View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5103_high_2 (Length: 549)

Name: NF5103_high_2
Description: NF5103
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5103_high_2
NF5103_high_2
[»] chr1 (52 HSPs)
chr1 (1-398)||(34777146-34777541)
chr1 (1-398)||(4854975-4855370)
chr1 (176-398)||(26224735-26224957)
chr1 (176-398)||(27088007-27088230)
chr1 (176-398)||(3012635-3012857)
chr1 (180-398)||(51895351-51895569)
chr1 (176-398)||(6817898-6818120)
chr1 (176-398)||(31237688-31237910)
chr1 (176-455)||(46582770-46583051)
chr1 (176-398)||(2870319-2870541)
chr1 (176-396)||(50555284-50555505)
chr1 (177-396)||(33600335-33600553)
chr1 (196-398)||(15105166-15105368)
chr1 (177-398)||(8168514-8168734)
chr1 (1-278)||(9120657-9120926)
chr1 (1-174)||(26224199-26224373)
chr1 (1-174)||(33599797-33599971)
chr1 (1-278)||(1443400-1443669)
chr1 (196-398)||(52642838-52643038)
chr1 (9-174)||(27088582-27088748)
chr1 (176-317)||(25277557-25277698)
chr1 (1-278)||(47012057-47012326)
chr1 (176-317)||(37345137-37345278)
chr1 (176-317)||(45045685-45045826)
chr1 (1-174)||(52642481-52642655)
chr1 (23-165)||(6817477-6817620)
chr1 (1-174)||(50554757-50554931)
chr1 (1-163)||(31237396-31237559)
chr1 (6-80)||(37087570-37087644)
chr1 (10-146)||(42558512-42558649)
chr1 (1-64)||(3012432-3012495)
chr1 (7-78)||(51895150-51895221)
chr1 (6-64)||(15105800-15105858)
chr1 (347-398)||(25277706-25277757)
chr1 (347-398)||(37345078-37345129)
chr1 (347-398)||(45045834-45045885)
chr1 (416-455)||(4855400-4855439)
chr1 (416-455)||(6818148-6818187)
chr1 (416-455)||(26224985-26225024)
chr1 (416-455)||(27087936-27087975)
chr1 (416-455)||(34777571-34777610)
chr1 (416-455)||(50555539-50555578)
chr1 (416-455)||(51895597-51895636)
chr1 (117-174)||(15105742-15105799)
chr1 (20-112)||(46637341-46637433)
chr1 (416-455)||(25277789-25277828)
chr1 (416-455)||(31237938-31237977)
chr1 (416-455)||(33600583-33600622)
chr1 (416-455)||(37345007-37345046)
chr1 (416-455)||(45045914-45045953)
chr1 (418-454)||(3012886-3012922)
chr1 (225-309)||(3370338-3370422)
[»] chr3 (65 HSPs)
chr3 (1-398)||(41978468-41978863)
chr3 (1-398)||(7883903-7884297)
chr3 (176-398)||(2225354-2225574)
chr3 (176-398)||(35904907-35905132)
chr3 (179-397)||(23292354-23292572)
chr3 (176-455)||(30599389-30599670)
chr3 (176-398)||(27898296-27898518)
chr3 (176-398)||(43765861-43766083)
chr3 (176-455)||(44794880-44795161)
chr3 (176-398)||(2377736-2377958)
chr3 (176-398)||(2660954-2661176)
chr3 (176-398)||(21349434-21349656)
chr3 (176-398)||(44275398-44275620)
chr3 (176-398)||(17516050-17516271)
chr3 (177-398)||(54899153-54899394)
chr3 (176-386)||(46198472-46198681)
chr3 (6-174)||(35904408-35904577)
chr3 (177-398)||(38192456-38192676)
chr3 (196-398)||(42280227-42280430)
chr3 (177-398)||(53093196-53093416)
chr3 (180-398)||(46609724-46609941)
chr3 (196-398)||(48830026-48830228)
chr3 (177-398)||(46309732-46309952)
chr3 (196-455)||(51685273-51685533)
chr3 (1-174)||(53188354-53188528)
chr3 (216-398)||(46113207-46113389)
chr3 (207-381)||(610351-610525)
chr3 (253-398)||(53190118-53190266)
chr3 (1-174)||(27897769-27897943)
chr3 (1-165)||(51685725-51685890)
chr3 (1-139)||(48829688-48829827)
chr3 (1-174)||(42281838-42282012)
chr3 (1-166)||(24845921-24846086)
chr3 (20-112)||(2378342-2378434)
chr3 (225-331)||(24845668-24845776)
chr3 (176-257)||(53188882-53188963)
chr3 (1-80)||(44274922-44275001)
chr3 (1-78)||(23292148-23292225)
chr3 (1-80)||(30598914-30598992)
chr3 (82-146)||(32843067-32843132)
chr3 (1-80)||(43766482-43766561)
chr3 (10-112)||(2975990-2976092)
chr3 (34-111)||(35862131-35862208)
chr3 (7-80)||(46199080-46199153)
chr3 (410-455)||(54899090-54899135)
chr3 (416-455)||(2377669-2377708)
chr3 (416-455)||(7884325-7884364)
chr3 (416-455)||(17515983-17516022)
chr3 (1-80)||(21350055-21350134)
chr3 (416-455)||(27898546-27898585)
chr3 (416-455)||(35905164-35905203)
chr3 (416-455)||(41978401-41978440)
chr3 (416-455)||(43765793-43765832)
chr3 (416-455)||(44275648-44275687)
chr3 (416-455)||(46198394-46198433)
chr3 (416-455)||(53190296-53190335)
chr3 (10-130)||(1847067-1847188)
chr3 (418-455)||(2225607-2225644)
chr3 (10-130)||(33112407-33112528)
chr3 (225-309)||(35862691-35862775)
chr3 (412-451)||(610277-610316)
chr3 (356-398)||(24845614-24845656)
chr3 (416-455)||(23292601-23292641)
chr3 (358-398)||(24845544-24845584)
chr3 (410-454)||(42280170-42280214)
[»] chr8 (54 HSPs)
chr8 (1-398)||(38547947-38548342)
chr8 (1-398)||(8608816-8609211)
chr8 (1-398)||(13107382-13107777)
chr8 (1-398)||(13283116-13283506)
chr8 (176-455)||(27691827-27692108)
chr8 (176-398)||(42942514-42942736)
chr8 (176-398)||(41041766-41041988)
chr8 (176-398)||(22272979-22273201)
chr8 (176-398)||(40338862-40339084)
chr8 (176-397)||(33707992-33708213)
chr8 (1-174)||(27404798-27404972)
chr8 (177-398)||(35510137-35510357)
chr8 (196-398)||(7744333-7744535)
chr8 (176-398)||(29237915-29238136)
chr8 (177-398)||(33761642-33761862)
chr8 (1-174)||(15307588-15307762)
chr8 (1-174)||(15487957-15488131)
chr8 (196-368)||(26239644-26239816)
chr8 (178-398)||(600809-601028)
chr8 (196-398)||(9672377-9672581)
chr8 (176-319)||(5037235-5037378)
chr8 (1-174)||(29238490-29238664)
chr8 (176-398)||(15307014-15307234)
chr8 (176-398)||(15487383-15487603)
chr8 (196-382)||(41824873-41825059)
chr8 (233-398)||(13485352-13485512)
chr8 (176-367)||(27405325-27405515)
chr8 (1-174)||(26239287-26239461)
chr8 (7-174)||(41824523-41824690)
chr8 (23-174)||(7743998-7744150)
chr8 (210-318)||(3152755-3152863)
chr8 (6-80)||(41041294-41041368)
chr8 (335-398)||(5037179-5037242)
chr8 (10-174)||(11720013-11720178)
chr8 (34-110)||(25705685-25705761)
chr8 (1-64)||(22273349-22273412)
chr8 (1-80)||(40338377-40338456)
chr8 (1-64)||(42942876-42942939)
chr8 (34-111)||(25370912-25370989)
chr8 (10-111)||(33369328-33369429)
chr8 (20-112)||(31822907-31822999)
chr8 (416-455)||(5037112-5037151)
chr8 (416-455)||(8609239-8609278)
chr8 (416-455)||(13283049-13283088)
chr8 (416-455)||(22272934-22272973)
chr8 (416-455)||(33708242-33708281)
chr8 (416-455)||(38547879-38547918)
chr8 (416-455)||(41042016-41042055)
chr8 (416-455)||(42942447-42942486)
chr8 (270-314)||(11720653-11720697)
chr8 (420-455)||(13485544-13485579)
chr8 (416-455)||(40339112-40339151)
chr8 (423-455)||(13107813-13107845)
chr8 (15-63)||(25371590-25371638)
[»] chr5 (42 HSPs)
chr5 (1-398)||(7268565-7268966)
chr5 (179-398)||(8540391-8540610)
chr5 (176-398)||(21841721-21841943)
chr5 (176-398)||(30464819-30465041)
chr5 (176-398)||(32135016-32135238)
chr5 (176-398)||(2180495-2180716)
chr5 (176-398)||(12737825-12738047)
chr5 (176-398)||(12800648-12800870)
chr5 (176-398)||(28821100-28821322)
chr5 (176-398)||(2853450-2853672)
chr5 (228-398)||(24540425-24540595)
chr5 (1-174)||(42472137-42472311)
chr5 (1-174)||(17575232-17575405)
chr5 (1-174)||(17575952-17576125)
chr5 (1-174)||(17577263-17577436)
chr5 (1-174)||(21842298-21842472)
chr5 (1-278)||(40781430-40781699)
chr5 (1-278)||(29620756-29621024)
chr5 (176-398)||(42472665-42472884)
chr5 (1-174)||(2181067-2181241)
chr5 (1-163)||(30464519-30464682)
chr5 (6-80)||(34328264-34328338)
chr5 (196-293)||(41494644-41494741)
chr5 (1-103)||(41494411-41494510)
chr5 (1-64)||(32134813-32134876)
chr5 (10-64)||(18624031-18624085)
chr5 (10-130)||(35291610-35291729)
chr5 (416-455)||(2180428-2180467)
chr5 (416-455)||(2853741-2853780)
chr5 (416-455)||(7268496-7268535)
chr5 (416-455)||(8540323-8540362)
chr5 (416-455)||(12737758-12737797)
chr5 (416-455)||(12800581-12800620)
chr5 (416-455)||(21841654-21841693)
chr5 (6-78)||(8540739-8540809)
chr5 (416-455)||(30465069-30465108)
chr5 (416-455)||(32135266-32135305)
chr5 (120-174)||(18624089-18624143)
chr5 (117-163)||(28036145-28036191)
chr5 (128-174)||(34328219-34328265)
chr5 (10-59)||(40329989-40330038)
chr5 (32-108)||(35400145-35400221)
[»] chr7 (57 HSPs)
chr7 (176-455)||(37114710-37114991)
chr7 (176-398)||(6604245-6604467)
chr7 (176-398)||(22154620-22154842)
chr7 (176-398)||(22210535-22210757)
chr7 (176-398)||(23905434-23905656)
chr7 (176-398)||(38473306-38473527)
chr7 (176-397)||(35692532-35692753)
chr7 (176-398)||(45360057-45360279)
chr7 (176-396)||(27665228-27665448)
chr7 (176-398)||(34776143-34776365)
chr7 (176-398)||(39858424-39858646)
chr7 (179-398)||(29995701-29995920)
chr7 (176-398)||(13168803-13169025)
chr7 (176-398)||(46438692-46438914)
chr7 (196-398)||(38550472-38550674)
chr7 (178-385)||(24227605-24227812)
chr7 (1-278)||(20478921-20479190)
chr7 (1-174)||(77353-77527)
chr7 (177-395)||(35402544-35402760)
chr7 (196-398)||(37792236-37792438)
chr7 (216-398)||(48851545-48851727)
chr7 (176-398)||(47385397-47385614)
chr7 (1-174)||(35692004-35692178)
chr7 (8-174)||(48851132-48851299)
chr7 (1-174)||(38550099-38550273)
chr7 (9-174)||(47384869-47385035)
chr7 (185-287)||(69032-69134)
chr7 (1-174)||(45360632-45360806)
chr7 (1-165)||(22155205-22155370)
chr7 (1-165)||(22211120-22211285)
chr7 (20-165)||(6604745-6604891)
chr7 (1-165)||(34775617-34775782)
chr7 (283-398)||(66802-66915)
chr7 (1-80)||(38472829-38472908)
chr7 (15-139)||(48311273-48311399)
chr7 (333-398)||(30939748-30939813)
chr7 (1-77)||(24227125-24227201)
chr7 (27-130)||(34692157-34692261)
chr7 (1-64)||(37114507-37114570)
chr7 (1-80)||(46438213-46438292)
chr7 (10-130)||(11683970-11684091)
chr7 (216-331)||(48310750-48310867)
chr7 (22-112)||(23954726-23954816)
chr7 (225-309)||(13035621-13035705)
chr7 (416-455)||(6604177-6604216)
chr7 (416-455)||(13168736-13168775)
chr7 (416-455)||(29995926-29995965)
chr7 (416-455)||(30939841-30939880)
chr7 (416-455)||(34776393-34776432)
chr7 (416-455)||(38473555-38473594)
chr7 (416-455)||(39858674-39858713)
chr7 (416-455)||(46438942-46438981)
chr7 (416-454)||(27665477-27665515)
chr7 (10-64)||(38614307-38614361)
chr7 (82-174)||(7403210-7403303)
chr7 (20-109)||(46995237-46995326)
chr7 (423-455)||(45359975-45360007)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (176-398)||(32438262-32438484)
chr6 (176-398)||(20524107-20524329)
chr6 (176-398)||(7372165-7372386)
chr6 (176-360)||(18644031-18644215)
chr6 (207-398)||(11355929-11356120)
chr6 (196-398)||(7050479-7050681)
chr6 (1-174)||(32437736-32437910)
chr6 (196-398)||(10569122-10569322)
chr6 (1-268)||(32454866-32455125)
chr6 (176-317)||(32517672-32517813)
chr6 (263-398)||(6900206-6900341)
chr6 (9-165)||(9399423-9399580)
chr6 (1-165)||(6902264-6902429)
chr6 (1-165)||(11356500-11356665)
chr6 (9-165)||(33267610-33267767)
chr6 (1-165)||(7050873-7051038)
chr6 (1-174)||(10569505-10569678)
chr6 (6-80)||(7371693-7371767)
chr6 (116-174)||(18644577-18644635)
chr6 (196-278)||(33268073-33268155)
chr6 (1-80)||(20524768-20524847)
chr6 (196-269)||(6901999-6902072)
chr6 (347-398)||(32517613-32517664)
chr6 (333-398)||(21091582-21091647)
chr6 (416-455)||(32438513-32438552)
chr6 (416-454)||(7372392-7372430)
chr6 (416-451)||(11355866-11355901)
chr6 (416-455)||(18643991-18644030)
chr6 (416-455)||(32517542-32517581)
chr6 (410-455)||(10569062-10569107)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (176-398)||(51012647-51012869)
chr4 (176-398)||(35402850-35403072)
chr4 (176-398)||(49523852-49524074)
chr4 (176-397)||(42981341-42981562)
chr4 (176-396)||(41760909-41761129)
chr4 (182-397)||(11255118-11255333)
chr4 (176-398)||(43520158-43520380)
chr4 (177-398)||(41782242-41782463)
chr4 (198-398)||(54386861-54387061)
chr4 (177-398)||(319845-320065)
chr4 (177-398)||(4172685-4172905)
chr4 (177-398)||(33265306-33265526)
chr4 (196-398)||(48645949-48646149)
chr4 (196-455)||(2692488-2692748)
chr4 (1-174)||(833811-833985)
chr4 (177-398)||(43507949-43508169)
chr4 (1-174)||(5438974-5439148)
chr4 (1-174)||(51013223-51013397)
chr4 (226-389)||(11602406-11602569)
chr4 (240-398)||(52867414-52867561)
chr4 (176-398)||(834237-834456)
chr4 (201-330)||(11640838-11640967)
chr4 (176-398)||(5438507-5438722)
chr4 (1-135)||(48645585-48645720)
chr4 (1-174)||(35402325-35402499)
chr4 (27-174)||(2691966-2692114)
chr4 (1-144)||(54387270-54387414)
chr4 (28-174)||(11641385-11641532)
chr4 (1-80)||(11254635-11254714)
chr4 (1-80)||(41760304-41760383)
chr4 (1-80)||(42981936-42982015)
chr4 (416-455)||(35403100-35403139)
chr4 (416-455)||(52867591-52867630)
chr4 (27-112)||(4519891-4519976)
chr4 (416-455)||(11255364-11255403)
chr4 (86-163)||(4614840-4614918)
chr4 (416-454)||(41761159-41761197)
chr4 (225-309)||(7150221-7150305)
chr4 (411-455)||(54386802-54386846)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (176-398)||(16763685-16763907)
chr2 (176-455)||(14388284-14388565)
chr2 (176-398)||(19907461-19907683)
chr2 (176-398)||(40560964-40561186)
chr2 (176-398)||(6798245-6798467)
chr2 (175-398)||(17696946-17697169)
chr2 (207-398)||(39663994-39664185)
chr2 (176-398)||(39455899-39456120)
chr2 (176-368)||(2767683-2767875)
chr2 (1-174)||(6783942-6784116)
chr2 (233-397)||(44708996-44709160)
chr2 (1-278)||(37021388-37021657)
chr2 (1-174)||(24206187-24206359)
chr2 (176-398)||(6784470-6784692)
chr2 (176-389)||(24206721-24206935)
chr2 (285-398)||(42518524-42518637)
chr2 (1-174)||(19581744-19581918)
chr2 (1-174)||(39663719-39663893)
chr2 (1-80)||(17697567-17697646)
chr2 (1-80)||(34400887-34400966)
chr2 (1-80)||(2768274-2768353)
chr2 (1-64)||(40561326-40561389)
chr2 (70-165)||(44708545-44708641)
chr2 (1-80)||(42518134-42518213)
chr2 (6-64)||(6798882-6798940)
chr2 (270-330)||(37646222-37646283)
chr2 (70-152)||(31471007-31471090)
chr2 (20-112)||(10715667-10715759)
chr2 (416-455)||(2767606-2767645)
chr2 (416-455)||(39455832-39455871)
chr2 (416-455)||(44709188-44709227)
chr2 (225-309)||(161216-161300)
chr2 (419-455)||(16763613-16763649)
chr2 (416-455)||(17696879-17696918)
chr2 (416-455)||(19907711-19907750)
chr2 (416-455)||(39664214-39664253)
chr2 (416-455)||(40560897-40560936)
chr2 (418-455)||(6798180-6798217)
chr2 (358-398)||(37646101-37646141)
chr2 (423-455)||(42518673-42518705)
[»] scaffold0564 (2 HSPs)
scaffold0564 (178-398)||(8989-9209)
scaffold0564 (416-455)||(8923-8962)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (176-398)||(4024-4246)
scaffold0058 (176-398)||(5196-5418)
scaffold0058 (416-455)||(3957-3996)
scaffold0058 (416-455)||(5129-5168)
[»] scaffold0345 (3 HSPs)
scaffold0345 (207-398)||(282-473)
scaffold0345 (1-165)||(861-1026)
scaffold0345 (416-451)||(219-254)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (196-398)||(107787-107989)
scaffold0004 (6-174)||(107246-107415)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 52)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 34777146 - 34777541
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34777146 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactatcaataacccaggaaggcctttct 34777245  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgatctggtccttgaattatatgcatatc 199  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||    |   ||||||||    
T  34777246 atgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttgccttttgcct---tgcatatc 34777342  T
Q  200 catcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34777343 catcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcataacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaac 34777442  T
Q  300 aaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34777443 aaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 34777541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 4854975 - 4855370
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  4854975 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctaaaatttgtgttgtaagaataccaaacactgtcaataacccagtaatacctttct 4855074  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgatctggtccttgaattatatgcatatc 199  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||    |   ||||||||    
T  4855075 atgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatatatgaatgttttgtttaaattatactgattttgccttttgcct---tgcatatc 4855171  T
Q  200 catcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4855172 catcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtaatccttggtgcatacatttgctgaac 4855271  T
Q  300 aaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4855272 aaagtaaaaagtaaaagacagacaatttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 4855370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Original strand, 26224735 - 26224957
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26224735 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaagaccatcaaataggtccttgaattttcacaacaaatatcactgtgat 26224834  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26224835 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcatatcatcataagtcatatatttg 26224934  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  26224935 atgttcataagtcaccacatagc 26224957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 27088230 - 27088007
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27088230 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgacttttcacaacagatatcactgtgat 27088131  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattata-aaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatattt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27088130 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaaagacacatatttgcatatcatcataagtcatatattt 27088031  T
Q  375 gatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  27088030 gatgttcataagtcactacatagc 27088007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Original strand, 3012635 - 3012857
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  3012635 tggtccttgaattatatgcatatccatcatattgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttggattttcacaacagatatcattgtgat 3012734  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3012735 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttg 3012834  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  3012835 atgttcataagtcattacatagc 3012857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 180 - 398
Target Start/End: Original strand, 51895351 - 51895569
Alignment:
Q  180 ccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcctt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51895351 ccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgatcctt 51895450  T
Q  280 ggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51895451 ggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaaatacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatattttatgt 51895550  T
Q  380 tcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  51895551 tcataagtcattacatagc 51895569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Original strand, 6817898 - 6818120
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  6817898 tggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttggtttttcacaacatatatcactgtgat 6817997  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6817998 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtgaaagacagacactttgattataaaaagacagacatgtgcataccatcataagtcatatatttg 6818097  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  6818098 atgttcataagtcattacatagc 6818120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Original strand, 31237688 - 31237910
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31237688 tggtccttgaattatatgcatatccattatatcgatcctcaaattagtgataataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 31237787  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31237788 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacattcactttgactataaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttg 31237887  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||| |||  |||||||    
T  31237888 atgttcataaatcaaaacatagc 31237910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 176 - 455
Target Start/End: Original strand, 46582770 - 46583051
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46582770 tggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 46582869  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  46582870 ccttggtgcatacatctgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagactgatattttcataccatcataagtaatatatttg 46582969  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc--nnnnnnnnnnnttacatagtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    |||||||||||||| ||||||||             |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46582970 atgttcataagtcattacatagccaaaaaaataacattacatagccatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 46583051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 2870541 - 2870319
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2870541 tggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgat 2870442  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2870441 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatgcactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttg 2870342  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    ||||||||||||||  |||||||    
T  2870341 atgttcataagtcatcacatagc 2870319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 176 - 396
Target Start/End: Original strand, 50555284 - 50555505
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50555284 tggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgat 50555383  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagt-aaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatattt 374  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  50555384 ccttggtgcatacatttactgaacaaggtaaaaaactaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcatgccatcataaatcatatattt 50555483  T
Q  375 gatgttcataagtcactacata 396  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  50555484 gatgttcataagtcattacata 50555505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 177 - 396
Target Start/End: Original strand, 33600335 - 33600553
Alignment:
Q  177 ggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33600335 ggtccttgaattatatgcatatccatcctttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaatatgtccttgaattttcacaacagatatcaatgtgatc 33600434  T
Q  277 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttga 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||||    
T  33600435 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacaatttgattgtaaaaagacagacatttgcattatatcataagtca-atatttga 33600533  T
Q  377 tgttcataagtcactacata 396  Q
    |||| |||||||| ||||||    
T  33600534 tgttaataagtcattacata 33600553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 196 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 15105368 - 15105166
Alignment:
Q  196 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 295  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15105368 tatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacataaatcattgtgatctttggtgcatacatttgct 15105269  T
Q  296 gaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  15105268 gaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgcaaaaagacagacattcgcataccatcatgagtcatatatttgatgttcataagtcattatat 15105169  T
Q  396 agc 398  Q
    |||    
T  15105168 agc 15105166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 177 - 398
Target Start/End: Original strand, 8168514 - 8168734
Alignment:
Q  177 ggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 276  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  8168514 ggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtcattgaattatcataacagatatcaatgtgatc 8168613  T
Q  277 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttga 376  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||| ||    
T  8168614 ctttgtgcatacatttgctaaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca-atattcga 8168712  T
Q  377 tgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||| |||||||| ||||||||    
T  8168713 tgttaataagtcattacatagc 8168734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 9120657 - 9120926
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9120657 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 9120756  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaatt-atactgatctggtccttgaattatatgcatat 198  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   ||          ||||| |  |  || ||||||||||||||||  |||||    
