View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5151-Insertion-1 (Length: 947)

Name: NF5151-Insertion-1
Description: NF5151
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5151-Insertion-1
NF5151-Insertion-1
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (258-947)||(33574535-33575224)
chr5 (258-947)||(15532310-15532999)
chr5 (258-947)||(15542492-15543181)
chr5 (259-947)||(26712453-26713140)
chr5 (259-947)||(26982191-26982878)
chr5 (345-936)||(14616626-14617215)
chr5 (328-936)||(34405307-34405914)
chr5 (326-936)||(22159202-22159812)
chr5 (497-811)||(11989166-11989480)
chr5 (258-819)||(7650052-7650611)
chr5 (145-263)||(7290273-7290391)
chr5 (156-263)||(9420720-9420827)
chr5 (269-407)||(11988986-11989127)
chr5 (563-668)||(23993447-23993552)
chr5 (461-520)||(13371932-13371991)
chr5 (148-229)||(31375894-31375976)
[»] chr3 (17 HSPs)
chr3 (258-947)||(22626422-22627111)
chr3 (258-947)||(11138680-11139368)
chr3 (259-947)||(39563621-39564304)
chr3 (328-814)||(13979070-13979552)
chr3 (451-679)||(35366091-35366319)
chr3 (148-263)||(53190002-53190117)
chr3 (147-263)||(6732104-6732221)
chr3 (148-263)||(6765024-6765140)
chr3 (795-942)||(1096863-1097009)
chr3 (148-263)||(33672400-33672515)
chr3 (333-502)||(46731386-46731555)
chr3 (147-263)||(9237823-9237939)
chr3 (451-813)||(47411772-47412125)
chr3 (759-942)||(31878279-31878463)
chr3 (156-235)||(900484-900563)
chr3 (154-189)||(9238202-9238237)
chr3 (148-230)||(23049243-23049326)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (258-947)||(13017299-13017988)
chr6 (266-943)||(22221175-22221849)
chr6 (266-943)||(22247010-22247684)
chr6 (258-936)||(14790077-14790753)
chr6 (258-935)||(14795106-14795781)
chr6 (328-936)||(32704434-32705040)
chr6 (272-936)||(19664789-19665451)
chr6 (328-936)||(1837932-1838539)
chr6 (162-493)||(30978225-30978557)
chr6 (328-851)||(20527343-20527864)
chr6 (274-816)||(16883254-16883795)
chr6 (489-946)||(32426817-32427271)
chr6 (571-936)||(15534547-15534912)
chr6 (354-756)||(12983586-12983989)
chr6 (354-679)||(12980699-12981022)
chr6 (272-527)||(15534923-15535177)
chr6 (347-936)||(7769588-7770187)
chr6 (457-579)||(15538036-15538158)
chr6 (730-936)||(15537742-15537947)
chr6 (156-263)||(12488865-12488972)
chr6 (147-262)||(15393919-15394034)
chr6 (832-946)||(32426634-32426748)
chr6 (328-408)||(27649087-27649168)
chr6 (621-683)||(15537975-15538037)
chr6 (274-381)||(15540582-15540689)
chr6 (333-408)||(32427286-32427362)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (258-947)||(31527836-31528525)
chr2 (259-947)||(31625994-31626684)
chr2 (259-929)||(40017443-40018112)
chr2 (259-743)||(16294550-16295032)
chr2 (259-942)||(13709524-13710204)
chr2 (333-946)||(36326369-36326987)
chr2 (333-799)||(23673529-23673995)
chr2 (348-935)||(32575887-32576471)
chr2 (145-263)||(27499496-27499614)
chr2 (148-263)||(27195653-27195768)
chr2 (146-263)||(4696659-4696776)
chr2 (547-607)||(8426784-8426844)
[»] chr7 (25 HSPs)
chr7 (258-947)||(23759718-23760407)
chr7 (259-947)||(11278939-11279625)
chr7 (259-947)||(33312450-33313129)
chr7 (259-846)||(46846423-46847007)
chr7 (258-946)||(294313-294995)
chr7 (328-936)||(17863274-17863881)
chr7 (328-935)||(17866533-17867139)
chr7 (258-936)||(6966606-6967282)
chr7 (259-835)||(36222420-36222993)
chr7 (328-936)||(24782864-24783474)
chr7 (345-818)||(36843135-36843607)
chr7 (275-818)||(23107566-23108106)
chr7 (328-818)||(9765373-9765867)
chr7 (272-815)||(3862029-3862562)
chr7 (8-147)||(31646021-31646160)
chr7 (270-559)||(23313382-23313671)
chr7 (620-818)||(23313673-23313871)
chr7 (672-936)||(35773054-35773318)
chr7 (156-263)||(11755572-11755679)
chr7 (499-606)||(2719331-2719438)
chr7 (154-230)||(18973681-18973758)
chr7 (501-542)||(27796686-27796727)
chr7 (148-230)||(7570613-7570696)
chr7 (148-230)||(7577028-7577111)
chr7 (148-203)||(21658807-21658862)
[»] chr4 (12 HSPs)
chr4 (258-947)||(12171429-12172107)
chr4 (328-936)||(647383-647990)
chr4 (333-913)||(26062876-26063457)
chr4 (345-936)||(650673-651263)
chr4 (339-818)||(26060163-26060641)
chr4 (269-818)||(2541461-2542008)
chr4 (148-263)||(12194696-12194811)
chr4 (148-262)||(14617630-14617744)
chr4 (156-263)||(22755876-22755982)
chr4 (343-404)||(11649429-11649490)
chr4 (496-666)||(16926976-16927144)
chr4 (501-536)||(6031606-6031641)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (333-947)||(7177-7791)
scaffold0063 (148-263)||(6995-7110)
[»] scaffold0500 (2 HSPs)
scaffold0500 (333-947)||(2138-2754)
scaffold0500 (145-263)||(2821-2939)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (266-708)||(24303-24743)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (343-947)||(2799-3405)
[»] scaffold0440 (2 HSPs)
scaffold0440 (183-650)||(9606-10073)
scaffold0440 (795-935)||(9468-9608)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (346-946)||(32506053-32506650)
chr1 (258-936)||(13492721-13493397)
chr1 (345-936)||(27282305-27282899)
chr1 (345-936)||(13495446-13496035)
chr1 (270-809)||(34065929-34066468)
chr1 (275-894)||(1936128-1936746)
chr1 (269-942)||(16190299-16190969)
chr1 (345-653)||(39545983-39546290)
chr1 (421-815)||(23990361-23990754)
chr1 (460-714)||(22104683-22104935)
chr1 (347-709)||(21152940-21153301)
chr1 (428-654)||(22453415-22453641)
chr1 (354-679)||(22456699-22457021)
chr1 (346-679)||(15297047-15297378)
chr1 (148-263)||(17762095-17762210)
chr1 (730-936)||(10759580-10759785)
chr1 (258-484)||(10764829-10765054)
chr1 (145-256)||(45532346-45532458)
chr1 (354-467)||(49147825-49147936)
chr1 (511-604)||(4204975-4205068)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (269-910)||(12575420-12576060)
chr8 (333-818)||(13096606-13097081)
chr8 (333-808)||(44007889-44008356)
chr8 (270-627)||(41778864-41779213)
chr8 (156-263)||(25317933-25318040)
chr8 (156-263)||(33578042-33578149)
chr8 (272-408)||(14418450-14418585)
chr8 (343-404)||(41836418-41836479)
chr8 (543-587)||(14418355-14418399)
chr8 (148-263)||(15928458-15928573)
chr8 (704-790)||(41779232-41779318)
chr8 (148-234)||(29354565-29354651)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (333-818)||(5995-6479)
[»] scaffold0665 (1 HSPs)
scaffold0665 (505-936)||(1-431)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (148-263)||(449-564)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (148-262)||(199633-199747)
[»] scaffold0363 (2 HSPs)
scaffold0363 (272-408)||(133-268)
scaffold0363 (543-587)||(319-363)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (146-234)||(24208-24297)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 606; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 606; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 258 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 33575224 - 33574535
Alignment:
Q  258 taaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaattgagagaagtatgg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33575224 taaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattgagagaagtatgg 33575125  T
Q  358 ttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattct 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33575124 ttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaattacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattct 33575025  T
Q  458 acccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccct 557  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33575024 acccaatctcttgatctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaatgttaatccct 33574925  T
Q  558 atatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaattt 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  33574924 atatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagttagggttagtggtcattcaattt 33574825  T
Q  658 ctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttt 757  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33574824 ctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaacttt 33574725  T
Q  758 tattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaa 857  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33574724 cattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccatagggttacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaa 33574625  T
Q  858 agtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccggatctccaag 947  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33574624 agtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagatctccaag 33574535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 571; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 258 - 947
Target Start/End: Original strand, 15532310 - 15532999
Alignment:
Q  258 taaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggttttta-gaaaattgagagaagtatg 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15532310 taaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaattgagagaagtatg 15532409  T
Q  357 gttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattc 456  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15532410 gttaagtccttcgaatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacagattaacttagtaattc 15532509  T
Q  457 tacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccc 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15532510 tacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccaatggaggtattaa-cgaacgttaatccc 15532608  T
Q  557 tatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatt 656  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15532609 tatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatt 15532708  T
Q  657 tctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaactt 756  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15532709 tctatgatcaatatgcatattcataacgctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcattaagcacaaagtaataagaataaaaactaaactt 15532808  T
Q  757 ttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagcta 856  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532809 tcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccatagggttacatcagattcatctcatgaattaaccacaaaagaattagttactcatagcta 15532908  T
Q  857 aagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccggatctccaag 947  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15532909 aagtataagctaactaacataagaaaacggattcatccatgtgaaggaagattgactcttagttttgatggttccccaccagatctccaag 15532999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 571; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 258 - 947
Target Start/End: Original strand, 15542492 - 15543181
Alignment:
Q  258 taaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggttttta-gaaaattgagagaagtatg 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15542492 taaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaattgagagaagtatg 15542591  T
Q  357 gttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattc 456  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15542592 gttaagtccttcgaatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacagattaacttagtaattc 15542691  T
Q  457 tacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccc 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15542692 tacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttgatctcttaagtgaattcgaaaccaatggaggtattaa-cgaacgttaatccc 15542790  T
Q  557 tatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatt 656  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15542791 tatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatt 15542890  T
Q  657 tctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaactt 756  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15542891 tctatgatcaatatgcatattcataacgctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcattaagcacaaagtaataagaataaaaactaaactt 15542990  T
Q  757 ttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagcta 856  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15542991 tcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccatagggttacatcagattcatctcatgaattaaccacaaaagaattagttactcatagcta 15543090  T
Q  857 aagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccggatctccaag 947  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15543091 aagtataagctaactaacataagaaaacggattcatacatgtgaaggaagattgactcttagttttgatggttccccaccagatctccaag 15543181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 259 - 947
Target Start/End: Original strand, 26712453 - 26713140
Alignment:
Q  259 aaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactga-ttaaaagcgataaagaattggtttttagaaaat-tgagagaagtatg 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||  | ||||||    ||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  26712453 aaatttatattagtgccctagacagttgagttgattttgtaacataaacaaaattaaaaatagtaaaagattggtttt-agaaaatctgagagaagaatg 26712551  T
Q  357 gttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattc 456  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26712552 gttaagtctttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaatt-caatcaatgattatttagtttcacgacagattaacttagtaattc 26712650  T
Q  457 tacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccc 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26712651 tacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaaaagaacgttaatccc 26712750  T
Q  557 tatatcataacctaataatga---tctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattca 653  Q
    ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26712751 tatgtcataacctaataatgatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagccagggttagtggtcattca 26712850  T
Q  654 atttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaa 753  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26712851 atttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtcaatgataaacatacataaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaa 26712950  T
Q  754 cttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatag 853  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  26712951 ctttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggtt-ccgtaggattacatcagatttatctcaggaattaaccacaa---aattagttactcatag 26713046  T
Q  854 ctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccggatctccaag 947  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26713047 ctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtaaaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagatctccaag 26713140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 259 - 947
Target Start/End: Original strand, 26982191 - 26982878
Alignment:
Q  259 aaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactga-ttaaaagcgataaagaattggtttttagaaaat-tgagagaagtatg 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||  | ||||||    ||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  26982191 aaatttatattagtgccctagacagttgagttgattttgtaacataaacaaaattaaaaatagtaaaagattggtttt-agaaaatctgagagaagaatg 26982289  T
Q  357 gttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattc 456  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26982290 gttaagtctttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaatt-caatcaatgattatttagtttcacgacagattaacttagtaattc 26982388  T
Q  457 tacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccc 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26982389 tacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaaaagaacgttaatccc 26982488  T
Q  557 tatatcataacctaataatga---tctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattca 653  Q
    ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26982489 tatgtcataacctaataatgatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagccagggttagtggtcattca 26982588  T
Q  654 atttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaa 753  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26982589 atttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtcaatgataaacatacataaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaa 26982688  T
Q  754 cttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatag 853  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  26982689 ctttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggtt-ccgtaggattacatcagatttatctcaggaattaaccacaa---aattagttactcatag 26982784  T
Q  854 ctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccggatctccaag 947  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26982785 ctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtaaaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagatctccaag 26982878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 345 - 936
Target Start/End: Original strand, 14616626 - 14617215
Alignment:
Q  345 gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatta 444  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  14616626 gagagaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaattttcactcctaatt-caatcaatgattatctagtttaacgacagatta 14616724  T
Q  445 acttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacg 544  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||       
T  14616725 acaaagtaattctacccaatctcttgacctataattctccccgcaagtgacaagcccttaatctcttgagtgaattcgaaaccgttggaggttttaacaa 14616824  T
Q  545 aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagt 644  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  14616825 aacgttaatccatatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccatggttagt 14616924  T
Q  645 ggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaata 744  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || || |||||| |||| || ||| ||| || ||||||||||||||     
T  14616925 ggtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagttagggttagtattcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaatt 14617024  T
Q  745 aaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagt 844  Q
    ||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| |||   ||||||    
T  14617025 aaaactagactttcattgatatttaaaggagttcaacaaactagggttctcataggattacatcatattcatctcaag-cttaaccagaaagagattagt 14617123  T
Q  845 tactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccacc 936  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||  |||| ||||||| | |||| ||||||| |||||||    
T  14617124 tactcataactaaagtacaagataactcacataaaaacaaggattcatacatgtattggataattgactatgagttgtgatggtctcccacc 14617215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 328 - 936
Target Start/End: Complemental strand, 34405914 - 34405307
Alignment:
Q  328 ttggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatt 426  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||     
T  34405914 ttggttttcagaatattagagagaagtatggttaagaccttcaaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgattatc 34405816  T
Q  427 tagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaac 526  Q
    |||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34405815 tagtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctcctcgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaac 34405716  T
Q  527 cattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagag 626  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||    
T  34405715 cgttggaggttttaaaagaacgttaatccctatctcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaagttaaacttattacctagatcagag 34405616  T
Q  627 ttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaag 726  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| || |||  ||     
T  34405615 tcaaaagccagggttagtggtcatttaatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaa 34405516  T
Q  727 cacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaatt 826  Q
    || |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |     
T  34405515 cataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaag-ctg 34405417  T
Q  827 aaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatg 926  Q
    ||||| |||   |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||| |  ||||||||||| |||||  |||| ||||||| | |||| |||||    
T  34405416 aaccataaagagattagttactcataactacagtacaagataactcacataaaatcaaggattcatatatgtattggataattgactatgagttgtgatg 34405317  T
Q  927 gtttcccacc 936  Q
    || |||||||    
T  34405316 gtctcccacc 34405307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 326 - 936
Target Start/End: Complemental strand, 22159812 - 22159202
Alignment:
Q  326 aattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgatta 424  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| || | |||||||||  | |||||||||| ||    
T  22159812 aattggttttaagaatattagagagaaatatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaaatcgcactcctagtt-caatcaatgacta 22159714  T
Q  425 tttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaa 524  Q
    | |||||  ||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22159713 tctagttcaacgatagattaacaaagtaactctacccaatctcttgacctagagttctccccacaagtaacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaa 22159614  T
Q  525 accattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcag 624  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  22159613 accattggaggttttaacagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagtttgattacttaggttaaacctattacctagatcag 22159514  T
Q  625 agttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaac-gtacataaggcact 723  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||  |||| || ||| |    
T  22159513 agtcaaaagccagggttaatggtcattcaatctctaacatcaatttgtatattcataaagctatggttagtagtcgatgataaacaatacaaaaagcatt 22159414  T
Q  724 aagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcagga 823  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||       
T  22159413 aaacacaaagtaatatgaataaaaactagactttcattgacattcaaaggagttcaacaaattagggttcccgtaggattacatcggattcatctca-tt 22159315  T
Q  824 attaaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttg 923  Q
     | |||||||||   |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| ||    
T  22159314 ctcaaccacaaagagattagttactcataactaaagtacaagataactcacataaaaacaaggattcatacatgtattggatgattgactatgagttgtg 22159215  T
Q  924 atggtttcccacc 936  Q
    ||| | |||||||    
T  22159214 atgctctcccacc 22159202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 497 - 811
Target Start/End: Original strand, 11989166 - 11989480
Alignment:
Q  497 accccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgatta 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11989166 accccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaatagaacgttaatctctatgttaaaacctaataatgatctatctctaacttgatta 11989265  T
Q  597 cttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaata 696  Q
    | ||||||||| ||| ||||||  ||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||    
T  11989266 cataggttaaacctaatacctagatcagagtcaaaagcgaaggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgtatattcataaagctagggttagta 11989365  T
Q  697 gtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 796  Q
    ||| || |||||| |||| || ||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11989366 gtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaataaaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaattagggttccca 11989465  T
Q  797 taggattacatcaga 811  Q
    ||  |||||||||||    
T  11989466 taaaattacatcaga 11989480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 258 - 819
Target Start/End: Original strand, 7650052 - 7650611
Alignment:
Q  258 taaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgatttagtaatataaac-tgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagta 354  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| | | ||||| | ||||| | ||| |||| |||| ||| ||||||||||    
T  7650052 taaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaaa-caataaa-agttgcttttaagaatattagagagaagta 7650148  T
Q  355 tggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaat 454  Q
    |||||||| | || ||||||| ||||| | | |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| | ||  |||||||   |||||    
T  7650149 tggttaagacatttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaatt-caatcaatgattatctagtttaaagatagattaacaaggtaat 7650247  T
Q  455 tctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatc 554  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| ||||  ||| |||||||    
