View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5164_low_1 (Length: 749)

Name: NF5164_low_1
Description: NF5164
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5164_low_1
NF5164_low_1
[»] chr7 (80 HSPs)
chr7 (54-736)||(41765070-41765749)
chr7 (368-736)||(41757298-41757666)
chr7 (19-223)||(29173540-29173744)
chr7 (54-232)||(48928289-48928466)
chr7 (54-253)||(48928556-48928754)
chr7 (19-200)||(32593146-32593326)
chr7 (26-221)||(26980325-26980520)
chr7 (26-232)||(31520688-31520893)
chr7 (54-249)||(21991610-21991805)
chr7 (55-248)||(5657474-5657667)
chr7 (26-250)||(12390596-12390818)
chr7 (54-232)||(22687230-22687408)
chr7 (54-253)||(18797299-18797496)
chr7 (54-248)||(8861260-8861454)
chr7 (54-250)||(30055499-30055696)
chr7 (54-222)||(12165753-12165921)
chr7 (54-248)||(4582894-4583088)
chr7 (54-250)||(32821045-32821241)
chr7 (55-247)||(24211717-24211909)
chr7 (54-249)||(43686015-43686209)
chr7 (54-248)||(6546494-6546688)
chr7 (54-232)||(7334785-7334963)
chr7 (54-248)||(15612751-15612944)
chr7 (54-232)||(38258536-38258714)
chr7 (54-250)||(9355818-9356014)
chr7 (53-232)||(33688253-33688431)
chr7 (54-248)||(27283719-27283913)
chr7 (54-249)||(31579056-31579256)
chr7 (55-246)||(27421373-27421563)
chr7 (57-166)||(11071263-11071372)
chr7 (54-248)||(10359206-10359400)
chr7 (54-232)||(25691536-25691715)
chr7 (57-232)||(37347013-37347188)
chr7 (54-248)||(37109847-37110043)
chr7 (55-251)||(17842577-17842775)
chr7 (54-249)||(32432431-32432621)
chr7 (94-211)||(35353120-35353238)
chr7 (99-252)||(26524364-26524517)
chr7 (54-168)||(10481660-10481774)
chr7 (26-169)||(38053540-38053675)
chr7 (79-232)||(23111181-23111334)
chr7 (54-246)||(44413371-44413564)
chr7 (54-139)||(37704241-37704326)
chr7 (54-152)||(44598737-44598835)
chr7 (53-130)||(15672753-15672830)
chr7 (118-248)||(34362205-34362334)
chr7 (54-148)||(43925177-43925270)
chr7 (19-64)||(41765018-41765063)
chr7 (18-64)||(4583095-4583141)
chr7 (18-64)||(43686216-43686262)
chr7 (19-64)||(9355766-9355811)
chr7 (19-64)||(18797503-18797548)
chr7 (19-64)||(23111368-23111413)
chr7 (19-64)||(37703438-37703483)
chr7 (19-64)||(38258721-38258766)
chr7 (26-64)||(10481781-10481819)
chr7 (54-104)||(26588076-26588126)
chr7 (26-64)||(31579011-31579049)
chr7 (19-64)||(17842524-17842569)
chr7 (19-64)||(27283920-27283965)
chr7 (27-64)||(30055703-30055740)
chr7 (19-64)||(32820993-32821038)
chr7 (19-64)||(37110050-37110095)
chr7 (19-64)||(37347197-37347242)
chr7 (19-64)||(37704333-37704378)
chr7 (19-64)||(46481069-46481114)
chr7 (55-115)||(37703491-37703551)
chr7 (21-64)||(11071382-11071425)
chr7 (184-246)||(8299192-8299254)
chr7 (27-61)||(32432631-32432665)
chr7 (109-151)||(34362149-34362191)
chr7 (19-61)||(35353287-35353329)
chr7 (19-64)||(21991812-21991857)
chr7 (55-115)||(46481122-46481182)
chr7 (203-254)||(40381934-40381985)
chr7 (19-54)||(48928237-48928272)
chr7 (19-54)||(48928504-48928539)
chr7 (25-63)||(7334971-7335009)
chr7 (203-232)||(3953747-3953776)
chr7 (203-232)||(23402374-23402403)
[»] chr3 (83 HSPs)
chr3 (54-253)||(22450954-22451153)
chr3 (19-232)||(11357320-11357534)
chr3 (54-250)||(33378776-33378969)
chr3 (53-251)||(21193594-21193792)
chr3 (57-249)||(11466814-11467006)
chr3 (57-232)||(52040916-52041092)
chr3 (34-237)||(40935993-40936195)
chr3 (54-248)||(4015451-4015645)
chr3 (54-232)||(27480370-27480548)
chr3 (58-248)||(37203058-37203248)
chr3 (55-250)||(48354930-48355125)
chr3 (54-248)||(51212972-51213166)
chr3 (54-250)||(35844315-35844512)
chr3 (54-232)||(43975879-43976054)
chr3 (54-248)||(37157699-37157892)
chr3 (54-250)||(34132924-34133120)
chr3 (54-246)||(46297753-46297945)
chr3 (54-225)||(44186492-44186663)
chr3 (54-251)||(39282641-39282837)
chr3 (56-232)||(53229145-53229322)
chr3 (57-249)||(26941254-26941446)
chr3 (54-250)||(4761640-4761838)
chr3 (54-232)||(29099362-29099540)
chr3 (55-249)||(40552251-40552445)
chr3 (54-200)||(42506066-42506212)
chr3 (54-249)||(3655193-3655388)
chr3 (58-200)||(2007972-2008114)
chr3 (55-232)||(32373479-32373654)
chr3 (67-232)||(20373300-20373465)
chr3 (53-226)||(45174516-45174692)
chr3 (53-232)||(44891514-44891683)
chr3 (53-232)||(22446054-22446234)
chr3 (54-249)||(7327473-7327669)
chr3 (55-170)||(43348327-43348441)
chr3 (54-216)||(3362276-3362440)
chr3 (54-145)||(29163912-29164003)
chr3 (54-232)||(24488953-24489131)
chr3 (54-232)||(25579746-25579924)
chr3 (54-190)||(24708106-24708242)
chr3 (56-148)||(46994654-46994746)
chr3 (54-189)||(14586661-14586796)
chr3 (53-166)||(53176127-53176240)
chr3 (79-250)||(47481511-47481682)
chr3 (54-127)||(33698265-33698338)
chr3 (53-201)||(21009792-21009940)
chr3 (57-151)||(38591786-38591880)
chr3 (55-148)||(54828693-54828786)
chr3 (54-125)||(22622709-22622780)
chr3 (55-137)||(11835619-11835702)
chr3 (53-224)||(54505823-54505993)
chr3 (55-132)||(36012244-36012322)
chr3 (19-64)||(39282844-39282889)
chr3 (19-64)||(46297701-46297746)
chr3 (19-64)||(48355133-48355178)
chr3 (19-63)||(52040861-52040905)
chr3 (97-162)||(53811696-53811767)
chr3 (55-121)||(1089811-1089877)
chr3 (19-61)||(46994600-46994642)
chr3 (19-64)||(3362447-3362492)
chr3 (19-64)||(20373183-20373228)
chr3 (27-64)||(21009749-21009786)
chr3 (19-64)||(34133127-34133172)
chr3 (27-64)||(42506022-42506059)
chr3 (19-59)||(4761587-4761627)
chr3 (24-64)||(27480310-27480350)
chr3 (28-64)||(37157899-37157935)
chr3 (28-64)||(37203259-37203295)
chr3 (203-250)||(40640637-40640684)
chr3 (18-64)||(44891689-44891735)
chr3 (26-64)||(47481714-47481752)
chr3 (30-64)||(54505999-54506033)
chr3 (19-64)||(2008124-2008169)
chr3 (19-64)||(11467016-11467061)
chr3 (19-64)||(26941199-26941244)
chr3 (26-64)||(1089886-1089924)
chr3 (26-64)||(7327428-7327466)
chr3 (26-64)||(11357096-11357134)
chr3 (26-64)||(11835573-11835611)
chr3 (26-64)||(53176246-53176284)
chr3 (184-250)||(55343405-55343471)
chr3 (154-247)||(11835702-11835790)
chr3 (19-64)||(25579931-25579976)
chr3 (28-57)||(38591897-38591926)
[»] chr1 (83 HSPs)
chr1 (19-232)||(14758053-14758274)
chr1 (54-250)||(15168083-15168286)
chr1 (26-250)||(11742309-11742532)
chr1 (60-232)||(31621545-31621717)
chr1 (54-246)||(33725586-33725778)
chr1 (57-250)||(16415639-16415833)
chr1 (55-232)||(47279201-47279378)
chr1 (54-246)||(15752027-15752219)
chr1 (55-216)||(40884841-40885002)
chr1 (54-232)||(4330291-4330471)
chr1 (55-249)||(2959743-2959937)
chr1 (54-248)||(38823210-38823404)
chr1 (54-249)||(10181994-10182189)
chr1 (54-232)||(27532967-27533144)
chr1 (54-250)||(48620631-48620827)
chr1 (54-248)||(3309144-3309338)
chr1 (54-170)||(27227471-27227587)
chr1 (54-250)||(34012363-34012559)
chr1 (54-232)||(27267186-27267361)
chr1 (57-248)||(42721035-42721226)
chr1 (54-250)||(15382927-15383123)
chr1 (54-232)||(7079049-7079238)
chr1 (54-229)||(9903040-9903215)
chr1 (54-249)||(18422646-18422841)
chr1 (54-211)||(32216088-32216245)
chr1 (53-250)||(32267028-32267225)
chr1 (53-246)||(41926161-41926354)
chr1 (54-250)||(3534926-3535122)
chr1 (55-250)||(39393377-39393573)
chr1 (54-250)||(1547281-1547469)
chr1 (54-229)||(10922742-10922917)
chr1 (54-246)||(238499-238690)
chr1 (54-232)||(47682480-47682657)
chr1 (54-248)||(30326938-30327132)
chr1 (54-166)||(25160710-25160822)
chr1 (54-249)||(19899755-19899950)
chr1 (62-249)||(30254419-30254605)
chr1 (62-232)||(28564775-28564945)
chr1 (62-250)||(37618886-37619078)
chr1 (100-248)||(21289661-21289816)
chr1 (54-252)||(8222123-8222318)
chr1 (54-232)||(37451298-37451475)
chr1 (54-219)||(51128884-51129049)
chr1 (54-246)||(28769651-28769842)
chr1 (61-180)||(27563898-27564017)
chr1 (62-232)||(23999359-23999529)
chr1 (67-209)||(46931446-46931588)
chr1 (54-148)||(27763297-27763391)
chr1 (614-710)||(26973139-26973235)
chr1 (54-148)||(22170807-22170901)
chr1 (18-64)||(238446-238492)
chr1 (19-64)||(30326886-30326931)
chr1 (19-64)||(37451482-37451527)
chr1 (19-64)||(40885010-40885055)
chr1 (19-64)||(47682428-47682473)
chr1 (19-61)||(2959948-2959990)
chr1 (22-64)||(15383130-15383172)
chr1 (26-64)||(23999544-23999582)
chr1 (26-64)||(46931606-46931644)
chr1 (19-64)||(1359869-1359914)
chr1 (19-64)||(8222325-8222370)
chr1 (19-64)||(10922924-10922969)
chr1 (19-64)||(15168293-15168338)
chr1 (19-64)||(22170908-22170953)
chr1 (19-64)||(32216252-32216297)
chr1 (19-64)||(47279386-47279431)
chr1 (54-163)||(38759610-38759723)
chr1 (26-61)||(4330481-4330516)
chr1 (29-64)||(18422848-18422883)
chr1 (19-58)||(27227419-27227458)
chr1 (19-58)||(27267134-27267173)
chr1 (26-64)||(19899710-19899748)
chr1 (19-64)||(15752226-15752271)
chr1 (19-64)||(30254620-30254665)
chr1 (19-64)||(38759730-38759775)
chr1 (19-64)||(38823411-38823456)
chr1 (202-250)||(4150489-4150537)
chr1 (19-55)||(16415852-16415888)
chr1 (19-59)||(25160834-25160874)
chr1 (18-65)||(3309349-3309396)
chr1 (19-57)||(31621488-31621526)
chr1 (19-53)||(33725534-33725568)
chr1 (203-248)||(43579242-43579287)
[»] chr5 (79 HSPs)
chr5 (19-248)||(14409270-14409501)
chr5 (54-232)||(33908249-33908427)
chr5 (26-249)||(1429098-1429321)
chr5 (19-250)||(24886100-24886333)
chr5 (54-248)||(31786627-31786821)
chr5 (54-232)||(22980809-22980987)
chr5 (54-232)||(26268090-26268268)
chr5 (54-250)||(19119857-19120053)
chr5 (53-232)||(699166-699345)
chr5 (20-254)||(8466739-8466972)
chr5 (54-232)||(30969305-30969483)
chr5 (54-250)||(8741867-8742064)
chr5 (54-248)||(7693230-7693424)
chr5 (54-255)||(27330299-27330498)
chr5 (55-249)||(39572818-39573012)
chr5 (57-229)||(5837574-5837746)
chr5 (54-246)||(25500907-25501099)
chr5 (54-250)||(38528218-38528413)
chr5 (55-249)||(9200232-9200426)
chr5 (54-248)||(36866762-36866956)
chr5 (54-248)||(40133385-40133579)
chr5 (54-250)||(12910348-12910549)
chr5 (55-247)||(32563150-32563342)
chr5 (54-248)||(23116203-23116397)
chr5 (57-250)||(5112297-5112490)
chr5 (54-224)||(22019656-22019826)
chr5 (54-232)||(27318468-27318646)
chr5 (54-251)||(36860420-36860618)
chr5 (54-232)||(35511458-35511636)
chr5 (54-180)||(23954770-23954897)
chr5 (54-250)||(22974063-22974259)
chr5 (55-247)||(31705594-31705785)
chr5 (54-190)||(6824460-6824598)
chr5 (55-194)||(21088748-21088887)
chr5 (54-232)||(22255197-22255376)
chr5 (54-248)||(15724490-15724682)
chr5 (53-250)||(35826464-35826660)
chr5 (54-249)||(35933901-35934090)
chr5 (54-169)||(15992521-15992636)
chr5 (54-209)||(28416508-28416663)
chr5 (54-250)||(14919509-14919706)
chr5 (54-167)||(43308633-43308746)
chr5 (54-170)||(7208845-7208960)
chr5 (61-249)||(8436965-8437152)
chr5 (99-190)||(25668707-25668798)
chr5 (54-170)||(35504443-35504559)
chr5 (111-232)||(11898018-11898139)
chr5 (54-209)||(17158012-17158166)
chr5 (57-128)||(42342851-42342921)
chr5 (54-126)||(13956343-13956415)
chr5 (18-64)||(21088694-21088740)
chr5 (18-64)||(36860625-36860671)
chr5 (18-64)||(36866963-36867009)
chr5 (18-64)||(40133586-40133632)
chr5 (154-255)||(13956426-13956527)
chr5 (19-64)||(27318416-27318461)
chr5 (19-61)||(23954718-23954760)
chr5 (18-64)||(33908434-33908480)
chr5 (19-64)||(2888374-2888419)
chr5 (54-187)||(5829962-5830086)
chr5 (19-64)||(5830093-5830138)
chr5 (19-64)||(22255383-22255428)
chr5 (19-64)||(26268275-26268320)
chr5 (19-55)||(699360-699396)
chr5 (19-61)||(22980997-22981039)
chr5 (53-95)||(25669739-25669781)
chr5 (19-61)||(31705541-31705583)
chr5 (19-64)||(7208793-7208838)
chr5 (19-64)||(17157960-17158005)
chr5 (19-64)||(35504566-35504611)
chr5 (19-55)||(14919457-14919493)
chr5 (173-248)||(16004476-16004552)
chr5 (20-64)||(35934097-35934141)
chr5 (19-62)||(8437168-8437211)
chr5 (203-250)||(22616492-22616539)
chr5 (26-64)||(5837756-5837794)
chr5 (26-64)||(19120060-19120098)
chr5 (19-61)||(22974011-22974053)
chr5 (19-60)||(13956291-13956332)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (54-255)||(7235025-7235225)
chr6 (19-232)||(33618850-33619071)
chr6 (20-249)||(8513232-8513473)
chr6 (54-232)||(15491631-15491809)
chr6 (55-247)||(20768087-20768275)
chr6 (54-250)||(4318812-4319009)
chr6 (54-249)||(3879929-3880124)
chr6 (63-246)||(6088910-6089094)
chr6 (54-254)||(29182157-29182357)
chr6 (55-246)||(30353349-30353540)
chr6 (54-232)||(21017102-21017280)
chr6 (54-251)||(1945830-1946028)
chr6 (54-248)||(33892993-33893186)
chr6 (62-250)||(5627389-5627577)
chr6 (54-249)||(7055205-7055400)
chr6 (117-250)||(18498431-18498565)
chr6 (54-187)||(6091173-6091306)
chr6 (19-64)||(3879877-3879922)
chr6 (19-64)||(21017050-21017095)
chr6 (26-64)||(1946035-1946073)
chr6 (26-64)||(5627592-5627630)
chr6 (19-64)||(6091120-6091166)
chr6 (19-54)||(7234973-7235008)
chr6 (203-250)||(19631747-19631794)
chr6 (26-64)||(29182365-29182403)
chr6 (19-64)||(20768283-20768328)
[»] chr4 (76 HSPs)
chr4 (54-248)||(28003003-28003197)
chr4 (55-250)||(38011852-38012047)
chr4 (54-232)||(33816550-33816728)
chr4 (55-250)||(25701075-25701270)
chr4 (57-232)||(5047985-5048160)
chr4 (54-232)||(34948114-34948292)
chr4 (54-248)||(55241122-55241315)
chr4 (55-251)||(27396613-27396809)
chr4 (54-250)||(35021052-35021248)
chr4 (69-248)||(19089485-19089664)
chr4 (54-231)||(23761089-23761265)
chr4 (54-250)||(29584217-29584411)
chr4 (54-251)||(55477908-55478109)
chr4 (53-232)||(7703533-7703704)
chr4 (57-226)||(32579466-32579637)
chr4 (54-249)||(35025613-35025800)
chr4 (54-238)||(32592103-32592287)
chr4 (54-249)||(37663758-37663951)
chr4 (61-232)||(49375982-49376154)
chr4 (54-232)||(19440665-19440843)
chr4 (54-254)||(9139241-9139439)
chr4 (57-246)||(36493708-36493897)
chr4 (54-249)||(25184112-25184307)
chr4 (54-246)||(33341397-33341592)
chr4 (54-232)||(4598009-4598185)
chr4 (54-232)||(37775685-37775861)
chr4 (54-232)||(46888174-46888352)
chr4 (54-222)||(17167739-17167907)
chr4 (54-222)||(17173316-17173484)
chr4 (73-232)||(50764748-50764905)
chr4 (54-246)||(47253751-47253934)
chr4 (54-223)||(54499254-54499425)
chr4 (54-232)||(879565-879743)
chr4 (61-194)||(4934226-4934360)
chr4 (54-250)||(30002649-30002837)
chr4 (54-230)||(6864053-6864229)
chr4 (54-250)||(32912597-32912793)
chr4 (54-250)||(34361509-34361704)
chr4 (56-249)||(37287732-37287919)
chr4 (54-248)||(39397918-39398103)
chr4 (62-254)||(42199723-42199915)
chr4 (54-140)||(1815409-1815495)
chr4 (54-170)||(50697320-50697435)
chr4 (54-148)||(17272068-17272158)
chr4 (19-64)||(3042820-3042865)
chr4 (19-64)||(4934167-4934212)
chr4 (19-64)||(17173491-17173536)
chr4 (19-64)||(28002951-28002996)
chr4 (19-64)||(33816481-33816526)
chr4 (19-64)||(35021000-35021045)
chr4 (19-64)||(35025561-35025606)
chr4 (26-64)||(1815502-1815540)
chr4 (26-64)||(17167914-17167952)
chr4 (26-64)||(32912552-32912590)
chr4 (27-64)||(19089426-19089463)
chr4 (19-64)||(25184314-25184359)
chr4 (19-64)||(36493654-36493699)
chr4 (27-64)||(37663714-37663751)
chr4 (203-252)||(38812263-38812312)
chr4 (54-126)||(3042741-3042813)
chr4 (154-250)||(4205114-4205210)
chr4 (19-54)||(38012065-38012100)
chr4 (19-62)||(49376170-49376213)
chr4 (19-58)||(50697448-50697487)
chr4 (19-61)||(5047931-5047973)
chr4 (26-64)||(42199930-42199968)
chr4 (182-251)||(17272008-17272077)
chr4 (19-64)||(33341599-33341644)
chr4 (19-64)||(47253941-47253986)
chr4 (19-55)||(6864245-6864281)
chr4 (203-246)||(20097494-20097537)
chr4 (19-53)||(879513-879547)
chr4 (203-252)||(2704508-2704557)
chr4 (19-64)||(7152169-7152214)
chr4 (173-250)||(7152242-7152319)
chr4 (203-248)||(38811813-38811858)
[»] chr8 (58 HSPs)
chr8 (54-249)||(27082835-27083030)
chr8 (54-248)||(5299943-5300137)
chr8 (53-250)||(38643975-38644172)
chr8 (54-250)||(34894964-34895160)
chr8 (54-254)||(36694963-36695163)
chr8 (54-248)||(6098515-6098709)
chr8 (54-232)||(37970516-37970694)
chr8 (54-249)||(16446872-16447067)
chr8 (55-248)||(33906223-33906404)
chr8 (54-232)||(465857-466035)
chr8 (54-232)||(1204942-1205120)
chr8 (62-232)||(10555207-10555377)
chr8 (54-248)||(13307622-13307816)
chr8 (54-259)||(1150102-1150306)
chr8 (54-250)||(9864145-9864341)
chr8 (53-249)||(34952027-34952223)
chr8 (54-232)||(11727039-11727217)
chr8 (54-248)||(12876108-12876302)
chr8 (54-250)||(16222860-16223056)
chr8 (54-250)||(43643592-43643788)
chr8 (54-232)||(23854428-23854606)
chr8 (55-248)||(41362517-41362707)
chr8 (53-250)||(40862416-40862613)
chr8 (62-253)||(31933891-31934082)
chr8 (54-167)||(1149629-1149742)
chr8 (20-140)||(7998401-7998522)
chr8 (54-249)||(30654580-30654775)
chr8 (55-170)||(39099117-39099232)
chr8 (54-221)||(41910985-41911153)
chr8 (55-170)||(1953987-1954103)
chr8 (55-165)||(35459709-35459819)
chr8 (54-166)||(7890954-7891066)
chr8 (59-168)||(44869576-44869686)
chr8 (54-196)||(43025753-43025895)
chr8 (54-221)||(8803814-8803974)
chr8 (54-122)||(4132683-4132750)
chr8 (18-64)||(40862619-40862665)
chr8 (19-64)||(4132631-4132676)
chr8 (124-248)||(4133077-4133199)
chr8 (19-64)||(6098463-6098508)
chr8 (19-64)||(27082783-27082828)
chr8 (19-64)||(33906412-33906457)
chr8 (19-64)||(36694911-36694956)
chr8 (19-64)||(37970464-37970509)
chr8 (99-149)||(33197947-33197997)
chr8 (19-64)||(1149577-1149622)
chr8 (19-64)||(1205127-1205172)
chr8 (19-64)||(9864348-9864393)
chr8 (19-64)||(16223063-16223108)
chr8 (19-64)||(43643540-43643585)
chr8 (180-251)||(24823395-24823466)
chr8 (26-64)||(8803769-8803807)
chr8 (26-64)||(30654535-30654573)
chr8 (19-64)||(13307823-13307868)
chr8 (26-62)||(7890909-7890945)
chr8 (26-61)||(43025905-43025940)
chr8 (19-61)||(11727227-11727269)
chr8 (208-249)||(7998361-7998402)
[»] chr2 (58 HSPs)
chr2 (54-254)||(36641980-36642182)
chr2 (54-251)||(4166919-4167116)
chr2 (54-254)||(33550995-33551195)
chr2 (54-249)||(19424637-19424832)
chr2 (54-248)||(19313852-19314045)
chr2 (54-246)||(33660377-33660569)
chr2 (54-252)||(29242147-29242345)
chr2 (54-249)||(4264086-4264281)
chr2 (54-248)||(4478368-4478564)
chr2 (54-167)||(45327801-45327914)
chr2 (54-246)||(43770848-43771039)
chr2 (54-216)||(27349948-27350109)
chr2 (54-248)||(41465509-41465695)
chr2 (19-167)||(7006895-7007043)
chr2 (79-247)||(13711465-13711633)
chr2 (54-250)||(31570743-31570939)
chr2 (58-232)||(4763644-4763821)
chr2 (55-232)||(26357593-26357770)
chr2 (54-222)||(3176965-3177133)
chr2 (54-246)||(41463859-41464051)
chr2 (54-249)||(17071746-17071941)
chr2 (55-250)||(39167373-39167568)
chr2 (54-216)||(37905740-37905902)
chr2 (54-232)||(44285965-44286143)
chr2 (54-211)||(43648254-43648411)
chr2 (54-216)||(33709241-33709403)
chr2 (54-148)||(41960940-41961034)
chr2 (54-249)||(17054105-17054300)
chr2 (57-250)||(18494292-18494473)
chr2 (54-250)||(2325387-2325575)
chr2 (57-249)||(5881533-5881729)
chr2 (62-224)||(33902092-33902252)
chr2 (55-222)||(19289333-19289500)
chr2 (54-248)||(44913662-44913857)
chr2 (79-249)||(11366415-11366585)
chr2 (54-147)||(31861953-31862046)
chr2 (103-221)||(41051263-41051382)
chr2 (19-64)||(3177140-3177185)
chr2 (18-64)||(4167123-4167169)
chr2 (54-232)||(35958925-35959090)
chr2 (19-64)||(35959097-35959142)
chr2 (19-64)||(44913865-44913910)
chr2 (65-145)||(19501760-19501839)
chr2 (26-64)||(11366345-11366383)
chr2 (26-64)||(19289287-19289325)
chr2 (19-64)||(2325335-2325380)
chr2 (19-64)||(17071694-17071739)
chr2 (19-64)||(41465702-41465747)
chr2 (28-64)||(4763832-4763868)
chr2 (20-59)||(43648203-43648242)
chr2 (19-64)||(17054053-17054098)
chr2 (19-64)||(44286150-44286195)
chr2 (28-64)||(41961041-41961077)
chr2 (26-61)||(19500879-19500914)
chr2 (26-64)||(18258251-18258289)
chr2 (203-232)||(6177791-6177820)
chr2 (54-107)||(18258296-18258349)
chr2 (19-64)||(37905911-37905956)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (54-249)||(133-328)
scaffold0002 (54-227)||(94374-94547)
scaffold0002 (54-147)||(408420-408512)
scaffold0002 (19-64)||(335-380)
[»] scaffold0291 (2 HSPs)
scaffold0291 (54-246)||(7889-8081)
scaffold0291 (27-64)||(8088-8125)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (54-246)||(11908-12103)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (62-246)||(43959-44143)
scaffold0061 (19-64)||(44158-44202)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (62-246)||(154644-154828)
scaffold0017 (19-64)||(154585-154629)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (55-200)||(267331-267477)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (62-232)||(146015-146185)
scaffold0022 (26-64)||(145962-146000)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (157-249)||(42347-42439)
scaffold0009 (52-104)||(100894-100948)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 568; Significance: 0; HSPs: 80)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 736
Target Start/End: Original strand, 41765070 - 41765749
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41765070 gtgttacacttaaaacaaggtagagtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccacc 41765169  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 253  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  41765170 gtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtattgactttatcagaaaagtcattctcatgacttcaccatggaattttccttaat 41765269  T
Q  254 tattaacattgcaatattg---atgttacacaaacgcttttttaaaatgttgtgacctacactgtggtatacaatttttgtgctgcttctattttcaggg 350  Q
    ||| |||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     |||||||||||||||    
T  41765270 tat-aacattgcaatattgcacatgttacacaaaagcttttttaaaatgttgtgacctacattgtggtatacaatttttg-----cttctattttcaggg 41765363  T
Q  351 gccagaggtctcgaatgcagttccaaacttgtacaagaattcgattcgtgcgttttgcaatgccaacacctcagaggaattcaagccagtaaaagatgta 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41765364 gccagaggtctcgaatgcagttccaaacttgtacaagaattcgattcgtgcgttttgcaatgccaacacctcagagggattcaagccagtaaaagatgta 41765463  T
Q  451 tctattccagaaatcaatgttcgaaccggcataattgatgatcttcttggtggaccatcaccatctaagagatcaattttggctttcttcgctggtgggc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41765464 tctattccagaaatcaatgttcgaaccggcataattgatgatcttcttggcggaccatcaccatctaagagatcaattttggctttcttcgctggtgggc 41765563  T
Q  551 ttcatggggatattaggaatgttctacttgaacattgggaacacaaagatgaagatcttcaagttcacaagtaccttccaaagggtgtgtcttactatga 650  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41765564 ttcatggggatattaggaatgttctacttgaacattgggaacacaaagatgaagatattcaagttcacaagtaccttccaaagggtgtgtcttactatgc 41765663  T
Q  651 tatgttgagaaaaagcaagttctgtctttgtcctagtgggtacgaggttgcaagtccaagagtggtggaagcaatatacacaggtt 736  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41765664 tatgttgagaaaaagcaagttttgtctttgtcctagtgggtgggaggttgcaagtccaagagtggtggaagcaatatacacaggtt 41765749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 368 - 736
Target Start/End: Original strand, 41757298 - 41757666
Alignment:
Q  368 cagttccaaacttgtacaagaattcgattcgtgcgttttgcaatgccaacacctcagaggaattcaagccagtaaaagatgtatctattccagaaatcaa 467  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  41757298 cagttccaaacttgtacaaaaattcaatccgagcgctttgcaatgcgaacacatcagagggattcaagcctgcaaaggatgtatctattccagaaaccaa 41757397  T
Q  468 tgttcgaaccggcataattgatgatcttcttggtggaccatcaccatctaagagatcaattttggctttcttcgctggtgggcttcatggggatattagg 567  Q
    | ||| |||||| | |||  ||| | || |||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    |||||    
T  41757398 tcttcaaaccggtacaatacatggtattgttggcgggccatcaccatctaagcgatcagttttggctttcttcgccggtggggttcatgggcccgttagg 41757497  T
Q  568 aatgttctacttgaacattgggaacacaaagatgaagatcttcaagttcacaagtaccttccaaagggtgtgtcttactatgatatgttgagaaaaagca 667  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41757498 cctgttctacttgaacattgggaacacaaagatgaagatcttcaagttcacaagtaccttccaaagggtgtgtcttactatgatatgttaagaaaaagca 41757597  T
Q  668 agttctgtctttgtcctagtgggtacgaggttgcaagtccaagagtggtggaagcaatatacacaggtt 736  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41757598 agttctgtctttgtcctagtgggtacgaggttgcaagtccaagagtggtggaagcaatatacacaggtt 41757666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29173744 - 29173540
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaatt 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  29173744 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtaacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtttgatgaatt 29173645  T
Q  119 gatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  29173644 gatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatactacagtgttaacttcaccagaaaagt 29173545  T
Q  219 cattc 223  Q
    |||||    
T  29173544 cattc 29173540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 48928289 - 48928466
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  48928289 gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatg-ggactgaacttttgatggcacc 48928387  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48928388 gtacaaatagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 48928466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 54 - 253
Target Start/End: Original strand, 48928556 - 48928754
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  48928556 gtgttacacttaaaataatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatg-ggactgaacttttgatggcacc 48928654  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 253  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||    
T  48928655 gtacaaatagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccataaaattttctttaat 48928754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 200
Target Start/End: Original strand, 32593146 - 32593326
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaatt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  32593146 caaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaaatgcagttttgataatctgatgaatt 32593245  T
Q  119 gatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgt 200  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  32593246 gatgatactgtga-gactgaacttttgataccaccatataaacagtggggtgctactcactacacttttaatgctatagtgt 32593326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26980520 - 26980325
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgata 125  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26980520 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgata 26980421  T
Q  126 ctatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcat 221  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||| |||||||||    
T  26980420 ttatggggactgaacttttgatgccactgtacaaaccgtggggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcaccataaaagtcat 26980325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 232
Target Start/End: Original strand, 31520688 - 31520893
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgata 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31520688 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgata 31520787  T
Q  126 ctatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctc 225  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||  |||||||| | |||||||  |||||| |  ||||||||| |||||||||| ||    
T  31520788 ctatg-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggagtgttactcactatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttc 31520886  T
Q  226 atgactt 232  Q
    |||||||    
T  31520887 atgactt 31520893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21991805 - 21991610
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  21991805 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgacact 21991706  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    |||||||||||||||||  |||| | ||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  21991705 gtacaaacagtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaacttcaccataaaaatcattctcatgacttcaccctagaattttcct 21991610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 55 - 248
Target Start/End: Original strand, 5657474 - 5657667
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  5657474 tgttacacttaaaacaaagtaggataaaattaaattaagtgtatttttgttaatatgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactg 5657573  T
Q  155 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  5657574 tacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 5657667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 250
Target Start/End: Original strand, 12390596 - 12390818
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgata 125  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12390596 agttgatgatattatgtga--gtcttaagtgttacacttaaaagaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataata 12390693  T
Q  126 ctatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctc 225  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| ||| | |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||  |||     
T  12390694 ctatggggacataacttttgatgtcactgcacaaacagtgggatgttactcattacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcgatctg 12390793  T
Q  226 atgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    ||||||| || || |||||||||||    
T  12390794 atgacttcaccatagaattttcctt 12390818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22687408 - 22687230
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  22687408 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgataccact 22687309  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    | ||||||||||| |||  |||||| ||| |||||||  ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22687308 gcacaaacagtggagtgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcatgactt 22687230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18797496 - 18797299
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||      
T  18797496 gtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcatt 18797397  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 253  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| ||||  ||   ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  18797396 gtacaaacagtggggtgttactcattacattttt--tatgttagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccttaat 18797299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8861454 - 8861260
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  8861454 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattgttgttaatctgattaattgatgatactatggggacttaacttttgatgccact 8861355  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    |||||||||||||||||  | |||  ||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  8861354 gtacaaacagtggggtgttattcataacacttttgatgctatagtgttaacttcgcgagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 8861260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30055696 - 30055499
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  30055696 gtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 30055597  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca-ccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||| | | |||||||||||| ||||||| || || |||||||||||    
T  30055596 gtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatattatagtgttaacttcatcaaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcctt 30055499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12165921 - 12165753
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||     
T  12165921 gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacttaagggacttaacttttgatgccact 12165822  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 222  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12165821 gtacaaacagtggggtgttactcacaacactttggatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcatt 12165753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4583088 - 4582894
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||      
T  4583088 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcatt 4582989  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || |||||| || || |||||||||    
T  4582988 gtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtattaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 4582894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Original strand, 32821045 - 32821241
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  32821045 gtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaactaaattaactgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgatgccatt 32821144  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||  |||| |||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  32821145 gtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatattgttaacttcaccaaaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttcctt 32821241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24211909 - 24211717
