View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5090-Insertion-6 (Length: 988)

Name: NF5090-Insertion-6
Description: NF5090
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5090-Insertion-6
NF5090-Insertion-6
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (234-728)||(11182151-11182649)
chr5 (17-189)||(11182855-11183027)
chr5 (759-988)||(11181785-11182018)
chr5 (759-951)||(24553499-24553692)
chr5 (759-952)||(19588657-19588853)
chr5 (759-988)||(3880211-3880443)
chr5 (771-952)||(28832182-28832365)
chr5 (759-952)||(42127401-42127596)
chr5 (759-924)||(31300615-31300782)
chr5 (759-923)||(17003980-17004145)
chr5 (759-988)||(12084129-12084362)
chr5 (759-931)||(14520140-14520315)
chr5 (759-936)||(11916979-11917158)
chr5 (781-951)||(6741784-6741958)
chr5 (770-954)||(33030928-33031117)
chr5 (777-931)||(36932362-36932518)
chr5 (777-931)||(9353344-9353500)
chr5 (777-931)||(15464460-15464617)
chr5 (820-988)||(10281722-10281895)
chr5 (784-885)||(28278450-28278553)
chr5 (778-931)||(7160915-7161068)
chr5 (770-931)||(2630153-2630316)
chr5 (784-852)||(38747173-38747241)
chr5 (190-226)||(11182695-11182731)
chr5 (860-913)||(15552461-15552515)
chr5 (860-913)||(31179380-31179434)
chr5 (860-913)||(31542950-31543004)
chr5 (860-913)||(31545296-31545350)
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (759-988)||(29159714-29159947)
chr7 (759-930)||(20284000-20284173)
chr7 (759-988)||(46516263-46516496)
chr7 (759-974)||(33332418-33332636)
chr7 (759-988)||(2647649-2647882)
chr7 (759-952)||(4796657-4796853)
chr7 (759-930)||(9190021-9190194)
chr7 (759-988)||(23402967-23403199)
chr7 (759-988)||(55859-56091)
chr7 (777-931)||(5817282-5817438)
chr7 (759-930)||(2580298-2580474)
chr7 (759-930)||(9185178-9185349)
chr7 (759-988)||(49091573-49091805)
chr7 (759-852)||(9235648-9235741)
chr7 (759-988)||(35960727-35960960)
chr7 (763-931)||(21983198-21983369)
chr7 (763-931)||(21988822-21988991)
chr7 (784-954)||(28617213-28617386)
chr7 (778-988)||(3047186-3047398)
chr7 (777-931)||(2479266-2479421)
chr7 (777-924)||(47263607-47263754)
chr7 (793-885)||(22270107-22270201)
chr7 (777-931)||(44848696-44848852)
chr7 (777-931)||(18413570-18413724)
chr7 (819-881)||(30814574-30814637)
chr7 (860-913)||(31155920-31155974)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (759-988)||(10077118-10077351)
chr6 (759-952)||(22963611-22963806)
chr6 (759-952)||(23824587-23824782)
chr6 (759-931)||(4629864-4630039)
chr6 (759-988)||(31979424-31979657)
chr6 (759-930)||(5017482-5017654)
chr6 (759-988)||(18232756-18232989)
chr6 (759-930)||(31936498-31936671)
chr6 (770-988)||(24435924-24436143)
chr6 (804-952)||(5572231-5572382)
chr6 (763-988)||(21801297-21801531)
chr6 (777-931)||(5757490-5757646)
chr6 (815-952)||(31086463-31086603)
chr6 (777-924)||(21355965-21356114)
chr6 (770-953)||(31076930-31077116)
chr6 (861-936)||(14521688-14521764)
chr6 (800-930)||(27165635-27165767)
chr6 (759-930)||(22708930-22709102)
chr6 (759-804)||(5572737-5572782)
chr6 (860-913)||(12195524-12195578)
chr6 (860-913)||(26065233-26065286)
chr6 (860-913)||(26085202-26085255)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (759-988)||(40844563-40844795)
chr3 (757-988)||(18552826-18553061)
chr3 (759-988)||(3328300-3328532)
chr3 (759-952)||(40592762-40592959)
chr3 (759-936)||(25929440-25929618)
chr3 (759-988)||(3715945-3716178)
chr3 (771-930)||(37466214-37466375)
chr3 (759-952)||(26298899-26299095)
chr3 (759-988)||(8370430-8370663)
chr3 (759-988)||(24695107-24695339)
chr3 (759-949)||(48438125-48438318)
chr3 (770-930)||(1417493-1417655)
chr3 (790-988)||(1736248-1736450)
chr3 (759-931)||(6794715-6794889)
chr3 (779-954)||(21711154-21711331)
chr3 (759-952)||(30709770-30709967)
chr3 (770-988)||(25795702-25795925)
chr3 (772-931)||(16264273-16264435)
chr3 (779-954)||(4386905-4387084)
chr3 (759-931)||(35925393-35925565)
chr3 (815-988)||(36029060-36029237)
chr3 (777-931)||(27974954-27975110)
chr3 (777-930)||(27986449-27986604)
chr3 (777-930)||(33386669-33386825)
chr3 (777-930)||(39039995-39040151)
chr3 (777-931)||(32143250-32143406)
chr3 (835-954)||(47923884-47924006)
chr3 (784-885)||(34491346-34491449)
chr3 (759-829)||(8126612-8126682)
chr3 (759-829)||(27026856-27026925)
chr3 (804-931)||(27452914-27453043)
chr3 (868-988)||(3323634-3323756)
chr3 (778-931)||(26928603-26928757)
chr3 (888-949)||(21353604-21353666)
chr3 (759-829)||(27038201-27038270)
chr3 (901-936)||(25929370-25929405)
chr3 (759-813)||(1417176-1417230)
chr3 (860-913)||(746953-747007)
chr3 (860-913)||(6063453-6063507)
chr3 (900-988)||(8126684-8126774)
chr3 (860-913)||(50494195-50494249)
chr3 (759-800)||(47924007-47924048)
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (759-988)||(47098778-47099010)
chr1 (759-952)||(13598309-13598505)
chr1 (759-952)||(27104362-27104558)
chr1 (763-988)||(19072842-19073072)
chr1 (763-988)||(19120732-19120962)
chr1 (759-931)||(775583-775757)
chr1 (759-988)||(16124469-16124703)
chr1 (759-930)||(47102854-47103027)
chr1 (759-931)||(29651722-29651896)
chr1 (759-988)||(47703889-47704122)
chr1 (759-930)||(32889349-32889523)
chr1 (759-952)||(9476173-9476368)
chr1 (777-931)||(26644909-26645066)
chr1 (777-949)||(17345512-17345687)
chr1 (836-951)||(22819416-22819535)
chr1 (778-931)||(3281637-3281793)
chr1 (777-880)||(50521165-50521271)
chr1 (779-931)||(37069700-37069855)
chr1 (759-833)||(40816844-40816918)
chr1 (760-933)||(9023849-9024017)
chr1 (779-931)||(21536581-21536736)
chr1 (781-931)||(13604635-13604788)
chr1 (860-913)||(47179929-47179982)
chr1 (860-913)||(47177578-47177631)
chr1 (860-913)||(9459428-9459482)
chr1 (860-913)||(9463255-9463309)
chr1 (860-913)||(16226383-16226437)
chr1 (860-913)||(16231779-16231833)
chr1 (857-913)||(2617732-2617789)
chr1 (860-889)||(13137985-13138014)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (759-952)||(5594-5790)
scaffold0006 (759-931)||(2403-2577)
scaffold0006 (781-931)||(133292-133445)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (772-988)||(10047303-10047523)
chr4 (759-936)||(39245905-39246084)
chr4 (770-988)||(6743369-6743590)
chr4 (759-930)||(25862035-25862208)
chr4 (759-931)||(54867095-54867268)
chr4 (759-936)||(24333723-24333899)
chr4 (760-933)||(34495833-34496007)
chr4 (772-930)||(5269204-5269364)
chr4 (758-952)||(38152429-38152625)
chr4 (772-988)||(42599526-42599747)
chr4 (759-931)||(5143170-5143344)
chr4 (793-952)||(36315220-36315381)
chr4 (793-952)||(36329429-36329590)
chr4 (761-931)||(5147590-5147762)
chr4 (759-931)||(3777461-3777634)
chr4 (763-988)||(3796472-3796702)
chr4 (759-952)||(16630670-16630866)
chr4 (777-924)||(5396690-5396840)
chr4 (836-954)||(39774293-39774414)
chr4 (777-931)||(31985646-31985801)
chr4 (836-933)||(18377348-18377446)
chr4 (836-954)||(5112226-5112346)
chr4 (815-950)||(16623285-16623424)
chr4 (770-951)||(1983291-1983473)
chr4 (782-930)||(8689498-8689647)
chr4 (777-930)||(28468542-28468696)
chr4 (860-913)||(18709173-18709227)
chr4 (860-913)||(18847423-18847476)
chr4 (860-913)||(22134627-22134680)
chr4 (759-810)||(16624144-16624195)
chr4 (793-832)||(21688436-21688475)
chr4 (860-913)||(16931798-16931852)
chr4 (860-913)||(16934152-16934206)
chr4 (860-913)||(22780382-22780436)
chr4 (860-913)||(22782747-22782801)
chr4 (860-913)||(44599847-44599901)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (759-988)||(26403183-26403416)
chr8 (759-930)||(19752407-19752580)
chr8 (759-922)||(4696617-4696782)
chr8 (759-988)||(23799530-23799763)
chr8 (759-952)||(5702473-5702669)
chr8 (759-913)||(9765849-9766006)
chr8 (770-988)||(6127142-6127365)
chr8 (777-951)||(6813611-6813789)
chr8 (777-931)||(4455956-4456113)
chr8 (777-931)||(19175766-19175923)
chr8 (787-954)||(9054825-9054995)
chr8 (770-929)||(28307484-28307644)
chr8 (777-931)||(7412269-7412426)
chr8 (826-949)||(3051097-3051224)
chr8 (777-931)||(31071241-31071398)
chr8 (869-931)||(1261966-1262029)
chr8 (860-913)||(43079874-43079928)
chr8 (860-913)||(43082245-43082299)
chr8 (860-913)||(28283230-28283283)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (759-988)||(33118047-33118280)
chr2 (759-988)||(31055953-31056188)
chr2 (759-988)||(10445397-10445630)
chr2 (772-988)||(20522144-20522364)
chr2 (759-988)||(34682287-34682520)
chr2 (759-952)||(33528611-33528807)
chr2 (759-988)||(39482842-39483075)
chr2 (759-952)||(17865114-17865310)
chr2 (764-954)||(2869681-2869875)
chr2 (759-988)||(8039971-8040206)
chr2 (759-952)||(16940199-16940395)
chr2 (759-952)||(17010864-17011060)
chr2 (759-988)||(21629860-21630087)
chr2 (759-952)||(34388770-34388965)
chr2 (772-952)||(13569253-13569435)
chr2 (763-988)||(8390103-8390331)
chr2 (763-988)||(14698961-14699176)
chr2 (772-988)||(10707205-10707424)
chr2 (760-974)||(40014839-40015054)
chr2 (759-924)||(23078489-23078657)
chr2 (775-924)||(42039688-42039840)
chr2 (777-931)||(28259189-28259345)
chr2 (770-927)||(35397433-35397593)
chr2 (860-948)||(2838024-2838114)
chr2 (777-881)||(36757825-36757931)
chr2 (836-931)||(15903901-15903997)
chr2 (836-936)||(1345547-1345652)
chr2 (777-930)||(40738773-40738926)
chr2 (836-975)||(27149262-27149402)
chr2 (869-931)||(25398517-25398580)
chr2 (869-931)||(25403655-25403718)
chr2 (860-913)||(35215595-35215649)
chr2 (860-913)||(35217972-35218026)
chr2 (860-913)||(42452973-42453026)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (759-948)||(10640-10832)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (759-952)||(17174-17370)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (758-954)||(85594-85791)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (777-931)||(8431-8588)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (777-931)||(43973-44129)
scaffold0087 (778-931)||(36844-37000)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (777-922)||(45182-45329)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (774-932)||(23455-23614)
scaffold0078 (867-930)||(43274-43338)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (867-930)||(29506-29570)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (860-913)||(266-320)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (857-913)||(6424-6481)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 403; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 234 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 11182649 - 11182151
Alignment:
Q  234 gttagtttacctatattcttaatatggaaagttttatccaaagctgctttcaattcatcaaactttg--agtgaag---ttcctaccaatattgtatcct 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||||||||    
T  11182649 gttagtttacctatattcttaatatggaaagttttatccaaagctgctttcaattcatcaaactttgtgagtgaagaagttcctaccaatattgtatcct 11182550  T
Q  329 agggtgcgatcagaatgtgattgcacaaatctatgagcaaatag--gaaattagtcaattctttaaaccaatggtgacttgcttgcttaaagaccatata 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11182549 agggtgcgatcagaatgtgattgcacaaatccatgagcaaatatacgaaattagtcaattctttaaaccaatggcgacttgcttgcttaaagaccatata 11182450  T
Q  427 atgacttaagaagtttgcatacctgacttagtttaggagtagagacccattgaggcatcttcatgtatatcgtgcctcatgtaaatggcaaccatgtaga 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11182449 atgacttaagaagtttgcatacctgacttagtttaggagtaga--cccattgaggcttcttcatgtatatcgtgcctcatgtaaatggcaaccatgtaga 11182352  T
Q  527 gaagctagggccaaaagaacagctctcactatggattactttgcattaagtgggaatctctcaaagtagttcaatccttctgtatgattgaagccttgtg 626  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11182351 gaagctagggccaaaagaacagttcttactatggataactttgcattaagtgggaatctctcaaagtagttcaatccttctgtatgattgaacccttgtg 11182252  T
Q  627 caacaagtcttagatttaaatttttctatacttgcattttcattttctgtactcgcttccaaaaatccacaaaataaaaattaggattctcacgatattc 726  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  11182251 caacaagtctt-gatttaaatttttctatacttgcattttcattttctgtactcgcttccaaaaatccacaaaataaaaattagggttctcacaattttc 11182153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11183027 - 11182855
Alignment:
Q  17 tacttttcatacaatgtaaaataaagcttataacccacacttaacttgcaacaatgagaccatgcatacgatagtgagtggtattgcaaaacgcggaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11183027 tacttttcatacaatgtaaaataaagcttataacccacacttaacttgcaacaatgagaccatgcatacgatagtgagtggtattgcaaaacgcggaaaa 11182928  T
Q  117 ccatgaagtgaaaattgaggtgtcttgtggattgcccttaaagatttacgtgtctcatgtgtgcagttcttgc 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11182927 ccatgaagtgaaaattgaggtgtcttgtggattgcccttaaagatttacgtgtctcatgtgtgcagttcttgc 11182855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 11182018 - 11181785
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagatggtaac 858  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11182018 aaaacagacttaaatctaagtgtagagcaataccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagatggtaac 11181919  T
Q  859 tcagttcggtccaatatgacctactcta--gggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaag 955  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||     
T  11181918 ctagttcggtctaatatgacctactctagggggagagagcaaccctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcctaaaa 11181819  T
Q  956 cctctcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
     |||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  11181818 gctctcaaatgaacaagacctaatttctacccat 11181785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 759 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 24553692 - 24553499
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  24553692 aaaacagacctaaatctaagtgtagagaaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttga 24553593  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactcta-gggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctt 951  Q
      |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||    
T  24553592 tccagttcggtccaatatgacctaatctatgggagagagcag-cctccactccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaaattagctt 24553499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 759 - 952
Target Start/End: Original strand, 19588657 - 19588853
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || | |    
T  19588657 aaaaaagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacactcaaagattgttga 19588756  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactc-tagggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctta 952  Q
    | |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||| ||||    
T  19588757 cccagttcggtccaatatgaactaatcttagggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattacctta 19588853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Original strand, 3880211 - 3880443
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |    
T  3880211 aaaacagacctaaatctaagtgtaaagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaac-aacacaccaagattgttga 3880309  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaag 955  Q
     ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| ||| |     
T  3880310 ttcagttctgtccaatatgacctaatctgaggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagtttacaa 3880409  T
Q  956 cctctcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
     ||  || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  3880410 gcttacacaagaacaagacctaatttctacccat 3880443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 771 - 952
Target Start/End: Original strand, 28832182 - 28832365
Alignment:
Q  771 aatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaactcagttcggtc 869  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | || | ||||||||    
T  28832182 aatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaatcaataaagataagcaatgaaagaaacaaacaaacacaccaagattgttgacccggttcggtc 28832281  T
Q  870 caatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctta 952  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  28832282 caatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaaattagctta 28832365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 759 - 952
Target Start/End: Complemental strand, 42127596 - 42127401
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  42127596 aaaacagacttaaatctaattgtagagcaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttga 42127497  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctta 952  Q
    | ||||||| || ||||||||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  42127496 cccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccccccaatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaaattagctta 42127401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 759 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 31300782 - 31300615
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |    
T  31300782 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagtgtaatcaaaacaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttga 31300683  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtg 924  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||    
T  31300682 cccagttcggtccaatatgacctagtctgagggagagagaaactctccaatccactaagatgaaagtg 31300615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 759 - 923
Target Start/End: Complemental strand, 17004145 - 17003980
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  17004145 aaaacagacctaaatctaagtgta-agcaacaccacaagcataatcaaagcaaaaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttga 17004047  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagt 923  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  || |||||||||| |||||||||    
T  17004046 cccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttcaatccactatgatgaaagt 17003980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 12084362 - 12084129
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggt 855  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || |    
T  12084362 aaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc-acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaatattgtt 12084264  T
Q  856 aactcagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaa 953  Q
     || |||||||||||| ||||||||| | | ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||| |||||    
T  12084263 gacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaattaacttaa 12084165  T
Q  954 agcctctcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
    |  ||  || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  12084164 aagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat 12084129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 759 - 931
Target Start/End: Original strand, 14520140 - 14520315
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggt 855  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   || |    
T  14520140 aaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc-acaaagataagcactgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgtt 14520238  T
Q  856 aactcagttcggtccaatatgacctactcta-gggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
     || |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||  || |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14520239 gacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggggagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtgttacaaa 14520315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 759 - 936
Target Start/End: Complemental strand, 11917158 - 11916979
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||| ||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || | |    
T  11917158 aaaaaagacctagatcttagtgtagagcaacaccacaagcataaacagtgcaataaagataagcaatgagagaaaggaacaaacacaccgagattgttga 11917059  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagt 936  Q
    | |||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||    
