View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5213_low_27 (Length: 322)

Name: NF5213_low_27
Description: NF5213
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5213_low_27
NF5213_low_27
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (12-316)||(35178422-35178726)
chr8 (12-257)||(10406452-10406697)
chr8 (146-308)||(5965172-5965335)
chr8 (144-316)||(32898193-32898366)
chr8 (142-314)||(28619279-28619451)
chr8 (144-316)||(5737063-5737236)
chr8 (151-316)||(35177596-35177761)
chr8 (144-315)||(10407332-10407504)
chr8 (144-316)||(1952733-1952891)
chr8 (142-311)||(32564227-32564405)
chr8 (159-263)||(32563828-32563933)
chr8 (261-315)||(10406409-10406463)
chr8 (158-231)||(41122527-41122601)
chr8 (200-309)||(5737818-5737917)
chr8 (266-322)||(45476414-45476470)
chr8 (12-63)||(1952048-1952099)
chr8 (144-191)||(28526295-28526342)
chr8 (261-312)||(30134792-30134843)
chr8 (269-316)||(41122616-41122663)
chr8 (277-314)||(41121329-41121366)
chr8 (144-191)||(28006324-28006371)
chr8 (144-191)||(28063627-28063674)
chr8 (144-199)||(30134855-30134910)
chr8 (197-259)||(41121361-41121423)
chr8 (144-197)||(36033032-36033085)
chr8 (199-239)||(39138453-39138494)
chr8 (199-270)||(33315098-33315170)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (6-322)||(14890773-14891074)
chr5 (12-316)||(28590730-28591034)
chr5 (12-316)||(40611462-40611766)
chr5 (12-319)||(544847-545153)
chr5 (12-315)||(25590633-25590936)
chr5 (12-314)||(32640492-32640794)
chr5 (12-316)||(8075452-8075754)
chr5 (62-316)||(2466440-2466694)
chr5 (12-314)||(4593723-4594020)
chr5 (144-316)||(40612407-40612580)
chr5 (144-316)||(2464871-2465044)
chr5 (144-316)||(8074652-8074825)
chr5 (144-316)||(14889971-14890144)
chr5 (144-316)||(4593062-4593229)
chr5 (144-316)||(28589901-28590077)
chr5 (144-316)||(9537244-9537410)
chr5 (153-314)||(545801-545955)
chr5 (179-288)||(9537838-9537948)
chr5 (152-316)||(18004860-18005025)
chr5 (12-70)||(2465696-2465754)
chr5 (260-315)||(34173483-34173538)
chr5 (151-248)||(32641498-32641596)
chr5 (152-263)||(27720714-27720827)
chr5 (197-319)||(32555323-32555451)
chr5 (187-263)||(21069540-21069617)
chr5 (268-316)||(2314387-2314435)
chr5 (260-307)||(578051-578098)
chr5 (154-197)||(23773301-23773344)
chr5 (217-272)||(30970289-30970344)
chr5 (146-195)||(19186055-19186104)
chr5 (267-312)||(32641599-32641644)
chr5 (145-197)||(23773180-23773232)
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (12-312)||(35727904-35728204)
chr7 (12-316)||(42477582-42477886)
chr7 (12-316)||(7258477-7258780)
chr7 (12-316)||(44333339-44333643)
chr7 (14-316)||(48788295-48788593)
chr7 (12-314)||(48646252-48646555)
chr7 (12-316)||(45583796-45584093)
chr7 (12-147)||(10895277-10895412)
chr7 (150-314)||(10898828-10898992)
chr7 (155-316)||(45584256-45584417)
chr7 (144-316)||(48647191-48647364)
chr7 (155-316)||(12221503-12221666)
chr7 (142-314)||(30924763-30924928)
chr7 (154-312)||(7509210-7509369)
chr7 (145-312)||(39708335-39708495)
chr7 (144-316)||(7259441-7259606)
chr7 (144-314)||(12223436-12223598)
chr7 (158-322)||(6680283-6680440)
chr7 (144-319)||(19433666-19433839)
chr7 (144-316)||(35728843-35729007)
chr7 (144-257)||(32794543-32794657)
chr7 (144-322)||(10894539-10894718)
chr7 (169-311)||(43457674-43457819)
chr7 (151-263)||(33607272-33607385)
chr7 (144-263)||(32793423-32793543)
chr7 (159-266)||(44529540-44529648)
chr7 (151-314)||(44334214-44334369)
chr7 (148-272)||(34707858-34707984)
chr7 (241-318)||(48777457-48777534)
chr7 (199-316)||(43461526-43461638)
chr7 (200-267)||(34710196-34710263)
chr7 (198-309)||(5929920-5930023)
chr7 (269-314)||(46286727-46286772)
chr7 (226-322)||(46287219-46287312)
chr7 (192-273)||(8047072-8047154)
chr7 (236-314)||(42478111-42478189)
chr7 (222-282)||(48249823-48249883)
chr7 (199-265)||(33061081-33061148)
chr7 (199-306)||(39824358-39824471)
chr7 (152-191)||(48787611-48787650)
chr7 (144-197)||(25621462-25621515)
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (12-322)||(36279934-36280244)
chr3 (12-316)||(55389087-55389390)
chr3 (12-314)||(48809274-48809574)
chr3 (12-316)||(17700721-17701025)
chr3 (12-316)||(53958719-53959021)
chr3 (12-314)||(48573189-48573494)
chr3 (13-282)||(52317150-52317418)
chr3 (144-314)||(48574207-48574378)
chr3 (144-316)||(55388261-55388436)
chr3 (144-316)||(17701676-17701850)
chr3 (146-272)||(36279190-36279317)
chr3 (144-314)||(52318073-52318236)
chr3 (203-316)||(2591827-2591941)
chr3 (169-316)||(36827235-36827376)
chr3 (145-316)||(48808574-48808736)
chr3 (261-314)||(53957877-53957930)
chr3 (257-316)||(33837365-33837424)
chr3 (248-314)||(19115020-19115086)
chr3 (199-272)||(40206163-40206237)
chr3 (269-314)||(45600833-45600878)
chr3 (268-322)||(47117945-47117999)
chr3 (269-322)||(45599080-45599133)
chr3 (269-322)||(47075245-47075298)
[»] chr2 (38 HSPs)
chr2 (12-312)||(2911105-2911404)
chr2 (12-314)||(31091144-31091446)
chr2 (12-316)||(24459071-24459375)
chr2 (12-314)||(39015209-39015511)
chr2 (12-279)||(32765898-32766164)
chr2 (12-314)||(39999951-40000254)
chr2 (144-316)||(32765139-32765312)
chr2 (144-314)||(2910304-2910475)
chr2 (38-117)||(14705018-14705097)
chr2 (144-316)||(31090359-31090532)
chr2 (151-309)||(24458269-24458428)
chr2 (144-316)||(39016142-39016304)
chr2 (152-314)||(14704209-14704363)
chr2 (200-316)||(7073852-7073969)
chr2 (146-259)||(38984742-38984857)
chr2 (218-316)||(17330042-17330140)
chr2 (241-322)||(5914858-5914939)
chr2 (269-316)||(43380789-43380836)
chr2 (144-257)||(39256762-39256876)
chr2 (261-316)||(33163304-33163359)
chr2 (217-307)||(8420747-8420842)
chr2 (254-319)||(31443084-31443149)
chr2 (205-263)||(33162020-33162078)
chr2 (267-317)||(39256871-39256921)
chr2 (142-191)||(18675452-18675501)
chr2 (266-307)||(28864662-28864703)
chr2 (182-265)||(7412532-7412616)
chr2 (254-314)||(12010263-12010323)
chr2 (271-315)||(21733627-21733671)
chr2 (254-318)||(33439441-33439504)
chr2 (191-257)||(33163248-33163315)
chr2 (197-272)||(39999185-39999259)
chr2 (217-279)||(12004779-12004841)
chr2 (217-275)||(31442614-31442672)
chr2 (236-294)||(31814197-31814255)
chr2 (271-316)||(21732317-21732362)
chr2 (144-197)||(26585401-26585454)
chr2 (144-192)||(38855949-38855997)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (12-316)||(52440177-52440481)
chr1 (12-278)||(7945191-7945457)
chr1 (14-257)||(9340659-9340902)
chr1 (79-314)||(32664706-32664941)
chr1 (146-314)||(6612634-6612803)
chr1 (154-312)||(52439667-52439826)
chr1 (151-314)||(51450224-51450388)
chr1 (205-315)||(22857368-22857479)
chr1 (151-316)||(34088214-34088370)
chr1 (144-309)||(32665525-32665683)
chr1 (144-263)||(25038133-25038252)
chr1 (144-263)||(25043345-25043464)
chr1 (151-257)||(6613737-6613844)
chr1 (153-314)||(34085746-34085893)
chr1 (261-316)||(9340891-9340946)
chr1 (246-316)||(51453570-51453640)
chr1 (267-316)||(6613839-6613888)
chr1 (217-315)||(26518312-26518407)
chr1 (268-315)||(9339849-9339896)
chr1 (199-257)||(23703948-23704006)
chr1 (266-316)||(39726538-39726588)
chr1 (247-312)||(5782600-5782665)
chr1 (268-316)||(7944357-7944405)
chr1 (217-257)||(17588802-17588842)
chr1 (191-256)||(22856945-22857011)
chr1 (270-316)||(25038103-25038149)
chr1 (270-316)||(25043315-25043361)
chr1 (269-314)||(3117873-3117918)
chr1 (277-322)||(22856894-22856939)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (12-316)||(47878119-47878405)
chr4 (119-304)||(42278727-42278912)
chr4 (133-313)||(54574630-54574810)
chr4 (144-272)||(19051106-19051232)
chr4 (154-316)||(4702957-4703118)
chr4 (148-316)||(20599644-20599807)
chr4 (146-316)||(42278251-42278413)
chr4 (161-316)||(4701985-4702141)
chr4 (144-314)||(47874767-47874930)
chr4 (170-272)||(6039367-6039470)
chr4 (268-316)||(26170865-26170913)
chr4 (142-191)||(21622192-21622241)
chr4 (144-185)||(24753282-24753323)
chr4 (199-263)||(19050488-19050552)
chr4 (144-191)||(24745782-24745829)
chr4 (217-272)||(42391688-42391743)
chr4 (271-318)||(56041180-56041227)
chr4 (284-322)||(26172809-26172847)
chr4 (269-313)||(53770944-53770988)
[»] scaffold0767 (2 HSPs)
scaffold0767 (144-316)||(5985-6154)
scaffold0767 (199-250)||(5870-5921)
[»] chr6 (3 HSPs)
chr6 (159-319)||(31239730-31239891)
chr6 (217-272)||(29845764-29845819)
chr6 (217-272)||(29857029-29857084)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (243-308)||(79303-79368)
[»] scaffold0237 (2 HSPs)
scaffold0237 (217-272)||(1969-2024)
scaffold0237 (217-272)||(3231-3286)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 12 - 316
Target Start/End: Original strand, 35178422 - 35178726
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35178422 atgaattatcatttgaatatatcttgagctcttgattattgtatgctcatacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 35178521  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||| |||    
T  35178522 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagggacctaattgatagtaaatatgcacagtgagggacctaacggtaagttgtgtttaatggaa 35178621  T
Q  212 gattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35178622 gattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggattttagatttaaggatttaagaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggt 35178721  T
Q  312 tcagg 316  Q
    |||||    
T  35178722 tcagg 35178726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 10406697 - 10406452
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||||| | ||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10406697 atgaattatcatttgaatatatcttgagctctttattattgtatgttcagacctatgtggtatttatatgaattatcatgttaatataacaataatcaag 10406598  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10406597 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacaataagttgtgtttaatagaa 10406498  T
Q  212 gattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggattt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  10406497 gattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggattt 10406452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 146 - 308
Target Start/End: Original strand, 5965172 - 5965335
Alignment:
Q  146 tcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatga 244  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||    
T  5965172 tcagggacctaattgatagtaagtatgcacagtcatggacttaacactaagttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaagagataattagatga 5965271  T
Q  245 catttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgattttt 308  Q
    || |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  5965272 cacttagggatttaagatttaggaatttagagatttgaaattcaatttgtggatattgattttt 5965335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 32898193 - 32898366
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacat 242  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||| |||||||| ||||||| || |||||||||| |||  |||| ||    
T  32898193 tgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagagacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattgatattgaacaaaaaagataattagat 32898292  T
Q  243 gacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  32898293 gacatttaaggatttaaaatttagggatttagggatttgatattcaatttgaggatattgatttttggttcagg 32898366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 142 - 314
Target Start/End: Original strand, 28619279 - 28619451
Alignment:
Q  142 attgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattaca 241  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||| || ||| ||| | |||||||||||||||  |||||| ||||| || |||| |||| |||| |    
T  28619279 attgtcattgacctaaatgatagtaagtatgcacagttagagacctaatagtaagttgtgtttaatgaaagattgatttttaataaaaaagagaattaga 28619378  T
Q  242 tgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttca 314  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28619379 tgacatttaggaatttgcaatttagggatttagggatttgaaattcaatttggggatattgatttttggttca 28619451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5737236 - 5737063
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacat 242  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||    
T  5737236 tgtcagagatctaattgatagtaagta-gtacagtcagggacctaacaataagttggtgtttaatggaagattaattttgaaaaaaagggagaattagat 5737138  T
Q  243 gacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaata-ttgatttttggttcagg 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  5737137 gacatttagggatttcagatttagagatttaaggatttgagattcaatttggggatatttgatttttggatcagg 5737063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 151 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 35177761 - 35177596
Alignment:
Q  151 gacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacattt 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||  ||||||||    
T  35177761 gacctaactgatagtaagtatgcatagtcagggacctaacaataggttggtgttta-tagaagattgattttgaacaaaaaagataattaggtgacattt 35177663  T
Q  250 agggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    | |||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  35177662 aaggatttaagatttaggaatttagggatttgatattcaatttggggatactgatttttggttcagg 35177596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 144 - 315
Target Start/End: Original strand, 10407332 - 10407504
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacat 242  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| | |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  10407332 tgtcagtgacttaactgatagtaagtatgaacagtcacggacctaacaacaggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaagagataattagat 10407431  T
Q  243 gacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcag 315  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||  | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10407432 gacatttaaggatttaagctttagggatttaacactttgatattcaatttgggcatattgatttttggttcag 10407504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 1952733 - 1952891
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgt-gtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacat 242  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  1952733 tgtcagggacctaactgatagtaaatatgcacagtcag-------acaataggttgttgtttaatggaagattgattttgaacaaaagagataattagat 1952825  T
Q  243 gacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||        |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1952826 gacatttaaggatttaagatttaggg--------atttgatattcaatttgggcatattgatttttggttcagg 1952891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 311
Target Start/End: Original strand, 32564227 - 32564405
Alignment:
Q  142 attgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagtt-gtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattac 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||  | |||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||     
T  32564227 attgtcagagacctaactgatagtaaatattcacagtccaagatcttacaataagttggtatttaatggaagaatgattttgaacaaaagagagaattag 32564326  T
Q  241 atga--------catttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggt 311  Q