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       
T  24211909 tgttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccattc 24211810  T
Q  155 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttc 247  Q
    || ||||||| |||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||||||    
T  24211809 tataaacagtagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttc 24211717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43686209 - 43686015
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||      
T  43686209 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatagggactgaacttttgatgccatt 43686110  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    ||||||||||| |||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||  ||||||||  |||||||||| || |||||| || || ||||||||||    
T  43686109 gtacaaacagt-gggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttcacccaaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcct 43686015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6546688 - 6546494
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||   | | |||||||||||  ||     
T  6546688 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggatagtaaacttttgatgttact 6546589  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    ||||||| |||||||||  |||| | ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||||| || || |||||||||    
T  6546588 gtacaaatagtggggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcactagaaaaatcattcttatgacttcaccatagaattttcc 6546494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7334963 - 7334785
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||      
T  7334963 gtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaagctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcatt 7334864  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||  ||| ||  ||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  7334863 gtacaaacagtggggtgttactcattacatattttatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattctcacgactt 7334785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Original strand, 15612751 - 15612944
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||     
T  15612751 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatagggactgaacttttgatgccact 15612850  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
     |||||||| |||||||  |||||  |||| ||||||  ||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| || || |||||||||    
T  15612851 ctacaaacactggggtgttactcataacac-tttgatgttatagtgttaacttcacaagaaacgttattctcatgacttcaccatagaattttcc 15612944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 38258714 - 38258536
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||      
T  38258714 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcatt 38258615  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||| | |||||||    
T  38258614 gtacaaacggtgtggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgactt 38258536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Original strand, 9355818 - 9356014
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||| ||||||||||| |||     
T  9355818 gtgttacacttaaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaacgataatatgagaactaaacttttgatgtcact 9355917  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||| |||| || |||||||||  | ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||  ||||||||||    
T  9355918 gtacaaacagtggggtattgctcactacattttttatgctatagtgttaaattcaccaaaatggtcattctcatgacttcaccataaaattttcctt 9356014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 53 - 232
Target Start/End: Original strand, 33688253 - 33688431
Alignment:
Q  53 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 152  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  33688253 agtgttacacttaaaacaaagtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatgccac 33688352  T
Q  153 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
     | ||||||||| || ||  |||||  |||||||||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  33688353 tggacaaacagtaggatgttactcataacacttttgatgttatagtgttaactt-accagaaaagtcattctcataactt 33688431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27283913 - 27283719
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||      
T  27283913 gtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtatagtcttgttaatctgataaattgataatactatgaggactgaacttttgatttcatt 27283814  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||| | || |||| || || |||||||||    
T  27283813 gtacaaacggtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttataacttcaccatagaattttcc 27283719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Original strand, 31579056 - 31579256
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||      
T  31579056 gtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcatt 31579155  T
Q  154 gta-----caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    |||      |||||||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| | ||||| ||||||| || || |||||||||    
T  31579156 gtataaattaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaattattcttatgacttcaccatagaattttcc 31579255  T
Q  249 t 249  Q
    |    
T  31579256 t 31579256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 246
Target Start/End: Original strand, 27421373 - 27421563
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||  |    
T  27421373 tgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaatttatgatattat-aggactgaacttttgatgtcattg 27421471  T
Q  155 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 246  Q
    |||||||||||| |||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||| ||||| || || |||||||    
T  27421472 tacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattatcacgacttcaccatagaatttt 27421563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 57 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 11071372 - 11071263
Alignment:
Q  57 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 156  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  11071372 ttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgta 11071273  T
Q  157 caaacagtgg 166  Q
    ||||||||||    
T  11071272 caaacagtgg 11071263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Original strand, 10359206 - 10359400
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagatt-aagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 152  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  10359206 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttaagtgtagtcttgttgatctgatgaattgatgatactatca-gactgaacttttgatgtcac 10359304  T
Q  153 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
     ||| ||| ||| || ||  |||||||||||||||||| |||||   |  | || ||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||    
T  10359305 tgtataaatagtaggatgttactcactacacttttgatgctataagattaattttaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcc 10359400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 25691536 - 25691715
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||     
T  25691536 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtatttttgttaatatgatgaattgataatactataagaactgaactgttgatgccact 25691635  T
Q  154 gtacaaacagtggggt-gccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    |||||||||||| |||    |||||| | |||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25691636 gtacaaacagtgaggtaattactcacaatacttttgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattctcatgactt 25691715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37347188 - 37347013
Alignment:
Q  57 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 156  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  37347188 ttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcctgttaatttaataaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgta 37347089  T
Q  157 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    |||||| |||||||  ||||| || | |||||||  |||||| |  ||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  37347088 caaacaatggggtgttactcattatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaaatcattttcatgactt 37347013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37110043 - 37109847
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggta--gggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 151  Q
    ||||||| |||| |||||||||  || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||    
T  37110043 gtgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgaacttttgatgtca 37109944  T
Q  152 ccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
      |||||||| ||||||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||| || || |||||||||    
T  37109943 ttgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttcc 37109847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 251
Target Start/End: Original strand, 17842577 - 17842775
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggta--gggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 152  Q
    |||||| |||| |||||||||  || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||     
T  17842577 tgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgagcttttgatgtcat 17842676  T
Q  153 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 251  Q
     |||||||| ||||||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||| || || ||||||||||||    
T  17842677 tgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttcctta 17842775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32432621 - 32432431
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||      
T  32432621 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattatattaactgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgtcatt 32432522  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||| ||||||||     ||||  |||||||||||||| ||||| || |||||| || || ||||||||||    
T  32432521 gtacaaacaatggggtgttactcacaacatttttgata-----gtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattttcct 32432431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 35353238 - 35353120
Alignment:
Q  94 tgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa-cttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatac 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |    
T  35353238 tgcagtcttgttaatctgatgaattggtgatactatggggacagaaacttttgattccatcgtacaaacaatggggtgctactcactacacttttgatgc 35353139  T
Q  193 tatagtgtcgacttcacca 211  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  35353138 tatagtgttgacttcacca 35353120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 252
Target Start/End: Original strand, 26524364 - 26524517
Alignment:
Q  99 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagt 198  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||  | |||| ||| |||||||  ||||||    
T  26524364 tcttgttaatatgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccactgcacaaacaatggagtgttagtcacaacatttttgatgttatagt 26524463  T
Q  199 gtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaa 252  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  26524464 gttaacatcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccttaa 26524517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 10481774 - 10481660
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||      
T  10481774 gtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagcgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataaagactgaatttttgatgtcatt 10481675  T
Q  154 gtacaaacagtgggg 168  Q
    |||||||||||||||    
T  10481674 gtacaaacagtgggg 10481660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 38053675 - 38053540
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgata 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||        ||||||| |    
T  38053675 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttataacaaagtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaat--------ttgatgaca 38053584  T
Q  126 ctatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggt 169  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  38053583 ctatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggt 38053540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23111334 - 23111181
Alignment:
Q  79 taaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcac 178  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||  ||||||    
T  23111334 taaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgatggttgaacttttgatgccattgtacaaatagtggtgtgttactcac 23111235  T
Q  179 tacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
     | | |||||||  ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23111234 aatatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcatgactt 23111181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 246
Target Start/End: Original strand, 44413371 - 44413564
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||  ||      
T  44413371 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatgaattgaagatactatggagaccgaacttttgatttcagt 44413470  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca-ccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 246  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||  ||||||||  ||||||   | |||||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  44413471 gtacaaacattggggtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttcattaaaaaaagtcattttcatgactttaccatagaatttt 44413564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 37704326 - 37704241
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  37704326 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatggggactgaa 37704241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 44598835 - 44598737
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 152  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  44598835 gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattgaatttttgatgccac 44598737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 130
Target Start/End: Original strand, 15672753 - 15672830
Alignment:
Q  53 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15672753 agtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatg 15672830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 118 - 248
Target Start/End: Original strand, 34362205 - 34362334
Alignment:
Q  118 tgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaag 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||  | |||||||    
T  34362205 tgatgatactatgagaactgaacttt-gatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttcctagaaaag 34362303  T
Q  218 tcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    |||||||||| | || || || |||||||||    
T  34362304 tcattctcataatttcaccatagaattttcc 34362334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 43925270 - 43925177
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 148  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | | |||||| |||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43925270 gtgttgcacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattattgttagtctgat-agttgatgatactatgtagactgaacttttgatg 43925177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 41765018 - 41765063
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41765018 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 41765063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 4583141 - 4583095
Alignment:
Q  18 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4583141 acaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactt 4583095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 43686262 - 43686216
Alignment:
Q  18 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43686262 acaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactt 43686216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 9355766 - 9355811
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9355766 caaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactt 9355811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 18797548 - 18797503
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797548 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 18797503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 23111413 - 23111368
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23111413 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 23111368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 37703438 - 37703483
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37703438 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtggtacactt 37703483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 38258766 - 38258721
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38258766 caaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 38258721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 10481819 - 10481781
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10481819 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 10481781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 104
Target Start/End: Original strand, 26588076 - 26588126
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  26588076 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgt 26588126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Original strand, 31579011 - 31579049
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31579011 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 31579049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 17842524 - 17842569
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17842524 caaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactt 17842569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 27283965 - 27283920
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27283965 caaacatagttgataatattatgtgatagttttaagtgttacactt 27283920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 30055740 - 30055703
Alignment:
Q  27 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30055740 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 30055703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 32820993 - 32821038
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32820993 caaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactt 32821038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 37110095 - 37110050
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37110095 caaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactt 37110050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 37347242 - 37347197
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37347242 caaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactt 37347197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 37704378 - 37704333
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37704378 caaacagagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactt 37704333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 46481069 - 46481114
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46481069 caaacaaagttaatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 46481114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 115
Target Start/End: Original strand, 37703491 - 37703551
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 115  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  37703491 tgttacacttaaaataagatatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatga 37703551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 11071425 - 11071382
Alignment:
Q  21 aacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11071425 aacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactt 11071382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8299254 - 8299192
Alignment:
Q  184 ttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 246  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| || || |||||||    
T  8299254 ttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 8299192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 32432665 - 32432631
Alignment:
Q  27 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32432665 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 32432631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 151
Target Start/End: Original strand, 34362149 - 34362191
Alignment:
Q  109 ctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 151  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  34362149 ctgatgaattgatgatactataagaactgaacttttgatgcca 34362191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 35353329 - 35353287
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 61  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35353329 caaatatagttgatgatattatgagatagtcttaagtgttaca 35353287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 21991857 - 21991812
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21991857 caaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 21991812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 115
Target Start/End: Original strand, 46481122 - 46481182
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||    
T  46481122 tgttacacttaaaacaatgtagaataaaattacatcaagtatagtcttgttaatctgatga 46481182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 40381985 - 40381934
Alignment:
Q  203 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||    
T  40381985 acttcaccagaaaagtcattctcataacttcaccgtagaattttccttaatt 40381934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 54
Target Start/End: Original strand, 48928237 - 48928272
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag 54  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48928237 caaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaag 48928272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 54
Target Start/End: Original strand, 48928504 - 48928539
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag 54  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48928504 caaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaag 48928539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 7335009 - 7334971
Alignment:
Q  25 tagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 63  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7335009 tagttgatgatattatctgataatcttaagtgttacact 7334971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3953776 - 3953747
Alignment:
Q  203 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3953776 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 3953747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 232
Target Start/End: Original strand, 23402374 - 23402403
Alignment:
Q  203 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23402374 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 23402403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 152; Significance: 4e-80; HSPs: 83)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22451153 - 22450954
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22451153 gtgttacacttaaaacaaggtaaggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccacc 22451054  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 253  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  22451053 atacaaacagtgaggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttccttaat 22450954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Original strand, 11357320 - 11357534
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaatt 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  11357320 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaatt 11357419  T
Q  119 gatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaag 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  11357420 gatgatactatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaacagtgggggtgttactcactatacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaag 11357519  T
Q  218 tcattctcatgactt 232  Q
    |||||||||||||||    
T  11357520 tcattctcatgactt 11357534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Original strand, 33378776 - 33378969
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  33378776 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatgtcacc 33378875  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    ||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||  | || |||||||||||    
T  33378876 gtacaaatattggggtactactcactacacttttgatactatagtgttgacttcac---aaaagtcattctcataactttgccatagaattttcctt 33378969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 53 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21193792 - 21193594
Alignment:
Q  53 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  21193792 agtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattaatgataccatggggactgaacttttgatgtcac 21193693  T
Q  153 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 251  Q
      ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| | | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  21193692 tctacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgattcaacagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactttaccatagaattttcctta 21193594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 57 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11467006 - 11466814
Alignment:
Q  57 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 156  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  11467006 ttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgccactgta 11466907  T
Q  157 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||  |||||| |  |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  11466906 caaacagtggggtgttactcacaacacttgcgatgttatagtcttaacttcatcagaaaagtcattctcaagacttcaccatagaattttcct 11466814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Original strand, 52040916 - 52041092
Alignment:
Q  57 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 156  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  52040916 ttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactata 52041015  T
Q  157 caaaca-gtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||||  ||||| |  ||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52041016 caaacatttggggagttactcactacacttttgatgttatagtattaacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 52041092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40936195 - 40935993
Alignment:
Q  34 atattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40936195 atatcatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaaaaagtt-ggataaaattatattaagtgtattcttgttaatctgatgaatagatgatactatgagg 40936097  T
Q  134 actgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttg 233  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||  |||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||     
T  40936096 actgaacttttgatgtcactgtataaacaatgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttc 40935997  T
Q  234 acaa 237  Q
    ||||    
T  40935996 acaa 40935993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4015645 - 4015451
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4015645 gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagactaattatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcact 4015546  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
     |||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  4015545 ctacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 4015451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 27480370 - 27480548
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27480370 gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcacc 27480469  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||||||| | || ||| ||||| || |||||||||  |||||||| ||||| |||| |||  |||||||||||||||    
T  27480470 gtacaaacaattggatgctactcattatacttttgatgttatagtgttgactttaccaaaaatatcattctcatgactt 27480548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 58 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37203248 - 37203058
Alignment:
Q  58 tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtac 157  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37203248 tacactaaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtac 37203149  T
Q  158 aaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  |||||| || |||| ||||| | ||||||| || || |||||||||    
T  37203148 aaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaattttcc 37203058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 48355125 - 48354930
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  48355125 tgttacatttataacaaggtaggataaaattagactaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattg 48355026  T
Q  155 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||| |||| ||| ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  48355025 tacaaacaatggggtgttactcattacatttttaatattatagtgttaacttcaccataaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 48354930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Original strand, 51212972 - 51213166
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  51212972 gtgttacacttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggactcaacttttgatgccatt 51213071  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    |||||||||||||||||   |||| |||| |||| ||  || |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  51213072 gtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttacagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 51213166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 35844512 - 35844315
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 152  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  35844512 gtgttacacttaaaactaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgtcac 35844413  T
Q  153 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
     |||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  35844412 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacatttttgttgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcctt 35844315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 43975879 - 43976054
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| || |    
T  43975879 gtgttacacttaaaacaagataagataaaattagattaagtgcaattttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggattaaacttttgatgtcatc 43975978  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||   || ||||||||||||||||||||    
T  43975979 gtacaaatagtggagtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgactt---caaaaaagtcattctcatgactt 43976054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37157892 - 37157699
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  37157892 gtgttacacttgaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccact 37157793  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  |||||| || ||||| |||| ||||||||| || || |||||||||    
T  37157792 gtac-aacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagccattttcatgacttcaccatagaattttcc 37157699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34133120 - 34132924
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||      
T  34133120 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcatt 34133021  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| || |||||| |  || |||||||||||    
T  34133020 gtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattttcgtgacttcattatagaattttcctt 34132924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 246
Target Start/End: Original strand, 46297753 - 46297945
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||      
T  46297753 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaagtttgattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacggggactgaacttttgacgccatt 46297852  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 246  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||| | |||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  46297853 gtacaaacagtggtgtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatttt 46297945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 225
