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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5178-Insertion-1 (Length: 868)

Name: NF5178-Insertion-1
Description: NF5178
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5178-Insertion-1
NF5178-Insertion-1
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (26-868)||(6676328-6677161)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 660; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 660; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 868
Target Start/End: Original strand, 6676328 - 6677161
Alignment:
Q  26 ctcatgcaccctgctttgataggtgaaatgtgtaatatgaaccaataccaaatttctattctagagttgttctggaagcatattcgtatatataccaata 125  Q
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T  6676328 ctcatgcaccatgctttgataggtgaaatgtgtaatataaaccaataccaaatttcta-----gagttgttctggaagcatattcgtata----ccaata 6676418  T
Q  126 cttgatgttgcggtgataattgtttaatctacgttacacttcagcttgttgatctctgatttcgtccaattgataaatggaatggaacgaatgataccta 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6676419 cttgatgttgcagtgataattgtttaatctacgttacacttcagcttgttgatctctgatttcgtccagttgataaatggaatggaacgaatgataccta 6676518  T
Q  226 gatcatggatatgcacagctgcattactaatacatctaaatatttagcattgagaacacaaatgaatagggagttacgatatgcgacaagctcgcaaccc 325  Q
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T  6676519 gatcatggatatgcacagctgcattactaatacatctaaatatttagctttgagaacacaaatgaatagggagttacgatatgcgacaagctcgcaacct 6676618  T
Q  326 tgtttttccaacg-tagcaacattgaatctccccaatattttgaacattgaaaccttcaagtattttatcccacttaaaccgatttatgcttttaccacc 424  Q
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T  6676619 tgtttttccaatgttagcaacattgaatc-ccccaatattttgaacattgaaacctt-aagtattttatcccacttaaaccgatttatgcttttaccacc 6676716  T
Q  425 attttatttcaatcccagtaatacgaatttagcacgatctgtgataggatctaaatcctaccacaatggaaaaccatgaaaactattggaaactacggtt 524  Q
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T  6676717 attttatttcaatcccagtaaaacgaatttagcacgatctgtgataggatctaaatcctaccacaatggaaaaccatgaaaactattggaaactacggtt 6676816  T
Q  525 gtaagctaaaatgataagagaatagaaactactagaaaataaaatacattttcattcatgttatatcaatttt-gactgaaatcatccctctcaattgtt 623  Q
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T  6676817 ctaagctaaaatgacaagagaatagaaactactagaaaataaaatacattttcattcatgttatatcaattttggactgaaattatctctctaaattgtt 6676916  T
Q  624 tttctttctcttaaataaaagagtgatttgatttccatatattttcagctttctttgatatannnnnnngaattcttcatcttaacatatcgtttttata 723  Q
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T  6676917 tttctttctcttaaataaaagagtgatttgatttccatatattttcagctttctttgatatttttttttgaattcttcgtcttaacaggtcgtttttata 6677016  T
Q  724 taattttatccaagtctcaattttattataatcttcatcattatcatttagtatgaatttttggactgaaatcacttctctcaattgtttttctttctct 823  Q
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T  6677017 taattttatccaagtcttaattttattataatcttcatcattatcatttagtatgaa-ttttggactgaaatcacctctctcaattgtttttctttctct 6677115  T
Q  824 tagttaaaagag-gatttccatatattttcagctttcgttgatatg 868  Q
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T  6677116 tagttaaaagagtgatttccatatattttcagctttctttgatatg 6677161  T

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