View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5192-Insertion-7 (Length: 534)

Name: NF5192-Insertion-7
Description: NF5192
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5192-Insertion-7
NF5192-Insertion-7
[»] chr3 (95 HSPs)
chr3 (7-534)||(54593488-54594017)
chr3 (7-534)||(6095457-6095984)
chr3 (7-513)||(30235908-30236415)
chr3 (7-534)||(49199322-49199856)
chr3 (7-534)||(46860254-46860785)
chr3 (16-471)||(4569743-4570202)
chr3 (7-509)||(47304035-47304543)
chr3 (7-390)||(34490996-34491379)
chr3 (7-509)||(41819404-41819906)
chr3 (7-534)||(43401654-43402175)
chr3 (7-534)||(43403597-43404118)
chr3 (7-534)||(36018634-36019159)
chr3 (7-534)||(55301827-55302350)
chr3 (168-480)||(46173311-46173615)
chr3 (167-390)||(40734442-40734665)
chr3 (178-385)||(40735337-40735545)
chr3 (167-390)||(44331489-44331712)
chr3 (167-390)||(29196387-29196612)
chr3 (167-390)||(5236458-5236680)
chr3 (30-367)||(5433906-5434239)
chr3 (167-390)||(44700480-44700703)
chr3 (167-390)||(19683889-19684113)
chr3 (167-383)||(22835010-22835226)
chr3 (167-390)||(45095109-45095331)
chr3 (145-324)||(31340268-31340447)
chr3 (167-390)||(9581227-9581450)
chr3 (196-390)||(7762237-7762433)
chr3 (167-375)||(760791-760999)
chr3 (167-371)||(29810812-29811016)
chr3 (178-390)||(29813017-29813230)
chr3 (167-390)||(29682303-29682526)
chr3 (167-382)||(31314389-31314604)
chr3 (178-390)||(16498984-16499196)
chr3 (167-390)||(37408403-37408626)
chr3 (178-390)||(51398768-51398981)
chr3 (7-230)||(40913121-40913350)
chr3 (178-401)||(53921493-53921717)
chr3 (167-390)||(23200138-23200360)
chr3 (167-390)||(39153362-39153585)
chr3 (167-390)||(5258144-5258368)
chr3 (169-401)||(32891049-32891282)
chr3 (167-390)||(23197939-23198161)
chr3 (166-390)||(9666467-9666693)
chr3 (178-390)||(7764422-7764632)
chr3 (167-390)||(5260323-5260547)
chr3 (167-390)||(23391910-23392133)
chr3 (178-390)||(9636126-9636340)
chr3 (178-374)||(23410346-23410543)
chr3 (282-471)||(40913352-40913544)
chr3 (7-334)||(35138762-35139091)
chr3 (226-390)||(7780004-7780168)
chr3 (226-390)||(32744437-32744600)
chr3 (223-390)||(801091-801260)
chr3 (84-433)||(26323027-26323383)
chr3 (378-512)||(31340101-31340236)
chr3 (7-177)||(1683270-1683440)
chr3 (223-390)||(6716500-6716667)
chr3 (223-390)||(54635125-54635292)
chr3 (191-339)||(5373198-5373350)
chr3 (68-437)||(20937501-20937872)
chr3 (208-352)||(51352150-51352293)
chr3 (167-401)||(2075065-2075281)
chr3 (181-275)||(26386597-26386692)
chr3 (223-390)||(45282983-45283154)
chr3 (257-401)||(33191866-33192009)
chr3 (120-367)||(39127442-39127693)
chr3 (223-390)||(3617449-3617618)
chr3 (237-339)||(54739005-54739108)
chr3 (223-387)||(25637426-25637592)
chr3 (12-96)||(28074404-28074488)
chr3 (245-357)||(25491003-25491114)
chr3 (324-401)||(27305700-27305777)
chr3 (228-367)||(4055788-4055926)
chr3 (314-387)||(10209265-10209340)
chr3 (173-331)||(8166516-8166677)
chr3 (314-387)||(4598526-4598601)
chr3 (314-387)||(10056309-10056384)
chr3 (314-387)||(10058531-10058606)
chr3 (314-387)||(10060753-10060828)
chr3 (314-387)||(10062975-10063050)
chr3 (314-387)||(10065197-10065272)
chr3 (314-387)||(10211485-10211560)
chr3 (223-387)||(4600747-4600914)
chr3 (67-175)||(34795712-34795819)
chr3 (242-312)||(28253346-28253417)
chr3 (244-311)||(4386875-4386941)
chr3 (243-331)||(24635277-24635366)
chr3 (120-177)||(36796692-36796749)
chr3 (257-312)||(37761548-37761604)
chr3 (369-421)||(49229607-49229659)
chr3 (257-335)||(1313860-1313939)
chr3 (245-327)||(3148054-3148137)
chr3 (228-350)||(4075511-4075636)
chr3 (271-328)||(2020187-2020245)
chr3 (297-326)||(31340242-31340271)
[»] chr1 (88 HSPs)
chr1 (14-529)||(11348488-11349006)
chr1 (7-534)||(37168080-37168606)
chr1 (7-512)||(13548879-13549385)
chr1 (7-534)||(29136031-29136558)
chr1 (7-512)||(13546972-13547474)
chr1 (7-513)||(31925585-31926091)
chr1 (14-512)||(47255216-47255716)
chr1 (7-517)||(7482104-7482615)
chr1 (7-513)||(42297850-42298360)
chr1 (9-523)||(47114957-47115472)
chr1 (7-534)||(37032926-37033458)
chr1 (11-460)||(193399-193849)
chr1 (7-534)||(34603359-34603874)
chr1 (7-467)||(19754274-19754737)
chr1 (11-471)||(19752472-19752930)
chr1 (11-296)||(37879006-37879292)
chr1 (167-390)||(28265555-28265778)
chr1 (178-390)||(8550787-8551001)
chr1 (292-534)||(37876623-37876865)
chr1 (178-390)||(28220227-28220440)
chr1 (178-390)||(31659192-31659405)
chr1 (167-390)||(834168-834391)
chr1 (183-390)||(49918309-49918517)
chr1 (167-390)||(50167176-50167399)
chr1 (196-390)||(3156837-3157032)
chr1 (167-385)||(44455104-44455322)
chr1 (167-390)||(28223422-28223645)
chr1 (168-380)||(1833467-1833679)
chr1 (178-390)||(4552638-4552851)
chr1 (167-390)||(3847122-3847345)
chr1 (178-390)||(13659337-13659550)
chr1 (178-390)||(46064872-46065085)
chr1 (167-383)||(50169218-50169434)
chr1 (178-374)||(37503574-37503768)
chr1 (167-383)||(196915-197132)
chr1 (167-390)||(3189275-3189498)
chr1 (167-390)||(3198092-3198315)
chr1 (167-390)||(3206931-3207154)
chr1 (165-401)||(15820249-15820485)
chr1 (178-390)||(37559868-37560083)
chr1 (167-400)||(23555257-23555489)
chr1 (167-390)||(41360859-41361081)
chr1 (68-405)||(22079166-22079501)
chr1 (300-534)||(28242382-28242616)
chr1 (7-219)||(28242172-28242385)
chr1 (167-390)||(10925167-10925393)
chr1 (167-401)||(927966-928202)
chr1 (190-401)||(16455588-16455799)
chr1 (167-387)||(20762616-20762837)
chr1 (169-390)||(13137977-13138196)
chr1 (178-390)||(45644355-45644569)
chr1 (167-390)||(30476447-30476672)
chr1 (223-390)||(13316352-13316520)
chr1 (7-174)||(34602557-34602724)
chr1 (30-436)||(6808253-6808667)
chr1 (168-390)||(40122197-40122421)
chr1 (178-390)||(51765349-51765565)
chr1 (196-400)||(37282682-37282887)
chr1 (227-401)||(36683694-36683858)
chr1 (223-390)||(9987202-9987369)
chr1 (223-390)||(20622237-20622406)
chr1 (166-400)||(44650153-44650389)
chr1 (223-390)||(40282377-40282545)
chr1 (243-396)||(3460715-3460869)
chr1 (235-438)||(2926520-2926726)
chr1 (223-390)||(9036417-9036584)
chr1 (208-438)||(12318475-12318706)
chr1 (223-387)||(21053958-21054123)
chr1 (179-399)||(8871054-8871259)
chr1 (9-328)||(41135605-41135926)
chr1 (208-462)||(9109347-9109603)
chr1 (223-390)||(44203631-44203800)
chr1 (156-331)||(25652018-25652195)
chr1 (260-399)||(2262965-2263106)
chr1 (243-335)||(32471481-32471573)
chr1 (452-512)||(194750-194810)
chr1 (166-294)||(44646881-44647010)
chr1 (228-331)||(16914234-16914338)
chr1 (157-331)||(1050503-1050678)
chr1 (239-330)||(4535541-4535633)
chr1 (273-363)||(5459956-5460046)
chr1 (228-367)||(13938143-13938281)
chr1 (109-177)||(3331439-3331505)
chr1 (7-82)||(4535784-4535860)
chr1 (67-148)||(12318725-12318806)
chr1 (243-307)||(35109494-35109557)
chr1 (61-113)||(9109680-9109732)
chr1 (320-400)||(44646795-44646875)
[»] chr5 (72 HSPs)
chr5 (7-530)||(213252-213775)
chr5 (11-513)||(5057834-5058336)
chr5 (11-471)||(40147048-40147508)
chr5 (7-509)||(27637495-27638000)
chr5 (7-401)||(28278099-28278494)
chr5 (7-492)||(27015315-27015789)
chr5 (7-385)||(38746788-38747167)
chr5 (69-516)||(16640814-16641263)
chr5 (167-390)||(533713-533936)
chr5 (178-390)||(42428431-42428644)
chr5 (178-385)||(13488157-13488365)
chr5 (167-401)||(13239696-13239930)
chr5 (178-390)||(32636778-32636991)
chr5 (178-401)||(16452035-16452258)
chr5 (167-390)||(25412706-25412928)
chr5 (168-383)||(537970-538185)
chr5 (167-390)||(39468550-39468773)
chr5 (168-375)||(42426251-42426458)
chr5 (167-385)||(28750661-28750879)
chr5 (178-390)||(33831634-33831847)
chr5 (167-401)||(3075648-3075882)
chr5 (178-390)||(8565947-8566160)
chr5 (167-390)||(30182533-30182756)
chr5 (167-390)||(13343005-13343228)
chr5 (167-401)||(31182917-31183149)
chr5 (167-390)||(37439078-37439309)
chr5 (9-474)||(316550-317014)
chr5 (178-383)||(30682930-30683134)
chr5 (168-401)||(9049332-9049565)
chr5 (173-401)||(13695680-13695910)
chr5 (167-390)||(36074043-36074268)
chr5 (223-390)||(16409475-16409643)
chr5 (178-376)||(42309950-42310149)
chr5 (223-390)||(26177883-26178050)
chr5 (223-390)||(9789224-9789392)
chr5 (223-390)||(18441648-18441816)
chr5 (167-320)||(5887487-5887640)
chr5 (167-390)||(19806328-19806530)
chr5 (56-282)||(4160465-4160690)
chr5 (223-390)||(29751160-29751328)
chr5 (9-396)||(33906024-33906412)
chr5 (223-390)||(22536290-22536457)
chr5 (223-390)||(29720364-29720532)
chr5 (223-390)||(29722524-29722692)
chr5 (326-474)||(4160702-4160850)
chr5 (223-390)||(26170774-26170930)
chr5 (223-390)||(10593258-10593426)
chr5 (297-401)||(42926965-42927069)
chr5 (7-331)||(35615954-35616278)
chr5 (238-474)||(10054732-10054969)
chr5 (449-534)||(40751202-40751284)
chr5 (223-390)||(25078120-25078289)
chr5 (223-390)||(25136089-25136258)
chr5 (120-460)||(10700580-10700921)
chr5 (249-328)||(30802854-30802934)
chr5 (223-390)||(40380090-40380259)
chr5 (223-390)||(40382301-40382470)
chr5 (7-181)||(14689622-14689793)
chr5 (243-352)||(3325933-3326043)
chr5 (282-438)||(30793195-30793348)
chr5 (267-324)||(42926911-42926968)
chr5 (453-512)||(40763211-40763270)
chr5 (168-238)||(42926838-42926908)
chr5 (314-387)||(16544499-16544574)
chr5 (314-387)||(16546721-16546796)
chr5 (243-335)||(22097884-22097975)
chr5 (272-353)||(8445764-8445846)
chr5 (237-315)||(14689503-14689581)
chr5 (195-330)||(6016979-6017115)
chr5 (7-65)||(30802723-30802782)
chr5 (7-59)||(16642211-16642264)
chr5 (108-180)||(8019472-8019542)
[»] chr7 (82 HSPs)
chr7 (7-534)||(34310571-34311101)
chr7 (7-534)||(4508563-4509091)
chr7 (7-534)||(3258779-3259305)
chr7 (7-534)||(4512247-4512775)
chr7 (7-492)||(48599235-48599719)
chr7 (7-534)||(4510405-4510933)
chr7 (7-534)||(2390065-2390596)
chr7 (7-526)||(29608524-29609040)
chr7 (7-509)||(2360859-2361356)
chr7 (7-386)||(6431754-6432134)
chr7 (7-509)||(8359198-8359703)
chr7 (7-401)||(22269756-22270151)
chr7 (255-512)||(32357934-32358190)
chr7 (7-475)||(22328306-22328784)
chr7 (167-390)||(27347761-27347984)
chr7 (266-512)||(6359829-6360077)
chr7 (167-390)||(48491523-48491745)
chr7 (179-383)||(30024740-30024945)
chr7 (167-390)||(31732970-31733193)
chr7 (167-390)||(41317435-41317658)
chr7 (168-401)||(26417261-26417494)
chr7 (178-390)||(14069834-14070047)
chr7 (178-390)||(14379862-14380075)
chr7 (167-390)||(8153286-8153509)
chr7 (165-390)||(23554982-23555208)
chr7 (167-385)||(4586105-4586323)
chr7 (178-399)||(31105385-31105607)
chr7 (167-390)||(35853859-35854082)
chr7 (178-382)||(47673953-47674157)
chr7 (167-383)||(47676144-47676360)
chr7 (167-390)||(43864188-43864411)
chr7 (14-230)||(6360073-6360290)
chr7 (167-390)||(36146409-36146633)
chr7 (167-390)||(38671223-38671446)
chr7 (167-390)||(41649012-41649234)
chr7 (167-390)||(48489375-48489598)
chr7 (167-390)||(18126588-18126811)
chr7 (167-376)||(1113601-1113810)
chr7 (167-390)||(29990999-29991221)
chr7 (168-375)||(495999-496206)
chr7 (167-390)||(4178719-4178941)
chr7 (167-401)||(4253518-4253754)
chr7 (173-401)||(23565052-23565280)
chr7 (167-390)||(12097868-12098083)
chr7 (167-371)||(19502122-19502326)
chr7 (181-333)||(31518752-31518905)
chr7 (227-390)||(25615857-25616021)
chr7 (168-390)||(25766960-25767180)
chr7 (231-401)||(31518911-31519081)
chr7 (167-401)||(48408747-48408984)
chr7 (167-397)||(36574510-36574740)
chr7 (183-401)||(23343934-23344151)
chr7 (249-390)||(2759198-2759339)
chr7 (223-390)||(39731369-39731537)
chr7 (167-304)||(4538627-4538764)
chr7 (223-390)||(20343897-20344064)
chr7 (223-390)||(43504154-43504323)
chr7 (167-302)||(24525985-24526121)
chr7 (167-254)||(2761439-2761526)
chr7 (297-385)||(24525508-24525596)
chr7 (244-353)||(5116625-5116735)
chr7 (223-390)||(24789841-24790009)
chr7 (172-383)||(3904624-3904837)
chr7 (67-316)||(1360226-1360479)
chr7 (223-390)||(6592340-6592509)
chr7 (223-390)||(18388760-18388929)
chr7 (223-390)||(18392196-18392365)
chr7 (244-392)||(18396338-18396488)
chr7 (317-390)||(30814530-30814603)
chr7 (223-390)||(6594558-6594727)
chr7 (309-385)||(1560671-1560749)
chr7 (292-397)||(5513661-5513766)
chr7 (242-331)||(43363531-43363623)
chr7 (223-390)||(32060322-32060493)
chr7 (167-287)||(5514113-5514234)
chr7 (167-240)||(24514912-24514984)
chr7 (234-307)||(13065482-13065555)
chr7 (228-367)||(26639326-26639469)
chr7 (235-331)||(27073828-27073925)
chr7 (235-331)||(27204388-27204485)
chr7 (237-311)||(28617176-28617249)
chr7 (7-39)||(32358189-32358221)
[»] chr8 (73 HSPs)
chr8 (11-513)||(42434868-42435372)
chr8 (20-512)||(4283320-4283812)
chr8 (69-534)||(18655246-18655713)
chr8 (7-530)||(11383769-11384291)
chr8 (7-534)||(40328562-40329086)
chr8 (10-471)||(40221531-40221992)
chr8 (9-353)||(44353577-44353923)
chr8 (166-471)||(10930118-10930424)
chr8 (196-534)||(3772164-3772502)
chr8 (178-390)||(27811232-27811445)
chr8 (167-390)||(15212730-15212953)
chr8 (167-390)||(33352094-33352317)
chr8 (167-390)||(43036367-43036590)
chr8 (167-384)||(18141764-18141981)
chr8 (167-390)||(4731602-4731825)
chr8 (167-372)||(30143286-30143489)
chr8 (165-390)||(40321022-40321247)
chr8 (179-390)||(42498149-42498362)
chr8 (167-390)||(3303671-3303894)
chr8 (167-401)||(1292454-1292687)
chr8 (165-390)||(5689213-5689438)
chr8 (167-390)||(31218201-31218425)
chr8 (165-390)||(1345372-1345597)
chr8 (167-390)||(17982597-17982821)
chr8 (178-390)||(34254331-34254543)
chr8 (198-390)||(34256507-34256700)
chr8 (167-390)||(19491700-19491922)
chr8 (167-382)||(30291549-30291767)
chr8 (167-390)||(6598916-6599139)
chr8 (167-390)||(6674369-6674592)
chr8 (169-393)||(8965689-8965914)
chr8 (167-390)||(9765693-9765911)
chr8 (167-390)||(12702635-12702862)
chr8 (167-390)||(1746219-1746442)
chr8 (178-395)||(4162454-4162668)
chr8 (167-371)||(44303798-44304003)
chr8 (178-390)||(19945359-19945574)
chr8 (168-384)||(41366622-41366837)
chr8 (167-385)||(18106087-18106302)
chr8 (167-390)||(4743215-4743427)
chr8 (223-388)||(2627735-2627902)
chr8 (261-401)||(10015119-10015257)
chr8 (167-312)||(41364926-41365071)
chr8 (167-401)||(8153705-8153936)
chr8 (178-339)||(10929753-10929904)
chr8 (223-390)||(25689955-25690122)
chr8 (223-390)||(3439504-3439671)
chr8 (301-390)||(4733784-4733873)
chr8 (299-395)||(3073870-3073965)
chr8 (257-367)||(7597648-7597759)
chr8 (257-397)||(11711993-11712135)
chr8 (245-353)||(1822313-1822423)
chr8 (245-353)||(1856758-1856868)
chr8 (368-471)||(2999723-2999825)
chr8 (369-516)||(10240270-10240417)
chr8 (7-80)||(22976317-22976389)
chr8 (245-332)||(10240175-10240264)
chr8 (273-367)||(32902197-32902292)
chr8 (165-327)||(3231859-3232023)
chr8 (314-387)||(42575327-42575402)
chr8 (314-386)||(15290614-15290688)
chr8 (314-386)||(15470983-15471057)
chr8 (9-169)||(40585510-40585669)
chr8 (257-393)||(29796317-29796456)
chr8 (244-339)||(30909389-30909483)
chr8 (264-330)||(40585754-40585822)
chr8 (11-82)||(2999830-2999902)
chr8 (109-177)||(10020332-10020398)
chr8 (271-339)||(11137073-11137145)
chr8 (314-365)||(38863949-38864000)
chr8 (349-390)||(27106898-27106939)
chr8 (11-103)||(9633826-9633918)
chr8 (399-459)||(11137203-11137262)
[»] chr4 (101 HSPs)
chr4 (7-534)||(50673705-50674231)
chr4 (7-513)||(35662225-35662730)
chr4 (7-512)||(12073176-12073681)
chr4 (7-513)||(8665190-8665694)
chr4 (7-480)||(54882803-54883278)
chr4 (20-534)||(41964211-41964724)
chr4 (7-534)||(379162-379691)
chr4 (7-513)||(8647921-8648433)
chr4 (7-471)||(6655739-6656203)
chr4 (113-534)||(40632334-40632756)
chr4 (7-436)||(46703284-46703715)
chr4 (7-534)||(50262553-50263083)
chr4 (86-534)||(2209575-2210029)
chr4 (10-471)||(27416886-27417333)
chr4 (142-534)||(41639345-41639735)
chr4 (7-314)||(55085442-55085750)
chr4 (210-492)||(26364223-26364504)
chr4 (7-480)||(12119322-12119801)
chr4 (167-390)||(26175637-26175860)
chr4 (11-516)||(33989649-33990138)
chr4 (167-390)||(56178637-56178860)
chr4 (167-401)||(54199897-54200130)
chr4 (167-390)||(48142986-48143211)
chr4 (178-390)||(36994478-36994691)
chr4 (167-390)||(5429623-5429846)
chr4 (167-382)||(9927467-9927681)
chr4 (167-401)||(52095352-52095586)
chr4 (165-390)||(36463390-36463615)
chr4 (167-390)||(34570415-34570638)
chr4 (161-513)||(21688186-21688535)
chr4 (122-472)||(26699361-26699716)
chr4 (178-390)||(48893639-48893856)
chr4 (169-401)||(31474096-31474329)
chr4 (167-390)||(12739551-12739774)
chr4 (167-382)||(37740570-37740784)
chr4 (167-390)||(47038412-47038633)
chr4 (167-390)||(52467355-52467579)
chr4 (167-401)||(6542169-6542405)
chr4 (167-401)||(4587902-4588137)
chr4 (167-398)||(37229714-37229947)
chr4 (167-390)||(5871764-5871987)
chr4 (167-390)||(29254438-29254661)
chr4 (168-351)||(12745476-12745659)
chr4 (212-390)||(46147392-46147570)
chr4 (178-392)||(29999804-30000019)
chr4 (167-353)||(12747794-12747980)
chr4 (167-349)||(24969055-24969238)
chr4 (184-390)||(3913408-3913614)
chr4 (169-390)||(5370083-5370308)
chr4 (167-390)||(45687183-45687407)
chr4 (168-401)||(5207832-5208066)
chr4 (167-371)||(52082684-52082881)
chr4 (236-390)||(12743926-12744080)
chr4 (236-390)||(12745315-12745469)
chr4 (7-180)||(26364048-26364222)
chr4 (178-401)||(51337018-51337242)
chr4 (167-311)||(41639207-41639351)
chr4 (223-390)||(13992293-13992461)
chr4 (9-472)||(33089683-33090129)
chr4 (243-351)||(12744087-12744195)
chr4 (167-382)||(13009453-13009655)
chr4 (68-438)||(22882707-22883077)
chr4 (68-438)||(22934371-22934741)
chr4 (7-118)||(40630767-40630878)
chr4 (223-390)||(31495316-31495485)
chr4 (393-513)||(55085320-55085439)
chr4 (165-374)||(48142393-48142605)
chr4 (122-447)||(35369394-35369711)
chr4 (167-401)||(29056301-29056537)
chr4 (108-327)||(32091363-32091583)
chr4 (223-390)||(8393394-8393562)
chr4 (223-390)||(8395603-8395771)
chr4 (196-345)||(53345189-53345340)
chr4 (244-438)||(34112838-34113030)
chr4 (77-181)||(41961264-41961368)
chr4 (228-401)||(44967818-44967992)
chr4 (413-534)||(46703739-46703860)
chr4 (7-122)||(46569816-46569931)
chr4 (7-151)||(34112394-34112539)
chr4 (167-350)||(6677412-6677597)
chr4 (237-401)||(5349924-5350087)
chr4 (243-397)||(21703829-21703985)
chr4 (7-66)||(2209491-2209550)
chr4 (238-437)||(38811143-38811342)
chr4 (157-344)||(52065530-52065719)
chr4 (236-329)||(44570427-44570521)
chr4 (242-315)||(34788851-34788924)
chr4 (72-181)||(22629105-22629209)
chr4 (345-401)||(24969787-24969843)
chr4 (314-387)||(5136155-5136230)
chr4 (314-387)||(5138380-5138455)
chr4 (242-344)||(16422653-16422756)
chr4 (68-169)||(3785934-3786034)
chr4 (314-369)||(7124992-7125048)
chr4 (68-287)||(35370452-35370661)
chr4 (314-369)||(7122773-7122829)
chr4 (140-180)||(25723433-25723473)
chr4 (395-438)||(3786135-3786178)
chr4 (276-365)||(37754986-37755076)
chr4 (236-311)||(39774254-39774329)
chr4 (257-312)||(1983272-1983325)
[»] chr6 (53 HSPs)
chr6 (11-533)||(26829979-26830505)
chr6 (7-534)||(5043411-5043939)
chr6 (7-419)||(21593449-21593860)
chr6 (7-534)||(17762770-17763302)
chr6 (7-534)||(2972793-2973324)
chr6 (7-534)||(3808561-3809093)
chr6 (7-471)||(603005-603465)
chr6 (8-533)||(22424682-22425209)
chr6 (205-513)||(21588913-21589220)
chr6 (195-534)||(17757994-17758335)
chr6 (167-399)||(28137400-28137632)
chr6 (167-390)||(9183032-9183255)
chr6 (266-534)||(26800630-26800898)
chr6 (167-390)||(2171532-2171754)
chr6 (167-390)||(5406200-5406422)
chr6 (167-390)||(5410525-5410747)
chr6 (167-390)||(26954287-26954509)
chr6 (167-390)||(33211186-33211409)
chr6 (167-383)||(5413401-5413616)
chr6 (167-368)||(3038926-3039127)
chr6 (178-390)||(31404675-31404887)
chr6 (196-388)||(30834538-30834733)
chr6 (178-390)||(16452329-16452543)
chr6 (167-390)||(33160352-33160577)
chr6 (120-474)||(25073463-25073826)
chr6 (165-365)||(4045364-4045566)
chr6 (223-390)||(3072759-3072928)
chr6 (223-390)||(412101-412270)
chr6 (227-390)||(16569037-16569189)
chr6 (223-390)||(6097451-6097608)
chr6 (293-383)||(5409076-5409167)
chr6 (7-135)||(17757865-17757995)
chr6 (223-390)||(27647861-27648028)
chr6 (223-390)||(16554869-16555037)
chr6 (223-390)||(16578518-16578686)
chr6 (223-390)||(16616694-16616862)
chr6 (223-390)||(16631425-16631593)
chr6 (223-390)||(16653112-16653280)
chr6 (223-390)||(25421305-25421474)
chr6 (62-181)||(5741001-5741120)
chr6 (223-390)||(6027246-6027415)
chr6 (11-88)||(26800558-26800634)
chr6 (300-480)||(9572667-9572849)
chr6 (323-390)||(34167180-34167248)
chr6 (314-387)||(13154005-13154080)
chr6 (314-387)||(33342108-33342183)
chr6 (314-387)||(34164948-34165023)
chr6 (235-328)||(186726-186820)
chr6 (227-287)||(16567200-16567261)
chr6 (268-350)||(2908503-2908586)
chr6 (124-188)||(11660507-11660571)
chr6 (278-311)||(31076932-31076965)
chr6 (235-315)||(5740074-5740154)
[»] chr2 (59 HSPs)
chr2 (7-534)||(45726712-45727238)
chr2 (7-534)||(1631590-1632117)
chr2 (7-492)||(35446785-35447269)
chr2 (7-534)||(42287968-42288494)
chr2 (7-534)||(17450373-17450884)
chr2 (7-516)||(33647952-33648465)
chr2 (7-480)||(24397840-24398318)
chr2 (178-390)||(36318010-36318223)
chr2 (178-390)||(17057370-17057583)
chr2 (178-390)||(17085353-17085566)
chr2 (167-390)||(36773506-36773729)
chr2 (167-385)||(29867813-29868031)
chr2 (167-390)||(723745-723968)
chr2 (167-390)||(38312184-38312407)
chr2 (165-390)||(33162451-33162676)
chr2 (167-376)||(42362296-42362505)
chr2 (167-390)||(2334418-2334641)
chr2 (167-390)||(34139771-34139995)
chr2 (167-382)||(14633834-14634050)
chr2 (167-390)||(11151592-11151815)
chr2 (167-383)||(11690445-11690661)
chr2 (177-390)||(6595006-6595221)
chr2 (167-390)||(36988076-36988299)
chr2 (167-390)||(11067249-11067472)
chr2 (167-390)||(4503133-4503356)
chr2 (167-390)||(45099699-45099922)
chr2 (167-390)||(5723256-5723478)
chr2 (167-390)||(36205665-36205887)
chr2 (167-375)||(13121712-13121919)
chr2 (271-515)||(7451166-7451410)
chr2 (167-390)||(4484330-4484554)
chr2 (167-390)||(30833290-30833514)
chr2 (165-396)||(17490143-17490368)
chr2 (167-401)||(11049493-11049732)
chr2 (167-401)||(7815264-7815498)
chr2 (167-325)||(24885605-24885763)
chr2 (223-390)||(32289565-32289732)
chr2 (217-393)||(26353178-26353354)
chr2 (16-480)||(30217956-30218410)
chr2 (167-353)||(14202450-14202631)
chr2 (223-390)||(6266691-6266859)
chr2 (167-267)||(39284829-39284929)
chr2 (167-331)||(12123644-12123809)
chr2 (223-387)||(13656035-13656200)
chr2 (317-390)||(39284930-39285003)
chr2 (244-474)||(42261402-42261633)
chr2 (223-390)||(12647386-12647555)
chr2 (228-331)||(34811281-34811385)
chr2 (7-94)||(7451083-7451170)
chr2 (269-401)||(42019859-42019995)
chr2 (282-367)||(28671989-28672075)
chr2 (243-311)||(41446159-41446227)
chr2 (236-331)||(41454247-41454343)
chr2 (67-171)||(43730991-43731093)
chr2 (167-241)||(5700272-5700347)
chr2 (322-368)||(42412117-42412162)
chr2 (245-367)||(7597036-7597158)
chr2 (136-181)||(16676138-16676182)
chr2 (347-402)||(2838079-2838135)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (7-512)||(7111-7617)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (7-534)||(17860-18386)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (7-390)||(11341-11725)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (7-336)||(80338-80668)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (208-534)||(10475-10800)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (178-390)||(149098-149311)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (196-390)||(434504-434701)
scaffold0002 (244-474)||(490237-490468)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (178-401)||(20405-20629)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (167-371)||(114547-114750)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (167-390)||(861-1083)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (167-390)||(11161-11385)
scaffold0491 (208-390)||(8735-8919)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (268-367)||(27466-27566)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (140-480)||(1307-1648)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (157-331)||(24986-25162)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (223-390)||(2604-2773)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (314-387)||(3729-3804)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (223-387)||(6272-6438)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 471; Significance: 0; HSPs: 95)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Original strand, 54593488 - 54594017
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54593488 aaagggttggtaccttttggggaagattcatggggatggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 54593587  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatc 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54593588 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatc 54593687  T
Q  207 atgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54593688 atgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgtgcagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatc 54593787  T
Q  307 tctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgtta 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54593788 tctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtatgtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgtta 54593887  T
Q  407 tcttttcttta--ctctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgc 504  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54593888 tcttttctttagtctctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacatggtttatagactatgtctatattcttgttattgc 54593987  T
Q  505 ttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54593988 ttgtggttatttatatttggttattggttg 54594017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 6095984 - 6095457
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  6095984 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 6095885  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6095884 gaagatccttagtgaaatcaaatgctaaaggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 6095785  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  6095784 catgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttgttctttgtaaacttcttgaagttaatttcttgtaacccatttgtat 6095685  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgtt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6095684 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgtgtgaacatttcttggtgttgtt 6095585  T
Q  406 atcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgct 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  6095584 atcttttctttactctctttatcttgtttatgccttg-gttggattgtggttttgctatacacttcgtttatagactaggtctatattgttgttattgct 6095486  T
Q  506 tgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6095485 tgtggttatttacatttgattattggttg 6095457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 513
Target Start/End: Original strand, 30235908 - 30236415
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  30235908 aaagggttggtgccttttggggaatattcatggggttggaaaacacaagagtggagagtcatttgtgagcaagttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 30236007  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  30236008 gaagatccttagtgaaatcgaaggctaatgattggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggatagtgaaaat 30236107  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  30236108 catgagtgtcttgttcattgatgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtat 30236207  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaac-atttcttggtgttgt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  30236208 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaatttcttggtgttgt 30236307  T
Q  405 tatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgc 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  30236308 tatcttttctttactctctttatcttgtttataccttg-gttggattgtgtttttgttatgcacttggtttatagactaggtctatattgttgttgttgc 30236406  T
Q  505 ttgtggtta 513  Q
    |||||||||    
T  30236407 ttgtggtta 30236415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 49199856 - 49199322
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagt-gagtcttgtgaaaccaaaat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||     
T  49199856 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacatatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggttgagtcttgtgaaaccaaaag 49199757  T
Q  106 aaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaa 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49199756 agaagatccttagtgaaatcaaaggctaatggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacactttgggagagtgaaaa 49199657  T
Q  205 tcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaaccca-tttgt 303  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  49199656 tcatgagtgtcttgttcgttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgt 49199557  T
Q  304 atctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaac-atttcttggtgt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  49199556 atctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctctcctccagactaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 49199457  T
Q  402 tgttatc---ttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgt 498  Q
    |||| ||   |||||| |||||||||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  |||| ||| ||||    
T  49199456 tgttgtctatttttctctactctctttatcttgttta-tcctttggttagattgtggttttgctatgcacttgttttctagattagatctagattgttgt 49199358  T
Q  499 tattgcttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49199357 tattgcttgtggttatttacatttggttattggttg 49199322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Original strand, 46860254 - 46860785
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  46860254 aaagggttggtgccttttggggaagattcatagggatgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 46860353  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaag--ggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaa 203  Q
     ||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46860354 gaagatccttag-gaaatcaaagactaagagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgagaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaa 46860452  T
Q  204 atc--atgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccattt 301  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46860453 attcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt 46860552  T
Q  302 gtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtg 400  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| || ||| ||||||||| ||||||    
T  46860553 gtatctctttgtaataactcattgatagtggattggagagatcaatctttcctccagagtaggtcattgttggaccgaattggatgaacattttttggtg 46860652  T
Q  401 ttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgtta 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||     
T  46860653 ttgttatcttttctttactctctttatcttgttta-tcctttggttagattgtggttttgctatgcacttggtttatagattaggtctatattgttgttg 46860751  T
Q  501 ttgcttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46860752 ttgtttgtggttatttacatttggttattggttg 46860785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 16 - 471
Target Start/End: Original strand, 4569743 - 4570202
Alignment:
Q  16 gtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaagatcct 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||| |    
T  4569743 gtgcctattggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagatgatctt 4569842  T
Q  116 tagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  4569843 tagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggtggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtg 4569942  T
Q  214 tcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt 313  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  4569943 ttttgttctttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagcttattgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgt 4570042  T
Q  314 aagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatctttt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4570043 aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctactccagagtaggtgaagtttggaccgaactgggtcaacatttcttggtgttgttatatttt 4570142  T
Q  413 c-tttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttg 471  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4570143 cttttgctccctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttg 4570202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 7 - 509
Target Start/End: Original strand, 47304035 - 47304543
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |    
T  47304035 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagt-ttttgtgagcaacttaggtgagtcttgtaaaaccaaaaga 47304133  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     || ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  47304134 gaatatccttagtgaaatcaaaaactaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaaacaattttaaacaccctgggagagtgaaaat 47304233  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||    
T  47304234 catgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatgggtagaaattatggttgttctttgtgagcttgttgaagttaatatcttgtaacccatctgtat 47304333  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaac-atttcttggtgttgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  47304334 ctcttcgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagtttgaccgaactgggtcaacaatttattggtgttgt 47304433  T
Q  405 tatcttttc------tttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgt 498  Q
    |||||||||      ||| || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  47304434 tatcttttcttttcttttgctttctttatcttgtttattcctt-agttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgt 47304532  T
Q  499 tattgcttgtg 509  Q
    | |||||||||    
T  47304533 tgttgcttgtg 47304543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 34490996 - 34491379
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  34490996 aaagggttggtgccttttggagaagattcatggagttgaaaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 34491095  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  34491096 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaatt 34491195  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    | ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  34491196 c-tgagtgtgttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat 34491294  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34491295 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 34491379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 7 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 41819906 - 41819404
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  41819906 aaagggttggtgccttttggg-aagattcatggggttgggaaacacatgagtggagactcatttgtgagcaacttgagtgagtcttatgaaaccaaaaga 41819808  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     |||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41819807 gaagatcttta-tgaaatcaaag-ctaagggttggttctcttttagcggttagattctagagttgggaaataattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 41819710  T
Q  206 -catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaaccca-tttgt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||    
T  41819709 tcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttttttgtgagcttgtctaagctaatttcttgtaacccattttgt 41819610  T
Q  304 atctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgtt 402  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41819609 atctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagacatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggtgaacatttattggtgtt 41819511  T
Q  403 gtta-tcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttat 501  Q
    |||| | |||||| |||| ||||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |    
T  41819510 gttatttttttctctactttctttatcttgttta-tcctttggttagattgtggttttgctatgcacttggtttatggactaggtctatattgttgttgt 41819412  T
Q  502 tgcttgtg 509  Q
    ||||||||    
T  41819411 tgcttgtg 41819404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 43402175 - 43401654
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| || ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  43402175 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagaatcatttgtgaacaacttgggtaagtcttgtgaaaccaaaaga 43402076  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||            ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43402075 gaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctctttt------------ctagagttgggaaacgattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 43401988  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaaccca-tttgta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||    
T  43401987 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacgcatttttta 43401888  T
Q  305 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaac-atttcttggtgtt 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  43401887 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaaattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtt 43401788  T
Q  403 gttatc---ttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgtt 499  Q
    ||| ||   |||||| |||||||||||||||||||| |||||   || ||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||  |||| ||| |||||    
T  43401787 gttgtctatttttctctactctctttatcttgttta-tcctttggttagattgtgattttgctatgcacttgttttctagattagatctagattgttgtt 43401689  T
Q  500 attgcttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43401688 attgcttgtggttatttacatttggttattggttg 43401654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 43404118 - 43403597
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  43404118 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcatttgggagcaacttgggtgagtcttgtgaaactaaaaga 43404019  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||            ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43404018 gaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctctttt------------ctaaagttgggaaacaattgtaaacactttgggagagtgaaaat 43403931  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccat-ttgta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| || ||    
T  43403930 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggcttgttctttgtgagcttgttgaagctcatttcttgtaactcatgtttta 43403831  T
Q  305 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaac-atttcttggtgtt 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||| ||||    
T  43403830 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttgatgtt 43403731  T
Q  403 gttat---cttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgtt 499  Q
    ||| |    ||||||  ||||||||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  |||| ||| || ||    
T  43403730 gttgtttatttttctccactctctttatcttgttta-tcctttggttagattgtggttttgctatgcacttgttttctagattagatctagattgttatt 43403632  T
Q  500 attgcttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43403631 attgcttgtggttatttacatttggttattggttg 43403597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Original strand, 36018634 - 36019159
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  36018634 aaagggttggtgccttttggggaagatccatggggatgggaaacacatgaatggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 36018733  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt-gttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaa- 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  36018734 gaagatccttagtgaaatcaaaggctatggattggttctcttttggggtttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 36018833  T
Q  205 tcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaaccca-tttgt 303  Q
    | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||    
T  36018834 taacgagtgacttgttcattggtgaaattgggaaaatgggttgaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaactcattttgt 36018933  T
Q  304 atctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttg 403  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||  |||| ||   |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  36018934 atctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagaggtcaatctctccccc--agtatgt-ttgttggaccgaactggatgaacattttttggtgttg 36019029  T
Q  404 ttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattg 503  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||   || ||||||||||||| ||  |||||| ||| |||| ||  |||| ||| || || |||    
T  36019030 ttatcttttttctactctctttatcttgttta-tcctttggttagattgtggttttgttaaacacttgttttctagattagatctagattgttattgttg 36019128  T
Q  504 cttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  36019129 cttgtggtaatttacatttgattattggttg 36019159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 55302350 - 55301827
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55302350 aaagggttggtgccttttgggaaaaattcatgaggttggaaaacacatgagtggagattcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaaga 55302251  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt-gttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  55302250 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaggggttggttctcttttgtaggttagattatagagttgggaaacaattgtaaataccttgggagagtgaaaat 55302151  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagcta---------atttattgtaacc 296  Q
    ||||||||||||||||||                || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||         |||| ||||||||    
T  55302150 catgagtgtcttgttcat----------------atgggtagaaattagggttgttctttgtaagtttgttgaagctaatttcttgtatttcttgtaacc 55302067  T
Q  297 catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttct 395  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||    
T  55302066 tatttgtatctctttgtaagaattcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaacttggtgaacatttct 55301967  T
Q  396 tggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttgg-tttatagactatgtctatattc 494  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||  |||| |||     
T  55301966 tagtgttgttatcttttctttactctctttatcttgttta-tcctttggttgaattgtggctttgctatgcacttggttttctagattagatctagattg 55301868  T
Q  495 ttgttattgcttgtgg-ttatttatatttggttattggttg 534  Q
    || ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  55301867 tttttattgcttgtggtttattcacatttggttattggttg 55301827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 168 - 480
Target Start/End: Original strand, 46173311 - 46173615
Alignment:
Q  168 ttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgt 267  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46173311 ttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggt---------aaaattggtagaaattagggttgttctttgt 46173401  T
Q  268 gagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca 367  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  46173402 gagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaattcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtca 46173501  T
Q  368 agttggaccaaactgggtgaac-atttcttggtgttgttatcttttc-tttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatg 465  Q
    ||||||||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||    
T  46173502 agttggaccgaactagatcaacaatttcttggtgttgttatcttttcttttgctttctttatcttgtttatttctt-agttggattgtggttttgctatg 46173600  T
Q  466 cacttggtttataga 480  Q
    |||||||||||||||    
T  46173601 cacttggtttataga 46173615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 40734442 - 40734665
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40734442 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 40734540  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  40734541 gtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacacatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggt 40734640  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  40734641 caagttggaccgaactgggtcaaca 40734665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 178 - 385
Target Start/End: Original strand, 40735337 - 40735545
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40735337 attgtaaacaccttggaaaagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 40735436  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40735437 gaagctaatttattgtaaccagtttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggacc 40735536  T
Q  377 aaactgggt 385  Q
     ||||||||    
T  40735537 gaactgggt 40735545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 44331489 - 44331712
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  44331489 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattaggaaaatgggtagaaattagggttgttcatt 44331587  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  44331588 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaagccatttgtatctctttgtaagaacttattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 44331687  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  44331688 caagttggaccgaactgggtcaaca 44331712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 29196612 - 29196387
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctt 264  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  29196612 gttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtttgttctt 29196513  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagg 364  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||    
T  29196512 tgtgagcttgtcaaagctaatttcttggaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattagg 29196413  T
Q  365 tcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||    
T  29196412 tcaagttggaccgaactgggtcaaca 29196387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 5236680 - 5236458
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5236680 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 5236582  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||| ||||| |||||    
T  5236581 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgataatggattcgagagatcaatctttcc-ccagattaggt 5236483  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||    
T  5236482 caatttggaccaaactgggtcaaca 5236458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 30 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5434239 - 5433906
Alignment:
Q  30 agattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaagatccttagtgaaatcaaag 129  Q
    |||||||||||| | | ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||| || ||||||||    
T  5434239 agattcatggggttaggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaagttgggtgagtcttgggaaaccaaaagagaagatcctta-tgtaatcaaag 5434141  T
Q  130 gctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggt 227  Q
     |||| | ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5434140 actaaagattgattctcttttgggggttagattatagagttgggaaacaattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 5434042  T
Q  228 gagattggga-aaattggtagaaattaggg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcatt 324  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||         
T  5434041 gagattgggagaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccttttatatctctttgtaaagaac----- 5433947  T
Q  325 gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca 367  Q
        ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5433946 --cggtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtca 5433906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 44700703 - 44700480
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44700703 gttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 44700604  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  44700603 gtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccacattaggt 44700505  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||    
T  44700504 caagttggaccgaactaggtcaaca 44700480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 19684113 - 19683889
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19684113 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 19684015  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  19684014 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggt 19683915  T
Q  366 caag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||    
T  19683914 caagtttggaccgaactgggtgaaca 19683889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 167 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22835226 - 22835010
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22835226 gttgggaaaca-ttgtaatcaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttcttt 22835128  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  22835127 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccgccatattaggt 22835028  T
Q  366 caagttggaccaaactgg 383  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  22835027 caagttggaccgaactgg 22835010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 45095109 - 45095331
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45095109 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggttgttcttt 45095205  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  45095206 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggt 45095305  T
Q  366 caag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||    
T  45095306 caagtttggaccgaactgggtgaaca 45095331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 145 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31340447 - 31340268
Alignment:
Q  145 cttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattgg 244  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31340447 cttttaggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgttttgttcattggtgagattgggaaaattgg 31340348  T
Q  245 tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcatt 324  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31340347 tagaaattgaggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcatt 31340268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 9581227 - 9581450
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  9581227 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgggattcggaaa-tgggtagaaattaggtttgttcttt 9581324  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9581325 gtgagcttgtttaagctaatttcttttaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 9581424  T
Q  366 caag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||    
T  9581425 caagtttggaccgaactgggtgaaca 9581450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 196 - 390
Target Start/End: Original strand, 7762237 - 7762433
Alignment:
Q  196 gagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaa 294  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  7762237 gagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgagaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaa 7762336  T
Q  295 cccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  7762337 ctcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 7762433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 167 - 375
Target Start/End: Original strand, 760791 - 760999
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  760791 gttgggaaaca-ttataaacaccttggatgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtctgttcttt 760889  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  760890 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 760989  T
Q  366 caagttggac 375  Q
    ||||||||||    
T  760990 caagttggac 760999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 167 - 371
Target Start/End: Original strand, 29810812 - 29811016
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  29810812 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttattcattggtgagattaggaaaatatgtagaaattagagttgttcttt 29810910  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  29810911 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 29811010  T
Q  366 caagtt 371  Q
    ||||||    
T  29811011 caagtt 29811016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Original strand, 29813017 - 29813230
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29813017 attgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgaggggcttgttaattggtgagattggaaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 29813116  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  29813117 gaagctaatttcttgtaacccatttgcatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcatgttggacc 29813216  T
Q  377 aaactgggtgaaca 390  Q
     |||||||| ||||    
T  29813217 gaactgggtcaaca 29813230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 29682303 - 29682526
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  29682303 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtttatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattatgtttgttcttt 29682401  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||| |    
T  29682402 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtcacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattagat 29682501  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  29682502 caagttggaccgaactgggtcaaca 29682526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 167 - 382
Target Start/End: Original strand, 31314389 - 31314604
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  31314389 gttgggaaaca-ttgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcataggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcatt 31314487  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| | |||||    
T  31314488 gtgatcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctttttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatatctcccccatattaggt 31314587  T
Q  366 caagttggaccaaactg 382  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31314588 caagttggaccgaactg 31314604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Original strand, 16498984 - 16499196
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16498984 attgtaaacaccttggggtagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaacggatagaaattagggttgtt-tttgtaagcttgtt 16499082  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16499083 gaagctaatttcttgttacccatttatatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaagttggacc 16499182  T
Q  377 aaactgggtgaaca 390  Q
     |||||||| ||||    
T  16499183 gaactgggtcaaca 16499196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 37408403 - 37408626
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  37408403 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttagt-gagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttcttt 37408500  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  37408501 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggt 37408600  T
Q  366 caag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||    
T  37408601 caagtttggatcgaactgggtgaaca 37408626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Original strand, 51398768 - 51398981
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  51398768 attgtaaacaccttggatgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgatgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttcttagtgaacttgtt 51398867  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  51398868 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatttatctctcccccagattaggtcaagttggacc 51398967  T
Q  377 aaactgggtgaaca 390  Q
     |||| ||| ||||    
T  51398968 gaacttggtcaaca 51398981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 230
Target Start/End: Original strand, 40913121 - 40913350
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggg-gaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaat 105  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||     
T  40913121 aaagggttggtgcctttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaaattgggtgagtcttgtgaaagcaaaag 40913220  T
Q  106 aaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt-gttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggaga----gtg 200  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||    
T  40913221 agaagatccttagtgaaattaaaggttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtacgtg 40913320  T
Q  201 aaaatcatgagtgtcttgttcattggtgag 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40913321 aaaattatgagtgtcttgttcattggtgag 40913350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 178 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 53921717 - 53921493
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  53921717 attgtaaaaaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggtttgttgtttgtgagcttgtt 53921618  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||    
T  53921617 aaagctaatttcttgtaactcatttgtatcattttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccggagtagatcaagtttgacc 53921518  T
Q  377 aaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
     |||||| | |||||||||| ||||    
T  53921517 gaactggataaacatttcttagtgt 53921493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 23200360 - 23200138
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23200360 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagagttgttcttt 23200264  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  23200263 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggt 23200164  T
Q  366 caag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||    
T  23200163 caagtttggaccgaactgggtgaaca 23200138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 39153585 - 39153362
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  39153585 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgaatgaaaatcattgagtgtcttgttcatgtgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttcatt 39153487  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||    
T  39153486 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatccctttataagaactcattgatagtggattggagagaacaatctctcccccagattaggt 39153387  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||    
T  39153386 caagttggactgaactgggtcaaca 39153362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 5258368 - 5258144
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattgg-tagaaattagggttgttctt 264  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  5258368 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctt 5258271  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagg 364  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  5258270 tgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctcttctccagagtagg 5258171  T
Q  365 tcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  5258170 tcaagtttggaccgaacttggtgaaca 5258144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 169 - 401
Target Start/End: Original strand, 32891049 - 32891282
Alignment:
Q  169 tgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttg 266  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||| | || ||||||||    
T  32891049 tgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtaaaaatcattgagtgtcttgttcttcggtgagattgagaaaatgggtagaaattaagttttgttctttg 32891147  T
