View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5169_low_5 (Length: 483)

Name: NF5169_low_5
Description: NF5169
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5169_low_5
NF5169_low_5
[»] chr3 (33 HSPs)
chr3 (153-350)||(46941050-46941247)
chr3 (154-350)||(54246055-54246251)
chr3 (155-346)||(54237097-54237288)
chr3 (154-346)||(42394326-42394518)
chr3 (155-349)||(40808863-40809057)
chr3 (155-347)||(45126836-45127028)
chr3 (155-351)||(24688310-24688506)
chr3 (144-353)||(25413675-25413886)
chr3 (163-347)||(42100688-42100872)
chr3 (154-347)||(36150130-36150323)
chr3 (154-349)||(47190933-47191127)
chr3 (155-345)||(53581766-53581956)
chr3 (155-346)||(40480750-40480941)
chr3 (153-347)||(52629840-52630022)
chr3 (155-345)||(27748565-27748746)
chr3 (154-345)||(1078229-1078411)
chr3 (208-349)||(53273645-53273786)
chr3 (156-298)||(51249357-51249499)
chr3 (154-245)||(29556866-29556956)
chr3 (248-349)||(10457893-10457994)
chr3 (154-350)||(11064629-11064823)
chr3 (248-350)||(4190266-4190368)
chr3 (248-350)||(9434121-9434223)
chr3 (259-348)||(25996267-25996356)
chr3 (248-349)||(52627978-52628079)
chr3 (248-347)||(34791829-34791928)
chr3 (248-347)||(51757593-51757692)
chr3 (245-350)||(29558232-29558337)
chr3 (154-227)||(4190172-4190245)
chr3 (155-227)||(9434244-9434316)
chr3 (158-233)||(19148882-19148957)
chr3 (253-297)||(19148829-19148873)
chr3 (175-223)||(45058584-45058632)
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (151-347)||(2614553-2614749)
chr5 (155-357)||(18033972-18034174)
chr5 (153-351)||(5256991-5257189)
chr5 (155-347)||(41334571-41334763)
chr5 (151-349)||(33801467-33801665)
chr5 (180-352)||(22512300-22512472)
chr5 (154-350)||(7617130-7617326)
chr5 (161-349)||(38470577-38470765)
chr5 (154-345)||(25914903-25915085)
chr5 (211-348)||(39122397-39122533)
chr5 (145-260)||(39122254-39122369)
chr5 (248-347)||(32473395-32473494)
chr5 (272-347)||(33855068-33855143)
chr5 (248-348)||(17208073-17208173)
chr5 (248-350)||(30622720-30622821)
chr5 (155-227)||(30622627-30622699)
chr5 (156-227)||(32473303-32473374)
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (152-347)||(11582766-11582961)
chr8 (152-350)||(36743388-36743586)
chr8 (154-350)||(30660649-30660845)
chr8 (159-345)||(29800862-29801048)
chr8 (155-348)||(2546995-2547188)
chr8 (156-348)||(42197344-42197536)
chr8 (154-345)||(30912469-30912660)
chr8 (161-347)||(29705362-29705548)
chr8 (155-348)||(31384663-31384856)
chr8 (155-356)||(42295186-42295386)
chr8 (154-345)||(20148762-20148953)
chr8 (183-352)||(5754898-5755067)
chr8 (161-347)||(2165877-2166063)
chr8 (156-345)||(26125637-26125825)
chr8 (153-346)||(45397317-45397509)
chr8 (154-347)||(1375542-1375735)
chr8 (155-294)||(9241605-9241744)
chr8 (155-350)||(3743768-3743963)
chr8 (248-348)||(18066719-18066819)
chr8 (155-348)||(40528542-40528736)
chr8 (251-345)||(42699259-42699353)
chr8 (248-351)||(35181512-35181615)
chr8 (248-349)||(34304786-34304887)
chr8 (248-350)||(33629994-33630096)
chr8 (153-227)||(35181636-35181710)
chr8 (254-348)||(16603633-16603727)
chr8 (154-227)||(34304908-34304980)
chr8 (253-346)||(16358839-16358933)
chr8 (182-227)||(18066653-18066698)
chr8 (314-347)||(28977146-28977179)
chr8 (155-227)||(10678060-10678132)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (152-347)||(24000917-24001112)
chr7 (161-347)||(42538345-42538531)
chr7 (155-344)||(26898310-26898499)
chr7 (161-331)||(27393174-27393344)
chr7 (154-347)||(5810831-5811024)
chr7 (153-345)||(44416840-44417032)
chr7 (155-345)||(43343532-43343722)
chr7 (159-350)||(5015392-5015583)
chr7 (154-345)||(44326180-44326371)
chr7 (155-345)||(10573751-10573941)
chr7 (155-349)||(41861672-41861868)
chr7 (154-345)||(4638106-4638297)
chr7 (161-338)||(32029731-32029908)
chr7 (150-347)||(42972852-42973049)
chr7 (154-347)||(45326020-45326213)
chr7 (154-345)||(16180264-16180454)
chr7 (154-348)||(35069720-35069914)
chr7 (161-348)||(9216301-9216487)
chr7 (155-348)||(43317442-43317635)
chr7 (179-309)||(38160511-38160641)
chr7 (155-348)||(5194139-5194332)
chr7 (155-348)||(24280504-24280697)
chr7 (259-356)||(40236910-40237007)
chr7 (154-267)||(47279631-47279744)
chr7 (280-347)||(39998408-39998475)
chr7 (248-347)||(31513287-31513386)
chr7 (248-350)||(27535232-27535334)
chr7 (248-350)||(33384867-33384970)
chr7 (248-346)||(31408634-31408732)
chr7 (153-227)||(40237039-40237113)
chr7 (154-227)||(31408540-31408613)
chr7 (154-227)||(31513407-31513480)
chr7 (311-348)||(38160658-38160695)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (161-348)||(9698247-9698434)
chr6 (156-347)||(13743130-13743321)
chr6 (156-347)||(13748630-13748821)
chr6 (154-350)||(26669916-26670112)
chr6 (149-345)||(24203889-24204085)
chr6 (154-350)||(26466796-26466992)
chr6 (154-352)||(3213395-3213593)
chr6 (154-351)||(7273242-7273439)
chr6 (153-356)||(21293583-21293787)
chr6 (159-350)||(7292744-7292935)
chr6 (154-348)||(21279928-21280122)
chr6 (155-345)||(30735984-30736174)
chr6 (161-352)||(7367544-7367735)
chr6 (156-347)||(30014343-30014534)
chr6 (248-345)||(27441544-27441641)
chr6 (248-349)||(33242401-33242502)
chr6 (248-347)||(33253913-33254012)
chr6 (280-348)||(31109255-31109323)
chr6 (154-227)||(27441662-27441735)
chr6 (155-227)||(33242523-33242595)
chr6 (144-227)||(33254034-33254118)
[»] chr1 (32 HSPs)
chr1 (155-350)||(5489773-5489968)
chr1 (155-347)||(43570994-43571186)
chr1 (155-349)||(48498870-48499064)
chr1 (155-351)||(23989431-23989628)
chr1 (154-351)||(24769406-24769603)
chr1 (156-347)||(37814778-37814969)
chr1 (153-345)||(4401329-4401522)
chr1 (154-345)||(7447828-7448018)
chr1 (149-345)||(2497464-2497660)
chr1 (154-348)||(750212-750406)
chr1 (153-347)||(50448166-50448360)
chr1 (151-299)||(4888091-4888238)
chr1 (248-348)||(45427746-45427846)
chr1 (248-349)||(44112675-44112776)
chr1 (248-347)||(48119628-48119727)
chr1 (248-347)||(35003294-35003393)
chr1 (248-347)||(46168383-46168482)
chr1 (248-349)||(45639733-45639834)
chr1 (348-429)||(34666533-34666614)
chr1 (248-348)||(41065152-41065252)
chr1 (248-348)||(45705824-45705924)
chr1 (248-347)||(35000114-35000213)
chr1 (248-347)||(38335918-38336017)
chr1 (254-348)||(38113202-38113296)
chr1 (154-227)||(44112797-44112870)
chr1 (175-225)||(47748463-47748513)
chr1 (248-349)||(26585460-26585561)
chr1 (301-349)||(14427345-14427393)
chr1 (155-227)||(35000021-35000093)
chr1 (154-227)||(35003414-35003487)
chr1 (155-227)||(45705945-45706017)
chr1 (447-483)||(34666634-34666670)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (154-345)||(43490308-43490499)
chr2 (154-348)||(30838631-30838825)
chr2 (154-346)||(19047158-19047350)
chr2 (152-350)||(4764631-4764829)
chr2 (155-347)||(1750414-1750606)
chr2 (161-351)||(12302167-12302357)
chr2 (155-347)||(16096747-16096940)
chr2 (155-349)||(43335671-43335865)
chr2 (143-305)||(42849754-42849916)
chr2 (188-347)||(13780676-13780835)
chr2 (154-346)||(34817683-34817875)
chr2 (179-348)||(42026766-42026937)
chr2 (208-345)||(8896544-8896681)
chr2 (248-352)||(43114552-43114656)
chr2 (150-297)||(39149197-39149342)
chr2 (248-345)||(11825655-11825752)
chr2 (248-349)||(16803966-16804067)
chr2 (248-349)||(16843248-16843349)
chr2 (253-345)||(33229303-33229396)
chr2 (248-345)||(41281975-41282072)
chr2 (248-347)||(12415461-12415560)
chr2 (248-347)||(12427521-12427620)
chr2 (248-350)||(34895742-34895844)
chr2 (254-348)||(18491704-18491798)
chr2 (248-349)||(966835-966936)
chr2 (262-345)||(4299435-4299518)
chr2 (262-345)||(6518484-6518566)
chr2 (258-345)||(7070418-7070505)
chr2 (248-317)||(4451951-4452020)
chr2 (154-227)||(34895648-34895721)
chr2 (155-227)||(11825562-11825634)
chr2 (155-227)||(16804088-16804160)
chr2 (155-227)||(16843370-16843442)
chr2 (155-227)||(43114677-43114749)
chr2 (154-227)||(6518401-6518474)
chr2 (145-227)||(18491825-18491907)
chr2 (155-227)||(4299328-4299400)
chr2 (154-227)||(41281881-41281954)
chr2 (314-347)||(42849913-42849946)
chr2 (155-227)||(966742-966814)
[»] scaffold0119 (1 HSPs)
scaffold0119 (154-350)||(682-878)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (154-346)||(112656-112848)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (155-345)||(27893750-27893940)
chr4 (154-350)||(27864561-27864757)
chr4 (155-349)||(33703139-33703333)
chr4 (154-347)||(27550309-27550502)
chr4 (154-350)||(55966253-55966449)
chr4 (153-350)||(23035977-23036174)
chr4 (154-349)||(1771173-1771368)
chr4 (154-349)||(28982729-28982924)
chr4 (155-345)||(43514594-43514784)
chr4 (155-344)||(23204686-23204875)
chr4 (155-347)||(35017733-35017924)
chr4 (158-348)||(48463361-48463551)
chr4 (155-345)||(43949709-43949900)
chr4 (155-349)||(25051691-25051885)
chr4 (153-345)||(31680904-31681096)
chr4 (154-345)||(43735744-43735935)
chr4 (159-347)||(45490225-45490413)
chr4 (154-352)||(28988468-28988665)
chr4 (161-347)||(12496956-12497142)
chr4 (179-345)||(39631102-39631269)
chr4 (152-347)||(27316617-27316813)
chr4 (154-348)||(21687005-21687199)
chr4 (155-305)||(51512173-51512323)
chr4 (154-346)||(41878407-41878592)
chr4 (153-345)||(41327449-41327641)
chr4 (160-347)||(41847971-41848158)
chr4 (248-347)||(17619153-17619252)
chr4 (153-293)||(56215804-56215943)
chr4 (167-294)||(46412389-46412516)
chr4 (248-349)||(711958-712059)
chr4 (248-357)||(55272377-55272486)
chr4 (253-345)||(3756252-3756344)
chr4 (248-348)||(32728356-32728456)
chr4 (248-348)||(48435580-48435680)
chr4 (259-350)||(35037002-35037093)
chr4 (248-345)||(38851515-38851612)
chr4 (267-349)||(960890-960972)
chr4 (154-227)||(19880074-19880147)
chr4 (267-348)||(49229684-49229765)
chr4 (155-227)||(55272284-55272356)
chr4 (301-352)||(46827760-46827811)
chr4 (151-227)||(3756156-3756232)
chr4 (248-312)||(19879989-19880053)
chr4 (275-307)||(49243934-49243966)
[»] scaffold0187 (2 HSPs)
scaffold0187 (155-348)||(14097-14289)
scaffold0187 (155-348)||(24425-24617)
[»] scaffold0385 (1 HSPs)
scaffold0385 (155-349)||(11249-11443)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (161-347)||(23335-23521)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (248-345)||(45720-45817)
scaffold0003 (154-227)||(45626-45699)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (248-347)||(35457-35556)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 33)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 46941247 - 46941050
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46941247 tagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagat 46941148  T
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttccttt 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46941147 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 46941050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 154 - 350
Target Start/End: Original strand, 54246055 - 54246251
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54246055 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacattctttacacccacataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 54246154  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttccttt 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54246155 aagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatctctaatacatagggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 54246251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 155 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 54237288 - 54237097
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54237288 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaatattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataa 54237189  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttc 346  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54237188 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 54237097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 154 - 346
Target Start/End: Original strand, 42394326 - 42394518
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42394326 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagata 42394425  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttc 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42394426 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggaatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 42394518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 155 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 40809057 - 40808863
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40809057 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 40808958  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 349  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  40808957 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatggggtgtaggaataaatggtgttgatgtaacattttcctt 40808863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 155 - 347
Target Start/End: Original strand, 45126836 - 45127028
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||    
T  45126836 gagtggtgatacatgtaccactccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctggcatgtggtaatctggaccccacataaatagaaaataa 45126935  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  45126936 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgggatgtatgaataaagggtgtttatgtaacattttcc 45127028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 155 - 351
Target Start/End: Original strand, 24688310 - 24688506
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24688310 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacccccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagataa 24688409  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttccttta 351  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24688410 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggagtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttccttta 24688506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 144 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 25413886 - 25413675
Alignment:
Q  144 tatatataat--agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacac 241  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  || || |||||||| ||||||||||| | |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25413886 tatatataatccagagtgatgatacatgtaccaccccatatgacaatacaccctttacacccacacaaaactctgacacgtggtaacctggaccccacac 25413787  T
Q  242 aaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaaca 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  25413786 aaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacataaggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaaca 25413687  T
Q  342 ttttcctttaat 353  Q
    ||||||| ||||    
T  25413686 ttttcctataat 25413675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 163 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 42100872 - 42100688
Alignment:
Q  163 atacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggt 262  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  42100872 atacatgtaccacctcatgtggcaatgcaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacctgaactccacacaaataaaagataaaatgtggt 42100773  T
Q  263 tgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42100772 tgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 42100688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 154 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 36150323 - 36150130
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36150323 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggactccacacaaatagaagata 36150224  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||| ||| || |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  36150223 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctgatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtattcatgtaacattttcc 36150130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 154 - 349
Target Start/End: Original strand, 47190933 - 47191127
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47190933 agagtgatgatacatgtaccattccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacatgtggtaacttggaccccacacaaatagaagata 47191032  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47191033 aagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatctctaatacatgg-gtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 47191127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 345
Target Start/End: Original strand, 53581766 - 53581956
