View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5176_low_70 (Length: 227)

Name: NF5176_low_70
Description: NF5176
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5176_low_70
NF5176_low_70
[»] chr3 (125 HSPs)
chr3 (1-225)||(35753673-35753897)
chr3 (3-149)||(34521262-34521408)
chr3 (1-142)||(41997822-41997963)
chr3 (1-142)||(45171309-45171450)
chr3 (1-148)||(12123321-12123468)
chr3 (4-146)||(34629981-34630123)
chr3 (3-145)||(54081284-54081425)
chr3 (1-142)||(26332322-26332463)
chr3 (1-146)||(40410711-40410856)
chr3 (1-134)||(44069365-44069498)
chr3 (1-142)||(54107672-54107813)
chr3 (1-157)||(4846838-4846994)
chr3 (3-142)||(28688234-28688373)
chr3 (1-147)||(41208399-41208545)
chr3 (1-147)||(43899316-43899462)
chr3 (3-147)||(7743009-7743154)
chr3 (1-134)||(10756729-10756862)
chr3 (1-142)||(15862185-15862326)
chr3 (1-147)||(26332560-26332710)
chr3 (1-155)||(12123080-12123234)
chr3 (1-147)||(15862417-15862563)
chr3 (1-142)||(19124192-19124333)
chr3 (1-142)||(45871700-45871841)
chr3 (5-141)||(7274889-7275024)
chr3 (8-147)||(41208649-41208788)
chr3 (4-159)||(45171054-45171209)
chr3 (4-142)||(7937808-7937946)
chr3 (3-117)||(17102621-17102735)
chr3 (1-151)||(31514105-31514254)
chr3 (1-143)||(34521499-34521641)
chr3 (1-142)||(44069126-44069267)
chr3 (1-142)||(54108362-54108503)
chr3 (1-148)||(40926008-40926155)
chr3 (3-142)||(50819461-50819600)
chr3 (3-142)||(50856264-50856403)
chr3 (1-140)||(53841268-53841407)
chr3 (1-143)||(21169668-21169810)
chr3 (1-142)||(7950278-7950419)
chr3 (1-142)||(8846079-8846220)
chr3 (10-147)||(28691364-28691501)
chr3 (1-142)||(31513866-31514007)
chr3 (3-151)||(19124416-19124563)
chr3 (4-140)||(50819225-50819361)
chr3 (4-140)||(50856503-50856639)
chr3 (3-142)||(8846320-8846459)
chr3 (1-132)||(52606141-52606272)
chr3 (1-147)||(14353044-14353190)
chr3 (36-142)||(52609639-52609745)
chr3 (1-134)||(54081525-54081659)
chr3 (1-142)||(27940275-27940416)
chr3 (1-142)||(40926253-40926393)
chr3 (1-144)||(17273778-17273921)
chr3 (23-142)||(43899114-43899233)
chr3 (20-146)||(35580210-35580336)
chr3 (1-147)||(40639359-40639505)
chr3 (1-134)||(14353290-14353422)
chr3 (1-142)||(17102387-17102528)
chr3 (1-146)||(37133276-37133421)
chr3 (5-134)||(45871935-45872064)
chr3 (1-149)||(9028187-9028335)
chr3 (10-134)||(22354953-22355077)
chr3 (1-145)||(53678433-53678577)
chr3 (1-148)||(2829650-2829796)
chr3 (1-147)||(40969496-40969642)
chr3 (1-131)||(47891527-47891657)
chr3 (1-122)||(27254007-27254128)
chr3 (1-118)||(28688017-28688134)
chr3 (54-146)||(33812723-33812815)
chr3 (3-134)||(28691125-28691256)
chr3 (3-148)||(5348576-5348721)
chr3 (4-122)||(29248342-29248460)
chr3 (1-142)||(40969258-40969399)
chr3 (4-142)||(52268349-52268486)
chr3 (9-142)||(51170631-51170764)
chr3 (1-144)||(2829408-2829552)
chr3 (3-122)||(10756952-10757071)
chr3 (1-144)||(17274018-17274161)
chr3 (1-147)||(47891755-47891901)
chr3 (1-107)||(53841065-53841171)
chr3 (1-122)||(5348810-5348931)
chr3 (1-142)||(9028433-9028574)
chr3 (59-140)||(35753408-35753489)
chr3 (3-100)||(35753477-35753574)
chr3 (3-146)||(40639116-40639259)
chr3 (4-146)||(2078717-2078859)
chr3 (1-124)||(29248550-29248673)
chr3 (1-147)||(46766620-46766767)
chr3 (1-147)||(51885606-51885752)
chr3 (1-124)||(54247292-54247406)
chr3 (69-142)||(7937646-7937719)
chr3 (3-100)||(22444430-22444527)
chr3 (9-149)||(46766863-46767004)
chr3 (1-145)||(7742775-7742919)
chr3 (58-142)||(33812842-33812926)
chr3 (1-124)||(53678675-53678798)
chr3 (56-115)||(22444237-22444296)
chr3 (3-145)||(49222271-49222411)
chr3 (1-147)||(41998061-41998202)
chr3 (34-134)||(49222047-49222147)
chr3 (38-142)||(53310001-53310105)
chr3 (4-146)||(21918496-21918637)
chr3 (3-133)||(33773034-33773165)
chr3 (68-147)||(51311827-51311906)
chr3 (2-142)||(588393-588534)
chr3 (1-109)||(2078519-2078627)
chr3 (3-142)||(7274656-7274785)
chr3 (56-148)||(50394321-50394413)
chr3 (59-142)||(13866964-13867047)
chr3 (59-142)||(49529120-49529203)
chr3 (35-147)||(38911494-38911606)
chr3 (19-142)||(51883862-51883985)
chr3 (56-142)||(50259110-50259196)
chr3 (3-45)||(52606362-52606404)
chr3 (5-74)||(4846667-4846735)
chr3 (18-133)||(20963547-20963663)
chr3 (88-142)||(43527026-43527080)
chr3 (59-124)||(52705480-52705545)
chr3 (3-71)||(43527068-43527136)
chr3 (12-72)||(43527238-43527297)
chr3 (70-142)||(44316630-44316702)
chr3 (10-152)||(50393310-50393453)
chr3 (3-42)||(51311693-51311732)
chr3 (82-132)||(967474-967524)
chr3 (88-149)||(588249-588310)
chr3 (1-33)||(22444298-22444330)
[»] scaffold0809 (2 HSPs)
scaffold0809 (1-147)||(4560-4706)
scaffold0809 (1-146)||(4337-4482)
[»] chr1 (125 HSPs)
chr1 (3-146)||(29256831-29256974)
chr1 (3-142)||(18793694-18793833)
chr1 (3-147)||(23281254-23281398)
chr1 (1-147)||(25088014-25088160)
chr1 (1-144)||(10654271-10654414)
chr1 (1-147)||(37199163-37199309)
chr1 (1-142)||(10923605-10923746)
chr1 (1-146)||(50574759-50574904)
chr1 (1-142)||(51691877-51692018)
chr1 (1-149)||(16267932-16268079)
chr1 (1-148)||(34028963-34029110)
chr1 (1-142)||(51692113-51692253)
chr1 (1-142)||(52412601-52412742)
chr1 (1-145)||(6181616-6181760)
chr1 (1-145)||(42607522-42607666)
chr1 (3-142)||(24590469-24590608)
chr1 (3-142)||(52412842-52412981)
chr1 (1-135)||(5463360-5463494)
chr1 (1-147)||(34028719-34028865)
chr1 (1-142)||(21035988-21036129)
chr1 (1-145)||(24655586-24655730)
chr1 (1-149)||(30611216-30611364)
chr1 (3-147)||(33753223-33753367)
chr1 (3-147)||(44222190-44222334)
chr1 (1-147)||(9881550-9881695)
chr1 (1-123)||(22584373-22584495)
chr1 (1-147)||(30293011-30293157)
chr1 (1-142)||(16267718-16267859)
chr1 (9-142)||(22584602-22584735)
chr1 (1-142)||(28970422-28970563)
chr1 (1-142)||(35986235-35986376)
chr1 (1-149)||(6181858-6182006)
chr1 (4-148)||(25088261-25088404)
chr1 (3-147)||(45305654-45305797)
chr1 (1-148)||(10654027-10654173)
chr1 (3-134)||(11787751-11787882)
chr1 (1-132)||(33753458-33753589)
chr1 (19-142)||(34279501-34279624)
chr1 (3-134)||(36657745-36657876)
chr1 (1-134)||(37198943-37199076)
chr1 (3-144)||(49291227-49291368)
chr1 (1-149)||(19986364-19986512)
chr1 (1-145)||(30293255-30293398)
chr1 (1-145)||(50118347-50118491)
chr1 (12-124)||(50574535-50574647)
chr1 (1-141)||(51810141-51810281)
chr1 (4-142)||(10923365-10923504)
chr1 (8-155)||(32563949-32564096)
chr1 (9-148)||(32564200-32564338)
chr1 (1-147)||(4045097-4045243)
chr1 (1-147)||(13944509-13944655)
chr1 (1-147)||(14118528-14118674)
chr1 (1-142)||(14775977-14776118)
chr1 (33-142)||(50921365-50921474)
chr1 (7-151)||(21384931-21385074)
chr1 (3-146)||(32517757-32517898)
chr1 (3-142)||(11787985-11788123)
chr1 (1-124)||(21385178-21385301)
chr1 (3-142)||(50921063-50921202)
chr1 (1-147)||(24655828-24655974)
chr1 (6-148)||(30792437-30792579)
chr1 (15-121)||(32517629-32517735)
chr1 (3-148)||(9119289-9119434)
chr1 (1-134)||(13944753-13944886)
chr1 (1-134)||(14775756-14775889)
chr1 (1-122)||(49291016-49291137)
chr1 (6-122)||(46949779-46949895)
chr1 (3-134)||(51810382-51810513)
chr1 (24-146)||(36884721-36884843)
chr1 (3-121)||(46738968-46739086)
chr1 (1-142)||(4045341-4045482)
chr1 (1-145)||(1831906-1832050)
chr1 (3-123)||(24590248-24590368)
chr1 (17-152)||(1831657-1831792)
chr1 (1-100)||(5118096-5118195)
chr1 (3-142)||(11394904-11395043)
chr1 (1-100)||(28112795-28112894)
chr1 (1-146)||(2125451-2125589)
chr1 (1-147)||(29257065-29257211)
chr1 (1-134)||(30611462-30611596)
chr1 (4-146)||(34621880-34622022)
chr1 (1-147)||(18793934-18794081)
chr1 (1-142)||(34279243-34279384)
chr1 (1-132)||(5463130-5463262)
chr1 (1-97)||(13831264-13831360)
chr1 (50-146)||(19885981-19886077)
chr1 (1-142)||(36657503-36657645)
chr1 (3-142)||(45305412-45305552)
chr1 (1-147)||(4550842-4550988)
chr1 (1-143)||(40533927-40534069)
chr1 (3-142)||(31125939-31126071)
chr1 (1-85)||(9119534-9119618)
chr1 (59-147)||(28112719-28112807)
chr1 (59-134)||(5118004-5118079)
chr1 (52-147)||(36077269-36077364)
chr1 (3-134)||(42607746-42607877)
chr1 (1-108)||(46949978-46950085)
chr1 (1-142)||(27209172-27209313)
chr1 (1-100)||(11797220-11797319)
chr1 (3-110)||(31126173-31126280)
chr1 (3-141)||(40703109-40703247)
chr1 (4-100)||(19886132-19886226)
chr1 (1-78)||(30792682-30792759)
chr1 (4-133)||(40534170-40534299)
chr1 (4-147)||(20260624-20260767)
chr1 (59-142)||(11797149-11797232)
chr1 (59-145)||(19886214-19886300)
chr1 (1-142)||(27209391-27209532)
chr1 (2-142)||(3569379-3569520)
chr1 (2-122)||(21036225-21036345)
chr1 (64-123)||(11394714-11394773)
chr1 (1-146)||(34621620-34621765)
chr1 (6-124)||(4054569-4054688)
chr1 (1-91)||(36884946-36885036)
chr1 (1-73)||(50921302-50921374)
chr1 (1-142)||(40702871-40703009)
chr1 (68-147)||(48702189-48702268)
chr1 (50-142)||(19269363-19269455)
chr1 (51-133)||(20260440-20260522)
chr1 (59-100)||(5118067-5118108)
chr1 (80-124)||(6241274-6241318)
chr1 (82-132)||(6714698-6714748)
chr1 (56-142)||(43727276-43727362)
chr1 (82-151)||(49548116-49548185)
chr1 (80-124)||(6242690-6242734)
[»] chr2 (103 HSPs)
chr2 (1-142)||(31450669-31450810)
chr2 (1-134)||(13354188-13354321)
chr2 (1-134)||(41377366-41377498)
chr2 (1-148)||(39454448-39454595)
chr2 (4-142)||(43183586-43183724)
chr2 (1-146)||(37744630-37744775)
chr2 (1-148)||(43183825-43183972)
chr2 (1-147)||(21470293-21470439)
chr2 (1-142)||(28203102-28203243)
chr2 (1-142)||(31450908-31451049)
chr2 (1-142)||(32933833-32933974)
chr2 (1-141)||(28631278-28631418)
chr2 (1-132)||(13354419-13354550)
chr2 (1-148)||(27132508-27132655)
chr2 (3-142)||(27476611-27476750)
chr2 (3-149)||(18565062-18565208)
chr2 (9-142)||(4104162-4104295)
chr2 (1-142)||(5961672-5961813)
chr2 (1-142)||(12303788-12303929)
chr2 (1-134)||(16655617-16655750)
chr2 (1-142)||(16736104-16736245)
chr2 (1-142)||(17856202-17856343)
chr2 (1-134)||(20908753-20908886)
chr2 (1-145)||(4121005-4121149)
chr2 (3-147)||(34820523-34820667)
chr2 (1-134)||(25642510-25642643)
chr2 (1-142)||(27883471-27883612)
chr2 (1-146)||(28631516-28631661)
chr2 (1-142)||(41377596-41377737)
chr2 (1-149)||(12304396-12304544)
chr2 (1-149)||(16655848-16655996)
chr2 (3-134)||(4104403-4104534)
chr2 (6-148)||(14877480-14877620)
chr2 (1-140)||(21470537-21470675)
chr2 (3-142)||(37412822-37412961)
chr2 (1-135)||(16260881-16261014)
chr2 (4-134)||(34127810-34127939)
chr2 (4-146)||(34820278-34820420)
chr2 (1-142)||(16736340-16736481)
chr2 (1-142)||(27132752-27132893)
chr2 (1-142)||(41659748-41659889)
chr2 (1-142)||(38275697-38275840)
chr2 (1-149)||(39150067-39150215)
chr2 (1-142)||(44612725-44612867)
chr2 (1-148)||(32933588-32933735)
chr2 (2-147)||(39912869-39913016)
chr2 (1-135)||(12304027-12304161)
chr2 (9-142)||(4120767-4120900)
chr2 (1-142)||(15137046-15137187)
chr2 (1-134)||(20908522-20908655)
chr2 (1-142)||(28202863-28203004)
chr2 (3-148)||(35408765-35408910)
chr2 (1-142)||(36442376-36442517)
chr2 (3-144)||(38275478-38275619)
chr2 (1-122)||(40694417-40694538)
chr2 (1-143)||(27476368-27476511)
chr2 (3-141)||(34127570-34127708)
chr2 (52-142)||(37744452-37744542)
chr2 (9-134)||(39912638-39912764)
chr2 (1-134)||(25642279-25642412)
chr2 (1-142)||(37412596-37412737)
chr2 (3-146)||(32503781-32503924)
chr2 (4-147)||(44915738-44915880)
chr2 (32-142)||(18565276-18565386)
chr2 (3-117)||(27883701-27883815)
chr2 (1-134)||(16261112-16261245)
chr2 (1-122)||(39149867-39149988)
chr2 (1-142)||(40694198-40694339)
chr2 (1-140)||(10833276-10833416)
chr2 (1-148)||(17856430-17856578)
chr2 (1-145)||(27913894-27914038)
chr2 (9-147)||(45389129-45389267)
chr2 (1-142)||(36211353-36211494)
chr2 (5-133)||(5921632-5921760)
chr2 (4-132)||(15829733-15829861)
chr2 (16-131)||(34484303-34484418)
chr2 (1-142)||(27246225-27246366)
chr2 (57-142)||(20297413-20297498)
chr2 (3-151)||(41659980-41660128)
chr2 (1-121)||(33819638-33819757)
chr2 (1-148)||(5720139-5720286)
chr2 (1-147)||(33819395-33819540)
chr2 (9-147)||(36442131-36442269)
chr2 (57-134)||(36211697-36211774)
chr2 (1-106)||(44915981-44916086)
chr2 (1-100)||(36211583-36211682)
chr2 (50-142)||(39454724-39454816)
chr2 (3-122)||(32503569-32503688)
chr2 (68-146)||(1580150-1580228)
chr2 (1-134)||(27914135-27914268)
chr2 (51-120)||(11943780-11943849)
chr2 (1-145)||(16350313-16350457)
chr2 (75-146)||(34484234-34484305)
chr2 (1-143)||(16350079-16350221)
chr2 (80-147)||(44610860-44610926)
chr2 (56-122)||(38073778-38073844)
chr2 (2-124)||(3603525-3603648)
chr2 (59-133)||(23992206-23992280)
chr2 (1-63)||(27246065-27246127)
chr2 (68-142)||(1580010-1580082)
chr2 (17-91)||(15136276-15136350)
chr2 (82-132)||(26424819-26424869)
chr2 (30-88)||(44612548-44612606)
[»] chr4 (92 HSPs)
chr4 (1-145)||(25218084-25218228)
chr4 (1-147)||(52914950-52915096)
chr4 (3-142)||(21218091-21218230)
chr4 (1-142)||(33626106-33626247)
chr4 (1-142)||(45683120-45683261)
chr4 (1-142)||(54136094-54136235)
chr4 (9-145)||(2738880-2739016)
chr4 (1-145)||(45911579-45911723)
chr4 (1-131)||(4965885-4966015)
chr4 (4-142)||(48209951-48210089)
chr4 (1-142)||(29864179-29864320)
chr4 (1-142)||(44710406-44710547)
chr4 (1-146)||(46621169-46621314)
chr4 (1-141)||(33625868-33626008)
chr4 (1-141)||(33882191-33882331)
chr4 (1-133)||(52915185-52915317)
chr4 (1-148)||(9010502-9010649)
chr4 (3-146)||(24504184-24504327)
chr4 (3-134)||(29864419-29864550)
chr4 (1-142)||(10014468-10014608)
chr4 (1-142)||(10021609-10021749)
chr4 (1-142)||(21217850-21217991)
chr4 (1-142)||(27347600-27347741)
chr4 (1-145)||(1157448-1157592)
chr4 (3-147)||(25058831-25058975)
chr4 (1-148)||(43317121-43317268)
chr4 (8-142)||(9010754-9010888)
chr4 (4-134)||(40067359-40067489)
chr4 (1-147)||(46620925-46621071)
chr4 (3-123)||(25218328-25218448)
chr4 (3-142)||(8751290-8751429)
chr4 (19-142)||(46200487-46200610)
chr4 (1-147)||(43316878-43317023)
chr4 (2-142)||(18862683-18862824)
chr4 (3-124)||(27347841-27347962)
chr4 (1-134)||(32384664-32384797)
chr4 (1-144)||(8246988-8247131)
chr4 (3-134)||(12381298-12381429)
chr4 (3-146)||(37515697-37515840)
chr4 (6-141)||(44432871-44433006)
chr4 (3-134)||(45911818-45911949)
chr4 (3-133)||(53645463-53645593)
chr4 (1-145)||(1157203-1157350)
chr4 (2-146)||(22831040-22831185)
chr4 (1-134)||(34958843-34958975)
chr4 (1-146)||(34959073-34959218)
chr4 (1-117)||(4793841-4793957)
chr4 (1-133)||(25977781-25977913)
chr4 (8-147)||(38866396-38866535)
chr4 (1-134)||(46535534-46535666)
chr4 (1-134)||(25593333-25593466)
chr4 (1-134)||(40067590-40067723)
chr4 (1-134)||(45683359-45683492)
chr4 (1-149)||(32385054-32385201)
chr4 (4-142)||(1205622-1205760)
chr4 (3-153)||(10014708-10014857)
chr4 (3-153)||(10021849-10021998)
chr4 (4-142)||(28570666-28570804)
chr4 (3-141)||(44710647-44710785)
chr4 (1-154)||(4966110-4966263)
chr4 (1-134)||(8246780-8246911)
chr4 (2-146)||(15985465-15985610)
chr4 (2-143)||(29970195-29970335)
chr4 (8-144)||(1205379-1205514)
chr4 (3-142)||(24503942-24504082)
chr4 (3-145)||(38866643-38866786)
chr4 (1-91)||(54191642-54191732)
chr4 (1-142)||(11242711-11242847)
chr4 (2-134)||(22830807-22830940)
chr4 (1-142)||(46200727-46200868)
chr4 (1-100)||(21051589-21051688)
chr4 (1-100)||(44428616-44428715)
chr4 (1-134)||(9657678-9657811)
chr4 (1-147)||(43969769-43969915)
chr4 (1-142)||(21051362-21051503)
chr4 (1-134)||(46535764-46535897)
chr4 (3-134)||(54191829-54191959)
chr4 (1-142)||(9657889-9658030)
chr4 (3-147)||(11102218-11102363)
chr4 (61-142)||(44428516-44428597)
chr4 (4-134)||(44169990-44170121)
chr4 (8-109)||(21885073-21885174)
chr4 (3-91)||(42779574-42779662)
chr4 (2-122)||(54136334-54136450)
chr4 (3-142)||(44170223-44170364)
chr4 (52-146)||(37515528-37515621)
chr4 (4-65)||(29970437-29970498)
chr4 (82-133)||(40256602-40256653)
chr4 (1-71)||(43969599-43969670)
chr4 (104-142)||(10017818-10017856)
chr4 (96-142)||(29970510-29970555)
chr4 (68-140)||(25181817-25181889)
[»] chr8 (93 HSPs)
chr8 (1-147)||(23244757-23244903)
chr8 (3-149)||(37393473-37393619)
chr8 (1-142)||(31230855-31230996)
chr8 (1-147)||(24456894-24457040)
chr8 (1-134)||(1826033-1826166)
chr8 (1-134)||(1860478-1860611)
chr8 (1-142)||(40040165-40040306)
chr8 (3-151)||(39912163-39912311)
chr8 (4-142)||(31230616-31230754)
chr8 (9-154)||(30872774-30872919)
chr8 (1-142)||(37393719-37393860)
chr8 (1-140)||(14920653-14920792)
chr8 (1-147)||(11198447-11198593)
chr8 (3-148)||(35224011-35224156)
chr8 (3-147)||(18017788-18017932)
chr8 (3-142)||(18914495-18914634)
chr8 (2-145)||(26736125-26736268)
chr8 (3-154)||(35223765-35223916)
chr8 (1-148)||(6843492-6843641)
chr8 (4-146)||(8654181-8654323)
chr8 (4-142)||(21515445-21515583)
chr8 (1-142)||(119120-119260)
chr8 (1-146)||(758343-758488)
chr8 (3-140)||(14920416-14920553)
chr8 (1-142)||(18018028-18018169)
chr8 (1-142)||(39240033-39240174)
chr8 (1-145)||(23244515-23244659)
chr8 (3-134)||(3869193-3869324)
chr8 (1-142)||(40032429-40032571)
chr8 (3-148)||(5416809-5416954)
chr8 (1-142)||(9495265-9495406)
chr8 (1-121)||(7041653-7041773)
chr8 (3-146)||(40094473-40094617)
chr8 (3-147)||(29027216-29027356)
chr8 (1-142)||(18621989-18622130)
chr8 (4-145)||(39240264-39240405)
chr8 (1-142)||(44254868-44255009)
chr8 (1-172)||(8653910-8654080)
chr8 (1-147)||(30650188-30650334)
chr8 (4-141)||(40094720-40094857)
chr8 (1-146)||(29026967-29027116)
chr8 (4-147)||(758589-758732)
chr8 (1-148)||(7041871-7042013)
chr8 (9-142)||(16645795-16645931)
chr8 (3-135)||(39911927-39912059)
chr8 (1-135)||(5417055-5417189)
chr8 (1-142)||(3868947-3869091)
chr8 (5-142)||(26736371-26736508)
chr8 (9-142)||(119366-119499)
chr8 (1-134)||(30568518-30568651)
chr8 (1-106)||(33542626-33542731)
chr8 (1-148)||(11639049-11639195)
chr8 (1-100)||(44678426-44678525)
chr8 (68-142)||(24456737-24456811)
chr8 (1-133)||(410604-410736)
chr8 (14-142)||(6844695-6844823)
chr8 (1-108)||(18914296-18914404)
chr8 (1-135)||(5525881-5526013)
chr8 (3-124)||(12873078-12873199)
chr8 (3-123)||(36343983-36344103)
chr8 (54-142)||(44678320-44678408)
chr8 (1-148)||(30873020-30873167)
chr8 (1-147)||(12873290-12873434)
chr8 (4-122)||(44255107-44255225)
chr8 (9-134)||(1825821-1825945)
chr8 (9-134)||(1860266-1860390)
chr8 (30-147)||(21512411-21512527)
chr8 (5-142)||(26217073-26217209)
chr8 (1-134)||(28206777-28206910)
chr8 (3-134)||(33542395-33542526)
chr8 (3-145)||(35486107-35486249)
chr8 (8-143)||(36344210-36344345)
chr8 (2-147)||(28206996-28207141)
chr8 (6-90)||(30568331-30568415)
chr8 (68-124)||(44678522-44678578)
chr8 (1-147)||(35485869-35486015)
chr8 (1-109)||(410405-410513)
chr8 (24-133)||(40032693-40032802)
chr8 (3-63)||(9495114-9495174)
chr8 (5-100)||(26217315-26217410)
chr8 (56-142)||(29770360-29770446)
chr8 (1-74)||(40040404-40040477)
chr8 (4-116)||(32733740-32733852)
chr8 (2-142)||(45436403-45436545)
chr8 (3-62)||(11639294-11639353)
chr8 (59-133)||(15740625-15740699)
chr8 (3-143)||(29769365-29769505)
chr8 (56-140)||(15741593-15741677)
chr8 (82-133)||(43633135-43633186)
chr8 (2-75)||(15741507-15741581)
chr8 (1-43)||(16645647-16645689)
chr8 (59-142)||(26217398-26217484)
chr8 (102-142)||(11639378-11639418)
[»] chr5 (83 HSPs)
chr5 (1-147)||(12593698-12593844)
chr5 (1-149)||(7399073-7399221)
chr5 (1-146)||(19205185-19205330)
chr5 (3-149)||(33699271-33699417)
chr5 (1-142)||(10656336-10656477)
chr5 (1-142)||(31656600-31656741)
chr5 (10-142)||(8418435-8418567)
chr5 (1-152)||(35263487-35263638)
chr5 (3-134)||(42710594-42710725)
chr5 (1-141)||(12694928-12695068)
chr5 (1-141)||(15267482-15267622)
chr5 (1-133)||(31656370-31656502)
chr5 (3-147)||(40589298-40589442)
chr5 (3-147)||(40589901-40590045)
chr5 (1-140)||(7210461-7210600)
chr5 (1-147)||(16353396-16353542)
chr5 (1-134)||(3878492-3878625)
chr5 (1-142)||(7210687-7210828)
chr5 (1-146)||(41859919-41860066)
chr5 (1-142)||(334299-334440)
chr5 (1-134)||(5087818-5087951)
chr5 (1-134)||(9692930-9693062)
chr5 (9-142)||(9693168-9693301)
chr5 (1-134)||(10656105-10656238)
chr5 (2-134)||(28392012-28392145)
chr5 (1-142)||(35263736-35263877)
chr5 (1-134)||(36751913-36752046)
chr5 (1-134)||(31908939-31909074)
chr5 (5-141)||(39706297-39706433)
chr5 (2-133)||(7399321-7399452)
chr5 (3-134)||(26289031-26289162)
chr5 (2-140)||(28391773-28391912)
chr5 (1-142)||(29023940-29024078)
chr5 (1-124)||(33762923-33763049)
chr5 (3-142)||(40589057-40589196)
chr5 (3-142)||(40589660-40589799)
chr5 (17-151)||(5088386-5088520)
chr5 (1-143)||(5624381-5624523)
chr5 (1-146)||(31909172-31909317)
chr5 (1-142)||(32272082-32272223)
chr5 (1-147)||(39706053-39706195)
chr5 (11-147)||(15267240-15267375)
chr5 (3-147)||(18514286-18514430)
chr5 (3-146)||(15670395-15670538)
chr5 (1-144)||(25923119-25923262)
chr5 (3-142)||(40774341-40774479)
chr5 (1-144)||(41372400-41372543)
chr5 (1-142)||(16353154-16353298)
chr5 (1-134)||(38416376-38416509)
chr5 (1-142)||(40774579-40774720)
chr5 (3-147)||(15476503-15476646)
chr5 (3-149)||(12593452-12593598)
chr5 (1-142)||(5152857-5152998)
chr5 (9-122)||(42710373-42710486)
chr5 (50-132)||(17736538-17736620)
chr5 (4-142)||(17861042-17861179)
chr5 (1-147)||(19204942-19205087)
chr5 (4-142)||(33763153-33763290)
chr5 (2-147)||(14051887-14052032)
chr5 (54-147)||(21750808-21750901)
chr5 (4-120)||(25923364-25923480)
chr5 (9-140)||(8418206-8418336)
chr5 (34-145)||(15476266-15476377)
chr5 (9-123)||(38416165-38416279)
chr5 (1-135)||(26289262-26289396)
chr5 (1-148)||(36752144-36752290)
chr5 (1-154)||(5152607-5152760)
chr5 (4-134)||(43570016-43570146)
chr5 (52-142)||(3879305-3879395)
chr5 (69-134)||(5460199-5460264)
chr5 (1-142)||(14143515-14143652)
chr5 (9-142)||(14143755-14143888)
chr5 (1-147)||(17861280-17861418)
chr5 (85-145)||(5460272-5460332)
chr5 (59-142)||(19185548-19185631)
chr5 (103-148)||(19615419-19615464)
chr5 (2-157)||(2597327-2597482)
chr5 (3-42)||(41859780-41859819)
chr5 (17-123)||(146479-146585)
chr5 (82-132)||(25333183-25333233)
chr5 (82-132)||(29961823-29961873)
chr5 (83-147)||(2596386-2596450)
chr5 (1-33)||(21750900-21750932)
[»] scaffold0168 (2 HSPs)
scaffold0168 (1-142)||(11729-11870)
scaffold0168 (3-147)||(11486-11630)
[»] chr7 (71 HSPs)
chr7 (4-142)||(10625329-10625467)
chr7 (1-147)||(35085737-35085883)
chr7 (1-142)||(23472798-23472939)
chr7 (1-142)||(47250788-47250929)
chr7 (1-147)||(8769280-8769426)
chr7 (4-142)||(8769527-8769665)
chr7 (1-147)||(23437150-23437296)
chr7 (1-142)||(2357070-2357211)
chr7 (3-157)||(43726486-43726640)
chr7 (10-146)||(43140697-43140833)
chr7 (3-142)||(18731022-18731161)
chr7 (1-135)||(21522230-21522362)
chr7 (3-142)||(44486176-44486315)
chr7 (1-147)||(473422-473568)
chr7 (4-142)||(35085985-35086123)
chr7 (1-122)||(34568606-34568727)
chr7 (3-142)||(31715866-31716004)
chr7 (4-134)||(9230922-9231052)
chr7 (1-123)||(31715655-31715777)
chr7 (1-147)||(32706730-32706876)
chr7 (1-147)||(32706974-32707119)
chr7 (3-145)||(39118010-39118152)
chr7 (4-149)||(5238447-5238592)
chr7 (3-148)||(9034559-9034704)
chr7 (1-142)||(11678706-11678847)
chr7 (1-142)||(24119717-24119858)
chr7 (3-124)||(47250578-47250699)
chr7 (3-134)||(11678947-11679077)
chr7 (4-134)||(2357300-2357430)
chr7 (1-142)||(44485574-44485715)
chr7 (3-147)||(23472591-23472735)
chr7 (3-142)||(44447917-44448055)
chr7 (4-142)||(26920162-26920300)
chr7 (1-146)||(21522460-21522603)
chr7 (1-122)||(44448154-44448275)
chr7 (1-133)||(41758691-41758823)
chr7 (4-142)||(47251142-47251279)
chr7 (1-105)||(9230716-9230820)
chr7 (1-96)||(38842081-38842175)
chr7 (1-142)||(31623666-31623807)
chr7 (1-142)||(36507051-36507192)
chr7 (1-117)||(34568826-34568942)
chr7 (3-134)||(38842266-38842396)
chr7 (3-145)||(28349625-28349766)
chr7 (3-142)||(473195-473331)
chr7 (3-142)||(22338275-22338415)
chr7 (4-147)||(43726242-43726383)
chr7 (8-142)||(37143767-37143900)
chr7 (56-134)||(48704105-48704183)
chr7 (1-148)||(37144005-37144152)
chr7 (70-148)||(10625103-10625181)
chr7 (1-134)||(47305138-47305271)
chr7 (4-100)||(47250942-47251038)
chr7 (1-122)||(47305369-47305490)
chr7 (2-142)||(22338516-22338659)
chr7 (1-101)||(23437394-23437494)
chr7 (56-147)||(38677039-38677130)
chr7 (19-147)||(15326870-15326998)
chr7 (2-144)||(38676059-38676201)
chr7 (20-133)||(43050396-43050510)
chr7 (59-148)||(28263493-28263582)
chr7 (56-142)||(40263608-40263694)
chr7 (1-42)||(10625186-10625227)
chr7 (59-123)||(48703802-48703866)
chr7 (82-133)||(43704957-43705008)
chr7 (3-57)||(24119949-24120003)
chr7 (82-132)||(45457099-45457149)
chr7 (59-144)||(4156553-4156638)
chr7 (98-154)||(9225626-9225681)
chr7 (80-124)||(19543511-19543555)
chr7 (84-132)||(42287324-42287372)
[»] chr6 (60 HSPs)
chr6 (1-142)||(3288933-3289074)
chr6 (1-146)||(24604874-24605018)
chr6 (1-151)||(33329200-33329350)
chr6 (1-142)||(6220298-6220439)
chr6 (1-134)||(9173912-9174045)
chr6 (1-146)||(25551578-25551723)
chr6 (3-140)||(1158593-1158732)
chr6 (4-156)||(3338466-3338618)
chr6 (1-140)||(24605116-24605254)
chr6 (1-147)||(33545064-33545210)
chr6 (1-146)||(33544821-33544966)
chr6 (1-142)||(35132604-35132745)
chr6 (1-142)||(3289152-3289293)
chr6 (1-134)||(29009965-29010098)
chr6 (1-146)||(31029523-31029668)
chr6 (1-122)||(33346501-33346622)
chr6 (1-122)||(35119053-35119174)
chr6 (1-134)||(12903232-12903365)
chr6 (1-142)||(14336905-14337046)
chr6 (1-145)||(13156081-13156220)
chr6 (1-145)||(13160937-13161076)
chr6 (9-132)||(11524778-11524901)
chr6 (8-134)||(25551358-25551484)
chr6 (1-133)||(7537847-7537979)
chr6 (1-142)||(29010196-29010337)
chr6 (4-143)||(6220058-6220197)
chr6 (4-142)||(1860731-1860868)
chr6 (3-117)||(12903455-12903569)
chr6 (5-147)||(19135692-19135834)
chr6 (3-133)||(24548485-24548615)
chr6 (1-142)||(11525008-11525148)
chr6 (3-124)||(14337146-14337267)
chr6 (1-142)||(31029766-31029907)
chr6 (5-135)||(1158837-1158965)
chr6 (1-147)||(2949294-2949435)
chr6 (8-133)||(2814560-2814685)
chr6 (1-134)||(3338719-3338850)
chr6 (1-142)||(13155842-13155983)
chr6 (1-142)||(13160698-13160839)
chr6 (5-132)||(2315592-2315719)
chr6 (5-100)||(33972452-33972547)
chr6 (57-134)||(11524716-11524793)
chr6 (1-100)||(2949533-2949632)
chr6 (4-143)||(31754206-31754345)
chr6 (9-123)||(29999653-29999767)
chr6 (3-142)||(24548244-24548383)
chr6 (1-151)||(35132843-35132982)
chr6 (51-142)||(32283029-32283120)
chr6 (1-147)||(17544695-17544840)
chr6 (59-134)||(33548158-33548232)
chr6 (1-62)||(33329448-33329509)
chr6 (69-145)||(17544454-17544529)
chr6 (5-88)||(33972260-33972344)
chr6 (59-142)||(17245624-17245707)
chr6 (80-146)||(33971927-33971993)
chr6 (59-142)||(6229687-6229769)
chr6 (68-109)||(7162399-7162440)
chr6 (1-46)||(29999512-29999557)
chr6 (80-124)||(17971840-17971884)
chr6 (80-124)||(29467278-29467322)
[»] scaffold0236 (2 HSPs)
scaffold0236 (1-130)||(11228-11357)
scaffold0236 (1-142)||(11456-11597)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (3-142)||(40596-40735)
scaffold0051 (4-147)||(40350-40493)
[»] scaffold0045 (4 HSPs)
scaffold0045 (1-145)||(65739-65883)
scaffold0045 (1-145)||(73071-73215)
scaffold0045 (1-142)||(65981-66122)
scaffold0045 (1-142)||(73313-73454)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (5-145)||(13787-13927)
scaffold0188 (1-142)||(13545-13685)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-147)||(177307-177453)
[»] scaffold1436 (2 HSPs)
scaffold1436 (3-153)||(1468-1617)
scaffold1436 (1-100)||(1717-1815)
[»] scaffold0128 (2 HSPs)
scaffold0128 (1-142)||(45078-45219)
scaffold0128 (9-78)||(44902-44971)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (10-135)||(90815-90940)
scaffold0016 (1-96)||(91750-91845)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (1-100)||(11713-11812)
scaffold0444 (61-142)||(11642-11723)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (2-134)||(93199-93333)
scaffold0022 (69-123)||(93524-93578)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (59-133)||(10920-10994)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (1-43)||(26038-26080)
scaffold0193 (68-146)||(25966-26044)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (68-140)||(24535-24607)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 125)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 35753673 - 35753897
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35753673 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaatttaaattaatggaccaaa 35753772  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattatataataaattttaagattaatgtatcatattttatttggttatcaaacg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35753773 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattatataataaattttaagattaatgtatcatattttatttggtcatcaaacg 35753872  T
Q  201 ttaaattgagacatagcatgataca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  35753873 ttaaattgagacatagcatgataca 35753897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 34521408 - 34521262
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34521408 ctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagc 34521309  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctatt 149  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  34521308 gatactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagcctatt 34521262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 41997963 - 41997822
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  41997963 acctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaatgaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaattaaattttaattaagggaccaaa 41997864  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41997863 acgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaattta 41997822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 45171309 - 45171450
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| || || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45171309 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggaaagaaattaagggaccaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 45171408  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  45171409 gcgatactacctaaatagttaagggactaaaaatgcaattta 45171450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 12123321 - 12123468
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  12123321 acctaacgcttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 12123420  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  12123421 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgaaatttaacctat 12123468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 34630123 - 34629981
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  34630123 taacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacg 34630024  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  34630023 atactacttaaatagttaagggaccaaaaatataatttaacct 34629981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 54081425 - 54081284
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54081425 ctaacgtttttaaattaaaactaacagaaaagaccaaaatatgtaacagagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaattaa-ggaccaaagc 54081327  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  54081326 gatactgcctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaacc 54081284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 26332463 - 26332322
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  26332463 acctaatgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaattgaaatttaattaagggaccaaa 26332364  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  26332363 gcgatactacctaaatagttaggggaccaaaaatgcaattta 26332322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 40410856 - 40410711
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  40410856 acctaacgttttttaattaaaactaacggaaataaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 40410757  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  40410756 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacct 40410711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 44069365 - 44069498
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  44069365 acctaacgtttttgaattaaaactaatagaaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaa 44069464  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44069465 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 44069498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 54107813 - 54107672
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54107813 acctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 54107714  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  54107713 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 54107672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 4846838 - 4846994
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||| | |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4846838 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatggccaaaatgtgtaacagagagaagttatgagaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaa 4846937  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattatataata 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||    
T  4846938 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctataatctaata 4846994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Original strand, 28688234 - 28688373
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| | | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28688234 ctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaacgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagc 28688333  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28688334 gatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgtaattta 28688373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 41208545 - 41208399
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||  |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41208545 acctaacgtttttgaattaaatctaacggaaatgaccaaaatgtgcaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 41208446  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  41208445 gcgatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaaccta 41208399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 43899316 - 43899462
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  43899316 acctaacgttgtttaattaaaactaacggtaaggaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaggggaccaaa 43899415  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  43899416 gcgatattacctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaatttagccta 43899462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 7743009 - 7743154
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| |||||| | || ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  7743009 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagataagttatgagaccaaaataaatcaaattttaattaagggatcaaagc 7743108  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtacc-aaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7743109 gatactacctaaatagttaagggaccaaaaaatgtaatttaaccta 7743154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 10756862 - 10756729
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10756862 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagcaacaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaa 10756763  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10756762 gcgatactacctaaatagctaagggaccaaaaat 10756729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 15862326 - 15862185
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15862326 acctaatgtttttgaattaaaactaatagaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaa 15862227  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||    
T  15862226 gcgatactacctaaataattaagggacctaaaatggaattta 15862185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 26332560 - 26332710
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagt-----taagggatcaaaataaatcgaattttaattaatgga 95  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||     ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  26332560 acctaatgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaggga 26332659  T
Q  96 ccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  26332660 ccaaagcgatactacctaaatagttaagg-accaaaaatgcaatttagccta 26332710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 12123234 - 12123080
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |   ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12123234 acctaacatttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 12123135  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattatataa 155  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  12123134 atgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctattttataa 12123080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 15862417 - 15862563
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||| |||    
T  15862417 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaataaagggacaaaa 15862516  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    | |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||    
T  15862517 gagatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccta 15862563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 19124333 - 19124192
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |   |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  19124333 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagagatcaaaatagatcgaattttaattaggggaccaaa 19124234  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    || ||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19124233 gcaatattacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 19124192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 45871841 - 45871700
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||| |||| | | | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45871841 acctaacgatttttaattaaaactaacggaaatgacccaaatgtataacagagagaatttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 45871742  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  45871741 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 45871700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 141
Target Start/End: Original strand, 7274889 - 7275024
Alignment:
Q  5 aacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcga 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  7274889 aacgtttttgaattaaaactaaaagaaatgaccaaaatgtgtaaca-agagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagtga 7274987  T
Q  105 tactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattt 141  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  7274988 tactacctaaatagttaacggaccaaaaatgcaattt 7275024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 147
Target Start/End: Original strand, 41208649 - 41208788
Alignment:
Q  8 gtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatac 107  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  41208649 gtttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagatgttaagggactaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 41208748  T
Q  108 tacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||    
T  41208749 tacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttagccta 41208788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 45171209 - 45171054
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||     
T  45171209 taacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacttagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaggggccaaagca 45171110  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattatataataaa 159  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||| | |||||||    
T  45171109 atactacctaaatagttaagggaccagaaatacaatttagcctattttttaataaa 45171054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Original strand, 7937808 - 7937946
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  7937808 taacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataattcgaattttaattaagggaccaaagtg 7937907  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  7937908 atactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgaaattta 7937946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 117
Target Start/End: Original strand, 17102621 - 17102735
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17102621 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatctataagagagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttatttaatggaccaaagc 17102720  T
Q  103 gatactacctaaata 117  Q
    |||||||||||||||    
T  17102721 gatactacctaaata 17102735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 31514105 - 31514254
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| |  |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31514105 acctaacgtttttgaattaaagctaacggaaag-accaaactgtgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaaaggaccaaa 31514203  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattat 151  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||    
T  31514204 gcgatactacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttagcctattat 31514254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 34521499 - 34521641
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| |  || |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34521499 acctaacgcttttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgtgtaacggaaagaaattaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 34521598  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  34521599 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaa 34521641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 44069267 - 44069126
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  44069267 acctaatgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaa 44069168  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  44069167 acgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 44069126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 54108362 - 54108503
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| | | | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54108362 acctaatgtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatgtataacagagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 54108461  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  54108462 gcgatactagctaaataattaagggaccaaaaatgcaattta 54108503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 40926155 - 40926008
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||    
T  40926155 acctaacgtttttcaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaatggatcaaaataaatcaaattttaattaagagatcaaa 40926056  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    |||||||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  40926055 gcgatactacataaatagttaaaagaccaaaaatgcaatttaacctat 40926008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Original strand, 50819461 - 50819600
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| | | | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50819461 ctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaaggacgaaaatgtgtaacacatagaagtaaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagc 50819560  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||||||| ||||||    
T  50819561 gatactaccttaacagttaagagaccaaaaatgcaattta 50819600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 50856403 - 50856264
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| | | | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50856403 ctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaaggacgaaaatgtgtaacacatagaagtaaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagc 50856304  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||||||| ||||||    
T  50856303 gatactaccttaacagttaagagaccaaaaatgcaattta 50856264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 53841268 - 53841407
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  53841268 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaattaagggaccaaaataaatcgaattttaattacgagaccaaa 53841367  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatt 140  Q
    || |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  53841368 gcaatactagctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatt 53841407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 21169810 - 21169668
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   | |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21169810 acctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaattgataacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 21169711  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaa 143  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||    
T  21169710 acgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatacaatttaa 21169668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 7950419 - 7950278
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  7950419 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaacagagaaaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagagaccaaa 7950320  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     | ||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  7950319 acaatactacataaatagttaagggactaaaaatgcaattta 7950278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 8846220 - 8846079
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||  |||||||    
T  8846220 acctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaattaatcgaattttagttaagagaccaaa 8846121  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8846120 acaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 8846079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 147
Target Start/End: Original strand, 28691364 - 28691501
Alignment:
Q  10 ttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatacta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  28691364 ttttgaattaaaactaacagaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaatgatcaaaataaatcaaattttaatttagggacaaaagcgatacta 28691463  T
