View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5224_high_4 (Length: 452)

Name: NF5224_high_4
Description: NF5224
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5224_high_4
NF5224_high_4
[»] chr3 (141 HSPs)
chr3 (10-449)||(53301244-53301684)
chr3 (10-449)||(27165235-27165674)
chr3 (10-449)||(45606647-45607084)
chr3 (10-449)||(7781087-7781524)
chr3 (10-449)||(8499503-8499942)
chr3 (10-449)||(17463163-17463599)
chr3 (10-449)||(34159311-34159747)
chr3 (10-449)||(55476476-55476912)
chr3 (29-449)||(13544029-13544445)
chr3 (10-449)||(15412414-15412853)
chr3 (29-449)||(12567564-12567981)
chr3 (10-449)||(6468875-6469311)
chr3 (10-449)||(13153996-13154433)
chr3 (10-449)||(16454021-16454458)
chr3 (10-449)||(10247464-10247900)
chr3 (10-449)||(13151531-13151968)
chr3 (10-449)||(28848362-28848788)
chr3 (194-449)||(54520989-54521244)
chr3 (211-449)||(46822445-46822683)
chr3 (10-314)||(9707482-9707784)
chr3 (194-449)||(15977700-15977954)
chr3 (194-449)||(29544582-29544837)
chr3 (10-313)||(8899079-8899379)
chr3 (210-449)||(10557091-10557330)
chr3 (10-313)||(16282688-16282988)
chr3 (10-313)||(38961768-38962068)
chr3 (237-449)||(12119394-12119606)
chr3 (10-313)||(41123875-41124172)
chr3 (197-398)||(12305315-12305516)
chr3 (248-449)||(13436520-13436721)
chr3 (261-449)||(24513910-24514098)
chr3 (234-449)||(38961578-38961794)
chr3 (234-449)||(41124146-41124361)
chr3 (277-449)||(16282498-16282670)
chr3 (303-449)||(20629932-20630078)
chr3 (247-449)||(25237063-25237265)
chr3 (234-449)||(17444504-17444719)
chr3 (247-449)||(25229476-25229678)
chr3 (10-230)||(17446614-17446831)
chr3 (41-204)||(52523666-52523831)
chr3 (10-206)||(29172565-29172760)
chr3 (314-449)||(10379614-10379749)
chr3 (10-206)||(24340660-24340856)
chr3 (10-219)||(50242807-50243014)
chr3 (320-449)||(27165738-27165867)
chr3 (320-449)||(38961385-38961514)
chr3 (320-449)||(55319044-55319173)
chr3 (321-449)||(15465448-15465576)
chr3 (10-204)||(16097319-16097509)
chr3 (10-219)||(43550448-43550656)
chr3 (320-446)||(55318854-55318980)
chr3 (320-449)||(10557394-10557523)
chr3 (320-449)||(53301051-53301180)
chr3 (321-449)||(26055005-26055133)
chr3 (323-449)||(8500009-8500135)
chr3 (331-449)||(13937520-13937638)
chr3 (320-449)||(14567432-14567561)
chr3 (320-449)||(41124425-41124554)
chr3 (10-184)||(15470915-15471085)
chr3 (10-201)||(14234475-14234665)
chr3 (10-204)||(17487844-17488038)
chr3 (40-206)||(23274705-23274871)
chr3 (319-441)||(36528447-36528569)
chr3 (320-449)||(46822747-46822876)
chr3 (321-449)||(5223677-5223805)
chr3 (10-204)||(11424702-11424892)
chr3 (10-206)||(37642202-37642398)
chr3 (10-204)||(13442262-13442456)
chr3 (10-204)||(14972842-14973036)
chr3 (10-188)||(17499326-17499504)
chr3 (194-313)||(11913927-11914047)
chr3 (25-194)||(17672626-17672794)
chr3 (40-205)||(42386428-42386593)
chr3 (41-206)||(53070636-53070799)
chr3 (320-449)||(20629739-20629868)
chr3 (10-204)||(16103771-16103960)
chr3 (10-166)||(36166583-36166737)
chr3 (84-204)||(2051138-2051260)
chr3 (10-201)||(12174205-12174389)
chr3 (339-430)||(16358234-16358325)
chr3 (10-204)||(40213660-40213853)
chr3 (10-206)||(12119707-12119902)
chr3 (10-128)||(13210342-13210460)
chr3 (10-204)||(24153148-24153341)
chr3 (10-204)||(43840920-43841114)
chr3 (320-449)||(16282305-16282434)
chr3 (232-313)||(17444693-17444773)
chr3 (10-91)||(28194678-28194759)
chr3 (10-157)||(15977500-15977646)
chr3 (10-166)||(21618434-21618588)
chr3 (36-128)||(32307691-32307783)
chr3 (10-128)||(49668091-49668206)
chr3 (10-188)||(20698391-20698568)
chr3 (10-188)||(25476340-25476518)
chr3 (10-204)||(26686875-26687069)
chr3 (10-151)||(12399197-12399338)
chr3 (320-449)||(17444311-17444440)
chr3 (10-141)||(18438521-18438653)
chr3 (319-427)||(3264323-3264431)
chr3 (10-128)||(9512911-9513026)
chr3 (10-128)||(9520886-9521001)
chr3 (36-204)||(14576772-14576939)
chr3 (10-201)||(22147467-22147658)
chr3 (10-132)||(55500927-55501048)
chr3 (10-151)||(23083353-23083494)
chr3 (41-206)||(37251105-37251270)
chr3 (36-151)||(14572603-14572717)
chr3 (340-449)||(17393221-17393330)
chr3 (41-206)||(22110289-22110454)
chr3 (41-186)||(43925977-43926123)
chr3 (245-313)||(25237009-25237076)
chr3 (9-75)||(10556969-10557035)
chr3 (10-75)||(45577950-45578015)
chr3 (10-84)||(17737221-17737294)
chr3 (396-450)||(15007868-15007922)
chr3 (9-75)||(44494793-44494859)
chr3 (320-384)||(15007988-15008052)
chr3 (340-408)||(30152450-30152518)
chr3 (320-438)||(34159811-34159929)
chr3 (340-410)||(51158683-51158753)
chr3 (340-409)||(16934851-16934920)
chr3 (340-409)||(25058298-25058367)
chr3 (340-409)||(49231768-49231837)
chr3 (36-144)||(1644674-1644780)
chr3 (146-206)||(17248224-17248283)
chr3 (405-449)||(36528340-36528384)
chr3 (41-128)||(12377940-12378029)
chr3 (320-438)||(17463663-17463781)
chr3 (320-438)||(55476976-55477094)
chr3 (340-449)||(14528625-14528734)
chr3 (351-410)||(8023799-8023858)
chr3 (29-151)||(46822272-46822394)
chr3 (342-409)||(54039167-54039234)
chr3 (399-449)||(16358408-16358458)
chr3 (340-409)||(1468654-1468723)
chr3 (340-449)||(8276474-8276583)
chr3 (199-236)||(15977663-15977700)
chr3 (340-409)||(17956869-17956938)
chr3 (394-427)||(21026150-21026183)
chr3 (405-449)||(3264494-3264538)
chr3 (351-411)||(8631319-8631379)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (10-449)||(38396-38835)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (10-449)||(37806-38243)
scaffold0134 (320-438)||(38307-38425)
[»] chr7 (134 HSPs)
chr7 (10-449)||(456306-456743)
chr7 (10-449)||(27216845-27217282)
chr7 (10-449)||(16232505-16232942)
chr7 (10-449)||(41522902-41523339)
chr7 (10-449)||(41525364-41525801)
chr7 (10-435)||(11393041-11393464)
chr7 (10-449)||(15376454-15376890)
chr7 (10-449)||(20384864-20385300)
chr7 (10-449)||(13869331-13869770)
chr7 (10-447)||(21189338-21189772)
chr7 (10-449)||(14948863-14949299)
chr7 (10-449)||(16213669-16214106)
chr7 (10-449)||(32125476-32125912)
chr7 (10-449)||(16410044-16410480)
chr7 (10-449)||(18640257-18640693)
chr7 (10-449)||(24702223-24702650)
chr7 (10-446)||(18430697-18431130)
chr7 (10-449)||(24704673-24705097)
chr7 (194-449)||(11303414-11303669)
chr7 (10-449)||(26355722-26356171)
chr7 (10-449)||(26358174-26358623)
chr7 (194-449)||(23664693-23664948)
chr7 (194-449)||(29796775-29797032)
chr7 (194-449)||(29800594-29800851)
chr7 (177-449)||(18627717-18627987)
chr7 (194-449)||(16108429-16108684)
chr7 (10-313)||(11972481-11972781)
chr7 (237-449)||(14269697-14269909)
chr7 (237-450)||(8940489-8940706)
chr7 (237-449)||(15081582-15081794)
chr7 (237-449)||(8468945-8469157)
chr7 (239-450)||(45847394-45847605)
chr7 (234-449)||(11972755-11972970)
chr7 (119-313)||(15081824-15082019)
chr7 (247-419)||(13841274-13841446)
chr7 (9-206)||(2280056-2280251)
chr7 (10-206)||(17061898-17062092)
chr7 (10-219)||(13647313-13647521)
chr7 (320-449)||(38897775-38897904)
chr7 (10-206)||(44116494-44116688)
chr7 (194-313)||(14269939-14270057)
chr7 (10-144)||(67733-67867)
chr7 (172-286)||(13841158-13841270)
chr7 (10-204)||(18456352-18456545)
chr7 (10-136)||(47831795-47831921)
chr7 (320-449)||(8940769-8940897)
chr7 (320-449)||(14156626-14156755)
chr7 (320-449)||(14269311-14269440)
chr7 (320-449)||(16214170-16214299)
chr7 (321-449)||(25926870-25926998)
chr7 (320-447)||(10501136-10501263)
chr7 (44-204)||(12255730-12255892)
chr7 (10-194)||(3386318-3386501)
chr7 (320-449)||(21189143-21189272)
chr7 (10-204)||(3564303-3564497)
chr7 (330-449)||(15081389-15081508)
chr7 (194-313)||(38898105-38898225)
chr7 (320-449)||(8940962-8941091)
chr7 (210-313)||(45847637-45847739)
chr7 (194-313)||(8940339-8940459)
chr7 (320-426)||(14156838-14156944)
chr7 (10-204)||(12698819-12699014)
chr7 (321-449)||(1856970-1857097)
chr7 (353-449)||(10500968-10501064)
chr7 (11-201)||(16219660-16219846)
chr7 (10-206)||(19486681-19486877)
chr7 (10-204)||(20110541-20110723)
chr7 (10-133)||(811141-811261)
chr7 (320-449)||(14269504-14269633)
chr7 (194-278)||(8468807-8468891)
chr7 (37-201)||(16056343-16056505)
chr7 (10-145)||(22072901-22073037)
chr7 (10-204)||(9509177-9509371)
chr7 (10-125)||(34200774-34200889)
chr7 (26-148)||(18005650-18005772)
chr7 (10-120)||(28505321-28505431)
chr7 (10-151)||(38227468-38227609)
chr7 (10-148)||(44014169-44014301)
chr7 (321-449)||(13918143-13918272)
chr7 (29-175)||(24275175-24275320)
chr7 (41-206)||(12756654-12756817)
chr7 (10-194)||(38898370-38898554)
chr7 (10-166)||(48273377-48273532)
chr7 (10-206)||(10063760-10063951)
chr7 (237-317)||(38897995-38898075)
chr7 (10-125)||(16495390-16495505)
chr7 (41-206)||(20220127-20220290)
chr7 (37-206)||(1867932-1868101)
chr7 (320-438)||(45847213-45847331)
chr7 (10-119)||(11996051-11996160)
chr7 (320-449)||(17985125-17985254)
chr7 (45-206)||(15008436-15008597)
chr7 (10-206)||(15754828-15755020)
chr7 (10-151)||(16386239-16386381)
chr7 (10-151)||(13831358-13831498)
chr7 (10-188)||(15143993-15144166)
chr7 (107-204)||(15113028-15113124)
chr7 (107-204)||(15116565-15116661)
chr7 (319-407)||(11310239-11310327)
chr7 (10-200)||(26211983-26212174)
chr7 (10-141)||(40443379-40443509)
chr7 (37-128)||(12901338-12901431)
chr7 (10-141)||(10589027-10589158)
chr7 (10-92)||(27847881-27847963)
chr7 (340-410)||(11286976-11287046)
chr7 (320-438)||(15376272-15376390)
chr7 (320-438)||(20384682-20384800)
chr7 (340-409)||(125965-126034)
chr7 (37-206)||(14044761-14044931)
chr7 (37-206)||(14354791-14354961)
chr7 (352-426)||(16202778-16202852)
chr7 (232-317)||(13745563-13745648)
chr7 (237-312)||(15119918-15119993)
chr7 (320-359)||(16410544-16410583)
chr7 (320-359)||(18628051-18628090)
chr7 (320-359)||(18640757-18640796)
chr7 (320-359)||(26355619-26355658)
chr7 (320-359)||(26358071-26358110)
chr7 (340-406)||(15951637-15951703)
chr7 (320-438)||(27217346-27217464)
chr7 (340-409)||(7822013-7822082)
chr7 (340-409)||(7829324-7829393)
chr7 (26-75)||(14932802-14932851)
chr7 (26-75)||(15356237-15356286)
chr7 (26-75)||(15360351-15360400)
chr7 (340-409)||(15760779-15760848)
chr7 (340-409)||(27102552-27102621)
chr7 (340-409)||(27109900-27109969)
chr7 (340-409)||(27175705-27175774)
chr7 (340-409)||(38784644-38784713)
chr7 (107-143)||(16324135-16324171)
chr7 (417-449)||(20110747-20110779)
chr7 (417-449)||(23461832-23461864)
chr7 (247-311)||(38294567-38294631)
[»] chr2 (130 HSPs)
chr2 (10-449)||(39682298-39682735)
chr2 (10-449)||(571382-571819)
chr2 (10-449)||(23130847-23131284)
chr2 (10-449)||(23133314-23133751)
chr2 (10-449)||(34402262-34402699)
chr2 (10-449)||(18808928-18809364)
chr2 (10-449)||(23711754-23712190)
chr2 (10-449)||(28577084-28577520)
chr2 (10-449)||(23709273-23709709)
chr2 (10-448)||(32039240-32039675)
chr2 (10-449)||(24897936-24898373)
chr2 (10-449)||(24905373-24905810)
chr2 (10-449)||(24900419-24900856)
chr2 (10-449)||(24902896-24903333)
chr2 (10-449)||(24907848-24908285)
chr2 (10-449)||(26505364-26505800)
chr2 (10-449)||(26507842-26508278)
chr2 (10-450)||(23135575-23136002)
chr2 (29-450)||(32214670-32215079)
chr2 (194-449)||(20261386-20261641)
chr2 (10-450)||(24529286-24529706)
chr2 (10-313)||(22105397-22105698)
chr2 (194-449)||(10684503-10684760)
chr2 (9-313)||(6725979-6726280)
chr2 (10-313)||(21154937-21155237)
chr2 (237-449)||(23706957-23707169)
chr2 (10-313)||(24367759-24368059)
chr2 (237-449)||(24918350-24918562)
chr2 (211-427)||(25616365-25616581)
chr2 (237-449)||(24671235-24671447)
chr2 (237-449)||(24642489-24642701)
chr2 (237-449)||(24681654-24681866)
chr2 (10-313)||(38967359-38967659)
chr2 (234-449)||(22105672-22105887)
chr2 (237-449)||(38967689-38967901)
chr2 (253-449)||(45027645-45027840)
chr2 (234-449)||(24368033-24368248)
chr2 (10-259)||(45029784-45030031)
chr2 (234-446)||(6726254-6726466)
chr2 (234-449)||(21154748-21154963)
chr2 (234-449)||(41523813-41524028)
chr2 (115-313)||(24642731-24642929)
chr2 (10-204)||(23708558-23708750)
chr2 (41-206)||(7670-7835)
chr2 (320-449)||(6726533-6726662)
chr2 (320-449)||(24529094-24529223)
chr2 (320-449)||(21154555-21154684)
chr2 (320-449)||(24918626-24918755)
chr2 (320-449)||(41523620-41523749)
chr2 (342-449)||(23931775-23931882)
chr2 (320-447)||(24368312-24368439)
chr2 (320-450)||(22105951-22106081)
chr2 (324-449)||(41523427-41523552)
chr2 (10-204)||(19671818-19672010)
chr2 (194-313)||(23707199-23707319)
chr2 (320-449)||(21154362-21154491)
chr2 (320-449)||(24681930-24682059)
chr2 (10-194)||(43137284-43137467)
chr2 (194-313)||(24918200-24918320)
chr2 (12-204)||(22337105-22337297)
chr2 (320-449)||(23706573-23706702)
chr2 (320-449)||(23709080-23709209)
chr2 (320-449)||(24671511-24671640)
chr2 (10-204)||(23060500-23060695)
chr2 (10-204)||(23076429-23076624)
chr2 (322-450)||(32214476-32214604)
chr2 (322-449)||(45027452-45027579)
chr2 (14-151)||(298806-298944)
chr2 (26-136)||(7679589-7679698)
chr2 (323-449)||(23931949-23932075)
chr2 (333-449)||(23706765-23706881)
chr2 (10-148)||(25175841-25175976)
chr2 (10-204)||(23660011-23660204)
chr2 (194-309)||(24671085-24671201)
chr2 (194-313)||(24681504-24681624)
chr2 (27-148)||(28405981-28406103)
chr2 (10-204)||(22731173-22731367)
chr2 (10-188)||(23285853-23286027)
chr2 (10-122)||(38136-38247)
chr2 (41-206)||(20520130-20520295)
chr2 (41-206)||(23207296-23207461)
chr2 (10-204)||(22738119-22738312)
chr2 (10-120)||(23071972-23072082)
chr2 (107-204)||(22459501-22459598)
chr2 (41-206)||(23791292-23791458)
chr2 (10-188)||(23654341-23654519)
chr2 (10-141)||(20309096-20309225)
chr2 (10-165)||(23103375-23103528)
chr2 (41-206)||(22413073-22413240)
chr2 (10-86)||(23040247-23040322)
chr2 (41-206)||(25108906-25109072)
chr2 (25-128)||(22134222-22134324)
chr2 (37-128)||(18786916-18787009)
chr2 (10-84)||(24643054-24643127)
chr2 (104-206)||(24697543-24697644)
chr2 (10-102)||(8946644-8946736)
chr2 (321-385)||(31345490-31345554)
chr2 (153-219)||(22173799-22173864)
chr2 (41-177)||(32451894-32452031)
chr2 (340-411)||(67339-67410)
chr2 (320-438)||(18809428-18809546)
chr2 (340-409)||(16900815-16900884)
chr2 (340-409)||(16994206-16994275)
chr2 (340-449)||(24686598-24686707)
chr2 (340-409)||(34823750-34823819)
chr2 (237-311)||(21368365-21368439)
chr2 (320-438)||(23711572-23711690)
chr2 (320-438)||(26505864-26505982)
chr2 (320-438)||(26508342-26508460)
chr2 (340-410)||(27261332-27261402)
chr2 (320-438)||(27920323-27920441)
chr2 (320-438)||(28577584-28577702)
chr2 (320-438)||(32039057-32039175)
chr2 (340-409)||(12727711-12727780)
chr2 (340-449)||(19887275-19887384)
chr2 (378-427)||(34135070-34135119)
chr2 (320-372)||(24642373-24642425)
chr2 (269-313)||(41524002-41524045)
chr2 (320-359)||(23131347-23131386)
chr2 (320-359)||(34402160-34402199)
chr2 (237-311)||(23799457-23799531)
chr2 (320-409)||(571883-571972)
chr2 (340-409)||(11232253-11232322)
chr2 (340-409)||(22514100-22514169)
chr2 (340-409)||(28776702-28776771)
chr2 (340-408)||(22274022-22274090)
chr2 (230-306)||(22686145-22686221)
chr2 (394-438)||(24788042-24788086)
chr2 (75-186)||(28349130-28349238)
chr2 (394-438)||(44584588-44584632)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (10-449)||(20732-21169)
[»] chr1 (87 HSPs)
chr1 (10-449)||(21474827-21475264)
chr1 (29-449)||(16361921-16362340)
chr1 (10-449)||(13988851-13989287)
chr1 (10-449)||(23593474-23593912)
chr1 (10-449)||(21923032-21923468)
chr1 (29-449)||(21840771-21841188)
chr1 (25-449)||(15859749-15860171)
chr1 (10-313)||(29776673-29776973)
chr1 (10-313)||(29298122-29298421)
chr1 (10-318)||(31612298-31612603)
chr1 (10-313)||(22122944-22123245)
chr1 (237-449)||(16274996-16275209)
chr1 (10-313)||(16275239-16275541)
chr1 (247-450)||(27161326-27161529)
chr1 (234-449)||(29776947-29777162)
chr1 (234-449)||(22122755-22122970)
chr1 (234-449)||(31612572-31612787)
chr1 (247-449)||(29298461-29298663)
chr1 (234-449)||(22050577-22050792)
chr1 (293-449)||(13227129-13227285)
chr1 (41-203)||(21861510-21861672)
chr1 (293-449)||(29535317-29535473)
chr1 (41-206)||(21896193-21896358)
chr1 (10-206)||(432997-433190)
chr1 (10-204)||(33680998-33681188)
chr1 (41-206)||(35261018-35261180)
chr1 (320-449)||(29298727-29298856)
chr1 (320-449)||(31612851-31612980)
chr1 (10-219)||(45574812-45575020)
chr1 (212-313)||(22050766-22050866)
chr1 (320-449)||(31613044-31613173)
chr1 (10-204)||(22237618-22237808)
chr1 (10-206)||(13212844-13213039)
chr1 (320-449)||(29777226-29777355)
chr1 (37-206)||(16758664-16758834)
chr1 (25-204)||(50210152-50210331)
chr1 (10-206)||(21346946-21347141)
chr1 (320-449)||(22122561-22122691)
chr1 (320-449)||(15859543-15859672)
chr1 (320-449)||(16274803-16274932)
chr1 (320-449)||(27161134-27161263)
chr1 (330-449)||(9044745-9044864)
chr1 (10-194)||(21707152-21707335)
chr1 (10-194)||(21711694-21711877)
chr1 (10-148)||(22921864-22921999)
chr1 (25-206)||(21342096-21342276)
chr1 (10-188)||(27250684-27250862)
chr1 (320-449)||(16401407-16401536)
chr1 (36-128)||(21754059-21754151)
chr1 (223-311)||(27161518-27161605)
chr1 (10-204)||(22532257-22532451)
chr1 (10-188)||(34509768-34509946)
chr1 (330-449)||(40129387-40129506)
chr1 (10-120)||(52927993-52928100)
chr1 (10-128)||(20248270-20248385)
chr1 (10-125)||(14295569-14295684)
chr1 (41-206)||(41049973-41050138)
chr1 (41-206)||(50614053-50614219)
chr1 (41-206)||(50621881-50622047)
chr1 (38-125)||(20918620-20918707)
chr1 (41-206)||(16368224-16368388)
chr1 (28-194)||(40389157-40389323)
chr1 (41-202)||(50686630-50686792)
chr1 (395-449)||(43543269-43543323)
chr1 (10-136)||(21161707-21161829)
chr1 (10-93)||(20847205-20847287)
chr1 (320-390)||(10812612-10812682)
chr1 (10-151)||(21026668-21026809)
chr1 (10-98)||(38801433-38801520)
chr1 (29-125)||(20454570-20454667)
chr1 (43-206)||(26064959-26065122)
chr1 (107-204)||(12271639-12271735)
chr1 (194-243)||(43543218-43543267)
chr1 (159-206)||(21477653-21477700)
chr1 (320-438)||(13989351-13989469)
chr1 (340-410)||(21858592-21858662)
chr1 (247-313)||(29298408-29298474)
chr1 (26-75)||(21714546-21714595)
chr1 (99-204)||(22354511-22354616)
chr1 (349-409)||(16655942-16656002)
chr1 (340-408)||(44035860-44035928)
chr1 (29-151)||(22468688-22468810)
chr1 (340-409)||(17003909-17003978)
chr1 (340-409)||(21650910-21650979)
chr1 (340-409)||(22366527-22366596)
chr1 (41-122)||(16093904-16093987)
chr1 (263-311)||(21244669-21244717)
[»] scaffold0230 (4 HSPs)
scaffold0230 (10-449)||(13932-14369)
scaffold0230 (236-449)||(23271-23484)
scaffold0230 (320-450)||(22917-23047)
scaffold0230 (320-406)||(23121-23207)
[»] chr6 (128 HSPs)
chr6 (10-449)||(8055014-8055451)
chr6 (29-449)||(30676450-30676868)
chr6 (10-449)||(12742302-12742739)
chr6 (10-449)||(24422532-24422968)
chr6 (10-449)||(33861779-33862215)
chr6 (10-449)||(33864263-33864699)
chr6 (10-449)||(18334333-18334769)
chr6 (10-449)||(22782212-22782648)
chr6 (29-449)||(34963377-34963795)
chr6 (10-449)||(1540652-1541088)
chr6 (10-449)||(2290921-2291357)
chr6 (10-449)||(25688487-25688924)
chr6 (10-449)||(26924381-26924817)
chr6 (10-449)||(19858663-19859096)
chr6 (10-313)||(19005031-19005331)
chr6 (29-450)||(19847711-19848109)
chr6 (198-449)||(28289077-28289326)
chr6 (223-449)||(17377588-17377814)
chr6 (236-449)||(1598266-1598478)
chr6 (194-405)||(12942368-12942579)
chr6 (211-449)||(23992604-23992844)
chr6 (15-295)||(25656619-25656897)
chr6 (237-449)||(18914142-18914354)
chr6 (261-449)||(25535641-25535829)
chr6 (237-449)||(31630281-31630493)
chr6 (237-449)||(19005361-19005573)
chr6 (10-241)||(1595534-1595763)
chr6 (9-204)||(20109127-20109322)
chr6 (37-206)||(25644335-25644505)
chr6 (210-313)||(31630523-31630626)
chr6 (194-313)||(18913994-18914112)
chr6 (10-219)||(25754794-25755001)
chr6 (320-449)||(1905-2034)
chr6 (320-449)||(8864-8993)
chr6 (320-449)||(19005637-19005766)
chr6 (320-446)||(1598542-1598668)
chr6 (10-219)||(20556864-20557069)
chr6 (10-194)||(3852011-3852194)
chr6 (320-449)||(19847519-19847648)
chr6 (10-206)||(8227448-8227644)
chr6 (321-449)||(27557016-27557144)
chr6 (194-313)||(15875473-15875591)
chr6 (10-184)||(23019396-23019567)
chr6 (10-204)||(25629294-25629488)
chr6 (340-447)||(31630090-31630197)
chr6 (320-450)||(25688988-25689118)
chr6 (320-449)||(30676257-30676386)
chr6 (320-449)||(1598735-1598864)
chr6 (324-449)||(18914422-18914547)
chr6 (324-449)||(18914615-18914740)
chr6 (320-449)||(25689181-25689310)
chr6 (10-188)||(20076688-20076862)
chr6 (321-449)||(23415258-23415386)
chr6 (10-204)||(29060527-29060722)
chr6 (25-120)||(27333241-27333336)
chr6 (25-120)||(27393981-27394076)
chr6 (320-450)||(112-242)
chr6 (367-449)||(15892149-15892231)
chr6 (41-206)||(18456735-18456898)
chr6 (28-194)||(16448520-16448686)
chr6 (10-204)||(19303480-19303673)
chr6 (324-438)||(26924199-26924313)
chr6 (10-166)||(17287773-17287929)
chr6 (10-188)||(20360915-20361093)
chr6 (320-439)||(25737128-25737247)
chr6 (37-127)||(9098528-9098620)
chr6 (10-145)||(19652186-19652317)
chr6 (237-360)||(15875621-15875734)
chr6 (25-204)||(18409766-18409945)
chr6 (10-204)||(20593761-20593955)
chr6 (10-151)||(16496232-16496373)
chr6 (37-128)||(19668386-19668479)
chr6 (194-263)||(18937252-18937321)
chr6 (10-204)||(20638222-20638416)
chr6 (320-415)||(22981321-22981416)
chr6 (320-415)||(23806992-23807087)
chr6 (10-201)||(28496417-28496605)
chr6 (10-201)||(29808828-29809016)
chr6 (10-206)||(1561291-1561483)
chr6 (41-178)||(18461895-18462031)
chr6 (36-136)||(4185828-4185928)
chr6 (36-136)||(4186381-4186481)
chr6 (10-141)||(35245574-35245703)
chr6 (382-449)||(17883238-17883305)
chr6 (10-204)||(22780166-22780360)
chr6 (10-84)||(25714405-25714478)
chr6 (41-188)||(18821801-18821946)
chr6 (10-127)||(22080754-22080858)
chr6 (10-87)||(22831491-22831568)
chr6 (14-94)||(16920679-16920759)
chr6 (320-438)||(18334151-18334269)
chr6 (340-438)||(19984130-19984228)
chr6 (320-438)||(24423032-24423150)
chr6 (340-449)||(16240296-16240405)
chr6 (340-449)||(16556945-16557054)
chr6 (340-449)||(16633501-16633610)
chr6 (340-449)||(16650175-16650284)
chr6 (10-136)||(31155404-31155527)
chr6 (41-206)||(23076749-23076915)
chr6 (77-136)||(4668218-4668277)
chr6 (77-136)||(4675065-4675124)
chr6 (74-206)||(18706356-18706488)
chr6 (104-206)||(18696570-18696670)
chr6 (340-449)||(25904474-25904584)
chr6 (320-438)||(33864763-33864881)
chr6 (340-410)||(35016043-35016113)
chr6 (340-449)||(27654597-27654706)
chr6 (394-438)||(10905416-10905460)
chr6 (41-85)||(11185524-11185568)
chr6 (340-410)||(22226608-22226679)
chr6 (340-411)||(22593620-22593691)
chr6 (351-409)||(16133087-16133145)
chr6 (340-438)||(21776107-21776205)
chr6 (237-311)||(35056707-35056781)
chr6 (340-409)||(1555527-1555596)
chr6 (340-409)||(10487971-10488040)
chr6 (340-409)||(16377288-16377357)
chr6 (340-409)||(16384612-16384681)
chr6 (340-409)||(16826408-16826477)
chr6 (149-206)||(18177609-18177666)
chr6 (149-206)||(18199353-18199410)
chr6 (149-206)||(18204205-18204262)
chr6 (320-409)||(26924035-26924124)
chr6 (340-409)||(33315116-33315185)
chr6 (149-206)||(35008276-35008333)
chr6 (413-449)||(25737028-25737064)
chr6 (43-124)||(33443068-33443150)
chr6 (41-93)||(35008167-35008219)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (10-449)||(13377-13814)
scaffold0444 (320-361)||(13878-13919)
[»] scaffold0023 (10 HSPs)
scaffold0023 (10-449)||(94396-94832)
scaffold0023 (29-449)||(17180-17598)
scaffold0023 (10-185)||(44439-44614)
scaffold0023 (10-149)||(100365-100501)
scaffold0023 (10-148)||(40169-40304)
scaffold0023 (320-430)||(17006-17116)
scaffold0023 (10-95)||(119863-119948)
scaffold0023 (26-99)||(101503-101576)
scaffold0023 (320-438)||(94896-95014)
scaffold0023 (340-409)||(154892-154961)
[»] chr8 (135 HSPs)
chr8 (10-449)||(14409185-14409621)
chr8 (10-449)||(1484387-1484823)
chr8 (10-449)||(4483266-4483702)
chr8 (10-449)||(5853033-5853469)
chr8 (29-449)||(16413056-16413474)
chr8 (10-449)||(22001738-22002174)
chr8 (10-449)||(20045936-20046372)
chr8 (10-449)||(4542114-4542550)
chr8 (10-449)||(14823759-14824196)
chr8 (38-449)||(15070571-15070982)
chr8 (139-449)||(24485784-24486093)
chr8 (211-449)||(32121912-32122150)
chr8 (10-313)||(20403212-20403512)
chr8 (210-449)||(27472157-27472395)
chr8 (211-449)||(18677805-18678043)
chr8 (10-313)||(15203108-15203408)
chr8 (10-313)||(19896250-19896554)
chr8 (248-449)||(25657893-25658094)
chr8 (10-313)||(45290571-45290872)
chr8 (248-449)||(16198115-16198316)
chr8 (237-449)||(38549745-38549957)
chr8 (239-449)||(16401665-16401875)
chr8 (257-449)||(24048841-24049032)
chr8 (237-449)||(1326672-1326884)
chr8 (234-446)||(45290385-45290597)
chr8 (234-449)||(15202919-15203134)
chr8 (25-311)||(19936882-19937168)
chr8 (153-313)||(32810058-32810216)
chr8 (230-449)||(19896524-19896743)
chr8 (234-449)||(20403486-20403701)
chr8 (237-449)||(19936648-19936850)
chr8 (320-450)||(19896807-19896937)
chr8 (41-206)||(20498581-20498746)
chr8 (319-449)||(15202726-15202856)
chr8 (320-450)||(27471963-27472093)
chr8 (320-449)||(15071046-15071175)
chr8 (320-449)||(20403765-20403894)
chr8 (320-449)||(32122214-32122343)
chr8 (10-206)||(13508022-13508218)
chr8 (210-313)||(38549987-38550090)
chr8 (10-136)||(6520356-6520482)
chr8 (10-148)||(38855246-38855384)
chr8 (320-441)||(16401287-16401408)
chr8 (10-206)||(41598173-41598367)
chr8 (10-206)||(13597554-13597750)
chr8 (321-449)||(14397481-14397609)
chr8 (10-204)||(22875053-22875246)
chr8 (348-450)||(45290287-45290389)
chr8 (320-449)||(15202533-15202662)
chr8 (320-449)||(38549552-38549681)
chr8 (341-449)||(16401472-16401580)
chr8 (320-446)||(16412866-16412992)
chr8 (331-449)||(38549360-38549478)
chr8 (10-204)||(16092281-16092475)
chr8 (26-145)||(21285601-21285720)
chr8 (10-188)||(22626723-22626901)
chr8 (330-449)||(24049106-24049225)
chr8 (210-313)||(20982603-20982710)
chr8 (10-197)||(17612056-17612243)
chr8 (320-450)||(19897000-19897130)
chr8 (25-204)||(28648983-28649162)
chr8 (10-204)||(18818348-18818542)
chr8 (10-204)||(23406367-23406563)
chr8 (9-188)||(20536195-20536374)
chr8 (41-206)||(37116366-37116532)
chr8 (201-313)||(16401907-16402020)
chr8 (194-313)||(1326914-1327038)
chr8 (10-175)||(7372766-7372931)
chr8 (9-119)||(21490982-21491092)
chr8 (10-219)||(25484245-25484445)
chr8 (320-449)||(19936455-19936584)
chr8 (10-166)||(21923905-21924061)
chr8 (237-313)||(13425335-13425411)
chr8 (10-148)||(23760839-23760974)
chr8 (10-125)||(5866292-5866407)
chr8 (10-203)||(18879176-18879364)
chr8 (41-204)||(19801367-19801527)
chr8 (237-312)||(20982498-20982573)
chr8 (10-141)||(31971245-31971375)
chr8 (25-204)||(6759261-6759437)
chr8 (10-136)||(17140904-17141030)
chr8 (237-305)||(13425237-13425305)
chr8 (10-122)||(16199666-16199777)
chr8 (10-166)||(26219702-26219856)
chr8 (10-166)||(26225270-26225424)
chr8 (10-151)||(21918992-21919133)
chr8 (29-206)||(26223923-26224098)
chr8 (41-206)||(17266930-17267096)
chr8 (36-148)||(21673718-21673830)
chr8 (10-128)||(26355713-26355828)
chr8 (342-449)||(11361024-11361131)
chr8 (41-206)||(17439443-17439609)
chr8 (37-128)||(983419-983512)
chr8 (41-206)||(24353039-24353204)
chr8 (10-125)||(21249372-21249488)
chr8 (10-125)||(21255210-21255326)
chr8 (10-141)||(21389454-21389583)
chr8 (10-141)||(21395984-21396113)
chr8 (10-141)||(21778780-21778909)
chr8 (10-141)||(21790477-21790606)
chr8 (394-449)||(32810263-32810318)
chr8 (10-122)||(45131019-45131129)
chr8 (340-438)||(24717722-24717820)
chr8 (340-449)||(15319989-15320098)
chr8 (340-449)||(15500358-15500467)
chr8 (340-409)||(29759429-29759498)
chr8 (320-438)||(1484887-1485005)
chr8 (104-206)||(22364745-22364845)
chr8 (340-409)||(13663129-13663198)
chr8 (320-409)||(20045783-20045872)
chr8 (340-409)||(22007126-22007195)
chr8 (237-308)||(21513636-21513707)
chr8 (320-438)||(5852851-5852969)
chr8 (320-438)||(14409003-14409121)
chr8 (340-410)||(17150655-17150725)
chr8 (237-311)||(18815609-18815683)
chr8 (104-184)||(40492812-40492890)
chr8 (149-188)||(14103180-14103219)
chr8 (340-427)||(21493050-21493137)
chr8 (29-151)||(23648560-23648682)
chr8 (29-75)||(18678170-18678216)
chr8 (340-410)||(22089412-22089482)
chr8 (194-236)||(35026849-35026891)
chr8 (237-311)||(36733302-36733376)
chr8 (237-311)||(38988730-38988804)
chr8 (237-311)||(39019827-39019901)
chr8 (340-449)||(223305-223414)
chr8 (340-409)||(272204-272273)
chr8 (340-409)||(643576-643645)
chr8 (340-449)||(688076-688185)
chr8 (340-449)||(736928-737037)
chr8 (340-409)||(829382-829451)
chr8 (340-449)||(860823-860932)
chr8 (41-94)||(19154936-19154989)
chr8 (237-301)||(5083004-5083068)
[»] chr5 (104 HSPs)
chr5 (10-449)||(39363369-39363806)
chr5 (10-449)||(20908997-20909433)
chr5 (10-449)||(264509-264945)
chr5 (11-449)||(38619420-38619858)
chr5 (10-449)||(10732681-10733117)
chr5 (10-449)||(39245121-39245557)
chr5 (10-449)||(42245106-42245542)
chr5 (10-449)||(23064496-23064935)
chr5 (10-449)||(29345965-29346401)
chr5 (10-449)||(29348438-29348874)
chr5 (10-449)||(29350911-29351347)
chr5 (10-449)||(2154372-2154791)
chr5 (211-449)||(17516904-17517142)
chr5 (194-449)||(37804643-37804898)
chr5 (10-313)||(29329919-29330216)
chr5 (237-449)||(20901661-20901873)
chr5 (10-313)||(32027378-32027678)
chr5 (194-449)||(9776525-9776780)
chr5 (10-313)||(20917829-20918125)
chr5 (247-449)||(20917587-20917789)
chr5 (234-449)||(32027652-32027867)
chr5 (234-449)||(29330190-29330404)
chr5 (10-313)||(20901903-20902187)
chr5 (41-204)||(22144068-22144231)
chr5 (320-450)||(17516517-17516647)
chr5 (10-204)||(21565533-21565723)
chr5 (10-204)||(11581184-11581376)
chr5 (320-449)||(32028124-32028254)
chr5 (320-449)||(20901468-20901597)
chr5 (9-201)||(21329440-21329631)
chr5 (10-194)||(36154777-36154957)
chr5 (10-204)||(23390435-23390629)
chr5 (320-450)||(32028511-32028641)
chr5 (320-449)||(29330468-29330597)
chr5 (9-201)||(21502099-21502290)
chr5 (320-445)||(295826-295951)
chr5 (320-449)||(296015-296144)
chr5 (320-449)||(17516711-17516840)
chr5 (10-204)||(19668886-19669076)
chr5 (10-206)||(10775659-10775853)
chr5 (320-449)||(2154179-2154308)
chr5 (10-166)||(22412172-22412327)
chr5 (10-204)||(9077940-9078134)
chr5 (10-184)||(26011995-26012166)
chr5 (320-449)||(20917394-20917523)
chr5 (10-204)||(1096454-1096649)
chr5 (28-194)||(18319027-18319193)
chr5 (10-206)||(40725841-40726037)
chr5 (10-204)||(24493556-24493750)
chr5 (14-204)||(25421524-25421714)
chr5 (10-130)||(21997547-21997667)
chr5 (10-128)||(22959547-22959662)
chr5 (10-188)||(24529208-24529386)
chr5 (13-204)||(8286781-8286973)
chr5 (10-206)||(31061053-31061248)
chr5 (320-449)||(32027931-32028060)
chr5 (320-449)||(32028318-32028447)
chr5 (28-194)||(24067110-24067276)
chr5 (10-113)||(19660865-19660968)
chr5 (10-151)||(13025298-13025439)
chr5 (10-151)||(13095482-13095623)
chr5 (10-151)||(21729056-21729197)
chr5 (10-151)||(21808381-21808522)
chr5 (10-120)||(36314565-36314675)
chr5 (41-202)||(22178161-22178323)
chr5 (14-204)||(25431387-25431576)
chr5 (41-128)||(20026954-20027043)
chr5 (10-151)||(22075006-22075148)
chr5 (10-166)||(37723891-37724045)
chr5 (88-166)||(20766097-20766175)
chr5 (340-410)||(27183208-27183278)
chr5 (340-449)||(22883904-22884013)
chr5 (10-93)||(21293020-21293102)
chr5 (320-438)||(264327-264445)
chr5 (75-206)||(29448055-29448187)
chr5 (340-409)||(1220384-1220453)
chr5 (340-409)||(10778832-10778901)
chr5 (10-75)||(20806854-20806919)
chr5 (340-449)||(43444009-43444118)
chr5 (237-308)||(18743965-18744036)
chr5 (320-438)||(20909497-20909615)
chr5 (340-410)||(32950213-32950283)
chr5 (340-449)||(11903-12012)
chr5 (340-449)||(25426177-25426286)
chr5 (349-409)||(28901495-28901555)
chr5 (349-409)||(28937890-28937950)
chr5 (342-449)||(7424879-7424986)
chr5 (234-313)||(20917776-20917855)
chr5 (351-438)||(31478947-31479034)
chr5 (320-359)||(39245621-39245660)
chr5 (320-359)||(39363869-39363908)
chr5 (237-311)||(1628169-1628243)
chr5 (340-409)||(1168832-1168901)
chr5 (340-409)||(11212734-11212803)
chr5 (340-437)||(11342190-11342287)
chr5 (340-409)||(21074249-21074318)
chr5 (340-409)||(21933283-21933352)
chr5 (340-409)||(21939453-21939522)
chr5 (340-449)||(22367095-22367204)
chr5 (26-75)||(26704075-26704124)
chr5 (26-75)||(26973808-26973857)
chr5 (340-409)||(35581340-35581409)
chr5 (340-409)||(36990679-36990748)
chr5 (237-309)||(21399896-21399968)
[»] chr4 (118 HSPs)
chr4 (10-449)||(15118093-15118529)
chr4 (10-450)||(3514992-3515430)
chr4 (10-449)||(44615273-44615710)
chr4 (25-449)||(19242699-19243122)
chr4 (33-449)||(14970447-14970861)
chr4 (10-449)||(50222080-50222516)
chr4 (10-449)||(44772824-44773264)
chr4 (10-449)||(1837260-1837686)
chr4 (10-449)||(7640927-7641359)
chr4 (194-449)||(15534348-15534603)
chr4 (194-449)||(36038037-36038292)
chr4 (194-449)||(49547514-49547769)
chr4 (10-313)||(18215151-18215451)
chr4 (194-449)||(14048744-14048999)
chr4 (10-359)||(18239250-18239596)
chr4 (10-313)||(12184-12484)
chr4 (10-313)||(52312495-52312795)
chr4 (237-449)||(52872813-52873025)
chr4 (244-449)||(29267570-29267775)
chr4 (10-313)||(15355201-15355502)
chr4 (29-313)||(19618049-19618330)
chr4 (237-450)||(362390-362603)
chr4 (237-447)||(19617809-19618019)
chr4 (237-449)||(15495914-15496126)
chr4 (237-449)||(14746252-14746464)
chr4 (237-450)||(19857798-19858001)
chr4 (277-449)||(11995-12167)
chr4 (234-449)||(52312769-52312983)
chr4 (37-204)||(43198492-43198661)
chr4 (41-206)||(13788-13953)
chr4 (37-206)||(52243131-52243302)
chr4 (10-206)||(44928861-44929057)
chr4 (320-449)||(362859-362988)
chr4 (320-449)||(18214751-18214880)
chr4 (237-366)||(18214992-18215121)
chr4 (320-430)||(14185621-14185731)
chr4 (320-450)||(52872619-52872749)
chr4 (320-449)||(3515493-3515622)
chr4 (320-449)||(52313240-52313369)
chr4 (330-449)||(362676-362795)
chr4 (194-313)||(15496948-15497066)
chr4 (194-313)||(52873055-52873173)
chr4 (10-219)||(51463838-51464045)
chr4 (320-449)||(14970254-14970383)
chr4 (320-449)||(15495721-15495850)
chr4 (9-219)||(23803235-23803443)
chr4 (10-133)||(39706298-39706421)
chr4 (10-219)||(12610935-12611135)
chr4 (10-204)||(16377462-16377654)
chr4 (320-449)||(19617614-19617743)
chr4 (320-449)||(19858064-19858193)
chr4 (332-449)||(14746059-14746176)
chr4 (10-194)||(44102199-44102382)
chr4 (320-449)||(52313047-52313176)
chr4 (10-204)||(7798762-7798956)
chr4 (194-313)||(14746494-14746614)
chr4 (237-337)||(15355071-15355171)
chr4 (10-206)||(15373471-15373666)
chr4 (10-166)||(14280301-14280456)
chr4 (10-188)||(7088865-7089043)
chr4 (10-188)||(12902745-12902923)
chr4 (10-204)||(16270175-16270369)
chr4 (10-188)||(22636423-22636601)
chr4 (9-166)||(6899877-6900034)
chr4 (16-166)||(8574846-8574994)
chr4 (10-206)||(15371190-15371385)
chr4 (93-206)||(15464868-15464981)
chr4 (10-166)||(54798731-54798887)
chr4 (230-313)||(19857685-19857768)
chr4 (26-120)||(12774011-12774105)
chr4 (10-206)||(15367678-15367873)
chr4 (10-206)||(15402691-15402886)
chr4 (10-120)||(15551805-15551915)
chr4 (10-203)||(44052817-44053010)
chr4 (210-278)||(362268-362336)
chr4 (10-132)||(52873378-52873500)
chr4 (37-128)||(12288223-12288316)
chr4 (10-206)||(15370006-15370200)
chr4 (41-206)||(21815568-21815731)
chr4 (41-206)||(46640393-46640558)
chr4 (10-188)||(7893690-7893869)
chr4 (303-450)||(30147191-30147338)
chr4 (10-126)||(8846347-8846460)
chr4 (27-204)||(14038653-14038830)
chr4 (11-204)||(16239909-16240102)
chr4 (41-194)||(22353852-22354005)
chr4 (10-141)||(17046475-17046604)
chr4 (41-206)||(53082089-53082254)
chr4 (10-203)||(16223520-16223712)
chr4 (320-438)||(22725284-22725401)
chr4 (11-100)||(3096282-3096370)
chr4 (28-194)||(20149832-20149998)
chr4 (10-136)||(14053309-14053434)
chr4 (340-437)||(14951270-14951367)
chr4 (61-136)||(16596687-16596762)
chr4 (29-151)||(23374351-23374473)
chr4 (342-410)||(55377225-55377293)
chr4 (41-177)||(6190481-6190618)
chr4 (122-204)||(8846472-8846553)
chr4 (324-390)||(14745925-14745991)
chr4 (320-438)||(15117911-15118029)
chr4 (340-438)||(25120046-25120144)
chr4 (340-409)||(14995644-14995713)
chr4 (340-441)||(43281694-43281795)
chr4 (194-242)||(19857611-19857659)
chr4 (412-449)||(12778423-12778460)
chr4 (340-449)||(18247739-18247848)
chr4 (340-449)||(47357183-47357292)
chr4 (342-449)||(15287859-15287966)
chr4 (342-449)||(15294969-15295076)
chr4 (340-438)||(5683367-5683465)
chr4 (340-438)||(22355071-22355169)
chr4 (340-449)||(10643746-10643855)
chr4 (352-449)||(16731688-16731785)
chr4 (340-409)||(17146320-17146389)
chr4 (340-409)||(18168293-18168362)
chr4 (320-357)||(44772723-44772760)
chr4 (342-442)||(9198558-9198658)
[»] scaffold0716 (2 HSPs)
scaffold0716 (10-449)||(4679-5116)
scaffold0716 (320-449)||(5180-5309)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (10-449)||(136665-137101)
scaffold0028 (10-449)||(139134-139570)
scaffold0028 (10-449)||(144072-144508)
scaffold0028 (10-449)||(134196-134632)
scaffold0028 (10-449)||(141603-142039)
scaffold0028 (40-127)||(62216-62303)
scaffold0028 (10-125)||(132649-132762)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (29-449)||(9246-9663)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (10-449)||(40385-40821)
scaffold0044 (340-449)||(37860-37968)
scaffold0044 (320-361)||(40885-40926)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (29-450)||(11292-11712)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (29-397)||(10777-11142)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (153-449)||(6074-6368)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (29-449)||(501088-501486)
scaffold0001 (320-446)||(501550-501676)
scaffold0001 (10-206)||(85562-85757)
scaffold0001 (26-204)||(160688-160864)
scaffold0001 (340-438)||(139589-139687)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (194-449)||(3190-3445)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (194-430)||(1595-1831)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (194-452)||(53609-53869)
scaffold0022 (41-206)||(128907-129072)
scaffold0022 (11-166)||(116416-116569)
scaffold0022 (45-206)||(78345-78505)
[»] scaffold0741 (4 HSPs)
scaffold0741 (194-449)||(4043-4300)
scaffold0741 (324-449)||(3657-3782)
scaffold0741 (320-449)||(3850-3979)
scaffold0741 (320-372)||(3541-3593)
[»] scaffold0306 (4 HSPs)
scaffold0306 (194-447)||(15087-15342)
scaffold0306 (278-449)||(11080-11251)
scaffold0306 (320-449)||(10887-11016)
scaffold0306 (320-449)||(15398-15526)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (223-449)||(6676-6902)
scaffold0317 (320-449)||(6483-6612)
[»] scaffold0043 (4 HSPs)
scaffold0043 (237-447)||(10001-10211)
scaffold0043 (320-449)||(10277-10406)
scaffold0043 (320-449)||(10470-10599)
scaffold0043 (278-313)||(9936-9971)
[»] scaffold1792 (3 HSPs)
scaffold1792 (236-449)||(416-629)
scaffold1792 (320-450)||(853-983)
scaffold1792 (320-406)||(693-779)
[»] scaffold0494 (3 HSPs)
scaffold0494 (237-446)||(267-476)
scaffold0494 (29-244)||(12194-12407)
scaffold0494 (237-313)||(506-582)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (237-449)||(30229-30441)
scaffold0149 (10-310)||(29916-30196)
scaffold0149 (320-449)||(30505-30634)
[»] scaffold0040 (4 HSPs)
scaffold0040 (245-437)||(13379-13571)
scaffold0040 (290-447)||(43002-43159)
scaffold0040 (320-449)||(43225-43354)
scaffold0040 (37-128)||(103644-103737)
[»] scaffold0747 (4 HSPs)
scaffold0747 (237-444)||(799-1006)
scaffold0747 (194-313)||(649-769)
scaffold0747 (340-449)||(1095-1204)
scaffold0747 (350-449)||(1225-1323)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (248-449)||(6682-6873)
scaffold0574 (320-449)||(6937-7066)
[»] scaffold0278 (4 HSPs)
scaffold0278 (284-449)||(7996-8161)
scaffold0278 (320-446)||(8225-8351)
scaffold0278 (323-449)||(8421-8547)
scaffold0278 (36-148)||(5657-5769)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (254-411)||(57708-57865)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (37-204)||(8481-8650)
scaffold0621 (10-148)||(6523-6661)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (41-206)||(53486-53651)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (293-450)||(68227-68384)
scaffold0064 (10-92)||(46983-47065)
[»] scaffold0145 (4 HSPs)
scaffold0145 (10-313)||(9734-10017)
scaffold0145 (10-204)||(32929-33123)
scaffold0145 (10-204)||(38748-38942)
scaffold0145 (248-310)||(10005-10067)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (10-204)||(3090-3283)
[»] scaffold1296 (2 HSPs)
scaffold1296 (320-449)||(1740-1869)
scaffold1296 (407-450)||(1634-1677)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (41-206)||(12587-12751)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (37-206)||(16037-16206)
scaffold0357 (41-206)||(13147-13313)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (10-206)||(158433-158627)
scaffold0003 (10-204)||(339889-340080)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (10-204)||(22610-22800)
scaffold0037 (10-219)||(82056-82264)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (196-313)||(27958-28074)
scaffold0114 (234-376)||(28048-28190)
scaffold0114 (10-141)||(15466-15596)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (10-204)||(10481-10671)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (37-206)||(27686-27855)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (10-194)||(16769-16952)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (10-206)||(17964-18160)
scaffold0247 (10-206)||(2111-2306)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (10-219)||(91-298)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (320-449)||(8311-8440)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (10-206)||(11452-11648)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (10-219)||(12049-12250)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (10-206)||(38193-38389)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (36-204)||(129919-130086)
scaffold0010 (41-206)||(60652-60818)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (10-133)||(6133-6256)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (10-204)||(1839-2033)
[»] scaffold0151 (2 HSPs)
scaffold0151 (320-446)||(36749-36875)
scaffold0151 (332-450)||(36938-37056)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (320-449)||(18423-18552)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (10-135)||(15785-15910)
scaffold0020 (26-75)||(178898-178947)
[»] scaffold0711 (3 HSPs)
scaffold0711 (321-449)||(7430-7558)
scaffold0711 (320-444)||(7243-7367)
scaffold0711 (322-415)||(7079-7172)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (321-449)||(17947-18075)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (10-204)||(45732-45922)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (321-449)||(31497-31625)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (194-313)||(10764-10882)
scaffold0513 (237-324)||(10647-10734)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (41-195)||(20372-20524)
scaffold0031 (10-166)||(128739-128894)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (10-135)||(6599-6724)
scaffold0333 (10-135)||(13979-14104)
[»] scaffold0034 (5 HSPs)
scaffold0034 (9-145)||(32525-32658)
scaffold0034 (340-410)||(39965-40035)
scaffold0034 (340-410)||(45448-45518)
scaffold0034 (340-410)||(79003-79073)
scaffold0034 (41-188)||(51839-51985)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (10-204)||(120-310)
[»] scaffold0138 (3 HSPs)
scaffold0138 (321-449)||(33465-33593)
scaffold0138 (10-136)||(12930-13053)
scaffold0138 (104-205)||(18176-18276)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (10-148)||(19255-19390)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (10-206)||(4199-4393)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (10-201)||(977-1167)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (10-204)||(13199-13393)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (25-204)||(39480-39658)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (25-204)||(75154-75332)
[»] scaffold0106 (5 HSPs)
scaffold0106 (194-313)||(15149-15269)
scaffold0106 (10-141)||(7254-7383)
scaffold0106 (10-141)||(1277-1406)
scaffold0106 (10-75)||(15306-15371)
scaffold0106 (237-286)||(15070-15119)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (80-206)||(225465-225590)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (10-194)||(161083-161267)
scaffold0007 (105-206)||(164573-164674)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (25-204)||(3125-3304)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (10-148)||(2801-2936)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (321-449)||(39626-39754)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (25-204)||(17154-17335)
scaffold0056 (41-206)||(79267-79430)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (41-148)||(1051-1158)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (10-125)||(15649-15764)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (10-166)||(44684-44840)
scaffold0122 (29-204)||(26004-26179)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (10-204)||(8472-8662)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (26-206)||(1086-1265)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (209-300)||(35955-36046)
scaffold0100 (10-128)||(23898-24013)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (28-194)||(4300-4465)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (10-204)||(3458-3652)
scaffold0292 (11-204)||(332-524)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (10-188)||(22871-23048)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (10-188)||(16555-16733)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (10-125)||(11280-11395)
scaffold0046 (10-125)||(1985-2100)
scaffold0046 (10-151)||(28402-28543)
scaffold0046 (10-78)||(4540-4608)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (10-204)||(25883-26077)
scaffold0026 (10-204)||(39845-40039)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (10-204)||(51901-52095)
scaffold0011 (10-188)||(167934-168111)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (43-206)||(7996-8161)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (321-449)||(19829-19957)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (37-145)||(10542-10650)
scaffold0078 (340-438)||(40628-40726)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (10-188)||(1004-1181)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (10-201)||(12754-12944)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (10-204)||(4496-4689)
scaffold0228 (10-204)||(12078-12271)
scaffold0228 (10-204)||(22030-22223)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (194-313)||(1203-1323)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (10-151)||(4837-4978)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (10-152)||(32948-33089)
scaffold0120 (10-152)||(45916-46057)
scaffold0120 (10-187)||(16101-16278)
scaffold0120 (10-84)||(17389-17462)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (10-204)||(39901-40094)
scaffold0080 (41-206)||(19822-19987)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (28-219)||(1250-1440)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (41-206)||(6220-6386)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (10-148)||(2640-2775)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (41-206)||(97024-97190)
scaffold0006 (41-206)||(106302-106468)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (36-201)||(6826-6987)
scaffold0556 (96-201)||(8089-8193)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (10-125)||(1087-1202)
scaffold0184 (340-438)||(32118-32216)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (14-204)||(6060-6253)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (10-148)||(14692-14827)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (330-425)||(113319-113414)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (41-206)||(267679-267844)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (10-122)||(13485-13596)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (37-206)||(25121-25289)
scaffold0123 (104-206)||(620-720)
scaffold0123 (247-310)||(16263-16326)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (10-125)||(34111-34226)
scaffold0175 (72-204)||(13141-13274)
scaffold0175 (10-75)||(261-326)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (10-141)||(32055-32184)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (40-188)||(24257-24406)
scaffold0042 (405-450)||(75644-75689)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (45-188)||(38339-38483)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (10-166)||(1940-2096)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (37-206)||(8011-8180)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (10-151)||(8467-8608)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (11-136)||(16271-16394)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (10-122)||(10446-10556)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (10-166)||(174754-174908)
scaffold0021 (10-92)||(121754-121835)
scaffold0021 (41-128)||(136382-136471)
scaffold0021 (41-128)||(145090-145179)
scaffold0021 (406-449)||(398-441)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (10-94)||(51570-51654)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (10-125)||(32089-32202)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (10-151)||(20898-21040)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (72-206)||(54-189)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (10-87)||(5184-5261)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (10-141)||(4699-4831)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (340-449)||(6196-6305)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (80-148)||(2213-2281)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (104-204)||(27912-28012)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (97-204)||(3469-3576)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (10-136)||(11450-11576)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (10-87)||(4890-4966)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (340-449)||(8566-8675)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (340-449)||(30470-30579)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (10-94)||(1098-1182)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (10-99)||(28813-28900)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (104-206)||(1735-1835)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (340-411)||(12519-12590)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (41-128)||(2694-2783)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (41-186)||(569-713)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (340-409)||(6970-7039)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (340-449)||(725-834)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (77-136)||(9133-9192)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (140-194)||(12047-12101)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (342-408)||(15780-15846)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (10-166)||(4505-4668)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (340-409)||(1375-1444)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (340-409)||(1296-1365)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (26-75)||(23843-23892)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (110-183)||(13092-13165)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (26-75)||(36454-36503)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (340-449)||(110065-110174)
scaffold0035 (340-449)||(118566-118675)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (342-409)||(912-979)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (149-188)||(10599-10638)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (149-188)||(617-656)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (232-311)||(15282-15361)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (340-410)||(868-938)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (340-410)||(53946-54016)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (340-410)||(19939-20009)
[»] scaffold1419 (1 HSPs)
scaffold1419 (149-206)||(149-206)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (340-409)||(18205-18274)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (340-449)||(28469-28578)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (340-409)||(38375-38444)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 141)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 53301684 - 53301244
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
53301684 caataatttggaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 53301585  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcat-caatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
53301584 ataacaatatcaaatgcaagtcattcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattacgtatacaattatatcacaatataaacaacataaaatgg 53301485  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
53301484 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgtacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 53301385  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
53301384 cataatcaattattcactgtgacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaat 53301285  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
53301284 atccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 53301244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 27165235 - 27165674
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
27165235 caataatttggaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgcaaaacaacatgat 27165334  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggt 209  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27165335 ataccaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataatttaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggt 27165434  T
210 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
27165435 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatc 27165534  T
310 ataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
27165535 ataatcaattattcactgtgacctacgttcagtaatttgatcataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaaga 27165634  T
410 tccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
27165635 tccatacctacaactttcgtgtttacccctaagaccaatt 27165674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 45607084 - 45606647
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
45607084 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 45606987  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
45606986 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 45606888  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
45606887 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 45606788  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
45606787 cataatcaattattcactgtgacctacattcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 45606688  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
45606687 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 45606647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 7781524 - 7781087
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
7781524 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 7781427  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
7781426 cataataatatcaaatgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 7781328  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
7781327 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcgat 7781228  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7781227 cataatcaattattcactgtgacctatgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 7781128  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
     |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
7781127 gtttatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaatt 7781087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 8499503 - 8499942
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||| | ||||||||||||    
8499503 caataatttggaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacacag-tagtatacaaaaacaacatga 8499600  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtc-atcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatg 207  Q
     |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| | |||||  || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8499601 cataataatatcaaatgcaagtcaatcaatgtctcaattattcacagataatctaattaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatg 8499700  T
208 gtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaa 307  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
8499701 ataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataaaacttcattaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaa 8499800  T
308 tcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8499801 tcataatcaattattcactgtgacctatgttccgtaatttcaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaa 8499900  T
408 catccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
8499901 cttccatatctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 8499942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 17463163 - 17463599
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
17463163 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 17463260  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
17463261 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 17463359  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
17463360 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 17463458  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17463459 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 17463558  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
17463559 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 17463599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 34159311 - 34159747
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
34159311 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 34159408  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
34159409 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaataa 34159507  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
34159508 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 34159606  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34159607 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 34159706  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
34159707 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 34159747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 55476476 - 55476912
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
55476476 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 55476573  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
55476574 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaataa 55476672  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
55476673 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 55476771  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
55476772 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 55476871  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
55476872 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 55476912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Original strand, 13544029 - 13544445
Alignment:
29 catcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||    
13544029 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 13544126  T
128 agtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 227  Q
    ||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
13544127 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatgataatcaacatcttaaaaca 13544225  T
228 tcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactg 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
13544226 tcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactg 13544324  T
328 taacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttc 427  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
13544325 ttacctacgtgcagta-tttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttc 13544423  T
428 gtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
13544424 gtgtttacacctaagaccaatt 13544445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 15412414 - 15412853
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||| | |||||| |||||    
15412414 caataatttggaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacacag-tagtatacaaaaacagcatga 15412511  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtc-atcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatg 207  Q
     |||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||| | |||||  || |  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
15412512 cataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatatcccaatataaacaacatcaaatg 15412611  T
208 gtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaa 307  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
15412612 ataatcaacatcttaaaacttcatatatacatataaaacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcga 15412711  T
308 tcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaa 407  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
15412712 tcataatcaattatacactgtgacctacgttcagtaatttgaccataaatcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcactagaaagctaa 15412811  T
408 catccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
15412812 catccatacctacaactttcgtgtttatacctaagaccaatt 15412853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Original strand, 12567564 - 12567981
Alignment:
29 catcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||    
12567564 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 12567661  T
128 agtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 227  Q
    ||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
12567662 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatgataatcaacatcttaaaaca 12567760  T
228 tcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactg 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
12567761 tcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactg 12567859  T
328 taacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttc 427  Q
    | |||||| |  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
12567860 ttacctacatgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttc 12567959  T
428 gtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
12567960 gtgtttacacctaagaccaatt 12567981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 6469311 - 6468875
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
6469311 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 6469214  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
6469213 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattagtcacatataattgaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 6469115  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
6469114 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 6469016  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6469015 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaattcttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 6468916  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
6468915 atttatacctccaactttcgtgtttacagctaagaccaatt 6468875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 13154433 - 13153996
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagatt-agttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatg 107  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || ||||    
13154433 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatg 13154336  T
108 atataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatg 207  Q
    | |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
13154335 acataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaata 13154237  T
208 gtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaa 307  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
13154236 ataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaa 13154138  T
308 tcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaa 407  Q
    |||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
13154137 tcatatacaattattcactgttacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaa 13154038  T
408 catccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
13154037 cattcatacctaaaactttcgtgtttacacctatgaccaatt 13153996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16454458 - 16454021
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
16454458 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 16454361  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
16454360 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaataa 16454262  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
16454261 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaat 16454163  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatcc-ttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaa 407  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16454162 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactatagttctataaatccattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaa 16454063  T
408 catccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
16454062 catttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 16454021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 10247900 - 10247464
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||| || |||||    
10247900 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatga 10247803  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
10247802 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 10247704  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||    
10247703 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactagttgatccat 10247605  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10247604 catattcaattattcactctgacctacgtgcagtaatttgagtataaatcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 10247505  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
10247504 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 10247464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 13151968 - 13151531
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagatt-agttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatg 107  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || ||||    
13151968 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatg 13151871  T
108 atataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatg 207  Q
    | |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
13151870 acataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaata 13151772  T
208 gtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaa 307  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||    
13151771 ataatcaacatcttaaaacatcatatatacatatcacacttcatcaggcatggacaatatcgtattcacaa-catataccttcatatactaattcatcaa 13151673  T
308 tcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaa 407  Q
    |||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
13151672 tcatatacaattattcactgttacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaa 13151573  T
408 catccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
13151572 cattcatacctaaaactttcgtgtttacacctatgaccaatt 13151531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 28848788 - 28848362
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
28848788 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 28848691  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||      
28848690 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataa-caacatcaaataa 28848592  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||           ||||||||||||| ||||||    
28848591 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggaaaatatcgtattcaca-----------acatatactaattcatcaat 28848503  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28848502 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 28848403  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
28848402 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 28848362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 194 - 449
Target Start/End: Original strand, 54520989 - 54521244
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacata 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
54520989 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacatacata 54521088  T
294 tactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacgg 393  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
54521089 tattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgg 54521188  T
394 cattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
54521189 cattagaaagctaacatccatacccacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 54521244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 211 - 449
Target Start/End: Original strand, 46822445 - 46822683
Alignment:
211 atcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatca 310  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
46822445 atcaacatcttaaaacatcatacatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatca 46822544  T
311 taatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacat 410  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
46822545 tattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacat 46822644  T
411 ccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
46822645 ccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 46822683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9707784 - 9707482
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| || |||||    
9707784 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatga 9707687  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||| ||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
9707686 cataataatatcaaatacaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 9707588  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
9707587 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataaaacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 9707488  T
309 cataat 314  Q
    ||||||    
9707487 cataat 9707482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 194 - 449
Target Start/End: Original strand, 15977700 - 15977954
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacata 293  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
15977700 aacaacatcaaataataaccaacatcttaaaacatcatatatacatataacactttatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcata 15977798  T
294 tactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacgg 393  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
15977799 tactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaattcttttgaagtcaaaccaacgg 15977898  T
394 cattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
15977899 cattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 15977954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 194 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 29544837 - 29544582
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacata 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||    
29544837 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcattttaacaaatatatagatacata 29544738  T
294 tactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacgg 393  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
29544737 tattaattcatcaatcataaacaattcttcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattcttttgaaatcaaaccaacgg 29544638  T
394 cattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
29544637 cattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 29544582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Original strand, 8899079 - 8899379
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
8899079 caataatttggaacttcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 8899176  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
8899177 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatca 8899275  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
8899276 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaat 8899374  T
309 cataa 313  Q
    |||||    
8899375 cataa 8899379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 210 - 449
Target Start/End: Original strand, 10557091 - 10557330
Alignment:
210 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatc 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
10557091 aatcaacatctcaaaacatcatatatacatataaaacttcatcaatcatggacaatatcgaattcacaaacatatacatacatatattaattcatcaatc 10557190  T
310 ataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    ||| |||||||||||| || ||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
10557191 atattcaattattcacagtgacctatgtgcagtaatctgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtaaaactaacggcattagaaagctaaca 10557290  T
410 tccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
10557291 tccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 10557330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16282988 - 16282688
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
16282988 caataatttggaactttatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 16282891  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||  ||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
16282890 cataataatattgaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 16282792  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
16282791 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaat 16282693  T
309 cataa 313  Q
    |||||    
16282692 cataa 16282688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 38962068 - 38961768
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
38962068 caataatttggaacttcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 38961971  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
38961970 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 38961872  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
38961871 taaccaacatcttaaaacatcatatatacatataatacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaat 38961773  T
309 cataa 313  Q
    |||||    
38961772 cataa 38961768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 237 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 12119606 - 12119394
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
12119606 catataatacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 12119507  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttaca 436  Q
    | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
12119506 tgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcactagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 12119407  T
437 cctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||    
12119406 cctaagaccaatt 12119394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Original strand, 41123875 - 41124172
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    ||||| | ||||||| ||||| || |||||    
41123875 caataatttggaactttatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa----caacaca-acagtatacaaaaacagcatga 41123969  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
41123970 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 41124068  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
41124069 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcaccaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaat 41124167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 197 - 398
Target Start/End: Original strand, 12305315 - 12305516
Alignment:
197 aacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatac 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
12305315 aacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacatacatatat 12305414  T
297 taatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcat 396  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12305415 taattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcat 12305514  T
397 ta 398  Q
    ||    
12305515 ta 12305516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 248 - 449
Target Start/End: Original strand, 13436520 - 13436721
Alignment:
248 tcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaattt 347  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
13436520 tcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatatatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaattg 13436619  T
348 gaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaa 447  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
13436620 gaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtatttatacctaagaccaa 13436719  T
448 tt 449  Q
    ||    
13436720 tt 13436721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 261 - 449
Target Start/End: Original strand, 24513910 - 24514098
Alignment:
261 acaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaa 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
24513910 acaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgatctacgtgcagtaatttgaccataactcaa 24514009  T
361 attctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
     ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
24514010 gttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 24514098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 234 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 38961794 - 38961578
Alignment:
234 atacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacct 333  Q
    |||||||||  | ||||||||||||  |||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
38961794 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 38961695  T
334 acgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacgg-cattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgct 432  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |    
38961694 acgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggccattagaaggctaacattcatacctacaactttcgtgtt 38961595  T
433 tacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||||||    
38961594 tacacctaagaccaatt 38961578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 234 - 449
Target Start/End: Original strand, 41124146 - 41124361
Alignment:
234 atacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacct 333  Q
    |||||||||  | ||||||||||||  |||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
41124146 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactagttcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 41124245  T
334 acgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgctt 433  Q
    |||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
41124246 acgtgcaataatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaatcaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 41124345  T
434 acacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||    
41124346 acacctaagaccaatt 41124361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 277 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16282670 - 16282498
Alignment:
277 aaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttt 376  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
16282670 aaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgacaataactcaagttctataaatccttt 16282571  T
377 tgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
16282570 tgaagtcaaaccaatggcattagaaatctaacattcatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 16282498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 303 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 20630078 - 20629932
Alignment:
303 atcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaa 402  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20630078 atcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaa 20629979  T
403 gctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
20629978 gctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaatt 20629932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 247 - 449
Target Start/End: Original strand, 25237063 - 25237265
Alignment:
247 ttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatt 346  Q
    ||||||||||||  |||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
25237063 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatt 25237162  T
347 tgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagacca 446  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
25237163 tgactataactcaagttctataaatccttttgaagttaaacacacggcattagaaacctaacattcataccaacaactttcgtgtttacacctaagacca 25237262  T
447 att 449  Q
    |||    
25237263 att 25237265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 234 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 17444719 - 17444504
Alignment:
234 atacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacct 333  Q
    |||||||||  | ||||||||||||  |||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||    
17444719 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacct 17444620  T
334 acgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgctt 433  Q
    |||| ||  |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
17444619 acgtgcaaaaatttgactataactcaagttcaataaatccttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 17444520  T
434 acacctaagaccaatt 449  Q
    |||| |||||||||||    
17444519 acacttaagaccaatt 17444504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 247 - 449
Target Start/End: Original strand, 25229476 - 25229678
Alignment:
247 ttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatt 346  Q
    ||||||||||||  |||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || || ||  |||||||    
25229476 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacttatgtgtagtaatt 25229575  T
347 tgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagacca 446  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
25229576 tgactataactcaagttctataaatccttttgaagttaaacacacggcattagaaacctaacattcataccaacaactttcgtgtttacacctaagacca 25229675  T
447 att 449  Q
    |||    
25229676 att 25229678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17446831 - 17446614
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
17446831 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 17446735  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
17446734 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatcattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaataa 17446636  T
209 taatcaacatcttaaaacatca 230  Q
    ||||||||||||||||||||||    
17446635 taatcaacatcttaaaacatca 17446614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523666
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |    
52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaaca 52523732  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
52523731 tctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 52523666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 29172760 - 29172565
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| || |||||    
29172760 caataatttgaaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatga 29172663  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
29172662 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatactatcaacatcaaat 29172565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 314 - 449
Target Start/End: Original strand, 10379614 - 10379749
Alignment:
314 tcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatcca 413  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
10379614 tcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatcca 10379713  T
414 tacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
10379714 tacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 10379749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24340856 - 24340660
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| | | |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||| |||| ||||||    
24340856 caataatttggaacatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaacatcatgat 24340757  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    |||| |||||| || |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
24340756 ataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 24340660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Original strand, 50242807 - 50243014
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||    
50242807 caataatttggaacttcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacagt-agtatacaaaaacaacatga 50242904  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||      
50242905 cataataatatcaaatgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatca 50243003  T
209 taatcaacatc 219  Q
    |||||||||||    
50243004 taatcaacatc 50243014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 27165738 - 27165867
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
27165738 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatacataccta 27165837  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
27165838 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 27165867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 38961514 - 38961385
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
38961514 attcactgtgacctacgtgcagcaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 38961415  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