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53581766 gagtgatgatacctgtaccaccctatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 53581865  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |  |||||||| |  |||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  53581866 agtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatacataggatgtacaatggagtgtatgaataaagagtgttcatgtaacatttt 53581956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 155 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 40480941 - 40480750
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40480941 gagtgatgatacatgtatcaccccatgcggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccctacacaaatagaagataa 40480842  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttc 346  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||| ||   || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40480841 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacataggatgtacaatggggcatatgaataaagggtgttcatgtaacattttc 40480750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 153 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 52630022 - 52629840
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  52630022 tagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtagcaacctggaccctacataaatagaagat 52629923  T
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||            ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52629922 aaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccttaatac------------atagggtgtaggaataaaaggtgttcatgtaatattttcc 52629840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 155 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27748746 - 27748565
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||         | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27748746 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacac---------cgacacaaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 27748656  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| |||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27748655 agtattgttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacataaggtgtataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 27748565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1078411 - 1078229
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  1078411 agagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctgaactccacacaaatagaagata 1078312  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
            ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||   |||||||||  | || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1078311 --------ttgtgagatgaacctacaaaaatat-cctaatacattaggtgtacaatgaggtgcaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 1078229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 208 - 349
Target Start/End: Original strand, 53273645 - 53273786
Alignment:
Q  208 aaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtaca 307  Q
    |||||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  53273645 aaaattctgatacgtggtaacctggatcccacataaataaaagataaagtatggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgggatgtaca 53273744  T
Q  308 ataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 349  Q
    ||  | | |||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  53273745 atgaggtataggaataaatgatgttcatataacattttcctt 53273786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 51249499 - 51249357
Alignment:
Q  156 agtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 255  Q
    ||||||||||||||||   ||| || ||  ||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  51249499 agtggtgatacatgtatatcctcatatgataatacactccttacattcatacaaaattctgacatgtggcaatctggatcccacacaaatagaagagaaa 51249400  T
Q  256 gtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatg 298  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||    
T  51249399 gtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatg 51249357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 245
Target Start/End: Original strand, 29556866 - 29556956
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29556866 agagtggtgatacatgtaccactacatgtggcaatacacaatttacacccatataaaa-tctgacatgtggcaacctgaaccccacacaaat 29556956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 349
Target Start/End: Original strand, 10457893 - 10457994
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10457893 aagagaaagtatggttgtgagataaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaaaggtgttcatgtaacattttcc 10457992  T
Q  348 tt 349  Q
    ||    
T  10457993 tt 10457994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 350
Target Start/End: Original strand, 11064629 - 11064823
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||| | ||||||||| | |||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||      
T  11064629 agagtggtgatacatgtacactcttgtgtgacaatacaccccttacacccacacaaaattttgacatgtggtaatctagaccccacacaaatagaagagt 11064728  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttccttt 350  Q
    ||||||| || ||||||||| | |  |||||||| ||||  ||| | |||||||||  | |||| ||||||| | ||||||  ||||||||||||||    
T  11064729 aagtgtgattatgagatgaattaatcaaaatatctctaaagcatagggtgtacaatgaggtgtatgaataaatgatgttca--taacattttccttt 11064823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 350
Target Start/End: Original strand, 4190266 - 4190368
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   |||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  4190266 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatctctaatacataaggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 4190365  T
Q  348 ttt 350  Q
    |||    
T  4190366 ttt 4190368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9434223 - 9434121
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||  |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  9434223 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagagtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 9434124  T
Q  348 ttt 350  Q
    |||    
T  9434123 ttt 9434121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 25996356 - 25996267
Alignment:
Q  259 tggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 348  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| |||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  25996356 tggttgtgagatgaatttaccaaaatgtccttaatatatggggtgtacaataagatgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcct 25996267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 248 - 349
Target Start/End: Original strand, 52627978 - 52628079
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||| | |||| ||||  ||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||    
T  52627978 aagagaaagtatgattgtgagatgaatttaccaaaatatacttaatgcatgaggtgtacaataggatgtatgattaaagggtgttcacgtaacattttcc 52628077  T
Q  348 tt 349  Q
    ||    
T  52628078 tt 52628079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 34791928 - 34791829
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||  || ||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  34791928 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattattaaaatgtccctaatgcatgaggtttacaatatggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 34791829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 51757692 - 51757593
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||| |||| || |||| |||||| |||||| |||||||    
T  51757692 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattactaaaatgtccataatgcatgaggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgtttatgtaatattttcc 51757593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 350
Target Start/End: Original strand, 29558232 - 29558337
Alignment:
Q  245 tagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattt 344  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||| |||| || |||| ||||||| || | |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||| |||||||     
T  29558232 tagaaaataaaatgtgattgtgagatgaatttaccaatatattcctaatatatagggtgtacaatgagatgtatgaataaagggtgttcatataacattg 29558331  T
Q  345 tccttt 350  Q
    ||||||    
T  29558332 tccttt 29558337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Original strand, 4190172 - 4190245
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  4190172 agagtggtgatacatgtatacccttatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 4190245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9434316 - 9434244
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9434316 gagtggtgatacatgtacactcccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 9434244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19148957 - 19148882
Alignment:
Q  158 tggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctgga 233  Q
    |||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  19148957 tggtgacacatgtacacccccatgtggcaatacaccacttacacccacacaaaattctgacatatggcaacctgga 19148882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 253 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19148873 - 19148829
Alignment:
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacat 297  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  19148873 aaagtgtgattgtgagataaatttactaaaatgtccctaatacat 19148829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 45058632 - 45058584
Alignment:
Q  175 ccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtg 223  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  45058632 ccttaggtggcaatacacccttgacacccacataaaaatctgacatgtg 45058584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 151 - 347
Target Start/End: Original strand, 2614553 - 2614749
Alignment:
Q  151 aatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaag 250  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2614553 aatagagtaatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaag 2614652  T
Q  251 ataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2614653 ataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 2614749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 155 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18034174 - 18033972
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18034174 gagtgatgatacatgtaccaccccatatggcaatacaccctttacacccatataaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 18034075  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcctttaatt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18034074 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggagtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttaaatt 18033975  T
Q  355 ata 357  Q
    |||    
T  18033974 ata 18033972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 153 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 5257189 - 5256991
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  5257189 tagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggcaatcttgaccccacataaatagaagat 5257090  T
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttccttta 351  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  5257089 aaagtgtggttgtgagatgaaattaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgggatgtatgaataaatggtgtttatgtaacatttttcttta 5256991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 155 - 347
Target Start/End: Original strand, 41334571 - 41334763
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41334571 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 41334670  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||  | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41334671 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatgaggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcc 41334763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 151 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 33801665 - 33801467
Alignment:
Q  151 aatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaag 250  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  |  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  33801665 aatagagtgatgatatatgtaccttcccatgtggcaatacactctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggatcccacacaaatagaag 33801566  T
Q  251 ataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  33801565 ataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaatggggtgtagaaataaaggatgttcatgtaacattttcctt 33801467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 180 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22512472 - 22512300
Alignment:
Q  180 tgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttact 279  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22512472 tgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacc 22512373  T
Q  280 aaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcctttaa 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22512372 aaaatatccctaatacatggagtgtacaatggagtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccattaa 22512300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 154 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7617326 - 7617130
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||||    
T  7617326 agagtgatgatacatgtatcaccccatgtggcaatacaccttttacaccaacacaaaattctgacatgtgacaacttagatcccacataaatagaagata 7617227  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttccttt 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7617226 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtataatggagtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 7617130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 161 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 38470765 - 38470577
Alignment:
Q  161 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 260  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38470765 tgatacatgtaccacctcatatggcaatacaccctttacacccacataaaattctgatacgtggtaatctggaccccacataaatagaagataaagtgtg 38470666  T
Q  261 gttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 349  Q
     |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  38470665 attgtgaaatgaatttaccaaaatatccttaatacatggggtgtacaatggaatgtatgaataaagggtgtttatgtaacattttcctt 38470577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 25914903 - 25915085
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25914903 agagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccatttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 25915002  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
            || |||||||||| ||| |||||||  ||||||||| | |||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25915003 --------ttatgagatgaacctacaaaaatat-tctaatacattgggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 25915085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 211 - 348
Target Start/End: Original strand, 39122397 - 39122533
Alignment:
Q  211 attctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaata 310  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||  |||     
T  39122397 attctgacatgtggcaacctaaaccccacacaaatagaagataaagtgtagttgtgagatgaatttaccaaaatattcctaatacatgg-gtgtctaatt 39122495  T
Q  311 ggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 348  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  39122496 agatgtatgaataaaaggtgttcatgtaatagtttcct 39122533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 260
Target Start/End: Original strand, 39122254 - 39122369
Alignment:
Q  145 atatataatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaa 244  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |   |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39122254 atatattaaagagtggtgatacatgtaccaccccatgtgacaatatatcatttacatccacacaagattctgacatgtggcaacctaaaccccacacaaa 39122353  T
Q  245 tagaagataaagtgtg 260  Q
    ||||||||||||||||    
T  39122354 tagaagataaagtgtg 39122369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 347
Target Start/End: Original strand, 32473395 - 32473494
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||  |||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  32473395 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatatccctaatgcatgtggtgtacaataaggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 32473494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 347
Target Start/End: Original strand, 33855068 - 33855143
Alignment:
Q  272 aacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33855068 aacttaccaaaatgttcctaatacatggggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 33855143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17208173 - 17208073
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||   |||| || |||| |||||||| ||||||||||||    
