View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5124_high_11 (Length: 311)

Name: NF5124_high_11
Description: NF5124
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5124_high_11
NF5124_high_11
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (4-244)||(18333817-18334057)
chr3 (4-237)||(4793468-4793701)
chr3 (4-236)||(8286303-8286535)
chr3 (4-244)||(21677890-21678130)
chr3 (4-244)||(35883953-35884193)
chr3 (4-244)||(15737927-15738167)
chr3 (4-244)||(15889538-15889778)
chr3 (4-244)||(18054449-18054689)
chr3 (4-244)||(18273885-18274125)
chr3 (4-244)||(18289186-18289426)
chr3 (4-244)||(18304487-18304727)
chr3 (4-244)||(29145589-29145829)
chr3 (4-244)||(6205090-6205330)
chr3 (4-244)||(8299158-8299398)
chr3 (4-244)||(4686842-4687082)
chr3 (4-244)||(4724818-4725058)
chr3 (4-244)||(20069227-20069467)
chr3 (4-244)||(22384411-22384651)
chr3 (4-244)||(7076393-7076633)
chr3 (4-244)||(29661803-29662043)
chr3 (4-244)||(32442338-32442578)
chr3 (4-244)||(5470175-5470415)
chr3 (4-244)||(5593190-5593430)
chr3 (4-244)||(10399331-10399571)
chr3 (1-236)||(16621320-16621555)
chr3 (1-244)||(28112784-28113027)
chr3 (4-244)||(8214922-8215162)
chr3 (4-244)||(28024469-28024709)
chr3 (1-244)||(28342364-28342607)
chr3 (1-234)||(19697687-19697920)
chr3 (4-244)||(4420102-4420342)
chr3 (4-244)||(5606147-5606387)
chr3 (4-244)||(7999747-7999987)
chr3 (4-244)||(10646260-10646500)
chr3 (4-244)||(20573676-20573916)
chr3 (4-244)||(22867681-22867921)
chr3 (4-244)||(22882740-22882980)
chr3 (1-244)||(47026640-47026883)
chr3 (1-239)||(5016906-5017144)
chr3 (4-244)||(6539575-6539815)
chr3 (4-244)||(31961288-31961528)
chr3 (9-244)||(4343514-4343749)
chr3 (1-244)||(24331350-24331593)
chr3 (4-244)||(51785210-51785450)
chr3 (4-244)||(18245928-18246168)
chr3 (4-244)||(48469114-48469354)
chr3 (4-244)||(17981782-17982022)
chr3 (4-244)||(18228383-18228623)
chr3 (45-239)||(11107226-11107420)
chr3 (1-128)||(32293931-32294058)
chr3 (1-128)||(17992761-17992888)
chr3 (1-128)||(31033066-31033193)
chr3 (4-128)||(4627088-4627212)
chr3 (4-128)||(5714376-5714500)
chr3 (4-128)||(5725286-5725410)
chr3 (4-128)||(5766958-5767082)
chr3 (19-197)||(5950650-5950828)
chr3 (135-199)||(15918749-15918813)
chr3 (142-199)||(15592882-15592939)
chr3 (142-199)||(20443349-20443406)
chr3 (142-199)||(41440475-41440532)
chr3 (135-235)||(7088991-7089091)
chr3 (135-235)||(11925322-11925422)
chr3 (135-235)||(16431601-16431701)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (4-244)||(18793929-18794169)
chr8 (4-244)||(27605656-27605896)
chr8 (4-244)||(14560849-14561089)
chr8 (4-244)||(2134011-2134251)
chr8 (4-244)||(29832551-29832791)
chr8 (4-239)||(19691328-19691563)
chr8 (1-244)||(19205110-19205353)
chr8 (4-244)||(18712709-18712949)
chr8 (1-244)||(28358700-28358943)
chr8 (4-244)||(12089474-12089714)
chr8 (4-244)||(19677672-19677912)
chr8 (4-239)||(9357855-9358090)
chr8 (4-244)||(31486622-31486862)
chr8 (1-244)||(31357753-31357996)
chr8 (4-239)||(33261964-33262199)
chr8 (1-242)||(22077659-22077900)
chr8 (1-128)||(15770915-15771042)
chr8 (1-128)||(44564325-44564452)
chr8 (1-124)||(21344919-21345042)
chr8 (177-244)||(16286626-16286694)
chr8 (136-235)||(19844401-19844500)
chr8 (135-235)||(14212273-14212373)
chr8 (135-235)||(22412172-22412272)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (4-244)||(10913544-10913784)
chr7 (4-244)||(2157797-2158037)
chr7 (4-244)||(26534548-26534788)
chr7 (4-244)||(5131219-5131459)
chr7 (1-236)||(10844851-10845086)
chr7 (1-244)||(26271758-26272001)
chr7 (4-244)||(2106838-2107078)
chr7 (4-244)||(5144015-5144255)
chr7 (4-244)||(11421454-11421694)
chr7 (4-244)||(22145418-22145658)
chr7 (4-236)||(16515105-16515337)
chr7 (1-244)||(26316520-26316763)
chr7 (4-244)||(26516015-26516255)
chr7 (1-244)||(4141918-4142161)
chr7 (1-244)||(4202612-4202855)
chr7 (1-244)||(45390443-45390686)
chr7 (4-244)||(26438480-26438720)
chr7 (1-236)||(10842666-10842901)
chr7 (1-236)||(16044550-16044784)
chr7 (1-236)||(16446678-16446913)
chr7 (1-244)||(26666586-26666829)
chr7 (4-244)||(3448529-3448769)
chr7 (4-244)||(11444110-11444350)
chr7 (4-244)||(31561065-31561305)
chr7 (4-244)||(24589209-24589449)
chr7 (4-230)||(16748192-16748418)
chr7 (1-128)||(2776593-2776720)
chr7 (89-244)||(9621873-9622028)
chr7 (1-128)||(26512368-26512495)
chr7 (1-128)||(26681778-26681905)
chr7 (1-128)||(31127246-31127373)
chr7 (1-128)||(45734652-45734779)
chr7 (1-128)||(31087294-31087421)
chr7 (1-128)||(39209811-39209938)
chr7 (19-197)||(9469590-9469768)
chr7 (19-197)||(16393124-16393302)
chr7 (19-197)||(30369636-30369814)
chr7 (124-235)||(25726729-25726840)
chr7 (135-235)||(2556767-2556867)
chr7 (135-235)||(15193315-15193415)
chr7 (135-235)||(16127624-16127724)
chr7 (143-199)||(16287193-16287249)
chr7 (135-235)||(29089748-29089848)
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (4-244)||(27022359-27022599)
chr6 (4-244)||(27287097-27287337)
chr6 (4-244)||(29552780-29553020)
chr6 (4-244)||(13295684-13295924)
chr6 (4-244)||(15421053-15421293)
chr6 (4-244)||(22931617-22931857)
chr6 (4-244)||(23854062-23854302)
chr6 (4-244)||(16677363-16677603)
chr6 (4-244)||(27179679-27179919)
chr6 (4-244)||(27269320-27269560)
chr6 (4-244)||(24866939-24867179)
chr6 (4-244)||(16753044-16753284)
chr6 (1-239)||(17089173-17089411)
chr6 (4-244)||(4542507-4542747)
chr6 (4-244)||(4720868-4721108)
chr6 (4-244)||(27626444-27626684)
chr6 (4-244)||(34461239-34461479)
chr6 (4-244)||(3699306-3699546)
chr6 (4-244)||(4760986-4761226)
chr6 (4-244)||(26113145-26113385)
chr6 (4-244)||(26921600-26921840)
chr6 (4-244)||(27010954-27011194)
chr6 (4-244)||(27060729-27060969)
chr6 (4-244)||(28210677-28210917)
chr6 (1-244)||(30554746-30554989)
chr6 (4-244)||(27488356-27488596)
chr6 (4-244)||(29504639-29504879)
chr6 (4-244)||(29576237-29576477)
chr6 (4-244)||(4776103-4776343)
chr6 (10-244)||(16940766-16941000)
chr6 (4-244)||(4528508-4528748)
chr6 (1-236)||(20171778-20172013)
chr6 (1-236)||(22163978-22164213)
chr6 (4-166)||(26992096-26992258)
chr6 (1-128)||(14142124-14142251)
chr6 (1-128)||(26789155-26789282)
chr6 (1-128)||(27197524-27197651)
chr6 (1-128)||(27251584-27251711)
chr6 (1-128)||(8902433-8902560)
chr6 (4-146)||(33373164-33373306)
chr6 (1-128)||(13520922-13521048)
chr6 (4-128)||(26775360-26775484)
chr6 (4-128)||(27358843-27358967)
chr6 (4-128)||(27449186-27449310)
chr6 (4-128)||(28163830-28163954)
chr6 (1-128)||(22455844-22455971)
chr6 (19-197)||(9136101-9136279)
chr6 (135-235)||(18119701-18119801)
chr6 (135-235)||(23971634-23971734)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (9-244)||(14668255-14668490)
chr4 (4-244)||(6573097-6573337)
chr4 (4-244)||(14760096-14760336)
chr4 (4-244)||(17016285-17016525)
chr4 (4-239)||(34185750-34185985)
chr4 (4-244)||(24589151-24589391)
chr4 (4-244)||(54836630-54836870)
chr4 (4-244)||(5009114-5009354)
chr4 (4-244)||(20335211-20335451)
chr4 (4-244)||(24115901-24116141)
chr4 (4-244)||(18313968-18314208)
chr4 (4-244)||(36341307-36341547)
chr4 (1-244)||(15231111-15231354)
chr4 (1-236)||(15281724-15281959)
chr4 (1-237)||(1903500-1903736)
chr4 (4-244)||(27160107-27160347)
chr4 (4-244)||(33670590-33670830)
chr4 (1-244)||(31123299-31123542)
chr4 (4-244)||(30756999-30757239)
chr4 (4-239)||(21972945-21973180)
chr4 (4-244)||(14101782-14102022)
chr4 (4-244)||(18797404-18797644)
chr4 (4-244)||(39853876-39854116)
chr4 (4-244)||(40102427-40102667)
chr4 (13-242)||(15388177-15388406)
chr4 (95-146)||(24459636-24459687)
chr4 (135-235)||(14725720-14725820)
chr4 (135-235)||(19767587-19767687)
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (4-244)||(30519-30759)
scaffold0143 (1-236)||(19304-19539)
scaffold0143 (1-128)||(7302-7429)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (4-236)||(3301-3533)
scaffold0089 (94-244)||(43871-44021)
scaffold0089 (165-236)||(32096-32167)
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (4-244)||(11552588-11552828)
chr5 (4-244)||(15655445-15655685)
chr5 (4-244)||(33295761-33296001)
chr5 (4-244)||(33780722-33780962)
chr5 (1-244)||(23629203-23629446)
chr5 (1-244)||(43081488-43081731)
chr5 (4-244)||(22995804-22996044)
chr5 (4-244)||(24684832-24685072)
chr5 (4-244)||(41677938-41678178)
chr5 (4-244)||(24973139-24973379)
chr5 (1-233)||(22891707-22891939)
chr5 (4-244)||(28652475-28652715)
chr5 (1-244)||(9320709-9320952)
chr5 (1-244)||(12135408-12135651)
chr5 (1-244)||(26483627-26483870)
chr5 (1-244)||(34619751-34619994)
chr5 (4-244)||(18497412-18497652)
chr5 (4-236)||(23895447-23895679)
chr5 (4-244)||(30937868-30938108)
chr5 (9-244)||(3792774-3793009)
chr5 (1-244)||(31434697-31434940)
chr5 (4-244)||(24586607-24586847)
chr5 (4-244)||(28956472-28956712)
chr5 (4-244)||(30171702-30171942)
chr5 (4-244)||(31823094-31823334)
chr5 (4-244)||(32592961-32593201)
chr5 (4-244)||(37355330-37355570)
chr5 (1-244)||(8662159-8662402)
chr5 (1-244)||(30032661-30032904)
chr5 (1-244)||(30155264-30155507)
chr5 (1-244)||(33519613-33519856)
chr5 (9-244)||(40470242-40470477)
chr5 (4-244)||(13321517-13321757)
chr5 (4-244)||(37668173-37668413)
chr5 (1-236)||(25203519-25203754)
chr5 (1-236)||(25267674-25267909)
chr5 (9-244)||(37758216-37758451)
chr5 (4-244)||(2514295-2514535)
chr5 (4-244)||(18372221-18372461)
chr5 (4-244)||(24727202-24727442)
chr5 (12-244)||(37767686-37767918)
chr5 (10-244)||(15755545-15755779)
chr5 (4-244)||(5641021-5641261)
chr5 (4-244)||(6877538-6877778)
chr5 (1-128)||(9547393-9547520)
chr5 (1-128)||(33878480-33878606)
chr5 (4-146)||(13183480-13183622)
chr5 (4-128)||(18125103-18125227)
chr5 (1-128)||(11326986-11327113)
chr5 (1-128)||(29887881-29888008)
chr5 (4-128)||(13439370-13439494)
chr5 (19-197)||(15784427-15784605)
chr5 (19-197)||(11944124-11944302)
chr5 (19-197)||(17957376-17957554)
chr5 (19-197)||(5439927-5440105)
chr5 (135-197)||(36375780-36375842)
chr5 (135-197)||(37000434-37000496)
chr5 (143-199)||(34468900-34468956)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (4-244)||(34294379-34294619)
chr2 (4-244)||(23125347-23125587)
chr2 (1-244)||(11631960-11632203)
chr2 (4-244)||(13933326-13933566)
chr2 (4-244)||(20841138-20841378)
chr2 (4-239)||(12658766-12659001)
chr2 (4-244)||(37948641-37948881)
chr2 (9-236)||(27431225-27431452)
chr2 (1-244)||(39893294-39893537)
chr2 (4-244)||(27806928-27807168)
chr2 (4-244)||(39048598-39048838)
chr2 (4-244)||(12590033-12590273)
chr2 (4-244)||(28885432-28885672)
chr2 (1-236)||(19453199-19453434)
chr2 (4-244)||(9346765-9347005)
chr2 (4-236)||(21699950-21700181)
chr2 (4-244)||(34864909-34865149)
chr2 (4-244)||(37380902-37381142)
chr2 (4-244)||(40236733-40236973)
chr2 (1-244)||(37682671-37682914)
chr2 (1-244)||(37697936-37698179)
chr2 (1-244)||(37928594-37928837)
chr2 (1-239)||(16826114-16826352)
chr2 (1-239)||(16895128-16895366)
chr2 (1-239)||(31879516-31879754)
chr2 (4-244)||(19413280-19413520)
chr2 (4-239)||(32053033-32053268)
chr2 (4-244)||(257432-257672)
chr2 (4-244)||(12713380-12713620)
chr2 (4-244)||(21673954-21674194)
chr2 (1-242)||(27394789-27395030)
chr2 (1-128)||(16164821-16164948)
chr2 (1-128)||(27779575-27779702)
chr2 (1-128)||(27819332-27819459)
chr2 (1-128)||(3785834-3785961)
chr2 (1-128)||(27119865-27119992)
chr2 (1-128)||(31890267-31890394)
chr2 (1-128)||(22924924-22925051)
chr2 (1-128)||(34158185-34158312)
chr2 (4-88)||(27827841-27827925)
chr2 (19-197)||(12383932-12384110)
chr2 (19-197)||(22949665-22949843)
chr2 (135-235)||(34701310-34701410)
chr2 (135-235)||(42393769-42393869)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (4-239)||(21894539-21894774)
chr1 (1-233)||(20339088-20339320)
chr1 (1-244)||(10948305-10948548)
chr1 (1-244)||(10965893-10966136)
chr1 (4-235)||(16204824-16205055)
chr1 (1-236)||(20464212-20464447)
chr1 (4-239)||(28588218-28588453)
chr1 (4-230)||(41790100-41790326)
chr1 (4-244)||(51641446-51641686)
chr1 (4-244)||(3644360-3644603)
chr1 (1-128)||(28153080-28153207)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (4-244)||(9262-9502)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (1-233)||(1411-1643)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (4-244)||(15807-16047)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (4-244)||(12797-13037)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (4-244)||(11175-11415)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (4-244)||(9248-9488)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (4-244)||(11718-11958)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-244)||(22978-23221)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (4-244)||(5969-6209)
scaffold0159 (166-244)||(23105-23183)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (1-236)||(9279-9514)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (1-236)||(5458-5693)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (22-235)||(43538-43762)
[»] scaffold1888 (1 HSPs)
scaffold1888 (130-244)||(1149-1263)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (19-197)||(29443-29621)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (163-231)||(33699-33770)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (142-224)||(35168-35250)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (135-235)||(10453-10553)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18334057 - 18333817
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334057 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 18333958  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18333957 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 18333858  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18333857 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 18333817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 237
Target Start/End: Original strand, 4793468 - 4793701
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4793468 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 4793567  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4793568 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 4793667  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4793668 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgt 4793701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Original strand, 8286303 - 8286535
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286303 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 8286402  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286403 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 8286502  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286503 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 8286535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21678130 - 21677890
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21678130 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 21678031  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678030 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 21677931  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21677930 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 21677890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 35884193 - 35883953
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35884193 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 35884094  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35884093 catcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 35883994  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35883993 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 35883953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 15737927 - 15738167
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15737927 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 15738026  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15738027 catcattccatacagtaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 15738126  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15738127 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 15738167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 15889538 - 15889778
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15889538 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 15889637  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15889638 catcattccatacaataggctgattctttctgaggagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 15889737  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15889738 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 15889778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18054689 - 18054449
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18054689 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 18054590  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18054589 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 18054490  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18054489 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 18054449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 18273885 - 18274125
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18273885 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 18273984  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18273985 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 18274084  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18274085 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 18274125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 18289186 - 18289426
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18289186 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 18289285  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18289286 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 18289385  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18289386 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 18289426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 18304487 - 18304727
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18304487 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 18304586  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18304587 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 18304686  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18304687 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 18304727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 29145589 - 29145829
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29145589 actgccaaatacataatcaaaggccttccctccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 29145688  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29145689 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 29145788  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  29145789 cccgaggaaacctctaacttgcttctcggtctgtggagctg 29145829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6205330 - 6205090
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6205330 actgccaaatacataatcaagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 6205231  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6205230 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 6205131  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  6205130 cccgaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtggagctg 6205090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8299398 - 8299158
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8299398 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 8299299  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8299298 catcattccatacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 8299199  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8299198 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 8299158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4687082 - 4686842
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4687082 actgccaaatacataatcaagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 4686983  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4686982 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 4686883  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4686882 cccgaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtggagctg 4686842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4725058 - 4724818
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4725058 actgccaaatacataatcaagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 4724959  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4724958 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 4724859  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4724858 cccgaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtggagctg 4724818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20069467 - 20069227
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20069467 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 20069368  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20069367 catcattccatacgataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacg 20069268  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20069267 cccgaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtggagctg 20069227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 22384411 - 22384651
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22384411 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 22384510  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22384511 catcattccatacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 22384610  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22384611 ttcgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 22384651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7076633 - 7076393