T  11917058 cccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagt 11916979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 781 - 951
Target Start/End: Original strand, 6741784 - 6741958
Alignment:
Q  781 tagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-gatggt-aactcagttcggtccaatatgac 878  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  | ||| ||||||||| |||||||||    
T  6741784 tagaacaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaaagattattaacacagttcggttcaatatgac 6741883  T
Q  879 ctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctt 951  Q
     |||||| ||| | |||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||  || |||| |||||||||||    
T  6741884 atactctgggggatagagcagctctccaatccattaagatggaagtgatacaaagaagttacaagaaattagctt 6741958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 770 - 954
Target Start/End: Complemental strand, 33031117 - 33030928
Alignment:
Q  770 aaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatg-aaagaaaggaacaaacaca-ccaaga-tggtaactcagttcg 866  Q
    ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||    
T  33031117 aaatctaagtgtagagcaataccacgagaataatcaaagcaataaagataaccaatgaaaataaaggaacaaacacatcaaagattgttaattcagttcg 33031018  T
Q  867 gtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaa 954  Q
    ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||  | | |||| ||||||||||||||    
T  33031017 gtcaaatatgacatactctgggggagagagcagctctccaattcactaagatgaaagtgatgcaatggggttacaagaaattagcttaaa 33030928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 777 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 36932518 - 36932362
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaat 873  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   || | || ||||||||||||||    
T  36932518 agtgtagagcaacaccacaagcataaacaaag-aacaaagataagcaatgaaa-aaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaat 36932421  T
Q  874 atgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  36932420 atgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 36932362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 777 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 9353500 - 9353344
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaat 873  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   || | || ||||||||||||||    
T  9353500 agtgtagagcaacaccacaagcatatacaaag-aacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaat 9353403  T
Q  874 atgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9353402 atgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 9353344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 777 - 931
Target Start/End: Original strand, 15464460 - 15464617
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaat 873  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |   || | || ||||||||||||||    
T  15464460 agtgtagagcaacaccacaagtataaccaaaacaataaagataagcaatgaaag-aagaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaat 15464558  T
Q  874 atgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    |||| ||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15464559 atgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 15464617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 820 - 988
Target Start/End: Original strand, 10281722 - 10281895
Alignment:
Q  820 agcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-gatggta-actcagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaaga 916  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||  || |||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||  ||||||||||||| ||    
T  10281722 agcaaagaaagaaaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactatga 10281821  T
Q  917 tgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaagcctctcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
    |||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| |  ||  || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  10281822 tgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat 10281895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 784 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 28278553 - 28278450
Alignment:
Q  784 agcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga--tggtaactcagttcggtccaatatgaccta 881  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  || | || |||||||||||||  |||||||    
T  28278553 agcaaaaccacaatcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaagaaagaaacacaccaagaattgttcacccagttcggtccaacttgaccta 28278454  T
Q  882 ctct 885  Q
    ||||    
T  28278453 ctct 28278450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 778 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 7161068 - 7160915
Alignment:
Q  778 gtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaa-caaacacaccaagatggtaactcagttcggtccaatatg 876  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | | ||||| || | ||||||| || |||||||||||| |||||||  ||||| | | |||||||    
T  7161068 gtgtaaagcaacaccacaggcataatcaaagcaacaaa-ataagaaa-gcaagaaagaaaacaaacacaccaaaatggtaatccagtttgattcaatatg 7160971  T
Q  877 acctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7160970 acctactataggggagagatcagctctccaatccactcagatgaaagtgatacaaa 7160915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 770 - 931
Target Start/End: Original strand, 2630153 - 2630316
Alignment:
Q  770 aaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaa-agaaaggaacaaacacaccaagatggt-aactcagttcgg 867  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| || ||| ||||   ||||||| || ||| || || |||  |||||||    
T  2630153 aaatctaagtgcagagcaacaccacaagcatatttaaagcaatagagataag-aaggaagagaataaaacaaacgcatcaatattgttaacctagttcgg 2630251  T
Q  868 tccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    ||||||||||||| || | ||||||| |||||  || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  2630252 tccaatatgacctgctttgagggagatagcagctcttcaatccactatgatgaaagtgatacaaa 2630316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 784 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 38747241 - 38747173
Alignment:
Q  784 agcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagat 852  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  38747241 agcaaaaccacaatcataatcaaagcaataaagataagcaattaaagaaaggaacaaatccaccaagat 38747173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11182731 - 11182695
Alignment:
Q  190 ttattctttcagtattccattacatcaatcttcaaag 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11182731 ttattctttcagtattccattacatcaatcttcaaag 11182695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 15552515 - 15552461
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15552515 cagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 15552461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Original strand, 31179380 - 31179434
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  31179380 cagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 31179434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 31543004 - 31542950
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  31543004 cagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 31542950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 31545350 - 31545296
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  31545350 cagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 31545296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 118; Significance: 1e-59; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Original strand, 29159714 - 29159947
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |    
T  29159714 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttga 29159813  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactcta-gggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaag 955  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| |     
T  29159814 cccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaa 29159913  T
Q  956 cctctcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
     ||  || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  29159914 gcttacacaagaacaagacctaatttctacccat 29159947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 759 - 930
Target Start/End: Original strand, 20284000 - 20284173
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  20284000 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagaaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttga 20284099  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 930  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20284100 cccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 20284173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 46516496 - 46516263
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  46516496 aaaacagacttaaatctaagtgtaaagcaacaccaaaagcataatcaaagcaatagagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttga 46516397  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactcta-gggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaag 955  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||     
T  46516396 cccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttaaaa 46516297  T
Q  956 cctctcaaaagaacaagac-taatctctacccat 988  Q
     ||  || ||||||||||| |||| |||||||||    
T  46516296 gcttacacaagaacaagacataatttctacccat 46516263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 759 - 974
Target Start/End: Complemental strand, 33332636 - 33332418
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  33332636 aaaacaaacctaaatctaagtgtagagcaacaccataagcataatcaaatcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttga 33332537  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaag 955  Q
    | ||||||| || ||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| |     
T  33332536 cccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataa 33332437  T
Q  956 cctctcaaaagaacaagac 974  Q
     ||  ||||||||||||||    
T  33332436 gcttacaaaagaacaagac 33332418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 2647882 - 2647649
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |    
T  2647882 aaaacagacctaaatctaagtttagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacatcaagattgttga 2647783  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaag 955  Q
    | || ||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| |     
T  2647782 cccaattcggcccaatatgacctattctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataa 2647683  T
Q  956 cctctcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
     ||  || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  2647682 gcttacacaagaacaagacctaatttctacccat 2647649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 759 - 952
Target Start/End: Complemental strand, 4796853 - 4796657
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  4796853 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgagagaaaggaacaaacacaccaagattgttaa 4796754  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctta 952  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||  |||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  4796753 cccagttcggtccaaaatgacctaatctgggggagaaagcagccctcaaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaagaaattagctta 4796657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 759 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 9190194 - 9190021
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |    
T  9190194 aaaacaaacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttga 9190095  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 930  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9190094 cccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 9190021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 23403199 - 23402967
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |    
T  23403199 aaaacagacctaaatgtaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaatataagcaatgaaagaaaggaacaaacacactaagattgttga 23403100  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaag 955  Q
    | || ||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |     
T  23403099 cccaattcggtctaatatgacctaatctgagggagtgagcagccctccaatctactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaaattagcttataa 23403001  T
Q  956 cctctcaaaagaacaag-actaatctctacccat 988  Q
     ||  ||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  23403000 gcttacaaaagaacaagtcctaatttctacccat 23402967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Original strand, 55859 - 56091
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaag-aaaggaacaaacacaccaagatggta- 856  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |      
T  55859 aaaacagacctagatctaagtatagagcaacaccacaagcataatcaaagcacaa-agataagcaatggaaggaaaggaacaaacacaccaagattattg 55957  T
Q  857 actcagttcggtccaatatgacctactctagggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaag 955  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| |     
T  55958 acccagttcggtccaatatgacctaatctggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataa 56057  T
Q  956 cctctcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
     ||  || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  56058 gcttacacaagaacaagacctaatttctacccat 56091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 777 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 5817438 - 5817282
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-gatggt-aactcagttcggtccaata 874  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  5817438 agtgtagaacaacaccacaagcataatcaacacaataatgataagcaatgtaagaaaggaacaaacacaccaaagattgttaactcagttcggtccaata 5817339  T
Q  875 tgacctactctagggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5817338 tgacctactctggggagagagcagctctccaatccactaatatgaaagtgatacaaa 5817282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 759 - 930
Target Start/End: Original strand, 2580298 - 2580474
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatg---aaagaaaggaacaaacacaccaaga-tgg 854  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  2580298 aaaacagacctaaatctaagtgtagagatacaccacaagtataaccaaagcaataaagataagcaatgaaaaaagagaggaacaaacacaccaagattgt 2580397  T
Q  855 taactcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 930  Q
    | || || ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2580398 tgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 2580474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 759 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 9185349 - 9185178
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| || | |    
T  9185349 aaaacagacctagatctaagtgtagagaaacaccacaagcataaacaaagcaataaagataagcaatgaaagagaggaacaa--acaccaagattgttga 9185252  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 930  Q
    | |||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9185251 cccagttcggtccaatataacctagtctgggggagagagaagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 9185178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Original strand, 49091573 - 49091805
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |    
T  49091573 aaaacagacctagatttaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc-acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacgcaccaagattgttga 49091671  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaag 955  Q
    | |||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||| |||| |     
T  49091672 cccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattaccttataa 49091771  T
Q  956 cctctcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
     ||  || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  49091772 gcttacacaagaacaagacctaatttctacccat 49091805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 759 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 9235741 - 9235648
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagat 852  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9235741 aaaacagacctaaatctaaatgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagat 9235648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Original strand, 35960727 - 35960960
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||||||| ||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||| || | |    
T  35960727 aaaacaggcctaaatctaagtgtagagaaacaccaccagcataaataaagcaataaagataagaaattaatgaaatgaacaaacacaccaagattgttga 35960826  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaag 955  Q
    |  |||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || | |||||||||||| |     
T  35960827 ccgagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaaaccactatgatgaaagtgttacaaatgagttagaagaaattagcttataa 35960926  T
Q  956 cctctcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
     ||  ||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  35960927 gcttacaaaagaacaatacctaatttctacccat 35960960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 763 - 931
Target Start/End: Original strand, 21983198 - 21983369
Alignment:
Q  763 cagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaag-aaaggaacaaacacaccaaga-tggtaactc 860  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||  |||| ||| || | || |    
T  21983198 cagacctaaatctgggtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaatagagataagcaacgaaagaaaaggaacaaatgcaccgagattgttgaccc 21983297  T
Q  861 agttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21983298 agttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 21983369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 763 - 931
Target Start/End: Original strand, 21988822 - 21988991
Alignment:
Q  763 cagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaag-aaaggaacaaacacaccaaga-tggtaactc 860  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || | || |    
T  21988822 cagacctaaatctgggtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaaggaacaaacacaccgagattgttgaccc 21988921  T
Q  861 agttcggtccaatatgacctactctagggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||   ||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  21988922 agttcggtccaatatgacctaatct-ggaggagagcaactctccaatccactttgatgaaagtgttacaaa 21988991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 784 - 954
Target Start/End: Complemental strand, 28617386 - 28617213
Alignment:
Q  784 agcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaa-caaacacaccaagatggta-actcagttcggtccaatatgaccta 881  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| || ||  || ||||||||||||||||||||||    
T  28617386 agcaacaccacaagcatattcaaagcaacaaagataagcaa-gaaaggaagaaaacaaacacaccaatattgtttacccagttcggtccaatatgaccta 28617288  T
Q  882 ctctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaa 954  Q
    |||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||| ||||||||||||||    
T  28617287 ctctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgatacaatggggttacaagaaattagcttaaa 28617213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 778 - 988
Target Start/End: Original strand, 3047186 - 3047398
Alignment:
Q  778 gtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaa-caaacacaccaagatggtaactcagttcggtccaatatg 876  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||  || | ||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3047186 gtgtaaagcaacaccacaagcataatcaaatcaaca-agataataaa-gcaagaaagaaaacaaacacaccaagatcgtaacccagttcggtccaatatg 3047283  T
Q  877 acctactct--agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaagcctctcaaaagaacaaga 973  Q
    |||| ||||   |||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||  ||| | |||||||||||    
