View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5126_high_8 (Length: 340)

Name: NF5126_high_8
Description: NF5126
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5126_high_8
NF5126_high_8
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (11-340)||(25597-25926)
[»] chr7 (59 HSPs)
chr7 (11-340)||(7826061-7826390)
chr7 (11-340)||(27105554-27105883)
chr7 (11-340)||(27172442-27172771)
chr7 (11-340)||(13379046-13379373)
chr7 (11-340)||(4442089-4442417)
chr7 (11-340)||(13458196-13458525)
chr7 (11-340)||(17925811-17926132)
chr7 (60-328)||(8709815-8710083)
chr7 (60-328)||(18587963-18588231)
chr7 (60-328)||(15158849-15159117)
chr7 (72-328)||(10872912-10873168)
chr7 (60-328)||(13688251-13688519)
chr7 (70-328)||(14334616-14334874)
chr7 (72-328)||(11550894-11551150)
chr7 (72-328)||(44789143-44789399)
chr7 (70-328)||(18179965-18180223)
chr7 (79-340)||(15626754-15627015)
chr7 (87-340)||(48813032-48813285)
chr7 (72-328)||(11235005-11235261)
chr7 (72-328)||(12689724-12689980)
chr7 (72-327)||(14956776-14957031)
chr7 (79-332)||(14139909-14140162)
chr7 (79-328)||(9590597-9590846)
chr7 (79-332)||(14262011-14262264)
chr7 (79-332)||(15100369-15100622)
chr7 (79-332)||(18051719-18051972)
chr7 (81-332)||(13023589-13023840)
chr7 (79-301)||(15169-15391)
chr7 (12-198)||(15716825-15717011)
chr7 (81-340)||(11386187-11386446)
chr7 (13-300)||(17143096-17143383)
chr7 (96-286)||(11770236-11770426)
chr7 (99-332)||(15342681-15342914)
chr7 (79-330)||(16948240-16948491)
chr7 (79-325)||(15146679-15146925)
chr7 (79-328)||(12204570-12204819)
chr7 (81-332)||(12458872-12459123)
chr7 (143-328)||(16727175-16727360)
chr7 (143-328)||(17704247-17704432)
chr7 (129-278)||(22034369-22034517)
chr7 (81-286)||(49154533-49154738)
chr7 (79-326)||(16070069-16070316)
chr7 (81-328)||(26092568-26092815)
chr7 (79-332)||(13675682-13675935)
chr7 (79-332)||(13966434-13966687)
chr7 (79-340)||(14041924-14042185)
chr7 (79-340)||(14351954-14352215)
chr7 (81-340)||(11300971-11301230)
chr7 (81-328)||(19614907-19615154)
chr7 (111-340)||(14284132-14284363)
chr7 (81-328)||(26116360-26116607)
chr7 (79-226)||(23503742-23503889)
chr7 (195-328)||(12799313-12799446)
chr7 (176-340)||(38926-39090)
chr7 (183-328)||(21754746-21754891)
chr7 (93-181)||(19149453-19149541)
chr7 (93-181)||(20748852-20748940)
chr7 (15-118)||(39148-39251)
chr7 (255-328)||(14150227-14150300)
[»] chr6 (58 HSPs)
chr6 (11-340)||(16380289-16380618)
chr6 (11-340)||(23998284-23998613)
chr6 (11-340)||(1646730-1647059)
chr6 (11-340)||(16647885-16648214)
chr6 (11-340)||(23025662-23025991)
chr6 (16-340)||(16100056-16100380)
chr6 (11-340)||(14130505-14130834)
chr6 (60-328)||(16573975-16574243)
chr6 (60-328)||(16621137-16621405)
chr6 (79-328)||(30678936-30679184)
chr6 (60-328)||(24293710-24293978)
chr6 (79-340)||(18963004-18963265)
chr6 (60-328)||(2872731-2872999)
chr6 (79-328)||(27189540-27189789)
chr6 (79-328)||(27259451-27259700)
chr6 (72-328)||(28261125-28261381)
chr6 (72-328)||(28284535-28284791)
chr6 (72-328)||(28339874-28340130)
chr6 (60-332)||(25114637-25114909)
chr6 (79-328)||(18183295-18183544)
chr6 (72-328)||(19866784-19867040)
chr6 (72-328)||(21755030-21755285)
chr6 (81-332)||(10466773-10467024)
chr6 (72-328)||(22435966-22436222)
chr6 (72-328)||(22828283-22828539)
chr6 (72-328)||(25607789-25608045)
chr6 (79-328)||(16961410-16961659)
chr6 (60-328)||(5837147-5837415)
chr6 (72-328)||(27563761-27564017)
chr6 (21-288)||(16925607-16925873)
chr6 (17-313)||(22760398-22760694)
chr6 (79-313)||(18405887-18406121)
chr6 (79-328)||(25769948-25770197)
chr6 (81-332)||(19437108-19437359)
chr6 (81-340)||(21567907-21568166)
chr6 (79-332)||(14377840-14378093)
chr6 (79-332)||(14379390-14379643)
chr6 (25-246)||(14643497-14643718)
chr6 (72-328)||(23085699-23085955)
chr6 (164-328)||(28311819-28311983)
chr6 (99-340)||(15461460-15461701)
chr6 (74-243)||(20633953-20634122)
chr6 (81-332)||(18796796-18797047)
chr6 (108-337)||(23080556-23080785)
chr6 (70-286)||(21473695-21473911)
chr6 (81-328)||(24366518-24366765)
chr6 (79-328)||(24516342-24516585)
chr6 (79-332)||(19455128-19455380)
chr6 (79-328)||(8761680-8761929)
chr6 (84-319)||(34643523-34643758)
chr6 (167-288)||(23496160-23496281)
chr6 (79-199)||(28280870-28280990)
chr6 (82-181)||(25763303-25763402)
chr6 (81-269)||(19881404-19881591)
chr6 (264-328)||(13751868-13751932)
chr6 (264-340)||(20135263-20135339)
chr6 (264-340)||(22197530-22197606)
chr6 (72-112)||(22444364-22444404)
[»] chr5 (46 HSPs)
chr5 (11-340)||(23507770-23508099)
chr5 (11-340)||(24583296-24583625)
chr5 (11-340)||(21935141-21935470)
chr5 (70-328)||(29474038-29474296)
chr5 (60-328)||(14997704-14997972)
chr5 (72-328)||(16358667-16358923)
chr5 (60-328)||(22136821-22137089)
chr5 (60-328)||(27683365-27683633)
chr5 (72-328)||(34568659-34568915)
chr5 (72-328)||(40710945-40711201)
chr5 (72-328)||(41773007-41773263)
chr5 (70-328)||(27520569-27520827)
chr5 (72-328)||(19772125-19772381)
chr5 (60-328)||(27612507-27612775)
chr5 (60-328)||(22330852-22331120)
chr5 (72-328)||(27666455-27666711)
chr5 (60-328)||(37289461-37289729)
chr5 (79-328)||(18781286-18781535)
chr5 (79-340)||(23473399-23473660)
chr5 (72-328)||(22350084-22350340)
chr5 (79-332)||(17267295-17267548)
chr5 (79-339)||(26736681-26736941)
chr5 (16-337)||(20250240-20250561)
chr5 (72-307)||(25428598-25428833)
chr5 (79-340)||(20466052-20466313)
chr5 (79-332)||(22233881-22234134)
chr5 (99-328)||(21561990-21562218)
chr5 (79-328)||(21337259-21337508)
chr5 (60-325)||(28892910-28893175)
chr5 (60-325)||(28921736-28922001)
chr5 (70-325)||(20778058-20778313)
chr5 (99-325)||(20823627-20823853)
chr5 (81-340)||(37541334-37541593)
chr5 (81-286)||(25850231-25850436)
chr5 (81-340)||(24796350-24796609)
chr5 (60-328)||(22464086-22464354)
chr5 (81-332)||(22504835-22505086)
chr5 (81-340)||(14884944-14885203)
chr5 (72-258)||(20801562-20801742)
chr5 (81-328)||(21676799-21677046)
chr5 (137-328)||(21409364-21409555)
chr5 (81-332)||(20344438-20344689)
chr5 (231-328)||(21984142-21984239)
chr5 (265-332)||(23078866-23078933)
chr5 (232-289)||(21625475-21625532)
chr5 (183-280)||(23564181-23564278)
[»] chr3 (75 HSPs)
chr3 (11-340)||(13965362-13965691)
chr3 (11-340)||(30139607-30139936)
chr3 (11-340)||(30149158-30149487)
chr3 (11-340)||(15611904-15612233)
chr3 (11-340)||(8272409-8272738)
chr3 (15-340)||(15948480-15948805)
chr3 (11-340)||(6150863-6151192)
chr3 (11-312)||(25768119-25768420)
chr3 (60-340)||(17200484-17200764)
chr3 (60-328)||(20060076-20060344)
chr3 (60-328)||(12888549-12888817)
chr3 (72-328)||(13254542-13254798)
chr3 (60-328)||(15587414-15587682)
chr3 (60-328)||(10007440-10007708)
chr3 (60-328)||(10908050-10908318)
chr3 (60-328)||(15346267-15346535)
chr3 (72-328)||(16637625-16637881)
chr3 (72-328)||(5108633-5108889)
chr3 (72-328)||(48427299-48427555)
chr3 (72-328)||(5422952-5423208)
chr3 (60-328)||(3687783-3688051)
chr3 (81-332)||(11959176-11959427)
chr3 (125-328)||(43164580-43164783)
chr3 (79-328)||(16804969-16805218)
chr3 (72-328)||(24185042-24185298)
chr3 (125-328)||(15714078-15714281)
chr3 (72-328)||(6602588-6602844)
chr3 (72-328)||(16754723-16754979)
chr3 (81-332)||(24189175-24189426)
chr3 (79-332)||(13943893-13944146)
chr3 (79-328)||(16826292-16826541)
chr3 (72-328)||(53383040-53383296)
chr3 (79-328)||(11888376-11888625)
chr3 (87-328)||(15400539-15400780)
chr3 (99-332)||(8745397-8745630)
chr3 (79-328)||(15357942-15358191)
chr3 (79-328)||(16694023-16694272)
chr3 (79-332)||(41179391-41179644)
chr3 (81-332)||(17188245-17188496)
chr3 (150-328)||(26791435-26791613)
chr3 (79-340)||(12180213-12180474)
chr3 (87-328)||(15013778-15014019)
chr3 (79-332)||(16378936-16379188)
chr3 (79-332)||(44779116-44779369)
chr3 (79-332)||(12358534-12358787)
chr3 (79-328)||(14579430-14579679)
chr3 (60-328)||(15229453-15229721)
chr3 (60-328)||(15235321-15235589)
chr3 (84-332)||(31940777-31941025)
chr3 (18-328)||(17491648-17491958)
chr3 (60-325)||(10418059-10418324)
chr3 (84-332)||(31693192-31693440)
chr3 (81-340)||(47125815-47126074)
chr3 (79-325)||(14291546-14291792)
chr3 (87-249)||(15261497-15261659)
chr3 (79-332)||(18132353-18132606)
chr3 (81-332)||(11949915-11950166)
chr3 (164-340)||(12844113-12844289)
chr3 (125-313)||(18437045-18437233)
chr3 (81-328)||(10407839-10408086)
chr3 (81-328)||(13970131-13970378)
chr3 (81-328)||(14088544-14088791)
chr3 (99-286)||(12510536-12510723)
chr3 (126-328)||(12272254-12272456)
chr3 (79-328)||(13318513-13318762)
chr3 (81-340)||(28756189-28756449)
chr3 (271-340)||(3296384-3296453)
chr3 (72-173)||(14874676-14874777)
chr3 (99-294)||(16834560-16834750)
chr3 (79-256)||(16327743-16327920)
chr3 (231-332)||(17493667-17493768)
chr3 (215-288)||(14874604-14874677)
chr3 (264-328)||(12071018-12071082)
chr3 (264-332)||(14575040-14575108)
chr3 (60-112)||(15723172-15723224)
[»] chr1 (43 HSPs)
chr1 (11-340)||(20829235-20829564)
chr1 (11-340)||(20927241-20927570)
chr1 (11-340)||(20527240-20527569)
chr1 (11-340)||(41215699-41216028)
chr1 (21-297)||(35930712-35930987)
chr1 (11-340)||(22133595-22133928)
chr1 (60-328)||(33388884-33389152)
chr1 (60-328)||(21832538-21832806)
chr1 (72-328)||(51331347-51331604)
chr1 (141-337)||(21200800-21200996)
chr1 (79-332)||(21233582-21233835)
chr1 (79-328)||(21839205-21839454)
chr1 (60-328)||(16348450-16348718)
chr1 (72-328)||(19108616-19108872)
chr1 (79-332)||(21743403-21743656)
chr1 (79-328)||(17042870-17043119)
chr1 (72-304)||(429995-430227)
chr1 (125-328)||(21751241-21751444)
chr1 (72-328)||(22503144-22503400)
chr1 (79-340)||(50618241-50618502)
chr1 (72-328)||(22360099-22360355)
chr1 (87-328)||(16378358-16378599)
chr1 (60-328)||(20854615-20854883)
chr1 (79-330)||(41310812-41311063)
chr1 (79-328)||(20296667-20296916)
chr1 (79-328)||(20833755-20834004)
chr1 (79-328)||(21862228-21862477)
chr1 (79-329)||(20937917-20938167)
chr1 (162-332)||(21739887-21740057)
chr1 (79-332)||(19660987-19661240)
chr1 (72-328)||(20140331-20140587)
chr1 (79-332)||(24097466-24097707)
chr1 (81-328)||(48425161-48425408)
chr1 (81-328)||(52988029-52988276)
chr1 (70-328)||(41351523-41351775)
chr1 (81-328)||(31537852-31538099)
chr1 (81-328)||(37679337-37679584)
chr1 (81-328)||(38910681-38910928)
chr1 (79-332)||(19856560-19856813)
chr1 (81-332)||(21953166-21953417)
chr1 (79-181)||(24792618-24792720)
chr1 (11-64)||(21200998-21201051)
chr1 (195-327)||(22016601-22016733)
[»] chr8 (57 HSPs)
chr8 (11-340)||(16875309-16875638)
chr8 (11-340)||(21848551-21848880)
chr8 (11-340)||(20650569-20650898)
chr8 (11-340)||(16414329-16414658)
chr8 (11-340)||(23155256-23155583)
chr8 (11-340)||(21194754-21195083)
chr8 (11-340)||(22436541-22436870)
chr8 (11-340)||(23902402-23902731)
chr8 (86-340)||(24932038-24932292)
chr8 (72-328)||(17672249-17672505)
chr8 (60-328)||(18858864-18859132)
chr8 (60-328)||(22118401-22118669)
chr8 (60-328)||(22127185-22127453)
chr8 (70-328)||(20016489-20016747)
chr8 (72-328)||(21164764-21165020)
chr8 (72-328)||(22042126-22042382)
chr8 (79-328)||(30311370-30311619)
chr8 (72-328)||(20390385-20390641)
chr8 (79-337)||(22246650-22246908)
chr8 (72-328)||(21392087-21392343)
chr8 (72-328)||(21781413-21781669)
chr8 (72-328)||(21786581-21786837)
chr8 (79-328)||(15535689-15535938)
chr8 (79-340)||(22422106-22422367)
chr8 (72-328)||(19980266-19980522)
chr8 (79-307)||(20394380-20394608)
chr8 (82-340)||(22522855-22523113)
chr8 (79-340)||(22375667-22375928)
chr8 (79-328)||(32602451-32602700)
chr8 (79-332)||(19984486-19984739)
chr8 (79-332)||(21323501-21323754)
chr8 (99-328)||(23887354-23887583)
chr8 (79-332)||(31414691-31414944)
chr8 (72-307)||(19864340-19864575)
chr8 (18-328)||(21253189-21253499)
chr8 (94-332)||(31569065-31569303)
chr8 (79-328)||(22131267-22131516)
chr8 (79-292)||(22373174-22373387)
chr8 (72-229)||(21782745-21782902)
chr8 (79-304)||(22060929-22061154)
chr8 (70-328)||(19482298-19482548)
chr8 (81-328)||(16269450-16269697)
chr8 (79-330)||(21927734-21927985)
chr8 (70-332)||(23657224-23657486)
chr8 (99-332)||(22053189-22053421)
chr8 (140-328)||(22030470-22030658)
chr8 (79-328)||(4984348-4984597)
chr8 (79-328)||(22989351-22989600)
chr8 (99-328)||(29301652-29301881)
chr8 (96-286)||(27356859-27357049)
chr8 (81-286)||(28983219-28983424)
chr8 (81-286)||(28988438-28988643)
chr8 (204-328)||(19114831-19114955)
chr8 (79-190)||(20008285-20008396)
chr8 (72-200)||(23652340-23652468)
chr8 (12-255)||(24630965-24631208)
chr8 (176-340)||(19870096-19870260)
[»] chr4 (41 HSPs)
chr4 (11-340)||(15290929-15291258)
chr4 (11-340)||(12340637-12340965)
chr4 (60-328)||(23957968-23958236)
chr4 (60-328)||(27713557-27713825)
chr4 (72-328)||(8388645-8388901)
chr4 (60-328)||(40475261-40475529)
chr4 (70-328)||(16234515-16234773)
chr4 (70-328)||(19776316-19776574)
chr4 (71-332)||(14161702-14161963)
chr4 (72-328)||(17092672-17092928)
chr4 (70-328)||(8051146-8051404)
chr4 (70-328)||(12478831-12479089)
chr4 (79-328)||(14301502-14301751)
chr4 (99-332)||(16251369-16251602)
chr4 (96-340)||(14696370-14696614)
chr4 (79-319)||(18224978-18225218)
chr4 (72-326)||(14682800-14683054)
chr4 (107-328)||(8708175-8708396)
chr4 (79-328)||(15001148-15001397)
chr4 (72-328)||(22631937-22632189)
chr4 (79-332)||(51604571-51604824)
chr4 (70-337)||(1647051-1647318)
chr4 (79-340)||(15356891-15357152)
chr4 (79-332)||(16149951-16150204)
chr4 (79-332)||(16154097-16154350)
chr4 (79-340)||(16218470-16218731)
chr4 (79-340)||(16221790-16222051)
chr4 (79-340)||(23443345-23443606)
chr4 (151-328)||(15145416-15145593)
chr4 (81-328)||(3262577-3262824)
chr4 (136-313)||(16353068-16353245)
chr4 (87-313)||(14848904-14849130)
chr4 (81-328)||(29451320-29451567)
chr4 (81-280)||(44659697-44659896)
chr4 (81-286)||(11205057-11205262)
chr4 (79-332)||(15072599-15072852)
chr4 (81-332)||(15258170-15258420)
chr4 (60-328)||(27902607-27902874)
chr4 (193-332)||(20892385-20892524)
chr4 (72-112)||(16353246-16353286)
chr4 (176-340)||(18547390-18547554)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (11-340)||(5581-5909)
scaffold0124 (79-332)||(14477-14730)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (11-340)||(24829499-24829828)
chr2 (11-340)||(22279908-22280237)
chr2 (14-340)||(25130415-25130741)
chr2 (11-339)||(24567980-24568308)
chr2 (11-340)||(22759882-22760209)
chr2 (72-328)||(9337446-9337702)
chr2 (72-328)||(9486080-9486336)
chr2 (60-328)||(27373121-27373389)
chr2 (60-328)||(24264222-24264490)
chr2 (72-328)||(27219880-27220136)
chr2 (60-328)||(41606708-41606976)
chr2 (72-328)||(44383893-44384149)
chr2 (70-328)||(24711896-24712154)
chr2 (60-328)||(10870702-10870970)
chr2 (72-328)||(24677353-24677609)
chr2 (72-328)||(16927224-16927480)
chr2 (72-328)||(17000864-17001120)
chr2 (79-332)||(19650369-19650622)
chr2 (72-328)||(24705805-24706061)
chr2 (72-328)||(24875073-24875329)
chr2 (59-328)||(21143364-21143633)
chr2 (79-332)||(25255790-25256042)
chr2 (79-328)||(21323589-21323838)
chr2 (79-332)||(27789611-27789864)
chr2 (72-328)||(23073727-23073983)
chr2 (72-288)||(23106091-23106307)
chr2 (93-332)||(12576238-12576477)
chr2 (81-340)||(23098329-23098588)
chr2 (72-328)||(22734097-22734353)
chr2 (81-332)||(19717336-19717587)
chr2 (72-253)||(24818628-24818809)
chr2 (125-328)||(23112656-23112859)
chr2 (79-332)||(23278647-23278900)
chr2 (81-340)||(31832531-31832790)
chr2 (81-328)||(1065624-1065871)
chr2 (167-328)||(23204273-23204434)
chr2 (81-312)||(30209256-30209487)
chr2 (126-328)||(30010507-30010709)
chr2 (21-117)||(10037866-10037962)
chr2 (21-113)||(10098255-10098347)
chr2 (72-169)||(23189782-23189879)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (11-340)||(414-743)
scaffold0302 (11-340)||(7356-7685)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (11-340)||(15111-15440)
scaffold0162 (14-340)||(10948-11274)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (11-340)||(8600-8929)
scaffold0022 (79-340)||(56026-56287)
scaffold0022 (79-340)||(40903-41164)
scaffold0022 (79-340)||(74623-74884)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (11-340)||(34288-34615)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (11-340)||(24379-24708)
scaffold0120 (79-307)||(8291-8519)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (11-340)||(7635-7964)
scaffold0266 (79-332)||(16383-16636)
[»] scaffold0008 (4 HSPs)
scaffold0008 (11-340)||(132263-132592)
scaffold0008 (11-340)||(25970-26301)
scaffold0008 (72-307)||(85037-85272)
scaffold0008 (72-301)||(85609-85838)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (15-340)||(1395-1720)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (11-291)||(42461-42741)
scaffold0076 (79-332)||(54193-54446)
scaffold0076 (81-328)||(31463-31710)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (11-340)||(1726-2055)
scaffold0218 (11-335)||(26530-26854)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (32-340)||(13399-13707)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (11-340)||(720-1049)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (11-337)||(582-906)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (11-340)||(6779-7108)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (11-251)||(6947-7187)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (69-340)||(89761-90032)
scaffold0021 (11-340)||(21629-21950)
scaffold0021 (11-340)||(31205-31526)
scaffold0021 (98-340)||(7445-7687)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (15-266)||(1732-1983)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (65-340)||(7014-7289)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (11-340)||(310-624)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (11-237)||(16261-16487)
[»] scaffold0610 (3 HSPs)
scaffold0610 (127-318)||(4722-4913)
scaffold0610 (11-134)||(6909-7032)
scaffold0610 (291-340)||(4676-4725)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (70-328)||(21507-21765)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (79-340)||(3170-3431)
scaffold0647 (18-328)||(7445-7755)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (79-340)||(6861-7122)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (72-328)||(15780-16036)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (70-316)||(21984-22230)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (79-328)||(9209-9458)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (79-332)||(2693-2946)
scaffold0044 (79-328)||(16429-16678)
[»] scaffold0079 (4 HSPs)
scaffold0079 (72-328)||(35760-36016)
scaffold0079 (79-332)||(2987-3240)
scaffold0079 (136-313)||(28404-28581)
scaffold0079 (72-112)||(28363-28403)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (72-328)||(17200-17456)
scaffold0028 (72-328)||(10738-10994)
scaffold0028 (70-328)||(45413-45671)
scaffold0028 (81-328)||(48300-48547)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (79-340)||(217194-217455)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (72-328)||(91-347)
scaffold0149 (79-328)||(5137-5386)
scaffold0149 (79-328)||(9568-9817)
[»] scaffold0058 (3 HSPs)
scaffold0058 (15-327)||(76630-76942)
scaffold0058 (70-332)||(21382-21644)
scaffold0058 (87-313)||(27049-27275)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (11-130)||(26250-26369)
scaffold0077 (79-332)||(19416-19669)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (79-332)||(2140-2393)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (11-197)||(2142-2327)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (79-328)||(17147-17396)
scaffold0040 (246-340)||(111681-111775)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (79-340)||(114812-115073)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (72-328)||(15764-16020)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (72-328)||(37606-37862)
scaffold0042 (79-286)||(22976-23183)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (17-304)||(7430-7717)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (79-332)||(18265-18518)
scaffold0348 (141-332)||(5631-5822)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (79-328)||(41967-42216)
scaffold0102 (79-328)||(51131-51380)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (72-304)||(323-555)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (72-332)||(24080-24340)
scaffold0018 (72-253)||(10602-10783)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (72-286)||(201296-201510)
scaffold0004 (79-332)||(324975-325229)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (79-328)||(19623-19872)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (87-328)||(13910-14151)
scaffold0109 (87-328)||(40432-40673)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (72-328)||(9630-9886)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (81-332)||(31101-31352)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (72-307)||(53899-54134)
scaffold0080 (79-328)||(11024-11274)
scaffold0080 (72-340)||(36612-36880)
scaffold0080 (72-340)||(31146-31414)
scaffold0080 (125-328)||(13679-13883)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (81-332)||(99344-99595)
scaffold0020 (215-286)||(175398-175469)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (87-328)||(10944-11186)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (70-328)||(5675-5933)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (79-328)||(565-814)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (79-328)||(20509-20758)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (79-332)||(9332-9585)
scaffold0222 (70-332)||(1271-1533)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (79-332)||(22145-22398)
scaffold0114 (72-328)||(18127-18383)
scaffold0114 (79-332)||(39327-39580)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (79-332)||(79613-79866)
scaffold0046 (162-332)||(60091-60261)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (79-328)||(58286-58535)
scaffold0017 (72-328)||(17852-18108)
scaffold0017 (79-157)||(195444-195522)
[»] scaffold0074 (3 HSPs)
scaffold0074 (72-340)||(5375-5643)
scaffold0074 (79-244)||(11392-11557)
scaffold0074 (249-332)||(14562-14645)
[»] scaffold2004 (1 HSPs)
scaffold2004 (125-328)||(599-802)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (81-340)||(1319-1578)
scaffold0476 (79-156)||(10437-10514)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (79-332)||(33605-33859)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (126-332)||(28940-29146)
scaffold0067 (79-328)||(49966-50215)
scaffold0067 (79-328)||(59000-59249)
scaffold0067 (79-328)||(65388-65637)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (79-328)||(3703-3952)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (79-328)||(771-1020)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (79-328)||(15007-15256)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (79-340)||(4185-4446)
scaffold0010 (79-332)||(45209-45462)
scaffold0010 (81-328)||(40119-40366)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (96-328)||(1285-1517)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (17-328)||(36235-36546)
scaffold0081 (18-328)||(20812-21122)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (70-328)||(4441-4699)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (79-332)||(637-889)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (79-328)||(11099-11348)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (99-332)||(24505-24738)
scaffold0104 (79-332)||(44199-44452)
[»] scaffold0083 (3 HSPs)
scaffold0083 (79-328)||(8820-9069)
scaffold0083 (100-284)||(6628-6812)
scaffold0083 (100-247)||(1324-1471)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (79-332)||(53316-53569)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (87-340)||(2279-2532)
scaffold0023 (72-313)||(151374-151615)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (99-332)||(262515-262748)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (81-332)||(5927-6178)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (137-332)||(972-1167)
scaffold0420 (137-332)||(7941-8136)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (137-328)||(17977-18168)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (137-328)||(12142-12333)
[»] scaffold0878 (1 HSPs)
scaffold0878 (246-340)||(4432-4526)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (126-328)||(2058-2260)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (126-328)||(29071-29273)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (79-340)||(14253-14514)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (79-332)||(11229-11482)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (87-340)||(495297-495550)
scaffold0001 (81-332)||(515135-515386)
scaffold0001 (126-328)||(452999-453201)
scaffold0001 (198-340)||(441078-441220)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (79-331)||(28796-29048)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (72-328)||(29702-29957)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (79-331)||(109901-110153)
scaffold0031 (72-253)||(54852-55033)
scaffold0031 (264-328)||(52711-52775)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (125-328)||(12997-13200)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (137-328)||(41291-41482)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (79-313)||(6142-6376)
scaffold0270 (79-313)||(13272-13506)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (79-313)||(24746-24980)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (72-249)||(8636-8812)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (79-332)||(1267-1520)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (79-332)||(5020-5273)
scaffold0035 (81-282)||(41939-42140)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (60-325)||(94683-94948)
scaffold0029 (72-245)||(107680-107853)
scaffold0029 (81-328)||(114832-115080)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (79-328)||(150840-151089)
scaffold0011 (79-340)||(24307-24568)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (79-332)||(250891-251144)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (60-244)||(8301-8485)
scaffold0358 (60-244)||(17497-17681)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (79-286)||(9886-10092)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (70-325)||(268870-269125)
scaffold0007 (140-256)||(84378-84494)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (79-332)||(12064-12318)
scaffold0309 (79-202)||(16912-17035)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (87-337)||(14747-14997)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (262-340)||(23415-23493)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (87-328)||(3860-4101)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (168-328)||(2713-2873)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (79-307)||(46841-47069)
scaffold0053 (84-285)||(55676-55877)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (60-328)||(69622-69890)
scaffold0034 (79-332)||(2735-2988)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (81-332)||(616-867)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (81-340)||(10560-10819)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (79-282)||(51081-51284)
scaffold0026 (176-340)||(31282-31446)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (126-340)||(198-412)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (79-328)||(8527-8777)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (79-332)||(497-750)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (171-328)||(28281-28438)
scaffold0215 (72-150)||(28446-28524)
[»] scaffold0146 (2 HSPs)
scaffold0146 (93-286)||(9782-9975)
scaffold0146 (93-286)||(17449-17642)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (79-307)||(2870-3098)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (126-332)||(4871-5077)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (79-328)||(721-970)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (79-328)||(49375-49623)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (79-331)||(49660-49910)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (72-328)||(176131-176386)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (79-286)||(37919-38126)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (79-328)||(9247-9496)
scaffold0235 (79-328)||(19461-19710)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (79-332)||(43187-43440)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (79-328)||(64305-64554)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (151-340)||(103568-103757)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (72-304)||(1188-1424)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (125-328)||(4675-4878)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (79-328)||(21120-21369)
[»] scaffold0719 (1 HSPs)
scaffold0719 (14-68)||(4793-4847)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (72-201)||(1030-1157)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (138-328)||(29262-29452)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (151-328)||(7085-7262)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (79-211)||(13239-13371)
scaffold0261 (79-211)||(21418-21550)
scaffold0261 (264-332)||(13147-13215)
scaffold0261 (264-332)||(21326-21394)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (213-340)||(4524-4651)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (153-332)||(36282-36461)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (79-180)||(1-102)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (262-340)||(6078-6156)
[»] scaffold2111 (1 HSPs)
scaffold2111 (99-286)||(415-602)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (99-328)||(25404-25630)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (79-211)||(1223-1355)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (216-328)||(3956-4068)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (231-328)||(4-101)
[»] scaffold0481 (1 HSPs)
scaffold0481 (195-339)||(12142-12286)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (241-328)||(1183-1270)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (309-340)||(208-239)
scaffold0456 (309-340)||(7353-7384)
[»] scaffold1985 (1 HSPs)
scaffold1985 (272-328)||(355-411)


Alignment Details
Target: scaffold0225 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 25597 - 25926
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25597 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 25696  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25697 ttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgtcgataat 25796  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25797 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 25896  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 25926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 59)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 7826061 - 7826390
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7826061 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 7826160  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7826161 ttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgtcgataat 7826260  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7826261 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 7826360  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7826361 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 7826390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27105883 - 27105554
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27105883 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 27105784  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27105783 ttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgtcgataat 27105684  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27105683 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 27105584  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27105583 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 27105554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 27172442 - 27172771
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27172442 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 27172541  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27172542 ttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgtcgataat 27172641  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27172642 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 27172741  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27172742 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 27172771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 13379046 - 13379373
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13379046 cacagaatactca--gtgtccatacctcgttcggaacgcggttttggatatatcttccgccttcactctgatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 13379143  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13379144 ttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagaggataaagattcttaatagtcaccttgttcaactgccgataat 13379243  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13379244 ccacacacaacctcatccttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggagaaacactcggcctgataaactgcttctcaagcaactc 13379343  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13379344 ttccaactgcttcttcaattcacccaactc 13379373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 4442089 - 4442417
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4442089 cacagaatactcttagtgttcatacctcgaccggaacgcggttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 4442188  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4442189 ttactaaacacttccgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagcggataccgattcttaatcgtcaccttcttcaactgccgataat 4442288  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4442289 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaataacactggagcaccccacggagaaacactcggcctgataaactgcttctcaagcaactc 4442388  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  4442389 ttctaactg-ctcttcaattcacccaactc 4442417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 13458196 - 13458525
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13458196 cacaaaatactcatagtgtccataccttgttcggaacacggtttcggatatatctttcgccttcactctaatctaatgatatcctgatctgaaatcaatc 13458295  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  13458296 ttactgaacacttccgcaccaaccagttggtccatcaaatcatcaatcctttgaagcggatatcgattcttaatcgttgccttgtttaactgccgataat 13458395  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13458396 ccacacacaacctcatgctttcatccttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacgaagaaacactcagtctaatgaactgcttctcaagtaactc 13458495  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  13458496 ttccaagtgcttcttcaattcacctaactc 13458525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 17925811 - 17926132
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  17925811 cacagaatactcatagtgtccatacctcattcgaaacgcggttttggatatatcttccgtcttcactctaatctgatgatatcttgatctcaaatcaatt 17925910  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    |||||||| || ||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17925911 ttactaaatacttccacaccaaccagctgatccctcaaatcatcaatcctcggaagcggatactgattcttaatcgtcaccttgttcaactaccgataat 17926010  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||    
T  17926011 ccacacacaacctcatgcttccatcctt--------ctaacaacactggagcaccccacggagaaacactcggcctgataaactgtttctcaaacaactc 17926102  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||| ||||| |||||||||| || ||||||    
T  17926103 ttctaactgcttcttcaattaactcaactc 17926132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Original strand, 8709815 - 8710083
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  8709815 atatcttcatcctttaccttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattc 8709914  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  8709915 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccgg 8710014  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8710015 cgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 8710083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18588231 - 18587963
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  18588231 atatcttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattc 18588132  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  18588131 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccgg 18588032  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18588031 cgctccccaaggtgaaacactcggtttaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 18587963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15159117 - 15158849
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  15159117 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 15159018  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  15159017 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccgg 15158918  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15158917 cgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 15158849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 10872912 - 10873168
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  10872912 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 10873011  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  10873012 acctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 10873111  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10873112 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 10873168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Original strand, 13688251 - 13688519
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  13688251 atatcttcatcctttactttaatctagtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 13688350  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  13688351 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccgg 13688450  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13688451 cgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 13688519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 328
Target Start/End: Original strand, 14334616 - 14334874
Alignment:
Q  70 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 169  Q
    |||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14334616 cctttaccttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgg 14334715  T
Q  170 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac 269  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||| | |||||| || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||     
T  14334716 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccgtctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaa 14334815  T
Q  270 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14334816 ggtgaaacactcggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 14334874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11551150 - 11550894
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11551150 tttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggat 11551051  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  11551050 acctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 11550951  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11550950 tgaaacacttggtctaacaaatttcttctcaagcaaatcttccaactgtttcttcaa 11550894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 44789399 - 44789143
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  44789399 tttactttaatctggtgacaacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 44789300  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  44789299 acctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 44789200  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  44789199 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttctaactgtttcttcaa 44789143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 70 - 328
Target Start/End: Original strand, 18179965 - 18180223
Alignment:
Q  70 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 169  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  18179965 cctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctctgaagtgg 18180064  T
Q  170 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac 269  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || |||||     
T  18180065 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaa 18180164  T
Q  270 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  18180165 ggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 18180223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 79 - 340
Target Start/End: Original strand, 15626754 - 15627015
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  15626754 taatctggtgatagcccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctatt 15626853  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||  || ||||||||| ||||||  |  || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||||    
T  15626854 ctttatcgtcattttattcaactgctgataattaatgcataacctcatgctaccatctttctttttaaccaacaacaccggtgctcctcaaggtgaaaca 15626953  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    |||||||| | ||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  15626954 ctcggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactc 15627015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 87 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 48813285 - 48813032
Alignment:
Q  87 tgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcg 186  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||    
T  48813285 tgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcgcccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggataccaatactttatcg 48813186  T
Q  187 tcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtct 286  Q
    | || || |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||||| |||    
T  48813185 ttactttattcaactgtcgataatcaatacataacctcatgctaccatctttcttcttaacaagtaacaccggcgctccccaaggtgaaacactcgatct 48813086  T
Q  287 aataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
     | ||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  48813085 tacaaacttcttatcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactc 48813032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11235261 - 11235005
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  11235261 tttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 11235162  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||| | |||||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  11235161 acctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 11235062  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  11235061 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 11235005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 12689724 - 12689980
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  12689724 tttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 12689823  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || || ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||| ||||  || ||||| || ||||| ||    
T  12689824 acctattcttgatagttactttgttcaactgtcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagtaaaactggcgctccccaagg 12689923  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| |||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12689924 tgaaacacttggtcgaacaaatttcttctcaagcaaatcttccaactgtttcttcaa 12689980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 72 - 327
Target Start/End: Original strand, 14956776 - 14957031
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14956776 tttactttaatttggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 14956875  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || || ||||| ||    
T  14956876 acctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagtaaaaccggcgctccccaagg 14956975  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttca 327  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14956976 tgaaacacttggtctaacaaatttcttctcaagcaaatcttccaactgtttcttca 14957031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 14139909 - 14140162
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  14139909 taatttgatggtaacctgacctcaagtcaatattactaaaaacctttgcacccaccagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctatt 14140008  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||| || |  |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| || || |||||||||||||||    
T  14140009 cttaattgtaactttgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcatgctaccttcctttttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaaca 14140108  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14140109 ctgggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattca 14140162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Original strand, 9590597 - 9590846
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |  | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||     
T  9590597 taatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaaattttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcagaagtggatacctata 9590696  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || |||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  9590697 cttgatagttaccttgttcaactgacgatagtcaatacacaacctcatgctaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaaca 9590796  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||||||||| | ||| || ||||| ||||| || || ||||||||    
T  9590797 cttggtctaataaatttcttttcgagcaaatcttctaattgtttcttcaa 9590846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14262264 - 14262011
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||    ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  14262264 taatatgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctgaacacacgagcacccactaactgatccattaaatcatcaaacctcggaagtggatacctatt 14262165  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || |||| ||| |  ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||    
T  14262164 ctttatcgtcactttattcagctgacagtaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccacggtgaaaca 14262065  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||| | ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  14262064 cttggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattca 14262011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15100622 - 15100369
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| || || || ||    ||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  15100622 taatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaatacacgagcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctatt 15100523  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||    
T  15100522 ctttatcgtaaccttgttcaactgacgataatcaatgcataacctcatgctgccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccacggtgaaaca 15100423  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||| | ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  15100422 cttggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcctccaattgtttcttcaattca 15100369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18051972 - 18051719
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||    
T  18051972 taatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctatt 18051873  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||| || |  ||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||    
T  18051872 cttaattgtaactttgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttcttcaccaacaacacaggtgctccccacggcgaaaca 18051773  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  18051772 ctgggtcttacaaacttcttatcaagtaaatcttccaactgtttcttcaattca 18051719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 81 - 332
Target Start/End: Original strand, 13023589 - 13023840
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| || |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||    
T  13023589 atctgatggtaaccagacctcaagtcaatcttgctaaacaccttcgcacccaccaattgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatatctattct 13023688  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  13023689 ttatcgtaactttgttcaactgacggtaatcaatgcacaacctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggagctccccaaggtgaaacact 13023788  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
     ||||| | ||||| ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  13023789 tggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaattgtttcttcaattca 13023840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15391 - 15169
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || | |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||    
T  15391 taatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcctcaattctcggaagtggatacctatt 15292  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || |||||||||||||| ||||| || | |||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  15291 cttgatagttaccttgttcaactgacgatagtcaatacactatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaaca 15192  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctc 301  Q
    || ||||||| ||| | ||||||    
T  15191 cttggtctaacaaatttcttctc 15169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15717011 - 15716825
Alignment:
Q  12 acagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatct 111  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  15717011 acagaatattcatagtgaccatatctagttcggaacgcagttttggatatatcctccgccttcactagtatctgctgatatcgtgaccttaaatcaatct 15716912  T
Q  112 tactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttca 198  Q
    |||| ||||| || |||||||| | ||||||||||| ||| |||||||| || || | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15716911 tactgaacacttccgcaccaaccaactgatccatcatatcctcaatcctcgggagcgaatactgattcttaatcgtcaccttgttca 15716825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 81 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11386446 - 11386187
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||||||| | |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||  ||||    
T  11386446 atctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcctcggaagcggatacctgttct 11386347  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||| || || || |  ||||| |||||||| ||||| |||||||| || | |||||| || || |||||||| || |||||    
T  11386346 ttatcgtaactttgttcaactgacggtagtctatgcacaatctcatgctaccatccttcttctttaccagcaacacaggcgctccccacggcgagacact 11386247  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    |||| | | ||||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11386246 cggttttacaaacttcttatcaaacaagtcttccaactgtttcttcaattcagccaactc 11386187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17143383 - 17143096
Alignment:
Q  13 cagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatctt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| || ||||| || | |||||| ||||  || || |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  17143383 cagaatattcatagtgtccatacctcgttcaaaatgcagtcttagatatgtccttcgccttcactcatatttggtgatatccagatcataaatcaatatt 17143284  T
Q  113 actaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatcc 212  Q
    ||||||||| | ||||||||| |  |||||||| || |  ||||||||  | || |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  17143283 actaaacacttatgcaccaacaatttgatccatgaagtagtcaatcctcaggagaggataccgattcttaaccatcaccttattcaactgccgataatcc 17143184  T
Q  213 acacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttct 300  Q
    | |||||||||||| ||    || ||||||||| | ||||||||||| || ||| |||  ||||||||| | || |||||||||||||    
T  17143183 atacacaacctcatactattgtccttcttcttatccaacaacactggtgctccctacgacgaaacactcagcctgataaactgcttct 17143096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11770426 - 11770236
Alignment:
Q  96 gatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgt 195  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||    ||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||    
T  11770426 gatctcaaattaatcttgctaaacacacgagcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctttatcgttactttgt 11770327  T
Q  196 tcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtct 286  Q
    ||||||| |||||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |  || || ||||||||||||||||| |||||    
T  11770326 tcaactgtcgataatcaatgcataacctcatgctaccatctttcttcttaactagcaatatcggcgctccccacggtgaaacacttggtct 11770236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 332
Target Start/End: Original strand, 15342681 - 15342914
Alignment:
Q  99 ctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttca 198  Q
    ||||| ||||||||||| || | || ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||| | ||| |||||||  ||||| || || || |||||||    
T  15342681 ctcaagtcaatcttactgaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcataaatcctcgaaagcggatacctgttctttattgtaactttgttca 15342780  T
Q  199 actgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgctt 298  Q
    |||| || ||||  | ||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||    
T  15342781 actgacggtaatatatacacaacctcatgctaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacactgggtcaaacaaacttctt 15342880  T
Q  299 ctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
     |||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  15342881 atcaagcaagtcttccaactttttcttcaattca 15342914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16948491 - 16948240
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||| |||| ||||||||| || |||||||| || || |||||||||| |||    
T  16948491 taatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaacacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaattctcgggagtggatacctatt 16948392  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||| | || || |||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || ||||| ||||||| |    
T  16948391 ctttatcataactttattcaactgacggtaatcaatgcacaatctcatgctaccatccttcttcttaactaacaacaccagcgctccccaaggtgaaaaa 16948292  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaatt 330  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  16948291 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaggtcttccaactgtttcttcaatt 16948240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15146925 - 15146679
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||   |||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  15146925 taatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctatt 15146826  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || || |||||||| |||||||| |  || |||||||| || || ||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||||    
T  15146825 cttcatagttactttattcaactgacgataatcaatgcataacctcatactaccgtctttcttcttcactaacaaaacaggtgctccccaaggtgaaaca 15146726  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattctt 325  Q
    || ||| ||| |||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15146725 cttggtataacaaactttttctcaagcaaatcttctaactgtttctt 15146679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 12204819 - 12204570
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||   |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  12204819 taatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacgcatgcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 12204720  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || |||| ||| || ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  12204719 ctttatcgtcactttattcagctgacggtaatctatgcacaacctcatgctaccatccttctttttatccaacaataccggcgctccccatggtgaaaca 12204620  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||| |||| | ||| | ||| ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  12204619 ctccgtcttacaaatttcttatcaagtaaatcctccaactgtttcttcaa 12204570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 81 - 332
Target Start/End: Original strand, 12458872 - 12459123
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| |  ||||| |||| ||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||  ||||    
T  12458872 atctgatggtaaccagacctcaaatcgatcttactgaacactttcgcacctactaactgatccattaggtcatcaatcctcggaagcggatacctgttct 12458971  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | || || || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || || || || |||||||||||    
T  12458972 ttattgtaactttgttcaactgacggtaatcaatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctcctcaaggtgaaacact 12459071  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
     ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12459072 tggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattca 12459123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 143 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16727360 - 16727175
Alignment:
Q  143 catcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttc 242  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16727360 catcaaatcatcaattctcagaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttc 16727261  T
Q  243 ttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || |||| ||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| ||| | ||| |||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  16727260 ttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgacacacttggtctaacaaatttcttttcaagcaaatcttctaactgtctcttcaa 16727175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 143 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17704432 - 17704247
Alignment:
Q  143 catcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttc 242  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17704432 catcaaatcatcaattctcagaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttc 17704333  T
Q  243 ttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || |||| ||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| ||| | ||| |||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  17704332 ttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgacacacttggtctaacaaatttcttttcaagcaaatcttctaactgtctcttcaa 17704247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 129 - 278
Target Start/End: Original strand, 22034369 - 22034517
Alignment:
Q  129 ccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgc 228  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||| |||| |  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||      
T  22034369 ccaaccagctgatccatcagttcatcattcctcgagagaggataccgattcttaatcgtaaccttgttcaactgccgataatccaca-aatacctcatat 22034467  T
Q  229 ttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22034468 taccatcctttttcttaaccaacaacactggagcaccccacgatgaaaca 22034517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 286
Target Start/End: Original strand, 49154533 - 49154738
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| | ||  |||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||  ||||    
T  49154533 atctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaatatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttct 49154632  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  49154633 tgatcgtaactttgttcaactgacggtaatctatacacaatctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacact 49154732  T
Q  281 cggtct 286  Q
     |||||    
T  49154733 gggtct 49154738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 79 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16070316 - 16070069
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| |||    ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||   ||    
T  16070316 taatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaagcacacgagcacccactaactggtccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacttgtt 16070217  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || |||| ||| || ||||| | |||||||||| | || | ||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||    
T  16070216 ctttatcgtcactttattcagctgacggtaatctatacacaacctcgtactactatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccacggtgaaaca 16070117  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttc 326  Q
    || ||||| | ||| | ||| |||||||| || |||||||| ||||||    
T  16070116 cttggtcttacaaatttcttatcaagcaaatcctccaactgtttcttc 16070069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26092815 - 26092568
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| | ||  |||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||  ||||    
T  26092815 atctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttct 26092716  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||| | |||||  ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  26092715 tgatcgtaactttgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacact 26092616  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     ||||| | ||||| ||| || | ||  || |||||||| ||||||||    
T  26092615 gggtcttacaaacttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaa 26092568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 13675682 - 13675935