Q  267 tgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtc 366  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||    
T  32891148 tgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagataaatctctcccccggagtaggtc 32891247  T
Q  367 aagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    | |||||||| |||||| | | |||||||||||||    
T  32891248 atgttggaccgaactggataatcatttcttggtgt 32891282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 23198161 - 23197939
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  23198161 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagagttgtttttt 23198065  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  23198064 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggt 23197965  T
Q  366 caag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||    
T  23197964 caagtttggaccgaactgggtgaaca 23197939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 166 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 9666693 - 9666467
Alignment:
Q  166 agttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttct 263  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||  || |||||    
T  9666693 agttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaaatgggtagaaattagattttgttct 9666594  T
Q  264 ttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtag 363  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| |||    
T  9666593 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttatacctctttgtaagaattctttgatagtggattggagagattgatctctcccccagattag 9666494  T
Q  364 gtcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||    
T  9666493 gtaaagttggaccgaactgggtcaaca 9666467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Original strand, 7764422 - 7764632
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7764422 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga--gggaaaag-ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 7764517  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtc-aagttggac 375  Q
     |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || || |||    
T  7764518 aaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatgaatctctcctccagagtaggtcaaatttagac 7764617  T
Q  376 caaactgggtgaaca 390  Q
    | |||||||||||||    
T  7764618 cgaactgggtgaaca 7764632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 5260547 - 5260323
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattgg-tagaaattagggttgttctt 264  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  5260547 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctt 5260450  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagg 364  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||    
T  5260449 tgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctcttctccaaagtagg 5260350  T
Q  365 tcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  5260349 tcaagtttggaccgaacttggtgaaca 5260323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 23392133 - 23391910
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatg-agtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| | |||||||||    
T  23392133 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcatttagtgtctttttcattggtgagtttgggaaaatgagtagaaattaagtttgttcttt 23392035  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||| ||| | |||||    
T  23392034 gtgagcttgtttaagataatttcttgtaacccatttgtatcactttgcaagaactctttgatagtggattgtagagataaatctctcccccaaattaggt 23391935  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  23391934 caagttggaccgaactgggtcaaca 23391910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 9636340 - 9636126
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggga-aaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 275  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9636340 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 9636242  T
Q  276 tgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgga 374  Q
      || ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  9636241 caaaactaatttcttgtaacccttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttgaa 9636142  T
Q  375 ccaaactgggtgaaca 390  Q
    || |||||||||||||    
T  9636141 ccgaactgggtgaaca 9636126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23410543 - 23410346
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  23410543 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattagtgaaatttggaaaatgggtagaaattatgtttattctttgtgagcttgtt 23410444  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttgga 374  Q
     ||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  23410443 taagctaatttcgtataacccatttgtatcactttgtaagaactcttagataatggattggagagataaatctctcccccaaattaggtcaagttgga 23410346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 282 - 471
Target Start/End: Original strand, 40913352 - 40913544
Alignment:
Q  282 taatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaact 381  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  40913352 taatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcatcgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaact 40913451  T
Q  382 gggtgaac-atttcttggtgttgttatc---ttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttg 471  Q
    |||| ||| || |||||||||| || ||   |||||| || ||||||||||||||||| |||||   || ||||||||||||||||||||||||    
T  40913452 gggtcaacaatctcttggtgttattgtctatttttctctaatctctttatcttgttta-tcctttggttagattgtggttttgctatgcacttg 40913544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 35139091 - 35138762
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaat 105  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| || |    |||||||||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  35139091 aaagggttgatgccttttgaggagagattcatgaggttggaaaacaaatcaaatgagagtcttta-tgagcaacttgaatgagtcttgggagaccaaaat 35138993  T
Q  106 aaaagatccttagtgaaat-caaaggctaagggtt-gttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgt-aaacacattgggagagtgaa 202  Q
    | ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||  |||||||||||| |||| ||| || |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  35138992 agaagatccttag-gaaataaaaaagctaagggttaattctcttttggg-gttaaattttaaagtt-ggaaacaattgtgaaacaccttgggagagtgaa 35138896  T
Q  203 aatca-tgagtgtcttgttcattg-gtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatt 300  Q
    ||||| |||||||||||||||| |   ||||||| | |||| ||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| ||| | ||    
T  35138895 aatcattgagtgtcttgttcatggaaagagattgag-aaatgggtagaaattatgtttgttcttggtgagtttgttgaagttaatttcttgcaactcttt 35138797  T
Q  301 tgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggat 334  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35138796 tgtatctctttgtaaagaactcattgatagtggat 35138762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 226 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 7780168 - 7780004
Alignment:
Q  226 gtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt 324  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7780168 gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaacct-tttgtatctcttttgtaagaactcatt 7780071  T
Q  325 gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  7780070 gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaagtgggtgaaca 7780004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 226 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 32744600 - 32744437
Alignment:
Q  226 gtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattg 325  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  32744600 gtgagattgaaaaaatgggtagaaattagt-ttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatcactttgtaagaactctttg 32744502  T
Q  326 atagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  32744501 atagtggattgaagagataaatctatcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 32744437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 801091 - 801260
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||| ||||||| | ||| |||||||||| |||||||||    
T  801091 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaact 801189  T
Q  321 cattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  801190 cattgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 801260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 26323383 - 26323027
Alignment:
Q  84 gtgagtcttgtgaaaccaaaataaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaatt-g 181  Q
    |||||||||| || ||||||| | || |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |    
T  26323383 gtgagtcttgggagaccaaaaaagaatatccttag-gaaatcaaaagctaagggttggttctcttttgagggttagattttagagttgggaaacaattgg 26323285  T
Q  182 taaacacattgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaa 279  Q
     |||||| ||| | ||||||| |||| | |||||||||||||| || |||||||| |||||  |||| |||||||| ||||| ||   ||| ||||||||    
T  26323284 gaaacaccttgagtgagtgaacatcattaagtgtcttgttcatgggatgagattgagaaaa-gggtaaaaattaggtttgtttttgaagagtttgttgaa 26323186  T
Q  280 gctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtgatc-aatctctcctcc-agagtaggtca-agttggac 375  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||| |||| || || ||||||||||||||| | |||||  |||  || | ||| || |||||||||||  |||||||    
T  26323185 gctaatttcttgtaacctttttgtatatcttggtaaaaaactcattgatagtgaagtggagatatcttatttatccccctagagtaggtcattgttggac 26323086  T
Q  376 caaactgggtgaacatttc-ttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtt 433  Q
    | || ||||| |||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26323085 cgaagtgggtaaacaattctttggtgttattctcttttctctactctctttatcttgtt 26323027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 378 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 31340236 - 31340101
Alignment:
Q  378 aactgggtgaacattt-cttggtgttgttatcttttcttta-ctctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggttt 475  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31340236 aactgggtcaacattttcttggtgttgttatcttttcttttgctttctttatcttgtttattccttagtt-ggattgtggttttgctatgcacttggttt 31340138  T
Q  476 atagactatgtctatattcttgttattgcttgtggtt 512  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31340137 atagactaggtctatattattgttgttgcttgtggtt 31340101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Original strand, 1683270 - 1683440
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaat 105  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||| | | || ||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  1683270 aaagggttggtgcattttgggaagagattcatggggttggaaaacacatgagtggataatcatttatgagcaactttggtgagtcttgtgagaccaaaag 1683369  T
Q  106 aaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt-gttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaaca 177  Q
    | |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1683370 agaagatccttag-aaaatcaaaggctaagggttggttatcttttggg-gttagaatctagagttgggaaaca 1683440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 6716500 - 6716667
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  6716500 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 6716596  T
Q  321 cattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    | ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6716597 ctttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 6716667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 54635125 - 54635292
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  54635125 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 54635221  T
Q  321 cattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    | ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  54635222 ctttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 54635292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 191 - 339
Target Start/End: Original strand, 5373198 - 5373350
Alignment:
Q  191 tgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattgg-tagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaattt 287  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||  || ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5373198 tgggtgagggaaaatcattgagtgtcttgttcattgaagagattgggaaaaaagggtagaaattaggctttgttctttttgagcttgttgaagctaattt 5373297  T
Q  288 attgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggag 339  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||    
T  5373298 attgtaacccttttatatctctttgtaaggaactcattgccaatggattggag 5373350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 68 - 437
Target Start/End: Original strand, 20937501 - 20937872
Alignment:
Q  68 tttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctaga 166  Q
    |||||||  |||||| |||| ||||| || ||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  20937501 tttgtgacaaacttgggtgattcttgggagaccaaaagagaagattcttag-gaaatcaaaggataaaggttggttctcttttgggagt-agattctaga 20937598  T
Q  167 gttgggaaacaattgtaaa-cacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaattggtagaaattagggttgttct 263  Q
    |||| |||| ||||| ||| ||  || |  ||||| || |||| |||| |||||||||| |   ||||| || ||||| ||||||||||| | ||||| |    
T  20937599 gttgagaaataattggaaaacagcttagatgagtgcaa-tcattgagtctcttgttcatagaaagagatcgg-aaaataggtagaaattatgtttgtttt 20937696  T
Q  264 ttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttg-taagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagta 362  Q
    | | ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||| ||| ||||    
T  20937697 tggagagcttgttgaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgaaaagaactcattgata-tagattggagagatcaatcgttcccccaaagta 20937795  T
Q  363 ggtca-agttggaccaaactgggtgaac-atttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatt 437  Q
     |||| ||||||||  |||| ||| ||| |||  || |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20937796 tgtcatagttggacagaactaggtaaacaattattttgtgtggttctcttttctctactctctttatcttgtttatt 20937872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 208 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 51352293 - 51352150
Alignment:
Q  208 tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatc 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |||| |||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||     
T  51352293 tgagtgtcttgtttattggtgagattaggaaaat-gatagaagttagggtttgttcattgtgagctttttaaagttaatttcttgtaacc-atttgtatt 51352196  T
Q  307 tctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctc 352  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  51352195 tctttgtaataactcattgagagtggatttgagagatcaatctctc 51352150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 2075281 - 2075065
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctt 264  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||    
T  2075281 gttgggaaacatttataaacaccttgct-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgatattgggaaaaatggtagtaattagagttggttctt 2075183  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagg 364  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||| |||||||                |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  2075182 tgtgagct--tttaagctaatttattgt-acccatt----------------aactaattgatagtggatttgagagatcaatctctccccgagagtagg 2075102  T
Q  365 tcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||    
T  2075101 tcaagttggatcgaactgggtaaacatttctgggtgt 2075065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26386692 - 26386597
Alignment:
Q  181 gtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 275  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26386692 gtaaatactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgt 26386597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 45282983 - 45283154
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt----gtaaga 317  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| ||||    ||||||    
T  45282983 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatccctttttttgtaaga 45283079  T
Q  318 actcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  45283080 actcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 45283154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 257 - 401
Target Start/End: Original strand, 33191866 - 33192009
Alignment:
Q  257 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctc 355  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  33191866 ttgttcttagagagcttgttgaagctaagttcttgtaacc-attt-tatgtctttgtaaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctct-ctc 33191962  T
Q  356 cagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    ||||| ||||||  ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||    
T  33191963 cagaggaggtcattgttggacaaaacttggtaaacattttttggtgt 33192009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Original strand, 39127442 - 39127693
Alignment:
Q  120 gaaatcaaaggctaagggtt-gttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaatt-gtaaacacattgggagagtgaaaatca-tgagtgtct 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  39127442 gaaatcaaaggctaagggttagttctcttttgtg-gttaaattctagagtttggaaacaattggaaaataccttggaagagtgaaaatcattgagcgtct 39127540  T
Q  217 tgttcat-tggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-a 314  Q
    | |||||  |  ||||||| | ||||  ||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||     ||||||||| || || |    
T  39127541 tattcatgagaagagattgag-aaataagtataaattatgtttgttcttggtgagcttgttgaagctaatttcttatagtttttttgtatcttttcgtaa 39127639  T
Q  315 agaactcattgat-agtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca 367  Q
    | ||||||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  39127640 ataactcattgataaatggatttgaaagatcaatctctcctccagagcaggtca 39127693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 3617449 - 3617618
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 319  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  || ||||| |||| |||| ||||    
T  3617449 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaac 3617545  T
Q  320 tcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  3617546 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 3617618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 54739108 - 54739005
Alignment:
Q  237 aaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggat 334  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  54739108 aaaaatggtagaaattagtgtttgttctttgtgagcttgttgaaactaattta-tgtaactcttttatatctctctgtaaagaactcattgatagtggat 54739010  T
Q  335 tggag 339  Q
    |||||    
T  54739009 tggag 54739005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 387
Target Start/End: Original strand, 25637426 - 25637592
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 319  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  || ||||| |||| |||| ||||    
T  25637426 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaac 25637522  T
Q  320 tcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 387  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25637523 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 25637592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 96
Target Start/End: Original strand, 28074404 - 28074488
Alignment:
Q  12 gttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtga 96  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  28074404 gttggtgcgttttggggaagattcatggggatgggaaacacatgagtggagagtctattgagagaaacttaggtgagtcttgtga 28074488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 25491114 - 25491003
Alignment:
Q  245 tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtgat 343  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||  || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  25491114 tagaaattaggtttgttctttgagagcttgttgaagctgatttcttatactccttttgtatctctttgtaaagaaatcattgatagtgaagtggagagat 25491015  T
Q  344 caatctctcctcca 357  Q
    |  |||||||||||    
T  25491014 c--tctctcctcca 25491003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 324 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 27305777 - 27305700
Alignment:
Q  324 tgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||    
T  27305777 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaatttggaccgaactgtgtatacatttctttgtgt 27305700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4055926 - 4055788
Alignment:
Q  228 gagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacc-catttgtatctctttgtaagaa-ctcattg 325  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| | || |||||  ||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  4055926 gagattgggaaa-tgggtagaaattagg-ttgttcttggagaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctcttttgtatctctttgtaagaaactcattg 4055829  T
Q  326 atagtggattggagtgatcaatctctcctccaga-gtaggtca 367  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  4055828 atagtggattgaagagatc--tctctcccccagatgtaggtca 4055788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 314 - 387
Target Start/End: Original strand, 10209265 - 10209340
Alignment:
Q  314 aagaactcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 387  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10209265 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtga 10209340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 8166677 - 8166516
Alignment:
Q  173 aaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat---gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtga 269  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||   | ||||||||||||| |  |||||||  ||| |  |||||||||||| |||||||| | ||    
T  8166677 aaacatttgtaaacacattgggtgggtgaaaatcattgagtgtgtcttgttcatggaagagattgataaa-tgagtagaaattaggtttgttcttggaga 8166579  T
Q  270 gcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 331  Q
    | ||||||||| |||| | || |||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  8166578 gtttgttgaagttaatatcttataacctttttgtatctctttgtaaagaacttgttgatagtg 8166516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 4598601 - 4598526
Alignment:
Q  314 aagaactcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 387  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4598601 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 4598526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 387
Target Start/End: Original strand, 10056309 - 10056384
Alignment:
Q  314 aagaactcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 387  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10056309 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 10056384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 387
Target Start/End: Original strand, 10058531 - 10058606
Alignment:
Q  314 aagaactcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 387  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10058531 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 10058606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 387
Target Start/End: Original strand, 10060753 - 10060828
Alignment:
Q  314 aagaactcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 387  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10060753 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 10060828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 387
Target Start/End: Original strand, 10062975 - 10063050
Alignment:
Q  314 aagaactcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 387  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10062975 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 10063050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 387
Target Start/End: Original strand, 10065197 - 10065272
Alignment:
Q  314 aagaactcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 387  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10065197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 10065272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 387
Target Start/End: Original strand, 10211485 - 10211560
Alignment:
Q  314 aagaactcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 387  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10211485 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 10211560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 4600914 - 4600747
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 319  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| | |  | |||||||||| ||||||||  |||||||  |||| |||| ||||    
T  4600914 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacct-tttgtattccttttgtaaagaac 4600817  T
Q  320 tcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 387  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4600816 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 4600747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 175
Target Start/End: Original strand, 34795712 - 34795819
Alignment:
Q  67 ttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaagatccttagtgaaatcaaaggctaaggg-ttgttctcttttgggtgttagattctag 165  Q
    |||||| || |||||| |||||||||| || ||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||| ||||||     
T  34795712 ttttgtaagaaacttgggtgagtcttgggagaccaaaagagaagatccttag-aaaatcaaaggctaagggatggttctcttttgtg-gttaaattctaa 34795809  T
Q  166 agttgggaaa 175  Q
    ||||||||||    
T  34795810 agttgggaaa 34795819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 28253417 - 28253346
Alignment:
Q  242 tggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttg 312  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||| ||||||    
T  28253417 tggtagaaattagggttcgttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacgattttgtatttctttg 28253346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 311
Target Start/End: Original strand, 4386875 - 4386941
Alignment:
Q  244 gtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt 311  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  4386875 gtagaaattaggttttgttctttgtgagctttt--aagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttt 4386941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 243 - 331
Target Start/End: Original strand, 24635277 - 24635366
Alignment:
Q  243 ggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtg 331  Q
    ||||||||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| |||  || ||||||||||||    
T  24635277 ggtagaaattaagtttgttcttggagagtttgttgaagctaattttttgtaactattttgtatctctttataatcaattcattgatagtg 24635366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 120 - 177
Target Start/End: Original strand, 36796692 - 36796749
Alignment:
Q  120 gaaatcaaaggctaagggttgttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaaca 177  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  36796692 gaaatcaaaggctaagggttgattacttttgagggttagattcaagagttgggaaaca 36796749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 37761604 - 37761548
Alignment:
Q  257 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttg-tatctctttg 312  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  37761604 ttgttctttgtgggcttgttaaaactaatttattgtaacccttttgatatctctttg 37761548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 49229659 - 49229607
Alignment:
Q  369 gttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactct 421  Q
    |||||| | |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49229659 gttggatcgaactgggtaaatatttcttagtgttgttatcttttctttactct 49229607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1313939 - 1313860
Alignment:
Q  257 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggatt 335  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| || || ||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  1313939 ttgttcttggagagcttgttaaagctaatttcttgcaagccttttgtatatctttgaaaagaactcattgatattggatt 1313860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 3148137 - 3148054
Alignment:
Q  245 tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaa-ctcattgat 327  Q
    ||||||||||| || |||||   |||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| | |||||||||| |||||||||    
T  3148137 tagaaattaggtttcttcttgaagagcttgttgaagctaatttcttgtaaccttattgtatttgtttgtaagaatctcattgat 3148054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4075636 - 4075511
Alignment:
Q  228 gagattgggaaaattggtagaaattag--ggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacc-catttgtatctctttgtaagaa-ctcat 323  Q
    |||||||||||| | |||||||||||   || ||||||| | || |||||  ||| |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||| ||| |    
T  4075636 gagattgggaaa-tgggtagaaattattaggctgttcttagagaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctcttttgtatcactttgtaagaaactctt 4075538  T
Q  324 tgatagtggattggagtgatcaatctc 350  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4075537 tgatagtggattggagagatcactctc 4075511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 328
Target Start/End: Original strand, 2020187 - 2020245
Alignment:
Q  271 cttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgata 328  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2020187 cttgttgaagctaatttcttataaccgttttgtatttctttgtaaagaactcattgata 2020245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 31340271 - 31340242
Alignment:
Q  297 catttgtatctctttgtaagaactcattga 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31340271 catttgtatctctttgtaagaactcattga 31340242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 420; Significance: 0; HSPs: 88)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 529
Target Start/End: Original strand, 11348488 - 11349006
Alignment:
Q  14 tggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaagatc 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11348488 tggtgccttttggagaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatc 11348587  T
Q  114 cttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatgagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11348588 cttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagt 11348687  T
Q  213 gtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  11348688 gtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttc 11348787  T
Q  313 taagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatctttt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11348788 taagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgagtgaacatttcttgatgttgttatctttt 11348887  T
Q  413 cttta--ctctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgcttgtgg 510  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11348888 ctttactctctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattgttgttattgcttgtgg 11348987  T
Q  511 ttatttatatttggttatt 529  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  11348988 ttatttacatttgattatt 11349006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Original strand, 37168080 - 37168606
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  37168080 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaactaaaaga 37168179  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  37168180 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaaaggttgattctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgagagagtgaaaat 37168279  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaaccca-tttgta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37168280 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgta 37168379  T
Q  305 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgt 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37168380 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgt 37168479  T
Q  405 tatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgc 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| | ||||| ||||    
T  37168480 tatcttttctttactctctttatcttgtttattccttggttt-gattgtggttttgctatgcactt-gattatagactaggtctata-tattgttgttgc 37168576  T
Q  505 ttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  37168577 ttgaggttatttacatttggttattggttg 37168606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 13549385 - 13548879
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  13549385 aaagggtcggtgccttttgaggaaaattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgaatcttgtgaaaccaaaaga 13549286  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13549285 gaagatacttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagatttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 13549186  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||    
T  13549185 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttaaacctaatttcatgtaacccatttgtat 13549086  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgtt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13549085 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgtt 13548986  T
Q  406 atcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcac-ttggtttatagactatgtctatattcttgttattgc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  13548985 atcttttctttactctctttatcttgtttattctttg-gttggattgtggttttgctatgcactttggtttatagactaggtctatattattgttgttgc 13548887  T
Q  505 ttgtggtt 512  Q
    ||||||||    
T  13548886 ttgtggtt 13548879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Original strand, 29136031 - 29136558
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  29136031 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaa-acatgagtggagagttttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 29136129  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt-gttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29136130 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttagttctcttttgggggttagattctagagttgtgaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 29136229  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  29136230 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttggaacccatttgtat 29136329  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgt 404  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  29136330 ttctttgtaagaactcattgatcgtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaacatttcttggtgctgt 29136429  T
Q  405 -tatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattg 503  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  29136430 ctat-ttttctctactctctttatcttgttta-tcctttggttagattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctattttgttgttattg 29136527  T
Q  504 cttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29136528 cttgtggttagttatatttggttattggttg 29136558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 13547474 - 13546972
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  13547474 aaagggtcggtgccttttgaggaaaattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgaatcttgtgaaaccaaaaga 13547375  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13547374 gaagatacttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagatttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 13547275  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13547274 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctattttcttgtaacccatttgtat 13547175  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgtt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13547174 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgtt 13547075  T
Q  406 atcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactat--gtctatattcttgttattg 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||     ||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||| |||    
T  13547074 atcttttctttactctctttatcttgtttattctttg-gttggattgtggttt-----tgcacttggtttataaactataggtctatattattgttgttg 13546981  T
Q  504 cttgtggtt 512  Q
    |||||||||    
T  13546980 cttgtggtt 13546972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 31926091 - 31925585
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  31926091 aaagggttggtgccttttggggaagattcatgggtttgggaaacacgtgagtggagaatcttttgtgagcaacttgggtgagacttgtgaaaccaaaaga 31925992  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31925991 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaatggttggttctcttttgggggttagattctagagttgg-aagcagttgtaaacaccttgggagagtgaaaat 31925893  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31925892 catgagtgtcttgttcattggtgagagtggaaaaatgggtagaaattagggatgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 31925793  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgtt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  31925792 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagttggaccgaactaggtgaacatttcttggtgttgtt 31925693  T
Q  406 atcttttctttactctctttatcttgt-ttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgc 504  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31925692 attttttctttactctcgttatcttgtattattctttg-gttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgc 31925594  T
Q  505 ttgtggtta 513  Q
    |||||||||    
T  31925593 ttgtggtta 31925585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 47255716 - 47255216
Alignment:
Q  14 tggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaagatc 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  47255716 tggtgccttttggggaagattcatgggt-tgggaaacacatgattggagagtcttttgtgagcaactt-agtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatc 47255619  T
Q  114 cttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatgagt 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  47255618 cttagtgaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaataattgtaaatgccttgggagagtgaaaatcatgagt 47255519  T
Q  213 gtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47255518 gtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttg 47255419  T
Q  313 taagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttt 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47255418 taagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttattttt 47255319  T
Q  412 t---ctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgcttgt 508  Q
    |    |||||||||||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |    
T  47255318 tttcttttactctctttatcttgttta-tcctttggttagattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttgttgcttat 47255220  T
Q  509 ggtt 512  Q
    ||||    
T  47255219 ggtt 47255216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 7482615 - 7482104
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  7482615 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaacaaaaaga 7482516  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  7482515 gaagatccttag-gaaatcaaag-ctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaagcaattgtaaacaccttgggaaagtgaaaat 7482418  T
Q  206 -catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccattt-gt 303  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  7482417 tcatgagtgtattgttcattggtgagattgggtaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgt 7482318  T
Q  304 atctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttg 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||    
T  7482317 atctctttgtaagaactcattgatagtgaattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaagttggaccgaactaggtgaacatttcatggtattg 7482218  T
Q  404 ttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtc--tatattcttgttat 501  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||  |||||| ||||| |    
T  7482217 tcatcttttctttactctctttatcttgtttattccttg-gttggattgtggttttgctatgcactt-gattatagactaggtctatatattgttgttgt 7482120  T
Q  502 tgcttgtggttattta 517  Q
    |||||| |||||||||    
T  7482119 tgcttgaggttattta 7482104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 42298360 - 42297850
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  42298360 aaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgcgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 42298261  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  42298260 gaagatcctaagtgaaatcaaaggctaagagttggttctcttttgggggttagattctagagttgtgaaacaattgtaaacaccttgggagagtaaaaat 42298161  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  42298160 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat 42298061  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaac-atttcttggtgttg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  42298060 ctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgttg 42297961  T
Q  404 ttatc---ttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgtta 500  Q
    || ||   ||||||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||    
T  42297960 ttgtctatttttctttactct-tttatcttgtttattatttg-gttggattgtgattttgctatgcacttggtttatagacttggtatatattattgtta 42297863  T
Q  501 ttgcttgtggtta 513  Q
    |||||| ||||||    
T  42297862 ttgcttatggtta 42297850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 523
Target Start/End: Original strand, 47114957 - 47115472
Alignment:
Q  9 agggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaa 108  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  47114957 agggttggtaccttttggg-aagattcatggggttgggaaacacatgaatggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagaga 47115055  T
Q  109 agatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatca 207  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  47115056 agatccttaatgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacatcttgggagagtgaaaatca 47115155  T
Q  208 tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaaccca-tttgtatc 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  47115156 tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatc 47115255  T
Q  307 tctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgtt 405  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  47115256 tctttgtaaaaacccattgatagtggattggagagatcaatctctgctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaacatttcttgatgttgtt 47115355  T
Q  406 atcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgct 505  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||   || ||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||  |||| ||| |||||||||||    
T  47115356 atcttttctctgctctttttatcttgttta-tccttttgttagattgtggttttgttatgcacttgttttctagattagatctagattgttgttattgct 47115454  T
Q  506 tgtggttatttatatttg 523  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  47115455 tgtgattatttacatttg 47115472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 37033458 - 37032926
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  37033458 aaagggttggtgccttttgaggaagattcatgaggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 37033359  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37033358 gaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctctttttggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 37033259  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaaccca-tttgta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |    
T  37033258 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccattttgca 37033159  T
Q  305 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaac-atttcttggtgtt 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||| || | || |||||    
T  37033158 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctcttctccatagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctattcgtgtt 37033059  T
Q  403 gttatc--ttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgtta 500  Q
    ||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||   || || |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||  |||| ||| ||||||    
T  37033058 gttgtctattttctctactctctttatcttgttta-tcctttggttagagtgtgattttgctatgcacttgttttctagattagatctagattgttgtta 37032960  T
Q  501 ttgcttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37032959 ttgcttgtggttatttacatttggttattggttg 37032926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 11 - 460
Target Start/End: Original strand, 193399 - 193849
Alignment:
Q  11 ggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaag 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||    
T  193399 ggttggtgccttttggg-aagattcatggggttgggaaacacatgtgtgaagagtcttttgtgagcaacttggatgagtcttgtgaaaccaaaagagaag 193497  T
Q  111 atccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  193498 atccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagggtgaaaatcatg 193597  T
Q  210 agtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctct 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  193598 agtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttattagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctct 193697  T
Q  310 ttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgtt-gttatc 408  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  193698 ttgtaataactcattgatagtggattggagagatcaatctcttctccagagtatgtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttcgttatc 193797  T
Q  409 ttttc-tttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttg 460  Q
    || || ||| || | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  193798 ttctcttttgctttatttatcttgtttattccttg-gttggattgtggttttg 193849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Original strand, 34603359 - 34603874
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  34603359 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtgaaaagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 34603458  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt-gttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaa- 204  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  34603459 gaagatccttag-gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggaggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggaaagtgaaaat 34603557  T
Q  205 tcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaaccca-tttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |    
T  34603558 tcatgagtgtcttgttcattggtgagattgaaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttttt 34603657  T
Q  304 atctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttg 403  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||              || |||||||    
T  34603658 atctctttgtaagaactcattgatggtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaa--------------ctaggtgttg 34603743  T
Q  404 ttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtc--tatattcttgttat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||  ||||||  ||||      
T  34603744 ttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttg-gttggattgtggttttgctatgcactt-gattatagactaggtctatatattgctgttgg 34603841  T
Q  502 tgcttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34603842 tgcttgaggttatttacatttgattattggttg 34603874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 7 - 467
Target Start/End: Original strand, 19754274 - 19754737
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  19754274 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 19754373  T
Q  107 aaagatcctta---gtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaa 202  Q
     || |||||||   ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||    
T  19754374 gaaaatccttataagtgaaatcaaaggataatggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacattcgtaaacaccttgagagagtgaa 19754473  T
Q  203 aatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattgg-tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccattt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19754474 aatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgattt 19754573  T
Q  302 gtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||| || ||||| |||| || ||||||     
T  19754574 gtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaagttggaccgaagtgggtcaacaatttttggtg- 19754672  T
Q  402 tgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgca 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||    
T  19754673 tgttatcttttctttactctctttatcttgttta-tccttttgttggattgtggttttgctatgca 19754737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 471
Target Start/End: Original strand, 19752472 - 19752930
Alignment:
Q  11 ggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | |||    
T  19752472 ggttggtgccttttggggaagattcattgagttgggaaacacatgagtggagagtattttgtgagcaacttagatgagtcttgtgaaaccaaaagagaag 19752571  T
Q  111 atccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  19752572 atccttagtgaaatcaaaggctaatgattggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaataatcgtaaacaccttgagagagtgaaaatcatg 19752671  T
Q  210 agtgtcttgttcattggtgagattggg-aaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19752672 agtgtcttgttcattggtgagattgagtaaaatgggtagaaattagggttgttctttgcgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctc 19752771  T
Q  309 tttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatc 408  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||| |||| ||| |||| |  || |   |||||||    
T  19752772 tttgtaagaactcattgatagaggattggagagatcaatctctctcccatattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaatcttttg---tgttatc 19752868  T
Q  409 ttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttg 471  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19752869 ttttatttactctctttatcttgttta-tccttttgttggattgtggttttactatgcacttg 19752930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 37879292 - 37879006
Alignment:
Q  11 ggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaag 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||    
T  37879292 ggttggtgccttttggggaaaattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaag 37879193  T
Q  111 atccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37879192 atccttagtgaaatcaaaggctaaggattggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatg 37879093  T
Q  210 agtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37879092 agtgtcttgttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 37879006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 28265778 - 28265555
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  28265778 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggcgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttcatt 28265680  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  28265679 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 28265580  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  28265579 caagttggaccgaactgggtcaaca 28265555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 8551001 - 8550787
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8551001 attgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtt 8550902  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggac 375  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8550901 taagctaatttcttgtaactcatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 8550802  T
Q  376 caaactgggtgaaca 390  Q
    | |||||||||||||    
T  8550801 cgaactgggtgaaca 8550787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 292 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 37876865 - 37876623
Alignment:
Q  292 taacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacat 391  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  37876865 taacccatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcctccagagtacatcaagttgaaccgaactgggtgaacat 37876766  T
Q  392 ttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctata 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37876765 ttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcatttggtt-gaattgtggtttttctatgcacttggtttatagactaggtctata 37876667  T
Q  492 ttcttgttattgcttgtgg-ttatttatatttggttattggttg 534  Q
     | ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  37876666 gtgttgtttttgcttgtggtttatttacatttggttattggttg 37876623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 28220440 - 28220227
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28220440 attgaaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattcggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 28220341  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28220340 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggacc 28220241  T
Q  377 aaactgggtgaaca 390  Q
     |||||||| ||||    
T  28220240 gaactgggtcaaca 28220227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Original strand, 31659192 - 31659405
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31659192 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggctgttctttgtgagcttgtt 31659291  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  31659292 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaacttattgatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaagttggacc 31659391  T
Q  377 aaactgggtgaaca 390  Q
     |||||||| ||||    
T  31659392 gaactgggtcaaca 31659405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 834391 - 834168
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  834391 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgcgtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatggatagaaattagggttgttcttt 834293  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  834292 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatctatctctcccccagagtaggt 834193  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  834192 caagttggaccgaactgggtcaaca 834168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 183 - 390
Target Start/End: Original strand, 49918309 - 49918517
Alignment:
Q  183 aaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagc 281  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49918309 aaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagc 49918408  T
Q  282 taatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaact 381  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||    
T  49918409 taatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaact 49918508  T
Q  382 gggtgaaca 390  Q
     ||| ||||    
T  49918509 aggtcaaca 49918517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 50167399 - 50167176
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  50167399 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattagtagaaattagggttgttattt 50167301  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |    
T  50167300 gtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaaaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattagct 50167201  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||    
T  50167200 caagttggaccgaactaggtcaaca 50167176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 196 - 390
Target Start/End: Original strand, 3156837 - 3157032
Alignment:
Q  196 gagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaa 294  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3156837 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaa 3156936  T
Q  295 cccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  3156937 cccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 3157032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 167 - 385
Target Start/End: Original strand, 44455104 - 44455322
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44455104 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaaccattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 44455202  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  44455203 gtgaacttgttgaaactaatttcttgtaactcatttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 44455302  T
Q  366 caagttggaccaaactgggt 385  Q
    |||||| |||| ||||||||    
T  44455303 caagtttgaccgaactgggt 44455322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 28223645 - 28223422
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  28223645 gttgggaaaca-ttgaagacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttgatcttt 28223547  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
     ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  28223546 ctgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggt 28223447  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  28223446 caagttggaccgaactgggtcaaca 28223422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 168 - 380
Target Start/End: Original strand, 1833467 - 1833679
Alignment:
Q  168 ttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttg 266  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1833467 ttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 1833565  T
Q  267 tgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtc 366  Q
    |||   | |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1833566 tgaatctattgaagctaaattcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccaccagattaggtc 1833665  T
Q  367 aagttggaccaaac 380  Q
    || |||||||||||    
T  1833666 aaattggaccaaac 1833679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 4552851 - 4552638
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  4552851 attgtaaacaccttgggtgagggaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtttgtcctttgtgagcttgtt 4552752  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4552751 gaagctaatttcttgtaacccctttgtatccctttgtaagaactcattgataatggattggagagatcaatctctccctcagagtaggtcaagttggacc 4552652  T
Q  377 aaactgggtgaaca 390  Q
     |||||||| ||||    
T  4552651 gaactgggtcaaca 4552638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 3847345 - 3847122
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3847345 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 3847247  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||| |||||    
T  3847246 gtgagtttgtttaagctaaatttttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatccatctcttccccagattaggt 3847147  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||    
T  3847146 caagttggaccgaacttggtcaaca 3847122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13659550 - 13659337
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13659550 attgtaaacaccttggggtagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaacggatagaaattagggttgttttttgtaagcttgtt 13659451  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13659450 gaagctaatttcttgttacccatttatatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaagttggacc 13659351  T
Q  377 aaactgggtgaaca 390  Q
     |||||||| ||||    
T  13659350 gaactgggtcaaca 13659337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Original strand, 46064872 - 46065085
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  46064872 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatggataaaaattaggtttgttctttgtgagctcgtt 46064971  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  46064972 gaagctaatttcttgtaactcatgtgtatctctttgtaagaactcattcatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaagttggatc 46065071  T