T  3047284 acctgctctggggggagagagccgttatccaatccactaatatgaaagtggtacaaatgagttacaagaaatcaacttaaaagctcac-aaagaacaaga 3047382  T
Q  974 -ctaatctctacccat 988  Q
     ||||| |||||||||    
T  3047383 cctaatttctacccat 3047398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 777 - 931
Target Start/End: Original strand, 2479266 - 2479421
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaat 873  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || | |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |   || | || ||||||||| ||||    
T  2479266 agtgtagagcaacaccacaagcatatacaaag-aacaaagataagcaatgaaagaa-gaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggttcaat 2479363  T
Q  874 atgacctactctagggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2479364 atgacctaatctagggggagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaa 2479421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 777 - 924
Target Start/End: Original strand, 47263607 - 47263754
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaat 873  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |   || | || ||||||||||||||    
T  47263607 agtgtagagcaacaccacaagcataaacaaag-aataaagataagcaatgaaa-taagaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaat 47263704  T
Q  874 atgacctactctagggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtg 924  Q
    |||||||| | | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  47263705 atgacctaatat-gggggagagcagctctccaatccactatgatgaaagtg 47263754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 793 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 22270201 - 22270107
Alignment:
Q  793 acaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacca--agatggtaactcagttcggtccaatatgacctactct 885  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| | || |||||||||||||  |||||||||||    
T  22270201 acaatcataatcaaagcaataaagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagagatgttcacccagttcggtccaacttgacctactct 22270107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 777 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 44848852 - 44848696
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaat 873  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |   || | || ||||||||| ||||    
T  44848852 agtgtagagcaacaccacaagcatatacaaag-aacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacatacacaccaaaagattgttgacccagttcggttcaat 44848755  T
Q  874 atgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    ||||||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  44848754 atgacctaacctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 44848696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 777 - 931
Target Start/End: Original strand, 18413570 - 18413724
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaat 873  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||   |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |   || | || |||||| | |||||    
T  18413570 agtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagcaaccaagataagcaa-gaaagaaag-aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcag-ccaat 18413666  T
Q  874 atgacctactctagggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18413667 atggcctaatctggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 18413724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 819 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 30814637 - 30814574
Alignment:
Q  819 aagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaactcagttcggtccaatatgaccta 881  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || | || |||||||||||||  |||||||    
T  30814637 aagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaattgttgacccagttcggtccaacttgaccta 30814574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Original strand, 31155920 - 31155974
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  31155920 cagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 31155974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 118; Significance: 1e-59; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 10077351 - 10077118
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  10077351 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttga 10077252  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaag 955  Q
    | || ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  || |||| |||||||||||| |     
T  10077251 cccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaaaagttacaagaaattagcttataa 10077152  T
Q  956 cctctcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
     ||  ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10077151 gcttacaaaagaacaagacctaatttctacccat 10077118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 759 - 952
Target Start/End: Original strand, 22963611 - 22963806
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  22963611 aaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaatagagataagctatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttga 22963710  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactctagggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctta 952  Q
    | ||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  22963711 cccagttcggtgcaatatgaccaaatctggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta 22963806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 759 - 952
Target Start/End: Complemental strand, 23824782 - 23824587
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  23824782 aaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaatagagataagctatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttga 23824683  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactctagggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctta 952  Q
    | ||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  23824682 cccagttcggtgcaatatgaccaaatctggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta 23824587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 759 - 931
Target Start/End: Original strand, 4629864 - 4630039
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacaca-ccaaga-tggta 856  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |     
T  4629864 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacatcaaagattgttg 4629963  T
Q  857 actcagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4629964 actcagttcagtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaa 4630039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Original strand, 31979424 - 31979657
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || | |    
T  31979424 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacatcacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaatagaggaacaaacacaccaagattgttga 31979523  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaag 955  Q
    | ||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||| ||||||| |||| |     
T  31979524 cccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttgcaaaagagttacaagaaattaacttataa 31979623  T
Q  956 cctctcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
     ||  ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31979624 gcttacaaaagaacaagacctaatttctacccat 31979657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 759 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 5017654 - 5017482
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  5017654 aaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc-acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttga 5017556  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactcta-gggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 930  Q
    | |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  5017555 cccagttcggtcaaatatgacctaatctaggggagagagcaaccctccaatctactatgatgaaagtgttacaa 5017482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Original strand, 18232756 - 18232989
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || | |    
T  18232756 aaaacaaacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcgatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttga 18232855  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaag 955  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||| |||||| |     
T  18232856 ctcaaatcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaattcactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaatcagcttataa 18232955  T
Q  956 cctctcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
     ||  || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  18232956 gcttacacaagaacaagacctaatttctacccat 18232989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 759 - 930
Target Start/End: Original strand, 31936498 - 31936671
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |    
T  31936498 aaaacagaccttaatcaaagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcaataaagataagcaatgaaagataggaacaaacacaccaagattgttga 31936597  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactctagg-gagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 930  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31936598 cctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctccaatccactaatatgaaagtgttacaa 31936671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 770 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 24436143 - 24435924
Alignment:
Q  770 aaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaa-caaacacaccaagatggtaactcagttcggt 868  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||| | ||||||| || | ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  24436143 aaatctaagtgtagag--acacaacaagcataaacaaagcaacaaagataagaaa-gcaagaaagaaaacaaacacaccaagatggtaacccagttcgat 24436047  T
Q  869 ccaatatgacctactcta-gggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatg-agtacaggaaattagcttaaagcctctcaaaag 966  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || |||||||| | |||| |||||||||||| |  ||  |||||     
T  24436046 ccaatatgacctactctaggggagagagcagccctccgatccactaggatgaaaatgttacaaatgaattacaagaaattagcttataagcttacaaaaa 24435947  T
Q  967 aacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
    ||||||| ||||| |||||||||    
T  24435946 aacaagacctaatttctacccat 24435924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 804 - 952
Target Start/End: Complemental strand, 5572382 - 5572231
Alignment:
Q  804 caaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagatggta-actcagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcc 901  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||  || || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  5572382 caaagcaataaatataagcagtgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccc 5572283  T
Q  902 tccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctta 952  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  5572282 tccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta 5572231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 763 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 21801531 - 21801297
Alignment:
Q  763 cagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacc-aaga------tggt 855  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||      || |    
T  21801531 cagacctaaatctaagtgtagaacaataccacaatcataatcaaagcaataaagataagtaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaagataaaagtgtt 21801432  T
Q  856 aactcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaa 953  Q
     || |||||| ||||||||||||||| |||  ||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| ||||||| ||||     
T  21801431 gac-cagttcagtccaatatgacctaatctgggggagcgagcagctctccaatccactaagataaaagtgttacaaaagagttacaagaaattatcttat 21801333  T
Q  954 agcctctcaaaagaacaagac-taatctctacccat 988  Q
    |  ||  |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21801332 aagcttacaaaagaacaagacttaatttctacccat 21801297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 777 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 5757646 - 5757490
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaat 873  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   || | || ||||||||||||||    
T  5757646 agtgtagagcaacaccacaagcataaacaaag-aacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaat 5757549  T
Q  874 atgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5757548 atgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 5757490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 815 - 952
Target Start/End: Complemental strand, 31086603 - 31086463
Alignment:
Q  815 agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaactcagttcggtccaatatgacctactcta-gggagagagcagtcctccaatccact 912  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||   ||||||||||||    
T  31086603 agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagagagcaactctccaatccact 31086504  T
Q  913 aagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctta 952  Q
    | |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  31086503 atgatgaaagtgttacaaaggagttacaagaaattagctta 31086463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 777 - 924
Target Start/End: Original strand, 21355965 - 21356114
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaat 873  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || | |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |   || | || ||||||||||||||    
T  21355965 agtgtagagcaacaccacaagcatatacaaag-aacaaagataagcaatgaaagaa-gaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaat 21356062  T
Q  874 atgacctactctag-ggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtg 924  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  21356063 atgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtg 21356114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 770 - 953
Target Start/End: Complemental strand, 31077116 - 31076930
Alignment:
Q  770 aaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaa-gcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagat-ggtaactcagttcgg 867  Q
    ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||| |||| | | |||||| | ||||||| | |||||||| |||||||| ||||||  ||||  |    
T  31077116 aaatctaagtgtagaacaacatcataagcataatcaaaagcaacaaatataagcca-gaaagaatgaaacaaacataccaagattggtaacctagtttag 31077018  T
Q  868 tccaatatgacctactctag-ggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaa 953  Q
    ||||||||||||||||||   ||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  31077017 tccaatatgacctactctctaggagatagcagctctccaatccactaagataaaagtgatacaaatgggttacaataaattagcttaa 31076930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 861 - 936
Target Start/End: Original strand, 14521688 - 14521764
Alignment:
Q  861 agttcggtccaatatgacctactctag-ggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagt 936  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||   ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14521688 agttcggtccaatatgacctactctcgaggagagagcacctctccaattcaataagatgaaagtgatacaaatgagt 14521764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 800 - 930
Target Start/End: Original strand, 27165635 - 27165767
Alignment:
Q  800 taatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaa-ggaacaaacacaccaa-gatggta-actcagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagag 895  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||  || |||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||    
T  27165635 taatcaaagcaaaa-agataagcaatgaaagaaaaggaacaaccacaccaaagattgtttacccagt-cggtccaatatgacctactatgggggacagag 27165732  T
Q  896 cagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 930  Q
     || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27165733 tagccctccaatcaactaagatgaaagtgatacaa 27165767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 759 - 930
Target Start/End: Original strand, 22708930 - 22709102
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggt 855  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||  ||  |||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |   || |    
T  22708930 aaaacagacctagatctaa-tgtagagcaacaccacaagtgtatccaaagcaataaagataagcaa-gaaaggaa-gaacaaacacaccaaaaaattgtt 22709026  T
Q  856 aactcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 930  Q
     ||  |||||||| |||||||| ||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22709027 gacctagttcggttcaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 22709102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 759 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 5572782 - 5572737
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatc 804  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5572782 aaaacagacataaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatc 5572737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Original strand, 12195524 - 12195578
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12195524 cagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 12195578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 26065286 - 26065233
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctagggagagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26065286 cagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccacta 26065233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 26085255 - 26085202
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctagggagagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26085255 cagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccacta 26085202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 117; Significance: 4e-59; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Original strand, 40844563 - 40844795
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | |    
T  40844563 aaaacaaacctaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacgaacacaccaagattgttga 40844662  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactctagggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaagc 956  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| |      
T  40844663 ttcagttcggtccaatatgacctaatctggggagagagcagccctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataag 40844762  T
Q  957 ctctcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
    ||  || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  40844763 cttacacaagaacaagacctaatttctacccat 40844795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 757 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 18553061 - 18552826
Alignment:
Q  757 gtaaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggt 855  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  18553061 gtaaaacagaactaaatctaagtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaataaagataatcaatgaaagaaaggaacaaatacaccaagattgtt 18552962  T
Q  856 aactcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaa 953  Q
     || |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||     
T  18552961 gacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttat 18552862  T
Q  954 agcctctcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
    |  ||  || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  18552861 aagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat 18552826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 3328532 - 3328300
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |    
T  3328532 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttga 3328433  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactctag-ggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaag 955  Q
    | ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |     