Q  110 cctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||||| |||||| || ||||||  |||||||||||    
T  28691464 cctaaataattaagggacaaaaaatacaatttaaccta 28691501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 31514007 - 31513866
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | | ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | | ||||    
T  31514007 acctaacatttttgaattaaaactaactggaaggaccaaaatgtgtaacatagagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaaagaatcaaa 31513908  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  31513907 gcgatactacctaaatagttaatggaccaaaaatgcaattta 31513866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 151
Target Start/End: Original strand, 19124416 - 19124563
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||| | ||||| |||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  19124416 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatgtgtaacagagaaaagtcaagagaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaac 19124515  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattat 151  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||    
T  19124516 gatactacctaaatagttaagg-accaaaaatataatttagcttattat 19124563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 50819361 - 50819225
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  50819361 taacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagataagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagcgacgaaagcg 50819262  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatt 140  Q
    || |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  50819261 atgctacgtaaatagttaagggaccaaaaatgcaatt 50819225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Original strand, 50856503 - 50856639
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  50856503 taacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagataagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagcgacgaaagcg 50856602  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatt 140  Q
    || |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  50856603 atgctacgtaaatagttaagggaccaaaaatgcaatt 50856639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Original strand, 8846320 - 8846459
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | | |||||||||||  || |||||||||| |||||||| ||||  |||||||||    
T  8846320 ctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaaagaccaaaataaatggaattttagttaagtgaccaaagc 8846419  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8846420 gatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 8846459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 52606272 - 52606141
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  52606272 acctaacgttttttatttaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 52606173  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaa 132  Q
     ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  52606172 acgatactacataaatagttaagggaccaaaa 52606141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14353190 - 14353044
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||| | ||||||| ||| | ||||  |||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14353190 acctaacatttttgaattaaaactgacggaaatggccaaaatgtgtcacagaggaaagttaagggactaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 14353091  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||    
T  14353090 gcgatactacctaaataattaagggatcaaaaatgcaatttaaccta 14353044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 142
Target Start/End: Original strand, 52609639 - 52609745
Alignment:
Q  36 ccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatg 135  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52609639 ccaaaatatgtaacagagagaaattaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatagtacctaaatagttaagggaccaaaaatg 52609738  T
Q  136 taattta 142  Q
     ||||||    
T  52609739 gaattta 52609745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 54081525 - 54081659
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaa-tatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||  ||| |||||||| | ||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54081525 acctaacatttttgaattaaaaataacgaaaatgaccaaaaatgtgtaacagagagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaa 54081624  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54081625 agcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 54081659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 27940416 - 27940275
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||| |  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  27940416 acctaatgtttttgaattgaacctaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagtttagggaccaaaataaatcaaatttaaattaagggaccaaa 27940317  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27940316 gtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgaaattta 27940275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 40926253 - 40926393
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||| | |||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40926253 acctaacgtttttcaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagtgaagttaagg-accaaaataaatcaaattttaattaatggaccaaa 40926351  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    | ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  40926352 gtgatactacctaaatagttaggggactaaaaatgcaattta 40926393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17273921 - 17273778
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  17273921 acctaacgttttttaattaaaactaacgaaaaagaccaaaatatgtaatgaagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaggaatcaaa 17273822  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaac 144  Q
     ||||||  ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  17273821 acgatacggcctaaatagttaagggaccaaaaatgcattttaac 17273778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 43899233 - 43899114
Alignment:
Q  23 ctaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  43899233 ctaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatgttacctaaatagttaa 43899134  T
Q  123 ggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     | |||||||||| ||||||    
T  43899133 aggaccaaaaatgcaattta 43899114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 146
Target Start/End: Original strand, 35580210 - 35580336
Alignment:
Q  20 aaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagt 119  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| ||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  35580210 aaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaatcgatactacctaaatagt 35580309  T
Q  120 taaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  35580310 taagggaccaaaaatgcaatttaacct 35580336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 40639359 - 40639505
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||  | ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  40639359 acctaacgtttttgaattaaaacacacggaaatgaccaaaatatgtaacagagagaagttaagataccaatataaatcaaattttaattaagggaccaaa 40639458  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||||||  ||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||    
T  40639459 gcgatactaattaaatagttaaaggaccaaaaacataatttagccta 40639505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 14353290 - 14353422
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| |  |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||     
T  14353290 acctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaa-tgtgtaacggagagaagttaaaggaccaagataaatcgaattttatttaagggaccaat 14353388  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14353389 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 14353422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 17102528 - 17102387
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  17102528 acctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgcccaaaatatgtaacagggagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaagaaa 17102429  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     | ||| |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  17102428 acaatattacctaaataattaagaaaccaaaaatgcaattta 17102387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 37133421 - 37133276
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  37133421 acctaacgtttttgaattaaaacttacgaaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 37133322  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  37133321 gcgatactaattaaatagctaagggaccaaaaacataatttaacct 37133276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 134
Target Start/End: Original strand, 45871935 - 45872064
Alignment:
Q  5 aacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcga 104  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | | |  ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  45871935 aacgctttttaattaaaactaacggaaaggacccaaatgtataacggagagaatttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacga 45872034  T
Q  105 tactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45872035 tactacctaaatagttaagggaccaaaaat 45872064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 9028335 - 9028187
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| |||   ||  || ||||||| || ||||||||||| |||||||| | | ||||||||    
T  9028335 acctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaataccaaaatgtgtagcaggaaggagttaagagaacaaaataaatcaaattttaacttagggaccaaa 9028236  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctatt 149  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9028235 gtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagcctatt 9028187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 22355077 - 22354953
Alignment:
Q  10 ttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatacta 109  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| | | ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  22355077 ttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacacagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaagaaccaaaacgatacta 22354978  T
Q  110 cctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    ||||||||||||||| || ||||||    
T  22354977 cctaaatagttaagggactaaaaat 22354953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 53678577 - 53678433
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||| |  |||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  53678577 acctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagatactaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaa 53678478  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
    |||||||||  |||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  53678477 gcgatactatttaaataattaagggaccaaaaacgtaatttaacc 53678433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 2829650 - 2829796
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  2829650 acctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatatgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaaagaccaaa 2829749  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
     | ||| ||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||    
T  2829750 tcaataatacataaatagttaagg-atcaaaaatgcaatttagcctat 2829796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 40969496 - 40969642
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | | |||||| ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||    
T  40969496 acctaacgtttttgaattaaaactgacggaaaggaccaaaatgtgtaaga-agagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagagactaa 40969594  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  40969595 agcgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatataatttaaccta 40969642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 47891657 - 47891527
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |   | ||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  47891657 acctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacgaatagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 47891558  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaa 131  Q
    |||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  47891557 gcgatactaattaaattgttaagggaccaaa 47891527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 27254128 - 27254007
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||  | |||||| ||| |  |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27254128 acctaacatttttgaattaaaactaacggaaataatcaaaatgtgtaacggagagaagttaaggaaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 27254029  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaa 122  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  27254028 gcgatactgcctaaatagttaa 27254007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 28688134 - 28688017
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  28688134 acctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaccggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggatcaaa 28688035  T
Q  101 gcgatactacctaaatag 118  Q
    | ||||||||||||||||    
T  28688034 gtgatactacctaaatag 28688017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 33812815 - 33812723
Alignment:
Q  54 agaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  33812815 agaagttaaaggatcaaaataaatcaaattttaattaaagaaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgaaatttaacct 33812723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 28691256 - 28691125
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  28691256 ctaacgtttttaaattaaaattaacataaaggatcaaaatgtgtaatgcagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaacaaagc 28691157  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
     |||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  28691156 aataccacctaaataattaagggaccaaaaat 28691125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 5348721 - 5348576
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaag 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |  ||||||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  5348721 ctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattgagggaccaaag 5348623  T
Q  102 cgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  5348622 cgatactaattaaatagttaagggactaaaaatgcaatttaacctat 5348576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 29248460 - 29248342
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||| |||| ||| ||    
T  29248460 taacgtttttgaattaaaactaatgaaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggaaccaaaataaattaaattttaattaagggactaaaacg 29248361  T
Q  104 atactacctaaatagttaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  29248360 ataccacctaaatagttaa 29248342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 40969399 - 40969258
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||| | | |||||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  40969399 acctaacgtttttgaattaaaactgacggaaatgaccaaaatgtgtaaga-agagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaa 40969301  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  40969300 agcgatactaattaaatagttaagggactaaaaatgcaattta 40969258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Original strand, 52268349 - 52268486
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||| |   ||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  52268349 taacgtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaaag-accaaaataaattgaattttaattaaaggaccaaaacg 52268447  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  52268448 atactaactaaatagttaatggaccaaaaatgcaattta 52268486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 51170631 - 51170764
Alignment:
Q  9 tttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatact 108  Q
    ||||| ||||||||||||  |||| ||| ||||| ||| | | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||    
T  51170631 ttttttaattaaaactaattgaaaagactaaaatgtgtaacatagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaatgatcaaaacgatact 51170730  T
Q  109 acctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  51170731 acctaaatagttaagggatcaaaaatgcaattta 51170764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 2829552 - 2829408
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatc-aaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | | | ||||||||||||||  | | |||||||||| ||| ||||||||  ||||||    
T  2829552 acctaatgtttttgaattaaaactagcagaaaagaccaaaatgtttaacagagagaagttaagaaaaccaaaataaatcaaatgttaattaagagaccaa 2829453  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaac 144  Q
    | | ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  2829452 aacaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaac 2829408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 10756952 - 10757071
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| ||| |  ||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  10756952 ctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaagatcaaaatgtgtaacggagagaaattaagagaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaaac 10757051  T
Q  103 gatactacctaaatagttaa 122  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  10757052 gatactgcctaaatagttaa 10757071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 17274018 - 17274161
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||| |    ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  17274018 acctaacatttttgaattaaaaataacggaatgaaccaaaatgtgtaacgatgagaaattaagagaccaaaataattcgaattttaattaaaagaccaaa 17274117  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaac 144  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||    
T  17274118 gcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatacaatttaac 17274161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 47891755 - 47891901
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||||||| ||||||    ||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  47891755 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagatgccaaaataaattaaattttaattaagggaccaa 47891853  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    ||| ||||||  ||||||||||| | | |||||||| |||||||||||    
T  47891854 agcaatactaattaaatagttaaaggaacaaaaatggaatttaaccta 47891901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 53841171 - 53841065
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  53841171 acctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaggatcaaaatgtgcaacagagataagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagcgaccaaa 53841072  T
Q  101 gcgatac 107  Q
    |||||||    
T  53841071 gcgatac 53841065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 5348810 - 5348931
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |  |||| |||||||   | ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  5348810 acctaacgtttttgaattaaaacacacggaaaggaccaaaatatgtaacggagaaaagttaaaataccaaaataaatcaaattttaattacgggaccaaa 5348909  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaa 122  Q
    |||||||||  |||||||||||    
T  5348910 gcgatactaattaaatagttaa 5348931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 9028433 - 9028574
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||| | | |   ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9028433 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaaaactaaaatgtataacgaagagaagttaaaggaccaaaataaattgaattttaattaaaggaccaaa 9028532  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     | |||||| || ||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  9028533 acaatactagcttaatagttaatgaaccaaaaatgcaattta 9028574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 35753489 - 35753408
Alignment:
Q  59 ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatt 140  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  35753489 ttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagaaaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatt 35753408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 35753574 - 35753477
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35753574 ctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtcacgtagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 35753477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 40639259 - 40639116
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaag 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||| |  ||||||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||     
T  40639259 ctaacgtttttgaattaaaaccaacggaaatgaccaaaatttgtaag-gagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaa 40639161  T
Q  102 cgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    ||||||||  ||||||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  40639160 cgatactaattaaatagttaaagaactaaaaatgcaatttaacct 40639116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 2078717 - 2078859
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| | | |||||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  2078717 taacgtgtttgaattaaaactaacagaaaagactaaaatgtgtaaga-agagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagc 2078815  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    |||| ||  ||||||||||||| || ||||||  ||||||||||    
T  2078816 gatattaattaaatagttaagggactaaaaatacaatttaacct 2078859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 29248550 - 29248673
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| | ||| |  |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||    
T  29248550 acctaacgtttttgaattaaaactaacgaaattgaccaaattgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaatagatcaaattttaattaaaggactaaa 29248649  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaagg 124  Q
    |  |||||| ||||||||||||||    
T  29248650 gtaatactatctaaatagttaagg 29248673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 46766767 - 46766620
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  || |||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  46766767 acctaacgttttttaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggatagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaa 46766668  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    | ||||| || | ||||||| || | |||||||||| |||||||||||    
T  46766667 aacgatattagcaaaatagtaaaaggaccaaaaatgcaatttaaccta 46766620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 51885606 - 51885752
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||| | | |||||| | ||||  | ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  51885606 acctaacgtttttgaattaaaactgacggaaagggtcaaaatatgtaaga-agagaaagctaagataccaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaa 51885704  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    | ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  51885705 aacgatattaattaaatagttaagggaccaaaaacataatttaaccta 51885752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 54247406 - 54247292
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  54247406 acctaacgtttttgaattaaaactaaca---------aaaatgtgtaatggaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaatcaatggaccaaa 54247316  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaagg 124  Q
    |||||||||  |||||||||||||    
T  54247315 gcgatactatttaaatagttaagg 54247292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 7937719 - 7937646
Alignment:
Q  69 aaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  7937719 aaaatgaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagcaaccaaaaatgcaattta 7937646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 100
Target Start/End: Original strand, 22444430 - 22444527
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22444430 ctaatgttttcgaattaaaactaaacaaaaggaccaaaatatgtaacagagagaagttaaggaaccgaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 22444527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 149
Target Start/End: Original strand, 46766863 - 46767004
Alignment:
Q  9 tttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatac 107  Q
    ||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |  ||||||| ||||||  |  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  46766863 ttttttaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaagttaagatacaaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 46766962  T
Q  108 tacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctatt 149  Q
    || | |||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||    
T  46766963 tagcaaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcctatt 46767004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 7742919 - 7742775
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||  | ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||   ||||||    
T  7742919 acctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaagaccaaaatgtgcaacagagagaagataagagaacaaaataaatcaaattttaattaagtaaccaaa 7742820  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
       ||  ||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||    
T  7742819 ataatgttacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatataacc 7742775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 142
Target Start/End: Original strand, 33812842 - 33812926
Alignment:
Q  58 gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  33812842 gttaagagatcaaaataaatcaaattttaattaagggactaaagcgatactacctaaatatttaagagaccaaaaatgaaattta 33812926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 53678675 - 53678798
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||| |  ||||||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  53678675 acctaacgtttttgaactaaaaccaacggaaagaaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaa 53678773  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaagg 124  Q
    ||||||||||  |||||||||||||    
T  53678774 agcgatactaattaaatagttaagg 53678798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 22444296 - 22444237
Alignment:
Q  56 aagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaa 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22444296 aagttaagggagcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaatcgatactacctaaa 22444237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Original strand, 49222271 - 49222411
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| | | ||||| ||||||| | ||||| ||| || ||||| ||| |||||||| |    
T  49222271 ctaacgtttttgaattaaaactaatgaaaatgaccaaaatatgtgacatatagaaggtaaggga-ccaaatagatc-aaatttaactaagggaccaaaac 49222368  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  49222369 gatactatctaaatagttaagagaccagaaacgtaatttaacc 49222411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 41998061 - 41998202
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaaca-----gaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatgga 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||      |||| ||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||          |||||||||| |||    
T  41998061 acctaacgtttttgaattaaaactaacgtaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagagaagttaggggatcaaa----------ttttaattaaggga 41998150  T
Q  96 ccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  41998151 ccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagccta 41998202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 49222147 - 49222047
Alignment:
Q  34 gaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaa 133  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||| | | | | ||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49222147 gaccaaaatgtgtaacagagagaagttgaagaaccgaaataaatcgaattttaattaaaagaccgaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaa 49222048  T
Q  134 t 134  Q
    |    
T  49222047 t 49222047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 142
Target Start/End: Original strand, 53310001 - 53310105
Alignment:
Q  38 aaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgta 137  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| |  || ||||||| |    
T  53310001 aaaatgtgtaatggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagagaccaaagtgatactacctaaataattaggagactaaaaatgca 53310100  T
Q  138 attta 142  Q
    |||||    
T  53310101 attta 53310105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 21918637 - 21918496
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |  |||| || ||||||  |  |||| ||||| |||||||||| | |||||||||     
T  21918637 taacgtttttgaattaaaactaac-gaaaggatcaaaatgtgtaag-gagataaagttaagatacaaaaaaaaatcaaattttaatttagggaccaaagt 21918540  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21918539 gatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacct 21918496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 133
Target Start/End: Original strand, 33773034 - 33773165
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaag-ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaag 101  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||  | ||||||||  |||||  | ||||||||||| ||||||||| || ||| |||||    
T  33773034 ctaacgtttttaaattaaaaccaacggaaacgaccaaaatatggaacagagagaaaattaagataccaaaataaatcaaattttaatcaagggatcaaag 33773133  T
Q  102 cgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaa 133  Q
     |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  33773134 tgatactaattaaatagttaagggaccaaaaa 33773165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Original strand, 51311827 - 51311906
Alignment:
Q  68 caaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  51311827 caaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaacagaccaaaaatgtaatttagccta 51311906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Original strand, 588393 - 588534
Alignment:
Q  2 cctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaag-ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||  | ||||| ||||| |||||||||||| | ||| ||    
T  588393 cctaacattttttaattaaaactaacgtaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaaaattaagataccaaaacaaatcaaattttaattaaggaaccgaa 588492  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||| ||  |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  588493 gcgatattaattaaatagttaagatatcaaaaatgcaattta 588534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 2078627 - 2078519
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||| | | |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||     
T  2078627 acctaacgtttttgaatcaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaaga-agagaaagttaagatatcaaaataaatcaaattttatttaagggaccag 2078529  T
Q  100 agcgatacta 109  Q
    ||||||||||    
T  2078528 agcgatacta 2078519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 7274785 - 7274656
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||| |||||||||||||| ||||  |||| || |||||| ||| |  |||||||||||||||||||||          ||||||||||  |||||||||    
T  7274785 ctaatgtttttgaattaaagctaatggaaatgaacaaaatctgtaacggagagaagttaagggatcaaa----------ttttaattaagagaccaaagc 7274696  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  7274695 gatactacctaaatatttaagggaccaaaaatgcaattta 7274656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 148
Target Start/End: Original strand, 50394321 - 50394413
Alignment:
Q  56 aagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| | | || |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  50394321 aagttaagggatcaaaataaatcaaaatttagttaagggaccaaaccaaaaccaattaaatagttaagggaccaaaaaggtaatttaacctat 50394413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Original strand, 13866964 - 13867047
Alignment:
Q  59 ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13866964 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 13867047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Original strand, 49529120 - 49529203
Alignment:
Q  59 ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  49529120 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 49529203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 147
Target Start/End: Original strand, 38911494 - 38911606
Alignment:
Q  35 accaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||| | || ||||||    
T  38911494 accaaaatgtgtaacagagaaaagttaatgaaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaaacaatattacctaaataattaaaggacaaaaaat 38911593  T
Q  135 gtaatttaaccta 147  Q
      |||||| ||||    
T  38911594 acaatttagccta 38911606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 51883985 - 51883862
Alignment:
Q  19 aaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaata 117  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||| | | |||||| ||||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  51883985 aaaactaacataaaagaccaaaatgtgtaaga-agagaaagttaagataccaaaataaattaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaata 51883887  T
Q  118 gttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||| |  ||||||| ||||||    
T  51883886 gttaagggattaaaaatgcaattta 51883862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 50259196 - 50259110
Alignment:
Q  56 aagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||||| |||||||| || || |||| |||| |||||||| ||| || |  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50259196 aagttaagggaccaaaataattcaaaatttagttaagggaccaaaccgaaaccaattaaatagttaagggaccaaaaatgtaattta 50259110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 45
Target Start/End: Original strand, 52606362 - 52606404
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatg 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52606362 ctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatg 52606404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 4846735 - 4846667
Alignment:
Q  5 aacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaata 74  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  4846735 aacgtttttgaattaaa-ctaatggaaaggaccaaaatgtgtaagagagagaagttaagggaccaaaata 4846667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Original strand, 20963547 - 20963663
Alignment:
Q  18 taaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaag-ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaat 116  Q
    |||||||||| |||||||| |||| | || | ||||||||  |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||  ||| |||| ||||||||  |||||    
T  20963547 taaaactaacggaaaggactaaaagaagtaacagagagaaacttaaaggaccaaaataaatcaaattttagttagaggatcaaaccgatactaattaaat 20963646  T
Q  117 agttaaggtaccaaaaa 133  Q
    |||||||| ||||||||    
T  20963647 agttaagggaccaaaaa 20963663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 43527080 - 43527026
Alignment:
Q  88 ttaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  43527080 ttaagggaccaaatcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaattta 43527026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 52705545 - 52705480
Alignment:
Q  59 ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaagg 124  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||| | ||||||  |||||||||||||    
T  52705545 ttaagggatcaaaataaatcaaattttagttaagggatcaaaccaatactaattaaatagttaagg 52705480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 43527136 - 43527068
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaa 71  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||    
T  43527136 ctaatgtttttgaatcaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaccagagagaagttaagggaccaaa 43527068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Original strand, 43527238 - 43527297
Alignment:
Q  12 ttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaa 72  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||    
T  43527238 ttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaaca-agagaagttaagggatgaaaa 43527297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 44316702 - 44316630
Alignment:
Q  70 aaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||| ||||||| |||  |||| ||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  44316702 aaataaatcaaattttagttaggggactaaaccgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 44316630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 50393453 - 50393310
Alignment:
Q  10 ttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatact 108  Q
    |||| |||||||  |||| |||| ||||||||  ||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||| |||| ||| |||| ||| |||    
T  50393453 tttttaattaaatttaacggaaatgaccaaaacgtgtaacagagagaaagttaagggaccaaaataaatcaaaatttagttaagggatcaaaccgaaact 50393354  T
Q  109 acctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattata 152  Q
    |  |||||| ||||||   |||||| |||||||| |||| ||||    
T  50393353 aattaaataattaaggggtcaaaaaggtaatttagcctactata 50393310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 51311732 - 51311693
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaat 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  51311732 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaat 51311693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 132
Target Start/End: Original strand, 967474 - 967524
Alignment:
Q  82 ttttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaa 132  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  967474 ttttagttaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaaggaaccaaaa 967524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 588310 - 588249
Alignment:
Q  88 ttaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctatt 149  Q
    |||| |||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  588310 ttaagggaccaaaacgatattaattaaatagttaagggaccaaaaacataatttaacctatt 588249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 22444330 - 22444298
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaag 33  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22444330 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaag 22444298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0809
Description:

Target: scaffold0809; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 4560 - 4706
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4560 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatctgtgacagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 4659  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  4660 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 4706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 4482 - 4337
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||    
T  4482 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagtgaagttaagagaccaaaataaatcaaatttcaattaaggaaccaaa 4383  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    | |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4382 gtgatagtacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacct 4337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 125)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 29256974 - 29256831
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  29256974 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagc 29256875  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  29256874 gatactacctaaatagttaagggaccaaaaatataatttaacct 29256831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 18793833 - 18793694
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18793833 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagc 18793734  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  18793733 gatactacctaaataattaagggaccaaaaatgaaattta 18793694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 23281254 - 23281398
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23281254 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttatgggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagc 23281353  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  23281354 gatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 23281398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25088160 - 25088014
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  25088160 acctaatgtttttgaattaaaactaaccgaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaaaggaccaaa 25088061  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  25088060 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 25088014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 10654271 - 10654414
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10654271 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaa 10654370  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaac 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  10654371 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaaattaac 10654414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 37199163 - 37199309
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37199163 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccagaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 37199262  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  37199263 gtgatactacctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaatttaaccta 37199309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 10923605 - 10923746
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10923605 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 10923704  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10923705 gcgataccacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 10923746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 50574759 - 50574904
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  50574759 acctaacgttttttaattaaaactaaccgaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 50574858  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  50574859 acgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatctaacct 50574904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 51692018 - 51691877
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  51692018 acctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatagagagaagttaatggaccaaaatagatcgaattttaattaagggaccaaa 51691919  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  51691918 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 51691877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 16267932 - 16268079
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16267932 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaagaaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagg-accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 16268030  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctatt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  16268031 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctatt 16268079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 34028963 - 34029110
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  34028963 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtataacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaa 34029062  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  34029063 gtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctat 34029110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 51692113 - 51692253
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51692113 acctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaac-gagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 51692211  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  51692212 acgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 51692253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 52412742 - 52412601
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  52412742 acctaacgttttggaattaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaa 52412643  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  52412642 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtatttta 52412601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 6181760 - 6181616
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6181760 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaatggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaa 6181661  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||||||||    
T  6181660 gcgatactaactaaataattaagggatcaaaaatgcaatttaacc 6181616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 42607666 - 42607522
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  42607666 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatttaaattaagggaccaaa 42607567  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
     ||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  42607566 acgatattatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacc 42607522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Original strand, 24590469 - 24590608
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  24590469 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaattgaattttaattaaaggaccaaagt 24590568  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24590569 gatactacctaaatagttaagggaccaaaaatataattta 24590608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Original strand, 52412842 - 52412981
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||     
T  52412842 ctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagt 52412941  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52412942 gataccacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaattta 52412981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 5463360 - 5463494
