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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF5100-Insertion-2 (Length: 1147)
Name: NF5100-Insertion-2
Description: NF5100
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF5100-Insertion-2 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 521; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 521; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 369 - 932
Target Start/End: Original strand, 2134891 - 2135455
Alignment:
| Q |
369 |
ccttttagatccagactttctaaaggttggctaaagttccctagacatgaaggaacgttgccacttaagttgttgaacgcaaaatcaagcatcacgagtg |
468 |
Q |
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| T |
2134891 |
ccttttagatccagactttctaaaggttggctaaagttccctagacatgaaggaatgttgccacctaagttgttgaacgtgaaatcaagcatcacgagtg |
2134990 |
T |
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| Q |
469 |
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568 |
Q |
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| T |
2134991 |
atttgagattgcatatggatggggatatttctcctgtcaatgaactatgggaaacatctaagctttttagccttgcttttttccacaaccattcaggtag |
2135090 |
T |
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| Q |
569 |
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668 |
Q |
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| T |
2135091 |
cgatgttatattgttgtttgacaacgtaagaaattccatctcagccaaatctcttataaatgttggaatctcaactaaattgcattcagccaactgtaat |
2135190 |
T |
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| Q |
669 |
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767 |
Q |
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| T |
2135191 |
atttgaagtccagaatttgttaaatgggatgaattgtttccacttaacaatgacagtttgttaaatgataaatctaaaaaaactagctttttgagattca |
2135290 |
T |
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| Q |
768 |
gaaacgtgtcaagctcaagctttccatgcagaaaattagagtgtaggttcaagcaagctaaattggttagattcattaaccaagatggaatttgaccctt |
867 |
Q |
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| T |
2135291 |
gaaacgtgtcaagctcaagctttccatgcagaaaattagagtgtaggttcaagtaagctaaattggttagattcattaaccaagatggaatttgaccctt |
2135390 |
T |
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| Q |
868 |
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932 |
Q |
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| T |
2135391 |
tatatagctatttgttgcacttaatacttctagttgcgtgagatttgcgaaagataatgggatat |
2135455 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 970
Target Start/End: Original strand, 2072166 - 2073127
Alignment:
| Q |
8 |
ggaagtattcattgctttccaactttggatcatttctgttggaaaacttccagagaactgattgtcagaaaggtcaatgatgtgaagcttagaaaatgtg |
107 |
Q |
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| T |
2072166 |
ggaagtattcattgctttccaactttggatcatttctgttggaaaactgccagagaagtcattgtgagaaaggtcaatgatgtgaagtttggaaaatgtg |
2072265 |
T |
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| Q |
108 |
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207 |
Q |
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| T |
2072266 |
catgtcatgttgccagagcacctaatgtctccatggaattcattgttacttaaagacaataccttcaactccggtaactctcccatccagaatggaaatg |
2072365 |
T |
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| Q |
208 |
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307 |
Q |
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| T |
2072366 |
aatcattgatgttgttataactaacatcaaagaattccagccttctattgttgaccaaagcccttggcaactgaccctgcagattgttgttgctaagatc |
2072465 |
T |
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| Q |
308 |
aatcttttgaaggcaatttcctatcatgtatgttttaggaatgaggccagacaatttattcccttttagatccagactttctaaaggttggctaaagttc |
407 |
Q |
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| T |
2072466 |
aatctgtttaagggaatttcctatcatgtatgtttgaggaatgaggccagataatttattcccttttagatccagactttctaaatattggctaaacttc |
2072565 |
T |
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| Q |
408 |
cctagacatgaaggaacgttgccacttaagttgttgaacgcaaaatcaagcatcacgagtgatttgagattgcatatggatggggatatttctcctgtca |
507 |
Q |
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| T |
2072566 |
cctagacatgaaggaacattgccgcttaagttgttgaatgataaatcaagtttcctgagtgatttgagattgcatatggatggggatatttctcctacca |
2072665 |
T |
|
| Q |
508 |
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607 |
Q |
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| T |
2072666 |
atgaattgttggaaacatctaagatttgtagactttcttttttccacaaccatttgggtagcgaagttatattgttgtttgacagtaaaagagtttccat |
2072765 |
T |
|
| Q |
608 |
ctcagccaaatctcttataaatgttggaatctcaactaaattgcattcagccaactgtaatatttgaagtccagaatttgttaaatgggatgaattgttt |
707 |
Q |
