9636340)
chr3 (397-619)||(23391910-23392133)
chr3 (317-504)||(40913352-40913544)
chr3 (397-563)||(801091-801260)
chr3 (421-608)||(23410353-23410543)
chr3 (397-560)||(7780004-7780168)
chr3 (609-780)||(1683270-1683440)
chr3 (397-560)||(32744437-32744600)
chr3 (342-719)||(20937501-20937880)
chr3 (397-563)||(6716500-6716667)
chr3 (397-563)||(54635125-54635292)
chr3 (406-689)||(39127421-39127708)
chr3 (386-529)||(33191866-33192009)
chr3 (436-578)||(51352150-51352293)
chr3 (209-413)||(31340042-31340240)
chr3 (397-563)||(45282983-45283154)
chr3 (397-563)||(3617449-3617618)
chr3 (511-605)||(26386597-26386692)
chr3 (402-558)||(4055769-4055926)
chr3 (400-563)||(25637426-25637592)
chr3 (446-595)||(5373198-5373353)
chr3 (386-619)||(2075065-2075281)
chr3 (691-815)||(28074366-28074488)
chr3 (400-563)||(4598526-4598693)
chr3 (391-613)||(8166453-8166677)
chr3 (400-563)||(10056217-10056384)
chr3 (400-563)||(10058439-10058606)
chr3 (400-563)||(10060661-10060828)
chr3 (400-563)||(10062883-10063050)
chr3 (400-563)||(10065105-10065272)
chr3 (400-563)||(10211393-10211560)
chr3 (402-558)||(4075476-4075636)
chr3 (386-464)||(27305700-27305777)
chr3 (611-720)||(34795712-34795819)
chr3 (400-563)||(4600747-4600914)
chr3 (400-563)||(10209173-10209340)
chr3 (431-541)||(25491003-25491114)
chr3 (183-243)||(4570210-4570272)
chr3 (351-557)||(1683483-1683687)
chr3 (243-380)||(5270557-5270689)
chr3 (186-266)||(34491480-34491557)
chr3 (182-266)||(40913566-40913647)
chr3 (366-419)||(49229607-49229660)
chr3 (457-544)||(24635276-24635366)
chr3 (458-515)||(40519258-40519317)
chr3 (354-471)||(50432599-50432719)
chr3 (233-266)||(5433786-5433819)
chr3 (491-543)||(28253363-28253416)
chr3 (444-548)||(3148037-3148144)
chr3 (452-506)||(54744304-54744359)
chr3 (609-667)||(36796692-36796749)
chr3 (661-719)||(50432840-50432898)
chr3 (462-491)||(31340242-31340271)
[»] chr7 (87 HSPs)
chr7 (183-834)||(34310496-34311154)
chr7 (183-834)||(4512181-4512827)
chr7 (185-809)||(4508499-4509118)
chr7 (183-809)||(4510339-4510960)
chr7 (233-780)||(8359157-8359703)
chr7 (233-834)||(2390012-2390615)
chr7 (235-815)||(3258745-3259322)
chr7 (233-815)||(29608490-29609060)
chr7 (317-806)||(48599255-48599744)
chr7 (196-807)||(2360784-2361382)
chr7 (401-815)||(6431720-6432134)
chr7 (386-815)||(22269724-22270151)
chr7 (288-831)||(22328282-22328834)
chr7 (183-531)||(32357848-32358190)
chr7 (556-815)||(6360073-6360331)
chr7 (397-619)||(27347761-27347984)
chr7 (397-621)||(23554982-23555208)
chr7 (404-607)||(30024740-30024945)
chr7 (404-619)||(47676144-47676360)
chr7 (397-619)||(31732970-31733193)
chr7 (397-619)||(35853859-35854082)
chr7 (421-619)||(48491523-48491723)
chr7 (397-608)||(14069834-14070047)
chr7 (397-608)||(14379862-14380075)
chr7 (397-619)||(8153286-8153509)
chr7 (397-619)||(41317435-41317658)
chr7 (435-608)||(47673981-47674157)
chr7 (388-608)||(31105385-31105607)
chr7 (397-619)||(43864188-43864411)
chr7 (402-619)||(4586105-4586323)
chr7 (386-618)||(26417261-26417494)
chr7 (397-619)||(36146409-36146633)
chr7 (397-619)||(48489375-48489598)
chr7 (421-619)||(1113601-1113801)
chr7 (397-619)||(29990999-29991221)
chr7 (397-619)||(38671223-38671446)
chr7 (421-619)||(18126588-18126788)
chr7 (397-619)||(41649012-41649234)
chr7 (421-618)||(496007-496206)
chr7 (201-520)||(6359762-6360077)
chr7 (397-618)||(25766960-25767180)
chr7 (386-619)||(4253518-4253754)
chr7 (397-619)||(19502122-19502346)
chr7 (386-619)||(48408747-48408984)
chr7 (386-613)||(23565052-23565280)
chr7 (421-619)||(4178719-4178917)
chr7 (455-605)||(31518752-31518905)
chr7 (397-559)||(25615857-25616021)
chr7 (397-619)||(12097868-12098083)
chr7 (397-619)||(39731321-39731537)
chr7 (390-619)||(36574510-36574740)
chr7 (386-555)||(31518911-31519081)
chr7 (386-603)||(23343934-23344151)
chr7 (491-619)||(4538636-4538764)
chr7 (397-563)||(43504154-43504323)
chr7 (397-537)||(2759198-2759339)
chr7 (491-619)||(24525992-24526121)
chr7 (397-563)||(20343897-20344064)
chr7 (404-614)||(3904624-3904837)
chr7 (395-542)||(18396338-18396488)
chr7 (397-563)||(24789841-24790009)
chr7 (472-720)||(1360226-1360479)
chr7 (354-542)||(5116625-5116817)
chr7 (397-563)||(6592340-6592509)
chr7 (397-563)||(18388760-18388929)
chr7 (397-563)||(18392196-18392365)
chr7 (402-491)||(24525508-24525596)
chr7 (532-619)||(2761439-2761526)
chr7 (397-563)||(6594558-6594727)
chr7 (397-563)||(32060322-32060493)
chr7 (402-479)||(1560671-1560749)
chr7 (387-558)||(26639326-26639503)
chr7 (183-266)||(30814690-30814770)
chr7 (499-619)||(5514113-5514234)
chr7 (546-619)||(24514912-24514984)
chr7 (397-471)||(30814530-30814603)
chr7 (390-485)||(5513661-5513755)
chr7 (333-543)||(43363405-43363622)
chr7 (750-834)||(32358191-32358274)
chr7 (195-266)||(22270241-22270310)
chr7 (228-265)||(22552448-22552485)
chr7 (605-681)||(37545121-37545195)
chr7 (183-250)||(6430432-6430496)
chr7 (457-551)||(27073828-27073925)
chr7 (457-551)||(27204388-27204485)
chr7 (491-552)||(13065494-13065555)
chr7 (592-719)||(23794024-23794149)
[»] chr1 (93 HSPs)
chr1 (183-834)||(13548792-13549438)
chr1 (183-815)||(11348447-11349080)
chr1 (199-834)||(37032873-37033511)
chr1 (180-834)||(13546883-13547527)
chr1 (236-834)||(37168027-37168622)
chr1 (225-834)||(29135978-29136585)
chr1 (233-815)||(47114921-47115502)
chr1 (200-834)||(47255148-47255772)
chr1 (313-834)||(42297888-42298413)
chr1 (236-781)||(31925553-31926092)
chr1 (233-834)||(7482064-7482669)
chr1 (328-815)||(193361-193849)
chr1 (321-815)||(19754240-19754737)
chr1 (232-834)||(34603306-34603894)
chr1 (317-815)||(19752435-19752930)
chr1 (491-834)||(37879007-37879349)
chr1 (202-491)||(37876573-37876860)
chr1 (233-488)||(28242382-28242635)
chr1 (567-834)||(28242119-28242385)
chr1 (397-608)||(8550787-8551001)
chr1 (397-619)||(28265555-28265778)
chr1 (397-608)||(28220227-28220440)
chr1 (397-608)||(31659192-31659405)
chr1 (397-619)||(834168-834391)
chr1 (421-618)||(1833467-1833666)
chr1 (402-619)||(44455104-44455322)
chr1 (397-603)||(49918309-49918517)
chr1 (429-608)||(37503589-37503768)
chr1 (397-608)||(3156820-3157032)
chr1 (397-619)||(3189275-3189498)
chr1 (397-619)||(3198092-3198315)
chr1 (397-619)||(3206931-3207154)
chr1 (397-619)||(3847122-3847345)
chr1 (397-619)||(28223422-28223645)
chr1 (397-608)||(4552638-4552851)
chr1 (397-608)||(46064872-46065085)
chr1 (404-619)||(50169218-50169434)
chr1 (397-619)||(50167176-50167399)
chr1 (397-608)||(13659337-13659550)
chr1 (386-621)||(15820249-15820485)
chr1 (397-619)||(41360859-41361081)
chr1 (387-619)||(23555257-23555489)
chr1 (612-834)||(34602557-34602777)
chr1 (291-747)||(6808263-6808726)
chr1 (404-619)||(196915-197132)
chr1 (382-719)||(22079166-22079501)
chr1 (397-617)||(13137977-13138196)
chr1 (400-619)||(20762616-20762837)
chr1 (397-619)||(10925167-10925393)
chr1 (397-608)||(37559868-37560083)
chr1 (397-608)||(45644355-45644569)
chr1 (397-563)||(13316352-13316520)
chr1 (386-619)||(927966-928202)
chr1 (386-599)||(16455585-16455799)
chr1 (397-618)||(40122197-40122421)
chr1 (437-619)||(30476486-30476672)
chr1 (397-608)||(51765349-51765565)
chr1 (397-563)||(9987202-9987369)
chr1 (337-578)||(12318463-12318706)
chr1 (397-563)||(20622237-20622406)
chr1 (386-559)||(36683694-36683858)
chr1 (354-778)||(41135605-41136030)
chr1 (397-563)||(40282377-40282545)
chr1 (397-563)||(9036417-9036584)
chr1 (345-556)||(2926516-2926730)
chr1 (387-620)||(44650153-44650389)
chr1 (390-513)||(5459956-5460081)
chr1 (388-607)||(8871054-8871259)
chr1 (342-717)||(25651931-25652308)
chr1 (400-563)||(21053958-21054123)
chr1 (387-604)||(37282682-37282901)
chr1 (397-563)||(44203631-44203800)
chr1 (388-526)||(2262965-2263106)
chr1 (333-514)||(9109354-9109539)
chr1 (402-558)||(13938143-13938300)
chr1 (441-551)||(3460707-3460821)
chr1 (633-806)||(12318720-12318890)
chr1 (390-619)||(1050439-1050668)
chr1 (606-807)||(16216709-16216904)
chr1 (444-543)||(4535527-4535629)
chr1 (492-620)||(44646881-44647010)
chr1 (609-689)||(3331428-3331505)
chr1 (183-266)||(19752952-19753032)
chr1 (447-546)||(32471478-32471579)
chr1 (457-558)||(16914234-16914338)
chr1 (200-256)||(19754772-19754826)
chr1 (492-549)||(918431-918487)
chr1 (705-783)||(4535784-4535863)
chr1 (606-689)||(10157490-10157571)
chr1 (397-518)||(38746716-38746842)
chr1 (234-267)||(6398927-6398960)
chr1 (674-727)||(9109680-9109733)
chr1 (387-468)||(44646795-44646875)
[»] chr2 (63 HSPs)
chr2 (184-834)||(45726660-45727305)
chr2 (181-781)||(35446675-35447270)
chr2 (182-834)||(1631520-1632170)
chr2 (237-807)||(42287953-42288520)
chr2 (238-834)||(17450321-17450898)
chr2 (293-834)||(24397787-24398332)
chr2 (316-815)||(33647918-33648421)
chr2 (397-619)||(2334418-2334641)
chr2 (397-619)||(36773506-36773729)
chr2 (397-608)||(17057370-17057583)
chr2 (397-608)||(17085353-17085566)
chr2 (397-608)||(36318010-36318223)
chr2 (402-619)||(29867813-29868031)
chr2 (397-619)||(723745-723968)
chr2 (397-619)||(38312184-38312407)
chr2 (397-621)||(33162451-33162676)
chr2 (397-619)||(34139771-34139995)
chr2 (421-619)||(42362296-42362496)
chr2 (233-514)||(7451167-7451448)
chr2 (397-619)||(36988076-36988299)
chr2 (405-619)||(14633834-14634050)
chr2 (397-619)||(45099699-45099922)
chr2 (397-619)||(5723256-5723478)
chr2 (397-619)||(11151592-11151815)
chr2 (404-619)||(11690445-11690661)
chr2 (397-619)||(4503133-4503356)
chr2 (397-619)||(11067249-11067472)
chr2 (431-619)||(13121712-13121901)
chr2 (397-609)||(6595006-6595221)
chr2 (397-619)||(36205665-36205887)
chr2 (275-719)||(30217923-30218358)
chr2 (397-619)||(4484330-4484554)
chr2 (397-619)||(30833290-30833514)
chr2 (391-621)||(17490143-17490368)
chr2 (386-619)||(11049493-11049732)
chr2 (435-619)||(7815311-7815498)
chr2 (435-619)||(14202450-14202631)
chr2 (463-619)||(24885605-24885763)
chr2 (394-569)||(26353178-26353354)
chr2 (397-563)||(32289565-32289732)
chr2 (397-563)||(6266691-6266859)
chr2 (389-619)||(12123578-12123809)
chr2 (519-619)||(39284829-39284929)
chr2 (400-563)||(13656035-13656200)
chr2 (295-542)||(42261384-42261633)
chr2 (397-563)||(12647386-12647555)
chr2 (408-474)||(28672022-28672088)
chr2 (386-514)||(42019859-42019992)
chr2 (397-471)||(39284930-39285003)
chr2 (693-815)||(7451049-7451170)
chr2 (406-599)||(7597021-7597217)
chr2 (615-720)||(43730991-43731093)
chr2 (439-514)||(24197946-24198023)
chr2 (421-466)||(42412117-42412161)
chr2 (544-619)||(5700271-5700347)
chr2 (457-543)||(34811281-34811370)
chr2 (473-514)||(4561137-4561180)
chr2 (432-543)||(41454254-41454366)
chr2 (609-834)||(42261826-42262047)
chr2 (179-241)||(29868182-29868241)
chr2 (592-630)||(24197829-24197867)
chr2 (385-441)||(2838079-2838135)
chr2 (447-503)||(16605654-16605711)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (183-834)||(7058-7703)
[»] chr8 (72 HSPs)
chr8 (183-834)||(11383716-11384366)
chr8 (183-834)||(42434779-42435429)
chr8 (274-766)||(4283321-4283813)
chr8 (236-815)||(40328528-40329102)
chr8 (317-815)||(40221494-40221992)
chr8 (231-718)||(18655246-18655734)
chr8 (435-815)||(44353541-44353923)
chr8 (317-620)||(10930118-10930424)
chr8 (233-590)||(3772164-3772521)
chr8 (397-619)||(43036367-43036590)
chr8 (397-608)||(27811232-27811445)
chr8 (397-619)||(15212730-15212953)
chr8 (397-619)||(33352094-33352317)
chr8 (397-619)||(4731602-4731825)
chr8 (403-619)||(18141764-18141981)
chr8 (397-607)||(42498149-42498362)
chr8 (429-619)||(30143286-30143476)
chr8 (397-621)||(40321022-40321247)
chr8 (397-619)||(3303671-3303894)
chr8 (386-619)||(1292454-1292687)
chr8 (421-621)||(1345395-1345597)
chr8 (397-619)||(17982597-17982821)
chr8 (397-608)||(34254331-34254543)
chr8 (397-619)||(19491700-19491922)
chr8 (397-621)||(5689213-5689438)
chr8 (397-619)||(31218201-31218425)
chr8 (397-608)||(34256507-34256719)
chr8 (435-619)||(30291549-30291737)
chr8 (397-619)||(9765693-9765911)
chr8 (397-619)||(44303798-44304023)
chr8 (394-617)||(8965689-8965914)
chr8 (397-619)||(6598916-6599139)
chr8 (397-619)||(6674369-6674592)
chr8 (397-608)||(19945359-19945574)
chr8 (397-619)||(1746219-1746442)
chr8 (397-619)||(12702635-12702862)
chr8 (392-608)||(4162454-4162668)
chr8 (397-619)||(4743215-4743427)
chr8 (403-618)||(41366622-41366837)
chr8 (402-619)||(18106087-18106302)
chr8 (399-563)||(2627735-2627902)
chr8 (446-608)||(10929753-10929907)
chr8 (476-619)||(41364926-41365071)
chr8 (386-619)||(8153705-8153936)
chr8 (386-525)||(10015119-10015257)
chr8 (397-563)||(25689955-25690122)
chr8 (397-563)||(3439504-3439671)
chr8 (404-529)||(7597648-7597776)
chr8 (390-529)||(11711993-11712135)
chr8 (392-503)||(3073870-3073981)
chr8 (415-548)||(32902191-32902327)
chr8 (394-558)||(29796317-29796485)
chr8 (397-487)||(4733784-4733873)
chr8 (317-414)||(2999723-2999820)
chr8 (277-425)||(10240263-10240411)
chr8 (707-834)||(22976264-22976389)
chr8 (435-573)||(1822282-1822423)
chr8 (435-573)||(1856727-1856868)
chr8 (492-719)||(33655402-33655628)
chr8 (631-719)||(40585569-40585656)
chr8 (400-563)||(42575327-42575494)
chr8 (456-659)||(10240061-10240264)
chr8 (401-563)||(15290522-15290688)
chr8 (401-563)||(15470891-15471057)
chr8 (406-474)||(38863949-38864017)
chr8 (334-429)||(9633551-9633640)
chr8 (445-542)||(30909389-30909487)
chr8 (447-514)||(38860413-38860482)
chr8 (609-689)||(10020321-10020398)
chr8 (461-621)||(3231859-3232023)
chr8 (179-226)||(4743023-4743069)
chr8 (183-237)||(4283819-4283872)
[»] chr4 (102 HSPs)
chr4 (232-834)||(12073123-12073721)
chr4 (181-834)||(50673636-50674284)
chr4 (183-834)||(2209438-2210096)
chr4 (233-815)||(41964166-41964743)
chr4 (182-674)||(40632334-40632826)
chr4 (233-815)||(379128-379710)
chr4 (313-834)||(54882750-54883273)
chr4 (321-834)||(8665137-8665651)
chr4 (232-815)||(35662191-35662767)
chr4 (317-815)||(6655705-6656203)
chr4 (326-834)||(46703231-46703740)
chr4 (321-834)||(8647868-8648382)
chr4 (183-834)||(50262487-50263136)
chr4 (317-815)||(27416886-27417370)
chr4 (181-644)||(41639345-41639803)
chr4 (293-780)||(12119322-12119815)
chr4 (474-831)||(55085442-55085801)
chr4 (278-834)||(33989593-33990131)
chr4 (291-736)||(26699337-26699786)
chr4 (318-576)||(26364223-26364483)
chr4 (397-619)||(26175637-26175860)
chr4 (397-619)||(56178637-56178860)
chr4 (386-619)||(52095352-52095586)
chr4 (397-619)||(47038412-47038633)
chr4 (397-608)||(36994478-36994691)
chr4 (397-619)||(5429623-5429846)
chr4 (405-619)||(9927467-9927681)
chr4 (386-617)||(31474096-31474329)
chr4 (397-621)||(36463390-36463615)
chr4 (397-619)||(48142986-48143211)
chr4 (397-608)||(48893639-48893856)
chr4 (386-619)||(54199897-54200130)
chr4 (397-619)||(34570415-34570638)
chr4 (377-623)||(21688188-21688437)
chr4 (397-619)||(12739551-12739774)
chr4 (405-619)||(37740570-37740784)
chr4 (397-619)||(52467355-52467579)
chr4 (606-834)||(26363995-26364222)
chr4 (386-619)||(6542169-6542405)
chr4 (316-815)||(33089648-33090129)
chr4 (397-619)||(5871764-5871987)
chr4 (395-608)||(29999804-30000019)
chr4 (437-618)||(12745476-12745659)
chr4 (389-619)||(37229714-37229947)
chr4 (439-619)||(24969055-24969238)
chr4 (435-602)||(3913408-3913578)
chr4 (295-719)||(22882652-22883077)
chr4 (295-719)||(22934316-22934741)
chr4 (435-619)||(12747794-12747980)
chr4 (386-619)||(4587902-4588137)
chr4 (397-619)||(29254438-29254661)
chr4 (397-574)||(46147392-46147570)
chr4 (397-619)||(45687183-45687407)
chr4 (397-617)||(5370083-5370308)
chr4 (386-618)||(5207832-5208066)
chr4 (421-619)||(52082688-52082881)
chr4 (351-719)||(35369405-35369763)
chr4 (397-619)||(13992293-13992509)
chr4 (477-619)||(41639207-41639351)
chr4 (397-550)||(12743926-12744080)
chr4 (397-550)||(12745315-12745469)
chr4 (386-608)||(51337018-51337242)
chr4 (421-619)||(13009468-13009655)
chr4 (397-563)||(31495316-31495485)
chr4 (669-834)||(40630714-40630878)
chr4 (234-394)||(55085286-55085439)
chr4 (437-543)||(12744087-12744195)
chr4 (435-621)||(48142413-48142605)
chr4 (397-563)||(8393394-8393562)
chr4 (397-563)||(8395603-8395771)
chr4 (351-605)||(38811144-38811399)
chr4 (461-718)||(32091324-32091583)
chr4 (605-710)||(41961264-41961368)
chr4 (386-549)||(5349924-5350087)
chr4 (386-619)||(29056301-29056537)
chr4 (345-542)||(34112838-34113034)
chr4 (386-558)||(44967818-44967992)
chr4 (619-781)||(34112393-34112555)
chr4 (390-543)||(21703829-21703985)
chr4 (496-719)||(35370449-35370661)
chr4 (665-834)||(46569816-46569984)
chr4 (233-374)||(46703739-46703879)
chr4 (617-719)||(3785934-3786034)
chr4 (342-543)||(44570307-44570514)
chr4 (443-590)||(53345189-53345340)
chr4 (400-563)||(5136063-5136230)
chr4 (400-563)||(5138288-5138455)
chr4 (183-266)||(6656222-6656305)
chr4 (421-563)||(7124901-7125046)
chr4 (342-429)||(3786097-3786185)
chr4 (385-563)||(7122682-7122864)
chr4 (386-529)||(37754949-37755095)
chr4 (444-619)||(52065540-52065719)
chr4 (182-267)||(21688538-21688621)
chr4 (438-619)||(6677412-6677597)
chr4 (386-443)||(24969787-24969843)
chr4 (473-543)||(34788851-34788923)
chr4 (233-301)||(54881566-54881629)
chr4 (444-543)||(16422653-16422755)
chr4 (285-387)||(32091618-32091719)
chr4 (447-515)||(1122865-1122937)
chr4 (232-266)||(41961691-41961725)
[»] chr6 (52 HSPs)
chr6 (183-815)||(5043377-5044006)
chr6 (181-815)||(17762736-17763371)
chr6 (183-815)||(26829909-26830543)
chr6 (207-834)||(3808518-3809147)
chr6 (368-815)||(21593415-21593860)
chr6 (195-815)||(22424626-22425246)
chr6 (236-834)||(2972777-2973377)
chr6 (317-834)||(603005-603518)
chr6 (183-591)||(17757994-17758402)
chr6 (183-581)||(21588913-21589308)
chr6 (233-520)||(26800630-26800917)
chr6 (388-619)||(28137400-28137632)
chr6 (397-619)||(9183032-9183255)
chr6 (397-619)||(2171532-2171754)
chr6 (397-619)||(5406200-5406422)
chr6 (397-619)||(5410525-5410747)
chr6 (397-608)||(31404675-31404887)
chr6 (397-619)||(26954287-26954509)
chr6 (397-619)||(33211186-33211409)
chr6 (404-619)||(5413401-5413616)
chr6 (421-619)||(3038927-3039127)
chr6 (399-608)||(30834538-30834750)
chr6 (397-608)||(16452329-16452543)
chr6 (397-619)||(33160352-33160577)
chr6 (342-667)||(25073463-25073798)
chr6 (423-621)||(4045364-4045566)
chr6 (397-563)||(3072759-3072928)
chr6 (397-563)||(412101-412270)
chr6 (397-559)||(16569037-16569189)
chr6 (397-563)||(6097451-6097608)
chr6 (652-808)||(17757838-17757995)
chr6 (404-489)||(5409076-5409161)
chr6 (397-563)||(27647861-27648028)
chr6 (397-563)||(16554869-16555037)
chr6 (397-563)||(16578518-16578686)
chr6 (397-563)||(16616694-16616862)
chr6 (397-563)||(16631425-16631593)
chr6 (397-563)||(16653112-16653280)
chr6 (294-488)||(9572667-9572862)
chr6 (397-563)||(25421305-25421474)
chr6 (397-563)||(6027246-6027415)
chr6 (583-722)||(5740978-5741117)
chr6 (400-563)||(13153913-13154080)
chr6 (400-563)||(33342108-33342275)
chr6 (400-563)||(34164856-34165023)
chr6 (397-563)||(34167078-34167248)
chr6 (699-805)||(26800530-26800634)
chr6 (495-608)||(16567160-16567265)
chr6 (183-258)||(602903-602975)
chr6 (595-663)||(11660507-11660574)
chr6 (386-423)||(12221094-12221131)
chr6 (404-441)||(4641090-4641127)
[»] chr5 (75 HSPs)
chr5 (317-834)||(40146991-40147508)
chr5 (231-808)||(213225-213800)
chr5 (183-833)||(5057779-5058423)
chr5 (183-833)||(27015263-27015896)
chr5 (270-815)||(27637487-27638034)
chr5 (386-834)||(28278045-28278494)
chr5 (402-815)||(38746754-38747167)
chr5 (275-718)||(16640818-16641263)
chr5 (314-834)||(316496-317014)
chr5 (386-619)||(13239696-13239930)
chr5 (397-608)||(42428431-42428644)
chr5 (397-619)||(533713-533936)
chr5 (402-608)||(13488157-13488365)
chr5 (397-619)||(25412706-25412928)
chr5 (397-608)||(32636778-32636991)
chr5 (386-608)||(16452035-16452258)
chr5 (402-619)||(28750661-28750879)
chr5 (421-618)||(42426259-42426458)
chr5 (435-619)||(39468587-39468773)
chr5 (397-619)||(13343005-13343228)
chr5 (404-618)||(537970-538185)
chr5 (386-619)||(31182917-31183149)
chr5 (397-608)||(33831634-33831847)
chr5 (397-608)||(8565947-8566160)
chr5 (397-619)||(30182533-30182756)
chr5 (386-619)||(3075648-3075882)
chr5 (397-619)||(36074043-36074268)
chr5 (397-619)||(37439078-37439309)
chr5 (404-608)||(30682930-30683134)
chr5 (386-618)||(9049332-9049565)
chr5 (386-626)||(13695680-13695923)
chr5 (397-563)||(16409475-16409643)
chr5 (397-619)||(19806328-19806530)
chr5 (397-563)||(26177883-26178050)
chr5 (425-608)||(42309963-42310149)
chr5 (397-563)||(9789224-9789392)
chr5 (397-563)||(18441648-18441816)
chr5 (391-807)||(33906024-33906439)
chr5 (314-462)||(4160702-4160850)
chr5 (468-619)||(5887487-5887640)
chr5 (397-563)||(29722524-29722692)
chr5 (397-563)||(29751160-29751328)
chr5 (504-731)||(4160465-4160690)
chr5 (294-548)||(10054713-10054969)
chr5 (397-563)||(22536290-22536457)
chr5 (397-563)||(26170774-26170930)
chr5 (397-563)||(29720364-29720532)
chr5 (183-346)||(40751195-40751351)
chr5 (397-563)||(10593258-10593426)
chr5 (328-680)||(10700580-10700933)
chr5 (350-834)||(35615902-35616381)
chr5 (397-563)||(25078120-25078289)
chr5 (397-563)||(25136089-25136258)
chr5 (183-346)||(40763200-40763356)
chr5 (335-489)||(30793212-30793362)
chr5 (397-563)||(40380090-40380259)
chr5 (397-563)||(40382301-40382470)
chr5 (386-491)||(42926965-42927069)
chr5 (386-543)||(3325933-3326093)
chr5 (343-549)||(30802843-30803046)
chr5 (447-550)||(22097877-22097981)
chr5 (400-508)||(16546684-16546796)
chr5 (548-618)||(42926838-42926908)
chr5 (605-719)||(14689622-14689734)
chr5 (400-563)||(16544407-16544574)
chr5 (615-754)||(21205873-21206011)
chr5 (196-258)||(28278592-28278652)
chr5 (464-519)||(42926911-42926968)
chr5 (183-258)||(38747281-38747353)
chr5 (724-834)||(30802672-30802780)
chr5 (435-522)||(8445756-8445846)
chr5 (180-265)||(40147531-40147613)
chr5 (592-680)||(8019471-8019557)
chr5 (181-238)||(13488517-13488571)
chr5 (460-526)||(32609572-32609641)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (183-834)||(17793-18439)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (397-834)||(11288-11725)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (452-815)||(80338-80702)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (232-578)||(10475-10820)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (397-619)||(114547-114770)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (397-608)||(149098-149311)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (397-590)||(434504-434701)
scaffold0002 (295-542)||(490219-490468)
scaffold0002 (609-834)||(490661-490882)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (386-608)||(20405-20629)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (397-619)||(861-1083)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (397-619)||(11161-11385)
scaffold0491 (397-619)||(8735-8959)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (394-621)||(27439-27670)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (291-718)||(1291-1729)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (397-563)||(2604-2773)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (400-563)||(3729-3895)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (444-615)||(25000-25175)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (400-563)||(6272-6438)
[»] scaffold0927 (1 HSPs)
scaffold0927 (234-286)||(3431-3482)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (404-441)||(6988-7025)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 633; Significance: 0; HSPs: 100)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 633; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 834
Target Start/End: Original strand, 55301581 - 55302403
Alignment:
Q  6 caggtatattcattcatcaatcttgtccttgtattctactatttttagcatgtttatgtctgtgtatatagattcctttgcttcttaatggcaggtcaca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55301581 caggtatattcattcatcaatcttgtccttgtattctactatttttagcatgtttatgtctgtgtatatagattcctttgcttcttaatggcaggtcaca 55301680  T
Q  106 gaagaatataaagacttcagcttggaggtaatgcatactttcactgccattgcattttctcttttttaatcaatttgtgttgtgaattccggactcaaat 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55301681 gaagaatataaagacttcaacttgaaggtaatgcatactttcactgccattgcattttctcttttttaatcaatttgtgttgtgaattccggactcaaat 55301780  T
Q  206 ttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatata 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  55301781 ttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtgaataaaccacaagcaataaaaacaatctagatcta 55301880  T
Q  306 atctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcaccc 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  55301881 atctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacactaagaaatgttcacca 55301980  T
Q  406 agttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gt---------ta 494  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||         ||    
T  55301981 agttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatacaaataggttacaagaaata 55302080  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc 594  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55302081 caagaaattagcttcaacaaacttacaaagaacaaccctaatttctacccat----------------atgaacaagacactcatgattttcactctccc 55302164  T
Q  595 aaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcac 694  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55302165 aaggtatttacaattgtttcccaactctataatctaacctacaaaagagaaccaacccctagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcac 55302264  T
Q  695 aagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagcccc 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  55302265 aagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaacctcatgaatttttcccaaaaggcaccaaccc-ttttcccaagagctcc 55302363  T
Q  795 ctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  55302364 ctcttttggttctccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 55302403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 183 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 54594086 - 54593435
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaa 282  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  54594086 tgttgtgaattcgggactcaaatttcacaccaatacaaactatatgatatgtagagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatataaataa-ccacaa 54593988  T
Q  283 gcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaagga-taaacaagataaagagag--taaagaaaag 379  Q
    ||||||| || ||| |||| ||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||   ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  54593987 gcaataacaagaatatagacatagtctataaa-ccatgtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagagagactaaagaaaag 54593889  T
Q  380 ataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54593888 ataacaacaccaagaaatgttcacccagtttggtccaact-tgacatactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 54593790  T
Q  480 gagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc 577  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54593789 gagatacaaatgggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctgcacattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc 54593690  T
Q  578 atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatc 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54593689 atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaa-caacccttagcctttgatttcactaaggatc 54593591  T
Q  678 ttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccc 777  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  54593590 ttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccatccccatgaatcttccccaaaaggtaccaaccc 54593491  T
Q  778 tttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
     ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  54593490 -ttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 54593435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 183 - 815
Target Start/End: Original strand, 49199254 - 49199890
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaa 282  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  49199254 tgttgtgaattc-ggtctcaaatttcacagcaatacaaattatatgatgtgtggagcaagtatcaatggcaaccaataaccaaatgtaaataa-ccacaa 49199351  T
Q  283 gcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaa---g 379  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |    
T  49199352 gcaataacaacaatctagatctaatctagaaaac-aagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatag 49199450  T
Q  380 ataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaa 478  Q
    | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49199451 acaacaacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctagtctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaa 49199550  T
Q  479 agagatacaaat---gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacac 575  Q
    |||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49199551 agagatacaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaacgaacaagacac 49199650  T
Q  576 tcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaagga 675  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49199651 tcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattagcctttgatttcactaagga 49199750  T
Q  676 tcttctattttggtttcacaagactc-actcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaa 774  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||    
T  49199751 tcttctcttttggtttcacaagactcaacccaagttgctcacaaaagactctccactcatatgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaa 49199850  T
Q  775 ccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt 815  Q
    ||| ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  49199851 ccc-ttttcacaatagccccctcttttggttctccaagatt 49199890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 182 - 834
Target Start/End: Original strand, 6095389 - 6096037
Alignment:
Q  182 gtgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccaca 281  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  6095389 gtgttgtgaattcgggactcaaatttcacaccaatacaaactat--gatgtgtggagcaagtatcaatggcaaccaataatcaaatgtaaataa-ccaca 6095485  T
Q  282 agcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagat 381  Q
    |||||||| |||||| ||||  || |||| ||| | ||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6095486 agcaataacaacaatatagacctagtctataaa-cgaagtgtatagcaaaaccacaatccaaccaaggcataaacaagataaagagagtaaagaaaagat 6095584  T
Q  382 aacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaga 481  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6095585 aacaacaccaagaaatgttcacacagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaga 6095683  T
Q  482 gatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcat 579  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6095684 gatacaaatgggttacaagaaattaacttcaagaagtttacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaataagacactcat 6095783  T
Q  580 gattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatctt 679  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6095784 gattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacctttagcatttgatttcactaaggatctt 6095883  T
Q  680 ctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctt 779  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  6095884 ctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccc-t 6095982  T
Q  780 tttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    ||||   ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  6095983 tttcaaaagagccccctcttttggttctccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 6096037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 233 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 46860804 - 46860220
Alignment:
Q  233 gtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaag 332  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || |||||| ||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  46860804 gtggagcaaatatcaatggcaaccaataaccaaatgtaaataa-ccacaaacaacaacaacaatatagacctaatctataaa-ccaagtgcatagcaaaa 46860707  T
Q  333 ccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctg 432  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46860706 ccacaatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaaaaaatgttcatccaattcggtccaacaatgacctactctg 46860607  T
Q  433 gaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaac 530  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  46860606 gaggaaagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa 46860507  T
Q  531 cctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcat--gattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatc 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  46860506 cctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcattgaattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttctcaactctagaatc 46860407  T
Q  629 taacccccaaaagagaaccaacc--cttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatct 726  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  46860406 taacccccaaaagagaaccaaccctcttagtctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactct 46860308  T
Q  727 ccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt 815  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  46860307 ccactcatgtgtttcccatccctatgaatcttccccaaaaggcaccaaccc-ttttcccaagagccccctcttttggttctccaagatt 46860220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 182 - 834
Target Start/End: Original strand, 43401586 - 43402228
Alignment:
Q  182 gtgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccaca 281  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||  ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  43401586 gtgttgtgaatttgggactcaaatttcacaccaataccaactat--gatctgtggagcaagtatcaatggcaaccaataaccaaatgtaaataa-ccaca 43401682  T
Q  282 agcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaa--- 378  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       
T  43401683 agcaataacaacaatctagatctaatctagaaaac-aagtgcatagcaaaatcacaatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaata 43401781  T
Q  379 gataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttaca 477  Q
    || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43401782 gacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatttctccaatccactatcaatgagttcttaca 43401881  T
Q  478 aagagatacaaat---gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 574  Q
    |||||||| |||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43401882 aagagataaaaaatgcgttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 43401981  T
Q  575 ctcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaagg 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43401982 ctcatgattttcactctcccaaggtgtttacaatcgtttcccaactcta------------gaaaagagaaccaacccatagcctttgatttcactaagg 43402069  T
Q  675 atcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaa 774  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||    
T  43402070 atcttctcttttggtttcacaagacttacccaagttgttcacaaatgattctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaa 43402169  T
Q  775 ccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  43402170 ccc-ttttctcaagagccccctcttttggttctccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 43402228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 183 - 815
Target Start/End: Original strand, 43403530 - 43404152
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaa 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  43403530 tgttgtgaattccggactaaaatttcacaccaatacaaactat--gatgtgtggagcaagtatcaatggcaaccaataaccaaatgtaaataa-ccacaa 43403626  T
Q  283 gcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaag--- 379  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||        
T  43403627 gcaataataacaatctagatctaatctagaaaac-aagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtggagaaaaataa 43403725  T
Q  380 ataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaa 478  Q
    | ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43403726 acaacaacatcaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaa 43403825  T
Q  479 agagatacaa-atg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacac 575  Q
    ||||||| || |||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43403826 agagataaaacatgagttacaagaaatgagcttcaacaagctcacaaagaacaagcctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacac 43403925  T
Q  576 tcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaagga 675  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||             |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43403926 tcatgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttcccaacttta------------gaaaagagaaccaacccatagcctttgatttcactaagga 43404013  T
Q  676 tcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaac 775  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||    
T  43404014 tcttctcttttagtttcacaagactcacccaagttgctcccaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaac 43404113  T
Q  776 cctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt 815  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  43404114 cc-ttttcccaagagccccctcttttggttctccaagatt 43404152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 231 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 30236458 - 30235855
Alignment:
Q  231 gtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaa 330  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |   | |||||||||||| || |||||| ||||  || |||| ||| ||||||||||| |||    
T  30236458 gtgtggagcaagtatcaatgtcaaccaacaaccaaaaattgattaaccacaagcaacaacaacaatatagacctagtctataaa-ccaagtgcataacaa 30236360  T
Q  331 agccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaacaatgacctact 429  Q
    |  |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  30236359 aaacacaatccaaccaaggtataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaattgttgacctagttcggtccaact-tgacctaat 30236261  T
Q  430 ctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac 527  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30236260 ctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac 30236161  T
Q  528 aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataat 627  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30236160 aaccctaatttctacccattttcccaatctcatcaatgaacaagacactcatgattttcactatcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaat 30236061  T
Q  628 ctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctc 727  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||    
T  30236060 ctaacccccaaaagagaaccaatcattagccttcgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaacttgctcacaaatgactctc 30235961  T
Q  728 cactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaa 826  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  30235960 cactcttgtgttttccaaccccatgaatattccccaaaaggcaccaaccc-ttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatc-ttgaa 30235863  T
Q  827 gctttgaa 834  Q
    ||||||||    
T  30235862 gctttgaa 30235855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 233 - 834
Target Start/End: Original strand, 41819363 - 41819959
Alignment:
Q  233 gtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaag 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    ||||||| ||||||||| || |||||| ||||  || || |  |||||||||||||||||||     
T  41819363 gtggagcaagtatcaatggcaaccaacaaccaa----aagtaaatcacaagcaacaacaacaatatagacctagtcca-taaaccaagtgcatagcaaaa 41819457  T
Q  333 ccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaag-aaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactct 431  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41819458 ccacaatctaaccaaaggataaacaagataaagaaagtagagaaaaaaataacaacaccaataaatgttcacccagtttggtccaacaatgacctactct 41819557  T
Q  432 ggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa---tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaaca 528  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||    
T  41819558 ggaggagagattgatgtctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttagacaagctcacaaaaaaca 41819656  T
Q  529 accctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg-attttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataat 627  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  41819657 accctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctcccaaggtgtttacaattatttcccaactctagaat 41819756  T
Q  628 ctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctc 727  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  41819757 ctaaccgctaaaagagaaccaacccttag-ctttgatttca-taaagatcttctcttttggtttcataagactcactcaagttgctcacaaatgagtctc 41819854  T
Q  728 cactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaa 826  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  41819855 cactcatgtgtttcccaaccccatgaatctt-cccaaaaggcaccaaccc-ttttcccaagagccccctcttttggttctctaagattcacatc-ttgaa 41819951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 233 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 36019178 - 36018581
Alignment:
Q  233 gtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaag 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||     
T  36019178 gtggagcaagtatcaatcacaaccaataatcaaatgtaaatta-ccacaagcaacaataacaatctagatctaatctagaaaac-aagtgtttaacaaaa 36019081  T
Q  333 ccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctg 432  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  || ||||  |    
T  36019080 ccacaatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagaaaaaagataacaacaccaaaaaatgttcatccagttcggtccaacaa--acatact--g 36018985  T
Q  433 gaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat---gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaa 529  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  36018984 ggggagagattgacctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgagttacaagaaattaacttcaacaagctcacaaagaacaa 36018886  T
Q  530 ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatc 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36018885 ccctaatttcaacccattttcccaatttcaccaatgaacaagtcactcgttaattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatc 36018786  T
Q  629 taacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctcc 728  Q
    ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  36018785 taaaccccaaaagagaaccaatccatagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctcc 36018686  T
Q  729 actcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaag 827  Q
    | |||||||||| ||| ||  ||| || |||||||||| |||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  36018685 attcatgtgtttcccatccccatggatcttccccaaaaggcaccaaccc-ttttcccaaaagctccctcttttggttctccaagattcacatc-ttgaag 36018588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 397 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 34491379 - 34490943
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  34491379 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 34491281  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc 594  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||    
T  34491280 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataacacactca-gaatttcactctccc 34491182  T
Q  595 aaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcac 694  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34491181 aaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcac 34491082  T
Q  695 aagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagcccc 794  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||   |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| | ||||||||    
T  34491081 aagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttttcaactccatgaatcttctccaaaaggcaccaaccc-ttttcacaagagcccc 34490983  T
Q  795 ctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  34490982 ctcttttggttctccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 34490943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 317 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 4570202 - 4569681
Alignment:
Q  317 caagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaagga-taaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtc 414  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||   ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4570202 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagggagcaaaagaaaatataacaacaccaagaaatgttgacccagttcggtc 4570103  T
Q  415 caacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaac 512  Q
    |||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  4570102 caaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaat 4570003  T
Q  513 aaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgt 611  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4570002 aagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgt 4569903  T
Q  612 ttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttg 711  Q
    || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4569902 tttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaagatcatctcttttggtttcacaagactcacccaagttg 4569803  T
Q  712 ctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaa 811  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||| | ||| || ||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||    
T  4569802 ctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaataggca-cacccccttttcccaagagccccctcttttgattctccaa 4569704  T
Q  812 ga-ttacatctttgaagctttgaa 834  Q
    || ||||||| |||||||||||||    
T  4569703 gatttacatc-ttgaagctttgaa 4569681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 225 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 47304591 - 47303982
Alignment:
Q  225 tatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgca 324  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||     ||||| ||||||||| || || ||| ||||  || |||| ||| |||||||||    
T  47304591 tatgatgtgtggagcaagtatcaatgacaaccaacaaccaaa-----gtaaatcacaagcaacaacaataatatagacctagtctataaa-ccaagtgca 47304498  T
Q  325 tagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaa------gaaaagataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaa 417  Q
    ||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||| || |||      ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||    
T  47304497 tagcaaaaccacaatccaactaaggaataaacaagataaagaaagcaaaagaaaagaaaagataacaacaccaataaattgttgacccagttcggtcaaa 47304398  T
Q  418 caatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaa 515  Q
    |  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||| |||| |||||||||     
T  47304397 ct-tgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacgaagagatacagatgggttacaagatattaacttcaacaag 47304299  T
Q  516 ctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcc 615  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  47304298 ctcacaaagaacaaccataatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcatgattttcactctcccagggtgtttaaaattgttttc 47304199  T
Q  616 caactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctca 715  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  47304198 caactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagtttttgatttcactaaggatattctcttttggttttacaagactcacctaagttgctca 47304099  T
Q  716 caaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt 815  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  47304098 caaaa-actctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccc-ttttcccaagagccccctcttttggttctccaagatt 47304001  T
Q  816 -acatctttgaagctttgaa 834  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  47304000 cacatc-ttgaagctttgaa 47303982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 231 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 46173688 - 46173311
Alignment:
Q  231 gtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagata--taatctagaaaaccaagtgcatagc 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     ||||||||||||||| |  || ||| || | |  || |||| ||| |||||||||||||    
T  46173688 gtgtggagcaagtatcaatggcaaccaacaaccaaa-----gtaaaccacaagcaacagcaataatatataaacctattctataaa-ccaagtgcatagc 46173595  T
Q  329 aaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaacaatgacct 426  Q
    ||| ||||||| |||| ||   |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||  ||||||    
T  46173594 aaaaccacaatccaactaagaaataaacaagataaagaaagcaaaagaaaagataacaacaccaagaaattgttgatctagttcggtccaact-tgacct 46173496  T
Q  427 actctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaag 524  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46173495 aatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaag 46173396  T
Q  525 aacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 618  Q
    ||||||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46173395 aacaaccctaatttctaccaatttt---------accaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 46173311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 416 - 831
Target Start/End: Original strand, 5433901 - 5434313
Alignment:
Q  416 aacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaac 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         |||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| |||    
T  5433901 aacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatccaccg-------gttctttacaaagagatataaaagggttacaagaaattagctttaac 5433993  T
Q  513 aaactcacaaagaacaa-ccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaatt 609  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5433994 aagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttctcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatt 5434092  T
Q  610 gtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagt 709  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |    
T  5434093 gtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaatcaatctttagtctttgattaca-taaggatcttctcttttggtttcccaagactcacccaact 5434191  T
Q  710 tgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaat-tttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctc 808  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||  |||||| | |||| ||||  ||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  5434192 tgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcctaaccccatgaatctctccctaaaaaacactaaccc-ttttcccaagagccccctcttttggttcta 5434290  T
Q  809 aaaga-ttacatctttgaagcttt 831  Q
     |||| ||||||| ||||||||||    
T  5434291 taagatttacatc-ttgaagcttt 5434313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 556 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 40913350 - 40913068
Alignment:
Q  556 ctcaccaatgaacaagacactcatgattttcac----tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacc 651  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40913350 ctcaccaatgaacaagacactcataattttcacgtactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacc 40913251  T
Q  652 cttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttat 751  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  40913250 cttaacctttaatttcactaaggatcttctcttttgctttcacaagactcacccaatttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccat 40913151  T
Q  752 gaattttc-cccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    |||| ||| || |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  40913150 gaatcttctccaaaaaggcaccaaccc-ttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacat-tttgaagctttgaa 40913068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 44700480 - 44700703
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gtta 494  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  44700480 tgttgacctagttcggtccaact-tgacctaatgtgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaataggtta 44700577  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  44700578 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 44700677  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  44700678 caaggtgtttacaaatgtttcccaac 44700703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 40734665 - 40734442
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgt--ta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  40734665 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgtgtta 40734567  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  40734566 caagaaattaggttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 40734467  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  40734466 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 40734442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 44331712 - 44331489
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  44331712 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaatggctta 44331614  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  44331613 caagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcctaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 44331514  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  44331513 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 44331489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 19683889 - 19684113
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  19683889 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 19683988  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  19683989 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgattttcactcacc 19684088  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  19684089 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 19684113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 29196387 - 29196612
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gtta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  29196387 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttc 29196485  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 592  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  29196486 caagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 29196585  T
Q  593 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  29196586 ccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 29196612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 402 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 40735545 - 40735337
Alignment:
Q  402 acccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaaga 499  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |    
T  40735545 acccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaactggttacaata 40735447  T
Q  500 aattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaagg 598  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  40735446 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacttttccaagg 40735347  T
Q  599 tgtttacaat 608  Q
    ||||||||||    
T  40735346 tgtttacaat 40735337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 7762433 - 7762220
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  7762433 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtta 7762334  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |    
T  7762333 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttctcaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactc-ac 7762235  T
Q  594 caaggtgtttacaat 608  Q
    ||||||||| |||||    
T  7762234 caaggtgttcacaat 7762220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 5236458 - 5236680
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  5236458 tgttgacccagtttggtccaa-attgacctaatctgg-ggaaagattgatctctcgaatccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 5236555  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  5236556 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 5236655  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  5236656 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5236680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 9581450 - 9581227
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  9581450 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtta 9581351  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
     ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  9581350 aaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccca-tttccgaatcccacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 9581252  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  9581251 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 9581227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 45095331 - 45095109
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  45095331 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 45095232  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  45095231 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 45095134  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  45095133 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 45095109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 404 - 619
Target Start/End: Original strand, 22835010 - 22835226
Alignment:
Q  404 ccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaa 501  Q
    |||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  22835010 ccagttcggtccaact-tgacctaatatggcggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaa 22835108  T
Q  502 ttagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtg 600  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22835109 ttagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtg 22835208  T
Q  601 tttacaattgtttcccaac 619  Q
     |||||| |||||||||||    
T  22835209 attacaa-tgtttcccaac 22835226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 464 - 651
Target Start/End: Original strand, 31340268 - 31340457
Alignment:
Q  464 aatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacc 561  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  31340268 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaacctcaatttctaccaattttcccaatctcacc 31340367  T
Q  562 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacc 651  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||    
T  31340368 aatgaacaaaacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccctaaaagggcaccaacc 31340457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 37408626 - 37408403
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    ||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  37408626 tgttcacccagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 37408527  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |    
T  37408526 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaataattttcactc-ac 37408428  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
     ||||||||||||| |||||||||||    
T  37408427 taaggtgtttacaa-tgtttcccaac 37408403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 386 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 32891282 - 32891049
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32891282 acaccaagaaatgattatccagttcggtccaaca-tgacctactccgggggagagatttatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagata 32891184  T
Q  486 caaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atga 581  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  32891183 caaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctacccattttctcaatctcaccgaagaacaagacactcaatga 32891084  T
Q  582 ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 617  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  32891083 tttttactcacccaaggtgtttacaa-tgtttccca 32891049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 51398981 - 51398768
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  51398981 tgttgaccaagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagataaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 51398883  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  51398882 caagaaattagcttcaacaagttcactaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaagacactcaatgattttcactcatc 51398783  T
Q  594 caaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||||||||||    
T  51398782 caaggtgtttacaat 51398768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 421 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 760991 - 760791
Alignment:
Q  421 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactc 518  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  760991 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctc 760892  T
Q  519 acaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 617  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||    
T  760891 acaaagaacagacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcatccaaggtgtttataa-tgtttccca 760793  T
Q  618 ac 619  Q
    ||    
T  760792 ac 760791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 29682526 - 29682303
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |    
T  29682526 tgttgacccagttcggtccaact-tgatctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtga 29682428  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  29682427 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacataatttctacccattttcccaatctcacaaataaacaagacactcaatgattttcactcacc 29682328  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  29682327 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 29682303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 421 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 29811012 - 29810812
Alignment:
Q  421 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactc 518  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29811012 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttc 29810913  T
Q  519 acaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 617  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  29810912 acaaagaacaactctaatttctacatattttcctaatctcaccaatgaataagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttccca 29810814  T
Q  618 ac 619  Q
    ||    
T  29810813 ac 29810812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 386 - 608
Target Start/End: Original strand, 53921493 - 53921717
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||| |||  ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  53921493 acactaagaaatgtttatccagttcggtcaaact-tgatctactccgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaatgata 53921591  T
Q  486 caaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgat 582  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53921592 caaatgagttacaagaaattagctttaacaagctcacaaacaacaaacctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgat 53921691  T
Q  583 tttcactctcccaaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  53921692 tttcactcacccaaggtttttacaat 53921717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 7764632 - 7764422
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  7764632 tgttcacccagttcggtctaaatttgacctactctggaggagagattcatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtta 7764533  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  7764532 caagaaattagctttaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc-ttttccc--tctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 7764437  T
Q  594 caaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||||||||||    
T  7764436 caaggtgtttacaat 7764422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 5258144 - 5258368
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||    
T  5258144 tgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggagaagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtta 5258243  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 592  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  5258244 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 5258342  T
Q  593 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5258343 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5258368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 16499196 - 16498984
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gtta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  16499196 tgttgacccagttcggtccaact-taacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaa 16499098  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  16499097 caagaaattagcttcaacaagcttacaaa-aacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactaccc 16498999  T
Q  594 caaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||||||||||    
T  16498998 caaggtgtttacaat 16498984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 354 - 703
Target Start/End: Original strand, 26323027 - 26323383
Alignment:
Q  354 aacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaa-gaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactct-ggaggagagatt-gatctct 450  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| | ||  ||| |||    
T  26323027 aacaagataaagagagtagagaaaagagaataacaccaaagaattgtttacccacttcggtccaacaatgacctactctagggggataaataagatatct 26323126  T
Q  451 ccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 547  Q
    ||| | ||||||||||||||| || || |||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||   || ||||| |||||||| ||||| ||    
T  26323127 ccacttcactatcaatgagttttttaccaagatatacaaaaaggttacaagaaattagcttcaacaaactcttcaaaaacaaacctaatttttaccc-tt 26323225  T
Q  548 ttcccaatctca-ccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagaga 644  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||| | |||| ||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  26323226 ttctcaatctcatcccatgaacaagacacttaatgatgttcactcactcaaggtgtttcccaattgtttcccaactctaaaatctaaccctcaaaagaga 26323325  T
Q  645 accaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcac 703  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  26323326 accaacccttagcttttgatttc-ctaaggatattcttttttggtctcccaagactcac 26323383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 29813230 - 29813017
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  29813230 tgttgacccagttcggtccaaca-tgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatgcaaatgggtta 29813132  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||| ||    
T  29813131 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctatttttccaatctcaccaattaacaagcccctcaatgattttcactcacc 29813032  T
Q  594 caaggtgtttacaat 608  Q
    ||| |||||||||||    
T  29813031 caatgtgtttacaat 29813017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 405 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 31314604 - 31314389
Alignment:
Q  405 cagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaat 502  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  31314604 cagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagatattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaagatacaaatgggttacaagaaat 31314506  T
Q  503 tagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgt 601  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  31314505 tagcttcaacaagatcacaatgaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcacctatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtgt 31314406  T
Q  602 ttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||| |||||||||||    
T  31314405 ttacaa-tgtttcccaac 31314389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 39153362 - 39153585
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||    
T  39153362 tgttgacccagttcagtccaact-tgacctaatctgggggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttcttataaagggatacaaatgagtta 39153460  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| || ||    
T  39153461 caagaaattagcttaaacaagctcacaatgaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacacatgaacaagacactcaatgattttcattcacc 39153560  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  39153561 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 39153585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 385 - 780
Target Start/End: Original strand, 35138694 - 35139091
Alignment:
Q  385 aacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagaga 483  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||||| ||||||||||||||| | | || ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35138694 aacaccaagaaatgtttatccgattcggttcaacaatgacctacttttgggg-gagattgttctcttccatccactatcaatgagttctttacaaagaga 35138792  T
Q  484 tacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcac-caatgaacaagacactca-t 579  Q
