View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5113-Insertion-5 (Length: 850)

Name: NF5113-Insertion-5
Description: NF5113
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5113-Insertion-5
NF5113-Insertion-5
[»] chr4 (139 HSPs)
chr4 (8-716)||(6132363-6133090)
chr4 (492-850)||(12395827-12396185)
chr4 (492-850)||(12400789-12401147)
chr4 (497-850)||(40637072-40637425)
chr4 (452-850)||(36378246-36378644)
chr4 (492-850)||(38928159-38928518)
chr4 (497-850)||(24880449-24880803)
chr4 (497-850)||(40091397-40091750)
chr4 (497-850)||(22800844-22801197)
chr4 (497-850)||(48486317-48486670)
chr4 (417-835)||(18409344-18409760)
chr4 (492-850)||(33415470-33415827)
chr4 (497-850)||(24888794-24889147)
chr4 (492-850)||(19095875-19096234)
chr4 (497-847)||(22802719-22803069)
chr4 (497-850)||(24878987-24879341)
chr4 (497-847)||(14633318-14633666)
chr4 (497-850)||(36921475-36921830)
chr4 (498-850)||(37313047-37313400)
chr4 (497-845)||(47868399-47868747)
chr4 (552-847)||(8631404-8631698)
chr4 (497-847)||(22046671-22047020)
chr4 (497-847)||(47274725-47275073)
chr4 (497-847)||(24348212-24348566)
chr4 (497-847)||(5198418-5198768)
chr4 (497-850)||(619430-619782)
chr4 (497-847)||(37089357-37089709)
chr4 (497-847)||(11434953-11435302)
chr4 (497-847)||(22044376-22044725)
chr4 (497-847)||(51015244-51015593)
chr4 (497-850)||(16453307-16453661)
chr4 (497-850)||(36919566-36919922)
chr4 (574-850)||(36380425-36380701)
chr4 (492-835)||(41997485-41997828)
chr4 (497-847)||(9148249-9148600)
chr4 (503-850)||(19322701-19323046)
chr4 (497-847)||(2484858-2485208)
chr4 (497-847)||(6764837-6765192)
chr4 (497-847)||(18847151-18847500)
chr4 (497-850)||(17662227-17662573)
chr4 (294-659)||(38270158-38270543)
chr4 (497-847)||(38409197-38409552)
chr4 (418-726)||(3937314-3937622)
chr4 (497-847)||(7941317-7941671)
chr4 (552-847)||(11006222-11006516)
chr4 (497-838)||(14787423-14787768)
chr4 (612-850)||(16455355-16455591)
chr4 (497-847)||(16934128-16934478)
chr4 (552-847)||(31849584-31849878)
chr4 (497-847)||(44599823-44600173)
chr4 (552-847)||(11008553-11008845)
chr4 (497-847)||(9174131-9174481)
chr4 (499-845)||(9176461-9176807)
chr4 (571-847)||(26085962-26086236)
chr4 (497-835)||(18537470-18537806)
chr4 (552-847)||(18709149-18709442)
chr4 (552-835)||(22132389-22132669)
chr4 (498-828)||(56030443-56030770)
chr4 (357-608)||(2891174-2891427)
chr4 (497-847)||(16931774-16932124)
chr4 (498-812)||(13543953-13544272)
chr4 (581-850)||(27499128-27499393)
chr4 (497-850)||(8756233-8756585)
chr4 (552-835)||(22134615-22134894)
chr4 (552-847)||(22780358-22780652)
chr4 (552-847)||(22782723-22783017)
chr4 (640-850)||(2891433-2891643)
chr4 (497-766)||(5637530-5637804)
chr4 (559-775)||(3824627-3824842)
chr4 (646-850)||(13547302-13547505)
chr4 (497-847)||(53405125-53405481)
chr4 (492-835)||(18534828-18535169)
chr4 (578-835)||(38890221-38890476)
chr4 (497-828)||(47210756-47211081)
chr4 (604-850)||(30136657-30136901)
chr4 (675-849)||(4215483-4215656)
chr4 (497-753)||(52942537-52942782)
chr4 (498-835)||(28453686-28454020)
chr4 (693-847)||(5635461-5635614)
chr4 (633-835)||(12102221-12102425)
chr4 (440-808)||(15032572-15032928)
chr4 (492-659)||(24446756-24446919)
chr4 (693-847)||(11437558-11437710)
chr4 (292-450)||(27498963-27499108)
chr4 (633-806)||(31983554-31983727)
chr4 (498-791)||(40998990-40999281)
chr4 (603-808)||(3982200-3982411)
chr4 (699-850)||(5101130-5101279)
chr4 (760-850)||(6133098-6133188)
chr4 (649-835)||(16185831-16186018)
chr4 (634-850)||(25357772-25357994)
chr4 (594-835)||(9863805-9864049)
chr4 (592-777)||(47150948-47151131)
chr4 (504-826)||(10112876-10113198)
chr4 (497-634)||(5100995-5101133)
chr4 (746-850)||(47563009-47563112)
chr4 (552-806)||(9022362-9022613)
chr4 (649-848)||(5336764-5336964)
chr4 (426-545)||(31983817-31983937)
chr4 (720-839)||(49088791-49088911)
chr4 (292-360)||(47564496-47564564)
chr4 (718-850)||(24446636-24446754)
chr4 (766-838)||(14789422-14789496)
chr4 (795-850)||(52942470-52942525)
chr4 (604-693)||(10114435-10114522)
chr4 (716-781)||(54928699-54928764)
chr4 (716-835)||(3578668-3578786)
chr4 (736-835)||(26557823-26557922)
chr4 (649-808)||(55822265-55822420)
chr4 (800-850)||(3937256-3937306)
chr4 (746-835)||(22295412-22295502)
chr4 (652-808)||(31300427-31300580)
chr4 (321-382)||(3937678-3937739)
chr4 (649-808)||(7050282-7050439)
chr4 (652-838)||(8529270-8529455)
chr4 (424-545)||(25357562-25357683)
chr4 (294-330)||(2891134-2891170)
chr4 (649-798)||(4570094-4570241)
chr4 (649-808)||(11853549-11853705)
chr4 (634-762)||(54906722-54906852)
chr4 (812-849)||(3824593-3824630)
chr4 (762-838)||(4884985-4885062)
chr4 (649-706)||(16638827-16638883)
chr4 (652-838)||(16688934-16689119)
chr4 (649-808)||(36769479-36769636)
chr4 (603-690)||(38208825-38208911)
chr4 (492-568)||(16186099-16186177)
chr4 (652-711)||(16489352-16489410)
chr4 (492-546)||(52043715-52043770)
chr4 (762-808)||(15831252-15831298)
chr4 (294-336)||(18537987-18538029)
chr4 (649-687)||(36771396-36771434)
chr4 (683-721)||(38270120-38270158)
chr4 (649-690)||(4874620-4874661)
chr4 (763-832)||(10047383-10047452)
chr4 (292-333)||(18535298-18535339)
chr4 (762-838)||(18587077-18587154)
chr4 (497-542)||(36380372-36380417)
chr4 (763-832)||(39245998-39246067)
[»] chr7 (111 HSPs)
chr7 (289-850)||(24748341-24748902)
chr7 (294-850)||(39145968-39146524)
chr7 (418-850)||(44724454-44724886)
chr7 (296-850)||(21679759-21680337)
chr7 (294-850)||(21677796-21678371)
chr7 (492-850)||(20137091-20137449)
chr7 (492-850)||(11355207-11355565)
chr7 (417-838)||(27832631-27833049)
chr7 (446-850)||(25276044-25276437)
chr7 (492-850)||(4295916-4296276)
chr7 (497-850)||(13099456-13099811)
chr7 (497-850)||(31435028-31435382)
chr7 (497-847)||(38393936-38394290)
chr7 (498-848)||(37412109-37412462)
chr7 (497-850)||(42330979-42331334)
chr7 (497-847)||(35583-35933)
chr7 (497-850)||(443549-443903)
chr7 (497-850)||(27306214-27306564)
chr7 (497-847)||(48457603-48457957)
chr7 (492-850)||(9680763-9681127)
chr7 (417-792)||(22828672-22829048)
chr7 (497-847)||(44518-44868)
chr7 (498-850)||(21990106-21990457)
chr7 (499-847)||(7470007-7470359)
chr7 (515-850)||(21592125-21592460)
chr7 (497-847)||(40836728-40837077)
chr7 (552-850)||(20626048-20626345)
chr7 (552-850)||(20629939-20630236)
chr7 (552-850)||(20642358-20642655)
chr7 (495-850)||(42223108-42223465)
chr7 (497-845)||(1049283-1049630)
chr7 (497-847)||(20299408-20299764)
chr7 (552-847)||(1849991-1850285)
chr7 (552-847)||(18345551-18345845)
chr7 (552-847)||(20297372-20297666)
chr7 (499-847)||(7471965-7472317)
chr7 (552-847)||(3878587-3878881)
chr7 (497-846)||(3035671-3036027)
chr7 (503-850)||(24258423-24258775)
chr7 (552-847)||(40946338-40946632)
chr7 (498-850)||(9679009-9679366)
chr7 (552-845)||(1046912-1047203)
chr7 (419-798)||(20091581-20091954)
chr7 (497-845)||(25542485-25542830)
chr7 (497-847)||(31155896-31156246)
chr7 (552-847)||(28487563-28487857)
chr7 (413-792)||(7188413-7188789)
chr7 (552-847)||(7351637-7351931)
chr7 (552-847)||(43253502-43253795)
chr7 (611-847)||(7092198-7092432)
chr7 (497-845)||(28485516-28485867)
chr7 (499-808)||(24817377-24817682)
chr7 (497-847)||(7349262-7349614)
chr7 (611-847)||(7094445-7094679)
chr7 (497-775)||(11757178-11757462)
chr7 (571-850)||(24813480-24813755)
chr7 (497-775)||(22251602-22251877)
chr7 (497-732)||(26804527-26804762)
chr7 (620-847)||(38396713-38396938)
chr7 (498-835)||(24465503-24465829)
chr7 (648-835)||(2935374-2935560)
chr7 (648-847)||(22108173-22108370)
chr7 (648-847)||(40549933-40550130)
chr7 (648-847)||(22137184-22137381)
chr7 (698-850)||(22393878-22394030)
chr7 (648-847)||(40552211-40552408)
chr7 (648-835)||(9027191-9027376)
chr7 (497-659)||(18567567-18567730)
chr7 (604-835)||(6332283-6332514)
chr7 (648-835)||(1606486-1606671)
chr7 (675-838)||(26295580-26295743)
chr7 (552-850)||(11081522-11081817)
chr7 (672-780)||(6348912-6349020)
chr7 (634-835)||(16297018-16297222)
chr7 (497-689)||(22392427-22392608)
chr7 (552-781)||(6048885-6049111)
chr7 (794-850)||(26804761-26804817)
chr7 (785-847)||(11759369-11759431)
chr7 (293-362)||(27833125-27833194)
chr7 (293-363)||(44724329-44724399)
chr7 (649-838)||(25351353-25351539)
chr7 (716-808)||(6046668-6046759)
chr7 (661-847)||(6067183-6067370)
chr7 (649-838)||(25410130-25410318)
chr7 (603-690)||(11084438-11084523)
chr7 (594-835)||(13290470-13290710)
chr7 (637-850)||(40281365-40281572)
chr7 (649-832)||(21369642-21369824)
chr7 (294-360)||(22829105-22829171)
chr7 (649-808)||(2120899-2121056)
chr7 (649-838)||(25357047-25357233)
chr7 (649-808)||(3320076-3320232)
chr7 (649-808)||(3324824-3324980)
chr7 (649-808)||(25405393-25405549)
chr7 (552-603)||(38396326-38396377)
chr7 (610-690)||(12310157-12310236)
chr7 (762-838)||(34546874-34546951)
chr7 (649-808)||(42006663-42006820)
chr7 (458-546)||(6048713-6048800)
chr7 (503-627)||(6348778-6348903)
chr7 (795-838)||(6359946-6359989)
chr7 (649-808)||(7069780-7069936)
chr7 (649-808)||(7074787-7074943)
chr7 (812-847)||(22251570-22251605)
chr7 (603-690)||(26210603-26210688)
chr7 (649-687)||(8378648-8378686)
chr7 (649-687)||(15541139-15541177)
chr7 (762-808)||(44010775-44010821)
chr7 (762-838)||(2075226-2075303)
chr7 (762-838)||(7464513-7464590)
chr7 (289-326)||(11355005-11355042)
[»] chr3 (156 HSPs)
chr3 (296-850)||(1626663-1627238)
chr3 (291-850)||(36011524-36012104)
chr3 (294-850)||(43423443-43424000)
chr3 (418-850)||(43421395-43421826)
chr3 (420-850)||(28101982-28102412)
chr3 (294-850)||(53468433-53469002)
chr3 (441-849)||(5926746-5927153)
chr3 (492-850)||(3314603-3314962)
chr3 (497-850)||(4308261-4308614)
chr3 (497-850)||(1313334-1313686)
chr3 (497-850)||(45882863-45883217)
chr3 (498-847)||(10956010-10956359)
chr3 (497-850)||(53917644-53917997)
chr3 (492-850)||(28761407-28761766)
chr3 (497-850)||(24979631-24979985)
chr3 (498-847)||(10958306-10958655)
chr3 (492-850)||(880431-880790)
chr3 (497-847)||(3859452-3859801)
chr3 (497-847)||(11170328-11170678)
chr3 (552-847)||(38890020-38890314)
chr3 (497-850)||(43228215-43228568)
chr3 (497-850)||(53915476-53915829)
chr3 (497-847)||(51726990-51727339)
chr3 (497-849)||(18099151-18099503)
chr3 (537-850)||(27101161-27101474)
chr3 (497-850)||(51943295-51943647)
chr3 (424-850)||(23633311-23633730)
chr3 (497-850)||(18096880-18097234)
chr3 (552-847)||(25533422-25533716)
chr3 (552-850)||(30005821-30006118)
chr3 (552-850)||(42990284-42990581)
chr3 (497-850)||(43226010-43226360)
chr3 (497-847)||(4103879-4104232)
chr3 (497-850)||(32264018-32264376)
chr3 (497-850)||(18162588-18162940)
chr3 (419-727)||(28100143-28100452)
chr3 (503-789)||(6561740-6562028)
chr3 (497-847)||(5191577-5191925)
chr3 (559-850)||(9604587-9604877)
chr3 (497-847)||(10084372-10084726)
chr3 (497-850)||(39715394-39715742)
chr3 (497-850)||(48361651-48362003)
chr3 (497-847)||(746675-747031)
chr3 (576-847)||(1321483-1321753)
chr3 (497-850)||(47148875-47149233)
chr3 (497-847)||(22114288-22114638)
chr3 (497-847)||(26720472-26720821)
chr3 (593-850)||(4666535-4666791)
chr3 (497-850)||(12267955-12268299)
chr3 (552-847)||(25388886-25389179)
chr3 (497-847)||(458204-458558)
chr3 (497-850)||(15780784-15781156)
chr3 (498-850)||(51674746-51675087)
chr3 (417-720)||(28137415-28137708)
chr3 (440-732)||(28180891-28181182)
chr3 (497-847)||(455827-456181)
chr3 (491-850)||(54691554-54691912)
chr3 (497-847)||(5522610-5522948)
chr3 (492-824)||(889779-890109)
chr3 (497-847)||(6063429-6063781)
chr3 (497-835)||(10191305-10191646)
chr3 (504-850)||(32219026-32219362)
chr3 (497-847)||(6065779-6066130)
chr3 (594-850)||(6484381-6484637)
chr3 (594-847)||(7606571-7606822)
chr3 (552-847)||(10621513-10621807)
chr3 (552-847)||(38210350-38210644)
chr3 (492-850)||(31151266-31151622)
chr3 (404-780)||(54884000-54884362)
chr3 (497-847)||(50493923-50494273)
chr3 (497-832)||(53591119-53591442)
chr3 (564-847)||(28413014-28413297)
chr3 (497-737)||(35777345-35777587)
chr3 (620-850)||(6231849-6232077)
chr3 (552-793)||(29956666-29956906)
chr3 (497-830)||(35917944-35918282)
chr3 (623-850)||(25688140-25688367)
chr3 (579-796)||(13420219-13420432)
chr3 (492-808)||(53597160-53597472)
chr3 (592-850)||(17795282-17795536)
chr3 (592-850)||(19103722-19103976)
chr3 (552-850)||(42992266-42992547)
chr3 (434-749)||(23636888-23637200)
chr3 (633-849)||(5886261-5886474)
chr3 (633-849)||(5899734-5899947)
chr3 (417-835)||(561769-562174)
chr3 (424-760)||(1673826-1674160)
chr3 (636-847)||(11168165-11168375)
chr3 (498-850)||(27635638-27635959)
chr3 (579-835)||(25635391-25635644)
chr3 (571-835)||(36871295-36871557)
chr3 (699-849)||(47701652-47701801)
chr3 (650-850)||(3306839-3307037)
chr3 (482-626)||(47701798-47701943)
chr3 (498-625)||(6231374-6231502)
chr3 (678-835)||(24181486-24181644)
chr3 (417-534)||(4663763-4663880)
chr3 (293-430)||(5927188-5927325)
chr3 (497-640)||(11163074-11163218)
chr3 (552-664)||(41849132-41849244)
chr3 (604-780)||(14634491-14634665)
chr3 (767-847)||(35919098-35919178)
chr3 (634-808)||(1620483-1620657)
chr3 (715-850)||(25634030-25634164)
chr3 (756-850)||(41849243-41849336)
chr3 (492-676)||(24177198-24177380)
chr3 (566-798)||(13419878-13420106)
chr3 (498-608)||(3306724-3306835)
chr3 (616-769)||(4560352-4560497)
chr3 (660-808)||(11007545-11007684)
chr3 (296-382)||(28102471-28102558)
chr3 (778-847)||(53894040-53894109)
chr3 (294-370)||(7754063-7754139)
chr3 (292-360)||(28137765-28137833)
chr3 (292-362)||(28100530-28100600)
chr3 (291-382)||(43421883-43421974)
chr3 (294-380)||(8183163-8183249)
chr3 (579-676)||(25633930-25634024)
chr3 (652-838)||(29913949-29914132)
chr3 (652-838)||(10595028-10595213)
chr3 (652-838)||(27761980-27762165)
chr3 (652-838)||(47878165-47878350)
chr3 (497-572)||(1321365-1321441)
chr3 (497-545)||(6484309-6484357)
chr3 (649-808)||(10094100-10094256)
chr3 (761-847)||(16996987-16997074)
chr3 (292-335)||(25635120-25635163)
chr3 (795-850)||(42992608-42992663)
chr3 (293-335)||(562207-562249)
chr3 (376-426)||(7754137-7754187)
chr3 (634-826)||(7768632-7768825)
chr3 (762-850)||(10612762-10612849)
chr3 (652-838)||(10897008-10897193)
chr3 (294-335)||(13420686-13420727)
chr3 (649-808)||(22626009-22626166)
chr3 (744-836)||(27420822-27420915)
chr3 (418-585)||(4560509-4560677)
chr3 (649-696)||(7418064-7418111)
chr3 (616-659)||(7606830-7606873)
chr3 (649-808)||(10100117-10100273)
chr3 (649-808)||(10200980-10201136)
chr3 (649-808)||(10208026-10208182)
chr3 (716-838)||(15823641-15823763)
chr3 (649-687)||(6303310-6303348)
chr3 (762-808)||(11079628-11079674)
chr3 (662-696)||(13893475-13893509)
chr3 (649-687)||(16462203-16462241)
chr3 (649-687)||(27544273-27544311)
chr3 (649-687)||(47883026-47883064)
chr3 (762-808)||(48390327-48390373)
chr3 (763-832)||(1736319-1736388)
chr3 (817-850)||(8183114-8183147)
chr3 (763-832)||(18552897-18552966)
chr3 (294-335)||(25633231-25633272)
chr3 (763-832)||(30709804-30709873)
chr3 (611-674)||(31021300-31021362)
[»] chr6 (97 HSPs)
chr6 (294-850)||(13056949-13057527)
chr6 (421-850)||(13039657-13040087)
chr6 (417-850)||(25477173-25477614)
chr6 (418-850)||(3631921-3632352)
chr6 (418-850)||(3629847-3630278)
chr6 (294-773)||(22490415-22490896)
chr6 (417-850)||(24338430-24338863)
chr6 (497-850)||(3390358-3390712)
chr6 (426-850)||(12161540-12161960)
chr6 (497-850)||(9019905-9020258)
chr6 (497-850)||(11983011-11983364)
chr6 (497-847)||(1230234-1230584)
chr6 (497-850)||(32279976-32280329)
chr6 (504-847)||(14458752-14459093)
chr6 (497-847)||(28241306-28241656)
chr6 (412-850)||(14466228-14466656)
chr6 (552-847)||(4816216-4816510)
chr6 (497-847)||(14507161-14507510)
chr6 (491-850)||(3233707-3234071)
chr6 (497-847)||(30967177-30967530)
chr6 (497-850)||(15541122-15541475)
chr6 (497-850)||(30728806-30729163)
chr6 (497-789)||(15530166-15530457)
chr6 (552-847)||(19704552-19704848)
chr6 (497-847)||(2628871-2629225)
chr6 (497-845)||(30034590-30034942)
chr6 (497-840)||(15532674-15533016)
chr6 (552-837)||(20915351-20915635)
chr6 (417-790)||(3027895-3028266)
chr6 (497-847)||(12195500-12195850)
chr6 (552-849)||(26065021-26065312)
chr6 (552-849)||(26084990-26085281)
chr6 (637-850)||(1069700-1069913)
chr6 (552-847)||(26932546-26932841)
chr6 (413-835)||(16455421-16455840)
chr6 (417-643)||(13870610-13870836)
chr6 (296-609)||(10583884-10584213)
chr6 (579-835)||(15719708-15719961)
chr6 (497-725)||(19227514-19227743)
chr6 (616-835)||(5273213-5273431)
chr6 (633-850)||(12186053-12186271)
chr6 (604-850)||(15367121-15367363)
chr6 (503-771)||(17012029-17012294)
chr6 (648-847)||(26066109-26066307)
chr6 (648-847)||(29754694-29754892)
chr6 (648-847)||(33308988-33309185)
chr6 (491-835)||(19696414-19696759)
chr6 (492-643)||(32447503-32447656)
chr6 (648-847)||(26068380-26068578)
chr6 (648-847)||(33311257-33311454)
chr6 (632-835)||(26945258-26945463)
chr6 (603-835)||(22857949-22858181)
chr6 (497-641)||(1072067-1072212)
chr6 (420-524)||(20220030-20220134)
chr6 (420-524)||(22114014-22114118)
chr6 (712-850)||(25465573-25465710)
chr6 (604-850)||(25078540-25078783)
chr6 (594-795)||(20526885-20527083)
chr6 (749-850)||(10584227-10584328)
chr6 (711-835)||(15346541-15346664)
chr6 (716-808)||(30445723-30445815)
chr6 (497-625)||(17852521-17852650)
chr6 (294-382)||(3632406-3632494)
chr6 (355-430)||(24338871-24338946)
chr6 (635-835)||(28037722-28037927)
chr6 (497-608)||(8995458-8995570)
chr6 (292-362)||(3630354-3630424)
chr6 (414-568)||(25466433-25466587)
chr6 (649-835)||(12911442-12911629)
chr6 (649-835)||(12937190-12937376)
chr6 (294-382)||(13039509-13039597)
chr6 (716-812)||(28078215-28078310)
chr6 (492-655)||(15346365-15346517)
chr6 (293-385)||(13870818-13870910)
chr6 (722-780)||(3833481-3833540)
chr6 (648-690)||(7542525-7542567)
chr6 (652-808)||(22351877-22352031)
chr6 (736-835)||(11262678-11262777)
chr6 (291-335)||(26944923-26944967)
chr6 (649-808)||(13878727-13878883)
chr6 (649-808)||(16785919-16786075)
chr6 (652-838)||(17694846-17695030)
chr6 (634-706)||(11138423-11138496)
chr6 (762-838)||(25941780-25941857)
chr6 (762-838)||(33215938-33216015)
chr6 (294-330)||(12162024-12162060)
chr6 (649-808)||(13883475-13883631)
chr6 (649-808)||(31248740-31248896)
chr6 (649-687)||(3577658-3577696)
chr6 (661-711)||(5165936-5165985)
chr6 (652-706)||(19701988-19702041)
chr6 (321-371)||(20219939-20219989)
chr6 (649-687)||(26887368-26887406)
chr6 (649-687)||(35201470-35201508)
chr6 (762-838)||(3577484-3577560)
chr6 (388-425)||(12161982-12162019)
chr6 (762-850)||(30443532-30443621)
[»] chr5 (104 HSPs)
chr5 (311-850)||(17072619-17073181)
chr5 (294-850)||(24126579-24127153)
chr5 (321-850)||(10474305-10474856)
chr5 (418-850)||(39397975-39398405)
chr5 (421-850)||(695758-696175)
chr5 (491-850)||(25904041-25904400)
chr5 (492-850)||(31472594-31472953)
chr5 (497-850)||(1189589-1189949)
chr5 (497-850)||(40221466-40221820)
chr5 (497-847)||(25921458-25921808)
chr5 (417-776)||(34530721-34531080)
chr5 (497-850)||(21947971-21948323)
chr5 (497-850)||(2818317-2818671)
chr5 (499-850)||(18511194-18511547)
chr5 (552-850)||(16092181-16092479)
chr5 (497-850)||(39854428-39854780)
chr5 (497-840)||(10529091-10529434)
chr5 (497-847)||(2174863-2175212)
chr5 (552-847)||(25804025-25804318)
chr5 (504-849)||(17818475-17818817)
chr5 (497-846)||(18596591-18596939)
chr5 (497-847)||(38882049-38882399)
chr5 (497-847)||(4236573-4236922)
chr5 (497-850)||(6756438-6756789)
chr5 (292-714)||(20044755-20045172)
chr5 (497-847)||(27912474-27912830)
chr5 (499-850)||(18509300-18509652)
chr5 (497-838)||(37705774-37706115)
chr5 (552-849)||(6745069-6745364)
chr5 (497-848)||(16776101-16776452)
chr5 (498-847)||(18466625-18466978)
chr5 (417-706)||(20042914-20043204)
chr5 (552-847)||(34479403-34479698)
chr5 (497-850)||(26097677-26098028)
chr5 (552-847)||(34477038-34477333)
chr5 (505-850)||(2954368-2954713)
chr5 (497-847)||(27910389-27910744)
chr5 (497-847)||(31545024-31545374)
chr5 (497-850)||(36402310-36402663)
chr5 (552-849)||(6747306-6747600)
chr5 (497-835)||(31179368-31179706)
chr5 (497-847)||(31542679-31543028)
chr5 (574-850)||(658338-658610)
chr5 (497-847)||(18468951-18469303)
chr5 (497-850)||(12555905-12556258)
chr5 (630-850)||(20505825-20506042)
chr5 (552-847)||(21684437-21684730)
chr5 (502-835)||(6661181-6661512)
chr5 (552-847)||(15552245-15552539)
chr5 (619-850)||(41585726-41585956)
chr5 (614-850)||(2723964-2724190)
chr5 (497-847)||(10586783-10587126)
chr5 (631-847)||(39798126-39798341)
chr5 (497-850)||(31465971-31466313)
chr5 (619-847)||(4410090-4410316)
chr5 (492-842)||(36208519-36208865)
chr5 (504-850)||(21288715-21289058)
chr5 (297-545)||(2723698-2723959)
chr5 (552-850)||(20053847-20054134)
chr5 (576-850)||(9020246-9020517)
chr5 (497-691)||(26098391-26098586)
chr5 (648-839)||(10749796-10749986)
chr5 (648-847)||(38960117-38960314)
chr5 (594-798)||(17413200-17413402)
chr5 (648-847)||(15354560-15354757)
chr5 (648-847)||(23665140-23665337)
chr5 (648-847)||(23793250-23793447)
chr5 (648-847)||(3373122-3373320)
chr5 (648-839)||(10757273-10757462)
chr5 (648-847)||(15356836-15357033)
chr5 (665-847)||(23741844-23742023)
chr5 (634-808)||(15143547-15143722)
chr5 (652-846)||(4897828-4898023)
chr5 (470-720)||(42770691-42770934)
chr5 (678-766)||(42770936-42771024)
chr5 (740-850)||(26098270-26098380)
chr5 (497-634)||(20507659-20507797)
chr5 (682-835)||(15445263-15445417)
chr5 (294-360)||(695631-695697)
chr5 (603-835)||(34033563-34033797)
chr5 (594-793)||(2144601-2144801)
chr5 (785-850)||(20043222-20043287)
chr5 (294-382)||(20042770-20042858)
chr5 (443-546)||(2144877-2144982)
chr5 (594-711)||(4754198-4754312)
chr5 (634-780)||(35430259-35430408)
chr5 (652-838)||(22672837-22673022)
chr5 (649-808)||(1170811-1170967)
chr5 (649-696)||(10627364-10627411)
chr5 (552-706)||(29748352-29748502)
chr5 (649-711)||(2298122-2298183)
chr5 (497-587)||(4410001-4410096)
chr5 (763-832)||(11916996-11917065)
chr5 (458-547)||(15225067-15225155)
chr5 (762-838)||(28786515-28786592)
chr5 (762-838)||(42238371-42238448)
chr5 (722-782)||(20045210-20045270)
chr5 (648-711)||(32520533-32520597)
chr5 (603-703)||(15224897-15224997)
chr5 (654-838)||(25445501-25445684)
chr5 (497-587)||(41585950-41586041)
chr5 (762-808)||(1240539-1240585)
chr5 (649-691)||(31782597-31782639)
chr5 (649-687)||(35385596-35385634)
[»] chr2 (97 HSPs)
chr2 (404-850)||(11739541-11739988)
chr2 (296-850)||(34979559-34980136)
chr2 (294-850)||(14836971-14837541)
chr2 (417-753)||(15539553-15539890)
chr2 (420-850)||(3022006-3022445)
chr2 (492-850)||(17849032-17849390)
chr2 (497-850)||(42923491-42923846)
chr2 (492-850)||(17848360-17848713)
chr2 (492-849)||(19007555-19007912)
chr2 (497-850)||(40032035-40032393)
chr2 (497-850)||(6258799-6259150)
chr2 (497-847)||(27104719-27105067)
chr2 (468-850)||(44289049-44289432)
chr2 (492-850)||(28196552-28196908)
chr2 (498-847)||(19501996-19502345)
chr2 (497-847)||(42452703-42453050)
chr2 (498-850)||(6264130-6264479)
chr2 (497-847)||(19504331-19504680)
chr2 (497-850)||(22287318-22287671)
chr2 (497-850)||(21520675-21521030)
chr2 (497-847)||(42064435-42064785)
chr2 (497-847)||(45279969-45280320)
chr2 (497-847)||(13910030-13910379)
chr2 (497-847)||(23452222-23452576)
chr2 (497-850)||(43623562-43623903)
chr2 (492-836)||(31732772-31733105)
chr2 (497-847)||(24162208-24162547)
chr2 (497-804)||(11578136-11578439)
chr2 (421-673)||(22163106-22163358)
chr2 (552-847)||(35217948-35218242)
chr2 (626-850)||(5375328-5375550)
chr2 (552-847)||(35215571-35215865)
chr2 (410-835)||(17897242-17897664)
chr2 (592-850)||(28459172-28459429)
chr2 (492-809)||(45239000-45239321)
chr2 (579-850)||(22874137-22874404)
chr2 (497-850)||(18800295-18800637)
chr2 (552-835)||(20146604-20146884)
chr2 (404-587)||(38019970-38020154)
chr2 (648-847)||(36558849-36559047)
chr2 (648-847)||(36561126-36561324)
chr2 (492-850)||(35107215-35107569)
chr2 (700-850)||(22407436-22407585)
chr2 (552-676)||(38020178-38020302)
chr2 (648-847)||(45332166-45332364)
chr2 (497-649)||(22407591-22407744)
chr2 (712-850)||(22707733-22707872)
chr2 (470-835)||(37962938-37963289)
chr2 (632-808)||(40699429-40699606)
chr2 (649-781)||(20589763-20589896)
chr2 (742-850)||(22163004-22163111)
chr2 (589-761)||(27136195-27136365)
chr2 (711-850)||(23870951-23871089)
chr2 (702-829)||(7462950-7463077)
chr2 (594-808)||(43139395-43139606)
chr2 (291-382)||(15539947-15540038)
chr2 (594-850)||(35028595-35028846)
chr2 (294-363)||(11740009-11740078)
chr2 (633-781)||(15693958-15694109)
chr2 (294-360)||(22163419-22163485)
chr2 (552-631)||(5377629-5377708)
chr2 (619-718)||(38414194-38414291)
chr2 (649-798)||(33603994-33604143)
chr2 (294-372)||(3021839-3021917)
chr2 (594-698)||(27583472-27583573)
chr2 (4-73)||(34483733-34483802)
chr2 (648-808)||(17921769-17921927)
chr2 (672-777)||(13828397-13828503)
chr2 (424-545)||(12342697-12342817)
chr2 (652-808)||(17943540-17943692)
chr2 (649-808)||(39686983-39687139)
chr2 (808-850)||(15539511-15539553)
chr2 (633-706)||(26345661-26345735)
chr2 (652-808)||(27517664-27517818)
chr2 (8-66)||(34473648-34473706)
chr2 (649-808)||(2740941-2741097)
chr2 (649-808)||(39680045-39680201)
chr2 (649-711)||(28458949-28459011)
chr2 (746-808)||(39287262-39287324)
chr2 (649-838)||(20054759-20054947)
chr2 (649-808)||(2736205-2736361)
chr2 (648-706)||(7502990-7503049)
chr2 (649-808)||(17462436-17462592)
chr2 (11-150)||(34459525-34459664)
chr2 (492-538)||(35028494-35028541)
chr2 (294-325)||(38019884-38019915)
chr2 (762-808)||(12781246-12781292)
chr2 (652-775)||(17932637-17932756)
chr2 (649-687)||(22712660-22712698)
chr2 (649-687)||(22717369-22717407)
chr2 (15-45)||(34448397-34448427)
chr2 (649-687)||(38190997-38191035)
chr2 (492-546)||(40699225-40699279)
chr2 (649-687)||(45567409-45567447)
chr2 (763-832)||(8390174-8390243)
chr2 (763-832)||(14699031-14699100)
chr2 (744-777)||(41303088-41303121)
[»] chr1 (118 HSPs)
chr1 (417-850)||(18839451-18839885)
chr1 (293-850)||(50248554-50249134)
chr1 (413-850)||(31489775-31490209)
chr1 (419-850)||(25251258-25251690)
chr1 (420-850)||(17186111-17186542)
chr1 (417-850)||(17323929-17324359)
chr1 (492-850)||(50076656-50077014)
chr1 (452-850)||(16428553-16428951)
chr1 (497-842)||(13215025-13215375)
chr1 (492-850)||(11457459-11457817)
chr1 (498-850)||(18307054-18307406)
chr1 (452-850)||(9241069-9241467)
chr1 (497-850)||(38925465-38925815)
chr1 (492-850)||(50078804-50079163)
chr1 (497-847)||(51749983-51750333)
chr1 (497-850)||(12302489-12302847)
chr1 (497-850)||(17324620-17324973)
chr1 (552-850)||(25127872-25128170)
chr1 (497-850)||(15823490-15823843)
chr1 (497-850)||(6756471-6756825)
chr1 (492-850)||(50307529-50307889)
chr1 (497-847)||(10399815-10400165)
chr1 (518-850)||(31424999-31425335)
chr1 (497-850)||(39462463-39462816)
chr1 (497-850)||(41646864-41647217)
chr1 (537-847)||(15294821-15295131)
chr1 (497-850)||(3579601-3579955)
chr1 (497-850)||(6995684-6996037)
chr1 (470-843)||(31422851-31423238)
chr1 (497-847)||(31735508-31735862)
chr1 (497-845)||(6822959-6823306)
chr1 (497-847)||(13761781-13762130)
chr1 (497-847)||(20302403-20302752)
chr1 (496-845)||(2617459-2617808)
chr1 (497-847)||(28840622-28840973)
chr1 (497-850)||(28998237-28998590)
chr1 (497-850)||(29003953-29004306)
chr1 (499-847)||(39932017-39932368)
chr1 (497-850)||(47906208-47906567)
chr1 (492-850)||(17318832-17319184)
chr1 (497-847)||(51752309-51752657)
chr1 (497-850)||(2949216-2949568)
chr1 (492-849)||(40133874-40134241)
chr1 (497-850)||(27336924-27337279)
chr1 (497-847)||(28842437-28842788)
chr1 (453-850)||(14183574-14183965)
chr1 (497-850)||(14097953-14098307)
chr1 (497-850)||(28207052-28207403)
chr1 (497-847)||(2510312-2510665)
chr1 (552-847)||(46431693-46431988)
chr1 (497-850)||(27339115-27339471)
chr1 (552-849)||(4131360-4131660)
chr1 (497-847)||(16226111-16226461)
chr1 (552-844)||(24325664-24325954)
chr1 (552-850)||(16432405-16432693)
chr1 (497-847)||(9463231-9463587)
chr1 (497-847)||(20291401-20291750)
chr1 (497-847)||(9459404-9459760)
chr1 (434-835)||(42922115-42922514)
chr1 (497-830)||(47451592-47451919)
chr1 (619-845)||(25248540-25248766)
chr1 (552-779)||(48665177-48665404)
chr1 (499-793)||(21948229-21948526)
chr1 (497-847)||(47179653-47180006)
chr1 (497-847)||(47177302-47177655)
chr1 (497-808)||(8347298-8347606)
chr1 (645-850)||(16429050-16429255)
chr1 (576-850)||(15669376-15669648)
chr1 (440-806)||(18800600-18800962)
chr1 (632-850)||(6115086-6115304)
chr1 (497-751)||(6823828-6824091)
chr1 (470-838)||(49495206-49495563)
chr1 (498-850)||(8349035-8349385)
chr1 (645-847)||(51757624-51757824)
chr1 (619-847)||(16231630-16231856)
chr1 (693-850)||(23816027-23816183)
chr1 (648-835)||(23785935-23786121)
chr1 (503-808)||(13125483-13125787)
chr1 (417-587)||(25248760-25248931)
chr1 (632-833)||(30790401-30790602)
chr1 (631-835)||(16561545-16561751)
chr1 (443-835)||(27916387-27916780)
chr1 (503-834)||(26520119-26520449)
chr1 (634-850)||(26613223-26613440)
chr1 (634-808)||(30738653-30738830)
chr1 (634-810)||(155788-155963)
chr1 (594-850)||(28279309-28279566)
chr1 (724-835)||(15916562-15916674)
chr1 (767-847)||(13358787-13358867)
chr1 (424-537)||(43104030-43104143)
chr1 (638-781)||(43104245-43104390)
chr1 (294-381)||(17323785-17323872)
chr1 (652-838)||(21353342-21353525)
chr1 (295-360)||(25251749-25251814)
chr1 (281-377)||(17186605-17186701)
chr1 (292-360)||(25248988-25249056)
chr1 (634-778)||(14353047-14353190)
chr1 (291-360)||(31489724-31489793)
chr1 (594-696)||(26332699-26332798)
chr1 (739-835)||(13127685-13127782)
chr1 (503-627)||(13127837-13127959)
chr1 (634-706)||(26332616-26332688)
chr1 (497-545)||(30790683-30790731)
chr1 (649-711)||(14997040-14997101)
chr1 (806-847)||(13447260-13447301)
chr1 (497-587)||(16231545-16231636)
chr1 (291-334)||(18839306-18839349)
chr1 (649-711)||(4144804-4144865)
chr1 (755-793)||(11693351-11693389)
chr1 (762-807)||(9521826-9521871)
chr1 (452-545)||(16431001-16431093)
chr1 (744-780)||(8213579-8213615)
chr1 (716-835)||(46783212-46783331)
chr1 (649-687)||(2232597-2232635)
chr1 (762-808)||(9526577-9526623)
chr1 (292-326)||(31423403-31423437)
chr1 (286-335)||(15669891-15669940)
chr1 (294-335)||(18801068-18801109)
[»] chr8 (79 HSPs)
chr8 (291-850)||(27106879-27107458)
chr8 (417-850)||(25952441-25952874)
chr8 (497-850)||(14419172-14419526)
chr8 (441-847)||(5372161-5372568)
chr8 (294-850)||(15185696-15186247)
chr8 (421-850)||(33541392-33541799)
chr8 (492-850)||(30480485-30480843)
chr8 (470-850)||(27910988-27911366)
chr8 (470-850)||(27957407-27957785)
chr8 (417-742)||(14477196-14477522)
chr8 (497-850)||(1225166-1225520)
chr8 (497-850)||(28251549-28251902)
chr8 (492-848)||(13858469-13858824)
chr8 (497-850)||(14807751-14808114)
chr8 (497-847)||(32339305-32339659)
chr8 (498-847)||(36865538-36865887)
chr8 (497-850)||(15072710-15073064)
chr8 (497-846)||(15067981-15068330)
chr8 (497-847)||(4424018-4424368)
chr8 (497-847)||(27829297-27829646)
chr8 (497-847)||(3874006-3874360)
chr8 (497-847)||(15809215-15809568)
chr8 (497-847)||(27826986-27827335)
chr8 (537-847)||(22684638-22684951)
chr8 (497-850)||(41384745-41385097)
chr8 (552-840)||(608790-609077)
chr8 (497-847)||(18810708-18811057)
chr8 (497-850)||(41382673-41383015)
chr8 (497-847)||(28283206-28283560)
chr8 (552-847)||(43079658-43079952)
chr8 (497-847)||(44720843-44721193)
chr8 (497-847)||(18812893-18813231)
chr8 (437-835)||(21482266-21482649)
chr8 (594-847)||(43530213-43530465)
chr8 (552-847)||(43082029-43082323)
chr8 (497-835)||(24873178-24873522)
chr8 (592-850)||(15956057-15956311)
chr8 (579-826)||(21480589-21480832)
chr8 (470-835)||(31162186-31162551)
chr8 (527-838)||(3005624-3005932)
chr8 (493-691)||(5622878-5623077)
chr8 (294-673)||(26774978-26775378)
chr8 (492-659)||(35872555-35872718)
chr8 (634-835)||(31578273-31578476)
chr8 (631-835)||(31035252-31035459)
chr8 (619-793)||(181622-181795)
chr8 (594-763)||(31573794-31573961)
chr8 (702-835)||(2468126-2468259)
chr8 (424-668)||(31034996-31035238)
chr8 (592-714)||(37214317-37214430)
chr8 (648-808)||(17847677-17847830)
chr8 (594-835)||(3895920-3896162)
chr8 (497-596)||(3886153-3886253)
chr8 (649-850)||(6376141-6376342)
chr8 (293-360)||(33541860-33541927)
chr8 (590-676)||(2468261-2468343)
chr8 (497-607)||(12517248-12517361)
chr8 (784-850)||(37214246-37214312)
chr8 (718-850)||(35872435-35872553)
chr8 (795-847)||(14477548-14477601)
chr8 (736-833)||(16833789-16833886)
chr8 (445-513)||(15949338-15949406)
chr8 (497-587)||(181537-181628)
chr8 (649-808)||(28327908-28328064)
chr8 (739-793)||(14419732-14419786)
chr8 (526-583)||(37214458-37214516)
chr8 (497-546)||(14419783-14419832)
chr8 (649-838)||(17799418-17799606)
chr8 (648-850)||(33838903-33839105)
chr8 (649-808)||(16757293-16757449)
chr8 (649-777)||(13985135-13985262)
chr8 (817-850)||(181799-181832)
chr8 (763-832)||(4696620-4696689)
chr8 (649-838)||(9021101-9021289)
chr8 (649-838)||(21033870-21034057)
chr8 (649-687)||(16752666-16752704)
chr8 (649-687)||(28895502-28895540)
chr8 (763-832)||(7412345-7412414)
chr8 (762-838)||(23179555-23179632)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (499-850)||(79140-79491)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (497-847)||(183626-183974)
scaffold0005 (497-838)||(51962-52307)
scaffold0005 (766-838)||(50234-50308)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (492-850)||(79807-80165)
scaffold0004 (649-687)||(188386-188424)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (497-847)||(3950-4298)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (497-847)||(41468-41818)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (552-847)||(69277-69570)
scaffold0025 (552-643)||(73211-73302)
scaffold0025 (615-658)||(73160-73203)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (552-850)||(14366-14661)
scaffold0131 (497-850)||(14972-15323)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (497-850)||(11455-11808)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (492-850)||(85179-85537)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (497-847)||(6152-6502)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (497-847)||(2833-3182)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (552-847)||(50-344)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (434-835)||(15817-16216)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (552-847)||(29180-29473)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (612-847)||(1438-1671)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (457-835)||(16646-17021)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (506-835)||(1638-1958)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (484-723)||(35580-35819)
scaffold0011 (766-850)||(35816-35900)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (552-793)||(2051-2290)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (648-847)||(22221-22418)
scaffold0140 (648-847)||(24496-24693)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (503-808)||(4773-5076)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (497-608)||(1054-1166)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (778-845)||(4666-4733)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (649-808)||(57452-57613)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (800-844)||(1439-1483)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (649-687)||(224819-224857)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (762-838)||(16980-17057)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 551; Significance: 0; HSPs: 139)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 551; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 716
Target Start/End: Original strand, 6132363 - 6133090
Alignment:
Q  8 gagttcacatacgaaaactttgaggataaatacacaaatggggaattgctgaaagactacattgttaaactgattctaaaacctataagcatttagaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6132363 gagttcacatacgaaaactttgaggataaatacacaaatggggaattgctgaaagactacattgttaaactgattctaaaacctataagcatttagaaat 6132462  T
Q  108 gtgaataggtgaaacaaaattagttataataagtggctcttttattacagttttatgcatatcattttttcttaactgtttcgctttgtcattgtatttg 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6132463 gtgaataggtgaagcaaaattagttataataagtggctctttttttacagttttatgcatatcattttttcttaactgtttcgctttgtcattgtatttg 6132562  T
Q  208 taattgacgatggtacaattaatgccacggtttgaaatgcaagttttctttgtacnnnnnnnnnnaaggaaggttttctttataattgttgtgaaagtgc 307  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6132563 taattgacaatggtacaattaatgccacggtttgaaatgcaagttttctttgtactttttttt--aaggaaggctttctttataattgttgtgaaagtgc 6132660  T
Q  308 ctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttgacatgttttatttgagctttaggtt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6132661 ctcaaaattgaagaaattggaattctggaagctgaaaatcggtggctgattttcagggtacggtgaccgattttgacatgttttatttgagctttaggtt 6132760  T
Q  408 cggcaaaaatcggtg---------------------gccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagtttt 486  Q
    |||||||||||||||                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6132761 cggcaaaaatcggtggccgatttggagcatttggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcatgcctagatttgttctagtttt 6132860  T
Q  487 attgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagg 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6132861 attgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacattgagatagaggaggctgaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagg 6132960  T
Q  587 gcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaaga 686  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6132961 gcttgtatagagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 6133060  T
Q  687 gattgagactctgggtagaaataggcggga 716  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  6133061 gattgagactttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 492 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 12396185 - 12395827
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||   |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  12396185 ggatgcttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 12396086  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396085 gtatagagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 12395986  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||    
T  12395985 gtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggggggctgctct 12395887  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12395886 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttctctc 12395827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 492 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 12401147 - 12400789
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||   |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  12401147 ggatgcttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 12401048  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12401047 gtatagagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagatt 12400948  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||    
T  12400947 gtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggggggctgctct 12400849  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12400848 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttctctc 12400789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 40637072 - 40637425
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| | | |||| | |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  40637072 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 40637171  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637172 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattgagac 40637271  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |    
T  40637272 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctccc 40637370  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637371 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 40637425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 452 - 850
Target Start/End: Original strand, 36378246 - 36378644
Alignment:
Q  452 aaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggatt-cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggc 550  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||  | |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||   |||    
T  36378246 aaacgtatttttgggcc-agatttgttacaattttat-gagggttacttttactataaatatagactttgtatcagaataaaccttgagatagacggggc 36378343  T
Q  551 t-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctggga 649  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  36378344 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaa 36378443  T
Q  650 aacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctttt 749  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  36378444 aacactattaggattaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctctt 36378543  T
Q  750 gtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  36378544 gtgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattattttgtgttctct 36378643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 492 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 38928518 - 38928159
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  38928518 ggattcttttactataaatataggctttgtattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38928419  T
Q  591 atatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38928418 gtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagat 38928319  T
Q  690 tgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctc 789  Q
    || | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||    
T  38928318 tggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtaaaacggagggctgctc 38928220  T
Q  790 tctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928219 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 38928159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 24880449 - 24880803
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggc-taaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||  ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  24880449 cttttactataaatatagaccttgtatcggagtaaacttggagatagagggggcgtaaactagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 24880548  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880549 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 24880648  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt-aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||     
T  24880649 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 24880747  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24880748 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctc 24880803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 40091750 - 40091397
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || | ||    
T  40091750 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgttta 40091651  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  40091650 gagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 40091551  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |    
T  40091550 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 40091452  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40091451 ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 40091397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 22801197 - 22800844
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| | || ||||    
T  22801197 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtata 22801098  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  22801097 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgagac 22800998  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  22800997 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctctccc 22800899  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22800898 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 22800844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 48486317 - 48486670
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  48486317 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 48486416  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48486417 gagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 48486516  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| |    
T  48486517 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctccc 48486615  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  48486616 ccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattattttgtgttttctc 48486670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 417 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 18409760 - 18409344
Alignment:
Q  417 tcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagac 516  Q
    ||||||||| | |||||||| | ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  18409760 tcggtggccaaatttgacagtagaaaataaaacagacacatattttcgggcctagatttgttccagttttttt-aggattcttttactataaatatagaa 18409662  T
Q  517 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 615  Q
     ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  18409661 tttgtatcagtgtaaacaatgagatagaga-ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcacttggcaaca 18409563  T
Q  616 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 715  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  18409562 aacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagacttttggtagaattaggcggg 18409463  T
Q  716 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 815  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||   ||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  18409462 agatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa-gttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctctccctcagactaggtcaatttgga 18409364  T
Q  816 tcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    | ||||||||| ||||||||    
T  18409363 ttgaactgggtaaacaaatt 18409344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 492 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 33415827 - 33415470
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  33415827 ggatttttttactacaaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggttt 33415728  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33415727 gtatagagtttgtctcttgg-aacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagatt 33415629  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  33415628 gaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctct 33415530  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33415529 ctccctcaggctaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttctctc 33415470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 24888794 - 24889147
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| | |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  24888794 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggattgtata 24888893  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  24888894 gagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactaggac 24888993  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |    
T  24888994 tttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatca-tatagtggaacggagggctgctctctccc 24889092  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24889093 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctc 24889147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 492 - 850
Target Start/End: Original strand, 19095875 - 19096234
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| ||    
T  19095875 ggatgcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggttt 19095974  T
Q  591 atatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19095975 gtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 19096074  T
Q  690 t-gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgct 788  Q
    | ||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||  |||||    
T  19096075 tagag-ctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatca-tatagtgaaacggagagctgct 19096172  T
Q  789 ctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19096173 ctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 19096234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 22803069 - 22802719
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  22803069 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 22802970  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  22802969 gagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 22802870  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||| |    
T  22802869 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatca-tatagtggaacggagggtttctctctccc 22802771  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22802770 ccagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 22802719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 24878987 - 24879341
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | |||||||||  |||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  24878987 cttttactataaatatagaccttgtatccgagtaaacttggagatagagggggctgaaactagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 24879086  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879087 gagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 24879186  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt-aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||     
T  24879187 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgatacacatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 24879285  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24879286 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctc 24879341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 14633318 - 14633666
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||| | |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  14633318 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga-agggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 14633416  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  14633417 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagagattgggac 14633515  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  14633516 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 14633614  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
     || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14633615 tcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14633666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 36921830 - 36921475
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga--tagagaaggctaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatat 594  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||  |||||  ||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  36921830 cttttacaataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagagatagagggggtgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 36921731  T
Q  595 agagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 693  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  36921730 atagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 36921631  T
Q  694 actctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 793  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  36921630 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctc 36921532  T
Q  794 acccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
     |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36921531 ccccagactagttaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 36921475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 498 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 37313400 - 37313047
Alignment:
Q  498 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatag 596  Q
    |||||||||||||||||   |||||||   ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  37313400 ttttactataaatataggttttgtatcaaagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 37313301  T
Q  597 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  37313300 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggatt 37313201  T
Q  697 ctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacc 796  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||    
T  37313200 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttcccc 37313101  T
Q  797 catactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || |||| ||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  37313100 cagactatgtcaatttggaccaaattggatcaacaaattcttttgttttctctc 37313047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 497 - 845
Target Start/End: Original strand, 47868399 - 47868747
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| | | |||| | |||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  47868399 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 47868498  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  47868499 gagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 47868598  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |    
T  47868599 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctccc 47868697  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47868698 ccatactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgtt 47868747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 8631698 - 8631404
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8631698 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 8631599  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8631598 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 8631499  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631498 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 8631404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 22047020 - 22046671
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| | |||| | |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  22047020 cttttactataaatataggccttgtatcggagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 22046921  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  22046920 gagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 22046821  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  22046820 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 22046723  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
     || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046722 tcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22046671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 47274725 - 47275073
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  47274725 cttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 47274824  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
     |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||    
T  47274825 -agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggac 47274923  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  47274924 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc-c 47275021  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47275022 ccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttct 47275073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 24348212 - 24348566
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    ||||| ||||||    |||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||     
T  24348212 cttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttg 24348311  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  24348312 tatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 24348411  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
     |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  24348412 ggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 24348510  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348511 tcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 24348566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 5198418 - 5198768
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  5198418 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtata 5198517  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  5198518 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggc 5198617  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |    
T  5198618 tttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 5198716  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5198717 ccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttct 5198768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 619782 - 619430
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  |||    
T  619782 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggtttgcata 619683  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||| | |    
T  619682 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgactgtcttggttaagggaagagattgggtc 619583  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  619582 tttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatgactgctctctc-c 619485  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  619484 cctaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctc 619430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 37089709 - 37089357
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacctt---gagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttat 592  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |    |||||||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |    
T  37089709 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaacttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 37089610  T
Q  593 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 692  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||     
T  37089609 atagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgg 37089510  T
Q  693 gactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 792  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  37089509 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctct 37089412  T
Q  793 cacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089411 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 37089357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 11434953 - 11435302
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| | |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  11434953 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 11435052  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  |  |||    
T  11435053 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtctaggac 11435152  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  11435153 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 11435250  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435251 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11435302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 22044725 - 22044376
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| | | |||| | |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  22044725 cttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 22044626  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  22044625 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 22044526  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  22044525 tttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 22044428  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
     || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044427 tcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22044376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 51015244 - 51015593
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| | |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  51015244 cttttactataaatatagactttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 51015343  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    | ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  51015344 gtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 51015443  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||   ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  51015444 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcggaggtctgctctctccc 51015541  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
     || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015542 tcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 51015593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 16453307 - 16453661
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||| | | |||||  |||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| | || || |    
T  16453307 cttttgctataaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtaca 16453406  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
     |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  16453407 aagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggac 16453506  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |  ||||||||| |    
T  16453507 tttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctccc 16453606  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  16453607 ccagactaggtcaatttggaccgaactgcgccaaaaaattcttttgtgttctctc 16453661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 36919922 - 36919566
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttga--gatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttata 593  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||  |||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  36919922 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgatagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgga 36919823  T
Q  594 tagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 692  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  36919822 taaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 36919723  T
Q  693 gactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 792  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||  || | |||||||||    
T  36919722 gacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttattcatca-tatagtggaatagatggctgctctct 36919624  T
Q  793 cacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    | || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919623 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 36919566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 574 - 850
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380701
Alignment:
Q  574 caacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctctt 673  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatctt 36380524  T
Q  674 ggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtg 773  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36380525 ggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtg 36380624  T
Q  774 gaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||| |||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36380625 gaactgagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggagcgaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctc 36380701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 492 - 835
Target Start/End: Original strand, 41997485 - 41997828
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  41997485 ggattcttctactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagttt 41997584  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  41997585 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagatt 41997684  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| | |||||    
T  41997685 gagattttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctct 41997784  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    ||| |||| ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||    
T  41997785 ctc-cccagactaggttaatttggaccgaactggataaacaaatt 41997828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 9148249 - 9148600
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga--tagagaaggctaaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttata 593  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| | | |||| ||||||  |||||  |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||    
T  9148249 cttttactataaatataggccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaagcaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgta 9148348  T
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 693  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  9148349 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 9148448  T
Q  694 actctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 793  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9148449 actttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctc 9148546  T
Q  794 acccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
     |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148547 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 9148600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 503 - 850
Target Start/End: Original strand, 19322701 - 19323046
Alignment:
Q  503 ctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagttt 601  Q
    |||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||  || | ||||||||||| |||| | |||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  19322701 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagttt 19322799  T
Q  602 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctggg 701  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19322800 g-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttggg 19322896  T
Q  702 tagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatac 801  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||    
T  19322897 tagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctcccccagac 19322996  T
Q  802 taggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||  |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  19322997 taggtcagttttggaccgaactggataaacaaattctttagtgttctctc 19323046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 2485208 - 2484858
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagataga-gaaggctaaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatat 594  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| | | |||| ||||| |||| |  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  2485208 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagctagaagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 2485109  T
Q  595 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  2485108 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 2485009  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||     
T  2485008 ctttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcc 2484911  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2484910 cccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgttct 2484858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 6764837 - 6765192
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| | | |||| ||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  6764837 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 6764936  T
Q  596 gagtttgtctcttg-----gcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
    |||||||||||||      | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  6764937 gagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 6765036  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  6765037 gggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggattggagggctgctct 6765135  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765136 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6765192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 18847151 - 18847500
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||     |||| |||||||||||  || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  18847151 cttttactataaatatagaccttgtatcaaaacaaactttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 18847250  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18847251 gagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattggagtctcttggttacgggaagagattggga 18847350  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||     
T  18847351 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc- 18847447  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847448 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 18847500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 17662573 - 17662227
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| ||||||    |||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        
T  17662573 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg---- 17662478  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
           |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  17662477 -------tttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactg 17662385  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  17662384 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 17662286  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662285 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 17662227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 294 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 38270543 - 38270158
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttgacatgttttat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| |  |||||||||   |||||| |    
T  38270543 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattgaaattctggtagcagaaaatcggtggccgattttcaaagcacgatagccgattttggactgtttt-t 38270445  T
Q  394 ttgagctttaggttcggcaaaaa---------------------tcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctaga 472  Q
    ||| || || |||||||||||||                     |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38270444 ttg-gcctttggttcggcaaaaatcgatggccgatttagagcattcggtggccgattttgacagcagaaaataaaacagaaacgtattttcgggcctaga 38270346  T
Q  473 tttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggc 571  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  38270345 tttgttccagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaagaggctgaaacaagggtttagaaaggc 38270246  T
Q  572 aacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactatta 659  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  38270245 aacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 38409197 - 38409552
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga------tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggct 589  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| ||||||      |||||  |||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  38409197 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaatggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtt 38409296  T
Q  590 tatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  38409297 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 38409396  T
Q  690 tgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctc 789  Q
    || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  38409397 tgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 38409494  T
Q  790 tctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38409495 tctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgagttct 38409552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 418 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 3937622 - 3937314
Alignment:
Q  418 cggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagaca 517  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  3937622 cggtggccgattttgacagcaggaaataaaacagaaacgtattttcgggcctagattttttccagttttatttaggattcttttactataaatatagact 3937523  T
Q  518 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 616  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||| |||||| |||||    
T  3937522 tt-tatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtatagagtttgtttcttgggaacaa 3937424  T
Q  617 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||    
T  3937423 acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtggga 3937324  T
Q  717 gacttattct 726  Q
    ||||||||||    
T  3937323 gacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 7941317 - 7941671
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga--tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttata 593  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||  ||||  |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  7941317 cttttactataaatatagacgttgtatcagagcaaaccgggagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 7941416  T
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaa--cactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    |||||||||||||||   | ||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  7941417 tagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctg 7941516  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||    
T  7941517 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctc 7941615  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941616 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7941671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 11006516 - 11006222
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11006516 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 11006417  T
Q  652 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  11006416 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 11006318  T
Q  751 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11006317 taatggtactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttct 11006222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 497 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 14787768 - 14787423
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga--tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttata 593  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    ||||| ||||||  |||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  14787768 cttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 14787669  T
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 693  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14787668 tagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtg 14787569  T
Q  694 actctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactg--ctctc 791  Q
    ||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||  |||||    
T  14787568 actttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 14787470  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    || |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14787469 tcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 14787423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 612 - 850
Target Start/End: Original strand, 16455355 - 16455591
Alignment:
Q  612 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg 711  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16455355 aacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 16455454  T
Q  712 cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatt 811  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16455455 cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatt 16455554  T
Q  812 tggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16455555 tggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtgttctctc 16455591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 16934478 - 16934128
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaa-acaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | |||| |||||||||||  |||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  16934478 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 16934379  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16934378 gagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgaga 16934279  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||     
T  16934278 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 16934181  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16934180 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 16934128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 31849878 - 31849584
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt-gagggttgattcaccctgggaa 650  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  31849878 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaa 31849779  T
Q  651 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  31849778 acactattaggattgagtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 31849680  T
Q  751 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849679 taacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 31849584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 44600173 - 44599823
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    | |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  44600173 cttttactataaatatagaccttgtattaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 44600074  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44600073 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 44599974  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||     
T  44599973 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 44599876  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  44599875 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 44599823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 11008845 - 11008553
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11008845 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 11008746  T
Q  652 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||    
T  11008745 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc---tttg 11008649  T
Q  751 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11008648 taatggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 11008553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 9174481 - 9174131
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | |||| | |||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  9174481 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 9174382  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9174381 gagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgaga 9174282  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||      
T  9174281 ctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgttctctgc 9174184  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9174183 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 9174131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 499 - 845
Target Start/End: Complemental strand, 9176807 - 9176461
Alignment:
Q  499 tttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatataga 597  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   | |||| | |||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||| |    
T  9176807 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaa 9176708  T
Q  598 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagact 696  Q
    ||||||||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176707 gtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagact 9176608  T
Q  697 ctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacc 796  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||    
T  9176607 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccc 9176510  T
Q  797 catactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||  ||||||||    
T  9176509 cagactaggtcaatttggaccgaacagagtcaacaaatttctttgtgtt 9176461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 571 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 26086236 - 26085962
Alignment:
Q  571 caacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtct 670  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26086236 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 26086137  T
Q  671 cttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 770  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||| | ||||||||| ||||    
T  26086136 cttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctc-tttgtaacgatactcatca-tata 26086039  T
Q  771 gtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||| |||| | |||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26086038 gtggatcggaaggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttct 26085962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 497 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 18537806 - 18537470
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct--aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatat 594  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| | |||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||   ||||||||| |||||| || |||    
T  18537806 cttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtat 18537709  T
Q  595 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18537708 agagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaga 18537612  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  18537611 cttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcc 18537512  T
Q  795 cccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    |||||| |||||||  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  18537511 cccataataggtcattttttgaccgaactgggtaaacaaatt 18537470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 18709442 - 18709149
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  18709442 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagttgattcaccttgggaaa 18709343  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  18709342 cactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 18709244  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || |  |||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18709243 aacgaaactcatca-tatagtggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 18709149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 552 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 22132669 - 22132389
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22132669 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 22132571  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  22132570 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 22132472  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    || | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22132471 aacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 22132389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 498 - 828
Target Start/End: Original strand, 56030443 - 56030770
Alignment:
Q  498 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatag 596  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| | || |||||    
T  56030443 ttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatag 56030542  T
Q  597 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 696  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   ||    
T  56030543 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagct 56030642  T
Q  697 ctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacc 796  Q
     ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||| |||| |||||||     || |||||||| |||||||||| ||    
T  56030643 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatttcttttgtaacgttattcatcat----atgaaacggagggctgctctctcccc 56030738  T
Q  797 catactaggtcaatttggatcgaactgggtca 828  Q
     | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  56030739 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 56030770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 357 - 608
Target Start/End: Original strand, 2891174 - 2891427
Alignment:
Q  357 ttttcaaggcacggtgaccgattttgacatgttttatttgagctttaggttcggcaaaaatcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacg 456  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  2891174 ttttcagggcacggtggccgattttgacctattttatttgagcttcaggttcggcaaaaatcggtggccgattttgacagcagaaaataaaacagaaacg 2891273  T
Q  457 tattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgt-atcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaa 554  Q
    |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||    
T  2891274 tatttatgggactagatttgttccagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtaatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaa 2891373  T
Q  555 caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt 608  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  2891374 caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt 2891427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 16932124 - 16931774