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5463360 acctaacatttttgaattaaaactaacagagaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaacggaccaaa 5463459  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatg 135  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  5463460 gcgatactagctaaatagttaagggactaaaaatg 5463494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 34028865 - 34028719
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | | ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  34028865 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaatagaagttaagggaccaaaataaattgaattttagttaagggaccaaa 34028766  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  34028765 gtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 34028719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 21036129 - 21035988
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21036129 acctaacgttttttaattaaaactaacttaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaatggaccaaa 21036030  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    | ||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  21036029 gtgatactatctaaatagttaaggaatcaaaaatgcaattta 21035988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24655730 - 24655586
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | | |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  24655730 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggcccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagagaccaaaatgaatcgaattttaattaagagaccaaa 24655631  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  24655630 gcgatactacctaaatacttaagggaccaaatatgcaatttaacc 24655586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 30611364 - 30611216
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30611364 acctaacgttttttaattaaaactaatagaaatgaccaaattatgtaacagagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaa 30611265  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctatt 149  Q
    | |||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  30611264 gtgataatatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacctatt 30611216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 33753367 - 33753223
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| |  | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33753367 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagacaaaaatgtgtaactgggagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagc 33753268  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  33753267 gatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 33753223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 44222334 - 44222190
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44222334 ctaatgtttttgaattaaaactaacagaaagaatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagc 44222235  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||| ||| |||||| |||| | |||||||||| |||||||||||    
T  44222234 gatattacataaataattaaaggaccaaaaatgcaatttaaccta 44222190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 9881695 - 9881550
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9881695 acctaacgtttttgaattaaaattaatggaaaagaccaaaatgtgtaac-gagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatttagggaccaaa 9881597  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  9881596 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 9881550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22584495 - 22584373
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  22584495 acctaacgtttttgatttaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaat 22584396  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaag 123  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  22584395 gtgatactacctaaatagttaag 22584373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 30293157 - 30293011
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | | | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  30293157 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtataacatagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaataaagagaccaaa 30293058  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  30293057 gcgatactacctaaatagttaatggaccaaaaatgcaatttaaccta 30293011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 16267859 - 16267718
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16267859 acctaacgtttttgaattaaaaccaacggtaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 16267760  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16267759 gcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 16267718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 22584602 - 22584735
Alignment:
Q  9 tttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatact 108  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22584602 ttttttaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatact 22584701  T
Q  109 acctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  22584702 acctaattagttaagggaccaaaaatataattta 22584735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 28970563 - 28970422
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28970563 acctaatgttttttaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagttcatggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaa 28970464  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  28970463 gcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaattta 28970422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 35986376 - 35986235
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35986376 acctaacgtttttgaattaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtatcggcgagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 35986277  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  35986276 gcgatactacctaaatagttaagggaacaaaaatgcaattta 35986235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 6181858 - 6182006
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  6181858 accttacgtttttgaattaaaactaattgaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggactaaa 6181957  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctatt 149  Q
    |||||||||| |||||||||| |  |||||||||  |||||| ||||||    
T  6181958 gcgatactacataaatagttatgagaccaaaaatacaatttagcctatt 6182006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 148
Target Start/End: Original strand, 25088261 - 25088404
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |  |||||||||||||| | || |||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  25088261 taacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacatggagaagttaagggaccgaactaaatcgaattttagttaa-ggaccaaaacg 25088359  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  25088360 atactacctaaatagttaagggaccaaaaatataatttaacctat 25088404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 45305654 - 45305797
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  45305654 ctaacgttttttaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatgtgtaacagagaga-gttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagt 45305752  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  45305753 gatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 45305797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 10654173 - 10654027
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  10654173 acctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacggacagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaa 10654074  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  10654073 gcg-tactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagcctat 10654027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11787882 - 11787751
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |  |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  11787882 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtataacggagagaagttaagggaccaaaataattcaaattttaattaagggaccaaagc 11787783  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11787782 gatactacctaaatagttaagggatcaaaaat 11787751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 33753458 - 33753589
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33753458 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagactaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 33753557  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaa 132  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  33753558 acgatactacctaaatagttatgggaccaaaa 33753589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 142
Target Start/End: Original strand, 34279501 - 34279624
Alignment:
Q  19 aaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatag 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  34279501 aaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaatgatactacctaaatag 34279600  T
Q  119 ttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||| |||||||||| ||||||    
T  34279601 ttaagggaccaaaaatgcaattta 34279624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Original strand, 36657745 - 36657876
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36657745 ctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaatagacagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagc 36657844  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  36657845 gatactgcataaatagttaagggaccaaaaat 36657876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 37199076 - 37198943
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  37199076 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagatagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 37198977  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||| | ||||||||||||||  |||||||||    
T  37198976 gcgatattgcctaaatagttaagaaaccaaaaat 37198943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 144
Target Start/End: Original strand, 49291227 - 49291368
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| | | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  49291227 ctaacgtttttgaatcaaaactaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacatagagaaattaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaac 49291326  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaac 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  49291327 gatactatctaaatagttaagggacgaaaaatgcaatttaac 49291368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 19986364 - 19986512
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||  |||||||    
T  19986364 acctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaagagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttatttaagagaccaaa 19986463  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctatt 149  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  19986464 gtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttatcctatt 19986512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 30293255 - 30293398
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||  |||||||| ||| | | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30293255 acctaacatttttgaattaaaactaatggaaaataccaaaatgtgtaacatagagaagttaagg-accaaaataaatcgaattttaattaaaggatcaaa 30293353  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  30293354 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacc 30293398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 50118491 - 50118347
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||| | |||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  50118491 acctaacatttttgaattaaaactaacgaaaatgatcaaaatgtgtaacagagagaaattaagagaccaaaataaatcgaattgtaattaagggaccaaa 50118392  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  50118391 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaacc 50118347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 50574647 - 50574535
Alignment:
Q  12 ttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacc 111  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50574647 ttgagttaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaatagaccaaagcgatactacc 50574548  T
Q  112 taaatagttaagg 124  Q
    |||||||||||||    
T  50574547 taaatagttaagg 50574535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 51810281 - 51810141
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51810281 acctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaa 51810182  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattt 141  Q
    | |||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||    
T  51810181 gtgatactacctaaatagttaagagactaaaaatgcaattt 51810141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 10923504 - 10923365
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaa-actaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  10923504 taacgtttttgaattaaatactaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacggagaaaagttaagggatcaaaataaatcaaattttacttaagggaccaaagc 10923405  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  10923404 gatactacctaaataattaagggaccaaaaatataattta 10923365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 32564096 - 32563949
Alignment:
Q  8 gtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatac 107  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32564096 gtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatac 32563997  T
Q  108 tacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattatataa 155  Q
      ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  32563996 agcctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccttttatataa 32563949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 148
Target Start/End: Original strand, 32564200 - 32564338
Alignment:
Q  9 tttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatact 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32564200 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaac-gatagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatact 32564298  T
Q  109 acctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    |||||||||||||| | || ||||||| |||||| |||||    
T  32564299 acctaaatagttaaaggactaaaaatgcaatttagcctat 32564338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4045243 - 4045097
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4045243 acctaacgtttttgaattaaaatcaatggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaatttaagggatcaaaataaattgaattttaattaagggaccaaa 4045144  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
     |||||||||||||||||||||||  | ||||||  |||||||||||    
T  4045143 acgatactacctaaatagttaaggggctaaaaatacaatttaaccta 4045097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 13944655 - 13944509
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | | || |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  13944655 acctaacatttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtttaatggagagaagttaagggaccaatataaatcaaattttaattaagggaccaaa 13944556  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
     |||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  13944555 acgatactagctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttaaccta 13944509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14118674 - 14118528
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| |  |||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14118674 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagactaaaatgtgtaacggagaaaagttaaagtaccaaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaa 14118575  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  14118574 gtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 14118528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 14775977 - 14776118
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| | || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  14775977 acctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagggagaatttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggaacaaa 14776076  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  14776077 acgatactacctaaatagttaagtgaccaaaaatgcaattta 14776118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 142
Target Start/End: Original strand, 50921365 - 50921474
Alignment:
Q  33 ggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaa 132  Q
    |||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50921365 ggaccaaaatgtgtaactgagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttacttaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaa 50921464  T
Q  133 atgtaattta 142  Q
    ||||||||||    
T  50921465 atgtaattta 50921474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 21385074 - 21384931
Alignment:
Q  7 cgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgata 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  21385074 cgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaatggagagaagttaaag-accaaaataaatcgaattttaattaagggataaaagcgata 21384976  T
Q  107 ctacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattat 151  Q
    |||| ||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||||    
T  21384975 ctacataaatagttaaagaaccagagatgtaatttagcctattat 21384931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 146
Target Start/End: Original strand, 32517757 - 32517898
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||     
T  32517757 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaaatgagagaagttgagggatcaaaataaatcaaattttaattaa--aaccaaagt 32517854  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  32517855 gatactacctaaatagataagggatcaaaaatgcaatttaacct 32517898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Original strand, 11787985 - 11788123
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11787985 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaag-agcaaaatgtgtaatggagataagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagc 11788083  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||| | |||||| ||||   |||||||||| ||||||    
T  11788084 gatactgcttaaataattaaaagaccaaaaatgcaattta 11788123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 21385178 - 21385301
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  21385178 acctaacgtttttgaattaaaatcaacggaaatgaccaaaatgtgttacatagagaagttaagggatcaaaataaattaaattttaattaagggaccaaa 21385277  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaagg 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  21385278 gcgatactacttaaatagttaagg 21385301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 50921202 - 50921063
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||| ||| | |||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  50921202 ctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaaaactaaaatgtgtaacagagagaaatcaagggaccaaaataaatcggattttaattaagggaccaaagt 50921103  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  50921102 gatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 50921063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 24655828 - 24655974
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |  || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  24655828 acctaacgtttttgaattaaaactaaccggaaggaccaaaatgtgtaacggatagaagttaatggctcaaaataaatcgaattttaattacgagaccaaa 24655927  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||||||| ||||||||||||  || ||||||| |||||| ||||    
T  24655928 gcgatactacttaaatagttaagagactaaaaatgcaatttagccta 24655974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 30792579 - 30792437
Alignment:
Q  6 acgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||     
T  30792579 acgtttttgaattaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtaacagagaaaagataagggaccaaaataaatcgaattttatttaagggatcaaagcgac 30792480  T
Q  106 actacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    | |||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||    
T  30792479 agtacctaaatagttaggggaccaaaaatgcaatttagcctat 30792437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 32517735 - 32517629
Alignment:
Q  15 aattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaa 114  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32517735 aattaaaactaacaaaaataaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggaatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaa 32517636  T
Q  115 atagtta 121  Q
    |||||||    
T  32517635 atagtta 32517629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 9119434 - 9119289
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||  | |||||| | | ||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  9119434 ctaacgtttttgaattgaaactaacggaaataaacaaaatgtataatgtatagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagc 9119335  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    |||||||||||| ||||||||| |  |||||| |||||||||||||    
T  9119334 gatactacctaagtagttaagggataaaaaatataatttaacctat 9119289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 13944753 - 13944886
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  13944753 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatttgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattctaattaagggatcaaa 13944852  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
     |||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  13944853 acgatactacctaaatgattaagggaccaaaaat 13944886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 14775889 - 14775756
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  14775889 acctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacagagataagttaagggagcaaaataaatcgaattttaattaaagaagcaaa 14775790  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
     | |||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  14775789 acaatactacctaaataattaagggaacaaaaat 14775756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 49291137 - 49291016
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| ||  ||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  49291137 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgacgaaaatgtgtaatgaagagaagttaaggaacaaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 49291038  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  49291037 gcgatactacctaaatagttaa 49291016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 46949895 - 46949779
Alignment:
Q  6 acgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgat 105  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |   | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  46949895 acgtttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacgaatagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgat 46949796  T
Q  106 actacctaaatagttaa 122  Q
    |||||||||||||||||    
T  46949795 actacctaaatagttaa 46949779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Original strand, 51810382 - 51810513
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||| | | || |||||    
T  51810382 ctaacatttttgaattaaaactaacaagaaggaccaaaatgtgtaacagagagaaattaagggaccaaaataaatcaatttttaattcaggaacaaaagc 51810481  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51810482 gatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 51810513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 36884843 - 36884721
Alignment:
Q  24 taacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaag 123  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  36884843 taacggaaaggaccaaaatatgtaatggagggaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagagaccaaagcgatactacctaaatagttaaa 36884744  T
Q  124 gtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    | | |||||||  ||||||||||    
T  36884743 ggaacaaaaatacaatttaacct 36884721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 121
Target Start/End: Original strand, 46738968 - 46739086
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| | |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  46738968 ctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgactaaaatgtgtaacagagagaagttaagcgaccaaagtaaatcgaattttaattaagggaccaaagt 46739067  T
Q  103 gatactacctaaatagtta 121  Q
    |||||||||||||||||||    
T  46739068 gatactacctaaatagtta 46739086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 4045341 - 4045482
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||   ||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4045341 acctaacgtttttgaattaaaactaatggaaaggactaaaatgtgtagcagagaaaagttaaaggactaaaataaatcgaattttaattaagagaccaaa 4045440  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    | |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  4045441 gtgatactacttaaatagttaagggaccaaacatgcaattta 4045482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 1831906 - 1832050
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| | |  |||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  1831906 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccataatatataacggagaaaagttaagagacgaaaataaatcgaattttaattaaaggactaaa 1832005  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
     ||||||||| || |||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  1832006 acgatactacatatatagttaagggaccaaaaatacaatttaacc 1832050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 24590368 - 24590248
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| | | ||| || ||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24590368 ctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggactaaaatgtgtaacatagacaaattaatagaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagc 24590269  T
Q  103 gatactacctaaatagttaag 123  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  24590268 gatactacttaaatagttaag 24590248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 1831792 - 1831657
Alignment:
Q  17 ttaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaat 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  1831792 ttaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaaagaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaagaccaaagtgatactacctaaat 1831693  T
Q  117 agttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattata 152  Q
    |||||||  ||| |||||  |||||| |||| ||||    
T  1831692 agttaagagaccgaaaattcaatttagcctaatata 1831657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 5118195 - 5118096
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5118195 acctaatgtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtataacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 5118096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Original strand, 11394904 - 11395043
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |    
T  11394904 ctaacatttttgaattaaaactaacggaaataaccataatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggatcaaaac 11395003  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11395004 aaaactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 11395043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 28112894 - 28112795
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  28112894 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaa 28112795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 2125451 - 2125589
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |   ||||||||||||||| ||||||||||| |||||      | ||||||||    
T  2125451 acctaacgttttttaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgt-taacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattt------agggaccaaa 2125543  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2125544 gcgatactacctaaataattaagggaccaaaaatgtaatttgacct 2125589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 29257065 - 29257211
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||  |||| |||    
T  29257065 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaatggaccaaaataaattgaattttaattaggggacaaaa 29257164  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
       |||||| |||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||    
T  29257165 ttaatactagctaaatagttaagagaccaaaaatgcaattaaaccta 29257211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 30611462 - 30611596
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaa-taaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| | | ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  30611462 acctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacaaagaaaagataagggaccaaaaataaatcgaattttaatttagggaccaa 30611561  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  30611562 agcgatacaacctaaatagttaagggatcaaaaat 30611596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 34621880 - 34622022
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  || ||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||    
T  34621880 taacgtttttgaattaaaactaactgaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggatcaaaacg 34621979  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  34621980 atactaattaaatagttaagggaccaaaaacataatttaacct 34622022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 18793934 - 18794081
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||| |   | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18793934 acctaacgcttttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaa-tgtgtaacgaaaagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 18794032  T
Q  101 gcg--atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  18794033 gcgatatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 18794081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 34279384 - 34279243
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||  || |   | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34279384 acctaacgcttttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgcgtaacgaaaagaagttaagagaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaa 34279285  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  34279284 gcgttactacctaaatagttaagagaccaaaaatgcaattta 34279243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 5463262 - 5463130
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttg-aattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    |||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  5463262 acctaacgtttttttaattaaaactgacggaaaggaccaaaatatgtacctgagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagagaccaa 5463163  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaa 132  Q
    ||||||| || ||||||| |||| | |||||||    
T  5463162 agcgatattatctaaataattaaagaaccaaaa 5463130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 13831264 - 13831360
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggacc 97  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13831264 acctaacatttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggacc 13831360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19886077 - 19885981
Alignment:
Q  50 agagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19886077 agagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaagcgatactacaaaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacct 19885981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 36657645 - 36657503
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagaga--agttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggacca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |  ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  36657645 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggac-aaaatatgtaacggagagaggagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccc 36657547  T
Q  99 aagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||| ||| | | ||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  36657546 aagagatgcaaactaaatagttaggggacgaaaaatgcaattta 36657503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 45305552 - 45305412
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaag 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  | | | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  45305552 ctaacgtttttgaattaaaagtaacggaaaagaccaaaaggtataacagagagaaagttaaaggaccaaaataaatcgaatcttaattaaaggaccaaag 45305453  T
Q  102 cgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    | |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  45305452 caatactacctaaatagttaactgaccaaaaatgcaattta 45305412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 4550842 - 4550988
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |  ||||||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4550842 acctaacgtttttgaatttaacctaacggaaaggaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaa 4550940  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||    
T  4550941 agcgatactaattaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagccta 4550988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 40534069 - 40533927
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||| || |||| ||||||||  | | ||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  40534069 acctaacgtttttaaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagaaaagttaagatagcgaaataaatcaaattttaattaagggatcaaa 40533970  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaa 143  Q
    |||||||||  ||||||||||||  || ||||||| |||||||    
T  40533969 gcgatactaattaaatagttaagagactaaaaatgcaatttaa 40533927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 31126071 - 31125939
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||| |||| || |||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  31126071 ctaacattttttaattaaaattaacggaaatgatcaaaatgtgtaatggagagaagttaaggaatcaaaataaatcgaattttaatta-------aaagc 31125979  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  31125978 gatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaattta 31125939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 9119534 - 9119618
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaatttt 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9119534 acctaacgtttttgaattaaaactaactgaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatttt 9119618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 59 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28112807 - 28112719
Alignment:
Q  59 ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  28112807 ttaagggatcaaaataaattgaattttaattaaggaaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 28112719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 59 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 5118079 - 5118004
Alignment:
Q  59 ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5118079 ttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaat 5118004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 36077364 - 36077269
Alignment:
Q  52 agagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  36077364 agagaacttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagccta 36077269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Original strand, 42607746 - 42607877
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| | |||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |    
T  42607746 ctaacctttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatttgtaacagagagtaattaaaggaccgaaataaatcaaattttaattaagagaccaaaac 42607845  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||    
T  42607846 gatactatctaaataattaagggatcaaaaat 42607877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 46949978 - 46950085
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  46949978 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaactgagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaaggagcaat 46950077  T
Q  101 gcgatact 108  Q
    | ||||||    
T  46950078 gtgatact 46950085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 27209313 - 27209172
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |   ||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27209313 acctaacggttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacgaagataagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 27209214  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    | |||| ||  ||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  27209213 gtgatattaattaaatagttaagggaccaaaaacataattta 27209172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 11797319 - 11797220
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| | | |  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11797319 acctaacattcttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtataacggagagaggttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 11797220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 110
Target Start/End: Original strand, 31126173 - 31126280
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||| | ||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31126173 ctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaagaactaaaatgtgtgacatagaaaagttaagggactaaaataaatcaaattttaattaatgtaccaaagc 31126272  T
Q  103 gatactac 110  Q
     |||||||    
T  31126273 aatactac 31126280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Original strand, 40703109 - 40703247
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaag 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||| ||||||    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  40703109 ctaacgtttttaaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagatgccaaaataaatcaaattttaactaagggaccaaag 40703207  T
Q  102 cgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattt 141  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  40703208 cgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 40703247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 100
Target Start/End: Original strand, 19886132 - 19886226
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19886132 taacgtttttaaattaaaactaacggaaatgacaaaaatgtgtga--gagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaa 19886226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 30792682 - 30792759
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatc 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  30792682 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatc 30792759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 133
Target Start/End: Original strand, 40534170 - 40534299
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||| || |||| ||||||||  | | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  40534170 taacattttttaattaaaactaacagaaagggtcaaaatgtgtaatggagaaaagttaagataccgaaataaatcaaattttaattaagagaccaaagcg 40534269  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaa 133  Q
    ||||||  ||||||||||||| | ||||||    
T  40534270 atactaattaaatagttaagggatcaaaaa 40534299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Original strand, 20260624 - 20260767
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagaga-agttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||| |||||||  | |||||||||||  ||||||||||| |||||||| |    
T  20260624 taacgtttttaaattaaaactaacaaaaatgaccaaaatatgtaag-gagagagagttaagataccaaaataaatcagattttaattaagggaccaaaac 20260722  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||||  |||||| |||||| || ||||||| |||||| ||||    
T  20260723 gatactaattaaataattaagggactaaaaatgcaatttagccta 20260767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 11797232 - 11797149
Alignment:
Q  59 ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||    
T  11797232 ttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggacaaaagcgatactacctaaataattaaaggaccaaaaatgcaattta 11797149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 59 - 145
Target Start/End: Original strand, 19886214 - 19886300
Alignment:
Q  59 ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||    
T  19886214 ttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagtgatactacctaaataattaaaggaccaaaaatacaatttaacc 19886300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 27209391 - 27209532
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||  |  ||||||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27209391 acctaacgttttttaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgcaag-gagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaa 27209489  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    | ||||||||  ||||| || |||| |||||||||| ||||||    
T  27209490 aacgatactaattaaattgtcaagggaccaaaaatgcaattta 27209532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 3569520 - 3569379
Alignment:
Q  2 cctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagag-aagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||| | |||||| || |||||  | ||||||| ||| |||||||||||| | ||||||    
T  3569520 cctaacgtttttgaattaaaactaacggaaattaccaaaatgtgtaacagagagaaaattaagataccaaaatatatcaaattttaattaaggaaccaaa 3569421  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     ||||||||  |||||| |||||| ||||||||  |||||||    
T  3569420 acgatactaattaaataattaagggaccaaaaacataattta 3569379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 122
Target Start/End: Original strand, 21036225 - 21036345
Alignment:
Q  2 cctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaag 101  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||| || ||||  |||| | ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  21036225 cctaaagttcttgaattaaaactaacggaaatgatcaaacaatgtaacagagaaaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaattaaagaaccaaag 21036324  T
Q  102 cgatactacctaaatagttaa 122  Q
     |||  |||||||||||||||    
T  21036325 tgatggtacctaaatagttaa 21036345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 11394773 - 11394714
Alignment:
Q  64 ggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaag 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11394773 ggatcaaaagaaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatattacctaaatagttaag 11394714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 34621765 - 34621620
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtga-tagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |  ||| | ||||||||  || |||||||||  ||||||||||||  ||||||    
T  34621765 acctaacgtttttgaattaaaactaatcgaaaggaccaaaatgtgtaaggaga-aaaagttaagatattaaaataaataaaattttaattaagagaccaa 34621667  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    | ||||||||  |||||| |||| | | |||||||| ||||||||||    
T  34621666 aacgatactaattaaataattaaaggatcaaaaatgcaatttaacct 34621620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4054688 - 4054569
Alignment:
Q  6 acgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||| |  ||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||| | |  ||| |||    
T  4054688 acgtttttgaattaaaactaacgtaaaagactaaaatgtgtaacggagagaaagtaaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaagaattaaatcga 4054589  T
Q  105 tactacctaaatagttaagg 124  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  4054588 tactatctaaatagttaagg 4054569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 36884946 - 36885036
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaa 91  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||| |||| ||| ||||| ||| | ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  36884946 acctaacattttttaattaaaattaacggaaatgacaaaaatgtgtaacagagataagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaa 36885036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 50921302 - 50921374
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaat 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||    
T  50921302 acctaacgtttttgaattaaaactaattgaaatgaccaaaatgtgtaactgagagaagttaagggaccaaaat 50921374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 40703009 - 40702871
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||| |   ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||| | |||||       
T  40703009 acctaacatttttgaattaaaactaacgaaaaagatcaaaatgtgtaactcagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaatttagggacc--- 40702913  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    | |||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  40702912 gtgatactaattaaatagttaagggaccaaaaacataattta 40702871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Original strand, 48702189 - 48702268
Alignment:
Q  68 caaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||| |||||| || ||||||| |||||| ||||    
T  48702189 caaaataaatccaattttaattaaaggaccaaaacgatactaacaaaataattaagggactaaaaatgcaatttagccta 48702268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 19269455 - 19269363
Alignment:
Q  50 agagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||| ||||||   ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19269455 agagaaaagttcaaggaccaaaataaaccgaattttaactaagagaccaaagtgatactggataaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 19269363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 51 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20260522 - 20260440
Alignment:
Q  51 gagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaa 133  Q
    ||||||||||||   | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  20260522 gagagaagttaaaataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaatgatactaattaaatagttaagagaccaaaaa 20260440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 5118108 - 5118067
Alignment:
Q  59 ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5118108 ttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 5118067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 6241318 - 6241274
Alignment:
Q  80 aattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaagg 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6241318 aattttaattaagggaccaaagcgatactaaataaatagttaagg 6241274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 132
Target Start/End: Original strand, 6714698 - 6714748
Alignment:
Q  82 ttttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaa 132  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  6714698 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 6714748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 43727362 - 43727276
Alignment:
Q  56 aagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||| |||| ||| || |  ||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  43727362 aagttaaaggatcaaaataaatcaaaatttagttaagggatcaaaccgaaaccaattaaatagttaagggactaaaaaggtaattta 43727276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 49548185 - 49548116
Alignment:
Q  82 ttttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattat 151  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| | | || ||||||||||    
T  49548185 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaaagcatttaaacctattat 49548116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Original strand, 6242690 - 6242734
Alignment:
Q  80 aattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaagg 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  6242690 aattttaattaagggaccaaagcgatactaattaattagttaagg 6242734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 103)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 31450810 - 31450669
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  31450810 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaaaggaccaaa 31450711  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31450710 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 31450669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 13354321 - 13354188
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13354321 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaatggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 13354222  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  13354221 gcgatactacctaaatagttaagggaccgaaaat 13354188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 41377498 - 41377366
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41377498 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatctgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 41377399  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41377398 gcgatactacctaaatagttaagg-accaaaaat 41377366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 39454595 - 39454448
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39454595 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 39454496  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    | |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  39454495 gtgatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctat 39454448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 43183724 - 43183586
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  43183724 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagatgttatgggaccaaaataaatctaattttaattaagggaccaaagcg 43183625  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  43183624 atactacctaaatagttaagggactaaaaatgtaattta 43183586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 37744630 - 37744775
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37744630 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatctataagagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 37744729  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  37744730 gcgatactatctaaatagttaaggaatcaaaaatgcaatttaacct 37744775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 43183825 - 43183972
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  43183825 acctaacgtttttgaattaaatctaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 43183924  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  43183925 gcgatactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttaacctat 43183972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21470439 - 21470293
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21470439 acctaatgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttgagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 21470340  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    | |||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  21470339 gtgatactgcctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagccta 21470293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 28203102 - 28203243
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28203102 acctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 28203201  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28203202 gcgatacgacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 28203243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 31450908 - 31451049
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  31450908 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacgtagagaagttaaaggatcaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaa 31451007  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  31451008 tcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaattta 31451049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 32933833 - 32933974
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  32933833 acctaacgttttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttatttaaaggaccaaa 32933932  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  32933933 gcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 32933974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 28631418 - 28631278
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28631418 acctaacgtttttgaattaaaactatcggaaatgaccaaaatgtgtaaaggagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 28631319  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattt 141  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28631318 gcgatgctacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaattt 28631278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 13354419 - 13354550
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13354419 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaatatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaa 13354518  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaa 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13354519 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaa 13354550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 27132655 - 27132508
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27132655 acctaatgtttttgaattaaaactatcggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 27132556  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  27132555 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaacctat 27132508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Original strand, 27476611 - 27476750
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  27476611 ctaacgttcttgatttaaaactaacggaaaggaccataatatgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaac 27476710  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  27476711 gatactacctaaatagttaagagaccaaaaatgcaattta 27476750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 18565208 - 18565062
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18565208 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggactaaagc 18565109  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctatt 149  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  18565108 gatactgcctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagcctatt 18565062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 4104295 - 4104162
Alignment:
Q  9 tttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatact 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4104295 tttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtataacagagagaagttaagataccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatact 4104196  T
Q  109 acctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4104195 acctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 4104162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 5961813 - 5961672
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  ||| ||||    
T  5961813 acctaacatttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaatttttaattatgggatcaaa 5961714  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  5961713 gcgatactacctaaatagttaaggggccaaaaatgcaattta 5961672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 12303929 - 12303788
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12303929 acctaatgtttttgaaataaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagatgagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagtgaccaaa 12303830  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12303829 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 12303788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16655750 - 16655617
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16655750 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgcaacagagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaa 16655651  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16655650 atgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 16655617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 16736245 - 16736104
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||   |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16736245 acctaacgttttcaaattaaaactactggaaaggaccaaaatgtgtaactgagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 16736146  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16736145 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 16736104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 17856343 - 17856202
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17856343 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacaaggagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 17856244  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||    
T  17856243 gcgatactacctaaataattaagggaccgaaaatgaaattta 17856202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 20908753 - 20908886
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20908753 acctaaagtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaa 20908852  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20908853 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 20908886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 4121005 - 4121149
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||  ||| || |||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4121005 acctgacgtttttgacttaaaactaacgaaaatgaacaaagtgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaa 4121104  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  4121105 acgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacc 4121149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 34820523 - 34820667
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  34820523 ctaacgtttttaaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaagc 34820622  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  34820623 gagactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaaccta 34820667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 25642510 - 25642643
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25642510 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 25642609  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  25642610 gcgatactacctaaatagttaagggaacaaaaat 25642643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 27883612 - 27883471
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  27883612 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttacttaagggaccaaa 27883513  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  27883512 gcgatattacttaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 27883471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 28631516 - 28631661
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  28631516 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgacgaaaatgtgtaacagagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaattaagagagcaaa 28631615  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  28631616 gcgatactacccaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaacct 28631661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 41377596 - 41377737
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  41377596 acctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattacgggaccaaa 41377695  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  41377696 gtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 41377737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 12304396 - 12304544
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||| |  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12304396 acctaacatttttgaattaaaactaacggaaatggccaaaatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaa 12304495  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctatt 149  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||| ||||||    
T  12304496 gcgatactacctaaattgttaagggacaaaaaatgcaatttagcctatt 12304544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 16655848 - 16655996
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  16655848 acctaacgttttttaattaaaactagtggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaaaggaccaaa 16655947  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctatt 149  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  16655948 acgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaacctatt 16655996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Original strand, 4104403 - 4104534
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  4104403 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggacccaaatgtataacggagagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaagc 4104502  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4104503 gatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 4104534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14877620 - 14877480
Alignment:
Q  6 acgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgat 105  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14877620 acgtttttgaattaaaactaacggaaattaccaaaatgtgtaa--gagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaatcgat 14877523  T
Q  106 actacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||| |||||| |||||    
T  14877522 actacctaaatagttttgggaccaaaaatgcaatttagcctat 14877480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 21470537 - 21470675
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21470537 acctaacgttttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgtagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggacc-aa 21470635  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  21470636 gcgatactacctaaatagttaagggactaaaaatggaatt 21470675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Original strand, 37412822 - 37412961
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  37412822 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaatgc 37412921  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  37412922 gatactacttaaatagttaaggggccaaaaatgcaattta 37412961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 16261014 - 16260881
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |  |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16261014 acctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtttaacggagagaagttaaaggaccaaaa-aaatcgaattttagttaagggaccaaa 16260916  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatg 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16260915 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatg 16260881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 134
Target Start/End: Original strand, 34127810 - 34127939
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  34127810 taacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaa-tgtgtaacagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaactttagttaagggaccaaagcg 34127908  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  34127909 atactacttaaatagttaagggtccaaaaat 34127939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 34820420 - 34820278
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  34820420 taacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaaggaccaaaataaatctaattttaattaaggaaccaaagcg 34820321  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  34820320 atactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttgacct 34820278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 16736340 - 16736481
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  16736340 acctaacgtttctgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccgaaataaatcgaattttaattaagggactaca 16736439  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || ||||||    
T  16736440 gcgatacaacctaaacagttaagggaccaaaagtgcaattta 16736481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 27132752 - 27132893
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |  || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27132752 acctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgactaaaatatgtaacggatagaagttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaa 27132851  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27132852 tcgacactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 27132893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 41659889 - 41659748
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41659889 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggcccaaaatgtgtaacagagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 41659790  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||  ||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  41659789 gcgatactaattaaatagttaagggacaaaaaatataattta 41659748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 38275697 - 38275840
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaag--ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggacca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | |||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  38275697 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagagttacgggaccaaaataaatcgaattttaattaagggatca 38275796  T
Q  99 aagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  38275797 aagtgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 38275840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 39150067 - 39150215
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| |  || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  39150067 acctaacgtttttgaattaaaattaacaggaaggactaaaatgtgtaacggaaagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaggtacaaaa 39150166  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctatt 149  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||    
T  39150167 gcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcctatt 39150215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 44612725 - 44612867
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44612725 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacatagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 44612824  T
Q  101 gcgatac--tacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  44612825 gcgatactatacgtaaatagttaagg-accaaacatgcaattta 44612867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 32933735 - 32933588
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | | |||||||||||  || |||||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  32933735 acctgacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaaagaccaaaataaatggaattttagttaagggatcaaa 32933636  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  32933635 gtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacctat 32933588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Original strand, 39912869 - 39913016
Alignment:
Q  2 cctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  39912869 cctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaaggtgtaacagagagaaagttaagggaccaaaataaatctaattttaattaagggaccaaa 39912968  T
Q  101 gcgatactacct-aaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  39912969 gtgatactacctaaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 39913016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 12304027 - 12304161
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||| |   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  12304027 acctaacatttttgaattaaaactaacggaaatggccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaaggacgaaa 12304126  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatg 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12304127 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatg 12304161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 4120900 - 4120767
Alignment:
Q  9 tttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatact 108  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |  ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4120900 tttttgaattaaaactaatggaaacgaccaaaatatgtaacggagagaaattaaaggaccaaaataaatcgaattttgattaagggaccaaagcgatact 4120801  T
Q  109 acctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  4120800 acctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 4120767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 15137046 - 15137187
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  | ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15137046 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggacccaaatgtgcaacagagaaaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 15137145  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  15137146 tcggtactacctaaatagttatgtgaccaaaaatgtaattta 15137187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 20908655 - 20908522
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |  ||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20908655 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaactaaaataaatcgaattttagttaaaggaccaaa 20908556  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20908555 gcgatactacctaaataattaagggaccaaaaat 20908522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 28203004 - 28202863
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| |  || ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28203004 acctaacgttattgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgtgtaacggatagaagttaaaggaccaatataaatcgaattttaattaagggaccaaa 28202905  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28202904 gcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 28202863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 148
Target Start/End: Original strand, 35408765 - 35408910
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  35408765 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaaggaaccaaagc 35408864  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||||||||  ||||||| |||||    
T  35408865 gatactaattaaatagttaatggaccaaaaacataatttagcctat 35408910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 36442376 - 36442517
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  36442376 acctaatgtttttgaattaaaactaacagaaatgactaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggatcaaaataaattaaattttaattaaaggatcaaa 36442475  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    || |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  36442476 gcaatactatctaaatagttaagggaccaaaaatataattta 36442517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 38275619 - 38275478
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||| | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  38275619 ctaacgtctttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaatagagggaagttaaagaaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagc 38275520  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaac 144  Q
     ||||||| ||||||||||||| | |||||||  ||||||||    
T  38275519 aatactacataaatagttaagggatcaaaaatacaatttaac 38275478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 40694417 - 40694538
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  40694417 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaattaagggaccaaaataaatctaattttaattaaaggaccaaa 40694516  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaa 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  40694517 gcgatactacctaaataattaa 40694538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 27476511 - 27476368
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaa-tatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||| |  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  27476511 acctaacgtttttgaattaaaactaacggataggaccaaaaatgtgtaaaggagagaatttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaacaa 27476412  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||  |||||||    
T  27476411 agcgatactacctaaatagtctagggaccaaaaatacaatttaa 27476368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 34127708 - 34127570
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||| || || |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  34127708 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaatggatagaagttaagcgacaaaaataaattgaattttaattaagggaccaaaac 34127609  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattt 141  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  34127608 gatactatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 34127570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 37744542 - 37744452
Alignment:
Q  52 agagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37744542 agagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaattta 37744452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 39912764 - 39912638
Alignment:
Q  9 tttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatac 107  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39912764 tttttgaattaaaactaacgtaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaaagttaacggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatac 39912665  T
Q  108 tacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  39912664 tacctaaatagttaagggaccaaaaat 39912638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25642412 - 25642279
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25642412 acctaacatttttgaattaaaactaactgaaaggatcaaaatgtgtaacagataaaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaa 25642313  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  25642312 gcgatactacttaaatagttaagggactaaaaat 25642279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 37412737 - 37412596
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||| |  || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  37412737 acctaacgcttttgaattaaaactaacgaaaagaactaaaatgtgtaacggaaagaagtcaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagagaccaaa 37412638  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37412637 gcgatactaactaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 37412596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 146
Target Start/End: Original strand, 32503781 - 32503924
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  32503781 ctaacgttttcgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaatc 32503880  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
     ||||||||||||||||||| | || || |||| ||||||||||    
T  32503881 aatactacctaaatagttaaaggactaagaatgcaatttaacct 32503924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 44915880 - 44915738
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  |||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  44915880 taacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaag-gagataagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcg 44915782  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  44915781 atactaattaaatagttaagggactaaaaatgcaatttaaccta 44915738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Original strand, 18565276 - 18565386
Alignment:
Q  32 aggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaa 131  Q
    ||||||||||||||| | || || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18565276 aggaccaaaatatgtaacagggaaaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagggacccaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaa 18565375  T
Q  132 aatgtaattta 142  Q
    |||| ||||||    
T  18565376 aatgcaattta 18565386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 117
Target Start/End: Original strand, 27883701 - 27883815
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  27883701 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagtcaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagc 27883800  T
Q  103 gatactacctaaata 117  Q
    |||||||||||||||    
T  27883801 gatactacctaaata 27883815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 16261112 - 16261245
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |  |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  16261112 acctaatgtttttgaattaaaactaaccaaaatgaccaaaatgtgtaacggagataagctaagggacaaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaa 16261211  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16261212 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 16261245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 39149988 - 39149867
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  39149988 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaatagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttagttaaaggactaaa 39149889  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaa 122  Q
    | |||||||  |||||||||||    
T  39149888 gtgatactatttaaatagttaa 39149867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 40694339 - 40694198
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||| | ||||||| ||  |  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  40694339 acctaacgtttttgaattaaaagtaatggaaatggccaaaatgtgcaactgagagaagttaagggactaaaataaatcgaatgttaattaagggactaaa 40694240  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  40694239 acgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatataattta 40694198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 10833276 - 10833416
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttg-aattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||||| | | | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  10833276 acctaacgtttttttaattaaaactaatcgaaatgaccaaaatgtataacagagagaagttaatggaccaaaataaatcgaattttaattgagggactaa 10833375  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatt 140  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  10833376 agcgatactacctaaatagctaagggaccaaaaatgcaatt 10833416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 17856430 - 17856578
Alignment:
Q  1 acctaacgt-ttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||  || ||||| | | | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17856430 acctaacgtatttttaattaaaactaacggaaataactaaaatgtataacagagagaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaa 17856529  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    | | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  17856530 accaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctat 17856578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 27914038 - 27913894
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||  ||||||||| || |||| |||    
T  27914038 acctaatgtttttgaattaaaactaacataaaagaccaaaatatgtaacggagagaagttaagatagcaaaataaattaaattttaataaagggactaaa 27913939  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  27913938 gcgatactaattaaatagttaaggaaccaaaaacataatttaacc 27913894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 45389267 - 45389129
Alignment:
Q  9 tttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatact 108  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |   ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  45389267 tttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagaaaagttaatggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgacact 45389168  T
Q  109 acctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  45389167 acctaaatagttcagggaccaaaaatgcaatttagccta 45389129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 36211494 - 36211353
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |   | ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  36211494 acctaacgtttttgaattaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtaacgaacagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 36211395  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     | |||| ||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  36211394 acaatacaacctaaacagttaagtgaccaaaaatgcaattta 36211353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 133
Target Start/End: Original strand, 5921632 - 5921760
Alignment:
Q  5 aacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5921632 aacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaggaacaaaaaaaaatcgaattttaattaagagaccaaagcga 5921731  T
Q  105 tactacctaaatagttaaggtaccaaaaa 133  Q
    |||||  ||||||||||||| | ||||||    
T  5921732 tactatataaatagttaagggatcaaaaa 5921760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 15829861 - 15829733
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |  || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  15829861 taacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaagatgtgtaacggatagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagtg 15829762  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaa 132  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  15829761 atactacctaaatagctaagagaccaaaa 15829733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 131
Target Start/End: Original strand, 34484303 - 34484418
Alignment:
Q  16 attaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaa 115  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  34484303 attaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagataagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagataccaaagcgatactacctaaa 34484402  T
Q  116 tagttaaggtaccaaa 131  Q
    || |||||| ||||||    
T  34484403 taattaagggaccaaa 34484418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 27246225 - 27246366
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaag-ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |  |||||||  |||||  | ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27246225 acctaacgtttttgaattaaaaataaccgaaaggaccaaaatgtgtaag-gagagaaaattaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaa 27246323  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||| |||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27246324 agcgatcctaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 27246366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 20297498 - 20297413
Alignment:
Q  57 agttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20297498 agttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactacctgaatagttaagggaccaaaaatgaaattta 20297413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 151
Target Start/End: Original strand, 41659980 - 41660128
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgat-agagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||| ||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  41659980 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaagaaccaaaatgtgtaagcagaga-aagttaagataccaaaataaattaaattttaattaagagaccaaag 41660078  T
Q  102 cgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattat 151  Q
     |||||||  ||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||    
T  41660079 tgatactaattaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttaaccttttat 41660128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 33819638 - 33819757
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  33819638 acctaacatttttgaattaaaactaacggaaatagccaaaatatgtaacggagagaagttaagg-accaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaa 33819736  T
Q  101 gcgatactacctaaatagtta 121  Q
    | ||||||||||||| |||||    
T  33819737 gtgatactacctaaacagtta 33819757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 5720286 - 5720139
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatag-agagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggacca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||| || |||||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  5720286 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaat--gtgaaaggagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaaagaacca 5720189  T
Q  99 aagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    || | ||| ||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5720188 aaacaatattaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacctat 5720139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 33819540 - 33819395
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |   ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||  |||||||    
T  33819540 acctaacatttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatctgtaacgaagaaaagttaagggaccaaa-taaatcaaattttaattaagagaccaaa 33819442  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
     || |||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||    
T  33819441 acggtactacctaaatagttaatggaccaaaagtgcaatttaaccta 33819395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 36442269 - 36442131
Alignment:
Q  9 tttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatact 108  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  | |||||||||| | | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  36442269 ttttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggggagaagttaatgaaccaaaataaatcaaatttttattaatagaccaaaacgatact 36442170  T
Q  109 acctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||  |||||| ||||    
T  36442169 acctaaatagtgaagggaacaaaaatacaatttagccta 36442131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 134
Target Start/End: Original strand, 36211697 - 36211774
Alignment:
Q  57 agttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36211697 agttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggacgaaagcgatactacctaaatagttaagagaccaaaaat 36211774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 44915981 - 44916086
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  44915981 acctcacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaacggagagaagttaagataccaaaataaatgaaattttaattaagggaccaaa 44916080  T
Q  101 gcgata 106  Q
     |||||    
T  44916081 acgata 44916086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 36211583 - 36211682
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  36211583 acctaacatttttgaattaaagctaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaa 36211682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 142
Target Start/End: Original strand, 39454724 - 39454816
Alignment:
Q  50 agagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  39454724 agagagaaattaagggacaaaaataaatcgaattttaattaaggaatcaaagcgatactacctgaatagtcaagggaccaaaaatgcaattta 39454816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 32503688 - 32503569
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  |||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| | | |||| |    
T  32503688 ctaacgtttttgacttaaaattaaaggaaatgatcaaaatgtgtaacagagagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttagttaaggaagcaaaac 32503589  T
Q  103 gatactacctaaatagttaa 122  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  32503588 gatactacctaaataattaa 32503569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 146
Target Start/End: Original strand, 1580150 - 1580228
Alignment:
Q  68 caaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  1580150 caaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactatttaaatagttaaggaaccaaaaacataatttaacct 1580228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 27914135 - 27914268
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagag-aagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||    ||||||||||| |||||||| ||| | |||||    
T  27914135 acctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgt-aaagagagaaagttaagatgccaaaataaatcaaattttaactaaggaaccaa 27914233  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    | ||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  27914234 aacgatactaattaaatagttaagggatcaaaaat 27914268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 120
Target Start/End: Original strand, 11943780 - 11943849
Alignment:
Q  51 gagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagtt 120  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  11943780 gagagaagttaatgaaccaaaataaatcgaattttaattaaagtaccaaagcgatactacctaaatagtt 11943849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 16350313 - 16350457
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||| ||||| ||  | ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  16350313 acctaacgttttttaattaaaactaacatgaatgactaaaatgtgcaacagagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaa 16350412  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
     | ||| ||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  16350413 acaataataattaaatagttaagggaacaaaaacataatttaacc 16350457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 34484305 - 34484234
Alignment:
Q  75 aatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  34484305 aatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttaacct 34484234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16350221 - 16350079
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| ||| |  ||||||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16350221 acctaacatttttgaattaaaacaaatggaaatgaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaa 16350123  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaa 143  Q
      ||||||||  |||||||| |||  |||||||||| |||||||    
T  16350122 tacgatactaattaaatagtcaagagaccaaaaatgcaatttaa 16350079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 44610926 - 44610860
Alignment:
Q  80 aattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  44610926 aattttaattaagggac-aaagcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaaccta 44610860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Original strand, 38073778 - 38073844
Alignment:
Q  56 aagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaa 122  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |  ||| |||||||| ||||||||||||    
T  38073778 aagttaagagatcaaaataaatcgaattttaattaaagaattaaaacgatactatctaaatagttaa 38073844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 3603648 - 3603525
Alignment:
Q  2 cctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaag-ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||  ||||   | ||||| | | | ||||||||| || ||||||||    
T  3603648 cctaacgtttttgaattaaatttaacggaaaggactaaaatatgtaacagagataaacttaaaataccaaaacataacaaattttaatcaagggaccaaa 3603549  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaagg 124  Q
    |||||||||  |||||||||||||    
T  3603548 gcgatactaaataaatagttaagg 3603525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 133
Target Start/End: Original strand, 23992206 - 23992280
Alignment:
Q  59 ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaa 133  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  |||||||| ||||||||  ||||||||| ||| ||||||||    
T  23992206 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatagttcagggaccaaaaa 23992280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 27246127 - 27246065
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaag 63  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  27246127 acctaacgttttttaattaaaactaatagaaatgacaaaaatgtgtaacagagagaagttaag 27246065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 1580082 - 1580010
Alignment:
Q  68 caaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| || | ||||||| |||||||    
T  1580082 caaaataaatcaaattttaattaa-ggaccaaaacgatactaattaaatagttatggga-caaaaatttaattta 1580010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 15136350 - 15136276
Alignment:
Q  17 ttaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaa 91  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||| | | ||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  15136350 ttaaaactaacagaaaggattaaaatgtgtaacaaagataagttaatggatcaaataatatcgaattttaattaa 15136276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 132
Target Start/End: Original strand, 26424819 - 26424869
Alignment:
Q  82 ttttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaa 132  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  26424819 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 26424869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 44612606 - 44612548
Alignment:
Q  30 aaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaat 88  Q
    ||||||||||||| ||| |  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44612606 aaaggaccaaaatgtgtaacggatagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaat 44612548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 92)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 25218228 - 25218084
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25218228 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 25218129  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25218128 gcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgaaatttaacc 25218084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 52915096 - 52914950