    |||||| |  || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| | |||||||   | |||||||||||||||| |    
T  35138793 tacaaaagagttgcaagaaattaacttcaacaaactcaccaagaacaaacataatttctacccattt-ctcaatctctttccatgaacaagacactcaat 35138891  T
Q  580 gattttcactctcccaaggtgttt-acaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg-atttcactaaggatc 677  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  35138892 gattttcactctcccaaggtgtttcacaattgtttcc-aactttaaaatttaacccc-aaaagagaattaacccttagcttttttatttc-ctaaggatc 35138988  T
Q  678 ttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaat-tttccccaaaatgcaccaacc 776  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||   | || ||||||||||||| |||||| | ||| ||||| ||| |||||    
T  35138989 ttctattttggtctcccaagactcattcaagttgctca-taaagactctcatttgatttgttttccaacctcatgaatctctcctcaaaaggcatcaacc 35139087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 23200138 - 23200360
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  23200138 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggtta 23200237  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  23200238 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgattttcactc-ac 23200335  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  23200336 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 23200360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 397 - 620
Target Start/End: Original strand, 9666467 - 9666693
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||  |||    
T  9666467 tgttgacccagttcggtccaacttt-acctaatctgggggagagatcaatctctccaatccactatcaaagaattcttacaaagaggtataaatgagtta 9666565  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaacc-ctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 592  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  9666566 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaatctaatttctacccatttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 9666665  T
Q  593 ccaaggtgtttacaattgtttcccaact 620  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9666666 ccaaggtgtttacaaatgtttcccaact 9666693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 5260323 - 5260547
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||    
T  5260323 tgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactttggagaagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtta 5260422  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 592  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  5260423 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcactc-a 5260521  T
Q  593 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5260522 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5260547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 23197939 - 23198161
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  23197939 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggtta 23198038  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  23198039 caagaaattagctttgacaagttcacaaaaaacaactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgattttcactc-ac 23198136  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  23198137 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 23198161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Original strand, 9636126 - 9636340
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  9636126 tgttcacccagttcggttcaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggtta 9636225  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 592  Q
    ||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  9636226 caagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcactc-a 9636324  T
Q  593 ccaaggtgtttacaat 608  Q
    ||||||||||||||||    
T  9636325 ccaaggtgtttacaat 9636340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 23391910 - 23392133
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||    
T  23391910 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatttgggggagagatttatctctacaatccactatcaaagagttcttgcaaagtgatacaaatgggtta 23392008  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacact-catgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||    
T  23392009 caagaaattatcttaaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctactcattttcccaaactcaccaatgaaaaagacactaaatgattttcactcacc 23392108  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  23392109 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 23392133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 317 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 40913544 - 40913352
Alignment:
Q  317 caagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaa---gataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcgg 412  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   || || |||||||||| || ||| |||||||||||    
T  40913544 caagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaaggataaacaagataaagagattagagaaaaatagacaataacaccaagagattgttgacccagttcgg 40913445  T
Q  413 tccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaatta 504  Q
    ||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  40913444 tccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatta 40913352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 801260 - 801091
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa---tgt 492  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||    
T  801260 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagt 801161  T
Q  493 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  801160 tacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 801091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 421 - 608
Target Start/End: Original strand, 23410353 - 23410543
Alignment:
Q  421 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactc 518  Q
    ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||| |||    
T  23410353 tgacctaatttgggggagagatttatctctccaatccattatctaagagttcttacaaagtgatacaaatgggttatacgaaattagcttaaacaagctc 23410452  T
Q  519 acaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23410453 acaaagaataaacataatttctacccattttccaaatttcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaat 23410543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 397 - 560
Target Start/End: Original strand, 7780004 - 7780168
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 494  Q
    |||||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  7780004 tgttcacccactttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaggtta 7780103  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcac 560  Q
    ||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7780104 caagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 7780168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 609 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 1683440 - 1683270
Alignment:
Q  609 tgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaag 708  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||    
T  1683440 tgtttcccaactctagattctaacccc-aaaagataaccaacccttagcctttgatttt-ctaaggatcttctcttttggtctcacaagactcaccaaag 1683343  T
Q  709 ttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaat-tttccccaaaatgcaccaacccttt 780  Q
    ||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  1683342 ttgctcataaatgattatccactcatgtgttttccaaccccatgaatctcttcccaaaatgcaccaacccttt 1683270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 397 - 560
Target Start/End: Original strand, 32744437 - 32744600
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gtta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  32744437 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggatagatttatctcttcaatccactatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgagtta 32744535  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcac 560  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  32744536 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaa-actaatttctacccattttttcaatctcac 32744600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 342 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 20937880 - 20937501
Alignment:
Q  342 aaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagag 440  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||  ||| ||| ||| ||||| ||||||| ||||| |||| ||| |||  |    
T  20937880 aaccaaataataaacaagataaagagagtagagaaaagagaaccacacaaaataattgtttacctagttctgtccaactatgacatactttgggggaacg 20937781  T
Q  441 attgatctctccaatccactatcaatgagttctta-caaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatt 537  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||| | || ||||| | |||||    
T  20937780 attgatctctccaatcta-tatcaatgagttcttttcaaagagatacaaaagggttacaagaaattaacttcaacaagctctccaaaaacaaacataatt 20937682  T
Q  538 tctacccattttcccaatctc-accaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtg-tttacaattgtttcccaactctataatctaaccc 634  Q
    |||||| ||||| || |||||   | |||||||||| |||| |||| || |||||  | ||| || ||| ||||| |||| |||||||| ||||| || |    
T  20937681 tctacctatttt-ccgatctctttctatgaacaagagactcaatga-ttgcactcatctaagctgttttccaattatttctcaactctagaatct-actc 20937585  T
Q  635 ccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaa 719  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||| |||| ||||||  |||||||    
T  20937584 ccaaaagagaaccaacctttatcctttgatttc-ctaagaatcttctcttttggtctcccaagaatcacccaagtttgtcacaaa 20937501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 6716667 - 6716500
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  6716667 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 6716568  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6716567 caagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 6716500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 54635292 - 54635125
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  54635292 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 54635193  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54635192 caagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 54635125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 406 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 39127708 - 39127421
Alignment:
Q  406 agttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccact-atcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgt--tacaagaaa 501  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| || || || |||||||||     || ||||||    
T  39127708 agttcagtccaacaatgacctgctctggaggagagattgatctttcaaatccatttatcaatgagttatttacgaaaagatacaaaaaaactataagaaa 39127609  T
Q  502 ttagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacca-atgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggt 599  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| |||  |||| | |||||||  |  ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  39127608 ttagcttcaacaagctcaccaagaacaaacataatttatacttattt-ctcaatctcttctcatgaataagacgctcaatgattttcactcttccaaggt 39127510  T
Q  600 gtttac-aattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggt 689  Q
     ||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||    
T  39127509 attttccaattgtttccaaactctagaatttaaccac-aaaagagaactaacccttagcctttgatttc-ctaagggtattctcttttggt 39127421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 386 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 33192009 - 33191866
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagat 484  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  33192009 acaccaaaaaatgtttaccaagttttgtccaacaatgacctcctctggag-agagattgatctctctaatccactatcaatgagttctttacaaagacat 33191911  T
Q  485 acaaatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaa 529  Q
    | ||  |||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  33191910 aaaatggttacaagaacttagcttcaacaagctctctaagaacaa 33191866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 436 - 578
Target Start/End: Original strand, 51352150 - 51352293
Alignment:
Q  436 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat-gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccct 533  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| || || ||||||| |||| ||||||    
T  51352150 gagagattgatctctcaaatccactctcaatgagttattacaaagaaatacaaatggttacaagaaattaactttaaaaagctcacaatgaacaaaccct 51352249  T
Q  534 aatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca 578  Q
    || |||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  51352250 aacttcta-tcattttcctaatctcaccaataaacaagacactca 51352293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 209 - 413
Target Start/End: Original strand, 31340042 - 31340240
Alignment:
Q  209 acaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatc 308  Q
    ||||||||||||| ||||  | |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||     ||||||||||||||| || || ||| ||||  || ||    
T  31340042 acaccaatacaaactata--atgtgtggagcatgtatcaatggcaaccaacaaccaaa-----gtaaaccacaagcaacaacaataatatagacctagtc 31340134  T
Q  309 tagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagag-taaagaaaagataacaacaccaag-aaatgttcaccca 406  Q
    || ||| |||||||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  31340135 tataaa-ccaagtgcatagcaaaaccacaatccaactaaggaataaacaagataaagaaagcaaaagaaaagataacaacaccaagaaaatgttgaccca 31340233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 45283154 - 45282983
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaaga----gatacaaatg 491  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    |||||||| |    
T  45283154 tgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaaaagggatacaaaag 45283055  T
Q  492 -ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
     |||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45283054 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 45282983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 3617618 - 3617449
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 492  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  3617618 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 3617519  T
Q  493 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3617518 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 3617449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 511 - 605
Target Start/End: Original strand, 26386597 - 26386692
Alignment:
Q  511 acaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttac 605  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||    
T  26386597 acaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtatttac 26386692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 402 - 558
Target Start/End: Original strand, 4055769 - 4055926
Alignment:
Q  402 acccagttcggtccaacaatgacctac-tctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaa---atgttaca 496  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||    
T  4055769 acccagttcggcccaacaatgacctacatctgggggagaga--gatctcttcaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaagaggttaca 4055866  T
Q  497 agaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 558  Q
    |||||||| |||  ||||  || | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4055867 agaaattaacttttacaagttctccaagaacaa-cctaatttctaccca-tttcccaatctc 4055926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 25637592 - 25637426
Alignment:
Q  400 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgttac 495  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | |||||    
T  25637592 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttac 25637493  T
Q  496 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    |||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25637492 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 25637426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 446 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 5373353 - 5373198
Alignment:
Q  446 tctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttcta 541  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||    
T  5373353 tctctccaatccattggcaatgagttccttacaaagagatataaaagggttacaataaattagcttcaacaagctcaaaaagaacaaagcctaatttcta 5373254  T
Q  542 ccc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccca 595  Q
    |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  5373253 cccttttttcccaatctcttcaatgaacaagacactcaatgattttccctcaccca 5373198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 386 - 619
Target Start/End: Original strand, 2075065 - 2075281
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||                  
T  2075065 acacccagaaatgtttacccagttcgatccaact-tgacctactctcggggagagattgatctctcaaatccactatcaattagtt-------------- 2075149  T
Q  486 caaatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaa-caaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgatt 583  Q
     ||  | ||||| ||||||||||  | || ||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2075150 -aatgggtacaataaattagctt--aaaagctcacaaagaaccaactctaattactaccatttttcccaatatcaccaatgaacaagacactcaatgatt 2075246  T
Q  584 ttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||   ||||||||||| || |||||||||||    
T  2075247 ttcactc-agcaaggtgtttataaatgtttcccaac 2075281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 691 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 28074488 - 28074366
Alignment:
Q  691 tcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagag 790  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||||| |||||||||| |||||||  || |||||| ||||    
T  28074488 tcacaagactcacctaagtttctctcaatagactctccactcatgtgtttcccatccccatgaatcttccccaaaacgcaccaa--ctatttcccaagag 28074391  T
Q  791 ccccctcctttggttctcaaagatt 815  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||    
T  28074390 ccccctcttttggttctccaagatt 28074366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 400 - 563
Target Start/End: Original strand, 4598526 - 4598693
Alignment:
Q  400 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttac 495  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||    
T  4598526 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttac 4598625  T
Q  496 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4598626 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 4598693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 391 - 613
Target Start/End: Original strand, 8166453 - 8166677
Alignment:
Q  391 aagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaa 489  Q
    |||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||  |||||  | |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  8166453 aagaaatgtttacccaattaggtctaacaatgacctactttgg-ggagaga--gaaatctccgcttcactatcaacaagttctttacaaagagatacaaa 8166549  T
Q  490 t--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc---atgattt 584  Q
       |||| |||| |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| || |||  |||||||  | ||||||||||||| |   |||||||    
T  8166550 aaggttataagatattaacttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttctactca-tttatcaatctcttccatgaacaagacacactcaatgattt 8166648  T
Q  585 tcactctcccaaggtgtttacaattgttt 613  Q
    |||| | ||||| |||||||||| |||||    
T  8166649 tcacccacccaatgtgtttacaaatgttt 8166677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 400 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 10056384 - 10056217
Alignment:
Q  400 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttac 495  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||    
T  10056384 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttac 10056285  T
Q  496 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10056284 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10056217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 400 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 10058606 - 10058439
Alignment:
Q  400 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttac 495  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||    
T  10058606 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttac 10058507  T
Q  496 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10058506 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10058439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 400 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 10060828 - 10060661
Alignment:
Q  400 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttac 495  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||    
T  10060828 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttac 10060729  T
Q  496 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10060728 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10060661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 400 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 10063050 - 10062883
Alignment:
Q  400 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttac 495  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||    
T  10063050 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttac 10062951  T
Q  496 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10062950 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10062883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 400 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 10065272 - 10065105
Alignment:
Q  400 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttac 495  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||    
T  10065272 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttac 10065173  T
Q  496 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10065172 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10065105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 400 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 10211560 - 10211393
Alignment:
Q  400 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttac 495  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||    
T  10211560 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttac 10211461  T
Q  496 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10211460 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10211393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 402 - 558
Target Start/End: Original strand, 4075476 - 4075636
Alignment:
Q  402 acccagttcggtccaacaatgacctac-tctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaa---atgttaca 496  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||   | ||||||    
T  4075476 acccagttcggcccaacaatgacctacatctgggggagag--tgatctctccaatccactatcaaagagtttcttacaaagtgatacaaaagaggttaca 4075573  T
Q  497 agaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaacc--ctaatttctacccattttcccaatctc 558  Q
    |||||||| |||  ||||  || | ||||||| ||   ||||||||||||| ||||||||||||    
T  4075574 agaaattaacttttacaagttctctaagaacagcctaataatttctaccca-tttcccaatctc 4075636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 386 - 464
Target Start/End: Original strand, 27305700 - 27305777
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatca 464  Q
    |||| |||||||||  || ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27305700 acacaaagaaatgtatacacagttcggtccaa-attgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatca 27305777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 611 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 34795819 - 34795712
Alignment:
Q  611 tttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagtt 710  Q
    |||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||    
T  34795819 tttcccaactttagaatttaaccac-aaaagagaaccatcccttagcctttgatttt-ctaaggatcttctcttttggtctcccaagactcacccaagtt 34795722  T
Q  711 gctcacaaaa 720  Q
     || ||||||    
T  34795721 tcttacaaaa 34795712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 400 - 563
Target Start/End: Original strand, 4600747 - 4600914
Alignment:
Q  400 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaaatg-ttac 495  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || |||||| | ||||    
T  4600747 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaaaggttac 4600846  T
Q  496 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4600847 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 4600914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 400 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 10209340 - 10209173
Alignment:
Q  400 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttac 495  Q
    |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||    
T  10209340 tcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggactacaagaggttac 10209241  T
Q  496 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10209240 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10209173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 541
Target Start/End: Original strand, 25491003 - 25491114
Alignment:
Q  431 tggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgt--tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac 527  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |   || ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  25491003 tggaggagaga--gatctctccacttcactatcaatgatttctttacaaagagatacaaaaggagtataagaaatcagcttcaacaagctctcaaagaac 25491100  T
Q  528 aaccctaatttcta 541  Q
    || |||||||||||    
T  25491101 aaacctaatttcta 25491114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4570272 - 4570210
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaatt--atatgaggtgtggagcaagt 243  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  4570272 tgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaattatatatgatgtgtggagcaagt 4570210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 1683687 - 1683483
Alignment:
Q  351 ataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaa-atgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctc 449  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  | ||||  ||| | | ||||| |||||||| ||||| ||| | |||||  ||||||    
T  1683687 ataaacaagataaagagagtagagaaa-gagaacaacaccaaatagatgtgtaccaaat-cggtctaacaatgatctactatggggaagaga--gatctc 1683592  T
Q  450 tccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagat-acaaatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 547  Q
    |||| | |||||| ||||||||||| |||||||||| | ||| | |||||||||||||| |||| || ||| | |||||| | | ||||||||| |||||    
T  1683591 tccacttcactataaatgagttctttacaaagagattaaaaacgatacaagaaattagcatcaataagctctcgaagaacgaacttaatttcta-ccatt 1683493  T
Q  548 ttcccaatct 557  Q
    ||| ||||||    
T  1683492 ttctcaatct 1683483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 243 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 5270689 - 5270557
Alignment:
Q  243 tatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaaca-atctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattc 341  Q
    |||||||||||||||||||| |||   ||  ||||||||||||| || || | |||||||| |||||||| || ||||||| |  ||||| |||||||      
T  5270689 tatcaatgacaaccaataacaaaa---aa--aaaccacaagcaacaacaatagatctagatctaatctagcaa-ccaagtgtaatgcaaaaccacaatcg 5270596  T
Q  342 aaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaaga 380  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5270595 aaccaaagaataaacatgataaagagagtagagaaaaga 5270557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 34491557 - 34491480
Alignment:
Q  186 tgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaa 266  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  34491557 tgtgaattc-ggactcaaattttacaccaatacaaactata--atgtgtggagcaagtattaatggcaaccaacaaccaaa 34491480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40913647 - 40913566
Alignment:
Q  182 gtgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaa 266  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||  | ||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  40913647 gtgttgtgaattc-ggactcaaatttcacaccaatacaaacaata--atgtgcggagcaagtatcaatggcgaccaacaaccaaa 40913566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 366 - 419
Target Start/End: Original strand, 49229607 - 49229660
Alignment:
Q  366 agagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaaca 419  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||    
T  49229607 agagtaaagaaaagataacaacactaagaaatatttacccagttcgatccaaca 49229660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 457 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 24635366 - 24635276
Alignment:
Q  457 cactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc 544  Q
    |||||||||||| ||  ||| |||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  24635366 cactatcaatgaattgattataaagagatacaaaatagttacaaaaaattagcttcaacaaactctccaagaacaaacttaatttctaccc 24635276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 458 - 515
Target Start/End: Original strand, 40519258 - 40519317
Alignment:
Q  458 actatcaatgagttctt-acaaagagatacaaa-tgttacaagaaattagcttcaacaaa 515  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  40519258 actatcaatgagttctttacaaagagatacaaaatattacaagaaattaacttcaacaaa 40519317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 354 - 471
Target Start/End: Original strand, 50432599 - 50432719
Alignment:
Q  354 aacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacac--caagaaat-gttcacccagttcggtccaacaatgacctac-tctggaggagagattgatctc 449  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||  | |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||    
T  50432599 aacaagataaagagagtagagaatagagaacaacacacctagaatttgttcacccagtttg-tccaacaatgacctacgtctgtaggagagagagatctc 50432697  T
Q  450 tccaatccactatcaatgagtt 471  Q
    |||| |  || |||||||||||    
T  50432698 tccacttaacaatcaatgagtt 50432719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 266
Target Start/End: Original strand, 5433786 - 5433819
Alignment:
Q  233 gtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaa 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5433786 gtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaa 5433819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 543
Target Start/End: Original strand, 28253363 - 28253416
Alignment:
Q  491 gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacc 543  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28253363 gttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacgaaccctaatttctacc 28253416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 548
Target Start/End: Original strand, 3148037 - 3148144
Alignment:
Q  444 gatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaa--atgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttct 540  Q
    ||||||| || | ||| ||||||||| |||||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||   ||||| || ||||||||||    
T  3148037 gatctctgcacttcacaatcaatgagattcttacaaacaaatacaataaggttacaagaaattagcttcaacaagctcttcaagaagaaacctaatttct 3148136  T
Q  541 acccattt 548  Q
    | ||||||    
T  3148137 atccattt 3148144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 452 - 506
Target Start/End: Original strand, 54744304 - 54744359
Alignment:
Q  452 caatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgttacaagaaattagc 506  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  54744304 caatccactatcagtaagttctttacaaagagatacaaaagttacaataaattagc 54744359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 609 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 36796749 - 36796692
Alignment:
Q  609 tgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttc 667  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  36796749 tgtttcccaactcttgaatctaaccctcaaaagt-aatcaacccttagcctttgatttc 36796692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 661 - 719
Target Start/End: Original strand, 50432840 - 50432898
Alignment:
Q  661 tgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaa 719  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| || ||||| |||  |||||||||||||||    
T  50432840 tgatttcactaaggatctccttttttggtctctcaagattcaaccaagttgctcacaaa 50432898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 462 - 491
Target Start/End: Original strand, 31340242 - 31340271
Alignment:
Q  462 tcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31340242 tcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 31340271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 440; Significance: 0; HSPs: 87)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 183 - 834
Target Start/End: Original strand, 34310496 - 34311154
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaat------tatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaa 276  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  34310496 tgttgtgaattccggattcaaagttcacaccaatacaattacaaactatatgatgtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaaataga 34310595  T
Q  277 ccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaagga-taaacaagataaagagagtaaaga 375  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||  || |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34310596 ccacaagcaataacaacaatatagacctagtctataaa-ccaagtgcatagcaaaaccacaattcaaccaaaggaataaacaagataaagagagtaaaga 34310694  T
Q  376 aaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctta 475  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34310695 aaagataacaacaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctta 34310794  T
Q  476 caaagagatacaaatgt--tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagac 573  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34310795 caaaaagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagac 34310894  T
Q  574 actcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaag 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34310895 actcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacctttagcctttgatttcactaag 34310994  T
Q  674 gatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcacca 773  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||  |||||||||| ||||||    
T  34310995 gatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccatccccatgaaccttccccaaaaggcacca 34311094  T
Q  774 accctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  34311095 accc-ttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 34311154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 183 - 834
Target Start/End: Original strand, 4512181 - 4512827
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaa 282  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4512181 tgttgtgaattc-ggactcaaatttcacaccaatacaaactat--gatgtgtggagcaagtatcaatggcaaccaataaccaaatgtaaataaaccacaa 4512277  T
Q  283 gcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagata 382  Q
    ||||||| |||||| ||||  || |||| ||| | ||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4512278 gcaataacaacaatatagacctagtctataaatc-aagtgcatagcaaaaacacaattcaactaatggataaacaagatcaagagagtaaagaaaagata 4512376  T
Q  383 acaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagag 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4512377 acaacaccaagaaatgttcacccagtacggtccaact-tgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttcttataaagag 4512475  T
Q  483 atacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg 580  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4512476 atacaaatgggttacaagaaattagcttcaataaactcacaaagaacaaccttaatttctacccattttccaaatctcaccaatcaacaaggcactcatg 4512575  T
Q  581 attttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttc 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4512576 attttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatataacccccaaaagagaactaacccttagcctttgatttcactaaggatcttc 4512675  T
Q  681 tattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaacccttt 780  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||  |||||| |||||||||| ||||||||||  |    
T  4512676 tcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttccaaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccc--t 4512773  T
Q  781 ttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  4512774 ttcccaagagccccctcttttggttctctaagattcacatc-ttgaagctttgaa 4512827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 185 - 809
Target Start/End: Original strand, 4508499 - 4509118
Alignment:
Q  185 ttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagc 284  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||  || || || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4508499 ttgtgaattc-ggtctcaaatttcacaccaatacaaactat--gaagtatgaagcaagtatcaatgccaaccaataaccaaatataaataaaccacaagc 4508595  T
Q  285 aataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataac 384  Q
    ||||| |||||| ||||  || |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4508596 aataacaacaatatagacctagtctataaa-ccaagtgcatagcaaaaccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaatataac 4508694  T
Q  385 aacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4508695 aacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaact-taacctactctgaagaagagattgatctctccaatccactctcaatgagttcttacaaagagat 4508793  T
Q  485 acaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgat 582  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4508794 acaaatgggttacaagaaattagcttcaataagctcacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatcaacaagacactcatgat 4508893  T
Q  583 tttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttcta 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  4508894 tttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccataaaagagaaccaatccttagcctttgatttcactaaggatcttatc 4508993  T
Q  683 ttttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaacccttttt 782  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||  |||    
T  4508994 ttttggtttcacaagactcaccaaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccc--ttt 4509091  T
Q  783 cccgagagccccctcctttggttctca 809  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  4509092 cccaagagctccctcttttggttctca 4509118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 183 - 809
Target Start/End: Original strand, 4510339 - 4510960
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaa 282  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4510339 tgttgtgaattc-ggactcaaatttcacaccaatacaaactat--gatgtgtggagcaagtatcaatggcaaccaataaccaaatgtaaataaaccacaa 4510435  T
Q  283 gcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagata 382  Q
    ||||||| |||||| ||||  || |||| ||| | ||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4510436 gcaataacaacaatatagacctagtctataaatc-aagtgcatagcaaaaacacaattcaactaatggataaacaagatcaagagagtaaagaaaagata 4510534  T
Q  383 acaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagag 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4510535 acaacaccaagaaatgttcacccagtacggtccaact-tgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttcttataaagag 4510633  T
Q  483 atacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg 580  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4510634 atacaaatgggttacaagaaattagcttcaataaactcacaaagaacaaccttaatttctacccattttccaaatctcaccaatcaacaaggcactcatg 4510733  T
Q  581 attttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttc 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4510734 attttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccataaaagagaaccaatcgttagcctttgatttcactaaggatcttc 4510833  T
Q  681 tattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaacccttt 780  Q
    | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||  |    
T  4510834 tcttttggtttcacaagactcaccaaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccc--t 4510931  T
Q  781 ttcccgagagccccctcctttggttctca 809  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  4510932 ttcccaagagctccctcttttggttctca 4510960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 233 - 780
Target Start/End: Original strand, 8359157 - 8359703
Alignment:
Q  233 gtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaag 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||    |||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  8359157 gtggagcaagtatcaatggcaaccaacaatcaaa----agtaaatcacaagcaacaacaacaatctagatctaatctagaaaac-aagtgcatagcaaaa 8359251  T
Q  333 ccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctg 432  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8359252 ccacaatctaaccaaaggataaacaagataatgagagtagagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctg 8359351  T
Q  433 gaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa---tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaa 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  8359352 gaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagtttaaacaagctcacaaagaaaaa 8359451  T
Q  530 ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatct 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  8359452 ccctaatttctacccattttcccaatctccccaatgaacaagacactcatgattttcactctctcaaggtgtttacaattgttttccaactcaagaatct 8359551  T
Q  630 -aacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctcc 728  Q
     ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  8359552 aaacccccaaaaaataaccaactcttagcctttgatttcactaaggattttctcttttggtttcacaagactcatccaagttgctcacaaaagactctcc 8359651  T
Q  729 actcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaacccttt 780  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  8359652 actcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttt 8359703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 233 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 2390615 - 2390012
Alignment:
Q  233 gtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaag 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||     
T  2390615 gtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaaataa-ccacaatcaataacaacaatctagatctaatctagaaaacaaa-tgtatagcaaaa 2390518  T
Q  333 ccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaag---ataacaacaccaagaaatg-ttcacccagttcggtccaacaatgacctac 428  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    | ||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  2390517 ccacaatccaacaaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaataaacaacaacaccaagagattattcacctagttcggtccaact-tgacctac 2390419  T
Q  429 tctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaa 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2390418 tctggaggagagattgatctctccaatccactatatatgagttattacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa 2390319  T
Q  527 caaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataa 626  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2390318 caaccctaatttctacccatttttcgaatttcaccaatgaacaagacacttatgattttcgctctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaa 2390219  T
Q  627 tctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatct 726  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  2390218 tctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactat 2390119  T
Q  727 ccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttga 825  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||||    
T  2390118 ccactcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaagccaccaaccc-ttttcgcaatagccccctcttttggttttccaagattcacatc-ttga 2390021  T
Q  826 agctttgaa 834  Q
    |||||||||    
T  2390020 agctttgaa 2390012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 235 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 3259322 - 3258745
Alignment:
Q  235 ggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagcc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||| ||    
T  3259322 ggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaaataa-ccacaagcaataacaacaatctagatctaatctagaaaac-acgggcatagcaaaacc 3259225  T
Q  335 acaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctgga 434  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  3259224 acaatccaaccaaggaataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaggaaatgttcacccagttcggttcaact-tgacctactctgga 3259126  T
Q  435 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccc 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3259125 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttacaaagagatacaaatgagttacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccc 3259026  T
Q  533 taatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg-attttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaa 631  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3259025 tagtttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactttcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaa 3258926  T
Q  632 cccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccact 731  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||    
T  3258925 cccccaaatgagaaccaacccttag-gtttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctaataaaagactctccact 3258828  T
Q  732 catgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt 815  Q
    ||| ||||| ||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||||    
T  3258827 catatgtttcccatccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccc-ttttcccaagagccccatctttttgttctccaagatt 3258745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 233 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 29609060 - 29608490
Alignment:
Q  233 gtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaag 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       |||||| ||| |||||||||| || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||     
T  29609060 gtggagcaagtatcaatgacaaccaa-------atgtaaataa-ccacaagcaacaacaacaatctagatctaatatagaaa-ccaagtgcatatcaaaa 29608970  T
Q  333 -ccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactct 431  Q
     |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  29608969 accacaatctaagcaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaagataacaacaccaagaaatattcactcagttcggtccaact-tgacctactct 29608871  T
Q  432 ggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaa 529  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29608870 ggaggagtgattgatatctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa 29608771  T
Q  530 ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgat-tttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatc 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29608770 ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaagacactcatgaagtttcgctctctcaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatc 29608671  T
Q  629 taacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctcc 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  29608670 taacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaagaatcttctattttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctcc 29608571  T
Q  729 actcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt 815  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||     |||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29608570 actcatgtgtttcccaaccccatgaat-----ccaaaaggcaccaaccc-ttttcacaagagccccctcttttggttctccaagatt 29608490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 317 - 806
Target Start/End: Original strand, 48599255 - 48599744
Alignment:
Q  317 caagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtcca 416  Q
    |||||||| |||||| | ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48599255 caagtgcacagcaaaactacaatccaaccaaggaataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacatcaagaaatgttcacccagttcggtcca 48599354  T
Q  417 acaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaa 514  Q
    ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  48599355 act-tgatctgctctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagctcttccaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaa 48599453  T
Q  515 actcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttc 614  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  48599454 gctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatatcaccaatgaacaagacaatcatgattttcactcctccaaggtgtttacaattgtttc 48599553  T
Q  615 ccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctc 714  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48599554 ccaactctagaatataacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctc 48599653  T
Q  715 acaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttc 806  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  48599654 acaaaagactctctactcatgttttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccc-ttttcacaagagccccctcttttggttc 48599744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 196 - 807
Target Start/End: Original strand, 2360784 - 2361382
Alignment:
Q  196 ggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaa 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     ||||| ||||||||| || | |||    
T  2360784 ggactcaaaattcacaccaatacaaactat--gatgtgtggagcaagtatcaatggcaaccaacaaccaaa-----gtaaatcacaagcaacaacatcaa 2360876  T
Q  296 tctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaa 395  Q
    | ||||  || |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |    ||||||       
T  2360877 tatagacctagtctagaaa-ccaagtgcatatcaaaaccacaattcaaccaaggaataaacaagataaagagaataaagaaaagaca----caccaaagg 2360971  T
Q  396 atgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tt 493  Q
     | || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  2360972 ttattgacccagttcggttcaact-tgacctaatctgggggagagattgatatctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtt 2361070  T
Q  494 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2361071 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcc 2361170  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttca 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2361171 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaa-cctcaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttca 2361269  T
Q  694 caagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccc 793  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||    
T  2361270 taagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcatccccaaaaggcaccaaccc-ttttcacaagagccc 2361368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 401 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 6432134 - 6431720
Alignment:
Q  401 cacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaag 498  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6432134 cacccagttcggtccaact-tgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaag 6432036  T
Q  499 aaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaagg 598  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6432035 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccattttcccaatctaaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaatg 6431936  T
Q  599 tgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaaga 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6431935 tgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaccctcaaaagagaaccaacccttagcatttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaaga 6431836  T
Q  699 ctcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcc 798  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||     
T  6431835 ctcacccaagttgctcacaaaagactctacactcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccc-tttccccaagagccccctct 6431737  T
Q  799 tttggttctcaaagatt 815  Q
    |||||||||| ||||||    
T  6431736 tttggttctccaagatt 6431720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 386 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 22270151 - 22269724
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22270151 acaccaagagatgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatcagttcttacaaagagata 22270053  T
Q  486 caaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatga-t 582  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22270052 caaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaat 22269953  T
Q  583 tttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttcta 682  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22269952 tttcactctcccaaggtgtttagaattgtttcc-aactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccatagcctatgatttcactaaggatcttcta 22269854  T
Q  683 ttttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaacccttttt 782  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||  ||  |||||| |||||||||| |||||||  || |||    
T  22269853 ttttggtttcacaagactcacccaagtttctctcaatagactctccactcatgtgtttcccctccccatgaatcttccccaaaaggcaccaa--ctcttt 22269756  T
Q  783 cccgagagccccctcctttggttctcaaagatt 815  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  22269755 cccaagag-cccctcttttggttctccaagatt 22269724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 288 - 831
Target Start/End: Original strand, 22328282 - 22328834
Alignment:
Q  288 aaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaac 387  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22328282 aaaaacaatctagatctaatcgagaaa-ccaagtgcataacaaaaccacaatcgaacaaaagaataaacaagataaagagagtagagaaaagataacaac 22328380  T
Q  388 accaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatac 486  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||| |||||||||||    
T  22328381 accaaaaaatatttacccagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatctctcaaatccactattaatgacttccttgcaaagagatac 22328480  T
Q  487 aaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccatt-ttcccaatctcaccaatg----aacaagacactc- 577  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| || || ||||||||||| | ||||    ||||||||||||     
T  22328481 aaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttctaacctttcttcccaatctctctaatgaacaaacaagacactca 22328580  T
Q  578 atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaa-cccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggat 676  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  22328581 atgattttcattccctcaaggtgtttacaattgtttcccaactttaggatctaaccccccaaaagagaaccaacccttagcttttgattaca-taaggat 22328679  T
Q  677 cttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaat-tttccccaaaatgcaccaac 775  Q
     |||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| || |||| |||||||| ||| |||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  22328680 attctcttttagtttcccaagattcacccaagttgctcacaaatgactctctactcatgtttttcccaaccctatgaatctctccccaaaaggcaccaac 22328779  T
Q  776 cctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaaga-ttacatctttgaagcttt 831  Q
     | ||||||  ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  22328780 tc-ttttcctaagagccccctcttttggttctccaagatttacatc-ttgaagcttt 22328834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 183 - 531
Target Start/End: Original strand, 32357848 - 32358190
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaa 282  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||     |||||||||||    
T  32357848 tgttgtgaattc-ggacacaaatttcacaccaatacaaattatatgatgtgtggagtaagtatcaatgacaaccaacaaccaaa-----gtaaaccacaa 32357941  T
Q  283 gcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagata 382  Q
    |||| || || ||| ||||  || | || ||  |||| |||||| |||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32357942 gcaacaacaataatatagacctagtttataat-ccaattgcataacaaaaccacaattcaagcaaggaataaacaagttaaagagagtaaagaaaagata 32358040  T
Q  383 acaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagag 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32358041 acaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaac-ttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagag 32358139  T
Q  483 atacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaacc 531  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  32358140 atacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagcacaacc 32358190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 556 - 815
Target Start/End: Original strand, 6360073 - 6360331
Alignment:
Q  556 ctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccctta 655  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6360073 ctcaccaatgaacaagtcactcatgattttcattctcccaaggtgtttaaaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccctta 6360172  T
Q  656 gcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaat 755  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||   ||||||    
T  6360173 gcctttgatttcactaaggatcttctcttttgatttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttttcaactccatgaat 6360272  T
Q  756 tttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt 815  Q
     |||  ||||| ||||||  || ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6360273 cttcttcaaaaggcaccattcc-ttttctcaagagccccctcttttggttctccaagatt 6360331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 27347984 - 27347761
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  27347984 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 27347886  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  27347885 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaatcctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 27347786  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||    
T  27347785 caatgtgtttacaa-tgtttcccaac 27347761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 397 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 23555208 - 23554982
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  23555208 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaggtacaaaagtgtta 23555109  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 592  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  23555108 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 23555010  T
Q  593 ccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 621  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23555009 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 23554982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 404 - 607
Target Start/End: Original strand, 30024740 - 30024945
Alignment:
Q  404 ccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaa 501  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30024740 ccagttcggtccaact-tgacctactctgggggagtgattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaa 30024838  T
Q  502 ttagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtg 600  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  30024839 ttagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtg 30024938  T
Q  601 tttacaa 607  Q
    |||||||    
T  30024939 tttacaa 30024945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 404 - 619
Target Start/End: Original strand, 47676144 - 47676360
Alignment:
Q  404 ccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaa 501  Q
    |||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  47676144 ccagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctctccattccactatcattgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaa 47676242  T
Q  502 ttagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtg 600  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  47676243 ttagcttcaacaaattcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcattgattttcactcacccaaggtg 47676342  T
Q  601 tttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  47676343 tttacaa-tgtttcccaac 47676360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 31732970 - 31733193
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  31732970 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccagtatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 31733068  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  31733069 caagaaattagcttcaccaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcagtctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 31733168  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  31733169 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 31733193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 35854082 - 35853859
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  35854082 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 35853983  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  35853982 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 35853884  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  35853883 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 35853859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 421 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 48491723 - 48491523
Alignment:
Q  421 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactc 518  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||    
T  48491723 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctttcaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttc 48491624  T
Q  519 acaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  48491623 acaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtgtttacaa-tgtttccca 48491525  T
Q  618 ac 619  Q
    ||    
T  48491524 ac 48491523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Original strand, 14069834 - 14070047
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  14069834 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 14069932  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  14069933 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 14070032  T
Q  594 caaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||||||||||    
T  14070033 caaggtgtttacaat 14070047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Original strand, 14379862 - 14380075
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  14379862 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 14379960  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  14379961 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 14380060  T
Q  594 caaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||||||||||    
T  14380061 caaggtgtttacaat 14380075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 8153509 - 8153286
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  8153509 tgttgacccagttcagtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgagtta 8153411  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  8153410 caagaaattagctttgacaatctcacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 8153311  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||    
T  8153310 caatgtgtttacaa-tgtttcccaac 8153286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 41317435 - 41317658
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  41317435 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatggatta 41317533  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |    
T  41317534 caagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagagactcaatgattttcactcatc 41317633  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  41317634 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 41317658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 435 - 608
Target Start/End: Original strand, 47673981 - 47674157
Alignment:
Q  435 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccc 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  47673981 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccc 47674080  T
Q  533 taatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47674081 taatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 47674157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 388 - 608
Target Start/End: Original strand, 31105385 - 31105607
Alignment:
Q  388 accaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataca 487  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  31105385 accaagaaatgtttacccagttcggtccaact-tgatctactcttggggagagatttatctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaaaagataca 31105483  T
Q  488 aatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattt 584  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  31105484 aatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaaaaaatctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattt 31105583  T
Q  585 tcactctcccaaggtgtttacaat 608  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  31105584 tcactcacccaaggtgtttacaat 31105607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 43864411 - 43864188
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||    
T  43864411 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaattagtttttacaaagagatacaaatgggtta 43864313  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  43864312 caggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccacttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 43864213  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  43864212 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 43864188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 402 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 4586323 - 4586105
Alignment:
Q  402 acccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaaga 499  Q
    ||||||||||||||||   |||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |    
T  4586323 acccagttcggtccaagt-tgacataatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaaatgggttacaaaa 4586225  T
Q  500 aattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaagg 598  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  4586224 aattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttacactcacccaagg 4586125  T
Q  599 tgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  4586124 tgtttacaa-tgtttcccaac 4586105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 386 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 26417494 - 26417261
Alignment:
Q  386 acaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat 484  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||||   |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26417494 acaccaagaaattgttgacccagtttggtccaatt-tgacctaacctgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagat 26417397  T
Q  485 acaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atga 581  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26417396 acaaatgggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatga 26417297  T
Q  582 ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 618  Q
    ||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||    
T  26417296 ttttcacccgctcaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 26417261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 36146409 - 36146633
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gtta 494  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  36146409 tgttgacctagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 36146507  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 592  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  36146508 c-agaaattagcttcaacaagctcacaaataacaaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 36146606  T
Q  593 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  36146607 ccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 36146633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 48489598 - 48489375
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||  |||    
T  48489598 tgtttacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttattgcaaagagatacaaatgggtta 48489500  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagaca-ctcatgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||    
T  48489499 caagaaattagcttcaacaagttttcaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacatttaatgattttcactcacc 48489400  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  48489399 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 48489375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 421 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 1113801 - 1113601
Alignment:
Q  421 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactc 518  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  1113801 tgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttataagaaattagcttcaacaagctc 1113702  T