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaa-acaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||   | |||| |||||||||||  |||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  16932124 cttttactataaatataaaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 16932025  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
    |||| |||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16932024 gagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgaga 16931925  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||     
T  16931924 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 16931827  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16931826 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 16931774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 498 - 812
Target Start/End: Original strand, 13543953 - 13544272
Alignment:
Q  498 ttttactataaatatagacattgtatcgg-tgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| ||||||    |||||  |||| |||||||| |  |||| | ||||||||||||||||| ||     
T  13543953 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 13544052  T
Q  592 tatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13544053 tatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 13544151  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  13544152 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagtactgctct 13544250  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaattt 812  Q
    ||  |||| |||||||||||||    
T  13544251 ctttcccagactaggtcaattt 13544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 581 - 850
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499393
Alignment:
Q  581 actagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacg 680  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacg 27499227  T
Q  681 ggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacgga 780  Q
      ||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||| |||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  27499228 ataagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaac---ctaatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacgaa 27499324  T
Q  781 ggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || ||||||| || |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27499325 gggctgctctttc-cccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 27499393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 8756585 - 8756233
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct--aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatat 594  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||   ||||  ||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||  || |||    
T  8756585 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattaggatttgtat 8756487  T
Q  595 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctctt-ggttacgggaagagattgag 693  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8756486 agagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaagagattgag 8756390  T
Q  694 actctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 793  Q
    ||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  8756389 actttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattatagtggaacggatggttgctctctc 8756290  T
Q  794 acccatactaggtc-aatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
      ||| ||||||||   |||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  8756289 ctccagactaggtcggttttggagcgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctc 8756233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 552 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 22134894 - 22134615
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22134894 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 22134796  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  || |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  22134795 cactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 22134697  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    || | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22134696 aacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 22134615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 22780652 - 22780358
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22780652 aaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 22780553  T
Q  652 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  22780552 cactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 22780454  T
Q  751 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  22780453 taacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 22780358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 22783017 - 22782723
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22783017 aaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 22782918  T
Q  652 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  22782917 cactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 22782819  T
Q  751 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||   ||||||||||    
T  22782818 taacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaaatatctttgtgttct 22782723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 640 - 850
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891643
Alignment:
Q  640 caccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattga 739  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattga 2891532  T
Q  740 tatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttt 839  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||| |||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2891533 tatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 2891632  T
Q  840 tgtgttctctc 850  Q
    |||||||||||    
T  2891633 tgtgttctctc 2891643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 497 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 5637804 - 5637530
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  | | |||| ||||||    |||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  5637804 cttttactataaatatagaccttgtataagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 5637705  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5637704 tatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 5637605  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 766  Q
     |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  5637604 ggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 5637530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 559 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 3824842 - 3824627
Alignment:
Q  559 ggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactatt 658  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3824842 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 3824743  T
Q  659 atgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggtta 758  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  3824742 aggattgagtctattggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 3824643  T
Q  759 ctcatcattatagtgga 775  Q
    ||||||| |||||||||    
T  3824642 ctcatca-tatagtgga 3824627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 646 - 850
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547505
Alignment:
Q  646 gggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctc 745  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  13547302 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatc 13547401  T
Q  746 ttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  13547402 ttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgtt 13547500  T
Q  846 ctctc 850  Q
    |||||    
T  13547501 ctctc 13547505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 53405125 - 53405481
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaa---ggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttat 592  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||| ||| |    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  53405125 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 53405224  T
Q  593 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 692  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  53405225 atagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggaaagaggctga 53405323  T
Q  693 gactctgggtagaaataggcgggaga------cttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactg 786  Q
    |||| | ||||||| || ||||||||      |||||||||||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||  |||    
T  53405324 gactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctcttttgaaacgatactcatca-tatagtggaacagagagctg 53405422  T
Q  787 ctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
      ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  53405423 --ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttttgttct 53405481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 492 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 18535169 - 18534828
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct--aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggct 589  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | |  || | ||||||||||||||||||  ||||  ||||||| ||| | |||   ||||||||| |||||| |    
T  18535169 ggatgcttttacaataaatatagacctcgattcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagtgtttaaaaaca-aacaacaaa-ctagggtt 18535072  T
Q  590 tatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  18535071 tgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagat 18534975  T
Q  690 tgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctc 789  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  18534974 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacggaggggtgctc 18534875  T
Q  790 tctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    || | |||| ||||||| |  |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  18534874 tcccccccagactaggtaagttttggaccgaacagggtaaacaaatt 18534828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 578 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890221
Alignment:
Q  578 aaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggtt 677  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatc 38890380  T
Q  678 acgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaac 777  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38890379 acgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 38890280  T
Q  778 ggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
     |||| |||||||||| || | | |||||||  |||||| |||||||||| ||||||||    
T  38890279 agagggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 38890221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 497 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 47211081 - 47210756
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga------tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggct 589  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||      |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  47211081 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 47210982  T
Q  590 tatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |             ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||      
T  47210981 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgt------------tgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggc 47210894  T
Q  690 tgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctc 789  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  47210893 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 47210795  T
Q  790 tctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtca 828  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  47210794 tctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgagtca 47210756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 604 - 850
Target Start/End: Original strand, 30136657 - 30136901
Alignment:
Q  604 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggta 703  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  30136657 ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaagaaattgtgactttgggta 30136754  T
Q  704 gaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatacta 803  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| || | ||||||||||  | ||||||    
T  30136755 gaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggctgctctctcctcaatacta 30136854  T
Q  804 ggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  30136855 ggtcaatttggaccgaattggataaacaaattcttttgtgttctctc 30136901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 675 - 849
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215656
Alignment:
Q  675 gttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgg 774  Q
    ||||||||||||| ||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgg 4215581  T
Q  775 aacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
    |||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4215582 aacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 4215656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 497 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 52942782 - 52942537
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtat--cggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttata 593  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||  | |  ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  52942782 ctttcactataaatatagaccttgtatatcagactaaactttgagatagagg-ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 52942684  T
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 693  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||               
T  52942683 tagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg----------- 52942595  T
Q  694 actctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaa 753  Q
      | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52942594 --tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 52942537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 498 - 835
Target Start/End: Original strand, 28453686 - 28454020
Alignment:
Q  498 ttttactataaatatagacattgtatcgg-tgtaaaccttgagatagagaaggct--aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatat 594  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||| |||||| | ||  ||||||||||| |||| | |||||  |||||||||| ||  |     
T  28453686 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtgaaccttgaggtagaga-gtctgaaaacaagggtttagaa-gccaacactaaaactagggtttgca- 28453782  T
Q  595 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  28453783 -gagtttg-ctcttggcaagaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgga 28453878  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    |  ||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  28453879 ccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaacttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctcc 28453978  T
Q  795 cccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    |||| ||||||| | | ||||| |||||||||| ||||||||    
T  28453979 cccagactaggttagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 28454020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 693 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635461
Alignment:
Q  693 gactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 792  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctct 5635516  T
Q  793 cacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5635515 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5635461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 633 - 835
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102425
Alignment:
Q  633 gttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcg-ggagacttattcttgtaa 731  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| ||||||  ||| ||||||||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 12102320  T
Q  732 cacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaac 830  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| ||| |||    
T  12102321 cccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaaac 12102420  T
Q  831 aaatt 835  Q
    |||||    
T  12102421 aaatt 12102425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 440 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 15032928 - 15032572
Alignment:
Q  440 aaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgag 539  Q
    |||||| |||| || || ||||| ||||  |||||||||| | ||||||   |||| |||||||||||||||||||| | ||| | | ||||||||||||    
T  15032928 aaaatataacagaatcgaatttttgggctgagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagacttggtaccagagtaaaccttgag 15032829  T
Q  540 atagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgat 638  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||| |||| | |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||          ||||| |||||    
T  15032828 ataaagggggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaa----------tgagg-ttgat 15032742  T
Q  639 tcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattg 738  Q
    |||   | ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| |||||  |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15032741 tcatatttggaaacactattaggattgagtctcttggacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattg 15032642  T
Q  739 atatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  15032641 atatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacgaagagctgctctctcccccaaactaggtca 15032572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 492 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 24446919 - 24446756
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||     ||||| ||    
T  24446919 ggatgcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaac-----tagggttt 24446825  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactatta 659  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24446824 gtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 693 - 847
Target Start/End: Original strand, 11437558 - 11437710
Alignment:
Q  693 gactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 792  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  11437558 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctct 11437655  T
Q  793 cacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    | || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11437656 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11437710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 292 - 450
Target Start/End: Original strand, 27498963 - 27499108
Alignment:
Q  292 attgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttgacatgtttt 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||             |||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  27498963 attgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctggaagctgaa-------------ttttcagggcagggtggccgattttgacctgtttt 27499049  T
Q  392 atttgagctttaggttcggcaaaaatcggtggccgattttgacagcataaaataaaaca 450  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27499050 atttgagcttcaggttcggcaaaaatcggtggccgattttgacagcagaaaataaaaca 27499108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 633 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983554
Alignment:
Q  633 gttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaa 731  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||   | ||||||||| ||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  732 cacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggt 806  Q
    | | ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  31983627 ccctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc-ccaatactaggt 31983554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 498 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 40999281 - 40998990
Alignment:
Q  498 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct--aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||| || || |||| | |||||||||||| |||||| | ||  ||||||||||| |||  | |||||| |||||||||| || ||||    
T  40999281 ttttactataaatataaaccttatatcagagtaaaccttgaggtagaga-gtctgaaaacaagggtttagac-gtcaacaagaaaactaggggttgtata 40999184  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||||  || ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  40999183 gagtttg-ctcttgacaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcacctaggaaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatcgagac 40999087  T
Q  696 tctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
    | ||||||||| ||||   |||||||   | ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||    
T  40999086 tttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtggaacagagggatgctctc 40998990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 603 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 3982411 - 3982200
Alignment:
Q  603 tctcttggcaacaaacactagggttt-gagggttg--attcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactc 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||  |||   ||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||     
T  3982411 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgtttttattcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactt 3982312  T
Q  698 tgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacc 796  Q
    ||||||||| || |   || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |     
T  3982311 tgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaacactttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccct 3982212  T
Q  797 catactaggtca 808  Q
    ||||||||||||    
T  3982211 catactaggtca 3982200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 699 - 850
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101279
Alignment:
Q  699 gggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcaccca 798  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||| ||||| |||| ||||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcat-atagtaaaacggagggctgctatctc-ccca 5101227  T
Q  799 tactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5101228 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 5101279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 760 - 850
Target Start/End: Original strand, 6133098 - 6133188
Alignment:
Q  760 tcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6133098 tcatcattatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtcaatttggatcgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 6133188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 649 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 16186018 - 16185831
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||   || |||||||||||| ||| | ||||||| ||||    
T  16186018 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatctt 16185919  T
Q  748 ttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||    
T  16185918 t-gtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 16185831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 634 - 850
Target Start/End: Original strand, 25357772 - 25357994
Alignment:
Q  634 ttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtaga---aat--aggcgggagacttattcttg 728  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| || |   |||  ||   | |||||||||||||    
T  25357772 ttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttg 25357871  T
Q  729 taacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtc 827  Q
    |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| || | ||||||||| | ||||| | ||||||||     
T  25357872 taaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtattggacctaactgggta 25357971  T
Q  828 aacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  25357972 aacaaatttttgtgtgttctctc 25357994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 594 - 835
Target Start/End: Original strand, 9863805 - 9864049
Alignment:
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 693  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9863805 tagagtttgt-tcttggcaacaaacactaaggttgg--gtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacgggaagagattgag 9863901  T
Q  694 actctgggtagaaat-aggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttac---tcatcattatagtggaacggaggactgctc 789  Q
    ||| ||||||||| | ||   | ||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  9863902 actttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcatcattatagtggaacggagagctgctc 9864000  T
Q  790 tct--cacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    |||  | |||| |||| |||| | ||||| |||||||||| ||||||||    
T  9864001 tctcccccccagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 9864049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 592 - 777
Target Start/End: Complemental strand, 47151131 - 47150948
Alignment:
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  |   |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  47151131 tatagagtttg-ctcttggtaaccaacactagggttgaaa--ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattg 47151035  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaac 777  Q
    ||| | ||||||||| ||||   || |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  47151034 agaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttctaaagttgctcatcattatagtggaac 47150948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 504 - 826
Target Start/End: Original strand, 10112876 - 10113198
Alignment:
Q  504 tataaatatagacattgtatcgg-tgtaaaccttgagatagagaaggct--aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtt 600  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||   | |  ||||||||||| |||| | |||||  |||||||||| || ||  |||||    
T  10112876 tataaatatagacattgtatcagatgtaaacctcgagagagagggagttgaaaacaagggtttagaa-gccaacacaaaaactagggtttgta--gagtt 10112972  T
Q  601 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttac-gggaagagattgagactctg 699  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||| ||    
T  10112973 tg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttg 10113069  T
Q  700 ggtagaaatag-gcgggagacttattcttgtaa-cacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcaccc 797  Q
    ||||||| |||    | ||||| |||||||||| |   |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||     
T  10113070 ggtagaattagatttgaagactaattcttgtaacctttttgatatctc-tttgtaatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctctctcccca 10113168  T
Q  798 atactaggtcaat-ttggatcgaactgggt 826  Q
    | ||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  10113169 agactaggttagtattggaccgaactgggt 10113198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 497 - 634
Target Start/End: Original strand, 5100995 - 5101133
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  | || |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||| || ||||    
T  5100995 cttttactataaatatagaccttgaatcagggtaaaccttgagatagaggggactgaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtata 5101094  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggt 634  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  5101095 gagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 746 - 850
Target Start/End: Original strand, 47563009 - 47563112
Alignment:
Q  746 ttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47563009 ttttgtaaggttactcatc-ttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgtt 47563107  T
Q  846 ctctc 850  Q
    |||||    
T  47563108 ctctc 47563112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 552 - 806
Target Start/End: Original strand, 9022362 - 9022613
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgg-gaa 650  Q
    ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| || || ||| ||   ||||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||| ||| |||    
T  9022362 aaacaagggtttagaa-gtcaacatcaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttggagaa 9022455  T
Q  651 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaac--acattgatatctctt 747  Q
    ||| ||||| ||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||   | ||||| |||||||||||    ||||||||||| |    
T  9022456 acagtattaggatagaatttcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaagactaattcttgtaacctctattgatatctc-t 9022554  T
Q  748 ttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggt 806  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  9022555 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacaaagggctgctctctcccccatattaggt 9022613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 649 - 848
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336764
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||   || |||| ||||||||||  |  | |||||||||    
T  5336964 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggact-tgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctcttatatctctt 5336866  T
Q  748 ttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    |   || |  | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||| ||||||||| |||||  ||||||  | |||||||||||||||||||    
T  5336865 tgtaaaagaaattcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctatagtaggtcaatattggactgaactgattaaacaaattcttttgtgttc 5336766  T
Q  847 tc 848  Q
    ||    
T  5336765 tc 5336764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 426 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 31983937 - 31983817
Alignment:
Q  426 gattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatc- 524  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |  ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||     
T  31983937 gattttgccagcagaaaataaaacataaacatatttttgggcttagatttgttccagttttttgaaggatacttttattataattatagacattgtatca 31983838  T
Q  525 ggtgtaaaccttgagatagag 545  Q
    | ||||||| |||||| ||||    
T  31983837 gatgtaaactttgagagagag 31983817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 720 - 839
Target Start/End: Original strand, 49088791 - 49088911
Alignment:
Q  720 ttattcttgtaacacattgatatct-cttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcaccc-atactaggtcaatttggatc 817  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||| ||| ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||  |    
T  49088791 ttattcttgtaactcattgacatcttcttttgtaatgttagtcatcat-atagtgaaacagagaactactctctccccccagactaggtcaatttgggcc 49088889  T
Q  818 gaactgggtcaacaaattcttt 839  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  49088890 gaactgggtcaacaaattcttt 49088911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 292 - 360
Target Start/End: Original strand, 47564496 - 47564564
Alignment:
Q  292 attgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgatttt 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| ||||||    
T  47564496 attgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattagaattctggaagcagaaaatcggtggccgatttt 47564564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 718 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446636
Alignment:
Q  718 acttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatc 817  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||             | ||||||| |    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc-------------ccatttggacc 24446669  T
Q  818 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446668 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 24446636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 766 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 14789496 - 14789422
Alignment:
Q  766 ttatagtggaacggaggactgctctctcaccc--atactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14789496 ttatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 14789422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 795 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 52942525 - 52942470
Alignment:
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52942525 cccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctc 52942470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 604 - 693
Target Start/End: Original strand, 10114435 - 10114522
Alignment:
Q  604 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 693  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  10114435 ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgataagagattgag 10114522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 716 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 54928764 - 54928699
Alignment:
Q  716 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggag 781  Q
    ||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  54928764 agactgattcttgtaacattttaatatctcttttgtaaagttactcatcactatagtggaacggag 54928699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 716 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 3578786 - 3578668
Alignment:
Q  716 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttgg 814  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||| |||||| || | || |    
T  3578786 agactaattcttgtaacattttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaatggagagctg-tctctcccccagactaggccagtattag 3578689  T
Q  815 atcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    | |||||||||| ||||||||    
T  3578688 accgaactgggtaaacaaatt 3578668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 736 - 835
Target Start/End: Original strand, 26557823 - 26557922
Alignment:
Q  736 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaat 834  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||| |||| | ||||| |||||| ||| |||||||    
T  26557823 ttgatatctcttt-gtaaagttactcatcgttatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaagtcagtattggaccgaactaggtaaacaaat 26557921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822420
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  55822265 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 55822359  T
Q  748 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  55822360 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctc-cccatactaggtca 55822420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 800 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 3937306 - 3937256
Alignment:
Q  800 actaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3937306 actagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcatttgtgttctctc 3937256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 746 - 835
Target Start/End: Original strand, 22295412 - 22295502
Alignment:
Q  746 ttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||| |||||| || | |||||  ||||||||| ||||||||    
T  22295412 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagaattgctctctcccccacactagggcagtattggactgaactgggtaaacaaatt 22295502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 652 - 808
Target Start/End: Original strand, 31300427 - 31300580
Alignment:
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||| |    
T  31300427 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 31300521  T
Q  751 taaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    ||| |  ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  31300522 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagggctgctctctc-cccagactaggtca 31300580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 3937739 - 3937678
Alignment:
Q  321 aaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttg 382  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  3937739 aaattggaattctgaaagcagaaaatcggtggccgattttcagggctcggtggccgattttg 3937678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050282
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |    
T  7050439 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 7050345  T
Q  748 ttgtaaggttactc--atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||||| |  ||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  7050344 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 7050282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 652 - 838
Target Start/End: Original strand, 8529270 - 8529455
Alignment:
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   || |||| ||||||| ||| ||   |||||||||| |    
T  8529270 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctcttt-g 8529364  T
Q  751 taaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    ||| |  ||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  8529365 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 8529455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 424 - 545
Target Start/End: Original strand, 25357562 - 25357683
Alignment:
Q  424 ccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtat 523  Q
    |||| |||| ||||| |||||| |||| || |||||||| ||||  |||||||||| | |||||    |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  25357562 ccgaatttggcagcagaaaatataacagaatcgtatttttgggctcagatttgttccaattttacgagggatacttttactataaatatagaccttgtat 25357661  T
Q  524 cggtgtaaaccttgagatagag 545  Q
    |   ||||||||||||| ||||    
T  25357662 caaagtaaaccttgagagagag 25357683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Original strand, 2891134 - 2891170
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaat 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891134 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaat 2891170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 798
Target Start/End: Original strand, 4570094 - 4570241
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |    
T  4570094 aaacactattaggatcgagtctcttggtcacgggaagaggttgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 4570188  T
Q  748 ttgtaaggttactc--atcattatagtggaacggaggactgctctctcaccca 798  Q
    |||||| |  ||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  4570189 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccccca 4570241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853705
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  11853549 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 11853643  T
Q  748 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  11853644 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 11853705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 634 - 762
Target Start/End: Original strand, 54906722 - 54906852
Alignment:
Q  634 ttgattcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgta 730  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| | ||||||| ||||   | ||||| |||||||||    
T  54906722 ttgattcaccatggagaaacactattagaattgagtctcttggtcactggaagagattcaagactttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 54906821  T
Q  731 acacattgatatctcttttgtaaggttactca 762  Q
    || | |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  54906822 actctttgatatctc-tttgtaaagttactca 54906852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 812 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 3824630 - 3824593
Alignment:
Q  812 tggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824630 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 3824593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 762 - 838
Target Start/End: Original strand, 4884985 - 4885062
Alignment:
Q  762 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  4884985 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 4885062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 706
Target Start/End: Original strand, 16638827 - 16638883
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaa 706  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  16638827 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagact-tgggtagaa 16638883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 652 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 16689119 - 16688934
Alignment:
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||||||  || |||| ||||||||| ||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||| |    
T  16689119 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 16689025  T
Q  751 taaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    ||| |  ||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  16689024 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccacaaactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 16688934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Original strand, 36769479 - 36769636
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| || ||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||    
T  36769479 aaacactattaggatcgagtttcttggtcacgggaagaggctgagact-tgggtaaaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 36769574  T
Q  748 ttgtaaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    | |||| |  ||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  36769575 t-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 36769636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 603 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 38208911 - 38208825
Alignment:
Q  603 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  38208911 tctcttggcaacaaacactaggg-ttga-gattgattcatcttggagaaacactattaagattgagtcttttggtcacaagaagagatt 38208825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 16186177 - 16186099
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct--aaacaagggttcagaaa 568  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||| ||||  ||||  ||||||||||| |||||    
T  16186177 ggatacttttactataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagagagagggggctaaaaacaagggtttagaaa 16186099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 652 - 711
Target Start/End: Original strand, 16489352 - 16489410
Alignment:
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg 711  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||    
T  16489352 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggact-tgggtagaattagg 16489410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 52043770 - 52043715
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatc-ggtgtaaaccttgagatagaga 546  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  52043770 ggatgcttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagaga 52043715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 762 - 808
Target Start/End: Original strand, 15831252 - 15831298
Alignment:
Q  762 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  15831252 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 15831298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 294 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 18538029 - 18537987
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaa 336  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18538029 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattgaagttctgaa 18537987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 36771396 - 36771434
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  36771396 aaacactattatgattgagtctcttggtcatgggaagag 36771434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 683 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 38270158 - 38270120
Alignment:
Q  683 aagagattgagactctgggtagaaataggcgggagactt 721  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  38270158 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactt 38270120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 4874661 - 4874620
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  4874661 aaacactattaagatagagtctcttggtcacgggaagagatt 4874620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 763 - 832
Target Start/End: Complemental strand, 10047452 - 10047383
Alignment:
Q  763 tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 832  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  10047452 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10047383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 18535339 - 18535298
Alignment:
Q  292 attgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattct 333  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18535339 attgttgtgaaagtgactcaatattgaagaaattggagttct 18535298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 762 - 838
Target Start/End: Original strand, 18587077 - 18587154
Alignment:
Q  762 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  18587077 atcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 18587154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 497 - 542
Target Start/End: Original strand, 36380372 - 36380417
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagata 542  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  36380372 cttttactataaatatggactttgtatcagagtaaaccttgagata 36380417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 763 - 832
Target Start/End: Complemental strand, 39246067 - 39245998
Alignment:
Q  763 tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 832  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  39246067 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 39245998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 371; Significance: 0; HSPs: 111)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 289 - 850
Target Start/End: Original strand, 24748341 - 24748902
Alignment:
Q  289 ataattgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttgacatgt 388  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  24748341 ataaatgttgtgaaagtgactcaaaattgaaaaaattagaattctggaagctgaaaatcggtggctgattttcagggcacggtgaccgattttgacctgt 24748440  T
Q  389 tttatttgagctttaggttcggcaaaaatcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttat 488  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24748441 tttatttgagcttcaggttcggcaaagatcggtggccaattttgacagcagaaaataaaacagaaacgtattttcggccctagatttgttccagttttat 24748540  T
Q  489 tgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactaggg 587  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||  |||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  24748541 tgag-attcttttattataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgacttagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactaggg 24748639  T
Q  588 cttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
     || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24748640 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagag 24748739  T
Q  688 attgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgc 787  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24748740 attgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgc 24748839  T
Q  788 tctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||||  ||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24748840 tctctcctccagattaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctc 24748902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 294 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 39146524 - 39145968
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttgacatgttttat 393  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||  |||||  |||||||| ||  ||||| ||||||||||| |||| | |    
T  39146524 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggaattttggaagcagaaaaccggtggtcgattttcagggttcggtggccgattttgac-tgttgttt 39146426  T
Q  394 ttgagctttaggttcggcaaaaatcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgagg 493  Q
    ||   || | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||    
T  39146425 tttgtctgttggtttggcaaaaaacggtggccgattttgacagcagaaaataaaacagaaacgtattttcagacctagatttgttccaattttattgagg 39146326  T
Q  494 attcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttat 592  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| || |    
T  39146325 attcttttactataaatatagacactgtatcagtgtaaaccttgagatggagggggctgaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgt 39146226  T
Q  593 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 692  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39146225 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgg 39146126  T
Q  693 gactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 792  Q
     ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |    
T  39146125 aactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgctcttt 39146026  T
Q  793 cacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
      || | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39146025 tccctaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 39145968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 418 - 850
Target Start/End: Original strand, 44724454 - 44724886
Alignment:
Q  418 cggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagaca 517  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724454 cggtggctgattttgatagcagaaaataaaacagaaacgtattttcggacctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagaca 44724553  T
Q  518 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 616  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||    
T  44724554 ttgtatcagtgtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 44724653  T
Q  617 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||||| |||||||||    
T  44724654 acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga 44724753  T
Q  717 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 816  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||     
T  44724754 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggac 44724852  T
Q  817 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724853 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 44724886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 296 - 850
Target Start/End: Original strand, 21679759 - 21680337
Alignment:
Q  296 ttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttgacatgttttattt 395  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||  | |||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21679759 ttgtgaaagtgcctcaaaaattaagaaattggaattctggaagctgaacatcggtggccgatttgtagggcatggtggccgattttgacctgttttattt 21679858  T
Q  396 gagctttaggttcggcaaaaatcggtggccgattttga---------------------cagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatt 474  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||                     ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21679859 gagcttcaggttcggaaaaaattggtggccgattttgagcattcagtggccgattttgacagcagaaaataaaatagaaacgtattttcgggcctagatt 21679958  T
Q  475 tgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaa 573  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21679959 tgttccagtttaattgaggattcttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaa 21680058  T
Q  574 caacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctctt 673  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21680059 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctt 21680158  T
Q  674 ggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtg 773  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21680159 ggttaccggaagagattgggactttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtg 21680257  T
Q  774 gaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaa---ctgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
     ||| |||  |||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21680258 aaacagagagctgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgctgggtcaacaaatacttttttgttctctc 21680337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 294 - 850
Target Start/End: Original strand, 21677796 - 21678371
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttgacatgttttat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||| | |||||| || ||||||||    
T  21677796 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaatcctggaagctgaaaatcggtggccgattttcagggcacagtggctgattttaacctgttttat 21677895  T
Q  394 ttgagctttaggttcggcaaaaatcggtggccgattt---------------------tgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctaga 472  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||                     |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  21677896 ttgagcttcaggttcggcaaaaatcggtggccaatttggagcattcagtgactgaatttgacagcagaaaataaaacaaaaaaatattttcgggcttaga 21677995  T
Q  473 tttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggc 571  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||    
T  21677996 tttgtttcagttttattgaggattcttttactataaatatagatattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 21678095  T
Q  572 aacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctc 671  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  21678096 aacatcaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 21678195  T
Q  672 ttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatag 771  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21678196 ttggttacgagaagatattgggactttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatca-tatag 21678294  T
Q  772 tggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || ||| | || |||||||||| || | ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  21678295 tgaaacagtgggctgctctctcccctagactaggttaatttggaccgaactgggacaacaaattc--ttgtgttctctc 21678371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 492 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 20137449 - 20137091
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  20137449 ggattcttttactataaatattggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagttt 20137350  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20137349 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgattacgggaagagatt 20137250  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20137249 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct 20137150  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137149 ctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 20137091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 492 - 850
Target Start/End: Original strand, 11355207 - 11355565
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  11355207 ggattcttttactataaatataggctttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 11355306  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11355307 gtatagagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatt 11355406  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  11355407 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaacgtttctcatca-tatagtggaacagagagctgctct 11355505  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| || | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11355506 ctcccctagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttctctc 11355565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 417 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 27833049 - 27832631
Alignment:
Q  417 tcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagac 516  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  27833049 tcggtggccaattttgacagcagaaaataaaacagaaatgtattttcgggcctagatttgttccagttttattgatgattcttttactataaatataggt 27832950  T
Q  517 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaag-gct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaac 614  Q
      |||||| | | |||||||| |||||||  | ||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  27832949 tgtgtatcagagcaaaccttgtgatagagtggagctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtatagagtttgtctcttggcaac 27832850  T
Q  615 aaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgg 714  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  27832849 atacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtaaaattaggcgg 27832750  T
Q  715 gagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgg 814  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| |||| |||||||||||||      
T  27832749 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctcccccagactaggtcaattt-- 27832652  T
Q  815 atcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
       ||||||||| |||||||||||    
T  27832651 ---gaactgggtaaacaaattctt 27832631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 446 - 850
Target Start/End: Original strand, 25276044 - 25276437
Alignment:
Q  446 aaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagag 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| | | |||| |||||||||||    
T  25276044 aaacataaacgtattttcgggcctagatttgttccagttttattgaggattcttttactataaatatatgctttgtatcagagcaaactttgagatagag 25276143  T
Q  546 aaggctaaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccc 644  Q
      ||||||| |||   || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  25276144 ggggctaaaacaataatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatct 25276243  T
Q  645 tgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatct 744  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25276244 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatct 25276343  T
Q  745 cttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 844  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||     |||| |||| |||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  25276344 cttttgtaaagttactcatcattatagtggaacg-------gctc-----cccagactaagtcaatatggaccgaactggttaaacaaattcttttgtgt 25276431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 492 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 4296276 - 4295916
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacatt-gtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggct 589  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |    
T  4296276 ggatgcttttactataaatatagacatttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 4296177  T
Q  590 tatatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaga 688  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4296176 tgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 4296077  T
Q  689 ttgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgct 788  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||    
T  4296076 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgct 4295978  T
Q  789 ctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4295977 atctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtgaacaaattcttttgtgttctctc 4295916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 13099811 - 13099456
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||||||||||||||  || | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  13099811 cttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 13099712  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  13099711 gagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 13099612  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||     
T  13099611 tttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcc 13099512  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099511 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 13099456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 31435382 - 31435028
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  31435382 cttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 31435283  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||  ||    
T  31435282 gagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaac 31435183  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  31435182 tttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 31435083  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435082 ccaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 31435028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 38393936 - 38394290
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||    |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  38393936 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 38394035  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  38394036 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 38394135  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  38394136 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 38394234  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394235 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38394290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 498 - 848
Target Start/End: Complemental strand, 37412462 - 37412109
Alignment:
Q  498 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatag 596  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  37412462 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 37412363  T
Q  597 agtttgtctcttg-gcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  37412362 agtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggac 37412263  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||     
T  37412262 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcc 37412163  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc 848  Q
    || | ||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  37412162 cctagactgggtcaatttggaccgaactggatcaataaattcttttgtgttctc 37412109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 42331334 - 42330979
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||| || || ||||    
T  42331334 cttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgtata 42331235  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggtt--acgggaagagattgag 693  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  42331234 gagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagattgag 42331135  T
Q  694 actctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 793  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||| ||  ||||||    
T  42331134 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatta-tatagtgaaacggagggctattctctc 42331036  T
Q  794 acccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
     |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331035 ccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 42330979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 35583 - 35933
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||    
T  35583 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgta 35682  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  35683 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 35782  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| |    
T  35783 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagagctgctttctccc 35881  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    | | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  35882 ctagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatttttttgtgttct 35933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 443549 - 443903
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||   |||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  443549 cttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggagctaaaacaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 443648  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  443649 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagagattgggac 443748  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct-ca 794  Q
    | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |     
T  443749 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttataacgttactcatca-tatagtgaaacgaagggctgctctctccc 443847  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443848 ccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 443903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 27306564 - 27306214
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  27306564 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-tata 27306466  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  27306465 gagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 27306366  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |    
T  27306365 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccc 27306267  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    | | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27306266 ctagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattc--ttgtgttctctc 27306214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 48457603 - 48457957
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||    |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  48457603 ctttcactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 48457702  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  48457703 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 48457802  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  48457803 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctc 48457901  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457902 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 48457957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 492 - 850
Target Start/End: Original strand, 9680763 - 9681127
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcgg-tgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactag 585  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    |||||  || | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||     
T  9680763 ggatgcttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggttgaaacaagggtttagaagggcaacaacaaaactat 9680862  T
Q  586 ggcttatatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaa 684  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9680863 ggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 9680962  T
Q  685 gagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggac 784  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| |    
T  9680963 gagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaatggagggc 9681061  T
Q  785 tgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9681062 tgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttctctc 9681127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 417 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 22829048 - 22828672
Alignment:
Q  417 tcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagac 516  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||| |    
T  22829048 tcggtggccgattttaacagcaggaaataaaacagaaacgtattttcgggcctagatttgttccagttttatgagggatacttttactataaatataggc 22828949  T
Q  517 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 615  Q
     ||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||  ||||    
T  22828948 tttgtatccgagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttatctcttgaaaaca 22828849  T
Q  616 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 715  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||   | | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22828848 aacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggg 22828749  T
Q  716 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 792  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  22828748 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcattattatagtgaaacagagggctgctctct 22828672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 44518 - 44868
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||    
T  44518 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgta 44617  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  44618 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtcttttggttacgggaagaggttgggac 44717  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||| |    
T  44718 tttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatagctgctttctccc 44816  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44817 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 44868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 498 - 850
Target Start/End: Original strand, 21990106 - 21990457
Alignment:
Q  498 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatag 596  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||| |  || |||||    
T  21990106 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagg-ggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatag 21990204  T
Q  597 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 696  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21990205 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggct 21990304  T
Q  697 ctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacc 796  Q
     || |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  21990305 ttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctctcccc 21990403  T
Q  797 catactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
     | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21990404 aagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 21990457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 499 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 7470359 - 7470007
Alignment:
Q  499 tttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttata 593  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||    |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  7470359 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 7470260  T
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 693  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  7470259 tagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 7470160  T
Q  694 actctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 793  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||    
T  7470159 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctccctc 7470061  T
Q  794 acccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
     |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470060 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7470007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 515 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 21592460 - 21592125
Alignment:
Q  515 acattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaa 613  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| | ||    
T  21592460 acattgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaa 21592361  T
Q  614 caaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcg 713  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |    
T  21592360 caaacactagggtttgagggttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtg 21592261  T
Q  714 ggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttg 813  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21592260 ggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttg 21592162  T
Q  814 gatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21592161 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 21592125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 40837077 - 40836728
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||  | ||||| |||  |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  40837077 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaatttggagattgagggggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 40836978  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  40836977 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 40836878  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  40836877 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 40836780  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836779 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 40836728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 552 - 850
Target Start/End: Original strand, 20626048 - 20626345
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  20626048 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 20626147  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20626148 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 20626247  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626248 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 20626345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 552 - 850
Target Start/End: Original strand, 20629939 - 20630236
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  20629939 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 20630038  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20630039 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 20630138  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630139 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 20630236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 552 - 850
Target Start/End: Original strand, 20642358 - 20642655
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  20642358 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 20642457  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20642458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 20642557  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642558 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 20642655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 495 - 850
Target Start/End: Original strand, 42223108 - 42223465
Alignment:
Q  495 ttcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagataga-gaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttat 592  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||| |  || | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |    
T  42223108 ttcttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagatgtgggatgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 42223207  T
Q  593 atagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42223208 atagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 42223307  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
       || ||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||    
T  42223308 gagctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaatggatggctgctctc 42223406  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42223407 tcccccatactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctc 42223465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 497 - 845
Target Start/End: Complemental strand, 1049630 - 1049283
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  | | |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  1049630 cttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 1049531  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  1049530 gagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 1049431  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |    
T  1049430 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 1049333  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049332 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 1049283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 20299408 - 20299764
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaaggg-ttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||    |||||  |||| ||||||||| || |||| | ||||||||||||||||| ||    
T  20299408 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggttt 20299507  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt-gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  20299508 gtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 20299607  T
Q  690 tgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctc 789  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||    
T  20299608 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggttgctc 20299706  T
Q  790 tctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299707 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 20299764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Original strand, 1849991 - 1850285
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  1849991 aaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaa 1850090  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  || |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1850091 cactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 1850190  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850191 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1850285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Original strand, 18345551 - 18345845
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  18345551 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 18345650  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18345651 cactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 18345750  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || | ||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18345751 aacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttct 18345845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Original strand, 20297372 - 20297666
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20297372 aaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 20297471  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20297472 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 20297571  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20297572 aacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 20297666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 499 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 7472317 - 7471965
Alignment:
Q  499 tttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttata 593  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||    |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||    
T  7472317 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 7472218  T
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 693  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||      
T  7472217 tagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgga 7472118  T
Q  694 actctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 793  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  7472117 actttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctctc 7472019  T
Q  794 acccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
     |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472018 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7471965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Original strand, 3878587 - 3878881
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||| |||    
T  3878587 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaa 3878686  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3878687 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 3878786  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878787 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactatgttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3878881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 497 - 846
Target Start/End: Original strand, 3035671 - 3036027
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||    |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  3035671 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttt 3035770  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaaga---ga 688  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |     
T  3035771 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagagg 3035870  T
Q  689 ttgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgct 788  Q
     || |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || | |||||||||| ||||||||  ||||| |||||    
T  3035871 ctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgcaacgatactcatcat-atagtggattggagggctgct 3035969  T
Q  789 ctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035970 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 3036027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 503 - 850
Target Start/End: Original strand, 24258423 - 24258775
Alignment:
Q  503 ctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagttt 601  Q
    ||||||||||||   ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  24258423 ctataaatataggttttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagttt 24258522  T
Q  602 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctggg 701  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||     
T  24258523 gtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttgga 24258622  T
Q  702 tagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatc---attatagtggaacggaggactgctctctcaccca 798  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||   ||    
T  24258623 tagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctctctctttca 24258722  T
Q  799 tactaggtcaatttggatcgaactgggtcaac-aaattcttttgtgttctctc 850  Q
     |||||||||||||||| |||| | | | ||| ||||||||||||||||||||    
T  24258723 gactaggtcaatttggaccgaattagatgaacaaaattcttttgtgttctctc 24258775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Original strand, 40946338 - 40946632
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||| |||    
T  40946338 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttactttggaaaa 40946437  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  40946438 cactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttctcttttgt 40946537  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40946538 aacgttactcatca-tatagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 40946632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 498 - 850
Target Start/End: Original strand, 9679009 - 9679366
Alignment:
Q  498 ttttactataaatatagacattgtatcgg-tgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| ||||||    |||||  |||| |||||||| |  |||| | ||||||||||||||||| ||     
T  9679009 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 9679108  T
Q  592 tatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9679109 tatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 9679207  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  9679208 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagtactgctct 9679306  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||  |||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9679307 ctttcccagactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaaattcttttgtgttatctc 9679366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 552 - 845
Target Start/End: Complemental strand, 1047203 - 1046912
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1047203 aaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 1047104  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  1047103 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 1047005  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    || | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047004 aacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 1046912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 419 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 20091954 - 20091581
Alignment:
Q  419 ggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacat 518  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||   |||| |||||||||||||||||||| |    
T  20091954 ggtggccgattttgacagcaggaaataaaacagaaacgtattttcaggcctagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactt 20091855  T
Q  519 tgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct--aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 616  Q
    | |||| | ||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||  | | ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||    
T  20091854 tttatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttcgga-ggcaaca-caaaactagggtttgtatagagtttg-ctattggcaacaa 20091758  T
Q  617 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 716  Q
    | | ||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20091757 agattagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga 20091660  T
Q  717 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcaccca 798  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20091659 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc---atagtggaacggagggctgctctctccccca 20091581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 497 - 845
Target Start/End: Original strand, 25542485 - 25542830
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  25542485 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagg-ggctgaaacaaaggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 25542583  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  25542584 gagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaagactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggac 25542682  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |    
T  25542683 tttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagagctgctctctccc 25542780  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    | | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25542781 ctagactaggttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 25542830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 31156246 - 31155896