Q  377 aaactgggtgaaca 390  Q
     |||||||| ||||    
T  46065072 gaactgggtaaaca 46065085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 167 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 50169434 - 50169218
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50169434 gttgggaaaca-ttgtaaataccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 50169336  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||| |||||    
T  50169335 gtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagtactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcccctagattaggt 50169236  T
Q  366 caagttggaccaaactgg 383  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  50169235 caagttggaccgaactgg 50169218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37503768 - 37503574
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37503768 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 37503669  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttgga 374  Q
    ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  37503668 gaagctaatttcttgtaacc---ttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaagttgga 37503574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 167 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 197132 - 196915
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  197132 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaattggtagaaattagggttgttcttt 197034  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctct-cctccagagtagg 364  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| || ||||| ||||    
T  197033 gtgagcttgtttaagttaatttcttgtaactcatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatttatctctccccccagattagg 196934  T
Q  365 tcaagttggaccaaactgg 383  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  196933 tcaagttggaccgaactgg 196915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 3189275 - 3189498
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  3189275 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggttgttcttt 3189372  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3189373 gtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggt 3189472  T
Q  366 caag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||    
T  3189473 caagtttggaccgaactgggtgaaca 3189498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 3198092 - 3198315
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  3198092 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggttgttcttt 3198189  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3198190 gtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggt 3198289  T
Q  366 caag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||    
T  3198290 caagtttggaccgaactgggtgaaca 3198315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 3206931 - 3207154
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  3206931 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggttgttcttt 3207028  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3207029 gtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggt 3207128  T
Q  366 caag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||    
T  3207129 caagtttggaccgaactgggtgaaca 3207154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 165 - 401
Target Start/End: Original strand, 15820249 - 15820485
Alignment:
Q  165 gagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttct 263  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || || |||| |||||||| |||||||    
T  15820249 gagttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttctttggtgatattggaaagatgggtaaaaattaggtttgttct 15820347  T
Q  264 ttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtag 363  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||| ||||||||||    
T  15820348 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctctttttaagaactcattgatagtgcattgaagagataaatctctcatccagagtag 15820447  T
Q  364 gtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    ||||||||||| | |||| ||| ||||||| |||||||    
T  15820448 gtcaagttggatcgaactaggtaaacatttattggtgt 15820485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 37560083 - 37559868
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37560083 attgtaaacacattaggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattaggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtt 37559984  T
Q  277 gaa-gctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctcc-agagtaggtcaagttgga 374  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  37559983 gaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtgaattggagagatcaatctctccccctagattaggtcaagttgga 37559884  T
Q  375 ccaaactgggtgaaca 390  Q
    || |||| ||| ||||    
T  37559883 ccgaacttggtcaaca 37559868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 167 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 23555489 - 23555257
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23555489 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgaatgaaaattattgagtgtcttattctttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 23555391  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| ||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||    
T  23555390 gtgaacttgttgaaactaatttcttataactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcc-ccatagtaggt 23555292  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtg 400  Q
    ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||    
T  23555291 caagttggatcgaactgagtaaacatttcttggtg 23555257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 41360859 - 41361081
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttg 266  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  41360859 gttgggaaaca-tcgtaaacatcttgggtgagtgaaaatattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttg 41360957  T
Q  267 tgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtc 366  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  41360958 tgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagtaggtc 41361057  T
Q  367 aagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |  ||||||| |||| ||| ||||    
T  41361058 atattggaccgaactaggtcaaca 41361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 68 - 405
Target Start/End: Original strand, 22079166 - 22079501
Alignment:
Q  68 tttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgttctcttttgggtgttagattctagag 167  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22079166 tttgtgagcaacttaggtgagtcttggcaaaccaaaatataagatgctta-tgaaatcaaaggctaaggattgttctcttttgggggttagattctagag 22079264  T
Q  168 ttgggaaacaattgt-aaacacattgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||| ||||||||||  ||| || |  || ||||||||  |||     |||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  22079265 ttgagaaacaattgggaaaaacttcaggtgagtgaaac-catt----tcttgttcatgggaagagattggaaaaat-ggtagaaattatgtttgttcttt 22079358  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagg 364  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  22079359 gtgagcttgttaaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaaagaactcattgatattggattggagagatcaatttctcctccaaagtagg 22079458  T
Q  365 tca-agttggaccaaactgggtgaacatttc-ttggtgttgtt 405  Q
    |||  | ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  22079459 tcattgctggaccaaacttggtaaacatttctttggtgttgtt 22079501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 300 - 534
Target Start/End: Original strand, 28242382 - 28242616
Alignment:
Q  300 ttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaa-gttggaccaaactgggtgaacatttcttgg 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28242382 ttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaacatttcttgg 28242480  T
Q  399 tgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtgg-ttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttg 497  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||   || |||||||| ||||||||| |||||||||| || | ||  |||| ||| |||    
T  28242481 tgttgttatcttttctctactctctttatcttgttta-tcattttgttagattgtggtttttgctattcacttggtttctaaattagatctagattgttg 28242579  T
Q  498 ttattgcttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28242580 ttgttgcttgaggttatttacatttggttattggttg 28242616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Original strand, 28242172 - 28242385
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  28242172 aaagggttggtgccttttggg-aagattcataaggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 28242270  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt-gttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaa- 204  Q
     || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  28242271 gaatatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctcttttaggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 28242370  T
Q  205 tcatgagtgtcttgt 219  Q
    || ||||||||||||    
T  28242371 tcttgagtgtcttgt 28242385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 10925167 - 10925393
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  10925167 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgaaaaaatggatagaaattatggttgttcttt 10925265  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt---aagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagta 362  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||| ||    
T  10925266 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaagaattcattgatagtggattggagaaatcaatctctcccctagatta 10925365  T
Q  363 ggtcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||| |||||||| | |||||||| ||||    
T  10925366 ggtaaagttggatcgaactgggtcaaca 10925393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 167 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 928202 - 927966
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctt 264  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| ||||||    
T  928202 gttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcaatgagtgtcttgttctttggtgatattggaaaaaatgatagaaattagggtttgttctt 928103  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||| |||| | |||  |||||    
T  928102 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttggatctctttgtaaaaactcattaatagtggattagagagaccaacctcttccccaaggtagg 928003  T
Q  365 tcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  928002 tcaagttagaccgaactgggtaaacatttctttgtgt 927966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 190 - 401
Target Start/End: Original strand, 16455588 - 16455799
Alignment:
Q  190 ttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaattta 288  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||  || ||||  ||||||||||||||||||||||     
T  16455588 ttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggtaaaatggtgagaaattagattttttcta-gtgagcttgttgaagctaatttc 16455686  T
Q  289 ttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||||| || ||    
T  16455687 ttgtaacccatttgtatctctgtgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccatagtcggtcaaattggaccaaactgtgtaaa 16455786  T
Q  389 catttcttggtgt 401  Q
    |||||||||||||    
T  16455787 catttcttggtgt 16455799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 167 - 387
Target Start/End: Original strand, 20762616 - 20762837
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattgg-tagaaattagggttgttctt 264  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  20762616 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtatcttgttcattggtgagattgagaaaaaagggtagaaattagggttgttctt 20762713  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagg 364  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20762714 tgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctacagagtagg 20762813  T
Q  365 tcaag-ttggaccaaactgggtga 387  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||    
T  20762814 tcaagtttggaccgaactaggtga 20762837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 169 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13138196 - 13137977
Alignment:
Q  169 tgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgt 267  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||| | |||||||||    
T  13138196 tgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattga-aaaatggatagaaattagg-tcgttctttgt 13138100  T
Q  268 gagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca 367  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||| | |||||||||||    
T  13138099 gagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctctttgtaagaacacattgatagtggattgaagagagcaatctctcccctagagtaggtca 13138000  T
Q  368 agttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
      ||||||| |||||||| ||||    
T  13137999 tattggaccgaactgggtcaaca 13137977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 45644569 - 45644355
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgt 275  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  45644569 attgtaaacatcttgggtgagtgaaaatcattaagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatggatagaaattaagttttgttctttgtgagcttgt 45644470  T
Q  276 tgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggac 375  Q
      |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  45644469 caaagctaatttcttgcaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatatctcccccagattaggtcaagttggac 45644370  T
Q  376 caaactgggtgaaca 390  Q
    | |||||||| ||||    
T  45644369 cgaactgggtcaaca 45644355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 30476672 - 30476447
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttca---ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttc 262  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30476672 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgggtgaaaatcattgagt-tcttgttcaatattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttc 30476575  T
Q  263 tttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagta 362  Q
    ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| | ||| |  |    
T  30476574 tttatgaacttgttgaagataatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatactggattggacagatcaatctctaccccatatga 30476475  T
Q  363 ggtcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  30476474 ggttaagttggaccgaactgggtcaaca 30476447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13316520 - 13316352
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactca 322  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13316520 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 13316421  T
Q  323 ttgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  13316420 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 13316352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 34602724 - 34602557
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  34602724 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtgaaaagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 34602625  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt-gttctcttttgggtgttagattctagagttgggaa 174  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  34602624 gaagatccttag-gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggaggttagattctagagttgggaa 34602557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 436
Target Start/End: Original strand, 6808253 - 6808667
Alignment:
Q  30 agattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaagatccttagtgaaatcaaag 129  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| | ||||||  ||  ||||||||| | |||||| ||| || ||||||||    
T  6808253 agattcatggggttggaaaacacatgaatgaagagtcatttgtgagcaactagggtgagtaatggaaaaccaaaagagaagatcatta-tgtaatcaaag 6808351  T
Q  130 gctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggt 227  Q
     |  | ||||| |||||||| | | ||||||||||||||||| |||||| | | |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||    
T  6808352 acggaaggttggttctctttcgag-gttagattctagagttgagaaacattgggaaacactttgggagagtgaaaattattgagtgtcttgttcatgagt 6808450  T
Q  228 -gagattgggaaaattggtagaaattagggtt------gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaac 319  Q
     |||||| || |||| ||||||||||||| ||      |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  6808451 agagattagggaaat-ggtagaaattaggattaggtttgttcttggagagcttgttgaagctaacttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaac 6808549  T
Q  320 tcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttac 418  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| |  ||||| || |||| | | || ||||||||| |||||| | | || | |||    
T  6808550 tcatttatagtggattggagagatcaatctcttcctcagagtaggttattgttggtccgaactagataaatatttcttggagttgttctttgttttctac 6808649  T
Q  419 tctctttatcttgtttat 436  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6808650 tctctttatcttgtttat 6808667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 168 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 40122421 - 40122197
Alignment:
Q  168 ttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttg 266  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||||||||    
T  40122421 ttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtaaaaatcattgaatgtcttgttcatttgtgagattggaaaaatgggtcgaaattagatttgttctttg 40122323  T
Q  267 tgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattg--atagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagg 364  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||    
T  40122322 tgagcttgtttaagctaatttcttataactcatttgtatcactttgtaagaactctttgatatagtggattagagagatcaatctctcccccatattagg 40122223  T
Q  365 tcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||    
T  40122222 tcaagttggaccgaactaggtcaaca 40122197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Original strand, 51765349 - 51765565
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggga-aaattggtagaaattagggttgttc-tttgtgagcttg 274  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  51765349 attgtaaacaccttggt-gagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtttgattgggagaaaagggtagaaattagggttgtacctttgtgaacttg 51765446  T
Q  275 ttgaagctaatttattgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-tt 371  Q
    |  |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  51765447 tcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggacaagttt 51765546  T
Q  372 ggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  51765547 ggaccgaactgggtgaaca 51765565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 196 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 37282887 - 37282682
Alignment:
Q  196 gagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgta 293  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37282887 gagtgaaaaccattgagtgtcttgttcattggagagattg--aaaaatggtataaattagggtttgttccttgtgagcttgttgaagctaatttatggta 37282790  T
Q  294 acccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatt 392  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||  |||| | | ||||||    
T  37282789 acccttttgcatctctttgtaaagaactcattagtagtggattggagagataaatctctcctttggagtaggtcaatttggactgaactagataaacatt 37282690  T
Q  393 tcttggtg 400  Q
    | ||||||    
T  37282689 ttttggtg 37282682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 227 - 401
Target Start/End: Original strand, 36683694 - 36683858
Alignment:
Q  227 tgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattga 326  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||          ||||||||||||||    
T  36683694 tgagattgggaaaataggtagaaattaggtttattctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttg----------taagaactcattga 36683783  T
Q  327 tagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  36683784 tagtggattgtagaaatcaatctctcccccagagtaggtcaagttagaccgaactgagtaaacatctcttggtgt 36683858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 9987202 - 9987369
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactc 321  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||| ||| ||||  |||||||| |||| | ||||||||    
T  9987202 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgcaacct-tttgtatcccttttgcaagaactc 9987299  T
Q  322 attgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9987300 attgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 9987369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 20622406 - 20622237
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt---gtaagaac 319  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||| ||||||||  |||||||| ||||   ||||||||    
T  20622406 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttttgtaagaac 20622309  T
Q  320 tcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  20622308 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 20622237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 166 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 44650389 - 44650153
Alignment:
Q  166 agttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttct 263  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || || |||||| |||| |||||    
T  44650389 agttggaaaacatttgtaaacactttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggagagattgagaaaaatg-taaaaattatggtttgttct 44650291  T
Q  264 ttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagta 362  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||  | ||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| | | | ||||    
T  44650290 ttgtgagtttgttaacgctaatttattgtaaatcttttatatctctttgtaaataattcattaatagtggattgaagagatcaatctcttcccaaaagta 44650191  T
Q  363 ggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtg 400  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| || |||| ||||||    
T  44650190 ggtcaatttggaccgaactaggtaaatattttttggtg 44650153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 40282377 - 40282545
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  40282377 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 40282474  T
Q  321 cattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  40282475 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 40282545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 243 - 396
Target Start/End: Original strand, 3460715 - 3460869
Alignment:
Q  243 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagt 340  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||     
T  3460715 ggtagaaattagagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccttttgtatatctttgtaaagaacatattgatagtcgattggaga 3460814  T
Q  341 gatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttctt 396  Q
    ||||||| ||| | | |||||||||||| || ||||||| | ||| ||||||||||    
T  3460815 gatcaatatcttc-ctagagtaggtcaatttagaccaaattaggtaaacatttctt 3460869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 235 - 438
Target Start/End: Original strand, 2926520 - 2926726
Alignment:
Q  235 ggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtgga 333  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||   || |||||| ||| |||||||||||||||  |||| ||||||||| || ||| |||||| |||||||    
T  2926520 ggaaaaatggtagaaattaggtttgtgcttgaagaacttgttaaagttaatttattgtaacctttttgcatctctttgaaacgaattcattggtagtgga 2926619  T
Q  334 ttggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttc-ttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttg 431  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||||  |||| ||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||    
T  2926620 ttggagagatcaatctcttctgcagagtaggtcattgttgcaccgaactaggtaaacaattctttggtgttgttctttttactctactctctttatcttg 2926719  T
Q  432 tttattc 438  Q
    |||||||    
T  2926720 tttattc 2926726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 9036417 - 9036584
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  9036417 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 9036513  T
Q  321 cattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    | |||||||||||||| || |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9036514 ctttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcgagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 9036584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 208 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 12318706 - 12318475
Alignment:
Q  208 tgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatc 306  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||     
T  12318706 tgagtttcttgttcatgggtagagatttggaaa-tgggtagaaattaggtttgttcatggagagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatg 12318608  T
Q  307 tctt-tgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaac-atttcttggtgttg 403  Q
    |||| | |||||||||||||||| || |   ||| ||||  ||||||| ||| ||||| |||   ||||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||    
T  12318607 tcttctttaagaactcattgatactgaagcagagagatc--tctctcccccatagtagttcattattggaccgaactaggtaaacaattttttggtgttg 12318510  T
Q  404 ttatcttttctttactctctttatcttgtttattc 438  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12318509 ttctcttttctttactccctttatcttgtttattc 12318475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 223 - 387
Target Start/End: Original strand, 21053958 - 21054123
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||| ||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  21053958 ttggtgagattgggaaaagtg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 21054055  T
Q  321 cattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 387  Q
    | ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21054056 ctttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 21054123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 179 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 8871259 - 8871054
Alignment:
Q  179 ttgtaaacacattgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttg 277  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  8871259 ttgtaaacaccttggatgagcgaaaatcat-agtgtcttgttcttttgtgagatttggaaaat-ggtagaaattagggtttgttctttgtgagttcgttg 8871162  T
Q  278 aagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacca 377  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| |||              ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||     
T  8871161 aagctaatttcttgtaaccattttgtaactc--------------ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatagtaggccaagttggaccg 8871076  T
Q  378 aactgggtgaacatttcttggt 399  Q
    || || || ||||||| |||||    
T  8871075 aattgagtaaacatttattggt 8871054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 328
Target Start/End: Original strand, 41135605 - 41135926
Alignment:
Q  9 agggttggtgccttttgggga-agattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataa 107  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||| || |  | ||||||||| ||||| |||||| |||||||||  |||||||||| |     
T  41135605 agggttggtgccttttagggagagattcatggggttgggaaacacatcaaaggagagtcttt-gtgagaaacttgggtgagtcttaggaaaccaaaagag 41135703  T
Q  108 aagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattg-taaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
    |||||| || | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||  |||||| ||||| ||| | ||||    
T  41135704 aagatcatttg-gaaattaaaggctaaggattggttctcttttgggggttagattctagagttgagaaacatttgaaaaacaccttgggtgag-ggaaat 41135801  T
Q  206 ca-tgagtgtcttgttcat-tggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgt 303  Q
    || ||||| |||||||| | ||  |||| |  |||||  ||||||||||||  ||||||||   || ||| |||||| |||||| |||||| || |||||    
T  41135802 cattgagtctcttgttcctgtgaggagaat-agaaaaagggtagaaattagatttgttcttgaagaactttttgaagttaatttcttgtaaaccttttgt 41135900  T
Q  304 atctctttgt-aagaactcattgata 328  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  41135901 atctatttgtaaagaactcgttgata 41135926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 9109603 - 9109347
Alignment:
Q  208 tgagtgtcttgttcattggt--gagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| || |||||||| | || | ||| | || |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  9109603 tgagtgtcttgttcat-ggtaggagattgagaaaat-ggaagaaattaagtttttacttggagaacttgttgaagttaatttcttgtaacccttttgtat 9109506  T
Q  306 ctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttg 403  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||| |   |||||| ||||  |||| |||||||| ||| ||||||| |||| | ||    
T  9109505 ctctttgtaaagaacacgttgatagtgtattggagagatcaatctcttccatagagtaagtcatcgttgaaccaaactaggtaaacattttttggggctg 9109406  T
Q  404 ttatcttttctttactctctttatc-ttgtttattccttgctttggattgtggttttgct 462  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||    
T  9109405 ttatttagtctctactctctttatctttgtttattctttggttt-gattgtggttatgct 9109347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 44203631 - 44203800
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 319  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  || ||||| |||| |||| ||||    
T  44203631 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaac 44203727  T
Q  320 tcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  44203728 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 44203800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 331
Target Start/End: Original strand, 25652018 - 25652195
Alignment:
Q  156 tagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgag-attgggaaaattggtagaaatta 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||||| |||| | ||||||||  |  |  |||| |||| |||||||||||||    
T  25652018 tagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttaagtgtgtgaaaatcattgagtattttgttcatgagaaaatattgagaaa-ttggtagaaatta 25652116  T
Q  254 gggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 331  Q
     |  |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  25652117 agtgtgttatttgagagtttgttgaagctaatttcttgtaactctcttgtatctctttgtaaagaactctttgatagtg 25652195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 2263106 - 2262965
Alignment:
Q  260 ttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccag 358  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||   ||    
T  2263106 ttcttggtgagcttgttgaagataatttcttgtaacccttttatatctttttgtaaagaacttattgatagtggattgaagagatcaatctttcccttag 2263007  T
Q  359 agtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggt 399  Q
     ||||||||  ||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  2263006 ggtaggtcattgttggtccgaactgagtaaacatttcttggt 2262965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 243 - 335
Target Start/End: Original strand, 32471481 - 32471573
Alignment:
Q  243 ggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtggatt 335  Q
    |||| |||||||| |||||||||| || || ||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32471481 ggtataaattaggtttgttctttgagaact-gttgaagttaatttattgcaactcttttgtatctctttgtaagaaactcattgatagtggatt 32471573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 452 - 512
Target Start/End: Original strand, 194750 - 194810
Alignment:
Q  452 gtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgcttgtggtt 512  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  194750 gtggttttgatatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttgttgcttgtggtt 194810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 44647010 - 44646881
Alignment:
Q  166 agttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttct 263  Q
    |||||| ||| | ||||||| || ||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || || |||||| |||| |||||    
T  44647010 agttggaaaatatttgtaaatactttggatgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggagagattgagaaaaatg-taaaaattatggtttgttct 44646912  T
Q  264 ttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaa 294  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  44646911 ttgtgagtttgttaacgctaatttattgtaa 44646881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16914338 - 16914234
Alignment:
Q  228 gagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaa-tttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattg 325  Q
    |||||||||||| | |||| |||||| | |||||||| | |||| |||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16914338 gagattgggaaa-tgggtaaaaattatgtttgttcttggagagcctgttgaagctaagtttcttctaacccttttgtatctctttgtaaagaactcattg 16914240  T
Q  326 atagtg 331  Q
    ||||||    
T  16914239 atagtg 16914234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1050678 - 1050503
Alignment:
Q  157 agattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcat-tggtgagattgggaaaattggtagaaattagg 255  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||   |||||||| |  ||||| |||||||||| ||  |||||||||||| | |||  ||||||||    
T  1050678 agattcttgggttgggaaacatttgtacacacattgaatgagtgaaattattgagtctcttgttcatgtgaagagattgggaaa-tgggtgaaaattagg 1050580  T
Q  256 gttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 331  Q
      ||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||    
T  1050579 tgtgttcttcgagagcttattgaagctaatttcttgtaacatttttgtgtctctttgtaaataactcgttgatagtg 1050503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 4535633 - 4535541
Alignment:
Q  239 aattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagt 330  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| | |||||| ||||||  ||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4535633 aattggtagaaattaagtttgttcttggagagcttattgaagtcaatttcttgtaacatttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagt 4535541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 363
Target Start/End: Original strand, 5459956 - 5460046
Alignment:
Q  273 tgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtag 363  Q
    ||||||||||||||| |||||||   ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  5459956 tgttgaagctaatttcttgtaacat-tttatatttctttgtaaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcatctagagtag 5460046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 367
Target Start/End: Original strand, 13938143 - 13938281
Alignment:
Q  228 gagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccattt-gtatctctttgtaagaa-ctcattg 325  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| | || |||||  ||  |||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  13938143 gagattgggaaa-tgggtagaaattagg-ttgttcttggagaacttgtaaaatataatttcttgtaaccttttttgtatctctttgtaagaaactcattg 13938240  T
Q  326 atagtggattggagtgatcaatctctcctccaga-gtaggtca 367  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  13938241 atagtggattggagagatc--tctctcccccagatgtaggtca 13938281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 177
Target Start/End: Original strand, 3331439 - 3331505
Alignment:
Q  109 agatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaaca 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  3331439 agatccttag-gaaatcaaaggctaagggtttgtttcttttggg-gttggattctagagttgggaaaca 3331505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 4535860 - 4535784
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttg 82  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  4535860 aaagggttggtgtcttttgggaatagattcatggggttgaaaaacacatgagtggatagtcgtttgtgagcaacttg 4535784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 12318806 - 12318725
Alignment:
Q  67 ttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt-gttctcttt 148  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||| || ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12318806 ttttatgagcaacttgggtgagtcttgggagaccaaaatagaaaatcttttg-gaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 12318725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 243 - 307
Target Start/End: Original strand, 35109494 - 35109557
Alignment:
Q  243 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatct 307  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||  || |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  35109494 ggtagaaattaaggtttgttctttgtgagct--tttaagctaatttcttgtaacctatttgtatct 35109557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 9109732 - 9109680
Alignment:
Q  61 agagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaagatc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  9109732 agagtcttttgtgagcaatttggatgagtcttgggaaatcaaaatagaagatc 9109680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 44646875 - 44646795
Alignment:
Q  320 tcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtg 400  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| | | | |||||||||| ||||||| |||| ||| || |||| ||||||    
T  44646875 tcattaatagtggattgaagagatcaatctcttcccaaaagtaggtcaatttggaccgaactaggtaaatattttttggtg 44646795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 398; Significance: 0; HSPs: 72)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 530
Target Start/End: Original strand, 213252 - 213775
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  213252 aaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 213351  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatc 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  213352 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt---ctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatc 213448  T
Q  207 atgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatc 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  213449 atgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccatttgtatc 213548  T
Q  307 tctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgtt 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  213549 tctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgtt 213648  T
Q  406 atcttttcttta--ctctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattg 503  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  213649 atctttcctttactctctctttatcttgtttattccttgcttttgattgtggttttgctatgcacttagttaatagactaggtctatattgttgttattg 213748  T
Q  504 cttgtggttatttatatttggttattg 530  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  213749 cttgtggttttttacatttggttattg 213775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 513
Target Start/End: Original strand, 5057834 - 5058336
Alignment:
Q  11 ggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||    
T  5057834 ggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagagaag 5057933  T
Q  111 atccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatg 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  5057934 atccttagtaaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttggaagagtgaaaatcatg 5058033  T
Q  210 agtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctct 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  5058034 agtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct--gtgagcttgttgaagctattttcttgtatcccatttgtatctct 5058131  T
Q  310 ttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatct 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5058132 ttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatct 5058231  T
Q  410 tttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtc--tatattcttgttattgcttg 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||    
T  5058232 tttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattatggttttactatgcactt-gattatagactaggtctatatattgttgttgttgcttg 5058330  T
Q  508 tggtta 513  Q
    ||||||    
T  5058331 tggtta 5058336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 471
Target Start/End: Original strand, 40147048 - 40147508
Alignment:
Q  11 ggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  40147048 ggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaag 40147147  T
Q  111 atccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  40147148 atccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtggaaatcatg 40147247  T
Q  210 agtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctct 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  40147248 agtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctct 40147347  T
Q  310 ttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatct 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  40147348 ttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttttttgtgtttttatct 40147447  T
Q  410 tttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttg 471  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  40147448 tttctttactctatttatcttgttta-tcctttggttgaattgtggttttgttatgcacttg 40147508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 7 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 27638000 - 27637495
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  27638000 aaagggttggtgcattttggg-aagattcatggggttaggaaacacatgagtgaagagtcttttatgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 27637902  T
Q  107 aa--agatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt-gttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaa 203  Q
     |  ||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  27637901 gagaagatccttagtgaaatcaaagactaaaagtttgttctcttttgggggttagatgctagagttgggaaacaattgtgaacaccttggaagagtgaaa 27637802  T
Q  204 at-catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaaccca-ttt 301  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||| |||    
T  27637801 attcatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttatgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccatttt 27637702  T
Q  302 gtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27637701 gtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctgcagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaatatttcttggtg 27637603  T
Q  401 ttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgtta 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  27637602 ttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattcctt-agttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattgttgttg 27637504  T
Q  501 ttgcttgtg 509  Q
    |||||||||    
T  27637503 ttgcttgtg 27637495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 7 - 401
Target Start/End: Original strand, 28278099 - 28278494
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  28278099 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagactattgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaaga 28278198  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgt-tctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     |||||  |||||||||||||| |||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28278199 gaagattgttagtgaaatcaaatgctaagggttggctctcttttaggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 28278298  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28278299 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 28278398  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  28278399 ctctttgtaaaaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacaattcttggtgt 28278494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 7 - 492
Target Start/End: Original strand, 27015315 - 27015789
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  27015315 aaagggttggtgccttttggggaagaatcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtaaaaccaaaaga 27015414  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt-gttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27015415 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacatcttgggagagtgaaaat 27015514  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        ||||||||||||    
T  27015515 catgagtgt-ttggtcattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaat--------acccatttgtat 27015605  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgtt 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27015606 ctctttgtaagaactcattgatagtggattgtacagatcaatctctcctccaaaataggtcaagttggaccgaactgggtgaacattttttggtg-tgtt 27015704  T
Q  406 atcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatat 492  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||| || |||||    
T  27015705 attttttctttactctctttatcttgtttatgctttg-gttgaattgtggttttgatatgcactt-gattatagactaggtatatat 27015789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 7 - 385
Target Start/End: Original strand, 38746788 - 38747167
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  38746788 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacgtgagtggagagtcatttgcgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 38746887  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38746888 gaagatccttattgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 38746987  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38746988 catgagtatcttgttcattaatgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 38747087  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggt 385  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38747088 ctctttggaaaaactcattgatagaggattggagagatcaatctctccctcagatcaggtcaagttggaccaaactgggt 38747167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 69 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 16641263 - 16640814
Alignment:
Q  69 ttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagag 167  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  16641263 ttgtgaacaactttggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatacttaaa-aaatcaaaggctaaaggttggttctcttttggggattagattctagag 16641165  T
Q  168 ttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--tggtagaaattagggtt-gttct 263  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||   ||||||||||||| ||| |||||    
T  16641164 ttggggaacatttgtaaacaccttgagtgagtgaaattcattaagtgtcttgttcattggcgagattgagaaaaaaatggtagaaattagtgtttgttct 16641065  T
Q  264 ttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtag 363  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |  |||| | ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16641064 ttgtgagcttgttgaagctgatttctgataactcttttgtatctctttgtaagaact---tgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 16640968  T
Q  364 gtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctc--tttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgc 461  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||| |||   ||  ||||||||||||     
T  16640967 gtcaagtagggccgaactgggtaaacatttcttggtgttgttatcttttctttgctctctatttatcttgcttatt-ctttagttaaattgtggttttgt 16640869  T
Q  462 tatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgcttgtggttattt 516  Q
    |||||| ||| ||| |||| ||  |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16640868 tatgcatttgatttctagattaaatctagatttttgttgttgcttgtggttattt 16640814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 533713 - 533936
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  533713 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgcgtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttggtcttt 533811  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||    
T  533812 gtgagcttgttgaagctaattttttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaaagatcaatctctcccccatattaggt 533911  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  533912 caagttggaccgaactgggtcaaca 533936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 42428644 - 42428431
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  42428644 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtttttctttgtgaacttgtt 42428545  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  42428544 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggacc 42428445  T
Q  377 aaactgggtgaaca 390  Q
     |||||||| ||||    
T  42428444 gaactgggtcaaca 42428431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 178 - 385
Target Start/End: Original strand, 13488157 - 13488365
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13488157 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 13488256  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  13488257 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaagttggacc 13488356  T
Q  377 aaactgggt 385  Q
     ||||||||    
T  13488357 gaactgggt 13488365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 167 - 401
Target Start/End: Original strand, 13239696 - 13239930
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13239696 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaaatggtagaaattagggtttttcttt 13239793  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13239794 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 13239893  T
Q  366 c-aagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    | || ||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  13239894 caaatttggaccgaactgggtgaacaatttttggtgt 13239930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Original strand, 32636778 - 32636991
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  32636778 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttgttctttgtgaacttgtc 32636877  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  32636878 aaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggacc 32636977  T
Q  377 aaactgggtgaaca 390  Q
     |||||||| ||||    
T  32636978 gaactgggtcaaca 32636991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 178 - 401
Target Start/End: Original strand, 16452035 - 16452258
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  16452035 attgtaaacaccttggta-agtgacaatcattgagtgtcttgttcattgatgagattggaaaaatgggtagaaattaagtttgttctttctgagcttgtt 16452133  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16452134 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattcatagtggattggagagataaatctctcccccagagtaggtcaagttggacc 16452233  T
Q  377 aaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
     |||||||| |||||||||||||||    
T  16452234 gaactgggtaaacatttcttggtgt 16452258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 25412706 - 25412928
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25412706 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggttgttcttt 25412802  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25412803 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 25412902  T
Q  366 caag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||    
T  25412903 caagtttggactgaactgggtgaaca 25412928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 168 - 383
Target Start/End: Original strand, 537970 - 538185
Alignment:
Q  168 ttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttg 266  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  537970 ttgggaaaca-tcgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgcgtgtcttgttcattagtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggttgctctttg 538068  T
Q  267 tgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtc 366  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||    
T  538069 tgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggtc 538168  T
Q  367 aagttggaccaaactgg 383  Q
    |||||||||| ||||||    
T  538169 aagttggaccgaactgg 538185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 39468773 - 39468550
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39468773 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattagtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 39468675  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  39468674 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggt 39468575  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
     || ||||||  |||||||| ||||    
T  39468574 taaattggactgaactgggtcaaca 39468550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 168 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42426458 - 42426251
Alignment:
Q  168 ttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttg 266  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42426458 ttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 42426360  T
Q  267 tgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtc 366  Q
    |||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||    
T  42426359 tgaaattgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccctgattaggtc 42426260  T
Q  367 aagttggac 375  Q
    |||||||||    
T  42426259 aagttggac 42426251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 167 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 28750879 - 28750661
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28750879 gttgggaaaca-ttgaaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 28750781  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
     |||  ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  28750780 atgaaattgttgaagttaatttcctgtaacccatttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 28750681  T
Q  366 caagttggaccaaactgggt 385  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  28750680 caagttggaccgaattgggt 28750661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Original strand, 33831634 - 33831847
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33831634 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcatttgtgagattggaaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtt 33831733  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||     
T  33831734 taagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggact 33831833  T
Q  377 aaactgggtgaaca 390  Q
     |||||||| ||||    
T  33831834 gaactgggtcaaca 33831847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 167 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 3075882 - 3075648
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  3075882 gttgggaaaca-ttgtaaacacctttgatgagtgaaaatcattgagtgtctcgttcatttgtgagattgagaaaataggtagaaattaggtttgttcttt 3075784  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  3075783 gtgagcttgctgaatctaatttcttgtaacccatttgtatctttttgtaagaattcgttgatagtgaattggagagatcaatctctccctcatagtaggt 3075684  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3075683 caagttggaccaaattgggtgaacatttcttggtgt 3075648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 8566160 - 8565947
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8566160 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatgggtagaacttaggtttgttctttgtgagcttgtt 8566061  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  8566060 taagctaatttcttgtaacccatttgtatccctctgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcacccagattaggtcaagttggacc 8565961  T
Q  377 aaactgggtgaaca 390  Q
     |||| ||| ||||    
T  8565960 gaactaggtcaaca 8565947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 30182533 - 30182756
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30182533 gttgggaaaca-ttgcaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggttgttcttt 30182630  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  30182631 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttctatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtatgt 30182730  T
Q  366 caag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||    
T  30182731 caagtttggaccgaactggatgaaca 30182756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 13343005 - 13343228
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattgg-tagaaattagggttgttctt 264  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  13343005 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctt 13343102  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagg 364  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13343103 tgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtagg 13343201  T
Q  365 tcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  13343202 tcatgtttggaccgaactgggtgaaca 13343228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 167 - 401
Target Start/End: Original strand, 31182917 - 31183149
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31182917 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttaggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgg-aaaatgggtagaaattaggattgttcttt 31183014  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||| ||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||    
T  31183015 gtgagtttgtttaagttaatttcttgtaacc-atttgtatccctttgtaagaactcattgatactggattggagagatctatctctcccccatattaggt 31183113  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  31183114 caagttggaccgaactgggtcaacattctttggtgt 31183149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 37439078 - 37439309
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaa--------aattggtagaaattagggt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||||    
T  37439078 gttgggaaaca-ttgtaaacactttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgggaaggaaaaataaaaggtagaaattagggt 37439175  T
Q  258 tgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctcca 357  Q
    |||||||||||| |||||  ||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37439176 tgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcca 37439275  T
Q  358 gagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  37439276 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 37439309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 474
Target Start/End: Original strand, 316550 - 317014
Alignment:
Q  9 agggttggtgccttttgggga-agattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataa 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||| ||||| || |    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||| || ||||||| |     
T  316550 agggttggtgccttttggggagagattcataaggttgggaaacacatcaaaagagagtcttt-gtgagcaacttg-gtgaatcttgggagaccaaaagag 316647  T
Q  108 aagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatc 206  Q
    || ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||  || |  | ||| |||||||| ||    
T  316648 aaaatcct-ag-gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattttaaagttggaaaacaattgggaaaaactcgggtgagtgaaa-tc 316744  T
Q  207 at-gagtgtcttgttcattggtga-gattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgta 304  Q
    || | || ||||||| |  ||  | ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  316745 attgggtctcttgtttaggggaaaagattgagaaaaa-ggtagaaattaggtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaatccttttgta 316843  T
Q  305 tctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgtt 402  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||    
T  316844 tctctttgtaaagaactcattgataatggatcggagggatcaatctctcccctagagtaggtcattgttggaccgaacttggtaaacaattctttgtgtt 316943  T
Q  403 gttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtt 474  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| |||  ||  |||||||||||||| | |||||||||    
T  316944 gttctcttttccctactctctttattttgtttattctttg-gttcaattgtggttttgctttacacttggtt 317014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 178 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 30683134 - 30682930