Q  519 acaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 617  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  1113701 acaaagaacaaccctaatttctatccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagttgtttacaa-tgtttccca 1113603  T
Q  618 ac 619  Q
    ||    
T  1113602 ac 1113601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 29991221 - 29990999
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||    
T  29991221 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattagaaagagatacaaaagggtta 29991122  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  29991121 caagaaattagctttgacaagttcacaaataacaaccctaatttctatcc-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 29991024  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  29991023 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 29990999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 38671223 - 38671446
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgt--ta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  38671223 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctattttgggggatagatttatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagtgatacaaatgtgtta 38671321  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  38671322 caataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcgctcacc 38671421  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  38671422 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 38671446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 421 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 18126788 - 18126588
Alignment:
Q  421 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactc 518  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  ||    
T  18126788 tgacctagtctgggggagagattgattcctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttgaacaagttc 18126689  T
Q  519 acaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 617  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  18126688 acaaagaacaaccctaatttctacacatttttccaatctcaccaatgaacaaaacactcaatgattttcactcacccaagttgtttacaa-tgtttccca 18126590  T
Q  618 ac 619  Q
    ||    
T  18126589 ac 18126588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 41649012 - 41649234
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gtta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  41649012 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtta 41649110  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  41649111 caagaaattagc-taaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccaatttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcacttacc 41649209  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  41649210 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 41649234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 421 - 618
Target Start/End: Original strand, 496007 - 496206
Alignment:
Q  421 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactc 518  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||    
T  496007 tgacctactataggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagctc 496106  T
Q  519 acaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacact-catgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 617  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  496107 acaaagaactaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaattaacaaaacactaaatgattttcactcacccaaggtttttacaa-tgtttccca 496205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 201 - 520
Target Start/End: Original strand, 6359762 - 6360077
Alignment:
Q  201 caaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctag 300  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||  |||||| |||||     ||||||||||||||||| || || ||| ||     
T  6359762 caaacttcacatcaatacaaactat--gatgtgtggagcaagtatcaatgggaaccaacaacca-----aagtaaaccacaagcaacaacaataatatat 6359854  T
Q  301 atataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaagg-ataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaagaaa-t 397  Q
    |  || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  6359855 acctagtcta-taaaccaagtgcatagcaaaaccacaatccaacttaaggaataaacaagataaagaaagcaaatgaaaagataacaacaccaagaaatt 6359953  T
Q  398 gttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttac 495  Q
    ||| |||||||||| ||||||  ||||||| | ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  6359954 gttgacccagttcgatccaac-ttgacctaatatggggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 6360052  T
Q  496 aagaaattagcttcaacaaactcac 520  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  6360053 aagaaattagcttcaacaagctcac 6360077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 397 - 618
Target Start/End: Original strand, 25766960 - 25767180
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa---tgtt 493  Q
    |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    |||    
T  25766960 tgttcacccagttcggtctaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttcaaaagagatacaaaaggggtt 25767059  T
Q  494 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 592  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  25767060 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttccaatct---caatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 25767155  T
Q  593 ccaaggtgtttacaattgtttcccaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25767156 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 25767180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 386 - 619
Target Start/End: Original strand, 4253518 - 4253754
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagat 484  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  4253518 acaccaagaaatgtttacctagttcggtccaa-attgacctactctgtgggagagattgatctctctaatccattatcaatgagttctttccaaagagat 4253616  T
Q  485 acaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atg 580  Q
    | |||   |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  4253617 ataaaagggttacatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttcta-ccattttaccaatttcaccaatgaacaagaaactcaatg 4253715  T
Q  581 attttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||    
T  4253716 attttcactcacctaaggtgtttacaaatgttttccaac 4253754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 19502346 - 19502122
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||| |||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  19502346 tgttcacccacttcgttccaaacttgacttactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtta 19502247  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttct-acccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 592  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||      
T  19502246 caagaaattagctttgacaagctcacaaaaaacaaccttaatttctaaccttttttcgcaatctcaccactgaacaagacactcaatgattctcactc-a 19502148  T
Q  593 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19502147 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 19502122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 386 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 48408984 - 48408747
Alignment:
Q  386 acaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-gaga 483  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  48408984 acaccaagaaattgttcacccagttcggtctaaacttgacatactctggaggagagattaaactctccaatccactatcaatgagttatttcaaaagaga 48408885  T
Q  484 tacaaatg---ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-at 579  Q
    |||||| |   |||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48408884 tacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagtttacaaagaacaacattaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaat 48408785  T
Q  580 gattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  48408784 gattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 48408747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 386 - 613
Target Start/End: Original strand, 23565052 - 23565280
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| |||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23565052 acaccaagaaatgattacc-agttcagtccaact-tgacctactctaggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 23565149  T
Q  486 caaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaa-ccctaatttctaccca--ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg 580  Q
    ||||   ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||  |     
T  23565150 caaaagagttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaagacctaatttctacctattttttcctaatctcaccaatgaacaagacact--tc 23565247  T
Q  581 attttcactctcccaaggtgtttacaattgttt 613  Q
    || ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23565248 atgttcactcacccaaggtgtttacaaatgttt 23565280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 421 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 4178917 - 4178719
Alignment:
Q  421 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactc 518  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||   |||  ||    
T  4178917 tgacctgctctggaggagagattgaactgttcaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttcccaagttc 4178819  T
Q  519 acaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  4178818 acaaagaacaaccctaatttctaccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttccca 4178721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 455 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 31518905 - 31518752
Alignment:
Q  455 tccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccc 552  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31518905 tccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaactagcttcaataagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttccc 31518806  T
Q  553 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttac 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31518805 aatctcaccaatgaacaagacactcgatgattttcactcacccaaggtgtttac 31518752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 397 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 25616021 - 25615857
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gtta 494  Q
    ||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||    
T  25616021 tgttcgcccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaatgatacaaatgggtta 25615922  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctca 559  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25615921 caagaaattagcttaaacaagcgcacatagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctca 25615857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 12097868 - 12098083
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||       |||||||||||||  |||    
T  12097868 tgttgacctagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattcatctctccaatccacta-caaagagtt-------agagatacaaatgggtta 12097958  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  12097959 caagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctaaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 12098058  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  12098059 caagatgtttacaa-tgtttcccaac 12098083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 39731537 - 39731321
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa--tgtt 493  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||    
T  39731537 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 39731438  T
Q  494 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 592  Q
    |||||||||||| |   ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||       |||||||||| |||||||||||||      
T  39731437 acaagaaattagatctgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc-tttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactc-a 39731347  T
Q  593 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  39731346 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 39731321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 390 - 619
Target Start/End: Original strand, 36574510 - 36574740
Alignment:
Q  390 caagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaa 488  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| | |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  36574510 caagaaatgtttacccagtttggtccaa-attgacctactctag-ggatggattgatctctccaaaccactatcaatgagttctttacaaagagatataa 36574607  T
Q  489 atg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattt 584  Q
    | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||    
T  36574608 aagggttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaatcttaatttctacc--tttccccaatctctccaataaacaagacactcgataattt 36574705  T
Q  585 tcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||| |||||    
T  36574706 tcactcacctaaggtgtttacaaatgttttccaac 36574740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 386 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 31519081 - 31518911
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggag-gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagat 484  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31519081 acaccaagaaatgtttatccagttcggtccaact-tgacctactctggggagagagattgatctctccaatccactgtcaatgagttcttacaaagagat 31518983  T
Q  485 acaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaat 555  Q
    ||||||  |||||||| || ||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  31518982 acaaatgagttacaag-aactagcttcaataagctcacagagaacaaacctaatttctacctattttcccaat 31518911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 386 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 23344151 - 23343934
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||    
T  23344151 acaccaagaaatgtttaccttgttcggtccaact-tgacctactctgg--gagagattaatttctccaatctattatcaatgagttctcacaaagatata 23344055  T
Q  486 caaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaa-caaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atga 581  Q
    | || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  23344054 ctaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaataaaccttaatttctaccc-ttttccaaatctcaccaatgaactagacattcaatga 23343956  T
Q  582 ttttcactctcccaaggtgttt 603  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  23343955 ttttcactcacccaaggtgttt 23343934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 491 - 619
Target Start/End: Original strand, 4538636 - 4538764
Alignment:
Q  491 gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcact 589  Q
    |||||||||||||||||| || ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4538636 gttacaagaaattagcttaaaaaatttcataaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 4538735  T
Q  590 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  4538736 cacccaaggtgtttacaatt-tttcccaac 4538764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Original strand, 43504154 - 43504323
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa---tgt 492  Q
    ||||||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||    
T  43504154 tgttcacccagttcgatccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagt 43504253  T
Q  493 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43504254 tacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 43504323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 397 - 537
Target Start/End: Original strand, 2759198 - 2759339
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gtta 494  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  2759198 tgttgaccaagttcggtccaact-tgacctaatctggggaagagattgatatctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgagtta 2759296  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatt 537  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2759297 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatt 2759339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 491 - 619
Target Start/End: Original strand, 24525992 - 24526121
Alignment:
Q  491 gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaac-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcac 588  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24525992 gttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttcccaatttcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 24526091  T
Q  589 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  24526092 tcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 24526121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 20344064 - 20343897
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtt 493  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  20344064 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggtt 20343966  T
Q  494 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20343965 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 20343897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 404 - 614
Target Start/End: Original strand, 3904624 - 3904837
Alignment:
Q  404 ccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaa--tgttacaagaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  3904624 ccagttcggtccaacaatgacctactctgagggagagattgatctctctgat-cactatcaatgagttctttacaaagagatgcaaaagtgttacaagaa 3904722  T
Q  501 attagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaag 597  Q
    ||||  ||||| |  ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  || | |||||||| |||| |||| |||||||| ||||||    
T  3904723 attacattcaataggctctcaaagaacaaaacctaatttcta-ccattttcccaatctcttcctaagaacaagagactcaatga-tttcactcgcccaag 3904820  T
Q  598 gtgtttacaattgtttc 614  Q
    |||||||||| ||||||    
T  3904821 gtgtttacaaatgtttc 3904837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 395 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 18396488 - 18396338
Alignment:
Q  395 aatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatac-aaatgt 492  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||    
T  18396488 aatgtttacccagttcggtccaccattgacctactcttgaggagagattgatctctccaatcctctatcaatgaattctttataaagagatacaaaatgt 18396389  T
Q  493 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctac 542  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  18396388 tacaaaaaaataggttcaacaaactctccaagaacaaaacctaatttctac 18396338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 24790009 - 24789841
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||||    
T  24790009 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatagtactctccaatccactatcaaagagtttttacaaaagggatacaaaatgtta 24789910  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  24789909 caagaaattagctttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttttaccc-ttttcccaatcttaccaa 24789841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 472 - 720
Target Start/End: Original strand, 1360226 - 1360479
Alignment:
Q  472 cttacaaagagatacaaat----gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcac-caatga 566  Q
    ||||||||||||||||||     ||||||||||||| ||||||||||  || | ||||  || |||||||||||||  ||||||||||||||  | ||||    
T  1360226 cttacaaagagatacaaaaaagggttacaagaaattcgcttcaacaagttctccaagacaaaacctaatttctacct-ttttcccaatctcattccatga 1360324  T
Q  567 acaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctataatctaaccccc-aaaagagaaccaacccttagcctttga 663  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||    
T  1360325 acaagagactcaatgattt-cactcaccaaaggtgtttcccaattgtttttcaactctagaatctaaccccccaaaagagaaccaatccatatcctttga 1360423  T
Q  664 tttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaa 720  Q
    |||| | ||  || |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1360424 tttcccaaaa-atattctcttttggttttccaagactcactcaagttgctcgcaaaa 1360479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 354 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 5116817 - 5116625
Alignment:
Q  354 aacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacac--caagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctc 451  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||  ||| |||| || ||||  ||| ||||||||||||  | || ||| ||||||||| |||||||    
T  5116817 aacaagataaagagggtagagaaaagagaacagcacatcaa-aaatatttaccctattcagtccaacaatgatttgctatgggggagagatttatctctc 5116719  T
Q  452 caatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctac 542  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| |||||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  5116718 caattcactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggtttacaataaattatcttcaacaaactatccaagaacaaacctaatttctac 5116625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Original strand, 6592340 - 6592509
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 492  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  6592340 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 6592439  T
Q  493 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6592440 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccca-tttcccaatctcaccaa 6592509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Original strand, 18388760 - 18388929
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 492  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  18388760 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 18388859  T
Q  493 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18388860 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 18388929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Original strand, 18392196 - 18392365
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 492  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  18392196 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 18392295  T
Q  493 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18392296 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 18392365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 402 - 491
Target Start/End: Original strand, 24525508 - 24525596
Alignment:
Q  402 acccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 491  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24525508 acccagttccgtccaact-tgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 24525596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 532 - 619
Target Start/End: Original strand, 2761439 - 2761526
Alignment:
Q  532 ctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  2761439 ctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcgatgattttcactcacccaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 2761526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Original strand, 6594558 - 6594727
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 492  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  6594558 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 6594657  T
Q  493 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6594658 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 6594727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Original strand, 32060322 - 32060493
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagag---atacaa-at 490  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||   |||||| |     
T  32060322 tgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaaggggatacaagag 32060421  T
Q  491 gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32060422 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 32060493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 402 - 479
Target Start/End: Original strand, 1560671 - 1560749
Alignment:
Q  402 acccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 479  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1560671 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 1560749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 387 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 26639503 - 26639326
Alignment:
Q  387 caccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaa----aga 481  Q
    ||||||||| | || | |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||  ||||||    | |    
T  26639503 caccaagaattttttagccagttcggtacaacaatgacatactatggaggagagattgatctctctaatccattatcaaagagttatttacaatgatata 26639404  T
Q  482 gatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 558  Q
     |||||||   |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  26639403 tatacaaaagggttacaagaaattaacatcaacaaactctccaagaacatacctaatttcta-ccattttcacaatctc 26639326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 30814770 - 30814690
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaa 266  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  30814770 tgttgtgaattc-ggactcaaatttcacaccagtacaaa--atatgatgtgtggagcaagtatcaatggcaaccaacaaccaaa 30814690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 499 - 619
Target Start/End: Original strand, 5514113 - 5514234
Alignment:
Q  499 aaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaa 596  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||| | ||||  ||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||  | ||    
T  5514113 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacataatttctactc-ttttttcaatctctcaaatgaacaagaaactcaatgattttcactcatcgaa 5514211  T
Q  597 ggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  5514212 ggtgtttacaagtgtttcccaac 5514234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 546 - 619
Target Start/End: Original strand, 24514912 - 24514984
Alignment:
Q  546 ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24514912 ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 24514984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 397 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 30814603 - 30814530
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 471  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30814603 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 30814530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 390 - 485
Target Start/End: Original strand, 5513661 - 5513755
Alignment:
Q  390 caagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagata 485  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||    
T  5513661 caagaaatgtttacccagttcagtccaa-attgacctactctggaggtgagattgat-tctccaattcagtgtcaatgagttctttacaaagagata 5513755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 543
Target Start/End: Original strand, 43363405 - 43363622
Alignment:
Q  333 ccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaac--accaagaaat-gttcacccagttcggtccaacaatgacctac- 428  Q
    |||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||  |||||||| | |||| || |||| || |||||||||||| ||     
T  43363405 ccacaatcgaaccaaagaacaaacaagataaagagagtagagtgtagagaacaactcaccaagaatttgttcccctagtttggcccaacaatgaccaaca 43363504  T
Q  429 tctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaa--gagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaa 523  Q
    | |||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||||| || |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||| ||| | ||    
T  43363505 tatggaggagaga--gatctatccacttcactatcaatgagttatttacaaatagagatacaaaagagttacaataaattagtttcaacaagctctccaa 43363602  T
Q  524 gaacaaccctaatttctacc 543  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  43363603 gaacaaacctaatttctacc 43363622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 750 - 834
Target Start/End: Original strand, 32358191 - 32358274
Alignment:
Q  750 atgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  32358191 atgaattttccccaaaaggcaccaaccc-ttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 32358274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22270310 - 22270241
Alignment:
Q  195 cggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaa 266  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||  || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  22270310 cggactcaaatttcacagcaatacaaactat--gatgtgtggagcaagtatcaatggcaaccaacaaccaaa 22270241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 265
Target Start/End: Original strand, 22552448 - 22552485
Alignment:
Q  228 gaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22552448 gaggtgtggagcaagtatcaatgacaactaataaccaa 22552485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 681
Target Start/End: Original strand, 37545121 - 37545195
Alignment:
Q  605 caattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttct 681  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||   |||| ||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||    
T  37545121 caattgtttcctaactctgtaatctaacct--aaaaaagaaccaactcttagcctttgatttttgtaaggatcttct 37545195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6430496 - 6430432
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatg 250  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||    
T  6430496 tgttgtgaattc-ggactcaaaactcacaccaatacaaactat--gatgtgtggagcaagtatcaatg 6430432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 457 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 27073925 - 27073828
Alignment:
Q  457 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcc 551  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||  |  ||||||||| |||||||    
T  27073925 cactgtcaacgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattaacttcaataaactcataacgaacaaaacatatttctaccaattttcc 27073828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 457 - 551
Target Start/End: Original strand, 27204388 - 27204485
Alignment:
Q  457 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcc 551  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||  |  ||||||||| |||||||    
T  27204388 cactgtcaacgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattaacttcaataaactcataacgaacaaaacatatttctaccaattttcc 27204485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 491 - 552
Target Start/End: Original strand, 13065494 - 13065555
Alignment:
Q  491 gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccc 552  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||  |||||||    
T  13065494 gttacaataaattagtttcaacaaactctcaaagtgcaatcctaatttctaccatttttccc 13065555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 592 - 719
Target Start/End: Original strand, 23794024 - 23794149
Alignment:
Q  592 cccaaggtgtttacaa-ttgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtt 690  Q
    ||||| |||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||| | ||| ||  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||| || |||||||     
T  23794024 cccaatgtgtttacaaattgtttttcaactctagaatctaaccacaaaatga--accaaccattagcctttgattt-tctaaggatctcctcttttggtc 23794120  T
Q  691 tcacaagactcactcaagttgctcacaaa 719  Q
    ||  | || |||| ||| |||||||||||    
T  23794121 tcttacgattcacccaaattgctcacaaa 23794149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 428; Significance: 0; HSPs: 93)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 183 - 834
Target Start/End: Original strand, 13548792 - 13549438
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaa 282  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||     |||||||||||    
T  13548792 tgttgtgaattctgaactcaaatttcacaccaatacaaactatatgatgtgtggagcaagtatcaatgacaaccaacaaccaaa-----gtaaaccacaa 13548886  T
Q  283 gcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagata 382  Q
    |||| || || ||| ||||  || |||| ||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13548887 gcaacaacaataatatagacctagtctataaaccaaagtgcatagcaaaaccacaatccaaccaaagaataaacaagataaagagagtaaagaaaagata 13548986  T
Q  383 acaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagag 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13548987 acaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagag 13549085  T
Q  483 atacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg 580  Q
    |||||||||  ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13549086 atacaaatgggttacatgaaattaggtttaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg 13549185  T
Q  581 attttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttc 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13549186 attttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaatctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaagtatcttc 13549285  T
Q  681 tattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaacccttt 780  Q
    | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||    
T  13549286 tcttttggtttcacaagattcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccaaccccatgaattttcctcaaaaggcaccgaccc-tt 13549384  T
Q  781 ttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||    
T  13549385 ttcacaagagctccctcttttggttatccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 13549438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 183 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 11349080 - 11348447
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaa 282  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  11349080 tgttgtgaattcgggactcaaattttacaccaatacaaactatatgatgtgtggagcaagtatcaatgacaattaataatcaaatgtaaataa-ccacaa 11348982  T
Q  283 gcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaagga-taaacaagataaagagag--taaagaaaag 379  Q
    ||||||| |||||| ||||  || |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||   ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11348981 gcaataacaacaatatagacctagtctataaa-ccaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagagagagtaaagaaaag 11348883  T
Q  380 ataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 479  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11348882 ataacaacatcaagaaatgttcactcagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttagaaa 11348784  T
Q  480 gagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc 577  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11348783 gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc 11348684  T
Q  578 atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatc 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11348683 atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatc 11348584  T
Q  678 ttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccc 777  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||  ||    
T  11348583 ttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccagacc 11348484  T
Q  778 tttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt 815  Q
     ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11348483 -ttttcccaagagccccctcttttggttctccaagatt 11348447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 199 - 834
Target Start/End: Original strand, 37032873 - 37033511
Alignment:
Q  199 ctcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatct 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37032873 ctcaaatttcacaacaatacaaactatatgatgtgtggagcaaatatcaatggcaaccaataaccaaatgtaaataa-ccacaagcaataacaacaatct 37032971  T
Q  299 agatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaa--gataacaacaccaagaaa 396  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||| || | |    
T  37032972 agatctaatctagaaaac-aagtgcatagcaaaatcacactctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaatagacaacaacacgaataga 37033070  T
Q  397 t-gttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tg--t 492  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |    
T  37033071 ttgttcacccagttcggtccaaccatgacctactatggagaagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatgcaaaatggat 37033170  T
Q  493 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctc 592  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37033171 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctc 37033270  T
Q  593 ccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttc 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37033271 ccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaccccaaaaagagaaccaacccatagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttc 37033370  T
Q  693 acaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagcc 792  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  37033371 acaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaacctcatgaatcttcctcaaaaggcaccaaccc-ttttcccaagagcc 37033469  T
Q  793 ccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  37033470 ccctcttttggttctccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 37033511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 180 - 834
Target Start/End: Original strand, 13546883 - 13547527
Alignment:
Q  180 ttgtgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaacca 279  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     ||||||||    
T  13546883 ttgtgttgtgaattc-ggtctcaaatttctcaccaatacaaactatataatgtgtggagcaagtatcaatggcaaccaacaaccaaa-----gtaaacca 13546976  T
Q  280 caagcaataaaaacaatctaga--tataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaa 377  Q
    ||||||| || || ||| ||||  |||| | || ||| |||||||||     || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13546977 caagcaacaacaataatatagacctatagtttataaa-ccaagtgca-----aaaccacaatccaaccaaagaataaacaagataaagagagtaaagaaa 13547070  T
Q  378 agataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttaca 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13547071 agataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttaca 13547169  T
Q  478 aagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacac 575  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13547170 aagagatacaaatgggttacaagaaaatagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacac 13547269  T
Q  576 tcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaagga 675  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13547270 tcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaatctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaagta 13547369  T
Q  676 tcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaac 775  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  13547370 tcttctcttttggtttcacaagattcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccaaccccatgaattttcctcaaaaggcaccgac 13547469  T
Q  776 cctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    || ||||| | ||||| ||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||    
T  13547470 cc-ttttcacaagagctccctcttttggttatccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 13547527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 236 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 37168622 - 37168027
Alignment:
Q  236 gagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagcca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| || || | | ||||  || |||| ||   ||||||||||||||| |||    
T  37168622 gagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaaataa-cctcaagcaacaacaata-tatagacctagtctataat--caagtgcatagcaaaacca 37168527  T
Q  336 caattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggag 435  Q
    ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  37168526 caatcaaaccaaggaataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggag 37168428  T
Q  436 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat---gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccc 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37168427 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccc 37168328  T
Q  533 taatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaac 632  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37168327 taatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctctcaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaac 37168228  T
Q  633 ccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactc 732  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  37168227 ccccaaaagagaatcaacctttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttagtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactc 37168128  T
Q  733 atgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagcttt 831  Q
    |||||||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  37168127 atgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccc-ttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatc-ttgaagcttt 37168030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 225 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 29136585 - 29135978
Alignment:
Q  225 tatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgca 324  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||  ||||  || |||| ||| |||||||||    
T  29136585 tatgatgtgtggagcaagtaccaatgacaaccaataaccaaatataactaa-ccacaagcaataacaacaaaatagacctagtctataaa-ccaagtgca 29136488  T
Q  325 tagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagata-acaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatga 423  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||    
T  29136487 tagcaaaaccacaatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaa-atagacagcaccaagaaatgttcacctagttcggtccaaacttga 29136389  T
Q  424 cctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcaca 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  29136388 cctactctggaggagagattgatctctccaatccacgatcaatgagttcttacaaagaaatacaaatgggttccaagaaattagcttcaacaagctcaca 29136289  T
Q  522 aagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29136288 aagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcacaactc 29136189  T
Q  622 tataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaag 721  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  29136188 tagaatctaacccccaaaagagaactaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaaa 29136089  T
Q  722 aatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatc 820  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  29136088 actctccactcatgt-ttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccc-ttttcccaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatc 29135991  T
Q  821 tttgaagctttgaa 834  Q
     |||||||||||||    
T  29135990 -ttgaagctttgaa 29135978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 233 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 47115502 - 47114921
Alignment:
Q  233 gtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaag 332  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  47115502 gtggagcaagtatcaatgacaatcaacaatcaaatgtaaataatc-acaagcaataacaacaatctagatctaatctagaaaac-aagtgcataacaaaa 47115405  T
Q  333 ccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctg 432  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47115404 ccacaatctaacaaaaggataaacaagataaaaagagcagagaaaagataacaacatcaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctg 47115305  T
Q  433 gaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat---gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaa 529  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  47115304 gagcagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaa 47115205  T
Q  530 ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatct 629  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47115204 ccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaagatgtttacaattgtttcccaactctagaatct 47115105  T
Q  630 aacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctcca 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  47115104 aacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcattaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctcca 47115005  T
Q  730 ctcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt 815  Q
     |||||||||| ||||||  |||||| || ||||||| | |||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  47115004 ttcatgtgtttcccaaccccatgaatctt-cccaaaaggtaccaaccc-tgttcccaagagccccctcttttggttctccaagatt 47114921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 200 - 834
Target Start/End: Original strand, 47255148 - 47255772
Alignment:
Q  200 tcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatcta 299  Q
    |||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||     |||||||||| |||||| || || ||| ||    
T  47255148 tcaaatttcacaccaatataaa--ctatgatgtgtggagcaggtatcaatggcaaccaacaacca-----aagtaaaccataagcaacaacaataatata 47255240  T
Q  300 gatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaa---agaaaagataacaacaccaagaaa 396  Q
    ||  || ||||  ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| |||||||||||||||||    
T  47255241 gacctagtcta-taaaccaagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaaagaaaaaaaataacaacaccaagaaa 47255339  T
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gtta 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  47255340 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 47255439  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc 594  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47255440 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc 47255539  T
Q  595 aaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcac 694  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47255540 aaggcatttacaattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagtctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcac 47255639  T
Q  695 aagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagcccc 794  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||||     ||||||| ||||||||    
T  47255640 aagactcact-aagttgctcacaaaagactctccaatcatgtgtttcccaacc-catgaatcttccccaaaaggcacca-----ttttcccaagagcccc 47255732  T
Q  795 ctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
     || |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  47255733 atcttttggttctccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 47255772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 313 - 834
Target Start/End: Original strand, 42297888 - 42298413
Alignment:
Q  313 aaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaa---gataacaacaccaagaaat-gttcacccagt 408  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| || |||||||||||    
T  42297888 aaaccaagtgcatagcaaaatcacaatccaaccaaataataaacaagataaa-agagtaaagaaaaatagacaacaacaccaagagattgttcacccagt 42297986  T
Q  409 tcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagc 506  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  42297987 tcggtccaaccatgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagc 42298086  T
Q  507 ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttaca 606  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42298087 ttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgatttttactctcccaaggtgtttaca 42298186  T
Q  607 attgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactca 706  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  42298187 attgtttcacaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagcctttgatttcacttaggatcttctcttttggtttcacaagactcaccca 42298286  T
Q  707 agttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttc 806  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  42298287 agttgctcgcaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaaccc-ttttcacaagagccccctcttttggttc 42298385  T
Q  807 tcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||||    
T  42298386 tccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 42298413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 236 - 781
Target Start/End: Original strand, 31925553 - 31926092
Alignment:
Q  236 gagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagcca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||| || ||| ||||  || |||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  31925553 gagcaagtatcaatgacaaccaacaaccaaatt------aaccacaagcaataacaataatatagacctagtctataaa-ccaagtgcatagcaaaacca 31925645  T
Q  336 caattcaaccaaaggataa-acaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctgga 434  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  31925646 caatccaaccaaagaataatacaagataacgagagtaaagaaaaaataacaacaccaagaaatgttcacctagttcggtccaact-tgacctactctaga 31925744  T
Q  435 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccc 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  31925745 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacatccc 31925844  T
Q  533 taatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaac 632  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||    
T  31925845 taatttctacccatttttccactctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaactgcttcc-aactctagaatctaac 31925943  T
Q  633 ccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactc 732  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  31925944 ccccaaaagagaaccaaccattagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagtctcacccaagttgctcacaaaagattctccactc 31926043  T
Q  733 atgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttt 781  Q
    | |||||| |||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  31926044 acgtgtttcccaaacccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccctttt 31926092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 233 - 834
Target Start/End: Original strand, 7482064 - 7482669
Alignment:
Q  233 gtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaa---ccacaagcaataaaaacaatctagata--taatctagaaaaccaagtgcatag 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||   || ||||||| || |||||| || | |  || |||| ||   |||||||||||    
T  7482064 gtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaattaatgtaaataacctcaagcaacaacaacaatatatagacctagtctataat--caagtgcatag 7482161  T
Q  328 caaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgaccta 427  Q
    |||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  7482162 caaaaccacaatccaaccaaggaataaacaagataaagagagtaaagaaaagatgacaataccatgaaatgttcacctagttcggtccaact-tgaccta 7482260  T
Q  428 ctctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat---gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaag 524  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  7482261 ctctgaaggagagattgatctctccaattcactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaag 7482360  T
Q  525 aacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactcta 623  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7482361 aacaaccctaatttctacccatttacccaatctcaccaatgaacaatacactcatgaattttcactttcccaaggtgtttacaattgcttcccaactcta 7482460  T
Q  624 taatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaa 723  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  7482461 gaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagc-tttgatttc-ctaaggatcttctctttttgtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagac 7482558  T
Q  724 tctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagag-ccccctcctttggttctcaaagatt-acatct 821  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||     
T  7482559 tctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccc-ttttcccaagagcccccctcttttggttctccaagattcacatc- 7482656  T
Q  822 ttgaagctttgaa 834  Q
    |||||||||||||    
T  7482657 ttgaagctttgaa 7482669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 328 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 193849 - 193361
Alignment:
Q  328 caaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataac-aacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacc 425  Q
    |||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||| | || ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  193849 caaaaccacaatccaaccaaggaataaacaagataaataaagcaaaagagaagataacgaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaact-tgaca 193751  T
Q  426 tactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaa 523  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  193750 tactctggagaagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctaataaa 193651  T
Q  524 gaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactcta 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193650 gaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcaccctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactcta 193551  T
Q  624 taatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaa 723  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  193550 gaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcatccaagttgctcacaaaagac 193451  T
Q  724 tctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt 815  Q
    ||| ||| ||||||||| ||||||  |||||| || ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  193450 tcttcacacatgtgtttcccaaccccatgaatctt-cccaaaaggcaccaa-ccttttccccaagagccccctcttttggttctccaagatt 193361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 321 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 19754737 - 19754240
Alignment:
Q  321 tgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaa 420  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| |||||||||||      
T  19754737 tgcatagcaaaaccacaatccaacaaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataaca-caccaaaaattgttgacccacttcggtccaact- 19754640  T
Q  421 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactc 518  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  19754639 tgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatcggttacaagaaattagcttcaacaagctc 19754540  T
Q  519 acaaagaacaaccctaatttctacccattttcc-caatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  19754539 acaaagaacaaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctctcaaggtgtttacgaatgtttccca 19754440  T
Q  618 actctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcac---taaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctc 714  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19754439 actctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattatcctttgatttcacttataaggattttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctc 19754340  T
Q  715 acaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagat 814  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||  |||||| || |||||    
T  19754339 acaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccc-ttttcacaagagccccctctcttggttttccaagat 19754241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 232 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 34603894 - 34603306
Alignment:
Q  232 tgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagata--taatctagaaaaccaagtgcatagca 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||  || | |||| || | |  || |||| ||   |||||||||||||    
T  34603894 tgtggagcaagtatcaatgacaaccaataatcaaatgtaaataa-cctcaagcaccaacagcaatatatagacctagtctataat--caagtgcatagca 34603798  T
Q  330 aagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctact 429  Q
    || ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||              |||||||||||  |||||||||    
T  34603797 aaaccacaatccaaccaaggaataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacacctag--------------ttcggtccaact-tgacctact 34603713  T
Q  430 ctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat---gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaa 526  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34603712 ctggaggagagattgatctcttcaatccaccatcaatgagttcttacaaagagataaaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaa 34603613  T
Q  527 caaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctata 625  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34603612 caaccctaatttctacccattttttcaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactttcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctaga 34603513  T
Q  626 atctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatc 725  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  34603512 atctaacctccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactt 34603414  T
Q  726 tccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttg 824  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||    
T  34603413 ttcactcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccc-ttttcccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatc-ttg 34603316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 317 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 19752930 - 19752435
Alignment:
Q  317 caagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtcca 416  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||  | |||| ||| |||||||||||    
T  19752930 caagtgcatagtaaaaccacaatccaacaaaaggataaacaagataaagagagtaaataaaagataaca---caaaagattgttgacctagttcggtcca 19752834  T
Q  417 acaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaa 514  Q
    ||  ||||||| | |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19752833 act-tgacctaatatgggagagagattgatctctccaatcctctatcaatgagttcttacaaagagatacaaatcggttacaagaaattagcttcaacaa 19752735  T
Q  515 actcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcc-caatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgttt 613  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  19752734 gctcgcaaagaacaaccctaatttctacccattttactcaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctctcaaggtgtttacgattattt 19752635  T
Q  614 cccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgct 713  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  19752634 cccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatcattagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcatctaagttgct 19752535  T
Q  714 cacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaaga 813  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||||   |||||| |||||||||| |||||||||  |||||   |||||||| || |||||||||| ||||    
T  19752534 cacaaaatactctccactcatgtgtttcccaactcaatgaatcttccccaaaaggcaccaacc--ttttcataagagccccatcttttggttctccaaga 19752437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 491 - 834
Target Start/End: Original strand, 37879007 - 37879349
Alignment:
Q  491 gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactc 590  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37879007 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactc 37879106  T
Q  591 tcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtt 690  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  37879107 tcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttgatt 37879206  T
Q  691 tcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagag 790  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||    
T  37879207 tcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaattttccccaaaaggcaccaa-cctttttcacaagag 37879305  T
Q  791 ccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  37879306 ccccctctttttgttctccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 37879349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 202 - 491
Target Start/End: Original strand, 37876573 - 37876860
Alignment:
Q  202 aaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctaga 301  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| | ||||    
T  37876573 aaatttcacaccaatacaaactatatgatgtgtggagcaagtatcaatggcaaccaataaccaaatgtaaataaaccacaagcaaaaacaacactataga 37876672  T
Q  302 tataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttc 401  Q
      || |||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37876673 cctagtctataaa-ccaagtgcatagaaaaaccacaattcaaccaaatgataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttc 37876771  T
Q  402 acccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 491  Q
    |||||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37876772 acccagttcggttcaac-ttgatgtactctggaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatg 37876860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 233 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 28242635 - 28242382
Alignment:
Q  233 gtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaag 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| || |||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||     
T  28242635 gtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaaataa-cctcaagcaacaacaacaatctagatctaatttagaaa-ccaagtgaatagcaaaa 28242538  T
Q  333 -ccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactct 431  Q
     |||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28242537 accacaatctaacaaaatgataaacaagataaagagagtagagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactct 28242438  T
Q  432 ggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28242437 ggaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaa 28242382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 567 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 28242385 - 28242119
Alignment:
Q  567 acaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatt 665  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28242385 acaagacactcaagaattttcactctcccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaacccctaaaagagaaccaacccatagcctttgatt 28242286  T
Q  666 tcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaa 765  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  28242285 tcactaaggatattctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccttatgaatctt-cccaaa 28242187  T
Q  766 atgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    | |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  28242186 aggcaccaaccc-ttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacat-tttgaagctttgaa 28242119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Original strand, 8550787 - 8551001
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  8550787 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgagtta 8550886  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  8550887 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 8550986  T
Q  594 caaggtgtttacaat 608  Q
    ||| |||||||||||    
T  8550987 caatgtgtttacaat 8551001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 28265555 - 28265778
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  28265555 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggtta 28265653  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  28265654 caagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcgccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 28265753  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  28265754 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 28265778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Original strand, 28220227 - 28220440
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  28220227 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 28220325  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  28220326 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccgaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcacc 28220425  T
Q  594 caaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||||| ||||    
T  28220426 caaggtgttttcaat 28220440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 31659405 - 31659192
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  31659405 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaatgggtta 31659307  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  31659306 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacagccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 31659207  T
Q  594 caaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||||||||||    
T  31659206 caaggtgtttacaat 31659192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 834168 - 834391
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  834168 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctactctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtta 834266  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  834267 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcacgcacc 834366  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  834367 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 834391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 421 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 1833666 - 1833467
Alignment:
Q  421 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactc 518  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| | | ||    
T  1833666 tgacctaatctggtggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaatttagcttcaatagattc 1833567  T
Q  519 acaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  1833566 acaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttccca 1833468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 402 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 44455322 - 44455104
Alignment:
Q  402 acccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaaga 499  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  44455322 acccagttcggtcaaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgagttacaaga 44455224  T
Q  500 aattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaagg 598  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  44455223 aattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatggttttcactcacccaagg 44455124  T
Q  599 tgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  44455123 tgtttacaa-tgtttcccaac 44455104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 397 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 49918517 - 49918309
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  49918517 tgttgacctagttcggtccaact-tgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 49918419  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  49918418 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 49918319  T
Q  594 caaggtgttt 603  Q
    ||||||||||    
T  49918318 caaggtgttt 49918309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 429 - 608
Target Start/End: Original strand, 37503589 - 37503768
Alignment:
Q  429 tctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaaca 528  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  37503589 tctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaag-gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaaca 37503687  T
Q  529 accctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37503688 accctaatttttacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 37503768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 3157032 - 3156820
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  3157032 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 3156934  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  3156933 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 3156835  T
Q  594 caaggtgtttacaat 608  Q
    || ||||||||||||    
T  3156834 cagggtgtttacaat 3156820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 3189498 - 3189275
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  3189498 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagagtta 3189399  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcc 593  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  3189398 caggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactc-ac 3189300  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  3189299 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3189275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 3198315 - 3198092
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  3198315 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagagtta 3198216  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcc 593  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  3198215 caggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactc-ac 3198117  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  3198116 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3198092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 3207154 - 3206931
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  3207154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagagtta 3207055  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcc 593  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  3207054 caggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactc-ac 3206956  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  3206955 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3206931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 3847122 - 3847345