T  7650248 tctactcaatctctttacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttgagtgaattcgaaatcgctggaggttttaatagaaggttaatc 7650347  T
Q  555 cctatatc---------ataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtg 645  Q
    ||||| ||         |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||   ||||||||    
T  7650348 cctatgtcataacctaaataacctaataatgatctatctctagcttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagc---ggttagtg 7650444  T
Q  646 gtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataa 745  Q
    || ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| |||| ||  || ||| || ||||||| ||||||||    
T  7650445 gttattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagttagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaaacattaaacataaagtaacatgaataa 7650544  T
Q  746 aaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctc 819  Q
    | |||| ||||| |||||| ||      ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||    
T  7650545 agactagactttcattgatatt------agttcaacaaattagggtt-ccataaaattacatcaaattcatctc 7650611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 145 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7290391 - 7290273
Alignment:
Q  145 tattgataaaaaattagcaagtgtattaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaaaaacgttatc 244  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||    
T  7290391 tattgatagaaaattagcaagtgtactaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactggtttaatctctacttaacaagaacattatc 7290292  T
Q  245 attaagatgtaattaaatt 263  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7290291 attaagatgtaattaaatt 7290273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 263
Target Start/End: Original strand, 9420720 - 9420827
Alignment:
Q  156 aattagcaagtgtattaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaaaaacgttatcattaagatgta 255  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  9420720 aattagcaagtgtactaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttccttagggatttttttaatttctacttaacaaaaacattgtcattaagatgta 9420819  T
Q  256 attaaatt 263  Q
    ||||||||    
T  9420820 attaaatt 9420827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 269 - 407
Target Start/End: Original strand, 11988986 - 11989127
Alignment:
Q  269 tggtgccctaggcagttgagttgattta-gtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtcct 366  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| |||||||  |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  11988986 tggtcccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaacagattaaaaacgataaaagattgatttt-agaaaattagagagaagtaaggttaagacct 11989084  T
Q  367 tcgaatcctccgaagctttcc--tatggcaatttgcactccta 407  Q
    ||||||||||| ||| | |||  ||||| ||||||||||||||    
T  11989085 tcgaatcctccaaagttctcctatatggtaatttgcactccta 11989127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 563 - 668
Target Start/End: Original strand, 23993447 - 23993552
Alignment:
Q  563 ataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatg 662  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||   |||| ||||  ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  23993447 ataacctaataattgtctatctctagcttaatttcttaggttaaccatatttcctagatcagattcaaaagtcatggctagtggtcattcaagttctaag 23993546  T
Q  663 atcaat 668  Q
    ||||||    
T  23993547 atcaat 23993552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 461 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 13371991 - 13371932
Alignment:
Q  461 caatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaatt 520  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  13371991 caatctcttgacttagaactctcccctaaagtcacaatcccttaatctcttaagtgaatt 13371932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31375976 - 31375894
Alignment:
Q  148 tgataaaaaattagcaagtgtattaatttgaatcg-agtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctactt 229  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||  |||||||| ||| || ||||||||  |||||||||||    
T  31375976 tgatacaaaattagcaagtgtactaatttatatcgaagtaataatttaattcgtatccacaaggactgttctaatctctactt 31375894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 603; Significance: 0; HSPs: 17)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 603; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 258 - 947
Target Start/End: Original strand, 22626422 - 22627111
Alignment:
Q  258 taaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaattgagagaagtatgg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22626422 taaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggattt-agaaaattgagagaagtatgg 22626520  T
Q  358 ttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattct 457  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626521 ttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattct 22626620  T
Q  458 acccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccct 557  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626621 atccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccct 22626720  T
Q  558 atatcataacctaataatgatct-atctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatt 656  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22626721 atatcataacctaataatgatcttatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatt 22626820  T
Q  657 tctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaactt 756  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626821 tctatgatcaatatgcatattcataacgctagggttaatagtctatcataaacatacataaggcattaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaactt 22626920  T
Q  757 ttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagcta 856  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626921 tcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagcta 22627020  T
Q  857 aagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccggatctccaag 947  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22627021 aagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagatctccaag 22627111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 551; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 258 - 947
Target Start/End: Original strand, 11138680 - 11139368
Alignment:
Q  258 taaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaattgagagaagtatgg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  11138680 taaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaatatagaattggattc-agaaaattgagagaagtatgg 11138778  T
Q  358 ttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattct 457  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11138779 ttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattct 11138878  T
Q  458 acccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccct 557  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11138879 atccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaactccttaatctcttaagtgaattcgaaaccataggaggtattaaacgaacgttaatccct 11138978  T
Q  558 atatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaattt 657  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11138979 atatcataacctaataatgatctatctctagcttgattactgaggttaaacctatta-ctatttcagagttaaaagccagggttagtggccattcaattt 11139077  T
Q  658 ctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttt 757  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11139078 ctatgatcaatatgcatattcataacgctagggttaatagtttatcataaacatacataaggcattaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttt 11139177  T
Q  758 tattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaa 857  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11139178 cattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaagaattaaccacaaaagaattagttactcaaagctaa 11139277  T
Q  858 agtataagctaactaacataag-aaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccggatctccaag 947  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11139278 agtataagataactaacataagaaaaaaggattcatacatgtgaaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagatctccaag 11139368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 259 - 947
Target Start/End: Original strand, 39563621 - 39564304
Alignment:
Q  259 aaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactga-ttaaaagcgataaagaattggtttttagaaaat-tgagagaagtatg 356  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  | ||||||    ||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  39563621 aaatttatattagtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaacaaaattaaaaatagtaaaagattggtttt-agaaaatctgagagaagaatg 39563719  T
Q  357 gttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattc 456  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39563720 gttaagtccttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaatt-caatcaatggttatttagtttcacgacagattaacttagtaattc 39563818  T
Q  457 tacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccc 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  39563819 tacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaaaagaacgttaatccc 39563918  T
Q  557 tatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatt 656  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  39563919 tatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcaga-ttaaaagtcagggttagtggtcattcaatt 39564017  T
Q  657 tctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaactt 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  39564018 tctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtcaatgataaacatacataaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaactt 39564117  T
Q  757 ttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagcta 856  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  39564118 tcattaatgttcaaaggagttcaacaaattagggtt-tcgtaggattacatcagatttatctcaggaattaaccacaa---aattagttactcatagcta 39564213  T
Q  857 aagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccggatctccaag 947  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  39564214 aagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtaaaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccatatctccaag 39564304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 328 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 13979552 - 13979070
Alignment:
Q  328 ttggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatt 426  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || | ||| |||||||||||    
T  13979552 ttggttttaagaatattagagagaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcc-aagttcaaacaatgattatt 13979454  T
Q  427 tagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaac 526  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  13979453 tagtttcatgacagattaacttagtaactctatccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaacctcttaatctcttaagtgaattcgaaat 13979354  T
Q  527 cattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagag 626  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  13979353 cgttcgaggtattaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctccaacttgattacttaagttaaaactattacctagttcagag 13979254  T
Q  627 ttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaag 726  Q
    |  |||| || ||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||| || ||||   |||  ||  || |||     
T  13979253 tcgaaagtcagggtcagtggtcattcaatctctacgatcaatttgcat-ttcataaagctagggtcagtagtcgatgataa---tacgaaaaacattaaa 13979158  T
Q  727 cacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattc 814  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  13979157 caaaaagtaatatgaaaaaagactaaactttcatttaaattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataagattacctcagattc 13979070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 451 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 35366319 - 35366091
Alignment:
Q  451 taattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgtt 550  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||| ||||  |  ||||    
T  35366319 taattctactcaatctcttgacctagaactctctccgcgagtgacaatcccttaatctcttaagtgaattcaagactcttggaggttttaacagtccgtt 35366220  T
Q  551 aatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcat 650  Q
    ||||| |   ||||| |||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  35366219 aatccatgagtcatagcctaataattttctatctctaacttaattacttaggttaaacctattacctagatcagagtcaaaagccaaggctagtggtcat 35366120  T
Q  651 tcaatttctatgatcaatatgcatattca 679  Q
    |||| || || ||||||| |||| |||||    
T  35366119 tcaagttttaagatcaatttgcacattca 35366091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 148 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 53190117 - 53190002
Alignment:
Q  148 tgataaaaaattagcaagtgtattaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaaaaacgttatcatt 247  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53190117 tgatagaaaattagcaagtgtactaatttgaatcgagtaataaattaattcgtttcctcagggactgttttaatctctacttaacaaaaacattatcatt 53190018  T
Q  248 aagatgtaattaaatt 263  Q
    ||||||| ||||||||    
T  53190017 aagatgtcattaaatt 53190002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6732221 - 6732104
Alignment:
Q  147 ttgataaaaaattagcaagtgtattaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaaaaacgtt-atca 245  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  6732221 ttgatagaaaattagcaagtgtactaatttgaatcgagtaataaattaattcgtttcctcagggactgttttaatctctacttaacaaaaacattaatca 6732122  T
Q  246 ttaagatgtaattaaatt 263  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6732121 ttaagatgtaattaaatt 6732104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 148 - 263
Target Start/End: Original strand, 6765024 - 6765140
Alignment:
Q  148 tgataaaaaattagcaagtgtattaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaaaaacgtt-atcat 246  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  6765024 tgatagaaaattagcaagtgtactaatttgaatcgagtaataaattaattcgtttcctcagggactgttttaatctctacttaacaaaaacattaatcat 6765123  T
Q  247 taagatgtaattaaatt 263  Q
    |||||||||||||||||    
T  6765124 taagatgtaattaaatt 6765140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 795 - 942
Target Start/End: Original strand, 1096863 - 1097009
Alignment:
Q  795 cataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatac 894  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096863 catagaattatatcagattcatgtcaagc-ttaaccacaaaggaattagttactcatagctaaagtataagttaactaacataagaaaaaggattcatac 1096961  T
Q  895 atgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccggatct 942  Q
    |||||  |||||||||||| | |||| |||||||| |||||| |||||    
T  1096962 atgtaatggatgattgactatgagttgtgatggttgcccaccagatct 1097009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 148 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33672515 - 33672400
Alignment:
Q  148 tgataaaaaattagcaagtgtattaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaaaaacgttatcatt 247  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  33672515 tgatagaaaattagcaagtgtactaatttgaatcgagtaataaaataatttgttttcttagggactgttttaatctctacttaacaagaacattatcatt 33672416  T
Q  248 aagatgtaattaaatt 263  Q
    ||||||||||||||||    
T  33672415 aagatgtaattaaatt 33672400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 333 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 46731555 - 46731386
Alignment:
Q  333 ttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtt 431  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  46731555 ttttagaaaattagagagatgtaaggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaatt-caatcaatgattatctagtt 46731457  T
Q  432 tcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaacccct 502  Q
      |||||  ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  46731456 caacgacatattaacaaagtaactctacccaatctcttgacctggagttctccccgcaagtaacaacccct 46731386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9237939 - 9237823
Alignment:
Q  147 ttgataaaaaattagcaagtgtattaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaaaaacgttatcat 246  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||| ||| |||    
T  9237939 ttgatagaaaattagcaagtgtactaatttgaatcgagtaataaaataatttgtttcctcagggactgttttaatttctacgtaacaagaacattaacat 9237840  T
Q  247 taagatgtaattaaatt 263  Q
    |||||||| ||||||||    
T  9237839 taagatgtgattaaatt 9237823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 451 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 47412125 - 47411772
Alignment:
Q  451 taattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgtt 550  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||||  || ||| ||| | ||||  |   |||    
T  47412125 taattctactcaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaa--------tctcttaagtgaattcgggactattagagattttaacagtctgtt 47412034  T
Q  551 aatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcat 650  Q
    |||| ||   ||| || ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| || |  ||||| ||||    
T  47412033 aatctctgagtcacaatctaataattttctatctctaacttaattacttaggttaaacctattacctagatcagagtcaaaaggcaggactagtgatcat 47411934  T
Q  651 tcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaact 750  Q
    |||| ||||| ||||||| | ||||||||  ||| ||| | || ||||| || |||||| |||| |   || ||| ||||| |||||||||||  |||||    
T  47411933 tcaagttctaagatcaattttcatattcaagaagttagtgctagtagtcaataataaacatacaaacaacattaaacacaaggtaatatgaat-taaact 47411835  T
Q  751 aaacttttattgatgttcaaaggagttca-acaaattagggttcccataggattacatcagatt 813  Q
    | ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  47411834 agactttcattgatattcaagggagttcatacatatta-ggtttccataaaattacatcagatt 47411772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 759 - 942
Target Start/End: Original strand, 31878279 - 31878463
Alignment:
Q  759 attgatgttcaaaggagttcaacaaatta--gggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagcta 856  Q
    |||||| || |||||||||  ||||||||  |||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||   | ||||| |||   ||||||||||||||||||    
T  31878279 attgatatttaaaggagtttgacaaattacagggttctcataagattatatcagattcatctaagtc-tcaaccataaagagattagttactcatagcta 31878377  T
Q  857 aagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccggatct 942  Q
    ||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||    
T  31878378 aagtacaaaataactaacataaaaacaaggattcatacatgtattggatgattgactatgagttttgatggttgcccaccagatct 31878463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 900563 - 900484
Alignment:
Q  156 aattagcaagtgtattaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaaa 235  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  900563 aattagcaaatgcagtaatttgaatcgagtaataaaataattcgttttctcagggactgttttaatctctacttaacaaa 900484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9238237 - 9238202
Alignment:
Q  154 aaaattagcaagtgtattaatttgaatcgagtaata 189  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9238237 aaaattagcaagtgtactaatttgaatcgagtaata 9238202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23049326 - 23049243
Alignment:
Q  148 tgataaaaaattagcaagtgtattaatttgaatcg-agtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctactta 230  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||  |||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||||||    
T  23049326 tgatacaaaattagcaagtgtactaatttatatcgaagtaataatttaattcgtatccacagggactattctaatctctactta 23049243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 587; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 587; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 258 - 947
Target Start/End: Original strand, 13017299 - 13017988
Alignment:
Q  258 taaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggttttt-agaaaattgagagaagtatg 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13017299 taaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttcagaaaattgagagaagtatg 13017398  T
Q  357 gttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattc 456  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13017399 gttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatatgatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattc 13017498  T
Q  457 tacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccc 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13017499 tacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaa-cgaacgttaatccc 13017597  T
Q  557 tatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatt 656  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13017598 tatatcataacctaataatgatctatctctaacttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaagagccagggttagtggtcattcaatt 13017697  T
Q  657 tctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaactt 756  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13017698 tctatgatcaatatgcatattcataacgctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcattaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaactt 13017797  T
Q  757 ttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagcta 856  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13017798 tcatttatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagcta 13017897  T
Q  857 aagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccggatctccaag 947  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13017898 acgtataagctaactaacacaagaaaaaggattcatacatgtgaaggatgattgactcttagttttgatggtttccaaccagatctccaag 13017988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 543; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 266 - 943
Target Start/End: Complemental strand, 22221849 - 22221175
Alignment:
Q  266 tattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaattgagagaagtatggttaagtcc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22221849 tattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaata--aactaattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattgagagaagcatggttaagtcc 22221752  T
Q  366 ttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatc 465  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22221751 ttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcttaaatacaatcaatgattatttagtatcacgacggattaacttagtaattctacccaatc 22221652  T
Q  466 tcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcata 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22221651 tcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctctcaagtgaattcgaaaccattagaggaattaaacaaacgttaatccatatatcata 22221552  T
Q  566 acctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatc 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22221551 acctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattaccttttttagatttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatc 22221452  T
Q  666 aatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatg 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22221451 aatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatg 22221352  T
Q  766 ttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataag 865  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22221351 ttcaaaagagttcaacaaattagggtt-ccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagcgaaagtataag 22221253  T
Q  866 ctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccggatctc 943  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22221252 ctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaagaatgattgactcttagttttgatggtttcccaccggatctc 22221175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 543; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 266 - 943
Target Start/End: Complemental strand, 22247684 - 22247010
Alignment:
Q  266 tattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaattgagagaagtatggttaagtcc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22247684 tattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaata--aactaattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattgagagaagcatggttaagtcc 22247587  T
Q  366 ttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatc 465  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22247586 ttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcttaaatacaatcaatgattatttagtatcacgacggattaacttagtaattctacccaatc 22247487  T
