View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5099-Insertion-3 (Length: 1220)

Name: NF5099-Insertion-3
Description: NF5099
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5099-Insertion-3
NF5099-Insertion-3
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (8-1004)||(77762-78767)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (9-957)||(42177-43132)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (8-1004)||(2495-3501)
[»] chr2 (4 HSPs)
chr2 (7-1004)||(22646522-22647528)
chr2 (7-1004)||(23191710-23192716)
chr2 (179-1004)||(23612627-23613461)
chr2 (7-1004)||(23617326-23618322)
[»] chr6 (4 HSPs)
chr6 (7-1004)||(23494521-23495526)
chr6 (7-1004)||(19026541-19027547)
chr6 (10-52)||(16312413-16312455)
chr6 (443-508)||(26462354-26462419)
[»] chr7 (2 HSPs)
chr7 (7-1004)||(18160607-18161613)
chr7 (10-1004)||(14324880-14325884)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (7-1004)||(6938-7944)
[»] chr3 (11 HSPs)
chr3 (10-1004)||(14684316-14685319)
chr3 (10-1004)||(7342631-7343634)
chr3 (7-871)||(10169138-10170006)
chr3 (10-959)||(10790470-10791426)
chr3 (336-929)||(12022779-12023374)
chr3 (10-526)||(12846320-12846839)
chr3 (10-724)||(13040607-13041324)
chr3 (10-724)||(13048684-13049401)
chr3 (453-685)||(134009-134241)
chr3 (10-124)||(12023589-12023703)
chr3 (939-1004)||(10170046-10170113)
[»] chr4 (3 HSPs)
chr4 (7-1004)||(13278379-13279385)
chr4 (7-1004)||(14558042-14559049)
chr4 (7-871)||(14715431-14716298)
[»] scaffold0101 (3 HSPs)
scaffold0101 (188-1004)||(47433-48258)
scaffold0101 (534-1004)||(52071-52547)
scaffold0101 (10-126)||(48256-48372)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (188-1004)||(22084545-22085370)
chr1 (10-959)||(41369866-41370822)
chr1 (7-877)||(22795770-22796643)
chr1 (315-929)||(21308980-21309594)
chr1 (10-929)||(22685956-22686880)
chr1 (8-126)||(22084429-22084547)
chr1 (21-127)||(21308683-21308789)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (7-1004)||(39312-40318)
[»] scaffold0253 (2 HSPs)
scaffold0253 (10-837)||(24521-25352)
scaffold0253 (878-1004)||(24379-24510)
[»] scaffold1701 (1 HSPs)
scaffold1701 (92-1004)||(1-922)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (7-766)||(31887-32648)
scaffold0022 (762-1004)||(57226-57474)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (10-959)||(1733277-1734233)
chr8 (324-879)||(22334693-22335248)
chr8 (7-282)||(22335268-22335546)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (7-1004)||(21528277-21529283)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (7-929)||(27978-28905)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (7-547)||(22966-23509)
scaffold0270 (669-1004)||(16364-16705)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (7-1004)||(45384-46390)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (9-1004)||(83011-84015)
scaffold0023 (7-502)||(15728-16226)
scaffold0023 (807-965)||(21398-21559)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (7-965)||(23058-24023)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (7-1004)||(116492-117498)
scaffold0001 (7-721)||(388059-388777)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (9-877)||(119584-120455)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (9-1004)||(27127-28130)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (27-1004)||(152553-153539)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (10-929)||(28828-29753)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (7-466)||(38806-39268)
scaffold0130 (519-697)||(38616-38794)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (447-844)||(72169-72566)
[»] scaffold0013 (5 HSPs)
scaffold0013 (441-827)||(118234-118620)
scaffold0013 (441-827)||(126078-126464)
scaffold0013 (15-124)||(110977-111086)
scaffold0013 (39-124)||(125683-125768)
scaffold0013 (15-124)||(117805-117914)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (349-541)||(7593-7785)


Alignment Details
Target: scaffold0051 (Bit Score: 729; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 729; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 1004
Target Start/End: Original strand, 77762 - 78767
Alignment:
Q  8 ggtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagcc 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  77762 ggtagacctccagacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaagccaaattgcttagcc 77861  T
Q  108 acgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattga 207  Q
    || |||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  77862 acatggttaggttgatagccgtacacgccgtatgggcttccagcagtcactcgactggacagaaaggtgggggtaaggtaagcttcccagatggcattga 77961  T
Q  208 tatctacttc---ttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaagaa 304  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  77962 tatctacttcttcttcactagaatcagttgggaatcctactgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaagga 78061  T
Q  305 tgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgaccta 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78062 tgtgcagcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatccggagaactcctatttccatactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgaccta 78161  T
Q  405 ttatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaa 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  78162 ttatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaacaaccagatagggccaggaa 78261  T
Q  505 taatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatatc 604  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||| ||||| |||||    
T  78262 tgatgagactgctaccaggttggaaatcctttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtatagagatcctaagataagcctacttaggcatatatc 78361  T
Q  605 cctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaag 704  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||     
T  78362 cctcccttcatggaattggattgctaaggttgtaaatttcttgggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatgtacatagacagccaataagtcaggaaa 78461  T
Q  705 gcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctccg 804  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  78462 gcaatatgctcctgatcagacattgtggtactagaagtgtcgtggtgatcgatgatgaaattaccataggcaggtctcgagaaatcgaaagatatctccg 78561  T
Q  805 aagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaatg 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  78562 aagaatgggtatcaggatcgaaaatctggcctataggtttcaaaccaactagaccagcaacatctagcaaagtgggagtcagcattccgcattttaaatg 78661  T
Q  904 aagacta-tggttgaagggttccagaatgata--gcagcaattatcatctcattatgat-gtttggtccgtgac-ggatagctgaataagatcgaaaatt 998  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| ||    
T  78662 aagactattggttgaagggttccagaaataaagggcagcaattatcatctcattatgatattttggtccctgacgggataactgaataagatcaaaagtt 78761  T
Q  999 cccatt 1004  Q
    ||||||    
T  78762 cccatt 78767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 659; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 659; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 957
Target Start/End: Original strand, 42177 - 43132
Alignment:
Q  9 gtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagcca 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42177 gtagacctccagacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaagccaaattgcctagcca 42276  T
Q  109 cgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattgat 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |  ||  ||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42277 cgtggttaggttgatatccgtacacgccgtgtggggttccagcaatcactcgattggaaaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccagatggcattgat 42376  T
Q  209 atctacttc---ttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaagaat 305  Q
    |||||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  42377 atctacttcttcttcactagaatcagttgggaatcctgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaagatgtgaaggat 42476  T
Q  306 gtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacctat 405  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42477 gtgcagcataagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatccggagaactcctatttccgtacagaagcatagccaaacctagaccttcgattgacctat 42576  T
Q  406 tatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaat 505  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  42577 catcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgctaactttgttttgaaagtggccagaagccacaattgaaacaaccagatagggccaggaat 42676  T
Q  506 aatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatatcc 605  Q
     | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  42677 gacgacgctactaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcatataaagatcctaatatgagcttactcaggcagatatcc 42776  T
Q  606 ctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaagg 705  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  42777 ctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagacagccaataagttaggaaag 42876  T
Q  706 cgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctccga 805  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  42877 caatatgctcctgatcagacactatggtactagaagtgttgtgatgatctatgatgaaattaccataagcaggcctcaagaaatcgaaagatatctccga 42976  T
Q  806 agaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaatga 904  Q
     |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||     
T  42977 tgaattggtgtcaggatcgaaagtttggcctataggtttcaggccaactagaccagcaacgtctaacaaagtgggagtcagcattccgcattttaaatgt 43076  T
Q  905 agacta-tggttgaagggttccagaa--tgatagcagcaattatcatctcattatg 957  Q
    || ||| | |||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||    
T  43077 aggctatttgttgaagggttccagaaatggagagcaacaattatcatctcattatg 43132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 658; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 658; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 1004
Target Start/End: Original strand, 2495 - 3501
Alignment:
Q  8 ggtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagcc 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2495 ggtagacctccagacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaattaagccaaattgcctagcc 2594  T
Q  108 acgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaa-gcttcccatgtggcattg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  2595 acgtggttaggttgatagccgtacacgccgtatgggcttccagcagtcactcgactggccaaaaaggtcggggtaaggtaaagcttcccagatggcattg 2694  T
Q  207 atatctacttc---ttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaaga 303  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||     
T  2695 atatctacttcttcttcactagaatcagttgggaattttgttgtaaaccatgaaggtccatgagatataatagtgaagggagccatcgaaggtgtgaagg 2794  T
Q  304 atgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacct 403  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2795 atgtgcagcctaagaaggcgttgaaagccactgcaaacaaatccggagaactcctatttccatactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacct 2894  T
Q  404 attatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccagga 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  2895 attatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaaatgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacagttgaaacaaccagatagggccagga 2994  T
Q  504 ataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatat 603  Q
    || |||| |||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  2995 atgatgagactgctaccaagatggatatcctttatgctggatactgcatggttcaaactctcatatagggatcctaagataagcttacttaggcatatat 3094  T
Q  604 ccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaa 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  3095 ccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaacttcttgggaatctgaatcgatcttgagcaaaagatgtacatagacagccaataagtcaggaa 3194  T
Q  704 ggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctcc 803  Q
     || || ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3195 agcaatgtgctcctgatcggacactgtggtattagaagtgtcgtggtgatcgatgatgaaattaccataggcaggtctcgagaaatcgaaagatatctcc 3294  T
Q  804 gaagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaat 902  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||    
T  3295 gaagaatgggtatcaggatcgaaaatctggcctataggttttaaacctactagaccagtaacatctagcaaaatgggagtcagcatcccgcattttaaat 3394  T
Q  903 gaagacta-tggttgaagggttccagaa--tgatagcagcaattatcatctcattatgat-gtttggtccgtgac-ggatagctgaataagatcgaaaat 997  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||   ||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  3395 gaagactattggttgaagggttccaaaaatggagggcagcaattatcatctcattatgatattttggtccctgacgggataactgaataagatcaaaaat 3494  T
Q  998 tcccatt 1004  Q
    |||||||    
T  3495 tcccatt 3501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 630; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 630; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 1004
Target Start/End: Original strand, 22646522 - 22647528
Alignment:
Q  7 aggtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagc 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  22646522 aggtagacctccagacatgctctataaggggtttcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttaatttgaactaagccaaattgtctagc 22646621  T
Q  107 cacgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  22646622 cacatggttaggttgatagccatacaccccgtacggacttccagcagtcactctactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccagatggcatta 22646721  T
Q  207 atatctac---ttcttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaaga 303  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  22646722 atatctacctcttcttcactagaatcagttgggaatcctgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctaatagtgaaaggagccatcgaaggtgtgaagg 22646821  T
Q  304 atgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacct 403  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22646822 atgtgcagcctaggaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatccggagaactcctatttccgtactggagcatggccaaacctagaccttcgattaacct 22646921  T
Q  404 attatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccagga 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22646922 attatcataagctttcgaaagagcacggggcaggtgtactgctaattttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaacaaccagatagggccagga 22647021  T
Q  504 ataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatat 603  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  22647022 atgatgagactactaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcatataaagatcctaaaatgagtttactcaggcaaatat 22647121  T
Q  604 ccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaa 703  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22647122 ctctcccttcatgcaattgggttgctaaggttgtaaacttcttagggatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagacagccaataagtcaggaa 22647221  T
Q  704 ggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctcc 803  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  22647222 agcgatatgctcctgatcagacactgtggtattagaagtgttgtgatggtcgatgatgaaattaccataagtaggtctcgagaaatcgaaagatatctct 22647321  T
Q  804 gaagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaat 902  Q
     | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||| || ||||||||||| || |||||||| || || ||| |||    
T  22647322 tatgaatgggtgtcaggatcgaaagtttggcctataggtttcaaaccgactaggctagcgacgtctagcaaagtaggtgtcagcattccacattttaaat 22647421  T
Q  903 gaagacta-tggttgaagggttccagaa--tgatagcagcaattatcatctcattatgatgttt-ggtccgtgac-ggatagctgaataagatcgaaaat 997  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22647422 gaagactattagttgaggggttccagaaatggagagcagcaattatcatctcattatgatatttaggtccctgacgggatagctgaataagatcaaaaat 22647521  T
Q  998 tcccatt 1004  Q
    |||||||    
T  22647522 tcccatt 22647528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 614; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 1004
Target Start/End: Complemental strand, 23192716 - 23191710
Alignment:
Q  7 aggtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagc 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  23192716 aggtagacctccaaacatgctctataaggggttgcctcaaatcatctaaacatttgtacaatgaacttggcttaatttgaactaagccaaattgtctagc 23192617  T
Q  107 cacgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||    |||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||     
T  23192616 cacatggttaggttgatagccatacaccccgtacggacttccaacagtcactctattggacaaaaaggtaggggtaaggtaagcttcccagatggcatta 23192517  T
Q  207 atatctac---ttcttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaaga 303  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  23192516 atatctacctcttcttcactagaatcagttgggaatcctgctgtaaaccatgaaggcccgtgagatctaatagtgaaaggagccatcgaaggtgtgaagg 23192417  T
Q  304 atgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacct 403  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23192416 atgtgcaacctaggaaggcgttgtaagccgctgcaaacaaatccggagaactcctatttccgtactggagcatggccaaacctagaccttcgattgacct 23192317  T
Q  404 attatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccagga 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23192316 attatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgtactgctaatttggttctgaaagtggccaaaagccacaattgaaataaccagatagggccagga 23192217  T
Q  504 ataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatat 603  Q
    || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  23192216 atgatgagactactaccgggttggaaatcttttatgctggatactgcgtggttcaaactctcatataaagatcctaagatgagcctactcaggcaaatat 23192117  T
Q  604 ccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaa 703  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||    
T  23192116 ctctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaacttcttagggatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacacagacagccaataagtcaagaa 23192017  T
Q  704 ggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctcc 803  Q
     ||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23192016 agcgatatgctcctaatcagacattgtggtattagaagtgttgtgatggtcgatgatgaaattaccataagtaggtctcgagaaatcgaaagatatctcc 23191917  T
Q  804 gaagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaat 902  Q
    || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||    
T  23191916 gatgaatgggtgtcaggatcgaaagtttggcctataggtttcaaaccaactagaccagcaacgtctagcaaagtaggtgtcagcattccgcattttaaat 23191817  T
Q  903 gaagacta-tggttgaagggttccagaa--tgatagcagcaattatcatctcattatgatgttt-ggtccgtgac-ggatagctgaataagatcgaaaat 997  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23191816 gaagactattagttgaggggttccagaaatggagagcagcaattatcatctcattatgatatttaggtccctgacgggatagctgaataagatcaaaaat 23191717  T
Q  998 tcccatt 1004  Q
    |||||||    
T  23191716 tcccatt 23191710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 514; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 179 - 1004
Target Start/End: Complemental strand, 23613461 - 23612627
Alignment:
Q  179 ggtaaggtaagcttcccatgtggcattgatatctac---ttcttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagta 275  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  23613461 ggtaaggtaagcttcccagatggcattaatatctacctcttcttcactagaatcagttgggaatcctgctgtaaaccatgaaggcccgtgagatctaata 23613362  T
Q  276 gtgaagggagccatcgaaggtgtgaagaatgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagca 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23613361 gtgaaaggagccatcgaaggtgtgaaggatgtgcaacctaggaaggcgttgtaagccgctgcaaacaaatccggagaactcctatttccgtactggagca 23613262  T
Q  376 tagccaaacctagaccttcgattgacctattatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagcca 475  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||    
T  23613261 tggccaaacctagaccttcgattgacctattatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgtactgctaatttggttctgaaagtggccaaaagcca 23613162  T
Q  476 caattgaaatagccagatagggccaggaataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagct 575  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  23613161 caattgaaataaccagatagggccaggaatgatgagactactaccgggttggaaatcttttatgctggatactgcgtggttcaaactctcatataaagat 23613062  T