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||   | |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  31156246 cttttactataaatatagagcttgtatcaaggcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 31156147  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  31156146 gagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgggtacgggaagagattggga 31156047  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||     
T  31156046 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatc-ctatagtggattggagggctgctctctcc 31155949  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31155948 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 31155896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Original strand, 28487563 - 28487857
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | ||||||||||||| | |||||    
T  28487563 aaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcacctttggaaa 28487662  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  28487663 cactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 28487762  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || ||||||||||| ||||||| | | ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28487763 aacgttactcatca-tatagtgaatcagagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 28487857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 413 - 792
Target Start/End: Original strand, 7188413 - 7188789
Alignment:
Q  413 aaaatcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatat 512  Q
    |||||||| | |||| |||| ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||||||   |||| ||||||||||||||||    
T  7188413 aaaatcggggcccgaatttgtcaggagaaaatataacataaacgtatttttgggctgagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatat 7188512  T
Q  513 agacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggc 611  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  7188513 agactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaataaaaatagggtttgtatagggtttg-ctcttggc 7188610  T
Q  612 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg 711  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| || |    
T  7188611 aacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagattgagactttgggtagaattaag 7188708  T
Q  712 cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 792  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  7188709 cgggagacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacggaaggctgctctct 7188789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 7351931 - 7351637
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7351931 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 7351832  T
Q  652 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  7351831 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 7351733  T
Q  751 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7351732 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 7351637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 43253795 - 43253502
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    |||||||| || |||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  43253795 aaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaa 43253697  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43253696 cactattaggattgagtctcttgattacggaaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgt 43253597  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| | || ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43253596 aacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccctcagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 43253502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 611 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 7092432 - 7092198
Alignment:
Q  611 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatag 710  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||    
T  7092432 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattag 7092333  T
Q  711 gcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat 810  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  7092332 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctc-cccagactaggtcaat 7092235  T
Q  811 ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7092234 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7092198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 497 - 845
Target Start/End: Original strand, 28485516 - 28485867
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagataga--gaaggct---aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||| |||  |||||     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  28485516 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 28485615  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28485616 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattg 28485715  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
     | || || ||| || ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| || | | ||||  |||||||    
T  28485716 gggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tataatgaatcagagggttgctctc 28485814  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    || | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485815 tc-ctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 28485867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 499 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 24817682 - 24817377
Alignment:
Q  499 tttactataaatatagacattgtatcgg-tgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatag 596  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | |||||| | |||||||| || |||||    
T  24817682 tttaatataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagg-ggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagagaactagggtttgtatag 24817585  T
Q  597 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 696  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24817584 agtttg-ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagact 24817489  T
Q  697 ctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacc 796  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||    
T  24817488 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccc 24817389  T
Q  797 catactaggtca 808  Q
    ||||||||||||    
T  24817388 catactaggtca 24817377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 7349614 - 7349262
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaa------ggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggct 589  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||| |||||       |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  7349614 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 7349515  T
Q  590 tatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagaga 688  Q
    | ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7349514 tgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 7349415  T
Q  689 ttgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgct 788  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||    
T  7349414 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgct 7349317  T
Q  789 ctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||| |||| |||||||||  ||||| ||||    |||||||||||  ||||||||||    
T  7349316 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaa----gtcaacaaatttctttgtgttct 7349262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 611 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 7094679 - 7094445
Alignment:
Q  611 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatag 710  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||||| |||    
T  7094679 caacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattag 7094581  T
Q  711 gcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat 810  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  7094580 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat 7094482  T
Q  811 ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7094481 ttggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 7094445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 497 - 775
Target Start/End: Original strand, 11757178 - 11757462
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaaggg-ttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||    |||||  |||| ||||||||| || |||| | ||||||||||||||||| ||    
T  11757178 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggttt 11757277  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt-gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  11757278 gtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 11757377  T
Q  690 tgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgga 775  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11757378 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 11757462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 571 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813480
Alignment:
Q  571 caacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtct 670  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtct 24813660  T
Q  671 cttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 770  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24813659 cttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattata 24813560  T
Q  771 gtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||| |||| | ||||| |||| |||| |||||||||  |||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  24813559 gtggagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctc 24813480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 497 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 22251877 - 22251602
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  22251877 cttttactataaatataaaccttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 22251778  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||        || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22251777 gagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggc 22251686  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgata----tctcttttgtaaggttactcatcattatagtgga 775  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22251685 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 22251602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 497 - 732
Target Start/End: Original strand, 26804527 - 26804762
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    | |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  26804527 cttttactataaatatagaccttgt----gagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 26804622  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactag---ggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 692  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  26804623 gagtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctga 26804722  T
Q  693 gactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaac 732  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26804723 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 26804762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 620 - 847
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396938
Alignment:
Q  620 ctagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagac 719  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 38396812  T
Q  720 ttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcga 819  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| | || |||||||||||||||| |||    
T  38396813 ttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaactttactcatca-tatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaatttggaccga 38396910  T
Q  820 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396911 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 38396938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 498 - 835
Target Start/End: Original strand, 24465503 - 24465829
Alignment:
Q  498 ttttactataaatatagacattgtatcgg-tgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||          ||||||||| || ||||    
T  24465503 ttttactatagatatagactttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtata 24465594  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||  |   |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  24465595 gcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgaa---ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggac 24465690  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| || |||||  |||||||||||| |    
T  24465691 tttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgatatgtcttttgtaaag-tactcatcattataatgaaacgggtgactgctctctccc 24465789  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    ||| ||||| ||||| || | ||||||| || ||||||||    
T  24465790 ccagactagatcaatatgaaccgaactgagtaaacaaatt 24465829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 648 - 835
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935560
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 2935472  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  2935473 tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 2935560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108370
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22108271  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    || |||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22108272 tt-gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 22108369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550130
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40550031  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    || |||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40550032 tt-gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 40550129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137381
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22137282  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    || |||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22137283 tt-gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 22137380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 698 - 850
Target Start/End: Original strand, 22393878 - 22394030
Alignment:
Q  698 tgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcaccc 797  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||| ||     
T  22393878 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctcccct 22393977  T
Q  798 atactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22393978 agactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctc 22394030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552408
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40552309  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    || |||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40552310 tt-gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 40552407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 648 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027191
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||     
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 9027279  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  9027278 tttgtaacgttactcatca-aatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 9027191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 497 - 659
Target Start/End: Original strand, 18567567 - 18567730
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  18567567 cttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 18567666  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactatta 659  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18567667 gagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 18567730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 604 - 835
Target Start/End: Original strand, 6332283 - 6332514
Alignment:
Q  604 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggta 703  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | ||||    
T  6332283 ctcttggcaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggta 6332380  T
Q  704 gaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatact 802  Q
    ||| |||||  || |||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || | |||    
T  6332381 gaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttctctcccctagact 6332480  T
Q  803 aggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| ||||||||    
T  6332481 aggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 6332514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 648 - 835
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606671
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||     
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 1606583  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  1606584 tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 1606671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 675 - 838
Target Start/End: Original strand, 26295580 - 26295743
Alignment:
Q  675 gttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgg 774  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  26295580 gttacaggaagcgattgtgactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtga 26295679  T
Q  775 aacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    ||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||    
T  26295680 aacagatgactgctctctcctccagactaggtcaatttggactgaactggataaacaaattctt 26295743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 552 - 850
Target Start/End: Original strand, 11081522 - 11081817
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || || ||| ||   |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||    
T  11081522 aaacaagggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcactttgggaaa 11081615  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacac--attgatatctcttt 748  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||  || | || ||| || ||||   | ||||| ||||||||||| |   ||||||||||||     
T  11081616 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctcttg 11081715  T
Q  749 tgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||| |||||||||| ||| | ||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  11081716 tgtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttct 11081814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 672 - 780
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6349020
Alignment:
Q  672 ttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatag 771  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattacag 6349011  T
Q  772 tggaacgga 780  Q
    |||||||||    
T  6349012 tggaacgga 6349020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 634 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297018
Alignment:
Q  634 ttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatag-gcgggagacttattcttgtaac 732  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||    | ||| | |||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaac 16297123  T
Q  733 ac-attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaac 830  Q
     |  || |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| || | |||| |||| | ||||| ||||||| || |||    
T  16297122 ccttttaatatctcttttgcaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcccctagactatgtcagtattggaccgaactgtgtaaac 16297023  T
Q  831 aaatt 835  Q
    |||||    
T  16297022 aaatt 16297018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 497 - 689
Target Start/End: Original strand, 22392427 - 22392608
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| | |||          ||||||||| || ||||    
T  22392427 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaatc--------aaactagggtttgtata 22392518  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    || |||| || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22392519 gaatttg-ctattggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagat 22392608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 552 - 781
Target Start/End: Original strand, 6048885 - 6049111
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgg-gaa 650  Q
    ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| || || ||| ||   ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||  |||    
T  6048885 aaacaagggtttagaa-gccaacatcaaaactagggtttgtaaagaatt---ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggattgattcaccttgaagaa 6048978  T
Q  651 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctttt 749  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||||| ||||   | |||| ||||||| |||| | |||||||| | |||    
T  6048979 acactattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaagacgtattcttataaccctttgatatc-ccttt 6049077  T
Q  750 gtaaggttactcatcat--tatagtggaacggag 781  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6049078 gtaaagttactcatcattatatagtggaacggag 6049111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 794 - 850
Target Start/End: Original strand, 26804761 - 26804817
Alignment:
Q  794 acccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804761 acccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 26804817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 785 - 847
Target Start/End: Original strand, 11759369 - 11759431
Alignment:
Q  785 tgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11759369 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11759431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 293 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27833194 - 27833125
Alignment:
Q  293 ttgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttca 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||    
T  27833194 ttgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattagaattctggaagcagaaaatcggtggccgattttca 27833125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 293 - 363
Target Start/End: Original strand, 44724329 - 44724399
Alignment:
Q  293 ttgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaa 363  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  44724329 ttgttgtgaacgtgcctcaaaattgaaaaaattgaaattctggaagctgaaaatcggtggccgattttcaa 44724399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 649 - 838
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351539
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |    
T  25351353 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 25351447  T
Q  748 ttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  25351448 ttgtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgttctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25351539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 716 - 808
Target Start/End: Original strand, 6046668 - 6046759
Alignment:
Q  716 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  6046668 agacttattcttgtaaacctttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaatgaagagctgctctctcccccagactaggtca 6046759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 661 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 6067370 - 6067183
Alignment:
Q  661 gattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttac 759  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||   || |||| ||||||||||  |  ||||||||||||   || |  ||    
T  6067370 gatttagtctcttggtcacgggaagagattgagactttga-tagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctctgatatctctttgtaaaaggaac 6067272  T
Q  760 tcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || ||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||| || ||||||| |||||||||| | |||||||    
T  6067271 tcgtcattatagtgaaacggagagctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccggactgggtaaacaaattctctcgtgttct 6067183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 649 - 838
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410318
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||    
T  25410130 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 25410225  T
Q  748 ttgtaaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    | |||| |  ||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  25410226 t-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25410318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 603 - 690
Target Start/End: Original strand, 11084438 - 11084523
Alignment:
Q  603 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11084438 tctcttggcaacaaacaatagggtt-gaga-ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagatt 11084523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 594 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 13290710 - 13290470
Alignment:
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 692  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || |  |  ||||||||| | | ||||||||||||  ||| ||||||||||| || |||||| |||      
T  13290710 tagagttt-tctcttggcaacaaacactaggcttgggag--tgattcaccttcgagaaacactattagaatttagtctcttggtcacaggaagatattag 13290614  T
Q  693 gactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
     ||||||||||||| ||||   || || | |||||||||||   ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||  || | |||    
T  13290613 aactctgggtagaattaggtttgaagaataattcttgtaaccttttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagcggaacagagagctacactc 13290515  T
Q  792 tcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    || | || ||| ||||| | ||||| |||||||||| ||||||||    
T  13290514 tccctcagacttggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 13290470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 637 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281365
Alignment:
Q  637 attcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacaca 735  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||   | ||||||||||||||||| |     
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccct 40281473  T
Q  736 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaat 834  Q
    ||||       ||||||| |||||||||| || | |||||||| |||  ||||||||| |||| ||||| ||| | |||||  |||||| || |||||||    
T  40281472 ttga-------tttgtaaagttactcatcgttgttgtggaacgaagggatgctctctcccccagactagttcagtattggacagaactgtgtaaacaaat 40281380  T
Q  835 tcttttgtgttctctc 850  Q
    | || |||||||||||    
T  40281379 t-ttgtgtgttctctc 40281365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 832
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369824
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| || ||||   | ||||| |||| |||||| ||   ||||||| |    
T  21369642 aaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggact-tgggtaaaattaggtttgaagactgattcatgtaactca---atatctc-t 21369736  T
Q  748 ttgtaaggttactc--atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaa 832  Q
    |||||| |  ||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||||   ||||| |||||||||| |||||    
T  21369737 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccgccatagtaggtcatcattggaccgaactgggtaaacaa 21369824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22829171 - 22829105
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgatttt 360  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||| ||||||    
T  22829171 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggaattctggaagtagaaaatcagtggccgatttt 22829105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Original strand, 2120899 - 2121056
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |    
T  2120899 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 2120993  T
Q  748 ttgtaaggttactc--atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||||| |  ||||  |||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  2120994 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 2121056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 649 - 838
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357233
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |    
T  25357047 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 25357141  T
Q  748 ttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||| || ||   || |||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  25357142 ttgtaaagaaactcatcattatagtggatcgaagagatgatctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25357233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320076
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  3320232 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 3320138  T
Q  748 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  3320137 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 3320076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324824
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  3324980 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 3324886  T
Q  748 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  3324885 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 3324824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405549
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  25405393 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 25405487  T
Q  748 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  25405488 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 25405549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 552 - 603
Target Start/End: Original strand, 38396326 - 38396377
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgt 603  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  38396326 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 610 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 12310236 - 12310157
Alignment:
Q  610 gcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctggg-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||||||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12310236 gcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgaacaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 12310157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 762 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 34546951 - 34546874
Alignment:
Q  762 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  34546951 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 34546874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006820
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||| ||||||| ||   ||||||| |    
T  42006663 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgatttttgtaactca---atatctc-t 42006757  T
Q  748 ttgtaaggttactc--atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||||| |  ||||  ||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  42006758 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgaagagctgctctctctcccagactaggtca 42006820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 458 - 546
Target Start/End: Original strand, 6048713 - 6048800
Alignment:
Q  458 attttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagaga 546  Q
    ||||| |||| ||||||||||| | |||| || ||||| ||||||||||||| ||| || |||||| | |||||||||||||| |||||    
T  6048713 atttttgggcttagatttgttccaatttt-ttaaggatgcttttactataaacataaaccttgtatagatgtaaaccttgagagagaga 6048800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 503 - 627
Target Start/End: Original strand, 6348778 - 6348903
Alignment:
Q  503 ctataaatatagacattgtatcgg-tgtaaaccttgagatagagaaggct--aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagt 599  Q
    ||||||||||| || ||||||| | ||||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||| |||| |  || || |||||||||| || ||| ||||    
T  6348778 ctataaatataaaccttgtatcagatgtaaacattgagatagagaggactgaaaacaagggtttagaa-gtaaaaaagaaaactagggtttgtatcgagt 6348876  T
Q  600 ttgtctcttggcaacaaacactagggtt 627  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6348877 ttg-ctcttggcaacaaacattagggtt 6348903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 795 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 6359989 - 6359946
Alignment:
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  6359989 cccatattaggtcaagttggatcgaactgggtcaacaatttctt 6359946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069936
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  7069780 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 7069874  T
Q  748 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| || ||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  7069875 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtca 7069936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074943
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  7074787 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 7074881  T
Q  748 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||| |||||||||    
T  7074882 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgcactctcccccagactaggtca 7074943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 812 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 22251605 - 22251570
Alignment:
Q  812 tggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251605 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22251570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 603 - 690
Target Start/End: Original strand, 26210603 - 26210688
Alignment:
Q  603 tctcttggcaacaaacactagggtt-tgagggttgattcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  26210603 tctcttggcaacaa-cactagggttgtga---ttgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagagatt 26210688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 8378686 - 8378648
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8378686 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagag 8378648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 15541177 - 15541139
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15541177 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 15541139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 762 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 44010821 - 44010775
Alignment:
Q  762 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  44010821 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 44010775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 762 - 838
Target Start/End: Original strand, 2075226 - 2075303
Alignment:
Q  762 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  2075226 atcattatagtggaacggaaagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 2075303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 762 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 7464590 - 7464513
Alignment:
Q  762 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  7464590 atcattatagtggaacggagagctgctctcttccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 7464513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 326
Target Start/End: Original strand, 11355005 - 11355042
Alignment:
Q  289 ataattgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattg 326  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11355005 ataactgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattg 11355042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 156)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 296 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 1627238 - 1626663
Alignment:
Q  296 ttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttgacatgttttattt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1627238 ttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctggaagctgaaaatcggtggccgattttcaggacacagtggccgattttgacctgttttattt 1627139  T
Q  396 gagctttaggttcggcaaaaatcggtggccgattt---------------------tgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatt 474  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||                     |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1627138 gagcttcaggttcggcaaaaatcggtggccgatttggagcattcggtggcagactttgacagcaaaaaataaaacagaaacgtattttcgagcctagatt 1627039  T
Q  475 tgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaa 573  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1627038 tgttccagttttattgatgattcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaa 1626939  T
Q  574 caacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctctt 673  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1626938 caacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt 1626839  T
Q  674 ggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtg 773  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1626838 ggttacggggagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtg 1626740  T
Q  774 gaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
     |||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1626739 aaacggagggctgctctctcgcccagactaggtcgatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 1626663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 291 - 850
Target Start/End: Original strand, 36011524 - 36012104
Alignment:
Q  291 aattgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttgacatgttt 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  36011524 aattgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaaatctggaaggtgaaaatcggtggccaattttcaaggcacggtggccgattttgacctgttt 36011623  T
Q  391 tatttgagctttaggttcggcaaaaatcggtggccgattt---------------------tgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcct 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||                     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36011624 tatttgagcttcaggttcggcaaaaatcggtggccgatttggagcattaggtggtcgattttgacaacataaaataaaacagaaacgtattttcgggcct 36011723  T
Q  470 agatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaa 568  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| || |||||    
T  36011724 agatttgttccagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaaggatttagaaa 36011823  T
Q  569 ggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagt 668  Q
    | ||||||| |||||| || || |||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |    
T  36011824 gacaacaacgaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggattgaat 36011923  T
Q  669 ctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcatta 768  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  36011924 atcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-ta 36012022  T
Q  769 tagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||||||| |||| |||||||||    || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36012023 tagtggaacagagggctgctctcttcttcagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctc 36012104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 294 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 43424000 - 43423443
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttgacatgttttat 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||  |||||| ||| | ||   ||||||| |||||||||   | | || |    
T  43424000 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctggtagtagaaaaccggtggccgatatccagaccacggtggccgattttggactctgtttt 43423901  T
Q  394 ttgagctttaggttcggcaaaaatcggtggccgatttt-gacagcataaaataaaacataaacgtattttc-gggcctagatttgttctagttttattga 491  Q
    |||    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  43423900 ttgtttgttag-ttcggcaaaaatcggtggccgatttttgacagcaaaaaataaaatagaaacgtattttttgggcctagatttgttccagttttattga 43423802  T
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  43423801 ggactcttttactataaatatagacattgtatcactgtaaaccttgagaaagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 43423702  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423701 gtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 43423602  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    | | || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||    
T  43423601 ggggctttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaactgagagctgctct 43423503  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423502 ctccctgagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 43423443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 418 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 43421826 - 43421395
Alignment:
Q  418 cggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagaca 517  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  43421826 cggtggccgattttgacagcagaaaataaaatagaa-cgtatttttgggcctagatttgttccagttttattgaggacttttttactataaatatagaca 43421728  T
Q  518 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 616  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  43421727 ttgtatcagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttggcaacaa 43421628  T
Q  617 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |  | ||||||||| ||| |||||    
T  43421627 acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattggggatttgggtagaattagacggga 43421528  T
Q  717 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 816  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||     
T  43421527 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggac 43421429  T
Q  817 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43421428 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 43421395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 420 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 28102412 - 28101982
Alignment:
Q  420 gtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacatt 519  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  28102412 gtggccgattttgacagcagaaaataaaacactaacgtattttcgggcctggatttgttccagttttatagaggattcttttactataaatataagcgtt 28102313  T
Q  520 gtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaac 618  Q
    ||||  | |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  28102312 gtattagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaac 28102213  T
Q  619 actagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggaga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||    
T  28102212 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggaga 28102113  T
Q  719 cttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcg 818  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||| || |  ||||||||||||||| |     
T  28102112 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttacttatca-tatagtggaacggatggctgctctctccccaaagctaggtcaatttggacca 28102014  T
Q  819 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28102013 aactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 28101982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 294 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 53469002 - 53468433
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttgacatgttttat 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||          || |||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||    
T  53469002 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattagaattctataagctg----------gccgattttcagggcacggtggccgattttgaccatttttat 53468913  T
Q  394 ttgagctttaggttcggcaaaaa---------------------tcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctaga 472  Q
    |||||||| ||||||||||||||                     ||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  53468912 ttgagcttcaggttcggcaaaaaccggtggccgagttggagcattcggtggccgattttaacaacagaaaataaaacagaaacatattttcgggcctaga 53468813  T
Q  473 tttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggc 571  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||||||| |||| |||    
T  53468812 tttgttccatttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctttagataaagggggctgaaacaagggtttagaatggc 53468713  T
Q  572 aacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctc 671  Q
    ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  53468712 aacaacaaaaccaggt-ttgtatagagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctc 53468614  T
Q  672 ttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatag 771  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53468613 ttggttacggggagagattgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatag 53468514  T
Q  772 tggaacggaggactgctctctcaccc--atactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || |||||||| |||||||  | |||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53468513 tgaaacggagggctgctctaccccccagacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 53468433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 441 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 5927153 - 5926746
Alignment:
Q  441 aaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga 540  Q
    |||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5927153 aaataaaacaaaaacatattttacggcctagatttgttccaagtttattgaagattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga 5927054  T
Q  541 tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatt 639  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5927053 tagagagggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgatt 5926954  T
Q  640 caccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattga 739  Q
    | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  5926953 cgccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattta 5926854  T
Q  740 tatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttt 839  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  5926853 tatatcttttgtaaggttactcatca-tataatgaaacggatgactgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc-tt 5926756  T
Q  840 tgtgttctct 849  Q
    ||||||||||    
T  5926755 tgtgttctct 5926746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 492 - 850
Target Start/End: Original strand, 3314603 - 3314962
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  3314603 ggatgcttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggttt 3314702  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
     ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3314703 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatt 3314802  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    | | || |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  3314803 ggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctct 3314902  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3314903 ctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 3314962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 4308614 - 4308261
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  4308614 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 4308515  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  4308514 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggac 4308415  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |    
T  4308414 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccc 4308316  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308315 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 4308261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 1313334 - 1313686
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  |||| |||||||| || | || ||||||||||||||||||| || ||||    
T  1313334 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaggttt-acaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 1313432  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  1313433 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgggac 1313532  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  1313533 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 1313631  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1313632 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 1313686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 45882863 - 45883217
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   ||||||  ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  45882863 cttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactatgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 45882962  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    || |||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  45882963 gattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggac 45883062  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |    
T  45883063 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccc 45883161  T
Q  796 cc-atactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45883162 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 45883217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 498 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 10956359 - 10956010
Alignment:
Q  498 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatag 596  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |  ||||||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  10956359 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacatgaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 10956260  T
Q  597 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 696  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10956259 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 10956160  T
Q  697 ctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacc 796  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  10956159 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccac 10956061  T
Q  797 catactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956060 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 10956010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 53917997 - 53917644
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||| |||  |||| |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||| || ||||    
T  53917997 cttttactataaatatagaccttgaatcagattaaaccttgagatggagggggctgaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtata 53917898  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  53917897 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggat 53917798  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  53917797 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 53917699  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917698 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 53917644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 492 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 28761766 - 28761407
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  || | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  28761766 ggatacttttactataaatatagactttgcatcagagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggttt 28761667  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  28761666 gtatatagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagatatt 28761568  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28761567 gagactttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggactgctct 28761468  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaa-tttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28761467 ctcccccagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaacaaattcttttgttttctctc 28761407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 24979631 - 24979985
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  24979631 ctttcactataaatatataccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 24979730  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24979731 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgagac 24979830  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt-aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||     
T  24979831 tttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaattaatatcttttttgtaaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctcc 24979929  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24979930 cccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 24979985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 498 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 10958655 - 10958306
Alignment:
Q  498 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatag 596  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |  ||||||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  10958655 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacataaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 10958556  T
Q  597 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 696  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||    
T  10958555 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgacact 10958456  T
Q  697 ctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacc 796  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  10958455 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcttca-tatagtggaacggagggctgctctctcccc 10958357  T
Q  797 catactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10958356 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttct 10958306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 492 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 880790 - 880431
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  880790 ggatgcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggtctgaaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggttt 880691  T
Q  591 atatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
     ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  880690 gtatagagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttggttacggaaagagat 880591  T
Q  690 tgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctc 789  Q
    || | || ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||| ||||||    
T  880590 tggggctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtaaaatggagggctgctc 880492  T
Q  790 tctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||| || | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  880491 tctcccctagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 880431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 3859452 - 3859801
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| | |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  3859452 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 3859551  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  3859552 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 3859651  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| |    
T  3859652 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcgtagggctgctctctccc 3859749  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859750 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3859801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 11170328 - 11170678
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  11170328 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 11170427  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || |||    
T  11170428 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggac 11170527  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |    
T  11170528 tttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccc 11170626  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11170627 ccagactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaattcttttgttttct 11170678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Original strand, 38890020 - 38890314
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38890020 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 38890119  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  38890120 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 38890219  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890220 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38890314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 43228215 - 43228568
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| | |||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  43228215 ctttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgtata 43228314  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  43228315 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 43228414  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  43228415 tttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 43228513  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43228514 ccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctc 43228568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 53915829 - 53915476
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| || | | ||||||||||||||||| || ||||    
T  53915829 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgtata 53915730  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53915729 gattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 53915630  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |    
T  53915629 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatt-tagtgaaacggagggctgctctctccc 53915531  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53915530 ccagactaggtcaattttgactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 53915476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 51727339 - 51726990
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  51727339 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgtata 51727240  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  51727239 gagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctgagac 51727141  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |    
T  51727140 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctccc 51727042  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51727041 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 51726990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 497 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 18099503 - 18099151
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacctt-gagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatat 594  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||| |  |||||||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||    
T  18099503 cttttactataa-tatagaccttgtatcagagtaaacttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 18099405  T
Q  595 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  18099404 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 18099305  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  18099304 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacattactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcc 18099206  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
    || | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099205 cctagactaggtcaatatggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 18099151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 537 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 27101474 - 27101161
Alignment:
Q  537 gagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  27101474 gagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 27101375  T
Q  636 gattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacaca 735  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  27101374 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaatgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 27101275  T
Q  736 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  27101274 ttgatatctcttttgcaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatt 27101176  T
Q  836 cttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||||||||||    
T  27101175 cttttgtgttctctc 27101161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 51943295 - 51943647
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||   ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  51943295 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggtgctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 51943394  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  51943395 gagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggc 51943494  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | | ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| |    
T  51943495 tttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctccc 51943592  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51943593 ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctc 51943647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 424 - 850
Target Start/End: Original strand, 23633311 - 23633730
Alignment:
Q  424 ccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtat 523  Q
    |||| |||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||   |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23633311 ccgaatttgccagcagaaaatataacagaaacgtattttcgagcctagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtat 23633410  T
Q  524 cggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacacta 622  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| | |||||| |||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23633411 cagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaaggatttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtatagtgtttg-ctcttggcaacaaacacta 23633508  T
Q  623 gggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagactta 722  Q
    ||||| |  |||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  23633509 gggttgg--ggttgatttacc--gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagactta 23633604  T
Q  723 ttcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaact 822  Q
    |||||||||| |  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || |||| |    
T  23633605 ttcttgtaacccgatgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttagaccgaaat 23633702  T
Q  823 gggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23633703 gggtaaacaaattcttttgtgttctctc 23633730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 18097234 - 18096880
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacctt-gagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatat 594  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   |||||| |  |||||||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||    
T  18097234 cttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaacttgagagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 18097135  T
Q  595 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  18097134 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 18097035  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||     
T  18097034 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagagctgctctctcc 18096936  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || | |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18096935 cctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacgaattcttttgtgttctctc 18096880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Original strand, 25533422 - 25533716
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  25533422 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 25533521  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25533522 cactattaggattgagtcttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 25533621  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533622 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 25533716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 552 - 850
Target Start/End: Original strand, 30005821 - 30006118
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30005821 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 30005920  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30005921 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgt 30006020  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30006021 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 30006118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 552 - 850
Target Start/End: Original strand, 42990284 - 42990581
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  42990284 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 42990383  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  42990384 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgt 42990483  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || ||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990484 aacgttactcatca-tatggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 42990581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 43226010 - 43226360
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| | |||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  || ||||    
T  43226010 ctttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactacgt-ttgtata 43226108  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  43226109 gagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 43226208  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  43226209 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 43226307  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  43226308 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtgttctctc 43226360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 4104232 - 4103879
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||    |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  4104232 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 4104133  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  4104132 tatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 4104033  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||    
T  4104032 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctatc 4103935  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4103934 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4103879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 32264376 - 32264018
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaa----ccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||    | |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||     
T  32264376 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattaactttgagatagagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttg 32264277  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  32264276 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctg 32264177  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
      ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32264176 gaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 32264077  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32264076 ctcccccagactaggtctatttggaccaaactggatcaac-aattcttttgtgttctctc 32264018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 18162588 - 18162940
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcg-gtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatat 594  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  | |||||| | |||||||||  || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  18162588 cttttactataaatatagaccttgtatcatgagtaaacttggagatagag--ggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 18162685  T
Q  595 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18162686 agagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 18162785  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt-aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 793  Q
    || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18162786 ctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatttattttgtaaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 18162884  T
Q  794 acccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
     |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18162885 ccccagactaggtcaatttgga-cgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttctctc 18162940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 419 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 28100452 - 28100143
Alignment:
Q  419 ggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacat 518  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |    
T  28100452 ggtggccgattttgacagcagaaaataaaacactaacgtattttcgggcctggatttgttccagttttatagaggattcttttactataaatataagcgt 28100353  T
Q  519 tgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaa 617  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  28100352 tgtatcagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaa 28100253  T
Q  618 cactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggag 717  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||    
T  28100252 cactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggag 28100153  T
Q  718 acttattctt 727  Q
    ||||||||||    
T  28100152 acttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 503 - 789
Target Start/End: Original strand, 6561740 - 6562028
Alignment:
Q  503 ctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagttt 601  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6561740 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 6561839  T
Q  602 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctggg 701  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  6561840 gtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 6561939  T
Q  702 tagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctc 789  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6561940 tagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttttgtaaggtaactcatcattatagtggagcggagggctgctc 6562028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 5191577 - 5191925
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | |||| | |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  5191577 cttttactataaatatagaccttgtatctaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 5191676  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  5191677 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 5191776  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| | |||| ||| |||||| |    
T  5191777 tttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcagagggctgttctctc-c 5191873  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191874 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5191925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 559 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 9604877 - 9604587
Alignment:
Q  559 ggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactatt 658  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9604877 ggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 9604778  T
Q  659 atgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggtta 758  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  9604777 aggattgagtctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 9604678  T
Q  759 ctcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9604677 ctcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 9604587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 10084726 - 10084372
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga----tagagaaggcta-aacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||    |||||  ||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||     
T  10084726 cttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagatagagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttg 10084627  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  10084626 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctg 10084527  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
     |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  10084526 ggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 10084428  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10084427 tccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 10084372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 39715394 - 39715742
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  39715394 cttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagg-ggctgaaataagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgtata 39715492  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39715493 gagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 39715592  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| ||| || |  ||  ||||| |    
T  39715593 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc---atagtgaaacagatggttg--ctctccc 39715687  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||||||| ||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39715688 ccatactagatcattttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 39715742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 48362003 - 48361651
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   |||||| |||||||| ||  |||| |||||||| || |||| | ||||||||||||||||| || ||||    
T  48362003 cttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatacagggggctgaaacaaggttt-agaatgacaacaacaaaactagggtttgtata 48361905  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  48361904 gagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggggc 48361805  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | | ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||  |||||||  |||||||||| |    
T  48361804 ttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcat-aatatagtaaaacggagagctgctctctccc 48361706  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48361705 ccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 48361651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 746675 - 747031
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaa------ggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggct 589  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||| |||||       |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  746675 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 746774  T
Q  590 tatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagaga 688  Q
    | ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  746775 tgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 746874  T
Q  689 ttgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgct 788  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  746875 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggaggactgct 746972  T
Q  789 ctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  746973 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 747031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 576 - 847
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321753
Alignment:
Q  576 acaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttgg 675  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 1321582  T
Q  676 ttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgga 775  Q
    |||| |||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1321583 ttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 1321681  T
Q  776 acggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
     |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321682 tcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1321753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 47149233 - 47148875
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcgg-tgtaaaccttgag----atagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||  |||||||    ||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  47149233 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaggccttgagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 47149134  T
Q  591 atatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
     ||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149133 gtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcaccttgg-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 47149035  T
Q  690 tgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctc 789  Q
    || | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  47149034 tgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtatcgttactcatca-tatagtgaaacagaggactgctc 47148936  T
Q  790 tctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  47148935 tctcccccagactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaaattattctgtgttctctc 47148875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 22114638 - 22114288
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| | ||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  22114638 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtata 22114539  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||     
T  22114538 gagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggat 22114439  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| || | ||||||  || |||||| |    
T  22114438 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tataatgaatcggagggatgatctctccc 22114340  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| || | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114339 ccaaacaaagtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22114288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 26720472 - 26720821
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| | |||||||||  |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  26720472 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 26720571  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || |||    
T  26720572 gagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggattgagtttcttggttacgggaagaggctgggac 26720670  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  26720671 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggaacggatgactgctctctccc 26720769  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    | | | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26720770 ctagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaccaaattcttttgtgttct 26720821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 593 - 850
Target Start/End: Original strand, 4666535 - 4666791
Alignment:
Q  593 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 692  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4666535 atagggtttgtctcttgacaacagacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattga 4666634  T
Q  693 gactctgggtagaaataggcgggaga--cttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  4666635 gactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct 4666734  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |   |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4666735 c---cccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctc 4666791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 12268299 - 12267955
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaa-ctagggcttatat 594  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| | |||||| |||||||||||   ||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||| || |||    
T  12268299 cttttactataaatatagaacttgtatcagagtaaactttgagatagagggagctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaaactagggtttgtat 12268200  T
Q  595 agagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 693  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12268199 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 12268100  T
Q  694 actctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 793  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  12268099 gctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-----------ctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctc 12268012  T
Q  794 acccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
     |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12268011 ccccaaactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 12267955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Original strand, 25388886 - 25389179
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  25388886 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattca-ccttggaaa 25388984  T
Q  652 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  25388985 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctc-tttg 25389083  T
Q  751 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25389084 taacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 25389179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 458204 - 458558
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||    |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  458204 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 458303  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  458304 tatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt 458403  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  458404 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctct 458501  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  458502 ctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 458558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 15780784 - 15781156
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | |||||||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  15780784 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 15780883  T
Q  596 gagtt-----------tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaa 684  Q
    |||||           |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15780884 gagtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaa 15780983  T
Q  685 gagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgata----tctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacgga 780  Q
    |||  ||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |    
T  15780984 gaggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatatttctcttttgtaaagttatttatcattatagtggaacgaa 15781083  T
Q  781 g---gactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |   | |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15781084 gggcgcctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctc 15781156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 498 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 51675087 - 51674746
Alignment:
Q  498 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatag 596  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||             
T  51675087 ttttactataaatatagacgttgtatcaatgtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaagg--------- 51674997  T
Q  597 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 696  Q
      |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  51674996 --tttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggatt 51674899  T
Q  697 ctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacc 796  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || || ||||| |||||||||| ||    
T  51674898 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaatgttactcatca-tatactgaaatggagggctgctctctcccc 51674800  T
Q  797 catactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51674799 cataccaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 51674746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 417 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 28137708 - 28137415
Alignment:
Q  417 tcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagac 516  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  28137708 tcggtggccgattttgacagcagaaaataaaacagaaacgtattttcgggcctagatttgttccagttttattgaggattcttttactataaatatatgc 28137609  T
Q  517 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 615  Q
     ||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||           ||||||||||||||||| ||||    
T  28137608 gttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaac-----------tagagtttgtctcttgggaaca 28137520  T
Q  616 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 715  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||     
T  28137519 aacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgga 28137420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 440 - 732
Target Start/End: Original strand, 28180891 - 28181182
Alignment:
Q  440 aaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgag 539  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28180891 aaaataaaatagaaacgtattttcgggcctcgatttgttccagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgag 28180990  T
Q  540 atagagaaggctaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatt 639  Q
    ||||||  |||| ||  ||| || |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  28180991 atagagggggctgaaataggttt-agaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgatt 28181089  T
Q  640 caccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaac 732  Q