T  17208173 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatgtccttaatgcatggggtgtacaataaagtgtatgattaaagggtgttcacgtaacattttcc 17208074  T
Q  348 t 348  Q
    |    
T  17208073 t 17208073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 350
Target Start/End: Original strand, 30622720 - 30622821
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||||  | ||||||||| |||| || |||| | |||||||||||||||||||    
T  30622720 aagagaaagtatggttgtgagataaatttaccaaaatatccttaatgcatgggct-tacaatagggtgtatgattaaaggatgttcatgtaacattttcc 30622818  T
Q  348 ttt 350  Q
    |||    
T  30622819 ttt 30622821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Original strand, 30622627 - 30622699
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  30622627 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaattttgacatgtggcaa 30622699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 227
Target Start/End: Original strand, 32473303 - 32473374
Alignment:
Q  156 agtggtgatacatgtaccacctt-atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  32473303 agtggtgatacatgtac-acctccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 32473374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 148; Significance: 7e-78; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 152 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11582961 - 11582766
Alignment:
Q  152 atagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaaga 251  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11582961 atagagtaatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaaga 11582862  T
Q  252 taaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11582861 taaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 11582766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 152 - 350
Target Start/End: Original strand, 36743388 - 36743586
Alignment:
Q  152 atagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaaga 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36743388 atagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaaga 36743487  T
Q  252 taaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttccttt 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36743488 taaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 36743586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 154 - 350
Target Start/End: Original strand, 30660649 - 30660845
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30660649 agagtgatgatacatgtatcatcctatgtggcaatacaccctttacatccacataaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 30660748  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttccttt 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30660749 aagtgtggttgtaagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 30660845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 159 - 345
Target Start/End: Original strand, 29800862 - 29801048
Alignment:
Q  159 ggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtg 258  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  29800862 ggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggcaatcttgaccccacataaatagaagataaagtg 29800961  T
Q  259 tggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  29800962 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgggatgtatgaataaatggtgtttatgtaacatttt 29801048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 155 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2547188 - 2546995
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2547188 gagtgatgatacatgtaccaccctatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggatcccacacaaatagaagataa 2547089  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2547088 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatggagtgtagaaataaagagtgttcatgtaacattttcct 2546995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 348
Target Start/End: Original strand, 42197344 - 42197536
Alignment:
Q  156 agtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 255  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42197344 agtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaa 42197443  T
Q  256 gtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42197444 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagtgtgtgcaatggggtgtaggaataaatggtgttcatgtaacattttcct 42197536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 30912469 - 30912660
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30912469 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctagaccccacacaaatagaagata 30912568  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30912569 aggtgcggttgtgagatgaacttaccaaaatacccctaatacatgaagtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 30912660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 161 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29705548 - 29705362
Alignment:
Q  161 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 260  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29705548 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccgcacaaatagaagataaagtgtg 29705449  T
Q  261 gttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29705448 gttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatacatggggtgtacaatggggtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcc 29705362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 155 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31384856 - 31384663
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31384856 gagtgatgatatatgtaccaccccatgtggcaatataccctttacatccacataaaattctgacacgtagcaacctggaccccacacaaatagaagataa 31384757  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 348  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  31384756 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatattcctaatacatggggtgtacaatagaatgtaagaataaagggtgttcatgtaatactttcct 31384663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 155 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 42295386 - 42295186
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  42295386 gagtgatgataaatgtaccatcctatgtggcaatataccctttacatccacacaaaattctgacatgtggcaacttggaccc-acataaatagaagataa 42295288  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcctttaatt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  42295287 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggagtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttttcttttatt 42295188  T
Q  355 at 356  Q
    ||    
T  42295187 at 42295186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20148953 - 20148762
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  20148953 agagtggtgatacatgtaccacaccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggatcccacataaatagatgata 20148854  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20148853 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatatatgaggtgtacaatgggatgtatgaataaagggtgtttatgtaacatttt 20148762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 183 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 5755067 - 5754898
Alignment:
Q  183 ggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaa 282  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5755067 ggcaatacaccctttacacccacacaaaattctaacacgtggcaacttggatcccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaa 5754968  T
Q  283 atatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcctttaa 352  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5754967 atatccctaatatatgggatgtacaatgggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcctttaa 5754898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 161 - 347
Target Start/End: Original strand, 2165877 - 2166063
Alignment:
Q  161 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 260  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2165877 tgatacatgtaccatcccatgtgacaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctgaaccccacacaaatagaagataaagtgtg 2165976  T
Q  261 gttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2165977 gttatgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatggggtatacaatggggtgtaggaataaatggtgttcatgtaatattttcc 2166063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 156 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26125825 - 26125637
Alignment:
Q  156 agtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 255  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26125825 agtggtgatatatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccgcataaaattctgacacgtggcaatctggaccc-acataaatagaagataaa 26125727  T
Q  256 gtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  26125726 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggaatgtatgaataaagggtgtttatgtaacatttt 26125637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 153 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 45397509 - 45397317
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  45397509 tagagtgatgatacatgtaccaccc-atgtggcaacacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaatctggagcccacacaaatagaagat 45397411  T
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttc 346  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  45397410 aaattgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacatagggtgtagaatggggtgtaggaataaagggtgttcacgtaacattttc 45397317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 154 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1375735 - 1375542
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||| | || ||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  1375735 agagtggtgatacatgtaccaccctatgtgacaatacattctttacacccacacaagattctaacacgtggcaatctgaactccacacaaatagaagata 1375636  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1375635 aagtgtagttgtgagataaatttaccaaaatatccctaatatatggggtgtacaattgggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaaaattttcc 1375542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 155 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9241744 - 9241605
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9241744 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaacacaccctttgcacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagataa 9241645  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaata 294  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9241644 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaata 9241605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 155 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3743963 - 3743768
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||    
T  3743963 gagtgatgatatatgtaccaccccatgtagcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctgaaccctacataaatagaagataa 3743864  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttccttt 350  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||| ||||| ||| ||| | | ||||||| |||||  ||| |||||||| ||||    
T  3743863 agtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatacttaatatatggggtgtataatgggagggatgaataaagggtgtatatggaacatttttcttt 3743768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 348
Target Start/End: Original strand, 18066719 - 18066819
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  18066719 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattactaaaatatccctaatacatgggatgtacaatagaatgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 18066818  T
Q  348 t 348  Q
    |    
T  18066819 t 18066819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 155 - 348
Target Start/End: Original strand, 40528542 - 40528736
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    |||||||||||||||| |  ||| ||||| ||||| |   |||||| ||| | |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  40528542 gagtggtgatacatgtgcaccctcatgtgacaatatatcatttacatccacacaaaattatgacatgtgacaacttgaaccccacacaaatagaagagaa 40528641  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaa-ggtgttcatgtaacattttcct 348  Q
    |||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||| |||| ||||||||| || | |  |||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  40528642 agtgtggttgtgagataaatttatcaaaatgtccctaatatatggggtgtacaatggggtttgtgaataaaagggtgttcatgtattattttcct 40528736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 251 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 42699353 - 42699259
Alignment:
Q  251 ataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42699353 ataaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccataatacataaggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 42699259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 248 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 35181615 - 35181512
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  35181615 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 35181516  T
Q  348 ttta 351  Q
    ||||    
T  35181515 ttta 35181512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 34304887 - 34304786
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||||||||||    
T  34304887 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaaggatgttcatgtaacattttcc 34304788  T
Q  348 tt 349  Q
    ||    
T  34304787 tt 34304786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 350
Target Start/End: Original strand, 33629994 - 33630096
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||  | |||| || |||| ||||||| ||||||||||| |    
T  33629994 aagagaaagtatagttgtgagatgaaattactaaaatgtccctaatgcatagggtgtacaatgaggtgtatgattaaagggtgttcgtgtaacatttttc 33630093  T
Q  348 ttt 350  Q
    |||    
T  33630094 ttt 33630096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35181710 - 35181636
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccacctt-atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  35181710 tagagtggtgatacatgtac-accttcatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 35181636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 348
Target Start/End: Original strand, 16603633 - 16603727
Alignment:
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 348  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||  |||| ||||| ||||| |||| | |||| || |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16603633 aagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatgtctttaatgcatggggtgtataataaggtgtatgattaaagggtgtgcatgtaacattttcct 16603727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34304980 - 34304908
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  34304980 agagtggtgatacatgtac-accccatgtggcaatacacctcttacacccaaacaaaatcctgacatgtggcaa 34304908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 346
Target Start/End: Original strand, 16358839 - 16358933
Alignment:
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttc-atgtaacattttc 346  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| | |||| |||||  ||||||||||| |||| || |||| ||| ||| |||||||||||||    
T  16358839 aaagtatggttgtgagatgaatttatcaaaatattcttaatgcatgggatgtacaatagggtgtatgattaaagggtcttcaatgtaacattttc 16358933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 227
Target Start/End: Original strand, 18066653 - 18066698
Alignment:
Q  182 tggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18066653 tggcaatacacctcttacacccacataaaattctgacatgtggcaa 18066698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28977179 - 28977146
Alignment:
Q  314 tgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28977179 tgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 28977146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Original strand, 10678060 - 10678132
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  10678060 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacatctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 10678132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 148; Significance: 7e-78; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 152 - 347
Target Start/End: Original strand, 24000917 - 24001112
Alignment:
Q  152 atagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaaga 251  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24000917 atagagtaatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaaga 24001016  T
Q  252 taaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24001017 taaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 24001112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 161 - 347
Target Start/End: Original strand, 42538345 - 42538531
Alignment:
Q  161 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42538345 tgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 42538444  T