T  3328432 cccagttcattccaatatgacctaatctagaggagagagcagcccttcaatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaaattagcttataa 3328334  T
Q  956 cctctcaaaagaacaag-actaatctctacccat 988  Q
     ||  ||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  3328333 gcttacaaaagaacaagtcctaatttctacccat 3328300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 759 - 952
Target Start/End: Complemental strand, 40592959 - 40592762
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaag-aaaggaacaaacacaccaaga-tggta 856  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |     
T  40592959 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaaggaacaaacacaccaagattgttg 40592860  T
Q  857 actcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctta 952  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||  |||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  40592859 acccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagaagctctccaatcgactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta 40592762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 759 - 936
Target Start/End: Complemental strand, 25929618 - 25929440
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaa--caaacacaccaagatggta 856  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| || | ||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  25929618 aaaacaaacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaacaaagataagaaa-gcaagaaagaaaaacaaacacaccaagatggta 25929520  T
Q  857 actcagttcggtccaatatgacctactctagggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagt 936  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25929519 acccagttcggtccaatacgacctactctggggggagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagt 25929440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 3716178 - 3715945
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |    
T  3716178 aaaacagacataaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcacaacaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttga 3716079  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactctagg-gagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaag 955  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| |     
T  3716078 cccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaa 3715979  T
Q  956 cctctcaaaagaacaagac-taatctctacccat 988  Q
     ||  || ||||||||||| |||| |||||||||    
T  3715978 acttacacaagaacaagacttaatttctacccat 3715945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 771 - 930
Target Start/End: Original strand, 37466214 - 37466375
Alignment:
Q  771 aatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaactcagttcggtc 869  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||||||    
T  37466214 aatctaagtgtagagcaacattacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacacagttcggtc 37466313  T
Q  870 caatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 930  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37466314 caatatgacctaatctgggggagagagtagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 37466375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 759 - 952
Target Start/End: Original strand, 26298899 - 26299095
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || | |    
T  26298899 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaacgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttga 26298998  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctta 952  Q
    | ||||||||| ||||||||| || |||  |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  26298999 cccagttcggttcaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta 26299095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 8370663 - 8370430
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggt 855  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || |    
T  8370663 aaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc-acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgtt 8370565  T
Q  856 aactcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaa 953  Q
     || |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  8370564 gacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaattagcttaa 8370466  T
Q  954 agcctctcaaaagaacaagac-taatctctacccat 988  Q
    |  ||  || ||||||||||| |||| |||||||||    
T  8370465 aagcttacacaagaacaagacataatttctacccat 8370430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 24695339 - 24695107
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || | |    
T  24695339 aaaacagagctaaatctaagtatagagcaacac-acaagcataatcaaagcaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttga 24695241  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactcta-gggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaag 955  Q
    |  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| |     
T  24695240 cctagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcaaccctctaatccgctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataa 24695141  T
Q  956 cctctcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
     ||  ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24695140 acttacaaaagaacaagacctaatttctacccat 24695107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 759 - 949
Target Start/End: Original strand, 48438125 - 48438318
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |  | |    
T  48438125 aaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataaacaatgacagaaaggaacaaacacaccaagattattga 48438224  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagc 949  Q
    |  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||    
T  48438225 cctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagc 48438318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 770 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 1417655 - 1417493
Alignment:
Q  770 aaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaactcagttcggt 868  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | || |||||||||    
T  1417655 aaatctaagtgtagagtaacatcacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggt 1417556  T
Q  869 ccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 930  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  1417555 ccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctccaatccactaagaagaaagtgttacaa 1417493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 790 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 1736450 - 1736248
Alignment:
Q  790 actacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaactcagttcggtccaatatgacctactct-ag 887  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | || |||||||||||||||||||||| |||  |    
T  1736450 actacaagcataatcaaagcaataaacataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaatattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggg 1736351  T
Q  888 ggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaagcctctcaaaagaacaaga-ctaatctctacc 985  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||| |||| |  ||  || |||||||||| ||||| ||||||    
T  1736350 ggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattaacttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacc 1736251  T
Q  986 cat 988  Q
    |||    
T  1736250 cat 1736248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 759 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 6794889 - 6794715
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  6794889 aaaacagacctaaatctaagtgtagagtagcatcacaagcataatcaaagcaatagagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttga 6794790  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    | | ||| |||||||||||||||| | |  ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6794789 cccggttaggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 6794715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 779 - 954
Target Start/End: Original strand, 21711154 - 21711331
Alignment:
Q  779 tgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaactcagttcggtccaatatga 877  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||    
T  21711154 tgtagagcaacaccataggcataatcaaagcaatagagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatga 21711253  T
Q  878 cctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaa 954  Q
    |||| |||  ||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  21711254 cctaatctgggggagagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaattagcttaaa 21711331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 759 - 952
Target Start/End: Complemental strand, 30709967 - 30709770
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggt 855  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || |    
T  30709967 aaaacagacctagatctaagtttagagcaacaccataagcataatcaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgtt 30709869  T
Q  856 aactcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctta 952  Q
     || |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  30709868 gacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaagaaattagctta 30709770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 770 - 988
Target Start/End: Original strand, 25795702 - 25795925
Alignment:
Q  770 aaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacc-aaga-tggtaactcagttcgg 867  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || | ||  |||||||    
T  25795702 aaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataataaaaacaataaaaataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaaagattgttgacctagttcgg 25795801  T
Q  868 tccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaagcctctcaaaa 965  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| |||| |||||||||||| |  ||  |||||    
T  25795802 tccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatctactaagatgaaagtgttacgaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaa 25795901  T
Q  966 gaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
    |||||||| ||||| |||||||||    
T  25795902 gaacaagacctaatttctacccat 25795925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 772 - 931
Target Start/End: Original strand, 16264273 - 16264435
Alignment:
Q  772 atctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggt 868  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |   || | ||  ||||||||    
T  16264273 atctaagtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagc-acaaagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacacaaaaagattgttgacctagttcggt 16264371  T
Q  869 ccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16264372 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 16264435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 779 - 954
Target Start/End: Complemental strand, 4387084 - 4386905
Alignment:
Q  779 tgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacaca-ccaaga-tggtaactcagttcggtccaatatg 876  Q
    |||||| |||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || | || |||||  || || ||||    
T  4387084 tgtagaacaacgccacatgcataatcaaaacaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacatcaaagattgtttacccagtttagttcagtatg 4386985  T
Q  877 acctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaa 954  Q
    |||||||||  ||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  4386984 acctactctgggggagagagcagctctccaatccaataagataaaagtgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaa 4386905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 759 - 931
Target Start/End: Original strand, 35925393 - 35925565
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggt 855  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |   || |    
T  35925393 aaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaaac-acaaagatgagcaatgaaagaaaagaacaaacacaccaaaagattgtt 35925491  T
Q  856 aactcagttcggtccaatatgacctactctagggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
     ||  ||||||||||||||||||||| | | ||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  35925492 gacctagttcggtccaatatgacctaat-ttgggag-gggcagttctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 35925565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 815 - 988
Target Start/End: Original strand, 36029060 - 36029237
Alignment:
Q  815 agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaactcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccact 912  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | || |||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||  ||||||||||||    
T  36029060 agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccgagattgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggagaaagcagctctccaatccact 36029159  T
Q  913 aagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaagcctctcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
    | |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| |  ||  || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  36029160 atgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacccat 36029237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 777 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 27975110 - 27974954
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaat 873  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   || | || ||||||||||||||    
T  27975110 agtgtagagcaacaccacaagcataaataaag-aacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaat 27975013  T
Q  874 atgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27975012 atgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 27974954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 777 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 27986604 - 27986449
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaat 873  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |   || | || ||||||||||||||    
T  27986604 agtgtagagcaacaccacaagcatatacaaagcaataaagataagcaa-gaaagaatg-aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaat 27986507  T
Q  874 atgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 930  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  27986506 atgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 27986449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 777 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 33386825 - 33386669
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaat 873  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |   || | |  ||||||||||||||    
T  33386825 agtgtagagcaacaccacaagtataaccaaaacaataaagataagcaatgaaag-aagaaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaat 33386727  T
Q  874 atgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 930  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  33386726 atgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 33386669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 777 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 39040151 - 39039995
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaat 873  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || | ||  |||||||||||||    
T  39040151 agtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacctagttcggtccaat 39040053  T
Q  874 atgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 930  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| ||   ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  39040052 atgacctaatctggggaagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 39039995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 777 - 931
Target Start/End: Original strand, 32143250 - 32143406
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaat 873  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |   || | ||  |||||||||||||    
T  32143250 agtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagcaataaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaagattgttgacctagttcggtccaat 32143347  T
Q  874 atgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  32143348 atgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 32143406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 835 - 954
Target Start/End: Complemental strand, 47924006 - 47923884
Alignment:
Q  835 gaacaaacacaccaagatggta-actcagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaat 932  Q
    |||||||||||||||||| ||  || ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||||||     
T  47924006 gaacaaacacaccaagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagagagcagcccttcaatctactatgatgaaagtgctacaaaa 47923907  T
Q  933 gag-tacaggaaattagcttaaa 954  Q
    ||| |||| ||||||||||||||    
T  47923906 gagttacaagaaattagcttaaa 47923884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 784 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 34491449 - 34491346
Alignment:
Q  784 agcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-gatggta-actcagttcggtccaatatgaccta 881  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  || |||||||||||||  |||||||    
T  34491449 agcaaaaccacaatcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaacttgaccta 34491350  T
Q  882 ctct 885  Q
    ||||    
T  34491349 ctct 34491346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 759 - 829
Target Start/End: Original strand, 8126612 - 8126682
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaa 829  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8126612 aaaacatacctaaatctaagtgtagagcaacaccacactcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaa 8126682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 759 - 829
Target Start/End: Original strand, 27026856 - 27026925
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaa 829  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  27026856 aaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc-acaaagataagcaatgaaa 27026925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 804 - 931
Target Start/End: Original strand, 27452914 - 27453043
Alignment:
Q  804 caaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagt 899  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |   || | |  |||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||     
T  27452914 caaagcaataaagataagcaa-gaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcagc 27453011  T
Q  900 cctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
     ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27453012 tctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 27453043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 868 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 3323756 - 3323634
Alignment:
Q  868 tccaatatgacctactctagg-gagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaagcctctcaaaa 965  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |  ||  |||||    
T  3323756 tccaatatgacctaatctgggagagagaacagccctccaatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaa 3323658  T
Q  966 gaacaagac-taatctctacccat 988  Q
    ||||||| | |||| |||||||||    
T  3323657 gaacaagtcataatttctacccat 3323634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 778 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 26928757 - 26928603
Alignment:
Q  778 gtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaata 874  Q
    |||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |   || | || |||||| | ||||||    
T  26928757 gtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagcaataaagataagcta-gaaagaaa-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcag-ccaata 26928661  T
Q  875 tgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    ||||||| |||  |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26928660 tgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 26928603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 888 - 949