    ||||         |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||||||||    
T  32564327 atgaaattgaaggatttagcgatttgagatttagggatttaggaatttgagattcaatacggggatattcatttttggt 32564405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32563933 - 32563828
Alignment:
Q  159 tgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagtt-gtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggattt 257  Q
    ||||| ||| |||||||| ||| |||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  32563933 tgatattaagtatgcacaatcatggatctaacagtaagttagtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagagaattagatggcatttagggattt 32563834  T
Q  258 gagatt 263  Q
    ||||||    
T  32563833 gagatt 32563828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 261 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10406463 - 10406409
Alignment:
Q  261 atttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcag 315  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10406463 atttagggatttaggaatttgatattcaatttggaaatattgatttttggttcag 10406409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 231
Target Start/End: Original strand, 41122527 - 41122601
Alignment:
Q  158 ctgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagtt-gtgtttaatagaagattaattttgaacaaaaga 231  Q
    |||||||||| |||||||| ||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41122527 ctgatagtaagtatgcacaatcaagggcctaacaataagtttgtgtttaatggaagattgattttgaacaaaaga 41122601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 309
Target Start/End: Original strand, 5737818 - 5737917
Alignment:
Q  200 tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaata 299  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||        || |||||||||||| |||    
T  5737818 tgtttaatggaatattgattttgaacaaaagagataattagatgacatttag--atttgagatttagggattt--------gagattcaatttggggata 5737907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 322
Target Start/End: Original strand, 45476414 - 45476470
Alignment:
Q  266 gggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcaggaactaa 322  Q
    |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45476414 gggatttagagatttgagatttaatttgggaatattgatttttggttcagggactaa 45476470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 1952099 - 1952048
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagac 63  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  1952099 atgaattatcatttgaatatattttgagctcttgattactgtatgctcagac 1952048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 191
Target Start/End: Original strand, 28526295 - 28526342
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaaca 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28526295 tgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaaca 28526342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 30134843 - 30134792
Alignment:
Q  261 atttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggtt 312  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30134843 atttaaggatttaaggatttgaaattcaatttgtgaatattgatttttggtt 30134792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 316
Target Start/End: Original strand, 41122616 - 41122663
Alignment:
Q  269 atttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  41122616 atttaggaatttgagattcaatttggagatattgatttttggttcagg 41122663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41121366 - 41121329
Alignment:
Q  277 atttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttca 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41121366 atttgaaattcaatttggggatattgatttttggttca 41121329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 191
Target Start/End: Original strand, 28006324 - 28006371
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaaca 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  28006324 tgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacaatcagggacctaaca 28006371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 191
Target Start/End: Original strand, 28063627 - 28063674
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaaca 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  28063627 tgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacaatcagggacctaaca 28063674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 30134910 - 30134855
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||||||    
T  30134910 tgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacaatcagagacctaacagtaagttg 30134855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 41121423 - 41121361
Alignment:
Q  197 ttgtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttga 259  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||  |||||||    
T  41121423 ttgtgtttaatgaaagattgattttgaacaaaagagagaattagatggcatttaaagatttga 41121361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36033085 - 36033032
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagt 197  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| || |||||| ||||    
T  36033085 tgtcagagacttaactgatagtaagtgtgcacagtcaggaacctaacaacaagt 36033032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 239
Target Start/End: Original strand, 39138453 - 39138494
Alignment:
Q  199 gtgtttaatagaagatt-aattttgaacaaaagagaggatta 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  39138453 gtgtttaatagaagatttaattttgaacaaaagagagaatta 39138494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 33315170 - 33315098
Alignment:
Q  199 gtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggattt-gagatttagggat 270  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | || |||| ||||||| || |||||| ||||||| |||||    
T  33315170 gtgtttaatagaagattgattttgatcaaaacaaagaattagatgacatatatggatttagagatttggggat 33315098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 6 - 322
Target Start/End: Original strand, 14890773 - 14891074
Alignment:
Q  6 actgatatgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaata 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14890773 actgaaatgaattatcatttgaatatatcttgagatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaata 14890872  T
Q  106 atcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgttta 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14890873 atcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagggacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacctaacaataagttgtgttta 14890972  T
Q  206 atagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatt 305  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14890973 atggaagattaattttgaacaaaagagaggattagatgac---------------atttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatt 14891057  T
Q  306 tttggttcaggaactaa 322  Q
    |||| |||||| |||||    
T  14891058 tttgattcagggactaa 14891074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 12 - 316
Target Start/End: Original strand, 28590730 - 28591034
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28590730 atgaattatcatttgaatatatcttgagctcttgattattgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 28590829  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  28590830 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagtgagctaactgatagtaagtatgcacagtcagggac-taacagtaagttgtgtttaatggaa 28590928  T
Q  212 gattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattga-tttttgg 310  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28590929 gattaattttgaacaaaaaagagaattatatgacatttagggatttgagatttaaggatttaagaatttgatattcaatttgggaatattgattttttgg 28591028  T
Q  311 ttcagg 316  Q
    ||||||    
T  28591029 ttcagg 28591034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 40611766 - 40611462
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40611766 atgaattatcatttgaatatatatcgagctcttgattaccgtatactcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 40611667  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||    
T  40611666 agtaatagatgttaatggatttgccaattcattgtctgggacctaactgatagtaagtatgtacagtcagggacctaacactaagttgtgtttaatgaaa 40611567  T
Q  212 gattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40611566 gattaattttgaacaaaagagagaattatatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggt 40611467  T
Q  312 tcagg 316  Q
    |||||    
T  40611466 tcagg 40611462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 545153 - 544847
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  545153 atgaattatcatttgaatatatcttgagctcttgattaccgtatactcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 545054  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaa 211  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  545053 agtaatagatgttaatagatttgttaattcattgttagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacaataagttgtgtttaatgaaa 544954  T
Q  212 gattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  544953 gattaattttgaacaaaagagataattatatgattttta-ggatttgagatttagggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggt 544855  T
Q  312 tcaggaac 319  Q
    ||||||||    
T  544854 tcaggaac 544847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 25590936 - 25590633
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25590936 atgaattatcatttgaacatatcttgagctcttgattattgtatgctcagacctatgcggtaatgatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 25590837  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||| |||    
T  25590836 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagggatctaactgatagtaagtatgcacagttagggacctaacaataagatttgtttaatggaa 25590737  T
Q  212 gattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25590736 gattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttatggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggt 25590637  T
Q  312 tcag 315  Q
    ||||    
T  25590636 tcag 25590633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 12 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 32640794 - 32640492
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32640794 atgaattatcatttcagaatatcttgagctcttgattattgtatgctcagacctacagggtagagatatgaattattatgtgaatataacaataatcaag 32640695  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  32640694 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagggacataactgatagtaagtatgcacaatcaaggacctaacagtaagttgtgtttaatggaa 32640595  T
Q  212 gattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggt 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32640594 gattaattttgaataaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaattttggaatattgatttttggt 32640495  T
Q  312 tca 314  Q
    |||    
T  32640494 tca 32640492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 316
Target Start/End: Original strand, 8075452 - 8075754
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8075452 atgaattatcatttgaatatatgttgagctattgattacggtatgctcagacatacggggtagagatatgaattattatgtgaatataacaataatcaag 8075551  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || | |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  8075552 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagtgacttaactgatggttagtatgcacagtca-ggacctaacagtaagttgtgtttaatggaa 8075650  T
Q  212 gattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8075651 gattaattttgaacaaaagagagaattagatgacattta-ggatttgagatttagggatataggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggt 8075749  T
Q  312 tcagg 316  Q
    |||||    
T  8075750 tcagg 8075754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 62 - 316
Target Start/End: Original strand, 2466440 - 2466694
Alignment:
Q  62 acctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactga 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||    
T  2466440 acctacggggtagagatatgaattatcatatgaatataacaataatcaacagtaatagatgctaatggattttctaattcattgtcaaggacataactga 2466539  T
Q  162 tagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgaga 261  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2466540 tagtaagtatgcacagtcagagacctaacaataagttgtgtttaatggagatttaattttgaacaaaaaagagaattagatgacatttagggatttgaga 2466639  T
Q  262 tttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2466640 tttaaggatttaagaatttgatattcaatttgggaatattgaattttggttcagg 2466694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 314
Target Start/End: Original strand, 4593723 - 4594020
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgt--atgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4593723 atgaattatcatttgaatatatcttgagctcttgattactgtgtatgctgagatctacgaggtagagatatgaattatcacgtgaatataacaataatca 4593822  T
Q  110 agagtaatagatgctaatggatttgctaattcatt-gtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaata 208  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||     
T  4593823 agagtagtagatgctattggatttgttaattcatttgtcagggatctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacattaagttatgtttaatg 4593922  T
Q  209 gaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgattttt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4593923 gaagattaattttgaacaaaagagataattagatgacatttagggatttga--------gatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgattttt 4594014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 40612407 - 40612580
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacat 242  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  40612407 tgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaagagataattagat 40612506  T
Q  243 gacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40612507 gatatttagggatttaagatttagggatttagggatttgttattcaatttgggcatattgatttttggttcagg 40612580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2465044 - 2464871
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacat 242  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||  |||| ||    
T  2465044 tgtcagtgacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattgactttgaacaaaaaagataattagat 2464945  T
Q  243 gacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2464944 gacatttaaggatttaagatttaaggatttagggatttgatattcaatttggggatattgatttttggttcagg 2464871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 8074825 - 8074652
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacat 242  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||| || |||| ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||  |||| ||    
T  8074825 tgtcagggacctaacttatagtaagtatgcacagtcagggagctaacagtaggttggtgtttaatgtaagattgattttgaacagaagagataattagat 8074726  T
Q  243 gacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8074725 gacatttaaagatttaagatttagggatttggggatttgatattcaatttgggcatattgatttttggttcagg 8074652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14890144 - 14889971
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaata-agttgtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacat 242  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||  | | | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  | || ||    