T  9120757 atgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtcaaaa---------aaaattcaatcacat-tggtccttgaattataatcatat 9120846  T
Q  199 ccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 278  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||    
T  9120847 ccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagagatcaatgtgatcct 9120926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 26224199 - 26224373
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  26224199 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaaacaaacaatgtcaataacccaggaagacctttct 26224298  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224299 atgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 26224373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 33599797 - 33599971
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33599797 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagcaaacactatcaataacccaggaaggtctttct 33599896  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33599897 atgtttgccctcagcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 33599971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1443669 - 1443400
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1443669 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 1443570  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaatt-atactgatctggtccttgaattatatgcatat 198  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   ||          ||||| |  |  || ||||||||||||||||  |||||    
T  1443569 atgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtcaaaa---------aaaattcaatcacat-tggtccttgaattataatcatat 1443480  T
Q  199 ccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 278  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| ||| |||||    
T  1443479 ccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagagatcaatgtaatcct 1443400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 196 - 398
Target Start/End: Original strand, 52642838 - 52643038
Alignment:
Q  196 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 295  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52642838 tatccatcatatcgatccctaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatatatttgct 52642937  T
Q  296 gaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  52642938 gaacaaagtaaaaagtaaaagac--acactttgattgtaaaaagacgaatatttgcaaaccatcataagtcatacatctgatgttcataagtcattacat 52643035  T
Q  396 agc 398  Q
    |||    
T  52643036 agc 52643038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27088748 - 27088582
Alignment:
Q  9 caatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgc 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27088748 caatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtgagaacaacaaacaccgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgc 27088649  T
Q  109 cctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27088648 cctctgcataaggtttgtttaacaatagttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 27088582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 176 - 317
Target Start/End: Original strand, 25277557 - 25277698
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25277557 tggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagacatcactgtgat 25277656  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25277657 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 25277698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 47012057 - 47012326
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47012057 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaaattgtgttgtaagaagagcaaacactgtcaataacccaggaagacctttct 47012156  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaatt-atactgatctggtccttgaattatatgcatat 198  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   ||          ||||| |  |  || ||||||||||||||||  |||||    
T  47012157 atgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtcaaaa---------aaaattcaatcacat-tggtccttgaattataatcatat 47012246  T
Q  199 ccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 278  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||    
T  47012247 caatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagagatcaatgtgatcct 47012326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 176 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 37345278 - 37345137
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37345278 tggtccttcaattatatgcatatccatcataccgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaatagttccttgaattttcacaacagacatcactgtgat 37345179  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37345178 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 37345137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 176 - 317
Target Start/End: Original strand, 45045685 - 45045826
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45045685 tggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcttcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaatagatatcactgtgat 45045784  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45045785 ccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaaga 45045826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 52642481 - 52642655
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52642481 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttatgttgtaaaaaaagccaacaccgtcaataacccaggaaggcctttct 52642580  T
Q  101 atgcttgccctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||  ||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||| ||||  |||||||    
T  52642581 atgtctgccctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtcaatggtttgttaaaatagtactgat 52642655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 165
Target Start/End: Original strand, 6817477 - 6817620
Alignment:
Q  23 gagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccctccg-ctaaggt 121  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | | || ||    
T  6817477 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgtctgccctctgccaaatgt 6817576  T
Q  122 ttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaat 165  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  6817577 ttgtttaacaatgattatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaat 6817620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 50554757 - 50554931
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  50554757 tctatgtacaatgatgtggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacactgtcaataacccaagaagacctttct 50554856  T
Q  101 atgcttgccctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||  ||||||| | | ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||||||  |||||||    
T  50554857 atgtctgccctctgccaaaggtttgtttaacaatagttatgtgatgtgcgaatggtttgtttaaatagtactgat 50554931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 31237396 - 31237559
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31237396 tctatgtacaatgataaggtgagagagcttcaatgttgctgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaagactgtcaataatccaggaaggcctttct 31237495  T
Q  101 atgcttgccctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaa 163  Q
    |||  ||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||| |||||||||    
T  31237496 atgtctgccctctgccaaaggtttgtttaacaatggctatgtgatgtgtaaatggtttgtttaa 31237559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 37087644 - 37087570
Alignment:
Q  6 gtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 80  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  37087644 gtacaatgatgaggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtattgtaagaaaagccaacactgtcaa 37087570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Original strand, 42558512 - 42558649
Alignment:
Q  10 aatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgcc 109  Q
    |||| |||| |||||| |||| ||||||||||||  | |||||||| || ||||| | | || ||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  42558512 aatggtgatgtgagagtgcttgaatgttggtgtccgataatttgtggtgcaagaaaatccaatactatcaaaaaccgagaaaggcctttctatgcttgcc 42558611  T
Q  110 ctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgt 146  Q
    ||  | | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42558612 ctttgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgt 42558649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 3012432 - 3012495
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaa 64  Q
    |||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3012432 tctatgtacagtgatgaggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaa 3012495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Original strand, 51895150 - 51895221
Alignment:
Q  7 tacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtc 78  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  51895150 tacaatgatgaggttagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaaaccaacactgtc 51895221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 15105858 - 15105800
Alignment:
Q  6 gtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaa 64  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15105858 gtacaatgaagatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctataatttgtgttgtaagaa 15105800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 398
Target Start/End: Original strand, 25277706 - 25277757
Alignment:
Q  347 tttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  25277706 tttgtataccatcataagtcatatatttgatgttcataagccattacatagc 25277757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 37345129 - 37345078
Alignment:
Q  347 tttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  37345129 tttgtataccatcataagtcatatatttgatgttcataagccattacatagc 37345078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 398
Target Start/End: Original strand, 45045834 - 45045885
Alignment:
Q  347 tttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  45045834 tttgtataccatcataagtcatatatttgatgttcataagccattacatagc 45045885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 4855400 - 4855439
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4855400 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 4855439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 6818148 - 6818187
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6818148 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 6818187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 26224985 - 26225024
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26224985 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 26225024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 27087975 - 27087936
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27087975 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 27087936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 34777571 - 34777610
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34777571 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 34777610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 50555539 - 50555578
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50555539 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 50555578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 51895597 - 51895636
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51895597 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 51895636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15105799 - 15105742
Alignment:
Q  117 aaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  15105799 aaggtttatttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaatagtactgat 15105742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 112
Target Start/End: Original strand, 46637341 - 46637433
Alignment:
Q  20 tgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccctc 112  Q
    |||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||| | | || |||   || |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  46637341 tgagagtgcttgaatgttggtgtcctacaatttgtgttgttagaaaatccaatacttcaaaaaacccaggaaggtcattctatgcttgccctc 46637433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 25277789 - 25277828
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  25277789 agtcatcaaatcatttgatgttcttaaatgattacatatc 25277828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 31237938 - 31237977
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  31237938 agtcatcaaatcatttgatgttcttaaatgattacatatc 31237977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 33600583 - 33600622
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  33600583 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgtttacatatc 33600622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 37345046 - 37345007
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  37345046 agtcatcaaatcatttgatgttcttaaatgattacatatc 37345007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 45045914 - 45045953
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45045914 agtcatcaaattatttgatgttcttaagtgattacatatc 45045953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 418 - 454
Target Start/End: Original strand, 3012886 - 3012922
Alignment:
Q  418 tcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatat 454  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3012886 tcatcaaatcatttgatattcttaagtgattacatat 3012922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 309
Target Start/End: Original strand, 3370338 - 3370422
Alignment:
Q  225 aaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 309  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||| |   ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||    
T  3370338 aaaataccatcaaataagtctttgaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttggtgcatatatgtgcataataaagtaaaaa 3370422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 65)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 41978863 - 41978468
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  41978863 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaatagcaaacactgtcaataacccaggaatacctttct 41978764  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgatctggtccttgaattatatgcatatc 199  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||    |   ||||||||    
T  41978763 atgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttgccttttgcct---tgcatatc 41978667  T
Q  200 catcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41978666 catcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaac 41978567  T
Q  300 aaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41978566 aaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 41978468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 7883903 - 7884297
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7883903 tctatgtacaatgttgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgcaagaaaagcaaacactgtcaataactcaggaaggtctttct 7884002  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgatctggtccttgaattatatgcatatc 199  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | || |  |   ||||||||    
T  7884003 atgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatact-attttgccttttacct---tgcatatc 7884098  T
Q  200 catcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaac 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7884099 catcatttcaatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaac 7884198  T
Q  300 aaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  7884199 aaagtaaaaagtaaaagatagacactttgattataaaaagacacacatttgcctaccatcataagtcatatatttaatgttcataagtcaccacatagc 7884297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Original strand, 2225354 - 2225574
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2225354 tggtccttgaattatatacatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 2225453  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2225454 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatc--aagtcatatatttg 2225551  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  2225552 atgttcataagtcactaaatagc 2225574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Original strand, 35904907 - 35905132
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35904907 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcattgaattttcacaacagatatcactgtgat 35905006  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatt---tgcataccatcataagtcatatat 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||    
T  35905007 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgatgaataccatcataagtcatatat 35905106  T
Q  373 ttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  35905107 ttgatgttcataagtcactacatagc 35905132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 179 - 397
Target Start/End: Original strand, 23292354 - 23292572
Alignment:
Q  179 tccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23292354 tccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgatcct 23292453  T
Q  279 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatg 378  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23292454 tggtgcataaatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatg 23292553  T
Q  379 ttcataagtcactacatag 397  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  23292554 ttcataagtcattacatag 23292572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 176 - 455
Target Start/End: Original strand, 30599389 - 30599670
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30599389 tggtccttgaattatatacatattcatcatattgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 30599488  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30599489 ccttggtgcatacatttgcagaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttg 30599588  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc--nnnnnnnnnnnttacatagtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    |||||||||||||| ||||||||             |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30599589 atgttcataagtcattacatagccaaaaaaataacattacatagccatcaagtcatttgatgttcttaagtgattacatatc 30599670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Original strand, 27898296 - 27898518
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27898296 tggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 27898395  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27898396 ccctggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataaatcatatatttg 27898495  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||| | ||||||||    
T  27898496 atgttcataagttattacatagc 27898518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 43766083 - 43765861
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43766083 tggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcatcaaattagtgaaaatactatcaaatatgtccttgaattttcacaacagatatcactatgat 43765984  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43765983 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataaatcatatatttg 43765884  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  43765883 atgttcataagtcattacatagc 43765861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 176 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 44795161 - 44794880
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44795161 tggttcttgaattatatccatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 44795062  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44795061 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacggacattttcataccatcataagtcatatatttg 44794962  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc--nnnnnnnnnnnttacatagtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    |||||||||||||| ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  44794961 atgttcataagtcattacatagccaaaaaaataacattacatagtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattatatatc 44794880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 2377958 - 2377736
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377958 tggtccttgaattatatgcatatccatcataacgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 2377859  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2377858 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaatatttgcatatcatcataaatcatatatttg 2377759  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  2377758 atgttcataagtcattacatagc 2377736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 2661176 - 2660954
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2661176 tggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattggtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 2661077  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2661076 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttg 2660977  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  2660976 atgttcataagtcattacatagc 2660954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 21349656 - 21349434
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  21349656 tggtcattgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacaattatcactgtggt 21349557  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21349556 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagatagacatttgcatactatcataagtcatatatttg 21349457  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  21349456 atgttcataagtcattacatagc 21349434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Original strand, 44275398 - 44275620
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44275398 tggtccttgaattatacacatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggttcttgaattttcacaatagatatcattgtgat 44275497  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44275498 ccttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaattaaaagacaaacactttgattataaaaagacagtcatttgcataccatcataagtcatatatttg 44275597  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  44275598 atgttcataagtcattacatagc 44275620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 17516271 - 17516050
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17516271 tggtccttgaattatat-catatccatcatatcgatactcaaattagtaaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgat 17516173  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17516172 ccttggtgcatacatttgcttaacaaagtaaaaagtaaaagacagatactttgattataaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttg 17516073  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||| ||||||| | ||||||||    
T  17516072 atgtacataagtgattacatagc 17516050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 177 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 54899394 - 54899153
Alignment:
Q  177 ggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54899394 ggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatc 54899295  T
Q  277 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaa--------------------gacatacactttgattataaaaagacacacatttgcatacc 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54899294 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcatact 54899195  T
Q  357 atcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54899194 atcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 54899153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 176 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 46198681 - 46198472
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||    
T  46198681 tggtccttgaattatatacatatctatcatatcgatcctcaaattagtaaaaataccatcaaataggtcctggattttt-acaacagatatcattgtgat 46198583  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46198582 ctttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaaaacagacatttgcataccatcataagtcatatatttg 46198483  T
Q  376 atgttcataag 386  Q
    |||||||||||    
T  46198482 atgttcataag 46198472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Original strand, 35904408 - 35904577
Alignment:
Q  6 gtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgct 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35904408 gtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgct 35904507  T