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  30683134 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt---ctttgtgaacttgtt 30683039  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaa--ctcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttgga 374  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30683038 gaagctaatttcttgtaacccttttgtatttctttgtaagaatactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttgga 30682939  T
Q  375 ccaaactgg 383  Q
    || ||||||    
T  30682938 ccgaactgg 30682930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 168 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 9049565 - 9049332
Alignment:
Q  168 ttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttg 266  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| | |||||||||| |||  | ||||    
T  9049565 ttgggaaacatttgtaaacactttgggtgagtaaaaatcactgagtgtcttgttgattagtgagtttgggaaaat-gatagaaattagtgtttgtttttg 9049467  T
Q  267 tgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtc 366  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||     
T  9049466 tgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaagaactcattgacagtggattggagagatcaatatctcccccaaagtaggtg 9049367  T
Q  367 aagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    |||||||||| || ||| | ||||||| |||||||    
T  9049366 aagttggaccgaaatggataaacattttttggtgt 9049332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 173 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 13695910 - 13695680
Alignment:
Q  173 aaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgag 270  Q
    ||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| |||| ||| |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13695910 aaacatttgtaaacaccttgtgtgagtgaaaatcattgagtatctttttctttggagagattgggaaaag-ggtacaaattagggtttgttctttgtgag 13695812  T
Q  271 cttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag 369  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||| | ||||||||||| ||||||||||     
T  13695811 cttgttaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactcattaatagtggattagagagattattctctcctccatagtaggtcaac 13695712  T
Q  370 ttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13695711 ttggaccaaactaggtaaacatttcttggtgt 13695680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 36074268 - 36074043
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatt---ggtagaaattagggttgttc 262  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||    
T  36074268 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaagggtagaaattagggttgttc 36074171  T
Q  263 tttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagta 362  Q
    |||| || |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  36074170 tttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccaaagta 36074072  T
Q  363 ggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  36074071 ggtcaagtttggaccgaactggatgaaca 36074043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 16409475 - 16409643
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactc 321  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  16409475 ttggtgagattggaaaaag-ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactc 16409573  T
Q  322 attgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16409574 attgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 16409643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 178 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 42310149 - 42309950
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||  |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||| | | ||| ||||||||||||||||    
T  42310149 attgtaaacattttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttgctcattggtgagattgagaaattgggtagaaatcaagtttgatctttgtgagcttgtt 42310050  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||| ||||| | ||||| ||||    
T  42310049 gaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaacttattgatagtggattagcgagatcaatctctcccccatagtagattaagtttgacc 42309950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 26177883 - 26178050
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactc 321  Q
    ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  26177883 ttggtgagattggaaaag--ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactc 26177980  T
Q  322 attgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26177981 attgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 26178050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 9789392 - 9789224
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactc 321  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| |||||| |||||  || ||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  9789392 ttggtgagattggaaaaag-ggtagaaattaaggttgttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactc 9789294  T
Q  322 attgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9789293 attgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 9789224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18441816 - 18441648
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactc 321  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  18441816 ttggtgagattggaaaaag-ggtagaaattagggttgttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactc 18441718  T
Q  322 attgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18441717 attgatagtggattggagagttcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 18441648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 167 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 5887640 - 5887487
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||  |||||||||    
T  5887640 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatggatagaaattagatttgttcttt 5887542  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaact 320  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5887541 gtgagcttgtttaagctaatttcttgcaacccatttgtatcactttgtaagaact 5887487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 19806328 - 19806530
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19806328 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaa-tcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaatta-ggttgttcttt 19806424  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||                   |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  19806425 gtgagtttgttgaagctaatttcttctaa-------------------aagaactccttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 19806505  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  19806506 caagttggaccgaactgggtcaaca 19806530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 282
Target Start/End: Original strand, 4160465 - 4160690
Alignment:
Q  56 agtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt-gttctcttttgggtg 154  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||| | ||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  4160465 agtggagagtcatttgtgagcaactagggtgaatcttgggaaaccaaaagagaagatccttag-gtaattaaaggctaagggttggttctcttttggggg 4160563  T
Q  155 ttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcat-tggtgagattgggaaaattggtagaaatta 253  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||   |||| ||| ||| ||||  |  |||||| |||||| ||||||||||||    
T  4160564 ttagattc-agagttgagaaacaattgtaaacacattggttgagtgaaatcaatgaatgttttgctcatgagaggagatttggaaaa-tggtagaaatta 4160661  T
Q  254 gggttgttctttgtgagcttgttgaagct 282  Q
    || |||||||| | || ||||||||||||    
T  4160662 ggtttgttcttggagaacttgttgaagct 4160690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 29751328 - 29751160
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  29751328 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 29751231  T
Q  321 cattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  29751230 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 29751160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 33906412 - 33906024
Alignment:
Q  9 agggttggtgccttttgggga-agattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataa 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| || |  | |||| |||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |     
T  33906412 agggttggtgccttttggggagagattcatggggttgagaaacacatcaaaggagagactta-gtgagcaacttgggtgagtcttgggaaaccaaaagag 33906314  T
Q  108 aagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg---ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgt-aaacacattgggagagtgaaa 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||   |||| ||| ||| | || |||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||| |||||||||     
T  33906313 aagatccttag-gaaatcaaaggctaatgactggcgttct-tttggggggatatattctagagttgtgaaacaaatgagaaacaccttgcgagagtgaac 33906216  T
Q  204 atcat-gagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccattt 301  Q
    ||||| ||||||||    ||| ||  || |||| |||| | |||| |||||||| | || ||| | |||||||| |||||||| || |||||| || |||    
T  33906215 atcattgagtgtct----catgggaagaaattgtgaaa-tgggtataaattaggttagtgcttggagagcttgtcgaagctaacttcttgtaatcctttt 33906121  T
Q  302 gtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaa-gttggaccaaactgggtgaacatttctt 396  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| | | |||||||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||    
T  33906120 gtatctctttgtaaagaactcattgatagtagattggaaagatcaatctcttccctagagtaggtcaatgttggaccgagctgggtaaacaattctt 33906024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 22536457 - 22536290
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  22536457 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 22536361  T
Q  321 cattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    | ||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22536360 ctttgatagtggattggggagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 22536290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 29720364 - 29720532
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  29720364 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 29720461  T
Q  321 cattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    | ||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  29720462 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 29720532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 29722524 - 29722692
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  29722524 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 29722621  T
Q  321 cattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtc-aagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  29722622 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaaca 29722692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 326 - 474
Target Start/End: Original strand, 4160702 - 4160850
Alignment:
Q  326 atagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctt 424  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |  |||| |    
T  4160702 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggtaaatatttattagtgttgttatcttttctatgttctcat 4160801  T
Q  425 tatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtt 474  Q
    |||||||||||||| |||  || |||| |||||||||| | |||||||||    
T  4160802 tatcttgtttattctttg-gttcgattatggttttgctttacacttggtt 4160850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 26170774 - 26170930
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactca 322  Q
    ||||||||||||| |||   ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||| |||||||         ||| ||||||||||||||    
T  26170774 ttggtgagattggaaaag--ggtagaaattaggattgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaac---------tct-tttgtaagaactca 26170861  T
Q  323 ttgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26170862 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 26170930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 10593258 - 10593426
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  10593258 ttggtgagattgggagaag-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 10593354  T
Q  321 catt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  10593355 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 10593426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 297 - 401
Target Start/End: Original strand, 42926965 - 42927069
Alignment:
Q  297 catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttctt 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  || ||||||||   || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  42926965 catttgtatctctttgtaagaactcattgacagtggattgaagaaataaatctctctctcatagtaggtcaagttggaccgaactgggtaaacatttctt 42927064  T
Q  397 ggtgt 401  Q
    |||||    
T  42927065 ggtgt 42927069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Original strand, 35615954 - 35616278
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaat 105  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||| | ||  ||||| || |  | ||||||||| || | ||||||  |||||||||| ||||||||||     
T  35615954 aaaggggtgatgccttttggggagagattcatggagttgagaaacacataaaagaagagtcttt-gtaatcaactttggtgagtcttgggaaaccaaaag 35616052  T
Q  106 aaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaatt-gtaaacacattgggagagtgaaa 203  Q
      |||||| | |  |||||||||||||| | |||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||||||    
T  35616053 cgaagatcatcaa-gaaatcaaaggcta-gagttgattctcttttgtg-gttagattctagagtttggaaacaattaggaaacaccttgggtgagtgaaa 35616149  T
Q  204 atcat-gagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccattt 301  Q
     |||| |||| |||||||||  ||  ||||||| |||| |  |||||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||| |||||| ||||||||| |||    
T  35616150 -tcattgagtctcttgttcacgggaagagattgagaaa-tgagtagaaattaggtttgttcttggagagctcgtttaagttaatttcttgtaaccctttt 35616247  T
Q  302 gtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 331  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  35616248 gtatttctttgtaaagaactcattgatagtg 35616278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 238 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 10054969 - 10054732
Alignment:
Q  238 aaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattg 336  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||   ||| |||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10054969 aaatgggtagaaattatgtttgttcttgaagagtttgttgaagctaatttcttataacct-tttgtatctctttgtaatgaactcattgatagtgtattg 10054871  T
Q  337 gagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaa-gttggaccaaactgggtgaacatttctt-ggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgttt 434  Q
    |||  |||||| ||||| ||| ||| ||| |  ||||||||||||| ||| |||   |||| |||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||    
T  10054870 gagatatcaatatctcccccaaagtgggtaattgttggaccaaactaggtaaacgactctttggtgttgttccattttctgtactctttttatcttgttt 10054771  T
Q  435 attccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtt 474  Q
    |||  |||| || ||||||  ||||||| | |||||||||    
T  10054770 attttttgc-ttcgattgtaattttgctttacacttggtt 10054732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 449 - 534
Target Start/End: Original strand, 40751202 - 40751284
Alignment:
Q  449 attgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgcttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||    
T  40751202 attgtggttttgctatgcacttggtttatagattaggtctatattgttgttattgcttgtgg---tttacatttggttattggttg 40751284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 25078120 - 25078289
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 319  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  || ||||| |||| |||| ||||    
T  25078120 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaac 25078216  T
Q  320 tcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25078217 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 25078289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 25136089 - 25136258
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 319  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  || ||||| |||| |||| ||||    
T  25136089 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaac 25136185  T
Q  320 tcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25136186 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 25136258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 10700921 - 10700580
Alignment:
Q  120 gaaatcaaaggctaagggttgttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaatt-gtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtctt 217  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |  |||||||| | ||||||||| |  |||||||||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| |||| | ||    
T  10700921 gaaataaaaggctaaggtttggtgacttttgggggctagattctaaaaatgggaaacaattaggaaacaccttgggtgcgtgaaaatcattgagtatttt 10700822  T
Q  218 gttcattggtg-agattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaa- 315  Q
    ||||||      ||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||  || ||||   |||||||||||||  ||     
T  10700821 gttcatgaaaatagattggaaaaaa-ggtagaaattaggtttgttcttagagagcttgttgaagctaattc-ttataacatttttgtatctctttaaaaa 10700724  T
Q  316 gaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttc-ttggtgttgttatcttttc 413  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||||| ||| |||||||||  |||  ||| ||||| || || | ||| || |||||||| |||||||    
T  10700723 gaactcattgatagtgaagtggagagatc--tctctcccccatagtaggtcattgtttcaccgaactgagtaaataattctttcgtgttgttctcttttc 10700626  T
Q  414 tttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttg 460  Q
    | ||| |||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  10700625 tctacgctctttatcttgcttattctttgattt-gattgtggttttg 10700580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 328
Target Start/End: Original strand, 30802854 - 30802934
Alignment:
Q  249 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgata 328  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  30802854 aattaggtttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttattgtaatccttttgtatctatttgtaaagaactcgttgata 30802934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 40380090 - 40380259
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 319  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||| ||||||||  || ||||| |||| |||| ||||    
T  40380090 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaa-ctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaac 40380186  T
Q  320 tcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  40380187 tcatttgatagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 40380259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 40382301 - 40382470
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 319  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  || ||||| |||| |||| ||||    
T  40382301 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaagttagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaac 40382397  T
Q  320 tcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  40382398 tcatttgatagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 40382470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 14689793 - 14689622
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || | |||| ||||| || |  | ||||| ||| |||||||||||   | ||||||| || ||||||| |    
T  14689793 aaagggttggtgccttttggaga-gattcgtgagaatgggaaacacataaaaggagagtattt-gtgagcaacttagataagtcttgggacaccaaaaga 14689696  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt-gttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattg 181  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14689695 aaagatccttag-aaaatcaaaggctaggggttggttctcttttggg-gatagattctagagttgtgaaacaattg 14689622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 243 - 352
Target Start/End: Original strand, 3325933 - 3326043
Alignment:
Q  243 ggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtg 341  Q
    ||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||| |    
T  3325933 ggtagaaattagttttgttcttgaagagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattgtgtatctctttgtaaagaactcaatgatggtggattagagag 3326032  T
Q  342 atcaatctctc 352  Q
    |||||| ||||    
T  3326033 atcaatatctc 3326043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 282 - 438
Target Start/End: Original strand, 30793195 - 30793348
Alignment:
Q  282 taatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaa 379  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| ||||  ||||||| | |||||| ||||  |||||||| ||    
T  30793195 taatttattgtaaccattttgtatctctttgtaaagaactaattgatagtgaagtggagagatc--tctctcccctagagtaagtcattgttggaccgaa 30793292  T
Q  380 ctgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattc 438  Q
    |  ||| |||||||||||||||  ||    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30793293 caaggtaaacatttcttggtgtgttt---gtttctctactctctttatcttgtttattc 30793348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 267 - 324
Target Start/End: Original strand, 42926911 - 42926968
Alignment:
Q  267 tgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcatt 324  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42926911 tgagattgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcatt 42926968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 453 - 512
Target Start/End: Original strand, 40763211 - 40763270
Alignment:
Q  453 tggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgcttgtggtt 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  40763211 tggttttgctatgcacttggtttatagattaggtctatattgttgttattgcttatggtt 40763270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 238
Target Start/End: Original strand, 42926838 - 42926908
Alignment:
Q  168 ttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaa 238  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42926838 ttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttctttggtgagattgggaa 42926908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 387
Target Start/End: Original strand, 16544499 - 16544574
Alignment:
Q  314 aagaactcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 387  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16544499 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 16544574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 387
Target Start/End: Original strand, 16546721 - 16546796
Alignment:
Q  314 aagaactcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 387  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16546721 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 16546796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 243 - 335
Target Start/End: Original strand, 22097884 - 22097975
Alignment:
Q  243 ggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggatt 335  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||| || ||||||  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  22097884 ggtagaaattagggttgttcttggagaatttgttgaagttaatttcttataaccc--ttgtatctatttgtaaaaaactcattgatagtggatt 22097975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 353
Target Start/End: Original strand, 8445764 - 8445846
Alignment:
Q  272 ttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcc 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||||||||| |||| ||  ||| |||||||||    
T  8445764 ttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttctttataaagaactaattgatagtagattagaaagatgaatctctcc 8445846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 14689581 - 14689503
Alignment:
Q  237 aaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaa 315  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| | | | |||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||    
T  14689581 aaaattggtagaaattatgtttgttcatggagtgcttgttgaagctaattttttgtaatatttttgtatctctttgtaa 14689503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 330
Target Start/End: Original strand, 6016979 - 6017115
Alignment:
Q  195 agagtgaaaat-catgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaag-ctaatttattg 291  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||||| |||| ||||||| || | |||||||| ||||||| |||    
T  6016979 agagtgaaaattcttgagtctcttgttcattagatgaaattgg--aaattggtagaaatta-ggttcttctttgagaacctgttgaagactaatttcttg 6017075  T
Q  292 taacccatttgtatctctttgtaag-aactcattgatagt 330  Q
    |||||  ||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  6017076 taacctttttttatttcttcgtaagaaactcattgatagt 6017115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 65
Target Start/End: Original strand, 30802723 - 30802782
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagt 65  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||    
T  30802723 aaagggtttgtgccttttggggagagattcatggggttagaaaacacatgagtggagagt 30802782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 16642264 - 16642211
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggatggaaaacatatgagtg 59  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||| |||||||    
T  16642264 aaagggttggtgccttttggggacagattcatggggttaggaaacacatgagtg 16642211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 180
Target Start/End: Original strand, 8019472 - 8019542
Alignment:
Q  108 aagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaatt 180  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| | ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  8019472 aagatccttaga-aaatcaaaggctaaggttggttat-ttttgggggttagattctatagttgggaaataatt 8019542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 395; Significance: 0; HSPs: 82)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 34311101 - 34310571
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  34311101 aaagggttggtgccttttggggaaggttcatggggatggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 34311002  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34311001 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaaaggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaataattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 34310902  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  34310901 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtat 34310802  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgt 404  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||    
T  34310801 ctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgttgt 34310702  T
Q  405 tatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgc 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34310701 tatcttttctttactctctttatcttgtttattcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattgttgttattgc 34310602  T
Q  505 ttgtggt-tatttatatttggttattggttg 534  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  34310601 ttgtggtctatttacatttggttattggttg 34310571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 4509091 - 4508563
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  4509091 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaactttggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 4508992  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4508991 taagatccttagtgaaatcaaaggctaaggattggttctcttttatgggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 4508892  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4508891 catgagtgtcttgttgattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttgttctttgtgagcttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 4508792  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgtt 405  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4508791 ctctttgtaagaactcattgagagtggattggagagatcaatctcttcttcagagtaggttaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgtt 4508692  T
Q  406 atcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgct 505  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4508691 atattttctttactctctttatcttgttta-tcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattgttgttattgct 4508593  T
Q  506 tgtgg-ttatttatatttggttattggttg 534  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4508592 tgtggtttatttatatttggttattggttg 4508563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Original strand, 3258779 - 3259305
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  3258779 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatgggaaacatatgagtggagagtcttttattagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 3258878  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  3258879 gaagatccttag-gaaatcaaac-ctaagggttggttctcatttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggaaagtgaaaat 3258976  T
Q  206 -catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgta 304  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  3258977 tcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaactagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaactcatttgta 3259076  T
Q  305 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgt 404  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3259077 tctctttgtaaaaacccattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttgaaccgaactgggtgaacatttcctggtgttgt 3259176  T
Q  405 tatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | || ||| |||| ||  |||| ||| ||||||||||    
T  3259177 tatcttttctttactctctttatcttgtttattccttg-gttggattgtggttttgctatgcccgtgttttctagattagatctagattgttgttattgc 3259275  T
Q  505 ttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3259276 ttgtggttatttacatttggttattggttg 3259305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 4512775 - 4512247
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  4512775 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 4512676  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt-gttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4512675 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttagttctcttttgggggttatattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 4512576  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4512575 catgagtgccttgttgattggtgagatttggaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 4512476  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgtt 405  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4512475 ctctttataagaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggtcaagttggaccgtactgggtgaacatttcttggtgttgtt 4512376  T
Q  406 atcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgct 505  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  || | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4512375 atcttttctttactctcttgatcttgtttatccattagtt-gaattgtgtttttgctatgcacttgatttatagactaggtctatattgttgttattgct 4512277  T
Q  506 tgtgg-ttatttatatttggttattggttg 534  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  4512276 tgtggtttatttacatttggttattggttg 4512247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 48599719 - 48599235
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  48599719 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaaaacatgagtagagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 48599620  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  48599619 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttatattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttggaggagtgaaaat 48599520  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  48599519 catgattgtcttgttcattggtgatattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat 48599420  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgtt 405  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  48599419 ctctttggaagagctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagcagatcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttgatgttgtt 48599320  T
Q  406 atcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  48599319 atcttttctttactctctttatcttgtttattccttg-gttggattgtagttttgctgtgcactt-gattatagactaggtctatat 48599235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 4510933 - 4510405
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  4510933 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaactttggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 4510834  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4510833 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaacgattggttctcttttatgggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 4510734  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4510733 catgagtgccttgttgattggtgagatttggaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 4510634  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgtt 405  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4510633 ctctttataagaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggtcaagttggaccgtactgggtgaacatttcttggtgttgtt 4510534  T
Q  406 atcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgct 505  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  || | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4510533 atcttttctttactctcttgatcttgtttatccattagtt-gaattgtgtttttgctatgcacttgatttatagactaggtctatattgttgttattgct 4510435  T
Q  506 tgtgg-ttatttatatttggttattggttg 534  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  4510434 tgtggtttatttacatttggttattggttg 4510405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Original strand, 2390065 - 2390596
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  2390065 aaagggttggtggcttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggatagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 2390164  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2390165 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagcgaaaat 2390264  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2390265 cataagtgtcttgttcattggtgaaattcgaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 2390364  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaa-catttcttggtgttgt 404  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||||||||    
T  2390365 ctctttgtaataactcatatatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactaggtgaataatctcttggtgttgt 2390464  T
Q  405 tat---cttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttat 501  Q
    | |    |||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||| || ||| ||| |||| ||  |||| ||| |||||||    
T  2390465 tgtttatttttctctactctctttatcttgttta-tccttttgttggattgtggttttgctatacatttgttttctagattagatctagattgttgttat 2390563  T
Q  502 tgcttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2390564 tgattgtggttatttacatttggttattggttg 2390596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 526
Target Start/End: Original strand, 29608524 - 29609040
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||     |||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29608524 aaagggttggtgccttttgg-----attcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaata 29608618  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  29608619 gaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgagagagcgaaact 29608718  T
Q  206 -catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgta 304  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29608719 tcatgagtgtcttgttctttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgta 29608818  T
Q  305 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  29608819 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatcactcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgagtgaatatttcttggtgttgt 29608918  T
Q  405 tatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtgg-ttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattg 503  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || | ||  |||| ||| ||||| |||    
T  29608919 tatcttttctctactctctttatcttgtttatcctttgc-ttagattgtggtttttgatatgcacttggtttctatattagatctagattgttgttgttg 29609017  T
Q  504 cttgtggttatttatatttggtt 526  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  29609018 cttgtggttatttacatttggtt 29609040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 7 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 2361356 - 2360859
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  2361356 aaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaaga 2361257  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2361256 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgag-gttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 2361158  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  2361157 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat 2361058  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgtt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||| || |    ||||||    |    
T  2361057 ctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaataacctttggtg----t 2360962  T
Q  406 atcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgct 505  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||| |||||    
T  2360961 gtcttttctttattctctttatcttgtttattccttg-gttgaattgtggttttgatatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgct 2360863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Original strand, 6431754 - 6432134
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  6431754 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 6431853  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6431854 gaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 6431953  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6431954 catgagtgtcttgttcattggttagattgggaaaatgggtagaaattaggattgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 6432053  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtg 386  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6432054 ctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaagttggaccgaactgggtg 6432134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 7 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 8359703 - 8359198
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  8359703 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttggatgagtcttgtgaaaccaaaaga 8359604  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgtt-agattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaa 204  Q
     || ||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8359603 gaaaatccttagtgaaatcaaaggctaagagttggttattttttgggggtttagattcttgagttggaaaacaattgtaaacaccttgagagagtgaaaa 8359504  T
Q  205 tcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaaccca-tttgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  8359503 tcatgagtgtcttgttcattggggagattgggaaaatgggtagaaattagggtttttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgt 8359404  T
Q  304 atctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgtt 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8359403 atctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgtt 8359304  T
Q  403 gttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttatt 502  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  |||| ||| ||||| ||    
T  8359303 gttatcttttctctactctcattatcttgttta-tcctttggttagattgtggttttgctatgcacttgttttctagattagatctagattgttgttgtt 8359205  T
Q  503 gcttgtg 509  Q
    |||||||    
T  8359204 gcttgtg 8359198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 7 - 401
Target Start/End: Original strand, 22269756 - 22270151
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22269756 aaagagttggtgccttttggggaagattcatggggaggggaaacacatgagtggagagtctattgagagaaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaata 22269855  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22269856 gaagatccttagtgaaatcataggctatgggttggttctcttttgggggttagattctagagttgg-aaacaattctaaacaccttgggagagtgaaaat 22269954  T
Q  206 -catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgta 304  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22269955 tcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 22270054  T
Q  305 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22270055 tctctttgtaagaactgattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatctcttggtgt 22270151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 255 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 32358190 - 32357934
Alignment:
Q  255 ggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcct 354  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32358190 ggttgtgctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcct 32358091  T
Q  355 ccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtg 454  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  32358090 ccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttaacttgtttattccttgc-ttgaattgtg 32357992  T
Q  455 gttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgcttgtggtt 512  Q
    |||||| |||||| |||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  32357991 gttttgttatgcaattggattataaactaggtctatattattgttgttgcttgtggtt 32357934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 7 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 22328784 - 22328306
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaat 105  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||     
T  22328784 aaagagttggtgccttttggggagagattcatagggttgggaaaaacatgagtagagagtcatttgtgagcaacttgggtgaatcttgggaaactaaaag 22328685  T
Q  106 aaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtg-ttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaa 203  Q
    | || ||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||    
T  22328684 agaatatcctta-tgtaatcaaaagctaagggttggttctcttttggggggttagatcctaaagttgggaaacaattgtaaacaccttgagggaatgaaa 22328586  T
Q  204 atcat-gagtgtcttgtt----cattggtgagattgggaaaattggt-agaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacc 296  Q
    ||||| ||||||||||||    |||| | ||||||||||| |  ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  22328585 atcattgagtgtcttgtttgttcattagagagattgggaagaaaggttagaaattagagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaact 22328486  T
Q  297 catttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaa-gttggaccaaactgggtgaacatttc 394  Q
    | |||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||| || ||||     
T  22328485 cttttgtatctctttgcaaggaagtcattaatagtggatttgagagatcaatctctcccctagagtaggtcattgttggaccgaactgggtaaatatttt 22328386  T
Q  395 ttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggttt 475  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22328385 ttggtgttgttatcttttctctactctctttatcttgtttatt-cttttgttcgattgtggttttgttatgcacttggttt 22328306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 27347761 - 27347984
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27347761 gttgggaaaca-ttgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggattgttcttt 27347859  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||    
T  27347860 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcccccagattaggt 27347959  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  27347960 caagttggaccgaactgggtcaaca 27347984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 266 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 6360077 - 6359829
Alignment:
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| | |||||    
T  6360077 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagttgattggagagatcaatctcttccccatattaggt 6359978  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaac-atttcttggtgttgttatcttttc-tttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgcta 463  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  6359977 caagttggatcgaactgggtcaacaatttcttggtgttgttatcttttcatttgctttctttatcttgtttattccttaagttggattgtggttttgcta 6359878  T
Q  464 tgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgcttgtggtt 512  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||    
T  6359877 tgcacttggtttatagactaggtatatattattgttgttgcttgtggtt 6359829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 48491523 - 48491745
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48491523 gttgggaaaca-ttgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 48491621  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  48491622 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgaaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 48491721  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  48491722 caagttgg-ccaaacttggtaaaca 48491745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 179 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 30024945 - 30024740
Alignment:
Q  179 ttgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttg 277  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30024945 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgttg 30024846  T
Q  278 aagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacca 377  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||     
T  30024845 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatcactcccccagagtaggtcaagttggaccg 30024746  T
Q  378 aactgg 383  Q
    ||||||    
T  30024745 aactgg 30024740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 31733193 - 31732970
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31733193 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagactgagaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 31733095  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  31733094 gtgagcttggtgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatactggattggagagatcaatctctcccccaaattaggt 31732995  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  31732994 caagttggaccgaactgggtcaaca 31732970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 41317658 - 41317435
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41317658 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggatgagtgaaaatcattgagtctcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 41317560  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  41317559 gtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaatccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 41317460  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  41317459 caagttggaccgaactgggtcaaca 41317435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 168 - 401
Target Start/End: Original strand, 26417261 - 26417494
Alignment:
Q  168 ttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttg 266  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26417261 ttgggaaaca-ttgtaaacaccttgagcgggtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 26417359  T
Q  267 tgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtc 366  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||    
T  26417360 tgagcttgttgaagataatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccaggttaggtc 26417458  T
Q  367 aagttggaccaaactgggtgaac-atttcttggtgt 401  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26417459 aaattggaccaaactgggtcaacaatttcttggtgt 26417494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 14070047 - 14069834
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  14070047 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 14069948  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  14069947 aaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagttggacc 14069848  T
Q  377 aaactgggtgaaca 390  Q
     |||||||| ||||    
T  14069847 gaactgggtcaaca 14069834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 14380075 - 14379862
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  14380075 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 14379976  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  14379975 aaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaagttggacc 14379876  T
Q  377 aaactgggtgaaca 390  Q
     |||||||| ||||    
T  14379875 gaactgggtcaaca 14379862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 8153286 - 8153509
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8153286 gttgggaaaca-ttgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttgttcttt 8153384  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  8153385 gtgagattgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 8153484  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||    
T  8153485 caagttggactgaactgggtcaaca 8153509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 390
Target Start/End: Original strand, 23554982 - 23555208
Alignment:
Q  165 gagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-tggtagaaattagggttgttc 262  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23554982 gagttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttc 23555079  T
Q  263 tttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagta 362  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23555080 tttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtacctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagta 23555179  T
Q  363 ggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23555180 ggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 23555208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 167 - 385
Target Start/End: Original strand, 4586105 - 4586323
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4586105 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 4586203  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||    
T  4586204 gtgaacttgttgaagctaattttttgtaacccatttttatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattatgt 4586303  T
Q  366 caagttggaccaaactgggt 385  Q
    ||| ||||||| ||||||||    
T  4586304 caacttggaccgaactgggt 4586323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 178 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 31105607 - 31105385
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  31105607 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagattttttctttgtgagcttgtt 31105508  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  31105507 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctttttgtaagaactcattgatggtggattggagagataaatctctccccaagagtagatcaagttggacc 31105408  T
Q  377 aaactgggtgaacatttcttggt 399  Q
     |||||||| |||||||||||||    
T  31105407 gaactgggtaaacatttcttggt 31105385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 35853859 - 35854082
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35853859 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttcttt 35853956  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  35853957 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggt 35854056  T
Q  366 caag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||    
T  35854057 caagtttggaccgaactgggtgaaca 35854082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 178 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 47674157 - 47673953
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47674157 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 47674058  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || |||||||||||||    
T  47674057 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccatattaagtcaagttggacc 47673959  T
Q  377 aaactg 382  Q
     |||||    
T  47673958 gaactg 47673953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 167 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 47676360 - 47676144
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47676360 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 47676262  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  47676261 gtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcaatgatagtggaatggagagatcaatctctcccccatattaggt 47676162  T
Q  366 caagttggaccaaactgg 383  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  47676161 caagttggaccgaactgg 47676144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 43864188 - 43864411
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  43864188 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaagtgggtagaaattagggttgttcttt 43864286  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||    
T  43864287 gtgaacttgttgaagctaatttcctgtaacccatttgtatctctttgtaaaaactaattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaggt 43864386  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  43864387 caagttggaccgaactgggtcaaca 43864411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6360290 - 6360073
Alignment:
Q  14 tggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaagatc 113  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  6360290 tggtgccttttgaagaagattcatggagttgaaaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatc 6360191  T
Q  114 cttagtgaaatcaaaggctaagggtt-gttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatgagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6360190 cttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattttaaacaccttgggagaatgaaaatcatgagt 6360091  T
Q  213 gtcttgttcattggtgag 230  Q
    | ||||||||||||||||    
T  6360090 gacttgttcattggtgag 6360073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 36146633 - 36146409
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctt 264  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||    
T  36146633 gttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtttgttatt 36146534  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||    
T  36146533 tgtgagcttgttgaagctaatttct-gtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagagatcaatctctcccccatattagg 36146435  T
Q  365 tcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||    
T  36146434 tcaagttggaccgaactaggtcaaca 36146409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 38671446 - 38671223
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38671446 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagcgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 38671348  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||| ||| | |||||    
T  38671347 gtgagcttgtttaagctaatttattgtaacacatttgtatcactttgtaagaactcattgatagtggattgaagagataaatctatcccccaaaataggt 38671248  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  38671247 caagttggaccgaactgggtcaaca 38671223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 41649234 - 41649012
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41649234 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaaattggtagaaattaggtttgttcttt 41649136  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  41649135 gtgagcttgttta-gctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggt 41649037  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  41649036 caagttggaccgaactgggtcaaca 41649012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 48489375 - 48489598
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatgag-tgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48489375 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaaatgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 48489473  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  48489474 gaaaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgcaataactcattcatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 48489573  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  48489574 caagttggaccgaactgggtaaaca 48489598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 18126588 - 18126811
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18126588 gttgggaaaca-ttgtaaacaacttgggtgagtgaaaatcattgagtgttttgttcattggtgagattggaaaaatgtgtagaaattagggttgttcttt 18126686  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||    
T  18126687 gtgaacttgttcaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaggaatcaatctctcccccagactaggt 18126786  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||| |||| | |||||| ||||    
T  18126787 caagtttgaccgacctgggtcaaca 18126811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 167 - 376
Target Start/End: Original strand, 1113601 - 1113810
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  1113601 gttgggaaaca-ttgtaaacaacttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatggatagaaattagggttgttcttt 1113699  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  1113700 gtgagcttgttgaagctaatttcttataacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggt 1113799  T
Q  366 caagttggacc 376  Q
    |||||| ||||    
T  1113800 caagtttgacc 1113810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 29990999 - 29991221
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||    
T  29990999 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaag-gatagaaattagggttgttattt 29991095  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29991096 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttctaataactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 29991195  T
Q  366 caag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||    
T  29991196 caagtttggaccgaactgggtgaaca 29991221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 168 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 496206 - 495999
Alignment:
Q  168 ttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatg-agtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttg 266  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  496206 ttgggaaaca-ttgtaaaaaccttgggtgagtgaaaatcatttagtgttttgttaatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtagttctttg 496108  T
Q  267 tgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtc 366  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||    
T  496107 tgagcttgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctctttataagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccctatagtaggtc 496008  T
Q  367 aagttggac 375  Q
    |||||||||    
T  496007 aagttggac 495999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 4178719 - 4178941
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4178719 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaggtagaaattagggttgttcttt 4178816  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| ||||   |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||| ||||    
T  4178817 gtgaacttgggaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattgaacagttcaatctctcctccagagcaggt 4178915  T
Q  366 caag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  4178916 caagtttgaaccaaactaggtgaaca 4178941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 167 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 4253754 - 4253518