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7076633 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 7076534  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7076533 catcattccatacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatgcgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 7076434  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7076433 tccgaggaagcctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 7076393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 29661803 - 29662043
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29661803 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 29661902  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29661903 catcattccatacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 29662002  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29662003 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggggctg 29662043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 32442578 - 32442338
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32442578 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 32442479  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32442478 catcattccatacaacagactgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 32442379  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  32442378 tccgaggaaacctctgacttgcttctcgatccgtggagctg 32442338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5470415 - 5470175
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5470415 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 5470316  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5470315 catcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 5470216  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5470215 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 5470175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 5593190 - 5593430
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5593190 actgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 5593289  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5593290 catcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 5593389  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5593390 cccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 5593430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10399571 - 10399331
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399571 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 10399472  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399471 catcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 10399372  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  10399371 tccgaggaaacctctgacttgtttctctgtctgtggagctg 10399331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 16621320 - 16621555
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16621320 aacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggc 16621419  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16621420 attcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 16621519  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 236  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16621520 tcgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 16621555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 28112784 - 28113027
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28112784 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagctccttggc 28112883  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28112884 attcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgctgtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 28112983  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28112984 acgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 28113027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8215162 - 8214922
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8215162 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 8215063  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8215062 catcattccacacaacaggctgattttttctgagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 8214963  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  8214962 tcccaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 8214922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28024709 - 28024469
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28024709 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcatt 28024610  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28024609 catcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacg 28024510  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28024509 cccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 28024469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28342607 - 28342364
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342607 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 28342508  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342507 attcatcattccatacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 28342408  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28342407 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 28342364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19697920 - 19697687
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19697920 aacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgacgctatcaaaagcttcttggc 19697821  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19697820 attcatcgttccatacaataggctgattcttcttgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaattgggagatgtaattcaa 19697721  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 234  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19697720 tcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtc 19697687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4420342 - 4420102
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4420342 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 4420243  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4420242 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 4420143  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4420142 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 4420102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 5606147 - 5606387
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5606147 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 5606246  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5606247 catcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 5606346  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5606347 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 5606387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7999987 - 7999747
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7999987 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 7999888  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7999887 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 7999788  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  7999787 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 7999747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10646500 - 10646260
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10646500 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 10646401  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10646400 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 10646301  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10646300 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 10646260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 20573676 - 20573916
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20573676 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 20573775  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20573776 cctcattccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggtccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 20573875  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  20573876 cccgaggaaacctctgacttgcttctctgtccgtggagctg 20573916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 22867681 - 22867921
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22867681 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 22867780  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22867781 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 22867880  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22867881 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 22867921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 22882740 - 22882980
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22882740 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 22882839  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22882840 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 22882939  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22882940 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 22882980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 47026883 - 47026640
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47026883 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 47026784  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47026783 attcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 47026684  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  47026683 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 47026640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 5017144 - 5016906
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5017144 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 5017045  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5017044 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 5016945  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgg 239  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5016944 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtgg 5016906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 6539575 - 6539815
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6539575 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 6539674  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6539675 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 6539774  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  6539775 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 6539815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 31961288 - 31961528
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31961288 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaagaataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 31961387  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31961388 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 31961487  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31961488 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 31961528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 244
Target Start/End: Original strand, 4343514 - 4343749
Alignment:
Q  9 caaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatca 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4343514 caaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatca 4343613  T
Q  109 ttccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccga 208  Q
    |||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  4343614 ttccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccca 4343713  T
Q  209 ggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4343714 agaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 4343749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24331593 - 24331350
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24331593 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctttttggc 24331494  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24331493 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 24331394  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24331393 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 24331350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 51785450 - 51785210
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51785450 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 51785351  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51785350 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 51785251  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  51785250 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 51785210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18246168 - 18245928
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18246168 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 18246069  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18246068 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 18245969  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  18245968 tcccaagaaacctctgacttgcttctctatctgtggagctg 18245928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 48469354 - 48469114
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48469354 actgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 48469255  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||| ||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48469254 cattattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 48469155  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  48469154 cccgaggaaacctatgacttgtttctctgtctgtggagctg 48469114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 17981782 - 17982022
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17981782 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 17981881  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17981882 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 17981981  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  17981982 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 17982022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18228623 - 18228383
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18228623 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 18228524  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18228523 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 18228424  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18228423 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 18228383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 45 - 239
Target Start/End: Original strand, 11107226 - 11107420
Alignment:
Q  45 gacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttg 144  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11107226 gacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcttcattccatacaataggctgactctttctgagtagcttg 11107325  T
Q  145 aaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgg 239  Q
    || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11107326 aagatcggcccacaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgg 11107420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 32294058 - 32293931
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32294058 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 32293959  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32293958 attcatcgttccatacaataggctgatt 32293931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 17992761 - 17992888
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17992761 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 17992860  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17992861 attcatcgttccatacaataggttgatt 17992888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 31033066 - 31033193
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31033066 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 31033165  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  31033166 attcatcgttccatataataggctgatt 31033193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 4627212 - 4627088
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4627212 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 4627113  T
Q  104 catcattccatacaataggctgatt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4627112 catcattccatacaataggctgatt 4627088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5714500 - 5714376
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714500 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 5714401  T
Q  104 catcattccatacaataggctgatt 128  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  5714400 catcgttccatacaataggctgatt 5714376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5725410 - 5725286
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5725410 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 5725311  T
Q  104 catcattccatacaataggctgatt 128  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  5725310 catcgttccatacaataggctgatt 5725286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 5766958 - 5767082
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5766958 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 5767057  T
Q  104 catcattccatacaataggctgatt 128  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  5767058 catcgttccatacaataggctgatt 5767082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 197
Target Start/End: Original strand, 5950650 - 5950828
Alignment:
Q  19 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 118  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||  || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||| || ||  |||| ||||    
T  5950650 atcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcctcggtccacacaa 5950749  T
Q  119 taggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 197  Q
    ||   || | ||| | |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5950750 taccttgttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 5950828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15918813 - 15918749
Alignment:
Q  135 gagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattca 199  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15918813 gagtagtttgaatatcggtccgcacgttgctgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 15918749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 199
Target Start/End: Original strand, 15592882 - 15592939
Alignment:
Q  142 ttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattca 199  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15592882 ttgaatatcggcctgcacgttgctgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 15592939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 20443406 - 20443349
Alignment:
Q  142 ttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattca 199  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20443406 ttgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagagatgaaacgggagatgtaattca 20443349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 41440532 - 41440475
Alignment:
Q  142 ttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattca 199  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41440532 ttgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagagatgaaacgggagatgtaattca 41440475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 7088991 - 7089091
Alignment:
Q  135 gagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 234  Q
    ||||| ||||||||| || || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||||||||| |||    
T  7088991 gagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctaccaagaaaacctctgacttgcttctctgtc 7089090  T
Q  235 t 235  Q
    |    
T  7089091 t 7089091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 11925322 - 11925422
Alignment:
Q  135 gagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 234  Q
    ||||| ||||||||| || || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||||||||| |||    
T  11925322 gagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctaccaagaaaacctctgacttgcttctctgtc 11925421  T
Q  235 t 235  Q
    |    
T  11925422 t 11925422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16431701 - 16431601
Alignment:
Q  135 gagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 234  Q
    ||||| ||||||||| || || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||||||||| |||    
T  16431701 gagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctaccaagaaaacctctgacttgcttctctgtc 16431602  T
Q  235 t 235  Q
    |    
T  16431601 t 16431601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18794169 - 18793929
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794169 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 18794070  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18794069 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatttaaacg 18793970  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18793969 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 18793929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 27605656 - 27605896
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27605656 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 27605755  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27605756 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 27605855  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27605856 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 27605896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14561089 - 14560849
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14561089 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 14560990  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14560989 catcattccatacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 14560890  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14560889 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 14560849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 2134011 - 2134251
