View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5189-Insertion-1 (Length: 1043)

Name: NF5189-Insertion-1
Description: NF5189
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5189-Insertion-1
NF5189-Insertion-1
[»] chr4 (86 HSPs)
chr4 (140-1005)||(54349687-54350558)
chr4 (8-163)||(41370349-41370504)
chr4 (8-155)||(25483336-25483483)
chr4 (8-163)||(50630764-50630919)
chr4 (8-163)||(55933133-55933288)
chr4 (8-153)||(36629239-36629384)
chr4 (8-155)||(54017604-54017751)
chr4 (8-153)||(39792869-39793014)
chr4 (8-155)||(52884695-52884843)
chr4 (8-140)||(54108928-54109059)
chr4 (8-145)||(54343017-54343147)
chr4 (8-158)||(50002423-50002573)
chr4 (8-153)||(39404400-39404545)
chr4 (35-163)||(49880152-49880280)
chr4 (8-155)||(1731656-1731803)
chr4 (8-155)||(3340807-3340954)
chr4 (8-155)||(10245920-10246066)
chr4 (14-153)||(34646664-34646803)
chr4 (8-155)||(36608670-36608817)
chr4 (8-153)||(39404020-39404165)
chr4 (8-155)||(22027970-22028117)
chr4 (8-155)||(52884887-52885037)
chr4 (14-155)||(4955332-4955473)
chr4 (8-137)||(18932758-18932887)
chr4 (8-152)||(50459724-50459868)
chr4 (8-155)||(3244460-3244607)
chr4 (8-155)||(32941132-32941279)
chr4 (8-155)||(44620660-44620806)
chr4 (8-155)||(22028378-22028527)
chr4 (8-146)||(44621011-44621149)
chr4 (26-140)||(45496820-45496934)
chr4 (8-156)||(54108537-54108684)
chr4 (8-149)||(20826223-20826364)
chr4 (8-153)||(36572021-36572166)
chr4 (8-146)||(44620362-44620500)
chr4 (8-136)||(54936215-54936342)
chr4 (8-155)||(22183273-22183420)
chr4 (8-155)||(49076840-49076986)
chr4 (10-155)||(2740700-2740843)
chr4 (8-154)||(16888825-16888971)
chr4 (8-154)||(16889545-16889691)
chr4 (32-164)||(6975489-6975621)
chr4 (37-153)||(41707503-41707618)
chr4 (8-152)||(49302907-49303053)
chr4 (9-155)||(4390111-4390257)
chr4 (46-155)||(2741071-2741180)
chr4 (8-149)||(20825842-20825983)
chr4 (9-153)||(19504707-19504842)
chr4 (36-155)||(3341128-3341247)
chr4 (51-155)||(49076501-49076604)
chr4 (8-99)||(23817690-23817781)
chr4 (8-155)||(34004594-34004739)
chr4 (8-153)||(43174508-43174654)
chr4 (37-155)||(54741216-54741334)
chr4 (8-153)||(45489341-45489485)
chr4 (103-163)||(50788087-50788147)
chr4 (37-150)||(760194-760306)
chr4 (18-153)||(40067045-40067181)
chr4 (8-104)||(31691203-31691301)
chr4 (8-155)||(51768069-51768216)
chr4 (47-142)||(54017750-54017845)
chr4 (8-155)||(3700365-3700504)
chr4 (37-155)||(28034229-28034347)
chr4 (89-147)||(44620304-44620362)
chr4 (66-155)||(10246347-10246436)
chr4 (8-115)||(43827480-43827586)
chr4 (89-155)||(44621426-44621492)
chr4 (23-155)||(23556890-23557022)
chr4 (8-109)||(18879852-18879953)
chr4 (89-153)||(44620946-44621011)
chr4 (67-155)||(11348396-11348484)
chr4 (14-113)||(15841383-15841482)
chr4 (37-134)||(48111736-48111833)
chr4 (37-152)||(34544107-34544225)
chr4 (8-75)||(41370738-41370805)
chr4 (8-99)||(3271843-3271936)
chr4 (126-163)||(18932887-18932924)
chr4 (132-164)||(18933103-18933135)
chr4 (107-155)||(45050601-45050649)
chr4 (37-88)||(11197293-11197344)
chr4 (8-63)||(43174233-43174288)
chr4 (8-63)||(45489723-45489778)
chr4 (423-481)||(39907668-39907726)
chr4 (114-155)||(11706636-11706677)
chr4 (8-45)||(19895406-19895443)
chr4 (118-163)||(41370693-41370738)
[»] chr6 (50 HSPs)
chr6 (8-163)||(3409251-3409406)
chr6 (8-163)||(2378118-2378273)
chr6 (8-163)||(29518495-29518650)
chr6 (8-163)||(29518912-29519067)
chr6 (8-163)||(32741171-32741326)
chr6 (8-153)||(2377756-2377901)
chr6 (8-163)||(3409652-3409807)
chr6 (8-163)||(35210196-35210351)
chr6 (8-163)||(14748353-14748504)
chr6 (8-163)||(3058218-3058373)
chr6 (8-155)||(2579883-2580030)
chr6 (8-155)||(10074374-10074521)
chr6 (8-163)||(26544041-26544196)
chr6 (8-149)||(2843560-2843702)
chr6 (8-163)||(3415450-3415607)
chr6 (8-162)||(1846741-1846895)
chr6 (8-153)||(2578454-2578598)
chr6 (8-153)||(16107680-16107825)
chr6 (8-153)||(16454577-16454722)
chr6 (8-163)||(1127352-1127507)
chr6 (8-149)||(16454913-16455054)
chr6 (8-155)||(10073627-10073772)
chr6 (8-150)||(2579503-2579645)
chr6 (8-153)||(5832038-5832182)
chr6 (11-155)||(10074005-10074149)
chr6 (8-152)||(6999807-6999951)
chr6 (8-154)||(2578846-2578991)
chr6 (8-155)||(10911565-10911713)
chr6 (47-150)||(32460630-32460733)
chr6 (31-149)||(9062384-9062501)
chr6 (6-155)||(593716-593867)
chr6 (12-152)||(1950200-1950340)
chr6 (8-153)||(2579120-2579261)
chr6 (8-153)||(16108065-16108198)
chr6 (35-160)||(5958641-5958766)
chr6 (31-155)||(6071132-6071256)
chr6 (36-155)||(8481927-8482045)
chr6 (8-155)||(12092493-12092640)
chr6 (284-477)||(1317162-1317355)
chr6 (9-155)||(12085046-12085191)
chr6 (82-135)||(35210498-35210551)
chr6 (380-493)||(6120293-6120402)
chr6 (8-155)||(12071702-12071849)
chr6 (72-151)||(17135144-17135223)
chr6 (39-140)||(2975567-2975668)
chr6 (335-460)||(4027786-4027914)
chr6 (78-118)||(14789285-14789325)
chr6 (8-92)||(31714732-31714815)
chr6 (8-51)||(3409405-3409448)
chr6 (36-87)||(11637760-11637811)
[»] chr8 (75 HSPs)
chr8 (8-163)||(3669679-3669834)
chr8 (8-153)||(34835211-34835356)
chr8 (8-163)||(3670052-3670207)
chr8 (8-153)||(34834878-34835023)
chr8 (8-163)||(1014256-1014411)
chr8 (8-163)||(30441073-30441232)
chr8 (8-153)||(3038301-3038446)
chr8 (8-155)||(45122068-45122215)
chr8 (17-153)||(33113387-33113523)
chr8 (8-153)||(34835476-34835622)
chr8 (8-153)||(34835742-34835888)
chr8 (18-163)||(20870594-20870741)
chr8 (8-163)||(1013882-1014037)
chr8 (8-155)||(45121921-45122068)
chr8 (16-152)||(147454-147590)
chr8 (8-153)||(25561826-25561972)
chr8 (8-141)||(45122638-45122771)
chr8 (8-155)||(6876873-6877021)
chr8 (8-148)||(9482615-9482755)
chr8 (8-155)||(9309355-9309501)
chr8 (8-155)||(9608745-9608892)
chr8 (8-153)||(30359273-30359418)
chr8 (8-153)||(37544501-37544646)
chr8 (8-153)||(40518584-40518729)
chr8 (8-161)||(40579517-40579670)
chr8 (8-153)||(40518071-40518218)
chr8 (8-163)||(6731896-6732042)
chr8 (13-155)||(41972158-41972303)
chr8 (8-130)||(9483198-9483320)
chr8 (8-145)||(18372005-18372142)
chr8 (8-153)||(30359611-30359756)
chr8 (13-148)||(70290-70425)
chr8 (8-155)||(5915872-5916014)
chr8 (8-153)||(1513926-1514071)
chr8 (8-155)||(5420651-5420798)
chr8 (8-152)||(32640543-32640682)
chr8 (8-155)||(8918775-8918922)
chr8 (8-155)||(45123006-45123153)
chr8 (78-163)||(41416252-41416335)
chr8 (8-148)||(6651510-6651641)
chr8 (83-152)||(18372785-18372854)
chr8 (70-151)||(18373004-18373085)
chr8 (8-153)||(45121667-45121811)
chr8 (8-155)||(4154679-4154824)
chr8 (37-155)||(4154321-4154438)
chr8 (41-161)||(32305478-32305591)
chr8 (83-152)||(18372342-18372411)
chr8 (39-151)||(18380059-18380171)
chr8 (8-155)||(9308977-9309128)
chr8 (8-148)||(18371672-18371807)
chr8 (18-132)||(9609108-9609222)
chr8 (8-155)||(147829-147967)
chr8 (82-145)||(25561729-25561792)
chr8 (42-152)||(43274824-43274934)
chr8 (66-152)||(3037777-3037865)
chr8 (37-153)||(8794113-8794229)
chr8 (8-76)||(40579280-40579348)
chr8 (8-151)||(43398079-43398225)
chr8 (8-155)||(9507777-9507929)
chr8 (60-155)||(9620739-9620834)
chr8 (8-155)||(12283873-12284019)
chr8 (70-153)||(18372676-18372758)
chr8 (258-477)||(5527068-5527290)
chr8 (111-152)||(18372485-18372526)
chr8 (39-155)||(5274775-5274891)
chr8 (319-481)||(13640091-13640252)
chr8 (319-481)||(13740504-13740665)
chr8 (349-475)||(37481438-37481563)
chr8 (8-73)||(8919155-8919220)
chr8 (78-150)||(20130454-20130525)
chr8 (42-152)||(40991756-40991866)
chr8 (103-155)||(20995507-20995559)
chr8 (8-76)||(41129067-41129135)
chr8 (66-119)||(18373239-18373292)
chr8 (78-155)||(33831978-33832055)
[»] chr2 (66 HSPs)
chr2 (8-163)||(36178616-36178771)
chr2 (8-159)||(37105920-37106071)
chr2 (8-165)||(41283486-41283643)
chr2 (8-163)||(14745678-14745833)
chr2 (8-163)||(37106180-37106335)
chr2 (8-163)||(5543009-5543164)
chr2 (8-153)||(6421387-6421532)
chr2 (8-163)||(5542636-5542791)
chr2 (8-153)||(15880265-15880410)
chr2 (8-155)||(962598-962745)
chr2 (8-148)||(15511506-15511646)
chr2 (8-155)||(42514649-42514796)
chr2 (8-153)||(36005891-36006035)
chr2 (8-137)||(36178182-36178311)
chr2 (8-163)||(1769884-1770039)
chr2 (37-155)||(28531354-28531472)
chr2 (8-163)||(14745304-14745460)
chr2 (16-151)||(28254258-28254391)
chr2 (8-139)||(6422126-6422257)
chr2 (8-155)||(35580735-35580881)
chr2 (8-155)||(40679640-40679787)
chr2 (8-150)||(33731653-33731795)
chr2 (8-155)||(38796629-38796778)
chr2 (8-153)||(40733519-40733664)
chr2 (8-153)||(6712978-6713124)
chr2 (48-155)||(16542449-16542556)
chr2 (48-163)||(36178320-36178435)
chr2 (8-163)||(7598601-7598748)
chr2 (67-152)||(31899496-31899581)
chr2 (8-155)||(37632608-37632755)
chr2 (8-144)||(40163383-40163520)
chr2 (8-153)||(40733885-40734029)
chr2 (8-155)||(7598228-7598375)
chr2 (8-155)||(12529039-12529186)
chr2 (47-155)||(31468800-31468904)
chr2 (11-153)||(5367457-5367599)
chr2 (14-155)||(30313178-30313318)
chr2 (78-155)||(38796299-38796376)
chr2 (8-147)||(29676543-29676676)
chr2 (8-142)||(23346250-23346383)
chr2 (8-155)||(29676903-29677055)
chr2 (8-99)||(3673124-3673215)
chr2 (37-155)||(33561491-33561609)
chr2 (101-155)||(36785667-36785721)
chr2 (8-93)||(6421793-6421878)
chr2 (8-155)||(16590888-16591030)
chr2 (38-155)||(30323464-30323581)
chr2 (343-465)||(4037121-4037242)
chr2 (47-155)||(33953821-33953929)
chr2 (43-147)||(37895107-37895211)
chr2 (8-83)||(3672773-3672848)
chr2 (53-139)||(28254168-28254254)
chr2 (39-152)||(31259658-31259774)
chr2 (37-155)||(37894732-37894850)
chr2 (41-153)||(29874067-29874179)
chr2 (23-155)||(29873563-29873695)
chr2 (107-153)||(6421306-6421352)
chr2 (8-93)||(6421688-6421773)
chr2 (10-99)||(36784273-36784362)
chr2 (42-113)||(2336666-2336737)
chr2 (37-152)||(9231252-9231367)
chr2 (119-155)||(3673085-3673121)
chr2 (48-152)||(12910231-12910335)
chr2 (39-154)||(31385738-31385853)
chr2 (93-140)||(42515031-42515078)
chr2 (53-91)||(35580496-35580534)
[»] chr1 (66 HSPs)
chr1 (8-163)||(44290835-44290991)
chr1 (8-163)||(44290469-44290624)
chr1 (8-163)||(3550712-3550864)
chr1 (10-153)||(26661535-26661678)
chr1 (8-155)||(41156991-41157138)
chr1 (8-163)||(41759475-41759630)
chr1 (8-163)||(48588499-48588654)
chr1 (8-155)||(41142372-41142520)
chr1 (8-163)||(3537610-3537765)
chr1 (8-155)||(41157375-41157522)
chr1 (31-161)||(32594750-32594880)
chr1 (8-153)||(37556113-37556258)
chr1 (8-154)||(40082408-40082553)
chr1 (8-155)||(5319976-5320123)
chr1 (8-163)||(50052035-50052189)
chr1 (8-153)||(17294579-17294725)
chr1 (10-155)||(29798199-29798344)
chr1 (8-155)||(34364507-34364654)
chr1 (32-155)||(34364925-34365048)
chr1 (8-163)||(45493985-45494145)
chr1 (8-155)||(31767172-31767319)
chr1 (12-158)||(38804370-38804516)
chr1 (78-163)||(3537228-3537313)
chr1 (20-153)||(26661921-26662054)
chr1 (8-164)||(32168709-32168854)
chr1 (8-153)||(34649440-34649585)
chr1 (8-147)||(14318875-14319014)
chr1 (8-155)||(24600325-24600472)
chr1 (8-155)||(39066211-39066358)
chr1 (37-155)||(22077535-22077653)
chr1 (8-151)||(9955911-9956056)
chr1 (8-153)||(11977282-11977427)
chr1 (8-152)||(37555733-37555876)
chr1 (8-155)||(3875342-3875489)
chr1 (9-155)||(45084382-45084522)
chr1 (66-155)||(41184494-41184583)
chr1 (8-155)||(24131999-24132143)
chr1 (8-155)||(66483-66630)
chr1 (35-163)||(44043810-44043943)
chr1 (8-155)||(37850611-37850758)
chr1 (8-155)||(30630649-30630796)
chr1 (8-145)||(5528765-5528902)
chr1 (66-155)||(44685456-44685546)
chr1 (8-155)||(66100-66247)
chr1 (8-149)||(5575110-5575249)
chr1 (13-154)||(22793279-22793421)
chr1 (8-153)||(45839629-45839778)
chr1 (340-493)||(18651565-18651713)
chr1 (8-155)||(19283466-19283613)
chr1 (8-130)||(22077121-22077243)
chr1 (78-155)||(21378122-21378199)
chr1 (39-155)||(22077871-22077986)
chr1 (37-155)||(1188628-1188746)
chr1 (123-164)||(50051777-50051818)
chr1 (108-155)||(35154150-35154197)
chr1 (37-155)||(1187404-1187522)
chr1 (54-128)||(4956218-4956292)
chr1 (37-113)||(10351202-10351278)
chr1 (103-155)||(50469187-50469239)
chr1 (104-155)||(4878803-4878854)
chr1 (8-73)||(11977026-11977091)
chr1 (123-155)||(22077248-22077280)
chr1 (103-155)||(47379891-47379943)
chr1 (90-165)||(4266875-4266950)
chr1 (385-478)||(472040-472131)
chr1 (47-84)||(47380217-47380254)
[»] chr3 (71 HSPs)
chr3 (8-163)||(22304561-22304716)
chr3 (8-153)||(37990650-37990795)
chr3 (8-153)||(43346802-43346947)
chr3 (8-163)||(39934966-39935123)
chr3 (8-153)||(37990988-37991133)
chr3 (8-155)||(15772854-15773001)
chr3 (8-153)||(35946524-35946669)
chr3 (14-163)||(4823647-4823796)
chr3 (8-155)||(12114573-12114720)
chr3 (8-155)||(29644913-29645060)
chr3 (8-155)||(32589704-32589850)
chr3 (8-155)||(33803263-33803410)
chr3 (8-163)||(39389062-39389217)
chr3 (8-155)||(54017827-54017974)
chr3 (8-155)||(54018209-54018356)
chr3 (8-155)||(15773192-15773341)
chr3 (8-155)||(21832356-21832501)
chr3 (8-153)||(22303966-22304104)
chr3 (8-155)||(25739436-25739583)
chr3 (8-155)||(29644592-29644739)
chr3 (8-155)||(42342399-42342546)
chr3 (8-153)||(32462911-32463057)
chr3 (8-155)||(41359776-41359919)
chr3 (11-163)||(50612461-50612618)
chr3 (8-153)||(52634678-52634822)
chr3 (8-155)||(42342101-42342248)
chr3 (8-155)||(39914252-39914399)
chr3 (8-153)||(25755396-25755541)
chr3 (10-155)||(31190017-31190154)
chr3 (8-155)||(45395664-45395811)
chr3 (12-155)||(53577364-53577507)
chr3 (36-153)||(45901715-45901833)
chr3 (31-148)||(3135107-3135224)
chr3 (71-164)||(51886552-51886645)
chr3 (37-155)||(8327904-8328022)
chr3 (8-154)||(53117986-53118131)
chr3 (36-153)||(49336726-49336843)
chr3 (8-155)||(1634326-1634473)
chr3 (101-163)||(22304238-22304300)
chr3 (8-153)||(32462569-32462715)
chr3 (82-164)||(37726495-37726577)
chr3 (8-153)||(3135465-3135617)
chr3 (48-163)||(3384317-3384432)
chr3 (8-155)||(9240149-9240296)
chr3 (31-129)||(33362327-33362425)
chr3 (39-145)||(42584864-42584970)
chr3 (340-477)||(5531150-5531286)
chr3 (8-152)||(11661954-11662098)
chr3 (12-153)||(33175674-33175820)
chr3 (8-102)||(22303670-22303764)
chr3 (101-155)||(43346650-43346704)
chr3 (88-153)||(11661537-11661602)
chr3 (338-473)||(25071005-25071141)
chr3 (8-155)||(44160558-44160702)
chr3 (23-155)||(47964544-47964676)
chr3 (66-152)||(7767383-7767469)
chr3 (66-155)||(39336298-39336387)
chr3 (45-105)||(52634990-52635050)
chr3 (37-155)||(47964955-47965073)
chr3 (31-113)||(39336004-39336086)
chr3 (47-152)||(46546375-46546480)
chr3 (8-85)||(54017559-54017636)
chr3 (123-155)||(12747878-12747910)
chr3 (8-51)||(8328374-8328417)
chr3 (8-63)||(41359502-41359557)
chr3 (37-88)||(53596542-53596593)
chr3 (8-46)||(22304302-22304340)
chr3 (37-79)||(48127642-48127684)
chr3 (43-88)||(16143505-16143550)
chr3 (527-588)||(25070911-25070972)
chr3 (23-152)||(25317161-25317290)
[»] chr5 (61 HSPs)
chr5 (8-164)||(6500442-6500597)
chr5 (8-163)||(27502047-27502202)
chr5 (8-163)||(32487386-32487540)
chr5 (8-155)||(40296326-40296473)
chr5 (8-163)||(18603131-18603286)
chr5 (8-158)||(36492228-36492378)
chr5 (12-162)||(41170627-41170777)
chr5 (8-163)||(6500815-6500969)
chr5 (11-155)||(13415774-13415918)
chr5 (35-163)||(9498692-9498820)
chr5 (8-163)||(624188-624343)
chr5 (8-155)||(3295026-3295172)
chr5 (8-155)||(15370099-15370246)
chr5 (8-152)||(3295356-3295498)
chr5 (8-155)||(26074157-26074304)
chr5 (8-155)||(41632782-41632929)
chr5 (8-154)||(299490-299636)
chr5 (8-153)||(26074614-26074759)
chr5 (8-152)||(25327938-25328082)
chr5 (13-153)||(6224198-6224338)
chr5 (8-148)||(11416988-11417128)
chr5 (8-155)||(12662663-12662810)
chr5 (8-143)||(33747783-33747918)
chr5 (8-153)||(26075172-26075318)
chr5 (8-153)||(42405609-42405752)
chr5 (8-145)||(34753036-34753173)
chr5 (8-163)||(623810-623965)
chr5 (8-155)||(36568580-36568725)
chr5 (8-155)||(35150007-35150153)
chr5 (17-163)||(5723811-5723957)
chr5 (20-158)||(29549278-29549416)
chr5 (8-153)||(1028528-1028673)
chr5 (8-153)||(24489217-24489360)
chr5 (8-129)||(15370428-15370549)
chr5 (34-153)||(26074818-26074938)
chr5 (80-163)||(7768842-7768925)
chr5 (8-155)||(26590921-26591068)
chr5 (11-153)||(300961-301095)
chr5 (10-152)||(2411010-2411152)
chr5 (8-150)||(38427553-38427694)
chr5 (32-152)||(35914852-35914972)
chr5 (78-153)||(26074320-26074395)
chr5 (66-153)||(42508614-42508701)
chr5 (8-153)||(35167849-35167994)
chr5 (68-155)||(31509623-31509710)
chr5 (18-152)||(41635212-41635346)
chr5 (47-154)||(36521946-36522053)
chr5 (85-153)||(39309686-39309754)
chr5 (115-166)||(5660287-5660338)
chr5 (37-152)||(36522277-36522392)
chr5 (6-64)||(38427310-38427368)
chr5 (8-63)||(26900028-26900083)
chr5 (31-141)||(31509745-31509856)
chr5 (19-98)||(36527117-36527196)
chr5 (113-155)||(35150747-35150789)
chr5 (113-155)||(35151038-35151080)
chr5 (95-152)||(6225047-6225104)
chr5 (37-88)||(13042606-13042657)
chr5 (31-118)||(19275566-19275652)
chr5 (106-163)||(22298956-22299014)
chr5 (79-153)||(42524719-42524792)
[»] chr7 (59 HSPs)
chr7 (8-155)||(1085627-1085774)
chr7 (8-163)||(37533022-37533176)
chr7 (8-155)||(7517580-7517727)
chr7 (10-155)||(23390-23535)
chr7 (8-161)||(29157559-29157712)
chr7 (8-153)||(30244272-30244417)
chr7 (8-153)||(45433243-45433388)
chr7 (8-148)||(11845198-11845338)
chr7 (8-164)||(37533375-37533531)
chr7 (8-155)||(22567050-22567196)
chr7 (8-153)||(6054562-6054707)
chr7 (26-155)||(7554025-7554154)
chr7 (8-153)||(45434638-45434783)
chr7 (8-153)||(45754718-45754862)
chr7 (8-153)||(30245079-30245220)
chr7 (8-147)||(19122740-19122878)
chr7 (8-155)||(36939744-36939891)
chr7 (8-155)||(40094785-40094932)
chr7 (11-155)||(24177435-24177579)
chr7 (38-163)||(14681502-14681627)
chr7 (36-155)||(22566702-22566820)
chr7 (8-149)||(34218045-34218186)
chr7 (31-155)||(1085282-1085407)
chr7 (8-153)||(47129097-47129242)
chr7 (12-152)||(9901648-9901786)
chr7 (35-155)||(16569196-16569316)
chr7 (35-155)||(16596346-16596466)
chr7 (8-155)||(8128452-8128599)
chr7 (16-155)||(118318-118459)
chr7 (19-155)||(36622960-36623096)
chr7 (8-152)||(20599317-20599463)
chr7 (8-150)||(30032572-30032714)
chr7 (20-152)||(24838724-24838857)
chr7 (34-155)||(40230328-40230449)
chr7 (34-155)||(43241495-43241616)
chr7 (67-155)||(28301613-28301701)
chr7 (60-152)||(41910657-41910749)
chr7 (8-134)||(37167808-37167928)
chr7 (82-155)||(30245494-30245567)
chr7 (82-155)||(30255339-30255412)
chr7 (38-155)||(36534825-36534942)
chr7 (8-113)||(30253534-30253635)
chr7 (8-155)||(41854635-41854781)
chr7 (85-155)||(30244701-30244771)
chr7 (87-155)||(36109007-36109075)
chr7 (8-109)||(28300264-28300366)
chr7 (337-464)||(18485180-18485303)
chr7 (8-74)||(47129450-47129516)
chr7 (118-161)||(14681281-14681324)
chr7 (8-59)||(28300579-28300630)
chr7 (413-479)||(26012245-26012310)
chr7 (105-155)||(40094502-40094552)
chr7 (10-72)||(45755010-45755072)
chr7 (78-150)||(44361545-44361616)
chr7 (8-63)||(37532762-37532817)
chr7 (8-87)||(40094424-40094503)
chr7 (103-153)||(36967335-36967385)
chr7 (37-88)||(21416181-21416232)
chr7 (37-99)||(4124128-4124190)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (8-153)||(525-670)
scaffold0702 (8-163)||(158-308)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (8-155)||(5396-5544)
scaffold0734 (20-155)||(5777-5917)
[»] scaffold0391 (3 HSPs)
scaffold0391 (8-153)||(1117-1262)
scaffold0391 (37-108)||(1731-1802)
scaffold0391 (104-155)||(3092-3143)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (35-155)||(5357-5477)
scaffold0078 (8-155)||(4982-5129)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (8-155)||(47360-47507)
[»] scaffold1482 (1 HSPs)
scaffold1482 (337-478)||(1610-1750)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (39-155)||(17496-17614)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (78-153)||(10192-10267)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (31-153)||(39840-39962)
scaffold0113 (23-153)||(39459-39588)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 714; Significance: 0; HSPs: 86)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 714; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 140 - 1005
Target Start/End: Original strand, 54349687 - 54350558
Alignment:
Q  140 ataactcacacttgcaaaccaacatagagaagcttcggtttacaacttggatttataatcgtatataaaagttgagtattgttcagaacaagcagataat 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54349687 ataactcacacttgcaa-ccaacatagagaagcttcggtttacaacttggatttataatcgtatataaaagttgagtattgttcagaacaagcagagaat 54349785  T
Q  240 ttacctggaaattgtaaggatactcatcgtggtggtggaccgatgaaggaagtgctccggtcgtcgatgacggtactttgaggatatcgtggttgccacc 339  Q
    |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54349786 ttacctggaaagggtaaggatactcacagtggtggtggaccgatgaaggaggtgctccggtcgttgatgacggtactttgaggatatcgtgattgccacc 54349885  T
Q  340 ccgttgaggagaaggggatgttgtacatgcaggtgctccaacgctcaagtcagtgtatgatcaagagtgagagtgaagcatagagagatacatacattat 439  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  54349886 ccgttgaagagaaggggatgttgtacatgcaggtgctccaacgctcaagtcagtgtatgatcaagagtgagagtgaagcataaagagatacatatattat 54349985  T
Q  440 gagcttgtcaagagctctttatatagggtcgaggagaccgttgtttagtcatggggcggccgtgatgaaaggtgtccattatgactgagattgaatgaac 539  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54349986 gagcttgtcaacagctctttatatagagtcgaggagaccgttgtatagtcatggggcggccgtgatgaaaggtgtccattatgactgagattgaatgagc 54350085  T
Q  540 gttaccaaccattggtagcagttatagactattattggtaggagaggattcaatactaagggttggctctgcttgttgggaatttgagtaattggaccct 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54350086 gttaccaaccattggtagcagttatagactattattggtaggagaggattcaatactaagggttggctttgcttgttgggaatttgagtaattggaccct 54350185  T
Q  640 aatttatggtggactcggtctttgcctagtccaaaacaagtataacatttagataataaatgaggtaggtatacgagatttttaaaaaacaaatatacta 739  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54350186 aatttatggtggactcggttttcgcctagtccaaaacaggtataatatttaggtaataaatgaggtaggtatacgagatttttaaaaaacaaatatacta 54350285  T
Q  740 ctgaataacaattgaaatttgtctggtcaattttgcatttttatttgctcgttaatttactagcagtcaaagagatgtaatggaawtttgttcacaataa 839  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54350286 ctgaataacaattgaaatttgtctggtcaattttgcatttttatttgttcgttaatttactagcagtcaaagagatgtaatggaa-tttgttcacaataa 54350384  T
Q  840 taataactc--tgtgagactaaacccaa--gtatatgtatgaaacagtcggtgtaaagaacaaaaatatgagctgaaacgagagatacgtgacatgactt 935  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54350385 taataactctttgtgagactaaacccaagtgtatatgtatgaaacagtcggtgtaaagaacaaaaatatgagctgaaacgagagatacgtgacatgactt 54350484  T
Q  936 gtcggcgttagtgcatgtgg-kgtggtgaccatctcacag-aaaaccac-acac-aggtcgcatgtgccaacgt 1005  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  54350485 gtcggcgttagtgcatgtggtggtggtgaccatctcacagaaaaaccacaacacaaggtcgcatgtgccaacgt 54350558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 41370504 - 41370349
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  41370504 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacactacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtttt 41370405  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370404 caacatttactattttatccgatttgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 41370349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 25483483 - 25483336
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  25483483 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataagatgtt 25483384  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25483383 caacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 25483336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 50630764 - 50630919
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  50630764 acatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataatgtgtt 50630863  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50630864 caacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacgcttgcaaaccaaca 50630919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 55933133 - 55933288
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55933133 acatcgaggctagaacaactgtacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 55933232  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55933233 caacccttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcaaaccaaca 55933288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 36629384 - 36629239
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36629384 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 36629285  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
     ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36629284 taacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 36629239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 54017604 - 54017751
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  54017604 acatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacatcacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatgtt 54017703  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  54017704 caacctttactattttatctgacgtgggacatataactcacacttgca 54017751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 39792869 - 39793014
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||    
T  39792869 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttacggttcctctttcttataaggtgtt 39792968  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39792969 caacatttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 39793014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 52884843 - 52884695
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttaccc-aaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgt 106  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||    
T  52884843 acatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatcgatcatcttacttataaggtgt 52884744  T
Q  107 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52884743 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 52884695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 54109059 - 54108928
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54109059 acatcgaagctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaactt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 54108961  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacata 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54108960 caacctttactattttatccgatgtgggacata 54108928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 145
Target Start/End: Original strand, 54343017 - 54343147
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||       |||||||||||||||| |||||||    
T  54343017 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg-------gggtcctcttacttataaggtgtt 54343109  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataact 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54343110 caacctttactattttatccgatgtgggacatataact 54343147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 50002573 - 50002423
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||  ||||||||||||||||||||  | |||||    
T  50002573 acatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttacttaaaaagtgtt 50002474  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 158  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50002473 caacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaac 50002423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 39404545 - 39404400
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39404545 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacattcttgcccaaaaccttaaggctataggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 39404446  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39404445 ccacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 39404400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 49880280 - 49880152
Alignment:
Q  35 caagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 134  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  49880280 caagagagacaccacgctcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtgg 49880181  T
Q  135 gacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49880180 gacatataactcacacttgcaaaccaaca 49880152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 1731656 - 1731803
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  1731656 acattgaggctagaacaaccacacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttatttataagatgtt 1731755  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1731756 caacctttactgttttatctgatgtgggacatataactcacatttgca 1731803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3340954 - 3340807
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  3340954 acatcgaggctagaacaaccccacaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgct 3340855  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3340854 caacctttactctttcatctgatgcgggacatataactcacacttgca 3340807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10246066 - 10245920
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||  || |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  10246066 acatcgaggctagaacaaccagacaagcaagggagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctttgggtttatgg-tcctcttacttataaggtgtt 10245968  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10245967 caacctttactcttttatccgatgtggggcatataactcacacttgca 10245920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 153
Target Start/End: Original strand, 34646664 - 34646803
Alignment:
Q  14 aggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacct 113  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  34646664 aggctagaacaaccacacagaccagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttagttataaggtgttcaacat 34646763  T
Q  114 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34646764 ttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 34646803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 36608670 - 36608817
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36608670 acatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatggatcctcttacttatgaggtgtt 36608769  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36608770 caacttttactcttttatccgatgttggacatataactcacacttgca 36608817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 39404165 - 39404020
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  39404165 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaatgctatgagtttatgagtcctcttacttataaagtgtt 39404066  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  39404065 caacctttactcttttattcaatgtaggacatataactcacacttg 39404020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 22027970 - 22028117
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22027970 acatcgagactaaaacaaccacataagcgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatatgtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 22028069  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22028070 caacctttcgtattttatccgatgtgggacatataagtcacacttgca 22028117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 52885037 - 52884887
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagaga--caccacacccttaccc-aaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggt 104  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||  |||||||  ||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  52885037 acatcgaggctagatcaaccacacaaataagagagagacaccacattcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggt 52884938  T
Q  105 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52884937 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 52884887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 4955332 - 4955473
Alignment:
Q  14 aggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacct 113  Q
    |||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4955332 aggctagagcaaccgcacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacct 4955431  T
Q  114 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4955432 taactattttatccgatatgagacatataactcacacttgca 4955473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 18932758 - 18932887
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  18932758 acatcgaggctataacaaccactcaagtaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttatttataaggtatt 18932857  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggac 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18932858 caacctttactattttatccgatgtaggac 18932887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 50459868 - 50459724
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||  |||||  |||| ||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  50459868 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacgctcttacctaaaaccttaagataatgggtttatgagtcctcttacttataagatgtt 50459769  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 152  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  50459768 caacctttactcttttaaccgatgtggaacatataactcacactt 50459724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 3244460 - 3244607