Q  576 cctaagatgagcttactaaggcagatatccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaa 675  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23613061 cctaagatgagcctactcaggcaaatatctctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaacttcttagggatctgaatcgatcttgagcagaaaa 23612962  T
Q  676 tatacatagaaagccaataagttaggaaggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccatagga 775  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |     
T  23612961 tatacacagacagccaataagtcaagaaagcgatatgctcctaatcagacattgtggtattagaagtgttgtgatggtcgatgatgaaattaccataagt 23612862  T
Q  776 aggtctcgagaaatcgaaagatatctccgaagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaa 875  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23612861 aggtctcgagaaatcgaaagatatctccgatgaatgggtgtcaggatcgaaagtttggcctataggtttcaaaccaactagaccagcaacgtctagcaaa 23612762  T
Q  876 gt-ggagtcagcatcccgcactttgaatgaagacta-tggttgaagggttccagaa--tgatagcagcaattatcatctcattatgatgttt-ggtccgt 970  Q
    || || |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  23612761 gtaggtgtcagcattccgcattttaaatgaagactattagttgaggggttccagaaatggagagcagcaattatcatctcattatgatatttaggtccct 23612662  T
Q  971 gac-ggatagctgaataagatcgaaaattcccatt 1004  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23612661 gacgggatagctgaataagatcaaaaattcccatt 23612627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 1004
Target Start/End: Complemental strand, 23618322 - 23617326
Alignment:
Q  7 aggtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagc 106  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| || ||    
T  23618322 aggtagacctccagacatgctttataaggggttgcctcaaatcatctagacacttgtacaatgaatttggcttaatttgaactaagccaaattgtctggc 23618223  T
Q  107 cacgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  23618222 cacatggttaggttgatagccgtacactccgtatgggcttccagcagtgactctactggacagaaaggtgggggtaaggtaagcttcccagatggcatta 23618123  T
Q  207 atatctac---ttcttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaaga 303  Q
    ||||||||   ||||||| ||||||| || |||||    || |||||||||||          |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||     
T  23618122 atatctacctcttcttcagtagaatcggttgggaactccgccgtaaaccatga----------gatctagtggtgaaaggagccatcgaaggtgtgaagg 23618033  T
Q  304 atgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacct 403  Q
    ||||||  | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  23618032 atgtgcaacttaggaaggcattgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctattactgtactggagcatggccaaacctaaaccttcgattgacct 23617933  T
Q  404 attatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccagga 503  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23617932 attatcataggctttcgaaagagcagggggcaggtgtactgctaattttgttctgaaagtggccaaaagccacaattgaaacaaccagatagggccagga 23617833  T
Q  504 ataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatat 603  Q
    || ||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23617832 atgatgaggctgctaccaggttggaagtctcttatgctggatactgcatggttcaaactctcatataaagatcctaagatgagcttactcaggcaaatat 23617733  T
Q  604 ccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaa 703  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  23617732 ctctcccttcatacaattggattgctaaggttgtaaacttcttagggatttgaatcgatcttgagcagaaaatatacatggacagccagtaagtcaggaa 23617633  T
Q  704 ggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctcc 803  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||| |  ||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23617632 agcgatatgctcctgatcagatactgtggtaatcgaagtattatgatggtcaatgatgaagttgccataagcaggtctcgagaaatcgaaagatatctcc 23617533  T
Q  804 gaagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaat 902  Q
    || |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||| |||    
T  23617532 gatgaatggatgtcaggatcgaaagtttggcctataggtttcaaaccgactagaccagcaacgtccagcaaagtaggtgtcagcattctgcattttaaat 23617433  T
Q  903 gaagacta-tggttgaagggttccagaa--tgatagcagcaattatcatctcattatgatgttt-ggtccgtgac-ggatagctgaataagatcgaaaat 997  Q
    |||||||| | || || ||||||| |||   ||  | |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23617432 gaagactattagtcgaggggttcctgaaatggagggaagcaatgatcatctcattatgatatttaggtccctgacgggatagctgaataagatcaaaaat 23617333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 622; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 622; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 1004
Target Start/End: Original strand, 23494521 - 23495526
Alignment:
Q  7 aggtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagc 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  23494521 aggtagacctccagacatgctctataaggggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttaatttgaactaagccaaattgtctagc 23494620  T
Q  107 cacgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattg 206  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  23494621 cacatggttaggtttatagccatacaccccgtacggacttccaacagtcactctactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccagatggcatta 23494720  T
Q  207 atatctac---ttcttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaaga 303  Q
    ||||||||   |||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  23494721 atatctacctcttcttcgctagaatcagttgg-aatcctgctgtaaaccatgaaggctcatgagatctagtagtgaaaggagccatcgaaggtgtgaagg 23494819  T
Q  304 atgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacct 403  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23494820 atgtgcagcctaagaaggcgttgtatgccactgcaaacaaatccggagaactcctatttccgtactggagcatggccaatcctagaccttcgattgacct 23494919  T
Q  404 attatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccagga 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23494920 attatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgtactaccaattttgtcctgaaagtggccaaaagccacaattgaaacagccagatagggccagga 23495019  T
Q  504 ataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatat 603  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  23495020 atgatgagactactaccaggttggaaatcttttatgctggacactgcatggttcaaactctcatataaagatcctaaaatgagcttactcaggcaaatat 23495119  T
Q  604 ccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaa 703  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||    
T  23495120 ctctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaacttcttagggatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagacaaccaataagtccggaa 23495219  T
Q  704 ggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctcc 803  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23495220 agcgatatgctcctgatcagacactgtggtgctagaagtgttgcgatggtcgatgatgaaattaccataagcaggtctcgagaaattgaaagatatctcc 23495319  T
Q  804 gaagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaat 902  Q
    || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||| |||    
T  23495320 gatgaatgggtgtcaggatcgaaagtttggcctataggtttcaaaccgactagaccagcaacgtctagcaaagtaggtgtcagcattccacattttaaat 23495419  T
Q  903 gaagacta-tggttgaagggttccagaa--tgatagcagcaattatcatctcattatgatgttt-ggtccgtgac-ggatagctgaataagatcgaaaat 997  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23495420 gaagactattagttgaggggttccagaaatggagagcagcaattatcatctcattatgatatttaggtccttgacgggatagctgaataagatcaaaaat 23495519  T
Q  998 tcccatt 1004  Q
    |||||||    
T  23495520 tcccatt 23495526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 1004
Target Start/End: Complemental strand, 19027547 - 19026541
Alignment:
Q  7 aggtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagc 106  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||| ||||||||| || |     
T  19027547 aggtagatctccatacatgctctataagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaatctggcttaatctgaactaagccaaattgtctgga 19027448  T
Q  107 cacgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattg 206  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||    ||| |||||||||||||||||||  || || | ||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||     
T  19027447 tacatggttgggttgatagccatacaccccgtatgggcttccagcagtcactctgctagatagaaaggtgggagtaagataagcttcccagatggcatta 19027348  T
Q  207 atatctacttc---ttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaaga 303  Q
    | |||||| ||   |||| |||||||||| || ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||     
T  19027347 acatctacctcatcttcagtagaatcagttggaaactttgctgtaaaccatgtaggcccatgagatctagtggtaaaaggagtcatcgaaggtgtgaagg 19027248  T
Q  304 atgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacct 403  Q
    ||||||  | ||  || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||| ||||||||| || ||    
T  19027247 atgtgcaacttagaaaagcattgtaagccactgcaaataaatctggagaactcctattaccatattggagcatggccaaacctaaaccttcgatcgatct 19027148  T
Q  404 attatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccagga 503  Q
    || ||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||     
T  19027147 atcattgtaggctttcgaaagagcagggggcaggtgtactgctagttttgttctaaaagtggccagaagccataattgaaacaaccagatggggccaggt 19027048  T
Q  504 ataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatat 603  Q
    ||||| |   ||||||||||||  |||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  19027047 ataataaggttgctaccaggttaaaaatcttttatgctagacactgcttggttcagactctcatataaagatcctaagatgagcttacttaagcaaatat 19026948  T
Q  604 ccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaa 703  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |  ||    
T  19026947 ctctcccttcatgcaattgaattgccagggttgtaaatttcttagggatcttaatcgatcttgagcagaaaatatacatagacaaccaataagtcaaaaa 19026848  T
Q  704 ggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctcc 803  Q
     || ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||||| || |||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  19026847 agcaatatgctcctgatcagacactttagtactagaagtgttatgatggtcaatgatgaaattgccataagcaggtctcgagaaatcgaaagatatttcc 19026748  T
Q  804 gaagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagtgga-gtcagcatcccgcactttgaat 902  Q
    || ||||| || |||||||||||  |||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||| ||||| ||| |||  || ||||| ||||| ||| |||    
T  19026747 gatgaatgagtgtcaggatcgaaggtttggcctataggttttaaaccaactaaaccggcaacgtctagtaaaatgggtgtgagcattccgcattttaaat 19026648  T
Q  903 gaagactatg-gttgaagggttccagaat--gatagcagcaattatcatctcattatgatgtttgg-tccgtgacgg-atagctgaataagatcgaaaat 997  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||   ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  19026647 gaagactattagttgaggggttccagaaatggagggcagcaatgatcatctcattatgatatttgggtccctgacgggatagctgaatgagatcaaaaat 19026548  T
Q  998 tcccatt 1004  Q
    |||||||    
T  19026547 tcccatt 19026541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 16312455 - 16312413
Alignment:
Q  10 tagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatc 52  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16312455 tagacctccagacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatc 16312413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 443 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 26462419 - 26462354
Alignment:
Q  443 tgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaataat 508  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| ||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  26462419 tgccagctttgttctaaaagtggccaaaacccacagttggaaaagccaaataggaccaggaataat 26462354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 610; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 610; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 1004
Target Start/End: Complemental strand, 18161613 - 18160607
Alignment:
Q  7 aggtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagc 106  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||    
T  18161613 aggtagacctccagacatgctcaataaggggttgcctcaaatcagctaaacacttgtacaatgaacttggcttaatttgaactaagcaaaattgtctagc 18161514  T
Q  107 cacgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattg 206  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  18161513 cacatgattaggttgatagccatacaccccgtacggacttccagcagtcactctactagacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccaaatggcatta 18161414  T
Q  207 atatctac---ttcttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaaga 303  Q
    |||| |||   |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  18161413 atatatacctcttcttcactagaatcagttgggaaccctgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaaaggagccatcgaaggtgtgaagg 18161314  T
Q  304 atgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacct 403  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18161313 aggtgcagcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatccggagaactcctatttccgtactggagcatggccaaacctagaccttcgattgacct 18161214  T
Q  404 attatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccagga 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  18161213 attatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgtactgctaattttgttctaaaagtggtcaaaagccacaattgaaacaaccagataaggccagga 18161114  T
Q  504 ataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatat 603  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18161113 atgatgagactactaccaggttggaaatcttttattctggatactgcatggttcaaactctcatataaagatcataagatgagcttactcaggcaaatat 18161014  T
Q  604 ccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaa 703  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  18161013 ctctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttagggatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagacagccaataattcaggaa 18160914  T
Q  704 ggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctcc 803  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18160913 agcgatatgctcctgatcagacactgtggtactagaagtgttgtgatggtcgatgatgaaattaccaaaagcaggtctcgagaaatcaaaagatatctcc 18160814  T
Q  804 gaagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaat 902  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||| || ||| |||| ||||| ||| |||    
T  18160813 gatgaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcaaaccgactagactagcaacgtctagccaagtaggtgtcggcattccgcattttaaat 18160714  T
Q  903 gaagacta-tggttgaagggttccagaa--tgatagcagcaattatcatctcattatgatgttt-ggtccgtgac-ggatagctgaataagatcgaaaat 997  Q
    |||||||| | ||| | |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  18160713 gaagactattagttaaggggttccagaaatggagagcagcaattatcatctcattatgatatttaggtccctgacgggatagctgaatgagatcaaaaat 18160614  T
Q  998 tcccatt 1004  Q
    || ||||    
T  18160613 tctcatt 18160607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 607; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 1004
Target Start/End: Complemental strand, 14325884 - 14324880
Alignment:
Q  10 tagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagccac 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| | ||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  14325884 tagacctccagacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatcgaggcacttgtatagtgatcttggcttgatttgaattaagccaaactgcctagccac 14325785  T
Q  110 gtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattgata 209  Q
     ||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  14325784 atggttgggttgatagccgtacacaccgtatgggcttccagcagttactcgactggacaaaaaggtgggagtaaggtaagcttcccagatggcatttata 14325685  T
Q  210 tctacttcttc---actagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaagaatg 306  Q
    |||||||||||   ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | |    
T  14325684 tctacttcttcttcactagaatccgatgggaatcttgccgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtggtaaagggagccatcgaaggtgtgaaagacg 14325585  T
Q  307 tgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacctatt 406  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14325584 tgcagcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatcaggagaactcctatttccgtactgaagcatggccagacctagaccttcgattgacctatt 14325485  T
Q  407 atcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaata 506  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  14325484 atcataagctttcgaaagagtagggggcagatgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacagttggaataaccagatagggccaggaata 14325385  T
Q  507 atgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaagg-cagatatcc 605  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||| || ||| || ||||||    
T  14325384 atgagactgctaccaggttggaaatcttttatactggatactgcatggttcaaactctcgtatagagatcctaagacaagcttgcttaggccatatatcc 14325285  T
Q  606 ctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaagg 705  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||    
T  14325284 ctcccttcatgcaactggatagctaaagtggtaaatttcttgggaatttgaatcgatcttgagcagaaaatatacatggatagccaataagtcaagaagg 14325185  T
Q  706 cgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctccga 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14325184 cgatatgctcctgatcagacactgtggtactagaagtgtcatgatgatcaatgatgaagttaccataggcaggtctcgagaaatcgaaagatatctctga 14325085  T
Q  806 agaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaatga 904  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||    |||    
T  14325084 agaatgggtatcagggtcgaaaatttggcctatgggtttcagaccgactagaccagcaacgtctagcaaagtaggagtcagcatcccacatttcaggtga 14324985  T
Q  905 agacta-tggttgaagggttccagaa-tg-atagcagcaattatcatctcattatgat-gtttggtccgtgac-ggatagctgaataagatcgaaaattc 999  Q
    || ||| |||||||||||||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||| |    
T  14324984 aggctattggttgaagggttccaaaagtgaagagcagcaattatcatttcattatgatattttggtccctgacgggataactgaatgagatcgaaaatac 14324885  T
Q  1000 ccatt 1004  Q
    |||||    
T  14324884 ccatt 14324880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 578; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 1004
Target Start/End: Complemental strand, 7944 - 6938
Alignment:
Q  7 aggtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagc 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  7944 aggtagacctccagacatgctctataaggggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttaatttgaactaagccaaattgtctagc 7845  T
Q  107 cacgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  7844 cacatggttaggttgatagccgtacaccccgtacgggcttccagcagttactctactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccagatggcatta 7745  T
Q  207 atatctac---ttcttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaaga 303  Q
    ||||||||   ||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||     
T  7744 atatctacctcttcttcactagaatcggttgggaaccctgctgtaaaccatgaaggcccatgagatatagtggtgaaaggagccatcgaaggtgtgaagg 7645  T
Q  304 atgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacct 403  Q
    ||||||  ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  7644 atgtgcaacctagaaaggcattgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctattaccgtactagagcatggccaaacccaaaccttcgattgacct 7545  T
Q  404 attatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccagga 503  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7544 attatcataggctttcgaaagagcagggggcaggtgtgctgctaattttgttctgaaagtggccaaaagccacaattgaaacaaccagatagggccagga 7445  T
Q  504 ataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatat 603  Q
    || || |  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  7444 atgataaggctactaccaggttggaaatcgtttatgctggatactgcatggttcaaactctcatataaagatcctaagatgagcttactcaagcaaatat 7345  T
Q  604 ccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaa 703  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||| |||||    
T  7344 ctctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaacttcttagggatctgaatcgatcttgagtagaaaatatacatggacaaccaataagtcaggaa 7245  T
Q  704 ggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctcc 803  Q
     |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7244 agcgatatgctcctgattagacactatggtactagaagtgttatgatggtcgatgatgaagttgccataagcaggtctcgagaagtcgaaagatatctcc 7145  T
Q  804 gaagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaat 902  Q
    || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||    