Target Start/End: Original strand, 44186492 - 44186663
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  44186492 gtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatttgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcact 44186591  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctc 225  Q
    ||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  44186592 gtataaacagcggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctc 44186663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 39282837 - 39282641
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  39282837 gtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatggatgataatatgagaactgaacttttgatgccact 39282738  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 251  Q
    ||| ||||||||||||   |||||| ||| |||||||  ||||||||  | || | ||||||| ||||| ||||||||| || || ||||||||||||    
T  39282737 gtataaacagtggggtattactcac-acagttttgatgttatagtgttaattttatcagaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttcctta 39282641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 56 - 232
Target Start/End: Original strand, 53229145 - 53229322
Alignment:
Q  56 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt 155  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  53229145 gttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaactgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgcaactgt 53229244  T
Q  156 acaaacagtg-gggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||||| || |||||   ||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||| | ||| |||||||||    
T  53229245 acaaacattgagggtgttgctcactacacttttgatgctatagtgttaatttcaccagaaaaataattttcatgactt 53229322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 57 - 249
Target Start/End: Original strand, 26941254 - 26941446
Alignment:
Q  57 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 156  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||    
T  26941254 ttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgataccatgaggactgaacttttgatgtcattata 26941353  T
Q  157 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    ||||||||||||||  ||||| || | |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||||| || || ||||||||||    
T  26941354 caaacagtggggtgttactcattataattttgattttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttcaccatagaattttcct 26941446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Original strand, 4761640 - 4761838
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  4761640 gtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 4761739  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc--agaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    ||||||||||||  |||  ||||| |||| |||||||| |||||| |  ||||||||  | |||||||| |||||||| || || || |||||||||||    
T  4761740 gtacaaacagtgaagtgttactcattacatttttgatattatagtattaacttcaccaaaaaaaagtcaatctcatgaattcaccatagaattttcctt 4761838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29099540 - 29099362
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||     
T  29099540 gtgttacacttaaaataaggcacgataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactgaactttagatgtcact 29099441  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||| |||| ||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29099440 gtacaaacagtggggtgttactcacgacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgactt 29099362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 249
Target Start/End: Original strand, 40552251 - 40552445
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    |||||| |||| |||||| || | |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |    
T  40552251 tgttacgcttataacaagctaagataaaattaaattaagtgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattg 40552350  T
Q  155 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    ||||||| |||| |||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  40552351 tacaaacggtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttctccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 40552445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 200
Target Start/End: Original strand, 42506066 - 42506212
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  42506066 gtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 42506165  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgt 200  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||  ||||||||    
T  42506166 gtacaaacagtggggtattactcattacaattttgatgttatagtgt 42506212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Original strand, 3655193 - 3655388
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  3655193 gtgttacgcttctaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 3655292  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  |||| | || |||||||||| | ||||||| || ||  |||||||||    
T  3655293 gtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaactttatcaaaaaagtcatttttatgacttcaccataaaattttcct 3655388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 58 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 2008114 - 2007972
Alignment:
Q  58 tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtac 157  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2008114 tacacttaaaacgaggtaggataaaattagattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatgctatggggattgaacttttgatgccactgtac 2008015  T
Q  158 aaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgt 200  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||| |  |||||||||    
T  2008014 aaacagtggggtgttactcacaacacttttaacgctatagtgt 2007972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32373654 - 32373479
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||   |||||||||||||||| |    
T  32373654 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgataccattggggtggaacttttgatgccactg 32373555  T
Q  155 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    |||||||||||| ||   |||||| ||||||||||| |||||||||  |||| |   |||||||||||||||||||||    
T  32373554 tacaaacagtggagt--tactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttattggaaaagtcattctcatgactt 32373479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 232
Target Start/End: Original strand, 20373300 - 20373465
Alignment:
Q  67 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgg 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  20373300 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgataccatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 20373399  T
Q  167 ggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||  ||||  |||| |||||||  |||||| |  ||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  20373400 ggtgttactcgttacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattcttatgactt 20373465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 45174692 - 45174516
Alignment:
Q  53 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  45174692 agtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgcta 45174593  T
Q  152 ccgtacaaacagtggggtgccact--cactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctca 226  Q
    | ||||||||||||  |||  |||  ||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||| |||||||    
T  45174592 ctgtacaaacagtgaagtgttactcacacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagttattctca 45174516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44891683 - 44891514
Alignment:
Q  53 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||      
T  44891683 agtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgattaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgcc-- 44891586  T
Q  153 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
           |||||||| ||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44891585 -------acagtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaagtcattttcatgactt 44891514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 232
Target Start/End: Original strand, 22446054 - 22446234
Alignment:
Q  53 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-ggactgaacttttgatgcca 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  22446054 agtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttatttatatgatgaattgatgatactatgagggtttgaacttttgatgcca 22446153  T
Q  152 ccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc-agaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    | ||||||| |||||||||  |||||||| | |||||||  |||| |||  |||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  22446154 ctgtacaaa-agtggggtgttactcactatatttttgatgatataatgttaacttcaccaaaaaaagtcattttcatgactt 22446234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Original strand, 7327473 - 7327669
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| ||||| || |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  7327473 gtgttacactagaaagaaggtaggataaaaataaattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcact 7327572  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtg-tcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    ||||||| | ||| |||  |||||| |||||||||||  ||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  7327573 gtacaaataatggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgtttaacttcactaaaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttcct 7327669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 43348441 - 43348327
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||      
T  43348441 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta-aaagactgaacttttgatgccacta 43348343  T
Q  155 tacaaacagtggggtg 170  Q
     |||||||||||||||    
T  43348342 aacaaacagtggggtg 43348327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3362440 - 3362276
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaa--gtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 151  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3362440 gtgtttcacttaaaataaggtaggataaaattagattaatagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgataccatgaggagtgaacttttgatgcca 3362341  T
Q  152 ccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaa 216  Q
    | ||||||| |||||| ||  |||||||| | || |||| |||||||||  ||||||||| ||||    
T  3362340 ctgtacaaatagtgggatgttactcactatatttctgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaa 3362276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 29164003 - 29163912
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29164003 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgatactaagaggactgaacttttg 29163912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 24488953 - 24489131
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||      
T  24488953 gtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgataatatggggactgaacttttgatgtcatt 24489052  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    || ||||||||||  ||  |||||| ||| |||| |||||||||| |  ||||||| | |||| ||||| || ||||||    
T  24489053 gtgcaaacagtggaatgttactcacaacatttttaatactatagtcttaacttcacaaaaaaaatcattttcgtgactt 24489131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25579924 - 25579746
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| || || |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||     
T  25579924 gtgttacactaaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctaataaactgatgataatatggggactgaacttttgatgtcact 25579825  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||| ||| ||| |  ||  | |||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25579824 gtataaatagtagaatgttattcacaacacttttgatgctatagtattaacttcaccagaaaaatcattctcataactt 25579746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 190
Target Start/End: Original strand, 24708106 - 24708242
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaa--gtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  24708106 gtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagatcaaaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtca 24708205  T
Q  152 ccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgat 190  Q
    | ||||  |||||| ||||  ||||||| || |||||||    
T  24708206 ctgtac--acagtgaggtgttactcactgcagttttgat 24708242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 148
Target Start/End: Original strand, 46994654 - 46994746
Alignment:
Q  56 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46994654 gttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatg 46994746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 189
Target Start/End: Original strand, 14586661 - 14586796
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||  |||     
T  14586661 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggacaaaacttttgatatcact 14586760  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttga 189  Q
    ||| ||| |||| ||||  |||||| ||||||||||    
T  14586761 gtataaatagtgaggtgttactcacaacacttttga 14586796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 53176240 - 53176127
Alignment:
Q  53 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 152  Q
    ||||||| | ||||||  |||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  53176240 agtgttatatttaaaatgaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgttat 53176141  T
Q  153 cgtacaaacagtgg 166  Q
     |||||||||||||    
T  53176140 tgtacaaacagtgg 53176127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 47481682 - 47481511
Alignment:
Q  79 taaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcac 178  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||||  |||||     
T  47481682 taaaattatattaagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgatactatgagggctaaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcat 47481583  T
Q  179 tacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||  ||||||  ||||||| || ||  ||||||||||    
T  47481582 tacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaacatcattcctatgacttcaccataaaattttcctt 47481511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 54 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 33698338 - 33698265
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatact 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33698338 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatact 33698265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 201
Target Start/End: Original strand, 21009792 - 21009940
Alignment:
Q  53 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 152  Q
    |||||||  |||| |||||| || | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||     
T  21009792 agtgttatgcttagaacaagttatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgataatatgagggctgaacttttgatgtcat 21009891  T
Q  153 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtc 201  Q
      |||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||  |||||||||    
T  21009892 tctacaaatagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtc 21009940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 38591880 - 38591786
Alignment:
Q  57 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 151  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  38591880 ttacacttgaaacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgataataatatgtggacttaacttttgatgcca 38591786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 148
Target Start/End: Original strand, 54828693 - 54828786
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 148  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||    
T  54828693 tgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttcatatgatgaattgatgatgctatgaagaatgaatttttgatg 54828786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 125
Target Start/End: Original strand, 22622709 - 22622780
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgata 125  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22622709 gtgttacacttgaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgata 22622780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 137
Target Start/End: Original strand, 11835619 - 11835702
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaa-attagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactg 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  11835619 tgttacacttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgtatttttgttaatatgataaattgatgatactatggggactg 11835702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 54505993 - 54505823
Alignment:
Q  53 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 152  Q
    |||||||  |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||     
T  54505993 agtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgtatttatgatactatgagg-ctgaatttttgatgtcat 54505895  T
Q  153 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattct 224  Q
      || ||| | |||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||| || ||||||||||||    
T  54505894 tctataaataatggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaacaaaaaagtcattct 54505823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 36012322 - 36012244
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag 132  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36012322 tgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaggtgtattcttgttcatctgatgaattgatgatattatgag 36012244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 39282889 - 39282844
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39282889 caaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 39282844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 46297701 - 46297746
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46297701 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 46297746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 48355178 - 48355133
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48355178 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 48355133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 63
Target Start/End: Original strand, 52040861 - 52040905
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 63  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52040861 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 52040905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 162
Target Start/End: Original strand, 53811696 - 53811767
Alignment:
Q  97 agtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg------actgaacttttgatgccaccgtacaaaca 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53811696 agtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggttatatactgaacttttgatgccactgtacaaaca 53811767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 1089877 - 1089811
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||| |||| ||||||| |||||||    
T  1089877 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatttaatgtagtcctgttgatctgataaattgat 1089811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 61
Target Start/End: Original strand, 46994600 - 46994642
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 61  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46994600 caaacataattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 46994642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 3362492 - 3362447
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3362492 caaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactt 3362447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 20373183 - 20373228
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20373183 caaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactt 20373228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 64
Target Start/End: Original strand, 21009749 - 21009786
Alignment:
Q  27 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21009749 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 21009786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 34133172 - 34133127
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34133172 caaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 34133127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 64
Target Start/End: Original strand, 42506022 - 42506059
Alignment:
Q  27 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42506022 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 42506059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 59
Target Start/End: Original strand, 4761587 - 4761627
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 59  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4761587 caaatatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 4761627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 64
Target Start/End: Original strand, 27480310 - 27480350
Alignment:
Q  24 atagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27480310 atagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactt 27480350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 37157935 - 37157899
Alignment:
Q  28 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37157935 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 37157899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 37203295 - 37203259
Alignment:
Q  28 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37203295 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 37203259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 203 - 250
Target Start/End: Original strand, 40640637 - 40640684
Alignment:
Q  203 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  40640637 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 40640684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 44891735 - 44891689
Alignment:
Q  18 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44891735 acaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 44891689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 47481752 - 47481714
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47481752 agtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 47481714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 54506033 - 54505999
Alignment:
Q  30 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54506033 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 54505999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 2008169 - 2008124
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2008169 caaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 2008124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 11467061 - 11467016
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11467061 caaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 11467016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 26941199 - 26941244
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26941199 caaacagagttgatgatattatatgatagttttaagtgttacactt 26941244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 1089924 - 1089886
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1089924 agttgttgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactt 1089886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Original strand, 7327428 - 7327466
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7327428 agttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 7327466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Original strand, 11357096 - 11357134
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  11357096 agttgatgatattatatgatagtcttgagtgttacactt 11357134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Original strand, 11835573 - 11835611
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11835573 agttgatgatatcatgtgatagtcttaattgttacactt 11835611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 53176284 - 53176246
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53176284 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 53176246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 184 - 250
Target Start/End: Original strand, 55343405 - 55343471
Alignment:
Q  184 ttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||| || || |||||||||||    
T  55343405 ttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcctt 55343471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 247
Target Start/End: Original strand, 11835702 - 11835790
Alignment:
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttc 247  Q
    |||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||     ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| || || ||||||||    
T  11835702 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgata-----gtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttc 11835790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 25579976 - 25579931
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  25579976 caaacagagttgctgatatcatgtaatagtcttaagtgttacactt 25579931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 38591926 - 38591897
Alignment:
Q  28 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38591926 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 38591897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 83)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14758274 - 14758053
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa--------gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||        |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14758274 caaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaatttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatct 14758175  T
Q  111 gatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc 210  Q
     |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  14758174 aatgaattgatgaaactatggggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagttgtgtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcacc 14758075  T
Q  211 agaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14758074 agaaaagtcattctcatgactt 14758053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15168286 - 15168083
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15168286 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaactgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccacc 15168187  T
Q  154 gt-------acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 246  Q
    ||       |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| || || |||||||    
T  15168186 gtacaacgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaagcattctcatcacttcacgatagaatttt 15168087  T
Q  247 cctt 250  Q
    ||||    
T  15168086 cctt 15168083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 250
Target Start/End: Original strand, 11742309 - 11742532
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgata 125  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11742309 agttgctgatatcatgtgatagtcttaattgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgata 11742408  T
Q  126 ctatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctc 225  Q
     |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11742409 ttatg-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttacttacaacacttttgataatatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctc 11742507  T
Q  226 atgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    || |||| || ||  ||||||||||    
T  11742508 ataacttcacgataaaattttcctt 11742532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 60 - 232
Target Start/End: Original strand, 31621545 - 31621717
Alignment:
Q  60 cacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaa 159  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  31621545 cacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaatttttgatgccaccgtacaa 31621644  T
Q  160 acagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    | || ||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31621645 atagcggggtgctactcaatacacctttgatgttatagtgttgacttcactagaaaagtcattctcatgactt 31621717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 54 - 246
Target Start/End: Original strand, 33725586 - 33725778
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33725586 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 33725685  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 246  Q
      | ||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||| || || |||||||    
T  33725686 aaagaaatagtgggctgctactcaatacacttttgatgatatagcgttgacttcactagaaaagtcattctcttgactttaccatagaatttt 33725778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 57 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16415833 - 16415639
Alignment:
Q  57 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 156  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  16415833 ttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactatgatggctgaacttttgatgccactgta 16415734  T
Q  157 caaaca-gtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    ||||||  | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||    
T  16415733 caaacatttagggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccttagaattttcctt 16415639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 55 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 47279378 - 47279201
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  47279378 tgttacaattaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttcgatgccactg 47279279  T
Q  155 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||| |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  47279278 tacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatagtataatgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgactt 47279201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15752219 - 15752027
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15752219 gtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt 15752120  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 246  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||| | |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  15752119 gtacaaacagtgaggtgttactcactatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 15752027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 55 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40885002 - 40884841
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  40885002 tgttacacttaaaacaagataggataaaactagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgaagatactatagggactgaacttttgatgccaccg 40884903  T
Q  155 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaa 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||    
T  40884902 tacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatggtgttgacttcaccagaaaa 40884841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4330471 - 4330291
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  4330471 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatcccact 4330372  T
Q  154 gtacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcga-cttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  4330371 gtacaaacattgggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgtttatcttcatcagaaaagtcattctcataactt 4330291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2959937 - 2959743
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  2959937 tgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgacactatgaggactgaacttttgatgtcactg 2959838  T
Q  155 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    ||||||||||||| ||  ||| |||||| |||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||    
T  2959837 tacaaacagtgggatgttacttactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcct 2959743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38823404 - 38823210
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||     
T  38823404 gtgttacacttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgacact 38823305  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    ||||||| |||||||||  |||| | ||| ||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  38823304 gtacaaatagtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaacttaaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 38823210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Original strand, 10181994 - 10182189