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2134011 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggcatt 2134110  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2134111 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 2134210  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2134211 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 2134251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29832791 - 29832551
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29832791 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 29832692  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29832691 catcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 29832592  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  29832591 tcccaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 29832551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19691563 - 19691328
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19691563 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccgcgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 19691464  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19691463 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcg 19691364  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgg 239  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19691363 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtttgtgg 19691328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 19205110 - 19205353
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19205110 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 19205209  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19205210 attcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 19205309  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  19205310 acgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtccgtggagctg 19205353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18712949 - 18712709
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18712949 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 18712850  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18712849 catcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 18712750  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18712749 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggagctg 18712709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 28358700 - 28358943
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28358700 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccgcggatgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 28358799  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28358800 attcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 28358899  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  28358900 acgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtccgtggagctg 28358943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 12089474 - 12089714
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12089474 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 12089573  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12089574 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 12089673  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12089674 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 12089714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19677912 - 19677672
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19677912 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcatt 19677813  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19677812 catcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaaacg 19677713  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19677712 tccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 19677672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9358090 - 9357855
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9358090 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 9357991  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9357990 catcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 9357891  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgg 239  Q
     || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9357890 tcccaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtgg 9357855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 31486622 - 31486862
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31486622 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 31486721  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  31486722 catcattccatacaacaggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacg 31486821  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31486822 cccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 31486862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 31357996 - 31357753
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31357996 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 31357897  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||| || || ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31357896 attcatcattccatacaacagggtggttctttttaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 31357797  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31357796 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 31357753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 33262199 - 33261964
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33262199 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 33262100  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33262099 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 33262000  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgg 239  Q
     || | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33261999 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtgg 33261964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 22077659 - 22077900
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  22077659 aacactgtcaagtacataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggc 22077758  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22077759 attcattattccacacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatcagatatgaatcgggagatgtaattcaa 22077858  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgc 242  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22077859 acgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtggtgc 22077900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 15771042 - 15770915
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15771042 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 15770943  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15770942 attcatcgttccatacaataggctgatt 15770915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 44564452 - 44564325
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44564452 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 44564353  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  44564352 attcatcgttctatacaataggctgatt 44564325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 21344919 - 21345042
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21344919 aacactgacaaatacaaaatcgaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgac 21345018  T
Q  101 attcatcattccatacaataggct 124  Q
    |||||||||||| ||||| |||||    
T  21345019 attcatcattccctacaagaggct 21345042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 177 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16286694 - 16286626
Alignment:
Q  177 tatgaatcgggagatgtaattcaaacgcc-cgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16286694 tatgaatcgggagatgtaattcaatcgtctcgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 16286626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19844500 - 19844401
Alignment:
Q  136 agtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtct 235  Q
    |||| ||||||||| || || || || || ||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| |  || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  19844500 agtaacttgaaaattggtccacatgtggcagtcatatgagatataaatctggagatgtagttcaatctaccaagaaaacctctgacttgcttctctgtct 19844401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14212373 - 14212273
Alignment:
Q  135 gagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 234  Q
    ||||| ||||||||| || || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||||||||| |||    
T  14212373 gagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctaccaagaaaacctctgacttgcttctctgtc 14212274  T
Q  235 t 235  Q
    |    
T  14212273 t 14212273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22412272 - 22412172
Alignment:
Q  135 gagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 234  Q
    ||||| ||||||||| || || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||||||||| |||    
T  22412272 gagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctaccaagaaaacctctgacttgcttctctgtc 22412173  T
Q  235 t 235  Q
    |    
T  22412172 t 22412172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 10913544 - 10913784
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10913544 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 10913643  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10913644 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 10913743  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10913744 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 10913784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2158037 - 2157797
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2158037 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 2157938  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2157937 catcattccatacaataggctgattcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 2157838  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2157837 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 2157797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 26534548 - 26534788
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26534548 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 26534647  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26534648 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggaaatgtaattcaaacg 26534747  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26534748 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtttgtggagctg 26534788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5131459 - 5131219
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5131459 actgccaaatacataatcaaaggcctcccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 5131360  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5131359 catcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 5131260  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5131259 tccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 5131219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10845086 - 10844851
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10845086 aacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttacagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 10844987  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10844986 attcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 10844887  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 236  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10844886 tcgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 10844851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 26271758 - 26272001
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26271758 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggc 26271857  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26271858 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 26271957  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  26271958 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 26272001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 2106838 - 2107078
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2106838 actgccaaatacataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 2106937  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2106938 catcattccatacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 2107037  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2107038 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtatgtggagctg 2107078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 5144015 - 5144255
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5144015 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 5144114  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5144115 catcattccatacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcaaacg 5144214  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5144215 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 5144255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 11421454 - 11421694
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11421454 actgccaaatacataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 11421553  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11421554 catcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 11421653  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11421654 cccgaggaaccctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 11421694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22145658 - 22145418
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22145658 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 22145559  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22145558 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 22145459  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  22145458 tccgaggaaacctctaacttgtttctcggtctgtggagctg 22145418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Original strand, 16515105 - 16515337
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16515105 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagattcttggcatt 16515204  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16515205 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcagcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcg 16515304  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 236  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16515305 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 16515337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 26316520 - 26316763
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26316520 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 26316619  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26316620 attcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaa 26316719  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  26316720 acgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 26316763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26516255 - 26516015
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26516255 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 26516156  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26516155 catcattccatacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 26516056  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  26516055 cccgaggaaacctctgacttgcttctctgtttgtggagctg 26516015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 4141918 - 4142161
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4141918 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 4142017  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4142018 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 4142117  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4142118 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 4142161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4202855 - 4202612
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4202855 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 4202756  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4202755 attcatcattccatacaataggctggctctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaa 4202656  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  4202655 acgtccgaggaagcctctaacttgcttctctgtctgtggagctg 4202612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 45390686 - 45390443
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45390686 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 45390587  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45390586 attcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagtttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 45390487  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  45390486 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 45390443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26438720 - 26438480
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26438720 actgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 26438621  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26438620 catcattccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 26438521  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26438520 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggagctg 26438480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 10842666 - 10842901
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10842666 aacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggc 10842765  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  10842766 attcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatataaatcgggagatgtaatgcaa 10842865  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 236  Q
     ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  10842866 tcgcccgaggaaacctctaacttgtttctcggtctg 10842901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16044784 - 16044550
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16044784 aacactgacaaatacataatcaaaggc-ttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctattaaaagcctcttggc 16044686  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16044685 attcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 16044586  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 236  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16044585 tcgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 16044550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 16446678 - 16446913
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16446678 aacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagccccttggc 16446777  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446778 attcatcgttccatacaatagtctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcctgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 16446877  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 236  Q
     | ||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  16446878 tcacccgaggaaacctcttacttgtgtctcggtctg 16446913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 26666586 - 26666829
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26666586 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 26666685  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||| | |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26666686 attcatcattccatacgacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 26666785  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  26666786 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 26666829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3448769 - 3448529
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3448769 actgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 3448670  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3448669 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 3448570  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  3448569 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 3448529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 11444350 - 11444110
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11444350 actgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 11444251  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11444250 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 11444151  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11444150 tcccaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 11444110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 31561065 - 31561305
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31561065 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 31561164  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31561165 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 31561264  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  31561265 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtttgtggagctg 31561305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 24589209 - 24589449
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589209 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgattccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 24589308  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589309 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 24589408  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24589409 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 24589449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Original strand, 16748192 - 16748418