38961414 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 38961385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 55319173 - 55319044
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
55319173 attcactgtgacttacgtgcagtaatttgaccataattcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 55319074  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
55319073 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 55319044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 321 - 449
Target Start/End: Original strand, 15465448 - 15465576
Alignment:
321 ttcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctac 420  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
15465448 ttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaatggcattagaaagctaacattcatacctac 15465547  T
421 aactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
15465548 aactttcgtgtttacacctaagaccaatt 15465576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 16097319 - 16097509
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||| ||    
16097319 caataatttggaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatcat 16097415  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
16097416 ataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 16097509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 43550656 - 43550448
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||| || | || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||  | ||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
43550656 caataatttggaacatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataatga-cagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatga 43550558  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
43550557 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatca 43550459  T
209 taatcaacatc 219  Q
    |||||||||||    
43550458 taatcaacatc 43550448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 320 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 55318980 - 55318854
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
55318980 attcactgcgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgatgtcataccaacggcattagaaagctaccatccataccta 55318881  T
420 caactttcgtgcttacacctaagacca 446  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
55318880 caactttcgtgtttacacctaagacca 55318854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 10557394 - 10557523
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10557394 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtccgaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 10557493  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
10557494 caacttttgtgtttacaactaagaccaatt 10557523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 53301180 - 53301051
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
53301180 attcactgtgacctatgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatacataccta 53301081  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
53301080 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 53301051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 321 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 26055133 - 26055005
Alignment:
321 ttcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctac 420  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
26055133 ttcactgtgacctacgtgcagtaattttaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaaaggcattagaaagctaacatccatacctac 26055034  T
421 aactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||    
26055033 aactttcatgtttacacctaagaccaatt 26055005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 323 - 449
Target Start/End: Original strand, 8500009 - 8500135
Alignment:
323 cactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaa 422  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
8500009 cactgtgacctacgtgcagtaacttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatctatacctacaa 8500108  T
423 ctttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||    
8500109 cttttgtgtttacacctaagaccaatt 8500135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 331 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 13937638 - 13937520
Alignment:
331 cctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtg 430  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13937638 cctacgtgcagtaatttgaccataacacaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtg 13937539  T
431 cttacacctaagaccaatt 449  Q
     ||||||||||||||||||    
13937538 tttacacctaagaccaatt 13937520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14567561 - 14567432
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
14567561 attcactgtgacctacgtgtagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgatgttagaccaacgacattagaaagctaacattcataccta 14567462  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
14567461 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 14567432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 41124425 - 41124554
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
41124425 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgatcataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacattcataccta 41124524  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
41124525 caacttttgtgtttacacctaagaccaatt 41124554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Original strand, 15470915 - 15471085
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||   |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
15470915 caataatttggaacatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 15471011  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatat 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||| | |||||||| ||| ||  |||||||||||||    
15471012 ataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 15471085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 201
Target Start/End: Original strand, 14234475 - 14234665
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
14234475 caataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 14234574  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacat 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||| | ||| | |||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||| ||  ||||||||    
14234575 ataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacat 14234665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 17487844 - 17488038
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||    
17487844 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatga 17487942  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||  |||||||| ||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
17487943 cataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 17488038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 206
Target Start/End: Original strand, 23274705 - 23274871
Alignment:
40 acttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatat 139  Q
    |||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||| | ||| ||    
23274705 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 23274804  T
140 ctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
23274805 ctcaaatattcacatataattcaagtaaagaatatacaattacatcacattataaacaacatcaaat 23274871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 319 - 441
Target Start/End: Original strand, 36528447 - 36528569
Alignment:
319 tattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacct 418  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
36528447 tattcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataattcatttagacgtcaaaccaatggcattagaaagctaacatccatacct 36528546  T
419 acaactttcgtgcttacacctaa 441  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
36528547 acaactttcgtgtttacacctaa 36528569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 46822747 - 46822876
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
46822747 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgacgataactcaagttttataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 46822846  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||    
46822847 caacttccgtgtttacacctaagaccaatt 46822876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 321 - 449
Target Start/End: Original strand, 5223677 - 5223805
Alignment:
321 ttcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctac 420  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
5223677 ttcactgtgacctacgtggagtaatttgatcataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaatggcattagaaagctaacatccatacctat 5223776  T
421 aactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||    
5223777 aactttcgtgtttacacctaagacgaatt 5223805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11424892 - 11424702
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||     
11424892 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgac 11424794  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    |||||||||||||  ||||   ||||| ||||||| ||| |||  |||||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||||||| ||||    
11424793 ataacaatatcaatagcaa---atcaacatctcaattatgcattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataaacaacttcaa 11424702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 37642398 - 37642202
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| | | |||| ||||||||| ||||| |||||||  |||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
37642398 caataatttggaacatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgat 37642299  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    |||| ||||||  | | |||| | ||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
37642298 ataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 37642202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 13442262 - 13442456
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||    
13442262 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatga 13442360  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||  |||||||| |||  |||  |||||||||||  |||| |||||||||    
13442361 cataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaa 13442456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 14972842 - 14973036
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||| | |||||| |||||    
14972842 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatga 14972940  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| |||  |||||||||||| ||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
14972941 cataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcatatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 14973036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 17499326 - 17499504
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||    
17499326 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatga 17499424  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||  |||||||| ||| ||||  |||||||||||    
17499425 cataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 17499504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11914047 - 11913927
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacataca 291  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
11914047 aacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatgtacataca 11913949  T
292 tatactaatttatcaatcataa 313  Q
    |||||||||| |||||||||||    
11913948 tatactaattcatcaatcataa 11913927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 194
Target Start/End: Original strand, 17672626 - 17672794
Alignment:
25 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
17672626 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17672723  T
124 tgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataa 194  Q
    ||||| ||| |||  |||||| |||||| ||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||    
17672724 tgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcacaatataa 17672794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 205
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386593
Alignment:
40 acttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaaca 42386526  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaa 205  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||    
42386527 tctcaaatattcattcataattcaagcaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaa 42386593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070636
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatat 139  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||  |    
53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacata-acagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 53070702  T
140 ctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
53070701 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatct-aacaacatcaaat 53070636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 20629868 - 20629739
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
20629868 attcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgctttaatgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 20629769  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
     |||||| ||| ||||||||||||||||||    
20629768 taacttttgtgtttacacctaagaccaatt 20629739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 16103771 - 16103960
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
16103771 caataatttggaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 16103867  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||| ||| | ||||||||  || ||  |||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
16103868 ataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaata-tcaaacataattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaa 16103960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Original strand, 36166583 - 36166737
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| || |||||| ||||||| |||||     
36166583 caatactttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacacag-cagtatacaaaacagcatgac 36166680  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagta 166  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||||    
36166681 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta 36166737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 84 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2051260 - 2051138
Alignment:
84 atagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaatta 181  Q
    |||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
2051260 ataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaatta 2051161  T
182 tatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
2051160 tatcacattataaacaacatcaa 2051138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12174389 - 12174205
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
12174389 caataatttggaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 12174293  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacat 201  Q
    ||||||||||| |||||||   | ||| | |||||||| ||| | |||| ||| ||| ||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
12174292 ataacaatatcgaatgcaa---aacaacaactcaaata-tcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 12174205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 339 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 16358325 - 16358234
Alignment:
339 cagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtg 430  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16358325 cagtaatttgaccataactcaagttctataaatccgtttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtg 16358234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 40213853 - 40213660
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgca-aaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||||| || |||||| || ||||| |||||    
40213853 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacatcaacacag-cagtatacataaacatcatga 40213756  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||  ||||| |||||| ||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
40213755 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacattcataatccaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaa 40213660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12119902 - 12119707
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| ||| || |||||| | |||||| |||||    
12119902 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataac-aacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatga 12119805  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtc-atcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
     |||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||| | |||||  || || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
12119804 cataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacagataatctaattaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaat 12119707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 13210460 - 13210342
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||    
13210460 caataatttgaaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgat 13210361  T
110 ataacaatatcaaatgcaa 128  Q
    |||| |||||| |||||||    
13210360 ataataatatcgaatgcaa 13210342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24153341 - 24153148
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  | ||||||||||  ||||| ||||||| |||||     
24153341 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gatagcaacataggtagtatacaaaacagcatgac 24153243  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||  |||| ||||| || |||  |||  || ||||||||  |||| |||||||||    
24153242 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgcacataacataatatcacatcataatcaacatcaa 24153148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 43840920 - 43841114
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| |||||    
43840920 caataatttggaacatcattatcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatga 43841018  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||| ||||||||| ||  |||| |||||||||  |||| |||||||| |||  |||  |||||||||||| |||| |||||||||    
43841019 cataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaa 43841114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16282434 - 16282305
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| || |||  ||||| |||| ||||||| |||||||    
16282434 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacatcagactaacaacattaaaaagataacatctataccta 16282335  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
16282334 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 16282305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 232 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17444773 - 17444693
Alignment:
232 atatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
17444773 atatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcataa 17444693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 91
Target Start/End: Original strand, 28194678 - 28194759
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacag 91  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
28194678 caataatttggaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacag 28194759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 157
Target Start/End: Original strand, 15977500 - 15977646
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||||||||||||    
15977500 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatga 15977597  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatata 157  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||    
15977598 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatata 15977646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Original strand, 21618434 - 21618588
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| | ||||||| ||||||| |||||     
21618434 caatactttggaacttcatcttctcaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacaca-acagtatacaaaacagcatgac 21618531  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagta 166  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||||    
21618532 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta 21618588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 128
Target Start/End: Original strand, 32307691 - 32307783
Alignment:
36 atcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaa 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
32307691 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 32307783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 49668206 - 49668091
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
49668206 caataatttggaacatcatcatc---atcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 49668110  T
110 ataacaatatcaaatgcaa 128  Q
    ||||||||||| |||||||    
49668109 ataacaatatcgaatgcaa 49668091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 20698568 - 20698391
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| |||||    
20698568 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 20698470  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
      ||| |||||||| ||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||  |||||||| ||| || || |||||||||||    
20698469 cgtaataatatcaattgcaattcatcaacatcttatatattcaaatattcttcaagtaatgcataaac-attatatcaca 20698391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25476518 - 25476340
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||| ||||| || |||||    
25476518 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaacaa-cagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatga 25476420  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||  |||||||||||| |||| |||  |||||||||||    
25476419 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgcataacattatatcaca 25476340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 26686875 - 26687069
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | |||||| |||||    
26686875 caataatttggaacatcatcatcttcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatga 26686973  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||| ||||||||| ||  |||| ||||||||   |||| |||||||| |||  |||  |||||||||||| |||| |||||||||    
26686974 cataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattccattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaa 26687069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 151
Target Start/End: Original strand, 12399197 - 12399338
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || |||||    
12399197 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatga 12399295  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattca 151  Q
     |||| |||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||    
12399296 cataataatatcaaatgcaattcaacaacatcttaaatattca 12399338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 17444440 - 17444311
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||  |||||| || | ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
17444440 attcactatgacctacgtgcagtaatttgaccatagctcaagttgtataaattgttttgacgttagaccaacgacattagaaagataacatccatactta 17444341  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||    
17444340 caactttcctgtttacacctaagaccaatt 17444311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Original strand, 18438521 - 18438653
Alignment:
10 caataatttgaaacc-tcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatg 107  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||    
18438521 caataatttgaaaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatg 18438619  T
108 atataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatct 141  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
18438620 atataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 18438653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 319 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 3264431 - 3264323
Alignment:
319 tattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacct 418  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| || |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
3264431 tattcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataattcatttagacgtcaaatcaacggccttagaaatctaacatccatacct 3264332  T
419 acaactttc 427  Q
    |||||||||    
3264331 acaactttc 3264323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 128
Target Start/End: Original strand, 9512911 - 9513026
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
9512911 caataatttggaacatcatcatc---atcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 9513007  T
110 ataacaatatcaaatgcaa 128  Q
    ||||||||||| |||||||    
9513008 ataacaatatcgaatgcaa 9513026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 128
Target Start/End: Original strand, 9520886 - 9521001
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
9520886 caataatttggaacatcatcatc---atcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 9520982  T
110 ataacaatatcaaatgcaa 128  Q
    ||||||||||| |||||||    
9520983 ataacaatatcgaatgcaa 9521001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14576939 - 14576772
Alignment:
36 atcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatca 135  Q
    |||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||    
14576939 atcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataacaa-cagcaacatagacagtataaacaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 14576841  T
136 atatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    | |||| |||||||||  |||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
14576840 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 14576772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22147658 - 22147467
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| | | |||| |||||| || ||||| |||||||  |||  | ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||    
22147658 caataatttggaacatcaacatcttcaacgacttggaccgagtcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgcaaaacatcatgat 22147559  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacat 201  Q
    |||| ||||||  | | |||| | ||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
22147558 ataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 22147467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Original strand, 55500927 - 55501048
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||| |||||    
55500927 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 55501024  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtca 132  Q
     |||| ||||||||||||||||||    
55501025 cataataatatcaaatgcaagtca 55501048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23083494 - 23083353
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||||||  ||||    
23083494 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatga 23083396  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattca 151  Q
     |||| |||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||    
23083395 cataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattca 23083353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 37251270 - 37251105
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
37251270 cttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 37251171  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||    ||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
37251170 tctcaaca--tcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaat 37251105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 151
Target Start/End: Original strand, 14572603 - 14572717
Alignment:
36 atcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatca 135  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| ||  ||||| ||    
14572603 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacatagacagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgagagtcaaca 14572701  T
136 atatctcaaatattca 151  Q
    | |||| |||||||||    
14572702 acatcttaaatattca 14572717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Original strand, 17393221 - 17393330
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||    
17393221 agtaatttgactataactaatgttctaaaaatcattttggagtcaaaccaacgccattggaaaggtaacatccatacctacaacttttgtgtttacatct 17393320  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||||||||||    
17393321 aagaccaatt 17393330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22110454 - 22110289
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaaca--acatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||   ||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |    
22110454 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacagca 22110355  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||    ||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||    
22110354 tctcaa--catcatatagaattcatgtaatgcgtatacatttatatcacattattaacaacttcaaat 22110289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 186
Target Start/End: Original strand, 43925977 - 43926123
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaaca--acatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||   ||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
43925977 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 43926076  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatca 186  Q
    ||||||| | ||||||| |||||| ||| ||| |||||| ||||||||    
43926077 tctcaaaca-tcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatatca 43926123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Original strand, 25237009 - 25237076
Alignment:
245 acttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
25237009 acttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcataa 25237076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 75
Target Start/End: Original strand, 10556969 - 10557035
Alignment:
9 tcaataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaa 75  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
10556969 tcaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 10557035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 45578015 - 45577950
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaa 75  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
45578015 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45577950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 84
Target Start/End: Original strand, 17737221 - 17737294
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaaca 84  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
17737221 caataacttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 17737294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 450
Target Start/End: Original strand, 15007868 - 15007922
Alignment:
396 ttagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaattt 450  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
15007868 ttagaaagctaacatccatacctataactttcgtgtttacacctaaaaccaattt 15007922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 75
Target Start/End: Original strand, 44494793 - 44494859
Alignment:
9 tcaataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaa 75  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
44494793 tcaataatttagaacttcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaa 44494859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 384
Target Start/End: Original strand, 15007988 - 15008052
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtca 384  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
15007988 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtca 15008052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 408
Target Start/End: Original strand, 30152450 - 30152518
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||| | |||||||||||||||    
30152450 agtaatttgatcataactcaaattctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaac 30152518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Original strand, 34159811 - 34159929
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  | | ||||| |||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
34159811 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 34159910  T
420 caactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| || |||||||    
34159911 caactttcatgtttacacc 34159929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 51158753 - 51158683
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacat 410  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | |||||||||||||||||    
51158753 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacat 51158683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 16934920 - 16934851
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
16934920 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaggccattagaaagctaaca 16934851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Original strand, 25058298 - 25058367
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
25058298 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaaccaacgccattagaaagctaaca 25058367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Original strand, 49231768 - 49231837
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
49231768 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaaccaacgccattagaaagctaaca 49231837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 1644780 - 1644674
Alignment:
36 atcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatca 135  Q
    ||||||||||||| |||  ||  | ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||| ||| ||    
1644780 atcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatgcaaatcatcattatataacaatatcgaatacaa-tcaaca 1644683  T
136 atatctcaa 144  Q
    |||||||||    
1644682 atatctcaa 1644674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17248283 - 17248224
Alignment:
146 tattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
17248283 tattcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaat 17248224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 449
Target Start/End: Original strand, 36528340 - 36528384
Alignment:
405 taacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
36528340 taacatccatacctacaactttcgtgtttacatctaagaccaatt 36528384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 128
Target Start/End: Original strand, 12377940 - 12378029
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaaca--acatgatataacaatatcaaatgcaa 128  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||   |||||||||||||||| ||||||  |||| |   |||||||||||||||||||||||||    
12377940 cttagaccgactcatacagcttagttaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaatagctcatgatataacaatatcaaatgcaa 12378029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Original strand, 17463663 - 17463781
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  | | ||||| |||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||    || |||    
17463663 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactgtaaagctaacacaattatcta 17463762  T
420 caactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| || |||||||    
17463763 caactttcatgtttacacc 17463781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Original strand, 55476976 - 55477094
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |   ||||| |||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
55476976 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccgaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 55477075  T
420 caactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| || |||||||    
55477076 caactttcatgtttacacc 55477094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14528734 - 14528625
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||| | ||||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||||||   |||||||||||||||||   || ||| ||||||| || |||||||     
14528734 agtaatttaatcataactaaagttctaaaaatcatttggaagtcaaaccaaatccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacacca 14528635  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
14528634 aaggccaatt 14528625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 410
Target Start/End: Original strand, 8023799 - 8023858
Alignment:
351 cataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacat 410  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||| | | |||||||||||||||||    
8023799 cataactcaaaatctagaaatcatttttaagtcaaacccaagccattagaaagctaacat 8023858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 151
Target Start/End: Original strand, 46822272 - 46822394
Alignment:
29 catcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgca-aaacaacatgatataacaatatcaaatgca 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| || |||| ||||| |||  | ||  ||||||| || |||| |||||||| ||||    
46822272 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaattgca 46822370  T
128 agtcatcaatatctcaaatattca 151  Q
    | ||| ||| |||| |||||||||    
46822371 attcaacaacatcttaaatattca 46822394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 54039234 - 54039167
Alignment:
342 taatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
54039234 taatttgatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaaca 54039167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 399 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16358458 - 16358408
Alignment:
399 gaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
16358458 gaaagctaacatctatatctaaaactttcatgtttacacctaagaccaatt 16358408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 1468723 - 1468654
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
1468723 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaaca 1468654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 8276583 - 8276474
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | |||||||||||||| |    || ||||||||||| || |||||||     
8276583 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttcgacgtcaaaccaaagccattagaaagctaataaaattatctacaactttcatgtttacacca 8276484  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
8276483 aagtccaatt 8276474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 236
Target Start/End: Original strand, 15977663 - 15977700
Alignment:
199 catcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatata 236  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
15977663 catcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatata 15977700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 17956938 - 17956869
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| | ||| ||| || |||||||||| | |||| |||||||||||    
17956938 agtaatttgatcataactcaagttctaaatatcatttagatgtcaaaccaaagccattggaaagctaaca 17956869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 394 - 427
Target Start/End: Original strand, 21026150 - 21026183
Alignment:
394 cattagaaagctaacatccatacctacaactttc 427  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
21026150 cattagaaatctaacatccatacctacaactttc 21026183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 3264538 - 3264494
Alignment:
405 taacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||    
3264538 taacatccatacctacaactttcgtgaagacacctaagatcaatt 3264494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 411
Target Start/End: Original strand, 8631319 - 8631379
Alignment:
351 cataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatc 411  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||    
8631319 cataactcaaaaactaaaaatcattttcaagtcaaaccaaagccattggaaagctaacatc 8631379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 38835 - 38396
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38835 caataatttggaacctcatcatcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 38736  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38735 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatatttatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggt 38636  T
210 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
38635 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatc 38536  T
310 ataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    ||||||||||||||| | | ||  || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
38535 ataatcaattattcaatatgacaaacatacagtaatttgaacataactcaaattctataaatcattttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaaca 38436  T
410 tccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||    
38435 tccatacctacaactttcgtgtttagccctaagatcaatt 38396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 37806 - 38243
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
37806 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 37903  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
37904 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 38002  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
38003 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 38102  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38103 cataatcaattattcactgtgacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 38202  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
38203 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 38243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Original strand, 38307 - 38425
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  | | ||||| |||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
38307 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 38406  T
420 caactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| || |||||||    
38407 caactttcatgtttacacc 38425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 134)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 456306 - 456743
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
456306 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 456403  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
456404 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 456502  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
456503 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 456602  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
456603 cataatcaattattcactgtgacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 456702  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
456703 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 456743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 27216845 - 27217282
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
27216845 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 27216942  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
27216943 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 27217041  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
27217042 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 27217141  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27217142 cataatcaattattcactgtgacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 27217241  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
27217242 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 27217282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 16232505 - 16232942
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
16232505 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 16232602  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
16232603 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 16232701  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
16232702 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 16232801  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
16232802 cataatcaattattcactgtgacctacgttcagtaatttgacaataactcaaattctataaatccttttgaattcaaaccaacggcattagaaagctaac 16232901  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
16232902 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 16232942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 41522902 - 41523339
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
41522902 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 41522999  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
41523000 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 41523098  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
41523099 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 41523198  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41523199 cataatcaattattcactgtgacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 41523298  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
41523299 atttatacctacaacttttatgtttacacctaagaccaatt 41523339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 41525364 - 41525801
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
41525364 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 41525461  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
41525462 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 41525560  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
41525561 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 41525660  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41525661 cataatcaattattcactgtgacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 41525760  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
41525761 atttatacctacaacttttatgtttacacctaagaccaatt 41525801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 10 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 11393464 - 11393041
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
11393464 caataatttggaactccatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 11393367  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
11393366 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 11393268  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
11393267 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 11393168  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11393167 cataatcaattattcactatgacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 11393068  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttac 435  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||    
11393067 atttatacctacaactttcgtgtttac 11393041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15376890 - 15376454
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
15376890 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 15376793  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
15376792 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 15376694  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
15376693 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 15376595  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15376594 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 15376495  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
15376494 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 15376454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 20385300 - 20384864
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
20385300 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 20385203  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
20385202 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 20385104  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
20385103 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 20385005  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20385004 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 20384905  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
20384904 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 20384864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 13869331 - 13869770
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||| | |||||| |||||    
13869331 caataatttggaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacacag-tagtatacaaaaacagcatga 13869428  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtc-atcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatg 207  Q
     |||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||| | |||||  || |  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
13869429 cataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcaaagataatctaattgatgcatatacaattatatcccaatataaacaacatcaaatg 13869528  T
208 gtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaa 307  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
13869529 ataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataaaacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaa 13869628  T
308 tcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
13869629 tcataatcaattattcactgtgacctacgttcagtaatttaaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcactagaaagctaa 13869728  T
408 catccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
13869729 catccatacctacaactttcgtgtttatacctaagaccaatt 13869770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 10 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 21189772 - 21189338
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
21189772 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 21189675  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
21189674 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 21189576  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
21189575 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaac-tatacattcatatactaattcatcaat 21189477  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
21189476 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattaaaaagctaac 21189377  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaa 447  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
21189376 attcatacctacaactttcttgtttacacctaagaccaa 21189338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14949299 - 14948863
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
14949299 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 14949202  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
14949201 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaataa 14949103  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
14949102 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 14949004  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14949003 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 14948904  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
14948903 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 14948863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 16213669 - 16214106
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| ||||||||    
16213669 caataatttggaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatga 16213766  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||| ||||||| |||  ||| || |||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
16213767 cataataatatcaaatccaagtcaacaacgtcttaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaacataa-caacatcaaatgg 16213865  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
16213866 taatcaacatatgaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 16213965  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16213966 cttattcaattattcactgtgacctacgtgcagtcatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 16214065  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
16214066 atccatacctacaacttttgtgtttacacgtaagaccaatt 16214106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 32125476 - 32125912
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
32125476 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 32125573  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
32125574 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 32125672  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
32125673 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 32125771  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
32125772 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggtattagaaagctaac 32125871  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
32125872 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 32125912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 16410044 - 16410480
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
16410044 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 16410141  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||      
16410142 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatcatagtataa-caacatcaaataa 16410240  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||    
16410241 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattgatatactaattcatcaat 16410339  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16410340 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 16410439  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
16410440 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 16410480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 18640257 - 18640693
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
18640257 caataatttggaccttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 18640354  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||      
18640355 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacataaaataa 18640453  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||    
18640454 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggaaaatatcgtattcacaa-catatacattcatatagtaattcatcaat 18640552  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
18640553 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataaatcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattataaagctaac 18640652  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
18640653 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 18640693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 24702223 - 24702650
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
24702223 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatga 24702320  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
24702321 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 24702419  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||          ||||||||||||| || |||    
24702420 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaa----------acatatactaattcatgaat 24702509  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24702510 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 24702609  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
24702610 atttatacctacaaccttcgtgtttacacctaagaccaatt 24702650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 446
Target Start/End: Original strand, 18430697 - 18431130
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||| || |||||    
18430697 caataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatataaaaacatcatga 18430794  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
18430795 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaataa 18430893  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
18430894 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 18430992  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    || | ||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
18430993 cagattcaattattcactatgttctacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaacctaag 18431092  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagacca 446  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
18431093 attcatacctacaactttcgtgtttacacctaagacca 18431130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 24704673 - 24705097
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||  ||| ||     
24704673 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaa--acaagac 24704768  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggt 209  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |    
24704769 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataat 24704867  T
210 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||          ||||||||||||| || ||||    
24704868 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaa----------acatatactaattcatgaatc 24704957  T
310 ataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24704958 atattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 24705057  T
410 tccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
24705058 tttatacctacaaccttcgtgtttacacctaagaccaatt 24705097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 194 - 449
Target Start/End: Original strand, 11303414 - 11303669
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacata 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
11303414 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacatacata 11303513  T
294 tactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacgg 393  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11303514 tattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacgg 11303613  T
394 cattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
11303614 cattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacatctaagaccaatt 11303669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 26356171 - 26355722
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaa--acagca--acatagaca-----gtatgcaaaa 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||   |||||||||||||  ||| ||  ||||| |||     |||| |||||    
26356171 caataatttggaacttcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacataaacacaacagtatacaaaa 26356072  T
101 -caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaac 199  Q
     || ||| | |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
26356071 acagcataacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caac 26355973  T
200 atcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatata--catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatact 297  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
26355972 attaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatatacatataacacttcatcaattatggacaatatcgtatttacaa-catatacattcatatact 26355874  T
298 aatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcatt 397  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
26355873 aattaatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgtagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggaatt 26355774  T
398 agaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
26355773 agaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttaacacataagaccaatt 26355722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 26358623 - 26358174
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaa--acagca--acatagaca-----gtatgcaaaa 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||   |||||||||||||  ||| ||  ||||| |||     |||| |||||    
26358623 caataatttggaacttcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacataaacacaacagtatacaaaa 26358524  T
101 -caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaac 199  Q
     || ||| | |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
26358523 acagcataacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caac 26358425  T
200 atcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatata--catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatact 297  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
26358424 attaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatatacatataacacttcatcaattatggacaatatcgtatttacaa-catatacattcatatact 26358326  T
298 aatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcatt 397  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
26358325 aattaatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgtagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggaatt 26358226  T
398 agaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
26358225 agaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttaacacataagaccaatt 26358174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 194 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 23664948 - 23664693
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacata 293  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
23664948 aacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatacatataacctttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacatacata 23664849  T
294 tactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacgg 393  Q
    || ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
23664848 tattaattcatcaatcatcaacaattcttcactgtgacctacatgcaataatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgg 23664749  T
394 cattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
23664748 cattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 23664693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 194 - 449
Target Start/End: Original strand, 29796775 - 29797032
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatat--atacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacataca 291  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
29796775 aacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatatacatataacccttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacataca 29796874  T
292 tatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaac 391  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
29796875 tatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgatctacgtgcagtaatttgaccatagctcaagttctataaattcttttgaagtcaaaccaac 29796974  T
392 ggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29796975 ggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 29797032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 194 - 449
Target Start/End: Original strand, 29800594 - 29800851
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatat--atacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacataca 291  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
29800594 aacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatatacatataacccttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacataca 29800693  T
292 tatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaac 391  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
29800694 tatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgatctacgtgcagtaatttgaccatagctcaagttctataaattcttttgaagtcaaaccaac 29800793  T
392 ggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29800794 ggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 29800851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 177 - 449
Target Start/End: Original strand, 18627717 - 18627987
Alignment:
177 aattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac 276  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
18627717 aattatatcacaatataa-caagatcaaatactaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcacggaaaatatcgtattcac 18627815  T
277 aaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttt 376  Q
    || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
18627816 aa-catatacattcatataataattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataaatcaagttctataaatccttt 18627914  T
377 tgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
18627915 tgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 18627987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 194 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16108684 - 16108429
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacata 293  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
16108684 aacaacatcaaacggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatattgtattcacaaatatatacatacata 16108585  T
294 tactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacgg 393  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |    
16108584 tattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacgtacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacag 16108485  T
394 cattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
16108484 cattagaaaactaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 16108429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Original strand, 11972481 - 11972781
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
11972481 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 11972578  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
11972579 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 11972677  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
11972678 taatcaatatcttaaaacatcatatatacatgtaacacttcatcaatcatgggcaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaat 11972776  T
309 cataa 313  Q
    |||||    
11972777 cataa 11972781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 237 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14269909 - 14269697
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
14269909 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 14269810  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttaca 436  Q
    | ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
14269809 tgcaaaaatttgaccataactcaatttctataaatccttttgaagtcgaaccaacggaattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 14269710  T
437 cctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||    
14269709 cctaagaccaatt 14269697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 237 - 450
Target Start/End: Original strand, 8940489 - 8940706
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
8940489 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 8940588  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgc----t 432  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     |    
8940589 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtgtgtt 8940688  T
433 tacacctaagaccaattt 450  Q
    ||||||||||||||||||    
8940689 tacacctaagaccaattt 8940706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 237 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15081794 - 15081582
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||||||    
15081794 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcacttagacctacg 15081695  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttaca 436  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
15081694 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattcttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaacttttgtgtttaca 15081595  T
437 cctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||    
15081594 cctaagaccaatt 15081582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 237 - 449
Target Start/End: Original strand, 8468945 - 8469157
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||     
8468945 catataacatttcatcaatcatgaacaatatcgtattcaaaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctaca 8469044  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttaca 436  Q
    | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
8469045 tgcagtaatttgatcataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgtcattagaaaactaacatctatacctacaactttcgtgtttaca 8469144  T
437 cctaagaccaatt 449  Q
     ||||||||||||    
8469145 gctaagaccaatt 8469157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 239 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 45847605 - 45847394
Alignment:
239 tataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgtt 338  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
45847605 tataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacagacatatacatacatataccaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtg 45847506  T
339 cagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacc 438  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
45847505 caataatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaactaacagagttagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttatacc 45847406  T
439 taagaccaattt 450  Q
    ||||||||||||    
45847405 taagaccaattt 45847394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 234 - 449
Target Start/End: Original strand, 11972755 - 11972970
Alignment:
234 atacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacct 333  Q
    |||||||||  | ||||||||||||  |||| ||| || ||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
11972755 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatgcattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 11972854  T
334 acgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgctt 433  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||    
11972855 acgtacagtaatttgactataactcaagttctatagatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgttt 11972954  T
434 acacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||    
11972955 acacctaagacaaatt 11972970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 119 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15082019 - 15081824
Alignment:
119 tcaaatgcaagtca-tcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaaca 217  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
15082019 tcaaatgcaagtcaatcaatgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcataatcaaca 15081921  T
218 tct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataa 313  Q
    ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
15081920 tcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatacatacatatactaattcatcaatcataa 15081824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 247 - 419
Target Start/End: Original strand, 13841274 - 13841446
Alignment:
247 ttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatt 346  Q
    ||||||||||||  |||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
13841274 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatt 13841373  T
347 tgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
13841374 tgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggaattagaaagctaacattcataccta 13841446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2280251 - 2280056
Alignment:
9 tcaataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatga 108  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
2280251 tcaataatttggaacatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatga 2280154  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || | | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
2280153 tataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacatcaaat 2280056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17062092 - 17061898
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||| ||||| | |||||     
17062092 caataatttgaaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaactcag-cagtatacaaaatagcatgac 17061994  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
17061993 ataataatatcaaatgcaagtcagcaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaat 17061898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Original strand, 13647313 - 13647521
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||| || | || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||    
13647313 caataatttggaacatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatga 13647411  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
13647412 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatca 13647510  T
209 taatcaacatc 219  Q
    |||||||||||    
13647511 taatcaacatc 13647521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 38897904 - 38897775
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38897904 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacgtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 38897805  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||    
38897804 caactttcgagtttacacctaagaccaatt 38897775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Original strand, 44116494 - 44116688
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| ||||||||    
44116494 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatga 44116591  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
44116592 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaat 44116688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14270057 - 14269939
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacata 293  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
14270057 aacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacata 14269959  T
294 tactaatttatcaatcataa 313  Q
    || ||||| |||||||||||    
14269958 tattaattcatcaatcataa 14269939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 144
Target Start/End: Original strand, 67733 - 67867
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
67733 caataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 67832  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaa 144  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||    
67833 ataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa 67867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 172 - 286
Target Start/End: Original strand, 13841158 - 13841270
Alignment:
172 tatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgta 271  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13841158 tatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgta 13841256  T
272 ttcacaaacatatac 286  Q
    |||| ||||||||||    
13841257 ttca-aaacatatac 13841270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18456545 - 18456352
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  |||||||||| |||||| |||||||||||||     
18456545 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgat-agcaacataggcagtatacaaaacaacatgac 18456447  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||  |||| |||||||| |||  |||  |||||||||||  |||| |||||||||    
18456446 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaa 18456352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 47831795 - 47831921
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||    
47831795 caataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcatatcatcatgat 47831894  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 136  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
47831895 ataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 47831921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 8940769 - 8940897
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8940769 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 8940868  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||||    
8940869 caacttt-ttgtttacacctaagaccaatt 8940897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14156755 - 14156626
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||| | | ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14156755 attcactgtgacctacatgcggtaatttgatcataagtcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 14156656  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||    
14156655 caactttcgtgttatcacctaagaccaatt 14156626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14269440 - 14269311
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
14269440 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgacaataactcaagttctataaatcgttttgacatcaaaccaacggaattagaaagctaacatccataccta 14269341  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
14269340 caacttttgtgtttacacctaagaccaatt 14269311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 16214170 - 16214299
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16214170 attcactgtgacctacgtgcagtaatatgaccataactcaagttctataaatctttttgacgtcataccaacggcattagaaagctaacatccataccta 16214269  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||||||    
16214270 caacctttgtgtttacacctaagaccaatt 16214299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 321 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 25926998 - 25926870
Alignment:
321 ttcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctac 420  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
25926998 ttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataactctttttgacgtcagaccaatggcattagaaagctaatatccatacctac 25926899  T
421 aactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
25926898 aactttcgtgtttacacctaagaccaatt 25926870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 320 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 10501263 - 10501136
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
10501263 attcactatgaccttcgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccatttgaagtcaaaccaacgacattagaaatctaacatccataccta 10501164  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaa 447  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||    
10501163 caacttttgtgtttacacctaagaccaa 10501136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12255892 - 12255730
Alignment:
44 agaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatct 141  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||  ||| ||||    
12255892 agacagactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatct 12255793  T
142 caaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
12255792 caaacattcatatataattcaagtaatacatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 12255730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 3386318 - 3386501
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | |||||| |||||    
3386318 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatga 3386415  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataa 194  Q
     || | |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
3386416 catgataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatcacaatataa 3386501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 21189272 - 21189143
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
21189272 attcactctgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattgttttgacgtcagaccaacggcattaaaaagctaatatccataccta 21189173  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
21189172 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 21189143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3564497 - 3564303
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
3564497 caataatttagaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatga 3564399  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||| |||  |||||||||||| ||||||||  |||| ||||||  |||| |||||||||    
3564398 cataataatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattagatcacatcataatcaacatcaa 3564303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 330 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15081508 - 15081389
Alignment:
330 acctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgt 429  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15081508 acctacgtgcagtaatttaaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgt 15081409  T
430 gcttacacctaagaccaatt 449  Q
    | ||||  ||||||||||||    
15081408 gtttacttctaagaccaatt 15081389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 38898225 - 38898105
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacataca 291  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
38898225 aacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatacataca 38898127  T
292 tatactaatttatcaatcataa 313  Q
    |||||||||| |||||||||||    
38898126 tatactaattcatcaatcataa 38898105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 8940962 - 8941091
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||  ||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8940962 attcactgcgacctatgtgcagtagtttgagcataactcaagttctataaatcattttgacttcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 8941061  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
8941062 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 8941091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 210 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45847739 - 45847637
Alignment:
210 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatc 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
45847739 aatcaacatcttaaa-catcatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatattaattcatcaatc 45847641  T
310 ataa 313  Q
    ||||    
45847640 ataa 45847637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Original strand, 8940339 - 8940459
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacataca 291  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |    
8940339 aacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatacataaa 8940437  T
292 tatactaatttatcaatcataa 313  Q
    |||||||||| |||||||||||    
8940438 tatactaattcatcaatcataa 8940459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 320 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 14156944 - 14156838
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
14156944 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaacataactcacgttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacattcataccta 14156845  T
420 caacttt 426  Q
    |||||||    
14156844 caacttt 14156838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 12698819 - 12699014
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaa--acaacatg 107  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||    
12698819 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatg 12698917  T
108 atataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    | |||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||  |||||||| |||  |||  |||||||||||  |||| |||||||||    
12698918 acataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaa 12699014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 321 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 1857097 - 1856970
Alignment:
321 ttcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctac 420  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
1857097 ttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttatataaatcgttttgacgtcagaccaatgacattagaaagctaacattcatacctac 1856998  T
421 aactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||    
1856997 aac-ttcgtgtttacacctaagaccaatt 1856970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 353 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 10501064 - 10500968
Alignment:
353 taactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
10501064 taactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcatgttatcacctaagaccaatt 10500968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16219846 - 16219660
Alignment:
11 aataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgata 110  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||   |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
16219846 aataatttggaacatcatcatctt---caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgata 16219750  T
111 taacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacat 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| | ||| | |||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||| ||  ||||||||    
16219749 taacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcttaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 16219660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19486877 - 19486681
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| | | |||| ||||||||| ||||| |||||||  |||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
19486877 caataatttggaacatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgat 19486778  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    |||| ||||||  | | |||| | ||| |||||||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
19486777 ataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 19486681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 20110541 - 20110723
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    || |||      |||||| |||||     
20110541 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagc----tataca------aaaacagcatgac 20110629  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
20110630 ataataatatcaaatgcaagtcaataacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 20110723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 811261 - 811141
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||    
811261 caataatttggaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 811165  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcat 133  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
811164 ataacaatatcgaatgcaagtcat 811141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14269633 - 14269504
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||| | |||| ||| || ||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
14269633 attcactctgacctgcgtgcaataatttgatgataactcaagttctataaatttttttgacgtcataccaaaggcattagaaagctaacatccataccta 14269534  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
14269533 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 14269504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 194 - 278
Target Start/End: Original strand, 8468807 - 8468891
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa 278  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8468807 aacaacatcaaataataatcaacatcataaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa 8468891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 201