Target Start/End: Original strand, 21353604 - 21353666
Alignment:
Q  888 ggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagc 949  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21353604 ggagagagcacctctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagc 21353666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 759 - 829
Target Start/End: Original strand, 27038201 - 27038270
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaa 829  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  27038201 aaaacagatctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc-acaaagataagcaatgaaa 27038270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 901 - 936
Target Start/End: Complemental strand, 25929405 - 25929370
Alignment:
Q  901 ctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagt 936  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25929405 ctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagt 25929370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 759 - 813
Target Start/End: Original strand, 1417176 - 1417230
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaata 813  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||    
T  1417176 aaaacagacctaaatctaagtgtagagtagcatcacaagcataatcaaagcaata 1417230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 747007 - 746953
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  747007 cagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccgatccacta 746953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Original strand, 6063453 - 6063507
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6063453 cagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 6063507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 900 - 988
Target Start/End: Original strand, 8126684 - 8126774
Alignment:
Q  900 cctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaagcctctcaaaagaacaagac-taatctctacccat 988  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| |  ||  ||||||||||| || |||| |||||||||    
T  8126684 cctccaatccactacgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaatacttaatttctacccat 8126774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 50494249 - 50494195
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  50494249 cagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 50494195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 759 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 47924048 - 47924007
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcat 800  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47924048 aaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcat 47924007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 110; Significance: 6e-55; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 47099010 - 47098778
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  47099010 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagtataatcaaagcaataaagataagcaatcaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttga 47098911  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaag 955  Q
    | |||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |     
T  47098910 cccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaaattagcttataa 47098812  T
Q  956 cctctcaaaagaacaag-actaatctctacccat 988  Q
     ||  ||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  47098811 gcttacaaaagaacaagtcctaatttctacccat 47098778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 759 - 952
Target Start/End: Original strand, 13598309 - 13598505
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  13598309 aaaacagacctagatctaagtgtagagaaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttga 13598408  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctta 952  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  13598409 cccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagatacaagaaattagctta 13598505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 759 - 952
Target Start/End: Complemental strand, 27104558 - 27104362
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |    
T  27104558 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaataaaggaacaaacacaccaagattgttga 27104459  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctta 952  Q
    | |||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  27104458 cacagttcggtccaatataacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta 27104362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 763 - 988
Target Start/End: Original strand, 19072842 - 19073072
Alignment:
Q  763 cagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-gatggta-actc 860  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  || |    
T  19072842 cagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaagattgttgaccc 19072941  T
Q  861 agttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaagcct 958  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| |  ||    
T  19072942 agttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagct 19073041  T
Q  959 ctcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
      ||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  19073042 tacaaaagaacaatacctaatttctacccat 19073072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 763 - 988
Target Start/End: Original strand, 19120732 - 19120962
Alignment:
Q  763 cagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-gatggta-actc 860  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  || |    
T  19120732 cagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaagattgttgaccc 19120831  T
Q  861 agttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaagcct 958  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| |  ||    
T  19120832 agttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagct 19120931  T
Q  959 ctcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
      ||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  19120932 tacaaaagaacaatacctaatttctacccat 19120962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 759 - 931
Target Start/End: Original strand, 775583 - 775757
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |    
T  775583 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacatcaagattgttga 775682  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    | || ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  775683 cccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaa 775757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 16124703 - 16124469
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaag-aaaggaacaaacacaccaaga-tggta 856  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |     
T  16124703 aaaacagacctagatctaaatgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaataaagataagctatgaaagaaaaggaacaaacacaccaagattgttg 16124604  T
Q  857 actcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaa 954  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| |    
T  16124603 actcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttata 16124504  T
Q  955 gcctctcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
      ||  || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  16124503 agcttacataagaacaagacctaatttctacccat 16124469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 759 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 47103027 - 47102854
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || | |    
T  47103027 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagtataatcaaagcaataaagataagcaatcaaagaaaggaacaaacacaccaaaattgttga 47102928  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactcta-gggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 930  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||    
T  47102927 cccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccatccaatccactaagatgaaaatgttacaa 47102854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 759 - 931
Target Start/End: Original strand, 29651722 - 29651896
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagatggta-a 857  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |    
T  29651722 aaaacagacttagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagatttttga 29651821  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29651822 cccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 29651896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 47704122 - 47703889
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |    
T  47704122 aaaatagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagtttaatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaaaaaacacaccaagattgttga 47704023  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatg-agtacaggaaattagcttaaag 955  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| | | |||| |||||||||||| |     
T  47704022 cccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaaattagcttacaa 47703923  T
Q  956 cctctcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
     ||  || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  47703922 gcttacacaagaacaagacctaatttctacccat 47703889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 759 - 930
Target Start/End: Original strand, 32889349 - 32889523
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatg-aaagaaaggaacaaacacaccaagatggtaa 857  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||      
T  32889349 aaaacagatctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagtataaccaaagcaataaagataagcaatgaaaagagaggaacaaacacaccaagattgttg 32889448  T
Q  858 ctc-agttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 930  Q
     || ||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32889449 atctagttcggtccaatatgacctagtctgggggatagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 32889523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 759 - 952
Target Start/End: Original strand, 9476173 - 9476368
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  9476173 aaaacagacataaatataagtgtagaa-aacatcacaagcataatcaaagcaaaaaagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttga 9476271  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactcta-gggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctta 952  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||  |||||| ||| || | ||||||||||||    
T  9476272 cccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtattacaaaagagttataagaaattagctta 9476368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 777 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 26645066 - 26644909
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaat 873  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || | || ||||||||||||||    
T  26645066 agtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaat 26644968  T
Q  874 atgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  26644967 atgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccattatgatgaaagtgttacaaa 26644909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 777 - 949
Target Start/End: Complemental strand, 17345687 - 17345512
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-gatggt-aactcagttcggtccaata 874  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  || |||  | ||| |||||||||| ||||    
T  17345687 agtgtagaacaacaccataagcataatcaaagccataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaaaacataaaagattattaacccagttcggtctaata 17345588  T
Q  875 tgacctactctagggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagc 949  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||||    
T  17345587 tgacctactctggggaaagaggagctctccaatccactaagatgaacgtggtacaaatgtgctacaagaaattagc 17345512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 836 - 951
Target Start/End: Original strand, 22819416 - 22819535
Alignment:
Q  836 aacaaacacac-caagatggtaactcagttcggtccaatatgacctactctaggg--agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaat 932  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||  |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22819416 aacaaacacacacaagatggtaacccaatttggtccaatatgacctactctggggggagagagtagccctccaatccaccaagatgaaagtgatacaaat 22819515  T
Q  933 gag-tacaggaaattagctt 951  Q
    ||| |||| |||||||||||    
T  22819516 gagttacaagaaattagctt 22819535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 778 - 931
Target Start/End: Original strand, 3281637 - 3281793
Alignment:
Q  778 gtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaata 874  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |   |  | || |||||||||||||||    
T  3281637 gtgtagagcaacaccacaagaataaacaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacatcaaaagattattgacccagttcggtccaata 3281735  T
Q  875 tgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  3281736 tgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccacgatgatgaaagtgttacaaa 3281793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 777 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 50521271 - 50521165
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacc-aaga--tggtaactcagttcggtccaat 873  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||    
T  50521271 agtgtagaacaacaccacaaacataatcaaagcaataaagagaaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaagatttggtaacccagttcggttcaat 50521172  T
Q  874 atgacct 880  Q
    |||||||    
T  50521171 atgacct 50521165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 779 - 931
Target Start/End: Original strand, 37069700 - 37069855
Alignment:
Q  779 tgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaatat 875  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |   || | || ||||||||||||||||    
T  37069700 tgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaa-agataagcaacgaaataaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatat 37069798  T
Q  876 gacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    |||||| |||  |||||||||||   |||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  37069799 gacctaatctgggggagagagcatctctccgatccactatgatgaaagtgttacaaa 37069855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 759 - 833
Target Start/End: Complemental strand, 40816918 - 40816844
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaa 833  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  40816918 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacgagcataatcaaagcaataaagataagtaatgaaagaaa 40816844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 760 - 933
Target Start/End: Complemental strand, 9024017 - 9023849
Alignment:
Q  760 aaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaag-gaacaaacacaccaagatggtaac 858  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || | |||||||  |||||||||      ||||||||    
T  9024017 aaacatacctaaatctaagtgtatagcaacaccacaagcataatcaatgcaataaagataag-aaagcaagaaagaaaacaaacac------atggtaac 9023925  T
Q  859 tcagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatg 933  Q
      |||||| |||||||||||||| | | ||| | | || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9023924 ctagttcgctccaatatgacctattatggggaatatagtagctctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatg 9023849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 779 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 21536736 - 21536581
Alignment:
Q  779 tgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaatat 875  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   || | || |||||||||  || ||    
T  21536736 tgtagagcaacaccacaagcatagacaaagcacaa-agataagcgatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtaaaaaat 21536638  T
Q  876 gacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    |||||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  21536637 gacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaa 21536581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 781 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 13604788 - 13604635
Alignment:
Q  781 tagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaatatga 877  Q
    ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |   || | || ||||| ||| ||||||||    
T  13604788 tagagcaacatcacaagcatatacaaagcaataaagataagtaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttaggttcaatatga 13604690  T
Q  878 cctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    |||| | |  ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  13604689 cctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaa 13604635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 47179982 - 47179929
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctagggagagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  47179982 cagttcggtccaatctgacctagtctggggagagagcagccctccaatccacta 47179929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 47177631 - 47177578
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctagggagagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  47177631 cagttcgatccaatctgacctagtctggggagagagcagccctccaatccacta 47177578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Original strand, 9459428 - 9459482
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  9459428 cagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 9459482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Original strand, 9463255 - 9463309
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  9463255 cagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 9463309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 16226437 - 16226383
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16226437 cagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 16226383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 16231833 - 16231779
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16231833 cagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 16231779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 857 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 2617789 - 2617732
Alignment:
Q  857 actcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2617789 actcagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccacta 2617732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 860 - 889
Target Start/End: Original strand, 13137985 - 13138014
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctaggg 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13137985 cagttcggtccaatatgacctactctaggg 13138014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 109; Significance: 3e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 759 - 952
Target Start/End: Original strand, 5594 - 5790
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  5594 aaaacagacctagatctaagtgtagagaaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttga 5693  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctta 952  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  5694 cccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagatacaagaaattagctta 5790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 759 - 931
Target Start/End: Original strand, 2403 - 2577
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  2403 aaaacagacctagatctaagtgtagaacaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttga 2502  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    | ||||||| |||||||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2503 cccagttcgctccaatatgacctaatctgggggagacagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 2577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 781 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 133445 - 133292