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||  ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  3244460 acatcgaggctggaacaaccatacaagtgagagagacgacacattcttacccaaaactttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgtt 3244559  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3244560 caacctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgca 3244607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 32941132 - 32941279
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  32941132 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagccctcttatttataaggtgtt 32941231  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| || | ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32941232 caacctttactgttctttccgatgtaagacatataactcacacttgca 32941279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 44620806 - 44620660
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||| || ||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  44620806 acatcgaggatataacaaccgcacaagcaagagagaaaccacactcttacccaaaaccttaaggttatg-gtttatgggtcctcttacttataaagtgtt 44620708  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620707 caacctctactatttcatccgatgtgggacatataactcacacttgca 44620660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 22028378 - 22028527
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22028378 acattgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgagtttatgggtcctcttactaataaggtgtt 22028477  T
Q  108 caaccttta--ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||   | ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  22028478 caacctttatttttttttatccgatgtaggacatataagtaacacttgca 22028527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 44621149 - 44621011
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  44621149 acatcgaggctagaataaccgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgtgccctcttacttataaggtgtt 44621050  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 146  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  44621049 caacctttactgttttatccgatgtgggtcatacaactc 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 45496934 - 45496820
Alignment:
Q  26 ccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttat 125  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  45496934 ccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacgattttat 45496835  T
Q  126 ccgatgtgggacata 140  Q
    |||||||||||||||    
T  45496834 ccgatgtgggacata 45496820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 54108684 - 54108537
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagttt-atgggtcctcttacttatgaggtgt 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  54108684 acattgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttagccaaaaccttaaggcaatgaattttatgggtccttttacttataaggtgt 54108585  T
Q  107 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaa 156  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||    
T  54108584 tcaacctttactattttatcctatatgggac--ataactcacacttgcaa 54108537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 20826364 - 20826223
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||| | |  ||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| | |||||    
T  20826364 acatcgaggctagaacaatcgcataaggaagagagacatcacactcttacctaaaatgttaaggctatgggtttatgggttctcttacttataacgtgtt 20826265  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 149  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20826264 caacttttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 20826223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 36572166 - 36572021
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||| || || ||||||||  |||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  36572166 acatcgaggcttgaacaaccgcacaagcgagagagacaccatactctaacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcttcttacttataaggtgtt 36572067  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36572066 caacatttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttg 36572021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 44620500 - 44620362
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||  |||||| |||| |||||||    
T  44620500 acatcaaggttagaacaaccacacaagcaagagaaacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggctctcttatttataaggtgtt 44620401  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 146  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  44620400 caacctttactgttttatccgatgtggaacatataactc 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 54936342 - 54936215
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  54936342 acatcgaggctagaacaaccacata-gtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgtt 54936244  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtggga 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54936243 caacctttactattttatctgatgtggga 54936215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 22183273 - 22183420
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||  |||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  ||||    
T  22183273 acatcgaggctagaacaaccgtacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttacttataaattgtt 22183372  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22183373 caacatttactcttttatccgatgtgggatatataactcacacttgca 22183420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 49076840 - 49076986
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || ||||||||  ||||||  ||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  49076840 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaaagacaccacactctaacccaaaaccttaaggttatgggtttatgggttctcttac-tataaggtgtt 49076938  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||    
T  49076939 caacctttactattttagccaatatggaacatataactcacacttgca 49076986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 2740843 - 2740700
Alignment:
Q  10 atcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttca 109  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  |||||||| |||||| |||||  ||||  |||||||  || |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  2740843 atcgaggctagaacaaccac--aagtgagagagacgccacactcttacgtaaaaccttaaggctctgggtttataggtcctcttacttataaggtgttca 2740746  T
Q  110 acctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2740745 acctttactgttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 2740700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 154
Target Start/End: Original strand, 16888825 - 16888971
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||  ||||||||| | | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||    
T  16888825 acatcgaaactagaacaatcgcacaaacaagagagacatcacactcttacccaaaaccgtaagacaatgagtttataggttctcttacttataaggtatt 16888924  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 154  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16888925 caacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgc 16888971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 154
Target Start/End: Original strand, 16889545 - 16889691
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |  |||||||  ||||||||||||| |||| ||    
T  16889545 acatcgaggttagaacaatcacacaaggaagagagacaccatactcttacccaaaactttaaggcagtaggtttatgaatcctcttacttataaggtatt 16889644  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 154  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16889645 caacctttacttttctatccgatttgagacatataactcacacttgc 16889691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 164
Target Start/End: Original strand, 6975489 - 6975621
Alignment:
Q  32 aagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatg 131  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||  ||||  |||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6975489 aagcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaagataatggatttatgagtcctcttacttataagatattcaacctttactattttatcggatg 6975588  T
Q  132 tgggacatataactcacacttgcaaaccaacat 164  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6975589 tgagacatataactcacatttgcaaactaacat 6975621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 153
Target Start/End: Original strand, 41707503 - 41707618
Alignment:
Q  37 agagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 136  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41707503 agagagacaccacactcttacc-aaaaccttaagacaatgagtttatgggttcttttacttatatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggga 41707601  T
Q  137 catataactcacacttg 153  Q
    |||||||||||||||||    
T  41707602 catataactcacacttg 41707618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 49303053 - 49302907
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttac--ttatgaggtg 105  Q
    ||||||||| |||||||| | |  ||| |||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| || ||    
T  49303053 acatcgaggatagaacaatcgcataagtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttttataagatg 49302954  T
Q  106 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 152  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  49302953 ttcaacctttacttttttatttgatgtgggacatataactcacactt 49302907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 155
Target Start/End: Original strand, 4390111 - 4390257
Alignment:
Q  9 catcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttc 108  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  ||||| |||||||||||  |||| |||||| | | | || ||||||||||||| ||||||||    
T  4390111 catcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaacgcaatgtgctaaaggatcctcttacttataaggtgttc 4390210  T
Q  109 aacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  4390211 aacctttactcttttatctgatgtgggatatgtaactcacacttgca 4390257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 2741180 - 2741071
Alignment:
Q  46 ccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 145  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2741180 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggagttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattctatctgatgtgggacatataact 2741081  T
Q  146 cacacttgca 155  Q
    ||||||||||    
T  2741080 cacacttgca 2741071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 20825983 - 20825842
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||| |||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| |   |||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  20825983 acatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaaggtttatgggtgctcttatttataaggtgtt 20825884  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20825883 caacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcaca 20825842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 19504842 - 19504707
Alignment:
Q  9 catcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttc 108  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||         ||||||    
T  19504842 catcgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaatagatttatgggtcctctt---------gtgttc 19504752  T
Q  109 aacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19504751 aacttttactattttatccgatatgggacatataactcatacttg 19504707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3341247 - 3341128
Alignment:
Q  36 aagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 135  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  3341247 aagaaagacatcacactcttacccaaaatcttaaaacaatgatgttatgggtcctcttacttataaagtgtttaacctttactcttttatccaatgtggg 3341148  T
Q  136 acatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3341147 acatataactcacacttgca 3341128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 155
Target Start/End: Original strand, 49076501 - 49076604
Alignment:
Q  51 cccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 150  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  49076501 cccttacccaaacttt-aagacaatgggtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatatggtacatataactcacac 49076599  T
Q  151 ttgca 155  Q
    |||||    
T  49076600 ttgca 49076604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 99
Target Start/End: Original strand, 23817690 - 23817781
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttat 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23817690 acatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgaatcctcttacttat 23817781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 34004594 - 34004739
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||  ||||| |||| | ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  34004594 acatcgaggctagaacaaccgcacaagggagagagacggcacactcttatcgaaaaccttaagg-aatgagtttatgggtcctcttacttataagttgtt 34004692  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34004693 caacctttagt-ttttatcatatgtgtgacatataactcacacttgca 34004739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 43174654 - 43174508
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||| |||||| ||||||||   || |||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||  ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  43174654 acatcaaggctacaacaaccatataaacaagagagacgccacactcttacccaacactttaaggtcataggtttatgtgtcctcttacttataaggtgtt 43174555  T
Q  108 caacctttact-attttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  43174554 caacctttactctttttatctgatgtgtggcatataactcacacttg 43174508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 155
Target Start/End: Original strand, 54741216 - 54741334
Alignment:
Q  37 agagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 136  Q
    ||||||| || |||| |||| ||||||  ||||| ||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  54741216 agagagagactacactcttatccaaaaccttaagacaatctgtgtatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgaga 54741315  T
Q  137 catataactcacacttgca 155  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  54741316 catataattcacacttgca 54741334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 45489341 - 45489485
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| ||||  || |  ||||| | || |||||||||||  ||||||    
T  45489341 acatcgaggctagaacaatcacactagcaaaagagacatcacactcttaccaaaaatcttaaa-cagtaggtttaagagttctcttacttatatggtgtt 45489439  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  45489440 caacctttactcttttatccgatgtgagacatataattcacacttg 45489485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 163
Target Start/End: Original strand, 50788087 - 50788147
Alignment:
Q  103 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50788087 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataacttacacttgcaaaccaaca 50788147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 760306 - 760194
Alignment:
Q  37 agagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 136  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  |||||||| | | || ||| ||||||||||    
T  760306 agagagacaccacacttttacc-aaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagttctcaaccttcatttttctattcgatgtggga 760208  T
Q  137 catataactcacac 150  Q
    ||||||||||||||    
T  760207 catataactcacac 760194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 40067181 - 40067045
Alignment:
Q  18 tagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaac-cttta 116  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| | ||  | |||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||    
T  40067181 tagaacaaccacataagcaagagagacatcacacttttacccaaaatcttaaggtagtggatctatgtgtcctcttacttataatgtgttcaacttttta 40067082  T
Q  117 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  40067081 cacttttatccgatgtagaacatataactcacacttg 40067045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 31691301 - 31691203
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagaga--gacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggt 104  Q
    |||||||||||||||||| |   |||||||||||  ||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31691301 acatcgaggctagaacaatcgtacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggt 31691203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 51768069 - 51768216
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||| |||||||| | |  ||| |||||||||| |  ||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  51768069 acatcgaggttagaacaatcccataagtaagagagacatcgtacttttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgagtcctcttatttataaggtgtt 51768168  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||| |||||| || ||| |||| | |||||||||||||||| |||||    
T  51768169 caacatttactcttatattcgatataggacatataactcacatttgca 51768216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 54017750 - 54017845
Alignment:
Q  47 cacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 142  Q
    ||||| |||||| ||||  ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  54017750 cacactcttacctaaaaccttaagacaatgggaatatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggatatata 54017845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3700504 - 3700365
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||   ||||||||| || || |||| ||||||  ||||||||||||||        ||| |||||||| |||||||    
T  3700504 acatcgaggcttgaataaccacacaaatgagagagacatcatactcttatccaaaaccttaaggcaatgagt--------ccttttacttataaggtgtt 3700413  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3700412 caacatttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 3700365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28034347 - 28034229
Alignment:
Q  37 agagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 136  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||  |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||  ||| || ||||||||| ||||    
T  28034347 agagagacgccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacctccacttttctatccgatgcggga 28034248  T
Q  137 catataactcacacttgca 155  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  28034247 catataattcacacttgca 28034229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 89 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 44620362 - 44620304
Alignment:
Q  89 ctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 147  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44620362 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcccatgtgggacatataactca 44620304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10246436 - 10246347
Alignment:
Q  66 ttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||    
T  10246436 ttaaggctatgggtttatgggtcctctaacttataagatgttcaacctttactcttttatccgatttgagacatataacagacacttgca 10246347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 43827586 - 43827480
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  43827586 acatcgaggttagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatcc-aaaccttaaggcaatgaatttatgggtcctcttatttataaggagtt 43827488  T
Q  108 caaccttt 115  Q
    ||| ||||    
T  43827487 caatcttt 43827480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 89 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 44621492 - 44621426
Alignment:
Q  89 ctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  44621492 ctcttacttataaggtgtttaacctttactgttttatcccatgttggacatataactcacacttgca 44621426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 155
Target Start/End: Original strand, 23556890 - 23557022
Alignment:
Q  23 caaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattt 122  Q
    ||||||| |||| |||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| |  ||||||||||  ||| ||     
T  23556890 caaccacacaagtaagagagacgtcacactcttatccaaaactttaaggcaatgattttatggattctcttatttataaaatgttcaacctccacttttc 23556989  T
Q  123 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||    
T  23556990 tatccgatgtaaaacatttaactcacacttgca 23557022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 18879953 - 18879852
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||  ||||| |||||||||||  |||||| |||  |||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  18879953 acatcgaagctagaacaaccacacaaccaaaagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttataggtcatcttacttataaggtgtt 18879854  T
Q  108 ca 109  Q
    ||    
T  18879853 ca 18879852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 44621011 - 44620946
Alignment:
Q  89 ctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatg-tgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  44621011 ctcttacttataaggtgttcaacctttacagttttatccgatgttgggacatctaactcacacttg 44620946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 155
Target Start/End: Original strand, 11348396 - 11348484
Alignment:
Q  67 taaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||| |||||| | |||||||||||  ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||    
T  11348396 taaggcaatgaatatatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccactattttatctgatgtagaacatataactcacaattgca 11348484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 113
Target Start/End: Original strand, 15841383 - 15841482
Alignment:
Q  14 aggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacct 113  Q
    |||||||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||  |||||| |||||  | |||||||||||    
T  15841383 aggctagagcaaccacacaagtgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgaatcctctcacttacaaagtgttcaacct 15841482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 134
Target Start/End: Original strand, 48111736 - 48111833
Alignment:
Q  37 agagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 134  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||  |||||| ||||  |||||  ||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  48111736 agagagacaccacactcatacctaaaaccttaaggtaatggatttataagtccttttacttataatgtgttcaacctttactcttttatccgaggtgg 48111833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 34544225 - 34544107
Alignment:
Q  37 agagagacaccacacccttacccaaaatt-ttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 135  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||| |||||||  ||| || ||| ||||||| |    
T  34544225 agagagataccacactcttacccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcatttataaagtgatcaacctccacttttctattcgatgtgag 34544126  T
Q  136 --acatataactcacactt 152  Q
      | |||||||||||||||    
T  34544125 atatatataactcacactt 34544107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 41370805 - 41370738
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaat 75  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||| ||||| ||||||||||    
T  41370805 acatcgaggttagaacaaccactcaagtaagagagacatcacatttttacctaaaatcttaaggcaat 41370738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 3271936 - 3271843
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaa-gagagacac-cacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||  || |||||| || ||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  3271936 acatcgaggctagaacaaccacataataaacgagagagacacacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggttctcttacttat 3271843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 163
Target Start/End: Original strand, 18932887 - 18932924
Alignment:
Q  126 ccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18932887 ccgatgtgggacatataactcagacttgcaaaccaaca 18932924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 164
Target Start/End: Original strand, 18933103 - 18933135
Alignment:
Q  132 tgggacatataactcacacttgcaaaccaacat 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18933103 tgggacatataactcacacttgcaaaccaacat 18933135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 45050649 - 45050601
Alignment:
Q  107 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45050649 tcaacctttactcttttatttgatgtgagacatataactcacacttgca 45050601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 11197344 - 11197293
Alignment:
Q  37 agagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtc 88  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  11197344 agagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 11197293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 43174288 - 43174233
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaa 63  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  43174288 acatcaaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 43174233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 63
Target Start/End: Original strand, 45489723 - 45489778
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaa 63  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  45489723 acatcgagactagaacaaccatgcaagcgagagagacaccacactattacccaaaa 45489778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 423 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 39907726 - 39907668
Alignment:
Q  423 agagatacatacattatgagcttgtcaagagctctttatatagggtcgaggagaccgtt 481  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| || ||||||||||||  ||||||||    
T  39907726 agagatacatacattgtgagtttgtccagagcttttaatatagggtcgacaagaccgtt 39907668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 155
Target Start/End: Original strand, 11706636 - 11706677
Alignment:
Q  114 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11706636 ttacttttttatccgatgtgggacatacaactcacccttgca 11706677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 19895443 - 19895406
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagaca 45  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19895443 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagaca 19895406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 41370738 - 41370693
Alignment:
Q  118 tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41370738 tattttatccgatatgggatatataactcactctttcaaaccaaca 41370693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 128; Significance: 1e-65; HSPs: 50)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3409406 - 3409251
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3409406 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 3409307  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409306 caacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 3409251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 2378273 - 2378118
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2378273 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 2378174  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378173 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 2378118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 29518650 - 29518495
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29518650 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 29518551  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518550 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 29518495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 29519067 - 29518912
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29519067 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 29518968  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518967 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 29518912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 32741326 - 32741171
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32741326 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 32741227  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32741226 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 32741171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 2377901 - 2377756
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2377901 acatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 2377802  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377801 caacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttg 2377756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3409807 - 3409652
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  3409807 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaaataaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatgtt 3409708  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409707 caacttttactattttatctgatgtggtacatataactcacacttgcaaaccaaca 3409652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 35210351 - 35210196
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35210351 acatcgaggctagagcaaccgcacaagcaaaagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggttttatgggtcctcttacttataaggtgtt 35210252  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35210251 caacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 35210196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 14748353 - 14748504
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14748353 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagaga----ccacactcttacccaaaaccttaacgcaatgagtttatgggtcctcttatttataaggtgtt 14748448  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14748449 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaatcaaca 14748504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3058373 - 3058218
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||| |||||| |||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  3058373 acatcgaggttagaaccaccctacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcatacttataaggtgtt 3058274  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3058273 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacacttgcaaaccaaca 3058218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 2579883 - 2580030
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||  || |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  2579883 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggctgtgggtttatgggtcctcttacttataatgtgtt 2579982  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2579983 caacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 2580030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 10074374 - 10074521
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10074374 acatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 10074473  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  10074474 caacctttacttttctatccgatgtgggacctctaactcacacttgca 10074521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 26544196 - 26544041
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||  || |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  26544196 acattgaggctagaacaatcgcacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaaccttaaggcggtgggtttatgggtcctcttacttataacgtgtt 26544097  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26544096 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 26544041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 2843702 - 2843560
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttat-gggtcctcttacttatgaggtgt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  2843702 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggggtcctcttacttataaggtgt 2843603  T
Q  107 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 149  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2843602 tcaacttttattattttatccgatgtgaaacatataactcaca 2843560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3415607 - 3415450
Alignment:
Q  8 acatcgaggctaga--acaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtg 105  Q
    ||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  3415607 acatcgaggctagagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttatatggtg 3415508  T
Q  106 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3415507 ttcaacctttactattttatgtgatgtgggacatataactcacactcgcaaaccaaca 3415450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 1846895 - 1846741
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1846895 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtgctcttacttataaggtgtt 1846796  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaac 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||    
T  1846795 caacctttactattttatccgatgtgagacatagaattcacacttgcaacccaac 1846741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 2578454 - 2578598
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  2578454 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgtt 2578553  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2578554 caacctttactcttttatccg-tgtgggacatataactcacacttg 2578598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16107825 - 16107680