    |||  |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  28181090 cactttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacgtattcttataac 28181182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 455827 - 456181
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||    |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  455827 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 455926  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  455927 tatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt 456026  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  456027 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctct 456124  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  456125 ctcccccagactaggtcgggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 456181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 491 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 54691912 - 54691554
Alignment:
Q  491 aggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| ||||||||  ||  |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  54691912 aggattcttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggtaaaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggttt 54691813  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | | ||||||| |||||||||||    
T  54691812 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggttatgggaagagatt 54691713  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
      | || || || ||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||| |||||||    
T  54691712 agggctttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttacccatca-tatagttaaacggagggctgctct 54691614  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| || | |||| ||||||||| |  ||||| |||| |||||||||||| |||| ||||    
T  54691613 ctcccctagactatgtcaatttgaactgaactaggtcgacaaattcttttatgttttctc 54691554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 5522948 - 5522610
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| | |||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||            
T  5522948 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg-------- 5522857  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
       |||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  5522856 ---tttgtctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 5522760  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  5522759 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 5522662  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
     || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522661 gcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5522610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 492 - 824
Target Start/End: Complemental strand, 890109 - 889779
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| ||||||||  || |||||| ||    
T  890109 ggatgcttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggaagctgaaacaagggtttagaatggcaacaa--aacctagggttt 890012  T
Q  591 atatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  890011 gtatagagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-t 889913  T
Q  690 tgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctc 789  Q
    || | || ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |     
T  889912 tggggctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgatt 889814  T
Q  790 tctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgg 824  Q
    |||| | || |||||||||||||||| ||||||||    
T  889813 tctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgg 889779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 6063781 - 6063429
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga--tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttata 593  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | |||| ||||||  |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  6063781 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 6063682  T
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattga 692  Q
    |||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  6063681 tagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 6063582  T
Q  693 gactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 792  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||    
T  6063581 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctct 6063484  T
Q  793 cacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    | |||| |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  6063483 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaaatttctttgtgttct 6063429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 497 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 10191646 - 10191305
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaa----ggcta-aacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||| ||| ||    ||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||     
T  10191646 cttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagataaagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttt 10191547  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||  ||    
T  10191546 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacaggaagaggctg 10191447  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
     |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | || || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  10191446 -gactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 10191349  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    || |  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10191348 tccctaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 10191305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 504 - 850
Target Start/End: Original strand, 32219026 - 32219362
Alignment:
Q  504 tataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttg 602  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||    
T  32219026 tataaatatagaccttgtatctgactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactag-----------agtttg 32219114  T
Q  603 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggt 702  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||     
T  32219115 tctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagattgggactttgggc 32219214  T
Q  703 agaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt-aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatac 801  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| |||| ||    
T  32219215 agaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctctcccagac 32219313  T
Q  802 taggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32219314 tatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 32219362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 6066130 - 6065779
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaagg-ct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatat 594  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | |||| |||||||||||  || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  6066130 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6066031  T
Q  595 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgag 693  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6066030 agattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 6065931  T
Q  694 actctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 793  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||||    
T  6065930 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggatggctgctctctc 6065833  T
Q  794 acccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
     || | |||||||||  |||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6065832 ccctagactaggtcagattggacagaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 6065779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 594 - 850
Target Start/End: Original strand, 6484381 - 6484637
Alignment:
Q  594 tagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 692  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||     
T  6484381 tagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacgggaagagattgg 6484480  T
Q  693 gactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 792  Q
    |  | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  6484481 ggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct 6484579  T
Q  793 cacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6484580 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 6484637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 594 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606571
Alignment:
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 693  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 7606723  T
Q  694 actctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 793  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  7606722 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttct-atttgtaacgttactcgtca-tatagtggatcggagggctgctctctc 7606625  T
Q  794 acccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
     |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606624 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7606571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 10621807 - 10621513
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  10621807 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 10621708  T
Q  652 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  10621707 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 10621609  T
Q  751 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10621608 taacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 10621513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Original strand, 38210350 - 38210644
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38210350 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 38210449  T
Q  652 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  38210450 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttg 38210548  T
Q  751 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  38210549 taacgaaactcatca-tatagtggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 38210644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 492 - 850
Target Start/End: Original strand, 31151266 - 31151622
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcgg-tgtaaaccttgagatagagaaggct--aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggc 588  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||     
T  31151266 ggatgcttttactataaatatagactttgtatcagatgtaaacctcgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaat-caacaagaaaactagggt 31151364  T
Q  589 ttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaga 688  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  31151365 ttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaaga 31151461  T
Q  689 ttgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgct 788  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  31151462 ttgggactttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggagggctgct 31151559  T
Q  789 ctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||| |||| |||||||||  |||||   ||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  31151560 ctctcccccagactaggtcagttttgggctgaactgggtaaacaaattctcatgtgttctctc 31151622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 404 - 780
Target Start/End: Original strand, 54884000 - 54884362
Alignment:
Q  404 ggttcggcaaaaatcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttac 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||            |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  54884000 ggttcggcaaaaatcggtggccgattttgacagcagaaa------------cgtattttcgggcctaaatttgttccaattttattgaggattcttttac 54884087  T
Q  504 tataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggcta-aacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttg 602  Q
     ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||   |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   || ||  |||||||    
T  54884088 cataaatataaacattggatcattgtaaaccttgagatagagggagctcgaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttgta--gagtttg 54884185  T
Q  603 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggt 702  Q
    | |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||  |    
T  54884186 tttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaactttgaat 54884285  T
Q  703 agaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacgga 780  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54884286 agaattaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgga 54884362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 50493923 - 50494273
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||   | ||||   |||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  50493923 ctttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 50494022  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  50494023 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagggattggga 50494122  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||     
T  50494123 ctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 50494220  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  50494221 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 50494273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 497 - 832
Target Start/End: Original strand, 53591119 - 53591442
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||            
T  53591119 cttttactataaatatagacattgtataagtgtaaaccttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactaggg-------- 53591210  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
       ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||     
T  53591211 ---tttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggat 53591307  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||||||| |    
T  53591308 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacgaagggatgctctctc-c 53591405  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 832  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53591406 ccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaacaa 53591442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 564 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 28413297 - 28413014
Alignment:
Q  564 agaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgat 663  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  28413297 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 28413198  T
Q  664 tg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactca 762  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||    
T  28413197 tgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactca 28413099  T
Q  763 tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaa-ttcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  28413098 tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaattaggtcaacaaatttcttttgtgttct 28413014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 497 - 737
Target Start/End: Original strand, 35777345 - 35777587
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   | |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  35777345 cttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 35777444  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35777445 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 35777544  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacatt 737  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35777545 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 620 - 850
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6232077
Alignment:
Q  620 ctagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagac 719  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggagac 6231947  T
Q  720 ttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcga 819  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||  | |||||||||||||| |||    
T  6231948 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagt-gaacggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggaccga 6232046  T
Q  820 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6232047 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 6232077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 552 - 793
Target Start/End: Original strand, 29956666 - 29956906
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  29956666 aaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 29956765  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  29956766 cactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgt 29956865  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 793  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29956866 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctc 29956906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 497 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 35918282 - 35917944
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||   | |||  |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  35918282 ctttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 35918183  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacac------tagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    ||||||||||||| | |||||||||      ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||     
T  35918182 gagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaagagac 35918083  T
Q  690 tgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctc 789  Q
    || || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||  ||||||    
T  35918082 tgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatta-tatagtggaacggagagctgctc 35917984  T
Q  790 tctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaac 830  Q
    |||| | || ||| ||||||||| || |||||||| |||||    
T  35917983 tctccctcagact-ggtcaatttagaccgaactggatcaac 35917944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 623 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688140
Alignment:
Q  623 gggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagactta 722  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 25688268  T
Q  723 ttcttgtaacacattgatatctcttttgt-aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaac 821  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  25688267 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaac 25688169  T
Q  822 tgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  25688168 tgggtcaaaaagttcttttgtgttctctc 25688140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 579 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 13420432 - 13420219
Alignment:
Q  579 aaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggtta 678  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  13420432 aaactagggtttgtatagagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtca 13420337  T
Q  679 cgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacg 778  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  13420336 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatggaacg 13420237  T
Q  779 gaggactgctctctcacc 796  Q
    |||  |||||||||||||    
T  13420236 gagagctgctctctcacc 13420219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 492 - 808
Target Start/End: Original strand, 53597160 - 53597472
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||  |   ||||||||||| | || | |||||| |||||||||| ||     
T  53597160 ggatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggatgaaacaagggtttataa-gtcaacaagaaaactaggggttg 53597258  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||| ||||||    
T  53597259 tatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaatagattg 53597355  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
    ||| | || |||||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  53597356 agattttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagggttgctctc 53597455  T
Q  792 tcacccatactaggtca 808  Q
    || | || |||||||||    
T  53597456 tcccacaaactaggtca 53597472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 592 - 850
Target Start/End: Original strand, 17795282 - 17795536
Alignment:
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  17795282 tatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattg 17795377  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
    || || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| | ||||||||    
T  17795378 aggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctctc 17795477  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || || | |||||||||||||| | |||| | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17795478 tcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctc 17795536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 592 - 850
Target Start/End: Original strand, 19103722 - 19103976
Alignment:
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  19103722 tatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattg 19103817  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
    || || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| | ||||||||    
T  19103818 aggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctctc 19103917  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || || | |||||||||||||| | |||| | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19103918 tcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctc 19103976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 552 - 850
Target Start/End: Original strand, 42992266 - 42992547
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  42992266 aaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaa 42992365  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||               ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  42992366 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagagagtg-gactttgggtag---------------ttattcttgtaactcattgatttctcttttgt 42992449  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || |||| |||||| ||||||| | ||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42992450 aacgttagtcatca-tatagtgaatcggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttttttgtgttctctc 42992547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 434 - 749
Target Start/End: Original strand, 23636888 - 23637200
Alignment:
Q  434 cagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaac 533  Q
    ||||| |||||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||||  | ||||||   ||||  ||||| |||||||||| || ||||||| | ||||||    
T  23636888 cagcagaaaatataacagaaacatatttttcggcctagatttgtttcaattttatgagggataattttaatataaatatatactttgtatcagagtaaac 23636987  T
Q  534 cttgagatagagaaggctaaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagg 632  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | |||||| |||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  23636988 cttgagatagaggaggctaaaacaagggtttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtatagagtctg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--g 23637083  T
Q  633 gttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaac 732  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23637084 gttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgttcatgggaagatattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 23637183  T
Q  733 acattgatatctctttt 749  Q
     ||||||||||||||||    
T  23637184 ccattgatatctctttt 23637200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 633 - 849
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886474
Alignment:
Q  633 gttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaac 732  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5886359  T
Q  733 acattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 832  Q
     ||||||| | || |||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5886360 ccattgatttgtc-tttgaaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 5886457  T
Q  833 attcttttgtgttctct 849  Q
    |||||||||||||||||    
T  5886458 attcttttgtgttctct 5886474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 633 - 849
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899947
Alignment:
Q  633 gttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaac 732  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5899832  T
Q  733 acattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 832  Q
     ||||||| |||| |||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5899833 ccattgatttctc-tttgcaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 5899930  T
Q  833 attcttttgtgttctct 849  Q
    |||||||||||||||||    
T  5899931 attcttttgtgttctct 5899947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 417 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 562174 - 561769
Alignment:
Q  417 tcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagac 516  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||   ||||  |||||||||||||||||||    
T  562174 tcggtggccgaatttgagagcaggaaataaaacagaaacgtattttcgggcc-agatttgttccatttttataagggataattttactataaatatagac 562076  T
Q  517 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 615  Q
     ||||||  | ||||          | ||  || | ||||||||||| || ||| |||| |  ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  562075 tttgtattagagtaa----------aaagggggttgaaacaagggtttag-aagtcaac-atgaaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaaca 561989  T
Q  616 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 715  Q
    ||||||||||||    |||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  561988 aacactagggtt--caggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtggg 561891  T
Q  716 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac-ccatactaggtca-atttg 813  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||| |||||||||  ||||    
T  561890 agacttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctctccctccagactaggtcagttttg 561791  T
Q  814 gatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    || ||||| |||| ||||||||    
T  561790 gaccgaaccgggtaaacaaatt 561769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 424 - 760
Target Start/End: Original strand, 1673826 - 1674160
Alignment:
Q  424 ccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgagg-attcttttactataaatatagacattgta 522  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||  |||||    
T  1673826 ccgattttgccaccagaaaataaaacagaaatgtattttcgggcttagatttgttctagtttt-ttgagggatacttttactataaatatagaacttgta 1673924  T
Q  523 tcggt-gtaaaccttgagatagagaaggct--aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaaca 619  Q
    ||    |||||||||||  |||||| | ||  ||| ||||||| |||| |  ||||| |||||||| | || |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1673925 tcaaaagtaaaccttgatgtagaga-gtctgaaaataagggtttagaa-gttaacaagaaaactagtgtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaaca 1674021  T
Q  620 ctagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagac 719  Q
    ||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1674022 ctagggtt--aggattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaatagacgggagac 1674119  T
Q  720 ttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttact 760  Q
    |||||| |||||| | ||||||| |||||||||| ||||||    
T  1674120 ttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttgtaaagttact 1674160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 636 - 847
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168375
Alignment:
Q  636 gattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacaca 735  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || || | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  736 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttacttatca-tatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaacttggtcaacaaatt 11168363  T
Q  836 cttttgtgttct 847  Q
    ||||||||||||    
T  11168364 cttttgtgttct 11168375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 498 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 27635959 - 27635638
Alignment:
Q  498 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatag 596  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||| || |||||    
T  27635959 ttttactacaaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatag 27635860  T
Q  597 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 696  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||                   |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||            ||    
T  27635859 agtttgtctcttgggaacaaacactagggt-------------------gggaaacaatattaagattgagtctcttggttacggg------------ct 27635791  T
Q  697 ctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacc 796  Q
     |||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  27635790 ttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccc 27635692  T
Q  797 catactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27635691 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 27635638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 579 - 835
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635644
Alignment:
Q  579 aaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggtta 678  Q
    ||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 25635487  T
Q  679 cgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacg 778  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  25635488 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcattatggtgaaaca 25635587  T
Q  779 gaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    ||||  ||||||||| ||    ||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  25635588 gagggttgctctctcccctcggctaggccaatttggaccaaactgcgtaaacaaatt 25635644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 571 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 36871557 - 36871295
Alignment:
Q  571 caacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtct 670  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  36871557 caacaagaaaactagggcttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggtt--aggattgattcaccttggaaaacactgttaagattgagtct 36871461  T
Q  671 cttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattat 769  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||   || |||||||||||| ||| | ||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  36871460 cttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttatctcttt-gtaaagttaatcatcattat 36871362  T
Q  770 agtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| | ||||| |||||||||| ||| ||||    
T  36871361 agtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatt 36871295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 699 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701652
Alignment:
Q  699 gggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcaccca 798  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccccca 47701703  T
Q  799 tactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
     | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  47701702 gattaggtcaatttggatcgaactggatcaacaaattcttttgcgttctct 47701652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 650 - 850
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3307037
Alignment:
Q  650 aacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctttt 749  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||    | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  750 gtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||| |  ||||||||  || | |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3306939 gtaaagttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttctct 3307036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 482 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 47701943 - 47701798
Alignment:
Q  482 gttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaa 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47701943 gttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 47701844  T
Q  581 actagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 626  Q
    ||||||| || |||||||||||||| || | ||||||||| |||||    
T  47701843 actagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 498 - 625
Target Start/End: Original strand, 6231374 - 6231502
Alignment:
Q  498 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatag 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  6231374 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagcgggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 6231473  T
Q  597 agtttgtctcttggcaacaaacactaggg 625  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6231474 agtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 678 - 835
Target Start/End: Original strand, 24181486 - 24181644
Alignment:
Q  678 acgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaac 777  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24181486 acgggaaaagattgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 24181585  T
Q  778 ggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    ||| ||||||||||||  ||| |||||||||  |||||| |||| ||||| ||||||||    
T  24181586 ggatgactgctctctcctccaaactaggtcagttttggaccgaattgggtaaacaaatt 24181644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 417 - 534
Target Start/End: Original strand, 4663763 - 4663880
Alignment:
Q  417 tcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagac 516  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4663763 tcggtggccgatttttacagtagaaaataaaacagaaacgtattttcaggcttagatttgttctagttttattgaagattcttttactataaatatagac 4663862  T
Q  517 attgtatcggtgtaaacc 534  Q
    |||||||| | |||||||    
T  4663863 attgtatcagagtaaacc 4663880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 293 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 5927325 - 5927188
Alignment:
Q  293 ttgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttgacatgtttta 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5927325 ttgttgtgaaagtgccttaaaattgaagaaattggaattttggaagctgaaaatcggtggctgattttcagagcacggtggccgattttgacctgtttta 5927226  T
Q  393 tttgagctttaggttcggcaaaaatcggtggccgattt 430  Q
    |||||||||  |||||| ||   |||| ||||||||||    
T  5927225 tttgagcttctggttcgacatttatcgatggccgattt 5927188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 497 - 640
Target Start/End: Original strand, 11163074 - 11163218
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  11163074 cttttacgataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 11163173  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattc 640  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||    
T  11163174 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 552 - 664
Target Start/End: Original strand, 41849132 - 41849244
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41849132 aaacaagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 41849231  T
Q  652 cactattatgatt 664  Q
    | |||||| ||||    
T  41849232 ctctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 604 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 14634665 - 14634491
Alignment:
Q  604 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggta 703  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14634665 ctcttggcaacaaacactggg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggta 14634569  T
Q  704 gaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacgga 780  Q
    | | ||||   | ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14634568 gcattaggtttgaagactgattcttgtaaacctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggaacgga 14634491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 767 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 35919178 - 35919098
Alignment:
Q  767 tatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35919178 tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 35919098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 634 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620483
Alignment:
Q  634 ttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaac 732  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||   || | ||  ||||||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaac 1620558  T
Q  733 acattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
     | ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||    
T  1620557 cctttgatatctcttt-gtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtca 1620483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 715 - 850
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634164
Alignment:
Q  715 gagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgg 814  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||  ||| |||||| |||||||     
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaatttgc 25634129  T
Q  815 atcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    | |||||| ||| |||||||| || |||||||||||    
T  25634130 accgaactaggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctc 25634164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 756 - 850
Target Start/End: Original strand, 41849243 - 41849336
Alignment:
Q  756 ttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41849243 ttactcatcat-atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 41849336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 492 - 676
Target Start/End: Original strand, 24177198 - 24177380
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct--aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggct 589  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||||||   |||||| ||||| |||||  ||||  ||||||| ||| |||  | |||||| |||||||||| |    
T  24177198 ggatacttttattataaatatagaccttgtatcatagtaaacattgagctagagggggctgaaaacaagagtttagat-gtcaacaagaaaactagggtt 24177296  T
Q  590 tatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggt 676  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24177297 tgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 566 - 798
Target Start/End: Original strand, 13419878 - 13420106
Alignment:
Q  566 aaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattg 665  Q
    |||| |||||| |||||||||| || ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||| |||      
T  13419878 aaagccaacaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggatca 13419972  T
Q  666 agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaaca-cattgatatctcttttgtaaggttactcat 763  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| | | | ||||||||| | ||  || ||| | ||| ||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  13419973 agtctcttggtcacggaaagagattcaaattttgggtagaatttggttggaagaataatttttgtaacatttttgatatctc-tttgtaaagttactcat 13420071  T
Q  764 cattatagtggaacggaggactgctctctcaccca 798  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||||| ||||    
T  13420072 cattatagtggaatagtggactcctctctccccca 13420106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 498 - 608
Target Start/End: Original strand, 3306724 - 3306835
Alignment:
Q  498 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatag 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  ||  ||||    
T  3306724 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctagagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatag 3306823  T
Q  597 agtttgtctctt 608  Q
    ||||||||||||    
T  3306824 agtttgtctctt 3306835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 616 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 4560497 - 4560352
Alignment:
Q  616 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 715  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||   || ||||||||| ||||| |     
T  4560497 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggcag- 4560399  T
Q  716 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattat 769  Q
       |||    ||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4560398 ---ctt----ttgtaacccattaatatctcttttgcaaagttactcatcattat 4560352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 660 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 11007684 - 11007545
Alignment:
Q  660 tgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttac 759  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||         | |||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||    
T  11007684 tgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg---------ttttcttgtaactctttgacatctcttttgtaaagttac 11007594  T
Q  760 tcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||||| || | |||||||||    
T  11007593 tcatcattatagtggaatggggggctcctctctcccctagactaggtca 11007545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 296 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 28102558 - 28102471
Alignment:
Q  296 ttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaatt-ggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttg 382  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  28102558 ttgtgaaagtgcctcaaaattgaataaatttggaattctgaaagcagaaaatcgggggctgattttcaaggttcggtggccgattttg 28102471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 778 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 53894109 - 53894040
Alignment:
Q  778 ggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53894109 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 53894040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 294 - 370
Target Start/End: Original strand, 7754063 - 7754139
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacgg 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||| |||||||| |||||||    
T  7754063 tgttgtgaaagtggctcaaaattgaagaaattggaattctggaagctaaaaatcgctggccgattttcagggcacgg 7754139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 292 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28137833 - 28137765
Alignment:
Q  292 attgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgatttt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| ||||||    
T  28137833 attgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctggaagtagaaaatcggtggccgatttt 28137765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 292 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 28100600 - 28100530
Alignment:
Q  292 attgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttca 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| | |||| ||||||||    
T  28100600 attgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctggaagtagaaaatcgatggccgattttca 28100530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 43421974 - 43421883
Alignment:
Q  291 aattgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttg 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||   |||| |||||||||   |||||| |||||||||    
T  43421974 aattgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattcaggtagcagaaaataaatggccgattttcaaactacggtggccgattttg 43421883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 8183249 - 8183163
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||  |||   ||||||||  |||||||| |||||||    
T  8183249 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattgaaattctgatagcagaaaatcagtgatcgattttcagagcacggtggccgattt 8183163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 579 - 676
Target Start/End: Original strand, 25633930 - 25634024
Alignment:
Q  579 aaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggt 676  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25633930 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggctgg--gattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 652 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 29914132 - 29913949
Alignment:
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  29914132 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 29914038  T
Q  751 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    ||| |  |||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  29914037 taaagaaactcatcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 29913949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 652 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 10595213 - 10595028
Alignment:
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||   || |||| |||||| |||| ||   |||||||||| |    
T  10595213 cactattaggattaagtctcttggtcacgggaagaggctgagact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctcttt-g 10595119  T
Q  751 taaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    ||| |  ||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  10595118 taaagaaactcatgtcattatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 10595028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 652 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27761980
Alignment:
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  27762165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 27762071  T
Q  751 taaggttactc--atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    ||| |  ||||  |||||||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  27762070 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagaaccgctctatcccccaaactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 27761980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 652 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 47878350 - 47878165
Alignment:
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||| |    
T  47878350 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 47878256  T
Q  751 taaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    ||| |  ||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||  ||| ||||||||| | || || |||||||||| |||||||||||    
T  47878255 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaattctt 47878165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 497 - 572
Target Start/End: Original strand, 1321365 - 1321441
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggca 572  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||    
T  1321365 cttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca 1321441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 497 - 545
Target Start/End: Original strand, 6484309 - 6484357
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagag 545  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6484309 cttttgctataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagag 6484357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094100
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  10094256 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 10094162  T
Q  748 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  10094161 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 10094100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 761 - 847
Target Start/End: Original strand, 16996987 - 16997074
Alignment:
Q  761 catcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| | | | |||  ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16996987 catcattatagtggaacggagaactgctcactcccccagactaggtaagtatgggactgaactgggtaaacaaattctcttgtgttct 16997074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 335
Target Start/End: Original strand, 25635120 - 25635163
Alignment:
Q  292 attgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctga 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25635120 attgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctga 25635163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 795 - 850
Target Start/End: Original strand, 42992608 - 42992663
Alignment:
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  42992608 cccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaaaaaattcttttgtattctctc 42992663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 562249 - 562207
Alignment:
Q  293 ttgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctga 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  562249 ttgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctga 562207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 376 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 7754187 - 7754137
Alignment:
Q  376 gattttgacatgttttatttgagctttaggttcggcaaaaatcggtggccg 426  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  7754187 gattttgacctgttttatttgagcttcaagttcggcaaaaatcgatggccg 7754137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 634 - 826
Target Start/End: Original strand, 7768632 - 7768825
Alignment:
Q  634 ttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaac 732  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||   | ||||  ||| || |||||| ||||   || |||| |||||||||||    
T  7768632 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgctcacgggctaaaattggaactttgagtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 7768731  T
Q  733 acattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggt 826  Q
       || ||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||  | ||| ||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  7768732 cttttaatataccttt-gtaaagttactcattattatagtggaacgaagggttactccctcccccatactaggtcagtattggatcgaattgggt 7768825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 762 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 10612849 - 10612762
Alignment:
Q  762 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  10612849 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttctctc 10612762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 652 - 838
Target Start/End: Original strand, 10897008 - 10897193
Alignment:
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||| |    
T  10897008 cactattaggattgattctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 10897102  T
Q  751 taaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    ||| |  ||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  10897103 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 10897193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13420727 - 13420686
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctga 335  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13420727 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctga 13420686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22626009
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggaga-cttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   || | || ||||||| ||| ||||   |||||||    
T  22626166 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaaaactgattcttgaaactcatt---atctctt 22626071  T
Q  748 ttgtaaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    | |||| |  ||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  22626070 t-gtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagaactgctctctcccccagactaggtca 22626009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 744 - 836
Target Start/End: Original strand, 27420822 - 27420915
Alignment:
Q  744 tcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattc 836  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||   ||||||||| |||||| |||||||  |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  27420822 tcttttgtaaagttactcatcattataatggaacatagagttgctctctcccccatagtaggtcagttttggaccgaactaggtaaacaaattc 27420915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 418 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 4560677 - 4560509
Alignment:
Q  418 cggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagaca 517  Q
    |||||||||| |||  ||| | |||||| | || |||| |||||||| |||||||||| ||| | |||||    |||| |||| ||||||| |||||||     
T  4560677 cggtggccgaattttccagtagaaaatatatcaaaaacttattttcgagcctagatttattccaattttacgagggatactttcactataagtatagact 4560578  T
Q  518 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactag 585  Q
     ||||||   |||||| |||||||||||  |||| |||||| |||| | ||||| ||||||||||||||    
T  4560577 atgtatcatagtaaacattgagatagagggggctgaaacaatggtttataaaggtaacaacaaaactag 4560509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 649 - 696
Target Start/End: Original strand, 7418064 - 7418111
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 696  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  7418064 aaacaccattatgattgagtctattggtcacgggaagagattgggact 7418111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 7606873 - 7606830
Alignment:
Q  616 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactatta 659  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7606873 aacagtaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 7606830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 10100273 - 10100117
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| |||||| || ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  10100273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtaaaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 10100179  T
Q  748 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  10100178 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 10100117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10200980
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  10201136 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 10201042  T
Q  748 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    ||| || |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  10201041 ttggaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 10200980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 10208182 - 10208026
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  10208182 aaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 10208088  T
Q  748 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| | || |||||||||    
T  10208087 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccgcagactaggtca 10208026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 716 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 15823763 - 15823641
Alignment:
Q  716 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttgg 814  Q
    ||||| ||||||||||| | |||| |||||||| |||| |  |||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| || | | || |||||| ||||    
T  15823763 agactaattcttgtaaccctttgacatctcttt-gtaaagaaactcttcattatagtggaacgtagagctgctctctctccaagagtaagtcaatattgg 15823665  T
Q  815 atcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    | |||| ||||| |||||||||||    
T  15823664 accgaattgggtaaacaaattctt 15823641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 6303310 - 6303348
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6303310 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 6303348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 762 - 808
Target Start/End: Original strand, 11079628 - 11079674
Alignment:
Q  762 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  11079628 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 11079674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 662 - 696
Target Start/End: Original strand, 13893475 - 13893509
Alignment:
Q  662 attgagtctcttggttacgggaagagattgagact 696  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13893475 attgagtctcttggtcacgggaagagattgagact 13893509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462241
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16462203 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 16462241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 27544273 - 27544311
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27544273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 27544311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47883026
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  47883064 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 47883026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 762 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 48390373 - 48390327
Alignment:
Q  762 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  48390373 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 48390327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 763 - 832
Target Start/End: Original strand, 1736319 - 1736388
Alignment:
Q  763 tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 832  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  1736319 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 817 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 8183147 - 8183114
Alignment:
Q  817 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8183147 cgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 8183114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 763 - 832
Target Start/End: Original strand, 18552897 - 18552966
Alignment:
Q  763 tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 832  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  18552897 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 18552966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 335
Target Start/End: Original strand, 25633231 - 25633272
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctga 335  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  25633231 tgttgtgaaagtgattcaaaattgaagaaattggagttctga 25633272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 763 - 832
Target Start/End: Original strand, 30709804 - 30709873
Alignment:
Q  763 tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 832  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  30709804 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 30709873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 611 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 31021362 - 31021300
Alignment:
Q  611 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttg 674  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31021362 caacaaacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggattgagtctcttg 31021300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 319; Significance: 1e-179; HSPs: 97)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 294 - 850
Target Start/End: Original strand, 13056949 - 13057527
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttgacatgttttat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||   | |  | |    
T  13056949 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctggaagcagaaaattggtggccgattttcagggctcggtggccgattttgcactctggttt 13057048  T
Q  394 ttgagctttaggttcggcaaaaatcggtggccga---------------------ttttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctaga 472  Q
    ||   || | ||||||||||||||||||||||||                     |||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13057049 tttgtctgttggttcggcaaaaatcggtggccgatttatggatttcgatggccaattttgatagtagaaaataaaacagaaacgtattttcgggcctaga 13057148  T
Q  473 tttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggc 571  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||    
T  13057149 tttgttccaattttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 13057248  T
Q  572 aacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctc 671  Q
    || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13057249 aagaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctc 13057348  T
Q  672 ttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatag 771  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13057349 ttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatag 13057448  T
Q  772 tggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || |||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13057449 tgaaacggagggctactctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactcggtcaacaaattcttttgtgttctctc 13057527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 421 - 850
Target Start/End: Original strand, 13039657 - 13040087
Alignment:
Q  421 tggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattg 520  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13039657 tggccgattttgacaacagaaaataaaacataaacgtattttcggacctagatttgttccagttttattgaggattcttttactataaatatagatattg 13039756  T
Q  521 tatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaaca 619  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13039757 tatcagtgtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaaca 13039856  T
Q  620 ctagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagac 719  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||    
T  13039857 ctagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgcgtagaattaggcggaagac 13039956  T
Q  720 ttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcga 819  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||| || |||    
T  13039957 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttagaccga 13040056  T
Q  820 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13040057 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 13040087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 417 - 850
Target Start/End: Original strand, 25477173 - 25477614
Alignment:
Q  417 tcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagac 516  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25477173 tcggtggccgattttgacatcagaaaataaaacagaaacatattttcgggcctagatttgttccagttttattgaggattcttttactgtaaatatagac 25477272  T
Q  517 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 615  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25477273 attgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttgggaaca 25477372  T
Q  616 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 715  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||| ||||||||    
T  25477373 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggctttgggtagaattaggcggg 25477472  T
Q  716 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaa-------ggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  25477473 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtca 25477572  T
Q  809 atttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25477573 atttggaccgaaatgggtcaacaaattcttttgtattctctc 25477614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 418 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 3632352 - 3631921
Alignment:
Q  418 cggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagaca 517  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3632352 cggtgaccgattttgacagcagaaaataaaatagaaacgtattttcgggcctagatttgttccagttttattgaggattcgtttactataaatatagaca 3632253  T
Q  518 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 616  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||   | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  3632252 ttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaa 3632153  T
Q  617 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 716  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||    
T  3632152 acactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcagga 3632053  T
Q  717 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 816  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |  |||| ||||||||||||||||     
T  3632052 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctgt--cccagactaggtcaatttggac 3631955  T
Q  817 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3631954 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctc 3631921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 418 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 3630278 - 3629847
Alignment:
Q  418 cggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagaca 517  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3630278 cggtggtcgattttgacagcagaaaataaaacagaaacgtatttttgggcctagatttgttccagttttattgaggattcttttactataaatatagaca 3630179  T
Q  518 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaa 616  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||  |||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  3630178 ttgtatcaatgtaaaacttgagatagagggggctgaaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaa 3630079  T
Q  617 acactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||| ||||    
T  3630078 acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggaggga 3629979  T
Q  717 gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggat 816  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  3629978 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactaat-aatatagtgaaactgagggctgctctctc-cccatactaggtcaatttggac 3629881  T
Q  817 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3629880 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 3629847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 294 - 773
Target Start/End: Original strand, 22490415 - 22490896
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttgacatgttttat 393  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22490415 tgttatgaaagtgcctcaaaattgaagaaattagaattctgaaagctgaaaatcgatggccgattttcagggcacggtggccgattttgacctgttttat 22490514  T
Q  394 ttgagctttaggttcggcaaaaatcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgagg 493  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22490515 ttgagcttcaggttcggcataaatcggtggctgattttgatagcagaaaataaaacagaaacgtattttcgggtctagatttgttccagttttattgagg 22490614  T
Q  494 attcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaaggg-ttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||     
T  22490615 attcttttaccataaatatagacattgaattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttg 22490714  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    || |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22490715 tatatagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattg 22490814  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtg 773  Q
     |||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22490815 ggactttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcattatagtg 22490896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 417 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 24338863 - 24338430
Alignment:
Q  417 tcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagac 516  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24338863 tcggtggccgattttgacaccaaaaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttccagttttattgaagattcttttactataaatatagac 24338764  T
Q  517 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 615  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||| ||||||    
T  24338763 attgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcataaagtttgtgtcttagcaaca 24338664  T
Q  616 aacacta-gggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgg 714  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||| | |    
T  24338663 aacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaagactttgggtagaattagtcag 24338564  T
Q  715 gagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgg 814  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||| |||| |||| ||||||||||    
T  24338563 aagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg--ctctcccccagactatgtcaatttgg 24338466  T
Q  815 atcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    | |||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||    
T  24338465 accgaactaggtaaacaaatatttttgtgttatctc 24338430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 3390358 - 3390712
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  3390358 cttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 3390457  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  3390458 gagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattggggc 3390557  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |    
T  3390558 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgctctctccc 3390657  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3390658 ccatactaggtcaatttggaccaaattgggtcaacaaattcttttgtgatctctc 3390712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 426 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 12161960 - 12161540
Alignment:
Q  426 gattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcg 525  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  12161960 gattttgacagcagaaaataaaacagaaacatattttcgggcctagatttgttccagttttattgaggattcttttactttaaatatagacattgtatca 12161861  T
Q  526 gtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagg 624  Q
     |||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  12161860 ttgtaaaccttgagataaagg-ggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctgg--aacaaacactagg 12161764  T
Q  625 gtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttatt 724  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| || || | |||||| |||||    
T  12161763 gtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgagactttaggtataattaagtgggagatttatt 12161664  T
Q  725 cttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgg 824  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| | ||| |||||| || | ||||||| |||||||| |||||||     
T  12161663 cttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtaaaatggatggctgttctctc-cctaaactaggttaatttggaccgaactga 12161566  T
Q  825 gtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
     |||||||||| ||||||||||||||    
T  12161565 atcaacaaattattttgtgttctctc 12161540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 9019905 - 9020258
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||   |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  9019905 cttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 9020004  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  9020005 gagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttataggaagagattgggac 9020104  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||| |    
T  9020105 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggggggctgctctctccc 9020203  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9020204 ccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 9020258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 11983364 - 11983011
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| | |||||||||  |||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  11983364 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaaaggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 11983265  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  11983264 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 11983165  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  11983164 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 11983066  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983065 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 11983011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 1230584 - 1230234
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||   | |||| |||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  1230584 ctttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaactttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 1230485  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||  || |||    
T  1230484 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagaggctgggac 1230385  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |    
T  1230384 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctccc 1230286  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230285 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1230234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 32279976 - 32280329
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||   |||||| | |||||||||  |||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  32279976 cttttcctatatatatagaccttgtatcatagtaaacttggagatagagg-ggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaatctagggtttgtata 32280074  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32280075 gagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 32280174  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    |   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||| |    
T  32280175 ttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtaaaacggagggctgctctctccc 32280274  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  32280275 ccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaaaaattctcttgtgttctctc 32280329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 504 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 14459093 - 14458752
Alignment:
Q  504 tataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttg 602  Q
    ||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||  |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14459093 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 14458994  T
Q  603 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggt 702  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||    
T  14458993 tctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgattc--cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 14458896  T
Q  703 agaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatact 802  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| |||| |||    
T  14458895 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagact 14458797  T
Q  803 aggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14458796 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14458752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 28241656 - 28241306
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| | | |||| | |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  28241656 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28241557  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  28241556 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 28241457  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||| |    
T  28241456 tttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctccc 28241358  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241357 ccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28241306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 412 - 850
Target Start/End: Original strand, 14466228 - 14466656
Alignment:
Q  412 aaaaatcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaata 511  Q
    |||||||  |||| ||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14466228 aaaaatcaatggctgatttcgacagcaggaaataaaacagaaacgtcttttcgg-cctagatttgttccagttttattgaggattcttttactatagata 14466326  T
Q  512 tagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttgg 610  Q
    ||||| ||||||  |  |||||||||||||||||| || | ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||           ||||||||| ||||    
T  14466327 tagactttgtattagaataaaccttgagatagagagggttgaaacaagagtttagaaagacaacagcaaaactag-----------agtttgtctattgg 14466415  T
Q  611 caacaaacactagggttt-gagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaata 709  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || | || |||||| ||    
T  14466416 caacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggagtttgagtagaatta 14466515  T
Q  710 ggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaa 809  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||| | || |||||||||||||||    
T  14466516 ggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgtttcccccatactaggtcaa 14466615  T
Q  810 tttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14466616 tttggaccgaactgggtcagcaaattctcttgtgttctctc 14466656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 4816510 - 4816216
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  4816510 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaa 4816411  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4816410 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 4816311  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816310 aacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4816216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 14507510 - 14507161
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  | | |||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  14507510 cttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 14507411  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  14507410 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 14507311  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | |||| |||| ||||||| | |||||| |||||||||| |    
T  14507310 tttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatacttatca-tatagtgaatcggagggctgctctctccc 14507213  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507212 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14507161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 491 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 3234071 - 3233707
Alignment:
Q  491 aggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggct 589  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| || |||||| |||||||||||||| || |    
T  3234071 aggatgcttttactataaatatagac-ttgtatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtt 3233973  T
Q  590 tatatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaga 688  Q
    | |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3233972 tgtatatagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 3233873  T
Q  689 ttgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgct 788  Q
    ||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |  ||||||| |||||||| |||||    
T  3233872 ttgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactca-ccgtatagtgaaacggagggctgct 3233774  T
Q  789 ctctcacccatactaggtcaatttggatc-----gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| || |     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3233773 ctctcccccacactaggtcaattttgaccgaactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 3233707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 30967177 - 30967530
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||    |||||  |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||     
T  30967177 cttttactataaatatagaccttgtataggc-taaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtttg 30967275  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  30967276 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 30967375  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
    | ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||    
T  30967376 aaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagagctgctctc 30967474  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967475 tcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 30967530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 15541475 - 15541122
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  15541475 cttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtata 15541376  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  15541375 gagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtcacgagaagagattgggac 15541276  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||      
T  15541275 tttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatca-tatagtgaaacagaaagctgctctctcct 15541177  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15541176 ccagactaggttaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 15541122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 30729163 - 30728806
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||   ||||| ||||||||||||| ||| || ||||    
T  30729163 cttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtatcgaaagacaacaacaaaacttgggtttgtata 30729064  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  || | |    
T  30729063 gagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttacgggaagaggctggggc 30728964  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgata----tctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  30728963 tttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcat-attatagtggaacggaaggctgctctc 30728865  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || | || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30728864 tcccgcagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctc 30728806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 497 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 15530457 - 15530166
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||   |||||||||  |||| || |||||| | |||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  15530457 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagagggggctgaagcaagggcttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 15530358  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15530357 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggc 15530258  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctc 789  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15530257 tttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaac-cattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 19704848 - 19704552
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19704848 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaa 19704749  T
Q  652 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct-ttt 749  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  19704748 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctcttt 19704649  T
Q  750 gtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19704648 gtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 19704552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 2629225 - 2628871
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaa-----ggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    ||||| |||||| |||||      |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  2629225 cttttactataaatatagaccttgtatcatgttaaactttgagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 2629126  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629125 gtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 2629026  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    | |||| ||||||||| |||||||   | ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  2629025 gggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggatcggagggctgctct 2628928  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2628927 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 2628871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 497 - 845
Target Start/End: Complemental strand, 30034942 - 30034590
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacctt----gagatagagaaggctaaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| ||    |||||||||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||     
T  30034942 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttaagagagatagagggagctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagtttg 30034843  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||  ||    
T  30034842 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggctg 30034743  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||    
T  30034742 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagcggatcggagggctgctctc 30034644  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    || |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034643 tcccccagactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 30034590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 497 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 15533016 - 15532674
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  15533016 cttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 15532917  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
     ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  15532916 aagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggac 15532817  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | | ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || |    
T  15532816 ttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctatc-c 15532719  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattctttt 840  Q
    | | ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  15532718 ctagactaggtcaattttgactgaactaggtcaacaaattctttt 15532674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 552 - 837
Target Start/End: Complemental strand, 20915635 - 20915351
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  20915635 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 20915536  T
Q  652 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  20915535 cactattaggattggagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 20915437  T