Q  106 tgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35904508 tgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 35904577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 177 - 398
Target Start/End: Original strand, 38192456 - 38192676
Alignment:
Q  177 ggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 276  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  38192456 ggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatc 38192555  T
Q  277 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttga 376  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||| ||||||||    
T  38192556 ctttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcgttatatcataagtca-atatttga 38192654  T
Q  377 tgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||| |||||||| ||||||||    
T  38192655 tgttaataagtcattacatagc 38192676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 196 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 42280430 - 42280227
Alignment:
Q  196 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 295  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42280430 tatccatcatatcaatccccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcattgtgatccttggtgcatacatttgct 42280331  T
Q  296 gaacaaagta-aaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactaca 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  42280330 gaacaaagtaaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatacatttgatgttcataagtcattaca 42280231  T
Q  395 tagc 398  Q
    ||||    
T  42280230 tagc 42280227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 177 - 398
Target Start/End: Original strand, 53093196 - 53093416
Alignment:
Q  177 ggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 276  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  53093196 ggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatc 53093295  T
Q  277 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttga 376  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||| ||    
T  53093296 ctttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaatactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca-atattcga 53093394  T
Q  377 tgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||| |||||||| ||||||||    
T  53093395 tgttaataagtcattacatagc 53093416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 180 - 398
Target Start/End: Original strand, 46609724 - 46609941
Alignment:
Q  180 ccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcctt 279  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  46609724 ccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcctt 46609823  T
Q  280 ggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 379  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||  ||||    
T  46609824 tgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca-atattcaatgt 46609922  T
Q  380 tcataagtcactacatagc 398  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  46609923 taataagtcattacatagc 46609941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 196 - 398
Target Start/End: Original strand, 48830026 - 48830228
Alignment:
Q  196 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 295  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48830026 tatccatcatatcgatctccaaattagtgaaaataccatcaaacaagtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttagtgcatacatttgct 48830125  T
Q  296 gaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  48830126 gaacaaagtaaaaagtaaaagacatatactttgattgtaaaaagacagacatttgtatatcatcataagtcatatatttgatgttcataagccattacat 48830225  T
Q  396 agc 398  Q
    |||    
T  48830226 agc 48830228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 177 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 46309952 - 46309732
Alignment:
Q  177 ggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 276  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  46309952 ggtccatgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatc 46309853  T
Q  277 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttga 376  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||| ||    
T  46309852 atttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca-atattcga 46309754  T
Q  377 tgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||| |||||||| ||||||||    
T  46309753 tgttaataagtcattacatagc 46309732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 196 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 51685533 - 51685273
Alignment:
Q  196 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 295  Q
    |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  51685533 tatcgatcatatcaatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatcgttggtgcatatatttgct 51685434  T
Q  296 gaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  51685433 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacggacatttgcaaaccatcataagtcatacatttgatgttcataagtcattacat 51685334  T
Q  396 ag-cnnnnnnnnnnnttacatagtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    || |           |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  51685333 agccaaaaaaaaacattacatagccatcaagtcatttgatgttcttaagtcattacatatc 51685273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 53188354 - 53188528
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  53188354 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttta 53188453  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53188454 atgtttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 53188528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 216 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 46113389 - 46113207
Alignment:
Q  216 aaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaa 315  Q
    ||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46113389 aaattagtgaagataccatcaaacaagtccttgaattttcacaacataaatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaa 46113290  T
Q  316 gacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46113289 gacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatacatttgatgttcataagtcattacatagc 46113207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 207 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 610525 - 610351
Alignment:
Q  207 tcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaa 306  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  610525 tcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacataaatcactatgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaa 610426  T
Q  307 aaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttc 381  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  610425 aaagtaaaagacagacactttgattgtaaaaaagcagacatttgcatataatcataagtcatacatttgatgttc 610351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 253 - 398
Target Start/End: Original strand, 53190118 - 53190266
Alignment:
Q  253 ttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagta---aaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacattt 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53190118 ttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaattattaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacatattt 53190217  T
Q  350 gcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53190218 gcataccatcataagtcatatatttgatgtttataagtcactacatagc 53190266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 27897769 - 27897943
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27897769 tctatgtacaatgatgaggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 27897868  T
Q  101 atgcttgccctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||| ||||||| | | |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||||  |||||||    
T  27897869 atgcctgccctctgccaaaggtttgtttagcaatggttatgtgatgtgcgaatggtttgtgtaaatagtactgat 27897943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 51685890 - 51685725
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51685890 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaataatccaggaaggcctttct 51685791  T
Q  101 atgcttgccctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaat 165  Q
    |||  ||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||| ||||    
T  51685790 atgtctgccctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgacgtgtgaatggtttgttaaaat 51685725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 48829688 - 48829827
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48829688 tctatgtacaatgatgatgtgaaagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaataacccaagaaggcctttct 48829787  T
Q  101 atgcttgccctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttat 139  Q
    ||   ||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  48829788 atatctgccctctgccaaaggtttgtttaacaatggttat 48829827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 42282012 - 42281838
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  42282012 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgccaataacccaagaaggcctttct 42281913  T
Q  101 atgcttgccctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||  || |||| | | || ||||||||||| ||| |||||||||||  ||||| |||||| ||||  |||||||    
T  42281912 atgtctgacctctgccaaatgtttgtttaacgatgattatttgatgtgcgaatggtttgttaaaatagtactgat 42281838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 24846086 - 24845921
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || ||| ||||||||    
T  24846086 tctatgtacaatggtgatatgagagtgcttcaatgttggtgtcatagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcgataacacatgaatgcctttct 24845987  T
Q  101 atg-cttgccctccgctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaatt 166  Q
    ||| ||  | || | | || |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  24845986 atgtctgtctctgc-caaatgtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaatt 24845921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 2378434 - 2378342
Alignment:
Q  20 tgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccctc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2378434 tgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaataacccaggaaggcctttatatgcctgccctc 2378342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24845776 - 24845668
Alignment:
Q  225 aaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagt--aaaagacatac 322  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24845776 aaaataccatcaaataagtctttgaattatcacaacatatatcaatgtgatctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaaagacatac 24845677  T
Q  323 actttgatt 331  Q
    |||||||||    
T  24845676 actttgatt 24845668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 176 - 257
Target Start/End: Original strand, 53188882 - 53188963
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcac 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||    
T  53188882 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatgtcatcaaataggtcattgaattttcac 53188963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 44274922 - 44275001
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 80  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  44274922 tctatgtacaatgatgaggtgagaaagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaa 44275001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 23292148 - 23292225
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtc 78  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  23292148 tctatgtacaatgatgaggtgagaaagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaaaccaacactgtc 23292225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 30598914 - 30598992
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 80  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  30598914 tctatgtacaatgatgaggtgagaga-cttcaatgttggtgacctagaatttgtgttgtaagaaaagctaacactgtcaa 30598992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 146
Target Start/End: Original strand, 32843067 - 32843132
Alignment:
Q  82 aacccaggaaggcctttctatgcttgccctccgct-aaggtttgtttaacaatggttatttgatgt 146  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32843067 aacccaggaaggcctttctatgtttgccctttgctaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgt 32843132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 43766561 - 43766482
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 80  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  43766561 tctatgtacaatgatgaggtgagagaagttcaatgttggtgtcctaaaatttgtgttgtaagaaaaggcaacactgtcaa 43766482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 112
Target Start/End: Original strand, 2975990 - 2976092
Alignment:
Q  10 aatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgcc 109  Q
    |||| |||| |||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||| || |||||  | |||||||||||| | |||||||||||||    
T  2975990 aatggtgatgtgagattgcttgaatgttgttgtcctagaatttgtgttgttagaaaagccaatactgtacaaaacccaggaaggtcattctatgcttgcc 2976089  T
Q  110 ctc 112  Q
    |||    
T  2976090 ctc 2976092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 111
Target Start/End: Original strand, 35862131 - 35862208
Alignment:
Q  34 tgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccct 111  Q
    ||||||||||  | |||||||||| |||||| ||  || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35862131 tgttggtgtcccataatttgtgttttaagaaaagtcaatactgtcaaaaactcaggaaggcctttctatgcttgccct 35862208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 46199153 - 46199080
Alignment:
Q  7 tacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 80  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  46199153 tacaatgatgaggtaagagagcttcaatgttggtgccctataatttgtattgtaagaaaagccaacactgtcaa 46199080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 54899135 - 54899090
Alignment:
Q  410 ttacatagtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54899135 ttacatagccatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 54899090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 2377708 - 2377669
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2377708 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 2377669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 7884325 - 7884364
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7884325 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 7884364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 17516022 - 17515983
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17516022 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 17515983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 21350134 - 21350055
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 80  Q
    |||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||| | | |||||||||||    
T  21350134 tctatgtacaatgataaggtgagagagcttcaatgttggtgtcctaaaatttgtgtactaagaaaaaccaacactgtcaa 21350055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 27898546 - 27898585
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27898546 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 27898585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 35905164 - 35905203
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35905164 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 35905203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 41978440 - 41978401
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41978440 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 41978401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 43765832 - 43765793
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43765832 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 43765793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 44275648 - 44275687
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44275648 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 44275687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 46198433 - 46198394
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46198433 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 46198394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 53190296 - 53190335
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53190296 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 53190335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 1847188 - 1847067
Alignment:
Q  10 aatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgcc 109  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||| | | || |||   || ||| | |||||||| ||||||| |||||    
T  1847188 aatggtgatgtgagagagcttgaatgttggtgtcctataatttgtgttgttagaaaatccaatactaataaaaactcgggaaggccattctatgtttgcc 1847089  T
Q  110 ctccg-ctaaggtttgtttaac 130  Q
    ||| | | ||||||||||||||    
T  1847088 ctctgccaaaggtttgtttaac 1847067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 418 - 455
Target Start/End: Original strand, 2225607 - 2225644
Alignment:
Q  418 tcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2225607 tcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 2225644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 33112407 - 33112528
Alignment:
Q  10 aatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgcc 109  Q
    |||| |||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | | || | ||| || |  | | ||||||| |||||||||||||    
T  33112407 aatggtgatgtgagagtgcttgaatgttggtgtcctagaatttgtgttgttagaaaatccaatattgtaaaaattctatgaaggccattctatgcttgcc 33112506  T
Q  110 ctccg-ctaaggtttgtttaac 130  Q
    ||| | | ||||||||||||||    
T  33112507 ctctgccaaaggtttgtttaac 33112528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 309
Target Start/End: Original strand, 35862691 - 35862775
Alignment:
Q  225 aaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 309  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||| |   ||||||| ||| ||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||    
T  35862691 aaaatacaatcagataagtccttgaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttgttgcatatatgtgcagaacaaagtaaaaa 35862775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 610316 - 610277
Alignment:
Q  412 acatagtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattaca 451  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  610316 acatagtcatcaagtcatttgatgttcataagtcattaca 610277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 356 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 24845656 - 24845614
Alignment:
Q  356 catcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24845656 catcataagtcatacatttgatgttcattagtcattacatagc 24845614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 23292601 - 23292641
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatg-ttcataagtgattacatatc 455  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23292601 agtcatcaaatcatttgatgtttcttaagtgattacatatc 23292641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 358 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 24845584 - 24845544
Alignment:
Q  358 tcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24845584 tcataagtcttacatttgatgttcataagtcattacatagc 24845544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 410 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 42280214 - 42280170
Alignment:
Q  410 ttacatagtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatat 454  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  42280214 ttacatagccatcaagtcatttgatgttcttaagtcattacatat 42280170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 54)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 38548342 - 38547947
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  38548342 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaatagcaaacactgtcaataatccaggaagacctttct 38548243  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgatctggtccttgaattatatgcatatc 199  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||    |   ||||||||    
T  38548242 atgcttgccctctacataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttgccttttgcct---tgcatatc 38548146  T
Q  200 catcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaac 299  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38548145 catcattttgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaac 38548046  T
Q  300 aaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38548045 aaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 38547947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 8608816 - 8609211
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8608816 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcagcgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacaacaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 8608915  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgatctggtccttgaattatatgcatatc 199  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | | ||    |   ||||||||    
T  8608916 atgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatattgattttgccttttgcct---tgcatatc 8609012  T
Q  200 catcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8609013 catcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaac 8609112  T
Q  300 aaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8609113 aaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatctatttgatgttcataagtcactacatagc 8609211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 13107382 - 13107777
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13107382 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 13107481  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgatctggtccttgaattatatgcatatc 199  Q
    ||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||    |   ||||||||    
T  13107482 atgcttgccttttgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttgccttttgcct---tgcatatc 13107578  T
Q  200 catcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaac 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13107579 catcatttcgattctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaac 13107678  T
Q  300 aaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13107679 aaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcctaccatcataagtcatatatttgatgttcaaaagtcactacatagc 13107777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 13283506 - 13283116
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13283506 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacaacaaacactgtcaataacccaggaaggtctttct 13283407  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgatctggtccttgaattatatgcatatc 199  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||    |   ||||||||    
T  13283406 atgtttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttgccttttgcct---tgcatatc 13283310  T
Q  200 catcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13283309 catcatttcgatcctcaaattagtgaaaatacgatcaaataggtccttgaattttcaca-----tatcactgtgatccttggtgcatacatttgctcaac 13283215  T
Q  300 aaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13283214 aaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 13283116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 176 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 27692108 - 27691827
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27692108 tggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 27692009  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27692008 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttg 27691909  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc--nnnnnnnnnnnttacatagtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    |||||||||||||| ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27691908 atgttcataagtcattacatagccaaaaaaataacattacatagtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 27691827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 42942736 - 42942514