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16748192 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataactcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 16748291  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16748292 catcattccatacaacaggttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccacaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacg 16748391  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctc 230  Q
     |||||||| |||||||||||||||||    
T  16748392 tccgaggaagcctctgacttgcttctc 16748418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 2776720 - 2776593
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2776720 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 2776621  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2776620 attcatcgttccatacaataggctgatt 2776593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 89 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9622028 - 9621873
Alignment:
Q  89 aagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcggga 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9622028 aagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgaga 9621929  T
Q  189 gatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  9621928 gatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 9621873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 26512368 - 26512495
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26512368 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 26512467  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26512468 attcatcgttccatacaataggctgatt 26512495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 26681778 - 26681905
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26681778 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 26681877  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26681878 attcatcgttccatacaataggctgatt 26681905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 31127373 - 31127246
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31127373 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 31127274  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31127273 attcatcgttccatacaataggctgatt 31127246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 45734779 - 45734652
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45734779 aacactgacaaatacaaaatcaaaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 45734680  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45734679 attcatcattccatacaataggccgatt 45734652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 31087294 - 31087421
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31087294 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 31087393  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31087394 attcatcgttccatacaataggctgatt 31087421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 39209811 - 39209938
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39209811 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 39209910  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  39209911 attcatcgttccatacaataggttgatt 39209938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9469768 - 9469590
Alignment:
Q  19 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 118  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||  || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||| || ||  |||| ||||    
T  9469768 atcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcggtccacacaa 9469669  T
Q  119 taggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 197  Q
    ||   || | ||| | |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9469668 taccttgttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 9469590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 197
Target Start/End: Original strand, 16393124 - 16393302
Alignment:
Q  19 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 118  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||  || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||| || ||  |||| ||||    
T  16393124 atcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcggtccacacaa 16393223  T
Q  119 taggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 197  Q
    ||   || | ||| | |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16393224 tactttgttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 16393302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 197
Target Start/End: Original strand, 30369636 - 30369814
Alignment:
Q  19 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 118  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||  || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||| || ||  |||| ||||    
T  30369636 atcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcggtccacacaa 30369735  T
Q  119 taggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 197  Q
    ||   || | ||| | |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30369736 taccttgttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 30369814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 124 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25726840 - 25726729
Alignment:
Q  124 tgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgactt 223  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| |||||||| || || || ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| |  || |  |||||||| ||||    
T  25726840 tgatctttactgagtaacttgaatatcggcccacatgtggcagtcatatgagagatgaatctggagatataattcaaccttcctaaaaaacctctaactt 25726741  T
Q  224 gcttctcggtct 235  Q
    ||||||| ||||    
T  25726740 gcttctcagtct 25726729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2556867 - 2556767
Alignment:
Q  135 gagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 234  Q
    ||||| ||||||||| || || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||||||||| |||    
T  2556867 gagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctaccaagaaaacctctgacttgcttctctgtc 2556768  T
Q  235 t 235  Q
    |    
T  2556767 t 2556767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15193415 - 15193315
Alignment:
Q  135 gagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 234  Q
    ||||| ||||||||| || || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||||||||| |||    
T  15193415 gagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctaccaagaaaacctctgacttgcttctctgtc 15193316  T
Q  235 t 235  Q
    |    
T  15193315 t 15193315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 16127624 - 16127724
Alignment:
Q  135 gagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 234  Q
    ||||| ||||||||| || || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||||||||| |||    
T  16127624 gagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctaccaagaaaacctctgacttgcttctctgtc 16127723  T
Q  235 t 235  Q
    |    
T  16127724 t 16127724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 199
Target Start/End: Original strand, 16287193 - 16287249
Alignment:
Q  143 tgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattca 199  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16287193 tgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 16287249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29089848 - 29089748
Alignment:
Q  135 gagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 234  Q
    ||||| ||||||||| || || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||||||||| |||    
T  29089848 gagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctaccaagaaaacctctgacttgcttctctgtc 29089749  T
Q  235 t 235  Q
    |    
T  29089748 t 29089748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27022599 - 27022359
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27022599 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 27022500  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27022499 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatataaatcgggagatgtaattcaaacg 27022400  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27022399 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 27022359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 27287097 - 27287337
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27287097 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacaggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 27287196  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27287197 catcattccatacaataggctgattatttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 27287296  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27287297 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 27287337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29553020 - 29552780
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29553020 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 29552921  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29552920 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 29552821  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  29552820 cccgaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtggagctg 29552780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 13295684 - 13295924
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13295684 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttagcatt 13295783  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13295784 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 13295883  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13295884 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 13295924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 15421053 - 15421293
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15421053 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 15421152  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15421153 catcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 15421252  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15421253 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 15421293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 22931617 - 22931857
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22931617 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 22931716  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22931717 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 22931816  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22931817 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 22931857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 23854062 - 23854302
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23854062 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 23854161  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23854162 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 23854261  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23854262 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 23854302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16677603 - 16677363
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16677603 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 16677504  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16677503 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcagattgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 16677404  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  16677403 cccgaggaaacctctgacttgtttctctgtctgtggagctg 16677363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27179919 - 27179679
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27179919 actgccaaatacataatcaaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggcatt 27179820  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27179819 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 27179720  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27179719 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 27179679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 27269320 - 27269560
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27269320 actgccaaatacataatcaaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggcatt 27269419  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27269420 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 27269519  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27269520 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 27269560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24867179 - 24866939
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24867179 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 24867080  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24867079 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 24866980  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24866979 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 24866939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16753284 - 16753044
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16753284 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 16753185  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16753184 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 16753085  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16753084 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggagctg 16753044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 17089173 - 17089411
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17089173 aacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggc 17089272  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17089273 attcatcgttccacacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggtagcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 17089372  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17089373 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtccgtgg 17089411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 4542507 - 4542747
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542507 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 4542606  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542607 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 4542706  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4542707 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 4542747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 4720868 - 4721108
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4720868 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 4720967  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4720968 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 4721067  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4721068 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 4721108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 27626444 - 27626684
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27626444 actgccaagtacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 27626543  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27626544 catcattccacacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 27626643  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27626644 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtccgtggagctg 27626684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 34461239 - 34461479
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34461239 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 34461338  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34461339 catcattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 34461438  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  34461439 cccgaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtggagctg 34461479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3699546 - 3699306
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3699546 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacacgtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 3699447  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3699446 catcattccatacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 3699347  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  3699346 cccgaggaaacctctgacttgtttctctgtctgtggagctg 3699306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4761226 - 4760986
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4761226 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 4761127  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4761126 catcattccatacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 4761027  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4761026 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 4760986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 26113145 - 26113385
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26113145 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 26113244  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26113245 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 26113344  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  26113345 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 26113385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26921840 - 26921600
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26921840 actgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaagataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 26921741  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26921740 cattattccaaacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 26921641  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26921640 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 26921600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27011194 - 27010954
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27011194 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 27011095  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27011094 catcattccatacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 27010995  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27010994 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 27010954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27060969 - 27060729
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27060969 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 27060870  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    |||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  27060869 catcgttccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacg 27060770  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27060769 tccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 27060729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28210917 - 28210677
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28210917 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 28210818  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28210817 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 28210718  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28210717 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 28210677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 30554746 - 30554989
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30554746 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 30554845  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30554846 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 30554945  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  30554946 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 30554989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27488596 - 27488356
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488596 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 27488497  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488496 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 27488397  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27488396 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 27488356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29504879 - 29504639
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29504879 actgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 29504780  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29504779 catcattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 29504680  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  29504679 tcccaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 29504639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29576477 - 29576237
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29576477 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 29576378  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29576377 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 29576278  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  29576277 tcccaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 29576237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4776343 - 4776103
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4776343 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 4776244  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4776243 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 4776144  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4776143 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 4776103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 244
Target Start/End: Original strand, 16940766 - 16941000
Alignment:
Q  10 aaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcat 109  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16940766 aaatacataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcat 16940865  T