Q  466 tcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcata 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22247486 tcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctctcaagtgaattcgaaaccattagaggaattaaacaaacgttaatccatatatcata 22247387  T
Q  566 acctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatc 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22247386 acctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctggttcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatc 22247287  T
Q  666 aatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatg 765  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  22247286 aatatgcatattcataaagctatggttaatagtctatcataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaaccaaactttcattgatg 22247187  T
Q  766 ttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataag 865  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22247186 ttcaaaagagttcaacaaattagggtt-ccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagcgaaagtataag 22247088  T
Q  866 ctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccggatctc 943  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22247087 ctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgaagaatgattgactcttagttttgatggtttcccaccggatctc 22247010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 258 - 936
Target Start/End: Complemental strand, 14790753 - 14790077
Alignment:
Q  258 taaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgatttagtaatataaac-tgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagta 354  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| | | ||||| | ||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  14790753 taaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaaa-caataaa-agttggttttcagaatattagagagaagta 14790657  T
Q  355 tggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaat 454  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||||    
T  14790656 tggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaat 14790558  T
Q  455 tctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatc 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  14790557 tctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaatc 14790458  T
Q  555 cctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaa 654  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  14790457 cctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatttaa 14790358  T
Q  655 tttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaac 754  Q
    | |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| || |||  || || |||||||||||||| ||||||| ||    
T  14790357 tctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagac 14790258  T
Q  755 ttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagc 854  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||   |||||||||||||| |    
T  14790257 tttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaag-cttaaccataaagagattagttactcataac 14790159  T
Q  855 taaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccacc 936  Q
    || |||| ||| ||||| |||||| |  |||||||||||||||||  |||| ||||||| | |||| ||||||| |||||||    
T  14790158 tacagtacaagataactcacataaaatcaaggattcatacatgtattggataattgactatgagttgtgatggtctcccacc 14790077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 258 - 935
Target Start/End: Complemental strand, 14795781 - 14795106
Alignment:
Q  258 taaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgatttagtaatataaac-tgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagta 354  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| | | ||||| | ||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  14795781 taaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaaa-caataaa-agttggttttcagaatattagagagaagta 14795685  T
Q  355 tggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaat 454  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||||    
T  14795684 tggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaat 14795586  T
Q  455 tctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatc 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  14795585 tctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaatc 14795486  T
Q  555 cctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaa 654  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  14795485 cctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatttaa 14795386  T
Q  655 tttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaac 754  Q
    | |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| || |||  || || |||||||||||||| ||||||| ||    
T  14795385 tctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagac 14795286  T
Q  755 ttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagc 854  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  ||   |||||||||||||| |    
T  14795285 tttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaag-cttaaccatgaagagattagttactcataac 14795187  T
Q  855 taaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccac 935  Q
    || |||| ||| ||||| |||||| |  |||||||||||||||||  |||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||    
T  14795186 tacagtacaagataactcacataaaatcaaggattcatacatgtattggataattgactatgagttgtgatggtctcccac 14795106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 328 - 936
Target Start/End: Original strand, 32704434 - 32705040
Alignment:
Q  328 ttggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatt 426  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||     
T  32704434 ttggttttcagaatattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgattatc 32704532  T
Q  427 tagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaac 526  Q
    |||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32704533 tagtttaacgacagattaacagagtaattctacccaatctcttgaaatagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaac 32704632  T
Q  527 cattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagag 626  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||    
T  32704633 cgttggaggttttaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctatcttgattacttaggttaaacttattacttagatcagag 32704732  T
Q  627 ttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaag 726  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| ||  || |||     
T  32704733 tcaaaagccagggttagtggtcatttaatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaaacattaaa 32704832  T
Q  727 cacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaatt 826  Q
    || |||||||| ||| | ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  32704833 cataaagtaat-tgacttaaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaag-ctt 32704930  T
Q  827 aaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatg 926  Q
    ||||| |||   |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||| |  |||||||||||||||||  |||| ||||||| | |||| |||||    
T  32704931 aaccataaagagattagttactcataactacagtacaagataactcacataaaatcaaggattcatacatgtattggataattgactatgagttgtgatg 32705030  T
Q  927 gtttcccacc 936  Q
    || |||||||    
T  32705031 gtctcccacc 32705040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 272 - 936
Target Start/End: Original strand, 19664789 - 19665451
Alignment:
Q  272 tgccctaggcagttgagttgat-ttagtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcg 369  Q
    |||||||||||||||  ||| | || |||| |||||| |||||||| | |||||   |||||||  |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  19664789 tgccctaggcagttggattggtatttgtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggttta-agaaaattagagagatgtatggttaagaccttcg 19664887  T
Q  370 aatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctctt 469  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  19664888 aatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caatcaatgattatctagtt-cacgacagattaacaaagtaactctacccaatatctt 19664985  T
Q  470 gacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacct 569  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  19664986 gacctagagttctccccgcaagtaacatccccttaatctcttaagtgaattcgaaatcattggagattttaatagaacgttaatccctatgtcataacct 19665085  T
Q  570 aataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaata 669  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||| ||||||||| ||||  ||||||     
T  19665086 aat-atgatctatctctatcttgattacttaggttaaacctattacctagatcagaattaaaagtcagggttagtgatcattcaatctctaacatcaatt 19665184  T
Q  670 tgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaac-gtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttc 768  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||  |||| || ||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||    
T  19665185 tgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacaatacaaaaagcatttaacacaaagtaatatgaataaaaactagactttcattgacattc 19665284  T
Q  769 aaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagcta 868  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||   ||||||||||||||  ||||||| ||| ||    
T  19665285 aaatgagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctca-gtctcaaccacaaagagattagttactcatatataaagtacaagata 19665383  T
Q  869 actaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccacc 936  Q
    ||| |||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| ||||||| |||||||    
T  19665384 actcacataaaaacaaggattcatacatgtattggatgattgactatgagttgtgatggtctcccacc 19665451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 328 - 936
Target Start/End: Complemental strand, 1838539 - 1837932
Alignment:
Q  328 ttggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatt 426  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  |||| |||||||||  | ||||||| |||||||    
T  1838539 ttggttttaagaatattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatgt-aattcgcactcctagtt-caatcaacgattatt 1838442  T
Q  427 tagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaac 526  Q
    |||||  ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1838441 tagttcaacgacagattaacaaagtaactctacccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaactccttaatctcttaagtgaatttgaaac 1838342  T
Q  527 cattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagag 626  Q
    |||||||| | ||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  1838341 cattggagattttaacataacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagatcagag 1838242  T
Q  627 ttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaac-gtacataaggcactaa 725  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||  |||| || ||| | |    
T  1838241 tcaaaagtcagggttagtggtcattcaatctctaacatcaatttgcatattcataaagttagggttagtagtcgatgataaacaatacaaaaagcattta 1838142  T
Q  726 gcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaat 825  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  1838141 acacaaagtaatatgaataaaaactagactttcattgacattcaaaggagttcaataaattagggttcccataggattacatcagattcatctca-gtct 1838043  T
Q  826 taaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgat 925  Q
     |||||||||   |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||| | |||| ||||    
T  1838042 caaccacaaagagattagttactcatatctaaagtacaagataactcacataaaaataaggtttcatacatgtattggatgattgactatgagttgtgat 1837943  T
Q  926 ggtttcccacc 936  Q
    ||| |||||||    
T  1837942 ggtctcccacc 1837932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 162 - 493
Target Start/End: Original strand, 30978225 - 30978557
Alignment:
Q  162 caagtgtattaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaaaaacgttatcattaagatgtaattaaa 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30978225 caagtgtactaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttatatctctacgtaacaaaaacgttatcattaagatgtaattaaa 30978324  T
Q  262 tttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggttttt-agaaaattgagagaagtatggtta 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30978325 tttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaattgagagaagtatggtta 30978424  T
Q  361 agtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacc 460  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30978425 agtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacc 30978524  T
Q  461 caatctcttgacctagaattctccccgcaagtg 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30978525 caatctcttgacctagaattctccccgcaagtg 30978557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 328 - 851
Target Start/End: Original strand, 20527343 - 20527864
Alignment:
Q  328 ttggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatt 426  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||     
T  20527343 ttggttttaagaatattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caatcaatgattatc 20527441  T
Q  427 tagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaac 526  Q
    ||  |||||||| |||||||  | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  20527442 taacttcacgacagattaacaaattaactttacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtaacaaccc-ttaatctcttaagtgaatttgaaac 20527540  T
Q  527 cattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagag 626  Q
    | |||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  20527541 cgttggaggttttaacagaacgttaatccctatgtcataatctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagttcagag 20527640  T
Q  627 ttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaag 726  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||| |||| || ||| |||     
T  20527641 tcaaaagccagggttagtggtcattcaatctctaaaatcaatttgcatattcataaagctagggttaggagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaa 20527740  T
Q  727 cacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaatt 826  Q
     | ||||||||||||||||| | || ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||  |     
T  20527741 tataaagtaatatgaataaagattagactttcattgatattcaaaggagttcaacacattaaggttcccataaaattacatcagattcatct-aggtctc 20527839  T
Q  827 aaccacaaaagaattagttactcat 851  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||    
T  20527840 aaccaaaaaagaatttgctactcat 20527864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 274 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 16883795 - 16883254
Alignment:
Q  274 ccctaggcagttgagttgattta-gtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaa 371  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||| ||||||  ||||||| | |||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  16883795 ccctaggcagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattggtttt-agaaaattagagagaagtatggttaagacattcgaa 16883697  T
Q  372 tcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttga 471  Q
    |||| ||||| | |||||||| |||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||  |||||||  |||||||  | |||  ||||||||||||||||    
T  16883696 tccttcgaagttctcctatggtaatttgcactactaatt-caaacaatgattatctatgttcacgaaagattaacacaataaccctacccaatctcttga 16883598  T
Q  472 cctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaa 571  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||  ||| ||||||    
T  16883597 cctagaattctccccacaagtggcaaccccttaatctcttatgtgaattcaaaaccgttggaggttttaacagaacattaatccctatg-catcacctaa 16883499  T
Q  572 taatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatg 671  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||  | |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  16883498 taatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagttcagagtcaaaagtgagggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttg 16883399  T
Q  672 catattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaa 771  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| || ||| |||  | ||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||    
T  16883398 catattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaagataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaa 16883299  T
Q  772 ggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcat 816  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  16883298 ggagttcaacaaattagggttctcataaaattacatcagattcat 16883254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 489 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 32427271 - 32426817
Alignment:
Q  489 aagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctag 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32427271 aagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaaccgttggaggtattaacagaatgttaatccctatgtcataacataataatgatctatctctag 32427172  T
Q  589 cttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctag 688  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||  ||  ||| |||| |||  ||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| || |||||| ||    
T  32427171 attgattacttaggttaaacttattacctagatc--agtcaaaatccagagttagtggtcattcaatctctaagatcgatttgcatactcctaaagccag 32427074  T
Q  689 ggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattag 788  Q
    ||||| | ||| || |||||| |||| || ||| ||| || |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  32427073 ggttagtggtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatataaattaaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaactag 32426974  T
Q  789 ggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggat 888  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| || ||||||    
T  32426973 ggttctcataggattatatcatattcatctcaag-cttaaccacaaaagaattagttactcctagctaaagtacaagataactaacgtaaaaacaaggat 32426875  T
Q  889 tcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccggatctccaa 946  Q
    |||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  32426874 tcatacatgtattggatgattgactatgagttttgatggttgcccaccagatctccaa 32426817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 571 - 936
Target Start/End: Complemental strand, 15534912 - 15534547
Alignment:
Q  571 ataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaatat 670  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||||||||| || | |||||||||| ||||| ||||  |||||| |    
T  15534912 ataatgatctatcactagcttgattacttatgttaaacctattaccaagatcagagttaaaagtcaagtttagtggtcactcaatctctaacatcaattt 15534813  T
Q  671 gcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacg-tacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttca 769  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||  |||| || ||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||    
T  15534812 tcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacaatacaaaaagcatttaacacaaagtaatatgaataaaaactagactttcattgacattca 15534713  T
Q  770 aaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaa 869  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||   |||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  15534712 aaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctca-atctcaaccacaaagagattagttactcatatctaaagtacaagataa 15534614  T
Q  870 ctaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccacc 936  Q
    || |||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||| | |||| ||||||| |||||||    
T  15534613 ctcacataaaaacaaggattcatatatgtattggatgattgactatgagttgtgatggtctcccacc 15534547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 354 - 756
Target Start/End: Original strand, 12983586 - 12983989
Alignment:
Q  354 atggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaa 453  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||  ||| || || ||||  | ||||||||| |  | |||||| ||||| |||||||  |||||    
T  12983586 atggtcaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatgaaaatctgtaccccta--ttcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagattaacaaagtaa 12983683  T
Q  454 ttctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaat 553  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |  |||||||    
T  12983684 ttctacccaatctcttgaccttgaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaacagtccgttaat 12983783  T
Q  554 ccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattca 653  Q
    || | | |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  12983784 ccatgtgtcataacctaataattttctatctctagcttaattacttaggttaaacatattacctagatcagagtcaaaagtcagggctagtggtcattca 12983883  T
Q  654 atttctatgatcaatatgcatattcataaa-gctagggttaatagtc--tatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaact 750  Q
    | ||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||| | || || ||  ||| |||||| |||| |  ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  12983884 agttctaagatcagtttgcatattcaaaaacgctagtgctagtactcaatataataaacatacagacagcattaaacacaaggtaatatgaattaaaact 12983983  T
Q  751 aaactt 756  Q
    | ||||    
T  12983984 agactt 12983989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 354 - 679
Target Start/End: Original strand, 12980699 - 12981022
Alignment:
Q  354 atggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaa 453  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||  |||||| || ||||  | ||||||||| |  | |||||| ||||| |||||||  |||||    
T  12980699 atggtcaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatgaaaatttgtaccccta--ttcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagattaacaaagtaa 12980796  T
Q  454 ttctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaat 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||  |  |||||||    
T  12980797 ttctacccaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaaccgcttaatctcttaagtgaattcgaaattgttggaggttttaacagtccgttaat 12980896  T
Q  554 ccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattca 653  Q
    || |   ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  12980897 ccatgagtcataacctaatacttttctatctctagcttaattacttaggttaaacatattacctagatcagagtcaaaagtcagggctagtggtcattca 12980996  T
Q  654 atttctatgatcaatatgcatattca 679  Q
    | ||||| ||||| | ||||||||||    
T  12980997 agttctaagatcagtttgcatattca 12981022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 272 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 15535177 - 15534923
Alignment:
Q  272 tgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaattga-gagaagtatggttaagtccttcga 370  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||  |||||||| | |||||   |||||||| | |||||| | | || ||||||||||| ||||| |    
T  15535177 tgccctaggcagttgagttgattttgtaaaacaaatagattaaaaacaataaaagtttggtttt-acaaaattaaagtgatgtatggttaagaccttcaa 15535079  T
Q  371 atcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttg 470  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||  ||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||    
T  15535078 atcctccgaagttttcctatggtaatttgcattcctaatt-caatcaatgattatctagttcaacgacagattaacaaagtaactctaaccaatctcttg 15534980  T
Q  471 acctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaacc 527  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15534979 acctagagttctccccgcaagtaacaacctcttaatctcttaagtgaattcgaaacc 15534923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 347 - 936
Target Start/End: Original strand, 7769588 - 7770187
Alignment:
Q  347 gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaac 446  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |  ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||||||| |||||  ||||||    
T  7769588 gagaaatatggttaagaccttcgaatcctccgatgctcttatatggtaatttgcac-cctcaattcaatcaatgttcatttagtttaacgacatattaac 7769686  T
Q  447 ttagtaattctacccaatctcttgacctag----aattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtga---attcgaaaccattggaggtatt 539  Q
      ||||||||||| |||||| |||||||||    ||||||| | |||||||  |||||||||||||||| |||||   |||||||| | |||||||| ||    
T  7769687 aaagtaattctactcaatcttttgacctagctataattctctctgcaagtgctaaccccttaatctcttcagtgatgaattcgaaatctttggaggtttt 7769786  T
Q  540 aaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagc----c 635  Q
    ||  |  |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||| ||||  ||||| | ||||||    |    
T  7769787 aacagtccgttaatccctaaatcataacctaataattgtctatctctaacttaattacttaggttaaacatatttcctagatcagattcaaaagccatgc 7769886  T
Q  636 atggttagtggtcattcaatttctat--gatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaag 733  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||  ||| ||| | || |||||  | ||||| | || ||||  ||||||||| |||||| | || ||| ||||| |    