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42942736 tggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattattgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgat 42942637  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42942636 ccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattatcaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttg 42942537  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  42942536 atgttcataagtcattacatagc 42942514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Original strand, 41041766 - 41041988
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  41041766 tggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagataccattgtgat 41041865  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41041866 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatctg 41041965  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  41041966 atgttcataagtcattacatagc 41041988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 22273201 - 22272979
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22273201 tggtccttgaattatatgcatatccatcgtatcgatcatcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgat 22273102  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22273101 ctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaagagacaggcaattgcataccatcataagtcatatatttg 22273002  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  22273001 atgttcataagtcattacatagc 22272979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Original strand, 40338862 - 40339084
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40338862 tggtccttgaattatatacatattcatcgtatcgatcctcaaattagtgaaaatacaatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 40338961  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40338962 ccttgttgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacatacatttgcataccatcataactcatatatttg 40339061  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||| | | ||||||||    
T  40339062 atgttcataattaattacatagc 40339084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 176 - 397
Target Start/End: Original strand, 33707992 - 33708213
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33707992 tggtcattgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgtt 33708091  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  33708092 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacactttgattataaaaagacagacattttcatatcatcataagtcatatatttg 33708191  T
Q  376 atgttcataagtcactacatag 397  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  33708192 atgttcataagtcattacatag 33708213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 27404798 - 27404972
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27404798 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaaacactgtcaataacccaggaaggcttttct 27404897  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27404898 atgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 27404972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 177 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 35510357 - 35510137
Alignment:
Q  177 ggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 276  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||    
T  35510357 ggtccttaaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtggtc 35510258  T
Q  277 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttga 376  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||| ||    
T  35510257 ctttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca-atattcga 35510159  T
Q  377 tgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||| |||||||| ||||||||    
T  35510158 tgttaataagtcattacatagc 35510137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 196 - 398
Target Start/End: Original strand, 7744333 - 7744535
Alignment:
Q  196 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 295  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| | || |||||||||||||||||||    
T  7744333 tatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaacaccatcaaataagtccttgaattttcacatcatatttcacttttattcttggtgcatacatttgct 7744432  T
Q  296 gaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  7744433 gaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatacatttgatgttcataagccattacat 7744532  T
Q  396 agc 398  Q
    |||    
T  7744533 agc 7744535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 29238136 - 29237915
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||    
T  29238136 tggtccttgaattatattcatatccgtcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgat 29238037  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||| |    
T  29238036 catttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca-atattcg 29237938  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    ||||| |||||||| ||||||||    
T  29237937 atgttaataagtcattacatagc 29237915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 177 - 398
Target Start/End: Original strand, 33761642 - 33761862
Alignment:
Q  177 ggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 276  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  33761642 ggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtcattgaattatcataacagatatcaatgtgatc 33761741  T
Q  277 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttga 376  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||||||||| ||||| ||    
T  33761742 ctttgtgcatacatttgctaaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaggacaaacatttgcattatatcataagtca-atattcga 33761840  T
Q  377 tgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||| |||||||| ||||||||    
T  33761841 tgttaataagtcattacatagc 33761862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15307762 - 15307588
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15307762 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttatgttgtaagaagagcaaacactgtcaataacccaggaaggcttttct 15307663  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15307662 atgtttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 15307588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15488131 - 15487957
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15488131 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttatgttgtaagaagagcaaacactgtcaataacccaggaaggcttttct 15488032  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15488031 atgtttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 15487957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 196 - 368
Target Start/End: Original strand, 26239644 - 26239816
Alignment:
Q  196 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 295  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26239644 tatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtcattgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 26239743  T
Q  296 gaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcat 368  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  26239744 caacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagaaagacatttgcataccatcataagtcat 26239816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 178 - 398
Target Start/End: Original strand, 600809 - 601028
Alignment:
Q  178 gtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 277  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||||    
T  600809 gtccttgaattatattcatatccgtcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcc 600908  T
Q  278 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgat 377  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||| |||    
T  600909 tttgtgcatacatttgctgaataaagtaaaaagtaaaagagaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca-atattcgat 601007  T
Q  378 gttcataagtcactacatagc 398  Q
    ||| |||||| | ||||||||    
T  601008 gttaataagttattacatagc 601028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 196 - 398
Target Start/End: Original strand, 9672377 - 9672581
Alignment:
Q  196 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 295  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9672377 tatccatcgtatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 9672476  T
Q  296 gaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacat---ttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcacta 392  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||   ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  9672477 gaacaaactaaaaagtaaaagacagacactttgattgtaaaaagacagacatttgttgcatatcatcataaat-atatatttgatgttcataaatcatta 9672575  T
Q  393 catagc 398  Q
    ||||||    
T  9672576 catagc 9672581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 176 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 5037378 - 5037235
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5037378 tggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgat 5037279  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 319  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5037278 ccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 5037235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 29238664 - 29238490
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||| | | |||||||||||||| |||||    
T  29238664 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatatgtgttgcaagaagagcaaacactcttagtaacccaggaaggcttttct 29238565  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29238564 atgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 29238490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 15307234 - 15307014
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||    
T  15307234 tggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaccatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgat 15307135  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    | || || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||| |    
T  15307134 catttgtacatatatttgctgaacaaagt-aaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca-atattcg 15307037  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    ||||| |||||||| ||||||||    
T  15307036 atgttaataagtcattacatagc 15307014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 15487603 - 15487383
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||    
T  15487603 tggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaccatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgat 15487504  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    | || || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||| |    
T  15487503 catttgtacatatatttgctgaacaaagt-aaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca-atattcg 15487406  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    ||||| |||||||| ||||||||    
T  15487405 atgttaataagtcattacatagc 15487383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 196 - 382
Target Start/End: Original strand, 41824873 - 41825059
Alignment:
Q  196 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 295  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41824873 tatccatcatattgatccccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcaccgtgatgcttggtgcatacatttgct 41824972  T
Q  296 gaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttca 382  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||    
T  41824973 gaacaaagtaaaaagtaaaagatatacactgtgattgtaaaaagccagacatttgcataccatcataaatcatgcatttaatgttca 41825059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 233 - 398
Target Start/End: Original strand, 13485352 - 13485512
Alignment:
Q  233 atcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgatta 332  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  13485352 atcaaataggtccttcaattttcacaacagatatcactgtgatccttgaggcatacatttgctg----aagtaaaaagtagaagacaaacactttgatta 13485447  T
Q  333 taaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13485448 taaaaa-acagacatttgcataccatcataaatcatatatttgatgttcataagtgattacatagc 13485512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 176 - 367
Target Start/End: Original strand, 27405325 - 27405515
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||    
T  27405325 tggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaacatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgat 27405424  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtca 367  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  27405425 cctttggacatacatttgctgaacaaag-aaaaaataaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca 27405515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 26239287 - 26239461
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  26239287 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgtagtaagaaaagccaacactgtcaataacacagaaaggcatttct 26239386  T
Q  101 atgcttgccctc-cgctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||  |||||||   | || |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || | ||||||||    
T  26239387 atgtctgccctctaccaaatgtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgttaaagtaatactgat 26239461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Original strand, 41824523 - 41824690
Alignment:
Q  7 tacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgctt 106  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  41824523 tacaatgatgatgtgagagagtttcaatgttggtgtcctaaaatttgtgttgtaagaaaag-taacactgtcaataacccaggaaggcctttctatatct 41824621  T
Q  107 gccctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||||| | | ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||  |||||||    
T  41824622 gccctctgccaaaggtttgtataacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgttaaaatagtactgat 41824690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 174
Target Start/End: Original strand, 7743998 - 7744150
Alignment:
Q  23 gagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccctccg-ctaaggt 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||| | |||||||||  ||||||| | | || ||    
T  7743998 gagagcttcattgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaaaagccaacattttcaataacccatgaatgtctttctatgtctgccctctgccaaatgt 7744097  T
Q  122 ttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  7744098 ttgtttaacaatgattatgtgatgtgtgaatgatttgttaaaataatactgat 7744150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 210 - 318
Target Start/End: Original strand, 3152755 - 3152863
Alignment:
Q  210 atcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 309  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3152755 atccccaaattagtgaaattaccatcaaatcagttcttgaattttcacaacataaatcaatgtgatccttggtgcatacatctactgaacaaagtaaaaa 3152854  T
Q  310 gtaaaagac 318  Q
    |||||||||    
T  3152855 gtaaaagac 3152863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 80
Target Start/End: Original strand, 41041294 - 41041368
Alignment:
Q  6 gtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 80  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  41041294 gtacaatgatgaggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaa 41041368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 5037242 - 5037179
Alignment:
Q  335 aaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5037242 aaaagacagacatttgtataccatcataagtcatatatttgatgtttataagtcactacatagc 5037179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 11720013 - 11720178
Alignment:
Q  10 aatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgcc 109  Q
    |||| |||| ||||||  ||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||| ||| |||||| | || ||||| ||||||  ||||||||  ||||    
T  11720013 aatggtgatgtgagagtacttgaatgttggtgtcccataatttgtgctgtaagaaaagccaacactttaaaaaacccgggaaggtttttctatgtctgcc 11720112  T
Q  110 ctccgctaaggttt-gtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    ||| || || |||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| || |||||||    
T  11720113 ctctgccaaagttttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaagttctactgat 11720178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 110
Target Start/End: Original strand, 25705685 - 25705761
Alignment:
Q  34 tgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccc 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25705685 tgttggtgtcctagattttgtgttgtaagaaaagccaatactgtgaaaaacccaggaaggcctttctatgcttgccc 25705761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 22273412 - 22273349
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaa 64  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22273412 tctatgtacaatgatgaggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaa 22273349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 40338377 - 40338456
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 80  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  40338377 tctatgtacaatgatgagctgagagagtttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 40338456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 42942939 - 42942876
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaa 64  Q
    |||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  42942939 tctatgtacaataatgaggtgagagagcttcaatgttggtgtcctataatttgtgttgtaagaa 42942876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 111
Target Start/End: Original strand, 25370912 - 25370989
Alignment:
Q  34 tgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccct 111  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||  || || || || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25370912 tgttggtgttctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaatacagtgaaaaactcaggaaggcctttctatgcttgccct 25370989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Original strand, 33369328 - 33369429
Alignment:
Q  10 aatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgcc 109  Q
    |||| |||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| || | | | || ||||| || || ||||||||| | |||||||||||||    
T  33369328 aatggtgatgtgagagcgcttgaatgttggtgtcctagaatttgtgttgttagtaaaaccaatactgtaaaaaaaccaggaaggtcattctatgcttgcc 33369427  T
Q  110 ct 111  Q
    ||    
T  33369428 ct 33369429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 31822999 - 31822907
Alignment:
Q  20 tgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccctc 112  Q
    |||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||| | | || |||   || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31822999 tgagagtgcttgaatgttggtgtcctacaatttgtgttgttagaaaatccaatacttcaaaaaacccaggaaggccattctatgcttgccctc 31822907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 5037151 - 5037112
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5037151 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 5037112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 8609239 - 8609278
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8609239 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 8609278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 13283088 - 13283049
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13283088 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 13283049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 22272973 - 22272934
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22272973 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 22272934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 33708242 - 33708281
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33708242 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 33708281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 38547918 - 38547879
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38547918 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 38547879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 41042016 - 41042055
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41042016 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 41042055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 42942486 - 42942447
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42942486 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 42942447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 314
Target Start/End: Original strand, 11720653 - 11720697
Alignment:
Q  270 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaa 314  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  11720653 tgtgatccttggtgcatatatgtgttgaacaaagtaaaaagtaaa 11720697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 455
Target Start/End: Original strand, 13485544 - 13485579
Alignment:
Q  420 atcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13485544 atcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 13485579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 40339112 - 40339151
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  40339112 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgatcacatatc 40339151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 423 - 455
Target Start/End: Original strand, 13107813 - 13107845
Alignment:
Q  423 aaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13107813 aaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 13107845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 25371638 - 25371590
Alignment:
Q  15 tgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaaga 63  Q
    |||| |||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  25371638 tgatgtgagagtgcttgaatattggtgtcctagaatttgtgttgtaaga 25371590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 42)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 7268966 - 7268565
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7268966 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttgatgtcctataatttg-gttgtaagaacaacaaacactgtcaataacctaggaaggcccttct 7268868  T
Q  101 atgcttgccctccgct-aaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgatctggtcctt-gaattata---tgca 195  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | || |  || |    ||||    
T  7268867 atgcttgccctctgcttaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttgccttttgccttttgccttgca 7268768  T
Q  196 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7268767 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataacatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 7268668  T
Q  296 gaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7268667 gaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttacataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacat 7268568  T
Q  396 agc 398  Q
    |||    
T  7268567 agc 7268565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 179 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 8540610 - 8540391
Alignment:
Q  179 tccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8540610 tccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgatcct 8540511  T
Q  279 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatg 378  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8540510 tggtgcataaatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatg 8540411  T
Q  379 ttcataagtcactacatagc 398  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  8540410 ttcataagtcattacatagc 8540391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 21841943 - 21841721
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21841943 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaatagatatcactgtgat 21841844  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
     ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21841843 tcttagtgcatacatttgctgaagaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcatatcatcataagtcatatatttg 21841744  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||| |||| |||||||    
T  21841743 atgttcataaatcacaacatagc 21841721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Original strand, 30464819 - 30465041
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30464819 tggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctaaaattagtgataataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 30464918  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30464919 ccttggtgcatatatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatgcactttgactataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttg 30465018  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  30465019 atgttcataagtcattacatagc 30465041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Original strand, 32135016 - 32135238