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  3847122 tgttgaccaagttcggtccaact-tgacctaatctggggaagagatggatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtta 3847220  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  3847221 caaaaatttagcttaaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 3847320  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  3847321 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3847345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 28223422 - 28223645
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  28223422 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 28223520  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  28223521 caagaaattagcttcaacaagttcagaaagatcaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 28223620  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||    
T  28223621 caaggtgtcttcaa-tgtttcccaac 28223645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Original strand, 4552638 - 4552851
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||    
T  4552638 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctactctgagggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttacaaagggatacaaaggggtta 4552736  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  4552737 caagaaattagcttcaacaagctcacaaaggacaaacctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttccctcacc 4552836  T
Q  594 caaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||||||||||    
T  4552837 caaggtgtttacaat 4552851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 46065085 - 46064872
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  46065085 tgtttacccagttcgatccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttcttacaaagagatacacatgagtta 46064987  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  46064986 caagaaattagcttcaacgagctcacaaagaacaaacctaatttttatccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 46064887  T
Q  594 caaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||||||||||    
T  46064886 caaggtgtttacaat 46064872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 404 - 619
Target Start/End: Original strand, 50169218 - 50169434
Alignment:
Q  404 ccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaa 501  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  50169218 ccagttcggtccaact-tgacctaatctaggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagtacttacaaagagatacaaatgagttacaagaaa 50169316  T
Q  502 ttagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtg 600  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  50169317 ttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggta 50169416  T
Q  601 tttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  50169417 tttacaa-tgtttcccaac 50169434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 50167176 - 50167399
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  50167176 tgttgacctagttcggtccaact-tgagctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggtta 50167274  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  50167275 caagaaattagctttgacaagctcacaaataacaaccctaatttctactaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 50167374  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  50167375 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 50167399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Original strand, 13659337 - 13659550
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gtta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  13659337 tgttgacccagttcggtccaact-taacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaa 13659435  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  13659436 caagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactaccc 13659535  T
Q  594 caaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||||||||||    
T  13659536 caaggtgtttacaat 13659550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 386 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 15820485 - 15820249
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15820485 acaccaataaatgtttacctagttcgatccaact-tgacctactctggatgagagatttatctcttcaatgcactatcaatgagttcttaaaaagagata 15820387  T
Q  486 caaatgt--tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgat 582  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15820386 caaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttttacccatctttccaatatcaccaaagaacaagacactcaatgat 15820287  T
Q  583 tttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 621  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15820286 tttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 15820249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 41361081 - 41360859
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| ||| |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  41361081 tgttgacctagttcggtccaata-tgacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 41360983  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc 594  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  41360982 caagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatattttcactcaccc 41360883  T
Q  595 aaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||    
T  41360882 aagatgtttacga-tgtttcccaac 41360859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 387 - 619
Target Start/End: Original strand, 23555257 - 23555489
Alignment:
Q  387 caccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac 486  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23555257 caccaagaaatgtttactcagttcgatccaact-tgacctactatgg-ggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac 23555354  T
Q  487 aaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgatt 583  Q
    |||||  ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| || |||    
T  23555355 aaatgagttataagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaaagaataagacactcaataatt 23555454  T
Q  584 ttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23555455 ttcattcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 23555489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 612 - 834
Target Start/End: Original strand, 34602557 - 34602777
Alignment:
Q  612 ttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttg 711  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34602557 ttcccaactctagaatctaacctccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttg 34602655  T
Q  712 ctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaa 811  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||| ||    
T  34602656 ctcacaaaagacttttcactcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccc-ttttaccaagagctccctcttttggttctccaa 34602754  T
Q  812 gatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    |||| ||||| |||||||||||||    
T  34602755 gattcacatc-ttgaagctttgaa 34602777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 291 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 6808726 - 6808263
Alignment:
Q  291 aacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacacc 390  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||| | ||||||  ||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||| | || | | |||||| ||    
T  6808726 aacaatctagatctgatctagaaa-ccaagtgtaaagcaaaatcactatcaaactaaagcataaacaagataaagagagtagaaaacaaagaacaactcc 6808628  T
Q  391 aagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaa 489  Q
    ||||||| || | | ||||||| |||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6808627 aagaaatatttatctagttcggaccaacaataacctactctgaggaagagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatacaaa 6808528  T
Q  490 --tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac------aaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaatgaacaagacactc-at 579  Q
       |||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||      || ||||||||||| |||||| || |||||| ||  ||||||||||||||| ||    
T  6808527 agagttacaagaagttagcttcaacaagctctccaagaacaaacctaatcctaatttcta-ccatttccctaatctctactcatgaacaagacactcaat 6808429  T
Q  580 gattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatctt 679  Q
     |||||||||||||||| |||||| | | |||||| |||||||| ||||||| || | |||||||||||||| |  | |||||||| || ||| ||||||    
T  6808428 aattttcactctcccaaagtgtttcccaatgtttctcaactctagaatctaa-cctcgaaagagaaccaaccttccgtctttgattaca-taatgatctt 6808331  T
Q  680 ctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaacc 747  Q
    || |||||||||  ||  |||||| | ||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||    
T  6808330 ctcttttggttttccattactcaccctagttgctcacaaatgactcttcattcatgtgttttccaacc 6808263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 404 - 619
Target Start/End: Original strand, 196915 - 197132
Alignment:
Q  404 ccagttcggtccaacaatgacctactctggagg-agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaa 500  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  196915 ccagttcggtccaact-tgacctaatctggggggagagataaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgagttacaagaa 197013  T
Q  501 attagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggt 599  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  197014 attaacttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggt 197113  T
Q  600 gtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  197114 gtttacaa-tgtttcccaac 197132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 382 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 22079501 - 22079166
Alignment:
Q  382 aacaacaccaa-gaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaa 479  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22079501 aacaacaccaaagaaatgtttaccaagtttggtccagcaatgacctactttggaggagaaattgatctctccaatccaatatcaatgagttctttacaaa 22079402  T
Q  480 gagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaatgaacaagacact 576  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||||        
T  22079401 gagatacaaaatggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaacataatttcta-ccatttttccaatctcttcccatgaacaaga---- 22079307  T
Q  577 catgattttcactctcc-caaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaagga 675  Q
     |||  |||||||| ||  ||| | ||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  22079306 aatg-gtttcactcacctgaagtttttcccaattgtttctcaactctagaatctaacccccaaaagagaa-caatccttagcctttgatttca-taagca 22079210  T
Q  676 tcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaa 719  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||    
T  22079209 tcttatattttggtttgccaagactcacctaagttgctcacaaa 22079166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 397 - 617
Target Start/End: Original strand, 13137977 - 13138196
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gtta 494  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||    
T  13137977 tgttgacccagttcggtccaata-tgacctactctaggggagagattgctctcttcaatccactatcaatgtgttcttacaaagagatgcaaatgggtta 13138075  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  13138076 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacga-cctaatttctatccatttt-tcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 13138173  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttccca 617  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  13138174 caaggtgtttacaa-tgtttccca 13138196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 400 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 20762837 - 20762616
Alignment:
Q  400 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgttacaa 497  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||    
T  20762837 tcacctagttcggtccaaacttgacctactctgtaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacgaagagatacaaaagggttacaa 20762738  T
Q  498 gaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccca 595  Q
    |||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||    
T  20762737 gaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttctcaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttcactc-acca 20762639  T
Q  596 aggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  20762638 aggtgtttacaa-tgtttcccaac 20762616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 10925393 - 10925167
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt---acaaagagatacaaatg-- 491  Q
    |||| |||||||||| ||||||  | ||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||      
T  10925393 tgttgacccagttcgatccaacttt-acctaatctaggggagagattgatttctccaatccactatcaatgaattcttcttacaaagagatacaaatgag 10925295  T
Q  492 ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactc 590  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10925294 ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctatccattttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 10925195  T
Q  591 tcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10925194 acccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 10925167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Original strand, 37559868 - 37560083
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactct-ggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tt 493  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  37559868 tgttgaccaagttcggtccaact-tgacctaatctagggggagagattgatctctccaattcactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 37559966  T
Q  494 acaagaaattagctt-caacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactct 591  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  37559967 acaagaaattagctttcaacaagttcacaaagaacaactctaatttctacccattttcctaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 37560066  T
Q  592 cccaaggtgtttacaat 608  Q
    || || |||||||||||    
T  37560067 cctaatgtgtttacaat 37560083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Original strand, 45644355 - 45644569
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gtta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  45644355 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttg 45644453  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacac-tcatgattttcactctc 592  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  45644454 caagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctatccattttctcaatctcaccaatgaacaagacacttaatgattttcactcac 45644553  T
Q  593 ccaaggtgtttacaat 608  Q
    ||||| ||||||||||    
T  45644554 ccaagatgtttacaat 45644569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Original strand, 13316352 - 13316520
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||    
T  13316352 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtta 13316451  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13316452 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 13316520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 386 - 619
Target Start/End: Original strand, 927966 - 928202
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||  ||| | |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||     
T  927966 acacaaagaaatgtttacccagttcggtctaact-tgacctaccttggggaagaggttggtctctctaatccactattaatgagtttttacaaagagatc 928064  T
Q  486 caaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tga 581  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |  |||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  928065 caaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctatcattttttccaatatcaccaaagaacaagacactcattga 928164  T
Q  582 ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  928165 ttttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 928202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 386 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 16455799 - 16455585
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||   ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16455799 acaccaagaaatgtttacacagtttggtccaatt-tgaccgactatgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacacagagata 16455701  T
Q  486 caaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgat 582  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||  |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16455700 caaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcac-tagaaaaaatctaatttctcaccattttaccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgat 16455602  T
Q  583 tttcactctcccaaggt 599  Q
    |||||||| ||||||||    
T  16455601 tttcactcacccaaggt 16455585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 397 - 618
Target Start/End: Original strand, 40122197 - 40122421
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat--caatgagttcttacaaagagatacaaatg--t 492  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||  |    
T  40122197 tgttgacctagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgagt 40122295  T
Q  493 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactct 591  Q
    || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||     
T  40122296 tataagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttcgacccatttttccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgatttttactca 40122395  T
Q  592 cccaaggtgtttacaattgtttcccaa 618  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40122396 cccaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 40122421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 437 - 619
Target Start/End: Original strand, 30476486 - 30476672
Alignment:
Q  437 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaacccta 534  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  30476486 agagattgatctgtccaatccagtatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaataaattatcttcaacaagttcataaagaacaacccta 30476585  T
Q  535 atttctacccattttcccaatctcaccaa---tgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  30476586 atttctacctattttcccaatctcaccaatattgaacaaga-actcaatgattttcacccacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 30476672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 51765565 - 51765349
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa---tgt 492  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||    
T  51765565 tgttcacccagttcggtccaaacttgtcctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaggggt 51765466  T
Q  493 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaa-gaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcact 589  Q
    ||||||||||||||||  ||||  ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  51765465 tacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatcaaaccaa-gaacaagacactcaatgatttacact 51765367  T
Q  590 ctcccaaggtgtttacaat 608  Q
    |  ||||||||||||||||    
T  51765366 c-accaaggtgtttacaat 51765349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 9987369 - 9987202
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||| |||     
T  9987369 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttgcaaaagggatacaaaaggttg 9987270  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9987269 caagaaattagattagacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 9987202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 337 - 578
Target Start/End: Original strand, 12318463 - 12318706
Alignment:
Q  337 aattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaa-tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggag 435  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||| ||||| ||||| ||| |    
T  12318463 aattgaaccaaagaataaacaagataaagggagtaaagaaaagagaacaacaccaaaaaattgtttacctagttcggtccaataatgaactactatgggg 12318562  T
Q  436 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttaca-aagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccc 532  Q
    ||||||  ||||||||   | || |||||||||||||||| | |||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||| ||    
T  12318563 gagaga--gatctctctgcttcagtatcaatgagttcttaaagaagacatacaaaatggttacaagaaattagcttcaacaagctctccatgaacaaacc 12318660  T
Q  533 taatttctacccattttcccaatctc-accaatgaacaagacactca 578  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| |||||    
T  12318661 taatttctaccca-tttccaaatctctacccatgaacaagaaactca 12318706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Original strand, 20622237 - 20622406
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac---aaagagatac-aaatgt 492  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||| ||| ||    
T  20622237 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaaagggatacaaaaggt 20622336  T
Q  493 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20622337 tacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 20622406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 386 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 36683858 - 36683694
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||      
T  36683858 acaccaagagatgtttactcagttcggtctaact-tgacctactctgggggagagattgatttctacaatccactatcaatgagttcttacaaat-ga-- 36683763  T
Q  486 caaatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctca 559  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36683762 -----gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaataaacctaatttctacctattttcccaatctca 36683694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 354 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 41136030 - 41135605
Alignment:
Q  354 aacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaa-tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctcc 452  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||||| || ||| |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||  |||||||  ||||||||     
T  41136030 aacaagataaagagagtagagaaaa-agaacaacacaaaaaaaatgtttacccaattaagtcgaacaatgacctactctgagggagaga--gatctctct 41135934  T
Q  453 aatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 549  Q
      | || |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |  ||||||||||||| |||||| ||  ||   ||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  41135933 gcttcagtatcaacgagttctttacaaatagatacaaaaggtttacaagaaattaacttcaaaaagttcttcaagaacaaatctaatttctacccttttt 41135834  T
Q  550 cccaatctcacca-atgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgttta-caattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaac 646  Q
    |  | ||||  || | |||||||| ||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41135833 ct-attctcctcacaggaacaagagactcaatgatttcc-ctcacccaaggtgtttttcaaatgtttctcaactctagaatctaacccccaaaagagaac 41135736  T
Q  647 caacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaac 746  Q
    ||| ||||||||||| ||||| | || |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||    
T  41135735 caatccttagcctttaatttc-caaatgatcttctcttttggtttcctaagactcacccaagtttctcac-aaagactctcctttgatgtgtttcccaac 41135638  T
Q  747 cttatgaat-tttccccaaaatgcaccaaccct 778  Q
    |  |||||| | |||| |||| |||||||||||    
T  41135637 cccatgaatctctccctaaaaggcaccaaccct 41135605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 40282545 - 40282377
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  40282545 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 40282446  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||| ||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40282445 caagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 40282377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 9036584 - 9036417
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  9036584 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctcgaggagagattgtactcttcaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 9036485  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9036484 caagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 9036417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 345 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 2926730 - 2926516
Alignment:
Q  345 caaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaa-gaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagatt 443  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  2926730 caaagaataaacaagataaagagagtagagtaaaaagaacaacaccaaagaattgtttacctagttcggtgcaacaatgacctactctgcagaagagatt 2926631  T
Q  444 gatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagat--acaaatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttct 540  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||  | ||| ||||||| |||||| ||| |||||  ||   ||| |||| ||||||||||    
T  2926630 gatctctccaatccactaccaatgaattcgtttcaaagagatgcaaaaaggttacaataaattaactttaacaagttcttcaagcacaaacctaatttct 2926531  T
Q  541 acccattttcccaatc 556  Q
    | ||||||| ||||||    
T  2926530 a-ccatttttccaatc 2926516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 387 - 620
Target Start/End: Original strand, 44650153 - 44650389
Alignment:
Q  387 caccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagata 485  Q
    |||||| |||| || ||| |||||||||||| | ||||||||| | | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  44650153 caccaaaaaatatttacctagttcggtccaa-attgacctacttttgggaagagattgatctcttcaatccactattaatgaattatttacaaagagata 44650251  T
Q  486 caaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atga 581  Q
     ||| |  |||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||| || |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  44650252 taaaagatttacaataaattagcgttaacaaactcacaaagaacaaaccataattttta-catttttctcaatctctccaatgaacaagacactcaataa 44650350  T
Q  582 ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaact 620  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  44650351 ttttcactcacccaaagtgtttacaaatgttttccaact 44650389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 390 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 5460081 - 5459956
Alignment:
Q  390 caagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagata-ca 487  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  |    
T  5460081 caagaaatgtttacctagttcagcccaacaatgatctactctagatgagagattgatctctccaatctactatcaatgagttctttacaaagaaatataa 5459982  T
Q  488 aatgttacaagaaattagcttcaaca 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5459981 aatgttacaagaaattagcttcaaca 5459956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 388 - 607
Target Start/End: Original strand, 8871054 - 8871259
Alignment:
Q  388 accaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataca 487  Q
    ||||| ||||||| || || |||||||||||  || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||  |         
T  8871054 accaataaatgtttactcaattcggtccaact-tggcctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-gagtt---acaaaatg----- 8871143  T
Q  488 aatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttc 586  Q
       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  8871144 ---gttacaagaaattagcttcaacgaactcacaaagaacaaaccctaatttcta-ccattttccaaatctcacaaaagaacaagacact-atgattttc 8871238  T
Q  587 actctcccaaggtgtttacaa 607  Q
     |||  |||||||||||||||    
T  8871239 gctcatccaaggtgtttacaa 8871259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 342 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 25652308 - 25651931
Alignment:
Q  342 aaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaa-gaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagag 440  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||| ||| |||| | |||||||||| |||||||||| | || || | || ||    
T  25652308 aaccaaataataaacaaaataaagagagtagagaaaagagggcaacaccaaagaattgtttatccagttcggttcaacaatgactttctatgtacgatag 25652209  T
Q  441 attgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatt 537  Q
    |  |||||||| | | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  | |||||    
T  25652208 a--gatctctc-acttcactatcaaagagttctttacaaagagatacaagagagttacaagaaattagcttcaacaaactctcaaataacacacttaatt 25652112  T
Q  538 tctacccattttcccaat-ctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaac-cc 634  Q
    |||| ||| |||| ||||  |  |  |||||||| | |||| ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |    
T  25652111 tcta-ccaatttctcaatattttctcatgaacaaaatactcaatgattttcacacacttaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaccttc 25652013  T
Q  635 ccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcaca 717  Q
      |||||||||||||  ||||   ||||||||  ||||||||||||  ||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  25652012 ataaaagagaaccaattcttaatatttgattt-tctaaggatcttcacttttgctttcccaagattcacccaagttgctcaca 25651931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 400 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 21054123 - 21053958
Alignment:
Q  400 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgttacaa 497  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||| |||    
T  21054123 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttgcaa 21054024  T
Q  498 gaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    |||||||| ||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21054023 gaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacac-ttttcccaatctcaccaa 21053958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 387 - 604
Target Start/End: Original strand, 37282682 - 37282901
Alignment:
Q  387 caccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagata 485  Q
    |||||| ||||||| | | ||||| |||||| | ||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||     
T  37282682 caccaaaaaatgtttatctagttcagtccaa-attgacctactccaaaggagagatttatctctccaatccactactaatgagttctttacaaagagatg 37282780  T
Q  486 caaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atga 581  Q
    ||||   ||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||     
T  37282781 caaaagggttaccataaattagcttcaacaagctcacaaggaacaaaccctaatttataccattttt--caatctctccaatgaacaagacactcaatgg 37282878  T
Q  582 ttttcactctcccaaggtgttta 604  Q
    |||||||||   |||||||||||    
T  37282879 ttttcactcatacaaggtgttta 37282901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 44203800 - 44203631
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 492  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  44203800 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 44203701  T
Q  493 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  44203700 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 44203631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 388 - 526
Target Start/End: Original strand, 2262965 - 2263106
Alignment:
Q  388 accaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatac 486  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||     
T  2262965 accaagaaatgtttactcagttcggaccaacaatgacctaccctaagggaaagattgatctcttcaatccactatcaataagttctttacaaaaagatat 2263064  T
Q  487 aaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaa 526  Q
    |||   |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  2263065 aaaagggttacaagaaattatcttcaacaagctcaccaagaa 2263106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 333 - 514
Target Start/End: Original strand, 9109354 - 9109539
Alignment:
Q  333 ccacaattcaaccaaaggataaacaa-gataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactct 431  Q
    |||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||  | |||||| | |||| ||||||| ||| |||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  9109354 ccacaatcaaaccaaagaataaacaaagataaagagagtagagactaaataacagccccaaaaaatgtttacctagtttggttcaacgatgacttactct 9109453  T
Q  432 ggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaa 514  Q
       | ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||    
T  9109454 atggaagagattgatctctccaatacactatcaacgtgttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattaacttcaacaa 9109539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 402 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 13938300 - 13938143
Alignment:
Q  402 acccagttcggtccaacaatgacctac-tctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatac---aaatgttaca 496  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||    
T  13938300 acccagttcagcccaacaatgacctacatctgggggagaga--gatctctccaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaaaaggttaca 13938203  T
Q  497 agaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 558  Q
    ||||||||  ||  ||||  || | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13938202 agaaattatattttacaagttctccaagaacaa-cctaatttctaccca-tttcccaatctc 13938143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 441 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 3460821 - 3460707
Alignment:
Q  441 attgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaat 536  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  3460821 attgatctctccaatcgactatcaatatgttctttacaaagatatacaaaagggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaat 3460722  T
Q  537 ttctacccattttcc 551  Q
    |||||||| ||||||    
T  3460721 ttctaccctttttcc 3460707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 633 - 806
Target Start/End: Original strand, 12318720 - 12318890
Alignment:
Q  633 ccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactc 732  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | |||||  |     
T  12318720 cccccaaagagaaccaacccttagcctttgatttc-caaaagattttctattttggtctcccaagactcacccaagttgctcataaaa-actctcctttg 12318817  T
Q  733 atgtgttttccaaccttatgaa-ttttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttc 806  Q
    ||||||||  ||| | |||||| || ||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||| ||| ||||||||    
T  12318818 atgtgtttctcaatcctatgaacttctccccaaaaggcaccaaccc--tctcccaagagccctctcatttggttc 12318890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 619
Target Start/End: Original strand, 1050439 - 1050668
Alignment:
Q  390 caagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaa 488  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||  ||| |||| ||  |||| |  | ||||||||| ||||| || ||||||||| ||||    
T  1050439 caagaaatgtttacccagtttggtcaaacaatgagctactcta-aggggagagtg--ctctacgcttcactatcaacgagttatttacaaagagacacaa 1050535  T
Q  489 a--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacca-atgaacaagacactcatgatttt 585  Q
    |  |||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||  || |||||||||| |||||  | |||    
T  1050536 aaatgttacaagaaattagcttcaataagctctcgaagaacacacctaattttcaccca-tttcccaatctcttcacatgaacaagagactcaataattt 1050634  T
Q  586 cactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||   ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  1050635 cactcattcaatgtgtgtacaaatgtttcccaac 1050668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 606 - 807
Target Start/End: Original strand, 16216709 - 16216904
Alignment:
Q  606 aattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactc 705  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||   |||   ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||  ||| | ||||||    
T  16216709 aattgtttctcaactctagaatctaaccct--aaactaaaccaactcgtagcctttgatttc-ctaaggatcttctcttttaagttttcaaaattcactc 16216805  T
Q  706 aagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattt-tccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggt 804  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||| |  |||||||| |  |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||    
T  16216806 aagttgctcac-aatgactctcctctcatgtgtttgccaa-cacatgaatttctatccaaaatgcaccaaccctttt--cgaagagccccctcttttggt 16216901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 444 - 543
Target Start/End: Original strand, 4535527 - 4535629
Alignment:
Q  444 gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttct 540  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| || ||| | |||||||| | ||||||||    
T  4535527 gatctctccacttaactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaatgttacaagaaattgacttcaataagctctccaagaacaaacttaatttct 4535626  T
Q  541 acc 543  Q
    |||    
T  4535627 acc 4535629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 492 - 620
Target Start/End: Original strand, 44646881 - 44647010
Alignment:
Q  492 ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcact 589  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||| || |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  44646881 ttacaataaattagcgttaacaaactcacaaagaacaaaccataattttta-catttttctcaatctctccaatgaacaagacactcaataattttcact 44646979  T
Q  590 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaact 620  Q
    |  |||| || ||||||| | ||| ||||||    
T  44646980 catccaaagtatttacaaatattttccaact 44647010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 609 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 3331505 - 3331428
Alignment:
Q  609 tgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggt 689  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  3331505 tgtttcccaactctagaatccaacccc-aaaaga-aacaaacccttagcctttgatttc-ctaaggatctcctcttttggt 3331428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19753032 - 19752952
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaa 266  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  19753032 tgttgtgaattcag-actcaaatttcacaccaatacaaa--ctatgatgtgcgaagcaagtatcaatggcaaccaacaaccaaa 19752952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 447 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 32471579 - 32471478
Alignment:
Q  447 ctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacc 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| ||| |||||| ||||||| |  || |||||||||| |||||||| ||||    
T  32471579 ctctcgaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaagagttgcaataaattaacttcaac-agttctcaaagaacaaacctaatttatacc 32471481  T
Q  544 cat 546  Q
    |||    
T  32471480 cat 32471478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 457 - 558
Target Start/End: Original strand, 16914234 - 16914338
Alignment:
Q  457 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaa-ttagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccc 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||||||| | |||||| |||||| ||||||    
T  16914234 cactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttagaagaaacttagcttcaacaggctctccaagaacaaacataatttttaccca-tttccc 16914332  T
Q  553 aatctc 558  Q
    ||||||    
T  16914333 aatctc 16914338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19754826 - 19754772
Alignment:
Q  200 tcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaacc 256  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19754826 tcaaatttcacaccaatagaaactat--gatgtgtggagcaagtatcaatgacaacc 19754772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 918487 - 918431
Alignment:
Q  492 ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttt 549  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  918487 ttacaagaaattatctt--acaaactcacaaagaacaaaccataatttctacccatttt 918431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 705 - 783
Target Start/End: Original strand, 4535784 - 4535863
Alignment:
Q  705 caagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaat-tttccccaaaatgcaccaaccctttttc 783  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||  |||||| | | |||||||  |||||||||||||||    
T  4535784 caagttgctcacaaacgactatccactcatgtgtttttcaaccccatgaatctattcccaaaagacaccaaccctttttc 4535863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 606 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 10157571 - 10157490
Alignment:
Q  606 aattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggt 689  Q
    ||||||||  ||||| || |||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  10157571 aattgtttttcaactttagaatctaaccccctaaat-gaaccaacccttagtctttgatttc-ctaaggatctcatattttggt 10157490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 397 - 518
Target Start/End: Original strand, 38746716 - 38746842
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctac-tctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagataca----aat 490  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||   ||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |    ||     
T  38746716 tgttcaccaaattcagtccaacaatgacctacatccggaggagagagatatctctccacttcac-atcaaagagttctttacaaagagatatacaaaaaa 38746814  T
Q  491 gttacaagaaattagcttcaacaaactc 518  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  38746815 gttacaagaaattagtttcaataaactc 38746842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6398960 - 6398927
Alignment:
Q  234 tggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaat 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6398960 tggagcaagtatcaatggcaaccaataaccaaat 6398927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 674 - 727
Target Start/End: Original strand, 9109680 - 9109733
Alignment:
Q  674 gatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctc 727  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||    
T  9109680 gatcttctattttgatttcccaagactcatccaaattgctcacaaaagactctc 9109733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 387 - 468
Target Start/End: Original strand, 44646795 - 44646875
Alignment:
Q  387 caccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatga 468  Q
    |||||| |||| || ||| |||||||||||| | ||||||||| | | | |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  44646795 caccaaaaaatatttacctagttcggtccaa-attgacctacttttgggaagagattgatctcttcaatccactattaatga 44646875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 413; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 184 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 45727305 - 45726660
Alignment:
Q  184 gttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaag 283  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  45727305 gttgtgaattcag-actcaaatttcacaccaatacaaactatatgatgtgtggagcaagtatcaatggcaactaataaccaaatgtaaataaaccacaag 45727207  T
Q  284 caataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataa 383  Q
    ||| || || ||| ||||  || |||| ||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  45727206 caacaacaataatatagacctagtctataaa-ctaagtgcatagcaaaaccacaatccaaccaaagaataaa--agataaagagagtaaagaaaagataa 45727110  T
Q  384 caacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaga 483  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45727109 caacactaaaaaatgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaga 45727011  T
Q  484 tacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatga 581  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45727010 tacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactcatga 45726911  T
Q  582 ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttct 681  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45726910 ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcctaaccctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttct 45726811  T
Q  682 attttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttt 781  Q
     ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||  |||||| |||||||||| ||||||||||  ||    
T  45726810 cttttggtttcacatgactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttccaaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccc--tt 45726713  T
Q  782 tcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  45726712 tcccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 45726660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 181 - 781
Target Start/End: Original strand, 35446675 - 35447270
Alignment:
Q  181 tgtgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccac 280  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||     |||||||||    
T  35446675 tgtgttgtgaattctg-actcaaatttcacatcaatataaactatatgatgtgtggagcaagtatcaatcccaaccaacaaccaaa-----gtaaaccac 35446768  T
Q  281 aagcaataaaaacaatcta--gatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaa 378  Q
    |  ||| || |||||| ||  ||| || |||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35446769 actcaacaacaacaatatatagatctagtctataat--caagtgcatagcaaaaccacaattcaaccaaagcataaacaagataaagagagtaaagaaaa 35446866  T
Q  379 gataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaa 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35446867 gataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaa 35446965  T
Q  479 agagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacact 576  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35446966 agagatacaaatgggttacaagaaattagattcaacaagatcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttaccaatctcaccaatgaacaagacact 35447065  T
Q  577 catgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggat 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35447066 catgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaagtat 35447165  T
Q  677 cttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaacc 776  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| || ||||||| |||||||||    
T  35447166 cttctcttttggttttacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatctttcccaaaaggcaccaacc 35447265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 182 - 834
Target Start/End: Original strand, 1631520 - 1632170
Alignment:
Q  182 gtgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccaca 281  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  1631520 gtgttgtgaatccgggattcaaatttcacatcaatacaaactatatgatgtgtggagtaagtatcaatgacaaccaacaaccaaatataaataaaccaca 1631619  T
Q  282 agcaataaaaacaatctagata--taatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaag 379  Q
    |||||||| |||||| || | |  || |||  ||   |||||| |||||||| ||||||| |||  || | ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  1631620 agcaataacaacaatatatagacttagtctgtaat--caagtgtatagcaaaaccacaatccaa--aaggaataaacaagataaagagagcaaggaaaag 1631715  T
Q  380 ataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 479  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1631716 ataacaacactaagaaatattcactcagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 1631814  T
Q  480 gagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc 577  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1631815 gagatacaaatgggttacaagatattagcttcaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactc 1631914  T
Q  578 atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatc 677  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1631915 atgattttcactctctcaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatc 1632014  T
Q  678 ttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccc 777  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||  |||||||||    
T  1632015 ttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaagacaccaaccc 1632114  T
Q  778 tttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
     ||||| | ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||    
T  1632115 -ttttcacaagagccccctcttttggttccccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 1632170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 237 - 807
Target Start/End: Original strand, 42287953 - 42288520
Alignment:
Q  237 agcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccac 336  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  42287953 agcaaatatcaatggcaaccaataaccaaatgtaaataa-ccacaagcaataacaacaatctagatctaatctagaaaac-aagtgcatagaaaaaccac 42288050  T
Q  337 aattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatg-ttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggag 435  Q
    ||| ||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |    
T  42288051 aatccaaccaaggaataaacaagttaaagagggtaaagaaaagataacagcaccaagaaattattgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgg-g 42288148  T
Q  436 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  42288149 gagagattgatctctccaatccattatcaatgagctcttacaaagaaatacaaatgggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaacctt 42288248  T
Q  534 aatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacc 633  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  42288249 aatttctacccattttcccaatctcaccaatgcacaagacactcgtgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaac 42288348  T
Q  634 cccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactca 733  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42288349 ccgaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactca 42288448  T
Q  734 tgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttct 807  Q
    ||||||| ||||||  |||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  42288449 tgtgtttcccaaccccatgaatctt-cccaaaaggcaccaaccc-ttttcccaagagccccctcttttggttct 42288520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 238 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 17450898 - 17450321
Alignment:
Q  238 gcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccaca 337  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    ||||||||| || ||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  17450898 gcaagtatcaatgacaaccgataaccaaatgtaaat----cacaagcaacaacaacaatctaaacctaatctagaaa-ccaagtgcatagcaaaaccaca 17450804  T
Q  338 attcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggagga 437  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||  |||    
T  17450803 atctaaccaaaggataaacaagataaagagagtacagaaaagataacaacaccaaagattgttcacctagttcggtccaact-tgacctactctgt-gga 17450706  T
Q  438 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatt 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |        ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  17450705 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttc--acaaatgg--------gttacaa-aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaagcctaatc 17450617  T
Q  538 tctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaaccccc 636  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  17450616 tctacccatttttcaaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttgcaaatgtttgccaactctagaatccaaccccc 17450517  T
Q  637 aaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaat-ctccactcatg 735  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || | || | ||||||    
T  17450516 aatagagaatcaacccttagcctttgatttc-ctaatgatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagtttctcacaattgactccttcgctcatg 17450418  T
Q  736 tgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    ||||| ||| ||  |||||| || | ||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  17450417 tgtttcccatccccatgaatctttcacaaagggcaccaaccc--tttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 17450321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 293 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 24398332 - 24397787
Alignment:
Q  293 caatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaa---gataacaacac 389  Q
    ||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||| || ||||   ||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  24398332 caatctaaatctaatctagaaa-ctaagtgcatagcaaaaccgcaatcggaccaa-gactaaacaagataaagagagtagagaaaaatagataacaacac 24398235  T
Q  390 caagaaat-gttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagataca 487  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24398234 caagtaattgttcagccagttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttctttacaaagagataca 24398135  T
Q  488 aa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccatt-ttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgat 582  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24398134 aaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccttaacttctaccctttcttcacaatctcaccaatgaacaagacactcattgat 24398035  T
Q  583 tttcactc-tcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttct 681  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| ||||    
T  24398034 tttcactcttccaaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaa---agaaccaacccttag-ctttgactt-tctaaggatattct 24397940  T
Q  682 attttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaat-tttccccaaaatgcaccaacccttt 780  Q
     |||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||  |||| | | |||| |||| |||||||||| ||    
T  24397939 cttttggtttcacaagactaacccaaattggtcacaaatgactctccactcatgtgtttaccagcccgatgagtctctccctaaaaggcaccaaccc-tt 24397841  T
Q  781 ttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  24397840 ttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacat-tttgaagctttgaa 24397787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 316 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 33648421 - 33647918
Alignment:
Q  316 ccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtcc 415  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  33648421 ccaagtgcatagcaaaatcacaattaaactaaagaataaacaagataaagagagtagagaaaagacaacaacaccaataaatgtttacccagttcggtcc 33648322  T
Q  416 aacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaac 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  33648321 aacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccgctatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaagggttacaggaaattagcttcaac 33648222  T
Q  513 aaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatct-caccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtg-tttacaat 608  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| | |  ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||  |    
T  33648221 aagctcacaaagaacaaaccctaattttta-ccattttctcaatctcctctcatgtacaagacactcaattattttcactctcccaagatgttttacggt 33648123  T
Q  609 tgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaag 708  Q
    | | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |  |||    
T  33648122 tatgtcccaactctagaatctaacccccaaaagataattaaccctt--gctttgatttccctaaggatcttctcttttggttttataagactcgcctaag 33648025  T
Q  709 ttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaat-tttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttct 807  Q
    | ||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||  ||||| | ||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||| |||| ||||    
T  33648024 tagctaacaaatgactctctactcatatgttttccaacctcgtgaatctctcctcaaaaggcaccaaccc-ttttcccaagagcctcctcttttgattct 33647926  T
Q  808 caaagatt 815  Q
    | ||||||    
T  33647925 ccaagatt 33647918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 2334418 - 2334641
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  2334418 tgttcccccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtta 2334517  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  2334518 ctagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaacccttatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 2334616  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  2334617 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 2334641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 36773729 - 36773506
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  36773729 tgttgacccagttcggtccaact-tgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagtta 36773631  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  36773630 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttattcccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 36773531  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  36773530 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 36773506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Original strand, 17057370 - 17057583
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  17057370 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 17057468  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  17057469 caaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 17057568  T
Q  594 caaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||||||||||    
T  17057569 caaggtgtttacaat 17057583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Original strand, 17085353 - 17085566
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  17085353 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 17085451  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  17085452 caaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 17085551  T
Q  594 caaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||||||||||    
T  17085552 caaggtgtttacaat 17085566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Original strand, 36318010 - 36318223
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  36318010 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctactctaagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 36318108  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  36318109 caataaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 36318208  T
Q  594 caaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||||||||||    
T  36318209 caaggtgtttacaat 36318223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 402 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 29868031 - 29867813
Alignment:
Q  402 acccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaaga 499  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  29868031 acccagttcggtccaact-tgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaaga 29867933  T
Q  500 aattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaagg 598  Q
    |||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  29867932 aattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagg 29867833  T
Q  599 tgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  29867832 tgtttacaa-tgtttcccaac 29867813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 723745 - 723968
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  723745 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtta 723843  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  723844 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccagttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 723943  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  723944 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 723968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 38312407 - 38312184
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  38312407 tgttgacccagttcggtccaact-tgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggtta 38312309  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  38312308 caagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaca 38312209  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||    
T  38312208 caaggtgtatacaa-tgtttcccaac 38312184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 397 - 621
Target Start/End: Original strand, 33162451 - 33162676
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  33162451 tgttgacctagttcggtccaact-tgacctaatctaggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacagagagatacaaatgggtta 33162549  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||    
T  33162550 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcctaatttcaccaatgaacaagacactcgatgattttcaatcacc 33162649  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaactc 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  33162650 caaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 33162676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 34139771 - 34139995
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatg--tt 493  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  ||    
T  34139771 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagggatacatatgggtt 34139869  T
Q  494 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 592  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  34139870 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 34139969  T
Q  593 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  34139970 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 34139995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 421 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 42362496 - 42362296
Alignment:
Q  421 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactc 518  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  42362496 tgacctaatctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctc 42362397  T
Q  519 acaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 617  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  42362396 acaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttccca 42362298  T
Q  618 ac 619  Q
    ||    
T  42362297 ac 42362296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 233 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 7451448 - 7451167
Alignment:
Q  233 gtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaag 332  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||| | | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||     
T  7451448 gtggagcaagtttcaatgacaaccaataacctcttgtcaat-aaccacaagcaataacaacaatctagatctaatctagaaaa-caagtgcataacaaaa 7451351  T
Q  333 ccacaattcaaccaaaggataaacaagataa--agagagtaaagaaaagata-acaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctact 429  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  7451350 ccacaatcgaaccaaagaataaacaagataaagagagagtagagaaaa-atagacaacaccaataaatgttcacccagttc-gtccaac-ttgacctact 7451254  T
Q  430 ctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaa 514  Q
     | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7451253 gtagaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgaattacaagaaattagcttcaacaa 7451167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 36988076 - 36988299
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  36988076 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtta 36988175  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||| ||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  36988176 caagaaattagttttgacaagctcacatagaacaaccctaatttctacccttttttccaatcccaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 36988274  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||| | |||||||||||    
T  36988275 caaggtgtttacta-tgtttcccaac 36988299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 405 - 619
Target Start/End: Original strand, 14633834 - 14634050
Alignment:
Q  405 cagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatg--ttacaagaaa 501  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  14633834 cagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatctatgagttcttacaaaagggatacaaatgggttacaagaaa 14633932  T
Q  502 ttagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtg 600  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14633933 ttagcttaaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccattttaccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtg 14634032  T
Q  601 tttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  14634033 tttacaa-tgtttcccaac 14634050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 45099922 - 45099699
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||    
T  45099922 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagtta 45099824  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 592  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  45099823 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 45099725  T
Q  593 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  45099724 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 45099699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 5723256 - 5723478
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac--aaatgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  5723256 tgttcacccagttcggtccaaacttaacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaaggtta 5723355  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  5723356 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaagcctaatttctaccc-ttttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 5723453  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  5723454 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5723478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 11151592 - 11151815
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  11151592 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagaggttgatctctccaatccactatctaagagttcttacaaagtgatacaaatgggtta 11151690  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  11151691 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttctacccattttcccaatttcaccaatgaacaagagactcaatgattttcactcacc 11151790  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  11151791 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 11151815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 404 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 11690661 - 11690445
Alignment:
Q  404 ccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaa 501  Q
    |||||||||||||||  |||| || | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  11690661 ccagttcggtccaact-tgacgtaatatgggggagaggttgatctctccaatccactatcaacgatttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaa 11690563  T
Q  502 ttagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtg 600  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11690562 ttagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtg 11690463  T
Q  601 tttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  11690462 tttacaa-tgtttcccaac 11690445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 4503133 - 4503356
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||    
T  4503133 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagtta 4503231  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 592  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  4503232 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcccaatctctccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 4503330  T
Q  593 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4503331 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4503356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 11067472 - 11067249
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  11067472 tgttgaccgagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccattataaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 11067374  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  11067373 caagaaattagctttgacaagctcacaaagtacaacactaatttctacccatttttccaatttcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcacc 11067274  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  11067273 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 11067249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 431 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 13121901 - 13121712
Alignment:
Q  431 tggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aa 529  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  13121901 tggaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagtttctacaaagagatacaaaggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaacaaa 13121802  T
Q  530 ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13121801 ccctaatttcta-ccattttcccagtctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaaatgtttcccaac 13121712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 397 - 609
Target Start/End: Original strand, 6595006 - 6595221
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||   ||||    
T  6595006 tgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagattcaaaagggtta 6595105  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 592  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||     
T  6595106 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcctaatctcaccaatgaacaagacacccaatgattctcactct- 6595204  T
Q  593 ccaaggtgtttacaatt 609  Q
    |||| ||||||||||||    
T  6595205 ccaaagtgtttacaatt 6595221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 36205665 - 36205887
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  36205665 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggatagattgaactctccaatccgctgtcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagtta 36205763  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  36205764 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 36205862  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||| | |||||||||||    