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52915096 acctaacgtttttgaattaaaattaaccgaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 52914997  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  52914996 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagccta 52914950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Original strand, 21218091 - 21218230
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21218091 ctaacgtttttgaattaaaactaactgaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagc 21218190  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  21218191 gatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaattta 21218230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 33626106 - 33626247
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  33626106 acctaacgttttttaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaa 33626205  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33626206 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgaaattta 33626247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 45683261 - 45683120
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  45683261 acctaatgtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttacttaaaggaccaaa 45683162  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  45683161 gcgatactacctaaatagttaagagatcaaaaatgtaattta 45683120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 54136235 - 54136094
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54136235 acctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaaattaaaggatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 54136136  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  54136135 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 54136094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 2739016 - 2738880
Alignment:
Q  9 tttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatact 108  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2739016 tttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatact 2738917  T
Q  109 acctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
    || ||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  2738916 acttaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttaacc 2738880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 45911723 - 45911579
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  45911723 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 45911624  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  45911623 gcgatactacctaaatagttaatgaaccaaaaatgcaatttaacc 45911579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 4966015 - 4965885
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4966015 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggagcaaa 4965916  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  4965915 gcgatactacctaaatagttaaaggaccaaa 4965885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 48210089 - 48209951
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |    
T  48210089 taacctttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaagggagagaagttaaaggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtg 48209990  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48209989 atactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaattta 48209951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 29864320 - 29864179
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29864320 acctaacctttttgaattaaaactaacagaaaggaccaacatgtgtaacagagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 29864221  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||    
T  29864220 gcgatactacctaaatagttaagggataaaaaatgcaattta 29864179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 44710547 - 44710406
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||    
T  44710547 acctaacgtttttgaattaaaattaacagaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcaaatttttgttaagagaccaaa 44710448  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  44710447 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 44710406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 46621169 - 46621314
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  46621169 acctaacgttttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaaattaaaggaccaaaataaatcgaattttagttaaaggaccaaa 46621268  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  46621269 acgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacct 46621314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 33626008 - 33625868
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33626008 acctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagataagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 33625909  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  33625908 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 33625868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 33882191 - 33882331
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |  |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  33882191 acctaacgtttttgaattaagactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 33882290  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  33882291 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 33882331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 52915185 - 52915317
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  52915185 acctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaaaggaccaaa 52915284  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  52915285 gcgatactacctaaatagttaagggacaaaaaa 52915317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 9010649 - 9010502
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9010649 acctaatgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 9010550  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    | ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  9010549 gtgatactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagcctat 9010502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 146
Target Start/End: Original strand, 24504184 - 24504327
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  24504184 ctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggactaaaac 24504283  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24504284 gatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttaacct 24504327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Original strand, 29864419 - 29864550
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29864419 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagatagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagc 29864518  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29864519 gatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 29864550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 10014608 - 10014468
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10014608 acctaacgtttttgaattaaaattaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatggatcaaaataaatcg-attttaattaagggaccaaa 10014510  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10014509 gcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 10014468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 10021749 - 10021609
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10021749 acctaacgtttttgaattaaaattaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatggatcaaaataaatcg-attttaattaagggaccaaa 10021651  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10021650 gcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 10021609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 21217991 - 21217850
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| |  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21217991 acctaacgcttttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 21217892  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21217891 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 21217850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 27347741 - 27347600
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27347741 acctaacgtttttgaattaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaa 27347642  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  27347641 gcgatactatctaaatagtcaagggaccaaaaatataattta 27347600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 1157448 - 1157592
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1157448 acctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaa 1157547  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||    
T  1157548 gcgatactacctaaatagttaagggactaaaaatacaatttaacc 1157592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25058975 - 25058831
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25058975 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggagcaaaatgtgtaacatagagaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagc 25058876  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||    
T  25058875 gatactacctaaatagttaagagacaaaaaatgcaatttaaccta 25058831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 43317121 - 43317268
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  43317121 acctaacgtttttcaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 43317220  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    ||||||||||||||||||||| |  || ||||||| |||||| |||||    
T  43317221 gcgatactacctaaatagttaggagactaaaaatgcaatttagcctat 43317268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 142
Target Start/End: Original strand, 9010754 - 9010888
Alignment:
Q  8 gtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatac 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9010754 gtttttgaattaaaactaacggaagtaaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagagatac 9010853  T
Q  108 tacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  9010854 tacctaaatagttaagggaccaaaaatataattta 9010888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 40067489 - 40067359
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  40067489 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaagcg 40067390  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  40067389 atattacctaaatagttaagggacaaaaaat 40067359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 46621071 - 46620925
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46621071 acctaacgtttttgaattaaaaataacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 46620972  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  46620971 acaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttgaccta 46620925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Original strand, 25218328 - 25218448
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  25218328 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaaac 25218427  T
Q  103 gatactacctaaatagttaag 123  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25218428 gatactacctaaatagttaag 25218448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 8751429 - 8751290
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||      
T  8751429 ctaacgttttttaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaaat 8751330  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  8751329 tatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaattta 8751290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 46200610 - 46200487
Alignment:
Q  19 aaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatag 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  46200610 aaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaatgatactacctaaatag 46200511  T
Q  119 ttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||| |||||||||| ||||||    
T  46200510 ttaagggaccaaaaatgcaattta 46200487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 43317023 - 43316878
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  43317023 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagataagttaagggaccaaaataaataaaattttaattaagggaccaaa 43316924  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  43316923 gcgatactaccttaatagttaagg-accaaaaatacaatttagccta 43316878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Original strand, 18862683 - 18862824
Alignment:
Q  2 cctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagag-aagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||  ||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18862683 cctaacgttttttaattaaaactaacggaatggacaaaaaggtgtaacagagagcaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggatcaaa 18862782  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18862783 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 18862824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 124
Target Start/End: Original strand, 27347841 - 27347962
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  27347841 ctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaatc 27347940  T
Q  103 gatactacctaaatagttaagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27347941 gatactacctaaatagttaagg 27347962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 32384797 - 32384664
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||| ||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  32384797 acctaacgtttttgaattaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaggttaaagaaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaa 32384698  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32384697 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 32384664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 8246988 - 8247131
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | | |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8246988 acctaacgtttttgaattaaaaataacagaaatgacgaaaatgtttaagggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 8247087  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaac 144  Q
    |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  8247088 gaaatattacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaac 8247131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Original strand, 12381298 - 12381429
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  12381298 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggatgaaagc 12381397  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||| | ||||||||||| ||| |||||||||    
T  12381398 gatattgcctaaatagtttagggaccaaaaat 12381429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 146
Target Start/End: Original strand, 37515697 - 37515840
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||  ||||||||| ||| | | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37515697 ctaacgttttttaattaaaactaatggaattgaccaaaatgtgtaacaaatagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagc 37515796  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||    
T  37515797 gatactacctaaatagttaagggactaaaaataaaatttaacct 37515840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 141
Target Start/End: Original strand, 44432871 - 44433006
Alignment:
Q  6 acgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgat 105  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||    
T  44432871 acgtttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaagtgat 44432970  T
Q  106 actacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattt 141  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  44432971 actatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 44433006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Original strand, 45911818 - 45911949
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  45911818 ctaacgtttttaaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagataagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagt 45911917  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  45911918 gatactacctaaatagttaggggaccaaaaat 45911949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 53645593 - 53645463
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  53645593 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaaccgaattttaattaagggaccaaagc 53645494  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaa 133  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  53645493 gatactatctaaatagttaagggacaaaaaa 53645463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 1157350 - 1157203
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagt---taagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggacc 97  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||    
T  1157350 acctaacatttttgaattaaaattaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagtacttaagggaccaaaataaattaaattttaattaaggaacc 1157251  T
Q  98 aaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1157250 aaagcgatattacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacc 1157203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 146
Target Start/End: Original strand, 22831040 - 22831185
Alignment:
Q  2 cctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || || |||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22831040 cctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaatggatagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 22831139  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  22831140 gcgatactagcaaaatagttaagggaccaaaaatccaatttaacct 22831185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 34958975 - 34958843
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| | ||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  34958975 acctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaattgtgtaacagagataagttaaggaa-caaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 34958877  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34958876 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 34958843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 34959073 - 34959218
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||| |||| |||| | | |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34959073 acctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaaattaaagaaccaaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaa 34959172  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  34959173 gcgataatacctaaatagttaagggaccaaaattgcaatttaacct 34959218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 4793841 - 4793957
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  4793841 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaa 4793940  T
Q  101 gcgatactacctaaata 117  Q
     ||||||||||||||||    
T  4793941 acgatactacctaaata 4793957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 25977913 - 25977781
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |  |||||||    
T  25977913 acctaacgtttttgaattaaaactaatggaaaagaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattgagagaccaaa 25977814  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaa 133  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  25977813 gcgatagtacctagatagttaagggaccaaaaa 25977781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 38866535 - 38866396
Alignment:
Q  8 gtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatac 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  |  ||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38866535 gtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaaccaaaataaatcaaattttagttaatggaccaaagcgatac 38866436  T
Q  108 tacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  38866435 tacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagccta 38866396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 46535666 - 46535534
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagaga-gaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||  ||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  46535666 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaat--gtgaacgagaagaaactaaggaaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaa 46535569  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46535568 agcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 46535534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 25593333 - 25593466
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25593333 acctaacgtttttaaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 25593432  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
     | ||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  25593433 acaatactccctaaatagttaagggacaaaaaat 25593466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 40067590 - 40067723
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| | ||  ||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  40067590 acctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacaggaagaagttaaggaaccaaaataaattgaattttagttaagggaccaaa 40067689  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  40067690 gcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaat 40067723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 45683359 - 45683492
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| | ||||||    
T  45683359 acctaacgtttttgaattaaaactaaccgaaaggaccaaaatgtgtaacggagataagttaaaggaccaaaataaatcaaattttagttaaggaaccaaa 45683458  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  45683459 gcaatattacctaaatagttaaggaaccaaaaat 45683492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 32385054 - 32385201
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |  ||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||  |||    
T  32385054 acctaacattttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaaccaaaataaatcaaattttagttaagggat-aaa 32385152  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctatt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  32385153 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacctatt 32385201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Original strand, 1205622 - 1205760
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| |  || ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  1205622 taacgtttttgaattaaaactaatggaaaagaccaaaatgtgtaacggaaagaaggtaagggacaaaaataaatcgaattttaattaagggagaaaagcg 1205721  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1205722 atactgcctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 1205760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 10014708 - 10014857
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| | | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |    
T  10014708 ctaacgtgtttgaattaaaactaacggaaatgaccaaa-tgtgtaacaaagagaagttaagagatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaatac 10014806  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattatat 153  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| ||||| ||||    
T  10014807 gatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaacttagcctataatat 10014857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 10021849 - 10021998
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| | | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |    
T  10021849 ctaacgtgtttgaattaaaactaacggaaatgaccaaa-tgtgtaacaaagagaagttaagagatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaatac 10021947  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattatat 153  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| ||||| ||||    
T  10021948 gatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaacttagcctataatat 10021998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Original strand, 28570666 - 28570804
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |    
T  28570666 taacttttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtg 28570765  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||||    
T  28570766 ataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaattta 28570804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Original strand, 44710647 - 44710785
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  44710647 ctaacttttttgaattaaaaccaacgaaaaggactaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaaac 44710746  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattt 141  Q
    |||||||| |||||| |||||| | |||||||| |||||    
T  44710747 gatactacataaatacttaagggatcaaaaatgcaattt 44710785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 4966110 - 4966263
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | || ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  4966110 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtataatggagagaagttaagagacaaaaataaatcgaattttaattaaggaatcaaa 4966209  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattatata 154  Q
     |||||| ||||||||||||||||  | | ||||| |||||| |||| ||||||    
T  4966210 acgataccacctaaatagttaaggggcaagaaatgcaatttaccctaatatata 4966263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 8246911 - 8246780
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  8246911 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaac-gagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 8246813  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
      |||| || ||||||| |||||| |||||||||    
T  8246812 atgatattatctaaataattaagg-accaaaaat 8246780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15985610 - 15985465
Alignment:
Q  2 cctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  |||||| || ||||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15985610 cctaacgtttttgaattaaaactaacgtaaaggaccaaaatgtgtattagagaaaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 15985511  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
     |||||||| | |||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  15985510 acgatactagcaaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttaacct 15985465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 29970335 - 29970195
Alignment:
Q  2 cctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaag 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||| |  |||| ||||||| | | ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  29970335 cctaacgtttttgaattaaaactaacggataagaccaaaatgtgtaacggagataagttaatg-accaaaataaatcaaattttaattaagggatcaaag 29970237  T
Q  102 cgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaa 143  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  29970236 cgatactacctaaatagttatgggaccaaaaatgcaatttaa 29970195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 1205514 - 1205379
Alignment:
Q  8 gtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatac 107  Q
    |||||| ||||||||||||| | || || | |||| ||| | ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1205514 gttttttaattaaaactaacggcaatgatcgaaatgtgtaacagaga-aagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatac 1205416  T
Q  108 tacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaac 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  1205415 tacctaaatagttaagggaccaaaagtgcaatttaac 1205379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 24504082 - 24503942
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaa-ggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  24504082 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaaggaccaagatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaagaaccaaaa 24503983  T
Q  102 cgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    | |||||||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||    
T  24503982 caatactacctaaataattaagggattaaaaatgcaattta 24503942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Original strand, 38866643 - 38866786
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaa-taaatcgaattttaattaatggaccaaag 101  Q
    |||| |||||| | |||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||    
T  38866643 ctaatgttttttatttaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggatcaaaaataaatcgaattttaattagagtaccaaag 38866742  T
Q  102 cgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||    
T  38866743 cgatactacctaaatagttaaggaatcaaaaatacaatttaacc 38866786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 54191732 - 54191642
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaa 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54191732 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 54191642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 11242711 - 11242847
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||      ||||  |||||||||| | |  || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11242711 acctaacgtttttgaattaaaag-----gaaataaccaaaatatataacggaaagaaattaagggaccaaaataaatcgaattttaatcaagggaccaaa 11242805  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11242806 gtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaattta 11242847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 22830940 - 22830807
Alignment:
Q  2 cctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22830940 cctaacatttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacggagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 22830841  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    || |||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  22830840 gctatactagcaaaatagttaagggaccaaaaat 22830807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 46200727 - 46200868
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||  || |   | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  46200727 acctaacgcttttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgcgtaacgaaaagaagttaagagaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaa 46200826  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  46200827 gcgttactacctaaatagttaagagaccaaaaatgcaattta 46200868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 21051589 - 21051688
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21051589 acctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaataaagagaagttaagggaccaaaataaatctaattttaattaagggaccaaa 21051688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 44428715 - 44428616
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  44428715 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaa 44428616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 9657811 - 9657678
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| |  ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  9657811 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgactaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagatatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaa 9657713  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    | ||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  9657712 aacgatactaattaaatagttaagggaccaaaaat 9657678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 43969769 - 43969915
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | | | | | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||| ||||    
T  43969769 acctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtataacaaaaagaagttaagggaccaaagtaaatcgaattttaatcaagggatcaaa 43969868  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
     ||||||||| ||||||||||| | |||||||||  |||||| ||||    
T  43969869 acgatactacataaatagttaacgaaccaaaaataaaatttagccta 43969915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 21051503 - 21051362
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||| |  || ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||  || ||||    
T  21051503 acctaacgtttttgaattaaatttaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggatagaagttaatggaccaaaataaatcaaattttagttaagagatcaaa 21051404  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  21051403 gcgatgctacctaaataattaagggacaaaaaatgtaattta 21051362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 46535764 - 46535897
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |   ||| ||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  46535764 acctaatgttttttaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtataccagaaagaagttaaaggaccaagataaatagaattttaattagaggaccaaa 46535863  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
     | ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  46535864 acaatactacctaaatagttaagtgaccaaaaat 46535897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Original strand, 54191829 - 54191959
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||| || | |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  54191829 ctaacattttttaattgaaactaag-gaaaggaccaaaatgtgtaatggggagaagttaatgaaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaac 54191927  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  54191928 gatgctatctaaatagttaagggaccaaaaat 54191959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 9657889 - 9658030
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |  ||||||| ||||||  | ||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  9657889 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagataccaaaataaattaaattttaattaggggaccaa 9657987  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    | ||||||||  ||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  9657988 aacgatactaattaaatagttaagggatcaaaaatataattta 9658030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 11102218 - 11102363
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaag 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |  ||||||| ||||||  |  |||||||||| |||||||||||| ||||||||     
T  11102218 ctaacatttttgaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaagttaagatactaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaac 11102317  T
Q  102 cgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    | ||||||  ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  11102318 caatactaattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaaccta 11102363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 44428597 - 44428516
Alignment:
Q  61 aagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44428597 aagggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaagcgataatacctaaatagttaaggtatcaaaaatgcaattta 44428516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 44170121 - 44169990
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  || |||| ||||||  |  |||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  44170121 taacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggatagaaagttaagatactaaaataaatcaaattttaatcaagggaccaaagc 44170022  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  44170021 gatactaattaaatagttaagggaccaaaaat 44169990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 109
Target Start/End: Original strand, 21885073 - 21885174
Alignment:
Q  8 gtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatac 107  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | | |  || |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21885073 gtttttgaattaaaagtaacggaaaggaccaaaatgtttaacggatagaaattaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagtgaccaaagcgatac 21885172  T
Q  108 ta 109  Q
    ||    
T  21885173 ta 21885174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 42779662 - 42779574
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaa 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | | ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  42779662 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacaaagataaattaacggattaaaataaatcgaattttaattaa 42779574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 122
Target Start/End: Original strand, 54136334 - 54136450
Alignment:
Q  2 cctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaag 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  | |||    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||     
T  54136334 cctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgcaacaga----agttaaggaaccaaaataaatcaaattttaattaaaggatcaaaa 54136429  T
Q  102 cgatactacctaaatagttaa 122  Q
    | || ||||||||||||||||    
T  54136430 caattctacctaaatagttaa 54136450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Original strand, 44170223 - 44170364
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtg-atagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || || |  || |||| |||||   | ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  44170223 ctaacgtttttaaattaaaactaacggaaaggaccaaaaaatatgtacggatagaaagttaaaataccaaaataaatcaaattttaattaagggatcaaa 44170322  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    || ||||||  ||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  44170323 gcaatactaattaaatagttaagggatcaaaaatgcaattta 44170364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 37515621 - 37515528
Alignment:
Q  52 agagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||    
T  37515621 agagaagttaagggacaaaaataaattaaattttaattaaaggatcaacgggatactacctaaatagttaa-gaaacaaaaatgcaatttaacct 37515528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 65
Target Start/End: Original strand, 29970437 - 29970498
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaaggg 65  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  29970437 taacgattttgaattaaaactaacggaaagctccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggg 29970498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 133
Target Start/End: Original strand, 40256602 - 40256653
Alignment:
Q  82 ttttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||| ||||||||    
T  40256602 ttttaattaatggaccaaagcgataccaattaaatacttaaggcaccaaaaa 40256653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 43969670 - 43969599
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaa-ggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaa 71  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||    
T  43969670 acctaacatttttgaattaaaaccaatggaaaaggaccaaaatatgtaacagatagaagttaagggaccaaa 43969599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 10017856 - 10017818
Alignment:
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10017856 atactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 10017818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 142
Target Start/End: Original strand, 29970510 - 29970555
Alignment:
Q  96 ccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29970510 ccaaaacgatactacctaaatagttaagg-accaaaaatgcaattta 29970555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 25181889 - 25181817
Alignment:
Q  68 caaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatt 140  Q
    ||||||||||| | ||||| |||| |||||||  |||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||    
T  25181889 caaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatccgatacaaactaaatagttagaggaccaaaaatgtaatt 25181817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 93)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 23244757 - 23244903
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  23244757 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaacatagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaactaagggaccaaa 23244856  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  23244857 gcgatactatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatctaaccta 23244903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 37393619 - 37393473
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  37393619 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaattgagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaaac 37393520  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctatt 149  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  37393519 gatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaacctatt 37393473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 31230855 - 31230996
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31230855 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggatcaaaataaattgaattttaattaagggaccaaa 31230954  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31230955 gcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaattta 31230996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 24456894 - 24457040
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  24456894 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaag 24456993  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  24456994 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 24457040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 1826033 - 1826166
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1826033 acctaacgtttttgaattaaaactaatgtaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 1826132  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1826133 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 1826166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 1860478 - 1860611
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1860478 acctaacgtttttgaattaaaactaatgtaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 1860577  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1860578 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 1860611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 40040306 - 40040165
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  40040306 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagggccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaacaaaataaatcgaattttaattaaggtaccaaa 40040207  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  40040206 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 40040165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 151
Target Start/End: Original strand, 39912163 - 39912311
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||     
T  39912163 ctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgactaaaatgtgtaatggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagt 39912262  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattat 151  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  39912263 gatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttaaccttttat 39912311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 31230754 - 31230616
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |    
T  31230754 taacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtg 31230655  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31230654 atactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtagttta 31230616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 30872919 - 30872774
Alignment:
Q  9 tttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatact 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  30872919 ttttttaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgttacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcaatact 30872820  T
Q  109 acctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattatata 154  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  30872819 acctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctataatata 30872774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 37393719 - 37393860
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  37393719 acctaacgtttttgaattaaaacttacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaa 37393818  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37393819 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 37393860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 14920653 - 14920792
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14920653 acctaacgttttcgaattaaaagtaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 14920752  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatt 140  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14920753 gcgatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatt 14920792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 11198447 - 11198593
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  11198447 acctaacgttttttaattaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 11198546  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  11198547 gcgatactgtctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 11198593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 148
Target Start/End: Original strand, 35224011 - 35224156
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  35224011 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaaac 35224110  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  35224111 gatactaactaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctat 35224156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18017932 - 18017788
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  18017932 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaaggaccaaaataaattgaattttaattaagtgaccaaagc 18017833  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||    
T  18017832 aatactacctaaatagttaagggaccaaatatgcaatttagccta 18017788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Original strand, 18914495 - 18914634
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  18914495 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggacaagagc 18914594  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  18914595 gatgctacctaaatagttaggggaccaaaaatgcaattta 18914634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 26736268 - 26736125
Alignment:
Q  2 cctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaag 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||  || |||||||||    
T  26736268 cctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaaggtaagggaccaaaataaattaaattttaaaaaagggaccaaag 26736169  T