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctt 264  Q
    ||||| ||||| |||||||||| || || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4253754 gttggaaaacatttgtaaacaccttaggtgagtgaaaatcattgagtttcttgttcattggtgaaattggtaaaat-ggtagaaattagggtttgttctt 4253656  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtag 363  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  ||||||||    
T  4253655 tgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaacccttttatatctctttggaaagaactcattgataatggattagagagatcaatctctcccacagagtag 4253556  T
Q  364 gtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  4253555 gtcaatttggaccgaactaggtaaacatttcttggtgt 4253518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 173 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 23565280 - 23565052
Alignment:
Q  173 aaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa--ttggtagaaattaggg-ttgttctttgtga 269  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  23565280 aaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaacatga--agtgtcttgttcattggtgagattaggaaaaaataggtagaaattaggtcttgttctttgtga 23565183  T
Q  270 gcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag 369  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  23565182 gcttgttgaaactaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcctagagtaggtcaag 23565083  T
Q  370 ttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    ||||||  |||| ||| | |||||||||||||    
T  23565082 ttggactgaact-ggtaatcatttcttggtgt 23565052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 12098083 - 12097868
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  12098083 gttgggaaaca-ttgtaaacatcttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggttagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcatt 12097985  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||       ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||    
T  12097984 gtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctct-------aactctttg-tagtggattggagagatgaatctctcccccagattaggt 12097893  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||    
T  12097892 caagttggaccgaactaggtcaaca 12097868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 167 - 371
Target Start/End: Original strand, 19502122 - 19502326
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggt-agaaattagggttgttctt 264  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||||| ||||||| ||    
T  19502122 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgagaatcattgagtgtcttgttcagtggtgagattgcgaaaaaaggttagaaattaaggttgttttt 19502219  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagg 364  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  19502220 tgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaag 19502319  T
Q  365 tcaagtt 371  Q
    |||||||    
T  19502320 tcaagtt 19502326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 181 - 333
Target Start/End: Original strand, 31518752 - 31518905
Alignment:
Q  181 gtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaa 279  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  31518752 gtaaacaccttgggtgagtgaaaatcatcgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttattgaa 31518851  T
Q  280 gctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtgga 333  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31518852 gctagtttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgacagtgga 31518905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 227 - 390
Target Start/End: Original strand, 25615857 - 25616021
Alignment:
Q  227 tgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattga 326  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25615857 tgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctatgtgcgcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcattttgtaagaactcattga 25615956  T
Q  327 tagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  25615957 tagtggattagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggcgaaca 25616021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 168 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 25767180 - 25766960
Alignment:
Q  168 ttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttg 266  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25767180 ttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg---agattggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttg 25767086  T
Q  267 tgagcttgttgaagctaatttattgtaacccattt-gtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  25767085 tgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggt 25766986  T
Q  366 caag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| || |||| |||||||||||||    
T  25766985 caagtttagaccgaactgggtgaaca 25766960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 231 - 401
Target Start/End: Original strand, 31518911 - 31519081
Alignment:
Q  231 attgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagt 330  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31518911 attgggaaaataggtagaaattaggtttgttctctgtgagcttattgaagctagttc-ttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgacagt 31519009  T
Q  331 ggattggagtgatcaatctctc-ctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  31519010 ggattggagagatcaatctctctccccagagtaggtcaagttggaccgaactggataaacatttcttggtgt 31519081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 167 - 401
Target Start/End: Original strand, 48408747 - 48408984
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||    
T  48408747 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattaatgttgttcttt 48408844  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaa-cccatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtag 363  Q
    || | |||||  |||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  48408845 gtaaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgaaataactcattgatagtggattggagagtttaatctctcctccagagtat 48408944  T
Q  364 gtcaag-ttggaccaaactgggtgaac-atttcttggtgt 401  Q
    |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  48408945 gtcaagtttagaccgaactgggtgaacaatttcttggtgt 48408984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 167 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 36574740 - 36574510
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctt 264  Q
    ||||| ||||| |||||||||| || || |||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||| |||  ||||||||||| | || ||||||    
T  36574740 gttggaaaacatttgtaaacaccttaggtgagtgaaaattatcgagtgtcttgtttattggagagattggggaaa--ggtagaaattaagatttgttctt 36574643  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtag 363  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| | |||||||    
T  36574642 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctctttgtaaagaactcattgatagtggtttggagagatcaatccatcc-ctagagtag 36574544  T
Q  364 gtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttg 397  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  36574543 gtcaatttggaccaaactgggtaaacatttcttg 36574510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 183 - 401
Target Start/End: Original strand, 23343934 - 23344151
Alignment:
Q  183 aaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttg-ttctttgtgagcttgttgaag 280  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  23343934 aaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtctagttcattggtgagatttggaaaag-ggtagaaattaaggtttattctttgtgagcttgttgaag 23344032  T
Q  281 ctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaac 380  Q
    ||||||| ||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  23344033 ctaatttcttgtaaccctttagtatatctttgtgagaactcattgataatagattggagaaattaatctctc--ccagagtaggtcaagttggaccgaac 23344130  T
Q  381 tgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
      ||| |||||||||||||||    
T  23344131 aaggtaaacatttcttggtgt 23344151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 249 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 2759339 - 2759198
Alignment:
Q  249 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatc 348  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2759339 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttatatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatc 2759240  T
Q  349 tctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  2759239 tcttccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaaca 2759198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 39731369 - 39731537
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactc 321  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  39731369 ttggtgagattggaaaaag-ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcagatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactc 39731467  T
Q  322 attgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  39731468 attgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 39731537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 167 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4538764 - 4538627
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4538764 gttgggaaa-aattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 4538666  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgta 304  Q
     |||  || || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  4538665 atgaaattttttaagctaatttcttgtaacccatttgta 4538627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 20343897 - 20344064
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  20343897 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 20343993  T
Q  321 catt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20343994 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 20344064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 43504323 - 43504154
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||| ||||||| | ||| |||||||||| |||||||||    
T  43504323 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaact 43504225  T
Q  321 cattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  43504224 cattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaaca 43504154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 167 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24526121 - 24525985
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagg-gttgttctt 264  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  24526121 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaaattgggaaaatgggtagaaattaggttttgttctt 24526023  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttg 302  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||    
T  24526022 tgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttg 24525985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 167 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2761526 - 2761439
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattag 254  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2761526 gttgggaaaca-ttgtaaacacattgggtgagtgaaaatcatcgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattag 2761439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 297 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 24525596 - 24525508
Alignment:
Q  297 catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggt 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  24525596 catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagttggacggaactgggt 24525508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 244 - 353
Target Start/End: Original strand, 5116625 - 5116735
Alignment:
Q  244 gtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtga 342  Q
    |||||||||||| |||||||| |  || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  5116625 gtagaaattaggtttgttcttggatagtttgttgaagataatttattgtaaaccttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtgaattggagaga 5116724  T
Q  343 tcaatctctcc 353  Q
    | |||||||||    
T  5116725 taaatctctcc 5116735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 24789841 - 24790009
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    ||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| |||||||   |||||||| |||| |||| ||||    
T  24789841 ttggtaagattgggaaaag-ggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacat-tttgtatcccttttgtaaaaact 24789938  T
Q  321 cattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    | ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24789939 ctttgatagtggattggagagtactatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 24790009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 3904837 - 3904624
Alignment:
Q  172 gaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtg 268  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||| |||| |||||||| | ||  |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |    
T  3904837 gaaacatttgtaaacaccttgggcgagtgaaa-tcattgagtctcttgttcttaggaagagattgggaaaat-ggtagaaattaggttttgttctttgag 3904740  T
Q  269 agcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca 367  Q
    ||| | |||||  |||||| ||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  3904739 agcctattgaatgtaatttcttgtaacacttttgcatctctttgtaaagaactcattgatagt-gatcagagagatcaatctctccctcagagtaggtca 3904641  T
Q  368 -agttggaccaaactgg 383  Q
      |||||||| ||||||    
T  3904640 ttgttggaccgaactgg 3904624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 1360479 - 1360226
Alignment:
Q  67 ttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtg-ttagattcta 164  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | || ||  || | ||||||||||| || || ||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  1360479 ttttgcgagcaacttgagtgagtcttggaaaaccaaaagagaatatttttgg-gaaatcaaaggatatggattggttctcttttggggggttagattcta 1360381  T
Q  165 gagttgggaaacaattgt-aaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaattggtagaaattagggttgtt 261  Q
    ||||||  |||||||||  |||||| || || |||||||| |||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |    
T  1360380 gagttgaaaaacaattgggaaacacctttggtgagtgaaa-tcattgagtctcttgttcatggaatgagattgggaaaaa-ggtagaaattaggttttgt 1360283  T
Q  262 ctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaaccc--atttgtatctctttgtaag 316  Q
    ||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  1360282 cttggagaacttgttgaagcgaatttcttgtaacccttttttgtatctctttgtaag 1360226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 6592509 - 6592340
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 319  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  || ||||| |||| |||| ||||    
T  6592509 ttggtgagattgggaaa-tgggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaac 6592413  T
Q  320 tcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6592412 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 6592340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18388929 - 18388760
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 319  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  || ||||| |||| |||| ||||    
T  18388929 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaac 18388833  T
Q  320 tcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18388832 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 18388760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18392365 - 18392196
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 319  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  || ||||| |||| |||| ||||    
T  18392365 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaac 18392269  T
Q  320 tcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18392268 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 18392196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 244 - 392
Target Start/End: Original strand, 18396338 - 18396488
Alignment:
Q  244 gtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagtg 341  Q
    |||||||||||| || |||||| | ||| |||||||| ||| ||| |||||||   ||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||| |    
T  18396338 gtagaaattaggttttgttcttggagagtttgttgaacctatttttttgtaacat-tttgtatctctttataaagaattcattgatagaggattggagag 18396436  T
Q  342 atcaatctctcctccagagtaggtcaa-gttggaccaaactgggtgaacatt 392  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||    
T  18396437 atcaatctctcctcaagagtaggtcaatggtggaccgaactgggtaaacatt 18396488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 317 - 390
Target Start/End: Original strand, 30814530 - 30814603
Alignment:
Q  317 aactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  30814530 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 30814603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 6594727 - 6594558
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 319  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  || ||||| |||| |||| ||||    
T  6594727 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaac 6594631  T
Q  320 tcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6594630 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 6594558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 309 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 1560749 - 1560671
Alignment:
Q  309 tttgtaagaactcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggt 385  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  1560749 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 1560671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 292 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 5513766 - 5513661
Alignment:
Q  292 taacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  5513766 taacccttttatatctctttgtaaagaactcattgacactgaattggaga-atcaatctcacctccagagtaggtcaatttggactgaactgggtaaaca 5513668  T
Q  391 tttcttg 397  Q
    |||||||    
T  5513667 tttcttg 5513661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 242 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 43363623 - 43363531
Alignment:
Q  242 tggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctc--tttgt-aagaactcattgatagtg 331  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||    
T  43363623 tggtagaaattaggtttgttcttggagagcttgttgaaactaatttattgtaactcttttgtatctctatttgtaaataactcattgatagtg 43363531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 32060493 - 32060322
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctc---tttgtaa-ga 317  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  || ||||| |   ||||||| ||    
T  32060493 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccctttttgtaaaga 32060397  T
Q  318 actcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  32060396 actcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaaca 32060322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5514234 - 5514113
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaatta-gggttgttctt 264  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |  |||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| | ||||   |||||||||| |  ||||||||    
T  5514234 gttgggaaacacttgtaaacaccttcgatgagtgaaaatcattgagtttcttgttcatttgagagatt-gaaaaaagagtagaaattatgttttgttctt 5514136  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaattt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5514135 tgtgagcttgttgaagctaattt 5514113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24514984 - 24514912
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa 240  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24514984 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa 24514912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 13065555 - 13065482
Alignment:
Q  234 gggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatct 307  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  13065555 gggaaaaatggtagaaattaggattgcactttgagagtttgttgaaactaatttattgtaaccgttttgtatct 13065482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 228 - 367
Target Start/End: Original strand, 26639326 - 26639469
Alignment:
Q  228 gagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttg----tatctctttgt-aagaactca 322  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||||    ||| || |||| || |||||     
T  26639326 gagattgtgaaaat-ggtagaaattaggtatgttcttggagagtttgttgatgttaatttcttgtaacccttttgtatatatatcattgtaaataactct 26639424  T
Q  323 ttgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca 367  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26639425 ttgataatggattagagagatcaatctctcctccatagtatgtca 26639469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 331
Target Start/End: Original strand, 27073828 - 27073925
Alignment:
Q  235 ggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 331  Q
    |||||||||||||||||  |  |||||| || |||| || |||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27073828 ggaaaattggtagaaatatgttttgttcgttatgagtttattgaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcgttgacagtg 27073925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27204485 - 27204388
Alignment:
Q  235 ggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 331  Q
    |||||||||||||||||  |  |||||| || |||| || |||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27204485 ggaaaattggtagaaatatgttttgttcgttatgagtttattgaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcgttgacagtg 27204388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 311
Target Start/End: Original strand, 28617176 - 28617249
Alignment:
Q  237 aaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt 311  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||  ||||||| ||||    
T  28617176 aaaataggtagaaattaggttttgttctttgtgagct--tttaagctaatttcttgtaaccccattgtatcacttt 28617249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 32358221 - 32358189
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatgg 39  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32358221 aaagggttggtgccttttggggaaaattcatgg 32358189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 391; Significance: 0; HSPs: 73)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 42435372 - 42434868
Alignment:
Q  11 ggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaag 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  42435372 ggttggtgacttttggggaagattcatggggttgggaaacatatgaatggagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaagagaag 42435273  T
Q  111 atccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42435272 atccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttggtaaacaattgtaaacactttgggagagtgaaaatcatg 42435173  T
Q  210 agtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctct 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42435172 agtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctct 42435073  T
Q  310 ttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatct 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42435072 ttgtaagaactcattgatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatct 42434973  T
Q  410 tttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtcta--tattcttgttattgcttg 507  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||    
T  42434972 tttctttactttctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcactt-gattatagactaggtctatctattgttgttgttgcttg 42434874  T
Q  508 tggtta 513  Q
    ||||||    
T  42434873 tggtta 42434868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 512
Target Start/End: Original strand, 4283320 - 4283812
Alignment:
Q  20 cttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaagatccttagt 119  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4283320 cttttgggaaagattcatggggttgggaaacacatgagtggaaagtcttttgtgagaaacttggttgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagt 4283419  T
Q  120 gaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatgagtgtcttg 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  4283420 gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttaggagagtgaaaatcatgagtgtcttg 4283519  T
Q  219 ttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaa 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4283520 ttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaa 4283619  T
Q  319 ctcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttac 418  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4283620 ctcattgatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttac 4283719  T
Q  419 tctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgcttgtggtt 512  Q
    ||||||||||||||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4283720 tctctttatcttgttta-tcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattgttgttattgcttgtggtt 4283812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 69 - 534
Target Start/End: Original strand, 18655246 - 18655713
Alignment:
Q  69 ttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgtt-ctcttttgggtgttagattctagag 167  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||     
T  18655246 ttgtgagcaacttcggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgatactcttttggg-gttagattctagac 18655344  T
Q  168 ttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgt 267  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  18655345 ttaggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgttttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgt 18655444  T
Q  268 gagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18655445 gagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcctccaaagtaggtca 18655544  T
Q  368 agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttcttta--ctctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatg 465  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18655545 agttggaccgaactgggtgaacattttttggtgttgttatcttttctttactctctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatg 18655644  T
Q  466 cacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgcttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18655645 cacttggtttatagactagatctatattgttgttattgcttgtgtttatttacatttggttattggttg 18655713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 530
Target Start/End: Original strand, 11383769 - 11384291
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| | || |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  11383769 aaagggttggtgccttttgaggaagattcatggggttgggaaatacataagtggaaagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 11383868  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11383869 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaataattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 11383968  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  11383969 catgagtgtcttgttcatta-tgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat 11384067  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgt- 404  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  11384068 ctctttgtaagaacccattgatactggattggagacatcgatctctcctccagagtaggttaagttggaccgaactgggtgaacattttttggtgttgtc 11384167  T
Q  405 tatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgc 504  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  |||| ||| ||||||||||    
T  11384168 tat-ttttctttactctctttatcttgttta-tcctttggttagattgtggttttgctatgcacttgttttctagattagatctagattgttgttattgc 11384265  T
Q  505 ttgtggttatttatatttggttattg 530  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  11384266 ttgtggttatttacatttggttattg 11384291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Original strand, 40328562 - 40329086
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  40328562 aaagggttggtgccttttagggaagattcatggggatgggaaacacatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 40328661  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     |||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40328662 gaagatctttagtgaaatcaaaggctatgagttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacatcttgggagagtgaaaat 40328761  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaaccca-tttgta 304  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| || ||||||    
T  40328762 catgaatgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaactcattttgta 40328861  T
Q  305 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgt 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40328862 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt----ttggacggaactgagtgaacatttcttggtgttgt 40328957  T
Q  405 tatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgc 504  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  |||| | | ||||||||||    
T  40328958 tatcttttctctactctccttttcttgttta-tcctttggttagattgtggttttgctatgcacttgttttctagattagatctagactgttgttattgc 40329056  T
Q  505 ttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  40329057 ttgtggttatttacatttggttgttggttg 40329086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 10 - 471
Target Start/End: Original strand, 40221531 - 40221992
Alignment:
Q  10 gggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaa 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | ||    
T  40221531 gggttagtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttaggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaa 40221630  T
Q  110 gatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40221631 gatccttagtgaaatcaaaggctaaaggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat 40221730  T
Q  209 gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctc 308  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40221731 gagtgtcttgttctttggtgagattggtaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctc 40221830  T
Q  309 tttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatc 408  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| || | |  ||||||||||||||    
T  40221831 tttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaataatctttggtgttgttatc 40221930  T
Q  409 ttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttg 471  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  40221931 ttgtctttactctctttatcttgttcattctttg-gttggattgtggttttgctatgcacttg 40221992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 9 - 353
Target Start/End: Original strand, 44353577 - 44353923
Alignment:
Q  9 agggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaa 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  44353577 agggttggtgccttttggagaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcatcggtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagaaa 44353676  T
Q  109 agatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatca 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  44353677 agattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggtgagtaaaaatca 44353776  T
Q  208 t-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatc 306  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  44353777 ttgagtatcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatc 44353876  T
Q  307 tctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  44353877 tctttgtaagaactcattgatagtggattgaaaagatcaatctctcc 44353923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 166 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 10930424 - 10930118
Alignment:
Q  166 agttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  10930424 agttgggaaacaattgtaaacattttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatcggtgagattgggaaaatggatagaaattagggttgctcttt 10930325  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  10930324 gtgagctcgttgaagctaatttcttgtaacccatttatatctctttgtaagaacacattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 10930225  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaac-atttcttggtgttgttatcttttc-tttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgcta 463  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||    
T  10930224 caagttggaccgaactgggtcaacaatttcttggtgttgttatcttttcttttgctccctttatcttgtttatt-cttttgttggattgtggttttgcta 10930126  T
Q  464 tgcacttg 471  Q
    ||||||||    
T  10930125 tgcacttg 10930118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 196 - 534
Target Start/End: Original strand, 3772164 - 3772502
Alignment:
Q  196 gagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaa 294  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  3772164 gagtgaaaatgattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaattgatagaaattaggtttgttctttgtgagcttatttaagctaatttcttgtaa 3772263  T
Q  295 cccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttc 394  Q
    | ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  3772264 ctcatttgtatatctttgtaagaatttattgatagtggattggagagatcaatctatctctcagagtaggtcaagttggaccaaactggataaatatttc 3772363  T
Q  395 ttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattc 494  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  |||| |||     
T  3772364 ttggtggtgttatcttttctctactctctttatcttgtttattctttg-gttagattgtggttttgctatgcacttgatttctagattaaatctagattg 3772462  T
Q  495 ttgttattgcttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||||||    
T  3772463 ttgttgttgcttgtggttattttcttttggtgattggttg 3772502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Original strand, 27811232 - 27811445
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27811232 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 27811331  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27811332 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaacccattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggacc 27811431  T
Q  377 aaactgggtgaaca 390  Q
     |||||||| ||||    
T  27811432 gaactgggtcaaca 27811445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 15212730 - 15212953
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15212730 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 15212828  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  15212829 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgataatggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 15212928  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  15212929 caagttggaccgaactgggtcaaca 15212953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 33352094 - 33352317
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  33352094 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgattgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggttgttcttt 33352192  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  33352193 gtgaacttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 33352292  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  33352293 caagttggaccgaactgggtcaaca 33352317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 43036367 - 43036590
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43036367 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 43036465  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  43036466 gtgaacttgttgaaactaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagagatcaatctctcctccagattaggt 43036565  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  43036566 caagttggaccgaactgggtcaaca 43036590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 167 - 384
Target Start/End: Original strand, 18141764 - 18141981
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18141764 gttgggaaacatttgtaaacaccttgggcgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgtgaaaatgggtagaaattagg-ttgttcttt 18141862  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||    
T  18141863 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcactttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggt 18141962  T
Q  366 caagttggaccaaactggg 384  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18141963 caagttggaccaaactggg 18141981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 4731602 - 4731825
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4731602 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgctcttt 4731700  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| | |||    
T  4731701 gtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcgatctctcccccagattcggt 4731800  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||    
T  4731801 caagttggaccgaattgggtcaaca 4731825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 167 - 372
Target Start/End: Original strand, 30143286 - 30143489
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttg 266  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30143286 gttgggaaaca-ttgtaaacacattgggtgagtgaaaatcatt-gtgtcttgttcattggccagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 30143383  T
Q  267 tgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtc 366  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||    
T  30143384 tgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagataaggtc 30143483  T
Q  367 aagttg 372  Q
    ||||||    
T  30143484 aagttg 30143489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 165 - 390
Target Start/End: Original strand, 40321022 - 40321247
Alignment:
Q  165 gagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttct 263  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| | || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  40321022 gagttgggaaaca-ttgtaaacaccttgagtgactgaaaatcattgagtgtcttgttcataggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttca 40321120  T
Q  264 ttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtag 363  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  40321121 ttgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccattagtatctctttgtaaaaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattag 40321220  T
Q  364 gtcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  40321221 gtcaagttggaccgaactgggtcaaca 40321247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 179 - 390
Target Start/End: Original strand, 42498149 - 42498362
Alignment:
Q  179 ttgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatt-ggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42498149 ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 42498247  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggac 375  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42498248 gaagctaatttcttgtaacccttttgtatttctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 42498347  T
Q  376 caaactgggtgaaca 390  Q
    | |||||||||||||    
T  42498348 cgaactgggtgaaca 42498362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 3303894 - 3303671
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  3303894 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgagtatcttgtttattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaagtttgttcttt 3303796  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||    
T  3303795 gtgagcttgtttaacctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccacagtaggt 3303696  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  3303695 caagttggaccgaactgggtaaaca 3303671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 167 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 1292687 - 1292454
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  1292687 gttgggaaacact-gtgaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttctttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaagtttgttcttt 1292589  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||| |||||||||||    
T  1292588 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagaaataaatctctcc-ccagagtaggt 1292490  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  1292489 caagttggaccgaactgggcaaacatttcttggtgt 1292454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 165 - 390
Target Start/End: Original strand, 5689213 - 5689438
Alignment:
Q  165 gagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttct 263  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| ||| || ||    
T  5689213 gagtttggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattaatgagattggaaaaatgggtagaaattaaggtggtgct 5689311  T
Q  264 ttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtag 363  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |    
T  5689312 ttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttg 5689411  T
Q  364 gtcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5689412 gtcaagttggaccgaactgggtcaaca 5689438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 31218201 - 31218425
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-tggtagaaattagggttgttctt 264  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31218201 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 31218298  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagg 364  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31218299 tgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtagg 31218398  T
Q  365 tcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31218399 tcaagtttggaccgaactgggtgaaca 31218425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 165 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 1345597 - 1345372
Alignment:
Q  165 gagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttct 263  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1345597 gagttgggaaata-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgtgtagaaattagggttgttct 1345499  T
Q  264 ttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtag 363  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||    
T  1345498 ttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatatgtatctctttgaaagaactcattgatagtggattgaagagttcaatctctcccccagagtag 1345399  T
Q  364 gtcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||||| |||| |||| ||| ||||    
T  1345398 gtcaagttagaccgaactaggtcaaca 1345372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 17982597 - 17982821
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattgg-tagaaattagggttgttctt 264  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  17982597 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctt 17982694  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagg 364  Q
    ||||| |||||  ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17982695 tgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtagg 17982794  T
Q  365 tcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17982795 tcaagtttggaccgaactgggtgaaca 17982821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 34254543 - 34254331
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  34254543 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 34254446  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggac 375  Q
     ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  34254445 aaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaacttattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggac 34254346  T
Q  376 caaactgggtgaaca 390  Q
    | |||||||||||||    
T  34254345 cgaactgggtgaaca 34254331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 198 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 34256700 - 34256507
Alignment:
Q  198 gtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacc 296  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| ||||||||    
T  34256700 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaat-ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacc 34256602  T
Q  297 catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  34256601 cttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 34256507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 19491922 - 19491700
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttg 266  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19491922 gttgggaaaca-tcgtaaacatcttgggtgagtgaaaatattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttg 19491824  T
Q  267 tgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtc 366  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  19491823 tgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagtaggtc 19491724  T
Q  367 aagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |  ||||||| |||| ||| ||||    
T  19491723 atattggaccgaactaggtcaaca 19491700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 167 - 382
Target Start/End: Original strand, 30291549 - 30291767
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctt 264  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  30291549 gttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgattgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggttttgttctt 30291648  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctct-cctccagagtag 363  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||     
T  30291649 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatcactttgtaagaattctttgatagtggattggagagatcaatctctccctccagattat 30291748  T
Q  364 gtcaagttggaccaaactg 382  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  30291749 gccaagttggaccgaactg 30291767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 6598916 - 6599139
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  6598916 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattaagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaagtttgttcttt 6599014  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  6599015 gcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatacttttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggt 6599114  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  6599115 caagttggaccgaactgggtcaaca 6599139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 6674369 - 6674592
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  6674369 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattaagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaagtttgttcttt 6674467  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  6674468 gcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatacttttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggt 6674567  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  6674568 caagttggaccgaactgggtcaaca 6674592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 169 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 8965914 - 8965689
Alignment:
Q  169 tgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttg 266  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||     
T  8965914 tgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaa-ggtagaaattagggtttgttcttta 8965816  T
Q  267 tgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtc 366  Q
    |||| ||||||||| |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  8965815 tgagtttgttgaagttaatttcttataacccttttatatctctttgtaagaactcattgatagtgcatcggagagataaatctctcccccatattaggtc 8965716  T
Q  367 aagttggaccaaactgggtgaacattt 393  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||    
T  8965715 aagttggaccgaactgggtaaacattt 8965689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 9765693 - 9765911
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttg 266  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9765693 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaatt---gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 9765788  T
Q  267 tgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtc 366  Q
    ||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||||||| ||||| ||||||    
T  9765789 tgagcttggcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagct-gctctctcccccagattaggtc 9765887  T
Q  367 aagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |  ||||||| |||||||| ||||    
T  9765888 atattggaccgaactgggtcaaca 9765911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 12702862 - 12702635
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatt-----ggtagaaattagggttgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||    
T  12702862 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattaagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaaaagggtagaaattagggttgt 12702765  T
Q  261 tctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagag 360  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||     
T  12702764 tctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtgtctctttgtaagaactcattgatattggattggagagatcaatctctcccctagat 12702665  T
Q  361 taggtcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12702664 taggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 12702635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 1746442 - 1746219
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatt-ggtagaaattagggttgttctt 264  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  1746442 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgaaaaaaaaaggtagaaattagggttgttctt 1746345  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagg 364  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  1746344 tgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccatagtagg 1746246  T
Q  365 tcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  1746245 tcaagtttggaccgaactgggtgaaca 1746219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 178 - 395
Target Start/End: Original strand, 4162454 - 4162668
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||    
T  4162454 attgtaaacaccttgagcgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattagtgaga---ggaaaatgggtagaagttaggtttgttctttgagaacttgtt 4162550  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4162551 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatag-ggattggagatatcaatctctccccaagagtaggtcaagttggacc 4162649  T
Q  377 aaactgggtgaacatttct 395  Q
     || ||||| |||||||||    
T  4162650 gaattgggtaaacatttct 4162668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 167 - 371
Target Start/End: Original strand, 44303798 - 44304003
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatt--ggtagaaattagggttgttct 263  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||    
T  44303798 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaagggtagaaattaaggttgttct 44303895  T
Q  264 ttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtag 363  Q
    |||||| |||||  |||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  44303896 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttttaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtag 44303995  T
Q  364 gtcaagtt 371  Q
    ||||||||    
T  44303996 gtcaagtt 44304003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 19945574 - 19945359
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattgg-tagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 275  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19945574 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattatggttgttctttgtgaacttgt 19945476  T
Q  276 tgaagctaatttattgtaacc-catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgg 373  Q
      |||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  19945475 caaagctaatttcttgtaaccacttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctcgagagtaggtcaagtttga 19945376  T
Q  374 accaaactgggtgaaca 390  Q
    ||| |||||||||||||    
T  19945375 accgaactgggtgaaca 19945359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 168 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 41366837 - 41366622
Alignment:
Q  168 ttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttg 266  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  41366837 ttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcaagactgagattgagaaaatgggtagaaattatgtttgttctttg 41366739  T
Q  267 tgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtc 366  Q
    | |||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||    
T  41366738 taagcttgtttaagctaatttcttttaacctatttgtatccctttgtaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctcc-ctagattaggtc 41366640  T
Q  367 aagttggaccaaactggg 384  Q
    |||||||||| |||||||    
T  41366639 aagttggaccgaactggg 41366622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 167 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 18106302 - 18106087
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||  ||||||||||    
T  18106302 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaattgttgagtgtcttgttcatcggtgagattggaaaaatggatagaaactatagttgttcttt 18106204  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  18106203 gcgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatct-tttgtaagaactcattgatagt-gtttggagagatcaatctctcc-ccagaataggt 18106107  T
Q  366 caagttggaccaaactgggt 385  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  18106106 caagttggaccgaactgggt 18106087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 4743427 - 4743215
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  4743427 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagcgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtag-aattaggtttgttcttt 4743330  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||| | |||||||||||||  | ||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  4743329 gtgtgtttgttgaagctaaaatcttgtaaccca----------tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggt 4743240  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  4743239 caagttggaccgaactgggtcaaca 4743215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 223 - 388
Target Start/End: Original strand, 2627735 - 2627902
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccattt-gtatctctt-tgtaagaact 320  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||| ||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||    
T  2627735 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaactctttttgtatctcttgtgtaagaact 2627833  T
Q  321 cattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaa 388  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2627834 cattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 2627902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 401
Target Start/End: Original strand, 10015119 - 10015257
Alignment:
Q  261 tctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagag 360  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||    
T  10015119 tctttgtgtgcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-taggaactcattgatagtggattggagagataaatctct-ctccatag 10015216  T
Q  361 taggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  10015217 taggtcaagttggaccgaactgggtaatcatttcttggtgt 10015257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 167 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 41365071 - 41364926
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41365071 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcaagactgagattgggaaaattggtagaaattaggtttgttcttt 41364973  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttg 312  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  41364972 gtgagtttgtttaagctaatttcttgtaacacatttgtatccctttg 41364926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 167 - 401
Target Start/End: Original strand, 8153705 - 8153936
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat---gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttct 263  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||  |||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||         
T  8153705 gttgggaaacatttgtatacaccttggatgagtgaaaatcattgagtgtgtcatgttcattggtgagattgagaaaat-ggtagaaattagggtt----- 8153798  T
Q  264 ttgtgagctt-gttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagta 362  Q
     | ||||||| ||||||||||| ||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||    
T  8153799 -tctgagctttgttgaagctaaattcgtgtaactcttttgtatatctttgtaagaactcattgatagttgattggagagatcaatctcttcctcagagta 8153897  T
Q  363 ggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    |||||||||||||| || ||| | || |||| |||||||    
T  8153898 ggtcaagttggaccgaaatggataaatattttttggtgt 8153936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 178 - 339
Target Start/End: Original strand, 10929753 - 10929904
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10929753 attgtaaacaccttggattagtgaaaatcattgagtgtcttgttctttggtgagatatggaaaatgggtagaaattatgtttgttctttgtgagcttgtt 10929852  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggag 339  Q
    ||||||||||| ||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10929853 gaagctaatttcttgtaa-----------ctctttgtaagaactcattgatagtggattggag 10929904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 25689955 - 25690122
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  25689955 ttggtgagattgggaaaaa-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 25690051  T
Q  321 cattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    | ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25690052 ctttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 25690122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 3439504 - 3439671
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| || ||| ||||   |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  3439504 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattatgaacttggc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 3439600  T
Q  321 cattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  3439601 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaaca 3439671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 301 - 390
Target Start/End: Original strand, 4733784 - 4733873
Alignment:
Q  301 tgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4733784 tgtatctctttgtaagaattcattgatagtggattggagagatcgatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 4733873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 299 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 3073965 - 3073870
Alignment:
Q  299 tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttct 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  3073965 tttgtatctctttgtaagaactcattgataatggcttggagagatcaatctctcc-ccatagtaggtcaagttgggccgaactgggtaaacatttct 3073870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 257 - 367
Target Start/End: Original strand, 7597648 - 7597759
Alignment:
Q  257 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctc 355  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  7597648 ttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttataatccttttgtatctctttgtaaagaatgcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 7597747  T
Q  356 cagagtaggtca 367  Q
    || |||||||||    
T  7597748 catagtaggtca 7597759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 257 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 11712135 - 11711993