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  | || |||| |||||| |||| ||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  13675682 taatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgttgaaaacctttgcacccactaactgatccattatgtcatcaatcctcggaagtggatacctgtt 13675781  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || ||||||||||| ||||| || |  || || ||||||||  | |||||||||||||| |||||||  || || ||||| |||||||||    
T  13675782 ctttattgtaactttgttcaactgacgatagtcaatgcataatctcatgctatcgtctttcttcttaaccaacaacatcggtgctccccaaggtgaaaca 13675881  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    ||  |||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  13675882 cttagtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttctttaattca 13675935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13966687 - 13966434
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |  |  |||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||  ||    
T  13966687 taatctgatggtaaccagatctcaaatcaatcttactaaaaattttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgtt 13966588  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||||    
T  13966587 ctttatcgtgactttgttcaactgacggtaatctatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaataacaccggtgctccccaaggtgaaaca 13966488  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||| | ||| || | ||  || |||||||| ||||||||||||    
T  13966487 ctgggtcttacaaatttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaattca 13966434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 340
Target Start/End: Original strand, 14041924 - 14042185
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || ||   |||||| |||| |||||||||||| |  ||||| |||||||||||| ||| |||    
T  14041924 taatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagttctcaattcttggaagtggacacctatt 14042023  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || |||||||| || ||||| || |  ||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| |||||||||    
T  14042024 ctttatcgttactttgttcaattgtcgatagtcaatgcacaatctcatactaccatctttcttctttactagcaataccggcgctccccaaggtgaaaca 14042123  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| || || |  || |||||||| ||| |||||||    
T  14042124 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcctctagttgtttcttcaactcagccaactc 14042185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 340
Target Start/End: Original strand, 14351954 - 14352215
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || ||   |||||| |||| |||||||||||| |  ||||| |||||||||||| ||| |||    
T  14351954 taatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagttctcaattcttggaagtggacacctatt 14352053  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || |||||||| || ||||| || |  ||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| |||||||||    
T  14352054 ctttatcgttactttgttcaattgtcgatagtcaatgcacaatctcatactaccatctttcttctttactagcaataccggcgctccccaaggtgaaaca 14352153  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| || || |  || |||||||| ||| |||||||    
T  14352154 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcctctagttgtttcttcaactcagccaactc 14352215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11301230 - 11300971
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||||||||| | ||  |||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| |  ||||    
T  11301230 atctgatggtaaccagacctcaaatcaatcttactaaatatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatatctgttct 11301131  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||| | |||||  ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  11301130 tgatcgtaactttgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacact 11301031  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
     ||||| | ||||| ||| |  | ||  || |||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  11301030 gggtcttacaaacttcttatataacaggtcctccaactgtttcttcaactcagccaactc 11300971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 328
Target Start/End: Original strand, 19614907 - 19615154
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| | || ||||||||| | |||||||||||  || ||||| || ||||| ||||| |  ||||    
T  19614907 atctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaattctcggaagcggatatctgttct 19615006  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || || |||||||| || || || |  || ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  19615007 ttatcgtaactttattcaactgacggtagtcaatgcataacctcatgctaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacact 19615106  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     ||||| | ||||| ||| || || || || |||||||| ||||||||    
T  19615107 tggtcttacaaacttcttgtcgagtaagtcctccaactgtttcttcaa 19615154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14284363 - 14284132
Alignment:
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    |||||||| | || ||||| ||| | |||||||||||| ||  ||||| | ||||| |||||||  ||||| ||||  || ||||||||||| || ||||    
T  14284363 ttactaaaaatctttgcacaaaccaactgatccatcaagtcgccaatcttcggaagcggatacctgttctttatcgcaactttgttcaactgacggtaat 14284264  T
Q  211 cca--cacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaac 308  Q
    | |  ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||     
T  14284263 ctatacacacaatctcatgctaccatccttcttctttaccaacaacacaagcgctccccacggtgagacactcggtcttacaaacttcttatcaagtaaa 14284164  T
Q  309 tcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| |||||||    
T  14284163 tcttctaactgtttcttcagttcagccaactc 14284132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 81 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26116607 - 26116360
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || | ||  |||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||  ||||    
T  26116607 atctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactgaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttct 26116508  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||| || | ||  | |||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  26116507 tgatcgtaactttgttcaactgacggtgatatatacacaatctcatactaccatccttcttcttgaccaacaanaccggtgctccccaaggtgaaacact 26116408  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     ||||| | ||||| ||| || | ||  || |||||||| ||||||||    
T  26116407 gggtcttacaaacttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaa 26116360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23503889 - 23503742
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||    
T  23503889 taatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctatt 23503790  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcat 226  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||| || |  |||||||||||    
T  23503789 cttaattgtaactttgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcat 23503742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 12799446 - 12799313
Alignment:
Q  195 ttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaact 294  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| | ||| |    
T  12799446 ttcaactgacggtaatctatacataacctaatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaatt 12799347  T
Q  295 gcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     ||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  12799346 tcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 12799313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 39090 - 38926
Alignment:
Q  176 attcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaa 275  Q
    ||||||||| || || || |||||||| || ||||||||||| | |||||| || ||||| ||||| ||||| |  ||||| || || ||||| |||||     
T  39090 attcttaatagtgactttattcaactgacggtaatccacacatagcctcatactgccatccttctttttaacgagtaacacaggtgctccccaaggtgag 38991  T
Q  276 acactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||| || || |||||||  ||||| |  |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38990 acactaggcctgataaactttttctctaataactcttctaactgtttctttaattcacccaactc 38926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 328
Target Start/End: Original strand, 21754746 - 21754891
Alignment:
Q  183 atcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcg 282  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  21754746 atcgtaaccttattcaactgacggtaatctatgcacaatctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgg 21754845  T
Q  283 gtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    |||| | ||| | ||| || | ||  ||||||||||| ||||||||    
T  21754846 gtcttacaaatttcttatccaacaggtcttccaactgtttcttcaa 21754891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 93 - 181
Target Start/End: Original strand, 19149453 - 19149541
Alignment:
Q  93 cctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattctt 181  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||    |||||| |||| | ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19149453 cctgacctcaaatcaattttactaaacatacgtgcacccactaaccgatccattaaatcgtcaattcttggaagtggatacctattctt 19149541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 93 - 181
Target Start/End: Original strand, 20748852 - 20748940
Alignment:
Q  93 cctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattctt 181  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||    |||||| |||| | ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20748852 cctgacctcaaatcaattttactaaacatacgtgcacccactaaccgatccattaaatcgtcaattcttggaagtggatacctattctt 20748940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 39251 - 39148
Alignment:
Q  15 gaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttac 114  Q
    ||||||||||| || ||||| |  |||| ||| ||||| ||  |||||||||||| ||| ||||  |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  39251 gaatactcataatgaccataacgggttctgaaggcagtcttcaatatatcttccgacttcactcgtatctgatggtaccctgacctcaaatcaattttac 39152  T
Q  115 taaa 118  Q
    ||||    
T  39151 taaa 39148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14150300 - 14150227
Alignment:
Q  255 actggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  14150300 actggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctcaagcaaatcttctaattgtttcttcaa 14150227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 58)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16380618 - 16380289
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16380618 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 16380519  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16380518 ttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgtcgataat 16380419  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16380418 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 16380319  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16380318 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 16380289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 23998284 - 23998613
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23998284 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 23998383  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23998384 ttgctaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 23998483  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23998484 ccatacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 23998583  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23998584 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 23998613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1647059 - 1646730
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1647059 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 1646960  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1646959 ttactaaacacctcagcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 1646860  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1646859 ccacacacaacctcatgcttccatccttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacacttggtctaataaactgcttctcaagcaactc 1646760  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1646759 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 1646730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16648214 - 16647885
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16648214 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttctgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 16648115  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16648114 ttactaaacacctttgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 16648015  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16648014 ccatacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 16647915  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16647914 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 16647885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23025991 - 23025662
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23025991 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcgagacgtagttttggatatatcttccgccttcactctaatctgatgatatcttgacctcaaatcaatc 23025892  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23025891 ttactaaacacctccacaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagcggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 23025792  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||    
T  23025791 ccacacaaaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacatcactggagcatcccacggagaaacactcggcctgataaactatttctcaagcaactc 23025692  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23025691 ttctaactgcttcttcaattcacccaactc 23025662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 16 - 340
Target Start/End: Original strand, 16100056 - 16100380
Alignment:
Q  16 aatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16100056 aatactcatagtgtccatacctcgttcgtaacgatgttttggatatatcttccgccttcactataatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttact 16100155  T
Q  116 aaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16100156 aaacacctctgcaccaactagttgatccatcaaatcatcaatccttggtagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccaca 16100255  T
Q  216 cacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttcca 315  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||||| |||||||| |    
T  16100256 cgcaacctcatggtttcatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggagaaacactcggcctgataaactgttactcaagtaactcttcta 16100355  T
Q  316 actgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    |||| |||||| | |||||||||||    
T  16100356 actgcttcttctactcacccaactc 16100380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 14130505 - 14130834
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14130505 cacataatactcatagtatccatacctcgttcgaaacgcggttttggatatatcttccgccttcactctaatctgatgatatcttgacctcaaatcaatc 14130604  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14130605 ttgctaaacacttccgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatttttaatcgtcactttgttcaactgccgataat 14130704  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  14130705 ccacaaacaacctcatgcttcaatcattcttcttaaccgacaacacttgagcaccccacggagaaacactcggtctaataatctgtttctcaagcaactc 14130804  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14130805 ttctaactggttctttaattcacccaactc 14130834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Original strand, 16573975 - 16574243
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16573975 atatcttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattc 16574074  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||  | ||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  16574075 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataattaatacatagcctcatactaccatctttcttcttgactaacaaaaccgg 16574174  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16574175 cgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 16574243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16621405 - 16621137
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16621405 atatcttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattc 16621306  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||  | ||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  16621305 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataattaatacatagcctcatactaccatctttcttcttgactaacaaaaccgg 16621206  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16621205 cgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 16621137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 30679184 - 30678936
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   || ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  30679184 taatctgatgatagcctgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgtacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtagatacctatt 30679085  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||||| |||    
T  30679084 ctttattgtcactttgttcaactgccggtaatctatacacaaccttatgctaccatctttcttcttaactaacaac-ccggcgctccccaaggtgagaca 30678986  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  30678985 ctcggtcttataaacttcttatcaagcaaatcttccaactgctttttcaa 30678936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24293978 - 24293710
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  24293978 atatcttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattc 24293879  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||  |||||||| | ||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||| |  ||    
T  24293878 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactatcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaatcgg 24293779  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24293778 cgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 24293710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 79 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18963265 - 18963004
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  18963265 taatctggtgatagcccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatacatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctatt 18963166  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||  ||||||||    
T  18963165 ctttatcgtcactttattcaactgtcgataatcaatacataacctcatgctaccatctttcttcttaaccaacaacaccggctctccccaacgtgaaaca 18963066  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    |||||||| | ||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  18963065 ctcggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactc 18963004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 2872999 - 2872731
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  2872999 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacccgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 2872900  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  2872899 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccgg 2872800  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  2872799 tgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 2872731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Original strand, 27189540 - 27189789
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  27189540 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 27189639  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| |||||||||    
T  27189640 cttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaaca 27189739  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||||| ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  27189740 cttggtctaacaaacttcttttcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 27189789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27259700 - 27259451
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  27259700 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 27259601  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| |||||||||    
T  27259600 cttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaaca 27259501  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||||| ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  27259500 cttggtctaacaaacttcttttcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 27259451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28261381 - 28261125
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || | |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  28261381 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 28261282  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || || |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  28261281 acctattcttgatagttactttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 28261182  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| || |||||||| | ||||||    
T  28261181 tgaaacacttggtctaacaaacttcttttcaagcaagtcctccaactgttccttcaa 28261125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 28284535 - 28284791
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || | |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  28284535 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 28284634  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || || |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  28284635 acctattcttgatagttactttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 28284734  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| || |||||||| | ||||||    
T  28284735 tgaaacacttggtctaacaaacttcttttcaagcaagtcctccaactgttccttcaa 28284791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28340130 - 28339874
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || | |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  28340130 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 28340031  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || || |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  28340030 acctattcttgatagttactttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 28339931  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| || |||||||| | ||||||    
T  28339930 tgaaacacttggtctaacaaacttcttttcaagcaagtcctccaactgttccttcaa 28339874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 60 - 332
Target Start/End: Original strand, 25114637 - 25114909
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||  | |||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  25114637 atatcttcaacctttactttaatctgatgataacctggccccaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 25114736  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| || ||||| | ||| | |||||| || |||||||||||||| |||| ||| || ||    
T  25114737 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgtcggtaatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccgg 25114836  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25114837 cgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattca 25114909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18183544 - 18183295
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||   |||||| |||| ||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||| |||    
T  18183544 taatctggtgataaccggacctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatgcatcaagtcatcaattctcggaagtggatacctatt 18183445  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||  |||||||| | ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  18183444 ctttatcgttaccttattcaactatcgataatcaatacacaatgtcatgctaccatctttcttcttaactaacaataccagagctccccacggtgaaaca 18183345  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||| ||||||| ||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  18183344 cttggtcttataaacttcttatcaagtaaatcttctaactgtttcttcaa 18183295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 19866784 - 19867040
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19866784 tttactttaatctcgtgataacctgatcttaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 19866883  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || || ||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||    
T  19866884 acctattcttgatagttactttgttcaactgacgataatcgatacataatctcatactaccatctttcttcttcactaacaaaaccggcgctccccaagg 19866983  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  19866984 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaa 19867040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 21755030 - 21755285
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||   |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21755030 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacaaatgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggat 21755129  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || || ||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||    
T  21755130 acctattcttgatagttac-ttgttcaactgacgataatcgatacataatctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaagg 21755228  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21755229 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaa 21755285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 81 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 10467024 - 10466773
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||  ||||    
T  10467024 atctgatggtaaccagacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacctgttct 10466925  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | |  || || ||||||||||| || ||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  10466924 ttactgtaactttgttcaactgacggtaatcaatgcacaacctcatgctaccatccttcttcttaactaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacact 10466825  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
     ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  10466824 tggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattca 10466773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 22435966 - 22436222
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22435966 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacatgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 22436065  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| ||| || || || || ||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||    
T  22436066 acctattattgatagttactttgtttaactgacgataatcgatacataatctcatactaccatctttcttcttcactaacaaaaccggcgctccccaagg 22436165  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  22436166 tgaaacacttggtctgacaaacttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaa 22436222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22828539 - 22828283
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22828539 tttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 22828440  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||| |||| ||| |  || |  ||||| ||    
T  22828439 acctattcttgatagttaccttattcaactgtcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagcaaaatcggcgttccccaagg 22828340  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22828339 tgaaacacttggtctaacaaatttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 22828283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 25608045 - 25607789
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||   |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25608045 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacacatgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggat 25607946  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || |||||||||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || || | ||| ||    
T  25607945 acctattctttatagtcaccttgttcaattgtcgataatcaatacacaaccttatgctaccatctttcttcttcactaacaaaacaggtgctctccaagg 25607846  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     |||||||| ||||||| ||||| ||| ||||| || ||||| || || ||||||||    
T  25607845 cgaaacacttggtctaacaaacttcttttcaagtaaatcttctaattgtttcttcaa 25607789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16961659 - 16961410
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |  ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  16961659 taatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaactttcgcaccgactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctatt 16961560  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || |||||||||||||  ||||| || | |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| || || || ||||| |||||||||    
T  16961559 cttgatagttaccttgttcaactaacgatagtcaatacacaatctcaggctaccatctttcttcttaactagcaaaacaggcgctccccaaggtgaaaca 16961460  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||||| ||| | |||||| ||||  ||||| || || ||||||||    
T  16961459 cttggtctaacaaatttcttctcgagcagatcttctaattgtttcttcaa 16961410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5837415 - 5837147
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5837415 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacaaaagcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 5837316  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||| |||||||| | ||| || |||||    |||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  5837315 tcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactgacgataatcgatacataatctcataaaaccatctttcttctttactagcaaaactgg 5837216  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| || |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  5837215 cgctccccaaggcgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaa 5837147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27564017 - 27563761
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27564017 tttactttaatttggtgataacctgatcttaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 27563918  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || || ||||||||||| ||||| || | |||||| ||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| ||    
T  27563917 acctattcttgatagtaactttgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcctgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaagg 27563818  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  27563817 tgaaacacttggtctaacaaatttcttctcaagcaattcttctaactatttcttcaa 27563761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16925873 - 16925607
Alignment:
Q  21 tcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaaca 120  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||| || || ||  | ||||||||  | || ||| ||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |    
T  16925873 tcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctacatatcttcatctttcactttaatctggtgataaccttacctcaaatcaatcttgctaaaaa 16925774  T
Q  121 cctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaa 220  Q
    | | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || | |||| |||||| |||||| || || |||||||||||||| ||||| || | || |||    
T  16925773 cttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg-aagtagatacctattcttgatagttaccttgttcaactgacgatagtcaatacgcaa 16925675  T
Q  221 cctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaa 288  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  16925674 tctcatgcttccatctttcttcttaactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaa 16925607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22760694 - 22760398
Alignment:
Q  17 atactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttacta 116  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||| ||| || || |||   ||||||||  | |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  22760694 atactcataatgtccataacgcgttctgaaagctgtcttgtgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctg 22760595  T
Q  117 aacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacac 216  Q
    |  ||   |||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || || || |||||||||||  ||||||| | ||    
T  22760594 acaacacgtgcacccactaactaatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctttattgttacattgttcaactgttgataatcaatac 22760495  T
Q  217 acaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttc 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| || ||||||||  |||||| |||||  |||||||| || |||||    
T  22760494 acaacctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaacgggcgctccccaaggcgaaacacttagtctaacaaactttttctcaagtaaatcttc 22760398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18406121 - 18405887
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||| ||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||    
T  18406121 taatctggtgatgacccgatctcaaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaggtggatacctatt 18406022  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||| |||    
T  18406021 ctttattgttaccttgttcaactgtcgataatcaatacacaacctcatgctaccatccttcttcttcactaacaaaaccggcgctccccaaggtgataca 18405922  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttc 313  Q
    || ||||||| |||||  |||||||| || |||||    
T  18405921 cttggtctaacaaactttttctcaagtaaatcttc 18405887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Original strand, 25769948 - 25770197
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| || || || ||    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  ||    
T  25769948 taatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaatacacgagcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggatacctgtt 25770047  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || |||||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||    
T  25770048 ctttatcgtcactttattcaactgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccacggtgaaaca 25770147  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    |||||||| | ||| | ||| ||||| |  || |||||||| ||||||||    
T  25770148 ctcggtcttacaaatttcttatcaagtacatcatccaactgcttcttcaa 25770197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 332
Target Start/End: Original strand, 19437108 - 19437359
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||    
T  19437108 atctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctctgcacccaccaactgatccatcaagtcataaatcctcggaagtggatacctgttct 19437207  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | || || || || |||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||  | || || ||||| || |||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  19437208 ttattgtaactttattcaactgacgataatcaatgcacgacctcatgctatcgtcctttttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgagacact 19437307  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
     ||| | | |||||  || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19437308 tggttttacaaacttattatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattca 19437359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21568166 - 21567907
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||||||  |  ||||||||||| || |||||||| || || |||||||  ||||    
T  21568166 atctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaatctttgcaccaaacaattgatccatcaagtcgtcaatcctcggcagcggatacctgttct 21568067  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | |||||||| ||||||||||  || || || |  ||||| |||||||| ||||| |||||||  || ||||| || || || ||||||||||| |||||    
T  21568066 ttatcgtcactttgttcaactaacggtagtctatgcacaatctcatgctaccatccttcttctctaccaacaatacaggcgctccccacggtgagacact 21567967  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    |||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21567966 cggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagccaactc 21567907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14378093 - 14377840
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| |||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||  ||    
T  14378093 taatttgatggtaacctgatctcaattcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccaacaagtcataaatcctaggaagtggatacctgtt 14377994  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || || |||||||  |||||||  |  ||||||||||| || || || |||||||| || |||||||| || || ||||||||||| |||    
T  14377993 ctttattgtaactttattcaactaacgataataaatgcacaacctcatactaccgtccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgagaca 14377894  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  14377893 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattca 14377840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14379643 - 14379390
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| |||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||  ||    
T  14379643 taatttgatggtaacctgatctcaattcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccaacaagtcataaatcctaggaagtggatacctgtt 14379544  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || || |||||||  |||||||  |  ||||||||||| || || || |||||||| || |||||||| || || ||||||||||| |||    
T  14379543 ctttattgtaactttattcaactaacgataataaatgcacaacctcatactaccgtccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgagaca 14379444  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  14379443 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattca 14379390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14643718 - 14643497
Alignment:
Q  25 agtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctc 124  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| ||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| ||    
T  14643718 agtgtccatatctagttcggaatgcagtcttggaaatatcctccgtcttcactcttatccggtgatatcatgatcttaaaccaatcttactgaacacttc 14643619  T
Q  125 tgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctc 224  Q
     ||| |||| | |||||||||||| || |||||||| || || | ||| ||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  14643618 cgcatcaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcctcgggagagcataacgattcttaattgtcaccatattcaactgtcgataatccacacacaacgtc 14643519  T
Q  225 atgcttccatctttcttcttaa 246  Q
    || ||  |||| ||||||||||    
T  14643518 atactaacatccttcttcttaa 14643497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 23085955 - 23085699
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| |||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||   |||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||| | ||    
T  23085955 tttactttaatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaattcttggaagggaat 23085856  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| ||||| || || |||||||| |||||| | |  || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||    
T  23085855 acctattctttatcgttactttattcaactgtcgataaccaatgcataacctcatacttccatctttcttcttgactaacaaaaccggcgctccccaagg 23085756  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| | ||| || || ||||||||    
T  23085755 tgaaacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaaatattctaattgtttcttcaa 23085699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 328
Target Start/End: Original strand, 28311819 - 28311983
Alignment:
Q  164 aagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagca 263  Q
    ||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || ||     
T  28311819 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgct 28311918  T
Q  264 ccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28311919 ccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttctaactgtttcttcaa 28311983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 340
Target Start/End: Original strand, 15461460 - 15461701
Alignment:
Q  99 ctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttca 198  Q
    ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| || | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| || || || |||||||    
T  15461460 ctcaagtcaatcttgctaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaaatcatcaatccgcggaagtggatatctattcttgattgtaactttgttca 15461559  T
Q  199 actgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgctt 298  Q
    |||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| | |||||  ||    
T  15461560 actgccgatagtcaatgcacaacctcatacttccatctttcttcttcaccaataacacgggcgctccccacggcgaaacacttggtctcacaaacttttt 15461659  T
Q  299 ctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
     |||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||||||    
T  15461660 atcaagcaagtcctccaactgtttctttaactcagccaactc 15461701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20634122 - 20633953
Alignment:
Q  74 tactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatac 173  Q
    |||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || || | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20634122 tactttaatctggtgataaccagatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatac 20634023  T
Q  174 cgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttct 243  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  20634022 ctattctttattgtcaccttgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatcttacttct 20633953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 81 - 332
Target Start/End: Original strand, 18796796 - 18797047
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| | || ||||||||| | |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||  ||||    
T  18796796 atctgatggtagcctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcctcggaagcggatacctgttct 18796895  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || || |||||||  ||||| || |  || | |||||| || | ||| |||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  18796896 ttatcgtaactttattcaactaacgatagtcaatgcatagcctcatactactatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacact 18796995  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    |||||| |  |||| ||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  18796996 cggtcttacgaacttcttatcaagcaagtcttccaattgtttcttcaattca 18797047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 337
Target Start/End: Original strand, 23080556 - 23080785
Alignment:
Q  108 atcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgat 207  Q
    ||||| ||||||||   |||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| | |||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  23080556 atcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtgaatatctattctttatcgttactttattcaactgtcgat 23080655  T
Q  208 aatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaa 307  Q
    |||| |  ||||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||| ||  | || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||  || ||||||||    
T  23080656 aatcaatgcacaatctcatactaccatctttcttcttaaccagcaatacatgcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaactttttatcaagcaa 23080755  T
Q  308 ctcttccaactgattcttcaattcacccaa 337  Q
     ||||| ||||| |||||||| ||| ||||    
T  23080756 atcttctaactgtttcttcaactcagccaa 23080785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 286
Target Start/End: Original strand, 21473695 - 21473911
Alignment:
Q  70 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 169  Q
    |||| ||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||  | |||||    ||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||| |    
T  21473695 ccttcactttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgttgaacacacgagcacccactaactgattcattaaatcatcaattctaggaagtcg 21473794  T
Q  170 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac 269  Q
    ||||   ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||    
T  21473795 atacatgttctttatcgtcactttattcaactgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccac 21473894  T
Q  270 ggtgaaacactcggtct 286  Q
    |||||||||||||||||    
T  21473895 ggtgaaacactcggtct 21473911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 328
Target Start/End: Original strand, 24366518 - 24366765
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || | ||  |||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||  ||||    
T  24366518 atctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactgaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttct 24366617  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  24366618 tgatcgtaactttgttcaactgacggtaatctatacacaatctcatactaccatccttcttcttgaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacact 24366717  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     ||||| | ||||| ||| || | ||  || |||||||| ||||||||    
T  24366718 aggtcttacaaacttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaa 24366765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24516585 - 24516342
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  24516585 taatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgtt 24516486  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || || |||||||| ||||| ||       |  ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| ||| | |||    
T  24516485 ctttattgtaactttattcaactgacgatagtc------aatgctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggcgctccccaaggttagaca 24516392  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  24516391 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 24516342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 19455128 - 19455380
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| ||   |||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| ||| |||||| ||  ||    
T  19455128 taatctgatggtaacctgacctcaagtaaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcgga-gtggattcctgtt 19455226  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    | | ||||| || ||||||||||| ||||| || |  || ||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || || || || |||||||||    
T  19455227 cgttatcgtaactttgttcaactgacgatagtcaatgcataacctcatagtaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctcctcaaggtgaaaca 19455326  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||| | ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  19455327 cttggtcttacaaaattcttatcaagcaagtcctccaaatgtttcttcaattca 19455380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8761929 - 8761680
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || || |  ||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||   ||    
T  8761929 taatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaaaactttcgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacttgtt 8761830  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || ||  | ||||||||||| ||||| || | |||||||||||| || ||||  |||||||| || ||||| || || || ||||| || || |||    
T  8761829 ctttattgtacctttgttcaactgacgatagtcaatacacaacctcatactaccattcttcttctttaccaacaataccggcgctccccaaggcgagaca 8761730  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||| | ||||| ||| ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  8761729 cttggtcttacaaacttcttatcaagtaagtcctccaactgtttcttcaa 8761680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 34643758 - 34643523
Alignment:
Q  84 tgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaa 183  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| | ||  |||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| |  ||||| |    
T  34643758 tgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatcttggcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctcggaagaggatatctgttcttta 34643659  T
Q  184 tcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcgg 283  Q
    |||| || || |||||||| || || || | |||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
T  34643658 tcgtaactttattcaactgacggtagtcaatacacaacctcatactaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgagacacttgg 34643559  T
Q  284 tctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactg 319  Q
    ||| | ||||| ||| || || || || ||||||||    
T  34643558 tcttacaaacttcttgtcgagtaaatcctccaactg 34643523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23496281 - 23496160
Alignment:
Q  167 tggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccc 266  Q
    |||||||| |||||| || || |||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| || |||    
T  23496281 tggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttctttactatcaaaactggcgctccc 23496182  T
Q  267 cacggtgaaacactcggtctaa 288  Q
     | ||||||||||| |||||||    
T  23496181 taaggtgaaacacttggtctaa 23496160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 28280990 - 28280870
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||    
T  28280990 taatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacctaccagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctatt 28280891  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaa 199  Q
    |||||| || || ||||||||    
T  28280890 cttaattgtaactttgttcaa 28280870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 25763402 - 25763303
Alignment:
Q  82 tctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattctt 181  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  25763402 tctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 25763303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 269
Target Start/End: Original strand, 19881404 - 19881591
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| | || ||||||||| | |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |    
T  19881404 atctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcctcggaagcggatatctatt-t 19881502  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac 269  Q
    | ||||| || || |||||||| || || || |  || |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  19881503 ttatcgtaactttattcaactgacggtagtcaatgcataacctcatactaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccac 19881591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13751932 - 13751868
Alignment:
Q  264 ccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  13751932 ccccaaggtgaaacactcggtcttacaaacttcttatcaagtaaatcttccaactgtttcttcaa 13751868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 340
Target Start/End: Original strand, 20135263 - 20135339
Alignment:
Q  264 ccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  20135263 ccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatctagtaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactc 20135339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22197606 - 22197530
Alignment:
Q  264 ccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  22197606 ccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatctagtaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactc 22197530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 112
Target Start/End: Original strand, 22444364 - 22444404
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatctt 112  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22444364 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatctt 22444404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 46)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 23507770 - 23508099
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507770 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 23507869  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23507870 ttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgtcgataat 23507969  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507970 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 23508069  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23508070 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 23508099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 24583296 - 24583625
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24583296 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttttgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 24583395  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24583396 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 24583495  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24583496 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgtttctcaagcaactc 24583595  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24583596 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 24583625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21935470 - 21935141
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21935470 cacagaatactcatagtgtccataccttgttcggaacgcagttttggatatatcttctgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 21935371  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21935370 ttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgtcgataat 21935271  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21935270 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 21935171  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21935170 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 21935141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 29474296 - 29474038
Alignment:
Q  70 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 169  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29474296 cctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgg 29474197  T
Q  170 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac 269  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||     
T  29474196 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaactggcgctccccaa 29474097  T
Q  270 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29474096 ggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 29474038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14997972 - 14997704
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  14997972 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 14997873  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  14997872 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccgg 14997773  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14997772 cgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 14997704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 16358667 - 16358923
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16358667 tttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 16358766  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  16358767 acctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 16358866  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16358867 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 16358923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Original strand, 22136821 - 22137089
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  22136821 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 22136920  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  22136921 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccgg 22137020  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22137021 cgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctcaagcaaatcttccaactgtttcttcaa 22137089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27683633 - 27683365
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  27683633 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 27683534  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  27683533 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccgg 27683434  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27683433 cgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 27683365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 34568659 - 34568915
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  34568659 tttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 34568758  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  34568759 acctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 34568858  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34568859 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 34568915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 40710945 - 40711201
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  40710945 tttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 40711044  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  40711045 acctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 40711144  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  40711145 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 40711201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 41773007 - 41773263
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  41773007 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 41773106  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || ||||||||||| || |||||||| |  || || ||||| ||    
T  41773107 acctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttttttactaacaaaatcggcgctccccaagg 41773206  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41773207 tgaaacactcggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 41773263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 70 - 328
Target Start/End: Original strand, 27520569 - 27520827
Alignment:
Q  70 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 169  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27520569 cctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgg 27520668  T
Q  170 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac 269  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| || || || |||||     
T  27520669 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaa 27520768  T
Q  270 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  27520769 ggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttctaactgtttcttcaa 27520827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 19772125 - 19772381
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19772125 tttactttaatctggtgatatcctcacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagttgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 19772224  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||| ||  | || ||||| ||    
T  19772225 acctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccagcgctccccaagg 19772324  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19772325 tgaaacactcggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 19772381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Original strand, 27612507 - 27612775
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  27612507 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctggtccatcaaatcatcaattc 27612606  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| ||| || || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| |  ||    
T  27612607 tcggaagtggatacctatttttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaatcgg 27612706  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27612707 cgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 27612775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22331120 - 22330852
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  22331120 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 22331021  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||  ||| || ||||||||||| || |||||||| || ||    
T  22331020 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaaatgccgataatcaatacataactgcatactaccatctttcttgtttactaacaaaaccgg 22330921  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  22330920 cgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 22330852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27666711 - 27666455
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||   |||||| |||| |||||||||||| |||||||| || | ||||||||    
T  27666711 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcgaaagtggat 27666612  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  27666611 acctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 27666512  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27666511 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 27666455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37289729 - 37289461
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  37289729 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 37289630  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || || || |||||||| |||||||| | ||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  37289629 tcggaagtggatacctattcttgatagttactttattcaactgtcgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccgg 37289530  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  37289529 tgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 37289461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Original strand, 18781286 - 18781535
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||| |||    
T  18781286 taatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaggtggatacctatt 18781385  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || |||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  18781386 cttgatagttaccttgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggtgctccccaaggtgaaaca 18781485  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  18781486 cttggtctaacaaatttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaa 18781535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 340
Target Start/End: Original strand, 23473399 - 23473660
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  23473399 taatttgatgataaaccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctatt 23473498  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || |||||||| || |||||||| |  || || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || || || |||||||||||||||    