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| T |
2072766 |
atcactaagatcacttatgaatgttggaatctcaacaaaattgcatgaagccaatcgtaaatcttgaattagagaatcagtcatacgagatgaacttttt |
2072865 |
T |
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| Q |
708 |
ccacttaacaatgacagtttgttaaatgataaatcta-aaaaactagctttttgagattcagaaacgtgtcaagctcaagctttccatgcagaaaattag |
806 |
Q |
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| T |
2072866 |
ccactatacaatgacagtttgttaaatgataaatcaagaaagactagctttttgaggttcagaaacttgtctaactctagctttccatgcaaagaattaa |
2072965 |
T |
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| Q |
807 |
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906 |
Q |
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| T |
2072966 |
agggtaggttcaagacaactaaatttgttaggttcataatccaagatggaatttcaccctttatattgctatttgctgcacttaaaagtactagctgagt |
2073065 |
T |
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| Q |
907 |
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970 |
Q |
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| T |
2073066 |
gagatttgcaaaagataat-ggatgttactgtcaattttgact-gaggatatatccaaggcaat |
2073127 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 965
Target Start/End: Original strand, 2065058 - 2066015
Alignment:
| Q |
8 |
ggaagtattcattgctttccaactttggatcatttctgttggaaaacttccagagaactgattgtcagaaaggtcaatgatgtgaagcttagaaaatgtg |
107 |
Q |
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2065058 |
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2065157 |
T |
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| Q |
108 |
catgtcatgttgccagagcacctaatgtctccatggaatgcattgttacttaaagacaataccttcaactcaggtaaatctcccagccagaatggaaatg |
207 |
Q |
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| T |
2065158 |
catgtcatgttgccagagcacctaatgtctccatggaattcattgttagttaaagacaataccttcaactcgggtaactctcccatccagaatggaaatg |
2065257 |
T |
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| Q |
208 |
aatcattgatattattgtagctaacatcaaagaattctagaattctgctgtttaccaatgcccttggcatctgaccctgcagattgttgttactgagatc |
307 |
Q |
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| T |
2065258 |
aatcattgatattgttataactaacatcaaagaattccagccttctattgttgaccaaagcccttggcaactgaccctgcagattgttgttgctaagatc |
2065357 |
T |
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| Q |
308 |
aatcttttgaaggcaatttcctatcatgtatgttttaggaatgaggccagacaatttattcccttttagatccagactttctaaaggttggctaaagttc |
407 |
Q |
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| T |
2065358 |
tatctgttgaagggaatttcctatcatgtatgtttgaggaatgaggccagataatttattcccttttagatccagactttctaaatattggctaaagttc |
2065457 |
T |
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| Q |
408 |
cctagacatgaaggaacgttgccacttaagttgttgaacgcaaaatcaagcatcacgagtgatttgagattgcatatggatggggatatttctcctgtca |
507 |
Q |
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| T |
2065458 |
cctagacatgaaggaacattgccgcttaagttgttgaacgataaatcaagttgtgtgagtgatttgagattgcatatggatggggatatttctcctctca |
2065557 |
T |
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| Q |
508 |
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607 |
Q |
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| T |
2065558 |
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2065657 |
T |
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| Q |
608 |
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705 |
Q |
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| T |
2065658 |
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2065755 |
T |
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| Q |
706 |
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804 |
Q |
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| T |
2065756 |
ttccactatacaatgacagtttgttatatgataaatctagaaaacctaggtttttgaggttcagaaatgtgtcaagctctaccttcccatgcaaaaaatt |
2065855 |
T |
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| Q |
805 |
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904 |
Q |
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| T |
2065856 |
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2065955 |
T |
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| Q |
905 |
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965 |
Q |
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| T |
2065956 |
gtgagatttgcaaaagataatgagatgtcactgccaatattgact-gaggatatgtccaag |
2066015 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 965
Target Start/End: Complemental strand, 2246634 - 2245677
Alignment:
| Q |
8 |
ggaagtattcattgctttccaactttggatcatttctgttggaaaacttccagagaactgattgtcagaaaggtcaatgatgtgaagcttagaaaatgtg |
107 |