Alignment:
Q  257 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctc 355  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||      
T  11712135 ttgttccttgagagcttgttgaagctaatttcttgaaacccttttatatctctttgtaaataactcattgatagtggattgaagagatcaatctctccct 11712036  T
Q  356 cagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttg 397  Q
    || |||||||||  ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  11712035 caaagtaggtcattgttggtcctaattgggtaaacatttcttg 11711993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 353
Target Start/End: Original strand, 1822313 - 1822423
Alignment:
Q  245 tagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtga 342  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||| | |||||| ||||||| ||    
T  1822313 tagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctatttgtaaataactcactaatagtgaattggagaga 1822412  T
Q  343 tcaatctctcc 353  Q
    |||||||||||    
T  1822413 tcaatctctcc 1822423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 353
Target Start/End: Original strand, 1856758 - 1856868
Alignment:
Q  245 tagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtga 342  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||| | |||||| ||||||| ||    
T  1856758 tagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctatttgtaaataactcactaatagtgaattggagaga 1856857  T
Q  343 tcaatctctcc 353  Q
    |||||||||||    
T  1856858 tcaatctctcc 1856868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 368 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 2999825 - 2999723
Alignment:
Q  368 agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgca 467  Q
    |||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||| ||||||||||||    
T  2999825 agtttgaccgaactgagtaaacatttcttgatgttgatatcttttctctactctctttatcttgtttattctttg-gttagattgtgattttgctatgca 2999727  T
Q  468 cttg 471  Q
    ||||    
T  2999726 cttg 2999723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 369 - 516
Target Start/End: Original strand, 10240270 - 10240417
Alignment:
Q  369 gttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcac 468  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||   || ||||||||||||||| | ||     
T  10240270 gttggatcaaactaggtaaacatttcttggttttgttctcttttcttcactctctttatcttgtttatttttttggttcgattgtggttttgctttacat 10240369  T
Q  469 ttggtttatagactatgtctatattcttgttattgcttgtggttattt 516  Q
    || |||| |||| ||  |||| ||| ||||||||| |||||| |||||    
T  10240370 ttcgtttctagattagatctagattgttgttattgtttgtggctattt 10240417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 80
Target Start/End: Original strand, 22976317 - 22976389
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaact 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22976317 aaagggttggtgccttttggggaagattcatgggg-ttgaaaacacatgagtgaagagtctattgtgagcaact 22976389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 332
Target Start/End: Original strand, 10240175 - 10240264
Alignment:
Q  245 tagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtgg 332  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10240175 tagaaatttgggtttgttctttgtgagcttgttgaatctaatttcttgtaaccatgttggatctctttgtaaagaactcattgatagtgg 10240264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 273 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 32902292 - 32902197
Alignment:
Q  273 tgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca 367  Q
    ||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  32902292 tgttgaagctaatttcttgtaacttttttgtatctctttctaaagaattcattgatagtgaatttgagagatcaatctctccccctgagtaggtca 32902197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 3232023 - 3231859
Alignment:
Q  165 gagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gtt 261  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||| | |||||  |||| |||| |||||||| | ||  ||||||| ||||| || ||||||||||| || |||    
T  3232023 gagttgggaaacattagtaaacaccttgggtgggtgaat-tcattgagtctcttgttcttaggaagagattgagaaaaatg-tagaaattaggctttgtt 3231926  T
Q  262 ctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgat 327  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3231925 cttcgtgagcttgttgaagctaattttttttaaccattttgtatctctttgtaaagaacttattgat 3231859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 42575402 - 42575327
Alignment:
Q  314 aagaactcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 387  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  42575402 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 42575327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 314 - 386
Target Start/End: Original strand, 15290614 - 15290688
Alignment:
Q  314 aagaactcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtg 386  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15290614 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg 15290688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 314 - 386
Target Start/End: Original strand, 15470983 - 15471057
Alignment:
Q  314 aagaactcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtg 386  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15470983 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg 15471057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 169
Target Start/End: Original strand, 40585510 - 40585669
Alignment:
Q  9 agggttggtgccttttgggga-agattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataa 107  Q
    ||||||| || ||||||| || |||||||||||| | ||||||| || |  | ||||||||| |||||||| ||| |||||| |||  | ||||||| |     
T  40585510 agggttgatgtcttttggtgagagattcatggggtttgaaaacacatcaaaggagagtcttt-gtgagcaatttgggtgagtattggtagaccaaaagag 40585608  T
Q  108 aagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt-gttctcttttgggtgttagattctagagtt 169  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  40585609 aagatccttag-gaaatcaaagactaagggttggttctcttttggg-ggtagattctaaagtt 40585669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 29796456 - 29796317
Alignment:
Q  257 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaa--ctcattgatagtggattggagtgatcaatctctcct 354  Q
    |||||||| | || |||||||||||| |||| |||||||   |||||| || ||||||| ||  |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||     
T  29796456 ttgttcttggagaacttgttgaagctgatttcttgtaacatttttgtacctatttgtaaaaaaactcatttataatggattggagagatcaatctctccc 29796357  T
Q  355 ccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacattt 393  Q
    |||  ||||||||  |||||||| |||| ||| |||||||    
T  29796356 ccaatgtaggtcattgttggaccgaacttggtaaacattt 29796317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 339
Target Start/End: Original strand, 30909389 - 30909483
Alignment:
Q  244 gtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggag 339  Q
    |||||||||||| ||  |||| | ||||||||| || ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||    
T  30909389 gtagaaattaggtttactcttggagagcttgtttaaactaatttcttgtaactc-tttgtatctctttgtaatgactcgttgatagtgaattggag 30909483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 330
Target Start/End: Original strand, 40585754 - 40585822
Alignment:
Q  264 ttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt--aagaactcattgatagt 330  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||| || ||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  40585754 ttgtgagcttgttgaaacgaattttttgtaagccttttgtatctttttgtaaaagaactcattgatagt 40585822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 2999902 - 2999830
Alignment:
Q  11 ggttggtgccttttggggaa-gattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttg 82  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  2999902 ggttggtgtcttttggggaaagattcatggggatgagaaacacatgagtagagagtcaattgtgagcaacttg 2999830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 177
Target Start/End: Original strand, 10020332 - 10020398
Alignment:
Q  109 agatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaaca 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  10020332 agatccttag-gaaatcaaaggctaagggtttgtttctttttgg-gttggattctagagttgggaaaca 10020398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Original strand, 11137073 - 11137145
Alignment:
Q  271 cttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt----aagaactcattgatagtggattggag 339  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||    || ||||||||||||||| |||||||    
T  11137073 cttgttgaagctaatttcttataaccgttttgtatctctttgtaaaaaaaaactcattgatagtgaattggag 11137145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 365
Target Start/End: Original strand, 38863949 - 38864000
Alignment:
Q  314 aagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||    
T  38863949 aagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctcccctgcatagtaggt 38864000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 27106939 - 27106898
Alignment:
Q  349 tctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27106939 tctcctccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaaca 27106898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 9633918 - 9633826
Alignment:
Q  11 ggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaa 103  Q
    ||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||    
T  9633918 ggttggtaccttttgggagagattaatggggttggtaaacacataagatgagagtcatttgtgagcaacttgggtgaatcttaggaaaccaaa 9633826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 399 - 459
Target Start/End: Original strand, 11137203 - 11137262
Alignment:
Q  399 tgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggtttt 459  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||    
T  11137203 tgttgttttgttttctctactctctttatcttgtttattcattg-gttcgattgtggtttt 11137262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 101)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 50674231 - 50673705
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  50674231 aaagggttggtgccttatgggaaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 50674132  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50674131 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 50674032  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  50674031 catgagtgtcgtgttcatttgtgagattgagaaaatgagtagaaattaggattgt-ctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat 50673933  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgtt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  50673932 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactaggtgaacatttcttggtgttgtt 50673833  T
Q  406 atcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgct 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  50673832 atcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcactt-gattatagactagatctatattgttgttattgct 50673734  T
Q  506 tgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  50673733 tatggtgatttacatttggttattggttg 50673705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 513
Target Start/End: Original strand, 35662225 - 35662730
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  35662225 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgaatggagagttctttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 35662324  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaa- 204  Q
     ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||     
T  35662325 gaagatccttag-gaaatcaaag-ctaagggttggttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgagagtgtgaaaaa 35662422  T
Q  205 tcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgta 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  35662423 tcatgagtgtcttgttcattggtgagattgaaaaaatgggtagaaattagggttgttctttatgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgta 35662522  T
Q  305 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgt 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  35662523 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatatctcctcaagagtaggtcaagttggaccgaactgaatgaacattttttggtgttgt 35662622  T
Q  405 tatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  35662623 tatcttttctttactctctttatcttgtttattccttg-gttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattgttgttgttgc 35662721  T
Q  505 ttgtggtta 513  Q
    || ||||||    
T  35662722 ttatggtta 35662730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 512
Target Start/End: Original strand, 12073176 - 12073681
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  12073176 aaagggttggtgccttttggg-aagattcatggggttggaaaacacatgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaaga 12073274  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12073275 gaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagtgtgaaaat 12073374  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12073375 catgagtgtcttgcttattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaactcatttgtat 12073474  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  12073475 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcttccagagtaggtcattgttggaccgaactaggtgaacatttcttggtgttgt 12073574  T
Q  405 tatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgc 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  |||| ||| ||||| ||||    
T  12073575 tatcttttctttactctctttatcttgtttattctttg-gttagattgtggttttgttatgcacttggtttctagattagatctagattgttgttgttgc 12073673  T
Q  505 ttgtggtt 512  Q
    ||||||||    
T  12073674 ttgtggtt 12073681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 513
Target Start/End: Original strand, 8665190 - 8665694
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  8665190 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacaggagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 8665289  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||||||||||||||| || | |||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  8665290 gaagatccttagtgaaatcaaaggttatgtgttggttttcttttgggggttagattctggagttgggaaacaattgtaaacaccttggaagagtgaaaat 8665389  T
Q  206 -catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgta 304  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8665390 tcatgagtgtcttgttcattggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgagagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 8665489  T
Q  305 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgt 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  8665490 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactaggtgtacatttcttggtgttgt 8665589  T
Q  405 tatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| || | ||||||| ||||| ||||    
T  8665590 tatcttttctttactctctttatcttgtttattccttg-gttggattgtggttttgctatgca-tttgattataga-ta-gactatattgttgttgttgc 8665685  T
Q  505 ttgtggtta 513  Q
    |||||||||    
T  8665686 ttgtggtta 8665694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 480
Target Start/End: Original strand, 54882803 - 54883278
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  54882803 aaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtgtagagtcttttgtgagaaacttgggtgagtctcgtgaaaccaaaaga 54882902  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54882903 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 54883002  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54883003 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 54883102  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaac-atttcttggtgttgt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  54883103 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagggatcaatctctcctccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatttcttggtgttgt 54883202  T
Q  405 tatc-ttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttataga 480  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  54883203 tatctttttctttactctctttatcttatttattctttg-gttgaattgtggttttgctctgcatttggtttataga 54883278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 534
Target Start/End: Original strand, 41964211 - 41964724
Alignment:
Q  20 cttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaagatccttagt 119  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  41964211 cttttgggaaagattcatggggttgggaaacacatgagtagagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagt 41964310  T
Q  120 gaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat-catgagtgtctt 217  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  41964311 gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggg-gttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggaaagtgaaaattcatgagtgtctt 41964409  T
Q  218 gttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccattt-gtatctctttgtaag 316  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  41964410 gttcgttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacccattttgtatccctttgtaag 41964509  T
Q  317 aactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttcttt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41964510 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgagcatttcttggtgttgttatcttttcttt 41964609  T
Q  417 actctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgcttgtggttattt 516  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41964610 actctc--tatcttgttta-tcctttggttagattgtggttttgctatgcacttgttttctagattagatctagattgttgttattgcttgtggttattt 41964706  T
Q  517 atatttggttattggttg 534  Q
    | ||||| || |||||||    
T  41964707 acatttgattgttggttg 41964724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Original strand, 379162 - 379691
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  379162 aaagggtcggtgccttttggggaagattcatgagaatgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaaga 379261  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  379262 gaagatccttag-gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgtgggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 379360  T
Q  206 c--atgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgt 303  Q
       || ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  379361 tcaattagtatcttgttcatttgtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgt 379460  T
Q  304 atctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgtt 402  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  379461 atcgctttgtaagaactaattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactggatgaacatttcttggtgtt 379560  T
Q  403 gttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttatt 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  379561 gttatcttttctttactctctttatcttgttta-tcctttggttagattgtggttttgttatgcacttggtttatagactaggtctatattgttgttgtt 379659  T
Q  503 gcttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    | ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  379660 gtttgtggttatttacatttgattattggttg 379691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 513
Target Start/End: Original strand, 8647921 - 8648433
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  8647921 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacaggagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaaga 8648020  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||||||||||||| | || | |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  8648021 gaagatccttagtgaaatcaaatgttatgtgttggttctcttttgggggttagattctggagttaggaaacaactgtaaacaccttggaagagtgaaaat 8648120  T
Q  206 -catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgta 304  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  8648121 tcatgagtgtcttgttcattggtgagaatgggaaaatggatagaaattagggttgttcattgtgagtttgttgaagctaatttcttataacccatttgta 8648220  T
Q  305 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8648221 tctctttgtaagaactcattgatattggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgt 8648320  T
Q  405 tatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtt---tatagactatgtc--tatattcttgtt 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||    |||||||| |||  |||||| |||||    
T  8648321 tatcttttctttactctctttatcttgtttattccttg-gttggattgtggttttgctatgcatttgattatagatagactaggtctatatattgttgtt 8648419  T
Q  500 attgcttgtggtta 513  Q
     |||||||||||||    
T  8648420 gttgcttgtggtta 8648433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 471
Target Start/End: Original strand, 6655739 - 6656203
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  6655739 aaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcatttctgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 6655838  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgtt-ctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6655839 gaagatcattagtaaaatcaaaggctaaaggttgtttctctttttggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 6655938  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  6655939 catgagtgtcttgttcacttgtgagattgaaaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat 6656038  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgtt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  6656039 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagttggaccgaattgggtgaacatttcttggtgttgtt 6656138  T
Q  406 atcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttg 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  6656139 atcttttctttactctctttatcttgttta-tccttttgttggattgtggttttgctatgcacttg 6656203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 113 - 534
Target Start/End: Original strand, 40632334 - 40632756
Alignment:
Q  113 ccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatgag 211  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40632334 ccttagtgaaatcaaatgttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgagaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgag 40632433  T
Q  212 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40632434 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt 40632533  T
Q  312 gtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttt 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40632534 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctaaagtaagtcaagttggaccgaactgggtaaacatttcttggtgttgttatcttt 40632633  T
Q  412 tctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgcttgtgg- 510  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||     
T  40632634 tttttactctctttatcttgttta-tcctttggttgaattgtggttttgccatgcacttggtatatagactaggtctatattgttgttattgcttgtggt 40632732  T
Q  511 ttatttatatttggttattggttg 534  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  40632733 ttatttacatttggttattggttg 40632756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 7 - 436
Target Start/End: Original strand, 46703284 - 46703715
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  46703284 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatgggaaa-acatgaatggagagtcttttgtcagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 46703382  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     || |||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46703383 gaaaatccttag-gaaatcaaaggctaaaagttggttctcttttgggggttagattatagtgttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 46703481  T
Q  206 -catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaaccca-tttgt 303  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  46703482 tcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgt 46703581  T
Q  304 atctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgtt 402  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  46703582 atctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaattgggtgaacatttcttggtgtt 46703681  T
Q  403 gttatcttttctttactctctttatcttgtttat 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46703682 gttatcttttctttactctctttatcttgtttat 46703715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 50263083 - 50262553
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||| |    
T  50263083 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacctcggtgactcttgtgaaaccaaaaga 50262984  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  50262983 gaagacccttagtgaaatcaaaggctaatggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaataccttgggagagtgaaaat 50262884  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50262883 catgagtgtcttgtttattg---agattgggaaaatggatcgaaattacggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 50262787  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaac-atttcttggtgttg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  50262786 ctctttgtaagaactcattgatagttgattggagatatcaatctttcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgttg 50262687  T
Q  404 ttatc---ttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtc--tatattcttgt 498  Q
    || ||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | ||| | |||| |||  |||||| ||||    
T  50262686 ttgtctatttttctctactctttttatcttgtttattccttac-ttggattgtggttttgccatgcactt-gattacatactaggtctatatattgttgt 50262589  T
Q  499 tattgcttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    | ||||||||||||| || | |||| || |||||||    
T  50262588 tgttgcttgtggttaattttttttgcttgttggttg 50262553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 86 - 534
Target Start/End: Original strand, 2209575 - 2210029
Alignment:
Q  86 gagtcttgtgaaaccaaaataaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaa 184  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2209575 gagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaataattgtaa 2209674  T
Q  185 acacattgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaa 284  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2209675 acaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgttgagattgggaaaatgggtagaaattagggtttttctttgtgagcttgttgaagctaa 2209774  T
Q  285 tttattgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactg 382  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  2209775 tttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactg 2209874  T
Q  383 ggtgaac-atttcttggtgttgttatc---ttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttata 478  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||| || ||   || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  2209875 ggtgaacaatctcttggtgttgttgtctatttttctctactctctttatcttgttta-tcatttggttagattgtggttttgctatgcacttgttttcta 2209973  T
Q  479 gactatgtctatattcttgttattgcttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    || ||  |||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2209974 gattagatctagattgttgttattgtttgtggttatttacatttggttattggttg 2210029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 10 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 27417333 - 27416886
Alignment:
Q  10 gggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaa 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||          || ||||||||||| ||||||||| | ||    
T  27417333 gggttggtgtcttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtctttt----------tgggtgagtcttgtaaaaccaaaaaagaa 27417244  T
Q  110 gatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  27417243 gatccttagtgaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattcttgagttttgaaacaattgtaaaca----gggagagtgaaaatcat 27417148  T
Q  209 gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27417147 gagtgtcttgttcattggtgagattggtaaaatgtgtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc 27417048  T
Q  309 tttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatc 408  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| || |||| |  ||||||||||||||    
T  27417047 tttgtaaaaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgagtcaacaatctttggtgttgttatc 27416948  T
Q  409 ttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttg 471  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27416947 ttgtctttactctctttatcttgtttattctttg-gttggattgtggttttgccatgcacttg 27416886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 142 - 534
Target Start/End: Original strand, 41639345 - 41639735
Alignment:
Q  142 tctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  41639345 tctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttaggagagtgaaaatcacgagtgtcttgtttattggtaagattgggaaaat 41639444  T
Q  242 tggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtg 341  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  41639445 gggtagaaattagggttgttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtaagaactcatcgatagtggattggagag 41639544  T
Q  342 atcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattcctt 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41639545 atcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgagtgaacatttcttggtgttgttatcgtttctttactctctttatcttgttta-tcctt 41639643  T
Q  442 gctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatat-tc--ttgttattgcttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
       ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||||||    
T  41639644 tggttgaattgtggttttgctatgcactt-gattatagactaggtctatatatcatttgttgttgcttgtgg---tttacatttggttattggttg 41639735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 55085750 - 55085442
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  55085750 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgtgtgagtcttgtgaaaccaaaaga 55085651  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  55085650 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgattctcctttgggggttagattctagagttcggaaacaattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 55085551  T
Q  206 ca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgta 304  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  55085550 cattgactgtcttgttcattggtgagatt-ggaaaataggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaaccatttgta 55085452  T
Q  305 tctctttgta 314  Q
    ||||||||||    
T  55085451 tctctttgta 55085442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 210 - 492
Target Start/End: Original strand, 26364223 - 26364504
Alignment:
Q  210 agtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctct 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26364223 agtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctct 26364322  T
Q  310 ttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaac-atttcttggtgttgttatc 408  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26364323 ttgtaagaactcattaatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtttgactgaactgggtcaacaatttcttggtgttgttatc 26364422  T
Q  409 ttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatat 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||||||||| ||||||||    
T  26364423 ttttctttactctctttatcttgtttattccttgc-ttggattgtggttttgctatacactt-aattatagactaggtctatat 26364504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 480
Target Start/End: Original strand, 12119322 - 12119801
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||  ||||| || ||||  || || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  12119322 aaagggttggttcccttttgggaagattcatggggttgcgaaacacattagtggtgaatcatttgtgagcaatttgggtgtgtcttgtgaaaccaaaaga 12119421  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||  |||||| |||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12119422 gaagatccttaa-gaaatcgaagt-taagggttggttctcttttgggggttagattatagagttgggaaacaattgtaaataccttgggagagtgaaaat 12119519  T
Q  206 c-atgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaatta-gggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgt 303  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  12119520 caatgagtgtcttgttcataggtgagattggaaaaaagagtagaaattatggtttgttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccttttgt 12119619  T
Q  304 atctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaac-atttcttggtg 400  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  12119620 atctctttgtaaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctcc-caagagtaggtcattgttggaccgaactaggtgaacaatttcttggtg 12119718  T
Q  401 ttgt----tatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttataga 480  Q
    ||||    ||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||  |  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12119719 ttgtcatctattttttctctactctctttatcttgtttagtctttg-gtccgattgtggttttgctatgcacttagtttctaga 12119801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 26175860 - 26175637
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  26175860 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggggagaaattagggttgttcttt 26175762  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  26175761 gtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 26175662  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  26175661 caagttggaccgaactgggtcaaca 26175637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 516
Target Start/End: Original strand, 33989649 - 33990138
Alignment:
Q  11 ggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaag 110  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||    
T  33989649 ggttggtgccttttgggagagattcatgggattgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttttgaaaccaaaagagaag 33989748  T
Q  111 atccttagtgaaatcaaaggctaagg-gttgttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatca-t 208  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||| ||||| | |    
T  33989749 atccttag-gtaatcaaaggctaaggatttgttctcttttggaggttagattctagagttgggaaacaactgtaaacaccttggttgagtaaaaattatt 33989847  T
Q  209 gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctc 308  Q
    |||||| |||||||          |||||        ||||| |||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  33989848 gagtgttttgttca----------tggga--------agaaactaggtttgttcttagagagtttgttgaagctaatttcttgtaatccttttgtatctc 33989929  T
Q  309 tttgt-aagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgtta 406  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||   |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  33989930 tttgtaaataactcgttaatagtggattggagagatcaatctctccaccagagtaggtcattcttggattgaactgggtaaacatttcttggtgttatta 33990029  T
Q  407 tcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgctt 506  Q
    | |||| | ||||||||||||||||||||||| |||  ||  ||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||  |||| ||| ||||| ||||||    
T  33990030 tattttttctactctctttatcttgtttattctttg-gttcaattctggatttgctatgcacttggtttctagattagatctagattgttgttgttgctt 33990128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 56178860 - 56178637
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  56178860 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttcttt 56178763  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  56178762 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 56178663  T
Q  366 caag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||    
T  56178662 caagtttggaccgaactgggtgaaca 56178637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 167 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 54200130 - 54199897
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54200130 gttgggaaaca-ttgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 54200032  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| ||||| |||||    
T  54200031 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtgaattagagagatcattctctcccccagattaggt 54199932  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| || |||||||    
T  54199931 caagttgga-cgaactgggtcaacaatttttggtgt 54199897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 48142986 - 48143211
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatt-ggtagaaattagggttgttctt 264  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  48142986 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggttgttctt 48143084  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagg 364  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48143085 tgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcataagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 48143184  T
Q  365 tcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  48143185 tcaagtttggaccaaactgggtgaaca 48143211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Original strand, 36994478 - 36994691
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36994478 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgtt 36994577  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  36994578 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattagatcaagttggacc 36994677  T
Q  377 aaactgggtgaaca 390  Q
     |||||||| ||||    
T  36994678 gaactgggtcaaca 36994691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 5429623 - 5429846
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||     
T  5429623 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttattcttc 5429721  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  5429722 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 5429821  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
     |||||||||| |||||||| ||||    
T  5429822 taagttggaccgaactgggtcaaca 5429846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 167 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 9927681 - 9927467
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9927681 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcactgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 9927584  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  9927583 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 9927484  T
Q  366 caagttggaccaaactg 382  Q
    ||||||||||| |||||    
T  9927483 caagttggaccgaactg 9927467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 167 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 52095586 - 52095352
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52095586 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 52095488  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  52095487 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaaatctttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg- 52095389  T
Q  366 caagtt-ggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  52095388 caagtttggaccgaactgggtgaacaatttttggtgt 52095352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 165 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 36463615 - 36463390
Alignment:
Q  165 gagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttct 263  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||     
T  36463615 gagttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaattcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggatagaaattagggctgttca 36463517  T
Q  264 ttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtag 363  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  36463516 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgacagtggattggagagatcaatctctcccccagattag 36463417  T
Q  364 gtcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  36463416 gtcaagttggaccgaactgggtcaaca 36463390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 34570638 - 34570415
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34570638 gttgggaaaca-ttgaaaacatcttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttcttt 34570540  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  34570539 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccaattgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 34570440  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
     |||||||| | |||||||| ||||    
T  34570439 taagttggatcgaactgggtcaaca 34570415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 161 - 513
Target Start/End: Original strand, 21688186 - 21688535
Alignment:
Q  161 tctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattgg-tagaaattagggttg 259  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  21688186 tctagagttgggaaacaattctaaacaccttgggggagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatcggtgagattgagaaaaatgggtagaaattagggttg 21688285  T
Q  260 ttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccaga 359  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| | |||    
T  21688286 ttctttgtgagcttgttgaaactaattttttgtaactcatttgtatctcttcggaagaactcattgataatgaattggagagatcaatccctcccctaga 21688385  T
Q  360 gtaggtcaagttggaccaaactgggtgaac-atttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatt-ccttgctttggattgtggtt 457  Q
     ||||||||||| |||| || || || ||| |||||||||||||||||||  |||||| |  |  |||||   |||||| | ||| ||  ||||||||||    
T  21688386 ttaggtcaagttagaccgaattgagtcaacaatttcttggtgttgttatc--ttcttt-cattgcttatc---tttattgctttgattatgattgtggtt 21688479  T
Q  458 ttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgcttgtggtta 513  Q
    ||| |||||| ||| |||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21688480 ttgttatgcatttgatttatagactagatctatattattgttgttgcttgtggtta 21688535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 26699716 - 26699361
Alignment:
Q  122 aatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgt 219  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  26699716 aatcaaaggttaaaggttggttctcttttaggggttagattataaagttgggaaacaattgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgt 26699617  T
Q  220 tcattggtgagattgggaa-aattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aag 316  Q
    | ||| | ||||||  ||| ||  |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  26699616 ttattagagagattcagaagaaagggtatagattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaag 26699517  T
Q  317 aactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctt 415  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||   |||||||||||||  |||||||| |||||||| || ||||||| |||  |||||||||||||    
T  26699516 aactcatttataatggattggagagatcaatctctatcccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtaaaaatttcttagtgccgttatcttttctt 26699417  T
Q  416 tactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttgg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  26699416 tactctctttatcttgtttattctttg-gttcaattatggttttgctatgcacttgg 26699361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 48893856 - 48893639
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttc----tttgtgagct 272  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  48893856 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtttgtgagct 48893757  T
Q  273 tgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttg 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  48893756 tgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttg 48893657  T
Q  373 gaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| |||||||| ||||    
T  48893656 gaccgaactgggtcaaca 48893639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 169 - 401
Target Start/End: Original strand, 31474096 - 31474329
Alignment:
Q  169 tgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattaggg-ttgttctttg 266  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||     
T  31474096 tgggaaaca-ttgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtcttgttctttt 31474194  T
Q  267 tgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtc 366  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  31474195 tgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagttgattggagagataaatctctccaccagagtagatc 31474294  T
Q  367 aagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  31474295 aagttggaccgaactgggtaaacatatcttggtgt 31474329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 12739774 - 12739551
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| || || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12739774 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttaggtgagtggaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggatagaaattagggttgttcttt 12739676  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  12739675 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtatgaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 12739576  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  12739575 caagttggaccgaactgggtcaaca 12739551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 167 - 382
Target Start/End: Original strand, 37740570 - 37740784
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  37740570 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggttgttcttt 37740667  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||    
T  37740668 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggt 37740767  T
Q  366 caagttggaccaaactg 382  Q
    ||||||||||| |||||    
T  37740768 caagttggaccgaactg 37740784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 47038633 - 47038412
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47038633 gttgggaaaca-ttataaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatgggtagaaattagggttgttcttt 47038536  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  47038535 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatc-atttgtatctgtttgtaaggactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaagt 47038437  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  47038436 caagttggaccgaactgggtcaaca 47038412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 52467579 - 52467355
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  52467579 gttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgaggttgggaaaatgggtagaaattaggtttgttcttt 52467480  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||    
T  52467479 gtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccatttgtatcactttgtaataactttttgatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggt 52467380  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  52467379 caagttggaccgaactgggtcaaca 52467355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 167 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 6542405 - 6542169
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-tggtagaaattagggtt-gttct 263  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  6542405 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggggagattgggaaaaaatggtagaaattaggatttgttct 6542307  T
Q  264 ttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtag 363  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  6542306 ttgtgagcttgttgaaactaatttcttgttagccttttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagggtag 6542207  T
Q  364 gtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  6542206 gtcaagttggaccgaactgggtaaacatttcttggtgt 6542169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 167 - 401
Target Start/End: Original strand, 4587902 - 4588137
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctt 264  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| | || ||||||    
T  4587902 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcatgttcattggtgaaattgggaaaaaaggtagaaattaagatttgttctt 4588000  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagg 364  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||    
T  4588001 tgtaagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagaacaatctctcccccataatagg 4588100  T
Q  365 tcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4588101 tgaagttggaccaaactgggtaaacatttcatggtgt 4588137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 167 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 37229947 - 37229714
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggt-tgttctt 264  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  37229947 gttggaaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggtgtgttctt 37229849  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttg-tatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtag 363  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  || |||||    
T  37229848 tgtgagcttgttaaagcaaatttgttgtaaccctttttatatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctccctcatagtag 37229749  T
Q  364 gtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttgg 398  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  37229748 gtcaagttggaccgaactaggtaaacatttcttgg 37229714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 5871764 - 5871987
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5871764 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggtttgttcttt 5871862  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  5871863 gtgagcttgtttaagcaaatttcttgtaacccatttttatcactttgcaagaactctttgatagtggattagagagatcaatctctcccccagattaggt 5871962  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||    
T  5871963 caagtttgaccgaactgggtcaaca 5871987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 29254438 - 29254661
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||    
T  29254438 gttgggaaaca-ttgtaaacacattgggtgaatgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaattgggtagaaattagagttgtttttt 29254536  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
     |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||    
T  29254537 atgagcttgttgaagttaatttcttgcaacccatttgtgtctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctctcccaaattaggt 29254636  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  29254637 caagttggaccgaactgggtcaaca 29254661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 168 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 12745659 - 12745476
Alignment:
Q  168 ttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttg 266  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12745659 ttgggaaacaat-gtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggcgagattaggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 12745561  T
Q  267 tgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctct 351  Q
    ||| |||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12745560 tgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct 12745476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 212 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 46147570 - 46147392
Alignment:
Q  212 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt 311  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  46147570 tgtcttgttcatcggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt 46147471  T
Q  312 gtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  46147470 gtaagaactctttgatagtggattggagacatcaatctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 46147392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 178 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30000019 - 29999804
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  30000019 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcgttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggttgttctttgtgaacatgtc 29999922  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgga 374  Q
     |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29999921 aaagctaatttcttgtaactcttttgtatcttttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 29999822  T
Q  375 ccaaactgggtgaacatt 392  Q
    || |||||||||||||||    
T  29999821 ccgaactgggtgaacatt 29999804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 167 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 12747980 - 12747794
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| || || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12747980 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttaggtgagtggaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggatagaaattagggttgttcttt 12747882  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcc 353  Q
    |||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12747881 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtatgaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 12747794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 167 - 349
Target Start/End: Original strand, 24969055 - 24969238
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  24969055 gttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagagtcttgttctttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagatttgttcttt 24969154  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatct 349  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24969155 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactaattgatagtggattggagagataaatct 24969238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 184 - 390
Target Start/End: Original strand, 3913408 - 3913614
Alignment:
Q  184 aacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagct 282  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  3913408 aacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgagtagaaattagagctgttctttgtgagtttgttgaagct 3913507  T
Q  283 aatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactg 382  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| || |||||| | | |||||    
T  3913508 aatttcttttaacccatttgtatatctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc-ctagagtatgtaaagttgtatcgaactg 3913606  T
Q  383 ggtgaaca 390  Q
    ||| ||||    
T  3913607 ggtcaaca 3913614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 169 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 5370308 - 5370083
Alignment:
Q  169 tgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatt---ggtagaaattagggttgttctt 264  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||    
T  5370308 tgggaaaca-ttgtaaacactttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaaaaagaggtagaaattagggttgttctt 5370211  T
Q  265 tgtgagcttgttgaa-gctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtag 363  Q
    ||||| |||||  || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5370210 tgtgaacttgtcaaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggactagagagatcaatctctcctccagagtag 5370111  T
Q  364 gtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  5370110 gtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 5370083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 45687407 - 45687183
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctt 264  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |  | || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||    
T  45687407 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaattttttgattgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggaagaaattaggttttgttctt 45687309  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagg 364  Q
    |||||||||||  |||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | || |    
T  45687308 tgtgagcttgtcaaagctaatttcttataactcatttgtatctatttgtaagaactcattgatagtggattggagagatctatctctcctccatattatg 45687209  T
Q  365 tcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||    
T  45687208 tcaagttggaccgaactgggtcaaca 45687183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 168 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 5208066 - 5207832
Alignment:
Q  168 ttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatg-agtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttcttt 265  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  5208066 ttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcatttagtgacttgttcattggagtgattggaaaaag-ggtagaaattagggtttgttcttt 5207968  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||    
T  5207967 gtgaacttgttgaagctaatttattgcaacccttgtatatctatttgtaagaactcattgatagtggattggaaagatcaatctctctcccagagtaggt 5207868  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    ||| ||||||  || ||||| ||||||| |||||||    
T  5207867 caatttggactgaattgggtaaacatttattggtgt 5207832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 167 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 52082881 - 52082684
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  52082881 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgactgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaactagggttgttcttt 52082783  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| |||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||       ||||| |||||||||||||||||||    
T  52082782 gtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaaatctttgatagtgga-------gatcattctctcctccagagtaggt 52082690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 236 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 12744080 - 12743926
Alignment:
Q  236 gaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatt 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12744080 gaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatt 12743981  T
Q  336 ggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12743980 ggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 12743926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 236 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 12745469 - 12745315
Alignment:
Q  236 gaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatt 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12745469 gaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatt 12745370  T
Q  336 ggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12745369 ggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 12745315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 180
Target Start/End: Original strand, 26364048 - 26364222
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  26364048 aaagggttggggccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 26364147  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt-gttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaatt 180  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26364148 gaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttggtggttagattttagagttgggaaacaatt 26364222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 178 - 401
Target Start/End: Original strand, 51337018 - 51337242
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattaggg--ttgttctttgtgagcttg 274  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||||     
T  51337018 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcctgttcattggtgagattgagaaaaagggtagaaattacggatttgttctttgtgagcttt 51337117  T
Q  275 ttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttgga 374  Q
    |  ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  || | ||||||||||||||    
T  51337118 t--aagataatttattataacccttttgtatctctttttaagaactcattgatagtgtattagagagatcaatctctcccacacattaggtcaagttgga 51337215  T
Q  375 ccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    || |||||||| |||||||| ||||||    
T  51337216 ccgaactgggtaaacatttcgtggtgt 51337242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 167 - 311
Target Start/End: Original strand, 41639207 - 41639351