Target Start/End: Original strand, 16056343 - 16056505
Alignment:
37 tcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 136  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
16056343 tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgc-aaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaa 16056441  T
137 tatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacat 201  Q
     |||||||| | ||| | |||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||| ||  ||||||||    
16056442 catctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 16056505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 145
Target Start/End: Original strand, 22072901 - 22073037
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| || |||||    
22072901 caatagtttggaacatcatcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatga 22073000  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaa 145  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
22073001 tataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 22073037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 9509177 - 9509371
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaa-aacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| |||| |||||    
9509177 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagtaacataggcagtatacaataacagcatga 9509275  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||  |||||||| |||  |||  | |||||||||  |||| |||||||||    
9509276 cataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaa 9509371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Original strand, 34200774 - 34200889
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
34200774 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgat 34200873  T
110 ataacaatatcaaatg 125  Q
    |||| |||||| ||||    
34200874 ataataatatcgaatg 34200889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 148
Target Start/End: Original strand, 18005650 - 18005772
Alignment:
26 catcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatg 125  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||    
18005650 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtatggaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 18005749  T
126 caagtcatcaatatctcaaatat 148  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||    
18005750 caaatcaacaacatctcaaatat 18005772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 28505431 - 28505321
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
28505431 caataatttggaacatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgat 28505332  T
110 ataacaatatc 120  Q
    |||| ||||||    
28505331 ataataatatc 28505321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 151
Target Start/End: Original strand, 38227468 - 38227609
Alignment:
10 caataatttg-aaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
38227468 caataatttggaaacatcatcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaacagcatga 38227566  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattca 151  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
38227567 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatattca 38227609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 148
Target Start/End: Original strand, 44014169 - 44014301
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
44014169 caataatttggaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 44014265  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatat 148  Q
    ||||||||||| |||||||   ||||| |||||||||||    
44014266 ataacaatatcgaatgcaa---atcaacatctcaaatat 44014301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 321 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 13918272 - 13918143
Alignment:
321 ttcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctac 420  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
13918272 ttcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaatggaattagaaagctaacattcatacctac 13918173  T
421 aactttcgtgcttacacct-aagaccaatt 449  Q
    |  ||||||| |||||||| ||||||||||    
13918172 agttttcgtgtttacacctaaagaccaatt 13918143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 175
Target Start/End: Original strand, 24275175 - 24275320
Alignment:
29 catcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||    
24275175 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 24275272  T
128 agtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtata 175  Q
    ||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||    
24275273 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 24275320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12756817 - 12756654
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatat 139  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| | |||  |    
12756817 cttagaccgactcgagcagtttagttaaataacaa-cagcaacaca-acaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgt 12756720  T
140 ctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
12756719 ctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaat 12756654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 38898554 - 38898370
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || | ||| || ||||||  |||| || |||||    
38898554 caataatttggaacttcaccatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacgacacag-cagtatataaaaacagcatga 38898457  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtca-tcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataa 194  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||    
38898456 cataataatatcaaatgcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacagtataa 38898370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Original strand, 48273377 - 48273532
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||| | |||||| |||||    
48273377 caatactttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatga 48273475  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagta 166  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||    
48273476 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctc-aatatacattcataattcaagta 48273532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10063951 - 10063760
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||| || ||| | | |||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||| |||| ||||||    
10063951 caataatttggaacatcaacaccttcaacgacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaacatcatgat 10063852  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    |||| |||||| ||  ||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||      | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
10063851 ataataatatcgaacacaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaa-----acatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 10063760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 38898075 - 38897995
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
38898075 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaa 38897995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Original strand, 16495390 - 16495505
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
16495390 caataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgat 16495489  T
110 ataacaatatcaaatg 125  Q
    |||| |||||| ||||    
16495490 ataataatatcgaatg 16495505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20220290 - 20220127
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||||   ||||||   |||||||||||||||||||||||||   ||||| |    
20220290 cttagaccgactcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaaca 20220194  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
20220193 tctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaat 20220127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867932
Alignment:
37 tcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaac--atgatataacaatatcaaatgcaagtcatc 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||  |||||| |  |||||||||||||||||| ||||| | | |    
1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaa-tgcaaatgaac 1868003  T
135 aatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    || |||||||| || ||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
1868002 aacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaat 1867932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 45847331 - 45847213
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||    || |||    
45847331 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcataccaacgacattagaaagttaacacaattatcta 45847232  T
420 caactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| || |||||||    
45847231 caactttcatgtttacacc 45847213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 11996160 - 11996051
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
11996160 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgat 11996061  T
110 ataacaatat 119  Q
    |||| |||||    
11996060 ataataatat 11996051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 17985254 - 17985125
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||| | ||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||| | ||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||||    
17985254 attcactatgacctacgtgtagtaatttgactataactcaagttctaaatatcattttggaatcaaaccaactccattagaaatttaacatccttaccta 17985155  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||    
17985154 caactttcatgtttacacctaagaccaatt 17985125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15008597 - 15008436
Alignment:
45 gaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctc 142  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||  |||||  ||||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| | |||    
15008597 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacacctc 15008499  T
143 aaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
15008498 aaacat-catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaat 15008436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15755020 - 15754828
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| | ||| ||||  |||||||||| || ||||||    
15755020 caattatttggaacatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgat 15754921  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    |||| |||||| |||||||   ||||| | |||||||| ||| | |||| ||| ||| ||  ||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||    
15754920 ataataatatcgaatgcaa---atcaacaactcaaata-tcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaat 15754828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 16386381 - 16386239
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||| || |||||    
16386381 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatga 16386282  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattca 151  Q
     ||||  ||||||| || |  ||||||| |||| |||||||||    
16386281 cataaatatatcaattgtatttcatcaacatcttaaatattca 16386239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 151
Target Start/End: Original strand, 13831358 - 13831498
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||  |  ||||| | ||||||||||||    
13831358 caataatttggaacttcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaaca-cggtagtatacaaaaacaacatga 13831455  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattca 151  Q
     |||| ||||| |||||||||||| |||  |||||| ||||||    
13831456 cataataatataaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattca 13831498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15144166 - 15143993
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaa-aacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| |||| || ||    
15144166 caataatttggaacatcatcatct----caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacat-ctcagtatgcaataacagcaaga 15144073  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
    ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||| |||  |||||| ||||| ||||||||  || ||||||||    
15144072 tatcataatatcaaatgcaagccaacaacatctcaagtatacattcataatttaagtaatgcgtataacatcatatcaca 15143993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 15113028 - 15113124
Alignment:
107 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| |   ||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
15113028 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctc-aatattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataattaacatcaa 15113124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 15116565 - 15116661
Alignment:
107 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| |   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
15116565 gatataacaatatcaattgcaagtcatcaacatctc-aatattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataaataacatcaa 15116661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 319 - 407
Target Start/End: Original strand, 11310239 - 11310327
Alignment:
319 tattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaa 407  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
11310239 tattcactctgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttatataattcatttagacgtcaaaccaatggcattagaaagctaa 11310327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Original strand, 26211983 - 26212174
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcat-cttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatg 107  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||    
26211983 caataatttggaacatcatcattcttcaacaacttagaccgactcatacaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatg 26212081  T
108 atataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaaca 200  Q
    | |||| |||||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||| |||    ||||||| ||| || |  ||||||||||| ||||| |||||    
26212082 acataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacattataatcaaca 26212174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Original strand, 40443379 - 40443509
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||  | ||||| |||||     
40443379 caataatttggaatatcatcatcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaac-aaacagcatgac 40443477  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatct 141  Q
    |||| |||||||| | ||| ||||||| ||||    
40443478 ataataatatcaatttcaattcatcaacatct 40443509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Original strand, 12901338 - 12901431
Alignment:
37 tcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaa 128  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
12901338 tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaa 12901431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Original strand, 10589027 - 10589158
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||    
10589027 caataatttggaacatcatcatcttcgacaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatga 10589125  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatct 141  Q
     ||||  ||||||| ||||| ||| ||| ||||    
10589126 cataatcatatcaattgcaattcaacaacatct 10589158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 27847963 - 27847881
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagt 92  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | || |||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
27847963 caataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagt 27847881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 410
Target Start/End: Original strand, 11286976 - 11287046
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacat 410  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||    
11286976 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagacaaaccaaagccattagaaagctaacat 11287046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 15376390 - 15376272
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  | | ||||| |||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
15376390 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 15376291  T
420 caactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| || |||||||    
15376290 caactttcatgtttacacc 15376272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20384800 - 20384682
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  | | ||||| |||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
20384800 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 20384701  T
420 caactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| || |||||||    
20384700 caactttcatgtttacacc 20384682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Original strand, 125965 - 126034
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
125965 agtaatttgatcataactcaagttctaaaactcatttggaagtcaaaccaaagccattagaaagctaaca 126034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Original strand, 14044761 - 14044931
Alignment:
37 tcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaaca--acatgatataacaatatcaaatgcaagtc-at 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||||||||| |||||   ||||||   | ||||||||||||||| ||| ||| || ||    
14044761 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaat 14044859  T
134 caatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||| |||||||| | |||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||| ||| ||| || ||||| ||||    
14044860 caacatctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaat 14044931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Original strand, 14354791 - 14354961
Alignment:
37 tcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaaca--acatgatataacaatatcaaatgcaagtc-at 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||||||||| |||||   ||||||   | ||||||||||||||| ||| ||| || ||    
14354791 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaat 14354889  T
134 caatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||| |||||||| | |||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||| ||| ||| || ||||| ||||    
14354890 caacatctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaat 14354961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 16202852 - 16202778
Alignment:
352 ataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaacttt 426  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
16202852 ataactcaaattctagaaatcatcatgaagtaaaaccaaagccattagaaatctaacatcactacctacaacttt 16202778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13745648 - 13745563
Alignment:
232 atatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaa 317  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||| |||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||    
13745648 atattcatataataattcattaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcatgatcaa 13745563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15119993 - 15119918
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcata 312  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||| || |||||||    
15119993 catataataattcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcataaatcata 15119918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 359
Target Start/End: Original strand, 16410544 - 16410583
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactca 359  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
16410544 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 16410583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 359
Target Start/End: Original strand, 18628051 - 18628090
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactca 359  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
18628051 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 18628090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 359
Target Start/End: Original strand, 18640757 - 18640796
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactca 359  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
18640757 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 18640796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26355658 - 26355619
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactca 359  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
26355658 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 26355619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26358110 - 26358071
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactca 359  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
26358110 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 26358071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15951703 - 15951637
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagcta 406  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||| ||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||||||||    
15951703 agtaatttaatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaaccaacgccattagaaagcta 15951637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Original strand, 27217346 - 27217464
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |  | | ||||| |||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||    || |||    
27217346 attcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactgtaaagctaacacaattatcta 27217445  T
420 caactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| || |||||||    
27217446 caactttcatgtttacacc 27217464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Original strand, 7822013 - 7822082
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
7822013 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaaca 7822082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Original strand, 7829324 - 7829393
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
7829324 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaaca 7829393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 14932851 - 14932802
Alignment:
26 catcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaa 75  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||   |||||||||||||||    
14932851 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 14932802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 15356286 - 15356237
Alignment:
26 catcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaa 75  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||   |||||||||||||||    
15356286 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 15356237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 15360400 - 15360351
Alignment:
26 catcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaa 75  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||   |||||||||||||||    
15360400 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 15360351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 15760848 - 15760779
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
15760848 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaaca 15760779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 27102621 - 27102552
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
27102621 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaaca 27102552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 27109969 - 27109900
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
27109969 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaaca 27109900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Original strand, 27175705 - 27175774
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
27175705 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaaca 27175774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 38784713 - 38784644
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
38784713 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaaca 38784644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 143
Target Start/End: Original strand, 16324135 - 16324171
Alignment:
107 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctca 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
16324135 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctca 16324171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 417 - 449
Target Start/End: Original strand, 20110747 - 20110779
Alignment:
417 ctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
20110747 ctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 20110779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 417 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 23461864 - 23461832
Alignment:
417 ctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
23461864 ctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 23461832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 311
Target Start/End: Original strand, 38294567 - 38294631
Alignment:
247 ttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcat 311  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||| | ||||||||||| |||| | ||||| |||||||||    
38294567 ttcatcaatcatgaacaacatcatattcgccaacatatacattcatagaataattcatcaatcat 38294631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 130)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 39682298 - 39682735
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
39682298 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 39682395  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
39682396 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 39682494  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
39682495 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 39682594  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39682595 catattcaattattcactgtgacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 39682694  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
39682695 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 39682735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 571382 - 571819
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
571382 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 571479  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| | |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
571480 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 571578  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
571579 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcattaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 571678  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
571679 cataatcaattattcactgtgacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgacgtcaaaccaacgacattagaaagctaac 571778  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
571779 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 571819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 23130847 - 23131284
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
23130847 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 23130944  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
23130945 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaataa 23131043  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
23131044 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaat 23131143  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
23131144 cataatcaattattcactgtgacctacgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcactagaaagctaac 23131243  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
23131244 atccatacctacaactttcgtgtttatacctaagaccaatt 23131284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 23133314 - 23133751
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
23133314 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 23133411  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
23133412 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaataa 23133510  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
23133511 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaat 23133610  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
23133611 cataatcaattattcactgtgacctacgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcactagaaagctaac 23133710  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
23133711 atccatacctacaactttcgtgtttatacctaagaccaatt 23133751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 34402699 - 34402262
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
34402699 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 34402602  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
34402601 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaataa 34402503  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
34402502 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaat 34402403  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
34402402 cataatcaattattcactgtgacctacgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcactagaaagctaac 34402303  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
34402302 atccatacctacaactttcgtgtttatacctaagaccaatt 34402262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 18808928 - 18809364
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
18808928 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 18809025  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
18809026 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 18809124  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
18809125 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 18809223  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18809224 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 18809323  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
18809324 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 18809364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 23712190 - 23711754
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
23712190 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 23712093  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
23712092 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 23711994  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
23711993 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 23711895  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23711894 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 23711795  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
23711794 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 23711754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 28577084 - 28577520
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||  | ||||||| ||||| || |||||    
28577084 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacgca-acagtatacaaaaacagcatga 28577181  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
28577182 tataataatatcaaatgcaagccaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 28577280  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
28577281 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatattgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 28577379  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28577380 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 28577479  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
28577480 attcatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 28577520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 23709709 - 23709273
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
23709709 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 23709612  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
23709611 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 23709513  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
23709512 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 23709414  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| |||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
23709413 catattcaattcttcattgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaactgcattagaaagctaac 23709314  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
23709313 attcatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaatt 23709273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 10 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 32039675 - 32039240
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| | ||||||| ||||| || |||||    
32039675 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaa-cagtaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 32039578  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
32039577 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatca 32039479  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
32039478 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcgatcatggacaatatcagattcacaa-catatacatacatatactaattcatcaat 32039380  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
32039379 cataatcaattattcactgtgacctacgttcagtaatttgaccataacttaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaaa 32039280  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaat 448  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
32039279 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaat 32039240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24898373 - 24897936
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagatt-agttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatg 107  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || ||||    
24898373 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatg 24898276  T
108 atataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatg 207  Q
    | |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
24898275 acataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaata 24898177  T
208 gtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaa 307  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
24898176 ataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaa 24898078  T
308 tcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaa 407  Q
    |||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
24898077 tcatatacaattattcactgttacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaa 24897978  T
408 catccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
24897977 cattcatacctacaactttcgtgtttacacctatgaccaatt 24897936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24905810 - 24905373
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagatt-agttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatg 107  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || ||||    
24905810 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatg 24905713  T
108 atataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatg 207  Q
    | |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
24905712 acataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaata 24905614  T
208 gtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaa 307  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
24905613 ataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaa 24905515  T
308 tcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaa 407  Q
    |||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
24905514 tcatatacaattattcactgttacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaa 24905415  T
408 catccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
24905414 cattcatacctacaactttcgtgtttacacctatgaccaatt 24905373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24900856 - 24900419
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagatt-agttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatg 107  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || ||||    
24900856 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatg 24900759  T
108 atataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatg 207  Q
    | |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
24900758 acataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaata 24900660  T
208 gtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaa 307  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||    
24900659 ataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catataaattcatatactaattcatcaa 24900561  T
308 tcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaa 407  Q
    |||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
24900560 tcatatacaattattcactgttacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaa 24900461  T
408 catccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
24900460 cattcatacctacaactttcgtgtttacacctatgaccaatt 24900419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24903333 - 24902896
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagatt-agttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatg 107  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || ||||    
24903333 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatg 24903236  T
108 atataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatg 207  Q
    | |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
24903235 acataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaata 24903137  T
208 gtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaa 307  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||    
24903136 ataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catataaattcatatactaattcatcaa 24903038  T
308 tcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaa 407  Q
    |||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
24903037 tcatatacaattattcactgttacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaa 24902938  T
408 catccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
24902937 cattcatacctacaactttcgtgtttacacctatgaccaatt 24902896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24908285 - 24907848
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagatt-agttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatg 107  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || ||||    
24908285 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatg 24908188  T
108 atataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatg 207  Q
    | |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
24908187 acataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaata 24908089  T
208 gtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaa 307  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
24908088 ataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaa 24907990  T
308 tcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaa 407  Q
    |||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
24907989 tcatatacaattattcactgttacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaa 24907890  T
408 catccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
24907889 cattcatacctacaactttcatgtttacacctatgaccaatt 24907848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 26505364 - 26505800
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa-catga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||  | |||||    
26505364 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaatagcatga 26505461  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
26505462 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaataa 26505560  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
26505561 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggaaaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 26505659  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26505660 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaattcttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 26505759  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
26505760 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagatcaatt 26505800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 26507842 - 26508278
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa-catga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||  | |||||    
26507842 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaatagcatga 26507939  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
26507940 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaataa 26508038  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
26508039 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggaaaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 26508137  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
26508138 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaattcttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaac 26508237  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
26508238 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 26508278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 10 - 450
Target Start/End: Original strand, 23135575 - 23136002
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
23135575 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 23135672  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||     
23135673 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataa-caacatcaaatga 23135771  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||| ||||||    
23135772 taatcagcatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcaca-----------acatatactaattcatcaat 23135860  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
23135861 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgggattagaaagctaac 23135960  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaattt 450  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
23135961 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattt 23136002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 29 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 32215079 - 32214670
Alignment:
29 catcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||    
32215079 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 32214982  T
128 agtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 227  Q
    ||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
32214981 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 32214883  T
228 tcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||          ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
32214882 tcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtatacacaaacat----------atactaattcatcaatcatattcaattattcactg 32214793  T
328 taacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttc 427  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
32214792 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaatggcattagaaagctaacatccatacctacaactttt 32214693  T
428 gtgcttacacctaagaccaattt 450  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
32214692 gtgtttacacctaagaacaattt 32214670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 194 - 449
Target Start/End: Original strand, 20261386 - 20261641
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacata 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
20261386 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacatacata 20261485  T
294 tactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacgg 393  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
20261486 tattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgg 20261585  T
394 cattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
20261586 cattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 20261641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 24529706 - 24529286
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| || ||||| |  |||||| ||||| || |||||    
24529706 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaa-caacaacacat-cagtatacaaaaacagcatga 24529609  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatatt-catatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatg 207  Q
     |||| |||||||| ||||||| | |||  |||||| |||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
24529608 cataataatatcaagtgcaagttaacaacgtctcaattatttcatatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaat- 24529511  T
208 gtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaa 307  Q
                      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
24529510 ------------------catcatatacacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaa 24529429  T
308 tcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaa 407  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
24529428 tcatattcaattattcactgtgacctacgtttagtaatttcaccatatctcaagtgctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaaggtaa 24529329  T
408 catccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaattt 450  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
24529328 catccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattt 24529286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Original strand, 22105397 - 22105698
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||    
22105397 caataatttgaaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatga 22105495  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
22105496 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacttctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatta 22105594  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
22105595 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatttacatacatatactaattcatcaat 22105693  T
309 cataa 313  Q
    |||||    
22105694 cataa 22105698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 194 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 10684760 - 10684503
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatata--catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacataca 291  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
10684760 aacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatatacatataacccttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacataca 10684661  T
292 tatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaac 391  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
10684660 tatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgatctacgtgcagtaatttgaccatagctcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaac 10684561  T
392 ggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10684560 ggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 10684503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 313
Target Start/End: Original strand, 6725979 - 6726280
Alignment:
9 tcaataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatg 107  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || ||||    
6725979 tcaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatg 6726076  T
108 atataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatg 207  Q
    | |||| ||||||||||| |||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
6726077 acataataatatcaaatgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaata 6726175  T
208 gtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaa 307  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
6726176 ataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaa 6726274  T
308 tcataa 313  Q
    ||||||    
6726275 tcataa 6726280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21155237 - 21154937
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
21155237 caataatttggaacttcttcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 21155140  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||| ||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
21155139 cataataatatcaattgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 21155041  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
21155040 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaat 21154942  T
309 cataa 313  Q
     ||||    
21154941 tataa 21154937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 237 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 23707169 - 23706957
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
23707169 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 23707070  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttaca 436  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
23707069 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 23706970  T
437 cctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||    
23706969 cctaagaccaatt 23706957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Original strand, 24367759 - 24368059
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
24367759 caataatttggaacttcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 24367856  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
24367857 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 24367955  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
24367956 taaccaacatcttaaaacatcatatatacatataatacttcatcaatcatggaaaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaat 24368054  T
309 cataa 313  Q
    |||||    
24368055 cataa 24368059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 237 - 449
Target Start/End: Original strand, 24918350 - 24918562
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
24918350 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 24918449  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttaca 436  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
24918450 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggaattagaaagctaacatccatacctacaactttcatgtttaca 24918549  T
437 cctaagaccaatt 449  Q
    | |||||||||||    
24918550 cttaagaccaatt 24918562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 211 - 427
Target Start/End: Original strand, 25616365 - 25616581
Alignment:
211 atcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatca 310  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
25616365 atcaacatcttaaaacatcatacatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatca 25616464  T
311 taatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacat 410  Q
    || ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
25616465 tattcaattattcattgtgacctacgtgaagtaatttgacgataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacat 25616564  T
411 ccatacctacaactttc 427  Q
    |||||||||||||||||    
25616565 ccatacctacaactttc 25616581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 237 - 449
Target Start/End: Original strand, 24671235 - 24671447
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
24671235 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctacg 24671334  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttaca 436  Q
    | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
24671335 tgcagtaatttgacaataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacaacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtttttaca 24671434  T
437 cctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||    
24671435 cctaagaccaatt 24671447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 237 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24642701 - 24642489
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||     
24642701 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctaca 24642602  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttaca 436  Q
    | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||    
24642601 tgcagtaatttgaccataacttaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaacttttgggtttaca 24642502  T
437 cctaagaccaatt 449  Q
    ||||||| |||||    
24642501 cctaagagcaatt 24642489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 237 - 449
Target Start/End: Original strand, 24681654 - 24681866
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
24681654 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctacg 24681753  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttaca 436  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
24681754 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcctttggaagcccaaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 24681853  T
437 cctaagaccaatt 449  Q
     ||||||||||||    
24681854 gctaagaccaatt 24681866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Original strand, 38967359 - 38967659
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa-catga 108  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || | ||| | ||| ||| |||||  | |||||    
38967359 caatattttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-catcgacaca-acaatatacaaaaatagcatga 38967456  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtca-tcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatg 207  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
38967457 aataataatatcaaatgcaagtcaatcaacatctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatata--caacatcaaata 38967554  T
208 gtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaa 307  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
38967555 ataatcaacatcttaagacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaa 38967653  T
308 tcataa 313  Q
    ||||||    
38967654 tcataa 38967659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 234 - 449
Target Start/End: Original strand, 22105672 - 22105887
Alignment:
234 atacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacct 333  Q
    |||||||||  | ||||||||||||  |||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
22105672 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 22105771  T
334 acgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgctt 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
22105772 acgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 22105871  T
434 acacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||    
22105872 acacctaagaccaatt 22105887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 237 - 449
Target Start/End: Original strand, 38967689 - 38967901
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | || ||    
38967689 catataacacttcaacaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgagctgcg 38967788  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttaca 436  Q
    | ||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||    
38967789 tgcagtaatttcactataactcaagttctataaatacttttgaagtcaaaccaacgacattagaaacctaacatccatatctacaactttcgtatttaca 38967888  T
437 cctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||    
38967889 cctaagaccaatt 38967901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 253 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 45027840 - 45027645
Alignment:
253 aatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgacca 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |    
45027840 aatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacgtgcagtaatttgacta 45027742  T
353 taactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
45027741 taattcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaatggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 45027645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 234 - 449
Target Start/End: Original strand, 24368033 - 24368248
Alignment:
234 atacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacct 333  Q
    |||||||||  | ||||||||||||  |||| ||  || ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
24368033 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatgatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 24368132  T
334 acgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgctt 433  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
24368133 acgtgcagtaatttaactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 24368232  T
434 acacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||    
24368233 acacctaagaccaatt 24368248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 45030031 - 45029784
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||| | ||||||||||||    
45030031 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-acaatatacaaaaacaacatga 45029934  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||      
45029933 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacatttatatcacaatat-aacaacatgaaataa 45029835  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 259  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
45029834 taatcatcatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 45029784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 234 - 446
Target Start/End: Original strand, 6726254 - 6726466
Alignment:
234 atacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacct 333  Q
    |||||||||  | ||||||||||||  |||| ||| || ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
6726254 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatgctaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 6726353  T
334 acgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgctt 433  Q
    | || |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
6726354 atgtgcagtaatttgactataacttaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 6726453  T
434 acacctaagacca 446  Q
    |||||||||||||    
6726454 acacctaagacca 6726466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 234 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 21154963 - 21154748
Alignment:
234 atacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacct 333  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||  |||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
21154963 atacatatactaattcatcaattataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 21154864  T
334 acgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgctt 433  Q
    | || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
21154863 atgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 21154764  T
434 acacctaagaccaatt 449  Q
    || |||||||| ||||    
21154763 acccctaagacaaatt 21154748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 234 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 41524028 - 41523813
Alignment:
234 atacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacct 333  Q
    |||||||||  | ||||||||||||  |||| ||| || ||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||    
41524028 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcgtatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacct 41523929  T
334 acgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgctt 433  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
41523928 acgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgacgttagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 41523829  T
434 acacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||    
41523828 acacctaagactaatt 41523813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 115 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24642929 - 24642731
Alignment:
115 aatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatca 214  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
24642929 aatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcataatca 24642831  T
215 acatc--ttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcata 312  Q
    |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
24642830 acatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgtacaatatcgtattcgc-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 24642732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23708750 - 23708558
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
23708750 caataatttggaacatcatcatctt--tcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgat 23708653  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
23708652 ataacaatatcaattgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 23708558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7835 - 7670
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatc 140  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
7835 cttagactgaatcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 7736  T
141 tcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||    
7735 tcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattaacaacaacattaaat 7670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 6726533 - 6726662
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6726533 attcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 6726632  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
6726633 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 6726662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24529223 - 24529094
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24529223 attcactgtgacctacgtgcagtaatatgaccataactcaagttctataaatcattttgacgtcataccaacggcattagaaagctaacatccataccta 24529124  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
24529123 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 24529094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 21154684 - 21154555
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21154684 attcactgtgatctacgtgcagtaatttgaccgtaactcaaattctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 21154585  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
21154584 caactttcgtgtttacacctaggaccaatt 21154555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 24918626 - 24918755
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
24918626 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgacgtcagaccaacggtattagaaagataacatccataccta 24918725  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
24918726 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 24918755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 41523749 - 41523620
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
41523749 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaagggcattataaagataacatccataccta 41523650  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||    
41523649 caaccttcgtgtttacacctaagaccaatt 41523620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 342 - 449
Target Start/End: Original strand, 23931775 - 23931882
Alignment:
342 taatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaa 441  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
23931775 taatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatcaatacctacaactttagtgtttacacctaa 23931874  T
442 gaccaatt 449  Q
    ||||||||    
23931875 gaccaatt 23931882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 320 - 447
Target Start/End: Original strand, 24368312 - 24368439
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24368312 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataacttaagttctataaatcgttttgacatcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 24368411  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaa 447  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
24368412 caactttcgtgtttacacctaagaccaa 24368439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 320 - 450
Target Start/End: Original strand, 22105951 - 22106081
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22105951 attcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgacatcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 22106050  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaattt 450  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
22106051 caacttttgtgtttacacctaagaccaattt 22106081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 324 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 41523552 - 41523427
Alignment:
324 actgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaac 423  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
41523552 actgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaac 41523453  T
424 tttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||    
41523452 tttcgtgtttacacgtaagaccaatt 41523427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 19671818 - 19672010
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| | | |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
19671818 caataatttggaacatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgat 19671917  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    |||| |||||| || |||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
19671918 ataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctc-aatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattat-aacaacatcaa 19672010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23707319 - 23707199
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacataca 291  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
23707319 aacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatacataca 23707221  T
292 tatactaatttatcaatcataa 313  Q
    |||||||||| |||||||||||    
23707220 tatactaattcatcaatcataa 23707199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 21154491 - 21154362
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||| | || |||| ||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21154491 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgactaaaagtcaagttctataaatcattttgacatcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 21154392  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
21154391 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 21154362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 24681930 - 24682059
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
24681930 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagctctataaatctttttgatgtcagactaacggcattagaatgctaacatccacaccta 24682029  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
24682030 caacttttgtgtttacacctaagaccaatt 24682059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 43137284 - 43137467
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    ||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||  | ||| | ||||||||||||    
43137284 caatactttggaacttaatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-taatatacaaaaacaacatga 43137381  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataa 194  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| | |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
43137382 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 43137467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Original strand, 24918200 - 24918320
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacataca 291  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
24918200 aacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatgcataca 24918298  T
292 tatactaatttatcaatcataa 313  Q
    |||||||||| |||||||||||    
24918299 tatactaattcatcaatcataa 24918320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 204
Target Start/End: Original strand, 22337105 - 22337297
Alignment:
12 ataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgata 110  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || | ||||  |||| || ||||| |    
22337105 ataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgaca 22337203  T
111 taacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    ||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
22337204 taataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaa 22337297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 23706702 - 23706573
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  |  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
23706702 attcactgtgacctacgtgcagtaacttgaccataactcaagttctataaattgttttgacatagaaccaacaccattagaaagctaacatccataccta 23706603  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
23706602 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 23706573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 23709209 - 23709080
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
23709209 attcactgtgacctatgtgcagtaattagaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaatctaacatccataccta 23709110  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||| ||||    
23709109 caacttacgtgtttacacctaggacgaatt 23709080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 24671511 - 24671640
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||    
24671511 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatatttttgatgtcaaataaatggcattagaaagctaacatccacaccta 24671610  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
24671611 caacttttgtgtttacacctaagaccaatt 24671640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 23060500 - 23060695
Alignment:
10 caataatttg-aaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatg 107  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
23060500 caataatttggaaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatg 23060598  T
108 atataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    | |||| |||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| |  |||| |||||||| |||  |||  |||||||||||  |||| |||||||||    
23060599 acataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattaaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaa 23060695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 23076429 - 23076624
Alignment:
10 caataatttg-aaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatg 107  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||||    
23076429 caataatttggaaacatcatcatcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatg 23076527  T
108 atataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    | |||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||  |||| |||||||| |||  |||  |||||||||||  |||| |||||||||    
23076528 acataataatatcaattgcaagtcaacaatatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaa 23076624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 322 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 32214604 - 32214476
Alignment:
322 tcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctaca 421  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32214604 tcactgtgacctacgtgctgtaatttgaccataacttaagttctataaattgttttgacgtcagagcaacggcattagaaagctaacatccatacctaca 32214505  T
422 actttcgtgcttacacctaagaccaattt 450  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||    
32214504 actttcgtgttatcacctaagaccaattt 32214476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 322 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 45027579 - 45027452
Alignment:
322 tcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctaca 421  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
45027579 tcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactaaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattcgaaatctaacatccatacctaca 45027480  T
422 actttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||    
45027479 acttttgtgtttacacctaagaccaatt 45027452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 298944 - 298806
Alignment:
14 aatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatata 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||    
298944 aatttgaaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacata 298845  T
113 acaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattca 151  Q
    |  ||||||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||    
298844 aatatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattca 298806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 136
Target Start/End: Original strand, 7679589 - 7679698
Alignment:
26 catcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatg 125  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
7679589 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc-aatg 7679687  T
126 caagtcatcaa 136  Q
     ||||||||||    
7679688 taagtcatcaa 7679698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 323 - 449
Target Start/End: Original strand, 23931949 - 23932075
Alignment:
323 cactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaa 422  Q
    |||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
23931949 cactgtgacctaagtgaagtaaattgaccataactaaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgaaattagaaagctaacatccatacctacaa 23932048  T
423 ctttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
23932049 ctttcgtgtttacacctaagaccaatt 23932075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 333 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 23706881 - 23706765
Alignment:
333 tacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgct 432  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |    
23706881 tacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataattcgttttgacgtcagacctacggcattagaaaggtaacatccataactataactttcgtgtt 23706782  T
433 tacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||||||    
23706781 tacacctaagaccaatt 23706765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 148
Target Start/End: Original strand, 25175841 - 25175976
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
25175841 caataatttggaacatcatcatc---atcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 25175937  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatat 148  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
25175938 ataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 25175976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 23660011 - 23660204
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |  ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | |||||  ||||     
23660011 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaacaa-cagcaacataggcagtatacgaaacaggatgac 23660109  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||   |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
23660110 ataataatatcaaatgcaaatcaacaacatcttaaatattcaatcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaa 23660204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 194 - 309
Target Start/End: Original strand, 24671085 - 24671201
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacataca 291  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
24671085 aacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataatacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatacataca 24671183  T
292 tatactaatttatcaatc 309  Q
    |||||||||| |||||||    
24671184 tatactaattcatcaatc 24671201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Original strand, 24681504 - 24681624
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacataca 291  Q
    |||||||||||||| | |||||||||   | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
24681504 aacaacatcaaatgatgatcaacatcaacttaaacatcatatatacatctaatacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatacataca 24681602  T
292 tatactaatttatcaatcataa 313  Q
    |||||||||| |||||||||||    
24681603 tatactaattcatcaatcataa 24681624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 148
Target Start/End: Original strand, 28405981 - 28406103
Alignment:
27 atcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatg 125  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
28405981 atcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 28406080  T
126 caagtcatcaatatctcaaatat 148  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||    
28406081 caaatcaacaacatctcaaatat 28406103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22731367 - 22731173
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||| |||||    
22731367 caataatttggaacatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatga 22731269  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||| ||||  |||||||| |||  |||  |||||||||||  |||| |||||||||    
22731268 cataataatatcaattgcaattcatcaacatattaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaa 22731173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 23285853 - 23286027
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  |||| ||     
23285853 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa--aaca-gac 23285948  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| || |  |||||||| ||| || |  |||||||||||    
23285949 ataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatgttcttcaagtaatgcataaaacattatatcaca 23286027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 38247 - 38136
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||     
38247 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgac 38149  T
110 ataacaatatcaa 122  Q
    |||| ||||||||    
38148 ataataatatcaa 38136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20520295 - 20520130
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||   ||||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |    
20520295 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaaca 20520197  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||    
20520196 tctcaaacat-catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacgacatcaaat 20520130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Original strand, 23207296 - 23207461
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaaca--acatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| | | |    
23207296 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgaca 23207395  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    |||| || ||| ||| |||||||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
23207396 tctc-aacatt-ataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaat 23207461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22738312 - 22738119
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||  || |||| |||| | | |||||| |||||    
22738312 caataatttggaacatcatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacattaa-ataggcagtttacaaaaacagcatga 22738215  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||  |||||||| |||  |||  |||||||||||  |||| |||||||||    
22738214 cataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaa 22738119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 23072082 - 23071972
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
23072082 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgat 23071983  T
110 ataacaatatc 120  Q
    |||| ||||||    
23071982 ataataatatc 23071972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22459598 - 22459501
Alignment:
107 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
22459598 gatataacaacatcaaatgaaagtcatcaacatctcaaatattcacatataactcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaataacatcaa 22459501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Original strand, 23791292 - 23791458
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||  | |||||| |||||||| |||||   ||||||   |||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |    
23791292 cttagaccgactcatgtagcttagttaataagcaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaaca 23791391  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
23791392 tctcaaacatt-atatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaat 23791458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23654519 - 23654341
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaa-acaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| || ||||| ||| || |||| ||| |||||    
23654519 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacagcataggcagcatacaaatacatcatga 23654421  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||  ||| | ||||||| ||| || |  |||||||||||    
23654420 cataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaagtattactcaagtaatgcataaaacattatatcaca 23654341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Original strand, 20309096 - 20309225
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||  | |||| |||||     
20309096 caataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtat--acaacagcatgac 20309193  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatct 141  Q
    ||||  ||||||||| ||| ||||||| ||||    
20309194 ataattatatcaaattcaattcatcaacatct 20309225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23103528 - 23103375
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||     
23103528 caatattttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-aaacagcaacataggcagtatac-aaacagcatgac 23103431  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagt 165  Q
    || |  ||||||||| ||| ||||||| |||||||  ||||||  |||||||||||    
23103430 atgattatatcaaattcaattcatcaacatctcaatcattcattcataattcaagt 23103375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22413240 - 22413073
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaac--atgatataacaatat--caaatgcaagtcatcaa 136  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||| |||||||| ||||||  |||||| |  |||||||||||||||  ||||||||| ||| |||    
22413240 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatatcaaatgcaaatcaacaa 22413141  T
137 tatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
     |||||||    ||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
22413140 catctcaaca--tcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaat 22413073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 23040322 - 23040247
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacata 86  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
23040322 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata 23040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Original strand, 25108906 - 25109072
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||  |||||||| |||||||| |||||   |||| |   ||||||||||||||||||||   || ||| |||||    
25108906 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaatagttcatgatataacaatatcaaagcaaaatcaacaata 25109005  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||    
25109006 tctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaat 25109072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22134324 - 22134222
Alignment:
25 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaat 124  Q
    |||||||| | |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||    
22134324 tcatcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaa-cagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcgaat 22134226  T
125 gcaa 128  Q
    ||||    
22134225 gcaa 22134222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18787009 - 18786916
Alignment:
37 tcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaaca--acatgatataacaatatcaaatgcaa 128  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||| ||   |||||||||||||| ||||||||||    
18787009 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgcaaaccagttcatgatataacaatctcaaatgcaa 18786916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 24643127 - 24643054
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaaca 84  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
24643127 caataatttggaacttcgtcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 24643054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24697644 - 24697543
Alignment:
104 catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
24697644 catgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatctcaaa-cttcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacataa 24697546  T
204 aat 206  Q
    |||    
24697545 aat 24697543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Original strand, 8946644 - 8946736
Alignment:
10 caataatttg-aaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaaca 102  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||||    
8946644 caataatttggaaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaca 8946736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 321 - 385
Target Start/End: Original strand, 31345490 - 31345554
Alignment:
321 ttcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaa 385  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
31345490 ttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcaa 31345554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22173864 - 22173799
Alignment:
153 atataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatc 219  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
22173864 atataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcataatcaacatc 22173799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451894
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaat-a 138  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||||||||||||| ||| || | |||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || |||| |    
32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatc-aatgcaagccaacaatca 32451933  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtataca 177  Q
    |||||| ||||||| || | |||||||| ||||||||||    
32451932 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtataca 32451894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 411
Target Start/End: Original strand, 67339 - 67410
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatc 411  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
67339 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtcaaaccaaagccattagaaatctaacatc 67410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Original strand, 18809428 - 18809546
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  | | ||||| |||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
18809428 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 18809527  T