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  32135016 tggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacggagatcactgtgat 32135115  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  32135116 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacatttgcataacatcctaagtcatatatttg 32135215  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  32135216 atgtccataagtcattacatagc 32135238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 2180716 - 2180495
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2180716 tggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 2180617  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  2180616 ccttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttgattataaaaagacagac-tttgcataccatcataaatcatatctttg 2180518  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    ||||||||||||||  |||||||    
T  2180517 atgttcataagtcataacatagc 2180495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 12738047 - 12737825
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738047 tggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcatcaaattagtgaaaataccaccaaataggtcattgaattttcacaacagatatcactgtgat 12737948  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  12737947 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttaattataaaaagacagacatttgcataccattataaatcatatatttg 12737848  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  12737847 atgttcataagtcattacatagc 12737825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 12800870 - 12800648
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12800870 tggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcatcaaattagtgaaaataccaccaaataggtcattgaattttcacaacagatatcactgtgat 12800771  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  12800770 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttaattataaaaagacagacatttgcataccattataaatcatatatttg 12800671  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  12800670 atgttcataagtcattacatagc 12800648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 28821322 - 28821100
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28821322 tggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataacatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 28821223  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28821222 ctttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacattttgattataaaaagacagatatttgcatatcatcataagtcatatatttg 28821123  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  28821122 atgttcataagtcattacatagc 28821100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Original strand, 2853450 - 2853672
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2853450 tggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatcaaataggtctttgaattttcacaacagatatcactgtgat 2853549  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  2853550 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatgcactttgattataaaaagacagacattttcatattatcataagtcatatatttg 2853649  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  2853650 atgttcataagtcattacatagc 2853672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 228 - 398
Target Start/End: Original strand, 24540425 - 24540595
Alignment:
Q  228 atactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacacttt 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24540425 ataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacacttt 24540524  T
Q  328 gattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24540525 gattataaaaagacatacattttcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcattacatagc 24540595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 42472137 - 42472311
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42472137 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaaacactgtcaataacccaggaaggcttttct 42472236  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42472237 atgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 42472311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17575405 - 17575232
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17575405 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttccatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 17575306  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17575305 atgcttgccctctgcataaggtt-gtttaacaatggttatttgatgtatgaatgatttgtttaaattatactgat 17575232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17576125 - 17575952
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17576125 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttccatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 17576026  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17576025 atgcttgccctctgcataaggtt-gtttaacaatggttatttgatgtatgaatgatttgtttaaattatactgat 17575952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17577436 - 17577263
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17577436 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttccatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 17577337  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17577336 atgcttgccctctgcataaggtt-gtttaacaatggttatttgatgtatgaatgatttgtttaaattatactgat 17577263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21842472 - 21842298
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21842472 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaatagctaacactgtcaataacccaggaaggtctttct 21842373  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21842372 atgcttgccctctgcataagatttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 21842298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 40781699 - 40781430
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  40781699 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaaacattgtcaataacccaggaagacctttct 40781600  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaatt-atactgatctggtccttgaattatatgcatat 198  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   ||          ||||| |  |  || ||||||||||||||||  |||||    
T  40781599 atgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtcaaaa---------aaaattcaatcacat-tggtccttgaattataatcatat 40781510  T
Q  199 ccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 278  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||    
T  40781509 ccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagagatcaatgtgatcct 40781430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 29620756 - 29621024
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29620756 tctatgtacaatgatgatgtgagagagtttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 29620855  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgatctggtccttgaattatatgcatatc 199  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||   ||          |||| |  |  || |||||||||||||| |  ||||||    
T  29620856 atgcttgccctctgcataagttttgtttaacaaaggttatttgatgtcaaaa---------aaaatcaatcacat-tggtccttgaattacaatcatatc 29620945  T
Q  200 catcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 278  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||    
T  29620946 catcattttgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagagatcaatgtgatcct 29621024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Original strand, 42472665 - 42472884
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||    
T  42472665 tggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaacatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgat 42472764  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||| |    
T  42472765 cctttggacatacatttgctgaacaaag-aaaaaataaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca-atattcg 42472862  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    | ||| |||||||| ||||||||    
T  42472863 a-gttaataagtcattacatagc 42472884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 2181241 - 2181067
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2181241 tctatgtacaatgatgaggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaataacgcaggaaggcctttct 2181142  T
Q  101 atgcttgccctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||||  |||||||    
T  2181141 atgcctgccctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtccgaatggtttatttaaatagtactgat 2181067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 30464519 - 30464682
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30464519 tctatgtacaatgataaggtgagagagcttcaatgttgctgacctagaatttgtgttgtaagagaagccaacactgtcaataaccaaggaaggcctttct 30464618  T
Q  101 atgcttgccctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaa 163  Q
    ||   | ||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  30464619 atatcttccctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtaaatggtttgtttaa 30464682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 34328338 - 34328264
Alignment:
Q  6 gtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 80  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  34328338 gtacaatgatgaggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaa 34328264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 196 - 293
Target Start/End: Original strand, 41494644 - 41494741
Alignment:
Q  196 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttg 293  Q
    |||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  41494644 tatccatcatattgatccccaaatttgtgaaaataccatcaaataattccttgaattttcacaacatatatcactgtaatccttagtgcatatatttg 41494741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 41494411 - 41494510
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  41494411 tctatgtacaatggtgatgtgagagtgcttcaatgttggtgtcatagaatttgtgttgtaagaaaaaccaacactgtcaataactc---aaggcctttct 41494507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 32134813 - 32134876
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaa 64  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32134813 tctacgtacaatgatgaggtgagagagcttcaacaatggtgtcctagaatttgtgttgtaagaa 32134876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 64
Target Start/End: Original strand, 18624031 - 18624085
Alignment:
Q  10 aatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaa 64  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18624031 aatgaagatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctataatttgtgttgtaagaa 18624085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 35291610 - 35291729
Alignment:
Q  10 aatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgcc 109  Q
    |||| |||| ||| || |||| |||||||||||| |||||||||||| || |||| | |||  ||||| || | |||| ||||||| |||||||||||||    
T  35291610 aatggtgatgtgatagtgcttgaatgttggtgtcctagaatttgtgtcgttagaaaatcaat-actgtaaaaatcccatgaaggccattctatgcttgcc 35291708  T
Q  110 ctccgctaaggtttgtttaac 130  Q
    |||  | ||||||||||||||    
T  35291709 ctctccaaaggtttgtttaac 35291729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 2180467 - 2180428
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2180467 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 2180428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 2853741 - 2853780
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2853741 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 2853780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 7268535 - 7268496
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7268535 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 7268496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 8540362 - 8540323
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8540362 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 8540323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 12737797 - 12737758
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12737797 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 12737758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 12800620 - 12800581
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12800620 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 12800581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 21841693 - 21841654
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21841693 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 21841654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 8540809 - 8540739
Alignment:
Q  6 gtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtc 78  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||| | | |||||||||    
T  8540809 gtacaatgatgaggtgagagagcttcaatgttggtgtcatagaa--tgtgttgtacgaaaaaccaacactgtc 8540739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 30465069 - 30465108
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  30465069 agtcatcaaatcgtttgatgttcttaagtgattacatatc 30465108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 32135266 - 32135305
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  32135266 agtcatcaaatcatttgatattcttaagtgattacatatc 32135305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 174
Target Start/End: Original strand, 18624089 - 18624143
Alignment:
Q  120 gtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  18624089 gtttatttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaatagtactgat 18624143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 163
Target Start/End: Original strand, 28036145 - 28036191
Alignment:
Q  117 aaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaa 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  28036145 aaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtcggaatggtttgtttaa 28036191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 34328265 - 34328219
Alignment:
Q  128 aacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34328265 aacaatggttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaataatactgat 34328219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 40330038 - 40329989
Alignment:
Q  10 aatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgt 59  Q
    |||| |||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  40330038 aatggtgatgtgagagtgcttgaatgttggtgtcctagaatttgtgttgt 40329989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 35400221 - 35400145
Alignment:
Q  32 aatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgc 108  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||| | | || |||   || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  35400221 aatgttggtgtcctacaatttgtgttgttagaaaatccaatacttcaaaaaacccaggaaggccattctatgcttgc 35400145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 57)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 176 - 455
Target Start/End: Original strand, 37114710 - 37114991
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  37114710 tggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtaat 37114809  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37114810 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaaatacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttg 37114909  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc--nnnnnnnnnnnttacatagtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    |||||||||||||| ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37114910 atgttcataagtcattacatagccaaaaaaataacattacatagtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 37114991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 6604467 - 6604245
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  6604467 tggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgacttttcacaacatatatcactgtgat 6604368  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6604367 cattggtgcatacatttactgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttg 6604268  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  6604267 atgttcataagtcattacatagc 6604245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 22154842 - 22154620
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22154842 tggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 22154743  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22154742 ccatggtgcatatatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaagacagactctttgattataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttg 22154643  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  22154642 atgttcataagtcattacatagc 22154620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 22210757 - 22210535
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22210757 tggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 22210658  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22210657 ccatggtgcatatatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaagacagactctttgattataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttg 22210558  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  22210557 atgttcataagtcattacatagc 22210535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Original strand, 23905434 - 23905656
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23905434 tggtcattgaattatatgcatatcaatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgat 23905533  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23905534 ctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaaaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttg 23905633  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  23905634 atgttcataagtcattacatagc 23905656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Original strand, 38473306 - 38473527
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473306 tggtccttgaattatatacatactcatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 38473405  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473406 ccttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaa-acatacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttg 38473504  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  38473505 atgttcataagtcattacatagc 38473527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 176 - 397
Target Start/End: Original strand, 35692532 - 35692753
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35692532 tggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcattgaattttcacaacagatatcactgtgat 35692631  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35692632 ccttggtgcatatatttgccgaacgaagtaaaaagcaaaagacagacactttgattataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttg 35692731  T
Q  376 atgttcataagtcactacatag 397  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  35692732 atgttcataagtcattacatag 35692753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 45360279 - 45360057
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45360279 tggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctaaaattagtgaaaataccatcaaataggtctttgaattttcacaacatatatcactgtgat 45360180  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45360179 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagataaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataaatcatatatttg 45360080  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  45360079 atgttcataagtcattacatagc 45360057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 176 - 396
Target Start/End: Original strand, 27665228 - 27665448
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665228 tggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaatatgtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 27665327  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27665328 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaaggcagacattttcataccatcataagtcatatatttg 27665427  T
Q  376 atgttcataagtcactacata 396  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  27665428 atgttcataagtcattacata 27665448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Original strand, 34776143 - 34776365
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34776143 tggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaatagatctttgaattttcacaacagatatcactgtgat 34776242  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34776243 ccttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaactaaaagacagacactcagattataaaaagacaaacatttgcataccatcataaatcatatatttg 34776342  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  34776343 atgttcataagtcattacatagc 34776365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Original strand, 39858424 - 39858646
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39858424 tggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaatgagtgaaaataccatgaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 39858523  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  39858524 cattggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccattataaatcatatatttg 39858623  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||| ||||    
T  39858624 atgttcataagtcattacttagc 39858646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 179 - 398
Target Start/End: Original strand, 29995701 - 29995920
Alignment:
Q  179 tccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 278  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29995701 tccttaaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatgaaataggtccttgaattttcacaacaaatatcactgtgatcct 29995800  T
Q  279 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29995801 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttgatg 29995900  T
Q  379 ttcataagtcactacatagc 398  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  29995901 ttcataagtcattacatagc 29995920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 13169025 - 13168803
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13169025 tggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaacataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcaatgtgat 13168926  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  13168925 ccttggtgcatacattcgctgaacaaaataaaaactaaaagacagacactttgattataaaaatacagacatttgcatatcattataaatcatatatttg 13168826  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  13168825 atgttcataagtcattacatagc 13168803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Original strand, 46438692 - 46438914
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46438692 tggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaataagtgaaaataccatcaaataggtcattgaattttcacaacagatatcactttgat 46438791  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46438792 ccttggtggatacatttgctgaatagagtaaaaagtagaagacaaacactttgattatagaaagacggacatttgcataccatcataagtcatatattta 46438891  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||| | ||||||||    
T  46438892 atgttcataagtgattacatagc 46438914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 196 - 398
Target Start/End: Original strand, 38550472 - 38550674
Alignment:
Q  196 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 295  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38550472 tatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaatttttacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 38550571  T
Q  296 gaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacat 395  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||    
T  38550572 gaacaaaataaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatacatttaattttcataagtcattacat 38550671  T
Q  396 agc 398  Q
    |||    
T  38550672 agc 38550674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 178 - 385
Target Start/End: Original strand, 24227605 - 24227812
Alignment:
Q  178 gtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 277  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  24227605 gtccttaaattatatacacatccatcatatcaatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggacatttaattttcacaacagatatcactgtgatca 24227704  T