T  7144 gatgaatgggtgtcaggatcgaaagtttggcctataggtttcaaaccgactagaccagcaacgtctagcaaagtaggtgtcagcattccgcattttaaat 7045  T
Q  903 gaagactatg-gttgaagggttccagaat--gatagcagcaattatcatctcattatgatgttt-ggtccgtgacgg-atagctgaataagatcgaaaat 997  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||   ||  |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||| || |||||||||| ||||| |||||    
T  7044 gaagactattagtcgaagggttccagaaatggagggcagcaatgatcatctcattatgatatttaggtccttgaagggatagctgaatgagatcaaaaat 6945  T
Q  998 tcccatt 1004  Q
    |||||||    
T  6944 tcccatt 6938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 566; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 566; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 1004
Target Start/End: Complemental strand, 14685319 - 14684316
Alignment:
Q  10 tagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagccac 109  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14685319 tagatctccagacatgctctatgagaggctgcctcaaatcatctaggcacttgtacagcgaacttggcttgatttgaattaggccaaattgcctagccac 14685220  T
Q  110 gtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattgata 209  Q
     ||||||||||||||||||||||     || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| || |||    
T  14685219 atggttaggttgatagccgtacacaccatatgggcttccagcggtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaagataagcttcccagatggcgtttata 14685120  T
Q  210 tctacttc---ttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaagaatg 306  Q
    ||||||||   |||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| | |    
T  14685119 tctacttcctcttcactagaatccgatgggaattttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctaatagtgaaaggagccatcgaaggagtgaaggaag 14685020  T
Q  307 tgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacctatt 406  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||||| || |||||    
T  14685019 tgcagcctaagaaggcgttgaaagccactgcaaacaaatccggagaactactatttccatattgaagcatggccagacctaaaccttcgatggatctatt 14684920  T
Q  407 atcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaata 506  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14684919 atcataagctttcaaaagagcagggggcaggtgaactgccagctttgttctgaaagtggccagaagccacagttggaatagccagatagggccagggata 14684820  T
Q  507 atgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatatccc 606  Q
    || | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| || ||||    
T  14684819 ataagactgctaccagattggaaatcctttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtatagagatcctaagataagcttgcttaggcatatgtccc 14684720  T
Q  607 tcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaaggc 706  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||    
T  14684719 tcccttcatgcaactgaatagctaaagtggtaaatttcttgggaatttgaatcgatcttgagcagaaaatatacatggatagccaataagtcaagaaggc 14684620  T
Q  707 gatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctccgaa 806  Q
     |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14684619 aatatgctcctgatccgacactgtagtactagaagtgtcgtgatgatcaatgatgaagttaccatatgcaggtctcgagaaatcgaaagatatctccgag 14684520  T
Q  807 gaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaatgaa 905  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||  ||||||    
T  14684519 gaatgggtatcagggtcgaaaatctggcctatgggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagtaggagttagcatcccacatttcaaatgaa 14684420  T
Q  906 gacta-tggttgaagggttccagaa-tg-atagcagcaattatcatctcattatgat-gtttggtccgtgac-ggatagctgaataagatcgaaaattcc 1000  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| || ||    
T  14684419 ggctattggttgaagggttccagaagtgaagagccgcaattatcatctcattgtgatattttggtccctgacgggataactgaatgagatcgaagatgcc 14684320  T
Q  1001 catt 1004  Q
    ||||    
T  14684319 catt 14684316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 523; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 1004
Target Start/End: Complemental strand, 7343634 - 7342631
Alignment:
Q  10 tagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagccac 109  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||    
T  7343634 tagaactccagacatgctctatgagaggttgcctaaaatcatcgaggcacttgtatagtgaacttggcttgatttgaattaagccaaactgcctagctac 7343535  T
Q  110 gtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattgata 209  Q
     ||||| ||||||||||| ||||    ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  7343534 atggttgggttgatagccatacacaccgtatgggcttccagcagttactcgactagacaaaaaggtgggagtaaggtaagcttcccagatggcatttata 7343435  T
Q  210 tctacttcttc---actagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaagaatg 306  Q
    |||||||||||   ||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||  | |    
T  7343434 tctacttcttcttcactagaatccgatggaaatcttgccgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtggtaaaaggagccatcgaaggtgtaaaagacg 7343335  T
Q  307 tgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacctatt 406  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  7343334 tgcagcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaaaaaatcaggagaactcctatttccatactgaagcatggccagacccagaccttcgattgacctatt 7343235  T
Q  407 atcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaata 506  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  7343234 gtcataagctttagaaagagcagggggcaggtgaactgccaacttggttctgaaagtggctagaagccatagttggaataaccagatagggccagggata 7343135  T
Q  507 atgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatatccc 606  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||| || ||||| || ||||    
T  7343134 atgagactgctaccaggttggaaatctcttatactggatactgcatggttcaaactctcgtacagagatcctaagataagcttgcttaggcatatgtccc 7343035  T
Q  607 tcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaaggc 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || || | ||||||    
T  7343034 tcccttcatgcaattggattgctaaagtggtgaatttcttgggaatctgaatcgaccttgagcaaaaaatgtacatggatagccagtatgtcaagaaggc 7342935  T
Q  707 gatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctccgaa 806  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  7342934 aatatgctcctgatcagacactgtggtactagaggtgtcatgatggtcgatgatgaagttaccataggcaggtctcgaaaaatcgaaagatatctccgag 7342835  T
Q  807 gaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaatgaa 905  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||    
T  7342834 gaatgagtatccgggtcgaaaatttggcctacaggtttcaagcccactaggccagcaacatcaagcaaagtgggagtcagcatcccacactttaagtgaa 7342735  T
Q  906 gacta-tggttgaagggttccagaa--tgatagcagcaattatcatctcattatgat-gtttggtccgtgac-ggatagctgaataagatcgaaaattcc 1000  Q
    | ||| |||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  7342734 ggctattggttgaagggttccagaaatggagagcagcgattatcatctcattatgatattttggtccctgtcgggatagctgaataagatcgaaaactcc 7342635  T
Q  1001 catt 1004  Q
    ||||    
T  7342634 catt 7342631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 475; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 871
Target Start/End: Original strand, 10169138 - 10170006
Alignment:
Q  7 aggtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagc 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| || ||    
T  10169138 aggtagacctccagacatgctctataagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaatttggcttaatttgaactaagccaaattgtctggc 10169237  T
Q  107 cacgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattg 206  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||     |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  |||||||     
T  10169238 cacatggttaagttgatagccgtacactccatacgggcttccagcagtcaccctactggacagaaaggtgggagtgaggtaagcttcccagatggcatta 10169337  T
Q  207 atatctacttc---ttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaaga 303  Q
    |||||||| ||   |||| |||||||||| |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      
T  10169338 atatctacctcatcttcagtagaatcagttgggaactttgccgtaaaccatgtaggcccatgagatctagtggtaaagggagccatcgaaggtgtgaaag 10169437  T
Q  304 atgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacct 403  Q
    ||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  10169438 atgtgcaacctagaaaggcattgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctattgtcgtactggagcatggccaaacctaaaccttcgactgacct 10169537  T
Q  404 attatcataagctttcgaaagagcaggggg-caggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccagg 502  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  10169538 attatcataggctttcgaaagagcagggggacaggtgtactgctaattttgttctgaaattggctaaaagccacaattgaaacaaccagatggggccagg 10169637  T
Q  503 aataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagata 602  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||    
T  10169638 aataataaggctgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcgtggttcaaactctcatataaagatcctaagatgagcttactcaagcaaata 10169737  T
Q  603 tccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttagga 702  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || |    
T  10169738 tctctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaacttcttagggatctgaatcgatcttgagcagaaaatatatatagacaaccaataagtcagaa 10169837  T
Q  703 aggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctc 802  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||  | ||| || |||||||| || ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10169838 aagcgatatgctcttgatcagacgctgtagtactagaagtgttataatggtcaatgatgaaattgccataagcaggtctcgaaaaatcgaaagatatctc 10169937  T
Q  803 cgaagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctag 871  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  10169938 cgatgaatgggtgtcaggatcgaaagtttggcctataggtttcaaaccaactagaccggcaacgtctag 10170006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 959
Target Start/End: Original strand, 10790470 - 10791426
Alignment:
Q  10 tagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagccac 109  Q
    ||||||||||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| || | ||||||    
T  10790470 tagacctccaggcatgctctataaggggttgtctcaaatcatctaaacacttatgcaacgaatttggcttgatttgaactaagccaaactgtcgagccac 10790569  T
Q  110 gtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattgata 209  Q
     || || |||||||||| |||||     || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  || |||| |||    
T  10790570 atgattgggttgatagctgtacacaccataggggcttccagcggtcactcgactggataaaaaggtgggggtaaggtaagcctcccagatgacatttata 10790669  T
Q  210 tctac---ttcttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaagaatg 306  Q
    || ||   ||||||| ||||||| |  |||||| |||  |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||| |      
T  10790670 tccacctcttcttcagtagaatccgatgggaattttgaagtaaaccacgaaggcccacgagatctggtagtaaaaggagccatcgaaggagtaaaggaaa 10790769  T
Q  307 tgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacctatt 406  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || | ||||| ||||||||| || || ||    
T  10790770 tgcagcttaagaaggcgttgaaagccactgcaaataaatctggagagctcctgttcccgtattggagcatggctagacctaaaccttcgatagatctgtt 10790869  T
Q  407 atcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaata 506  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||     
T  10790870 gtcataggctttcgagagagcagggggcaagtgaactgccagctttgttctgaaagtggccaaaagccacagttgaaataaccagacagggccaggaatg 10790969  T
Q  507 atgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatatccc 606  Q
    || | ||||||||||| | | ||||  |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || || |    
T  10790970 ataagactgctaccagctcgaaaattctttatgctggataccgcatggttcaaactttcatataaagatcctaagatgagtttacttaggcatatgtctc 10791069  T
Q  607 tcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaaggc 706  Q
     |||||| ||||| || || ||||| || |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||||||    
T  10791070 gcccttcgtgcaactgaatagctaaagtggtaaattttttggggatttgaatcgatctcgagcagaatatatacatggatagccaataagtcaagaaggc 10791169  T
Q  707 gatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctccgaa 806  Q
     || ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||| | ||||||    
T  10791170 tatgtgctcctgatccgacactgtagtgctagaagtgtcgtaatgatcaatgatgaagttaccataagcaggtctcgaaaaatcaaaagatgtttccgaa 10791269  T
Q  807 gaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaatgaa 905  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| | ||||    
T  10791270 gaatgagtatcaggatcgaaaatttggcctatgggtttcaggccaactaaaccagcaacatctagtaacgtaggagtcagcatcccacattttaagtgaa 10791369  T
Q  906 gacta-tggttgaagggttccagaa-tg-atagcagcaattatcatctcattatgat 959  Q
    | ||| |||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10791370 ggctattggttgaaggattccagaagtgaagagcagcaattatcatttcattatgat 10791426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 336 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 12023374 - 12022779
Alignment:
Q  336 gcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacctattatcataagctttcgaaagagcagggggca 435  Q
    ||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||| | ||||||||  |||||||| || |||   ||||||||||| ||||||   |||||||    
T  12023374 gcaaacaaatctggagaactcatgttgccatactgaagcatggacaaacctattccttcgatggatctaccctcataagcttttgaaagacttgggggca 12023275  T
Q  436 ggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaataatgacactgctaccaggttggaaatcttt 535  Q
    | || ||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| ||||| || | ||| || |||||||| |||||||  |||||||||||||| || || ||    
T  12023274 gatggactgccaatcttgttttgaaagtggccaaaagccataattggaacaaccaaatggggccaggtataatgaggctgctaccaggttgaaagtcctt 12023175  T
Q  536 tatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatatccctcccttcatgcaattggattgctaaggtt 635  Q
     || || |||||  | || |||| | |||| |||||||  || || || |||||||| | ||| || || || |||||||| |  || ||  ||||||||    
T  12023174 aatactagatacctcttgattcagattctcatataaagaccccaaaataagcttactcaagcaaatgtctcttccttcatgtaggtgtatatctaaggtt 12023075  T
Q  636 gtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaaggcgatatgctcctgatcagacactgtggtac 735  Q
    || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || | |||||| ||||  || || || ||||  |||| ||| |||   ||      
T  12023074 gtgaatttcttgggaatttgaattgatctcgagcaaaaaatatacattgacaaccaataggttaaaaaagcaatgtgctattgattagatactccagtgt 12022975  T
Q  736 tacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctccgaagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcc 835  Q
    || | ||||  ||||| || || ||||| || ||||||| ||| || | |||||||||||  | ||| || || || ||||||||||||||| |||||||    
T  12022974 tagaggtgttatgatggtcaattatgaaattgccataggcaggcctagtgaaatcgaaagtcagctctgacgagtgtgtatcaggatcgaaagtttggcc 12022875  T
Q  836 tataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaatgaagacta-tggttgaagggttccagaa 929  Q
     |||||||| |  ||    || |||||||||||||  ||||| || || |||||||| || ||| ||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  12022874 aataggttttaagccagtaaggccagcaacatctaataaagtgggtgtaagcatcccacattttaaatgaagactactagtcgaagggttccagaa 12022779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 12846839 - 12846320
Alignment:
Q  10 tagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagccac 109  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  12846839 tagatctccacacatgctctatcagaggctgcctcaggtcatctacacatttgtacaatgaacttggcctgatttgaaccaagccaaattgcctagctac 12846740  T
Q  110 gtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattgata 209  Q
     |||||||| ||||| || || |    ||| ||||| |||||||  | |   ||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||| | ||||| |      
T  12846739 atggttaggctgatacccatatactccgtatgggctcccagcagcgattttgctggataaaaaggtgggggttaaataagcctcccatatagcattaacg 12846640  T
Q  210 tcta---cttcttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaagaatg 306  Q
    || |   | |||||  | ||||||||  | ||  ||  ||| ||||| |  |||||| |||  ||||| ||||| |||||||||||||| || ||  |||    
T  12846639 tcaacctcatcttcgtttgaatcagttcgaaactttcatgtgaaccaagttggcccacgagtcctagtggtgaaaggagccatcgaaggggtaaaagatg 12846540  T
Q  307 tgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacctatt 406  Q
    | |  | ||||||||| || ||||| |  | |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||  |||||||  || | ||     
T  12846539 tacaacttaagaaggcattataagcaatggaaaacaagtctggagaactcctgttgccatactgaagcatggccaaacctattccttcgacggatcgatc 12846440  T
Q  407 atcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaata 506  Q
     ||||||||||  ||||||   ||||| ||||| | ||| || || ||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||| ||||||||| | |||    
T  12846439 ctcataagcttctgaaagacttgggggaaggtggattgctaatttcgttctgaaagtgggcaaaagccataattgaaacaaccaaatagggccaagtata 12846340  T
Q  507 atgacactgctaccaggttg 526  Q
    ||||  ||||||| ||||||    
T  12846339 atgaggctgctactaggttg 12846320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 724
Target Start/End: Original strand, 13040607 - 13041324
Alignment:
Q  10 tagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagccac 109  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||  ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| | || ||    
T  13040607 tagatctccacacatgttctatcagaggttgcctcaggtcgcctacacatttgtacaatgaacttggcctgatttgaaccaagccaaattgcttggctac 13040706  T
Q  110 gtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattgata 209  Q
     |||||||| ||||| || || |     || ||||| | |||||| | |   || || |||||||||||| | || || || |||||| | ||||| |||    
T  13040707 atggttaggatgatatccatatactccatatgggctcctagcagttattttgctagataaaaaggtggggattagatatgcctcccatatagcattaata 13040806  T
Q  210 tcta---cttcttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaagaatg 306  Q
    || |   | |||||  | |||||||| || ||  ||||||| ||||| |  |||||| |||  |||||  |||| |||||||||||||| || ||  | |    
T  13040807 tcaacctcatcttcggtcgaatcagttggaaactttgctgtgaaccaagtcggcccacgagtcctagtgatgaaaggagccatcgaaggggtaaaagagg 13040906  T
Q  307 tgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacctatt 406  Q
    | |  | ||||||||| || ||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||  | ||| ||||||| ||||||||||   ||||||  ||  |||     
T  13040907 tacaacttaagaaggcattataagcaatggcaaataagtctggagaactcctgttgtcatacagaagcatggccaaacctattgcttcgagggatatatc 13041006  T
Q  407 atcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaata 506  Q
     ||||||||||| |||| |   ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||| || | ||| || |||||||| |||    
T  13041007 ctcataagcttttgaaaaacttgggggcaggtggactgctaatttcgttctgaaagtggccaaaagccataattggaacaaccaaatggggccaggtata 13041106  T
Q  507 atgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatatccc 606  Q
    || |  |||||||||||||| || || || || || || ||  | || |||| | |||| |||||||  || || || || ||||  |  || ||||| |    
T  13041107 ataaggctgctaccaggttgaaagtccttaatactagacacaacttgattcagattctcatataaagaccccaaaataagtttacccaaacaaatatctc 13041206  T
Q  607 tcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaaggc 706  Q
    |  ||||||| |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || | |||||||||||  |||||    
T  13041207 ttacttcatgtagctgtatagctaaggttgtgaatttcttgggaatttggattgatctcgagcaaaaaatatacattgacaaccaataagttaaaaaggc 13041306  T
Q  707 gatatgctcctgatcaga 724  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  13041307 gatgtgctcttgatcaga 13041324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 724
Target Start/End: Original strand, 13048684 - 13049401
Alignment:
Q  10 tagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagccac 109  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||  ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| | || ||    
T  13048684 tagatctccacacatgttctatcagaggttgcctcaggtcgcctacacatttgtacaatgaacttggcctgatttgaaccaagccaaattgcttggctac 13048783  T
Q  110 gtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattgata 209  Q
     |||||||| ||||| || || |     || ||||| | |||||| | |   || || |||||||||||| | || || || |||||| | ||||| |||    
T  13048784 atggttaggatgatatccatatactccatatgggctcctagcagttattttgctagataaaaaggtggggattagatatgcctcccatatagcattaata 13048883  T
Q  210 tcta---cttcttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaagaatg 306  Q
    || |   | |||||  | |||||||| || ||  ||||||| ||||| |  |||||| |||  |||||  |||| |||||||||||||| || ||  | |    