Q  102 cgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  26736168 cgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttaacc 26736125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 35223916 - 35223765
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  35223916 ctaacgtttttgaattaaaacaaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagtcaagggaccaaagc 35223817  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattatata 154  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  35223816 gatactacctaaatagtaaagggaccaaaaatgcaatttagcctataatata 35223765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 6843641 - 6843492
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagtta--agggatcaaaataaatcgaattttaattaatggacca 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  6843641 acctaacgttttttaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttataagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggatca 6843542  T
Q  99 aagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
     || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  6843541 tagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacctat 6843492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 8654181 - 8654323
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |     
T  8654181 taacgtttttgaattaaaactaacggaaagtaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggagcaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaaaca 8654280  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8654281 atattacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacct 8654323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Original strand, 21515445 - 21515583
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21515445 taacgtttttgaattaaagctaacggaaatgaccaaaatatgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcg 21515544  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||    
T  21515545 atactacgtaaatagttaaaagactaaaaatgtaattta 21515583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 119260 - 119120
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  119260 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagg-accaaaataaatcgaattttaatcaagggaccaaa 119162  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  119161 gtaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 119120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 758488 - 758343
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  758488 acctaacgtttttgaattaaaatcaatggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaatttaagggatcaaaataaatttaattttaattaagggaccaaa 758389  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  758388 gcgatactacctaaatagttaaggggccaaaaatgcaatttaacct 758343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 14920553 - 14920416
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  14920553 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatatgtaacagggagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaatgaccaaaac 14920454  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatt 140  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14920453 aatactacctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaatt 14920416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 18018028 - 18018169
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  18018028 acctaacgtttttaaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggagcaaa 18018127  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18018128 gcaatacttcctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 18018169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 39240174 - 39240033
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39240174 acctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaaggaatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 39240075  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  39240074 atgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 39240033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23244659 - 23244515
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  23244659 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaacgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaagaaccaaa 23244560  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
    |||||||||| ||||| ||||  | |||||||||| |||||||||    
T  23244559 gcgatactacataaatggttagtggaccaaaaatgcaatttaacc 23244515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Original strand, 3869193 - 3869324
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  3869193 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaaagtgtaacggagagaagttaagggacaaaaaaaaatcgaattttaattaagggaccaaaac 3869292  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3869293 gatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 3869324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 40032571 - 40032429
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaa-ttaatggaccaa 99  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  40032571 acctaatgttttttaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagacagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatttaagagaccaa 40032472  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  40032471 agcgatactacctaaataattaagtgaccaaaaatgcaattta 40032429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 5416954 - 5416809
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||||||  |||||||| |    
T  5416954 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaagaccaaaatcaatcgaattttaattagaggaccaaaac 5416855  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||| |||||    
T  5416854 gatactacctaaatagttaggggaccaaaaatacaatttagcctat 5416809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 9495265 - 9495406
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  || |  |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  9495265 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgagtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaactttaattaacggaccaaa 9495364  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    || ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9495365 gcaatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 9495406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 7041773 - 7041653
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7041773 acctaatgtttttcaattaaaactttcgaaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 7041674  T
Q  101 gcgatactacctaaatagtta 121  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7041673 gcgatactacctaaatagtta 7041653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 40094617 - 40094473
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  40094617 ctaacgttcttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggaaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagc 40094518  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtac-caaaaatgtaatttaacct 146  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  40094517 gatactacctaaatagttaagggacaaaaaaatgcaatttaacct 40094473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 29027216 - 29027356
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  29027216 ctaacgtttttgaattaaaactaac-gaaa---ccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaac 29027311  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||    
T  29027312 gatactacctaaatagttaagagaccaaaaatataatttagccta 29027356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 18621989 - 18622130
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18621989 acctaacatttttgaattaaaactaacggaaaagagcaaaatgtgtaacagatagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaa 18622088  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||    
T  18622089 gcgatactatctaaatagttaagagaccaaaagtgcaattta 18622130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 39240264 - 39240405
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  || |||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||  ||||||| ||    
T  39240264 taacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagagaccaaaataaattaaattttaattaagagaccaaaacg 39240363  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  39240364 atactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttaacc 39240405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 44255009 - 44254868
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  44255009 acctaacatttttgaattaaaactaacggaaaacactaaaatgtgtaacagaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 44254910  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  44254909 gcgatactacttaaatagttaaggatccaaaaatgcaattta 44254868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 8654080 - 8653910
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| | | |   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  8654080 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatatgtaacaaatgaaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaa 8653981  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattatataataaattttaagattaat 172  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||| ||| ||| ||||| | |||| ||||||||    
T  8653980 acgatactacctaaatagttaggggaccaaaaatacaatttagcctttta-ataattagtttttagattaat 8653910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 30650334 - 30650188
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  30650334 acctaaggttttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggaaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 30650235  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    | |||||||||||||||||||  | || ||||||| |||||| ||||    
T  30650234 gtgatactacctaaatagttagaggactaaaaatgcaatttagccta 30650188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 141
Target Start/End: Original strand, 40094720 - 40094857
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  40094720 taacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaaagtgtaacggagagaagttaagggacaaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaaaca 40094819  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattt 141  Q
     |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40094820 gtactaattaaatagttaagggaccaaaaatgtaattt 40094857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 29027116 - 29026967
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29027116 acctaacgttttagaattaaaactaacagaaatgaccaaattgtgtaacgggtagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 29027017  T
Q  101 gcgatactacctaaa----tagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
      |||||||||||||    ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29027016 atgatactacctaaatagctagttaagggaccaaaaatgcaatttaacct 29026967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Original strand, 758589 - 758732
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  758589 taacgtttttgaattaaaactaatggaaatgactaaaatgtgtagcagagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatttaaggaccaaagtg 758688  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||    
T  758689 atactacttaaatagttaagggaccaaacatgcaatttagccta 758732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 7041871 - 7042013
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||     || ||||||||    
T  7041871 acctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattt-----aagggaccaaa 7041965  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  7041966 gcgatactatataaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctat 7042013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 16645795 - 16645931
Alignment:
Q  9 tttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgt----gatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcga 104  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||    ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |    
T  16645795 tttttgaattaaaactaatggaaaggaacaaaatgtgtaactgat-gagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacaa 16645893  T
Q  105 tactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16645894 tactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 16645931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 39912059 - 39911927
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||     
T  39912059 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatataacggagagaagttaaaggaccaaaataaaccgaattttaattaagcgaccaaaga 39911960  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatg 135  Q
    |||| || ||||||| |||||| || |||||||    
T  39911959 gataatatctaaataattaagggacaaaaaatg 39911927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 5417055 - 5417189
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagaga-gaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||  |  |||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  5417055 acctaacgtttttgaaataaaactaacggaaatgaccaaaatgtgcaac-gagaagaagttaaggaaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaa 5417153  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatg 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5417154 agcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatg 5417189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 3869091 - 3868947
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatat---gtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggacc 97  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   || |  ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3869091 acctaatgtttttgaattaaaactaacagaaaagaccaaaatgtactgtaacggagagaagttaagagactaaaataaatcgaattttaattaagggacc 3868992  T
Q  98 aaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||| || ||||||    
T  3868991 aaagtgatactacataaatagttaagggatcaaaagtgcaattta 3868947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 142
Target Start/End: Original strand, 26736371 - 26736508
Alignment:
Q  5 aacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgataga-gagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| || || |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  26736371 aacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgt-atcgaagagaagttaaaggaccacaataaatcgaattttaattaaaggaccaaatca 26736469  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  26736470 atactatctaaatagttaagggatcgaaaatgtaattta 26736508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 119366 - 119499
Alignment:
Q  9 tttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatact 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||    | |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  119366 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaccggtgagaagttaagggaccaaaataaagcaaattttaattaagggactaaagcgatact 119465  T
Q  109 acctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| ||||||    
T  119466 acctaaatagttaagggatcaacaatgcaattta 119499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 30568518 - 30568651
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||| |  |||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  30568518 acctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaacggagaaaaattaagggaccaaaataaatcaaattttaaataagggaccaaa 30568617  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30568618 tcgatactaactaaatagttaagggaccaaaaat 30568651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 33542626 - 33542731
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  33542626 acctaacatttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacggagagaagttaagaaatcaaaataaatcaaattttaattaaatgaccaaa 33542725  T
Q  101 gcgata 106  Q
    ||||||    
T  33542726 gcgata 33542731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 11639195 - 11639049
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11639195 acctaacgtttt-gaattaaaacttacgaaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagagacgaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 11639097  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    ||||  |||||||||||||||||| || ||||||  |||||| |||||    
T  11639096 gcgacgctacctaaatagttaagggacaaaaaatacaatttagcctat 11639049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 44678426 - 44678525
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  44678426 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaacgtgtaacagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaa 44678525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 24456811 - 24456737
Alignment:
Q  68 caaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24456811 caaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 24456737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 410604 - 410736
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  | ||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  410604 acctaacgtttttgaattaaaacaaacgaaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaaggtaagataccaaaataaatcaaattttaattaaggaaccaaa 410703  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaa 133  Q
     ||||||||   |||||||||||| | ||||||    
T  410704 acgatactaataaaatagttaagggatcaaaaa 410736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 142
Target Start/End: Original strand, 6844695 - 6844823
Alignment:
Q  14 gaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactaccta 113  Q
    |||||||||||||  | || ||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||  || ||||||||| |||||||    
T  6844695 gaattaaaactaatgggaaagaccaaaatgtgtaatggagagaagttaagggaccaagataaatcgatttttaattaagagatcaaagcgatgctaccta 6844794  T
Q  114 aatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  6844795 aatagttaagagaccaaaaatgcaattta 6844823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18914404 - 18914296
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaa-ttttaattaatggaccaa 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||    
T  18914404 acctaacatttttgaattaaaactaactgaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatttttaattaaagaaccaa 18914305  T
Q  100 agcgatact 108  Q
    |||||||||    
T  18914304 agcgatact 18914296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 5526013 - 5525881
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||  ||||   ||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5526013 acctaacgtttttgaattaaaactaaaggaaatggccaaa--atgtataagagataagtaaagggactaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaa 5525916  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatg 135  Q
     ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  5525915 tcgatactacctaaatagttaagggactaaaaatg 5525881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 12873199 - 12873078
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||||||     
T  12873199 ctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagaaaccaaaataaattaaattttaattaaaggaccaaagt 12873100  T
Q  103 gatactacctaaatagttaagg 124  Q
    |||||||  |||||||||||||    
T  12873099 gatactaattaaatagttaagg 12873078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 36344103 - 36343983
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| | | ||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||      
T  36344103 ctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaagaccaaaatgtgtaacatagaaaagttaaaggaccaaaattaatcgaattttaattaagggaccaaaat 36344004  T
Q  103 gatactacctaaatagttaag 123  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  36344003 aatactacctaaataattaag 36343983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 44678408 - 44678320
Alignment:
Q  54 agaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  44678408 agaagttaagaaaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 44678320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 30873020 - 30873167
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||| ||||| ||| |  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||    
T  30873020 acctaacgtttttgaactaaaactaacgaaaatgactaaaatgtgtaacggatagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaaggaatcaaa 30873119  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
       |||||||| ||||| |||||| || ||||||| |||||| |||||    
T  30873120 ctaatactaccaaaataattaagggacaaaaaatgcaatttagcctat 30873167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 12873290 - 12873434
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| |  |||||| ||||||  | |||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  12873290 acctaacgtttttgaattaaaactaaaaaaaatgaccaaaatgtgtaag-gagaga-gttaagataccaaaataaatcagattttaattaagggaccaaa 12873387  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
     ||||||||  ||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  12873388 acgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagccta 12873434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Original strand, 44255107 - 44255225
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| | ||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |     
T  44255107 taacatttttgaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatgtgtaacagagataagttaagagaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaaaca 44255206  T
Q  104 atactacctaaatagttaa 122  Q
    || | ||||||||||||||    
T  44255207 atcccacctaaatagttaa 44255225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 1825945 - 1825821
Alignment:
Q  9 tttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatact 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||  || |||| |||| ||    
T  1825945 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggactaaaat-aatcaaattttaattaagagatcaaaacgatgct 1825847  T
Q  109 acctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
     | ||||||||||||| |||||||||    
T  1825846 ccttaaatagttaagggaccaaaaat 1825821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 1860390 - 1860266
Alignment:
Q  9 tttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatact 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||  || |||| |||| ||    
T  1860390 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggactaaaat-aatcaaattttaattaagagatcaaaacgatgct 1860292  T
Q  109 acctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
     | ||||||||||||| |||||||||    
T  1860291 ccttaaatagttaagggaccaaaaat 1860266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21512527 - 21512411
Alignment:
Q  30 aaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtacca 129  Q
    ||||||||||||| |||    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  21512527 aaaggaccaaaatgtgtagcggagagaagttaaggggccaaaataaatcaaattttaattaatggactaaagcgatact-cctaaatagttaagggacga 21512429  T
Q  130 aaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||  |||||| ||||    
T  21512428 aaaatacaatttagccta 21512411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 26217209 - 26217073
Alignment:
Q  5 aacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcga 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | | |||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || |||||  ||    
T  26217209 aacgtttttaaattaaaactaacggaaaggacgaaa-tgtgtaacaaagaggagttaagggaccaaaataaattaaattttaattaaagggccaaaatga 26217111  T
Q  105 tactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  26217110 tactacttaaatagttaagggaccaaaaaaataattta 26217073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 28206910 - 28206777
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgt---gatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggacc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||   ||||||   || |||||  | ||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  28206910 acctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggatcaaaatgtgtaacgataga---aaattaagataccaaaatacatcaaattttaattaagggacc 28206814  T
Q  98 aaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||||| | ||||||||| || |||||||||    
T  28206813 aaagcgatactagcaaaatagttatgggaccaaaaat 28206777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 33542526 - 33542395
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagaga-agttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaag 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |  |||||| ||||||   | |||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  33542526 ctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaatgaccaaaatgtgtaag-gagagagagttaaaataccaaaataaatcagattttaattaagggaccaaag 33542428  T
Q  102 cgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    ||||||||  ||||||||||| | |||||||||    
T  33542427 cgatactaattaaatagttaaaggaccaaaaat 33542395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Original strand, 35486107 - 35486249
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||| |  ||||||| ||||||  |  |||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  35486107 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggagcacaaggtgtaag-gagagaaagttaagatactaaaataaattaaattttaattaagggaccaaag 35486205  T
Q  102 cgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
    ||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  35486206 cgatactaattaaatagttaggggaccaaaaatgcaatctaacc 35486249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 143
Target Start/End: Original strand, 36344210 - 36344345
Alignment:
Q  8 gtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatac 107  Q
    |||||||||| |||| |||  |||  ||||||||| |||||  || | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  36344210 gtttttgaatcaaaattaaaggaattgaccaaaatgtgtgacggaaataagttaaaggatcaaaataaatcaaattttaattaaaagaccaaagcaatac 36344309  T
Q  108 tacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaa 143  Q
    ||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||    
T  36344310 tacctaaatagttaaaggataaaaaatgcaatttaa 36344345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Original strand, 28206996 - 28207141
Alignment:
Q  2 cctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgt---gatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggacca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||   ||||||   ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||  ||    
T  28206996 cctaacgtttttgaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatttgtaacgataga---aagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaaggggtca 28207092  T
Q  99 aagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||    
T  28207093 aagcgatactagcaaaataattaagggatcaaaaatgcaatttagccta 28207141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 30568415 - 30568331
Alignment:
Q  6 acgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaatta 90  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||| | | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30568415 acgtttttgaattaaaacaaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaatagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatta 30568331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 124
Target Start/End: Original strand, 44678522 - 44678578
Alignment:
Q  68 caaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaagg 124  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44678522 caaaataaatcgaattttaattagaggaccaaagcgatactacctaaatagttaagg 44678578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 35486015 - 35485869
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| | ||| | |||||||||||   | ||||||||| | |||||||||||| |||| |||    
T  35486015 acctaacgtttttgaattaaaactaatgaaaatgaccaaaatgtttgacaaagagaagttaatataccaaaataaaacaaattttaattaagggactaaa 35485916  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||| ||  | ||||||||||| | ||||||  ||||||| ||||    
T  35485915 gcgatattaattgaatagttaagggatcaaaaacataatttagccta 35485869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 410513 - 410405
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtga-tagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |  ||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  410513 acctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaaggagaga-aagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagagaccaa 410415  T
Q  100 agcgatacta 109  Q
     |||||||||    
T  410414 cgcgatacta 410405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 133
Target Start/End: Original strand, 40032693 - 40032802
Alignment:
Q  24 taacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaag 123  Q
    |||| |||| || |||||| ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  40032693 taacggaaatgatcaaaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaaatgatactacataaatagctaag 40032792  T
Q  124 gtaccaaaaa 133  Q
    | || |||||    
T  40032793 ggacaaaaaa 40032802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 9495174 - 9495114
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaag 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||||||||||    
T  9495174 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatttataagagagagaagttaag 9495114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 100
Target Start/End: Original strand, 26217315 - 26217410
Alignment:
Q  5 aacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| ||| |   ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  26217315 aacgtttttgaattaaaactaatggaaatgacgaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggtacaaaataaatcaaattttaattaagagaccaaa 26217410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 142
Target Start/End: Original strand, 29770360 - 29770446
Alignment:
Q  56 aagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |||||||| ||| || |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29770360 aagttaagggatcaagataaatcaaaatttagttaagggaccaaaccgaaaccaattaaatagttaagggaccaaaaaggtaattta 29770446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 40040404 - 40040477
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaata 74  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  40040404 acctaacatttttgaattaaaactaatgaaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaata 40040477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 32733852 - 32733740
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||| |   | ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||      
T  32733852 taacatttttgaattaaaattaacggaaaggagcaaaatgtgtaacgtatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaaaaaaccaaagta 32733753  T
Q  104 atactacctaaat 116  Q
    ||| |||||||||    
T  32733752 atattacctaaat 32733740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Original strand, 45436403 - 45436545
Alignment:
Q  2 cctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatc--aaaataaatcgaattttaattaatggacca 98  Q
    ||||||||| || |||||||  |||| |||| ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||| |  |||||||||| || |||| |||| ||||||    
T  45436403 cctaacgttatt-aattaaatttaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaaagttaagggacccaaaaataaatcaaaatttagttaagggacca 45436501  T
Q  99 aagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    || ||| || |  ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  45436502 aaccgaaaccaattaaatagttaagggacaaaaaatgtaattta 45436545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 62
Target Start/End: Original strand, 11639294 - 11639353
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaa 62  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  11639294 ctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaagttaa 11639353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15740699 - 15740625
Alignment:
Q  59 ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaa 133  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  |||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  15740699 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatagttaatggaccaaaaa 15740625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 29769505 - 29769365
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaag 101  Q
    ||||||||||| |||||||  |||| |||| ||||||||  ||| | | |||||| ||||||||| ||||||||||| || |||| |||| | ||||||     
T  29769505 ctaacgttttt-aattaaatttaacggaaatgaccaaaacttgtaacaaagagaaagttaagggaccaaaataaatcaaaatttagttaaggaaccaaac 29769407  T
Q  102 cgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaa 143  Q
    ||| || |  ||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  29769406 cgaaaccaattaaatagttaagagaccaaaaaggtaatttaa 29769365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 140
Target Start/End: Original strand, 15741593 - 15741677
Alignment:
Q  56 aagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatt 140  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || |||| |||  |||||||| |||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15741593 aagttaaggaaccaaaataaatcaaaatttagttagaggaccaaaccgataccaattaaatagttaagggaccaaaaaggtaatt 15741677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 43633186 - 43633135
Alignment:
Q  82 ttttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaa 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||    
T  43633186 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaa 43633135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 75
Target Start/End: Original strand, 15741507 - 15741581
Alignment:
Q  2 cctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagag-aagttaagggatcaaaataa 75  Q
    |||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||| | | |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15741507 cctaacgttttttaattaaatttaacggaaaggaccaaaatgtataacggagagaaagttaagggatcaaaataa 15741581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 16645689 - 16645647
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaata 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  16645689 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaata 16645647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Original strand, 26217398 - 26217484
Alignment:
Q  59 ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactac----ctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||    |||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  26217398 ttaagagaccaaaataaatcaaattttaattaagagaccaaa-cgatactacctacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 26217484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 142
Target Start/End: Original strand, 11639378 - 11639418
Alignment:
Q  102 cgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  11639378 cgatactacctaaatagttaagggacgaaaaatgcaattta 11639418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 83)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 12593698 - 12593844
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12593698 acctaacgtttttaaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaa 12593797  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    || ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  12593798 gcaatactacctaaatagttaaaggactaaaaatgtaatttaaccta 12593844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 7399221 - 7399073
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7399221 acctaacgtttttgaattaaaaataacgaaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 7399122  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctatt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  7399121 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctatt 7399073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 19205185 - 19205330
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19205185 acctaaagtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggggtcaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaa 19205284  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  19205285 gcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttaacct 19205330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 33699417 - 33699271
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |    
T  33699417 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaaccgaattttagttaaaggaccaaaac 33699318  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctatt 149  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||    
T  33699317 gatactacctaaatagttaagggaccataaatgcaatttagcctatt 33699271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 10656336 - 10656477
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  10656336 acctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggactaaaataaatcaaattttacttaaaggaccaaa 10656435  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  10656436 gcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaattta 10656477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 31656600 - 31656741
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31656600 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaacagagagaagttatgggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 31656699  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  31656700 gcgatactgcctaataagttaagggaccaaaaatgtaattta 31656741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 142
Target Start/End: Original strand, 8418435 - 8418567
Alignment:
Q  10 ttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatacta 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| | | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8418435 tttttaattaaaactaacagaaagaaccaaaatgtataacagagaaaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaacggaccaaagcgatacta 8418534  T
Q  110 cctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8418535 cctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 8418567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 35263638 - 35263487
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  35263638 acctaatgttttttaattaaaattaacggaaaggaccaaaatatgtaacaaagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaa 35263539  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattata 152  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||    
T  35263538 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaatata 35263487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Original strand, 42710594 - 42710725
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  42710594 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatttataacaaagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagc 42710693  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42710694 gatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 42710725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 12694928 - 12695068
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  12694928 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaataaccaaaatgtgtaatggaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 12695027  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattt 141  Q
    | |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  12695028 gtgatactacctaaatagttaagggactaaaaatgcaattt 12695068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 15267482 - 15267622
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  15267482 acctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaa 15267581  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattt 141  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||    
T  15267582 gcgatactacctaaatagttaaaggatcaaaaatgcaattt 15267622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 31656502 - 31656370
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31656502 acctaatgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtatcagagagaagttaaaggatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 31656403  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31656402 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaa 31656370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 40589298 - 40589442
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  40589298 ctaacatttttgaattaaaactaatggaaaggaccagaatatgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaac 40589397  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  40589398 gatactacctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaatttagccta 40589442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 40589901 - 40590045
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  40589901 ctaacatttttgaattaaaactaatggaaaggaccagaatatgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaac 40590000  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  40590001 gatactacctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaatttagccta 40590045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 7210600 - 7210461
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7210600 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatcaagggaccaaa 7210501  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatt 140  Q
     ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  7210500 acgatagtacctaaatatttaagggaccaaaaatgcaatt 7210461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 16353396 - 16353542
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16353396 acctaacgttttttaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaggggaccaaa 16353495  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||    
T  16353496 gcgatactacttaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagccta 16353542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 3878625 - 3878492
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3878625 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgcaatagagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaacgaccaaa 3878526  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  3878525 gcgatactacctaaataattaagggaccaaaaat 3878492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 7210687 - 7210828
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | | |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7210687 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacataaagaagttaaaagaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 7210786  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||    
T  7210787 gcgatactacctaaatagttaagtgaccaagaatgcaattta 7210828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 41859919 - 41860066
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  41859919 acctaacctttttgaattaatactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaagggatcaaaataaattgaattttaattaagggaccaaa 41860018  T
Q  101 gcgatac--tacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    | |||||  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  41860019 gtgatactatacctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttaacct 41860066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 334440 - 334299
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  334440 acctaacgtttttgaattaaaactaatgggaaggaccaaaatgtgtaaaggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 334341  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    | |||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||    
T  334340 gtgatactacctaaatagttaaaggactaaaaatgcaattta 334299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 5087951 - 5087818
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |  ||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  5087951 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaaccaaaataaattgaattttagttaagggaccaaa 5087852  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5087851 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 5087818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 9693062 - 9692930
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9693062 acctaacgttattgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagtcaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 9692963  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  9692962 gcgatactacctaaatagtt-agggaccaaaaat 9692930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 9693168 - 9693301
Alignment:
Q  9 tttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatact 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  9693168 tttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaatataaatcgatttttaattaagggaccaaatcgatact 9693267  T
Q  109 acctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  9693268 acctaaatcgttaagggaccaaaaatgcaattta 9693301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 10656238 - 10656105
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  10656238 acctaacgtttttgaattaaaactaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacggagataagttaaaggagcaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaa 10656139  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10656138 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 10656105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Original strand, 28392012 - 28392145
Alignment:
Q  2 cctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaag-ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28392012 cctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaggttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 28392111  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  28392112 gcgatactacctaaatagttaagagaccaaaaat 28392145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 35263736 - 35263877
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  35263736 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaatttaatggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaa 35263835  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  35263836 gtcatactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaattta 35263877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 36752046 - 36751913