Q  261 gttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42538445 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 42538531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 155 - 344
Target Start/End: Original strand, 26898310 - 26898499
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26898310 gagtggtgatacatgtaccatcctatgtggcaatacaccttttacacccacataaaattctgacacgtggtaacctggaccccacacaaatagaatataa 26898409  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattt 344  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26898410 agtgtggttgtaagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggaatgtacaattgggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattt 26898499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 161 - 331
Target Start/End: Original strand, 27393174 - 27393344
Alignment:
Q  161 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 260  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27393174 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacatcctttacacccacataaaattctgacatgaggcaacctggaccccacataaatagaagataaagtgtg 27393273  T
Q  261 gttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgt 331  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27393274 gttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacatagagtgtacaataggatgtaggaataaagggtgt 27393344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 154 - 347
Target Start/End: Original strand, 5810831 - 5811024
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5810831 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattttgacatgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 5810930  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5810931 aagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatatatagggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtggtcatgtaacattttcc 5811024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Original strand, 44416840 - 44417032
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||| | ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44416840 tagagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccttttacatccacacaaatttctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagat 44416939  T
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  44416940 aaagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatacatggggtgtacaatagggtgtagaaataaatgatgttcatgtaacatttt 44417032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 155 - 345
Target Start/End: Original strand, 43343532 - 43343722
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||| | ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43343532 gagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccttttacatccacacaaatttctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 43343631  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  43343632 agtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatacatggggtgtacaatagggtgtagaaataaatgatgttcatgtaacatttt 43343722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 159 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5015583 - 5015392
Alignment:
Q  159 ggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtg 258  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| || | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5015583 ggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacactcacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtg 5015484  T
Q  259 tggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttccttt 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5015483 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatggagtgtagaaataaagagtgttcatgtaacattttccttt 5015392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 44326371 - 44326180
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  44326371 agagtggtgatacatgtaccacaccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggatcccacataaatagatgata 44326272  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  44326271 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatatatgaggtgtacaatgggatgtatgaataaagggtgtttatgtaacatttt 44326180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10573941 - 10573751
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  10573941 gagtggtgatacatgtaccaccgcatgtgacaatatatcctttacacccacataaaattctgatatgtggcaatcttgaccccacataaatagaagataa 10573842  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10573841 agtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatattcctaatacatggggtgtacaataggatgtatgaataaagggtgtttatgtaacatttt 10573751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 41861868 - 41861672
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41861868 gagtggtgatacatgtaccactccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccatacaaatagaagataa 41861769  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccc--taatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 349  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  |||||||| | ||||| ||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41861768 agtgtggttgtgagataaacttaccaaaatatctctataatacatagggtgtataattgggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 41861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 4638106 - 4638297
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4638106 agagtggtgatacatgtaccaccctacgtgacaatacaccctttacatccatacaagattctgacacgtggtaacctagaccccacacaaatagaagata 4638205  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4638206 aagtatggttgtgagatgaacttaccaaaatatccataatatatggggtgtacaattgagtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacatttt 4638297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 161 - 338
Target Start/End: Original strand, 32029731 - 32029908
Alignment:
Q  161 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 260  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32029731 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagataaagtgtg 32029830  T
Q  261 gttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgta 338  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||    
T  32029831 gttgttagatgaatttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatggggtgtaggaataaaaagtgtttatgta 32029908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 150 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 42973049 - 42972852
Alignment:
Q  150 taatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaa 249  Q
    |||||||||  |||||||||||| | | |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42973049 taatagagtaatgatacatgtactatcctatgtggcaatacaccatttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaa 42972950  T
Q  250 gataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  42972949 gataaaatgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatggagtgtaggaataaaggatgttcaggtaacattttcc 42972852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 154 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 45326213 - 45326020
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||| |  |||||||||||| ||||||||||||    
T  45326213 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtgacaatacaccatttacacccacataaaattctgacaggtggtagtctggaccccacataaatagaagata 45326114  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  45326113 aagtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatatatggggtgtacaatgtgatgtatgaataaaaggtgtttatgtaacactttcc 45326020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 16180264 - 16180454
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16180264 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 16180363  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||||| ||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16180364 aagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatatttataatacgtggggtgtacaat-gggtgtaggaataaatggtgttgatgtaacatttt 16180454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 154 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 35069914 - 35069720
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||| | | | |||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  35069914 agagtgatgatacatgtaccatcctatgtggcaatatatcctttacatctacacaaaattctgacacgtggcaacttggacctcacataaatagaagata 35069815  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35069814 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatgaggtgtaggaataaagagtgttcatgtaacattttcct 35069720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 161 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9216487 - 9216301
Alignment:
Q  161 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 260  Q
    ||||| || |||||||  ||||| ||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9216487 tgatatatataccaccccatgtgacaatacaccttttacatccacacaaaattctgacatgcggcaacttaaaccccacacaaatagaagataaaatgtg 9216388  T
Q  261 gttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 348  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9216387 gttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatgcatgg-gtgtacaataggatataggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 9216301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 155 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 43317635 - 43317442
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |    
T  43317635 gagtggtgatacatgtacacccttgtgtggcaatacaccccttacacccacacaaaattctgacatgtggcaatctagaccccacacaaatagaagagta 43317536  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 348  Q
    |||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||  ||| |  ||||||||  | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43317535 agtgtgattgtgagatgaatttatcaaaatatccctaaagcataggatgtacaatgaggtgtatgaataaatggtgttcatgtaacattttcct 43317442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 179 - 309
Target Start/End: Original strand, 38160511 - 38160641
Alignment:
Q  179 atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttac 278  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  38160511 atgtggcaatacaccccttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagataaagtgtagttgtgagatgaagttac 38160610  T
Q  279 taaaatatccctaatacatggagtgtacaat 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38160611 taaaatatccctaatacatggggtgtacaat 38160641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 155 - 348
Target Start/End: Original strand, 5194139 - 5194332
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||  | ||||||||| | |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |    
T  5194139 gagtagtgatacatgtacacccttgtgtggcaatacaacccttacacccacacaaaattttgacatgtggcaatctagaccccacacaaatagaagagta 5194238  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 348  Q
    |||||| |||||||||||| |||  ||||||||| ||| |||| | |||||||||  | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5194239 agtgtgattgtgagatgaatttatcaaaatatccttaaaacatagggtgtacaatgaggtgtatgaataaatggtgttcatgtaacattttcct 5194332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 155 - 348
Target Start/End: Original strand, 24280504 - 24280697
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| |||  |||||||   |||||| |  | |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  24280504 gagtggtgatacatgtacacctttacgtgataatacacctcttacactcgcacaaaattctgatatatggcaacttggaccccacacaaatagaagagaa 24280603  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 348  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| | |||||  |||| |||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24280604 agtgtgattgtgagatgaatttaccaaaatatttctagtgcatgggatgtagaatagggtgtatgaataaagggtgttcacgtaacattttcct 24280697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 40237007 - 40236910
Alignment:
Q  259 tggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcctttaattat 356  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40237007 tggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaataggatgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcctttagttat 40236910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 267
Target Start/End: Original strand, 47279631 - 47279744
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |  || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| || | | ||||||||||||    
T  47279631 agagtggtgatacatgtaccatcccatctgacaatacaccctttatacccacataaaattctgatatgtggtaatctggatcctatataaatagaagata 47279730  T
Q  254 aagtgtggttgtga 267  Q
    ||||||||||||||    
T  47279731 aagtgtggttgtga 47279744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 280 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 39998475 - 39998408
Alignment:
Q  280 aaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  39998475 aaaatatccctaatacatggggtgtacaataggatgtatgattaaaatgtgttcatgtaacattttcc 39998408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31513386 - 31513287
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| || ||||||||| |||| || ||||  ||||||||||||||||||||    
T  31513386 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtatacaatagggtgtatgattaaagagtgttcatgtaacattttcc 31513287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 248 - 350
Target Start/End: Original strand, 27535232 - 27535334
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||  |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  27535232 aagagaaagtatagttgtgagatgaaattaccaaaatgtctttaacacatggagtgtacaatagagtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 27535331  T
Q  348 ttt 350  Q
    |||    
T  27535332 ttt 27535334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 33384970 - 33384867
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaata-ggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttc 346  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||| || |||| || |||| | ||||||||||||||||||    
T  33384970 aagagaaagtatgtttgtgagatgaatttaccaaaatgtccctaatgcatggagtatacaataggggtgtatgattaaatgatgttcatgtaacattttc 33384871  T
Q  347 cttt 350  Q
    ||||    
T  33384870 cttt 33384867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 346
Target Start/End: Original strand, 31408634 - 31408732
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttc 346  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||  ||||||||||  |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  31408634 aagagaaagtatggttgtgaaatgaatttaccaaaatatccttaatgcatgggatgtacaatagagtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttc 31408732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40237113 - 40237039
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  40237113 tagagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 40237039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Original strand, 31408540 - 31408613
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31408540 agagtggtgatacatgtacacccccatgtgacaatacacctcttacacccacataaaatcctgacatgtggcaa 31408613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31513480 - 31513407
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||| | | | ||||| ||||||||||||||    
T  31513480 agagtggtgatacatgtacacccttatgtggcaatacacctcttacatctacacaaaatcctgacatgtggcaa 31513407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 348
Target Start/End: Original strand, 38160658 - 38160695
Alignment:
Q  311 ggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 348  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38160658 ggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 38160695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 148; Significance: 7e-78; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 161 - 348
Target Start/End: Original strand, 9698247 - 9698434
Alignment:
Q  161 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9698247 tgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 9698346  T
Q  261 gttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 348  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9698347 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcct 9698434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 347
Target Start/End: Original strand, 13743130 - 13743321
Alignment:
Q  156 agtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13743130 agtggtgatacatgtaccaccctatgtggcaatatatcctttacacccacacaagattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 13743229  T
Q  256 gtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13743230 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaattggatgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 13743321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 347