T  13048884 tcaacctcatcttcggtcgaatcagttggaaactttgctgtgaaccaagtcggcccacgagtcctagtgatgaaaggagccatcgaaggggtaaaagagg 13048983  T
Q  307 tgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacctatt 406  Q
    | |  | ||||||||| || ||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||  | ||| ||||||| ||||||||||   ||||||  ||  |||     
T  13048984 tacaacttaagaaggcattataagcaatggcaaataagtctggagaactcctgttgtcatacagaagcatggccaaacctattgcttcgagggatatatc 13049083  T
Q  407 atcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaata 506  Q
     ||||||||||| |||| |   ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||| || | ||| || |||||||| |||    
T  13049084 ctcataagcttttgaaaaacttgggggcaggtggactgctaatttcgttctgaaagtggccaaaagccataattggaacaaccaaatggggccaggtata 13049183  T
Q  507 atgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatatccc 606  Q
    || |  |||||||||||||| || || || || || || ||  | || |||| | |||| |||||||  || || || || ||||  |  || ||||| |    
T  13049184 ataaggctgctaccaggttgaaagtccttaatactagacacaacttgattcagattctcatataaagaccccaaaataagtttacccaaacaaatatctc 13049283  T
Q  607 tcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaaggc 706  Q
    |  ||||||| |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || | |||||||||||  |||||    
T  13049284 ttacttcatgtagctgtatagctaaggttgtgaatttcttgggaatttggattgatctcgagcaaaaaatatacattgacaaccaataagttaaaaaggc 13049383  T
Q  707 gatatgctcctgatcaga 724  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  13049384 gatgtgctcttgatcaga 13049401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 453 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 134241 - 134009
Alignment:
Q  453 gttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcat 552  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| |||||||  | ||| ||||| ||||| || || | ||| | |||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |    
T  134241 gttctaaaagtggccaagagccataattgaagcaaccaaataggaccaggtatgattagactacaaccaggttggaactcttttatgctagccactgctt 134142  T
Q  553 ggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatatccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaat 652  Q
    | |||||  |||| ||||  | |||||||||||| || || ||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| || |||||    
T  134141 gattcaagttctcatatagggatcctaagatgagtttgctcaggcaaatgtctttcccttcatgcaattggatggctaatgttgtgatttttttgggaat 134042  T
Q  653 ctgaatcgatcttgagcagaaaatatacataga 685  Q
     || || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  134041 ttgtatggatctcgagcaaaaaatgtacataga 134009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 12023703 - 12023589
Alignment:
Q  10 tagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagccac 109  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  || ||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| || ||    
T  12023703 tagatctccatacatgttctatcagaggctgcctcaggtcgtctacgcacttgtacagtgaacttggcctgatttgaaccaagccaaattgcctggctac 12023604  T
Q  110 gtggttaggttgata 124  Q
     |||||||| |||||    
T  12023603 atggttaggctgata 12023589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 939 - 1004
Target Start/End: Original strand, 10170046 - 10170113
Alignment:
Q  939 caattatcatctcattatgatgttt-ggtccgtgacgg-atagctgaataagatcgaaaattcccatt 1004  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10170046 caatgatcatctcattatgatatttaggtccctgacgggatagctgaatgagatcaaaaattcccatt 10170113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 550; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 1004
Target Start/End: Complemental strand, 13279385 - 13278379
Alignment:
Q  7 aggtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagc 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||    
T  13279385 aggtagacctccaaacatgctctataagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaacgaatttggcttaatctgaactaggccaaattgtctggc 13279286  T
Q  107 cacgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattg 206  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |     |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  13279285 cacatggttaggttgataaccgtatactccatacgggcttccagcggtcaccctactggacagaaaggtgggggtaaggtaagcttcccaaatggcatta 13279186  T
Q  207 atatctac---ttcttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaaga 303  Q
    ||||||||   ||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||     
T  13279185 atatctacctcttcttcagtagaatcagttgggaactttgctgtaaaccatgtaggcccatgagatctagtggtgaaaggagccatcaaaggtgtgaagg 13279086  T
Q  304 atgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacct 403  Q
     |||||  ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13279085 ttgtgcaacctagaaaggcaatgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctattaccgtactggagcatggccaaacctaaaccttcgattgacct 13278986  T
Q  404 attatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccagga 503  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  13278985 attatcataggctttcgaaagagcaggaggcatgtgtactgctaattttgttctgaaagtggccaaaagccacaattgaaacaaccagatggggccagga 13278886  T
Q  504 ataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatat 603  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  13278885 atgataaggctactaccaggttggaaatcttttatgctggatactacatggttcaaactctcatataaagatcctaagatgagcttactcaagcaaatat 13278786  T
Q  604 ccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaa 703  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  13278785 ctctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaacttcttagggatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatggacagccaataagtcaggaa 13278686  T
Q  704 ggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctcc 803  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13278685 agcgatatgctcctgatcagacactgtggtactagaagtgttatgatggtcgatgatgaagttgccataagcaggtctcgagaaatcgaaagatatctcc 13278586  T
Q  804 gaagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaat 902  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||    
T  13278585 gatgaatgggtatcaggatcgaaagtttggcctataagtttcaaaccgactagaccagcaacgtctagcaaagtaggtgtcagcattccgcattttaaat 13278486  T
Q  903 gaagactatg-gttgaagggttccagaat--gatagcagcaattatcatctcattatgatgttt-ggtccgtgac-ggatagctgaataagatcgaaaat 997  Q
    |||| ||||  ||||| |||||||||||   ||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||| ||||  |||||    
T  13278485 gaaggctattagttgaggggttccagaaatggagggcagcaatgatcatctcattgtgatatttaggtccctgacaggatagctgaatgagattaaaaat 13278386  T
Q  998 tcccatt 1004  Q
    |||||||    
T  13278385 tcccatt 13278379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 515; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 1004
Target Start/End: Complemental strand, 14559049 - 14558042
Alignment:
Q  7 aggtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagc 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||    
T  14559049 aggtagacctccaaacatgctctataaggggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggtttaatttgaattaagccaaattgcctagc 14558950  T
Q  107 cacgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||     
T  14558949 cacatggttaggttgatagccgtacaccccgtacgggcttccagcagtcactctactagacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccagatgacatta 14558850  T
Q  207 atatctacttcttc---actagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaaga 303  Q
    | ||||||||||||   ||||||||| || ||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||     
T  14558849 acatctacttcttcttcactagaatcggttgggaaccctgctgtaaaccataaaggcccacgagatctagtggtgaaaggagccatcgaaggtgtgaagg 14558750  T
Q  304 atgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacct 403  Q
    ||||||  ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  14558749 atgtgcaacctagaaaggcattgtaggccactgcaaacaaatctggagaactcctattaccgtactggagcatggccaaacctaaaccttcgattgacct 14558650  T
Q  404 attatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccagga 503  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14558649 attatcataggctttcgaaagagcatggggcaggtgtactgctaattttgttctgaaagtggccaaaagccacaattgaaacaaccagatagggccagga 14558550  T
Q  504 ataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttc-aaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagata 602  Q
    || || |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| | ||| |||    
T  14558549 atgataaggctactaccaggttggaaatcttttatgctggataccgcatggttcaaaactctcatataaagatcataagatgagcttactcaagcaaata 14558450  T
Q  603 tccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttagga 702  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||  |||    
T  14558449 tctctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaacttcttagggatctgaatcgatcttgagtagaaaatatacatggacaaccaataagtctgga 14558350  T
Q  703 aggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctc 802  Q
    | || |||||||||||||| || | |||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  14558349 aagcaatatgctcctgatcggataatgtggtactagaagtgttatgatgatcaatgatgaagttgccataagcaggtctcgagaagtctaaagatatctc 14558250  T
Q  803 cgaagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaa 901  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||| ||| ||    
T  14558249 cgatgaatgggtgtcgggatcgaaaatctgacctataggtttcagaccgactagaccagcaacgtctaacaaagtaggtgtcagcattccgcattttaaa 14558150  T
Q  902 tgaagactatggttgaaggg-ttccagaa--tgatagcagcaattatcatctcattatgatgttt-ggtccgtgac-ggatagctgaataagatcgaaaa 996  Q
    ||||| ||||   | ||||| ||||||||   ||  |||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||    
T  14558149 tgaaggctattagtcaagggattccagaaatggagggcagaaatgatcatctcattatgatatttaggtccctgacgggatagttgaatgagatcaaaaa 14558050  T
Q  997 ttcccatt 1004  Q
    ||||||||    
T  14558049 ttcccatt 14558042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 871
Target Start/End: Complemental strand, 14716298 - 14715431
Alignment:
Q  7 aggtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagc 106  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  14716298 aggtagacctccatacatgttctataagaggttgcctcaggtcatctagacatttgtacaatgaatctggcttgatttgaactaagccaaattgtctggc 14716199  T
Q  107 cacgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattg 206  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||     || |||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||| || || |||||||||||  |||||||     
T  14716198 tacatggttgggttgatagccatacactccatatgggcttccagcagttactctactagacagaaaggtgggagttagataagcttcccaaatggcatta 14716099  T
Q  207 atatctacttc---ttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaaga 303  Q
    | |||||||||   |||| |||||||||  || ||  ||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| || || |||||||||||| |||||||      
T  14716098 acatctacttcatcttcagtagaatcagctggaaactttgctgtaaaccatgtaggcccgtgagtcctagtggtaaaaggagccatcgaaagtgtgaaag 14715999  T
Q  304 atgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacct 403  Q
    |||| |  | ||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||||| |||||||||| |||||||||||  ||    
T  14715998 atgtacaacttaaaaaagcattgtaagctactgcaaataaatctggagagctcctgttgccatattggagcatggccaaacctaaaccttcgattggtct 14715899  T
Q  404 attatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccagga 503  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||     
T  14715898 attattataatctttcgaaagagcagggggcagatgtactgctaacttcgttctgaaagtggctaagagccataattgaaataaccagatggggccaggt 14715799  T
Q  504 ataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatat 603  Q
    ||||  |   |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||| | | || |||| || |||||| || |||||||| | ||| ||||    
T  14715798 ataacaaggttgctactaggttggaaatctttaatgctagatactgcttgattcagattttcatatagagatcctaaaataagcttactcaagcaaatat 14715699  T
Q  604 ccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaa 703  Q
    |  |||||||||||||||| || ||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| ||||| |  ||    
T  14715698 ctatcccttcatgcaattgaatagctaaagttgtaagcttcttgggaatctggatcgatctcgagcaaaaaatgtacattgacaaccagtaagtcaaaaa 14715599  T
Q  704 ggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctcc 803  Q
     || |||||||| ||||| ||||||  || |||| |||| || ||||| || || ||||| ||  |||| | ||||||||  |||||||| || |  ||     
T  14715598 agcaatatgctcttgatcggacacttcggcactagaagtatcatgatggtcaattatgaaattgacataagcaggtctcgtaaaatcgaaggacaattct 14715499  T
Q  804 gaagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctag 871  Q
    || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||    
T  14715498 gaggaatgtgtgtcaggatcaaaggtttggccaataggttttaaaccaactagaccagcaacgtctag 14715431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 549; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 549; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 188 - 1004
Target Start/End: Complemental strand, 48258 - 47433
Alignment:
Q  188 agcttcccatgtggcattgatatctacttcttc---actagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaaggga 284  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||   | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48258 agcttcccagatggcattaatatctacttcttcttcagtagaatcagttgggaatcttgttgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtaaaggga 48159  T
Q  285 gccatcgaaggtgtgaagaatgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaac 384  Q
    |||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48158 gccatcgaaggtgtgaaagacgtgcagcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatcaggagaactcctatttccgtactgaagcatggccaaac 48059  T
Q  385 ctagaccttcgattgacctattatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaa 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  48058 ctagaccttcgattgacctattatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacagttggaa 47959  T
Q  485 tagccagatagggccaggaataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatg 584  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  47958 taaccagatagggccaggaataatgagactgctaccaggttggaaatcttttatactggatactgcatggttcaaactctcgtatagagatcctaagata 47859  T
Q  585 agcttactaaggcagatatccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatag 684  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  47858 agcttgcttaggcatatatccctcccttcatgcaattggattgctaaagtggtgaatttcttgggaatcagaatcgatcttgagcaaaaaatgtacatgg 47759  T
Q  685 aaagccaataagttaggaaggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcga 784  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47758 atagccaataagtcaagaaggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactagaagtgtcgtgatgatcaatgatgaagttaccataggcaggtctcga 47659  T
Q  785 gaaatcgaaagatatctccgaagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtc 883  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47658 aaaatcgaaagatatctccgaggaatgagtatcagggtcgaaaatttggcctacaggtttcagacccactagaccagcaacatctagcaaagtaggagtc 47559  T
Q  884 agcatcccgcactttgaatgaagacta-tggttgaagggttccagaa--tgatagcagcaattatcatctcattatgat-gtttggtccgtgac-ggata 978  Q
    |||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || | |||||    
T  47558 agcatcccacactttaagtgaaggctattggttgaagggttccagaaatggagagcagcgattatcatctcattatgatattttggtccctgccgggata 47459  T
Q  979 gctgaataagatcgaaaattcccatt 1004  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  47458 gctgaataagatcgaagattcccatt 47433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 534 - 1004
Target Start/End: Complemental strand, 52547 - 52071
Alignment:
Q  534 tttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatatccctcccttcatgcaattggattgctaagg 633  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52547 tttatactggatactgcatggttcaaactctcgtatagagatcctaagataagcttgcttaggcatatatccctcccttcatgcaattggattgctaaag 52448  T
Q  634 ttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaaggcgatatgctcctgatcagacactgtggt 733  Q
    | || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52447 tggtgaatttcttgggaatctgaattgatcttgagcaaaaaatgtacatggatagccaataagtcaagaaggcgatatgctcctgatcagacactgtggt 52348  T
Q  734 actacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctccgaagaatgggtatcaggatcgaaaatttgg 833  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  52347 actagaagtgtcgtgatgatcaatgatgaagttaccataggcaggtctcgagaaatcgaaagatatctccgaggaatgagtatcagggtcaaaaatttgg 52248  T
Q  834 cctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaatgaagacta-tggttgaagggttccagaa-- 929  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  52247 cctacaggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagtaggagtcagcatcccacattttaagtgaaggctattggttgaagggttccagaaat 52148  T
Q  930 tgatagcagcaattatcatctcattatgat-gtttggtccgtgac-ggatagctgaataagatcgaaaattcccatt 1004  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52147 ggagagcagcgattatcatctcattatgatattttggtccctgccgggatagctgaataagatcgaagattcccatt 52071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 48372 - 48256
Alignment:
Q  10 tagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagccac 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  48372 tagacctccagacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaagcacttgtacaatgaacttggcttgatctgaattaagccaaattgcctagccac 48273  T
Q  110 gtggttaggttgatagc 126  Q
     ||||||||||||||||    
T  48272 atggttaggttgatagc 48256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 537; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 537; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 188 - 1004
Target Start/End: Original strand, 22084545 - 22085370
Alignment:
Q  188 agcttcccatgtggcattgatatctacttcttc---actagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaaggga 284  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||   | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22084545 agcttcccagatggcattaatatctacttcttcttcagtagaatcagttgggaatcttgttgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtaaaggga 22084644  T
Q  285 gccatcgaaggtgtgaagaatgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaac 384  Q
    |||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22084645 gccatcgaaggtgtgaaagacgtgcagcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatcaggagaactcctatttccgtactgaagcatggccaaac 22084744  T
Q  385 ctagaccttcgattgacctattatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaa 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  22084745 ctagaccttcgattgacctattatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacagttggaa 22084844  T
Q  485 tagccagatagggccaggaataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatg 584  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||     
T  22084845 taaccagatagggccaggaataatgagactgctaccaagttggaaatcctttatactggatactgcatggttcaaactctcgtaaagagatcctaagata 22084944  T
Q  585 agcttactaaggcagatatccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatag 684  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  22084945 agcttgcttaggcatatatccctcccttcatgcaattggattgctaaagtggtgaatttcttgggaatcagaatcgatcttgagcaaaaaatgtacatgg 22085044  T
Q  685 aaagccaataagttaggaaggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcga 784  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22085045 atagccaataagtcaagaaggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactagaagtgtcgtgatgatcaatgatgaagttaccataggcaggtctcga 22085144  T
Q  785 gaaatcgaaagatatctccgaagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtc 883  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22085145 aaaatcgaaagatatctccgaggaatgagtatcagggtcgaaaatttggcctacaggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagtaggagtc 22085244  T
Q  884 agcatcccgcactttgaatgaagacta-tggttgaagggttccagaa--tgatagcagcaattatcatctcattatgat-gtttggtccgtgac-ggata 978  Q
    || ||||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || | |||||    
T  22085245 agaatcccacactttaagtgaaggctattggttgaagggttccagaaatggagagcagcgattatcatctcattatgatattttggtccctgccgggata 22085344  T
Q  979 gctgaataagatcgaaaattcccatt 1004  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  22085345 gctgaataagatcgaagattcccatt 22085370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 41370822 - 41369866