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16107825 acatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgtt 16107726  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
     |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16107725 taacctttacttttttatccgatgtgacacatataactcacacttg 16107680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16454722 - 16454577
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16454722 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 16454623  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16454622 caacttttattcttttatctgatgtgggacacataactcacacttg 16454577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 1127507 - 1127352
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1127507 acatcgaggttagagcaaccacataagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgtt 1127408  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  1127407 caacctttactattttacccgatgtgggatatataactcacagttgcaaaccaaca 1127352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16455054 - 16454913
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16455054 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctattacttataaggtgtt 16454955  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 149  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16454954 caacctttactcttttatctgatgtgggacacataactcaca 16454913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 10073627 - 10073772
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  10073627 acatcgatgctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagccaatgagtttatggatcctcttacttataaggtgtt 10073726  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10073727 caacctttac--ttttctccgatgtgggacatataactaacacttgca 10073772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Original strand, 2579503 - 2579645
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |     
T  2579503 acatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccatacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggccctcttacttataaggtatc 2579602  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 150  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2579603 cgacctttacttttttgtccgatgtgggacatataactcacac 2579645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 5832038 - 5832182
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||   ||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5832038 acatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacacttttacccaaaatcttaagggg-tggctttatgggtcctcttacttataaggtgtt 5832136  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5832137 caacctttactcttttatccaatgtgggacatataacttacacttg 5832182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Original strand, 10074005 - 10074149
Alignment:
Q  11 tcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaa 110  Q
    ||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10074005 tcgaggctagaacaaccaaataagcgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 10074104  T
Q  111 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    | |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10074105 cgtttacttttctatccgatgtgggatatataactcacccttgca 10074149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 152
Target Start/End: Original strand, 6999807 - 6999951
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||||| |||||| |||| ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  6999807 acatcgagactagaacaaccacattagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcagtgagtttatggatcctcttacatataaggtgtt 6999906  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 152  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6999907 caacttttacttttttatccgatgtaggacatataactcacactt 6999951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 154
Target Start/End: Original strand, 2578846 - 2578991
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||    
T  2578846 acatcgaggtcagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgagtttatggatcctcttatttataaggtatt 2578945  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 154  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2578946 caacatttact-ttttatccgatgagggacatataaatcacacttgc 2578991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10911713 - 10911565
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||| ||||||| ||   || |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10911713 acatcgaggcttgaacaacaacattagtaagagagacatcacactcttattcaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgtt 10911614  T
Q  108 caacctttac-tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10911613 caacctttactttttttatctgatgtaggacatataactcacacttgca 10911565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 150
Target Start/End: Original strand, 32460630 - 32460733
Alignment:
Q  47 cacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 146  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32460630 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatacgatgtgggacatataactc 32460729  T
Q  147 acac 150  Q
    ||||    
T  32460730 acac 32460733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 149
Target Start/End: Original strand, 9062384 - 9062501
Alignment:
Q  31 caagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgat 130  Q
    |||| |||||||| |||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  9062384 caagtaagagagataccacacttttacccaaaactt-aagacaatgagtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgat 9062482  T
Q  131 gtgggacatataactcaca 149  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9062483 gtgggacatataactcaca 9062501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 155
Target Start/End: Original strand, 593716 - 593867
Alignment:
Q  6 caacatcgaggctagaacaaccactcaagca--agagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgagg 103  Q
    |||||||||| |||||||||||   |||| |  ||||||| |||||||  ||||||||||  |||||||| |  ||||||| |||||||||||||| |||    
T  593716 caacatcgagcctagaacaaccgtacaagtaagagagagataccacactattacccaaaaccttaaggcagtcggtttatgagtcctcttacttataagg 593815  T
Q  104 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  593816 tgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatacaactcacacttgca 593867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 152
Target Start/End: Original strand, 1950200 - 1950340
Alignment:
Q  12 cgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaac 111  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||  |||||||| |   ||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  1950200 cgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcattagatttatggctcctcttacttgtaaggtgttcaac 1950299  T
Q  112 ctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 152  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1950300 ctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 1950340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 2579120 - 2579261
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||   |||| |  ||| |||||||| ||||    ||||| |||||||    
T  2579120 acatcgaggctagaacaaccacacgagcaagagagacaccacactcttagccaaagccttaaagttatgggtttatggttcct----cttataaggtgtt 2579215  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2579216 caacttttactcttttatccgatgtgggacatataactaacacttg 2579261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16108198 - 16108065
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||            |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16108198 acatcgaggttataacaaccccacaagcaagagagacaccacaccctta------------aggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 16108111  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16108110 caacatttactcttttatctgatgtggaacatataactcacacttg 16108065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 160
Target Start/End: Original strand, 5958641 - 5958766
Alignment:
Q  35 caagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 134  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  5958641 caagagagacatcacactctatcccaaaactttaagacaatgagtttatgagttctcttatttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtaa 5958740  T
Q  135 gacatataactcacacttgcaaacca 160  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5958741 cacatataactcacaattgcacacca 5958766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 6071256 - 6071132
Alignment:
Q  31 caagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgat 130  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||||||||  ||| || ||| | ||    
T  6071256 caagcgagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcatctcacttataaagtgttcaacctccacttttctattcaat 6071157  T
Q  131 gtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  6071156 gtgggacatataactcacacttgca 6071132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8482045 - 8481927
Alignment:
Q  36 aagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| | |||||||||||  ||| || |||| ||||| ||    
T  8482045 aagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcatctcatttataaagtgttcaacctccacttttatatctgatgt-gg 8481947  T
Q  136 acatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8481946 acatataactcacacttgca 8481927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 12092493 - 12092640
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||| |||| ||| ||||| | ||||  ||||||||||||||  ||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| |    
T  12092493 acatccaggccagagcaacctcacaagtgagagagacaccacagtcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatggatcctctcacttataaagtgct 12092592  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  12092593 caacctccacttttctatccgatgtgggacatctaacacacccttgca 12092640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 284 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 1317355 - 1317162
Alignment:
Q  284 gaaggaagtgctccggtcgtcgatgacggtactttgaggatatcgtggttgccaccccgttgaggagaaggggatgttgtacatgcaggtgctccaacgc 383  Q
    |||| ||||||| || |||| |||| ||||||||  ||||| | ||||  || ||||||||||||||||  || |||||||| | ||  |||||| ||||    
T  1317355 gaagtaagtgcttcgatcgttgatggcggtacttcaaggatgtggtggccgcaaccccgttgaggagaaaagggtgttgtacctacaattgctccgacgc 1317256  T
Q  384 tcaagtcagtgtatgatcaagagtgagagtga-agcatagagagatacatacattatgagcttgtcaagagctctttatatagggtcgaggagac 477  Q
    |||||||||  || ||  ||||||| |||  | ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  1317255 tcaagtcagcatacgagtaagagtg-gaggcagagtgtatagagatacatacattatgagcttgtcaagagtccattatataggatcgaggagac 1317162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 155
Target Start/End: Original strand, 12085046 - 12085191
Alignment:
Q  9 catcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttc 108  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| |||  |||||| ||||| |   |||| | ||||||    
T  12085046 catcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggccatggttttatgagtcctttctattataaagtgttc 12085145  T
Q  109 aacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    || ||  ||| || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12085146 aaactccact-ttctatctgatgcaggacatataactcacacttgca 12085191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 35210551 - 35210498
Alignment:
Q  82 atgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 135  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35210551 atgggtcctcttacttacaaggtattcaacctttactattttatccgatgtggg 35210498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 380 - 493
Target Start/End: Original strand, 6120293 - 6120402
Alignment:
Q  380 acgctcaagtcagtgtatgatcaagagtgagagtgaagcatagagagatacatacattatgagcttgtcaagagctctttatatagggtcgaggagaccg 479  Q
    |||| ||||| ||| ||||| |||||||  || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||    
T  6120293 acgcccaagttagtatatgaccaagagttgga-tgaagcatagagatatacataccttgtgagcttgtcaaaagcgc---atatagggtcgaggagaccg 6120388  T
Q  480 ttgtttagtcatgg 493  Q
    |||| | |||||||    
T  6120389 ttgtatggtcatgg 6120402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 12071702 - 12071849
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  ||  ||||||| ||||| |   |||| | |||||    
T  12071702 acatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtcataggtttatgagtcctttctattataaagtgtt 12071801  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||| ||  | | || |||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  12071802 caaactccatttttctatctgatgcgagacatataactcacacttgca 12071849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 151
Target Start/End: Original strand, 17135144 - 17135223
Alignment:
Q  72 caatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacact 151  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| |||| || ||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17135144 caatgagtttatgaatcctcttgcttataaggtattaaacatttacttctctatccgatgtgagacatataactcacact 17135223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 2975668 - 2975567
Alignment:
Q  39 agagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggaca 138  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||| |||||| ||| |  |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||| || |||  |||||||||||    
T  2975668 agagacatcacactcttattcaaaactttaagacaaaggatttatgggtcatcttgcttataaggtgttcaacatttacttttctatttgatgtgggaca 2975569  T
Q  139 ta 140  Q
    ||    
T  2975568 ta 2975567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 4027914 - 4027786
Alignment:
Q  335 ccaccccgttgaggagaagggg-atgttgtacatgcaggtgc----tccaacgctcaagtcagtgtatgatcaagagtgagagtgaagcatagagagata 429  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||    ||  || | ||||||||  ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4027914 ccaccccgttgaggagaaggggtatgttgtacttactggtgcgtgctctgacacccaagtcagcatatgagcaagagtg-gagtgaagc-tagagagata 4027817  T
Q  430 catacattatgagcttgtcaagagctcttta 460  Q
    ||||| |  ||||||||||||||| ||||||    
T  4027816 catacctcgtgagcttgtcaagagttcttta 4027786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 118
Target Start/End: Original strand, 14789285 - 14789325
Alignment:
Q  78 gtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttact 118  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  14789285 gtttatgggtcctcttacttgtaaggtgttcaacctttact 14789325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 31714815 - 31714732
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctct 92  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | | | || |||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31714815 acatcgaggctagagcaaccacacaagcgaaaaa-acgccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagttaatgggtcctct 31714732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 3409448 - 3409405
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacac 51  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  3409448 acatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccacac 3409405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 87
Target Start/End: Original strand, 11637760 - 11637811
Alignment:
Q  36 aagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggt 87  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  11637760 aagagagacaccacactcttatccaaaatcttaagacaatgggtttatgggt 11637811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 75)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3669834 - 3669679
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  3669834 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgtt 3669735  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3669734 caacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 3669679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 34835356 - 34835211
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34835356 acatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 34835257  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  34835256 caacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacccttg 34835211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3670207 - 3670052
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3670207 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttatgggtcctcatacttataaggtgtt 3670108  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3670107 aaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 3670052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 34835023 - 34834878
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  34835023 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcatcttacttataaggtgtt 34834924  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34834923 taacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttg 34834878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 1014256 - 1014411
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1014256 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaggagagacaccacactcttacccaaaactttaaggtaacgagtttacgggtcctcttacttataaggtgtt 1014355  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1014356 caacctttactattttatctgatgtatgacatataactcacacttgcaaaccaaca 1014411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 30441232 - 30441073
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttactta----tgagg 103  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    | |||    
T  30441232 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataattaagg 30441133  T
Q  104 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30441132 tgttcaacctttactattttagccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 30441073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 3038301 - 3038446
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  3038301 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttacttataaagtgtt 3038400  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038401 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 3038446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 45122068 - 45122215
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  45122068 acatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgggttctcttacttataaggtgtt 45122167  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45122168 caacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 45122215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 153
Target Start/End: Original strand, 33113387 - 33113523
Alignment:
Q  17 ctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaaccttta 116  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  33113387 ctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagacgttcaaccttta 33113486  T
Q  117 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33113487 ctattttatccgatgtaggacatataactcaaacttg 33113523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 34835622 - 34835476
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34835622 acatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 34835523  T
Q  108 caacctttactattttatc-cgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
     ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  34835522 aaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttg 34835476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 34835888 - 34835742
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34835888 acatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 34835789  T
Q  108 caacctttactattttatc-cgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
     ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  34835788 aaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttg 34835742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 163
Target Start/End: Original strand, 20870594 - 20870741
Alignment:
Q  18 tagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttac 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20870594 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttac 20870693  T
Q  118 tattttatccgatgtgggac--atataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20870694 tattttatctgatgtggaacatatataactcacacttgcaaaccaaca 20870741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 1013882 - 1014037
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| || ||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  1013882 acatcgaggctagaacaaccgcacaagtaaaagagacaacacactcttactcaaaactctaaggcaatgggtttattggtcctcttacttatagggtgtt 1013981  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1013982 caacttttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttgcaaaccaaca 1014037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 45121921 - 45122068
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||| ||| |||||| | ||||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  45121921 acatcgaggcttgaataaccacacgagcaaaagagacgccacactgttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaagtgtt 45122020  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45122021 caacctttactattttatgcgatgtgggacatataactcacacttgca 45122068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 147590 - 147454
Alignment:
Q  16 gctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaaccttt 115  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  147590 gctagaactaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaataggtttatgggtcctcttatttataaggtgttcaaccttt 147491  T
Q  116 actattttatccgatgtgggacatataactcacactt 152  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  147490 actcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 147454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 25561826 - 25561972
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttaccc-aaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgt 106  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||| ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25561826 acatcgaggctagagcaaccacacaagcaagagagatgtcacactcttaccccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgt 25561925  T
Q  107 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25561926 tcaacgtttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 25561972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 45122771 - 45122638
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45122771 acatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 45122672  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatat 141  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  45122671 caacctttactattttatccgatgcgggccatat 45122638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 6876873 - 6877021
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||   |||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||    
T  6876873 acatcgaggctagaacaaccacacaaacaagagaaacaccacactcttacccaaaaccctaagacaatgagtgtatgggtcatcttatttataaggtgtt 6876972  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggac-atataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6876973 caacctttacttttttatccgatgtgggactatataactcacacttgca 6877021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 148
Target Start/End: Original strand, 9482615 - 9482755
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||  |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9482615 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagataccacactcttatacaaaatctttaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 9482714  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 148  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  9482715 caacctttactcttttatcccatgtggaacatataactcac 9482755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9309501 - 9309355
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||  |   | |||||||||||||| ||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9309501 acatcgaggctagaacaaccacatactga-gagagacaccacactcttacccgacaccttaaggcaatgagtttaagggtcctcttacttataaggtgtt 9309403  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9309402 caacatttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 9309355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9608892 - 9608745
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||  ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  9608892 acatcgaggctagaacaacctcactagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaaggtgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgtt 9608793  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9608792 caacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 9608745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 30359418 - 30359273
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||| ||||||| ||||||  | |||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30359418 acattgaggctaaaacaacatcacaagaaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttgcttataaggtgtt 30359319  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30359318 caacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 30359273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 37544501 - 37544646
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| |||||||||||  |||| | ||||  ||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  37544501 acatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaagtaatggatttatgggtcctctttcttataatgtgtt 37544600  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  37544601 caacctttactattttatccgatgtgcgacttataactcacacttg 37544646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 40518729 - 40518584
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||| |||||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  40518729 acattgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcattgggtttatgggtcctcttatttataaggtgtt 40518630  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40518629 caacctttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 40518584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 161
Target Start/End: Original strand, 40579517 - 40579670
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40579517 acatcgaggatagaacaaccgtacaagcaatagagacaccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 40579616  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 161  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  |||||||| ||||||||| |||||||    
T  40579617 caacctttactattttatccaatatgaaacatataattcacacttggaaaccaa 40579670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 40518218 - 40518071
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  40518218 acatcaaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcattgggtttatgggtccatttacttataaggtgtt 40518119  T
Q  108 caacctttac--tattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  40518118 caacctttacttttttttatccaatgtggaacatataactcacacttg 40518071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 6732042 - 6731896
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||         |    
T  6732042 acatcgaggttagaacaaccgcataagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctcttactt---------t 6731952  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6731951 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaacaaca 6731896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 41972303 - 41972158
Alignment:
Q  13 gaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaa---aattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttca 109  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||   || |||| ||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  41972303 gaggctggaacaaccacacaagcaagagtgacgccacactcttacccaacaaaactttatggcaatgggtttatgggtcctatcacttataaggtgttca 41972204  T
Q  110 acctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41972203 acctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 41972158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Original strand, 9483198 - 9483320
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9483198 acatcgaggctagaacaaccgcacgagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 9483297  T
Q  108 caacctttactattttatccgat 130  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  9483298 caacctttactcttttatccgat 9483320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 145
Target Start/End: Original strand, 18372005 - 18372142
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18372005 acattgaggctagagcaaccgcacaagcgagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatggatcctcttacttataaggtgtt 18372104  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataact 145  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  18372105 caacctttactattttattggatgtggtacatataact 18372142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 30359756 - 30359611
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||| | |||||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30359756 acatcgaagttagaacaaccgcataagtaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggttatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgtt 30359657  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  30359656 caacttttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttg 30359611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 148
Target Start/End: Original strand, 70290 - 70425
Alignment:
Q  13 gaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacc 112  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  70290 gaggttagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacctaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaaca 70389  T
Q  113 tttactattttatccgatgtgggacatataactcac 148  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  70390 tttactcttttatccgatgtgggacatataactcac 70425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5916014 - 5915872
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    ||||| | |||||    
T  5916014 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcct----cttataaagtgtt 5915919  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
     || ||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5915918 -aaactttacatttttatccaatgtaggacatataactcacacttgca 5915872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 1513926 - 1514071
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||||||| |||| | || | |||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||  ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1513926 acatcgaggctagaataaccccacatgtaagagagataccacacttttacccaaaaccttaaggttatgggtttaagggtcctcttacttataaggtgtt 1514025  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1514026 caacctttactcttttatccgatgtgggatatataactcatacttg 1514071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5420798 - 5420651
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  || |||||  ||||| |||||  ||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  5420798 acatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagggagacgtcacactcttacaaaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataagatgtt 5420699  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5420698 caacctttactattctatccgatgtgggacatataatacacacttgca 5420651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 152
Target Start/End: Original strand, 32640543 - 32640682
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||     ||||    
T  32640543 acatcgaggctagaacaatcacaaaagcaagagagacgcaacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatcggtcctcttaccta-----tgtt 32640637  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 152  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  32640638 caacctttactcttttatccgatgtgagacagataactcacactt 32640682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 8918775 - 8918922
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||| || ||||||||| || |||||| ||||  ||||| |||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  8918775 acatcgaggttaaaacaaccacacacgcaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcaataggtttatgggtcctcttacttataaagtgtt 8918874  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| |  |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8918875 caacctttactctgctatctgatgtgggacatgtaactcacacttgca 8918922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 45123153 - 45123006
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacaccct--tacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtg 105  Q
    ||||||||  |||||||||| | |||  |||||||||||||||| ||  |||||||||  |||||  |||  ||||||||||| |||||||||  |||||    