Target Start/End: Original strand, 13748630 - 13748821
Alignment:
Q  156 agtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13748630 agtggtgatacatgtaccaccctatgtggcaatatatcctttacacccacacaagattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 13748729  T
Q  256 gtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13748730 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaattggatgtatgaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 13748821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 154 - 350
Target Start/End: Original strand, 26669916 - 26670112
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26669916 agagcggtgatatatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggactccacacaaatagaagata 26670015  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttccttt 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26670016 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 26670112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 149 - 345
Target Start/End: Original strand, 24203889 - 24204085
Alignment:
Q  149 ataatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaataga 248  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24203889 ataattgagtgatgatacatgtaccactccatgtgacaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaataga 24203988  T
Q  249 agataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24203989 atataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggagtgtacaatagggtgtaggaataaatggtgttcatgtaacatttt 24204085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 154 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26466992 - 26466796
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26466992 agagtgatgatacatttaccaccctatgtggcaatacaccttttacacccatacaaaatcctgatacgtggcaacctgaaccccaaacaaatagaagata 26466893  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttccttt 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26466892 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaataaccctaatacatggagtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgtttatgtaacattttccttt 26466796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 154 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 3213593 - 3213395
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3213593 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaagata 3213494  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcctttaa 352  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  3213493 aagtatggttgtgaaatgaatttaccaaaatatccttaatacatggggtgtacaatgagatgtatgaataaagggtgtttatgtaacattttcctttaa 3213395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 154 - 351
Target Start/End: Original strand, 7273242 - 7273439
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| |||| |||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  7273242 agagtgatgatgcatgtaccaccccatgtggtaatacactctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagata 7273341  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttccttta 351  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7273342 aagtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatggggtgtacaataaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttta 7273439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 153 - 356
Target Start/End: Original strand, 21293583 - 21293787
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21293583 tagagtggtgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaagat 21293682  T
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcct-tta 351  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |   ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  21293683 aaagtgtggttgtgaaatgaatttaccaaaatatccttaatacatggggtgtacagtgaaatgtatgaataaagggtgtttatgtaacattttcctatta 21293782  T
Q  352 attat 356  Q
    |||||    
T  21293783 attat 21293787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 159 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7292935 - 7292744
Alignment:
Q  159 ggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtg 258  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7292935 ggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacacaaacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtg 7292836  T
Q  259 tggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttccttt 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||  | |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  7292835 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatgaggtgtatgaataaatggtgttcttgtaacattttccttt 7292744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 154 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21280122 - 21279928
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21280122 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatataccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 21280023  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 348  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21280022 aagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatatccctaatacatgggatgtgcaatggaatgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcct 21279928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 30736174 - 30735984
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30736174 gagtgatgatacatgtaccatcccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagataa 30736075  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30736074 agtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatatcactaatacatgaggtgtacaatggggtgtaggaataaaaagtgttcatgtaacatttt 30735984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 161 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 7367735 - 7367544
Alignment:
Q  161 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 260  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  7367735 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggatcccacataaatagaaaataaagtgtg 7367636  T
Q  261 gttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcctttaa 352  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  | |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  7367635 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgggatgtacaatgaggtgtatgaataaatgatgttcatataacattttcctttaa 7367544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 156 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 30014534 - 30014343
Alignment:
Q  156 agtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 255  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  30014534 agtgatgatacatgtatcaccccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggtaacttggaccccatataaatagaagataaa 30014435  T
Q  256 gtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30014434 gtatggttgtgagatgaacttaccaaaatatgcctaatacatgggatgtataatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 30014343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 248 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27441641 - 27441544
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  27441641 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatacataggatgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacatttt 27441544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 248 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 33242502 - 33242401
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  33242502 aagagaaagtatgtttgtgagatgaatttaccaaaatgtccttaatacatggggtgtacaataaggtgtatgattaaatggtgttcatgtaacattttcc 33242403  T
Q  348 tt 349  Q
    ||    
T  33242402 tt 33242401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 33254012 - 33253913
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||||||||| || |||||||||||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||| |||  || |||| |||||||||||||||||||||    
T  33254012 aagataaagtatgattgtgagatgaatttaccaatatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtgtgattaaatggtgttcatgtaacattttcc 33253913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 348
Target Start/End: Original strand, 31109255 - 31109323
Alignment:
Q  280 aaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 348  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||| ||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  31109255 aaaatatccctagtgcatggggtgtataatgggatgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcct 31109323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27441735 - 27441662
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtac-caccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27441735 agagtggtgatacatgtacacaccc-atgtggcaatacacctcttacacccacataaaatcctgacatgtggcaa 27441662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33242595 - 33242523
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  33242595 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 33242523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33254118 - 33254034
Alignment:
Q  144 tatatata-atagagtggtgatacatgtaccacctt-atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||| ||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  33254118 tatatatatatagagtggtgatacatgtac-acctccatgtggcaatacaccttttatacccacacaaaatccggacatgtggcaa 33254034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 148; Significance: 7e-78; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 155 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5489968 - 5489773
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5489968 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 5489869  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttccttt 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5489868 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 5489773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 155 - 347
Target Start/End: Original strand, 43570994 - 43571186
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43570994 gagtgatgatatatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 43571093  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43571094 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 43571186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 155 - 349
Target Start/End: Original strand, 48498870 - 48499064
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48498870 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 48498969  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 349  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  48498970 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatggagtgtagaaataaagagtgttcatgtaacattttcctt 48499064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 155 - 351
Target Start/End: Original strand, 23989431 - 23989628
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23989431 gagtggtgatacatgtaccaccctatatggcaatacaccctttacacccacacaagattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 23989530  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaa-ggtgttcatgtaacattttccttta 351  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| | || |||||| |  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23989531 agtgtggttgtgagataaatttaccaaaatatccctaatacatagggtatacaattgagtgtatgaataaaagggtgttcatgtaacattttccttta 23989628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 154 - 351
Target Start/End: Original strand, 24769406 - 24769603
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24769406 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 24769505  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttccttta 351  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24769506 aagtgtggttgtgataagaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatggagtgtagaaataaaaggtgttcatgaaacattttccttta 24769603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 156 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 37814969 - 37814778
Alignment:
Q  156 agtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 255  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  37814969 agtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccatataaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaagataaa 37814870  T
Q  256 gtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  37814869 gtgtggttgtgaaatgaatttaccaaaatatccttaatacatggggtgtacaatgagatgtatgaataaagggtgtttatgtaacattttcc 37814778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4401522 - 4401329
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  4401522 tagagtgatgatacatgtaccaccctatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcatattggaccccacacaaatagaagat 4401423  T
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaag-gtgttcatgtaacatttt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4401422 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatggggtgtacaatgaagtgtaggaataaaagagtgttcatgtatcatttt 4401329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 7448018 - 7447828
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7448018 agagtgatgatacatgtaccattccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 7447919  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7447918 aagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatctgtaatacatgg-gtgtacaatgggatgtaggaataaaggatgttcatgtaacatttt 7447828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 149 - 345
Target Start/End: Original strand, 2497464 - 2497660
Alignment:
Q  149 ataatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaataga 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||| |||||||    
T  2497464 ataatagagtggtgatacatgtaccacaccatgtggcaatacaccctttatacccacataaaattctgacacgtgacaatctggatcccacataaataga 2497563  T
Q  249 agataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  2497564 tgataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccttaatatatggggtgtacaatggaatgtatgaataaatggtgtttatgtaacatttt 2497660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 154 - 348
Target Start/End: Original strand, 750212 - 750406
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  750212 agagtgatgatacatgtaccatcccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggtaacatggaccccacacaaatagaagata 750311  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 348  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||  || |||||||| |||||||||||||    
T  750312 aagtgtggttttgagatgaatttatcaaaatatccctgatacatggggtgtacaatggggtgtaggaaataagggtgttcacgtaacattttcct 750406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 347
Target Start/End: Original strand, 50448166 - 50448360
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  50448166 tagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacatggaacccacaaaaatagaagat 50448265  T
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |  ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  50448266 aaaatgtggttgtaagatgaacttacaaaaatatccctaatacataaggtgtacaatggagtgtagaaataaagagtgttcatgtaacattttcc 50448360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 151 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4888238 - 4888091
Alignment:
Q  151 aatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaag 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||| ||| | |||||||||| |  ||||||  ||||| ||||||||||||||     
T  4888238 aatagagtgatgatacatgtaccaccc-atgtggcaatatatcctttacatccacacaaaattctgatacatggcaatttggacaccacacaaatagaaa 4888140  T
Q  251 ataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatgg 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4888139 ataaagtgtggttgtgagataaacttaccaaaatatccctaatacatgg 4888091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 248 - 348
Target Start/End: Original strand, 45427746 - 45427846
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  45427746 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggagtgtacaatagggtgtatgattaaaaggtattcatgtaacattttcc 45427845  T
Q  348 t 348  Q
    |    
T  45427846 t 45427846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 44112776 - 44112675
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  44112776 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 44112677  T
Q  348 tt 349  Q
    ||    
T  44112676 tt 44112675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 248 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 48119727 - 48119628
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  48119727 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 48119628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 35003393 - 35003294