T  14890144 tgtcagagaccaaactaatagtaagtatgcacaatcagggacctaacagcagattggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaagaaataactagat 14890045  T
Q  243 gacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14890044 gacatttaaggatttaagatttagggatttagcgaattgatattcaatttgggcatattgatttttggttcagg 14889971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4593229 - 4593062
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacat 242  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  4593229 tgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacagtatgttggtgtttaatgaaagattgattttgaacaaaagagataattagat 4593130  T
Q  243 gacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||      ||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4593129 gacatttaagaatttaagatttagggatt------ttttattttcaatttgggcatattgatttttggttcagg 4593062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28590077 - 28589901
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagtt-gtgtttaatagaagattaattttgaac---aaaagagaggatta 239  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || ||| ||||||||| ||||||| |||||||||   |||| | |  ||||    
T  28590077 tgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagagacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaaaaaaataatta 28589978  T
Q  240 catgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||| |||||||  |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  28589977 catgacatttaaggatttaaggtttagagatttagtgatttgatattcaattttggtatattgatttttggttcagg 28589901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9537410 - 9537244
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatag-aagattaattttgaacaaaagagaggattaca 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||| | ||||||| |||||||| | |||||| | |||||||||||||||| |||| |    
T  9537410 tgtcagagacctaaatgatagtaagtatgcacagtcaaggacctaatagtaagttggtgtttaatgggaagattgactttgaacaaaagagagaattaga 9537311  T
Q  242 tgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||        |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9537310 tgacatttatggattttagatttaggg--------atttgagattcaatttggggatattgatttttgattcagg 9537244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 314
Target Start/End: Original strand, 545801 - 545955
Alignment:
Q  153 cctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagtt-gtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttag 251  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||  |||| ||||||||||     
T  545801 cctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacagtaggttagtgtttaatggaagattgattcagaacaaaagagataattagatgacatttaa 545900  T
Q  252 ggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttca 314  Q
     ||||| ||||||||||        |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  545901 cgatttaagatttaggg--------atttgttattcaatttgggcatattgatttttggttca 545955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 179 - 288
Target Start/End: Original strand, 9537838 - 9537948
Alignment:
Q  179 cagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaa 277  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  9537838 cagggacctaacattaagttgatgtttaatggaagattgattttgaacaaaggagagaattagataacatttaggaatttgagatttagggatttaggga 9537937  T
Q  278 tttgaaattca 288  Q
     |||| |||||    
T  9537938 attgagattca 9537948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18005025 - 18004860
Alignment:
Q  152 acctaactgatagtaa--atatgcacag--tcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgaca 246  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||| || |||    
T  18005025 acctaactgatcgtaagtatatgcacagagtcagagacttaacagtaaattggtatttaatggaagattaatattgaacaagagagagaattagataaca 18004926  T
Q  247 tttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    |||| |||||||||||    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  18004925 tttaaggatttgagat----ggatttagggatttgatattcaatttggggatattgaattttgattcagg 18004860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 70
Target Start/End: Original strand, 2465696 - 2465754
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggg 70  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2465696 atgaattatcatttgtatatatcttgatctcttgattattgtatgctcagacctacggg 2465754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 34173538 - 34173483
Alignment:
Q  260 gatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcag 315  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34173538 gatttagggatttagtgatttgaaattcaatttggggatattgatttttggttcag 34173483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 248
Target Start/End: Original strand, 32641498 - 32641596
Alignment:
Q  151 gacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatt 248  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  32641498 gacctaactgataataagtatgcacagttagggacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaagataattagatgacatt 32641596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27720827 - 27720714
Alignment:
Q  152 acctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataa-gttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacattt 249  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| | |||||| ||| | ||| |||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  27720827 acctaactgataataagtatgcacaattagggacctaatagtaaagttgatgtttaatgaaagattgattttgaacaaaagagagaattatatgatattt 27720728  T
Q  250 agggatttgagatt 263  Q
    |||||||| |||||    
T  27720727 agggatttaagatt 27720714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 319
Target Start/End: Original strand, 32555323 - 32555451
Alignment:
Q  197 ttgtgtttaatagaagatta-attttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttga-----gatttagggatttaggaatttgaaattcaat 290  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||     || || ||||||||||||||||| ||| | |    
T  32555323 ttgtgtttaatggaagatttgattttgatcaaaagagagaattagatgagatttagggatttgaggattgaattcgggatttaggaatttgagatttagt 32555422  T
Q  291 ttgggaatattgatttttggttcaggaac 319  Q
     || || |||||||||| |||||||||||    
T  32555423 atgagattattgattttcggttcaggaac 32555451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21069617 - 21069540
Alignment:
Q  187 taacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatt 263  Q
    ||||| ||||||| ||||||||  || ||| |||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21069617 taacagtaagttggtgtttaatgaaatattgattttgaagaaaatagagaattagatgacatttagggatttgagatt 21069540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 316
Target Start/End: Original strand, 2314387 - 2314435
Alignment:
Q  268 gatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  2314387 gatttaggaatttgatattcaatttggggatattaaattttggttcagg 2314435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 260 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 578098 - 578051
Alignment:
Q  260 gatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttt 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  578098 gatttagggatttagaaatttgagatccaatttgagaatattgatttt 578051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 197
Target Start/End: Original strand, 23773301 - 23773344
Alignment:
Q  154 ctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagt 197  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23773301 ctaactaatagtaagtatgcacagtcagggacctaacaataagt 23773344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 30970344 - 30970289
Alignment:
Q  217 attttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggattt 272  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  30970344 attttgaacaaaatagagaattgtatgacatttaggaatttgagatttaggaattt 30970289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 195
Target Start/End: Original strand, 19186055 - 19186104
Alignment:
Q  146 tcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataa 195  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||    
T  19186055 tcagggacctaactgatagtaagtatacacagtcagggatctaacaataa 19186104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 312
Target Start/End: Original strand, 32641599 - 32641644
Alignment:
Q  267 ggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggtt 312  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32641599 ggatttagggatttcatattcaatttggggatattgatttttggtt 32641644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 197
Target Start/End: Original strand, 23773180 - 23773232
Alignment:
Q  145 gtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagt 197  Q
    |||| |||||||||| |||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  23773180 gtcatagacctaactaatagtaagcatgcatagtcagggacctaacaataagt 23773232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 12 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 35728204 - 35727904
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35728204 atgaattatcatttgaatatatcttgaactcttgatcactgtatgctcagacctacgaggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 35728105  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| |||    
T  35728104 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagtgatctaacaataaattgtgtttaatggaa 35728005  T
Q  212 gattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35728004 gattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaggaatttagaaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggt 35727905  T
Q  312 t 312  Q
    |    
T  35727904 t 35727904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 12 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42477886 - 42477582
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42477886 atgaattatcatttgaatatattttgagcttttgattattgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 42477787  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaa 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||    
T  42477786 agtaatagatgctaatagatttgctaattcattgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacattaagttgtgcttaatggaa 42477687  T
Q  212 gattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  42477686 gattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaagtatttaggaatttgatattcaatatgggaatattagtttttggt 42477587  T
Q  312 tcagg 316  Q
    |||||    
T  42477586 tcagg 42477582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7258780 - 7258477
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7258780 atgaattatcatttgaatatatcttgagctcttgattattgtatgctcagacctacggggtaaatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 7258681  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaa 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||| |||    
T  7258680 agtaatagatgttaatggatttgctaattaattgtcatggacctaacagatagtaagtatgcacagttagggatctaacaataaattgtgtttaatggaa 7258581  T
Q  212 gattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggt 311  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7258580 gattaa-tttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggt 7258482  T
Q  312 tcagg 316  Q
    |||||    
T  7258481 tcagg 7258477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 44333643 - 44333339
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44333643 atgaattatcatttgaatatatcttaagctcttgattattgtatgcccaaacctgcgaggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 44333544  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | |||    
T  44333543 agtaatagatgctaatggatttgctaattcatcgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcaaggacctaacaataagttgtgtttgttggaa 44333444  T
Q  212 gattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggt 311  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44333443 gattaatcttgaacaaatgagagaattagttgaaatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggt 44333344  T
Q  312 tcagg 316  Q
    |||||    
T  44333343 tcagg 44333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 48788295 - 48788593
Alignment:
Q  14 gaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagag 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48788295 gaattatcatttgaatatatcttgagctcttgattattgtatgctcgg-cctacgaggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagaa 48788393  T
Q  114 taatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaaga 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  48788394 taatagatgctaatgtatttgctaattcattgtaagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacaataagttgtgtttaatggaaga 48788493  T
Q  214 ttaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttc 313  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||   |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48788494 ttaattttgaacaaaagagagaattaaatgaca---agggatttgagatttaagaatttaggaatttgatattcaatttgtgaatattgatttttggttc 48788590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 48646555 - 48646252
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48646555 atgatttatcatttgaatataccttgagctcttggttactgtatgctcggacctatggggttgagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 48646456  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||    
T  48646455 agtaatagatgctaatggatttgcttattcattgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacagtaagttgtatttaatggaa 48646356  T
Q  212 gattaattttgaacaaaagagaggatt-acatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttgg 310  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||    
T  48646355 gattaattttgaacaaaaaagagaattaagatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgatattcaatttagaaatattaatttttgg 48646256  T
Q  311 ttca 314  Q
    ||||    
T  48646255 ttca 48646252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 45584093 - 45583796
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45584093 atgaattatgatttgaatatatcttgagctcttgattattgtatgctcaaacctgcggggtagagatataaattatcatgtgaatataacaataatcaag 45583994  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagtt-gtgtttaataga 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||    
T  45583993 agtaatagatgctaatcgatttgctaattcattgtcaatgacctaactgatagtaagtatgcatagtcagggacctaacagtaagttggtgtttaatgga 45583894  T
Q  211 agattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttgg 310  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||  |||| |||||||| | |||||| ||||||||||        |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  45583893 agattgattttgatcaaaaaagataattagatgacattaaaggatttaagatttaggg--------atttgatattcaatttggggatattgatttttgg 45583802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 147
Target Start/End: Original strand, 10895277 - 10895412
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10895277 atgaattatcatttgaatatatcttgagctcttgattattgtatgctcagacctatggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 10895376  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtc 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10895377 agtaataaatgctaatggatttgctaattcattgtc 10895412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Original strand, 10898828 - 10898992
Alignment:
Q  150 agacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacattt 249  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  10898828 agacctaactgatactaagtatgcatagtcagggacctaacagtaagttgtgtttaatggaagattaattttgaacaaatgagagaattagatgacattt 10898927  T
Q  250 agggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttca 314  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10898928 agggatttgagatgtaagaatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttca 10898992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 155 - 316
Target Start/End: Original strand, 45584256 - 45584417
Alignment:
Q  155 taactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttaggg 253  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||    
T  45584256 taactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacagtaggttgatgtttaatggaagattgattttgatcaaaaaagataattagatgacatttaggg 45584355  T
Q  254 atttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45584356 atttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattga-ttttggttcagg 45584417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 48647191 - 48647364
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacat 242  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||    
T  48647191 tgtcagggacctaactaatagtaagtatgcacaatcaaggacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaatagataattagat 48647290  T
Q  243 gacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    || ||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48647291 gatatttaaggatttaagatttagggatatagggatttggtattcaatttgggcatattgatttttggttcagg 48647364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 155 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12221666 - 12221503
Alignment:
Q  155 taactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgttt--aatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagg 252  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||   | |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||     
T  12221666 taactgataataagtatgcacaatcacggacctaacagtaagtttgatatccaataaaagattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttaga 12221567  T
Q  253 gatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12221566 gaattgagatttagggatttagaaatttgatattcaatttggggatattgatctttggttcagg 12221503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 314
Target Start/End: Original strand, 30924763 - 30924928
Alignment:
Q  142 attgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattac 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  ||||     
T  30924763 attgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagagacctaacaataggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaagataattag 30924862  T
Q  241 atgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttca 314  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||        |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30924863 atgacatttaaggatttaagatttaggg--------atttgatattcaatttggggatattgatttttggttca 30924928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 154 - 312
Target Start/End: Original strand, 7509210 - 7509369
Alignment:
Q  154 ctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagg 252  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | || |||| | |||||| |||| || ||||||||||| |||| | |||| |||| |||||||    
T  7509210 ctaactgatagtaagtatgcacagtcaaagacttaagagtacgttgatatttaatggaaggttgattttgaacaagagagtgaattaaatgatatttagg 7509309  T
Q  253 gatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggtt 312  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7509310 gatttgagatttaggggtttagggatttgagattcaatttggggatattgatttttggtt 7509369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 39708495 - 39708335
Alignment:
Q  145 gtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatg 243  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||    
T  39708495 gtcagggaccaaactgatagtaagtatacacagtcagggacctaacagtaagttaatgtttaatggaagatcgattttgaacaaaagagagaattagatg 39708396  T
Q  244 acatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggtt 312  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39708395 acatttaagaatttaagatttaggg--------atttgaaattcaatttgagaatattgatttttggtt 39708335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 7259441 - 7259606
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacat 242  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  |||| |     
T  7259441 tgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaataatagattgatgtttaatagaagattgattttgagcaaaaaagataattagag 7259540  T
Q  243 gacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||        |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7259541 gacatttaaggatttaagatttaggg--------atttgatattcaatttggggatattaatttttggttcagg 7259606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 314
Target Start/End: Original strand, 12223436 - 12223598
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacat 242  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||   |||| ||    
T  12223436 tgtcagggacctaa-tgatagtaagtatgcacattcagggacctaataataagttggtgtttaatggaagattgattttgaactaaagaggtaattagat 12223534  T
Q  243 gacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttca 314  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||        |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12223535 gacatttatggatttgaaatttaggg--------atttgagattcaatttggggatattgatttttggttca 12223598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 158 - 322
Target Start/End: Original strand, 6680283 - 6680440
Alignment:
Q  158 ctgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagtt-gtgtttaatag-aagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggat 255  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  6680283 ctgatagtaaatatgtacagtcaag-atttaacaataagttagtgtttaatgggaagattgattttgaacaaaagagagaattagatgatatttagggat 6680381  T
Q  256 ttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcaggaactaa 322  Q
    ||||        |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  6680382 ttga--------gatttatgaatttaaaattcaatttggggatattgatttttggtttagggactaa 6680440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 319
Target Start/End: Original strand, 19433666 - 19433839
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacat 242  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| | ||||||| |||||||| ||||||| |||  |||||||| |||  |||| ||    
T  19433666 tgtcagagatctaactgatagtaagtatgcaca-taagggacctaatagtaagttggtgtttaatggaagattgatt--gaacaaaatagataattaaat 19433762  T
Q  243 gacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcaggaac 319  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||| || || ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19433763 gacattcagggatttcagattttgggagttggggattagagattcaatttggggatattgatttttagttcaggaac 19433839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 35728843 - 35729007
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgt-gtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacat 242  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| | ||| || ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  35728843 tgtcagggacctgactgatagtaagtatgcac-gccagggacctcacagtaggttgcagtttaatggaagattgattttgaacaaaagagataattagat 35728941  T
Q  243 gacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35728942 gacatttaaggatttaagatttagggattta--------atattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 35729007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 257
Target Start/End: Original strand, 32794543 - 32794657
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagtt-gtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacat 242  Q
    |||||| || |||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  32794543 tgtcagcgaactaattaatagtaagtatgcacagtcagggacctaacaataagtttgtgtttaatggaaaattgattttgaacaaaagagagcattagat 32794642  T
Q  243 gacatttagggattt 257  Q
    |||||| ||||||||    
T  32794643 gacattcagggattt 32794657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 10894718 - 10894539
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagagg-attaca 241  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  || ||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||||||| |||| | ||  |||| |    
T  10894718 tgtcagggacctaactggtagtaagtatgcacagtcagatacctaacattagattggtgtttaatagaagattgattttgaaaaaaaaaaagatattaga 10894619  T
Q  242 tgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcaggaactaa 322  Q
    ||||||||| | |||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||    
T  10894618 tgacatttaagaatttaagattttcggatttagggatttgatattcaatttggggata-tgatttttggtccagggactaa 10894539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 43457819 - 43457674
Alignment:
Q  169 tatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagagg--attacatgacatttagggatttgagattta 265  Q
    |||||||||||| |||||||| |  |||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||   |||| |||| |||||||| ||||||||||     
T  43457819 tatgcacagtcaaggacttaaaataaagttggtgtttaattgatgattgattttgaacaaaagagagagaattagatgatatttaggggtttgagatttg 43457720  T
Q  266 gggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggt 311  Q
    | |||||| | |||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  43457719 gtgatttaaggatttgagattcaatttagggatattgatttttggt 43457674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 263
Target Start/End: Original strand, 33607272 - 33607385
Alignment:
Q  151 gacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacattt 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| || || | |||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  33607272 gacctaactgatagtaagtatgcaaagtcagggacctaacagtaggtaggtgtttaatggaagaatgattttaaacaaaagagagaattagatgacattt 33607371  T
Q  250 agggatttgagatt 263  Q
    |||||||| |||||    
T  33607372 agggatttaagatt 33607385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32793543 - 32793423
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagtt-gtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacat 242  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||  |||||||| || ||||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||| |     
T  32793543 tgtcagagatctaactgatagtaagtatgcacaatcagagacttacaaataagttggtatttaatgaaagattgattttgaacaaaatagagaattagaa 32793444  T
Q  243 gacatttagggatttgagatt 263  Q
    |||||| ||| ||||||||||    
T  32793443 gacattcaggtatttgagatt 32793423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 44529648 - 44529540
Alignment:
Q  159 tgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggattt 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||| || |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||    
T  44529648 tgatagtaagtatgcacagtcagggacttaaaatgaagttgatttttaatggatgattgattttgaacaaaagagataattagatgacatttaggggttt 44529549  T
Q  258 gagatttag 266  Q
     ||||||||    
T  44529548 aagatttag 44529540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 314
Target Start/End: Original strand, 44334214 - 44334369
Alignment:
Q  151 gacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacattt 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||| | || |||| ||||||||  || | | |||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  44334214 gacctaactgatagtaagtatgcacagtaagg-acctaatagtaggttggtgtttaatgaaataatgattttgaacaaaagagataattagatgacattt 44334312  T
Q  250 agggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttca 314  Q
    | | |||| ||||||||||||||        || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44334313 aagaatttaagatttagggattt--------gatattcaatttggggatattgatttttggttca 44334369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 34707984 - 34707858
Alignment:
Q  148 agagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaa-tagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgac 245  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| | ||| |||  | | | ||||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  34707984 agagacttaactgatagtaagtatgcataatcatggatcttatagtaagttggtgtttaaatggaaaattgattttgaacaaaagagagaattatatgac 34707885  T
Q  246 atttagggatttgagatttagggattt 272  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||    
T  34707884 atttaagaatttgagatttagggattt 34707858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 48777534 - 48777457
Alignment:
Q  241 atgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaa-tttgggaatattgatttttggttcaggaa 318  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  48777534 atgacatttaaggatttaaaatttagggatttagggatttgaaattcaattttggggatattga-ttttggttcaggaa 48777457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 316
Target Start/End: Original strand, 43461526 - 43461638
Alignment:
Q  199 gtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaat 298  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||| ||| |||| |||| ||||||    ||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||  || ||    
T  43461526 gtgtttaatggatgattgattttgaacgaaa-agagaattagatgaca----ggggtttgagatttagtgatttagggatttgagattcaattgagggat 43461620  T
Q  299 attgatttttggttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43461621 attgatttttggttcagg 43461638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 267
Target Start/End: Original strand, 34710196 - 34710263
Alignment:
Q  200 tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagg 267  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  34710196 tgtttaatgaaaaattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttaaggatttgaaatttagg 34710263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 309
Target Start/End: Original strand, 5929920 - 5930023
Alignment:
Q  198 tgtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaa 297  Q
    ||||||||||  |||| | ||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |        |||||| ||||||||||||||    
T  5929920 tgtgtttaatgaaagactgattttgaatgaaagagagaattaaatgacatttatggatttgagatttagag--------atttgagattcaatttgggaa 5930011  T
Q  298 tattgatttttg 309  Q
    ||||||||||||    
T  5930012 tattgatttttg 5930023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 46286772 - 46286727
Alignment:
Q  269 atttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttca 314  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46286772 atttagggatttgaaatttaatttgggaatattgatttttggttca 46286727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 322
Target Start/End: Original strand, 46287219 - 46287312
Alignment:
Q  226 aaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcaggaactaa 322  Q
    |||| |||| |||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||    
T  46287219 aaaaaagagaattagatgacatttaag-atttgagatttaaggatttagggatttga--ttcaatttaggaatattgatttttgatttagggactaa 46287312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8047154 - 8047072
Alignment:
Q  192 ataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggattta 273  Q
    |||||||| ||||||||  || ||| || ||||||||||||||  |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8047154 ataagttgatgtttaatgaaatattgatattgaacaaaagagataattagatgatatttagtgatttgagatttagggattta 8047072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 314
Target Start/End: Original strand, 42478111 - 42478189
Alignment:
Q  236 attacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttca 314  Q
    |||| |||| ||||| |||||| ||||||| || |||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  42478111 attagatgatatttaaggatttaagatttatgggtttagggatttgatattcaattaggggatattgattttttgttca 42478189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 48249883 - 48249823
Alignment:
Q  222 gaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttga 282  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  48249883 gaacaaaagagagagttatatgacatgtaaggatttaagatttagtgatttaggaatttga 48249823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 199 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 33061148 - 33061081
Alignment:
Q  199 gtgtttaatagaagat-taattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagattta 265  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| |||||||    
T  33061148 gtgtttaatggaagatatgattttgaacaaaagagataattaaataacatttagggatttaagattta 33061081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 199 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39824471 - 39824358
Alignment:
Q  199 gtgtttaatagaagatta-attttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgag------atttagggatttaggaatttgaaattcaatt 291  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||| | | |||| |||| ||||| |||||||||      ||||||  ||||| | |||||||||||||||    
T  39824471 gtgtttaatggaagatttgattttgaacaaaagggtgaattaaatgagatttaaggatttgaggattaaatttaga-atttatggatttgaaattcaatt 39824373  T
Q  292 tgggaatattgattt 306  Q
    |||||||||||||||    
T  39824372 tgggaatattgattt 39824358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 48787650 - 48787611
Alignment:
Q  152 acctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaaca 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  48787650 acctaactgatagtaaatatgcacagtcagtgacctaaca 48787611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Original strand, 25621462 - 25621515
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||| ||||    
T  25621462 tgtcagagacctaactgatagtaagtatgcacaatcaagaacctaacaacaagt 25621515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 12 - 322
Target Start/End: Original strand, 36279934 - 36280244
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  36279934 atgaattattatttgaatatatcttgagctcttgattattgtatgctcagacctacggggtagagttatgaattattatatgaatataacaataatcaag 36280033  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaa 211  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  36280034 actaatagatgctaatgaatttgctaattcattgtcagggacctaactgatagtaattatgcacagtcagggacctaacattaagttgtgtttaatggaa 36280133  T
Q  212 gattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36280134 gattaattttgaacaaaagagagaattaaatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggt 36280233  T
Q  312 tcaggaactaa 322  Q
    | ||| |||||    
T  36280234 ttagggactaa 36280244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 316
Target Start/End: Original strand, 55389087 - 55389390
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55389087 atgaattatcatttgaatatatcttgagctcttgattattgtatgctcagacctacggaatagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 55389186  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaa 211  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
T  55389187 agtaa-agatgataattgatttgctaattcattgtcatggacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacctaagagtaagttgtgtttaatggaa 55389285  T
Q  212 gattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggt 311  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  55389286 tattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgattttcggt 55389385  T
Q  312 tcagg 316  Q
    |||||    
T  55389386 tcagg 55389390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 12 - 314
Target Start/End: Original strand, 48809274 - 48809574
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48809274 atgaattatcatttaaatatatcttgagctcttgattattgtatgctcagacctacggg-tagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 48809372  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  48809373 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagttagggacctaacaataaattgtgtttaatggaa 48809472  T
Q  212 gattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggt 311  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48809473 gattaa-tttgaacaaaatagagaattagatgacatttagggatttgagatttaagtatttaggaatttgatattcaatttaggaatattgatttttggt 48809571  T
Q  312 tca 314  Q
    |||    
T  48809572 tca 48809574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 12 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17701025 - 17700721
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17701025 atgaattatcatttgaatatatctggagctcttgattattgtatgcttagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 17700926  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaa 211  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  17700925 agtaatagatgttaatagatttgctaattcattgtcagggacctaactgatagtaagtatgtacagtcagggacctaacagtaagttgtgtttaatggaa 17700826  T
Q  212 gattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggt 311  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  17700825 gattaattttgaacaaaatagagaattatatgacatttaaggatttgagatttaagaatttaggaatttgatattcaattttggattattgattttttgt 17700726  T
Q  312 tcagg 316  Q
    |||||    
T  17700725 tcagg 17700721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 12 - 316
Target Start/End: Original strand, 53958719 - 53959021
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53958719 atgaattatcatttgaatatatcttgagctcttgattattgtatgctaagacctaaaaggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaaa 53958818  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaa 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||    
T  53958819 agtaatagatgctaatggatctgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggaccttacaacaagttgtgtttaatggaa 53958918  T
Q  212 gattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggt 311  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53958919 gattaa-tttgaacaaaagagagaattagatgacattta-agatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggt 53959016  T
Q  312 tcagg 316  Q
    |||||    
T  53959017 tcagg 53959021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 48573494 - 48573189
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48573494 atgaattatcatttcaatatatcttgagctcttgattattgtatgcttagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 48573395  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataa---gttgtgtttaata 208  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||   ||||||||||||     
T  48573394 agtaatagatgctaatatatttgctaattcatcgtcatgcacctaactgatagtaagtatgtacagtcagggacctaacagtaagttgttgtgtttaatg 48573295  T
Q  209 gaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgattttt 308  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  48573294 gaaggttaattttgaataaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaagaatttaggaatttgatattcaattttggaatattgattttt 48573195  T
Q  309 ggttca 314  Q
    ||||||    
T  48573194 ggttca 48573189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 52317418 - 52317150
Alignment:
Q  13 tgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  52317418 tgaattatcatttgaatatatcttgagctcttaattattgtatgctcagacctacgggttagagatatgaattattatgtgaatataacaatactcaaga 52317319  T
Q  113 gtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  52317318 gtaatagatgctaatggatttgctaatttattgtcagagacctaactgattgtaagtatgcacag-cagggacctaacagtaaattgtgtttaatggaag 52317220  T
Q  213 attaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttga 282  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  52317219 attaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatatgaaatttaaggatttaggaatttga 52317150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 144 - 314
Target Start/End: Original strand, 48574207 - 48574378
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagtt-gtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||  |||| ||    
T  48574207 tgtcagagacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacaataggttagtgtttaatggatgattgattttgaacaaaaaagataattatat 48574306  T
Q  243 gacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttca 314  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  48574307 gacatttaaggatttaagatttagggatttagagatttgatattcaatttggggatattgaattttggttca 48574378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 55388436 - 55388261
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagagg--attac 240  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||   ||||     
T  55388436 tgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcaggaacttaacagtaggttggtgtttaatagaatattgattttgaacaaaaaaaagataattag 55388337  T
Q  241 atgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55388336 atgacatttaaggatttaagatttaggaatttagggatttgatattcaatttggggatattgatttttggttcagg 55388261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 17701676 - 17701850
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttg-aacaaaagagaggattaca 241  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||  |||  |    
T  17701676 tgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattaattttataacaaaaaagataattgta 17701775  T
Q  242 tgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    |||||| || |||||| ||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17701776 tgacatgtaaggatttaagatttaggaattttgggatttgatattcaatttgggaatattgatttttgcttcagg 17701850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36279317 - 36279190
Alignment:
Q  146 tcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatga 244  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||    
T  36279317 tcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaagataattagatga 36279218  T
Q  245 catttagggatttgagatttagggattt 272  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  36279217 cttttaaggatttaagatttagggattt 36279190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 314
Target Start/End: Original strand, 52318073 - 52318236
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacat 242  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| |||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||    
T  52318073 tgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagttaaagacctaacaataggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaagataattagat 52318172  T
Q  243 gacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttca 314  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||        |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  52318173 gacatttaaggatttaagatttaggg--------atttgatattcaatttggggatattgttttttggttca 52318236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 203 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2591941 - 2591827
Alignment:
Q  203 ttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttga-aattcaatttgggaatatt 301  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||| |  |||||    
T  2591941 ttaatggatgattgattttgaacaaaagagagaattagatgacatttagagatttgagatttaagaatttaggaatttgagatttcaatttcgagatatt 2591842  T
Q  302 gatttttggttcagg 316  Q
    |||||||| ||||||    
T  2591841 gatttttgcttcagg 2591827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 169 - 316
Target Start/End: Original strand, 36827235 - 36827376
Alignment:
Q  169 tatgcacagtcagggacttaacaataagttgt-gtttaatagaagatta-attttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttag 266  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||  ||||||  |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||           
T  36827235 tatgtacagtcagggacataacaacaagttgttgtttaatgaaagatttgattttgaacaaaagagagaattagttgacatttaaggatttga------- 36827327  T
Q  267 ggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  36827328 -gatttaggaatttgaaattcaatttggggatattgattttcgattcagg 36827376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48808736 - 48808574
Alignment:
Q  145 gtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaaga-gaggattacat 242  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||| |||||    ||||||| ||||||| ||||| | ||  |||| ||    
T  48808736 gtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcaggaacataacagtaggttggtgtttg---gaagattgattttgagcaaaaaaagataattagat 48808640  T
Q  243 gacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
     | ||||| |||||| ||||||||||||||        || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48808639 aatatttaaggatttaagatttagggattt--------gatattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 48808574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 53957930 - 53957877
Alignment:
Q  261 atttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttca 314  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53957930 atttaaggatttagggatttgacattcaatttggggatattgatttttggttca 53957877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33837424 - 33837365
Alignment:
Q  257 tgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    |||||||||| || ||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  33837424 tgagatttagagacttaaggatttgaaattcaatctggggatattgatttttggttcagg 33837365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 314
Target Start/End: Original strand, 19115020 - 19115086
Alignment:
Q  248 ttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttca 314  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || || ||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  19115020 ttagggatttgagatttaaggatttggggatatgatattcaaattggggatattgatttttagttca 19115086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 40206237 - 40206163
Alignment:
Q  199 gtgtttaatagaagatt-aattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggattt 272  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||   |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  40206237 gtgtttaatggaagatttaattttgaactaaagaggaaattagatgagatttagagatttgagatttagggattt 40206163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 314
Target Start/End: Original strand, 45600833 - 45600878
Alignment:
Q  269 atttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttca 314  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  45600833 atttagggatttgaaattcaagttggggatattgatttttggttca 45600878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 322
Target Start/End: Original strand, 47117945 - 47117999
Alignment:
Q  268 gatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcaggaactaa 322  Q
    |||||||| ||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  47117945 gatttagggattcgagattcaagttggggatattgatttttggttcagggactaa 47117999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 45599133 - 45599080
Alignment:
Q  269 atttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcaggaactaa 322  Q
    ||||||| ||||||  ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45599133 atttagggatttgagtttcaagttaagaatattgatttttggttcaggaactaa 45599080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 322
Target Start/End: Original strand, 47075245 - 47075298
Alignment:
Q  269 atttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcaggaactaa 322  Q
    ||||||| |||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  47075245 atttagggatttaagattcaagttggggatattgatttttggttcagggactaa 47075298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 38)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 12 - 312
Target Start/End: Original strand, 2911105 - 2911404
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2911105 atgaattatcatttgaatatatattgagctcttgattattgtatgttcagacctacggggttgagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 2911204  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  2911205 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgata-taagtatgcacagtcagagacctaacagtaagttgtgtttaatggaa 2911303  T
Q  212 gattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2911304 gattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttaggaatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttggaaatattgatttttggt 2911403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 12 - 314
Target Start/End: Original strand, 31091144 - 31091446
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31091144 atgaattatcatttgaatatatattgaactcttgattattgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 31091243  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||  |     
T  31091244 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagggacctaactgatagtaagtatgcgcagtcagagatctaacagtaagttgtgtttaatgaat 31091343  T
Q  212 gattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  31091344 gattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttacggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatctcggaatattgatttttggt 31091443  T
Q  312 tca 314  Q
    |||    
T  31091444 tca 31091446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 12 - 316
Target Start/End: Original strand, 24459071 - 24459375
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24459071 atgaattatcatttgaatatatcttgagctcttgattattgtatgctcagacttacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 24459170  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaa 211  Q
    ||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  ||    
T  24459171 agtaatagaagctggtggatatgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaagtatgcgcagttagggacctaacagtaagttgtgtttaatgaaa 24459270  T
Q  212 gattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24459271 gattaattttgaacaaaagagataattagacgacatttagggatttcagatttaaggatttacgaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggt 24459370  T
Q  312 tcagg 316  Q
    |||||    
T  24459371 tcagg 24459375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 12 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 39015511 - 39015209
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39015511 atgaattatcatttgaatatatcttgagctcttgattactgtatgctcagacctacatggaagagatatgaattatcatgtgaatataacaacaatcaag 39015412  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaa 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  39015411 agtaatagatgataatggatttgttaattcattgtcagggacctaaccaatagtaggtatgcacagtcactgacctaacaataagttgtgtttaatggaa 39015312  T
Q  212 gattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggt 311  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39015311 gattaattttaaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttagggattttggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggt 39015212  T
Q  312 tca 314  Q
    |||    
T  39015211 tca 39015209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 279
Target Start/End: Original strand, 32765898 - 32766164
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32765898 atgaattatcatttaaatatatcttgagctcttgattattgtatactcagacctgcggg-tagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 32765996  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaa 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  32765997 agtaatagatgctaatcgatttgctaattcattgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagagacctaacaataagttgtgtttaatggaa 32766096  T
Q  212 gattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32766097 gattaattttgaacaaaagagaaaattaaatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatt 32766164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 314
Target Start/End: Original strand, 39999951 - 40000254
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaa-tatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaa 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39999951 atgaattatcatttgaaatatatcttgaacacttgattatagtatgctcagatctacggggtagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaa 40000050  T
Q  111 gagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaataga 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||  | || |||||||||||||||  |    
T  40000051 gagtaatagatactaatggattttttaattcattgtcagggacctaactcatagtaagtatacatagtcagggaccgatcagtaagttgtgtttaatgaa 40000150  T
Q  211 agattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttgg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40000151 agattaattttgaacaaaagagagaattagatgacacttatggatttgagatttaaggatttagaaatttgatattcaatttgggaatattgatttttgg 40000250  T
Q  311 ttca 314  Q
    ||||    
T  40000251 ttca 40000254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 32765312 - 32765139
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacat 242  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||    
T  32765312 tgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacagtaggttgctgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaagataattagat 32765213  T
Q  243 gacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32765212 gacatttaaggatttaaaatttagggatttagggatttgatattcaatttggggatattgatttttggttcagg 32765139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 2910475 - 2910304
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacat 242  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||  |||||| ||||||||||||  |||  | || ||    
T  2910475 tgtcagggacctaactgatattaagtatgcacagtcagggacctaacagtaggttggtgtttaatgtaagattgattttgaacaaacaagataactagat 2910376  T
Q  243 gacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttca 314  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2910375 gacatttaaggatttgaaatttacggatttagggattcgatattcaatttggggatattgatttttggttca 2910304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 117
Target Start/End: Original strand, 14705018 - 14705097
Alignment:
Q  38 atatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaat 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14705018 atatcttgattattgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaat 14705097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31090532 - 31090359
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacat 242  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||    
T  31090532 tgtcagggacctaaatgatagtaagtatgcacagtcaggaacctaatagtaggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaagggataattagat 31090433  T
Q  243 gacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    |||||||| |||||| |  |||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31090432 gacatttatggatttaaattttagggatttaaggatttgatattcaatttggggatattaatttttggttcagg 31090359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 151 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24458428 - 24458269
Alignment:
Q  151 gacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacattt 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||    
T  24458428 gacctaactgatagtaagtatgcacagtaagagacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaagataattagatgacattt 24458329  T
Q  250 agggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttg 309  Q
    | |||||| | ||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  24458328 aaggatttaaaatttagggatttagggatctgatattcaatttgaggatattgatttttg 24458269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 39016142 - 39016304
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagtt-gtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||  |||| ||    
T  39016142 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaac--taggttggtgtttaatggaagatt-gttttgaacaaaatagataattagat 39016238  T
Q  243 gacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||        |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39016239 gacatttaaggatttaagatttaggg--------atttcatattcaatttgggcatattgatttttggttcagg 39016304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14704363 - 14704209
Alignment:
Q  152 acctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacattta 250  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | |  |||| ||||||||||    
T  14704363 acctaactgatagtaagtatgcacagt-agggaactaacaataggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaatataattagatgacattta 14704265  T
Q  251 gggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttca 314  Q
     |||||| ||||||||||        |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14704264 aggatttaagatttaggg--------atttgatattcaatttggggatattgatttttggttca 14704209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7073969 - 7073852
Alignment:
Q  200 tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaata 299  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||| ||||||||| ||||||    
T  7073969 tgtttaatggatgattgattttgaacgaaagagagaattagatgatatttagggatttgagatatagtgatttaaggatttgagattcaatttaggaata 7073870  T
Q  300 ttg-atttttggttcagg 316  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  7073869 ttgaatttttggttcagg 7073852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 146 - 259
Target Start/End: Original strand, 38984742 - 38984857
Alignment:
Q  146 tcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaat-agaagattaattttgaacaaaagagaggattacatg 243  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||  ||  ||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  38984742 tcagagacctaactgataataagtatgcacaatcaaagatctaacaataagttggtgtttaatgaaaagatttattttgaacaaaagagagaattagatg 38984841  T
Q  244 acatttagggatttga 259  Q
    ||||||| ||||||||    
T  38984842 acatttacggatttga 38984857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 218 - 316
Target Start/End: Original strand, 17330042 - 17330140
Alignment:
Q  218 ttttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||   |||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  17330042 ttttgaacaaaagagagaattatatgacattcaggggtttgaaatttagggatttaatgatttgagattcaatttagggatattgattttgggttcagg 17330140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 322
Target Start/End: Original strand, 5914858 - 5914939
Alignment:
Q  241 atgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcaggaactaa 322  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  5914858 atgacatttaggaatttgagatttagggatttagagattttagattcaagctggggatattgatttttggttcagggactaa 5914939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43380836 - 43380789
Alignment:
Q  269 atttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43380836 atttaggaatttgaaattcaatttggggatattgatttttggttcagg 43380789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 257
Target Start/End: Original strand, 39256762 - 39256876
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacat 242  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| | |||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| ||    
T  39256762 tgtcagggacctaactaatagtaagtatgcacaatcagcgacctaacagtaagttggtttttaatggaagattgactttgaacaaaagagagaattagat 39256861  T
Q  243 gacatttagggattt 257  Q
    | ||| || ||||||    
T  39256862 gtcatataaggattt 39256876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 316
Target Start/End: Original strand, 33163304 - 33163359
Alignment:
Q  261 atttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33163304 atttaggaatttagagatttgaaattcaatttggggatattgatttttggttcagg 33163359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 307
Target Start/End: Original strand, 8420747 - 8420842
Alignment:
Q  217 attttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttga-gattta----gggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttt 307  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| | |||| |    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  8420747 attttgaacaaaagagggaattagatgaaatttagggattttatgattaaattcgggatttaggaatttgagattcaatttcggaatattgatttt 8420842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 319
Target Start/End: Original strand, 31443084 - 31443149
Alignment:
Q  254 atttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcaggaac 319  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  31443084 atttgggatatagggatttaggaatttgagatttaatttggagatattgattttcggttcaggaac 31443149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33162078 - 33162020
Alignment:
Q  205 aatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatt 263  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  33162078 aatataagattgattttgaacaaaagagataattagatgacatttaaggatttgagatt 33162020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 317
Target Start/End: Original strand, 39256871 - 39256921
Alignment:
Q  267 ggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagga 317  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  39256871 ggatttagggatttgagattcaattggggaatattaatttttggttcagga 39256921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18675501 - 18675452
Alignment:
Q  142 attgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaaca 191  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  18675501 attgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcaggaacctaaca 18675452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 307
Target Start/End: Original strand, 28864662 - 28864703
Alignment:
Q  266 gggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttt 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28864662 gggatttagggatttgaaattcaacttgggaatattgatttt 28864703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 265
Target Start/End: Original strand, 7412532 - 7412616
Alignment:
Q  182 ggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagattta 265  Q
    |||| ||||| ||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||   ||||||||||||    