Q  110 tccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgag 209  Q
    ||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  16940866 tccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaa 16940965  T
Q  210 gaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16940966 gaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 16941000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4528748 - 4528508
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4528748 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 4528649  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    |||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4528648 catcatcccatacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 4528549  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4528548 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 4528508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20172013 - 20171778
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20172013 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactcttgatactatcaaaagcttcttggc 20171914  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20171913 attcatcgttccacacaatgggttgattcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcggtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaa 20171814  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 236  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  20171813 acgtccgaggaaacctctaacttgtttctcagtctg 20171778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 22163978 - 22164213
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22163978 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactcttgatactatcaaaagcttcttggc 22164077  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22164078 attcatcgttccacacaatgggttgattcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcggtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaa 22164177  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 236  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22164178 acgtccgaggaaacctctaacttgtttctcagtctg 22164213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 26992258 - 26992096
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26992258 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 26992159  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcgg 166  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26992158 catcattccatagaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcgg 26992096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 14142124 - 14142251
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14142124 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 14142223  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14142224 attcatcgttccatacaataggctgatt 14142251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26789282 - 26789155
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26789282 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 26789183  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26789182 attcatcgttccatacaataggctgatt 26789155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27197651 - 27197524
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27197651 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 27197552  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27197551 attcatcgttccatacaataggctgatt 27197524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 27251584 - 27251711
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27251584 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 27251683  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27251684 attcatcgttccatacaataggctgatt 27251711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 8902433 - 8902560
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  8902433 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcatgatgctatcaaaagcttcctggc 8902532  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8902533 attcatcattccatacaataggccgatt 8902560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 33373164 - 33373306
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33373164 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcatt 33373263  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaa 146  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  33373264 catcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaa 33373306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 13520922 - 13521048
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  13520922 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttc-cggc 13521020  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13521021 attcatcgttccatacaataggctgatt 13521048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 26775360 - 26775484
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26775360 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 26775459  T
Q  104 catcattccatacaataggctgatt 128  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  26775460 catcgttccatacaataggctgatt 26775484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 27358843 - 27358967
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27358843 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 27358942  T
Q  104 catcattccatacaataggctgatt 128  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  27358943 catcgttccatacaataggctgatt 27358967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 27449186 - 27449310
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27449186 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 27449285  T
Q  104 catcattccatacaataggctgatt 128  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  27449286 catcgttccatacaataggctgatt 27449310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 28163954 - 28163830
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28163954 actgccaaatacataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 28163855  T
Q  104 catcattccatacaataggctgatt 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  28163854 catcattccatacaataggccgatt 28163830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 22455844 - 22455971
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22455844 aacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaagaataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 22455943  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||    
T  22455944 attcattattccacacaataggttgatt 22455971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 197
Target Start/End: Original strand, 9136101 - 9136279
Alignment:
Q  19 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 118  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||  || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||| || ||  |||| ||||    
T  9136101 atcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcggtccacacaa 9136200  T
Q  119 taggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 197  Q
    ||   || | ||| | |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9136201 taccttgttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 9136279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18119801 - 18119701
Alignment:
Q  135 gagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 234  Q
    ||||| ||||||||| || || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||||||||| |||    
T  18119801 gagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctaccaagaaaacctctgacttgcttctctgtc 18119702  T
Q  235 t 235  Q
    |    
T  18119701 t 18119701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 23971634 - 23971734
Alignment:
Q  135 gagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 234  Q
    ||||| ||||||||| || || || || || ||||||||||| || |||| |||||| |||||||  |  || || |||||||||||||||||||| |||    
T  23971634 gagtaacttgaaaattggtccacatgtggcagtcatgtgagagataaatctggagatataattcagtctaccaagaaaacctctgacttgcttctctgtc 23971733  T
Q  235 t 235  Q
    |    
T  23971734 t 23971734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14668490 - 14668255
Alignment:
Q  9 caaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatca 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668490 caaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatca 14668391  T
Q  109 ttccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccga 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668390 ttccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccga 14668291  T
Q  209 ggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14668290 ggaaatctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 14668255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6573337 - 6573097
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6573337 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 6573238  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6573237 catcattccatacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 6573138  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  6573137 cccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 6573097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 14760096 - 14760336
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14760096 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 14760195  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14760196 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 14760295  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14760296 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 14760336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17016525 - 17016285
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17016525 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 17016426  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17016425 catcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 17016326  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17016325 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 17016285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Original strand, 34185750 - 34185985
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34185750 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 34185849  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34185850 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 34185949  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34185950 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgg 34185985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 24589151 - 24589391
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24589151 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 24589250  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589251 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 24589350  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24589351 cccgaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtggagctg 24589391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 54836870 - 54836630
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54836870 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 54836771  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  54836770 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacg 54836671  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54836670 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 54836630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5009354 - 5009114
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5009354 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 5009255  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5009254 catcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 5009155  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5009154 tccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 5009114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 20335211 - 20335451
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20335211 actgccaaatacataatcaaaggccttccttctacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 20335310  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20335311 catcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 20335410  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20335411 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtccgtggagctg 20335451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24116141 - 24115901
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24116141 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 24116042  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24116041 catcattccatacgacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 24115942  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24115941 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 24115901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 18313968 - 18314208
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18313968 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 18314067  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18314068 catcgttccatacaataggctgattcttgctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 18314167  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18314168 cccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 18314208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 36341307 - 36341547
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36341307 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcttt 36341406  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36341407 catcattccatacgataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 36341506  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  36341507 tccgaggaaacctctgacttgtttctctgtctgtggagctg 36341547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15231354 - 15231111
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15231354 aacactgacaaatacataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggc 15231255  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15231254 attcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 15231155  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15231154 tcgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggagctg 15231111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 15281724 - 15281959
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15281724 aacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaaatcttgatgctatcaaaagctccttggc 15281823  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15281824 attcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 15281923  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 236  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15281924 tcgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 15281959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1903736 - 1903500
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1903736 aacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggc 1903637  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1903636 attcaacgttccatacaataggctgattcttcctgagtaacttgaagatcggcccgcaggctgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 1903537  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1903536 acgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgt 1903500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 27160107 - 27160347
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27160107 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 27160206  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27160207 catcattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 27160306  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27160307 cccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 27160347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 33670590 - 33670830
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33670590 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcatt 33670689  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33670690 catcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaaacg 33670789  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  33670790 tccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 33670830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 31123299 - 31123542
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31123299 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 31123398  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31123399 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 31123498  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31123499 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 31123542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30757239 - 30756999
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30757239 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 30757140  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30757139 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 30757040  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  30757039 tcccaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 30756999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21973180 - 21972945
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21973180 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 21973081  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21973080 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 21972981  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgg 239  Q
     || | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21972980 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtgg 21972945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14102022 - 14101782
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14102022 actgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 14101923  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14101922 catcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacg 14101823  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14101822 tccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 14101782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 18797404 - 18797644
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797404 actgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtacttcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 18797503  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797504 catcattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 18797603  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  18797604 cccgaggaaacctctgacttgcttctctgtccgtggagctg 18797644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 39854116 - 39853876
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854116 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 39854017  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854016 catcattccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaagataggcccgcaggttgtggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 39853917  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  39853916 cccgaggaaacctctgacttgcttctctgtttgtggagctg 39853876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 40102427 - 40102667
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40102427 actgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 40102526  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40102527 catcattccatacaacaggctggttcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 40102626  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  40102627 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 40102667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 242
Target Start/End: Original strand, 15388177 - 15388406
Alignment:
Q  13 tacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcc 112  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15388177 tacataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcc 15388276  T
Q  113 atacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaa 212  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15388277 acacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaa 15388376  T
Q  213 acctctgacttgcttctcggtctgtggtgc 242  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15388377 acctcggacttgcttttcggtctgtggtgc 15388406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 146
Target Start/End: Original strand, 24459636 - 24459687
Alignment:
Q  95 cttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaa 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24459636 cttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaa 24459687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 14725720 - 14725820
Alignment:
Q  135 gagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 234  Q
    ||||| ||||||||| || || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||||||||| |||    
T  14725720 gagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctaccaagaaaacctctgacttgcttctctgtc 14725819  T
Q  235 t 235  Q
    |    
T  14725820 t 14725820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19767687 - 19767587
Alignment:
Q  135 gagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 234  Q
    ||||| ||||||||| || || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||||||||| |||    
T  19767687 gagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctaccaagaaaacctctgacttgcttctctgtc 19767588  T
Q  235 t 235  Q
    |    