Q  751 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattct 837  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20915436 taacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 20915351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 417 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 3028266 - 3027895
Alignment:
Q  417 tcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatt--tgttctagttttattgaggattcttttactataaatatag 514  Q
    |||||||| || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  |||||| || | ||| ||||||||||||||||||    
T  3028266 tcggtggctgaatttgacagcaggatataaaacataaacgtattttcgagcctagattgttgtttcagttttttt-atgatacttttactataaatatag 3028168  T
Q  515 acattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct--aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggca 612  Q
    || |||||||   ||||||| ||||||| |   ||||  |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  3028167 accttgtatcaaagtaaaccatgagataaaaggggctgaaaacaagggtttggaa-ggcaaca-caaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggca 3028071  T
Q  613 acaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggc 712  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  3028070 acaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgagtagaattaggc 3027973  T
Q  713 gggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
     ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3027972 tggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 3027895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 12195850 - 12195500
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  12195850 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 12195751  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12195750 gagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 12195651  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    || || |||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||     
T  12195650 ctttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 12195553  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  12195552 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaagtttctttgtgttct 12195500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 552 - 849
Target Start/End: Original strand, 26065021 - 26065312
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26065021 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttg---gaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 26065117  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||    
T  26065118 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctc-tttgt 26065216  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
    || ||||||| | | ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26065217 aacgttactcgtta-tatagtggatcggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctct 26065312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 552 - 849
Target Start/End: Original strand, 26084990 - 26085281
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26084990 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttg---gaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 26085086  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||    
T  26085087 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctc-tttgt 26085185  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
    || ||||||| | | ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26085186 aacgttactcgtta-tatagtggatcggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctct 26085281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 637 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069700
Alignment:
Q  637 attcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacat 736  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 1069814  T
Q  737 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattc 836  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  1069813 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaaattc 1069714  T
Q  837 ttttgtgttctctc 850  Q
    |||| |||||||||    
T  1069713 ttttatgttctctc 1069700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 26932841 - 26932546
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  26932841 aaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaa 26932742  T
Q  652 cactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  26932741 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 26932643  T
Q  751 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaa-ttcttttgtgttct 847  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  |||||  ||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26932642 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttcttttgtgttct 26932546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 413 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 16455840 - 16455421
Alignment:
Q  413 aaaatcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatat 512  Q
    |||||||| | |||||||||  |||| |||||||||||  | |||||||| ||||  |||||||||| | ||||   | |||| | ||||||||||||||    
T  16455840 aaaatcggggcccgattttgctagcaaaaaataaaaca--atcgtatttttgggctcagatttgttccaatttttcag-ggatacctttactataaatat 16455744  T
Q  513 agacattgtatcggtgtaaaccttgaga--tagagaaggct--aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt 608  Q
    | || |||||||||||||||||||||||  |||||| | ||  ||||||||||| |||| | |||||  |||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  16455743 ataccttgtatcggtgtaaaccttgagaggtagaga-gtctgaaaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtacagagttt-tctctt 16455647  T
Q  609 ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaat 708  Q
    |||||| ||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| | |||| ||||||||| |||| ||||||||| |    
T  16455646 ggcaacgaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacactgttaggattaagtctcttgctcacggaaagagattgggactttgggtagaatt 16455549  T
Q  709 aggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16455548 aggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtca 16455449  T
Q  809 at-ttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
     | ||||| ||||||| || ||||||||    
T  16455448 gtattggaccgaactgagtaaacaaatt 16455421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 417 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 13870836 - 13870610
Alignment:
Q  417 tcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagac 516  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  13870836 tcggtggccgattttgacagcaggaaataaaatagaaacgtattttcgggcctagatttgttccagttttattgaggattctttttatataaatataggc 13870737  T
Q  517 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 615  Q
     ||||||| | | ||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  13870736 tttgtatcagagcaaaccttgagatagag-gggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttgtctcttggcaaca 13870638  T
Q  616 aacactagggtttgagggttgattcacc 643  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13870637 aacacttgggtttgagggttgattcacc 13870610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 296 - 609
Target Start/End: Original strand, 10583884 - 10584213
Alignment:
Q  296 ttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttgacatgttttattt 395  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||   ||||||| ||| | ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10583884 ttgtgaaagtgccttaaaattgaagaaattggaattctggaagctgaaaaccggtggtccattttcagggcgcagtggccgattttgacctgttttattt 10583983  T
Q  396 gagctttaggttcggcaaaaatcgg--------------------tggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagattt 475  Q
    |||||| ||||||||||||||||||                    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  10583984 gagcttcaggttcggcaaaaatcggtgccgatttggagcattcggtggccgattttgacagcagaaaataaaacagtaacatattttcgggcctagattt 10584083  T
Q  476 gttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaacaagggttcagaaaggcaaca 575  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||  |||||| |||| | ||| ||||||    
T  10584084 gttccagttttattgaggattcttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagag--gg--aaacaaaggtttataaaagcaaca 10584179  T
Q  576 acaaaactagggcttatatagagtttgtctcttg 609  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  10584180 acaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttg 10584213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 579 - 835
Target Start/End: Original strand, 15719708 - 15719961
Alignment:
Q  579 aaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggtta 678  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||   | ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  15719708 aaactagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtca 15719803  T
Q  679 cgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacg 778  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  15719804 tgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 15719903  T
Q  779 gaggactgctctct-cacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    |||   |||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  15719904 gagagttgctctttccccccatactaggtcaatttggaccgaacttggtaaacaaatt 15719961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 497 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 19227743 - 19227514
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| | | |||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  19227743 cttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 19227644  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    |||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  19227643 gagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 19227544  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattc 725  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19227543 tttgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 616 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273213
Alignment:
Q  616 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgg 714  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  715 gagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgg 814  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc-ttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgg 5273234  T
Q  815 atcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  5273233 accgaactgggtcaacaaatt 5273213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 633 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186053
Alignment:
Q  633 gttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcg-ggagacttattcttgtaa 731  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| || ||||   ||||||||||||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  732 cacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaaca 831  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |  |||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  12186171 ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaaca 12186072  T
Q  832 aattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  12186071 aattattttgtgttctctc 12186053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 604 - 850
Target Start/End: Original strand, 15367121 - 15367363
Alignment:
Q  604 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggta 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||    
T  15367121 ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcgggaagagattgaaactttgggta 15367217  T
Q  704 gaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc-acccatact 802  Q
     || ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| |||||| ||||||| |||||| | ||||||||||  |||| |||    
T  15367218 aaattaatcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatca-tatagtgaaacggaaggctgctctctctccccagact 15367316  T
Q  803 aggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  15367317 aggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctc 15367363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 503 - 771
Target Start/End: Original strand, 17012029 - 17012294
Alignment:
Q  503 ctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaacaa--gggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtt 600  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  | || || ||  ||||| |||| |  ||||||||| |||||| || |||| ||||    
T  17012029 ctataaatatagaccttgtatcggagtaaaccttgagatagaggggtctgaataaaagggtttagaa-gtaaacaacaaa-ctagggtttgtataaagtt 17012126  T
Q  601 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgg 700  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||  || | |    
T  17012127 tg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgatgcttttg 17012223  T
Q  701 gtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatag 771  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17012224 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatag 17012294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066109
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 26066209  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||||||| |||||| ||||  |||||||| |||||| |||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26066208 tttgtaacgttacttatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 26066110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754694
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc- 29754794  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29754793 tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 29754695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309185
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||     
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 33309085  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  33309086 tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 33309184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 491 - 835
Target Start/End: Original strand, 19696414 - 19696759
Alignment:
Q  491 aggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagag--aaggct--aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagg 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |   ||||||||||| ||||  | ||||  ||||||||||| |||||   |||||||||  ||||    
T  19696414 aggattcttttactataaatatagaccttgtatatgatgaaaccttgagagagagggagggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaat-tagg 19696511  T
Q  587 gcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaaga 686  Q
    | || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |   |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || || | ||||    
T  19696512 gtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaatcactagggttcaaa--ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctttgtcactgaaaga 19696608  T
Q  687 gattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggact 785  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||   || |||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||   ||    
T  19696609 gattgagactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatagct 19696708  T
Q  786 gctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    |||||||| |||| ||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||    
T  19696709 gctctctctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 19696759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 492 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 32447656 - 32447503
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  32447656 ggattcttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 32447557  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactag-ggtttgagggttgattcacc 643  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  32447556 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcacc 32447503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068380
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 26068480  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||||||| ||| |||||||  |||||||| |||||| |||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26068479 tttgtaacgttgctcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 26068381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311454
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||     
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 33311354  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| ||||| |||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  33311355 tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 33311453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 632 - 835
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945463
Alignment:
Q  632 ggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgta 730  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||   | ||||||||| |||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgta 26945357  T
Q  731 acacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaa 829  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||| | |||| | || ||||  |||||| |||||||||| ||    
T  26945358 actcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaactgggtaaa 26945457  T
Q  830 caaatt 835  Q
    ||||||    
T  26945458 caaatt 26945463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 603 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 22858181 - 22857949
Alignment:
Q  603 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggt 702  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | |||    
T  22858181 tctcttggtaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggt 22858084  T
Q  703 agaaatagg-cgggagacttattcttgtaacac-attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccata 800  Q
    |||  ||||   | ||||| ||||||||||| |  ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |    
T  22858083 agatttaggtttgaagactaattcttgtaacccttttgatatatc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccaga 22857985  T
Q  801 ctaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| || ||||||||    
T  22857984 ctaggtcagtattggaccgaactgtgtaaacaaatt 22857949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 497 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 1072212 - 1072067
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  1072212 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaactttgagatagaaggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtata 1072113  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattca 641  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1072112 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 420 - 524
Target Start/End: Original strand, 20220030 - 20220134
Alignment:
Q  420 gtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacatt 519  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20220030 gtggccgattttgacagcagaaaataaaacaaaaacatattttcgggtctagatttgttccagttttattgatgattcctttactataaatatagacatt 20220129  T
Q  520 gtatc 524  Q
    |||||    
T  20220130 gtatc 20220134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 420 - 524
Target Start/End: Original strand, 22114014 - 22114118
Alignment:
Q  420 gtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacatt 519  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22114014 gtggccgattttgacagcagaaaataaaacaaaaacatattttcgggtctagatttgttccagttttattgatgattcctttactataaatatagacatt 22114113  T
Q  520 gtatc 524  Q
    |||||    
T  22114114 gtatc 22114118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 712 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 25465710 - 25465573
Alignment:
Q  712 cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat- 810  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |     
T  25465710 cgggagacttattcttgtacccctttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagta 25465612  T
Q  811 ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  25465611 ttggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctc 25465573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 604 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 25078783 - 25078540
Alignment:
Q  604 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggta 703  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |   |||||||||| ||| ||||||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |  |||    
T  25078783 ctcttggcaacaaacattagggttgaaa--ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgagatt-taagta 25078687  T
Q  704 gaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatact 802  Q
    ||| ||||   || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||  ||    
T  25078686 gaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcattacagtggaacggaggactgctttct-tcccagtct 25078588  T
Q  803 aggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  25078587 aggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctc 25078540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 594 - 795
Target Start/End: Original strand, 20526885 - 20527083
Alignment:
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 693  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||    
T  20526885 tagagtttg-ctcttgacaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaag 20526981  T
Q  694 actctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 792  Q
    ||| | ||||||| ||||   | ||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20526982 acttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttattcatcattatagtggaacggagagctgctctct 20527080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 749 - 850
Target Start/End: Original strand, 10584227 - 10584328
Alignment:
Q  749 tgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc 848  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  10584227 tgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttctc 10584326  T
Q  849 tc 850  Q
    ||    
T  10584327 tc 10584328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 711 - 835
Target Start/End: Original strand, 15346541 - 15346664
Alignment:
Q  711 gcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat 810  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||   |||||||||| |||| |||||||||||    
T  15346541 gcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcat-atagtgaaacggaaagctgctctctcccccagactaggtcaat 15346639  T
Q  811 ttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||    
T  15346640 ttggaccgaactgggtaaacaaatt 15346664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 716 - 808
Target Start/End: Original strand, 30445723 - 30445815
Alignment:
Q  716 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  30445723 agactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctccaccatactaggtca 30445815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 497 - 625
Target Start/End: Original strand, 17852521 - 17852650
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| | || ||||    
T  17852521 cttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtata 17852620  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 625  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  17852621 gagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 3632494 - 3632406
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttg 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3632494 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctggaagctgaaaatcgatgcccgattttcaaagcacggtggccgattttg 3632406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 355 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 24338946 - 24338871
Alignment:
Q  355 gattttcaaggcacggtgaccgattttgacatgttttatttgagctttaggttcggcaaaaatcggtggccgattt 430  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24338946 gattttcagggcacggtggccgattttgacctgttttatttgagcttcaggttcggcaaaaatcggtggccgattt 24338871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 635 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037722
Alignment:
Q  635 tgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggaga-cttattcttgtaaca 733  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| | |||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    | | ||||||||||||||     
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  734 cattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgga---acggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaa 829  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   ||| | | |||||||||| ||||  ||||||||  |||||| ||| |||||| ||    
T  28037827 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggacggacgaaaggctgctctctcccccagtctaggtcagttttggaccgagctgggtaaa 28037728  T
Q  830 caaatt 835  Q
    ||||||    
T  28037727 caaatt 28037722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 497 - 608
Target Start/End: Original strand, 8995458 - 8995570
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||   |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  8995458 cttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 8995557  T
Q  596 gagtttgtctctt 608  Q
    |||||||||||||    
T  8995558 gagtttgtctctt 8995570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 292 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 3630424 - 3630354
Alignment:
Q  292 attgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttca 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  3630424 attgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctagaagctgaaaatcggtggccgattttca 3630354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 414 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 25466587 - 25466433
Alignment:
Q  414 aaatcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatata 513  Q
    |||||||| |||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| | | |||||| |||||||||||||||||    
T  25466587 aaatcggttgccgattttactagcagaaaataaaacataaacgtattttcgggctcagatttgttccagttct-tcgaggatacttttactataaatata 25466489  T
Q  514 gacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct--aaacaagggttcagaaa 568  Q
    ||  || | || | |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||    
T  25466488 gatcttttgtcagagtaaaccttgaggtagag-aggctgaaaacaagggtttagaaa 25466433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 649 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 12911629 - 12911442
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||  || ||||||||||| | ||||||  ||||   || | || |||||||||||   || |||||||||    
T  12911629 aaacactattaagattgagtctcttagtcacgataatagattgagacttttggtagagttaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctctt 12911530  T
Q  748 ttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtc-aatttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||   |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12911529 t-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaatt 12911442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 649 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 12937376 - 12937190
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||| | ||||||| ||||   || | || |||||||||||   || |||||||||    
T  12937376 aaacactattaagattgagtctcttagtcacgagaatagattgaaacttttggtagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctctt 12937277  T
Q  748 ttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtc-aatttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||   |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12937276 t-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc-cccagactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaatt 12937190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 294 - 382
Target Start/End: Original strand, 13039509 - 13039597
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttg 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||  |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  13039509 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattgaaattctggaagcagaaaaccggtggccgattttcagggctcggtggccgattttg 13039597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 716 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 28078310 - 28078215
Alignment:
Q  716 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaattt 812  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    | |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28078310 agacttattcttgtaac-ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggattataagactgctctctccctcatactaggtcaattt 28078215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 492 - 655
Target Start/End: Original strand, 15346365 - 15346517
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| |||        |   ||||||||| ||    
T  15346365 ggatacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaccaagggtttaga--------attcaaactagggttt 15346456  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacact 655  Q
     |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||    
T  15346457 gtataaaatttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacact 15346517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 293 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 13870910 - 13870818
Alignment:
Q  293 ttgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttgaca 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||  |||||||| ||  ||||| ||||||||||||    
T  13870910 ttgttgtgaaagtgccttaaaattgaagaaattggaattttggaagcagaaaatcggtggtcgattttcagggttcggtggccgattttgaca 13870818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 722 - 780
Target Start/End: Original strand, 3833481 - 3833540
Alignment:
Q  722 attcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggtt-actcatcattatagtggaacgga 780  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  3833481 attcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttaactcatcattatagtggaacgga 3833540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 648 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 7542567 - 7542525
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7542567 gaaacactattatgattgagtctcttggtcacgggaagagatt 7542525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 652 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351877
Alignment:
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||   || |||| |||| |||||| ||   |||||||||| |    
T  22352031 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagatt-tgggtagaattaggtttgaagactgattcatgtaactca---atatctcttt-g 22351937  T
Q  751 taaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    ||| |  ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  22351936 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagaactgctctctcccccagactaggtca 22351877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 736 - 835
Target Start/End: Original strand, 11262678 - 11262777
Alignment:
Q  736 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaat 834  Q
    ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||| |||||||    
T  11262678 ttgatatctcttt-gtaaagaaactcatcattatattgtaacggagaactgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaacggggtaaacaaat 11262776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 335
Target Start/End: Original strand, 26944923 - 26944967
Alignment:
Q  291 aattgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctga 335  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26944923 aattgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctga 26944967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878883
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  13878727 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 13878821  T
Q  748 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  13878822 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 13878883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16786075
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  16785919 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 16786013  T
Q  748 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  16786014 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 16786075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 652 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 17695030 - 17694846
Alignment:
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||| |    
T  17695030 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 17694936  T
Q  751 taaggttactc-atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    ||| |  |||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| || | |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  17694935 taaagaaactatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 17694846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 634 - 706
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138496
Alignment:
Q  634 ttgattcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaa 706  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| | |||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaa 11138496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 762 - 838
Target Start/End: Original strand, 25941780 - 25941857
Alignment:
Q  762 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  25941780 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25941857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 762 - 838
Target Start/End: Original strand, 33215938 - 33216015
Alignment:
Q  762 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  33215938 atcattatagtggaacggagagctgctctatcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 33216015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12162060 - 12162024
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaat 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12162060 tgttgtgaaagtgcctcaaaattaaagaaattggaat 12162024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883631
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||  |||   |||||| |    
T  13883475 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaattcat---tatctc-t 13883569  T
Q  748 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  13883570 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 13883631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248740
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  31248896 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 31248802  T
Q  748 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||| || |||||||||||    
T  31248801 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctactctctcccctatactaggtca 31248740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 3577696 - 3577658
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3577696 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 3577658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 661 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 5165985 - 5165936
Alignment:
Q  661 gattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg 711  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  5165985 gattgagtctcttggtcacgggaagagattgggact-tgggtagaattagg 5165936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 652 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 19702041 - 19701988
Alignment:
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaa 706  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  19702041 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagact-tgggtagaa 19701988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 371
Target Start/End: Original strand, 20219939 - 20219989
Alignment:
Q  321 aaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggt 371  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  20219939 aaattggaattatggaagctgaaaatcggtggccgattttcagggcacggt 20219989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887368
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26887406 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 26887368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201470
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35201508 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 35201470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 762 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 3577560 - 3577484
Alignment:
Q  762 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  3577560 atcattatagtggaacggagagctgctctctc-cccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 3577484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 388 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 12162019 - 12161982
Alignment:
Q  388 ttttatttgagctttaggttcggcaaaaatcggtggcc 425  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  12162019 ttttatttgagcttcagattcggcaaaaatcggtggcc 12161982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 762 - 850
Target Start/End: Original strand, 30443532 - 30443621
Alignment:
Q  762 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||| || | ||||||| | | ||||| |||||||||| |||||||| || |||||| ||||    
T  30443532 atcattatagtgtaacggagagctgctctctccccgagactaggtaagtattggaccgaactgggtaaacaaatttttgtgtgttttctc 30443621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 104)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 311 - 850
Target Start/End: Original strand, 17072619 - 17073181
Alignment:
Q  311 aaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttgacatgttttatttgagctttaggttcgg 410  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  17072619 aaaattaaagaaattggaattttgaaagctgaaaatcggtggccgattttcaaggtacagtggccgattttgacctgttttatttgagcttcaagttcgg 17072718  T
Q  411 caaaaa----------------------tcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttat 488  Q
    ||||||                      |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  17072719 caaaaaatcggtggccgatttggagcattcggtggccgattttgacagtagaaaataaaacataaacgtattttcaggcctagatttgttccatttttat 17072818  T
Q  489 tgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactaggg 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17072819 tgaggattcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaggg 17072918  T
Q  588 cttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
     || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17072919 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagag 17073018  T
Q  688 attgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgc 787  Q
    |||| | || | | ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  17073019 attggggctttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgc 17073118  T
Q  788 tctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17073119 tctctcccccagactcggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgctttctctc 17073181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 294 - 850
Target Start/End: Original strand, 24126579 - 24127153
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttgacatgttttat 393  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | || ||   |||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  24126579 tgttgtgaaagtgtctcaaaattgaagaaattggaattctagaagctgaaaattggtggccggttgtc---gcacggtggccgattttgacctgttttgt 24126675  T
Q  394 ttgagctttaggttcggcaaaaatcggtggccgattt---------------------tgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctaga 472  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||                     |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  24126676 ttgagcttcagattcggcaaaaatcggtggccgatttggagtattcggtggccgattttgacagcagaaaataaaacataaatgtattttcgagtctaga 24126775  T
Q  473 tttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggc 571  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||| ||| |||||| |    
T  24126776 tttgttccagttttattgaggattcttttactataaatatagacattatatcagtgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagagtttagaaagac 24126875  T
Q  572 aacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctc 671  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24126876 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctc 24126975  T
Q  672 ttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatag 771  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24126976 ttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatag 24127074  T
Q  772 tggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24127075 tgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 24127153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 321 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 10474856 - 10474305
Alignment:
Q  321 aaattggaattctgaaagctgaaaa-ttggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttgacatgttttatttgagctttaggttcggcaaaaatcg 419  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  10474856 aaattggaattctggaagctgaaaaattggtggccgattttcagggcacggtggccgattttgacctgttttatttgagcttcaggttcggaaaaaatcg 10474757  T
Q  420 gtggccgattt---------------------tgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattct 498  Q
    |||||||||||                     |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10474756 gtggccgatttggagcattcggtggccgattttgacagcagaaaataaaacagaaacgtattttcgggcctagatttgttccagttttattgaggattct 10474657  T
Q  499 tttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatataga 597  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  10474656 cttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgaaatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtataga 10474557  T
Q  598 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactc 697  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  10474556 gtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggactt 10474457  T
Q  698 tgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcaccc 797  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| |||    
T  10474456 tgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttctaaggttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctccccc 10474358  T
Q  798 atactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10474357 atactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 10474305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 418 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 39398405 - 39397975
Alignment:
Q  418 cggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagaca 517  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39398405 cggtggccgattt-gacagcagaaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttccagttttattgaggattcttttactataaatataaaca 39398307  T
Q  518 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctc-ttggcaaca 615  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  39398306 ttgtaccggtgtaaaccttgagatagag-gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaaca 39398208  T
Q  616 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 715  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||| |     
T  39398207 aacacta-ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaactttgggtagaattaggcagt 39398109  T
Q  716 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 815  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  || | ||||||  |||||| | |||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  39398108 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtgacgttaccaatta-tatagtaaaacggatggctgctctctcccacagactaggtcaatttgga 39398010  T
Q  816 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
     |||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  39398009 ccgaactaggtcaaaacattcttttgtgttctctc 39397975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 421 - 850
Target Start/End: Original strand, 695758 - 696175
Alignment:
Q  421 tggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattg 520  Q
    |||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  695758 tggccgattttgccaacagaaaatataacataaacgtattt-caagcctagatttgttccagttttattgagaattcttttactatgaatatagacattg 695856  T
Q  521 tatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaaca 619  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||  || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||           ||||| |||| | ||||||||    
T  695857 tatgagtgtaaaccttgagataaagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg-----------tttgtatctttggaacaaaca 695945  T
Q  620 ctagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagac 719  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  695946 ctagggtttgagggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagac 696044  T
Q  720 ttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcga 819  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||| |||    
T  696045 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccga 696144  T
Q  820 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  696145 actgggtcaacaaattattttgtgttctctc 696175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 491 - 850
Target Start/End: Original strand, 25904041 - 25904400
Alignment:
Q  491 aggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggct 589  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  25904041 aggatgcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggat 25904140  T
Q  590 tatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25904141 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 25904240  T
Q  690 tgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctc 789  Q
    |  | || || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  25904241 tagggctttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattgtaacgttacttatca-tatagtgaaacggatgactgctc 25904339  T
Q  790 tctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25904340 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattattttgtgttctctc 25904400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 492 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 31472953 - 31472594
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  31472953 ggatgcttttactataaatatggacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 31472854  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31472853 gtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 31472754  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    | |||| | ||||||| |||||||||  | | ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  31472753 gggacttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctct 31472654  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31472653 ctcccccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 31472594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 1189949 - 1189589
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcgg-tgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    |||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  1189949 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggttt 1189850  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
     ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1189849 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaagagatt 1189750  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  1189749 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagggatgctct 1189650  T
Q  791 ct-cacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1189649 ctcctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 1189589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 40221466 - 40221820
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  40221466 cttttactataaatatagacattgactcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 40221565  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  40221566 gagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgggac 40221665  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  40221666 ttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccc 40221765  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40221766 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgctctctc 40221820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 25921808 - 25921458
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  25921808 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 25921709  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  25921708 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 25921609  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |    
T  25921608 tctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagagctgctctctccc 25921510  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921509 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 25921458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 417 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 34531080 - 34530721
Alignment:
Q  417 tcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagac 516  Q
    ||||||||||| || || || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  34531080 tcggtggccgaattcgatagtagaaaataaaacataaacgtattttcaggcctagatttgttccagttttttt-aggattcttttactgtaaatatagac 34530982  T
Q  517 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 615  Q
     ||| ||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  34530981 tttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaca 34530882  T
Q  616 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 715  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||| ||||||||    
T  34530881 aacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattaggactttgagtagaattaggcggg 34530782  T
Q  716 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaa 776  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  34530781 agatttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaa 34530721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 21947971 - 21948323
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  21947971 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagg-ggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 21948069  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |||    
T  21948070 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggac 21948169  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  21948170 tttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 21948268  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948269 ccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 21948323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 2818671 - 2818317
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || || ||||    
T  2818671 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactatggtttgtata 2818572  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt-gattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  || ||    
T  2818571 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaaaggctggga 2818472  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  2818471 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggaggactgctctctcc 2818373  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2818372 cccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 2818317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 499 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 18511547 - 18511194
Alignment:
Q  499 tttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga--tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||  |||||  |||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || ||||    
T  18511547 tttaatataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtata 18511448  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18511447 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 18511348  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  18511347 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 18511249  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    | | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18511248 ctagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 18511194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 552 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 16092479 - 16092181
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16092479 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 16092380  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16092379 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgagatctcttttgt 16092280  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  | | ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16092279 aaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcctctagactaggtcaatttagactgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctc 16092181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 39854428 - 39854780
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  39854428 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagg-ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39854526  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||    
T  39854527 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactggaac 39854626  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  39854627 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgctactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 39854725  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39854726 ccagactagatcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 39854780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 497 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 10529434 - 10529091
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||  || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  10529434 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttttata 10529335  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  10529334 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 10529235  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| | |||||||||| |    
T  10529234 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggaaggctgctctctccc 10529136  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattctttt 840  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10529135 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 10529091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 2174863 - 2175212
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||| | | |||| | |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  2174863 cttttactataaatacaggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 2174962  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  2174963 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 2175062  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  2175063 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttacttatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 2175160  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2175161 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2175212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Original strand, 25804025 - 25804318
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25804025 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 25804124  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25804125 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 25804224  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25804225 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 25804318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 504 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 17818817 - 17818475
Alignment:
Q  504 tataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttg 602  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |    
T  17818817 tataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagaaagagg-ggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcg 17818719  T
Q  603 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggt 702  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17818718 tctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagactgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggt 17818619  T
Q  703 agaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatact 802  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||  |||||| |||| |||    
T  17818618 agaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tacagtggaacagagggct--tctctcccccaaact 17818522  T
Q  803 aggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17818521 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 17818475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 497 - 846
Target Start/End: Original strand, 18596591 - 18596939
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||| |||||||  |||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  18596591 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgggatagagggggctgaaacaagggt--ataaagacaacaacaaaactagggtttgtata 18596688  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18596689 gagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 18596788  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||      
T  18596789 tttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcct 18596888  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18596889 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacagattcttttgtgttc 18596939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 38882049 - 38882399
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaagg-ct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatat 594  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| | |||||||||  || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  38882049 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 38882148  T
Q  595 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  38882149 agagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 38882248  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||     
T  38882249 ctttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcc 38882346  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
     ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882347 tccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38882399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 4236573 - 4236922
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| | |||||| ||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  4236573 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 4236672  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  4236673 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 4236772  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  4236773 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 4236871  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4236872 ccaaactaggtcaatttggaccgaact-ggtcaataaattcttttgtgttct 4236922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 6756438 - 6756789
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||    ||||| |||||||||||   ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  6756438 cttttactattaatatagatcttgtatcatattaaactttgagatagagggagctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtata 6756537  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6756538 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgagac 6756637  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |    
T  6756638 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta--acattgatatcttttttgtaaggttacacatcattatagtgaaac-gagggctgctctctccc 6756734  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6756735 ccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatcttttgtgttctctc 6756789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 292 - 714
Target Start/End: Original strand, 20044755 - 20045172
Alignment:
Q  292 attgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttgaca---tgt 388  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||       |  ||| ||||| |||| |||| ||   |||    
T  20044755 attgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggaattctggaagcagaaaatcggtggc-------ccgggctcggtggccgaatttg-cagtttgt 20044846  T
Q  389 tttatttgagctttaggttcggcaaaaatcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttat 488  Q
    ||| ||||  |||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20044847 tttttttggccttt-ggttcgacatttatcggtggccgattttgacagtagggaataaaacagaaatgtattttcgggtctagatttgttccagttttat 20044945  T
Q  489 tgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactaggg 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | | ||||||||||| ||||  |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  20044946 tgaggattcttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagacagagggggctgaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactaggg 20045045  T
Q  588 cttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20045046 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagag 20045145  T
Q  688 attgagactctgggtagaaataggcgg 714  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||    
T  20045146 attgggactttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 27912474 - 27912830
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagaga---aggct----aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggct 589  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||| |||||   ||| |    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  27912474 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 27912573  T
Q  590 tatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    | ||||||||||||||||| | |||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||      
T  27912574 tgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggc 27912673  T
Q  690 tgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctc 789  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  27912674 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggaacagagaactgctc 27912772  T
Q  790 tctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912773 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27912830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 499 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 18509652 - 18509300
Alignment:
Q  499 tttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaagg-ct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatag 596  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||| | ||| || || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || |||||    
T  18509652 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatag 18509553  T
Q  597 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 696  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  18509552 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggact 18509453  T
Q  697 ctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacc 796  Q
     ||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||    
T  18509452 ttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatctattttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggtgggctgctctctcccc 18509354  T
Q  797 catactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
     | |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18509353 tagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 18509300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 497 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 37706115 - 37705774
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| || |||| ||||||||||| ||||| |||||| || ||||    
T  37706115 cttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgtata 37706016  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |      
T  37706015 gactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 37705916  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | | ||  |||||| |    
T  37705915 tttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatggctattctctccc 37705817  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  37705816 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 37705774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 552 - 849
Target Start/End: Original strand, 6745069 - 6745364
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  6745069 aaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaa 6745167  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  6745168 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 6745267  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745268 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 6745364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 497 - 848
Target Start/End: Original strand, 16776101 - 16776452
Alignment:
Q  497 cttttactataaa-tatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatat 594  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||    
T  16776101 cttttactataaaatatagaccttgtatctgagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttacaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 16776200  T
Q  595 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  16776201 agagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 16776300  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| ||||     
T  16776301 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac-cattgatttctcttttgtaacgttacttatca-tatagtggatcggagggctgctatctcc 16776398  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc 848  Q
    |||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776399 cccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc 16776452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 498 - 847
Target Start/End: Original strand, 18466625 - 18466978
Alignment:
Q  498 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttat 592  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||    |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      
T  18466625 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgg 18466724  T
Q  593 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 692  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||     
T  18466725 atagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgg 18466824  T
Q  693 gactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 792  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||    
T  18466825 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tataatggaacggagagctgctctct 18466923  T
Q  793 cacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18466924 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttct 18466978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 417 - 706
Target Start/End: Original strand, 20042914 - 20043204
Alignment:
Q  417 tcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagac 516  Q
    ||||||||||||||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20042914 tcggtggccgattttgagatcaggaaataaaacagaaacgtattttcgggcctagatttattccagttttattgaggattcttttactataaatataggc 20043013  T
Q  517 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 615  Q
     |||||||   | ||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  20043014 tttgtatcatagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaaca 20043113  T
Q  616 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaa 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  20043114 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttggatagaa 20043204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 34479698 - 34479403
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  34479698 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 34479599  T
Q  652 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctttt 749  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  34479598 cactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 34479500  T
Q  750 gtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479499 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 34479403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 26097677 - 26098028
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||  |||| ||| || |||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||    
T  26097677 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttggata 26097776  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |   || |||    
T  26097777 gagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcaccttgg-aaacactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctgggac 26097875  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||      
T  26097876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacagagg-ctgctctctcct 26097973  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26097974 ccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 26098028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 34477333 - 34477038
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  34477333 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 34477234  T
Q  652 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctttt 749  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  34477233 cactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 34477135  T
Q  750 gtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34477134 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttct 34477038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 505 - 850
Target Start/End: Original strand, 2954368 - 2954713
Alignment:
Q  505 ataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgt 603  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || | || | |||||    
T  2954368 ataaatataggctttgtatcagtgtaaactttgagatagaggagtatgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgt 2954467  T
Q  604 ctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggt 702  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2954468 ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggt 2954567  T
Q  703 agaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatact 802  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||||| |||| |||    
T  2954568 agaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatca-tatagtgaagcggagggatgctctctcccccaaact 2954665  T
Q  803 aggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2954666 aggtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 2954713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 27910389 - 27910744
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaa------ggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggct 589  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||| |||||       |||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||| |    
T  27910389 cttttactataaatatagaccttgtatcaggttaaactttgagagagagatagcgggggctgaaacaaggtttaa-aaaggcaacaacaaaactagggtt 27910487  T
Q  590 tatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||      
T  27910488 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagaggc 27910587  T
Q  690 tgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctc 789  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||    
T  27910588 tgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tataatggaacggagagctgctc 27910686  T
Q  790 tctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910687 tctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27910744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 31545024 - 31545374
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | |||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  31545024 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 31545123  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  31545124 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattagagtctcttggttacgggaagaaattggga 31545223  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||   ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||     
T  31545224 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacagtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 31545321  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31545322 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 31545374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 36402663 - 36402310
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | |||  || ||||||||| || ||||    
T  36402663 cttttactataaatatagaccttatatcagagtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaatcacgaaactagggtttgtata 36402564  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  ||    
T  36402563 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaatctcttggttacgggaggagattggaac 36402464  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || | |||||||||| |    
T  36402463 tttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagatgtctgctctctccc 36402365  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36402364 ccagactaggtcaatttagatcgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 36402310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 552 - 849
Target Start/End: Original strand, 6747306 - 6747600
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | || |||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  6747306 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttgtataaaatttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaa 6747404  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  6747405 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttct-ttttgt 6747503  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
    || ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747504 aacgttactcgtca-tatagtggatcggagggctgctctctctctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 6747600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 497 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 31179706 - 31179368
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   | |||| |||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  31179706 cttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 31179607  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31179606 gagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 31179507  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||     
T  31179506 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 31179409  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  31179408 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 31179368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 31542679 - 31543028
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  31542679 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 31542778  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31542779 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 31542878  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||   ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||     
T  31542879 ctttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctc-tttgtaacagtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 31542975  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31542976 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 31543028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 574 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658338
Alignment:
Q  574 caacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctctt 673  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctctt 658511  T
Q  674 ggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtg 773  Q
    ||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  658510 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtg 658412  T
Q  774 gaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
     |||||| | ||||||||   |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  658411 aaacggatggctgctctc---cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 658338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 18468951 - 18469303
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    ||||| ||||||    |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  18468951 cttttactataaatatagaccttgtatcatgataaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 18469050  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18469051 tatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 18469150  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
     |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| | |||||||||| ||  ||||||||    
T  18469151 ggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tctagtggaacgaagagctgctctc 18469249  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |  |||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  18469250 t--cccagactaggtcaatttggaccgaactggattaacaaattcttttgcgttct 18469303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 12556258 - 12555905
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||| ||||||| |||| | ||||||||||||||| | || ||||    
T  12556258 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtata 12556159  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  12556158 gagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggctacgggaagagattg-gag 12556060  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    | | ||||||| ||| |  ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| || | |||||||| ||||| ||||     
T  12556059 ttttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatc-ttaaagcgaaacggagggctgctatctcc 12555961  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12555960 cccatactagttcaatttggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttctctc 12555905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 630 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 20506042 - 20505825
Alignment:
Q  630 agggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgt 729  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20506042 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  730 aacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaa 829  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||  ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20505942 aacacattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 20505846  T
Q  830 caaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20505845 caaattcttttgtgttctctc 20505825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 21684730 - 21684437
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| || ||||| |    
T  21684730 aaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggata 21684631  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | || || |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  21684630 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgt 21684532  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||   ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21684531 aacaatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttct 21684437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 502 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 6661512 - 6661181
Alignment:
Q  502 actataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtt 600  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| | |||||| |||| |||||  | |||||||||    
T  6661512 actataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattagggtatgtatagagtt 6661414  T
Q  601 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgg 700  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||    
T  6661413 tgt-tcttggcaacaaacactagagttgg--ggttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagattttgg 6661317  T
Q  701 gtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccata 800  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || |    
T  6661316 gtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttgctcataattatagtggaacggatgactgctctctccctcaga 6661217  T
Q  801 ctaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||    
T  6661216 ctaggtcagatttggaccgaactggataaacaaatt 6661181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Original strand, 15552245 - 15552539
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15552245 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 15552344  T
Q  652 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  15552345 cactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 15552443  T
Q  751 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15552444 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 15552539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 619 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585726
Alignment:
Q  619 actagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggaga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||| ||||| |||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggaga 41585857  T
Q  719 cttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcg 818  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  41585856 cttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccg 41585758  T
Q  819 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41585757 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 41585726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 614 - 850
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724190
Alignment:
Q  614 caaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcg 713  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||         |||||| ||||||    
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg---------gtagaattaggcg 2724054  T
Q  714 ggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttg 813  Q
    || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2724055 ggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttg 2724153  T
Q  814 gatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2724154 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 2724190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 10586783 - 10587126
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaa---ggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttat 592  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||| ||| |    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||           
T  10586783 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactag------- 10586875  T
Q  593 atagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
        |||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  10586876 ----agtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagattg 10586971  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  10586972 agactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 10587069  T
Q  792 t-cacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    | | |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10587070 tccccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 10587126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 631 - 847
Target Start/End: Original strand, 39798126 - 39798341
Alignment:
Q  631 gggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgta 730  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39798126 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 39798225  T
Q  731 acacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaac 830  Q
    || ||||||| |||||||| ||| | ||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39798226 acccattgatttctcttttataatgatactcatc-gtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtcaac 39798324  T
Q  831 aaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||||||||||||||    
T  39798325 aaattcttttgtgttct 39798341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 31466313 - 31465971
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||||| |   |||| |||||| |||| | ||| | ||| |||||||||||| || ||||    
T  31466313 cttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataaaaggggctgaaacaaaggtttaaaaaagtaacgacaaaactagggtttgtata 31466214  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  31466213 gagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggac 31466114  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||          ||| |||||||| | |    
T  31466113 tttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatca-tat----------agggctgctctcaccc 31466026  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  31466025 ccagactagttcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtattctctc 31465971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 619 - 847
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410316
Alignment:
Q  619 actagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggaga 718  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 4410189  T
Q  719 cttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcg 818  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||  |||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||    