Alignment:
Q  10 tagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagccac 109  Q
    ||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| || |||||| || | ||||||    
T  41370822 tagacctccaggcgtgctctataagaggttgcctcaaatcatctaaacacttatgcaacgaacttggcttgatttgaattaagccaaactgtcgagccac 41370723  T
Q  110 gtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattgata 209  Q
     || || ||||| |||| |||||     ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  41370722 atgattgggttggtagctgtacacaccatataggcttccagcggtcactcgactggacaaaaaggtaggggtaaggtaagcttcccagatggcatttata 41370623  T
Q  210 tctac---ttcttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaagaatg 306  Q
    |||||   ||||||| |||| || |  |||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| |      
T  41370622 tctacctcttcttcagtagactccgatgggaattttgcggtaaaccacgaaggcccacgagatctagtagtaaaaggagccatcgaaggagtaaaggaaa 41370523  T
Q  307 tgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacctatt 406  Q
    ||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| || || || |||||||| || | ||||| |||||||||  | |  ||    
T  41370522 tgcagcttaaaaaggcgttgaaagccactgcaaatagatctggagagctcctgttcccatattgaagcatggctagacctaaaccttcgataaatcggtt 41370423  T
Q  407 atcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaata 506  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||     
T  41370422 gtcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccagctttgttctgaaagtggccaaaagccatagttgaaatagtcagatagggccatgaatg 41370323  T
Q  507 atgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatatccc 606  Q
    || | ||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  41370322 ataagactgctaccagcttgaaaatcctttacgctggataccgcatggttcaaactctcatatagagatcctaagatgagcttacttaggcatatgtctc 41370223  T
Q  607 tcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaaggc 706  Q
     |||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  41370222 gcccttcgtgcaactgaatagctaaagtggtaaatttcttgggaatttgaatcgatctcgagcagaaaatatacatggatagccaataagtcaggaaggc 41370123  T
Q  707 gatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctccgaa 806  Q
     || ||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||| |||||||||||| ||    
T  41370122 tatgtgctcctgatccgacacggtagtactagaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataagcaggtctcaaaaaatcaaaagatatctccaaa 41370023  T
Q  807 gaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaatgaa 905  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| |||||||||||||| || ||| ||||||| |||||| || ||| | ||||    
T  41370022 gagtgagtatcaggatcgaaaatttggcctacgggtttcaggccaactaaaccagcaacatctaacagagtaggagtcaacatcccacattttaagtgaa 41369923  T
Q  906 gacta-tggttgaagggttccagaa-tg-atagcagcaattatcatctcattatgat 959  Q
    | ||| |||||||||| ||||| || || | |||||| |||||||||||||| ||||    
T  41369922 ggctattggttgaaggattccaaaagtgaagagcagcgattatcatctcattgtgat 41369866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 7 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 22796643 - 22795770
Alignment:
Q  7 aggtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagc 106  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||  |||||||| || ||    
T  22796643 aggtagatctccatacatgttctataagaggttgcctcaggtcatctagacatttgtacaatgaatctggcttaatttgaactaaaccaaattgtctggc 22796544  T
Q  107 cacgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattg 206  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||     || |||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||| || || |||||||||||  |||||||     
T  22796543 tacgtggttgggttgatagccatacactccataggggcttccagcagttactctactagacagaaaggtgggagtcagataagcttcccaaatggcatta 22796444  T
Q  207 atatctacttc---ttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaaga 303  Q
    | |||||| ||   |||| |||||||||  || ||  | ||||||||||||| |||||| ||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||      
T  22796443 acatctacctcatcttcagtagaatcagctggaaacttggctgtaaaccatgtaggcccgtgagtcctagtggtaaaaggagccatcgaaggtgtgaaag 22796344  T
Q  304 atgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacct 403  Q
    |||| |  | |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  22796343 atgtacaacttaagaaagcattgtaagctactgcaaataaatctggagagctcctgttgccatattggagcatggccaaacctaaaccttcgattgatct 22796244  T
Q  404 attatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccagga 503  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||     
T  22796243 attatcataatctttcgaaagagcagggggcagatgtactgctaacttcgttctgaaagtggctaagagccataattgaaataaccagatggggccaggg 22796144  T
Q  504 ataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatat 603  Q
    ||||  |  ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||| || |||| | | || |||| || |||||| || |||||||| | ||| ||||    
T  22796143 ataacaaggctgctaccaggttggaaatctttaatgttagacactgcttgattcagattttcatatagagatcctaaaataagcttactcaagcaaatat 22796044  T
Q  604 ccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaa 703  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |  ||    
T  22796043 ctctcccttcatgcaattgaatagctaaagttgtaagcttcttgggaatctgaatcgatctcgagcaaaaaatgtacatcgacagccagtaagtcaaaaa 22795944  T
Q  704 ggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctcc 803  Q
     || |||||||| ||||| || |||  || |||| |||| || ||||| || || ||||| || ||||| | ||||||||  |||||||| || |  ||     
T  22795943 agcaatatgctcttgatcggatacttcggcactagaagtatcatgatggtcaattatgaaattgccataagcaggtctcgtaaaatcgaaggacaattct 22795844  T
Q  804 gaagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt 877  Q
    || ||||| || |||||||||||  ||||||| |||||||| | ||| |  ||||||||||| |||| ||||||    
T  22795843 gaggaatgtgtgtcaggatcgaaggtttggccaataggttttaaaccaatgagaccagcaacgtctaacaaagt 22795770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 315 - 929
Target Start/End: Original strand, 21308980 - 21309594
Alignment:
Q  315 aagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacctattatcataag 414  Q
    ||||| || |||||||| |  |||||||||| ||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||    
T  21308980 aagaaagcattgtaagcgatggcaaacaaatttggggaactcctgttaccatactgaagcatggccaaacctaatccttcgattgatctattctcataag 21309079  T
Q  415 ctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaataatgacact 514  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||| ||| || |||||||| ||||| |  ||    
T  21309080 ctttcgaaagagttgtgggcaagtgtactgctaactttgttctgaaagtggctaagagtcataattggaataaccaaatggggccaggtataataaggct 21309179  T
Q  515 gctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatatccctcccttca 614  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||| || || |||| | |||| |||| ||  || || || |||||||| | ||| || |  || |||||     
T  21309180 gctaccaggttggaaatccttaatgctagataccgcttgattcagattctcatatagagaccccaaaataagcttactcaagcaaatgt--cttccttcg 21309277  T
Q  615 tgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaaggcgatatgct 714  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||| || | | ||||||| |  || || |||||||    
T  21309278 tgcaattgtatagctaaggttgtgaacttcttgggaatttgaattgatctcgagcaagaaatgtacattgacaactaataagtcaaaaaagcaatatgct 21309377  T
Q  715 cctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctccgaagaatgggt 814  Q
    | ||||| || |||   |||||| | || || ||||| || || ||||| || ||||||| ||| || | |||||||||||  | ||| || ||||| ||    
T  21309378 cttgatcggatactccagtactagaggtatcatgatggtcaattatgaaattgccataggcaggcctagtgaaatcgaaagtcagctctgatgaatgtgt 21309477  T
Q  815 atcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaatgaagacta-tg 912  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| | |||    || |||||||||||||  ||||| || || |||||||| || ||| ||||||||||| ||    
T  21309478 atcagggtcgaaaatttggccaataggttttaaaccattaaggccagcaacatctaataaagtgggggtaagcatcccacattttaaatgaagactattg 21309577  T
Q  913 gttgaagggttccagaa 929  Q
    || ||||||||| ||||    
T  21309578 gtcgaagggttcaagaa 21309594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 22686880 - 22685956
Alignment:
Q  10 tagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagccac 109  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||  || |||| ||| |||||||||||  ||||| ||||||  || |  ||||||||||| |||||    
T  22686880 tagatctccatacatgctctatcagaggttacctcaggtcgtctacacatttgtacaatgagtttggcctgatttagacaaaaccaaattgcctggccac 22686781  T
Q  110 gtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattgata 209  Q
     |||||||| |||||||| || |     || ||||| |||||||| | || ||| || | ||| |||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |    
T  22686780 atggttaggctgatagccatatactccatatgggctgccagcagtgattctactcgatagaaaagtgggggttaagtaagcttcccatatagcattaaca 22686681  T
Q  210 tctacttc---ttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaagaatg 306  Q
    || || ||   |||||| ||| |||  |||||| ||||| | ||||| |  ||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||| |  ||  | |    
T  22686680 tcaacctcgtcttcactggaaacagctgggaattttgctatgaaccaagttggctcacgagtcctagtggtgaagggagccatcgaaggggcaaaagagg 22686581  T
Q  307 tgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacctatt 406  Q
    | | ||  ||||| || || ||||  |  ||||||||||||||||||||| | |  || | ||||||||| ||||||||||  |||| ||| || |||||    
T  22686580 tacagctcaagaacgcattataagtgatggcaaacaaatctggagaactcatgtcaccatgctgaagcatggccaaacctaatccttagatggatctatt 22686481  T
Q  407 atcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaata 506  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||  |  ||| | || ||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||| || |||||||| |||    
T  22686480 ctcataagctttcgaaagagtggggggcaaatttactactaattttgtcctgaaagtggctaagagccacaattggaataaccaaatggggccaggtata 22686381  T
Q  507 atgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatatccc 606  Q
    || |  |||||||||||||||||||| || || || ||||| || || |||||| |||| |||||||  || || || |||||||| | ||| ||||| |    
T  22686380 ataaggctgctaccaggttggaaatccttaatactagataccgcctgattcaaattctcatataaagaccccaaaataagcttactcaagcaaatatctc 22686281  T
Q  607 tcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaaggc 706  Q
    | |||| ||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||| | ||||| ||||| || | ||||||  | |  || ||    
T  22686280 ttccttgatgcaattgtatagctaaggttgtgaacttcttgggaatctgaattgacctcgagaaaaaaatgtacattgacaaccaatagatcaaaaaagc 22686181  T
Q  707 gatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctccgaa 806  Q
     |||||||| |||||||| |||   |  ||| | || || ||||| || || ||||| ||  |||||| |||||| | |||||||||||  | ||| ||     
T  22686180 aatatgctcttgatcagatacttcagctctagaggtatcatgatggtcaattatgaaattgtcataggcaggtctagtgaaatcgaaagtcagctctgag 22686081  T
Q  807 gaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaatgaa 905  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |  || |  || |||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||    
T  22686080 gaatgtgtatcaggatcgaagatttggccaataggttttaagccaataaggccagcaacatctaataaagtgggagtgagcatcccacattttaagtgaa 22685981  T
Q  906 gact-atggttgaagggttccagaa 929  Q
    ||||  |||| || |||||||||||    
T  22685980 gactgttggtcgaggggttccagaa 22685956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 126
Target Start/End: Original strand, 22084429 - 22084547
Alignment:
Q  8 ggtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagcc 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  22084429 ggtagacctccagacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaagcacttgtacaatgaacttggcttgatctgaattaagccaaattgcctagcc 22084528  T
Q  108 acgtggttaggttgatagc 126  Q
    || ||||||||||||||||    
T  22084529 acatggttaggttgatagc 22084547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Original strand, 21308683 - 21308789
Alignment:
Q  21 acatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagccacgtggttaggtt 120  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  || ||||  || |||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| ||||| || || ||||| || |    
T  21308683 acatgctctatcggaggttgcctcaggtcgtctacgcatttgtacaatgagtttggcctgatttgaaccaagccaaactgcctggctacatggttgggct 21308782  T
Q  121 gatagcc 127  Q
    |||||||    
T  21308783 gatagcc 21308789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 482; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 1004
Target Start/End: Original strand, 39312 - 40318
Alignment:
Q  7 aggtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagc 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||    ||    
T  39312 aggtagacctccagacatgctctataagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtataatgaatttggcttaatctgaacaaggccgaattgttcggc 39411  T
Q  107 cacgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||     |||||| ||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||     
T  39412 cacatggttaggttgatagccgtacactccatacgggtttccagcggtcaccctactggacagaaaggtgggggtaaggtaagcttctcagatggcatta 39511  T
Q  207 atatctacttcttc---actagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaaga 303  Q
    ||||||||||||||   | |||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||     
T  39512 atatctacttcttcttcattagaatcagttgggaactttgctgtaaaccatgtaggcccatgagatctagtggtgaaaggagccatcgaaggtgtgaagg 39611  T
Q  304 atgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacct 403  Q
     |||||  ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  39612 ctgtgcaacctagaaaggcattgtaagtcactgcaaacaaatctggagaactcctattaccatactggagcatggccaaacctaaaccttcgactgacct 39711  T
Q  404 attatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccagga 503  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  39712 attatcataggctttcgaaagagcaaggggcaggtgtactgctaatttcgttctgaaagtggccaaaagccacaattgaaacaaccagatggggccagga 39811  T
Q  504 ataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatat 603  Q
    || || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||| | ||| ||||    
T  39812 atgataaggctgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcgcggttcagactctcatataaagatcctaagatgaacttactcaagcaaatat 39911  T
Q  604 ccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaa 703  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  39912 ctctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtgaacttcttagggatctgaatcgatcttgagtagaaaatatacatagatagccaataagtcagaaa 40011  T
Q  704 ggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctcc 803  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40012 agcgatatgctcttgatcagacactgtagtactagaagtgtcatgatggtcaatgatgaaattgccataagcaggtctcgaaaaatcgaaagatatctcc 40111  T
Q  804 gaagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaat 902  Q
    || |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||    
T  40112 gatgaatgggtgtcaggattgaaagtttggcctataggtttcaaaccaactagaccagccacgtccagcaaagtaggtgtcagcattccgcattttaaat 40211  T
Q  903 gaagacta-tggttgaagggttccagaa--tgatagcagcaattatcatctcattatgatgttt-ggtccgtgac-ggatagctgaataagatcgaaaat 997  Q
    |||||||| | || || || ||||||||   ||  |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||| ||||  |||||    
T  40212 gaagactattagtcgagggattccagaaatggagggcagcaatgatcatctcattatgatatttaggtccctgacgggatagctgaatgagattaaaaat 40311  T
Q  998 tcccatt 1004  Q
    |||||||    
T  40312 tcccatt 40318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 474; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 837
Target Start/End: Complemental strand, 25352 - 24521
Alignment:
Q  10 tagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagccac 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||    
T  25352 tagatctccagacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatcgaggcacttgtacagtgaacttggcttgatttgaattaagccaaactgcctagctac 25253  T
Q  110 gtggttaggttgatagccg-tacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattgat 208  Q
     ||||| |||||||||| | ||||    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  25252 atggttgggttgatagcagatacacaccgtatgggcttccagcagttactcgactggacaaaaaggtgggagtaaggtaagcttcccagatggcatttat 25153  T
Q  209 atctacttcttc---actagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaagaat 305  Q
    ||||||||||||   ||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| ||  |     
T  25152 atctacttcttcttcactagaatccgatggaaatcttgccgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtggtaaaaggatccatcgaaggtgtaaaagac 25053  T
Q  306 gtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacctat 405  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  25052 gtgcagcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatcaggagaactcctatttccatactgaagcatggccagacctagaccttcgattgacctat 24953  T
Q  406 tatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaat 505  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  24952 tgtcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaacttggttctgaaagtggctagaaaccatagttggaataaccagatagggccatgaat 24853  T
Q  506 aatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatatcc 605  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| || |||    
T  24852 aatgagactgctaccaggttggaaatcttttatactggatactgcatggttcaaactctcgtatagagatcctaagataagcttgcttaggcatatgtcc 24753  T
Q  606 ctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaagg 705  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || || | |||||    
T  24752 ctcccttcatgcaattggattgctaatgtggtgaatttcttgggaatctgaatcgaccttgagcaaaaaatgtacatggatagccagtaggtcaagaagg 24653  T
Q  706 cgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctccga 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  24652 cgatatgctcctgatcagacactgtggtactagaagtgtcatgatggtcaatgatgaagttaccataggcaggtctcgaaaaatcgaaagatatctctga 24553  T
Q  806 agaatgggtatcaggatcgaaaatttggccta 837  Q
     ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  24552 ggaatgagtatccgggtcaaaaatttggccta 24521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 878 - 1004
Target Start/End: Complemental strand, 24510 - 24379
Alignment:
Q  878 ggagtcagcatcccgcactttgaatgaagactat-ggttgaagggttccagaat--gatagcagcaattatcatctcattatgatgttt-ggtccgtgac 973  Q
    |||||||||||||| |||||| | | ||| |||| ||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || |    
T  24510 ggagtcagcatcccacactttaagttaagtctattggttgaagggttccagaaatggagagcagcgattatcatctcattatgatattttggtccctgcc 24411  T
Q  974 gg-atagctgaataagatcgaaaattcccatt 1004  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24410 gggatagctgaataagatcgaaaactcccatt 24379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1701 (Bit Score: 472; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1701
Description:

Target: scaffold1701; HSP #1
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 92 - 1004
Target Start/End: Original strand, 1 - 922
Alignment:
Q  92 gccaaattgcctagccacgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagct 191  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1 gccaaactgcctagccacatggttgggttgatagccgtacacaccgtatgggcttccagcagttactcgactggacaaaaaggtgggagtaaggtaagct 100  T
Q  192 tcccatgtggcattgatatctacttc---ttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagcca 288  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||   |||||||||||| |  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  101 tcccagatggcatttatatctacttcttcttcactagaatccgatgggaactttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctaacagtgaaaggagcca 200  T
Q  289 tcgaaggtgtgaagaatgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctag 388  Q
    ||||||| |||||| | |||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||     
T  201 tcgaaggagtgaaggaagtgcagcataagaaggcattgaaagccactacaaacaaatccggagaactcctatttccatattgaagcatggccagacctaa 300  T
Q  389 accttcgattgacctattatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagc 488  Q
    ||| ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  301 accctcgatggatctattatcgtaatctttcgaaagagcagggggcaggtgaaccgccagttttgttctgaaagtggccagaagccatagttggaatagc 400  T
Q  489 cagatagggccaggaataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagct 588  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  401 cagatagggccagggataataagactgctaccaggttgaaaatcctttatgctagatactgcatgattcaaactctcgtatagagatcctaagatgagct 500  T