T  23473499 ctttatcgttactttgttcaattgtcgataatcaatgcataatctcatgctaccatctttcttcttaactagcaataccggcgctccccacggtgaaaca 23473598  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    || ||||| | ||||| ||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  23473599 cttggtcttacaaacttcttatcaagtaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactc 23473660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 22350084 - 22350340
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  22350084 tttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaaatggat 22350183  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||| | |||||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  22350184 acctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 22350283  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22350284 tgaaacacttggtctaacaaatttcttctcaagcaaatcttccaactgtttcttcaa 22350340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17267548 - 17267295
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||    
T  17267548 taatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctatt 17267449  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||| || |  ||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||||  || || |||||||||||||||    
T  17267448 cttaattgtaactttgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttcttcaccaacaacataggcgctccccacggtgaaaca 17267349  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17267348 ctgggtctaacaaacttcttatcaagcaaatcttccaactgtttcttcaattca 17267295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 26736941 - 26736681
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||    
T  26736941 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaatacatgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacatatt 26736842  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| || |||||||||| ||| |||| ||| || || || ||||| |||||||||    
T  26736841 ctttatcgttactttgttcaactgtcgataatcaatacacaatctcatactaccatctttctccttcactagcaataccggcgctccccaaggtgaaaca 26736742  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaact 339  Q
    ||  |||| | |||||  || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||    
T  26736741 cttagtcttacaaactttttatcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaact 26736681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20250561 - 20250240
Alignment:
Q  16 aatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttact 115  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||   || ||||  || || |||||||||||| |||||||||||||| |    
T  20250561 aatactcataatgtccataccttgttcgaaacgcagtcttagaaatatcttccattttcactcatatttggtgatatcctgatgtcaaatcaatcttaat 20250462  T
Q  116 aaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccaca 215  Q
    |||||||||  ||||||| | ||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||    |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||     
T  20250461 aaacacctcaacaccaaccaactgatccattagatcatctatccttggaagaggatatttgttcttaatggttaccttgttcaattgtcgataatccacg 20250362  T
Q  216 cacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttcca 315  Q
    ||| | ||||| || ||||| |||||||| || | ||||   |  || ||||||| |||||||| | | || ||||||||| |||| | |||||||||||    
T  20250361 cacgagctcatactaccatcattcttcttcaccagcaacgtcgatgctccccacgatgaaacacgcagcctgataaactgcctctctaacaactcttcca 20250262  T
Q  316 actgattcttcaattcacccaa 337  Q
    |||| |||||||| || |||||    
T  20250261 actgcttcttcaactcgcccaa 20250240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Original strand, 25428598 - 25428833
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  25428598 tttactttaatctggtgataacccgatctcagatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 25428697  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  || || ||||| ||    
T  25428698 acctattctttattgttaccttgttcaactgtcgataatcaatacacaacctcatgctaccatccttcttcttcactaacaaaatcggcgctccccaagg 25428797  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaa 307  Q
    ||||||||| |||||||  ||||  |||||||||||    
T  25428798 tgaaacacttggtctaaccaactttttctcaagcaa 25428833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20466313 - 20466052
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  20466313 taatctggtgataacctgatcttaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccagtaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacttatt 20466214  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || |  || |||||||| |||||||  |  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||||||||    
T  20466213 ctttattgttagtttattcaactgtcgataataaatgcataacctcatgctaccatctttcttattaactaacaatactggcgctcgccaaggtgaaaca 20466114  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    |||||| | | ||||| ||| ||||| || || || ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  20466113 ctcggttttacaaacttcttatcaagtaaatcgtctaactgtttcttcaactcagccaactc 20466052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22234134 - 22233881
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||||||   |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  22234134 taatctgatggtaacctaacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacctatt 22234035  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || |||| | | || |  || | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  22234034 ctttatcgtcactttattcagcggacggttgtctatacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccatggtgaaaca 22233935  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    |||||||| | ||| | ||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  22233934 ctcggtcttacaaatttcttatcaagtaaatcctccaactgtttcttcaattca 22233881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21562218 - 21561990
Alignment:
Q  99 ctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttca 198  Q
    |||||||||||||| || |||||   ||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||    
T  21562218 ctcaaatcaatcttgctgaacacgcgtgcacca-ctaactgatccattaaaccatcaattctcggaagtggatacctattctttatcgtcactttattca 21562120  T
Q  199 actgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgctt 298  Q
    |||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||| ||||||| ||| ||||| | ||||| |||    
T  21562119 actgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatctttcttcttaaccaacaacacctgcgctccccaaggtgaaatacttggtcttacaaacttctt 21562020  T
Q  299 ctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  21562019 atcaagtaaatcctccaactgtttcttcaa 21561990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21337508 - 21337259
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||   |||||| | || |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  21337508 taatctggtgataacccgacctcaaatcaatcttgctaaacacacatgcacccaataactgatccatcaagtcatcaattcttggaattggatacctatt 21337409  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || ||| ||||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||| |||||||||||| | ||| |  || || ||||| |||||||||    
T  21337408 ctttatcgttactttggtcaactgtcgataatcaatgcacaatctcatgctaccatttttcttcttaaccagcaatataggcgctccccaaggtgaaaca 21337309  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     | ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||| || || ||||||||    
T  21337308 tttggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcttctaattgtttcttcaa 21337259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28893175 - 28892910
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||| ||| |||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| || | ||| |||||||| ||||||||||    
T  28893175 atatcttcatccttcactttaatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttgctaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatcc 28893076  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
      ||||||||||| | |||||| || || || ||||||||||| ||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||    
T  28893075 gcggaagtggatatctattctttattgtaactttgttcaactgacgatagtcaatgcacaacctcatacttccatctttcttcttcaccaataacacggg 28892976  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattctt 325  Q
     || |||||||| |||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  28892975 cgctccccacggcgaaacactgggtcttacaaacttcttgtcaagcaagtcctccaactgtttctt 28892910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28922001 - 28921736
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||| ||| |||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| || | ||| |||||||| ||||||||||    
T  28922001 atatcttcatccttcactttaatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttgctaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatcc 28921902  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
      ||||||||||| | |||||| || || || ||||||||||| ||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||    
T  28921901 gcggaagtggatatctattctttattgtaactttgttcaactgacgatagtcaatgcacaacctcatacttccatctttcttcttcaccaataacacggg 28921802  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattctt 325  Q
     || |||||||| |||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  28921801 cgctccccacggcgaaacactgggtcttacaaacttcttgtcaagcaagtcctccaactgtttctt 28921736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 325
Target Start/End: Original strand, 20778058 - 20778313
Alignment:
Q  70 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 169  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || |  ||||| || | ||| |||||||| || |||||||  || |||||    
T  20778058 ccttcactttaatttgatggtaacccgacctcaagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcgtcaatccgcgggagtgg 20778157  T
Q  170 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac 269  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||||    
T  20778158 atacctattctttattgtaaccttgttcaactgacgatagtcaatgcacaacctcatacttccatctttcttctttaccaataacacgggcgctccccac 20778257  T
Q  270 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattctt 325  Q
    || |||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  20778258 ggcgaaacactaggtctcacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttctt 20778313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 325
Target Start/End: Original strand, 20823627 - 20823853
Alignment:
Q  99 ctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttca 198  Q
    ||||| |||||||||||||| || |  ||||| || | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| || || || |||||||    
T  20823627 ctcaagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaaatcatcaatccgcggaagtggatatctattctttattgtaactttgttca 20823726  T
Q  199 actgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgctt 298  Q
    |||| ||||| || |  ||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| | ||||| |||    
T  20823727 actgacgatagtcaatgcacaacctcatactcccatctttctttttcaccaacaacacgggtgctccccacggcgaaacactaggtctcacaaacttctt 20823826  T
Q  299 ctcaagcaactcttccaactgattctt 325  Q
     |||||||| || |||||||| |||||    
T  20823827 atcaagcaagtcctccaactgtttctt 20823853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 37541593 - 37541334
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| | ||  |||||||| |  ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||  ||||    
T  37541593 atctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaattgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttct 37541494  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||| | |||||  ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  37541493 tgatcgtaactttgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttcttgaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacact 37541394  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
     ||||| | ||||| ||| || | ||  || |||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  37541393 gggtcttacaaacttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagccaactc 37541334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 81 - 286
Target Start/End: Original strand, 25850231 - 25850436
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |  |  |||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| |  ||||    
T  25850231 atctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaaaattttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctcggaagcggatatctgttct 25850330  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  25850331 ttatcgtaaccttgttcaactgacggtaatctatacacaatctcatactaccatccttcttcttgaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacact 25850430  T
Q  281 cggtct 286  Q
     |||||    
T  25850431 gggtct 25850436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24796609 - 24796350
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || | ||  |||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||  ||||    
T  24796609 atctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactgaaaatcttggcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttct 24796510  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||| |  || |  ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  24796509 tgatcgtaactttgttcaactgacggtaatctatgcaaagtctcatactaccatccttcttctttactaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacact 24796410  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
     ||||| | ||||| ||| || | ||  || |||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  24796409 gggtcttacaaacttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagccaactc 24796350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Original strand, 22464086 - 22464354
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||| ||| |||| ||||| || || || ||||  |||||||||||||| || |  ||||| || | ||| |||||||| ||||||||||    
T  22464086 atatcttcatccttcactttaatttgatggtaacccgacctcaggtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatcc 22464185  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
      ||||||||||| | |||||| || || || ||||||||||| ||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||    
T  22464186 gcggaagtggatatctattctttattgtaactttgttcaactgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatccttcttcttcaccaataacacagg 22464285  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || |||||||| |||||| | ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  22464286 cgctccccacggcgaaacattgggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 22464354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 332
Target Start/End: Original strand, 22504835 - 22505086
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || | |   |||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||||  ||||    
T  22504835 atctgatgataaccagacctcaagtcaatcttactgaaaatcctagcaccaaccaactgattcatcaagtcatcaattctatgaagcggatacctgttct 22504934  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||    
T  22504935 ttatcgtaaccttgttcaactgacggtaatcaatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacactgatgctccccaaggtgaaacact 22505034  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
     ||||| | ||| | ||| || | ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  22505035 aggtcttacaaatttcttatccaacaggtcttccaactgtttcttcaattca 22505086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14885203 - 14884944
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || | ||  |||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||  ||||    
T  14885203 atctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactgaaaatcttggcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttct 14885104  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||| |  || |  ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  14885103 tgatcgtaactttgttcaactgacggtaatctatgcaaagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacact 14885004  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
     ||||| | ||||| ||| || |  |  || |||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  14885003 gggtcttacaaacttcttatctaataggtcctccaactgtttcttcaactcagccaactc 14884944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 258
Target Start/End: Original strand, 20801562 - 20801742
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  20801562 tttactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatgaaatcatcaattctcggaagaggat 20801661  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactg 258  Q
    |||      || || | || ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20801662 acc------tattcattactttgttcaactgacgataatcgatacataacctcatactaccatctttcttctttactaacaaaactg 20801742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21677046 - 21676799
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| | || ||||||||| | |||||||||||  || ||||| || ||||| ||||| | |||||    
T  21677046 atctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaattctcggaagcggatatctattct 21676947  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | | ||| || || |||||||| || || || |  || |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  21676946 ttaccgtaactttattcaactgacggtagtcaatgcataacctcatactaccatctttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtggaacact 21676847  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     ||||| | ||||| ||| || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  21676846 tggtcttacaaacttcttgtcgagcaagtcctctaactgtttcttcaa 21676799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 137 - 328
Target Start/End: Original strand, 21409364 - 21409555
Alignment:
Q  137 ctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatct 236  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| | |||||| || ||||| || ||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||    
T  21409364 ctgatccatcaaatcgtcgatcctcggaggtggatatctattctttattgtcactttattcaacttccggtaatctatacataacctcatgctaccatct 21409463  T
Q  237 ttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||||| || ||||| |   | ||||| || || ||||||||||| | |||||  || |||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  21409464 ttcttcttaaccaataacaccgacactccccaaggcgatacactcggtcttacaaactttttatcaagcaaatcttctaactgctttttcaa 21409555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 332
Target Start/End: Original strand, 20344438 - 20344689
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| | ||  |||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||  ||||    
T  20344438 atctgatgataaccagacctcaagtcaatcttgctaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttct 20344537  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||| |  || |  ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||  | ||||| |||||||||||    
T  20344538 ttatcgtgactttgttcaactgacggtaatctatgcatagtctcatactaccatccttcttcttaaccaataacaccggtcctccccaaggtgaaacact 20344637  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
     ||||| | ||| | ||| || | ||  || |||||||| ||||||||||||    
T  20344638 gggtcttacaaatttcttatctaacaggtcctccaactgcttcttcaattca 20344689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21984239 - 21984142
Alignment:
Q  231 ccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| | || || ||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21984239 ccatctttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtcttacaatcttcttatcaagtaaatcctccaattgtttcttcaa 21984142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 265 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23078933 - 23078866
Alignment:
Q  265 cccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  23078933 cccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattca 23078866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 289
Target Start/End: Original strand, 21625475 - 21625532
Alignment:
Q  232 catctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaat 289  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  21625475 catctttcttcttcaccaacaacactggtgctccccaagatgaaacacttggtctaat 21625532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23564278 - 23564181
Alignment:
Q  183 atcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| |  || ||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || ||  |||| |||||||||||    
T  23564278 atcgtaaccttattcaactgtcggtaatcgatgcataacctcatggtaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgcttcccatggtgaaacact 23564181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13965691 - 13965362
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13965691 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatctaccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcgaatcaatc 13965592  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13965591 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 13965492  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13965491 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 13965392  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13965391 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 13965362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 30139607 - 30139936
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30139607 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 30139706  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30139707 ttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgtcgataat 30139806  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30139807 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 30139906  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30139907 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 30139936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 30149158 - 30149487
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30149158 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 30149257  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30149258 ttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgtcgataat 30149357  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30149358 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 30149457  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30149458 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 30149487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 15611904 - 15612233
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15611904 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 15612003  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15612004 ttactaaacacctcagcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 15612103  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15612104 ccacacacaacctcatgcttccatccttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacacttggtctaataaactgcttctcaagcaactc 15612203  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15612204 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 15612233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8272738 - 8272409
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8272738 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttctgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 8272639  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8272638 ttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactaccgataat 8272539  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8272538 ccacacacaacctcatgcttccatatttcttcttaactagcaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 8272439  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8272438 ttccaactgattcttcatttcacccaactc 8272409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15948805 - 15948480
Alignment:
Q  15 gaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15948805 gaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcggttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctaatctcaaatcaatcttac 15948706  T
Q  115 taaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccac 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15948705 taaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgttactttgttcaactgccgataatccac 15948606  T
Q  215 acacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttcc 314  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  15948605 acacaacctcatacttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggcgaaacactcggcctaataaactgtttctcaagcaactcttct 15948506  T
Q  315 aactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15948505 aactgtttcttcaattcacccaactc 15948480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6151192 - 6150863
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6151192 cacaaaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacacagttttggatatatcttctgccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 6151093  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6151092 ttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatatcgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 6150993  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  6150992 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggagaaacactcggcctgataaactgtttctcaagcaactc 6150893  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6150892 ttctaactgtttctttaattcacccaactc 6150863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 312
Target Start/End: Original strand, 25768119 - 25768420
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25768119 cacagaatactcatagtgtccataccttgtttggaacgcggttttggatatatcatctgctttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatg 25768218  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25768219 ttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttagaagcggatatcgattcttaatcgtcactttgttcaactgccgataat 25768318  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  25768319 ccacacacaatctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccatggagaaacactcggcctgataaactgcttctcaagcaactc 25768418  T
Q  311 tt 312  Q
    ||    
T  25768419 tt 25768420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 60 - 340
Target Start/End: Original strand, 17200484 - 17200764
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17200484 atatcttccgccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagttgatccatcaaatcatcaatcc 17200583  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  17200584 tcgggagcggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgacgataatccacacacaatcttatgcttcaatctttcttcttaaccaacaacactgg 17200683  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17200684 agcaccccacggagaaacactcggcctgataaactgcttctcaagcaattcttctaactgcttcttcaattcacccaactc 17200764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 20060344 - 20060076
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  20060344 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattc 20060245  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  20060244 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccgg 20060145  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20060144 cgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 20060076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Original strand, 12888549 - 12888817
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  12888549 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattc 12888648  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || ||    
T  12888649 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccgg 12888748  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12888749 cgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 12888817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 13254542 - 13254798
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13254542 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagttgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 13254641  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||    
T  13254642 acctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaagg 13254741  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13254742 tgaaacactcggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 13254798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15587682 - 15587414
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15587682 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattc 15587583  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  15587582 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccgg 15587483  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15587482 cgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 15587414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Original strand, 10007440 - 10007708
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  10007440 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattc 10007539  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  10007540 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccgg 10007639  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  10007640 cgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaaccgtttcttcaa 10007708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Original strand, 10908050 - 10908318
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  10908050 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattc 10908149  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || ||    
T  10908150 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactatcaaaaccgg 10908249  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10908250 cgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 10908318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15346535 - 15346267
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15346535 atatcttcatcctttactttaagctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattc 15346436  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  15346435 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccgg 15346336  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  15346335 cgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttctaactgtttcttcaa 15346267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 16637625 - 16637881
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16637625 tttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 16637724  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  16637725 acctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 16637824  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16637825 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 16637881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5108889 - 5108633
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5108889 tttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 5108790  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||    
T  5108789 acctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaagg 5108690  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5108689 tgaaacactcggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 5108633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 48427299 - 48427555
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  48427299 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 48427398  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  48427399 acctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 48427498  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  48427499 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttctaactgtttcttcaa 48427555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5423208 - 5422952
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5423208 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 5423109  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  5423108 acctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 5423009  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  5423008 tgaaacacttggtctaacaaacttcttttcaagcaagtcctccaattgtttcttcaa 5422952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Original strand, 3687783 - 3688051
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   ||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  3687783 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgctcccactagctgatccatcaaatcatcaattc 3687882  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || ||    
T  3687883 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccgg 3687982  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||| || ||||| || |||||||| ||||||||    
T  3687983 cgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttttcgagcaagtcctccaactgtttcttcaa 3688051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 81 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 11959427 - 11959176
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  11959427 atctgatggtaaccagacctcaaatcaatcttactgaacacctttgcactcactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacctattct 11959328  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||| || || || |  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  11959327 ttatcgtaactttgttcaactgacggtagtcaatgcacaacctcatgctaccatccttcttcttaactaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacact 11959228  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
     ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  11959227 tggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattca 11959176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 125 - 328
Target Start/End: Original strand, 43164580 - 43164783
Alignment:
Q  125 tgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctc 224  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  43164580 tgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgc 43164679  T
Q  225 atgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattct 324  Q
    || || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  43164680 atactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttct 43164779  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  43164780 tcaa 43164783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16805218 - 16804969
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  16805218 taatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 16805119  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || ||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  16805118 cttgatagttactttgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaaca 16805019  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||||| ||| | ||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  16805018 cttggtctaacaaatttcttttcaagcaaatcttctaactgtttcttcaa 16804969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 24185042 - 24185298
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24185042 tttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 24185141  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || || ||||| ||    
T  24185142 acctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagtaaaaccggtgctccccaagg 24185241  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24185242 tgaaacacttggtctaacaaatttcttctcaagcaaatcttccaactgtttcttcaa 24185298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 125 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15714281 - 15714078
Alignment:
Q  125 tgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctc 224  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |    
T  15714281 tgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacataaccgc 15714182  T
Q  225 atgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattct 324  Q
    || || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15714181 atactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttct 15714082  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  15714081 tcaa 15714078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 6602588 - 6602844
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6602588 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 6602687  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || |||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  6602688 acctattcttgatagttaccttgctcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 6602787  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| || |||| ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  6602788 tgaaacacttggcctaacaaacttcttttcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 6602844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16754979 - 16754723
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16754979 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 16754880  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| ||  | || ||||| ||    
T  16754879 acctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaacctgcgctccccaagg 16754780  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||| || ||||| || |||||||| ||||||||    
T  16754779 tgaaacacttggtctaacaaacttcttttctagcaagtcctccaactgtttcttcaa 16754723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 81 - 332
Target Start/End: Original strand, 24189175 - 24189426
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  24189175 atctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttct 24189274  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || || |||||||| ||||| || |  || | |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| |    
T  24189275 ttatcgtaactttattcaactgacgatagtcaatgcatagcctcatactaccatcctttttctttactaacaacacaggcgctccccacggtgaaacatt 24189374  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    |||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24189375 cggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcttccaactgattcttcaattca 24189426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 13943893 - 13944146
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||    
T  13943893 taatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctatt 13943992  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||| || |  ||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||||| || || |||||||||||||||    
T  13943993 cttaattgtaactttgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttcttcaccaacaacacaggtgctccccacggtgaaaca 13944092  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||||| ||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  13944093 ctgggtctaacaaacttcttatcaagtaaatcttccaactgtttcttcaattca 13944146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16826541 - 16826292
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  16826541 taatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcgtcaatcctcggaagtggatacctatt 16826442  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || |||| ||| || ||||| | ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||    
T  16826441 ctttatcgtcactttattcagctgacggtaatctatacacaacttcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccacggtgaaaca 16826342  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||| | | ||| | ||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  16826341 cttggtttcacaaatttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 16826292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 53383296 - 53383040
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  53383296 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 53383197  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || || ||||||||| |||||||||| | |||||||| |||  | |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  53383196 acctattcttgatagttactttgttcaacggccgataatcaatacacaaccgcatagtaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 53383097  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  53383096 tgaaacacttggtctaacaaacttcttttcaagcaaatcctccaactgtttcttcaa 53383040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11888625 - 11888376
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11888625 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacctatt 11888526  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
     || ||||| || ||  ||||||| |||||||| |  || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |  ||  | ||||| |||||||||    
T  11888525 gtttatcgttactttaatcaactgtcgataatcaatgcataacctcatgctaccgtctttcttcttaactaacaaaatcggcactccccaaggtgaaaca 11888426  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||| || || ||||||||    
T  11888425 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcttctaattgtttcttcaa 11888376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15400780 - 15400539
Alignment:
Q  87 tgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcg 186  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |    
T  15400780 tgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatag 15400681  T
Q  187 tcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtct 286  Q
    | |||||||||||||| |||||||| | ||| | |||||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  15400680 ttaccttgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtct 15400581  T
Q  287 aataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15400580 aacaaatttcttctcgagcaaatcttccaactgtttcttcaa 15400539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 8745630 - 8745397
Alignment:
Q  99 ctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttca 198  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| || || |||||||    
T  8745630 ctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttca 8745531  T
Q  199 actgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgctt 298  Q
    | || ||||| || |  ||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| | ||||| |||    
T  8745530 attgacgatagtcaatgcacaacctcatacttccatcctttttcttcaccaacaacacaggtgctccccacggcgaaacactgggtcttacaaacttctt 8745431  T
Q  299 ctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
     ||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  8745430 atcaagtaaatcttccaactgtttcttcaattca 8745397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Original strand, 15357942 - 15358191
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  15357942 taatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 15358041  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||| | |||||| || |||||||||||||| |||| ||| |  || || ||||| ||||||| |    
T  15358042 cttgatagtaaccttgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaatcggcgctccccaaggtgaaata 15358141  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15358142 cttggtctaacaaatttcttctcgagcaaatcttccaactgtttcttcaa 15358191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Original strand, 16694023 - 16694272
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || |  ||||| |||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||  |||    
T  16694023 taatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaagactttcgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacatatt 16694122  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || ||||| |||||||| ||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  16694123 cttgatagttaccttattcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaaca 16694222  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||  |||||| ||| | ||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  16694223 cttagtctaacaaatttcttttcaagcaaatcttctaactgtttcttcaa 16694272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 41179391 - 41179644
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||    
T  41179391 taatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctatt 41179490  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||| || |  ||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||    
T  41179491 cttaattgtaactttgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttcttcaccaacaacacaggtgctccccacggcgaaaca 41179590  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  41179591 ctgggtcttacaaacttcttatcaagtaaatcttccaactgtttcttcaattca 41179644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 81 - 332
Target Start/End: Original strand, 17188245 - 17188496
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||    
T  17188245 atctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccaccaactgatccatcaagtcatccatcctcggaagtggatacctgttct 17188344  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || || |||||||  ||||| || |  || | |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||  || || |||||||||||||||||    
T  17188345 ttatcgtaactttattcaactaacgatagtcaatgcatagcctcatactaccatcctttttctttactaacaacaaaggcgctccccacggtgaaacact 17188444  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    |||||| | ||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17188445 cggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcttctaactgattcttcaattca 17188496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 150 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26791613 - 26791435
Alignment:
Q  150 tcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaacta 249  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| ||||    
T  26791613 tcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttacta 26791514  T
Q  250 acaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    |||| || || || ||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26791513 acaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttgatctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 26791435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 340
Target Start/End: Original strand, 12180213 - 12180474
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||   |||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  12180213 taatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgtt 12180312  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |   | ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  12180313 ctttatcgtaactttgttcaactgacgataatcaatgaataacctcatggtaccatcattcttcttaaccaacaatactggcgctccccacggtgaaaca 12180412  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    |||||||| | ||| | ||| ||||| || || |||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  12180413 ctcggtcttacaaatttcttatcaagtaagtcctccaactatttcttcaactcagccaactc 12180474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15014019 - 15013778
Alignment:
Q  87 tgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcg 186  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||   |||| | |||| || |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||| || |    
T  15014019 tgatagcccgatcttaaatcaatcttactgaacacacgtgcatccactaactaatccatcaaatcgtggatcctcggaagtggatacctattctttattg 15013920  T
Q  187 tcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtct 286  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||| ||||| |||||||||||    
T  15013919 tcactttgttcaactgccggtgatctatacacaacctcatgctaccatctttcttcttaaccaacaacaccagcgctccccaaggtgacacactcggtct 15013820  T
Q  287 aataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     | ||||| ||| |||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  15013819 tacaaacttcttttcaagcaaatcttctaactgctttttcaa 15013778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16379188 - 16378936
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||    
T  16379188 taatttgatggtaacctgacctcaaatcaatcttactaaaaacctttgcacccactaggtggtccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatgcctatt 16379089  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||| || |  |||||||||||||| |  || || ||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||    
T  16379088 cttaattgtaactttgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcatgctactgtcctttttcttcaccaacaacacaggcactccccacggtgaaaca 16378989  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || |||| || ||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  16378988 ctgggtcgaacaaacttcttatcaagcaagtctt-caactgtttcttcaattca 16378936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 44779116 - 44779369
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| | |||    
T  44779116 taatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaattctcggaagcggatatctatt 44779215  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||| || |  ||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||    
T  44779216 cttaattgtaactttgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttcttcaccaacaacacaggtgctccccacggcgaaaca 44779315  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  44779316 ctgggtcttacaaacttcttatcaagtaaatcttccaactgtttcttcaattca 44779369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12358787 - 12358534
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||| || |||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  12358787 taatctgatggtaacctgacctcaagtcattcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgtt 12358688  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || |||| |||||| | |||||| |  || ||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| || || ||||| |||||||||    
T  12358687 ctttattgtaactttgtgcaactgacaataatcaatgcataacctcatgctaccatccttcttcttaaccatcaacaccggcgctccccaaggtgaaaca 12358588  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||| | |  |||||||| ||||||||||||    
T  12358587 cttggtcttacaaacttcttatcaagctagttgtccaactgtttcttcaattca 12358534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14579679 - 14579430
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  14579679 taatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaattgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctatt 14579580  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||  |||||||| |  || |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| || ||||||    
T  14579579 ctttatcgttaccttattcaactatcgataatcaatgcataacctcatactgccatctttcttctttactaacaaaacgggcgctccccaaggcgaaaca 14579480  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||| | |||||  ||||||||||| || || || || ||||||||    
T  14579479 cttggtcttacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaa 14579430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Original strand, 15229453 - 15229721
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||   |||||| |||| |||||| || ||||||||||| |    
T  15229453 atatcttcccccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacgcgtgcacccactaactgatcgattaaatcatcaattc 15229552  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| ||||||||  | |||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  15229553 tcggaagtggatacctattctttatcgtcactatattcagctgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccgg 15229652  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| | ||| | ||| ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  15229653 cgctccccaaggtgaaactctcggtcttacaaatttcttgtcaagtaaatcctccaactgtttcttcaa 15229721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Original strand, 15235321 - 15235589
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||   |||||| |||| |||||| || ||||||||||| |    
T  15235321 atatcttcccccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacgcgtgcacccactaactgatcgattaaatcatcaattc 15235420  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| ||||||||  | |||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  15235421 tcggaagtggatacctattctttatcgtcactatattcagctgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccgg 15235520  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| | ||| | ||| ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  15235521 cgctccccaaggtgaaactctcggtcttacaaatttcttgtcaagtaaatcctccaactgtttcttcaa 15235589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 332
Target Start/End: Original strand, 31940777 - 31941025
Alignment:
Q  84 tgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaa 183  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||| |||| ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||  ||||| |    
T  31940777 tgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactggtccatcaagtcgtcaatcctcggaagtggatacctgttcttta 31940876  T
Q  184 tcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcgg 283  Q
    |||| || ||||||||||| ||||| || |  |||| ||||||||| || || |||||||| || ||||| || || || ||||||| |||||||||  |    
T  31940877 tcgtaactttgttcaactgacgatagtcaatgcacagcctcatgctaccgtccttcttctttaccaacaataccggcgctccccacgatgaaacactgtg 31940976  T
Q  284 tctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    ||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31940977 tcttacaaacttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattca 31941025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 328
Target Start/End: Original strand, 17491648 - 17491958
Alignment:
Q  18 tactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaa 117  Q
    |||||||| |||||||| | ||||| ||| || |||||    ||||||||  | || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |    
T  17491648 tactcataatgtccataacgcgttctgaaagctgttttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgctga 17491747  T
Q  118 acacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacaca 217  Q
    | ||   |||||| |||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || ||||| || | |||    
T  17491748 aaacacttgcacccactaactgatccatcaaataatcaattctcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaaatgtcgatagtcaataca 17491847  T
Q  218 caacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaac 317  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| || |||| ||| ||||||| |||||  |||||||| || ||||| ||     
T  17491848 caatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaaccggcgctccccaaggcgaaaaacttggtctaacaaactttttctcaagtaaatcttctaat 17491947  T
Q  318 tgattcttcaa 328  Q
    || ||||||||    
T  17491948 tgtttcttcaa 17491958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10418324 - 10418059
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||| ||| |||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || |  ||||| || | ||| |||||||||||||||||||    
T  10418324 atatcttcgtccttcactttaatttgatggtaacccgacctcaagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaaatcatcaatcc 10418225  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
      ||||||||||| | |||||| || || || ||||||||||| ||||| || |  ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||    
T  10418224 gcggaagtggatatctattctttattgtaactttgttcaactgacgatagtcaatgcacaacctcatacttccatctttctttttcaccaataacacggg 10418125  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattctt 325  Q
     || |||||||| |||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  10418124 tgctccccacggcgaaacactaggtctcacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttctt 10418059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31693440 - 31693192
Alignment:
Q  84 tgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaa 183  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||| |||| ||| |||||||| || |||| ||| |||||||||||||  ||||| |    
T  31693440 tgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactggtccatcaagtcgtcaaccctcggaagtggatacctgttcttta 31693341  T
Q  184 tcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcgg 283  Q
    |||| || ||||||||||| ||||| || |  |||| ||||||||| || || |||||||| || ||| | |  || || ||||||||||||||||| ||    
T  31693340 tcgtaactttgttcaactgacgatagtcaatgcacagcctcatgctaccgtccttcttctttaccaactatatcggcgctccccacggtgaaacactggg 31693241  T
Q  284 tctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    ||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  31693240 tcttacaaacttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcgtcaattca 31693192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 81 - 340
Target Start/End: Original strand, 47125815 - 47126074
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| | ||  |||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||  ||||    
T  47125815 atctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaaaatcttggcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttct 47125914  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||| | |||||  ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  47125915 tgatcgtaactttgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttactaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacact 47126014  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
     ||||| | |||||  || || | ||  || |||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  47126015 gggtcttacaaactttttatctaacagttcctccaactgtttcttcaactcagccaactc 47126074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14291792 - 14291546
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || || || ||||||||||| || || |||||    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||  ||    
T  14291792 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaattttgctgaacacacaagcacccactaactgatccattaaatcgtcaattctcagaagtggatacctgtt 14291693  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || |||| ||| || ||||| | || |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||    
T  14291692 ctttatcgtcactttattcagctgacggtaatctatactcaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgcttcccacggtgaaaca 14291593  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattctt 325  Q
    |||||||| | ||| | ||| ||||| || ||||||||||| |||||    
T  14291592 ctcggtcttacaaatttcttatcaagtaaatcttccaactgtttctt 14291546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 249
Target Start/End: Original strand, 15261497 - 15261659
Alignment:
Q  87 tgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcg 186  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||    
T  15261497 tgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaattcatcaattctcggaagtggatatctattctttatcg 15261596  T
Q  187 tcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaacta 249  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  15261597 tcactttgtttaactgtcgataatcaatgcacaatctcatactaccatctttcttcttaacta 15261659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18132606 - 18132353
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||| |||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||  ||    
T  18132606 taatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaatcctcggaagtggatacctgtt 18132507  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    |||||| || || || ||||| |  |||||  | |  || |||||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| |||    
T  18132506 cttaattgtaactttattcaattaacgatagacaatgcataacctcatactaccatccttcttctttaccaacaatacaggcgctccccaaggtgagaca 18132407  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  18132406 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtgttccaactgtttcttcaattca 18132353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 11950166 - 11949915
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||| || |  ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||  ||||    
T  11950166 atctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacccttgcacccaccaaatgatccatcaagtcgtcaatcctcggaagtggatacctgttct 11950067  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | || || || || |||||||| ||||| || |  || |||||||| || ||||| |||||||| || ||||| || |  || ||||| ||||| |||||    
T  11950066 ttattgtaactttattcaactgacgatagtcaatgcataacctcatactaccatccttcttctttaccaacaataccgacgctccccaaggtgagacact 11949967  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
     ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11949966 tggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattca 11949915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12844289 - 12844113
Alignment:
Q  164 aagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagca 263  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || ||     
T  12844289 aagtggatacctattctttatcgttactttgttcaactgtcgatagtcaatgcacaacctcatactaccatctttcttcttcactaacaaaatcggcgct 12844190  T
Q  264 ccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||||    
T  12844189 ccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttatcaagcaaatcttctaattgtttcttcaactcagccaactc 12844113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Original strand, 18437045 - 18437233
Alignment:
Q  125 tgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctc 224  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||  |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||| |||    
T  18437045 tgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgggagtggatacatattctttattgtcactttgttaaactgtcgataatcaatacacaatctc 18437144  T
Q  225 atgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttc 313  Q
    || || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| || |||||||| ||||||| |||||  |||||||| || |||||    
T  18437145 atcctaccatctttcttcttcactagcaaaaccggcgctccccaaggcgaaacacttggtctaacaaactttttctcaagtaaatcttc 18437233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 328
Target Start/End: Original strand, 10407839 - 10408086
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || | ||  |||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||  ||||    