T  36205863 caaggtgtttacca-tgtttcccaac 36205887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 275 - 719
Target Start/End: Original strand, 30217923 - 30218358
Alignment:
Q  275 aaccacaagcaataaaaacaat-ctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaa 373  Q
    |||||||||||| |||| || | ||||||  |||||||||| ||||||| | | || | |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  30217923 aaccacaagcaacaaaatcatttctagatccaatctagaaa-ccaagtgtaaaacacaaccacaatcaaaccaaagaataaacaagataaagagagtaga 30218021  T
Q  374 gaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-c 472  Q
    ||||| | | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||      
T  30218022 gaaaa-agagctacaccaaaaaatgtttaccgagttcagtccaacaatgacttactctgggggagtgattgatcttttcaacccactatcaatgaattat 30218120  T
Q  473 ttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatct-caccaatgaaca 569  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||| |  | |||||||    
T  30218121 ttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagcttcaataagctctccaagaacaaacctaacttctaccca-tttctcaatctccttccatgaaca 30218219  T
Q  570 agacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttca 668  Q
    |||||||| ||||||| ||||||  |||||          ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||     
T  30218220 agacactcaatgatttccactctgtcaagg----------tgtttcccaactctagagcctaacccccaaaagagaaccaatatttagcttttgatttc- 30218308  T
Q  669 ctaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaa 719  Q
    |||||||||  |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30218309 ctaaggatc-ccccttttggtttcgcaagactcactcaagttgctcacaaa 30218358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 4484330 - 4484554
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa--tgtt 493  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||    
T  4484330 tgttcacccagttctgtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggtt 4484429  T
Q  494 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactct 591  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||     
T  4484430 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatttcaccaa-gaacaagacactcaatgatttacactc- 4484527  T
Q  592 cccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4484528 accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4484554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 30833514 - 30833290
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa--tgtt 493  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||    
T  30833514 tgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggtt 30833415  T
Q  494 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactct 591  Q
    ||||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||     
T  30833414 acaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgatttacactc- 30833317  T
Q  592 cccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||    
T  30833316 accaaagtgtttacaa-tgtttcccaac 30833290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 391 - 621
Target Start/End: Original strand, 17490143 - 17490368
Alignment:
Q  391 aagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa- 489  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  17490143 aagaaatgtttacccagttcggtccaa-attgacctactctaggggagagattgatctctacaatccactatcaatgagttcttacaaagagttacaaaa 17490241  T
Q  490 -tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttca 587  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  17490242 gagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaataa----aatttcta-ccatttt-ccaatctcaacaatgaacaagacattcaatgattttca 17490335  T
Q  588 ctctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 621  Q
    | | ||||  |||||| ||| ||||| |||||||    
T  17490336 cccacccactgtgtttgcaa-tgttttccaactc 17490368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 386 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 11049732 - 11049493
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||| | || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11049732 acacaaagaaatgtttacccagttcagtccaatt-tgacctattatgaaggagagattgatcttttcaatctactatcaatgagttcttacaaagagata 11049634  T
Q  486 c---aaatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaa---agaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc- 577  Q
    |   ||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||     
T  11049633 ctaaaagggttataagaaattagcttcaacaagctcacaaattagaacaaaccctaatttata-ccattttcctaatctcaccaaaaaacaagacactca 11049535  T
Q  578 atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11049534 atgattttcacttacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 11049493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 435 - 619
Target Start/End: Original strand, 7815311 - 7815498
Alignment:
Q  435 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aacc 531  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  7815311 ggagagattaatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagcttctaaagaacaaacc 7815410  T
Q  532 ctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||| ||||    
T  7815411 ctaatttc-aacctttttctcaatctcaccaatgaacaagacacgcaatgattttcacccacctaaggtgtttacaaatgtttctcaac 7815498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 435 - 619
Target Start/End: Original strand, 14202450 - 14202631
Alignment:
Q  435 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaacccta 534  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||    
T  14202450 ggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaag-gatga----gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacata 14202544  T
Q  535 atttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc---atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |   || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14202545 atttctacccattttcccaatctcagaaatgaaaaagacacactcaataattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 14202631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 463 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 24885763 - 24885605
Alignment:
Q  463 caatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcac 560  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  24885763 caatgagttcttacagaggggtacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctactcattttcccaattttac 24885664  T
Q  561 caatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  24885663 aaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 24885605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 394 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 26353354 - 26353178
Alignment:
Q  394 aaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tg 491  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||    
T  26353354 aaatgtttacccggttcggtccaact-tgacctactctaagggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagtacttacaaaaagatacaaaagtg 26353256  T
Q  492 ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaaca 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||  |||||||||||| |||||    
T  26353255 ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaaccttaatttctacac-ttttttcaatctcaccaaagaaca 26353178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 32289732 - 32289565
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa--tgtt 493  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||    
T  32289732 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatttactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 32289633  T
Q  494 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    |||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  32289632 acaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc--ttttccaatctcaccaa 32289565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 6266859 - 6266691
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  6266859 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 6266760  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||| ||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6266759 caagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 6266691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 389 - 619
Target Start/End: Original strand, 12123578 - 12123809
Alignment:
Q  389 ccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagataca 487  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  ||| ||||   | |||||||| ||||||||| |||||  ||||||    
T  12123578 ccaagaaatatttactcagttcggtccaacaatgacttactctggagaaaaga--gatttctctgcttcactatcattgagttctttacaaaatgataca 12123675  T
Q  488 aatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattt 584  Q
    || |  ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  12123676 aaagagttacaagaaataagcttcaacaaaatcataaagaacaactctaatttatactcatttt-ccaatctctcaaatgaacaagacactcgatgattt 12123774  T
Q  585 tcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||  |||||||||||| || |||||||||||    
T  12123775 tcactcatccaaggtgtttataaatgtttcccaac 12123809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 519 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 39284929 - 39284829
Alignment:
Q  519 acaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 617  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  39284929 acaaagagcaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttccca 39284831  T
Q  618 ac 619  Q
    ||    
T  39284830 ac 39284829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 400 - 563
Target Start/End: Original strand, 13656035 - 13656200
Alignment:
Q  400 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaa-atgttaca 496  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||    
T  13656035 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttaca 13656134  T
Q  497 agaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13656135 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 13656200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 295 - 542
Target Start/End: Original strand, 42261384 - 42261633
Alignment:
Q  295 atctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaaga 394  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||| ||||||   |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||      
T  42261384 atctagatctaatctagcaa-ccaagtgtatagcaaaaccacaaacaaaccaaa--ataatcaagataaagagagtaaagaaaa-agaacaacatcaaat 42261479  T
Q  395 aat-gttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagat--tgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaat 490  Q
    ||| ||| ||||||||| || ||||| | ||||||| ||| |||||||   ||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||     
T  42261480 aattgtttacccagttcagttcaacactaacctactatgggggagagagaatgatctctccgcttcactatcaatgagtactttacaaagatatacaaaa 42261579  T
Q  491 g--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctac 542  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| | ||||||||||    
T  42261580 gagttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaacttaatttctac 42261633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Original strand, 12647386 - 12647555
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 492  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  12647386 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 12647485  T
Q  493 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12647486 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 12647555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 408 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 28672088 - 28672022
Alignment:
Q  408 ttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  28672088 ttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactgtcagtgagttctt 28672022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 386 - 514
Target Start/End: Original strand, 42019859 - 42019992
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag---ttcttacaaagag 482  Q
    |||||||||| |||| | ||| || ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||   || ||||||||||    
T  42019859 acaccaagaagtgtttatccaatttggtccaacaataacctactatggggaagagattgatctctcaaattcactatcaatgagttttttttacaaagag 42019958  T
Q  483 atacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaa 514  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  42019959 atacaaaagagttacaagaaattagcttctacaa 42019992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 397 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 39285003 - 39284930
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 471  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39285003 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 39284930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 693 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 7451170 - 7451049
Alignment:
Q  693 acaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagcc 792  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||| ||||||  || |||||| ||| ||  ||||||    
T  7451170 acaagtcttactcaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccataaatcttctccaaaagtcatcaaccc-tttaccaaagagcc 7451072  T
Q  793 ccctcctttggttctcaaagatt 815  Q
    ||||| |||||||||| ||||||    
T  7451071 ccctcttttggttctccaagatt 7451049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 406 - 599
Target Start/End: Original strand, 7597021 - 7597217
Alignment:
Q  406 agttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaat 502  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  || || |||||||||||| ||||||| ||||||||| |  |||||||||||    
T  7597021 agttcggtctaacaatgacctactctgaaggagaga--gatctctccgttctacaatcaatgagttctttacaaaaagatacaaaagacttacaagaaat 7597118  T
Q  503 tagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggt 599  Q
    ||| ||| ||||  ||| || |||| || |||||||||||  || |||| |||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||| || |||||    
T  7597119 tagtttcgacaagttcataaggaacaaaacctaatttctattca-tttctcaatctcttcccatgaacaagacactgagtgattttcactcacctaaggt 7597217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 615 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 43731093 - 43730991
Alignment:
Q  615 ccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctc 714  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||    
T  43731093 ccaactctagaatttaacccc-aaaaga-aaccaacctttagactttgatttc-ctacggatattctattttggtttcccaagattcacccaaattgctc 43730997  T
Q  715 acaaaa 720  Q
    ||||||    
T  43730996 acaaaa 43730991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 439 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 24198023 - 24197946
Alignment:
Q  439 agattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatgttacaagaaattag-cttcaacaa 514  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  24198023 agatagatctctccaatccattatcaaagagtttcttgcaaagagatacaagggttacaagaaattagccttcaacaa 24197946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 421 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 42412161 - 42412117
Alignment:
Q  421 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaat 466  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42412161 tgacctactctgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaat 42412117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 544 - 619
Target Start/End: Original strand, 5700271 - 5700347
Alignment:
Q  544 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  5700271 cattttctcaatctctccaatgaacaagacactcaatgtttttcattcacccaaagtgtttacaaatgtttctcaac 5700347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 457 - 543
Target Start/End: Original strand, 34811281 - 34811370
Alignment:
Q  457 cactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacc 543  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||| |||||||||||||||| ||| | |||| ||| | |||||||||||    
T  34811281 cactatcaatgagtttcttacaaagagatataaaagagttacaataaattagcttcaacaagctctctaagagcaatcttaatttctacc 34811370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 473 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 4561180 - 4561137
Alignment:
Q  473 ttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaa 514  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4561180 ttacaaagagatacaaaaatgttacaagaaattagcttcaacaa 4561137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 432 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 41454366 - 41454254
Alignment:
Q  432 ggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaaca 528  Q
    ||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |  || | |||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  41454366 ggaggagaga--gatctgtccacttcactatcaatgagttctttacaaatatatacaaaagagttgctagaaattagcttcaacaagctctcaaaaaaca 41454269  T
Q  529 accctaatttctacc 543  Q
    |  ||||||||||||    
T  41454268 aatctaatttctacc 41454254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 609 - 834
Target Start/End: Original strand, 42261826 - 42262047
Alignment:
Q  609 tgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaag 708  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||||||||| |||| ||| | || ||||||| ||  ||||||| | ||||    
T  42261826 tgtttcccaactctagattctaacccctaaaag-gaaccaatccgtagcttttgatttc-ctaatgatatactcttttggtctcgtaagactcgcccaag 42261923  T
Q  709 ttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaat-tttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttct 807  Q
    ||||||| |||| | |||||  | |||||||| |||| |  |||||| | || || ||| ||||||||||  | |||  ||||||||||  |||||||||    
T  42261924 ttgctcataaaa-actctcctttgatgtgtttcccaatcccatgaatctctcacctaaaggcaccaaccc--tctccaaagagcccccttttttggttct 42262020  T
Q  808 caaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    | |||||| ||||| |||||||||||||    
T  42262021 ccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 42262047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29868241 - 29868182
Alignment:
Q  179 tttgtgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaa 241  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||   ||||| |||||||||||    
T  29868241 tttgtgttgtgaattc-ggactcaaatttcacagcaatacaaa--ctatgatgtgtggagcaa 29868182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 592 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 24197867 - 24197829
Alignment:
Q  592 cccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatcta 630  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24197867 cccaaggtgtttacaattgtttcccagccctataatcta 24197829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 2838135 - 2838079
Alignment:
Q  385 aacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagaga 441  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  2838135 aacaccaagaaattgttgacccagttcggtccaata-tgacctactctgggggagaga 2838079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 447 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 16605711 - 16605654
Alignment:
Q  447 ctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaatgttacaagaaatt 503  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  16605711 ctctccaatccattatcaatgagtttcttataaagatatacaagagttacaagaaatt 16605654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 183 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 7703 - 7058
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccgga-ctcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccaca 281  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     ||||||||||    
T  7703 tgttgtgaatttcggaactcaaatttcacaccaatacaaactat--gatgtgtggagcaagtatcaatggcaaccaacaaccaaa-----gtaaaccaca 7611  T
Q  282 agcaataaaaacaatctagata--taatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaag 379  Q
    ||||| || || ||| || | |  || |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7610 agcaacaacaataatatatagacctagtctataaa-ccaagtgcatagcaaaaccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaag 7512  T
Q  380 ataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7511 ataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaact-taacctactctagaggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaa 7413  T
Q  480 gagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc 577  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7412 gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactc 7313  T
Q  578 atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatc 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7312 atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcc-agctctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgattttactaaggatc 7214  T
Q  678 ttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccc 777  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  7213 ttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccc 7114  T
Q  778 tttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
     ||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  7113 -ttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 7058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 72)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 183 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 11384366 - 11383716
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaata--caaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccac 280  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  11384366 tgttgtgaactctggactcaaatttcacaccaatatacaaattatatgatgtgtggagtaagtatcattgacaagcaataaccaaatgtaaataa-ccac 11384268  T
Q  281 aagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaaga 380  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11384267 aagcaataacaacaatctagatctaatctagaaaac-aagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaa-a 11384170  T
Q  381 ta-acaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 479  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  11384169 tagacaacaccaaaaaatgttcacccagttcggtccaact-taacctactctggaggagagatcgatgtctccaatccagtatcaatgggttcttacaaa 11384071  T
Q  480 gagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc 577  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  11384070 gagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcat-aatgaacaagacactc 11383972  T
Q  578 atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatc 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11383971 atgattttcactctcccaaggtgtttacaattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatc 11383872  T
Q  678 ttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccc 777  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||| ||||||  |||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  11383871 ttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactttccacttatgtatttcccaaccccatgaatcttcctcaaaaggcaccaaccc 11383772  T
Q  778 tttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
     ||||| | | ||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  11383771 -ttttcacaatagccccctcttttggttctccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 11383716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 183 - 834
Target Start/End: Original strand, 42434779 - 42435429
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaa 282  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||  |  || ||||||||    
T  42434779 tgttgtgaatttggaactcaaatttcacaccaatacaaactatatgatgtgaggagcaagtatcaatggcaaccaacaaccaaaaat--gttaaccacaa 42434876  T
Q  283 gcaataaaaacaatc--tagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaagga-taaacaagataaagagagtaaagaaaag 379  Q
    |||| || ||||||   ||||  || |||| ||   ||||||||||||||| ||||||| |||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42434877 gcaacaacaacaatagatagacctagtctataat--caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagaaagtaaagaaaag 42434974  T
Q  380 ataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42434975 ataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 42435073  T
Q  480 gagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc 577  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42435074 gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactc 42435173  T
Q  578 atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatc 677  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42435174 atgattttcactctcccaaagtgtttacaattgtttaccaactctagaatctaaccctcaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatc 42435273  T
Q  678 ttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccc 777  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||  |||||| ||||||||||  |||||| ||    
T  42435274 ttctcttttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagactctccattcatatgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaagtcaccaa-cc 42435372  T
Q  778 tttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  42435373 tttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 42435429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 274 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 4283813 - 4283321
Alignment:
Q  274 aaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaa 373  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||  || |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4283813 aaaccacaagcaataacaacaatatagacctagtctataaa-ccaagtgcatagcaaaaccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaa 4283715  T
Q  374 gaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttct 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4283714 gaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctagaggggagattgatctctccaatccactatcaatgagttct 4283616  T
Q  474 tacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaag 571  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4283615 tacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaag 4283516  T
Q  572 acactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacta 671  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4283515 acactcatgattttcactctcctaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcacta 4283416  T
Q  672 aggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaa 766  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||  |||||| || |||||||    
T  4283415 aggatcttctcttttggtttcacaagactcaaccaagtttctcacaaaagactttccactcatgtgtttcccaaccccatgaatctttcccaaaa 4283321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 236 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 40329102 - 40328528
Alignment:
Q  236 gagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagcca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  40329102 gagcaagtatcaatgacaaccaacaaccaaatgtaaataa-ccacaagcaataacaacagtctagatctaatctagaaaac-aagtgcatagcaaaacca 40329005  T
Q  336 caattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggag 435  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||     |||||||||||||    
T  40329004 caatctaaccaaaggataaacaagaaaaggagagtagagaaaagataacaacaccaagaaatgttcactcagttccgtccaa-----acctactctggag 40328910  T
Q  436 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat---gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccc 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  40328909 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgagttacaagaaattagtttaaacaagctcacaaagaacaaacc 40328810  T
Q  533 taatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaac 632  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40328809 taatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaagatgtttacaattgtttcccaactctagaatctaac 40328710  T
Q  633 ccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactc 732  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  40328709 ccccaaaagagaaccaactcatagcctttgatttcactaaagatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctacactc 40328610  T
Q  733 atgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt 815  Q
    |||||||| ||| ||  |||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  40328609 atgtgtttcccatccccatgaatcttccctaaaaggcaccaaccc-ttttcccaagaaccccctcttttggttctccaagatt 40328528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 317 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 40221992 - 40221494
Alignment:
Q  317 caagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtcca 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | || |||||||||||||||    
T  40221992 caagtgcatagcaaaaccacaatccaaccaaagaatgaacaagataaagagagtaaagacaagataacaacaccaaagattattgacccagttcggtcca 40221893  T
Q  417 acaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaa 514  Q
    ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  40221892 act-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaa 40221794  T
Q  515 actcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttc 614  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40221793 gctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttaccaatctcaccaaagaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttc 40221694  T
Q  615 ccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctc 714  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  40221693 ccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacctttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggttttacaagactcacctaagttgctc 40221594  T
Q  715 acaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagat 814  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| |||| |||||  |||||| ||||||||||  |||||||||| |||||    
T  40221593 acaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcactaaccc-ctttcccaagagccccctattttggttctcgaagat 40221495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 231 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 18655734 - 18655246
Alignment:
Q  231 gtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaa 330  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||||||    
T  18655734 gtgtggagcaaatatcaatgacaaccaataaccaaatgtaaataaac-acaagcaataacaacaatatagatctagtctataaa-ccaagtgcatagcaa 18655637  T
Q  331 agccacaattcaaccaaagga-taaacaagataaagagag--taaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgaccta 427  Q
    | ||||||| |||   ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18655636 aaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagagagagtaaagaaaagataacaacaccaaaaaatgttcacccagttcggtccaact-tgaccta 18655538  T
Q  428 ctctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaaga 525  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18655537 ctttggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaga 18655438  T
Q  526 acaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctata 625  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  18655437 acaaccttaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaaaacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcctaagtctaga 18655338  T
Q  626 atctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaa 718  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18655337 atctaa-ccccaaaagagtatcaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttgatttcacaagactcaccgaagttgctcacaa 18655246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 435 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 44353923 - 44353541
Alignment:
Q  435 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgt--tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccc 532  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  44353923 ggagagattgatcttttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccc 44353824  T
Q  533 taatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaa 631  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44353823 taatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagatactcaatgatttttactcacccaatgtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaa 44353724  T
Q  632 cccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccact 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | || ||||||||    
T  44353723 cccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaagaatcttttcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcaccgatgactctccact 44353624  T
Q  732 catgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt 815  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| |||||||||| | ||| | ||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  44353623 catgtgttttccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaaccc-tcttcacaagagccccctcttttagttctccaagatt 44353541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 317 - 620
Target Start/End: Original strand, 10930118 - 10930424
Alignment:
Q  317 caagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtc 414  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  10930118 caagtgcatagcaaaaccacaatccaacaaaagaataaacaagataaagggagcaaaagaaaagataacaacaccaagaaattgttgacccagttcggtc 10930217  T
Q  415 caacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaac 512  Q
    ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  10930218 caact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgtgttcttacaaagagatataaatgggttacaagaaattagcttcaac 10930316  T
Q  513 aaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtt 612  Q
     | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10930317 gagctcacaaagagcaaccctaatttctatccattttcccaatctcaccgatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaaatgtttacaattgtt 10930416  T
Q  613 tcccaact 620  Q
    ||||||||    
T  10930417 tcccaact 10930424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 233 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 3772521 - 3772164
Alignment:
Q  233 gtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaag 332  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | || ||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||     
T  3772521 gtggagcaggtatcaatggcaaccaatcaccaaaagaaaataa-ccacaagcaacaacaacaatctagatttaatctagaaatc-aagtgcatagcaaaa 3772424  T
Q  333 ccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctg 432  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  3772423 ccacaatctaaccaaagaataaacaagataaagagagtagagaaaagataacaccaccaagaaatatttatccagtttggtccaac-ttgacctactctg 3772325  T
Q  433 gaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaac 530  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  3772324 agagatagattgatctctccaatccactatcaataaattcttacaaagatatacaaatgagttacaagaaattagcttaaataagctcacaaagaacaaa 3772225  T
Q  531 cctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactc 590  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3772224 cctaatttctatcaattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatcattttcactc 3772164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 43036590 - 43036367
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  43036590 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctggaggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaatta 43036492  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  43036491 caagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 43036392  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  43036391 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 43036367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 27811445 - 27811232
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||    
T  27811445 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgggttcttacaaagagatacaaatgggtta 27811347  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  27811346 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 27811247  T
Q  594 caaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||||||||||    
T  27811246 caaggtgtttacaat 27811232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 15212953 - 15212730
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  15212953 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 15212855  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  15212854 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacattcaatgattttcactcacc 15212755  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  15212754 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 15212730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 33352317 - 33352094
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  33352317 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 33352219  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||    
T  33352218 caagaaattaggttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcaatcacc 33352119  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  33352118 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 33352094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 4731825 - 4731602
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| ||||| |||||||||||  ||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  4731825 tgttgacccaattcggtccaact-tgaccgaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 4731727  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  4731726 caagaaattaggttcaacaagctcacaaagagcaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 4731627  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  4731626 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4731602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 403 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 18141981 - 18141764
Alignment:
Q  403 cccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaa 500  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  18141981 cccagtttggtccaact-tgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgggttacaagaa 18141883  T
Q  501 attagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggt 599  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18141882 attagcttcaacaagctcacaaagaacaa-cctaatttctacccattttcacaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcgcccaaggt 18141784  T
Q  600 gtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  18141783 gtttacaaatgtttcccaac 18141764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 397 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 42498362 - 42498149
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||    
T  42498362 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaaatacaaaagggtta 42498263  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 592  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  42498262 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 42498164  T
Q  593 ccaaggtgtttacaa 607  Q
    |||||||||||||||    
T  42498163 ccaaggtgtttacaa 42498149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 429 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 30143476 - 30143286
Alignment:
Q  429 tctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaa 526  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30143476 tctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa 30143377  T
Q  527 caaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  30143376 caaccctaatttctacccattttcccaatctggccaatgaacaagacac-aatgattttcactcacccaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 30143286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 397 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 40321247 - 40321022
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |||    
T  40321247 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagtttttacaaagagatactaatgggtta 40321149  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |     
T  40321148 caagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacctatgaacaagacactcaatgattttcagtcact 40321049  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaactc 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  40321048 caaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 40321022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 3303671 - 3303894
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  3303671 tgtttacccagttcggtccaact-tgacctactgtgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 3303769  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |     
T  3303770 caagaaattaggttaaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctacccattttcccaatctcaccaataaacaagatactcaatgattttcactcact 3303869  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  3303870 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3303894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 386 - 619
Target Start/End: Original strand, 1292454 - 1292687
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1292454 acaccaagaaatgtttgcccagttcggtccaact-tgacctactctgg-ggagagatttatttctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 1292551  T
Q  486 caaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgat 582  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  1292552 caaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctacccattttctcaatctcaccaaagaacaagacactcaataat 1292651  T
Q  583 tttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||    
T  1292652 tttcactcacccaaggtgttcac-agtgtttcccaac 1292687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 421 - 621
Target Start/End: Original strand, 1345395 - 1345597
Alignment:
Q  421 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactc 518  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  1345395 tgacctactctgggggagagattgaactcttcaatccactatcaatgagttctttcaaagagatacatatgggttacaagaaattagcttcaataaactc 1345494  T
Q  519 acaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 617  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  1345495 acaaagaacaaccctaatttctacacattttcccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tatttccca 1345593  T
Q  618 actc 621  Q
    ||||    
T  1345594 actc 1345597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 17982821 - 17982597
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||    
T  17982821 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtta 17982722  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 592  Q
    |||||||||| |||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  17982721 caagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 17982623  T
Q  593 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  17982622 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 17982597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Original strand, 34254331 - 34254543
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||    
T  34254331 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaaagggtta 34254430  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  34254431 caagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 34254528  T
Q  594 caaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||||||||||    
T  34254529 caaggtgtttacaat 34254543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 19491700 - 19491922
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| ||| |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  19491700 tgttgacctagttcggtccaata-tgacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 19491798  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc 594  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  19491799 caagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatattttcactcaccc 19491898  T
Q  595 aaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||    
T  19491899 aagatgtttacga-tgtttcccaac 19491922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 397 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 5689438 - 5689213
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gtta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  5689438 tgttgacccagttcggtccaact-tgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 5689340  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  5689339 caagaaattagctttgacaagctcacaaagcaccaccttaatttctacccatttttccaatctcattaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 5689240  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaactc 621  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5689239 caaggtgtttacaa-tgtttccaaactc 5689213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 31218425 - 31218201
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||    
T  31218425 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtta 31218326  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 592  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  31218325 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 31218227  T
Q  593 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31218226 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 31218201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Original strand, 34256507 - 34256719
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  34256507 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 34256606  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||| |||  ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |    
T  34256607 caagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacac-ac 34256704  T
Q  594 caaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||||||||||    
T  34256705 caaggtgtttacaat 34256719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 435 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 30291737 - 30291549
Alignment:
Q  435 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aacc 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  30291737 ggagagattgatctctccaatccactatcaaagaattcttacaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaac 30291638  T
Q  532 ctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  30291637 ctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcaatcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 30291549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 9765911 - 9765693
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  9765911 tgttgacccagttcggtccaata-tgacctaatctgggggagagagc-agctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 9765814  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc 594  Q
    ||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| |||    
T  9765813 caagaaattagctttgccaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc---aatttcactcaccc 9765717  T
Q  595 aaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  9765716 aaggtgtttacaa-tgtttcccaac 9765693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 44304023 - 44303798
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||||||| |||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||    
T  44304023 tgttcacctagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaaaggatta 44303924  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc--attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactct 591  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  44303923 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccttaatttctaccctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc- 44303825  T
Q  592 cccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||    
T  44303824 accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 44303798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 394 - 617
Target Start/End: Original strand, 8965689 - 8965914
Alignment:
Q  394 aaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tg 491  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||   |    
T  8965689 aaatgtttacccagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagatttatctctccgatgcactatcaatgagttcttacaaagagatataaaaggg 8965787  T
Q  492 ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcact 589  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8965788 ttataagaaattaacttcaacaaactcataaagaacaaaccctaatttcta-cctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 8965886  T
Q  590 ctcccaaggtgtttacaattgtttccca 617  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||    
T  8965887 cacccaaggtgtttacaaatgtttccca 8965914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 6599139 - 6598916
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||    
T  6599139 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagtatacaaatgggtta 6599041  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacac-tcatgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |     
T  6599040 caagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaacttaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacacttaatgattttcactcact 6598941  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  6598940 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 6598916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 6674592 - 6674369
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||    
T  6674592 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagtatacaaatgggtta 6674494  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacac-tcatgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |     
T  6674493 caagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaacttaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacacttaatgattttcactcact 6674394  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  6674393 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 6674369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Original strand, 19945359 - 19945574
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa---tgtt 493  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||    
T  19945359 tgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctcgaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagtggtt 19945458  T
Q  494 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactct 591  Q
    |||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  19945459 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccataatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc- 19945557  T
Q  592 cccaaggtgtttacaat 608  Q
     ||||||||||||||||    
T  19945558 accaaggtgtttacaat 19945574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 1746219 - 1746442
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||    
T  1746219 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagggtta 1746317  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 592  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  1746318 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 1746416  T
Q  593 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  1746417 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 1746442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 12702635 - 12702862
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   ||||    
T  12702635 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttacaaagagacacaaaagggtta 12702733  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc-----attttcccaatctcaccaatgaacaagacac-tcatgattttcac 588  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  12702734 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacacttaatgattttcac 12702833  T
Q  589 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12702834 tc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 12702862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 392 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 4162668 - 4162454
Alignment:
Q  392 agaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 491  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4162668 agaaatgtttacccaattcggtccaact-tgacctactcttggggagagattgatatctccaatcc-ctatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 4162571  T
Q  492 --ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcac 588  Q
      |||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4162570 agttacaagaaattagcttcaacaagttctcaaagaacaaacctaacttctacccattttcc---tctcactaatgaacaagacactcaatgattttcac 4162474  T
Q  589 tctcccaaggtgtttacaat 608  Q
    || | |||||||||||||||    
T  4162473 tcgctcaaggtgtttacaat 4162454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 4743215 - 4743427
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgttaca 496  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |        ||||||    
T  4743215 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatgg--------gttaca 4743305  T
Q  497 agaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccca 595  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  4743306 agattttagcttcaacaaacacacaaagaacaaacctaatt-ctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcgctcaccca 4743404  T
Q  596 aggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  4743405 aggtgtttacaa-tgtttcccaac 4743427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 403 - 618
Target Start/End: Original strand, 41366622 - 41366837
Alignment:
Q  403 cccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaa 500  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||    
T  41366622 cccagttcggtccaact-tgacctaatctag-ggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagggatacaaataggttaaaagaa 41366719  T
Q  501 attagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggt 599  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  41366720 attagcttaaacaagcttacaaagaacaaacataatttctacccattttctcaatctcagtcttgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggt 41366819  T
Q  600 gtttacaattgtttcccaa 618  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  41366820 gtttacaa-tgtttcccaa 41366837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 402 - 619
Target Start/End: Original strand, 18106087 - 18106302
Alignment:
Q  402 acccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaaga 499  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  18106087 acccagttcggtccaact-tgacctattctgg-ggagagattgatctctccaaac-actatcaatgagttcttacaaa-agatacaaatgagttacaaga 18106182  T
Q  500 aattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaagg 598  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||  || |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||    
T  18106183 aattagcttcaacaagctcgcaaagaacaactatagtttctatccatttttccaatctcaccgatgaacaagacactcaacaattttcactcacccaagg 18106282  T
Q  599 tgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  18106283 tgtttacaa-tgtttcccaac 18106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 399 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 2627902 - 2627735
Alignment:
Q  399 ttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttaca-aagagatacaaa---tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||     
T  2627902 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacacaagagatacaaaaagagttg 2627803  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2627802 caagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 2627735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 446 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 10929907 - 10929753
Alignment:
Q  446 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccca 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10929907 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagag---------ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacataatttctaccca 10929817  T
Q  546 ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 608  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  10929816 ttttccatatctcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactaatccaaggtgtttacaat 10929753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 476 - 619
Target Start/End: Original strand, 41364926 - 41365071
Alignment:
Q  476 caaagagatacaaatgt--tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagac 573  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||    
T  41364926 caaagggatacaaatgtgttacaagaaattagcttaaacaaactcacaaagaacaaacctaatttctaccaattttcccaatctcagtcttgaacaagac 41365025  T
Q  574 actc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41365026 actcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 41365071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 386 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 8153936 - 8153705
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    ||||||| |||| || | ||| |||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  8153936 acaccaaaaaatatttatccatttcggtccaact-tgacctactctgaggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagatata 8153838  T
Q  486 caaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaa-ctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc---at 579  Q
    ||||   |||||| ||| |||||||||||||| |||| |      |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |   ||    
T  8153837 caaaagagttacacgaatttagcttcaacaaagctcaga------aaccctaatttcta-ccattttctcaatctcaccaatgaacatgacacactcaat 8153745  T
Q  580 gattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8153744 gattttcactcatccaaggtgtatacaaatgtttcccaac 8153705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 386 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 10015257 - 10015119
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  10015257 acaccaagaaatgattacccagttcggtccaact-tgacctactatggag-agagatttatctctccaatccactatcaatgagttccta-aaagagata 10015161  T
Q  486 caaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaaga 525  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  10015160 caaatgagttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaaga 10015119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 25690122 - 25689955
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  25690122 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 25690023  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25690022 caagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cctttttcccaatctcaccaa 25689955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 3439671 - 3439504
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 494  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  3439671 tgttcatccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 3439572  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||||   |||  ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3439571 caagaaattagctt-gccaagttcataatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 3439504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 404 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 7597776 - 7597648
Alignment:
Q  404 ccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatg--ttacaagaa 500  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||    
T  7597776 ccagttcggtctaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgcattctttacaaagagatacaaaaggattataagaa 7597677  T
Q  501 attagcttcaacaaactcacaaagaacaa 529  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  7597676 attagcttcaacaagctctccaagaacaa 7597648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 390 - 529
Target Start/End: Original strand, 11711993 - 11712135
Alignment:
Q  390 caagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaa 488  Q
    ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  11711993 caagaaatgtttacccaattaggaccaacaatgacctactttgagggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataa 11712092  T
Q  489 a--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaa 529  Q
    |   ||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  11712093 aagggtttcaagaaattagcttcaacaagctctcaaggaacaa 11712135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 392 - 503
Target Start/End: Original strand, 3073870 - 3073981
Alignment:
Q  392 agaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac--aaa 489  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  3073870 agaaatgtttacccagttcggcccaact-tgacctactatgg-ggagagattgatctctccaagccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaa 3073967  T
Q  490 tgttacaagaaatt 503  Q
    ||||||||||||||    
T  3073968 tgttacaagaaatt 3073981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 415 - 548
Target Start/End: Original strand, 32902191 - 32902327
Alignment:
Q  415 caacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatac--aaatgttacaagaaattagcttcaa 511  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  32902191 caacaatgacctactcagggggagagattgatctctcaaattcactatcaatgaattctttagaaagagatacaaaaaagttacaagaaattagcttcaa 32902290  T
Q  512 caaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattt 548  Q
    || | || | | |||||| | ||||||||||||||||    
T  32902291 cagagtctccatgaacaaacataatttctacccattt 32902327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 394 - 558
Target Start/End: Original strand, 29796317 - 29796485
Alignment:
Q  394 aaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag--ttcttacaaagagatac--aaa 489  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || ||||||| || |||  |||    
T  29796317 aaatgtttaccaagttcggtccaacaatgacctacattgggggagagattgatctctccaatccattataaatgagtttttttacaaataggtacaaaaa 29796416  T
Q  490 tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 558  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  || | |||||| |||| | |||||||| | |||||||||||||    
T  29796417 tgttacaagaaatcagcttcaacaagttctccaagaacaaaccttgatttctactc-ttttcccaatctc 29796485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 397 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 4733873 - 4733784
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataca 487  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4733873 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagataca 4733784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 317 - 414
Target Start/End: Original strand, 2999723 - 2999820
Alignment:
Q  317 caagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtc 414  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  2999723 caagtgcatagcaaaatcacaatctaaccaaagaataaacaagataaagagagtagagaaaagatatcaacatcaagaaatgtttactcagttcggtc 2999820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 277 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 10240411 - 10240263
Alignment:
Q  277 ccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaagga-taaacaagataaagagagtaaaga 375  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| | || || | |||||| |||||||  |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||    
T  10240411 ccacaaacaataacaacaatctagatctaatctagaaa-cgaaatgtaaagcaaaaccacaatcgaaccaaaaaaataaacaagataaagagagtgaaga 10240313  T
Q  376 aaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacc 425  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||    
T  10240312 aaagagaacaaaaccaagaaatgtttacctagtttgatccaacaatgacc 10240263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 707 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 22976389 - 22976264
Alignment:
Q  707 agttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttc 806  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||    
T  22976389 agttgctcacaatagactcttcactcatgtgttttc-aaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttt-ccaagagcctcctcttttggttc 22976292  T
Q  807 tcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||||    
T  22976291 tccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 22976264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 435 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 1822423 - 1822282
Alignment:
Q  435 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aac 530  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| || ||||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  1822423 ggagagattgatctctccaattcactattagtgagttatttacaaatagatataaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaac 1822324  T
Q  531 cctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagac 573  Q
    | ||||||||| || ||||  ||||||| | ||||||||||||    
T  1822323 cataatttctatcc-tttttgcaatctctcaaatgaacaagac 1822282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 435 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 1856868 - 1856727
Alignment:
Q  435 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aac 530  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| || ||||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  1856868 ggagagattgatctctccaattcactattagtgagttatttacaaatagatataaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaac 1856769  T
Q  531 cctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagac 573  Q
    | ||||||||| || ||||  ||||||| | ||||||||||||    
T  1856768 cataatttctatcc-tttttgcaatctctcaaatgaacaagac 1856727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 492 - 719
Target Start/End: Original strand, 33655402 - 33655628
Alignment:
Q  492 ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactc 590  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||| | |||| |  ||| ||  | |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33655402 ttacgagaaatcagcttcaacaaactctctaagaacaaatctaatttctatctattt-cttaatatcttccatgaacaagacactcaatgattt-cactc 33655499  T
Q  591 tcccaaggtgtttacaa-ttgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggt 689  Q
      ||||| ||||| ||| || ||| ||||||||| ||| ||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||| |    
T  33655500 atccaagatgttttcaaattattttccaactctaaaatttaacccttgaaagagaaccaacccttaacctttgattt-tctaaggatcttctcttttgtt 33655598  T
Q  690 ttcacaagactcactcaagttgctcacaaa 719  Q
     ||  |||| |||| ||| |||||||||||    
T  33655599 ctcctaagattcacccaaattgctcacaaa 33655628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 631 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 40585656 - 40585569
Alignment:
Q  631 acccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaa 719  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |  ||| |||||| ||| |||||||||||    
T  40585656 acccccaaaagagaaccaacccttagtctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtctaccaatactcacccaaattgctcacaaa 40585569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 400 - 563
Target Start/End: Original strand, 42575327 - 42575494
Alignment:
Q  400 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttac 495  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||    
T  42575327 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttac 42575426  T
Q  496 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||| |  |   |||| | |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42575427 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaatccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 42575494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 456 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 10240264 - 10240061
Alignment:
Q  456 ccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaa-atg-ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcc 551  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  | || |||    
T  10240264 ccactatcaatgagttctttacaaagagatccaacatggttacaagaaattagattcaacaagctcacaaagaacaaacccaaatttcta-tctttgtcc 10240166  T
Q  552 caatct-caccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgttt-acaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaa 649  Q
    |||||| | || | |||||||| ||||  || |||| ||| || ||| |||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  10240165 caatctcctcccaagaacaagagactc--ga-tttcgctcacctaagatgtttctcaattgtttcccaaatctagaatctaacccc--aaagagaaccaa 10240071  T
Q  650 cccttagcct 659  Q
    | ||||||||    
T  10240070 ctcttagcct 10240061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 401 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 15290688 - 15290522
Alignment:
Q  401 cacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttaca 496  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | ||||||    
T  15290688 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttaca 15290589  T
Q  497 agaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    |||||||||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15290588 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 15290522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 401 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 15471057 - 15470891