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10181994 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgccact 10182093  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    ||||||||||||| |||  || ||||| | |||| ||  || ||| |  ||||||||| |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||    
T  10182094 gtacaaacagtggcgtgttacgcactatattttttatgttacagttttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcct 10182189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 27532967 - 27533144
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||     
T  27532967 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt-gattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccact 27533065  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||||| |||||| ||  || ||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27533066 gtacaaagagtgggttgttacccacaatacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataactt 27533144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 48620827 - 48620631
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||     
T  48620827 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcact 48620728  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  |||| |||  ||||||| |||||||||||| | || |||| |  || |||||||||||    
T  48620727 gtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatattgttaacttcacaagaaaagtcattttaataacttcaacatagaattttcctt 48620631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3309338 - 3309144
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 152  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  3309338 gtgttacatttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagattgaacttttgataccac 3309239  T
Q  153 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
     ||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  3309238 tgtacaaacagt-gggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttaccagaaaagtcattctcatgactttaccatagaattttcc 3309144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 170
Target Start/End: Original strand, 27227471 - 27227587
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27227471 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccact 27227570  T
Q  154 gtacaaacagtggggtg 170  Q
    |||||||||||| ||||    
T  27227571 gtacaaacagtgaggtg 27227587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Original strand, 34012363 - 34012559
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  34012363 gtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccact 34012462  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
     |||||||||||| |||  |||||||||| | |||||  ||||||||  |||||| || ||| |||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  34012463 ttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttatagtgttaacttcatcataaacgtcattttcatgacttcaccatagaattttcctt 34012559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 27267186 - 27267361
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||     
T  27267186 gtgttacactcaaaacaaggtagattaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttaatgccact 27267284  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |  ||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27267285 gtacaaacagtggggtgtcactcactacattttttatgc--tagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgactt 27267361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 57 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 42721226 - 42721035
Alignment:
Q  57 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 156  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  || |||    
T  42721226 ttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgttactgta 42721127  T
Q  157 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    ||||||||||||||  |||||||| | |||| ||  ||||| |   ||||||||| |||| ||||| ||||||||| || || |||||||||    
T  42721126 caaacagtggggtgttactcactatattttttatgatatagggctaacttcaccaaaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttcc 42721035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15383123 - 15382927
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||      
T  15383123 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactacgatgactgaacttttgatgacatt 15383024  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    |||||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  | ||||||| |||||||||| | || |||| || || |||||||||||    
T  15383023 gtacaaacggtgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaatttcaccaaaaaagtcatttttataacttcaccatagaattttcctt 15382927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 7079049 - 7079238
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||      
T  7079049 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcatt 7079148  T
Q  154 gtacaaac-----------agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||||||           |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  7079149 gtacaaacagtgaggtgttagtggggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattatcatgactt 7079238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 229
Target Start/End: Original strand, 9903040 - 9903215
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||     
T  9903040 gtgttacacttgaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatagtatgtggattgaacttttgatgtcact 9903139  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatga 229  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  |||||| || |||||||||| ||||||    
T  9903140 gtacaaacagcggggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattttcatga 9903215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18422841 - 18422646
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||      
T  18422841 gtgttacgcatataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcatt 18422742  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    |||||||| ||||||||  ||||  || | |||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||| || || ||||||||||    
T  18422741 gtacaaacggtggggtgttactcgttatatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttcct 18422646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32216245 - 32216088
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||      
T  32216245 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatttgattaagtttagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgacgccatt 32216146  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacca 211  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||  ||||||||  |||||||||    
T  32216145 gtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 32216088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 53 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 32267225 - 32267028
Alignment:
Q  53 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 152  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||     
T  32267225 agtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgggttgatgataatatgaggagtgaacttttgatgtcat 32267126  T
Q  153 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
     |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  |||| |||  ||||||| | |||||||||||| ||||||| || ||  ||||||||||    
T  32267125 tgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatattgttaacttcacaaaaaaagtcattcttatgacttcaccataaaattttcctt 32267028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 53 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41926354 - 41926161
Alignment:
Q  53 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 152  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  41926354 agtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttgtgatgccac 41926255  T
Q  153 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 246  Q
     |||||||||||||| |   |||||||| | |||||||  |||||| |  |||||| || |||| ||||| |||| |||| || || |||||||    
T  41926254 tgtacaaacagtgggatattactcactatatttttgatgttatagtattaacttcatcaaaaaaatcattttcataacttcaccatagaatttt 41926161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3535122 - 3534926
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||| |||     
T  3535122 gtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgataatattaaggggactgaacttttgatgtcact 3535023  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    | |||||||||  ||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||| | ||||| ||||||| | ||| |||||||||||    
T  3535022 gcacaaacagtaaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaattaattctaatgacttcataatagaattttcctt 3534926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 39393573 - 39393377
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||     
T  39393573 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagatgaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattaaacttttgatgccact 39393474  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    ||||||||| ||  ||   |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||    
T  39393473 gtacaaacaatgaagtattactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcattagaaaagtcattctcataacttcaccgtagaattttcctt 39393377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 1547469 - 1547281
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  1547469 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatga--------tactatgagaactgaacttttgatgccact 1547378  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    | ||||||||||| |||  |||||| ||| |||| ||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  1547377 gcacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 1547281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10922917 - 10922742
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||      
T  10922917 gtgttacccttataacaaggtatgataaaataagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcatt 10922818  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatga 229  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10922817 gtacaaacagtggggtcttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatga 10922742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 246
Target Start/End: Original strand, 238499 - 238690
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||      
T  238499 gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgattaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcatt 238598  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 246  Q
    ||||||||||| || ||  |||||| ||| |||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| ||| || |||||| || || |||||||    
T  238599 gtacaaacagt-ggatgttactcacaacatttttaatactatagtgttaacttcaccaaaaaagttattttcgtgacttcactatagaatttt 238690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 47682480 - 47682657
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  47682480 gtgttacacttaaaacaaggcagaataaaattagtttaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggaatgaacttttgataccact 47682579  T
Q  154 gtacaaacagtggg-gtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    |||||| ||||||| |||  |||||| ||| |||| || |  ||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  47682580 gtacaagcagtgggagtgttactcacaacattttttatgc--tagtgttaacttcaccaaaaaagtcactctcatgactt 47682657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Original strand, 30326938 - 30327132
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |      
T  30326938 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgctatt 30327037  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    |||||||| || ||||   ||||| |||| |||||||  ||||||||  | ||||| | |||||||||| | ||||||| || || |||||||||    
T  30327038 gtacaaacggttgggtattactcattacatttttgatgttatagtgttaaattcacaaaaaaagtcatttttatgacttcactatagaattttcc 30327132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 25160822 - 25160710
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  25160822 gtgttacacttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttattaatctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt 25160723  T
Q  154 gtacaaacagtgg 166  Q
    |||||||| ||||    
T  25160722 gtacaaacggtgg 25160710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Original strand, 19899755 - 19899950
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||      
T  19899755 gtgttacgcttagaacaatgtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggttgaacttttgatgccatt 19899854  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
     ||||||||||| ||||  ||||  |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||| | ||||||| || || ||||||||||    
T  19899855 ctacaaacagtgaggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattattatgacttcaccatagaattttcct 19899950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30254605 - 30254419
Alignment:
Q  62 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 161  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  30254605 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtctagtcttgttaatctgatgaattgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 30254506  T
Q  162 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    ||| | ||   ||||| |||| |||||||  |||| |||  |||||| || |||||||||||| || |||| || || ||||||||||    
T  30254505 agt-gtgtattactcattacatttttgatgttatattgttaacttcaacaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaattttcct 30254419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 232
Target Start/End: Original strand, 28564775 - 28564945
Alignment:
Q  62 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 161  Q
    |||| ||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  28564775 cttataacaaggcatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaac 28564874  T
Q  162 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    |||  ||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||| || |||| ||||| |||| ||||    
T  28564875 agtaaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaaatcattttcataactt 28564945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 250
Target Start/End: Original strand, 37618886 - 37619078
Alignment:
Q  62 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg--atactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaa 159  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||    
T  37618886 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtattgttaatctgatgaattgatgatatactatgagaactgaacttttgatgtcattttacaa 37618985  T
Q  160 acagtggggtg--ccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    |||||||||||    ||||| || | |||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||| || |||| || || |||||||||||    
T  37618986 acagtggggtgttttactcattaaatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaattttcctt 37619078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21289816 - 21289661
Alignment:
Q  100 cttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacactt-------ttgatac 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||       || ||      
T  21289816 cttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacattttttattatttatga 21289717  T
Q  193 tatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  21289716 tatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcacaatagatttttcc 21289661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8222318 - 8222123
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  8222318 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccatt 8222219  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaa 252  Q
    ||   ||| ||| ||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||| | ||| |||||| | ||||||| ||  | |||||||||||||    
T  8222218 gt---aacggtgtggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaggtcatttttatgacttcaccgtagaattttccttaa 8222123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37451475 - 37451298
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||      
T  37451475 gtgttacacttataacaaggtcagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgataaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcatt 37451377  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    |||||||| || |||||  ||| | |||| |||||||  ||||||||  |||| |||| |||||||||| | |||||||    
T  37451376 gtacaaacggtagggtgttacttattacatttttgatgttatagtgttaactttaccaaaaaagtcatttttatgactt 37451298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 51129049 - 51128884
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||      
T  51129049 gtgttacacttataacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcatt 51128950  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtc 219  Q
    |||||||| |||| |||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||| | |||||||    
T  51128949 gtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtc 51128884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28769842 - 28769651
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||  ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||      
T  28769842 gtgttacgtttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggaccgaacctttgatgccatt 28769743  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 246  Q
    |||||||| || |||||  ||||| |||| |||||||   |||||||  ||||||| | |||||| ||| | ||||||| || || |||||||    
T  28769742 gtacaaacggt-gggtgttactcattacatttttgatgtcatagtgttaacttcacaaaaaaagttatttttatgacttcaccatagaatttt 28769651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 180
Target Start/End: Original strand, 27563898 - 27564017
Alignment:
Q  61 acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaa 160  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||  | ||||||||||||||| |||  ||||||    
T  27563898 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatcggaactgaacttttgatgtcactatacaaa 27563997  T
Q  161 cagtggggtgccactcacta 180  Q
    |||||| |||  ||||||||    
T  27563998 cagtggagtgttactcacta 27564017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23999529 - 23999359
Alignment:
Q  62 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 161  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||     
T  23999529 cttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaat 23999430  T
Q  162 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    |||||||||  ||||  || | |||| ||  | ||||||  ||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  23999429 agtggggtgttactcgttatattttttatgttgtagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgactt 23999359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 46931588 - 46931446
Alignment:
Q  67 aacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgg 166  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    ||||||||||||    
T  46931588 aacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatattatgagggctgaatttttgatgccgttctacaaacagtgg 46931489  T
Q  167 ggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 209  Q
    |||   ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||||    
T  46931488 ggtattactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 46931446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 148
Target Start/End: Original strand, 27763297 - 27763391
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 148  Q
    ||||||| |||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27763297 gtgttacgcttagaactaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatactatgagggctggacttttgatg 27763391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 614 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 26973235 - 26973139
Alignment:
Q  614 ttcacaagtaccttccaaagggtgtgtcttactatgatatgttgagaaaaagcaagttctgtctttgtcctagtgggtacgaggttgcaagtccaag 710  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  26973235 ttcaaaagtatcttccaaagggtgtttcttactatgaaatgctgagaaagagcaagttctgtctctgtcctagtggttatgaggtggctagtccaag 26973139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 22170901 - 22170807
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 148  Q
    |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  22170901 gtgttacatttgaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtgttattaatctaatgaattgatgatattatgtagactgaacttttgatg 22170807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 64
Target Start/End: Original strand, 238446 - 238492
Alignment:
Q  18 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  238446 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 238492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 30326886 - 30326931
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30326886 caaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactt 30326931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 37451527 - 37451482
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37451527 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 37451482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 40885055 - 40885010
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40885055 caaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactt 40885010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 47682428 - 47682473
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47682428 caaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactt 47682473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 2959990 - 2959948
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 61  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2959990 caaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 2959948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 15383172 - 15383130
Alignment:
Q  22 acatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15383172 acatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactt 15383130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 23999582 - 23999544
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23999582 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 23999544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 46931644 - 46931606
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46931644 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 46931606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 1359869 - 1359914
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1359869 caaacatagttgatgatattatatgataatcttaagtgttacactt 1359914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 8222370 - 8222325
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8222370 caaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactt 8222325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 10922969 - 10922924
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10922969 caaacagagttgatgatattatgtgacagtcttaagtgttacactt 10922924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 15168338 - 15168293
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15168338 caaacatagttgatgatattatgcgatagccttaagtgttacactt 15168293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 22170953 - 22170908
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22170953 caaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 22170908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 32216297 - 32216252
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32216297 caaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 32216252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 47279431 - 47279386
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47279431 caaacatagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 47279386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 38759723 - 38759610
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga----ctgaacttttgatgc 149  Q
    ||||||||||||||| ||| || | |||||||| ||||| || ||| || ||||| |||||||||||||||| || || ||    ||||||||||||||     
T  38759723 gtgttacacttaaaataagatatgataaaattaaattaaatgtagttttattaatatgatgaattgatgatattacgaagactggctgaacttttgatgt 38759624  T
Q  150 caccgtacaaacag 163  Q
    ||| ||||||||||    
T  38759623 cactgtacaaacag 38759610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 4330516 - 4330481
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4330516 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 4330481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 18422883 - 18422848
Alignment:
Q  29 tgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18422883 tgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 18422848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 58
Target Start/End: Original strand, 27227419 - 27227458
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtt 58  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27227419 caaacatagttgatgatatcatgtgatagtcttaagtgtt 27227458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 58
Target Start/End: Original strand, 27267134 - 27267173
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtt 58  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27267134 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtt 27267173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Original strand, 19899710 - 19899748
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19899710 agttggtgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 19899748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 15752271 - 15752226
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15752271 caaacagagttaatgatattatgtgatactcttaagtgttacactt 15752226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 30254665 - 30254620
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30254665 caaacagagttgatgttattatgtgacagtcttaagtgttacactt 30254620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 38759775 - 38759730
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  38759775 caaacatagttggtgatattatctgatagtctcaagtgttacactt 38759730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 38823456 - 38823411
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38823456 caaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 38823411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 250
Target Start/End: Original strand, 4150489 - 4150537
Alignment:
Q  202 gacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  4150489 gacttcaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcctt 4150537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 16415888 - 16415852
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 55  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16415888 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 16415852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 25160874 - 25160834
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 59  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25160874 caaacaaagttgatgatattatgtgatagttttaagtgtta 25160834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 3309396 - 3309349
Alignment:
Q  18 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactta 65  Q
    ||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  3309396 acaaacagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacactta 3309349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 57
Target Start/End: Original strand, 31621488 - 31621526
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 57  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  31621488 caaacatagttgttgatattatgcgatagtcttaagtgt 31621526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 53
Target Start/End: Original strand, 33725534 - 33725568
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33725534 caaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaa 33725568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 43579287 - 43579242
Alignment:
Q  203 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  43579287 acttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 43579242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 147; Significance: 4e-77; HSPs: 79)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 248
Target Start/End: Original strand, 14409270 - 14409501
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt---tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409270 caaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagagtagttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 14409369  T
Q  116 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaa 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  14409370 attgatgatactatga-gactgaacttttgatgccaccgtattaagagtggggtgctactcactacatttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaa 14409468  T
Q  216 agtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    | ||||||||||||||| || || |||||||||    
T  14409469 aatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 14409501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33908427 - 33908249
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33908427 gtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgaataattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 33908328  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33908327 gtacaaacagtggagtgctactcactacacttttgatgatatagtgttgacttcaccagaaagttcattctcatgactt 33908249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 249
Target Start/End: Original strand, 1429098 - 1429321
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgata 125  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1429098 agtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatttgatgaattgatgata 1429197  T
Q  126 ctatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctc 225  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| | ||||||| |||||||||  ||||||||| || ||||||| ||    
T  1429198 ctatggagactgaatttttgatgccagtgtacaaacagtggggtgttactcactatatttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaagagtcattttc 1429297  T
Q  226 atgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    ||||||| || || || |||||||    
T  1429298 atgacttcaccatagatttttcct 1429321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24886333 - 24886100
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaatt 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  24886333 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgagtt 24886234  T
Q  119 gatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc--agaaaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  |||||| |  ||||||||  | ||||    
T  24886233 gatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaaa 24886134  T
Q  217 gtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    ||||||||||||| || || ||  ||||||||||    
T  24886133 gtcattctcatgatttcaccataaaattttcctt 24886100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Original strand, 31786627 - 31786821
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  31786627 gtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccact 31786726  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    |||||||||||||||     ||||||||| |||| || |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||| || || |||||||||    
T  31786727 gtacaaacagtggggcagtgctcactacatttttcatgctatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcactacttcactatagaattttcc 31786821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22980987 - 22980809
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||      
T  22980987 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcatt 22980888  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    |  |||||||||||||   |||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22980887 gctcaaacagtggggtattactcactgtatttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataactt 22980809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26268268 - 26268090