Alignment:
Q  781 tagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaatatga 877  Q
    ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |   || | || ||||| ||| ||||||||    
T  133445 tagagcaacatcacaagcatatacaaagcaataaagataagtaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttaggttcaatatga 133347  T
Q  878 cctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    |||| | |  ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  133346 cctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaa 133292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 109; Significance: 3e-54; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 772 - 988
Target Start/End: Original strand, 10047303 - 10047523
Alignment:
Q  772 atctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaactcagttcggtcc 870  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||    
T  10047303 atctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtcc 10047402  T
Q  871 aatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaagcctctcaaaagaa 968  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| |  ||  || |||||    
T  10047403 aatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaa 10047502  T
Q  969 caaga-ctaatctctacccat 988  Q
    ||||| ||||| |||||||||    
T  10047503 caagacctaatttctacccat 10047523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 759 - 936
Target Start/End: Original strand, 39245905 - 39246084
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  39245905 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaggcataatcaaaacaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttga 39246004  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagt 936  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  39246005 cccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagt 39246084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 770 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 6743590 - 6743369
Alignment:
Q  770 aaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagca-atatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagatggtaactcagttcggt 868  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  6743590 aaatctgagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcatatagagataagaaatggaagaaaggaacaaacacaccaagatgttgacccagttcggt 6743491  T
Q  869 ccaatatgacctactcta-gggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaagcctctcaaaag 966  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||  ||||||||||| || ||  ||||||    
T  6743490 ccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagctacaaaaaattagcttatag-cttacaaaag 6743392  T
Q  967 aacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
    ||||||| ||||| |||||||||    
T  6743391 aacaagacctaatttctacccat 6743369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 759 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 25862208 - 25862035
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |    
T  25862208 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaataaacacaccaagattgttga 25862109  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 930  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  25862108 ctcagttcggtccaatatgacctaatatggggaagagagcggccctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 25862035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 759 - 931
Target Start/End: Original strand, 54867095 - 54867268
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  54867095 aaaacagacatagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagtaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttga 54867194  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactctagggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||| || ||||||    
T  54867195 cccagttcggtccaatatgacctagtctggggagagagcagcccttcaatcaactatgatgaaaatgttacaaa 54867268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 759 - 936
Target Start/End: Original strand, 24333723 - 24333899
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  24333723 aaaacagacctagatctaagtgtagagcaacac---aagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaagaaacaaacacaccaagattgttaa 24333819  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagt 936  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||    
T  24333820 ctcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaacgtgttacaaaagagt 24333899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 760 - 933
Target Start/End: Complemental strand, 34496007 - 34495833
Alignment:
Q  760 aaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaa-caaacacaccaagatggtaac 858  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  34496007 aaacagtcccaaaactaagtgtaaagcatcaacacaagcataatcaaagcaataaa-acaagcaatgaaagaaagaaaacaaacacaccaagatggtaac 34495909  T
Q  859 tcagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatg 933  Q
      |||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34495908 ctagttcggtccaacatgacttactctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatg 34495833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 772 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 5269364 - 5269204
Alignment:
Q  772 atctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaactcagttcggtcc 870  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||  ||||||||||    
T  5269364 atctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaatataagaaatgaaagaaaggaacaaacacaacaagattgttgacctagttcggtcc 5269265  T
Q  871 aatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 930  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  5269264 aatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 5269204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 758 - 952
Target Start/End: Complemental strand, 38152625 - 38152429
Alignment:
Q  758 taaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggta 856  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  38152625 taaaacagacctagatctaagtgtatagcaacaccacaagcataatcaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttg 38152527  T
Q  857 actcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctta 952  Q
    || ||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||| || | ||||||||||||    
T  38152526 acccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactatggtgaaagtgttacaaaagagttataagaaattagctta 38152429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 772 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 42599747 - 42599526
Alignment:
Q  772 atctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaactcagttcggtcc 870  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || ||| ||||    
T  42599747 atctaaatgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccaattcagtcc 42599648  T
Q  871 aatatgacctactctagg---gagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaagcctctcaaaag 966  Q
    |||||||| || | | ||   |||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||| |||||||||||| |  ||  ||||||    
T  42599647 aatatgacataatatgggggagagagagcaaccctccaatccactaagatgaaaatgttac-aatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaag 42599549  T
Q  967 aacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
    ||||||| ||||| |||||||||    
T  42599548 aacaagacctaatttctacccat 42599526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 759 - 931
Target Start/End: Original strand, 5143170 - 5143344
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || | |    
T  5143170 aaaacagacctaaatctaagtgtagaacaacaccacaaacataatcaaaacaatagagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacactgagattgttga 5143269  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    |  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  5143270 cctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaacccactatgatgaaagtgttacaaa 5143344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 793 - 952
Target Start/End: Complemental strand, 36315381 - 36315220
Alignment:
Q  793 acaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaag-atggtaactcagttcggtccaatatgacctactct-aggga 890  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  36315381 acaagcataatcaaagcaatagagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggggga 36315282  T
Q  891 gagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctta 952  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  36315281 gagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaattagctta 36315220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 793 - 952
Target Start/End: Complemental strand, 36329590 - 36329429
Alignment:
Q  793 acaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaag-atggtaactcagttcggtccaatatgacctactct-aggga 890  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  36329590 acaagcataatcaaagcaatagagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggggga 36329491  T
Q  891 gagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctta 952  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  36329490 gagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaattagctta 36329429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 761 - 931
Target Start/End: Original strand, 5147590 - 5147762
Alignment:
Q  761 aacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaact 859  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||     
T  5147590 aacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaaacataatcaaaacaatagagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccgagattgttgacc 5147689  T
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    |||||||||||||||||||||| | |  ||||| ||||||  ||||| |||| || |||||||||| ||||||    
T  5147690 cagttcggtccaatatgacctaatttgggggagggagcagctctccagtccattatgatgaaagtgttacaaa 5147762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 759 - 931
Target Start/End: Original strand, 3777461 - 3777634
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |    
T  3777461 aaaacagacctagatctaagtgtagaacaaaaccacaagcataatcaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccgagattgttga 3777559  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactctag-ggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3777560 cccagttcggtccaatataacctaatctagaggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 3777634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 763 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 3796702 - 3796472
Alignment:
Q  763 cagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-gatggta-actc 860  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  || |    
T  3796702 cagacctaaatctaagtgtagagtaacatcacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgaccc 3796603  T
Q  861 agttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaagcct 958  Q
    ||||| ||||||||||||||| | | ||| ||||||||   ||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| |  ||    
T  3796602 agttccgtccaatatgacctaatatgggggagagagcaactctctaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagct 3796503  T
Q  959 ctcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
      || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  3796502 tgcacaagaacaagacctaatttctacccat 3796472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 759 - 952
Target Start/End: Complemental strand, 16630866 - 16630670
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaag-aaaggaacaaacacaccaa-gatggta 856  Q
    |||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |     
T  16630866 aaaacaaacctagatctaagtgtaaagcaacaccacaagcataatcaaag-aacaaagataagcaatgaaagaaaaggaacaaacacaccaaggttgttg 16630768  T
Q  857 actcagttcggtccaatatgacctactctag-ggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctta 952  Q
    ||  |||||||||||||||||| || ||| | ||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  16630767 acctagttcggtccaatatgacataatctggaggagagaacagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta 16630670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 777 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 5396840 - 5396690
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaat 873  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |   || | || ||||||||||||||    
T  5396840 agtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaagaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaat 5396742  T
Q  874 atgacctactctag-ggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtg 924  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  5396741 atgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtg 5396690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 836 - 954
Target Start/End: Complemental strand, 39774414 - 39774293
Alignment:
Q  836 aacaaacacac-caagatggtaactcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaat- 932  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  39774414 aacaaacacacacaagatggtaactcagttcggtccaatatgacctactctgggggatagagcagctctccaatccactaaaatgaaagtgatacaaata 39774315  T
Q  933 gagtacaggaaattagcttaaa 954  Q
    |  |||| ||||||||||||||    
T  39774314 ggttacaagaaattagcttaaa 39774293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 777 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 31985801 - 31985646
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaat 873  Q
    ||||||||||||| | |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |   || | || ||||||||||||||    
T  31985801 agtgtagagcaactccacaagcatatacaaagcaataaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaat 31985704  T
Q  874 atgacctactctagggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31985703 atgacctaatctggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 31985646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 836 - 933
Target Start/End: Original strand, 18377348 - 18377446
Alignment:
Q  836 aacaaacacaccaagatggtaactcagttcggtccaatatgacctactctag-ggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatg 933  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18377348 aacaaacacaccaagatggtaacccagttcagttctatatgacctactctggaggagagagcagccctccattccactaagatgaaagtgatacaaatg 18377446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 836 - 954
Target Start/End: Original strand, 5112226 - 5112346
Alignment:
Q  836 aacaaacacaccaagatggtaactcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatga 934  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  5112226 aacaaacacaccaagatggtaacccagttcggtccaatatgatctactttgggggtgagagcagctctccaatccactaatatgaaagtgttacaaatgg 5112325  T
Q  935 g-tacaggaaattagcttaaa 954  Q
    | |||| ||||||||||||||    
T  5112326 gttacaagaaattagcttaaa 5112346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 815 - 950
Target Start/End: Complemental strand, 16623424 - 16623285
Alignment:
Q  815 agataagcaatgaaagaaa-ggaacaaacacaccaagatggta-actcagttcggtccaatatgacctactctag-ggagagagcagtcctccaatccac 911  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  || ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||  |||||||||||    
T  16623424 agataagcaatgaaagaaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccac 16623325  T
Q  912 taagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagct 950  Q
    || |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||    
T  16623324 tatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagct 16623285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 770 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 1983473 - 1983291
Alignment:
Q  770 aaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaa-caaacacaccaagatggtaactcagttcggt 868  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||| ||| | | ||||| || | ||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  1983473 aaatctaagtgtaaagcatcaccacaaacataatcaaaacaaca-atataagaaa-gcaagaaagaaaacaaacacaccaatatggtaacccagttcggt 1983376  T
Q  869 ccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctt 951  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||| | | |||| |||||||||||    
T  1983375 ccaatatgacctactatgggggagatagcagctctccaatccactaggatcaaagtgatacaaaggggttacaagaaattagctt 1983291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 782 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 8689647 - 8689498
Alignment:
Q  782 agagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaatatgac 878  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   || | |  ||||||||||||||||||     
T  8689647 agagcaacaccacaagcataaacaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaagtaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgat 8689549  T
Q  879 ctactctagggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 930  Q
    ||| | | ||| ||||| ||  |||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  8689548 ctaatat-gggggagaggagctctcctatccactatgatgaaagtgttacaa 8689498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 777 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 28468696 - 28468542
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaat 873  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||   |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |   || | || |||||| | |||||    
T  28468696 agtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagcaaccaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcag-ccaat 28468600  T
Q  874 atgacctactctag-ggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 930  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  28468599 atgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 28468542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Original strand, 18709173 - 18709227
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18709173 cagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccaatccacta 18709227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 18847476 - 18847423
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctagggagagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18847476 cagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccaatccacta 18847423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Original strand, 22134627 - 22134680
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctagggagagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22134627 cagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccaatccacta 22134680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 759 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 16624195 - 16624144
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagca 810  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16624195 aaaacagacctagatttaagtgtagagcaacaccacaagaataatcaaagca 16624144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 793 - 832
Target Start/End: Complemental strand, 21688475 - 21688436
Alignment:
Q  793 acaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaa 832  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21688475 acaatcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaa 21688436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Original strand, 16931798 - 16931852
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16931798 cagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 16931852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Original strand, 16934152 - 16934206
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16934152 cagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 16934206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Original strand, 22780382 - 22780436