T  7412532 ggacctaacattaagttggtggttaatagaaaattgattttgaacaaaagagataattatatgacatttataaatttgagattta 7412616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12010323 - 12010263
Alignment:
Q  254 atttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttca 314  Q
    ||||| |||||||| || |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12010323 atttgggatttaggaatctagagatttgatattcaatttggggatattgatttttggttca 12010263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 315
Target Start/End: Original strand, 21733627 - 21733671
Alignment:
Q  271 ttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcag 315  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21733627 ttagggatttgagattcaatttgggaatattgattttcggttcag 21733671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 33439504 - 33439441
Alignment:
Q  254 atttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcaggaa 318  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  33439504 atttgggatttagggatgtagggatttgacattcaattt-ggaatattgattttcagttcaggaa 33439441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 257
Target Start/End: Original strand, 33163248 - 33163315
Alignment:
Q  191 aataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggattt 257  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||    
T  33163248 aataagttgatgtttaatggaagattgattttgaacacaagagataattatatgacatttaggaattt 33163315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 197 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 39999259 - 39999185
Alignment:
Q  197 ttgtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggattt 272  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |  |||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  39999259 ttgtgtttaataggagatttattttgaacaaaa-aaaaaattagataacatttaaggatttaagatttagggattt 39999185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 279
Target Start/End: Original strand, 12004779 - 12004841
Alignment:
Q  217 attttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatt 279  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||    
T  12004779 attttgaacaaaagagataattagatgagatttatgaatttgatatttagggattaaggaatt 12004841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31442672 - 31442614
Alignment:
Q  217 attttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttagg 275  Q
    ||||| ||||||||||   |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31442672 attttaaacaaaagaggaaattagatgagatttagggatttgagatttaggaatttagg 31442614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 294
Target Start/End: Original strand, 31814197 - 31814255
Alignment:
Q  236 attacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgg 294  Q
    |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  31814197 attagatgatatttagagatttaagatttagggatttaaagatttgaaattcaatttgg 31814255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21732362 - 21732317
Alignment:
Q  271 ttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21732362 ttagggatttgagattcaatttggggatattaatttttggttcagg 21732317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 26585454 - 26585401
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagt 197  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||    
T  26585454 tgtcagggacctaactcatagtaaatatgcacaatcaaggacctaacaacaagt 26585401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 192
Target Start/End: Original strand, 38855949 - 38855997
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaa 192  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  38855949 tgtcagggaactaactgatagtaagtatgcactgtcagggacctaacaa 38855997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 316
Target Start/End: Original strand, 52440177 - 52440481
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52440177 atgaattgtcatttgaatatatcttgagctattggttattgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 52440276  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaa 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||  ||    
T  52440277 agtaatagaagctaatggatttgctaattcattgtcaaggacctaactgatagtaagtatgcgcagttggggacctaacactaagttgtgtttaatgaaa 52440376  T
Q  212 gattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggt 311  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  52440377 gattaattttaaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatacttatttttggt 52440476  T
Q  312 tcagg 316  Q
    |||||    
T  52440477 tcagg 52440481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 12 - 278
Target Start/End: Original strand, 7945191 - 7945457
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7945191 atgaattatcatttgaaaatatcttgagctcttgattattgtatgctcagacttacggggtaaagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 7945290  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  7945291 agtaatagatgctaatggatttcctaattcattgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagagacctaacaataagttgtgtttaatggaa 7945390  T
Q  212 gattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaat 278  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  7945391 gattaattttgaacaaaagagagaattatatgacatttagggatttgagatttaagaatttgggaat 7945457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 9340659 - 9340902
Alignment:
Q  14 gaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagag 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9340659 gaattatcatttgaatatatcttgagctcttgattattgtatgtttagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataagaataatcaagag 9340758  T
Q  114 taatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaaga 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9340759 taatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacagtaagttgtgtttaatggaaga 9340858  T
Q  214 ttaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggattt 257  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  9340859 ttaattttgaacaaaagagaaaattagatgacatttagggattt 9340902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 79 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 32664941 - 32664706
Alignment:
Q  79 atgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  32664941 atgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttcctaattcattgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacaat 32664842  T
Q  179 cagggacttaacaataagttgtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaat 278  Q
    ||||||| ||||| ||||  |||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32664841 cagggacctaacagtaagccgtgtttaatgaaagattaattttaaacaaaagagagaattaaatcagatttagggatttgagatttaaggatttaggaat 32664742  T
Q  279 ttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttca 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32664741 ttgatattcaatttgggaatattgatttttgattca 32664706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 146 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6612803 - 6612634
Alignment:
Q  146 tcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatga 244  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |  ||   |||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| |||| ||||    
T  6612803 tcagggacctaactgatagtaagtatgcacagttaaagatcaaacagtaagttggtgtttaatggaagattgattttaaacaaaaaagagaattagatga 6612704  T
Q  245 catttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttca 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6612703 catttagggatttgagatttaggaatttagggatttgagattcaatttggggatattgatttttggttca 6612634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 154 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 52439826 - 52439667
Alignment:
Q  154 ctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagg 252  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||| |    
T  52439826 ctaattgatagtaagtatgcgcagtcagggacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaagataattagatgacatttaag 52439727  T
Q  253 gatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggtt 312  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  52439726 gatttaaaatttagggatttaggaatttgatattcaatttgaggatattgatttttggtt 52439667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 151 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 51450388 - 51450224
Alignment:
Q  151 gacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacattt 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | || ||| ||| | ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||| ||    
T  51450388 gacctaactgatagtaagtatgcacactaagagacctaatagtaagttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaagagataattagatgacactt 51450289  T
Q  250 agggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttca 314  Q
    | |||||||||||||||  |||| |  |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  51450288 acggatttgagatttagaaattttgagatttgagattcaagttggggatatttatttttggttca 51450224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 205 - 315
Target Start/End: Original strand, 22857368 - 22857479
Alignment:
Q  205 aatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagattt-agggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattga 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||  |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||    
T  22857368 aatagaagattgattttgaacaaaaaggaaaattagatgatatttagggatttgagattttagggatttaaggatttgagattcaatttgggtatattga 22857467  T
Q  304 tttttggttcag 315  Q
    ||||||||||||    
T  22857468 tttttggttcag 22857479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 151 - 316
Target Start/End: Original strand, 34088214 - 34088370
Alignment:
Q  151 gacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacattt 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |  ||||| ||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  34088214 gacctaactgatagtaagtatgcacagtcag--atctaacagtaagttaatgtttagtggaagattaattttgaacaaaagagagaattagataacattt 34088311  T
Q  250 agggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    |  ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  34088312 aatgatttgagatttaggg--------atttgaaattcaatttggggatattgaatttttgttcagg 34088370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 309
Target Start/End: Original strand, 32665525 - 32665683
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacat 242  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| || |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||    
T  32665525 tgtcagggacctaactgatagtaagtgtgtgcagtcagggacctaacagtaggttggtgttgaatagaagattgattttgaacaaaaaagataattagat 32665624  T
Q  243 gacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttg 309  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||        || |||||||||||| |||||||||||||    
T  32665625 gacatttaaggatttaagatttagggattt--------gatattcaatttggggatattgatttttg 32665683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25038252 - 25038133
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatg 243  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||   ||||| |||||||  | |||||||||||| || |||| |||    
T  25038252 tgtcagacacccaactgatagtaagtatgcacagtaagggacctaacaataagttggtgttaatggaagattgttcttgaacaaaagaaagaattatatg 25038153  T
Q  244 acatttagggatttgagatt 263  Q
    || |||||||||||||||||    
T  25038152 acttttagggatttgagatt 25038133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25043464 - 25043345
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatg 243  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||   ||||| |||||||  | |||||||||||| || |||| |||    
T  25043464 tgtcagacacccaactgatagtaagtatgcacagtaagggacctaacaataagttggtgttaatggaagattgttcttgaacaaaagaaagaattatatg 25043365  T
Q  244 acatttagggatttgagatt 263  Q
    || |||||||||||||||||    
T  25043364 acttttagggatttgagatt 25043345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 151 - 257
Target Start/End: Original strand, 6613737 - 6613844
Alignment:
Q  151 gacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacattt 249  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  6613737 gacctaactgataataagtatgcataatcagggacttaatagtaagttgatgtttaatagaaaattgattttgtacaaaagagagaattatatgacattt 6613836  T
Q  250 agggattt 257  Q
    | ||||||    
T  6613837 aaggattt 6613844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 34085893 - 34085746
Alignment:
Q  153 cctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttag 251  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||| ||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||          
T  34085893 cctaactgatagtaaatatgcatagtcaaggatataacagtaagttgttgattaaaggaagattgattttgaacaaaagaaagaattagatgac------ 34085800  T
Q  252 ggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttca 314  Q
             |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34085799 ---------atttagtggtttaggaatttgaaattcaatttggggatattgatttttggttca 34085746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 316
Target Start/End: Original strand, 9340891 - 9340946
Alignment:
Q  261 atttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  9340891 atttagggatttaggaatttgatattcattttgggaatattgaattttggttcagg 9340946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 316
Target Start/End: Original strand, 51453570 - 51453640
Alignment:
Q  246 atttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||    
T  51453570 atttaaggatttgagatttaaggatttagggatttgaaattcaatttgcggatattgatttatgattcagg 51453640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 316
Target Start/End: Original strand, 6613839 - 6613888
Alignment:
Q  267 ggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6613839 ggatttagggatttgagattcaatttggggatattgatttttggttcagg 6613888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 26518407 - 26518312
Alignment:
Q  217 attttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcag 315  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||  |   || ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||| |||||||    
T  26518407 attttgaacaaaagagggaattagatgagatttagggattaaa---ttcgggatttaggaatttgagattcaatttggagatattggttttcggttcag 26518312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9339896 - 9339849
Alignment:
Q  268 gatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcag 315  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9339896 gatttagggatttgatattcaatttggggatattgatttttggttcag 9339849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23704006 - 23703948
Alignment:
Q  199 gtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggattt 257  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||    
T  23704006 gtgtttaatggaaaattaattttgaacaaaagagataattagatgacatttagagattt 23703948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 316
Target Start/End: Original strand, 39726538 - 39726588
Alignment:
Q  266 gggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39726538 gggatttagggatttggaattcaatttggtgatattgatttttggttcagg 39726588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 247 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5782665 - 5782600
Alignment:
Q  247 tttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggtt 312  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||    
T  5782665 tttagggatttgtgatttaaggatttaggaatgtgagattgatattggggatattgatttttggtt 5782600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7944405 - 7944357
Alignment:
Q  268 gatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  7944405 gatttagggatttgatattcaatttggggatattgatttttggtccagg 7944357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17588842 - 17588802
Alignment:
Q  217 attttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggattt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  17588842 attttgaacaaaagagaggattaaatgagatttagggattt 17588802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22857011 - 22856945
Alignment:
Q  191 aataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatt 256  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  22857011 aataagttgatgtttaatgaaagattgatttttaacaaaagagagaattagatgacattcagggatt 22856945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25038149 - 25038103
Alignment:
Q  270 tttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    |||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  25038149 tttagggatttgagattcaatttagggatattgatttttggttcagg 25038103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25043361 - 25043315
Alignment:
Q  270 tttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    |||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  25043361 tttagggatttgagattcaatttagggatattgatttttggttcagg 25043315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3117918 - 3117873
Alignment:
Q  269 atttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttca 314  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3117918 atttagggatttgatattcaatttggggatattaatttttggttca 3117873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 22856939 - 22856894
Alignment:
Q  277 atttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcaggaactaa 322  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22856939 atttgagattcaatttgaggatattgaattttggttcaggaactaa 22856894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 316
Target Start/End: Original strand, 47878119 - 47878405
Alignment:
Q  12 atgaattatcatttgaatatatcttgatatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47878119 atgaattatcatttgaatatatcttgagctcttgattattgtatacttagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaag 47878218  T
Q  112 agtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaa 211  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| | || |||||| ||                  ||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
T  47878219 agtaataaatgccaatagatttgctaattcattgtctgggaactaacttat------------------gggacctaatagtaagttgtgtttaatggaa 47878300  T
Q  212 gattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggt 311  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47878301 gattaattttgagcaaaagagagaattagatgagatttagggatttgtgatttaagaatttaggaatttgatattcaattttggaatattgatttttggt 47878400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 119 - 304
Target Start/End: Original strand, 42278727 - 42278912
Alignment:
Q  119 gatgctaatggatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaagattaat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  42278727 gatgctaatagatttgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaagtatgcacagccagagacctaacagtaagtcgtgtttaatggaagattaat 42278826  T
Q  219 tttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgat 304  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42278827 tttgaacaaaagagagaattatatgacatttagggatttgagatttaaggatttagaaatttgatattcaatttgggaatattgat 42278912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 54574810 - 54574630
Alignment:
Q  133 tgctaattcattgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagag 232  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  54574810 tgctaattcattgttagggacctaactgatagtaagtatgcacagttagggacctaacagtaagttgtgtttaatggaagattaattttgaactaaagag 54574711  T
Q  233 aggattacatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttc 313  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  54574710 agaattagatgacatttagggatttgagatttaaggagttaggaatttgatattcaatttgagaattttgatttttggttc 54574630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 144 - 272
Target Start/End: Original strand, 19051106 - 19051232
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||| ||||||| |||||||||||||||| | | || |||    
T  19051106 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacctaacaataagt--tgattaatggaagattgattttgaacaaaagagcgaactagatg 19051203  T
Q  244 acatttagggatttgagatttagggattt 272  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19051204 acatttagagatttgagatttagggattt 19051232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 154 - 316
Target Start/End: Original strand, 4702957 - 4703118
Alignment:
Q  154 ctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagg 252  Q
    |||| ||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  4702957 ctaattgataataagtatacacagtcagggatataacagtaagttgatgtttaatggaagattgattttgaacaaaagaga--attaaatgacatttagg 4703054  T
Q  253 gatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    |||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4703055 gatttgagatttagtgattcagagatttgagattcaatttggggatattgatttttgggtcagg 4703118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 148 - 316
Target Start/End: Original strand, 20599644 - 20599807
Alignment:
Q  148 agagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggactta--acaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatga 244  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  ||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20599644 agagacccaactgataataagtatgcacagttagggacctataacagtaagttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaagagagaattagatga 20599743  T
Q  245 catttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    ||||||| |||||        | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20599744 catttagagattt--------gcgatttaggaatttgagattcaatttgggaatattaatttttggttcagg 20599807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 146 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42278413 - 42278251
Alignment:
Q  146 tcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagtt-gtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatga 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||    
T  42278413 tcagggacctaactgatagtaaatatgcttagtcagggacctaacagtaggttggtgtttaatggaagatttattttgaacaaaaaaga-tattagatga 42278315  T
Q  245 catttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    || ||| |||||| ||||||||||        |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42278314 cagttaaggatttaagatttaggg--------atttgatattcaatttggggatattgatttttggttcagg 42278251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4702141 - 4701985
Alignment:
Q  161 atagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagt-tgtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttga 259  Q
    |||||||||||| | ||||||| |  ||||| ||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  4702141 atagtaaatatgtatagtcaggaatctaacagtaagtgtgtgtttaatggaagattgtttttgaacaaaatagagaattaaatgacatgtagggatttga 4702042  T
Q  260 gatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    ||| |||||||||||  |||||| |||||||||  | ||||||| ||||| ||||||    
T  4702041 gatctagggatttagagatttgagattcaattttaggatattgacttttgtttcagg 4701985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 47874930 - 47874767
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgtgtttaatagaagattaattttgaac-aaaagagaggattacat 242  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||  |||| ||    
T  47874930 tgtcagggacccaactgatagtaagtatgttcagtcagggacctaacagtaggttgtgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaaagataattatat 47874831  T
Q  243 gacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttca 314  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||        |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  47874830 gacatttaaggatttaagatttaggg--------atttgatattcaattttgggatattgatttttggttca 47874767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6039470 - 6039367
Alignment:
Q  170 atgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttaggg 268  Q
    ||||||| | || ||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  6039470 atgcacaattagagacctaacagtaagttgatgtttaatggaagattgattttgaacaaaagagagaattatatgacatttagggatttgagatctagtg 6039371  T
Q  269 attt 272  Q
    ||||    
T  6039370 attt 6039367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 268 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26170913 - 26170865
Alignment:
Q  268 gatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26170913 gatttagggatttcaaattcaatttgggaatattgattttcggttcagg 26170865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21622241 - 21622192
Alignment:
Q  142 attgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaaca 191  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  21622241 attgttagagacctaactgatagtaagtatgcacagtcagagacctaaca 21622192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 185
Target Start/End: Original strand, 24753282 - 24753323
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggac 185  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24753282 tgtcagggacctaactgatagtaattatgcacagtcagggac 24753323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19050552 - 19050488
Alignment:
Q  199 gtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatt 263  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19050552 gtgtttaatggaaaattgattttgaacaaaaaagagatttagatggcatttagggatttgagatt 19050488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 191
Target Start/End: Original strand, 24745782 - 24745829
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaaca 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  24745782 tgtcagggacctaactgatagtaattatacacagtcagggacctaaca 24745829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 272
Target Start/End: Original strand, 42391688 - 42391743
Alignment:
Q  217 attttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggattt 272  Q
    |||||||||||||||| | || | |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  42391688 attttgaacaaaagagtgaatcatatgagatttacggatttgagatttagggattt 42391743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 271 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 56041227 - 56041180
Alignment:
Q  271 ttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcaggaa 318  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  56041227 ttagggatttgaaattcaatttgtggatattgatttttagttcaggaa 56041180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 322
Target Start/End: Original strand, 26172809 - 26172847
Alignment:
Q  284 attcaatttgggaatattgatttttggttcaggaactaa 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26172809 attcaattttggaatattgatttttgattcaggaactaa 26172847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 313
Target Start/End: Original strand, 53770944 - 53770988
Alignment:
Q  269 atttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttc 313  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  53770944 atttagggatttgagattcaagttggggatattgatttttggttc 53770988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0767
Description:

Target: scaffold0767; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 144 - 316
Target Start/End: Original strand, 5985 - 6154
Alignment:
Q  144 tgtcagagacctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttg-tgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  5985 tgtcagagacctaactgatagtaagtatgcacag----ggacctaacagtaagttggtgtttaattgaagattgattttgaacaaaagagataattatat 6080  T
Q  243 gacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcagg 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6081 gacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgagattatatttggggatattgatttttggttcagg 6154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5921 - 5870
Alignment:
Q  199 gtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacattta 250  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5921 gtgtttaatggaagattgattttgaacaaaagagagaattagatgacattta 5870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 3)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 159 - 319
Target Start/End: Original strand, 31239730 - 31239891
Alignment:
Q  159 tgatagtaaatatgcacagtcagggacttaacaataagttgt-gtttaatagaagattaattttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggattt 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||  ||||| |||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||| |||| | || ||||| ||||||    
T  31239730 tgatagtaagtatgcacagtcacagatctaacagtaagttgttgtttaatgaaaaattaattttgaacaaaagagagaattagacgatatttaaggattt 31239829  T
Q  258 gagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgatttttggttcaggaac 319  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  31239830 gagatttagggatttaaggatttgagattcaatttggggatattgatttttggttcaagaac 31239891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29845819 - 29845764
Alignment:
Q  217 attttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggattt 272  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  29845819 attttgaacaaaagagataattaaatgagatttagagatttgtgatttagggattt 29845764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29857084 - 29857029
Alignment:
Q  217 attttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggattt 272  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  29857084 attttgaacaaaagagataattaaatgagatttagagatttgtgatttagggattt 29857029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 243 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 79368 - 79303
Alignment:
Q  243 gacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgaaattcaatttgggaatattgattttt 308  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||    
T  79368 gacatttaggtatttgagatttaaggatttaggaattcgagattcaatttaggcatattgattttt 79303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 2024 - 1969
Alignment:
Q  217 attttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggattt 272  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  2024 attttgaacaaaagagataattaaatgagatttagagatttgtgatttagggattt 1969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3286 - 3231
Alignment:
Q  217 attttgaacaaaagagaggattacatgacatttagggatttgagatttagggattt 272  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  3286 attttgaacaaaagagataattaaatgagatttagagatttgtgatttagggattt 3231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University