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  26268268 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaatttgattaattgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgtcacc 26268169  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26268168 gtacaaacagtggggtgttactcaaaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgactt 26268090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19120053 - 19119857
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||     
T  19120053 gtgttatacttaaaacaaggtaggataaaattagagtaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgacactatggggactgaacttttgatgtcact 19119954  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    |||||||||||||||||  |||  | ||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  19119953 gtacaaacagtggggtgttactagcaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccacaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 19119857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 53 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 699345 - 699166
Alignment:
Q  53 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 152  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  699345 agtgttacacttaaaataaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgtcac 699246  T
Q  153 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
     |||||||||||||||||  |||||||| | |||| || |||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  699245 tgtacaaacagtggggtgttactcactagattttttatgctatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcataactt 699166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8466972 - 8466739
Alignment:
Q  20 aaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattg 119  Q
    ||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  8466972 aaacagagttggtgatatcatatgatagtcttaagtgttacatttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattg 8466873  T
Q  120 atgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtc 219  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||||||  | |||| |||||||||||  || |||||  |||||||||||||||||    
T  8466872 atgatactatggggattgaacttttgataccactgtacaaagag-ggggtgttattcacaacacttttgatgttacagtgttaacttcaccagaaaagtc 8466774  T
Q  220 attctcatgacttgacaatggaattttccttaatt 254  Q
    ||||||||||| | |  || |||||||||||||||    
T  8466773 attctcatgacctcatcatagaattttccttaatt 8466739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 30969305 - 30969483
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  30969305 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 30969404  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  30969405 gtataaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagataaatcattctcatgactt 30969483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Original strand, 8741867 - 8742064
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||      
T  8741867 gtgttacacttaaaacaaggtatgacaaaattagattaattgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccatt 8741966  T
Q  154 gtacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    ||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  8741967 gtacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 8742064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7693424 - 7693230
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | | || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  7693424 gtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcatgttaatctaatgaattgatgatactaagaggattgaacttttgatgccact 7693325  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| || || |||||||||    
T  7693324 gtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttaatgacttcaccatagaattttcc 7693230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27330498 - 27330299
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  27330498 gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccatt 27330399  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 253  Q
    |||||||||||  ||||  |||||  |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||    
T  27330398 gtacaaacagtaaggtgttactca--acacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattttccttaat 27330301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39573012 - 39572818
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  39573012 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactg 39572913  T
Q  155 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
     ||||||||||| |||  |||||| ||| |||| ||| |||||| |  |||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  39572912 cacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatattatagtattaacttaactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 39572818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5837746 - 5837574
Alignment:
Q  57 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 156  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| |||    
T  5837746 ttacacttaaaacaatgtaggattaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatggagactgaaattttgatgtcactgta 5837647  T
Q  157 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatga 229  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  5837646 caaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaccttcaccagaaaagtcattctcatga 5837574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 246
Target Start/End: Original strand, 25500907 - 25501099
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||      
T  25500907 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggacttaacttttgatggcagt 25501006  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 246  Q
    |||||||||||| ||||  | |||| ||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  25501007 gtacaaacagtgaggtgttattcacaacacttttgatgctatagtgttaactttaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 25501099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Original strand, 38528218 - 38528413
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  38528218 gtgttacacttgaaacaaggtaagataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-gactgaacttttgatgtcact 38528316  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    ||| ||||| |||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||| |||||||  |||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  38528317 gtataaacaatggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaaaccattttcatgacttcaccatagaattttcctt 38528413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9200426 - 9200232
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |    
T  9200426 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaagaggactaaacttttgatgtcactg 9200327  T
Q  155 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||| ||| | ||||||| || ||  |||||||||    
T  9200326 tacaaactgtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagttattttaatgacttcaccataaaattttcct 9200232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36866956 - 36866762
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||      
T  36866956 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatcgggactgaacttttgatgccatt 36866857  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    |||||||||||||||||  |||||| | | |||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| || |||||| || || |||||||||    
T  36866856 gtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 36866762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 40133579 - 40133385
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||      
T  40133579 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatattatggggactgaacttttgatgccatt 40133480  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| || |||||| || || |||||||||    
T  40133479 gtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatactataatgttaacttcaccacaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 40133385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12910549 - 12910348
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcc--- 150  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |       
T  12910549 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcatgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgtcact 12910450  T
Q  151 --accgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
      || |||||||||||||||||  || ||||| | |||||||  |||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||||||| || || |||||||||    
T  12910449 gtactgtacaaacagtggggtgttacgcactatatttttgatgttatagttttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcc 12910350  T
Q  249 tt 250  Q
    ||    
T  12910349 tt 12910348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 32563342 - 32563150
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| |    
T  32563342 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgtcactg 32563243  T
Q  155 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttc 247  Q
    |||| ||||||| |||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||| ||||| | ||||||| || || ||||||||    
T  32563242 tacagacagtggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaaatcattttaatgacttcaccatagaattttc 32563150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Original strand, 23116203 - 23116397
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||     
T  23116203 gtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatattgttaatctgatgaattgatgatactatgtaaactgaacttttgattccact 23116302  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||| |||  ||||||  | |||||||||| ||||||| | || || |||||||||    
T  23116303 gtacaaacagtggggtgctactcactacagttttgatgttataatgttaacttcataaaaaaagtcattttcatgacgtcaccatagaattttcc 23116397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 57 - 250
Target Start/End: Original strand, 5112297 - 5112490
Alignment:
Q  57 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 156  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  5112297 ttacacttaaaacatggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgta 5112396  T
Q  157 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    ||||||||||||||  |||||||| | |||| ||  |||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||    
T  5112397 caaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccataaaattttcctt 5112490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22019826 - 22019656
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||     
T  22019826 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaagtgatgatactaaggggacttaacttttgatgtcact 22019727  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattct 224  Q
     |||||||| |||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  22019726 atacaaacaatggggtgttactcacaacacttttgattctatagttttaacttcaccagaaaagtcattct 22019656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 27318468 - 27318646
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||      
T  27318468 gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactgtgagaactaaacttttgatgtcatt 27318567  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||  | ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27318568 gtacaaacagtggtgtgttactcactacattttttatgttttagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgactt 27318646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 36860618 - 36860420
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaa-ggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 152  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  36860618 gtgttacacttaaaaaaaaggtaggataaaattagattaaatgtactcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcat 36860519  T
Q  153 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 251  Q
     |||||||||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || |||||| || || ||||||||||||    
T  36860518 tgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttatactatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattttcctta 36860420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 35511458 - 35511636
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||     
T  35511458 gtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattggtgatagtatgatgactgaacttttgatgtcact 35511557  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
     |||||||||||| |||  |||||||||| | |||||  |||| |||  |||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  35511558 ttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttataatgttaacttcatcagaaacgtcattttcatgactt 35511636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 180
Target Start/End: Original strand, 23954770 - 23954897
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac- 152  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||     
T  23954770 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggaaactgaacttttgatgccact 23954869  T
Q  153 cgtacaaacagtggggtgccactcacta 180  Q
     ||| |||||||||||||  ||||||||    
T  23954870 agtaaaaacagtggggtgttactcacta 23954897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Original strand, 22974063 - 22974259
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||  |      
T  22974063 gtgttacgcttataacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgataatatgagaattgaacttttgatgttatt 22974162  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||  |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||| || || |||||||||||    
T  22974163 gtacaaacagtgggatgttactcattacttttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataacttcaccatagaattttcctt 22974259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 247
Target Start/End: Original strand, 31705594 - 31705785
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    |||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||  |    
T  31705594 tgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactggacttttgatgtcattg 31705692  T
Q  155 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttc 247  Q
    ||||||| || |||||  ||||  |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||| | ||||||| || || ||||||||    
T  31705693 tacaaacggtagggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaattttc 31705785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 190
Target Start/End: Original strand, 6824460 - 6824598
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactga--acttttgatgcca 151  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||    
T  6824460 gtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaattgatgatactatgaagactgaacacttttgatgtca 6824559  T
Q  152 ccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgat 190  Q
    | ||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||    
T  6824560 ctgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgat 6824598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 21088748 - 21088887
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || | |||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  |    
T  21088748 tgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaaatgtattcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattg 21088847  T
Q  155 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatacta 194  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||    
T  21088848 tacaaacagtggggtgtcactcacaacattttttatacta 21088887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22255376 - 22255197
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||      
T  22255376 gtgttacgcttataacaaaataggctaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgataatatgagaactgaacttttgatgccatt 22255277  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactaca-cttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| ||||  |||||||  |||| |||  ||||||||| |||||| ||| | |||||||    
T  22255276 gtacaaacggtggggtgttactcattacattttttgatgttataatgttaacttcaccaaaaaagttatttttatgactt 22255197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15724682 - 15724490
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||| |||||||| |||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||      
T  15724682 gtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcatt 15724585  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    ||| |||||||||||||  |||||| | |||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| || || |||||||||    
T  15724584 gtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttcc 15724490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 250
Target Start/End: Original strand, 35826464 - 35826660
Alignment:
Q  53 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 152  Q
    |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||  || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35826464 agtgttacgcttaaaacaatgtagaataaaattagattaaatgtggtattgttaatct-atgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcac 35826562  T
Q  153 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
     ||||||||| ||  |||  ||||| |||| |||||||  |||||| |  ||||||| | |||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  35826563 tgtacaaacaatgaagtgttactcagtacatttttgatgttatagtattaacttcacaaaaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcctt 35826660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 35934090 - 35933901
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaat-tagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 152  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  35934090 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaactagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactggacttttgatgccac 35933991  T
Q  153 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
      ||     |||| ||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| || |||| ||||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  35933990 --ta-----agtgaggtgttactcacaacacttttgattctatagtgttaacttcatcaaaaaaatcattctcatgacttcaccatacaattttcct 35933901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 169
Target Start/End: Original strand, 15992521 - 15992636
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  15992521 gtgttgcactcaaatcaaggtagaataaaattagatcaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcact 15992620  T
Q  154 gtacaaacagtggggt 169  Q
    ||||||||||||||||    
T  15992621 gtacaaacagtggggt 15992636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 209
Target Start/End: Original strand, 28416508 - 28416663
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||||||| ||||     
T  28416508 gtgttacacttaaaataaggcagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggagattgaacttttgattccact 28416607  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 209  Q
    |||||||||||||| ||  |||||| | |||||||||| ||||||||  |||||||    
T  28416608 gtacaaacagtgggatgttactcacaatacttttgatattatagtgttaacttcac 28416663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Original strand, 14919509 - 14919706
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  14919509 gtgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 14919608  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttca-ccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
     || |||||||| ||||  ||||| |||| |||||||  |||| |||  |||||| | | |||| | ||||||||||||| || ||  ||||||||||    
T  14919609 atataaacagtgaggtgttactcattacatttttgatgttataatgttaacttcatcaaaaaaaataattctcatgacttcaccatataattttcctt 14919706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 167
Target Start/End: Original strand, 43308633 - 43308746
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  43308633 gtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagtatagttttgttaagctgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt 43308732  T
Q  154 gtacaaacagtggg 167  Q
    |||| |||||||||    
T  43308733 gtacgaacagtggg 43308746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 170
Target Start/End: Original strand, 7208845 - 7208960
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||      
T  7208845 gtgttacgtttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcaat 7208943  T
Q  154 gtacaaacagtggggtg 170  Q
    |||||||| || |||||    
T  7208944 gtacaaacggtagggtg 7208960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8437152 - 8436965
Alignment:
Q  61 acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaa 160  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||   ||| |||| |||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  8437152 acttaaaacaaggcaggataaaattagattaagcatagttttgtaaatctgatgg-ttgatgatataatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaa 8437054  T
Q  161 cagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    || |||| ||  |||||||||||||| ||  |||||||||  | ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||||| ||||    
T  8437053 caatgggatgttactcactacactttggaagctatagtgttaatttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcacattagaattgtcct 8436965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25668798 - 25668707
Alignment:
Q  99 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgat 190  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  25668798 tcttgttaatctaatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgttcaaacagtggggtgttactcacaacacttttgat 25668707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 35504559 - 35504443
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| || | |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| || |    
T  35504559 gtgttacgcttataatatggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgattgaacttttgatgtcatc 35504460  T
Q  154 gtacaaacagtggggtg 170  Q
     ||||||| ||| ||||    
T  35504459 atacaaacggtgaggtg 35504443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11898139 - 11898018
Alignment:
Q  111 gatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||| |||||  ||||| | |||||||||| ||||| | |  |||| |||    
T  11898139 gatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcactgtacaactagtagggtgttactcagtgcacttttgatgctataatattaactttacc 11898040  T
Q  211 agaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    |||||||| ||| |||||||||    
T  11898039 agaaaagttattatcatgactt 11898018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 209
Target Start/End: Original strand, 17158012 - 17158166
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||| || |||||| | || ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||| ||      
T  17158012 gtgttacacttataataaggtaagatacaattatactaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactataatgac-gaacttttgatgtcatt 17158110  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcac 209  Q
    |||||||| |||| |||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  |||||||    
T  17158111 gtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcac 17158166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 42342921 - 42342851
Alignment:
Q  57 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta 128  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342921 ttacacttaaaacaag-taagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta 42342851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 126
Target Start/End: Original strand, 13956343 - 13956415
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatac 126  Q
    ||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13956343 gtgttacacttgaaacaagataaaataaaattagattaagtgaagttttgttaatctgatgaattgatgatac 13956415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 64
Target Start/End: Original strand, 21088694 - 21088740
Alignment:
Q  18 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21088694 acaaacatagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactt 21088740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 36860671 - 36860625
Alignment:
Q  18 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36860671 acaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactt 36860625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 36867009 - 36866963
Alignment:
Q  18 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36867009 acaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactt 36866963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 40133632 - 40133586
Alignment:
Q  18 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40133632 acaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactt 40133586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 255
Target Start/End: Original strand, 13956426 - 13956527
Alignment:
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 253  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||  |||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  13956426 gtacaaacagtgaggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatgagaaaagtcattttcatgacttcaccgtagaattttccttaat 13956525  T
Q  254 ta 255  Q
    ||    
T  13956526 ta 13956527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 27318416 - 27318461
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27318416 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 27318461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 61
Target Start/End: Original strand, 23954718 - 23954760
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 61  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23954718 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 23954760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 33908480 - 33908434
Alignment:
Q  18 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33908480 acaaacatagttgacgatattatgcgatagtcttaagtgttacactt 33908434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 2888374 - 2888419
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2888374 caaacatatttgatgatattatctgatagtcttaagtgttacactt 2888419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5830086 - 5829962
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||      
T  5830086 gtgttacgcttataacaaggtaagataaaatgagattaagtgtagtcttgttaat---------tgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcatt 5829996  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacactttt 187  Q
    |||||||| || |||||  ||||| |||| ||||    
T  5829995 gtacaaacggtagggtgttactcattacattttt 5829962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 5830138 - 5830093
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5830138 caaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactt 5830093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 22255428 - 22255383
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22255428 caaacatagttgatgatattatgtaatagttttaagtgttacactt 22255383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 26268320 - 26268275
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26268320 caaacatagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 26268275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 699396 - 699360
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 55  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  699396 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 699360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 22981039 - 22980997
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 61  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22981039 caaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 22980997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 25669781 - 25669739
Alignment:
Q  53 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtg 95  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25669781 agtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtg 25669739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 61
Target Start/End: Original strand, 31705541 - 31705583
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 61  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31705541 caaacagagttgatgatattatgtgatggtcttaagtgttaca 31705583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 7208793 - 7208838
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7208793 caaacagagttgaaaatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 7208838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 17157960 - 17158005
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17157960 caaacagagttgataatattatgtgatggtcttaagtgttacactt 17158005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 35504611 - 35504566
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35504611 caaacagatttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 35504566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 55
Target Start/End: Original strand, 14919457 - 14919493
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 55  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14919457 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 14919493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 248
Target Start/End: Original strand, 16004476 - 16004552
Alignment:
Q  173 actcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtc-attctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    |||||| ||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||    
T  16004476 actcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcaattctcatgactttaccatagaattttcc 16004552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 35934141 - 35934097
Alignment:
Q  20 aaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35934141 aaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 35934097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 8437211 - 8437168
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 62  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8437211 caaacagagttgatcatattatgtgataatcttaagtgttacac 8437168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22616539 - 22616492
Alignment:
Q  203 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  22616539 acttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcctt 22616492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 5837794 - 5837756
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5837794 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 5837756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 19120098 - 19120060
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19120098 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 19120060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 61
Target Start/End: Original strand, 22974011 - 22974053
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 61  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22974011 caaacagagttgataatattatgtaatagtcttaagtgttaca 22974053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 60
Target Start/End: Original strand, 13956291 - 13956332
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 60  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13956291 caaacaaatttgatgatattatatgatagtcttaagtgttac 13956332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 142; Significance: 4e-74; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 7235025 - 7235225
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  7235025 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatgag-actgaacttttgatggcacc 7235123  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 253  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || || ||||||||| ||||    
T  7235124 gtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccggaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttccataat 7235223  T
Q  254 ta 255  Q
    ||    
T  7235224 ta 7235225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33619071 - 33618850
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaa-------acaa-ggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  |       |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33619071 caaacatagttgatgatattatgcgatactcttaagtgtcacacttctagggtgttacactggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatct 33618972  T
Q  111 gatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  33618971 gatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccaccgtacaaataatgggttgctactcactacacttttgatgcgatagtgttgacttcacc 33618872  T
Q  211 agaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||||||  ||| ||||||||    