T  4410190 cttattcttgtaacctattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccg 4410287  T
Q  819 aactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410288 aactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4410316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 492 - 842
Target Start/End: Original strand, 36208519 - 36208865
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct--aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggct 589  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||   ||||||||| |||||| |    
T  36208519 ggatgcttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggtt 36208616  T
Q  590 tatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    | || |||| || |||||  ||   | | |||||||||   |  |||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36208617 t-tagagagatt-tctctaagcgggagaaactagggttgttg--ttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagat 36208712  T
Q  690 tgagactctgggtagaaataggcggg-agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgct 788  Q
    ||||||| ||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  36208713 tgagactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgct 36208812  T
Q  789 ctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgt 842  Q
    || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  36208813 ctttc-cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgt 36208865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 504 - 850
Target Start/End: Original strand, 21288715 - 21289058
Alignment:
Q  504 tataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttg 602  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||  || | ||| ||||||| ||||  ||||||| |||| ||||| || |||||||||||    
T  21288715 tataaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggttgaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttg 21288814  T
Q  603 tctcttggcaacaaacactagggtt------tgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 696  Q
    |||||| | ||||||||||||||||      |||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  21288815 tctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcaccttga-aaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattaggact 21288913  T
Q  697 ctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacc 796  Q
     ||| ||||| || |||||||| || |||||||||| |||        ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  21288914 ttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaactcat--------cttttgtaacgttactcatc-ttatagtgaaacggagggctgctctctcccc 21289004  T
Q  797 catactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21289005 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctc 21289058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 297 - 545
Target Start/End: Original strand, 2723698 - 2723959
Alignment:
Q  297 tgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttgacatgttttatttg 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||        |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2723698 tgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctggaagctgaaaatcggt--------ttcagggcacggtggccgattttgacctgttttatttg 2723789  T
Q  397 agctttaggttcggcaaaaatcggtg---------------------gccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagattt 475  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||                     ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2723790 agcttcaggttcggcaaaaatcggtggccaatttggagcatttggtggccgattttgacagcaggaaataaaacagaaacgtattttcgggcctagattt 2723889  T
Q  476 gttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagag 545  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2723890 gttccaagtttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagag 2723959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 552 - 850
Target Start/End: Original strand, 20053847 - 20054134
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||| |||||||  |||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  20053847 aaacaagggtttagaa-ggcaacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgggaaa 20053942  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |     |||||| |||| |  |||||| |||| |||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  20053943 cactattaggattgagtctcttggtttgg-----agattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc---gatatctcttttgt 20054034  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20054035 aaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggaccgaactgcgtaaacaaattcttttgtgttctctc 20054134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 576 - 850
Target Start/End: Original strand, 9020246 - 9020517
Alignment:
Q  576 acaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttgg 675  Q
    |||||| ||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9020246 acaaaagtagggtttgtatagagttg--ctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttgg 9020341  T
Q  676 ttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgga 775  Q
    | ||||||||||||||   || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9020342 tcacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgga 9020441  T
Q  776 acggaggactgctctctcacccatactaggtc-aatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
     |||| | ||||||||||  ||| | ||||||   |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  9020442 tcggatggctgctctctcctccaaattaggtctgttttggaccgaactggataaaccaattcttttgtgttctctc 9020517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 497 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 26098586 - 26098391
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||| |||| |||||||| || ||||||| || ||||    
T  26098586 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgtata 26098487  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26098486 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaaacactattatgattgagtctcttggttacggaaagagattg 26098391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 648 - 839
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10749986
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 10749894  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttt 839  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10749895 tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttt 10749986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38960117
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 38960216  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    || |||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  38960215 tt-gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 38960118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 594 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 17413402 - 17413200
Alignment:
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 693  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  17413402 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgag 17413306  T
Q  694 actctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 792  Q
    ||| | ||||||| ||||   | | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  17413305 actttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctct 17413206  T
Q  793 caccca 798  Q
    | ||||    
T  17413205 ccccca 17413200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354560
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15354659  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    || |||| ||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15354658 tt-gtaacgttactcattaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 15354561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665337
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23665238  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    || |||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23665239 tt-gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 23665336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793250
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23793349  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    || |||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23793348 tt-gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 23793251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3373122
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattga-gtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 3373222  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||  ||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3373221 tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 3373123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 648 - 839
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757462
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||     
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttc- 10757370  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttt 839  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  || || |||||||||||||||||||||||    
T  10757371 tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaacaaattcttt 10757462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356836
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15356935  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    || |||| ||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15356934 tt-gtaacgttactcattaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 15356837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 665 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 23742023 - 23741844
Alignment:
Q  665 gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatc 764  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  23742023 gagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 23741926  T
Q  765 attatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |  |||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23741925 aa-atagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 23741844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 634 - 808
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143722
Alignment:
Q  634 ttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaac 732  Q
    |||||||||| | |||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||  || | ||||||||| ||||   || ||||||||||||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 15143646  T
Q  733 acattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| || | |||||||||    
T  15143647 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtca 15143722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 652 - 846
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4898023
Alignment:
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||  || |||| |||||||||||   ||||||||||| |||    
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattg 4897927  T
Q  751 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| | || ||||| |||| |||||||||||||| | || ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4897928 taaagttactcatcattatagcggaacagtgggctgctttctcccccatactaggtcagtattcgactgaactgggtaaacaaatt-ttttgtgttc 4898023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 470 - 720
Target Start/End: Original strand, 42770691 - 42770934
Alignment:
Q  470 agatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct--aaacaagggttcagaa 567  Q
    |||||||||| | ||||||   |||| ||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||  |||    
T  42770691 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatataaactttgtatcga-gtaaaccttgagatagaggggactgaaaacaagggtttggaa 42770789  T
Q  568 aggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgag 667  Q
     ||||||| ||||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |  |||| ||||||| ||||||||  ||||| || ||||    
T  42770790 -ggcaaca-caaaattaggt-ttatatagaatttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttcattcaccatgggaaac--tattaggactgag 42770881  T
Q  668 tctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagact 720  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||    
T  42770882 tctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 678 - 766
Target Start/End: Original strand, 42770936 - 42771024
Alignment:
Q  678 acgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 766  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42770936 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 42771024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 740 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 26098380 - 26098270
Alignment:
Q  740 tatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcaccc-atactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  26098380 tatctcttttgtaacgttactcatcat-atggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattctt 26098282  T
Q  839 ttgtgttctctc 850  Q
    || |||||||||    
T  26098281 ttatgttctctc 26098270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 497 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 20507797 - 20507659
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| || || || ||||    
T  20507797 cttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtttgtata 20507698  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggt 634  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||    
T  20507697 gagtttgtctctttggaacaaacacaagggtttaagggt 20507659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 682 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 15445417 - 15445263
Alignment:
Q  682 gaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacgga 780  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||   || || | ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  15445417 gaagagattgagactttgagtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaa 15445318  T
Q  781 ggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    || |||||||||  |||| ||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||    
T  15445317 gggctgctctct-tcccagactaggtcagtattggactgaactgggtaaacaaatt 15445263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 360
Target Start/End: Original strand, 695631 - 695697
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgatttt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  695631 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattgaaattctggaagctgaaaattggtggccgatttt 695697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 603 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 34033797 - 34033563
Alignment:
Q  603 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag-actctgg 700  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  | |||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||    
T  34033797 tctcttggcaacaaacactagcgttgg--gattgatttaccttggagaaacactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattcaggattttgg 34033700  T
Q  701 gtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacatt-gatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcaccca 798  Q
    |||||| || |   || ||||| || | ||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||| |||     
T  34033699 gtagaattaagtttgaagacttgttatggtaaccccttcgatatctcttttgtaaagttactcatcattactgtggaacatagaactgctctctc-ccct 34033601  T
Q  799 tactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  34033600 gactaggtcagtattggatcgaactgggtaaacaaatt 34033563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 594 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 2144801 - 2144601
Alignment:
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaa-acactagggtttgagggttgattcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||     
T  2144801 tagagtttg-ctcttggcaacaacacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtcgcgggaagagattc 2144705  T
Q  692 ag-actctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattg-atatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgct 788  Q
    || ||| ||||| ||| ||||   || |||| |||||||||||   ||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2144704 aggactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttttatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgct 2144606  T
Q  789 ctctc 793  Q
    |||||    
T  2144605 ctctc 2144601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 785 - 850
Target Start/End: Original strand, 20043222 - 20043287
Alignment:
Q  785 tgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20043222 tgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctc 20043287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 294 - 382
Target Start/End: Original strand, 20042770 - 20042858
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttg 382  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  20042770 tgttgtgaaagtgatttaaaattgaagaaattggaattctggaagaagaaaattgatggccgattttcagggcacggtggccgaatttg 20042858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 2144982 - 2144877
Alignment:
Q  443 ataaaacataaacgtattttc-gggcctagatttgttctagttttattgagg-attcttttactataaatatagacattgtatc-ggtgtaaaccttgag 539  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  2144982 ataaaacataaacgtattttctgggccgagatttgttccaattat-ttgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgag 2144884  T
Q  540 atagaga 546  Q
    | |||||    
T  2144883 agagaga 2144877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 594 - 711
Target Start/End: Original strand, 4754198 - 4754312
Alignment:
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 693  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||  |||||||||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  4754198 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgaaaaacactattagaattgagcctcttggtcactggaagagattgtg 4754294  T
Q  694 actctgggtagaaatagg 711  Q
    ||| ||| ||||| ||||    
T  4754295 actttggatagaattagg 4754312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 634 - 780
Target Start/End: Original strand, 35430259 - 35430408
Alignment:
Q  634 ttgattcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgta 730  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||| | | || ||||||||| ||||   || |||| |||||||||    
T  35430259 ttgattcaccttggagaaacactattacaattgagtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 35430358  T
Q  731 acacatt-gatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacgga 780  Q
    |  | || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35430359 attcttttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacgga 35430408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 652 - 838
Target Start/End: Original strand, 22672837 - 22673022
Alignment:
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||| |    
T  22672837 cactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 22672931  T
Q  751 taaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    ||| |  ||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  22672932 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 22673022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1170967
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  1170811 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 1170905  T
Q  748 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  1170906 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 1170967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 696
Target Start/End: Original strand, 10627364 - 10627411
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 696  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10627364 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagact 10627411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 552 - 706
Target Start/End: Original strand, 29748352 - 29748502
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgg-gaa 650  Q
    ||||||||||| |||| | |||||| |||||||||| || || ||| ||   |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||  | ||| |||    
T  29748352 aaacaagggtttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacagtagggtt--aggattgattcgtcttggagaa 29748445  T
Q  651 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactctgggtagaa 706  Q
    |||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| |||||||||    
T  29748446 acactaataggattgagtctcttggtcacgggaatagattcgggactttgggtagaa 29748502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 2298183 - 2298122
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg 711  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||    
T  2298183 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagact-tgggtagaattagg 2298122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 497 - 587
Target Start/End: Original strand, 4410001 - 4410096
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactaggg 587  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| | | |||| ||||||    |||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4410001 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 4410096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 763 - 832
Target Start/End: Original strand, 11916996 - 11917065
Alignment:
Q  763 tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 832  Q
    |||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  11916996 tcattatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 11917065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 458 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 15225155 - 15225067
Alignment:
Q  458 attttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaa 547  Q
    ||||| |||| ||||||||||| | |||| || ||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  15225155 atttttgggcttagatttgttccaatttt-ttaaggatgcttttactataaacataaaccttgtaacgatgtaaaccttgagagagagaa 15225067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 762 - 838
Target Start/End: Original strand, 28786515 - 28786592
Alignment:
Q  762 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  28786515 atcattataatggaacggagaactgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 28786592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 762 - 838
Target Start/End: Original strand, 42238371 - 42238448
Alignment:
Q  762 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  42238371 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 42238448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 722 - 782
Target Start/End: Original strand, 20045210 - 20045270
Alignment:
Q  722 attcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggagg 782  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  20045210 attcttttaacccattgatatcttttttgtaaagttacttatcattatagagaaacggagg 20045270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 648 - 711
Target Start/End: Original strand, 32520533 - 32520597
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga-gactctgggtagaaatagg 711  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||    
T  32520533 gaaacactattaagattgagtctctcgattacgggaagagattcatgactttgggtagaattagg 32520597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 603 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 15224997 - 15224897
Alignment:
Q  603 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctg-ggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactctgg 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| ||  |||||||||||| |||  ||||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||    
T  15224997 tctcttggcaacaaacactagggtt--atgattgattcaccttgaagaaacactattaggataaagtcttttggtcatgggaagagattcgagactttgg 15224900  T
Q  701 gta 703  Q
    |||    
T  15224899 gta 15224897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 654 - 838
Target Start/End: Original strand, 25445501 - 25445684
Alignment:
Q  654 ctattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgta 752  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   || |||| |||||||| || ||   |||||||||| |||    
T  25445501 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctcttt-gta 25445595  T
Q  753 aggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    | |  ||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  25445596 aagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25445684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 497 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 41586041 - 41585950
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactaggg 587  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||   ||| |||||||||||||    
T  41586041 cttttactataaatataggttttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaataacaagaacaaaactaggg 41585950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 762 - 808
Target Start/End: Original strand, 1240539 - 1240585
Alignment:
Q  762 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  1240539 atcattatagtggaacggagagctgctctctctcccaaactaggtca 1240585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 31782639 - 31782597
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31782639 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattg 31782597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385596
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35385634 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 35385596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 97)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 404 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 11739988 - 11739541
Alignment:
Q  404 ggttcggcaaaaatcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttac 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11739988 ggttcggcaaaaatcggtggccgattttgacagcagaaaataaaacagaaacgtattttcgtgtctagatttgttccagttttattgaggattcttttac 11739889  T
Q  504 tataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggcta-aacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttg 602  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||| |||||||    
T  11739888 tataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctggaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatggagtttg 11739789  T
Q  603 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggt 702  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| |||||    
T  11739788 tctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattgggactttgggt 11739689  T
Q  703 agaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatact 802  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  11739688 agaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccccagact 11739589  T
Q  803 aggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11739588 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 11739541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 296 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 34980136 - 34979559
Alignment:
Q  296 ttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttgacatgttttattt 395  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||| |||||| | | ||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  34980136 ttgtgaaaatgcctcaaaattgaagaaattagaattctagaagctgaaaatcggtggccgatttttaggacacggtggccgattttgacctgctttattt 34980037  T
Q  396 gagctttaggttcggcaaaaatcgg---------------------tggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatt 474  Q
    |||||||||||| ||||||||||||                     ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  34980036 gagctttaggtttggcaaaaatcggggcccaatttggagcattcggtggccgattttcacagcagaaaataaaacagaaacgtatcttcgggcctagatt 34979937  T
Q  475 tgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaa 573  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||| ||    
T  34979936 tgttccagttttattgaggattctttggccataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagcgtttagaaaggtaa 34979837  T
Q  574 caacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctctt 673  Q
    ||| |||||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34979836 caaaaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctctt 34979737  T
Q  674 ggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtg 773  Q
    |||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34979736 ggttacgggaagagattcggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttgtaaggttcctcatcattatagtg 34979637  T
Q  774 gaacggaggactgctct-ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||| ||| || |||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34979636 gaacgaagggctactctccccccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 34979559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 294 - 850
Target Start/End: Original strand, 14836971 - 14837541
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttgacatgttttat 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14836971 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattagaattctggaagctgaaaattggtggccg-ttttcagggcacggtggccgattttgacatgttttat 14837069  T
Q  394 ttgagctttaggttcggcaaaaatcggtggccgattt---------------------tgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctaga 472  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||                     |||||||| |||| |||| | ||||||||||||| || ||||    
T  14837070 ttgagcttcaggttcggcaaaaatcggcggccgatttggagcattcggagaccgattttgacagcagaaaaaaaaa-acaaacgtattttcgagcttaga 14837168  T
Q  473 tttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggc 571  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| | |||| |    
T  14837169 tttgctccagttttattgaggattcttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggttaaaaaagac 14837268  T
Q  572 aacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctc 671  Q
    |||||||||||||||| || || | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  14837269 aacaacaaaactagggtttgtacatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 14837368  T
Q  672 ttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatag 771  Q
    ||      ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14837369 tt------gggaagagattgagactttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatag 14837462  T
Q  772 tggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || |||||| |  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14837463 tgaaacggatggatgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctc 14837541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 417 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 15539890 - 15539553
Alignment:
Q  417 tcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagac 516  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15539890 tcggtggccgattttgacagcagaaaataaaacagaaacgtattttcgggcctagatttgttccagttttattgaggattgttttactataaatatagac 15539791  T
Q  517 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 615  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||  || | ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15539790 attgtatcagtgtaaaccttgagatatagggggttgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaca 15539691  T
Q  616 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 715  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15539690 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggg 15539591  T
Q  716 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaa 753  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15539590 agacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaa 15539553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 420 - 850
Target Start/End: Original strand, 3022006 - 3022445
Alignment:
Q  420 gtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacatt 519  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  3022006 gtggccgattttgatagcaggaaataaaacagaaacgtattttcgggcctagatttgttggagttttattgaggattctcttactataaatatagacttt 3022105  T
Q  520 gtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaac 618  Q
    ||||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  3022106 gtatcagagtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaac 3022205  T
Q  619 actagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggaga 718  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||    
T  3022206 actacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggttttaggtagaattaggcgggaga 3022305  T
Q  719 cttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatca---------ttatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaa 809  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||         ||||| || ||| || | |||||||||| |||| ||||||||||    
T  3022306 cttattcttgtaacccattaatatctc-tttataaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaa 3022404  T
Q  810 tttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3022405 tttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 3022445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 492 - 850
Target Start/End: Original strand, 17849032 - 17849390
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| | |     
T  17849032 ggatgcttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagataacaacaaaactagagttc 17849131  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
     ||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17849132 gtatagagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagatt 17849231  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  17849232 gagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacgg-gggctgctct 17849330  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| | |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17849331 ctcccacatactaggtcaatttggacaagactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 17849390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 42923846 - 42923491
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga--tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttata 593  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  || ||    
T  42923846 cttttactataaatatagaccttgaatcatagtaaaccttgagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttgta 42923747  T
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 693  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  42923746 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggg 42923647  T
Q  694 actctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 793  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  42923646 gctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcgtca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 42923548  T
Q  794 acccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
     || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42923547 ccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 42923491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 492 - 850
Target Start/End: Original strand, 17848360 - 17848713
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  || |||||||||||||  |||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  17848360 ggattcttttactataaatataggctttgtatcagt--aatccttgagatagagggggctcaaacgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggttt 17848457  T
Q  591 atatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17848458 gtatagagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 17848557  T
Q  690 tgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctc 789  Q
    |||| || ||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  17848558 tgaggctttgggtaga---aggcgggagacttattcttgtaac-cattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatgactgctc 17848652  T
Q  790 tctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17848653 tctcccccatactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 17848713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 492 - 849
Target Start/End: Original strand, 19007555 - 19007912
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||    
T  19007555 ggattcttttactataaatataggctttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggttt 19007654  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19007655 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagatt 19007754  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    | | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||    
T  19007755 ggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacgaagggctgctct 19007853  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19007854 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctct 19007912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 40032393 - 40032035
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  40032393 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 40032294  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||    
T  40032293 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggttaggac 40032194  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgata----tctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
    | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  40032193 tttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaagttactcatcattatagtgaaacggagggccgctctc 40032094  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40032093 tccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtattctctc 40032035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 6259150 - 6258799
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||| ||||||||||| ||| | ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  6259150 cttttactataaatatagaccttgtattagactaaactttgagatagaggaggatgaaacaagagtttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtata 6259051  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | |    
T  6259050 gagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga--agattggggc 6258953  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  6258952 tttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtgaaacggagggctgctctctc-c 6258854  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6258853 ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 6258799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 27104719 - 27105067
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  27104719 cttttactataaatatagaccttgtatcagagaaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 27104818  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  27104819 gagtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 27104917  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  27104918 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacattactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 27105015  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27105016 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27105067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 468 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 44289432 - 44289049
Alignment:
Q  468 ctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaa-caagggttcaga 566  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||   | ||||||||| ||||||  | ||||| ||| |||| ||     
T  44289432 ctagatttgttccagttttattgaggattcttttactataaatataggttttgtatcatagcaaaccttgatatagaggggactaaaacaaaggtttagg 44289333  T
Q  567 aaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattga 666  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  44289332 aaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 44289233  T
Q  667 gtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 766  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || | || | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44289232 gtcacttggttacgggaagagattgggacttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaagattactcatcat 44289133  T
Q  767 tatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||||| ||| || |  |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44289132 tatagtgaaacagatggttgctctttcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 44289049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 492 - 850
Target Start/End: Original strand, 28196552 - 28196908
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  28196552 ggattcttttactataaatatatgctttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 28196651  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28196652 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagatt 28196751  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    ||| || ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||| | | |||||||    
T  28196752 gaggctttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatca-tatagtgaaacgaatggctgctct 28196850  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28196851 ctcccccagactaggtcaatt--gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 28196908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 498 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 19502345 - 19501996
Alignment:
Q  498 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatag 596  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| | |||||| ||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  19502345 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtag 19502246  T
Q  597 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 696  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19502245 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 19502146  T
Q  697 ctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacc 796  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  19502145 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcgaagggctgctctctcccc 19502047  T
Q  797 catactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502046 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 19501996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 42452703 - 42453050
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | | |||| | |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  42452703 cttttattataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 42452802  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
     |||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  42452803 aagtttgtctct--gtaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 42452900  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  42452901 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctc-c 42452998  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452999 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42453050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 498 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 6264479 - 6264130
Alignment:
Q  498 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatag 596  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||||||||  |||| |||||| |||| |||||||||||||||||    ||| || |||||    
T  6264479 ttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatag 6264384  T
Q  597 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 696  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  || |||||| | ||    
T  6264383 agtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgataaaagattggggct 6264284  T
Q  697 ctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacc 796  Q
     ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  6264283 ttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccc 6264184  T
Q  797 catactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6264183 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 6264130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 19504680 - 19504331
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| | |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  19504680 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 19504581  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  || |||    
T  19504580 gagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagaggctgggac 19504482  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| |    
T  19504481 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctatctccc 19504383  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504382 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 19504331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 22287671 - 22287318
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  22287671 cttttactataaatatagaccttgtattaaagtaaactttgagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 22287572  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    |||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  22287571 gagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgacac 22287472  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    |  |||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| |    
T  22287471 ttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaatggagggctgctctctccc 22287373  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22287372 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 22287318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 21521030 - 21520675
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaagg--ct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttata 593  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |  ||||| |||||| | ||| ||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21521030 cttttactataaatataaaccttgtatcagactaaactttgagagatagatggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggcttgta 21520931  T
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 693  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |  |    
T  21520930 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctagg 21520831  T
Q  694 actctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 793  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||    
T  21520830 actttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctc 21520732  T
Q  794 acccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
     |||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21520731 ccccagactaggtcaatttggaccgaactttgtcaacaaattcttttgtgttctctc 21520675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 42064435 - 42064785
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| | |||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  42064435 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 42064534  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  42064535 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 42064634  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||   ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  42064635 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 42064732  T
Q  796 ccatactaggtc-aatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064733 ccagactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42064785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 45280320 - 45279969
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaag-gcaacaacaaaactagggcttatat 594  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| | | |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| || |||    
T  45280320 ctttcactataaatatataccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 45280221  T
Q  595 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  45280220 agagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 45280121  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||     
T  45280120 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcc 45280022  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45280021 cccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 45279969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 13910379 - 13910030
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| | |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  13910379 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 13910280  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  13910279 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagagactggaac 13910180  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||   ||||||||| ||||||||| | || | |||||||||| |    
T  13910179 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcagatggctgctctctccc 13910082  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910081 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13910030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 23452576 - 23452222
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaa----ggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||| ||| |     |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  23452576 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 23452477  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  23452476 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 23452377  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
     |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||    
T  23452376 ggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctc 23452278  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452277 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 23452222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 43623903 - 43623562
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||   |||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  43623903 cttttactataaaaatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagaggggggtgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 43623804  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    |||||||||||            |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  43623803 gagtttgtctc------------actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 43623716  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |    
T  43623715 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccc 43623617  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43623616 ccaaactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 43623562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 492 - 836
Target Start/End: Complemental strand, 31733105 - 31732772
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| | | |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  31733105 ggatgcttttactataaatatagactttgtaacagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagttt 31733006  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||            ||    
T  31733005 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttggt------------tt 31732918  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31732917 gggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctct 31732818  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattc 836  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  31732817 ctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtaaacaaattc 31732772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 24162547 - 24162208
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  24162547 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 24162448  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |          || |||    
T  24162447 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttgc----------tgggac 24162358  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||| |    
T  24162357 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaatgctactcatca-tatagtggattggatggctgctctctccc 24162260  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24162259 ccggactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 24162208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 497 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 11578439 - 11578136
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | ||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | |||||| |||||||||| || ||||    
T  11578439 cttttactataaatatagaccttatatcagggtaaatcttgagatagagtgggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaaaaaaactagggtttgtata 11578341  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    || ||| ||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  11578340 gaatttttctcttggcaacaaac--tagggttgg--ggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac 11578245  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |    
T  11578244 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgctctttccc 11578145  T
Q  796 ccatactag 804  Q
    ||| |||||    
T  11578144 ccagactag 11578136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 421 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 22163358 - 22163106
Alignment:
Q  421 tggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattg 520  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22163358 tggccaattttgacagcaggaaataaaacagaaatgtattttcgggcctagatttgttccagttttattgaggattcttttactataaatatagacattg 22163259  T
Q  521 tatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaaca 619  Q
    |||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||   ||||||||    
T  22163258 tatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaaca 22163159  T
Q  620 ctagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctctt 673  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  22163158 ctagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta-ggttgagtctctt 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 35218242 - 35217948
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  35218242 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 35218143  T
Q  652 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||    
T  35218142 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccgttgatttctc-tttg 35218044  T
Q  751 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  35218043 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 35217948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 626 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375328
Alignment:
Q  626 tttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattc 725  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg-agacttattc 5375452  T
Q  726 ttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactggg 825  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5375451 ttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcat-atagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggg 5375353  T
Q  826 tcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5375352 tcaacaaattcttttgtgttctctc 5375328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 35215865 - 35215571
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  35215865 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 35215766  T
Q  652 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  35215765 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttg 35215667  T
Q  751 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  35215666 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 35215571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 410 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 17897664 - 17897242
Alignment:
Q  410 gcaaaaatcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgagg-attcttttactataa 508  Q
    ||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||| || | |||||| ||||  |||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||    
T  17897664 gcaaaaatcggggcccgattttttcagcagaaaataaaacagaatcatatttt-gggctgagatttgttccagtttttttgagggatacttttactataa 17897566  T
Q  509 atatagacattgtatcgg-tgtaaaccttgagatagagaaggctaa--acaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtct 605  Q
    |||||||| ||||||| | |||||| |||||| |||||| | || |  ||||||||| |||| | |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  17897565 atatagaccttgtatcagatgtaaaacttgaggtagaga-gtctgagaacaagggtttagaa-gtcaacaataaaactagggtttgtatagagtttg-ct 17897469  T
Q  606 cttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtaga 705  Q
    ||| |||||||||||||||  |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||| ||||||||| | || |||||    
T  17897468 cttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaaaagattgagattttgagtaga 17897372  T
Q  706 aataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactagg 805  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||| ||||||    
T  17897371 attaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatggctgctctctc-cccagactagg 17897273  T
Q  806 tcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    ||| | ||||  |||||||||| ||||||||    
T  17897272 tcagtattggtccgaactgggtaaacaaatt 17897242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 592 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 28459429 - 28459172
Alignment:
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28459429 tatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtttg 28459330  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
     | ||   |||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  28459329 gggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggcttctctc 28459230  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  28459229 t-acctagactaggtcaatttggatcgaactagataaacaaattcttttgtgttctctc 28459172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 492 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 45239321 - 45239000
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcgg-tgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactag 585  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |  ||| | ||||||||||||||    |||||  |||| |||||| | || |||||| ||| |||||||||||    
T  45239321 ggatgcttttactataaatatagaccattcatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaatgatttagaaagacaaaaacaaaactag 45239222  T
Q  586 ggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaag 685  Q
    || || |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45239221 ggtttgtatagactttctct-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 45239123  T
Q  686 agattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggact 785  Q
    |||||| |  | | ||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  45239122 agattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggct 45239024  T
Q  786 gctctctcacccatactaggtcaa 809  Q
    |||||||| |||| ||||||||||    
T  45239023 gctctctcccccagactaggtcaa 45239000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 579 - 850
Target Start/End: Original strand, 22874137 - 22874404
Alignment:
Q  579 aaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggtta 678  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| || |    
T  22874137 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtca 22874232  T
Q  679 cgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacg 778  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  22874233 cgggaagagattgaggctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaact 22874332  T
Q  779 gaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22874333 gagagctgctctctccctcatactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattctcttgtgttctctc 22874404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 18800637 - 18800295
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | |||||| ||  |||| ||||||||||| |||||          || |||||| || ||||    
T  18800637 cttttactataaatatagaccttgtatcagggtaaacatggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aagctagggtttgtata 18800546  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| | |    
T  18800545 gaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattggggc 18800450  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| |    
T  18800449 tttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcattatagtgaaacggagggctactctctc-c 18800351  T
Q  796 ccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| || ||||||  |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18800350 ccagaccaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctc 18800295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 552 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 20146884 - 20146604
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||| | |||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||| |||||||    
T  20146884 aaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaa 20146789  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    || || || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20146788 caatagtaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgt 20146689  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||| |||| | ||||| |||||||||| ||| ||||    
T  20146688 aaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatt 20146604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 404 - 587
Target Start/End: Original strand, 38019970 - 38020154
Alignment:
Q  404 ggttcggcaaaaatcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttac 503  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  38019970 ggttcagcaaaaatcagtggccgattttgacagtagaaaataaaacagaaacgtattttcgggcctagatttattccagttttattgaggatttttttac 38020069  T
Q  504 tataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactaggg 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38020070 tataaatatagacattgtatcggtgtaaacctggagatagagggggttggaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 38020154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558849
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 36558949  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36558948 tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 36558850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561126
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 36561226  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36561225 tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 36561127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 492 - 850
Target Start/End: Original strand, 35107215 - 35107569
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaa--caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggct 589  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| | |||||  |||| ||| |||| | |||||| |||||||||| |    
T  35107215 ggatacttttactataaatatagacattgtatcatagtaaaccttgaggtagaga-gtctaaaaccaagagtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtt 35107312  T
Q  590 tatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||    || ||| || |||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35107313 tgtatagagtttg-ctcttggcaacaaaca----gggttg-ggattgattcaccttgagaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagat 35107406  T
Q  690 tgagactctgggtagaaataggcg--ggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgc 787  Q
    || |||| ||||||||| |||     | ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||     
T  35107407 tgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaac-ctttgttatctcttttgtaatgttactcatcattatagtggaacggatggttgt 35107505  T
Q  788 tctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||  |||| ||||||||| | ||||| |||| | ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  35107506 tctctttcccagactaggtcagtattggaccgaaataggtaaacaaatatttttgtgttctctc 35107569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 700 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 22407585 - 22407436
Alignment:
Q  700 ggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccat 799  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||     
T  22407585 ggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccag 22407487  T
Q  800 actaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22407486 actaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 22407436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 552 - 676
Target Start/End: Original strand, 38020178 - 38020302
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  38020178 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccatggtaaa 38020277  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggt 676  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  38020278 cactattaggattgagtctcttggt 38020302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332166
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||     
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctc- 45332266  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||| |  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||    
T  45332265 tttgtaaaggtactcatca-tatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttc 45332167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 497 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 22407744 - 22407591
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||| ||   ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  22407744 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgtgagatatagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 22407645  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctggga 649  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22407644 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 22407591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 712 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707733
Alignment:
Q  712 cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac--ccatactaggtcaa 809  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |  ||| ||||||||||    
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaa 22707774  T
Q  810 tttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22707773 tttggactgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 22707733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 470 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 37963289 - 37962938
Alignment:
Q  470 agatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaa 568  Q
    |||||||||| | ||||||   |||| |||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||    
T  37963289 agatttgttccaattttatgatggatacttttactataaatatagactttgtataagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 37963190  T
Q  569 ggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagt 668  Q
              ||||||||| || | || |||||| |||||| |||||||||| | ||||   | |||||||| || | | ||||| ||||  ||||||||    
T  37963189 tc--------aaactagggtttgtgtatagtttg-ctcttgacaacaaacaccatggtt---gtgttgattccccttagaaaacattattgagattgagt 37963102  T
Q  669 ctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcatta 768  Q
    |||||||| ||  |||||||||||| || ||||||||| ||| || |||||||||||||||||  ||||||| |   |||||||| |||| |||||||||    
T  37963101 ctcttggtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaatccattgattt---ttttgtaaagttattcatcatta 37963005  T
Q  769 tagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    ||||| ||| | |||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  37963004 tagtgaaacagtggactgatctctctcccacactaggttaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 37962938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 632 - 808
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699606
Alignment:
Q  632 ggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgta 730  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||   | ||||||||| |||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 40699528  T
Q  731 acacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| || |||| |||||||||    
T  40699529 atcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtca 40699606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 649 - 781
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589896
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcg-ggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20589763 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctctt 20589862  T
Q  748 ttgtaaggttactcatcattatagtggaacggag 781  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20589863 ttgtgaagttactcatcattatagtgtaacggag 20589896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 742 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 22163111 - 22163004
Alignment:
Q  742 tctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttg 841  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22163111 tctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttg 22163013  T
Q  842 tgttctctc 850  Q
    |||||||||    
T  22163012 tgttctctc 22163004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 589 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 27136365 - 27136195
Alignment:
Q  589 ttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaga 688  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||| |    
T  27136365 ttatatagagcttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaagaaa 27136269  T
Q  689 ttgagactctgggtagaaataggcg-ggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactc 761  Q
    ||| |||| || |||||| ||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27136268 ttgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactc 27136195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 711 - 850
Target Start/End: Original strand, 23870951 - 23871089
Alignment:
Q  711 gcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat 810  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| |  | | |||||||||    
T  23870951 gcggcagacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtcaat 23871049  T
Q  811 ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23871050 ttggatcaaactaggtcaacaaattcttttgagttctctc 23871089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 702 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462950
Alignment:
Q  702 tagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatac 801  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccatta-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagac 7462979  T
Q  802 taggtcaa-tttggatcgaactgggtcaa 829  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7462978 taggtcaattttggaccgaactgggtcaa 7462950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 594 - 808
Target Start/End: Original strand, 43139395 - 43139606
Alignment:
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 693  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  43139395 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcatcttgggaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgag 43139491  T
Q  694 actctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 792  Q
    ||| | ||||||| |||| |   ||||| ||| |||||||   ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |    
T  43139492 actttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaaccttttgatttctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggtacagaggactgttcttt 43139590  T
Q  793 cacccatactaggtca 808  Q
      || |||||||||||    
T  43139591 tccctatactaggtca 43139606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 291 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 15540038 - 15539947
Alignment:
Q  291 aattgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttg 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15540038 aattgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctggaagcagaaaatcgatggccgattttcaaggctcggtggccgattttg 15539947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 594 - 850
Target Start/End: Original strand, 35028595 - 35028846
Alignment:
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 693  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||     
T  35028595 tagagtttg-ctcttggtaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcgcattggaaaacactattatgattgagtctcttgatcacgagaagagattgac 35028691  T
Q  694 actctgggtagaaata-ggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 792  Q
    ||| ||||||||| || |   | | ||| |||||||||||   || ||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||    
T  35028692 actttgggtagaattatgtttgaatactaattcttgtaaccttttaatatctcttttctaaaattactcatcattgcagtggaacggagagctgctctct 35028791  T
Q  793 cacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    | ||| |||||||||| | |  |||||||||| | |||||||| |||||| |||||||    
T  35028792 cccccttactaggtcagtat--atcgaactggctaaacaaatt-ttttgtattctctc 35028846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 294 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 11740078 - 11740009
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaa 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  11740078 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagttgaaaatcggtggccgattttcaa 11740009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 633 - 781
Target Start/End: Original strand, 15693958 - 15694109
Alignment:
Q  633 gttgattcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgt 729  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||||||| || |||||||||| | |||| ||||||||| ||||   || |||| ||||||||    
T  15693958 gttgattcaccgtggagaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 15694057  T
Q  730 aacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggag 781  Q
    |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15694058 aaccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattttagtggaacggag 15694109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22163485 - 22163419
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgatttt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  22163485 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctggaagctgaaaatcggtggccgatttt 22163419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 552 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 5377708 - 5377629
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgag 631  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  5377708 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgag 5377629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 619 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  619 actagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggaga 718  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||| |||| | ||||||| |||||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcac-ggaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggaga 38414194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 649 - 798
Target Start/End: Original strand, 33603994 - 33604143
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| |||||||||| | || |||| ||||   || |||| |||||| ||||   ||||||| ||||    
T  33603994 aaacactattataattgagtcttttggtcatgggaagtgattgagactttaggaagaattaggtttgaagactaattcttctaaccttttgatatatctt 33604093  T
Q  748 ttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcaccca 798  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  33604094 t-gtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccca 33604143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 372
Target Start/End: Original strand, 3021839 - 3021917
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||| |||||||| ||| |||||    
T  3021839 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctggaagcaggaaatccgtggccgattttcagggctcggtg 3021917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 594 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 27583573 - 27583472
Alignment:
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 693  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27583573 tagagttt-tctcttggcaacgaacactaaggttgggag--tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag 27583477  T
Q  694 actct 698  Q
     ||||    
T  27583476 tctct 27583472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 34483802 - 34483733
Alignment:
Q  4 aacagagttcacatacgaaaactttgaggataaatacacaaatggggaattgctgaaagactacattgtt 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || ||||||| |||||||||    
T  34483802 aacagagttcacatacgaaaactttgaggataaatacacaaaagcagaactgatgaaagattacattgtt 34483733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 648 - 808
Target Start/End: Original strand, 17921769 - 17921927
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctc 745  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||| ||||     | ||| ||||||| ||| | |||||   ||    
T  17921769 gaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggttttaaaactgattcttgcaaccctttgat---tc 17921865  T
Q  746 ttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  17921866 tttcataaagttagtcatcattatagtggaacggagggctgctctct-acccagactaggtca 17921927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 672 - 777
Target Start/End: Complemental strand, 13828503 - 13828397
Alignment:
Q  672 ttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 770  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| || |   || |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  13828503 ttggtcacgggaagagattcagactttgggtagaattatgtttgaagacttattcttgtagccctttgatatctcttttgtaaaattactcataattata 13828404  T
Q  771 gtggaac 777  Q
    |||||||    
T  13828403 gtggaac 13828397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 12342817 - 12342697
Alignment:
Q  424 ccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtat 523  Q
    |||| |||| ||||| |||| | ||||||| | |||||| |||   |||||||||| | |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12342817 ccgaatttgccagcagaaaaaataacataatcatatttttggggtcagatttgttccaattttttt-aggatacttttactataaatatacacattgtat 12342719  T
Q  524 cggtgtaaaccttgagatagag 545  Q
    | | ||||||||||||||||||    
T  12342718 cagagtaaaccttgagatagag 12342697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 652 - 808
Target Start/End: Original strand, 17943540 - 17943692
Alignment:
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  17943540 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctc-tttg 17943634  T
Q  751 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    ||| |  |||||||||||||||||| | |||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  17943635 taaagaaactcatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtca 17943692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687139
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  39686983 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 39687077  T
Q  748 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  39687078 ttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 39687139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 808 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 15539553 - 15539511
Alignment:
Q  808 aatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539553 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 15539511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 633 - 706
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345735
Alignment:
Q  633 gttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactctgggtagaa 706  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaa 26345735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 652 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 27517818 - 27517664
Alignment:
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||| |    
T  27517818 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 27517724  T
Q  751 taaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    ||| |  ||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  27517723 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 27517664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 34473706 - 34473648
Alignment:
Q  8 gagttcacatacgaaaactttgaggataaatacacaaatggggaattgctgaaagacta 66  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  34473706 gagttcacctacgaaaactacgaggataaatacacaaatggggaactgttgaaagacta 34473648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741097
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||     ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  2740941 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggact-tgggtagaattaggtttaaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 2741035  T
Q  748 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  2741036 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 2741097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Original strand, 39680045 - 39680201
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||   | ||| | ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  39680045 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagact-tgggtagaattaggtttgaagattgattcttgaaactcat---tatctc-t 39680139  T
Q  748 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  39680140 ttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 39680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458949
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg 711  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||| ||||    
T  28459011 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 746 - 808
Target Start/End: Original strand, 39287262 - 39287324
Alignment:
Q  746 ttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||    
T  39287262 ttttgtaaaattactcatcattatagtggaacgaagagctgctctctccctcatactaggtca 39287324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 649 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054759
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |    
T  20054947 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 20054853  T
Q  748 ttgtaaggttactc--atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    |||||| |  ||||  ||||||||||| || |||||  ||||||||||  ||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  20054852 ttgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 20054759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736361
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| | ||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  2736205 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-ttggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 2736299  T
Q  748 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  2736300 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 2736361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 648 - 706
Target Start/End: Original strand, 7502990 - 7503049
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgagactctgggtagaa 706  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7502990 gaaacactattaggattgagtatcttggtcaagggaagagatttgagactttgggtagaa 7503049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462592
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| | |   |||||| |    
T  17462436 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcct---tatctc-t 17462530  T
Q  748 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  17462531 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 17462592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 34459664 - 34459525
Alignment:
Q  11 ttcacatacgaaaactttgaggataaatacacaaatggggaattgctgaaagactacattgttaaactgattctaaaacctataagcatttagaaatgtg 110  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||   ||  |||| ||||| ||||||| |  |||| || || | |||||||||||  || |||| |    
T  34459664 ttcatatacgaagactttgaggataaatacacaaatccagatctgctcaaagattacattgctgcactgcttgtagatcctataagcatcgagcaatgcg 34459565  T
Q  111 aataggtgaaacaaaattagttataataagtggctctttt 150  Q
    | |||  ||| ||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  34459564 agtagaagaagcaagatcagttataataagtggctatttt 34459525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 538
Target Start/End: Original strand, 35028494 - 35028541
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatc-ggtgtaaaccttga 538  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  35028494 ggatacttttactataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttga 35028541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 325
Target Start/End: Original strand, 38019884 - 38019915
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaatt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38019884 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaatt 38019915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 762 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 12781292 - 12781246
Alignment:
Q  762 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  12781292 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 12781246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 652 - 775
Target Start/End: Original strand, 17932637 - 17932756
Alignment:
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  17932637 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 17932731  T
Q  751 taaggttactcatcattatagtgga 775  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||    
T  17932732 taaagaaactcatcattatagtgga 17932756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712660