Alignment:
Q  401 cacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttaca 496  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | ||||||    
T  15471057 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttaca 15470958  T
Q  497 agaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    |||||||||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15470957 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 15470891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 406 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 38864017 - 38863949
Alignment:
Q  406 agttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 474  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38864017 agttcggtctaacaataacctactatgcaggggagattgatctctccaatccactatcaacgagttctt 38863949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 429
Target Start/End: Original strand, 9633551 - 9633640
Alignment:
Q  334 cacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacacc-aagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctact 429  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||       ||| ||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9633551 cacaattgaaccaaagaataaacaagataaagagagt-------agaaaacaacaccaaagaattgtttacacagttcggtccaacaatgacctact 9633640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 30909487 - 30909389
Alignment:
Q  445 atctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctac 542  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||  || ||||||||||||    
T  30909487 atctctccaattcactatcaacgagtcattacaaagagatacaaagagttacaagaaattagtttaaacaagctctccaagagtaaacctaatttctac 30909389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 514
Target Start/End: Original strand, 38860413 - 38860482
Alignment:
Q  447 ctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatgttacaagaaattag-cttcaacaa 514  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||    
T  38860413 ctctccaatccactatcaaatagtttcttacaaagagatacaatagttataagaaattagccttcaacaa 38860482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 609 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 10020398 - 10020321
Alignment:
Q  609 tgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggt 689  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  10020398 tgtttcccaactctagaatccaaccca-aaaaga-aacaaacccttagcctttgatttc-ctaaggatctcctcttttggt 10020321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 621
Target Start/End: Original strand, 3231859 - 3232023
Alignment:
Q  461 atcaatgagttctt-acaaagagatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatc 556  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| |  ||||| |||||    
T  3231859 atcaataagttctttacaaagagatacaaaatggttaaaaaaaattagcttcaacaagctcacgaagaacaaagcctaatttcta-catttttctcaatc 3231957  T
Q  557 tc-accaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 621  Q
    ||  || | |||||||| |||| ||||  ||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  3231958 tcttcctaagaacaagagactcaatga-attcacccacccaaggtgtttactaatgtttcccaactc 3232023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 226
Target Start/End: Original strand, 4743023 - 4743069
Alignment:
Q  179 tttgtgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattata 226  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4743023 tttgtgttgtgaattc-ggactcaaatctcacaccaatacaaactata 4743069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4283872 - 4283819
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtgga 237  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  4283872 tgttgtgaattc-ggtctcaaattttacaccaatacaaactatatgatgtgtgga 4283819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 102)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 232 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 12073721 - 12073123
Alignment:
Q  232 tgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaa 331  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || ||||||  | || |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12073721 tgtggagcaagtatcaatggcaataaacaaccaa--ggaa-taaaccacaagcaacaacaacaatctagatctaatctagaaa-ccaagtgcataacaaa 12073626  T
Q  332 gccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactct 431  Q
     |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12073625 accacaatctaaccaaagaataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacctagttcggtccaacaatgacctactct 12073526  T
Q  432 ggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaa 529  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12073525 ggaagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa 12073426  T
Q  530 ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatct 629  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12073425 acctaatttctacccattttcccaatctcaccaataagcaagacactcatgattttcacactcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatct 12073326  T
Q  630 aacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctcca 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||    
T  12073325 aacccccaaaagagaaccaacccttagcatttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcataagactcacccaagttgctcacaaaagactcttca 12073226  T
Q  730 ctcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaaga-ttacatctttgaagc 828  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  12073225 ctcatgtgttttccaaccccatgaatctt-cccaaaaggcaccaaccctttttcccaagag-cccctcttttggttctccaagatttacatc-ttgaagc 12073129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 181 - 834
Target Start/End: Original strand, 50673636 - 50674284
Alignment:
Q  181 tgtgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccac 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||     
T  50673636 tgtgttgtgaattccggactcaaattacacattaatacaaattat--gatgtgtggagcaagtatcaatgtcaaccaataaccaaatgtaaatca-ccat 50673732  T
Q  281 aagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaagga-taaacaagataaagagagtaaagaaaag 379  Q
    ||||||||| |||||| ||||| || |||| ||   ||||||||||||||| ||||||| |||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50673733 aagcaataacaacaatatagatctagtctataat--caagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagagagtaaagaaaag 50673830  T
Q  380 ataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50673831 ataacaacaccaagaaatgttcacctagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 50673929  T
Q  480 gagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc 577  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  50673930 gagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaga-caatcctaatttctactcattttctcaatctcacaaatgaacacgacactc 50674028  T
Q  578 atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatc 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50674029 atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatc 50674128  T
Q  678 ttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccc 777  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| || |||| || ||||||||||    
T  50674129 ttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatctttcccataaggcaccaaccc 50674228  T
Q  778 tttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
     |||||   ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  50674229 -ttttcattagagccccctcttttggttctccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 50674284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 183 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 2210096 - 2209438
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaa 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2210096 tgttgttaattccggactcaaatttcacaccaatacaaactat--gatgtgtggagcaagtatcaatggcaaccaataaccaaatgtaaataa-ccacaa 2210000  T
Q  283 gcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaa---g 379  Q
     |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||   |    
T  2209999 acaataacaacaatctagatctaatctagaaaac-aagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaatgataaacaagataaagagagtagagaaaaatag 2209901  T
Q  380 ataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaa 478  Q
    | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2209900 acaacaacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaa 2209801  T
Q  479 agagatacaaat---gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacac 575  Q
    |||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2209800 agagatacaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaaaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaacaatgaacaagacac 2209701  T
Q  576 tcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaagga 675  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2209700 tcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccatagcctttgatttcactaagga 2209601  T
Q  676 tcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaa-----agaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgca 770  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |       | || |      || ||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| |||    
T  2209600 tcttctcttttggtttcacaagactcgctgagaaccaacccatagcctttgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggca 2209501  T
Q  771 ccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  2209500 ccaaccc-ttttcccaagagtcccctcgtttggttctccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 2209438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 233 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 41964743 - 41964166
Alignment:
Q  233 gtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaag 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  41964743 gtggagcaagtatcaatggcaaccaacaatcaaatgtaaataa-ccacaagcaataacaacaatctagatctaatctagaaaac-aagtgcatagcaaaa 41964646  T
Q  333 ccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctg 432  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41964645 ccacaatctaaccaaaggataaacaagata--gagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgctcacccagttcggtccaact-tgacctactctg 41964549  T
Q  433 gaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat---gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaa 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41964548 gaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaaatgggttacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaa 41964449  T
Q  530 ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatc 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41964448 ccctaatttctacccattttcccaatttcaccaacgaacaagacactcatgaattttcactttcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatc 41964349  T
Q  629 taacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctcc 728  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  41964348 taacccc-aaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctct 41964250  T
Q  729 actcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt 815  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||| || |||||||   || ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  41964249 actcatgtgtttcccaaccccatgaatctttcccaaaa--gactaaccc-ttttcccaagagccccctcttttggttctccaagatt 41964166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 182 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 40632826 - 40632334
Alignment:
Q  182 gtgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccaca 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40632826 gtgttgtgaattccggactcaaattacacaccaatacaaactatatgatgtgtagagcaagtatcaatggcaaccaataaccaaatgtaaataaaccaca 40632727  T
Q  282 agcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagat 381  Q
    |||||||| |||||| ||||  || |||| | | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40632726 agcaataacaacaatatagacctagtctatata-ccaagtgcatggcaaaaccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaaaaaaagat 40632628  T
Q  382 aacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaga 481  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40632627 aacaacaccaagaaatgtttacccagttcggtccaact-tgacttactttagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaga 40632529  T
Q  482 gatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcat 579  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40632528 gatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcat 40632429  T
Q  580 gattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaagg 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  40632428 gattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttctcaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttaacatttgatttcactaagg 40632334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 233 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 379710 - 379128
Alignment:
Q  233 gtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaag 332  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||| || |||||| ||||  || |||| ||| ||||||||||| ||||     
T  379710 gtggagcaagtatcagtggcaaccaataatcaaatgtaaataa-ccacaaacaacaacaacaatatagacctagtctataaa-ccaagtgcataacaaaa 379613  T
Q  333 ccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctg 432  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  379612 ccacaatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctg 379513  T
Q  433 gaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaac 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  379512 gaggagagattgatctctccaatccactatcaattagttcttacaaagcgatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa 379413  T
Q  531 cctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcat--gattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatc 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  379412 cctaatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagatactaattgaattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatc 379313  T
Q  629 taacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctcc 728  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  379312 taacccacaaaagagaaccaacccttagcctttgatttc-ctaaggatcttctcttttgatttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctcc 379214  T
Q  729 actcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt 815  Q
    |||||||||||| |||  || |||||| |||||||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  379213 actcatgtgtttcccattctcatgaatcttccccaaaaggcaccgaccc-ttttcacaagagccccctcttttggttctccaagatt 379128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 313 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 54883273 - 54882750
Alignment:
Q  313 aaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaa-gataacaacaccaagaaat-gttcacccagttc 410  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  54883273 aaaccaaatgcagagcaaaaccacaattcaaccaaagaataaataagataaagagagtaaagaaaaagataacaacaccaagaaattgttgacccagttc 54883174  T
Q  411 ggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagctt 508  Q
    ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  54883173 ggtccaact-tgacttaatctggaggagagattgatccctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctt 54883075  T
Q  509 caacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaat 608  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54883074 caacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaat 54882975  T
Q  609 tgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaag 708  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  54882974 tgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacgagactcacccaag 54882875  T
Q  709 ttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctc 808  Q
    || ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  54882874 tttctcacaaaagactctacactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaaccc-ttttcataagagccccctcttttggttctc 54882776  T
Q  809 aaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
     |||||| |||| ||||||||||||||    
T  54882775 caagattcacat-tttgaagctttgaa 54882750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 321 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 8665651 - 8665137
Alignment:
Q  321 tgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaa 420  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||      
T  8665651 tgcatagcaaaaccacaatccaaccaaggaataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgtacacctagtttggtccaact- 8665553  T
Q  421 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactc 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  8665552 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctc 8665453  T
Q  519 acaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 617  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8665452 tcaaagaacaaccctaatttctacccattttcccattctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactcttccaaggtgtttacaattgtttccca 8665353  T
Q  618 actctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcaca 717  Q
    |||| | |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8665352 actccagaatctaacccccaaaagaaaaccaacacataacctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcaca 8665253  T
Q  718 aaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-a 816  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  8665252 aaagactctccactcctgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccc-ttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattca 8665154  T
Q  817 catctttgaagctttgaa 834  Q
    |||| |||||||||||||    
T  8665153 catc-ttgaagctttgaa 8665137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 232 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 35662767 - 35662191
Alignment:
Q  232 tgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaa 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||     ||| |||||| || |||||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  35662767 tgtggagcaagtatcaatggcaaccaacaaccaaaattaa-----ccataagcaacaacaacaatatagacatagtctataaa-ccaagtgcatagcaaa 35662674  T
Q  332 gccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactct 431  Q
     ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  35662673 accacaatccaaccaaggaataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaaaaaatgttcattcagttcggtccaact-tgacctactct 35662575  T
Q  432 ggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaa 529  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35662574 tgaggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaaactcataaagaacaa 35662475  T
Q  530 ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatc 628  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35662474 ccctaatttctacccattttttcaatctcaccaatgaacaagacactcatgatttttcacactctcaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatc 35662375  T
Q  629 taacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctcc 728  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||    
T  35662374 taacacccaaaagagaaccaacccttag-ctttgatttc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaagaactctcc 35662277  T
Q  729 actcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt 815  Q
    | |||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  35662276 attcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccc-ttttcctaagagccccctcttttggttctccaagatt 35662191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 317 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 6656203 - 6655705
Alignment:
Q  317 caagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtcca 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6656203 caagtgcatagcaaaaccacaatccaacaaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccaattcggtcca 6656104  T
Q  417 acaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaa 514  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6656103 act-tgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaa 6656005  T
Q  515 actcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttc 614  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6656004 gttcacaaagaacaaccttaatttctacccattttttcaatctcacaagtgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttc 6655905  T
Q  615 ccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctc 714  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6655904 ccaactctagaatctaaccccaaaaagagaaacaacctttagcctttgattttactaatgatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctc 6655805  T
Q  715 acaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagat 814  Q
    | ||| || ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  6655804 agaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaaccc-tttccccaagagccccctcttttggttctccaagat 6655706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 326 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 46703740 - 46703231
Alignment:
Q  326 agcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacc 425  Q
    |||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46703740 agcaaaaccacaatctaaccaaatgataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccaattcggtccaacaatgacc 46703641  T
Q  426 tactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa---tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaa 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  46703640 tactctggaggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaa 46703541  T
Q  523 agaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg-attttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 621  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46703540 agaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaacac 46703441  T
Q  622 tataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaag 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  46703440 tataatctaacccccaaaagagaaccaacttttagcctttgatttc-ctaaggattttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctgacaaaag 46703342  T
Q  722 aatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatc 820  Q
    | |||||| |||||| ||| ||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||    
T  46703341 actctccattcatgt-tttcccatccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccc-ttttcccaagagccccctcttttgattctcgaagattcacatc 46703244  T
Q  821 tttgaagctttgaa 834  Q
     |||||||||||||    
T  46703243 -ttgaagctttgaa 46703231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 321 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 8648382 - 8647868
Alignment:
Q  321 tgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaa 420  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  8648382 tgcatagcaaaaccacaatccaaccaaggaataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagtttggtccaact- 8648284  T
Q  421 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactc 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8648283 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttataagaaattagcttcaacaaactc 8648184  T
Q  519 acaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 617  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  8648183 acaatgaacaaccctaatttctatccattttcccattctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactcttccaaggtgtttacagttgtttccta 8648084  T
Q  618 actctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcaca 717  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8648083 actccagaatctaacccccaaaagagaaccaacacataacatttgatttcactaaggatcttctcttttgatttcacaagactcacccaagttgctcaca 8647984  T
Q  718 aaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-a 816  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  8647983 aaagactctccactcctgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccc-ttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattca 8647885  T
Q  817 catctttgaagctttgaa 834  Q
    |||| |||||||||||||    
T  8647884 catc-ttgaagctttgaa 8647868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 183 - 834
Target Start/End: Original strand, 50262487 - 50263136
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaa 282  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||   || ||| ||||||    
T  50262487 tgttgtgaattcag-actcaaatttcacaccaatacaaactat--gatgtgtggagcaagtatcaatgacaaccaacaagcaaaaaaaattaa-ccacaa 50262582  T
Q  283 gcaataaaaacaatctagatata-atctagaa---aaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaa 378  Q
    |||| || ||||||    ||||| | |||| |   || ||||||||| ||||| ||||||| |||  || | |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  50262583 gcaacaacaacaat----atatagacctagtatgtaatcaagtgcatggcaaaaccacaatccaagtaaggaataaacaagataaaaagagtagagaaaa 50262678  T
Q  379 ---gataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 474  Q
       || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  50262679 atagacaacaacaccaagagattgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatatctccaatcaactatcaatgagttctt 50262778  T
Q  475 acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaaga 572  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||   || |||||||    
T  50262779 acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccgtaatttcgatccattttcccaatctca---ataaacaaga 50262875  T
Q  573 cactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaa 672  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50262876 cactcatgattttcactctcccaaggtatttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattagcctttgatttcactaa 50262975  T
Q  673 ggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcacc 772  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||    
T  50262976 gggtcttctcttttggtttcacaagagtcaccgaggttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcacc 50263075  T
Q  773 aaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  50263076 aacccttttt-ccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 50263136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 317 - 815
Target Start/End: Original strand, 27416886 - 27417370
Alignment:
Q  317 caagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtcca 416  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||| || ||||||||||||    
T  27416886 caagtgcatggcaaaaccacaatccaaccaaagaataaacaagataaagagagtaaagacaagataacaacaccaaagattgttgactcagttcggtcca 27416985  T
Q  417 acaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaa 514  Q
    ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27416986 act-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 27417084  T
Q  515 actcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttc 614  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  27417085 gctcacaaagaacaaccctaatttctacacattttaccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc----tgtttacaattgtttc 27417180  T
Q  615 ccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctc 714  Q
      ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||            
T  27417181 aaaactcaagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagtctttgatttcactaaggatcttcttttttggttttacaagactcaccca-------- 27417272  T
Q  715 acaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagat 814  Q
      |||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||  |||||||||  |||||| |||||||| || |||||||||| |||||    
T  27417273 --aaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaagacaccaaccc-ctttcccaagagccccttcttttggttctccaagat 27417369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 181 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 41639803 - 41639345
Alignment:
Q  181 tgtgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccac 280  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    |||||    
T  41639803 tgtgttgtgaattcag-actcaaatttcacatcaatacaaactat--gatgtgtggagcaagtatcaatggcaaccaataaccaaatgtaa----accac 41639711  T
Q  281 aagcaataaaaaca---atctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaa 377  Q
    |||||| || ||     || ||||  || |||| ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41639710 aagcaacaacaaatgatatatagacctagtctataat--caagtgcatagcaaaaccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaa 41639613  T
Q  378 agataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttaca 477  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41639612 cgataacaacaccaagaaatgttcactcagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttaca 41639514  T
Q  478 aagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacac 575  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  41639513 aatagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaataaacaagacac 41639414  T
Q  576 tcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagaga 644  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41639413 tcgtgattttcactctcctaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagaga 41639345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 293 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 12119815 - 12119322
Alignment:
Q  293 caatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagata----acaaca 388  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||   |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||    ||||||    
T  12119815 caatctagatctaatctagaaa-ctaagtgcatagcaaaaccacaatcggaccaaagactaaacaagataaagagagtagagaaaaaatagatgacaaca 12119717  T
Q  389 ccaagaaat-gttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatac 486  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12119716 ccaagaaattgttcacctagttcggtccaacaatgacctactcttg-ggagagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatac 12119618  T
Q  487 aaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccc-taatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcat-gat 582  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  12119617 aaaagggttacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaaccataatttctactcttttttccaatctcacctatgaacaagacactcattgat 12119518  T
Q  583 tttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttcta 682  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||     
T  12119517 tttcactctcccaaggtatttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccctta-acttcgatttc-ttaaggatcttctc 12119420  T
Q  683 ttttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaacccttt 780  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||  |||||  |||||| ||||| |||  | |||||||||||    
T  12119419 ttttggtttcacaagacacacccaaattgctcacaaatgattcaccactaatgtgtttcgcaaccccatgaatcttcccaaaagggaaccaacccttt 12119322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 474 - 831
Target Start/End: Original strand, 55085442 - 55085801
Alignment:
Q  474 tacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaag 571  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  55085442 tacaaagagatacaaatggtttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacctattttcc-aatctcaccaatgaacaag 55085540  T
Q  572 acactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcact 670  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55085541 acagtcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgtttccgaactctagaatctaacccccaaaggagaatcaacccttagcctttgatttcact 55085640  T
Q  671 aaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgca 770  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| |||    
T  55085641 aaggatcttctcttttggtttcacaagactcacacaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggca 55085740  T
Q  771 ccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaaga-ttacatctttgaagcttt 831  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  |||||||    
T  55085741 ccaaccc-tttccccaagagccccctcttttggttctccaagatttacatcttgaaagcttt 55085801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 278 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 33990131 - 33989593
Alignment:
Q  278 cacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaa 377  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  33990131 cacaagcaacaacaacaatctagatctaatctagaaa-ccaagtgcatagcaaatccagaattgaaccaaagaataaacaagataaagagagtagaaaaa 33990033  T
Q  378 agataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttac 476  Q
    | |||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||    
T  33990032 atataataacaccaagaaatgtttacccagttcaatccaagaatgacctactctggtggagagattgatctctccaatccactattaacgagttatttac 33989933  T
Q  477 aaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 574  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||                  |||||||| |||    
T  33989932 aaagagatacaaaaggattacaagaaattagcttcaacaaactctctaagaacaaacctagtttcttccc------------------atgaacaaaaca 33989851  T
Q  575 ctc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaag 673  Q
    ||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||    
T  33989850 ctcaataatttttactcaaccaaggtgtttacagttgtttcccaactctagaatctaacctccaaaagagaacaaatccttagcctttgattac-ctaag 33989752  T
Q  674 gatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcacca 773  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |  |||||| |  ||||||| ||||||    
T  33989751 gatcttctcttttggtttcaaaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaatcccatgaatctctcccaaaaggcacca 33989652  T
Q  774 accctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    |||  || |||| ||||||||||  |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  33989651 acc--ttctcccaagagccccctattttggttcttcaagattcacatc-ttgaagctttgaa 33989593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 291 - 736
Target Start/End: Original strand, 26699337 - 26699786
Alignment:
Q  291 aacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacacc 390  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  26699337 aacaatctagatctaatctagaat-ccaagtgcatagcaaaaccataattgaaccaaagaataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacggcact 26699435  T
Q  391 aagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaa 489  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26699436 aagaaatttttacccagttcggtccaacaatgacctactctgggatagagattgatctctccaatccattataaatgagttctttacaaagagatacaaa 26699535  T
Q  490 --tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccatt-ttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattt 584  Q
       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||| || |||  |||||| | ||| ||||||||| || |||||||    
T  26699536 agagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatctataccctttcttctgaatctctctaataaacaagacattcaatgattt 26699635  T
Q  585 tcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctatt 684  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||| |||| ||| ||    
T  26699636 tcactcacccaaagtgtttacaattgtttcccaactttataatctaacccctaaaagagaaccaacctttaacctttgattaca-taaagatcatctctt 26699734  T
Q  685 ttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgt 736  Q
    || ||||   ||||||||    ||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  26699735 ttagttttctaagactcatctgagttgttcactaatgaatctccactcatgt 26699786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 318 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 26364483 - 26364223
Alignment:
Q  318 aagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtcca 416  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |    
T  26364483 aagtgtatagcaaaaccacaatccaagcaaggaataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaattgttgacccagttcagtcaa 26364384  T
Q  417 acaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaa 514  Q
    ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26364383 act-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactattaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaa 26364285  T
Q  515 actcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacact 576  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26364284 gttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacact 26364223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 26175637 - 26175860
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  26175637 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 26175735  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  26175736 caagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctccccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 26175835  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  26175836 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 26175860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 56178637 - 56178860
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  56178637 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 56178736  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  56178737 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 56178835  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  56178836 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 56178860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 386 - 619
Target Start/End: Original strand, 52095352 - 52095586
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  52095352 acaccaaaaattgttcacccagttcggtccaaacttg-cctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaaagatttcttacaaagagata 52095450  T
Q  486 caaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgat 582  Q
    ||||||  |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52095451 caaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgat 52095550  T
Q  583 tttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  52095551 tttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 52095586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 47038412 - 47038633
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg-ttac 495  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  47038412 tgttgacccagttcggtccaact-tgacttactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtccttacaaacagatacaaatgattac 47038510  T
Q  496 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 594  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  47038511 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt-ccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 47038609  T
Q  595 aaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||| || |||||||||||    
T  47038610 aaggtgtttataa-tgtttcccaac 47038633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 36994691 - 36994478
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  36994691 tgttgacccagttcggtccaact-tgatctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtta 36994593  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  36994592 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 36994493  T
Q  594 caaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||||||||||    
T  36994492 caaggtgtttacaat 36994478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 5429846 - 5429623
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  5429846 tgttgacccagttcggtccaact-taacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatacaaatgggtta 5429748  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  5429747 caagaaattagcttcaacaagctcacgaagaataaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 5429648  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  5429647 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5429623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 405 - 619
Target Start/End: Original strand, 9927467 - 9927681
Alignment:
Q  405 cagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaat 502  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9927467 cagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaat 9927565  T
Q  503 tagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgt 601  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  9927566 tagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactcagtgattttcactc-accaaggtgt 9927664  T
Q  602 ttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||| |||||||||||    
T  9927665 ttacaa-tgtttcccaac 9927681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 386 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 31474329 - 31474096
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31474329 acaccaagatatgtttacccagttcggtccaact-tgatctactctggtggagagatttatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagata 31474231  T
Q  486 caaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atga 581  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31474230 caaatgagttacaagaaattagcttcaacaaactcaaaaagaacaagacctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatga 31474131  T
Q  582 ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 617  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  31474130 ttttcactcacccaaagtgtttacaa-tgtttccca 31474096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 397 - 621
Target Start/End: Original strand, 36463390 - 36463615
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  36463390 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactgtcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggtta 36463488  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  36463489 caagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacagccctaatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgaatttcactcacc 36463588  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaactc 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  36463589 caaggtgtttacaa-tgtttcccaactc 36463615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 48143211 - 48142986
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    ||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||   ||||    
T  48143211 tgttcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttatgaagagatacaaaagggtta 48143112  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 592  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  48143111 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 48143012  T
Q  593 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  48143011 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 48142986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Original strand, 48893639 - 48893856
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gtta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  48893639 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagtta 48893737  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaa----gaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcact 589  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48893738 caagaaattagcttcaacaagctcacaaacaatgaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 48893837  T
Q  590 ctcccaaggtgtttacaat 608  Q
    | |||||||||||||||||    
T  48893838 cacccaaggtgtttacaat 48893856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 386 - 619
Target Start/End: Original strand, 54199897 - 54200130
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    ||||||| || |||| |||||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54199897 acaccaaaaattgttgacccagttcg-tccaact-tgacctaatctgggggagagaatgatctctctaattcactatcaatgagttcttacaaagagata 54199994  T
Q  486 caaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgat 582  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54199995 caaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgat 54200094  T
Q  583 tttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  54200095 tttcactcacccaatgtgtttacaa-tgtttcccaac 54200130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 34570415 - 34570638
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||| ||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  34570415 tgttgacccagttcgatccaact-taacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaattgggtta 34570513  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  34570514 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 34570613  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  34570614 caagatgttttcaa-tgtttcccaac 34570638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 377 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 21688437 - 21688188
Alignment:
Q  377 aagataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctta 475  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||| |||  ||||||| ||| | |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||     
T  21688437 aagataacaacaccaagaaattgttgactcaattcggtctaact-tgacctaatctaggggagggattgatctctccaattcattatcaatgagttcttc 21688339  T
Q  476 caaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcc-caatctcaccaatgaacaaga 572  Q
    | ||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  21688338 cgaagagatacaaatgagttacaaaaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccgatgaacaaga 21688239  T
Q  573 cactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactcta 623  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21688238 cactcatgattttcactcccccaaggtgtttagaattgtttcccaactcta 21688188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 12739551 - 12739774
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||    
T  12739551 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatacaaatagatacaaatgggtta 12739649  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  12739650 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttccactcacc 12739749  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
     ||||||||||||| |||||||||||    
T  12739750 taaggtgtttacaa-tgtttcccaac 12739774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 405 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 37740784 - 37740570
Alignment:
Q  405 cagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaat 502  Q
    ||||||||||||||  ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  37740784 cagttcggtccaact-tgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaat 37740686  T
Q  503 tagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgt 601  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  37740685 tagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactc-accaaggtgt 37740587  T
Q  602 ttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||| |||||||||||    
T  37740586 ttacaa-tgtttcccaac 37740570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 52467355 - 52467579
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||  |||    
T  52467355 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaaaaagttattacaaagtgatacaaatgggtta 52467453  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  52467454 caagatattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaacctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 52467553  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  52467554 caaggtgtttacaaatgtttcccaac 52467579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 606 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 26364222 - 26363995
Alignment:
Q  606 aattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactc 705  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  26364222 aattgtttcccaactctaaaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcatttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaccc 26364123  T
Q  706 aagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggtt 805  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||| || ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  26364122 aagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggccccaaccc-ttttcacaagagccccctcttttggtt 26364024  T
Q  806 ctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  26364023 ctccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 26363995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 386 - 619
Target Start/End: Original strand, 6542169 - 6542405
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6542169 acaccaagaaatgtttacccagttcggtccaact-tgacctaccctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagata 6542267  T
Q  486 caaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atg 580  Q
    |||| |  | |||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  6542268 caaaaggctaacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaatcctaatttctaccattttttcccaatctccccaatgaacaagacactcaata 6542367  T
Q  581 attttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6542368 attttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 6542405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 316 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 33090129 - 33089648
Alignment:
Q  316 ccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaa-gaaatgttcacccagttcggtc 414  Q
    ||||||| | |||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||  ||| ||| |||| | | ||| |||||    
T  33090129 ccaagtgtaaagcaaaaccacaatcgaaccaaaaaataaacaagataaagagagcagagaaaagagaacaacttcaaagaattgtttatctagtccggtc 33090030  T
Q  415 caacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaa 511  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   |||| || |||||||||||||    
T  33090029 caacaataacctactctagaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttctttacagagagatacaaaatggttataataaattagcttcaa 33089930  T
Q  512 caaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaatt 609  Q
    ||| ||| | |||||||| | |||||||||  || | || |||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||          |    
T  33089929 caagctctccaagaacaaacataatttctattca-tctctcaatctcttcccatgaacaagacactcaatgattttcactcttccaagg----------t 33089841  T
Q  610 gtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagt 709  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||           || | |||||    
T  33089840 gtttcccaactctataatctaacctccaaaagagaaccaacctttagcctttgattt-tctaaggatcttctcttttgg-----------tctcccaagt 33089753  T
Q  710 tgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaat-tttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctc 808  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| | |||  |||||| | || ||||||  |||||||||  | |||| ||||||||||| |||| |||||    
T  33089752 tgctcacaaatgactctccactcatgtgtttttcgaccccatgaatctctctccaaaagacaccaaccc--tctcccaagagccccctcttttgattctc 33089655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 5871987 - 5871764
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| ||||||||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||  |||    
T  5871987 tgttgacccagttcggtcaaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctctaatccactatcaaagagttcttgcaaagtgataaaaatgggtta 5871889  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  5871888 caagaaatttgcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 5871789  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  5871788 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5871764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 395 - 608
Target Start/End: Original strand, 29999804 - 30000019
Alignment:
Q  395 aatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa--tg 491  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   |    
T  29999804 aatgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaaagatacaaaagag 29999903  T
Q  492 ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactc 590  Q
    |||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29999904 ttacaagaaattagctttgacatgttcacaaagaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaacgattttcactc 30000002  T
Q  591 tcccaaggtgtttacaat 608  Q
      ||||||||||||||||    
T  30000003 -accaaggtgtttacaat 30000019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 437 - 618
Target Start/End: Original strand, 12745476 - 12745659
Alignment:
Q  437 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaacccta 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||||    
T  12745476 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaacccta 12745575  T
Q  535 atttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 618  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  12745576 atttctacccattttcctaatctcgccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac-attgtttcccaa 12745659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 389 - 619
Target Start/End: Original strand, 37229714 - 37229947
Alignment:
Q  389 ccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 488  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  37229714 ccaagaaatgtttacctagttcggtccaact-tgacctactatgagggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatataa 37229812  T
Q  489 a---tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaaca-accctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgatt 583  Q
    |    ||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37229813 aaagggttacaacaaatttgctttaacaagctcacaaagaacacaccctaatttcta-ccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcattgatt 37229911  T
Q  584 ttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37229912 ttcactcacccaaggtgtttacaaatgttttccaac 37229947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 439 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 24969238 - 24969055
Alignment:
Q  439 agattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaat 536  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  24969238 agatttatctctccaatccactatcaattagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaatctaat 24969139  T
Q  537 ttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  24969138 ttctacccatttttccaatctcaccaaagaacaagactctcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 24969055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 435 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 3913578 - 3913408
Alignment:
Q  435 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccc 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  3913578 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagatatacaaatgggttaaaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacagctc 3913479  T
Q  533 taatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtt 602  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  3913478 taatttctactcattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 3913408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 295 - 719
Target Start/End: Original strand, 22882652 - 22883077
Alignment:
Q  295 atctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaac--caaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaa 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | || ||| |||||||  ||   ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||    
T  22882652 atctagatataatcta-aaaaccaagtttaaagtaaaaccacaatggaatatcaaagaataaataagataaagagagtatagaaaaaataaca---ccaa 22882747  T
Q  393 gaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaa-- 489  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||      
T  22882748 gaaatgtttatccagttcggtccaacaatgacctactccg--ggggagattgatttctctaatccactaccaatgagttctttacgaagagatacaaaag 22882845  T
Q  490 tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaatgaacaagacactc-atgattttca 587  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||   | ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22882846 ggttacaagaaattagcttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttttatccatttt-tcaatctctttccatgaacaaggcactcaatgattttca 22882944  T
Q  588 ctctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctataatctaa-cccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattt 685  Q
    || || ||| | |||  | |||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  22882945 ctttctcaaagcgttacctaattgttttccaattctagaatctaaccccccaaaagagaaccaaccattatcctttgattt-tctaaggatcttctcttt 22883043  T
Q  686 tggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaa 719  Q
    |||| ||  ||||||| | ||| |||||||||||    
T  22883044 tggtctcctaagactcgcccaaattgctcacaaa 22883077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 295 - 719
Target Start/End: Original strand, 22934316 - 22934741
Alignment:
Q  295 atctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaac--caaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaa 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | || ||| |||||||  ||   ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||    
T  22934316 atctagatataatcta-aaaaccaagtttaaagtaaaaccacaatggaatatcaaagaataaataagataaagagagtatagaaaaaataaca---ccaa 22934411  T
Q  393 gaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaa-- 489  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||      
T  22934412 gaaatgtttatccagttcggtccaacaatgacctactccg--ggggagattgatttctctaatccactaccaatgagttctttacgaagagatacaaaag 22934509  T
Q  490 tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaatgaacaagacactc-atgattttca 587  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||   | ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22934510 ggttacaagaaattagcttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttttatccatttt-tcaatctctttccatgaacaaggcactcaatgattttca 22934608  T
Q  588 ctctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctataatctaa-cccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattt 685  Q
    || || ||| | |||  | |||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  22934609 ctttctcaaagcgttacctaattgttttccaattctagaatctaaccccccaaaagagaaccaaccattatcctttgattt-tctaaggatcttctcttt 22934707  T
Q  686 tggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaa 719  Q
    |||| ||  ||||||| | ||| |||||||||||    
T  22934708 tggtctcctaagactcgcccaaattgctcacaaa 22934741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 435 - 619
Target Start/End: Original strand, 12747794 - 12747980
Alignment:
Q  435 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccc 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||    
T  12747794 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatacaaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccc 12747893  T
Q  533 taatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  12747894 taatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttccactcacctaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 12747980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 386 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 4588137 - 4587902
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4588137 acaccatgaaatgtttacccagtttggtccaact-tcacctattatgggggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 4588039  T
Q  486 caaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atga 581  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  4588038 caaaagggttacaagaaattagcttcaacaagcttacaaagaacaaatcttaatttctaccttttttcccaatttcaccaatgaacatgacactcaatga 4587939  T
Q  582 ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4587938 ttttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 4587902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 29254661 - 29254438
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||     
T  29254661 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatttgggagagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagacacaaatgggttg 29254563  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||    
T  29254562 caagaaattaacttcaacaagctcataaaaaacaactctaatttctacccaatttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcattcacc 29254463  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||    
T  29254462 caatgtgtttacaa-tgtttcccaac 29254438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 397 - 574
Target Start/End: Original strand, 46147392 - 46147570
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  46147392 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatttgggggagagattgatgtctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagtta 46147490  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 574  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  46147491 caagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccgatgaacaagaca 46147570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 45687183 - 45687407
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gtta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  45687183 tgttgacccagttcggtccaact-tgacataatatggaggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatacaaatgagtta 45687281  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 592  Q
     |||||||||||||  |||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  | |||||||| |    
T  45687282 taagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttcttcccattttcccaatctcaccaatgaacaagacaatcaaaaaatttcactcac 45687381  T
Q  593 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  45687382 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 45687407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 397 - 617
Target Start/End: Original strand, 5370083 - 5370308
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  5370083 tgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctagtccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 5370182  T
Q  495 caagaaattagc-ttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacc---cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcact 589  Q
    |||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5370183 caagaaattagcttttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctcttttttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 5370282  T
Q  590 ctcccaaggtgtttacaattgtttccca 617  Q
    |  |||| |||||||||| |||||||||    
T  5370283 c-accaaagtgtttacaa-tgtttccca 5370308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 386 - 618
Target Start/End: Original strand, 5207832 - 5208066
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaa--agaga 483  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  5207832 acaccaataaatgtttacccaattcagtccaa-attgacctactctgggagagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaatagata 5207930  T
Q  484 tacaaatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacact-catga 581  Q
    |||||  ||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| ||||  ||||    
T  5207931 tacaagggttgcaataaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaaccctaatttctaccc-tttttccaatcactccaatgaacaagtcactaaatga 5208029  T
Q  582 ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 618  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5208030 ttttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaa 5208066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 421 - 619
Target Start/End: Original strand, 52082688 - 52082881
Alignment:
Q  421 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactc 518  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||||  ||    
T  52082688 tgacctactctggaggagagaatgatctc-------cactatcaaagatttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttc 52082780  T
Q  519 acaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 617  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  52082781 acaaagaacaaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacagtcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttccca 52082879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 351 - 719
Target Start/End: Original strand, 35369405 - 35369763
Alignment:
Q  351 ataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctct 450  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||    ||||  ||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||| || ||||    
T  35369405 ataaacaagataaagagagtaaaagaaag----caacgtcaagaaatgtttaccttgtttggtccaacaatgacctactatgg--gagagatcgacctct 35369498  T
Q  451 ccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 549  Q
     |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |   |||  |||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||     
T  35369499 tcaattcaccatcaatgagttctttacaaagagataga---gttttaagaaattagtttcatcaagctcaccaagaacaaacctaatttctactcattt- 35369594  T
Q  550 cccaatctcac-caatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaac 646  Q
    |||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  35369595 cccaatgtcttgcaatgaacaagacactcaatgattttcactctac-aaggtgtttcccaattgtttcccaattctataatccaacccc-aaaagagaac 35369692  T
Q  647 caacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaa 719  Q
    |||||||||||||||||||   | || |||||||||||||| | ||   |||||||| ||||||||| |||||    
T  35369693 caacccttagcctttgatt--cccaaagatcttctattttgctatccatagactcacccaagttgcttacaaa 35369763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 13992293 - 13992509
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||    
T  13992293 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aagagatacaaaagagtta 13992391  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 592  Q
    ||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||| |||||||||||||      
T  13992392 caagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactc-a 13992483  T
Q  593 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13992484 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 13992509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 477 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 41639351 - 41639207
Alignment:
Q  477 aaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 574  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  41639351 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagtttacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaataaacaagaca 41639252  T
Q  575 ctcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  41639251 ctcgtgattttcactctcctaaggtgtttacaattgttacccaac 41639207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 397 - 550
Target Start/End: Original strand, 12743926 - 12744080
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gtta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  12743926 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 12744024  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttc 550  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12744025 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttc 12744080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 397 - 550
Target Start/End: Original strand, 12745315 - 12745469
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gtta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  12745315 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 12745413  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttc 550  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12745414 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttc 12745469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 386 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 51337242 - 51337018
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51337242 acaccacgaaatgtttacccagttcggtccaact-tgacctaatgtgtgggagagattgatctctctaatacactatcaatgagttcttaaaaagagata 51337144  T
Q  486 caaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaa--ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atg 580  Q
    |||| |  ||| || |||||| ||| ||  | ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  51337143 caaaagggttataataaattatcttaaa--agctcacaaagaacaaatccgtaatttctaccctttttctcaatctcaccaatgaacaggacactcaatg 51337046  T
Q  581 attttcactctcccaaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  51337045 attttcactcacccaaggtgtttacaat 51337018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 421 - 619
Target Start/End: Original strand, 13009468 - 13009655
Alignment:
Q  421 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgttacaagaaattagcttcaacaaa-ctca 519  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||    ||| ||| ||||    
T  13009468 tgacctaatttggaggagagatcgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgtt--------tta----caagaaagctca 13009555  T
Q  520 caaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 618  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13009556 cgaagaacaaacctaatttctacccattttcacaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 13009654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Original strand, 31495316 - 31495485
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa---tgt 492  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||    