T  7769887 atggctagtggtcattcaagttctataagataaatttacacattcaagatgctagtgctagtagttaatcataaacatacatatgtcattaaacacaagg 7769986  T
Q  734 taatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttca-acaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccac 832  Q
     |||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||   ||| | |||||||||||||||||| | |  | ||||||    
T  7769987 aaatatgaat-taaactagactttcattgatattcaagggagttcatacaaatta-ggtattcatggaattacatcagattcatct-aagtctcaaccac 7770083  T
Q  833 aaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcc 932  Q
    ||    ||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||   || |  || ||||||||||||||  |||| | ||||| |  ||||||||||| |||    
T  7770084 aaggagattagttactcatagataaagtacaagatagctaatgcaaaagtaaagattcatacatgtattggataactgactatgtgttttgatggtctcc 7770183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 457 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 15538158 - 15538036
Alignment:
Q  457 tacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccc 556  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  15538158 tacccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaacaccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggttttaacagaacgttaatccc 15538059  T
Q  557 tatatcataacctaataatgatc 579  Q
    ||| ||||||| |||||||||||    
T  15538058 tatgtcataacttaataatgatc 15538036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 730 - 936
Target Start/End: Complemental strand, 15537947 - 15537742
Alignment:
Q  730 aaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaac 829  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |  | |||    
T  15537947 aaagtactatgaataaaaattagactttcattgacattcaaaggagttcaacaaattagggttcccatatgattacatcaaattcatctca-gtctcaac 15537849  T
Q  830 cacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtt 929  Q
    ||||||   |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |||||| || ||||| |||||||||||   ||||||||||| | |||| |||||||     
T  15537848 cacaaagagattagttactcatatctaatgtacaagataactcacataaaaacaaggagtcatacatgtattagatgattgactatgagttgtgatggtc 15537749  T
Q  930 tcccacc 936  Q
    |||||||    
T  15537748 tcccacc 15537742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 156 - 263
Target Start/End: Original strand, 12488865 - 12488972
Alignment:
Q  156 aattagcaagtgtattaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaaaaacgttatcattaagatgta 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  12488865 aattagcaagtgtattaatttaaatcgagtaataaaataattcgtttcctcatggactgtcttaatctctacttaacaagaacattaacattaagatgta 12488964  T
Q  256 attaaatt 263  Q
    ||||||||    
T  12488965 attaaatt 12488972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 15393919 - 15394034
Alignment:
Q  147 ttgataaaaaattagcaagtgtattaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaaaaacgttatcat 246  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  15393919 ttgatagaaaattagcaagtgtactaatttgaatcgagtaataaaataatttgttccctcaggaactattttaatctctacttaacaagaacattaacat 15394018  T
Q  247 taagatgtaattaaat 262  Q
    |||| | |||||||||    
T  15394019 taaggtataattaaat 15394034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 832 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 32426748 - 32426634
Alignment:
Q  832 caaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttc 931  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  32426748 caaaagaattagttactcctagctaaagtacaagataactaacgtaaaaacaaggattcatacgtgtattggatgattgactatgagttttgatggttgc 32426649  T
Q  932 ccaccggatctccaa 946  Q
     |||| |||||||||    
T  32426648 tcaccagatctccaa 32426634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 27649168 - 27649087
Alignment:
Q  328 ttggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaa 408  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||    
T  27649168 ttggttttaagaaaattagagcgaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcacttctaa 27649087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 621 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 15538037 - 15537975
Alignment:
Q  621 tcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaa 683  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||    
T  15538037 tcagagttaaaagcaagggttagtgatcattcaatctctaacatcaatttgcatattcataaa 15537975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 274 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 15540689 - 15540582
Alignment:
Q  274 ccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaat 372  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||||| | ||||| | ||   ||||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||    
T  15540689 ccctaggcagttgagttgattttctaaaataaagggattaaaaacaataaa-agtttagttttagaaaattaaagagatttatggttaagaccttcgaat 15540591  T
Q  373 cctccgaag 381  Q
    |||||||||    
T  15540590 cctccgaag 15540582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 333 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 32427362 - 32427286
Alignment:
Q  333 ttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaa 408  Q
    |||||||||||| |||||| || || ||||| |||| |||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  32427362 ttttagaaaattagagagatgtttgattaagacctttgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaa 32427286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 583; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 258 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 31528525 - 31527836
Alignment:
Q  258 taaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggttttta-gaaaattgagagaagtatg 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31528525 taaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaattgagagaagtatg 31528426  T
Q  357 gttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattc 456  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31528425 gttaagtccttcgaatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacagattaacttagtaattc 31528326  T
Q  457 tacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccc 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31528325 tacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccaatggaggtattaa-cgaacgttaatccc 31528227  T
Q  557 tatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatt 656  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31528226 tatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatt 31528127  T
Q  657 tctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaactt 756  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31528126 tctatgatcaatatgcatattcataacgctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcattaagcacaaagtaataagaataaaaactaaactt 31528027  T
Q  757 ttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagcta 856  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31528026 tcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagcta 31527927  T
Q  857 aagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccggatctccaag 947  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31527926 aagtataagctaactaacataagaaaacggattcatacatgtgaaggaagattgactcttagttttgatggttccccaccagatctccaag 31527836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 259 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 31626684 - 31625994
Alignment:
Q  259 aaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactga-ttaaaagcgataaagaattggtttttagaaaat-tgagagaagtatg 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||   |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  31626684 aaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaaaggaattaaaaataataaaggattggtttt-agaaaatctgagagaagaatg 31626586  T
Q  357 gttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattc 456  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31626585 gttaagtcattcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaatt-caatcaattattatttagtttcacgacagattaacttagtaattc 31626487  T
Q  457 tacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccc 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||     
T  31626486 tacccaatctcttgacctagaattctccctgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaatcgttggaggtattaaaagaacgttaatcct 31626387  T
Q  557 tatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatt 656  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31626386 tatgttataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatt 31626287  T
Q  657 tctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaata--aaaactaaac 754  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||  || ||| ||||  ||||||||||||  |  | || |     
T  31626286 tctataatcaatatgtatattcataaagctagggttaatagtcgatgataaacatacataaaacattaaacacagggtaatatgaatagtaggattacat 31626187  T
Q  755 ttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagc 854  Q
       |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31626186 caatatgtatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccgtaggattacatcagattcatctcaagaattaaccacaaaagaattagttactcatagc 31626087  T
Q  855 taaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccggatctccaag 947  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31626086 taaagtataagctaactcacataagaaaaatgattcgtacatgtaaaggatgattgactcatagttttgatggttgcccaccagatctccaag 31625994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 259 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 40018112 - 40017443
Alignment:
Q  259 aaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaattgagagaagtatggt 358  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| | ||||   | ||||||    ||||||||||||||||||||    
T  40018112 aaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattt-gtaacataaacggattaaaaacaataagagactggtttaagaaaaattgagagaagtatggt 40018014  T
Q  359 taagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattattta---gtttcacgacggattaacttagtaatt 455  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||   |||| ||||| |||||||| |||| ||    
T  40018013 taagaccttcgaatcctccgaaactctcctatggtaatttgcactcctaatt-caaccaatgattatttataagttttacgacagattaactcagtactt 40017915  T
Q  456 ctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatcc 555  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |    
T  40017914 ctccccaatcctttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccc-ttattctcttaagtgaattcgaaactgttggaggtattaaaagaacgttaattc 40017816  T
Q  556 ctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaat 655  Q
     ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  40017815 atatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagttcaaagtcaaaagccagggtcagtggtcattcaat 40017716  T
Q  656 ttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaact 755  Q
     |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||| || |||||| |||| || ||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  40017715 ctctacgatcaatttgcatattcataaagatagggtcagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaact 40017616  T
Q  756 tttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagct 855  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40017615 ttcattgaaattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcatattcatctcaag-cttaaccacaaaagaattagttactcatagtt 40017517  T
Q  856 aaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtt 929  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||||    
T  40017516 aaagtataagctaactaacataggaagaaggattcatacatgtaatggatgactgactatgagttttgatggtt 40017443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 259 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 16295032 - 16294550
Alignment:
Q  259 aaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactgattaaaagcga-taaagaattggtttttagaaaattgagagaagtatgg 357  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| | | |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16295032 aaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattttgtatcataaaccgattaaaaacaaataaaga-ttagttttcagaaaattgagagaagtatgg 16294934  T
Q  358 ttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattct 457  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16294933 ttaagtccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctagttt-aatcaatgattatttagtttcacgacagattaacttagtaattct 16294835  T
Q  458 acccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccct 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16294834 acccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaaa-gaacgttaatccct 16294736  T
Q  558 atatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaattt 657  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16294735 atgtcataacctaataatgatctatctctaacttgattacttaggttaaacctattacatagttcagagttaaaagccagagttagtggtcattcaattt 16294636  T
Q  658 ctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaat 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| || ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  16294635 ctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacacaaagcattaaacacaaggtaatatgaat 16294550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 259 - 942
Target Start/End: Complemental strand, 13710204 - 13709524
Alignment:
Q  259 aaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatgg 357  Q
    |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| || |||| |||||| |||||||| | |||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13710204 aaatttatattgatgcctgaggaagttgagttgagtt-gtaacataaacggattaaaaacaataaaagattggtttt-agaaaatttgagagaagtatgg 13710107  T
Q  358 ttaagtccttcgaatcctccgaa-gctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattc 456  Q
    ||||| ||||| |||| || ||| ||| |||||||  ||||||||||||||| |  |  |||||||||| |||||  || || |||||||  ||||||||    
T  13710106 ttaagaccttcaaatcatctgaaagctctcctatgataatttgcactcctaattt-aggcaatgattatctagttcaacaacagattaacaaagtaattc 13710008  T
Q  457 tacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccc 556  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||   ||||||||||||    
T  13710007 tacccgatctcttgacccataattctcccctcaagtgacaaccccataatctctttagtgaattcgaaatcgttggaggttttaacaaaacgttaatccc 13709908  T
Q  557 tatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatt 656  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||  ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||     
T  13709907 tatgtcataacctaataatgatctatatctagcttgattacttgggttaaacttatcacctaggtcagagtcaaaatccagggttagtggtcattcaatc 13709808  T
Q  657 tctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaactt 756  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| || ||| ||| || |||||||||||||| |||| || ||||    
T  13709807 tctaagatcaatttacatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaaattagactt 13709708  T
Q  757 ttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagcta 856  Q
    | |||||| |||   | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13709707 tcattgatattc-ttgaagttcaacaaattagggttcacataggattacatcagattcatctca-gaattaaccacaagagaattagttactcatagcta 13709610  T
Q  857 aagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccggatct 942  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13709609 aagtataagctaactaacataagaataaggattcatacatgtaatggatgattgactattagttttgatggttgcccaccagatct 13709524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 333 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 36326987 - 36326369
Alignment:
Q  333 ttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtt 431  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||    
T  36326987 ttttagaaaattagagagatgtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgattatctaatt 36326889  T
Q  432 tcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattc----gaaacc 527  Q
    | ||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     |||||     
T  36326888 taacgatagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccctgcaagtgacaactccttaatctcttaagtgaattaatttgaaact 36326789  T
Q  528 attggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagt 627  Q
     |||||||||||||  |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||| |||    
T  36326788 gttggaggtattaacagaacgttaatccctgtgtcatagcctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcaaagt 36326689  T
Q  628 taaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagc 727  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||  ||| || ||| ||| |    
T  36326688 caaaagccagggttagtggtcattcaatctctaagatcgatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaac--acaaaaagcattaaac 36326591  T
Q  728 acaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaatta 827  Q
    | |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  36326590 ataaagtaatatgaattaaaactagactttcattgatattcaaatgagttcaacaaactagggttcccataggattacatcagattcatctcaag-ctta 36326492  T
Q  828 accacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaag----gattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttg 923  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| || |||    ||||||||| ||||  |||||||||||| | |||||||    
T  36326491 accacaaaagaattagttactcatagataaagtacaagataactaacgtaaaaacaaggattgattcatacgtgtattggatgattgactatgagttttg 36326392  T
Q  924 atggtttcccaccggatctccaa 946  Q
    ||||||  ||| | |||||||||    
T  36326391 atggttggccatcagatctccaa 36326369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 333 - 799
Target Start/End: Original strand, 23673529 - 23673995
Alignment:
Q  333 ttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtt 431  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  23673529 ttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caatcaatgattatctagtt 23673627  T
Q  432 tcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattg 531  Q
    | |||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  23673628 taacgacaaattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaacagttg 23673727  T
Q  532 gaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaa 631  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||    
T  23673728 gaggttttaacagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaa 23673827  T
Q  632 agccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaa 731  Q
    || || || ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| |||| || ||| ||| || ||    
T  23673828 agtcagggatagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagttagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataa 23673927  T
Q  732 agtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccatag 799  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23673928 agtaatatgaattaaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaattaaggttcccatag 23673995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 348 - 935
Target Start/End: Original strand, 32575887 - 32576471
Alignment:
Q  348 agaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaact 447  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32575887 agaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagctctcctatgataatttgcactcctagtt-caaaaaatgattatttagtttcacgacagattaact 32575985  T
Q  448 tagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaac 547  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  32575986 tagtaactctaccaaatcccttgacctagaattctccccacaagtgacaaccccttaatctcttgactgaattcgaaattgttggaggtattaaaagaac 32576085  T
Q  548 gttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggt 647  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||| || ||| |||| |    
T  32576086 gttaatccctatgtcgtaacctaataaagatctatctttagcttgattatttaggttaaacatattacctagttcatagtcaaaagacagggtcagtgat 32576185  T
Q  648 cattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaa 747  Q
    |||||||| | || ||||||| ||||||||||||||| |||| | | ||||| || |||||| | || || ||| ||| || ||||||||||| |||||     
T  32576186 cattcaatctatacgatcaatttgcatattcataaagttaggatcagtagtcaatgataaacatgcaaaaagcattaa-caaaaagtaatatggataaag 32576284  T
Q  748 actaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttac 847  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |  | |||||||||   ||||||||     
T  32576285 actaaactttcattgaaattcaaaggagttcaacaaattagggttcctataggattacatcatattcatct-aagtctcaaccacaaagagattagttat 32576383  T
Q  848 tcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccac 935  Q
    | |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||| ||||| | |||||||||||| ||||||    
T  32576384 tgatagctaaagtagaagataactaacataaaaacaaggattcatacaagtattggatgactgactgtgagttttgatggtctcccac 32576471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 145 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27499614 - 27499496
Alignment:
Q  145 tattgataaaaaattagcaagtgtattaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaaaaacgttatc 244  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  27499614 tattgatagaaaattagcaagtgtactaaattgaatcgagtaataaattaattcgtttcctcagggactgttttaatctctacttaacaaaaacattatc 27499515  T
Q  245 attaagatgtaattaaatt 263  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27499514 attaagatgtaattaaatt 27499496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 148 - 263
Target Start/End: Original strand, 27195653 - 27195768
Alignment:
Q  148 tgataaaaaattagcaagtgtattaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaaaaacgttatcatt 247  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  27195653 tgatagaaaattagcaagtgtactaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgttttaatctctgcttaacaagaacattatcatt 27195752  T
Q  248 aagatgtaattaaatt 263  Q
    ||||||||||||||||    
T  27195753 aagatgtaattaaatt 27195768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 146 - 263
Target Start/End: Original strand, 4696659 - 4696776
Alignment:
Q  146 attgataaaaaattagcaagtgtattaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaaaaacgttatca 245  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  4696659 attgatagtaaattagcaagtgtactaatttgaatcgagtaataaaataattcttttcctcagggactgttttaatctctacttaacaagaacattatca 4696758  T
Q  246 ttaagatgtaattaaatt 263  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4696759 ttaagatgtaattaaatt 4696776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 547 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 8426844 - 8426784
Alignment:
Q  547 cgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaa 607  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8426844 cgttaatccctaaatcataacctaataattttctatctctagcttaattacttaggttaaa 8426784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 579; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 579; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 258 - 947
Target Start/End: Original strand, 23759718 - 23760407
Alignment:
Q  258 taaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggttttta-gaaaattgagagaagtatg 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23759718 taaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaatcgagagaagtatg 23759817  T
Q  357 gttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattc 456  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23759818 gttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattc 23759917  T
Q  457 tacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccc 556  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23759918 tacccaatctcttgccctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaaccattggaggtattaa-cgaacgttaatccc 23760016  T
Q  557 tatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatt 656  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23760017 tatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcggagttaaaagccagggttagtggtcattcaatt 23760116  T
Q  657 tctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaactt 756  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760117 tctatgatcaatatgcatattcacgacgctaggattaatagtctatcataaacgtacataaggtactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaactt 23760216  T
Q  757 ttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagcta 856  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760217 tcattaatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagcta 23760316  T