Q  278 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgat 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24227705 ttggtacatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattacaaaaagacagacatttgtataccatcataaatcatatatttgat 24227804  T
Q  378 gttcataa 385  Q
    ||||||||    
T  24227805 gttcataa 24227812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20479190 - 20478921
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20479190 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 20479091  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaatt-atactgatctggtccttgaattatatgcatat 198  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   ||          ||||| |  |  || ||||||||||||||||  |||||    
T  20479090 atgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtcaaaa---------aaaattcaatcacat-tggtccttgaattataatcatat 20479001  T
Q  199 ccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 278  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||    
T  20479000 ccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagagatcaatgtgatcct 20478921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 77527 - 77353
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  77527 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcttttct 77428  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77427 atgcttgcactatgcataaggtttgtttaacaatggttatttaatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 77353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 177 - 395
Target Start/End: Original strand, 35402544 - 35402760
Alignment:
Q  177 ggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 276  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  35402544 ggtccttgaattatattca-atccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatc 35402642  T
Q  277 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttga 376  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||| ||    
T  35402643 ctttgagcatatatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagataaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca-atattcga 35402741  T
Q  377 tgttcataagtcactacat 395  Q
    |||| |||||||| |||||    
T  35402742 tgttaataagtcattacat 35402760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 196 - 398
Target Start/End: Original strand, 37792236 - 37792438
Alignment:
Q  196 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 295  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  37792236 tatccatcatattgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaccatatatcactgtgatcattggtgcatacatttgtt 37792335  T
Q  296 gaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacat 395  Q
    | ||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  37792336 gtacaaagtaaaaagtaaaagtcaaagactttgattgtaaaaagacagacatttgcttaccatcatatgtcatacatttgatgttcataagtaattacat 37792435  T
Q  396 agc 398  Q
    |||    
T  37792436 agc 37792438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 216 - 398
Target Start/End: Original strand, 48851545 - 48851727
Alignment:
Q  216 aaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaa 315  Q
    ||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48851545 aaattagtgaaaatctcatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcattgtgatccttggggcatacatttgctgaccaaagtaaaaagtaaaa 48851644  T
Q  316 gacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  48851645 gacagacactttgattgtaaaaagacatacatttgcataccatcagaagttatacatttgatgttcataagtctttacatagc 48851727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Original strand, 47385397 - 47385614
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  47385397 tggtccttctattatatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaattaccatcaaataagtccttgaattttcacaacatacatca-tgtgat 47385495  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    | |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||| |||||    
T  47385496 cat----gcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacacattgattgtaaaaagacagacatttacataccatcataactgatacatttg 47385591  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  47385592 atgttcataagtcattacatagc 47385614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 35692004 - 35692178
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35692004 tctatgtacaatgatgatgtgagaaagcttcaatgttggtgtccaagaatttgcgttgtaagaaaagcaaacactgtcaataacctaggaaggcctttct 35692103  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    || | ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  35692104 attcctgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatgttttctttaaattatattgat 35692178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Original strand, 48851132 - 48851299
Alignment:
Q  8 acaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttg 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48851132 acaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcatagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaataacctaggaaggcctttctatgcttg 48851231  T
Q  108 ccctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    ||||| | | || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  48851232 ccctctgccaaatgtttggttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaatagtactgat 48851299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 38550099 - 38550273
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38550099 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 38550198  T
Q  101 atgcttgccctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    ||| |||||| | | | || |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||  |||||||    
T  38550199 atgtttgcccactgccaaatgtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgttaaaatagtactgat 38550273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Original strand, 47384869 - 47385035
Alignment:
Q  9 caatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgc 108  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47384869 caatgatgatgtgagagagattcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaaaccaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgtttgc 47384968  T
Q  109 cctc-cgctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    ||||   | ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  47384969 cctcttccaaagttttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaatggtactgat 47385035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 185 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 69134 - 69032
Alignment:
Q  185 aattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  69134 aattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatccttggtgc 69035  T
Q  285 ata 287  Q
    |||    
T  69034 ata 69032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 45360806 - 45360632
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45360806 tctatgtacaatgatgaggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacactgtcaataacccaagaaggcctttct 45360707  T
Q  101 atgcttgccctc-cgctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||  |||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||||  |||||||    
T  45360706 atgtctgccctcttccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgcgaatggtctgtttaaatagtactgat 45360632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22155370 - 22155205
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22155370 tctatgtacaatgatgaggtgagataacttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaataacctaggaaggcctttct 22155271  T
Q  101 atgcttgccctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaat 165  Q
    |||  || |||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  22155270 atgtctgtcctctgccaaagttttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaat 22155205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22211285 - 22211120
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22211285 tctatgtacaatgatgaggtgagataacttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaataacctaggaaggcctttct 22211186  T
Q  101 atgcttgccctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaat 165  Q
    |||  || |||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  22211185 atgtctgtcctctgccaaagttttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaat 22211120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 6604891 - 6604745
Alignment:
Q  20 tgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccctccg-ctaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||    
T  6604891 tgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttatgttgtaagaaaagtcaactatgtcaataacccaggaaggcctttctatgcctgccctctgccaaa 6604792  T
Q  119 ggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaat 165  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||    
T  6604791 ggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatagtttgtttaaat 6604745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 34775617 - 34775782
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  34775617 tctatgtacaatgatgaggtgagagagcttcaatgttggtggcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacagtgtcaataatccaggaaggcctttct 34775716  T
Q  101 atgcttgccctc-cgctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaat 165  Q
    |||| | |||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||    
T  34775717 atgcataccctctaccaaaggtttgtttaacaatggttatatgatgtgcgaatggtttgtttaaat 34775782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 283 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 66915 - 66802
Alignment:
Q  283 gcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttca 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||   ||||| ||||| |||||||||||| |    
T  66915 gcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagaaaggcatttgcattatatcat-agtca-atatttgatgttaa 66818  T
Q  383 taagtcactacatagc 398  Q
    ||||||| ||||||||    
T  66817 taagtcattacatagc 66802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 38472829 - 38472908
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 80  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  38472829 tctatgtacaattatgagatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaa 38472908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 48311399 - 48311273
Alignment:
Q  15 tgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggc-ctttctatgcttgccctcc 113  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||     
T  48311399 tgatgtgagagtgcttgaatgttggtgtaatagattttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaataacccaggaagactttttctatgcttgccctct 48311300  T
Q  114 g-ctaaggtttgtttaacaatggttat 139  Q
    | | ||| |||||| ||||||||||||    
T  48311299 gtcaaagttttgttcaacaatggttat 48311273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 333 - 398
Target Start/End: Original strand, 30939748 - 30939813
Alignment:
Q  333 taaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30939748 taaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgttcataagtcattacatagc 30939813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 24227125 - 24227201
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgt 77  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24227125 tctatgtacaatgatgagatgagagagcttcaatgttagtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgt 24227201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 34692261 - 34692157
Alignment:
Q  27 gcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccctccg-ctaaggtttgt 125  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  34692261 gcttgaatgttggtgtggtagaatttgtgctgtaagaaaagccaacactctcaaaaacccagaaaggtctttctatgcttgccctctgccaaaggtttgt 34692162  T
Q  126 ttaac 130  Q
    |||||    
T  34692161 ttaac 34692157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 37114507 - 37114570
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaa 64  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37114507 tctatgtacaatgatgaggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaa 37114570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 46438213 - 46438292
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 80  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  46438213 tctatgtacaatgatgaggtgagagagcttcaatgttggtgtcctataatttgtgttgtaaaaaaagccaacactgtcaa 46438292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 11684091 - 11683970
Alignment:
Q  10 aatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgcc 109  Q
    |||| |||| ||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | | || ||| | || || ||| ||||| |||||||||||||||    
T  11684091 aatggtgatgtgagagtacttgaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaaaccaatactcttaaaaatccaagaaggtctttctatgcttgcc 11683992  T
Q  110 ctccg-ctaaggtttgtttaac 130  Q
    ||| | | ||||||||||||||    
T  11683991 ctctgccaaaggtttgtttaac 11683970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 48310867 - 48310750
Alignment:
Q  216 aaattagtgaaaa-tactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagta-aaaagtaa 313  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||| | |||| ||||||||||||||||| ||||  ||    
T  48310867 aaattagtgaaaaatatcatcaaataagtcattgaattatcacaacatatatcaatatgatctttgctacatatatttgctgaacaaagtagaaaataaa 48310768  T
Q  314 aagacatacactttgatt 331  Q
    |||||| |||||||||||    
T  48310767 aagacagacactttgatt 48310750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 23954816 - 23954726
Alignment:
Q  22 agagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccctc 112  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | | || |||   || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23954816 agagtgcttgaatgttggtgtcctagaatttgtgttgttagaaaatccaatacttcaaaaaacccaggaaggccattctatgcttgccctc 23954726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13035705 - 13035621
Alignment:
Q  225 aaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 309  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |   ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||    
T  13035705 aaaataccatcaaataagtccttgaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttggtgcatatatgtgcaaaacaaagtaaaaa 13035621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 6604216 - 6604177
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6604216 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 6604177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 13168775 - 13168736
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13168775 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 13168736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 29995926 - 29995965
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29995926 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 29995965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 30939841 - 30939880
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30939841 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 30939880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 34776393 - 34776432
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34776393 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 34776432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 38473555 - 38473594
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38473555 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 38473594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 39858674 - 39858713
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39858674 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 39858713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 46438942 - 46438981
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46438942 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 46438981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 454
Target Start/End: Original strand, 27665477 - 27665515
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatat 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27665477 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatat 27665515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 38614361 - 38614307
Alignment:
Q  10 aatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaa 64  Q
    |||| |||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  38614361 aatggtgatgtgagagtgcttaaatgttggtgtcctagaatttgtgttgttagaa 38614307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 7403303 - 7403210
Alignment:
Q  82 aacccaggaaggcctttctatgcttgccctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | | |||||||||||||| ||  || | ||||||  ||||| ||||||||| || |||||||    
T  7403303 aacccaggaagacctttctatggttgccctctgccaaaggtttgtttaaccataattgtgtgatgtccgaatggtttgtttaacttctactgat 7403210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 109
Target Start/End: Original strand, 46995237 - 46995326
Alignment:
Q  20 tgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgcc 109  Q
    |||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||| | | || |||   || |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  46995237 tgagagtgcttgaatgttggtgtcctacaatttgtgttgttagaaaatccaatacttcaaaaaacccatgaaggccattctatgcttgcc 46995326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 423 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 45360007 - 45359975
Alignment:
Q  423 aaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45360007 aaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 45359975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Original strand, 32438262 - 32438484
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  32438262 tggtcctttaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaatagatatcactatgat 32438361  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32438362 ccttggtccatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 32438461  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  32438462 atgttcataagtcactacatagc 32438484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 20524329 - 20524107
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20524329 tggtccttgaattatatatgtatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactatgat 20524230  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20524229 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttg 20524130  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  20524129 atgttcataagtcattacatagc 20524107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Original strand, 7372165 - 7372386
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  7372165 tggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaatcga-atcactgtgat 7372263  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7372264 ccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttg 7372363  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  7372364 atgttcataagtcattacatagc 7372386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 176 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18644215 - 18644031
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18644215 tggtccttgaattatatgcatatccattatttcgatcatcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 18644116  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatca 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18644115 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatca 18644031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 207 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 11356120 - 11355929
Alignment:
Q  207 tcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaa 306  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11356120 tcgatcctcaaattagtaaaaataccatcaaacaggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaa 11356021  T
Q  307 aaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11356020 aaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcattagtcatatatttgatgttcataagtcattacatagc 11355929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 196 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 7050681 - 7050479
Alignment:
Q  196 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 295  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7050681 tatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtcattgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 7050582  T
Q  296 gaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7050581 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcattacat 7050482  T
Q  396 agc 398  Q
    |||    
T  7050481 agc 7050479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 32437736 - 32437910
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32437736 tctatgtacaatgatgatgtgagaaagcttcaatgttgttgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 32437835  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32437836 atgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 32437910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 196 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 10569322 - 10569122
Alignment:
Q  196 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 295  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10569322 tatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttca--acatatatcattgtgatccttggtgcatacatttgct 10569225  T
Q  296 gaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacat 395  Q
     ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  10569224 aaacaaagtaaaaagtaaaaaacagacactttgattgtaaaaagatagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgttcataactcattacat 10569125  T
Q  396 agc 398  Q
    |||    
T  10569124 agc 10569122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 32454866 - 32455125
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  32454866 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaaacaccgtcaataacccaggaagaccttttt 32454965  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgatctggtccttgaattatatgcatatc 199  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   ||          |||||  | |    ||||||||||||||||  ||||||    
T  32454966 atgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtcaaaa---------aaaattcaattacattggtccttgaattataatcatatc 32455056  T
Q  200 catcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatca 268  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  32455057 catcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagagatca 32455125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 176 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 32517813 - 32517672
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32517813 tggtccttcaattatatgcatatccatcataccgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaatagttccttgaattttcacaacagacatcactgtgat 32517714  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32517713 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 32517672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 263 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 6900341 - 6900206
Alignment:
Q  263 atatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcata 362  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  6900341 atatcactgtgatccttggttcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaggacagacatttgcataccattata 6900242  T
Q  363 agtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6900241 agtcatacatttgatgttcataagtcattacatagc 6900206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 9399580 - 9399423
Alignment:
Q  9 caatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgc 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9399580 caatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgccaataatccaggaaggcctttctatgcttgc 9399481  T
Q  109 cctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaat 165  Q
    |||  | | ||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||    
T  9399480 cctttgccaaagatttgtttaacaatggttatgtaatgtgtgaatggtttgtttaaat 9399423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 6902429 - 6902264
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6902429 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgtagtaagaaaagccaacactgtcaataacccaggaaggtctttct 6902330  T