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||  |||| |||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  35003393 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgtatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 35003294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 46168482 - 46168383
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| | |||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||    
T  46168482 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcattgggtgtacaataggatatatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 46168383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 248 - 349
Target Start/End: Original strand, 45639733 - 45639834
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||    
T  45639733 aagagaaagtatgattgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgtatggggtgtacaataggatgtatgattaaagagtgttcatgtaacattttcc 45639832  T
Q  348 tt 349  Q
    ||    
T  45639833 tt 45639834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 348 - 429
Target Start/End: Original strand, 34666533 - 34666614
Alignment:
Q  348 tttaattataccttttcattgcaccnnnnnnntatattaaattctttcattgttctttaagcaattagtagttatgttcagt 429  Q
    ||||||||||||||||||||| |||       ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34666533 tttaattataccttttcattgtaccaaaaatttatattaaattctttgattgttctttaagcagttagtagttatgttcagt 34666614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 248 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 41065252 - 41065152
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  41065252 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgcccctaatgcatggggtgtacaacagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 41065153  T
Q  348 t 348  Q
    |    
T  41065152 t 41065152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 248 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 45705924 - 45705824
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||  ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||||||    
T  45705924 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttatcaaaatgtccataatgcatggagtgtacaatagaatgtatgattaaagggtgttcatataacattttcc 45705825  T
Q  348 t 348  Q
    |    
T  45705824 t 45705824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 347
Target Start/End: Original strand, 35000114 - 35000213
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  35000114 aagagaaagtatggttgtgagataaatttatcaaaatgtccctaatacatgaagtatacaatagagtgtatgattaaaaggtgttcatgtaacattttcc 35000213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 38336017 - 38335918
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||  ||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  38336017 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatgggatgtacaataaggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 38335918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 348
Target Start/End: Original strand, 38113202 - 38113296
Alignment:
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 348  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||  |||| ||||| |||||||||||| |||| || |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  38113202 aagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatgtcattaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatataacattttcct 38113296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44112870 - 44112797
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccacctt-atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  44112870 agagtggtgatacatgtac-accttcatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 44112797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 225
Target Start/End: Original strand, 47748463 - 47748513
Alignment:
Q  175 ccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggc 225  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  47748463 ccttaggtggcaatacacccttgacacccatataaaaatctgacatgtggc 47748513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 26585561 - 26585460
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||   |||| || ||||   ||||||| |||||||||||    
T  26585561 aagagaaagtatgattgcgagatgaatttactaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatatagtgtatgattaaagaatgttcatctaacattttcc 26585462  T
Q  348 tt 349  Q
    ||    
T  26585461 tt 26585460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 14427393 - 14427345
Alignment:
Q  301 gtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 349  Q
    |||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14427393 gtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcctt 14427345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Original strand, 35000021 - 35000093
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  35000021 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacatctcttacacccatacaaaatcctgacatgtggcaa 35000093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35003487 - 35003414
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    |||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  35003487 agagtggtgatacatgcacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 35003414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 45706017 - 45705945
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccacctt-atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  45706017 gagtggtgatacatgtac-acctccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 45705945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 447 - 483
Target Start/End: Original strand, 34666634 - 34666670
Alignment:
Q  447 gttactaatagtattagtaatttcctggttaatacta 483  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  34666634 gttactaataatattagtaatttcttggttaatacta 34666670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 43490308 - 43490499
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  43490308 agagtgatgctacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaagata 43490407  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43490408 aagtgtggttatgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagagtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 43490499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 154 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30838825 - 30838631
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30838825 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacacctacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 30838726  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30838725 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaataagatgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcct 30838631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 154 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 19047350 - 19047158
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19047350 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagata 19047251  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttc 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19047250 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggaatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 19047158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 152 - 350
Target Start/End: Original strand, 4764631 - 4764829
Alignment:
Q  152 atagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaaga 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4764631 atagagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaaga 4764730  T
Q  252 taaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttccttt 350  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4764731 taaagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatatttataatacatggggtgtacaatagggtgtaggaataaatggtgttgatgtaacattttccttt 4764829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 155 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1750606 - 1750414
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| |||||  |||||||||  ||||||||| |||| |||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1750606 gagtgatgatatttgtaccaccccatgtggcaacacaccctttacactcacacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataa 1750507  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1750506 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 1750414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 161 - 351
Target Start/End: Original strand, 12302167 - 12302357
Alignment:
Q  161 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 260  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12302167 tgatacatgtatcaccccatgtggcaatacatcctttacatccacacaaaattctgacacatggtaacctggaccccacataaatagaagataaagtgtg 12302266  T
Q  261 gttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttccttta 351  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12302267 gttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggggtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttccttta 12302357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 155 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16096940 - 16096747
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggacccc-acacaaatagaagata 253  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||||||||    
T  16096940 gagtgatgatacatgtaccacatcatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttagacccccacataagtagaagata 16096841  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16096840 aagtgtggttgtgagattaactcaccaaaatatccctaatacatggggtgtataatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 16096747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 155 - 349
Target Start/End: Original strand, 43335671 - 43335865
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  43335671 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatataccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggatcccacataaatagaagataa 43335770  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 349  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  43335771 agtgtagttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgggatgtacaatgaggtgtaggaataaatgatgttcatataacattttcctt 43335865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Original strand, 42849754 - 42849916
Alignment:
Q  143 atatatata-atagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacac 241  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  42849754 atatatatatatatagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacac 42849853  T
Q  242 aaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgta 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  42849854 aaatagaa-ataaagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatacatggggtgta 42849916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 188 - 347
Target Start/End: Original strand, 13780676 - 13780835
Alignment:
Q  188 tacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatc 287  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  13780676 tacaccctttacacctatacaaaattctgacatgtggcaacctggaccccacataaatagaagagaaagtgtggttgtgagatgaatttatcaaaatatc 13780775  T
Q  288 cctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    ||||||  |||| |||||||||  | |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13780776 cctaatgtatggggtgtacaatgaggtgtgtgaataaaatgtgttgatgtaacattttcc 13780835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 154 - 346
Target Start/End: Original strand, 34817683 - 34817875
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||  ||  |||||||||| | | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |    
T  34817683 agagtgatgatacatgtacacccccatgtggcaatgctccccttacacccatacaaaattctgacatgtggcaacctggatcccgtacaaatagaagaga 34817782  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttc 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| | | || | ||||| |||||||||  | |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34817783 aagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatgtgcgtagtgcatggggtgtacaatgaggtgtgtgaataaagggtgttcatgtaacattttc 34817875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 179 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 42026937 - 42026766
Alignment:
Q  179 atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttac 278  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |    
T  42026937 atgtggcaatacaccccttacacccacacaaaattctgacatcttgcaacctagaccccacacaaatagaaaagaaagtgtagttgtgagatgaatttgc 42026838  T
Q  279 taaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaa--aggtgttcatgtaacattttcct 348  Q
     |||||||||||||| |  ||  |||||||| | ||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  42026837 caaaatatccctaatgcgcgggatgtacaatggaatgtatgaataaattgggtgttcatgtaacattttcct 42026766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 208 - 345
Target Start/End: Original strand, 8896544 - 8896681
Alignment:
Q  208 aaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtaca 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| |  || | |||||||    
T  8896544 aaaattctgacatgtggcaacctgaacctcacacaaatagaaaagaaagtgtgattgtgagatgaatttaccaaaatattcctattgtatagggtgtaca 8896643  T
Q  308 ataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    || | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8896644 atggaatgtgtgaataaagggtgttcatgtaacatttt 8896681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 248 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 43114656 - 43114552
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  43114656 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 43114557  T
Q  348 tttaa 352  Q
    |||||    
T  43114556 tttaa 43114552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 150 - 297
Target Start/End: Original strand, 39149197 - 39149342
Alignment:
Q  150 taatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaa 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||  |||||||||| | |||||| ||| | |||| ||  | ||||| ||||||||| ||    
T  39149197 taatagagtgatgatacatgtaccaccc-atgtggtaatacaccttttacacccacacaaaattatgagacgtggtaatttagaccc-acacaaataaaa 39149294  T
Q  250 gataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacat 297  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  39149295 gataaagtgtagttgtgggatgaacttaccaaaatatctctaatacat 39149342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 248 - 345
Target Start/End: Original strand, 11825655 - 11825752
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  11825655 aagagaaagtatgattgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacatttt 11825752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 248 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16804067 - 16803966
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| |||||  ||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  16804067 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattatcaaaatgtccctaatgcatgggatgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 16803968  T
Q  348 tt 349  Q
    ||    
T  16803967 tt 16803966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 248 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16843349 - 16843248
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| |||||  ||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  16843349 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattatcaaaatgtccctaatgcatgggatgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 16843250  T
Q  348 tt 349  Q
    ||    
T  16843249 tt 16843248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 253 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33229396 - 33229303
Alignment:
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaa-ggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  33229396 aaagtgtgattgtatgatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgaggtgtaggaataaaagggtgttcatgtatcatttt 33229303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 248 - 345
Target Start/End: Original strand, 41281975 - 41282072
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  41281975 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattatcaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacatttt 41282072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 347
Target Start/End: Original strand, 12415461 - 12415560
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  12415461 aagagaaagtatggttgtgagataaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaataaggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 12415560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 347