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22712698 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 22712660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717369
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22717407 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 22717369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 34448427 - 34448397
Alignment:
Q  15 catacgaaaactttgaggataaatacacaaa 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34448427 catacgaaaactttgaggataaatacacaaa 34448397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 38190997 - 38191035
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  38190997 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagag 38191035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 492 - 546
Target Start/End: Original strand, 40699225 - 40699279
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagaga 546  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||| |||||    
T  40699225 ggatacttttactataaatatagaccttgcatcagagtaaaccttgagagagaga 40699279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567447
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  45567409 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 45567447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 763 - 832
Target Start/End: Original strand, 8390174 - 8390243
Alignment:
Q  763 tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 832  Q
    |||| ||||||||  ||||  |||||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8390174 tcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaa 8390243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 763 - 832
Target Start/End: Original strand, 14699031 - 14699100
Alignment:
Q  763 tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 832  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  14699031 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14699100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 744 - 777
Target Start/End: Complemental strand, 41303121 - 41303088
Alignment:
Q  744 tcttttgtaaggttactcatcattatagtggaac 777  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41303121 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 41303088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 118)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 417 - 850
Target Start/End: Original strand, 18839451 - 18839885
Alignment:
Q  417 tcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagac 516  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839451 tcggtggccgattttgacagcagaaaattaaacagaaacgtattttcgggcctagatttgttatagttttattgaggattcttttactataaatatagac 18839550  T
Q  517 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 615  Q
    |||||||   |||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||||    
T  18839551 attgtattattgtaaaccatgagatagagggggctgaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaaca 18839650  T
Q  616 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 715  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18839651 aacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagactttgggtagaattaggcggg 18839750  T
Q  716 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 815  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18839751 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttcccccatactaggtcaatttgga 18839850  T
Q  816 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18839851 ccgaactgggtcaacaaattctttcgtgttctctc 18839885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 293 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 50249134 - 50248554
Alignment:
Q  293 ttgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttgacatgtttta 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  50249134 ttgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctggaagctgaaaatcggccgctgattttcagggcacggtggccgattttgacctgtttta 50249035  T
Q  393 tttgagctttaggttcggcaaaaatcggtggccgattt---------------------tgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctag 471  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||                     |||||||| ||| ||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  50249034 tttgagcttcaggttcggcaaaaatcggtggccgatttggagcattcggtggccgattttgacagcagaaattaaaacagaaacatatttacgggcctag 50248935  T
Q  472 atttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaagg 570  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| |||||| |||| | ||||     
T  50248934 atttgttccagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaaaggtttaaaaaga 50248835  T
Q  571 caacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtct 670  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  50248834 caacaacaaaactatgatttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtct 50248735  T
Q  671 cttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 770  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50248734 cttggttacaggaagagatcgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatca-tata 50248636  T
Q  771 gtggaacggaggactg--ctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| ||| || |  ||  ||||||| || | |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50248635 gtgaaacagatggttgttctctctcccctagactaggtcaatttggtccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 50248554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 413 - 850
Target Start/End: Original strand, 31489775 - 31490209
Alignment:
Q  413 aaaatcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatat 512  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31489775 aaaattgggggccgattttgacagcagaaaataaaacagaaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatat 31489874  T
Q  513 agacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggc 611  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||  || | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||  |||||||||| |     
T  31489875 agacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag--tttgtctctttgg 31489972  T
Q  612 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg 711  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  31489973 aacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattagg 31490072  T
Q  712 cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatt 811  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||    
T  31490073 cggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatca-tatggtgaaacggagggctgctctc-cccccagactaggtcaatt 31490170  T
Q  812 tggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  31490171 tggactgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctc 31490209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 419 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 25251690 - 25251258
Alignment:
Q  419 ggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacat 518  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |    
T  25251690 ggtggccgattttaacagcagaatataaaaaagaaacgtattttcgggcctagatttgttccagttttattgaagatttttttactataaatatagactt 25251591  T
Q  519 tgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaa 617  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| | ||||||    
T  25251590 tgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataacgtttgtctcttcgaaacaaa 25251491  T
Q  618 cactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggag 717  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |     
T  25251490 cactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaaa 25251391  T
Q  718 acttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatc 817  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  25251390 acttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctccccaatactaggtcaatttggacc 25251291  T
Q  818 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25251290 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 25251258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 420 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 17186542 - 17186111
Alignment:
Q  420 gtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacatt 519  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  17186542 gtggccgattttgacagcaggaaataaaaaagaaacgtatttttggacctaaatttgttccagttttattgaggattcttttaatataaatatagatttt 17186443  T
Q  520 gtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaac 618  Q
    ||||| | | ||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17186442 gtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaac 17186343  T
Q  619 actagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggaga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||  ||||||    
T  17186342 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaactttgggtagaattagaagggaga 17186243  T
Q  719 cttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcg 818  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  17186242 cttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccg 17186143  T
Q  819 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17186142 aattgggtaaacaaattcttttgtgttctctc 17186111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 417 - 850
Target Start/End: Original strand, 17323929 - 17324359
Alignment:
Q  417 tcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagac 516  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17323929 tcggtggccaattttgacagcagaaattaaaacagaaacgtactttcgtgcctaaatttgttccagttttattgaggattcttttattataaatatagac 17324028  T
Q  517 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 615  Q
     ||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |  || ||||||||||||||||||||||||    
T  17324029 tttgtattagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttatagagtttgtctcttggcaaca 17324126  T
Q  616 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 715  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||  ||| |||||| || ||||||||    
T  17324127 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaactttgggtaaaattaggcggg 17324226  T
Q  716 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccat-actaggtcaatttgg 814  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  17324227 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctctc-cccatgactaggtcaatttgg 17324325  T
Q  815 atcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    | |||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  17324326 accgaactaggtcaacaaattc--ttgtgttctctc 17324359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 492 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 50077014 - 50076656
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  50077014 ggatgcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaagggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactagggttt 50076915  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
     |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076914 gtataaagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 50076815  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    | || | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50076814 gggaatttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctct 50076715  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076714 ctc-cccagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 50076656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 452 - 850
Target Start/End: Original strand, 16428553 - 16428951
Alignment:
Q  452 aaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct 551  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||   |||| ||||||||||||||||||   || |||| | | ||||| | ||||||||  ||||    
T  16428553 aaacgtattttcgagcc-agatttgttcgaattttataagggatacttttactataaatataggttttatatcagagcaaaccattagatagagggggct 16428651  T
Q  552 -aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaa 650  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  16428652 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaa 16428751  T
Q  651 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16428752 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 16428851  T
Q  751 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16428852 taaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctc 16428951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 497 - 842
Target Start/End: Original strand, 13215025 - 13215375
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  13215025 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 13215124  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13215125 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 13215224  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgata----tctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13215225 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactcatcattatagtggaacggagggctgctctc 13215324  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgt 842  Q
    || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  13215325 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgtcaacaaattcttttgt 13215375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 492 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 11457817 - 11457459
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  11457817 ggatgcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggttt 11457718  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
     |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11457717 gtatagagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagatt 11457618  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    | |  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||    
T  11457617 gggggtttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggatgtctgctct 11457519  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11457518 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 11457459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 498 - 850
Target Start/End: Original strand, 18307054 - 18307406
Alignment:
Q  498 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatag 596  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  18307054 ttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataa 18307153  T
Q  597 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 696  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  18307154 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggct 18307253  T
Q  697 ctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacc 796  Q
     ||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||    
T  18307254 ttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctc-cc 18307352  T
Q  797 catactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18307353 cagactaggtcaatttggaccgaacggagtcaacaaattcttttgtgttctctc 18307406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 452 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 9241467 - 9241069
Alignment:
Q  452 aaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaagg-c 550  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||| | |||||| | || | |||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| ||||||||  || |    
T  9241467 aaacgtatttttgggtc-agatttgttccaattttatgggggttacttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggggc 9241369  T
Q  551 t-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctggga 649  Q
    | |||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9241368 tgaaacaaggttt-agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaa 9241270  T
Q  650 aacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctttt 749  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9241269 aacattattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttt 9241170  T
Q  750 gtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  9241169 gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactggggaaacaaattcttttttgttctct 9241070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 38925815 - 38925465
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  38925815 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 38925716  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38925715 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 38925616  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||  |||||||| |||||||||| |    
T  38925615 tttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtaaaacggagggctgctctctc-c 38925520  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38925519 ccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctc 38925465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 492 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 50079163 - 50078804
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||    
T  50079163 ggatgcttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggttt 50079064  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50079063 gcatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatt 50078964  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
      |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || | |||||||    
T  50078963 tggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctct 50078864  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  50078863 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaatttggtaaacaaattcttttgtgttctctc 50078804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 51749983 - 51750333
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| | |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  51749983 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 51750082  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  51750083 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 51750182  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  51750183 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 51750281  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750282 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 51750333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 12302847 - 12302489
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcgg-tgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  12302847 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggttt 12302748  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302747 gtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 12302648  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    | |||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  12302647 gggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctct 12302549  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302548 ctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 12302489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 17324973 - 17324620
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | | | ||||||||  ||||| ||  ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||| || ||||    
T  17324973 cttttactataaatatagaccttgaaccagagtaaacctgaagatacagggggctaaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtata 17324874  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17324873 gagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 17324774  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  17324773 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 17324675  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324674 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 17324620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 552 - 850
Target Start/End: Original strand, 25127872 - 25128170
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  25127872 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaa 25127971  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25127972 cactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattcattgatatctcttttgt 25128071  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25128072 aaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtcaattaggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 25128170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 15823490 - 15823843
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | |||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  15823490 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 15823589  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  15823590 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 15823689  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  15823690 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaacgttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctctccc 15823788  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15823789 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 15823843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 6756471 - 6756825
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  6756471 cttttgctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaaatagaggggactgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 6756570  T
Q  596 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||| ||    
T  6756571 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct--tgattacgagaagagattggga 6756668  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct-c 793  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  6756669 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaagactgctctctcc 6756768  T
Q  794 acccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
     |||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  6756769 ccccagactaggtcagtttggaccgaactggatcaacaaattcttttctgttctctc 6756825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 492 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 50307889 - 50307529
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||   ||||||||||||||| |   |||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  50307889 ggattcttttactataaatataagctttgtatcaaagtaaaccttgagatatatggggctgaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggttt 50307790  T
Q  591 atatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50307789 gtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 50307690  T
Q  690 tgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctc 789  Q
    || | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  50307689 tggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctc 50307591  T
Q  790 tctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattc-ttttgtgttctctc 850  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50307590 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgttctctc 50307529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 10400165 - 10399815
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| | | ||||   |||||||||  |||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || ||||    
T  10400165 ctttttctataaatatagaccttgtatcagagcaaactgggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtata 10400066  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10400065 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 10399966  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  10399965 tttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 10399867  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399866 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 10399815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 518 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 31425335 - 31424999
Alignment:
Q  518 ttgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt-ggcaaca 615  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||    
T  31425335 ttgtatcaatgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaaca 31425236  T
Q  616 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagt---ctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggc 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  31425235 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggc 31425136  T
Q  713 gggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaattt 812  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31425135 gggaggcttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctctc-cccatactaggtcaattt 31425037  T
Q  813 ggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31425036 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 31424999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 39462463 - 39462816
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||| || ||||    
T  39462463 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagaaggctgaaacaaaggtttagaaatgcaaaaacaaaactagggtttgtata 39462562  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39462563 gagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 39462662  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||| |||||||  |||||||||| |    
T  39462663 tttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctcttttgaaaagttattcatca-tatagtgaaacggagagctgctctctccc 39462761  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39462762 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 39462816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 41646864 - 41647217
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  41646864 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 41646963  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  41646964 gagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgcgac 41647063  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||      
T  41647064 tttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcca 41647162  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
     || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41647163 tcagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctc 41647217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 537 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 15295131 - 15294821
Alignment:
Q  537 gagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  15295131 gagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggtt 15295032  T
Q  636 gattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacaca 735  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  15295031 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaaccca 15294932  T
Q  736 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15294931 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 15294833  T
Q  836 cttttgtgttct 847  Q
    ||||||||||||    
T  15294832 cttttgtgttct 15294821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 3579955 - 3579601
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaagg--ct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttata 593  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||  |||||||||||  ||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  3579955 cttttactttaaatatagaccttgtatcagcgtaaaatttgagatagagggggggctgaaacaagggttcagaaaggcagcaacaaaactagggtttgta 3579856  T
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  3579855 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtctcttgattacggaaagagattggg 3579756  T
Q  694 actctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 793  Q
     || |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||| || |||||||||    
T  3579755 gctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat--tagtgaaacggatgattgctctctc 3579658  T
Q  794 acccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
     || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3579657 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctc 3579601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 6996037 - 6995684
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||  |||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  6996037 cttttattataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggggccgaaacaacggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 6995938  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  6995937 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 6995838  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||      
T  6995837 tttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctcttttataacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcct 6995739  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6995738 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 6995684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 470 - 843
Target Start/End: Complemental strand, 31423238 - 31422851
Alignment:
Q  470 agatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaa 568  Q
    |||||||||| | |||||| |  ||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||    
T  31423238 agatttgttccaattttatgggagatacttttactataaatataagcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 31423139  T
Q  569 ggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgag 667  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  31423138 ggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacactattagaattgag 31423039  T
Q  668 tctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcatt 767  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31423038 tctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcatt 31422939  T
Q  768 ata------------gtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtg 843  Q
    |||            ||| ||| |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31422938 atagtgaaagagagggtgaaacagagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgagctgggtgaacaaattcttttgtg 31422851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 31735862 - 31735508
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacct----tgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |    ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  31735862 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaatgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 31735763  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  31735762 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggctg 31735663  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  31735662 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 31735564  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735563 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 31735508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 497 - 845
Target Start/End: Original strand, 6822959 - 6823306
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  6822959 cttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 6823058  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  6823059 gagtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggc 6823157  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  6823158 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 6823256  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823257 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 6823306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 13761781 - 13762130
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| | |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  13761781 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacataactagggtttgtata 13761880  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  13761881 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtctgtgac 13761980  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| |    
T  13761981 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggaccggagggcttctctctccc 13762078  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13762079 ccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13762130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 20302403 - 20302752
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  20302403 cttttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 20302502  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |  |||    
T  20302503 gagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagactaggac 20302602  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  20302603 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-gatagtggatcggaggactactctctccc 20302700  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20302701 ccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 20302752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 496 - 845
Target Start/End: Original strand, 2617459 - 2617808
Alignment:
Q  496 tcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatat 594  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| | | |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  2617459 tctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtat 2617558  T
Q  595 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  2617559 agagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 2617658  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    || ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||     
T  2617659 ctttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcc 2617757  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    | || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  2617758 ctcagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttgtgtt 2617808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 28840622 - 28840973
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga--tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttata 593  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| ||||||  || ||  || | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  28840622 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatacagggggatgaaacaagggtttagaaaggaaacaacaaaactagggtttgta 28840721  T
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 693  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  28840722 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 28840821  T
Q  694 actctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 793  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28840822 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctc 28840919  T
Q  794 acccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
     |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840920 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28840973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 28998590 - 28998237
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || ||||    
T  28998590 cttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtata 28998491  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    |||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  28998490 gagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggc 28998391  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||| ||| ||| ||||  || |||||| |    
T  28998390 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatca-tatggtgaaactgagggttgttctctccc 28998292  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998291 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 28998237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 29004306 - 29003953
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || ||||    
T  29004306 cttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtata 29004207  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    |||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  29004206 gagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggc 29004107  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||| ||| ||| ||||  || |||||| |    
T  29004106 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatca-tatggtgaaactgagggttgttctctccc 29004008  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004007 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 29003953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 499 - 847
Target Start/End: Original strand, 39932017 - 39932368
Alignment:
Q  499 tttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga--tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |   |||| ||||||  |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  39932017 tttactataaatatagaccttgtatgagacaaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39932116  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39932117 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagac 39932216  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc-tca 794  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||     
T  39932217 tttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggaacggagggctgctctcttcc 39932315  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39932316 cccatactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 39932368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 47906208 - 47906567
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaa------ggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggct 589  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||| |||||       |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |    
T  47906208 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatggtt 47906307  T
Q  590 tatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906308 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 47906407  T
Q  690 tgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctc 789  Q
    || | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||    
T  47906408 tggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctc 47906506  T
Q  790 tctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906507 tctcccccagacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 47906567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 492 - 850
Target Start/End: Original strand, 17318832 - 17319184
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    ||||| |||||||||||||||||   |||||||   ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  17318832 ggatttttttactataaatataggttttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 17318931  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17318932 gtttagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaacag------gattgagtctcttggttacgggaacagatt 17319025  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  17319026 gggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctcttttgttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctct 17319125  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17319126 ctc-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 17319184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 51752309 - 51752657
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| | |||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  51752309 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggtaacaacaaaattagggcttgtata 51752408  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  51752409 gagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactatta-gattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 51752507  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | |||||| || |||||||||  ||||| |||||||||| |    
T  51752508 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcacca-tatagtggattggagggctgctctctccc 51752605  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51752606 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 51752657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 2949568 - 2949216
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||| | | ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| | || ||||    
T  2949568 cttttacaataaatatagatattgaatccgagaaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtata 2949469  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||| | |    
T  2949468 gagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattggggc 2949369  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |    
T  2949368 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctc-c 2949271  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949270 cccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 2949216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 492 - 849
Target Start/End: Original strand, 40133874 - 40134241
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagag-------aagg--ct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaa 581  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||| ||||||||| ||       ||||  || ||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  40133874 ggattcttttactataaatataggctttgtatcagagtaaatcttgagatataggggctgaaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaa 40133973  T
Q  582 ctagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgg 681  Q
    | | || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||    
T  40133974 cgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactactaggattgagtctcttggtcacgg 40134073  T
Q  682 gaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggag 781  Q
    ||||||||||||  | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  40134074 gaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggat 40134173  T
Q  782 gactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  40134174 ggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccggactaggtaaacaaattcttttgtgttctct 40134241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 27337279 - 27336924
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||| ||||||    |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  27337279 cttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttt 27337180  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  27337179 tataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggctg 27337081  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
     |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  27337080 tgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 27336983  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27336982 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 27336924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 28842437 - 28842788
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga--tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttata 593  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| | | |||| ||||||  |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  28842437 cttttactataaatataaaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 28842536  T
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 693  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  28842537 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgag 28842636  T
Q  694 actctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 793  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||    
T  28842637 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctaatctctc 28842734  T
Q  794 acccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
     |||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28842735 ccccagactaggtcaatttggacagaactaggtcaacaaattctattgtgttct 28842788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 453 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 14183965 - 14183574
Alignment:
Q  453 aacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct- 551  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||| ||||     
T  14183965 aacgaatttttgggcc-agatttgttctagttttttt-aggattcttttactataaatatagaccatgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctg 14183868  T
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||| | |||||   ||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| |||    
T  14183867 aaacaagggtttagaatg-caacac--aaactagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaa 14183774  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   | | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  14183773 cactattataattgagtctcttggttacgggaagagattagaattttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgt 14183674  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||  |||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  14183673 aaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttttttgtggtctctc 14183574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 14098307 - 14097953
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||    ||||| |||||||||||  | || |||||| |||| | ||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  14098307 ctttcactataaatatagaccttgtatcaaactaaactttgagatagaggggactgaaacaatggtttaaaaaggcaactacaaaactagggtttgtata 14098208  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gaga 694  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  14098207 gagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagag- 14098109  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt-aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 793  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  14098108 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 14098010  T
Q  794 acccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
     | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14098009 ccacaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 14097953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 28207403 - 28207052
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || | ||    
T  28207403 cttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgta 28207304  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
     |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  28207303 aagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggttacaggaagagattggggc 28207204  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||  || || || ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||||||| |||||||||| |    
T  28207203 tttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacggagggctgctctctccc 28207107  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28207106 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 28207052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 2510665 - 2510312
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||    |||||  |||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||     
T  2510665 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttataaaggcaaccacaaaactagggtttg 2510566  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  2510565 tatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattt 2510466  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
     |||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||    
T  2510465 ggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctctcttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctc 2510368  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510367 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2510312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 46431988 - 46431693
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  46431988 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 46431889  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  46431888 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 46431790  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct--cacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||  | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431789 aacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 46431693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 27339471 - 27339115
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||| ||||||    |||||  |||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||     
T  27339471 cttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggtttg 27339372  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  27339371 tatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggctg 27339272  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  27339271 agactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgatctc 27339174  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27339173 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 27339115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 552 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 4131660 - 4131360
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4131660 aaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaa 4131561  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgata----tctctt 747  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  || |||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||    ||||||    
T  4131560 cactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaacccattgatatctttctctt 4131462  T
Q  748 ttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4131461 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactatgtcaacaaattcttttgtgttct 4131362  T
Q  848 ct 849  Q
    ||    
T  4131361 ct 4131360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 16226111 - 16226461
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | |||| |||||||||||  | ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  16226111 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggtctaaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 16226210  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16226211 gagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 16226310  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||     
T  16226311 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 16226408  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  16226409 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 16226461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 552 - 844
Target Start/End: Original strand, 24325664 - 24325954
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  24325664 aaacaagggtt-agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttaggaaa 24325762  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24325763 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 24325862  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 844  Q
    || ||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||| |||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325863 aatgttactcatca-tatagtgaatcgaatggctgctctctcccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 24325954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 552 - 850
Target Start/End: Original strand, 16432405 - 16432693
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16432405 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg-----------tttgtctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 16432493  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    || ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16432494 cattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatatctcttttgt 16432593  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcaccc-atactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16432594 aatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 16432693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 9463587 - 9463231
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaa------ggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggct 589  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||| |||||       |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  9463587 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 9463488  T
Q  590 tatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagaga 688  Q
    | ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9463487 tgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagaga 9463388  T
Q  689 ttgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgct 788  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||    
T  9463387 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgct 9463290  T
Q  789 ctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9463289 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 9463231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 20291401 - 20291750
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  | | |||  |||||||||||   | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  20291401 cttttactataaatatagaccttgtattagagcaaattttgagatagagggagatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 20291500  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  |||    
T  20291501 gagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactaggac 20291600  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | | ||||||| ||||||||| ||||||  || |||||| |    
T  20291601 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgattctcatca-tatagtggatcggagggttgttctctccc 20291698  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20291699 ccacactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttct 20291750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 9459760 - 9459404
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaa------ggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggct 589  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||| |||||       |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  9459760 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggtt 9459661  T
Q  590 tatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagaga 688  Q
    | ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9459660 tgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagaga 9459561  T
Q  689 ttgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgct 788  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||    
T  9459560 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgct 9459463  T
Q  789 ctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9459462 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 9459404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 434 - 835
Target Start/End: Original strand, 42922115 - 42922514
Alignment:
Q  434 cagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaac 533  Q
    ||||| |||||| ||||||| | |||||| ||||  |||||||||| |  |||||   |||| |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||    
T  42922115 cagcaaaaaatataacataatcatatttttgggctgagatttgttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaac 42922214  T
Q  534 cttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagg 632  Q
    ||| ||||||||  || | ||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  42922215 cttaagatagagggggttgaaataagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg 42922311  T
Q  633 gttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaac 732  Q
     |||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  42922312 -ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaac 42922410  T
Q  733 acattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaaca 831  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| | ||||| |||||||||| ||||    
T  42922411 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaaca 42922510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 497 - 830
Target Start/End: Original strand, 47451592 - 47451919
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||  |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  47451592 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggcttaaacaagggtttggaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 47451691  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |         ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  47451692 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattagtgt------ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 47451785  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | |||||| || ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |    
T  47451786 tttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacgaatgactgctctctccc 47451884  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaac 830  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47451885 ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 47451919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 619 - 845
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248540
Alignment:
Q  619 actagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggaga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggaga 25248667  T
Q  719 cttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcg 818  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||| ||    
T  25248666 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggaccg 25248567  T
Q  819 aactgggtcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  25248566 aactgggtcaacaaattcttttgtgtt 25248540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 552 - 779
Target Start/End: Original strand, 48665177 - 48665404
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  48665177 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaa 48665276  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggtta-cgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48665277 cactattaggattgagtctcttggttaccgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 48665376  T
Q  751 taaggttactcatcattatagtggaacgg 779  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  48665377 taacgttactcatca-tatagtggaacgg 48665404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 499 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 21948526 - 21948229
Alignment:
Q  499 tttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttata 593  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    ||||| ||||||    |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  21948526 tttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 21948427  T
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 693  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |    
T  21948426 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagacgctggg 21948328  T
Q  694 actctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 793  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21948327 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctc 21948229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 47179653 - 47180006
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | |||| ||||||    |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||     
T  47179653 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 47179752  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47179753 tatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt 47179852  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  47179853 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctct 47179950  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  47179951 ctc-cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 47180006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 47177302 - 47177655
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | |||| ||||||    |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||     
T  47177302 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 47177401  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgat-tgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  47177402 tatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatgggagtctcttggttacgggaagagatt 47177501  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  47177502 gggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctct 47177599  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  47177600 ctc-cccagactaggtcagattggatcgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 47177655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 497 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 8347606 - 8347298
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcgg-tgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatat 594  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||  || | ||||||||||| |||| | |||||| |||||||||| || |||    
T  8347606 cttttactataaa-atagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtat 8347509  T
Q  595 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  8347508 agagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggtt--agggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttgatcacgggaagagattgaga 8347412  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    || || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||     
T  8347411 ctttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtggaacggagggatgctctttcc 8347312  T
Q  795 cccatactaggtca 808  Q
    || | |||||||||    
T  8347311 cctagactaggtca 8347298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 645 - 850
Target Start/End: Original strand, 16429050 - 16429255
Alignment:
Q  645 tgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatct 744  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16429050 tgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatct 16429149  T
Q  745 cttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 844  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16429150 cttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgt 16429249  T
Q  845 tctctc 850  Q
    ||||||    
T  16429250 tctctc 16429255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 576 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 15669648 - 15669376
Alignment:
Q  576 acaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttgg 675  Q
    |||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15669648 acaaaagtagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 15669552  T
Q  676 ttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgga 775  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||    
T  15669551 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtgga 15669452  T
Q  776 acggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||| | |||||||||| || | |||||||||  ||| ||  |||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  15669451 acggatggctgctctctccccgagactaggtcagttttagactgaactgtgtaaacaaattttgttgtgttctctc 15669376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 440 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 18800962 - 18800600
Alignment:
Q  440 aaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgag 539  Q
    |||||| |||| || | |||||| ||||  |||||| ||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  18800962 aaaatataacagaatcatatttttgggctgagattttttccaattttat-gaggatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgag 18800864  T
Q  540 atagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgat 638  Q
    ||| |   |||| |||||| |||| |||| | |||||| ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |  |||||||    
T  18800863 atacaaggggctgaaacaaaggtttagaa-gtcaacaagaaaactacggtttgtatagagtttg-ctcttggccacaaatactagggttgg--ggttgat 18800768  T
Q  639 tcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattg 738  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||   ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  18800767 tcaccctgagaaacactattaggattgagtctctaggtcacgggtagagatttgaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattg 18800668  T
Q  739 atatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggt 806  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  18800667 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaagcggagaactgctctctcccccaaactaggt 18800600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 632 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115086
Alignment:
Q  632 ggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaa 731  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaa 6115205  T
Q  732 cacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaaca 831  Q
    |  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  6115204 ccaattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaaca 6115105  T
Q  832 aattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  6115104 aattattttgtgttctctc 6115086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 497 - 751
Target Start/End: Original strand, 6823828 - 6824091
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaagg-ct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatat 594  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||  || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  6823828 cttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6823927  T
Q  595 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctctt-------ggttacgggaagag 687  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||       ||||||||||||||    
T  6823928 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgattgaatctcttggttacgggttacgggaagag 6824027  T
Q  688 attgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||| | || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  6824028 attggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 6824091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 470 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 49495563 - 49495206
Alignment:
Q  470 agatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaa 568  Q
    |||||||||| | ||||||   |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| | |||    
T  49495563 agatttgttcgaattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaa 49495464  T
Q  569 ggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagt 668  Q
              ||||||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||    
T  49495463 tc--------aaactagggtttgcatatagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gagttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagt 49495376  T
Q  669 ctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcatta 768  Q
    || ||||| |||| ||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49495375 cttttggtcacggtaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 49495276  T
Q  769 tagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    ||||| |||| ||| ||  |||||| || | |||| |||||||| || |||||| ||| || ||||||||    
T  49495275 tagtgaaacgaagggcttatctctccccaagactatgtcaatttagaccgaactaggtaaagaaattctt 49495206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 498 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 8349385 - 8349035
Alignment:
Q  498 ttttactataaatatagacattgtatcgg-tgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||  | || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| | |||||| |||| || || || ||||    
T  8349385 ttttattataaatatagatcttgtattagatgcaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattaaggtttgtata 8349287  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  |||| |||||||||||||  |||    
T  8349286 gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggtttattcaccttgggaaacactattaggattgagtttgatggtcacgggaagagattaggac 8349190  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | | ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||  || |||||| |    
T  8349189 tttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtatctcttttgttaagttactcatcattatagtggaatagagggttgttctctccc 8349090  T
Q  796 ccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    | | |||| ||||  ||| || |||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  8349089 caagactatgtcagttttagaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctc 8349035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 645 - 847
Target Start/End: Original strand, 51757624 - 51757824
Alignment:
Q  645 tgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatct 744  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| |||    
T  51757624 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttct 51757723  T
Q  745 cttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 844  Q
    | ||||||| | |||||| || |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  51757724 c-tttgtaacgatactcacca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 51757821  T
Q  845 tct 847  Q
    |||    
T  51757822 tct 51757824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 619 - 847
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231856
Alignment:
Q  619 actagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggag 717  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  718 acttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatc 817  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggacc 16231827  T
Q  818 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||| |||||||||||   ||||||||||    
T  16231828 gaact-ggtcaacaaatatctttgtgttct 16231856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 693 - 850
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816183
Alignment:
Q  693 gactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 792  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||  ||||||||    
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat-ataatggatcggagggatgctctct 23816125  T
Q  793 cacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23816126 cccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 23816183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 648 - 835
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786121
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 23786033  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  23786034 tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 23786121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 503 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 13125787 - 13125483
Alignment:
Q  503 ctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta-tatagagtt 600  Q
    ||||||||| | || ||||||| | ||||| ||||||| | ||  |||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||| ||  |||||||||    
T  13125787 ctataaatagaaaccttgtatcagagtaaaacttgagagaaagggggctgaaacaagggttaagaa-gccaacaaggaaactagggtttggtatagagtt 13125689  T
Q  601 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgg 700  Q
    || |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| || ||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| |||    
T  13125688 tg-ctcttggcgacaaacactagggtt-gagg-ttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgg 13125592  T
Q  701 gtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccat 799  Q
    |||||| ||||   || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| | ||| |    
T  13125591 gtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagttgctctccccccctt 13125492  T
Q  800 actaggtca 808  Q
    |||||||||    
T  13125491 actaggtca 13125483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 417 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 25248931 - 25248760
Alignment:
Q  417 tcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagac 516  Q
    ||||| |||||||||  |||||  |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  25248931 tcggtagccgatttttgcagcaggaaataaaacagaaacatactttcgggcctagatttgttcaagttttattgaggattttttttctagaaatatagac 25248832  T
Q  517 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactaggg 587  Q
     ||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25248831 tttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 25248760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 632 - 833
Target Start/End: Complemental strand, 30790602 - 30790401
Alignment:
Q  632 ggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcg-ggagacttattcttgta 730  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||| || |||||| ||||   |||||||||||||||||    
T  30790602 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 30790504  T
Q  731 acacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaa 829  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||| |||||||||  |||||| |||||||| | ||    
T  30790503 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 30790405  T
Q  830 caaa 833  Q
    ||||    
T  30790404 caaa 30790401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 631 - 835
Target Start/End: Original strand, 16561545 - 16561751
Alignment:
Q  631 gggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgt 729  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  16561545 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgt 16561644  T
Q  730 aacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtca 828  Q
    ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||| |  | ||||||||| | ||||| ||||||| || |    
T  16561645 aaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaa 16561744  T
Q  829 acaaatt 835  Q
    |||||||    
T  16561745 acaaatt 16561751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 443 - 835
Target Start/End: Original strand, 27916387 - 27916780
Alignment:
Q  443 ataaaacataaacgtattttcggg-cctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcgg-tgtaaaccttgaga 540  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| | ||||   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||    
T  27916387 ataaaacataaacgtcttttctggacctagatttgttccaattttggag-ggatacttttactataaatatagacattgtatcaaatgtaaactgtgaga 27916485  T
Q  541 tagagaaggcta---aacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttga 637  Q
     | |||  || |   |||||||||| |||| | || ||| |||||||||| || ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   ||||    
T  27916486 aacagagagccagaaaacaagggtttagaa-gccagcaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttga 27916579  T
Q  638 ttcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaaca--c 734  Q
    |||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||  |||||||||| |||| ||||| ||| ||||   || |||| |||||| ||||   |    
T  27916580 ttcaccttggaaaacactattagaattgagtctcttggtcacatgaagagattgtgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttc 27916679  T
Q  735 attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaa 833  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| | ||||| |||| ||||| ||||||    
T  27916680 tttgatatctcttt-gtaaagttactcatcgttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattgggtaaacaaa 27916778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 503 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 26520449 - 26520119
Alignment:
Q  503 ctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaagg-ct--aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagt 599  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||  || ||  |||||| |||| |||| | |||||| |||||||||| || ||||||||    
T  26520449 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagt 26520351  T
Q  600 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttg------gttacgggaagagattgag 693  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      || |||||||||||||| |    
T  26520350 ttg-ctcttggcaacaaacactaagatt-gagg-ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacagtcacgggaagagattggg 26520254  T
Q  694 actctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct 792  Q
    ||| ||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||        |||| ||| || || ||||||||||||||||||  |||||| |    
T  26520253 actttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgata--------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctcttt 26520162  T
Q  793 cacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaat 834  Q
    | |||| | |||||||  |||||| | |||||||| |||||||    
T  26520161 cccccaaattaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaat 26520119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 634 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613223
Alignment:
Q  634 ttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaac 732  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||| || ||||||||||||| || ||||||||| ||||   || ||||||||||||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 26613341  T
Q  733 acattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaaca 831  Q
     | ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||  || ||||||| |||| | ||||||| | || || |||||||||| ||||    
T  26613340 cctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtcagtatttgaccgaactgggtaaaca 26613241  T
Q  832 aattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||| || |||||||||||    
T  26613240 aatt-ttgtgtgttctctc 26613223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 634 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738653
Alignment:
Q  634 ttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaac 732  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||| || | ||||||||| ||||   | |||||||||||||||||    
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 30738731  T
Q  733 acattgatatctcttttgtaaggttactcatc--attatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  30738730 cctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctctctcacccatactaggtca 30738653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 634 - 810
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155963
Alignment:
Q  634 ttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaac 732  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||   | ||| | |||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaac 155887  T
Q  733 acattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat 810  Q
       ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||    
T  155888 cttttgttatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctc-cccaaactaggtcaat 155963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 594 - 850
Target Start/End: Original strand, 28279309 - 28279566
Alignment:
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 692  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||| || ||| |||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||     
T  28279309 tagagtttg-ctcttgacaacaaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttcttggtcacgggaagagattgg 28279405  T
Q  693 gactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
    |||| | ||||||| ||||   || |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||   || |||     
T  28279406 gacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaattgagagttgttctt 28279505  T
Q  792 tcaccc-atactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || ||| | ||||||||| | || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  28279506 tccccctagactaggtcagtattagatcgaactgggtaaacaaatttttgtgtgttctctc 28279566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 724 - 835
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916674
Alignment:
Q  724 tcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaa-tttggatcgaact 822  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaact 15916661  T
Q  823 gggtcaacaaatt 835  Q
    |||| ||||||||    
T  15916662 gggtaaacaaatt 15916674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 767 - 847
Target Start/End: Original strand, 13358787 - 13358867
Alignment:
Q  767 tatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13358787 tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13358867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 424 - 537
Target Start/End: Original strand, 43104030 - 43104143
Alignment:
Q  424 ccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattga-ggattcttttactataaatatagacattgta 522  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  43104030 ccgattttgccaacataaaataaaacagaaacatatttttgggcttagatttgttccagtttt-ttgagggatacttttactataaatatagaccttgta 43104128  T
Q  523 tcggtgtaaaccttg 537  Q
    || | ||||||||||    
T  43104129 tcagagtaaaccttg 43104143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 638 - 781
Target Start/End: Original strand, 43104245 - 43104390
Alignment:
Q  638 ttcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttatt-cttgtaacaca 735  Q
    |||||| ||| |||||||||||  ||||||||| ||||| || |||||| ||||| ||| ||||||||| ||||   || || || || |||||||| |     
T  43104245 ttcaccttggaaaacactattagaattgagtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattaggtttgaagatttttttcttgtaaccct 43104344  T
Q  736 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggag 781  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43104345 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggag 43104390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 294 - 381
Target Start/End: Original strand, 17323785 - 17323872
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgatttt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  17323785 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctggaagtagaaaatcggtgaccgattttcagggctcggtggccgatttt 17323872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 652 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 21353525 - 21353342
Alignment:
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||| |    
T  21353525 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 21353431  T
Q  751 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    ||| |  |||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  21353430 taaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatctttagaccgaactgggtaaacaaattctt 21353342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 25251814 - 25251749
Alignment:
Q  295 gttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgatttt 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||    
T  25251814 gttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctggaagcagaaaatcggtggccgatttt 25251749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 281 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 17186701 - 17186605
Alignment:
Q  281 ttttctttataattgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccga 377  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  17186701 ttttcttcatatttgttgtgaaagcgactcaaaattgaagaaattgaaaatctggaagcagaaaatcggtggctgattttcagggctcggtggccga 17186605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 292 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 25249056 - 25248988
Alignment:
Q  292 attgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgatttt 360  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||    
T  25249056 attgttgtgatagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctggaagcagaaaatcggtggccgatttt 25248988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 634 - 778
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353190
Alignment:
Q  634 ttgattcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaa 731  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||   || || |||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattaggtttgaaac-tattcttgtaa 14353145  T
Q  732 cacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacg 778  Q
    | | |||| |  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  14353146 ccctttgaaa--tcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacg 14353190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 291 - 360
Target Start/End: Original strand, 31489724 - 31489793
Alignment:
Q  291 aattgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgatttt 360  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||    
T  31489724 aattgttgcgaaagtgccttaaaattgaagaaattggaattctggaagcagaaaattgggggccgatttt 31489793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 594 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 26332798 - 26332699
Alignment:
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 693  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  || ||||||||    
T  26332798 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggtttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgaaaatagattgag 26332702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 739 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 13127782 - 13127685
Alignment:
Q  739 atatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||| ||||||| | | ||||| ||||| |||| ||||||||    
T  13127782 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcctccagactaggttagtattggaccgaaccgggtaaacaaatt 13127685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 503 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 13127959 - 13127837
Alignment:
Q  503 ctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttg 602  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||| ||||  |   ||||||||||| || ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||     
T  13127959 ctataaatataaaccttgtatcggagtaaacctttagagagaggggttgaaacaagggtttag-aagccaacaagaaaagtagggtttatatagagttt- 13127862  T
Q  603 tctcttggcaacaaacactagggtt 627  Q
     || |||||||||||||||||||||    
T  13127861 ccttttggcaacaaacactagggtt 13127837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 634 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332616