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22780382 cagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 22780436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Original strand, 22782747 - 22782801
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22782747 cagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 22782801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Original strand, 44599847 - 44599901
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  44599847 cagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 44599901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 106; Significance: 2e-52; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 26403416 - 26403183
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || | |    
T  26403416 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaaacgaggaacaaacacaccaagattgttga 26403317  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaag 955  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||| |     
T  26403316 cccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttataggaaattagcttacaa 26403217  T
Q  956 cctctcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
     ||  || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  26403216 gcttgcacaagaacaagacctaatttctacccat 26403183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 759 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 19752580 - 19752407
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || | |    
T  19752580 aaaacagacctaaatctaagtgtagtgcaacaccacaagcataatcaaagcaatagagataagtaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttga 19752481  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactcta-gggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 930  Q
    |  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19752480 cctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 19752407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 759 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 4696782 - 4696617
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |    
T  4696782 aaaacagacataaatctaagtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttga 4696683  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaag 922  Q
    | ||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4696682 cccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaag 4696617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 23799763 - 23799530
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  23799763 aaaatagacctagatctaagtgtagagaagtaccacaaacataatcaaagcaatagagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttga 23799664  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactctag-ggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaag 955  Q
    | |||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| |     
T  23799663 cccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaa 23799564  T
Q  956 cctctcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
     ||  || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  23799563 gcttacacaagaacaagacctaatttctacccat 23799530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 759 - 952
Target Start/End: Complemental strand, 5702669 - 5702473
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | |    
T  5702669 aaaacagacctagatctaagtgtagagcatcaccacaagcataattaaagcaatagagataagctatgaaggaaaggaacaaacacaccaagattgttga 5702570  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctta 952  Q
    | |||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  5702569 cccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcatccctccaatcccctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta 5702473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 759 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 9766006 - 9765849
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-ga-tggta 856  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |     
T  9766006 aaaacaaacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaagggaacaaacacaccaatgattgttg 9765907  T
Q  857 actcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||    
T  9765906 acccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccacta 9765849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 770 - 988
Target Start/End: Original strand, 6127142 - 6127365
Alignment:
Q  770 aaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gatggtaactcagttcgg 867  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    || | |||||||||||    
T  6127142 aaatttaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcactaaagataagcaatgaaagagatgaacaaacacatcaaatattgttgactcagttcgg 6127241  T
Q  868 tccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaagcctctcaaaa 965  Q
    |||||||||||||| | | ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| |  ||  |||||    
T  6127242 tccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaa 6127341  T
Q  966 gaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
    |||||||| ||||| |||||||||    
T  6127342 gaacaagacctaatttctacccat 6127365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 777 - 951
Target Start/End: Original strand, 6813611 - 6813789
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacc-aaga-tggtaactcagttcggtccaata 874  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| |||||||||||||||    
T  6813611 agtgtagaacaacatcacaagcataatcaaagcaataaagataagaaatgaaagaaaggaacaaacataccaaagattgttaacccagttcggtccaata 6813710  T
Q  875 tgacctactcta-gggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctt 951  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| | | |||| |||||||||||    
T  6813711 taacctacactaggggagagagcagctctccaatccaataagatgaaagtgacacaaaggggttacaagaaattagctt 6813789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 777 - 931
Target Start/End: Original strand, 4455956 - 4456113
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaat 873  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || | || | ||||||||||||    
T  4455956 agtgtagagcaacacaacaagcataaacaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgctgacccggttcggtccaat 4456054  T
Q  874 atgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    ||| |||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4456055 atggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 4456113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 777 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 19175923 - 19175766
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaat 873  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |   || | ||  |||||||||||||    
T  19175923 agtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacaaaaagattgttgacctagttcggtccaat 19175825  T
Q  874 atgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    |||||||| |||  |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19175824 atgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 19175766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 787 - 954
Target Start/End: Complemental strand, 9054995 - 9054825
Alignment:
Q  787 aacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagatggta-actcagttcggtccaatatgacctactct 885  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||   | |||||||||||| ||  |  |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9054995 aacaccacaagtataatcaaagcaataaagataagtcatgaaagaagcaatcaaacacaccaatattatttactctgttcagtccaatatgacctactct 9054896  T
Q  886 ag-ggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa-tgagtacaggaaattagcttaaa 954  Q
     | |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  9054895 ggaggagagagcagctctctaatccactaagatgaaagtgatacaaagtggttacaagaaattagcttaaa 9054825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 770 - 929
Target Start/End: Original strand, 28307484 - 28307644
Alignment:
Q  770 aaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagat-ggtaactcagttcggt 868  Q
    ||||||||||||| | || ||| |||||||||| |||||||||| | ||||| || | ||||| | || |||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  28307484 aaatctaagtgtataacagcaccacaagcataaacaaagcaataaatataagaaa-gcaagaatgaaataaacacgccaagattggtaacccagttcggt 28307582  T
Q  869 ccaatatgacctactctaggga-gagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgataca 929  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28307583 ccaaaatgacctactctggggatgagagcagctctccaatccactaagatggaagtaataca 28307644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 777 - 931
Target Start/End: Original strand, 7412269 - 7412426
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga----tggtaactcagttcggtccaa 872  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    || | || |||||||||||||    
T  7412269 agtgtagagcaacaccacaagcatatacaaag-aacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccatgaaaattgttgacccagttcggtccaa 7412366  T
Q  873 tatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    ||||||||| | | ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7412367 tatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 7412426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 826 - 949
Target Start/End: Original strand, 3051097 - 3051224
Alignment:
Q  826 gaaagaaaggaacaaacacaccaa-gatg-gtaactcagttcggtccaatatgacctactctag-ggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaag 922  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||  ||||| || ||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  3051097 gaaagaaaacaacaaacacaccaaagattagtaacccaattcggtctaatataacctcctctggaggagagagcacctctccaatccactaagatgaaag 3051196  T
Q  923 tgatacaaatgag-tacaggaaattagc 949  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  3051197 tgatacaaatgagttacaagaaattagc 3051224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 777 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 31071398 - 31071241
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga----tggtaactcagttcggtccaa 872  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||   |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |    || | ||  ||||||||||||    
T  31071398 agtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagcaaccaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagattgttgaccgagttcggtccaa 31071301  T
Q  873 tatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31071300 tatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 31071241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 869 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 1262029 - 1261966
Alignment:
Q  869 ccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1262029 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 1261966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 43079928 - 43079874
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  43079928 cagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 43079874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 43082299 - 43082245
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  43082299 cagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 43082245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Original strand, 28283230 - 28283283
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctagggagagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28283230 cagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccacta 28283283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 106; Significance: 2e-52; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Original strand, 33118047 - 33118280
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |      
T  33118047 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagtaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgg 33118146  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaag 955  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||  || |||| |||||||||||| |     
T  33118147 ctcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaaaatagttacaagaaattagcttataa 33118246  T
Q  956 cctctcaaaagaacaagac-taatctctacccat 988  Q
     ||  || ||||||||||| |||| |||||||||    
T  33118247 gcttacacaagaacaagacttaatttctacccat 33118280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Original strand, 31055953 - 31056188
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaag-aaaggaacaaacacacc-aaga-tggt 855  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |    
T  31055953 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaaggaacaaacacaccaaagattgtt 31056052  T
Q  856 aactcagttcggtccaatatgacctactcta-gggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaa 953  Q
     ||  |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||     
T  31056053 gacctagttcggttcaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaataaattagcttat 31056152  T
Q  954 agcctctcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
    |  ||  ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31056153 aagcttacaaaagaacaagacctaatttctacccat 31056188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 10445630 - 10445397
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |    
T  10445630 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaaaaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttga 10445531  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaag 955  Q
      |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| |     
T  10445530 tccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactattatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaa 10445431  T
Q  956 cctctcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
     ||  || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  10445430 tcttacacaagaacaagacctaatttctacccat 10445397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 772 - 988
Target Start/End: Original strand, 20522144 - 20522364
Alignment:
Q  772 atctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaactcagttcggtcc 870  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||    
T  20522144 atctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagaaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtcc 20522243  T
Q  871 aatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaagcctctcaaaagaa 968  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||| | | |||| |||||||| ||| |  ||  ||||||||    
T  20522244 aatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaattagattataagcttacaaaagaa 20522343  T
Q  969 caagac-taatctctacccat 988  Q
    |||||| |||| |||||||||    
T  20522344 caagacttaatttctacccat 20522364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 34682520 - 34682287
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |    
T  34682520 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaacaaataaatataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttga 34682421  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaag 955  Q
    | ||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| ||    
T  34682420 cccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacag 34682321  T
Q  956 cctctcaaaagaacaagac-taatctctacccat 988  Q
     ||  || ||||||||||| |||| |||||||||    
T  34682320 gcttacacaagaacaagacttaatttctacccat 34682287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 759 - 952
Target Start/End: Complemental strand, 33528807 - 33528611
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  33528807 aaaacagacctagatctaaatgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttga 33528708  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactctagg-gagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctta 952  Q
    | |||||||||||||||||||||| | | ||  ||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  33528707 cccagttcggtccaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta 33528611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Original strand, 39482842 - 39483075
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |    
T  39482842 aaaacagacctaaatctaagtgtagaacaacaccacaagcataaccaaagcaataaagataaacaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttga 39482941  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaag 955  Q
    |  ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| |||| |||||||||||| |     
T  39482942 cctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcaggcctccaatccactatgatgaaaatgttacaaaagagttacaagaaattagcttataa 39483041  T
Q  956 cctctcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
     ||  || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  39483042 gcttacacaagaacaagacctaatttctacccat 39483075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 759 - 952
Target Start/End: Original strand, 17865114 - 17865310
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || | |    
T  17865114 aaaacatacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataatcaatgaaagaaaggaacaatcacaccaagattgttga 17865213  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctta 952  Q
    | |||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  17865214 cccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta 17865310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 764 - 954
Target Start/End: Complemental strand, 2869875 - 2869681
Alignment:
Q  764 agacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaag-gaacaaacacaccaaga-tggtaactca 861  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| | || | || ||    
T  2869875 agacctaaatctaagtgtagagcaacaccataagcatattcaaagcaacaaagataagcaaataaaggaagagaacaaacacaccaatattgtttaccca 2869776  T
Q  862 gttcggtccaatatgacctactcta-gggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaa 954  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  2869775 gttcggtccaatatgacctactctaggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgatacaaaggagttacaagaaattagcttaaa 2869681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Original strand, 8039971 - 8040206
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||| ||| ||||| || | |    
T  8039971 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaggagaggaaaaaatacatcaagattgttga 8040070  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag---tacaggaaattagcttaa 953  Q
    | |||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||   |||| ||||||||||||     
T  8040071 cccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagagttacaagaaattagcttac 8040170  T
Q  954 agcctctcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
    |  ||  || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  8040171 aagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat 8040206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 759 - 952
Target Start/End: Complemental strand, 16940395 - 16940199
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  16940395 aaaacagacctagatctaagtgcagagcgacaccaaaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttga 16940296  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatg-agtacaggaaattagctta 952  Q
    | || |||||||||||||||| || |||  |||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| | | |||| ||||||||||||    
T  16940295 cccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaaattagctta 16940199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 759 - 952
Target Start/End: Complemental strand, 17011060 - 17010864
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  17011060 aaaacagacctagatctaagtgcagagcgacaccaaaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttga 17010961  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatg-agtacaggaaattagctta 952  Q
    | || |||||||||||||||| || |||  |||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| | | |||| ||||||||||||    