Q  857 aagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccggatctccaag 947  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23760317 aagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacaagtgaaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccagatctccaag 23760407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 259 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 11279625 - 11278939
Alignment:
Q  259 aaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactgattaaaagcga-taaagaattggtttttagaaaattgagagaagtatgg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11279625 aaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacgaataaaga-ttggtttttagaagattgagagaagtatgg 11279527  T
Q  358 ttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattct 457  Q
    |||||||||||||||| | ||||| | |||| ||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11279526 ttaagtccttcgaatctttcgaagttctcctctggtaatttgcactcctagtt-caataaatgattatttagtttcacgacagattaacttagtaattct 11279428  T
Q  458 acccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccct 557  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  11279427 acccaatctcttgacctaggattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaatctgaaaccgttggaggtattaat-gaacgttaatctct 11279329  T
Q  558 atatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaattt 657  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11279328 atgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaattt 11279229  T
Q  658 ctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttt 757  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| || ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11279228 ctatgatcaatatgcatgttcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaagcacaaggtaatatgaataaagactaaacttt 11279129  T
Q  758 tattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaa 857  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11279128 cattgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccatagggttacatcagattcatctcacgaattaaccacaaaagaattagttactcataggtaa 11279029  T
Q  858 agtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccggatctccaag 947  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11279028 agtataagctaactaacataagaaaaatgattcatacatgtaaaggatgattgactcttagttttgatggttgcccaccagatctccaag 11278939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 259 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 33313129 - 33312450
Alignment:
Q  259 aaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactga-ttaaaagcgataaagaattggtttttagaaaat-tgagagaagtatg 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||   |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  |||    
T  33313129 aaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaacggaattaaaaataataaaggattggtttt-agaaaatctgagagaaaaatg 33313031  T
Q  357 gttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattc 456  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33313030 gttaagtccttcgaatcctctgaagctctcctatggtaatttgctttcctaatt-caatcaatgattatttagtttcacgacgaattaacttagtaattc 33312932  T
Q  457 tacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccc 556  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||     
T  33312931 tacccaatcttttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaaatgaattcgaaaccggcggaggtattaaaagaacgttaatcca 33312832  T
Q  557 tatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatt 656  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  33312831 tatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacatattacctagttcagagttaaaagtcagggttagtggtcattcaatt 33312732  T
Q  657 tctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaactt 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  33312731 tctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtcgatgataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaattt 33312632  T
Q  757 ttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagcta 856  Q
    | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33312631 tcattaatgttcaatggagttcaacaaattagggttcccgtaggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagcta 33312532  T
Q  857 aagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccggatctccaag 947  Q
    ||||||||||         |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  33312531 aagtataagc---------taagaaaaaggattcatacatgtgaaggatgattgactcttagtttcgatggtttcccaccatatctccaag 33312450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 259 - 846
Target Start/End: Original strand, 46846423 - 46847007
Alignment:
Q  259 aaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactgattaaaag-cgataaagaattggtttttagaaaattgagagaagtatgg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||| |||||  | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46846423 aaatttatattggtgccctaggcagttgagttgaattcttattataaactgactaaaaaacaataaaagattggtttttagaaaattgagagaagtatgg 46846522  T
Q  358 ttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattct 457  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  46846523 ttaagtccttcgaatcctccgaagttcttctatggtaatttgcactcctagtt-caatcaatgattatttagtttcacgacagattaacctaataattct 46846621  T
Q  458 acccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccct 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  46846622 acccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaactgaattcgaaaacgttggaggttttaaaagatcgttaatccct 46846721  T
Q  558 atatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaattt 657  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  46846722 atgtcataacctaataataatctatctctaacttgattacttaggttaaacctattacttagttcagagttaaaagtcagggttagtgatcattcaattt 46846821  T
Q  658 ctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttt 757  Q
    | ||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| || |||||| |||| || ||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  46846822 ccatgatcaatatgcatgttc---aagctagggttaatagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaacttt 46846918  T
Q  758 tattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagtta 846  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46846919 cattgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccatagggttacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagtta 46847007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 258 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 294995 - 294313
Alignment:
Q  258 taaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaattgagagaagtatgg 357  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||  ||||| ||| |||| |||| ||| |||||||| |  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  294995 taaatttatattgatgcccgaggcagt--agttgtttt-gtaacataagctggttaaaagcaaataaggattggtttt-agaaaattgagagaagtatgg 294900  T
Q  358 ttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattct 457  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||  ||||| |||||||  ||||||| |    
T  294899 ttaagtctttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaa-tgcaatcaatgattatctaattcaacgacagattaacaaagtaattat 294801  T
Q  458 acccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccct 557  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||   |||||||||||||    
T  294800 acccaatctcttgaactagaattctccccataagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaactgttggatgttttaacaaaacgttaatccct 294701  T
Q  558 atatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaattt 657  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |    
T  294700 atgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcattcaatct 294601  T
Q  658 ctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttt 757  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||  || |||||| ||||  | ||| ||| || |||||||||||||| |||| || |||||    
T  294600 ctaagatcaatttgcatattcataaaactagagttaatagttcatgataaacatacaataagcattaaacataaagtaatatgaattaaaattatacttt 294501  T
Q  758 tattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaa 857  Q
     |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  294500 cattgatattcaaaggagttcaacaaactagggttcccataggattacatcagattcatctcagg-attaaccacaagagaattagttactcatagctaa 294402  T
Q  858 agtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccggatctccaa 946  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  294401 agtataagctaactaacataagaagaaagattcatacatgtaatggatgattgactattagttttgatggttgctcaccagatctccaa 294313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 328 - 936
Target Start/End: Original strand, 17863274 - 17863881
Alignment:
Q  328 ttggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatt 426  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||     
T  17863274 ttggttttcagaatattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgattatc 17863372  T
Q  427 tagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaac 526  Q
    |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17863373 tagtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaac 17863472  T
Q  527 cattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagag 626  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||    
T  17863473 cgttggaggttttaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagag 17863572  T
Q  627 ttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaag 726  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| || |||  ||     
T  17863573 tcaaaagccagggttagtggtcatttaatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaa 17863672  T
Q  727 cacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaatt 826  Q
    || |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  17863673 cataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaag-ctt 17863771  T
Q  827 aaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatg 926  Q
    ||||| |||   |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||| |  |||||||||||||||||  |||| ||||||| | |||| |||||    
T  17863772 aaccataaagagattagttactcataactacagtacaagataactcacataaaatcaaggattcatacatgtattggataattgactatgagttgtgatg 17863871  T
Q  927 gtttcccacc 936  Q
    || |||||||    
T  17863872 gtctcccacc 17863881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 328 - 935
Target Start/End: Original strand, 17866533 - 17867139
Alignment:
Q  328 ttggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatt 426  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||     
T  17866533 ttggttttcagaatattagagagaagtatggtttagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgattatc 17866631  T
Q  427 tagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaac 526  Q
    |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17866632 tagtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaac 17866731  T
Q  527 cattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagag 626  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||    
T  17866732 cgttggaggttttaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagag 17866831  T
Q  627 ttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaag 726  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| || |||  ||     
T  17866832 tcaaaagccagggttagtggtcatttaatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaa 17866931  T
Q  727 cacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaatt 826  Q
    || |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  17866932 cataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaag-ctt 17867030  T
Q  827 aaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatg 926  Q
    ||||| |||   |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||| |  |||||||||||||||||  |||| ||||||| | |||| |||||    
T  17867031 aaccataaagagattagttactcataactacagtacaagataactcacataaaatcaaggattcatacatgtattggataattgactatgagttgtgatg 17867130  T
Q  927 gtttcccac 935  Q
    || ||||||    
T  17867131 gtctcccac 17867139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 314; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 258 - 936
Target Start/End: Complemental strand, 6967282 - 6966606
Alignment:
Q  258 taaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgatttagtaatataaac-tgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagta 354  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| | | ||||| | ||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  6967282 taaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaaa-caataaa-agttggttttcagaatattagagagaagta 6967186  T
Q  355 tggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaat 454  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||  |||||||  ||||||    
T  6967185 tggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgattatctagtttaacgatagattaacaaagtaat 6967087  T
Q  455 tctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatc 554  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  6967086 tctacccaatctcttaacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaatc 6966987  T
Q  555 cctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaa 654  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  6966986 cctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatttaa 6966887  T
Q  655 tttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaac 754  Q
    | |||| ||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| || |||  || || |||||||||||||| ||||||| ||    
T  6966886 tctctaagatcagtttgaatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagac 6966787  T
Q  755 ttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagc 854  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||   |||||||||||||| |    
T  6966786 tttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaag-cttaaccataaagagattagttactcataac 6966688  T
Q  855 taaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccacc 936  Q
    || |||| ||| ||||| |||||| |  |||||||||||||||||  |||| ||||||| | |||| ||||||| |||||||    
T  6966687 tacagtacaagataactcacataaaatcaaggattcatacatgtattggataattgactatgagttgtgatggtctcccacc 6966606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 259 - 835
Target Start/End: Original strand, 36222420 - 36222993
Alignment:
Q  259 aaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaattgagagaagtatggt 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | |  ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36222420 aaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttctaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattgagagaagtatggt 36222519  T
Q  359 taagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattcta 458  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||    
T  36222520 taagtccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaattttcactcctagtt-caatcaatgattatttagtttcactacaaattaacttagtaatttta 36222618  T
Q  459 cccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatcccta 558  Q
    || |||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  36222619 cctaatctcttgacctagaattctcc-----agtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatttaa-gaacgttaatctcta 36222712  T
Q  559 tatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatttc 658  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  36222713 tgtcataacctaataatgatctatctctaacttgattacttaggttaaatctattagctagttcagagttaaaagcgagggttagtggtcattcaatttc 36222812  T
Q  659 tatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaa-taaaaactaaacttt 757  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| || |||||| |||| || ||| ||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  36222813 catgatcaatatgcatgttcataaagctagggctagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaattaaagactaaacttt 36222912  T
Q  758 tat------tgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaa 835  Q
     ||      |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  36222913 cattgaatatgatattcaaa-gagttcaacaaattaggattcccatagg-ttacatcagattcacctcaggaa-taaccacaaa 36222993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 328 - 936
Target Start/End: Complemental strand, 24783474 - 24782864
Alignment:
Q  328 ttggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatt 426  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | || ||||| ||||| || |||||| | ||||||||||||||     
T  24783474 ttggttttaagaatattagagagaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcatatggtaattttcattcctaatt-caatcaatgattatc 24783376  T
Q  427 tagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaac 526  Q
    |||||| ||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24783375 tagtttaacgagagattaacaaagtaattatacccaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaac 24783276  T
Q  527 cattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttg---attacttaggttaaatctattacctaattca 623  Q
    | |||||| | ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||  |||||||||  |||    
T  24783275 cgttggagattttaacagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatatatctctagcttgattattacttaggttaaacttattacctagatca 24783176  T
Q  624 gagttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcact 723  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| |||| || |||      
T  24783175 gagtcaaaagccagggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctatggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcatc 24783076  T
Q  724 aagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcagga 823  Q
    || || ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  24783075 aaacataaagtaatatggattaaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaactacggttcccataggattacatcagattcatcttaag- 24782977  T
Q  824 attaaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttg 923  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||  |||| ||||||| | |||| ||    
T  24782976 cttaaccacaaaaagattagttactcataactaaagtacaagataactcacataaaaacaaggattcatacatgtattggataattgactatgagttgtg 24782877  T
Q  924 atggtttcccacc 936  Q
    ||||| |||||||    
T  24782876 atggtctcccacc 24782864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 345 - 818
Target Start/End: Original strand, 36843135 - 36843607
Alignment:
Q  345 gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatta 444  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||| |||||  ||||| |||||    
T  36843135 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaattcgcactcctactt-caatcaatgattatctagttcaacgacagatta 36843233  T
Q  445 acttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacg 544  Q
    ||  | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  36843234 acaaattaactctacccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggttttaacag 36843333  T
Q  545 aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagt 644  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||| | |||||    
T  36843334 aacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccaggattagt 36843433  T
Q  645 ggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaac-gtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaat 743  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||  || | || ||| ||| |||||||||||||||||    
T  36843434 ggtcattcaatctctaacatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacaatataaaaagcattaaacacaaagtaatatgaat 36843533  T
Q  744 aaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 818  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  36843534 aaaaactagactttcattgacattcaaa-gagttcaacaaattagagttcccacaagattacatcaaattcatct 36843607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 275 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 23108106 - 23107566
Alignment:
Q  275 cctaggcagttgagttgat-ttagtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaat 372  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||| ||||||  ||||||| | |||||  ||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  23108106 cctagacagttgagttgatgtttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattggtttt-agaaaattagagagaaatgtggttaagaccttcgaat 23108008  T
Q  373 cctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgac 472  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  |||||     
T  23108007 catccgaagctctcctatggtaatttgcactcctagtt-caaacaatgattatttagtttcacaacagattaacttagtaactctacccaattccttgag 23107909  T
Q  473 ctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaat 572  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23107908 ctataattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaattgtttgaggtattaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaat 23107809  T
Q  573 aatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgc 672  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |  ||| |||||||||||||| ||||  |||||| |||    
T  23107808 aatgatctatctctaacttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagtcaaaagtctgggtcagtggtcattcaatctctactatcaatttgc 23107709  T
Q  673 atattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaag 772  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| || |||||| | || || ||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||    
T  23107708 atattcataacgttagggttaatagtcgatgataaacatgcaaaaagcattaaacaaaaagtaatatgaataaagactaaactttcattgaaattcaaag 23107609  T
Q  773 gagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 818  Q
    |||||||||||   |||||| | ||| |||||||||| ||||||||    
T  23107608 gagttcaacaa---agggtttctataagattacatcaaattcatct 23107566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 328 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 9765867 - 9765373
Alignment:
Q  328 ttggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatt 426  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||     
T  9765867 ttggttttaagaatattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgattatc 9765769  T
Q  427 tagtttcacga---------cggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtga 517  Q
    |||||||||||         | |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  |||||||||||||||||||    
T  9765768 tagtttcacgagtttcacggcagattaacaaagtaactctacccaatctcttgacctataattctccctgcaagtaaaatacccttaatctcttaagtga 9765669  T
Q  518 attcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacct 617  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||   ||| ||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  9765668 attcgaaaccattagaggttttaacaaaacattagtccttatgtcataacctaataatcatctatctctagcttgattacttaagttaaacttattacct 9765569  T
Q  618 aattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataa 717  Q
    |   |||||| ||||| || ||||||||||||||||||      ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| | || ||    
T  9765568 agaccagagtcaaaagtcagggttagtggtcattcaat-----cgatcaatttgcatatccataaagctagggttaatagtcgatggtaaacatgcaaaa 9765474  T
Q  718 ggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatc 817  Q
     ||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  9765473 cgcattaaacataaagtaatatgaataaaaactagacttttattcatattcaaagaagttcaacaaattagggttctcataggattacatcatattcatc 9765374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 272 - 815
Target Start/End: Original strand, 3862029 - 3862562
Alignment:
Q  272 tgccctaggcagttgagttgattta--gtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttc 368  Q
    |||||||||||||| | |||||||   |||| ||||||||||||||| | |||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  3862029 tgccctaggcagttcaattgattttttgtaacataaactgattaaaaacaataaaagattggtttt-ataaaattagagagaagtatgattaagaccttc 3862127  T
Q  369 gaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctct 468  Q
    ||||||| ||||| | |||||||        ||||||||| | |||  ||||||||| |||||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3862128 gaatccttcgaagttctcctatg--------cactcctaatt-caagaaatgattatctagttcaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctct 3862218  T
Q  469 tgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatc----tcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcat 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| ||||  ||||| || |||| ||  | ||||||||||||||||    
T  3862219 tgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaattaatgtcttaagtgaattcaaaactgttggaagttttaaccgtcctttaatccctatatcat 3862318  T