Q  589 tactaaggcagatatccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaag 688  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  501 tacttaggcatatgtccctcccttcatgcaactggatagctaaagtggtaaatttcttgggaatttgaatcgatcttgagcagaaaatatacatggatag 600  T
Q  689 ccaataagttaggaaggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaa 788  Q
    ||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  601 ccaataagtcaagaaagcaatatgctcctgatcagacactgtagtactagaagtatcatgatgatcaatgatgaagttaccataggcaggtctcgagaaa 700  T
Q  789 tcgaaagatatctccgaagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagca 887  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  701 tcgaaagatatctctgaagaatgggtatcagggtcgaaaatttggcctatgggtttcagaccgactagaccagcaacgtctagcaaagtaggagtcagca 800  T
Q  888 tcccgcactttgaatgaagacta-tggttgaagggttccagaa-tg-atagcagcaattatcatctcattatgat-gtttggtccgtgac-ggatagctg 982  Q
    |||| || ||    ||||| ||| |||||||||||||||| || || | ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| | || ||||| |||    
T  801 tcccacatttcaggtgaaggctattggttgaagggttccaaaagtgaagagcagcaattatcatttcattgtgatattttggtcccttacgggataactg 900  T
Q  983 aataagatcgaaaattcccatt 1004  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  901 aatgagatcgaaaatacccatt 922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 449; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 766
Target Start/End: Original strand, 31887 - 32648
Alignment:
Q  7 aggtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagc 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  31887 aggtagacctccaaacatgctctatgaggtgttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttaatttgaactaagccaaattgtctagc 31986  T
Q  107 cacgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||     
T  31987 cacatggttaggttgatagccgtacaccccgtacgggcttccagcagtcactctactggacaaaaaggtgggg-taaggtaagcttcccagatggcatta 32085  T
Q  207 atatctac---ttcttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaaga 303  Q
    ||||||||   ||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||     
T  32086 atatctacctcttcttcactagaatcggttgggaaccctgctgtgaaccatgaaggcccatgagatctagtggtgaaaggagccatcgaaggcgtgaagg 32185  T
Q  304 atgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacct 403  Q
    ||||||  ||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  | |||||||| |||||||| ||||||    
T  32186 atgtgcaacctagaaaggcattataagccactgcaaacaaatctggagaactcctattaccgtactggagcaatgtcaaacctaaaccttcgactgacct 32285  T
Q  404 attatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccagga 503  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    ||||| |||||||||    
T  32286 attatcatagactttcgaaagagcagggggtaggtgtactactaattttgttctgaaagtggccaaaagccacaattgaaacgatcagatggggccagga 32385  T
Q  504 ataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatat 603  Q
    || || |  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  32386 atgataaggctactaccaggttggaaatcctttatgctggatactgcatggttcaaactctcatataaagatcctaagatgagcttactcaagcaaatat 32485  T
Q  604 ccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaa 703  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||    
T  32486 ctctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaacttcttagggatctgaatcgatcttgagcagaagatatacatggacaaccaataagttaggaa 32585  T
Q  704 ggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagtt 766  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  32586 agcgatatgctcctgatcagacactgtggtactagaagtgttatgatggtcgatgatgaagtt 32648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 762 - 1004
Target Start/End: Original strand, 57226 - 57474
Alignment:
Q  762 aagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctccgaagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccag 861  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  57226 aagttgccataagcaggtctcgagaaatcgaaagatatctccgatgaatgggtgtcaggatcgaaagtttggcctataggtttcaaaccgactagaccag 57325  T
Q  862 caacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaatgaagacta-tggttgaagggttccagaa--tgatagcagcaattatcatctcattatg 957  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| || || ||| ||||||||||| | || || |||||||||||   ||  |||||||| ||||||||||||||    
T  57326 caacgtctagcaaagtaggtgtcagcattccacattttaaatgaagactattagtcgaggggttccagaaatggagggcagcaatgatcatctcattatg 57425  T
Q  958 atgttt-ggtccgtgac-ggatagctgaataagatcgaaaattcccatt 1004  Q
    || ||| | ||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  57426 atatttagttccctgacgggatagctgaatgggatcaaaaattcccatt 57474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 423; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 959
Target Start/End: Original strand, 1733277 - 1734233
Alignment:
Q  10 tagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagccac 109  Q
    ||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||| || |||||| || | ||||||    
T  1733277 tagacctccaggcgtgctctataagaggttgcctcaaatcatctaaacacttatgcaacaaacttggcttgatttgaattaagccaaactgtcgagccac 1733376  T
Q  110 gtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattgata 209  Q
     || || ||||| |||| |||||     || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  1733377 atgattgggttggtagctgtacacaccatatgggcttccagcggtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccagatggcatttata 1733476  T
Q  210 tctac---ttcttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaagaatg 306  Q
    || ||   ||||||| ||||||| |  |||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| |      
T  1733477 tccacctcttcttcagtagaatccgatgggaattttgatgtaaaccacgaaggcccacgagatctagtagtaaaaggagccatcgaaggagtaaaggaaa 1733576  T
Q  307 tgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacctatt 406  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||  |||| || || || |||||||| || | ||||| ||||||||| || || ||    
T  1733577 tgcagcttaagaaggcgttgaaagccactgcaaatagatctggagagttcctgttcccatattgaagcatggctagacctaaaccttcgatagatctgtt 1733676  T
Q  407 atcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaata 506  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1733677 gtcataggctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccagctttgttctgaaagtggccaaaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaatg 1733776  T
Q  507 atgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatatccc 606  Q
    || | ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| ||||| || || |    
T  1733777 ataagactgctaccagcttgaaaatcctttatgctggataccgcatggttcaaactctcatatagagatcctaagatgagtttacttaggcatatgtctc 1733876  T
Q  607 tcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaaggc 706  Q
     |||||||||||| |  || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  1733877 gcccttcatgcaactaaatagctaaagtggtaaatttcttaggaatttgaatcgatctcgagcaaaaaatatacatggatagccaataagtcaggaaggc 1733976  T
Q  707 gatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctccgaa 806  Q
     || ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  1733977 tatgtgctcctgatccgacactgtagtactagaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataagcaggtctcgaaaaatcaaaagatatttccgaa 1734076  T
Q  807 gaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaatgaa 905  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||||||||  || || |||||||||||||| || ||| | ||||    
T  1734077 gagtgagtatcaggatcgaaaatttggcctacgggtttcaggccaactaaaccagcaacatctaataacgtaggagtcagcatcccacattttaagtgaa 1734176  T
Q  906 gacta-tggttgaagggttccagaa-tg-atagcagcaattatcatctcattatgat 959  Q
    | ||| |||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1734177 ggctattggttgaaggattccagaagtgaagagcagcaattatcatctcattgtgat 1734233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 324 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 22335248 - 22334693
Alignment:
Q  324 ttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacctattatcataagctttcgaaa 423  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||  |||||||||    
T  22335248 ttgtaagccaccgcaaataaatctggagagctcctgttgccatattggagcatagccaaacctaaacctttgattggtctattatcatagtctttcgaaa 22335149  T
Q  424 gagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaataatgacactgctaccagg 523  Q
    ||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  22335148 gagcagggggcagatgtactgctagctttgttctgaaagtggctaagagccataattgaaataaccagatggggccaggtataataaggctgctaccagg 22335049  T
Q  524 ttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatatccctcccttcatgcaattgg 623  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||| ||||||| ||||| |||||||||||| | ||| || || |||||||||||||||||     
T  22335048 ttgaaaatcttttatgctagatactgcttggttcagattctcatataaagatcctaggatgagcttacttaagcaaatgtctctcccttcatgcaattga 22334949  T
Q  624 attgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaaggcgatatgctcctgatcag 723  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |  || || |||||||| |||||||    
T  22334948 atagctaaagttgtaaacttcttaggaatctgaatcgatctcgagcagaaaatatacatagacagtcaataagtcaaaaaagcaatatgctcttgatcag 22334849  T
Q  724 acactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctccgaagaatgggtatcaggatc 823  Q
    |||||   |||||| |||  | |||||| || || ||||| || ||||| |  |||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||    
T  22334848 acactccagtactagaagaattgtgatggtcaattatgaaattgccataagcgggtctcgaaaagtcgaaagatacttccgatgaatgtgtatcaggatc 22334749  T
Q  824 gaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagtgg 879  Q
    |||  ||||||| |||||||| | ||| | ||||||  |||  |||||||||||||    
T  22334748 gaaggtttggccgataggttttaaaccaattagaccgacaatgtctagcaaagtgg 22334693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22335546 - 22335268
Alignment:
Q  7 aggtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagc 106  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||| || ||    
T  22335546 aggtagatctccatacatgttctataagaggttgcctcaggtcatctagacatttgtacaatgaatctggcttaatttgaactaagccaaattgtctggc 22335447  T
Q  107 cacgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattg 206  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||     || ||| |||||||||| |||| ||| |||| |||||| || || || |||| ||||||  | |||||     
T  22335446 tacatggttgggttgatagccatacactccatatgggattccagcagttactctactagacagaaaggtaggagttagataagtttcccaaatagcatta 22335347  T
Q  207 atatctact---tcttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagg 282  Q
    | |||||||   |||||| |||||||| | || ||  ||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| |||||||    
T  22335346 acatctacttcatcttcagtagaatcaattggaaactttgctgtaaaccatgtaggcccgtgagtcctagtggtgaagg 22335268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 309; Significance: 1e-173; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 7 - 1004
Target Start/End: Original strand, 21528277 - 21529283
Alignment:
Q  7 aggtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagc 106  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| || || |||| ||| ||||| || ||    
T  21528277 aggtagatctccatacatgctctatgagaggttgcctcaagtcatctaaacacttgtataatgaatctggcttaatctgtactaagccgaattgtctggc 21528376  T
Q  107 cacgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattg 206  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||     || |||||||||||||| |||| | | || | |||||||||||| ||||||||||||||  | |||||     
T  21528377 tacatggttgggttgatagccatacactccatatgggcttccagcagttactctattagatagaaaggtgggggtgaggtaagcttcccaaatagcatta 21528476  T
Q  207 atatcta---cttcttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaaga 303  Q
    | |||||   | |||||| | |||||||| || ||  ||||||||||||| | |||| | ||||  ||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  21528477 acatctacctcatcttcagtggaatcagttggaaactttgctgtaaaccacgtaggctcgtgagtcctagtggtaaaaggagccatcgaaggtgtgaagg 21528576  T
Q  304 atgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacct 403  Q
    ||||||  | ||| || || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || || || || ||||| |||| ||||| |||||| || |  ||    
T  21528577 atgtgcaacttaaaaaagcattgtaagccactgcaaataaatatggagagctcctgttaccatattggagcatggccagacctaaaccttcaatgggtct 21528676  T
Q  404 attatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccagga 503  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||  || || ||||||||     
T  21528677 attgtcgtaggctttcgaaagagcagggggcagatgtattgctaactttgttctgaaagtggctaagagccacagttgaaataaacaaatggggccaggt 21528776  T
Q  504 ataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatat 603  Q
    ||||| |  |||||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |    
T  21528777 ataataaggctgctaccaggttgaaagtcttttatactagacactgcttggttcagactctcatataaagatcctaagatgagcttacttaagcagatgt 21528876  T
Q  604 ccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaa 703  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |  ||    
T  21528877 ctctcccttcatgcaattgaattgctaaggttgtaaacttcttagggatttgaatcgatcttgagtagaaaatatacatggacagccaataagtcaaaaa 21528976  T
Q  704 ggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctcc 803  Q
     || |||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||  ||||| || || ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||    |||    
T  21528977 agcaatatgctcttgatcagacactttagtactagaagtgttatgatggtcaattatgaaattgccataagcaggtctcgagaaatcgaaagaccattcc 21529076  T
Q  804 gaagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaat 902  Q
    || ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||| |||    
T  21529077 gatgaatgtgtgtcaggatcgaaggtctggcctataggttttagaccaactagaccagcaacgtctagcaaagtgggcgtgagcattccacattttaaat 21529176  T
Q  903 gaagacta-tggttgaagggttccag-aatg-atagcagcaattatcatctcattatgatgttt-ggtccgtgac-ggatagctgaataagatcgaaaat 997  Q
    |||||||| | |||||||||||| || |||| |  |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||    
T  21529177 gaagactattagttgaagggttctagaaatgaagggcagcaatgatcatctcattatgatatttgggtccctgacgggatagctggatgagatcaaaaat 21529276  T
Q  998 tcccatt 1004  Q
    |||||||    
T  21529277 tcccatt 21529283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 302; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 7 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 28905 - 27978
Alignment:
Q  7 aggtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagc 106  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| || ||    
T  28905 aggtagatctccatacatgctctataagaggttgcctcaagtcatctaagcacttgtataatgaatctggtttgatttgaactaaaccaaattgtctggc 28806  T
Q  107 cacgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattg 206  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||     || ||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||| || |||||||||||  | |||||     
T  28805 tacatggttgggttgatcgccatacactccatatgggcttccagcagtcactctactagatagaaaggtgggggtcagataagcttcccaaatagcatta 28706  T
Q  207 atatctacttc---ttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaaga 303  Q
    | |||||||||   |||| | |||||||| || ||  ||||||||||||| | |||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||||||||||     
T  28705 acatctacttcatcttcagtggaatcagttggaaactttgctgtaaaccacgtaggcccgtgagtcctagtggtaaaaggagccattgaaggtgtgaagg 28606  T
Q  304 atgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacct 403  Q
    ||||||  | ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || || || || || || ||||| |||||||||| ||||||||| |  ||    
T  28605 atgtgcaacttaaaaaagcattgtaagccactgcaaataaatctggagagcttctgttaccatattggagcatggccaaacctaaaccttcgataggtct 28506  T
Q  404 attatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccagga 503  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||     
T  28505 gttgtcataggctttcgaaagagcagggggcagatgtactgctagctttgttctgaaggtggctaagagccacagttgaaataaccagatggggccaggt 28406  T
Q  504 ataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatat 603  Q
    ||||| |  ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  28405 ataataaggctgctaccaggctgaaaatcttttatactagacactgcttggttcaaactctcatacaaagatcctaagatgagcttacttaagcaaatat 28306  T
Q  604 ccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaa 703  Q
    | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||  ||    
T  28305 ctctcccttcgtgtaattgaattgctaaggttgtaaacttcttagggatctgaatcgatcttgagcagaaaatgtacatagacagcaaataagttaaaaa 28206  T
Q  704 ggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctcc 803  Q
     || |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  ||||| || || ||||| || || ||   ||||||||||||||||||||| |  |||    
T  28205 agcaatatgctcttgatcagacactttggtactataagtgttatgatggtcaattatgaaattgccgtaaccaggtctcgagaaatcgaaagacacttcc 28106  T
Q  804 gaagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaat 902  Q
    || ||||| || |||||||||||  | || ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| || || ||| |||    
T  28105 gatgaatgtgtgtcaggatcgaaggtctgtcctataggttttagaccaactagaccggccacgtctagcaaagtgggcgtgagcattccacattttaaat 28006  T
Q  903 gaagacta-tggttgaagggttccagaa 929  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||    
T  28005 gaagactattagttgaagggttccagaa 27978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 7 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 23509 - 22966
Alignment:
Q  7 aggtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagc 106  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| || ||||||||| |||||    
T  23509 aggtagatctccagacatactcaataaggggttgccccaaatcatctaaacacttgtacattgaacttggtttaatttgaattaagccaaattgtctagc 23410  T
Q  107 cacgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  23409 cacatggttaggttgatagccgtacaccccgtacgggcttccagcagtcactctactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccaaatggcatta 23310  T
Q  207 atatctacttctt---cactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaaga 303  Q
    | |  ||| ||||   |||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||     
T  23309 acaaatacctctttttcactagaatcggttgggaaccctgctgtaaaccatgaaggcccacgagatctagtggtgaaaggagccatcgaaggtgtgaagg 23210  T
Q  304 atgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacct 403  Q
    ||||||  ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  23209 atgtgcaacctagaaaggcattgtaggccactgcaaacaaatctagagaactcctattaccgtactggagcatggccaaagctaaaccttcgattgacct 23110  T
Q  404 attatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccagga 503  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23109 attatcataggctttcgaaagagcagggggcaggtgtactgctaattttgttctgaaagtggccaaaagccacaattgaaacaaccagatagggccagga 23010  T
Q  504 ataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatac 547  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23009 atgataaggctactaccaggttggaaatcttttatgctggatac 22966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 669 - 1004
Target Start/End: Complemental strand, 16705 - 16364
Alignment:
Q  669 cagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaaggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttac 768  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  16705 cagaaaatatacatggacaaccaataagttaggaaagcgatatgctcctgatcggatactgtggcactagaagtgttatgatgatcgatgatgaagttgc 16606  T
Q  769 cataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctccgaagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatc 868  Q
    |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16605 cataagcaggtctcgagaagtcgaaagatatctccgatgaatgggtgtcaggatcgaaagtctgacctataggtttcagaccgactagaccagcaacgtc 16506  T
Q  869 tagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaatgaagacta-tggttgaagggttccagaa--tgatagcagcaattatcatctcattatgatgttt- 963  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||| || | || || || ||||||||   ||  |||||||| |||||||||||||||| |||     
T  16505 tagcaaagtaggtgtcagcattccgcattttaaatgaagattattagtcgagggattccagaaatggagggcagcaatgatcatctcattatgatattta 16406  T
Q  964 ggtccgtgac-ggatagctgaataagatcgaaaattcccatt 1004  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16405 ggtccctgacgggatagctgaatgagatcaaaaattcccatt 16364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 297; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 7 - 1004