T  45123153 acatcgagattagaacaaccccacaaataagagagacaccacactctcttacccaaaaccttaagaaaataggtttatgggtcatcttactta--aggtg 45123056  T
Q  106 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45123055 tttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 45123006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Original strand, 41416252 - 41416335
Alignment:
Q  78 gtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41416252 gtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact--cacttgcaaaccaaca 41416335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 6651641 - 6651510
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||         | ||    
T  6651641 acatcgaggttagaacaatcgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctctta---------tttt 6651551  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6651550 caacctttactattttatccgatgtgagacatataactcac 6651510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 152
Target Start/End: Original strand, 18372785 - 18372854
Alignment:
Q  83 tgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 152  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18372785 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcacactt 18372854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 151
Target Start/End: Original strand, 18373004 - 18373085
Alignment:
Q  70 ggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacact 151  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18373004 ggcaatgagtttatgagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgaagtgggacatataaatcacact 18373085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 45121667 - 45121811
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| | ||||| ||||| |||||  |||||||  |  |||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  45121667 acatcgaggctagaacaaccccataagtaagagagatatcacactcttactcaaaaccttaaggctgtaggtttatggatcctcttacttataaggtgat 45121766  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  45121767 caacctttactcttttatccgatgtgggaca-acaactcacacttg 45121811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 4154679 - 4154824
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||| |||| ||| ||||||| |||||  ||||||| |||||| |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||    
T  4154679 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctttcacttataaagtgtt 4154776  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4154777 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgca 4154824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 155
Target Start/End: Original strand, 4154321 - 4154438
Alignment:
Q  37 agagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 136  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||  ||| || |||| ||||| |||    
T  4154321 agagagacatcacacacttacccaaaatattaaggcaatgagtttatgggt-ctctcacttataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtagga 4154419  T
Q  137 catataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  4154420 catataactcacatttgca 4154438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 32305591 - 32305478
Alignment:
Q  41 agacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacata 140  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| |||||| |||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  32305591 agacgccacactcttatccaaaatcttaaggtaatgggtttataggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcc-------gacata 32305499  T
Q  141 taactcacacttgcaaaccaa 161  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  32305498 taactcacacttgcaaaccaa 32305478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 152
Target Start/End: Original strand, 18372342 - 18372411
Alignment:
Q  83 tgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 152  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18372342 tgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacactt 18372411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 151
Target Start/End: Original strand, 18380059 - 18380171
Alignment:
Q  39 agagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggaca 138  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||  |||||| | || |||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  18380059 agaggcaccacactcttactcaaaaccttaaggtagtgggtttataggcccccttacttataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggata 18380158  T
Q  139 tataactcacact 151  Q
    |||||||||||||    
T  18380159 tataactcacact 18380171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9309128 - 9308977
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacc---cttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||    ||| |||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||| |  |    
T  9309128 acatcgaggctagaacaaccacata-gtgagagagacaccacactactcttgcccaaaacctttaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataacat 9309030  T
Q  105 gttcaacctttactattttatccgatgtg--ggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9309029 gttcaacttttactcttttatctgatgtgtaggacatataactcacacttgca 9308977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 148
Target Start/End: Original strand, 18371672 - 18371807
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||   ||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||     ||||    
T  18371672 acatcgaagctagagcaaccgcacaaatgagagacacaccacactcttacccaaaaccttaaggca-tgggtttatgggtcttcttacttaa----tgtt 18371766  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18371767 caacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcac 18371807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 9609222 - 9609108
Alignment:
Q  18 tagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttac 117  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  9609222 tagaacaaccacactagcaagagagacgccacactcttaccgaaaacattaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataagatgttcaacctttac 9609123  T
Q  118 tattttatccgatgt 132  Q
    | || |||| |||||    
T  9609122 ttttctatctgatgt 9609108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 147967 - 147829
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||         |||  | ||||    
T  147967 acattgaggctagaacaactgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggt---------tatatgttgtt 147877  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  147876 caacatttacttttttatcagatgtgggacatataactcacacttgca 147829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 145
Target Start/End: Original strand, 25561729 - 25561792
Alignment:
Q  82 atgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 145  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25561729 atgggtactcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataact 25561792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 152
Target Start/End: Original strand, 43274824 - 43274934
Alignment:
Q  42 gacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat 141  Q
    |||||||||| ||||| |||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||    
T  43274824 gacaccacactcttactcaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcttacttataatatattcaacctttactcttttatctgatgtgaaacatat 43274923  T
Q  142 aactcacactt 152  Q
    |||||||||||    
T  43274924 aactcacactt 43274934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 152
Target Start/End: Original strand, 3037777 - 3037865
Alignment:
Q  66 ttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac--atataactcacactt 152  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  3037777 ttaagacaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactatttcatccgatgtggaacatatataactcacactt 3037865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8794229 - 8794113
Alignment:
Q  37 agagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 136  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||  |||||  | |  ||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||| | |||||||||||||| ||    
T  8794229 agagagacaccgcactctcacccaaaaccttaagatattaggtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacatttattcttttatccgatgtgaga 8794130  T
Q  137 catataactcacacttg 153  Q
    |||||||||||||||||    
T  8794129 catataactcacacttg 8794113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 76
Target Start/End: Original strand, 40579280 - 40579348
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatg 76  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  40579280 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcctaaggcaatg 40579348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 151
Target Start/End: Original strand, 43398079 - 43398225
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctc---ttacttatgaggt 104  Q
    ||||||||| |||| ||||| | | || || ||| || |||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||| |||| ||||    
T  43398079 acatcgaggttagagcaaccgcactagtaaaagaaacgccacattcttatccaaaactttaaggcaatgaatttatgggtcctcctcttatttataaggt 43398178  T
Q  105 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacact 151  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  43398179 gttcaacctttacttttctatccgatatgagatatataactcacact 43398225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9507929 - 9507777
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||| |||||||||   |||  | |||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  9507929 acatcgaggcttgaacaaccatataagagatagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtatt 9507830  T
Q  108 caacctttact---attttatccgatgtg--ggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||    |||||||| || ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  9507829 caacctttactgtacttttatccaatatggaggagatataactcacacttgca 9507777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 155
Target Start/End: Original strand, 9620739 - 9620834
Alignment:
Q  60 aaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||| | |||| || |||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  9620739 aaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgatcaacttctacttttctatctgttgtgagacatataactcacacttgca 9620834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 12284019 - 12283873
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||| ||||||  ||||| |  |||||||||| ||| | |||||| | || | ||    
T  12284019 acatagaggctagaacaaccacacaagtgagagagacactacactcttatccaaaaccttaagact-tgagtttatgtgtcattttacttttaagatatt 12283921  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  12283920 caacatttacttttttatctgacgtgggacatataacttacacttgca 12283873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 153
Target Start/End: Original strand, 18372676 - 18372758
Alignment:
Q  70 ggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  18372676 ggcaatgggtttatgagtcctcttacttataag-tgttcaacctttactattttatccgaaatggaacatataaatcacacttg 18372758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 258 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 5527290 - 5527068
Alignment:
Q  258 gatactcatcgtggtggtggaccgatg-aaggaagtgctccggtcgtcgatgacggtactttgaggatatcgtggttgccaccccgttgaggagaa--gg 354  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| | ||| | ||||| || |||| |||| |||| ||  |||||| | ||||| |  ||||| ||||| ||||  ||    
T  5527290 gatactcatagtggtggtggatcgacggaagtaggtgcttcgatcgttgatggcggttctccgaggatgtggtggtggaaaccccattgagtagaaaggg 5527191  T
Q  355 ggatgttgtacatgcaggtgctccaacgctcaagtcagtgtatgatcaagagt-gagagtgaagcatagagagatacatacattatgagcttgtcaagag 453  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| || | ||| ||||| ||||| ||| ||| ||| ||| || ||| |||||||||||  || ||||||||||||||     
T  5527190 ggatgttgtacctgctggtgctccgacacccaaatcagtatatgagcaaaagttgag-gtggagaatatagagatacatatcttgtgagcttgtcaagaa 5527092  T
Q  454 ctctttatatagggtcgaggagac 477  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  5527091 ctctttatatagggtcaaggagac 5527068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 152
Target Start/End: Original strand, 18372485 - 18372526
Alignment:
Q  111 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372485 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 18372526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5274891 - 5274775
Alignment:
Q  39 agagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggaca 138  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||  | |||| | ||||||||||| | || |||||| | |||| | |||    
T  5274891 agagacatcacactcttactcaaaatcttaaggcaatgattttatgggtcttcccatttataaagtgttcaacctctccttttttattcaatgtagaaca 5274792  T
Q  139 tataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||| |||||||    
T  5274791 tataactcatacttgca 5274775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 319 - 481
Target Start/End: Original strand, 13640091 - 13640252
Alignment:
Q  319 gaggatatcgtggttgccaccccgttgaggagaaggggatgttgtacatgcaggtgctccaacgctcaagtcagtgtatgatcaagagtgagagtgaagc 418  Q
    |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||   ||  ||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  13640091 gaggatgtggtggtcgcaaccccgttgaggagaagggg-tgttgtacctacatgtgctctggcgtccaagtcagcatatgagcaagaatggga-tgaagc 13640188  T
Q  419 atagagagatacatacattatgagcttgtcaagagctc-tttatatagggtcgaggagaccgtt 481  Q
     |||||| ||||| || ||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  13640189 gtagagaaatacaaaccttatgagtttgtcaaaagcccgtttatatagggtcgatgagaccgtt 13640252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 319 - 481
Target Start/End: Original strand, 13740504 - 13740665
Alignment:
Q  319 gaggatatcgtggttgccaccccgttgaggagaaggggatgttgtacatgcaggtgctccaacgctcaagtcagtgtatgatcaagagtgagagtgaagc 418  Q
    |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||   ||  ||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  13740504 gaggatgtggtggtcgcaaccccgttgaggagaagggg-tgttgtacctacatgtgctctggcgtccaagtcagcatatgagcaagaatggga-tgaagc 13740601  T
Q  419 atagagagatacatacattatgagcttgtcaagagctc-tttatatagggtcgaggagaccgtt 481  Q
     |||||| ||||| || ||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  13740602 gtagagaaatacaaaccttatgagtttgtcaaaagcccgtttatatagggtcgatgagaccgtt 13740665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 475
Target Start/End: Original strand, 37481438 - 37481563
Alignment:
Q  349 agaaggggatgttgtacatgcaggtgctccaacgctcaagtcagtgtatgatcaagagtgagagtgaagcatagagagatacatacattatgagcttgtc 448  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||   |||||||||||||| ||| | |||||| ||||  ||| ||||||||||||||||  || | || |||||    
T  37481438 agaagggggtgttgtacctgcaagtgctttgacgctcaagtcagtatataagcaagagcgagac-gaaacatagagagatacatatcttgtaagtttgtc 37481536  T
Q  449 aagagctctttatatagggtcgaggag 475  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||    
T  37481537 aagagctcattacatagggtcaaggag 37481563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 73
Target Start/End: Original strand, 8919155 - 8919220
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggca 73  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  8919155 acatcgaagctagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggca 8919220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 20130525 - 20130454
Alignment:
Q  78 gtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 150  Q
    |||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20130525 gtttatggatcatcttacttaa-aggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcacac 20130454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 40991866 - 40991756
Alignment:
Q  42 gacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat 141  Q
    ||||||||| | | ||||||||  || ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| || ||  | ||||||||| | |    
T  40991866 gacaccacatcttaacccaaaaccttgaggcattgggtttatgggtcctctcacttatgaagtgttcaacctccacttttctaagcaatgtgggacttct 40991767  T
Q  142 aactcacactt 152  Q
    |||||||||||    
T  40991766 aactcacactt 40991756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 103 - 155
Target Start/End: Original strand, 20995507 - 20995559
Alignment:
Q  103 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20995507 gtgttcaacctccacttttttatctgatgtgagacatataactcacacttgca 20995559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 41129135 - 41129067
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatg 76  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||    
T  41129135 acatcgaggtttgaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcatacccaaaaccttaagacaatg 41129067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 119
Target Start/End: Original strand, 18373239 - 18373292
Alignment:
Q  66 ttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttacta 119  Q
    ||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  18373239 ttaagacaatgggttaatggatcctcttatttataaggtgttcaacctttacta 18373292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33832055 - 33831978
Alignment:
Q  78 gtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | |||| || | | | | ||| |||||||||||||||||||||    
T  33832055 gtttataggtcctcttacttataaagtgttcaacttctacttttctcttcaacgtgagacatataactcacacttgca 33831978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 66)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 36178616 - 36178771
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36178616 acatagaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 36178715  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36178716 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaactaaca 36178771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 37106071 - 37105920
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  37106071 acatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtccccttacttataaggtgtt 37105972  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaacc 159  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37105971 caacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttgcaaacc 37105920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Original strand, 41283486 - 41283643
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41283486 acatcaaggctagaacaaccacacaaacaagagagacgccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 41283585  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacata 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41283586 caacctttactattttatccgatatgggacatataactcacacttgcaaaccaacata 41283643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 14745678 - 14745833
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14745678 acatcgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 14745777  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745778 caacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 14745833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 37106335 - 37106180
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37106335 acatcgaggctagaacaatcgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 37106236  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106235 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 37106180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 5543009 - 5543164
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5543009 acatcgaggcttgaacaaccgcacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatggatcctcttacttataaggtgtt 5543108  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5543109 caacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 5543164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 6421532 - 6421387
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  6421532 acatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgtt 6421433  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6421432 caacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 6421387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 5542636 - 5542791
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5542636 acatcgagacttgaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 5542735  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542736 caacctttactattttattcgatatgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 5542791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15880410 - 15880265
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15880410 acatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 15880311  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15880310 caacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttg 15880265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 962745 - 962598
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  962745 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacaacacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctctcacttataaggtgtt 962646  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  962645 caacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 962598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 148
Target Start/End: Original strand, 15511506 - 15511646
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  15511506 acatcgagactagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataacgtgtt 15511605  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 148  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15511606 caacctttactcttttatccgttgtgtgacatataactcac 15511646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 42514796 - 42514649
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42514796 acatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 42514697  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42514696 caacctttacttttctatctgatgtaggacatataactcacacttgca 42514649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 36005891 - 36006035
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36005891 acatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 36005990  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36005991 caacttttact-ttctattcgatgtgggacatataactcacacttg 36006035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 36178182 - 36178311
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  36178182 acatcgaggctataacaaccacacaagcaagagaggcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggttcccttacttataaggtgtt 36178281  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggac 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178282 caacctttactattttatccgatgtgggac 36178311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 1770039 - 1769884
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||  ||||  || || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1770039 acatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttattcaaagcttcaaagctatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgtt 1769940  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1769939 caacttttactcttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcacaccaaca 1769884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 155
Target Start/End: Original strand, 28531354 - 28531472
Alignment:
Q  37 agagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 136  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  28531354 agagagtcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggacctcttacttataaggtgttcaacctttgcttttctatccgatgtggga 28531453  T
Q  137 catataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28531454 catataactcacacttgca 28531472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 14745304 - 14745460
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccact-caagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||  |   |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||  || |||    
T  14745304 acatcgaggctagaacaaccaccacttacaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcatacttacaagatgt 14745403  T
Q  107 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14745404 tcaaccattactattttattcgatgtgggacatataactcacagttgcaaaccaaca 14745460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 151
Target Start/End: Original strand, 28254258 - 28254391
Alignment:
Q  16 gctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaaccttt 115  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  28254258 gctagaacaaccccacaag--agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaaccttt 28254355  T
Q  116 actattttatccgatgtgggacatataactcacact 151  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28254356 acttttctatccgatgtgggacatataagtcacact 28254391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 6422257 - 6422126
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  6422257 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttaattataatgtgtt 6422158  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacat 139  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6422157 caacctttacttttttatctgatgtgggacat 6422126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 35580735 - 35580881
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  35580735 acatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg-tcctctcacttataaggtgtt 35580833  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580834 caacatttattgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 35580881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 40679640 - 40679787
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  40679640 acatcgagactagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggttctcttacttataaggtgtt 40679739  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  40679740 caacccttacttttctatccgatatgggacatataactcacatttgca 40679787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 33731795 - 33731653
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  33731795 acatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggatcctcttacttataaggtgct 33731696  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 150  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  33731695 caacctttactcttttatccgatgtgagatatataactcacac 33731653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 38796629 - 38796778
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccaca--cccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtg 105  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||  | |||||||||||  |||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  38796629 acatcgaggcttgaacaaccacacaagcaatagagacgccacatactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttacttataaggtg 38796728  T
Q  106 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38796729 ttcaacctttattgttttatcagatgtgggacatataactcacacttgca 38796778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 40733664 - 40733519
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40733664 acatcgagacttgaactaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggttgtaggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 40733565  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40733564 caacatttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 40733519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 6713124 - 6712978
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaatt-ttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgt 106  Q
    |||||||||||||||||| | |  |||||||||||||| ||||| |||||||||||   |||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6713124 acatcgaggctagaacaatcccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaaccttaaagcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 6713025  T
Q  107 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6713024 tcaacatttactgttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 6712978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16542556 - 16542449
Alignment:
Q  48 acacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 147  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16542556 acactcttactcaaaatcttaaggcaatgagtttataagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacttataactca 16542457  T
Q  148 cacttgca 155  Q
    ||||||||    
T  16542456 cacttgca 16542449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 163
Target Start/End: Original strand, 36178320 - 36178435
Alignment:
Q  48 acacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 147  Q
    |||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36178320 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtccccttacttataaggtgttccacctttactattttatccgaagtgggacatataactca 36178419  T
Q  148 cacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||||    
T  36178420 cacttgcaaaccaaca 36178435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 7598748 - 7598601
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||        |||||||||||||||||||| |||||||    
T  7598748 acatcgatgcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttaccaaaaacgttaagg--------ttatgggtcctcttacttataaggtgtt 7598657  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7598656 caacctttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacaccaaca 7598601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Original strand, 31899496 - 31899581
Alignment:
Q  67 taaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31899496 taaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacactt 31899581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 37632608 - 37632755
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||| ||| |  | |||||| ||||||||| |||||||||||  |||| |  ||| |||||||||||||||||||||| |  |||     
T  37632608 acatcgaggctagaacaatcacacttgtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaagttatgggtttatgggtcctcttacttataaaatgtc 37632707  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37632708 aaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 37632755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 144
Target Start/End: Original strand, 40163383 - 40163520
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaagg-caatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgt 106  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| | || |  ||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  40163383 acatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaagacactaggttaatgggtcatcttacttataaggtgt 40163482  T
Q  107 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataac 144  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40163483 tcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataac 40163520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 40734029 - 40733885
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||| | |||||||||||| |||||||    
T  40734029 acatcgagacttgaacaaccacacaagcgagacagacaccacactcttacccaaaactttaaggctgt-aggttatgagccctcttacttataaggtgtt 40733931  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
     || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40733930 aaatctttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttg 40733885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 7598375 - 7598228
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||  |||||||||||| |  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  7598375 acatcgaggcttgaacaaccgcacaagtgagagagacaccatattcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctcttatttataaggtgtt 7598276  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
     |||||||||| || ||| |||||| | |||||||| |||||||||||    
T  7598275 gaacctttacttttctattcgatgtagaacatataattcacacttgca 7598228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 12529039 - 12529186
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||| |||| |||||||||| | ||| |||||||||||| ||   |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  12529039 acattgaggttagaacaaccgcacaaacaagagagacactacgttcttatctaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttatacggtgtt 12529138  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12529139 caatctttactgttttatttgatgtaggacatataactcacacttgca 12529186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 155
Target Start/End: Original strand, 31468800 - 31468904
Alignment:
Q  47 cacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 146  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468800 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctta----taagatattcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 31468895  T
Q  147 acacttgca 155  Q
    |||||||||    
T  31468896 acacttgca 31468904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 5367599 - 5367457
Alignment:
Q  11 tcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaa 110  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  ||| ||| |||| || |||||||||| ||||||||||    
T  5367599 tcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggttatgtgttcatggatcatcttacttataaggtgttcaa 5367500  T
Q  111 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  5367499 cctttgctcttttatccgatctgggacatatatatcacacttg 5367457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30313318 - 30313178
Alignment:
Q  14 aggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacct 113  Q
    |||| ||| ||||||| ||||  |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  30313318 aggccagagcaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttttgggtcctctcacttat-aagtgttcaacct 30313220  T
Q  114 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
      ||| || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  30313219 ccacttttctatccgatgtgagacatataacacacgcttgca 30313178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 155
Target Start/End: Original strand, 38796299 - 38796376
Alignment:
Q  78 gtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38796299 gtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 38796376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 29676676 - 29676543
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||| | ||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||      |||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||    
T  29676676 acatcgaggtttgaataaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa------ggcaatgagtttatgggttctctcacttataatgtgtt 29676583  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 147  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  29676582 caatctttactcttttatccaatgtgagacatataactca 29676543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 23346383 - 23346250
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  23346383 acatctaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttaccgaaaaccttaaggctatgggtttatgggccctctta-ttataaggtgtt 23346285  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatata 142  Q
     |||||||||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  23346284 taacctttacttttctatacgatgtgagacatata 23346250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 29677055 - 29676903
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtc-----ctcttacttatgag 102  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||  |||   ||||||||||| |||||||||||     |||| || ||| ||    
T  29677055 acatcgaggttggaacaaccccacaattaagagagacaccacactcttacttaaagccttaaggcaatgggtttatgggtcttctcctctcacctataag 29676956  T
Q  103 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29676955 gtgttaaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacctgca 29676903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 3673215 - 3673124
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttat 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3673215 acatcgaggctagaacaaccacactagtaagagagacatcacactcttagccaaaatcttaaagcaatgagtttatggatcctcttacttat 3673124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 155
Target Start/End: Original strand, 33561491 - 33561609
Alignment:
Q  37 agagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 136  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||  ||| || |||| ||||||| |    
T  33561491 agagagatatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccacttttctatctgatgtggaa 33561590  T
Q  137 catataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33561591 catataactcacacttgca 33561609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 155
Target Start/End: Original strand, 36785667 - 36785721
Alignment:
Q  101 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785667 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36785721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 6421878 - 6421793
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctctt 93  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6421878 acatcgaggccagaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctt 6421793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16591030 - 16590888
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||  | |  |||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||      ||||    
T  16591030 acattgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacattagattcttacttaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttactt------tgtt 16590937  T
Q  108 caacctttactatttt-atccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16590936 caacctttactttttttatttgatgtgggacatataactcacacttgca 16590888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30323581 - 30323464
Alignment:
Q  38 gagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 137  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||||||  | | || |||| ||| ||||||    
T  30323581 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttataggtcctctcacttctaaagtgttcaacctccaattttctatctgatttgggac 30323482  T
Q  138 atataactcacacttgca 155  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  30323481 atataacacacacttgca 30323464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 343 - 465
Target Start/End: Original strand, 4037121 - 4037242
Alignment:
Q  343 ttgaggagaagggg-atgttgtacatgcaggtgctccaacgctcaagtcagtgtatgatcaagagtgagagtgaagcatagagagatacatacattatga 441  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| |  |||| |||  |||||||||| | || |||    
T  4037121 ttgaggagaagggggatgttgtacatgcaagtgctccaacacccaagttagtgtatgagcaagagtggggatgaaacat--agagatacatcccttgtga 4037218  T
Q  442 gcttgtcaagagctctttatatag 465  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||    
T  4037219 gcttgtcaagaactcattatatag 4037242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 155
Target Start/End: Original strand, 33953821 - 33953929
Alignment:
Q  47 cacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 146  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||   |||||||||||  ||| || |||| |||||||||| ||||||||    
T  33953821 cacactcttacccaaaattttaaggcaacaggtttatgggtcctctcacttatatagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacttataactc 33953920  T
Q  147 acacttgca 155  Q
    ||| |||||    
T  33953921 acatttgca 33953929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 147
Target Start/End: Original strand, 37895107 - 37895211
Alignment:
Q  43 acaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 142  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || |||||| | |||| |||||| |||| | || ||||||||||||||||||||    
T  37895107 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgtgttcttttacttttaaggttttcaacttttatttttctatccgatgtgggacatata 37895206  T
Q  143 actca 147  Q
    |||||    
T  37895207 actca 37895211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 3672848 - 3672773
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttat 83  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3672848 acatcgagactagaacaaccacacaattaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttat 3672773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 139
Target Start/End: Original strand, 28254168 - 28254254
Alignment:
Q  53 cttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacat 139  Q
    ||||||| ||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  28254168 cttaccctaaactttaaggcaaagtgtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacat 28254254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 152
Target Start/End: Original strand, 31259658 - 31259774
Alignment:
Q  39 agagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatcc---gatgtggg 135  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||  ||  ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||   |||||| |    
T  31259658 agagataccacactcttacccaaaaccttaaggtgataggtttatgggtcatcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatccgatgatgtgag 31259757  T
Q  136 acatataactcacactt 152  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31259758 acatataactcgcactt 31259774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 155
Target Start/End: Original strand, 37894732 - 37894850
Alignment:
Q  37 agagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 136  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||| |||| || | |||||||| || ||| | ||||||||    
T  37894732 agagacacaccacacttttaaccaaaatcttaaggcaatggatttatgagtcttcttacttataaggtttttagcctttacttttctattcaatgtggga 37894831  T
Q  137 catataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  37894832 catataactcacatttgca 37894850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 153
Target Start/End: Original strand, 29874067 - 29874179
Alignment:
Q  41 agacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacata 140  Q
    |||| |||||| |||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  | |||| | |||||||||||  ||| || |||| |||||||||||||    
T  29874067 agacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcccaattataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacata 29874166  T
Q  141 taactcacacttg 153  Q
    |||| ||||||||    
T  29874167 taacacacacttg 29874179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 155
Target Start/End: Original strand, 29873563 - 29873695
Alignment:
Q  23 caaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattt 122  Q
    ||||||| ||||  ||||||||  ||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |  ||||||||||  ||| ||     
T  29873563 caaccacacaagtgagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcccacttataaaatgttcaacctccacttttc 29873662  T
Q  123 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  29873663 tatctgatgtgggacatgtaacacacccttgca 29873695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 6421352 - 6421306
Alignment:
Q  107 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6421352 tcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttg 6421306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 6421773 - 6421688
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctctt 93  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||  || || ||||  ||||||||||||||||    
T  6421773 acatcgaggccggaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaacctttagtcaataggtttatgggtcctctt 6421688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 99
Target Start/End: Original strand, 36784273 - 36784362
Alignment:
Q  10 atcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttat 99  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||  ||| ||||||  ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  36784273 atcgaggcttgaataaccacacaagcaagagagacacaacacttttatccaaaaccttaagacaaagggtttatgggtcatcttacttat 36784362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 42 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 2336737 - 2336666
Alignment:
Q  42 gacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacct 113  Q
    ||||||||| | | ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  2336737 gacaccacatcttaacccaaaatcttaaggcattgaatttatgggtcctctcacttataaagtgttcaacct 2336666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 9231367 - 9231252
Alignment:
Q  37 agagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 136  Q
    ||||||| || |||| |||| |||||| ||||||||  || ||| |||| |||||||| |||| |  ||||||||||||||| || |||| ||| || ||    
T  9231367 agagagatactacactcttaaccaaaactttaaggcggtgggttgatggatcctcttatttataatatgttcaacctttacttttctatctgatatgaga 9231268  T
Q  137 catataactcacactt 152  Q
    ||||||||||| ||||    
T  9231267 catataactcatactt 9231252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3673121 - 3673085
Alignment:
Q  119 attttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3673121 attttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 3673085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 12910335 - 12910231
Alignment:
Q  48 acacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 147  Q
    |||| |||||||||||  ||||| |||||| |||||  ||| | | |||||| ||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  12910335 acactcttacccaaaaccttaagacaatgaatttataagtcatttcacttataaggggttcaacctgtacttttccatccgatgtggaacatataactca 12910236  T
Q  148 cactt 152  Q
     ||||    
T  12910235 aactt 12910231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 31385853 - 31385738
Alignment:
Q  39 agagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggaca 138  Q
    |||||||||||||   | |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||  | | || || |||||||  |||     
T  31385853 agagacaccacacttattcccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctttcacttataaggtgctcaacctccatttttctaaccgatgtcagact 31385754  T
Q  139 tataactcacacttgc 154  Q
    | ||||||||||||||    
T  31385753 tctaactcacacttgc 31385738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 42515078 - 42515031
Alignment:
Q  93 tacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacata 140  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  42515078 tacttataaggtgtttaacctttacttttctatccgatgtgggacata 42515031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 91
Target Start/End: Original strand, 35580496 - 35580534
Alignment:
Q  53 cttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctc 91  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  35580496 cttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctc 35580534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 117; Significance: 4e-59; HSPs: 66)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 44290835 - 44290991
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacaccctt-acccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgt 106  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44290835 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagatacaccacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 44290934  T
Q  107 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290935 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 44290991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 44290469 - 44290624
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| || |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  44290469 acatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagaaagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatgtt 44290568  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290569 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 44290624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3550864 - 3550712
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  3550864 acatcgaggctagaacaaccgt---agcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgtt 3550768  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3550767 caacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgccaaccaaca 3550712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 26661535 - 26661678
Alignment:
Q  10 atcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttca 109  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  26661535 atcgaggcttgaacaaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaggtgttca 26661634  T
Q  110 acctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26661635 acctttactcttttacccgatgtgggacatataactcacacttg 26661678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 41157138 - 41156991
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41157138 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 41157039  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  41157038 caacctttactcttttatccgttatgggacatataattcacacttgca 41156991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 41759630 - 41759475
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||||| || |||||||||| |||||||    
T  41759630 acatcaaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcatcttacttataaggtgtt 41759531  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41759530 caacttttactattttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcaaaccaaca 41759475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 48588499 - 48588654
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  48588499 acatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttacgggtcttcttacttataaggtgtt 48588598  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48588599 caacctttactattttatccgatgtcggacatagaactcacacttgcaaaccaaca 48588654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 41142520 - 41142372
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacaccctt-acccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  41142520 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactctttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttacttataaggtgt 41142421  T
Q  107 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41142420 tcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 41142372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 3537610 - 3537765
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||| |||||||||||| || |||||||    
T  3537610 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttataggtcctcttactcataaggtgtt 3537709  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  3537710 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacacgtacaaaccaaca 3537765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 41157522 - 41157375
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41157522 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagacagacaccacactcttactcaaaacctaaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 41157423  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41157422 caacttttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 41157375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 32594750 - 32594880
Alignment:
Q  31 caagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgat 130  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32594750 caagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgat 32594849  T
Q  131 gtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32594850 gtaggacatataactcacacttgcaaaccaa 32594880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 37556258 - 37556113
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  37556258 acatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttat-ggtcctcttacttataagatgtt 37556160  T
Q  108 caacctttacta-ttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37556159 caacctttactatttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 37556113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 40082553 - 40082408
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  40082553 acatcgaggctagaacaaacgcacaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatga-tcctcttacttataaggtgtt 40082455  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40082454 caacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgc 40082408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 5319976 - 5320123
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5319976 acattgaggctagaacaaccacataagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctctcacttataaggtgtt 5320075  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5320076 caacttttacttttctatccgatgtggaacatataactcacacttgca 5320123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 50052035 - 50052189
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||  |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  50052035 acatcgaggttagaacaac-acataaacaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagaaaataggtttatgggtcctcttacttataagatgtt 50052133  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  50052134 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttaaaaaccaaca 50052189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 17294725 - 17294579
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaacca-ctcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgt 106  Q
    |||||||||||||| |||||  |  |||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  17294725 acatcgaggctagagcaacctgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgt 17294626  T
Q  107 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294625 tcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 17294579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 29798344 - 29798199
Alignment:
Q  10 atcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttca 109  Q
    ||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  29798344 atcgaggttagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttatccaagaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttca 29798245  T
Q  110 acctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29798244 acctttactattttatccaatgtaggacatataactcacacttgca 29798199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 34364654 - 34364507
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  34364654 acatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttacggatcctcttacttataaggtgtt 34364555  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34364554 caacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 34364507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 34365048 - 34364925
Alignment:
Q  32 aagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatg 131  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34365048 aagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttattattttatccgatg 34364949  T
Q  132 tgggacatataactcacacttgca 155  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  34364948 tgtgacatataactcacacttgca 34364925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 45493985 - 45494145
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatga----gg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||      ||    
T  45493985 acatcgaggcttgaacaaccacataaggaagagagacaccacactcttatccaaaactttaaggcaatgggtttatggatcatcttacttatatatatgg 45494084  T
Q  104 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat-aactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45494085 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataaactcacacttgcaaaccaaca 45494145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 31767172 - 31767319
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||||||  |||||||| |  ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  31767172 acatcgagtctagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggttaatgggtcctcttacttataaggtgtt 31767271  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31767272 caacctttactgttttatccgatgtggaacatataacccacacttgca 31767319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 158
Target Start/End: Original strand, 38804370 - 38804516
Alignment:
Q  12 cgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaac 111  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||  ||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  38804370 cgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggttatgggtttatggatcctcttacttataatgtgttcaac 38804469  T
Q  112 ctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 158  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  38804470 ctttactcttttattcgatgtgggacgtataactcacacttgtaaac 38804516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Original strand, 3537228 - 3537313
Alignment:
Q  78 gtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537228 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 3537313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 153
Target Start/End: Original strand, 26661921 - 26662054
Alignment:
Q  20 gaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttacta 119  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  26661921 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttctcacttataaggtgttcaacctttactc 26662020  T
Q  120 ttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26662021 ttttatctgatatgggatatataactcacacttg 26662054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 164
Target Start/End: Original strand, 32168709 - 32168854
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||      |||||||    
T  32168709 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctctta------aggtgtt 32168802  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacat 164  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32168803 caacctttactattttatcc-----gggacatataactcacacttgcaaaccaacat 32168854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 34649585 - 34649440
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||| |||||||||||  |||||||| |  |||||||||| ||   |||||| |||||||    
T  34649585 acatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacgcctcactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggttcttgcacttataaggtgtt 34649486  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34649485 caacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 34649440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14319014 - 14318875
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14319014 acattgaggctagaacaaccgcacaaataagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatagatttatgggtcttcttacttataaggtgtt 14318915  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 147  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14318914 caacctttactattttatccgacgtggaacatataactca 14318875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 24600325 - 24600472
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||    
T  24600325 acatcgaggctagaacaaccatactagcgagagagacaccacactcttacacaaaaccttaagacaatgagtttatgagttctcttacttataatatgtt 24600424  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24600425 caacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 24600472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 39066211 - 39066358
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| |||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  39066211 acatcaaggctagaacaaccacataagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgattttatgggtcatcttagttataaggtgtt 39066310  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39066311 caacctttacttttctatccgatgtggaatatataactcacacttgca 39066358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 155
Target Start/End: Original strand, 22077535 - 22077653
Alignment:
Q  37 agagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 136  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  22077535 agagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggctacgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgaga 22077634  T
Q  137 catataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22077635 catataactcacacttgca 22077653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 9956056 - 9955911
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagttt-atgggtcctcttacttatgaggtgt 106  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  9956056 acatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttaatgggtcctcttacttataatgtgt 9955957  T
Q  107 tcaacctttac-tattttatccgatgtgggacatataactcacact 151  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9955956 tcaacctttactttttttatctgatgtgggacatataactcacact 9955911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 11977427 - 11977282
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |  ||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  11977427 acatcgaggctagaacaaccgcacttgcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtgctcttacttataaggtgtt 11977328  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11977327 caacatttactgttttacccgatgtgggacatataactcacacttg 11977282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 37555876 - 37555733
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| | |  ||||  ||||||||||||||| | || ||    
T  37555876 acatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaggattta-aggtcctcttacttataatgtatt 37555778  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 152  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37555777 caaccttcactattttatccgatgtgggacttataactcacactt 37555733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 3875342 - 3875489
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||  |||||||| |||||  |||||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  3875342 acatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagactccacattcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgta 3875441  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  3875442 caacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactgactcttgca 3875489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 45084522 - 45084382
Alignment:
Q  9 catcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttc 108  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| |       |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45084522 catcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacaccactctcttacccaaaaccttaagacg------ttatgggtcctcttacttataaggtgttc 45084429  T
Q  109 aacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45084428 aacctttactgttttatccgatgtgggagatataactcacacttgca 45084382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 41184494 - 41184583
Alignment:
Q  66 ttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41184494 ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 41184583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 24131999 - 24132143
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||  || |||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||    
T  24131999 acatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacac--ttacccaaacctt-aaggcaatgagtttatggatccccttatttataaggtgtt 24132095  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24132096 caacctttacttttctatccgatgagggacatataactcacagttgca 24132143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 66483 - 66630
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| | | || |||||||||||  ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  66483 acattgaggctagaacaaccgcacaagcgagagagacgctatactcttacccaaaaccttaaggccatatgtttatggatcctcttacttataaggtgtt 66582  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  66583 caacctttacttttctatccgatatggaacatataactcacacttgca 66630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 163
Target Start/End: Original strand, 44043810 - 44043943
Alignment:
Q  35 caagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacct------ttactattttatccg 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |      |||||||||||| ||    
T  44043810 caagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacatttactattactattttattcg 44043909  T
Q  129 atgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44043910 atgtgggacatataact-acacttgcaaaccaaca 44043943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 37850611 - 37850758
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||||| |||| || |||  ||||  || |  |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37850611 acatcgaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacaccacactcttatccgaaaccttaaaacattaggtttatgggttctcttacttataaggtgtt 37850710  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37850711 caacctctactgttttatgcgatgtgggacatataactcacacttgca 37850758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 30630649 - 30630796
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||  | || ||| || ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||     
T  30630649 acatcgaggccagaacaaccacataagtgatagggacgccccactcttacccaaaactttaaggcaatgtgtttatgggttctcttacttataaagtgtc 30630748  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
     |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  30630749 aaacctttaattttttatccgatgtgagacatataaatcacacttgca 30630796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 145
Target Start/End: Original strand, 5528765 - 5528902
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||| |||||||||| |  ||  ||||||||| ||||||  ||||||||||  |||||  |||||||||||| ||||||||| |||| || ||||    
T  5528765 acatcgaggatagaacaaccgcataaagaagagagacgccacacatttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgagtcctcttatttataagatgtt 5528864  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataact 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5528865 caacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 5528902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 44685546 - 44685456
Alignment:
Q  66 ttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaa-cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44685546 ttaaggcaatgagtttattggtcctcttacttataaggttttcaaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 44685456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 66100 - 66247
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||   ||||| | |||||| |||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  66100 acatcgaggccagaacaaccatacaagt--gagaggcgccacactcttacccaaaaccttaaggccataggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 66197  T
Q  108 c-aacctttactattttatccgatgtgggacat-ataactcacacttgca 155  Q
    | |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  66198 caaacctttacttttctatccgatgtgagacatgattactcacacttgca 66247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 5575249 - 5575110
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||| ||| |  |||  |||||||| |||||| |||| ||||||  |||| || |||  ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5575249 acatcgaggctagaactacctcataag--agagagacgccacactcttatccaaaaccttaaagctatggatttataggtcctcttacttataaggtgtt 5575152  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 149  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5575151 caacctttactcttctatccgacgtgggacatataattcaca 5575110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 22793421 - 22793279
Alignment:
Q  13 gaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaa-tgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaac 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||   |||||||| || |||||||| |||||| |||||| | || ||||||    
T  22793421 gaggccagaacaaccacacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccgtaaggcaaatgggtttatggatcctctcacttataaagttttcaac 22793322  T
Q  112 ctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 154  Q
    || |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22793321 ctctacttttctatacgatgtgggacatataactcacacttgc 22793279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 45839778 - 45839629
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||| |   |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  45839778 acatcgaggccagaacaatcccacaagcaagagagacaccacaatcttacccaaaaccttaaggcattacatttatgggtcttcttacttataaggtgtt 45839679  T
Q  108 c-----aacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |     |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45839678 cgattcaacctttatt-ttctatccgatgtgggacatataactcatacttg 45839629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 340 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 18651713 - 18651565
Alignment:
Q  340 ccgttgaggagaaggggatgttgtacatgcaggtgctccaacgctcaagtcagtgtatgatcaagagtgagagtgaagcatagagagatacatacattat 439  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||     |  ||||   |||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  18651713 ccgttaagaagaagggggtgttgtacctgcagacgctccaacgctcaagtcag-----gtgcaagcaagagaatggagcatagagagatacataccttat 18651619  T
Q  440 gagcttgtcaagagctctttatatagggtcgaggagaccgttgtttagtcatgg 493  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| | |||||||    
T  18651618 gagcttgtcaagagctcattatatagagtttaggagaccgttgtgtggtcatgg 18651565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 19283466 - 19283613
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||| |||||||| ||||| | ||||  |||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||  | ||| |    
T  19283466 acatccaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcgatgagtttatgtgtcctctcatttacaaagtgct 19283565  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19283566 caacctccacttttctatccggtgtgggacatataactcacacttgca 19283613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Original strand, 22077121 - 22077243
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||| |||||||| |  |||  || |||||  ||||| |||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  22077121 acatcgaggcttgaacaaccgcataagtgagggagacgtcacactcttatccaaaaccttagggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtatt 22077220  T
Q  108 caacctttactattttatccgat 130  Q
    ||||||||||| || ||||||||    
T  22077221 caacctttacttttctatccgat 22077243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 155
Target Start/End: Original strand, 21378122 - 21378199
Alignment:
Q  78 gtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21378122 gtttatgggtcctcttacttataagatattcaacctttactgttctatccgatctgggacatataactgacacttgca 21378199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 155
Target Start/End: Original strand, 22077871 - 22077986
Alignment:
Q  39 agagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggaca 138  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | || |||||||| |   |||    
T  22077871 agagacgccacactcttaccccaaacctta-ggctatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttatttttctatccgatttaaaaca 22077969  T
Q  139 tataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||    
T  22077970 tataactcacacttgca 22077986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 155
Target Start/End: Original strand, 1188628 - 1188746
Alignment:
Q  37 agagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 136  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||| |||||| |  | ||||||||  ||| || |||||||| ||| |    
T  1188628 agagagacgccacacttttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgagtcttctcacttataaaatattcaacctccacttttctatccgatatggaa 1188727  T
Q  137 catataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1188728 catataactcacacttgca 1188746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 164
Target Start/End: Original strand, 50051777 - 50051818
Alignment:
Q  123 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50051777 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacat 50051818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 155
Target Start/End: Original strand, 35154150 - 35154197
Alignment:
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35154150 caacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 35154197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 155
Target Start/End: Original strand, 1187404 - 1187522
Alignment:
Q  37 agagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 136  Q
    ||||||||  |||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |  |||| |||||  ||| || ||| ||||||| ||    
T  1187404 agagagacgtcacacttttactcaaaatcttaaggtaatgagtttatgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttatattcgatgtgaga 1187503  T
Q  137 catataactcacacttgca 155  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  1187504 catataattcacacttgca 1187522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 4956292 - 4956218
Alignment:
Q  54 ttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccg 128  Q
    ||||| |||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||    
T  4956292 ttacctaaaactttagagcaatgagtttatggatcctcttacttataagatgttcaacctttacttttctatccg 4956218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 10351278 - 10351202
Alignment:
Q  37 agagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacct 113  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||| |||||| | |||||||||||    
T  10351278 agagagacgccacactcttacccaaaatcttaaagtaatgtgtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacct 10351202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 155
Target Start/End: Original strand, 50469187 - 50469239
Alignment:
Q  103 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50469187 gtgttcaacctttactttattatctgatgtaggacatataactcacacttgca 50469239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 104 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 4878854 - 4878803
Alignment:
Q  104 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4878854 tgttcaagcttcactattttatccgatgtggaacatataactcacaattgca 4878803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 11977091 - 11977026
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggca 73  Q
    |||||||||||||||| ||| | |  |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  11977091 acatcgaggctagaactaccgcacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 11977026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 155
Target Start/End: Original strand, 22077248 - 22077280
Alignment:
Q  123 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077248 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 22077280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 103 - 155
Target Start/End: Original strand, 47379891 - 47379943
Alignment:
Q  103 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47379891 gtgttcaacctccacttttctatccgatgtgggatatataactcacacttgca 47379943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 165
Target Start/End: Original strand, 4266875 - 4266950
Alignment:
Q  90 tcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacata 165  Q
    |||||||| | | ||||||||| |||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  4266875 tcttacttctaatgtgttcaacatttactcttttatctaatgtaggacatataactcacatttgtaaaacaacata 4266950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 385 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 472131 - 472040
Alignment:
Q  385 caagtcagtgtatgatcaagagtgagagtgaagcatagagagatacatacattatgagcttgtcaagagctctttatatagggtcgaggagacc 478  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||| | || |||| |||| ||| ||||  ||||||||||| | ||||||    
T  472131 caagtcagtgtatgat-aagagtgagagccaaacatagagagatacatgccttgtgagtttgttaagtgctc-atatatagggtcaatgagacc 472040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 84
Target Start/End: Original strand, 47380217 - 47380254
Alignment:
Q  47 cacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatg 84  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47380217 cacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatg 47380254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 71)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 22304716 - 22304561
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  22304716 acatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtatt 22304617  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22304616 caacctttactattttatccgatgtgggacatatagctcacacttgcaaaccaaca 22304561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 37990650 - 37990795
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  37990650 acatcgaggctagaacaatcacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgtt 37990749  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37990750 caacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttg 37990795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 43346802 - 43346947
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  43346802 acatagaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttataaggtgtt 43346901  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43346902 caacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 43346947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 39934966 - 39935123
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  39934966 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaactttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggtgtt 39935065  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39935066 caacctttactcttttatccgatgtaggacatataactctcacacttgcaaaccaaca 39935123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 37990988 - 37991133
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  37990988 acatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgatgagtttataggtcctcttacttataaggtgtt 37991087  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37991088 caacctttactattttatccaatgtgagacatataactcacacttg 37991133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15773001 - 15772854
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15773001 acatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 15772902  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15772901 caacatttactcttttatccgatatgggacatataactcacacttgca 15772854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 35946669 - 35946524
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35946669 acatcgaggctagaacaattgcacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 35946570  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35946569 caacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 35946524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4823796 - 4823647
Alignment:
Q  14 aggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacct 113  Q
    ||||||||||| || |  |||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |    
T  4823796 aggctagaacatccgcataagcaaaaaagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcctacttataaggtgtttaactt 4823697  T
Q  114 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4823696 ttactattttatccgatgtgagacttataactcacacttgcaaaccaaca 4823647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 12114573 - 12114720
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12114573 acatcgtggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 12114672  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12114673 caacctttacttttctatccgatgtgggatatataacttacacttgca 12114720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 29644913 - 29645060
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29644913 acatcgaggctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 29645012  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29645013 taacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttgca 29645060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 32589850 - 32589704
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32589850 acatcgagcctagaacaaccacacaagcaagagagacatcgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 32589751  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  32589750 caacctttattattttatcttatgtgggacatat-actcacacttgca 32589704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 33803263 - 33803410
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  || ||||| |||||| ||||||||| |  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  33803263 acatcgaggctagaacaaccacacaagagagggagacgccacactcttacccaataccttaatgcaatgggtttatgggtcctcttacttatatggtgtt 33803362  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33803363 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacaattgca 33803410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 39389217 - 39389062
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||| ||||||||||||   | || |||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| || | |||||||    
T  39389217 acatcaaggctagaacaattgcacaggcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttagttttaaggtgtt 39389118  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39389117 caacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcaaaccaaca 39389062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 54017827 - 54017974
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  |  ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  54017827 acatcgaagctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgagtcctcttacttataaggtgtt 54017926  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54017927 caacctttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 54017974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 54018209 - 54018356
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54018209 acatcgaggctagaacaaccacacaagcatgagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 54018308  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  54018309 caatctttactcttttatccgatgcaggacatataactcacacttgca 54018356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15773341 - 15773192
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaag--agagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtg 105  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  15773341 acatcgaggttagaacaaccacacaagcaagcaagagacatcacactcttacccaaaactttaaggcaatgagcttatgagtcctcttacttataagatg 15773242  T
Q  106 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773241 ttcaacttttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 15773192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 21832356 - 21832501
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |  ||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21832356 acatcgaggctagaacaaccagacaagcaagagagacgccactc--ttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgtt 21832453  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21832454 caacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacacttgca 21832501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 22303966 - 22304104
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||         
T  22303966 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccgcttacttataag----- 22304060  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22304061 --acctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 22304104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 25739436 - 25739583
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  25739436 acatcgaggctagaactaccgcacaagctagagagacgtcacactcttacccaaaacctaaaagcaatgagtttatgggtcctcttacttatatgatgtt 25739535  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25739536 caacttttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 25739583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 29644592 - 29644739
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29644592 acatcgaagctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggttctcttacttataaggtgtt 29644691  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29644692 caacctttactctttaatccgatgtgggacatataactcacacttgca 29644739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 42342399 - 42342546
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||| |||||||||||  ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42342399 acattgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgtt 42342498  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342499 gaacctttactcttttatcggatgtgggacatataactcacacttgca 42342546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 32462911 - 32463057
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||    
T  32462911 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcttcttacttataaggtatt 32463010  T
Q  108 caacc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32463011 caaccttttactcttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 32463057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 41359776 - 41359919
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  41359776 acatcgaggctagaacaaccacacaagcgagagagacgccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtatt 41359875  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  41359876 caacctttactattgtatccgatgtggg----ataactcacacttgca 41359919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 163
Target Start/End: Original strand, 50612461 - 50612618
Alignment:
Q  11 tcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtt-----tatgggtcctcttacttatgaggtg 105  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||  |||  |||     |||| |||||||||||||| |||||    
T  50612461 tcgaggatggaacaaccactcaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagataatatgttagatttatgagtcctcttacttataaggtg 50612560  T
Q  106 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50612561 ttcaatctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 50612618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 52634822 - 52634678
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||  ||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  52634822 acatcaaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc-tcttacttataaggcgtt 52634724  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52634723 caacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 52634678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 42342101 - 42342248
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||    
T  42342101 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggcatt 42342200  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
     ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  42342201 gaacatttactcttttatccgatgtggaacatatgaatcacacttgca 42342248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 39914399 - 39914252
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  39914399 acatcgaggctagaacaaccgcataagtgagagagacaccacactcttatccaaaatattaaggcattaggtttatgggtcctcttatttataaggtgtt 39914300  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39914299 caacctctactgttttatctgatgtgagacatataactcacacttgca 39914252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 25755541 - 25755396
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||  ||||||| || |||| | |||||  |||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  25755541 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacacttttacccacaactttaggacaatggatttatgagtcctcttacttataaggtatt 25755442  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25755441 caacctttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttg 25755396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 31190154 - 31190017
Alignment:
Q  10 atcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttca 109  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||        |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31190154 atcgaggctagaacaacccgacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc--------tatgggtcctctaacttataaggtgttca 31190063  T
Q  110 acctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31190062 acctttactcttttatccgatgtgggacatatcactcacacttgca 31190017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 45395664 - 45395811
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  45395664 acatcgaggctagagcaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgggtttatggatcctcttacttataacgtgtt 45395763  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
     |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  45395764 taacctttactcttttattcgatgtgggatatataacttacacttgca 45395811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 53577507 - 53577364
Alignment:
Q  12 cgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaac 111  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||  |||||||| ||| |||| || | || ||||||||    
T  53577507 cgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaagaccttaaggcaatatgtttatggatccacttatttttaagatgttcaac 53577408  T
Q  112 ctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53577407 ctttactgttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgca 53577364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 45901833 - 45901715
Alignment:
Q  36 aagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacc-tttactattttatccgatgtgg 134  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  | |||||||||||||||    
T  45901833 aagagagacaccacactcttaccaaaaactttaaggccatgagtttatgcgtcctcttacttataaggtgttcaacctttttttcttttatccgatgtgg 45901734  T
Q  135 gacatataactcacacttg 153  Q
    |||||||||||||||||||    
T  45901733 gacatataactcacacttg 45901715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 148
Target Start/End: Original strand, 3135107 - 3135224
Alignment:
Q  31 caagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgat 130  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| |||| || |||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3135107 caagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttatggcagtgggtttatgggttcttttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgat 3135206  T
Q  131 gtgggacatataactcac 148  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3135207 gtgggacatataactcac 3135224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 51886645 - 51886552
Alignment:
Q  71 gcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacat 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51886645 gcaatgagtttatgggtcctcttacttatatgatgttcaacctttactattttattcgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaacat 51886552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8328022 - 8327904
Alignment:
Q  37 agagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 136  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |  |||||||||| ||||||||||| || | |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8328022 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattacgtttatgggttctcttacttataagatattcatcctttactcttttatccgatgtggga 8327923  T
Q  137 catataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8327922 catataactcacacttgca 8327904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 154
Target Start/End: Original strand, 53117986 - 53118131
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  |  |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||  |||||| |||||| |||||||    
T  53117986 acatcgatgctagaacaaccacacttgtgagagagacactacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggttt-tgaatcctctcacttataaggtgtt 53118084  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  53118085 caacctttactcttttatccgatatggaacatataactcacacttgc 53118131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 153
Target Start/End: Original strand, 49336726 - 49336843
Alignment:
Q  36 aagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||| |    
T  49336726 aagagagacaccacactcttacccagaactttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataaggtggtcaacctttacttttctatccgatgtgag 49336825  T
Q  136 acatataactcacacttg 153  Q
    |||| |||||||||||||    
T  49336826 acatgtaactcacacttg 49336843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 1634326 - 1634473
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||| ||| ||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  1634326 acatcgaggctagaacaacca-tatagtgagagagataccgcactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttatgggtcctcttacttataatgtgtt 1634424  T
Q  108 caacc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
     |||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1634425 taaccttttatttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 1634473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 22304300 - 22304238
Alignment:
Q  101 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304300 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 22304238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 32462569 - 32462715
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||| ||||| | | ||| |||||||||| |||||| |||| ||||||  |||| |||||  |||||||| || |||||||||| |||||||    
T  32462569 acatcgaggctaaaacaatcccacaaacaagagagaccccacactcttatccaaaaccttaaagcaataggtttatggatcatcttacttataaggtgtt 32462668  T
Q  108 caacc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  32462669 caaccttttactctttcattcgatgtgggacatataactcacacttg 32462715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 37726577 - 37726495
Alignment:
Q  82 atgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacat 164  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37726577 atggatcctcttacttataaggtattcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaacat 37726495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 3135465 - 3135617
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttat--gggtcctcttac-----ttatg 100  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||| | ||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||     | ||     
T  3135465 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggggtcctcttactaatataata 3135564  T
Q  101 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3135565 aggtgttcaacttttactcttttatctgaggtgggacatataactcacacttg 3135617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 163
Target Start/End: Original strand, 3384317 - 3384432
Alignment:
Q  48 acacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 147  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  3384317 acactcttacccaaaactttaaggcattaagtttatgggtcctcttccttataaagtgtttaacctatactgttttatcatatgtgggacatataactca 3384416  T
Q  148 cacttgcaaaccaaca 163  Q
    | |||||| |||||||    
T  3384417 cgcttgcacaccaaca 3384432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9240296 - 9240149
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||||||| |||| | | |   ||||||||||||||  |||| || |||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9240296 acatcgaggctagaataaccgcactattgagagagacaccacattcttatccgaaatcttaaggtaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgtt 9240197  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    || | ||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9240196 cagcttttacttctctatccgatgtggaacatataactcacacttgca 9240149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 129
Target Start/End: Original strand, 33362327 - 33362425
Alignment:
Q  31 caagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccga 129  Q
    ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  33362327 caagcaagagagagacgccacacttacccaaaatcttaaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttattattttatccga 33362425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 145
Target Start/End: Original strand, 42584864 - 42584970
Alignment:
Q  39 agagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggaca 138  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  42584864 agagacaccacactctttctcaaaatcttaagacaattggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaatctttactcttctatccgatgtgggaca 42584963  T
Q  139 tataact 145  Q
    |||||||    
T  42584964 tataact 42584970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 340 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 5531286 - 5531150
Alignment:
Q  340 ccgttgaggagaaggggatgttgtacatgcaggtgctccaacgctcaagtcagtgtatgatcaagagtgagagtgaagcatagagagatacatacattat 439  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||  || | ||||||||||||||||||| || | | ||||| ||||||||| ||||||| || |    
T  5531286 ccgttaaggagaaggggatgttgtatctgcaggtgctctgacacccaagtcagtgtatgatcaatagcg-gggtgaaacatagagaggtacatactttgt 5531188  T
Q  440 gagcttgtcaagagctctttatatagggtcgaggagac 477  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||    
T  5531187 gagcttgtcgagagcccattatatagtgtcgaggagac 5531150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 11662098 - 11661954
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaatt-ttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||| ||| |||||||||||   ||||||||||  ||||||| | ||||| |||| | ||||||    
T  11662098 acatcgaggctagaacaaccacacaatga-gagagacacctcactcttacccaaaaaccttaaggcaattggtttatgaggcctctcacttttaaggtgt 11662000  T
Q  107 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 152  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  11661999 tcaacctttactcttttatccaatgtggggcatttaactcacactt 11661954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 153
Target Start/End: Original strand, 33175674 - 33175820
Alignment:
Q  12 cgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacaccct--tacccaaaattttaaggcaatgagtttat---gggtcctcttacttatgaggtgt 106  Q
    |||||||||||||| ||| ||||  ||||||||  ||||| ||  |||||||||  ||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||    
T  33175674 cgaggctagaacaatcacacaagtgagagagacgtcacacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttattatgggttctcttacttataaggtgt 33175773  T
Q  107 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  33175774 tcaacctttacttttctatctgatgtgagacatataactcacacttg 33175820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 102
Target Start/End: Original strand, 22303670 - 22303764
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgag 102  Q
    |||||||||||||||||| | | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22303670 acatcgaggctagaacaatcgcacaagtaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttgtgag 22303764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 43346704 - 43346650
Alignment:
Q  101 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43346704 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatacaactcacacttgca 43346650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 11661602 - 11661537
Alignment:
Q  88 cctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11661602 cctcttacttataagatgtttaaccgttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 11661537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 338 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 25071141 - 25071005
Alignment:
Q  338 ccccgttgaggagaaggggat-gttgtacatgcaggtgctccaacgctcaagtcagtgtatgatcaagagtgagagtgaagcatagagagatacatacat 436  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||| ||  | |||||||||||| || || |||||||| |||||  |||||||||||||||||| |    
T  25071141 ccccgttgaggagaagggggttgttgtatctgcaggtgttctgatgctcaagtcagtatacgagcaagagtgggagtggtgcatagagagatacatacct 25071042  T
Q  437 tatgagcttgtcaagagctctttatatagggtcgagg 473  Q
    | |||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||    
T  25071041 tgtgagcttgtcaaaagcttgttatacagggttgagg 25071005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 44160558 - 44160702
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||| |||||  |||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  44160558 acatcgaggctagaacaatcgc--aagtaagagagacgccacattcttacc-aaaaccttaagacaatgggtttatggatcctcttatttataaggtgtt 44160654  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||| | |||||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  44160655 caacctttattgttttatccaatatgaaacatataactgacacttgca 44160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 155
Target Start/End: Original strand, 47964544 - 47964676
Alignment:
Q  23 caaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattt 122  Q
    ||||||| ||||  |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||   | |||||||||  ||  ||     
T  47964544 caaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctcacttatatagcgttcaacctccacatttc 47964643  T
Q  123 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  47964644 tatccgatgcgggacatacaactcacacttgca 47964676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 152
Target Start/End: Original strand, 7767383 - 7767469
Alignment:
Q  66 ttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 152  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| | |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7767383 ttaagacaatgggtttatgagtcctcttagttataaagtgtccaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcagactt 7767469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 39336298 - 39336387
Alignment:
Q  66 ttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||  |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39336298 ttaaagcaatgagtttatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccaactttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 39336387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 52635050 - 52634990
Alignment:
Q  45 accacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtg 105  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  52635050 accacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttatttataaggtg 52634990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 155
Target Start/End: Original strand, 47964955 - 47965073
Alignment:
Q  37 agagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 136  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||| | ||||| ||||||    |||| |||||  ||| || ||||||||||   |    
T  47964955 agagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggcttatgagccctctcacttatataatgtttaacctccacttttctatccgatgtaaaa 47965054  T
Q  137 catataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||||    
T  47965055 catataactcacacttgca 47965073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 39336004 - 39336086
Alignment:
Q  31 caagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacct 113  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||| ||| | | | |||| | |||||||||||    
T  39336004 caagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgattttatgagtcttatcatttataaagtgttcaacct 39336086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Original strand, 46546375 - 46546480
Alignment:
Q  47 cacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 146  Q
    ||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||| | |||| |||||| | |||||||||||  ||  ||  |||| |||| |||||||||||||    
T  46546375 cacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggattctctaacttataaagtgttcaacctccacatttcaatccaatgtaggacatataactc 46546474  T
Q  147 acactt 152  Q
    ||||||    
T  46546475 acactt 46546480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 85
Target Start/End: Original strand, 54017559 - 54017636
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgg 85  Q
    |||||||||| | ||||| |||  ||| || ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  54017559 acatcgaggccaaaacaatcacataagtaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 54017636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 155
Target Start/End: Original strand, 12747878 - 12747910
Alignment:
Q  123 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747878 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 12747910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 8328417 - 8328374
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacac 51  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  8328417 acatcgaggctaaaacaaccccacaagcaagagagacaccacac 8328374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 63
Target Start/End: Original strand, 41359502 - 41359557
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaa 63  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  41359502 acattgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacgccacactcttacccaaaa 41359557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 53596593 - 53596542
Alignment:
Q  37 agagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtc 88  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  53596593 agagagacaccacactcttacctaaaatcttaagtcaatgggtttatgggtc 53596542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 22304340 - 22304302
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacac 46  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22304340 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacac 22304302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 79
Target Start/End: Original strand, 48127642 - 48127684
Alignment:
Q  37 agagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagt 79  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  48127642 agagagacaccacacacttacccaaaatcttaaggtaatgagt 48127684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 16143550 - 16143505
Alignment:
Q  43 acaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtc 88  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16143550 acactacactcttacccaaaactttaaggcaatgagcttatgggtc 16143505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 527 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 25070972 - 25070911
Alignment:
Q  527 agattgaatgaacgttaccaaccattggtagcagttatagactattattggtaggagaggat 588  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  25070972 agattaaatgaccgttacaaaccattagtagccgttatatgctattattggttggagaggat 25070911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 25317290 - 25317161
Alignment:
Q  23 caaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattt 122  Q
    ||||||| ||||  ||||| |||| ||||  ||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| | |||  | ||| |||||||  ||| ||     
T  25317290 caaccacacaagtgagagacacactacacttttacccaaaaccttaaggcaacaagtttatgggtcctctcagttacaaagtgctcaacctccacttttc 25317191  T
Q  123 tatccgatgtgggacatataactcacactt 152  Q
     ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  25317190 catctggtgtgggacacataactcacactt 25317161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 113; Significance: 9e-57; HSPs: 61)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 6500597 - 6500442
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  6500597 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttaaaggtcctcttacttataaggtgtt 6500498  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500497 caacctttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttgcaaaccaacat 6500442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 27502047 - 27502202
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27502047 acatcgaggatagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttaccaaaaatcttaaggcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 27502146  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27502147 taacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 27502202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 32487540 - 32487386
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||  ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32487540 acatcgaggctagaacaaccacataagcaagagatacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat-aggtgtt 32487442  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487441 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 32487386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 40296326 - 40296473
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40296326 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 40296425  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40296426 caaccttttctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 40296473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 18603131 - 18603286
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18603131 acatcgaggctagaactaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 18603230  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18603231 caacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgaaaactaaca 18603286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 158
Target Start/End: Original strand, 36492228 - 36492378
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||  | |||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  36492228 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaacctaaaggtaatgtgtttattggtcctcttacttataaggtgtt 36492327  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 158  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36492328 caacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 36492378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 41170777 - 41170627
Alignment:
Q  12 cgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaac 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41170777 cgaggctagaacaaccacacaagcaagaaaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaac 41170678  T
Q  112 ctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaac 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  41170677 ctttactattttatccgatgtgggacatataactcacaattacaaaccaac 41170627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 6500969 - 6500815
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  6500969 acatcgaggctagaataaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtccttttatttataaggtgtt 6500870  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500869 caacctttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttgcaaaccaaca 6500815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Original strand, 13415774 - 13415918
Alignment:
Q  11 tcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaa 110  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13415774 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 13415873  T
Q  111 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13415874 cctttactaatttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 13415918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 163
Target Start/End: Original strand, 9498692 - 9498820
Alignment:
Q  35 caagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  9498692 caagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattctatctgatgtga 9498791  T
Q  135 gacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9498792 gacatataactcacatttgcaaaccaaca 9498820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 624343 - 624188
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| | |||||    
T  624343 acatcgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggctatgggtttatgggtcatcttacttataacgtgtt 624244  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  624243 caacctttactattttatacaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 624188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 3295026 - 3295172
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3295026 acatcgaggctacaacaaccacacaaccaagagagacaccacactcatacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcttcttacttataaggtgtt 3295125  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3295126 caacctttactattttatccgatgtgggacatat-actcacacttgca 3295172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15370246 - 15370099
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  ||  ||||||||||||||||||||| || ||||    
T  15370246 acatcgaggctagaacaatcccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctgtggatttatgggtcctcttacttataagatgtt 15370147  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370146 caacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 15370099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 152
Target Start/End: Original strand, 3295356 - 3295498
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3295356 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaacacactcttacc-aaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 3295454  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3295455 caacctttactattttatccgatgtggaacatat-actcacactt 3295498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 26074157 - 26074304
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||| |||| ||||||| | ||  ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  26074157 acatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttcatgggtcctcttacatatgaggtgtt 26074256  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26074257 caacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgca 26074304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 41632929 - 41632782
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41632929 acatcgagactaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaagcattgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 41632830  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  41632829 caacctttacttttctatccgatgtgagacatataacttacacttgca 41632782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 299636 - 299490
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||||||| |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  299636 acatcgatgctagaacaaccgtacaagcaatagagacgccacactcttacacaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcatcttacttataaggtgtt 299537  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  299536 caacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 299490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 26074759 - 26074614
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||| |||| ||||||| | ||  ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26074759 acatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 26074660  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26074659 caacctttactcttttatccgatatggaacatataactcacacttg 26074614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 25328082 - 25327938
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25328082 acattgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 25327983  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 152  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25327982 caacttttactgttttatccgatgtaggacatataactcacactt 25327938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 6224338 - 6224198
Alignment:
Q  13 gaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacc 112  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||  ||| |||||||| |||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6224338 gaggctagaccaaccgcacaagcaactgaggcaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 6224239  T
Q  113 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6224238 tttactcttttatccgaagtgggacatataactcacacttg 6224198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 148
Target Start/End: Original strand, 11416988 - 11417128
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||| |||||||||| | | ||||||||||||| | ||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11416988 acatcgaagctagaacaatcccacaagcaagagagagatcacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggtgtt 11417087  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11417088 caacctttactattttatccgatgtggaacatataactcac 11417128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 12662663 - 12662810
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||| |||||  |||||||||  |||||||||| |  ||||    
T  12662663 acatcgaggctagaagaaccccacaagcaagaaaggcaccacactcttacccaaaaacttaagacaatggatttatgggttttcttacttataaaatgtt 12662762  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12662763 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 12662810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 33747918 - 33747783
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||    
T  33747918 acatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcctcttacttataaagtatt 33747819  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataa 143  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33747818 taacctttactattttatccgatgtgggacatataa 33747783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 26075172 - 26075318
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacaccctt-acccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgt 106  Q
    |||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||  ||||| ||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26075172 acatcgaggctaaaacaaccacacttgcaagagagacgacacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 26075271  T
Q  107 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  26075272 tcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataaatcacacttg 26075318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 42405609 - 42405752
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  |||||||| |  ||||||| ||||| |||||| | |||||||    
T  42405609 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagag--acaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtccttttacttgtaaggtgtt 42405706  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42405707 caacctttactattttatccgatgttggacatataactcacacttg 42405752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 145
Target Start/End: Original strand, 34753036 - 34753173
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  34753036 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttcttacttataaggtgtt 34753135  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataact 145  Q
    |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  34753136 caacttttacttttctatccaatgtgggacatataact 34753173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 623965 - 623810
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| || ||||||||| ||  ||||||| | | |||||    
T  623965 acattgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggctataagtttatggctcaacttacttgtaaagtgtt 623866  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  623865 caacctttactattatatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 623810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 36568580 - 36568725
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| |||||||    
T  36568580 acatcgaggatagaacaaccacacaag--agagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttacgggtcatctcacttataaggtgtt 36568677  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36568678 caacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36568725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 35150153 - 35150007
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||| |||| |||||||||||| | ||  |||||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  35150153 acattgaggttagaacaaccacactagtgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtc-tcttacttataaggtgtt 35150055  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35150054 caaccttgactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 35150007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Original strand, 5723811 - 5723957
Alignment:
Q  17 ctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaaccttta 116  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| | || ||| |||||||  ||||| |||| | || |||||| ||||||| ||| | ||||||||| ||||    
T  5723811 ctagaacaaccgcacaagcaagagagacactatactctttcccaaaaccttaagacaataaattaatgggttctcttacatataatgtgttcaactttta 5723910  T
Q  117 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5723911 ttattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 5723957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 158
Target Start/End: Original strand, 29549278 - 29549416
Alignment:
Q  20 gaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttacta 119  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||| ||||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  29549278 gaacaaccacataagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggtaatgtgtttatgggtcttcttacttatatggtgttcatcctttacta 29549377  T
Q  120 ttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 158  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29549378 ttttatctgatatggaacatataactcacacttgcaaac 29549416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 1028528 - 1028673
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||  ||  |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  1028528 acatcgaggctagaacaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggttataggtttatgggtcctcttacttataaagtgtt 1028627  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1028628 catcctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 1028673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 24489217 - 24489360
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||| || |||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  24489217 acatcgagactagaacaaccgcacaagtaaaagagacgccacactcttacgcaaaatcttaaggcaatgggtttatgggt--tcttactaataaggtgtt 24489314  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
     ||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24489315 taaccttttcttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 24489360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 15370549 - 15370428
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15370549 acatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccacactcttacgcaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 15370450  T
Q  108 caacctttactattttatccga 129  Q
    |||| |||||| ||| ||||||    
T  15370449 caacatttactgtttcatccga 15370428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 153
Target Start/End: Original strand, 26074818 - 26074938
Alignment:
Q  34 gcaagagagacaccacaccctt-acccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgt 132  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||||| ||||  |||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26074818 gcaagagagacgccacactctttacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcctacttatattgtgttcaacctttactcttttatccgatgt 26074917  T
Q  133 gggacatataactcacacttg 153  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26074918 gggacatataactcacacttg 26074938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 7768925 - 7768842
Alignment:
Q  80 ttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  7768925 ttatgggtccttttacttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtaggatatataactcacacttgaaaaccaaca 7768842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 26590921 - 26591068
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||  |||||||| |||||| ||||| |||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  26590921 acatcgaggttagaacaaccacactagtgagagagacgccacactcttactcaaaaccttaaggcattgaatttatggatcctcttacttataaggtgtt 26591020  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| ||  || |||| ||| |||| ||| |||||||||||    
T  26591021 caacctttacttttcgattcgatatggaacatttaaatcacacttgca 26591068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 301095 - 300961
Alignment:
Q  11 tcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaa 110  Q
    ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||        ||||||||||| |||| |||||    
T  301095 tcgagacttgaacagccacacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaatcttaaggcaatggatt--------ctcttacttataaggtattcaa 301004  T
Q  111 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  301003 cctttactgttttatctgatgtgggacatataacccacacttg 300961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 2411152 - 2411010
Alignment:
Q  10 atcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttca 109  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || |||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||||    
T  2411152 atcgaggttagaacaatcattcaagtaatagagaaactacactcttactcaaaaccttaaggcaataagtttatgggttctcttacttacaagatgttca 2411053  T
Q  110 acctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 152  Q
    || ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  2411052 acttttacttctctatccaatgtaggacatataactcacactt 2411010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 38427694 - 38427553
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||  ||||| ||||| |||||  ||||| |||||  || ||||||||||| |||||| || ||||    
T  38427694 acatcgaggttagaacaaccgcacaagtgagagagacgtcacactcttacacaaaaccttaagacaatggattaatgggtcctct-acttataagatgtt 38427596  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 150  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38427595 caacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacac 38427553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 35914972 - 35914852
Alignment:
Q  32 aagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatg 131  Q
    |||||||||||| ||||||  |||| |||| | |||| |||||||  |||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35914972 aagcaagagagataccacattcttatccaataatttagggcaatggatttacgggtcttcttacttataaaatgttcaacctttactcttttatccgatg 35914873  T
Q  132 tgggacatataactcacactt 152  Q
    || ||||||||||||| ||||    
T  35914872 tgtgacatataactcatactt 35914852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 26074395 - 26074320
Alignment:
Q  78 gtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26074395 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaatctttagttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 26074320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 42508701 - 42508614
Alignment:
Q  66 ttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  42508701 ttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttattagatgtttaacctttacttttctatccgatgtgggatatataattcacacttg 42508614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 35167849 - 35167994
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||   |||||||| ||||| |||||| ||||  | ||||||||   |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  35167849 acatcgatgctagaacaaccacactagtgtgagagacatcacactcttaccaaaaacatcaaggcaatagatttatgggtcatcctacttataaggtgtt 35167948  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| || | |||||||| |||||    
T  35167949 caacctttactcttttatctgatgtgagatacataactcatacttg 35167994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 31509710 - 31509623
Alignment:
Q  68 aaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||  ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31509710 aaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgca 31509623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 152
Target Start/End: Original strand, 41635212 - 41635346
Alignment:
Q  18 tagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttac 117  Q
    |||| ||||||  |||| || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  41635212 tagagcaaccatacaagtaaaagagatactacactcttacctaaaattttaagacaatggatttatggatcctcttatttataaggtgttcaacatttac 41635311  T
Q  118 tattttatccgatgtgggacatataactcacactt 152  Q
    | ||||||| |||| |  |||||||||||| ||||    
T  41635312 tcttttatctgatgggaaacatataactcatactt 41635346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 154
Target Start/End: Original strand, 36521946 - 36522053
Alignment:
Q  47 cacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 146  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| | |||    |||||||||||  ||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  36521946 cacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctctcatttaaagagtgttcaacctcaacttttctatctgatgtgggacatataactc 36522045  T
Q  147 acacttgc 154  Q
    ||||||||    
T  36522046 acacttgc 36522053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 39309754 - 39309686
Alignment:
Q  85 ggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39309754 ggtcctcttatttataatgtgttcaacatttacccttttatccgatgtgggacatataactcatacttg 39309686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 5660338 - 5660287
Alignment:
Q  115 tactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacatag 166  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5660338 tactattttattcgatgtggaacatataactcacatttgcaaaccaacatag 5660287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 152
Target Start/End: Original strand, 36522277 - 36522392
Alignment:
Q  37 agagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 136  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||||  |||| |||||| |||||||| |||||| |  |||||||| |  | | || ||||| ||||| ||    
T  36522277 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaagataatgggtttattggtcctctcacttataaaatgttcaacttccatttttctatccaatgtgaga 36522376  T
Q  137 catataactcacactt 152  Q
    ||||||||||||||||    
T  36522377 catataactcacactt 36522392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 38427368 - 38427310
Alignment:
Q  6 caacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaat 64  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  38427368 caacatcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaat 38427310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 63
Target Start/End: Original strand, 26900028 - 26900083
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaa 63  Q
    ||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26900028 acatcaaggctagaacaaacccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa 26900083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 31509856 - 31509745
Alignment:
Q  31 caagcaagagagacaccacacccttacccaaaatttt-aaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccga 129  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||   | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||  ||| || |||||||    
T  31509856 caagcgagagagacaccacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccga 31509757  T
Q  130 tgtgggacatat 141  Q
    |||| |||||||    
T  31509756 tgtgagacatat 31509745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 98
Target Start/End: Original strand, 36527117 - 36527196
Alignment:
Q  19 agaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttactta 98  Q
    |||||| |||| ||||  ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  36527117 agaacagccacacaagtgagagagacagcacactcttatccaaaatcttaaggcaatgcgtttatggatcctctcactta 36527196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 35150789 - 35150747
Alignment:
Q  113 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35150789 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 35150747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 35151080 - 35151038
Alignment:
Q  113 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35151080 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 35151038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 6225104 - 6225047
Alignment:
Q  95 cttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 152  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  6225104 cttataaggtgttcaacctttattcttttatctgatgtgggatatataactcagactt 6225047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 13042657 - 13042606
Alignment:
Q  37 agagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtc 88  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  13042657 agagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 13042606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 19275652 - 19275566
