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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5121-Insertion-2 (Length: 811)

Name: NF5121-Insertion-2
Description: NF5121
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5121-Insertion-2
NF5121-Insertion-2
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (8-811)||(54013685-54014482)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 749; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 749; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 54014482 - 54013685
Alignment:
Q  8 tttaaccggtgagattctcagatcttcaatttaactttttaagccttatcacatggattatgtttttggagactgtctatttatacagccatagaggaag 107  Q
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T  54014482 tttaaccggtgagattctcagatcttcaatttaactttttaagccttatcacatggattatgtttttggaaactgtctatttataaagccataaaggaag 54014383  T
Q  108 accagttgcatatttattccggttcatgaaccatgatacctccatgtgtttactatttactttatccacacgatcaattaatcagagtaaacatttttac 207  Q
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T  54014382 accagttacatatttattccggttcatgaaccatgatacctccatgtgtttactatttactttatccacacgatcaattaatcagagtaaacatttttac 54014283  T
Q  208 acacgcatctaattaaattacacaatgatatcgttttcttaaatttattgttaaaatatgtacataaatatctatctgattatatggttagatgtgattg 307  Q
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T  54014282 acacgcatctaattaaattacacaatgatatcgttttcttaaatttattgttaaaatatgttcataaatatctatatgattatatggttagatgtgattg 54014183  T
Q  308 aatacacgtgtaattttttgaccgaccctatattagaataggacctatcctatattggaacctattctatactccttccaaactacatgtaaatattgta 407  Q
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T  54014182 aatacacgtgtaattttttgaccgaccctatattagaataggaccgatcctatattggaacctattctatactccttccaaactacatgtaaatattgta 54014083  T
Q  408 ttggtgattaagcatgactttgtattggtgcagctggaaatgcaacatttttggaacatctaattttgatggcagtgattggaatacctatctttggggc 507  Q
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T  54014082 ttggtgattaagcatgactttgtattggtgcagctggaaatgcaacatttttggaacatctaattttgatggcagtgattggaatacctatctttggggc 54013983  T
Q  508 ttcaatgatgggatatggatccggaagtttggtatacggctatgttttgatttttgattttctaagatgcttgggtcattgcaacgttgaaataatccca 607  Q
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T  54013982 ttcaatgatgggatatggatccggaagtttggtatacggctatgttttgatttttgattttctaagatgcttgggtcattgcaacgttgaaataatccca 54013883  T
Q  608 cacaaattgttcaaggcatttccatttcttagatatgtgatatacacaccaacgtaagtttattaaaatttacatttacatttgtccaaaatttagatta 707  Q
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T  54013882 cacaaattgttcaaggcatttccatttcttagatatgtgatacacacaccaacgtaagtttattaaaatttacatttacatttgtccaaaatttagatta 54013783  T
Q  708 cagttaatgcacccttgaggttgagtaaacaaaacaaagtacgaatctctcttacttacactcattacttgttcaattgtcagacacataaaatagcccc 807  Q
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T  54013782 cagttaatgcacccttgaggttgagt------aacaaagtacgaatctctcttacttacactcattacttgttcaattgtcagacacataaaatagcccc 54013689  T

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