T  33618871 agaaaagtatttcccatgactt 33618850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8513473 - 8513232
Alignment:
Q  20 aaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt-----------aaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaa 107  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||    
T  8513473 aaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaagtgtattcttgttaa 8513374  T
Q  108 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttc 207  Q
    | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||    
T  8513373 tatgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaacttc 8513274  T
Q  208 accagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  8513273 accagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 8513232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15491809 - 15491631
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  15491809 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgcattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccact 15491710  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||  || | |||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15491709 gtacaaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttacaatgttaacttcacgagaaaagtcattctcataactt 15491631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20768275 - 20768087
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  20768275 tgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagt--aatcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgccacta 20768178  T
Q  155 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttc 247  Q
     ||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  20768177 -acaaacaatgga-tgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttc 20768087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Original strand, 4318812 - 4319009
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 152  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||    
T  4318812 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgggggttgaacttttgatgtcac 4318911  T
Q  153 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
     |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  4318912 tgtacaaacagtggggtgttactcataacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 4319009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Original strand, 3879929 - 3880124
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||      
T  3879929 gtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagaataagtatattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgtcatt 3880028  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    ||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  3880029 gtacaaacagtagggtgttactcacaacacttttgatactataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcgtgacttcaccatagaattttcct 3880124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 63 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6089094 - 6088910
Alignment:
Q  63 ttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 161  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6089094 ttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaaggatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactgaacttttgatgccactttacaaac 6088995  T
Q  162 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 246  Q
    ||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||    
T  6088994 agtggggcgttactcacaacacttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaatttt 6088910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29182357 - 29182157
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||     
T  29182357 gtgttacacttaaaatatggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgataatatggagactgaacttttgatgacact 29182258  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 253  Q
    ||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||| ||  ||| ||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||    
T  29182257 gtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcatcaataaaatcattctcatgacttcaccataaaatttttcttaat 29182158  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  29182157 t 29182157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 246
Target Start/End: Original strand, 30353349 - 30353540
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||| |    
T  30353349 tgttacacttaaaacaaggcatgataaaattagattaagtgtattcttgtttatatgatgaattgatgatactatggagactgaactatcgatgccactg 30353448  T
Q  155 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 246  Q
    ||||||||||| | |   |||| | |||||||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  30353449 tacaaacagtgagatattactcgcaacacttttgatgttataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 30353540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 21017102 - 21017280
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  21017102 gtgttacacttaaaataacgtaggataaaattagattaagtttattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccatt 21017201  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||||| | |||||||  |||||| ||| |||| |||||| | |||  ||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  21017202 gtacaaataatggggtgttactcacaacattttttatactacaatgttaacttcaccaaaaaagtcattttcgtgactt 21017280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1946028 - 1945830
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||      
T  1946028 gtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacttgatgaattcatgatactatgagggctgaacttttgatgtcatt 1945929  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc-agaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 251  Q
     ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||    
T  1945928 ctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaagtcattcttatgacttcaccgtagaattttcctta 1945830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Original strand, 33892993 - 33893186
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||  ||      
T  33892993 gtgttatacataaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaacttttaatatcatt 33893091  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| | |||| | ||||| ||||||| || || |||||||||    
T  33893092 gtacaaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaaattattctaatgactttaccatagaattttcc 33893186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5627577 - 5627389
Alignment:
Q  62 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 161  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||     
T  5627577 cttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaat 5627478  T
Q  162 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    |||||||||  ||||| || | |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||    
T  5627477 agtggggtgttactcattatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccttagaattttcctt 5627389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Original strand, 7055205 - 7055400
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||      
T  7055205 gtgttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcatt 7055304  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
     |||||| |||| ||||  ||| | || | |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||||| || ||  |||||||||    
T  7055305 ctacaaatagtgaggtgttactaattatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttcaccataaaattttcct 7055400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 117 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18498565 - 18498431
Alignment:
Q  117 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| ||    
T  18498565 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaactgtgggggtgttgctcactacacttttgatgctataatgttaacttcaccaggaa 18498466  T
Q  216 agtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||||||    
T  18498465 agtcattctcatgacttcactatagatttttcctt 18498431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 187
Target Start/End: Original strand, 6091173 - 6091306
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||      
T  6091173 gtgttacgcttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgagtactgaacttttgatggcatt 6091272  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacactttt 187  Q
    ||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  6091273 gtacaaacaatggtgtgttactcactacattttt 6091306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 3879877 - 3879922
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3879877 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 3879922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 21017050 - 21017095
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21017050 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 21017095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 1946073 - 1946035
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1946073 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 1946035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 5627630 - 5627592
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5627630 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactt 5627592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 6091120 - 6091166
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6091120 caaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactt 6091166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 54
Target Start/End: Original strand, 7234973 - 7235008
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag 54  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7234973 caaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaag 7235008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19631794 - 19631747
Alignment:
Q  203 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||    
T  19631794 acttcaccagaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcctt 19631747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 29182403 - 29182365
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29182403 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 29182365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 20768328 - 20768283
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  20768328 caaacataattgatgatattatgcgatgatcttaagtgttacactt 20768283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 76)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Original strand, 28003003 - 28003197
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  28003003 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatccgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcact 28003102  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  28003103 gtacaaacagtggagtactactgactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 28003197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 55 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 38012047 - 38011852
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38012047 tgttacacttaaaacaaggtataataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatggggactgaacttttgatggcaccg 38011948  T
Q  155 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  38011947 tacaaacagtggggtgctattcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgatttcaccatagaattttcctt 38011852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 33816550 - 33816728
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33816550 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgataaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccacc 33816649  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33816650 gtataaatagtgaggtgctactcactacacttttgatgctacaatgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgactt 33816728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 55 - 250
Target Start/End: Original strand, 25701075 - 25701270
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  25701075 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatttagtgtagtcctgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactg 25701174  T
Q  155 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||  |||| |||  |||| |||| |||||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||    
T  25701175 tacaaacagtagggtgttactcactacacttttgatgttataatgttaactttaccaaaaaagtcattatcatgacttcaccataaaattttcctt 25701270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 57 - 232
Target Start/End: Original strand, 5047985 - 5048160
Alignment:
Q  57 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 156  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||    
T  5047985 ttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgcagtcttgttaatctcatgaattgatgatactatgggaactgaacttttgatatcatcgta 5048084  T
Q  157 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  5048085 caaacagtgtggtcctactcactacacttttgatgttatagagttgacttcaccagaaaaatcattctcataactt 5048160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 34948114 - 34948292
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  34948114 gtgttgcactttaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccact 34948213  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
     ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34948214 ttacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcgccagaaaagtcattctcatgactt 34948292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Original strand, 55241122 - 55241315
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  55241122 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttctta-tctgataaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccact 55241220  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    |||||||||||||||||  |||| | ||| |||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  55241221 gtacaaacagtggggtgttactcgcaacaattttgataatatagtattaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 55241315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27396809 - 27396613
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  |    
T  27396809 tgttacacttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggacgaaacttttgatgtcattg 27396710  T
Q  155 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 251  Q
    |||||||||| |||||  |||||  |||||||| || ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||    
T  27396709 tacaaacagtagggtgttactcataacacttttaatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttttctta 27396613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Original strand, 35021052 - 35021248
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||      
T  35021052 gtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggacgaaacttttgacgccaat 35021151  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  35021152 gtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttataatgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcctt 35021248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 69 - 248
Target Start/End: Original strand, 19089485 - 19089664
Alignment:
Q  69 caaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtgggg 168  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  19089485 caaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtgggg 19089584  T
Q  169 tgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    ||  ||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||| || |||||| ||||| ||||||| || || |||||||||    
T  19089585 tgttactcattacaattttgatattatagtgttaacttcatcaaaaaagttattcttatgacttcaccatagaattttcc 19089664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23761265 - 23761089
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  23761265 gtgttacacttaaaacaaggtaga-taaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcact 23761167  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgact 231  Q
     ||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||| || |||| ||||||||||||||||    
T  23761166 atacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttacaagaatagtcattctcatgact 23761089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Original strand, 29584217 - 29584411
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  29584217 gtgtaacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccatt 29584316  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    |||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||    
T  29584317 gtacaaacagtgaggtgttactca--acacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattttcctt 29584411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 251
Target Start/End: Original strand, 55477908 - 55478109
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  55477908 gtgttacacttataacaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 55478007  T
Q  154 gt----acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    ||    ||||||||||| |||  ||||  |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  55478008 gtacaaacaaacagtggagtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcct 55478107  T
Q  250 ta 251  Q
    ||    
T  55478108 ta 55478109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 53 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7703704 - 7703533
Alignment:
Q  53 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  7703704 agtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga--------tactatggggactgaacttttgatgtcac 7703613  T
Q  153 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7703612 cgtacaaacagtggggtgttactgacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 7703533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 57 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32579637 - 32579466
Alignment:
Q  57 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgt- 155  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||     
T  32579637 ttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtacagtcatgttaatctgatgaactgataatactatga-gactaaacttttgatggcaccgta 32579539  T
Q  156 --acaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctca 226  Q
      ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32579538 caacaaacactggggtgctactcactgcacttttgatgttataatgttgacttcaccagaaaagtcattctca 32579466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Original strand, 35025613 - 35025800
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  35025613 gtgtgacacttaaaacaagataggataaaattatattaaatgcagtcttgttaatctgat--------gatactacgaggactgaacttttgatgtcaac 35025704  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |  || ||||||||||    
T  35025705 gtataaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaatcattttcatgacttcagcatagaattttcct 35025800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 32592287 - 32592103
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||     
T  32592287 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcact 32592188  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaat 238  Q
     |||||||||||| |||  |||| | |||||||||||||| ||||||  |||||| || |||||||||| | ||||||| |||||    
T  32592187 atacaaacagtggagtgttactctcaacacttttgatactgtagtgttaacttcatcaaaaaagtcattataatgacttcacaat 32592103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Original strand, 37663758 - 37663951
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  37663758 gtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 37663857  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| |||| ||    ||||||  |||||| || |||||||||||| ||||||| || || ||||||||||    
T  37663858 gtacaaacagtggggtgttactcattacagttttaat--gttagtgttaacttcatcaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcct 37663951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 49376154 - 49375982
Alignment:
Q  61 acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaa 160  Q
    ||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  49376154 acttaaatcaaggcagaataaaattagatcaagcgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaag 49376055  T
Q  161 cagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccag-aaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49376054 cagtggggtgttactcacgacacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaaaagtcattctcatgactt 49375982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 19440665 - 19440843
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| |||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  19440665 gtgttacgcttataacaagctaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccatt 19440764  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    |||||||| |||| |||  | ||| |||| |||||||  ||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19440765 gtacaaacggtggagtgttaatcattacatttttgatgttatagtgttaacatcaccaaaaaagtcattctcatgactt 19440843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9139439 - 9139241
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||     
T  9139439 gtgttacagttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatggggattgaactttttatgtcact 9139340  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 253  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||  | |||| || |||||  ||  ||||||||| |||||||| | ||||||||| || || ||||||||||||||    
T  9139339 gtacaaacggtggggtgttactcact--attttttatgctataacgttaacttcaccaaaaaagtcaatttcatgacttcaccatagaattttccttaat 9139242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 246
Target Start/End: Original strand, 36493708 - 36493897
Alignment:
Q  57 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 156  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  36493708 ttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgta 36493807  T
Q  157 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 246  Q
    |||||| |||||||  |||||||| | |||||||  |||||| |  ||||||||| |||||| ||| ||||||||| || || |||||||    
T  36493808 caaacaatggggtgttactcactatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaagttattttcatgacttcaccatagaatttt 36493897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25184307 - 25184112
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||      
T  25184307 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcatt 25184208  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    ||||||||||| | |||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  25184207 gtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaatagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 25184112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 33341592 - 33341397
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  33341592 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgatgccact 33341494  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcacta----cacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 246  Q
    |||||||||||||||||   ||| | |    || |||||||  ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||    
T  33341493 gtacaaacagtggggtgttcctcgcaacaatcaattttgatgatatagtgttaatttcaccagaaaaatcattctcatgacttcactatagaatttt 33341397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4598185 - 4598009
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||     
T  4598185 gtgttacacttaaaacaagc-aggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgagtctaaggggactgaacttttgatgccact 4598087  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4598086 gtacaaacagtggggtgttactcacaacac-tttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgactt 4598009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37775861 - 37775685
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||     
T  37775861 gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta--aggggggaacttttgatgccact 37775764  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||| |||| ||| |||||||   ||||||||| |||| ||||| | |||||||    
T  37775763 gtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttaatattatagtgctaacttcaccaaaaaaatcattttaatgactt 37775685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 46888174 - 46888352
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||| |     
T  46888174 gtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattaacgatagtatggggactgaacttttgatgccgct 46888273  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||||| ||||||||   |||||||||| |||||||  |||||| |  |||||| ||||||||| ||| || ||||||    
T  46888274 gtacaaatagtggggtattactcactacaattttgatgttatagtattaacttcatcagaaaagttattttcttgactt 46888352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17167907 - 17167739
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| ||      
T  17167907 gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagaatgaacttttgatgtcatt 17167808  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 222  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  17167807 gtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaacttcatcagaaaagtcatt 17167739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17173484 - 17173316
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| ||      
T  17173484 gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagattgaacttttgatgtcatt 17173385  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 222  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  17173384 gtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaacttcatcagaaaagtcatt 17173316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 50764905 - 50764748
Alignment:
Q  73 gtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgcc 172  Q
    ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  50764905 gtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgtt 50764806  T
Q  173 actcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    |||||| |||||||||||    ||||||  |||||| || |||||| |||||||||||||    
T  50764805 actcacaacacttttgat--gttagtgttaacttcatcaaaaaagttattctcatgactt 50764748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 47253934 - 47253751
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  47253934 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatga--------tactatgaggactgaacttttgatgtcact 47253843  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 246  Q
    ||| ||||| |||| ||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  47253842 gtataaacaatggg-tgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 47253751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 223
Target Start/End: Original strand, 54499254 - 54499425
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 152  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||     
T  54499254 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaaattagattaagtatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatgtcat 54499353  T
Q  153 c-gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattc 223  Q
      |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  54499354 tagtacaaacggtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattc 54499425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 879565 - 879743
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||| ||      
T  879565 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattatgtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattaaacttttgatgtcatt 879664  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||||||| || ||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  879665 gtacaaacaatgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtttacttcaccaaaaaaattattctcatgactt 879743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 61 - 194
Target Start/End: Original strand, 4934226 - 4934360
Alignment:
Q  61 acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaa 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  4934226 acttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaaatgatgatactatgaggattgaacttttgatgccagtgtacaaa 4934325  T
Q  161 cagt-ggggtgccactcactacacttttgatacta 194  Q
    || | ||||||  |||||||||| |||| ||||||    
T  4934326 caatgggggtgttactcactacattttttatacta 4934360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Original strand, 30002649 - 30002837
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||        ||||||| || |||||||||||||||| |||     
T  30002649 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat--------gatactaagaagactgaacttttgatgtcact 30002740  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    |||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||| || || || ||||||||    
T  30002741 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgctacagtgttaacttcaccagaaaaatcattttaatgacttcaccatagagttttcctt 30002837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6864229 - 6864053
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |      
T  6864229 gtgttacgcttataacaaggtatgataaaattaaattaaatgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgctatt 6864130  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgac 230  Q
    ||||||| ||| || ||  | ||| || | |||||||  |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6864129 gtacaaaaagttggatgttattcattaaatttttgatgttatagtgataacttcaccaaaaaagtcattctcatgac 6864053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Original strand, 32912597 - 32912793
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||  ||      
T  32912597 gtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatattatgagtgctgaacttttgatatcatt 32912696  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
     |||||| | | |||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||||||    
T  32912697 ctacaaatactagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcctt 32912793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Original strand, 34361509 - 34361704
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| | | ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||      
T  34361509 gtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtaattttgttaaccggatgaattgatgatattatgagg-ctgaacttttaatgtcatt 34361607  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
     ||||||||||||||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||||||    
T  34361608 ctacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcctt 34361704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37287919 - 37287732
Alignment:
Q  56 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||        || |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  37287919 gttacacttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatcttatga--------tattatgaggattgaacttttgatgccactg 37287828  T
Q  155 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacc-agaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  37287827 tacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttaccaaaaaaagtcattctcattacttcaccatagaattttcct 37287732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 39398103 - 39397918
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||         ||||||||||  || |||||||||||||||| |||     
T  39398103 gtgttacacttaaaataaggcaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat---------tgatgatactgagaagactgaacttttgatgtcact 39398013  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||||    
T  39398012 gtacaaacaatggggtgttactcacaacacttttaatgttatagtgttaacttcaccataaaagtcattctaatgacttcaccatagaattttcc 39397918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 42199915 - 42199723
Alignment:
Q  62 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 161  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||   ||||||     
T  42199915 cttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaactttttatgtcattctacaaat 42199816  T
Q  162 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaatt 254  Q
    | ||||||   ||||| |||| |||||||  |||||| |  ||||||||| |||| ||||||| |||| || || || || ||||||| ||||    
T  42199815 aatggggtattactcattacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattcttatgatttcaccatagatttttcctaaatt 42199723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 1815495 - 1815409