Q  101 atgcttgccctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaat 165  Q
    |||  ||||||| | | || |||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||| ||||    
T  6902329 atgtctgccctctgccaaatgtttgtttaacattggttatgtgatgtgtgaatggtttgttaaaat 6902264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 11356665 - 11356500
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  11356665 tctatgtacaatgatgaggtgagagagcttcaatgttggtgtcatagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactatcaataacccaagaaagcctttct 11356566  T
Q  101 atgcttgccctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaat 165  Q
    |||  ||||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  11356565 atgtctgccctctgccaaaggtttgtttaacaaaggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaat 11356500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 33267610 - 33267767
Alignment:
Q  9 caatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgc 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  33267610 caatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaataacctaggaaggtctttttatgcttgc 33267709  T
Q  109 cctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaat 165  Q
     ||  | | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  33267710 tctatgtcaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaat 33267767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 7051038 - 7050873
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7051038 tctatgtaaaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctataatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaatagcccaggaaggcctttct 7050939  T
Q  101 atgcttgccctccgcta-aggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaat 165  Q
    |||  ||| ||  || | ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| ||||    
T  7050938 atgtctgctctttgccataggtttgtttaacaatggttatgcgatgtgtgaatggtttgttaaaat 7050873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10569678 - 10569505
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  10569678 tctatgtacaatgatgatgtgagcgagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactatcaataacccaggaaagcc-ttct 10569580  T
Q  101 atgcttgccctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||  |||| || | | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| ||||  |||||||    
T  10569579 atgtctgccatctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgcgatgtgtgaatggtttgttaaaatagtactgat 10569505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 80
Target Start/End: Original strand, 7371693 - 7371767
Alignment:
Q  6 gtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 80  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  7371693 gtacaatgatgaggtgagagagcttcaatgctggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaa 7371767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 116 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18644635 - 18644577
Alignment:
Q  116 taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18644635 taaggtttgtttaacaattgttatttgatatatgaatgttttgtttaaattatactgat 18644577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 278
Target Start/End: Original strand, 33268073 - 33268155
Alignment:
Q  196 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 278  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  33268073 tatccatcatatcgatccctaaattattgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcaatgtgatcct 33268155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 20524847 - 20524768
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 80  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  20524847 tctatgtacaatgatgaggttagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaaggcaacactgtcaa 20524768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 196 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 6902072 - 6901999
Alignment:
Q  196 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcac 269  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  6902072 tatccatcatatcaatccccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcac 6901999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 32517664 - 32517613
Alignment:
Q  347 tttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  32517664 tttgtataccatcataagtcatatatttgatgttcataagccattacatagc 32517613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 398
Target Start/End: Original strand, 21091582 - 21091647
Alignment:
Q  333 taaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||| ||| |||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21091582 taaaaatacagacatttgcatattttcataagtcataaatttgatgttcataagtcattacatagc 21091647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 32438513 - 32438552
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32438513 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 32438552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 454
Target Start/End: Original strand, 7372392 - 7372430
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatat 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7372392 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatat 7372430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 11355901 - 11355866
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattaca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11355901 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattaca 11355866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 18644030 - 18643991
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18644030 agtcatcaaattatttgatgttcttaagtgattacatatc 18643991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 32517581 - 32517542
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  32517581 agtcatcaaatcatttgatgttcttaaatgattacatatc 32517542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 410 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 10569107 - 10569062
Alignment:
Q  410 ttacatagtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10569107 ttacatagccatcaagtcatttgatgttcttaagtcattacatatc 10569062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 51012869 - 51012647
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  51012869 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcaatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttaaattttcacaacagatattactgcgat 51012770  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51012769 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 51012670  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  51012669 atgttcataagtcactacatagc 51012647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Original strand, 35402850 - 35403072
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35402850 tggttcttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 35402949  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35402950 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaacgacagacactttgattataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttg 35403049  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  35403050 atgttcataagtcattacatagc 35403072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 49524074 - 49523852
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  49524074 tggtcattgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacaaatataactgtgat 49523975  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49523974 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaacacagacatttgcataccatcataagtcatatatttg 49523875  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  49523874 atgttcataagtcattacatagc 49523852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 176 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 42981562 - 42981341
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42981562 tggtccttgaattatatacatatctatcatatcgatccttaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacaggtatcactgtgat 42981463  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42981462 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttg 42981363  T
Q  376 atgttcataagtcactacatag 397  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  42981362 atgttcataagtcattacatag 42981341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 176 - 396
Target Start/End: Original strand, 41760909 - 41761129
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  41760909 tggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcataccagatatcactgtgat 41761008  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41761009 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttg 41761108  T
Q  376 atgttcataagtcactacata 396  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  41761109 atgttcataagtcattacata 41761129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 182 - 397
Target Start/End: Original strand, 11255118 - 11255333
Alignment:
Q  182 ttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttgg 281  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  11255118 ttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcattag 11255217  T
Q  282 tgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttc 381  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11255218 tgcatacatttgctgagcaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagatatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttc 11255317  T
Q  382 ataagtcactacatag 397  Q
    |||||||| |||||||    
T  11255318 ataagtcattacatag 11255333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 43520380 - 43520158
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43520380 tggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaatagatccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 43520281  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43520280 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttg 43520181  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    ||| |||| ||||| ||||||||    
T  43520180 atgctcatgagtcattacatagc 43520158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 177 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 41782463 - 41782242
Alignment:
Q  177 ggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41782463 ggtccttgaattatatgcatatccatcatatcaatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaattggtccttgatttttcacaacagatatcaccgtgatc 41782364  T
Q  277 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttga 376  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  41782363 cttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatatgcacactatcataagtcatatatttga 41782264  T
Q  377 tgttcataagtcactacatagc 398  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  41782263 tgttcataagtcattacatagc 41782242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 198 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 54387061 - 54386861
Alignment:
Q  198 tccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctga 297  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  54387061 tccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcactgcaattcttggtgcatacatttgctga 54386962  T
Q  298 acaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatag 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  54386961 acaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatacatttgatgttcataagtcattacatag 54386862  T
Q  398 c 398  Q
    |    
T  54386861 c 54386861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 177 - 398
Target Start/End: Original strand, 319845 - 320065
Alignment:
Q  177 ggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 276  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  319845 ggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatc 319944  T
Q  277 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttga 376  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||| ||    
T  319945 ctttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca-atattcga 320043  T
Q  377 tgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||| |||||||| ||||||||    
T  320044 tgttaataagtcattacatagc 320065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 177 - 398
Target Start/End: Original strand, 4172685 - 4172905
Alignment:
Q  177 ggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 276  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  4172685 ggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatc 4172784  T
Q  277 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttga 376  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||| ||    
T  4172785 ctttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca-atattcga 4172883  T
Q  377 tgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||| |||||||| ||||||||    
T  4172884 tgttaataagtcattacatagc 4172905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 177 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 33265526 - 33265306
Alignment:
Q  177 ggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 276  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  33265526 ggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatc 33265427  T
Q  277 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttga 376  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||| ||    
T  33265426 ctttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca-atattcga 33265328  T
Q  377 tgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||| |||||||| ||||||||    
T  33265327 tgttaataagtcattacatagc 33265306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 196 - 398
Target Start/End: Original strand, 48645949 - 48646149
Alignment:
Q  196 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 295  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48645949 tatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 48646048  T
Q  296 gaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacat 395  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48646049 gaataaagtaaaaagtaaaagacaaatactttgattgtaaaaag--agacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcattacat 48646146  T
Q  396 agc 398  Q
    |||    
T  48646147 agc 48646149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 196 - 455
Target Start/End: Original strand, 2692488 - 2692748
Alignment:
Q  196 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 295  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  2692488 tatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcattgtgatccttggttcatacatttgtt 2692587  T
Q  296 gaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  2692588 gaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatacatttgatgttcataagtcattacat 2692687  T
Q  396 agcnnnnnnnnnnn-ttacatagtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
     ||            |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2692688 ggccaaaaaaagaacttacatagccatcaagtcatttgatgttcttaagtcattacatatc 2692748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 833811 - 833985
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  833811 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaaacactgtcaataacccaggaaggcttttct 833910  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  833911 atgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 833985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 177 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 43508169 - 43507949
Alignment:
Q  177 ggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 276  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||    
T  43508169 ggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaagataccatcaaattggtccttgaattatcataacaaatatcaatgtgatc 43508070  T
Q  277 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttga 376  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| ||||||| ||||| ||    
T  43508069 ctttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcctaagtca-atattcga 43507971  T
Q  377 tgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||| |||||||| ||||||||    
T  43507970 tgttaataagtcattacatagc 43507949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 5439148 - 5438974
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5439148 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaaacactgtcaataacccaggaaggcttttct 5439049  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  5439048 atgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtataaatattttgtttaaattatactgat 5438974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 51013397 - 51013223
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  51013397 tctatgtacaatgatgatgtaagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccataaaggcctttct 51013298  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51013297 atacttgccctctgcataaggtttgtttaacaatgattatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 51013223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 226 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 11602569 - 11602406
Alignment:
Q  226 aaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacact 325  Q
    |||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11602569 aaatacaatcaaataagtcgttcaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatctgctaaacaaagtaaaaagtaaaagacatacact 11602470  T
Q  326 ttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtca 389  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11602469 ttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtcacacatttgatgttcataagtca 11602406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 240 - 398
Target Start/End: Original strand, 52867414 - 52867561
Alignment:
Q  240 aggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaag 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||           |    
T  52867414 aggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtagaagacagacacttt-----------g 52867502  T
Q  340 acacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52867503 acaaacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcattacatagc 52867561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Original strand, 834237 - 834456
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||    
T  834237 tggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaacatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgat 834336  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||   ||||||||||| ||||| |    
T  834337 cctttggacatacatttgctgaacaaag-aaaaaataaaagacaaacactttgaatataaaaagacaaacattttcattatatcataagtca-atattcg 834434  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    | ||| |||||||| ||||||||    
T  834435 a-gttaataagtcattacatagc 834456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 201 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11640967 - 11640838
Alignment:
Q  201 atcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaaca 300  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11640967 atcatatcgatctccaaattagtgaaaatacaatcaaataagtcgttcaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatctgctgaaca 11640868  T
Q  301 aagtaaaaagtaaaagacatacactttgat 330  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11640867 aagtaaaaagtaaaaaacatacactttgat 11640838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 5438722 - 5438507
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||||||    |||||||||| ||| |||||| |||| | ||||    
T  5438722 tggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaacatcaaa----tccttgaattatcataacagaaatcaatttgat 5438627  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||   ||||||||||| ||||| |    
T  5438626 cctttggacatacatttgctgaacaaag-aaaaaataaaagacaaacactttgaatataaaaagacaaacattttcattatatcataagtca-atattcg 5438529  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    | ||| |||||||| ||||||||    
T  5438528 a-gttaataagtcattacatagc 5438507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 48645585 - 48645720
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  48645585 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgccaataacccaggaaggtctttct 48645684  T
Q  101 atgcttgccctccg-ctaaggtttgtttaacaatgg 135  Q
    |||  ||||||| | | || ||||||||||||||||    
T  48645685 atgtctgccctctgccaaaagtttgtttaacaatgg 48645720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 35402325 - 35402499
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  35402325 tctatgtacaatgatgaggtgaaagagcttcgatgttggtgtccaagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacactatcaataacctaggaagacctttct 35402424  T
Q  101 atgcttgccctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||| ||||||| | | |||||||||||||||||||| || |||||| | |||| |||||||||||  |||||||    
T  35402425 atgcctgccctctgccaaaggtttgtttaacaatggtcatgtgatgtgtcaatggtttgtttaaatagtactgat 35402499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 174
Target Start/End: Original strand, 2691966 - 2692114
Alignment:
Q  27 gcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccctccg-ctaaggtttgt 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||  | ||||| | | |||||||||    
T  2691966 gcttcaatgttggtgtcatagaatttgtgttgtaagaaaagccaacattgttaataatccaggaaggcctttttatgtcttccctctgccaaaggtttgt 2692065  T
Q  126 ttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  2692066 ttaacaatgattatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaattgtactgat 2692114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 54387414 - 54387270
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54387414 tctatgtataataatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaataacccaggaagacctttct 54387315  T
Q  101 atgcttgccctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttatttgat 144  Q
    |||  ||||||  | | || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  54387314 atgtctgccctatgccaaatgtttgtttaacgatggttatgtgat 54387270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11641532 - 11641385
Alignment:
Q  28 cttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccctccg-ctaaggtttgtt 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||  | ||||| | | ||||||| ||    
T  11641532 cttcaatgttggtgtcatagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactatcaataatccaagaagacctttctatgtcttccctctgtcaaaggtttatt 11641433  T
Q  127 taacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  11641432 taacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttttttaaattgtactgat 11641385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 11254635 - 11254714
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 80  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  11254635 tctatgtacaatgatgaggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaa 11254714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 41760304 - 41760383
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 80  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  41760304 tctatgtacaatgatgaggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaatccaacactgtcaa 41760383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 42982015 - 42981936
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 80  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||    
T  42982015 tctatgtacaatgatgaggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgttttgtaaggaaagccaacactgtcaa 42981936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 35403100 - 35403139
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35403100 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 35403139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 52867591 - 52867630
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52867591 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 52867630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 4519976 - 4519891
Alignment:
Q  27 gcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccctc 112  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | | || |||   || |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4519976 gcttgaatgttggtgtcctagaatttgtgttgttagaagatccaatacttcaaaaaacccaggaaggtcattctatgcttgccctc 4519891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 11255364 - 11255403