Target Start/End: Complemental strand, 46390 - 45384
Alignment:
Q  7 aggtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagc 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||  ||||||| ||| ||    
T  46390 aggtagatctccacacatgctctataagaggttgcctcaagtcatctaaacacttgtataatgaatctggtttgatttgaactaaaccaaatttcctggc 46291  T
Q  107 cacgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattg 206  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||    ||| ||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||| || |||||||||||  | |||||     
T  46290 tacatggttgggttgatagccatacactccgtatgggcttccagcagtcactctactagatagaaaggtgggggtcagataagcttcccaaatagcatta 46191  T
Q  207 atatctacttc---ttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaaga 303  Q
    | |||||| ||   |||| | ||||| || || ||  ||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | || || |||||||||||||||||||||     
T  46190 acatctacctcatcttcagtggaatcggttggaaactttgctgtaaaccacgtaggcccgtgagtcctaatggtaaaaggagccatcgaaggtgtgaagg 46091  T
Q  304 atgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacct 403  Q
    ||||||  | ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  | || || ||||| ||||||||||  ||||| || |  ||    
T  46090 atgtgcaacttaaaaaagcattgtaagccactgcaaataaatctggagagctcctgttaacatattggagcatggccaaacctaatccttcaataggtct 45991  T
Q  404 attatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccagga 503  Q
     || ||||| | ||||||||||||| ||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||     
T  45990 gttgtcataggttttcgaaagagcaaggggcagatgtactgctagctttgttctgaaggtggctaagagccacagttgaaataaccagatggggccaggt 45891  T
Q  504 ataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatat 603  Q
    ||||| |  ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||| |||||| || |||| ||||||||||| |||||| | | | ||||    
T  45890 ataataaggctgctaccaggctgaaaatcttttatactagacactgcttggttcatactctcatacaaagatcctaagatgaccttacttaagtaaatat 45791  T
Q  604 ccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaa 703  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||  ||    
T  45790 ctctcccttcttgcaattgaattgctaaggttgtaaacttcttagggatctgaatcgatcttgagcagaaaatgtacatagacaaccaataagttaaaaa 45691  T
Q  704 ggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctcc 803  Q
     || |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  ||||| || || ||||| || |  || | ||||||||||||||||||||| |  |||    
T  45690 agcaatatgctcttgatcagacactttggtactagaagtgttatgatggtcaattatgaaattgcggtaagcaggtctcgagaaatcgaaagacacttcc 45591  T
Q  804 gaagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaat 902  Q
    || ||||| || |||||||||||  | || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||| |||    
T  45590 gaggaatgtgtgtcaggatcgaaggtctgtcctataggttttagaccaactagaccggcaacgtctagcaaagtgggcgtgagcattccacattttaaat 45491  T
Q  903 gaagacta-tggttgaagggttccag-aatg-atagcagcaattatcatctcattatgatgttt-ggtccgtgac-ggatagctgaataagatcgaaaat 997  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| |||| |  || ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||    
T  45490 gaagactattagttgaagggttccagaaatgaagggcggcaatgatcatttcattatgatatttgggtccctgacgggatagctggatgagatcaaaaat 45391  T
Q  998 tcccatt 1004  Q
    |||||||    
T  45390 tcccatt 45384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 9 - 1004
Target Start/End: Original strand, 83011 - 84015
Alignment:
Q  9 gtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagcca 108  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||| |  || |    
T  83011 gtagatctccatacatgttctataagaggttgcctcaggtcatctaaacacttgtacaatgaatctggcttaatttgaactaagccaaattgtccggcta 83110  T
Q  109 cgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattgat 208  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||     || |||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||||  |  | |||||||||||  | ||||  |     
T  83111 catggttgggttgatagccatacactccatatgggcttccagcagttactctactagacagaaaagtgggatttcgataagcttcccaaatagcatgaac 83210  T
Q  209 atctacttc---ttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaagaat 305  Q
    |||||||||   |||  |||||| ||| || ||  ||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||| ||    
T  83211 atctacttcatcttccgtagaattagttggaaactttgctgtaaaccatgtaggcccgtgagtcctagtggtaaaaggagccatcgaaggtgtgaaggat 83310  T
Q  306 gtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacctat 405  Q
    ||||  | ||| || || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||||| |||||||||| |||||| || |  ||||    
T  83311 gtgcaacttaaaaaagcattgtaagccattgcaaataaatctggagagctcctgttgccatattggagcatggccaaacctaaaccttcaataggtctat 83410  T
Q  406 tatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaat 505  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  83411 tgtcataggctttcgaaagagcagggggcagatgtactgctaactttgttctgaaagtggctatgagccataattgaaataaccagatggggccaggtat 83510  T
Q  506 aatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatatcc 605  Q
    ||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||| | |||| ||||||| ||||| |||||||||||| | ||| || ||     
T  83511 aataaggctgctaccaggttgaaaatcttttatgctagttactgcttggttcagattctcatataaagatcctaggatgagcttacttaagcaaatgtct 83610  T
Q  606 ctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaagg 705  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || |    
T  83611 ctcccttcatgcaattgaatagctaaagttgtaaacttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagacagccaataagtcaaaaaag 83710  T
Q  706 cgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctccga 805  Q
    | ||||| |||||||||||||||   |||||| |||| | |||||| || || ||||| || ||| | | ||||||||| || |||||||| |  |||||    
T  83711 caatatgttcctgatcagacacttcagtactagaagtattgtgatggtcaatcatgaaattgccacaagcaggtctcgaaaattcgaaagacacttccga 83810  T
Q  806 agaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagtgga-gtcagcatcccgcactttgaatga 904  Q
     ||||| || |||||||||||  ||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||| || || ||| | |||    
T  83811 tgaatgtgtgtcaggatcgaaggtttggccgataggttttaaaccaactagaccggcaacgtctagcaaagtgggcgtgagcattccacattttaagtga 83910  T
Q  905 agactatg-gttgaagggttccagaa-tgatag-cagcaattatcatctcattatgatgttt-ggtccgtgac-ggatagctgaataagatcgaaaattc 999  Q
    |||||||  || |||||||||||||| |||  | ||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||| |    
T  83911 agactattagtcgaagggttccagaaatgaagggcagcaatgatcttctcattatgatatttgggtccctgacgggatagctggatgagatcaaaaatcc 84010  T
Q  1000 ccatt 1004  Q
    |||||    
T  84011 ccatt 84015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 502
Target Start/End: Original strand, 15728 - 16226
Alignment:
Q  7 aggtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagc 106  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||||||  ||||| | |||||||| | |||||| | ||| ||    
T  15728 aggtagatctccatacatgttctatgagaggttgcctcaggtcatccacgcacttgtacaatgagtttggcctaatttgaaccaagccaaactacctggc 15827  T
Q  107 cacgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattg 206  Q
     || || || ||||||||||| ||||     ||  |||| |||||||| |||| ||| || | ||||||||| || || |||||||||||| |||||||     
T  15828 tacatgattgggttgatagccatacactccatataggctcccagcagtgactctactagatagaaaggtgggagttagataagcttcccatatggcatta 15927  T
Q  207 atatctacttc---ttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaaga 303  Q
    | ||| |||||   |||  | |||||||  || ||  ||||||||||||| | ||||||  | |  |||||||| || |||||||||||||| |||||      
T  15928 acatcaacttcatcttcggtggaatcagatggaaactttgctgtaaaccaagtaggcccgcgggtcctagtagtaaaaggagccatcgaaggggtgaaag 16027  T
Q  304 atgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacct 403  Q
    |||| |  |  |||||  | || ||||| |  |||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||  |||||||| |  ||    
T  16028 atgtacaactcaagaaaccattataagcgatggcaaacaaatctggggagctcctgtttccatattggagcattgccaaacctaatccttcgatcggtct 16127  T
Q  404 attatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccagg 502  Q
    ||  |||||||||||||||||||  |||||||| ||  || | ||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  16128 atcctcataagctttcgaaagagttgggggcagatgcgctactaacttcgttctgaaagtggctaagagccataattggaataaccaaatagggccagg 16226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 807 - 965
Target Start/End: Original strand, 21398 - 21559
Alignment:
Q  807 gaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagtg-gagtcagcatcccgcactttgaatgaa 905  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||| |  |||| ||||||||||| ||||||| | || |||||||| || |||  |||||    
T  21398 gaatgtgtatcagg-tcaaaaatttggccaattggttttaaaccaataagactagcaacatctaacaaagtgagtgtgagcatcccacattttatatgaa 21496  T
Q  906 gacta-tggttgaagggttccagaatgata--gcagcaattatcatctcattatgatgtttgg 965  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  |||  |||||||| ||||| ||| |||||| |||||    
T  21497 gactattggtcgaagggttccagaaatatagggcagcaatgatcatttcagtatgatatttgg 21559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 7 - 965
Target Start/End: Original strand, 23058 - 24023
Alignment:
Q  7 aggtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagc 106  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||| || ||    
T  23058 aggtagatctccatacatgctctataagaggttgtctcaagtcatctaaacatttgtacaatgaatctggcttaattagaactaagccaaattgtctggc 23157  T
Q  107 cacgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattg 206  Q
     || ||||| ||||||||||| |||| |   || ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| || || || |||||||||||  | |||||     
T  23158 tacatggttgggttgatagccatacacgccatatgggcttccagcggttactctactagacaaaaaggtaggagttagataagcttcccaaatagcatta 23257  T
Q  207 atatcta---cttcttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaaga 303  Q
    | |||||   | |||||| | |||||||| || ||  ||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  23258 acatctacctcatcttcagtggaatcagttggaaactttgctgtaaaccatgtaggcccgtgagtcctagtggtaaaaggagccatcgaaggtgtgaagg 23357  T
Q  304 atgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacct 403  Q
    ||||||  | ||| || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||||| |||||||||| |||||| || |  ||    
T  23358 atgtgcaacttaaaaaagcattataagccactgcaaataaatctggagagctcctgttaccatattggagcatggccaaacctaaaccttcaataggtct 23457  T
Q  404 attatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccagga 503  Q
    ||| || |  ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||     
T  23458 attgtcgttggctttcgaaagagcagggggcagatgtactgctaacttagttctgaaagtggctaagagccataattgaaataaccagatggggccaggt 23557  T
Q  504 ataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatat 603  Q
    ||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| ||||||| | |||| ||||||| ||||| |||||| ||||| | ||| || |    
T  23558 ataataaggctgctaccagtttgaaaatcttttatgctagacactgcttggttcagattctcatataaagatcctaggatgagtttacttaagcaaatgt 23657  T
Q  604 ccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaa 703  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||    
T  23658 ctctcccttcgtgcaattgaatagctaaagttgtaaacttcttaggaatctgaatcgatctcgagcagaaaatatacatagacagccaataagtcaaaaa 23757  T
Q  704 ggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctcc 803  Q
     || ||||| |||||||||||||||   |||||| |||||| |||||| || || ||||| || ||||| | ||||||||| || |||||||| || |||    
T  23758 agcaatatgttcctgatcagacacttcagtactagaagtgttgtgatggtcaattatgaaattgccataagcaggtctcgaaaagtcgaaagacatttcc 23857  T
Q  804 gaagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaat 902  Q
    || ||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| |||| |||||| || || ||||| || || |||   |    
T  23858 gatgaatgtgtgtcaggatcaaaggtttggccgataggttttaaaccaactagaccggcaacgtctaacaaagtgggcgtgagcattccacattttaggt 23957  T
Q  903 gaagacta-tggttgaagggttccag-aatg-atagcagcaattatcatctcattatgatgtttgg 965  Q
    |||||||| | || |||||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23958 gaagactattagtcgaagggttccagaaatgaagggcagcaataatcatctcattatgatatttgg 24023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 7 - 1004
Target Start/End: Complemental strand, 117498 - 116492
Alignment:
Q  7 aggtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagc 106  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| ||| ||||  || ||    
T  117498 aggtagatctccatacatgccctataagaagtttcctcaagtcatctaaacacttgtataatgaatttggcttaatctgaactaagccgaattttctggc 117399  T
Q  107 cacgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattg 206  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||     || |||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||| || |||||||| ||  | |||||     
T  117398 tacatggttgggttgatagccatacactccatatgggcttccagcagttactctactagacagaaaggtgggggttagataagcttctcaaatagcatta 117299  T
Q  207 atatctacttc---ttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaaga 303  Q
    | |||||| ||   |||| | |||||||| || ||  ||||||||||||| | |||||| ||||  ||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  117298 acatctacctcatcttcagtggaatcagttggaaactttgctgtaaaccacgtaggcccgtgagtcctagtggtaaaaggagccatcgaaggtgtgaagg 117199  T
Q  304 atgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacct 403  Q
    ||||||  | ||  || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||||| |||||| || |  ||    
T  117198 atgtgcaacttagaaaagcattgtaagccactgcaaataaatctggagagctcctattaccatattggagcatggccaaacctaaaccttcaataggtct 117099  T
Q  404 attatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccagga 503  Q
    ||| || ||  |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| |||||  |||||||      
T  117098 attgtcgtagactttcgaaagagcagggggcagatgtactgctaactttgttctgaaagtggctaagagccacagttgaaataaccagacggggccagtt 116999  T
Q  504 ataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatat 603  Q
    || || |  ||||| || ||||| || |||||||| || || ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| | ||| || |    
T  116998 atgataaggctgctgcctggttgaaagtcttttatactagacactgcttggttcagactctcatataaagatcctaggatgagcttacttaagcaaatgt 116899  T
Q  604 ccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaa 703  Q
    | ||||||||||| ||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |  ||    
T  116898 ctctcccttcatgtaattaaatagctaaggttgtaaacttcttaggaatctgaatcgatctcgagcagaaaatatacatagacaaccaataagtcaaaaa 116799  T
Q  704 ggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctcc 803  Q
     || |||||||| ||||||||||||   | |||| | || | |||||| || || ||||| || ||||  | ||||||||| ||||||||||| |  ||     
T  116798 agcaatatgctcttgatcagacacttcagcactagacgtattgtgatggtctattatgaaattgccattagcaggtctcgaaaaatcgaaagacacttct 116699  T
Q  804 gaagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaat 902  Q
    || ||||| || |||||||||||  ||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| || || |||   |    
T  116698 gatgaatgtgtgtcaggatcgaaggtttggccgataggttttaaaccaactagaccggcaacgtctagcaaagtgggcatgagcattccacattttaggt 116599  T
Q  903 gaagacta-tggttgaagggttccag-aatg-atagcagcaattatcatctcattatgatgttt-ggtccgtgac-ggatagctgaataagatcgaaaat 997  Q
    |||||||| | || |||||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||    
T  116598 gaagactattagtcgaagggttccagaaatgaagggcagcaatgatcatctcattatgatatttgggtccctgacgggatagctggatgagatcaaaaat 116499  T
Q  998 tcccatt 1004  Q
    |||||||    
T  116498 tcccatt 116492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 721
Target Start/End: Original strand, 388059 - 388777
Alignment:
Q  7 aggtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagc 106  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||||||   |||| | |||||||||| |||||| ||||| ||    
T  388059 aggtagatctccatacatgttctatgaggggttgcctcaagtcatctacgcatttgtacaatgagtctggcctaatttgaactaagccaaactgcctggc 388158  T
Q  107 cacgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattg 206  Q
     || ||||| || |||||||| ||||     || |||||||||||||| |||| ||| || | ||||||||| || || |||||||||||| |||||||     
T  388159 tacatggttgggctgatagccatacactccatatgggcttccagcagttactctactagatagaaaggtgggagttagataagcttcccatatggcatta 388258  T
Q  207 atatctacttcttc---actagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaaga 303  Q
    | ||| ||||| ||   | |||||||||  || ||  ||| ||||||||| |  |||||  |||  ||||| || || |||||||||||||| ||||||     
T  388259 acatcaacttcatctttagtagaatcagctggaaactttgttgtaaaccaagttggcccgcgagtcctagtggtaaaaggagccatcgaaggggtgaagg 388358  T
Q  304 atgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacct 403  Q
    || | |  | |||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||  | || || ||||||||||||||||  |||||||| |  ||    
T  388359 atatacaacttaagaaagcattgtaagcaacagcaaacaaatctggagagctcatgttgtcatattggagcatagccaaacctaagccttcgatgggtct 388458  T
Q  404 attatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccagga 503  Q
    ||  |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| | ||| |||||||| ||||| |  ||||| || || |||| ||| || ||||||||     
T  388459 atcctcataagctttcgaaagagtggggggcagatgcactgctagcttcgttctgaaggtggctaagagccataactggaataaccaaatggggccaggt 388558  T
Q  504 ataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaaga-tgagcttactaaggcagata 602  Q
    ||||| |   ||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || |||  | |||| |||| || |||||| | | |||||||| | ||| |||    
T  388559 ataataaggttgctaccaggttggaaatccttaatgctagacactgcttgattccgattctcatatagagatcctaaaaataagcttactcaagcaaata 388658  T
Q  603 tccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttagga 702  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |  |    
T  388659 tctctcccttcatgcaattgaatagctaaagttgtaaacttcttgggaatctgaattgatctcgagcaaaaaatatacattgatagccaataagtcaaaa 388758  T
Q  703 aggcgatatgctcctgatc 721  Q
    |||| || |||||||||||    
T  388759 aggcaatgtgctcctgatc 388777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 9 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 120455 - 119584
Alignment:
Q  9 gtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagcca 108  Q
    ||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||  |||| | |||||||||| |||||| || || || |    
T  120455 gtagatctccatacctgttctataagaggttgcctcaggtcatctacacatttgtacaatgaatctggcctaatttgaactaagccaaactgtctggcta 120356  T
Q  109 cgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattgat 208  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||    || || ||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||| || || |||||||||||  ||||||| |     
T  120355 catggttgggttgatagccatacattccatatggacttccagcagttactctactagacagaaaggtgggagttagataagcttcccagatggcattaac 120256  T
Q  209 atctacttc---ttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaagaat 305  Q
    |||||||||   |||| |||||||||  || ||  ||| ||||||||| | |||||| ||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||  ||    
T  120255 atctacttcatcttcagtagaatcagctggaaactttgttgtaaaccaagtaggcccgtgagtcctagtggtaaaaggagccatcgaaggtgtgaaagat 120156  T
Q  306 gtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacctat 405  Q
    || | || ||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||||| |||||||||| ||||||||| |  ||||    
T  120155 gtacagcttaaaaaagcattgtaagcaactgcaaataaatctggagagctcctgttgccatattggagcatggccaaacctaaaccttcgatgggtctat 120056  T
Q  406 tatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaat 505  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||    
T  120055 tgtcataagcttttgaaagagcagggggaagatgtactgctaacttcgttctgaaagtggctaagagccataattgaaacaaccaaatagggccaggtat 119956  T
Q  506 aatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatatcc 605  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| | |||| |||| ||  |||||||| || ||||| | ||| |||||     
T  119955 aataaggctgctaccaggttggaaatcttttatgctagacactgcttggttcagattctcatatagagaccctaagataagtttactcaagcaaatatct 119856  T
Q  606 ctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaagg 705  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||||||||| || | ||||||||| |  ||      
T  119855 ctcccttcatgcaattgaatagctaaagttgtaaacttcttgggaatctggattgatatcgagcaaaaaatatacattgacaaccaataagtcaaaaaac 119756  T
Q  706 cgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctccga 805  Q
    | |||||||| ||||||||||||   | |||| |||| |  ||||| || || |||||||| ||||| | ||||||| | || |||||||| |  || ||    