Q |
| |
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|
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| T |
2246634 |
ggaagtattcattgctttcaaactatggatcatttctgttggaaaacttccagagaactgattgtgagaaaggtcaatgatgtgaagcttggaaaatgtg |
2246535 |
T |
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| Q |
108 |
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207 |
Q |
| |
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| T |
2246534 |
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2246435 |
T |
|
| Q |
208 |
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307 |
Q |
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| T |
2246434 |
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2246335 |
T |
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| Q |
308 |
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407 |
Q |
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| T |
2246334 |
aatcatccgaagggaatttcctatcatgtatgtttgaggaatgaggccagacaatttattccattttagatccagcctttctaacaattggctaaagttc |
2246235 |
T |
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| Q |
408 |
cctagacatgaaggaacgttgccacttaagttgttgaacgcaaaatcaagcatcacgagtgatttgagattgcatatggatggggatatttctcctgtca |
507 |
Q |
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| T |
2246234 |
cccagacatgaaggagtgcggcctcttaagttgttgaatgataaatcaagttgcatgagtgatttgag-ttgcatatggatggggatatttctcctttca |
2246136 |
T |
|
| Q |
508 |
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607 |
Q |
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| T |
2246135 |
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2246036 |
T |
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| Q |
608 |
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706 |
Q |
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| T |
2246035 |
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2245936 |
T |
|
| Q |
707 |
tccacttaacaatgacagtttgttaaatgataaa-tctaaaaaactagctttttgagattcagaaacgtgtcaagctcaagctttccatgcagaaaatta |
805 |
Q |
| |
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| T |
2245935 |
cccactgtacaatgacagtttgttgaatgctaaattcagaacaactagctttttgagcttcagaaacatgtcaagctcttgctttccatgcaaagaatta |
2245836 |
T |
|
| Q |
806 |
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904 |
Q |
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| T |
2245835 |
tgag-gtaggttcaaaatgactaaatttgttaggttcattatccaagatggaatttcacccttcatattgctatttgctgcacttaatacttctagttgg |
2245737 |
T |
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| Q |
905 |
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965 |
Q |
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| T |
2245736 |
gtgagatttgcaaaaggtaatgggatgtcactgccaatattgact-gaggatatttccaag |
2245677 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 965
Target Start/End: Complemental strand, 2692809 - 2691852
Alignment:
| Q |
8 |
ggaagtattcattgctttccaactttggatcatttctgttggaaaacttccagagaactgattgtcagaaaggtcaatgatgtgaagcttagaaaatgtg |
107 |
Q |
| |
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| T |
2692809 |
ggaagttttcattgcattccatctttggatcatttctgatggaaaacttccagagaactcattgtgggaaaggtcaataatgtgaagcttgggaaatgtg |
2692710 |
T |
|
| Q |
108 |
catgtcatgttgccagagcacctaatgtctccatggaatgcattgttacttaaagacaataccttcaactcaggtaaatctcccagccagaatggaaatg |
207 |
Q |
| |
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| T |
2692709 |
catgtcatgtagatagggcacctaatgtctccatgaaattcgttgttacttaaagacagcacctttagctcgggcaattctcccatccagaatggaaatg |
2692610 |
T |
|
| Q |
208 |
aatcattgatattattgtagctaacatcaaagaattctagaattctgctgtttaccaatgcccttggcatctgaccctgcagattgttgttactgagatc |
307 |
Q |
| |
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| T |
2692609 |
aatcattgatattgttataactaacatcaaagaactctagccttctgttgttgaccaatgcccttggcaactgaccctgcagtttgttgttactgagatc |
2692510 |
T |
|
| Q |
308 |
aatcttttgaaggcaatttcctatcatgtatgttttaggaatgaggccagacaatttattcccttttagatccagactttctaaaggttggctaaagttc |
407 |
Q |
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| T |
2692509 |
aatctgctgaagggaattttctatcatgtatgtttgaggaatgacgcctgacaatttgttcccatttagatccagattttctaaggattgactaaagttt |
2692410 |
T |
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| Q |
408 |
cctagacatgaaggaacgttgccacttaagttgttgaacgcaaaatcaagcatcacgagtgatttgagattgcatatggatggggatatttctcctgtca |
507 |
Q |
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2692310 |
T |
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T |
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707 |
Q |
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T |
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806 |