T  10407839 atctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactgaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttct 10407938  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||| | |||||  ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  10407939 tgatcgtaactttgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttcttgaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacact 10408038  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     ||||| | ||||| ||| || | ||  || |||||||| ||||||||    
T  10408039 gggtcttacaaacttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaa 10408086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13970378 - 13970131
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| | ||  |||||||| | |||||||||||  || |||||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  13970378 atctgatggtaacctgatctcaagtcaattttactaaaaatcttcgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaatcctcggaagcggatatctgttct 13970279  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || || ||||| || || || || | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  13970278 ttatcgtaactttattcaattgacggtagtcaatacataacctcatgctaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacact 13970179  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     ||||| | ||||| ||| || || || || |||||||| ||||||||    
T  13970178 tggtcttacaaacttcttgtcgagtaagtcctccaactgtttcttcaa 13970131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 328
Target Start/End: Original strand, 14088544 - 14088791
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| | || ||||||||| | |||||||||||  || ||||| || ||||| ||||| |  ||||    
T  14088544 atctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaattctcggaagcggatatctgttct 14088643  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || || |||||||| || || || |  || ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  14088644 ttatcgtaactttattcaactgacggtagtcaatgcataacctcatgctaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacact 14088743  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     ||||| | ||||| ||| || || || || |||||||| ||||||||    
T  14088744 tggtcttacaaacttcttgtcgagtaagtcctccaactgtttcttcaa 14088791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12510723 - 12510536
Alignment:
Q  99 ctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttca 198  Q
    ||||| ||||||||||| || | ||  |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||    
T  12510723 ctcaagtcaatcttactgaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaaatcgtcaattctcggaagcggatacctgttctttatcgtaacctttttca 12510624  T
Q  199 actgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtct 286  Q
    |||| || ||||| |  ||||  ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  12510623 actgacggtaatctatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtct 12510536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 328
Target Start/End: Original strand, 12272254 - 12272456
Alignment:
Q  126 gcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctca 225  Q
    ||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||| | | |||||| |  || |||||||    
T  12272254 gcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaaccttgttaaacggacaataatcaatgcataacctca 12272353  T
Q  226 tgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattctt 325  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| |  || || ||||| | ||||||||| ||||| | ||| | ||| |||||||| ||  ||||||| |||||    
T  12272354 tgctaccatccttcttcttaaccaacaatatcggcgctccccaagttgaaacactgggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcccccaactgtttctt 12272453  T
Q  326 caa 328  Q
    |||    
T  12272454 caa 12272456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13318762 - 13318513
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || | |||||| || | |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |  ||    
T  13318762 taatttgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaacttttgcacccaccaactgatccatcaaatcatcaatcctcgggagtggatatctgtt 13318663  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || || ||||||||  |||| || |  ||||| ||||  || ||||| |||||||| || |||||||| || |  ||||| |||||||||    
T  13318662 ctttattgtaactttattcaactgatgatagtcaatgcacaatctcacactaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgttccccatggtgaaaca 13318563  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||| | ||| | ||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  13318562 ctgggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 13318513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 340
Target Start/End: Original strand, 28756189 - 28756449
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| | ||   ||||||| |  ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||  ||||    
T  28756189 atctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaaaatcttaacaccaaccaattgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttct 28756288  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagc-accccacggtgaaacac 279  Q
    | ||||| || |||||||| || || ||||| | |||||  ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || ||  ||||| ||||||||||    
T  28756289 tgatcgtaactttgttcaattgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctcccccaaggtgaaacac 28756388  T
Q  280 tcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    | ||||| | |||||  || || | ||  || |||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  28756389 tgggtcttacaaactttttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagccaactc 28756449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 271 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3296453 - 3296384
Alignment:
Q  271 gtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  3296453 gtgaaacactcagtctgataaactgcttctcaagcaagtcttccaactgcttcttcaactcacacaactc 3296384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14874777 - 14874676
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14874777 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 14874678  T
Q  172 ac 173  Q
    ||    
T  14874677 ac 14874676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16834750 - 16834560
Alignment:
Q  99 ctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttca 198  Q
    ||||| ||||||||||| || | || ||||||||| | |||||||||||| |||||     | ||||| |||||||  ||||| || || || |||||||    
T  16834750 ctcaagtcaatcttactgaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcatc-----tcggaagcggatacctgttctttattgtaactttgttca 16834656  T
Q  199 actgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaact 294  Q
    |||| || ||||| | ||||||||||| ||| ||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| ||||||||||| |||| || |||||    
T  16834655 actgacggtaatctatacacaacctcaggctaccatccttcttctttaccaataacacaggcgctccccatggtgaaacactgggtcgaacaaact 16834560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16327920 - 16327743
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || || ||  |||| |||||||||||||| | ||  |||||||| | |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||  ||    
T  16327920 taatctgatggtaaccagacatcaagtcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctcgaaagtggatacctgtt 16327821  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacac 256  Q
    ||| ||| | ||||| |||||||| || ||||| |  ||||  ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16327820 ctttatcatgaccttattcaactgacggtaatctatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacac 16327743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 332
Target Start/End: Original strand, 17493667 - 17493768
Alignment:
Q  231 ccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaatt 330  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |  || || ||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  17493667 ccatccttcttcttaaccaacaatatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaatt 17493766  T
Q  331 ca 332  Q
    ||    
T  17493767 ca 17493768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14874677 - 14874604
Alignment:
Q  215 acacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaa 288  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  14874677 acacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagaaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaa 14874604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 328
Target Start/End: Original strand, 12071018 - 12071082
Alignment:
Q  264 ccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  12071018 ccccaaggtgaaacacttggcctaacaaacttcttctcaaacaagtcttccaactgtttcttcaa 12071082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 332
Target Start/End: Original strand, 14575040 - 14575108
Alignment:
Q  264 ccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| | ||| | ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  14575040 ccccaaggtgaaacacttggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattca 14575108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 15723224 - 15723172
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatctt 112  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15723224 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatctt 15723172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 43)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20829564 - 20829235
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20829564 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 20829465  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20829464 ttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgtcgataat 20829365  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20829364 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 20829265  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20829264 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 20829235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 20927241 - 20927570
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20927241 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcggttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcatatcaatc 20927340  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20927341 ttgctaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctttgaagtggatatcgattcttaatcgtcactttgttcaactgccgataat 20927440  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20927441 ccacacacaacctcatgcttccatcattcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggagatacacttcgtctaataaactgtttctcaagcaactc 20927540  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20927541 ttctaactgtttcttcaattcacccaactc 20927570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 20527240 - 20527569
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20527240 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaatgcggttttggatttatcttctgccttcactctaatcagatgatatcctgatctcaaatcaatc 20527339  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||||| || | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20527340 ttactaaacacctttgtatcttctagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcactttgttcaactgccgataat 20527439  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20527440 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggagaaacactcggcctgataaactgcttctcaagcaactc 20527539  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  20527540 ttctaactgcttctgcaattcacccaactc 20527569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 41216028 - 41215699
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41216028 cacagaatactcatagtttccatacctcgttcggaacgcggttttggatatatcttacaccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 41215929  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41215928 ttactaaacacttccgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagcggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 41215829  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||| ||| |||||    
T  41215828 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactagagcaccccacggagaaacactcggcctgataaactacttcttaagtaactc 41215729  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||| ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  41215728 ttctaactgtttcttcaactcagccaactc 41215699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 35930987 - 35930712
Alignment:
Q  21 tcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaaca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35930987 tcatagtgtccatacctcgttcggaacgtggttttggatatatcttccgccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaaca 35930888  T
Q  121 cctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaa 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35930887 cctcagcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaa 35930788  T
Q  221 cctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgct 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  35930787 cctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggcgaaaca-tcggtctaataaactgct 35930712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22133928 - 22133595
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaat--ctgatgatatcctgatctcaaatcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22133928 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcataacgcggtcttggatatatcttccgcctttactctaatatctgatgatatcctgatctcaaatcaa 22133829  T
Q  109 tcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgata 208  Q
    ||||||||||||  || | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133828 tcttactaaacatttcagtaccaaatagctgatccatcagatcatcaacccttggaagcggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgata 22133729  T
Q  209 atccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca--ctcggtctaataaactgcttctcaagca 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||  ||| | || || ||| ||||||||||||    
T  22133728 atccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccacacagagaaacaatctctgcctgatgaaccgcttctcaagca 22133629  T
Q  307 actcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  22133628 actcttccagctgcttcttcagttcacccaactc 22133595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 33389152 - 33388884
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  33389152 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattc 33389053  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  33389052 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccgg 33388953  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33388952 cgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaactttttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 33388884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Original strand, 21832538 - 21832806
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  21832538 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattc 21832637  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| | |||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  21832638 tcggaagtggatacctaatcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccgg 21832737  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21832738 cgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 21832806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 51331604 - 51331347
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  51331604 tttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 51331505  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  51331504 acctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 51331405  T
Q  272 -tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  51331404 ttgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 51331347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 141 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21200996 - 21200800
Alignment:
Q  141 tccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttct 240  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||    
T  21200996 tccatcaaatcatcaatcctcgggagtggatatcgattcttaatcattaccttattcaactgccgataatccatacacaacctcatactaccatccttct 21200897  T
Q  241 tcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaa 337  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21200896 tcttaactaacaacagtggagcacccaatggcgaaacactcggcctgataaaatgcttctcgagcaactcttccaactgtttcttcaactcacccaa 21200800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21233835 - 21233582
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  21233835 taatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 21233736  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || |||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| |  ||||| |||||||||    
T  21233735 cttgatagttaccttgttcaactgacgatagtcaatacacaaactcatgctaccatatttcttcttcactagcaaaactggcgttccccaaggtgaaaca 21233636  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  21233635 cttggtctaacaaatttcttctcaagcaattcttctaactgtttcttcaattca 21233582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Original strand, 21839205 - 21839454
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  21839205 taatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 21839304  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||||    
T  21839305 cttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaaca 21839404  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  21839405 cttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 21839454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16348718 - 16348450
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16348718 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattc 16348619  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || ||    
T  16348618 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccgg 16348519  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||| || ||||| || |||||||| ||||||||    
T  16348518 cgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttttcgagcaagtcctccaactgtttcttcaa 16348450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 19108616 - 19108872
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19108616 tttacttttatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 19108715  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  19108716 acctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 19108815  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19108816 tgaaacacttggtctaacaaatttcttctcaagcaaatcttccaactgtttcttcaa 19108872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21743656 - 21743403
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||    
T  21743656 taatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcgtcaattctcggaagtggatacctatt 21743557  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || |||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||    
T  21743556 ctttatcgtcactttattcagctgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccacggtgaaaca 21743457  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    |||||||| | ||| |  || |||||||| || |||||||  ||||||||||||    
T  21743456 ctcggtcttacaaatttattatcaagcaagtcctccaactatttcttcaattca 21743403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17043119 - 17042870
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||    
T  17043119 taatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggtagtggatacctatt 17043020  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || ||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  17043019 cttgatagttactttgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaaca 17042920  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||||| ||| | ||| |||||||| || || ||||| ||||||||    
T  17042919 cttggtctaacaaatttcttttcaagcaaatcctctaactgtttcttcaa 17042870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 430227 - 429995
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || | |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  430227 tttactttaatatggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatccttggaagttgat 430128  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  430127 acctattctttattgtcaccttgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 430028  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaag 304  Q
     |||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  430027 cgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaag 429995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 125 - 328
Target Start/End: Original strand, 21751241 - 21751444
Alignment:
Q  125 tgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctc 224  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||| |||||||  | ||||||||||    
T  21751241 tgcacctactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggatacctattctttattgttactttgttcaactgtcgataataaatacacaacctc 21751340  T
Q  225 atgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattct 324  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||  |||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  21751341 atgctaccatccttcttctttactaacaacacaggcgctccccaaagtgaaacacttggtctaacaaactttttctcaagcaaatctttcaactgtttct 21751440  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  21751441 tcaa 21751444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22503400 - 22503144
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22503400 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactatctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 22503301  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || ||  | |||||||  |||||||| | |||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  22503300 acctattcttgatagttactctattcaacttacgataatcaatacacaatctcatgctaccatttttcttcttcactagcaaaaccggcgctccccaggg 22503201  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  22503200 tgaaacactgggtcttacaaacttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaa 22503144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 50618502 - 50618241
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||||   |||||| |||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||    
T  50618502 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgttaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacctatt 50618403  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||  ||  |||||||||| |||| | || | |||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||  | || |||||||||||||||    
T  50618402 ctttatcaacattttgttcaactaccgacagtcaatacacaatctcatactaccatctttcttctttactaacaaaacgtgcgctccccacggtgaaaca 50618303  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  50618302 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactc 50618241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22360355 - 22360099
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| |||||  | || || | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22360355 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgttgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggat 22360256  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    | | |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  22360255 atctattctttattgtcaccttgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatttttcttcttcactagcaaaaccggcgctccccaagg 22360156  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||  |||||||| || ||||| || || ||||||||    
T  22360155 tgaaacacttggtttaacaaactttttctcaagtaaatcttctaattgtttcttcaa 22360099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 328
Target Start/End: Original strand, 16378358 - 16378599
Alignment:
Q  87 tgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcg 186  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16378358 tgataacctgatctcaaatcaatcttgttgaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctattctttatcg 16378457  T
Q  187 tcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtct 286  Q
    | || || |||||||| || ||||| | ||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||| |  || || ||||| || |||||||| |||||    
T  16378458 ttactttattcaactgtcggtaatcaatacacaatttcatactaccatctttctttttaactaacaatatcggcgctccccaaggagaaacacttggtct 16378557  T
Q  287 aataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     | ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||    
T  16378558 cacaaacttcttatcaagcaaatcctctaactgtttcttcaa 16378599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 20854883 - 20854615
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||| ||| |||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || |  ||||| || | ||| |||||||| ||||||||||    
T  20854883 atatcttcatccttcactttaatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatcc 20854784  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
      ||||||||||| | |||||| || || || ||||||||||| ||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||    
T  20854783 gcggaagtggatatctattctttattgtaactttgttcaactgacgatagtcaatgcacaacctcatacttccatctttcttcttcaccaataacacggg 20854684  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || |||||||| |||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  20854683 tgctccccacggcgaaacactgggtctcacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 20854615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 330
Target Start/End: Original strand, 41310812 - 41311063
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || || || ||||||||| | |||| ||||||   |||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||    
T  41310812 taatctgatggtaaccggacctcaaatcagttttacgaaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcgtcaattctcggaagtggatacctatt 41310911  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || ||||||||  | ||||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||  ||||||||||| ||    
T  41310912 ctttatcgtcactttattcaactgatggtaatctatacacaaactcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgcttcccacggtgaatca 41311011  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaatt 330  Q
    |||||||| | ||| | ||| ||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  41311012 ctcggtcttacaaatttcttatcaagtaaatcctccaactgtttcttcaatt 41311063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Original strand, 20296667 - 20296916
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| | ||  |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||  ||    
T  20296667 taatctgatggtaaccagacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaaatcctcaattctcggaagcggatacctgtt 20296766  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||    
T  20296767 ctttatcgtaaccttgttcaactgacggtaatctatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaaca 20296866  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||| | ||| | ||| || | ||  ||||||||||| ||||||||    
T  20296867 ctgggtcttacaaatttcttatccaacaggtcttccaactgtttcttcaa 20296916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 20834004 - 20833755
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| |||||| |||| || |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  ||    
T  20834004 taatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcatactgaaaacctttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatatctgtt 20833905  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || || || ||||| ||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  20833904 ctttattgtaactttattaaactgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatccttcttctttactaacaacaccggcgctccccaaggtgaaaca 20833805  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  20833804 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 20833755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21862477 - 21862228
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||  ||||| || |||||   |||||| || | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||    
T  21862477 taatctggtgataacccgatctcaaatgtatcttgctgaacacacgtgcacccaccaactgatccatcaagtcatctattcttggaagtggatacctatt 21862378  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    |||  |||| || ||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||||    
T  21862377 ctttctcgttactttgttcaactgtcgataatcaatgcacaatctcatgctaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaaca 21862278  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || | ||||| |||||  |||| |||||| || || || || ||||||||    
T  21862277 cttgttctaacaaactttttctaaagcaaatcctctaattgtttcttcaa 21862228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20938167 - 20937917
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||  ||    
T  20938167 taatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaatcctaggaagtggatacctgtt 20938068  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || || |||||||| ||||| || |  || |||||||| || ||||| || ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| |||    
T  20938067 ctttattgtaactttattcaactgacgatagtcaatgcataacctcatactaccatccttattctttaccaacaataccggcgctccccaaggtgagaca 20937968  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaat 329  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||||||    
T  20937967 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcctccaactgtttcttcaat 20937917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 162 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21740057 - 21739887
Alignment:
Q  162 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggag 261  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| || |||| ||| || ||||| | ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  || |    
T  21740057 ggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcagctgacggtaatctatacacaacatcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacatcggcg 21739958  T
Q  262 caccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  21739957 ctccccacggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattca 21739887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19661240 - 19660987
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || || | |||||| |||| ||||||||| || || ||||| || |||||||||||||  ||    
T  19661240 taatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacatttgcacccactaactgatccattaagtcgtcaattctcggaagtggatacctgtt 19661141  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||||| || |  || ||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||  ||    
T  19661140 ctttatcgtaactttattcaactgacgatagtcaatgcataacctcatagtaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgacgca 19661041  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | |||||  || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19661040 cttggtcttacaaactttttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattca 19660987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 20140331 - 20140587
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  20140331 tttactttaatctggtgataacctgaactcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcgattctcggaagtggat 20140430  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | |  || ||| |||| || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||    
T  20140431 acctattctttattgtcactttgttcaactgacgataagcaatgcataacttcatactaccgtctttcttctttaccaacaaaacgggcgctccccaagg 20140530  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||| |||||  ||||||||||| || || || || ||||||||    
T  20140531 cgagacacttggtctaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaa 20140587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24097707 - 24097466
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| || ||||| || ||||||| |||||| |||| ||||||||| || |||||||| || |||||||||||||  ||    
T  24097707 taatctgatggtaacctgacctcaagtcgatcttgctgaacacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaattctcggaagtggatacctgtt 24097608  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || |||||||| || || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||            ||||||||||    
T  24097607 ctttatcgtaactttgttcaattgacggtaatcaatgcacaatctcatgctaccatccttcttcttaactaacaacac------------cggtgaaaca 24097520  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  24097519 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattca 24097466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 328
Target Start/End: Original strand, 48425161 - 48425408
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| | ||  |||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||  ||||    
T  48425161 atctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttct 48425260  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||| | |||||  ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  48425261 tgatcgtaactttgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacact 48425360  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     ||||| | ||||| ||| || | ||  || |||||||| ||||||||    
T  48425361 gggtcttacaaacttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaa 48425408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 328
Target Start/End: Original strand, 52988029 - 52988276
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| | ||  |||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||  ||||    
T  52988029 atctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttct 52988128  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||| | |||||  ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  52988129 tgatcgtaactttgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacact 52988228  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     ||||| | ||||| ||| || | ||  || |||||||| ||||||||    
T  52988229 gggtcttacaaacttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaa 52988276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 70 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 41351775 - 41351523
Alignment:
Q  70 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 169  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||    ||||| |||| |||||||||||| |  ||       ||||||||    
T  41351775 cctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgcgcacccactaactgatccatcaatttctc-------ggaagtgg 41351683  T
Q  170 ataccgatt-cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcacccca 268  Q
    ||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || |||||    
T  41351682 atacctatttcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctcccca 41351583  T
Q  269 cggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||| | | || ||||| || |||||||| ||||||||    
T  41351582 aggtgaaacacttggtctaacaaacttcctttcgagcaagtcctccaactgtttcttcaa 41351523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31538099 - 31537852
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| | ||  |||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| |  ||||    
T  31538099 atctgatgataaccagacctcaaatctatcttactaaatatcttagcaccaaccagttgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatatctgttct 31538000  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||| | |||||  ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  31537999 tgatcgtaactttgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacact 31537900  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     ||||| | ||||| ||| || | ||  || |||||||| ||||||||    
T  31537899 gggtcttacaaacttcttatctaacaggtcctccaactgcttcttcaa 31537852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 328
Target Start/End: Original strand, 37679337 - 37679584
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| | ||  |||||||| |  ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||  ||||    
T  37679337 atctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaatatcttagcaccaaccaattgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttct 37679436  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||| | |||||  ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  37679437 tgatcgtaactttgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttctttttgaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacact 37679536  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     ||||| | ||||| ||| || | ||  || |||||||| ||||||||    
T  37679537 gggtcttacaaacttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaa 37679584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 38910928 - 38910681
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || | ||  |||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| |  ||||    
T  38910928 atctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactgaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatatctgttct 38910829  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||| | |||||  ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  38910828 tgatcgtaactttgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacact 38910729  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     ||||| | ||||| ||| || | ||  || |||||||| ||||||||    
T  38910728 gggtcttacaaacttcttatctaacagatcctccaactgcttcttcaa 38910681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 19856560 - 19856813
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| || || ||||||||||| || |||| |||||| ||||  |||||||| || || ||||| || |||||||||||||  ||    
T  19856560 taatctgatggtaacctgaccttaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaattgatccattaagtcgtcaattctcggaagtggatacctgtt 19856659  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || || ||||||||  |||| || |  || ||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||    
T  19856660 ctttattgtaactttattcaactgatgatagtcaatgcataacctcatagtaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgacaca 19856759  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | |||||  || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  19856760 cttggtcttacaaactttttatcaagtaagtcttccaactgtttcttcaattca 19856813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 332
Target Start/End: Original strand, 21953166 - 21953417
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| | ||  |||||||| | |||||||||||| || ||||| |  ||||| |||||||  ||||    
T  21953166 atctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattccaggaagcggatacctgttct 21953265  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||| |    
T  21953266 ttatcgtaactttgttcaactgacggtaatcaatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacatt 21953365  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
     ||||| | ||| | ||| || | ||  || |||||||| ||||||||||||    
T  21953366 gggtcttacaaatttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaattca 21953417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 24792720 - 24792618
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  24792720 taatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 24792621  T
Q  179 ctt 181  Q
    |||    
T  24792620 ctt 24792618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 21201051 - 21200998
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatc 64  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21201051 cacagaatattcatagtgaccatatctcgttcggaacgcagttttggatatatc 21200998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22016733 - 22016601
Alignment:
Q  195 ttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaact 294  Q
    |||||||| |||||||| |  || ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||  || || ||||| ||||||||||| ||||| | ||| |    
T  22016733 ttcaactgacgataatcaatgcataacctcatgctaccatccttcttctttaccaacaacatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaatt 22016634  T
Q  295 gcttctcaagcaactcttccaactgattcttca 327  Q
     ||| |||||||| || |||||||| |||||||    
T  22016633 tcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttca 22016601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 57)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16875638 - 16875309
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16875638 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttctgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 16875539  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16875538 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccaattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 16875439  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16875438 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccagcaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 16875339  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16875338 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 16875309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21848880 - 21848551
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21848880 cacagaatactcatagtgtccataccttgttcggaacgcagttttggatatatctttcgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 21848781  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21848780 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaaatggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 21848681  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21848680 ccacacataacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactagagcaccccacggcgaaacacttggtctgataaactgcttctcaagcaactc 21848581  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21848580 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 21848551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20650898 - 20650569
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20650898 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgctgttttggatatatcttctgcctttactctaatttgatgatatcctgatctcaaatcaatc 20650799  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20650798 ttactaaacacctctgcaccaactagttgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggataccgattcttaattgtcaccttgttcaactgccgataat 20650699  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  || || ||||||| |||||||||||||||    
T  20650698 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggagaagcacaaggcctgataaacttcttctcaagcaactc 20650599  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  20650598 ttctaactgtttcttcaattcatccaactc 20650569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 16414329 - 16414658
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16414329 cacagaatactcatagtgtccataccttgttcggaatgcggttttggatatatcttctacctttcctctagtatgatgatatcctgatctcaaatcaatc 16414428  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16414429 ttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcactttgttcaactgccgataat 16414528  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16414529 ccacacacatcctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacattggagcaccccacggagaaatactcggtctgataaactgcttctcaagcaattc 16414628  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||| ||||| | ||| ||||||||||||||    
T  16414629 ttctaactgttccttaaattcacccaactc 16414658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23155583 - 23155256
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23155583 cacagaatactca--gtgtccatacctcgttcggaacgcggttttggatatatcttccgccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 23155486  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23155485 ttactaaacacttctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcagaagcggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccaataat 23155386  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||    
T  23155385 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaacaacaacactggagcaccccacggagaaacactcggcctgataaactacttctcaagcaattc 23155286  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  23155285 ttctaactgtttcttgagttcacccaactc 23155256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21195083 - 21194754
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21195083 cacaaaatactcatagtgtccataccttgttcggaacacggttttggatatatcttccgccttcactctattatgatgatatcctgatctgaaatcaatc 21194984  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  21194983 ttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccattaaatcatcaatcctcagaagcggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgtcggtaat 21194884  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  21194883 ccacacacaacctcacgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggagaaacactcggcctgataaactgcttctcaagcaattc 21194784  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21194783 ttctaactgcttcttcaattcacccaactc 21194754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 22436541 - 22436870
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22436541 cacagaatactcatactgtccataccttgttcggaacgcggttttggatatatcttccgctttcactctaatatgatgatatcctgatctcaaatcaatc 22436640  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22436641 ttactaaacacctctgcaccaaccagccgatccatcaaatcatcaatcctcataagcggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 22436740  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||    
T  22436741 ccacacacaacctcatgtttctatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggagaaacactcgccctgataaactacttctcaagcaactc 22436840  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  22436841 ttctaactgcttcttcaattcaccgaactc 22436870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 23902402 - 23902731
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  23902402 cacagaatactcatagtgtccatgcctcgtttggaacgcggttttggatatatcttccacctttactaaaatatgataatatcccgatctcaaatcaatc 23902501  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23902502 ttactgaacacttccgcaccaaccagctgatccattaaatcatcaatcctcagaagcggatactgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 23902601  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23902602 ccacacacaacctcatgctcccatccttcttcttaaccaacaacattggaacaccccacggagaaaaactcagtctaatgaactgcttctcaagcaactc 23902701  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23902702 ttccaactgcttcttcaattcacccaactc 23902731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 86 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24932292 - 24932038
Alignment:
Q  86 atgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatc 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  24932292 atgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccgaccagctgatccatcaaatcatcaatcattggaagtggataccgatttttaatc 24932193  T
Q  186 gtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtc 285  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| | |    
T  24932192 gtcactttgttcaactgccaataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactatagcaccccacggcgaaacactcagcc 24932093  T
Q  286 taataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24932092 tgataacctgcttctcaagcaactcttctaactgtttcttcaattcacccaactc 24932038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17672505 - 17672249
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17672505 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 17672406  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||    
T  17672405 acctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaagg 17672306  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17672305 tgaaacactcggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 17672249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Original strand, 18858864 - 18859132
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  18858864 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 18858963  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || ||||||||| ||||||||||||| | ||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  18858964 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttccactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccgg 18859063  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  18859064 cgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 18859132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22118669 - 22118401
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  22118669 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 22118570  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  22118569 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccgg 22118470  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  22118469 cgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 22118401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22127453 - 22127185
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  22127453 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 22127354  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  22127353 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccgg 22127254  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  22127253 cgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 22127185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 20016747 - 20016489
Alignment:
Q  70 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 169  Q
    |||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20016747 cctttaccttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgg 20016648  T
Q  170 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac 269  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||     
T  20016647 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccgacgctccccaa 20016548  T
Q  270 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20016547 ggtgaaacactcggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 20016489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21165020 - 21164764
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21165020 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaatgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 21164921  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||    
T  21164920 acctattcttgatagttactttgttcaactgacgataatcgatacacaacctcatactaccatctttcttcttcactaacaaaaccggcgctccccaagg 21164821  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21164820 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaa 21164764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 22042126 - 22042382
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || |  ||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22042126 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactttcgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 22042225  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || |||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |     
T  22042226 acctattcttgatagttaccttgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaagt 22042325  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  22042326 tgaaacacttggtctaacaaatttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaa 22042382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 30311619 - 30311370
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || | |||||| |||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  30311619 taatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattatcggaagtggatacctatt 30311520  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || |||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  30311519 cttgatagttaccttgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctatcatctttcttctttactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaaca 30311420  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  30311419 cttggtctaacaaatttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaa 30311370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 20390385 - 20390641
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| |||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||||   || ||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  20390385 tttactttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgaacccactaactgatccataaaatcatcaattctcggaagtggat 20390484  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| ||| || |||||||| || |||||||| || ||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||    
T  20390485 acctattatttatcgtcactttattcaactgacggtaaactatacacaacctcatgctaccatctttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaagg 20390584  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  20390585 tgaaacactcggtcttacaaacttcttgtcaagtaaatcttccaactgtttcttcaa 20390641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 79 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22246908 - 22246650
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||   |||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  22246908 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaagcatcaattcttggaagtggatacccatt 22246809  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || || || ||||| |||||||||    
T  22246808 ctttatcgttaccttattcaattgtcgataatcaatacacaacctcatactaccatctttcttcttaactagcaataccggcgctccccaaggtgaaaca 22246709  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaa 337  Q
    || ||||| | ||||  ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||    
T  22246708 cttggtcttacaaacatcttatcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaa 22246650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21392343 - 21392087
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21392343 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggat 21392244  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||| || ||  | ||||| ||    
T  21392243 acctattctttattgtcaccttgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccttctttcttcttcactagcaaaaccggcactccccaagg 21392144  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||| || || || || ||||||||    
T  21392143 tgaaacactgggtctaacaaactttttctcaagcaagtcctctaattgtttcttcaa 21392087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21781669 - 21781413
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21781669 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggat 21781570  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||| || ||  | ||||| ||    
T  21781569 acctattctttattgtcaccttgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccttctttcttcttcactagcaaaaccggcactccccaagg 21781470  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||| || || || || ||||||||    
T  21781469 tgaaacactgggtctaacaaactttttctcaagcaagtcctctaattgtttcttcaa 21781413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21786837 - 21786581
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21786837 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggat 21786738  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||| || ||  | ||||| ||    
T  21786737 acctattctttattgtcaccttgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccttctttcttcttcactagcaaaaccggcactccccaagg 21786638  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||| || || || || ||||||||    
T  21786637 tgaaacactgggtctaacaaactttttctcaagcaagtcctctaattgtttcttcaa 21786581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Original strand, 15535689 - 15535938
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  15535689 taatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 15535788  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || ||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  15535789 cttgatagttactttgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaaca 15535888  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||||| ||| |  || || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  15535889 cttggtctaacaaatttattttcgagcaaatcttctaactgtttcttcaa 15535938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22422367 - 22422106
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||    
T  22422367 taatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgaatacctatt 22422268  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || |||||||| ||||| || | |||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||||    
T  22422267 ctttatcgtcactttattcaactgtcgatagtcaatacacaatcttatgctaccatctttcttcttaaccagcaataccggcgctccccaaggtgaaaca 22422168  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  22422167 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactc 22422106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 19980266 - 19980522
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  19980266 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtggat 19980365  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || || ||||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||    
T  19980366 acctattcttgatagttactttgttcaactgacggtaatcgatacataatctcatactaccatctttcttctttactaacaaaacgggcgctccccaagg 19980465  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||||||||    
T  19980466 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaaatcttctaaccgtttcttcaa 19980522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20394608 - 20394380
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||   |||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| || |||    
T  20394608 taatctgatgatagcccgatctcaaatcaatcttaataaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcgattcttagaagtggatccctatt 20394509  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| | |  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |  || ||||| |||||||||    
T  20394508 ctttattgtcactttgttcaattgccggtaatctataaccaacctcatgctaccatctttcttcttaaccaacaacaccgacgctccccaaggtgaaaca 20394409  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaa 307  Q
    |||||||| | ||||| ||| ||||||||    
T  20394408 ctcggtcttacaaacttcttatcaagcaa 20394380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 340
Target Start/End: Original strand, 22522855 - 22523113
Alignment:
Q  82 tctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattctt 181  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    ||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  22522855 tctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgagcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctgttctt 22522954  T
Q  182 aatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactc 281  Q
     ||||| || ||||||||||| |||||||| |  || || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| || | ||| |||||||||||     
T  22522955 tatcgttactttgttcaactgtcgataatcaatgcataatctcatgctaccatccttcttcttaactagcaatactggcgctcgccaaggtgaaacactt 22523054  T
Q  282 ggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||||    
T  22523055 ggtctaacaaacttcttatcaagcaaatcttctaattgtttcttcaactcagccaactc 22523113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22375928 - 22375667
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  22375928 taatctgttgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaatacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatatctatt 22375829  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || || |||||||  |||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||| || || || ||||| ||||||| |    
T  22375828 ctttatcgttactttattcaactatcgataatcaatacacaatctcatactaccatctttcttcttaactagcaataccggcgctccccaaggtgaaata 22375729  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  22375728 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactc 22375667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Original strand, 32602451 - 32602700
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||    
T  32602451 taatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcaccctctaactgatccatcaaatcatcaattctcggtagtggatacctatt 32602550  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || ||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  32602551 cttgatagttactttgttcaactgacgatagtcaatacacaacctcatgctactatctttcttctttactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaaca 32602650  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||||| ||| | ||| |||||||| || || ||||| ||||||||    
T  32602651 cttggtctaacaaatttcttttcaagcaaatcatctaactgtttcttcaa 32602700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 19984486 - 19984739
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||   |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  19984486 taatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactgaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcagaagtggatacctatt 19984585  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || |||| ||| || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||||    
T  19984586 ctttatcgtcactttattcagctgacggtaatctatacataacctcatgctaccatcattcttcttaaccagcaataccggtgctccccaaggtgaaaca 19984685  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||| | ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  19984686 cttggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattca 19984739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21323754 - 21323501
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||    
T  21323754 taatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacttttgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaatcctcggaagtggatacctatt 21323655  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || || |||||||| ||||| || | ||| |||||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| |||    