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaac 140  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1815495 gtgttacccttaaaacaaggtaggataaaattagagtaaatgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaac 1815409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 54 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 50697435 - 50697320
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||      
T  50697435 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gagaattgaacttttgatgtcatt 50697337  T
Q  154 gtacaaacagtggggtg 170  Q
    |||||||| || |||||    
T  50697336 gtacaaacggtagggtg 50697320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 17272158 - 17272068
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 148  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  17272158 gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatacta----gactgaacttttgatg 17272068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 3042865 - 3042820
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3042865 caaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 3042820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 4934167 - 4934212
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4934167 caaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactt 4934212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 17173536 - 17173491
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17173536 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 17173491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 28002951 - 28002996
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28002951 caaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactt 28002996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 33816481 - 33816526
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33816481 caaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactt 33816526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 35021000 - 35021045
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35021000 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 35021045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 35025561 - 35025606
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35025561 caaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactt 35025606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 1815540 - 1815502
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1815540 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 1815502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 17167952 - 17167914
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17167952 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 17167914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Original strand, 32912552 - 32912590
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32912552 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 32912590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 64
Target Start/End: Original strand, 19089426 - 19089463
Alignment:
Q  27 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089426 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 19089463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 25184359 - 25184314
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25184359 caaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 25184314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 36493654 - 36493699
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36493654 caaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactt 36493699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 64
Target Start/End: Original strand, 37663714 - 37663751
Alignment:
Q  27 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37663714 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 37663751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 252
Target Start/End: Original strand, 38812263 - 38812312
Alignment:
Q  203 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  38812263 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccttaa 38812312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 3042813 - 3042741
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatac 126  Q
    ||||||| |||| || |||||| | |||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  3042813 gtgttacgcttataataaggtatgataaaattatattaagtgtaatcttgttaatatgatgaattgatgatac 3042741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4205210 - 4205114
Alignment:
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    |||||||||||||||||  | |||  ||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||| || || |||||||||||    
T  4205210 gtacaaacagtggggtgttattcagaacatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcctgacttcaccatagaattttcctt 4205114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 38012100 - 38012065
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38012100 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag 38012065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 49376213 - 49376170
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49376213 caaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacac 49376170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 50697487 - 50697448
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtt 58  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50697487 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtt 50697448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 61
Target Start/End: Original strand, 5047931 - 5047973
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 61  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5047931 caaacatagtttatgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 5047973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 42199968 - 42199930
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42199968 agtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 42199930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17272077 - 17272008
Alignment:
Q  182 acttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 251  Q
    |||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||    
T  17272077 acttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattttcctta 17272008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 33341644 - 33341599
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33341644 caaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 33341599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 47253986 - 47253941
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47253986 caaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 47253941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 6864281 - 6864245
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 55  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6864281 caaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 6864245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Original strand, 20097494 - 20097537
Alignment:
Q  203 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  20097494 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 20097537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 53
Target Start/End: Original strand, 879513 - 879547
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa 53  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  879513 caaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa 879547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 2704557 - 2704508
Alignment:
Q  203 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaa 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||||    
T  2704557 acttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccataaaattttccttaa 2704508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 7152169 - 7152214
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  7152169 caaacagagttgatgatgttatgtgatagtattaagtgttatactt 7152214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 250
Target Start/End: Original strand, 7152242 - 7152319
Alignment:
Q  173 actcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    |||||||| |||||||||  |||| |||  |||| |||||||||||||||  |||||||| || || |||||||||||    
T  7152242 actcactatacttttgatgttataatgttaactttaccagaaaagtcattagcatgacttcaccatagaattttcctt 7152319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38811858 - 38811813
Alignment:
Q  203 acttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||    
T  38811858 acttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 38811813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 120; Significance: 5e-61; HSPs: 58)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Original strand, 27082835 - 27083030
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  27082835 gtgttagacttaaaacatggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttaatgccact 27082934  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||    
T  27082935 gcacaaacagtggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcagtctgatgacttcaccatagaattttcct 27083030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Original strand, 5299943 - 5300137
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  5299943 gtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactgaacttttgatgccact 5300042  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    ||||||||||| | |||| ||| || ||||||||||| |||||||||  ||||||  | |||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  5300043 gtacaaacagtagagtgctacttacaacacttttgatgctatagtgttaacttcattaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 5300137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 53 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 38644172 - 38643975
Alignment:
Q  53 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  38644172 agtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccac 38644073  T
Q  153 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
       |||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  38644072 tagacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttgaccaaaaaagtcattctcatgatttcaccatagaattttcctt 38643975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34895160 - 34894964
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  34895160 gtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccact 34895061  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
     |||||||||||| |||  |||||||||| | |||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  34895060 ttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcctt 34894964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Original strand, 36694963 - 36695163
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||      
T  36694963 gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcatt 36695062  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 253  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||||||    
T  36695063 gtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcctgacttcaccatagaattttccttaat 36695162  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  36695163 t 36695163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Original strand, 6098515 - 6098709
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  6098515 gtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgacgatactatggggactgaacttttgatgtcact 6098614  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| | ||||||| ||||||| |  ||||||||| |||||| ||| ||||||||| || || |||||||||    
T  6098615 gtacaaacagtggggtgttactcactatatttttgatgctatagtattaacttcaccaaaaaagttattttcatgacttcaccatagaattttcc 6098709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 37970516 - 37970694
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||      
T  37970516 gtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatggcatt 37970615  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37970616 gtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgactt 37970694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Original strand, 16446872 - 16447067
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||      
T  16446872 gtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatggggactaaacttttgatgccatt 16446971  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
     ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  |||| | ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||    
T  16446972 atacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaactttatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcct 16447067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 33906404 - 33906223
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||                
T  33906404 tgttacccttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaactt------------ 33906317  T
Q  155 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || || || |||||||||    
T  33906316 tataaacagtggggtgctactcactacacttttaatactatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcataatttcaccatagaattttcc 33906223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 466035 - 465857
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||     
T  466035 gtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaatttttgatgccact 465936  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||| ||||  ||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  465935 gtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatcgtgttaacttcaccacaaaagtcattttaatgactt 465857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1205120 - 1204942
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  1205120 gtgttacgcttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtaatcttgttaatatgatgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 1205021  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||||||||||  |||  |||||||||| |||| ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1205020 gtacaaacagtgatgtgttactcactacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 1204942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 232
Target Start/End: Original strand, 10555207 - 10555377
Alignment:
Q  62 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 161  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||    
T  10555207 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaac 10555306  T
Q  162 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||| |||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10555307 agtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgactt 10555377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13307816 - 13307622
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  13307816 gtgttacatttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgctaatctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatgtcact 13307717  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||    
T  13307716 gtacaaatagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 13307622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 1150102 - 1150306
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |       
T  1150102 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcgtt 1150201  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 253  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||  ||||| ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||||||| ||||    
T  1150202 gtacaaacagtgggatgttactcattacatttttgatgttatagcgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcc-taat 1150300  T
Q  254 tattaa 259  Q
    ||||||    
T  1150301 tattaa 1150306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9864341 - 9864145
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||      
T  9864341 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcatt 9864242  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| || |||||| |  || |||||||||||    
T  9864241 gtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattttcgtgacttcattatagaattttcctt 9864145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 53 - 249
Target Start/End: Original strand, 34952027 - 34952223
Alignment:
Q  53 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 152  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||    
T  34952027 agtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatttgatgaattgatgatactaaagggactgaacttttgatgtcac 34952126  T
Q  153 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
     |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||| || || ||||||||||    
T  34952127 tgtacaaacagtgggctgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttgaccagaaaagtcattttaatgactttactatagaattttcct 34952223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11727217 - 11727039
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  11727217 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccact 11727118  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
     |||||| |||||||||  ||| || |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  11727117 atacaaatagtggggtgttacttacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataactt 11727039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12876302 - 12876108
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  12876302 gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtatccttcttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 12876203  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    ||||||||||| |||||  |||||| ||| |||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||| || || |||||||||    
T  12876202 gtacaaacagttgggtgttactcacaacattttttatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtgacttaaccatagaattttcc 12876108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16223056 - 16222860
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  16223056 gtgttacgtttaaaacaaggaaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 16222957  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    |||||||| ||||||  | |||||||| | |||| ||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||    
T  16222956 gtacaaactgtggggaactactcactatattttttatgttatagtgttaaattcaccagaaaagtcattctcatgatttcaccgtagaattttcctt 16222860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Original strand, 43643592 - 43643788
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||      
T  43643592 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcatt 43643691  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    ||||||||||| | |||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  43643692 gtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaatagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 43643788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 23854428 - 23854606
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| || ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  23854428 gtgttacacttataactaggtaagataaaattagattaattgtagtattgttaatctaatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 23854527  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    | ||||||||| |||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23854528 gcacaaacagttgggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgactt 23854606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 41362707 - 41362517
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||      
T  41362707 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaattatatcaagtttagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggtctgaacttttgatgtcacta 41362608  T
Q  155 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||| |||| || |  ||||||  ||||||||| |||||||||| |||| |||| || || |||||||||    
T  41362607 tacaaatagtggggtgttactcactaca-tttttatgc--tagtgttaacttcaccaaaaaagtcattttcataacttcaccatagaattttcc 41362517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40862613 - 40862416
Alignment:
Q  53 agtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 152  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| | | |||||| | |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||     
T  40862613 agtgttacacttagaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttagtatgaaaaattgatgataccatga-gactgaacttttgatgccat 40862515  T
Q  153 cgtacaaacagtggggtgccactcactaca-cttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
     |||||||||||||||||  |||||| |||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| || |||||| || || |||||||||||    
T  40862514 tgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaagttattttcgtgacttcactatagaattttcctt 40862416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 253
Target Start/End: Original strand, 31933891 - 31934082
Alignment:
Q  62 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 161  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||| |||     
T  31933891 cttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtataaag 31933990  T
Q  162 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 253  Q
    |||||||||  ||||| || | ||||||||  |||||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  | |||||||| |||||    
T  31933991 agtggggtgttactcattatatttttgatatcatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataacttcacgttagaattttctttaat 31934082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 167
Target Start/End: Original strand, 1149629 - 1149742
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||      
T  1149629 gtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggacagaacttttgatgtcatt 1149728  T
Q  154 gtacaaacagtggg 167  Q
    ||||||||||||||    
T  1149729 gtacaaacagtggg 1149742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 7998522 - 7998401
Alignment:
Q  20 aaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggt-aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaatt 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  7998522 aaacagagttgttgatattatgtgatagtattaagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgtatt 7998423  T
Q  119 gatgatactatgaggactgaac 140  Q
    ||||||| |||| |||| ||||    
T  7998422 gatgatattatggggaccgaac 7998401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Original strand, 30654580 - 30654775
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||      
T  30654580 gtgttacgcttaaaacaatgtatggtaaaattaaattaagtgtagtcttgttaacctgatgaagtgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcatt 30654679  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
      |||||||||||||||  ||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| |||| ||| ||| ||||||| || ||  |||||||||    
T  30654680 caacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcactcttatgacttcaccataaaattttcct 30654775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 55 - 170
Target Start/End: Original strand, 39099117 - 39099232
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  39099117 tgttacacttaaaacagggtaagataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgctagtg 39099216  T
Q  155 tacaaacagtggggtg 170  Q
    |||||| |||||||||    
T  39099217 tacaaagagtggggtg 39099232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 221
Target Start/End: Original strand, 41910985 - 41911153
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||     
T  41910985 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgttgactgaatttttgatgctact 41911084  T
Q  154 gtacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcat 221  Q
    ||   || ||| ||||||  |||||| |||||||||||  |||||| |  ||||||||| |||| ||||    
T  41911085 gttataatagtgggggtgttactcacgacacttttgatgatatagtattaacttcaccaaaaaaatcat 41911153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 170
Target Start/End: Original strand, 1953987 - 1954103
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgat-gatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  1953987 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttagtgtagtcatattaatctgatgaattgatagatactatgagggctgaacttttgatgccact 1954086  T
Q  154 gtacaaacagtggggtg 170  Q
    || |||| ||| |||||    
T  1954087 gtccaaatagtagggtg 1954103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 165
Target Start/End: Original strand, 35459709 - 35459819
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |    
T  35459709 tgttacatttataacaaagtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatattatgaggactgaacttttaatgtcattg 35459808  T
Q  155 tacaaacagtg 165  Q
    ||||| |||||    
T  35459809 tacaatcagtg 35459819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 54 - 166
Target Start/End: Original strand, 7890954 - 7891066
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| ||||| ||| | ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||      
T  7890954 gtgttacgcttataacaaagtaagataaaactagattgagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggaccgaacttttgatgccatt 7891053  T
Q  154 gtacaaacagtgg 166  Q
    |||||||| ||||    
T  7891054 gtacaaacggtgg 7891066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 44869686 - 44869576
Alignment:
Q  59 acacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtac 157  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  || |    
T  44869686 acacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattattgttaatctgataaattgatgatactatgacgattgaacttttgatgtcattgtgc 44869587  T
Q  158 aaacagtgggg 168  Q
    |||||||||||    
T  44869586 aaacagtgggg 44869576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 43025895 - 43025753
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| || |||      
T  43025895 gtgttacagttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttcttagtctgatgaattgatgatattatatgaactgaacttttaataccatt 43025796  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactata 196  Q
    ||||||| ||||||||   | |||| |||||||||||||||||    
T  43025795 gtacaaagagtggggtattaatcacaacacttttgatactata 43025753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 221
Target Start/End: Original strand, 8803814 - 8803974
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||       | |||||||||||||| ||      
T  8803814 gtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgata-------ggctgaacttttgatgtcatt 8803906  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcat 221  Q
     |||||| ||||| |||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  8803907 ctacaaatagtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcat 8803974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 122
Target Start/End: Original strand, 4132683 - 4132750
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  4132683 gtgttacacttaaa-caaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatg 4132750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 40862665 - 40862619
Alignment:
Q  18 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40862665 acaaacatagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 40862619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 4132631 - 4132676
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4132631 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttatgtgttacactt 4132676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 248
Target Start/End: Original strand, 4133077 - 4133199
Alignment:
Q  124 tactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||   ||||||||   |||| || |  ||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  4133077 tactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtcaggtattactcactatcttttttatgc--tagtgttaacttcaccaaaaaagtcattc 4133174  T
Q  224 tcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    | |||||||||| ||  ||||||||    
T  4133175 tgatgacttgaccataaaattttcc 4133199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 6098463 - 6098508
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6098463 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 6098508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 27082783 - 27082828
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27082783 caaacatagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 27082828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 33906457 - 33906412
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33906457 caaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactt 33906412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 36694911 - 36694956
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36694911 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 36694956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 37970464 - 37970509
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37970464 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 37970509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 33197997 - 33197947
Alignment:
Q  99 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgc 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  33197997 tcttgttaatctgatgaattgatgatattatggagactgaacttttgatgc 33197947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 1149577 - 1149622
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1149577 caaacaaagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 1149622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 1205172 - 1205127
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1205172 caaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactt 1205127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 9864393 - 9864348
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9864393 caaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 9864348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 16223108 - 16223063
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16223108 caaacaaagttgatgatattatgtgatactcttaagtgttacactt 16223063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 43643540 - 43643585
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43643540 caaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 43643585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 180 - 251
Target Start/End: Original strand, 24823395 - 24823466
Alignment:
Q  180 acacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 251  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| || || | ||||||||||    
T  24823395 acacttttgatattatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcataactttaccatagtattttcctta 24823466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Original strand, 8803769 - 8803807
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8803769 agttgatgatattatgtgatagtattaagtgttacactt 8803807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Original strand, 30654535 - 30654573
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30654535 agtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 30654573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 13307868 - 13307823
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13307868 caaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 13307823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 62
Target Start/End: Original strand, 7890909 - 7890945
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 62  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7890909 agttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacac 7890945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 43025940 - 43025905
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 61  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43025940 agttgatgatattatgtgatagttttaagtgttaca 43025905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 11727269 - 11727227
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 61  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11727269 caaacaaagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 11727227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7998402 - 7998361
Alignment:
Q  208 accagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  7998402 accagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 7998361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 58)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 36642182 - 36641980