T  31495316 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatcaactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagt 31495415  T
Q  493 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31495416 tacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaatcctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 31495485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 669 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 40630878 - 40630714
Alignment:
Q  669 ctaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatg 768  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| |    
T  40630878 ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaagg 40630779  T
Q  769 caccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    ||||||||| ||||| | | ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  40630778 caccaaccc-ttttcacaaaagctccctcttttggttctccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 40630714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 234 - 394
Target Start/End: Original strand, 55085286 - 55085439
Alignment:
Q  234 tggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagc 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||       ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  55085286 tggagcaagtatcaatgacaaccaacaatcaaatt------aactacaagcaataacaacaatctagatctaatttagaaa-ccaagtgcatagcaaaac 55085378  T
Q  334 cacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaaga 394  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55085379 cacaatccaaccaaggaataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaaga 55085439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 437 - 543
Target Start/End: Original strand, 12744087 - 12744195
Alignment:
Q  437 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaacccta 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||    
T  12744087 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaacccta 12744186  T
Q  535 atttctacc 543  Q
    |||||||||    
T  12744187 atttctacc 12744195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 435 - 621
Target Start/End: Original strand, 48142413 - 48142605
Alignment:
Q  435 ggagagattgatctctccaatccactat--caatgagttctt-acaaagagata--caaatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-a 528  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||  |||||||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |    
T  48142413 ggagagattgatctttcaaatctactatatcaatgagttctttacaaagagatatacaagggttacaagaaactagcttcaacaagctcacaaagaacaa 48142512  T
Q  529 accctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 621  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| || |||||||||||||    
T  48142513 accctaatttcta-tcatgttcccaatctcatcaatgggcaagacactcaatgattttcactcacccgaagtgtttaaaaatgtttcccaactc 48142605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 8393562 - 8393394
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtt 493  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  8393562 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggtt 8393463  T
Q  494 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    |||||||||||||||  |||   |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8393462 acaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 8393394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 8395771 - 8395603
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtt 493  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  8395771 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggtt 8395672  T
Q  494 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    |||||||||||||||  |||   |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8395671 acaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 8395603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 351 - 605
Target Start/End: Original strand, 38811144 - 38811399
Alignment:
Q  351 ataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacacc-aagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctc 449  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||    
T  38811144 ataaacaatataaagagagtagagaaaagagaacaacaccgaagaattgtttacccagttcggtccaacaatgacctactcttggggagaga--gatctc 38811241  T
Q  450 tccaatccactatcaatgagt-tcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccat 546  Q
    |||  | ||||||||||||||   ||||||||| |||||||   || || ||||||||  |||||||||||| | |||||||| | |||||| ||||||     
T  38811242 tccgcttcactatcaatgagtcatttacaaaga-atacaaaatggtcactagaaattaaattcaacaaactctccaagaacaaacttaatttgtaccca- 38811339  T
Q  547 tttcccaatctc-accaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttac 605  Q
    |||| |||||||   | |||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  38811340 tttctcaatctctttctatgaacaagagactcaatga-tttcactcacccaaggtgtttac 38811399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 461 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 32091583 - 32091324
Alignment:
Q  461 atcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatc- 556  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||     
T  32091583 atcaatgtgttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagtttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttcta-gcattttcccaatct 32091485  T
Q  557 tcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgttt-acaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccctt 654  Q
    || || |||||||||| |||| |||| |||| ||| ||||| ||||||  ||||||||||| |||| || ||||| | |||||||| ||||||||| |||    
T  32091484 tctcccatgaacaagagactcaatga-tttcgctcacccaatgtgtttctcaattgtttccaaactttagaatctta-ccccaaaaaagaaccaacactt 32091387  T
Q  655 agcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaa 718  Q
     |||||||||||| |||||||||||||  | |||| || ||| ||| || ||||||| ||||||    
T  32091386 tgcctttgatttc-ctaaggatcttctcctctggtctcccaaaacttacccaagttgttcacaa 32091324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 605 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 41961368 - 41961264
Alignment:
Q  605 caattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcact 704  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||| || ||||||||||     
T  41961368 caattgtttcccaactctagaatctaaccctcaaaagagaaccaacccttagcttttgatttc-ctaaggatattcttttttggtctcccaagactcacc 41961270  T
Q  705 caagtt 710  Q
    ||||||    
T  41961269 caagtt 41961264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 386 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 5350087 - 5349924
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagat 484  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  | || |||||| |||||||| ||||||||||    
T  5350087 acaccaataaatgtttacccaattcagtccaacaatgacctactctgg-ggagaga--gatctctccgcttcattatcaacgagttctttacaaagagat 5349991  T
Q  485 acaaatgt--tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 549  Q
    ||||| |   |||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5349990 acaaacgagctacaaggaattagcttcgacaagttcacaaagaacaaacctaatttctacccatttt 5349924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 386 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 29056537 - 29056301
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagat 484  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||| || |  ||||||| ||||  ||||||| | |||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  29056537 acaccaagaagtgtttacacagttcggtcaaa-atggacctacactgggtgagagataggtctctctaatccattatcaatgaggttgttacaaagagat 29056439  T
Q  485 acaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaacc-ctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tg 580  Q
    | ||| |  || ||||||||||| |  ||||| | |||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||    
T  29056438 ataaaaggattgcaagaaattagttctaacaagcacacaaagaacaaactctaattcctacc-attttcccaatctctctaatgaacaaaacactcaatg 29056340  T
Q  581 attttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  29056339 atttttactcacccaaggtgtttccaaatgtttcccaac 29056301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 345 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 34113034 - 34112838
Alignment:
Q  345 caaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattg 444  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||  || || |||| ||| | |||||||||||||||||||||| | | |||||||  |    
T  34113034 caaagaataaacaagataaagtgagtagagaaaagagaacacca--aataattgtttaccaaattcggtccaacaatgacctactataggggagaga--g 34112939  T
Q  445 atctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttcta 541  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||   |||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||| | |||||||||    
T  34112938 atctctccacttcactatcaatgagttctttacaaagagatgcaaaagggttacatgaaattagcttcaacaagctctcctagaacaaacataatttcta 34112839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 386 - 558
Target Start/End: Original strand, 44967818 - 44967992
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagat 484  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| || ||||||||||||    
T  44967818 acacaaagaaatgtttacccaggtcggtccaacagtgacttattctgggggagagattgatccctctaatctactctcaacgagttttttacaaagagat 44967917  T
Q  485 acaaat-gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 558  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||| | |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44967918 acaaatggttacaagaaattggcttcagcaagctctccaagagcaaaacctaatttcta-ccattttcccaatctc 44967992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 619 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 34112555 - 34112393
Alignment:
Q  619 ctctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaa 718  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||  ||||| |||  |||||||||||||     
T  34112555 ctctataatctaccttccaaaagagaaccaaactttagcctttgatttc-ctaaggatcttcagttttgtttttccaagattcatccaagttgctcacag 34112457  T
Q  719 aagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaa-ttttccccaaaatgcaccaaccctttt 781  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||   ||||  | ||||||||| ||||||||||||||    
T  34112456 atgactctccactcatgtgttttccaaccccgtgaacctctccccaaaaggcaccaaccctttt 34112393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 390 - 543
Target Start/End: Original strand, 21703829 - 21703985
Alignment:
Q  390 caagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatac-- 486  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||      
T  21703829 caagaaatgtttacccagttcggtcaaacaatgacctactatgg-ggatagattgatatctccaatccactgtcaatgagttctttacaaaaagatacaa 21703927  T
Q  487 aaatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacc 543  Q
    ||| | |||||||||| | ||||||||| ||  | |||||| || |||||||||||||    
T  21703928 aaagggtacaagaaatcatcttcaacaagctttctaagaacaaaacctaatttctacc 21703985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 496 - 719
Target Start/End: Original strand, 35370449 - 35370661
Alignment:
Q  496 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcac-caatgaacaagacactca-tgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||   |||||||||||||||||| | |||||||||||      
T  35370449 aagaaattagtttcatcaagctcaccaagaacaaacctaatttctactcattt-cccaatgtcttgcaatgaacaagacactcaataattttcactctta 35370547  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttca 693  Q
    ||||||||||          ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||     
T  35370548 caaggtgttt----------cccaattctataatctaactcc-aaaagagaaccaaccattagcctttgatttc-ccaaagatcttctattttggtatcc 35370635  T
Q  694 caagactcactcaagttgctcacaaa 719  Q
      |||||||| ||||||||| |||||    
T  35370636 atagactcacccaagttgcttacaaa 35370661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 665 - 834
Target Start/End: Original strand, 46569816 - 46569984
Alignment:
Q  665 ttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaa 764  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||  |||||| || |||||    
T  46569816 ttcaataaggaccttctcttttggtttcataagattcacctaagttgttcacaaaagactttccactcatttgtttcccaaccccatgaatctttcccaa 46569915  T
Q  765 aatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    || ||||||| || ||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  46569916 aaggcaccaatcc-ttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 46569984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 233 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 46703879 - 46703739
Alignment:
Q  233 gtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagata--taatctagaaaaccaagtgcatagcaa 330  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| || |||||| || | |  || |||| ||   ||||||||||||||    
T  46703879 gtggagtaagtatcaataacaaccaataaccaaatgtaaataa-cctcaagcaacaacaacaatatatagacctattctataat--caagtgcatagcaa 46703783  T
Q  331 agccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaag 374  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46703782 aaccacaatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaag 46703739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 617 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 3786034 - 3785934
Alignment:
Q  617 aactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcac 716  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  3786034 aactctagaatcta-cccccaaaagagaaccaactcttagcctttgatttc-ctaaggatattctcttttggtctcccaagactcgcacaatttgctcac 3785937  T
Q  717 aaa 719  Q
    |||    
T  3785936 aaa 3785934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 543
Target Start/End: Original strand, 44570307 - 44570514
Alignment:
Q  342 aaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaacaatgacctactct--ggaggag 438  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  || ||||||| ||| |||| ||| |||||||| | ||||| |||| ||||||||  |   |||    
T  44570307 aaccaaagaataaataagataaaaagagtaaagaagggagaacaacaacaaaaaattgtttacccagtttgatccaataatgccctactctaagatagag 44570406  T
Q  439 agattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaa 535  Q
    |||  ||| ||||||   | |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||| | |||    
T  44570407 agagagatatctccacatctctatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaatgttacaagaaattagtttcaacaagctctccaacaacaaacataa 44570506  T
Q  536 tttctacc 543  Q
    ||||||||    
T  44570507 tttctacc 44570514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 443 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 53345340 - 53345189
Alignment:
Q  443 tgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaa-caaccctaattt 538  Q
    ||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  53345340 tgatccctacaatccaatattaatgagttctttacaaaaagatataaaagggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaatcaaccttaattt 53345241  T
Q  539 ctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactc 590  Q
    |||  ||||||| ||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||    
T  53345240 cta-tcattttctcaatctctccgataaacaagacactcaatgattttcactc 53345189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 400 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 5136230 - 5136063
Alignment:
Q  400 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttac 495  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||    
T  5136230 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttac 5136131  T
Q  496 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5136130 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 5136063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 400 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 5138455 - 5138288
Alignment:
Q  400 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttac 495  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||    
T  5138455 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttac 5138356  T
Q  496 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5138355 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 5138288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6656305 - 6656222
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaa 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  6656305 tgttgtgaattccggactcaaatttcacatcaataaacaaactatgatgtgtggagcaagtatcaatgacatccaacaaccaaa 6656222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 421 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 7125046 - 7124901
Alignment:
Q  421 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgttacaagaaattagcttcaacaaac 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| | ||||||||||||||| ||  ||||      
T  7125046 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattag-tttgacaagt 7124948  T
Q  517 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7124947 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 7124901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 3786185 - 3786097
Alignment:
Q  342 aaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacacc-aagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctact 429  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || |||| || ||||| ||| |||||||||||||||    
T  3786185 aaccaaagaatgaacaagataaagagagtagagaaaagagaacaacaccaaataattgttaactcagtttggtacaacaatgacctact 3786097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 385 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 7122864 - 7122682
Alignment:
Q  385 aacaccaagaaat-gttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaag 480  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||      ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  7122864 aacacaaagaaattgttcacccagttcggtctttgcttgacctactatggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaag 7122765  T
Q  481 agatacaa-atgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
      |||||| | ||||||||||||||| ||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7122764 gaatacaagaggttacaagaaattag-tttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 7122682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 386 - 529
Target Start/End: Original strand, 37754949 - 37755095
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagat 484  Q
    |||| ||||||| || | ||||||  ||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||    
T  37754949 acactaagaaatatttatccagtttagtctaacaattacctactatgggggagagattgatctcttcaaaccattatcaatgagttttttagaaagagat 37755048  T
Q  485 --acaaatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaa 529  Q
      | ||| |||||||||||||| ||||| |||| || | ||||||||    
T  37755049 aaaaaaaggttacaagaaattatcttcaccaaattctctaagaacaa 37755095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 444 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 52065719 - 52065540
Alignment:
Q  444 gatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatg---ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttc 539  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |   |||||  ||| ||||||||| || ||| | |||||||||| |||||||    
T  52065719 gatctctccacttcactatcaatgagtttctaacaaagagatacaaaaggggttacagaaaaatagcttcaataagctctctaagaacaacc-taatttc 52065621  T
Q  540 tacccattttcccaatctca-ccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||  ||| |||||| ||  ||  ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  52065620 tacctgttt-cccaatatcttccgttgatcaagagactcgatgattttcactcacccaaggggttcacaattgtttcccaac 52065540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21688621 - 21688538
Alignment:
Q  182 gtgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaat 267  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  21688621 gtgttgtgaatttcgaactcaaattttacactaatacaaactat--gatgtgtggagcaagtatcaatgacaatcaacaactaaat 21688538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 438 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 6677597 - 6677412
Alignment:
Q  438 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaag--aacaaccc 532  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| || ||||| ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| | |||  || || ||    
T  6677597 gagattgatctctcaaatccattatcaaagacttctttacaaagatatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaaaaaaaacc 6677498  T
Q  533 taatttctacccattttcccaatctc-accaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||  || | |||||||| |||||    ||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  6677497 taatttcta-ccatttt-ccaatttcttcccaagaacaagagactcaattatttcactcatccaatgtgtttacaaatgtttcccaac 6677412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 24969843 - 24969787
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagatt 443  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  24969843 acaccaagaaatgtttacccagttcggtccaac-ttgacctactctgggggatagatt 24969787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 473 - 543
Target Start/End: Original strand, 34788851 - 34788923
Alignment:
Q  473 ttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacc 543  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||| | |||| ||| |||||||||||||    
T  34788851 ttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattaacttcaacaagctctccaagagcaatcctaatttctacc 34788923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 54881629 - 54881566
Alignment:
Q  233 gtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctaga 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||     || ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  54881629 gtggagcaagtatcaatgacaaccaacaacca-----aaataaaccacaagcaataacaacaatataga 54881566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 543
Target Start/End: Original strand, 16422653 - 16422755
Alignment:
Q  444 gatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttct 540  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |  || | ||||||||||||||| || ||| |||| ||||| | ||||||||    
T  16422653 gatctctccacttcactatccatgagttcattacaaagatatacaaaagggtttctagaaattagcttcaaaaagctctcaaaaaacaaacataatttct 16422752  T
Q  541 acc 543  Q
    |||    
T  16422753 acc 16422755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 32091719 - 32091618
Alignment:
Q  285 aataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaag-aaaagataa 383  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||| | || ||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  32091719 aataacaacaatttagatctaatctagcaaac-aagtgtaaagaaaa-ccacaattgaactaaagaataaacaagataaagagcgtagagaaaaagataa 32091622  T
Q  384 caac 387  Q
    ||||    
T  32091621 caac 32091618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 447 - 515
Target Start/End: Original strand, 1122865 - 1122937
Alignment:
Q  447 ctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatac---aaatgttacaagaaattagcttcaacaaa 515  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  1122865 ctctcaaatctactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaaaatgttactataaattaacttcaacaaa 1122937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 41961725 - 41961691
Alignment:
Q  232 tgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaa 266  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41961725 tgtggggcaagtatcaatgacaaccaataaccaaa 41961691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 52)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 183 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 5044006 - 5043377
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaa 282  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  5044006 tgttgtgaattcctgacttaaatttcacaccaatacaaactat--gatgtgtggagcacgtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaaataa-cctcaa 5043910  T
Q  283 gcaataaaaacaatctagata--taatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaaga 380  Q
    |||| || |||||| || | |  || |||| ||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5043909 gcaacaacaacaatatatagacctattctataat--caagtgcatagcaaaaccacaatccaaccaagaaataaacaagataaagagagtaaagaaaaga 5043812  T
Q  381 taacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaag 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5043811 taacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaag 5043712  T
Q  481 agatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca 578  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5043711 agatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctactcattttctcaatctcacgaatgaacaagacactca 5043612  T
Q  579 tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatct 678  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  5043611 tgattttcactctcacaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagcctttgattccactaaggatct 5043512  T
Q  679 tctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccct 778  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| || ||||||| ||||||||||     
T  5043511 tctcttttggtttcacaagactcacccaaattgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatctt-cccaaaaggcaccaaccc- 5043414  T
Q  779 ttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt 815  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  5043413 ttttcccaagagccctctcttttggttctccaagatt 5043377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 181 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 17763371 - 17762736
Alignment:
Q  181 tgtgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccac 280  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  17763371 tgtgttgtgaattcgggactcaaatttcacaccaatataaactat--gatgtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaaataatc-ac 17763275  T
Q  281 aagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaa-gaaaag 379  Q
    || |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17763274 aaacaataacaacaatctagatctaatctagataac-aagtgcatagcaaaactacaatctaaccaaaggatgaacaagataaagagagtaaaagaaaag 17763176  T
Q  380 ataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17763175 ataacaacaccaagaaatgttcacctagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagattgatcactccaatccactatcaatgagttcttccaaa 17763076  T
Q  480 gagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc 577  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17763075 aagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactc 17762976  T
Q  578 atga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggat 676  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17762975 atgaattttcactctctcaaagtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggat 17762876  T
Q  677 cttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattt--tccccaaaatgcaccaa 774  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| |   |||||||| |||||||    
T  17762875 cttctctttttgtttcacaagactcacccaagttgctcccaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatctaacccccaaaaggcaccaa 17762776  T
Q  775 ccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt 815  Q
     || ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17762775 acc-ttttcacaagagccccctcttttggttctccaagatt 17762736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 183 - 815
Target Start/End: Original strand, 26829909 - 26830543
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaa 282  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  26829909 tgttgtgaattcggggctcaaatttcacaccaatacaaactatatgatgtgtggagcaagtatcaatggaaaccaataaccaaatgtaaat-aaccacaa 26830007  T
Q  283 gcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattc-aaccaaaggataaacaagataa--agagagtaaagaaaag 379  Q
    ||||||| |||||| || |  || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||| | || ||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26830008 gcaataacaacaatataaacctagtcta-taaaccaagtgcatagcaaaaccacaatccaaagcaaggaataaacaagataaagagagagtaaagaaaag 26830106  T
Q  380 ataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26830107 ataacaacaccaagaaatgttcacccagttcagtcaaac-ttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 26830205  T
Q  480 gagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctca-ccaatgaacaagacact 576  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26830206 gagatacaaatggattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacccatttttccaatctcacccaatgaacaagacact 26830305  T
Q  577 catgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggat 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26830306 catgattttcactctcccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaagaat 26830405  T
Q  677 cttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaacc 776  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||||||  |||||| ||| |||||| ||||||| |    
T  26830406 cttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaatgactctgcgctcatctgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaa-c 26830504  T
Q  777 ctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt 815  Q
    ||||||||| |||| | |||| |||||||||| ||||||    
T  26830505 ctttttcccaagagactcctcttttggttctccaagatt 26830543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 207 - 834
Target Start/End: Original strand, 3808518 - 3809147
Alignment:
Q  207 tcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataa 306  Q
    ||||||||||||||| |||  ||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||| |||    
T  3808518 tcacaccaatacaaactat--gatatgtggagcaagtatcaatggcaaccaataatcaaatgtaaataa-ccaaaagcaatagcaacaatctagatctaa 3808614  T
Q  307 tctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaa---gataacaacaccaagaaat-gttca 402  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || |||||| |||||| || |||||    
T  3808615 tctagaaaacaaa-tgcatagcaaaaccataatctaaccaaaggataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaaccccaagagattgttca 3808713  T
Q  403 cccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat---gttacaaga 499  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||    
T  3808714 cctagttcggtccaatcatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaaga 3808813  T
Q  500 aattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggt 599  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3808814 aattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagacacttgtgattttcactctcccaaggt 3808913  T
Q  600 gtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagac 699  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  3808914 gtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaa-agaaccaacccttagcctttgatttcactaaggattttctcttttggttttacaagac 3809012  T
Q  700 tcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagag-ccccctcc 798  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||| | |||||||| ||||| | |||| |||||||     
T  3809013 tcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggaaccaaccc-ttttcacaagagcccccctct 3809111  T
Q  799 tttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  3809112 tttggttctccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 3809147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 368 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 21593860 - 21593415
Alignment:
Q  368 agtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatg 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21593860 agtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatg 21593762  T
Q  468 agttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21593761 agttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatg 21593662  T
Q  566 aacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatt 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21593661 aacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttag-ctttgatt 21593563  T
Q  666 tcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaa 765  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||    
T  21593562 tc-ctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcaaaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccatgaatcttctccaaa 21593464  T
Q  766 atgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt 815  Q
    | |||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21593463 aggcaccaaccc-tttccccaagagccccctcttttggttctccaagatt 21593415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 195 - 815
Target Start/End: Original strand, 22424626 - 22425246
Alignment:
Q  195 cggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaaca 294  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||  || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||    
T  22424626 cggactcaaatttcacattaatacaaactat--gatgtgtggagcaagtatcaatggtaaccaataaccaaatgtaaataa-ccacaaacaacaacaaca 22424722  T
Q  295 atctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaag--ccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaa 392  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||||| | |||   |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22424723 atctagatctaatatagaaa-ccaagtgcattgaaaaaaaccacaatctaacctaaggataaacaagataaagagagtagagaaaagataacaacaccaa 22424821  T
Q  393 gaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat-- 490  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       
T  22424822 gaaatgttcacccagtacggtccaacaatgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaaat 22424920  T
Q  491 --gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg-attttca 587  Q
      |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22424921 gggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaacgaacaagacactcatgaattttca 22425020  T
Q  588 ctctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttg 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  22425021 ctctcccaaagtgtttacaattgtttcccaactctataatctaa-ccccaaaagagaaccaacccttag-ctttgatttc-ctaaggatattctcttttg 22425117  T
Q  688 gtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccga 787  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||  ||| || ||| ||| |||||||||  |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  22425118 gtttcacaagactaaccgaagttgctcttaaatgactcttcacccatgtgtttcacaaccccatgaatcttccccaaaatgcaccaaccc-ttatcccaa 22425216  T
Q  788 gag--ccccctcctttggttctcaaagatt 815  Q
    |||  ||||||| |||||||||| ||||||    
T  22425217 gaggcccccctcttttggttctccaagatt 22425246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 236 - 834
Target Start/End: Original strand, 2972777 - 2973377
Alignment:
Q  236 gagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaag-cc 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||| || |||||| ||||  || |||| ||| | |||||||||| |||  ||    
T  2972777 gagcaagtatcaatggcaaccaataatcaaatgtaaataa-ccacaaacaacaacaacaatatagacctagtctataaa-ctaagtgcatagaaaaaacc 2972874  T
Q  335 acaattcaaccaaaggataaacaagataaagagag----taaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactc 430  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||    
T  2972875 acaatctaaccaaatgataaacaagatatagagagagagtaaaaaaaa-ataacaacaccaagaaatgttcacctagttcggtcgaact-tgacctactc 2972972  T
Q  431 tggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaaca 528  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2972973 ttgaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaaca 2973072  T
Q  529 accctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatc 628  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2973073 aacctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacacgacacttatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatc 2973172  T
Q  629 taacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctcc 728  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||| |    
T  2973173 taatccctaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgttcacaaatgactctgc 2973272  T
Q  729 actcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaag 827  Q
    | |||||||||| ||||||  |||||| ||||| |||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  2973273 attcatgtgtttcccaaccccatgaatcttcccaaaaaagcaccaaccc-ttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatc-ttgaag 2973370  T
Q  828 ctttgaa 834  Q
    |||||||    
T  2973371 ctttgaa 2973377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 317 - 834
Target Start/End: Original strand, 603005 - 603518
Alignment:
Q  317 caagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaa---gataacaacaccaagaaat-gttcacccagttcgg 412  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||||| ||||| || ||| |||||||||||    
T  603005 caagtgcatagtaaaaccacaatccaaccaaggcataaacaagataaagagagtagagaaaaatagacaacaacatcaagagattgttgacccagttcgg 603104  T
Q  413 tccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttca 510  Q
    ||||||  ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  603105 tccaact-tgacctaatcttggggagagattgatttctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttca 603203  T
Q  511 acaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattg 610  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  603204 acaagctcacaaagaacaacacaaatttctaccca--------atctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactatcccaaggtgtttacaattg 603295  T
Q  611 tttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagtt 710  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  603296 tttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagtt 603395  T
Q  711 gctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaa 810  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||| |||||||||| ||| | | ||||||||||| |||||||||| |    
T  603396 gctcacaaaggacactccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaaccc-tttcctcaagagccccctcttttggttctcca 603494  T
Q  811 agatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||    
T  603495 agattcacatc-ttgaagctttgaa 603518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 183 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 17758402 - 17757994
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaa 282  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  17758402 tgttgtgaattcgggactcaaatttcacaccaatacaaactat--gatgtgtggagcaagtatcaatggcaaccaataaccaaatgtaaataa-ccgcaa 17758306  T
Q  283 gcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaa-gaaaagat 381  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  17758305 gcaataacaacaatctagatctaatctagaaaac-aagtgcatagcaaaaccacaatctaaccaaaggataaacaagataaagagcgtaaaaggaaagat 17758207  T
Q  382 aacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaga 481  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17758206 aacaacaccaagaaatgttcacctagttcggtccaaacttgaactactctagaggggagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaga 17758107  T
Q  482 gatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcat 579  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  17758106 gatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaagaagacactcat 17758007  T
Q  580 g-attttcactct 591  Q
    | |||||||||||    
T  17758006 gaattttcactct 17757994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 183 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 21589308 - 21588913
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaa 282  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||   | || ||||||||    
T  21589308 tgttgtgaattctggactcaaatttcacaccaatataaactat--gatgtgtggagcaagtatcaatggaaaccaacaaccaaaaa-atgttaaccacaa 21589212  T
Q  283 gcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagata 382  Q
    ||||||| |||||| ||||  || |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21589211 gcaataacaacaatatagacctagtctataaa-ccaagtgcatagcaaaaccacaatccaactaaggaataaacaagataaggaaagtaaagaaaagata 21589113  T
Q  383 acaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagag 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21589112 acaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagag 21589014  T
Q  483 atacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg 580  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21589013 atacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg 21588914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 233 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 26800917 - 26800630
Alignment:
Q  233 gtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaag 332  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||     
T  26800917 gtggagcaagtatcaatggcaaccaataaccaaatgtaaatta-ccacaagcaataacaacaatctagatctagtctagaaaac-aagtgcatagcaaaa 26800820  T
Q  333 ccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctg 432  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26800819 ccacaatctaaccaaaagataaacaagataaaaagagtagagaaaagataacaacaccaagaaatgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctg 26800720  T
Q  433 gaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa---tgttacaagaaattagcttcaacaaactcac 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26800719 gaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaattagttacaagaaattagcttcaacaagctcac 26800630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 388 - 619
Target Start/End: Original strand, 28137400 - 28137632
Alignment:
Q  388 accaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataca 487  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28137400 accaagaaatgttcacacaattcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaaataca 28137498  T
Q  488 aatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattt 584  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28137499 aatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccattctcaccaatgaacaagacactcaatgattt 28137598  T
Q  585 tcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28137599 tcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 28137632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 9183032 - 9183255
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  9183032 tgttgacccagttcggtccaact-tgacataatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 9183130  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  9183131 caagaaattagcttcaacaaattcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 9183230  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  9183231 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 9183255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 2171532 - 2171754
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgttac 495  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  2171532 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaagggttac 2171631  T
Q  496 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 594  Q
    |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  2171632 aagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-acc 2171730  T
Q  595 aaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  2171731 aaggtgtttacaa-tgtttcccaac 2171754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 5406200 - 5406422
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  5406200 tgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 5406299  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  5406300 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 5406397  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  5406398 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5406422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 5410525 - 5410747
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  5410525 tgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 5410624  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  5410625 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 5410722  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  5410723 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5410747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Original strand, 31404675 - 31404887
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  31404675 tgttcacccagttcggtccaaacttggcctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 31404774  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  31404775 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccattttcccaatctcactgatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 31404872  T
Q  594 caaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||||||||||    
T  31404873 caaggtgtttacaat 31404887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 26954287 - 26954509
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gtta 494  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  26954287 tgttgacctagttcggtccaact-tgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacagatgagtta 26954385  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  26954386 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttata-ccaatttcccaatctcacatatgaacaagacactcaatgattttcactcccc 26954484  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
     ||||||||||||| |||||||||||    
T  26954485 aaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 26954509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 33211186 - 33211409
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgt--ta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  33211186 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctactctgggggagagattgatctctccaatccattataaatgagttcttacaaagagatacaaatgagcta 33211284  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |  ||    
T  33211285 caagaaattaacttcatcaagctcacaaagaacaaccataatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaaaacactcaatgattttcagtgacc 33211384  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  33211385 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 33211409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 404 - 619
Target Start/End: Original strand, 5413401 - 5413616
Alignment:
Q  404 ccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaa 501  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  5413401 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaa 5413500  T
Q  502 ttagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtg 600  Q
    |||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||    
T  5413501 ttagctttgacaagttcgcaaagaacaaccctaatttcta-cctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaatgtg 5413598  T
Q  601 tttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  5413599 tttacaa-tgtttcccaac 5413616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 421 - 619
Target Start/End: Original strand, 3038927 - 3039127
Alignment:
Q  421 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactc 518  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||    
T  3038927 tgacctaatctgggggagagattaatctctccaatccactattaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagctc 3039026  T
Q  519 acaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 617  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  3039027 acaatgaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacattcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaa-tgtttccca 3039125  T
Q  618 ac 619  Q
    ||    
T  3039126 ac 3039127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 399 - 608
Target Start/End: Original strand, 30834538 - 30834750
Alignment:
Q  399 ttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgttaca 496  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||    
T  30834538 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttaca 30834637  T
Q  497 agaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 594  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  30834638 agaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-acc 30834736  T
Q  595 aaggtgtttacaat 608  Q
     |||||||||||||    
T  30834737 gaggtgtttacaat 30834750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Original strand, 16452329 - 16452543
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata--caaatgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||  ||||    
T  16452329 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatatgaaagggtta 16452428  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 592  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  16452429 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 16452527  T
Q  593 ccaaggtgtttacaat 608  Q
    ||||||||||||||||    
T  16452528 ccaaggtgtttacaat 16452543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 33160352 - 33160577
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    ||||||||||||| |||||||   |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  33160352 tgttcacccagtttggtccaaacttgaaatactctggaggagagattgatctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtta 33160451  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atga-ttttcactct 591  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||     
T  33160452 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaactctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgatttttcactc- 33160550  T
Q  592 cccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||    
T  33160551 accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 33160577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 342 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 25073798 - 25073463
Alignment:
Q  342 aaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaa------caccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggag 435  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||      |||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||| ||||| | || |     
T  25073798 aaccaaagaataaacaagataaagagagcagagaaaagagaacaaacaacacaccaagaaatgtttacctagtttagtctaacaataacctaatttgaat 25073699  T
Q  436 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccc 532  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  |||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||  |    
T  25073698 gagagattgatttctctaatccactatcaatgagttctttacatagagatacaaaagggttacaataaaatagctttaacaagctcacgaagaataaatc 25073599  T
Q  533 taatttctacccattttcccaatctca-ccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctataatct 629  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||  || |||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  25073598 taatttctacc-attttttcaatctcctcccatgaacaagatactcaatgattt-cactcacccaagatgtttcccaattgtttcccaactctagaatct 25073501  T
Q  630 aacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttc 667  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25073500 aacccccaaaagagaatcaacccttagcctttaatttc 25073463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 423 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 4045566 - 4045364
Alignment:
Q  423 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagata-caaatg-ttacaagaaattagcttcaacaaactca 519  Q
    ||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4045566 acctactttggggtagaaattgatctctccaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaatgattacaagaaattagcttcaacaagctca 4045467  T
Q  520 caaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 617  Q
     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  4045466 taaagaacaaaccctaatttcta-ccattttcccaatctctccaataaacaagacactcaatgattttcactcaccctaggtgtttacaaatgtttccca 4045368  T
Q  618 actc 621  Q
    ||||    
T  4045367 actc 4045364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Original strand, 3072759 - 3072928
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa---tgt 492  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||    
T  3072759 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagt 3072858  T
Q  493 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3072859 tacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttcta-ccattttcccaatctcaccaa 3072928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 412270 - 412101
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa---tgt 492  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||    
T  412270 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagt 412171  T
Q  493 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||| ||  | ||  |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  412170 tacaagaaattagatttgataagttcacaatgaacaaccctaatttcta-cctttttcccaatctcaccaa 412101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 397 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 16569189 - 16569037
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgttaca 496  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||    
T  16569189 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaag----------gttaca 16569101  T
Q  497 agaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctca 559  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16569100 agaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatctca 16569037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Original strand, 6097451 - 6097608
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgttaca 496  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       ||||||    
T  6097451 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-aga-------gttaca 6097542  T
Q  497 agaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6097543 agaaattagatttgacaagttcacaaagaacaatcctaatttcta-ccatttttccaatctcaccaa 6097608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 652 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 17757995 - 17757838
Alignment:
Q  652 cttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttat 751  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  17757995 cttagcctttgatttcactgatgatcttctctttttgtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccat 17757896  T
Q  752 gaattt--tccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctc 808  Q
    |||| |   ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  17757895 gaatctaacccccaaaatgcaccaaccc-ttttcacaagagccccctattttggttctc 17757838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 404 - 489
Target Start/End: Original strand, 5409076 - 5409161
Alignment:
Q  404 ccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 489  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5409076 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 5409161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 27648028 - 27647861
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  27648028 tgttcacccagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 27647929  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27647928 caagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 27647861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 16555037 - 16554869
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtt 493  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  16555037 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggtt 16554938  T
Q  494 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16554937 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 16554869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Original strand, 16578518 - 16578686
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtt 493  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  16578518 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggtt 16578617  T
Q  494 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16578618 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 16578686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 16616862 - 16616694
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtt 493  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  16616862 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggtt 16616763  T
Q  494 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16616762 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 16616694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 16631593 - 16631425
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtt 493  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  16631593 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggtt 16631494  T
Q  494 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16631493 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 16631425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 16653280 - 16653112
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtt 493  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  16653280 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggtt 16653181  T
Q  494 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16653180 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttttaccc-ttttcccaatctcaccaa 16653112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 294 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 9572862 - 9572667
Alignment:
Q  294 aatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaag 393  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||  || ||||| ||| | |||||||||| |  | |||||||||||||||| ||||    
T  9572862 aatctagatctaatctagaaa-ccaagtgcatagaaataccacaatcgaatcaaagaatagataagataaagacacgagagaaaagataacaacatcaag 9572764  T
Q  394 aaatgttc-acccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaa 488  Q
    |||| ||  |||||||||| | |||  ||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  9572763 aaatattttacccagttcgtttcaatgatgacctactctaaagtagagattgatctctgcaatccactatcaatgggttcttaacaaagagttacaa 9572667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 25421474 - 25421305
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 492  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  25421474 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 25421375  T
Q  493 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25421374 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 25421305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 6027415 - 6027246
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 492  Q
    |||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  6027415 tgttcacccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 6027316  T
Q  493 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6027315 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 6027246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 583 - 722
Target Start/End: Original strand, 5740978 - 5741117
Alignment:
Q  583 tttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttct 681  Q
    |||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||| || |||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  5740978 tttcactcaccgaaggtgttttccaattgttttccaactttagaatctaaccccccaaaagtaaccaacccttagcctttgattt-actaaggatcttca 5741076  T
Q  682 attttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaaga 722  Q
     |||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  5741077 ctttttgtttctcaagattcacccaaattgctcacaaaaga 5741117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 400 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 13154080 - 13153913
Alignment:
Q  400 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttac 495  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||    
T  13154080 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttac 13153981  T
Q  496 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13153980 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 13153913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 400 - 563
Target Start/End: Original strand, 33342108 - 33342275
Alignment:
Q  400 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttac 495  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||    
T  33342108 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggagtacaagaggttac 33342207  T
Q  496 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33342208 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 33342275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 400 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 34165023 - 34164856
Alignment:
Q  400 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttac 495  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||    
T  34165023 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttac 34164924  T
Q  496 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34164923 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 34164856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 34167248 - 34167078
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 492  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||  |||||| | ||    
T  34167248 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaataagttctttacaaaaggaatacaagaggt 34167149  T
Q  493 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    |||||||||||||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34167148 tacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 34167078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 699 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 26800634 - 26800530
Alignment:
Q  699 ctcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcc 798  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  26800634 ctcacccaagttgctctcaatagactctccactcatgtgtttcccatcc-catgaatcttccccaaaaggcaccaa-cctttttcccaagagccccctct 26800537  T
Q  799 tttggtt 805  Q
    |||||||    
T  26800536 tttggtt 26800530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 495 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 16567265 - 16567160
Alignment:
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaac-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 592  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||          |||||||||| ||||||||||||| |    
T  16567265 caagaaattagcttaaacaagctcacaaaaaacaaaacctaatttctaaccattttcccaatct----------caagacactcaatgattttcactcac 16567176  T
Q  593 ccaaggtgtttacaat 608  Q
    ||||||||||||||||    
T  16567175 ccaaggtgtttacaat 16567160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 258
Target Start/End: Original strand, 602903 - 602975
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaa 258  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  602903 tgttgtgaattc-ggactcaaaactcacaccaatacaaactat--gatgtgtggagcaagtatcaatggcaaccaa 602975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 595 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 11660574 - 11660507
Alignment:
Q  595 aaggtgtttacaa-ttgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttga 663  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||    
T  11660574 aaggtgtttacaaattgtttccgaactctagaatctaacccc--aaaatgaaccaacccttagcctttga 11660507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 423
Target Start/End: Original strand, 12221094 - 12221131
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatga 423  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12221094 acaccaagaaatgtttacccagttcggtccaacaatga 12221131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 4641127 - 4641090
Alignment:
Q  404 ccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagaga 441  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4641127 ccagttcggtccaataatgacctactctagaggagaga 4641090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 386; Significance: 0; HSPs: 75)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 317 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 40147508 - 40146991
Alignment:
Q  317 caagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtcca 416  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  40147508 caagtgcataacaaaaccacaattcaaccaaaggataaacaagataaatagagtaaagaaaagataaaaacacaaaaaaatgttcacccagttcggtcca 40147409  T
Q  417 acaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaa 514  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  40147408 act-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaa 40147310  T
Q  515 actcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttc 614  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40147309 gctcacgaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgatttccactctcccaaggtgtttacaattgtttc 40147210  T
Q  615 ccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctc 714  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40147209 ccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctc 40147110  T
Q  715 acaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagat 814  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  40147109 acaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaa-ccattttcccaagagccccctcttttggttctccaagat 40147011  T
Q  815 t-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  40147010 tcacatc-ttgaagctttgaa 40146991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 231 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 213800 - 213225
Alignment:
Q  231 gtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaa 330  Q
    |||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||  || ||||  || | |||||||||||||    
T  213800 gtgtagagcaagtatcaatagcaatcaataaccaaatgtaaa-aaaccacaagcaataacaacaatatagacctagtctattaa-ctaagtgcatagcaa 213703  T
Q  331 agccacaat-tcaaccaaaggataaacaagataa--agagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgaccta 427  Q
    | |||||||   || ||| | |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  213702 aaccacaatcaaaagcaaggaataaacaagataaagagagagtaaaggaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 213603  T
Q  428 ctctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaaga 525  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  213602 ctatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaaga 213503  T
Q  526 acaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctata 625  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  213502 acaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctaga 213403  T
Q  626 atctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatc 725  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  213402 atctaacccccaaaagag----aacccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactc 213307  T
Q  726 tccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctc 808  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  213306 tccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaaccc-ttttcccaagagccccctcttttggttctc 213225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 183 - 833
Target Start/End: Complemental strand, 5058423 - 5057779
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaa 282  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||  |  || ||||||||    
T  5058423 tgttgtgaatttcgaactcaaatttcacaccaatataaattat--gatgtgtggaacaagtatcaatggcaaccaacaaccaaaaat--gttaaccacaa 5058328  T
Q  283 gcaataaaaacaatctagata--taatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaagga-taaacaagataaagagagtaaagaaaag 379  Q
    |||| || |||||| || | |  || |||| ||   ||||||||||| ||| ||| ||| |||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5058327 gcaacaacaacaatatatagacctagtctataat--caagtgcatagtaaaaccataatccaaagcaaggaataaacaagataaagagagtaaagaaaag 5058230  T
Q  380 ataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5058229 ataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 5058131  T
Q  480 gagatacaaatgt--tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc 577  Q
    ||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5058130 gagatacaaatgggatacaagaaaatagcttcaacaagctcaca--gaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc 5058033  T
Q  578 atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatc 677  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5058032 atgattttcactcttccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgattttactaaggatc 5057933  T
Q  678 ttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccc 777  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  5057932 ttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaa-cc 5057834  T
Q  778 tttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttga 833  Q
    |||||||| | || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5057833 tttttcccaaaag-cccctcttttggttctcaaagattcacatc-ttgaagctttga 5057779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 183 - 833
Target Start/End: Complemental strand, 27015896 - 27015263