T  21323654 ctttattgtaactttattcaactgacgatagtcaatacataacctcatactaccatccttcttctttaccaacaataccggcgctccccaaggtgagaca 21323555  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21323554 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattca 21323501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 328
Target Start/End: Original strand, 23887354 - 23887583
Alignment:
Q  99 ctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttca 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||   |||||| |||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| || || ||||    
T  23887354 ctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactaatccatcaaatcatcaattcttcgaagtggatacctattctttatcgttactttattca 23887453  T
Q  199 actgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgctt 298  Q
    |||| |||||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||  | ||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  23887454 actgtcgataatcaatgcataacctcatgctaccatctttcttcttaactaacaaaatcggcactccccaaggtgaaacactcggtcttacaaacttctt 23887553  T
Q  299 ctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     |||||||| |||||  |||| ||||||||    
T  23887554 atcaagcaaatcttcttactgtttcttcaa 23887583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31414944 - 31414691
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||    
T  31414944 taatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaacacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaattctcggaagtggatacctatt 31414845  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| || ||||  |  || ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||||    
T  31414844 ctttatcgtaactttgttcaactgacggtaattaatgcataatttcatgctaccatccttcttcttaactaacaacaccggcactccccaaggtgaaaca 31414745  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  31414744 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattca 31414691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 19864575 - 19864340
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |  |  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19864575 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaaatttagcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggat 19864476  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||||  ||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  19864475 acctattctttattgtcaccttgttcaactttcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaaccggcgctccccaagg 19864376  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaa 307  Q
    |||||| || ||||||| |||||  |||||| ||||    
T  19864375 tgaaactcttggtctaacaaactttttctcatgcaa 19864340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 328
Target Start/End: Original strand, 21253189 - 21253499
Alignment:
Q  18 tactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||| || || ||    ||||||||  | |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |    
T  21253189 tactcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctga 21253288  T
Q  118 acacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacaca 217  Q
    | || | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || | |||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || | | |    
T  21253289 aaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgaaagttgatacctattctttattgtcaccttgttcaactgtcgatagtcaataaa 21253388  T
Q  218 caacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaac 317  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| || | ||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||| || || ||     
T  21253389 caatctcatgctaccatctttcttcttcacaagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaactttttctcgagcaaatcctctaat 21253488  T
Q  318 tgattcttcaa 328  Q
    || ||||||||    
T  21253489 tgtttcttcaa 21253499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31569303 - 31569065
Alignment:
Q  94 ctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcacctt 193  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| || || ||    
T  31569303 ctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaacttt 31569204  T
Q  194 gttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaac 293  Q
    |||||| || ||||| || |  ||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  31569203 gttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttcttcaccaacaacacaggtgctccccacggcgaaacactgggtcttacaaac 31569104  T
Q  294 tgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  31569103 ttcttatcaagtaagtcttccaactgtttcttcaattca 31569065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22131516 - 22131267
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| || || || | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  22131516 taatctggtgataccctgttctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 22131417  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || |||||||||||||| | ||| || | |||||| |||||||  || ||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  22131416 cttgatagttaccttgttcaactgacaatagtcaatacacaatctcatgccaccgtctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaaca 22131317  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || |||||||  || | ||| |||||||| ||||| || || ||||||||    
T  22131316 cttggtctaacgaatttcttttcaagcaaatcttctaattgtttcttcaa 22131267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 292
Target Start/End: Original strand, 22373174 - 22373387
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  22373174 taatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacacgagcacccactaactgatccattaaatcatcaattcttggaagtggatatctatt 22373273  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || |||||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||||||    
T  22373274 ctttatcgtcactttattcaactgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccagcgctccccaaggtgaaaca 22373373  T
Q  279 ctcggtctaataaa 292  Q
    |||||||| |||||    
T  22373374 ctcggtcttataaa 22373387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21782902 - 21782745
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21782902 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggat 21782803  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgct 229  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||    
T  21782802 acctattctttattgtcaccttgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgct 21782745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 22061154 - 22060929
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || || | |||||| || | ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  22061154 taatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacttttgcacccaccaactgattcattaagtcatcaatcctgggaagtggatacctgtt 22061055  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||    
T  22061054 ctttatcgtaactttgttcaactgacgataatcaatgcacaacctcatgctaccgtccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccaaggtgaaaca 22060955  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaag 304  Q
    || ||||||| ||||| ||| |||||    
T  22060954 ctgggtctaacaaacttcttatcaag 22060929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19482548 - 19482298
Alignment:
Q  70 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 169  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||    ||||| |||| |||||||||||| ||        | ||||||||    
T  19482548 cctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgcgcacccactaactgatccatcaattc--------tcggaagtgg 19482457  T
Q  170 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac 269  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || |||||     
T  19482456 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaa 19482357  T
Q  270 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| | | || ||||| || |||||||| ||||||||    
T  19482356 ggtgaaacacttggtctaacaaacttcctttcgagcaagtcctccaactgtttcttcaa 19482298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 81 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16269697 - 16269450
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| | ||  |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||  ||||    
T  16269697 atctgatgataactagacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaaatcgtcaattctcggaagcggatacctgttct 16269598  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  16269597 ttatcgtaaccttgttcaactgacggtaatctatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacact 16269498  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     ||||| | ||| | ||| || | ||  ||||||||||| ||||||||    
T  16269497 gggtcttacaaatttcttatccaacaggtcttccaactgtttcttcaa 16269450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 330
Target Start/End: Original strand, 21927734 - 21927985
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    ||||| |||| ||||||||| || || ||||| || ||||||||||||| |||    
T  21927734 taatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactgaacacacgagcacccactaactgatccattaagtcgtcaattctcggaagtggatacctatt 21927833  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||| |||| || |||| ||| || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || || |||||||||    
T  21927834 ctttatcatcactttattcagctgacggtaatctatacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggtgctccacaaggtgaaaca 21927933  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaatt 330  Q
    |||||||| | ||| | ||| ||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  21927934 ctcggtcttacaaatttcttatcaagtaagtcctccaactgtttcttcaatt 21927985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 332
Target Start/End: Original strand, 23657224 - 23657486
Alignment:
Q  70 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 169  Q
    |||| ||| |||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || || | |||||| || | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  23657224 ccttcactttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaaaacttttgcacctacgaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtgg 23657323  T
Q  170 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac 269  Q
    |||||  ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| |  || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||     
T  23657324 atacctgttctttatcgtaactttgttcaattgacgataatcaatgcataatctcatgctaccatccttcttcttaactaacaacaccagcgctccccaa 23657423  T
Q  270 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    ||||||||||| ||||| | ||| | ||| |||||||| || || || || || |||||||||    
T  23657424 ggtgaaacacttggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcctcaaattgttttttcaattca 23657486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 332
Target Start/End: Original strand, 22053189 - 22053421
Alignment:
Q  99 ctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttca 198  Q
    ||||| ||||||||| | || | || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||  ||||| || || || |||||||    
T  22053189 ctcaagtcaatcttattgaaaatctttgcaccaaccagctgatccatcaagtcatcaattctcggaagcggatacctgttctttattgtaactttgttca 22053288  T
Q  199 actgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgctt 298  Q
    |||| ||||| || |  |||||||||||||| || || |||||||| || |||||||| || ||  |||||||||||||| | ||||||| ||||| |||    
T  22053289 actgacgatagtcaatgcacaacctcatgctaccgtccttcttctttaccaacaacacaggcgc-tcccacggtgaaacattgggtctaacaaacttctt 22053387  T
Q  299 ctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
     |||||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  22053388 atcaagctagtcctccaactgtttcttcaattca 22053421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 328
Target Start/End: Original strand, 22030470 - 22030658
Alignment:
Q  140 atccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttc 239  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||| |||||||||    
T  22030470 atccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttc 22030569  T
Q  240 ttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||| | ||||  || || || || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||    
T  22030570 ttcatcactagaaaaacgggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttattctcaagcaaatcttctaaccgtttcttcaa 22030658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Original strand, 4984348 - 4984597
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| | ||  |||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||   ||    
T  4984348 taatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacttgtt 4984447  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| || ||||| | |||||  ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||    
T  4984448 cttgatcgtaactttgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttcttgaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaaca 4984547  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||| | ||||| ||| || | ||  || |||||||| ||||||||    
T  4984548 ctgggtcttacaaacttcttatccaacaggtcctccaactgtttcttcaa 4984597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Original strand, 22989351 - 22989600
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||   |||| | |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  22989351 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacttgcagccactaactgatccatcaagtcatcaattattggaagtggatacctatt 22989450  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || || |||||| | |||||||| |  || ||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |  || ||  |||| |||||||||    
T  22989451 ctttatcgttactttattcaaccgtcgataatcaatgcataatatcatgctaccatctttcttcttaactagcaatatcggcgcttcccaaggtgaaaca 22989550  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||| | ||||  ||| ||||| || ||||| || || ||||||||    
T  22989551 cttggtcttacaaacatcttatcaagtaaatcttctaaatgtttcttcaa 22989600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 29301881 - 29301652
Alignment:
Q  99 ctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttca 198  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||   |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||| || |||||||    
T  29301881 ctcaagtcaattttactgaacacacgtgcacccactaactgatccatcagatcatcaatcctcggaagcggatacctgttctttatcgtaactttgttca 29301782  T
Q  199 actgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgctt 298  Q
    |||| || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || | ||| | |||    
T  29301781 actgacggtaatcgatgcacaatctcatgctaccatcctttttctttactaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacacttggccttacaaatttctt 29301682  T
Q  299 ctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  29301681 atcaagtaagtcctccaactgtttcttcaa 29301652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 286
Target Start/End: Original strand, 27356859 - 27357049
Alignment:
Q  96 gatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgt 195  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||  |||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||  ||||| ||||  || ||||    
T  27356859 gatctcaagtcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttctttatcgaaactttgt 27356958  T
Q  196 tcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtct 286  Q
    ||||||| || ||||| |  ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  27356959 tcaactgacggtaatctatgcacaatctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtct 27357049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 286
Target Start/End: Original strand, 28983219 - 28983424
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||  |||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||  ||||    
T  28983219 atctgatgataaccagccctcaaatcaatcttactgaaaatcttggcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttct 28983318  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||| | ||| |  ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  28983319 tgatcgtaactttgttcaactgacggtaatctatacaaagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacact 28983418  T
Q  281 cggtct 286  Q
     |||||    
T  28983419 gggtct 28983424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 286
Target Start/End: Original strand, 28988438 - 28988643
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||  |||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||  ||||    
T  28988438 atctgatgataaccagccctcaaatcaatcttactgaaaatcttggcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttct 28988537  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||| | ||| |  ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  28988538 tgatcgtaactttgttcaactgacggtaatctatacaaagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacact 28988637  T
Q  281 cggtct 286  Q
     |||||    
T  28988638 gggtct 28988643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 204 - 328
Target Start/End: Original strand, 19114831 - 19114955
Alignment:
Q  204 cgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaa 303  Q
    |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  19114831 cgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaa 19114930  T
Q  304 gcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||    
T  19114931 gcaagtcttctaactgtttcttcaa 19114955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20008396 - 20008285
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||   |||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| | |||    
T  20008396 taatctgatggtaacctgagctcaaatcaatcttactgaacacgcgtgcacccactaattgatccattaaatcatcaattctcggaagtggatatctatt 20008297  T
Q  179 cttaatcgtcac 190  Q
    ||| ||||||||    
T  20008296 ctttatcgtcac 20008285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 200
Target Start/End: Original strand, 23652340 - 23652468
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||    
T  23652340 tttactttaatctggtgataacctgatcttaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcagaagtagat 23652439  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaac 200  Q
    ||| |||||| || ||||| || ||||||    
T  23652440 acctattctttattgtcacttttttcaac 23652468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24631208 - 24630965
Alignment:
Q  12 acagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatct 111  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||| |||| || | || | |||||||||   ||| || |  || || |||||| | ||||||||||||||||    
T  24631208 acagaatactcatagtgactatacctagttcagaacacaatctttggtatatcttctaacttcacacgtatttggtgatatacagatctcaaatcaatct 24631109  T
Q  112 tactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatc 211  Q
    | |||||||| | ||||||||  | ||||| ||| | ||| || || ||||||||  ||||    |||||||| || ||||| || |  || ||||||||    
T  24631108 tgctaaacacttgtgcaccaaacaactgattcataagatcctctattcttggaagatgatattttttcttaatggtaaccttatttagttgtcgataatc 24631009  T
Q  212 cacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaaca 255  Q
    ||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| |||||||    
T  24631008 cacacacaacctcatacttagatcattcttcttaacaaacaaca 24630965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 340
Target Start/End: Original strand, 19870096 - 19870260
Alignment:
Q  176 attcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaa 275  Q
    ||||||||| || || || |||||||| || ||||||||||| | |||||| || ||||| ||||| ||||| |  ||||| || || ||||| |||||     
T  19870096 attcttaatagtgactttattcaactgacggtaatccacacatagcctcatactgccatccttctttttaacgagtaacacaggtgctccccaaggtgag 19870195  T
Q  276 acactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||| || || |||||||  ||||| |  |||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  19870196 acactaggcctgataaactttttctctaataactcttctaattgtttctttaattcacccaactc 19870260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 41)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15291258 - 15290929
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15291258 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttctgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 15291159  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15291158 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgcagataat 15291059  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15291058 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacattggagcaccccacggtgaaccactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 15290959  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290958 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 15290929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12340965 - 12340637
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||||||||    
T  12340965 cacagaatactcatagtgtccattccctgttcggaacgcggttttggatatatcccacacctttactcatatctggtgatctcccaatcttaaatcaatc 12340866  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  12340865 ttactgaacacttctgcaccaaccaattgatccatcaaatcatcaatcctcgggagcggataccaattgttaatcgtcaccttgttcaaatgctgataat 12340766  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    |||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||   ||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  12340765 ccacacacaacctcatac-accatccttcttcttaactaacaacactggagcaccctactaggaaatactcaacctaataatctgattctcgagcaactc 12340667  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||| |||||||  |||| ||||||    
T  12340666 ttccaactgcttcttcagctcactcaactc 12340637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Original strand, 23957968 - 23958236
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  23957968 atatcttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattc 23958067  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  23958068 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccgg 23958167  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23958168 cgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 23958236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Original strand, 27713557 - 27713825
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  27713557 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgacccatcaaatcatcaattc 27713656  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  27713657 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccgg 27713756  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27713757 cgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 27713825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 8388645 - 8388901
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8388645 tttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 8388744  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  8388745 acctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 8388844  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  8388845 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttctaactgtttcttcaa 8388901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Original strand, 40475261 - 40475529
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  40475261 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 40475360  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||    
T  40475361 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatccttcttctttactaacaaaaccgg 40475460  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  40475461 cgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaaatcttccaacagtttcttcaa 40475529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16234773 - 16234515
Alignment:
Q  70 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 169  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16234773 cctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgg 16234674  T
Q  170 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac 269  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || |||||     
T  16234673 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaa 16234574  T
Q  270 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  16234573 ggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttctaactgtttcttcaa 16234515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19776574 - 19776316
Alignment:
Q  70 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 169  Q
    |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19776574 cctttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgg 19776475  T
Q  170 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac 269  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| |  || || |||||     
T  19776474 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaatcggcgctccccaa 19776375  T
Q  270 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19776374 ggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 19776316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 71 - 332
Target Start/End: Original strand, 14161702 - 14161963
Alignment:
Q  71 ctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgga 170  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  | |||||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14161702 ctttactctaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgttgaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtgga 14161801  T
Q  171 taccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacg 270  Q
    |||| |||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |    
T  14161802 tacctattctgtatcgttaccttgttcaactgtcgataatcaatacacagtctcatactaccatctttcttcttgactaacaacactggcgctccccaag 14161901  T
Q  271 gtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    | |||||||| ||||| | ||| | ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  14161902 gagaaacacttggtctcacaaatttcttgtcaagcaaatcctccaactgtttcttcaattca 14161963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17092928 - 17092672
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17092928 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagttgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 17092829  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  17092828 acctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 17092729  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  17092728 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttctaactgtttcttcaa 17092672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 70 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8051404 - 8051146
Alignment:
Q  70 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 169  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  8051404 cctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgg 8051305  T
Q  170 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac 269  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||  | |||||     
T  8051304 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcactccccaa 8051205  T
Q  270 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8051204 ggcgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 8051146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 70 - 328
Target Start/End: Original strand, 12478831 - 12479089
Alignment:
Q  70 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 169  Q
    |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12478831 cctttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgg 12478930  T
Q  170 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac 269  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || |||||     
T  12478931 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaa 12479030  T
Q  270 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  12479031 ggtgaaacacttggtctaacaaacttcttttcaagcaagtcttctaactgtttcttcaa 12479089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14301751 - 14301502
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  14301751 taatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 14301652  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||||    
T  14301651 cttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaaca 14301552  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  14301551 cttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 14301502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 99 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16251602 - 16251369
Alignment:
Q  99 ctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttca 198  Q
    |||||||||||||| || || || | |||||| |||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  16251602 ctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatacatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttca 16251503  T
Q  199 actgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgctt 298  Q
    |||| ||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| | |||    
T  16251502 actgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttctt 16251403  T
Q  299 ctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  16251402 ctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaattca 16251369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 340
Target Start/End: Original strand, 14696370 - 14696614
Alignment:
Q  96 gatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgt 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   | |||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  |||||| ||||| || ||||    
T  14696370 gatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtacacccactaactgatccataaaatcatcaattcttggaagtagatacatattctttatcgttactttgt 14696469  T
Q  196 tcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactg 295  Q
    ||||||| |||||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| | |||||     
T  14696470 tcaactgtcgataatcaatgcataacctcatgctaccatctttcttcttaactagcaatactggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaactt 14696569  T
Q  296 cttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  14696570 cttatcaagtaaatcttctaactgtttcttcaactcaaccaactc 14696614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 18225218 - 18224978
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  18225218 taatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 18225119  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || |||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  18225118 cttgatagttaccttgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttgactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaaca 18225019  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactg 319  Q
    || ||||||| ||| | |||||  ||||| ||||| |||||    
T  18225018 cttggtctaacaaatttcttcttgagcaaatcttctaactg 18224978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 72 - 326
Target Start/End: Original strand, 14682800 - 14683054
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14682800 tttactttaatctggtgataacctgacctcagatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 14682899  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || || ||||| ||    
T  14682900 acctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagtaaaaccggcgctccccaagg 14682999  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttc 326  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14683000 tgaaacacttggtctaacaaatttcttctcaagcaaatcttccaactgtttcttc 14683054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 107 - 328
Target Start/End: Original strand, 8708175 - 8708396
Alignment:
Q  107 aatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccga 206  Q
    |||||||||||||||   |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||     
T  8708175 aatcttactaaacacgcgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcaactgacgg 8708274  T
Q  207 taatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagca 306  Q
    ||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| |    
T  8708275 taatctatacacaacctcacgctaccatctttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaacttcttatcaagta 8708374  T
Q  307 actcttccaactgattcttcaa 328  Q
    | || |||||||| ||||||||    
T  8708375 aatcctccaactgtttcttcaa 8708396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15001397 - 15001148
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  15001397 taatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcgtcaatcctcggaagtggatacctatt 15001298  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || |||||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||  | || ||||||||||||    
T  15001297 ctttatcgtcactttattcaactgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcactcctcacggtgaaaca 15001198  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||| | ||| | ||| |||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  15001197 cttggtcttacaaatttcttgtcaagcaagttctccaactgtttcttcaa 15001148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 22631937 - 22632189
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22631937 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 22632036  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||    ||||||||||||| |||||||| || |   | ||||| ||    
T  22632037 acctattctttattgtcaccttgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatg----catctttcttcttcactaacaaaaccgacactccccaagg 22632132  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  |||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  22632133 tgaaacacttggtctaacaaactttttctcaagtaaatcttctaactgtttcttcaa 22632189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 51604824 - 51604571
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||    
T  51604824 taatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctatt 51604725  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||| || |  ||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||||| || || |||||||| |||||     
T  51604724 cttaattgtaactttgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttcttcaccaacaacacaggtgctccccacggcgaaacg 51604625  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  51604624 ctgggtcttacaaacttcttatcaagtaaatcttccaactgtttcttcaattca 51604571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 1647318 - 1647051
Alignment:
Q  70 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 169  Q
    |||| ||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || | |||||| || | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1647318 ccttcactttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaacttttgcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatcctcggaagtgg 1647219  T
Q  170 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac 269  Q
    ||||| |||||| || || || || ||||| || ||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  1647218 atacctattctttattgtaactttattcaattgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatctttcttctttactaacaacacaggtgctccccac 1647119  T
Q  270 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaa 337  Q
    ||||| ||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||| ||||    
T  1647118 ggtgagacactgggtcttacaaacttcttgtcaagcaaatcctccaactgtttcttcaactcagccaa 1647051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15357152 - 15356891
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| || || |||||||| || || |||| |||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  15357152 taatctgatggtaacctgaccttaagtcaatcttgctgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgtt 15357053  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |  || || |||||| | ||||| ||||||||||| ||||| |  || || ||||||||| |||||    
T  15357052 ctttatcgtaactttgttcaactgacgataatcgatgcataatctcatggtaccatccttcttcttaaccaacaatatcggcgctccccacggtaaaaca 15356953  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    || ||||| | ||| | ||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  15356952 cttggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcttccaattgtttcttcaactcagccaactc 15356891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 16149951 - 16150204
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  16149951 taatctggtggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgtt 16150050  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || || |||||||| |||||||| |  |||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||    
T  16150051 ctttattgtaactttattcaactgacgataatcaatgcacaacctcatagtaccatccttattcttaaccaacaacactgacgctccccaaggtgaaaca 16150150  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||| | ||| |||||||| || |||||||  ||||||||||||    
T  16150151 cttggtcttacaaaattcttatcaagcaagtcctccaactatttcttcaattca 16150204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 16154097 - 16154350
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  16154097 taatctggtggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgtt 16154196  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || || |||||||| |||||||| |  |||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||    
T  16154197 ctttattgtaactttattcaactgacgataatcaatgcacaacctcatagtaccatccttattcttaaccaacaacactgacgctccccaaggtgaaaca 16154296  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||| | ||| |||||||| || |||||||  ||||||||||||    
T  16154297 cttggtcttacaaaattcttatcaagcaagtcctccaactatttcttcaattca 16154350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 340
Target Start/End: Original strand, 16218470 - 16218731
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||   |||||| |||| || |||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||    
T  16218470 taatctggtgataacccgacctcaagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactaatccattaagtcatcaattctcggaagtggatacctatt 16218569  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |  || || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || || || || || |||||||||    
T  16218570 ctttatcgttactttgttcaactatcgataatcaatgcataatctcatgctaccatctttcttcttaactagcaataccggtgctccacaaggtgaaaca 16218669  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    || ||||| ||||||| ||| | ||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  16218670 cttggtcttataaacttcttatgaagtaaatcttctaactgcttcttcaactcaaccaactc 16218731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 340
Target Start/End: Original strand, 16221790 - 16222051
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||   |||||| |||| || |||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||    
T  16221790 taatctggtgataacccgacctcaagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactaatccattaagtcatcaattctcggaagtggatacctatt 16221889  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |  || || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || || || || || |||||||||    
T  16221890 ctttatcgttactttgttcaactatcgataatcaatgcataatctcatgctaccatctttcttcttaactagcaataccggtgctccacaaggtgaaaca 16221989  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    || ||||| ||||||| ||| | ||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  16221990 cttggtcttataaacttcttatgaagtaaatcttctaactgcttcttcaactcaaccaactc 16222051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 340
Target Start/End: Original strand, 23443345 - 23443606
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||   |||||| |||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||  |||    
T  23443345 taatctggtgataacccaatctcaaatcaatcttggtaaacacacatgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacatatt 23443444  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || ||||||||||  ||||| || | |||||| ||||| || |||||||||||||||| || ||| |  || || || || |||||||||    
T  23443445 ctttatcgttactttgttcaactatcgatagtcaatacacaatctcatactaccatctttcttcttaattagcaatatcggcgctcctcaaggtgaaaca 23443544  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
     | ||||| | |||||  || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  23443545 tttggtcttacaaactttttatcaagcaaatcttctaactgtttcttcaattcagccaactc 23443606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 151 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15145593 - 15145416
Alignment:
Q  151 catcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaa 250  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  15145593 catcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactgacgataatcgatacataatctcatactaccatctttcttcttcactaa 15145494  T
Q  251 caacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||| |  || || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  15145493 caaaaaaggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttctaactgtttcttcaa 15145416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 3262824 - 3262577
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| | ||  |||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||  ||||    
T  3262824 atctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttct 3262725  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||| | |||||  ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  3262724 tgatcgtaactttgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacact 3262625  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     ||||| | ||||| ||| || | ||  || |||||||| ||||||||    
T  3262624 gggtcttacaaacttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaa 3262577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 136 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16353245 - 16353068
Alignment:
Q  136 gctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatc 235  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || || || || ||||||||  ||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  16353245 gctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttattcaactgatgataatcgatacataacctcatactaccatc 16353146  T
Q  236 tttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttc 313  Q
    ||| ||||| |||||||| || || || || || ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  16353145 ttttttctttactaacaaaacgggcgctcctcaaggtgaaaaacttggtctaacaaacttcttctcaagcaaatcttc 16353068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14849130 - 14848904
Alignment:
Q  87 tgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcg 186  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | |||||| ||||    
T  14849130 tgataacccgatctcaaatcaaccttgctaaatacacgcgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatttttggaagtggatatctattctttatcg 14849031  T
Q  187 tcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtct 286  Q
    | || || |||||||| |||||||| |  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |  || || ||| | ||||||||||| |||||    
T  14849030 ttactttattcaactgtcgataatcaatgcataacctcatgctaccatctttctttttaactagcaatatcggcgctccctaaggtgaaacacttggtct 14848931  T
Q  287 aataaactgcttctcaagcaactcttc 313  Q
     | ||||| ||||||||| || |||||    
T  14848930 tacaaacttcttctcaagtaaatcttc 14848904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 29451567 - 29451320
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || | ||  |||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| |  ||||    
T  29451567 atctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactgaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatatctgttct 29451468  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||| | ||| |  ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  29451467 tgatcgtaaccttgttcaactgacggtaatctatacatagtctcatactaccatccttcttcttgaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacact 29451368  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     ||||| | ||||| ||| || | ||  || |||||||| ||||||||    
T  29451367 gggtcttacaaacttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaa 29451320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 44659896 - 44659697
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || | ||  |||||||| | |||||||||||| || ||||| || || || ||||| |  ||||    
T  44659896 atctgatgataacctgacctcaaatcaatcttactgaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctagggagcggatatctgttct 44659797  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||| | |||||  ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  44659796 tgatcgtaaccttgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttcttgaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacact 44659697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 81 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11205262 - 11205057
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| | ||  |||||||| |  ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||  ||||    
T  11205262 atctgatgataaccagacctcaagtcaatcttgctaaagatcttagcaccaaccaattgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttct 11205163  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  11205162 ttatcgtaaccttgttcaactgacggtaatctatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacact 11205063  T
Q  281 cggtct 286  Q
     |||||    
T  11205062 gggtct 11205057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 15072599 - 15072852
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| |  ||    
T  15072599 taatttgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacacgagcacccactaactgatccattaaatcatcaattatcggaagtggatatctgtt 15072698  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || |||| ||| || ||| | | |||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || || |  || ||||| |||||||||    
T  15072699 ctttatcgtcactttattcagctgacggtaacctatacacaacctcatactgccatcattcttcttaaccaataataccgacgctccccaaggtgaaaca 15072798  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    |||||||| | ||| | ||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  15072799 ctcggtcttacaaatttcttatcaagtaaatcctccaactgtttcttcaattca 15072852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 332
Target Start/End: Original strand, 15258170 - 15258420
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||    ||||| |||| |||||| || || ||||||||||| | |||||||||||  ||||    
T  15258170 atctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctaaacacacgagcacccactaactgatcgattaa-tcatcaatcctcgaaagtggatacctgttct 15258268  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |  || ||||||||||| || || ||||||||||| | |||||| |  || ||||| |||||| ||||    
T  15258269 ttatcgtaaccttattcaactgtcggtaatcaatgcataacctcatgctaccgtccttcttcttaaccagcaacaccgacgctccccaaggtgaatcact 15258368  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
     ||||| | ||| | ||| || ||||| || |||||| | ||||||||||||    
T  15258369 tggtcttacaaatttcttatcgagcaagtcctccaacagtttcttcaattca 15258420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Original strand, 27902607 - 27902874
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||| ||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || | |||||| || |  || |||||||| ||||||||||    
T  27902607 atatcttcatccttcactttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaacttttgcacctaccatttggtccatcaagtcatcaatcc 27902706  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||| |  ||||| || || || ||||||||||| ||||| || |  ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||  |    
T  27902707 tcggaagtggatatctgttctttattgtaactttgttcaactgacgatagtcaatgcacaatctcatactaccatccttcttctttaccaacaacacaag 27902806  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||||   |||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| || | |||||| ||||||||    
T  27902807 cgctccccacaacgaaacactgggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcct-caactgtttcttcaa 27902874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 332
Target Start/End: Original strand, 20892385 - 20892524
Alignment:
Q  193 tgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaa 292  Q
    |||||||||| || ||||| |  ||||  ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| | |||    
T  20892385 tgttcaactgacggtaatcaatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaa 20892484  T
Q  293 ctgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||| || | ||| || | |||||| ||||||||||||    
T  20892485 cttcttatccaacaagtccttcaactgtttcttcaattca 20892524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16353286 - 16353246
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatctt 112  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16353286 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatctt 16353246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18547554 - 18547390
Alignment:
Q  176 attcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaa 275  Q
    ||||||||| || || || ||||| || || ||||||||||| | |||||| || ||||| ||||| ||||| |  ||||| || || ||||| |||||     
T  18547554 attcttaatagtgactttattcaattgacggtaatccacacatagcctcatactgccatccttctttttaacaagtaacacgggtgctccccaaggtgag 18547455  T
Q  276 acactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    |||||  | || |||||||  ||||| |  |||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  18547454 acactaagcctgataaactttttctctaataactcttctaattgtttctttaattcacccaactc 18547390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 5909 - 5581
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5909 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttctgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 5810  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5809 ttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 5710  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5709 ccacacacaacctcatgcttccatccttcttcttaaccaacaacactggagca-cccacggtgaaacacttggtctaataaactgcttctcaagcaactc 5611  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5610 ctccaactgattcttcaattcacccaactc 5581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 14477 - 14730
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||   |||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  14477 taatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgtt 14576  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |  || ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  14577 ctttatcgtaactttgttcaactgacgataatcaatgcataacctcatggtaccatccttcttcttaaccaacaatactggcgctccccacggtgaaaca 14676  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||| | | ||| |  || |||||||| |  |||||||| ||||||||||||    
T  14677 cttggtattacaaatttattatcaagcaagttctccaactgtttcttcaattca 14730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24829828 - 24829499
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24829828 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcgaaacgcggttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatattctgatctctaatcaatc 24829729  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24829728 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 24829629  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24829628 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccatggcgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 24829529  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24829528 ttccaactgatttttcaattcacccaactc 24829499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 22279908 - 22280237
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22279908 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgctgttttggatatatattcagtctttactctgatctgatgatatccagatctcaaatcaatc 22280007  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22280008 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaattgccgataat 22280107  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22280108 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagccccccacggcgaaacacttggtctaataaactgcttctgaagcaactc 22280207  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||    
T  22280208 ttctaattgtttcttcaattcacccaactc 22280237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 25130415 - 25130741
Alignment:
Q  14 agaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatctta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25130415 agaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcggttttggatatatcttccgccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatctta 25130514  T
Q  114 ctaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatcca 213  Q
    |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25130515 ctaaacacttccgcaccaaccagttgatccataaaatcatcaatcctcggaagcggataccgattcttaatcgtcacctagttcaactgccgataatcca 25130614  T
Q  214 cacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttc 313  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25130615 cactcaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactagagcaccccacggagaaacacttggcctaataaactgcttctcaagcaactcttc 25130714  T
Q  314 caactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25130715 taactgcttcttcaattcacccaactc 25130741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24568308 - 24567980
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24568308 cacagaatactcatagtgtccataccttgtttggaacgtggttttggatatatcttccgccttcactctaatatgatgatatcctgatctcaaatcaatc 24568209  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24568208 ttactaaacacctctgcaccaaccagctaatccattaaatcatcaatccttggaagcagataccgattcttaatcgtcactttgttcaactgccgataat 24568109  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||    
T  24568108 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaagactggagcacccaacggagaaacactcggcttgataaactgcttctcaagaaactc 24568009  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaact 339  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  24568008 ttctaactgctgcttcaattcacccaact 24567980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22760209 - 22759882
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22760209 cacagaatactcatagtgtccataccttgttttgaacacggttttggatatatcttccgccttcactctaatatgatgatatcttgatctcaaatcaatc 22760110  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  22760109 ttactaagcacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagcgggtaccgattcttaatcgtcccattcttcaactgccgataat 22760010  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22760009 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccatggagaaaca--cggcctgataaactgcttctcaagcaactc 22759912  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22759911 ttccaactgcttcttcaattcacccaactc 22759882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 9337446 - 9337702
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  9337446 tttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 9337545  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  9337546 acctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 9337645  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9337646 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 9337702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 9486080 - 9486336
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  9486080 tttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 9486179  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  9486180 acctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 9486279  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9486280 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 9486336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Original strand, 27373121 - 27373389
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  27373121 atatcttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattc 27373220  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  27373221 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccgg 27373320  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  27373321 tgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 27373389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Original strand, 24264222 - 24264490
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  24264222 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 24264321  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  24264322 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccgg 24264421  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24264422 cgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 24264490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 27219880 - 27220136
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27219880 tttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 27219979  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  27219980 acctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 27220079  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27220080 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 27220136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 41606976 - 41606708
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  41606976 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 41606877  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  41606876 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccgg 41606777  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  41606776 cgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 41606708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 44384149 - 44383893
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  44384149 tttactttaatctggtgataacctaatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 44384050  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  44384049 acctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 44383950  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  44383949 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 44383893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 70 - 328
Target Start/End: Original strand, 24711896 - 24712154
Alignment:
Q  70 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 169  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24711896 cctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgg 24711995  T
Q  170 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac 269  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||  |||||||| | ||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || |||||     
T  24711996 atacctattcttgatagttaccttgttcaactatcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggtgctccccaa 24712095  T
Q  270 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24712096 ggtgaaacactcggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 24712154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Original strand, 10870702 - 10870970
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   ||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  10870702 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgctcccactagctgatccatcaaatcatcaattc 10870801  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | |||||||||||||  ||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || ||    
T  10870802 tcggaagtggatacctgttcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccgg 10870901  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10870902 cgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 10870970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 24677353 - 24677609
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||  | | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24677353 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaatcttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 24677452  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||    
T  24677453 acctattcttgatagttactttgttcaactgacgataatcaatacacaacctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggtgctccccaagg 24677552  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  24677553 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaaatcttctaactgcttcttcaa 24677609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 16927224 - 16927480
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16927224 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 16927323  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || ||  |||| ||    
T  16927324 acctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgcttcccaagg 16927423  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  16927424 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttctaactgtttcttcaa 16927480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 17000864 - 17001120
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17000864 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 17000963  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| || || ||  |||| ||    
T  17000964 acctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgcttcccaagg 17001063  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  17001064 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttctaactgtttcttcaa 17001120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19650622 - 19650369
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || |||||  |||| ||||||||||| || |||| |||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  19650622 taatctgatggtaacctgacttcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctatt 19650523  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| || ||||| | ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  19650522 ctttatcgtaactttgttcaactgacggtaatcaatacataatctcatgctaccatccttcttcttaactaacaacaccggcgctccccaaggtgaaaca 19650423  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  19650422 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattca 19650369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24706061 - 24705805