420 caactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| || |||||||    
18809528 caactttcatgtttacacc 18809546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Original strand, 16900815 - 16900884
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
16900815 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagtcattagaaagctaaca 16900884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Original strand, 16994206 - 16994275
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
16994206 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagtcattagaaagctaaca 16994275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24686707 - 24686598
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||| |   || ||| ||||||| || |||||||     
24686707 agtaatttgatcataacgcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacttaattatctaaaactttcatgtttacacca 24686608  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||||||||||    
24686607 aagaccaatt 24686598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Original strand, 34823750 - 34823819
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
34823750 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaaccaacgtcattagaaagctaaca 34823819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 311
Target Start/End: Original strand, 21368365 - 21368439
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcat 311  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
21368365 catataataattcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcat 21368439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23711690 - 23711572
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  | | ||||| |||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||    || |||    
23711690 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactgtaaagctaacacaattatcta 23711591  T
420 caactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| || |||||||    
23711590 caactttcatgtttacacc 23711572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Original strand, 26505864 - 26505982
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  | | ||||| |||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||    || |||    
26505864 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactgtaaagctaacacaattatcta 26505963  T
420 caactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| || |||||||    
26505964 caactttcatgtttacacc 26505982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Original strand, 26508342 - 26508460
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  | | ||||| |||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||    || |||    
26508342 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactgtaaagctaacacaattatcta 26508441  T
420 caactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| || |||||||    
26508442 caactttcatgtttacacc 26508460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 410
Target Start/End: Original strand, 27261332 - 27261402
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacat 410  Q
    |||||||||| |||||||||| || || ||||  ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
27261332 agtaatttgatcataactcaagttataaaaattatttggaagtcaaaccaaagccattagaaagctaacat 27261402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 27920441 - 27920323
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  | | ||||| |||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||    || |||    
27920441 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactgtaaagctaacacaattatcta 27920342  T
420 caactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| || |||||||    
27920341 caactttcatgtttacacc 27920323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Original strand, 28577584 - 28577702
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  | | ||||| |||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
28577584 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 28577683  T
420 caactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| || |||||||    
28577684 caactttcatgtttacacc 28577702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 32039175 - 32039057
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  | | ||||| |||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||    || |||    
32039175 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactgtaaagctaacacaattatcta 32039076  T
420 caactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| || |||||||    
32039075 caactttcatgtttacacc 32039057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Original strand, 12727711 - 12727780
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || ||||| |||| | ||||||||||||||||    
12727711 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaacccaaggccattagaaagctaaca 12727780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 19887384 - 19887275
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    || ||||||||||| || |||||||     
19887384 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacacca 19887285  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
19887284 aagtccaatt 19887275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 34135119 - 34135070
Alignment:
378 gaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttc 427  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
34135119 gaagtcaaaccaaagcaattagaaagctaacttccatacctacaactttc 34135070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 24642425 - 24642373
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatc 372  Q
    ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
24642425 attcactgtgacctacgtgtagttatttgaccataactcaagttctataaatc 24642373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41524045 - 41524002
Alignment:
269 gtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataa 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
41524045 gtattcacaa-catatacatacatatactaattcatcaatcataa 41524002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 359
Target Start/End: Original strand, 23131347 - 23131386
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactca 359  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
23131347 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 23131386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34402199 - 34402160
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactca 359  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
34402199 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 34402160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 311
Target Start/End: Original strand, 23799457 - 23799531
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcat 311  Q
    ||||||| | ||||||||||||| | || ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
23799457 catataataattcatcaatcatgaataacatcatattcaacaacatatacattcatataataattcatcaatcat 23799531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 409
Target Start/End: Original strand, 571883 - 571972
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |  | | || || |||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    
571883 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccttaactcataaaccaaaattcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaaca 571972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 11232322 - 11232253
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
11232322 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaaca 11232253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 22514169 - 22514100
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
22514169 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaaca 22514100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 28776771 - 28776702
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
28776771 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaaca 28776702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 340 - 408
Target Start/End: Original strand, 22274022 - 22274090
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||||||||| |||||||||| || || ||||| ||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||    
22274022 agtaatttgatcataactcaagttttaaaaatcatttagacatcaaaccaaggccattagaaagctaac 22274090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 230 - 306
Target Start/End: Original strand, 22686145 - 22686221
Alignment:
230 atatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatca 306  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||| | || ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||    
22686145 atatattcatataataattcatcaatcatgaaaaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatca 22686221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 394 - 438
Target Start/End: Original strand, 24788042 - 24788086
Alignment:
394 cattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
24788042 cattggaaagataacatccatacctacaactttcatgtttacacc 24788086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 186
Target Start/End: Original strand, 28349130 - 28349238
Alignment:
75 aacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtat 174  Q
    |||||||||| | ||||||| |||| || | |||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||  || |||   ||||||| |||||| |||||||    
28349130 aacagcaacacaaacagtatacaaa-cagcgtgatataacaatatcttatgcaattcaacaatgtct--aacatttccatataatccaagtaatgcgtat 28349226  T
175 acaattatatca 186  Q
    ||||||||||||    
28349227 acaattatatca 28349238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 394 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 44584632 - 44584588
Alignment:
394 cattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
44584632 cattggaaagctaacatacatacctacaacttttgtgtttacacc 44584588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 20732 - 21169
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
20732 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 20829  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
20830 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 20928  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
20929 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 21028  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21029 cataatcaattattcactgtgacctacgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 21128  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
21129 atttatacctacaactttcttgtttacacctaagaccaatt 21169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 87)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 21475264 - 21474827
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
21475264 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 21475167  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
21475166 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 21475068  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
21475067 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 21474968  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21474967 cataatcaattattcactgtgacctacgtttagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 21474868  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
21474867 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 21474827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Original strand, 16361921 - 16362340
Alignment:
29 catcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtat-gcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||| | |||||||   |||||||||||| |||| |||||||||||||    
16361921 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gacagcaacaca-acagtatataaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 16362018  T
128 agtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 227  Q
    ||||| |||  |||||| |||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16362019 agtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 16362118  T
228 tcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
16362119 tcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattaacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataataaattattcactg 16362218  T
328 taacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttc 427  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
16362219 tgacctacgttcagtaatttgaccataacttaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaaccgcattagaaagctaacttccatacctacaactttc 16362318  T
428 gtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||| ||||||||||    
16362319 gtgtttacacccaagaccaatt 16362340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 13988851 - 13989287
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
13988851 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 13988948  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
13988949 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 13989047  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
13989048 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 13989146  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13989147 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 13989246  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
13989247 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 13989287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 23593912 - 23593474
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
23593912 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 23593815  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
23593814 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 23593715  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
23593714 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcattaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 23593615  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
23593614 cataatcaattattcactgtgacctacgttcagtaatttaactataacgcaagttctataaattattttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaac 23593515  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
23593514 atacatacctacaactttcttgtttacacctaagactaatt 23593474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 21923468 - 21923032
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
21923468 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 21923371  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
21923370 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 21923272  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
21923271 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 21923173  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21923172 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 21923073  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
21923072 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 21923032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Original strand, 21840771 - 21841188
Alignment:
29 catcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||    
21840771 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 21840868  T
128 agtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 227  Q
    ||||| |||  |||||| |||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
21840869 agtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 21840967  T
228 tcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactg 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
21840968 tcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcacaa-catatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactg 21841066  T
328 taacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttc 427  Q
    | |||||| |  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
21841067 ttacctacatgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttc 21841166  T
428 gtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
21841167 gtgtttacacctaagaccaatt 21841188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 25 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15860171 - 15859749
Alignment:
25 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaa 123  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| || |||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||    
15860171 tcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatattaaa 15860074  T
124 tgcaagtca-tcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatctta 222  Q
    ||||||||| ||||  ||| || || ||| | |||||||||  | |||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
15860073 tgcaagtcaatcaacgtcttaattactcacaaataattcaatcaatgcacatacaattatatcacaatataa-caacatcagatggtaatcaacatctta 15859975  T
223 aaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattatt 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
15859974 agacatcatatatacatataacacttcatcaaccatggacaatatcgtattcgcaag-atatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattatt 15859876  T
323 cactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaa 422  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
15859875 cactgtgacctacgtgcagttatttgaccataactcaagttgtataaattcttttgaagtcaaaccaacggcattagaaaactaacatccatacctacaa 15859776  T
423 ctttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
15859775 ctttcgtgcttacacctaagaccaatt 15859749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Original strand, 29776673 - 29776973
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaac-aacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||  |||||||    
29776673 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaataacatga 29776770  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
29776771 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 29776869  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
29776870 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaat 29776968  T
309 cataa 313  Q
    |||||    
29776969 cataa 29776973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Original strand, 29298122 - 29298421
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
29298122 caataatttgaaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 29298219  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||      
29298220 -ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataat-aacatcaaataa 29298317  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
29298318 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatatatatactaattcatcaat 29298416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 318
Target Start/End: Original strand, 31612298 - 31612603
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | | ||||| ||||| || |||||    
31612298 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatga 31612395  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
31612396 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcagttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 31612494  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
31612495 taatcaatatcttaaaacatcatatatacatataatacttcatcaatcatggacaatattgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaat 31612593  T
309 cataatcaat 318  Q
    ||||| ||||    
31612594 cataaacaat 31612603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22123245 - 22122944
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa-catga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||  | |||||    
22123245 caataatttggaacttcatcatcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacaca-acagtatacaaaaatagcatga 22123147  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
22123146 cataataatatcaaatgcaagtcaacaatgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 22123048  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||    
22123047 taatcaatatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacataaacatacatataccaattcatcaat 22122949  T
309 cataa 313  Q
    |||||    
22122948 cataa 22122944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 237 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16275209 - 16274996
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
16275209 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgaattcacaaacatatacatacatatattaattcatcaatcgtattcaattattcactgtgacctacg 16275110  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggca-ttagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttac 435  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
16275109 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtgaaaccaatgacatttagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 16275010  T
436 acctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||    
16275009 acctaagaccaatt 16274996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16275541 - 16275239
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || | |||||| |||||| ||||| || |||||    
16275541 caataatttagaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaa-caacgacatag-cagtatacaaaaacagcatga 16275444  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtca-tcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatg 207  Q
     |||| |||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||||| ||| ||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||     
16275443 cataataatatcaattgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacataaaattcaattaatgcatataccattatatcacaatataa-caacatcaaata 16275345  T
208 gtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaa 307  Q
     ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
16275344 ataatcaatatcttgaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgcaaacatatacatacatatactaattcatcaa 16275245  T
308 tcataa 313  Q
    ||||||    
16275244 tcataa 16275239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 247 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 27161529 - 27161326
Alignment:
247 ttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatt 346  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
27161529 ttcatcaatcattaacaatattttattcataaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatt 27161430  T
347 tgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagacca 446  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
27161429 tgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagacca 27161330  T
447 attt 450  Q
    ||||    
27161329 attt 27161326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 234 - 449
Target Start/End: Original strand, 29776947 - 29777162
Alignment:
234 atacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacct 333  Q
    |||||||||  | ||||||||||||  |||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
29776947 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 29777046  T
334 acgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgctt 433  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
29777047 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaacccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgatt 29777146  T
434 acacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||    
29777147 acacctaagaccaatt 29777162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 234 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 22122970 - 22122755
Alignment:
234 atacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacct 333  Q
    ||||||||| || ||||||||||||  |||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
22122970 atacatataccaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 22122871  T
334 acgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgctt 433  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
22122870 acgtgcagtaatttgactataacccaagttctataaatcgttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctagcatccatacctacaactttcatgttt 22122771  T
434 acacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||    
22122770 acacctaagaccaatt 22122755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 234 - 449
Target Start/End: Original strand, 31612572 - 31612787
Alignment:
234 atacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacct 333  Q
    |||||||||  | ||||||||||||  |||||||| || | | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||    
31612572 atacatatactaattcatcaatcataaacaatatcatactgataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactttgacct 31612671  T
334 acgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgctt 433  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
31612672 acgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgacatttgaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 31612771  T
434 acacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||    
31612772 acacctaagaccaatt 31612787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 247 - 449
Target Start/End: Original strand, 29298461 - 29298663
Alignment:
247 ttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatt 346  Q
    ||||||||||||  |||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || || || ||||||||    
29298461 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacttatgtgcagtaatt 29298560  T
347 tgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagacca 446  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
29298561 tgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaatggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttacacctaagacca 29298660  T
447 att 449  Q
    |||    
29298661 att 29298663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 234 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 22050792 - 22050577
Alignment:
234 atacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacct 333  Q
    |||||||||  | ||||||||||||  |||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
22050792 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 22050693  T
334 acgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgctt 433  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | | ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
22050692 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacattagaccattgacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 22050593  T
434 acacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||    
22050592 acacctaagaccaatt 22050577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 293 - 449
Target Start/End: Original strand, 13227129 - 13227285
Alignment:
293 atactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacg 392  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
13227129 atactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacg 13227228  T
393 gcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||    
13227229 gcactagaaagctaacatccatacataaaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 13227285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861510
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatc 140  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 21861573  T
141 tcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatca 203  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
21861572 tcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatca 21861510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 293 - 449
Target Start/End: Original strand, 29535317 - 29535473
Alignment:
293 atactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacg 392  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
29535317 atactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaattcttttgaagtcaaaccaacg 29535416  T
393 gcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
29535417 acactagaaagctaacatccatacatacaactttcgtgtttatacctaagaccaatt 29535473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896193
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatc 140  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 21896259  T
141 tcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
21896258 tcaaacattcatatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 21896193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Original strand, 432997 - 433190
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||     |||||| || |||||| ||||| || || ||    
432997 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacg----gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaaga 433092  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
433093 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 433190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 33680998 - 33681188
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||   |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
33680998 caataatttggaacatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 33681094  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
33681095 ataacaatatcgaatgcaagtcgtcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 33681188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35261018
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatc 140  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||| |||    
35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaacatc 35261084  T
141 tcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
35261083 tcaaacattcatacataattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacatcaaat 35261018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 29298727 - 29298856
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
29298727 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttttataaatcgttttgacgtcagaacaacggcattagaaagctaacatccataccta 29298826  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
29298827 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 29298856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 31612851 - 31612980
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
31612851 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagcttaaatccataccta 31612950  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
     |||||| ||| ||||||||||||||||||    
31612951 taactttagtgtttacacctaagaccaatt 31612980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 45575020 - 45574812
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||| || | || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||    
45575020 caataatttggaacatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatga 45574922  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||| ||||||||||||| |||  |||||| |||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||      
45574921 cataataataccaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aagaacatcaaatca 45574823  T
209 taatcaacatc 219  Q
    |||||||||||    
45574822 taatcaacatc 45574812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 212 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22050866 - 22050766
Alignment:
212 tcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
22050866 tcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 22050768  T
312 aa 313  Q
    ||    
22050767 aa 22050766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 31613044 - 31613173
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
31613044 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggtattagaaacctaacatccataccta 31613143  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
31613144 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 31613173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 22237618 - 22237808
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| || ||||||    
22237618 caataatttgaaacatcatcatctt---caacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgcaaatcatcatgat 22237714  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||  || ||||||||||||    
22237715 ataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataactttagaaacaacatcaa 22237808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13213039 - 13212844
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||  | ||||||| ||||| ||||||||    
13213039 caataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacgca-acagtatacaaaaacaacatga 13212942  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtca-tcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||| | ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
13212941 cataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaat 13212844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 29777226 - 29777355
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
29777226 attcattgtgacctacgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttaacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatacataccta 29777325  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
29777326 caacttttgtgtttacacctaagactaatt 29777355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Original strand, 16758664 - 16758834
Alignment:
37 tcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaaca--acatgatataacaatatcaaatgcaagtcatc 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||| |||  || |    
16758664 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaac 16758763  T
135 aatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    || ||| | || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
16758764 aacatcac-aacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacaacaaat 16758834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 50210331 - 50210152
Alignment:
25 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaa 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
50210331 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 50210233  T
124 tgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||| |||  |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||  |||| |||||||||    
50210232 tgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaa 50210152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Original strand, 21346946 - 21347141
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||   ||| || |||||| ||||| ||||||||    
21346946 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caaagacacag-cagtatacaaaaacaacatga 21347043  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtca-tcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||| | ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
21347044 cataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaat 21347141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 22122691 - 22122561
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22122691 attcactgtgatctatgtgcagtaatttgaccataactcaagttctacaaatcgttttgaagtaaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 22122592  T
420 caac-tttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
22122591 caacttttagtgtttacacctaagaccaatt 22122561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15859672 - 15859543
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
15859672 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgatcataactcaagttctataaatagttttgaggtcagaccaacgacattagaaagctaacattcataccta 15859573  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||    
15859572 caactttcgtgtatacacctaagaccaatt 15859543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16274932 - 16274803
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
16274932 attcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatagttttgacgtcagaccaatgatattagaaagctaacatccataccta 16274833  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
16274832 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 16274803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 27161263 - 27161134
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
27161263 attcactgtgacctacatgcagtaatttgaccataattcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacagtattagaaagctaacatccataccta 27161164  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||    
27161163 caactttcctgtttacacctaagaccaatt 27161134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 330 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 9044864 - 9044745
Alignment:
330 acctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgt 429  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
9044864 acctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgttagaccaacggcattagaaaactaacatacatacctacaactttcgt 9044765  T
430 gcttacacctaagaccaatt 449  Q
    | ||||||||||||| ||||    
9044764 gtttacacctaagactaatt 9044745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 21707152 - 21707335
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa-catga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||| | | ||||| ||||| || |||||    
21707152 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatga 21707249  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataa 194  Q
     | || |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
21707250 cagaataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattatatcacaatataa 21707335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 21711694 - 21711877
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa-catga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||| | | ||||| ||||| || |||||    
21711694 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatga 21711791  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataa 194  Q
     | || |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
21711792 cagaataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattatatcacaatataa 21711877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 22921999 - 22921864
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
22921999 caataatttggaacatcatcatc---atcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 22921903  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatat 148  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
22921902 ataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 22921864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 206
Target Start/End: Original strand, 21342096 - 21342276
Alignment:
25 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||   ||| || |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
21342096 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caaagacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 21342193  T
124 tgcaagtc-atcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    |||||||| |||||  |||||| |||||| | ||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
21342194 tgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattacatcacaatat-aacaacatcaaat 21342276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 27250862 - 27250684
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||| | |||||| |||||    
27250862 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 27250764  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| || |  |||||||||||    
27250763 cataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcaca 27250684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 16401407 - 16401536
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | || | ||||| || | |||||||||||||||||||||||    
16401407 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttatataaatcctttccacgttagaccaatggaaatagaaagctaacatccataccta 16401506  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||    
16401507 caacttttgtgtctacacctaagaccaatt 16401536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 128
Target Start/End: Original strand, 21754059 - 21754151
Alignment:
36 atcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaa 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
21754059 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa 21754151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 223 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27161605 - 27161518
Alignment:
223 aaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcat 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
27161605 aaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatacatatatatactaattcatcaatcat 27161518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 22532257 - 22532451
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| |||||    
22532257 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 22532355  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||| | ||||| ||| ||| |||| ||||||||||  |||||||||||| |||  |||  |||||||||||  |||| |||||||||    
22532356 cataataatatccattgcaattcaacaacatcttaaatattcattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaa 22532451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 34509768 - 34509946
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| |||||    
34509768 caataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 34509866  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
     ||||  ||||||||||||||||| ||| |||| || ||| |||  |||  ||||||| ||| ||||  |||||||||||    
34509867 cataatgatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcaca 34509946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 330 - 449
Target Start/End: Original strand, 40129387 - 40129506
Alignment:
330 acctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgt 429  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| | || ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
40129387 acctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatcgttttgatgccagaccaacgacattagaaatctaacattcatacctacaactttagt 40129486  T
430 gcttacacctaagaccaatt 449  Q
    | |||||||||||| |||||    
40129487 gtttacacctaagatcaatt 40129506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 52928100 - 52927993
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||   |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
52928100 caataatttggaacatcaccatctt---caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcatgat 52928004  T
110 ataacaatatc 120  Q
    |||||||||||    
52928003 ataacaatatc 52927993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 128
Target Start/End: Original strand, 20248270 - 20248385
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
20248270 caataatttggaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 20248366  T
110 ataacaatatcaaatgcaa 128  Q
    ||||||||||| |||||||    
20248367 ataacaatatcgaatgcaa 20248385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 14295684 - 14295569
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | ||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||    
14295684 caataatttggaacatcatcatcttcaacattttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgat 14295585  T
110 ataacaatatcaaatg 125  Q
    |||| |||||| ||||    
14295584 ataataatatcgaatg 14295569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 41050138 - 41049973
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||   ||| ||||||||||||| ||||||  |||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
41050138 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 41050039  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||    |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||    
41050038 tctcaaca--tcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacgtcaaat 41049973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 50614219 - 50614053
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaaca--acatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||   ||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
50614219 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 50614120  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||| | || | ||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||  | |||||||||||    
50614119 tctcaaaca-tcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaat 50614053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 50622047 - 50621881
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaaca--acatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||   ||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
50622047 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 50621948  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||| | || | ||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||  | |||||||||||    
50621947 tctcaaaca-tcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaat 50621881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 125
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918707
Alignment:
38 caacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatg 125  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||    
20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 20918707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16368388 - 16368224
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||  |||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |    
16368388 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacaattcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 16368290  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||    || | ||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
16368289 tctcaa--catcgtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaat 16368224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 194
Target Start/End: Original strand, 40389157 - 40389323
Alignment:
28 tcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgc 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||||| |||||| ||| |  |||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||    
40389157 tcatcttaatcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataac-aacagcgacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 40389254  T
127 aagtc-atcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataa 194  Q
    ||||| ||||   |||||| |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
40389255 aagtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa 40389323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 41 - 202
Target Start/End: Original strand, 50686630 - 50686792
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| ||||    |||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |    
50686630 cttagaccgactcatgcagtttagttaataaacaaacggcaacataggcagttcataaaatagttcatgatataacaatgtcaaatgcaaatcaacaaca 50686729  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatc 202  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
50686730 tctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatc 50686792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 395 - 449
Target Start/End: Original strand, 43543269 - 43543323
Alignment:
395 attagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
43543269 attagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 43543323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 21161707 - 21161829
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||||||| || |||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| || | ||||    
21161707 caataatttggaacatcatcatc---atcaacttggatcgactcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaacaaa-acagtatgcaaatcatcgtgat 21161802  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 136  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||    
21161803 ataacaatatcgaatgcaattcatcaa 21161829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 20847287 - 20847205
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagta 93  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
20847287 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 20847205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 320 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 10812682 - 10812612
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaa 390  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
10812682 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccatagctcaagttttataaatcattttgaagtcaaaccaa 10812612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 151
Target Start/End: Original strand, 21026668 - 21026809
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||| | | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| || |||||    
21026668 caataatttggaacatcatcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatga 21026766  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattca 151  Q
      |||  ||||||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||    
21026767 cgtaaatatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattca 21026809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 38801520 - 38801433
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaa 98  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
38801520 caataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaa 38801433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 20454667 - 20454570
Alignment:
29 catcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaaca--acatgatataacaatatcaaatg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||   |||| |||||||||||||||||    
20454667 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagcacataaaacagctcatggtataacaatatcaaatg 20454570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 206
Target Start/End: Original strand, 26064959 - 26065122
Alignment:
43 tagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatc 140  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||||| |||||   |||| ||  ||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||| |||    
26064959 tagaccaactcatgcagcttagttgataaacaaacagcaacataggcagtacataaaataattcatgatataacaataccaa-tgcaaatcaacaacatc 26065057  T
141 tcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||    
26065058 tcaaagat-catatataattcaagtaatacatatacaaatatatcacattattaatgacatcaaat 26065122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 12271639 - 12271735
Alignment:
107 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| | ||||| |   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
12271639 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaa-tatttacgtataactaaagtaatatatatacaattatatcacattataaataacatcaa 12271735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 243
Target Start/End: Original strand, 43543218 - 43543267
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataa 243  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43543218 aacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataa 43543267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 206
Target Start/End: Original strand, 21477653 - 21477700
Alignment:
159 ttcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
21477653 ttcaagtaatgcgtatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 21477700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Original strand, 13989351 - 13989469
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  | | ||||| |||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
13989351 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 13989450  T
420 caactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| || |||||||    
13989451 caactttcatgtttacacc 13989469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 410
Target Start/End: Original strand, 21858592 - 21858662
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacat 410  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | | |||||||||||||||    
21858592 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccgttagaaagctaacat 21858662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 313
Target Start/End: Original strand, 29298408 - 29298474
Alignment:
247 ttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataa 313  Q
    ||||||||||||  |||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
29298408 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcataa 29298474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 75
Target Start/End: Original strand, 21714546 - 21714595
Alignment:
26 catcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaa 75  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
21714546 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 21714595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22354616 - 22354511
Alignment:
99 aacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaa 198  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||  |||||||| ||  ||||  |||||||||||  |||| |||    
22354616 aacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaa 22354517  T
199 catcaa 204  Q
    ||||||    
22354516 catcaa 22354511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 349 - 409
Target Start/End: Original strand, 16655942 - 16656002
Alignment:
349 accataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
16655942 accatatctcaaaatctataaatcatttttaagtcaaaccaaagtcattagaaacctaaca 16656002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 44035928 - 44035860
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||||||||| |||||||||| || || ||||| ||| || |||||||||| | |||||||||||||||    
44035928 agtaatttgatcataactcaagttataaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaac 44035860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 22468810 - 22468688
Alignment:
29 catcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaa-aacaacatgatataacaatatcaaatgca 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| || |||||||||| |||  | ||| |||| ||||| || | |||||||| ||||    
22468810 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcataatatcaattgca 22468712  T
128 agtcatcaatatctcaaatattca 151  Q
    | ||| ||| |||| || ||||||    
22468711 attcaacaacatcttaattattca 22468688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Original strand, 17003909 - 17003978
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
17003909 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaaca 17003978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 21650979 - 21650910
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||| | || || ||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
21650979 agtaatttgatcataactctagttttaaaaatcatttggacgtcaaaccaaggccattagaaagctaaca 21650910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Original strand, 22366527 - 22366596
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
22366527 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttcgatgtcaaaccaaagtcattagaaagctaaca 22366596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16093987 - 16093904
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaaca--acatgatataacaatatcaa 122  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||  |||||| |||||||||| ||||||  ||||||   |||||||||||||||||||    
16093987 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaatagcaacataggcagtatagaaaacagctcatgatataacaatatcaa 16093904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 263 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21244717 - 21244669
Alignment:
263 aatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcat 311  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
21244717 aatatcatattcatcaacatatacattcatataataatttatcaatcat 21244669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 4)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 13932 - 14369
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
13932 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 14029  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
14030 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 14128  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
14129 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 14228  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14229 catattcaattattcactgtgacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 14328  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
14329 atttatacctacaacgttcgtgtttacacctaagaccaatt 14369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 236 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 23484 - 23271
Alignment:
236 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctac 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
23484 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctac 23385  T
336 gttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttac 435  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
23384 gtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatctatacctacaacttttgtgtttac 23285  T
436 acctaagaccaatt 449  Q
    |||| |||| ||||    
23284 accttagactaatt 23271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 320 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 23047 - 22917
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
23047 attcactgtgacctacgtgcagtaatatgaccataactcatgttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccatatcta 22948  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaattt 450  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
22947 caacttttgtgtttacacctaagaccaattt 22917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 320 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 23207 - 23121
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagcta 406  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
23207 attcactgtgacctacatgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagcta 23121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 128)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 8055014 - 8055451
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | | ||||| ||||| || |||||    
8055014 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaaa-agtatacaaaaacagcatga 8055111  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
8055112 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 8055210  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
8055211 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 8055310  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
8055311 cataatcaattattcattgtgacctacattcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaac 8055410  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
8055411 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 8055451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 30676868 - 30676450
Alignment:
29 catcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||    
30676868 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgca 30676771  T
128 agtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 227  Q
    ||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
30676770 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 30676672  T
228 tcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
30676671 tcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactg 30676572  T
328 taacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttc 427  Q
    | ||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30676571 tgacctacgtgaagtaattttaccataactcaagttctataaattattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttc 30676472  T
428 gtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
30676471 gtgtttacacctaagaccaatt 30676450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 12742302 - 12742739
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
12742302 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 12742399  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
12742400 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 12742498  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
12742499 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaaggtcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 12742598  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12742599 catattcaattattcactgtgacctacttgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 12742698  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
12742699 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 12742739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 24422532 - 24422968
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
24422532 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 24422629  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
24422630 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 24422728  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
24422729 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 24422827  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24422828 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 24422927  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
24422928 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 24422968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 33861779 - 33862215
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
33861779 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 33861876  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
33861877 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 33861975  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
33861976 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 33862074  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33862075 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 33862174  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
33862175 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 33862215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 33864263 - 33864699
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
33864263 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 33864360  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
33864361 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 33864459  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
33864460 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 33864558  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33864559 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 33864658  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
33864659 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 33864699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 18334769 - 18334333
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
18334769 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 18334672  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
18334671 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaataa 18334573  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
18334572 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 18334474  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18334473 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 18334374  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
18334373 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 18334333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 22782212 - 22782648
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| || |||||    
22782212 caataatttggaaattcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatga 22782309  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
22782310 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacacataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatca 22782408  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
22782409 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcacaa-catatacatacatatactaattcatcaat 22782507  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22782508 catattcaattattcactgtgacctatgtgcagtaatttgaccataactcaaattctataaattcttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 22782607  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
22782608 attcatacctacaactttcctacttacacctaagaccaatt 22782648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Original strand, 34963377 - 34963795
Alignment:
29 catcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||    
34963377 catcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 34963474  T
128 agtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 227  Q
    ||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
34963475 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 34963573  T
228 tcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
34963574 tcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactg 34963673  T
328 taacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttc 427  Q
    | | ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34963674 tgatctatgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaactttc 34963773  T
428 gtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
     || ||||||||||||||||||    
34963774 atgtttacacctaagaccaatt 34963795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 1541088 - 1540652
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||  ||||    
1541088 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagtatga 1540991  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
1540990 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacaatataa-caacatcaaataa 1540892  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
1540891 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 1540793  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1540792 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 1540693  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
1540692 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 1540652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 2291357 - 2290921
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
2291357 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatga 2291260  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
2291259 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaataa 2291161  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
2291160 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcagtcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 2291062  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2291061 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 2290962  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
2290961 atttatatctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 2290921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 25688487 - 25688924
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| || |||||    
25688487 caataatttggaacctcattatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacata-acagtatacaaaaacagcatga 25688584  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||| ||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| | | |||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
25688585 cataataatatcaactgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatataatcatatcacaatataa-caacaccaaatgg 25688683  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
25688684 taatcaacatcttaaaacatcatttatacatataacacttcctcaatcatggacaatatcgtattcacaaaaatatacatacatatactaattcatcaat 25688783  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
25688784 catattcaattattcactgtcacctacgtgcagtaatttgaccataactcaatttttataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattacaaagctaac 25688883  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
25688884 atccatacctacaactttcgtgtttacagctaagaccaatt 25688924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 26924817 - 26924381
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | | ||||| ||||| || |||||    
26924817 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatga 26924720  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
26924719 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaataa 26924621  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
26924620 taatcaacatcttaaaacatcatatgtacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacatacatatactaattcatcaat 26924522  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26924521 catattcaattattcactatgacgtacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 26924422  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
26924421 atccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaacaatt 26924381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 19859096 - 19858663
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
19859096 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 19858999  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
19858998 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 19858900  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||    
19858899 caatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacag-catatacattcatatactaattcatcaat 19858801  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
19858800 catattcaattattcactgtgacctatgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaag---ac 19858704  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    || ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
19858703 attcatacctacaacttttgtgtttacacctaagatcaatt 19858663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Original strand, 19005031 - 19005331
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
19005031 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 19005128  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
19005129 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 19005227  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
19005228 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacatttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaat 19005326  T
309 cataa 313  Q
    |||||    
19005327 cataa 19005331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 29 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 19848109 - 19847711
Alignment:
29 catcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaa-aacaacatgatataacaatatcaaatgca 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||  |||| ||||| |||  | ||  |||| ||  | |||| |||||||| ||||    
19848109 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaat-agcagcataggcagattacatcaacagcaacacataaaaatatcaattgca 19848011  T
128 agtcatcaatatctcaaatatt-catatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaac 226  Q
    | ||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||                   |    
19848010 attcaacaatatcttaaatatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaat-------------------c 19847931  T
227 atcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcact 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
19847930 atcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcact 19847831  T
327 gtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaacttt 426  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||||||    
19847830 gtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaatcta----gcatacctacaacttt 19847735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 198 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 28289326 - 28289077
Alignment:
198 acatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatact 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |    
28289326 acatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgc--tcacaaatatatacatacatatatt 28289229  T
298 aatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcatt 397  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
28289228 aattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgacatt 28289129  T
398 agaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
28289128 agaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctgagaccaatt 28289077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 223 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 17377814 - 17377588
Alignment:
223 aaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattatt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
17377814 aaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactatttcatcaatcatattcaattatt 17377715  T
323 cactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaa 422  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
17377714 cactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatacttttgaagtcaaaccaatggcattagaaagctaacatccatacctacaa 17377615  T
423 ctttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
17377614 ctttcgtgtttacacctaagaccaatt 17377588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 236 - 449
Target Start/End: Original strand, 1598266 - 1598478
Alignment:
236 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctac 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
1598266 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 1598364  T
336 gttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttac 435  Q
    || |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
1598365 gtgcagtaatttgactatgactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttac 1598464  T
436 acctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||    
1598465 acctaagaccaatt 1598478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 194 - 405
Target Start/End: Original strand, 12942368 - 12942579
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacata 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
12942368 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacatacata 12942467  T
294 tactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacgg 393  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
12942468 tattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaattcgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacga 12942567  T
394 cattagaaagct 405  Q
    ||||||||||||    
12942568 cattagaaagct 12942579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 211 - 449
Target Start/End: Original strand, 23992604 - 23992844
Alignment:
211 atcaacatcttaaaacatcat---atatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaa 307  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
23992604 atcaacatcttaaaacatcatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacatacatatactaattcatcaa 23992702  T
308 tcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaa 407  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||| |    
23992703 tcatattcaattattcattgtgacctacgtgcagtaaattgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacaacattagaaagctga 23992802  T
408 catccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
23992803 catccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 23992844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 295
Target Start/End: Original strand, 25656619 - 25656897
Alignment:
15 atttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataa 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||    
25656619 atttggaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataa 25656716  T
114 caatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatc 213  Q
     |||||||||||||||| |  ||  |||||| |||||| ||||||||||| || | | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
25656717 taatatcaaatgcaagttaataacgtctcaattattcacatataattcaactaatacatatataattatatcacaatataaa-aacatcaaatggtaatc 25656815  T
214 aacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatata 295  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
25656816 aacatcttaaaacatcttatatacatataacacttcatcaatcttggacaatatcgtagtcacaaatatatacatacatata 25656897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 237 - 449
Target Start/End: Original strand, 18914142 - 18914354
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
18914142 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtatttacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacg 18914241  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttaca 436  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     
18914242 tgcagtaatttgaccataactcaagttctatacatccttttgaagttaaaccaacagcattagaaagttaacatccatacctacaactttcgtgtttacc 18914341  T
437 cctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||    
18914342 cctaagaccaatt 18914354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 261 - 449
Target Start/End: Original strand, 25535641 - 25535829
Alignment:
261 acaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||    
25535641 acaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacatgcagtaatttgaccataactcaa 25535740  T
361 attctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
25535741 gttctataaatcattttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 25535829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 237 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 31630493 - 31630281
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| || ||||    
31630493 catataacactttatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatatttaattattcattgtgacatacg 31630394  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttaca 436  Q
    | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||    
31630393 tgcaataatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaacgtctatacctacaaatttcgtgtttaca 31630294  T
437 cctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||    
31630293 cctaagaccaatt 31630281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 237 - 449
Target Start/End: Original strand, 19005361 - 19005573
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||     
19005361 catataacatttcatcaattatgaacaatatcgcattcacaaacatatacatacctatagtaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctaca 19005460  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttaca 436  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
19005461 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaatttttgtgtttaca 19005560  T
437 cctaagaccaatt 449  Q
    |||||||| ||||    
19005561 cctaagactaatt 19005573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 241
Target Start/End: Original strand, 1595534 - 1595763
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
1595534 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacata-acagtatacaaaaacaacatga 1595631  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
1595632 cataataatatcaaatgcaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatggatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaataa 1595730  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatat 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
1595731 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatat 1595763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 204
Target Start/End: Original strand, 20109127 - 20109322
Alignment:
9 tcaataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatga 108  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
20109127 tcaataatttggaacatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacataa 20109224  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtataca--attatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
20109225 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaa 20109322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Original strand, 25644335 - 25644505
Alignment:
37 tcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatca 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||    
25644335 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatca 25644434  T
136 atatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
25644435 acatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcgtatacaattatatcacatcaaaaacaacatcaaat 25644505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 210 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31630626 - 31630523
Alignment:
210 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
31630626 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatc 31630527  T
310 ataa 313  Q
    ||||    
31630526 ataa 31630523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Original strand, 18913994 - 18914112
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacata 293  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
18913994 aacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattca-taacatatacatacata 18914092  T
294 tactaatttatcaatcataa 313  Q
    |||||||| |||||||||||    
18914093 tactaattcatcaatcataa 18914112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Original strand, 25754794 - 25755001
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| | |||||| |||||    
25754794 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-tagtatacaaaaacagcatga 25754891  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||      
25754892 cataataatatcaaatgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatca 25754990  T
209 taatcaacatc 219  Q
    |||||||||||    
25754991 taatcaacatc 25755001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 2034 - 1905
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
2034 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 1935  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||    
1934 caactttcgtgtgtacacctaagaccaatt 1905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 8993 - 8864
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
8993 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 8894  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||    
8893 caactttcgtgtgtacacctaagaccaatt 8864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 19005637 - 19005766
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
19005637 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaacataactcaagttctataaatcgttttgaagtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 19005736  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
19005737 caacttttgtgtttacacctaagaccaatt 19005766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 320 - 446
Target Start/End: Original strand, 1598542 - 1598668
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1598542 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattgttttgatgtcataccaacggcattagaaagctaacatccataccta 1598641  T
420 caactttcgtgcttacacctaagacca 446  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||    
1598642 caactttcgtgtttatacctaagacca 1598668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20557069 - 20556864
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||| ||||     
20557069 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgg 20556972  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  ||||||   |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
20556971 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa--tttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatca 20556875  T
209 taatcaacatc 219  Q
    |||||||||||    
20556874 taatcaacatc 20556864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 3852194 - 3852011
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| | | ||||| ||||| || |||||    
3852194 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataacaa-cagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatga 3852097  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataa 194  Q
     || | ||||| |||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
3852096 catgataatataaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 3852011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 19847648 - 19847519
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
19847648 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgacgataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagactaatggcattagaaagctaacatccataccta 19847549  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
19847548 caactttcgtgtttatacctaggaccaatt 19847519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8227644 - 8227448
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| | |||||| ||||||||| ||||| |||||||  |||  | ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
8227644 caataatttggaacatcaacatcttcaacaacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaacatcatgat 8227545  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    |||| ||||||  | | |||| | ||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
8227544 ataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 8227448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 321 - 449
Target Start/End: Original strand, 27557016 - 27557144
Alignment:
321 ttcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctac 420  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
27557016 ttcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattgttttaacgtcagaccaatggcattagaaagctaacatccatacctac 27557115  T
421 aactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||    
27557116 aactttcatgtttacacctaagaccaatt 27557144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Original strand, 15875473 - 15875591
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacata 293  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
15875473 aacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacatttcattaatcatttacaatatcgtattcac-aacatatacatacata 15875571  T
294 tactaatttatcaatcataa 313  Q
    || ||||| |||||||||||    
15875572 taataattcatcaatcataa 15875591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Original strand, 23019396 - 23019567
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
23019396 caataatttggaacatcatcatctt--tcatcttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaacaacatgat 23019493  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatat 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| | |||||||| ||| ||  |||||||||||||    