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | | | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  36752046 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtttaacagagagaagttaagggactaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 36751947  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
     ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  36751946 tcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaat 36751913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 31909074 - 31908939
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  31909074 acctaacgtttttgaattgaaactaacggaaatgaccaaaatgtgcaatagagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggatcaaa 31908975  T
Q  101 gcgatactacctaa--atagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  31908974 gcgatactacctaaatatagttaaggcaccaaaaat 31908939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 141
Target Start/End: Original strand, 39706297 - 39706433
Alignment:
Q  5 aacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcga 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||   |    
T  39706297 aacgtttttgaattgaaactaacaaaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaagaa 39706396  T
Q  105 tactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattt 141  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  39706397 tactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 39706433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 7399321 - 7399452
Alignment:
Q  2 cctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaag 101  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  7399321 cctaacttgtttgaataaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaag 7399420  T
Q  102 cgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaa 133  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  7399421 cgatactacctaaataattaagggacaaaaaa 7399452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26289162 - 26289031
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | | ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  26289162 ctaacgtttttaaattaaaactaacggaaaggacgaaaatgtgtgacatatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacgaaagc 26289063  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26289062 gatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 26289031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 28391912 - 28391773
Alignment:
Q  2 cctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  28391912 cctaacatttttgaattaaaactaactaaaaggaccaaaatgtgtaatggagagaaagttaagggatcaaaataaatcgaactttaattaagggaccaaa 28391813  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatt 140  Q
    |  ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  28391812 gtaatactgcctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatt 28391773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 29024078 - 29023940
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||   |||||||||||||||| | ||||||    
T  29024078 acctaacatttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatatgtaacagagagaaattaagggaccaaaa---atcgaattttaattaaggaaccaaa 29023982  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29023981 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 29023940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 33763049 - 33762923
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagt--taagggatcaaaataaatcgaattttaa-ttaatggacc 97  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  33763049 acctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacagagagaagttataagggatcaaaataaatcgaattttaatttaagggacc 33762950  T
Q  98 aaagcgatactacctaaatagttaagg 124  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  33762949 aaagcgatactacctaaataattaagg 33762923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 40589196 - 40589057
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||     
T  40589196 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagtcaagggaccaaaataaatcgaattttaatttggagaccaaagt 40589097  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  40589096 gaaactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 40589057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 40589799 - 40589660
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||     
T  40589799 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagtcaagggaccaaaataaatcgaattttaatttggagaccaaagt 40589700  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  40589699 gaaactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 40589660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 151
Target Start/End: Original strand, 5088386 - 5088520
Alignment:
Q  17 ttaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5088386 ttaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacaaaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaagcgatactacctaaat 5088485  T
Q  117 agttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattat 151  Q
    |||||||  |||||||||  |||||| ||||||||    
T  5088486 agttaagagaccaaaaatacaatttagcctattat 5088520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 5624523 - 5624381
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   | |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5624523 acctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaattgataacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 5624424  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaa 143  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||    
T  5624423 acgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatacaatttaa 5624381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 31909172 - 31909317
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  31909172 acctaacattttttaattaaaattaacgaaaatgaccaaaatatgtaaaagatagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacgaaa 31909271  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
     |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31909272 acgatactacctaaacagttaagggaccaaaaatgcaatttaacct 31909317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 32272082 - 32272223
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||| || |||||||| | | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32272082 acctaacgtttttaaattaaaactaacgaaaatgaacaaaatatataacatagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 32272181  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||| || |||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  32272182 gcgatattatctaaatagttaagagaccaaaaatgcaattta 32272223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 39706195 - 39706053
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39706195 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatatctaactgagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaa 39706096  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||    ||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||    
T  39706095 gcg----tacataaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagccta 39706053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15267375 - 15267240
Alignment:
Q  11 tttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactac 110  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||| ||| || |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  15267375 tttgaattaaaactaatagaaatgagcaaaatgtgtaattgagagaagttaaggggccaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaaacgatactac 15267276  T
Q  111 ctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  15267275 ct-aatagttaagggaccaaaaatgcaatttaaccta 15267240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18514430 - 18514286
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  ||||||||     
T  18514430 ctaacgtttttgaattaaaactaatggaaacgaccaaaatgtgtaacatagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaactaagcgaccaaagg 18514331  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  18514330 gatacttcctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 18514286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 146
Target Start/End: Original strand, 15670395 - 15670538
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||   |||||| |    
T  15670395 ctaacgtttttgaattaaaactaatcgaaaggaccaacatgtgtaatgcagagaagttaagggaccaaaataaataaaattttaattaaataaccaaaac 15670494  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  15670495 gatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaacct 15670538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 25923262 - 25923119
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| | | |  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25923262 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaatggtaaaaatgtataacggagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaa 25923163  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaac 144  Q
     ||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||    
T  25923162 ccgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatacaatttaac 25923119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 40774479 - 40774341
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |    
T  40774479 ctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaagagagagaagttaagggaccaaaataaatcg-attttaattaagggactaaaac 40774381  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  40774380 aatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgaaattta 40774341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 41372400 - 41372543
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41372400 acctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 41372499  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaac 144  Q
     ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  41372500 acgatattaattaaatagttaagggaccaaaaacataatttaac 41372543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 16353298 - 16353154
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || | | ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16353298 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccgaaatgagtaacatagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 16353199  T
Q  101 gcgatactacctaaa---tagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16353198 tcgatactacctaaatagtagttaagggaccaaaaatgtaattta 16353154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 38416376 - 38416509
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |  || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  38416376 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacggaaagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagtgagcaaa 38416475  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  38416476 gcgatactacctaaataattaagagaccaaaaat 38416509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 40774579 - 40774720
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||   |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  40774579 acctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtgacgtagagaaataaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggactaaa 40774678  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| ||||||    
T  40774679 gcgatactagctaaataattaaggaatcaaaaatgcaattta 40774720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Original strand, 15476503 - 15476646
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |   |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15476503 ctaacatttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagc 15476602  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    ||||||||||||||| |||||| | | |||||| |||||||||||    
T  15476603 gatactacctaaataattaaggga-ctaaaatgcaatttaaccta 15476646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 12593598 - 12593452
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||| | ||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||||  ||||    
T  12593598 ctaacgtttttgacttaaaactaaaggaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaggaaccaatataaatcgaattttagttaagggactgaagc 12593499  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctatt 149  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||    
T  12593498 gatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagcctatt 12593452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 5152857 - 5152998
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||| | | |||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5152857 acctaacgtttttgaattaaaaccaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaaattaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 5152956  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  5152957 gcgatactaaataaatagttaagggaccaaaaacataattta 5152998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 42710486 - 42710373
Alignment:
Q  9 tttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatact 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  42710486 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacatagagaagttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaaagaactaaagcgatact 42710387  T
Q  109 acctaaatagttaa 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  42710386 accgaaatagttaa 42710373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 132
Target Start/End: Original strand, 17736538 - 17736620
Alignment:
Q  50 agagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaa 132  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17736538 agagagaatttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaa 17736620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 17861179 - 17861042
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||     ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  17861179 taacgtttttgaattaaaactaacggaatggaccaaaatgtgtaccgaagagaagttaagg-accaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagca 17861081  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    | | ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  17861080 acattacctaaatagttaaaggaccaaaaatataattta 17861042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19205087 - 19204942
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||   ||||||||||||||| ||  ||   | || |||||||||||| ||||||||    
T  19205087 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaccagagagaagttaaggtatttaagcca-tcaaattttaattaagggaccaaa 19204989  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  19204988 gtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 19204942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Original strand, 33763153 - 33763290
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||| |  |||||| ||| |  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  33763153 taacgtttttgaattaaaaccaaaggaaatgtacaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccgaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaagcg 33763252  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33763253 atacta-ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 33763290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14052032 - 14051887
Alignment:
Q  2 cctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaag 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |  |||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||     
T  14052032 cctaacgtttttgaattaaaactaattgaaaggaccaaaatgtgtaacggagaaaagttcaggaaccaaaataaatcgaattttaattaaaaaaccaaaa 14051933  T
Q  102 cgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    | ||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||    
T  14051932 caatattacctaaatagttaagagaccaaaaatacaatttaaccta 14051887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21750901 - 21750808
Alignment:
Q  54 agaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  21750901 agaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaaggcaatttagccta 21750808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 120
Target Start/End: Original strand, 25923364 - 25923480
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |  ||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |     
T  25923364 taacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaaattaagagaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaaaca 25923463  T
Q  104 atactacctaaatagtt 120  Q
    ||||||| |||||||||    
T  25923464 atactacataaatagtt 25923480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 8418336 - 8418206
Alignment:
Q  9 tttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatact 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  8418336 tttttgaattaaaactaacggaaatgacaaaaatgtgtaacagagagaagttaaga-accaaaataaatcgaattttaattaagtgaccaaaacgatact 8418238  T
Q  109 acctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatt 140  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||| ||||    
T  8418237 acctaaataattaatggaccaaaaatgcaatt 8418206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15476377 - 15476266
Alignment:
Q  34 gaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaa 133  Q
    ||||||||| ||| |  ||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15476377 gaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataaataaaattttaattaagggatcaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaa 15476278  T
Q  134 tgtaatttaacc 145  Q
    | ||||||||||    
T  15476277 tataatttaacc 15476266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 38416279 - 38416165
Alignment:
Q  9 tttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatact 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||| |  |||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38416279 tttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaaccgagagaagttaagaaaacaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatact 38416180  T
Q  109 acctaaatagttaag 123  Q
    ||||||||| |||||    
T  38416179 acctaaataattaag 38416165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 26289262 - 26289396
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaa-ctaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||  ||||||| ||||| ||  || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  26289262 acctaacgtttttgaattaaaaaccaacgaaaaggacaaaaatgtgcaatggagagaagttaagg-atcaaaatgaatcgaattttaattaagggaccaa 26289360  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatg 135  Q
    | ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||    
T  26289361 aacgatactatttaaatagttaaaggaccaaaaatg 26289396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 36752144 - 36752290
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||   ||||||||||||| ||  | | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||    
T  36752144 acctaacttttttaaattaaaaccaatgaaaaggaccaaaatgtgcaacaaagagaagttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaa-ggattgaa 36752242  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  36752243 gcgatactacataaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctat 36752290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 5152760 - 5152607
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagaga-agttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | | ||| | |||||||  | ||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  5152760 acctaaagtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaaga-agatagagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaaggggccaa 5152662  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattatata 154  Q
    ||  ||||||  || |||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  5152661 agtcatactaattacatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctataatata 5152607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 134
Target Start/End: Original strand, 43570016 - 43570146
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||| || |||||| ||| |  |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  43570016 taacgtttttgaatcaaaactaatcgaaatgatcaaaatgtgtaacggagagaagttaatgggacaaaataaatcaaattttaattaagggaacaaagcg 43570115  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    || ||| |||||||||||||| || ||||||    
T  43570116 atgctatctaaatagttaagggacaaaaaat 43570146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 142
Target Start/End: Original strand, 3879305 - 3879395
Alignment:
Q  52 agagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3879305 agagaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaaataatgaaccaaagtcatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 3879395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 5460264 - 5460199
Alignment:
Q  69 aaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  5460264 aaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactgtctaaatagttaagggaccaaaaat 5460199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 14143652 - 14143515
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  |||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||   ||||||    
T  14143652 acctaatgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacggagagaagttaa-ggactaaaataaatc-aattttaattaa-aaaccaaa 14143556  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     |||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  14143555 acgatactatctaaatagttaaggga-caaaaatataattta 14143515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 14143755 - 14143888
Alignment:
Q  9 tttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatact 108  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||  ||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||  |||||    
T  14143755 ttttttaattaaaattaacaaaagtgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaattaaattttaatgaagagaccaaagtaatact 14143854  T
Q  109 acctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    || ||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  14143855 acttaaatagttaaaggaccaaaaatgcaattta 14143888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 17861280 - 17861418
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| |  |||||||||||  ||| |||||||||      ||||||||| ||||||||    
T  17861280 acctaacgtttttgaattaaaaccaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttacaggaccaaaataaa------tttaattaa-ggaccaaa 17861372  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    | ||||||||||||||| || ||| |||||||||  |||||| ||||    
T  17861373 gtgatactacctaaataatt-agggaccaaaaatacaatttagccta 17861418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 145
Target Start/End: Original strand, 5460272 - 5460332
Alignment:
Q  85 taattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  5460272 taattaagggaccaaagcgatactatctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaacc 5460332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Original strand, 19185548 - 19185631
Alignment:
Q  59 ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  |||||||| | ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19185548 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccaatactaattaaatagttaagggaccaaaaaggtaattta 19185631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 19615464 - 19615419
Alignment:
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19615464 gatactacctaaatagtcaagggaccaaaaatgcaatttaacctat 19615419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 157
Target Start/End: Original strand, 2597327 - 2597482
Alignment:
Q  2 cctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||| |||||||  |||| |||| ||||||||  ||| | | |||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||| ||||  |||||||    
T  2597327 cctaacgttttt-aattaaatttaacggaaatgaccaaaacgtgtaacaaagagaaagttaaaggaccaaaataaatcaaaatttagttaagagaccaaa 2597425  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattatataata 157  Q
     | | || |  ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||||    
T  2597426 ccaaaaccaattaaatagttaagggaccaaaaagataatttaaccttttatttaata 2597482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 41859819 - 41859780
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaat 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41859819 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaat 41859780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Original strand, 146479 - 146585
Alignment:
Q  17 ttaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaat 116  Q
    |||||||||| | ||| || |||| | ||| | ||||| || ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||| ||||| |||||||||    
T  146479 ttaaaactaagaaaaatgatcaaattgtgtaacagagataacttaagcgttcaaaatgaatcgaattttatttaacagacgaaaacgataatacctaaat 146578  T
Q  117 agttaag 123  Q
    |||||||    
T  146579 agttaag 146585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 132
Target Start/End: Original strand, 25333183 - 25333233
Alignment:
Q  82 ttttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaa 132  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  25333183 ttttaattaaaggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 25333233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 29961873 - 29961823
Alignment:
Q  82 ttttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaa 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  29961873 ttttagttaatggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 29961823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 2596450 - 2596386
Alignment:
Q  83 tttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    ||||||||| |||||||| ||| || |  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  2596450 tttaattaagggaccaaaccgaaaccaattaaatagttaagggaccaaaaaggtaatttagccta 2596386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 21750932 - 21750900
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaag 33  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21750932 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaag 21750900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 11729 - 11870
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11729 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatatataacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaa 11828  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11829 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 11870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 11630 - 11486
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11630 ctaacgtttttaaattaaaactaacgaaaaagaccaaaatatgcaacggagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagc 11531  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  11530 gatactttctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 11486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 71)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Original strand, 10625329 - 10625467
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |    
T  10625329 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaaaggaccaaaatg 10625428  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10625429 atactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 10625467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 35085883 - 35085737
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35085883 acctaacatttttgaattaaaactaactgaaaggatcaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaa 35085784  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  35085783 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 35085737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 23472798 - 23472939
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23472798 acctaacgtttttaaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaataaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 23472897  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  23472898 gcgaaactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 23472939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 47250788 - 47250929
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47250788 acctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaa 47250887  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  47250888 gtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 47250929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8769426 - 8769280
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  8769426 acctaacgtttttgaattaaatctaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattcagggaccaaa 8769327  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  8769326 acaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaaccta 8769280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Original strand, 8769527 - 8769665
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8769527 taacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagatgttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcg 8769626  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  8769627 atactacctaaatagttaagggactaaaaatgcaattta 8769665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23437296 - 23437150
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23437296 acctaacgtttttgaattaaaactaatggaaaggaccaaaatatgtaaccgagagaggttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 23437197  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||    
T  23437196 gcgatactacctaaatagttaaggaatcaaaaatgcaatttagccta 23437150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 2357211 - 2357070
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  2357211 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaatggagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 2357112  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    | |||||||  ||||||||||||  | |||||||| ||||||    
T  2357111 gtgatactatttaaatagttaagagatcaaaaatgcaattta 2357070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 43726486 - 43726640
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||| |    
T  43726486 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaggaactaaaac 43726585  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattatataata 157  Q
     |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  43726586 aataccacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctattatttaata 43726640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 43140833 - 43140697
Alignment:
Q  10 ttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatacta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43140833 ttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatatgtaacagagaggagttaagagaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatacta 43140734  T
Q  110 cctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
     |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  43140733 tctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttaacct 43140697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 18731161 - 18731022
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |   ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18731161 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagataagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaagc 18731062  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18731061 gatactatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 18731022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 21522362 - 21522230
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  21522362 acctaacgtttttgaattaaaattaacagaaaagaccaaaatatgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaa--gaattttaattaagggaccaaa 21522265  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatg 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21522264 gcgatactacctaaataattaagggaccaaaaatg 21522230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Original strand, 44486176 - 44486315
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||    
T  44486176 ctaacgttttggaatttaaactaacagaaaggaccaaaatatgtaacagagagaaattaagggaccaaaataaattaaatattaattaaaggaccaaagc 44486275  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  44486276 gatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaattta 44486315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 473422 - 473568
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  473422 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaattgagagaagttaagggacgaaaataaatcaaattttaattaaaagaccaaa 473521  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||||||||||||||||||| | |  || |||| |||||||||||    
T  473522 gcgatactacctaaatagttaaagaattaacaatgcaatttaaccta 473568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Original strand, 35085985 - 35086123
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  35085985 taacgtttttgaattaaaactaacggaaaggtccaaaatatgtaacaaagagaagttaagggaccacaataaatcaaattttagttaagggaccaaagcg 35086084  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  35086085 atactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaattta 35086123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 34568727 - 34568606
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34568727 acctaacatttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 34568628  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34568627 gcgatactacctaaatagttaa 34568606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Original strand, 31715866 - 31716004
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  |||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31715866 ctaacgtttttgaattaaaactaac-gaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttataggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagc 31715964  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31715965 gatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 31716004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 134
Target Start/End: Original strand, 9230922 - 9231052
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||    
T  9230922 taacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagtgaccaaaataaatcaaatcttaattaagggaccaaaacg 9231021  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  9231022 atactacctaaatcgttaagggaccaaaaat 9231052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 31715777 - 31715655
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  31715777 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatctgtaacagagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaggggtcaaa 31715678  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  31715677 gcgatactacctaaatagttaag 31715655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 32706876 - 32706730
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  32706876 acctaacgtttttgaattagaactaacggaaaggactaaaatgtgtaattgagagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagggtcaaaa 32706777  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  32706776 acaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 32706730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 32706974 - 32707119
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  32706974 acctaacgtttttgaattaaaac-aacagaaaggaccaaaatatgtaacagagagaagttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggaccaaa 32707072  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| || ||||||  |||||| ||||    
T  32707073 gcgatactatctaaataattaagggactaaaaatacaatttagccta 32707119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 39118152 - 39118010
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| | ||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |    
T  39118152 ctaacgtttttgaattaaaattaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttagggaatcaaaataaatcgaaatttaattaagggatcaaaac 39118053  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  39118052 gatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaacc 39118010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 5238592 - 5238447
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  5238592 taacgtttttgaagtaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagagaacttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcg 5238493  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctatt 149  Q
    |||||||||||| |||||| | | |||||||| |||||| ||||||    
T  5238492 atactacctaaacagttaatggatcaaaaatgcaatttagcctatt 5238447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 148
Target Start/End: Original strand, 9034559 - 9034704
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  9034559 ctaacgtttttgatttaaaactaacgaaaaggaccaaaatctgtaacagagggaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagagaccaaagc 9034658  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||| |||||    
T  9034659 gatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatacaatttagcctat 9034704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 11678847 - 11678706
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11678847 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtataacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 11678748  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    | |||| || ||||||| |||| | |||||||||| ||||||    
T  11678747 gtgatattatctaaatatttaaaggaccaaaaatgcaattta 11678706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 24119858 - 24119717
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||    
T  24119858 acctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatttgtaacggagagaagttaagggatcaaaagaaatcaaattttaattaagagaccaaa 24119759  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24119758 gtgatactatctaaatagttaagaaaccaaaaatgtaattta 24119717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 47250699 - 47250578
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||      
T  47250699 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaatggggagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaaat 47250600  T
Q  103 gatactacctaaatagttaagg 124  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  47250599 gatactacctaaataattaagg 47250578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Original strand, 11678947 - 11679077
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11678947 ctaacctttttgaat-aaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagc 11679045  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11679046 gatactacttaaatagttaagggaccaaaaat 11679077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 134
Target Start/End: Original strand, 2357300 - 2357430
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| || ||||| ||    
T  2357300 taacatttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttagttaagggcccaaaacg 2357399  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  2357400 atactacctaaatagttaagggaccagaaat 2357430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 44485574 - 44485715
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  44485574 acctaatgttttggaatttaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaattgaatattaattaaaggaccaaa 44485673  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  44485674 gcgataatacttaaatagttaaaggaccaaaaatgcaattta 44485715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23472735 - 23472591
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |  |||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||  ||||||| |    
T  23472735 ctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaagttaaagaaccaaaatgaatcgaattttaattaaaagaccaaaac 23472636  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  23472635 gatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagccta 23472591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 44448055 - 44447917
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  44448055 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaatggccaaaatgtgtaaaagagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa-ggaccaaaac 44447957  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     |||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  44447956 aatactatctaaatagttaacggaccaaaaatgcaattta 44447917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Original strand, 26920162 - 26920300
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26920162 taacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcg 26920261  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||| ||| |||||| ||||| |  ||||||| ||||||    
T  26920262 atacaaccgaaatagataagggattaaaaatgcaattta 26920300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 21522460 - 21522603
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | |  |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21522460 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgt-taacggagagaagttaagg-accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 21522557  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||    
T  21522558 gcgatgctacctaaatagttaagggaccaaaaacacaatttaacct 21522603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 44448154 - 44448275
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  44448154 acctaacatttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacagagaaaagttaagggaccaaaataaattaaattttaattaagggaccaaa 44448253  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaa 122  Q
    |||||||||| |||||| ||||    
T  44448254 gcgatactacttaaataattaa 44448275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 41758823 - 41758691
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41758823 acctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 41758724  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaa 133  Q
     ||||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  41758723 acgatactatttaaatagttaagggacaaaaaa 41758691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Original strand, 47251142 - 47251279
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  |||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||     
T  47251142 taacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaac-gagaaaagttaagggaccaaaataaattaaattttaattaagagaccaaagca 47251240  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  47251241 atactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaattta 47251279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 9230820 - 9230716
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9230820 acctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgatcaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 9230721  T
Q  101 gcgat 105  Q
    |||||    
T  9230720 gcgat 9230716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 38842175 - 38842081
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggac 96  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38842175 acctaacgtttttgaattaaaattaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaa-ggatcaaaataaatcgaattttaattaagggac 38842081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 31623666 - 31623807
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |  |||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||| || | || |||||    
T  31623666 acctaacgtttttgaattaaaactaatcgaaaggaccaaaatgtgtaacggagaaaagttatgggaccaaaataaatcaaattttacttgagggtccaaa 31623765  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  31623766 acgatactacctgaataattaaggtactaaaaatgcaattta 31623807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 36507051 - 36507192
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| ||||||||||  | | ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  36507051 acctaatgtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaagataccgaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 36507150  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     ||||||||  ||||||||||||  ||||||||  |||||||    
T  36507151 tcgatactaattaaatagttaagagaccaaaaacataattta 36507192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 34568826 - 34568942
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  34568826 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtataacagagagaagttaagggacaaaaataaatcaaattttaattaagggatcaaa 34568925  T
Q  101 gcgatactacctaaata 117  Q
    | |||||||| ||||||    
T  34568926 gtgatactacataaata 34568942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Original strand, 38842266 - 38842396
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |  |  |||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  38842266 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaatatgtgtaacgggtagaagtta-gagaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagc 38842364  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  38842365 gatgctacctaaatagttaaggaatcaaaaat 38842396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Original strand, 28349625 - 28349766
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||||| |    
T  28349625 ctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaa-agagaaaagttaagataccaaaataaattaaattttaattaagggaccaaaac 28349723  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
     ||||||  ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  28349724 aatactaattaaatagttaagggaccaaaaacataatttaacc 28349766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 473331 - 473195
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||   ||| ||| | ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  473331 ctaacgtttttgacttaaaactaaaggaaaggac---aatgtgtaacagagaaaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagc 473235  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||||    