Alignment:
Q  634 ttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaa 706  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaa 26332616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 497 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 30790731 - 30790683
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagag 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  30790731 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagag 30790683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 711
Target Start/End: Original strand, 14997040 - 14997101
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg 711  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14997040 aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagagattgagact-tgggtagaattagg 14997101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 806 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 13447301 - 13447260
Alignment:
Q  806 tcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13447301 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13447260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 497 - 587
Target Start/End: Original strand, 16231545 - 16231636
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactaggg 587  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | |||| |||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||    
T  16231545 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtctagaaaagcaacaagaaaactaggg 16231636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 291 - 334
Target Start/End: Original strand, 18839306 - 18839349
Alignment:
Q  291 aattgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctg 334  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18839306 aattattgtgaaagtgcctcaaaattgaataaattggaattctg 18839349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144804
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg 711  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||    
T  4144865 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggact-tgggtagaattagg 4144804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 755 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 11693389 - 11693351
Alignment:
Q  755 gttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11693389 gttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctc 11693351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 762 - 807
Target Start/End: Original strand, 9521826 - 9521871
Alignment:
Q  762 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtc 807  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  9521826 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtc 9521871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 452 - 545
Target Start/End: Original strand, 16431001 - 16431093
Alignment:
Q  452 aaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagag 545  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||   |||| ||||||||||||||||||   ||||||| | | ||||||||||||||||    
T  16431001 aaacgtgttttcgggcc-agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatataggttttgtatcagagcaaaccttgagatagag 16431093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 744 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 8213615 - 8213579
Alignment:
Q  744 tcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacgga 780  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8213615 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgga 8213579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 716 - 835
Target Start/End: Original strand, 46783212 - 46783331
Alignment:
Q  716 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttgg 814  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||| |||  ||| | ||||  ||| | || |||||| ||||    
T  46783212 agactaattcttgtaaccctttgatatct-ttttgtaaagaaactcatcattatagtggaacagagagctgttatctcctccagagtaagtcaatattgg 46783310  T
Q  815 atcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    |||||||||| | ||||||||    
T  46783311 atcgaactggataaacaaatt 46783331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232635
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2232597 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 2232635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 762 - 808
Target Start/End: Original strand, 9526577 - 9526623
Alignment:
Q  762 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  9526577 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 9526623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 31423437 - 31423403
Alignment:
Q  292 attgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattg 326  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31423437 attgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattg 31423403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15669940 - 15669891
Alignment:
Q  286 tttataattgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctga 335  Q
    ||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||    
T  15669940 tttataaatgttgtgaaagtaacttaaaattgaagaaattggagttctga 15669891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18801109 - 18801068
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctga 335  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18801109 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaaggaattggagttctga 18801068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 79)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 291 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 27107458 - 27106879
Alignment:
Q  291 aattgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgatttt-gac-atgt 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||  ||| |||| |||||||| |||  |||    
T  27107458 aattgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattagaattctggaagctgaaaatcgatggccgattttcagagcatggtggccgattttggactctgt 27107359  T
Q  389 tttatttgagctttaggttcggcaaaaatcggtgg---------------------ccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggc 467  Q
    |||||    || || ||||||||||||||||||||                     ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27107358 tttat---ggcctttggttcggcaaaaatcggtggccgatttggagcattcgatggccgattttgacagcagaaaataaaatagaaacgtattttcgggc 27107262  T
Q  468 ctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcaga 566  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||    
T  27107261 ctagatttgttccagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttaga 27107162  T
Q  567 aaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattga 666  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27107161 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 27107062  T
Q  667 gtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  27107061 gtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttgtagggttactcatca- 27106963  T
Q  767 tatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27106962 tatagtgaaacggagggctgctatctcctccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgttttctc 27106879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 417 - 850
Target Start/End: Original strand, 25952441 - 25952874
Alignment:
Q  417 tcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagac 516  Q
    |||| ||| |||||||||| ||  |||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  25952441 tcgggggctgattttgacaacaggaaataaacaagaaacgtattttcgggcttagatttgttccagttttattgaggattcttttactataaatataagc 25952540  T
Q  517 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 615  Q
     ||||||| | | ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  25952541 tttgtatcagaggaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattaggg-ttgtatatagtttgtctcttggcaaca 25952639  T
Q  616 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 715  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||| ||||| |     
T  25952640 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagacattgggtagaattaggcaga 25952739  T
Q  716 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttgga 815  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  25952740 agacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgga 25952839  T
Q  816 tcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25952840 ccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 25952874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 14419526 - 14419172
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  14419526 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtata 14419427  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14419426 gagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 14419327  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |    
T  14419326 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgctctctccc 14419227  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14419226 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 14419172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 441 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 5372568 - 5372161
Alignment:
Q  441 aaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga 540  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  5372568 aaataaaatagaaacgtattttcgggtctagattttttctagttctattgaggattcttttactataattatagacattgtatcagtgtaaatcttgaga 5372469  T
Q  541 tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatt 639  Q
    |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  5372468 tagagg-ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaatt 5372370  T
Q  640 caccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattga 739  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  5372369 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggactttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattga 5372270  T
Q  740 tatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctct-cacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||    
T  5372269 tatcttttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctctccccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattatt 5372170  T
Q  839 ttgtgttct 847  Q
    || ||||||    
T  5372169 ttctgttct 5372161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 294 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 15186247 - 15185696
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttgac-atgtttta 392  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||| ||| |  |||||||| ||| ||||| |||| ||  || ||| |||     
T  15186247 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaataggaattatggaagcaaaaaatcggtcgtcgattttcagggctcggtggccgaattgcactatgattt- 15186149  T
Q  393 tttgagctttaggttcggcaaaaatcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgag 492  Q
    ||| |||||| ||||||  ||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   |    
T  15186148 tttcagcttt-ggttcgtgaattttcggtggccgattttgacagcaggaaataaaacagaaacgtattttcgggcctagatttgttccaattttatgagg 15186050  T
Q  493 gattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||||  || |||||||||| || |||    
T  15186049 gatacttttactataaatataaactttgtatcagagtaaaccttgagataaaggtgactgaaacaagggtttagaaagaaaataacaaaactatggttta 15185950  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgag--tctcttggttacgggaagagat 689  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15185949 tataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattgagtctctcttggttacgggaagagat 15185850  T
Q  690 tgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctc 789  Q
    |       ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  15185849 t-------tgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttactcatcattatagtgaaacggaggactgttc 15185757  T
Q  790 tctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15185756 tctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttctctc 15185696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 421 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 33541799 - 33541392
Alignment:
Q  421 tggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattg 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33541799 tggccgattttgacagcagaaaataaaacagaaacgtattttcgggcctagatttgttcgagttttattgaggattcttttactataaatatagacattg 33541700  T
Q  521 tatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaaca 619  Q
    |||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  33541699 tatcagtgtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaaca 33541600  T
Q  620 ctagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagac 719  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||            
T  33541599 ctagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattagg-------- 33541508  T
Q  720 ttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcga 819  Q
                  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  33541507 --------------cattgatatctcttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggaaggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 33541423  T
Q  820 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    | |||||||| || |||||||||||||||||    
T  33541422 attgggtcaaaaatttcttttgtgttctctc 33541392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 492 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 30480843 - 30480485
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||    
T  30480843 ggatgcttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagttt 30480744  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
     ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30480743 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 30480644  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| || ||| | |||||||    
T  30480643 gaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttagtcatca-tatagtgaaatggatggctgctct 30480545  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30480544 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 30480485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 470 - 850
Target Start/End: Original strand, 27910988 - 27911366
Alignment:
Q  470 agatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaa 568  Q
    |||||||||| | |||||| |  ||| ||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||     
T  27910988 agatttgttccaattttatgggagatacttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa- 27911086  T
Q  569 ggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagt 668  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27911087 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 27911186  T
Q  669 ctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcatta 768  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  27911187 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatca-ta 27911285  T
Q  769 tagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27911286 tagtgaaacggagggttgctctctc-cccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttgtgctctctc 27911366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 470 - 850
Target Start/End: Original strand, 27957407 - 27957785
Alignment:
Q  470 agatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaa 568  Q
    |||||||||| | |||||| |  ||| ||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||     
T  27957407 agatttgttccaattttatgggagatacttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa- 27957505  T
Q  569 ggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagt 668  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27957506 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 27957605  T
Q  669 ctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcatta 768  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  27957606 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatca-ta 27957704  T
Q  769 tagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27957705 tagtgaaacggagggttgctctctc-cccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttgtgctctctc 27957785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 417 - 742
Target Start/End: Original strand, 14477196 - 14477522
Alignment:
Q  417 tcggtggccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagac 516  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14477196 tcggtggccgattttgacagcaagaaataaaatagaaacgtattttcgggtctagatttattccagttttattgaggattcttttactataaatataggc 14477295  T
Q  517 attgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaaca 615  Q
     ||||||| | | ||||||||||||||||  || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  14477296 tttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttggcaaca 14477395  T
Q  616 aacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 715  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14477396 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggg 14477495  T
Q  716 agacttattcttgtaacacattgatat 742  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||    
T  14477496 agacttattcttgtaatccattgatat 14477522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 1225166 - 1225520
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  1225166 cttttactataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 1225265  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  1225266 gagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 1225365  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | | ||||||||     
T  1225366 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggccgctctctcc 1225464  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1225465 ctcatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 1225520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 28251902 - 28251549
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   |||||| |||||||||||  || | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  28251902 cttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 28251803  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  28251802 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 28251703  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | |||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  28251702 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 28251604  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251603 ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 28251549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 492 - 848
Target Start/End: Complemental strand, 13858824 - 13858469
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||  || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  13858824 ggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 13858725  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13858724 gtatagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagatt 13858625  T
Q  691 gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    | | || ||||||||| || |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  13858624 ggggctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctct 13858526  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc 848  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13858525 ctcccccagactaggtcaatttggacagaactgggtaaacaaattc-tttgtgttctc 13858469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 14807751 - 14808114
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  14807751 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 14807850  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  14807851 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 14807950  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactg--------- 786  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||             
T  14807951 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccc 14808049  T
Q  787 -ctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14808050 cctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 14808114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 32339305 - 32339659
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga----tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||    |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  32339305 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 32339404  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339405 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 32339504  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
     | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  32339505 gggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 32339603  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32339604 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaaattcttttgtgttct 32339659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 498 - 847
Target Start/End: Original strand, 36865538 - 36865887
Alignment:
Q  498 ttttactataaatatagacattgtatcgg-tgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  36865538 ttttactataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 36865637  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||  ||    
T  36865638 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct---tcacgggaagagattggaac 36865734  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |    
T  36865735 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctccc 36865834  T
Q  796 cc-atactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  36865835 ccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattctcttgtgttct 36865887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 15072710 - 15073064
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  15072710 cttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatggtttgtata 15072809  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaaga-gattgaga 694  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||    
T  15072810 gagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagggttggga 15072909  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||     
T  15072910 ctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tacagtggaacggagggctgctctctcc 15073008  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15073009 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctc 15073064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 497 - 846
Target Start/End: Original strand, 15067981 - 15068330
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||    ||||| ||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  15067981 cttttactataaatataaaccttgtatcaacctaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaaccagggtttgtata 15068080  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  15068081 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggattgagtcttttggttacggaaagaggttgagac 15068180  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  15068181 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tataatggaacggagggctgctctctccc 15068279  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15068280 ccagactaggtcaatttggactgaactgggccaacaaattcttttgtgttc 15068330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 4424018 - 4424368
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| | | |||| |||||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  4424018 cttttactataaatacagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 4424117  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  4424118 gagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 4424217  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||  |||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| |    
T  4424218 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaacattactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccc 4424316  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4424317 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4424368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 27829297 - 27829646
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| | | |||| | |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  27829297 cttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 27829396  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  27829397 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 27829496  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||   ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  27829497 cttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 27829594  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829595 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27829646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 3874006 - 3874360
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaa----ggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||| ||| |     |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||     
T  3874006 cttttactataaatatagactttgtatcaggctaaactttgagagagatagcgggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagtttg 3874105  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  3874106 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctg 3874205  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  3874206 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 3874304  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874305 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3874360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 15809215 - 15809568
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaa----ggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||| ||| ||    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  15809215 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 15809314  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |     
T  15809315 tatagagtttgtcttttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaacta 15809413  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||    
T  15809414 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctc 15809512  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809513 ttccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 15809568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 27826986 - 27827335
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| | | |||| | |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  27826986 cttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 27827085  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  || |||    
T  27827086 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggac 27827185  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||   ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  27827186 cttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 27827283  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827284 ccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27827335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 537 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 22684951 - 22684638
Alignment:
Q  537 gagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||    
T  22684951 gagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggtt 22684852  T
Q  636 gattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaac--- 732  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||       
T  22684851 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 22684752  T
Q  733 acattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 832  Q
    | |||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22684751 atattgatttctctattgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 22684653  T
Q  833 attcttttgtgttct 847  Q
    |||||||||||||||    
T  22684652 attcttttgtgttct 22684638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 41384745 - 41385097
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||   |||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| || ||||    
T  41384745 cttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaaattgagatagagg-ggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtata 41384843  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  41384844 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 41384943  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | | ||||||| |||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |    
T  41384944 tttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 41385042  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41385043 ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttctgttctctc 41385097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 552 - 840
Target Start/End: Original strand, 608790 - 609077
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  608790 aaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaa 608889  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  608890 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 608989  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattctttt 840  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  608990 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 609077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 18810708 - 18811057
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| | | |||| | |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  18810708 cttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 18810807  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  || |||    
T  18810808 gagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaataggctgggac 18810907  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||   ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |    
T  18810908 tttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 18811005  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18811006 ccagattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 18811057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 41382673 - 41383015
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||| | ||||||||||| ||||| || ||||    
T  41382673 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagatggggctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtata 41382772  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  41382773 gaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacc-----------tattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 41382861  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |    
T  41382862 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 41382960  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41382961 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 41383015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 28283560 - 28283206
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaa------ggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggct 589  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||| |||||       |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |    
T  28283560 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtt 28283461  T
Q  590 tatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    | ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28283460 tgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagat 28283361  T
Q  690 tgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctc 789  Q
    || | || ||||||||| |||| || ||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  28283360 tggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 28283263  T
Q  790 tctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283262 tctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28283206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Original strand, 43079658 - 43079952
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  43079658 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 43079757  T
Q  652 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  43079758 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 43079856  T
Q  751 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43079857 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 43079952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 44720843 - 44721193
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||   | |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  || ||||    
T  44720843 cttttactataaatatagaccttatatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatgttttgtata 44720942  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa-cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  44720943 gagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 44721042  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||     
T  44721043 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagagctgctctctcc 44721140  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44721141 cgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 44721193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 18812893 - 18813231
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| | | |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||              
T  18812893 cttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag---------- 18812982  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
     |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  || |||    
T  18812983 -agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgggtacgggaagaggctgtgac 18813081  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||   ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |    
T  18813082 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 18813179  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18813180 ccatattaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 18813231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 437 - 835
Target Start/End: Original strand, 21482266 - 21482649
Alignment:
Q  437 cataaaataaaacata-aacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacct 535  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||| |    
T  21482266 cataaaataaaa-atataacgtatttt--ggcctagatttgttccagtttttt--aggattcttttactataaatatagaatttgtatcagagtaaactt 21482360  T
Q  536 tgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggt 634  Q
    ||||||||||  | || ||||||||||| |||||          ||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  21482361 tgagatagagtggactgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggt 21482448  T
Q  635 tgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacac 734  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |    
T  21482449 tgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaaccc 21482548  T
Q  735 attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaat 834  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21482549 attgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaat 21482648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 594 - 847
Target Start/End: Original strand, 43530213 - 43530465
Alignment:
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 693  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  || |    
T  43530213 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggctggg 43530312  T
Q  694 actctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 793  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  43530313 actttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctcttttgtaacgctactcatca-tatagtggatcggagggctgctgtctc 43530411  T
Q  794 acccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
     |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43530412 tcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 43530465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Original strand, 43082029 - 43082323
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  43082029 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 43082128  T
Q  652 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  43082129 cactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 43082227  T
Q  751 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43082228 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 43082323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 497 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 24873522 - 24873178
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaa------ggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggct 589  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||| |||||       |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  24873522 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 24873423  T
Q  590 tatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagaga 688  Q
    | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24873422 tgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagaga 24873323  T
Q  689 ttgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgct 788  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||    
T  24873322 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgct 24873225  T
Q  789 ctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||| |||| || |||||||||||    
T  24873224 ctctcccccatactaggtcagattggaccgaattgagtcaacaaatt 24873178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 592 - 850
Target Start/End: Original strand, 15956057 - 15956311
Alignment:
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  15956057 tatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaagagattg 15956152  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||    
T  15956153 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggtttctctc 15956252  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || | || | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15956253 tccctcagattaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtattctctc 15956311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 579 - 826
Target Start/End: Original strand, 21480589 - 21480832
Alignment:
Q  579 aaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggtta 678  Q
    ||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21480589 aaactagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggttt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtta 21480684  T
Q  679 cgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacg 778  Q
    |||||||| |||| |  | | ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  21480685 cgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 21480784  T
Q  779 gaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggt 826  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21480785 gagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaacgaactgggt 21480832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 470 - 835
Target Start/End: Original strand, 31162186 - 31162551
Alignment:
Q  470 agatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaa--caagggttcagaa 567  Q
    |||||||||| | ||||||   |||| |||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| ||||  |||||||  ||| |||| ||||    
T  31162186 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaaccttgagaaagagggggctaaaaacaaaggtttagaa 31162285  T
Q  568 aggcaa-caacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattga 666  Q
    |  ||| |||||||  ||| | || |||| |||||| |||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  31162286 a--caagcaacaaat-tagtgtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaacgtt--agggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 31162379  T
Q  667 gtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 766  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31162380 gtctcttggtcaccggaagagattgggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcat 31162479  T
Q  767 tatagtggaacggaggactgctctct--cacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||  | |||| ||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||    
T  31162480 tatagtggaacagagggctgctctctcccccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 31162551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 527 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 3005932 - 3005624
Alignment:
Q  527 tgtaaaccttgagatagagaaggct--aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagg 624  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||  |||  |  ||||||| | || ||||||||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  3005932 tgtaaaccttgagatagagggggctggaaacaagggtttagaaa--caaataacaaactagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaatagg 3005836  T
Q  625 gtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttatt 724  Q
    ||| ||   |||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3005835 gttgga---ttgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttatt 3005739  T
Q  725 cttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactg 823  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||  |||||| |||||||    
T  3005738 cttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactg 3005639  T
Q  824 ggtcaacaaattctt 838  Q
    ||| |||||||||||    
T  3005638 ggtaaacaaattctt 3005624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 493 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 5623077 - 5622878
Alignment:
Q  493 gattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||| |  |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  5623077 gattcttttactataaatataggttttgtatcagaataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 5622978  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5622977 tatagagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaaacattatttggattgagtctcttgattacgggaagagattg 5622878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 294 - 673
Target Start/End: Original strand, 26774978 - 26775378
Alignment:
Q  294 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgattttcaaggcacggtgaccgattttgacatgt-ttta 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||  || | |||     
T  26774978 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctggtagcagaaaatcggtggccgattttcagagcacgttgaccgattttggaatctgtttt 26775077  T
Q  393 tttgagctttaggttcggcaaaaatcggtg---------------------gccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctag 471  Q
    ||||  ||||| ||||||||||| ||||||                     ||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| | | |||     
T  26775078 tttggccttta-gttcggcaaaagtcggtgcccgatttggagcattcggtggccgattttgacagcaggaaatagaacagaaacgtatttttgag-ctat 26775175  T
Q  472 atttgttctagttttattgaggatt-cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaag 569  Q
    |||||||  | ||||| ||||| || |||||||||||||||||| | ||||||| | | ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  26775176 atttgttacaatttta-tgagggttacttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 26775274  T
Q  570 gcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtc 669  Q
    |||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  26775275 gcaacaacaatactagggtttgtatatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacactattagaattgagtc 26775374  T
Q  670 tctt 673  Q
    ||||    
T  26775375 tctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 492 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 35872718 - 35872555
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||     ||||| ||    
T  35872718 ggatgcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaac-----tagggttt 35872624  T
Q  591 atatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactatta 659  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35872623 gtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 634 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578273
Alignment:
Q  634 ttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaac 732  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||| ||||   || |||| |||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31578377  T
Q  733 acattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaaca 831  Q
       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | | ||| |||||||||| ||||    
T  31578376 cttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtcagtataggaccgaactgggtaaaca 31578277  T
Q  832 aatt 835  Q
    ||||    
T  31578276 aatt 31578273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 631 - 835
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035459
Alignment:
Q  631 gggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgt 729  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||| ||||   | ||||||||||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgt 31035351  T
Q  730 aacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatac--taggtcaat-ttggatcgaactgggt 826  Q
    ||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||  ||||||| | ||||| ||||||||||    
T  31035352 aaccctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattggaccgaactgggt 31035450  T
Q  827 caacaaatt 835  Q
     ||||||||    
T  31035451 aaacaaatt 31035459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 619 - 793
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181795
Alignment:
Q  619 actagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactatt-atgattgagtctcttggttacg--ggaagagattgagactctgggtagaaataggcggg 715  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||     
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgga 181721  T
Q  716 agacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 793  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||| ||| || ||||||||||||    
T  181722 agacttattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatc---atagtgaaacagatgactgctctctc 181795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 594 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 31573961 - 31573794
Alignment:
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 693  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31573961 tagagttt-tctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag 31573865  T
Q  694 actctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcat 763  Q
    ||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  31573864 actttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaattctttgatatctcttttgtaaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 702 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468126
Alignment:
Q  702 tagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatac 801  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||| |||| |     
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagat 2468160  T
Q  802 taggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||    
T  2468159 taggtcaatttggacagaactaggtaaacaaatt 2468126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 424 - 668
Target Start/End: Original strand, 31034996 - 31035238
Alignment:
Q  424 ccgattttgacagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtat 523  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||  |||||||||| | |||| |  |||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  31034996 ccgattttgccagcagaaaataaatcagaatcgtatttttgggctcagatttgttccaatttttt--aggatatttttactataaatatagaccttgtat 31035093  T
Q  524 cgg-tgtaaaccttgaga--tagagaaggct--aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaac 618  Q
    | | ||||||| ||||||  |||||| | ||  |||||| |||| |||| | |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31035094 cagatgtaaactttgagaggtagaga-gtctgaaaacaatggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaac 31035190  T
Q  619 actagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagt 668  Q
    |||||||||   || |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  31035191 actagggtt--gggattgattcaccttgggaaacaccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 592 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 37214430 - 37214317
Alignment:
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37214430 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac---------attgagtctcttggttacgggaagcgattg 37214340  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgg 714  Q
      ||| ||||||||| |||||||    
T  37214339 gaactttgggtagaattaggcgg 37214317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 648 - 808
Target Start/End: Original strand, 17847677 - 17847830
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  17847677 gaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac-ctttgatatctct 17847775  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||||||        ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  17847776 tttgtaa-------aatcattatagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggtca 17847830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 594 - 835
Target Start/End: Original strand, 3895920 - 3896162
Alignment:
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgg-gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga 692  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |  | |||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||| ||||     
T  3895920 tagagtttg-cttttggcaacaaacaatagggttgg--gattgattcactttggagaaacactattgcgattgagtctcttcgtcacgggaagaaattgg 3896016  T
Q  693 gactctgggtagaaataggcgggagactta-ttcttgtaacacat-tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 790  Q
    |||| || ||| || ||||   || | ||| |||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||    
T  3896017 gactttgagtataattaggtttgaaaattaattcttgtaactcttatgatatctcttttgtaaagttactcatcattaaagtagaacggatggctgctct 3896116  T
Q  791 ctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    ||| |||||| ||| ||| | |||||||||| || || ||||||||    
T  3896117 ctcccccatagtagatcagtattggatcgaattgagtaaacaaatt 3896162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 497 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 3886253 - 3886153
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  3886253 cttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 3886154  T
Q  596 g 596  Q
    |    
T  3886153 g 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 649 - 850
Target Start/End: Original strand, 6376141 - 6376342
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |  |||||| ||||   || |||| |||||||| ||   ||||||||||||    
T  6376141 aaacactgttaagattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgttaccttttgatatctctt 6376240  T
Q  748 ttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| | || ||||||||| | ||||| ||||||  || |||||||| || |||||||    
T  6376241 t-gtaaagttactcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaacttagtaaacaaatt-ttgtgtgttc 6376338  T
Q  847 tctc 850  Q
    ||||    
T  6376339 tctc 6376342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 293 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 33541927 - 33541860
Alignment:
Q  293 ttgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctgaaagctgaaaattggtggctgatttt 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  33541927 ttgttgtgaaagtgcctcaaaattaaagaaattggaattctggaagctgaaaatcggtggccgatttt 33541860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 590 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 2468343 - 2468261
Alignment:
Q  590 tatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggt 676  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2468343 tatatagagtttg-ctcttggcaacaaatactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 497 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 12517361 - 12517248
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga--tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttata 593  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| | | |||| ||||||  |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  12517361 cttttactatatatatataccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 12517262  T
Q  594 tagagtttgtctct 607  Q
    ||||||||||||||    
T  12517261 tagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 784 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 37214312 - 37214246
Alignment:
Q  784 ctgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37214312 ctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttttctc 37214246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 718 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872435
Alignment:
Q  718 acttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatc 817  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||             | ||||||| |    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc-------------ccatttggacc 35872468  T
Q  818 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35872467 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 35872435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 795 - 847
Target Start/End: Original strand, 14477548 - 14477601
Alignment:
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactg-ggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14477548 cccagactaggtcaatttggatcgaactgcggtcaacaaattcttttgtgttct 14477601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 736 - 833
Target Start/End: Original strand, 16833789 - 16833886
Alignment:
Q  736 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaa 833  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||| | || |||| |||| ||| |  |||||||||| ||||||    
T  16833789 ttgatatctcttttgtaaagttactcaacattatagtggaacgaaaggctgctctctcccacagactaagtcacttttggacgaactgggtaaacaaa 16833886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 445 - 513
Target Start/End: Original strand, 15949338 - 15949406
Alignment:
Q  445 aaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatata 513  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||| |||| ||||||||||||    
T  15949338 aaaacataaatgtattttcgggcctagatttgttccactttttttaaggatgctttcactataaatata 15949406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 497 - 587
Target Start/End: Original strand, 181537 - 181628
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactaggg 587  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||||||||  |||| ||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||    
T  181537 cttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggcttagaatggcaacaataaaactaggg 181628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28328064
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  28327908 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 28328002  T
Q  748 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  28328003 ttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 28328064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 739 - 793
Target Start/End: Original strand, 14419732 - 14419786
Alignment:
Q  739 atatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||    
T  14419732 atatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggatggctgctctctc 14419786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 526 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 37214516 - 37214458
Alignment:
Q  526 gtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaact 583  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37214516 gtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact 37214458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 497 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 14419832 - 14419783
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagaga 546  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14419832 cttttgctataaatatagacattgtatcagggtaaaccttgagatagaga 14419783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 649 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 17799606 - 17799418
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || ||| || ||||   || |||| |||||| |||| ||   |||||||||    
T  17799606 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagact-tgagtataattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctctt 17799511  T
Q  748 ttgtaaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    | |||| |  ||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  17799510 t-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 17799418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 648 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 33839105 - 33838903
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattga-gactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctc 745  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| | |||| ||||||||| ||||   || |||| ||||||||||| | |||  ||||     
T  33839105 gaaacactattaggattgagtctcttggtca--ggaagagattcaagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttggaatct- 33839009  T
Q  746 ttttgtaaggttactcatca-ttatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtg 843  Q
     ||||||| |||||| |  | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||| | || || |||| ||||| |||||||| |  ||||    
T  33839008 -tttgtaaagttacttaaaagttatagtggaacggagaactgctctctcccccataatatgtcagtattcgaccgaattgggtaaacaaattttcgtgtg 33838910  T
Q  844 ttctctc 850  Q
    |||||||    
T  33838909 ttctctc 33838903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757293
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||| ||| |||   |||||| |    
T  16757449 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-t 16757355  T
Q  748 ttgtaaggttactca-tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  16757354 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 16757293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 777
Target Start/End: Complemental strand, 13985262 - 13985135
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| | |||| ||||||||| ||||   || ||| ||||||||||| | |||  |||||      
T  13985262 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaaccctttggaatctc-- 13985165  T
Q  748 ttgtaaggttactcatcattatagtggaac 777  Q
    || ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  13985164 ttataaagttacccctcattatagtggaac 13985135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 817 - 850
Target Start/End: Original strand, 181799 - 181832
Alignment:
Q  817 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  181799 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 181832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 763 - 832
Target Start/End: Original strand, 4696620 - 4696689
Alignment:
Q  763 tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 832  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4696620 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 4696689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 649 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021101
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg-cgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |    
T  9021289 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggact-tgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 9021195  T
Q  748 ttgtaaggttactc--atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    |||||| |  ||||  ||||||||||| || |||||  ||||||||||  ||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  9021194 ttgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 9021101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 649 - 838
Target Start/End: Original strand, 21033870 - 21034057
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctctt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| | | | |||| ||||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||    
T  21033870 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagggctgg-gact-tgggtagaaataggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctctt 21033964  T
Q  748 ttgtaaggttactcat--cattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    | |||| |  ||||||  ||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  21033965 t-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagatctgctcttttccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 21034057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752666
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16752704 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 16752666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895540
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28895502 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 28895540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 763 - 832
Target Start/End: Complemental strand, 7412414 - 7412345
Alignment:
Q  763 tcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 832  Q
    |||| ||||||||  ||||  |||||||||| |||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  7412414 tcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 7412345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 762 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 23179632 - 23179555
Alignment:
Q  762 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  23179632 atcattatagtggaacggatagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 23179555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 499 - 850
Target Start/End: Original strand, 79140 - 79491
Alignment:
Q  499 tttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatataga 597  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  79140 tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaacttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 79239  T
Q  598 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactc 697  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |     
T  79240 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaatt 79339  T
Q  698 tgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcaccc 797  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  79340 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctccccc 79438  T
Q  798 atactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  79439 agactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgttctctc 79491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 183974 - 183626
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||| | |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  183974 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga-agggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 183876  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  183875 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagagattgggac 183777  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  183776 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 183678  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
     || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183677 tcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 183626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 497 - 838
Target Start/End: Original strand, 51962 - 52307
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaga--tagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttata 593  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    ||||| ||||||  |||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  51962 cttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 52061  T
Q  594 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgag 693  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52062 tagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtg 52161  T
Q  694 actctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactg--ctctc 791  Q
    ||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||  |||||    
T  52162 actttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 52260  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    || |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  52261 tcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 52307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 766 - 838
Target Start/End: Original strand, 50234 - 50308
Alignment:
Q  766 ttatagtggaacggaggactgctctctcaccc--atactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  50234 ttatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggacctaactgggtcaacaaattctt 50308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 205; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 492 - 850
Target Start/End: Original strand, 79807 - 80165
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctt 590  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||    
T  79807 ggattcttttactataaatatagtttttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggttt 79906  T
Q  591 atatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  79907 gtatagagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagat 80006  T
Q  690 tgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctc 789  Q
    || | || ||||||| | ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  80007 tggggctttgggtag-attaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctc 80104  T
Q  790 tctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  80105 tctcccccagactaggtcaatttggattgaactgggtcaacaaattcttttgtgatctctc 80165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188386
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  188424 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 188386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 3950 - 4298
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  3950 cttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 4049  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
     |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||    
T  4050 -agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggac 4148  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  4149 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc-c 4246  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4247 ccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttct 4298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 200; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 41818 - 41468
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| | | |||| | |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  41818 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 41719  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  41718 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 41619  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||| |    
T  41618 tttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctccc 41520  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41519 ccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 41468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 200; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 69570 - 69277
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  69570 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 69471  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  69470 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 69372  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69371 aacgttactcatca-tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 69277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 552 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 73302 - 73211
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 643  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73302 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 73211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 615 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 73203 - 73160
Alignment:
Q  615 aaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactatt 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  73203 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 552 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 14661 - 14366
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14661 aaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 14562  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14561 cactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 14462  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14461 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtgttctctc 14366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Original strand, 14972 - 15323
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||  |||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  14972 cttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaatgatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttata 15071  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
     |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15072 aagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattcagac 15171  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||| |    
T  15172 tttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtggaacggaaggctgctgtctccc 15270  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  15271 ccatgctaggtcaatttggaccgaactgactcaacaaattc--ttgtgttctctc 15323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 195; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 11808 - 11455
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||  |||| ||||| || || |||| | ||||||||||||||||| || ||||    
T  11808 cttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtata 11709  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11708 gagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 11609  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||  |||||||||| |    
T  11608 tttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggattggagagctgctctctccc 11510  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11509 ccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 11455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 492 - 850
Target Start/End: Original strand, 85179 - 85537
Alignment:
Q  492 ggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggctta 591  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||  |||  |||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||     
T  85179 ggattcttttactataaatataggctttgtatcaaagtaaaccttgagatagaagaggagaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttg 85278  T
Q  592 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  85279 tatagagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattg 85378  T
Q  692 agactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctc 791  Q
     |||| || ||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  85379 tgactttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttcgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctc 85478  T
Q  792 tcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    || |||| |||||||||||||| |  ||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  85479 tcccccagactaggtcaatttgaactgaaccaggtaaacaaattcttttgtgttctctc 85537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 177; Significance: 6e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 6152 - 6502
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| || ||||    
T  6152 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaataaaactagggtttgtata 6251  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgaga 694  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6252 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattggga 6351  T
Q  695 ctctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctca 794  Q
    || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||     
T  6352 ctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcc 6449  T
Q  795 cccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  6450 cccagactaggtcagattggaccgaactgagtcaacaaatttctttgtgttct 6502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 2833 - 3182
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| | | |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  2833 cttttactataaatatagaacttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 2932  T
Q  596 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |  |||    
T  2933 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggcttggac 3032  T
Q  696 tctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcac 795  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||| ||||| |||| |    
T  3033 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctatctccc 3130  T
Q  796 ccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    | | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  3131 cgagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatattttgtgttct 3182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Original strand, 50 - 344
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  50 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 149  T
Q  652 cactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 750  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  150 cactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 248  T
Q  751 taaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  249 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 160; Significance: 8e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 434 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 16216 - 15817
Alignment:
Q  434 cagcataaaataaaacataaacgtattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaac 533  Q
    ||||| |||||| ||||||| | |||||| ||||  |||||||||| |  |||||   |||| |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||    
T  16216 cagcaaaaaatataacataatcatatttttgggctgagatttgttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaac 16117  T
Q  534 cttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagg 632  Q
    ||| ||||||||  || | ||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  16116 cttaagatagagggggttgaaataagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg 16020  T
Q  633 gttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaac 732  Q
     |||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16019 -ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaac 15921  T
Q  733 acattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaat-ttggatcgaactgggtcaaca 831  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| | ||||| |||||||||| ||||    
T  15920 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaaca 15821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 160; Significance: 8e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 552 - 847
Target Start/End: Original strand, 29180 - 29473
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| || ||||| |    
T  29180 aaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggata 29279  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | || || |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  29280 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgt 29378  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||   ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29379 aacaatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttct 29473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 152; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 612 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 1671 - 1438
Alignment:
Q  612 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaatagg 711  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||    
T  1671 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 1572  T
Q  712 cgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatt 811  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1571 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatt 1474  T
Q  812 tggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1473 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 144; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 457 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 17021 - 16646
Alignment:
Q  457 tattttcgggcctagatttgttctagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct--aaa 554  Q
    |||||| | |||||||||||||  | |||| || |||||  ||||| |||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||    
T  17021 tatttttgagcctagatttgtttcaattttttt-aggataattttaatataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctgaaaa 16923  T
Q  555 caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacac 654  Q
    ||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||| | ||||||||    
T  16922 caagggttt-gaaagacaaca-caaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacac 16828  T
Q  655 tattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaag 754  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  16827 tattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattgagactttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 16728  T
Q  755 gttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||  |  |||||| |||| || ||||||  |||||| |||||||||| ||||||||    
T  16727 gttactcatcattatagtgggacaaagggtttatctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 16646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 506 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 1958 - 1638
Alignment:
Q  506 taaatatagacattgtatcgg-tgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgt 603  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||| | |||||| |||||||||| || ||||||||||      
T  1958 taaatatagaccttgtatcagatgtaaacctagagatagaggtggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagttt-- 1862  T
Q  604 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggta 703  Q
           |||||||||||||||||    |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  1861 -------caacaaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggta 1771  T
Q  704 gaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatacta 803  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  1770 gaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatacta 1671  T
Q  804 ggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaatt 835  Q
    |||||  ||| || |||||||||| ||||||||    
T  1670 ggtcagtttttgaccgaactgggtaaacaaatt 1638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 136; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 484 - 723
Target Start/End: Original strand, 35580 - 35819
Alignment:
Q  484 tttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggctaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaact 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||  | |||||||  |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35580 tttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcagtacaaaccgggtgatagaggcgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact 35679  T
Q  584 agggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacggga 683  Q
    |||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  35680 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaacactattaggattaagtctcttggttacggga 35779  T
Q  684 agagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttat 723  Q
    ||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  35780 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 766 - 850
Target Start/End: Original strand, 35816 - 35900
Alignment:
Q  766 ttatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |  | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35816 ttatagtggaacggagggctgctctcttccttagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattattttgtgttctctc 35900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 122; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 552 - 793
Target Start/End: Original strand, 2051 - 2290
Alignment:
Q  552 aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaa 651  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| | || ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2051 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 2149  T
Q  652 cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgt 751  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  2150 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattaatttctcttttgt 2249  T
Q  752 aaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctc 793  Q
    || ||| ||||||| ||||||| | |||||| || |||||||    
T  2250 aacgttcctcatca-tatagtgaatcggagggctactctctc 2290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22418
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 22319  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    || |||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22320 tt-gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 22417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24693
Alignment:
Q  648 gaaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactctgggtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 24594  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    || |||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24595 tt-gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 24692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 90; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 503 - 808
Target Start/End: Original strand, 4773 - 5076
Alignment:
Q  503 ctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct--aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatatagagtt 600  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||  | ||  ||| |||| || |||| |  | ||||||| |||||| |||||||| |||    
T  4773 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggtctgaaaaaaaggatttagaa-gtaagcaacaaa-ctagggtttatatagcgtt 4870  T
Q  601 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgagactctgg 700  Q
    | |||||  |||||||||||||| ||| |||  ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||  || | |    
T  4871 t-tctctcagcaacaaacactagagtt-gagt-ttgattcatgttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttg 4967  T
Q  701 gtagaaataggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccat 799  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||     
T  4968 gtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctttttgtaaagatactcatcattatagtggaacatagaactgctctctgccccag 5067  T
Q  800 actaggtca 808  Q
    |||||||||    
T  5068 actaggtca 5076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 497 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 1166 - 1054
Alignment:
Q  497 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagaaggct-aaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttatata 595  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| | | |||| ||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  1166 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 1067  T
Q  596 gagtttgtctctt 608  Q
    |||||||||||||    
T  1066 gagtttgtctctt 1054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 778 - 845
Target Start/End: Complemental strand, 4733 - 4666
Alignment:
Q  778 ggaggactgctctctcacccatactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4733 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgtt 4666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 57613 - 57452
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagatt-gagactctgggtagaaataggcggga-gacttattcttgtaacacattgatatctct 746  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||||| | |||| ||||| ||| ||||   || ||  |||||||||||| | ||||||||| |    
T  57613 aaacactattaggattgaatctcttggtcattggaagagattcgggactttgggtggaattaggtttgaagatctattcttgtaaccctttgatatctat 57514  T
Q  747 tttgtaaggttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca 808  Q
    ||||||| ||||||||| | |||| |||||| |||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  57513 tttgtaaagttactcattaatataatggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 57452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 800 - 844
Target Start/End: Complemental strand, 1483 - 1439
Alignment:
Q  800 actaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 844  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1483 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224857
Alignment:
Q  649 aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  224819 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 224857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 762 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 17057 - 16980
Alignment:
Q  762 atcattatagtggaacggaggactgctctctcacccatactaggtca-atttggatcgaactgggtcaacaaattctt 838  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||    
T  17057 atcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 16980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University