Alignment:
Q  31 caagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttact 118  Q
    ||||| ||| |||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| ||||    
T  19275652 caagcgagacagacgccacaatcttacccaaaatcttaagacaatgaatttatgggtcttcttccttat-aagtgttcaacctctact 19275566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 163
Target Start/End: Original strand, 22298956 - 22299014
Alignment:
Q  106 ttcaacctttactatttt-atccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22298956 ttcaacctttattatttttatctgatgtgagacatataacccacacatgcaaaccaaca 22299014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 42524792 - 42524719
Alignment:
Q  79 tttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||||| ||||||||| | || || |||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  42524792 tttatgagtcctcttattcataagatgttcaac-tttacttttctatccgatgtgagacatataattcacacttg 42524719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 112; Significance: 4e-56; HSPs: 59)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 1085627 - 1085774
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  1085627 acatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgtt 1085726  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085727 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 1085774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 37533022 - 37533176
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37533022 acatcgaggttagaacaagcgcacaagcaagagagacaccacact-ttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 37533120  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533121 caacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 37533176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 7517727 - 7517580
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7517727 acatcgaggctagaacaaccacacaagtgagacagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 7517628  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517627 caacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 7517580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 155
Target Start/End: Original strand, 23390 - 23535
Alignment:
Q  10 atcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttca 109  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23390 atcgaggctagaacaaccgcacatgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttca 23489  T
Q  110 acctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23490 acctttactattgtatccgatgtggaacatataactcacaattgca 23535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 29157712 - 29157559
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||| || ||||| |||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  29157712 acatcaagactagagcaactacacgagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcgtcttacttataaggtgtt 29157613  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 161  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29157612 caacctttactattttatccggtgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 29157559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 30244417 - 30244272
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  30244417 acatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtctt 30244318  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30244317 caacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 30244272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 45433388 - 45433243
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  45433388 acatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatgagttctcttacttataaggtgtt 45433289  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45433288 caacctttactcttttatccgatgtggatcatataactcacacttg 45433243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 11845338 - 11845198
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11845338 acatcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgtt 11845239  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11845238 caacctttactattttatccgatgtggaacatataactcac 11845198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 164
Target Start/End: Original strand, 37533375 - 37533531
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37533375 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgtt 37533474  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacat 164  Q
    |||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  37533475 caacctttactattttattcaatgtagaacatataactcacacttacaaatcaacat 37533531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 22567050 - 22567196
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22567050 acatcgaggcccgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 22567149  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22567150 caacctttactcttttatccgatgt-ggacatattactcacacttgca 22567196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 6054707 - 6054562
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||| | |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6054707 acatcaaggctagaacaaccatacaagtaggagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 6054608  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6054607 caacatttactattttatccgatgtgagacatataactaacacttg 6054562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 7554154 - 7554025
Alignment:
Q  26 ccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttat 125  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7554154 ccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttat 7554055  T
Q  126 ccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7554054 ccgatgtgggacatataactcacacttgca 7554025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 45434783 - 45434638
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||  | |||| |||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45434783 acatcgaggctagaacaactccacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcagtaagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 45434684  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45434683 caacctttacttttttatccgatgtgggacatataacttacacttg 45434638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 45754862 - 45754718
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  45754862 acatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgagtcatcttacttataaggtgtt 45754763  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45754762 caacatttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttg 45754718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 30245220 - 30245079
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||     ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  30245220 acatcgaggcttgaacaaccac----acaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcgtcttacttataaggtgtt 30245125  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30245124 caacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttg 30245079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19122878 - 19122740
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19122878 acatcgagactagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgagtcctcttacttataaggtgtt 19122779  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19122778 caacctttactattttatccgatgt-ggacatataactca 19122740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 36939744 - 36939891
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||  ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36939744 acatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagaaacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgtt 36939843  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36939844 caacttttactattttatacgatttgggacatataactcacacttgca 36939891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 40094785 - 40094932
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40094785 acatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacgatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 40094884  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
     |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40094885 gaacctttactcttttattcgatgtgagacatataactcacacttgca 40094932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24177579 - 24177435
Alignment:
Q  11 tcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaa 110  Q
    |||||||||  |||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||     
T  24177579 tcgaggctaagacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttaccaaaaactttaaggcaatgggtttatgggtccgcttacttataaggtgttcag 24177480  T
Q  111 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24177479 cctttactcttttatccgatgtgggacatataactcatacttgca 24177435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 14681627 - 14681502
Alignment:
Q  38 gagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14681627 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggccctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggac 14681528  T
Q  138 atataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  14681527 atataacttacacttgcaaaccaaca 14681502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 155
Target Start/End: Original strand, 22566702 - 22566820
Alignment:
Q  36 aagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 135  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22566702 aagagagac-ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggg 22566800  T
Q  136 acatataactcacacttgca 155  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  22566801 acatattactcacacttgca 22566820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Original strand, 34218045 - 34218186
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  34218045 acatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttataaggtgtt 34218144  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 149  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34218145 caacatttacttttttatccgatgtgagacatataactcaca 34218186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 155
Target Start/End: Original strand, 1085282 - 1085407
Alignment:
Q  31 caagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgat 130  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1085282 caaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttatgagttgttcaacttttactattttatccgat 1085381  T
Q  131 gtgggacat-ataactcacacttgca 155  Q
     |||||||| | ||||||||||||||    
T  1085382 atgggacataaaaactcacacttgca 1085407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 47129242 - 47129097
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  |  ||||||||||||||| | |||||||||  |||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  47129242 acattgaggctagaacaaccacacttgtgagagagacaccacactcctacccaaaaccttaaagcgatgggtttatgggtcctcttacttataagaggtt 47129143  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47129142 caacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 47129097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 9901786 - 9901648
Alignment:
Q  12 cgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaac 111  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||| || ||||||||    
T  9901786 cgaggctagaacaaccgcactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatggatcctc-tacgtataagatgttcaac 9901688  T
Q  112 ctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 152  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9901687 ctttactgttttatccgatgt-ggacatataactcacactt 9901648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16569316 - 16569196
Alignment:
Q  35 caagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 134  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||     
T  16569316 caagagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtga 16569217  T
Q  135 gacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16569216 gacatataactcacacttgca 16569196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 155
Target Start/End: Original strand, 16596346 - 16596466
Alignment:
Q  35 caagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 134  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||     
T  16596346 caagagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtga 16596445  T
Q  135 gacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16596446 gacatataactcacacttgca 16596466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 8128452 - 8128599
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  8128452 acatcgatgctagaacaaccacataagcgagagtgacaccacactcttaaccaaaaccttaaggttatgggtttatgggtcctcttacatataaggtgtt 8128551  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8128552 caacctttatttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 8128599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 155
Target Start/End: Original strand, 118318 - 118459
Alignment:
Q  16 gctagaacaaccactcaagcaagaga--gacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacct 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||||  ||| || |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  118318 gctagaacaaccacacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttacggtaatgggtttatggatcctcttacttattaggtgttcaacct 118417  T
Q  114 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  118418 ttacttttctatctgatgtgggacatataacttacacttgca 118459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 36623096 - 36622960
Alignment:
Q  19 agaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttact 118  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||| ||||| || | |||||||||  |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| |  |||| ||||||||||    
T  36623096 agaacaatcacacaagtaagagaggcaccatactcctacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcctcctacttataaaatgtttaacctttact 36622997  T
Q  119 attttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36622996 attttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36622960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20599463 - 20599317
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacaccct--tacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtg 105  Q
    ||||| ||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | |||    
T  20599463 acatcaaggttaaaacaaccatacaagcaagagagacaccacactctcttacccaaaacgttaaggcaatgagtttatatgtcctcttatttataaagtg 20599364  T
Q  106 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 152  Q
    || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20599363 tttatcctttacttttttatccgatatgggacatataactcacactt 20599317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 30032714 - 30032572
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||   ||||| |||||||||||  ||||||| ||  |||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  30032714 acatcgaggatagaacaaccgcacaagcaagagagatgtcacactcttacccaaaaccttaaggctataggtttatggatactcttacttataaggtgtt 30032615  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 150  Q
    ||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30032614 caacacttactcttttattcgatgtgggacatataactcacac 30032572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 152
Target Start/End: Original strand, 24838724 - 24838857
Alignment:
Q  20 gaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcct-cttacttatgaggtgttcaacctttact 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||  ||||| ||| | |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24838724 gaacaaccacacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaacgggtttatggatccttcttacttataaggtgttcaacctttact 24838823  T
Q  119 attttatccgatgtgggacatataactcacactt 152  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24838824 cttttattcgatgtgagacatataacttacactt 24838857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 155
Target Start/End: Original strand, 40230328 - 40230449
Alignment:
Q  34 gcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg 133  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||  ||||| | ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  40230328 gcaagagagacaccagacttttacccaaaaccttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacttttacttttttattcgatgtg 40230427  T
Q  134 ggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  40230428 ggacatataacttacacttgca 40230449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 43241616 - 43241495
Alignment:
Q  34 gcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg 133  Q
    |||||||||||| || ||  ||||| ||||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  43241616 gcaagagagacatcatacttttacctaaaaccttaagtcaataagtttatgagtccttttacttataaggtgttcaacctttatttttttatccgatgtg 43241517  T
Q  134 ggacatataactcacacttgca 155  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  43241516 gaacatataactcacacttgca 43241495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 155
Target Start/End: Original strand, 28301613 - 28301701
Alignment:
Q  67 taaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28301613 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcagcttttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgca 28301701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 152
Target Start/End: Original strand, 41910657 - 41910749
Alignment:
Q  60 aaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 152  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41910657 aaaatcttaagccaatgggtttatgggtcctctcagttataaggtattcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 41910749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 37167928 - 37167808
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||||       ||||    
T  37167928 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagtcaatggatttatggatcctcttact------ctgtt 37167835  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgg 134  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||    
T  37167834 caacatttactattttatctgatgtgg 37167808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30245567 - 30245494
Alignment:
Q  82 atgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30245567 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 30245494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30255412 - 30255339
Alignment:
Q  82 atgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30255412 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacgcacacttgca 30255339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 155
Target Start/End: Original strand, 36534825 - 36534942
Alignment:
Q  38 gagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 137  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |  |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  36534825 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaagactttaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctctactgttttatccgaggtgggac 36534924  T
Q  138 atataactcacacttgca 155  Q
    |||||| | |||||||||    
T  36534925 atataagttacacttgca 36534942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 30253635 - 30253534
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||     ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  30253635 acatcgaggcttgaacaaccac----acaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttataaggtctt 30253540  T
Q  108 caacct 113  Q
    ||||||    
T  30253539 caacct 30253534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 41854781 - 41854635
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||| |||| ||||  ||||| |||||||||||  |||||||| |   ||||| |||| |||| ||||| |||||||    
T  41854781 acattgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattatatttataggtcatcttgcttataaggtgtt 41854682  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  41854681 caacctttactctttta-ctgatgtgggacatataactcatacttgca 41854635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30244771 - 30244701
Alignment:
Q  85 ggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30244771 ggtcctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 30244701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 155
Target Start/End: Original strand, 36109007 - 36109075
Alignment:
Q  87 tcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  36109007 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagaaatataactcacacttgca 36109075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 109
Target Start/End: Original strand, 28300264 - 28300366
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttat-gggtcctcttacttatgaggtgt 106  Q
    ||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  28300264 acatcgaggcccgaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatggggttctcttacttataaggtgt 28300363  T
Q  107 tca 109  Q
    |||    
T  28300364 tca 28300366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 337 - 464
Target Start/End: Original strand, 18485180 - 18485303
Alignment:
Q  337 accccgttgaggagaaggggatgttgtacatgcaggtgctccaacgctcaagtcagtgtatgatcaagagtgagagtgaagcatagagagatacatacat 436  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| | |||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||||| || ||   ||||||||||||||||||| |    
T  18485180 accccgtttaggagaagggggtgttgtacctacaggcgctccgaggctcaagtcagtatatgaacaagagaga-ag---agcatagagagatacatacct 18485275  T
Q  437 tatgagcttgtcaagagctctttatata 464  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||    
T  18485276 tgtgagcttgtcaagaactcattatata 18485303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 47129516 - 47129450
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaa 74  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  47129516 acatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 47129450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 14681324 - 14681281
Alignment:
Q  118 tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 161  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14681324 tattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 14681281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 59
Target Start/End: Original strand, 28300579 - 28300630
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttaccc 59  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28300579 acatcgaggctagaataaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccc 28300630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 413 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 26012310 - 26012245
Alignment:
Q  413 tgaagcatagagagatacatacattatgagcttgtcaagagctctttatatagggtcgaggagaccg 479  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  26012310 tgaagcatagagagatacgtacattgtgagcttgtcaagaggtgtttatata-ggtcaaggagaccg 26012245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 155
Target Start/End: Original strand, 40094502 - 40094552
Alignment:
Q  105 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40094502 gttcaacctttactcttttatctgatgttggacatataactcacacttgca 40094552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 45755072 - 45755010
Alignment:
Q  10 atcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggc 72  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45755072 atcgaggcttgaacaaccacacaagtaagggagacaccacacttttacccaaaattttaaggc 45755010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 150
Target Start/End: Original strand, 44361545 - 44361616
Alignment:
Q  78 gtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 150  Q
    |||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  44361545 gtttatggatcatcttacttaa-aggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcacac 44361616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 63
Target Start/End: Original strand, 37532762 - 37532817
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaa 63  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  37532762 acatcgaggctagaacaacagcacaagctagagagacaccacactcttacccaaaa 37532817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 87
Target Start/End: Original strand, 40094424 - 40094503
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggt 87  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||| |||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  40094424 acatcggggctagaacaaccacataagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaactttaaagtaatgagtttatgggt 40094503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 153
Target Start/End: Original strand, 36967335 - 36967385
Alignment:
Q  103 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36967335 gtgtttaatctttacttttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 36967385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 88
Target Start/End: Original strand, 21416181 - 21416232
Alignment:
Q  37 agagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtc 88  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  21416181 agagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 21416232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 99
Target Start/End: Original strand, 4124128 - 4124190
Alignment:
Q  37 agagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttat 99  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4124128 agagagacaccacacttttatccaaaaccttaatgcaatgagtttattggtcctctcacttat 4124190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 110; Significance: 6e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 525 - 670
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  525 acatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 624  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  625 caacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttg 670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 158 - 308
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  |  |||   ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  158 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaaccta-aagt--atg-gtttatgg-tcctcttacttataaggtgtt 252  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  253 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5544 - 5396
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaat-tttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgt 106  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  5544 acatcgaggcttgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaactttaagacaatatgtttatgggccctcttacttataaggtgt 5445  T
Q  107 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5444 tcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 5396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5917 - 5777
Alignment:
Q  20 gaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattt-----taaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctt 114  Q
    |||||||| | |||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||     |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5917 gaacaaccccacaagtaaaagagacaccacactcttactcaaaatttaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctt 5818  T
Q  115 tactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5817 tactattttatccgatgtgcgacatataactcacacttgca 5777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 90; Significance: 5e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 1117 - 1262
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  1117 acatcgaggctagaacaaccacataaacaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctttttcttataaggtgtt 1216  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1217 caacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttg 1262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 108
Target Start/End: Original strand, 1731 - 1802
Alignment:
Q  37 agagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1731 agagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctcacttataaggtgttc 1802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 155
Target Start/End: Original strand, 3092 - 3143
Alignment:
Q  104 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3092 tgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacctgca 3143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5477 - 5357
Alignment:
Q  35 caagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 134  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  5477 caagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgg 5378  T
Q  135 gacatataactcacacttgca 155  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  5377 aacatataactcacacttgca 5357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5129 - 4982
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    |||||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||| | |||||||| || | ||    
T  5129 acatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccataaggcaatgagtttatgggtctttttacttataagatatt 5030  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
     |||||||||| || | ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5029 aaacctttactgttctctccgatgtgagacatataattcacacttgca 4982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 47507 - 47360
Alignment:
Q  8 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgtt 107  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  47507 acatcgaggttagaacaaccgcgcaagcaagagagacaccacatttttacccaaaactttaaggcaatgggtttatggattctcttacttataaggtgtt 47408  T
Q  108 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 155  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  47407 caaactttactattttatcggatgtgagacatttaattcacacttgca 47360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1482 (Bit Score: 70; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1482
Description:

Target: scaffold1482; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 337 - 478
Target Start/End: Original strand, 1610 - 1750
Alignment:
Q  337 accccgttgaggagaaggggatgttgtacatgcaggtgctccaacgctcaagtcagtgtatgatcaagagtgagagtgaagcatagagagatacatacat 436  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |    
T  1610 accccgttgaggagaagggggtgttgtatctgcatgtgctccgacgcccaagtcaatgtatgaacaagagtg-gggtgaagcatagagagatacatacct 1708  T
Q  437 tatgagcttgtcaagagctctttatatagggtcgaggagacc 478  Q
    | |||| ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  1709 tgtgagattgtccagagctcattatatagagtctaggagacc 1750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 68; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 155
Target Start/End: Original strand, 17496 - 17614
Alignment:
Q  39 agagacaccacacccttacccaaaatt--ttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 136  Q
    |||||||||| || |||||||||||    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17496 agagacaccatactcttacccaaaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgtga 17595  T
Q  137 catataactcacacttgca 155  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17596 catataactcacacttgca 17614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 60; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 153
Target Start/End: Original strand, 10192 - 10267
Alignment:
Q  78 gtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10192 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttaccattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 10267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 39962 - 39840
Alignment:
Q  31 caagcaagagagacaccacacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactattttatccgat 130  Q
    ||||| ||||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||| |||||||   || ||| |||||| | | || |||||   ||| || ||||||||    
T  39962 caagcgagagagacaccacatttttaaccaaaattttaaggtaataagtttatatctcatctcacttataaagagtccaaccaccacttttctatccgat 39863  T
Q  131 gtgggacatataactcacacttg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  39862 gtgggacatataactcacacttg 39840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 39588 - 39459
Alignment:
Q  23 caaccactcaagcaagagagacacca-cacccttacccaaaattttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttatgaggtgttcaacctttactatt 121  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| || |||||||   |||||| | |||||| |||||| ||| |||||||||  ||| ||    
T  39588 caaccacacaagcaagagagacgccaacacttttacccaaaactt-aaggcaacatgtttatagttcctctcacttataaggagttcaacctccactttt 39490  T
Q  122 ttatccgatgtgggacatataactcacacttg 153  Q
     ||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  39489 ctatgcg-tgtgagacatataactcacacttg 39459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University