T  473234 gatactgcctaaatagttaagcgatcaaaaatgcaattta 473195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 22338415 - 22338275
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||| |||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  22338415 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaaggtaccaaag 22338316  T
Q  102 cgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    | ||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  22338315 caatactaattaaatagttaagggaccaaaaacataattta 22338275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 43726383 - 43726242
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  43726383 taacatttttgaattaaaactaat-gaaaagatcaaaatgtgtaacagagagaagttaaggaaccaaa-taaatcaaattttaattaagggaccaaagcg 43726286  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    | ||||| |||||| |||||| |||||||||  |||||||||||    
T  43726285 agactacttaaataattaagggaccaaaaatacaatttaaccta 43726242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 37143900 - 37143767
Alignment:
Q  8 gtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatac 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  37143900 gtttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacagagaaaagttaagataccaaa-taaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatac 37143802  T
Q  108 tacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  37143801 taattaaatagttaagggaccaaaaacataattta 37143767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 134
Target Start/End: Original strand, 48704105 - 48704183
Alignment:
Q  56 aagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48704105 aagttaaaggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 48704183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 37144005 - 37144152
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaag-ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| || |||||| ||| |  |||||||  |||||  | ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  37144005 acctaacgtatttaaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaag-gagagaaaattaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaa 37144103  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    | ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  37144104 aacgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacctat 37144152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 70 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 10625181 - 10625103
Alignment:
Q  70 aaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  10625181 aaataaatcgaattttagttaagggaccaacacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagcctat 10625103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 47305271 - 47305138
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||| ||| |  |||| || ||||||  | ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  47305271 acctaacgtctttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaag-gagataaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaa 47305173  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  47305172 agcgatactaattaaatagttaagggaccaaaaat 47305138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 47251038 - 47250942
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagag-agaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |  | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47251038 taacgtttttga-ttaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggggagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 47250942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 47305369 - 47305490
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| || ||| |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  47305369 acctaacatttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaatggagtgaagttaagataccaaaataaattaaattttaattaagggagcaaa 47305468  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaa 122  Q
     ||||||||  |||||||||||    
T  47305469 acgatactaattaaatagttaa 47305490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Original strand, 22338516 - 22338659
Alignment:
Q  2 cctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggat--caaaataaatcgaattttaattaatggacca 98  Q
    |||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |  ||  ||||||||||  |||||||||||| |||| |    
T  22338516 cctaacatttttgaattaaaattaatgtaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaaagttacgacataccaaaataaatgaaattttaattaagggacga 22338615  T
Q  99 aagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22338616 aagcgatactaattaattagttaagggaccaaaaatgcaattta 22338659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 23437394 - 23437494
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | | ||| |||||| | || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  23437394 acctaacatttttgaattaaaactaacgggaaggaccaaaatgtgtaacaaagataagttacgagaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 23437493  T
Q  101 g 101  Q
    |    
T  23437494 g 23437494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 147
Target Start/End: Original strand, 38677039 - 38677130
Alignment:
Q  56 aagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||| || |  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  38677039 aagttaagggatcaaaataaatcaaaatttagttaagggaccaaaccgaaaccaattaaatagttaagggaccaaaaaggtaatttagccta 38677130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15326998 - 15326870
Alignment:
Q  19 aaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaata 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||||||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||    
T  15326998 aaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatactaattaaata 15326900  T
Q  118 gttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||   || ||||||| |||||| ||||    
T  15326899 gttaaaaaactaaaaatgcaatttagccta 15326870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 38676201 - 38676059
Alignment:
Q  2 cctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||| |||||||  |||| |||| ||||||||  ||| | |||||||| |||||| || ||||||||||| || |||| |||| ||||||||    
T  38676201 cctaacgttttt-aattaaatttaacggaaatgaccaaaacgtgtaacagagagaaagttaagagaccaaaataaatcaaaatttagttaagggaccaaa 38676103  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaac 144  Q
     ||| |  |  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  38676102 ccgaaatcaattaaatagttaagggaccaaaaatataatttaac 38676059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 43050510 - 43050396
Alignment:
Q  20 aaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagtt-aagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatag 118  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | | |||||| || |||||| ||||||||||| | |||||||||  |||||||| | ||| ||  |||||||    
T  43050510 aaactaacggaaagcaccaaaatatgtaacaaagagaaatttaagggaccaaaataaatcaatttttaattaggggaccaaaccaatattaattaaatag 43050411  T
Q  119 ttaaggtaccaaaaa 133  Q
    |||||| ||||||||    
T  43050410 ttaagggaccaaaaa 43050396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 28263582 - 28263493
Alignment:
Q  59 ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctat 148  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||| |||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||    
T  28263582 ttaaggtaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatagttaagggatcaaaaaagtaatttagcctat 28263493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 142
Target Start/End: Original strand, 40263608 - 40263694
Alignment:
Q  56 aagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||| || |  |||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  40263608 aagttaagggaccaaaataaatcaaaatttagttaagggaccaaaccgaaaccaattaaatatttaagggaccaaaaaggtaattta 40263694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 10625227 - 10625186
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaat 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  10625227 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaat 10625186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 48703866 - 48703802
Alignment:
Q  59 ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaag 123  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||    
T  48703866 ttaagtgatcaaaataaatcaaattataattaagggaccaaaacgatattactttaatagttaag 48703802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 43705008 - 43704957
Alignment:
Q  82 ttttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaa 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||    
T  43705008 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaa 43704957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Original strand, 24119949 - 24120003
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa 57  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  24119949 ctaacattttttaattaaaattaacagaaagaaccaaaatatgtaacagagagaa 24120003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 132
Target Start/End: Original strand, 45457099 - 45457149
Alignment:
Q  82 ttttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaa 132  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  45457099 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 45457149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 144
Target Start/End: Original strand, 4156553 - 4156638
Alignment:
Q  59 ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaac 144  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||| |||  | ||||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  4156553 ttaagagaccaaaataaatcaaattttagttagggtaccaaacagatactaattaaatagttaagggaccaaaaaggcaatttaac 4156638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 9225681 - 9225626
Alignment:
Q  98 aaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattatata 154  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  9225681 aaagcgatactacctaaata-ttaagagaccaaaaatgcaatttagcctaatatata 9225626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 19543555 - 19543511
Alignment:
Q  80 aattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaagg 124  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  19543555 aattttaattaagggatcaaagcgatactaaataaatagttaagg 19543511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 42287372 - 42287324
Alignment:
Q  84 ttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaa 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  42287372 ttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 42287324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 60)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 3289074 - 3288933
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  3289074 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgtaatggagagaagttaggggaccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaa 3288975  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  3288974 gcgatactacctaaatagttaagggaccataaatgcaattta 3288933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24605018 - 24604874
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24605018 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaacgtgtaacagagagaagt-aagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 24604920  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24604919 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacct 24604874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 33329350 - 33329200
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33329350 acctaacgtttttgaattaaaactaatagaaaggaccaaaatgtgtaacggggagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 33329251  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattat 151  Q
    || ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||| ||||    
T  33329250 gcaatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagccttttat 33329200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 6220298 - 6220439
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  6220298 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattgatggaccaaa 6220397  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||    
T  6220398 gcgatactacctaaatagttaagggattaaaaatgcaattta 6220439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 9174045 - 9173912
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9174045 acctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaa 9173946  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9173945 gcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 9173912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 25551578 - 25551723
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25551578 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggacctaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaggggaccaaa 25551677  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  25551678 gcgatactacttaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaacct 25551723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 1158732 - 1158593
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaaca--gaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1158732 ctaacgtttttgaattaaaactaacacggaaaggaccaacatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaa 1158633  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1158632 gcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgtaatt 1158593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3338618 - 3338466
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3338618 taacgtttttgaattaaaactaacggaaatgagcaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcg 3338519  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattatataat 156  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  3338518 atactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcctataatataat 3338466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 24605116 - 24605254
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24605116 acctaatgtttttgaattaaaactaacgaaaatgac-aaaatgtgtaacagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 24605214  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatt 140  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24605215 tcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatt 24605254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 33545064 - 33545210
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33545064 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaa 33545163  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    | |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||    
T  33545164 gtgatactacctaaatagttaatgcaccaaaaatataatttagccta 33545210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 33544966 - 33544821
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33544966 acctaacctttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 33544867  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    || ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  33544866 gcaatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacct 33544821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 35132745 - 35132604
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  35132745 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgcaacagagagaagttaaaggaccaaaataaatctaattttaattatgggaccaaa 35132646  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  35132645 gcgatactacctaaatagttaatggaccaaaaatgcaattta 35132604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 3289152 - 3289293
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  3289152 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaacaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaggcaccaaa 3289251  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  3289252 gcgatattacctaaatagtttagggaccaaaaatgcaattta 3289293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 29010098 - 29009965
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  29010098 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtagcggagagaagttaagggaccgaaataattcgaattttaattaagggaccaaa 29009999  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  29009998 gcgatactacgtaaatagttaagggaccaaaaat 29009965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 31029668 - 31029523
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31029668 acctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacgcagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaa 31029569  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||    
T  31029568 gcgatactacctaaataattaagggatcaaaaatgcaatttaacct 31029523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 33346622 - 33346501
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33346622 acctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaggatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 33346523  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  33346522 gcgatactacctaaatagttaa 33346501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 35119053 - 35119174
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |  ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35119053 acctaacgtttttgaattaaaattaacagaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaaattaatggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 35119152  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  35119153 gcgatactacctaaatagttaa 35119174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 12903365 - 12903232
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| || |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12903365 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagataagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaa 12903266  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | |||||||||    
T  12903265 gcgatactatctaaataattaaagaaccaaaaat 12903232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 14337046 - 14336905
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | | | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14337046 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtataacaaagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaa 14336947  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| ||||||    
T  14336946 gcgatactagctaaataattaagggatcaaaaatgcaattta 14336905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 13156081 - 13156220
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |   ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  13156081 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacgaagaaaaattaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggacca-- 13156178  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
       ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  13156179 ---atactacctaaatagttaagggacaaaaaatgtaatttaacc 13156220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 13160937 - 13161076
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |   ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  13160937 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacgaagaaaaattaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggacca-- 13161034  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
       ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  13161035 ---atactacctaaatagttaagggacaaaaaatgtaatttaacc 13161076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 11524901 - 11524778
Alignment:
Q  9 tttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatact 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |  |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11524901 tttttgaattaaaaccaacagaaaggactaaaatgtgtaacggagagaggttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatact 11524802  T
Q  109 acctaaatagttaaggtaccaaaa 132  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  11524801 acctaaatagttaagggaccaaaa 11524778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25551484 - 25551358
Alignment:
Q  8 gtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatac 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  25551484 gtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagaaaagttaagggactaaaataaatcaaatttcaattaagggaccaaagcaatac 25551385  T
Q  108 tacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25551384 tacctaaatagttaagggaccaaaaat 25551358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 7537847 - 7537979
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  7537847 acctaatgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaaccgagagaagttatgggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacaaaa 7537946  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaa 133  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || |||||    
T  7537947 gcgataccacttaaatagttaagggacaaaaaa 7537979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 29010196 - 29010337
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  29010196 acctaatgtttttgaattaaaattaacagaatggaccaaaatgtgtaatggatggaagttaaggggccaaaataaatcgaattttagttaagggaccaca 29010295  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  29010296 gcgatactacataaatagtcaaggaaccaaaaatgcaattta 29010337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 6220197 - 6220058
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  6220197 taacgtttttgaatgaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagggagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagagacgaaagcg 6220098  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaa 143  Q
    ||| ||  ||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  6220097 atattaattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaa 6220058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Original strand, 1860731 - 1860868
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||| |   ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  1860731 taacgtttttgaattaagactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaaggaacccaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagag 1860830  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1860831 atac-acctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 1860868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 117
Target Start/End: Original strand, 12903455 - 12903569
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | | |  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  12903455 ctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtattacggagagaagttaaggaatcaaaataattcgaattttaattaaaggaccaaagg 12903554  T
Q  103 gatactacctaaata 117  Q
    |||||||||||||||    
T  12903555 gatactacctaaata 12903569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 147
Target Start/End: Original strand, 19135692 - 19135834
Alignment:
Q  5 aacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcga 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| || ||| |  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  || |||| |||    
T  19135692 aacgttttttaattaaaactaatggaaaggaccaacatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagagatcaaaacga 19135791  T
Q  105 tactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  19135792 tactacctaaatacttaatggaccaaaaatgcaatttagccta 19135834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 133
Target Start/End: Original strand, 24548485 - 24548615
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||     
T  24548485 ctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaactcagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaagt 24548584  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaa 133  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  24548585 gatactaattaaatagttaagggaccaaaaa 24548615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 11525008 - 11525148
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | |  || |||||||| || |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  11525008 acctaacgttttttaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaagga-aagttaagagaccaaaataaattgaattttaaataagggaccaaa 11525106  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  11525107 ccgatactacctaaattgttaagggaccaaaaatgcaattta 11525148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 124
Target Start/End: Original strand, 14337146 - 14337267
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |  || |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||     
T  14337146 ctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaagaccaaaatgtgtaacggaaagaatttaagggaccaaaataaatcaaattttaactaagggaccaaagt 14337245  T
Q  103 gatactacctaaatagttaagg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14337246 gatactacctaaatagttaagg 14337267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 31029766 - 31029907
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| | ||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  31029766 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaatgatcaaaatgtgtaacagagaaaagataaaggaccaaaataaatcgaattttagttaagggactaaa 31029865  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     | ||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  31029866 acaatactatttaaatggttaagggaccaaaaatgcaattta 31029907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Original strand, 1158837 - 1158965
Alignment:
Q  5 aacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| | | |  |||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  1158837 aacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtataacggagataa-ttaagggaccaaaataaatcaaattt-aattaagggaccaaagcga 1158934  T
Q  105 tactacctaaatagttaaggtaccaaaaatg 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1158935 tactacttaaatagttaaggtaccaaaaatg 1158965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 2949435 - 2949294
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| | |     ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2949435 acctaacgtttttgaattaaaactactggaaaggaccaaaatgtgtaaca-----aagttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 2949341  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    | |||||||| ||||||||||| | || ||||||| |||||| ||||    
T  2949340 gtgatactacttaaatagttaacggacaaaaaatgcaatttagccta 2949294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 133
Target Start/End: Original strand, 2814560 - 2814685
Alignment:
Q  8 gtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatac 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| | ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  2814560 gtttttgaattaaaactaacggaaagaatcaaaatgtgtaacagagagaagttaagaaaccaaaataaatcaaattttaattaaagaaccaaagcgatac 2814659  T
Q  108 tacctaaatagttaaggtaccaaaaa 133  Q
    ||  ||||||||||||  ||||||||    
T  2814660 taattaaatagttaagagaccaaaaa 2814685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 3338719 - 3338850
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3338719 acctaaccttttcgaattaaaactaac-gaaag-accaaaatgtgtaacagatagaagttaaagaaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaa 3338816  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
     ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  3338817 acgatactacttaaatagttaagggaccaaaaat 3338850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 13155983 - 13155842
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||| |||| |  |||||| ||| |  || |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13155983 acctaacgaatttgaattaaaacaaacggaaatggtcaaaatgtgtaacggaaagaagttaagcgactaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 13155884  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  13155883 acgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatataattta 13155842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 13160839 - 13160698
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||| |||| |  |||||| ||| |  || |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13160839 acctaacgaatttgaattaaaacaaacggaaatggtcaaaatgtgtaacggaaagaagttaagcgactaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 13160740  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  13160739 acgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatataattta 13160698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 2315719 - 2315592
Alignment:
Q  5 aacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtga-tagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  2315719 aacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaaggagaga-aagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagcgaccaaagcg 2315621  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaa 132  Q
    ||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  2315620 atactaattaaatagttaagaaaccaaaa 2315592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 100
Target Start/End: Original strand, 33972452 - 33972547
Alignment:
Q  5 aacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  33972452 aacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaa 33972547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11524793 - 11524716
Alignment:
Q  57 agttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  11524793 agttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaat 11524716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 2949533 - 2949632
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  2949533 acctaacgttgttgaattaaaactaaccataaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 2949632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31754345 - 31754206
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||    
T  31754345 taacgtttttgaattaaaactaatggaaaggtccaaaataagtaacggagagaagttaagagattaaaataaatagaattttaattaagagaccaaaacg 31754246  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaa 143  Q
    || |||  |||  |||||||| || |||||| ||||||||    
T  31754245 attctatataatcagttaaggaacaaaaaatataatttaa 31754206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Original strand, 29999653 - 29999767
Alignment:
Q  9 tttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatact 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||    
T  29999653 tttttgaattaaaagtaacagaaaggactaaaatgtgtaacagatagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattacgggactaaagcgatact 29999752  T
Q  109 acctaaatagttaag 123  Q
    |  ||||||||||||    
T  29999753 aattaaatagttaag 29999767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 24548383 - 24548244
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaag 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||| ||||||  | ||||||||||| |||||||| ||| |  | ||||    
T  24548383 ctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaactaaggctcaaaag 24548285  T
Q  102 cgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24548284 cgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 24548244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 35132843 - 35132982
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |  |||||||||||||||| |||||||           |||||| ||||||||    
T  35132843 acctaacgtttttgaattaaaactaatagaaaggaccaaaatgtataacggagagaagttaagggaccaaaata-----------aattaagggaccaaa 35132931  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattat 151  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||| ||| ||||    
T  35132932 gcggtactacctaaatagttaagggaccgaaaatacaatttagccttttat 35132982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 32283120 - 32283029
Alignment:
Q  51 gagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  32283120 gagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatataattta 32283029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 17544695 - 17544840
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgt---gatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggacc 97  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||   || | |||  | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17544695 acctaatgtttttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatatgtaacgataga---aaatcaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 17544791  T
Q  98 aaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||| |||| || | ||||||||| || | |||||||| |||||||||||    
T  17544792 aaagtgatattagcaaaatagttacggga-caaaaatgcaatttaaccta 17544840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 59 - 134
Target Start/End: Original strand, 33548158 - 33548232
Alignment:
Q  59 ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  33548158 ttaagagatcaaaataa-tcaaattttaattaaggggccaaagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaat 33548232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 33329448 - 33329509
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaa 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | |||||||||||||    
T  33329448 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgcaacagagagaagttaa 33329509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17544529 - 17544454
Alignment:
Q  69 aaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  17544529 aaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaagcgatattagcaaaatagttaaggga-caaaaatgcaatttaacc 17544454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 33972344 - 33972260
Alignment:
Q  5 aacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaaggg-atcaaaataaatcgaattttaat 88  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  33972344 aacgtttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagagaaattatgggaaaaaaaataaatcgaattttaat 33972260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Original strand, 17245624 - 17245707
Alignment:
Q  59 ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  |||||||| ||||||||  |||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  17245624 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaataattaagggaccaaaaatgcaattta 17245707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 33971993 - 33971927
Alignment:
Q  80 aattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    |||||||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  33971993 aattttaattaagggataaaaacaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacct 33971927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Original strand, 6229687 - 6229769
Alignment:
Q  59 ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  6229687 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagttag-ggaccaaaccgatactaattaaatagttaagggaccaaaaaggcaattta 6229769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 7162440 - 7162399
Alignment:
Q  68 caaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatacta 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7162440 caaaataaatcaaattttaattaagggactaaagcgatacta 7162399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 29999557 - 29999512
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgt 46  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  29999557 acctaacgttttttaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatatgt 29999512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Original strand, 17971840 - 17971884
Alignment:
Q  80 aattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaagg 124  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17971840 aatttgaattaagggaccaaagcgatactactaaaatagttaagg 17971884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Original strand, 29467278 - 29467322
Alignment:
Q  80 aattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaagg 124  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  29467278 aattttaattaaaggaccaaagcaatactaaataaatagttaagg 29467322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 11357 - 11228
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  11357 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggacgaaa 11258  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaa 130  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11257 gcaatactacctaaatagttaagggaccaa 11228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 11456 - 11597
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11456 acctaacgtttttgaattaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaa 11555  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||    
T  11556 gcgatactacctaaatagttaagggataaaaaatgcaattta 11597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Original strand, 40596 - 40735
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40596 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaatgaaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagc 40695  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  40696 aatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 40735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 40493 - 40350
Alignment:
Q  4 taacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |   |||| | |||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  40493 taacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatctgtaacgtagagtaattaagggaccgaaataaatcaaattttaattaagggactaaagcg 40394  T
Q  104 atactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  40393 atactatctaaataattaagggaccaaaaatacaatttagccta 40350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 65883 - 65739
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  65883 acctaacgttttggaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagagaccaaa 65784  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
    || ||| ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||    
T  65783 gcaatattacctaaatagttaagagaccaaaaatgcagtttaacc 65739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 73215 - 73071
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  73215 acctaacgttttggaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagagaccaaa 73116  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
    || ||| ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||    
T  73115 gcaatattacctaaatagttaagagaccaaaaatgcagtttaacc 73071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 65981 - 66122
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | || |||    
T  65981 acctaacatttttgaattaaaactaataaaaaggaccaaaatatgtaacaaagagaagttaagggactaaaataaattgaattttaattaaggaactaaa 66080  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  66081 acgatactacctaaatagttaagcgaccaaaaatgtaattta 66122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 73313 - 73454
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | || |||    
T  73313 acctaacatttttgaattaaaactaataaaaaggaccaaaatatgtaacaaagagaagttaagggactaaaataaattgaattttaattaaggaactaaa 73412  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  73413 acgatactacctaaatagttaagcgaccaaaaatgtaattta 73454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Original strand, 13787 - 13927
Alignment:
Q  5 aacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcga 104  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||| ||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13787 aacgtttttgaattaaaatcaacggaaataaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcga 13886  T
Q  105 tactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacc 145  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||    
T  13887 tactacctaaatagttaggggaccaaaaatacaatttaacc 13927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 13685 - 13545
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  13685 acctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcggattttaactaagggaccaaa 13586  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    || || ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13585 gcaattctaactaaatagttaagg-accaaaaatgcaattta 13545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 177307 - 177453
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |     
T  177307 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaacaaaatgtgtaacatagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggatcgat 177406  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 147  Q
      |||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  177407 ctgataatacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagccta 177453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1436 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold1436
Description:

Target: scaffold1436; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 1617 - 1468
Alignment:
Q  3 ctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  1617 ctaacgtgtttgaattaaaactaacggaaatgaccaaa-tgtgtaacaaagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaatgc 1519  T
Q  103 gatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacctattatat 153  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||| || ||| ||||| ||||    
T  1518 gatactacctaaatagttaagtgacaaaaaatgcaacttagcctataatat 1468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1436; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 1717 - 1815
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1717 acctaacgtttttgaattaaaattaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatggatcaaaataaatcg-attttaattaagggaccaaa 1815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0128 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0128
Description:

Target: scaffold0128; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 45078 - 45219
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||| ||| ||||    
T  45078 acctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccacaataaatcaatttttaattaagggagcaaa 45177  T
Q  101 gcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  45178 gcgataatacctaaatagttaagggactaaaaatgcaattta 45219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0128; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 44971 - 44902
Alignment:
Q  9 tttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatc 78  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||| | | |||||| ||||||||  ||||||||||    
T  44971 ttttttaattaaaactaacagaaaagatcaaaatgtgtaacatagagaaattaagggaagaaaataaatc 44902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 90940 - 90815
Alignment:
Q  10 ttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatacta 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  90940 ttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaagagaaagaagttaagttaccaaaataaatcaaatttcaattaagggacaaaagcgatacta 90841  T
Q  110 cctaaatagttaaggtaccaaaaatg 135  Q
    ||||||||||||||| || |||||||    
T  90840 cctaaatagttaagggactaaaaatg 90815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 91750 - 91845
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggac 96  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||| ||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  91750 acctaatgattttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgcaagagaaagaagttaagttaccaaaataaatcaaattttaattaagggac 91845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 11812 - 11713
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||||||    
T  11812 acctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagtcaagggaccaaa 11713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 11723 - 11642
Alignment:
Q  61 aagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaattta 142  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11723 aagggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaagcgataatacctaaatagttaaggtatcaaaaatgcaattta 11642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 93333 - 93199
Alignment:
Q  2 cctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgat-agagagaa-gttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||    
T  93333 cctaacgtttttgaattaaaactaacgtaaaggaccaaaatgtgtaaacagagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagtgactaa 93234  T
Q  100 agcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaat 134  Q
    | ||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  93233 aacgatactaattaaatagttaagggaccaaaaat 93199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 123
Target Start/End: Original strand, 93524 - 93578
Alignment:
Q  69 aaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaag 123  Q
    |||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  93524 aaaataaatcaaattttagttaagagaccaaagcgatactaattaaatagttaag 93578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 133
Target Start/End: Original strand, 10920 - 10994
Alignment:
Q  59 ttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaa 133  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  10920 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatagttaagggaccaaaaa 10994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 26080 - 26038
Alignment:
Q  1 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaata 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26080 acctaacgtttttgaattaaaactaaaggaaaggaccaaaata 26038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 26044 - 25966
Alignment:
Q  68 caaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaacct 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| ||||||| |  ||||||| || ||||||||||    
T  26044 caaaataaatcgagttttaattaagggatcaaagtgataccaactacatagttaggagaccaaaagtgcaatttaacct 25966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 140
Target Start/End: Original strand, 24535 - 24607
Alignment:
Q  68 caaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatt 140  Q
    ||||||||||| | ||||| |||  |||||||  |||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24535 caaaataaatcaatttttagttagaggaccaatccgataccaactaaatagttagagtaccaaaaatgtaatt 24607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University