Q  565 aacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgat 664  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||   |  ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||| ||     
T  3862319 aacctaataattttctatctctagcttaattacttaggttaaacacaccacctagttcagagtttaaagccagggttagtggtcaattaagttctaagac 3862418  T
Q  665 caatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgat 764  Q
    || | |||| ||| ||       ||| || ||||| || |||||| |||| || ||| |||  ||||  | |||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  3862419 cagtctgcaaatttat-------gggctagtagtcaataataaacatacacaaagcattaaaaacaagatgatataaataaaaactagactttcattgat 3862511  T
Q  765 gttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattca 815  Q
     || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  3862512 atttaaaggagttcaacaaattagggttctcataagattacattagattca 3862562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 31646160 - 31646021
Alignment:
Q  8 aatagagaggcaaggtaattaacaggcaccatcatgaaaacgaaggcggcaataaaataagcaagtgcactcatgggatattaaaaatacaaaggaagac 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31646160 aatagagaggcaaggtaattaacaggcaccatcatgaaaacgaaggcggcaataaaataagcaagtgcactcatgggatattaaaaatacaacggaagac 31646061  T
Q  108 tagattactggcacacaattaacaatgtccaattagctat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31646060 tagattactggcacacaattaacaatgtccaattagctat 31646021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 270 - 559
Target Start/End: Original strand, 23313382 - 23313671
Alignment:
Q  270 ggtgccctaggcagttgagttgattta-gtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtcctt 367  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||||  ||||||| | |||||  | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23313382 ggtgccctaggtagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagaatggtttt-agaaaattagagagaagtatggttaagacctt 23313480  T
Q  368 cgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctc 467  Q
     ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||| ||||| ||  ||||||   |||| |||||||||||||    
T  23313481 tgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactactaatt-caaacaatgattatctaggttcacaacatattaacactgtaactctacccaatctc 23313579  T
Q  468 ttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctat 559  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  23313580 ttggcctagaattctccccgcaagtggaaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaatcgttggaggttttaacagaacgttaacccctat 23313671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 620 - 818
Target Start/End: Original strand, 23313673 - 23313871
Alignment:
Q  620 ttcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataagg 719  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| |||| || |    
T  23313673 ttcagagtcaaaagccaaggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggtttgtagtcgatgataaacatacaaaaag 23313772  T
Q  720 cactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 818  Q
    || ||| || ||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  23313773 cattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggagtttaacaaattagagttcccataagattacatcggattcatct 23313871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 672 - 936
Target Start/End: Original strand, 35773054 - 35773318
Alignment:
Q  672 catattcataaagctagggttaatagtctatcataaacg-tacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaa 770  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||  |||| || ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  35773054 catattcataaagttagggttagtagttgatgataaacaatacaaaaagcatttaacacaaagtaatatgaataaaaactaaactttcattgacattcaa 35773153  T
Q  771 aggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaac 870  Q
    | |||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||| |  | |||||||||   |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  35773154 atgagttcaacaaattagagttcttataggattacataagattcatctca-gtctcaaccacaaacagattagttactcatatctaacgtacaagataac 35773252  T
Q  871 taacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccacc 936  Q
    | |||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| ||||||| |||||||    
T  35773253 tcacataaaaacaaggattcatacatgtattggatgattgactatgagttgtgatggtctcccacc 35773318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 263
Target Start/End: Original strand, 11755572 - 11755679
Alignment:
Q  156 aattagcaagtgtattaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaaaaacgttatcattaagatgta 255  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||||||| ||    
T  11755572 aattagcaagtgtactaatttgaatcgagtgataaaataattcgtttccatagggactgttttaatctctacttaacaagcatgttaacattaagatata 11755671  T
Q  256 attaaatt 263  Q
     |||||||    
T  11755672 gttaaatt 11755679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 499 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 2719438 - 2719331
Alignment:
Q  499 cccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattact 598  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |  || ||||||||  || |||||||| ||| |||  |||||||||||||| |||| |    
T  2719438 cccttaatctcttaagtgaattcaaaaccgttggaggtttttatagatcgttaatctataaatcataacttaacaattgtctatctctagcttaattaat 2719339  T
Q  599 taggttaa 606  Q
    || |||||    
T  2719338 taagttaa 2719331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 230
Target Start/End: Original strand, 18973681 - 18973758
Alignment:
Q  154 aaaattagcaagtgtattaatttgaatcga-gtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctactta 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||  |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  18973681 aaaattagcaagtgtactaatttatatcgaagtaataatttaattcgtatccacagggactgttctaatctctactta 18973758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 501 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 27796727 - 27796686
Alignment:
Q  501 cttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaa 542  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  27796727 cttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaa 27796686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7570696 - 7570613
Alignment:
Q  148 tgataaaaaattagcaagtgtattaatttgaatcg-agtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctactta 230  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||  |||||||| | | |||||||||||  ||||||||||||    
T  7570696 tgatagaaaattagcaagtgtactaatttatatcgaagtaataatttaattcgtattcacagggactgttctaatctctactta 7570613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7577111 - 7577028
Alignment:
Q  148 tgataaaaaattagcaagtgtattaatttgaatcg-agtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctactta 230  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||  |||||||| | | |||||||||||  ||||||||||||    
T  7577111 tgatagaaaattagcaagtgtactaatttatatcgaagtaataatttaattcgtattcacagggactgttctaatctctactta 7577028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 203
Target Start/End: Original strand, 21658807 - 21658862
Alignment:
Q  148 tgataaaaaattagcaagtgtattaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttc 203  Q
    ||||| ||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21658807 tgatagaaaattaacaagtgtacttatttaaatcgagtgataaaataattcgtttc 21658862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 532; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 532; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 258 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 12172107 - 12171429
Alignment:
Q  258 taaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaattgagagaagtatgg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||           ||||||    
T  12172107 taaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagatttggtttctagaa-----------gtatgg 12172019  T
Q  358 ttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattct 457  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12172018 ttaagtccttggaatcttccgaagctcgcctatggtaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattct 12171919  T
Q  458 acccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccct 557  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12171918 acccaatctcttgacctacaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccct 12171819  T
Q  558 atatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaattt 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12171818 atatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattaagaattaaaagccagggttagtggtcattcaattt 12171719  T
Q  658 ctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttt 757  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12171718 ctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaacttt 12171619  T
Q  758 tattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaa 857  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12171618 cattgatgttcaaaggagttcaacaaatttgggttccaatagggttacatcagattcatctcagaaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaa 12171519  T
Q  858 agtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccggatctccaag 947  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12171518 agtagaagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtgacggatgatttactcttagttttgatggtttcccaccagatctccaag 12171429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 328 - 936
Target Start/End: Original strand, 647383 - 647990
Alignment:
Q  328 ttggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatt 426  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||     
T  647383 ttggttttcagaatattagagagaagtatggttaagatcttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgattatc 647481  T
Q  427 tagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaac 526  Q
    |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  647482 tagtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaac 647581  T
Q  527 cattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagag 626  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||    
T  647582 cgttggaggttttaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagag 647681  T
Q  627 ttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaag 726  Q
    | |||||||| ||||||||| |||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| || |||  ||     
T  647682 tcaaaagccagggttagtggccatttaatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaa 647781  T
Q  727 cacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaatt 826  Q
    || |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  647782 cataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaag-ctt 647880  T
Q  827 aaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatg 926  Q
    ||||| |||   |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||| |  ||||||||||| |||||  |||| ||||||| | |||| |||||    
T  647881 aaccataaagagattagttactcataactacagtacaagataactcacataaaatcaaggattcatatatgtattggataattgactatgagttgtgatg 647980  T
Q  927 gtttcccacc 936  Q
    || |||||||    
T  647981 gtctcccacc 647990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 333 - 913
Target Start/End: Original strand, 26062876 - 26063457
Alignment:
Q  333 ttttagaaaatt---gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttag 429  Q
    ||||||||||||   |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  26062876 ttttagaaaattagagagagatgtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caatcaatgattatctag 26062974  T
Q  430 tttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccat 529  Q
    ||  ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26062975 ttcaacgacagattaacaaagtaactctacccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccat 26063074  T
Q  530 tggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagtta 629  Q
    ||||||| ||||  ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |    
T  26063075 tggaggttttaacagaacgtttatccatatgtcataacctaataatgatcaatctctagcttgattacttaggtt-aacctattacctagatcagagtca 26063173  T
Q  630 aaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaac-gtacataaggcactaagca 728  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||  |||| || ||| ||| ||    
T  26063174 aaagccagggttagtggtcattcaatctctaacatcaatttgcatattcataaagctagggttattagtcgatgataaacaatacaaaaagcattaaaca 26063273  T
Q  729 caaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaa 828  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |  | ||    
T  26063274 caaagtaatatgaataaaaactagactttcattgacattcaaaggagttcaacaaatcagggttcccatatgattacattagattcatctca-gtctcaa 26063372  T
Q  829 ccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgact 913  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26063373 ccacaaagaaattagttactcatatctaaagtacaagataactcacataaaaacaaggattcatacatgtattggatgattgact 26063457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 345 - 936
Target Start/End: Original strand, 650673 - 651263
Alignment:
Q  345 gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatta 444  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  650673 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgattatctagtttaacgacagatta 650771  T
Q  445 acttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacg 544  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  650772 acaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaag 650871  T
Q  545 aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagt 644  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  650872 aacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagt 650971  T
Q  645 ggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaata 744  Q
    || |||| ||| |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||  |  | || |||||| |||| || |||  || || ||||||||||||||     
T  650972 ggccatttaatctctaagatcagtttgcatattcataaagttagggttaggaaacaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaatt 651071  T
Q  745 aaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaatta-gggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattag 843  Q
    ||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||   |||||    
T  651072 aaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattaggggttcccataggattacatcagattcatctcaag-cttaaccataaagagattag 651170  T
Q  844 ttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccacc 936  Q
    ||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||| |  ||||||||||| |||||  |||| ||||||| | |||| ||||||| |||||||    
T  651171 ttactcataactacagtacaagataactcacataaaatcaaggattcatatatgtatgggataattgactatgagttgtgatggtctcccacc 651263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 339 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 26060641 - 26060163
Alignment:
Q  339 aaaattgagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgac 438  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||| ||| |||     
T  26060641 aaaattgagagaagcatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgattatctagcttcccgat 26060543  T
Q  439 ggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtat 538  Q
     |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  26060542 agattaacaaagtaactctacccaatctcttgacctagaattctccctgcaaataacaaccccttaatgtcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttt 26060443  T
Q  539 taaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatg 638  Q
    |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||| ||||| ||||    
T  26060442 taatagaacgttaatccctatgtcataacctaataatggtctatctctagcttgattacttaagttaaacatattacctagatcagagtcaaaagtcatg 26060343  T
Q  639 gttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaata 738  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| |||| || ||| ||| || |||||||||    
T  26060342 gttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgtatattcatgaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaata 26060243  T
Q  739 tgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 818  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||| ||||  |||| |||| ||||||||    
T  26060242 tgaataaaatctagacttttattgatattcaaaagagttcaacaaactaggattctcatacaattatatcatattcatct 26060163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 269 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 2542008 - 2541461
Alignment:
Q  269 tggtgccctaggcagttgagttgatt-tagtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaattgagagaagtatggttaagtcctt 367  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| |||||||| | |||||  || ||||||| ||||||| | ||| ||||||||||| ||||    
T  2542008 tggtgccctaggcagttgagtttattcttgtaacataaacggattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaa-agaggtatggttaagacctt 2541910  T
Q  368 cgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctc 467  Q
    ||||||||| |||| | || ||||| |||||| |||||||  | ||| |||||||||| |||||  ||||| |||||||  ||||||| || ||||||||    
T  2541909 cgaatcctctgaagttctcttatggtaatttgtactcctattt-caagcaatgattatctagttaaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctc 2541811  T
Q  468 ttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataac 567  Q
    |||||||| |||||| | || || | |||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  2541810 ttgacctaaaattcttctcggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcaaaaccattgaaggttttaacagtccgttaatccctatatcataac 2541711  T
Q  568 ctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaa 667  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |   ||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||| |||||     
T  2541710 ctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagttcagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatcag 2541611  T
Q  668 tatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgtt 767  Q
      |||| | | || ||||||||  |  ||||| || |||||| |||  ||  || ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  2541610 cctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacatacgaaaatcattaaacacaagataatatgaataaaaactagacttttattgat-at 2541512  T
Q  768 caaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 818  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2541511 gaaaggaattcaacaaattagagttcccataagattacattagattcatct 2541461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 148 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12194811 - 12194696
Alignment:
Q  148 tgataaaaaattagcaagtgtattaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaaaaacgttatcatt 247  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  12194811 tgataaaaaattagcaagtgtactaatttgaatcgagtaataaaataatttgtttcctcagggactgttttaatctctacttaacaagaacattaacatt 12194712  T
Q  248 aagatgtaattaaatt 263  Q
    ||||||||||||||||    
T  12194711 aagatgtaattaaatt 12194696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 148 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14617744 - 14617630
Alignment:
Q  148 tgataaaaaattagcaagtgtattaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaaaaacgttatcatt 247  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  14617744 tgatagaaaattagcaagtgtactaatttgaatcgagtaataaattaattcgtttcctcagggactgttttaatctctacttaacaagaacattaacatt 14617645  T
Q  248 aagatgtaattaaat 262  Q
    ||||| |||||||||    
T  14617644 aagatataattaaat 14617630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22755982 - 22755876
Alignment:
Q  156 aattagcaagtgtattaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaaaaacgttatcattaagatgta 255  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||  | |||| ||||||||| ||    
T  22755982 aattagcaagtgtactaatttgaatcgagtaataaa-taattcgtttccacagggactgttttaatctctacttaccaagcatgttaacattaagatata 22755884  T
Q  256 attaaatt 263  Q
    ||||||||    
T  22755883 attaaatt 22755876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 404
Target Start/End: Original strand, 11649429 - 11649490
Alignment:
Q  343 ttgagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactc 404  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  11649429 ttgagagaagcatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactc 11649490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 496 - 666
Target Start/End: Original strand, 16926976 - 16927144
Alignment:
Q  496 aaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgatt 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||  |   ||||||| ||| ||||||||||||||||  |  |||||||  || |||    
T  16926976 aaccccttaatctcttaagtgaattag-aaccgttggaggttttaatagtttgttaatctctagatcataacctaataattgttcatctctaatttaatt 16927074  T
Q  596 acttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatca 666  Q
    |||||||||||   |||| ||||  | ||| || |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  16927075 acttaggttaaccatatttcctagataaga-ttcaaagccatggctagtggtcatttaagttctaagatca 16927144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 6031641 - 6031606
Alignment:
Q  501 cttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggt 536  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6031641 cttaatctcttaagtgaattcgaaaccattagaggt 6031606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 464; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 333 - 947
Target Start/End: Original strand, 7177 - 7791
Alignment:
Q  333 ttttagaaaat-tgagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtt 431  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  7177 ttttagaaaatctgagagaagaatggttaagtccttcgaatcctctgatactctcctatggtaatttgtactcctaatt-caatcaatgattatttagtt 7275  T
Q  432 tcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattg 531  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7276 tcacgacagattaacttagtaattctattcaatctcttgacttagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttg 7375  T
Q  532 gaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaa 631  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||    
T  7376 gaggtattaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagctttattacttaggttaaacctattacctagttctgagtaaaa 7475  T
Q  632 agccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaa 731  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||| ||| | |||    
T  7476 agccagggttagtggtcaatcaaattctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtcgatgataaacatacataaagcattaaactcaa 7575  T
Q  732 agtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacca 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7576 agtaatatgaataaaaactaaactttcatttatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccgtaggattacatcagattcatctcaggaattaacca 7675  T
Q  832 caaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttc 931  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7676 caaaagaattagttactcataactaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttc 7775  T
Q  932 ccaccggatctccaag 947  Q
    ||||||||||||||||    
T  7776 ccaccggatctccaag 7791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 148 - 263
Target Start/End: Original strand, 6995 - 7110
Alignment:
Q  148 tgataaaaaattagcaagtgtattaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaaaaacgttatcatt 247  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6995 tgatagaaaattagcaagtgtactaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctgagggactgtttaaatctctacttaacaaaaacattatcatt 7094  T
Q  248 aagatgtaattaaatt 263  Q
    ||||||||||||||||    
T  7095 aagatgtaattaaatt 7110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 435; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 333 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 2754 - 2138
Alignment:
Q  333 ttttagaaaat-tgagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtt 431  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  2754 ttttagaaaatctgagagaagaatggttaagtccttcgaatcctctgatactctcctatggtaacttgcactcctaatt-caatcaatgattatttagtt 2656  T
Q  432 tcacgacggattaacttagtaat--tctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccat 529  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  2655 tcacgacagattaacttagtaatattctactcaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaacccctaaatctcttaagtgaattcgaaaccgt 2556  T
Q  530 tggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagtta 629  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |    
T  2555 tggaggtattaaaagaacgttgatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggtcaaacctattacctagttcagagtaa 2456  T
Q  630 aaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcac 729  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||| ||| ||| |||    
T  2455 aaagccagggttagtggtcatttattttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagttgatgataaacatacataaagcattaaacac 2356  T
Q  730 aaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaac 829  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2355 aaagtaatatgaataaagactaaactttcattgaagttcaaaggagttcaacaaattagggttcccgtaggattacatcagattcatcttaggaattaac 2256  T
Q  830 cacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtt 929  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2255 cacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagttaactaacataagagaaaggattcatacatgtaaaggatgattgactcttagttttgatggtt 2156  T
Q  930 tcccaccggatctccaag 947  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  2155 tcccaccagatccccaag 2138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 2939 - 2821
Alignment:
Q  145 tattgataaaaaattagcaagtgtattaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaaaaacgttatc 244  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2939 tattgatagaaaattagcaagtgtactaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagagactgtttaaatctctacttaacaaaaacattatc 2840  T
Q  245 attaagatgtaattaaatt 263  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2839 attaagatgtaattaaatt 2821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 266 - 708
Target Start/End: Original strand, 24303 - 24743
Alignment:
Q  266 tattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaattgagagaagtatggttaagtcc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24303 tattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaata--aactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattgagagaagcatggttaagtcc 24400  T
Q  366 ttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatc 465  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24401 ttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacaataaatgattatttagtatcacgacggattaacttagtaattctacccaatc 24500  T
Q  466 tcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcata 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24501 tcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttatgtgaattcgaaaccattggaggaattaaataaacgttaatccctatatcata 24600  T
Q  566 acctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatc 665  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24601 acctaataatgatatatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctggttcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatc 24700  T
Q  666 aatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaa 708  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24701 aatatgcatattcataaagctatggttaatagtctatcataaa 24743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 363; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 343 - 947
Target Start/End: Original strand, 2799 - 3405
Alignment:
Q  343 ttgagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggat 442  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  2799 ttgagagaagtatcgttaagacctttgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctagtt-caatcaatgattatatagtttcacgaaagat 2897  T
Q  443 taacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaa 542  Q
    |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  2898 taaggtagtaattctaccaaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaactattggaggtattaaa 2997  T
Q  543 cgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggtta 642  Q
     |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2998 agaacgttaatccttgtgtcataatctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacgtattacctagttcagagttgaaagccatggtta 3097  T
Q  643 gtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcat-aaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcaca---aagtaata 738  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| |||| ||  || ||| ||||   ||||||||    
T  3098 gtgttcattcaaattctgtgatcaatttgcatattcataaaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaaacattaaacacaaagaagtaata 3197  T
Q  739 tgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaaga 838  Q
    ||| |||| |||||||||| ||| |  |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3198 tgagtaaagactaaactttcatttaaattcaaatgagttcaacaaattaggatttccataagattacataagattcatctcaggaa-taaccacaaaaga 3296  T
Q  839 attagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccgg 938  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  3297 attagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaagaaggattcatacatgtaaaggatgattgactcttagttttgatggttgcccaccag 3396  T
Q  939 atctccaag 947  Q
    |||||||||    
T  3397 atctccaag 3405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 183 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 10073 - 9606
Alignment:
Q  183 agtaataaaataattcgtttcctcagggactgt-ttaaatctctacttaacaaaaacgttatcattaag-atgtaattaaatttatattggtgccctagg 280  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  |||||||| |||   | |||| |  ||| |||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  10073 agtaataaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggatgta--taaatttatattggtcccctagg 9976  T
Q  281 cagttgagttgatttagtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaattgagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaa 380  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9975 cagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaataattggtttttagaaaattgagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaa 9876  T
Q  381 gctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaatt 480  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9875 gctctcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaatt 9776  T
Q  481 ctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatct 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9775 ctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatct 9676  T
Q  581 atctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcat 650  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9675 atctttagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcat 9606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 795 - 935
Target Start/End: Complemental strand, 9608 - 9468
Alignment:
Q  795 cataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatac 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9608 cataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatac 9509  T
Q  895 atgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccac 935  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9508 atgtgaaggatgattgactcttagttttgatggtttcccac 9468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 346 - 946
Target Start/End: Original strand, 32506053 - 32506650
Alignment:
Q  346 agagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaa 445  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  32506053 agagaagtgtggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgattatctagtttaacgacagattaa 32506151  T
Q  446 cttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacga 545  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  32506152 caaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaacaga 32506251  T
Q  546 acgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtg 645  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||    
T  32506252 acgttaatccctatgtcataacctaataatgacctatctctagcttgattacttaagttaaacttattacctagatcagagtcaaaagtcagggttagtg 32506351  T
Q  646 gtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataa 745  Q
    |||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| ||  || ||| || ||||||||||   | |    
T  32506352 gtcattcaatctctaagatcgatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaaacattaaacataaagtaatat---tta 32506448  T
Q  746 aaactaaacttttattgatgttc--aaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattag 843  Q
    |||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||    
T  32506449 aaactagactttcattgatattcaaaaaggagttcaacaaactagggttcccataggattacatcagattcatctcaag-cttaatcacaaaagaattag 32506547  T
Q  844 ttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccggatctc 943  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  32506548 ttactcatagctaaagtacaagataactaacgtaaaaacaaggattcatacgtgtattggatgattgactatgagttttgatggttgcccaccagatctc 32506647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 258 - 936
Target Start/End: Complemental strand, 13493397 - 13492721
Alignment:
Q  258 taaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgatttagtaatataaac-tgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagta 354  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| | | ||||| | ||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  13493397 taaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaaa-caataaa-agttggttttcagaatattagagagaagta 13493301  T
Q  355 tggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaat 454  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||||    
T  13493300 tggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaat 13493202  T
Q  455 tctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatc 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  13493201 tctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaacagaacgttaatc 13493102  T
Q  555 cctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaa 654  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  13493101 cctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcattcaa 13493002  T
Q  655 tttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaac 754  Q
    | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| || ||| ||| || |||||||||||||| ||||||| ||    
T  13493001 tctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaaactagac 13492902  T
Q  755 ttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagc 854  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||   |||| |||||||||      
T  13492901 tttcattgatattcaaaggagttcaacaaactagggttcccataagattacatcaaatttatctcaag-tttaaccacaaagagattaattactcataaa 13492803  T
Q  855 taaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccacc 936  Q
    ||||||| |||  |||| |||||| || |||||||||||||||||  |||| ||||||| | |||| || |||| |||||||    
T  13492802 taaagtacaagaaaactcacataaaaacaaggattcatacatgtattggataattgactatgagttgtgttggtctcccacc 13492721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 345 - 936
Target Start/End: Original strand, 27282305 - 27282899
Alignment:
Q  345 gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatta 444  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||  ||||| |||||    
T  27282305 gagagaagtatggttaagactttcgaattctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgattatctagttcaacgaccgatta 27282403  T
Q  445 acttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacg 544  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| |    
T  27282404 acaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaatcgttggaggttttaaaag 27282503  T
Q  545 aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagt 644  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||    
T  27282504 aacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaatccagggttagt 27282603  T
Q  645 ggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaata 744  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||| || | | ||| || ||||||||||||||     
T  27282604 ggtcattcaatctctaagatcaattttcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaagatacaaaaaggattaaacataaagtaatatgaatt 27282703  T
Q  745 aaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagt 844  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||    
T  27282704 aaaactagactttcattgatattcaaaggtgttcaacaaattagggttcccataggattatatcagattcatctcagg-attaaccacaaagagattagt 27282802  T
Q  845 tactcatagctaaagtataagctaactaacat-----aagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccacc 936  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||     || ||||| ||||||||||||||  |||| ||||||| | |||| ||||||| |||||||    
T  27282803 tactcatagctaaagtacaagataactcacataaaaaaaaaaaaaagattcatacatgtattggataattgactatgagttgtgatggtctcccacc 27282899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 345 - 936
Target Start/End: Complemental strand, 13496035 - 13495446
Alignment:
Q  345 gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatta 444  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  13496035 gagagaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caatcaatgattatctactttaacgacagatta 13495937  T
Q  445 acttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacg 544  Q
    |   ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   |    
T  13495936 agaaagtaattatatccaatctcttgacctagaattctacccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttagcag 13495837  T
Q  545 aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagt 644  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||| | |||||||    
T  13495836 aacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagctagggttagt 13495737  T
Q  645 ggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaata 744  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| || ||| ||| || ||||||||||||||     
T  13495736 ggtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaatt 13495637  T
Q  745 aaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagt 844  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||   ||||||    
T  13495636 aaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaactagggttcccataggattacatcatatttatctcaag-tttaaccacaaagagattagt 13495538  T
Q  845 tactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccacc 936  Q
    |||||||| |||||||| |||  |||| |||||| || |||||||||||||||||  |||| ||||||| | |||| || |||| |||||||    
T  13495537 tactcataactaaagtacaagacaactcacataaaaacaaggattcatacatgtattggataattgactatgagttgtgttggtctcccacc 13495446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 270 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 34066468 - 34065929
Alignment:
Q  270 ggtgccctaggcagttgagttgattta-gtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtcctt 367  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||  ||||||| | |||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  34066468 ggtgccctaggcagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattggtttt-agaaaattagagagaagtatggttaagacctt 34066370  T
Q  368 cgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctc 467  Q
    |||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||||||    
T  34066369 cgaatcctccgaagttctcctatgataatttgcactcctaatt-caatcaatgattatctagtttaacgatagattaacaaagtaattctacccaatctc 34066271  T
Q  468 ttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataac 567  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||    
T  34066270 ttgaccttgaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaacagaacgttaatctctatgtcataac 34066171  T
Q  568 ctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaa 667  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  34066170 ctaataatgatctatctctaacttgattacttaggttaaacttattacctaggtcagagtcaaaagccagggttagtggtcatttaatctctaagatcaa 34066071  T
Q  668 tatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgtt 767  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||| ||| || || ||||||||||| ||||||| | ||| |||||| ||    
T  34066070 tttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacgtacaaaaagcattaaacataacgtaatatgaattaaaactagattttcattgatatt 34065971  T
Q  768 caaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatca 809  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  34065970 caaaaaagttcaacaaattaggattcccataagattacatca 34065929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 275 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 1936746 - 1936128
Alignment:
Q  275 cctaggcagttgagttgatt-tagtaatataaactg-attaaaagcgataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaa 371  Q
    |||||||||||||||||||| | |||  |||||||| ||||||| || |||| | || | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  1936746 cctaggcagttgagttgattgttgtatcataaactgaattaaaaacggtaaa-attttggttttagaaaattagagagaagtatggttaagaccttcgaa 1936648  T
Q  372 tcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttga 471  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||  ||||| |||||| ||||||||||    
T  1936647 tcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcct-agttcaatcaatgattatctagcttcacgaaagattaacaaagtaactctaccaaatctcttga 1936549  T
Q  472 cctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaa 571  Q
      || | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| | || ||||| ||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  1936548 tttatagttctccccgcaagtaacaatcccttaatctcttaagtgaatttgaaa-cgtttgaggttttaaaagaatgttattccctatgtcataacctaa 1936450  T
Q  572 taatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatg 671  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||   ||| | |  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |     
T  1936449 taatgatctatctctagcatgattacttaggttaaacttattacctggatcaaattcgaaagccatggttagtggtcatttaatctctaagatcaatttt 1936350  T
Q  672 catattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaa 771  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| |||| || ||| ||| || |||||||||||||| ||||||| ||||  |||||| ||||||    
T  1936349 catattcataaagttagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaaactagacttccattgatattcaaa 1936250  T
Q  772 ggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaact 871  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| | |  | |||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  1936249 ggagttcaacaaattatggttcccataagattacatgagattcatct-aagtctcaaccacaaagagattagttactcatagctaaagtacaagataact 1936151  T
Q  872 aacataagaaaaaggattcatac 894  Q
    | ||||  || ||||||||||||    
T  1936150 accatagaaacaaggattcatac 1936128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 269 - 942
Target Start/End: Original strand, 16190299 - 16190969
Alignment:
Q  269 tggtgccctaggcagttgagttgat-ttagtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaattga-gagaagtatggttaagtcct 366  Q
    |||||||||||| | |||||||||| || |||| ||||||  ||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  16190299 tggtgccctaggaaattgagttgatgtttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaga-ttggtttt-agaaaattaaagagaagtatggttaagacct 16190396  T
Q  367 tcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaat-tctacccaatc 465  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| | ||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||  | |||| | |||||||||    
T  16190397 tcgaatcctccgaagttctcctatgataatttgcactcttaatt-caagcaatgattatctagtttaacgacaaattaacaaaataatatatacccaatc 16190495  T
Q  466 tcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaat----ctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctatat 561  Q
    |||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||           ||||||| |    
T  16190496 tcttgacccataattctccccacgagtgacaaccccttaattaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaa-----------tccctatgt 16190584  T
Q  562 cataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctat 661  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||     
T  16190585 cataacctaatattgatctatctctaacttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagttaaaagccaaggttagtggtcatccaatctctag 16190684  T
Q  662 gatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttatt 761  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| |||| || ||| ||| || |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||    
T  16190685 gatcaatttgcatattcataaagctaaggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatataaattaaaactagactttcatt 16190784  T
Q  762 gatgttc-----aaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagcta 856  Q
    ||| |||     |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | || | |||||||||   |||||||||| |||||||    
T  16190785 gatattcaaattaaaggagttcaacaaattagggttcctataagattacatcagattcatct-aagactcaaccacaaatagattagttacttatagcta 16190883  T
Q  857 aagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtttcccaccggatct 942  Q
    ||||| | | |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||| | | ||||||||||| |||||| |||||    
T  16190884 aagtaaacgataactaacataaaaacaaggattcatacatgtattggatgattgactatgaattttgatggttgcccaccagatct 16190969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 345 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 39546290 - 39545983
Alignment:
Q  345 gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatta 444  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  39546290 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgattatctagtttcacgacagatta 39546192  T
Q  445 acttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacg 544  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||  |    
T  39546191 acaaagtaactctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtaacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaatcgttggaggttttaatag 39546092  T
Q  545 aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagt 644  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||    
T  39546091 aacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaagttaaacttattacctagatcagagtcaaaatccattgttagt 39545992  T
Q  645 ggtcattca 653  Q
     ||||||||    
T  39545991 tgtcattca 39545983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 421 - 815
Target Start/End: Original strand, 23990361 - 23990754
Alignment:
Q  421 attatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaatt 520  Q
    ||||| |||||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23990361 attatctagttcaacgacagattaacaaagtaattctacccaatcacttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaaactcttaagtgaatt 23990460  T
Q  521 cgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaat 620  Q
    ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||      
T  23990461 cgaaaccgttggaggttttaacagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatcaatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctaga 23990560  T
Q  621 tcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatttct--at--gatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacata 716  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||  ||||||| ||||||||||||||||     ||| ||||| || |||||| |||| |    
T  23990561 tcagagtcaaaagccagggttagtggtcattcaatctcttaattagatcaatttgcatattcataaagc-----ttagtagtcaatgataaacatacaaa 23990655  T
Q  717 aggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattca 815  Q
    |  || | |  | ||  |||| ||||| ||||||| |||||  |  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23990656 aaacattgaagataatataatgtgaattaaaactagactttcttaaatattcagaggagttcaacaaattagtgttcccataagattaaatcagattca 23990754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 460 - 714
Target Start/End: Original strand, 22104683 - 22104935
Alignment:
Q  460 ccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctat 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22104683 ccaatctcttgacctagaattctccccgtaagtgacagacc-ttaatctcttaagtgaattcaaaatcgttggaggtattaaa-gaacgttaatccctat 22104780  T
Q  560 atcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatttct 659  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||    
T  22104781 gtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacatagttcagagttaaaaaccagaattagtggtcattcaatttct 22104880  T
Q  660 atgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtaca 714  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| ||||    
T  22104881 atgatcaatatgcatattcataaagctagagttagtagtcgatgataaacctaca 22104935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 347 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 21153301 - 21152940
Alignment:
Q  347 gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaac 446  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |   |||| ||||||||| || || | ||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||    
T  21153301 gagaaatatggttaagaccttcgaatcctccgatgctcttaaatggtaatttgcacccccaatt-caatcaatgttcatttagtttaacgacagattaac 21153203  T
Q  447 ttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaa 546  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |      
T  21153202 acagtaattctactcaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaatttgaaacctttggaggttttaatagtc 21153103  T
Q  547 cgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtgg 646  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| ||||| || || ||||||    
T  21153102 cgttaatccctaaatcataacctaataactgtctatctctagcttaattacttaggttaaatatattccctagatcagagtcaaaagtcagggctagtgg 21153003  T
Q  647 tcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaac 709  Q
    |||||||| ||||| | ||||| | || |||||  | ||||| | || ||||| |||||||||    
T  21153002 tcattcaagttctaagttcaatttacacattcaagatgctagtgctagtagtcaatcataaac 21152940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 428 - 654
Target Start/End: Original strand, 22453415 - 22453641
Alignment:
Q  428 agtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaacc 527  Q
    ||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22453415 agtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaact 22453514  T
Q  528 attggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagt 627  Q
     |||||||| ||||  |  ||||||||| |   |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22453515 gttggaggttttaacagtccgttaatccatgagtcataacctaataattttctatctctagcttaattacttaggttaaacctattacctaaatcagagt 22453614  T
Q  628 taaaagccatggttagtggtcattcaa 654  Q
     |||||||| || ||||||||||||||    
T  22453615 caaaagccagggctagtggtcattcaa 22453641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 354 - 679
Target Start/End: Original strand, 22456699 - 22457021
Alignment:
Q  354 atggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaa 453  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| || ||||  | ||||||||| |  | |||||| ||||| || ||||  |||||    
T  22456699 atggtcaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggaaatttgtaccccta--ttcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagactaacaaagtaa 22456796  T
Q  454 ttctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaat 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||  |  |||||||    
T  22456797 ttctacccaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaactc-ttaatctcttaagtgaattcgaaactgttggaggttttaacagtccgttaat 22456895  T
Q  554 ccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattca 653  Q
    || |   |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  22456896 ccatgagtcataacctaataattttctatctcttgcttaattacttaggttaaacctattacctaaaacagagtcaaaagtcagggctagtggtcattca 22456995  T
Q  654 atttctatgatcaatatgcatattca 679  Q
    | ||||| ||||| | ||||||||||    
T  22456996 agttctaagatcagtttgcatattca 22457021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 346 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 15297378 - 15297047
Alignment:
Q  346 agagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaa 445  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | | | | | || ||||||||| ||  ||| ||||||||  | || |||||| ||||| ||||||    
T  15297378 agagaaatatgattaagaccttcgaatcctccgatgttcttccacggtaatttgcacccc--aattcaatcaatattcatctagtttaacgacagattaa 15297281  T
Q  446 cttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacga 545  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||  |     
T  15297280 caaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctctctgcaagtgacaacccttaaatctcttaagtgaatttgaaactgttggaggttttaacagt 15297181  T
Q  546 acgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtg 645  Q
     ||||||||| |   |||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||||||||  | |||||    
T  15297180 ccgttaatccatgagtcataacctaataattttctatctctaacttaattacttaggttaaaactattacctagatcagattcaaaagccagagctagtg 15297081  T
Q  646 gtcattcaatttctatgatcaatatgcatattca 679  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  15297080 gtcattcaagttctaagatcaatttgcatattca 15297047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 148 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17762210 - 17762095
Alignment:
Q  148 tgataaaaaattagcaagtgtattaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaaaaacgttatcatt 247  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17762210 tgataaataattagcaagtgtactaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgttttaatctctacttaacaagaacattatcatt 17762111  T
Q  248 aagatgtaattaaatt 263  Q
    ||||||||||||||||    
T  17762110 aagatgtaattaaatt 17762095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 730 - 936
Target Start/End: Complemental strand, 10759785 - 10759580
Alignment:
Q  730 aaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaac 829  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  10759785 aaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaag-cttaac 10759687  T
Q  830 cacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattgactcttagttttgatggtt 929  Q
    || |||   |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||| |  ||||||||||| |||||  |||| ||||||| | |||| |||||||     
T  10759686 cataaagagattagttactcataactacagtacaagataactcacataaaatcaaggattcatatatgtattggataattgactatgagttgtgatggtc 10759587  T
Q  930 tcccacc 936  Q
    |||||||    
T  10759586 tcccacc 10759580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 258 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 10765054 - 10764829
Alignment:
Q  258 taaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgatttagtaatataaac-tgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagta 354  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| | | ||||| | ||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  10765054 taaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaaa-caataaa-agttggttttcagaatattagagagaagta 10764958  T
Q  355 tggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaat 454  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| || |||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||||    
T  10764957 tggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaacttgcactcctaatt-caagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaat 10764859  T
Q  455 tctacccaatctcttgacctagaattctcc 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10764858 tctacccaatctcttgacctagaattctcc 10764829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 256
Target Start/End: Original strand, 45532346 - 45532458
Alignment:
Q  145 tattgataaaaaattagcaagtgtattaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaa-aaacgttat 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||     
T  45532346 tattgataaataattagcaagtgtactaatttaaatcgagtaataaaataattcatttccccaaggactgttttaatctctacttaacaagaaacattaa 45532445  T
Q  244 cattaagatgtaa 256  Q
    |||||||||||||    
T  45532446 cattaagatgtaa 45532458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 49147936 - 49147825
Alignment:
Q  354 atggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaa 453  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| || |||  || ||||||||| |  | |||||| ||||| |||||||  |||||    
T  49147936 atggtcaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggaaatttgtacccct--attcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagattaacaaagtaa 49147839  T
Q  454 ttctacccaatctc 467  Q
    ||||||||||||||    
T  49147838 ttctacccaatctc 49147825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 604
Target Start/End: Original strand, 4204975 - 4205068
Alignment:
Q  511 taagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggtt 604  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||  |  |||||||||||| |  ||||||||  |||  |||||||||||||| |||  |||||||    
T  4204975 taagtgaattcgaaaccgttggaggttttaatagtccgttaatccctaaactataacctagcaattgtctatctctagcttaattgattaggtt 4205068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 277; Significance: 1e-154; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 269 - 910
Target Start/End: Original strand, 12575420 - 12576060
Alignment:
Q  269 tggtgccctaggcagttgagttgattta-gtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtcct 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| | |||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  12575420 tggtgccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaattgattaaaaacaataaaagattggtttt-agaaaattagagagaagtatggttaagacca 12575518  T
Q  367 tcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatct 466  Q
    | ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||  |||||||||||| |||||    
T  12575519 ttgaatcctccgaagttttcttatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgataatctagtttaacgacagattaacaaagtaattctacctaatct 12575617  T
Q  467 cttga-cctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcata 565  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||    
T  12575618 cttaaacctagaattctccccgcaagtaacaaccc-ttaatctcttaagtgaattagaaaccattggaggttttaacaatacgttaatccttatatcata 12575716  T
Q  566 acctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatc 665  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||   ||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  12575717 acctaataatgatctatctctaacttgattacttatgttaaacctattaccttgatcaaagtcaaaagccaaggttagtagtcattcaatctctaagatc 12575816  T
Q  666 aatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatg 765  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| || | ||  || |||||  |||| || ||  | | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  12575817 aatttgcatattcataaagttagggctagttgttgatgataaagatacaaaaagcgttgaacacaaagtaatatgaataaaaactagactttcattgata 12575916  T
Q  766 ttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataag 865  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||   ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  12575917 ttcaaaggagttcaacaaattagggttcctataggattacatcagattcatct-aagtctcaaccacaaagagattagttactcatcgctaaagtacaag 12576015  T
Q  866 ctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagaggatgattg 910  Q
     |||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||||    
T  12576016 ataactaacataaaaacaatgattcatacatgtattggatgattg 12576060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 333 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 13097081 - 13096606
Alignment:
Q  333 ttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtt 431  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |  || |||||||||| |||||    
T  13097081 ttttagaaaattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttatcctatgt-aatttgcactcctaattt-aagcaatgattatctagtt 13096984  T
Q  432 tcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattg 531  Q
      | ||  |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |    
T  13096983 caatgaaagattaacaaagtaattctacccaatctcttggcctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatgtcttaagtgaatttgaaaccgtgg 13096884  T
Q  532 gaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaa 631  Q
    ||||| ||||  |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||    
T  13096883 gaggttttaacagaacgtaaatccctatgtcataatctaataatgatctatctctagcttgattacttagcttaaacttattacctaggtcagagttaaa 13096784  T
Q  632 a-gccatg-gttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcac 729  Q
    | |||| | ||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| |||| || ||| ||         
T  13096783 aggccaggagttagtgatcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggatagtagtcgatgataaacataca-aaagcatta----- 13096690  T
Q  730 aaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 818  Q
         || || ||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13096689 -----aacatcaattaaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaataaatcagggttcccataggattacatcaggttcatct 13096606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 333 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 44008356 - 44007889
Alignment:
Q  333 ttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtt 431  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  44008356 ttttagaaaattagaaagaattatggttatgaccttcgaatcctccgaagctcgcctttggtaatctgcactcctagtt-caaacaatgattatttagtt 44008258  T
Q  432 tcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattg 531  Q
    ||||||  |||||     |||| |||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| | |||    
T  44008257 tcacgatagatta-----gtaactctaccaaatccctcgacctagaattctccc-gcaagtgacaactccttaatctcataagtgaatttgaaatcgttg 44008164  T
Q  532 gaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaa 631  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||| | |||    
T  44008163 gaggtattaaaagaacgttaatccctgtgtcgtaacctaacaatgatctatttctagcttgattagttaggttaaacttattacctagttcagaatcaaa 44008064  T
Q  632 agccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaa 731  Q
    |||||  || |||| ||||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||| || | || ||| ||| || |     
T  44008063 agccagagtcagtgttcattcaatctctacggtcaatttgcattttcataaagctagggtcaatagtcgatgataaacata-aaaaagcattaaacaaag 44007965  T
Q  732 agtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatc 808  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||    
T  44007964 agtaataagaataaagactaaactttaattgaaattcaaaggagttcaacaaattaagg-aaccataggattacatc 44007889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 270 - 627
Target Start/End: Original strand, 41778864 - 41779213
Alignment:
Q  270 ggtgccctaggcagttgagttgattta-gtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaattga-gagaagtatggttaagtcctt 367  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||  ||||||| | |||||  |||| |||  |||| ||| | |||||||||||||||| ||||    
T  41778864 ggtgccctaggcagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattgattt--agaagattaaagagaagtatggttaagacctt 41778961  T
Q  368 cgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctc 467  Q
    | |||| ||||||| | |||||||  ||||||||||  ||| | ||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||  | ||| |||||||||||||    
T  41778962 caaatcttccgaagttctcctatgctaatttgcactagtaatt-caaacaatgattatctaggttcacgacagattaacacaataactctacccaatctc 41779060  T
Q  468 ttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataac 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    |  | |||     | || ||||||||| |||||||    
T  41779061 ttgacctagaattctccccgcaagtggcaaccccttaatatcttaagtgaattcaaaacca----aaatgtta---ttatgtcaatccctatgtcataac 41779153  T
Q  568 ctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagt 627  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  41779154 ctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagttcagagt 41779213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25318040 - 25317933
Alignment:
Q  156 aattagcaagtgtattaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaaaaacgttatcattaagatgta 255  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25318040 aattagcaagtgtactaatttgaatcgagtaataaaataaatcgtttcctcagggactgttttaatctctacttaacaagaacattatcattaagatgta 25317941  T
Q  256 attaaatt 263  Q
    ||||||||    
T  25317940 attaaatt 25317933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 156 - 263
Target Start/End: Original strand, 33578042 - 33578149
Alignment:
Q  156 aattagcaagtgtattaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaaaaacgttatcattaagatgta 255  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  33578042 aattagcaagtgtactaatttgaatcgagtaataaaataattcgttttctcagggactgttttaatctctacttaacaggaacattatcattaagatgta 33578141  T
Q  256 attaaatt 263  Q
    ||||||||    
T  33578142 attaaatt 33578149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 14418585 - 14418450
Alignment:
Q  272 tgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcga 370  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||  ||||||| | ||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  14418585 tgccctaggcagttgagttggtttt-taacataaacaaattaaaaacaataaa-agttggttttaagaatattagagagaagtatggttaagacattcga 14418488  T
Q  371 atcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaa 408  Q
    ||||||||||  | |||||||  |||||||||||||||    
T  14418487 atcctccgaatttctcctatgataatttgcactcctaa 14418450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 404
Target Start/End: Original strand, 41836418 - 41836479
Alignment:
Q  343 ttgagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactc 404  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  41836418 ttgagagaagcatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactc 41836479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 543 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 14418399 - 14418355
Alignment:
Q  543 cgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctcta 587  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14418399 cgaacgttaatccctatatcataatctaataatgatctatctcta 14418355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 263
Target Start/End: Original strand, 15928458 - 15928573
Alignment:
Q  148 tgataaaaaattagcaagtgtattaatttgaatcga-gtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaaaaacgttatcat 246  Q
    ||||| |||| ||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||  ||| | |||||   |    
T  15928458 tgatagaaaactagcaagtgaactaatttaaatcgaagtaataaaatattt-gtttccacagggactgttttaatctctacttggcaagatcgttaatgt 15928556  T
Q  247 taagatgtaattaaatt 263  Q
    |||||||||||||||||    
T  15928557 taagatgtaattaaatt 15928573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 704 - 790
Target Start/End: Original strand, 41779232 - 41779318
Alignment:
Q  704 ataaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattaggg 790  Q
    |||||| |||| || ||| ||| || ||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  41779232 ataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatggataaagactaaactttcattgatatttaaaggagttcaacaaattaggg 41779318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29354651 - 29354565
Alignment:
Q  148 tgataaaaaattagcaagtgtattaatttgaatcga-gtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaa 234  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||| | |||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||    
T  29354651 tgatagaaaattagcaagtatactaatttaactcgaagtaataaa-taattcgtttccacacggactgttttaatctctaattaacaa 29354565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 333 - 818
Target Start/End: Original strand, 5995 - 6479
Alignment:
Q  333 ttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtt 431  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||| |    
T  5995 ttttagaaaattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaggttctcctatggtaatttgcactactaatt-caaacaatgattatctaggt 6093  T
Q  432 tcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattg 531  Q
    ||||||| |||||||  | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  6094 tcacgacagattaacacaataactctacccaatctcttgatctagaattctccccgcaagtggcaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaatcattg 6193  T
Q  532 gaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaatctattacctaattcagagttaaa 631  Q
    ||||| ||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||| |||    
T  6194 gaggttttaacagaacgttaaaccctatgtcataacctaataatgatctatctctaggttgattacttagattaaacttattacctagttcagagtcaaa 6293  T
Q  632 agccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcactaagcacaa 731  Q
    || || |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| || ||| ||| || ||    
T  6294 agtcagggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataa 6393  T
Q  732 agtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 818  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6394 agtaacatgaataaacact-gactttcattgatattcaaaggagttcaacaaattaaggttcccataagattacatcagattcatct 6479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0665 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0665
Description:

Target: scaffold0665; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 505 - 936
Target Start/End: Original strand, 1 - 431
Alignment:
Q  505 atctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggtt 604  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 atctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggtt 100  T
Q  605 aaatctattacctaattcagagttaaaagccatggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatca 704  Q
    |||  |||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||| |||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  101 aaacttattacctagatcagagtcaaaaaccagggttagtagtcatttaatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatga 200  T
Q  705 taaacgtacataaggcactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaacttttattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggatta 804  Q
    ||||| |||| || |||  || || |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  201 taaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggatta 300  T
Q  805 catcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaaagtataagctaactaacataagaaaaaggattcatacatgtagagga 904  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||  ||   |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||| |  |||||||||||||||||  |||    
T  301 catcagattcatctcaag-cttaaccatgaagagattagttactcataactacagtacaagataactcacataaaatcaaggattcatacatgtattgga 399  T
Q  905 tgattgactcttagttttgatggtttcccacc 936  Q
    | ||||||| | |||| ||||||| |||||||    
T  400 taattgactatgagttgtgatggtctcccacc 431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 148 - 263
Target Start/End: Original strand, 449 - 564
Alignment:
Q  148 tgataaaaaattagcaagtgtattaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaaaaacgttatcatt 247  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  449 tgatagaaaattagcaagtgtactaatttgaatcgagtaataaattaattcgtttcctcagagactgttttaatctctacttaacaaaaacattatcatt 548  T
Q  248 aagatgtaattaaatt 263  Q
    ||||||||||||||||    
T  549 aagatgtaattaaatt 564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 83; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 148 - 262
Target Start/End: Original strand, 199633 - 199747
Alignment:
Q  148 tgataaaaaattagcaagtgtattaatttgaatcgagtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaaaaacgttatcatt 247  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  199633 tgatagaaaattagcaagtgtactaatttgaatcgagtaataaattaattcgtttcctcagggactgttttaatctctacttaacaagaacattaacatt 199732  T
Q  248 aagatgtaattaaat 262  Q
    ||||| |||||||||    
T  199733 aagatataattaaat 199747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 46; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 408
Target Start/End: Original strand, 133 - 268
Alignment:
Q  272 tgccctaggcagttgagttgatttagtaatataaactgattaaaagcgataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcga 370  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||  ||||||| | ||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  133 tgccctaggcagttgagttggtttt-taacataaacaaattaaaaacaataaa-agttggttttaagaatattagagagaagtatggttaagacattcga 230  T
Q  371 atcctccgaagctttcctatggcaatttgcactcctaa 408  Q
    ||||||||||  | |||||||  |||||||||||||||    
T  231 atcctccgaatttctcctatgataatttgcactcctaa 268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 543 - 587
Target Start/End: Original strand, 319 - 363
Alignment:
Q  543 cgaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctcta 587  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  319 cgaacgttaatccctatatcataatctaataatgatctatctcta 363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 146 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24297 - 24208
Alignment:
Q  146 attgataaaaaattagcaagtgtattaatttgaatcg-agtaataaaataattcgtttcctcagggactgtttaaatctctacttaacaa 234  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||||||| ||| || ||||||||  ||||||||||| ||||    
T  24297 attgatagaaaattagcaagtgtattaatttatatcgaagtaataatttaattcgtatccacaaggactgttctaatctctacttgacaa 24208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University