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa--ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 151  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36642182 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtca 36642083  T
Q  152 ccgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 251  Q
    | |||||||||||| ||||  |||| | ||||||||||| ||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||    
T  36642082 ctgtacaaacagtgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtattaatttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttttctta 36641983  T
Q  252 att 254  Q
    |||    
T  36641982 att 36641980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4167116 - 4166919
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  4167116 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgccatt 4167017  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctta 251  Q
    |||||||||||||||||  |||||| | | ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||||    
T  4167016 gtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactataatgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcctta 4166919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Original strand, 33550995 - 33551195
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||      
T  33550995 gtgttacgcttaaaacaacgtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagaccgaacttttgatgtcatt 33551094  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaat 253  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||    
T  33551095 gtacaaacagtggggtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttccataat 33551194  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  33551195 t 33551195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Original strand, 19424637 - 19424832
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  19424637 gtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccact 19424736  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
     || ||||| |||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  19424737 atataaacaatggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagccattctcatgacttcaccataaaattttcct 19424832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19314045 - 19313852
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     
T  19314045 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattcgattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactat-aggactgaacttttgatgtcact 19313947  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    ||| ||| |||  ||||  |||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||    
T  19313946 gtataaatagtaaggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgacttcaccatagaattttcc 19313852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 246
Target Start/End: Original strand, 33660377 - 33660569
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  33660377 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcctgttaatctaatgaattgatgatactaagaggactgaacttttgatgccact 33660476  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 246  Q
    ||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||| || |||||||||||| | ||||||| || || |||||||    
T  33660477 gtacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttaactagaaaagtcattttaatgacttcaccatagaatttt 33660569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 252
Target Start/End: Original strand, 29242147 - 29242345
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  29242147 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgataccact 29242246  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttccttaa 252  Q
    |||||||||||||||||  || ||||| | |||| ||  |||||| |  ||||||||| ||||  |||| ||||||||| || || |||||||||||||    
T  29242247 gtacaaacagtggggtgttacgcactatattttttatgttatagttttaacttcaccaaaaaaaccattttcatgacttcaccatagaattttccttaa 29242345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Original strand, 4264086 - 4264281
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||     
T  4264086 gtgttaaacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttcttaatatgatgaattgataatactatggagactgaacttttgatgtcact 4264185  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    |||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||| || || ||||||||||    
T  4264186 gtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttaccagaaaagtcattatgatgacttcaccatagaattttcct 4264281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4478564 - 4478368
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 152  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4478564 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccac 4478465  T
Q  153 cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctc-atgacttgacaatggaattttcc 248  Q
     ||||||||| ||| |||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||  ||||| || ||||||| || || |||||||||    
T  4478464 tgtacaaacaatggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaatatcattttctatgacttcactatagaattttcc 4478368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 45327914 - 45327801
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  45327914 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcacc 45327815  T
Q  154 gtacaaacagtggg 167  Q
    ||| ||||| ||||    
T  45327814 gtataaacaatggg 45327801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 246
Target Start/End: Original strand, 43770848 - 43771039
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  43770848 gtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattaaattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgccact 43770947  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 246  Q
    ||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||||| || || |||||||    
T  43770948 gtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaaatcattctaatgacttcaccatagaatttt 43771039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Original strand, 27349948 - 27350109
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||     
T  27349948 gtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaacttttgatgtcact 27350046  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaa 216  Q
    |||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||    
T  27350047 gtacaaacagtgtggtgttactcacaacatttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaa 27350109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 41465695 - 41465509
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||| |    
T  41465695 gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagttcagtcttgtgaatctaatgaattgatgatattatagggactgaacttttgataccagc 41465596  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
    ||        | |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  41465595 gt--------tagggtgctactcactacacctttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 41465509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Original strand, 7006895 - 7007043
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaatt 118  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||    
T  7006895 caaacagagttgctgatatcatgtgatattcttaagtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatcttataaatt 7006994  T
Q  119 gatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggg 167  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7006995 gatgatactatgggaactaaacttttgatgctactgtacaaacagtggg 7007043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13711633 - 13711465
Alignment:
Q  79 taaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcac 178  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||  ||||||    
T  13711633 taaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgataccatgtggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactcac 13711534  T
Q  179 tacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttc 247  Q
     ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||    
T  13711533 aacacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattctgatgacttcaccatagaattttc 13711465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Original strand, 31570743 - 31570939
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  31570743 gtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattcatgatactatgtggactgaacttttgatgtcact 31570842  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
     || ||| |||||||||  ||| || |||||||| ||  ||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| || || |||||||||||    
T  31570843 ataaaaatagtggggtgttacttacaacacttttaatgttatagtgttaatttcaccagaaaagttattctcataacttcaccatagaattttcctt 31570939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 58 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4763821 - 4763644
Alignment:
Q  58 tacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtac 157  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||    
T  4763821 tacacttgaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgattatactatgggaactgaacttttgatgtcactgtac 4763722  T
Q  158 aaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcg---acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||| |  |||||||| |   |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4763721 aaacagtggggtgttactcactacagttttgttgatatagtgttgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgactt 4763644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26357770 - 26357593
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||| ||| |    
T  26357770 tgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtgatcttgttaatatgatgaattgataactctataagaactgaacttttgatgtcactg 26357671  T
Q  155 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  26357670 tacaaacagtgggatgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgactt 26357593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3177133 - 3176965
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  3177133 gtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 3177034  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 222  Q
    ||||||||||| | |||  |||||  ||| |||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||    
T  3177033 gtacaaacagttgcgtgttactcaaaacatttttgatattatagtattaacttcatcagaaaagtcatt 3176965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 246
Target Start/End: Original strand, 41463859 - 41464051
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||| ||||||||| ||| | |||||||| |||||  | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  41463859 gtgttacaattaaaacaaagtatgataaaattatattaaaagtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccact 41463958  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 246  Q
    |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||  |||||| |  ||||||||| ||| |||||||||| ||||| || || |||||||    
T  41463959 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgattttatagtattaacttcaccaaaaatgtcattctcacgacttcaccatagaatttt 41464051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Original strand, 17071746 - 17071941
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||      
T  17071746 gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaataccgaacttttgatgtcatt 17071845  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    ||||||| | || | ||  ||| |||||| ||||| |  ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  17071846 gtacaaataatgagatgttacttactacatttttgttgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcgcatgacttcaccatagaattttcct 17071941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 250
Target Start/End: Original strand, 39167373 - 39167568
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  39167373 tgttacacttaaaacaaggtataataaaattagaataagtgtattcttgttactctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattg 39167472  T
Q  155 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||  |||  |||||| || |||| |||||||| |||||| || ||  ||||||||||    
T  39167473 tacaaacagtgaggtgttactcacaatacttttgatactattctgttaacttcatcaaaaaaatcattctcgtgacttcaccataaaattttcctt 39167568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37905902 - 37905740
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  37905902 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 37905803  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaa 216  Q
    |||||||| ||||||||  ||||  |||| |||| ||  ||||||||  ||||||||| ||||    
T  37905802 gtacaaacggtggggtgttactcgttacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaa 37905740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44286143 - 44285965
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  44286143 gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatgaatttatgatactatgtggactaaacttttgatgccact 44286044  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
     ||||||||||| | |    ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  44286043 atacaaacagtgagatattgctcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcatcagaaaaatcattcgcatgactt 44285965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 211
Target Start/End: Original strand, 43648254 - 43648411
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||      
T  43648254 gtgttacacttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcatt 43648353  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcacca 211  Q
     ||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||||||    
T  43648354 atacaaacagtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 43648411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 216
Target Start/End: Original strand, 33709241 - 33709403
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  33709241 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgaatatttgatgatactatggggactgaacttttgatgtcact 33709340  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaa 216  Q
    |||| |||||||| |||  |||| | |||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||    
T  33709341 gtactaacagtggagtgttactcgcaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccataaaa 33709403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 41961034 - 41960940
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 148  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41961034 gtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatg 41960940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Original strand, 17054105 - 17054300
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||||||||| ||      
T  17054105 gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaataccgnacttttgatgtcatt 17054204  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    ||||||||| || | ||  ||| |||||| |||||||  |||||| |  ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  17054205 gtacaaacaatgagatgttacttactacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattcgcatgacttcaccatagaattttcct 17054300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 250
Target Start/End: Original strand, 18494292 - 18494473
Alignment:
Q  57 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 156  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          
T  18494292 ttacacttaatacaaggtaggataaaattagatcaagtgtattctagtgaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc------ 18494385  T
Q  157 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
          ||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| || |  |||||||||||    
T  18494386 ------gtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccacagaattttcctt 18494473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 250
Target Start/End: Original strand, 2325387 - 2325575
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  2325387 gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat--------ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccagt 2325478  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcctt 250  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| |||| || ||||  |||| |||  ||||||| ||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||    
T  2325479 gtacaaacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatattgttaacttcacgagaaaagtcattcacataacttcaccatagaattttcctt 2325575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 57 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5881729 - 5881533
Alignment:
Q  57 ttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgta 156  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||    
T  5881729 ttacacttaaaacaaggtatgataaa-ttagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactcaacttttgatgtcactgta 5881631  T
Q  157 caaacagtggggtgccactcactacac-----ttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||     |||||||  |||| | || |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||  |||||||||    
T  5881630 caaacagtggggtgttactcacaacacttttgttttgatgttataatatcaacttcaccagaaaagtcattttaatgacttcacaataaaattttcct 5881533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33902252 - 33902092
Alignment:
Q  62 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 161  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||    
T  33902252 cttaaaacaaggtaggataaaattcgattaaatatagtcttgttaatctgatgaactgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattttacaaac 33902153  T
Q  162 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattct 224  Q
    ||||||||   |||||||||| ||||  ||   ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33902152 agtggggtattactcactacattttt--tatgttagtgttaacttcaccagaaaagtcattct 33902092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 222
Target Start/End: Original strand, 19289333 - 19289500
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||  |    
T  19289333 tgttacatttataacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatgagttgatgatactgtgagaacttaacttttgatgtcattg 19289432  T
Q  155 tacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcatt 222  Q
    |||||||| |||||||  ||||| || | |||||||  ||||||||  |||||| || ||||||||||    
T  19289433 tacaaacaatggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcatt 19289500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 44913857 - 44913662
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gaggactgaacttttgatgccac 152  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| ||     
T  44913857 gtgttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgggggattgaactttttatgtcat 44913758  T
Q  153 cgtacaaac-agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcc 248  Q
      ||||||| |||| ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||  |||||| || |||||||||| || |||||| || || |||||||||    
T  44913757 tttacaaacaagtgaggtgttactcacaacatttttgatactacagtgttaacttca-cataaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 44913662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Original strand, 11366415 - 11366585
Alignment:
Q  79 taaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgccactcac 178  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||| |||| | ||  |||||     
T  11366415 taaaattatattaaatgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattatacaaatagtgagatgttactcat 11366514  T
Q  179 tacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    |||| |||||||  ||||||||  | ||||||| |||||||||||| |||| || || || ||||||||||    
T  11366515 tacatttttgatgttatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattcttatgatttcaccatagaattttcct 11366585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 31862046 - 31861953
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgat 147  Q
    ||||||| |||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  31862046 gtgttacgcttataacaatgtatgttaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataatgactgaaattttgat 31861953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 221
Target Start/End: Original strand, 41051263 - 41051382
Alignment:
Q  103 gttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac-cgtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||  |  ||| ||||||||||| ||||||| |     
T  41051263 gttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactggtacaaatagtgaagtgttatacacaacacttttgatgctatagtatt 41051362  T
Q  202 gacttcaccagaaaagtcat 221  Q
      ||||| ||||||||||||    
T  41051363 agcttcatcagaaaagtcat 41051382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 3177185 - 3177140
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3177185 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 3177140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 4167169 - 4167123
Alignment:
Q  18 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4167169 acaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactt 4167123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 35959090 - 35958925
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||||||| ||| ||      
T  35959090 gtgttacgcttataacaaggtaggataaa-ttatattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatg------------ctgaacttttaatgtcatt 35959004  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    |||||||||||||||||   |||| |||| |||| ||  ||||||| | ||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  35959003 gtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttatagtggcaacttcaccaaaaaagtcatttttatgactt 35958925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 35959142 - 35959097
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35959142 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaactgttacactt 35959097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 44913910 - 44913865
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44913910 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 44913865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 145
Target Start/End: Original strand, 19501760 - 19501839
Alignment:
Q  65 aaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 145  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  19501760 aaaacaaagtagaataaaattagattaaatgtagt-ttgttaatctgatgaattgatgatactatagagactgaacttttg 19501839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Original strand, 11366345 - 11366383
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11366345 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 11366383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Original strand, 19289287 - 19289325
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19289287 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 19289325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 2325335 - 2325380
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2325335 caaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 2325380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 17071694 - 17071739
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17071694 caaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 17071739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 41465747 - 41465702
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41465747 caaacataattgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactt 41465702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 4763868 - 4763832
Alignment:
Q  28 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763868 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 4763832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 59
Target Start/End: Original strand, 43648203 - 43648242
Alignment:
Q  20 aaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 59  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43648203 aaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 43648242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 17054053 - 17054098
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17054053 caaacaaatttgatgatattatgtgatagtnttaagtgttacactt 17054098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 44286195 - 44286150
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44286195 caaacaaagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 44286150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 41961077 - 41961041
Alignment:
Q  28 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41961077 ttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactt 41961041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Original strand, 19500879 - 19500914
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 61  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500879 agttgataatattatgtgatagtcttaagtgttaca 19500914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Original strand, 18258251 - 18258289
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18258251 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 18258289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6177820 - 6177791
Alignment:
Q  203 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6177820 acttcaccagaaaagtcattctcatgactt 6177791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 107
Target Start/End: Original strand, 18258296 - 18258349
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaa 107  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  | |||||||||    
T  18258296 gtgttacacttaaaaaaatgtaggataaaattagattaagtttattcttgttaa 18258349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 37905956 - 37905911
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  37905956 caaacagagttaatgatattatgcgatagttttaagtgttacactt 37905911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 328 - 133
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  328 gtgttacacttaaaataagataggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccatt 229  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| ||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||    
T  228 gtacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatactacagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcct 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 227
Target Start/End: Original strand, 94374 - 94547
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||     
T  94374 gtgttacacttgaaacaagctagaataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctcatgaattgatgatagtatggggaccaaacttttgatgccact 94473  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcat 227  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||| |||  |||||| ||||||||||||| ||||    
T  94474 gtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttataatgttaacttcatcagaaaagtcattttcat 94547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 147
Target Start/End: Original strand, 408420 - 408512
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgat 147  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  408420 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgat 408512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 380 - 335
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  380 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8081 - 7889
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  8081 gtgttacgcttatagcaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 7982  T
Q  154 gtacaaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 246  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||  |||||| || |||||||||||| || |||| || || |||||||    
T  7981 gtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaatttt 7889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 8125 - 8088
Alignment:
Q  27 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8125 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 8088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 88; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12103 - 11908
Alignment:
Q  54 gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccacc 153  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  12103 gtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgataccact 12004  T
Q  154 g-tacaaacagt-ggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtca-ttctcatgacttgacaatggaatttt 246  Q
    | |||||||| | ||||||  |||||| |||||||| ||  ||| ||||  | |||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||    
T  12003 gatacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttaatgttatggtgttaatttcaccagaaaagtcatttctcatgacttcaccatagaatttt 11908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 44143 - 43959
Alignment:
Q  62 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 161  Q
    |||| |||||| || | |||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  44143 cttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaac 44044  T
Q  162 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 246  Q
    |  ||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||| |||| | ||||| || || |||||||    
T  44043 aacggggtgttactcattacatttttgatattatagcgttaacttcaccaaaaaagtctttcttacgacttcaccatagaatttt 43959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 44202 - 44158
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44202 caaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgttacactt 44158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 246
Target Start/End: Original strand, 154644 - 154828
Alignment:
Q  62 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 161  Q
    |||| |||||| || | |||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  154644 cttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaac 154743  T
Q  162 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaatttt 246  Q
    |  ||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||| |||| | ||||| || || |||||||    
T  154744 aacggggtgttactcattacatttttgatattatagcgttaacttcaccaaaaaagtctttcttacgacttcaccatagaatttt 154828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 154585 - 154629
Alignment:
Q  19 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  154585 caaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgttacactt 154629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 267477 - 267331
Alignment:
Q  55 tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccg 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||||| ||| |    
T  267477 tgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgctaatctaatgaattgatgatattatagagactgaacttttgatgacactg 267378  T
Q  155 tac-aaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgt 200  Q
    ||| ||||||| || ||  |||||||| | ||||||| |||||||||    
T  267377 tacaaaacagttggatgttactcactatatttttgatgctatagtgt 267331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 232
Target Start/End: Original strand, 146015 - 146185
Alignment:
Q  62 cttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaac 161  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||   ||||||     
T  146015 cttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattctacaaat 146114  T
Q  162 agtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 232  Q
    | |||||||  ||||| |||| |||| ||  |||| |||  |||| |||| |||| ||||||| |||||||    
T  146115 aatggggtgttactcattacattttttatgttataatgttaacttaaccaaaaaaatcattcttatgactt 146185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Original strand, 145962 - 146000
Alignment:
Q  26 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  145962 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 146000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 42439 - 42347
Alignment:
Q  157 caaacagtggggtgccactcactacacttttgatactatagtgtcgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttgacaatggaattttcct 249  Q
    |||| |||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  42439 caaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaattattctcatgacttcaccataaaattttcct 42347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 100948 - 100894
Alignment:
Q  52 aagtgttacac--ttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgt 104  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  100948 aagtgttacacagttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgt 100894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University