Target Start/End: Original strand, 12427521 - 12427620
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  12427521 aagagaaagtatggttgtgagataaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaataaggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 12427620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 248 - 350
Target Start/End: Original strand, 34895742 - 34895844
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||||||||| || |||||||||||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||||| |||||    
T  34895742 aagataaagtatgattgtgagatgaatttaccaatatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtgtgattaaatggtgttcatgtaacactttcc 34895841  T
Q  348 ttt 350  Q
    |||    
T  34895842 ttt 34895844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18491798 - 18491704
Alignment:
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 348  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||| | | |||| ||||  |||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18491798 aagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatgttcttaatgcatgaggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcct 18491704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 349
Target Start/End: Original strand, 966835 - 966936
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||  | | |||| ||||| |||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  966835 aagagaaagtatgtttgtgagatgaatttaccaaaacgttcttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 966934  T
Q  348 tt 349  Q
    ||    
T  966935 tt 966936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 345
Target Start/End: Original strand, 4299435 - 4299518
Alignment:
Q  262 ttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||||||||    
T  4299435 ttgtgagatgaatttaccaaaatgtcattaatgcatggagtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatataacatttt 4299518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 345
Target Start/End: Original strand, 6518484 - 6518566
Alignment:
Q  262 ttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||  |||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  6518484 ttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagagtgtatg-attaaaggtgttcatgtaacatttt 6518566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 7070505 - 7070418
Alignment:
Q  258 gtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    |||||||| ||||||| |||  ||||| |||| |||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7070505 gtggttgtaagatgaatttatcaaaatgtccccaataaatggaggttacaatgggatgtatgaataaagggtgttcatgtaacatttt 7070418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 317
Target Start/End: Original strand, 4451951 - 4452020
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgta 317  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||   |||||||||| ||||||    
T  4451951 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccctaatgcatatggtgtacaataagatgta 4452020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Original strand, 34895648 - 34895721
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  34895648 agagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 34895721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Original strand, 11825562 - 11825634
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  11825562 gagtggtgatacatgtacatccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 11825634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16804160 - 16804088
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||  || ||| || ||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16804160 gagtggtgatacatgtacacccctatatgacaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 16804088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16843442 - 16843370
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||  || ||| || ||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16843442 gagtggtgatacatgtacacccctatatgacaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 16843370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 43114749 - 43114677
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  43114749 gagtggtgatacatgtacaccctcatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacaagtggcaa 43114677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Original strand, 6518401 - 6518474
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccacctt-atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  6518401 agagtggtgatacatgtac-acctccatgtgtcaatacaccttttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 6518474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18491907 - 18491825
Alignment:
Q  145 atatataatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  18491907 atataaaaaagagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctaacatgtggcaa 18491825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Original strand, 4299328 - 4299400
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccacctt-atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  4299328 gagtggtgatacatgta-caccttcatgtggcaatacatctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 4299400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Original strand, 41281881 - 41281954
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    |||||||||||||||||||  ||  || |||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  41281881 agagtggtgatacatgtacacccccatatggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 41281954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 347
Target Start/End: Original strand, 42849913 - 42849946
Alignment:
Q  314 tgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42849913 tgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 42849946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Original strand, 966742 - 966814
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  966742 gagtggtgatacatgtacatccccatgtggaaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 966814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 154 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 878 - 682
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  878 agagcggtgatatatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggactccacacaaatagaagata 779  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttccttt 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  778 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttccttt 682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 154 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 112848 - 112656
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  112848 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagata 112749  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttc 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  112748 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggaatgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttc 112656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 155 - 345
Target Start/End: Original strand, 27893750 - 27893940
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  27893750 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggcaatcttgaccccacataaatagaagataa 27893849  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  27893850 agtgtggttgtgagatgaaattaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgggatgtatgaataaatggtgtttatgtaacatttt 27893940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 154 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27864757 - 27864561
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||    
T  27864757 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccacataaaattctgacatgtggtaatctgaaccccacataaatagaaaata 27864658  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttccttt 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27864657 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgggatgtatgaataaatggtgtttatgtaacattttccttt 27864561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 155 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 33703333 - 33703139
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  33703333 gagtgatgatacatgtaccaccccatatggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggatcccgcacaaatagaagataa 33703234  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 349  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33703233 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaataagatgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 33703139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 154 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27550502 - 27550309
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27550502 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagata 27550403  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  27550402 aagtgtggttgtaagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatggagtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcc 27550309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 154 - 350
Target Start/End: Original strand, 55966253 - 55966449
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  55966253 agagtggtgatacatgtaccactccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacaggtggcaatctagaccccacataaatagaagata 55966352  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttccttt 350  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  55966353 aattgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgggatgtacaatgggatgtatgaataaagggtgtttatgtaacattttccttt 55966449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23036174 - 23035977
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23036174 tagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaacacatcctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagat 23036075  T
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttccttt 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  23036074 aaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatatatagggtgtacaatagggtgtaggaataaaggaggttcatgtaacattttccttt 23035977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 154 - 349
Target Start/End: Original strand, 1771173 - 1771368
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1771173 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgagacgtggcaacttggaccccacataaatagaagata 1771272  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 349  Q
    || |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1771273 aaatgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatctctaatacatggggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 1771368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 154 - 349
Target Start/End: Original strand, 28982729 - 28982924
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28982729 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 28982828  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 349  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28982829 aagtgcggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatatatgggatgtacaatagggtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcctt 28982924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 155 - 345
Target Start/End: Original strand, 43514594 - 43514784
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43514594 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacatccacaaaaaattctgacacgtggcaacctagaccccacacaaatagaagataa 43514693  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43514694 ggtgtggttgtgagatgaacttaccaaaataaccctaatacatgaagtgtacaatggagtgtaggaataaagggtgttcatgtaacatttt 43514784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 344
Target Start/End: Original strand, 23204686 - 23204875
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23204686 gagtgatgatacacgtaccatcccatgtggcaatatatcctttacacccacataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacataaatagaagataa 23204785  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattt 344  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23204786 agtgtggttgtgacatgaacttacaaaaatatccctaatacataggatgtacaatgggatgtaggaataaagagtgttcatgtaacattt 23204875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 155 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 35017924 - 35017733
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||   |||||| ||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35017924 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacatcttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 35017825  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35017824 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccct-atacatggggtgtacaatgagatataggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 35017733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 158 - 348
Target Start/End: Original strand, 48463361 - 48463551
Alignment:
Q  158 tggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagt 257  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  48463361 tggtgatacatgtaccactctatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggtaatctgaaccccacataaatagaaaataaagt 48463460  T
Q  258 gtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 348  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  48463461 atggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgggatgtacaatgaaatgtatgaataaatggtgtttatgtaacattttcct 48463551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 155 - 345
Target Start/End: Original strand, 43949709 - 43949900
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||   |||| ||| ||||||||||||||||    
T  43949709 gagtgatgatacatgtaccaccctatttggcaatacaccctttatacccatacaaaattctgacacgtggcatattggatcccgcacaaatagaagataa 43949808  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaa-ggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  | || |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  43949809 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgaggtgcaggaataaaagggtgttcatgtatcatttt 43949900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 155 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 25051885 - 25051691
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||   |||||| ||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  25051885 gagtgatgatacatgtaccaccccacgtggcaatacatcatttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagataa 25051786  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 349  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  25051785 agtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggggtgtaggaataaagtgtgttcatgtgacattttcctt 25051691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31681096 - 31680904
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 252  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||||    
T  31681096 tagagtggtgatacatgtagcatcccatgtggcaatacaccctttacacctacataaaattctgacacgtggcaatctaaaccccacataaatagaagat 31680997  T
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||| | ||||| ||||||| |||||| | ||||||||||    
T  31680996 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatatacggggtgtacaatggaatgtatgaataaatggtgtttacgtaacatttt 31680904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 43735935 - 43735744
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  43735935 agagtgatgatacatgtaccaccccacgtggcaatacaccctttacatccacataaaattctgacacgtgacaacttggatcccacacaaatagaagata 43735836  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  43735835 aagtgtgattgtgagatgaacttatcaaaatatctctaatacatggaatgtataatgagatgtaggaataaaggatgttcatgtaatatttt 43735744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 159 - 347
Target Start/End: Original strand, 45490225 - 45490413
Alignment:
Q  159 ggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtg 258  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| |   |||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  45490225 ggtgatacatgtagtaccctatgtggcaatatatcatttacacccacacaagattctgacacgtggcaacctggatcccgtacaaatagaagataaagtg 45490324  T
Q  259 tggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45490325 tggttgtgagatgaatttactaaagtatccctaatacatgaggtgtacaattggatgtataaataaaatgtgttcatgtaacattttcc 45490413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 154 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 28988665 - 28988468
