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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF5110_high_11 (Length: 492)
Name: NF5110_high_11
Description: NF5110
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF5110_high_11 |
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Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 426; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 40553021 - 40552559
Alignment:
| Q |
19 |
cgatcagctaaaaatgattctttgtctagcactagaggatcattctgattttcagtcacctcaggaagaagcacatttagcagcttgagcacttcatatc |
118 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
40553021 |
cgatcagctaaaaatgattctttgtctagcactagaggatcattctgattttcagtcacctcaggaagaagcacatttagcagcttgagcacttcatatc |
40552922 |
T |
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| Q |
119 |
cctagcaagaaagaaacatccccaaattattctcttactacaaataagaaaactcacaattcatacatgcttaannnnnnngtacaagggtattactaag |
218 |
Q |
| |
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| T |
40552921 |
cctagcaagaaagaaacatccccaaattattctcttactacaaataagaaaactcacaattcatacatgcttaatttttt-gtacaagggtattactaag |
40552823 |
T |
|
| Q |
219 |
aaaataaaatcacttataacaactgctattcagaatgaaactaaccatagtcataaaaataaataaatcttttgacccaccaaatataatggggacgtgg |
318 |
Q |
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| T |
40552822 |
aaaataaaatcacttataacaactgctattcagaatgaaaccaaccatagtcataaaaataaataaatcttttgacccaccaaatataatggggacgtgg |
40552723 |
T |
|
| Q |
319 |
aattaagacattaaacataaacaccaaattccatatgccatattattgttatatatacatcaccagataatttatcacaactgtacagaacctttacttg |
418 |
Q |
| |
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| T |
40552722 |
aattaagacattaaacataaacaccaaattccatatgccatattattgttatttatacatcaccagataatttatcataactgtacagaacctttacttg |
40552623 |
T |
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| Q |
419 |
aaaacatgaaattaatcaatattgttatcatattacagaaagataaaacagatacgaagaataa |
482 |
Q |
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| T |
40552622 |
aaaacatgaaattaatcaatattgttatcatattacagaaagataaaacagatacgaagaataa |
40552559 |
T |
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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 261 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 22137753 - 22137532
Alignment:
| Q |
261 |
aaccatagtcataaaaataaataaatcttttgacccaccaaatataatggggacgtggaattaagacattaaacataaacaccaaattccatatgccata |
360 |
Q |
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|
|
| T |
22137753 |
aaccatagtcataaaaataaataaatcttttgacccaccaaatataatggggacgtggaattaagacattaaacataaacaccaaattccatatgccata |
22137654 |
T |
|
| Q |
361 |
ttattgttatatatacatcaccagataatttatcacaactgtacagaacctttacttgaaaacatgaaattaatcaatattgttatcatattacagaaag |
460 |
Q |
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| T |
22137653 |
ttattgttatttatacatcaccagataatttatcataactgtacagaacctttacttgaaaacatgaaattaatcaatattgttatcatattacagaaag |
22137554 |
T |
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| Q |
461 |
ataaaacagatacgaagaataa |
482 |
Q |
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| T |
22137553 |
ataaaacagatacgaagaataa |
22137532 |
T |
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