T  17010960 cccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaaattagctta 17010864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 759 - 988
Target Start/End: Original strand, 21629860 - 21630087
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  21629860 aaaacagacctagatctaagtgtagagcagcaccacaat-----tcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttga 21629954  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactctagggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaagc 956  Q
    | |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| ||| |      
T  21629955 cccagttcagtccaatatgacctaatctggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagtttataag 21630054  T
Q  957 ctctcaaaagaacaagac-taatctctacccat 988  Q
    ||  || ||||||||||| |||| |||||||||    
T  21630055 cttacacaagaacaagacttaatttctacccat 21630087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 759 - 952
Target Start/End: Original strand, 34388770 - 34388965
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| || | |    
T  34388770 aaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcaaaatcaaagc-acaaagataaacaaagaaagaaaggaacaaacacaccgagattgttga 34388868  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctta 952  Q
    | || ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  34388869 cccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta 34388965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 772 - 952
Target Start/End: Original strand, 13569253 - 13569435
Alignment:
Q  772 atctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagatggta-actcagttcggtcc 870  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||  || |||||||||||    
T  13569253 atctaagtatagagaaacaccacaagcataatcaaagcacaa-agataatcaatgaaagaaaggaataaacacaccaaaattgttgacccagttcggtcc 13569351  T
Q  871 aatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctta 952  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  13569352 aatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta 13569435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 763 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 8390331 - 8390103
Alignment:
Q  763 cagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaactca 861  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | || | || ||    
T  8390331 cagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc-acaaagataagcgatgaaagaaatgaacaaacacaccaaaattgttgaccca 8390233  T
Q  862 gttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaagcctc 959  Q
    ||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| || ||| ||| |||| |||||||||||| |  ||     
T  8390232 gttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaaagagttacaagaaattagcttacaagctt 8390133  T
Q  960 tcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
     || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  8390132 gcacaagaacaagacctaatttctacccat 8390103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 763 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 14699176 - 14698961
Alignment:
Q  763 cagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaactca 861  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||| || | || ||    
T  14699176 cagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaat-------------gaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaccca 14699090  T
Q  862 gttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaagcctc 959  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| |||| |||||||||||| |  ||     
T  14699089 gttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaag-gttacaaaagagttacaagaaattagcttataagctt 14698991  T
Q  960 tcaaaagaacaaga-ctaatctctacccat 988  Q
     || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  14698990 acacaagaacaagacctaatttctacccat 14698961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 772 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 10707424 - 10707205
Alignment:
Q  772 atctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaactcagttcggtcc 870  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||| || | || |||||||||||    
T  10707424 atctaagtgtagagcaacactgcaagcataatcaaagc-acaaagataagcaaagaaagaaatgaataaacacaccgagattgttgacccagttcggtcc 10707326  T
Q  871 aatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaagcctctcaaaagaa 968  Q
    ||||||||||| | |  |||||||| ||   ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| |  ||  || |||||    
T  10707325 aatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaa 10707226  T
Q  969 caaga-ctaatctctacccat 988  Q
    ||||| ||||| |||||||||    
T  10707225 caagacctaatttctacccat 10707205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 760 - 974
Target Start/End: Original strand, 40014839 - 40015054
Alignment:
Q  760 aaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaa--caaacacaccaagatggtaa 857  Q
    |||||| || ||| ||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||  || ||||||||  |||| | || ||||||||||    
T  40014839 aaacagtcctaaaactaagtgtaaaacatcaccacaagcataatcaaagcaaca-agataagaaaccaa-gaaaggaaaacaaatatac-aagatggtaa 40014935  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaag 955  Q
    | ||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||     
T  40014936 cccagttagatccaatatgacatactctgagggagagaacatccctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagttgcgagaaattagcttaaaa 40015035  T
Q  956 cctctcaaaagaacaagac 974  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  40015036 actcacaaaagaacaagac 40015054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 759 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 23078657 - 23078489
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa---gatggt 855  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||| |    
T  23078657 aaaacatacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc-acaaagataagcaatgaaagaatggaacaaacacaccaaaagaatgtt 23078559  T
Q  856 aactcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtg 924  Q
     || ||||||| |||||||||||||| | |  |||||||| ||   ||||||||||||| ||||||||||    
T  23078558 gacccagttcgatccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtg 23078489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 775 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 42039840 - 42039688
Alignment:
Q  775 taagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacc--aagatggtaactc-agttcggtcca 871  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||| ||   || |||||||||||    
T  42039840 taagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc-acaaagataagcaatgaaagaaaggagcaagcacaccaaaagattgttgatctagttcggtcca 42039742  T
Q  872 atatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtg 924  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||    
T  42039741 atatgacctaatctgtgggagagagcagctctctaatccactatgatgaaagtg 42039688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 777 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 28259345 - 28259189
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaat 873  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || | |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |   || | || ||||||||||||||    
T  28259345 agtgtagagcaacaccacaagcatatacaaag-aacaaagataagcaatgaaagaa-gaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaat 28259248  T
Q  874 atgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    |||||||| | | ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28259247 atgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 28259189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 770 - 927
Target Start/End: Original strand, 35397433 - 35397593
Alignment:
Q  770 aaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaactcagttcggt 868  Q
    ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| | |||||||||||||| | || | || |||||||||    
T  35397433 aaatctatgtgcagagcaaaaccacaagcataatcaaagcaatcaatataagcaatgaaagaaggaaacaaacacaccaatattgtttacccagttcggt 35397532  T
Q  869 ccaatatgacctac-tctag-ggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgata 927  Q
     |||| | |||||| ||| | ||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  35397533 tcaatctaacctacatctggaggagatagcagctcttcaatccactaagatgaaagtgata 35397593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 860 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 2838114 - 2838024
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattag 948  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  2838114 cagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacatctccaatccactaaaatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaattag 2838024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 777 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 36757931 - 36757825
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaat 873  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || | || || |||||||||||    
T  36757931 agtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccaattcggtccaat 36757833  T
Q  874 atgaccta 881  Q
    ||||||||    
T  36757832 atgaccta 36757825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 836 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 15903997 - 15903901
Alignment:
Q  836 aacaaacacaccaagatggtaactcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15903997 aacaaatacaccaagatggtaacctagttcgatccaatatgacctactctgacggagagagaaaatctccaatccactaagataaaagtgatacaaa 15903901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 836 - 936
Target Start/End: Complemental strand, 1345652 - 1345547
Alignment:
Q  836 aacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccac-taagatgaaagtgatacaa 930  Q
    ||||||||||||||||   || | || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  1345652 aacaaacacaccaagaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacctctccgatccacttaagatgaaagtgatacaa 1345553  T
Q  931 atgagt 936  Q
    ||||||    
T  1345552 atgagt 1345547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 777 - 930
Target Start/End: Original strand, 40738773 - 40738926
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaat 873  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| |   || | || |||||| | |||||    
T  40738773 agtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagcaataaagataagcta-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcag-ccaat 40738869  T
Q  874 atgacctactctagggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 930  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  40738870 atgacctaatctggggggagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 40738926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 836 - 975
Target Start/End: Complemental strand, 27149402 - 27149262
Alignment:
Q  836 aacaaacacaccaaga-tggtaactcagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatg 933  Q
    ||||||||||| |||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  27149402 aacaaacacac-aagactggtaaccaagtttggtccaatatgacctactatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgatacaaagg 27149304  T
Q  934 agt-acaggaaattagcttaaagcctctcaaaagaacaagact 975  Q
     || ||| ||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||    
T  27149303 ggtaacaagaaattaccttaaaagctcac-aaagaacaagact 27149262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 869 - 931
Target Start/End: Original strand, 25398517 - 25398580
Alignment:
Q  869 ccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  25398517 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 25398580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 869 - 931
Target Start/End: Original strand, 25403655 - 25403718
Alignment:
Q  869 ccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  25403655 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 25403718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Original strand, 35215595 - 35215649
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  35215595 cagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 35215649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Original strand, 35217972 - 35218026
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  35217972 cagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 35218026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 42453026 - 42452973
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctagggagagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  42453026 cagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccacta 42452973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 105; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 759 - 948
Target Start/End: Original strand, 10640 - 10832
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagatggta-a 857  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |  |    
T  10640 aaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattattga 10739  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattag 948  Q
    | |||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||    
T  10740 cccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattag 10832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 77; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 759 - 952
Target Start/End: Original strand, 17174 - 17370
Alignment:
Q  759 aaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggtaa 857  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || | |    
T  17174 aaaacatacctaaatctaagtatagagcaacaccacaagcataattaaagcaataaagataagaaatgaaagaaaggagcaaacacaccaaaattgttga 17273  T
Q  858 ctcagttcggtccaatatgacctactctagg-gagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagctta 952  Q
    | ||||||||| |||||||||||| | | ||  ||||||||  ||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  17274 cccagttcggttcaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccattatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta 17370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 68; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 758 - 954
Target Start/End: Original strand, 85594 - 85791
Alignment:
Q  758 taaaacagacccaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga-tggta 856  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| || |     
T  85594 taaaacagacctagatctaagtgtagagcaacatcacaagcataaccaaagc-acaaagataagcaatgaaagaaaagaacaaacacatctagattgttg 85692  T
Q  857 actcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgag-tacaggaaattagcttaaa 954  Q
    || |||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| |  ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  85693 acccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcggctctccaatccaccatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaattagcttaaa 85791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 65; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 777 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 8588 - 8431
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaat 873  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |   || | || ||||||||||||||    
T  8588 agtgtagagcaacaccacaagtataaccaaaacaataaagataagcaatgaaagaa-gaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaat 8490  T
Q  874 atgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8489 atgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 8431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 61; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 777 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 44129 - 43973
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaat 873  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |   || | || ||||||||||||||    
T  44129 agtgtagagcaacaccacaagcataaacaaag-aacaaagataagcaatgaaag-aaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaat 44032  T
Q  874 atgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    |||| ||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  44031 atgatctattctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 43973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 778 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 37000 - 36844
Alignment:
Q  778 gtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaata 874  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   || | || |||||||||||||||    
T  37000 gtgtagaccaacaccacaagtataaacaaagcacaa-agataagcaataaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaata 36902  T
Q  875 tgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 931  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||  | |||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  36901 tgacctaatctagggaagagagcagctcgccaacccactatgatgaaagtgttacaaa 36844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 48; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 777 - 922
Target Start/End: Original strand, 45182 - 45329
Alignment:
Q  777 agtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---tggtaactcagttcggtccaat 873  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  ||||| || | |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |   || | |||||||||||| ||||    
T  45182 agtgtagagcaacaccacaaacatatacaaag-aacaaagataagcaatgaaagaatg-aacaaacacaccaaaagattgttgactcagttcggttcaat 45279  T
Q  874 atgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccactaagatgaaag 922  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  45280 atgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaag 45329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 48; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 774 - 932
Target Start/End: Original strand, 23455 - 23614
Alignment:
Q  774 ctaagtgtagagcaacactacaagcata--atcaaagcaatatagataagcaatgaaagaaaggaa-caaacacaccaagatggtaactcagttcggtcc 870  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||  || ||||||| | ||||||| || | ||||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23455 ctaagtgtaaagcaacaccacaagcatataattaaagcaaca-agataagaaa-gcaagaaagaaaacaaaca-accaagatggtaacctagttcggtcc 23551  T
Q  871 aatatgacctactcta-gggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaaat 932  Q
    ||||||||||||| || |||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23552 aatatgacctactttaggggagaaagaagctatccaattcactaagatgaaagtgatacaaat 23614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 867 - 930
Target Start/End: Original strand, 43274 - 43338
Alignment:
Q  867 gtccaatatgacctactctag-ggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 930  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43274 gtccaatatgacctactctagaggagagaacaattctctaatccactaagatgaaagtgatacaa 43338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 41; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 867 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 29570 - 29506
Alignment:
Q  867 gtccaatatgacctactctag-ggagagagcagtcctccaatccactaagatgaaagtgatacaa 930  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29570 gtccaatatgacctactctagaggagagaacaattctctaatccactaagatgaaagtgatacaa 29506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 860 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 320 - 266
Alignment:
Q  860 cagttcggtccaatatgacctactctaggg-agagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  320 cagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 857 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 6481 - 6424
Alignment:
Q  857 actcagttcggtccaatatgacctactct-agggagagagcagtcctccaatccacta 913  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6481 actcagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 6424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University