23019494 ataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 23019567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25629488 - 25629294
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||| |  |||||| | |||||| |||||    
25629488 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattacaa-caggaacacatgcagtatacgaaaacagcatga 25629390  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||  |||||||||||| ||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
25629389 cataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaa 25629294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 340 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 31630197 - 31630090
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
31630197 agtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataactacaactttcgtgtttacacct 31630098  T
440 aagaccaa 447  Q
    ||||||||    
31630097 aagaccaa 31630090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 320 - 450
Target Start/End: Original strand, 25688988 - 25689118
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25688988 attcactatgacctacgtgcagtaatatgaccataacgcaagttctataaatttttttgacgtccgaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 25689087  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaattt 450  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
25689088 caacttttgtgtttacacctaagaccaattt 25689118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 30676386 - 30676257
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
30676386 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagagcaacggaattagaaagctaacatccataccta 30676287  T
420 caactttcgtgctta-cacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||||    
30676286 caactttagt-cttatcacctaagaccaatt 30676257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 1598735 - 1598864
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
1598735 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttaacgtcagaccaacggaattagaaagctaacatccataccta 1598834  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||  || |||||| || ||||||||    
1598835 caactttaatgtttacacttatgaccaatt 1598864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 324 - 449
Target Start/End: Original strand, 18914422 - 18914547
Alignment:
324 actgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaac 423  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
18914422 actgtgacctacgtgcagtactttgaccataactcaagttctatcaatcgttttgacttcagaccaacggtattagaaagctaacttccatacctacaac 18914521  T
424 tttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
18914522 tttcgtgtttacacctaagaccaatt 18914547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 324 - 449
Target Start/End: Original strand, 18914615 - 18914740
Alignment:
324 actgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaac 423  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||    
18914615 actgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatttttttgatgtcagaccaacgacattagaaatctaacatttatacctacaac 18914714  T
424 tttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
18914715 tttcgtgtttacacctaagaccaatt 18914740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 25689181 - 25689310
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||    
25689181 attcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattgttttgatgtcagaccaacgtcattagaatgctgacatccacaccta 25689280  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
25689281 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 25689310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 20076688 - 20076862
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| |||||     
20076688 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaaacagcatgac 20076786  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
    |||| ||||||||||||||   ||||| |||| ||| |||||  |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||    
20076787 ataataatatcaaatgcaa---atcaacatcttaaaaattcaattatacttcaagtaatgcgtataacattatatcaca 20076862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 321 - 449
Target Start/End: Original strand, 23415258 - 23415386
Alignment:
321 ttcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctac 420  Q
    ||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
23415258 ttcacagtgacctacgtgcagtaacttgaccataactcaagttctataaattgttttgacgtcagaccaatggcattagaaaactaacatccatacctac 23415357  T
421 aactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||    
23415358 aactttcgtgtttacacctaagacaaatt 23415386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 29060527 - 29060722
Alignment:
10 caataatttg-aaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatg 107  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
29060527 caataatttggaaacatcatcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatg 29060625  T
108 atataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    | |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||  |||||||||||| |||  |||  |||||||| ||  |||| |||||||||    
29060626 acataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatctcatcataatcaacatcaa 29060722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 27333336 - 27333241
Alignment:
25 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
27333336 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 27333241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 27394076 - 27393981
Alignment:
25 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
27394076 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 27393981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 320 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 242 - 112
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||     
242 attcactatgacctacgtgcagtactttgaccataactcaagttatataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaaactaacatccatacctt 143  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaattt 450  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||    
142 caactttcgtgtatacacctaagaccaattt 112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 367 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15892231 - 15892149
Alignment:
367 taaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
15892231 taaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctagcatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 15892149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18456898
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatat 139  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||| |||  |    
18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18456832  T
140 ctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
18456833 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaat 18456898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16448686 - 16448520
Alignment:
28 tcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgc 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| || |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||    
16448686 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 16448589  T
127 aagtca-tcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataa 194  Q
    |||||| ||||  |||||| |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
16448588 aagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa 16448520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19303673 - 19303480
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||     
19303673 caataatttggaacatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacacaggaagtatacaaaacaacatgac 19303575  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||  ||| |||||||| ||   |||  |||||||||||  |||| |||||||||    
19303574 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgtacataacattatatcacatcataatcaacatcaa 19303480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 324 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 26924313 - 26924199
Alignment:
324 actgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaac 423  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
26924313 actgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatttatacctacaac 26924214  T
424 tttcgtgcttacacc 438  Q
    |||| || |||||||    
26924213 tttcatgtttacacc 26924199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 17287929 - 17287773
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaa-acaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||    
17287929 caataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggtagtatacaaacacagcatga 17287831  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagta 166  Q
     |||| |||||||| ||||||||| ||  |||| |||||||||  |||| ||||||||    
17287830 cataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagta 17287773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 20361093 - 20360915
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || | |||||| |||||    
20361093 caataatttggaacatcatcattttcatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatga 20360995  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||  |||||||| ||| ||||  |||||||||||    
20360994 cataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 20360915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 320 - 439
Target Start/End: Original strand, 25737128 - 25737247
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||  ||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
25737128 attcactgtgacctacatgcagtaatatgaccataactcatgttctataaattgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 25737227  T
420 caactttcgtgcttacacct 439  Q
    ||||||| ||| ||||||||    
25737228 caacttttgtgtttacacct 25737247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 9098620 - 9098528
Alignment:
37 tcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgca 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
9098620 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgca 9098528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 145
Target Start/End: Original strand, 19652186 - 19652317
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
19652186 caataatttggaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 19652282  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaa 145  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||    
19652283 ataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 19652317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 237 - 360
Target Start/End: Original strand, 15875621 - 15875734
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||          ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
15875621 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacat----------atactaattcatcaatcatattcaattatttactgtgacctacg 15875710  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaa 360  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
15875711 tgcagtaatttgaccataactcaa 15875734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18409945 - 18409766
Alignment:
25 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaa 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||| |||| |||||||||    
18409945 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatcaaa 18409847  T
124 tgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    ||||||||| ||| |||||||  || |||  ||||||||| || | | ||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
18409846 tgcaagtcaacaacatctcaatcatccattcataattcaaataatacatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 18409766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 20593761 - 20593955
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  |||||| | |||||| |||||    
20593761 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataa-aaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatga 20593859  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||   |||| ||||||| ||||||||  | |||||||||  |||| |||||||||    
20593860 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataaatcaagtaatgcgtataacaatatatcacatcataatcaacatcaa 20593955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 151
Target Start/End: Original strand, 16496232 - 16496373
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || |||||    
16496232 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatga 16496330  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattca 151  Q
     |||| |||||||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||    
16496331 cataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattca 16496373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Original strand, 19668386 - 19668479
Alignment:
37 tcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaaca--acatgatataacaatatcaaatgcaa 128  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
19668386 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaa 19668479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 194 - 263
Target Start/End: Original strand, 18937252 - 18937321
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggaca 263  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18937252 aacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggaca 18937321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20638416 - 20638222
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | ||||||||||||    
20638416 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatga 20638318  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||| ||||| | ||||| ||||  |||||||| | ||  |||||||| ||| || |   ||||||||||  |||| |||||||||    
20638317 cataataatatcaattgcaatttatcaacatctttaatattcaaacattcttcaagtaatgcataaaacgttatatcacatcataatcaacatcaa 20638222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 320 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 22981416 - 22981321
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccata 415  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
22981416 attcactgtgacctacgtgcagtaatttaaccataactcaagttctataaatcgttttgacgcccgaccaacggcattagaaagctaacatccata 22981321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 320 - 415
Target Start/End: Original strand, 23806992 - 23807087
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccata 415  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
23806992 attcactgtgacctacgtgcagtaatttaaccataactcaagttctataaatcgttttgacgcccgaccaacggcattagaaagctaacatccata 23807087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 28496605 - 28496417
Alignment:
10 caataatttg-aaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||    
28496605 caataatttggaaacatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatga 28496506  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacat 201  Q
    ||||| |||||| |||| ||   ||||| | |||||||| ||| | |||| ||| ||| ||  ||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
28496505 tataataatatcgaatgtaa---atcaacaactcaaata-tcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacat 28496417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29809016 - 29808828
Alignment:
10 caataatttg-aaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||    
29809016 caataatttggaaacatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatga 29808917  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacat 201  Q
    ||||| |||||| |||| ||   ||||| | |||||||| ||| | |||| ||| ||| ||  ||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
29808916 tataataatatcgaatgtaa---atcaacaactcaaata-tcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacat 29808828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Original strand, 1561291 - 1561483
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| | ||| ||||  |||||||||| || ||||||    
1561291 caattatttggaacatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgat 1561390  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    |||| |||||| |||||||   ||||| | |||||||| ||| | |||| ||| ||| ||  ||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||    
1561391 ataataatatcgaatgcaa---atcaacaactcaaata-tcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaat 1561483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 178
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18462031
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatat 139  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||| |||  |    
18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18461992  T
140 ctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaa 178  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
18461993 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaa 18462031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 4185928 - 4185828
Alignment:
36 atcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatca 135  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
4185928 atcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatca 4185829  T
136 a 136  Q
    |    
4185828 a 4185828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 136
Target Start/End: Original strand, 4186381 - 4186481
Alignment:
36 atcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatca 135  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
4186381 atcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacaggcagcaacatagacagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatca 4186480  T
136 a 136  Q
    |    
4186481 a 4186481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Original strand, 35245574 - 35245703
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||  | ||||||||||     
35245574 caataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtat--acaacaacatgac 35245671  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatct 141  Q
    |||| |||||||| | ||| ||||||| ||||    
35245672 ataataatatcaatttcaattcatcaacatct 35245703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 382 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 17883305 - 17883238
Alignment:
382 tcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
17883305 tcaaaccaacgacattagaatgctaacatccatacctacaactttcgtgtttacaccaaagaccaatt 17883238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22780360 - 22780166
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| || ||| | |||||| | |||    
22780360 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacaaaaacataggcaatatacaaaaacagcttga 22780262  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||| ||||||||| ||  |||| |||||||||  |||| |||||||| |||    |  |||||||||||| |||| |||||||||    
22780261 cataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacgcaacattatatcacaacataatcaacatcaa 22780166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 84
Target Start/End: Original strand, 25714405 - 25714478
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaaca 84  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
25714405 caataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821801
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaat-a 138  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||| ||||  ||||||||||| || ||||| || |||| |    
18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgccataacaatatc-aacgcaagccaacaatca 18821850  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
    |||||| ||||||| || | |||||||| ||||||||| |||||||||||    
18821849 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtatac-attatatcaca 18821801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 22080858 - 22080754
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||             ||||||| |||||||||||||| ||||||    
22080858 caataatttggaacatcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagtta-------------aacataggcagtatgcaaaacatcatgat 22080772  T
110 ataacaatatcaaatgca 127  Q
    ||||||||||| ||||||    
22080771 ataacaatatcgaatgca 22080754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 87
Target Start/End: Original strand, 22831491 - 22831568
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatag 87  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | ||   ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
22831491 caataatttggaacatcatcatcttcaacatagtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 22831568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 16920759 - 16920679
Alignment:
14 aatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtat 94  Q
    |||||| ||| |||||||||| | || ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
16920759 aatttggaacatcatcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtat 16920679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 18334269 - 18334151
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  | | ||||| |||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
18334269 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 18334170  T
420 caactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| || |||||||    
18334169 caactttcatgtttacacc 18334151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 19984228 - 19984130
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||| |   |||||| ||||||| || |||||||    
19984228 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaggtcaaaccaaagtcattagaaagctaacttaattacctaaaactttcatgtttacacc 19984130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Original strand, 24423032 - 24423150
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  | | ||||| |||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
24423032 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 24423131  T
420 caactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| || |||||||    
24423132 caactttcatgtttacacc 24423150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Original strand, 16240296 - 16240405
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||| || |||||||||| | |||||||||||||||||   || ||| ||||||| || |||||||     
16240296 agtaatttgatcataactcaagtcctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacaccg 16240395  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
16240396 aagtccaatt 16240405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16557054 - 16556945
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || || ||||||| | |||||||||||||||||   || ||| ||||||| || |||||||     
16557054 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgttaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacacca 16556955  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
16556954 aaggccaatt 16556945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16633610 - 16633501
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || || ||||||| | |||||||||||||||||   || ||| ||||||| || |||||||     
16633610 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgttaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacacca 16633511  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
16633510 aaggccaatt 16633501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16650284 - 16650175
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || || ||| || |||||||||| | |||||||||||||||||   || ||| ||||||| || |||||||     
16650284 agtaatttgatcataactcaagttctaaaattcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacacca 16650185  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
16650184 aaggccaatt 16650175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 31155527 - 31155404
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaa-cagcaacatagacagtatgcaaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||||||| ||  ||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  || | |||    
31155527 caataatttggaacatcatcatc---atcaacttggattgactcatgcaacttagttaaataacaaaacagcaac-taaacagtatgcaagtcatcgtga 31155432  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 136  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||    
31155431 tataacaatatcgaatgcaattcatcaa 31155404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Original strand, 23076749 - 23076915
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||||   ||||||   |  ||||||| |||||||| ||  | ||| ||| |    
23076749 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaacaaca 23076848  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
     || ||| || ||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
23076849 acttaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaat 23076915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 4668277 - 4668218
Alignment:
77 cagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
4668277 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaa 4668218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 4675124 - 4675065
Alignment:
77 cagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
4675124 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaa 4675065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Original strand, 18706356 - 18706488
Alignment:
74 aaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcg 171  Q
    |||||||||||||| || |||  ||||||   |||||||||||||||||||| |||| |||  || |||| ||| || ||||||||||||| ||| |||     
18706356 aaacagcaacataggcaatatataaaacagttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatcttaaacat-catatataattcatgtaatgca 18706453  T
172 tatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    |||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||    
18706454 tatacatttatatgacattattaacaacatcaaat 18706488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 206
Target Start/End: Original strand, 18696570 - 18696670
Alignment:
104 catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatca 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||  || ||||| || || ||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
18696570 catgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctccaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatta 18696667  T
204 aat 206  Q
    |||    
18696668 aat 18696670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Original strand, 25904474 - 25904584
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaa-tccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||| || ||| || |||||||||| | |||||||||||||||||   || ||| ||||||| || |||||||    
25904474 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacacc 25904573  T
439 taagaccaatt 449  Q
     ||| ||||||    
25904574 aaaggccaatt 25904584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Original strand, 33864763 - 33864881
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  | | ||||| |||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||    || |||    
33864763 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactgtaaagctaacacaattatcta 33864862  T
420 caactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| || |||||||    
33864863 caactttcatgtttacacc 33864881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 35016113 - 35016043
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacat 410  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||| ||| | |||||||||||||||||    
35016113 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaagcaaagccattagaaagctaacat 35016043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 27654706 - 27654597
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    || ||||||||||| || |||||||     
27654706 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaatgccattagaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacacca 27654607  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
27654606 aagtccaatt 27654597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 394 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 10905460 - 10905416
Alignment:
394 cattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
10905460 cattggaaagctaacatccatacctacaactttcatgtttacacc 10905416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 85
Target Start/End: Original strand, 11185524 - 11185568
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacat 85  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
11185524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacat 11185568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 22226679 - 22226608
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaa-tccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacat 410  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||| || ||| || |||||||||| | |||||||||||||||||    
22226679 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacat 22226608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22593691 - 22593620
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatc 411  Q
    |||||||||| |||||||||| || || ||||| ||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||    
22593691 agtaatttgatcataactcaagttataaaaatcatttggaagtcaaactaaatccattagaaagctaacatc 22593620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 16133145 - 16133087
Alignment:
351 cataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
16133145 cataactcaaaaactaaaaatcattttcaagtcaaaccaacgacattggaaagctaaca 16133087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 21776205 - 21776107
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||||||||| | ||||||||||||||||    || ||||||||||| || |||||||    
21776205 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcattttggcgtcaaaccaaagccattagaaagctaacaaagttatctacaactttcatgtttacacc 21776107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 311
Target Start/End: Original strand, 35056707 - 35056781
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcat 311  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||| ||| || |||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
35056707 catataataattcatcaatcatgaacaacatcataatcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcat 35056781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Original strand, 1555527 - 1555596
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
1555527 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaaca 1555596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Original strand, 10487971 - 10488040
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
10487971 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaaca 10488040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 16377357 - 16377288
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
16377357 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaaca 16377288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 16384681 - 16384612
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
16384681 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaaca 16384612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 16826477 - 16826408
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
16826477 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaaca 16826408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18177666 - 18177609
Alignment:
149 tcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||||||||||  || ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
18177666 tcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaat 18177609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18199410 - 18199353
Alignment:
149 tcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||||||||||  || ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
18199410 tcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaat 18199353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 206
Target Start/End: Original strand, 18204205 - 18204262
Alignment:
149 tcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||||||||||  || ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
18204205 tcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaat 18204262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 26924124 - 26924035
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |  | | ||||| |||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||    
26924124 attcactgtgacctacatgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactgtaaagctaaca 26924035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 33315185 - 33315116
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||||| || || ||||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
33315185 agtaatttgatcataactcaagttttaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaaca 33315116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 206
Target Start/End: Original strand, 35008276 - 35008333
Alignment:
149 tcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    |||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
35008276 tcatatataattcatgtaatgaatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaat 35008333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 413 - 449
Target Start/End: Original strand, 25737028 - 25737064
Alignment:
413 atacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
25737028 atacctacaactttcgtgtttacacctaagacgaatt 25737064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 43 - 124
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443150
Alignment:
43 tagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaaca--acatgatataacaatatcaaat 124  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||  ||||||||||||| ||||||  ||||||   || ||||||||||||||||||    
33443068 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagtatataaaacatctcaagatataacaatatcaaat 33443150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 93
Target Start/End: Original strand, 35008167 - 35008219
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagta 93  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||||    
35008167 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagta 35008219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 13377 - 13814
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
13377 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 13474  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||      
13475 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataa-caacatcaaataa 13573  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
13574 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatgtaacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 13673  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
13674 cataatcaattattcactgtgacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagataac 13773  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
13774 atttatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaatt 13814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 361
Target Start/End: Original strand, 13878 - 13919
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaa 361  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
13878 attcactgtgacctacgttcagtaatttgaccataactcaaa 13919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 10)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 94396 - 94832
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
94396 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 94493  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
94494 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 94592  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
94593 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 94691  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
94692 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 94791  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
94792 attcatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 94832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 17598 - 17180
Alignment:
29 catcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||    
17598 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat-agcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 17501  T
128 agtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 227  Q
    ||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
17500 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacagtataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 17402  T
228 tcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactg 327  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||    
17401 tcatatatacatatgacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaagcatatacatacatatactaattcatcgatcatattcaactattcactg 17302  T
328 taacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttc 427  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
17301 tgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacaaaaatacctacaactttc 17202  T
428 gtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
17201 gtgtttacacctaagaccaatt 17180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 44439 - 44614
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa--caacatg 107  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||  || ||||    
44439 caataattttgaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaaacagcatg 44536  T
108 atataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatc 185  Q
    | |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
44537 acataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatagaattatatc 44614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 149
Target Start/End: Original strand, 100365 - 100501
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
100365 caataatttggaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 100461  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatatt 149  Q
    |||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||    
100462 ataataatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatt 100501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 40304 - 40169
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
40304 caataatttggaacatcatcatc---atcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggcaaatcatcatgat 40208  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatat 148  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
40207 ataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 40169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 320 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 17116 - 17006
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||| | |||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
17116 attcactatgacctacgtgcattaatttgatcataactcaagttctataaacctttttgatatcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 17017  T
420 caactttcgtg 430  Q
    |||||||||||    
17016 caactttcgtg 17006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 95
Target Start/End: Original strand, 119863 - 119948
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatg 95  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
119863 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 119948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 99
Target Start/End: Original strand, 101503 - 101576
Alignment:
26 catcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaa 99  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
101503 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Original strand, 94896 - 95014
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  | | ||||| |||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
94896 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 94995  T
420 caactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| || |||||||    
94996 caactttcatgtttacacc 95014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 154961 - 154892
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||  ||| ||  ||||||||||| ||||| ||||||||||    
154961 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatgatttggacctcaaaccaacgtcattataaagctaaca 154892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 135)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14409621 - 14409185
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| || |||||    
14409621 caataatttggaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatga 14409524  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
14409523 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 14409425  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
14409424 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 14409326  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14409325 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 14409226  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
14409225 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 14409185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 1484387 - 1484823
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
1484387 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 1484484  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
1484485 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 1484583  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
1484584 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 1484682  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1484683 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 1484782  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
1484783 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 1484823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 4483266 - 4483702
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
4483266 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 4483362  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
4483363 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaataa 4483461  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
4483462 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaat 4483561  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
4483562 cataatcaattattcagtgtgacctacgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcactagaaagctaac 4483661  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
4483662 atccatacctacaactttcgtgtttatacctaagaccaatt 4483702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 5853469 - 5853033
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
5853469 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 5853372  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
5853371 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 5853273  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
5853272 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 5853174  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5853173 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 5853074  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
5853073 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 5853033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16413474 - 16413056
Alignment:
29 catcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||    
16413474 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 16413377  T
128 agtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 227  Q
    ||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
16413376 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 16413278  T
228 tcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
16413277 tcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactg 16413178  T
328 taacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttc 427  Q
    | | ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
16413177 tgatctacgtgaagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagcaagctaacatccatacctacaactgtc 16413078  T
428 gtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
16413077 gtgtttacacctaagaccaatt 16413056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 22001738 - 22002174
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
22001738 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 22001835  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
22001836 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaataa 22001934  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
22001935 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 22002033  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
22002034 catattcaattattcaatgttacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaattcttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaac 22002133  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
22002134 atttatacctacaactttcatgtttacacctaagaccaatt 22002174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 20046372 - 20045936
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
20046372 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatga 20046275  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
20046274 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 20046176  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||    
20046175 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggaaaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactcattcatcaat 20046077  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
20046076 catattcaattattcactatgacctacatgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtgaaaccaacggcattagaaatctaac 20045977  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
20045976 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 20045936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 4542550 - 4542114
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||  || ||||| || |||||    
4542550 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acaagatacaaaaacagcatga 4542453  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
4542452 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatagttcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaataa 4542354  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
4542353 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 4542255  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    ||||  |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
4542254 catatacaattattcactgcgacctacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatcattttgaagtcaagcgaacggcattagaaagctaac 4542155  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
4542154 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 4542114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 14823759 - 14824196
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||   ||||||||||||| || ||||| | ||||||| ||||| || |||||    
14823759 caataatttggaacttcatcatcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataacaa-caacaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 14823855  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||      
14823856 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacattaaataa 14823954  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatata--catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatca 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
14823955 taatcaacatcttaaaacatcatatatatacatataacacttcatcaatcatggataatatcgtatttacaa-catatacattcatatactaattaatca 14824053  T
307 atcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagcta 406  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14824054 atcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagcta 14824153  T
407 acatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
14824154 acattcatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 14824196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 38 - 449
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070982
Alignment:
38 caacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtc-atca 135  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacacag-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatca 15070668  T
136 atatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatat 235  Q
    |  |||||| |||||| | |||||  || |  ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
15070669 acgtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatatctgaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatcataaat 15070768  T
236 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctac 335  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
15070769 acatataaaacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactatgacctac 15070868  T
336 gttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttac 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
15070869 gttcagtaatttgaccataactcaagttgtataaatcatttttaagtcaaaccaacggcactagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttat 15070968  T
436 acctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||    
15070969 acctaagaccaatt 15070982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 139 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24486093 - 24485784
Alignment:
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatataca 238  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
24486093 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataataatcaacatcttagaacatcatatataca 24485995  T
239 tataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgtt 338  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
24485994 tataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtg 24485895  T
339 cagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
24485894 cagtaatttgactataactcaagttttataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttacacc 24485795  T
439 taagaccaatt 449  Q
     ||||||||||    
24485794 caagaccaatt 24485784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 211 - 449
Target Start/End: Original strand, 32121912 - 32122150
Alignment:
211 atcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatca 310  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
32121912 atcaacatcttaaaacatcatacatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatgcatacatatactaattcatcaatca 32122011  T
311 taatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacat 410  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
32122012 tattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaactaacggcattagaaagctaacat 32122111  T
411 ccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
32122112 ccatacctacaacattcgtgtttacacctaagaacaatt 32122150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Original strand, 20403212 - 20403512
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
20403212 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 20403309  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
20403310 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 20403408  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
20403409 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaat 20403507  T
309 cataa 313  Q
    |||||    
20403508 cataa 20403512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 210 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 27472395 - 27472157
Alignment:
210 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatc 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
27472395 aatcaacatcttaaa-catcatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatc 27472297  T
310 ataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
27472296 atattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgacattagaaatctaaca 27472197  T
410 tccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
27472196 tccatacctacaactttcgtgtttacagctaagaccaatt 27472157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 211 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 18678043 - 18677805
Alignment:
211 atcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatca 310  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
18678043 atcaacatcttaaaacatcatacataaatataacacttcatcaatcatggataatatcgtattcacaaacatatacatatacatactaattcatcaatca 18677944  T
311 taatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacat 410  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
18677943 tattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattcttttgaagtcaaaccaacggcactagaaagctaacat 18677844  T
411 ccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
18677843 ccatacctacaactttcgtgtttatacctaagaccaatt 18677805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15203408 - 15203108
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
15203408 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 15203311  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| ||||||||||| |||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
15203310 cataataatatcaaatgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 15203212  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
15203211 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggataatatcttattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaat 15203113  T
309 cataa 313  Q
    |||||    
15203112 cataa 15203108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Original strand, 19896250 - 19896554
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | || |||| ||||| || |||||    
19896250 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acggtatacaaaaacagcatga 19896347  T
109 tataacaata---tcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaa 205  Q
     |||| ||||   |||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
19896348 cataataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaa 19896446  T
206 tggtaatcaacatctt-aaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttat 304  Q
    |  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
19896447 taataatcaacatcttaaaaatatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatatatacatatactaattcat 19896545  T
305 caatcataa 313  Q
    |||||||||    
19896546 caatcataa 19896554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 248 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 25658094 - 25657893
Alignment:
248 tcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaattt 347  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
25658094 tcatcaatcatgaacaatatcaaattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaattt 25657995  T
348 gaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaa 447  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
25657994 gaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaacaaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcatgtttacaccaaagaccaa 25657895  T
448 tt 449  Q
    ||    
25657894 tt 25657893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45290872 - 45290571
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| | ||||||| ||||| || |||||    
45290872 caataatttggaacttcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatga 45290775  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtca-tcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatg 207  Q
     |||| ||||||||||| ||| || ||||  |||||| |||||| ||||||||||| || |||  |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||     
45290774 cataataatatcaaatgtaagccaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcagatacaattatatcacagtataa-caacgtcaaata 45290676  T
208 gtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaa 307  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
45290675 ataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaa 45290577  T
308 tcataa 313  Q
    ||||||    
45290576 tcataa 45290571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 248 - 449
Target Start/End: Original strand, 16198115 - 16198316
Alignment:
248 tcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaattt 347  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||     
16198115 tcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctacgtgcagtaattg 16198214  T
348 gaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaa 447  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
16198215 gaccataactcaagttctataaatatttttaaagtcaaaccaacggcattagaaagctaatatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaa 16198314  T
448 tt 449  Q
    ||    
16198315 tt 16198316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 237 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 38549957 - 38549745
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||    
38549957 catataaaaattcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacatacg 38549858  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttaca 436  Q
    | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
38549857 tgcagtattttgaccataactcaagttctataaatctttttgaagtcaaaccaacgacattagaaaactaacatccatacctacaacttttgtgtttata 38549758  T
437 cctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||    
38549757 cctaagaccaatt 38549745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 239 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16401875 - 16401665
Alignment:
239 tataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgtt 338  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |     
16401875 tataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacctg 16401776  T
339 cagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacc 438  Q
    | ||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
16401775 ctgtaatctgactataactcaagttttataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaatctaacatcaatacctacaactttcgtgtttacacc 16401676  T
439 taagaccaatt 449  Q
    |||||||||||    
16401675 taagaccaatt 16401665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 257 - 449
Target Start/End: Original strand, 24048841 - 24049032
Alignment:
257 atggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataac 356  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
24048841 atgnacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctac-tgcagtaatttgaccataac 24048939  T
357 tcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
24048940 tcaagttctataaattgttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaatt 24049032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 237 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 1326884 - 1326672
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
1326884 catataacacttcatcaatcataaacaatatcgtatttacaaacatgtacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 1326785  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttaca 436  Q
    | |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||    
1326784 tgcagtaatttgaccataactcaagttttataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagataacattcatacctacaactttcgtttttaca 1326685  T
437 cctaagaccaatt 449  Q
    | |||||||||||    
1326684 cttaagaccaatt 1326672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 234 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 45290597 - 45290385
Alignment:
234 atacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacct 333  Q
    |||||||||  | ||||||||||||  |||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | || |||||||||| ||||||||||||| | | ||    
45290597 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcatattcaattattcactatgatct 45290498  T
334 acgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgctt 433  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
45290497 acgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgttt 45290398  T
434 acacctaagacca 446  Q
    |||||||||||||    
45290397 acacctaagacca 45290385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 234 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15203134 - 15202919
Alignment:
234 atacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacct 333  Q
    |||||||||  | ||||||||||||  | || ||| || ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
15203134 atacatatactaattcatcaatcataaataacatcatactcataaacatatacattcatatattaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 15203035  T
334 acgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgctt 433  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
15203034 acgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaattcttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaacttttgtgttt 15202935  T
434 acacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||    
15202934 acacctaagaccaatt 15202919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19937168 - 19936882
Alignment:
25 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaa 123  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| || ||||||    
19937168 tcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataagatcaaa 19937071  T
124 tgcaagtca-tcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatct-- 220  Q
    ||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||  | |||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||       
19937070 tgcaagtcaatcaacgtctcaattactcacaaataattcaatcaatgcacatacagttatatcacaatataa-caacatcaaatgataatcaacatcaac 19936972  T
221 taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcat 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
19936971 ttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 19936882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 153 - 313
Target Start/End: Original strand, 32810058 - 32810216
Alignment:
153 atataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatc 252  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
32810058 atataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatgtaacacttcatc 32810156  T
253 aatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
32810157 aatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcataa 32810216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 230 - 449
Target Start/End: Original strand, 19896524 - 19896743
Alignment:
230 atatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgta 329  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||  |||| ||| || ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||     
19896524 atatatacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatcctaattcatcaatcacattcaattattcactgtg 19896623  T
330 acctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgt 429  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| || ||||||||||| ||||||    
19896624 acctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcgctagaaagttaaaattcatacctacaattttcgt 19896723  T
430 gcttacacctaagaccaatt 449  Q
    | ||||||||||||||||||    
19896724 gtttacacctaagaccaatt 19896743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 234 - 449
Target Start/End: Original strand, 20403486 - 20403701
Alignment:
234 atacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacct 333  Q
    |||||||||  | ||||||||||||  |||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||    
20403486 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatatttaattattcactgtgacct 20403585  T
334 acgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgctt 433  Q
    |||  ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||    
20403586 acgcgcagtaatatgacaataactcaagttctataaatccttttcaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacattaatacctacaactttcgtgttt 20403685  T
434 acacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||    
20403686 acacctaagaccaatt 20403701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 237 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 19936850 - 19936648
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||          ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
19936850 catataacacttcatcaatcatgaacaatataatattcacaaacatatac----------taattcatcaatcataaacaattattcactgtgacctacg 19936761  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttaca 436  Q
    | |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
19936760 tgcagtaatttgactatacctcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaatgacattagaaatctaacattcatacctacaactttcgtgtttaca 19936661  T
437 cctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||    
19936660 cctaagaccaatt 19936648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 320 - 450
Target Start/End: Original strand, 19896807 - 19896937
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19896807 attcactgtgacctacttgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 19896906  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaattt 450  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
19896907 caactttcgtgtttacacctaagaccaattt 19896937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498746
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatc 140  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaatagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 20498680  T
141 tcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
20498681 tcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 20498746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 319 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15202856 - 15202726
Alignment:
319 tattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacct 418  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
15202856 tattcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattcttttgaagtcaaaccaatagcattagaaagctaacatccatacct 15202757  T
419 acaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
15202756 acaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 15202726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 320 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 27472093 - 27471963
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
27472093 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 27471994  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaattt 450  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
27471993 caactttcgtgtttacacctaagaccaattt 27471963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 15071046 - 15071175
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15071046 attcactgtgacctacgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 15071145  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||    
15071146 caactttcgtgtttacccctaagatcaatt 15071175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 20403765 - 20403894
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
20403765 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacattcataccta 20403864  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
20403865 caacttttgtgtttacacctaagaccaatt 20403894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 32122214 - 32122343
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32122214 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacatcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 32122313  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
32122314 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 32122343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13508218 - 13508022
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| | | |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||    
13508218 caataatttggaacgtcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaacatcatgat 13508119  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    |||| |||||| || |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
13508118 ataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 13508022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 210 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 38550090 - 38549987
Alignment:
210 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatc 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
38550090 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacgtatactaattcatcaatc 38549991  T
310 ataa 313  Q
    ||||    
38549990 ataa 38549987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 6520356 - 6520482
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
6520356 caataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 6520455  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 136  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
6520456 ataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 6520482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 38855384 - 38855246
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
38855384 caataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 38855285  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatat 148  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
38855284 ataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 38855246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 320 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 16401408 - 16401287
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16401408 attcactgtgacctacgtgctgtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacgtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 16401309  T
420 caactttcgtgcttacacctaa 441  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
16401308 caactttcgtgtttacacctaa 16401287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Original strand, 41598173 - 41598367
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||  ||||| ||||| || |||||    
41598173 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaa-cagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatga 41598270  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
41598271 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaat 41598367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13597750 - 13597554
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| | | |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||| ||||||    
13597750 caataatttggaacgtcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaacatcatgat 13597651  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    |||| |||||| || |||||| | ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
13597650 ataataatatcgaacgcaagtaaacaacatcccaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 13597554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 321 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14397609 - 14397481
Alignment:
321 ttcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctac 420  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
14397609 ttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctacaaatcattttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacattcatacctac 14397510  T
421 aactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||    
14397509 agctttcgtgtttacacctaagaccaatt 14397481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 22875053 - 22875246
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||| || |||||| |||||||||||||     
22875053 caataatttggaacatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcag-cagcaacacaggcagtatacaaaacaacatgac 22875151  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
22875152 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaa 22875246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 348 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 45290389 - 45290287
Alignment:
348 gaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaa 447  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
45290389 gaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaa 45290290  T
448 ttt 450  Q
    |||    
45290289 ttt 45290287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15202662 - 15202533
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
15202662 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacgtcagaccaacggtattagaaagctaacatccataccta 15202563  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
15202562 caacttttgtgtttacacctaagaccaatt 15202533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 38549681 - 38549552
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
38549681 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggaattaaaaagctaacatccataccta 38549582  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||| |||| ||| |||||||| |||||    
38549581 caacttccgtgtttatacctaagatcaatt 38549552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 341 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16401580 - 16401472
Alignment:
341 gtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacaccta 440  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
16401580 gtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcgttggaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacaccta 16401481  T
441 agaccaatt 449  Q
    |||||||||    
16401480 agaccaatt 16401472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 320 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 16412992 - 16412866
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
16412992 attcactgtgacctacgtatagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacatcagaccaacggaattagaaagctaacatccataccta 16412893  T
420 caactttcgtgcttacacctaagacca 446  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
16412892 caactttcgtgtttacacctaagacca 16412866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 331 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 38549478 - 38549360
Alignment:
331 cctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtg 430  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
38549478 cctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcataccaacgacattagaaagctaacatccatacatacaactttcgtg 38549379  T
431 cttacacctaagaccaatt 449  Q
     ||||||||||||||||||    
38549378 tttacacctaagaccaatt 38549360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16092475 - 16092281
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| || |||||    
16092475 caatagtttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatga 16092377  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
16092376 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataatttaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaa 16092281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 145
Target Start/End: Original strand, 21285601 - 21285720
Alignment:
26 catcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatg 125  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21285601 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatg 21285700  T
126 caagtcatcaatatctcaaa 145  Q
    ||| ||| ||| ||||||||    
21285701 caaatcaacaacatctcaaa 21285720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 22626723 - 22626901
Alignment:
10 caataatttgaaacc-tcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatga 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
22626723 caataatttgaaaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacaacatga 22626821  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
     |||| |||||||||| ||| ||| ||| |||| |||||||||  |||| |||||||| || |||||  |||||||||||    
22626822 cataataatatcaaatacaaatcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtgtataacattatatcaca 22626901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 330 - 449
Target Start/End: Original strand, 24049106 - 24049225
Alignment:
330 acctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgt 429  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
24049106 acctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttttataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccatacctataactttcgt 24049205  T
430 gcttacacctaagaccaatt 449  Q
    | ||||||||||||||||||    
24049206 gtttacacctaagaccaatt 24049225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 210 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20982710 - 20982603
Alignment:
210 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatata----acacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
20982710 aatcaacatcttaaaacatcatatatatatatatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatc 20982611  T
306 aatcataa 313  Q
    ||||||||    
20982610 aatcataa 20982603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17612243 - 17612056
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| | | |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||    
17612243 caataatttggaacatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaacatcatgat 17612144  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaaca 197  Q
    |||| ||||||  | | |||| | ||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
17612143 ataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaaca 17612056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 320 - 450
Target Start/End: Original strand, 19897000 - 19897130
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
19897000 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacgtcagaccaacggcattagaaatctaacattcataccta 19897099  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaattt 450  Q
    ||||||| ||  ||||| |||||||||||||    
19897100 caacttttgtatttacagctaagaccaattt 19897130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28649162 - 28648983
Alignment:
25 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaa 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||    
28649162 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa-agcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaa 28649064  T
124 tgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    ||||||||| ||| |||| || ||| |||  |||||||||||| || |||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
28649063 tgcaagtcaacaacatcttaattatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaa 28648983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18818542 - 18818348
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| |||||    
18818542 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 18818444  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||| || |||||| ||  |||| |||||||||  |||| |||||||| |||  |||  |||||||||||| |||| |||||||||    
18818443 cataataatatcaattgtaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaa 18818348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 23406367 - 23406563
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
23406367 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatga 23406465  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatca-at-atctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||| ||||||||| || || |||| |||||||||  |||| |||||||| |||  |||  |||||||||||| |||  |||||||||    
23406466 cataataatatcaattgcaagtcaacatatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacatagtcaacatcaa 23406563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 188
Target Start/End: Original strand, 20536195 - 20536374
Alignment:
9 tcaataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatg 107  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| | |||||| ||||    
20536195 tcaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatg 20536293  T
108 atataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
    | |||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||  |||||||| |||  |||  |||||||||||    
20536294 acataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 20536374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116532
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||   ||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 37116465  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
37116466 tctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaat 37116532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 201 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16402020 - 16401907
Alignment:
201 tcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatacta 298  Q
    ||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
16402020 tcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacatttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatacatacatatacta 16401922  T
299 atttatcaatcataa 313  Q
    ||| |||||||||||    
16401921 attcatcaatcataa 16401907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1327038 - 1326914
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatata------acacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatataca 287  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
1327038 aacaacatcaaataataatcaacatctcaaaacatcgtatatacatatatatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatataca 1326940  T
288 tacatatactaatttatcaatcataa 313  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||    
1326939 tacatataccaattcatcaatcataa 1326914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Original strand, 7372766 - 7372931
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| |||||    
7372766 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 7372864  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtata 175  Q
     |||| |||||||| ||||||||| ||  |||| |||||||||  |||| |||||||| ||| ||||    
7372865 cataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcttata 7372931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 119
Target Start/End: Original strand, 21490982 - 21491092
Alignment:
9 tcaataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatga 108  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
21490982 tcaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatga 21491081  T
109 tataacaatat 119  Q
    ||||| |||||    
21491082 tataataatat 21491092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25484445 - 25484245
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |  || |||      |||||| |||||     
25484445 caataatttagaacttcatcatcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataacaa-cagctag-tataca------aaaacagcatgac 25484354  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggt 209  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |    
25484353 ataataatatcaaatgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aataacatcaaatcat 25484255  T
210 aatcaacatc 219  Q
    ||||||||||    
25484254 aatcaacatc 25484245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 19936584 - 19936455
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| | | || |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||    
19936584 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgagcataactcaagttctataaatcgttttaacgccagaccaacggaattagaaagctaatatccatagcta 19936485  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||    
19936484 caactttcatgtttacacctaagaccaatt 19936455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 21924061 - 21923905
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||    
21924061 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatga 21923963  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagta 166  Q
     || | |||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||  |||| ||||||||    
21923962 catgataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagta 21923905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 237 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13425411 - 13425335
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
13425411 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataa 13425335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 23760974 - 23760839
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||   |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||    
23760974 caataatttggaacatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcatcatgat 23760878  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatat 148  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||| ||| |||||||||||    
23760877 ataacaatattgaattcaaatcaacaacatctcaaatat 23760839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 5866407 - 5866292
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
5866407 caataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgat 5866308  T
110 ataacaatatcaaatg 125  Q
    |||| |||||| ||||    
5866307 ataataatatcgaatg 5866292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18879364 - 18879176
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  ||||  |     
18879364 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa--aaca--ac 18879270  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatca 203  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||  |||||||| |||  |||  |||||||||||  |||| ||||||||    
18879269 ataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcacatcataatcaacatca 18879176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801367
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatc 140  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| |||  ||    
19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaat-agcaacaca-acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtc 19801430  T
141 tcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
19801429 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattataacacaatat-aacaacatcaa 19801367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 237 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 20982573 - 20982498
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcata 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
20982573 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 20982498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Original strand, 31971245 - 31971375