Q |
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| T |
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T |
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906 |
Q |
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2691910 |
T |
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965 |
Q |
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2691909 |
gagatttgcaaaagataatgggatgtcactgccaatattgact-gaggatatatccaag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 942
Target Start/End: Original strand, 2137761 - 2138689
Alignment:
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T |
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214 |
Q |
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| T |
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T |
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314 |
Q |
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| T |
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T |
|
| Q |
315 |
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414 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
415 |
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514 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
515 |
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614 |
Q |
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| T |
2138261 |
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T |
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| Q |
615 |
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714 |
Q |
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| T |
2138361 |
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T |
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| Q |
715 |
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813 |
Q |
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| T |
2138461 |
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T |
|
| Q |
814 |
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913 |
Q |
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| T |
2138561 |
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T |
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| Q |
914 |
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Q |
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2138661 |
gcaaaagataatggaatgtcactgccaat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 966
Target Start/End: Original strand, 2097877 - 2098828
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| Q |
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114 |
Q |
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T |
|
| Q |
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214 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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gatattattgtagctaacatcaaagaattctagaattctgctgtttaccaatgcccttggcatctgaccctgcagattgttgttactgagatcaatcttt |
314 |
Q |
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| T |
2098077 |
gatattgttataactaacatcaaagaactctaggcttctgctatttaccaatgcccttggcaactgaccctgcagaatgttgttgctaaaatcaatccgc |
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T |
|
| Q |
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414 |
Q |
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| T |
2098177 |
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T |
|
| Q |
415 |
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514 |
Q |
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| T |
2098277 |
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2098376 |
T |
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| Q |
515 |
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614 |
Q |
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| T |
2098377 |
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T |
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714 |
Q |
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| T |
2098477 |
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T |
|
| Q |
715 |
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813 |
Q |
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| T |
2098577 |
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T |
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| Q |
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913 |
Q |
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| T |
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2098776 |
T |
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| Q |
914 |
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966 |