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11255364 agtcatcaaattatttgatgttcttaagtgattacatatc 11255403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4614918 - 4614840
Alignment:
Q  86 caggaaggcctttctatgcttgccctccgctaa-ggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaa 163  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||| || |||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  4614918 caggaaggcctttctatgctttccctttgccaaaggtttgtttaaaaagggttatgtgatgtcagaatggtttgtttaa 4614840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 454
Target Start/End: Original strand, 41761159 - 41761197
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatat 454  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41761159 agtcatcaaatcatttgatgttctcaagtgattacatat 41761197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 7150305 - 7150221
Alignment:
Q  225 aaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 309  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||| |   ||||||| ||| |||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||    
T  7150305 aaaataccatcaaataagtcctttaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttggcgcatatatgtgtagaacaaagtaaaaa 7150221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 411 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 54386846 - 54386802
Alignment:
Q  411 tacatagtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  54386846 tacatagccatcaagtcatttgatgttcttaagtcattacatatc 54386802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 16763907 - 16763685
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16763907 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcattgaatttacacaacagatatcactgtgat 16763808  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16763807 ccttggtgcatacatttgctgaacagagtaaaaagtaaaagatagacactttgattataaaaagacacacatttgcatactatcataagtcatatatttg 16763708  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16763707 atgttcataagtcactacatagc 16763685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 176 - 455
Target Start/End: Original strand, 14388284 - 14388565
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14388284 tggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 14388383  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14388384 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacactttgattataaaaaaacagacatttgcataccatcataagtcatatatttg 14388483  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc--nnnnnnnnnnnttacatagtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||| |||||| |||| |||             |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14388484 atgttcacaagtcattacaaagccaaaaaaataacattacatagccatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 14388565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Original strand, 19907461 - 19907683
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19907461 tggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaatgagtgaaaataccatgaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 19907560  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19907561 cattggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccattataaatcatatatttg 19907660  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||| ||||    
T  19907661 atgttcataagtcattacttagc 19907683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 40561186 - 40560964
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40561186 tggtccttaaattatatgcacatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcaatgtgat 40561087  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  40561086 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagccatacactttgattataaaaagacagacatttgcatatcatcataaatcatatatttg 40560987  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||| ||| | ||||||||    
T  40560986 atgttcatcagtaattacatagc 40560964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 6798467 - 6798245
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6798467 tggtccttcaattgtatacatattcatcaaatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaatatgtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 6798368  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6798367 ccttggtgcatacatttgatgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcatatcatcataagttatatatttg 6798268  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  6798267 atgttcataagtcattacatagc 6798245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 175 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 17697169 - 17696946
Alignment:
Q  175 ctggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtga 274  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  17697169 ctggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctaaaattggtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatacatcactatga 17697070  T
Q  275 tccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatattt 374  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17697069 tccttggtggatacatttgttgaacaaagtaaaaagtagaagacagacactttgattataaaaagacagatatttgcataccatcataagtcatatattt 17696970  T
Q  375 gatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    ||||||||||||| | ||||||||    
T  17696969 gatgttcataagtgattacatagc 17696946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 207 - 398
Target Start/End: Original strand, 39663994 - 39664185
Alignment:
Q  207 tcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39663994 tcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaa 39664093  T
Q  307 aaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39664094 aaactaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatctgcataccatcataaatcatatatttgatgttcataagtcattacatagc 39664185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 39456120 - 39455899
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  39456120 tggtcattgaattatatgcatattcatcatattgattctcaaatgagtgaaaatatcatcaaataggtccttaaattttcacaacagatatcactatgat 39456021  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  39456020 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaga-actttgattataaaaagacagacatttgtataccatcataagtcatatacttg 39455922  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  39455921 atgttcataagtcattacatagc 39455899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 176 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 2767875 - 2767683
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2767875 tggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaatttagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattttcacaatagatatcactgtgat 2767776  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcat 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2767775 ccttggtgcatacattttctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaactctttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcat 2767683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 6783942 - 6784116
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6783942 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaaacactgtcaataactcaggaaggcttttct 6784041  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6784042 atgtttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 6784116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 397
Target Start/End: Original strand, 44708996 - 44709160
Alignment:
Q  233 atcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgatta 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  44708996 atcaaattggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtcaaagacagacactttgatta 44709095  T
Q  333 taaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatag 397  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44709096 taaaaatgcagacatttgcataccatcataagacatatatttgatgttcataagtcattacatag 44709160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37021657 - 37021388
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37021657 tctatgtacaatgatgatgtgggagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 37021558  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaatt-atactgatctggtccttgaattatatgcatat 198  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   ||          ||||| |  |  || ||||||||||||||||  |||||    
T  37021557 atgcttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtcaaaa---------aaaattcaatcacat-tggtccttgaattataatcatat 37021468  T
Q  199 ccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  37021467 ccatcattttgatcctcaaattaatgaaaaaaccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcct 37021388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 24206187 - 24206359
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24206187 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggt--cctagaatttgtgttgtaagaagagcaaacactgtcaataactcaggaaggcttttct 24206284  T
Q  101 atgcttgccctccgc-taaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24206285 atacttgccctctgcataaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttatttaaattatactgat 24206359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Original strand, 6784470 - 6784692
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatact-atcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtga 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |   ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| |  ||    
T  6784470 tggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatctttaaattagtaaaaaaaaacatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaattgga 6784569  T
Q  275 tccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatattt 374  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||     
T  6784570 tcctttggacatacatttgctgaacaaagtcaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca-atattc 6784668  T
Q  375 gatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||| |||||||| ||||||||    
T  6784669 gatgttaataagtcattacatagc 6784692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 176 - 389
Target Start/End: Original strand, 24206721 - 24206935
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatact--atcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtg 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    ||||||| |||||||||||| | | |||||| |||| | ||    
T  24206721 tggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaaatcatcaaattggtccttgaattattataacagaaatcaatttg 24206820  T
Q  274 atccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatt 373  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||    
T  24206821 atcctttggacatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacaatttgattataaaaagacaaacatttgcattatatcataagtca-atatt 24206919  T
Q  374 tgatgttcataagtca 389  Q
     |||||| ||||||||    
T  24206920 cgatgttaataagtca 24206935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 285 - 398
Target Start/End: Original strand, 42518524 - 42518637
Alignment:
Q  285 atacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcata 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42518524 atacatttgctgaacaaagtaaaaaataaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcata 42518623  T
Q  385 agtcactacatagc 398  Q
    ||||  ||||||||    
T  42518624 agtctttacatagc 42518637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 19581744 - 19581918
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19581744 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggcgtcctagaatttgtattgtaagaaaagccaacactgtcaataacccaggaagacctttct 19581843  T
Q  101 atgcttgccctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||  | ||||| | | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| ||||  |||||||    
T  19581844 atgtcttccctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgcgatgtgtgaatggtttgttaaaatagtactgat 19581918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 39663719 - 39663893
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  39663719 tctatgtacaacgatgaggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacaccgtcaataatctaggaaggcctttct 39663818  T
Q  101 atgcttgccctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    |||  ||||||| | | || |||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||  |||||||    
T  39663819 atgtctgccctctgccaaaagtttgtttaacaatggttatgtgatgtgcgaatggtttgtttaaatagtactgat 39663893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 17697646 - 17697567
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 80  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  17697646 tctatgtacaatgatgaggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtcagaaaagccaacactgtcaa 17697567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 34400887 - 34400966
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 80  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  34400887 tctatgtacaatgatgaggtgagagagcttcaatgttggtgtcttagaattcgtgttttaagaaaagccaacactgtcaa 34400966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 2768353 - 2768274
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 80  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||    
T  2768353 tctatgtacaatgatgaggtgagagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaaaaaaagccaacactatcaa 2768274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 40561389 - 40561326
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaa 64  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  40561389 tctatgtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctataatttgtgttgtaagaa 40561326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 165
Target Start/End: Original strand, 44708545 - 44708641
Alignment:
Q  70 aacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaat 165  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||  | ||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  44708545 aacattgtcaataatccaggaaggcatttctatgtctaccctctgtcaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaat 44708641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 42518134 - 42518213
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 80  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  42518134 tctatgtacaatgatgaggtgagagagctttaatgttggtgtcctaaaatttttgttgtaagaaaagccaacactgtcaa 42518213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 6798940 - 6798882
Alignment:
Q  6 gtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaa 64  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  6798940 gtacaatgatgaggtgagagagcttcaatgttggtgtcctaaaatttgtgttgtaagaa 6798882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 37646283 - 37646222
Alignment:
Q  270 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagt-aaaagacatacactttgat 330  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  37646283 tgtgatctttggtgcatatatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaagacatgcactttgat 37646222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 31471090 - 31471007
Alignment:
Q  70 aacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccctccgctaa-ggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaat 152  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31471090 aacactatcaataacacaggaatgcctttctatgtctgccctctgccaaaggtttgtttaacaatggttatgtgatgtttgaat 31471007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 112
Target Start/End: Original strand, 10715667 - 10715759
Alignment:
Q  20 tgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgcttgccctc 112  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| |||||| || | |||| || |||| |||| |||||||||||||    
T  10715667 tgagagtgcttgaatgttggtgtcgtagaatttgtgctgcaagaaaagccaacactctccacaacctagaaaggtctttatatgcttgccctc 10715759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 2767645 - 2767606
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2767645 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 2767606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 39455871 - 39455832
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39455871 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 39455832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 44709188 - 44709227
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44709188 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 44709227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 161300 - 161216
Alignment:
Q  225 aaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 309  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |   ||||||| |||  ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||    
T  161300 aaaataccatcaaataagtccttgaattatttaaacagatgtcaacgtgatccttggtgcatatatgtgcataacaaagtaaaaa 161216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 419 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 16763649 - 16763613
Alignment:
Q  419 catcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16763649 catcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 16763613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 17696918 - 17696879
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17696918 agtcatcaaatgatttgatgttcttaagtgattacatatc 17696879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 19907711 - 19907750
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19907711 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgatcacatatc 19907750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Original strand, 39664214 - 39664253
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  39664214 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattatatatc 39664253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 40560936 - 40560897
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  40560936 agtcatcaaatcatttgatgttcttaggtgattacatatc 40560897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 418 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 6798217 - 6798180
Alignment:
Q  418 tcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6798217 tcatcaaataatttgatgttcttaagtgattacatatc 6798180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 358 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 37646141 - 37646101
Alignment:
Q  358 tcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37646141 tcataagtcttacatttgatgttcataagtcattacatagc 37646101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 423 - 455
Target Start/End: Original strand, 42518673 - 42518705
Alignment:
Q  423 aaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42518673 aaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 42518705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0564
Description:

Target: scaffold0564; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 178 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 9209 - 8989
Alignment:
Q  178 gtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9209 gtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaatagatatcactgtgatcc 9110  T
Q  278 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgat 377  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9109 ttggtgcatacatctgccgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcatactatcataagtcatatatttgat 9010  T
Q  378 gttcataagtcactacatagc 398  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  9009 gttcataagtcactatatagc 8989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 8962 - 8923
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8962 agtcatcaaatcatttgatgttcgtaagtgattacatatc 8923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 4246 - 4024
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4246 tggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 4147  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4146 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattatcaaaagacagacatttttataccatcataagtcatatatttg 4047  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  4046 atgttcataagtcattacatagc 4024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 176 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 5418 - 5196
Alignment:
Q  176 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5418 tggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 5319  T
Q  276 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5318 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattatcaaaagacagacatttttataccatcataagtcatatatttg 5219  T
Q  376 atgttcataagtcactacatagc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  5218 atgttcataagtcattacatagc 5196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 3996 - 3957
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3996 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 3957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 5168 - 5129
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattacatatc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5168 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattacatatc 5129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0345
Description:

Target: scaffold0345; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 207 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 473 - 282
Alignment:
Q  207 tcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaa 306  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  473 tcgatcctcaaattagtaaaaataccatcaaacaggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgccgaacaaagtaa 374  T
Q  307 aaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacatagc 398  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  373 aaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcaggagtcatatatttgatgttcataagtcattacatagc 282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 1026 - 861
Alignment:
Q  1 tctacgtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttct 100  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  1026 tctatgtacaatgatgaggtgagagagcttcaatgttggtgtcatagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactatcaataacccaagaaagcctttct 927  T
Q  101 atgcttgccctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaat 165  Q
    |||  ||||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  926 atgtctgccctctgccaaaggtttgtttaacaaaggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaat 861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 254 - 219
Alignment:
Q  416 agtcatcaaatcatttgatgttcataagtgattaca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  254 agtcatcaaatcatttgatgttcttaagtgattaca 219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 196 - 398
Target Start/End: Original strand, 107787 - 107989
Alignment:
Q  196 tatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 295  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  107787 tatccatcatatcgatccctaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttaaattttcacaatataaatcactgtgatcattggtgcatacatttgct 107886  T
Q  296 gaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgttcataagtcactacat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  107887 gaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatacatttgatgttcatatgtcattacat 107986  T
Q  396 agc 398  Q
    |||    
T  107987 agc 107989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Original strand, 107246 - 107415
Alignment:
Q  6 gtacaatgatgatatgagagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaataacccaggaaggcctttctatgct 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  107246 gtacaatgatgatgtgagagagcttcaatgttggtgtcctaaaatttgtgttgtaagaaaattcaacattgtcaataacccaggaaggcctttctatgca 107345  T
Q  106 tgccctccg-ctaaggtttgtttaacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgat 174  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  107346 tgccctctgccaaaggtttgtttaacagtggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaatagtactgat 107415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University