T  19767587 t 19767587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30759 - 30519
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 30660  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30659 catcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 30560  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30559 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 30519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19539 - 19304
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19539 aacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggc 19440  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19439 attcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 19340  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 236  Q
     ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19339 tcgcccgaggaaacctctaacttgtttctcggtctg 19304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 7429 - 7302
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7429 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 7330  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7329 attcatcattccatacaataggctgatt 7302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3533 - 3301
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3533 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 3434  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3433 catcgttccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 3334  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3333 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 3301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 94 - 244
Target Start/End: Original strand, 43871 - 44021
Alignment:
Q  94 tcttggcattcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgt 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43871 tcttgacattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgt 43970  T
Q  194 aattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43971 aattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctgggtctgtggagctg 44021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 236
Target Start/End: Original strand, 32096 - 32167
Alignment:
Q  165 ggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32096 ggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 32167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 11552828 - 11552588
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11552828 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 11552729  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11552728 catcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 11552629  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11552628 cccgaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtggagctg 11552588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 15655445 - 15655685
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15655445 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 15655544  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15655545 catcattccatacaatgggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 15655644  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15655645 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 15655685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33296001 - 33295761
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33296001 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 33295902  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33295901 catcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 33295802  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33295801 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 33295761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33780962 - 33780722
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33780962 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 33780863  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33780862 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 33780763  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33780762 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 33780722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23629446 - 23629203
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23629446 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 23629347  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23629346 attcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 23629247  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23629246 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 23629203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 43081731 - 43081488
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081731 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 43081632  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081631 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 43081532  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43081531 acgtccgaggaagcctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 43081488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 22995804 - 22996044
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22995804 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 22995903  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22995904 catcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 22996003  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22996004 cccgaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtggagctg 22996044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 24684832 - 24685072
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24684832 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 24684931  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24684932 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 24685031  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24685032 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 24685072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 41678178 - 41677938
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41678178 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 41678079  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41678078 catcattccatacaataggctgattctttctgagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 41677979  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  41677978 tccgaggaaacctctaacttgcttctcggtctgtggagctg 41677938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24973379 - 24973139
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24973379 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 24973280  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  24973279 cattattccatacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatttaagcg 24973180  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24973179 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 24973139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22891939 - 22891707
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22891939 aacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggc 22891840  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22891839 attcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcgggccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaa 22891740  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22891739 acgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggt 22891707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28652715 - 28652475
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28652715 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 28652616  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28652615 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 28652516  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28652515 tccgaggaagcctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 28652475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9320952 - 9320709
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9320952 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 9320853  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9320852 attcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaa 9320753  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  9320752 acgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 9320709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12135651 - 12135408
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12135651 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 12135552  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12135551 attcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaa 12135452  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12135451 acgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 12135408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26483870 - 26483627
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26483870 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 26483771  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26483770 attcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaa 26483671  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  26483670 acgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 26483627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 34619994 - 34619751
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34619994 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggc 34619895  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34619894 attcatcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaa 34619795  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  34619794 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 34619751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 18497412 - 18497652
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18497412 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 18497511  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18497512 catcattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 18497611  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  18497612 cccgaggaaacctctgacttgtttctctgtctgtggagctg 18497652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23895679 - 23895447
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  23895679 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcataagcttcttggcatt 23895580  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23895579 catcgttccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcg 23895480  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 236  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23895479 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 23895447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30938108 - 30937868
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30938108 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatatgtggttccagcaggtaactcttggtgctatcaaaagcttcttggcatt 30938009  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30938008 catcgttccatacaataggctgattcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 30937909  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30937908 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 30937868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3793009 - 3792774
Alignment:
Q  9 caaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatca 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3793009 caaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatca 3792910  T
Q  109 ttccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccga 208  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3792909 ttccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccga 3792810  T
Q  209 ggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  3792809 ggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 3792774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 31434940 - 31434697
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31434940 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 31434841  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31434840 attcatcattccatacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 31434741  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31434740 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 31434697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24586847 - 24586607
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586847 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 24586748  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586747 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 24586648  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24586647 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 24586607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 28956472 - 28956712
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28956472 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcatt 28956571  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28956572 catcattccatacaataggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacg 28956671  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28956672 cccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 28956712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30171942 - 30171702
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30171942 actgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcact 30171843  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30171842 catcattccatacaataggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacg 30171743  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  30171742 cccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 30171702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 31823094 - 31823334
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31823094 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 31823193  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31823194 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 31823293  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31823294 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 31823334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 32592961 - 32593201
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32592961 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcatt 32593060  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  32593061 catcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgagagatgtaattcaaacg 32593160  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  32593161 cccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 32593201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 37355330 - 37355570
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37355330 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 37355429  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37355430 catcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 37355529  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  37355530 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 37355570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 8662159 - 8662402
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8662159 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 8662258  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8662259 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 8662358  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  8662359 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 8662402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30032904 - 30032661
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30032904 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 30032805  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30032804 attcatcattccatacaataggctggttctttctaagcagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 30032705  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  30032704 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 30032661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30155507 - 30155264
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30155507 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 30155408  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30155407 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 30155308  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  30155307 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 30155264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33519856 - 33519613
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33519856 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 33519757  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33519756 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 33519657  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  33519656 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 33519613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 244
Target Start/End: Original strand, 40470242 - 40470477
Alignment:
Q  9 caaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatca 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40470242 caaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatca 40470341  T
Q  109 ttccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccga 208  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470342 ttccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccga 40470441  T
Q  209 ggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  40470442 ggaaacctctgacttgcttctctgtccgtggagctg 40470477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 13321517 - 13321757
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13321517 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 13321616  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13321617 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 13321716  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13321717 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 13321757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 37668173 - 37668413
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37668173 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 37668272  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37668273 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 37668372  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  37668373 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 37668413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25203754 - 25203519
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25203754 aacactgacaagtacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggc 25203655  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25203654 agtcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 25203555  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 236  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25203554 tcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 25203519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25267909 - 25267674
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25267909 aacactgacaagtacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggc 25267810  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25267809 agtcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 25267710  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 236  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25267709 tcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 25267674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37758451 - 37758216
Alignment:
Q  9 caaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatca 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37758451 caaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatca 37758352  T
Q  109 ttccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccga 208  Q
    |||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  37758351 ttccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccca 37758252  T
Q  209 ggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  37758251 agaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 37758216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2514535 - 2514295
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2514535 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaactcttgatgctatcaaaagcctcttggcatt 2514436  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2514435 catcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 2514336  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2514335 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 2514295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 18372221 - 18372461
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18372221 actgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 18372320  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18372321 catcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacg 18372420  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18372421 tccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 18372461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24727442 - 24727202
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24727442 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 24727343  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24727342 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 24727243  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24727242 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 24727202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 244