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaa 282  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||| |||  || | ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||     ||||| |||||    
T  27015896 tgttgtgaatttgggacccaaatttcacagcaaaacaaactat--gatgggtggagcaagtattaatggcaatcaacaaccaaa-----gtaaatcacaa 27015804  T
Q  283 gcaataaaaacaatctagata--taatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaaga 380  Q
    |||| || |||||| || |||  || |||| ||   |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27015803 gcaacaacaacaatatatatacctagtctataat--caagtgcatatcaaaaccacaattcaaccaaagcataaacaagataaagagagtaaagaaaaaa 27015706  T
Q  381 taacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaag 480  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27015705 taaca-caccaaaaaatgttcacccagttcggtccaact-tgacctattttggaggagagattgatctgtacaatccactatcaatgagttcttacaaag 27015608  T
Q  481 agatacaaatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg 580  Q
    |||||||||||      |  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27015607 agatacaaatg------ggtattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaccaa-acactcatg 27015515  T
Q  581 attttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttc 680  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27015514 attttcactctcccaagatgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttc 27015415  T
Q  681 tattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaacccttt 780  Q
    | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||| | |||||||||| |||||||||| ||    
T  27015414 tcttttggttttacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgattcttccccaaaaggcaccaaccc-tt 27015316  T
Q  781 ttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttga 833  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  27015315 ttcacaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatc-ttgaagctttga 27015263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 270 - 815
Target Start/End: Original strand, 27637487 - 27638034
Alignment:
Q  270 aagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagag 369  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||| ||||  || |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||||    
T  27637487 aagtaaatcacaagcaacaacaacaatatagacctagtctataaa-ccaagtgcatagcaaaaccacaatccaactaaggaataaacaagataaagagag 27637585  T
Q  370 taaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27637586 taaagaaaagataacaacaccaagaaatattcacccagttcggtccaacaatgacctactctgcaggagagattgatctctccaatccactat-aatgag 27637684  T
Q  470 ttcttacaaagagatacaaa---tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatga 566  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27637685 ttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagtttaaacaagctcataaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatga 27637784  T
Q  567 acaagacactcatg-attttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatt 665  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  27637785 acaagacactcatgaattttcactcttccaaggtgttcacaattgtttcccaactctagcatctaacccccaaaagagaacaaacttttagtctttgatt 27637884  T
Q  666 tcactaaggatct--tctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttcccca 763  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| | ||||  |||||| || ||||    
T  27637885 tcactaaggatcttctctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcataaaagactcttcactcatgtgtttcctaaccccatgaatctt-ccca 27637983  T
Q  764 aaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt 815  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27637984 aaatgcaccaaccc-ttttcccaagagctccctcttttggttctccaagatt 27638034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 386 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 28278494 - 28278045
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28278494 acaccaagaattgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagata 28278396  T
Q  486 caaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgatt 583  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28278395 caaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgatt 28278296  T
Q  584 ttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctat 683  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |    
T  28278295 ttcactctcccaatgtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccctaaaagagagccaacccttagcatttgatttcactaacaatcttctct 28278196  T
Q  684 tttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttc 783  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  28278195 tttgatttcacaagactcacccaagttgctcacaatagtctctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccc-ttttc 28278097  T
Q  784 ccgagag-ccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    || |||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  28278096 ccaagagcccccctcttttggttctccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 28278045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 402 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 38747167 - 38746754
Alignment:
Q  402 acccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaaga 499  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||    
T  38747167 acccagtttggtccaact-tgacctgatctgagggagagattgatctctccaatcctctatcaatgagtttttccaaagagatacaaatgggttacaaga 38747069  T
Q  500 aattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggt 599  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38747068 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcattaatgaacaagatactcatgattttcactctcccaaggt 38746969  T
Q  600 gtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagac 699  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38746968 gtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcaataaggatcttctcttttggtttcacaagac 38746869  T
Q  700 tcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcct 799  Q
    |||| |||||||||| |||| || |||||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||| |    
T  38746868 tcacccaagttgctcgcaaatgactctccactcacgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccc-ttttcttaagagccccctctt 38746770  T
Q  800 ttggttctcaaagatt 815  Q
    ||||||||| ||||||    
T  38746769 ttggttctccaagatt 38746754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 275 - 718
Target Start/End: Original strand, 16640818 - 16641263
Alignment:
Q  275 aaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaa--gagagtaa 372  Q
    |||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||| | || |||||| |||| |||||||| ||| |||| |||| |||||||||  ||||| ||    
T  16640818 aaccacaagcaacaacaaaaatctagatttaatctagaaatcaaa-tgcataacaaaaccacaatttaactaaagaataagcaagataaatagagagcaa 16640916  T
Q  373 agaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  16640917 agaaaagataacaacaccaagaaatgtttacccagttcggccctact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa---gttc 16641012  T
Q  473 ttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaacc-ctaatttctacccatttt--cccaatctcaccaatgaa 567  Q
    ||||||||||||||||| |  |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||    
T  16641013 ttacaaagagatacaaaagagttatcagaaatcagcttcaacaagctcacaaagaacaaacactaatttctaccatttttttctcaatctcgccaatgaa 16641112  T
Q  568 caagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgattt 666  Q
    ||||||||| | ||| |||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16641113 caagacacttaatgaatttcactcactcaaggtgtttacaaatgttccccaactctagaatctaatccccaaaagagaaccaacctttagcctttgattt 16641212  T
Q  667 cactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaa 718  Q
       |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  16641213 -tttaagtatcttctcttttggtttcacaagactcaccaaagttgttcacaa 16641263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 314 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 317014 - 316496
Alignment:
Q  314 aaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggt 413  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  317014 aaccaagtgtaaagcaaaaccacaattgaaccaaagaataaacaaaataaagagagtagggaaaagagaacaacacaaagaattgtttaccaagttcggt 316915  T
Q  414 ccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttca 510  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  316914 ccaacaatgacctactctaggggagagattgatccctccgatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggattacaagaaattagcttca 316815  T
Q  511 acaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatc-tcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 608  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |  ||  | ||||||| || | |||| |||||||| ||| || | ||  ||||    
T  316814 acaagctctccaagaacaaacctaatttcta-cctttttctcaatcttttcccctaaacaagagacccaatga-tttcactcacccgagtttttcccaat 316717  T
Q  609 tgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaag 708  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| || ||||| |||| ||||    
T  316716 tgttttccaactttaaaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttc-ct-aggattttctcttttggtctcccaagattcac-caag 316620  T
Q  709 ttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaat-tttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttct 807  Q
    |||||||| ||||| ||||   | |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||| | |||||||||    
T  316619 ttgctcac-aaagactctcttttgatgtgtttcccaaccttatgaatctctccccaaaaggcaccaaccc--tctcccaagagcccccccttttggttct 316523  T
Q  808 caaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    | |||||| ||||| |||||||||||||    
T  316522 ccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 316496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 386 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 13239930 - 13239696
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13239930 acaccaaaaattgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 13239831  T
Q  486 caaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgat 582  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13239830 caaaagagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaaaaaccctaatttctaccattttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgat 13239731  T
Q  583 tttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13239730 tttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 13239696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Original strand, 42428431 - 42428644
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  42428431 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 42428529  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  42428530 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaaaaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 42428629  T
Q  594 caaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||||||||||    
T  42428630 caaggtgtttacaat 42428644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 533936 - 533713
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  533936 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 533838  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  533837 caaaaaattagcttcaacaagctcacaaagaccaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacacgcaatgattttcactcacc 533738  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  533737 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 533713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 402 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 13488365 - 13488157
Alignment:
Q  402 acccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaaga 499  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13488365 acccagttcggtccaact-tgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaaga 13488267  T
Q  500 aattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaagg 598  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  13488266 aattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaatgaacaagacactcaataattttcactcacccaagg 13488167  T
Q  599 tgtttacaat 608  Q
    ||||||||||    
T  13488166 tgtttacaat 13488157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 25412928 - 25412706
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  25412928 tgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 25412829  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  25412828 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 25412731  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  25412730 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 25412706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 32636991 - 32636778
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  32636991 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggtta 32636893  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  32636892 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcacc 32636793  T
Q  594 caaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||||||||||    
T  32636792 caaggtgtttacaat 32636778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 386 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 16452258 - 16452035
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16452258 acaccaagaaatgtttacccagttcggtccaact-tgacctactctgggggagagatttatctctccaatccactatgaatgagttcttacaaagagata 16452160  T
Q  486 caaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgat 582  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16452159 caaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcagaaagaacaaacttaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaagacactcaatgat 16452060  T
Q  583 tttcactctcccaaggtgtttacaat 608  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||    
T  16452059 tgtcact-taccaaggtgtttacaat 16452035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 402 - 619
Target Start/End: Original strand, 28750661 - 28750879
Alignment:
Q  402 acccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaaga 499  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||    
T  28750661 acccaattcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgggttacagga 28750759  T
Q  500 aattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaagg 598  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28750760 aattaacttcaacaatttcataaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagg 28750859  T
Q  599 tgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||| ||| |||||||||||    
T  28750860 tgttttcaa-tgtttcccaac 28750879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 421 - 618
Target Start/End: Original strand, 42426259 - 42426458
Alignment:
Q  421 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactc 518  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||  ||    
T  42426259 tgacctaatcagggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaatttc 42426358  T
Q  519 acaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  42426359 acaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaataattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttccca 42426457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 435 - 619
Target Start/End: Original strand, 39468587 - 39468773
Alignment:
Q  435 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccc 532  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39468587 ggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccc 39468686  T
Q  533 taatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  39468687 taatttctacccattttcccaatctcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 39468773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 13343228 - 13343005
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  13343228 tgttcacccagttcggtccaaacatgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaaggatta 13343130  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 592  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  13343129 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 13343031  T
Q  593 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13343030 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 13343005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 404 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 538185 - 537970
Alignment:
Q  404 ccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaa 501  Q
    |||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  538185 ccagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaa 538087  T
Q  502 ttagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtg 600  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  538086 ttagcttcaacaagctcacaaagagcaaccttaatttctacccattttcccaatctcactaatgaacaagacacgcaatgattttcactcacccaaggtg 537987  T
Q  601 tttacaattgtttcccaa 618  Q
    ||||| | ||||||||||    
T  537986 tttacga-tgtttcccaa 537970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 386 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 31183149 - 31182917
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31183149 acaccaaagaatgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatatgggggagagatagatctctccaatccagtatcaatgagttcttacaaagggata 31183051  T
Q  486 caaatg-ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgatt 583  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31183050 caaatggttacaagaaattaacttaaacaaactcacaaagaacaatcctaatttctacccatttt-ccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgatt 31182952  T
Q  584 ttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  31182951 ttcactcacctaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 31182917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 33831847 - 33831634
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| ||||||||| |||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  33831847 tgttgacccagttcagtccaact-tgacctaatatgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 33831749  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  33831748 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacc 33831649  T
Q  594 caaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||||||||||    
T  33831648 caaggtgtttacaat 33831634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Original strand, 8565947 - 8566160
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||    
T  8565947 tgttgacctagttcggtccaact-tgacctaatctgggtgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacagagggatacaaatgggtta 8566045  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  8566046 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaagttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 8566145  T
Q  594 caaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||||||||||    
T  8566146 caaggtgtttacaat 8566160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 30182756 - 30182533
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  |||    
T  30182756 tgttcatccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatagaaaagggtta 30182657  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  30182656 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 30182558  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||    
T  30182557 caaggtgtttgcaa-tgtttcccaac 30182533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 386 - 619
Target Start/End: Original strand, 3075648 - 3075882
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||    
T  3075648 acaccaagaaatgttcacccaatttggtccaact-tgacctactatgagggagagattgatctctccaattcactatcaacgaattcttacaaaaagata 3075746  T
Q  486 caaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgat 582  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  3075747 caaatgggttacaagaaattagattcagcaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttctcaatctcacaaatgaacgagacactcaatgat 3075846  T
Q  583 tttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||    
T  3075847 tttcactcatcaaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 3075882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 36074043 - 36074268
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||    
T  36074043 tgttcatccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagtta 36074141  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc---attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactc 590  Q
    ||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36074142 caagaaattagctttgacaagttcgcaaagaacaaccctaatttctacccttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 36074241  T
Q  591 tcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||    
T  36074242 -accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 36074268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 37439309 - 37439078
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  37439309 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtta 37439210  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccatt--------ttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgatttt 585  Q
    |||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||        |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  37439209 caagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccttttatttttccttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgatttt 37439110  T
Q  586 cactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  37439109 cactc-accaaagtgtttacaa-tgtttcccaac 37439078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 404 - 608
Target Start/End: Original strand, 30682930 - 30683134
Alignment:
Q  404 ccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagt--tcttacaaagagatacaaatg--ttacaaga 499  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |  ||||||||    
T  30682930 ccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtattcttacaaagaaatacaaaagggttacaaga 30683028  T
Q  500 aattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaagg 598  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  30683029 aattagcttcaacaagttcacaaagaac---cctaatttctaccctttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaagg 30683124  T
Q  599 tgtttacaat 608  Q
    ||||||||||    
T  30683125 tgtttacaat 30683134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 386 - 618
Target Start/End: Original strand, 9049332 - 9049565
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    ||||||| ||||||| | ||| |||||||||||  | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9049332 acaccaaaaaatgtttatccatttcggtccaact-tcacctactttgggggagatattgatctctccaatccactgtcaatgagttcttacaaagagata 9049430  T
Q  486 caaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgat 582  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  9049431 caaaatggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaacaaacactaatttcta-tcattttcccaaactcactaatcaacaagacactcagtgat 9049529  T
Q  583 tttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 618  Q
    ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9049530 ttttactcacccaaagtgtttacaaatgtttcccaa 9049565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 386 - 626
Target Start/End: Original strand, 13695680 - 13695923
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagat 484  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||   ||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13695680 acaccaagaaatgtttacctagtttggtccaagt-tgacctactatggaggagagaataatctctctaatccactattaatgagttctttacaaagagat 13695778  T
Q  485 acaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atg 580  Q
    |||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| |||| |||| |||    
T  13695779 acaaaagggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttgtaccc-ttttcccaatctctccaaagaaaaagatactcaatg 13695877  T
Q  581 attttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataa 626  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||    
T  13695878 attttcactcacacaaggtgtttacaaatgttttccagctcaataa 13695923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 16409643 - 16409475
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa--tgtt 493  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||    
T  16409643 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 16409544  T
Q  494 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    |||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16409543 acaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc-tttttccaatctcaccaa 16409475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 19806530 - 19806328
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgttaca 496  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||                 ||| |    
T  19806530 tgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaggagttctt-----------------ttaga 19806449  T
Q  497 agaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccca 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  19806448 agaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaacc-taatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatga-tttcactcaccca 19806351  T
Q  596 aggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  19806350 aggtgtttacaa-tgtttcccaac 19806328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 26178050 - 26177883
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa--tgtt 493  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||    
T  26178050 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 26177951  T
Q  494 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    |||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  26177950 acaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc--ttttccaatctcaccaa 26177883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 425 - 608
Target Start/End: Original strand, 42309963 - 42310149
Alignment:
Q  425 ctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaa 522  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42309963 ctactatgggggagagattgatctcgctaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaa 42310062  T
Q  523 agaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 608  Q
    ||| ||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||  ||||||||||    
T  42310063 agatcaaacttgatttctacccaatttctcaatctcaccaatgagcaagacactcaatgattttcacttacccaaaatgtttacaat 42310149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Original strand, 9789224 - 9789392
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa--tgtt 493  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||    
T  9789224 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 9789323  T
Q  494 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    |||||||||||| ||  ||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  9789324 acaagaaattagatttgacaagttcacaaggaacaaccttaatttctaccc-tttttccaatctcaccaa 9789392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Original strand, 18441648 - 18441816
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa--tgtt 493  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||    
T  18441648 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 18441747  T
Q  494 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    |||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18441748 acaagaaattagatttgacaagttcacaaggaacaaccctaatttctaccc-tttttccaatctcaccaa 18441816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 391 - 807
Target Start/End: Original strand, 33906024 - 33906439
Alignment:
Q  391 aagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaa 489  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33906024 aagaattgtttacccagctcggtccaacattgacctactctagggaagagattgatctttccaatctactatcaatgagttctttacaaagagatacaaa 33906123  T
Q  490 tg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaatgaacaagacactc-atgatttt 585  Q
     |  ||||||||| |||||||| |||| ||| | ||| || | |||||||| |||||| |||| |||| ||  || |||    |||||||| ||||| ||    
T  33906124 aggattacaagaagttagcttcgacaagctctccaagcactaacctaatttataccca-tttcacaatttcttcccatg----agacactcaatgatgtt 33906218  T
Q  586 cactctcccaaggtgttt-acaattgtttcccaactctataatcta-acccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctat 683  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||||||| |||||||| ||| ||  |||||||||||   |||  | ||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  33906219 cactctcgcaaggtgtttctcatttgtttcacaactctagaatatatccccccaaaagaacgccagtcattagcctttgatttc-ctaaggatcttctct 33906317  T
Q  684 tttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaat-tttccccaaaatgcaccaacccttttt 782  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||  |||||  | ||||||||  |||||  |||||| | ||||||||| ||||||||||  | |    
T  33906318 tttggtttcccaagactcacccaagttgctcac-taagtctctcctttgatgtgtttctcaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaaccc--tct 33906414  T
Q  783 cccgagagccccctcctttggttct 807  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||    
T  33906415 cccaagagcccccttttttggttct 33906439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 314 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 4160850 - 4160702
Alignment:
Q  314 aaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggt 413  Q
    ||||||||| | |||||| ||| |||  |||||||| ||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  4160850 aaccaagtgtaaagcaaaaccataatcgaaccaaagaataaacaagataatgagaacatagaaaagataacaacactaataaatatttacccagtttggt 4160751  T
Q  414 ccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4160750 ccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 4160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 468 - 619
Target Start/End: Original strand, 5887487 - 5887640
Alignment:
Q  468 agttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatg 565  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  5887487 agttcttacaaagtgatacaaatgggttgcaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttctatccattttctcaatctcacaaatg 5887586  T
Q  566 aacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5887587 aacaagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 5887640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 29722692 - 29722524
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  29722692 tgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 29722593  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||| ||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29722592 caagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 29722524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Original strand, 29751160 - 29751328
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  29751160 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 29751259  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||| ||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29751260 caagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 29751328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 504 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 4160690 - 4160465
Alignment:
Q  504 agcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacca-atgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtt 602  Q
    |||||||||||  || | |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||  |  |||| ||| ||| ||||   ||||||||  |||| |||||    
T  4160690 agcttcaacaagttctccaagaacaaacctaatttctacc-attttccaaatctcctctcatgagcaaaacattcattgatttcactcaaccaatgtgtt 4160592  T
Q  603 tacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactca 702  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  4160591 tacaattgtttctcaactctg-aatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttaattac-ctaaggatcttctcttttggtttcccaagattca 4160494  T
Q  703 ctcaagttgctcacaaaagaatctccact 731  Q
    | | ||||||||||||| || ||||||||    
T  4160493 ccctagttgctcacaaatgactctccact 4160465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 294 - 548
Target Start/End: Original strand, 10054713 - 10054969
Alignment:
Q  294 aatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaag 393  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||| | ||||||   |||||  || ||||  |||||||||||||| |||||| ||||||   |||||||||||     
T  10054713 aatctagatctaatctagcaa-ccaagtgtaaagcaaaattacaatcgaagcaaaaaataaacaagataaaaagagtacagaaaatggaacaacaccaaa 10054811  T
Q  394 aaat-gttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatac-aaat 490  Q
     | | ||| ||| |||| ||||||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  10054812 gagtcgtttacctagtttggtccaacaattacccactttgggggagatattgatatctccaatacactatcaatgagttcattacaaagagatacaaaag 10054911  T
Q  491 gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattt 548  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||||    
T  10054912 gttataagaaattagcttcaacaaactcttcaagaacaaacataatttctacccattt 10054969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Original strand, 22536290 - 22536457
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  22536290 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactccccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 22536389  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22536390 caagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 22536457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 26170930 - 26170774
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgttaca 496  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       ||||||    
T  26170930 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-aga-------gttaca 26170839  T
Q  497 agaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  26170838 agaaattagatttgacaagttcacaaagaacaatcctaatttctaccc--ttttccaatctcaccaa 26170774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 29720532 - 29720364
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  29720532 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 29720433  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||| ||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29720432 caagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 29720364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 183 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 40751351 - 40751195
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaa 282  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||  ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  40751351 tgttgtgaattccggacttaaatctcacaccaatacaaactat--gatttgtggagtaagtatcaatgacaaccaataaccaaat----gtaaaccacaa 40751258  T
Q  283 gcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaacca 346  Q
    ||||||| |||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  40751257 gcaataacaacaatatagacctaatcta-taaaccaagtgcatagcaaaaccacaatttaacca 40751195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 10593426 - 10593258
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatac-aaatgtt 493  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  10593426 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggtt 10593327  T
Q  494 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||| | |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  10593326 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttctcccaatctcaccaa 10593258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 328 - 680
Target Start/End: Original strand, 10700580 - 10700933
Alignment:
Q  328 caaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaa-gaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacct 426  Q
    |||| |||||||  || ||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || ||| | || || |||||||||  |||||||||||    
T  10700580 caaaaccacaatcaaatcaaagaataagcaagataaagagcgtagagaaaagagaacaacacgaaagaattatttactcagttcggtgaaacaatgacct 10700679  T
Q  427 actctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaa 523  Q
    ||| ||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| ||| | ||    
T  10700680 actatgggggagaga--gatctctccacttcactatcaatgagttctttttaaagagatacaaaaatgttataagaa-ttagcttcaacaagctctctaa 10700776  T
Q  524 gaacaaccctaatttctacccattttcccaatct-caccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaact 620  Q
    |||||| ||||||||||| || |||| |||||||      |||||||| | |||| ||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||  |    
T  10700777 gaacaaacctaatttcta-ccttttttccaatctattttcatgaacaaaatactcaatgattttcacgcacccaaggtgtttcctaattgtttcccattt 10700875  T
Q  621 ctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttc 680  Q
     || |||||| ||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  10700876 ttagaatctagcccccaaaag-tcaccaaaccttagccttttatttc-ctgaggatcttc 10700933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 350 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 35616381 - 35615902
Alignment:
Q  350 gataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctc 449  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| | || |||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||  ||||      
T  35616381 gataaacaagacaaggagagtagagaaaatagaaaaacaccaaaaaatgtcc--ccagctcggtccaacaatgacctactctaggtgagaga--gatcat 35616286  T
Q  450 tccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccat 546  Q
    |    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |  ||||||||||||| ||| ||| | ||| | |||||||| |||||||||||| |||    
T  35616285 tatgtttcactatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaagggttacaagaaattaacttaaacgagctctccaagaacaaacctaatttctactcat 35616186  T
Q  547 tttcccaatctca-ccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagag 643  Q
    || | |||||||  ||  ||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||    
T  35616185 tt-ctcaatctcttcccgtgaacaagagactcaatgattt-cactcacccaaggtgtttcctaattgtttccaaactctagaatctaa-ccacaaaagag 35616089  T
Q  644 aaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttcc 743  Q
    || |||| | ||||||||||||||  | | |||||||  |||||||||| ||||||||||  |||||| | || ||||| ||| |  | ||||||||  |    
T  35616088 aatcaactc-tagcctttgatttc-ttgatgatcttcgcttttggtttcccaagactcaccaaagttgattac-aaagactcttcttttatgtgtttctc 35615992  T
Q  744 aaccttatgaat-tttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    |||   |||||| | ||||||||| ||| || |||  |||||| |||| |||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  35615991 aactccatgaatctctccccaaaaggcatcacccc--tttcccaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 35615902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 25078289 - 25078120
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 492  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  25078289 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 25078190  T
Q  493 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25078189 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 25078120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 25136258 - 25136089
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 492  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  25136258 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 25136159  T
Q  493 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25136158 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 25136089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 183 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 40763356 - 40763200
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaa 282  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||    
T  40763356 tgttgtgaattccggacttaaatctcacaccaatataaactat--gatctgtggagcaagtatcaatgacaaccaataatcaaat----gtaaaccataa 40763263  T
Q  283 gcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaacca 346  Q
    ||||||| |||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  40763262 gcaataacaacaatatagacctaatcta-taaaccaagtgcatagcaaaaccataatttaacca 40763200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 335 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 30793362 - 30793212
Alignment:
Q  335 acaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctgga 434  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    ||  ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| |     
T  30793362 acaattaaaccaaagaataaacaagataaagagagtagagaaac---aaacacaccaagaaatgtttaccttgttcggtccaacaatgacttactctagg 30793266  T
Q  435 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaa 489  Q
    |||||||  |||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30793265 ggagaga--gatctctccacttcactatcaattagttctttacaaagagatacaaa 30793212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 40380259 - 40380090
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 492  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  40380259 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 40380160  T
Q  493 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40380159 tacaagaaattag-tttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 40380090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 40382470 - 40382301
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 492  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  40382470 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 40382371  T
Q  493 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  40382370 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaacttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 40382301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 386 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 42927069 - 42926965
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||   |||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42927069 acaccaagaaatgtttacccagttcggtccaact-tgacctactatgagagagagatttatttcttcaatccactgtcaatgagttcttacaaagagata 42926971  T
Q  486 caaatg 491  Q
    ||||||    
T  42926970 caaatg 42926965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 386 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 3326093 - 3325933
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagat 484  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||   |||||||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  3326093 acaccaaaaaatatttacccagttcggcgaaacaatgacctactatgtgagagatattgatctctctaatccaccatcattgagttctttacaaagagat 3325994  T
Q  485 aca-aat-gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacc 543  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||  ||||||||||||    
T  3325993 acacaatggttacaagaaattagcttcaacaagctcttcaagaacaaaactaatttctacc 3325933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 343 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 30803046 - 30802843
Alignment:
Q  343 accaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagat 442  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||   |||| ||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||  |||||||     
T  30803046 accaaagaataaacaagataaagagagta--gaaaaacaaaca-cacaaaaaaatgttaaccctgttcggtccaacaatgacctattgtgcgggagaga- 30802951  T
Q  443 tgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttc 539  Q
     ||||||||   | || |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  30802950 -gatctctctgcttcattatcaacgagttctttacaaatagatacaaaaggattacaataaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaa-ttc 30802853  T
Q  540 tacccatttt 549  Q
    ||||||||||    
T  30802852 tacccatttt 30802843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 447 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 22097981 - 22097877
Alignment:
Q  447 ctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccca 545  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||     
T  22097981 ctctctaatccactatcaatgagttttttacaaatagatacaagggttataagaaattaacttcaacaaattctccaagaacaaccctaatttctaccct 22097882  T
Q  546 ttttc 550  Q
    |||||    
T  22097881 ttttc 22097877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 400 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 16546796 - 16546684
Alignment:
Q  400 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgttac 495  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | |||||    
T  16546796 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttac 16546697  T
Q  496 aagaaattagctt 508  Q
    |||||||||||||    
T  16546696 aagaaattagctt 16546684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 548 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 42926908 - 42926838
Alignment:
Q  548 ttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 618  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  42926908 ttcccaatctcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 42926838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 605 - 719
Target Start/End: Original strand, 14689622 - 14689734
Alignment:
Q  605 caattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcact 704  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| || ||||||| |      
T  14689622 caattgtttcacaactctagaatctatcccc-aaaagagaaccaacccctagcctttgattt-tctaaggatcttttcttttggtgtcccaagacttatc 14689719  T
Q  705 caagttgctcacaaa 719  Q
     ||||||||||||||    
T  14689720 taagttgctcacaaa 14689734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 400 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 16544574 - 16544407
Alignment:
Q  400 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgttac 495  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||||     
T  16544574 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttat 16544475  T
Q  496 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
     |||||||||||| |  |   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16544474 gagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 16544407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 615 - 754
Target Start/End: Original strand, 21205873 - 21206011
Alignment:
Q  615 ccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctc 714  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||  || | |||| ||| || ||     
T  21205873 ccaactccataatctaaccctcaaaagagaaccaatccttagtctttgatttca-taaggttcttcacttttagtttcctaaaattcacccaaatttctg 21205971  T
Q  715 acaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaa 754  Q
    ||||| || ||  ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21205972 acaaatgactcctcactcatgtgtttcccaaccctatgaa 21206011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 28278652 - 28278592
Alignment:
Q  196 ggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28278652 ggactcaaatttcacaccaatacaaa--atatgatgtgtggagcaagtatcaatggcaaccaa 28278592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 464 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 42926968 - 42926911
Alignment:
Q  464 aatgagttcttacaaagagatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactca 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42926968 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaatctca 42926911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 38747353 - 38747281
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaa 258  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  38747353 tgttgtgaattt-ggactcaaatttcacaccaatacaaactat--gatgtgtggagcaagtatcaatggcaaccaa 38747281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 724 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 30802780 - 30802672
Alignment:
Q  724 tctccactcatgtgttttccaaccttatgaat-tttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagattacatctt 822  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||| | ||||||||| |||| |||||  |||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||      
T  30802780 tctccactcatgtgttttctaaccccatgaatctctccccaaaaggcacaaaccc--tttcccaagagcctcctcttttggttctctaagataacatc-a 30802684  T
Q  823 tgaagctttgaa 834  Q
    ||||||||||||    
T  30802683 tgaagctttgaa 30802672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 435 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 8445846 - 8445756
Alignment:
Q  435 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaa 522  Q
    ||||||||| |||| || |||| ||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8445846 ggagagattcatctttctaatctactatcaattagttctttataaagaaatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaaacttacaa 8445756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 40147613 - 40147531
Alignment:
Q  180 ttgtgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaa 265  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||    
T  40147613 ttgtgttgtgaattc-ggactcaaaactcacaccaatacaaactat--gatgtgtggagcaagtattaatggaaaccaacaaccaa 40147531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 592 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 8019557 - 8019471
Alignment:
Q  592 cccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttc 680  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||| || |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8019557 cccaaggtgtttcctaattatttcccaactatagaatctaacccccaaaa-ataaccaa-ccttagcctttgattt-tctaaggatcttc 8019471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13488571 - 13488517
Alignment:
Q  181 tgtgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggag 238  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  13488571 tgtgttgtgaattc-ggactcaaatctcacaccaatacaaa--atatgatgtgtggag 13488517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 460 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 32609641 - 32609572
Alignment:
Q  460 tatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaa 526  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  32609641 tatcaataagttctttacaaagaaatacaaaagagttacaagaaattaacttcaacaaactctcaaagaa 32609572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 383; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 183 - 834
Target Start/End: Original strand, 17793 - 18439
Alignment:
Q  183 tgttgtgaattccggactcaaatttcacaccaatacaaattatatgaggtgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaa 282  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  17793 tgttatgaattctggactcaaatttcacaccaatacaaactat--gatgtgtgtagcaagtatcaatagcaaccaataatcaaatgtaaataa-ccacaa 17889  T
Q  283 gcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaagga-taaacaagataaagagagtaaagaaaagat 381  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17890 gcaataacaacaatctagatctaatctagaaaacaaa-tgcatagcaaaaccacaatctaaccaaaggaataaacaagataaagagagtaaagaaaagat 17988  T
Q  382 aacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaga 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17989 aacaacaccaagaaatgttcacccagttcgatccaaacttgacctaccctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-ttacaaaga 18087  T
Q  482 gatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcat 579  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  18088 gatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctaccaattttcccactctcaccaatgaacaaaacactcat 18187  T
Q  580 gattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatctt 679  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18188 gattttcactctcccaaagtgtttacaattgttt-ccaactctataatctaa-ccccaaaagagaaccaactcttagtctttgatttcactaaggatctt 18285  T
Q  680 ctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaat-tttccccaaaatgcaccaaccct 778  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||| ||||||||||     
T  18286 ctcttttggttttacaagactcactcaagttgctcacaaataactctccactcatgtgtttt-caacctcatgaatcttcccccaaaaggcaccaaccc- 18383  T
Q  779 ttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    ||||| | ||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  18384 ttttcacaagagccccctctttttgttctccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 18439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 397 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 11725 - 11288
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--tta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  11725 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 11626  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  11625 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 11526  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttca 693  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11525 -aaggtgtttacaat-gtttcccaactctagaatctaaccccaaaaagagaaacaacctttagcctttgattttactaatgatcttctcttttggtttca 11428  T
Q  694 caagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccc 793  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||| |||||||||| ||| ||| |||||||    
T  11427 caagactcacccaagttgctcagaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaaccc-tttccccaagagccc 11329  T
Q  794 cctcctttggttctcaaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    | || |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  11328 catcttttggttctccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 11288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 452 - 815
Target Start/End: Original strand, 80338 - 80702
Alignment:
Q  452 caatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 549  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80338 caattcactatctatgagttcttacaaaaagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 80437  T
Q  550 cccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  80438 cccaatctcagcaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgttcacaattgtttcctaactctagaatctaacccccaaaatagaaccaa 80537  T
Q  650 cccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaacctt 749  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||      
T  80538 cccttagcctttgatttcactaaggatctactcttttagtttcccaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccgctcatgtgtttcccaacccc 80637  T
Q  750 atgaattttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttctcaaagatt 815  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  80638 atgaatcttccccaaaaggcaccaaccc-ttttcataagagccccctcttttggttctccaagatt 80702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 148; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 232 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 10820 - 10475
Alignment:
Q  232 tgtggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaataaaaacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaa 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||    
T  10820 tgtggagaaagtatcaatgacaaccgataaccaaaagaaaataa-ccacaagcaacaacaacaatctagatttaatctagaaatc-aagtgtatagtaaa 10723  T
Q  332 gccacaattcaaccaaaggataaacaagataaa-gagagtaaagaaaagataacaacaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactc 430  Q
     | |||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10722 actacaatctaatcaaagaataaacaagataaaagagagtagaggaaagataacaacaccaagaaatgtttacccagttcggtccaact-tgacctactc 10624  T
Q  431 tggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac- 527  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||  |||  | ||||||||||||     
T  10623 tggaggagagattgatctcttcaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaaatggttacaataaattagc-acaa-gagctcacaaagaaca 10526  T
Q  528 aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca 578  Q
    ||||||||||| || |  |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  10525 aaccctaatttatatctttttttccaatctcacaaatgaacaagacactca 10475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 135; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 114770 - 114547
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||| ||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  114770 tgttcatccagttcggtctaaacttaacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagcgtta 114671  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  114670 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccttaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 114572  T
Q  594 caaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  114571 caaggtgtttacaa-tgtttcccaac 114547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 132; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 397 - 608
Target Start/End: Original strand, 149098 - 149311
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat--gtta 494  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  149098 tgttgacccagttcggtccaact-taacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaa 149196  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 593  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  149197 caagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactaccc 149296  T
Q  594 caaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||||||||||    
T  149297 caaggtgtttacaat 149311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 131; Significance: 2e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 397 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 434701 - 434504
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  434701 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 434602  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt-cccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactc 590  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  434601 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttccccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 434504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 295 - 542
Target Start/End: Original strand, 490219 - 490468
Alignment:
Q  295 atctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaacaccaaga 394  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||| ||||||   |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||      
T  490219 atctagatctaatctagcaa-ccaagtgtatagcaaaaccacaaacaaaccaaa--ataatcaagataaagagagtaaagaaaa-agaacaacatcaaat 490314  T
Q  395 aat-gttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagat--tgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaat 490  Q
    ||| ||| ||||||||| || ||||| | ||||||| ||| |||||||   ||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||     
T  490315 aattgtttacccagttcagttcaacactaacctactatgggggagagagaatgatctctccgcttcactatcaatgagtactttacaaagatatacaaaa 490414  T
Q  491 g--ttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctac 542  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| | ||||||||||    
T  490415 gagttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaacttaatttctac 490468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 609 - 834
Target Start/End: Original strand, 490661 - 490882
Alignment:
Q  609 tgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaag 708  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||||||||| |||| ||| | || ||||||| ||  ||||||| | ||||    
T  490661 tgtttcccaactctagattctaacccctaaaag-gaaccaatccgtagcttttgatttc-ctaatgatatactcttttggtctcgtaagactcgcccaag 490758  T
Q  709 ttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaaccttatgaat-tttccccaaaatgcaccaaccctttttcccgagagccccctcctttggttct 807  Q
    ||||||| |||| | |||||  | |||||||| |||| |  |||||| | || || ||| ||||||||||  | |||  ||||||||||  |||||||||    
T  490759 ttgctcataaaa-actctcctttgatgtgtttcccaatcccatgaatctctcacctaaaggcaccaaccc--tctccaaagagcccccttttttggttct 490855  T
Q  808 caaagatt-acatctttgaagctttgaa 834  Q
    | |||||| ||||| |||||||||||||    
T  490856 ccaagattcacatc-ttgaagctttgaa 490882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 127; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 386 - 608
Target Start/End: Original strand, 20405 - 20629
Alignment:
Q  386 acaccaagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagata 485  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  20405 acaccaaaaattgttgacccagttcggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccaatatcaaagagttcttacaaagagata 20503  T
Q  486 caaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgat 582  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||    
T  20504 caaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaaaaacaaacctaatttctgctcattttcccaatctcaccaatgaataataaactcaatgat 20603  T
Q  583 tttcactctcccaaggtgtttacaat 608  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  20604 tttcactcacccaaggtgtttacaat 20629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 120; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 1083 - 861
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgtta 494  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||||    
T  1083 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttgtt-caaagagatacaaaagggtta 985  T
Q  495 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 592  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||      
T  984 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgattttcactc-a 887  T
Q  593 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  886 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 113; Significance: 9e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 11161 - 11385
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa--tgtt 493  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||    
T  11161 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggtt 11260  T
Q  494 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactct 591  Q
    |||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||     
T  11261 acaagaaattagattttacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgatttacactc- 11358  T
Q  592 cccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||    
T  11359 accaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 11385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 397 - 619
Target Start/End: Original strand, 8735 - 8959
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaa--tgtt 493  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||    
T  8735 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggtt 8834  T
Q  494 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactct 591  Q
    |||||||||||| ||  | ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||     
T  8835 acaagaaattagattttataagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatggtttacactc- 8932  T
Q  592 cccaaggtgtttacaattgtttcccaac 619  Q
     ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8933 accaaggtctttacaa-tgtttcccaac 8959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 394 - 621
Target Start/End: Original strand, 27439 - 27670
Alignment:
Q  394 aaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaat-- 490  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||      
T  27439 aaatgtttacctaattcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaataagttatttacaaagagatacaaatga 27538  T
Q  491 gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctc-accaatgaacaagacactcatgattttcac 588  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||  | |||||||||| | ||||| |||||||  ||   |||||||| |||||    ||||||    
T  27539 gttacaagaaattagcttcaacaagctcttcaagaacaatacataatttctactc-ttttcacaatctcttccctagaacaagagactcaaagatttcac 27637  T
Q  589 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactc 621  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27638 tcatccaaggtgtttacaaatgtttcccaactc 27670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 69; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 291 - 718
Target Start/End: Original strand, 1291 - 1729
Alignment:
Q  291 aacaatctagatataatctagaaaaccaagtgcatagcaaagccacaattcaaccaaaggataaacaagataaagagagtaaagaaaagataacaaca-c 389  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||| |||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||| |    
T  1291 aacaatctagatctaatctagaaa-ccaagtgtaaagtaaaaccacaatcaaaccaaaaaataaataagataaagagagtaaagagaagagaaaaacatc 1389  T
Q  390 caagaaatgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaa 488  Q
     ||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||  |  ||||| ||||||||| |||   ||||| ||||    
T  1390 aaagaattgtttacccaatttggtccaacaatgacctactcttg-ggagaga--gatctctcctcttgactattaatgagttctttatgcagagaaacaa 1486  T
Q  489 a--tgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaatgaacaagacactc-atgattt 584  Q
    |   ||| ||| |||| | ||||| ||| |||||  ||||||| |||||||| || ||| |||| |||||||  || |||||||||  |||| || ||||    
T  1487 aagggttgcaaaaaatcaacttcaccaagctcacccagaacaaacctaattttta-ccaatttcacaatctcttcccatgaacaagtaactcaattattt 1585  T
Q  585 tc-actctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccctt----------agcctttgatttcactaa 672  Q
     | | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||          ||| ||||||||| ||||    
T  1586 acaagtctcccaaggtgttttctaattgtttcccaactctagaatctaa-ccccaaaagagaaccaacacttataagttataagcttttgatttc-ctaa 1683  T
Q  673 ggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaa 718  Q
    ||||||||| ||||| | || |||||||| | ||||||||||||||    
T  1684 ggatcttctcttttgatctcccaagactcgcccaagttgctcacaa 1729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 64; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 397 - 563
Target Start/End: Original strand, 2604 - 2773
Alignment:
Q  397 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaa-atgt 492  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  2604 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggt 2703  T
Q  493 tacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2704 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 2773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 400 - 563
Target Start/End: Original strand, 3729 - 3895
Alignment:
Q  400 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaagaga-tacaa-atgttac 495  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| | |||||    
T  3729 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttac 3828  T
Q  496 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    |||||||||||||  |||   |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3829 aagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 3895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 55; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 444 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 25175 - 25000
Alignment:
Q  444 gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaat--gttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttct 540  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||    
T  25175 gatctctctacttcactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaaggttacaagaaattaccttcaacaaactctcaaagaacaaaactagtttct 25076  T
Q  541 acccattttccc-aatctcacca-atgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcc 615  Q
    | |||||||||| |||||   ||  ||| ||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25075 a-ccattttcccgaatcttgtcatgtgatcaacagactcaatga-tttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcc 25000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 400 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 6438 - 6272
Alignment:
Q  400 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctt-acaaa-gagatacaaatg-ttac 495  Q
    ||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  | ||||    
T  6438 tcacccagttcggtccaaacttaacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagggcttac 6339  T
Q  496 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 563  Q
    |||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6338 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 6272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0927 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0927
Description:

Target: scaffold0927; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 286
Target Start/End: Original strand, 3431 - 3482
Alignment:
Q  234 tggagcaagtatcaatgacaaccaataaccaaatgtaagtaaaccacaagcaa 286  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  3431 tggagcaagtatcaatggcaaccaataactaaatgtaaat-aaccacaagcaa 3482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 441
Target Start/End: Original strand, 6988 - 7025
Alignment:
Q  404 ccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagaga 441  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  6988 ccagttcggtccaataatgacctactctagaggagaga 7025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University