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || |  ||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24706061 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactttcgcacccactaactaatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 24705962  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| ||| || || || |||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| ||    
T  24705961 acctatttttgatagttaccttgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaagg 24705862  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| |||   |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  24705861 tgaaacacttggtctaacaaatctcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaa 24705805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24875329 - 24875073
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| ||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24875329 tttactttaatctgatgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaatcgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 24875230  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||| | |||||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  24875229 acctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 24875130  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24875129 tgaaacacttggtctaacaaatttcttctcaagcaaatcttccaactgtttcttcaa 24875073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 59 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21143633 - 21143364
Alignment:
Q  59 tatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatc 158  Q
    |||||||||  | |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  21143633 tatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatt 21143534  T
Q  159 cttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactg 258  Q
    || |||||| |||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||| | |||||| || |||||||||||||| |||| ||| || |    
T  21143533 ctcggaagttgatacctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccg 21143434  T
Q  259 gagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  21143433 gcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctcaagcaaggcttccaactgtttcttcaa 21143364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 25255790 - 25256042
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||   |||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  25255790 taatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacacgtgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctatt 25255889  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||    
T  25255890 ctttatcgtaaccttgttcaactgacgataatcaatgcataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgc-tcccacggtgaaaca 25255988  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||| | ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  25255989 cttggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattca 25256042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21323838 - 21323589
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||    
T  21323838 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatatctatt 21323739  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || |||||||| |||||   ||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  21323738 cttgatagttaccttgtttaactgtttatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaaca 21323639  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  21323638 cttggtctaacaaacttcttctcaagcagatcttctaactgtttcttcaa 21323589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 27789611 - 27789864
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||    
T  27789611 taatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctatt 27789710  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||| || |  ||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||    
T  27789711 cttaattgtaactttgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttcttcaccaacaacacaggtgctccccacggcgaaaca 27789810  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  27789811 ctgggtcttacaaacttcttatcaagtaaatcttccaactgtttcttcaattca 27789864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 23073727 - 23073983
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| || || |    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23073727 tttactttaatctggtgataacccgatctcagatctatcttgctgaaaatacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 23073826  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || || ||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| || || || ||||| ||    
T  23073827 acctattctttattgttactttgttcaactgtcgatagtcaatacacaacctcatgctaccatccttcttcttccctaacaaaaccggcgctccccaagg 23073926  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  23073927 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaaatcttctaattgtttcttcaa 23073983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23106307 - 23106091
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || | |||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23106307 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggat 23106208  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| || | ||| || || || ||||| ||    
T  23106207 acctattctttattgtcaccttgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcaccagcaaaacgggcgctccccaagg 23106108  T
Q  272 tgaaacactcggtctaa 288  Q
    ||||||||| |||||||    
T  23106107 tgaaacacttggtctaa 23106091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 93 - 332
Target Start/End: Original strand, 12576238 - 12576477
Alignment:
Q  93 cctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcacct 192  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| || || |    
T  12576238 cctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactt 12576337  T
Q  193 tgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaa 292  Q
    ||||||| || ||||| || |  ||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  12576338 tgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttcttcaccaacaacacaggtgctccccacggcgaaacactgggtcttacaaa 12576437  T
Q  293 ctgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  12576438 cttcttatcaagtaaatcttccaactgtttcttcaattca 12576477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 81 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23098588 - 23098329
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||||||| | |||||||||||| || ||||||||  |||| |||||||  ||||    
T  23098588 atctgatggtatcctgacctcaagtcaatcttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcctcagaagcggatacctgttct 23098489  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | |||||||| ||||||||||| || || || |  ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||  || || |||||||| || |||||    
T  23098488 ttatcgtcactttgttcaactgacggtagtctatgcacaatctcatgctaccatccttcttctttaccaacaacataggcgctccccacggcgagacact 23098389  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    |||||| | || || ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23098388 cggtcttacaagcttcttatcaagcacgtcttccaactgtttcttcaattcagccaactc 23098329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22734353 - 22734097
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| |||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | || ||   || ||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22734353 tttactttaatatggtgataacctgatctcaaatctatcttgttgaaaacacttgtacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 22734254  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || ||||||||||| || ||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  22734253 acctattctttattgttaccttgttcaattgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaaccggcgctccccaagg 22734154  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  |||||||| || ||||| || || ||||||||    
T  22734153 tgaaacacttggtctaacaaactttttctcaagtaaatcttctaattgtttcttcaa 22734097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19717587 - 19717336
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||  |||| |||| |||||| || | |||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||    
T  19717587 atctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgttaaaaacctttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcagaagtggatatctgttct 19717488  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||| |  |||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||  | || ||||||||||| |||||    
T  19717487 ttatcgtaactttgttcaactgacggtaatcaatgcacaacctcatgctaccgtccttcttctttaccaacaacacaagcgctccccacggtgagacact 19717388  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
     ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  19717387 tggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcttccaactgtttctttaattca 19717336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24818809 - 24818628
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24818809 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaatacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcagttcttggaagtggat 24818710  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaa 253  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  24818709 acctattctttatcgttaccttattcaactgtcgataatcaaggcataacctcatactaccatctttcttcttaaccaacaa 24818628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 125 - 328
Target Start/End: Original strand, 23112656 - 23112859
Alignment:
Q  125 tgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctc 224  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||  || |||||||| | ||||||||||    
T  23112656 tgcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcagttgacgataatctatacacaacctc 23112755  T
Q  225 atgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattct 324  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||| |||| | ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| || || ||||| || ||||    
T  23112756 atgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgcatcccaagttgaaacactcggtcttacaaacttcttatcaagtaaatcctccaattgtttct 23112855  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  23112856 tcaa 23112859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 23278647 - 23278900
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || |||||  |||| |||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  23278647 taatttgatggtaacctgacttcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgtt 23278746  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || ||||||||||| ||||| || |  || |||||||| || ||||| |||||||| || || || || || ||  || | ||||| |||    
T  23278747 cttgattgtaactttgttcaactgacgatagtcaatgcataacctcatactaccatccttcttctttaccaataataccggcgcttcctaaggtgagaca 23278846  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| || | |||||| ||||||||||||    
T  23278847 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctacaactgtttcttcaattca 23278900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 340
Target Start/End: Original strand, 31832531 - 31832790
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| | ||  |||||||| |  ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||  ||||    
T  31832531 atctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaattgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttct 31832630  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||| | |||||  ||||| || ||||| || ||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  31832631 tgatcgtaactttgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatcctttttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacact 31832730  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
     ||||| | ||||| ||| || | ||  || |||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  31832731 gggtcttacaaacttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagccaactc 31832790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 328
Target Start/End: Original strand, 1065624 - 1065871
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || | ||  |||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||  ||||    
T  1065624 atctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactgaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttct 1065723  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||| | |||||  ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  1065724 tgatcgtaactttgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggcgaaacact 1065823  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     ||||| | ||||| ||| || | ||  || |||||||| ||||||||    
T  1065824 gggtcttacaaacttcttatctaacaggtcctccaactgcttcttcaa 1065871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 167 - 328
Target Start/End: Original strand, 23204273 - 23204434
Alignment:
Q  167 tggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccc 266  Q
    |||||||| |||||| || || |||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| || |||    
T  23204273 tggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttctttactatcaaaactggcgctccc 23204372  T
Q  267 cacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     | ||||||||||| ||||||| ||| | ||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  23204373 taaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttttcgagcaaatcttctaactgtttcttcaa 23204434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 30209487 - 30209256
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||    ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||  |||||    
T  30209487 atctggtgatagcctgaccttaactcaattttactgaacacacgcgcacccactaactgatccatcaaatcttcgatcctcggaagtggatacttattct 30209388  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | || ||||| || || ||||| |  ||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||  || || ||||| || || |||||    
T  30209387 ttattgtcactttatttaactgtcagtaatctatacataacctcatgcgaccatctttcttcttaaccaataacatcggcgctccccagggcgatacact 30209288  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactctt 312  Q
    |||||| | |||||  || |||||||| ||||    
T  30209287 cggtcttacaaactttttatcaagcaaatctt 30209256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 30010709 - 30010507
Alignment:
Q  126 gcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctca 225  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||  |||||| || ||||| || || |||||     |||| | ||| |||||||    
T  30010709 gcacccactaacggatccatcaaatcgtcgatcctcggaagtggatacttattctttattgtcactttatttaactgttagcaatctatacataacctca 30010610  T
Q  226 tgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattctt 325  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| | ||| |  || |||||||| ||||| ||||| || ||    
T  30010609 tgctaccatctttcttcttaaccaataacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaattttttatcaagcaaatcttctaactgtttttt 30010510  T
Q  326 caa 328  Q
    |||    
T  30010509 caa 30010507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 10037962 - 10037866
Alignment:
Q  21 tcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaa 117  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||| || | ||| ||||  ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  10037962 tcatagtgcccatacctcgttcgaaatgcagttttgaaaatatcctctgtcttcactcgtatctggtgatattcagatcttaaatcaatcttactaa 10037866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 10098347 - 10098255
Alignment:
Q  21 tcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatctta 113  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||| || | ||| ||||  ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  10098347 tcatagtgcccatacctcgttcgaaatgcagttttgaaaatatcctctgtcttcactcgtatctggtgatattcggatcttaaatcaatctta 10098255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 169
Target Start/End: Original strand, 23189782 - 23189879
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 169  Q
    |||||| ||||||  ||||| ||| | ||||| |||||||| || || || | |||||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23189782 tttactttaatctagtgataacctaacctcaagtcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaaccgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgg 23189879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 414 - 743
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  414 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcggttttggatatatcttccgcctttactctaatctggtgatatcctgatctcaaatcaatc 513  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  514 ttactaaacacctctgcaccaaccagcagatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgacgataat 613  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  614 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggcgaaacacttggtctaataagttgcttctcaagcaactc 713  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  714 ttccaactgtttcttcaattcacccaactc 743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 7356 - 7685
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7356 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcggttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 7455  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7456 ttactaaacacctatgcaccaaccagctgatccatcatatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgacgataat 7555  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7556 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggcgaaacacttggtctaataagttgcttctcaagcaactc 7655  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7656 ttccaactgtttcttcaattcacccaactc 7685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 15111 - 15440
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15111 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 15210  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15211 ttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 15310  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15311 ccacacacaacctcatacttccatctttcttcttaaccaacaacactggagctctccacggtgaaatacttggtctaataaactgtttctcaagcaactc 15410  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15411 ttctaactgtttcttcaattcacccaactc 15440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11274 - 10948
Alignment:
Q  14 agaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatctta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11274 agaatactcatagtgtccataccttgttcggaatgcggttttggatatatcttccgccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatctta 11175  T
Q  114 ctaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatcca 213  Q
    || |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11174 ctgaacacctctgaaccaaccagttgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcactttgttcaagtgccgataatcca 11075  T
Q  214 cacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11074 cacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactagagcaccccacggcgaaacacttggtctaataaactgcttctcaaataactcttc 10975  T
Q  314 caactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10974 taactgtttcttcaattcacccaactc 10948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8929 - 8600
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8929 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcgaaacgcggttttggatatatcttccgcctttacccttatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 8830  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  8829 ttactaaacacctcagcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatagtcaaattgttcaactgccgataat 8730  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8729 ccacacacaacctcatgctcccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggcgaaacacttggtctaataaactgcttctcaagcaactc 8630  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8629 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 8600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 340
Target Start/End: Original strand, 56026 - 56287
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||||   |||||| |||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||    
T  56026 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgttaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacctatt 56125  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||  ||  |||||||||| |||| | || | |||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||  | || |||||||||||||||    
T  56126 ctttatcaacattttgttcaactaccgacagtcaatacacaatctcatactaccatctttcttctttactaacaaaacgtgcgctccccacggtgaaaca 56225  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  56226 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactc 56287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 340
Target Start/End: Original strand, 40903 - 41164
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||    
T  40903 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcagttcttggaagtggatacctatt 41002  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || ||||||||||| ||||| || | |||||| ||| | || |||||||||||||||||||  || | ||| || ||||| |||||||||    
T  41003 ctttattgttactttgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcgtactaccatctttcttcttaactagaaaaattggcgctccccaaggtgaaaca 41102  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||||    
T  41103 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcttctaagtgtttcttcaactcagccaactc 41164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 340
Target Start/End: Original strand, 74623 - 74884
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||    
T  74623 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcagttcttggaagtggatacctatt 74722  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || ||||||||||| ||||| || | |||||| ||| | || |||||||||||||||||||  || | ||| || ||||| |||||||||    
T  74723 ctttattgttactttgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcgtactaccatctttcttcttaactagaaaaattggcgctccccaaggtgaaaca 74822  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||||    
T  74823 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcttctaagtgtttcttcaactcagccaactc 74884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 34288 - 34615
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34288 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcgaaacgcggttttgggtatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 34387  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34388 ttactaaacacctctgcaccgaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtgcataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 34487  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  34488 ccacacacaacctcatacttccatcttttttcttaaccaacaacactggagcaccccacggagaaacactcggtctaataaactgct--tcaagcaactc 34585  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34586 ttccaactgtttcttcaattcacccaactc 34615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 24379 - 24708
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24379 cacagcatactcatagtgtccataccttgttcggaacgcggttttggatatatcttccgccttcactctaatctgatgatatcctgatcttaaatcaatc 24478  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24479 ttactaaacacctctgcaccaaccagttgatccatcaaatcatcaatccttggaagcggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgaaaat 24578  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  24579 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggagaaacactcagcctgataaactgcttctcaagcaactc 24678  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24679 ttctaactgcttcttcaattcacccaactc 24708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 307
Target Start/End: Original strand, 8291 - 8519
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  8291 taatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 8390  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || ||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  || || || ||||| ||||||| |    
T  8391 ctttattgtcactttattcaactgtcgataatcaatacacaacctcatgctaccatccttcttcttcactaacagaaccggcgctccccaaggtgaaaga 8490  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaa 307  Q
    || ||||||| |||||  |||||||||||    
T  8491 cttggtctaacaaactttttctcaagcaa 8519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7964 - 7635
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7964 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcggttttggatatatctttcgcctttactctaatctgatgatatcctgacctcaaatcaatc 7865  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  7864 ttactaaacacctctgcaccaaccagttgatccatcaaatcatcaatccgtggaagtggatatcgattcttaatcgtcaccttgttcaactgttgataat 7765  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  7764 ccacacacaacctcatatttccatctttcttcttaaccaacaatacgggagcaccccacggtgaaacacttggcctaataaactgcttctcaagcaactc 7665  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7664 ttccaactgtttcttcaattcacccaactc 7635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 16383 - 16636
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||| ||||||||  ||    
T  16383 taatctgatggtaacctgacctcaaataaattttactaaacacacaagcacccactaactgatccattaaatcgtcaattctcggaactggatacctgtt 16482  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || |||| ||| || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||    
T  16483 ctttatcgtcactttattcagctgacggtaatctatacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccacggtgaaaca 16582  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    |||||||| | ||  | ||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  16583 ctcggtcttacaactttcttatccagtaaatcctccaactgtttcttcaattca 16636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 4)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 132592 - 132263
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132592 cacagagtactcatagtgtccatatctcgttcggaacgcggtttgggatatatcttcagcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 132493  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  132492 ttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgccactttgttcaactgccgataat 132393  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  132392 ccacacacaacctcgtacttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccatggcgaaaaacgtggtctaataaactgtttctcaagcaactc 132293  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  132292 ttccaactgtttcttcaattcacccaactc 132263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 25970 - 26301
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25970 cacagaatactcatagtgtccatacttcgtttggaacgcggttatggatatatcttccgccttcactctaatcggatgatatcctgatctcaaatcaatc 26069  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  26070 ttactaaacacctctgcaccaacaagatgatacatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcacaatgttcaactgacgataat 26169  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtct--aataaactgcttctcaagcaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||  || |||||||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  26170 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactcaagcaacccacgaagatacactcggcctgatataaactgcttctcaagcaac 26269  T
Q  309 tcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  26270 tcttctaactgtttcttcaattcacccaactc 26301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 85272 - 85037
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| || || || | || ||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  85272 tttactttaatctggtgataaccttatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgtacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcgtaagtggat 85173  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  85172 acctattctttattgtcaccttgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcattctaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 85073  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaa 307  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| |||||| |||||    
T  85072 tgaaacacttggtctgacaaacttcttctcgagcaa 85037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 72 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 85838 - 85609
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  85838 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttactgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgtaagtggat 85739  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || |||||||||||||  ||||| || | |||||| ||| | || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  85738 acctattcttgatagttaccttgttcaactatcgatagtcaatacacaatctcttactaccatctttcttcttcactaccaataccggcgctccccaagg 85639  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctc 301  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  85638 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctc 85609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 15 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1720 - 1395
Alignment:
Q  15 gaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttac 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  1720 gaatactcatagtttccataccttgttcggaacgcggttttggatacatcttctgccttcactctaatctgatgatatcctaacttcaaatcaatcttac 1621  T
Q  115 taaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccac 214  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1620 taaacacctctgcaccaaccaactgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcactttgttcaactgccgataatccac 1521  T
Q  215 acacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttcc 314  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1520 acacaacctcattcttccatctttcttcttaaccaacaacactagagcaccccacggcgaaacacttggtctaataaactgcttctcaagcaactcttcc 1421  T
Q  315 aactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1420 aactgtttcttcaattcacccaactc 1395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 291
Target Start/End: Original strand, 42461 - 42741
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42461 cacaaaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 42560  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42561 ttactaaacacctatgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactggcgataat 42660  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataa 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42661 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttctcaaccaacaacattggagcaccccacggcgaaacactcggtctaataa 42741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 54446 - 54193
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||    
T  54446 taatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactatctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatatctatt 54347  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| || || || |||||||| || |||||||| || || ||||| ||  |||||    
T  54346 ctttatcgtaactttgttcaactgacgataatcaatgcacaacctcatactaccgtccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccaaggcaaaaca 54247  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||| ||||||||    
T  54246 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaggtcttccaactgtttcctcaattca 54193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31710 - 31463
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| | || ||||||||| | |||||||||||  || ||||| || ||||||||||| |  ||||    
T  31710 atctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcatgtcgtcaattctcggaagtggatatcttttct 31611  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | || || || || |||||||| || || || |  || |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  31610 ttattgtaactttattcaactgacggtagtcaatgcataacctcatactaccatctttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacact 31511  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     ||||| | ||||| ||| |  ||||| || || ||||| ||||||||    
T  31510 tggtcttacaaacttcttgttgagcaagtcctctaactgtttcttcaa 31463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 2055 - 1726
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  2055 cacagaatactcatagtgtctatacctcgttcggaatgcggttttggatatatcttccgccttcactctaatttgatgatatcccgatctcaaatcaatc 1956  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1955 ttactaaacacttctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcactttgttcaactaccgataat 1856  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1855 ccacacacaacatcatgctcccatctttcttcttaaccagcaatactggagcaccccacggtgaaacacttggtctaataaactacttctcaagcaactc 1756  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  1755 ttctaactatttcttcaattcacccaactc 1726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 26530 - 26854
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| || |||||||||    
T  26530 cacagaatactcatagtgtccataccttgttcggaaagcggtattggatatatcttccgccttcactctcatctgaagatatcctgaccttaaatcaatc 26629  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    || || || | ||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  26630 ttgctgaatatctccgcactaactaactgatccatcaaataatcaatcctcggaagcggataccaattctttatagtcaccatgttcaactgccgataat 26729  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||    
T  26730 ccacacataacctcatgcttccatccttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggaggaacacttggcatgataaactgcttctcgagcaactc 26829  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcaccc 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  26830 ttccaactgcttcttcaattcaccc 26854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 32 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13707 - 13399
Alignment:
Q  32 atacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacca 131  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13707 atacctcgttcggaacgcggttttggatatatcttttgccttcactgtaatctgatgatatcctgatctcaattcaatcttactaaacacctctgcacca 13608  T
Q  132 actagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13607 actagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatactcattcttaatcgtcactttgttcaactgccgataatccacacataacctcatgcttc 13508  T
Q  232 catctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattc 331  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13507 tatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacggtgaaacacttggtctaataaactgcttctcaagcaactcttctaactgtttcttcaattc 13408  T
Q  332 acccaactc 340  Q
    |||||||||    
T  13407 acccaactc 13399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1049 - 720
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1049 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacatggttttaggtatatcttccgccttcactctaatctgatgatatcccgatctcaaatcaatc 950  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  949 ttactaaacacttctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagcggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactatcgataat 850  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  849 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaataacactggagcaccccacggagatacactcggcctgataaactgcttttcaagcaactc 750  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  749 ttccaactgcttcttcaattcacccaactc 720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 906 - 582
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  906 cacagaatactcatagtgttcatacctcgttcggaacacagttttggatatatcttccgccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 807  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||  || |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  806 ttactaaacatttccgcaccaaccaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaatcggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 707  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  706 ccacacacaacctcatgcttccatctttc-tcttaaccaacaacactggagcacccc-cggagacacactcggcctaataaaatacttctcaagcaactc 609  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaa 337  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||    
T  608 ttccaactacttcttcaattcacccaa 582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7108 - 6779
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7108 cacagaatacccatagtgtccatacctcgtttggaacgctgttttggatatatcttccgccttcactctaatatgatgatatcctgatctcaaatcaatc 7009  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7008 ttactaaacacttccgcaccaaccagctaatccatcaaaccatcaatcctcggaagcggataccgattcttaatcgtcaccttgttcgactgccgataat 6909  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  6908 ccacacacaacctcatgctcccatccttcttcctaacgaacaacactggagcatcccacggagaaacactcggcctgataaactgcttcacaagcaactc 6809  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  6808 ttctaactacttcttcaattcacccaactc 6779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 251
Target Start/End: Original strand, 6947 - 7187
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6947 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgaagttttgaatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 7046  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7047 ttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctctgaagtggataccgatttttaatcgtcaccttgttcaattgccgataat 7146  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaac 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7147 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaac 7187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 69 - 340
Target Start/End: Original strand, 89761 - 90032
Alignment:
Q  69 gcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtg 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  89761 gccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacttccgcaccaaccagctgatccatgaaatcatcaatccttggaagtg 89860  T
Q  169 gataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcacccca 268  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  89861 gataccgattcttaatcgtcactttattcaacagccgataatccacacacaacctcatggttccatctttcttcttaaccaacaatactggagcacccca 89960  T
Q  269 cggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  89961 cggagaaacactcggcctgataaactgcttctcaagcaactcttccaactatttcttcaattcacccaactc 90032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21950 - 21629
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21950 cacataatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcggttttgaatatatcttccgccttcactctaatatgatgatatcctgatctcaaatcaatc 21851  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||       ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21850 ttactaaacacttccacaccaaccagctgctccatcaa-tcatc-------ggaagcggataccgattcttaattgtcaccttgttcaactgccgataat 21759  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| | || || ||| |||||||||||||||| ||    
T  21758 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacattggagcaccccacggagacacattaggcctgatatactgcttctcaagcaattc 21659  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21658 ttataactgtttcttcaattcacccaactc 21629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 31526 - 31205
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31526 cacataatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcggttttgaatatatcttccgccttcactctaatatgatgatatcctgatctcaaatcaatc 31427  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||       ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31426 ttactaaacacttccacaccaaccagctgctccatcaa-tcatc-------ggaagcggataccgattcttaattgtcaccttgttcaactgccgataat 31335  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| | || || ||| |||||||||||||||| ||    
T  31334 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacattggagcaccccacggagacacattaggcctgatatactgcttctcaagcaattc 31235  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31234 ttataactgtttcttcaattcacccaactc 31205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 98 - 340
Target Start/End: Original strand, 7445 - 7687
Alignment:
Q  98 tctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttc 197  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7445 tctcaaatcaattttgctaaacacctctgtaccaaccagctgatccatcaaatcatcagtccttggaagcggatatcgattcttaatcgtcaccttgttc 7544  T
Q  198 aactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgct 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  7545 aactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatatttcttctaaagcaacaacactagagcaccccacggagaaacactcggcctgataaactgct 7644  T
Q  298 tctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7645 tctcaagcaactcttctaactgcttcttcaattcacccaactc 7687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1983 - 1732
Alignment:
Q  15 gaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1983 gaatactcatagtgtccatacctcgatcagaacgcggttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttgc 1884  T
Q  115 taaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccac 214  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  1883 taaacacctctgcaccaaccaactgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcataatcgtcactttgttcaactaccgataatccag 1784  T
Q  215 acacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccc 266  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1783 acacaacctcatgcttccatatttcttcttaaccaacaacattggagcaccc 1732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 65 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7289 - 7014
Alignment:
Q  65 ttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttgga 164  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7289 ttccgtctttactctaatctgatgatatcctgatcttaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcataaatccttgga 7190  T
Q  165 agtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcac 264  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  7189 agcggataccgattcttaattgtcactttgttcaactgccgataatccacacttctcctcatacttccatctttcttcttaaccaacaacactagagcac 7090  T
Q  265 cccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  7089 cccacggagaaacactcggcctgataaaatgcttctcaagcaactcttctgactgtttcttcaattcacccaactc 7014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 310 - 624
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||                ||||||||||| |||    
T  310 cacagaatactcatagtgtccataccttgttcggaacgcgattttggatatatattccgccttcactctc---------------gatctcaaatctatc 394  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  395 ttactaaacacctctgcaccaaccagttgatccatcaaatcatcaatcttcggaagtggattccgattcttaatcgttactttgttcaactgccgataat 494  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactc 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  495 ccacacacaacctcatgctcccatccttcttcttaaccaacaacactggagcaccccatggagaaacaatcggcctgataaactgcttctctagcaactc 594  T
Q  311 ttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  595 ttctaactgtttcttcaattcacccaactc 624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 237
Target Start/End: Original strand, 16261 - 16487
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16261 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcggttttagatatatcttccgcattcattctaatttgatgatatcctgatctcaaatcaatc 16360  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataat 210  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16361 ttactaaacacttccgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactaacgataat 16460  T
Q  211 ccacacacaacctcatgcttccatctt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16461 ccacacacaacctcatgcttccatctt 16487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 127 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 4913 - 4722
Alignment:
Q  127 caccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcat 226  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4913 caccaaccaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagcagataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccaataatccacacacaacctcat 4814  T
Q  227 gcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaact 318  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4813 gcttccatctttcttcttaacgaacaaaactggagcaccccacggagaaaccctcggcctgataaactgcttcttaagcaactcttctaact 4722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 7032 - 6909
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7032 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgctgttttggatatatcttccgccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 6933  T
Q  111 ttactaaacacctctgcaccaact 134  Q
    | ||| ||||||||||||||||||    
T  6932 tcactgaacacctctgcaccaact 6909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4725 - 4676
Alignment:
Q  291 aactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  4725 aactacttcttaagcaactcttctaactacttcttcaattcacccaactc 4676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 328
Target Start/End: Original strand, 21507 - 21765
Alignment:
Q  70 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 169  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21507 cctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgg 21606  T
Q  170 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac 269  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || |||||     
T  21607 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaa 21706  T
Q  270 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21707 ggtgaaacactcggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 21765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 79 - 340
Target Start/End: Original strand, 3170 - 3431
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  3170 taatctggtgatagcccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaattgatccatcaaatcatcaattcttggaagtgggtacctatt 3269  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||||    
T  3270 ctttatcgtcactttattcaactgccgataatcaatacataacctcatgctaccgtctttcttcttaaccaacaacacgggcgttccccaaggtgaaaca 3369  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    |||||||| | ||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  3370 ctcggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcttctaactgtttcttcaattcagccaactc 3431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 7755 - 7445
Alignment:
Q  18 tactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaa 117  Q
    |||||||| |||||||| | ||||| ||| ||||| ||    ||||||||  | || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |    
T  7755 tactcataatgtccataacccgttctgaaagcagtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgctga 7656  T
Q  118 acacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacaca 217  Q
    | || | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || | |||    
T  7655 aaacatttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttgaaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactgtcgatagtcaataca 7556  T
Q  218 caacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaac 317  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||||||| ||| ||||||| ||| | |||||||||||  ||||| ||     
T  7555 caatctcatgctaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaatacttggtctaacaaatttcttctcaagcagatcttctaat 7456  T
Q  318 tgattcttcaa 328  Q
    || ||||||||    
T  7455 tgtttcttcaa 7445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 79 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7122 - 6861
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  7122 taatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcgtcaattcttggaagtggatacctatt 7023  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||    
T  7022 ctttatcgtcactttgtttaactgtcgataatcaatacacaatctcatactgccatctttcttcttcactaacaaaacgggcgctccccacggtgaaaca 6923  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    || ||||| | ||||| ||| ||||| || ||||| || || |||||||| ||| |||||||    
T  6922 cttggtcttacaaacttcttatcaagaaaatcttctaattgtttcttcaactcaaccaactc 6861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16036 - 15780
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16036 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 15937  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||| |||| ||| | ||| || ||||| ||    
T  15936 acctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagcaaaattggcgctccccaagg 15837  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15836 tgaaacacttggtctaacaaatttcttctcaagcaaatcttccaactgtttcttcaa 15780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 70 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22230 - 21984
Alignment:
Q  70 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 169  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22230 ccttcactttaatctgatgatagctcgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcgattcttggaagtgg 22131  T
Q  170 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac 269  Q
    ||| | |||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||     
T  22130 ataactattctttattgtcactttgttcaacttccggtaatctatacacaacctcatgctaccatctttcttcttaacgagcaacactggcgctccccaa 22031  T
Q  270 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaa 316  Q
    ||||||||||||||| | | ||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  22030 ggtgaaacactcggtattacaaacttcttatcaagcaaatcttccaa 21984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Original strand, 9209 - 9458
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  9209 taatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 9308  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||||    
T  9309 cttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaaca 9408  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  9409 cttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 9458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 2693 - 2946
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||   | |||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  2693 taatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgttcacccactaactaatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 2792  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||||    
T  2793 cttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaaca 2892  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  2893 cttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattca 2946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Original strand, 16429 - 16678
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  16429 taatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 16528  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || |||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  16529 cttgatagttaccttgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgcttccatctttcttcttcactaccaaaactggcgctccccaaggtgaaaca 16628  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||||| ||| | |||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  16629 cttggtctaacaaatttcttctcgagcagatcttcaaactgtttcttcaa 16678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 4)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 35760 - 36016
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  35760 tttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 35859  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || || ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  35860 acctattcttgatagttactttgttcaactgacgataatcgatacataacctcatactaccatctttcttctttactaacaaaactggcgctccccaagg 35959  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  35960 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaattcttctaattgtttcttcaa 36016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 2987 - 3240
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||| |||| ||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||  ||    
T  2987 taatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcgtcggaagtggatacctgtt 3086  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |  || | ||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  3087 ctttatcgtaactttgttcaactgacgataatcaatgcatagcctcatggtaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccaaggtgaaaca 3186  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||| | ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  3187 cttggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattca 3240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 136 - 313
Target Start/End: Original strand, 28404 - 28581
Alignment:
Q  136 gctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatc 235  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || || || || ||||||||  ||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  28404 gctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttattcaactgatgataatcgatacataacctcatactaccatc 28503  T
Q  236 tttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttc 313  Q
    ||| ||||| |||||||| || || || || || ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  28504 ttttttctttactaacaaaacgggcgctcctcaaggtgaaaaacttggtctaacaaacttcttctcaagcaaatcttc 28581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 112
Target Start/End: Original strand, 28363 - 28403
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatctt 112  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28363 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatctt 28403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 17200 - 17456
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  17200 tttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtcgat 17299  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||    
T  17300 acctattcttgatagttaccttgttcaattgtcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagcaacaccggcgctccccaagg 17399  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17400 tgaaacacttggtctaacaaatttcttctcaagcaaatcttccaactgtttcttcaa 17456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 10738 - 10994
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  10738 tttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtcgat 10837  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||| |||| ||| ||  | || ||||| ||    
T  10838 acctattcttgatagttaccttgttcaattgtcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccagcgctccccaagg 10937  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10938 tgaaacacttggtctaacaaatttcttctcaagcaaatcttccaactgtttcttcaa 10994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 70 - 328
Target Start/End: Original strand, 45413 - 45671
Alignment:
Q  70 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 169  Q
    |||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  45413 cctttaccttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcgtcaattcttggaagcgg 45512  T
Q  170 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac 269  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||| ||| |||||||| | ||| | |||||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || |||||     
T  45513 atacctattcttgatagttaccttgttcacctgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaa 45612  T
Q  270 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  45613 ggtgaaacactcggtctaacaaatttcttctcaagcaaatcttccaactgtttcttcaa 45671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 48547 - 48300
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| | || ||||||||| | |||||||||||  || ||||| || ||||| ||||| | |||||    
T  48547 atctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaattctcggaagcggatatctattct 48448  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | |  || || || |||||||| || || || |  || |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  48447 ttactgtaactttattcaactgacggtagtcaatgcataacctcatactaccatctttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacact 48348  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     ||||| | ||||| ||| || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  48347 tggtcttacaaacttcttgtcgagcaagtcctctaactgtttcttcaa 48300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 79 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 217455 - 217194
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  217455 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgcaaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctatt 217356  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| |||||||| || |||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||| |  ||  | |||||||||||||||    
T  217355 ctttatcgtcactttgttcaattgtcgataatcaatacacaatctcatactaccatctttcttcttaactagcaatatcggcactccccacggtgaaaca 217256  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    || ||||| | ||||| ||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  217255 cttggtcttacaaacttcttatcaagtaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactc 217194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 91 - 347
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  91 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacgcgtgcacccacaaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 190  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || ||||| |||||||| || |||||||| | ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||    
T  191 acctattcttgatagtcacattgttcaagtgacgataatcgatacataatctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaagg 290  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  291 tgaaacacttggtctaaaaaacttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaa 347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5386 - 5137
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||    ||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  5386 taatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctgaatacacgagcacccactaattgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgtt 5287  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  5286 ctttatcgtaaccttgttcaactgacgataatcaatgcaaaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccaaggtgaaaca 5187  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||| | ||| | ||| |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  5186 cttggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcctccaattgtttcttcaa 5137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 9817 - 9568
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||    ||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  9817 taatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctgaatacacgagcacccactaattgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgtt 9718  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  9717 ctttatcgtaaccttgttcaactgacgataatcaatgcaaaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccaaggtgaaaca 9618  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||| | ||| | ||| |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  9617 cttggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcctccaattgtttcttcaa 9568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 327
Target Start/End: Original strand, 76630 - 76942
Alignment:
Q  15 gaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttac 114  Q
    ||||| ||| |||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||| |||||  | |||| ||||||||    
T  76630 gaatattcaaagtgtccatatctagtccggaatgcagttttggatatatactccgcctttactcgtatctggtgataacctgactttaaattaatcttac 76729  T
Q  115 taaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccac 214  Q
    | ||||| | ||| ||||| | |||||||||||| || || |||||| |  | |||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  76730 tgaacacttatgccccaaccaactgatccatcaagtcgtcgatccttaggtgaggatattgattcttaatcgtaactttgttcaactgtcgataatccac 76829  T
Q  215 acacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttcc 314  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||  || |||||||| ||||| | ||| ||||||    
T  76830 acacaacctcatactgccatccttcatcttaactaacaacattggattaccccacagtgaaaccctcgacctgataaactgtttctctaacaattcttcc 76929  T
Q  315 aactgattcttca 327  Q
    || || |||||||    
T  76930 aattgcttcttca 76942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 332
Target Start/End: Original strand, 21382 - 21644
Alignment:
Q  70 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 169  Q
    |||| ||| |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||| || |  ||||||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  21382 ccttcactttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacttttgcacccaccacttgatccaccaagtcgtcaatcctcggaagtgg 21481  T
Q  170 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac 269  Q
    |||||  ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  21482 atacctgttctttatcgtaactttgttcaactgacgataatcaatgcacaacctcatgctaccgtccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccac 21581  T
Q  270 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  21582 ggtgaaacactaggtctaacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattca 21644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27275 - 27049
Alignment:
Q  87 tgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcg 186  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| || |    
T  27275 tgatagcccgatcttaagtcaattttactgaacacacgtgcacccactaactgatacatcaaatcattgatcctcggaagtggatacctattctttattg 27176  T
Q  187 tcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtct 286  Q
    |||| || ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| || || |||||||| ||    
T  27175 tcactttattcaactgccggtaatctatacataacctcatgctaccatctttctttttaaccaataacaccggcgctccccaaggcgacacactcggcct 27076  T