Q |
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| T |
2098777 |
gcaaaagataatgggatctcactgccaatattgact-gaggatatctccaagg |
2098828 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
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Q |
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T |
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206 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
207 |
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306 |
Q |
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| T |
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T |
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307 |
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406 |
Q |
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| T |
2056067 |
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T |
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407 |
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506 |
Q |
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| T |
2056167 |
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T |
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507 |
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606 |
Q |
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| T |
2056266 |
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T |
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607 |
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706 |
Q |
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gatcagccatatctcttataaatgttggaatctcaactaaattgcatgaagccagtactaaggattgaattgcataatcaatcatacgagatgaactatt |
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T |
|
| Q |
707 |
tccacttaacaatgacagtttgttaaatgataaatcta-aaaaactagctttttgagattcagaaacgtgtcaagctcaagctttccatgcagaaaatta |
805 |
Q |
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| T |
2056464 |
tccactatgcaatgacagtttgttgaatgataaatttagaattattagatttttgaacttcaaaaaagtgtcaagctctagctttccatgcaaaaaatta |
2056563 |
T |
|
| Q |
806 |
gagtgtaggttcaagcaagctaaattggttagattcattaaccaagatggaatttgaccctttatatagctatttgttgcacttaatacttctagctgcg |
905 |
Q |
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| T |
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taggctaggttcaagatacctaaatttgtttggttcattatccaagatggaatttcacccattatactgctatttcttgcaataaatacttcta---gcg |
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T |
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| Q |
906 |
tgagatttgcgaaagataatgggatatcactcccaatattaactggaggatatatccaa |
964 |
Q |
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| T |
2056661 |
tgagatttgcaaaagataatgggattccactgccaatattgact-gatgatatatccaa |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 512
Target Start/End: Original strand, 2121849 - 2122353
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Q |
| |
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|
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Q |
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| T |
2121949 |
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T |
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| Q |
208 |
aatcattgatattattgtagctaacatcaaagaattctagaattctgctgtttaccaatgcccttggcatctgaccctgcagattgttgttactgagatc |
307 |
Q |
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| T |
2122049 |
aatcattgatgttgttataactaacatcaaagaattccagccttctattgttgaccaaagcccttggcaactgaccctgcagattgttgttgctaagatc |
2122148 |
T |
|
| Q |
308 |
aatcttttgaaggcaatttcctatcatgtatgttttaggaatgaggccagacaatttattcccttttagatccagactttctaaaggttggctaaagttc |
407 |
Q |
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2122149 |
aatctgttgaagggaatttcctatcatgtatgtttgaggaatgaggccagataatttattcccttttagatccagactttataaatattggctaaagttc |
2122248 |
T |
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| Q |
408 |
cctagacatgaaggaacgttgccacttaagttgttgaacgcaaaatcaagcatcacgagtgatttgagattgcatatggatggggatatttctcctgtca |
507 |
Q |
| |
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2122249 |
cctagacatgaaggaacattgccgcttaagttgttgaacgataaatcaagttgtgtgagtgatttgagattgcatatggatggggatatttctcctgtca |
2122348 |
T |
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508 |
atgaa |
512 |
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2122349 |
atgaa |
2122353 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 281 - 966
Target Start/End: Original strand, 2125424 - 2126109
Alignment:
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281 |
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| T |
2125424 |