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
31971245 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgac 31971343  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatct 141  Q
    |||| |||||||| | ||| ||||||| ||||    
31971344 ataataatatcaattccaattcatcaacatct 31971375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Original strand, 6759261 - 6759437
Alignment:
25 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaa 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
6759261 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 6759359  T
124 tgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    ||||||||| ||   |||||| ||| ||   ||||||||| || ||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
6759360 tgcaagtcaaca---tctcaattatacactcataattcaattaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaa 6759437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 17140904 - 17141030
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||     
17140904 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgac 17141003  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 136  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||    
17141004 ataataatatcgaatgtaaatcatcaa 17141030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 237 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13425305 - 13425237
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13425305 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatc 13425237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16199777 - 16199666
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
16199777 caataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattc-aaacaacatgac 16199679  T
110 ataacaatatcaa 122  Q
    |||| ||||||||    
16199678 ataataatatcaa 16199666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Original strand, 26219702 - 26219856
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    ||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| || |||||| ||||| |  ||||     
26219702 caatactttggaacttcatcatcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacacag-cagtatacaaaatagtatgac 26219799  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagta 166  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||||    
26219800 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta 26219856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 26225424 - 26225270
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||| ||| |||||||  ||||     
26225424 caatactttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acaatatacaaaacagtatgac 26225327  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagta 166  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||||    
26225326 ataataatatcaaatacaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta 26225270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 21919133 - 21918992
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| |||||    
21919133 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 21919035  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattca 151  Q
     |||| |||||||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||    
21919034 cataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattca 21918992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 26223923 - 26224098
Alignment:
29 catcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaaatgca 127  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| ||| ||||||||||| |||||| | || || ||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||||    
26223923 catcttaatcaacttagatcgacccatgcagcttaattaaataacaa-cagcaataaag-caatatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgca 26224020  T
128 agtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
26224021 agtcaacaacatctcaattattcacatataatttaattaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaat 26224098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17267096 - 17266930
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||||   |||||    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
17267096 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17266997  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||| || ||||||||||||  ||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
17266996 tctcaaacat-catatataattcttgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaat 17266930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 148
Target Start/End: Original strand, 21673718 - 21673830
Alignment:
36 atcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatca 135  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
21673718 atcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaaca 21673817  T
136 atatctcaaatat 148  Q
    | |||||||||||    
21673818 acatctcaaatat 21673830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26355828 - 26355713
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||    
26355828 caataatttggaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcacgat 26355732  T
110 ataacaatatcaaatgcaa 128  Q
    ||||||||||| |||||||    
26355731 ataacaatatcgaatgcaa 26355713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 342 - 449
Target Start/End: Original strand, 11361024 - 11361131
Alignment:
342 taatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaa 441  Q
    |||||| || |||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
11361024 taatttaactataacttaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacagtattagaaagctaacatccatacctacaagttttgtgtttacacctaa 11361123  T
442 gaccaatt 449  Q
    ||||||||    
11361124 gaccaatt 11361131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17439609 - 17439443
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||||   ||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
17439609 cttagtccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17439510  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| ||| | |||||| ||||    
17439509 tctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattatcaacattaaat 17439443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 983512 - 983419
Alignment:
37 tcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa---catgatataacaatatcaaatgcaa 128  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||   |||||||||||||| ||||||||||    
983512 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaacaagttcatgatataacaatctcaaatgcaa 983419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Original strand, 24353039 - 24353204
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaaca--acatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||   ||||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |    
24353039 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 24353137  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||| | || |||| |||||| ||| ||| |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||    
24353138 tctcaaaca-tcgtatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaat 24353204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Original strand, 21249372 - 21249488
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaat-aacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||||  ||||||||||  || |||||    
21249372 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatga 21249471  T
109 tataacaatatcaaatg 125  Q
    ||||| |||||| ||||    
21249472 tataataatatcgaatg 21249488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Original strand, 21255210 - 21255326
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaat-aacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||||  ||||||||||  || |||||    
21255210 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatga 21255309  T
109 tataacaatatcaaatg 125  Q
    ||||| |||||| ||||    
21255310 tataataatatcgaatg 21255326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 21389583 - 21389454
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||  | |||| |||||     
21389583 caataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtat--acaacagcatgac 21389486  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatct 141  Q
    ||||  ||||||||| ||| ||||||| ||||    
21389485 ataattatatcaaattcaattcatcaacatct 21389454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 21396113 - 21395984
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    ||||||| || ||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||| |||||     
21396113 caataatgtggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat--acaacagcatgag 21396016  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatct 141  Q
    ||||  ||||||||| ||| ||||||| ||||    
21396015 ataattatatcaaattcaattcatcaacatct 21395984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 21778909 - 21778780
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||  | |||| |||||     
21778909 caataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtat--acaacagcatgac 21778812  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatct 141  Q
    ||||  ||||||||| ||| ||||||| ||||    
21778811 ataattatatcaaattcaattcatcaacatct 21778780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 21790606 - 21790477
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    ||||||| || ||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||| |||||     
21790606 caataatgtggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat--acaacagcatgag 21790509  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatct 141  Q
    ||||  ||||||||| ||| ||||||| ||||    
21790508 ataattatatcaaattcaattcatcaacatct 21790477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 394 - 449
Target Start/End: Original strand, 32810263 - 32810318
Alignment:
394 cattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
32810263 cattacaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 32810318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 45131129 - 45131019
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  | ||||| |||||     
45131129 caataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaac-aaacagcatgac 45131032  T
110 ataacaatatcaa 122  Q
    |||| ||||||||    
45131031 ataataatatcaa 45131019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 24717820 - 24717722
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||   |||||| ||||||| || |||||||    
24717820 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaaggcattagaaatctaacataattacctaaaactttcatgtttacacc 24717722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15320098 - 15319989
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | |||||||||||||||||   || ||| ||||||| || |||||||     
15320098 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacatagttatctaaaactttcatgtttacacca 15319999  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
15319998 aaggccaatt 15319989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15500467 - 15500358
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | |||||||||||||||||   || ||| ||||||| || |||||||     
15500467 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacatagttatctaaaactttcatgtttacacca 15500368  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
15500367 aaggccaatt 15500358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Original strand, 29759429 - 29759498
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
29759429 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtcaaaccaaagccattagaaagctaaca 29759498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Original strand, 1484887 - 1485005
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  | | ||||| |||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
1484887 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 1484986  T
420 caactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| || |||||||    
1484987 caactttcatgtttacacc 1485005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 206
Target Start/End: Original strand, 22364745 - 22364845
Alignment:
104 catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatca 203  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||| ||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||||    
22364745 catgatataacaatatcaaa-gaaaatcaacaacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcactttattaacaacatca 22364842  T
204 aat 206  Q
    |||    
22364843 aat 22364845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 13663198 - 13663129
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
13663198 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaaccaacgccattagaaagctaaca 13663129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 20045872 - 20045783
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  | | ||||| |||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    
20045872 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaaca 20045783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 22007195 - 22007126
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
22007195 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaaccaacgccattagaaagctaaca 22007126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 308
Target Start/End: Original strand, 21513636 - 21513707
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
21513636 catataatacttcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaat 21513707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 5852969 - 5852851
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  | | ||||| |||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||    || |||    
5852969 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactgtaaagctaacacaattatcta 5852870  T
420 caactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| || |||||||    
5852869 caactttcatgtttacacc 5852851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14409121 - 14409003
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  | | ||||| |||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||    || |||    
14409121 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactgtaaagctaacacaattatcta 14409022  T
420 caactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| || |||||||    
14409021 caactttcatgtttacacc 14409003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 17150725 - 17150655
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacat 410  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||    
17150725 agtaatttaatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtccaaccaaagccattagaaagctaacat 17150655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18815683 - 18815609
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcat 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||  ||||||||||| || ||| ||||| |||||||||    
18815683 catataatacttcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcacataataattcatcaatcat 18815609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 40492890 - 40492812
Alignment:
104 catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatat 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| | ||||| |||||||| | ||||| ||||||| |||||    
40492890 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaaca-tcataaataattcatg-attgcatatacaaatatat 40492812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14103219 - 14103180
Alignment:
149 tcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
14103219 tcatatataattcatgtaatgcgtatacaattatatcaca 14103180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 21493137 - 21493050
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttc 427  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||    ||||||| |||||| ||||   ||||||||||||||||| || ||||||||    
21493137 agtattttgatcataactcaagttctataaatctaaatgaagtccaaccaatggcaaatgaaagctaacatccatatcttcaactttc 21493050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 151
Target Start/End: Original strand, 23648560 - 23648682
Alignment:
29 catcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaa-aacaacatgatataacaatatcaaatgca 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||| || |||||||||| |||  | ||| |||||||||| |||| |||||||  ||||    
23648560 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaac-aatagcaacataggcagattacaacaacaacatgacataataatatcatttgca 23648658  T
128 agtcatcaatatctcaaatattca 151  Q
    |  || ||| |||| |||||||||    
23648659 atacaacaacatcttaaatattca 23648682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 18678216 - 18678170
Alignment:
29 catcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaa 75  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||    
18678216 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaa 18678170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 22089482 - 22089412
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacat 410  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||  | ||| ||| || |||||||||| | |||||||||||||||||    
22089482 agtaatttgatcataactcaagttcttaatatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacat 22089412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35026891 - 35026849
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatata 236  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
35026891 aacaatatcaaacgataatcaacatcttaaaacatcatatata 35026849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 36733376 - 36733302
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcat 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||| | |||||||||    
36733376 catataatacttcatcaatcatgaaaaacatcatattcatcaacatatacattcatataataaatcatcaatcat 36733302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 311
Target Start/End: Original strand, 38988730 - 38988804
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcat 311  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||  ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
38988730 catataataattcatcaatcatgaacatcatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcat 38988804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 311
Target Start/End: Original strand, 39019827 - 39019901
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcat 311  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||  ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
39019827 catataataattcatcaatcatgaacatcatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcat 39019901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 223414 - 223305
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | |||||||||||||| |    || ||||||||||| || |||||||     
223414 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaggccattagaaagctaataaaattatctacaactttcatgtttacacca 223315  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
223314 aagtccaatt 223305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 272273 - 272204
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
272273 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaaca 272204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Original strand, 643576 - 643645
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
643576 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaaca 643645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 688185 - 688076
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | |||||||||||||| |    || ||||||||||| || |||||||     
688185 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaggccattagaaagctaataaaattatctacaactttcatgtttacacca 688086  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
688085 aagtccaatt 688076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 737037 - 736928
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | |||||||||||||| |    || ||||||||||| || |||||||     
737037 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaggccattagaaagctaataaaattatctacaactttcatgtttacacca 736938  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
736937 aagtccaatt 736928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Original strand, 829382 - 829451
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
829382 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaaca 829451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 860932 - 860823
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | |||||||||||||| |    || ||||||||||| || |||||||     
860932 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaggccattagaaagctaataaaattatctacaactttcatgtttacacca 860833  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
860832 aagtccaatt 860823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 19154989 - 19154936
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtat 94  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
19154989 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtat 19154936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5083068 - 5083004
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatt 301  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||    
5083068 catataataattcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataatt 5083004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 104)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 39363369 - 39363806
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
39363369 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 39363466  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
39363467 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaataa 39363565  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
39363566 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaat 39363665  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
39363666 cataatcaattattcagtgtgacctacgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaatcaacggcactagaaagctaac 39363765  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
39363766 atccatacctacaactttcgtgtttatacctaagaccaatt 39363806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 20908997 - 20909433
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
20908997 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa-agcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 20909094  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
20909095 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaataa 20909193  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
20909194 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 20909292  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20909293 catattcaattattcactctgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 20909392  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
20909393 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 20909433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 264945 - 264509
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
264945 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 264848  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
264847 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 264749  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
264748 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 264650  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
264649 catatttaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaatctaac 264550  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
264549 atttatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaatt 264509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 11 - 449
Target Start/End: Original strand, 38619420 - 38619858
Alignment:
11 aataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || | ||| ||  ||||| ||||| || |||||     
38619420 aataatttggaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacgacacagt-agtatacaaaaacagcatgac 38619517  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtca-tcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||| | |||||  || |  ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||     
38619518 ataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatattccaatataaacaacatcaaatga 38619617  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
38619618 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataaaacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 38619717  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
38619718 cataatcaattattcactgtgacctacgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcactagaaatctaac 38619817  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
38619818 atccatacctacaactttcgtgtttatacctaagaccaatt 38619858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 10733117 - 10732681
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
10733117 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 10733020  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||      
10733019 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaccgtataa-caacatcaaataa 10732921  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
10732920 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaaaatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 10732822  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10732821 catattcaattattcactgtgatctacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 10732722  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
10732721 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 10732681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 39245121 - 39245557
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
39245121 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 39245218  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| ||||||||||||||||||  ||  || ||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
39245219 cataataatatcaaatgcaagtcaataacgtcccaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacaatataa-caacatcaaataa 39245317  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
39245318 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 39245416  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39245417 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttaactataaatcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 39245516  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
39245517 atttatacctacaactttcgtgtttacacataagaccaatt 39245557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 42245542 - 42245106
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
42245542 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 42245445  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
42245444 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaataa 42245346  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
42245345 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 42245247  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
42245246 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactatagttctataaatccatttgaagtcaaaccaacggcattagaaatctaac 42245147  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
42245146 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 42245106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 23064496 - 23064935
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || | ||| ||  ||||| ||||| || |||||    
23064496 caataatttggaaccccatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacgacacagt-agtatacaaaaacagcatga 23064593  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtca-tcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatg 207  Q
      ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||| | |||||  || |  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
23064594 cctaataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatatcccaatataaacaacatcaaatg 23064693  T
208 gtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaa 307  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
23064694 ataatcaacatcttaaaacataatatatacatataaaacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaa 23064793  T
308 tcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaa 407  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |    
23064794 tcataataaattattcactgtgacctacgttcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaacgaacggcactagaaagctga 23064893  T
408 catccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
23064894 catccatacctacaactttcgtgtttatatctaagaccaatt 23064935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 29345965 - 29346401
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||| || |||||    
29345965 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaa-cagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatga 29346062  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
29346063 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 29346161  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||    
29346162 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactagttgatccat 29346260  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29346261 catattcaattattcactctgacctacgtgcagtaatttgagtataaatcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 29346360  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
29346361 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 29346401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 29348438 - 29348874
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||| ||||| || |||||    
29348438 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaa-cagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatga 29348535  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
29348536 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 29348634  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||    
29348635 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactagttgatccat 29348733  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
29348734 catattcaattattcactctgacctacgtgcagtaatttgagtataaatcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcatttgaaagctaac 29348833  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
29348834 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 29348874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 29350911 - 29351347
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||| ||||| || |||||    
29350911 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaa-cagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatga 29351008  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
29351009 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 29351107  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||    
29351108 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactagttgatccat 29351206  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
29351207 catattcaattattcactctgacctacgtgcagtaatttgagtataaatcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcatttgaaagctaac 29351306  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
29351307 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 29351347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 2154791 - 2154372
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
2154791 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaat-agcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 2154694  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatatt-catatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatg 207  Q
     |||| |||||||| ||||||||| |||  |||||| |||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
2154693 cataataatatcaactgcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaat- 2154596  T
208 gtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaa 307  Q
                      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
2154595 ------------------catcatatatacatataacacttcatcaatcatggacagtatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaa 2154514  T
308 tcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaa 407  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2154513 tcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaa 2154414  T
408 catccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
     || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
2154413 tattcatacctacaactttagtgtttacacctaagaccaatt 2154372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 211 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 17517142 - 17516904
Alignment:
211 atcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatca 310  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
17517142 atcaacatcttaaaacatcatacatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatca 17517043  T
311 taatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacat 410  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17517042 tattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgacgataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacat 17516943  T
411 ccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
17516942 ccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 17516904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 194 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 37804898 - 37804643
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacata 293  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
37804898 aacaacatcaaattctaattaacatcttaaaacatcatatatacatataacgcttcattaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacatacata 37804799  T
294 tactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacgg 393  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
37804798 tattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcattaatttgaccataactcaagttttataaatccttttgaagtcaaaccaacgg 37804699  T
394 cattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
37804698 cattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 37804643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Original strand, 29329919 - 29330216
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
29329919 caataatttcgaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatga 29330016  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
29330017 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 29330115  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
29330116 taatca---tcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaat 29330211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 237 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 20901873 - 20901661
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||    
20901873 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcacagtgacctacg 20901774  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttaca 436  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
20901773 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaatctaacatccatacctacaactttcatgtttaca 20901674  T
437 cctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||    
20901673 cctaagaccaatt 20901661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Original strand, 32027378 - 32027678
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || ||||| | ||||||| ||||| || |||||    
32027378 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaa-caacaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 32027475  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||| ||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
32027476 cataataatatcaaatccaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 32027574  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
32027575 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaat 32027673  T
309 cataa 313  Q
    |||||    
32027674 cataa 32027678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 194 - 449
Target Start/End: Original strand, 9776525 - 9776780
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacata 293  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
9776525 aacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatacatataacccttcaccaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacatacata 9776624  T
294 tactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacgg 393  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
9776625 tattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccatagctcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgg 9776724  T
394 cattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
     ||||||||||||||||   || ||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
9776725 tattagaaagctaacataattatctacaactttcatgtttacaccaaagaccaatt 9776780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20918125 - 20917829
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
20918125 caatagtttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 20918028  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     | || ||||| |||    ||||| |||  |||||| |||||| || |||||||||||  || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||      
20918027 caaaataatataaaa----agtcaacaacgtctcaattattcacatctaattcaagtaaagcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaataa 20917933  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
20917932 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaagatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaat 20917834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 247 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 20917789 - 20917587
Alignment:
247 ttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatt 346  Q
    ||||||||||||  |||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || || ||||| ||||||||    
20917789 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcaccgtgacttacgtgcagtaatt 20917690  T
347 tgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagacca 446  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
20917689 tgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttacacctaagacca 20917590  T
447 att 449  Q
    |||    
20917589 att 20917587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 234 - 449
Target Start/End: Original strand, 32027652 - 32027867
Alignment:
234 atacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacct 333  Q
    |||||||||  | ||||||||||||  |||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||    
32027652 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcacagtgacct 32027751  T
334 acgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgctt 433  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||    
32027752 acgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaatctaacattcatacctacaactttcttgttt 32027851  T
434 acacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||    
32027852 acacctaagaccaatt 32027867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 234 - 449
Target Start/End: Original strand, 29330190 - 29330404
Alignment:
234 atacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacct 333  Q
    |||||||||  | ||||||||||||  |||| ||| || ||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||    
29330190 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcgtaaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaatt-ttcactgttacct 29330288  T
334 acgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgctt 433  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
29330289 acgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaaatcaaaccaacagcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 29330388  T
434 acacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||    
29330389 acacctaagaccaatt 29330404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20902187 - 20901903
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaat-caacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatg 107  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||    
20902187 caataatttggaacttcatcatcttaattcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatg 20902090  T
108 atataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatatt-catatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    | |||| |||||||| ||||||||| |||  |||||| |||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
20902089 acataataatatcaagtgcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaat 20901991  T
207 ggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatca 306  Q
                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
20901990 -------------------catcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatca 20901910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144231
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatc 140  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||    
22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacatc 22144167  T
141 tcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
22144168 tcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattgtaaacaacatcaa 22144231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 320 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 17516647 - 17516517
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17516647 attcactgtgacctacgtgaagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacatcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 17516548  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaattt 450  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
17516547 caactttcgtgtttacacctaagaccaattt 17516517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 21565533 - 21565723
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| || ||||||    
21565533 caataatttggaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatccaaatcatcatgat 21565629  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
21565630 ataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatttcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 21565723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11581376 - 11581184
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
11581376 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatga 11581279  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| ||||||||||||||||||  ||  |||||| ||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
11581278 cataataatatcaaatgcaagtcaataacgtctcaattattcacgtataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 11581184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 32028124 - 32028254
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaa-ccaacggcattagaaagctaacatccatacct 418  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
32028124 attcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagctctataaatcgttttgacgtcaaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacct 32028223  T
419 acaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
32028224 acaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 32028254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 20901597 - 20901468
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
20901597 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactaaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctgacatccataccta 20901498  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||    
20901497 caacgttcgtgtttacacctaagaccaatt 20901468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21329631 - 21329440
Alignment:
9 tcaataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatga 108  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |    
21329631 tcaataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcataa 21329532  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacat 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||  ||| | ||| | |||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||| ||  ||||||||    
21329531 tataacaatatcgaattcaagtcatcaacatcataaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacat 21329440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 36154957 - 36154777
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    ||||| || |||||| ||||| || |||||    
36154957 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa----caacacag-cagtatacaaaaacagcatga 36154863  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataa 194  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
36154862 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 36154777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23390629 - 23390435
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
23390629 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatga 23390531  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||  |||||||| |||  |||  |||||||||||  |||| |||||||||    
23390530 cataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaa 23390435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 320 - 450
Target Start/End: Original strand, 32028511 - 32028641
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
32028511 attcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagctctataaatcgttttgatgtcagaccaacgatattagaaagctaacatccataccta 32028610  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaattt 450  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
32028611 caactttcgtgtttacacctaagaccaattt 32028641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 29330468 - 29330597
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
29330468 attcactgtgacatacgtgcattaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggccttagaaagctaacatccataccta 29330567  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
29330568 caacttttgtgtttacacctaagaccaatt 29330597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21502290 - 21502099
Alignment:
9 tcaataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatga 108  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||    
21502290 tcaataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcagcatga 21502191  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacat 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| | ||| | |||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||| ||  ||||||||    
21502190 tataacaatatcgaatgcaagtcatcatcatcttaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 21502099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 320 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 295951 - 295826
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
295951 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgatgtcagatcaacgacattagaaagctaacattcataccta 295852  T
420 caactttcgtgcttacacctaagacc 445  Q
    |||||||| || ||||||||||||||    
295851 caactttcatggttacacctaagacc 295826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 296144 - 296015
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
296144 attcagtgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattgttttgacgtcagaccaacgtcattagaaagctaacatccataccta 296045  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||    
296044 caacttttgtgtatacacctaagaccaatt 296015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 17516840 - 17516711
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
17516840 attcactgtgacctatgtgcagtaattcgacgataactcaagttctataaatctttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 17516741  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
17516740 caactttcgtgtttacacctaggaccaatt 17516711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 19668886 - 19669076
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||    
19668886 caataatttggaacatcatcatcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcgtgat 19668985  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    ||||||||||| |||||||   ||||| | |||||||| ||| | |||| ||  ||| ||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
19668986 ataacaatatcgaatgcaa---atcaacaactcaaata-tcaaacataagtcctgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 19669076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10775853 - 10775659
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa-catga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||| ||| || ||||||  ||||| | |||||    
10775853 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacga-cagcgacacag-cagtatataaaaccagcatga 10775756  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtca-tcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
10775755 cataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat--acaacatcaaat 10775659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 2154308 - 2154179
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    |||||| || || ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
2154308 attcaccgtgacatacgtgcagtaatttgactataacttaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattaaaaagctaacatccataccta 2154209  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
2154208 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 2154179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Original strand, 22412172 - 22412327
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |  | |||||||| |||||| ||||||| |||||     
22412172 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacgataa-caacataggcagtatacaaaacagcatgac 22412270  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagta 166  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||||    
22412271 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta 22412327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 9077940 - 9078134
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||| |||||    
9077940 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacagcatga 9078038  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||| |||  |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
9078039 cataataatatcaagtgcaagtcaacaacatctcaattatacattcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaa 9078134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 26012166 - 26011995
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
26012166 caataatttggaacatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaagcaacatgat 26012069  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatat 184  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||| | ||| | |||||||| ||| ||  |||||||||||||    
26012068 ataacaatatcaaatgtgaatcaacaacatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 26011995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 20917523 - 20917394
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
20917523 attcattgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttttataaatgattttgacgtcagaccagcggcattagaaagctaacattcataccta 20917424  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||    
20917423 caactttcgtgtttacacctaagatcaatt 20917394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 1096454 - 1096649
Alignment:
10 caataatttg-aaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatg 107  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| ||||||     
1096454 caataatttggaaacatcaacatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacata 1096552  T
108 atataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| |||  |||||||||||| ||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
1096553 acataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcacatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 1096649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18319193 - 18319027
Alignment:
28 tcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgc 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| || |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||    
18319193 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 18319096  T
127 aagtca-tcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataa 194  Q
    |||||| ||||  |||||| |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
18319095 aagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa 18319027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Original strand, 40725841 - 40726037
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| | | |||| ||||||||| ||||| |||||||  |||  | ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||    
40725841 caataatttggaacatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaagcatcatgat 40725940  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    |||| ||||||  | | |||| | ||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
40725941 ataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 40726037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 24493556 - 24493750
Alignment:
10 caataatttg-aaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||  |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
24493556 caataatttggaaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaacaat-agcaacataggcagtatacaaaacagcatga 24493654  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||  |||| |||||||  |||  |||  |||||||||||  |||| |||||||||    
24493655 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtgatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaa 24493750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 204
Target Start/End: Original strand, 25421524 - 25421714
Alignment:
14 aatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatata 112  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | |||||||||||| |||    
25421524 aattggaaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacata 25421622  T
113 acaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    | |||||||| ||||||||| ||  |||| |||||||||  |||| |||||||| |||  |||  |||||||||||  |||| |||||||||    
25421623 ataatatcaattgcaagtcaacagcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaa 25421714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 21997667 - 21997547
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
21997667 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatga 21997569  T
109 tataacaatatcaaatgcaagt 130  Q
     |||| ||||||||||||||||    
21997568 cataataatatcaaatgcaagt 21997547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22959662 - 22959547
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
22959662 caataatttggaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 22959566  T
110 ataacaatatcaaatgcaa 128  Q
    ||||||||||  |||||||    
22959565 ataacaatattgaatgcaa 22959547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 24529208 - 24529386
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | ||||||||||||    
24529208 caataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatga 24529306  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
     ||||  ||||||||||||||||| ||| |||| || ||| |||  |||  ||||||| ||| ||||  |||||||||||    
24529307 cataatgatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcaca 24529386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8286973 - 8286781
Alignment:
13 taatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc--aaaacaacatgata 110  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||| |    
8286973 taatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgaca 8286875  T
111 taacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| ||| | ||  |||||||| |||  |||  |||||||||||  |||| |||||||||    
8286874 taataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaataatcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaa 8286781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Original strand, 31061053 - 31061248
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| | ||  ||||| | |||||| |||||    
31061053 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaaaacag-tagtatacaaaaacagcatga 31061150  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtc-atcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
     |||| ||||||||||||||||| |||||  | |||| |||||| | |||||| || || ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
31061151 cataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtatcaattattcacaaataatttaattaatgcatataaaattatatcacaatat-aacaacatcaaat 31061248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 32027931 - 32028060
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
32027931 attcattgtgacttacgtgcagtaatttgaccataactcaagctctataaatcgttttgacgtccgaccaatggcattagaaagctaacatccataaata 32028030  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
32028031 caatttttgtgtttacacctaagaccaatt 32028060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 32028318 - 32028447
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||  |||||||    
32028318 attcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagctctataaattgttttgacgtcagaccaacagcactagaaagctaacatatataccta 32028417  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||    
32028418 caactttcgtgttttcacctaaaaccaatt 32028447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 194
Target Start/End: Original strand, 24067110 - 24067276
Alignment:
28 tcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgc 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||||| |||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
24067110 tcatcttaatcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataacaa-cagcgacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 24067207  T
127 aagtca-tcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataa 194  Q
    |||||| |||   |||||| |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
24067208 aagtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa 24067276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 19660968 - 19660865
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||    
19660968 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcttgat 19660869  T
110 ataa 113  Q
    ||||    
19660868 ataa 19660865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 151
Target Start/End: Original strand, 13025298 - 13025439
Alignment:
10 caataatttg-aaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
13025298 caataatttggaaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatga 13025396  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattca 151  Q
     |||   ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
13025397 catattgatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatattca 13025439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 151
Target Start/End: Original strand, 13095482 - 13095623
Alignment:
10 caataatttg-aaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
13095482 caataatttggaaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatga 13095580  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattca 151  Q
     |||   ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
13095581 catattgatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatattca 13095623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 21729197 - 21729056
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || |||||    
21729197 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatga 21729099  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattca 151  Q
     |||| |||||||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||    
21729098 cataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattca 21729056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 21808522 - 21808381
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || |||||    
21808522 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatga 21808424  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattca 151  Q
     |||| |||||||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||    
21808423 cataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattca 21808381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 120
Target Start/End: Original strand, 36314565 - 36314675
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||    
36314565 caataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgat 36314664  T
110 ataacaatatc 120  Q
    |||| ||||||    
36314665 ataataatatc 36314675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22178161
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaac--atgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||| |||||||| ||||||  |||||| |  ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |    
22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 22178224  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatc 202  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
22178223 tctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatc 22178161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 204
Target Start/End: Original strand, 25431387 - 25431576
Alignment:
14 aatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatata 112  Q
    |||| ||||| |||||||||| || || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
25431387 aattggaaacatcatcatcttcataaa-ttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacata 25431484  T
113 acaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    | |||||||| ||||||||| ||| |||| |||| ||||  |||| |||||||| |||  |||  |||||||||||  |||| |||||||||    
25431485 ataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatgttcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaa 25431576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026954
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaaca--acatgatataacaatatcaaatgcaa 128  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||||||||| ||||||||||||||    
20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaacagttcatgatataataatatcaaatgcaa 20026954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 151
Target Start/End: Original strand, 22075006 - 22075148
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcat-cttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatg 107  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| |||||||    
22075006 caataatttggaacatcatcattcttcaacaacttagaccgactcattcagcttagttaaataac-aacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatg 22075104  T
108 atataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattca 151  Q
    | |||| |||||||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||    
22075105 acataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattca 22075148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Original strand, 37723891 - 37724045
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| | || ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||  | |||| |||||     
37723891 caataatttggaacttcaacatcttcaacatcttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtat--acaacagcatgac 37723988  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagta 166  Q
    || |  |||||||||  || ||||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||    
37723989 atgattatatcaaattaaattcatcaacatctcaatcattcattcataattcaagta 37724045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 20766175 - 20766097
Alignment:
88 acagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagta 166  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||||    
20766175 acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta 20766097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 27183278 - 27183208
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacat 410  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
27183278 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtcaaaccaaagccattagaaagctaacat 27183208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 22884013 - 22883904
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||  | |||||||||| | |||||||||||||||||   |||||| ||||||| || |||||||     
22884013 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttgaacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattacctaaaactttcatgtttacaccc 22883914  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
22883913 aaggccaatt 22883904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 21293102 - 21293020
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagta 93  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | || |||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
21293102 caataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 21293020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 264445 - 264327
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  | | ||||| |||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||    || |||    
264445 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacggcactgtaaagctaacacaattatcta 264346  T
420 caactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| || |||||||    
264345 caactttcatgtttacacc 264327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 206
Target Start/End: Original strand, 29448055 - 29448187
Alignment:
75 aacagcaacatagacagtatgcaaaacaac--atgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgt 172  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| | |||||  ||||||| ||| ||| |    
29448055 aacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaaca-tcatacgtaattcatgtaatgcat 29448153  T
173 atacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    |||||| || |||||  ||| | |||||||||||    
29448154 atacaaatacatcaccttattatcaacatcaaat 29448187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 1220453 - 1220384
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
1220453 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaaccaacgccattagaaagctaaca 1220384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 10778901 - 10778832
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
10778901 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaaccaacgccattagaaagctaaca 10778832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 20806919 - 20806854
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaa 75  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
20806919 caataatttggaaattcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaa 20806854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 43444118 - 43444009
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    || ||||||||||| || |||||||     
43444118 agtaatttaatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacaaagttatctacaactttcatgtttacacca 43444019  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
43444018 aagtccaatt 43444009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 308
Target Start/End: Original strand, 18743965 - 18744036
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
18743965 catataatacttcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaat 18744036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Original strand, 20909497 - 20909615
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  | | ||||| |||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||    || |||    
20909497 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactgtaaagctaacacaattatcta 20909596  T
420 caactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| || |||||||    
20909597 caactttcatgtttacacc 20909615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 410
Target Start/End: Original strand, 32950213 - 32950283
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacat 410  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||  ||| || |||||||||| | |||||||||||||||||    
32950213 agtaatttgatcataactcacattctaaaaattatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacat 32950283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Original strand, 11903 - 12012
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    || ||||||||||| || |||||||     
11903 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaatgccattagaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacacca 12002  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
12003 aagtccaatt 12012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Original strand, 25426177 - 25426286
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    || ||||||||||| || |||||||     
25426177 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaatgccattagaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacacca 25426276  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
25426277 aagtccaatt 25426286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 349 - 409
Target Start/End: Original strand, 28901495 - 28901555
Alignment:
349 accataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
28901495 accatatctcaaaatctataaatcatttttaagtcaaaccaaagtcattagaaacctaaca 28901555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 349 - 409
Target Start/End: Original strand, 28937890 - 28937950
Alignment:
349 accataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
28937890 accatatctcaaaatctataaatcatttttaagtcaaaccaaagtcattagaaacctaaca 28937950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 449
Target Start/End: Original strand, 7424879 - 7424986
Alignment:
342 taatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaa 441  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | |||||||||||||| |    || ||||||||||| || ||||||| ||    
7424879 taatttgatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaataaaattatctacaactttcatgtttacaccaaa 7424978  T
442 gaccaatt 449  Q
    | ||||||    
7424979 gtccaatt 7424986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20917855 - 20917776
Alignment:
234 atacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataa 313  Q
    |||||||||  | ||||||||||||  |||| ||  || ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
20917855 atacatatactaattcatcaatcataaacaacataatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcataa 20917776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 438
Target Start/End: Original strand, 31478947 - 31479034
Alignment:
351 cataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacc 438  Q
    ||||| ||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||  || ||| ||||||| || |||||||    
31478947 cataaatcaaaatctaaaaattctttttaagtcaaaccaaagtcattataaagctaacatctttatctaaaactttcatgtttacacc 31479034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 359
Target Start/End: Original strand, 39245621 - 39245660
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactca 359  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
39245621 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 39245660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 359
Target Start/End: Original strand, 39363869 - 39363908
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactca 359  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
39363869 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactca 39363908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1628243 - 1628169
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcat 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| || || |||||||||    
1628243 catataatacttcatcaatcattaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataatagttcatcaatcat 1628169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 1168901 - 1168832
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||||| | | | ||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||    
1168901 agtaatttgatcataactcaagtccaaaaaatcatttggaagccaaaccaaagccattagaaagctaaca 1168832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 11212803 - 11212734
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || || ||||||| | ||| ||||||||||||    
11212803 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgttaaaccaaagccataagaaagctaaca 11212734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 437
Target Start/End: Original strand, 11342190 - 11342287
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacac 437  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||| |   || ||||||||||| || ||||||    
11342190 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacttaattatctacaactttcatgtttacac 11342287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 21074318 - 21074249
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
21074318 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaatgccattagaaagctaaca 21074249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 21933352 - 21933283
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
21933352 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaaca 21933283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 21939522 - 21939453
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
21939522 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaaca 21939453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 22367204 - 22367095
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||| | |||| ||||| || || ||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    || ||||||||||| || |||||||     
22367204 agtaatttaatcatatctcaagttttaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacacca 22367105  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
22367104 aagtccaatt 22367095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 75
Target Start/End: Original strand, 26704075 - 26704124
Alignment:
26 catcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaa 75  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
26704075 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 26704124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 75
Target Start/End: Original strand, 26973808 - 26973857
Alignment:
26 catcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaa 75  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
26973808 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 26973857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Original strand, 35581340 - 35581409
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
35581340 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaaca 35581409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 36990748 - 36990679
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
36990748 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaaca 36990679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21399968 - 21399896
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatc 309  Q
    ||||||| | |||||||| |||| |||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
21399968 catataataattcatcaaccatgaacaacatcatattcattaacatatacattcatataataattcatcaatc 21399896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 118)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15118529 - 15118093
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
15118529 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 15118432  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
15118431 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 15118333  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
15118332 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 15118234  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15118233 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 15118134  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
15118133 atttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 15118093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 10 - 450
Target Start/End: Original strand, 3514992 - 3515430
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||| || || ||    
3514992 caataatttagaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcaaga 3515089  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
3515090 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatgg 3515188  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
3515189 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaaaatatacatacatataataattcatcaat 3515288  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3515289 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccatagctcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 3515388  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaattt 450  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
3515389 atccatacctacaacttttgtgtttacacctaagaccaattt 3515430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 44615273 - 44615710
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaa-acaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| ||| |||||    
44615273 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaatacagcatga 44615370  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
44615371 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaataa 44615469  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
44615470 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacattcatatactaattcatcaat 44615569  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44615570 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 44615669  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
44615670 atttatacctacaaatttcgtgtttacacttaagaccaatt 44615710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 25 - 449
Target Start/End: Original strand, 19242699 - 19243122
Alignment:
25 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
19242699 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 19242796  T
124 tgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaa 223  Q
    ||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
19242797 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaactccaaatggtaatcaacatcttaa 19242896  T
224 aacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
19242897 aacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattc 19242996  T
324 actgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaac 423  Q
    ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
19242997 actatgacctacgttcagtaatttaaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatacatacctacaac 19243096  T
424 tttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||| || ||| ||||||||| ||||    
19243097 tttcttgtttatacctaagactaatt 19243122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 33 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14970861 - 14970447
Alignment:
33 ttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtc 131  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||| | || || ||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
14970861 ttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaacag-caatatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 14970764  T
132 atcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 231  Q
    | |||  |||||| |||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14970763 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 14970665  T
232 atatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaac 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
14970664 atatacatataacacttcatcaattatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatattaattcatcaatcatattcaattattcactgtgac 14970565  T
332 ctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgc 431  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
14970564 ctatgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgt 14970465  T
432 ttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||||    
14970464 ttacacctaagaccaatt 14970447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 50222516 - 50222080
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||| || |||||    
50222516 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acattatacaaaaacagcatga 50222419  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||      
50222418 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caatatcaaataa 50222320  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
50222319 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 50222221  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
50222220 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 50222121  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
50222120 atttatacctacatcttttgtgtttacacctaagaccaatt 50222080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 44773264 - 44772824
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
44773264 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 44773167  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
44773166 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 44773068  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatata----catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttat 304  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||    
44773067 taatcaacatcttaaaatatcatatatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcgtatactaattcat 44772969  T
305 caatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagc 404  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
44772968 caatcatattcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatctttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagc 44772869  T
405 taacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
44772868 taacattcatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 44772824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 1837686 - 1837260
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
1837686 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 1837589  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||| ||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||      
1837588 cataataataccaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacgattatatcacattataa-caacatcaaataa 1837490  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||           ||||||||||||| ||||||    
1837489 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataaaacttcatcaatcatggacaatatcgttttcaca-----------acatatactaattcatcaat 1837401  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
1837400 catattcaattattcactatgacctacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatcctttttaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 1837301  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
1837300 atttatacctacaactttcatgtttacacctaagaccaatt 1837260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 7641359 - 7640927
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |          ||||||||||||     
7641359 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca----------aaaacaacatgac 7641271  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggt 209  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |    
7641270 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataat 7641172  T
210 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatata------acacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattta 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||      ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |    
7641171 aatcaacatcttaaaatatcatatatatatatatatataacacttcatcaatcatgaaaaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactcattca 7641073  T
304 tcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaag 403  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
7641072 tcaatcatattcaattattcactgtgacctacaggcagtaatttaactataactcaagttctataaatccttttgaagtgaaaccaatggcattagaaag 7640973  T
404 ctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
7640972 ctaacatttatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 7640927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 194 - 449
Target Start/End: Original strand, 15534348 - 15534603
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacata 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
15534348 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacatacata 15534447  T
294 tactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacgg 393  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
15534448 tattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgg 15534547  T
394 cattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
15534548 cattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 15534603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 194 - 449
Target Start/End: Original strand, 36038037 - 36038292
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacata 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
36038037 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacatacata 36038136  T
294 tactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacgg 393  Q
    |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
36038137 tcttaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgg 36038236  T
394 cattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
36038237 tattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaaggccaatt 36038292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 194 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 49547769 - 49547514
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacata 293  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
49547769 aacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatcatagatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacatacata 49547670  T
294 tactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacgg 393  Q