Q  287 aataaactgcttctcaagcaactcttc 313  Q
     | ||||| ||| |||||||| |||||    
T  27075 tacaaacttcttatcaagcaaatcttc 27049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26369 - 26250
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26369 cacaaaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcggttttggatatctcttccgccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 26270  T
Q  111 ttactaaacacctctgcacc 130  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26269 ttactaaacacctctgcacc 26250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19669 - 19416
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||| || || || | |||||| |||| ||||||||| || || ||||||||  ||||||||||||  ||    
T  19669 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccattaagtcgtcaatcctcagaagtggatacctgtt 19570  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || || |||||||| | ||| || |  || ||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| || || || ||||| || ||||||    
T  19569 ctttattgtaactttattcaactgacaatagtcaatgcataacctcatgctaccatccttcttcttaaccagcaataccggcgctccccaaggcgaaaca 19470  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  19469 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattca 19416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 2140 - 2393
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||   |||||| ||||  |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||    
T  2140 taatctgatggtaaccagacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaattgatccattaaatcgtcaattctcggaagtggatacctatt 2239  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || |||||||| || ||||  | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||    
T  2240 ctttatcgtcactttattcaactgacggtaatatatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccacggtgaaaca 2339  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    |||||||| | ||| | ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  2340 ctcggtcttacaaatttcttatcaagcaaatcctccaactgtttcttcaattca 2393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 197
Target Start/End: Original strand, 2142 - 2327
Alignment:
Q  11 cacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatc 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2142 cacataatactcatagtgtccatacctcgttcggaacacagttttggatatatcttccgccttcactctaatctgatgatatcctaatctcaaatcaatc 2241  T
Q  111 tt----actaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttc 197  Q
    ||    |||  | ||||       ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2242 tttgggactggatacct-----taaatcagctgatccatcaaatcatcaatccttgggagtggataccgattcttaatcgtcactttgttc 2327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Original strand, 17147 - 17396
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||   |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  17147 taatctggtgataacccgatctcaaattaatcttactaaacacacgtgcacccactaattgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctatt 17246  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || || |||||||| |||||||| | | |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||    
T  17247 ctttatcgttactttattcaactgtcgataatcaataaacaatctcatactaccatctttcttcttaactaacaataccggtgctccccacggtgaaaca 17346  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||| | ||||| ||| ||||| || ||||| | ||| ||||||||    
T  17347 cttggtcttacaaacttcttatcaagaaaatcttctagctgcttcttcaa 17396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 111775 - 111681
Alignment:
Q  246 actaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||||    
T  111775 actaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaactttttctcaagcaaatcttctaattgtttcttcaactcagccaactc 111681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 115073 - 114812
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  115073 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctatt 114974  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |  ||||| |||||||||    
T  114973 ctttatcgttactttattcaactgtcgataatcaatgcataacctcatgctaccatctttcttcttaactaacaataccgacgatccccaaggtgaaaca 114874  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    |||||||| | ||||| ||| ||||| || ||||| || || |||||||| ||| |||||||    
T  114873 ctcggtcttacaaacttcttatcaagtaaatcttctaattgtttcttcaactcagccaactc 114812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16020 - 15764
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16020 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaacacatgtgcacccactaactaatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 15921  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || ||||| || |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| || || || ||||| ||    
T  15920 acctattctttattgtcactttattcaactgtcgataatcaatacacaacctcatactagcatctttcttcttaactagcaataccggcgctccccaagg 15821  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || |||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||| || || ||||||||    
T  15820 tggaacacttggtctcacaaacttcttatcaagcaaatcttctaattgtttcttcaa 15764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37862 - 37606
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || | |||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  37862 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacatgtgcacccactaactaatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 37763  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||    
T  37762 acctattcttgatagttactttgttcaactgacgataatcgatacacaacctcatacaaccatctttcttcttcacgaacaaaaccggcgctccccaagg 37663  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    | ||||||| |||| || ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  37662 taaaacacttggtcgaacaaacttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaa 37606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 286
Target Start/End: Original strand, 22976 - 23183
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||| |||||||    | |||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  22976 taatctggtggtagcccgatctcaaatcaatcttgctaaacagacattcacccactaactgatccatcaaatcatctattcttggaagtggatacctatt 23075  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || || |||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||    
T  23076 ctttatcgttactttattcaactgtcgataatctatacacaacctcatactaccatctttcttcttaactaacaataccggcgctccccaaggtgaaaca 23175  T
Q  279 ctcggtct 286  Q
    ||||||||    
T  23176 ctcggtct 23183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 304
Target Start/End: Original strand, 7430 - 7717
Alignment:
Q  17 atactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttacta 116  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||| || ||    ||||||||  | |||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||     
T  7430 atactcataatgtccataccacgttctgaacgctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctg 7529  T
Q  117 aacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacac 216  Q
    || || |  ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||    
T  7530 aaaacattagcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaactgtcgatagtcaacac 7629  T
Q  217 acaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaag 304  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || || || ||||| |||||||||||  |||||| |||||  ||||||||    
T  7630 acaacctcatgctaccatctttcctcttcactaacaaaacgggcgctccccaaggtgaaacacttcgtctaacaaactttttctcaag 7717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18518 - 18265
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || | |||||| || |  || |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||  ||    
T  18518 taatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaacttttgcacccaccaattggtccatcaagtcatcaatcctcggatgtggatacctgtt 18419  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||    
T  18418 ctttatcgtaactttgttcaactgacgataatcaatgcacaacctcatgctaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaaca 18319  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18318 ctgggtctaacaaacttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattca 18265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 141 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 5822 - 5631
Alignment:
Q  141 tccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttct 240  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||| || || ||||    
T  5822 tccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaactgacgatagtcaatgcacaacctcatgctaccgtccttct 5723  T
Q  241 tcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  5722 tctttacaaacaacacaggtgctccccacggtgaaacactgggtctaacaaacttcttatcaagcaagtcttccgactgtttcttcaattca 5631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Original strand, 41967 - 42216
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  ||    
T  41967 taatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacacacgagcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggatacctgtt 42066  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || ||||||    
T  42067 cttaatcgtcactttattcaactgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggcgaaaca 42166  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||| | ||| | ||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  42167 cttggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 42216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 51380 - 51131
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  51380 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 51281  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || ||||||||||  |||||||| | ||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||||    
T  51280 cttgatagttactttgttcaactaacgataatcgatacataatctcatactaccgtctttcttcttcactaacaaaaccggcgctccccatggtgaaaca 51181  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     | ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  51180 attggtctaacaaacttcttctcaagcaaatcttctaattgtttcttcaa 51131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 304
Target Start/End: Original strand, 323 - 555
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || | |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  323 tttactttaatatggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatccttggaagttgat 422  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  423 acctattctttattgtcaccttgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 522  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaag 304  Q
     |||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  523 cgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaag 555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24340 - 24080
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||  ||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||||   |||||| |||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  24340 tttactttaatctagtgataacccaatctcaagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtggat 24241  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || || || ||||| ||    
T  24240 acctattctttatcgttaccttattcaactgtcgataatcaatacataatctcatgctaccatctttcttcttaactagcaataccggtgctccccaagg 24141  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  24140 tgaaacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcttctaattgtttcttcaattca 24080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10783 - 10602
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10783 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaatacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcagttcttggaagtggat 10684  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaa 253  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  10683 acctattctttatcgttaccttattcaactgtcgataatcaaggcataacctcatactaccatctttcttcttaaccaacaa 10602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 201510 - 201296
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| |||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||||   || ||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  201510 tttactttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttgctaaacactcgtgtacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggat 201411  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| ||| || |||||||| || |||||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||    
T  201410 acctattttttatcgtcactttattcaactgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatctttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaagg 201311  T
Q  272 tgaaacactcggtct 286  Q
    |||||||||||||||    
T  201310 tgaaacactcggtct 201296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 324975 - 325229
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||   ||    
T  324975 taatctgatggtaacctgaccttaagtcaatcttactaaaaaccttcgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaatcctcggaagtggatacttgtt 325074  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || || |||||||  ||||| || |  |||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| |||    
T  325075 ctttattgtaactttattcaactaacgatagtcaatgcacaacctcatgctaccgtccttcttctttaccaacaataccggcgctccccaaggtgagaca 325174  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttcc-aactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | |||||  || |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||    
T  325175 cttggtcttacaaactttttatcaagcaagtcttccaaaccgtttcttcaattca 325229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Original strand, 19623 - 19872
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||    ||||| ||||  |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  19623 taatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctgaacacacgagcacccactaattgatccattagatcatcaatcctcggaagtggatacctatt 19722  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || |||| ||| || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||    
T  19723 ctttatcgtcactttattcagctgacggtaatctatacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccacggtgaaaca 19822  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    |||||||| | ||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19823 ctcggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 19872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14151 - 13910
Alignment:
Q  87 tgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcg 186  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || || || | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |    
T  14151 tgataccccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatag 14052  T
Q  187 tcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtct 286  Q
    | ||||||||||||||  |||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  14051 ttaccttgttcaactgatgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtct 13952  T
Q  287 aataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||| | ||| |||||||| ||||| || || ||||||||    
T  13951 aacaaatttcttttcaagcaaatcttctaattgtttcttcaa 13910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 328
Target Start/End: Original strand, 40432 - 40673
Alignment:
Q  87 tgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcg 186  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||| || |    
T  40432 tgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcagttctcggaagtggatacctattcttgatag 40531  T
Q  187 tcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtct 286  Q
    | |||||||||||||| |||||||| | ||| | |||||| || |||||||||||||| |||| ||| |  || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  40532 ttaccttgttcaactgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtct 40631  T
Q  287 aataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  40632 aacaaatttcttctcaagcaagtcttccaactatttcttcaa 40673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Original strand, 9630 - 9886
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   || ||| |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  9630 tttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgtacccactaactgatccatcagatcatcaattctcggaagtggat 9729  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || |||||||||||||| || ||||| | ||| | |||||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||    
T  9730 acctattcttgatagttaccttgttcaactgtcggtaatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaagg 9829  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9830 tgaaacacttggtctaacaaatttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 9886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 81 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31352 - 31101
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  31352 atctgatggtaaccagacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacctattct 31253  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||| || || || ||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  31252 ttatcgtaactttgttaaattgacggtaatcaatgcacaacctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacact 31153  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
     ||||| | |||||  || |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  31152 tggtcttacaaacttgttatcaagcaaatcctccaactgtttcttcaattca 31101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Original strand, 53899 - 54134
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53899 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggat 53998  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || | ||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||  ||    
T  53999 acctattctttattgtcaccttgttcaactgtcgatagtcaatacacaatgtcatgctaccatctttcttctttactagcaaaacgggcgctcccctagg 54098  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaa 307  Q
    ||||||||  ||||||| |||||  ||||| |||||    
T  54099 tgaaacacgtggtctaacaaactttttctcgagcaa 54134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11274 - 11024
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  11274 taatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 11175  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactg--gagcaccccacggtgaaa 276  Q
    ||| || || |||||||||||||| ||||| || | |||||| |||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||  | || ||||| |||||||    
T  11174 cttgatagttaccttgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcaggctaccatctttcttctttactagcaaaactggcgcgctccccaaggtgaaa 11075  T
Q  277 cactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||   ||||| ||| | ||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  11074 cact-tttctaacaaatttcttttcaagcaaatcttctaactgtttcttcaa 11024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 340
Target Start/End: Original strand, 36612 - 36880
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| | ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  36612 tttactttgatctggtgataacctaatctcaaattaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaaatctcggaagtggat 36711  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || || |||||||| || |||||||| | ||| || ||||| || |||||||||||||  ||||| || || || || ||||| ||    
T  36712 acctattcttgatagttactttgttcaattgacgataatcgatacataatctcatactaccatctttcttctgtactaataaaaccggcgctccccatgg 36811  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  36812 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcacctaactc 36880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 340
Target Start/End: Original strand, 31146 - 31414
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| | ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||| || || ||   |||||| |||| |||||||||||||||||||   || ||||||||||    
T  31146 tttactttgatctggtgataacctaatctcaaattaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcatatctcggaagtggat 31245  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || || || |||||||| || |||||||| | ||| || ||||| || |||||||||||||  ||||| || || || || ||||| ||    
T  31246 acctattcttgatagttactttgttcaattgacgataatcgatacataatctcatactaccatctttcttctgtactaataaaaccggcgctccccatgg 31345  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  31346 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcacctaactc 31414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 125 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13883 - 13679
Alignment:
Q  125 tgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctc 224  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| ||||| || | |||||| |||    
T  13883 tgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgacgatagtcaatacacaatctc 13784  T
Q  225 atgcttccatctttcttcttaactaacaacactg--gagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgatt 322  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||  | || ||||| |||||||||||   ||||| ||| | ||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  13783 atgctaccatctttcttctttactagcaaaactggcgcgctccccaaggtgaaacact-tttctaacaaatttcttttcaagcaaatcttctaactgttt 13685  T
Q  323 cttcaa 328  Q
    ||||||    
T  13684 cttcaa 13679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 81 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 99595 - 99344
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||| || | ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  99595 atctgatggtaacctgacctcaattcaatcttactaaaaacctttgcacccaccaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttct 99496  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | || || || || |||||||| |||||||| |  |||||||||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  99495 ttattgtaactttattcaactgacgataatcaatgcacaacctcatgctaccgtccttcttctttaccaacaacacaggtgctccccacggtgagacact 99396  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
     ||||| | ||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  99395 tggtcttacaaaattcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattca 99344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 286
Target Start/End: Original strand, 175398 - 175469
Alignment:
Q  215 acacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtct 286  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || || |||||||||||||||||    
T  175398 acacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctcctcaaggtgaaacactcggtct 175469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 87 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11186 - 10944
Alignment:
Q  87 tgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcg 186  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || || || | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| |    
T  11186 tgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacatgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctgttcttaatag 11087  T
Q  187 tcacctt-gttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtc 285  Q
    | || || |||||||||  | ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  11086 ttacttttgttcaactgatgttaatcgatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtc 10987  T
Q  286 taataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||| |||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10986 taacaaactttttctcgagcaaatcttctaactgattcttcaa 10944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5933 - 5675
Alignment:
Q  70 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 169  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| |||| ||| |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  5933 ccttcactttaatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactggtccatcaagtcgtcaattcttggaagtgg 5834  T
Q  170 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac 269  Q
    ||||| |||||| ||||| || || ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||||     
T  5833 atacctattctttatcgttactttattcaattgtcgataatcaatacataacctcatgctaccatctttcttcttaactaacaaaacgggcgctccccaa 5734  T
Q  270 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| ||| || ||||| ||||| || || ||||||||    
T  5733 ggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatccagcaaatcttctaattgtttcttcaa 5675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 814 - 565
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   | |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  814 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgttcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctatt 715  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || ||||| |||||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||| || ||||||    
T  714 ctttattgttaccttattcaactgtcggtaatcaatacacaacctcatgctaccatccttcttcttcactaacaaaaccggcgctccccaaggcgaaaca 615  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||||| |||||  ||||||||||| || || || || ||||||||    
T  614 cttggtctaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaa 565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Original strand, 20509 - 20758
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||    ||||| |||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  20509 taatctgttgataacctgatctcaagtcaatcttgctgaaaacactagcacccactaactgatccattaagtcatcaattcttggaagtggatacctatt 20608  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| |||||||||    
T  20609 ctttattgtcactttgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactaacaagattggcgctccccaaggtgaaaca 20708  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||||| |||||  ||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  20709 cttggtctaacaaactttttctcgagcaaatcttctaagtgtttcttcaa 20758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 9332 - 9585
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  9332 taatttgatggtaacctgatctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcatccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgtt 9431  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || || |||||||| |||||||| |  || |||||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| |||    
T  9432 ctttattgtaactttattcaactgacgataatcaatgcataacctcatactaccatccttcttctttaccaacaataccggcgctccccaaggtgagaca 9531  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9532 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattca 9585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1533 - 1271
Alignment:
Q  70 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 169  Q
    |||||||  |||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1533 cctttaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacttttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtgg 1434  T
Q  170 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac 269  Q
    ||| |  ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |  ||||   ||||||| || || |||||||| || |||||||  || || ||||||    
T  1433 atatctgttctttatcgtaactttgttcaactgacgatagtcaatgcacagggtcatgctaccgtccttcttctttaccaacaacataggcgctccccac 1334  T
Q  270 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || || ||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  1333 ggcgagacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattca 1271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 22145 - 22398
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || | | |||| || | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  ||    
T  22145 taatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaactttttcacccaccaactggtccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatatctgtt 22244  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || |||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || || |||||||||||||||    
T  22245 ctttatcgtaactttgttcaactgatgataatcaatgcacaacctcatgctaccatccttcttctttaacaacaacacaggcgctccccacggtgaaaca 22344  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22345 ctgggtctaacaaacttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattca 22398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18383 - 18127
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| || || || | |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18383 tttactataatctagtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcactcactaactgatccatcaaatcatcaatcctcagaagtggat 18284  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| || || || | ||| ||    
T  18283 acctattctttattgtcaccttgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaaccggcgctctccaagg 18184  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||| || || || || ||||||||    
T  18183 tgaaacacttggtctaacaaactttttctcgagcaaatcctctaattgtttcttcaa 18127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 39327 - 39580
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || | |||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  39327 taatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaacttttgcacccaccaactggtccatgaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgtt 39426  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || |||||||| || ||||| || |  ||||||||| |||| || || |||||||| || ||||||||  | || |||||| ||||||||    
T  39427 ctttatcgtaactttgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcgtgctaccgtccttcttctttaccaacaacacaagcgctccccacagtgaaaca 39526  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  39527 ctgggtctaacaaacttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattca 39580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 79866 - 79613
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || | || ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||  ||    
T  79866 taatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcgaaagtggatacctgtt 79767  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || ||||||||||| ||||| || |  ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||    
T  79766 ctttatggtaactttgttcaactgacgatagtcaatgcacaatctcattctaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaaca 79667  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  79666 ctgggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattca 79613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 332
Target Start/End: Original strand, 60091 - 60261
Alignment:
Q  162 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggag 261  Q
    ||||||||||| |  ||||| |||||||| || |||| ||| |  ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |    
T  60091 ggaagtggatatctgttctttatcgtcactttattcagctgacagtaatctatacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcg 60190  T
Q  262 caccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| | ||| | ||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  60191 ctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatctagtaaatcctccaactgtttcttcaattca 60261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Original strand, 58286 - 58535
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  58286 taatctggtgataacccgacctcaaatcaatcttgctaaaaacttttgcacccactaattgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 58385  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || |||||||||||||| ||||| || |  ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  58386 cttgatagttaccttgttcaactgacgatagtcaatgcacaatctcatgctaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaata 58485  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||||| ||| | ||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  58486 cttggtctaacaaatttcttttcgagcaaatcttctaactgtttcttcaa 58535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18108 - 17852
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||| || || || | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  18108 tttactttaatctggtgataacatgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggtagtggat 18009  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| ||| || || || || |||||||||||  | ||||| | |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||| || ||||| ||    
T  18008 acctatttttgatagttactttgttcaactgatggtaatcaatacacaatctcatgctaccatctatcttcttcactagcaaaactggcgctccccaagg 17909  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | ||||||| | || ||||| ||||| ||||||||    
T  17908 tgaaacacttggtctaaaaaatttcttctcaggaaaatcttctaactgtttcttcaa 17852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 195522 - 195444
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaat 157  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  195522 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaat 195444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 340
Target Start/End: Original strand, 5375 - 5643
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||| |||||||| ||||||||||||  | ||||||||||    
T  5375 tttactttaatctggtgataacccaatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccaacaaatcatcaattataggaagtggat 5474  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |  || ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||| || || || ||||||||    
T  5475 acctattctttatcgttactttgttcaactatcgataatcaatgcataacctcatgctaccatccttcttcttatctagcaataccggcgctccccacgg 5574  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| || ||||| || || || ||||| ||| |||||||    
T  5575 tgaaacacttggtcttacaaacttcttctcaagtaaatcttctaattgttttttcaactcagccaactc 5643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 11392 - 11557
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||    
T  11392 taatcagatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacatgtt 11491  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttctt 244  Q
    ||| ||||| || || ||||| || | |||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||    
T  11492 ctttatcgtaactttattcaattgacaataatcaatgcacaacctcatgctaccgtccttcttctt 11557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 249 - 332
Target Start/End: Original strand, 14562 - 14645
Alignment:
Q  249 aacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  14562 aacaacacaggcgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcctccaactgtttcttcaattca 14645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2004 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold2004
Description:

Target: scaffold2004; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 125 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 802 - 599
Alignment:
Q  125 tgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctc 224  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || || || || |||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  802 tgcacccactaactaatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctttattgttacttttttcaactgtcgataatcaatacacaacctc 703  T
Q  225 atgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattct 324  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  702 atgctaccatccttcttctttactaacaacacaggcgctccccatggtgaaacacttggtctaacaaactttttctcaagcaaatcttctaattgtttct 603  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  602 tcaa 599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 81 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1578 - 1319
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||   ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||  |  ||||    
T  1578 atctgatggtagcctgacctcaagtcaatcttactgaaaaccctcgcacccactagctgatccatcaagtcatcaatcctcgggagcggatgtctgttct 1479  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | || || || || |||||||| ||||| || |  || | |||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  1478 ttattgtaactttattcaactgacgatattcaatgcatagcctcatacttccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacact 1379  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    |||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1378 cggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcttccaactgattcttcaattcagccaactc 1319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 156
Target Start/End: Original strand, 10437 - 10514
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaa 156  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||   |||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  10437 taatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacacatgcacccactaactgatccatcaagtcatcaa 10514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 33605 - 33859
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  |||||||   |||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  33605 taatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgttaaacacacgtgcacccactaattgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgtt 33704  T
Q  179 ctt-aatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaac 277  Q
    ||| ||| || |||||||||||||| |||||||| |  || ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  33705 ctttaatggtaaccttgttcaactgacgataatcaatgcataacctcaagctaccatccttcttcttaaccaacaacactggcgcttcccacggtgaaac 33804  T
Q  278 actcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    ||| ||||| | ||| | ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  33805 acttggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattca 33859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 332
Target Start/End: Original strand, 28940 - 29146
Alignment:
Q  126 gcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctca 225  Q
    ||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |  || ||| |||    
T  28940 gcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatgcataacgtca 29039  T
Q  226 tgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattctt 325  Q
    || | ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  29040 tgttgccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcctccaactgtttctt 29139  T
Q  326 caattca 332  Q
    |||||||    
T  29140 caattca 29146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 50215 - 49966
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || | |||||  || | ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||    
T  50215 taatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaacttttgcactcaccaactggtccatcaagtcatcaatcctcggtagtggatacctgtt 50116  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || || |||||||  ||||| || |  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||    
T  50115 ctttattgtaactttattcaactaacgatagtcgatgcacaatctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacacaggcgctccccatggtgaaaca 50016  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||| |  |||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  50015 cttggtcttacgaacttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 49966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 59249 - 59000
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || | |||||  || | ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||    
T  59249 taatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaacttttgcactcaccaactggtccatcaagtcatcaatcctcggtagtggatacctgtt 59150  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || || |||||||  ||||| || |  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||    
T  59149 ctttattgtaactttattcaactaacgatagtcgatgcacaatctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacacaggcgctccccatggtgaaaca 59050  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||| |  |||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  59049 cttggtcttacgaacttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 59000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 65637 - 65388
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || | |||||  || | ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||    
T  65637 taatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaacttttgcactcaccaactggtccatcaagtcatcaatcctcggtagtggatacctgtt 65538  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || || |||||||  ||||| || |  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||    
T  65537 ctttattgtaactttattcaactaacgatagtcgatgcacaatctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacacaggcgctccccatggtgaaaca 65438  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||| |  |||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  65437 cttggtcttacgaacttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 65388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Original strand, 3703 - 3952
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||    
T  3703 taatctggtgataacccgatctcagatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgaaagtggatacctatt 3802  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |  | ||| |||||||||    
T  3803 ctttattgttactttgttcaactgtcgataatcaatacacaacctcatgctaccatccttcttctttactaacaacacaggcgttcgccaaggtgaaaca 3902  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||||| |||||  ||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  3903 cttggtctaacaaactttttctcaagcaaatcttctaattgtttcttcaa 3952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Original strand, 771 - 1020
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| |||||| |||| || ||||||||    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||    
T  771 taatctgatggtaacctgacctcaaaccaattttgctaaacacacgagcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagttgatacctatt 870  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || |||||||| |  ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||    
T  871 ctttatcgtcactttattcaactgacattaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccacggtgaaaca 970  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     ||||||| | ||| | ||| ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  971 ttcggtcttacaaatttcttatcaagtaaatcctccaactgtttcttcaa 1020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15256 - 15007
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||   |||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  15256 taatccgatgataacccgatctcaaagcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtgtatacctatt 15157  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || || |||||| | |||||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||    
T  15156 ctttattgttactttcttcaaccgtcgataatcaatgcataacctcatgctaccatctttcttcttaactaacaataccggcgctccccacggtgaaaca 15057  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||| | ||||| ||| | ||| || ||||| ||||  ||||||||    
T  15056 cttggtcttacaaacttcttattaagtaaatcttctaactatttcttcaa 15007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 340
Target Start/End: Original strand, 4185 - 4446
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||   |||||| || |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  4185 taatctggtgataacccgatcttaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccacaaaatgatccatcaaatcatcaattcttggaagcggatacctatt 4284  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||| |   | || |||||||||||||||    
T  4285 ctttatcgttactctattcaactgtcgataatcaatacacaatctcatactaccatctttcttcttaacaagcaatatcagcgctccccacggtgaaaca 4384  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  4385 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactc 4446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 45462 - 45209
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||    
T  45462 taatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctatt 45363  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||| || |  ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| |||    
T  45362 cttaattgtaactttgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttctttaccaacaataccggcgctccccaaggtgagaca 45263  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  45262 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcttccaactgcttctttaattca 45209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 40366 - 40119
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| | ||  |||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||  ||||    
T  40366 atctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaatatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttct 40267  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||| | |||||  ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  40266 tgatcgtaactttgttcaactgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacact 40167  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     ||||| | ||||| ||| || | ||  || |||||||| ||||||||    
T  40166 gggtcttacaaacttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaa 40119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 96 - 328
Target Start/End: Original strand, 1285 - 1517
Alignment:
Q  96 gatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgt 195  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||   |||||| |||| ||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||  |  || || ||||| ||||    
T  1285 gatcttaaatcaatcttactgaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaattgtcgatcctcggaagtggatacctgtaatttattgtcactttgt 1384  T
Q  196 tcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactg 295  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||     
T  1385 tcaactgccgataatctatacaaaacctcatgctaccatctttcttcttaaccaacaacactgacgctccccaaggtgacacactcggtcttacaaactt 1484  T
Q  296 cttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  1485 cttatccagcaaatcttctaactgctttttcaa 1517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 328
Target Start/End: Original strand, 36235 - 36546
Alignment:
Q  17 atactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttacta 116  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||| || || ||    ||||||||  | |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  36235 atactcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctg 36334  T
Q  117 aacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacac 216  Q
    || || | |  ||| |||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || ||||| || | ||    
T  36335 aaaacttttcaacccactaactgatccatcaaatcattaattctcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaattgtcgatagtcaatac 36434  T
Q  217 acaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaa 316  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||||||||| | ||||||| |||||  |||| ||| || ||||| ||    
T  36435 acaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacagttggtctaacaaactttttcttaagaaaatcttctaa 36534  T
Q  317 ctgattcttcaa 328  Q
     || ||||||||    
T  36535 ttgtttcttcaa 36546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 328
Target Start/End: Original strand, 20812 - 21122
Alignment:
Q  18 tactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaa 117  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||| || || ||    ||||||||  | |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |    
T  20812 tactcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctga 20911  T
Q  118 acacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacaca 217  Q
    | || | |  ||| |||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || ||||| || | |||    
T  20912 aaacttttcaacccactaactgatccatcaaatcattaattctcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaattgtcgatagtcaataca 21011  T
Q  218 caacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaac 317  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||||||||| | ||||||| |||||  |||| ||| || ||||| ||     
T  21012 caatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacagttggtctaacaaactttttcttaagaaaatcttctaat 21111  T
Q  318 tgattcttcaa 328  Q
    || ||||||||    
T  21112 tgtttcttcaa 21122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 328
Target Start/End: Original strand, 4441 - 4699
Alignment:
Q  70 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 169  Q
    |||| ||| |||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||   |||||| || | ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  4441 ccttcactttaatctgatggtaaccggacctcaaatcaattttactaaacacaggtgcacccacaaactgatccattaaatcgtcaattctcggaagtgg 4540  T
Q  170 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac 269  Q
    |||||  ||||| |||||||| || || | ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || || || ||||||    
T  4541 atacctgttctttatcgtcactttatttagctgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatctttcttcttaaccaataataccggcgctccccac 4640  T
Q  270 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||||||||||| | ||| | ||| ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  4641 ggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatcaagtaaatcctccaactgtttcttcaa 4699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 889 - 637
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || |||| |||||| |||| ||||||||| || || |||||||| |||||||||||||  ||    
T  889 taatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaa-acctttgcacccactaactgatccattaagtcgtcaatcctcggaagtggatacctgtt 791  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||||  | ||| || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||||  || || ||||| |||||||||    
T  790 ctttatcgtaactttgttcaactgacgataataaatacataatctcatggtaccatccttcttcttaaccaacaacatcggcgctccccaaggtgaaaca 691  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  690 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattca 637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Original strand, 11099 - 11348
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || || || ||||| ||||||||  | |||||   |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  11099 taatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttgttgaacacgcgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggatacctatt 11198  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || ||||| || ||||||||  | ||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||     
T  11199 ctttattgtcactttattcaactgaaggtaatctatacacaatctcatgctaccatctttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacg 11298  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    |||||||| | ||||| ||| ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  11299 ctcggtcttacaaacttcttatcaagtaaatcctccaactgtttcttcaa 11348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 332
Target Start/End: Original strand, 24505 - 24738
Alignment:
Q  99 ctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttca 198  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |    
T  24505 ctcaagtcaatcttactgaacacccttgcacccactaactgatccattaagtcatcaattctcggaagtggatacctattctttatcgtaactttgttta 24604  T
Q  199 actgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgctt 298  Q
    |||| |  ||||| |  || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||    
T  24605 actgacagtaatcaatgcataatctcatgctaccatccttcttcttgactaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttctt 24704  T
Q  299 ctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
     |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  24705 atcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattca 24738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 44452 - 44199
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||    
T  44452 taatctgatggtaacccgacctcaaatcaattttactgaacacacgagcacccactaactgatccatcaaatcgtcaattctcggaagtggatacctgtt 44353  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || |||| ||| || ||||| | ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |  || || ||||||||| |||||    
T  44352 ctttatcgtcactttattcagctgacggtaatctatacataacctcacgctaccatccttcttcttaaccaacaatatcggcgctccccacggttaaaca 44253  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    |||||||| | ||||| ||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  44252 ctcggtcttacaaacttcttatcaagtaaatcctccaactggttcttcaattca 44199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 9069 - 8820
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  9069 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatctatccttggaagtggatacctatt 8970  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || ||  ||||||| ||||| || |  || |||||||| || ||||||||||||||||| || || |  || || ||||| |||||||||    
T  8969 ctttatcgttactttactcaactgtcgatagtcaatgcataacctcatactaccatctttcttcttaaccaaaaatatcggggctccccaaggtgaaaca 8870  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    |||||||| | ||||| ||| |  || || ||||| ||||| ||||||||    
T  8869 ctcggtcttacaaacttcttattgagtaaatcttctaactgtttcttcaa 8820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 284
Target Start/End: Original strand, 6628 - 6812
Alignment:
Q  100 tcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaa 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||  ||||    
T  6628 tcaaatcaatcttgctaaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatctatccttggaagtggatacctattctttatcgttactttactcaa 6727  T
Q  200 ctgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggt 284  Q
    ||| ||||| || |  || |||||||| || ||||||||||||||||| || || |  ||  | ||||| |||||||||||||||    
T  6728 ctgtcgatagtcaatgcataacctcatactaccatctttcttcttaaccaaaaatatcggcactccccaaggtgaaacactcggt 6812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Original strand, 1324 - 1471
Alignment:
Q  100 tcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaa 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||  ||||    
T  1324 tcaaatcaatcttgctaaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatctatccttggaagtggatacctattctttatcgttactttactcaa 1423  T
Q  200 ctgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaac 247  Q
    ||| ||||| || |  || |||||||| || |||||||||||||||||    
T  1424 ctgtcgatagtcaatgcataacctcatactaccatctttcttcttaac 1471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 53316 - 53569
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |  ||    
T  53316 taatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaattgatccatcaagtcatcaatcctagaaagtggatatctgtt 53415  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || || |||||||| | ||| || |  || ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||    
T  53416 ctttattgtaactttattcaactgacaatagtcaatgcataacctcatgctaccgtccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaaca 53515  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  53516 ctaggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattca 53569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 2532 - 2279
Alignment:
Q  87 tgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcg 186  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||  | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||    
T  2532 tgataaccggatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaattcatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacctattctttatcg 2433  T
Q  187 tcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtct 286  Q
    | || ||||||||||| |||||||| |  || || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |  || || ||||| |||||||||||  ||||    
T  2432 ttactttgttcaactgtcgataatcaatgcataatctcatgctaccatctttcttcttaactagcaatatcggcgctccccaaggtgaaacacttcgtct 2333  T
Q  287 aataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
     | ||||| ||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  2332 tacaaacttcttatcaagtaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactc 2279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 313
Target Start/End: Original strand, 151374 - 151615
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || || | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  151374 tttactttaatctggtgataaccagatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggat 151473  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||||| | ||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| || | ||| || || ||  |||| ||    
T  151474 acctattctttattgtcaccttgttcaactgtcaatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcaccagcaaaaccggcgctacccaagg 151573  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttc 313  Q
     |||| ||| ||||||| |||||  |||||||| || |||||    
T  151574 cgaaatacttggtctaacaaactttttctcaagtaaatcttc 151615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 332
Target Start/End: Original strand, 262515 - 262748
Alignment:
Q  99 ctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttca 198  Q
    ||||| ||||||||||| || | || ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||| | ||| |||||||  ||||| || || || |||||||    
T  262515 ctcaagtcaatcttactgaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcataaatcctcgaaagcggatacctgttctttattgtaactttgttca 262614  T
Q  199 actgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgctt 298  Q
    |||| || ||||  | ||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||    
T  262615 actgacggtaatatatacacaacctcatgctaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacactgggtcaaacaaacttctt 262714  T
Q  299 ctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
     |||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  262715 atcaagcaagtcttccaactttttcttcaattca 262748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6178 - 5927
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| | || ||||||||| | |||||||||||| || ||||||||  |||| |||||||  ||||    
T  6178 atctgatggtaaccagacctcaagtcgatcttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcctcagaagcggatacctgttct 6079  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  6078 ttatcgtaaccttgttcaactgacggtaatcaatgcacaacctcatactaccatccttcttctttactagtaacaccggcgctccccaaggtgaaacact 5979  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
     ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  5978 tggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattca 5927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 332
Target Start/End: Original strand, 972 - 1167
Alignment:
Q  137 ctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatct 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  |||||||| ||||| || ||     
T  972 ctgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttattcaactgacgataatcaatgcacaaccttatgctaccgtcc 1071  T
Q  237 ttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  1072 ttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacactgggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcttctaactgtttcttcaattca 1167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 332
Target Start/End: Original strand, 7941 - 8136
Alignment:
Q  137 ctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatct 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  |||||||| ||||| || ||     
T  7941 ctgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttattcaactgacgataatcaatgcacaaccttatgctaccgtcc 8040  T
Q  237 ttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  8041 ttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacagtgaaacactgggtctaacaaacttcttatcaagcaagtcttcaaactgtttcttcaattca 8136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 328
Target Start/End: Original strand, 17977 - 18168
Alignment:
Q  137 ctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatct 236  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||| |||||||| | | |||| |||||||| ||||||    
T  17977 ctgatccatcaagtcatcaattattggaagtggatacctattctttattgttactttgttcaactgtcgataatcaataaacaatctcatgctaccatct 18076  T
Q  237 ttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  18077 ttcttcttcactaacaaaacgggtgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaactttttctcaagcaaatcttctaattgtttcttcaa 18168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 12333 - 12142
Alignment:
Q  137 ctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatct 236  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||| ||||||    
T  12333 ctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatct 12234  T
Q  237 ttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    |||||||| |||| ||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  12233 ttcttctttactagcaaaactagcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctcgagcaaatcttctaattgtttcttcaa 12142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0878 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0878
Description:

Target: scaffold0878; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 246 - 340
Target Start/End: Original strand, 4432 - 4526
Alignment:
Q  246 actaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4432 actaacaacactggagcaccccacggcgaaacacttagtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgtttcttcaattcacccaactc 4526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 126 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 2260 - 2058
Alignment:
Q  126 gcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctca 225  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  2260 gcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttattcaactgacgataatctatacacaacctca 2161  T
Q  226 tgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattctt 325  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||||||| ||||||||||||| | ||| | ||| ||||| || || |||||||| |||||    
T  2160 tgctaccatccttcttcttaaccaaaaatactggcgctccccacggttaaacactcggtcttacaaatttcttatcaagtaagtcctccaactgtttctt 2061  T
Q  326 caa 328  Q
    |||    
T  2060 caa 2058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 126 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 29273 - 29071