accctgcagattgttgttgttgaaatcaatcatctgaagggaacttcctatcatgtatgtttgaggaatgaggccagacaatttattcccttttagcatt |
2125523 |
T |
|
| Q |
381 |
agactttctaaaggttggctaaagttccctagacatgaaggaacgttgccacttaagttgttgaacgcaaaatcaagcatcacgagtgatttgagattgc |
480 |
Q |
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| | ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |
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| T |
2125524 |
atattttctaaagattggctaaagttacccagacatgaaggaatgttgccgcttaagttgttgatcgataaatcaagagtcacgagtgatttgagattgc |
2125623 |
T |
|
| Q |
481 |
atatggatggggatatttctcctgtcaatgaactatgggaaacacctaagctttgtagccttgctttttgccacaaccattcaggtagcgatgttatatt |
580 |
Q |
| |
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| T |
2125624 |
atatggatgggggtatttctcctgtcaatgaattgtgggaaacaagtaagcttattagacttgcttttttccacaaccaattgggcagcaatgtcatatt |
2125723 |
T |
|
| Q |
581 |
gttgtttgacaacgtaagaaattccatctcagccaaatctcttataaatgttggaatctcaactaaattgcattcagccaactgtaatatttgaagtcca |
680 |
Q |
| |
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| T |
2125724 |
gttgtttgacaacataagaaattccagatcaggcatgtctcttataaatgttggaatctcaactaaattgcatgaagccaattgtaagactcgaatttga |
2125823 |
T |
|
| Q |
681 |
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779 |
Q |
| |
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| T |
2125824 |
gaatcggtcctatgggaagaactttttccactatacaatgacaatttgttgaatgataaatctagaaaaactagctttttgaggttcagaaatgtgtcaa |
2125923 |
T |
|
| Q |
780 |
gctcaagctttccatgcagaaaattagagtgtaggttcaagcaagctaaattggttagattcattaaccaagatggaatttgaccctttatatagctatt |
879 |
Q |
| |
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| T |
2125924 |
gctctagctttccatgcaaaaaattagagcgtaggctcaagtaagctaaatttgctagattcattatccatgatggaatttcaccctttatattgctatt |
2126023 |
T |
|
| Q |
880 |
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966 |
Q |
| |
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| T |
2126024 |
tgttgcacctagaagttctagttgggtgagatttgcaaaagataatgggatgtcactgccaatattgact-gaggatatatccaagg |
2126109 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 2134639 - 2134892
Alignment:
| Q |
10 |
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109 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2134639 |
aagtattcattgctttccaactttggatcatttctgttggaaaacttccagagaactgattgtgagaaaggtcaatgatgtgaagtttggaaaatgtgca |
2134738 |
T |
|
| Q |
110 |
tgtcatgttgccagagcacctaatgtctccatggaatgcattgttacttaaagacaataccttcaactcaggtaaatctcccagccagaatggaaatgaa |
209 |
Q |
| |
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|
|
| T |
2134739 |
tgtcatgttgccagagcacctaacgtctccatggaattcattgttacctaaagacaataccttcaactcaggtaaatctcccagccagaatggaaatgaa |
2134838 |
T |
|
| Q |
210 |
tcattgatattattgtagctaacatcaaagaattctagaattctgctgtttacc |
263 |
Q |
| |
|
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| T |
2134839 |
tcattgatattattgtagctaacatcaaagaattctagaattctgctgtttacc |
2134892 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 464 - 930
Target Start/End: Original strand, 2113786 - 2114253
Alignment:
| Q |
464 |
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563 |
Q |
| |
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| T |
2113786 |
gagtgacttgagattgcatatggatggggatatttctcctgtcaatgaattttgagaaacatctaagttttttagacttgctttcttccacaaccaattg |
2113885 |
T |
|
| Q |
564 |
ggtagcgatgttatattgttgtttgacaacgtaagaaattccatctcagccaaatctcttataaatgttggaatctcaactaaattgcattcagccaact |
663 |
Q |
| |
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| T |
2113886 |
ggtagcgatgttatattgttgtttgacaacataagagattccagatcatccagatatcttatatatgttggaatctcaactaaattgcatgaatccaatt |
2113985 |
T |
|
| Q |
664 |
gtaatatttgaagtccagaatttgttaaatgggatgaattgtttccacttaacaatgacagtttgttaaatgataaatcta-aaaaactagctttttgag |
762 |
Q |
| |
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| T |
2113986 |
gtaagatttgaatacgagaatcggtcatatttgaagaacttttcccactatacaatgacagtttgttgaatgataaatctagaaaaactagctttctgag |
2114085 |
T |
|
| Q |
763 |
attcagaaacgtgtcaagctcaagctttccatgcagaaaattagagtgtaggttcaagcaagctaaattggttagattcattaaccaagatggaatttga |
862 |
Q |
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| T |
2114086 |
cttcagaaacgtgtcaagctctagctttccatgcaaaaaattagagcgtaggttcaagcatgctaaattggaatgattcattatccatgatggaatttga |
2114185 |
T |
|
| Q |
863 |
ccctttatatagctatttgttgca-cttaatacttctagctgcgtgagatttgcgaaagataatgggat |
930 |
Q |
| |
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| T |
2114186 |
ccctttatattgcaatctgttgcatctaaata-gtgtagctgggtgagatttgcaaaagataatgggat |
2114253 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 1697748 - 1696950
Alignment:
| Q |
15 |
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114 |