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttg 266  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41639207 gttgggtaacaattgtaaacaccttaggagagtgaaaatcacgagtgtcttgtttattggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 41639306  T
Q  267 tgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt 311  Q
    | | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41639307 taaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 41639351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13992461 - 13992293
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattgg-tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactc 321  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  13992461 ttggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctctt-gtaagaactc 13992363  T
Q  322 attgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  13992362 attgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaaca 13992293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 472
Target Start/End: Original strand, 33089683 - 33090129
Alignment:
Q  9 agggttggtgccttttgggga-agattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataa 107  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||||  | |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||           |||||| |     
T  33089683 agggttggtgtcttttggagagagattcatggggtcgaaaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggaga-----------ccaaaagag 33089771  T
Q  108 aagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatc 206  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||          | |||| ||||||||||||    
T  33089772 aagatccttaga-aaatcaaaggctaaaggttggttctcttttggaggttagattatagagttgggaaaca----------ccttggaagagtgaaaatc 33089860  T
Q  207 at-gagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgta 304  Q
    || ||||||||||||||| ||  ||||||| || | |   ||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  33089861 attgagtgtcttgttcatgggaagagattgagaga-tgaatagaaattatgtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttattataaccattttgta 33089959  T
Q  305 tctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttc-ttggtgt 401  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||  ||| | | |||| ||| |||  ||    
T  33089960 tctctctgtaaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcctctagagtaggttattgttggaccggactagataaacaattctttgaagt 33090059  T
Q  402 tgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttgg 472  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||||||| | |||||||    
T  33090060 tgttctcttttctctgctctctttatcttgtttattttttg-gttcgattgtggttttgctttacacttgg 33090129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 243 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 12744195 - 12744087
Alignment:
Q  243 ggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtga 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12744195 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaga 12744096  T
Q  343 tcaatctct 351  Q
    |||||||||    
T  12744095 tcaatctct 12744087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 167 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 13009655 - 13009453
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  13009655 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgtgaaaatgggtagaaattaggtttgttcttc 13009557  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||             ||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||    
T  13009556 gtgagc-------------tttcttgtaaaacatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcgatctctcctccaaattaggt 13009470  T
Q  366 caagttggaccaaactg 382  Q
    |||||| |||| |||||    
T  13009469 caagttagaccgaactg 13009453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 68 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22883077 - 22882707
Alignment:
Q  68 tttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtg-ttagattctag 165  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||  || ||||||| | |||||||||||  |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  22883077 tttgtgagcaatttgggcgagtcttaggagaccaaaagagaagatccttaga-aaatcaaaggataatggttggttctcttttggggggttagattctag 22882979  T
Q  166 agttgggaaacaatt-gtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaattggtagaaattagggttgttc 262  Q
    | |||| |||||||| |  ||| | ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||| |   |||||||  ||||| | || |||||||| ||||||    
T  22882978 aattggaaaacaattaggtaacgctttgagaaagtgaaaatcattgagtgccttgttcatggaaagagattga-aaaatggataaaaattaggtttgttc 22882880  T
Q  263 tttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagt 361  Q
    || | ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||  |||||  ||||| || ||||    
T  22882879 ttggagagtttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcgtaaagaactcattggtagtggattagagaaatcaa--tctcccccggagt 22882782  T
Q  362 aggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattc 438  Q
    ||||||  |||||||| |||||| | ||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22882781 aggtcattgttggaccgaactggataaacatttcttgg---tgttattttttctatactctctttatcttatttattc 22882707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 68 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22934741 - 22934371
Alignment:
Q  68 tttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtg-ttagattctag 165  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||  || ||||||| | |||||||||||  |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  22934741 tttgtgagcaatttgggcgagtcttaggagaccaaaagagaagatccttaga-aaatcaaaggataatggttggttctcttttggggggttagattctag 22934643  T
Q  166 agttgggaaacaatt-gtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaattggtagaaattagggttgttc 262  Q
    | |||| |||||||| |  ||| | ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||| |   |||||||  ||||| | || |||||||| ||||||    
T  22934642 aattggaaaacaattaggtaacgctttgagaaagtgaaaatcattgagtgccttgttcatggaaagagattga-aaaatggataaaaattaggtttgttc 22934544  T
Q  263 tttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagt 361  Q
    || | ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||  |||||  ||||| || ||||    
T  22934543 ttggagagtttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcgtaaagaactcattggtagtggattagagaaatcaa--tctcccccggagt 22934446  T
Q  362 aggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattc 438  Q
    ||||||  |||||||| |||||| | ||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22934445 aggtcattgttggaccgaactggataaacatttcttgg---tgttattttttctatactctctttatcttatttattc 22934371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 118
Target Start/End: Original strand, 40630767 - 40630878
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  40630767 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 40630866  T
Q  107 aaagatccttag 118  Q
     |||||||||||    
T  40630867 gaagatccttag 40630878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 31495485 - 31495316
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||| ||||||| | ||| |||||||||| |||||||||    
T  31495485 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattaggattgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaact 31495387  T
Q  321 cattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31495386 cattgatagttgattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 31495316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 393 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 55085439 - 55085320
Alignment:
Q  393 tcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatat 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||  |||| ||    
T  55085439 tcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttg-gttggattgtggttttgctatgcacttggtttctaaattagatctagat 55085341  T
Q  493 tcttgttattgcttgtggtta 513  Q
    | |||||||||||||| ||||    
T  55085340 tgttgttattgcttgtagtta 55085320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 165 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 48142605 - 48142393
Alignment:
Q  165 gagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttc 262  Q
    ||||||||||||| || ||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||    
T  48142605 gagttgggaaacatttttaaacacttcgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgcccattgatgagattgggaacat-gatagaaattagggtttgttc 48142507  T
Q  263 tttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattg--atagtggattggagtgatcaatctctcctccaga 359  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| | | |    
T  48142506 tttgtgagcttgttgaagctagtttcttgtaacccttgtatatctctttgtaaagaactcattgatatagtagatttgaaagatcaatctctcc-ctaca 48142408  T
Q  360 gtaggtcaagttgga 374  Q
    ||||||||| |||||    
T  48142407 gtaggtcaatttgga 48142393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 122 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 35369711 - 35369394
Alignment:
Q  122 aatcaaaggctaagggtt-gttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaatt-gtaaacacattgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttg 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||| |||||||||||    
T  35369711 aatcaaaggctaagggttggttctcttttggg-gttggattatagaattgggaaacaattgggaaacacctt-gtagagtgaaaatcattgagtgtcttg 35369614  T
Q  219 ttcattg-gtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aag 316  Q
    |||||||   || |||||| ||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||  |||     | ||||||||||| |||    
T  35369613 ttcattgcaagacattggg-aaatgagtagaaattaggtttgttcttggtgagcttgatgaaactaatttcttaaaac-----tctatctctttgtaaag 35369520  T
Q  317 aactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctt 415  Q
    ||||||||||| ||| |||| || | || |||||||  ||| |||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||    ||||  ||    
T  35369519 aactcattgatggtgaattgaagaggtcgatctctc--ccatagtaggtcattgttggaccaaacaaggtaaacatttcttgacgttg----ctttcttt 35369426  T
Q  416 tactctctttatcttgtttattccttgctttg 447  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  35369425 tactctctttatcttgtttattttttgctttg 35369394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 167 - 401
Target Start/End: Original strand, 29056301 - 29056537
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctt 264  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||    
T  29056301 gttgggaaacatttggaaacaccttgggtgagtaaaaatcattgagtgttttgttcattagagagattgggaaaat-ggtaggaattagagtttgttctt 29056399  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaa-ctcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtag 363  Q
    |||| |||||||  | ||||||| ||| || || ||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| || | |||||||  |||| ||||    
T  29056400 tgtgtgcttgttagaactaatttcttgcaatccttttatatctctttgtaacaacctcattgataatggattagagagacctatctctcacccagtgtag 29056499  T
Q  364 gtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    ||| | || |||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  29056500 gtccattttgaccgaactgtgtaaacacttcttggtgt 29056537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 327
Target Start/End: Original strand, 32091363 - 32091583
Alignment:
Q  108 aagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgt-aaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||| || |||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||| ||| |||| |    
T  32091363 aagatccttag-gaaatcaaaggcaaagtgttggttcttttttggg-gtaagattctaaagtttggaaacaattgagaaacacattgggtgagcgaaa-t 32091459  T
Q  206 cat-gagtgtcttgttcattggtga-gattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgt 303  Q
    ||| |||| |||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||||    
T  32091460 cattgagtctcttgttcatgggagaagattgggaaaat-gctagaaattaggtttgttcttggagagtttgttgaaactaatttcttgtaactcttttgt 32091558  T
Q  304 atctctttgt-aagaactcattgat 327  Q
    |||||||||| |||||| |||||||    
T  32091559 atctctttgtaaagaacacattgat 32091583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 8393394 - 8393562
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||| | |||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  8393394 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 8393490  T
Q  321 catt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8393491 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 8393562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 8395603 - 8395771
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||| | |||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  8395603 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 8395699  T
Q  321 catt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8395700 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 8395771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 196 - 345
Target Start/End: Original strand, 53345189 - 53345340
Alignment:
Q  196 gagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttg-ttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgta 293  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||| |||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  53345189 gagtgaaaatcattgagtgtcttgtttatcggagagattgagaaaat-gatagaaattaaggttgattctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgta 53345287  T
Q  294 acccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtgatca 345  Q
    |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||||    
T  53345288 acccttttatatctttttgtaaagaactcattaatattggattgtagggatca 53345340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 244 - 438
Target Start/End: Original strand, 34112838 - 34113030
Alignment:
Q  244 gtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtga 342  Q
    |||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  34112838 gtagaaattatgtttgttctaggagagcttgttgaagctaatttcatgtaacccttttgcatctctttgtaaagaactcattgatagtgaagtggagaga 34112937  T
Q  343 tcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattc 438  Q
    ||  ||||||| | | |||||||||  |||||||| || | ||| |||| || ||  || |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  34112938 tc--tctctcccctatagtaggtcattgttggaccgaatttggtaaacaattatt--tggtgttctcttttctctactcactttatcttgtttattc 34113030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Original strand, 41961264 - 41961368
Alignment:
Q  77 aacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaa 175  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| | || |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  41961264 aacttgggtgagtcttgggagaccaaaaaagaatatccttag-gaaatcaaaagctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaa 41961362  T
Q  176 caattg 181  Q
    ||||||    
T  41961363 caattg 41961368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 228 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 44967992 - 44967818
Alignment:
Q  228 gagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattg 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || | |||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||    
T  44967992 gagattgggaaaat-ggtagaaattaggttttgctcttggagagcttgctgaagccaatttcttgtaacc-atttgtatctctttgtaaaaaactcgttg 44967895  T
Q  326 atagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    | ||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||| | |||||| |||||||||| ||||    
T  44967894 agagtagattagagggatcaatctctcccccagaataagtcactgttggaccgacctgggtaaacatttctttgtgt 44967818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 413 - 534
Target Start/End: Original strand, 46703739 - 46703860
Alignment:
Q  413 ctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatat--tcttgttattgcttgtgg 510  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| || | ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||  | ||||| ||||||| ||    
T  46703739 ctttactctctttatcttgtttatcctttggttag-attgtggttttgctatgcacttgatt-atagaataggtctatatattgttgttgttgcttgagg 46703836  T
Q  511 ttatttatatttggttattggttg 534  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  46703837 ttatttacatttggttattggttg 46703860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 46569931 - 46569816
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||| |    
T  46569931 aaaggattggtgccttttgggaaagattcatggggttgggaaacaaatgagtggaaagtcttttgtgaacaacttaggtgaatcttatgaaaccaaaaga 46569832  T
Q  107 aaagatccttagtgaa 122  Q
     ||| |||||| ||||    
T  46569831 gaaggtccttattgaa 46569816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 34112394 - 34112539
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||  ||| |||||  ||| |||||     
T  34112394 aaagggttggtgccttttggggagaggttcacggggttggaaaacacatgagtggagagtcatctgtgagcaacttggatgaatcttggaaaaacaaaac 34112493  T
Q  106 aaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt-gttctcttttgg 151  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  34112494 tgaagatccttag-gaaatcaaaggctaaagtttggttctcttttgg 34112539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 350
Target Start/End: Original strand, 6677412 - 6677597
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaattggtagaaattagggttgtt--ct 263  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    ||||| |||||||| | ||  || ||||| |||  |||||||||||||| || ||  ||    
T  6677412 gttgggaaacatttgtaaacacattggatgagtgaaataattgagtctcttgttcttgggaagaaattggaaaa--tggtagaaattaggttttttttct 6677509  T
Q  264 ttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctc 350  Q
    | | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||| || |||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  6677510 tggagagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatatctttgtaaagaagtctttgataatggatttgagagatcaatctc 6677597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 237 - 401
Target Start/End: Original strand, 5349924 - 5350087
Alignment:
Q  237 aaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggatt 335  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| | | ||||||||||||||| |||||||| |||||| || |      
T  5349924 aaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgaacttgtcgaagctaattccttgtagctcgtttgtatctctttgtaaagaactcgttgataatgaagc 5350023  T
Q  336 ggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    |||| ||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||  || ||||| ||||||| |||||||    
T  5350024 ggagagatc--tctctcc-ccagagtaggtcattgttggactgaattgggtaaacatttattggtgt 5350087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 243 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 21703985 - 21703829
Alignment:
Q  243 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagt 340  Q
    ||||||||||||| || |||||| |  |||||||||||| | |||| ||||| ||  ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  21703985 ggtagaaattaggttttgttcttagaaagcttgttgaagatgatttcttgtaccctttttgtatctttttgtaaagaactcattgacagtggattggaga 21703886  T
Q  341 gatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttg 397  Q
     |||||||| ||| ||| |||||||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  21703885 tatcaatctatcc-ccatagtaggtcattgtttgaccgaactgggtaaacatttcttg 21703829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 66
Target Start/End: Original strand, 2209491 - 2209550
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtc 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||    
T  2209491 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtc 2209550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 38811342 - 38811143
Alignment:
Q  238 aaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaaga-actcattgatagtggattg 336  Q
    |||| |||| |||||| | |||||||| | ||| ||||||||  |||||| | || |||  ||||||| |||||||||   |||||||||||||| |  |    
T  38811342 aaatgggtacaaattaagtttgttcttggagagtttgttgaatttaatttctagtgaccattttgtat-tctttgtaaatgactcattgatagtgaagcg 38811244  T
Q  337 gagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaa-gttggaccaaactgggtgaacatttctt-ggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgttt 434  Q
    ||| ||||  ||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  38811243 gagagatc--tctctccccaagagtaggtcattgttggaccgaactgggtaaacaattcttcggtgttgttctcttttctctactctctttatattgttt 38811146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 344
Target Start/End: Original strand, 52065530 - 52065719
Alignment:
Q  157 agattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaattggtagaaattag 254  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||  ||  || |||||||||   ||||||||||||    
T  52065530 agattcttgggttgggaaacaattgtgaaccccttgggtgagtgaaaatcatcgagtctcttgatcaacggaagatattgggaaaca-ggtagaaattag 52065628  T
Q  255 ggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccattt-gtatctctttgtaag-aactcattgatagtggattggagtgatc 344  Q
    | |||||||| | |||||| ||||||||| |||  |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  52065629 g-ttgttcttagagagcttattgaagctatttttctgtaaccccttttgtatctctttgttagaaactcattgatagtgaagtggagagatc 52065719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 44570521 - 44570427
Alignment:
Q  236 gaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatag 329  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| || | |||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44570521 gaaaaatggtagaaattatgtttgttgttggagagcttgttgaaactaatttcttgtaacatttttgtatctctttgtaaagaactcattgatag 44570427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 34788924 - 34788851
Alignment:
Q  242 tggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaa 315  Q
    |||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  34788924 tggtagaaattaggattgctcttggagagcttgttgaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaa 34788851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22629209 - 22629105
Alignment:
Q  72 tgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgttctcttttgggtgttagattctagagttgg 171  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  || || | |||    |||||||||||||||||||    
T  22629209 tgagcaatttgagtgaatcttgggagaccaacataaaagatccttag-aaaatcaaaggctaagttttttttttttt----tgttagattctagagttgg 22629115  T
Q  172 gaaacaattg 181  Q
    ||||||||||    
T  22629114 gaaacaattg 22629105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 401
Target Start/End: Original strand, 24969787 - 24969843
Alignment:
Q  345 aatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24969787 aatctatcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtaaacatttcttggtgt 24969843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 387
Target Start/End: Original strand, 5136155 - 5136230
Alignment:
Q  314 aagaactcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 387  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5136155 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 5136230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 387
Target Start/End: Original strand, 5138380 - 5138455
Alignment:
Q  314 aagaactcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 387  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5138380 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 5138455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16422756 - 16422653
Alignment:
Q  242 tggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagt 340  Q
    |||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||| | | ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | |||||     
T  16422756 tggtagaaattatgtttgttttttgagagctttttgaagctaatttctagaaacccttttgtatatctttgtaatgaactcatggatagtgaagtggaga 16422657  T
Q  341 gatc 344  Q
    ||||    
T  16422656 gatc 16422653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 169
Target Start/End: Original strand, 3785934 - 3786034
Alignment:
Q  68 tttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt-gttctcttttgggtgttagattctaga 166  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| || ||||||| | || |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  3785934 tttgtgagcaaattgtgcgagtcttgggagaccaaaagagaatatccttag-gaaatcaaaggctaagagttggttctcttttggg-ggtagattctaga 3786031  T
Q  167 gtt 169  Q
    |||    
T  3786032 gtt 3786034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 369
Target Start/End: Original strand, 7124992 - 7125048
Alignment:
Q  314 aagaactcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag 369  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  7124992 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaag 7125048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35370661 - 35370452
Alignment:
Q  68 tttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt-gttctcttttgggtgttagattctaga 166  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||   || ||||||||| |||||| || | ||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||| ||||    
T  35370661 tttgtaagcaacttgggtgagtctatggataccaaaatagaagatctttgg-gaaatcaaaggctaatggttggttctctttt-ggagttagattataga 35370564  T
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattg-gtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctt 264  Q
     |||||          |||||| |||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||   || |||||| ||||  |||||||||||| ||||||||    
T  35370563 attggg----------aaacaccttgtaagagtgaaaattattgagtgtcttgttcattgcaagacattggg-aaatgagtagaaattaggtttgttctt 35370475  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaattt 287  Q
     ||||||||| |||| |||||||    
T  35370474 ggtgagcttgatgaaactaattt 35370452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 369
Target Start/End: Original strand, 7122773 - 7122829
Alignment:
Q  314 aagaactcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag 369  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  7122773 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccatagtaggtcaag 7122829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 25723473 - 25723433
Alignment:
Q  140 gttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaatt 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  25723473 gttctcttttgggtgttagattctagagatggaaaacaatt 25723433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 395 - 438
Target Start/End: Original strand, 3786135 - 3786178
Alignment:
Q  395 ttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattc 438  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3786135 ttggtgttgttctcttttctctactctctttatcttgttcattc 3786178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 37755076 - 37754986
Alignment:
Q  276 tgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaa-ctcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||| |||||| ||||||||  ||| ||||||||| ||| || |||||||||| ||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||    
T  37755076 tgaagataatttcttgtaacctttttttatctctttctaaaaaactcattgataatggtttgaagagatcaatctctcccccatagtaggt 37754986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 311
Target Start/End: Original strand, 39774254 - 39774329
Alignment:
Q  236 gaaaattggtagaaattagg-gttg-ttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  || |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  39774254 gaaaattggtagaaattaggtcttgtttctttgtgagct--tttaagctaatttcttgtaacctatttgtatcacttt 39774329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 257 - 312
Target Start/End: Original strand, 1983272 - 1983325
Alignment:
Q  257 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttg 312  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  1983272 ttgttctttgtgagcttg--caagctaatttcttgtaacccctttgtatcactttg 1983325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 53)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 26830505 - 26829979
Alignment:
Q  11 ggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaag 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||    
T  26830505 ggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcgcagagtcatttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagagaag 26830406  T
Q  111 atccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatg 209  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26830405 attcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatg 26830306  T
Q  210 agtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctc 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  26830305 agtgtcttgttcattgggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccatttgtatctc 26830206  T
Q  309 tttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatc 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26830205 tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttgactgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatc 26830106  T
Q  409 ttttctttact--ctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgctt 506  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  26830105 ttttctttactctctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtttatattgttgttattgctt 26830006  T
Q  507 gtggttatttatatttggttattggtt 533  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26830005 gtggttatttacatttggttattggtt 26829979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Original strand, 5043411 - 5043939
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5043411 aaagggttggtgccttttggg-aagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaatttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 5043509  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5043510 gaagatccttagtggaatcaaaggctaagagttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgtgagagtgaaaat 5043609  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5043610 catgagtgtcttgttcattcgtgagattgagaaaatgagtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat 5043709  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgt 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5043710 ctctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgt 5043809  T
Q  405 tatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtc--tatattcttgttatt 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||  |||||| ||||| ||    
T  5043810 tatcttttctttactctctttatcttgtttatttcttg-gttggattgtggttttgctatgcactt-gattatagaataggtctatatattgttgttgtt 5043907  T
Q  503 gcttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  5043908 gcttgaggttatttacatttggttattggttg 5043939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 419
Target Start/End: Original strand, 21593449 - 21593860
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  21593449 aaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcatttttgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 21593548  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21593549 gaagatccttag-gaaatcaaag-ctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 21593646  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21593647 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 21593746  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgtt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21593747 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgtt 21593846  T
Q  406 atcttttctttact 419  Q
    ||||||||||||||    
T  21593847 atcttttctttact 21593860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Original strand, 17762770 - 17763302
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttgggga--agattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaa 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17762770 aaaggtttggtgccttttgggggttagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgggagcaacttgggtgagtcttgtgaaacaaaaa 17762869  T
Q  105 taaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaa 203  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17762870 gagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacactttgagagagtgaaa 17762969  T
Q  204 at-catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttg 302  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  17762970 attcatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttg 17763069  T
Q  303 tatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17763070 tatctttttggaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactaggtgaacatttcttggtgt 17763169  T
Q  402 tgttatcttttc-tttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgtta 500  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||   || |||||| ||||||||||||||||| | | |||| ||  |||| ||| ||||||    
T  17763170 tgttatcttttcttttactctctttatcttgttca-tcctttggttagattgtagttttgctatgcacttgttatctagattagatctagattgttgtta 17763268  T
Q  501 ttgcttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17763269 ttgtttgtgattatttacatttggttattggttg 17763302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 2973324 - 2972793
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||| || |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  2973324 aaagggttggtgcttttttgggaagattcatggggttgggaaacacatgaatgcagagtcatttgtgaacaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 2973225  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2973224 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttagggattagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 2973125  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2973124 cataagtgtcgtgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 2973025  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgtt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2973024 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaagttcgaccgaactaggtgaacatttcttggtgttgtt 2972925  T
Q  406 atcttttcttta----ctctctttatcttgtttattccttgctttggattgtgg-ttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgtta 500  Q
    || |||| ||||    |||||| ||||||||||| || ||   || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||     
T  2972924 at-ttttttttactctctctctatatcttgttta-tcatttggttagattgtggttttttctatgcacttagtttatagactaggtctatattgttgttg 2972827  T
Q  501 ttgcttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2972826 ttgtttgtggttatttacatttgattattggttg 2972793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 3809093 - 3808561
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  3809093 aaagggttggttccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtaaaaccaaaaga 3808994  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3808993 gaaaatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttct-ttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 3808895  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaaccca-tttgta 304  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  3808894 cacaagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccattttgta 3808795  T
Q  305 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaac-atttcttggtgtt 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||| || |||||| |||    
T  3808794 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcatgattggaccgaactaggtgaacaatctcttggggtt 3808695  T
Q  403 gttatc---ttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgtt 499  Q
    ||| ||   |||||| |||||||||||||||||||| |||||   || |||| ||||||||||||||| ||| ||| |||| ||  |||| ||| ||| |    
T  3808694 gttgtctatttttctctactctctttatcttgttta-tcctttggttagattatggttttgctatgcatttgttttctagattagatctagattgttgct 3808596  T
Q  500 attgcttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3808595 attgcttttggttatttacatttgattattggttg 3808561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 7 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 603465 - 603005
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  603465 aaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagtgtcctttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 603366  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt-gttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  603365 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaatggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggatagtgaaaat 603266  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  603265 catgagtgtcttgttcattggtgagattg--------ggtagaaatttgtgttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 603174  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaac-atttcttggtgttgt 404  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| ||||||    
T  603173 ctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagaaatcaatctctccccaagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctcttgatgttgt 603074  T
Q  405 tatc---ttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttg 471  Q
    | ||   |||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  603073 tgtctatttttctctactctctttatcttgtttatgccttg-gttggattgtggttttactatgcacttg 603005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 8 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 22425209 - 22424682
Alignment:
Q  8 aagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataa 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||| |||||| |||  |||||||||  || |||||||||||||||||| |     
T  22425209 aagggttggtgcattttggggaagattcatggggttgtgaaacacatgggtgaagagtcatttaagagcaacttcggttagtcttgtgaaaccaaaagag 22425110  T
Q  108 aagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat- 205  Q
    || |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  22425109 aatatccttag-gaaatcaaag-ctaagggttggttctcttttggg-gttagattatagagttgggaaacaattgtaaacactttgggagagtgaaaatt 22425013  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaaccca--tttgt 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||    
T  22425012 catgagtgtcttgttcgttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttttgt 22424913  T
Q  304 atctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgtt 402  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22424912 atctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcattgttggaccgtactgggtgaacatttcttggtgtt 22424814  T
Q  403 gttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtgg--ttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgtta 500  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   || ||||||||  |||| | ||||||||||||| || | ||  |||| ||| |||||     
T  22424813 gttatcttttctctactctctttatcttgttta-tccttaggttagattgtggtttttttcaatgcacttggtttctatattagatctagattgttgttg 22424715  T
Q  501 ttgcttgtggttatttatatttggttattggtt 533  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22424714 ttgtttgtggttatttacatttggttattggtt 22424682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 205 - 513
Target Start/End: Original strand, 21588913 - 21589220
Alignment:
Q  205 tcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgta 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21588913 tcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 21589012  T
Q  305 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgt 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21589013 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgt 21589112  T
Q  405 tatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgc 504  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21589113 tatcttttctttactttccttatcttgtttattcctt-agttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattgttgttattgc 21589211  T
Q  505 ttgtggtta 513  Q
    |||||||||    
T  21589212 ttgtggtta 21589220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 195 - 534
Target Start/End: Original strand, 17757994 - 17758335
Alignment:
Q  195 agagtgaaaat-catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgta 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17757994 agagtgaaaattcatgagtgtcttcttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgta 17758093  T
Q  294 acccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaacatt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  17758094 acccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtagttcaagtttggaccgaactaggtgaacatt 17758193  T
Q  393 tcttggtgttgttatcttttc-tttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctata 491  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  |||| |    
T  17758194 tcttggtgttgttatctttccttttacgctctttatcttgttta-tcctttggttagattgtggttttgctatgcacttgttttctagattagatctaga 17758292  T
Q  492 ttcttgttattgcttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17758293 ttgttgttattgcttgcggttatttacatttggttattggttg 17758335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 167 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 28137632 - 28137400
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28137632 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 28137534  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  28137533 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatttctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggt 28137434  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaacatttcttggt 399  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  28137433 caagttggaccgaattgtgtgaacatttcttggt 28137400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 9183255 - 9183032
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9183255 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 9183157  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  9183156 gtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagattatgt 9183057  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  9183056 caagttggaccgaactgggtcaaca 9183032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 266 - 534
Target Start/End: Original strand, 26800630 - 26800898
Alignment:
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccattt-gtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26800630 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactaattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 26800728  T
Q  365 tcaa-gttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgcta 463  Q
    |||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||   || ||||||||||||||||    
T  26800729 tcattgttggaccgaactggatgaacatttcttggtgttgttatcttttctctactctttttatcttgttta-tcttttggttagattgtggttttgcta 26800827  T
Q  464 tgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgcttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    |||||||| ||| |||||||  |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26800828 tgcacttgttttctagactagatctagattgttgttattgcttgtggtaatttacatttggttattggttg 26800898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 2171754 - 2171532
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2171754 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggttgttcttt 2171657  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2171656 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccc-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggt 2171558  T
Q  366 caag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||    
T  2171557 caagtttggaccgaactgggtgaaca 2171532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 5406422 - 5406200
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5406422 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggttgttcttt 5406326  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5406325 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 5406226  T
Q  366 caag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||    
T  5406225 caagtttgaaccgaactgggtgaaca 5406200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 5410747 - 5410525
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5410747 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggttgttcttt 5410651  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5410650 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 5410551  T
Q  366 caag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||    
T  5410550 caagtttgaaccgaactgggtgaaca 5410525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 26954509 - 26954287
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  26954509 gttgggaaaca-ttgtaaacacctttggggagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatatgtgagattgggaaa-ttggtataaattagggttgttcttt 26954412  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  26954411 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatctgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggt 26954312  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||    
T  26954311 caagttggaccgaactaggtcaaca 26954287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 33211409 - 33211186
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||  | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33211409 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtcactgaaaatcattgagtgttttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattatggttgttcttt 33211311  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  33211310 gtgagcttgatgaagttaatttcttgtagctcatttgtatctctttgtaagaactcatttataatggattggagagatcaatctctcccccagagtaggt 33211211  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  33211210 caagttggaccgaactgggtcaaca 33211186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 167 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 5413616 - 5413401
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5413616 gttgggaaaca-ttgtaaacacattggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaa-ggtagaaattagggttgttcttt 5413520  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    | || |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5413519 gcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 5413420  T
Q  366 caag-ttggaccaaactgg 383  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  5413419 caagtttggaccgaactgg 5413401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 167 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 3039127 - 3038926
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3039127 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcatt 3039029  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||    
T  3039028 gtgagctttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttaatagtggattggagagattaatctctcccccagattaggt 3038929  T
Q  366 caa 368  Q
    |||    
T  3038928 caa 3038926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 31404887 - 31404675
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  31404887 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatcagtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 31404790  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggac 375  Q
     |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31404789 aaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggccaagtttggac 31404690  T
Q  376 caaactgggtgaaca 390  Q
    | |||||||||||||    
T  31404689 cgaactgggtgaaca 31404675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 196 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 30834733 - 30834538
Alignment:
Q  196 gagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattgg-tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgta 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  30834733 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgta 30834634  T
Q  294 acccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaa 388  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  30834633 acccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 30834538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16452543 - 16452329
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattgg-tagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 275  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16452543 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 16452445  T
Q  276 tgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgga 374  Q
      |||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16452444 caaagctaatttcttgtaaccctttcatatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 16452345  T
Q  375 ccaaactgggtgaaca 390  Q
    || |||||||||||||    
T  16452344 ccgaactgggtgaaca 16452329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 33160577 - 33160352
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaa-tcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatt-ggtagaaattagggttgttct 263  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||    
T  33160577 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagagttgttct 33160480  T
Q  264 ttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtag 363  Q
    |||||| |||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  33160479 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatggtggattggagagatcaatctctcctccagagtat 33160380  T
Q  364 gtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||    
T  33160379 ttcaagtttggaccaaactgggtgaaca 33160352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 120 - 474
Target Start/End: Original strand, 25073463 - 25073826
Alignment:
Q  120 gaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgt-aaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtct 216  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||| |||| |||| |||    
T  25073463 gaaattaaaggctaagggttgattctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgggaaacatcttgggtgagtgaaa-tcattgagtatct 25073561  T
Q  217 tgttcattggtg-agattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-a 314  Q
    ||||||| || | ||||||  ||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  25073562 tgttcatgggaggagattgaaaaaat-ggtagaaattagatttattcttcgtgagcttgttaaagctattttattgtaacccttttgtatctctatgtaa 25073660  T
Q  315 agaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtg------ttgttat 407  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| | || | ||||| |  ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||      ||||| |    
T  25073661 agaactcattgatagtggattagagaaatcaatctctcattcaaattaggttattgttagactaaactaggtaaacatttcttggtgtgttgtttgttct 25073760  T
Q  408 cttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtt 474  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||||| || |||||||||    
T  25073761 cttttctctgctctctttatcttgtttattctttggttt-gatattggttttgcaatacacttggtt 25073826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 165 - 365
Target Start/End: Original strand, 4045364 - 4045566
Alignment:
Q  165 gagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttc 262  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4045364 gagttgggaaacatttgtaaacacctagggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtttattggagagattgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttc 4045462  T
Q  263 tttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagt 361  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||| |||    
T  4045463 tttatgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcattttatatctctttgtaaataactcattgatagtggattggagagatcaatttctaccccaaagt 4045562  T
Q  362 aggt 365  Q
    ||||    
T  4045563 aggt 4045566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 3072928 - 3072759
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||| ||||||| | ||| |||||||||| |||||||||    
T  3072928 ttggtgagattgggaaaat-ggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaact 3072830  T
Q  321 cattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  3072829 cattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 3072759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 412101 - 412270
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||| |  || ||||||| ||||||| | ||| |||||||||| |||||||||    
T  412101 ttggtgagattgggaaaaa-ggtagaaattagggttgttcattgtgaacttatcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaact 412199  T
Q  321 cattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  412200 cattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 412270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 227 - 390
Target Start/End: Original strand, 16569037 - 16569189
Alignment:
Q  227 tgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattg 325  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||            |||||||||||||||||    
T  16569037 tgagattgagaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacc------------tttgtaagaactcattg 16569124  T
Q  326 atagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16569125 atagtggattggagagatcaatctctcctccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 16569189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 6097608 - 6097451
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactca 322  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||| |||||||         ||| ||||||||||||||    
T  6097608 ttggtgagattggaaaaat-ggtagaaattaggattgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaac---------tct-tttgtaagaactca 6097520  T
Q  323 ttgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6097519 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 6097451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 293 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 5409167 - 5409076
Alignment:
Q  293 aacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgg 383  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5409167 aacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 5409076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 135
Target Start/End: Original strand, 17757865 - 17757995
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttgggga--agattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaa 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17757865 aaagggttggtgcattttgggggttagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaacaaaaa 17757964  T
Q  105 taaaagatccttagtgaaatcaaaggctaag 135  Q
     | |||||| | |||||||||||||||||||    
T  17757965 gagaagatcatcagtgaaatcaaaggctaag 17757995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 27647861 - 27648028
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  27647861 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 27647957  T
Q  321 cattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    | ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27647958 ctttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactgggtgaaca 27648028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 16554869 - 16555037
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  16554869 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 16554965  T
Q  321 catt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16554966 catttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 16555037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16578686 - 16578518
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  16578686 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 16578590  T
Q  321 catt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16578589 catttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 16578518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 16616694 - 16616862
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  16616694 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 16616790  T
Q  321 catt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16616791 catttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 16616862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 16631425 - 16631593
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  16631425 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 16631521  T
Q  321 catt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16631522 catttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 16631593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 16653112 - 16653280
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  16653112 ttggtgagattgggaaaag-ggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 16653208  T
Q  321 catt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16653209 catttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 16653280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 25421305 - 25421474
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 319  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  || ||||| |||| |||| ||||    
T  25421305 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaac 25421401  T
Q  320 tcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25421402 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 25421474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5741120 - 5741001
Alignment:
Q  62 gagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgttctctttt-gggtgttagat 160  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||||    
T  5741120 gagtcttttgtgagcaatttgggtgaatcttgagaaacaaaaagtgaagatccttagt-aaatcaaaggctaagggttggttacttttggggggttagat 5741022  T
Q  161 tctagagttgggaaacaattg 181  Q
    |||| |||||| |||||||||    
T  5741021 tctaaagttggaaaacaattg 5741001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 6027246 - 6027415
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 319  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  || ||||| |||| |||| ||||    
T  6027246 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaac 6027342  T
Q  320 tcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6027343 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 6027415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 88
Target Start/End: Original strand, 26800558 - 26800634
Alignment:
Q  11 ggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgag 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  26800558 ggttggtgccttttggggaagattcat-gggatgggaaacacatgagtggagagtctattgagagcaacttgggtgag 26800634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 300 - 480
Target Start/End: Original strand, 9572667 - 9572849
Alignment:
Q  300 ttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggt-gaacatttctt 396  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||   ||| | | ||||||||  || |||||||    
T  9572667 ttgtaactctttgttaagaacccattgatagtggattgcagagatcaatctctactttagagtaggtcatcattgaaacgaactgggtaaaatatttctt 9572766  T
Q  397 ggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttataga 480  Q
    | |||||||||||||||| |  | |||||||||| | ||||| |||  || ||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  9572767 gatgttgttatcttttctctcgtgtctttatcttatctattctttg-attcgattgtggtatttctatgcacttggtttctaga 9572849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 390
Target Start/End: Original strand, 34167180 - 34167248
Alignment:
Q  323 ttgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  34167180 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 34167248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 387
Target Start/End: Original strand, 13154005 - 13154080
Alignment:
Q  314 aagaactcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 387  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  13154005 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 13154080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 33342183 - 33342108
Alignment:
Q  314 aagaactcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 387  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33342183 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 33342108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 387
Target Start/End: Original strand, 34164948 - 34165023
Alignment:
Q  314 aagaactcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 387  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  34164948 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 34165023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 328
Target Start/End: Original strand, 186726 - 186820
Alignment:
Q  235 ggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgata 328  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| ||| || || || | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  186726 ggaaaaatggtagaaataaggtttgttcttggagagcttgttgaagttaaatttttatagctcttttgtatctctttgtaaagaattcattgata 186820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 287
Target Start/End: Original strand, 16567200 - 16567261
Alignment:
Q  227 tgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaattt 287  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16567200 tgagattgggaaaatggttagaaattaggttttgttttttgtgagcttgtttaagctaattt 16567261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 350
Target Start/End: Original strand, 2908503 - 2908586
Alignment:
Q  268 gagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagtgatcaatctc 350  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  ||| | |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  2908503 gagcttgttgaagataattttttacaactcttttgtatcttattgtaaagaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctc 2908586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 188
Target Start/End: Original strand, 11660507 - 11660571
Alignment:
Q  124 tcaaaggctaagggttgttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaa-ttgtaaacac 188  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11660507 tcaaaggctaagggttggttcattttggg-gttagattctagagttcggaaacaatttgtaaacac 11660571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 311
Target Start/End: Original strand, 31076932 - 31076965
Alignment:
Q  278 aagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31076932 aagctaatttattgtaacccatttgtatcacttt 31076965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5740154 - 5740074
Alignment:
Q  235 ggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaa 315  Q
    ||||||| | |||||| |||| ||| | || | |||||||||||| | |||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  5740154 ggaaaatggatagaaactaggtttgcttttagagagcttgttgaaaccaatttattgtaaaccttttgtatttctttgtaa 5740074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 371; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Original strand, 45726712 - 45727238
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  45726712 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccaaaaga 45726811  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45726812 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagggttaggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 45726911  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  45726912 catgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtat 45727011  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgtt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  45727012 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacattttttagtgttgtt 45727111  T
Q  406 atcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgct 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  45727112 atcttttctttactctctttatct--tttattctttg-gttggattgtggttttgctatgcacttagtttatagactaggtctatattattgttgttgct 45727208  T
Q  506 tgtgg-ttatttatatttggttattggttg 534  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  45727209 tgtggtttatttacatttggttattagttg 45727238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 1632117 - 1631590
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  1632117 aaagggttggtgtcttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 1632018  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  1632017 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgagagagtgaaaat 1631918  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1631917 catgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggattgttctttgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccatttgtat 1631818  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgtt 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  1631817 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgagtgaatatttcttagtgttgtt 1631718  T
Q  406 atcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtc--tatattcttgttattg 503  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||  |||||| |||||||||    
T  1631717 atcttttccttgctctctttatcttgtttattcct---tttggattgtggttttgctatacactt-gattacagactaagtctatatattgttgttattg 1631622  T
Q  504 cttgtgg-ttatttatatttggttattggttg 534  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1631621 cttgtggtttatttatatttggttgttggttg 1631590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 35447269 - 35446785
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  35447269 aaagggttggtgccttttgggaaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtaaaaccaaaaga 35447170  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35447169 gaagatacttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 35447070  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  35447069 catgagtgtcttgttcattggtgagattggtaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgatcttgttgaatctaatttcttgtaacccatttgtat 35446970  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgtt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35446969 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcactctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgtt 35446870  T
Q  406 atcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatat 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  35446869 atcttttctttactctctttatcttgtttatgctttg-gttgaattgtggttttgctatgcactt-gattatagactagatctatat 35446785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 42288494 - 42287968
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  42288494 aaagggttggtgccttttggg-aagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 42288396  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42288395 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttcgggtttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 42288296  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42288295 cacgagtgtcttgtgcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 42288196  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaa-catttcttggtgttgt 404  Q
     ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| |||    
T  42288195 ttctttgtaagagctcattgataatggattggagagatcaatctctcc-ccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaataatttcttggtgctgt 42288097  T
Q  405 tatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgc 504  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||  |||| ||| ||||||||||    
T  42288096 tatcttttctttaccctctttaacttgtttattccttg-gttggattgtggtttttctatgcacttgttttctagattagatctagattgttgttattgc 42287998  T
Q  505 ttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42287997 ttgtggttatttacatttggttattggttg 42287968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Original strand, 17450373 - 17450884
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtag-agtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaat 105  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| | || ||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  17450373 aaagggttggtgccctttgtgaaagattcatggggatgggaaacacatgagcgaaggagtcaattgtgagaaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaag 17450472  T
Q  106 aaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaa 204  Q
    | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  17450473 agaagatcattag-gaaatcaaaggctaagggttgattctctattgggggttggattctagagttggcaaacatttgcaaacaccttgggtgagtgaaaa 17450571  T
Q  205 tcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgt 303  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17450572 tcattgagtgtcttgttcattggtgagatttgaaaaatgggtagagattaggcttgttctttgtgagcttgttgaagctaattt-ttgtaacccatttgt 17450670  T
Q  304 atctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttg 403  Q
                |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||    
T  17450671 ------------gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc-acagagtaggtcaagttggaccgaactaggtgaacaatctttggtgttg 17450757  T
Q  404 ttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattg 503  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||| |||| || || || ||| ||||| |||    
T  17450758 ttatcttttctgtactctctttatcttgttta-tcctttggttagattgtggttttgctatgcacttggtttctagattaggtttagattgttgttgttg 17450856  T
Q  504 cttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    ||||||   ||||| |||||||||| |||||    
T  17450857 cttgtg---atttacatttggttatcggttg 17450884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 516
Target Start/End: Original strand, 33647952 - 33648465
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaat 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| | || ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||  | ||||||| | |||||||||     
T  33647952 aaagggttggtgccttttgaggagagattcacgaggttggaaaacatatgagtagagagtcatttgttagctacttaggcgagtcttataaaaccaaaag 33648051  T
Q  106 aaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaa-cacattgggagagtgaaa 203  Q
    | ||||||||||| ||||||||||   |||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  ||||| ||  ||||||||||||||    
T  33648052 agaagatccttagggaaatcaaagc--aagggttaattatcttttgggggttagattctagagttgggacataaccgtaaaacatcttgggagagtgaaa 33648149  T
Q  204 atcat-gagtgtcttgttcattggtg-agattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatt 300  Q
    || || ||||||||||| |||  | | |||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  33648150 ataattgagtgtcttgtacatgagaggagattgagaaaat-ggtaaaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcctgtaacccttt 33648248  T
Q  301 tgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaa-gttggaccaaactgggtgaacatttcttgg 398  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  33648249 tgtatttctttgtaaagaactcattgatagcggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtaaacatttattgg 33648348  T
Q  399 tgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgt 498  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | ||| ||| ||||    
T  33648349 tgttgttgtcttttctctactctctttatcttgtttattctttagttt-aattgtgattttgctatgcacttggcttatagattaggcctagattgttgt 33648447  T
Q  499 tattgcttgtggttattt 516  Q
    | ||||| || |||||||    
T  33648448 tgttgctcgtagttattt 33648465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 480
Target Start/End: Original strand, 24397840 - 24398318
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaat 105  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||     
T  24397840 aaagggttggtgccttttagggagagactcatcgggctggtaaacacatgagtggagagtcatttgtgaccaatttgggttagtcttgtgaaaccaaaag 24397939  T
Q  106 aaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaaca-cattgggagagtgaaaa 204  Q
    | || ||||||||  || ||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  24397940 agaatatccttag-aaagtcaaa-gctaagggttggt-tc-tttgggggttagattatagagttgggaaacaattgtaaacacctttggaagagtgaaaa 24398035  T
Q  205 tc-atgagtgtcttgttcattggtgagattgggaa-aattggtagaaatt-agggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccattt 301  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  24398036 tcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgtgaagaaagggtagaagttaaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccctttt 24398135  T
Q  302 gtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaac-atttcttgg 398  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||| |||||| ||||| ||| |||||    
T  24398136 gtatctctttgtaaagaactcattgataatggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtcattgttggaccgaactggctgaacaattacttgg 24398235  T
Q  399 tgttgttatc---ttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttataga 480  Q
    ||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| || | |  |  ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24398236 tgttgttatctatttttctctactctctttatcttgtttagtcttgg--tccgattgcggttttgctatgcacttagtttctaga 24398318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 36318223 - 36318010
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36318223 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 36318124  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  36318123 gaaactaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccttagagtaggtcaagttggacc 36318024  T
Q  377 aaactgggtgaaca 390  Q
     |||||||| ||||    
T  36318023 gaactgggtcaaca 36318010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 17057583 - 17057370
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17057583 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgcaagcttgtt 17057484  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17057483 gaagctaattttttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaagttggacc 17057384  T
Q  377 aaactgggtgaaca 390  Q
     |||||||| ||||    
T  17057383 gaactgggtcaaca 17057370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 17085566 - 17085353
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17085566 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgcaagcttgtt 17085467  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17085466 gaagctaattttttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaagttggacc 17085367  T
Q  377 aaactgggtgaaca 390  Q
     |||||||| ||||    
T  17085366 gaactgggtcaaca 17085353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 36773506 - 36773729
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  36773506 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggaataaattagggttgttcttt 36773604  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||    
T  36773605 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgt 36773704  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  36773705 caagttggaccgaactgggtcaaca 36773729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 167 - 385
Target Start/End: Original strand, 29867813 - 29868031
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29867813 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 29867911  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  29867912 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggt 29868011  T
Q  366 caagttggaccaaactgggt 385  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  29868012 caagttggaccgaactgggt 29868031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 723968 - 723745
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  723968 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaactgggtagaaattaggtttgttcttt 723870  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  723869 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 723770  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  723769 caagttggaccgaactgggtcaaca 723745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 38312184 - 38312407
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38312184 gttgggaaaca-ttgtatacaccttgtgtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 38312282  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||    
T  38312283 gtgaacttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgt 38312382  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  38312383 caagttggaccgaactgggtcaaca 38312407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 165 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 33162676 - 33162451
Alignment:
Q  165 gagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttct 263  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33162676 gagttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgattgaaaatcatcgagtgtcttgttcattggtgaaattaggaaaatgggtagaaattagggttgttct 33162578  T
Q  264 ttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtag 363  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||| |||    
T  33162577 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctctgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccctagattag 33162478  T
Q  364 gtcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  33162477 gtcaagttggaccgaactaggtcaaca 33162451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 167 - 376
Target Start/End: Original strand, 42362296 - 42362505
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  42362296 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttcttt 42362394  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||    
T  42362395 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatctatctctcccccagattaggt 42362494  T
Q  366 caagttggacc 376  Q
    |||||||||||    
T  42362495 caagttggacc 42362505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 2334641 - 2334418
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2334641 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaataagggttgttcttt 2334544  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2334543 gtgaacttgttgaagctaatttctagtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 2334444  T
Q  366 caag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||    
T  2334443 caagtttggaccgaactgggggaaca 2334418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 34139995 - 34139771
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34139995 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 34139897  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagg 364  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  34139896 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatatgtatcccttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattagg 34139797  T
Q  365 tcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||    
T  34139796 tcaagttggaccgaactgggtcaaca 34139771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 167 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 14634050 - 14633834
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14634050 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattggtaaaatgggtagaaattaggattgttcttt 14633952  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagg 364  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  14633951 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttttgtaagaactcatagatagtggattggagagatcaatctctcccccagattagg 14633852  T
Q  365 tcaagttggaccaaactg 382  Q
    |||||||||||| |||||    
T  14633851 tcaagttggaccgaactg 14633834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 11151815 - 11151592
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  11151815 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtctcttgttcattggtgaaattgggaaaatgggtagaaattagatttgttcttt 11151717  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||    
T  11151716 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcactttgtaagaactcttagatagtggattggagagatcaacctctcccccagattaggt 11151617  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  11151616 caagttggaccgaactgggtcaaca 11151592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 167 - 383
Target Start/End: Original strand, 11690445 - 11690661
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11690445 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttcttt 11690543  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | || ||    
T  11690544 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaaatcgttgatagtggattggagagatcaacctctcccccatattacgt 11690643  T
Q  366 caagttggaccaaactgg 383  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  11690644 caagttggaccgaactgg 11690661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 177 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 6595221 - 6595006
Alignment:
Q  177 aattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-tggtagaaattagggttgttctttgtgagcttg 274  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6595221 aattgtaaacactttgg-agagtgagaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattaggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 6595123  T
Q  275 ttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgg 373  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6595122 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgaatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgg 6595023  T
Q  374 accaaactgggtgaaca 390  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  6595022 accgaactgagtgaaca 6595006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 36988299 - 36988076
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  36988299 gttgggaaaca-tagtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgggattggaaaaaagggtagaaattagggttgttctat 36988202  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||||||  || ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36988201 gtgagcttgtcaaaactaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 36988102  T
Q  366 caag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||    
T  36988101 caagtttggaccgaactgggtgaaca 36988076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 11067249 - 11067472
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  11067249 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgaaattggaaaaatgggtagaaattagtgttgtacttt 11067347  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||    
T  11067348 gtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcatttataatggattgaagagatcaatctctcccccagattaggt 11067447  T
Q  366 caagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||    
T  11067448 caagttggaccgaactcggtcaaca 11067472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 4503356 - 4503133
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-tggtagaaattagggttgttctt 264  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4503356 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggagagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctt 4503259  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagg 364  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4503258 tgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtagg 4503160  T
Q  365 tcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  4503159 tcaagtttggaccgaactgggtgaaca 4503133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 45099699 - 45099922
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattgg-tagaaattagggttgttctt 264  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  45099699 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctt 45099796  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagg 364  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  45099797 tgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtagg 45099895  T
Q  365 tcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  45099896 tcaagtttggaccgaactgggtgaaca 45099922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 5723478 - 5723256
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  5723478 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaag-ggtagaaattaggcttgttcttt 5723382  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| |||||  |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  5723381 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacctttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggt 5723282  T
Q  366 caag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||    
T  5723281 taagtttggaccgaactgggtgaaca 5723256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 36205887 - 36205665
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36205887 gttgggaaaca-tggtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggttgttcttt 36205790  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  36205789 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aagaactcattgacagcggattggagagttcaatctatcctccagagtaggt 36205691  T
Q  366 caag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||    
T  36205690 caagtttggaccgaactgggtgaaca 36205665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 167 - 375
Target Start/End: Original strand, 13121712 - 13121919
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctt 264  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13121712 gttgggaaacatttgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagactgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttctt 13121810  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagg 364  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| | || |    
T  13121811 tgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacc--tttgtatctctttgtagaaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctctcctccaaactatg 13121908  T
Q  365 tcaagttggac 375  Q
    | |||||||||    
T  13121909 ttaagttggac 13121919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 271 - 515
Target Start/End: Original strand, 7451166 - 7451410
Alignment:
Q  271 cttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagt 370  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  7451166 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcctctacagtaggtcaagt 7451265  T
Q  371 tggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgt-tatcttttcttta--ctctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgca 467  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| ||||||    
T  7451266 tgga-cgaactgggtgaacatttattggtgttgtctat-ttttctctactctctctttatcttgtttattctttg-gttcgattgtggttttgttatgca 7451362  T
Q  468 cttggtttatagactatgtctatattcttgttattgcttgtggttatt 515  Q
    |||| ||| |||| ||  |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7451363 cttgttttctagattagatctagattgttgttattgcttgtggttatt 7451410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 4484554 - 4484330
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggga-aaattggtagaaattagggttgttctt 264  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  4484554 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgaaattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctt 4484458  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtag 363  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4484457 tgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtag 4484358  T
Q  364 gtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  4484357 gtcaagtttggacagaactgggtgaaca 4484330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 30833290 - 30833514
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggga-aaattggtagaaattagggttgttctt 264  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  30833290 gttgggaaaca-ttgtaaacactttggt-gagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctt 30833386  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtag 363  Q
    ||||| |||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  30833387 tgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtag 30833486  T
Q  364 gtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  30833487 gtcaagtttggactgaactgggtgaaca 30833514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 165 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 17490368 - 17490143
Alignment:
Q  165 gagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttct 263  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||| |||| | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||    || ||||    
T  17490368 gagttggaaaaca-ttgcaaacacagtgggtgggtgaaaatcattgaatgtcttgttcattgttgagattggaaaa--tggtagaaatt----ttattct 17490276  T
Q  264 ttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtag 363  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||    
T  17490275 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtaactctttgtaagaactcattgatagtggattgtagagatcaatctctcccctagagtag 17490176  T
Q  364 gtcaagttggaccaaactgggtgaacatttctt 396  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17490175 gtcaatttggaccgaactgggtaaacatttctt 17490143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 167 - 401
Target Start/End: Original strand, 11049493 - 11049732
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttct- 263  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||     
T  11049493 gttgggaaacatttgtaaacaccttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttgttttttggtgagattaggaaaat-ggtataaattagggtttgttcta 11049591  T
Q  264 --ttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccattt-gtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagag 360  Q
      |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || |     
T  11049592 atttgtgagcttgttgaagctaatttcttataacccttttagtatctctttgtaagaactcattgatagtagattgaaaagatcaatctctccttcataa 11049691  T
Q  361 taggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    |||||||| ||||||  |||||||| |||||||||| ||||    
T  11049692 taggtcaaattggactgaactgggtaaacatttctttgtgt 11049732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 167 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 7815498 - 7815264
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctt 264  Q
    |||| |||||| |||||||||| || || | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||||||    
T  7815498 gttgagaaacatttgtaaacaccttaggtgggtgaaaatcattgcgtgtcttgttcattggtgagattgagaaaaa-ggttgaaattagggtttgttctt 7815400  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagg 364  Q
    |   ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||      
T  7815399 tagaagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagattaatctctcc-acatagtata 7815301  T
Q  365 tcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
    |||| ||||||  |||||||| || ||||||||||||    
T  7815300 tcaaattggactgaactgggtaaatatttcttggtgt 7815264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 167 - 325
Target Start/End: Original strand, 24885605 - 24885763
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  24885605 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtaaaattgggaaaatgagtagaaattaggtttgttcttt 24885703  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattg 325  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  24885704 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtacccctctgtaagaactcattg 24885763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 32289565 - 32289732
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactc 321  Q
    ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  32289565 ttggtgagattggaaaag--ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactc 32289662  T
Q  322 attgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32289663 attgatagtaaattagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 32289732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 217 - 393
Target Start/End: Original strand, 26353178 - 26353354
Alignment:
Q  217 tgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaa 315  Q
    ||||| ||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||    
T  26353178 tgttctttggtgagattgaaaaaagtg-tagaaattaaggtttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtatctttttgtaa 26353276  T
Q  316 gaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacattt 393  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  26353277 gtactcattgatagtggattggagagatcactctctcccttagagtaggtcaagttggaccgaaccgggtaaacattt 26353354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 30218410 - 30217956
Alignment:
Q  16 gtgccttttgggga-agattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaagatcc 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |  |  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||     |||||    
T  30218410 gtgccttttggggagagattcatggggttgggaaacacaccaaaggagaatcttt-gtgagcaacttgagtgagtcttgcgaaaccaaaagggg-gatcc 30218313  T
Q  115 ttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagt 212  Q
    |||| ||||||||| |||||   ||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||          | |||  |||||| ||||||| ||||    
T  30218312 ttag-gaaatcaaaagctaaatattggttctcttttgggggttaggctctagagttgggaaaca----------ccttgacagagtggaaatcattgagt 30218224  T
Q  213 gtcttgttcattggtg-agattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt 311  Q
    ||||||||||| |  | |||||| |||| | ||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  30218223 gtcttgttcatggaaggagattgagaaa-tgggtagaagttaggtttgttcttggagagcttattgaagctaatttcttgtaaccattttgtatctcttt 30218125  T
Q  312 gt-aagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatct 409  Q
    || || || ||||||||||||| ||| |  |||||||| |||| |||||||| ||||  |||||||  |||| ||| ||||||| ||||||| | | | |    
T  30218124 gtaaataattcattgatagtgggttgaaaagatcaatcactcccccagagtaagtcattgttggactgaactcggtaaacattttttggtgtagctct-t 30218026  T
Q  410 tttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttataga 480  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| || | | |||||||||| ||||    
T  30218025 tttctctactctctttatcttgtttattctttggttt-gattgtggttgtgttttacacttggtttctaga 30217956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 167 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 14202631 - 14202450
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat---gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttct 263  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||   | ||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  14202631 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtgtctttttcatttctgagattgggaaaatgggtagaaattatgtttgttct 14202533  T
Q  264 ttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcc 353  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||        ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14202532 ttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcat-------cctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcc 14202450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 6266691 - 6266859
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  6266691 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 6266788  T
Q  321 cattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6266789 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 6266859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 267
Target Start/End: Original strand, 39284829 - 39284929
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  39284829 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtatcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgctcttt 39284927  T
Q  266 gt 267  Q
    ||    
T  39284928 gt 39284929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 167 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12123809 - 12123644
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  12123809 gttgggaaacatttataaacaccttggatgagtgaaaatcatcgagtgtcttgttcatttgagagattgg-aaaatgagtataaattagagttgttcttt 12123711  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 331  Q
     |||  ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  12123710 atgattttgttgaagcttatttcttgtaactcttttgtatcattttgtaaagaactcaatgatagtg 12123644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 223 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 13656200 - 13656035
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 320  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  || ||||| |||| |||||||||    
T  13656200 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaact 13656104  T
Q  321 catt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 387  Q
    |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  13656103 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 13656035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 317 - 390
Target Start/End: Original strand, 39284930 - 39285003
Alignment:
Q  317 aactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  39284930 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 39285003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 244 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 42261633 - 42261402
Alignment:
Q  244 gtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtga 342  Q
    |||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |  |||| ||    
T  42261633 gtagaaattaagtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatatctttgtaaagtactcattgatagtgaagcggagaga 42261534  T
Q  343 tca--atctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaac-atttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattc 438  Q
    |||   ||||||| ||| ||||||| |  |||| ||  |||||||| ||| |||  ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  42261533 tcattctctctcccccatagtaggttagtgttgaactgaactgggtaaacaattatttgatgttgttct-ttttctttactctctttatcttgattatt- 42261436  T
Q  439 cttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtt 474  Q
     ||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  42261435 -ttggttt-gtttgtggttttgctatacacttggtt 42261402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 12647555 - 12647386
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 319  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  || ||||| |||| |||| ||||    
T  12647555 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaac 12647459  T
Q  320 tcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  12647458 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 12647386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 228 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 34811385 - 34811281
Alignment:
Q  228 gagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaag-aactcattga 326  Q
    |||||| | |||| |||||||||||| | ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  34811385 gagatttgaaaaaatggtagaaattaagattgctcttagagagcttgttgaagctaatttattgtaactcttttatatctctttgtaagaaactcattga 34811286  T
Q  327 tagtg 331  Q
    |||||    
T  34811285 tagtg 34811281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 94
Target Start/End: Original strand, 7451083 - 7451170
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgt 94  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  7451083 aaagggttgatgacttttggagaagatttatggggttggaaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgagtaagacttgt 7451170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 269 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 42019995 - 42019859
Alignment:
Q  269 agcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt---aagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  42019995 agcttgtagaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaaaaaaactcattgatagtgaatttgagagatcaatctcttccccatagtaggt 42019896  T
Q  366 ca-agttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
     |  ||||||||||| ||| | |||| ||||||||||    
T  42019895 tattgttggaccaaattggataaacacttcttggtgt 42019859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 367
Target Start/End: Original strand, 28671989 - 28672075
Alignment:
Q  282 taatttattgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtca 367  Q
    |||||| |||| |||  |||||||||||||  || ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28671989 taatttcttgttaccgttttgtatctctttacaaagaactcactgacagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 28672075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 243 - 311
Target Start/End: Original strand, 41446159 - 41446227
Alignment:
Q  243 ggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt 311  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||    
T  41446159 ggtagaaattatgtttgttctttgagagcttgttgaagctaattttaagtaacccttttgtatctcttt 41446227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 331
Target Start/End: Original strand, 41454247 - 41454343
Alignment:
Q  236 gaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 331  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  41454247 gaaaaatggtagaaattagatttgttttttgagagcttgttgaagctaatttctagcaactcttttgtatatatttgtaaagaactcattgatagtg 41454343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 171
Target Start/End: Original strand, 43730991 - 43731093
Alignment:
Q  67 ttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaataaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgttctcttttgggtgttagattctaga 166  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| || |||| ||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||    
T  43730991 ttttgtgagcaatttgggtgaatcttgggaaaccaaaatagaatatccgtag-gaaatcaaagtctaaaggttggtttcttttggg-gttaaattctaga 43731088  T
Q  167 gttgg 171  Q
    |||||    
T  43731089 gttgg 43731093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5700347 - 5700272
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat 241  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5700347 gttgagaaacatttgtaaacactttgggtgaatgaaaaacattgagtgtcttgttcattggagagattgagaaaat 5700272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 368
Target Start/End: Original strand, 42412117 - 42412162
Alignment:
Q  322 attgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaa 368  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42412117 attgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccagagtaggtcaa 42412162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7597158 - 7597036
Alignment:
Q  245 tagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagtga 342  Q
    ||||||||||| || |||| || ||| ||||| ||| ||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||  |||| ||    
T  7597158 tagaaattaggttttgttccttatgaacttgtcgaaactaatttcttgtaagtcttttgtatctttttgtaaagaactcattgattgtagaacggagaga 7597059  T
Q  343 tcaatctctcctccagagtaggtca 367  Q
    ||  |||||||| ||||||||||||    
T  7597058 tc--tctctccttcagagtaggtca 7597036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 181
Target Start/End: Original strand, 16676138 - 16676182
Alignment:
Q  136 ggttgttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattg 181  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16676138 ggttgttttcttttggg-gttagattctagagtttggaaacaattg 16676182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 347 - 402
Target Start/End: Original strand, 2838079 - 2838135
Alignment:
Q  347 tctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaac-atttcttggtgtt 402  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  2838079 tctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatttcttggtgtt 2838135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 370; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 512
Target Start/End: Original strand, 7111 - 7617
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  7111 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 7210  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7211 gaagatccttagtaaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagctgg-aaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat 7309  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7310 catgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 7409  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgtt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7410 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggaaagatcaatctctcctctagagtaggttaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgtt 7509  T
Q  406 atcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtc--tatattcttgttattg 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||| |||    
T  7510 atcttttctttactctctttatcttgttta-tcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatatattattgttgttg 7608  T
Q  504 cttgtggtt 512  Q
    |||||||||    
T  7609 cttgtggtt 7617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 18386 - 17860
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttgggg-aagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaat 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  18386 aaagggttggtgccttttgggggaagattcatgaggttg-aaaacacatgagtggagagttatttgtgagcaacttgagtgagtcttgtaaaaccaaaag 18288  T
Q  106 aaaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaa 204  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18287 agaagatccttagtgaaatcaaagactaagagttggttctcttttggg-gttagattatagagttgg-aaacaattgtaaacactttgggagagtgaaaa 18190  T
Q  205 tcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgta 304  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18189 tcatgagtgttttgttcattggtgagagtgggaaaattggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgta 18090  T
Q  305 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttg 403  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18089 tctctttgtaa-aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagggtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacatttcttggtgttg 17991  T
Q  404 ttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattg 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||  |||| ||| |||||||||    
T  17990 ttatcttttctttactctctttatcttgtttattcctttggttagattgtggttttgctatgcatttgttttctagattagatctagattgttgttattg 17891  T
Q  504 cttgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17890 cttgtggttatttacatttgattattggttg 17860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 11341 - 11725
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  11341 aaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcatttctgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 11440  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgtt-ctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||    
T  11441 gaagatcattagtaaaatcaaaggctaaaggttgtttctctttttggggttagattctagagttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaat 11538  T
Q  206 cat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgta 304  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11539 cattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgta 11638  T
Q  305 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11639 tctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 11725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 80668 - 80338
Alignment:
Q  7 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatggaaaacatatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaata 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |    
T  80668 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagcggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgggaaactaaaaga 80569  T
Q  107 aaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg-ttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaat 205  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  80568 gtagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctattttgggggttagattctagagttaggaaacaattgtgaacaccttgggagagtgaaaat 80469  T
Q  206 catgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtat 305  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  80468 catgagtgtcttgttcattgctgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtat 80369  T
Q  306 ctctttgtaagaactcattgatagtggattg 336  Q
    || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  80368 ctttttgtaagaactcatagatagtgaattg 80338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 208 - 534
Target Start/End: Original strand, 10475 - 10800
Alignment:
Q  208 tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatc 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  10475 tgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaaaaagatataaattagggtttgttctttgtgagctc-ttgt-gctaatttattgtaaccattttgtatc 10572  T
Q  307 tctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgtta 406  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10573 tctttgtaagaactcgttgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtaaacatttcttggtgttgtta 10672  T
Q  407 tcttttctttactctc-tttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattcttgttattgct 505  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||  || |||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||  |||| ||| ||||| |||||    
T  10673 tctttcctctactctcttttatcttgtttattctttg-attagattgtagttttactatacacttgatttctagattaaatctagattgttgttgttgct 10771  T
Q  506 tgtggttatttatatttggttattggttg 534  Q
    |||||||||||   ||||||||| |||||    
T  10772 tgtggttattttcttttggttatcggttg 10800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 138; Significance: 7e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 149311 - 149098
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  149311 attgtaaacaccttggggtagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaacggatagaaattagggttgttttttgtaagcttgtt 149212  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  149211 gaagctaatttcttgttacccatttatatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaagttggacc 149112  T
Q  377 aaactgggtgaaca 390  Q
     |||||||| ||||    
T  149111 gaactgggtcaaca 149098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 196 - 390
Target Start/End: Original strand, 434504 - 434701
Alignment:
Q  196 gagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggg-aaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgta 293  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  434504 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgta 434603  T
Q  294 acccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  434604 acccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 434701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 244 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 490468 - 490237
Alignment:
Q  244 gtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtga 342  Q
    |||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |  |||| ||    
T  490468 gtagaaattaagtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatatctttgtaaagtactcattgatagtgaagcggagaga 490369  T
Q  343 tca--atctctcctccagagtaggtca-agttggaccaaactgggtgaac-atttcttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattc 438  Q
    |||   ||||||| ||| ||||||| |  |||| ||  |||||||| ||| |||  ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  490368 tcattctctctcccccatagtaggttagtgttgaactgaactgggtaaacaattatttgatgttgttct-ttttctttactctctttatcttgattatt- 490271  T
Q  439 cttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtt 474  Q
     ||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  490270 -ttggttt-gtttgtggttttgctatacacttggtt 490237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 178 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 20629 - 20405
Alignment:
Q  178 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 276  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  20629 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtttattattcattggtgagattgggaaaatgagcagaaattaggtttgttttttgtgaacttgtt 20530  T
Q  277 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20529 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatattggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggacc 20430  T
Q  377 aaactgggtgaacatttcttggtgt 401  Q
     |||||||| |||| || |||||||    
T  20429 gaactgggtcaacaatttttggtgt 20405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 167 - 371
Target Start/End: Original strand, 114547 - 114750
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 265  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  114547 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattaaggttgttcttt 114644  T
Q  266 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggt 365  Q
    |||| |||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  114645 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacgcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 114744  T
Q  366 caagtt 371  Q
     |||||    
T  114745 taagtt 114750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 861 - 1083
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattgg-tagaaattagggttgttctt 264  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  861 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctt 957  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagg 364  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  958 tgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-aacaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtagg 1056  T
Q  365 tcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  1057 tcaagtttggaccgaactgggtgaaca 1083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 11385 - 11161
Alignment:
Q  167 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggga-aaattggtagaaattagggttgttctt 264  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  11385 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctt 11289  T
Q  265 tgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtag 363  Q
    ||||| |||||  || ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  11288 tgtgaacttgtaaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcgttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtag 11189  T
Q  364 gtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11188 gtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 11161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 208 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 8919 - 8735
Alignment:
Q  208 tgagtgtcttgttcattggtgagattggga-aaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatc 306  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8919 tgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttataaaatctaatttcttgtaacccttttgtatc 8821  T
Q  307 tcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8820 tcttttgtaagaactcgttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 8735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 268 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27566 - 27466
Alignment:
Q  268 gagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtc 366  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27566 gagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaaataacttattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtc 27467  T
Q  367 a 367  Q
    |    
T  27466 a 27466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 140 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 1648 - 1307
Alignment:
Q  140 gttctcttttgggtgttagattctagagttgggaaacaatt-gtaaacacattgggagagt-gaaaatcat-gagtgtcttgttcattggt-gagattgg 235  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| | | |||| || ||||  ||||||||| ||  |||||||     
T  1648 gttctcttttggg-gttagattctagagttgggaaacaattagaaaacaccttgggagacttgtaaataattgagttacttgttcatgggaagagattgt 1550  T
Q  236 gaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggat 334  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||||| ||||| | |||| ||| ||||| ||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  |     
T  1549 gaaa-ttggtaaaaattaggtttgttctgggtgagcttggtgaagttgattttttgcaacccttttgtttctctgcataaagaactcattaatagtcaag 1451  T
Q  335 tggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaa-gttggaccaaactgggtgaacatttcttgg-tgttgttatcttttctttactctctttatcttgt 432  Q
     |||| ||||  ||||||| | |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||| ||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||| |    
T  1450 aggagagatc--tctctcc-caagagtaggtcattgttggaccaaattgggtaaacaattctttgatgtttttctcttctctttactctctttatcttat 1354  T
Q  433 ttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttataga 480  Q
    |||||  ||| ||| |||||||||||| || | |||||||||| ||||    
T  1353 ttattttttggttt-gattgtggttttactttacacttggtttctaga 1307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 331
Target Start/End: Original strand, 24986 - 25162
Alignment:
Q  157 agattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcat-tggtgagattgggaaaattggtagaaattag 254  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| | ||| |||  ||   ||||| || ||| ||||||||| |||    
T  24986 agattcttgggtttggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaa-tcattgagtctgttgatcacatgacaagattcgggaaaatggtagaaactag 25084  T
Q  255 ggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 331  Q
      |||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25085 ttttgttctttgagagtttgttgaaggtaatttcttgtaacctttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtg 25162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 2773 - 2604
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 319  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  || ||||| |||| |||| ||||    
T  2773 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaac 2677  T
Q  320 tcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 390  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2676 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 2604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 314 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 3804 - 3729
Alignment:
Q  314 aagaactcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 387  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3804 aagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 3729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 387
Target Start/End: Original strand, 6272 - 6438
Alignment:
Q  223 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 319  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| |||||| || || ||||| |||| |||| ||||    
T  6272 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaagccctt-gtatcccttttgtaaagaac 6368  T
Q  320 tcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 387  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  6369 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggttaagtttggaccgaactgggtga 6438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University