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||| | |||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28988665 agagtggtgatacatgtacaccctcatgtgacaatacaccccttac-ctcatacaaaattctgacatatggcaacctggaccccacacaaatagaagaga 28988567  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcctttaa 352  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  ||||| |||||| | ||||| |||||||||  | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28988566 aagtgtggttatgagatgaatttatcaaaatgtccctagtgcatggggtgtacaatgaggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacattttcctttaa 28988468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12497142 - 12496956
Alignment:
Q  161 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 260  Q
    ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||  |||||||||| | |||||||| ||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12497142 tgatacatgcaccaccccatgtgacaatacacgttttacacccacacaaaattctaacacgtggcaaattgaacctcacacaaatagaagataaagtgtg 12497043  T
Q  261 gttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
     |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||| |  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  12497042 attgtaagatgaacttaccaaaatatctctaatacatgggatgtacaatggagtgtaggaataaagggtgttcatataacattttcc 12496956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 39631269 - 39631102
Alignment:
Q  179 atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttac 278  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||| | |||||||||||| ||| ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39631269 atgtgacaatacatcctttacacccacacaaaattctgacacgtgacatattgaaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttac 39631170  T
Q  279 taaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaa-ggtgttcatgtaacatttt 345  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||  | ||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  39631169 caaaatatccctaatacatgaggtgtacaatgaggtgtaggaataaaagggggttcatgtatcatttt 39631102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 152 - 347
Target Start/End: Original strand, 27316617 - 27316813
Alignment:
Q  152 atagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaa-ttctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaag 250  Q
    |||||||| |||||||| || || |  ||||| |||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||    
T  27316617 atagagtgatgatacatttatcatcccatgtgacaatacaccctttacatccacacaaaaattctgacacgtggcaacttggactccaaataaatagaag 27316716  T
Q  251 ataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||  | |||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  27316717 ataaagtgtggttatgagatgaacttaccaaaatatccttaatacatggggtgtataatgaggtgtaggaataaagggtgttcgtttaacattttcc 27316813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 154 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21687199 - 21687005
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||  |||||||  || | |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  21687199 agagtgatgatatatgtaccaacctatgtggcaatacattctttacattcacacaaaattctgacacgtggcaacctgaactccagacaaatagaagata 21687100  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 348  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    |||| ||| || ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21687099 aagtatggttatgagatgaacttactaaaatatttctaatacataagatgtataatggggtgtaaaaataaaggatgttcatgtaacattttcct 21687005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 155 - 305
Target Start/End: Original strand, 51512173 - 51512323
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||   || | ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51512173 gagtgatgatacatgtaccaccccacgtggcaatacatctttaatacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaataaaagataa 51512272  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgta 305  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  51512273 agtgtggttataagatgaacttaccaaaatatctctaatacatggggtgta 51512323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 154 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 41878592 - 41878407
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| |       |||||| ||||||||| | | |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  41878592 agagtggtgatacatgtaccacctga-------atacactctttacaccaacacaaaattctgacacgtgacaatctggaccccacacaaatagaagaga 41878500  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttc 346  Q
    | || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||  || | |||||||||  | |||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  41878499 aggtttggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatggatagggtgtacaatgaggtgtatgaataaagagtgttcatgtaacattttc 41878407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Original strand, 41327449 - 41327641
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 252  Q
    |||||| |||||||||||||  | | || ||||||||||| | |||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  41327449 tagagtagtgatacatgtacatcttaatctggcaatacaccccttacactcacaaaaaattctaacatgtggcaacctggaccccacacaaattgaagag 41327548  T
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| || | |||   ||||||||| || |||  ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  41327549 aaagtgtggatgtgagatgaatttaccaaaatgtccgtagtgcataaggtgtacaatggggtgtgtgaataaagggtgtctatgtaacatttt 41327641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 41848158 - 41847971
Alignment:
Q  160 gtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgt 259  Q
    |||||||||||||  ||  |||||||||||||| | ||||| |||   |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  41848158 gtgatacatgtacacccccatgtggcaatacaccccttacatccacgcaaaattctgacatgtgacaatctgaaccccacacaaatagaagagaaagtgt 41848059  T
Q  260 ggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    ||||||| |||||| || | ||||| || ||||| ||||| |||||||||  | |||  ||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  41848058 ggttgtgcgatgaatttgccaaaatgtctctaatgcatggggtgtacaatgaggtgtgtgaaaaaaggatgttcttgtaacattttcc 41847971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 248 - 347
Target Start/End: Original strand, 17619153 - 17619252
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17619153 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaaaggtgttcatgtaacattttcc 17619252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Original strand, 56215804 - 56215943
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 252  Q
    ||||||||||||||||||||  |   ||||||| ||||||   ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||     
T  56215804 tagagtggtgatacatgtacaccaccatgtggccatacacctcttacacccacacaaaattctgacatatagcaacctagaccccacacaaatag-agag 56215902  T
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaat 293  Q
    |||||||||||||||||| || || | |||||||| |||||    
T  56215903 aaagtgtggttgtgagataaattttccaaaatatcgctaat 56215943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 294
Target Start/End: Original strand, 46412389 - 46412516
Alignment:
Q  167 atgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtg 266  Q
    |||||||||| ||| || ||||| ||  |||||| | | | |||||||||||| |||||||  |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46412389 atgtaccaccctatatgacaatatactttttacatctacacaaaattctgacacgtggcaatttaaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtg 46412488  T
Q  267 agatgaacttactaaaatatccctaata 294  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  46412489 agaagaacttaccaaaatatctctaata 46412516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 248 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 712059 - 711958
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| | |||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  712059 aagagaaagtatgtttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatagggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcc 711960  T
Q  348 tt 349  Q
    ||    
T  711959 tt 711958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 248 - 357
Target Start/End: Original strand, 55272377 - 55272486
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||| || |||| | |||||||||||||||||||    
T  55272377 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagagtgtatgattaaaggatgttcatgtaacattttcc 55272476  T
Q  348 tttaattata 357  Q
      ||||||||    
T  55272477 aataattata 55272486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 253 - 345
Target Start/End: Original strand, 3756252 - 3756344
Alignment:
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    ||||| || ||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  3756252 aaagtatgattgtgagataaatttactaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacatttt 3756344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 248 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 32728456 - 32728356
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||||||||||    
T  32728456 aagagaaagtatgattgtgagatgaatttactaaaatgtccttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaaggatgttcatgtaacattttcc 32728357  T
Q  348 t 348  Q
    |    
T  32728356 t 32728356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 348
Target Start/End: Original strand, 48435580 - 48435680
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||||||||| || |||||||||||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||||| |||||    
T  48435580 aagataaagtatgattgtgagatgaatttaccaatatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtgtgattaaatggtgttcatgtaacactttcc 48435679  T
Q  348 t 348  Q
    |    
T  48435680 t 48435680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 35037093 - 35037002
Alignment:
Q  259 tggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttccttt 350  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||| |  |||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  35037093 tggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagagtgtatggttaaagggtgctcatgtaacatttttcttt 35037002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 38851612 - 38851515
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||  ||||| ||| |||| ||||||||||||| || |||||| || |||| | | |||||||||||||||    
T  38851612 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttatcaaaatgtccataatgcatggagtgtacattatgatgtatgattaaaggatattcatgtaacatttt 38851515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 349
Target Start/End: Original strand, 960890 - 960972
Alignment:
Q  267 agatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 349  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||  || | |||||||||||  |||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  960890 agatgaatttaccaaaatgtccctaatgtatagggtgtacaatagagtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcctt 960972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19880147 - 19880074
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  19880147 agagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 19880074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 267 - 348
Target Start/End: Original strand, 49229684 - 49229765
Alignment:
Q  267 agatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 348  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||| || |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  49229684 agatgaatttaccagaatatccttaatgcatgaagtgtacaatagggtgtatgattaaaggatgttcatataacattttcct 49229765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Original strand, 55272284 - 55272356
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  55272284 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 55272356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 352
Target Start/End: Original strand, 46827760 - 46827811
Alignment:
Q  301 gtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcctttaa 352  Q
    |||||||||||  |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46827760 gtgtacaatagagtgtatgattaaagggtgttcatgtaacattttcctttaa 46827811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 227
Target Start/End: Original strand, 3756156 - 3756232
Alignment:
Q  151 aatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacact-ttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  3756156 aatagagtggtgatacatgtacactcccatgtggcaataca-actcttacacccacataaaatcatgacatgtggcaa 3756232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19880053 - 19879989
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaatagg 312  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  19880053 aagagaaagtatgattgtgagatgaatttaccaaaatgtccataatatatggggtgtacaatagg 19879989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 307
Target Start/End: Original strand, 49243934 - 49243966
Alignment:
Q  275 ttactaaaatatccctaatacatggagtgtaca 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49243934 ttactaaaatacccctaatacatggagtgtaca 49243966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0187
Description:

Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 155 - 348
Target Start/End: Original strand, 14097 - 14289
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14097 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccc-acacaaatagaagataa 14195  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 348  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14196 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacataggatgtacaatggggtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcct 14289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 155 - 348
Target Start/End: Original strand, 24425 - 24617
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24425 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccc-acacaaatagaagataa 24523  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcct 348  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24524 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacataggatgtacaatggggtgtagaaataaagggtgttcatgtaacattttcct 24617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 155 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 11443 - 11249
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||| || ||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  11443 gagtgatgatacatgtaccatcccatgtggcaatacactatttacacctacacaaaattctgacacgtagcaacttggaccccacatcaatagaagataa 11344  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcctt 349  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||| |||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  11343 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatatatggggtgtacaatggggtgtatgaataaagtgtgttcatgtgacattttcctt 11249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 347
Target Start/End: Original strand, 23335 - 23521
Alignment:
Q  161 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 260  Q
    ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||  |||||||||| | |||||||| ||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23335 tgatacatgcaccaccccatgtgacaatacacgttttacacccacacaaaattctaacacgtggcaaattgaacctcacacaaatagaagataaagtgtg 23434  T
Q  261 gttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
     |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||| |  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23435 attgtaagatgaacttaccaaaatatctctaatacatgggatgtacaatggagtgtaggaataaagggtgttcatataacattttcc 23521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 248 - 345
Target Start/End: Original strand, 45720 - 45817
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacatttt 345  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  45720 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatacataggatgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacatttt 45817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Original strand, 45626 - 45699
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtac-caccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  45626 agagtggtgatacatgtacacaccc-atgtggcaatacacctcttacacccacataaaatcctgacatgtggcaa 45699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 347
Target Start/End: Original strand, 35457 - 35556
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaataggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacattttcc 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| || || |||||||| ||||| |||||||||| | |||| || |||| |||||| ||||||||||||||    
T  35457 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaatatgtccctaatgcatggggtgtacaatatggtgtatgattaaatggtgtttatgtaacattttcc 35556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University