Q |
| |
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| T |
1697748 |
ttcattgatttccagctctgaatcatttctaaaggcaaacttccagagaatttattgaaagaaagatcaatgatgtgaagtttggaaaatgagcatgtca |
1697649 |
T |
|
| Q |
115 |
tgttgcca------gagcacctaatgtctccatggaatgcattgttacttaaagacaataccttcaactcaggtaaatctcccagccagaatggaaatga |
208 |
Q |
| |
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| T |
1697648 |
tgtttccaatcctagggcactttattggtccatgaaattcgttgccacgcaaagccaataccttcaactcaggtatagttcccagccagaatggaaacaa |
1697549 |
T |
|
| Q |
209 |
atcattgatattattgtagctaacatcaaagaattctagaattctgctgtttaccaatgcccttggcatctgaccctgcagattgttgttactgagatca |
308 |
Q |
| |
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| T |
1697548 |
atctttgatattgttatggctaacatcaaagaactctagccttctgcagttaaccaatgctcttggcaactgaccctgcagattattgttgctgaggtca |
1697449 |
T |
|
| Q |
309 |
atcttttgaaggcaatttcctatcatgtatgttttaggaatgaggccagacaatttattcccttttagatccagactttctaaaggttggctaaagttcc |
408 |
Q |
| |
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| T |
1697448 |
atcatctgaagggaattttgagtcatatatgtttgaggaatgagaccagataatttgtttccttttagcatcaaaatttctaaagagtggctaaagttac |
1697349 |
T |
|
| Q |
409 |
ctagacatgaaggaacgttgccacttaagttgttgaacgcaaaatcaagcatcacgagtgatttgagattgcatatggatggggatatttctcctgtcaa |
508 |
Q |
| |
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|
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| T |
1697348 |
ctagacatgaaggaacattgccgcttaaattgttgaacgataaatcaagatgcatgagtgatttgagattgcatatggacaaggatatttctcctgtcaa |
1697249 |
T |
|
| Q |
509 |
tgaactatgggaaacacctaagctttgtagccttgctttttgccacaaccattcaggtagcgatgttatattgttgtttgacaacgtaagaaattccatc |
608 |
Q |
| |
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| T |
1697248 |
tgaaccgtgggaaacagttaagctttgtagacttgtttttctccacaaccaactaggtagtgaagttatactgttgtttgacaggataatacatcctaaa |
1697149 |
T |
|
| Q |
609 |
tcagccaaatctcttataaatgttggaatctcaactaaattgcattcagccaactgtaatatttgaagtccagaatttgttaaatgggatgaattgtttc |
708 |
Q |
| |
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| T |
1697148 |
tcactaagatctcttataaatgtcggaatctcaaccaaattgcatgaagccagttgtaaaacatggattcgagaatcagttacgttggaagaactttttc |
1697049 |
T |
|
| Q |
709 |
cacttaacaatgacagtttgttaaatgataaatcta-aaaaactagctttttgagattcagaaacgtgtcaagctcaagctttccatgcagaaaattag |
806 |
Q |
| |
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| T |
1697048 |
caccgagcaaggacaatttgttgaacgataaatttagaaaaattaactttttgaacttgagaaacatgtcaaactctagctttccatgcaagaaattag |
1696950 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 2125247 - 2125420
Alignment:
| Q |
15 |
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114 |
Q |
| |
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||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
2125247 |
ttcattgttttccatccttggatcatttctgatggaaaacttccagagaattcattgtgagaaaggtcaatgatgtgaagcttgggaaatgtgcatgtca |
2125346 |
T |
|
| Q |
115 |
tgttgccagagcacctaatgtctccatggaatgcattgttacttaaagacaataccttcaactcaggtaaatct |
188 |
Q |
| |
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|
|
| T |
2125347 |
tgttgccagagcacctaatgtctccatggaatgcattgttacttaaagacaataccttcaactcgggtaaatct |
2125420 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Original strand, 2104173 - 2104344
Alignment:
| Q |
8 |
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107 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
2104173 |
ggaagttttcattgctttccatctaaggatcatttctgatggaaaatttccagagaaatcattgtgagaaaggtcaatgatatgaagctttgtaaatgtg |
2104272 |
T |
|
| Q |
108 |
catgtcatgttgccagagcacctaatgtctccatggaatgcattgttacttaaagacaataccttcaactca |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
2104273 |
catgtcatgtttccagggcacctaatgactccatgaaattcattgttacgtaaagataataccttcaactca |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 812 - 945
Target Start/End: Complemental strand, 1696872 - 1696739
Alignment:
| Q |
812 |
aggttcaagcaagctaaattggttagattcattaaccaagatggaatttgaccctttatatagctatttgttgcacttaatacttctagctgcgtgagat |
911 |
Q |
| |
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||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||| || ||||||| ||| | ||| || ||| || |||| | |
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| T |
1696872 |
aggttcaagtatgctaaatcggttaggttcattatccaagatggaatttcaccccttaaattgctattttctgcgcgtaaatattgtaggtggatgaggt |
1696773 |
T |
|
| Q |
912 |
ttgcgaaagataatgggatatcactcccaatatt |
945 |
Q |
| |
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| T |
1696772 |
ttgcaaaagataatggtatatcgctgccaatatt |
1696739 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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