Target Start/End: Original strand, 37767686 - 37767918
Alignment:
Q  12 atacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37767686 atacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattc 37767785  T
Q  112 catacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagga 211  Q
    ||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||    
T  37767786 catacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaaga 37767885  T
Q  212 aacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  37767886 aacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 37767918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 244
Target Start/End: Original strand, 15755545 - 15755779
Alignment:
Q  10 aaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcat 109  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15755545 aaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcat 15755644  T
Q  110 tccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgag 209  Q
    ||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  15755645 tccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaa 15755744  T
Q  210 gaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  15755745 gaaacctctgacttgcttctctgtccgtggagctg 15755779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5641261 - 5641021
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5641261 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 5641162  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5641161 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 5641062  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5641061 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 5641021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6877778 - 6877538
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6877778 actgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 6877679  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    |||||| |||||||| |||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6877678 catcatcccatacaacaggctggttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 6877579  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  6877578 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 6877538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 9547393 - 9547520
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9547393 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatactatcaaaagcttcctggc 9547492  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9547493 attcatcgttccatacaataggctgatt 9547520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33878606 - 33878480
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  33878606 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttc-cggc 33878508  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33878507 attcatcgttccatacaataggctgatt 33878480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 13183480 - 13183622
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  13183480 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggaatt 13183579  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaa 146  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13183580 catcgttccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaa 13183622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 18125103 - 18125227
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18125103 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 18125202  T
Q  104 catcattccatacaataggctgatt 128  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  18125203 catcgttccatacaataggctgatt 18125227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 11327113 - 11326986
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11327113 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccatgggagggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 11327014  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  11327013 attcatcgttccatacaataggttgatt 11326986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 29887881 - 29888008
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29887881 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacggatgagacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 29887980  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29887981 attcatcgttccatacaataggctgatt 29888008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 13439370 - 13439494
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13439370 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 13439469  T
Q  104 catcattccatacaataggctgatt 128  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  13439470 catcgttccatacaataggctgatt 13439494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 197
Target Start/End: Original strand, 15784427 - 15784605
Alignment:
Q  19 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 118  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||  || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||||| ||  |||||||||    
T  15784427 atcaaaggtctcccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcattcttcggtccatacaa 15784526  T
Q  119 taggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 197  Q
    ||   || | ||| | |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15784527 taccttgttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 15784605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 197
Target Start/End: Original strand, 11944124 - 11944302
Alignment:
Q  19 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 118  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||  || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||| || ||  |||| ||||    
T  11944124 atcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcggtccacacaa 11944223  T
Q  119 taggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 197  Q
    ||   || | ||| | |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11944224 taccttgttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 11944302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17957554 - 17957376
Alignment:
Q  19 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 118  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||  || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||| || ||  |||| ||||    
T  17957554 atcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcggtccacacaa 17957455  T
Q  119 taggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 197  Q
    ||   || | ||| | |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17957454 taccttgttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 17957376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 197
Target Start/End: Original strand, 5439927 - 5440105
Alignment:
Q  19 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 118  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||  || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||| || ||  ||||  |||    
T  5439927 atcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcggtccacgcaa 5440026  T
Q  119 taggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 197  Q
    ||   || | ||| | |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5440027 taccttgttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 5440105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 197
Target Start/End: Original strand, 36375780 - 36375842
Alignment:
Q  135 gagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 197  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36375780 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 36375842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 197
Target Start/End: Original strand, 37000434 - 37000496
Alignment:
Q  135 gagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 197  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37000434 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 37000496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 34468956 - 34468900
Alignment:
Q  143 tgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattca 199  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34468956 tgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 34468900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 34294619 - 34294379
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34294619 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 34294520  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34294519 catcgttccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 34294420  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34294419 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 34294379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 23125347 - 23125587
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23125347 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtggcacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 23125446  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23125447 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 23125546  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23125547 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 23125587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 11631960 - 11632203
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11631960 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 11632059  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11632060 attcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 11632159  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11632160 acgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 11632203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 13933326 - 13933566
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13933326 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 13933425  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13933426 catcattccatacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 13933525  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  13933526 cccgaggaaacctctgacttgcttctctgtttgtggagctg 13933566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20841378 - 20841138
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20841378 actgccaagtacataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 20841279  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20841278 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 20841179  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20841178 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 20841138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12659001 - 12658766
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12659001 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 12658902  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12658901 catcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcg 12658802  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgg 239  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12658801 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtttgtgg 12658766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 37948641 - 37948881
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37948641 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 37948740  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37948741 catcattccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 37948840  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37948841 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 37948881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 236
Target Start/End: Original strand, 27431225 - 27431452
Alignment:
Q  9 caaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatca 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27431225 caaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatca 27431324  T
Q  109 ttccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccga 208  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  27431325 ttccatacaataggctaattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccga 27431424  T
Q  209 ggaaacctctgacttgcttctcggtctg 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27431425 ggaaacctctgacttgcttctcggtctg 27431452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 39893537 - 39893294
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39893537 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 39893438  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39893437 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaa 39893338  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  39893337 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 39893294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27807168 - 27806928
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27807168 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 27807069  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27807068 catcattccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 27806969  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  27806968 cccgaggaaacctctgacttgcttctctgtccgtggagctg 27806928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 39048598 - 39048838
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39048598 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 39048697  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39048698 catcattccatacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 39048797  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  39048798 cccgaggaaacctcttacttgcttctcagtctgtggagctg 39048838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12590273 - 12590033
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12590273 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 12590174  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    |||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12590173 catcgttccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 12590074  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  12590073 tccgaggaaacctctgacttgcttctctgtccgtggagctg 12590033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28885672 - 28885432
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28885672 actgccaaatacataaccaagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttgacatt 28885573  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885572 catcattccatacaataggttgattctttctgagtagcttgaagaccggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 28885473  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28885472 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 28885432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 19453199 - 19453434
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19453199 aacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgccatcaaaagctccttggc 19453298  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19453299 attcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 19453398  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 236  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19453399 tcgcccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctg 19453434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 9346765 - 9347005
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9346765 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcatt 9346864  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9346865 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 9346964  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  9346965 tccgaggaagcctctgacttgcttctctgtttgtggagctg 9347005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Original strand, 21699950 - 21700181
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21699950 actgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggattggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcatt 21700049  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21700050 catcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcg 21700149  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 236  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21700150 cccgaggaaacctctga-ttgtttctcggtctg 21700181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 34865149 - 34864909
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34865149 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 34865050  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34865049 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 34864950  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  34864949 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 34864909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37381142 - 37380902
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37381142 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 37381043  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  37381042 catcattccatacaacaggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaagtg 37380943  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37380942 tccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggagctg 37380902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 40236973 - 40236733
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40236973 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcgaaagcttcttggcatt 40236874  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||| |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40236873 cattattccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 40236774  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  40236773 tccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 40236733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 37682671 - 37682914
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37682671 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 37682770  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37682771 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 37682870  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  37682871 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 37682914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 37697936 - 37698179
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37697936 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 37698035  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698036 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 37698135  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  37698136 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 37698179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37928837 - 37928594
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37928837 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 37928738  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37928737 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 37928638  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  37928637 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 37928594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 16826114 - 16826352
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16826114 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 16826213  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16826214 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 16826313  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgg 239  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16826314 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtgg 16826352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16895366 - 16895128
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16895366 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 16895267  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16895266 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 16895167  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgg 239  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16895166 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtgg 16895128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 31879754 - 31879516
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31879754 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 31879655  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31879654 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 31879555  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgg 239  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31879554 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtgg 31879516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 19413280 - 19413520
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19413280 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 19413379  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19413380 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 19413479  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19413480 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 19413520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 32053268 - 32053033
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32053268 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 32053169  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32053168 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 32053069  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgg 239  Q
     || | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32053068 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtgg 32053033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 257432 - 257672
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  257432 actgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 257531  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  257532 catcattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 257631  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  257632 cccgaggaaacctctgacttgcttctctgtttgtggagctg 257672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 12713380 - 12713620
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12713380 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 12713479  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12713480 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 12713579  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12713580 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 12713620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 21673954 - 21674194
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21673954 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 21674053  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21674054 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 21674153  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  21674154 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtccgtggagctg 21674194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27395030 - 27394789
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  27395030 aacactgtcaagtacataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggc 27394931  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394930 attcattattccacacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 27394831  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgc 242  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  27394830 acgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtggtgc 27394789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16164948 - 16164821
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16164948 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 16164849  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16164848 attcatcgttccatacaataggctgatt 16164821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27779702 - 27779575
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27779702 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 27779603  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27779602 attcatcgttccatacaataggctgatt 27779575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27819459 - 27819332
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27819459 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 27819360  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27819359 attcatcgttccatacaataggctgatt 27819332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 3785961 - 3785834
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3785961 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcagttaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 3785862  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3785861 attcatcgttccatacaataggctgatt 3785834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27119992 - 27119865
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27119992 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 27119893  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27119892 attcatcattccatacaataggctgatt 27119865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 31890267 - 31890394
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31890267 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 31890366  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31890367 attcattgttccatacaataggctgatt 31890394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 22924924 - 22925051
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22924924 aacactgacaaatacaaaatcaaaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 22925023  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22925024 attcatcgttccatacaataggttgatt 22925051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 34158312 - 34158185
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34158312 aacactgacatatacaaaatcagaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 34158213  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34158212 attcatcgttccatacaataggctgatt 34158185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 27827925 - 27827841
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaa 88  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27827925 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaa 27827841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12384110 - 12383932
Alignment:
Q  19 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 118  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||  || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||| || ||  |||| ||||    
T  12384110 atcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcggtccacacaa 12384011  T
Q  119 taggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 197  Q
    ||   || | ||| | |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12384010 taccttgttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 12383932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22949843 - 22949665
Alignment:
Q  19 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 118  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||  || || |||||||| |||| ||| || || ||||| |||||||| |  ||||| || ||  |||| ||||    
T  22949843 atcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttttttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcggtccacacaa 22949744  T
Q  119 taggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 197  Q
    ||   || | ||| | |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22949743 taccttgttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 22949665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34701410 - 34701310
Alignment:
Q  135 gagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 234  Q
    ||||| ||||||||| || || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||||||||| |||    
T  34701410 gagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctaccaagaaaacctctgacttgcttctctgtc 34701311  T
Q  235 t 235  Q
    |    
T  34701310 t 34701310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 42393869 - 42393769
Alignment:
Q  135 gagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 234  Q
    ||||| ||||||||| || || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||||||||| |||    
T  42393869 gagtaacttgaaaattggtccacacgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctaccaagaaaacctctgacttgcttctctgtc 42393770  T
Q  235 t 235  Q
    |    
T  42393769 t 42393769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Original strand, 21894539 - 21894774
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21894539 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 21894638  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21894639 catcattccatacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 21894738  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21894739 cccgaggaaacctctgacttgcttctctgtttgtgg 21894774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 20339088 - 20339320
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20339088 aacattgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggc 20339187  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20339188 attcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 20339287  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggt 233  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20339288 tcgcccgaggaaacctctgacttgcttttcggt 20339320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10948548 - 10948305
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10948548 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 10948449  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10948448 attcatcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 10948349  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10948348 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 10948305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10966136 - 10965893
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10966136 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 10966037  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10966036 attcatcattccatacaacaggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaa 10965937  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  10965936 acgtccgaggaaacctctgacttgcttctctgtttgtggagctg 10965893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 235
Target Start/End: Original strand, 16204824 - 16205055
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  16204824 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctctttggcagt 16204923  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16204924 catcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcg 16205023  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtct 235  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16205024 tctgaggaaacctctgacttgcttctcggtct 16205055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20464447 - 20464212
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20464447 aacactgacaaatacataattaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtgtttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggc 20464348  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20464347 attcatcgttccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 20464248  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 236  Q
     |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20464247 tcgcccgaggaaacctcagacttgtttctcggtctg 20464212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 28588453 - 28588218
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28588453 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 28588354  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  28588353 catcattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaaccgggagatgtaattcagacg 28588254  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtgg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28588253 cccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtgg 28588218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Original strand, 41790100 - 41790326
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41790100 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 41790199  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41790200 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 41790299  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctc 230  Q
     |||||||| |||||||||||||||||    
T  41790300 tccgaggaagcctctgacttgcttctc 41790326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 51641686 - 51641446
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51641686 actgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcatt 51641587  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51641586 catcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacg 51641487  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  51641486 tccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 51641446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3644603 - 3644360
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattctt-gatgctatcaaaagcttctt-ggca 101  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3644603 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattctttgatgctatcaaaagcttctttggca 3644504  T
Q  102 ttcatcattccatacaataggctgatt-ttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3644503 ttcatcattccatacaataggctgattcttttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 3644404  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  3644403 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 3644360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 28153207 - 28153080
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28153207 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggc 28153108  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgatt 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28153107 attcatcgttccatacaataggctgatt 28153080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9502 - 9262
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9502 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgacatt 9403  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9402 catcattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 9303  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9302 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 9262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 1411 - 1643
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1411 aacattgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggc 1510  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1511 attcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 1610  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggt 233  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1611 tcgcccgaggaaacctctgacttgcttttcggt 1643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16047 - 15807
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16047 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 15948  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15947 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 15848  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15847 tccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctg 15807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13037 - 12797
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13037 actgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 12938  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12937 catcattccatacaacaggctggttttttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcg 12838  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12837 tcccaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 12797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 11415 - 11175
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11415 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 11316  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11315 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 11216  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11215 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 11175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9488 - 9248
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9488 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 9389  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9388 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 9289  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  9288 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 9248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 11718 - 11958
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11718 actgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 11817  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11818 catcattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 11917  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11918 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 11958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 22978 - 23221
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22978 aacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 23077  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23078 attcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaa 23177  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23178 acgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 23221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 244
Target Start/End: Original strand, 5969 - 6209
Alignment:
Q  4 actgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatt 103  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5969 actgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatactatcaaaagcctcttggcatt 6068  T
Q  104 catcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6069 catcattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacg 6168  T
Q  204 cccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
     || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  6169 tcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 6209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 166 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23183 - 23105
Alignment:
Q  166 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctg 244  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23183 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctg 23105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9514 - 9279
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |    
T  9514 aacactgacagatacataatcaaaggccttccttccacaagtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgttatcaaaagccccttgac 9415  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9414 attcatcgttccatacaataggctgattcttccagagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 9315  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 236  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9314 tcgcccgaggaagcctctgacttgtttctcggtctg 9279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 5458 - 5693
Alignment:
Q  1 aacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggc 100  Q
    |||||||| | |||||  ||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5458 aacactgatagatacatgatcaacgaccttccttccacaggtgggacaaggataggtggctctaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggc 5557  T
Q  101 attcatcattccatacaataggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaa 200  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||    
T  5558 attcatcatttcataccacaggttgatttttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggtggcagtcatgtgagatatgaaccttgagatataattcaa 5657  T
Q  201 acgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 236  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  5658 acgcccgagaaaacctctgacttgcttctcagtctg 5693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Original strand, 43538 - 43762
Alignment:
Q  22 aaaggccttccttccacgggagggacaaggata-ggtggttccagcaggtaatt-cttgatgctatc--aaaagcttcttggcattca--tcattccata 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  43538 aaaggccttccttccacgggtgggacaaggataaggtggttccagcaggtaatttcttgatgctatacaaaaagcttcttggcattcaattaattccata 43637  T
Q  116 caatagg-ctgattttttctga-gtagcttgaaaatcggcccgcaggtt-gcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaa-ttcaaacgcccgagga 211  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||    
T  43638 caataggactgattctttctaaagtagcttgaagatcggcccgcaggtttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattttaagcgtccgagga 43737  T
Q  212 aacctctgacttgc-ttctcggtct 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  43738 aacctctgacttgctttctcggtct 43762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1888 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1888
Description:

Target: scaffold1888; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1263 - 1149
Alignment:
Q  130 tttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttct 229  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1263 tttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcattcgttcgaggaaacctctgacttgcttct 1164  T
Q  230 cggtctgtggtgctg 244  Q
    |||||||||| ||||    
T  1163 cggtctgtggagctg 1149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 29621 - 29443
Alignment:
Q  19 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 118  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||| ||| || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||| || ||| |||| ||||    
T  29621 atcaaaggtcttccttcaactggagggataagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcagtccacacaa 29522  T
Q  119 taggctgattttttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatt 197  Q
    ||   || ||||| | |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29521 taccttgttttttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 29443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33770 - 33699
Alignment:
Q  163 gcggtcatgtgagatat-gaa-tcgggagatgtaattcaaacgccc-gaggaaacctctgacttgcttctcg 231  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  33770 gcggtcatgtgagatatagaagtcgggagatgtaattcaaacgccccgaggaaacctctgacttgtttctcg 33699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 224
Target Start/End: Original strand, 35168 - 35250
Alignment:
Q  142 ttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttg 224  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||| || ||||| |||||    
T  35168 ttgaatatcggcccgcacgttgccgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattcagtcgtccgagaaaccctcttacttg 35250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10553 - 10453
Alignment:
Q  135 gagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 234  Q
    ||||| ||||||||| || || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||||||||| |||    
T  10553 gagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctaccaagaaaacctctgacttgcttctctgtc 10454  T
Q  235 t 235  Q
    |    
T  10453 t 10453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University