    || ||||| |||||||||||  |||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
49547669 tattaattcatcaatcataaataattcttcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgg 49547570  T
394 cattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
49547569 cattagaaagctaacatccatacctacaaatttcgtgtttacacctaagaccaatt 49547514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18215451 - 18215151
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| || |||||    
18215451 caataatttgaaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatga 18215354  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
18215353 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatca 18215255  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
18215254 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaat 18215156  T
309 cataa 313  Q
    |||||    
18215155 cataa 18215151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 194 - 449
Target Start/End: Original strand, 14048744 - 14048999
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacata 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14048744 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacctcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaacatatacatacata 14048843  T
294 tactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacgg 393  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
14048844 tattaatttatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataacacaagttctgtaaatccttttgaagtcaaaccaacgg 14048943  T
394 cattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||    
14048944 cattagaaagctaacattcatacccacaactttcatgtttacacctaaaaccaatt 14048999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18239596 - 18239250
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||| || |||||    
18239596 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatga 18239499  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||      
18239498 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataa-caacatcaaataa 18239400  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
18239399 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactcattcatcaat 18239301  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactca 359  Q
    |||| ||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||    
18239300 catattcaaaaattcactgtgacctacgtgaagtaatttgacaataactca 18239250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12484 - 12184
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
12484 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 12387  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||      
12386 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatccaataa 12288  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
12287 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaat 12189  T
309 cataa 313  Q
    |||||    
12188 cataa 12184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Original strand, 52312495 - 52312795
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
52312495 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 52312592  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
52312593 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaataa 52312691  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
52312692 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcattaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaat 52312790  T
309 cataa 313  Q
    |||||    
52312791 cataa 52312795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 237 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 52873025 - 52872813
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
52873025 catataacacatcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 52872926  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttaca 436  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
52872925 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctagcatccatacctacaactttcgtgtttaca 52872826  T
437 cctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||    
52872825 cctaagaccaatt 52872813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 244 - 449
Target Start/End: Original strand, 29267570 - 29267775
Alignment:
244 cacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagta 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
29267570 cacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgcaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgttcagta 29267669  T
344 atttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaaga 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
29267670 atttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatttatacctacaactttcgtgtttacacctaaga 29267769  T
444 ccaatt 449  Q
    ||||||    
29267770 ccaatt 29267775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15355502 - 15355201
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| || |||||| ||||| || |||||    
15355502 caataatttggaacttcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatga 15355405  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtca-tcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatg 207  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
15355404 cataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaata 15355306  T
208 gtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaa 307  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
15355305 ataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacatttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaa 15355207  T
308 tcataa 313  Q
    ||||||    
15355206 tcataa 15355201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19618330 - 19618049
Alignment:
29 catcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||    
19618330 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 19618233  T
128 agtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 227  Q
    ||||| |||  |||||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
19618232 agtcaacaacgtctcaattattcacctataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 19618134  T
228 tcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
19618133 tcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatacatacatataccaattcatcaatcataa 19618049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 237 - 450
Target Start/End: Original strand, 362390 - 362603
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
362390 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 362489  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttaca 436  Q
    | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
362490 tgcagtaatttgaccataaatcaagttctataaatcgttttgaagtcaaactaacgacattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 362589  T
437 cctaagaccaattt 450  Q
    |||||||| |||||    
362590 cctaagactaattt 362603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 237 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 19618019 - 19617809
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
19618019 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 19617920  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttaca 436  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||    
19617919 tgcagtaatttgaccataactcaacttctataaatccttttgaagtcacaccaacagcattagaaagctaacatccatacctataacttttgtgttaaca 19617820  T
437 cctaagaccaa 447  Q
    |||||||||||    
19617819 cctaagaccaa 19617809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 237 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15496126 - 15495914
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||    
15496126 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcagaaacatatacatacatatattaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacttacg 15496027  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttaca 436  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
15496026 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaaacctttcgaatttaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttaca 15495927  T
437 cctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||    
15495926 cctaagaccaatt 15495914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 237 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14746464 - 14746252
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
14746464 catataacacttcatcaatcatgaacataatagtattcacaaacatatacatatatatactaattcatcaatcatatttaattattcactgtgacctacg 14746365  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttaca 436  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
14746364 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttaaagtcaaaccaacggaattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtccttaca 14746265  T
437 cctaagaccaatt 449  Q
    || ||||||||||    
14746264 ccgaagaccaatt 14746252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 237 - 450
Target Start/End: Original strand, 19857798 - 19858001
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||          ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
19857798 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacat----------atactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 19857887  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttaca 436  Q
    | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
19857888 tgcagtaatttgaccataaatcaagttctataaattattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatacatacctacaactttcgtgtttaca 19857987  T
437 cctaagaccaattt 450  Q
    ||||||||||||||    
19857988 cctaagaccaattt 19858001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 277 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 12167 - 11995
Alignment:
277 aaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttt 376  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
12167 aaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttt 12068  T
377 tgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
12067 tgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacattgatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 11995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 234 - 449
Target Start/End: Original strand, 52312769 - 52312983
Alignment:
234 atacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacct 333  Q
    |||||||||  | ||||||||||||  |||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
52312769 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 52312868  T
334 acgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgctt 433  Q
     ||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
52312869 gcgtgcagtaatt-gactataactcaagttctataaatccttttgaagtaaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgttt 52312967  T
434 acacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||    
52312968 acacctaagaccaatt 52312983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 43198661 - 43198492
Alignment:
37 tcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatc 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
43198661 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatc 43198562  T
135 aatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
43198561 aatatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 43198492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13788
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatc 140  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 13854  T
141 tcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
13853 tcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 13788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 52243302 - 52243131
Alignment:
37 tcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatc 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| || ||| |    
52243302 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaac 52243203  T
135 aatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    || |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
52243202 aacatctcaaacattcatatataatccaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 52243131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 44929057 - 44928861
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| || |||||    
44929057 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatga 44928959  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
     |||| ||| ||||||||||||||  || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
44928958 cataataatgtcaaatgcaagtcaataacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacataaaat 44928861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 362859 - 362988
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
362859 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaaattctataaatctttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 362958  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||    
362959 caactttcgggtttacacctaagaccaatt 362988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 18214880 - 18214751
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18214880 attcactgtgacctacgtgcagtaatatgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 18214781  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
18214780 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 18214751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18215121 - 18214992
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
18215121 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattaataaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 18215022  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattcta 366  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||    
18215021 tgcagtaatttgaccataactcaagttcta 18214992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 320 - 430
Target Start/End: Original strand, 14185621 - 14185731
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14185621 attcactgtgacctacgttcaataatttgaccataactcaagttctataaatccttttgacgtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 14185720  T
420 caactttcgtg 430  Q
    |||||||||||    
14185721 caactttcgtg 14185731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 320 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 52872749 - 52872619
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
52872749 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacagaattagaaagctaacatccataccta 52872650  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaattt 450  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
52872649 caactttcgtgtttacacctaagaccaattt 52872619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 3515493 - 3515622
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3515493 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtgagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 3515592  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||    
3515593 caactttcgtgtttacgcctaagaccaatt 3515622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 52313240 - 52313369
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
52313240 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 52313339  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
     |||||||||| |||||||||||| |||||    
52313340 taactttcgtgtttacacctaagatcaatt 52313369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 330 - 449
Target Start/End: Original strand, 362676 - 362795
Alignment:
330 acctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgt 429  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
362676 acctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgatgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttagt 362775  T
430 gcttacacctaagaccaatt 449  Q
    | ||||||||||||||||||    
362776 gtttacacctaagaccaatt 362795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15497066 - 15496948
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacata 293  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
15497066 aacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcac-aacatatacatacata 15496968  T
294 tactaatttatcaatcataa 313  Q
    || ||||| |||||||||||    
15496967 tattaattcatcaatcataa 15496948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 52873173 - 52873055
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacata 293  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
52873173 aacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacgta 52873075  T
294 tactaatttatcaatcataa 313  Q
    || ||||| |||||||||||    
52873074 tattaattcatcaatcataa 52873055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 51464045 - 51463838
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| | |||||| |||||    
51464045 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-tagtatacaaaaacagcatga 51463948  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||| |||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||      
51463947 cataataatatcaaatgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatca 51463849  T
209 taatcaacatc 219  Q
    |||||||||||    
51463848 taatcaacatc 51463838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14970383 - 14970254
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14970383 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 14970284  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||| ||| |  |||||||||||||||    
14970283 caacttttgtgttatcacctaagaccaatt 14970254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15495850 - 15495721
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
15495850 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 15495751  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
15495750 caacttttgtgtttacacctaagaccaatt 15495721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23803443 - 23803235
Alignment:
9 tcaataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatg 107  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| | |||||| ||||    
23803443 tcaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-tagtatacaaaaacagcatg 23803346  T
108 atataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatg 207  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| |||  ||| || |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||     
23803345 acataataatatcaaatgcaaatcaacaacgtctaaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacataaaatc 23803247  T
208 gtaatcaacatc 219  Q
     |||||||||||    
23803246 ataatcaacatc 23803235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 39706421 - 39706298
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
39706421 caataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 39706322  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcat 133  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
39706321 ataacaatatcgaatgcaagtcat 39706298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Original strand, 12610935 - 12611135
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||      |||||| |||||     
12610935 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-aca------aaaacagcatgac 12611026  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggt 209  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |    
12611027 ataataatatcaaatgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatcat 12611125  T
210 aatcaacatc 219  Q
    ||||||||||    
12611126 aatcaacatc 12611135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16377654 - 16377462
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||     
16377654 caataatttggaacttcattatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaa-cagcatgac 16377557  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||  |||||||||||| ||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
16377556 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaa 16377462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 19617743 - 19617614
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19617743 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttcaataaatcattttggcgttagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 19617644  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||    
19617643 caactttcgtgtctacacctaagaccaatt 19617614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 19858064 - 19858193
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
19858064 attcactgtgacctacgtgcaataatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 19858163  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||    
19858164 caacttttgtgtttgcacctaagaccaatt 19858193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 332 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14746176 - 14746059
Alignment:
332 ctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgc 431  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
14746176 ctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagataacatccatacctacaactttcttgt 14746077  T
432 ttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||||    
14746076 ttacacctaagaccaatt 14746059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 44102199 - 44102382
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||| ||  ||||| ||||| || |||||    
44102199 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caataacacagt-agtatacaaaaacagcatga 44102296  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataa 194  Q
     |||| |||||||||||||||| | |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
44102297 cataataatatcaaatgcaagtaaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 44102382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 52313047 - 52313176
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
52313047 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataaatcaagttctataaatcgttttgacgtcataccaaaggcattagaaatctaacatccataccta 52313146  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||    
52313147 caacttttgtgtttacacctaagatcaatt 52313176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 7798762 - 7798956
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| |||||    
7798762 caataatttagaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 7798860  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||||||| |||  |||  ||| |||||||| |||| |||||||||    
7798861 cataataatatcaattgcaagtcatcaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattgtatcacaacataatcaacatcaa 7798956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14746614 - 14746494
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacataca 291  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
14746614 aacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcgc-aacatatacataca 14746516  T
292 tatactaatttatcaatcataa 313  Q
    |||||||||| |||||||||||    
14746515 tatactaattcatcaatcataa 14746494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 237 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15355171 - 15355071
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
15355171 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatatatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacg 15355072  T
337 t 337  Q
    |    
15355071 t 15355071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Original strand, 15373471 - 15373666
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| | | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| | ||||||| ||||| || |||||    
15373471 caataatttgaaacatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatga 15373568  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtca-tcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
15373569 cataataatatcaaatgcaagtcaatcaatgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaat 15373666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Original strand, 14280301 - 14280456
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||  | |||||| | ||||||||||||    
14280301 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cggcagtatacaaaaacaacatga 14280398  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagta 166  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||  ||||||||||||    
14280399 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatagattcataattcaagta 14280456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 7088865 - 7089043
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| |||||    
7088865 caataatttagaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 7088963  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||||| |||| | ||||||| |||| ||||||||| ||| || |  |||||||||||    
7088964 cataataatatcaattgcaattcatcaacatcttacatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcaca 7089043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 12902745 - 12902923
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| |||||    
12902745 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 12902843  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
     |||| |||||||| || || ||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| || |  |||||||||||    
12902844 cataataatatcaattgtaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcaca 12902923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16270369 - 16270175
Alignment:
10 caataatttg-aaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
16270369 caataatttggaaacatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaacagcatga 16270271  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||  |||| |||||||| |||  |||  |||||||||||  |||| |||||||||    
16270270 cataataatatcaaatgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaa 16270175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 22636423 - 22636601
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | |||||| |||||    
22636423 caataatttggaaaatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatga 22636521  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||  |||||||| ||| ||||  |||||||||||    
22636522 cataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 22636601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 166
Target Start/End: Original strand, 6899877 - 6900034
Alignment:
9 tcaataatttg-aaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatg 107  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||     
6899877 tcaataatttggaaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaacaacata 6899975  T
108 atataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagta 166  Q
      |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||  |||| ||||||||    
6899976 gcataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagta 6900034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 8574994 - 8574846
Alignment:
16 tttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataaca 115  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||| |    
8574994 tttggaacctcatcatcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaacaacatgacataata 8574897  T
116 atatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagta 166  Q
    |||||||||| || ||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||||    
8574896 atatcaaatgtaattcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta 8574846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Original strand, 15371190 - 15371385
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| | | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| | ||||||| ||||| || |||||    
15371190 caataatttggaacatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatga 15371287  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtca-tcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
15371288 cataataatatcaaatgcaagtcaatcaatgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaat 15371385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15464981 - 15464868
Alignment:
93 atgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatat 192  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |    
15464981 atgcaaaatagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtattgcatatacaattatatcaaatttt 15464882  T
193 aaacaacatcaaat 206  Q
    |||| |||||||||    
15464881 aaacgacatcaaat 15464868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 54798887 - 54798731
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||| |  |||||| | |||||| |||||    
54798887 caatactttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatga 54798789  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagta 166  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||||    
54798788 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta 54798731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 230 - 313
Target Start/End: Original strand, 19857685 - 19857768
Alignment:
230 atatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataa 313  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
19857685 atatatatataaaatacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataa 19857768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 120
Target Start/End: Original strand, 12774011 - 12774105
Alignment:
26 catcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatc 120  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
12774011 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 12774105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Original strand, 15367678 - 15367873
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| | | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| | ||||||| ||||| || |||||    
15367678 caataatttggaacatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatga 15367775  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtca-tcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||| ||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
15367776 cataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaat 15367873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Original strand, 15402691 - 15402886
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| | | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| | ||||||| ||||| || |||||    
15402691 caataatttggaacatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatga 15402788  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtca-tcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||| ||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
15402789 cataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaat 15402886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 120
Target Start/End: Original strand, 15551805 - 15551915
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||    
15551805 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgat 15551904  T
110 ataacaatatc 120  Q
    |||| ||||||    
15551905 ataataatatc 15551915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 203
Target Start/End: Original strand, 44052817 - 44053010
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||||||| |||||| | |||||| |||||    
44052817 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataac-aacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 44052915  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatca 203  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||  |||||||| |||  |||  |||||||||||  |||| ||||||||    
44052916 cataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcacatcataatcaacatca 44053010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 210 - 278
Target Start/End: Original strand, 362268 - 362336
Alignment:
210 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
362268 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatattgtattcacaa 362336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 52873500 - 52873378
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| |||||    
52873500 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 52873402  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtca 132  Q
     |||| |||||||| |||||||||    
52873401 cataataatatcaattgcaagtca 52873378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12288316 - 12288223
Alignment:
37 tcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaaca--acatgatataacaatatcaaatgcaa 128  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
12288316 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatgcaa 12288223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Original strand, 15370006 - 15370200
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| | | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| | |||||| |||||    
15370006 caataatttggaacatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatga 15370103  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtc-atcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
     |||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||| ||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
15370104 cataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaacta-cgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaat 15370200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21815731 - 21815568
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatat 139  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||| | || |||| | |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||| |||  |    
21815731 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataac-gacagcaacaca-actgtatacaaaaacagcatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgt 21815634  T
140 ctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
21815633 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcataatat-aacaacatcaaat 21815568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 46640558 - 46640393
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaaca--acatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||   |||||||||||||||||||||| || |||  || |    
46640558 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataaca 46640459  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||    |||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||  || |||||||||||||    
46640458 tctcaa--catcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacatcattaacaacatcaaat 46640393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 7893690 - 7893869
Alignment:
10 caataatttg-aaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatg 107  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||| | |||||| ||||    
7893690 caataatttggaaacatcatcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatg 7893788  T
108 atataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
    | |||| |||||||| ||||||||| ||  |||| |||||||||  |||| |||||||| |||  |||| ||||| |||||    
7893789 acataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataccattatttcaca 7893869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 303 - 450
Target Start/End: Original strand, 30147191 - 30147338
Alignment:
303 atcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaa 402  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||| | ||||   ||    
30147191 atcaatcatattcaattattcactgtgacctatgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgttgtcataccaatgtcatttttaa 30147290  T
403 gctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaattt 450  Q
      | | |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
30147291 ttttatatccatacttacaacttttgtgtttacacctaagaccaattt 30147338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 126
Target Start/End: Original strand, 8846347 - 8846460
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||     
8846347 caataatttggaacatcatcatc---atcaacttagaccgacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgag 8846443  T
110 ataacaatatcaaatgc 126  Q
    ||||||||||| |||||    
8846444 ataacaatatcgaatgc 8846460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 204
Target Start/End: Original strand, 14038653 - 14038830
Alignment:
27 atcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatg 125  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||  |||| |||||||||||    
14038653 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatg 14038751  T
126 caagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||| |||  ||| |||||||| |||  |||  |||||||||||  |||| |||||||||    
14038752 caagtcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaa 14038830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16240102 - 16239909
Alignment:
11 aataatttg-aaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||  ||| |||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||     
16240102 aataatttggaaacatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataacaat-agcaaaataggcagtatacaaaacagcatgac 16240004  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||  |||| || ||||| |||  |||  ||||||||| |  |||| |||||||||    
16240003 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatactttaagtaatgcaaataacattatatcatatcataatcaacatcaa 16239909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 194
Target Start/End: Original strand, 22353852 - 22354005
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaa-aacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatat 139  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| |||  || |  |||||||||| ||||||||||||| | ||| ||| |||  |    
22353852 cttagaccgactcatgcagcttaggtaaataacaa-cagcagcataggcagattgtagcaacaacatgacataacaatatcaattacaattcaacaacgt 22353950  T
140 ctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataa 194  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
22353951 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 22354005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Original strand, 17046475 - 17046604
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||  | ||||||||||     
17046475 caataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtat--agaacaacatgac 17046572  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatct 141  Q
    ||||  ||||||||| ||| ||||||| ||||    
17046573 ataattatatcaaattcaattcatcaacatct 17046604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 53082254 - 53082089
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||   ||||||   |||||||||||||||||||| |||| |||  || |    
53082254 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataaca 53082156  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
53082155 tctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaat 53082089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 203
Target Start/End: Original strand, 16223520 - 16223712
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| | | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| | |||||| |||||    
16223520 caataatttggaacatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatga 16223617  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtc-atcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatca 203  Q
     |||| |||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||| ||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
16223618 cataataatatctaatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacccatatacaattatatcacaatat-aacaacatca 16223712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22725401 - 22725284
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    || |||    
22725401 attcagtgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagtcctataaatcattttgatgtcaaaccaacgg-attagaaagctaacacaattatcta 22725303  T
420 caactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| || |||||||    
22725302 caactttcatgtttacacc 22725284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 100
Target Start/End: Original strand, 3096282 - 3096370
Alignment:
11 aataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
3096282 aataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 3096370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 194
Target Start/End: Original strand, 20149832 - 20149998
Alignment:
28 tcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgc 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||  | ||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||    
20149832 tcatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttgataaaataacaa-cagcgacacat-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 20149929  T
127 aagtca-tcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataa 194  Q
    |||||| |||   |||||| |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
20149930 aagtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa 20149998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14053434 - 14053309
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | || |||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||| |||||     
14053434 caataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatac-aaacagcatgac 14053336  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 136  Q
    |||| |||||||| | ||| |||||||    
14053335 ataataatatcaatttcaattcatcaa 14053309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 340 - 437
Target Start/End: Original strand, 14951270 - 14951367
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacac 437  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||   || ||||||||||| || ||||||    
14951270 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctacaactttcatgtttacac 14951367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 136
Target Start/End: Original strand, 16596687 - 16596762
Alignment:
61 ttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| |||||| |||| || |||||||    
16596687 ttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcatcaa 16596762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23374473 - 23374351
Alignment:
29 catcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgca 127  Q
    |||||| | ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||  ||||||| ||||    
23374473 catcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 23374375  T
128 agtcatcaatatctcaaatattca 151  Q
    | ||| ||| |||| |||||||||    
23374374 attcaacaacatcttaaatattca 23374351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 55377293 - 55377225
Alignment:
342 taatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacat 410  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
55377293 taatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtcaaaccaaagccattagaaagctaacat 55377225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 177
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190618
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaat-a 138  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||| || | |||| | ||||| ||||||||||| |||| |||  | |||| |    
6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatc-aatgtaagcgaacaatca 6190579  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtataca 177  Q
    |||||| ||||||| || | |||||||| ||||||||||    
6190580 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtataca 6190618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 204
Target Start/End: Original strand, 8846472 - 8846553
Alignment:
122 aatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
8846472 aatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 8846553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 324 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 14745991 - 14745925
Alignment:
324 actgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaa 390  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||| |||||    
14745991 actgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagtgctataaatcgttttgacgtcagaccaa 14745925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 15118029 - 15117911
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  | | ||||| |||| |||||||||| ||| || | |||||||||||    || |||    
15118029 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcataaaccaaaaatcattttcaagtcaaaccgacgccactggaaagctaacacaattatcta 15117930  T
420 caactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| || |||||||    
15117929 caactttcatgtttacacc 15117911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25120144 - 25120046
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||| |   |||||| ||||||| || |||||||    
25120144 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacttaattacctaaaactttcatgtttacacc 25120046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Original strand, 14995644 - 14995713
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
14995644 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttagacctcaaaccaacgacattagaaagctaaca 14995713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 43281795 - 43281694
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||   |||||||| |||| || | ||||||    
43281795 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtaaaaccatagccattagaaagctaacatcttaacctacaattttcatgttaacacct 43281696  T
440 aa 441  Q
    ||    
43281695 aa 43281694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 242
Target Start/End: Original strand, 19857611 - 19857659
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatata 242  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
19857611 aacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatatatata 19857659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 412 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 12778460 - 12778423
Alignment:
412 catacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
12778460 catacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 12778423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Original strand, 18247739 - 18247848
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    || ||||||||||| || |||||||     
18247739 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacacca 18247838  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
18247839 aagtccaatt 18247848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Original strand, 47357183 - 47357292
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    || ||||||||||| || |||||||     
47357183 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggatgtcaaaccaaggccattagaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacacca 47357282  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
47357283 aagtccaatt 47357292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15287966 - 15287859
Alignment:
342 taatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaa 441  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | |||||||||||||| |    || ||||||||||| || ||||||| ||    
15287966 taatttgatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaataaaattatctacaactttcatgtttacaccaaa 15287867  T
442 gaccaatt 449  Q
    | ||||||    
15287866 gtccaatt 15287859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15295076 - 15294969
Alignment:
342 taatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaa 441  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | |||||||||||||| |    || ||||||||||| || ||||||| ||    
15295076 taatttgatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaataaaattatctacaactttcatgtttacaccaaa 15294977  T
442 gaccaatt 449  Q
    | ||||||    
15294976 gtccaatt 15294969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 5683465 - 5683367
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || ||||||||||   |||| |||||||||||    |||||| ||||||| || |||||||    
5683465 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaaaccattggaaagctaacaaaattacctaaaactttcatgtttacacc 5683367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22355169 - 22355071
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    || ||||||||||| || |||||||    
22355169 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacaaaattatctacaactttcatgtttacacc 22355071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Original strand, 10643746 - 10643855
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||| ||||| ||| || ||||||||||   |||||||||||||||||   || ||||||||||| || || ||||     
10643746 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggatgtcaaaccaaaaccattagaaagctaacataattatctacaactttcatgtttgcacca 10643845  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
10643846 aagtccaatt 10643855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 449
Target Start/End: Original strand, 16731688 - 16731785
Alignment:
352 ataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||   || ||| ||||||| || ||||||| ||| ||||||    
16731688 ataactcaagttcaaaaaatcatttggaagtcaaaccaaagccattagagagctaacataattatctaaaactttcatgtttacaccaaaggccaatt 16731785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 17146389 - 17146320
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
17146389 agtaatttaatcatatctcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaaca 17146320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Original strand, 18168293 - 18168362
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||| ||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
18168293 agtaatttaatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaatcaacgccattagaaagctaaca 18168362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 44772760 - 44772723
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataact 357  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
44772760 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataact 44772723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 442
Target Start/End: Original strand, 9198558 - 9198658
Alignment:
342 taatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaa 441  Q
    |||||||||||||| |||| || || ||||| ||||||||| | |||||   |||||||||  |||||||||||  || ||||||| || ||||| ||||    
9198558 taatttgaccataaatcaagttgtagaaatcattttgaagtaagaccaaatccattagaaatataacatccatatataaaactttcatgtttacaactaa 9198657  T
442 g 442  Q
    |    
9198658 g 9198658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 2)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 4679 - 5116
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| ||||||||    
4679 caataatttggaacctcatcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatga 4776  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
4777 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatgg 4875  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
4876 taatcaacatcttaaaacaacatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 4975  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
4976 catattcaattattcactatgacctacgtgctgtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccattggaattagaaagctaac 5075  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
5076 atccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 5116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 5180 - 5309
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
5180 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctatatatcgttttgacgtcagaccaacggcataagaaaactaacatccataccta 5279  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||    
5280 caactttcatgtttacacctaagaccaatt 5309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 136665 - 137101
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaa-acaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| ||| |||||    
136665 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaatacagcatga 136762  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
136763 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaataa 136861  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
136862 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 136960  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
136961 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 137060  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
137061 atttatacctacaactttcgtgtttacacttaagaccaatt 137101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 139134 - 139570
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaa-acaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| ||| |||||    
139134 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaatacagcatga 139231  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
139232 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaataa 139330  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
139331 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 139429  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
139430 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 139529  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
139530 atttatacctacaactttcgtgtttacacttaagaccaatt 139570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 144072 - 144508
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaa-acaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| ||| |||||    
144072 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaatacagcatga 144169  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
144170 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaataa 144268  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
144269 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 144367  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
144368 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 144467  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
144468 atttatacctacaactttcgtgtttacacttaagaccaatt 144508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 134196 - 134632
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaa-acaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| ||| |||||    
134196 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaatacagcatga 134293  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
134294 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaataa 134392  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
134393 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 134491  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
134492 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 134591  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
134592 atttatacctacaactttcgtgtttacacttaagaccaatt 134632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 141603 - 142039
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaa-acaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| ||| |||||    
141603 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaatacagcatga 141700  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
141701 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaataa 141799  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
141800 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 141898  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
141899 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactctagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 141998  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
141999 atttatacctacaactttcgtgtttacacttaagaccaatt 142039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 127
Target Start/End: Original strand, 62216 - 62303
Alignment:
40 acttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgca 127  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||    
62216 acttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgaaaaacatcatggtataataatatcgaatgca 62303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Original strand, 132649 - 132762
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||    
132649 caataatttggaacatcatcatc---atcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatga 132745  T
109 tataacaatatcaaatg 125  Q
    || ||||||||| ||||    
132746 tacaacaatatcgaatg 132762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Original strand, 9246 - 9663
Alignment:
29 catcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||| || ||||| |||| |||||||||||||    
9246 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 9343  T
128 agtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 227  Q
    ||||| |||  |||||| |||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
9344 agtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 9442  T
228 tcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactg 327  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
9443 tcaaatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcacaa-catatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactg 9541  T
328 taacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttc 427  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
9542 ttacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagagagctaacattcatacctacaactttc 9641  T
428 gtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
9642 gtgtttacacctaagaccaatt 9663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 449
Target Start/End: Original strand, 40385 - 40821
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||  ||||    
40385 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacaggatga 40482  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      
40483 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa-caacatcaaataa 40581  T
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaat 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
40582 taatcaacatcttaaaacttcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaat 40680  T
309 cataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40681 catattcaattattcactctgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 40780  T
409 atccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
40781 atttatatctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 40821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Original strand, 37860 - 37968
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||   || ||| ||||||| || |||||||     
37860 agtaatttgatcataactcaagttcta-aaatcatttggaagtcaaaccaaagccatttgaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacacca 37958  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
37959 aaggccaatt 37968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 361
Target Start/End: Original strand, 40885 - 40926
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
40885 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaaa 40926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 29 - 450
Target Start/End: Original strand, 11292 - 11712
Alignment:
29 catcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgca 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||    
11292 catcttaatcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 11389  T
128 agtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 227  Q
    ||||| |||  |||||| |||||| |||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
11390 agtcaacaacgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caaaatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 11488  T
228 tca-tatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcact 326  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||    
11489 tcaatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattaact 11588  T
327 gtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaacttt 426  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
11589 gtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaacccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaagtat 11688  T
427 cgtgcttacacctaagaccaattt 450  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
11689 cgtgtttacacctaagaccaattt 11712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 29 - 397
Target Start/End: Original strand, 10777 - 11142
Alignment:
29 catcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||    
10777 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 10874  T
128 agtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 227  Q
    ||||| |||  |||||| |||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
10875 agtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 10973  T
228 tcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactg 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
10974 tcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcacaa-catatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactg 11072  T
328 taacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcatt 397  Q
    | |||||| |  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
11073 ttacctacatgaagtaatttgactataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcatt 11142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 153 - 449
Target Start/End: Original strand, 6074 - 6368
Alignment:
153 atataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatc 252  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6074 atataattcaagtaatgcatatgcaattaaatcacaatataa-caacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatc 6172  T
253 aatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgacca 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |    
6173 aatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagtaatttgacta 6271  T
353 taactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
6272 taactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 6368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Original strand, 501088 - 501486
Alignment:
29 catcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
501088 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 501185  T
128 agtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 227  Q
    ||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
501186 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatagtaatcaacatcttaaaaca 501284  T
228 tcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactg 327  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||    
501285 ttatatatacatataacacatcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatat-------------------tcaattattcactg 501365  T
328 taacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttc 427  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
501366 tgacctacgtgcagtaatttgatcataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatctat-cctacaactttc 501464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 320 - 446
Target Start/End: Original strand, 501550 - 501676
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
501550 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacatcagaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 501649  T
420 caactttcgtgcttacacctaagacca 446  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
501650 caactttcgtgtttacacctaagacca 501676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 85757 - 85562
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| | |||||| |||||    
85757 caataatttggaacttcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatga 85660  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtc-atcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
     |||| ||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||| | ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
85659 cataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctgaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaat 85562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 204
Target Start/End: Original strand, 160688 - 160864
Alignment:
26 catcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatg 125  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
160688 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatg 160787  T
126 caagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    ||| ||| ||| || ||||||| ||| | |||| ||| ||| |   ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
160788 caa-tcaacaacatgtcaaata-tcaaacataagtcatgtaatatatatacaattatataacattataaacaacatcaa 160864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 139687 - 139589
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||| ||| ||||||||| ||| |||| ||||| | | ||  ||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| || |||||||    
139687 agtattttcaccataactaaaaatctaaaaatcatatggagctcaaaccaaagccattagaaagctaactttcatacctacgactttcatgtttacacc 139589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 194 - 449
Target Start/End: Original strand, 3190 - 3445
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacata 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3190 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatctacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaacatatacatacata 3289  T
294 tactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacgg 393  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
3290 tattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgg 3389  T
394 cattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
3390 cattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacaactaagaacaatt 3445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 194 - 430
Target Start/End: Original strand, 1595 - 1831
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacata 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
1595 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatataaatacata 1694  T
294 tactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacgg 393  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
1695 tattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgg 1794  T
394 cattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtg 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1795 cattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtg 1831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 194 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 53869 - 53609
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacataca 291  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
53869 aacaacatcaaatgataatcaacatctacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatataatattcacaaacatatacataca 53770  T
292 tatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaac 391  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||     
53769 tatactaatttatcaatcatattcaattattcattgtgacctacgtgcagtaatttgaccatatctcaagttctataaatccctttgacgtcaaaccaat 53670  T
392 ggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatttga 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
53669 ggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacagctaagaccaatttga 53609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 129072 - 128907
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
129072 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 128974  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
128973 tctcaaacat-catatataattcatgtaatggatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaat 128907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Original strand, 116416 - 116569
Alignment:
11 aataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgata 110  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||| ||||| |    
116416 aatactttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaacagcatgaca 116513  T
111 taacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagta 166  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||||    
116514 taatcatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta 116569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 206
Target Start/End: Original strand, 78345 - 78505
Alignment:
45 gaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaaca--acatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctc 142  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||    
78345 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctc 78443  T
143 aaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||    || | ||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
78444 aa--catcgtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaat 78505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 183; Significance: 8e-99; HSPs: 4)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 194 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 4300 - 4043
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacataca 291  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
4300 aacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatataatattcacaaacatatacataca 4201  T
292 tatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaac 391  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
4200 tatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacccacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaac 4101  T
392 ggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||    
4100 gacattagaaagctaacatccatacctacacctttcatgtttacacctatgaccaatt 4043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 324 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 3782 - 3657
Alignment:
324 actgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaac 423  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3782 actgtgacctacgttcagtaatttgagcataactcaagttacataaatcgttttgacctcataccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaac 3683  T
424 tttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||    
3682 tttcatgtttacagctaagaccaatt 3657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 3979 - 3850
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| ||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
3979 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgatcataactcaagtttcataaatcgttttgacatcagaccaacggaattagaaagctaacatcaataccta 3880  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||    
3879 caactttcgtgtttccacctaagaccaatt 3850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3593 - 3541
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatc 372  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
3593 attcacagtgacctacgtgcagtattttgaccataactcaagttctataaatc 3541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 4)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 194 - 447
Target Start/End: Original strand, 15087 - 15342
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacataca 291  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
15087 aacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatagtattcacaaacatataaataca 15186  T
292 tatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaac 391  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||| |    
15187 tatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccagc 15286  T
392 ggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaa 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
15287 ggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtggttacacctaagaccaa 15342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 278 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 11251 - 11080
Alignment:
278 aacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatcctttt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
11251 aacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagtactataaatcgtttt 11152  T
378 gaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    || |||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
11151 gacgtcggaccaacggcattggaaatctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 11080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 11016 - 10887
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
11016 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgacgtcagaccaacggcattagaaaactaacatccataccta 10917  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
10916 caactttcgtgtttacagctaagaccaatt 10887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 15398 - 15526
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
15398 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaattgttttgatgtcagaccaacgacattagaaagctaacgtccataccta 15497  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
15498 caactttcgtgtttaca-ctaagaccaatt 15526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 223 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 6902 - 6676
Alignment:
223 aaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattatt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
6902 aaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattatt 6803  T
323 cactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaa 422  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
6802 cactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcggaccaacggcattggaaatctaacatccatacctacaa 6703  T
423 ctttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
6702 ctttcgtgtttacacctaagaccaatt 6676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 6612 - 6483
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
6612 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgacgtcagaccaacggcattagaaaactaacatccataccta 6513  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
6512 caactttcgtgtttacagctaagaccaatt 6483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 4)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 237 - 447
Target Start/End: Original strand, 10001 - 10211
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||     
10001 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacacacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctaca 10100  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttaca 436  Q
    |  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
10101 tgaaataatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcaatagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttaca 10200  T
437 cctaagaccaa 447  Q
    |||||||||||    
10201 cctaagaccaa 10211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 10277 - 10406
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
10277 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgacaataactcaagttctataaatcgttttgatgtcagaccaacggcattagaaatctaacatccataccta 10376  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||    
10377 caactttcgtgttgacacataagaccaatt 10406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 10470 - 10599
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
10470 attcattgtgacctacatgcagtaatttgaccataacgcaagttctataaatctttttgacgtcagaccaacggtattagaaagctaacatccataccta 10569  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
10570 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 10599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 313
Target Start/End: Original strand, 9936 - 9971
Alignment:
278 aacatatacatacatatactaatttatcaatcataa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
9936 aacatatacatacatatactaattcatcaatcataa 9971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 236 - 449
Target Start/End: Original strand, 416 - 629
Alignment:
236 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctac 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
416 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacttacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctac 515  T
336 gttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttac 435  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
516 gtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatctatacctacaacttttgtgtttac 615  T
436 acctaagaccaatt 449  Q
    |||| |||| ||||    
616 accttagactaatt 629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 320 - 450
Target Start/End: Original strand, 853 - 983
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
853 attcactgtgacctacgtgcagtaatatgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccatatcta 952  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaattt 450  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
953 caacttttgtgtttacacctaagaccaattt 983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 320 - 406
Target Start/End: Original strand, 693 - 779
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagcta 406  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
693 attcactgtgacctacatgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagcta 779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 237 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 476 - 267
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
476 catataacactttatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcactgtgacctacg 377  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttaca 436  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
376 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctataactttcttgtttaca 277  T
437 cctaagacca 446  Q
    ||||||||||    
276 cctaagacca 267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12407 - 12194
Alignment:
29 catcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||| || ||||| || ||||| | || |||||||||||||    
12407 catcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatcaaatgca 12310  T
128 agtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 227  Q
    ||||| |||  |||||| |||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
12309 agtcaacaacgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 12211  T
228 tcatatatacatataac 244  Q
    |||||||||||||||||    
12210 tcatatatacatataac 12194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 237 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 582 - 506
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
582 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataa 506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 237 - 449
Target Start/End: Original strand, 30229 - 30441
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
30229 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 30328  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttaca 436  Q
    | |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
30329 tgcagtaatttgaccataactcaagtactacaaatccttttgaagtgaaaccaacggtattagaaagctaacatccatacctacaactttaatgtttaca 30428  T
437 cctaagaccaatt 449  Q
    || ||||||||||    
30429 ccgaagaccaatt 30441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 310
Target Start/End: Original strand, 29916 - 30196
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatc-aacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatg 107  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || ||||    
29916 caataatttggaacttcatcatcttaattgaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatg 30013  T
108 atataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatg 207  Q
    | |||| |||||||| || |||||| |||  |||||| |||||| ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
30014 acataataatatcaagtgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataattcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaat- 30111  T
208 gtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaa 307  Q
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
30112 ------------------catcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaagcatatacatacatatactaattcatcaa 30193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 30505 - 30634
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
30505 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactaaagttttataaatcgttttgacgtcacaccaatggcattggaaagctaacatccataccta 30604  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
30605 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 30634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 4)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 245 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 13571 - 13379
Alignment:
245 acttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
13571 acttcatcaatcatggacaatatcatattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcattgtgacctacgttcagtaa 13472  T
345 tttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacac 437  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
13471 tttgaccataactcaagttttataaatccttttgaagtcaaaccaacggcactagtaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacac 13379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 290 - 447
Target Start/End: Original strand, 43002 - 43159
Alignment:
290 catatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaacca 389  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
43002 catatactaattcatcaatcatattcagttattcactgtgacctacgtgcactaatttgactataactcaagttctataaacccttttgaagtcaaacca 43101  T
390 acggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaa 447  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
43102 acggcattagaaagctaacattcatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaa 43159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 43225 - 43354
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
43225 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaacgacattagaaagctaacattcataccta 43324  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
43325 caacttttgtgtttacacctaagaccaatt 43354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 103737 - 103644
Alignment:
37 tcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaa 128  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||  || ||||||||||||||  |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
103737 tcaacttagaccgactaatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtataaaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaa 103644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 4)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 237 - 444
Target Start/End: Original strand, 799 - 1006
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacg 336  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
799 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatacaaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacg 898  T
337 ttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttaca 436  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
899 tgcagtaatttgaccataactcaagttctataaataattttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttact 998  T
437 cctaagac 444  Q
    ||||||||    
999 cctaagac 1006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Original strand, 649 - 769
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacataca 291  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
649 aacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatacataca 747  T
292 tatactaatttatcaatcataa 313  Q
    |||||||||| |||||||||||    
748 tatactaattaatcaatcataa 769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Original strand, 1095 - 1204
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
1095 agtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacatcagaccaacggaattagaaagctaacatccatacctacaacttttgtgtttacacct 1194  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||||||||||    
1195 aagaccaatt 1204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 350 - 449
Target Start/End: Original strand, 1225 - 1323
Alignment:
350 ccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
1225 ccataactcaagttctataaatcgtttagacgtcagaccaacggcat-agaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 1323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 248 - 449
Target Start/End: Original strand, 6682 - 6873
Alignment:
248 tcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaattt 347  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||          ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
6682 tcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacat----------atactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacgtgcagtaattt 6771  T
348 gaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaa 447  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
6772 gaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaa 6871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 6937 - 7066
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6937 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgacgtcataccaacggcattagaaagctaacatccataccta 7036  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
7037 caactttcgtgtttacacctaagaccaatt 7066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 4)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 284 - 449
Target Start/End: Original strand, 7996 - 8161
Alignment:
284 tacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtc 383  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
7996 tacatacatatattaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacgtgcagtaatttgaccataattcaaattctataaatccttttgaagtc 8095  T
384 aaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
8096 aaaccaacggaattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaatt 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 320 - 446
Target Start/End: Original strand, 8225 - 8351
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
8225 attcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcaaaccaaggggattagaaagctaacatccatatcta 8324  T
420 caactttcgtgcttacacctaagacca 446  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
8325 caacttttgtgtttacacctaagacca 8351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 323 - 449
Target Start/End: Original strand, 8421 - 8547