Alignment:
Q  126 gcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctca 225  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  29273 gcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttattcaactgacgataatctatacacaacctca 29174  T
Q  226 tgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattctt 325  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||||||| ||||||||||||| | ||| | ||| ||||| || || |||||||| |||||    
T  29173 tgctaccatccttcttcttaaccaaaaatactggcgctccccacggttaaacactcggtcttacaaatttcttatcaagtaagtcctccaactgtttctt 29074  T
Q  326 caa 328  Q
    |||    
T  29073 caa 29071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14514 - 14253
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||   |||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||   |||    
T  14514 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaacacacgtgcacccactaactgatccataaaatcattaattcttggaagtggatatttatt 14415  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || || ||||| || |||||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |  || || | |||||||||||||    
T  14414 ctttatcgttactttattcaagtgtcgataatcaatgcataacctcatgctaccatctttcttcttaactagcaatatcggcgctctccacggtgaaaca 14315  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    || ||||| | ||||| ||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| ||| |||||||    
T  14314 cttggtcttacaaacttcttatcaagtaaatcttctaactttttcttcaactcagccaactc 14253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 11229 - 11482
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||    
T  11229 taatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacacgagcacccactaactgatccattaaatcgtcaattctcggaagtggatacctatt 11328  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || || | ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| || || || |||||||||||||||    
T  11329 ctttatcgtcactttatttagctgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccgacaataccggtgctccccacggtgaaaca 11428  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    |||||||| | ||| | ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||    
T  11429 ctcggtcttacaaatttcttatcaagtaaatcctcgaactgtttcttcaattca 11482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 340
Target Start/End: Original strand, 495297 - 495550
Alignment:
Q  87 tgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcg 186  Q
    ||||| || |||||||||| ||| || ||||||||   || ||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  495297 tgataaccagatctcaaataaatattgctaaacacacgtgaacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctttatcg 495396  T
Q  187 tcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtct 286  Q
    | || ||||||||||| |||||||| |  || || ||||| || ||||||||||||||||||| ||| || || || |||||||||| |||||| |||||    
T  495397 ttactttgttcaactgtcgataatcaatgcataatctcatactaccatctttcttcttaactagcaataccggcgctccccacggtgcaacacttggtct 495496  T
Q  287 aataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
     | ||||| ||| |||||||| || || || |  |||||||| ||| |||||||    
T  495497 tacaaacttcttatcaagcaaatcatctaaatatttcttcaactcagccaactc 495550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 81 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 515386 - 515135
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| | ||  |||||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| |||||    
T  515386 atctgatggtaaccagacctcaagtcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcatcaattctaggaagcggatacctattct 515287  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  515286 ttatcgtaaccttgttcaactgacggtaatctatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacact 515187  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
     ||||| | ||| | ||| || | ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  515186 gggtcttacaaatttcttatccaacaggtcttccaactgtttcttcaattca 515135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 453201 - 452999
Alignment:
Q  126 gcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctca 225  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| || |||| ||| || ||||| | ||| ||||||     
T  453201 gcacccactaactgatccattaaatcatcgatcctcggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcagctgacggtaatctatacataacctcg 453102  T
Q  226 tgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattctt 325  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | ||| |  ||  | ||||||||||||||||||| ||| | ||| | ||| |||||||| || || ||||| |||||    
T  453101 tgctaccatccttcttcttaaccagcaatatcggcactccccacggtgaaacactcgatcttacaaatttcttatcaagcaagtcctctaactgtttctt 453002  T
Q  326 caa 328  Q
    |||    
T  453001 caa 452999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 198 - 340
Target Start/End: Original strand, 441078 - 441220
Alignment:
Q  198 aactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgct 297  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || || ||  |||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||    
T  441078 aactgtcgataatcaatacacaacctcatactaccatctttcttcttaactagcaataccggcgctacccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttct 441177  T
Q  298 tctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    | ||||| || ||||| ||||  |||||||| ||| |||||||    
T  441178 tatcaagtaaatcttctaactatttcttcaactcagccaactc 441220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 331
Target Start/End: Original strand, 28796 - 29048
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||   |||||| |||| |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| | |||    
T  28796 taatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactgaacacgcgtgcacccactaactgatctattaaatcatcaattctcggaagtggatatctatt 28895  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || |||| ||| || ||||| | |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||    
T  28896 ctttatcgtcactttattcagctgacggtaatctatacacaatctcatgctaccacccttcttcttaactaacaataccggcgctccccaaggtgaaaca 28995  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattc 331  Q
    |||||||| | ||| | ||| || || || || |||||||| |||||||||||    
T  28996 ctcggtcttacaaatttcttatccagtaaatcctccaactgtttcttcaattc 29048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 29957 - 29702
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  29957 tttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactatctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggat 29858  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| ||  | || ||||||||||  ||||| || | |||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||  | ||||| ||    
T  29857 acctattcttgatactaactttgttcaactaacgatagtcaatacacgatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcactccccaagg 29758  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     |||| ||| |||||||  || | |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  29757 agaaatacttggtctaacgaa-ttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaa 29702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 331
Target Start/End: Original strand, 109901 - 110153
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||   |||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||  ||    
T  109901 taatctgatggtaaccagacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcgtcaattctcggaagcggatacctgtt 110000  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| ||| |||||||||  |||||||| |  || |||||| |||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||| |||||||    
T  110001 ctttatcgtaaccatgttcaacttacgataatcaatgcataacctcgtgctgccatccttcttcttaacaaataacaccggcgctccccacgatgaaaca 110100  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattc 331  Q
    || ||||| | ||| | ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  110101 cttggtcttacaaatttcttatcaagcaactcctccaattgtttcttcaattc 110153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 55033 - 54852
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55033 tttactttaatctggttataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggat 54934  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaa 253  Q
    | | |||||| || || || ||||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  54933 atctattcttgatagttactttgttcaactgacggtaatcaatacataatctcatactaccatctttcttcttcactaacaa 54852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 52775 - 52711
Alignment:
Q  264 ccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  52775 ccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaattcttctaactgtttcttcaa 52711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 125 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13200 - 12997
Alignment:
Q  125 tgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctc 224  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| | |||||| |||    
T  13200 tgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacttattctttatcgttactttgttcaactgcggataatcaatacacaatctc 13101  T
Q  225 atgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattct 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| || || || |||||  |||||||||| ||||| | |||||  ||  ||||||| ||||| || || ||||    
T  13100 atgctaccatctttcttcttaactagcaaaaccggcgctccccaacgtgaaacacttggtcttacaaactttttaccaagcaaatcttctaattgtttct 13001  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  13000 tcaa 12997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 137 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 41482 - 41291
Alignment:
Q  137 ctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatct 236  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||| | |||| |    
T  41482 ctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctttatggtcaccttgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgataccattt 41383  T
Q  237 ttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    |||||||| |||||||  || || || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||| || || || || ||||||||    
T  41382 ttcttcttcactaacagaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaa 41291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 313
Target Start/End: Original strand, 6142 - 6376
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||   |||||  |||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  6142 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcactcactaactgatccaacaagtcatcaattcttggaagtggatacctatt 6241  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || ||||||||||   |||| || | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||  || || || || ||||| | |||||||    
T  6242 ctttatcgttactttgttcaactattgatagtcaatacacaatctcatactaccatctttcttcttaactagaaataccggcgctccccaagttgaaaca 6341  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttc 313  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| |||||    
T  6342 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcttc 6376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 313
Target Start/End: Original strand, 13272 - 13506
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||   |||||  |||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  13272 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcactcactaactgatccaacaagtcatcaattcttggaagtggatacctatt 13371  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || ||||||||||   |||| || | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||  || || || || ||||| | |||||||    
T  13372 ctttatcgttactttgttcaactattgatagtcaatacacaatctcatactaccatctttcttcttaactagaaataccggcgctccccaagttgaaaca 13471  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttc 313  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| |||||    
T  13472 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcttc 13506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24980 - 24746
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || ||   |||||| |||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  24980 taatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattatcggaagtggatacctatt 24881  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| |  ||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||||    
T  24880 ctttatcgttattttgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatccttcttctttactaacaagacaggcgctccccaaggtgaaaca 24781  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttc 313  Q
    || ||||| | |||||  ||||| ||||| |||||    
T  24780 cttggtcttacaaactttttctcgagcaaatcttc 24746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 249
Target Start/End: Original strand, 8636 - 8812
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || | |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  8636 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaa-acttttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtgaat 8734  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaacta 249  Q
    ||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  8735 acctattctttattgtcacctttttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcacta 8812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1520 - 1267
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| ||||    ||||| |||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  1520 taatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactatacacacgagcacccactgactgatccattaaatcatcaatcctcggaaatggatacctgtt 1421  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || || ||||| |||||||  |  || ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  1420 ctttatcgtcactttatttaactgacgataataaatgcataacctcatggtaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccaaggtgaaaca 1321  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||| | ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  1320 cttggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattca 1267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 5020 - 5273
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||   |||||| ||||  |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||  ||    
T  5020 taatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaacacacgtgcacccactaattgatccattaaatcgtcaattctcggaagtggatacctgtt 5119  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |  || ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||| |||||||||    
T  5120 ctttatcgtaaccttattcaactgtcggtaatcaatgcataacctcatggtaccatcattcttcttaaccaacaacaccagcgctccccaaggtgaaaca 5219  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    ||  |||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||  ||||||||||||    
T  5220 ctttgtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactatttcttcaattca 5273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 81 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 42140 - 41939
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||||   |||||   |||||| |||| ||||||||||||||| || |||||  |||||||||||| |||||    
T  42140 atctggtgatagcctgatcttaagtcaatcttaaagaacacaaatgcacccactaactgatccatcaaatcgtcgatcctcagaagtggatacctattct 42041  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | || ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |  || ||||| ||||| |||||    
T  42040 ttattgtcactttgttcaactgccggtaatctatacacaacttcatgctaccatctttcttcttaaccaacaacaccgacgctccccaaggtgacacact 41941  T
Q  281 cg 282  Q
    ||    
T  41940 cg 41939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 94948 - 94683
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||| ||| |||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| || | ||| |||||||| ||||||||||    
T  94948 atatcttcatccttcactttaatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttgctaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatcc 94849  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
      ||||||||||| | |||||| || || || ||||||||||| ||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||    
T  94848 gcggaagtggatatctattctttattgtaactttgttcaactgacgatagtcaatgcacaacctcatacttccatctttcttctttaccaataacacggg 94749  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattctt 325  Q
     || |||||||| |||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  94748 cgccccccacggcgaaacactgggtcttacaaacttcttgtcaagcaagtcctccaactgtttctt 94683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 107853 - 107680
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  107853 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcttgcacccactaactgatccatcaaatcatccattctcggaagtggat 107754  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttctta 245  Q
    ||| |||||| || || | |||||||||||| |||||||  | ||| |||| ||| || |||||||||||||||    
T  107753 acctattcttgatagttatcttgttcaactgtcgataattaatacataaccgcatactaccatctttcttctta 107680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 328
Target Start/End: Original strand, 114832 - 115080
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| |||||||| | || ||||||||| | |||||||||||  || ||||| || ||||| ||||| |  ||||    
T  114832 atctgatggtaacctgaccacaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaattctcggaagaggatatctgttct 114931  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac-ggtgaaacac 279  Q
    | ||||| || || ||||||||  | || || | |||||||||||| || ||||| ||||||||  | | |||||| || || |||||| ||||||||||    
T  114932 ttatcgtaactttattcaactgatggtagtcaatacacaacctcatactaccatccttcttctttgccagcaacacaggcgctccccacgggtgaaacac 115031  T
Q  280 tcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    | | ||| | ||||| ||| || || || || || ||||||||||||||    
T  115032 ttgctcttacaaacttcttgtcgagtaagtcctctaactgattcttcaa 115080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Original strand, 150840 - 151089
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||   |||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  150840 taatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgtt 150939  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || ||||||||||| ||||| || |  || ||||||||  | ||||| ||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||||    
T  150940 ctttattgtaactttgttcaactgacgatagtcaatgcataacctcatagtaccatccttcttcttaaccagcaataccggcgctccccaaggtgaaaca 151039  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  151040 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 151089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24568 - 24307
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||  |||||||| || || ||||| |||||||||||||||| |||    
T  24568 taatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaattgatccattaagtcgtcaattcttggaagtggatacctatt 24469  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || || |||||||| | |||||| |  |||||  |||| || |||||||||||||| |||| ||| |  || || |||||||||||||||    
T  24468 ctttatcgttactttattcaactgtcaataatcaatgcacaatatcatactaccatctttcttctttactagcaatatcggcgctccccacggtgaaaca 24369  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    || ||||| | ||||| ||| ||||| || ||||| || || |||||||  ||| |||||||    
T  24368 cttggtcttacaaactacttatcaagaaaatcttctaattgtttcttcatctcagccaactc 24307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 250891 - 251144
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||||| |||||| || |  |||||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||    
T  250891 taatctgatggtaaccagacctcaagtcaatcttgctgaacacctttgcacccaccaattgatccattaagtcatcaattctcggaagtggatacctatt 250990  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| |||    
T  250991 ctttatcgtaactttgttcaactgacggtaatcaatgcacaacctcatactaccatccttcttctttaccaacaataccggcgctccccaaggtgagaca 251090  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  251091 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttctttaattca 251144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 244
Target Start/End: Original strand, 8301 - 8485
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || | |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8301 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaattgatccatcaaatcatcaatcc 8400  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttctt 244  Q
    | | ||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||| ||||| || | ||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  8401 tcgaaagtggatacctattctttattgacaccttgttcaactgtcgatagtcaatacataatctcatactaccatctttcttctt 8485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 244
Target Start/End: Original strand, 17497 - 17681
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || | |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17497 atatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaattgatccatcaaatcatcaatcc 17596  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttctt 244  Q
    | | ||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||| ||||| || | ||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  17597 tcgaaagtggatacctattctttattgacaccttgttcaactgtcgatagtcaatacataatctcatactaccatctttcttctt 17681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10092 - 9886
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| || || |||||||| || || |||| |||||| |||| ||||||||| || || |||||||| |||||||||||||  ||    
T  10092 taatctgatggta-cctgaccttaagtcaatcttgctgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcgtcaatcctcggaagtggatacctgtt 9994  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||    
T  9993 ctttatcgtaactttgttcaactgacgataatcaatgcataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgaaaca 9894  T
Q  279 ctcggtct 286  Q
    || |||||    
T  9893 cttggtct 9886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 325
Target Start/End: Original strand, 268870 - 269125
Alignment:
Q  70 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 169  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || |  ||||| || | ||| |||||||| ||||||||||  || |||||    
T  268870 ccttcactttaatttgatggtaacccgacctcaagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatccgcgggagtgg 268969  T
Q  170 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac 269  Q
    ||||| |||||| || || || ||||||||||| ||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||||    
T  268970 atacctattctttattgtaactttgttcaactgacgatagtcaatgcacaacctcatacttccatctttcttcttcaccaataacacgggtgctccccac 269069  T
Q  270 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattctt 325  Q
    || |||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  269070 ggcgaaacactaggtctcacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttctt 269125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 84494 - 84378
Alignment:
Q  140 atccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttc 239  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||| |||||| |||||| || ||||| || |||||||||| |||||| | ||| ||||||||||| |||||||||    
T  84494 atccatcaaatcgttaatcctcggaagtcgatacctattctttattgtcactttattcaactgcctataatctatacataacctcatgctaccatctttc 84395  T
Q  240 ttcttaactaacaacac 256  Q
    |||||||| || |||||    
T  84394 ttcttaaccaataacac 84378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 12064 - 12318
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaat-caatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgat 177  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||| |||| |||||||||||   |||||| ||||  |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||  |    
T  12064 taatctgatggtaacctgacctcaaattcaattttactaaacacacgtgcacccactaattgatccattaaatcgtcaattctcggaagtggatacctgt 12163  T
Q  178 tcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaac 277  Q
    |||| |||||||| || ||||  ||  | ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||    
T  12164 tctttatcgtcactttattcagttgttggtaatctatacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccatggtgaaac 12263  T
Q  278 actcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || |||||| ||||| | ||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  12264 acccggtcttataaatttcttatcaaggaaatcctccaactgtttcttcaattca 12318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 79 - 202
Target Start/End: Original strand, 16912 - 17035
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  16912 taatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggatacctatt 17011  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactg 202  Q
    ||| || |||||||||||||||||    
T  17012 ctttattgtcaccttgttcaactg 17035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 337
Target Start/End: Original strand, 14747 - 14997
Alignment:
Q  87 tgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcg 186  Q
    ||||| |||||||||||||  || || ||||||||   || ||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14747 tgataacctgatctcaaattgatgttgctaaacacacgtgtacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctttatcg 14846  T
Q  187 tcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtct 286  Q
    |||| || ||||  || || ||||| |  || ||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||  | || |||| |||||||||||| |||||    
T  14847 tcactttattcacttgacggtaatcaatgcataacctcatgctaccatctttcttcttaactagtaataccagtgctccccgcggtgaaacacttggtct 14946  T
Q  287 aataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaa 337  Q
     | ||||| ||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| ||||    
T  14947 tacaaacttcttatcaagtaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaa 14997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 262 - 340
Target Start/End: Original strand, 23415 - 23493
Alignment:
Q  262 caccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23415 caccccacggtgaaacacttggtctaataaactgcttctcaagcaactcctccaactgattcttcaattcacccaactc 23493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 328
Target Start/End: Original strand, 3860 - 4101
Alignment:
Q  87 tgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcg 186  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||   |||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||    
T  3860 tgataacccgatctcaaatctatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattttttatcg 3959  T
Q  187 tcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtct 286  Q
    | || |||||||||| || ||| || |   |||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  3960 ttactttgttcaactaccaatagtcaatgtacaatctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtct 4059  T
Q  287 aataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || |||||  ||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  4060 aacaaactttttctcaagcaaatcttctaattgtttcttcaa 4101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 168 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 2873 - 2713
Alignment:
Q  168 ggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcacccc 267  Q
    ||||||| |||||| || || || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| || || || ||||    
T  2873 ggatacctattcttgatagttactttgttcaactgacgataatcaatacacaacctcatactaccatctttcttctttacttacaaaaccggcgctcccc 2774  T
Q  268 acggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    | ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  2773 aaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaa 2713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 47069 - 46841
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || || || ||| ||||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||| | ||| || ||||||||||||| |||    
T  47069 taatctgatggtaaccggacctccaatcaattttactaaacacacgtgcacccactagctgatccattaaatcgttaattctcggaagtggatacctatt 46970  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || |||| ||| || |||||   ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||    
T  46969 ctttatcgtcactttattcagctgacggtaatctgtacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcactccccacggtgaaaca 46870  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaa 307  Q
    || ||||| | ||| | ||| ||||||||    
T  46869 cttggtcttacaaatttcttatcaagcaa 46841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 55877 - 55676
Alignment:
Q  84 tgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaa 183  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| | || | || |||||| || | ||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |  ||||| |    
T  55877 tgatggtaacctgacctcaagtcaatcttattgaaaatctttgcaccgaccaactggtccatcaagtcgtcaatcctcggaagcggatatctgttcttta 55778  T
Q  184 tcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcgg 283  Q
    || | || ||||| ||||| || ||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||| ||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  55777 tcataactttgtttaactgacggtaatcaatgcacaacctcatgctaccatccttcttctttaccaacagcacaggcgctccccacggtgaaacactagg 55678  T
Q  284 tc 285  Q
    ||    
T  55677 tc 55676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 328
Target Start/End: Original strand, 69622 - 69890
Alignment:
Q  60 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcc 159  Q
    ||||||||  |||| ||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || | |||||| || |  || |||||||| ||||||||||    
T  69622 atatcttcatccttcactttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaacttttgcacctaccaattggtccatcaagtcatcaatcc 69721  T
Q  160 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactgg 259  Q
    | ||||||||||| |  ||||| || || || ||||||||||| ||||| || |  ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  69722 tcggaagtggatatctgttctttattgtaactttgttcaactgacgatagtcaatgcacaatctcatactaccatccttcttctttaccaacaacacagg 69821  T
Q  260 agcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     || |||||||| |||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  69822 cgctccccacggcgaaacactaggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 69890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 2988 - 2735
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || |||| |||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  2988 taatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgtt 2889  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
     || || || || |||||||| || ||||| || |  || |||||||||||    || ||||||||||| |||||||  |  || |||||||||||||||    
T  2888 atttattgtaactttgttcaattgacgatagtcaatgcataacctcatgctattgtccttcttcttaaccaacaacatcgacgctccccacggtgaaaca 2789  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||||| ||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  2788 ctgggtcttacaaacttcttatcgagcaagtcctccaactgtttcttcaattca 2735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 867 - 616
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| | ||  |||||||| | |||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||| ||||    
T  867 atctgatggtaaccagacctcaagtcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcctcggaagcagataccggttct 768  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | ||||| || ||||||||||  || ||||| |  ||||  ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  767 ttatcgtaactttgttcaactaacggtaatcaatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccagggtgaaacact 668  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
     ||||| | ||||| ||| || | ||| || |||||||| ||||||||||||    
T  667 gggtcttacaaacttcttatctaacaagtcctccaactgtttcttcaattca 616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10819 - 10560
Alignment:
Q  81 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 180  Q
    |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| |  | ||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |  ||||  ||||||  ||||    
T  10819 atctgatggtaaccagacctcaagtcgatcttactaaaaatatttgcaccaaccaactgatccatcaagtcatcaatcttcagaagcagatacctgttct 10720  T
Q  181 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacact 280  Q
    | || || || ||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||| |  || ||||||||| | |||||    
T  10719 ttattgtaactttgttcaactgacggtaatctatacacaatctcatgctaccatctttcttctttaccaacaacacagtcgctccccacggtaagacact 10620  T
Q  281 cggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    |||||| | ||||| ||| ||||| || ||||| ||||| ||||||| |||| |||||||    
T  10619 cggtcttacaaacttcttatcaagtaaatcttctaactgtttcttcagttcagccaactc 10560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 79 - 282
Target Start/End: Original strand, 51081 - 51284
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||| |||    
T  51081 taatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaaatacaagagcacccactaactgatccattaaatcttcaattctcgaaagtggatacctatt 51180  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || |||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || || || |||||| ||||||||    
T  51181 ctttatcgtcactttcttcagctgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaacaacaataccggcgctccccacagtgaaaca 51280  T
Q  279 ctcg 282  Q
    ||||    
T  51281 ctcg 51284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 176 - 340
Target Start/End: Original strand, 31282 - 31446
Alignment:
Q  176 attcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaa 275  Q
    |||||| || |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||| || |||    
T  31282 attctttattgtcatcttgttcaactgtcgataatcaatacacaacctcatgctaccatccttcttcttcactaacaaaaccggcgctccccaaggcgaa 31381  T
Q  276 acactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    | ||| ||||||| |||||  ||||||||||| ||||| || || |||||||||||  |||||||    
T  31382 aaacttggtctaaaaaactttttctcaagcaaatcttctaattgtttcttcaattcggccaactc 31446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 340
Target Start/End: Original strand, 198 - 412
Alignment:
Q  126 gcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctca 225  Q
    ||||| |||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || || || || |||||||| | |||||| |  || || ||||    
T  198 gcacccactaacggatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctttatagttacttttttcaactgacaataatcaatgcataatctca 297  T
Q  226 tgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattctt 325  Q
    | || |||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| || |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| || ||||| || || |||||    
T  298 tactaccatctttcttctttactagcaacacgggtgctccccaaggcgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagaaaatcttctaattgtttctt 397  T
Q  326 caattcacccaactc 340  Q
    ||| ||| |||||||    
T  398 caactcagccaactc 412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8777 - 8527
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||    
T  8777 taatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggattcctatt 8678  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaac-aacactggagcaccccacggtgaaac 277  Q
    ||| || || ||||| ||||| || ||||||||    || | |||||| || |||||||||||||| |||| | || ||  | || ||||| ||||||||    
T  8677 cttgatagttaccttcttcaattgtcgataatcattccatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaaccagtgctccccaaggtgaaac 8578  T
Q  278 actcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||| ||||||| ||| | |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  8577 acttggtctaacaaatttcttctcaaacaagtcttccaactgtttcttcaa 8527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 497 - 750
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| || || |||| |||||| |||| ||||||||| || || |||||||| |||||||||||||  ||    
T  497 taatctgatggtaagctgacctcaagtcaatcttgctgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcgtcaatcctcggaagtggatacccgtt 596  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || ||||||||||| ||||| || |  || ||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| |  || || ||| | |||||||||    
T  597 ctttattgtaactttgttcaactgacgatagtcaatgcataacctcatagtaccatccttcttcttaaccaacaatatcggcgctccctaaggtgaaaca 696  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  697 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattca 750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 171 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28438 - 28281
Alignment:
Q  171 taccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacg 270  Q
    |||| |||||| || || || ||||||||||| |||||||  | ||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |    
T  28438 tacctattcttgatagttactttgttcaactgacgataattgatacataacctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaag 28339  T
Q  271 gtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28338 gtgaaacactcggtctaacaaacttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaa 28281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 28524 - 28446
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaat 150  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   |||||| |||| ||||||||| ||||    
T  28524 tttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccattaaat 28446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 9975 - 9782
Alignment:
Q  93 cctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcacct 192  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||    ||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||    
T  9975 cctgacctcaagtcaatcttactaaacacacgagcacccactaagtgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaacct 9876  T
Q  193 tgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtct 286  Q
    | |||||||| |||||||| |  || ||||||||||| || || ||||||||||| | |||||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  9875 tattcaactgacgataatcaatgcataacctcatgctaccgtccttcttcttaaccagcaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtct 9782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 17642 - 17449
Alignment:
Q  93 cctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcacct 192  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||    ||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||    
T  17642 cctgacctcaagtcaatcttactaaacacacgagcacccactaagtgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaacct 17543  T
Q  193 tgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtct 286  Q
    | |||||||| |||||||| |  || ||||||||||| || || ||||||||||| | |||||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  17542 tattcaactgacgataatcaatgcataacctcatgctaccgtccttcttcttaaccagcaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtct 17449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 307
Target Start/End: Original strand, 2870 - 3098
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| |||||  | || ||   |||| | |||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||    
T  2870 taatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgatgaaaacacgtgcatccactaactgatccatcaagtcatcaattcatggaagtggatacctatt 2969  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||| | || | |||||| ||||| || ||||||| |||||| |||| ||| |  || || ||||| |||||||||    
T  2970 ctttatcgttactttgttcaactgccgacagtcaatacacaatctcatactaccatcttacttctttactatcaaaatcggcgctccccaaggtgaaaca 3069  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaa 307  Q
    || ||||||| |||||  |||||||||||    
T  3070 cttggtctaacaaactttttctcaagcaa 3098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 5077 - 4871
Alignment:
Q  126 gcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctca 225  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||||| || |||| ||| || ||||| | |||||| ||||    
T  5077 gcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggatatctattctttatcgtcactttattcagctgacggtaatctatacacaatctca 4978  T
Q  226 tgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattctt 325  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| | ||| | ||| ||||| || || ||||| || |||||    
T  4977 tactaccatccttcttcttaaccaacaatacaggggctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatcaagtaaatcctccaattgtttctt 4878  T
Q  326 caattca 332  Q
     ||||||    
T  4877 taattca 4871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Original strand, 721 - 970
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||   |||||  |||| |||||||||||| | |||||| || ||||||||||||| |||    
T  721 taatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgcggaaaacacgtgcactcactaactgatccatcaagttatcaattctcggaagtggatacctatt 820  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || || |||| ||| ||||| || | |||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  821 ctttattgttactttattcagctgtcgatagtcaatacacaatctcatgctactatcattcttctttactaacaaaactggcgctcctcaaggtgaaaca 920  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||||| |||||  ||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  921 cttggtctaacaaactttttctcaagcaaatcttctaattgtttcttcaa 970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Original strand, 49375 - 49623
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| || || || ||    ||||| |||| ||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||||| | |    
T  49375 taatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaatacacgagcacccactaactgatccattaaaccatcgatcctcagaagtggatacctaat 49474  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || |||||||  || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||    
T  49475 ctttatcgtcactttattcaactaacggtaatcaatacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgaaaca 49574  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||| |  || | ||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  49575 cttggtctta-caatttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 49623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 49910 - 49660
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||| ||| || ||||| |||||||||||||| |  |||||    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || | |||| ||||||  ||    
T  49910 taatctaatggtaacctgacctcaaatcaatcttgcagaacacacgagcacccactaactgatccatgaaatcgtcaattctcgaaagtagatacctgtt 49811  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || |||| ||| || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||  |||||||    
T  49810 ctttatcgtcactttattcagctgacggtaatctatacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccac--tgaaaca 49713  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattc 331  Q
    |||||||| | ||| | ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  49712 ctcggtcttacaaatttcttatcaagcaaatcctccaactgtttcttcaattc 49660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 176386 - 176131
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| |||||| ||| || || || |||||||||||| | ||||||||   |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||    
T  176386 tttactttaatctaatggtaacccgacctcaaatcaatcatgctaaacacgcgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaattcgcggaagtggat 176287  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacgg 271  Q
    ||| |||||| |||| ||| || ||||  || |  ||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |  ||  |||| ||    
T  176286 acctattctttatcgccactttattcaggtgacagtaatctatacacaacctcatgctaccatttttcttcttaaccaacaacaccgacgc-tcccaagg 176188  T
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||||| ||| | |||||  || ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  176187 tgaaacactcgatcttacaaactttttatcaagtaaatcctccaactgtttcttcaa 176131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 286
Target Start/End: Original strand, 37919 - 38126
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| | |||||||||||  ||    
T  37919 taatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaattgatccattaagtcatcaatcctcgaaagtggatacctgtt 38018  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || ||||||||||| |||||||| |  || ||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||||    
T  38019 ctttattgtaactttgttcaactgacgataatcaatgcataacctcatagtaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgttccccaaggtgaaaca 38118  T
Q  279 ctcggtct 286  Q
    || |||||    
T  38119 cttggtct 38126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 9496 - 9247
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| | || ||| |||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||  ||    
T  9496 taatttgatggtaacctgacctcaagtcaatttaacaaaaaacctttgcacccactagctgatccgtcaagtcatcaatcctcagaagtggatacctgtt 9397  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || || |||||||| ||||| || |  |||||| |||| || ||||| | |||||| || ||||| || || || ||||| ||||| |||    
T  9396 ctttattgtaactttattcaactgacgatagtcaatgcacaacttcatactaccatcctccttctttaccaacaaaaccggcgctccccaaggtgagaca 9297  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  9296 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcttccaaccgtttcttcaa 9247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19710 - 19461
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| | || ||| |||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||  ||    
T  19710 taatttgatggtaacctgacctcaagtcaatttaacaaaaaacctttgcacccactagctgatccgtcaagtcatcaatcctcagaagtggatacctgtt 19611  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || || |||||||| ||||| || |  |||||| |||| || ||||| | |||||| || ||||| || || || ||||| ||||| |||    
T  19610 ctttattgtaactttattcaactgacgatagtcaatgcacaacttcatactaccatcctccttctttaccaacaaaaccggcgctccccaaggtgagaca 19511  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  19510 cttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcttccaaccgtttcttcaa 19461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 43187 - 43440
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||| |||| |||||||||||| || |||||||| | |||||||||||  ||    
T  43187 taatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaatcctcgaaagtggatacctgtt 43286  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| || || || || |||||||| ||||| || |  || ||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||    || ||||| ||||| |||    
T  43287 ctttattgtaactttattcaactgacgatagtcaatgcataacctcatgctactgtccttcttctttaccaacaataccaacgctccccaaggtgagaca 43386  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    || ||||| | ||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  43387 cttggtcttacaaaattcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattca 43440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 64554 - 64305
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||| || |||||    ||| | |||| |||||| || ||| |||||||||| | ||||||||||| |||    
T  64554 taatctgatggtaaccggacctcaaatcaatcttgctgaacacacgagcatccactaactgatcaattaaaccatcaatcctcgtaagtggatacctatt 64455  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| |||||||| || |||| ||| || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |  || ||||| |||||||||    
T  64454 ctttatcgtcactttattcagctgacggtaatctatacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccgacgctccccaaggtgaaaca 64355  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||| | | ||| | ||| |||||||| || | |||||| ||||||||    
T  64354 cttggtgttacaaatttcttatcaagcaagtccttcaactgtttcttcaa 64305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 151 - 340
Target Start/End: Original strand, 103568 - 103757
Alignment:
Q  151 catcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaa 250  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||     
T  103568 catcaattctcggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaactatcgataatcaatgcacaatctcatactaccatctttcttcttaactag 103667  T
Q  251 caacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||| |  || || ||||| ||||||||||| ||||| | |||||  || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  103668 caatatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaactttttatcaagtaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactc 103757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 1424 - 1188
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| |||| || ||||| || ||||||||| | ||||| || || || | |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1424 tttactttaatatggtgataacccgatctcaaagctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccataaaatcatcaatcctcggaagtggat 1325  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttcc----atctttcttcttaactaacaacactggagcacccc 267  Q
    |||  ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||  ||||||| ||    |||||||||||| |||| ||| ||  | || ||||    
T  1324 accttttctttattgtcaccttgtttaactgtcgatagtcaatacacaatatcatgctaccatatatctttcttcttcactagcaaaaccagcgctcccc 1225  T
Q  268 acggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaag 304  Q
    | || |||||||| ||||||| |||||  ||||||||    
T  1224 aaggcgaaacacttggtctaacaaactttttctcaag 1188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 125 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4878 - 4675
Alignment:
Q  125 tgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctc 224  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| | |||||| |||||||| || ||||  || || ||||| |  |||||||||    
T  4878 tgcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcagaagtggatatctattctttatcgtcactttattcagttgacggtaatctatgcacaacctc 4779  T
Q  225 atgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattct 324  Q
    ||| | ||||||||||||||||| ||||| |  || || ||| | ||||||||||||||||| | ||| | ||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  4778 atgataccatctttcttcttaaccaacaatatcggcgctccctaaggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatcaagtaaatcctccaactgtttct 4679  T
Q  325 tcaa 328  Q
    ||||    
T  4678 tcaa 4675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 328
Target Start/End: Original strand, 21120 - 21369
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| | || ||||||||| | ||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| |  ||    
T  21120 taatctaatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactggtccatcaagtcatcaattctcggaagcggatatctgtt 21219  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaaca 278  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||||| || |  || | |||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||    
T  21220 ctttatcgtaactttattcaactgacgatagtcaatgcatagcctcatactaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaaca 21319  T
Q  279 ctcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    || ||||| | ||||| ||| || || || ||  ||||||| ||||||||    
T  21320 cttggtcttacaaacttcttgtcgagaaaatccaccaactgtttcttcaa 21369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0719 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0719
Description:

Target: scaffold0719; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 68
Target Start/End: Original strand, 4793 - 4847
Alignment:
Q  14 agaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatatatcttcc 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4793 agaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcggttttggatatatcttcc 4847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 201
Target Start/End: Original strand, 1030 - 1157
Alignment:
Q  72 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 171  Q
    |||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||| || || || | |||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1030 tttactttaatctggtgataac--gatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccaccaactgatccatcaaatcatcaatactcggaagtggat 1127  T
Q  172 accgattcttaatcgtcaccttgttcaact 201  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  1128 acctattcttgattgtcaccttgttcaact 1157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 328
Target Start/End: Original strand, 29262 - 29452
Alignment:
Q  138 tgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctt 237  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |  ||||  ||||| || ||||| |    
T  29262 tgatccatcaaatcgtcaattctcggaagcggatacctgttctttatcgtaaccttattcaactgacggtaatctatgcacagtctcatactaccatcct 29361  T
Q  238 tcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    |||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||| || | ||  || |||||||| ||||||||    
T  29362 tcttcttaaccaacaacaccggtgccccccaaggtgaaacactgggtcttacaaacttcttatccaacaggtcctccaactgtttcttcaa 29452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 328
Target Start/End: Original strand, 7085 - 7262
Alignment:
Q  151 catcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaa 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| || || |||||||| ||  | || | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  7085 catcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttattcaactgacggaagtctatacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaa 7184  T
Q  251 caacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    |||||| || || ||||| ||||||||||| | ||| | ||| | ||| |||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  7185 caacaccggcgctccccaaggtgaaacacttgatcttacaaatttcttatcaagcaagttctccaactgtttcttcaa 7262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13371 - 13239
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||    ||||| ||||  |||||||| || | ||||||||| |||||||||||||  ||    
T  13371 taatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctaaacacacgagcacccactaaatgatccatgaagttatcaatcctcggaagtggatacctgtt 13272  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatc 211  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  13271 ctttatcgtaaccttattcaactgacgataatc 13239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21550 - 21418
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||    ||||| ||||  |||||||| || | ||||||||| |||||||||||||  ||    
T  21550 taatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctaaacacacgagcacccactaaatgatccatgaagttatcaatcctcggaagtggatacctgtt 21451  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatc 211  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  21450 ctttatcgtaaccttattcaactgacgataatc 21418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13215 - 13147
Alignment:
Q  264 ccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  13215 ccccacggtgaaacacttggtcttacaaatttcttatcaagcaagacctccaactgtttcttcaattca 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21394 - 21326
Alignment:
Q  264 ccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  21394 ccccacggtgaaacacttggtcttacaaatttcttatcaagcaagacctccaactgtttcttcaattca 21326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 340
Target Start/End: Original strand, 4524 - 4651
Alignment:
Q  213 acacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactctt 312  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||| || |    
T  4524 acacataacttcatgctaccatctttcttcttaactagtaacaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtcttacgaactccttatcaagcaaatcct 4623  T
Q  313 ccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    | ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  4624 ctaactgtttcttcaactcagccaactc 4651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 332
Target Start/End: Original strand, 36282 - 36461
Alignment:
Q  153 tcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaaca 252  Q
    ||||||||  ||||||||||||  || || ||||| ||||| ||||| || | |||||| |  || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  36282 tcaatcctcagaagtggatacctgttgtttatcgtaaccttattcaattgacaataatcaatgcataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaaca 36381  T
Q  253 acactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattca 332  Q
    | |  || || ||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||||    
T  36382 aaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaagttctccaactgtttcttcaattca 36461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 102 - 1
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||   |||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  102 taatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctgaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctatt 3  T
Q  179 ct 180  Q
    ||    
T  2 ct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6156 - 6078
Alignment:
Q  262 caccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  6156 caccccacggagaaacactcggtctgataaaccgcttttcaagtaactcttctaactgtttcttcaactcatccaactc 6078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2111 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2111
Description:

Target: scaffold2111; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 602 - 415
Alignment:
Q  99 ctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttca 198  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||  || ||| | || ||||| ||||| |  ||||| ||||| || || ||||    
T  602 ctcaagtcaatcttactaaaaacttttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcagttctcggaagcggatatctgttctttatcgtaactttattca 503  T
Q  199 actgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtct 286  Q
      || || || || |  ||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||    
T  502 gttgacggtagtcaatgcacaacctcatactaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacacttggtct 415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 328
Target Start/End: Original strand, 25404 - 25630
Alignment:
Q  99 ctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttca 198  Q
    ||||| ||||| |||||||| || | |||||| || | ||| |||||||| |||||||  || ||||||||||| |  ||||| || || || |||||||    
T  25404 ctcaagtcaattttactaaaaacttttgcacccaccaactggtccatcaagtcatcaaatctcggaagtggatatctgttctttattgtaactttgttca 25503  T
Q  199 actgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgctt 298  Q
    |||| ||||| || |  ||||| ||||| || |||||   |||||| || |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| | ||||| |||    
T  25504 actgacgatagtcaatgcacaatctcatactaccatc---cttctttaccaacaacacaggcgctccccatggcgaaacactgggtcttacaaacttctt 25600  T
Q  299 ctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  25601 atcatgcaagtcctccaactgtttcttcaa 25630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 211
Target Start/End: Original strand, 1223 - 1355
Alignment:
Q  79 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 178  Q
    |||||||||| || || || ||||| || ||||||||||| | ||  |||||||| | |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||    ||    
T  1223 taatctgatggtaaccagacctcaagtcgatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcctcggaagcggatatatgtt 1322  T
Q  179 cttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatc 211  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  1323 ctttatcgtaaccttgttcaactgacggtaatc 1355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 216 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4068 - 3956
Alignment:
Q  216 cacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttcca 315  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||| || || |  ||||| |    
T  4068 cacaacctcatactaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttgtcgagtagatcttcta 3969  T
Q  316 actgattcttcaa 328  Q
    |||| ||||||||    
T  3968 actgtttcttcaa 3956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 328
Target Start/End: Original strand, 4 - 101
Alignment:
Q  231 ccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4 ccatccttcttctttaccaacaataccggcgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaa 101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0481 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0481
Description:

Target: scaffold0481; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 12286 - 12142
Alignment:
Q  195 ttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaact 294  Q
    |||||||| || ||||||||||| | |||||| || ||||| ||||| ||||| |  ||||| || || ||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  12286 ttcaactgacggtaatccacacatagcctcatactgccatccttctttttaacgagtaacacaggtgctccccaaggtgagacactaggcctgataaact 12187  T
Q  295 gcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaact 339  Q
      ||||| |  |||||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  12186 ttttctctaataactcttctaattgtttctttaattcacccaact 12142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 241 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 1270 - 1183
Alignment:
Q  241 tcttaactaacaacactggagcaccccacggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    |||| |||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| | ||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  1270 tcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttttcaagcaaatcttctaactgtttcttcaa 1183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 309 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 239 - 208
Alignment:
Q  309 tcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  239 tcttccaactgattcttcaattcacccaactc 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 309 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7384 - 7353
Alignment:
Q  309 tcttccaactgattcttcaattcacccaactc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7384 tcttccaactgattcttcaattcacccaactc 7353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1985 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1985
Description:

Target: scaffold1985; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 411 - 355
Alignment:
Q  272 tgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 328  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  411 tgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaaatcttctaattgtttcttcaa 355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University