T  119755 caatatgctcttgatcagacacttcagcactagaagtattatgatggtcaattatgaagttgccataagcaggtctcaaaaattcgaaagacaattctga 119656  T
Q  806 agaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt 877  Q
    ||| || || |||||||||||  ||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  119655 agagtgtgtgtcaggatcgaaggtttggccaataggttttaaaccaactagaccagcaacatctagcaaagt 119584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 180; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 1004
Target Start/End: Original strand, 27127 - 28130
Alignment:
Q  9 gtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagcca 108  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||  || |||||||||||  ||||| | ||||||||||  ||||| ||||| || |    
T  27127 gtagatctccatacatgttctataaggggttgcctcaagtcatctacgcatttgtacaatgagtttggcctaatttgaactaaaccaaactgcctggcta 27226  T
Q  109 cgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattgat 208  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||  |  || || ||||||||||| |||| ||| || | ||||||||| || || |||||||||||| ||||||| |     
T  27227 catggtt-ggttgatagccatacacttcatatggacttccagcagttactctactagatagaaaggtgggagttagataagcttcccatatggcattaac 27325  T
Q  209 atctacttc---ttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaagaat 305  Q
    ||| |||||   |||  ||| |||||  |  ||  ||| ||||||||| | |||||| ||||  ||||| || || |||||||||||||| |||||| ||    
T  27326 atcaacttcatcttctttaggatcagctgtaaactttgttgtaaaccaagtaggcccgtgagtcctagtggtaaaaggagccatcgaaggggtgaaggat 27425  T
Q  306 gtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacctat 405  Q
    || |    |||||| || |||||||| |  |||||||||||| |||| ||||| || || || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  27426 gtacaatttaagaaagcattgtaagcaatagcaaacaaatctagagagctcctgttgccatattggagcatggccaaacctagaccttcgatggatctat 27525  T
Q  406 tatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaat 505  Q
    | ||||||| |||||||||||  |||||||| || ||||| | ||| |||||||| ||||| |  ||||| || || || | ||| ||||||||||| ||    
T  27526 tctcataagttttcgaaagagtggggggcagatgcactgctagcttcgttctgaaggtggctaagagccataactggaacaaccaaatagggccaggtat 27625  T
Q  506 aatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatatcc 605  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||| | |||| |||| || |||||| || |||||||| | ||| |||||     
T  27626 aataaggctgctaccaggttggaaatccttaatgctagatactgcttgattcagattctcatatagagatcctaaaataagcttactcaagcaaatatct 27725  T
Q  606 ctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaagg 705  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |  |||     
T  27726 ctcccttcatgcaattgaatagctaaagttgtaaacttcttgggaatctgaattgatctcgagcaaaaaatgtacattgacagccaataagtcaaaaaga 27825  T
Q  706 cgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctccga 805  Q
    | ||||||||||||||| | |||     |||| | || || ||||| || || ||||| || ||||| | |||||| |  ||||||||||| |  || ||    
T  27826 caatatgctcctgatcaaatacttcaacactagaggtatcatgatggtcaattatgaaattgccataagcaggtcttgtaaaatcgaaagacagttctga 27925  T
Q  806 agaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaatga 904  Q
    ||| || || |||||||||||  ||||||| |||||||| | ||| |  ||||||||||| |||| |||||| || || |||||||| || |||  ||||    
T  27926 agagtgtgtgtcaggatcgaaggtttggccaataggttttaaaccaatgagaccagcaacgtctaacaaagtgggtgtgagcatcccacattttagatga 28025  T
Q  905 agacta-tggttgaagggttccagaatgata--gcagcaattatcatctcattatgatgttt-ggtccgtgac-ggatagctgaataagatcgaaaattc 999  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||   ||  |||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||  ||||| |    
T  28026 agactattggtcgaaggattccagaagtgtaaggcagcaatgatcatttcattatgatatttgggtccttgacgggatagctggataagataaaaaatcc 28125  T
Q  1000 ccatt 1004  Q
    |||||    
T  28126 ccatt 28130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 162; Significance: 7e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 1004
Target Start/End: Complemental strand, 153539 - 152553
Alignment:
Q  27 tctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagccacgtggttaggttgatagc 126  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||  || ||||||| |||  ||||| | |||||||| | |||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  153539 tctatgaggggttgcctcaggtcatctacgcatttgtacagtgagtttggcctaatttgaaccaagccaaactgcctggctacatggttgggttgatagc 153440  T
Q  127 cgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattgatatctact---tcttcact 223  Q
    | ||||     || |||||||||||||| |||| ||| || | ||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |  || |||   |||||| |    
T  153439 catacactccatatgggcttccagcagtaactctactagatagaaaggtgggagttagataagcttctcatgtggcattaacgtcaacttcatcttcagt 153340  T
Q  224 agaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaagaatgtgccgcctaagaaggcg 323  Q
    ||||||||| || ||  ||||||||||||| | ||||||  |||  |||||||| || |||||||||||||| |||||  |||| |  | ||||||  |     
T  153339 agaatcagttggaaactttgctgtaaaccaagtaggcccgcgagtcctagtagtaaaaggagccatcgaaggggtgaaagatgtacaacttaagaaaaca 153240  T
Q  324 ttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacctattatcataagctttcgaaa 423  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||||||||||  |||| |||||  ||||  ||||||||||||||||    
T  153239 ttgtaagcaatagcaaacaaatctggagagctcctgttgccatattggagcatggccaaacctaagcctttgattggtctatcctcataagctttcgaaa 153140  T
Q  424 gagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaataatgacactgctaccagg 523  Q
    |||  |||||||| || ||| | ||| | |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||| ||| || |||||||| || || |  ||| |||||||    
T  153139 gagtggggggcagatgcactactaacctcgttctgaaagtggctaagagccataattggaataaccaaatggggccaggtatgataaggctgttaccagg 153040  T
Q  524 ttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatatccctcccttcatgcaattgg 623  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| | || |||| | |||| |||| || ||| || || |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||     
T  153039 ttggaaatctttaatgctagatactacttgattcagattctcatatagagatcccaaaataagcttactcaagcaaatatctctcccttcatgcaattga 152940  T
Q  624 attgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaaggcgatatgctcctgatcag 723  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |  || || || ||||| ||||| |    
T  152939 atagctaaagttgtaaacttcttaggaatctgaattgatctcgagcaaaaaatatacattgacagccaataagtcaaaaacgcaatgtgctcttgatcgg 152840  T
Q  724 acactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctccgaagaatgggtatcaggatc 823  Q
    | |||   |||||  | || || ||||| || || ||||| || ||||| | |||||| |  ||||||||||| |  || || || || |||||||| ||    
T  152839 atactccagtactggaggtatcatgatggtcaattatgaaattgccataagcaggtctagtaaaatcgaaagacagttctgatgagtgtgtatcagggtc 152740  T
Q  824 gaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaatgaagacta-tggttgaaggg 921  Q
    |||  ||||||| |||||||| | ||| |  ||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||  | |||  |||||||||| |||| |||||     
T  152739 gaaggtttggccaataggttttaaaccaataagaccagcaacgtctaacaaagtgggtgtgagcatcccatattttagatgaagactattggtcgaagga 152640  T
Q  922 ttccagaatgata--gcagcaattatcatctcattatgat-gtttggtccgtgac-ggatagctgaataagatcgaaaattcccatt 1004  Q
    ||||||||   ||  |||||||| ||||| ||| ||||||  |||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  152639 ttccagaaatgtaaggcagcaatgatcatttcagtatgatattttggtccttgtcgggatagctggataagatcaaaaatccccatt 152553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 148; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 929
Target Start/End: Original strand, 28828 - 29753
Alignment:
Q  10 tagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagccac 109  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||||||| |  ||||| |||||||||| | |||||| ||||| || ||    
T  28828 tagatctccatacatgttctatcagaggttgcctcaggtcatctacgcacttgtacaataagtttggcctgatttgaaccaagccaaactgcctggctac 28927  T
Q  110 gtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattgata 209  Q
     ||||| ||||||||||| || |     || ||||| |||||||| |||| ||| || | |||||||||||| || |||||||||||| ||||||| | |    
T  28928 atggttgggttgatagccatatactccatatgggctcccagcagtgactctactagatagaaaggtgggggttagataagcttcccatatggcattaaca 29027  T
Q  210 tctacttc---ttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtg-tgaagaat 305  Q
    || |||||   |||  | |||||||  || ||  ||| ||||||||| | ||||||| |||  ||||| || || |||||||||||||| | ||||  |     
T  29028 tcaacttcatcttcgatggaatcagctggaaactttgttgtaaaccaagtaggcccacgagtcctagtggtaaaaggagccatcgaagggggtgaaagag 29127  T
Q  306 gtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacctat 405  Q
    || |  |  | ||| || || ||||| |  |||||||||||||| || ||||| || || ||||||| ||| ||||||||||  |||||||| |  ||||    
T  29128 gtacaactcaggaaagcattataagcgatggcaaacaaatctggggagctcctgttgccatactgaatcatggccaaacctaatccttcgatcggtctat 29227  T
Q  406 tatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaat 505  Q
      |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |  ||||| ||||| |||| ||| || |||||||| ||    
T  29228 cctcataagctttcgaaagagttgggggcagatgtactgctaactttgttctgaaattggctaagagccataattggaataaccaaatggggccaggtat 29327  T
Q  506 aatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatatcc 605  Q
     || |  |||||||||||||||||||| || ||||| |||||  | || |||| | |||| |||| ||  || || || |||||||| | ||| |||||     
T  29328 gataaggctgctaccaggttggaaatccttaatgctagatacctcttgattcagattctcatatagagaccccaaaataagcttactcaagcaaatatct 29427  T
Q  606 ctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaagg 705  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |  || |    
T  29428 cttccttcatgcaattgtatagctaaggttgtgaacttcttgggaatctgaattgatctcgagcaaaaaatgtacattgacagccaataagtcaaaaaag 29527  T
Q  706 cgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctccga 805  Q
    | |||||||| ||||| || |||   |||||| | || || ||||| || || ||||| ||  |||||| ||| || | ||||||||| |  | ||| ||    
T  29528 caatatgctcttgatcggatactccagtactagaggtatcatgatggtcaattatgaaattgtcataggcaggcctagtgaaatcgaaggtcagctctga 29627  T
Q  806 agaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggtttcagaccgactagaccagcaacatctagcaaagt-ggagtcagcatcccgcactttgaatga 904  Q
     ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||| |  || ||||||||||||| |||||| || || |||||||| || ||| |||||    
T  29628 tgaatgtgtatcagggtcaaaaatttggccaataggttttaaaccaataaggccagcaacatctaacaaagtgggtgtgagcatccctcattttaaatga 29727  T
Q  905 agacta-tggttgaagggttccagaa 929  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||    
T  29728 agactattggtcgaagggttccagaa 29753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 85; Significance: 7e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 39268 - 38806
Alignment:
Q  7 aggtagacctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagc 106  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||  ||||||  ||| ||||||||||||  |||| | |||||||||| |||||| | ||| ||    
T  39268 aggtagatctccatacatgttctataaggggttgccccaggtcatctgcacatttgtacaatgaatctggcctaatttgaactaagccaaacttcctggc 39169  T
Q  107 cacgtggttaggttgatagccgtacatgttgtacgggcttccagcagtcactcgactggacaaaaaggtgggggtaaggtaagcttcccatgtggcattg 206  Q
     || || ||||| |||||||| ||||     || |||||||||||||| |||| ||| || | ||||||||| || || |||||||||||| |||||||     
T  39168 tacatgattaggctgatagccatacactccatatgggcttccagcagttactctactagatataaaggtgggagttagataagcttcccatatggcatta 39069  T
Q  207 atatctacttc---ttcactagaatcagtggggaatcttgctgtaaaccatgaaggcccatgagatctagtagtgaagggagccatcgaaggtgtgaaga 303  Q
    | ||| |||||   |||| |||||||||  |||||  ||| ||||||||| | ||||||  ||   ||||| || || |||||||||||||| |||||      
T  39068 acatcaacttcatcttcagtagaatcagctgggaactttgttgtaaaccaagtaggcccgcgaatcctagtggtaaaaggagccatcgaaggggtgaaag 38969  T
Q  304 atgtgccgcctaagaaggcgttgtaagccactgcaaacaaatctggagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacct 403  Q
    |||| | || ||| ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||||||||||  |||||||| |  ||    
T  38968 atgtacagcttaaaaaggcattgtaagcaacaacaaacaaatctggagagctcctgttgccatattggagcatggccaaacctaagccttcgatgggtct 38869  T
Q  404 attatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaactttgttctgaaagtggc 466  Q
    ||  |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| | ||| |||||||| |||||    
T  38868 atcctcataagctttcgaaagagtggggggcagatgtactgctagcttcgttctgaaggtggc 38806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 519 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 38794 - 38616
Alignment:
Q  519 ccaggttggaaatcttttatgctggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatatccctcccttcatgca 618  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||| || |||| | |||| |||| || |||||| || |||||||| | ||| ||||| ||||||||||| |    
T  38794 ccaggttggaaatccttaatgctagacactgcttgattcagattctcatatagagatcctaaaataagcttactcaagcaaatatctctcccttcatgta 38695  T
Q  619 attggattgctaaggttgtaaatttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagt 697  Q
     ||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  38694 gttgaatagctaaagttgtgaacttcttgggaatctggattgatctcgagcaaaaaatgtacattgacagccaataagt 38616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 66; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 447 - 844
Target Start/End: Complemental strand, 72566 - 72169
Alignment:
Q  447 aactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgctggata 546  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| || | ||| | ||||||||| ||||| |  |||||||||||||  || ||||| ||||  |  |    
T  72566 aacttagttctgaaagtggccaaaagccataattggaacaaccaaacagggccaggtataatcaggctgctaccaggttcaaagtctttgatgcaagcca 72467  T
Q  547 ctgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatatccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaatttctt 646  Q
    || | || |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||  | ||| ||||| || || ||||| ||||| |  |||| |||||| || |||||    
T  72466 cttcctgattcagattctcgtataaagatcctaagataagcttacctaagcaaatatctcttccctcatgtaattgtacggctagggttgtgaacttctt 72367  T
Q  647 aggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaaggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaagtgtcg 746  Q
    ||| || || || ||||| ||| |||||||||||||||| | |||| | ||||  ||||| |  ||||| |||||||| |||   || ||| | ||||||    
T  72366 agggatttggatggatctcgagtagaaaatatacatagataaccaaaaggttaaaaaggcaacgtgctcttgatcagatacttcagtgctagaggtgtcg 72267  T
Q  747 tgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctccgaagaatgggtatcaggatcgaaaatttggcctataggttt 844  Q
    ||||| || || || || || ||||||| ||| || |  |||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  72266 tgatggtcaattataaaattgccataggcaggcctggcaaaatcgaaggatagctctgaagaatgcgtatcaggatcgaaagtctggccgatgggttt 72169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 59; Significance: 2e-24; HSPs: 5)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 441 - 827
Target Start/End: Original strand, 118234 - 118620
Alignment:
Q  441 actgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgc 540  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| || | ||| | ||||||| | ||||| |  |||||||||||||  || ||||| ||||    
T  118234 actgctaacttagttctgaaagtggccaaaagccataattggaacaaccaaacagggccaagtataatcaggctgctaccaggttcaaagtctttgatgc 118333  T
Q  541 tggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatatccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaa 640  Q
      |  ||| | || |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||  | ||| ||||| || || ||||| ||||  || |||| |||||| ||    
T  118334 aagccacttcctgattcagattctcgtataaagatcctaagataagcttacctaagcaaatatctcttccctcatgtaattatatggctagggttgtgaa 118433  T
Q  641 tttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaaggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaa 740  Q
     ||||| || || || || ||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| ||||  ||||| |  ||||| |||||||| |||   || ||| |     
T  118434 cttcttggggatttggatggatctcgagtagaaaatatacatagataaccaataggttaaaaaggcaacgtgctcttgatcagatacttcagtgctagag 118533  T
Q  741 gtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctccgaagaatgggtatcaggatcgaaa 827  Q
    ||||||||||| ||||| || || || ||||||| ||| || |  ||||| || |||| ||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  118534 gtgtcgtgatggtcgattataaaattgccataggcaggcctggcaaaatcaaaggatagctctgaagaatgcatatcaggatcgaaa 118620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 441 - 827
Target Start/End: Original strand, 126078 - 126464
Alignment:
Q  441 actgccaactttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgc 540  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| || | ||| | ||||||||| ||||| |  || ||||||||||| || ||||| | ||    
T  126078 actgctaacttagttctgaaagtggccaaaagccataattggaacaaccaaacagggccaggtataatcaggctactaccaggttgaaagtctttgacgc 126177  T
Q  541 tggatactgcatggttcaaactctcgtataaagctcctaagatgagcttactaaggcagatatccctcccttcatgcaattggattgctaaggttgtaaa 640  Q
    | |  ||||| || |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||  |  || ||||  || || ||||| ||||| || |||| |||||| ||    
T  126178 tagccactgcctgattcagattctcgtataaagatcctaagataagcttacctaaacaaatatttcttccctcatgtaattgtatggctagggttgtgaa 126277  T
Q  641 tttcttaggaatctgaatcgatcttgagcagaaaatatacatagaaagccaataagttaggaaggcgatatgctcctgatcagacactgtggtactacaa 740  Q
     ||||| || || || || ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||||| |   |||| | |||||| |||   || ||| |     
T  126278 cttcttggggatttggatggatctcgagcagaaaatatacatagataaccaataggttaaaaaggcaacgcgctctttatcagatacttcagtgctagag 126377  T
Q  741 gtgtcgtgatgatcgatgatgaagttaccataggaaggtctcgagaaatcgaaagatatctccgaagaatgggtatcaggatcgaaa 827  Q
    ||||||||||| || || || || || ||| ||| ||| || |  |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  126378 gtgtcgtgatggtcaattataaaattgccaaaggcaggcctggcaaaatcgaaggatagctctgaagaatgcgtatcaggatcgaaa 126464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Original strand, 110977 - 111086
Alignment:
Q  15 ctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagccacgtggt 114  Q
    ||||| || |||||||| || || |||||||| | ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| || || || |    
T  110977 ctccaaacgtgctctatcaggggctgcctcaagtaatctacacatttatacaatgaacttggcctgatttgaaccaagccaaattgcctggctacatgat 111076  T
Q  115 taggttgata 124  Q
    |||| |||||    
T  111077 taggctgata 111086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 124
Target Start/End: Original strand, 125683 - 125768
Alignment:
Q  39 tgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagccacgtggttaggttgata 124  Q
    |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  125683 tgcctcaagtcatctacacatttatacaatgaacttggcctgatttgaaccaagccaaattgcctggctacatgattaggctgata 125768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Original strand, 117805 - 117914
Alignment:
Q  15 ctccacacatgctctatgagaggttgcctcaaatcatctaaacacttgtacaatgaacttggcttgatttgaactaggccaaattgcctagccacgtggt 114  Q
    ||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||| ||| || |||||||||||| || ||| |||||| | |||||||||| | || || || |    
T  117805 ctccaaacgtgctctatcaggggctgcctcaagtcatctacacatttatacaatgaacttcgcctgaattgaaccaagccaaattgcttggctacatgat 117904  T
Q  115 taggttgata 124  Q
    ||||||||||    
T  117905 taggttgata 117914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 349 - 541
Target Start/End: Original strand, 7593 - 7785
Alignment:
Q  349 gagaactcctatttccgtactgaagcatagccaaacctagaccttcgattgacctattatcataagctttcgaaagagcagggggcaggtgaactgccaa 448  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||  ||||| |||||||||||    ||||| ||||  | |||||     
T  7593 gagaacttctattaccatattgaagcatggccaaacctattccttcgatggatctatcctcatacgctttcgaaaggctggggggaaggttgattgccag 7692  T
Q  449 ctttgttctgaaagtggccagaagccacaattgaaatagccagatagggccaggaataatgacactgctaccaggttggaaatcttttatgct 541  Q
     |||||| |||| ||||||| |||||||| ||| || | ||| ||||||||||| || || |  || |  |||| ||||||||||||||||||    
T  7693 ttttgttttgaaggtggccaaaagccacagttggaacaaccaaatagggccaggtatgattaggctaccgccagattggaaatcttttatgct 7785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University