Alignment:
323 cactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaa 422  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
8421 cactgtgacctacgtgcagtaatttcaccataactcaagttgtataaatctttttgacgtcataccaatggaattagaaagctaacatccatatctacaa 8520  T
423 ctttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||    
8521 cttttgtgtttacacgtaagaccaatt 8547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 148
Target Start/End: Original strand, 5657 - 5769
Alignment:
36 atcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatca 135  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
5657 atcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtatgaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaaca 5756  T
136 atatctcaaatat 148  Q
    | |||||||||||    
5757 acatctcaaatat 5769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 254 - 411
Target Start/End: Original strand, 57708 - 57865
Alignment:
254 atcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccat 353  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
57708 atcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcactcatattcaagtattcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccat 57807  T
354 aactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatc 411  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
57808 aactcaagttttataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatc 57865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 204
Target Start/End: Original strand, 8481 - 8650
Alignment:
37 tcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
8481 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 8580  T
137 tatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtataca--attatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
8581 catctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaa 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 148
Target Start/End: Original strand, 6523 - 6661
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
6523 caataatttggaacatcatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 6622  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatat 148  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
6623 ataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 6661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 53651 - 53486
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatc 140  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
53651 cttagactgattcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 53552  T
141 tcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
53551 tcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 53486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 293 - 450
Target Start/End: Original strand, 68227 - 68384
Alignment:
293 atactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacg 392  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
68227 atactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaatg 68326  T
393 gcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaattt 450  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
68327 gcactagaaagctaacatccatacatacaactttcgtgtttacacataagaccaattt 68384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 92
Target Start/End: Original strand, 46983 - 47065
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagt 92  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
46983 caataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 47065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 313
Target Start/End: Original strand, 9734 - 10017
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||||||  ||||    
9734 caataatttgggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagaatga 9831  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaata-ttcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatg 207  Q
     |||| |||||||| ||||||||| |||  |||||| || |||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
9832 cataataatatcaagtgcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaat- 9929  T
208 gtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaa 307  Q
                      | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
9930 ------------------cgtcatatatacatataacacttcatcaatcatgtacaatatcgtattcacaaacttatacatacatatactaactcatcaa 10011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 32929 - 33123
Alignment:
10 caataatttg-aaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
32929 caataatttggaaacatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaacagcatga 33027  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||  |||| |||||||| |||  |||  |||||||||||  |||| |||||||||    
33028 cataataatatcaaatgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaa 33123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 38748 - 38942
Alignment:
10 caataatttg-aaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
38748 caataatttggaaacatcatcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaacagcatga 38846  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||||||||| | | ||| |||| |||||||||  |||| |||||||| |||  |||  |||||||||||  |||| |||||||||    
38847 cataataatatcaaatgcaaataaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaa 38942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 310
Target Start/End: Original strand, 10005 - 10067
Alignment:
248 tcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatca 310  Q
    |||||||||||  |||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
10005 tcatcaatcataaacaacatcgtactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatca 10067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3283 - 3090
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||     
3283 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacaacatgac 3185  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
3184 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 3090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 1740 - 1869
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
1740 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgactataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaacgacattagaaagctaacatccataccta 1839  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||    
1840 caactttcttgtttacacctaagaccaatt 1869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 450
Target Start/End: Original strand, 1634 - 1677
Alignment:
407 acatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaattt 450  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
1634 acatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattt 1677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12751
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatc 140  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 12686  T
141 tcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
12687 tcaaatacttatatataattc-agtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 12751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16206 - 16037
Alignment:
37 tcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
16206 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaa 16107  T
137 tatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
     |||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
16106 catctcaaacattcttatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaat 16037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13313
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatc 140  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatc 13246  T
141 tcaaa-tattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    | |||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
13247 tgaaaccattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaat 13313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 158627 - 158433
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |||||    
158627 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 158530  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
158529 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaat 158433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 340080 - 339889
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||||| |||||| |||||||||||||     
340080 caataattttgaacttcatcatcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac--acaacaacataggcagtatacaaaacaacatgac 339983  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| |||  |||||||||||| || |||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
339982 ataataatatcaaat-caagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaa 339889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22800 - 22610
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||   |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
22800 caataatttggaacatcatcacctt---caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgcaaatcatcatgat 22704  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
22703 ataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 22610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Original strand, 82056 - 82264
Alignment:
10 caataatttgaaacct-catcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatg 107  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||| || ||||    
82056 caataatttggaaccttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaa-cagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatg 82153  T
108 atataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatg 207  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||     
82154 acataataatatcaaatgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatc 82252  T
208 gtaatcaacatc 219  Q
     |||||||||||    
82253 ataatcaacatc 82264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 196 - 313
Target Start/End: Original strand, 27958 - 28074
Alignment:
196 caacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatata 295  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
27958 caacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatata 28056  T
296 ctaatttatcaatcataa 313  Q
    |||||| |||||||||||    
28057 ctaattcatcaatcataa 28074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 234 - 376
Target Start/End: Original strand, 28048 - 28190
Alignment:
234 atacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattcactgtaacct 333  Q
    |||||||||  | ||||||||||||  |||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
28048 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 28147  T
334 acgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttt 376  Q
    ||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
28148 acgtgaagtaatttgactataactcaagttctataaatccttt 28190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15596 - 15466
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||     
15596 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aagagcaacataggcagtatacaaaacaacatgac 15498  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatct 141  Q
    |||| |||||||| | ||| ||||||| ||||    
15497 ataataatatcaatttcaattcatcaacatct 15466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10671 - 10481
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||   |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
10671 caataatttggaacatcaccatctt---caacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 10575  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
10574 ataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 10481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27855 - 27686
Alignment:
37 tcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||    
27855 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaa 27756  T
137 tatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
     |||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
27755 catctcaaacattcacatataattctagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaat 27686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 16769 - 16952
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||    
16769 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacagt-agtatacaaaaacaacatga 16866  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataa 194  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
16867 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 16952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18160 - 17964
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| | | |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||  || |||||| |||| ||||||    
18160 caataatttggaacatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaacatcatgat 18061  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    |||| |||||| || |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
18060 ataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 17964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2306 - 2111
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| | ||||||||||||    
2306 caataatttagaacttcatcattttaatcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacaacatga 2209  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtc-atcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
     |||| ||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||| | ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
2208 cataataatatcaaatgcaagtcaattaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaat 2111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Original strand, 91 - 298
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||| | | ||||| ||||| ||||||||    
91 caataattgggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatga 188  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||      
189 cataataatatcaaatgcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatca 287  T
209 taatcaacatc 219  Q
    |||||||||||    
288 taatcaacatc 298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 8311 - 8440
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
8311 attcactgtgaccaacgtgcagtaattttaccataactcaagttctataaatccttttgaagtcaaaccaatagcattagaaagctaacatccataccta 8410  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||||    
8411 caactttcatgtttacacctaagagcaatt 8440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Original strand, 11452 - 11648
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| | | |||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
11452 caataatttggaacatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgat 11551  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    |||| ||||||  | | |||| | ||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
11552 ataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 11648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Original strand, 12049 - 12250
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||       |||||||| || |||||| | |||||| |||||    
12049 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa-------cagcaacacag-cagtatactaaaacagcatga 12140  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgg 208  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
12141 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatca 12239  T
209 taatcaacatc 219  Q
    |||||||||||    
12240 taatcaacatc 12250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 38389 - 38193
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| | | |||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
38389 caataatttggaacatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgat 38290  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    |||| ||||||  | | |||| | ||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
38289 ataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 38193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 204
Target Start/End: Original strand, 129919 - 130086
Alignment:
36 atcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatca 135  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
129919 atcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 130018  T
136 atatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    | |||||||||| ||| | |||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
130019 acatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattgtaaacaacatcaa 130086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 60818 - 60652
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaac--atgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||| ||| ||| |    
60818 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagctcatgatataccaatatcaa-tgcaaatcaacaaca 60720  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  || |||||||||||||    
60719 tctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacataattaacaacatcaaat 60652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 6256 - 6133
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||    
6256 caataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 6157  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcat 133  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
6156 ataacaatatcgaatgcaagtcat 6133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 1839 - 2033
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
1839 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatga 1937  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||  |||||||| |||  |||  |||||||||||  |||| |||||||||    
1938 cataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaa 2033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 320 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 36875 - 36749
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
36875 attcactgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacgtcagaccaacaacattagaaagttaacatccataccta 36776  T
420 caactttcgtgcttacacctaagacca 446  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
36775 caactttcgtgtttacacctaagacca 36749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 332 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 37056 - 36938
Alignment:
332 ctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgc 431  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
37056 ctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatctttttgacgtcagaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgt 36957  T
432 ttacacctaagaccaattt 450  Q
    ||||| ||| ||| |||||    
36956 ttacatctatgactaattt 36938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 320 - 449
Target Start/End: Original strand, 18423 - 18552
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
18423 attcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaatgacattagaaagctaacatccataccta 18522  T
420 caactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
18523 caacttttgtgtttacacctaagaccaatt 18552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 15910 - 15785
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||    
15910 caataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgat 15811  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatca 135  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
15810 ataacaatatcgaatgcaagtcatca 15785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 75
Target Start/End: Original strand, 178898 - 178947
Alignment:
26 catcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaa 75  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
178898 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 178947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0711
Description:

Target: scaffold0711; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 321 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 7558 - 7430
Alignment:
321 ttcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctac 420  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
7558 ttcactgtgacctacgtgtagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgatgtcagaccaacggtattagaaagctaacatccatacctac 7459  T
421 aactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||    
7458 aacttttgtgtttacacccaagaccaatt 7430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 320 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 7367 - 7243
Alignment:
320 attcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccataccta 419  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |||| ||||||| |||||||| | ||||||  |||||||    
7367 attcactgtgacctacgtgcaataatttgaccataactcaagttttataaattgttttgacgtcagaccaacgacattagaaggataacatttataccta 7268  T
420 caactttcgtgcttacacctaagac 444  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
7267 caactttcgtgtttacacctaagac 7243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 322 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 7172 - 7079
Alignment:
322 tcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccata 415  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||    
7172 tcactgtgacctatgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacggcagagcaacggcattagaaagctaacatccata 7079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 321 - 449
Target Start/End: Original strand, 17947 - 18075
Alignment:
321 ttcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctac 420  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
17947 ttcactgtgacctatgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcattttgacgtcagaccaatggtattagaaagctaacatccatacctac 18046  T
421 aactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||    
18047 aacttttgtgtttacacctaagaccaatt 18075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 45922 - 45732
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| || ||||||    
45922 caataatttggaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgcaaatcatcatgat 45826  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| || ||| | |||||||| ||  ||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
45825 ataacaatatcgaatgtaagtcatcaacatctcaatta-tcaaacataattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 45732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 321 - 449
Target Start/End: Original strand, 31497 - 31625
Alignment:
321 ttcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctac 420  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
31497 ttcactgtgacctacgtgcagtaatttaaccataactcaagttctataaatcgttttgacgtcagaccaatggcattagaaagctaacattaatacctac 31596  T
421 aactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
31597 aactttcgtgtttacacctaagaccaatt 31625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 10882 - 10764
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacata 293  Q
    |||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
10882 aacaacatcaaataatactcaacattttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaattatggacagtatcgtattcac-aacatatacatacata 10784  T
294 tactaatttatcaatcataa 313  Q
    |||||||| |||||||||||    
10783 tactaattcatcaatcataa 10764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 237 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10734 - 10647
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcataatcaattattca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
10734 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattca 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 41 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20372
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatc 140  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||  ||    
20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacat-cagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 20427  T
141 tcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaa 195  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
20426 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaa 20372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Original strand, 128739 - 128894
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| | | |  |   |||||| |||||     
128739 caataatttggaacatcatcatcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaa-agcaacaaaaaaaaaaaaaaaaacagcatgac 128837  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagta 166  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||  |||| ||||||||    
128838 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagta 128894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 135
Target Start/End: Original strand, 6599 - 6724
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||    
6599 caataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgat 6698  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatca 135  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||    
6699 ataacaatatcgaatgcaagttatca 6724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 135
Target Start/End: Original strand, 13979 - 14104
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||    
13979 caataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgat 14078  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatca 135  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||    
14079 ataacaatatcgaatgcaagttatca 14104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 5)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 145
Target Start/End: Original strand, 32525 - 32658
Alignment:
9 tcaataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatga 108  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
32525 tcaataatttggaacatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatga 32622  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaa 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
32623 tataacaatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 32658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 410
Target Start/End: Original strand, 39965 - 40035
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacat 410  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||    
39965 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtaaaaccaaagccattagaaagctgacat 40035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 410
Target Start/End: Original strand, 45448 - 45518
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacat 410  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||  ||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
45448 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaattatttggaagtaaaaccaaagccattagaaagctaacat 45518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 410
Target Start/End: Original strand, 79003 - 79073
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacat 410  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| |  ||||||||||||||||    
79003 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggatgtcaaaccaaagcaattagaaagctaacat 79073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 51985 - 51839
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaat-a 138  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||| || | |||| | || || |||| |||||| |||||||| || |||| |    
51985 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagc-acataggcagcattcaaaaatagcaagacataataatatc-aatgcaagccaacaatca 51888  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
    |||||| ||||||| || | |||||||| ||||||||| |||||||||||    
51887 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtatac-attatatcaca 51839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 120 - 310
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   ||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
120 caataatttggaacatcatcatc---atcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 216  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||| ||| | |||||||| ||| ||  ||||||||||||| | | |||||||||||||||    
217 ataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataatattataaacaacatcaa 310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 321 - 449
Target Start/End: Original strand, 33465 - 33593
Alignment:
321 ttcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctac 420  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
33465 ttcaccgtgacctacgtgcagtaatttgaccataactcaagttctataaatcgtttttacgtcagaccaacgacattagaaatctaacatccatacctac 33564  T
421 aactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||    
33565 aacttttgtgtttacacctaagaccaatt 33593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 12930 - 13053
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||   |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
12930 caataattttgaacatcatcatctt---caacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcagcatgat 13026  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 136  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
13027 ataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 13053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18276 - 18176
Alignment:
104 catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatca 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||    
18276 catgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatca 18178  T
204 aa 205  Q
    ||    
18177 aa 18176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 148
Target Start/End: Original strand, 19255 - 19390
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
19255 caataatttggaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 19351  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatat 148  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
19352 ataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 19390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Original strand, 4199 - 4393
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||| ||| || |||||| ||||| || |||||    
4199 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-gacagcgacacag-cagtatacaaaaccagcatga 4296  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtc-atcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
     |||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
4297 cataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat--acaacatcaaat 4393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1167 - 977
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| | || ||||||    
1167 caataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatgcagatcatcatgat 1068  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacat 201  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||  ||| | ||| | |||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||| ||  ||||||||    
1067 ataacaacatcgaatgcaagtcatcaacatcataaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacat 977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 13199 - 13393
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| |||||    
13199 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 13297  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||  |||||||| ||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
13298 cataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 13393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Original strand, 39480 - 39658
Alignment:
25 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaat 124  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||    
39480 tcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 39578  T
125 gcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||||| |||  |||  |||||||||||  |||| |||||||||    
39579 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaa 39658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 75332 - 75154
Alignment:
25 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaat 124  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||    
75332 tcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 75234  T
125 gcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||||| |||  |||  |||||||||||  |||| |||||||||    
75233 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaa 75154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 5)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15269 - 15149
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacataca 291  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
15269 aacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatattgtattcgc-aacatatacataca 15171  T
292 tatactaatttatcaatcataa 313  Q
    |||||||||| |||||||||||    
15170 tatactaattcatcaatcataa 15149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Original strand, 7254 - 7383
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | ||||||||||     
7254 caataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat--acaacaacatgaa 7351  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatct 141  Q
    ||||  ||||||||| ||| ||||||| ||||    
7352 ataattatatcaaattcaattcatcaacatct 7383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Original strand, 1277 - 1406
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  || | |||| |||||     
1277 caataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag--tgtacaacatcatgac 1374  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatct 141  Q
    ||||  ||||||||| ||| ||||||| ||||    
1375 ataattatatcaaattcaattcatcaacatct 1406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 15371 - 15306
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaa 75  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
15371 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15119 - 15070
Alignment:
237 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatac 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
15119 catataacacttcatcaattatgaacaatatagtattcacaaacatatac 15070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 206
Target Start/End: Original strand, 225465 - 225590
Alignment:
80 caacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaat 179  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
225465 caacatagtcagtatgcaaaacagcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaat 225563  T
180 tatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
225564 tatatcacattataaacaacatcaaat 225590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 161267 - 161083
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| ||| || |||||| | ||||||  ||||    
161267 caataatttgaaacttcatcatcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatc-aacagcgacacag-cagtatacaaaaacataatga 161170  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtc-atcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataa 194  Q
     |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| | ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
161169 cataataatatcaaatgcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa 161083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 164674 - 164573
Alignment:
105 atgatataacaatatcaaatgcaagtca-tcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatca 203  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
164674 atgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatca 164576  T
204 aat 206  Q
    |||    
164575 aat 164573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3304 - 3125
Alignment:
25 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaa 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||    
3304 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaa 3206  T
124 tgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    || || ||| ||| ||||||| ||| |||  |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||  |||| |||||||||    
3205 tgtaattcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaa 3125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 2936 - 2801
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||    
2936 caataatttggaacatcatcatc---atcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgcaaatcatcatgat 2840  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatat 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
2839 ataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 2801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 321 - 449
Target Start/End: Original strand, 39626 - 39754
Alignment:
321 ttcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctac 420  Q
    |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
39626 ttcactgtgacctacgtgtaataatttgaccataactcaagttctataaatcgttttgacgttagaccaatggcattagaaagctaacatccataactac 39725  T
421 aactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||    
39726 aacttttgtgtttacacctaagaccaatt 39754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17335 - 17154
Alignment:
25 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaaca---tgatataacaatatca 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||   ||| |||| |||||||    
17335 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatatca 17237  T
122 aatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||| |||  |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||  |||| |||||||||    
17236 aatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaa 17154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79267
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatat 139  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||  |||| || ||||| |||| ||| |||||||||||||| |||  |    
79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacac-gacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgt 79333  T
140 ctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
79332 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaagtatatcacaatat-aacaacatcaaat 79267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 41 - 148
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1158
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatc 140  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||    
1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacatc 1150  T
141 tcaaatat 148  Q
    ||||||||    
1151 tcaaatat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Original strand, 15649 - 15764
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||    
15649 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaccatcatgat 15748  T
110 ataacaatatcaaatg 125  Q
    |||| |||||| ||||    
15749 ataataatatcgaatg 15764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 44840 - 44684
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||| | |||||| |||||    
44840 caatactttggaacttcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatga 44742  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagta 166  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||||    
44741 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta 44684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 26004
Alignment:
29 catcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgca 127  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||| |    
26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgta 26081  T
128 agtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    | ||| |||  |||||| ||| |||  |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||  |||| |||||||||    
26080 attcaacaacgtctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaa 26004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8662 - 8472
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    ||||||||| ||||||  |||||| |||||     
8662 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca----gcaacataggcagtatcaaaaacagcatgac 8567  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||  |||| |||||||||  |||| |||||||| |||  |||  |||||||||||| |||| |||||||||    
8566 ataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaa 8472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 206
Target Start/End: Original strand, 1086 - 1265
Alignment:
26 catcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatg 125  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||     
1086 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaata 1185  T
126 caagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    || |||||||| || ||||| | ||| | |||||||| | | ||  ||||||| ||||| ||| ||  |||||||||||||    
1186 caggtcatcaacatttcaaaca-tcaaacataattcatggaatgtatatacaactatataacattaacaacaacatcaaat 1265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 209 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 36046 - 35955
Alignment:
209 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacac-ttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
36046 taatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacactttcatcaatcatggacaatatcatattcac-aacatatacatacatatactaat 35955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 24013 - 23898
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||   |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
24013 caataatttggaacatcatcatctt---caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 23917  T
110 ataacaatatcaaatgcaa 128  Q
    ||||||||||| |||||||    
23916 ataacaatatcgaatgcaa 23898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 194
Target Start/End: Original strand, 4300 - 4465
Alignment:
28 tcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgc 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| |||    
4300 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacagt-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgc 4397  T
127 aagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataa 194  Q
    || ||| |||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
4398 aaatcaacaacgtctcaattaatcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 4465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 3458 - 3652
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||| |||||| | |||||| |||||    
3458 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaa-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 3556  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||  |||||||| |||  |||  |||||||||||  |||| |||||||||    
3557 cataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcaaataacattatatcacatcataatcaacatcaa 3652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 204
Target Start/End: Original strand, 332 - 524
Alignment:
11 aataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgata 110  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||| | |||||      
332 aataatttggaacatcatcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaataacataggcagtatacaaaatagcatgacg 430  T
111 taacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    ||| |||||||| || |||||| ||| |||| ||||||||   |||| |||||||| |||  |||  |||||||||||  |||| |||||||||    
431 taataatatcaattggaagtcaacaacatcttaaatattcgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaa 524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 22871 - 23048
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | |||||| |||||    
22871 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-ccagtatacaaaaacagcatga 22968  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||  |||| |||||||| |||  |||  |||||||||||    
22969 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 23048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16733 - 16555
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | |||||| |||||    
16733 caataatttgaaacatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatga 16635  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
     |||| ||||||||||| |||||| ||  ||||||| ||| |||  |||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
16634 cataataatatcaaatggaagtcaacagcatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 16555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Original strand, 11280 - 11395
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
11280 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgat 11379  T
110 ataacaatatcaaatg 125  Q
    |||| |||||| ||||    
11380 ataataatatcgaatg 11395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Original strand, 1985 - 2100
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||    
1985 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgcaaaccatcatgat 2084  T
110 ataacaatatcaaatg 125  Q
    |||| |||||| ||||    
2085 ataataatatcgaatg 2100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 151
Target Start/End: Original strand, 28402 - 28543
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | ||||||||||||    
28402 caatagtttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatga 28500  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattca 151  Q
     |||| |||||||| ||||| ||| ||| |||| | |||||||    
28501 cataataatatcaattgcaattcaacaacatcttatatattca 28543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Original strand, 4540 - 4608
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaaca 78  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
4540 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaca 4608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 25883 - 26077
Alignment:
10 caataatttg-aaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| | |||||    
25883 caataatttggaaacatcattatcttcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaatatcatga 25981  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||| |||||||| ||| | ||  |||||||||||  |||| |||||||||    
25982 cataataatatcaaatgcaagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaacatcaa 26077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 39845 - 40039
Alignment:
10 caataatttg-aaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| | |||||    
39845 caataatttggaaacatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaatatcatga 39943  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||| |||||||| ||| | ||  |||||||||||  |||| |||||||||    
39944 cataataatatcaaatgcaagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaacatcaa 40039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 51901 - 52095
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||| |||||    
51901 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatga 51999  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||| ||||||||| ||  |||| |||||||||  |||| |||||||| |||  |||  |||||||||||| |||| | |||||||    
52000 cataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatctacatcaa 52095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 168111 - 167934
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | |||| | |||||    
168111 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatga 168013  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| || || |||||||||||    
168012 cataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaac-attatatcaca 167934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 7996
Alignment:
43 tagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaac--atgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatc 140  Q
    ||||||||| | ||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || |  ||||||||| ||||||||||| || ||| ||| |||    
8161 tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaatcagctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacatc 8062  T
141 tcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
8061 ttaaacattcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaaat 7996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 321 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 19957 - 19829
Alignment:
321 ttcactgtaacctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctac 420  Q
    |||||| | ||||||||  ||||||||||| ||||||||| || ||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
19957 ttcactatgacctacgtgtagtaatttgacgataactcaagttatataattcgttttgacgtcagaccaatggcattagaaagctaacatccatacctac 19858  T
421 aactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||||    
19857 aacttttgcgtttacacctaagaccaatt 19829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 145
Target Start/End: Original strand, 10542 - 10650
Alignment:
37 tcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
10542 tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 10641  T
137 tatctcaaa 145  Q
     ||||||||    
10642 catctcaaa 10650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 438
Target Start/End: Original strand, 40628 - 40726
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || || ||||||| | ||||||||||||||| |   |||||| ||||||| || |||||||    
40628 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgttaaaccaaagccattagaaagctaacttaattacctaaaactttcatgtttacacc 40726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1181 - 1004
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | |||| | |||||    
1181 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatga 1083  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| || || |||||||||||    
1082 cataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaac-attatatcaca 1004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 201
Target Start/End: Original strand, 12754 - 12944
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||| ||||| ||| |||||||  | |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||    
12754 caatcatttggaacatcatcataatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatgat 12853  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacat 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||| | ||| | |||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||| ||  ||||||||    
12854 ataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaataacaacat 12944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 4496 - 4689
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||  |||| || |||||    
4496 caataatttggaacataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatga 4593  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
4594 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaa 4689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 12078 - 12271
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||  |||| || |||||    
12078 caataatttggaacataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatga 12175  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
12176 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaa 12271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 22030 - 22223
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||  |||| || |||||    
22030 caataatttggaacataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatga 22127  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
22128 cataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaa 22223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 194 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1323 - 1203
Alignment:
194 aacaacatcaaatggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacataca 291  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| || || ||    
1323 aacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcttattctc-aacatttatattca 1225  T
292 tatactaatttatcaatcataa 313  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
1224 tatactaatttattaatcataa 1203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 151
Target Start/End: Original strand, 4837 - 4978
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || |||||    
4837 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatga 4935  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattca 151  Q
     |||| |||||||||||||| ||| ||| |||| || ||||||    
4936 cataataatatcaaatgcaattcaacaacatcttaagtattca 4978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 33089 - 32948
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||| || |||||| ||||||| |||||     
33089 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgac 32991  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcat 152  Q
    |||| |||||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||||    
32990 ataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattcat 32948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 152
Target Start/End: Original strand, 45916 - 46057
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||| || |||||| ||||||| |||||     
45916 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgac 46014  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcat 152  Q
    |||| |||||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||||    
46015 ataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattcat 46057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 187
Target Start/End: Original strand, 16101 - 16278
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | |||||| || ||    
16101 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaaga 16199  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcac 187  Q
    ||| | ||||||||||||||| || ||  ||||||| ||| |||  |||| ||||||| ||| ||||  ||||||||||    
16200 tatcataatatcaaatgcaagccaacatcatctcaagtatacattcataactcaagtaatgcatataacattatatcac 16278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 17462 - 17389
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaaca 84  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||    
17462 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaaca 17389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 39901 - 40094
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||     
39901 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacaacatgac 39999  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  || |||| |||||||    |||| |||||||| |||  |||  |||||||||||  |||| |||||||||    
40000 ataataatatcaaatgcatgtcaataacatcttaaatatttgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaa 40094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19987 - 19822
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaaca--acatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
19987 cttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaaca 19888  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||  |   ||||| |||| ||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||| || ||||||||||    
19887 tctc--agcatcataaataactcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaataacatcaaat 19822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1440 - 1250
Alignment:
28 tcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgc 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||  |||| |   ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||    
1440 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa-caataacacatg-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 1343  T
127 aagtca-tcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatc 219  Q
    |||||| |||   |||||| |||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
1342 aagtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaatcataatcaacatc 1250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6220
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaac--atgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  |||||| |  ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |    
6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 6287  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||  |||||||||||||    
6286 tctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaat 6220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 2775 - 2640
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||| |    
2775 caataatttggaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtatgtaaatcatcatgtt 2679  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatat 148  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||    
2678 ataacaatattgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 2640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Original strand, 97024 - 97190
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||  || |||||||||||||| |||||   ||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
97024 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 97123  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
97124 tctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaat 97190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Original strand, 106302 - 106468
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||  || |||||||||||||| |||||   ||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
106302 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 106401  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
106402 tctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaat 106468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 201
Target Start/End: Original strand, 6826 - 6987
Alignment:
36 atcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatca 135  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||   ||||    
6826 atcatcttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaatgcaa---atca 6922  T
136 atatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacat 201  Q
    | | |||||||| ||| | |||| ||| ||| ||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
6923 acaactcaaata-tcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 6987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 201
Target Start/End: Original strand, 8089 - 8193
Alignment:
96 caaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaa 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| | |||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||| ||  ||    
8089 caaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaa 8187  T
196 caacat 201  Q
    ||||||    
8188 caacat 8193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 1202 - 1087
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
1202 caataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgat 1103  T
110 ataacaatatcaaatg 125  Q
    |||| |||||| ||||    
1102 ataataatatcgaatg 1087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 32216 - 32118
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacc 438  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || || ||||||| | ||||||||||||||| |   |||||| ||||||| || |||||||    
32216 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgttaaaccaaagccattagaaagctaacttaattacctaaaactttcatgtttacacc 32118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6253 - 6060
Alignment:
14 aatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataaca--aacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgata 110  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||  ||||| | |||||| ||||| |    
6253 aatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgaca 6154  T
111 taacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
    | | |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||  |||||||| |||  |||  |||||||||||  |||| |||||||||    
6153 tgataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaa 6060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14827 - 14692
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| || ||||||    
14827 caataatttggaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagtaagaaaatcatcatgat 14731  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatat 148  Q
    |||  |||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
14730 atagtaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 14692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 330 - 425
Target Start/End: Original strand, 113319 - 113414
Alignment:
330 acctacgttcagtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactt 425  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
113319 acctacgtttagtaatttgaccataactcaagttctaaaactcattttggagtcaaaccaacgtcattagaaatgtaacatccatacctacaactt 113414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Original strand, 267679 - 267844
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||| |||||||  ||||||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
267679 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaata 267778  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||    |||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||    
267779 tctcaa--catcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaccatcaaat 267844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Original strand, 13485 - 13596
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
13485 caataatttggaacatcatcaacttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgac 13583  T
110 ataacaatatcaa 122  Q
    || | ||||||||    
13584 atgataatatcaa 13596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25289
Alignment:
37 tcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaaca--acatgatataacaatatcaaatgcaagtcatc 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||||||   ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |    
25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacgatatc-aatgcaaatcaac 25219  T
135 aatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    || |||||||| | |||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||    
25220 aacatctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattat-tacaacatcaaat 25289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 206
Target Start/End: Original strand, 620 - 720
Alignment:
104 catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatca 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||||| || ||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
620 catgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatca 717  T
204 aat 206  Q
    |||    
718 aat 720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 310
Target Start/End: Original strand, 16263 - 16326
Alignment:
247 ttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatca 310  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
16263 ttcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatca 16326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Original strand, 34111 - 34226
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||  || ||||||    
34111 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaacccatcatgat 34210  T
110 ataacaatatcaaatg 125  Q
    |||| |||||| ||||    
34211 ataataatatcgaatg 34226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 204
Target Start/End: Original strand, 13141 - 13274
Alignment:
72 acaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgc 170  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||  |||| |||||||||  |||| |||||||| |||    
13141 acaaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgc 13240  T
171 gtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 204  Q
      |||  |||||||||||| |||| |||||||||    
13241 acataacattatatcacaacataatcaacatcaa 13274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 75
Target Start/End: Original strand, 261 - 326
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaa 75  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
261 caataatttggaacatcattatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaa 326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Original strand, 32055 - 32184
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  | |||||||||||     
32055 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaac-aaacaacatgac 32152  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatct 141  Q
    |||| |||||||| | ||| ||||||| ||||    
32153 ataataatatcaatttcaattcatcaacatct 32184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24257
Alignment:
40 acttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaat 137  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||     
24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaac 24308  T
138 atctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
    |||| ||||||||| ||||  |||||||| |||  |||  |||||||||||    
24307 atcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 24257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 75689 - 75644
Alignment:
405 taacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaattt 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
75689 taacatccatacctacaactttcgtgtttacacctaagaccaattt 75644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 188
Target Start/End: Original strand, 38339 - 38483
Alignment:
45 gaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaaca--acatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctc 142  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||||||   |||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||    
38339 gaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatctc 38438  T
143 aaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
    ||| | |||||||||||||| ||| ||| ||||||  |||||||||    
38439 aaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacatatatatcaca 38483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Original strand, 1940 - 2096
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||    
1940 caataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatga 2038  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagta 166  Q
     ||||  ||||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||| | || |||||||||    
2039 cataatgatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagta 2096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8180 - 8011
Alignment:
37 tcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaaca--acatgatataacaatatcaaatgcaagtcatc 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| ||   ||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
8180 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaac 8081  T
135 aatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    || ||| |||    |||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||| ||| ||| |||||||| ||||    
8080 aacatcacaa--catcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacattaaat 8011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 151
Target Start/End: Original strand, 8467 - 8608
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| || ||||||||||  ||||| | ||||||  ||||    
8467 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatga 8565  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattca 151  Q
     |||| |||||||| ||||||||| ||| |||| ||| |||||    
8566 cataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaacattca 8608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 136
Target Start/End: Original strand, 16271 - 16394
Alignment:
11 aataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgata 110  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||  | |||| ||||| |    
16271 aataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtat--acaacagcatgaca 16368  T
111 taacaatatcaaatgcaagtcatcaa 136  Q
    |||  ||||||||| ||| |||||||    
16369 taattatatcaaattcaattcatcaa 16394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 10556 - 10446
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  | |||| |||||     
10556 caataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtat--acaacagcatgac 10459  T
110 ataacaatatcaa 122  Q
    |||| ||||||||    
10458 ataataatatcaa 10446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Original strand, 174754 - 174908
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgat 109  Q
    |||||||||| | | |||||| ||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| |||||     
174754 caataatttggagcatcatcaacttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat--acaacagcatgac 174851  T
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagta 166  Q
    || |  ||||||||| ||| ||| ||| |||||||  ||||||  ||||||||||||    
174852 atgattatatcaaattcaattcaacaacatctcaatcattcattcataattcaagta 174908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 92
Target Start/End: Original strand, 121754 - 121835
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagt 92  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
121754 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagt 121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 136471 - 136382
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaaca--acatgatataacaatatcaaatgcaa 128  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||| |||||| |||||  |||||||   |||||||||||||||||||||||||    
136471 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaa 136382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 145179 - 145090
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaaca--acatgatataacaatatcaaatgcaa 128  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||| |||||| |||||  |||||||   |||||||||||||||||||||||||    
145179 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaa 145090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 406 - 449
Target Start/End: Original strand, 398 - 441
Alignment:
406 aacatccatacctacaactttcgtgcttacacctaagaccaatt 449  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
398 aacatccatacgtacgactttcgtgtttacacctaagaccaatt 441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 94
Target Start/End: Original strand, 51570 - 51654
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtat 94  Q
    |||||||||| ||| ||||||| || | || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
51570 caataatttggaacatcatcattttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 51654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Original strand, 32089 - 32202
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||| || |||||    
32089 caataatttggaacatcatcatc---atcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatga 32185  T
109 tataacaatatcaaatg 125  Q
    |||||||||||| ||||    
32186 tataacaatatcgaatg 32202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 151
Target Start/End: Original strand, 20898 - 21040
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| | | |||||||||||||| |  || |||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
20898 caataatttggaacatcaacatcttcaacgacttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatga 20997  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattca 151  Q
     |||| |||||||| ||||| ||| ||| |||| | |||||||    
20998 cataataatatcaattgcaattcaacaacatcttatatattca 21040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 206
Target Start/End: Original strand, 54 - 189
Alignment:
72 acaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattg 169  Q
    |||||||||||||||| |||||   ||||||   |||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||||| || ||||||||||||| ||| ||    
54 acaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcagatgcaaatcaataacatctcaaacat-catatataattcatgtaatg 152  T
170 cgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    | |||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||    
153 catatacatttatataacattattaacaacatcaaat 189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 5261 - 5184
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatag 87  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
5261 caataatttggaacgtcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacatag 5184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Original strand, 4699 - 4831
Alignment:
10 caataatttg-aaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatg 107  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | |||||| ||||    
4699 caataatttggaaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatg 4797  T
108 atataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatct 141  Q
    | ||||  | ||||| ||||| ||||||| ||||    
4798 acataaatacatcaattgcaattcatcaaaatct 4831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 6305 - 6196
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||   || ||| ||||||| || |||||||     
6305 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttagaagtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctataactttcatgtttacacca 6206  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
6205 aaggccaatt 6196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2213
Alignment:
80 caacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatat 148  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
2281 caacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 2213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 204
Target Start/End: Original strand, 27912 - 28012
Alignment:
104 catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatca 203  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||    
27912 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatca 28011  T
204 a 204  Q
    |    
28012 a 28012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3576 - 3469
Alignment:
97 aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaac 196  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| ||||||||  |||||||||||  |||| |    
3576 aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacactcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatc 3477  T
197 aacatcaa 204  Q
    ||||||||    
3476 aacatcaa 3469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 11576 - 11450
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatga 108  Q
    |||||||||| ||| || ||||||| | ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| | ||||||||||||    
11576 caataatttggaacatcttcatcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatga 11478  T
109 tataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 136  Q
     |||| |||||||| | ||| |||||||    
11477 cataataatatcaatttcaattcatcaa 11450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 4966 - 4890
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatag 87  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
4966 caataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacatag 4890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Original strand, 8566 - 8675
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| | | ||||||||||||| | |||||||||||||||||   || ||| ||||||| || |||||||     
8566 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatctagaagtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacacca 8665  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
8666 aaggccaatt 8675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Original strand, 30470 - 30579
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| | |||||||||||||||||   || ||| ||||||| || |||||||     
30470 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacataattatctaaaactttcatgtttacacca 30569  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
30570 aaggccaatt 30579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 1182 - 1098
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtat 94  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||    
1182 caataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtat 1098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 28900 - 28813
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataaca-aacagcaacatagacagtatgcaaa 99  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||    
28900 caataatttggaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaa 28813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1835 - 1735
Alignment:
104 catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    |||||||||||| | ||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||||| |||    
1835 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa--catcatatataatttatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacgtca 1738  T
204 aat 206  Q
    |||    
1737 aat 1735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 12590 - 12519
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatc 411  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
12590 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtcaacccaaagccattagaaagctaacatc 12519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 128
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2783
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaaca--acatgatataacaatatcaaatgcaa 128  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||   |||||||||||||||| ||||||  ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
2694 cttagaccgactcatgcagcttagtcaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaa 2783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 186
Target Start/End: Original strand, 569 - 713
Alignment:
41 cttagaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaa--catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaata 138  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |    
569 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaaca 667  T
139 tctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatca 186  Q
    || |||    |||||||||||||| ||| ||| |||||| | ||||||    
668 tcccaaca--tcatatataattcatgtaatgcatatacattaatatca 713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 7039 - 6970
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
7039 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacctcaaaccaacgccattagaaagctaaca 6970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Original strand, 725 - 834
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || |||| ||||| | ||||||||||||||| |   || ||||||||||| || |||||||     
725 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacgtcagaccaaagccattagaaagctaacgtaattatctacaactttcatgtttacacca 824  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
825 aagtccaatt 834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 136
Target Start/End: Original strand, 9133 - 9192
Alignment:
77 cagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
9133 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaa 9192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 194
Target Start/End: Original strand, 12047 - 12101
Alignment:
140 ctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataa 194  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
12047 ctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatatcacaatataa 12101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 408
Target Start/End: Original strand, 15780 - 15846
Alignment:
342 taatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaac 408  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||    
15780 taatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaagtcaaaccaaagccattagaaatctaac 15846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Original strand, 4505 - 4668
Alignment:
10 caataatttgaaacctcatcatcttaatcaactt-------agaccgactcttgcagattagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaa-aac 101  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |       |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||| | |    
4505 caataatttggaacatcatcatcttaatcaacctcttatatagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacagcataggcagtatgcaacagc 4603  T
102 aacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagta 166  Q
    | || ||||| | ||||||||||  || ||| ||| |||| |||||||||| |||| ||||||||    
4604 agcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatcttaaatattcatttatacttcaagta 4668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Original strand, 1375 - 1444
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || || ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
1375 agtaatttgatcataactcaagttctaaaactcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaagctaaca 1444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 1365 - 1296
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||| |||||||||   ||||||||||||||||    
1365 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggaaatcaaaccaaaaccattagaaagctaaca 1296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 75
Target Start/End: Original strand, 23843 - 23892
Alignment:
26 catcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaa 75  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
23843 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 23892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 183
Target Start/End: Original strand, 13092 - 13165
Alignment:
110 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattgcgtatacaattata 183  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||||    
13092 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattgaagtaatgcatatataattata 13165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 75
Target Start/End: Original strand, 36454 - 36503
Alignment:
26 catcatcttaatcaacttagaccgactcttgcagattagttaaataacaa 75  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
36454 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 36503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 110174 - 110065
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| |   || ||| ||||||| || |||||||     
110174 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggatgtcaaatcaaagccattagaaagctaacgtaattatctaaaactttcatgtttacacca 110075  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
110074 aaggccaatt 110065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 118675 - 118566
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| |   || ||| ||||||| || |||||||     
118675 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggatgtcaaatcaaagccattagaaagctaacgtaattatctaaaactttcatgtttacacca 118576  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
118575 aaggccaatt 118566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 409
Target Start/End: Original strand, 912 - 979
Alignment:
342 taatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||| ||||| |||| || || ||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
912 taatttgatcataattcaagttataaaaatcatttggaagtcaaaccaaagccattagaaagctaaca 979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 188
Target Start/End: Original strand, 10599 - 10638
Alignment:
149 tcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
10599 tcatatataattcatgtaatgcgtatacaattatatcaca 10638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 656 - 617
Alignment:
149 tcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 188  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
656 tcatatataattcatgtaatgcgtatacaattatatcaca 617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 311
Target Start/End: Original strand, 15282 - 15361
Alignment:
232 atatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcaatcat 311  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||   |||||||||| || ||| ||||| |||||||||    
15282 atattcatataataattcatcaatcatgaacaatatcatattcatcgacatatacattcaaataataattcatcaatcat 15361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 410
Target Start/End: Original strand, 868 - 938
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacat 410  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| ||||| |||  | |||||||||| | |||||||||||||||||    
868 agtaatttgatcataactcaggttctaaaaatcatttgcacgtcaaaccaaagccattagaaagctaacat 938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 410
Target Start/End: Original strand, 53946 - 54016
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacat 410  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||| ||||| |||  |||||||||||| | |||||||||| ||||||    
53946 agtaatttaatcataactcaagttctaaaaatcatttgaaagtcaaaccaaagccattagaaagttaacat 54016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 20009 - 19939
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacat 410  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||  ||||||||| | |||| ||||||||||||    
20009 agtaatttgatcataactcaagttctaaaaatcatttggacttcaaaccaaagccattggaaagctaacat 19939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 206
Target Start/End: Original strand, 149 - 206
Alignment:
149 tcatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 206  Q
    ||||||| ||||||  || ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
149 tcatataaaattcacataatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaat 206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Original strand, 18205 - 18274
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||||| || || ||||| ||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
18205 agtaatttgatcataactcaagttataaaaatcatttggacctcaaaccaaagccattagaaagctaaca 18274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 449
Target Start/End: Original strand, 28469 - 28578
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaacatccatacctacaactttcgtgcttacacct 439  Q
    |||||||||| |||||||||| || || ||||| ||| || |||||||||| | ||||||||| |||| |    || ||||||||||| || |||||||     
28469 agtaatttgatcataactcaagttataaaaatcatttggacgtcaaaccaaagccattagaaaactaaaaaaattatctacaactttcatgtttacacca 28568  T
440 aagaccaatt 449  Q
    ||| ||||||    
28569 aagtccaatt 28578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Original strand, 38375 - 38444
Alignment:
340 agtaatttgaccataactcaaattctataaatccttttgaagtcaaaccaacggcattagaaagctaaca 409  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
38375 agtaatttgatcataactcgagttctaaaaatcatttggacctgaaaccaacgccattagaaagctaaca 38444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University